INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 T:C C T 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 3548832 G/C 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 C:G G C 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000116213:ENST00000270708:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378320:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000471223:exon_3548450_3553662:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000424367:exon_3548777_3548902:WDR8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 3638674 C/T 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3638585_3638771:TP73 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 3745924 G/A 1 14 6 20 6.36428381845528 3.2724497920906 3.09183402636468 A:G G A 10 0.545408298681766 0.184468819237692 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000461667:exon_3745830_3745937:KIAA0562 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 3755675 T/C 1 5 9 14 2.27295850659117 4.90867468813589 -2.63571618154472 T:C T C 10 0.545408298681766 0.185085810189955 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3755647_3755683:KIAA0562 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 3761479 C/T 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 T:C C T 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494951:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378223:exon_3761471_3761547:KIAA0562 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 3800242 A/G 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 A:G A G 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000169598:ENST00000378209:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000491998:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000430539:exon_3800071_3801984:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000468793:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000477548:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000339350:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000378206:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000475969:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000448632:exon_3800071_3800305:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000461150:exon_3800071_3800364:DFFB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 11114940 G/T 1 210 209 419 95.4642572768291 113.990334424489 -18.5260771476599 A:T:G G T 10 0.545408298681766 0.069690615656458 ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11114641_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 11115061 G/A 1 170 153 323 77.2805892240998 83.4474696983102 -6.16688047421042 A:G G A 10 0.545408298681766 0.502847304764239 ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11115019_11115261:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11115019_11115141:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11115019_11115141:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 11134043 C/T 1 36 18 54 16.3653012474564 9.81734937627179 6.54795187118464 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0768966921713766 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11133991_11134065:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11133991_11134065:EXOSC10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 11158105 C/T 1 17 19 36 7.72805892240998 10.3627576749536 -2.63469875254358 T:C C T 10 0.545408298681766 0.405871052078179 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11158077_11158213:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11158077_11158213:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000460196:exon_11158077_11158213:EXOSC10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 15 14 29 6.81887551977351 7.63571618154472 -0.816840661771214 T:C C T 10 0.545408298681766 0.852678436276024 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 12164437 C/T 1 13 7 20 5.90969211713704 3.81785809077236 2.09183402636468 T:C C T 10 0.545408298681766 0.37882271700965 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12164436_12164588:TNFRSF8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 15844615 A/G 1 6 12 18 2.7275502079094 6.54489958418119 -3.81734937627179 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0959765577209017 ENSG00000132906:ENST00000333868:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000348549:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375890:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375874:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000400777:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000447522:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000474305:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000440484:exon_15844605_15844890:CASP9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 15909850 C/G 1 12 11 23 5.45510041581881 5.99949128549943 -0.544390869680617 C:G C G 10 0.545408298681766 0.837052105141715 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 15911349 G/A 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15911191_15911605:AGMAT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 17312743 C/T 1 17 17 34 7.72805892240998 9.27194107759002 -1.54388215518004 T:C C T 10 0.545408298681766 0.609659374880455 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312454_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17312476_17312853:ATP13A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 17313343 G/A 1 14 11 25 6.36428381845528 5.99949128549943 0.364792532955851 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312958_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313300_17313451:ATP13A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 17313654 C/T 1 9 2 11 4.09132531186411 1.09081659736353 3.00050871450057 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0774548990144863 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313541_17313764:ATP13A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 17314702 C/T 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 T:C C T 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314633_17314729:ATP13A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 17314942 G/A 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314817_17314969:ATP13A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 17319011 G/A 1 10 6 16 4.54591701318234 3.2724497920906 1.27346722109174 A:G G A 10 0.545408298681766 0.62020159802431 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000503552:exon_17318981_17319076:ATP13A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 19411129 A/G 1 26 27 53 11.8193842342741 14.7260240644077 -2.9066398301336 A:G A G 10 0.545408298681766 0.490813445476131 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19410998_19411192:UBR4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 19413261 T/A 1 22 34 56 10.0010174290011 18.54388215518 -8.54286472617889 A:T T A 10 0.545408298681766 0.0228553364979956 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19413173_19413315:UBR4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 19415304 C/T 1 41 52 93 18.6382597540476 28.3612315314518 -9.72297177740424 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0477000498892693 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 19433449 A/G 1 33 23 56 15.0015261435017 12.5443908696806 2.45713527382111 A:G A G 10 0.545408298681766 0.591929380935694 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000494503:exon_19433331_19433460:UBR4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 23418153 C/T 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 T:C C T 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 23419261 G/A 1 2 7 9 0.909183402636468 3.81785809077236 -2.90867468813589 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0890512388728988 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 23419374 G/T 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 T:G G T 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 23419383 C/T 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 T:C C T 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 23419855 T/C 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 25889632 T/C 1 4 11 15 1.81836680527294 5.99949128549943 -4.18112448022649 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0374068965367827 ENSG00000157978:ENST00000374338:exon_25889561_25889644:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000488127:exon_25889561_25889644:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000484476:exon_25889307_25889644:LDLRAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 25890189 A/G 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 A:G A G 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000157978:ENST00000374338:exon_25890152_25890282:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000488127:exon_25890152_25891698:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000484476:exon_25890152_25890282:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000474283:exon_25890125_25890282:LDLRAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 26610891 A/C 1 11 16 27 5.00050871450057 8.72653277890826 -3.72602406440768 A:C A C 10 0.545408298681766 0.177124759497704 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26610853_26612032:UBXN11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 26644537 C/A 1 1123 1219 2342 510.506480580377 664.852716093073 -154.346235512696 A:T:C C A 10 0.545408298681766 1.78407880252275e-10 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26644448_26644562:CD52;ENSG00000169442:ENST00000492808:exon_26644449_26644562:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26644449_26644562:CD52 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 1157 813 1970 525.962598425197 443.416946828276 82.5456515969211 A:T:C:G A G 10 0.545408298681766 0.000187960973437090 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 1145 820 1965 520.507498009378 447.234804919048 73.2726930903299 A:T:G A G 10 0.545408298681766 0.00093749185171006 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 11 9 20 5.00050871450057 4.90867468813589 0.0918340263646806 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 26883511 A/C 1 19 17 36 8.63724232504645 9.27194107759002 -0.634698752543576 A:C A C 10 0.545408298681766 0.868122767399527 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000488985:exon_26883489_26883527:RPS6KA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 58 46 104 26.3663186764576 25.0887817393612 1.27753693709634 T:C T C 10 0.545408298681766 0.844210932064932 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 26900735 C/G 1 69 65 134 31.3668273909581 35.4515394143148 -4.08471202335664 C:G C G 10 0.545408298681766 0.488766184057348 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 47 18 65 21.365809961957 9.81734937627179 11.5484605856852 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00397852552858790 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 50 23 73 22.7295850659117 12.5443908696806 10.1851941962311 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0183696829368367 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 51 31 82 23.1841767672299 16.9076572591347 6.27651950809519 A:G A G 10 0.545408298681766 0.183571278263745 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 28800380 C/A 1 11 6 17 5.00050871450057 3.2724497920906 1.72805892240998 A:C C A 10 0.545408298681766 0.471102205741298 ENSG00000204138:ENST00000373839:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000493669:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373836:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373835:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373837:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373838:exon_28800066_28800663:PHACTR4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 28861636 G/A 1 20 22 42 9.09183402636468 11.9989825709989 -2.90714854463417 A:G G A 10 0.545408298681766 0.438935386349495 ENSG00000180198:ENST00000398962:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000398958:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373834:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000427469:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000434290:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373833:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000419074:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373832:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000439292:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373831:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000411533:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000430407:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000429051:exon_28861562_28861658:RCC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 84 72 156 38.1857029107317 39.2693975050871 -1.08369459435549 T:G T G 10 0.545408298681766 0.872545290821712 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 29529699 T/C 1 9 8 17 4.09132531186411 4.36326638945413 -0.271941077590022 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475773:exon_29529643_29529713:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463412:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000453185:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29529654_29529745:MECR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 19 17 36 8.63724232504645 9.27194107759002 -0.634698752543576 A:G A G 10 0.545408298681766 0.868122767399527 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 310 270 580 140.923427408653 147.260240644077 -6.33681323542427 T:C T C 10 0.545408298681766 0.616889745044279 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 72 75 147 32.7306024949129 40.9056224011324 -8.1750199062196 A:C:G G A 10 0.545408298681766 0.185493876966268 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 31769560 C/G 1 15 21 36 6.81887551977351 11.4535742723171 -4.63469875254358 C:G C G 10 0.545408298681766 0.133568745000621 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31769458_31769617:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000446633:exon_31769458_31769620:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000463988:exon_31769458_31769629:SNRNP40 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 31897643 G/A 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 A:G G A 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31897530_31897720:SERINC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 31898234 T/C 1 16 4 20 7.27346722109174 2.18163319472706 5.09183402636468 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0243023276820164 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31898177_31898256:SERINC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 95 88 183 43.1862116252322 47.9959302839954 -4.80971865876317 A:G A G 10 0.545408298681766 0.50430507049429 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 32658878 A/G 1 17 19 36 7.72805892240998 10.3627576749536 -2.63469875254358 A:G A G 10 0.545408298681766 0.405871052078179 ENSG00000084652:ENST00000373610:exon_32658809_32658901:TXLNA;ENSG00000084652:ENST00000373609:exon_32658809_32658901:TXLNA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 32672932 G/A 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 A:G G A 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000160051:ENST00000291358:exon_32672841_32674288:IQCC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 33960062 A/G 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000121903:ENST00000373411:exon_33959818_33961991:ZSCAN20;ENSG00000121903:ENST00000326544:exon_33959818_33961253:ZSCAN20;ENSG00000121903:ENST00000361328:exon_33959818_33961995:ZSCAN20;ENSG00000121903:ENST00000401072:exon_33959818_33961991:ZSCAN20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 35919979 A/G 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 A:C:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000485551:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000335883:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000440579:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000467109:exon_35919963_35920237:KIAA0319L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 36638146 G/A 1 22 32 54 10.0010174290011 17.4530655578165 -7.45204812881536 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0547345563392524 ENSG00000116871:ENST00000429533:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000462118:exon_36637569_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36638070_36638228:MAP7D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 36638206 G/A 1 37 34 71 16.8198929487747 18.54388215518 -1.72398920640538 A:G G A 10 0.545408298681766 0.721383882955254 ENSG00000116871:ENST00000429533:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000462118:exon_36637569_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36638070_36638228:MAP7D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 36809037 T/C 1 25 18 43 11.3647925329558 9.81734937627179 1.54744315668406 T:C T C 10 0.545408298681766 0.65017499705898 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36808965_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36805225_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36808965_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36808965_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000425273:exon_36808800_36809049:STK40 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 37 32 69 16.8198929487747 17.4530655578165 -0.633172609041853 T:G G T 10 0.545408298681766 0.904179696170547 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 38338795 A/G 1 20 11 31 9.09183402636468 5.99949128549943 3.09234274086525 A:G A G 10 0.545408298681766 0.284898217962211 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 15 15 30 6.81887551977351 8.18112448022649 -1.36224896045298 T:C C T 10 0.545408298681766 0.714695541216207 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 40349131 G/A 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 A:G G A 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40348990_40349145:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40348990_40349176:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40348990_40349183:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000491865:exon_40348990_40349152:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40348990_40349153:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40348990_40349147:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40348990_40349168:TRIT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 40768276 C/T 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:C C T 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 40771432 C/T 1 17 8 25 7.72805892240998 4.36326638945413 3.36479253295585 T:C C T 10 0.545408298681766 0.228470955877391 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40771387_40771440:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40771387_40771440:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40771387_40771440:COL9A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 40773150 G/A 0 8 0 8 3.63673361054587 0 3.63673361054587 G G 10 0.545408298681766 0.00965399767040904 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 40879808 G/C 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 C:G G C 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000084070:ENST00000487871:exon_40879649_40879912:SMAP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 40881041 C/G 1 93 117 210 42.2770282225958 63.8127709457666 -21.5357427231709 C:G C G 10 0.545408298681766 0.00351061539254938 ENSG00000084070:ENST00000435168:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000372718:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000372708:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000487871:exon_40880944_40881041:SMAP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 40980559 G/A 1 16 7 23 7.27346722109174 3.81785809077236 3.45560913031938 A:G G A 10 0.545408298681766 0.208241264648541 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000415550:exon_40980187_40980699:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 12 9 21 5.45510041581881 4.90867468813589 0.546425727682915 T:G G T 10 0.545408298681766 0.831119559812142 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 41493811 C/T 1 9 11 20 4.09132531186411 5.99949128549943 -1.90816597363532 T:C C T 10 0.545408298681766 0.501718810318948 ENSG00000010803:ENST00000372597:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372596:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000337495:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372595:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000326197:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361191:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361705:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397174:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397171:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000456518:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000402904:exon_41492877_41493991:SCMH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 41976320 G/A 0 13 0 13 5.90969211713704 0 5.90969211713704 G G 10 0.545408298681766 0.000413311221647668 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 41976345 T/C 1 15 1 16 6.81887551977351 0.545408298681766 6.27346722109174 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00152068660329624 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 41976497 G/A 1 10 16 26 4.54591701318234 8.72653277890826 -4.18061576572592 A:G G A 10 0.545408298681766 0.116134696463967 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 42046899 C/T 1 9 2 11 4.09132531186411 1.09081659736353 3.00050871450057 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0774548990144863 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_42045408_42050989:HIVEP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 11 15 26 5.00050871450057 8.18112448022649 -3.18061576572592 T:C T C 10 0.545408298681766 0.239917577897468 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 43131653 G/A 1 23 19 42 10.4556091303194 10.3627576749536 0.0928514553658282 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000171960:ENST00000304979:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000372550:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000440068:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000455203:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000461351:exon_43131651_43131738:PPIH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 43308451 A/G 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 A:G A G 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000164010:ENST00000487556:exon_43308188_43310654:ERMAP;ENSG00000164010:ENST00000372517:exon_43308188_43310654:ERMAP;ENSG00000164010:ENST00000372514:exon_43308188_43310660:ERMAP;ENSG00000164010:ENST00000328249:exon_43308188_43310656:ERMAP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 43395635 C/T 1 16 19 35 7.27346722109174 10.3627576749536 -3.08929045386181 T:C C T 10 0.545408298681766 0.312446243194695 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43395544_43395646:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43395544_43395706:SLC2A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 43396414 G/A 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 A:G G A 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000475162:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43396297_43396611:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43395990_43396537:SLC2A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 43408966 G/A 1 24 14 38 10.9102008316376 7.63571618154472 3.27448465009289 A:G G A 10 0.545408298681766 0.330119381885145 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000415851:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43408897_43408992:SLC2A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 43828752 G/A 1 29 35 64 13.1831593382288 19.0892904538618 -5.90613111563302 A:G G A 10 0.545408298681766 0.166928752944264 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43828622_43828874:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43828622_43828858:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43828622_43828874:CDC20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 44684912 C/T 1 23 23 46 10.4556091303194 12.5443908696806 -2.08878173936123 T:C C T 10 0.545408298681766 0.556524391457977 ENSG00000178028:ENST00000361745:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000446292:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372283:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000315913:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372289:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000488433:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000483741:exon_44684728_44684913:DMAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 45205598 T/C 1 8 10 18 3.63673361054587 5.45408298681766 -1.81734937627179 T:C T C 10 0.545408298681766 0.479767431495367 ENSG00000142945:ENST00000452259:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000493027:exon_45205497_45205674:KIF2C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 45218895 A/T 1 21 11 32 9.54642572768291 5.99949128549943 3.54693444218349 A:T:C A T 10 0.545408298681766 0.219897929913113 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 45224998 A/C 1 42 23 65 19.0928514553658 12.5443908696806 6.54846058568521 A:C A C 10 0.545408298681766 0.106947536650752 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45224878_45225020:KIF2C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 45226084 G/A 1 31 31 62 14.0923427408653 16.9076572591347 -2.81531451826949 A:G G A 10 0.545408298681766 0.524316896949048 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45225952_45226156:KIF2C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 45269333 A/G 1 12 9 21 5.45510041581881 4.90867468813589 0.546425727682915 A:G A G 10 0.545408298681766 0.831119559812142 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45269272_45269696:PLK3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 45270024 G/C 1 13 14 27 5.90969211713704 7.63571618154472 -1.72602406440768 C:G G C 10 0.545408298681766 0.564456320968141 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45270011_45270451:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461769:exon_45270011_45270173:PLK3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 45444038 G/A 1 16 17 33 7.27346722109174 9.27194107759002 -1.99847385649828 A:G G A 10 0.545408298681766 0.490611458768862 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000480675:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000477953:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372182:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000487532:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000497010:exon_45443987_45444132:EIF2B3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 45469155 C/T 1 24 23 47 10.9102008316376 12.5443908696806 -1.634190038043 T:C C T 10 0.545408298681766 0.662218976126322 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 45469586 G/A 1 20 16 36 9.09183402636468 8.72653277890826 0.365301247456424 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486296:exon_45469527_45469608:HECTD3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 45476663 G/A 1 9 5 14 4.09132531186411 2.72704149340883 1.36428381845528 A:G G A 10 0.545408298681766 0.594806597584705 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45476561_45477001:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45476561_45477027:HECTD3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 45479709 A/G 1 41 30 71 18.6382597540476 16.362248960453 2.27601079359462 A:G A G 10 0.545408298681766 0.634568344750932 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 45479772 G/T 1 3 7 10 1.3637751039547 3.81785809077236 -2.45408298681766 T:G G T 10 0.545408298681766 0.201980178309513 ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD;ENSG00000126088:ENST00000472254:exon_45479722_45480248:UROD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 45806768 T/G 1 12 11 23 5.45510041581881 5.99949128549943 -0.544390869680617 T:G T G 10 0.545408298681766 0.837052105141715 ENSG00000132773:ENST00000372090:exon_45806745_45806887:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000477731:exon_45806745_45806887:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000471337:exon_45806745_45806887:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000495703:exon_45806745_45806887:TOE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 45973928 G/A 1 7 1 8 3.18214190922764 0.545408298681766 2.63673361054587 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0793702040361015 ENSG00000132763:ENST00000401061:exon_45973884_45974036:MMACHC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 13 10 23 5.90969211713704 5.45408298681766 0.455609130319382 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 95 79 174 43.1862116252322 43.0872555958595 0.0989560293727223 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 114 74 188 51.8234539502787 40.3602141024507 11.463239847828 T:C C T 10 0.545408298681766 0.106893109713944 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 68 54 122 30.9122356896399 29.4520481288154 1.46018756082455 A:G A G 10 0.545408298681766 0.855830826840528 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 80 64 144 36.3673361054587 34.906131115633 1.4612049898257 T:C T C 10 0.545408298681766 0.867173403110387 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 A:G A G 10 0.545408298681766 0.823095632852268 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 9 20 29 4.09132531186411 10.9081659736353 -6.81684066177121 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0142303080708571 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 46660295 T/C 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000085998:ENST00000371984:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371992:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000396420:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371986:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000477114:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000497439:exon_46660254_46660323:POMGNT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 20 35 55 9.09183402636468 19.0892904538618 -9.99745642749713 A:T:G A G 10 0.545408298681766 0.00944815781976788 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 47767914 G/A 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G G A 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000447475:exon_47767906_47768018:STIL;ENSG00000123473:ENST00000413565:exon_47767906_47768018:STIL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 52266242 G/A 1 67 53 120 30.4576439883217 28.9066398301336 1.55100415818808 A:G G A 10 0.545408298681766 0.78430813501305 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 52290984 T/G 1 26 45 71 11.8193842342741 24.5433734406795 -12.7239892064054 T:G T G 10 0.545408298681766 0.00273229678669522 ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000473805:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000475715:exon_52290969_52291054:NRD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 41 46 87 18.6382597540476 25.0887817393612 -6.45052198531364 A:G A G 10 0.545408298681766 0.196108829467297 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 62960101 A/G 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000116641:ENST00000371140:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000395441:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000251157:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000340370:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000454575:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000479983:exon_62959946_62960969:DOCK7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 63284830 G/A 1 8 14 22 3.63673361054587 7.63571618154472 -3.99898257099885 A:G G A 10 0.545408298681766 0.091726310756609 ENSG00000125703:ENST00000317868:exon_63284676_63285006:ATG4C;ENSG00000125703:ENST00000371120:exon_63284676_63285006:ATG4C;ENSG00000125703:ENST00000371118:exon_63284676_63284850:ATG4C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 64095111 A/G 1 26 19 45 11.8193842342741 10.3627576749536 1.45662655932053 A:G A G 10 0.545408298681766 0.765113155079019 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64095096_64095258:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64095096_64095258:PGM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 14 24 38 6.36428381845528 13.0897991683624 -6.72551534990711 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0336412219745849 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 65310489 T/C 1 14 11 25 6.36428381845528 5.99949128549943 0.364792532955851 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 65311214 G/C 1 14 14 28 6.36428381845528 7.63571618154472 -1.27143236308945 C:G G C 10 0.545408298681766 0.70569768807638 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 65321250 G/A 1 18 13 31 8.18265062372821 7.09030788286296 1.09234274086525 A:G G A 10 0.545408298681766 0.722444112386434 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65321192_65321381:JAK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 65335095 T/C 1 10 14 24 4.54591701318234 7.63571618154472 -3.08979916836238 T:C T C 10 0.545408298681766 0.223719116182242 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65334994_65335157:JAK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 67436618 A/C 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 A:C A C 10 0.545408298681766 0.609212519966719 ENSG00000198160:ENST00000357692:exon_67436491_67436642:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000401041:exon_67436491_67436642:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000371016:exon_67436491_67436642:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000371014:exon_67436491_67436642:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000371011:exon_67436491_67436642:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000355977:exon_67436491_67436642:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000439314:exon_67436491_67436642:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000371018:exon_67436491_67436642:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000371017:exon_67436491_67436642:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000401042:exon_67436491_67436642:MIER1;ENSG00000198160:ENST00000355356:exon_67436491_67436642:MIER1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 67833527 G/C 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 C:G G C 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67833508_67833708:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67833508_67833708:IL12RB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 67861520 C/A 1 4 13 17 1.81836680527294 7.09030788286296 -5.27194107759002 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0132274194655084 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67861230_67862583:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67861230_67862583:IL12RB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 29 22 51 13.1831593382288 11.9989825709989 1.18417676722994 T:G G T 10 0.545408298681766 0.779956307457004 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 75175797 G/A 1 90 67 157 40.9132531186411 36.5423560116783 4.37089710696274 A:G G A 10 0.545408298681766 0.521721279405129 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 75204447 G/A 1 23 25 48 10.4556091303194 13.6352074670442 -3.17959833672477 A:G G A 10 0.545408298681766 0.386322747729154 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75204374_75204472:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75204374_75204472:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75204374_75204472:TYW3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 42 33 75 19.0928514553658 17.9984738564983 1.09437759886755 A:G A G 10 0.545408298681766 0.817774338110568 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 75217990 A/T 1 19 19 38 8.63724232504645 10.3627576749536 -1.72551534990711 A:T A T 10 0.545408298681766 0.626617643778788 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75217976_75218109:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000421739:exon_75217976_75218109:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75217976_75218109:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75217976_75218109:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75217976_75218078:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75217976_75218109:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000486467:exon_75217976_75218109:TYW3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 76216186 C/T 1 121 116 237 55.0055958595063 63.2673626470849 -8.26176678757854 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.296818050083408 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76216136_76216231:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76216136_76216231:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76216136_76216231:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76216136_76216231:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000530953:exon_76216140_76216225:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000534334:exon_76216136_76216231:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76216136_76216231:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76216136_76216231:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76216136_76216231:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000532207:exon_76216136_76216231:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000528016:exon_76216136_76216231:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76216136_76216231:ACADM HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 76227022 A/G 1 205 193 398 93.191298770238 105.263801645581 -12.0725028753429 A:G A G 10 0.545408298681766 0.227382004869595 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76226807_76227300:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76226807_76227055:ACADM HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 76255228 G/A 1 15 15 30 6.81887551977351 8.18112448022649 -1.36224896045298 A:G G A 10 0.545408298681766 0.714695541216207 ENSG00000137955:ENST00000496055:exon_76253182_76256202:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000461653:exon_76254844_76256202:RABGGTB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 77634948 G/A 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 A:G G A 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000142892:ENST00000370812:exon_77634945_77635080:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000487906:exon_77634945_77635004:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000359130:exon_77634945_77635080:PIGK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 78163080 C/T 1 17 15 32 7.72805892240998 8.18112448022649 -0.453065557816512 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78161672_78163159:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78161676_78163159:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78161676_78163159:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78161676_78163159:USP33 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 78201745 G/T 1 3 7 10 1.3637751039547 3.81785809077236 -2.45408298681766 T:G G T 10 0.545408298681766 0.201980178309513 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000524536:exon_78201741_78201843:USP33 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 79093818 A/G 1 137 427 564 62.2790630805981 232.889343537114 -170.610280456516 A:G A G 10 0.545408298681766 2.72892488202681e-48 ENSG00000137959:ENST00000452835:exon_79093591_79093892:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 79094081 T/A 1 34 9 43 15.45611784482 4.90867468813589 10.5474431566841 A:T T A 10 0.545408298681766 0.00110795402490627 ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 79095581 T/C 1 207 286 493 94.1004821728744 155.986773422985 -61.8862912501106 T:C T C 10 0.545408298681766 2.92841094454378e-08 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 84944989 A/G 1 56 50 106 25.4571352738211 27.2704149340883 -1.8132796602672 A:G A G 10 0.545408298681766 0.770074750028064 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 84961108 G/A 1 37 33 70 16.8198929487747 17.9984738564983 -1.17858090772362 A:G G A 10 0.545408298681766 0.810912302165128 ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84961056_84961138:RPF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 85113203 T/C 1 3 10 13 1.3637751039547 5.45408298681766 -4.09030788286296 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0265238704491956 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 18 14 32 8.18265062372821 7.63571618154472 0.546934442183489 T:C C T 10 0.545408298681766 0.861580977164548 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 90398847 G/A 1 17 14 31 7.72805892240998 7.63571618154472 0.0923427408652548 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000171492:ENST00000337338:exon_90398626_90402170:LRRC8D;ENSG00000171492:ENST00000394593:exon_90398626_90401560:LRRC8D;ENSG00000171492:ENST00000532201:exon_90398626_90398992:LRRC8D;ENSG00000171492:ENST00000414841:exon_90398626_90398977:LRRC8D;ENSG00000171492:ENST00000527156:exon_90398626_90399187:LRRC8D;ENSG00000171492:ENST00000441269:exon_90398626_90399451:LRRC8D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 90486412 T/G 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 T:G T G 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000162664:ENST00000394590:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000394583:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000340281:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000370447:exon_90486351_90486481:ZNF326 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 91980428 A/G 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000097046:ENST00000430031:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000370415:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000234626:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000428239:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000486509:exon_91980376_91980554:CDC7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 92728424 T/C 1 10 14 24 4.54591701318234 7.63571618154472 -3.08979916836238 T:C T C 10 0.545408298681766 0.223719116182242 ENSG00000174842:ENST00000370360:exon_92728420_92728483:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000495106:exon_92728420_92728483:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000495852:exon_92728420_92728483:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000463560:exon_92728422_92728483:GLMN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 93306317 G/A 1 10 13 23 4.54591701318234 7.09030788286296 -2.54439086968062 A:G G A 10 0.545408298681766 0.302592597377063 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 61 64 125 27.7300937804123 34.906131115633 -7.17603733522075 A:G G A 10 0.545408298681766 0.209095185525412 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 93651922 T/C 1 5 9 14 2.27295850659117 4.90867468813589 -2.63571618154472 T:C T C 10 0.545408298681766 0.185085810189955 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93651902_93652060:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000528942:exon_93651902_93651957:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93651902_93652060:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93651902_93652060:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93651902_93652060:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000448243:exon_93651902_93651955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93651902_93652060:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000479653:exon_93651902_93652060:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93651902_93652060:CCDC18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 93672723 A/C 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 A:C A C 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 93720153 G/T 1 13 18 31 5.90969211713704 9.81734937627179 -3.90765725913475 T:G G T 10 0.545408298681766 0.206191318588596 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000447456:exon_93720074_93720171:CCDC18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 34 37 71 15.45611784482 20.1801070512253 -4.72398920640538 A:G A G 10 0.545408298681766 0.284218645891353 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 94930345 G/A 1 12 5 17 5.45510041581881 2.72704149340883 2.72805892240998 A:G G A 10 0.545408298681766 0.227116627671435 ENSG00000117528:ENST00000454898:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000394233:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000370214:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000315713:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000468860:exon_94930331_94930429:ABCD3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 95709939 T/G 1 18 9 27 8.18265062372821 4.90867468813589 3.27397593559232 T:G T G 10 0.545408298681766 0.247994952889908 ENSG00000122481:ENST00000370202:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000263893:exon_95709767_95710271:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000429514:exon_95709767_95710207:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000492639:exon_95709767_95709967:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000495272:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000419345:exon_95709767_95710271:RWDD3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 104118096 T/C 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 T:C T C 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000240038:ENST00000477657:exon_104118063_104118162:AMY2B;ENSG00000240038:ENST00000361355:exon_104118063_104118162:AMY2B;ENSG00000240038:ENST00000491397:exon_104118063_104118162:AMY2B;ENSG00000240038:ENST00000338852:exon_104118063_104118162:AMY2B;ENSG00000240038:ENST00000456136:exon_104118063_104118162:AMY2B;ENSG00000240038:ENST00000462971:exon_104118063_104118403:AMY2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 109486196 A/G 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 A:G A G 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369976:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000482889:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369972:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109486097_109486237:CLCC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 109824361 A/C 1 10 3 13 4.54591701318234 1.6362248960453 2.90969211713704 A:C A C 10 0.545408298681766 0.162038106908021 ENSG00000134222:ENST00000369909:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000369904:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000409267:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000369907:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000438534:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000492431:exon_109824241_109825041:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000409138:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000369903:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000429031:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000418914:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000474126:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000459765:exon_109824026_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000471740:exon_109824241_109824682:PSRC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 110170896 T/C 1 11 17 28 5.00050871450057 9.27194107759002 -4.27143236308945 T:C T C 10 0.545408298681766 0.128767570080049 ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000529299:exon_110170705_110171157:AMPD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 110172094 T/C 1 15 7 22 6.81887551977351 3.81785809077236 3.00101742900115 T:C T C 10 0.545408298681766 0.284228668887522 ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110171949_110172112:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110171949_110172112:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110171949_110172112:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110171949_110172112:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110171949_110172112:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110171949_110172112:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110171949_110172112:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110171949_110172112:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110171949_110172112:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000532851:exon_110171731_110172314:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000533132:exon_110171731_110172174:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000479919:exon_110171949_110172112:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000476688:exon_110171949_110172112:AMPD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 110279701 C/T 1 12 1 13 5.45510041581881 0.545408298681766 4.90969211713704 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00903562293581201 ENSG00000134202:ENST00000256594:exon_110276554_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000361066:exon_110279124_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000486823:exon_110279552_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000476321:exon_110279597_110280189:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000488824:exon_110279598_110279791:GSTM3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 110466338 C/A 1 42 15 57 19.0928514553658 8.18112448022649 10.9117269751393 A:C C A 10 0.545408298681766 0.00476361591717174 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 645 530 1175 293.211647350261 289.066398301336 4.14524904892494 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.814772929661502 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 111783981 G/A 1 140 418 558 63.6428381845528 227.980668848978 -164.337830664425 A:G G A 10 0.545408298681766 2.70464527611450e-45 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/T 1 416 140 556 189.110147748385 76.3571618154472 112.752985932938 T:C C T 10 0.545408298681766 6.72690828094341e-23 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 112298582 A/G 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 A:G A G 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000064703:ENST00000533164:exon_112298435_112298847:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112297927_112298847:DDX20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 112309123 C/A 1 29 22 51 13.1831593382288 11.9989825709989 1.18417676722994 A:C C A 10 0.545408298681766 0.779956307457004 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 112309331 T/C 1 24 29 53 10.9102008316376 15.8168406617712 -4.9066398301336 T:C T C 10 0.545408298681766 0.214147498014451 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 113236681 C/T 1 18 13 31 8.18265062372821 7.09030788286296 1.09234274086525 T:C C T 10 0.545408298681766 0.722444112386434 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113236527_113236794:MOV10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 13 16 29 5.90969211713704 8.72653277890826 -2.81684066177121 A:G A G 10 0.545408298681766 0.352105502963958 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 113239382 G/A 1 38 29 67 17.2744846500929 15.8168406617712 1.45764398832168 A:G G A 10 0.545408298681766 0.806445644950556 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113239361_113239468:MOV10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 37 27 64 16.8198929487747 14.7260240644077 2.09386888436698 T:C T C 10 0.545408298681766 0.618160765243602 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 76 49 125 34.5489693001858 26.7250066354065 7.82396266477925 T:C C T 10 0.545408298681766 0.177930931875297 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 114301335 C/T 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 T:C C T 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114301281_114301470:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000446739:exon_114301281_114301780:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000493212:exon_114301281_114302111:PHTF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 19 29 48 8.63724232504645 15.8168406617712 -7.17959833672477 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0422941000940427 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 114448389 C/T 1 8 7 15 3.63673361054587 3.81785809077236 -0.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114447763_114448397:DCLRE1B;ENSG00000118655:ENST00000466480:exon_114448031_114448397:DCLRE1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 114973429 T/C 1 9 1 10 4.09132531186411 0.545408298681766 3.54591701318234 T:C T C 10 0.545408298681766 0.026642084489569 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114973420_114973534:TRIM33 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 116931628 C/A 1 188 175 363 85.463239847828 95.446452269309 -9.98321242148106 A:C C A 10 0.545408298681766 0.292466622538355 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000445896:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000491156:exon_116931524_116931641:ATP1A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 116947051 G/A 1 352 297 649 160.016278864018 161.986264708484 -1.96998584446612 A:G G A 10 0.545408298681766 0.87482629361751 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116947038_116947394:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116947038_116947396:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116947038_116947396:ATP1A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 117617705 A/G 1 31 24 55 14.0923427408653 13.0897991683624 1.00254357250287 A:G A G 10 0.545408298681766 0.892461297916145 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 117618067 C/T 1 28 37 65 12.7285676369106 20.1801070512253 -7.45153941431479 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0804158208279573 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 119575687 C/T 1 21 19 40 9.54642572768291 10.3627576749536 -0.816331947270641 T:C C T 10 0.545408298681766 0.874222536565282 ENSG00000116874:ENST00000369426:exon_119573839_119576011:WARS2;ENSG00000116874:ENST00000235521:exon_119573844_119575982:WARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 21 31 52 9.54642572768291 16.9076572591347 -7.36123153145183 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0503662608245788 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 144931087 T/C 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 T:C T C 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 0 0 60 60 0 32.724497920906 -32.724497920906 A G A 10 0.545408298681766 2.86609247324604e-21 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 78 78 0 42.5418472971777 -42.5418472971777 C T C 10 0.545408298681766 1.97005004296863e-27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 58 58 0 31.6336813235424 -31.6336813235424 T G T 10 0.545408298681766 1.38690652690989e-20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 43 43 0 23.4525568433159 -23.4525568433159 A C A 10 0.545408298681766 1.89550372548204e-15 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 1 97 1 98 44.0953950278687 0.545408298681766 43.5499867291869 A:G G A 10 0.545408298681766 2.23458631647326e-24 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 75 75 0 40.9056224011324 -40.9056224011324 C T C 10 0.545408298681766 2.09706913494002e-26 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 96 96 0 52.3591966734495 -52.3591966734495 T C T 10 0.545408298681766 1.35414234119429e-33 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 145492281 C/T 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000152022:ENST00000369308:exon_145492235_145492375:LIX1L;ENSG00000152022:ENST00000449167:exon_145492235_145492375:LIX1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 146740502 C/G 1 12 14 26 5.45510041581881 7.63571618154472 -2.18061576572592 C:G C G 10 0.545408298681766 0.434248996287525 ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146740441_146740537:CHD1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 149915754 G/A 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 A:G G A 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000163113:ENST00000369135:exon_149912231_149916964:OTUD7B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 103 64 167 46.8229452357781 34.906131115633 11.9168141201451 T:G G T 10 0.545408298681766 0.0736068587514353 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 150316708 C/T 1 15 9 24 6.81887551977351 4.90867468813589 1.91020083163762 T:C C T 10 0.545408298681766 0.540096346477239 ENSG00000117360:ENST00000324862:exon_150316638_150316737:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000414970:exon_150316638_150316737:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000467329:exon_150316638_150316737:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000493553:exon_150316638_150316851:PRPF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 150444026 G/A 1 15 10 25 6.81887551977351 5.45408298681766 1.36479253295585 A:G G A 10 0.545408298681766 0.689530950640826 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 151006539 C/A 1 3 8 11 1.3637751039547 4.36326638945413 -2.99949128549943 A:C C A 10 0.545408298681766 0.126277531853182 ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_151006282_151007683:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_151006282_151006589:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_151006282_151008187:PRUNE HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 151026815 C/T 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 T:C C T 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 151259043 C/T 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 T:C C T 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000143373:ENST00000443959:exon_151258751_151259181:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000528005:exon_151258751_151259181:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 151259543 G/A 1 13 12 25 5.90969211713704 6.54489958418119 -0.635207467044149 A:G G A 10 0.545408298681766 0.842593548431809 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 151374025 T/C 1 268 257 525 121.830575953287 140.169932761214 -18.3393568079271 A:T:C T C 10 0.545408298681766 0.114581364859479 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151374018_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151374018_151374410:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151373715_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000466425:exon_151374018_151374106:PSMB4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 42 24 66 19.0928514553658 13.0897991683624 6.00305228700345 A:C A C 10 0.545408298681766 0.173472148543954 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 151735545 A/G 1 49 38 87 22.2749933645935 20.7255153499071 1.54947801468636 A:G A G 10 0.545408298681766 0.748297193865028 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 151825991 G/T 1 9 3 12 4.09132531186411 1.6362248960453 2.45510041581881 T:G G T 10 0.545408298681766 0.245731957393402 ENSG00000196407:ENST00000368817:exon_151825919_151826173:THEM5;ENSG00000196407:ENST00000368818:exon_151825919_151826173:THEM5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 153636860 A/G 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G A G 10 0.545408298681766 0.735472382770589 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 10 9 19 4.54591701318234 4.90867468813589 -0.362757674953554 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 155220390 G/A 1 14 17 31 6.36428381845528 9.27194107759002 -2.90765725913475 A:G G A 10 0.545408298681766 0.367542886339084 ENSG00000160767:ENST00000350210:exon_155220067_155220612:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368370:exon_155220067_155220612:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000423573:exon_155220067_155220720:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368366:exon_155220067_155220720:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368368:exon_155220067_155220612:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000361361:exon_155220067_155220612:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000323361:exon_155220267_155220612:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000497941:exon_155220379_155220612:FAM189B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 155297999 G/A 1 3 8 11 1.3637751039547 4.36326638945413 -2.99949128549943 A:G G A 10 0.545408298681766 0.126277531853182 ENSG00000160753:ENST00000368354:exon_155297941_155298066:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000368352:exon_155297941_155298066:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000392405:exon_155297941_155298066:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000292253:exon_155297941_155298066:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000484664:exon_155297941_155298066:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000368347:exon_155297941_155298066:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000462780:exon_155297941_155298066:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000368349:exon_155297941_155298066:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000490373:exon_155297941_155298066:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000479924:exon_155297941_155298066:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000471876:exon_155297941_155298066:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000292254:exon_155297941_155298066:RUSC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 155735901 C/T 1 9 11 20 4.09132531186411 5.99949128549943 -1.90816597363532 T:C C T 10 0.545408298681766 0.501718810318948 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000497369:exon_155735240_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000476028:exon_155735249_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471442:exon_155735249_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000477831:exon_155735250_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000495937:exon_155735250_155736500:GON4L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 156213921 C/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C C T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000160781:ENST00000292291:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000492619:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000360733:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000335852:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000356983:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368271:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000340183:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000491107:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368270:exon_156213214_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000468632:exon_156213214_156214194:PAQR6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 156233189 C/T 1 12 16 28 5.45510041581881 8.72653277890826 -3.27143236308945 T:C C T 10 0.545408298681766 0.255841661593369 ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156233186_156233361:SMG5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 156263940 T/C 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 T:C T C 10 0.545408298681766 0.609212519966719 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 156264000 G/A 1 15 13 28 6.81887551977351 7.09030788286296 -0.271432363089448 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 156264648 C/T 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000198715:ENST00000472870:exon_156264550_156264807:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156264550_156264807:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156264156_156264783:C1orf85 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 156446903 T/C 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 T:C T C 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000353795:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000340875:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000454816:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000493077:exon_156446721_156446994:MEF2D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 15 6 21 6.81887551977351 3.2724497920906 3.54642572768291 A:G G A 10 0.545408298681766 0.130926508572863 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 10 16 26 4.54591701318234 8.72653277890826 -4.18061576572592 A:G G A 10 0.545408298681766 0.116134696463967 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 156566196 C/A 1 41 38 79 18.6382597540476 20.7255153499071 -2.08725559585951 A:C C A 10 0.545408298681766 0.652734887262545 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000415314:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000494414:exon_156565873_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000497287:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000463513:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000498641:exon_156566179_156566297:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000529520:exon_156565873_156566294:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000473910:exon_156565873_156567913:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000531129:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000474904:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000498756:exon_156566086_156566270:GPATCH4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 21 28 49 9.54642572768291 15.2714323630894 -5.72500663540653 A:G A G 10 0.545408298681766 0.114700126160969 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 20 18 38 9.09183402636468 9.81734937627179 -0.725515349907107 A:G G A 10 0.545408298681766 0.87122541036102 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 1233 1021 2254 560.511567725383 556.861872954083 3.64969477129944 A:T:C:G G A 10 0.545408298681766 0.882320754763942 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 161088583 T/G 1 11 15 26 5.00050871450057 8.18112448022649 -3.18061576572592 T:G T G 10 0.545408298681766 0.239917577897468 ENSG00000158793:ENST00000368009:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000392190:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000453609:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000486962:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000492411:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000478277:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000496861:exon_161088010_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000491497:exon_161088171_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000485594:exon_161088576_161088671:NIT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 161094190 A/G 1 14 14 28 6.36428381845528 7.63571618154472 -1.27143236308945 A:G A G 10 0.545408298681766 0.70569768807638 ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161093931_161095235:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000479728:exon_161093931_161094601:NIT1;ENSG00000158796:ENST00000368006:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000392188:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000458050:exon_161094130_161094252:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000368005:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000464113:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000473679:exon_161094130_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000490843:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000463227:exon_161093928_161094316:DEDD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 161143801 G/A 1 31 30 61 14.0923427408653 16.362248960453 -2.26990621958773 A:G G A 10 0.545408298681766 0.60783422549599 ENSG00000158850:ENST00000319769:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000470882:exon_161143395_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000407555:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000310413:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367998:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367997:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000466504:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000465740:exon_161143649_161143839:B4GALT3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 161145005 C/T 1 21 24 45 9.54642572768291 13.0897991683624 -3.54337344067947 T:C C T 10 0.545408298681766 0.298548392309109 ENSG00000158850:ENST00000319769:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000470882:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000407555:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000310413:exon_161144924_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367998:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367997:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000466504:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000465740:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000493164:exon_161144697_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000496313:exon_161144785_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000487004:exon_161144842_161145018:B4GALT3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 161172233 C/A 1 54 51 105 24.5479518711846 27.8158232327701 -3.26787136158543 A:C C A 10 0.545408298681766 0.557027919397705 ENSG00000158864:ENST00000479948:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000496133:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161171937_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000496553:exon_161171836_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000467295:exon_161172139_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000475570:exon_161172162_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000478866:exon_161172166_161172270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161172169_161172270:NDUFS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 163309219 A/T 1 2 9 11 0.909183402636468 4.90867468813589 -3.99949128549943 A:T A T 10 0.545408298681766 0.0289147202703354 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000442820:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163309071_163309267:NUF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 166818566 A/G 1 16 11 27 7.27346722109174 5.99949128549943 1.27397593559232 A:G A G 10 0.545408298681766 0.701415732858495 ENSG00000143157:ENST00000367876:exon_166818175_166819660:POGK;ENSG00000143157:ENST00000367875:exon_166818175_166823710:POGK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 47 46 93 21.365809961957 25.0887817393612 -3.72297177740424 A:G G A 10 0.545408298681766 0.466806400534766 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 167973976 C/T 1 46 36 82 20.9112182606388 19.6346987525436 1.27651950809519 T:C C T 10 0.545408298681766 0.824952686431013 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000470721:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_167973771_167974031:DCAF6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 65 55 120 29.5484605856852 29.9974564274971 -0.448995841811922 A:T:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 169821135 C/T 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 T:C C T 10 0.545408298681766 0.152877514803084 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 169951997 C/T 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 171486912 G/A 1 41 29 70 18.6382597540476 15.8168406617712 2.82141909227638 A:G G A 10 0.545408298681766 0.54928937231531 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171486730_171486953:BAT2L2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 28 23 51 12.7285676369106 12.5443908696806 0.184176767229935 A:T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 26 20 46 11.8193842342741 10.9081659736353 0.911218260638764 A:G A G 10 0.545408298681766 0.882598076098547 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 14 21 35 6.36428381845528 11.4535742723171 -5.08929045386181 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0912742261267931 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 171763549 C/T 1 20 17 37 9.09183402636468 9.27194107759002 -0.180107051225342 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000466643:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000476386:exon_171763534_171763667:METTL13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 26 40 66 11.8193842342741 21.8163319472706 -9.99694771299656 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0181626525870977 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 21 33 54 9.54642572768291 17.9984738564983 -8.45204812881537 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0278628182035967 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 180124061 G/C 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180123968_180124307:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180123969_180124307:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180124032_180124307:QSOX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 180159654 C/T 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180159568_180159715:QSOX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 180159657 C/T 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180159568_180159715:QSOX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 180953853 A/G 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180953813_180953907:STX6;ENSG00000135823:ENST00000469135:exon_180953813_180953907:STX6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 181018236 A/G 1 10 7 17 4.54591701318234 3.81785809077236 0.728058922409978 A:G A G 10 0.545408298681766 0.810655514815455 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 22 27 49 10.0010174290011 14.7260240644077 -4.72500663540653 A:G G A 10 0.545408298681766 0.197352926950644 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 183515428 G/A 1 13 16 29 5.90969211713704 8.72653277890826 -2.81684066177121 A:G G A 10 0.545408298681766 0.352105502963958 ENSG00000116698:ENST00000367537:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000458370:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000367539:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000392015:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000413782:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000508461:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000347615:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000507469:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000515829:exon_183515101_183515472:SMG7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 183542387 T/C 1 16 8 24 7.27346722109174 4.36326638945413 2.91020083163762 T:C T C 10 0.545408298681766 0.305959560181242 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183542320_183542427:NCF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 184663537 A/C 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 A:C A C 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184663178_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184659637_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184663197_184663606:EDEM3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 184663581 T/C 1 10 4 14 4.54591701318234 2.18163319472706 2.36428381845528 T:C T C 10 0.545408298681766 0.284657873718901 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184663178_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184659637_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184663197_184663606:EDEM3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 184677464 G/A 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G G A 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184677287_184677478:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184677287_184677478:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184677287_184677478:EDEM3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 186310238 C/T 1 56 47 103 25.4571352738211 25.634190038043 -0.177054764221896 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186310160_186310291:TPR;ENSG00000047410:ENST00000481347:exon_186310160_186310291:TPR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 186363119 C/G 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000157181:ENST00000287859:exon_186363079_186363147:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000419367:exon_186363079_186363147:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000432021:exon_186363079_186363147:C1orf27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 192780268 T/C 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 T:C T C 10 0.545408298681766 0.823095632852268 ENSG00000116741:ENST00000235382:exon_192780111_192780277:RGS2;ENSG00000116741:ENST00000464302:exon_192780111_192780369:RGS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 192780657 C/T 1 13 7 20 5.90969211713704 3.81785809077236 2.09183402636468 T:C C T 10 0.545408298681766 0.37882271700965 ENSG00000116741:ENST00000235382:exon_192780532_192781403:RGS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 200534248 C/T 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200534197_200534381:KIF14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 200558363 T/C 1 3 8 11 1.3637751039547 4.36326638945413 -2.99949128549943 T:C T C 10 0.545408298681766 0.126277531853182 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200558345_200558497:KIF14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 200956288 A/G 1 13 2 15 5.90969211713704 1.09081659736353 4.81887551977351 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0167123385626709 ENSG00000116852:ENST00000477146:exon_200956124_200956329:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000332129:exon_200956124_200956329:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000360529:exon_200956124_200956329:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000461742:exon_200956124_200956329:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000422435:exon_200956124_200956329:KIF21B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 200959302 G/A 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000116852:ENST00000477146:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000332129:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000360529:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000461742:exon_200959266_200959460:KIF21B;ENSG00000116852:ENST00000422435:exon_200959266_200959460:KIF21B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 16 17 33 7.27346722109174 9.27194107759002 -1.99847385649828 A:T A T 10 0.545408298681766 0.490611458768862 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 29 30 59 13.1831593382288 16.362248960453 -3.17908962222419 A:G G A 10 0.545408298681766 0.434324328565220 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 30 38 68 13.637751039547 20.7255153499071 -7.08776431036009 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0890684322804304 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 203743490 A/G 1 7 17 24 3.18214190922764 9.27194107759002 -6.08979916836238 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0138736076082817 ENSG00000122188:ENST00000442561:exon_203743003_203745245:LAX1;ENSG00000122188:ENST00000367217:exon_203743003_203743850:LAX1;ENSG00000122188:ENST00000367215:exon_203743003_203745361:LAX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 203818973 C/A 1 45 69 114 20.4566265593205 37.6331726090418 -17.1765460497213 A:C C A 10 0.545408298681766 0.001331866828806 ENSG00000058673:ENST00000367214:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367212:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000332127:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000495527:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367210:exon_203818839_203819154:ZC3H11A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 206665052 C/T 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 T:C C T 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000162888:ENST00000367119:exon_206664449_206666409:C1orf147 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 206757857 C/A 1 31 27 58 14.0923427408653 14.7260240644077 -0.633681323542428 A:C C A 10 0.545408298681766 0.895615591805283 ENSG00000136653:ENST00000355294:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367117:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000338603:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367118:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000435226:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000304534:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000491368:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000481486:exon_206757807_206758627:RASSF5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 206944233 A/G 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G A G 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 207087435 C/T 1 163 144 307 74.0984473148721 78.5387950101743 -4.44034769530215 T:C C T 10 0.545408298681766 0.646677151651135 ENSG00000162894:ENST00000420007:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000367091:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000463473:exon_207087207_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000525793:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000529560:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000533312:exon_207086977_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000530505:exon_207087146_207087439:FAIM3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 18 16 34 8.18265062372821 8.72653277890826 -0.543882155180043 A:G A G 10 0.545408298681766 0.864915346461896 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 18 12 30 8.18265062372821 6.54489958418119 1.63775103954702 A:G A G 10 0.545408298681766 0.587107629990466 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 19 7 26 8.63724232504645 3.81785809077236 4.81938423427408 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0749820404617132 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 T:C T C 10 0.545408298681766 0.40572272702491 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 43 31 74 19.5474431566841 16.9076572591347 2.63978589754932 C:G C G 10 0.545408298681766 0.561444415371146 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 210004199 C/G 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 C:G C G 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210004148_210004388:C1orf107 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 210006603 C/T 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210006530_210006703:C1orf107 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 27 35 62 12.2739759355923 19.0892904538618 -6.81531451826949 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0968940738558893 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 211844616 T/C 1 8 17 25 3.63673361054587 9.27194107759002 -5.63520746704415 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0270581853548481 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211844544_211844626:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211844511_211844626:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211844544_211844626:NEK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 211848807 A/C 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 A:C A C 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211848726_211848960:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211848726_211848899:NEK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 212558675 C/T 1 3 8 11 1.3637751039547 4.36326638945413 -2.99949128549943 T:C C T 10 0.545408298681766 0.126277531853182 ENSG00000065600:ENST00000261455:exon_212558616_212558767:TMEM206;ENSG00000065600:ENST00000467822:exon_212558616_212558767:TMEM206;ENSG00000065600:ENST00000471937:exon_212558616_212558767:TMEM206 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 93 79 172 42.2770282225958 43.0872555958595 -0.81022737326375 A:T:C T C 10 0.545408298681766 0.939012466133665 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 212788567 C/T 1 11 26 37 5.00050871450057 14.1806157657259 -9.18010705122534 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00270879509830805 ENSG00000162772:ENST00000366981:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366987:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000426071:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000391902:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000341491:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000465155:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366985:exon_212788494_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000464547:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366983:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000336937:exon_212788490_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366984:exon_212788490_212788603:ATF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 36 42 78 16.3653012474564 22.9071485446342 -6.54184729717775 T:C T C 10 0.545408298681766 0.140907688595242 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 213031948 G/C 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213031597_213032532:FLVCR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 15 12 27 6.81887551977351 6.54489958418119 0.273975935592318 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 213147400 G/A 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000143494:ENST00000366966:exon_213147297_213147412:VASH2;ENSG00000143494:ENST00000366968:exon_213147297_213147412:VASH2;ENSG00000143494:ENST00000366965:exon_213147297_213147412:VASH2;ENSG00000143494:ENST00000271776:exon_213146766_213147412:VASH2;ENSG00000143494:ENST00000366967:exon_213147297_213147412:VASH2;ENSG00000143494:ENST00000517399:exon_213147297_213147412:VASH2;ENSG00000143494:ENST00000343712:exon_213147297_213147412:VASH2;ENSG00000143494:ENST00000437953:exon_213147297_213147412:VASH2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 213414543 A/G 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 A:G A G 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000136643:ENST00000366960:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000366959:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000490299:exon_213414045_213415640:RPS6KC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214787130 G/A 1 5 9 14 2.27295850659117 4.90867468813589 -2.63571618154472 A:G G A 10 0.545408298681766 0.185085810189955 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000464322:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000495259:exon_214787057_214787236:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214813487 A/G 1 16 19 35 7.27346722109174 10.3627576749536 -3.08929045386181 A:G A G 10 0.545408298681766 0.312446243194695 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214813782 A/G 1 14 23 37 6.36428381845528 12.5443908696806 -6.18010705122534 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0474509922336889 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214813941 C/G 1 33 18 51 15.0015261435017 9.81734937627179 5.18417676722994 C:G C G 10 0.545408298681766 0.160833200351362 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214814125 G/A 1 20 19 39 9.09183402636468 10.3627576749536 -1.27092364858887 A:G G A 10 0.545408298681766 0.748656616025534 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214814571 C/T 1 25 14 39 11.3647925329558 7.63571618154472 3.72907635141113 T:C C T 10 0.545408298681766 0.262256685898951 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214814582 G/A 1 13 24 37 5.90969211713704 13.0897991683624 -7.18010705122534 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0204282393643407 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214814733 T/G 1 29 23 52 13.1831593382288 12.5443908696806 0.63876846854817 T:G T G 10 0.545408298681766 0.89011795175493 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214814778 G/A 1 28 18 46 12.7285676369106 9.81734937627179 2.91121826063877 A:G G A 10 0.545408298681766 0.45981348125917 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214814995 C/T 1 20 20 40 9.09183402636468 10.9081659736353 -1.81633194727064 T:C C T 10 0.545408298681766 0.634736264508819 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214815916 T/C 1 24 22 46 10.9102008316376 11.9989825709989 -1.08878173936123 T:C T C 10 0.545408298681766 0.768829741939571 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214816142 T/G 1 19 6 25 8.63724232504645 3.2724497920906 5.36479253295585 A:T:G T G 10 0.545408298681766 0.0426056892034127 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214816224 G/A 1 30 21 51 13.637751039547 11.4535742723171 2.18417676722993 A:G G A 10 0.545408298681766 0.576148167375372 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214816297 A/G 1 23 26 49 10.4556091303194 14.1806157657259 -3.72500663540653 A:G A G 10 0.545408298681766 0.316472655951376 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214818215 G/A 1 31 40 71 14.0923427408653 21.8163319472706 -7.72398920640539 A:G G A 10 0.545408298681766 0.073723909519126 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214818223 T/A 1 29 42 71 13.1831593382288 22.9071485446342 -9.72398920640538 A:T T A 10 0.545408298681766 0.0232470299432213 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214818846 A/G 1 42 33 75 19.0928514553658 17.9984738564983 1.09437759886755 A:G A G 10 0.545408298681766 0.817774338110568 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214818945 A/C 1 35 38 73 15.9107095461382 20.7255153499071 -4.81480580376892 A:C A C 10 0.545408298681766 0.290420563361407 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214819328 G/A 1 50 61 111 22.7295850659117 33.2699062195877 -10.540321153676 A:G G A 10 0.545408298681766 0.045728076383019 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214819587 A/G 1 62 47 109 28.1846854817305 25.634190038043 2.55049544368751 A:G A G 10 0.545408298681766 0.63229940578398 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214819980 C/T 1 52 61 113 23.6387684685482 33.2699062195877 -9.63113775103956 T:C C T 10 0.545408298681766 0.072916831891047 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214820099 A/G 1 66 68 134 30.0030522870034 37.0877643103601 -7.08471202335664 A:G A G 10 0.545408298681766 0.225506885876828 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214820299 A/G 1 58 44 102 26.3663186764576 23.9979651419977 2.36835353445987 A:G A G 10 0.545408298681766 0.691222703353589 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214820494 G/A 1 59 50 109 26.8209103777758 27.2704149340883 -0.449504556312494 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214820524 T/C 1 60 55 115 27.275502079094 29.9974564274971 -2.72195434840309 T:C T C 10 0.545408298681766 0.640159264312711 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 40 42 82 18.1836680527294 22.9071485446342 -4.72348049190481 A:G G A 10 0.545408298681766 0.318983596666717 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 51 67 118 23.1841767672299 36.5423560116783 -13.3581792444484 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0159369519064022 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 214837110 C/G 1 41 58 99 18.6382597540476 31.6336813235424 -12.9954215694948 C:G C G 10 0.545408298681766 0.011255726785284 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 215793834 G/A 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 A:G G A 10 0.545408298681766 0.609212519966719 ENSG00000136636:ENST00000259154:exon_215793399_215795073:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000444044:exon_215793399_215795147:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000495537:exon_215793399_215795073:KCTD3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 27 22 49 12.2739759355923 11.9989825709989 0.274993364593467 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 220197625 G/T 1 74 72 146 33.6397858975493 39.2693975050871 -5.62961160753783 T:G G T 10 0.545408298681766 0.361432029239065 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220197606_220197798:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220197606_220197798:EPRS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 220330672 C/T 1 21 10 31 9.54642572768291 5.45408298681766 4.09234274086525 T:C C T 10 0.545408298681766 0.15261533738701 ENSG00000118873:ENST00000358951:exon_220330612_220330830:RAB3GAP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 220331205 C/G 1 21 13 34 9.54642572768291 7.09030788286296 2.45611784481996 C:G C G 10 0.545408298681766 0.491664610186756 ENSG00000118873:ENST00000358951:exon_220331144_220331218:RAB3GAP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 220921945 G/C 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 C:G G C 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000117791:ENST00000469583:exon_220921567_220922145:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220921611_220922145:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220921676_220922145:MOSC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 30 32 62 13.637751039547 17.4530655578165 -3.81531451826949 T:C T C 10 0.545408298681766 0.372496282895695 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 26 29 55 11.8193842342741 15.8168406617712 -3.99745642749713 T:C T C 10 0.545408298681766 0.282532860463817 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 222802376 A/G 1 8 12 20 3.63673361054587 6.54489958418119 -2.90816597363532 A:G A G 10 0.545408298681766 0.261293206047355 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 222802926 C/T 1 10 8 18 4.54591701318234 4.36326638945413 0.182650623728212 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 222803204 A/G 1 11 12 23 5.00050871450057 6.54489958418119 -1.54439086968062 A:G A G 10 0.545408298681766 0.536899606886051 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 225611661 C/T 1 23 30 53 10.4556091303194 16.362248960453 -5.9066398301336 T:C C T 10 0.545408298681766 0.128497170054934 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000421383:exon_225611623_225611791:LBR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 12 6 18 5.45510041581881 3.2724497920906 2.18265062372821 T:G T G 10 0.545408298681766 0.350631698949064 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 227149203 G/A 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227149078_227149263:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227149078_227149263:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227149078_227149203:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227149078_227149203:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227149078_227149203:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000489044:exon_227149078_227149263:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227149087_227149263:ADCK3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 227172290 C/T 1 13 6 19 5.90969211713704 3.2724497920906 2.63724232504645 T:C C T 10 0.545408298681766 0.25633390279836 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227172249_227172356:ADCK3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 227174210 T/C 1 14 11 25 6.36428381845528 5.99949128549943 0.364792532955851 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 227920061 T/G 1 38 34 72 17.2744846500929 18.54388215518 -1.26939750508715 T:G T G 10 0.545408298681766 0.81327802608365 ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 227920103 G/A 1 39 34 73 17.7290763514111 18.54388215518 -0.814805803768916 A:G G A 10 0.545408298681766 0.906595615636945 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 227922918 A/C 1 24 24 48 10.9102008316376 13.0897991683624 -2.17959833672477 A:C A C 10 0.545408298681766 0.563800902624110 ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227922697_227923200:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922713_227923112:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922713_227923090:JMJD4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 21 16 37 9.54642572768291 8.72653277890826 0.819892948774658 A:C:G A G 10 0.545408298681766 0.869519945016435 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 227935831 C/T 1 11 10 21 5.00050871450057 5.45408298681766 -0.453574272317086 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 229683264 G/A 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000135776:ENST00000344517:exon_229683246_229683448:ABCB10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 229772643 C/T 1 10 16 26 4.54591701318234 8.72653277890826 -4.18061576572592 T:C C T 10 0.545408298681766 0.116134696463967 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 230384970 G/A 1 8 14 22 3.63673361054587 7.63571618154472 -3.99898257099885 A:G G A 10 0.545408298681766 0.091726310756609 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230384930_230385017:GALNT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 230814668 A/G 1 10 15 25 4.54591701318234 8.18112448022649 -3.63520746704415 A:G A G 10 0.545408298681766 0.162508278459262 ENSG00000135775:ENST00000494371:exon_230814659_230819174:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230814659_230814798:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230814659_230814798:COG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 15 20 35 6.81887551977351 10.9081659736353 -4.08929045386181 A:G A G 10 0.545408298681766 0.177456662008176 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 11 13 24 5.00050871450057 7.09030788286296 -2.08979916836238 A:T T A 10 0.545408298681766 0.418235923516124 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 231376806 G/C 1 12 14 26 5.45510041581881 7.63571618154472 -2.18061576572592 C:G G C 10 0.545408298681766 0.434248996287525 ENSG00000143633:ENST00000366649:exon_231376770_231376913:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000318906:exon_231376770_231376916:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000366651:exon_231376770_231376924:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000366648:exon_231376770_231376924:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000451322:exon_231376770_231376836:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000421623:exon_231376770_231376924:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000471936:exon_231376770_231376933:C1orf131 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 231377081 C/T 1 13 6 19 5.90969211713704 3.2724497920906 2.63724232504645 T:C C T 10 0.545408298681766 0.25633390279836 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231376919_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000436239:exon_231376953_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231376956_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231376962_231377202:GNPAT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 231401902 G/A 1 18 17 35 8.18265062372821 9.27194107759002 -1.08929045386181 A:G G A 10 0.545408298681766 0.736735697725999 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000492459:exon_231401880_231401911:GNPAT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 231488524 C/T 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000010072:ENST00000391858:exon_231487050_231488878:C1orf124;ENSG00000010072:ENST00000295050:exon_231488356_231490769:C1orf124 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 234509972 A/G 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 A:G A G 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000168275:ENST00000366612:exon_234509447_234510135:C1orf31 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 234529519 C/T 1 43 5 48 19.5474431566841 2.72704149340883 16.8204016632752 T:C C T 10 0.545408298681766 2.53729301366846e-07 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 234529540 G/A 1 46 5 51 20.9112182606388 2.72704149340883 18.1841767672299 A:G G A 10 0.545408298681766 5.14213713828108e-08 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 49 5 54 22.2749933645935 2.72704149340883 19.5479518711846 T:C C T 10 0.545408298681766 1.04217930518238e-08 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 49 17 66 22.2749933645935 9.27194107759002 13.0030522870034 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00119966382909174 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 234546245 C/T 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 T:C C T 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234546191_234546277:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000481183:exon_234546191_234546277:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000463793:exon_234546150_234546277:TARBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 234582651 T/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C T C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234582549_234582721:TARBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 234584231 C/T 1 11 4 15 5.00050871450057 2.18163319472706 2.81887551977351 T:C C T 10 0.545408298681766 0.195702635515563 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234584226_234584325:TARBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 234606998 A/G 1 8 7 15 3.63673361054587 3.81785809077236 -0.18112448022649 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234606934_234607003:TARBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 235318375 C/G 1 71 83 154 32.2760107935946 45.2688887905866 -12.992877996992 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0427263462220408 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235318196_235318427:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235318196_235318427:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235318196_235318427:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235318196_235318427:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000447801:exon_235318196_235318427:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235318196_235318427:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235318196_235318427:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000468751:exon_235318196_235318427:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235318245_235318427:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235318196_235318427:ARID4B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 22 5 27 10.0010174290011 2.72704149340883 7.27397593559232 A:T T A 10 0.545408298681766 0.00579427272213458 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 19 3 22 8.63724232504645 1.6362248960453 7.00101742900115 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00226288954251699 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 14 1 15 6.36428381845528 0.545408298681766 5.81887551977351 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00276275720990584 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 T:C C T 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 7 10 17 3.18214190922764 5.45408298681766 -2.27194107759002 A:G G A 10 0.545408298681766 0.332347257730029 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236706278 G/T 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 T:G G T 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236706215_236706290:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236706300 T/A 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 A:T T A 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 19 22 41 8.63724232504645 11.9989825709989 -3.36174024595241 T:C T C 10 0.545408298681766 0.347110233601756 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 21 21 42 9.54642572768291 11.4535742723171 -1.90714854463417 T:C C T 10 0.545408298681766 0.642610157471559 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 41 30 71 18.6382597540476 16.362248960453 2.27601079359462 T:C T C 10 0.545408298681766 0.634568344750932 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 54 50 104 24.5479518711846 27.2704149340883 -2.72246306290366 T:C T C 10 0.545408298681766 0.623067313974852 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 42 40 82 19.0928514553658 21.8163319472706 -2.72348049190481 A:G A G 10 0.545408298681766 0.580045478126583 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236721780 C/T 1 44 42 86 20.0020348580023 22.9071485446342 -2.90511368663187 T:C C T 10 0.545408298681766 0.588505225638176 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236723074 G/C 1 19 8 27 8.63724232504645 4.36326638945413 4.27397593559232 C:G G C 10 0.545408298681766 0.122032486533752 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236723108 C/T 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236737983 A/G 1 29 29 58 13.1831593382288 15.8168406617712 -2.63368132354243 A:G A G 10 0.545408298681766 0.511627221853868 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236737961_236738203:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000490339:exon_236737961_236738075:HEATR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236748433 G/A 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236749649 T/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C T C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236749730 C/T 1 8 18 26 3.63673361054587 9.81734937627179 -6.18061576572592 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0175300447010677 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 236755856 T/C 1 9 5 14 4.09132531186411 2.72704149340883 1.36428381845528 T:C T C 10 0.545408298681766 0.594806597584705 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236755823_236755933:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236755823_236755933:HEATR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 237054569 A/G 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237054433_237054629:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237054433_237054629:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237054433_237054629:MTR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 237058828 C/T 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 241695792 T/C 1 10 2 12 4.54591701318234 1.09081659736353 3.45510041581881 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0775833003018699 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241695434_241695798:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241695434_241695798:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484628:exon_241695638_241695798:KMO;ENSG00000117009:ENST00000480967:exon_241695669_241695798:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484229:exon_241695679_241695798:KMO;ENSG00000117009:ENST00000477907:exon_241695701_241695798:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241695705_241695798:KMO HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 241712134 C/T 1 10 2 12 4.54591701318234 1.09081659736353 3.45510041581881 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0775833003018699 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484628:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000480967:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484229:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241712129_241712198:KMO HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 241798631 C/T 1 8 7 15 3.63673361054587 3.81785809077236 -0.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000203668:ENST00000366553:exon_241792155_241799232:CHML HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 242035382 C/T 1 14 12 26 6.36428381845528 6.54489958418119 -0.180615765725915 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242035334_242035580:EXO1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 A:G A G 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 243419429 T/A 1 7 1 8 3.18214190922764 0.545408298681766 2.63673361054587 A:T T A 10 0.545408298681766 0.0793702040361015 ENSG00000054282:ENST00000448231:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000343783:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000391846:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000490065:exon_243419336_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243419358_243419542:SDCCAG8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 245849729 G/A 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 A:G G A 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 245849969 C/T 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 0.609212519966719 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 245850506 G/C 1 17 9 26 7.72805892240998 4.90867468813589 2.81938423427408 C:G G C 10 0.545408298681766 0.32654404784484 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 1 245851289 G/T 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 T:G G T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 294953 A/G 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000015171:ENST00000509513:exon_294843_295201:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000397962:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381607:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000309776:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381604:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381602:exon_294843_295201:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000397959:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381591:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000403354:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000402736:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381584:exon_294843_295028:ZMYND11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 56 57 113 25.4571352738211 31.0882730248607 -5.63113775103956 A:G G A 10 0.545408298681766 0.299718361738967 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 1060218 G/A 1 118 115 233 53.6418207555516 62.7219543484031 -9.08013359285147 A:G G A 10 0.545408298681766 0.236929567850498 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1060187_1060252:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000483839:exon_1060193_1060252:GTPBP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 1061767 G/A 1 40 58 98 18.1836680527294 31.6336813235424 -13.4500132708131 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00803807354966922 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1061693_1061836:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000483839:exon_1061693_1061836:GTPBP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 10 8 18 4.54591701318234 4.36326638945413 0.182650623728212 A:T A T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 T:C C T 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 12131081 T/G 1 15 4 19 6.81887551977351 2.18163319472706 4.63724232504645 T:G T G 10 0.545408298681766 0.0376877739096181 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 92 78 170 41.8224365212775 42.5418472971777 -0.719410775900215 T:C T C 10 0.545408298681766 0.938680906447872 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 107 90 197 48.641312041051 49.0867468813589 -0.445434840307904 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 12292348 G/T 1 85 106 191 38.6402946120499 57.8132796602672 -19.1729850482173 T:G G T 10 0.545408298681766 0.00570100704701772 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 13151224 G/A 1 26 23 49 11.8193842342741 12.5443908696806 -0.725006635406533 A:G G A 10 0.545408298681766 0.886364092929424 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000487935:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13151097_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13151112_13151288:OPTN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 13239651 A/G 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 A:G A G 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000481292:exon_13239623_13239767:MCM10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 14 6 20 6.36428381845528 3.2724497920906 3.09183402636468 T:C T C 10 0.545408298681766 0.184468819237692 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 22 23 45 10.0010174290011 12.5443908696806 -2.54337344067947 A:G A G 10 0.545408298681766 0.458063612156695 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 14943176 C/G 1 10 16 26 4.54591701318234 8.72653277890826 -4.18061576572592 C:G C G 10 0.545408298681766 0.116134696463967 ENSG00000152455:ENST00000378331:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000433779:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000378325:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000354919:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000313519:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000358298:exon_14943132_14943261:SUV39H2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 14974905 T/C 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000152457:ENST00000378289:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378275:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000449101:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000453695:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378246:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000357717:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378249:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000396817:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378255:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378254:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378258:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378278:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000418843:exon_14974853_14974954:DCLRE1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 14976727 G/C 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000152457:ENST00000378289:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378275:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000449101:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000453695:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378246:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000357717:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378249:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000396817:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378255:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378254:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378258:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378278:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000418843:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378241:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000456122:exon_14976722_14976774:DCLRE1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 17686334 C/T 1 7 2 9 3.18214190922764 1.09081659736353 2.09132531186411 T:C C T 10 0.545408298681766 0.19585774268132 ENSG00000136738:ENST00000377524:exon_17686124_17686378:STAM;ENSG00000136738:ENST00000460949:exon_17686124_17686378:STAM;ENSG00000136738:ENST00000445846:exon_17686207_17686378:STAM;ENSG00000136738:ENST00000377500:exon_17686207_17686378:STAM HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 24908686 T/C 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 T:C T C 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000376410:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000445703:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000446003:exon_24908402_24910298:ARHGAP21 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 26998637 T/G 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 T:G T G 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000148459:ENST00000376215:exon_26998567_26998697:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000376203:exon_26998567_26998697:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000396343:exon_26998567_26998697:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000473224:exon_26998567_26998697:PDSS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 27303605 A/T 1 3 11 14 1.3637751039547 5.99949128549943 -4.63571618154472 A:T A T 10 0.545408298681766 0.0151242027682239 ENSG00000107890:ENST00000445828:exon_27303423_27303608:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27303423_27303640:ANKRD26 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 27389314 C/T 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 T:C C T 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27389014_27389405:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27389014_27389427:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27389014_27389427:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27389014_27389421:ANKRD26 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 28 31 59 12.7285676369106 16.9076572591347 -4.17908962222419 A:G G A 10 0.545408298681766 0.29696083640997 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 27437964 T/C 1 79 83 162 35.9127444041405 45.2688887905866 -9.35614438644609 T:C T C 10 0.545408298681766 0.155444383577236 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27437835_27437969:YME1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 26 37 63 11.8193842342741 20.1801070512253 -8.36072281695126 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0422383026751088 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 37 30 67 16.8198929487747 16.362248960453 0.457643988321678 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 41 37 78 18.6382597540476 20.1801070512253 -1.54184729717775 T:C T C 10 0.545408298681766 0.734399075177763 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 27508758 T/C 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 T:C T C 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000426079:exon_27508652_27508786:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000412279:exon_27508652_27508786:ACBD5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 30728101 T/C 1 102 147 249 46.3683535344599 80.1750199062196 -33.8066663717597 T:C T C 10 0.545408298681766 1.84851482385404e-05 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 31791311 G/A 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G G A 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000148516:ENST00000320985:exon_31791276_31791437:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000437844:exon_31791276_31791437:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000488625:exon_31791276_31791437:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000424869:exon_31791276_31791437:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000361642:exon_31791276_31791437:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000446923:exon_31791276_31791437:ZEB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 33200468 G/A 1 21 7 28 9.54642572768291 3.81785809077236 5.72856763691055 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0357530206664566 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000494395:exon_33200455_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33200376_33200598:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33200376_33200598:ITGB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 34620220 C/T 1 7 13 20 3.18214190922764 7.09030788286296 -3.90816597363532 T:C C T 10 0.545408298681766 0.113964264894792 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000466092:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34620045_34620272:PARD3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 38126632 T/C 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 T:C T C 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000198105:ENST00000485560:exon_38126545_38126640:ZNF248;ENSG00000198105:ENST00000395867:exon_38126545_38126640:ZNF248;ENSG00000198105:ENST00000357328:exon_38126545_38126640:ZNF248;ENSG00000198105:ENST00000494133:exon_38126545_38126640:ZNF248;ENSG00000198105:ENST00000374648:exon_38126545_38126640:ZNF248;ENSG00000198105:ENST00000395873:exon_38126545_38126640:ZNF248;ENSG00000198105:ENST00000395874:exon_38126574_38126640:ZNF248 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 38344700 C/G 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 C:G C G 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 38404188 G/C 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 C:G G C 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000075407:ENST00000361085:exon_38404123_38404218:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000351773:exon_38404123_38404218:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000479469:exon_38404123_38404313:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000463776:exon_38404123_38404250:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000477790:exon_38404123_38404621:ZNF37A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 38407519 A/G 1 13 11 24 5.90969211713704 5.99949128549943 -0.0897991683623838 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000075407:ENST00000361085:exon_38406318_38411511:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000351773:exon_38406318_38412276:ZNF37A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 43089156 C/T 1 6 10 16 2.7275502079094 5.45408298681766 -2.72653277890826 T:C C T 10 0.545408298681766 0.211691046173674 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 43289407 G/A 1 27 27 54 12.2739759355923 14.7260240644077 -2.45204812881536 A:G G A 10 0.545408298681766 0.585063321541413 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43289300_43289439:BMS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 43678796 C/T 1 15 10 25 6.81887551977351 5.45408298681766 1.36479253295585 T:C C T 10 0.545408298681766 0.689530950640826 ENSG00000169826:ENST00000374466:exon_43678698_43680756:CSGALNACT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 50374930 C/T 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 T:C C T 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000204161:ENST00000374156:exon_50374490_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374151:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374153:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000488276:exon_50374914_50375038:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000474718:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000453436:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374149:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374148:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000470884:exon_50374813_50375054:C10orf128 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 50678369 T/C 1 10 6 16 4.54591701318234 3.2724497920906 1.27346722109174 T:C T C 10 0.545408298681766 0.62020159802431 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 52026532 G/A 0 55 0 55 25.0025435725029 0 25.0025435725029 G G 10 0.545408298681766 3.63446225195557e-15 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 14 13 27 6.36428381845528 7.09030788286296 -0.726024064407682 A:G A G 10 0.545408298681766 0.84779448787691 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 58118630 T/C 1 47 58 105 21.365809961957 31.6336813235424 -10.2678713615854 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0497433523857905 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000318387:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000460654:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000467523:exon_58118566_58118708:ZWINT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 23 22 45 10.4556091303194 11.9989825709989 -1.54337344067947 A:G G A 10 0.545408298681766 0.656302340959095 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 64974380 G/C 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 C:G G C 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 70101417 G/C 1 151 132 283 68.6433468990533 71.9938954259931 -3.35054852693978 T:C:G G C 10 0.545408298681766 0.720324216658002 ENSG00000096746:ENST00000469172:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000441000:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000265866:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000354695:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000481819:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000491200:exon_70101342_70101437:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000490442:exon_70100931_70101608:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000478698:exon_70100931_70101608:HNRNPH3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 70482238 G/A 1 10 9 19 4.54591701318234 4.90867468813589 -0.362757674953554 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70482212_70482334:CCAR1;ENSG00000060339:ENST00000494903:exon_70482212_70482334:CCAR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 70549579 G/A 1 51 43 94 23.1841767672299 23.4525568433159 -0.268380076086004 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70549467_70549672:CCAR1;ENSG00000060339:ENST00000480627:exon_70549467_70549629:CCAR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 70748784 G/A 1 10 3 13 4.54591701318234 1.6362248960453 2.90969211713704 A:G G A 10 0.545408298681766 0.162038106908021 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 71142420 G/A 1 30 33 63 13.637751039547 17.9984738564983 -4.36072281695126 A:G G A 10 0.545408298681766 0.311651947353321 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 71874683 G/A 1 40 34 74 18.1836680527294 18.54388215518 -0.360214102450684 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 71874734 G/A 1 33 23 56 15.0015261435017 12.5443908696806 2.45713527382111 A:C:G G A 10 0.545408298681766 0.591929380935694 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 71874784 C/T 1 19 15 34 8.63724232504645 8.18112448022649 0.456117844819955 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 27 44 71 12.2739759355923 23.9979651419977 -11.7239892064054 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00590143688109045 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 71906150 T/C 1 13 9 22 5.90969211713704 4.90867468813589 1.00101742900115 T:C T C 10 0.545408298681766 0.83113387846694 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 16 11 27 7.27346722109174 5.99949128549943 1.27397593559232 T:C C T 10 0.545408298681766 0.701415732858495 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 72358577 G/A 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000180644:ENST00000373209:exon_72357104_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000441259:exon_72357105_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000318971:exon_72357105_72358937:PRF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 73587868 A/C 1 78 69 147 35.4581527028223 37.6331726090418 -2.1750199062196 A:C:G A C 10 0.545408298681766 0.740823058828641 ENSG00000197746:ENST00000394936:exon_73587771_73587914:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000373120:exon_73587771_73587914:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000357471:exon_73587771_73587914:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394934:exon_73587771_73587914:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394940:exon_73587771_73587914:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000402059:exon_73587771_73587914:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000404083:exon_73587771_73587914:PSAP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 74834651 T/C 1 15 13 28 6.81887551977351 7.09030788286296 -0.271432363089448 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000122884:ENST00000307116:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000394890:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000412021:exon_74834566_74834679:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000440381:exon_74834566_74834673:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000263556:exon_74834566_74834673:P4HA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 74894375 T/C 1 83 62 145 37.7311112094134 33.8153145182695 3.91579669114393 T:C T C 10 0.545408298681766 0.559629395065363 ENSG00000122882:ENST00000494307:exon_74894361_74894512:ECD;ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74893414_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74894283_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74894283_74894571:ECD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 74896664 T/C 1 31 43 74 14.0923427408653 23.4525568433159 -9.36021410245069 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0350325609003855 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74896462_74896676:ECD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 74897816 C/T 1 35 17 52 15.9107095461382 9.27194107759002 6.63876846854817 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0706045475187961 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74897761_74897828:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74897761_74897828:ECD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 74899111 A/G 1 44 15 59 20.0020348580023 8.18112448022649 11.8209103777758 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00234568378345423 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74899067_74899253:ECD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 74899134 C/G 1 46 14 60 20.9112182606388 7.63571618154472 13.275502079094 C:G C G 10 0.545408298681766 0.000621202739221932 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74899067_74899253:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74899067_74899253:ECD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 74916173 T/A 1 21 25 46 9.54642572768291 13.6352074670442 -4.08878173936124 A:T T A 10 0.545408298681766 0.238949066042351 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000484976:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000453402:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74916033_74916211:ECD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 74923562 C/T 1 27 18 45 12.2739759355923 9.81734937627179 2.45662655932053 T:C C T 10 0.545408298681766 0.549931162252618 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74923491_74923708:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74923491_74923708:ECD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 75006804 A/G 1 20 12 32 9.09183402636468 6.54489958418119 2.54693444218349 A:G A G 10 0.545408298681766 0.382100303850759 ENSG00000213551:ENST00000372950:exon_75006768_75008620:DNAJC9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 75148116 A/G 1 70 44 114 31.8214190922764 23.9979651419977 7.82345395027868 A:G A G 10 0.545408298681766 0.158289472382762 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75148070_75148172:ANXA7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 76788860 C/T 1 19 19 38 8.63724232504645 10.3627576749536 -1.72551534990711 T:C C T 10 0.545408298681766 0.626617643778788 ENSG00000156650:ENST00000372725:exon_76788247_76792051:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372724:exon_76788247_76792050:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000287239:exon_76788247_76792380:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372714:exon_76788247_76790948:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372711:exon_76788247_76792380:MYST4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 76789077 G/A 1 18 20 38 8.18265062372821 10.9081659736353 -2.72551534990711 A:G G A 10 0.545408298681766 0.417110767640708 ENSG00000156650:ENST00000372725:exon_76788247_76792051:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372724:exon_76788247_76792050:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000287239:exon_76788247_76792380:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372714:exon_76788247_76790948:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372711:exon_76788247_76792380:MYST4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 86130899 C/T 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 86131003 T/C 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 T:C T C 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 86131059 A/G 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 A:G A G 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 T:C T C 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 88203068 T/C 1 14 21 35 6.36428381845528 11.4535742723171 -5.08929045386181 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0912742261267931 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000484070:exon_88203032_88203789:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372075:exon_88203032_88203120:WAPAL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 5 11 16 2.27295850659117 5.99949128549943 -3.72653277890826 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0783914597682892 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 90767482 A/G 1 30 40 70 13.637751039547 21.8163319472706 -8.17858090772362 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0547977050455303 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494410:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000460510:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000477270:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000466081:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000371857:exon_90767457_90767594:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90767457_90767594:FAS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 91007360 T/G 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000107798:ENST00000336233:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000371829:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000456827:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000425287:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000428800:exon_91007295_91007588:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000282673:exon_91007295_91007406:LIPA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 91470834 A/C 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 A:C A C 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000447580:exon_91470718_91470847:KIF20B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 91479211 G/T 1 13 13 26 5.90969211713704 7.09030788286296 -1.18061576572592 T:G G T 10 0.545408298681766 0.696154695081167 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91479176_91479463:KIF20B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 12 10 22 5.45510041581881 5.45408298681766 0.00101742900114843 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 23 20 43 10.4556091303194 10.9081659736353 -0.452556843315937 A:T T A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 17 10 27 7.72805892240998 5.45408298681766 2.27397593559232 A:G A G 10 0.545408298681766 0.442451269997159 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 27 24 51 12.2739759355923 13.0897991683624 -0.815823232770065 A:G A G 10 0.545408298681766 0.88843880926409 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 20 18 38 9.09183402636468 9.81734937627179 -0.725515349907107 A:G A G 10 0.545408298681766 0.87122541036102 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 91522548 A/G 1 11 21 32 5.00050871450057 11.4535742723171 -6.45306555781651 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0315324411880694 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91522395_91522592:KIF20B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 91528504 C/T 1 19 11 30 8.63724232504645 5.99949128549943 2.63775103954702 T:C C T 10 0.545408298681766 0.364545047610998 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91528495_91528645:KIF20B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 93608142 G/A 1 7 11 18 3.18214190922764 5.99949128549943 -2.81734937627179 A:G G A 10 0.545408298681766 0.237114548756310 ENSG00000107854:ENST00000371627:exon_93608140_93608392:TNKS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 17 31 48 7.72805892240998 16.9076572591347 -9.17959833672477 C:G G C 10 0.545408298681766 0.00878824194337534 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 19 24 43 8.63724232504645 13.0897991683624 -4.45255684331594 A:G A G 10 0.545408298681766 0.220103990154113 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 95459817 C/T 1 21 26 47 9.54642572768291 14.1806157657259 -4.634190038043 T:C C T 10 0.545408298681766 0.189100819444811 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95459787_95459863:FRA10AC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 10 12 22 4.54591701318234 6.54489958418119 -1.99898257099885 A:C A C 10 0.545408298681766 0.401540564367046 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 96997670 A/G 1 1103 981 2084 501.414646554012 535.045541006812 -33.6308944528003 A:T:C:G A G 10 0.545408298681766 0.140577971972142 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 96997820 A/G 1 540 535 1075 245.479518711846 291.793439794745 -46.3139210828984 A:C:G A G 10 0.545408298681766 0.00482046782889587 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000492511:exon_96997697_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_96997767_96997868:PDLIM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 97607165 G/A 1 3 8 11 1.3637751039547 4.36326638945413 -2.99949128549943 A:G G A 10 0.545408298681766 0.126277531853182 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 97919011 A/G 1 10 13 23 4.54591701318234 7.09030788286296 -2.54439086968062 A:G A G 10 0.545408298681766 0.302592597377063 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 97919380 G/T 1 18 15 33 8.18265062372821 8.18112448022649 0.00152614350172264 T:G G T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 34 37 71 15.45611784482 20.1801070512253 -4.72398920640538 A:G A G 10 0.545408298681766 0.284218645891353 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 98287792 G/T 1 42 30 72 19.0928514553658 16.362248960453 2.73060249491285 T:G G T 10 0.545408298681766 0.555399218161793 ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98287788_98287934:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000485093:exon_98287788_98287930:TM9SF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 98369536 A/G 1 29 42 71 13.1831593382288 22.9071485446342 -9.72398920640538 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0232470299432213 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000467625:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98369469_98369624:PIK3AP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 98380137 T/C 1 46 46 92 20.9112182606388 25.0887817393612 -4.17756347872247 T:C T C 10 0.545408298681766 0.40326713805392 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98380109_98380168:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000461252:exon_98380109_98380191:PIK3AP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 45 40 85 20.4566265593205 21.8163319472706 -1.35970538795011 T:C C T 10 0.545408298681766 0.827753090045925 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 98405353 C/A 1 29 27 56 13.1831593382288 14.7260240644077 -1.54286472617889 A:C C A 10 0.545408298681766 0.68944141709458 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98405230_98405419:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98405230_98405419:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000461252:exon_98405230_98405374:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000468783:exon_98405230_98405419:PIK3AP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 98469507 C/A 1 11 11 22 5.00050871450057 5.99949128549943 -0.998982570998852 A:C C A 10 0.545408298681766 0.675286531050552 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 98742605 C/T 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:C C T 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000155640:ENST00000286067:exon_98741041_98745582:C10orf12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 99205731 A/G 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 A:G A G 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99205712_99205751:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99205712_99205743:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370885:exon_99205712_99205750:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000485122:exon_99205712_99205742:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000476234:exon_99205712_99205763:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000489158:exon_99205712_99205763:EXOSC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 13 16 29 5.90969211713704 8.72653277890826 -2.81684066177121 A:G G A 10 0.545408298681766 0.352105502963958 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 5 15 20 2.27295850659117 8.18112448022649 -5.90816597363532 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0116162413801585 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 99969568 A/G 1 10 3 13 4.54591701318234 1.6362248960453 2.90969211713704 A:G A G 10 0.545408298681766 0.162038106908021 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 101166544 C/T 1 42 38 80 19.0928514553658 20.7255153499071 -1.63266389454128 T:C C T 10 0.545408298681766 0.737159237410845 ENSG00000120053:ENST00000370508:exon_101166483_101166606:GOT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 101478157 G/C 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000014919:ENST00000370483:exon_101478103_101478257:COX15;ENSG00000014919:ENST00000016171:exon_101478103_101478257:COX15 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 101639616 C/T 1 14 14 28 6.36428381845528 7.63571618154472 -1.27143236308945 T:C C T 10 0.545408298681766 0.70569768807638 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 102107251 C/G 1 40 32 72 18.1836680527294 17.4530655578165 0.730602494912848 C:G C G 10 0.545408298681766 0.906161155401931 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102107233_102107288:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102106881_102107288:SCD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 102116311 A/C 1 55 52 107 25.0025435725029 28.3612315314518 -3.35868795894896 A:C A C 10 0.545408298681766 0.560534421154422 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102116289_102116367:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102116289_102116521:SCD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 102762656 C/T 1 2 10 12 0.909183402636468 5.45408298681766 -4.54489958418119 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0162217557673648 ENSG00000107816:ENST00000426584:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000489526:exon_102762254_102762934:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000429732:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000481129:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102759233_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000454422:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000459989:exon_102762462_102762703:LZTS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 103920626 C/T 1 127 98 225 57.7331460674157 53.4500132708131 4.28313279660265 T:C C T 10 0.545408298681766 0.592586358201671 ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000477977:exon_103920487_103920850:NOLC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 16 17 33 7.27346722109174 9.27194107759002 -1.99847385649828 C:G C G 10 0.545408298681766 0.490611458768862 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 104436641 C/T 1 38 39 77 17.2744846500929 21.2709236485889 -3.99643899849598 T:C C T 10 0.545408298681766 0.362790397115819 ENSG00000138175:ENST00000260746:exon_104436315_104436698:ARL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 104572963 T/C 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 T:C T C 10 0.545408298681766 0.40572272702491 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 104573017 G/T 1 3 8 11 1.3637751039547 4.36326638945413 -2.99949128549943 T:G G T 10 0.545408298681766 0.126277531853182 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 39 30 69 17.7290763514111 16.362248960453 1.36682739095815 A:G G A 10 0.545408298681766 0.809339831953809 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 105164784 A/G 1 16 15 31 7.27346722109174 8.18112448022649 -0.907657259134746 A:G A G 10 0.545408298681766 0.857269904474793 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105164779_105164940:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000493610:exon_105164779_105164940:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000471061:exon_105164779_105165129:PDCD11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 24 47 71 10.9102008316376 25.634190038043 -14.7239892064054 T:C C T 10 0.545408298681766 0.000491491689271047 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 28 26 54 12.7285676369106 14.1806157657259 -1.45204812881536 T:C T C 10 0.545408298681766 0.784924417495986 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 105362179 G/A 1 9 8 17 4.09132531186411 4.36326638945413 -0.271941077590022 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 105657316 G/C 1 16 23 39 7.27346722109174 12.5443908696806 -5.27092364858887 C:G G C 10 0.545408298681766 0.107529436357931 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105657306_105657477:OBFC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 105659826 T/C 1 20 23 43 9.09183402636468 12.5443908696806 -3.45255684331594 T:C T C 10 0.545408298681766 0.358350515482876 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105659820_105659981:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105659820_105659981:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105659820_105659981:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105659718_105659911:OBFC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 105882765 A/G 1 10 2 12 4.54591701318234 1.09081659736353 3.45510041581881 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0775833003018699 ENSG00000156384:ENST00000369729:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000463224:exon_105882723_105883121:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000369727:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000336358:exon_105882524_105882844:C10orf78 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 205 197 402 93.191298770238 107.445434840308 -14.2541360700699 A:C C A 10 0.545408298681766 0.160847032204135 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 112266822 G/A 1 27 21 48 12.2739759355923 11.4535742723171 0.820401663275232 A:G G A 10 0.545408298681766 0.885194809013043 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 112266823 C/T 1 30 20 50 13.637751039547 10.9081659736353 2.7295850659117 T:C C T 10 0.545408298681766 0.479713162907400 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 114220331 C/T 1 14 11 25 6.36428381845528 5.99949128549943 0.364792532955851 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000151532:ENST00000489142:exon_114220283_114220341:VTI1A;ENSG00000151532:ENST00000393077:exon_114220283_114220341:VTI1A;ENSG00000151532:ENST00000432306:exon_114220283_114220341:VTI1A;ENSG00000151532:ENST00000496445:exon_114220283_114220341:VTI1A;ENSG00000151532:ENST00000494728:exon_114220283_114220341:VTI1A;ENSG00000151532:ENST00000489357:exon_114220283_114220341:VTI1A;ENSG00000151532:ENST00000480057:exon_114220283_114220341:VTI1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 115489152 C/G 1 18 18 36 8.18265062372821 9.81734937627179 -1.63469875254357 C:G C G 10 0.545408298681766 0.618256262605604 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 115489167 G/A 1 17 18 35 7.72805892240998 9.81734937627179 -2.08929045386181 A:G G A 10 0.545408298681766 0.501106521181595 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 115594990 G/C 1 18 13 31 8.18265062372821 7.09030788286296 1.09234274086525 C:G G C 10 0.545408298681766 0.722444112386434 ENSG00000198924:ENST00000369305:exon_115594488_115595071:DCLRE1A;ENSG00000198924:ENST00000361384:exon_115594488_115595071:DCLRE1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 115609915 C/G 1 16 13 29 7.27346722109174 7.09030788286296 0.183159338228786 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000198924:ENST00000369305:exon_115608739_115610403:DCLRE1A;ENSG00000198924:ENST00000361384:exon_115608739_115610403:DCLRE1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 116073801 T/C 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 T:C T C 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000169129:ENST00000369271:exon_116073630_116073809:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000304129:exon_116073630_116073809:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000392974:exon_116073630_116073809:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000419268:exon_116073630_116073809:AFAP1L2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 116602805 A/G 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 A:G A G 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000151553:ENST00000369248:exon_116602692_116602985:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000369250:exon_116602692_116602985:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000392942:exon_116602692_116602985:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000455766:exon_116602692_116602985:FAM160B1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 116735132 G/A 1 5 18 23 2.27295850659117 9.81734937627179 -7.54439086968062 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00248227550146127 ENSG00000165832:ENST00000298746:exon_116734882_116737430:TRUB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 9 11 20 4.09132531186411 5.99949128549943 -1.90816597363532 T:C T C 10 0.545408298681766 0.501718810318948 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 121196264 C/T 1 15 10 25 6.81887551977351 5.45408298681766 1.36479253295585 T:C C T 10 0.545408298681766 0.689530950640826 ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000369108:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000457057:exon_121196163_121196276:GRK5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 122637901 T/G 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 T:G T G 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122637865_122637971:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122637865_122637971:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122637865_122637971:WDR11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 A:G G A 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 124742792 G/A 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 124742895 G/C 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 C:G G C 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000496079:exon_124742806_124742986:PSTK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 126089434 G/A 1 8 13 21 3.63673361054587 7.09030788286296 -3.45357427231709 A:G G A 10 0.545408298681766 0.187341762630804 ENSG00000065154:ENST00000368845:exon_126089409_126089553:OAT;ENSG00000065154:ENST00000471127:exon_126089409_126089553:OAT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 191 194 385 86.8270149517827 105.809209944263 -18.9821949924799 T:C:G T C 10 0.545408298681766 0.0581459011585845 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 211 220 431 95.9188489781474 119.989825709989 -24.0709767318411 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0202695399003220 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 129900858 C/T 1 128 141 269 58.187737768734 76.902570114129 -18.7148323453951 T:C:G C T 10 0.545408298681766 0.0234190908261163 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 129901501 G/C 1 103 129 232 46.8229452357781 70.3576705299478 -23.5347252941697 C:G G C 10 0.545408298681766 0.00235297860157372 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 129901747 C/T 1 102 116 218 46.3683535344599 63.2673626470849 -16.899009112625 T:C:G C T 10 0.545408298681766 0.0246084984857878 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 146 162 308 66.3703883924622 88.3561443864461 -21.9857559939839 A:T:G G A 10 0.545408298681766 0.0137514666048975 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 138 118 256 62.7336547819163 64.3581792444484 -1.6245244625321 T:C T C 10 0.545408298681766 0.850830295423002 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 129903465 A/G 1 114 96 210 51.8234539502787 52.3591966734495 -0.535742723170856 A:T:G A G 10 0.545408298681766 0.944870186398865 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 129904917 G/A 1 84 72 156 38.1857029107317 39.2693975050871 -1.08369459435549 A:G G A 10 0.545408298681766 0.872545290821712 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 129905896 T/A 1 62 63 125 28.1846854817305 34.3607228169513 -6.17603733522075 A:T T A 10 0.545408298681766 0.281755401818203 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 129906928 G/A 1 70 73 143 31.8214190922764 39.8148058037689 -7.99338671149254 A:C:G G A 10 0.545408298681766 0.180346627723836 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 129906980 C/T 1 51 63 114 23.1841767672299 34.3607228169513 -11.1765460497213 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.0384719329557891 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 129917560 T/C 1 19 15 34 8.63724232504645 8.18112448022649 0.456117844819955 T:C:G T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129917517_129917583:MKI67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 10 135186806 A/G 1 52 54 106 23.6387684685482 29.4520481288154 -5.8132796602672 A:G A G 10 0.545408298681766 0.283501281472682 ENSG00000127884:ENST00000368547:exon_135186750_135187193:ECHS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 233067 C/T 1 14 15 29 6.36428381845528 8.18112448022649 -1.81684066177121 T:C C T 10 0.545408298681766 0.57718202619655 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 233212 C/A 1 15 14 29 6.81887551977351 7.63571618154472 -0.816840661771214 A:C C A 10 0.545408298681766 0.852678436276024 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525776:exon_233192_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_233209_233215:SIRT3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 290816 A/G 1 10 17 27 4.54591701318234 9.27194107759002 -4.72602406440768 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0817558899817688 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 89 93 182 40.4586614173228 50.7229717774042 -10.2643103600814 C:G G C 10 0.545408298681766 0.136571023816428 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 499059 C/T 1 92 74 166 41.8224365212775 40.3602141024507 1.46222241882685 T:C C T 10 0.545408298681766 0.876201054239005 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_499015_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_499031_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_499047_499185:RNH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 534197 C/T 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 T:C C T 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 534242 A/G 1 20 23 43 9.09183402636468 12.5443908696806 -3.45255684331594 A:G A G 10 0.545408298681766 0.358350515482876 ENSG00000174775:ENST00000397594:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000397596:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000493230:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000451590:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000417302:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000311189:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000468682:exon_534212_534375:HRAS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 555724 C/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C C T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000185522:ENST00000469990:exon_555305_555930:C11orf35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 562421 G/A 1 11 9 20 5.00050871450057 4.90867468813589 0.0918340263646806 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_562385_562776:RASSF7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 563257 G/A 1 5 10 15 2.27295850659117 5.45408298681766 -3.18112448022649 A:G G A 10 0.545408298681766 0.121647049471624 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563189_563478:RASSF7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 563649 C/T 1 18 14 32 8.18265062372821 7.63571618154472 0.546934442183489 T:C C T 10 0.545408298681766 0.861580977164548 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563558_564018:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563558_564021:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563558_563685:RASSF7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 608593 G/A 1 33 21 54 15.0015261435017 11.4535742723171 3.54795187118464 A:G G A 10 0.545408298681766 0.343054826798617 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 610277 T/C 1 10 17 27 4.54591701318234 9.27194107759002 -4.72602406440768 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0817558899817688 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_610196_610347:PHRF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 614864 C/T 1 76 75 151 34.5489693001858 40.9056224011324 -6.35665310094667 T:C C T 10 0.545408298681766 0.326874487960904 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614797_614984:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614797_614952:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532788:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614797_614887:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 654043 G/A 1 15 8 23 6.81887551977351 4.36326638945413 2.45560913031938 A:G G A 10 0.545408298681766 0.403117218653481 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_653941_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_653962_654051:DEAF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 674638 C/T 1 12 15 27 5.45510041581881 8.18112448022649 -2.72602406440768 T:C C T 10 0.545408298681766 0.336126149245224 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 802379 T/C 1 6 10 16 2.7275502079094 5.45408298681766 -2.72653277890826 T:C T C 10 0.545408298681766 0.211691046173674 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 804212 C/A 1 6 12 18 2.7275502079094 6.54489958418119 -3.81734937627179 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0959765577209017 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_804094_804675:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_804094_805103:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_804094_804469:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534649:exon_804094_804463:LRDD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 837582 G/A 1 42 71 113 19.0928514553658 38.7239892064054 -19.6311377510396 A:G G A 10 0.545408298681766 0.000291569669245701 ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_837460_837613:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528143:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_837460_837612:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532075:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_837356_837605:POLR2L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 840363 C/T 1 59 77 136 26.8209103777758 41.996438998496 -15.1755286207202 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00968856244403902 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 840477 A/G 1 190 169 359 86.3724232504645 92.1740024772185 -5.80157922675399 A:G A G 10 0.545408298681766 0.56002794457939 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 870446 G/A 1 25 26 51 11.3647925329558 14.1806157657259 -2.81582323277007 A:G G A 10 0.545408298681766 0.482748596261773 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 2924610 G/A 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2924344_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000492567:exon_2924606_2924719:SLC22A18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 2929552 A/G 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000492567:exon_2929463_2929560:SLC22A18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 3028140 G/A 1 14 25 39 6.36428381845528 13.6352074670442 -7.27092364858887 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0236064066703146 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3028109_3028240:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3028109_3030127:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3028109_3028189:CARS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 29 10 39 13.1831593382288 5.45408298681766 7.72907635141113 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0150326133103874 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 3381843 A/G 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:G A G 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 4103524 A/G 1 8 13 21 3.63673361054587 7.09030788286296 -3.45357427231709 A:G A G 10 0.545408298681766 0.187341762630804 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 34 29 63 15.45611784482 15.8168406617712 -0.360722816951256 A:C C A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 120 107 227 54.5510041581881 58.358687958949 -3.80768380076088 A:G A G 10 0.545408298681766 0.640992240168569 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 5632212 G/A 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 A:G G A 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000121236:ENST00000278302:exon_5632007_5634182:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000507320:exon_5632007_5632930:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000515469:exon_5632007_5633659:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000380107:exon_5632007_5633653:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000511284:exon_5632007_5632334:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000380109:exon_5632007_5632572:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000380097:exon_5632007_5634182:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000396867:exon_5632007_5634182:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000445329:exon_5632007_5634182:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000515022:exon_5632007_5632575:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000506134:exon_5632007_5632817:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000380090:exon_5632007_5634188:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000469187:exon_5632007_5632509:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000481603:exon_5632007_5634188:TRIM6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 5663706 G/C 1 10 8 18 4.54591701318234 4.36326638945413 0.182650623728212 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5663636_5663736:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5663636_5663736:TRIM34 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 31 24 55 14.0923427408653 13.0897991683624 1.00254357250287 A:C C A 10 0.545408298681766 0.892461297916145 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 5688940 C/T 1 6 13 19 2.7275502079094 7.09030788286296 -4.36275767495355 T:C C T 10 0.545408298681766 0.062974453261368 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5688919_5688941:TRIM5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 5701001 C/T 1 24 18 42 10.9102008316376 9.81734937627179 1.09285145536583 T:C C T 10 0.545408298681766 0.759328842149155 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700991_5701037:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700991_5701087:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700991_5701063:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700991_5701161:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 127 112 239 57.7331460674157 61.0857294523578 -3.35258338494207 T:C T C 10 0.545408298681766 0.696853685204729 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 164 122 286 74.5530390161904 66.5398124391754 8.01322657701493 A:G G A 10 0.545408298681766 0.373143067592798 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 6239139 A/G 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 A:G A G 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000532797:exon_6239035_6239380:FAM160A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 6415499 A/G 1 15 14 29 6.81887551977351 7.63571618154472 -0.816840661771214 A:G A G 10 0.545408298681766 0.852678436276024 ENSG00000166311:ENST00000299397:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000356761:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000342245:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000534405:exon_6415428_6416221:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000527275:exon_6415428_6416008:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000533123:exon_6415428_6416228:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000531303:exon_6415408_6416008:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000526280:exon_6415428_6416228:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000531336:exon_6415126_6415603:SMPD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 6588228 G/A 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 A:G G A 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6588155_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525080:exon_6588155_6588582:DNHD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 77 58 135 35.003561001504 31.6336813235424 3.36987967796159 T:C C T 10 0.545408298681766 0.60439762294725 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 88 102 190 40.0040697160046 55.6316464655401 -15.6275767495355 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0239134940190966 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 6632857 A/T 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 A:T A T 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632619_6633179:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000532344:exon_6632632_6633049:TAF10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 6636106 T/A 1 43 32 75 19.5474431566841 17.4530655578165 2.09437759886755 A:T T A 10 0.545408298681766 0.644852590658279 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000429085:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000524611:exon_6636097_6636222:TPP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 6976988 A/T 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 A:T A T 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000149054:ENST00000527171:exon_6976921_6977336:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000278319:exon_6976921_6979068:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000299468:exon_6976921_6977013:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000529755:exon_6976921_6977341:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000414517:exon_6976921_6979079:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000529903:exon_6976921_6977013:ZNF215;ENSG00000149054:ENST00000532533:exon_6976921_6977013:ZNF215 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 8933064 G/A 1 22 19 41 10.0010174290011 10.3627576749536 -0.361740245952406 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000166452:ENST00000299576:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309377:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309357:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000426510:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529876:exon_8932736_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000525005:exon_8932739_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000524577:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534506:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000396648:exon_8932885_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534147:exon_8932990_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529942:exon_8933012_8933218:C11orf17 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 9769483 C/T 1 31 17 48 14.0923427408653 9.27194107759002 4.82040166327523 T:C C T 10 0.545408298681766 0.192274094721294 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 13441126 A/G 1 6 11 17 2.7275502079094 5.99949128549943 -3.27194107759002 A:G A G 10 0.545408298681766 0.14387918634876 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13441040_13441292:BTBD10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 13443250 C/T 1 10 11 21 4.54591701318234 5.99949128549943 -1.45357427231709 T:C C T 10 0.545408298681766 0.662270617460159 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13443189_13443362:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13443189_13443385:BTBD10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 17095967 T/A 1 537 793 1330 244.115743607892 432.50878085464 -188.393037246749 A:T T A 10 0.545408298681766 4.67867085696386e-25 ENSG00000110700:ENST00000531008:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000531908:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000228140:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000526895:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000525634:exon_17095936_17096013:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000525828:exon_17095940_17096013:RPS13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 17351683 C/G 1 31 18 49 14.0923427408653 9.81734937627179 4.27499336459347 C:G C G 10 0.545408298681766 0.252092717433169 ENSG00000070081:ENST00000532658:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000533773:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000405119:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000323688:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000529010:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000458064:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000527580:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000531242:exon_17351674_17351844:NUCB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 18309464 G/A 1 17 8 25 7.72805892240998 4.36326638945413 3.36479253295585 A:G G A 10 0.545408298681766 0.228470955877391 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18309440_18309560:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18309440_18309560:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18309440_18309560:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18309440_18309560:HPS5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 18319180 G/T 1 9 5 14 4.09132531186411 2.72704149340883 1.36428381845528 T:G G T 10 0.545408298681766 0.594806597584705 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000531848:exon_18319106_18319264:HPS5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 18327684 G/T 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 T:G G T 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18327682_18327894:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18327682_18327894:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18327682_18327894:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18327682_18327894:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000531848:exon_18327682_18327894:HPS5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 18357419 A/G 1 17 11 28 7.72805892240998 5.99949128549943 1.72856763691055 A:G A G 10 0.545408298681766 0.572612553515050 ENSG00000110768:ENST00000453096:exon_18357301_18357493:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000531757:exon_18357301_18357451:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000418116:exon_18357301_18357493:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000525831:exon_18357301_18357431:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000265963:exon_18357301_18357493:GTF2H1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 18422487 C/A 1 329 488 817 149.560669733699 266.159249756702 -116.598580023003 A:C C A 10 0.545408298681766 3.13677784248646e-16 ENSG00000134333:ENST00000422447:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000396222:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000379412:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000445376:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000227157:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000478970:exon_18422384_18422517:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000486690:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000460405:exon_18422384_18422557:LDHA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 18633971 G/A 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 A:G G A 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 27362359 T/G 1 6 11 17 2.7275502079094 5.99949128549943 -3.27194107759002 T:G T G 10 0.545408298681766 0.14387918634876 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 32874926 G/A 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 33054503 T/G 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 T:G T G 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000121690:ENST00000241051:exon_33054435_33054513:DEPDC7;ENSG00000121690:ENST00000311388:exon_33054435_33054513:DEPDC7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 33076191 T/C 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 33106616 C/T 1 39 29 68 17.7290763514111 15.8168406617712 1.91223568963991 T:C C T 10 0.545408298681766 0.715301786572405 ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 35226155 A/G 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 A:G A G 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531110:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534296:exon_35226059_35226456:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525241:exon_35226059_35226358:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526553:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534082:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528672:exon_35226059_35226187:CD44 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 35827958 A/G 1 18 16 34 8.18265062372821 8.72653277890826 -0.543882155180043 A:G A G 10 0.545408298681766 0.864915346461896 ENSG00000166326:ENST00000299413:exon_35827908_35829775:TRIM44;ENSG00000166326:ENST00000532066:exon_35827908_35828171:TRIM44 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 44636833 G/A 1 119 136 255 54.0964124568698 74.1755286207202 -20.0791161638503 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0118927394400982 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 17 11 28 7.72805892240998 5.99949128549943 1.72856763691055 A:G A G 10 0.545408298681766 0.572612553515050 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 46564521 A/T 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 A:T A T 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000110497:ENST00000314845:exon_46563495_46564531:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000533727:exon_46563495_46564531:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000534300:exon_46563495_46564948:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000426438:exon_46563495_46564948:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000314823:exon_46563495_46564531:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000298834:exon_46563495_46564948:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000458649:exon_46563495_46564948:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000528950:exon_46563495_46564948:AMBRA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 57080882 C/T 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 T:C C T 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 58318619 C/G 1 45 50 95 20.4566265593205 27.2704149340883 -6.81378837476777 C:G C G 10 0.545408298681766 0.180414415290866 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58318538_58318705:LPXN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 58384883 A/G 1 30 21 51 13.637751039547 11.4535742723171 2.18417676722993 A:G A G 10 0.545408298681766 0.576148167375372 ENSG00000186660:ENST00000316059:exon_58384669_58388515:ZFP91;ENSG00000186660:ENST00000389918:exon_58384669_58385041:ZFP91;ENSG00000255073:ENST00000389919:exon_58384669_58385041:AP001350.3;ENSG00000255073:ENST00000422974:exon_58384669_58385041:AP001350.3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 58978940 C/T 1 32 18 50 14.5469344421835 9.81734937627179 4.7295850659117 T:C C T 10 0.545408298681766 0.202277667652345 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 60610056 G/C 1 36 31 67 16.3653012474564 16.9076572591347 -0.542356011678319 C:G G C 10 0.545408298681766 0.902970993267651 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 60617834 C/A 1 53 51 104 24.0933601698664 27.8158232327701 -3.72246306290366 A:C C A 10 0.545408298681766 0.491316021451523 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 86 75 161 39.0948863133681 40.9056224011324 -1.81073608776433 A:G G A 10 0.545408298681766 0.812471051523471 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 60673868 T/C 1 38 35 73 17.2744846500929 19.0892904538618 -1.81480580376892 T:C T C 10 0.545408298681766 0.724807466971783 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60673836_60674056:PRPF19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 60689445 T/C 1 68 37 105 30.9122356896399 20.1801070512253 10.7321286384146 T:C T C 10 0.545408298681766 0.03931741826868 ENSG00000110108:ENST00000227525:exon_60689246_60690913:TMEM109;ENSG00000110108:ENST00000446886:exon_60689246_60689485:TMEM109 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 61557422 G/A 1 15 8 23 6.81887551977351 4.36326638945413 2.45560913031938 A:G G A 10 0.545408298681766 0.403117218653481 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 61560035 C/T 1 184 198 382 83.6448730425551 107.99084313899 -24.3459700964346 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0135741145499969 ENSG00000134825:ENST00000257262:exon_61560028_61560085:C11orf10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 61895741 A/G 1 16 9 25 7.27346722109174 4.90867468813589 2.36479253295585 A:G A G 10 0.545408298681766 0.423463149171332 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61895623_61895773:INCENP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 61897359 C/T 1 16 5 21 7.27346722109174 2.72704149340883 4.54642572768291 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0502218138253225 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 61908440 T/C 1 12 8 20 5.45510041581881 4.36326638945413 1.09183402636468 T:C T C 10 0.545408298681766 0.660903045813617 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61908385_61908516:INCENP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 61913196 G/T 1 11 14 25 5.00050871450057 7.63571618154472 -2.63520746704415 T:G G T 10 0.545408298681766 0.319613639852798 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61913101_61913223:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61913101_61913223:INCENP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 62293948 G/A 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 62294309 C/T 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 T:C C T 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 62458275 T/C 1 27 31 58 12.2739759355923 16.9076572591347 -4.63368132354243 T:C T C 10 0.545408298681766 0.236971032601583 ENSG00000168000:ENST00000405837:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000433053:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000403734:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000470529:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000278893:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000360796:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000463679:exon_62458259_62458814:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000403550:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000407022:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000301781:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000421906:exon_62458259_62458339:BSCL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 62484531 C/T 1 85 84 169 38.6402946120499 45.8142970892683 -7.17400247721845 T:C C T 10 0.545408298681766 0.279984479697877 ENSG00000214753:ENST00000301785:exon_62484461_62484661:HNRNPUL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 62496519 T/C 1 35 31 66 15.9107095461382 16.9076572591347 -0.996947712996555 T:C T C 10 0.545408298681766 0.806184746198234 ENSG00000162222:ENST00000530625:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000294161:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62496011_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62496295_62496558:TTC9C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 62505764 C/T 1 41 42 83 18.6382597540476 22.9071485446342 -4.26888879058658 T:C C T 10 0.545408298681766 0.378452896307667 ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62505760_62506108:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62505760_62506075:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532276:exon_62505760_62505962:TTC9C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 62652779 C/T 1 143 153 296 65.0066132885075 83.4474696983102 -18.4408564098027 T:C C T 10 0.545408298681766 0.035456139428265 ENSG00000168003:ENST00000377891:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377892:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377889:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377890:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000338663:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000422606:exon_62652649_62652829:SLC3A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 63449125 C/A 1 15 8 23 6.81887551977351 4.36326638945413 2.45560913031938 A:C C A 10 0.545408298681766 0.403117218653481 ENSG00000133318:ENST00000341307:exon_63448922_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000339997:exon_63448922_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000356000:exon_63448922_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000377819:exon_63448990_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000354497:exon_63448990_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000338850:exon_63448990_63449250:RTN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 63585804 C/A 1 27 26 53 12.2739759355923 14.1806157657259 -1.9066398301336 A:C C A 10 0.545408298681766 0.679447026135616 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63585688_63585837:C11orf84 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 63970625 G/A 1 79 79 158 35.9127444041405 43.0872555958595 -7.17451119171902 A:G G A 10 0.545408298681766 0.26386780014249 ENSG00000168439:ENST00000358794:exon_63970597_63970700:STIP1;ENSG00000168439:ENST00000305218:exon_63970597_63970700:STIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 63979162 C/T 1 134 79 213 60.9152879766434 43.0872555958595 17.8280323807838 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0158499650962822 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63979117_63979219:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63979117_63979219:FERMT3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 63993287 C/T 1 13 13 26 5.90969211713704 7.09030788286296 -1.18061576572592 T:C C T 10 0.545408298681766 0.696154695081167 ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63993258_63993341:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63993258_63993341:TRPT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 69 68 137 31.3668273909581 37.0877643103601 -5.72093691940194 T:C T C 10 0.545408298681766 0.345782363855224 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 64799998 T/C 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 T:C T C 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000525648:exon_64799903_64800023:SNX15 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 64877197 C/T 1 107 106 213 48.641312041051 57.8132796602672 -9.17196761921615 T:C C T 10 0.545408298681766 0.21585009656614 ENSG00000149823:ENST00000279281:exon_64877177_64877395:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000527646:exon_64877177_64877395:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000531146:exon_64877177_64877329:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000533827:exon_64877177_64877395:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000534591:exon_64877177_64878075:C11orf2;ENSG00000149823:ENST00000526856:exon_64877177_64877395:C11orf2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 64880743 C/T 1 20 17 37 9.09183402636468 9.27194107759002 -0.180107051225342 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000524986:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64880283_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000345348:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529414:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000524690:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530892:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531029:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527851:exon_64880211_64881066:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534667:exon_64880686_64880886:TM7SF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 64893365 T/A 1 46 31 77 20.9112182606388 16.9076572591347 4.00356100150402 A:T T A 10 0.545408298681766 0.423295401941039 ENSG00000149792:ENST00000524482:exon_64893198_64894828:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000528529:exon_64893198_64893774:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000534078:exon_64893198_64893476:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000526319:exon_64893198_64893414:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000279242:exon_64893198_64894843:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000533943:exon_64893198_64893650:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000532671:exon_64893198_64894835:MRPL49 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 64 39 103 29.093868884367 21.2709236485889 7.8229452357781 T:C C T 10 0.545408298681766 0.137655826877860 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 65161525 G/A 1 7 10 17 3.18214190922764 5.45408298681766 -2.27194107759002 A:G G A 10 0.545408298681766 0.332347257730029 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65161512_65161570:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000526201:exon_65161512_65161570:FRMD8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 65164357 C/T 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65164270_65164408:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000531151:exon_65164270_65164491:FRMD8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 65271832 C/T 1 185 163 348 84.0994647438733 88.9015526851279 -4.80208794125456 T:C C T 10 0.545408298681766 0.628173584738071 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 65338034 A/G 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:G A G 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65337931_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527920:exon_65337956_65338226:SSSCA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 60 33 93 27.275502079094 17.9984738564983 9.27702822259576 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0605588821751375 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 65384727 C/T 1 12 2 14 5.45510041581881 1.09081659736353 4.36428381845528 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0281542292726246 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65384721_65384820:PCNXL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 65386206 C/G 1 12 9 21 5.45510041581881 4.90867468813589 0.546425727682915 A:C:G C G 10 0.545408298681766 0.831119559812142 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65385411_65386538:PCNXL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 65387012 C/T 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387008_65387131:PCNXL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 65392695 C/T 1 10 6 16 4.54591701318234 3.2724497920906 1.27346722109174 T:C C T 10 0.545408298681766 0.62020159802431 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65392642_65392751:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000530174:exon_65392598_65392751:PCNXL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 65546857 A/C 1 9 2 11 4.09132531186411 1.09081659736353 3.00050871450057 A:C A C 10 0.545408298681766 0.0774548990144863 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 65547333 G/A 1 11 4 15 5.00050871450057 2.18163319472706 2.81887551977351 A:G G A 10 0.545408298681766 0.195702635515563 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 65623739 A/G 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 A:G A G 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172803:ENST00000530101:exon_65623600_65624367:SNX32 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 65649984 T/C 1 1 7 8 0.454591701318234 3.81785809077236 -3.36326638945413 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0271590031820889 ENSG00000172543:ENST00000307886:exon_65649901_65649997:CTSW;ENSG00000172543:ENST00000528419:exon_65649901_65649997:CTSW;ENSG00000172543:ENST00000526034:exon_65649901_65649997:CTSW HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 65826704 G/A 1 231 198 429 105.010683004512 107.99084313899 -2.9801601344776 A:G G A 10 0.545408298681766 0.77141382612363 ENSG00000087365:ENST00000528302:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000322535:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000355456:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000529994:exon_65826672_65826809:SF3B2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 66031660 C/T 1 21 23 44 9.54642572768291 12.5443908696806 -2.9979651419977 T:C C T 10 0.545408298681766 0.368660718109055 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031517_66031690:KLC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 66105194 G/A 1 46 43 89 20.9112182606388 23.4525568433159 -2.54133858267717 A:G G A 10 0.545408298681766 0.596272186342166 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66104804_66105278:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66104840_66105360:BRMS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 66260623 G/A 1 17 23 40 7.72805892240998 12.5443908696806 -4.81633194727064 A:G G A 10 0.545408298681766 0.152697094851348 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66260538_66260650:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66260538_66260650:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66260538_66260650:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66260538_66260650:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66260538_66260650:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526250:exon_66260538_66260650:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533799:exon_66260538_66260650:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000525738:exon_66260538_66260650:DPP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 66276576 G/A 1 31 39 70 14.0923427408653 21.2709236485889 -7.17858090772362 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0931366183732562 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66276550_66277021:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66276550_66277128:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66276550_66277130:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66276550_66277130:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66276550_66276816:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66276550_66277127:DPP3;ENSG00000174483:ENST00000419755:exon_66276546_66276785:BBS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 67351297 G/A 1 454 205 659 206.384632398478 111.808701229762 94.5759311687162 A:T:G G A 10 0.545408298681766 7.1722462834164e-14 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67351066_67351315:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67351213_67351315:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351293_67351315:GSTP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 67351585 C/G 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 C:G C G 10 0.545408298681766 0.52782144426649 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 1066 679 1745 484.594753605237 370.332234804919 114.262518800318 A:G A G 10 0.545408298681766 3.55039503393944e-08 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 1354 983 2337 615.517163584889 536.136357604176 79.3808059807129 A:T:C:G T C 10 0.545408298681766 0.000956067962289973 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 15 18 33 6.81887551977351 9.81734937627179 -2.99847385649828 T:C C T 10 0.545408298681766 0.300665631885240 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 67816463 G/C 1 72 64 136 32.7306024949129 34.906131115633 -2.17552862072017 C:G G C 10 0.545408298681766 0.73096716623693 ENSG00000110719:ENST00000265686:exon_67816346_67816464:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000532635:exon_67816346_67816464:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000525724:exon_67816346_67816464:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000533005:exon_67816346_67816464:TCIRG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 68704028 C/T 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 T:C C T 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 33 45 78 15.0015261435017 24.5433734406795 -9.54184729717775 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0311002366292617 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 71175192 A/T 1 4 60 64 1.81836680527294 32.724497920906 -30.906131115633 A:T A T 10 0.545408298681766 1.84445232397775e-16 ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71175099_71175554:NADSYN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 71507205 C/T 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000158483:ENST00000346333:exon_71507063_71507212:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000526393:exon_71507063_71507986:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000426628:exon_71507063_71507212:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000416039:exon_71507063_71507281:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000510443:exon_71507063_71507212:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000359244:exon_71507063_71507212:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000528685:exon_71507063_71507354:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000393714:exon_71507063_71507354:FAM86C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 71726785 A/G 1 39 48 87 17.7290763514111 26.1795983367248 -8.45052198531364 A:G A G 10 0.545408298681766 0.084392244173615 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71723941_71727306:NUMA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 71941033 G/C 1 44 29 73 20.0020348580023 15.8168406617712 4.18519419623108 C:G G C 10 0.545408298681766 0.3487598082247 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71940968_71941063:INPPL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 72397200 C/T 1 38 34 72 17.2744846500929 18.54388215518 -1.26939750508715 T:C C T 10 0.545408298681766 0.81327802608365 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72397087_72397236:ARAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 72415329 G/A 1 13 6 19 5.90969211713704 3.2724497920906 2.63724232504645 A:G G A 10 0.545408298681766 0.25633390279836 ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72415197_72415379:ARAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 73120653 A/G 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000054965:ENST00000064778:exon_73120532_73120706:FAM168A;ENSG00000054965:ENST00000356467:exon_73120532_73120706:FAM168A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 80 89 169 36.3673361054587 48.5413385826772 -12.1740024772185 A:G G A 10 0.545408298681766 0.063790459631547 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 73915481 T/C 1 12 16 28 5.45510041581881 8.72653277890826 -3.27143236308945 T:C T C 10 0.545408298681766 0.255841661593369 ENSG00000214517:ENST00000398427:exon_73915398_73915490:PPME1;ENSG00000214517:ENST00000328257:exon_73915398_73915490:PPME1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 15 18 33 6.81887551977351 9.81734937627179 -2.99847385649828 T:C T C 10 0.545408298681766 0.300665631885240 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 77378388 T/C 1 16 11 27 7.27346722109174 5.99949128549943 1.27397593559232 T:C T C 10 0.545408298681766 0.701415732858495 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 77378505 A/G 1 27 18 45 12.2739759355923 9.81734937627179 2.45662655932053 A:G A G 10 0.545408298681766 0.549931162252618 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 77409568 T/C 1 8 18 26 3.63673361054587 9.81734937627179 -6.18061576572592 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0175300447010677 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531026:exon_77409532_77409573:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531768:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000532556:exon_77409532_77409738:RSF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 3 15 18 1.3637751039547 8.18112448022649 -6.81734937627179 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00142745849794577 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 77583266 G/A 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 A:G G A 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 77825320 T/C 1 7 15 22 3.18214190922764 8.18112448022649 -4.99898257099885 T:C T C 10 0.545408298681766 0.051425600821252 ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532306:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77825312_77825422:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530454:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525870:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532050:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000527099:exon_77825312_77825438:ALG8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 77920863 C/A 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 A:C C A 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 T:C C T 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 78279790 T/G 1 9 10 19 4.09132531186411 5.45408298681766 -1.36275767495355 T:G T G 10 0.545408298681766 0.646488798036141 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000526709:exon_78279761_78279798:NARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 82535963 C/T 1 49 50 99 22.2749933645935 27.2704149340883 -4.99542156949483 T:C C T 10 0.545408298681766 0.315067502006245 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82534544_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532767:exon_82535409_82542480:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82535410_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82535415_82536164:PRCP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 82643625 T/C 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 82644764 C/G 1 11 13 24 5.00050871450057 7.09030788286296 -2.08979916836238 C:G C G 10 0.545408298681766 0.418235923516124 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 13 13 26 5.90969211713704 7.09030788286296 -1.18061576572592 A:G G A 10 0.545408298681766 0.696154695081167 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 26 17 43 11.8193842342741 9.27194107759002 2.54744315668406 T:G G T 10 0.545408298681766 0.449297848654812 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 92895920 T/C 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:C T C 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000180773:ENST00000326402:exon_92895872_92896041:SLC36A4;ENSG00000180773:ENST00000529184:exon_92895872_92896041:SLC36A4;ENSG00000180773:ENST00000526735:exon_92895872_92896041:SLC36A4;ENSG00000180773:ENST00000534116:exon_92895872_92896041:SLC36A4;ENSG00000180773:ENST00000331527:exon_92895872_92896041:SLC36A4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 32 26 58 14.5469344421835 14.1806157657259 0.366318676457572 A:C A C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 93913036 A/G 1 9 2 11 4.09132531186411 1.09081659736353 3.00050871450057 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0774548990144863 ENSG00000110218:ENST00000227638:exon_93912768_93913423:PANX1;ENSG00000110218:ENST00000436171:exon_93912768_93913423:PANX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 31 25 56 14.0923427408653 13.6352074670442 0.457135273821104 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 94862577 G/T 1 11 15 26 5.00050871450057 8.18112448022649 -3.18061576572592 T:G G T 10 0.545408298681766 0.239917577897468 ENSG00000149218:ENST00000278505:exon_94861541_94865815:ENDOD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 95512060 A/G 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 A:G A G 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000077458:ENST00000358780:exon_95511986_95512121:FAM76B;ENSG00000077458:ENST00000398187:exon_95511986_95512121:FAM76B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 95712897 G/T 1 11 11 22 5.00050871450057 5.99949128549943 -0.998982570998852 T:G G T 10 0.545408298681766 0.675286531050552 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95709762_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95711440_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95712112_95713127:MAML2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 104900488 G/A 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 A:G G A 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000137752:ENST00000532439:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000526568:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000527979:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000533400:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000436863:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000415981:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000393136:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000446369:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000525825:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000534497:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000529871:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000528974:exon_104900392_104900626:CASP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 105880309 C/T 1 9 17 26 4.09132531186411 9.27194107759002 -5.18061576572592 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0487303373374218 ENSG00000170903:ENST00000301919:exon_105878629_105880837:KIAA1826 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 19 20 39 8.63724232504645 10.9081659736353 -2.27092364858887 C:G G C 10 0.545408298681766 0.521400139870112 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 107299623 A/C 1 15 10 25 6.81887551977351 5.45408298681766 1.36479253295585 A:C A C 10 0.545408298681766 0.689530950640826 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 107992346 G/C 1 10 11 21 4.54591701318234 5.99949128549943 -1.45357427231709 C:G G C 10 0.545408298681766 0.662270617460159 ENSG00000075239:ENST00000265838:exon_107992243_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000524833:exon_107992294_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000299355:exon_107992294_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000531813:exon_107992311_107992405:ACAT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 108043988 C/T 1 12 11 23 5.45510041581881 5.99949128549943 -0.544390869680617 T:C C T 10 0.545408298681766 0.837052105141715 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000533535:exon_108041859_108044578:NPAT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 108163487 C/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C C T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000149311:ENST00000278616:exon_108163346_108163520:ATM;ENSG00000149311:ENST00000299392:exon_108163346_108163520:ATM;ENSG00000149311:ENST00000452508:exon_108163346_108163520:ATM;ENSG00000149311:ENST00000524792:exon_108163346_108163520:ATM HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 110035262 A/G 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000149289:ENST00000278590:exon_110035066_110042566:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000528673:exon_110035066_110036659:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000453089:exon_110035066_110042564:ZC3H12C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 10 13 23 4.54591701318234 7.09030788286296 -2.54439086968062 T:C C T 10 0.545408298681766 0.302592597377063 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 111747297 A/G 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527377:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111747205_111747363:AP001781.3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 115 81 196 52.2780456515969 44.178072193223 8.09997345837387 A:C A C 10 0.545408298681766 0.251946067275481 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 111896324 C/T 1 9 12 21 4.09132531186411 6.54489958418119 -2.45357427231709 T:C C T 10 0.545408298681766 0.381262320809038 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111896320_111896475:DLAT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 24 14 38 10.9102008316376 7.63571618154472 3.27448465009289 T:C T C 10 0.545408298681766 0.330119381885145 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 111916647 G/A 1 17 11 28 7.72805892240998 5.99949128549943 1.72856763691055 A:G G A 10 0.545408298681766 0.572612553515050 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111916587_111916694:DLAT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 113186968 T/G 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 T:G T G 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000149292:ENST00000529221:exon_113186965_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000429951:exon_113186673_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000442859:exon_113186965_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000529850:exon_113186965_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000436332:exon_113186965_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000314756:exon_113186965_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000278593:exon_113186965_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000504025:exon_113186965_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000520742:exon_113186965_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000525965:exon_113186965_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000464224:exon_113186965_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000494714:exon_113186965_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000393020:exon_113186965_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000455306:exon_113186965_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000489064:exon_113186965_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000527781:exon_113186963_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000483239:exon_113186963_113187037:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000524580:exon_113186965_113187037:TTC12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 113194168 A/C 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 A:C A C 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000149292:ENST00000529221:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000429951:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000442859:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000531164:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000529850:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000436332:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000314756:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000278593:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000504025:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000520742:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000525965:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000464224:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000494714:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000393020:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000455306:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000489064:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000527781:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000483239:exon_113194010_113194173:TTC12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 21 23 44 9.54642572768291 12.5443908696806 -2.9979651419977 A:G A G 10 0.545408298681766 0.368660718109055 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 117096652 G/A 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 A:G G A 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117096647_117096737:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117095417_117097592:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117096647_117096737:PCSK7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 117097952 C/T 1 12 5 17 5.45510041581881 2.72704149340883 2.72805892240998 T:C C T 10 0.545408298681766 0.227116627671435 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117097873_117098038:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117097873_117098038:PCSK7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 118404804 G/A 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000149582:ENST00000411589:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000442938:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000359862:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526465:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000354284:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000532762:exon_118404744_118404835:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526973:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000354064:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000533627:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000533102:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000524522:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000313236:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000524725:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526853:exon_118404744_118404844:TMEM25 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 120350819 A/G 1 8 12 20 3.63673361054587 6.54489958418119 -2.90816597363532 A:G A G 10 0.545408298681766 0.261293206047355 ENSG00000196914:ENST00000397843:exon_120350669_120351139:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000356641:exon_120350669_120351139:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000532993:exon_120350669_120351139:ARHGEF12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 39 43 82 17.7290763514111 23.4525568433159 -5.72348049190481 T:C T C 10 0.545408298681766 0.223032217136848 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 27 20 47 12.2739759355923 10.9081659736353 1.365809961957 A:T T A 10 0.545408298681766 0.770232276057536 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 126176578 G/A 1 34 33 67 15.45611784482 17.9984738564983 -2.54235601167832 A:G G A 10 0.545408298681766 0.542038869542138 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126176465_126176639:DCPS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 40 31 71 18.1836680527294 16.9076572591347 1.27601079359462 T:C T C 10 0.545408298681766 0.81219370347863 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 130010313 G/A 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 A:G G A 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000084234:ENST00000533616:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000528499:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000263574:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000345598:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000338167:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000278756:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000533860:exon_130010293_130010378:APLP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 11 130784574 C/T 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 406292 G/A 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 A:G G A 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 427575 A/G 1 9 11 20 4.09132531186411 5.99949128549943 -1.90816597363532 A:G A G 10 0.545408298681766 0.501718810318948 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 547683 T/C 1 12 12 24 5.45510041581881 6.54489958418119 -1.08979916836238 T:C T C 10 0.545408298681766 0.686028395996258 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_547501_547720:CCDC77 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 862989 T/C 1 17 19 36 7.72805892240998 10.3627576749536 -2.63469875254358 T:C T C 10 0.545408298681766 0.405871052078179 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_862089_863490:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_862225_863490:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000447667:exon_862225_863490:WNK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 863505 A/C 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 A:C A C 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 939302 A/G 1 20 11 31 9.09183402636468 5.99949128549943 3.09234274086525 A:G A G 10 0.545408298681766 0.284898217962211 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_939169_939326:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_939169_939326:WNK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 998338 A/G 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 A:G A G 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_998306_998389:WNK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 998365 G/T 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 T:G G T 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_998306_998389:WNK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 1022569 A/C 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 A:C A C 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000002016:ENST00000358495:exon_1021243_1022618:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000228345:exon_1021255_1022618:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000430095:exon_1021255_1022618:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000468231:exon_1021655_1022618:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000481052:exon_1021661_1022618:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000488642:exon_1021924_1022618:RAD52 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 1863449 A/T 1 22 19 41 10.0010174290011 10.3627576749536 -0.361740245952406 A:T:C A T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1863424_1863680:ADIPOR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 34 39 73 15.45611784482 21.2709236485889 -5.81480580376892 A:G A G 10 0.545408298681766 0.196059045517026 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 2973615 T/C 1 7 12 19 3.18214190922764 6.54489958418119 -3.36275767495355 T:C T C 10 0.545408298681766 0.165845385921528 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 3782647 A/T 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 A:T A T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3782612_3782758:EFCAB4B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 3782701 C/T 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3782612_3782758:EFCAB4B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 3788260 G/A 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 A:G G A 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3788081_3788264:EFCAB4B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 3789452 C/T 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3789404_3789515:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3789404_3789515:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3789404_3789515:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3789404_3789515:EFCAB4B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 4388084 C/G 1 51 34 85 23.1841767672299 18.54388215518 4.64029461204989 C:G C G 10 0.545408298681766 0.328724205584998 ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4387926_4388085:CCND2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 31 24 55 14.0923427408653 13.0897991683624 1.00254357250287 A:G G A 10 0.545408298681766 0.892461297916145 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 4662210 T/C 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 T:C T C 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000111247:ENST00000321524:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000352618:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000228843:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000442992:exon_4662149_4662313:RAD51AP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 6450945 T/C 1 15 19 34 6.81887551977351 10.3627576749536 -3.54388215518004 T:C T C 10 0.545408298681766 0.232628088714879 ENSG00000067182:ENST00000162749:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A;ENSG00000067182:ENST00000440083:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 17 11 28 7.72805892240998 5.99949128549943 1.72856763691055 A:G A G 10 0.545408298681766 0.572612553515050 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 19 13 32 8.63724232504645 7.09030788286296 1.54693444218349 A:C:G A G 10 0.545408298681766 0.600606398401896 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 43 35 78 19.5474431566841 19.0892904538618 0.45815270282225 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 40 56 96 18.1836680527294 30.5428647261789 -12.3591966734495 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0135511071351666 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 6639981 C/G 1 99 87 186 45.0045784305052 47.4505219853136 -2.44594355480847 C:G C G 10 0.545408298681766 0.768456956292067 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6639857_6639983:NCAPD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 6640519 G/A 1 165 174 339 75.0076307175086 94.9010439706273 -19.8934132531187 A:C:G G A 10 0.545408298681766 0.03328360054411 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6640493_6641120:NCAPD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 6643991 C/G 1 4493 3424 7917 2042.48051402283 1867.47801468637 175.002499336459 A:T:C:G C G 10 0.545408298681766 7.80148790258745e-05 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000496049:exon_6643976_6644307:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6643976_6644157:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6643958_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6643985_6644027:GAPDH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4335 3112 7447 1970.65502521454 1697.31062549766 273.344399716889 A:T:C:G T C 10 0.545408298681766 1.91789063046848e-10 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 4514 3403 7917 2052.02693975051 1856.02444041405 196.002499336459 T:C:G T C 10 0.545408298681766 9.6580147585978e-06 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 6690909 C/T 1 107 112 219 48.641312041051 61.0857294523578 -12.4444174113068 T:C C T 10 0.545408298681766 0.103203766471425 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6690815_6690980:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6690815_6690980:CHD4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 6858126 G/A 1 135 72 207 61.3698796779616 39.2693975050871 22.1004821728744 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00207807109612796 ENSG00000089693:ENST00000435120:exon_6857936_6858148:MLF2;ENSG00000089693:ENST00000203630:exon_6857936_6858148:MLF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 55 50 105 25.0025435725029 27.2704149340883 -2.26787136158543 A:G A G 10 0.545408298681766 0.69545997831797 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 A:T T A 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 5 10 15 2.27295850659117 5.45408298681766 -3.18112448022649 A:G A G 10 0.545408298681766 0.121647049471624 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 7045160 G/C 1 24 18 42 10.9102008316376 9.81734937627179 1.09285145536583 C:G G C 10 0.545408298681766 0.759328842149155 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7044710_7046724:ATN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 7077036 C/A 1 17 18 35 7.72805892240998 9.81734937627179 -2.08929045386181 A:C C A 10 0.545408298681766 0.501106521181595 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 7252337 G/T 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 T:G G T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000139178:ENST00000266542:exon_7252282_7252356:C1RL;ENSG00000139178:ENST00000396661:exon_7252282_7252356:C1RL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 9094548 A/G 1 15 15 30 6.81887551977351 8.18112448022649 -1.36224896045298 A:G A G 10 0.545408298681766 0.714695541216207 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 9833524 C/G 1 61 48 109 27.7300937804123 26.1795983367248 1.55049544368751 C:G C G 10 0.545408298681766 0.774072396275743 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 124 104 228 56.369370963461 56.7224630629037 -0.353092099442648 A:T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 10999708 T/C 1 14 6 20 6.36428381845528 3.2724497920906 3.09183402636468 T:C T C 10 0.545408298681766 0.184468819237692 ENSG00000111215:ENST00000228811:exon_10999644_10999966:PRR4;ENSG00000111215:ENST00000431566:exon_10999640_10999909:PRR4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 11091432 C/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C C T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000212127:ENST00000390676:exon_11090853_11091806:TAS2R14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 15103605 A/G 1 361 1571 1932 164.107604175882 856.836437229054 -692.728833053172 A:G A G 10 0.545408298681766 5.84980897286235e-231 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15103466_15103658:ARHGDIB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 16516994 G/A 1 282 309 591 128.194859771742 168.531164292666 -40.3363045209237 A:G G A 10 0.545408298681766 0.000938997769921786 ENSG00000008394:ENST00000010404:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396210:exon_16516729_16517342:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396209:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396207:exon_16516729_16517343:MGST1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 26 28 54 11.8193842342741 15.2714323630894 -3.45204812881536 T:G T G 10 0.545408298681766 0.412513350579577 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 21654831 G/T 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:G G T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000111711:ENST00000229314:exon_21654699_21654882:GOLT1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 71 57 128 32.2760107935946 31.0882730248607 1.18773776873395 T:C C T 10 0.545408298681766 0.859472198205718 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 22602796 A/G 1 20 19 39 9.09183402636468 10.3627576749536 -1.27092364858887 A:G A G 10 0.545408298681766 0.748656616025534 ENSG00000111731:ENST00000333957:exon_22601541_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000446597:exon_22602479_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000396028:exon_22602479_22602825:KIAA0528 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 22670964 T/A 1 7 1 8 3.18214190922764 0.545408298681766 2.63673361054587 A:T T A 10 0.545408298681766 0.0793702040361015 ENSG00000111731:ENST00000333957:exon_22670920_22671071:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000446597:exon_22670920_22671071:KIAA0528 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 22680809 T/C 1 9 10 19 4.09132531186411 5.45408298681766 -1.36275767495355 T:C T C 10 0.545408298681766 0.646488798036141 ENSG00000111731:ENST00000333957:exon_22680655_22680826:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000446597:exon_22680655_22680826:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000396028:exon_22680655_22680826:KIAA0528 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 26784850 G/A 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 A:G G A 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26784799_26784992:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26784799_26784992:ITPR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 26809316 G/A 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 A:G G A 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26809230_26809481:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26809230_26809481:ITPR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 26810816 T/G 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26810640_26810825:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26810640_26810825:ITPR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 27064232 C/T 1 65 56 121 29.5484605856852 30.5428647261789 -0.994404140493685 T:C C T 10 0.545408298681766 0.85572914992704 ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27064111_27064250:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27064111_27064250:C12orf11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 27143508 G/A 1 17 14 31 7.72805892240998 7.63571618154472 0.0923427408652548 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000064115:ENST00000343028:exon_27143383_27143560:TM7SF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 27521255 C/T 1 14 10 24 6.36428381845528 5.45408298681766 0.910200831637616 T:C C T 10 0.545408298681766 0.83838234018214 ENSG00000029153:ENST00000261178:exon_27521195_27521345:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000266503:exon_27521195_27521345:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000311001:exon_27521195_27521345:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000457040:exon_27521195_27521345:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000395901:exon_27521195_27521345:ARNTL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 28603112 A/G 1 10 23 33 4.54591701318234 12.5443908696806 -7.99847385649828 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0077254296795093 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28603094_28603186:CCDC91 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 29486745 T/C 1 10 8 18 4.54591701318234 4.36326638945413 0.182650623728212 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 30809648 T/C 1 5 9 14 2.27295850659117 4.90867468813589 -2.63571618154472 T:C T C 10 0.545408298681766 0.185085810189955 ENSG00000133704:ENST00000256079:exon_30809618_30809684:IPO8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 30868002 C/T 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 T:C C T 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000110888:ENST00000298892:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000251071:exon_30867893_30868078:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000433722:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000308433:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000438006:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000454014:exon_30867893_30868078:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000417045:exon_30867893_30868075:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000395805:exon_30867893_30868015:CAPRIN2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 30881809 T/C 1 3 10 13 1.3637751039547 5.45408298681766 -4.09030788286296 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0265238704491956 ENSG00000110888:ENST00000298892:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000251071:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000433722:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000308433:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000438006:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000454014:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000417045:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000395805:exon_30881582_30882259:CAPRIN2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 31249861 C/G 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 C:G C G 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31249793_31249924:DDX11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 31253995 C/T 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31253961_31254064:DDX11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 31604928 G/C 1 21 41 62 9.54642572768291 22.3617402459524 -12.8153145182695 C:G G C 10 0.545408298681766 0.00128006745106155 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 31605044 G/T 1 27 22 49 12.2739759355923 11.9989825709989 0.274993364593467 T:G G T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 31944985 T/G 0 14 0 14 6.36428381845528 0 6.36428381845528 T T 10 0.545408298681766 0.000222207897951029 ENSG00000188375:ENST00000340398:exon_31944119_31945175:H3F3C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 32134207 C/A 1 15 16 31 6.81887551977351 8.72653277890826 -1.90765725913475 A:C C A 10 0.545408298681766 0.589254202403613 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 32134815 G/A 1 12 14 26 5.45510041581881 7.63571618154472 -2.18061576572592 A:G G A 10 0.545408298681766 0.434248996287525 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 32134943 A/G 1 24 12 36 10.9102008316376 6.54489958418119 4.36530124745643 A:G A G 10 0.545408298681766 0.180371600954516 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 32135186 T/A 1 31 21 52 14.0923427408653 11.4535742723171 2.63876846854817 A:T T A 10 0.545408298681766 0.489297497349205 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 32137565 G/A 1 54 33 87 24.5479518711846 17.9984738564983 6.54947801468636 A:G G A 10 0.545408298681766 0.163374568132565 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 32137852 C/G 1 68 62 130 30.9122356896399 33.8153145182695 -2.90307882862957 A:C:G C G 10 0.545408298681766 0.659859129219531 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 32854366 A/C 1 12 18 30 5.45510041581881 9.81734937627179 -4.36224896045298 A:C A C 10 0.545408298681766 0.141575029470383 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32854349_32854496:DNM1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 32860302 G/A 1 11 18 29 5.00050871450057 9.81734937627179 -4.81684066177121 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0922890718008582 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32860301_32860347:DNM1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 32875406 A/G 1 12 20 32 5.45510041581881 10.9081659736353 -5.45306555781651 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0742248918341754 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32875361_32875567:DNM1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 32896365 G/C 1 34 31 65 15.45611784482 16.9076572591347 -1.45153941431479 C:G G C 10 0.545408298681766 0.803513334458848 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 32896366 A/T 1 32 31 63 14.5469344421835 16.9076572591347 -2.36072281695126 A:T A T 10 0.545408298681766 0.613276770356751 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 32908237 C/A 1 21 20 41 9.54642572768291 10.9081659736353 -1.36174024595241 A:T:C C A 10 0.545408298681766 0.754330123216359 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 32908518 G/A 1 19 34 53 8.63724232504645 18.54388215518 -9.9066398301336 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00819778980451866 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 38715000 A/G 1 9 1 10 4.09132531186411 0.545408298681766 3.54591701318234 A:G A G 10 0.545408298681766 0.026642084489569 ENSG00000175548:ENST00000308742:exon_38713963_38723527:ALG10B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 40758652 T/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C T C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40758644_40763087:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40758644_40758935:LRRK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 42554505 A/G 1 32 20 52 14.5469344421835 10.9081659736353 3.63876846854817 A:G A G 10 0.545408298681766 0.332588533234256 ENSG00000015153:ENST00000327791:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000380790:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000442791:exon_42552837_42554628:YAF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 46320421 G/A 1 85 92 177 38.6402946120499 50.1775634787225 -11.5372688666726 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0830235158168577 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 48 35 83 21.8204016632752 19.0892904538618 2.73111120941342 A:T A T 10 0.545408298681766 0.582699062467623 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 46322449 C/T 1 42 31 73 19.0928514553658 16.9076572591347 2.18519419623108 T:C C T 10 0.545408298681766 0.639743736942244 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 48539482 T/G 1 66 70 136 30.0030522870034 38.1785809077236 -8.17552862072018 T:G T G 10 0.545408298681766 0.168654993937617 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000312352:exon_48539347_48539488:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000443538:exon_48539347_48539887:PFKM HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 57 59 116 25.9117269751393 32.1790896222242 -6.26736264708486 T:G T G 10 0.545408298681766 0.263482474755471 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 49424534 G/A 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49424384_49424551:MLL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 49495321 C/A 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 A:C C A 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000139636:ENST00000417750:exon_49495255_49495332:LMBR1L;ENSG00000139636:ENST00000267102:exon_49495255_49495332:LMBR1L;ENSG00000139636:ENST00000395141:exon_49495255_49495332:LMBR1L;ENSG00000139636:ENST00000451245:exon_49495255_49495332:LMBR1L;ENSG00000139636:ENST00000457164:exon_49495255_49495332:LMBR1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 49888776 G/A 1 21 23 44 9.54642572768291 12.5443908696806 -2.9979651419977 A:G G A 10 0.545408298681766 0.368660718109055 ENSG00000123352:ENST00000321898:exon_49888524_49888785:SPATS2;ENSG00000123352:ENST00000447889:exon_49888524_49888785:SPATS2;ENSG00000123352:ENST00000395063:exon_49888524_49888785:SPATS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 50189602 A/G 1 9 5 14 4.09132531186411 2.72704149340883 1.36428381845528 A:G A G 10 0.545408298681766 0.594806597584705 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 50189807 C/A 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 A:C C A 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 50189834 T/G 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 T:G T G 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 50190653 C/T 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 50232169 A/T 1 14 11 25 6.36428381845528 5.99949128549943 0.364792532955851 A:T A T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50231560_50232798:BCDIN3D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 51203371 C/T 1 21 30 51 9.54642572768291 16.362248960453 -6.81582323277007 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0668718993388538 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 51442944 G/A 1 23 18 41 10.4556091303194 9.81734937627179 0.638259754047596 A:G G A 10 0.545408298681766 0.876617208699921 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51442817_51442968:LETMD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 51681903 T/C 1 18 16 34 8.18265062372821 8.72653277890826 -0.543882155180043 T:C T C 10 0.545408298681766 0.864915346461896 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51681892_51681972:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51681892_51681972:BIN2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 51685831 T/C 1 30 18 48 13.637751039547 9.81734937627179 3.82040166327523 T:C T C 10 0.545408298681766 0.311176669161335 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 51696500 G/A 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 A:G G A 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51696470_51696564:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51696470_51696564:BIN2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 51707626 C/T 1 11 14 25 5.00050871450057 7.63571618154472 -2.63520746704415 T:C C T 10 0.545408298681766 0.319613639852798 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51707607_51707687:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51707607_51707687:BIN2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 52467406 A/G 1 19 21 40 8.63724232504645 11.4535742723171 -2.81633194727064 A:G A G 10 0.545408298681766 0.428137170927263 ENSG00000123395:ENST00000433776:exon_52467359_52467686:C12orf44;ENSG00000123395:ENST00000336854:exon_52467359_52467686:C12orf44 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 52470979 C/T 1 39 33 72 17.7290763514111 17.9984738564983 -0.269397505087152 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000123395:ENST00000433776:exon_52470570_52471278:C12orf44;ENSG00000123395:ENST00000336854:exon_52470570_52471278:C12orf44 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 53590347 C/T 1 12 4 16 5.45510041581881 2.18163319472706 3.27346722109174 T:C C T 10 0.545408298681766 0.132245501357764 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 16 18 34 7.27346722109174 9.81734937627179 -2.54388215518004 T:C T C 10 0.545408298681766 0.394439936472409 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 53662624 C/A 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 A:C C A 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53662539_53662631:ESPL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 15 12 27 6.81887551977351 6.54489958418119 0.273975935592318 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 53682457 G/A 1 15 10 25 6.81887551977351 5.45408298681766 1.36479253295585 A:G G A 10 0.545408298681766 0.689530950640826 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 53682986 C/T 1 14 14 28 6.36428381845528 7.63571618154472 -1.27143236308945 T:C C T 10 0.545408298681766 0.70569768807638 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682874_53683087:ESPL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 54110197 A/G 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 A:G A G 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54110044_54110199:CALCOCO1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 31 42 73 14.0923427408653 22.9071485446342 -8.81480580376892 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0452033029984643 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 54675113 G/A 1 14 16 30 6.36428381845528 8.72653277890826 -2.36224896045298 A:G G A 10 0.545408298681766 0.464241697645823 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 55368188 T/C 1 12 9 21 5.45510041581881 4.90867468813589 0.546425727682915 T:C T C 10 0.545408298681766 0.831119559812142 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 55368245 G/A 1 5 9 14 2.27295850659117 4.90867468813589 -2.63571618154472 A:G G A 10 0.545408298681766 0.185085810189955 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 55368368 G/A 1 18 24 42 8.18265062372821 13.0897991683624 -4.90714854463417 A:G G A 10 0.545408298681766 0.162473143356235 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 55806134 T/C 0 13 0 13 5.90969211713704 0 5.90969211713704 T T 10 0.545408298681766 0.000413311221647668 ENSG00000179899:ENST00000326184:exon_55805506_55808295:PHC1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 55806238 A/G 0 15 0 15 6.81887551977351 0 6.81887551977351 A A 10 0.545408298681766 0.000119732304563585 ENSG00000179899:ENST00000326184:exon_55805506_55808295:PHC1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 56743044 G/A 1 20 24 44 9.09183402636468 13.0897991683624 -3.9979651419977 A:G G A 10 0.545408298681766 0.230305834018183 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56742947_56743045:STAT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 25 32 57 11.3647925329558 17.4530655578165 -6.08827302486066 A:G G A 10 0.545408298681766 0.111725870800005 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 33 17 50 15.0015261435017 9.27194107759002 5.7295850659117 T:C C T 10 0.545408298681766 0.118522074207983 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 56822378 T/A 1 18 14 32 8.18265062372821 7.63571618154472 0.546934442183489 A:T T A 10 0.545408298681766 0.861580977164548 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 56825311 C/T 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 T:C C T 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56825255_56825388:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56825255_56825388:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56825255_56825388:TIMELESS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 56827694 C/G 1 8 20 28 3.63673361054587 10.9081659736353 -7.27143236308945 C:G C G 10 0.545408298681766 0.00711370724229827 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56827557_56827710:TIMELESS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 57106660 A/T 1 3608 2992 6600 1640.16685835619 1631.86162965584 8.30522870034451 A:T:C:G A T 10 0.545408298681766 0.84323453936574 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57106570_57106692:NACA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 2731 2410 5141 1241.4899363001 1314.43399982306 -72.9440635229589 A:T:C:G A G 10 0.545408298681766 0.0422767532304044 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 57109931 A/T 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:T A T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57109655_57115243:NACA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 57112637 G/A 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57109655_57115243:NACA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 15 14 29 6.81887551977351 7.63571618154472 -0.816840661771214 T:G T G 10 0.545408298681766 0.852678436276024 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 57499408 G/A 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G G A 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 57649840 C/T 1 10 4 14 4.54591701318234 2.18163319472706 2.36428381845528 T:C C T 10 0.545408298681766 0.284657873718901 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57649773_57649857:R3HDM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 57674246 G/C 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 C:G G C 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57674141_57674313:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57674141_57674313:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57674141_57674313:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57674141_57674313:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57674141_57674313:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57674141_57674313:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57674141_57674313:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57674141_57674313:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57674141_57674313:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57674141_57674313:R3HDM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 57869582 T/C 1 15 3 18 6.81887551977351 1.6362248960453 5.18265062372821 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0163417451705557 ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57869559_57869714:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57869559_57869714:ARHGAP9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 32 53 85 14.5469344421835 28.9066398301336 -14.3597053879501 A:C A C 10 0.545408298681766 0.00213061591541907 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 57910869 T/G 1 43 33 76 19.5474431566841 17.9984738564983 1.54896930018578 T:G T G 10 0.545408298681766 0.731594101793 ENSG00000175197:ENST00000346473:exon_57910373_57910963:DDIT3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 58145156 C/T 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 T:C C T 10 0.545408298681766 0.157468107643023 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 36 25 61 16.3653012474564 13.6352074670442 2.73009378041228 A:G A G 10 0.545408298681766 0.521964132718036 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 20 29 49 9.09183402636468 15.8168406617712 -6.72500663540653 A:T T A 10 0.545408298681766 0.0619322557196894 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 68052178 G/T 1 20 11 31 9.09183402636468 5.99949128549943 3.09234274086525 A:T:C:G G T 10 0.545408298681766 0.284898217962211 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 69 104 173 31.3668273909581 56.7224630629037 -25.3556356719455 A:C:G G A 10 0.545408298681766 0.000123877989374263 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 72164377 G/A 1 27 29 56 12.2739759355923 15.8168406617712 -3.54286472617889 A:G G A 10 0.545408298681766 0.350763608453663 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 72307616 A/G 1 11 6 17 5.00050871450057 3.2724497920906 1.72805892240998 A:G A G 10 0.545408298681766 0.471102205741298 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 75900588 A/G 1 28 27 55 12.7285676369106 14.7260240644077 -1.99745642749713 A:G A G 10 0.545408298681766 0.591361303121694 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75900562_75900696:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75900562_75900696:KRR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 76453966 G/A 1 588 495 1083 267.299920375122 269.977107847474 -2.67718747235256 A:G G A 10 0.545408298681766 0.878767552188632 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76453918_76454059:NAP1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 93175846 A/T 1 4 10 14 1.81836680527294 5.45408298681766 -3.63571618154472 A:T:G A T 10 0.545408298681766 0.061538052903825 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93175726_93175911:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93175726_93175911:EEA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 94673277 G/A 1 12 3 15 5.45510041581881 1.6362248960453 3.81887551977351 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0670236061210686 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94673248_94673425:PLXNC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 94694743 T/C 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94694686_94694833:PLXNC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 94772742 C/T 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 T:C C T 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94772567_94772818:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94772567_94772818:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397807:exon_94772567_94772818:CCDC41 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 95694394 G/A 1 95 80 175 43.1862116252322 43.6326638945413 -0.446452269309049 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95693941_95696566:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95693941_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95692870_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95693941_95694944:VEZT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 98928103 C/T 1 49 41 90 22.2749933645935 22.3617402459524 -0.0867468813589376 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000120802:ENST00000266732:exon_98926601_98928321:TMPO HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 98987778 C/T 1 231 270 501 105.010683004512 147.260240644077 -42.2495576395648 T:C C T 10 0.545408298681766 0.000160570224478697 ENSG00000075415:ENST00000401722:exon_98987753_98987913:SLC25A3;ENSG00000075415:ENST00000228318:exon_98987753_98987913:SLC25A3;ENSG00000075415:ENST00000188376:exon_98987403_98987913:SLC25A3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 99007356 T/C 1 55 54 109 25.0025435725029 29.4520481288154 -4.44950455631249 T:C T C 10 0.545408298681766 0.441767670901353 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 99007623 C/T 1 79 91 170 35.9127444041405 49.6321551800407 -13.7194107759002 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0374685129108299 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 100452564 G/T 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 T:G G T 10 0.545408298681766 0.609212519966719 ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100451807_100453311:UHRF1BP1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 100691876 A/T 1 6 10 16 2.7275502079094 5.45408298681766 -2.72653277890826 A:T A T 10 0.545408298681766 0.211691046173674 ENSG00000136021:ENST00000360820:exon_100691809_100691953:SCYL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 101682749 C/T 1 7 1 8 3.18214190922764 0.545408298681766 2.63673361054587 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0793702040361015 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101682738_101682819:UTP20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 101755809 T/C 1 4 11 15 1.81836680527294 5.99949128549943 -4.18112448022649 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0374068965367827 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101755740_101755838:UTP20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 104327979 C/T 1 670 465 1135 304.576439883217 253.614858887021 50.9615809961956 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.00235804173942104 ENSG00000166598:ENST00000299767:exon_104327734_104328065:HSP90B1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 104341015 T/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C T C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 104341398 T/A 1 4 14 18 1.81836680527294 7.63571618154472 -5.81734937627179 A:T T A 10 0.545408298681766 0.00772425505573054 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 104698582 A/G 1 11 7 18 5.00050871450057 3.81785809077236 1.18265062372821 A:G A G 10 0.545408298681766 0.641965040336765 ENSG00000255150:ENST00000527879:exon_104697517_104698980:EID3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 105380152 A/C 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 A:C A C 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 106633569 C/T 1 10 39 49 4.54591701318234 21.2709236485889 -16.7250066354065 T:C C T 10 0.545408298681766 1.76504629628708e-06 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 12 10 22 5.45510041581881 5.45408298681766 0.00101742900114843 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 107364873 C/T 1 1 10 11 0.454591701318234 5.45408298681766 -4.99949128549943 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00370287780098129 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 109017264 T/C 1 23 18 41 10.4556091303194 9.81734937627179 0.638259754047596 T:C T C 10 0.545408298681766 0.876617208699921 ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109015686_109017663:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 109017266 G/A 1 24 18 42 10.9102008316376 9.81734937627179 1.09285145536583 A:G G A 10 0.545408298681766 0.759328842149155 ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109015686_109017663:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 109182049 T/C 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000084112:ENST00000326495:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000360239:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000303438:exon_109180971_109183020:SSH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 75 57 132 34.0943775988676 31.0882730248607 3.00610457400689 A:T A T 10 0.545408298681766 0.662275076906224 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 T:G G T 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 T:C C T 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 110341933 A/G 1 11 15 26 5.00050871450057 8.18112448022649 -3.18061576572592 A:G A G 10 0.545408298681766 0.239917577897468 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110341742_110341952:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110341742_110341952:TCHP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 110352361 G/A 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 A:G G A 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110352247_110352432:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110352247_110352432:TCHP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 110456175 A/G 1 17 15 32 7.72805892240998 8.18112448022649 -0.453065557816512 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110456150_110456293:ANKRD13A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 110937404 T/C 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 T:C T C 10 0.545408298681766 0.275319682750414 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 110974890 T/C 1 28 22 50 12.7285676369106 11.9989825709989 0.729585065911701 T:C T C 10 0.545408298681766 0.887700129725969 ENSG00000196850:ENST00000354300:exon_110972237_110974900:PPTC7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 111099224 G/A 1 112 117 229 50.9142705476422 63.8127709457666 -12.8985003981244 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0969445026354465 ENSG00000122986:ENST00000356742:exon_111098969_111099253:HVCN1;ENSG00000122986:ENST00000377649:exon_111098969_111099253:HVCN1;ENSG00000122986:ENST00000439744:exon_111099080_111099253:HVCN1;ENSG00000122986:ENST00000242607:exon_111098969_111099253:HVCN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 111993712 C/T 1 7 2 9 3.18214190922764 1.09081659736353 2.09132531186411 T:C C T 10 0.545408298681766 0.19585774268132 ENSG00000204842:ENST00000377617:exon_111993687_111993723:ATXN2;ENSG00000204842:ENST00000389153:exon_111993687_111993723:ATXN2;ENSG00000204842:ENST00000483311:exon_111993687_111993723:ATXN2;ENSG00000204842:ENST00000392645:exon_111993687_111993723:ATXN2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 112187149 C/T 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112186977_112187149:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112186977_112187149:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000504803:exon_112186977_112187573:ACAD10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 112191641 G/A 1 4 10 14 1.81836680527294 5.45408298681766 -3.63571618154472 A:G G A 10 0.545408298681766 0.061538052903825 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000512792:exon_112191511_112191719:ACAD10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 113386779 C/G 1 13 16 29 5.90969211713704 8.72653277890826 -2.81684066177121 C:G C G 10 0.545408298681766 0.352105502963958 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113386666_113387010:OAS3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 113398919 G/A 1 14 14 28 6.36428381845528 7.63571618154472 -1.27143236308945 A:T:G G A 10 0.545408298681766 0.70569768807638 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113398876_113399051:OAS3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 113403684 C/T 1 19 16 35 8.63724232504645 8.72653277890826 -0.0892904538618104 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113403549_113403834:OAS3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 113424893 C/G 1 94 69 163 42.731619923914 37.6331726090418 5.09844731487215 A:C:G C G 10 0.545408298681766 0.432740179752584 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 113533150 C/T 1 17 7 24 7.72805892240998 3.81785809077236 3.91020083163762 T:C C T 10 0.545408298681766 0.150191116982183 ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113533130_113533219:DTX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 113596736 G/A 1 98 80 178 44.5499867291869 43.6326638945413 0.917322834645653 A:G G A 10 0.545408298681766 0.940042781917679 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113594986_113596917:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113594986_113596914:DDX54 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 113722545 C/T 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 T:C C T 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000186815:ENST00000335509:exon_113722523_113722576:TPCN1;ENSG00000186815:ENST00000428632:exon_113722523_113722576:TPCN1;ENSG00000186815:ENST00000392569:exon_113722523_113722576:TPCN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 113737574 G/T 1 7 1 8 3.18214190922764 0.545408298681766 2.63673361054587 T:G G T 10 0.545408298681766 0.0793702040361015 ENSG00000089060:ENST00000202831:exon_113736572_113737779:SLC24A6;ENSG00000089060:ENST00000377458:exon_113736572_113737779:SLC24A6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 113875765 C/A 1 7 1 8 3.18214190922764 0.545408298681766 2.63673361054587 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0793702040361015 ENSG00000139410:ENST00000345635:exon_113875691_113876080:SDSL;ENSG00000139410:ENST00000403593:exon_113875691_113876080:SDSL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 114261053 G/A 1 7 12 19 3.18214190922764 6.54489958418119 -3.36275767495355 A:G G A 10 0.545408298681766 0.165845385921528 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114259863_114261126:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114261014_114261126:RBM19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 T:C C T 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 114377885 G/C 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 C:G G C 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 25 27 52 11.3647925329558 14.7260240644077 -3.36123153145183 T:C T C 10 0.545408298681766 0.403848243759171 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 118682751 C/T 1 24 20 44 10.9102008316376 10.9081659736353 0.00203485800229686 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000135090:ENST00000392533:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000359811:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000419821:exon_118682699_118682770:TAOK3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 120589160 A/G 1 22 24 46 10.0010174290011 13.0897991683624 -3.08878173936123 A:G A G 10 0.545408298681766 0.377497591498940 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 120637199 G/A 1 1280 1273 2553 581.87737768734 694.304764221888 -112.427386534549 A:T:C:G G A 10 0.545408298681766 8.4271855256957e-06 ENSG00000089157:ENST00000313104:exon_120637113_120637288:RPLP0;ENSG00000089157:ENST00000228306:exon_120637113_120637288:RPLP0;ENSG00000089157:ENST00000392514:exon_120637113_120637288:RPLP0 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 120661977 T/C 1 8 11 19 3.63673361054587 5.99949128549943 -2.36275767495355 T:C T C 10 0.545408298681766 0.357731776873343 ENSG00000089159:ENST00000424649:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000228307:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000267257:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000458477:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000323871:exon_120661954_120662183:PXN;ENSG00000089159:ENST00000440827:exon_120661954_120662180:PXN;ENSG00000089159:ENST00000331257:exon_120661954_120662180:PXN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 120995397 G/C 1 74 59 133 33.6397858975493 32.1790896222242 1.46069627532512 C:G G C 10 0.545408298681766 0.861850118465682 ENSG00000022840:ENST00000458409:exon_120995349_120995485:RNF10;ENSG00000022840:ENST00000325954:exon_120995349_120995485:RNF10;ENSG00000022840:ENST00000413266:exon_120995349_120995485:RNF10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 12 13 25 5.45510041581881 7.09030788286296 -1.63520746704415 T:C T C 10 0.545408298681766 0.551039108147693 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 121666646 A/G 1 24 15 39 10.9102008316376 8.18112448022649 2.72907635141113 A:G A G 10 0.545408298681766 0.424011343844242 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121666528_121666669:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121666528_121666669:P2RX4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 121691096 G/A 1 14 12 26 6.36428381845528 6.54489958418119 -0.180615765725915 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121691076_121691275:CAMKK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 30 29 59 13.637751039547 15.8168406617712 -2.17908962222419 T:C C T 10 0.545408298681766 0.60235970223008 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 29 37 66 13.1831593382288 20.1801070512253 -6.99694771299655 A:G G A 10 0.545408298681766 0.107365514420020 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 38 47 85 17.2744846500929 25.634190038043 -8.35970538795011 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0809139017275489 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 55 70 125 25.0025435725029 38.1785809077236 -13.1760373352208 T:C T C 10 0.545408298681766 0.019423580895201 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 122626381 G/A 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122626238_122628963:MLXIP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 123467163 C/G 1 21 20 41 9.54642572768291 10.9081659736353 -1.36174024595241 C:G C G 10 0.545408298681766 0.754330123216359 ENSG00000182196:ENST00000392435:exon_123467016_123467460:ARL6IP4;ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123467016_123467452:ARL6IP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 123950471 G/A 1 75 53 128 34.0943775988676 28.9066398301336 5.18773776873396 A:C:G G A 10 0.545408298681766 0.375738050653387 ENSG00000184209:ENST00000438124:exon_123950085_123950941:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000526639:exon_123950085_123951483:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000392420:exon_123950085_123950941:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000361485:exon_123950085_123950937:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000412157:exon_123950085_123950936:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000350887:exon_123950085_123950937:SNRNP35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 124104049 A/G 1 27 28 55 12.2739759355923 15.2714323630894 -2.99745642749713 A:G A G 10 0.545408298681766 0.420482774551251 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103979_124104271:DDX55 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 124104686 G/A 1 42 50 92 19.0928514553658 27.2704149340883 -8.17756347872247 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0941116559380895 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 124144395 A/G 1 20 18 38 9.09183402636468 9.81734937627179 -0.725515349907107 A:G A G 10 0.545408298681766 0.87122541036102 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 124144793 T/C 1 20 21 41 9.09183402636468 11.4535742723171 -2.36174024595241 T:C T C 10 0.545408298681766 0.531170282862538 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144713_124145620:GTF2H3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 124221796 G/A 1 10 14 24 4.54591701318234 7.63571618154472 -3.08979916836238 A:G G A 10 0.545408298681766 0.223719116182242 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124221606_124221818:ATP6V0A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 124228414 A/G 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124228332_124228482:ATP6V0A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 124957588 C/T 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000448008:exon_124957498_124957677:NCOR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 124957627 C/T 1 16 7 23 7.27346722109174 3.81785809077236 3.45560913031938 T:C C T 10 0.545408298681766 0.208241264648541 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000448008:exon_124957498_124957677:NCOR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 125298877 G/A 1 20 55 75 9.09183402636468 29.9974564274971 -20.9056224011325 A:G G A 10 0.545408298681766 1.18645298757002e-06 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125298748_125298951:SCARB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 125348263 C/T 1 28 24 52 12.7285676369106 13.0897991683624 -0.36123153145183 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125348141_125348519:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125348141_125348519:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125348141_125348393:SCARB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 125398039 G/C 1 1440 1894 3334 654.612049898257 1033.00331770326 -378.391267805008 A:T:C:G G C 10 0.545408298681766 2.63695429224872e-39 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 125434716 G/A 1 17 18 35 7.72805892240998 9.81734937627179 -2.08929045386181 A:G G A 10 0.545408298681766 0.501106521181595 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434695_125434789:DHX37 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 125448960 C/T 1 16 25 41 7.27346722109174 13.6352074670442 -6.36174024595241 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0587627657917865 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 12 125591727 C/T 1 14 7 21 6.36428381845528 3.81785809077236 2.54642572768291 T:C C T 10 0.545408298681766 0.283494118559072 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125591667_125591814:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125591667_125591814:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125591667_125591814:AACS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 20398669 T/C 0 0 11 11 0 5.99949128549943 -5.99949128549943 C T C 10 0.545408298681766 0.000171331231453132 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20397622_20399375:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20397624_20399375:ZMYM5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 0 297 10 307 135.013735291516 5.45408298681766 129.559652304698 A:T:C T C 10 0.545408298681766 4.90593557586026e-64 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 24234517 A/G 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 A:G A G 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000127863:ENST00000248484:exon_24234504_24234629:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000403372:exon_24234504_24234629:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382258:exon_24234504_24234629:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382263:exon_24234504_24234629:TNFRSF19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 25052261 C/T 1 12 13 25 5.45510041581881 7.09030788286296 -1.63520746704415 T:C C T 10 0.545408298681766 0.551039108147693 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25052231_25052414:PARP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 25075859 C/T 1 9 11 20 4.09132531186411 5.99949128549943 -1.90816597363532 T:C C T 10 0.545408298681766 0.501718810318948 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25075771_25075972:PARP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 25480295 C/T 1 22 19 41 10.0010174290011 10.3627576749536 -0.361740245952406 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 25487103 T/C 1 13 11 24 5.90969211713704 5.99949128549943 -0.0897991683623838 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25486720_25487229:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25486720_25487229:CENPJ HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 25823441 C/T 1 20 10 30 9.09183402636468 5.45408298681766 3.63775103954702 T:C C T 10 0.545408298681766 0.203010938958958 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25820339_25823630:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25820343_25823630:MTMR6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 25823451 A/G 1 25 11 36 11.3647925329558 5.99949128549943 5.36530124745642 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0931512567153025 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25820339_25823630:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25820343_25823630:MTMR6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 26789638 T/C 1 35 29 64 15.9107095461382 15.8168406617712 0.0938688843669766 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000127870:ENST00000468480:exon_26789611_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000498039:exon_26789276_26789729:RNF6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 26793644 T/C 1 25 18 43 11.3647925329558 9.81734937627179 1.54744315668406 T:C T C 10 0.545408298681766 0.65017499705898 ENSG00000127870:ENST00000468480:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000498039:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000476347:exon_26793433_26793804:RNF6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 161 123 284 73.1892639122357 67.0852207378572 6.10404317437846 T:C C T 10 0.545408298681766 0.475242657959222 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 28239940 G/C 1 107 75 182 48.641312041051 40.9056224011324 7.73568963991859 C:G G C 10 0.545408298681766 0.264600098809178 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 116 116 232 52.7326373529151 63.2673626470849 -10.5347252941697 A:G G A 10 0.545408298681766 0.166820525916483 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 30091714 G/A 1 24 11 35 10.9102008316376 5.99949128549943 4.91070954613819 A:G G A 10 0.545408298681766 0.125592828818817 ENSG00000139514:ENST00000380752:exon_30091710_30091927:SLC7A1;ENSG00000139514:ENST00000473577:exon_30091710_30091927:SLC7A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 30091819 G/C 1 11 11 22 5.00050871450057 5.99949128549943 -0.998982570998852 C:G G C 10 0.545408298681766 0.675286531050552 ENSG00000139514:ENST00000380752:exon_30091710_30091927:SLC7A1;ENSG00000139514:ENST00000473577:exon_30091710_30091927:SLC7A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 33249986 T/C 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000083642:ENST00000315596:exon_33249981_33250096:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000400481:exon_33249981_33250096:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000421084:exon_33249981_33250096:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000456898:exon_33249981_33250096:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000498550:exon_33249981_33250096:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000450460:exon_33249981_33250096:PDS5B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 20 21 41 9.09183402636468 11.4535742723171 -2.36174024595241 A:G G A 10 0.545408298681766 0.531170282862538 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 29 46 75 13.1831593382288 25.0887817393612 -11.9056224011324 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00727654649402587 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 25 21 46 11.3647925329558 11.4535742723171 -0.0887817393612362 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 39587166 A/G 1 29 28 57 13.1831593382288 15.2714323630894 -2.08827302486066 A:G A G 10 0.545408298681766 0.596864260205659 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 18 21 39 8.18265062372821 11.4535742723171 -3.27092364858887 A:G A G 10 0.545408298681766 0.335698443993020 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 39587865 A/C 1 27 35 62 12.2739759355923 19.0892904538618 -6.81531451826949 A:C A C 10 0.545408298681766 0.0968940738558893 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 39587889 T/C 1 30 32 62 13.637751039547 17.4530655578165 -3.81531451826949 T:C T C 10 0.545408298681766 0.372496282895695 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 43148565 T/C 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 T:C T C 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000120659:ENST00000239849:exon_43148289_43148658:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000398795:exon_43148291_43148658:TNFSF11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 43462352 T/C 1 84 49 133 38.1857029107317 26.7250066354065 11.4606962753251 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0550064071581706 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 43469157 G/A 1 45 30 75 20.4566265593205 16.362248960453 4.09437759886755 A:G G A 10 0.545408298681766 0.356157199788681 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 43469211 G/A 1 24 16 40 10.9102008316376 8.72653277890826 2.18366805272936 A:G G A 10 0.545408298681766 0.528502949406548 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 45 0 45 20.4566265593205 0 20.4566265593205 G G 10 0.545408298681766 2.00037906543383e-12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 45563464 G/C 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000083635:ENST00000379161:exon_45563160_45563618:NUFIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 46067593 G/A 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 A:G G A 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46067482_46067621:COG3;ENSG00000136152:ENST00000465942:exon_46067482_46067621:COG3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 48528283 C/T 1 39 27 66 17.7290763514111 14.7260240644077 3.00305228700345 T:C C T 10 0.545408298681766 0.536896105664052 ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000467222:exon_48528275_48528689:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48528278_48528417:SUCLA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 48547467 A/T 1 20 11 31 9.09183402636468 5.99949128549943 3.09234274086525 A:T A T 10 0.545408298681766 0.284898217962211 ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000433022:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000497202:exon_48547399_48547527:SUCLA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 50056926 G/A 1 7 15 22 3.18214190922764 8.18112448022649 -4.99898257099885 A:G G A 10 0.545408298681766 0.051425600821252 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 50134150 A/G 1 8 1 9 3.63673361054587 0.545408298681766 3.09132531186411 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0460880501374676 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50134054_50134220:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50134054_50134220:RCBTB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 50204880 G/A 1 6 10 16 2.7275502079094 5.45408298681766 -2.72653277890826 A:G G A 10 0.545408298681766 0.211691046173674 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 7 11 18 3.18214190922764 5.99949128549943 -2.81734937627179 T:C T C 10 0.545408298681766 0.237114548756310 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 50283819 T/C 1 21 26 47 9.54642572768291 14.1806157657259 -4.634190038043 T:C T C 10 0.545408298681766 0.189100819444811 ENSG00000102753:ENST00000261667:exon_50283708_50283836:KPNA3;ENSG00000102753:ENST00000457886:exon_50283708_50283836:KPNA3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 52602919 A/C 1 11 4 15 5.00050871450057 2.18163319472706 2.81887551977351 A:C A C 10 0.545408298681766 0.195702635515563 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 52603194 G/T 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 T:G G T 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 11 6 17 5.00050871450057 3.2724497920906 1.72805892240998 T:C C T 10 0.545408298681766 0.471102205741298 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 52604666 C/T 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 T:C C T 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 76100715 G/C 1 243 282 525 110.465783420331 153.805140228258 -43.3393568079271 C:G G C 10 0.545408298681766 0.000159778165153493 ENSG00000188243:ENST00000406936:exon_76099350_76100775:COMMD6;ENSG00000188243:ENST00000377615:exon_76099355_76100775:COMMD6;ENSG00000188243:ENST00000483290:exon_76100572_76100775:COMMD6;ENSG00000188243:ENST00000377619:exon_76100572_76100775:COMMD6;ENSG00000188243:ENST00000486516:exon_76100572_76100775:COMMD6;ENSG00000188243:ENST00000497707:exon_76100572_76100775:COMMD6;ENSG00000188243:ENST00000355801:exon_76100572_76100775:COMMD6;ENSG00000188243:ENST00000377612:exon_76100572_76100775:COMMD6;ENSG00000188243:ENST00000460675:exon_76100572_76100775:COMMD6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 76335170 G/A 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 A:G G A 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76335068_76335174:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000533305:exon_76335068_76335174:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76335068_76335174:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000534657:exon_76335068_76335174:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76335068_76335174:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465309:exon_76335068_76335174:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76335068_76335174:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76334797_76335174:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76334797_76335174:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76334797_76335174:LMO7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 77574983 A/G 1 14 20 34 6.36428381845528 10.9081659736353 -4.54388215518004 A:G A G 10 0.545408298681766 0.124287429768297 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 77575137 A/G 1 27 19 46 12.2739759355923 10.3627576749536 1.91121826063876 A:G A G 10 0.545408298681766 0.657632938359347 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 77632470 C/T 1 11 17 28 5.00050871450057 9.27194107759002 -4.27143236308945 T:C C T 10 0.545408298681766 0.128767570080049 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77632353_77632541:MYCBP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 96638636 A/C 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 A:C A C 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000102595:ENST00000376747:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376722:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000465196:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376714:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000461329:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000467305:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000397618:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376712:exon_96638587_96638686:UGGT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 141 169 310 64.097429885871 92.1740024772185 -28.0765725913475 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00166455428909553 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 101287292 G/A 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 A:G G A 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 103418728 A/G 1 24 30 54 10.9102008316376 16.362248960453 -5.45204812881536 A:G A G 10 0.545408298681766 0.171210368476640 ENSG00000151287:ENST00000376027:exon_103418340_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376019:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376022:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376021:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376032:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376029:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376031:exon_103418467_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000455589:exon_103418467_103418930:C13orf27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 17 24 41 7.72805892240998 13.0897991683624 -5.3617402459524 T:C T C 10 0.545408298681766 0.116015498210352 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 94 73 167 42.731619923914 39.8148058037689 2.91681412014508 T:C:G G C 10 0.545408298681766 0.697806878688802 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 108862180 C/A 1 2 18 20 0.909183402636468 9.81734937627179 -8.90816597363532 A:C C A 10 0.545408298681766 4.78253457945229e-05 ENSG00000174405:ENST00000405925:exon_108859794_108863644:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000442234:exon_108859794_108863648:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000356922:exon_108860565_108863644:LIG4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 111290630 T/C 1 3 7 10 1.3637751039547 3.81785809077236 -2.45408298681766 T:C T C 10 0.545408298681766 0.201980178309513 ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 111293915 T/G 1 49 55 104 22.2749933645935 29.9974564274971 -7.72246306290366 T:G T G 10 0.545408298681766 0.139834576058042 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000375781:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000490421:exon_111293764_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111293764_111293957:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111293787_111293955:CARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 13 37 50 5.90969211713704 20.1801070512253 -14.2704149340883 T:C T C 10 0.545408298681766 5.06430698652153e-05 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 113508839 G/C 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000068650:ENST00000487903:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375630:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000375645:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000283558:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000431624:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000459908:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000418678:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000432166:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000489577:exon_113508593_113508844:ATP11A;ENSG00000068650:ENST00000471555:exon_113508593_113508844:ATP11A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 15 17 32 6.81887551977351 9.27194107759002 -2.45306555781651 T:C C T 10 0.545408298681766 0.478260491529797 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 39 43 82 17.7290763514111 23.4525568433159 -5.72348049190481 A:G A G 10 0.545408298681766 0.223032217136848 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 113975754 C/T 1 50 55 105 22.7295850659117 29.9974564274971 -7.26787136158543 T:C C T 10 0.545408298681766 0.170153335370245 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113974660_113975785:LAMP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 114149891 T/C 1 9 10 19 4.09132531186411 5.45408298681766 -1.36275767495355 T:C T C 10 0.545408298681766 0.646488798036141 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 114150107 C/T 1 18 12 30 8.18265062372821 6.54489958418119 1.63775103954702 T:C C T 10 0.545408298681766 0.587107629990466 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 114152755 C/T 1 15 15 30 6.81887551977351 8.18112448022649 -1.36224896045298 T:C C T 10 0.545408298681766 0.714695541216207 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000473287:exon_114152657_114152960:TMCO3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 114154419 G/A 1 8 15 23 3.63673361054587 8.18112448022649 -4.54439086968062 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0619742792817211 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114154336_114154464:TMCO3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 114156093 C/T 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 T:C C T 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114156067_114156195:TMCO3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 115002305 G/A 1 15 13 28 6.81887551977351 7.09030788286296 -0.271432363089448 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115002277_115002371:CDC16 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 115004914 C/T 1 19 15 34 8.63724232504645 8.18112448022649 0.456117844819955 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 115004935 T/C 1 31 27 58 14.0923427408653 14.7260240644077 -0.633681323542428 T:C T C 10 0.545408298681766 0.895615591805283 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 13 115030714 T/C 1 92 105 197 41.8224365212775 57.2678713615854 -15.4454348403079 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0315952070304339 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 20764585 A/C 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 A:C A C 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20764549_20764605:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20764549_20764605:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20764549_20764605:TTC5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 20784431 G/A 1 111 144 255 50.459678846324 78.5387950101743 -28.0791161638503 A:G G A 10 0.545408298681766 0.000518234165017229 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20784386_20784731:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 30 22 52 13.637751039547 11.9989825709989 1.63876846854817 T:C T C 10 0.545408298681766 0.67843835374151 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 39 43 82 17.7290763514111 23.4525568433159 -5.72348049190481 A:C A C 10 0.545408298681766 0.223032217136848 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 22 20 42 10.0010174290011 10.9081659736353 -0.907148544634172 T:C T C 10 0.545408298681766 0.877115307471195 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 35 22 57 15.9107095461382 11.9989825709989 3.91172697513934 A:G G A 10 0.545408298681766 0.352175961622531 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 50 56 106 22.7295850659117 30.5428647261789 -7.8132796602672 A:G A G 10 0.545408298681766 0.143332239284062 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 21968619 A/G 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 A:G A G 10 0.545408298681766 0.399082180852789 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 107 104 211 48.641312041051 56.7224630629037 -8.08115102185263 T:C T C 10 0.545408298681766 0.269355428936737 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 23020921 G/C 1 163 102 265 74.0984473148721 55.6316464655401 18.466800849332 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0225453651970031 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 23240328 T/A 1 488 394 882 221.840750243298 214.890869680616 6.94988056268241 A:T T A 10 0.545408298681766 0.660293212068449 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 23248112 A/G 1 18 21 39 8.18265062372821 11.4535742723171 -3.27092364858887 A:G A G 10 0.545408298681766 0.335698443993020 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23248002_23248146:SLC7A7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 45 29 74 20.4566265593205 15.8168406617712 4.63978589754932 C:G G C 10 0.545408298681766 0.295375595138015 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 23465463 G/A 1 11 10 21 5.00050871450057 5.45408298681766 -0.453574272317086 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000100802:ENST00000299088:exon_23465157_23465477:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000341470:exon_23465157_23465477:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397382:exon_23465157_23465477:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397380:exon_23465157_23465477:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397379:exon_23465157_23465477:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397377:exon_23465157_23465477:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397376:exon_23465157_23465477:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000406429:exon_23465157_23465477:C14orf93 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 23530738 G/A 1 27 41 68 12.2739759355923 22.3617402459524 -10.0877643103601 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0148794985942447 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000473758:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000338631:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000357481:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000397341:exon_23530507_23530831:ACIN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 23530807 C/G 1 71 45 116 32.2760107935946 24.5433734406795 7.73263735291514 C:G C G 10 0.545408298681766 0.162251761056135 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000473758:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000338631:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000357481:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23530507_23530831:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000397341:exon_23530507_23530831:ACIN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 23549285 G/A 1 54 53 107 24.5479518711846 28.9066398301336 -4.35868795894896 A:G G A 10 0.545408298681766 0.437623611664617 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 52 35 87 23.6387684685482 19.0892904538618 4.54947801468636 A:G A G 10 0.545408298681766 0.335203347738473 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 23549383 G/T 1 62 30 92 28.1846854817305 16.362248960453 11.8224365212775 T:G G T 10 0.545408298681766 0.0156178221269946 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 68 66 134 30.9122356896399 35.9969477129966 -5.08471202335664 T:C T C 10 0.545408298681766 0.386794148101307 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 23944505 G/A 1 20 23 43 9.09183402636468 12.5443908696806 -3.45255684331594 A:G G A 10 0.545408298681766 0.358350515482876 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 27 25 52 12.2739759355923 13.6352074670442 -1.36123153145183 A:C C A 10 0.545408298681766 0.781014063465773 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24458162 G/C 1 9 3 12 4.09132531186411 1.6362248960453 2.45510041581881 C:G G C 10 0.545408298681766 0.245731957393402 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:T A T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 495 461 956 225.022892152526 251.433225692294 -26.4103335397683 A:T:C:G T C 10 0.545408298681766 0.0912133761717542 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 26 23 49 11.8193842342741 12.5443908696806 -0.725006635406533 T:C C T 10 0.545408298681766 0.886364092929424 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 30 30 60 13.637751039547 16.362248960453 -2.72449792090596 T:C T C 10 0.545408298681766 0.517980026266761 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24653523 G/C 1 34 43 77 15.45611784482 23.4525568433159 -7.99643899849598 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0853895047896974 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653504_24653624:IPO4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 15 10 25 6.81887551977351 5.45408298681766 1.36479253295585 A:G G A 10 0.545408298681766 0.689530950640826 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 23 14 37 10.4556091303194 7.63571618154472 2.81989294877466 T:C T C 10 0.545408298681766 0.410658794157108 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24662177 C/T 1 17 15 32 7.72805892240998 8.18112448022649 -0.453065557816512 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000100926:ENST00000261789:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528669:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000529332:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000524835:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000396854:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000531406:exon_24661854_24662319:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528895:exon_24661919_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530563:exon_24661937_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530468:exon_24662049_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000525592:exon_24662094_24662475:TM9SF1;ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24661854_24662475:RP11-468E2.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 107 77 184 48.641312041051 41.996438998496 6.64487304255506 T:C C T 10 0.545408298681766 0.336674007322786 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24707879 T/C 1 67 58 125 30.4576439883217 31.6336813235424 -1.17603733522075 T:C T C 10 0.545408298681766 0.857709534884319 ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24707795_24708445:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24707452_24707984:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24707795_24708445:GMPR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 22 15 37 10.0010174290011 8.18112448022649 1.81989294877466 A:G G A 10 0.545408298681766 0.621954129017817 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 19 12 31 8.63724232504645 6.54489958418119 2.09234274086525 T:C T C 10 0.545408298681766 0.476878416492098 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24760808 C/T 1 29 17 46 13.1831593382288 9.27194107759002 3.91121826063877 T:C C T 10 0.545408298681766 0.300248776397170 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24771285 G/A 1 10 7 17 4.54591701318234 3.81785809077236 0.728058922409978 A:G G A 10 0.545408298681766 0.810655514815455 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24771171_24771312:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24771171_24771312:C14orf21 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24773387 T/C 1 12 13 25 5.45510041581881 7.09030788286296 -1.63520746704415 T:C T C 10 0.545408298681766 0.551039108147693 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24773247_24773483:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24773247_24773394:C14orf21 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24839083 G/C 1 1 10 11 0.454591701318234 5.45408298681766 -4.99949128549943 C:G G C 10 0.545408298681766 0.00370287780098129 ENSG00000100968:ENST00000440487:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000424781:exon_24838705_24839800:NFATC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24839165 C/T 1 11 10 21 5.00050871450057 5.45408298681766 -0.453574272317086 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000100968:ENST00000440487:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000424781:exon_24838705_24839800:NFATC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24843620 T/C 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 T:C T C 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24843532_24843672:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24843532_24843672:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24843532_24843672:NFATC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24845841 T/C 1 5 20 25 2.27295850659117 10.9081659736353 -8.63520746704415 T:C T C 10 0.545408298681766 0.000857748677555245 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 13 10 23 5.90969211713704 5.45408298681766 0.455609130319382 A:C A C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24906515 C/T 1 28 13 41 12.7285676369106 7.09030788286296 5.63825975404759 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0852658304611499 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24906534 G/A 1 27 12 39 12.2739759355923 6.54489958418119 5.72907635141113 A:G G A 10 0.545408298681766 0.076675292675428 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24909281 C/T 1 77 81 158 35.003561001504 44.178072193223 -9.17451119171903 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.15071599145344 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24909362 T/C 1 90 86 176 40.9132531186411 46.9051136866319 -5.99186056799082 T:C T C 10 0.545408298681766 0.36499706392224 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24909475 C/G 1 64 59 123 29.093868884367 32.1790896222242 -3.08522073785722 C:G C G 10 0.545408298681766 0.58798404363178 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24909629 C/A 1 60 55 115 27.275502079094 29.9974564274971 -2.72195434840309 A:C C A 10 0.545408298681766 0.640159264312711 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24909731 C/T 1 40 30 70 18.1836680527294 16.362248960453 1.82141909227638 T:C C T 10 0.545408298681766 0.719459603198602 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24910846 C/T 1 14 2 16 6.36428381845528 1.09081659736353 5.27346722109174 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00984881910601707 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24910876 G/A 1 12 2 14 5.45510041581881 1.09081659736353 4.36428381845528 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0281542292726246 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24910973 T/G 1 27 10 37 12.2739759355923 5.45408298681766 6.81989294877466 T:G T G 10 0.545408298681766 0.0306539407892437 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24910974 T/A 1 26 8 34 11.8193842342741 4.36326638945413 7.45611784481996 A:T T A 10 0.545408298681766 0.00977252496154654 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 24911452 T/C 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 T:C T C 10 0.545408298681766 0.823095632852268 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24911384_24911466:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24911384_24911466:SDR39U1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 31582526 T/C 1 21 28 49 9.54642572768291 15.2714323630894 -5.72500663540653 T:C T C 10 0.545408298681766 0.114700126160969 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31582483_31582690:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31582483_31582690:HECTD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 35222732 C/T 1 47 19 66 21.365809961957 10.3627576749536 11.0030522870034 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00640102265548164 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35221938_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35221943_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35221943_35222910:BAZ1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 18 19 37 8.18265062372821 10.3627576749536 -2.18010705122534 A:G G A 10 0.545408298681766 0.511375414673015 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 39517925 T/C 1 13 15 28 5.90969211713704 8.18112448022649 -2.27143236308945 T:C T C 10 0.545408298681766 0.449579236151987 ENSG00000100934:ENST00000307712:exon_39517856_39517933:SEC23A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 39648629 C/T 1 179 177 356 81.3719145359639 96.5372688666726 -15.1653543307087 T:C C T 10 0.545408298681766 0.110439963295524 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39648528_39648666:PNN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 39818028 A/G 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 A:G A G 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 11 17 28 5.00050871450057 9.27194107759002 -4.27143236308945 C:G G C 10 0.545408298681766 0.128767570080049 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 50074122 T/A 1 16 11 27 7.27346722109174 5.99949128549943 1.27397593559232 A:T T A 10 0.545408298681766 0.701415732858495 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 50074520 C/T 1 30 27 57 13.637751039547 14.7260240644077 -1.08827302486066 T:C C T 10 0.545408298681766 0.7914726677892 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 50085571 G/A 1 1186 1474 2660 539.145757763426 803.931832256923 -264.786074493497 A:T:C:G G A 10 0.545408298681766 9.18692581220528e-25 ENSG00000165502:ENST00000298289:exon_50085407_50085858:RPL36AL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 16 19 35 7.27346722109174 10.3627576749536 -3.08929045386181 T:C T C 10 0.545408298681766 0.312446243194695 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 50583083 G/T 1 10 4 14 4.54591701318234 2.18163319472706 2.36428381845528 T:G G T 10 0.545408298681766 0.284657873718901 ENSG00000100483:ENST00000395859:exon_50583005_50583297:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000491402:exon_50583005_50583318:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000395860:exon_50583005_50583275:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000484763:exon_50582798_50583276:C14orf138 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 12 16 28 5.45510041581881 8.72653277890826 -3.27143236308945 T:C C T 10 0.545408298681766 0.255841661593369 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 50616878 G/A 1 3 9 12 1.3637751039547 4.90867468813589 -3.54489958418119 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0458142407340025 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50616726_50616948:SOS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 50769717 G/A 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000087299:ENST00000261699:exon_50769620_50769735:L2HGDH;ENSG00000087299:ENST00000267436:exon_50769620_50769735:L2HGDH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 50799126 G/C 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 C:G G C 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000100490:ENST00000395834:exon_50798980_50799150:CDKL1;ENSG00000100490:ENST00000534267:exon_50798644_50799150:CDKL1;ENSG00000100490:ENST00000216378:exon_50798645_50799410:CDKL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 50901768 G/A 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000012983:ENST00000429500:exon_50901680_50901783:MAP4K5;ENSG00000012983:ENST00000013125:exon_50901680_50901783:MAP4K5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 50907128 A/G 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 A:G A G 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000012983:ENST00000429500:exon_50907080_50907159:MAP4K5;ENSG00000012983:ENST00000013125:exon_50907080_50907159:MAP4K5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 51202311 G/C 1 36 24 60 16.3653012474564 13.0897991683624 3.27550207909404 C:G G C 10 0.545408298681766 0.437968593155197 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51202234_51202335:NIN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 51716188 T/G 1 43 36 79 19.5474431566841 19.6346987525436 -0.0872555958595136 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716186_51716287:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716186_51716287:TMX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 51716467 G/A 1 47 52 99 21.365809961957 28.3612315314518 -6.99542156949483 A:G G A 10 0.545408298681766 0.15935367160812 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716411_51716483:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716411_51716483:TMX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 55310492 G/A 1 20 24 44 9.09183402636468 13.0897991683624 -3.9979651419977 A:G G A 10 0.545408298681766 0.230305834018183 ENSG00000131979:ENST00000254299:exon_55308735_55310861:GCH1;ENSG00000131979:ENST00000491895:exon_55309096_55310861:GCH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 57099859 G/A 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 A:G G A 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000070269:ENST00000261556:exon_57099713_57099889:C14orf101 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 57676330 G/T 1 10 24 34 4.54591701318234 13.0897991683624 -8.54388215518004 T:G G T 10 0.545408298681766 0.00504360063976242 ENSG00000070367:ENST00000340918:exon_57676285_57676500:EXOC5;ENSG00000070367:ENST00000413566:exon_57676285_57676500:EXOC5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 57741550 A/G 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 A:G A G 10 0.545408298681766 0.823095632852268 ENSG00000053770:ENST00000431972:exon_57740962_57741607:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000446279:exon_57740962_57741742:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000261558:exon_57740962_57741607:MUDENG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 59939727 T/C 1 14 7 21 6.36428381845528 3.81785809077236 2.54642572768291 T:C T C 10 0.545408298681766 0.283494118559072 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 59950690 A/C 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 A:C A C 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59950527_59951086:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000481608:exon_59950398_59950724:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000527981:exon_59950398_59951126:C14orf149 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 68060574 G/A 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000100564:ENST00000216452:exon_68060460_68060669:PIGH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 68123146 C/T 1 37 52 89 16.8198929487747 28.3612315314518 -11.5413385826772 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0186801139103625 ENSG00000100568:ENST00000216456:exon_68123133_68123306:VTI1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 68159269 C/T 1 28 42 70 12.7285676369106 22.9071485446342 -10.1785809077236 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0161665052568599 ENSG00000072042:ENST00000381346:exon_68159155_68159310:RDH11;ENSG00000072042:ENST00000428130:exon_68159155_68159310:RDH11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 69521345 G/A 1 22 15 37 10.0010174290011 8.18112448022649 1.81989294877466 A:G G A 10 0.545408298681766 0.621954129017817 ENSG00000139990:ENST00000341516:exon_69517638_69522328:DCAF5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 70634546 C/T 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000100678:ENST00000381269:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000356921:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000494208:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000357887:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000358407:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000534137:exon_70633356_70635201:SLC8A3;ENSG00000100678:ENST00000528359:exon_70633356_70635201:SLC8A3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 72117156 T/C 1 7 19 26 3.18214190922764 10.3627576749536 -7.18061576572592 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00534271043841662 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72117052_72117226:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72117052_72117226:SIPA1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 73406582 T/G 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000514191:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000505361:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000510612:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000508412:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000514486:exon_73406510_73406610:DCAF4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 73425364 C/T 1 25 12 37 11.3647925329558 6.54489958418119 4.81989294877466 T:C C T 10 0.545408298681766 0.137051377517197 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73425320_73426300:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73425320_73426411:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73425320_73425654:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73425320_73426356:DCAF4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 73743367 A/G 1 50 40 90 22.7295850659117 21.8163319472706 0.913253118641059 A:G A G 10 0.545408298681766 0.91581223597422 ENSG00000133961:ENST00000355058:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000359560:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000454166:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000356296:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000326018:exon_73741918_73744001:NUMB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 74340797 A/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:T A T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000140043:ENST00000267568:exon_74340726_74340917:PTGR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 74388908 T/C 1 8 16 24 3.63673361054587 8.72653277890826 -5.08979916836238 A:T:C T C 10 0.545408298681766 0.0412369155098749 ENSG00000119725:ENST00000334521:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000458102:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000442160:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000398139:exon_74388769_74388909:ZNF410 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 14 20 34 6.36428381845528 10.9081659736353 -4.54388215518004 A:G G A 10 0.545408298681766 0.124287429768297 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 16 13 29 7.27346722109174 7.09030788286296 0.183159338228786 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 75513828 G/A 1 10 2 12 4.54591701318234 1.09081659736353 3.45510041581881 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0775833003018699 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 75574087 C/T 1 21 18 39 9.54642572768291 9.81734937627179 -0.270923648588873 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75574046_75574190:NEK9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 75590822 G/A 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75590749_75590926:NEK9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 8 10 18 3.63673361054587 5.45408298681766 -1.81734937627179 A:G A G 10 0.545408298681766 0.479767431495367 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 T:C T C 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 77272992 C/G 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 C:G C G 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000013523:ENST00000251089:exon_77272759_77273192:ANGEL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 19 16 35 8.63724232504645 8.72653277890826 -0.0892904538618104 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 78140355 T/A 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 A:T T A 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000100601:ENST00000216489:exon_78138749_78140584:ALKBH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 78183928 A/G 1 7 18 25 3.18214190922764 9.81734937627179 -6.63520746704415 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00865663998729649 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78183839_78183937:C14orf156 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 78184566 C/A 1 104 93 197 47.2775369370963 50.7229717774042 -3.4454348403079 A:C C A 10 0.545408298681766 0.667841517251375 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78183946_78184629:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78183946_78184629:SNW1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 90398907 G/A 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 A:G G A 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90398870_90398971:C14orf143 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 90744672 G/A 1 15 15 30 6.81887551977351 8.18112448022649 -1.36224896045298 A:G G A 10 0.545408298681766 0.714695541216207 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90744398_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90744402_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90744402_90744805:C14orf102 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 90745422 T/C 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 T:C T C 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90745406_90745477:C14orf102 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 92549586 G/A 1 10 2 12 4.54591701318234 1.09081659736353 3.45510041581881 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0775833003018699 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92549470_92549602:ATXN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 404 287 691 183.655047332567 156.532181721667 27.1228656108997 A:T:G T G 10 0.545408298681766 0.0391285076346983 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 93107590 C/T 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93107583_93107674:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93107583_93107674:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93107583_93107674:RIN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 22 23 45 10.0010174290011 12.5443908696806 -2.54337344067947 A:G G A 10 0.545408298681766 0.458063612156695 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 93119232 G/C 1 25 28 53 11.3647925329558 15.2714323630894 -3.9066398301336 C:G G C 10 0.545408298681766 0.334398250886362 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 93199080 C/T 1 33 20 53 15.0015261435017 10.9081659736353 4.0933601698664 T:C C T 10 0.545408298681766 0.273080898340748 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93198994_93199160:LGMN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 93412743 G/A 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:G G A 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000100605:ENST00000354313:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000405174:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000267615:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000311458:exon_93412676_93412838:ITPK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 94423294 T/C 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94423112_94423767:ASB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 100 94 194 45.4591701318234 51.268380076086 -5.80920994426261 A:T:C T C 10 0.545408298681766 0.427942328030463 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 95999820 T/C 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.364803080636778 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 96010424 G/A 1 65 92 157 29.5484605856852 50.1775634787225 -20.6291028930373 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00099119720438642 ENSG00000182512:ENST00000331334:exon_96010284_96011055:GLRX5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 100759277 C/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C C T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000197119:ENST00000359232:exon_100757448_100759369:SLC25A29;ENSG00000197119:ENST00000392908:exon_100757448_100759369:SLC25A29 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 103342049 T/C 1 19 37 56 8.63724232504645 20.1801070512253 -11.5428647261789 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00280685571933716 ENSG00000131323:ENST00000392745:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000347662:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000351691:exon_103341961_103342065:TRAF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 104194196 C/G 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 C:G C G 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104194083_104194251:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104194083_104194251:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000392675:exon_104193791_104194251:ZFYVE21 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 25 18 43 11.3647925329558 9.81734937627179 1.54744315668406 T:C C T 10 0.545408298681766 0.65017499705898 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 36 34 70 16.3653012474564 18.54388215518 -2.17858090772362 T:C C T 10 0.545408298681766 0.632239889020562 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 105239894 C/T 1 64 45 109 29.093868884367 24.5433734406795 4.55049544368751 T:C C T 10 0.545408298681766 0.388827760960412 ENSG00000142208:ENST00000349310:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000407796:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000402615:exon_105239792_105239917:AKT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 47 60 107 21.365809961957 32.724497920906 -11.358687958949 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0323038639792972 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 105518336 G/T 1 8 10 18 3.63673361054587 5.45408298681766 -1.81734937627179 T:G G T 10 0.545408298681766 0.479767431495367 ENSG00000183484:ENST00000392585:exon_105515728_105518439:GPR132;ENSG00000183484:ENST00000329797:exon_105515739_105518439:GPR132 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 105954821 C/T 1 401 207 608 182.291272228612 112.899517827126 69.3917544014863 T:C:G C T 10 0.545408298681766 1.30960837182341e-08 ENSG00000213145:ENST00000496700:exon_105954808_105954853:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000409393:exon_105954808_105954853:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000392531:exon_105954808_105954853:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000330233:exon_105954808_105954853:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000460900:exon_105953534_105954853:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000461556:exon_105954808_105954853:CRIP1;ENSG00000185347:ENST00000477724:exon_105954808_105954853:C14orf80 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 106318342 T/C 1 7 18 25 3.18214190922764 9.81734937627179 -6.63520746704415 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00865663998729649 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 106347420 T/C 0 11 0 11 5.00050871450057 0 5.00050871450057 T T 10 0.545408298681766 0.00144172735090439 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 106452817 A/G 1 45 2 47 20.4566265593205 1.09081659736353 19.365809961957 A:G A G 10 0.545408298681766 6.753363290995e-10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 106471268 A/G 1 5 10 15 2.27295850659117 5.45408298681766 -3.18112448022649 A:G A G 10 0.545408298681766 0.121647049471624 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 106471353 C/T 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 T:C C T 10 0.545408298681766 0.792480799523164 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 106733593 G/A 1 19 14 33 8.63724232504645 7.63571618154472 1.00152614350172 A:G G A 10 0.545408298681766 0.861592713125228 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 14 106791131 A/G 0 148 0 148 67.2795717950986 0 67.2795717950986 A A 10 0.545408298681766 1.17009109552155e-39 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 21937964 A/G 0 13 0 13 5.90969211713704 0 5.90969211713704 A A 10 0.545408298681766 0.000413311221647668 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 22939192 G/A 1 13 16 29 5.90969211713704 8.72653277890826 -2.81684066177121 A:G G A 10 0.545408298681766 0.352105502963958 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22939175_22939266:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22939175_22939266:CYFIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 22960868 G/C 1 25 28 53 11.3647925329558 15.2714323630894 -3.9066398301336 C:G G C 10 0.545408298681766 0.334398250886362 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 34 37 71 15.45611784482 20.1801070512253 -4.72398920640538 T:C C T 10 0.545408298681766 0.284218645891353 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 31197564 G/A 1 16 5 21 7.27346722109174 2.72704149340883 4.54642572768291 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0502218138253225 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31196715_31198100:FAN1;ENSG00000198690:ENST00000441675:exon_31196715_31198100:FAN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 31229420 T/C 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 T:C T C 10 0.545408298681766 0.609212519966719 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31229322_31229462:FAN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 34542872 C/G 1 11 7 18 5.00050871450057 3.81785809077236 1.18265062372821 C:G C G 10 0.545408298681766 0.641965040336765 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34542832_34542930:SLC12A6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 34634124 C/G 0 449 0 449 204.111673891887 0 204.111673891887 C C 10 0.545408298681766 6.99169432819334e-119 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 34634138 G/A 1 463 33 496 210.475957710342 17.9984738564983 192.477483853844 A:G G A 10 0.545408298681766 2.98931160035032e-82 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 34634139 T/C 1 453 38 491 205.93004069716 20.7255153499071 185.204525347253 T:C:G T C 10 0.545408298681766 7.23706921861613e-76 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 35273620 C/T 1 13 16 29 5.90969211713704 8.72653277890826 -2.81684066177121 T:C C T 10 0.545408298681766 0.352105502963958 ENSG00000198146:ENST00000356321:exon_35270542_35275691:ZNF770 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 40265799 A/G 1 17 22 39 7.72805892240998 11.9989825709989 -4.27092364858887 A:G A G 10 0.545408298681766 0.198683257277398 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40265793_40265950:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40265793_40265950:EIF2AK4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 40313141 C/T 1 10 20 30 4.54591701318234 10.9081659736353 -6.36224896045298 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0263692713371029 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40313100_40313228:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40313100_40313228:EIF2AK4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 40327290 A/G 1 48 57 105 21.8204016632752 31.0882730248607 -9.26787136158543 A:T:G A G 10 0.545408298681766 0.0775489495433278 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 54 63 117 24.5479518711846 34.3607228169513 -9.81277094576662 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0774835601371942 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 40328665 G/A 1 461 438 899 209.566774307706 238.888834822614 -29.3220605149076 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0520417952499815 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40327891_40328701:SRP14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 40462780 G/A 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 A:G G A 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40462738_40462831:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40462738_40462882:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40462738_40462882:BUB1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 40477831 G/A 1 38 27 65 17.2744846500929 14.7260240644077 2.54846058568521 A:G G A 10 0.545408298681766 0.536798131768691 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40477752_40477843:BUB1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 53 18 71 24.0933601698664 9.81734937627179 14.2760107935946 A:G A G 10 0.545408298681766 0.000729086784456003 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 53 18 71 24.0933601698664 9.81734937627179 14.2760107935946 A:C C A 10 0.545408298681766 0.000729086784456003 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 42459034 T/C 1 20 12 32 9.09183402636468 6.54489958418119 2.54693444218349 T:C T C 10 0.545408298681766 0.382100303850759 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42458970_42459111:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42458970_42459111:VPS39 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 43621947 A/G 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 A:G A G 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000168806:ENST00000305641:exon_43619976_43622891:LCMT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 43661802 T/C 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 T:C T C 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43661794_43662246:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43661794_43662258:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43661794_43662258:ZSCAN29 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 43724646 T/G 1 16 18 34 7.27346722109174 9.81734937627179 -2.54388215518004 T:G T G 10 0.545408298681766 0.394439936472409 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43724392_43724875:TP53BP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 43748304 A/G 1 18 13 31 8.18265062372821 7.09030788286296 1.09234274086525 A:G A G 10 0.545408298681766 0.722444112386434 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43748090_43748529:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000480860:exon_43748090_43748350:TP53BP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 43762196 C/T 1 2 9 11 0.909183402636468 4.90867468813589 -3.99949128549943 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0289147202703354 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43762056_43762264:TP53BP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 85 143 228 38.6402946120499 77.9933867114925 -39.3530920994426 T:C:G C T 10 0.545408298681766 2.33756108195108e-07 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 67 99 166 30.4576439883217 53.9954215694948 -23.5377775811732 T:C:G C T 10 0.545408298681766 0.000310161456880024 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 44069069 G/C 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000128886:ENST00000319359:exon_44068968_44069741:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000486851:exon_44068968_44069164:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000433927:exon_44068968_44069162:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000497700:exon_44068968_44069166:ELL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 66 73 139 30.0030522870034 39.8148058037689 -9.81175351676547 T:C T C 10 0.545408298681766 0.105429656199625 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 38 35 73 17.2744846500929 19.0892904538618 -1.81480580376892 A:C A C 10 0.545408298681766 0.724807466971783 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 44943757 A/G 1 17 10 27 7.72805892240998 5.45408298681766 2.27397593559232 A:G A G 10 0.545408298681766 0.442451269997159 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 45707936 T/C 1 15 12 27 6.81887551977351 6.54489958418119 0.273975935592318 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45707785_45707977:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45707785_45708007:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531624:exon_45707785_45707977:SPATA5L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 50782703 A/G 1 22 22 44 10.0010174290011 11.9989825709989 -1.9979651419977 A:G A G 10 0.545408298681766 0.54917812353393 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50782460_50782722:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50782460_50782722:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50782460_50782722:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50782460_50782722:USP8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 51294832 G/A 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000081014:ENST00000261842:exon_51294699_51298097:AP4E1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 13 11 24 5.90969211713704 5.99949128549943 -0.0897991683623838 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 52613593 G/C 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 C:G G C 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52613556_52613706:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52613556_52613706:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52613556_52613706:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52613556_52613706:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52613556_52613706:MYO5A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 52901283 T/C 1 9 8 17 4.09132531186411 4.36326638945413 -0.271941077590022 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 52901284 T/C 1 9 10 19 4.09132531186411 5.45408298681766 -1.36275767495355 T:C T C 10 0.545408298681766 0.646488798036141 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 52901433 C/T 1 3 11 14 1.3637751039547 5.99949128549943 -4.63571618154472 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0151242027682239 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 52901638 T/C 1 11 13 24 5.00050871450057 7.09030788286296 -2.08979916836238 T:C T C 10 0.545408298681766 0.418235923516124 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 52901977 G/A 1 11 12 23 5.00050871450057 6.54489958418119 -1.54439086968062 A:G G A 10 0.545408298681766 0.536899606886051 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 55619796 T/C 1 7 2 9 3.18214190922764 1.09081659736353 2.09132531186411 T:C T C 10 0.545408298681766 0.19585774268132 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55619729_55619833:PIGB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 56386514 T/A 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 A:T T A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 58000981 C/T 1 14 16 30 6.36428381845528 8.72653277890826 -2.36224896045298 T:C C T 10 0.545408298681766 0.464241697645823 ENSG00000137878:ENST00000460962:exon_58000912_58001556:GCOM1;ENSG00000255529:ENST00000380563:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000299638:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000494490:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464277:exon_58000912_58001382:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000482852:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464308:exon_58000912_58001531:GRINL1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 14 19 33 6.36428381845528 10.3627576749536 -3.99847385649828 A:G A G 10 0.545408298681766 0.167008656421679 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 60639874 G/A 1 75 111 186 34.0943775988676 60.540321153676 -26.4459435548085 A:T:G G A 10 0.545408298681766 0.00011782819496979 ENSG00000182718:ENST00000396024:exon_60639333_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000332680:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000421017:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000451270:exon_60639351_60639888:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000356292:exon_60639536_60639888:ANXA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 62212781 T/C 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 T:C T C 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62212697_62212846:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62212697_62212846:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62212697_62212846:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62212697_62212846:VPS13C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 78 75 153 35.4581527028223 40.9056224011324 -5.44746969831019 A:G G A 10 0.545408298681766 0.416983797201949 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 3 12 15 1.3637751039547 6.54489958418119 -5.18112448022649 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0085123178847361 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 63918307 G/C 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 C:G G C 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63918184_63918353:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63918184_63918353:HERC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 63922752 T/A 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:T T A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63922665_63922834:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63922665_63922834:HERC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 63932513 G/C 1 17 12 29 7.72805892240998 6.54489958418119 1.18315933822879 C:G G C 10 0.545408298681766 0.71234601175556 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63932351_63932644:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63932351_63932644:HERC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 63937209 C/G 1 12 6 18 5.45510041581881 3.2724497920906 2.18265062372821 C:G C G 10 0.545408298681766 0.350631698949064 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63937191_63937296:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63937191_63937296:HERC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 63970456 T/C 1 10 7 17 4.54591701318234 3.81785809077236 0.728058922409978 T:C T C 10 0.545408298681766 0.810655514815455 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63970044_63970564:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63970044_63970564:HERC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 24 23 47 10.9102008316376 12.5443908696806 -1.634190038043 A:G G A 10 0.545408298681766 0.662218976126322 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 64455123 G/T 1 101 108 209 45.9137618331416 58.9040962576307 -12.9903344244891 T:G G T 10 0.545408298681766 0.0822294410475659 ENSG00000166794:ENST00000300026:exon_64455051_64455404:PPIB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 64966526 C/T 1 16 9 25 7.27346722109174 4.90867468813589 2.36479253295585 T:C C T 10 0.545408298681766 0.423463149171332 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64966115_64968455:ZNF609 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 69709748 C/A 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 A:C C A 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69709722_69709850:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69709722_69709850:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69709722_69709850:KIF23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 69728949 A/G 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 A:G A G 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728903_69729061:KIF23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 69732736 C/T 1 6 10 16 2.7275502079094 5.45408298681766 -2.72653277890826 T:C C T 10 0.545408298681766 0.211691046173674 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 74336633 T/C 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 T:C T C 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000140464:ENST00000418568:exon_74336562_74336640:PML;ENSG00000140464:ENST00000417341:exon_74336562_74340151:PML;ENSG00000140464:ENST00000436891:exon_74336562_74340151:PML;ENSG00000140464:ENST00000268058:exon_74336562_74339112:PML HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 75340900 G/A 1 18 11 29 8.18265062372821 5.99949128549943 2.18315933822879 A:G G A 10 0.545408298681766 0.46021652389844 ENSG00000138621:ENST00000342932:exon_75340894_75341062:PPCDC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 76726465 G/T 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 T:G G T 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000140386:ENST00000324767:exon_76726419_76726651:SCAPER;ENSG00000140386:ENST00000303521:exon_76726419_76726651:SCAPER HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 32 42 74 14.5469344421835 22.9071485446342 -8.36021410245068 A:T T A 10 0.545408298681766 0.0612109891474304 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 77756711 A/G 1 20 29 49 9.09183402636468 15.8168406617712 -6.72500663540653 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0619322557196894 ENSG00000140382:ENST00000336216:exon_77756582_77756729:HMG20A;ENSG00000140382:ENST00000435040:exon_77756582_77756729:HMG20A;ENSG00000140382:ENST00000381714:exon_77756582_77756729:HMG20A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 78337303 C/T 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 T:C C T 10 0.545408298681766 0.40572272702491 ENSG00000167202:ENST00000418039:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000409931:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000300584:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000420639:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000435468:exon_78337242_78337410:TBC1D2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 78441769 T/C 1 20 10 30 9.09183402636468 5.45408298681766 3.63775103954702 T:C T C 10 0.545408298681766 0.203010938958958 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78441663_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78441719_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000379576:exon_78441720_78441772:IDH3A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 78789488 C/T 1 19 6 25 8.63724232504645 3.2724497920906 5.36479253295585 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0426056892034127 ENSG00000136381:ENST00000258886:exon_78789468_78789653:IREB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 79606186 G/A 1 59 36 95 26.8209103777758 19.6346987525436 7.18621162523223 A:G G A 10 0.545408298681766 0.149740711124833 ENSG00000166557:ENST00000299705:exon_79606099_79606347:TMED3;ENSG00000166557:ENST00000424155:exon_79606099_79606347:TMED3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 22 53 75 10.0010174290011 28.9066398301336 -18.9056224011324 T:C T C 10 0.545408298681766 1.26111557804563e-05 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 80263217 C/T 1 385 408 793 175.01780500752 222.526585862161 -47.5087808546404 A:T:C:G C T 10 0.545408298681766 0.000792415578735969 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 244 238 482 110.920375121649 129.80717508626 -18.8867999646112 A:C A C 10 0.545408298681766 0.0904993085021638 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 185 159 344 84.0994647438733 86.7199194904008 -2.6204547465275 T:C C T 10 0.545408298681766 0.78680340920468 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 81271557 C/A 1 93 49 142 42.2770282225958 26.7250066354065 15.5520215871892 A:C C A 10 0.545408298681766 0.00890383998530089 ENSG00000117899:ENST00000261758:exon_81268095_81271818:MESDC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 82512429 C/G 1 13 9 22 5.90969211713704 4.90867468813589 1.00101742900115 C:G C G 10 0.545408298681766 0.83113387846694 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82512419_82512570:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82512419_82512570:EFTUD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 83499766 G/A 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 A:G G A 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83499351_83499831:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83499351_83499831:WHAMM HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 83686759 T/C 1 119 83 202 54.0964124568698 45.2688887905866 8.82752366628327 T:C T C 10 0.545408298681766 0.229807522791777 ENSG00000064726:ENST00000261721:exon_83685174_83686977:BTBD1;ENSG00000064726:ENST00000379403:exon_83685185_83686977:BTBD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 83735926 C/G 1 28 23 51 12.7285676369106 12.5443908696806 0.184176767229935 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000064726:ENST00000261721:exon_83735503_83736106:BTBD1;ENSG00000064726:ENST00000379403:exon_83735503_83736106:BTBD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 85188839 C/T 1 12 14 26 5.45510041581881 7.63571618154472 -2.18061576572592 T:C C T 10 0.545408298681766 0.434248996287525 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 85341859 G/A 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 A:G G A 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85341819_85342106:ZNF592 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 86123462 T/C 1 3 8 11 1.3637751039547 4.36326638945413 -2.99949128549943 T:C T C 10 0.545408298681766 0.126277531853182 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 86123833 T/C 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 86123924 C/T 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 T:C C T 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 86123988 G/A 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 86124044 G/C 1 3 7 10 1.3637751039547 3.81785809077236 -2.45408298681766 C:G G C 10 0.545408298681766 0.201980178309513 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 86124419 C/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C C T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 86124483 C/G 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 C:G C G 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 16 22 38 7.27346722109174 11.9989825709989 -4.72551534990711 T:C C T 10 0.545408298681766 0.143050788663091 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 86287867 G/A 1 23 15 38 10.4556091303194 8.18112448022649 2.27448465009289 A:G G A 10 0.545408298681766 0.516754282489672 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 89169703 C/G 1 13 13 26 5.90969211713704 7.09030788286296 -1.18061576572592 C:G C G 10 0.545408298681766 0.696154695081167 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 89169858 A/G 1 15 10 25 6.81887551977351 5.45408298681766 1.36479253295585 A:G A G 10 0.545408298681766 0.689530950640826 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 89172558 G/C 1 11 10 21 5.00050871450057 5.45408298681766 -0.453574272317086 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89172457_89172657:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89172457_89172657:AEN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 194 179 373 88.1907900557374 97.6280854640361 -9.43729540829872 A:G A G 10 0.545408298681766 0.349351145413197 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 89865082 T/C 1 11 13 24 5.00050871450057 7.09030788286296 -2.08979916836238 T:C T C 10 0.545408298681766 0.418235923516124 ENSG00000140521:ENST00000268124:exon_89864967_89865084:POLG;ENSG00000140521:ENST00000442287:exon_89864967_89865084:POLG;ENSG00000140521:ENST00000532584:exon_89865006_89865246:POLG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 90138670 C/T 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:C C T 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90138624_90138842:C15orf42 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 90168108 C/T 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 T:C C T 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 90168873 T/C 1 14 4 18 6.36428381845528 2.18163319472706 4.18265062372821 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0579173231641151 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 90771750 T/G 1 11 14 25 5.00050871450057 7.63571618154472 -2.63520746704415 T:G T G 10 0.545408298681766 0.319613639852798 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 90814664 C/T 1 48 52 100 21.8204016632752 28.3612315314518 -6.5408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 0.193214962728483 ENSG00000182768:ENST00000331497:exon_90814420_90816463:NGRN;ENSG00000182768:ENST00000379095:exon_90814420_90815440:NGRN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 A:G G A 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 91449654 T/C 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 T:C T C 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91449600_91449727:MAN2A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 91449702 A/T 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:T A T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91449600_91449727:MAN2A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 91474738 G/C 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 C:G G C 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000184508:ENST00000330334:exon_91474155_91474786:HDDC3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 91478544 A/C 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 A:C A C 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91478174_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000495068:exon_91478515_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000497152:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91478516_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000439771:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000486253:exon_91478540_91478605:UNC45A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 91485698 G/C 1 18 12 30 8.18265062372821 6.54489958418119 1.63775103954702 C:G G C 10 0.545408298681766 0.587107629990466 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91485667_91485978:UNC45A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 91499986 G/T 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 T:G G T 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000166965:ENST00000394258:exon_91499842_91500130:RCCD1;ENSG00000166965:ENST00000300233:exon_91499840_91500130:RCCD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 91525197 C/T 1 58 49 107 26.3663186764576 26.7250066354065 -0.358687958948959 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 91543010 T/C 1 3 14 17 1.3637751039547 7.63571618154472 -6.27194107759002 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00261134955015915 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91542907_91543023:VPS33B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 18 17 35 8.18265062372821 9.27194107759002 -1.08929045386181 A:G G A 10 0.545408298681766 0.736735697725999 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 101110096 T/C 1 12 11 23 5.45510041581881 5.99949128549943 -0.544390869680617 T:C T C 10 0.545408298681766 0.837052105141715 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 101591923 A/G 1 9 17 26 4.09132531186411 9.27194107759002 -5.18061576572592 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0487303373374218 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101591916_101592165:LRRK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 101595257 G/A 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101595151_101595428:LRRK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 101598200 G/A 1 23 12 35 10.4556091303194 6.54489958418119 3.91070954613819 A:G G A 10 0.545408298681766 0.234665003070601 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 101598314 C/T 1 15 3 18 6.81887551977351 1.6362248960453 5.18265062372821 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0163417451705557 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 21 22 43 9.54642572768291 11.9989825709989 -2.45255684331594 T:C C T 10 0.545408298681766 0.540680933575845 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 304514 C/T 1 12 11 23 5.45510041581881 5.99949128549943 -0.544390869680617 T:C C T 10 0.545408298681766 0.837052105141715 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000419173:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000426695:exon_304328_304564:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000438220:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000447499:exon_304380_304673:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000453430:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000449945:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420046:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420500:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000417499:exon_304328_304618:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000496874:exon_304121_304680:ITFG3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 347179 G/A 1 13 14 27 5.90969211713704 7.63571618154472 -1.72602406440768 A:G G A 10 0.545408298681766 0.564456320968141 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347056_347226:AXIN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 94 67 161 42.731619923914 36.5423560116783 6.18926391223567 A:G A G 10 0.545408298681766 0.343012372652449 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 424277 G/A 1 21 11 32 9.54642572768291 5.99949128549943 3.54693444218349 A:G G A 10 0.545408298681766 0.219897929913113 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 30 23 53 13.637751039547 12.5443908696806 1.0933601698664 T:C T C 10 0.545408298681766 0.784574586230343 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 31 7 38 14.0923427408653 3.81785809077236 10.2744846500929 T:C T C 10 0.545408298681766 0.000857695913543812 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 24 9 33 10.9102008316376 4.90867468813589 6.00152614350172 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0369239183834611 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 427784 G/A 1 23 7 30 10.4556091303194 3.81785809077236 6.63775103954702 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0164285040252378 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427671_427805:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427671_427807:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 427820 C/T 1 21 4 25 9.54642572768291 2.18163319472706 7.36479253295585 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00391298195450678 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 602672 C/T 1 21 24 45 9.54642572768291 13.0897991683624 -3.54337344067947 T:C C T 10 0.545408298681766 0.298548392309109 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602605_602771:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_602605_602771:SOLH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 17 19 36 7.72805892240998 10.3627576749536 -2.63469875254358 A:G A G 10 0.545408298681766 0.405871052078179 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 685360 C/T 1 10 8 18 4.54591701318234 4.36326638945413 0.182650623728212 T:C C T 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 841175 C/T 1 12 9 21 5.45510041581881 4.90867468813589 0.546425727682915 T:C C T 10 0.545408298681766 0.831119559812142 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840525_842367:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840525_842347:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_841161_841370:CHTF18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 845819 A/G 1 8 7 15 3.63673361054587 3.81785809077236 -0.18112448022649 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 847936 C/T 1 11 13 24 5.00050871450057 7.09030788286296 -2.08979916836238 T:C C T 10 0.545408298681766 0.418235923516124 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847839_847975:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847839_848063:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847839_848072:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847839_847975:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847839_848074:CHTF18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 848013 G/A 1 27 26 53 12.2739759355923 14.1806157657259 -1.9066398301336 A:G G A 10 0.545408298681766 0.679447026135616 ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847839_848063:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847839_848072:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847839_848074:CHTF18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 1364365 A/G 1 157 159 316 71.3708971069627 86.7199194904008 -15.3490223834381 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0900272872555262 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000443007:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000473256:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1364294_1364377:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000402301:exon_1364294_1364377:UBE2I HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 1374818 A/G 1 169 163 332 76.8259975227815 88.9015526851279 -12.0755551623463 A:G A G 10 0.545408298681766 0.186308443501552 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1374731_1375351:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1374731_1375215:UBE2I HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 1545448 A/G 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 A:G A G 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1545347_1545624:TELO2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 1547477 T/C 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 T:C T C 10 0.545408298681766 0.823095632852268 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1547362_1547509:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1547362_1547509:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1547362_1547509:TELO2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 1552761 C/T 1 11 12 23 5.00050871450057 6.54489958418119 -1.54439086968062 T:C C T 10 0.545408298681766 0.536899606886051 ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1552314_1553003:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1552646_1552762:TELO2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 13 16 29 5.90969211713704 8.72653277890826 -2.81684066177121 A:G A G 10 0.545408298681766 0.352105502963958 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 1814440 A/G 1 16 17 33 7.27346722109174 9.27194107759002 -1.99847385649828 A:G A G 10 0.545408298681766 0.490611458768862 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2014424 C/G 1 15 24 39 6.81887551977351 13.0897991683624 -6.27092364858887 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0529500651021668 ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2014591 C/T 1 721 317 1038 327.760616650447 172.89443068212 154.866185968327 T:C C T 10 0.545408298681766 1.13314045451467e-22 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 16 19 35 7.27346722109174 10.3627576749536 -3.08929045386181 A:C A C 10 0.545408298681766 0.312446243194695 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2025604 G/C 1 24 39 63 10.9102008316376 21.2709236485889 -10.3607228169513 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0108944075649159 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2025678 C/A 1 26 28 54 11.8193842342741 15.2714323630894 -3.45204812881536 A:C C A 10 0.545408298681766 0.412513350579577 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 54 48 102 24.5479518711846 26.1795983367248 -1.63164646554013 A:C A C 10 0.545408298681766 0.766126632606621 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 57 58 115 25.9117269751393 31.6336813235424 -5.72195434840309 T:C T C 10 0.545408298681766 0.303495840363035 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2048796 C/T 1 33 29 62 15.0015261435017 15.8168406617712 -0.81531451826949 T:C C T 10 0.545408298681766 0.898718002629282 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2048826 C/G 1 19 20 39 8.63724232504645 10.9081659736353 -2.27092364858887 C:G C G 10 0.545408298681766 0.521400139870112 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 36 27 63 16.3653012474564 14.7260240644077 1.63927718304874 A:G A G 10 0.545408298681766 0.706062731995767 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2049728 C/T 1 43 28 71 19.5474431566841 15.2714323630894 4.27601079359461 T:C C T 10 0.545408298681766 0.341341891650377 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2049849 T/C 1 43 31 74 19.5474431566841 16.9076572591347 2.63978589754932 T:C T C 10 0.545408298681766 0.561444415371146 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2050192 G/T 1 34 29 63 15.45611784482 15.8168406617712 -0.360722816951256 T:G G T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2051060 T/A 1 13 21 34 5.90969211713704 11.4535742723171 -5.54388215518004 A:T T A 10 0.545408298681766 0.0598073713590268 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2051005_2051192:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2051005_2051192:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2051005_2051192:ZNF598 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2256461 C/G 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 C:G C G 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2257105 C/G 1 22 37 59 10.0010174290011 20.1801070512253 -10.1790896222242 C:G C G 10 0.545408298681766 0.00869526966424979 ENSG00000167965:ENST00000382450:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301724:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000397124:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301725:exon_2257036_2257111:MLST8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 23 10 33 10.4556091303194 5.45408298681766 5.00152614350172 T:G G T 10 0.545408298681766 0.0835064672123072 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 2983483 C/G 0 27 0 27 12.2739759355923 0 12.2739759355923 C C 10 0.545408298681766 9.69213788362646e-08 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 3191356 G/A 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000085644:ENST00000396878:exon_3190690_3192804:ZNF213;ENSG00000085644:ENST00000332670:exon_3190690_3192804:ZNF213;ENSG00000085644:ENST00000416391:exon_3190690_3192804:ZNF213 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 3339435 G/C 1 14 9 23 6.36428381845528 4.90867468813589 1.45560913031938 C:G G C 10 0.545408298681766 0.676543181314199 ENSG00000006194:ENST00000219069:exon_3339393_3341460:ZNF263 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 3367229 T/C 1 26 12 38 11.8193842342741 6.54489958418119 5.27448465009289 T:C T C 10 0.545408298681766 0.103023587548291 ENSG00000162086:ENST00000293995:exon_3367190_3368574:ZNF75A;ENSG00000162086:ENST00000498240:exon_3367190_3368574:ZNF75A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 22 19 41 10.0010174290011 10.3627576749536 -0.361740245952406 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 4487486 G/A 1 32 50 82 14.5469344421835 27.2704149340883 -12.7234804919048 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0053805951523949 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4487403_4487486:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4487403_4487486:DNAJA3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 12 9 21 5.45510041581881 4.90867468813589 0.546425727682915 T:C C T 10 0.545408298681766 0.831119559812142 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 4751045 C/T 1 7 2 9 3.18214190922764 1.09081659736353 2.09132531186411 T:C C T 10 0.545408298681766 0.19585774268132 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4750971_4751135:ANKS3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 4855279 A/G 1 36 36 72 16.3653012474564 19.6346987525436 -3.26939750508715 A:G A G 10 0.545408298681766 0.47837703213071 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4853204_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4855102_4855311:GLYR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 8999138 T/C 1 55 47 102 25.0025435725029 25.634190038043 -0.631646465540133 T:C T C 10 0.545408298681766 0.921024305131787 ENSG00000187555:ENST00000344836:exon_8999044_8999188:USP7;ENSG00000187555:ENST00000381886:exon_8999044_8999188:USP7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 10575824 C/A 1 9 12 21 4.09132531186411 6.54489958418119 -2.45357427231709 A:C C A 10 0.545408298681766 0.381262320809038 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10575693_10577494:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10575693_10577494:ATF7IP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 10989219 C/G 1 13 12 25 5.90969211713704 6.54489958418119 -0.635207467044149 C:G C G 10 0.545408298681766 0.842593548431809 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_10989139_10989285:CIITA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 11001691 C/T 1 9 12 21 4.09132531186411 6.54489958418119 -2.45357427231709 T:C C T 10 0.545408298681766 0.381262320809038 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 11001694 T/C 1 9 12 21 4.09132531186411 6.54489958418119 -2.45357427231709 T:C T C 10 0.545408298681766 0.381262320809038 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 11001770 G/T 1 18 12 30 8.18265062372821 6.54489958418119 1.63775103954702 T:G G T 10 0.545408298681766 0.587107629990466 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 11001914 G/A 1 20 15 35 9.09183402636468 8.18112448022649 0.91070954613819 A:G G A 10 0.545408298681766 0.865669207088407 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 11933678 G/C 1 374 419 793 170.01729629302 228.52607714766 -58.5087808546404 C:G G C 10 0.545408298681766 3.42737575118455e-05 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11933552_11933842:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11933552_11933842:RSL1D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 61 62 123 27.7300937804123 33.8153145182695 -6.08522073785721 T:C:G G C 10 0.545408298681766 0.278370397257962 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 11981487 G/A 1 42 43 85 19.0928514553658 23.4525568433159 -4.35970538795011 A:G G A 10 0.545408298681766 0.383806979746297 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11981427_11981607:GSPT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 12009304 C/A 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:C C A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_12009226_12009762:GSPT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 12061626 G/A 1 217 217 434 98.6463991860568 118.353600813943 -19.7072016278864 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0601120178497559 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 12061674 G/A 1 127 152 279 57.7331460674157 82.9020613996284 -25.1689153322127 A:C:G G A 10 0.545408298681766 0.00261867204353980 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 14742400 T/G 1 32 22 54 14.5469344421835 11.9989825709989 2.54795187118464 T:G T G 10 0.545408298681766 0.498642168890702 ENSG00000103429:ENST00000261658:exon_14742245_14742449:BFAR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 15116567 C/T 1 25 7 32 11.3647925329558 3.81785809077236 7.54693444218349 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0073275986044256 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15116561_15116611:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15116561_15116611:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15116561_15116611:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15116561_15116611:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15116561_15116611:PDXDC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 15129940 C/T 1 27 23 50 12.2739759355923 12.5443908696806 -0.270414934088299 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 15166891 T/C 1 18 15 33 8.18265062372821 8.18112448022649 0.00152614350172264 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000085721:ENST00000198767:exon_15166807_15166937:RRN3;ENSG00000085721:ENST00000429751:exon_15166807_15166937:RRN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 15170452 C/A 1 25 14 39 11.3647925329558 7.63571618154472 3.72907635141113 A:C C A 10 0.545408298681766 0.262256685898951 ENSG00000085721:ENST00000198767:exon_15170415_15170507:RRN3;ENSG00000085721:ENST00000429751:exon_15170415_15170507:RRN3;ENSG00000085721:ENST00000327307:exon_15170355_15170507:RRN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 15790607 C/T 1 20 15 35 9.09183402636468 8.18112448022649 0.91070954613819 T:C C T 10 0.545408298681766 0.865669207088407 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15790566_15790717:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396353:exon_15790566_15790717:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15790566_15790717:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15790566_15790717:NDE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 15818141 A/C 1 11 21 32 5.00050871450057 11.4535742723171 -6.45306555781651 A:C A C 10 0.545408298681766 0.0315324411880694 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 16 32 48 7.27346722109174 17.4530655578165 -10.1795983367248 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00352898352612306 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 16162019 T/C 1 10 4 14 4.54591701318234 2.18163319472706 2.36428381845528 T:C T C 10 0.545408298681766 0.284657873718901 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16162013_16162159:ABCC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 11 3 14 5.00050871450057 1.6362248960453 3.36428381845528 T:C C T 10 0.545408298681766 0.104979576849638 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 19547357 A/G 1 11 4 15 5.00050871450057 2.18163319472706 2.81887551977351 A:G A G 10 0.545408298681766 0.195702635515563 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 19547503 C/T 1 8 7 15 3.63673361054587 3.81785809077236 -0.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 19680546 T/C 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 T:C T C 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 22319517 T/G 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 T:G T G 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000058600:ENST00000299853:exon_22319469_22319546:POLR3E;ENSG00000058600:ENST00000359210:exon_22319469_22319546:POLR3E;ENSG00000058600:ENST00000431699:exon_22319469_22319546:POLR3E;ENSG00000058600:ENST00000418581:exon_22319469_22319546:POLR3E HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 24231449 C/T 1 201 149 350 91.372931964965 81.2658365035831 10.1070954613819 T:C C T 10 0.545408298681766 0.283524982746632 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24231282_24231932:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24225979_24231932:PRKCB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 24582299 C/G 1 66 58 124 30.0030522870034 31.6336813235424 -1.63062903653898 C:G C G 10 0.545408298681766 0.787237149728631 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 93 78 171 42.2770282225958 42.5418472971777 -0.264819074581986 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 24801737 G/A 1 12 8 20 5.45510041581881 4.36326638945413 1.09183402636468 A:G G A 10 0.545408298681766 0.660903045813617 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 24802325 C/T 1 8 12 20 3.63673361054587 6.54489958418119 -2.90816597363532 T:C C T 10 0.545408298681766 0.261293206047355 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 24834233 C/T 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834195_24834334:TNRC6A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 24835168 G/A 1 12 7 19 5.45510041581881 3.81785809077236 1.63724232504645 A:G G A 10 0.545408298681766 0.497799653196701 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834753_24836196:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834753_24837545:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834753_24836090:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834753_24836107:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834753_24836107:TNRC6A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 27374400 A/G 1 20 18 38 9.09183402636468 9.81734937627179 -0.725515349907107 A:G A G 10 0.545408298681766 0.87122541036102 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 27375157 T/C 1 13 33 46 5.90969211713704 17.9984738564983 -12.0887817393612 T:C T C 10 0.545408298681766 0.000505732843282234 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 27472772 C/T 1 14 12 26 6.36428381845528 6.54489958418119 -0.180615765725915 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27471935_27472883:GTF3C1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 27474910 A/G 1 12 17 29 5.45510041581881 9.27194107759002 -3.81684066177121 A:G A G 10 0.545408298681766 0.191707546875996 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27474862_27474913:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27474862_27474913:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27474862_27474913:GTF3C1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 27481557 G/A 1 13 14 27 5.90969211713704 7.63571618154472 -1.72602406440768 A:G G A 10 0.545408298681766 0.564456320968141 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27481429_27481716:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27481429_27481716:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27481429_27481716:GTF3C1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 28145165 T/A 1 13 24 37 5.90969211713704 13.0897991683624 -7.18010705122534 A:T T A 10 0.545408298681766 0.0204282393643407 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28145162_28145254:XPO6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 28222690 G/A 1 11 5 16 5.00050871450057 2.72704149340883 2.27346722109174 A:G G A 10 0.545408298681766 0.319419221699540 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28222687_28223190:XPO6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 28506872 A/G 1 7 2 9 3.18214190922764 1.09081659736353 2.09132531186411 A:G A G 10 0.545408298681766 0.19585774268132 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28506420_28507410:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28506420_28507410:AC138894.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 28507644 C/G 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 C:G C G 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 28508048 A/G 1 10 3 13 4.54591701318234 1.6362248960453 2.90969211713704 A:G A G 10 0.545408298681766 0.162038106908021 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 28508069 C/T 1 14 5 19 6.36428381845528 2.72704149340883 3.63724232504645 T:C C T 10 0.545408298681766 0.109502725206357 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 28602991 A/G 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 A:G A G 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 29821295 C/T 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 T:C C T 10 0.545408298681766 0.523850288987059 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 29994922 C/T 1 9 14 23 4.09132531186411 7.63571618154472 -3.54439086968062 T:C C T 10 0.545408298681766 0.147937741171306 ENSG00000149930:ENST00000416441:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_29994824_29994985:TAOK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 5 12 17 2.27295850659117 6.54489958418119 -4.27194107759002 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0496545389818462 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 30081476 C/T 1 2904 2444 5348 1320.13430062815 1332.97788197824 -12.8435813500846 A:T:C:G C T 10 0.545408298681766 0.73139593276865 ENSG00000149925:ENST00000395248:exon_30081438_30081741:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000338110:exon_30081438_30081734:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000436540:exon_30081438_30081734:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000412304:exon_30081438_30081734:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000395240:exon_30081438_30081741:ALDOA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 30198151 A/G 1 701 705 1406 318.668782624082 384.512850570645 -65.844067946563 A:G A G 10 0.545408298681766 0.000447981231085747 ENSG00000102879:ENST00000219150:exon_30198137_30198266:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000440463:exon_30198137_30198316:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000421578:exon_30198137_30198266:CORO1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 30393171 C/T 1 104 108 212 47.2775369370963 58.9040962576307 -11.6265593205344 T:C:G C T 10 0.545408298681766 0.112931792497194 ENSG00000180096:ENST00000321367:exon_30393081_30393204:SEPT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 31477697 G/A 0 19 0 19 8.63724232504645 0 8.63724232504645 G G 10 0.545408298681766 1.73829416739409e-05 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31477400_31478426:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31477400_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31477400_31478485:ARMC5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 46642286 G/A 1 13 5 18 5.90969211713704 2.72704149340883 3.18265062372821 A:G G A 10 0.545408298681766 0.158835868694104 ENSG00000171241:ENST00000303383:exon_46642209_46642301:SHCBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 50745583 T/G 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 T:G T G 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000167207:ENST00000526417:exon_50744469_50746284:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000300589:exon_50744469_50746284:NOD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 56396430 C/A 1 67 58 125 30.4576439883217 31.6336813235424 -1.17603733522075 A:C:G C A 10 0.545408298681766 0.857709534884319 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 57015084 C/G 1 7 14 21 3.18214190922764 7.63571618154472 -4.45357427231709 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0770912319259954 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57015070_57015137:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57015070_57015137:CETP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 57016127 G/A 1 5 18 23 2.27295850659117 9.81734937627179 -7.54439086968062 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00248227550146127 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 57080528 C/A 1 7 2 9 3.18214190922764 1.09081659736353 2.09132531186411 A:C C A 10 0.545408298681766 0.19585774268132 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57080464_57080553:NLRC5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 57392733 A/C 1 167 144 311 75.9168141201451 78.5387950101743 -2.62198089002922 A:C A C 10 0.545408298681766 0.77608280418744 ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57392684_57392801:CCL22 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 57601792 C/T 1 8 13 21 3.63673361054587 7.09030788286296 -3.45357427231709 T:C C T 10 0.545408298681766 0.187341762630804 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 57786711 C/T 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786690_57786840:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786690_57786840:KATNB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 58550484 G/A 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000418480:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000467320:exon_58550036_58550576:SETD6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 58552921 G/A 1 15 15 30 6.81887551977351 8.18112448022649 -1.36224896045298 A:G G A 10 0.545408298681766 0.714695541216207 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 58579274 C/T 1 68 56 124 30.9122356896399 30.5428647261789 0.369370963461019 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58579265_58579395:CNOT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 58616984 T/C 1 25 14 39 11.3647925329558 7.63571618154472 3.72907635141113 T:C T C 10 0.545408298681766 0.262256685898951 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58616960_58617086:CNOT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 58743454 A/C 1 43 44 87 19.5474431566841 23.9979651419977 -4.45052198531364 A:C A C 10 0.545408298681766 0.389211040143857 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000494627:exon_58742953_58743471:GOT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 58750604 G/A 1 31 39 70 14.0923427408653 21.2709236485889 -7.17858090772362 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0931366183732562 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58750567_58750717:GOT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 58757668 A/C 1 41 29 70 18.6382597540476 15.8168406617712 2.82141909227638 A:C A C 10 0.545408298681766 0.54928937231531 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 58757683 A/G 1 44 28 72 20.0020348580023 15.2714323630894 4.73060249491285 A:G A G 10 0.545408298681766 0.287957229305284 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 66977895 C/T 1 34 24 58 15.45611784482 13.0897991683624 2.36631867645757 T:C C T 10 0.545408298681766 0.598674783403684 ENSG00000172831:ENST00000417689:exon_66977742_66978972:CES2;ENSG00000172831:ENST00000317091:exon_66977742_66978999:CES2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 67265360 C/A 1 29 27 56 13.1831593382288 14.7260240644077 -1.54286472617889 A:C C A 10 0.545408298681766 0.68944141709458 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265333_67265452:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265333_67265452:FHOD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 67268008 G/A 1 18 19 37 8.18265062372821 10.3627576749536 -2.18010705122534 A:G G A 10 0.545408298681766 0.511375414673015 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67267560_67268170:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67267560_67268170:FHOD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 67578257 C/T 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000039523:ENST00000379312:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000042381:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000422602:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000428437:exon_67578202_67578334:FAM65A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 67682157 C/T 1 47 28 75 21.365809961957 15.2714323630894 6.09437759886755 T:C C T 10 0.545408298681766 0.165676439673969 ENSG00000159753:ENST00000334583:exon_67681955_67682217:RLTPR;ENSG00000159753:ENST00000398282:exon_67681955_67682217:RLTPR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 67691668 A/G 1 26 22 48 11.8193842342741 11.9989825709989 -0.179598336724768 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 67696089 A/G 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:G A G 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000102981:ENST00000458121:exon_67695799_67696680:PARD6A;ENSG00000102981:ENST00000219255:exon_67695796_67696677:PARD6A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 67696346 C/T 1 12 6 18 5.45510041581881 3.2724497920906 2.18265062372821 T:C C T 10 0.545408298681766 0.350631698949064 ENSG00000102981:ENST00000458121:exon_67695799_67696680:PARD6A;ENSG00000102981:ENST00000219255:exon_67695796_67696677:PARD6A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 67911517 T/C 1 18 32 50 8.18265062372821 17.4530655578165 -9.2704149340883 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0101019863036074 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 67964203 T/C 1 8 4 12 3.63673361054587 2.18163319472706 1.45510041581881 T:C T C 10 0.545408298681766 0.564607771258684 ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964088_67964221:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67963848_67964221:CTRL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 67969531 A/G 1 83 72 155 37.7311112094134 39.2693975050871 -1.53828629567373 A:G A G 10 0.545408298681766 0.809321111364588 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969485_67969600:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969452_67969600:PSMB10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 171 123 294 77.735180925418 67.0852207378572 10.6499601875608 A:G A G 10 0.545408298681766 0.219128768857977 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 67973953 G/A 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G G A 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000213398:ENST00000264005:exon_67973653_67974381:LCAT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 67980969 G/C 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000124067:ENST00000338335:exon_67980840_67981008:SLC12A4;ENSG00000124067:ENST00000422611:exon_67980840_67981008:SLC12A4;ENSG00000124067:ENST00000316341:exon_67980840_67981008:SLC12A4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 67984589 A/G 1 4 15 19 1.81836680527294 8.18112448022649 -6.36275767495355 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00446598462024043 ENSG00000124067:ENST00000338335:exon_67984557_67984614:SLC12A4;ENSG00000124067:ENST00000316341:exon_67984557_67984614:SLC12A4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 68072004 A/G 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000167264:ENST00000358896:exon_68071909_68072052:DUS2L;ENSG00000167264:ENST00000432752:exon_68071909_68072052:DUS2L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 68293320 T/C 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 T:C T C 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000103066:ENST00000219345:exon_68293049_68294965:PLA2G15;ENSG00000103066:ENST00000444212:exon_68293049_68294959:PLA2G15;ENSG00000103066:ENST00000413021:exon_68293049_68294959:PLA2G15 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 11 7 18 5.00050871450057 3.81785809077236 1.18265062372821 T:C C T 10 0.545408298681766 0.641965040336765 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 68390697 C/T 1 24 34 58 10.9102008316376 18.54388215518 -7.63368132354243 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0481265347230857 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68390604_68390700:PRMT7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 68598007 A/G 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000184939:ENST00000398253:exon_68596947_68601039:ZFP90 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 69373432 T/C 1 13 10 23 5.90969211713704 5.45408298681766 0.455609130319382 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69373079_69373513:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69373079_69373460:COG8;ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 22 27 49 10.0010174290011 14.7260240644077 -4.72500663540653 A:G G A 10 0.545408298681766 0.197352926950644 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 71 88 159 32.2760107935946 47.9959302839954 -15.7199194904008 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0134350499584183 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 69783140 G/A 1 85 101 186 38.6402946120499 55.0862381668584 -16.4459435548085 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0182361761583337 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69783116_69783241:NOB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 69973825 G/A 1 16 10 26 7.27346722109174 5.45408298681766 1.81938423427408 A:G G A 10 0.545408298681766 0.556992721605183 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 70164334 A/G 1 9 1 10 4.09132531186411 0.545408298681766 3.54591701318234 A:G A G 10 0.545408298681766 0.026642084489569 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70164326_70164447:PDPR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 70190401 C/T 0 11 0 11 5.00050871450057 0 5.00050871450057 C C 10 0.545408298681766 0.00144172735090439 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70190378_70195205:PDPR;ENSG00000090857:ENST00000205055:exon_70190378_70190765:PDPR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 42 35 77 19.0928514553658 19.0892904538618 0.00356100150401772 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 70395387 C/T 1 15 20 35 6.81887551977351 10.9081659736353 -4.08929045386181 T:C C T 10 0.545408298681766 0.177456662008176 ENSG00000168872:ENST00000302243:exon_70395321_70395413:DDX19A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 16 10 26 7.27346722109174 5.45408298681766 1.81938423427408 T:C C T 10 0.545408298681766 0.556992721605183 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 70726795 C/A 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 A:C C A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 72822296 G/A 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 A:G G A 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72816784_72822747:ZFHX3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 19 0 19 8.63724232504645 0 8.63724232504645 C C 10 0.545408298681766 1.73829416739409e-05 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 74499589 G/A 1 14 15 29 6.36428381845528 8.18112448022649 -1.81684066177121 A:G G A 10 0.545408298681766 0.57718202619655 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74499574_74499711:GLG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 74537591 C/T 1 21 7 28 9.54642572768291 3.81785809077236 5.72856763691055 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0357530206664566 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74537429_74537644:GLG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 74664810 A/T 1 11 10 21 5.00050871450057 5.45408298681766 -0.453574272317086 A:T A T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 6 12 18 2.7275502079094 6.54489958418119 -3.81734937627179 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0959765577209017 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 74695079 G/T 1 16 14 30 7.27346722109174 7.63571618154472 -0.362248960452979 T:G G T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000168411:ENST00000444004:exon_74694988_74695347:RFWD3;ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74694830_74695349:RFWD3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 75263661 G/A 1 12 16 28 5.45510041581881 8.72653277890826 -3.27143236308945 A:G G A 10 0.545408298681766 0.255841661593369 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75262929_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75262929_75263921:BCAR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 75269046 C/T 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 0.609212519966719 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 75276775 G/A 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75276368_75276988:BCAR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 75327916 A/G 1 68 73 141 30.9122356896399 39.8148058037689 -8.90257011412901 A:G A G 10 0.545408298681766 0.150320951734593 ENSG00000153774:ENST00000283882:exon_75327608_75327940:CFDP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 75646576 G/T 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 T:G G T 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 75646685 G/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:G G T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 96 122 218 43.6408033265505 66.5398124391754 -22.899009112625 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00214535717087661 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 81056441 T/G 1 2 18 20 0.909183402636468 9.81734937627179 -8.90816597363532 T:G T G 10 0.545408298681766 4.78253457945229e-05 ENSG00000166451:ENST00000299572:exon_81056360_81056490:CENPN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 81061827 G/A 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 A:G G A 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000393335:exon_81061776_81061902:CENPN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 81076821 T/C 1 28 26 54 12.7285676369106 14.1806157657259 -1.45204812881536 T:C T C 10 0.545408298681766 0.784924417495986 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 81077915 T/C 1 39 33 72 17.7290763514111 17.9984738564983 -0.269397505087152 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 81819768 T/C 1 81 52 133 36.821927806777 28.3612315314518 8.46069627532512 T:C T C 10 0.545408298681766 0.163340541494495 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81819548_81819787:PLCG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 81888152 A/G 1 40 17 57 18.1836680527294 9.27194107759002 8.91172697513934 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0229050817243218 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81888049_81888192:PLCG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 79 107 186 35.9127444041405 58.358687958949 -22.4459435548085 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00114276394364314 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 82182286 C/G 1 17 24 41 7.72805892240998 13.0897991683624 -5.3617402459524 C:G C G 10 0.545408298681766 0.116015498210352 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 82182354 G/A 1 8 23 31 3.63673361054587 12.5443908696806 -8.90765725913474 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00171490419034146 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 84212710 C/T 1 34 23 57 15.45611784482 12.5443908696806 2.91172697513934 T:C C T 10 0.545408298681766 0.506624786714982 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 84212853 G/C 1 36 22 58 16.3653012474564 11.9989825709989 4.36631867645757 C:G G C 10 0.545408298681766 0.291865126284488 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 22 12 34 10.0010174290011 6.54489958418119 3.45611784481996 A:T A T 10 0.545408298681766 0.301556362796936 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 84213684 C/T 1 21 8 29 9.54642572768291 4.36326638945413 5.18315933822879 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0620778492599737 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84213552_84213689:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84213552_84213686:TAF1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 84215390 T/C 1 10 11 21 4.54591701318234 5.99949128549943 -1.45357427231709 T:C T C 10 0.545408298681766 0.662270617460159 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84215352_84215664:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84215352_84215469:TAF1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 84516309 G/A 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 A:G G A 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84516198_84516316:KIAA1609 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 84691044 C/T 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 T:C C T 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84690477_84691550:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84690477_84691519:KLHL36 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 84 85 169 38.1857029107317 46.3597053879501 -8.17400247721845 A:G A G 10 0.545408298681766 0.216882107665918 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 84808824 C/G 1 21 34 55 9.54642572768291 18.54388215518 -8.99745642749713 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0204830430898467 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84808766_84808831:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84808766_84808831:USP10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 85015541 G/A 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G G A 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000153786:ENST00000313732:exon_85015476_85015600:ZDHHC7;ENSG00000153786:ENST00000344861:exon_85015476_85015600:ZDHHC7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 85706047 A/C 1 14 20 34 6.36428381845528 10.9081659736353 -4.54388215518004 A:C A C 10 0.545408298681766 0.124287429768297 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 85711860 C/T 1 65 58 123 29.5484605856852 31.6336813235424 -2.08522073785722 T:C C T 10 0.545408298681766 0.71799173154239 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 85945231 C/T 1 110 72 182 50.0050871450057 39.2693975050871 10.7356896399186 T:C C T 10 0.545408298681766 0.118086214865485 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85945176_85945264:IRF8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 86565882 G/C 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 C:G G C 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 88872511 T/C 1 42 36 78 19.0928514553658 19.6346987525436 -0.541847297177746 T:C T C 10 0.545408298681766 0.909963452549803 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872429_88872529:CDT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 89346774 G/T 1 12 12 24 5.45510041581881 6.54489958418119 -1.08979916836238 T:G G T 10 0.545408298681766 0.686028395996258 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 89348038 G/C 1 24 19 43 10.9102008316376 10.3627576749536 0.547443156684063 C:G G C 10 0.545408298681766 0.87989592289833 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 89655007 G/A 1 9 17 26 4.09132531186411 9.27194107759002 -5.18061576572592 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0487303373374218 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 89661807 C/T 1 26 25 51 11.8193842342741 13.6352074670442 -1.81582323277007 T:C C T 10 0.545408298681766 0.673800632131134 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000529800:exon_89661775_89661831:CPNE7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 89662990 T/C 1 41 36 77 18.6382597540476 19.6346987525436 -0.996438998495979 T:C T C 10 0.545408298681766 0.820120617072616 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 56 36 92 25.4571352738211 19.6346987525436 5.82243652127753 A:C:G G A 10 0.545408298681766 0.249766697683245 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 16 90075226 C/T 1 19 6 25 8.63724232504645 3.2724497920906 5.36479253295585 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0426056892034127 ENSG00000003249:ENST00000304733:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000002501:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000392973:exon_90075192_90075332:DBNDD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 62 52 114 28.1846854817305 28.3612315314518 -0.176546049721324 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 694806 C/T 1 21 23 44 9.54642572768291 12.5443908696806 -2.9979651419977 T:C C T 10 0.545408298681766 0.368660718109055 ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_694774_695749:RNMTL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 970413 C/T 1 14 21 35 6.36428381845528 11.4535742723171 -5.08929045386181 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0912742261267931 ENSG00000159842:ENST00000302538:exon_970317_970482:ABR;ENSG00000159842:ENST00000291107:exon_970317_970482:ABR;ENSG00000159842:ENST00000382259:exon_970317_970482:ABR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1370542 C/A 1 82 76 158 37.2765195080952 41.4510306998142 -4.17451119171903 A:C C A 10 0.545408298681766 0.523323205276243 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1370536_1370635:MYO1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1371393 C/T 1 50 56 106 22.7295850659117 30.5428647261789 -7.8132796602672 T:C C T 10 0.545408298681766 0.143332239284062 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1371282_1371417:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1371282_1371417:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1371282_1371417:MYO1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1377943 A/G 1 38 28 66 17.2744846500929 15.2714323630894 2.00305228700344 A:G A G 10 0.545408298681766 0.711092012212913 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1377904_1377984:MYO1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1383893 G/A 1 37 29 66 16.8198929487747 15.8168406617712 1.00305228700345 A:G G A 10 0.545408298681766 0.901755835120494 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1383821_1383919:MYO1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1489236 G/A 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 A:G G A 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1489207_1489345:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1489207_1489345:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1488954_1489345:SLC43A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1578488 G/A 1 57 46 103 25.9117269751393 25.0887817393612 0.822945235778104 A:G G A 10 0.545408298681766 0.921321816260174 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1578446_1578633:PRPF8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1578939 C/T 1 61 61 122 27.7300937804123 33.2699062195877 -5.53981243917545 T:C C T 10 0.545408298681766 0.318762256009545 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1578914_1579106:PRPF8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1580929 G/C 1 23 37 60 10.4556091303194 20.1801070512253 -9.72449792090596 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0134255763457022 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1580859_1580988:PRPF8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1584324 A/G 1 50 53 103 22.7295850659117 28.9066398301336 -6.1770547642219 A:G A G 10 0.545408298681766 0.235758864441380 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1584223_1584348:PRPF8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1585130 A/G 1 49 33 82 22.2749933645935 17.9984738564983 4.27651950809519 A:G A G 10 0.545408298681766 0.37588342947287 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1585114_1585332:PRPF8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1637074 A/G 1 6 10 16 2.7275502079094 5.45408298681766 -2.72653277890826 A:G A G 10 0.545408298681766 0.211691046173674 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1637302 A/G 1 13 10 23 5.90969211713704 5.45408298681766 0.455609130319382 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1638891 G/A 1 12 4 16 5.45510041581881 2.18163319472706 3.27346722109174 A:G G A 10 0.545408298681766 0.132245501357764 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1638866_1639011:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1638866_1639011:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1638866_1639011:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1638866_1639011:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1638866_1639011:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1638866_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1638866_1639011:WDR81 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1639458 A/G 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 A:G A G 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1638866_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1639333_1639512:WDR81 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1795180 T/C 1 39 27 66 17.7290763514111 14.7260240644077 3.00305228700345 T:C T C 10 0.545408298681766 0.536896105664052 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1940232 A/G 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 A:G A G 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1940129_1940250:DPH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1943880 C/G 1 13 7 20 5.90969211713704 3.81785809077236 2.09183402636468 C:G C G 10 0.545408298681766 0.37882271700965 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1943799_1943899:DPH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 1960974 C/T 1 27 31 58 12.2739759355923 16.9076572591347 -4.63368132354243 T:C C T 10 0.545408298681766 0.236971032601583 ENSG00000177374:ENST00000399849:exon_1959965_1962980:HIC1;ENSG00000177374:ENST00000322941:exon_1959965_1962980:HIC1;ENSG00000177374:ENST00000416386:exon_1959965_1962980:HIC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 2186100 C/T 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 T:C C T 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2185941_2186153:SMG6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 2203025 T/G 1 12 6 18 5.45510041581881 3.2724497920906 2.18265062372821 T:G T G 10 0.545408298681766 0.350631698949064 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 2203175 C/G 1 22 10 32 10.0010174290011 5.45408298681766 4.54693444218349 C:G C G 10 0.545408298681766 0.113465476709352 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 16 11 27 7.27346722109174 5.99949128549943 1.27397593559232 A:G A G 10 0.545408298681766 0.701415732858495 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 2268311 G/A 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 A:G G A 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2268191_2268351:SGSM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 2275734 C/G 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 C:G C G 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2275637_2275782:SGSM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 3844345 G/A 1 24 27 51 10.9102008316376 14.7260240644077 -3.81582323277006 A:G G A 10 0.545408298681766 0.325445709924403 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3844265_3844600:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3844265_3844600:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3844265_3844600:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3844265_3844600:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3844265_3844600:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3844265_3844600:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3844265_3844600:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3844265_3844600:ATP2A3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 3910165 A/G 1 18 18 36 8.18265062372821 9.81734937627179 -1.63469875254357 A:G A G 10 0.545408298681766 0.618256262605604 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3907739_3910264:ZZEF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 3926110 C/G 1 2 8 10 0.909183402636468 4.36326638945413 -3.45408298681766 C:G C G 10 0.545408298681766 0.051055470816189 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3926003_3926122:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3925940_3926122:ZZEF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 3953083 T/C 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3953002_3953153:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3953002_3953153:ZZEF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 3953102 A/G 1 3 7 10 1.3637751039547 3.81785809077236 -2.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 0.201980178309513 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3953002_3953153:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3953002_3953153:ZZEF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 3966064 A/G 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 A:G A G 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3966047_3966211:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3966047_3966211:ZZEF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 3968064 A/C 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:C A C 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3967655_3968123:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3967655_3968123:ZZEF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 4446457 G/A 1 52 35 87 23.6387684685482 19.0892904538618 4.54947801468636 A:G G A 10 0.545408298681766 0.335203347738473 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 4585821 G/A 1 25 20 45 11.3647925329558 10.9081659736353 0.456626559320529 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4585797_4585868:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4585797_4585868:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4585797_4585868:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4585797_4585868:PELP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 4796286 C/T 0 19 0 19 8.63724232504645 0 8.63724232504645 C C 10 0.545408298681766 1.73829416739409e-05 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4796274_4796362:MINK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 5425076 A/G 1 18 9 27 8.18265062372821 4.90867468813589 3.27397593559232 A:G A G 10 0.545408298681766 0.247994952889908 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 18 9 27 8.18265062372821 4.90867468813589 3.27397593559232 T:C T C 10 0.545408298681766 0.247994952889908 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 5485367 A/T 1 15 7 22 6.81887551977351 3.81785809077236 3.00101742900115 A:T A T 10 0.545408298681766 0.284228668887522 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5485179_5485382:NLRP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 5487164 C/G 1 10 6 16 4.54591701318234 3.2724497920906 1.27346722109174 C:G C G 10 0.545408298681766 0.62020159802431 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5487007_5487832:NLRP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 6524298 T/A 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:T T A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6524108_6524318:KIAA0753 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 6661584 T/C 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 T:C:G T C 10 0.545408298681766 0.523850288987059 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 19 14 33 8.63724232504645 7.63571618154472 1.00152614350172 C:G C G 10 0.545408298681766 0.861592713125228 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 9 13 22 4.09132531186411 7.09030788286296 -2.99898257099885 T:C T C 10 0.545408298681766 0.207313306024605 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 18 16 34 8.18265062372821 8.72653277890826 -0.543882155180043 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.864915346461896 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 12 20 32 5.45510041581881 10.9081659736353 -5.45306555781651 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0742248918341754 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 86 77 163 39.0948863133681 41.996438998496 -2.90155268512786 A:G G A 10 0.545408298681766 0.69426362575442 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7154582 T/C 1 57 76 133 25.9117269751393 41.4510306998142 -15.5393037246749 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0087432400189271 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7210386 T/G 1 6 12 18 2.7275502079094 6.54489958418119 -3.81734937627179 T:G T G 10 0.545408298681766 0.0959765577209017 ENSG00000132507:ENST00000336452:exon_7210318_7210434:EIF5A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7224921 C/G 1 10 11 21 4.54591701318234 5.99949128549943 -1.45357427231709 C:G C G 10 0.545408298681766 0.662270617460159 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7224879_7225106:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7224879_7225106:NEURL4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7230845 G/T 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:G G T 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7230759_7231203:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7230759_7231203:NEURL4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7245371 A/G 1 45 39 84 20.4566265593205 21.2709236485889 -0.814297089268344 A:G A G 10 0.545408298681766 0.912881366892866 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7245267_7245386:ACAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7251605 G/C 1 10 11 21 4.54591701318234 5.99949128549943 -1.45357427231709 C:G G C 10 0.545408298681766 0.662270617460159 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7460517 G/C 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 C:G G C 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7460416_7460549:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7462555 G/A 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 A:G G A 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000161955:ENST00000380535:exon_7461609_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396542:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7461793_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7461914_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462104_7462614:TNFSF13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7462969 A/G 1 3 8 11 1.3637751039547 4.36326638945413 -2.99949128549943 A:G A G 10 0.545408298681766 0.126277531853182 ENSG00000239697:ENST00000518220:exon_7462941_7463019:TNFSF12;ENSG00000248871:ENST00000293826:exon_7462941_7463019:TNFSF12-TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462941_7463019:TNFSF13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7477938 G/C 1 250 215 465 113.647925329559 117.26278421658 -3.61485888702119 A:C:G G C 10 0.545408298681766 0.744613934808362 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7477864_7477996:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7477864_7477996:EIF4A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7479892 C/T 1 349 322 671 158.652503760064 175.621472175529 -16.968968415465 T:C C T 10 0.545408298681766 0.200775810295032 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7479842_7480010:EIF4A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7751778 G/A 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 128 118 246 58.187737768734 64.3581792444484 -6.17044147571444 A:G G A 10 0.545408298681766 0.442707785975764 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 43 32 75 19.5474431566841 17.4530655578165 2.09437759886755 A:G A G 10 0.545408298681766 0.644852590658279 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 8046772 C/G 1 23 20 43 10.4556091303194 10.9081659736353 -0.452556843315937 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 8053085 T/G 1 11 20 31 5.00050871450057 10.9081659736353 -5.90765725913475 T:G T G 10 0.545408298681766 0.0456230917285206 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000413754:exon_8053073_8053194:PER1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 8064083 T/G 1 40 27 67 18.1836680527294 14.7260240644077 3.45764398832168 T:C:G T G 10 0.545408298681766 0.462028269458455 ENSG00000220205:ENST00000316509:exon_8062467_8064189:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 8076778 C/T 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 T:C C T 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 8076802 T/A 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 A:T T A 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 8108331 A/G 1 147 85 232 66.8249800937804 46.3597053879501 20.4652747058303 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0068511639337135 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 145 88 233 65.9157966911439 47.9959302839954 17.9198664071485 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0211094604106377 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 8135061 T/C 1 15 15 30 6.81887551977351 8.18112448022649 -1.36224896045298 T:C T C 10 0.545408298681766 0.714695541216207 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8135044_8135133:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8135044_8135133:C17orf68 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 8135446 G/A 1 10 24 34 4.54591701318234 13.0897991683624 -8.54388215518004 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00504360063976242 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8135221_8135545:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8135221_8135545:C17orf68 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 8161149 C/T 1 14 15 29 6.36428381845528 8.18112448022649 -1.81684066177121 T:C C T 10 0.545408298681766 0.57718202619655 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8161125_8161256:PFAS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 8281059 A/C 1 18 19 37 8.18265062372821 10.3627576749536 -2.18010705122534 A:C A C 10 0.545408298681766 0.511375414673015 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 10541515 C/T 1 7 1 8 3.18214190922764 0.545408298681766 2.63673361054587 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0793702040361015 ENSG00000109063:ENST00000226209:exon_10541360_10541749:MYH3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 12899963 T/C 1 15 19 34 6.81887551977351 10.3627576749536 -3.54388215518004 T:C T C 10 0.545408298681766 0.232628088714879 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 12915009 G/A 1 9 5 14 4.09132531186411 2.72704149340883 1.36428381845528 A:G G A 10 0.545408298681766 0.594806597584705 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12914980_12915099:ELAC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 13980058 A/T 1 16 12 28 7.27346722109174 6.54489958418119 0.728567636910553 A:T A T 10 0.545408298681766 0.850972449556202 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 13 20 33 5.90969211713704 10.9081659736353 -4.99847385649828 A:G G A 10 0.545408298681766 0.114274055943939 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 14005439 G/A 1 14 5 19 6.36428381845528 2.72704149340883 3.63724232504645 A:G G A 10 0.545408298681766 0.109502725206357 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_14005435_14005559:COX10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 16842912 A/G 1 131 134 265 59.5515128726887 73.0847120233566 -13.533199150668 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0961699799068653 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 16852206 A/C 1 88 136 224 40.0040697160046 74.1755286207202 -34.1714589047156 A:T:C A C 10 0.545408298681766 5.94620643806676e-06 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 17425631 C/T 1 16 4 20 7.27346722109174 2.18163319472706 5.09183402636468 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0243023276820164 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000421096:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000461404:exon_17425594_17425709:PEMT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 17696531 G/C 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 C:G G C 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17696263_17696878:RAI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 17696755 C/A 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:C C A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17696263_17696878:RAI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 17698254 G/A 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G G A 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17697562_17700505:RAI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 17707105 T/C 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 T:C T C 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17707070_17707163:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17707070_17707355:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17707070_17707433:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17707070_17707355:RAI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 17750907 G/A 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17750663_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000486413:exon_17750866_17751097:TOM1L2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 66 71 137 30.0030522870034 38.7239892064054 -8.72093691940194 A:T:G G A 10 0.545408298681766 0.144853206058566 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 18167505 T/C 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 T:C T C 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 18219835 T/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C T C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 18220770 G/A 1 12 1 13 5.45510041581881 0.545408298681766 4.90969211713704 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00903562293581201 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 19578873 A/T 1 14 25 39 6.36428381845528 13.6352074670442 -7.27092364858887 A:T A T 10 0.545408298681766 0.0236064066703146 ENSG00000072210:ENST00000176643:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000395575:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000339618:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000472059:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000476965:exon_19578871_19579060:ALDH3A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 20108184 C/G 1 11 11 22 5.00050871450057 5.99949128549943 -0.998982570998852 C:G C G 10 0.545408298681766 0.675286531050552 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 20108239 A/T 1 12 12 24 5.45510041581881 6.54489958418119 -1.08979916836238 A:T A T 10 0.545408298681766 0.686028395996258 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 20163529 A/G 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 A:G A G 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20163505_20163607:SPECC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 20217375 G/A 1 2 7 9 0.909183402636468 3.81785809077236 -2.90867468813589 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0890512388728988 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20217289_20222339:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20217289_20218068:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20217289_20218047:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000492188:exon_20217289_20218047:SPECC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 10 0 10 4.54591701318234 0 4.54591701318234 T T 10 0.545408298681766 0.00270614740341092 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 14 0 14 6.36428381845528 0 6.36428381845528 G G 10 0.545408298681766 0.000222207897951029 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 16 0 16 7.27346722109174 0 7.27346722109174 G G 10 0.545408298681766 6.46385035602346e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 1 16 1 17 7.27346722109174 0.545408298681766 6.72805892240998 T:C C T 10 0.545408298681766 0.000835626696628304 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 21203964 C/G 0 17 0 17 7.72805892240998 0 7.72805892240998 C C 10 0.545408298681766 6.57923297009578e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 21 0 21 9.54642572768291 0 9.54642572768291 C C 10 0.545408298681766 4.65059056829628e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 34 0 34 15.45611784482 0 15.45611784482 C C 10 0.545408298681766 1.21380027832295e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 21 0 21 9.54642572768291 0 9.54642572768291 C C 10 0.545408298681766 4.65059056829628e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 13 0 13 5.90969211713704 0 5.90969211713704 C C 10 0.545408298681766 0.000413311221647668 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 21 0 21 9.54642572768291 0 9.54642572768291 C C 10 0.545408298681766 4.65059056829628e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 24 0 24 10.9102008316376 0 10.9102008316376 G G 10 0.545408298681766 6.60828956736528e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 54 0 54 24.5479518711846 0 24.5479518711846 G G 10 0.545408298681766 6.75732775079494e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 25909829 C/A 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 A:C C A 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 26900799 C/T 1 352 345 697 160.016278864018 188.165863045209 -28.1495841811909 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0331709436090094 ENSG00000109107:ENST00000395319:exon_26900753_26900952:ALDOC;ENSG00000109107:ENST00000226253:exon_26900753_26900952:ALDOC;ENSG00000109107:ENST00000395321:exon_26900753_26900952:ALDOC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 26955330 A/C 1 48 38 86 21.8204016632752 20.7255153499071 1.09488631336813 A:C A C 10 0.545408298681766 0.829497144406133 ENSG00000007202:ENST00000389003:exon_26955283_26955577:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000005905:exon_26955283_26955577:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000528896:exon_26955283_26955577:KIAA0100 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 26961718 G/A 1 12 15 27 5.45510041581881 8.18112448022649 -2.72602406440768 A:G G A 10 0.545408298681766 0.336126149245224 ENSG00000007202:ENST00000389003:exon_26961535_26962129:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000005905:exon_26961535_26962627:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000528896:exon_26961535_26962627:KIAA0100 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27009749 C/T 1 25 29 54 11.3647925329558 15.8168406617712 -4.45204812881536 T:C C T 10 0.545408298681766 0.274164623235989 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27009745_27009874:SUPT6H;ENSG00000109111:ENST00000347486:exon_27009745_27009874:SUPT6H HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27014396 C/T 1 22 21 43 10.0010174290011 11.4535742723171 -1.45255684331594 T:C C T 10 0.545408298681766 0.759814246368948 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27014483 C/A 1 34 30 64 15.45611784482 16.362248960453 -0.906131115633023 A:C C A 10 0.545408298681766 0.900246077111763 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27075423 C/T 1 88 101 189 40.0040697160046 55.0862381668584 -15.0821684508538 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0285002379936648 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075280_27075441:TRAF4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27085564 A/G 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 A:G A G 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000173065:ENST00000452648:exon_27082996_27086894:C17orf63;ENSG00000173065:ENST00000341217:exon_27082996_27086894:C17orf63 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 57 49 106 25.9117269751393 26.7250066354065 -0.813279660267195 T:C C T 10 0.545408298681766 0.92239249357696 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 63 56 119 28.6392771830487 30.5428647261789 -1.90358754313015 T:C C T 10 0.545408298681766 0.782575963975183 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27208326 C/T 1 22 30 52 10.0010174290011 16.362248960453 -6.36123153145183 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0939791988342782 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27208210_27208393:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27208210_27208393:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394910:exon_27208210_27208393:FLOT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 17 9 26 7.72805892240998 4.90867468813589 2.81938423427408 T:C C T 10 0.545408298681766 0.32654404784484 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27424316 G/A 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533652:exon_27423915_27424371:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527686:exon_27424164_27424368:MYO18A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27438469 G/A 1 9 10 19 4.09132531186411 5.45408298681766 -1.36275767495355 A:G G A 10 0.545408298681766 0.646488798036141 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438442_27438601:MYO18A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27530413 T/C 0 11 0 11 5.00050871450057 0 5.00050871450057 T T 10 0.545408298681766 0.00144172735090439 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27613677 G/A 1 19 13 32 8.63724232504645 7.09030788286296 1.54693444218349 A:G G A 10 0.545408298681766 0.600606398401896 ENSG00000108256:ENST00000225388:exon_27613010_27614734:NUFIP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27904711 G/A 1 16 10 26 7.27346722109174 5.45408298681766 1.81938423427408 A:G G A 10 0.545408298681766 0.556992721605183 ENSG00000108262:ENST00000225394:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394868:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000473217:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394869:exon_27904663_27904760:GIT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 27959903 G/A 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 A:G G A 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000141298:ENST00000269033:exon_27952956_27959949:SSH2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 28511884 G/A 1 72 90 162 32.7306024949129 49.0867468813589 -16.3561443864461 A:T:G G A 10 0.545408298681766 0.0113889305229297 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 28511978 G/A 1 104 73 177 47.2775369370963 39.8148058037689 7.46273113332742 A:G G A 10 0.545408298681766 0.290651808460586 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 28576076 T/C 1 63 44 107 28.6392771830487 23.9979651419977 4.64131204105104 T:C T C 10 0.545408298681766 0.383753714181843 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28575223_28576186:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28575223_28576186:BLMH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 28612448 G/C 1 24 20 44 10.9102008316376 10.9081659736353 0.00203485800229686 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28612406_28612498:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28612406_28612498:BLMH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 29111125 T/G 1 36 26 62 16.3653012474564 14.1806157657259 2.18468548173051 T:G T G 10 0.545408298681766 0.611791903676391 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 29113016 A/G 1 24 11 35 10.9102008316376 5.99949128549943 4.91070954613819 A:G A G 10 0.545408298681766 0.125592828818817 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29112937_29113049:CRLF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 29161358 C/T 1 3 9 12 1.3637751039547 4.90867468813589 -3.54489958418119 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0458142407340025 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 29161845 G/A 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 A:G G A 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 29162173 T/C 1 3 7 10 1.3637751039547 3.81785809077236 -2.45408298681766 T:C T C 10 0.545408298681766 0.201980178309513 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 29214387 T/C 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 T:C T C 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29214210_29214390:ATAD5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 29220905 T/C 1 11 19 30 5.00050871450057 10.3627576749536 -5.36224896045298 T:C T C 10 0.545408298681766 0.065281714411376 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29220312_29221168:ATAD5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 29226228 T/C 1 21 15 36 9.54642572768291 8.18112448022649 1.36530124745642 T:C T C 10 0.545408298681766 0.738807244293181 ENSG00000172171:ENST00000306049:exon_29226001_29226624:C17orf42 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 A:T T A 10 0.545408298681766 0.803992710629594 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 30533970 A/G 1 3 9 12 1.3637751039547 4.90867468813589 -3.54489958418119 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0458142407340025 ENSG00000126858:ENST00000333942:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000394692:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000358365:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000354266:exon_30533929_30534048:RHOT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 33433487 C/T 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 T:C C T 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000185379:ENST00000345365:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000474236:exon_33433405_33433490:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000360276:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000335858:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000394589:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000489139:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000345766:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000460118:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000494406:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000418935:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000415064:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000339934:exon_33433405_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000486323:exon_33433460_33433500:RAD51L3;ENSG00000185379:ENST00000467861:exon_33433460_33433500:RAD51L3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 33456425 C/T 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 T:C C T 10 0.545408298681766 0.428822200674009 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 33749546 A/G 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 33749919 A/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:C A C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000447040:exon_33749664_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000445092:exon_33749840_33750087:SLFN12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 33768199 G/A 1 24 33 57 10.9102008316376 17.9984738564983 -7.08827302486066 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0632659760185674 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 14 8 22 6.36428381845528 4.36326638945413 2.00101742900115 C:G G C 10 0.545408298681766 0.521743237801811 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 34416038 C/T 1 182 254 436 82.7356896399186 138.533707865169 -55.79801822525 T:C C T 10 0.545408298681766 1.05000199359277e-07 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34415602_34416108:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34415602_34416108:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34415605_34416108:CCL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 34416537 G/A 1 436 309 745 198.20198177475 168.531164292666 29.6708174820843 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0299358470965331 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 34432581 T/C 1 9 3 12 4.09132531186411 1.6362248960453 2.45510041581881 T:C T C 10 0.545408298681766 0.245731957393402 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 34432586 A/G 1 10 3 13 4.54591701318234 1.6362248960453 2.90969211713704 A:G A G 10 0.545408298681766 0.162038106908021 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 34432663 A/G 1 283 159 442 128.64945147306 86.7199194904008 41.9295319826594 A:G A G 10 0.545408298681766 5.79099717513885e-05 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 34432664 T/A 1 284 159 443 129.104043174378 86.7199194904008 42.3841236839777 A:T T A 10 0.545408298681766 4.82155191730118e-05 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 A:G G A 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 37 34 71 16.8198929487747 18.54388215518 -1.72398920640538 A:G G A 10 0.545408298681766 0.721383882955254 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 35896123 T/C 1 14 10 24 6.36428381845528 5.45408298681766 0.910200831637616 T:C T C 10 0.545408298681766 0.83838234018214 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000508220:exon_35896081_35897580:SYNRG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 18 12 30 8.18265062372821 6.54489958418119 1.63775103954702 C:G C G 10 0.545408298681766 0.587107629990466 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 35956391 G/C 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 C:G G C 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000378189:exon_35956270_35956391:SYNRG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 14 19 33 6.36428381845528 10.3627576749536 -3.99847385649828 A:G G A 10 0.545408298681766 0.167008656421679 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 36909499 A/T 1 117 89 206 53.1872290542334 48.5413385826772 4.64589047155621 A:T A T 10 0.545408298681766 0.529634961200729 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909403_36909587:PSMB3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 36926731 T/G 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 T:G T G 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 36926767 G/A 1 5 9 14 2.27295850659117 4.90867468813589 -2.63571618154472 A:G G A 10 0.545408298681766 0.185085810189955 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 37627436 G/A 1 21 24 45 9.54642572768291 13.0897991683624 -3.54337344067947 A:G G A 10 0.545408298681766 0.298548392309109 ENSG00000167258:ENST00000300647:exon_37627135_37628016:CDK12;ENSG00000167258:ENST00000430627:exon_37627132_37628016:CDK12;ENSG00000167258:ENST00000447079:exon_37627132_37628016:CDK12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 37922259 G/A 1 20 12 32 9.09183402636468 6.54489958418119 2.54693444218349 A:G G A 10 0.545408298681766 0.382100303850759 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37913968_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37921198_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37922043_37922746:IKZF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 38062196 G/A 1 9 5 14 4.09132531186411 2.72704149340883 1.36428381845528 A:G G A 10 0.545408298681766 0.594806597584705 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 18 9 27 8.18265062372821 4.90867468813589 3.27397593559232 T:C C T 10 0.545408298681766 0.247994952889908 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 38068621 T/C 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 T:C T C 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38068579_38068750:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000464556:exon_38068579_38068750:GSDMB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 14 9 23 6.36428381845528 4.90867468813589 1.45560913031938 A:G A G 10 0.545408298681766 0.676543181314199 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 38990834 G/C 1 20 33 53 9.09183402636468 17.9984738564983 -8.9066398301336 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0182446643558603 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 40175798 C/T 1 19 12 31 8.63724232504645 6.54489958418119 2.09234274086525 T:C C T 10 0.545408298681766 0.476878416492098 ENSG00000168256:ENST00000307641:exon_40175672_40177659:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000393884:exon_40175672_40177654:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000485789:exon_40175672_40176283:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000479407:exon_40175672_40176283:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000393885:exon_40175672_40177076:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000393880:exon_40175672_40176792:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000393881:exon_40175672_40176792:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000491638:exon_40175672_40176238:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000462043:exon_40175672_40176117:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000316082:exon_40175672_40175958:NKIRAS2;ENSG00000168256:ENST00000393879:exon_40175672_40177659:NKIRAS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 30 30 60 13.637751039547 16.362248960453 -2.72449792090596 A:C C A 10 0.545408298681766 0.517980026266761 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 50 55 105 22.7295850659117 29.9974564274971 -7.26787136158543 A:G A G 10 0.545408298681766 0.170153335370245 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 13 25 38 5.90969211713704 13.6352074670442 -7.72551534990711 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0139821717217304 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 40822678 C/T 1 14 21 35 6.36428381845528 11.4535742723171 -5.08929045386181 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0912742261267931 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000412503:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000445882:exon_40822591_40822723:PLEKHH3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 40835922 A/C 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 A:C A C 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40835839_40835940:CNTNAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 40842762 C/A 1 2 7 9 0.909183402636468 3.81785809077236 -2.90867468813589 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0890512388728988 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40842757_40842960:CNTNAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 15 7 22 6.81887551977351 3.81785809077236 3.00101742900115 T:C T C 10 0.545408298681766 0.284228668887522 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 41234470 A/G 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 A:G A G 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000487825:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461574:exon_41234421_41234592:BRCA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 41244000 T/C 1 9 15 24 4.09132531186411 8.18112448022649 -4.08979916836238 T:C T C 10 0.545408298681766 0.103758116307969 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 41244435 T/C 1 14 5 19 6.36428381845528 2.72704149340883 3.63724232504645 T:C T C 10 0.545408298681766 0.109502725206357 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 41244936 G/A 1 12 10 22 5.45510041581881 5.45408298681766 0.00101742900114843 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 41245237 A/G 1 11 16 27 5.00050871450057 8.72653277890826 -3.72602406440768 A:G A G 10 0.545408298681766 0.177124759497704 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 16 6 22 7.27346722109174 3.2724497920906 4.00101742900115 A:G G A 10 0.545408298681766 0.132099344893526 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 13 6 19 5.90969211713704 3.2724497920906 2.63724232504645 C:G C G 10 0.545408298681766 0.25633390279836 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 42152103 G/A 1 14 13 27 6.36428381845528 7.09030788286296 -0.726024064407682 A:G G A 10 0.545408298681766 0.84779448787691 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 42225547 A/C 1 6 11 17 2.7275502079094 5.99949128549943 -3.27194107759002 A:C A C 10 0.545408298681766 0.14387918634876 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42225226_42226395:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42225226_42226395:C17orf53 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 8 12 20 3.63673361054587 6.54489958418119 -2.90816597363532 C:G C G 10 0.545408298681766 0.261293206047355 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 42254281 A/G 1 2 10 12 0.909183402636468 5.45408298681766 -4.54489958418119 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0162217557673648 ENSG00000161664:ENST00000293414:exon_42254106_42254598:ASB16;ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 42268255 G/C 1 16 9 25 7.27346722109174 4.90867468813589 2.36479253295585 C:G G C 10 0.545408298681766 0.423463149171332 ENSG00000168591:ENST00000357984:exon_42267869_42269098:TMUB2;ENSG00000168591:ENST00000319511:exon_42267869_42269098:TMUB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 42953409 A/G 1 14 13 27 6.36428381845528 7.09030788286296 -0.726024064407682 A:G A G 10 0.545408298681766 0.84779448787691 ENSG00000108883:ENST00000426333:exon_42953302_42953468:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000402521:exon_42953302_42953468:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000262414:exon_42953302_42953468:EFTUD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 43111558 G/A 1 20 10 30 9.09183402636468 5.45408298681766 3.63775103954702 A:G G A 10 0.545408298681766 0.203010938958958 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 43314946 C/T 1 16 17 33 7.27346722109174 9.27194107759002 -1.99847385649828 T:C C T 10 0.545408298681766 0.490611458768862 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43314913_43315006:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43314913_43315006:FMNL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 43319770 C/T 1 28 28 56 12.7285676369106 15.2714323630894 -2.54286472617889 T:C C T 10 0.545408298681766 0.50527297468746 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43319708_43319832:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43319708_43319832:FMNL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 43342141 G/C 1 20 11 31 9.09183402636468 5.99949128549943 3.09234274086525 C:G G C 10 0.545408298681766 0.284898217962211 ENSG00000006062:ENST00000344686:exon_43340488_43342167:MAP3K14;ENSG00000006062:ENST00000376926:exon_43340495_43342167:MAP3K14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 44109474 G/A 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 A:G G A 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44109413_44109665:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44109413_44109665:KIAA1267 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 44117135 C/T 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 T:C C T 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44117068_44117250:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44117068_44117250:KIAA1267 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 44248499 G/C 1 8 4 12 3.63673361054587 2.18163319472706 1.45510041581881 C:G G C 10 0.545408298681766 0.564607771258684 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 20 26 46 9.09183402636468 14.1806157657259 -5.08878173936124 A:G G A 10 0.545408298681766 0.140613338777031 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 45735975 G/A 1 75 58 133 34.0943775988676 31.6336813235424 2.46069627532513 A:G G A 10 0.545408298681766 0.727794987457622 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45735874_45736026:KPNB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 45750468 T/C 1 98 78 176 44.5499867291869 42.5418472971777 2.00813943200919 T:C T C 10 0.545408298681766 0.820447758624187 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45750384_45750531:KPNB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 46688256 T/C 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:C T C 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000120087:ENST00000239165:exon_46687881_46688379:HOXB7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 48226811 C/T 1 51 41 92 23.1841767672299 22.3617402459524 0.822436521277531 T:C C T 10 0.545408298681766 0.91678489892779 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 48431032 G/A 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000509778:exon_48430991_48431035:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 48431197 C/T 1 5 9 14 2.27295850659117 4.90867468813589 -2.63571618154472 T:C C T 10 0.545408298681766 0.185085810189955 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 48432324 G/C 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 C:G G C 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48432215_48432417:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48432215_48432417:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48432215_48432417:XYLT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 48433958 T/C 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 T:C T C 10 0.545408298681766 0.40572272702491 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48433872_48434134:XYLT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 48437456 C/G 1 8 11 19 3.63673361054587 5.99949128549943 -2.36275767495355 C:G C G 10 0.545408298681766 0.357731776873343 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48437330_48438512:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48437330_48438512:XYLT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 48456193 T/C 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 48549791 C/G 1 3 17 20 1.3637751039547 9.27194107759002 -7.90816597363532 C:G C G 10 0.545408298681766 0.000417929586138099 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000508245:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000510262:exon_48549789_48549807:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512119:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512537:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000503295:exon_48549492_48549940:ACSF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 48557326 G/A 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 A:G G A 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 48557348 T/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C T C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 48629458 A/G 1 10 13 23 4.54591701318234 7.09030788286296 -2.54439086968062 A:G A G 10 0.545408298681766 0.302592597377063 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48629146_48629541:SPATA20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 49350802 A/C 1 24 21 45 10.9102008316376 11.4535742723171 -0.543373440679469 A:C A C 10 0.545408298681766 0.882099628476873 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49350723_49350811:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000508506:exon_49350723_49350811:UTP18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 56584205 A/C 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 A:C A C 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56584104_56584232:MTMR4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 56584508 T/C 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56584484_56584680:MTMR4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 56585872 G/C 1 11 11 22 5.00050871450057 5.99949128549943 -0.998982570998852 C:G G C 10 0.545408298681766 0.675286531050552 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56585829_56585925:MTMR4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 26 30 56 11.8193842342741 16.362248960453 -4.5428647261789 A:G G A 10 0.545408298681766 0.229981504501609 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 58031412 A/G 1 12 8 20 5.45510041581881 4.36326638945413 1.09183402636468 A:G A G 10 0.545408298681766 0.660903045813617 ENSG00000189050:ENST00000305783:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000482446:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000343124:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000442346:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000466544:exon_58031406_58031507:RNFT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 60040329 C/T 1 11 17 28 5.00050871450057 9.27194107759002 -4.27143236308945 T:C C T 10 0.545408298681766 0.128767570080049 ENSG00000108510:ENST00000262436:exon_60040113_60040332:MED13;ENSG00000108510:ENST00000397786:exon_60040113_60040332:MED13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 60769803 A/G 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:G A G 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000011028:ENST00000303375:exon_60769592_60770953:MRC2;ENSG00000011028:ENST00000446119:exon_60769592_60770953:MRC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 61685319 G/A 1 63 52 115 28.6392771830487 28.3612315314518 0.278045651596912 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000136463:ENST00000258975:exon_61685162_61685724:TACO1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 65916249 A/G 1 18 20 38 8.18265062372821 10.9081659736353 -2.72551534990711 A:G A G 10 0.545408298681766 0.417110767640708 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65916131_65916259:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65916131_65916259:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65916131_65916259:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65916131_65916259:BPTF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 67109833 T/A 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:T T A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000154262:ENST00000284425:exon_67109759_67109878:ABCA6;ENSG00000154262:ENST00000446604:exon_67109759_67109878:ABCA6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 67273882 C/A 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:C C A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67273782_67273983:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67273782_67273983:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67273782_67273983:ABCA5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 67290840 T/C 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67290796_67290854:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67290796_67290854:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67290796_67290854:ABCA5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 67513003 C/A 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:C C A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000108984:ENST00000359094:exon_67512996_67513044:MAP2K6;ENSG00000108984:ENST00000435374:exon_67512996_67513044:MAP2K6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 71192663 G/A 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71192646_71192890:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71192646_71192890:COG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 71204440 C/T 1 54 68 122 24.5479518711846 37.0877643103601 -12.5398124391754 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0231945653001768 ENSG00000133193:ENST00000405159:exon_71203492_71205907:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000403627:exon_71203492_71205907:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000255557:exon_71203493_71205907:FAM104A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 71238433 G/A 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G G A 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71238383_71238490:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71238383_71238490:C17orf80 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 63 69 132 28.6392771830487 37.6331726090418 -8.99389542599311 T:C T C 10 0.545408298681766 0.116705785349065 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 8 12 20 3.63673361054587 6.54489958418119 -2.90816597363532 C:G G C 10 0.545408298681766 0.261293206047355 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 33 27 60 15.0015261435017 14.7260240644077 0.275502079094041 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 37 25 62 16.8198929487747 13.6352074670442 3.18468548173051 C:G G C 10 0.545408298681766 0.446245233812479 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 74077797 C/T 1 25 23 48 11.3647925329558 12.5443908696806 -1.17959833672477 T:C C T 10 0.545408298681766 0.77296178094281 ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000421794:exon_74077681_74077836:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 74163821 G/A 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000141576:ENST00000269391:exon_74163732_74163878:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000319945:exon_74163732_74163878:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000301610:exon_74163732_74163878:RNF157 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 74261677 T/C 1 150 165 315 68.1887551977351 89.9923692824914 -21.8036140847563 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0148857114282312 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74261283_74261706:FAM100B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 33 24 57 15.0015261435017 13.0897991683624 1.91172697513934 T:C T C 10 0.545408298681766 0.690423307678617 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 74387284 C/T 1 18 20 38 8.18265062372821 10.9081659736353 -2.72551534990711 T:C:G C T 10 0.545408298681766 0.417110767640708 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74385614_74387694:UBE2O HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 29 25 54 13.1831593382288 13.6352074670442 -0.452048128815363 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 75484395 C/T 1 156 158 314 70.9163054056445 86.174511191719 -15.2582057860745 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0890804193342893 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75484322_75484403:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75484322_75484403:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75484322_75484403:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75484322_75484403:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75484322_75484403:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75484322_75484403:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75484322_75484403:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75484322_75484403:SEPT9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 75494705 A/G 0 0 220 220 0 119.989825709989 -119.989825709989 G A G 10 0.545408298681766 4.75040599408325e-76 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 76115353 T/C 1 10 5 15 4.54591701318234 2.72704149340883 1.81887551977351 T:C T C 10 0.545408298681766 0.440723047905603 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 76130575 A/T 1 12 8 20 5.45510041581881 4.36326638945413 1.09183402636468 A:T A T 10 0.545408298681766 0.660903045813617 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130475_76130645:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130537_76130645:TMC8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 76131070 G/A 1 22 22 44 10.0010174290011 11.9989825709989 -1.9979651419977 A:G G A 10 0.545408298681766 0.54917812353393 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130951_76131090:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130951_76131090:TMC8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 76134828 C/A 1 13 13 26 5.90969211713704 7.09030788286296 -1.18061576572592 A:C C A 10 0.545408298681766 0.696154695081167 ENSG00000167895:ENST00000301627:exon_76134690_76134885:TMC8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 1 21 28 49 9.54642572768291 15.2714323630894 -5.72500663540653 T:C T C 10 0.545408298681766 0.114700126160969 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 1 22 34 56 10.0010174290011 18.54388215518 -8.54286472617889 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0228553364979956 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 12 15 27 5.45510041581881 8.18112448022649 -2.72602406440768 T:C C T 10 0.545408298681766 0.336126149245224 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 76814782 G/A 1 10 5 15 4.54591701318234 2.72704149340883 1.81887551977351 A:G G A 10 0.545408298681766 0.440723047905603 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76814749_76814860:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76814749_76814860:USP36 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 76817090 C/T 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 T:C C T 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76817073_76817143:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76817073_76817143:USP36 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 78084769 G/A 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78084740_78084824:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78084740_78084824:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78084740_78084824:GAA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 78085871 G/A 1 2 7 9 0.909183402636468 3.81785809077236 -2.90867468813589 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0890512388728988 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78085782_78085899:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78085782_78085899:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78085782_78085899:GAA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 78087041 G/A 1 6 10 16 2.7275502079094 5.45408298681766 -2.72653277890826 A:G G A 10 0.545408298681766 0.211691046173674 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78087017_78087165:GAA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 78087109 A/G 1 8 7 15 3.63673361054587 3.81785809077236 -0.18112448022649 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78087017_78087165:GAA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 78092063 G/A 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091992_78092156:GAA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 78113832 G/A 1 22 27 49 10.0010174290011 14.7260240644077 -4.72500663540653 A:G G A 10 0.545408298681766 0.197352926950644 ENSG00000141543:ENST00000269349:exon_78113807_78113939:EIF4A3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 T:C C T 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 78293189 A/T 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 A:T A T 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78292990_78295258:RNF213 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 78865630 A/G 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 A:G A G 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78865520_78865637:RPTOR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 79219903 G/C 1 36 34 70 16.3653012474564 18.54388215518 -2.17858090772362 C:G G C 10 0.545408298681766 0.632239889020562 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 79526402 G/C 1 27 19 46 12.2739759355923 10.3627576749536 1.91121826063876 C:G G C 10 0.545408298681766 0.657632938359347 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79523915_79526442:NPLOC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 79571637 C/G 1 17 16 33 7.72805892240998 8.72653277890826 -0.998473856498277 C:G C G 10 0.545408298681766 0.730494475947213 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79571574_79571753:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79571574_79571753:NPLOC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 8 15 23 3.63673361054587 8.18112448022649 -4.54439086968062 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0619742792817211 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 79991603 C/T 1 8 10 18 3.63673361054587 5.45408298681766 -1.81734937627179 T:C C T 10 0.545408298681766 0.479767431495367 ENSG00000169750:ENST00000306897:exon_79991575_79992077:RAC3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 80006957 A/C 1 7 11 18 3.18214190922764 5.99949128549943 -2.81734937627179 A:C A C 10 0.545408298681766 0.237114548756310 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 80007887 A/G 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 80007897 G/T 1 3 7 10 1.3637751039547 3.81785809077236 -2.45408298681766 T:G G T 10 0.545408298681766 0.201980178309513 ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 80008392 G/T 1 8 16 24 3.63673361054587 8.72653277890826 -5.08979916836238 T:G G T 10 0.545408298681766 0.0412369155098749 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80008278_80008431:RFNG;ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 80014861 T/G 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80014505_80015346:GPS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 80016017 C/T 1 151 169 320 68.6433468990533 92.1740024772185 -23.5306555781651 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00970899569716185 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80015754_80016130:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80015782_80016130:DUS1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 80017902 C/T 1 41 46 87 18.6382597540476 25.0887817393612 -6.45052198531364 T:C C T 10 0.545408298681766 0.196108829467297 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80017824_80017969:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80017824_80017969:DUS1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 80020812 C/T 1 52 38 90 23.6387684685482 20.7255153499071 2.91325311864106 T:C C T 10 0.545408298681766 0.597016536208683 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80020737_80020849:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80020737_80020820:DUS1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 80045086 G/C 1 58 44 102 26.3663186764576 23.9979651419977 2.36835353445987 C:G G C 10 0.545408298681766 0.691222703353589 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044926_80045129:FASN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 30 17 47 13.637751039547 9.27194107759002 4.365809961957 A:T:G G A 10 0.545408298681766 0.241479766928559 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 80373452 C/T 1 14 16 30 6.36428381845528 8.72653277890826 -2.36224896045298 T:C C T 10 0.545408298681766 0.464241697645823 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 80391684 A/G 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 A:G A G 10 0.545408298681766 0.609212519966719 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80391534_80391698:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80391534_80391698:HEXDC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 17 80585094 C/T 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 T:C C T 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000141580:ENST00000392325:exon_80585080_80585167:WDR45L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 166819 T/C 1 22 13 35 10.0010174290011 7.09030788286296 2.91070954613819 T:C T C 10 0.545408298681766 0.396807608459019 ENSG00000101557:ENST00000400266:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000261601:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000383589:exon_166787_166819:USP14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 658064 G/C 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 C:G G C 10 0.545408298681766 0.40572272702491 ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 276 236 512 125.467309563833 128.716358488897 -3.2490489250642 T:C C T 10 0.545408298681766 0.79009924785262 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 2705700 A/G 1 6 11 17 2.7275502079094 5.99949128549943 -3.27194107759002 A:G A G 10 0.545408298681766 0.14387918634876 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2705692_2705805:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2705692_2705805:SMCHD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 2707619 G/A 1 10 5 15 4.54591701318234 2.72704149340883 1.81887551977351 A:G G A 10 0.545408298681766 0.440723047905603 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2707561_2707643:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2707561_2707643:SMCHD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 2724930 A/T 1 5 10 15 2.27295850659117 5.45408298681766 -3.18112448022649 A:T A T 10 0.545408298681766 0.121647049471624 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2724897_2724993:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2724897_2724993:SMCHD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 2763697 C/T 1 9 10 19 4.09132531186411 5.45408298681766 -1.36275767495355 T:C C T 10 0.545408298681766 0.646488798036141 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2763635_2763787:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2763635_2763787:SMCHD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 2920288 G/A 1 9 8 17 4.09132531186411 4.36326638945413 -0.271941077590022 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000101577:ENST00000261596:exon_2916992_2920435:LPIN2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 3450455 C/A 1 4 10 14 1.81836680527294 5.45408298681766 -3.63571618154472 A:C C A 10 0.545408298681766 0.061538052903825 ENSG00000177426:ENST00000407501:exon_3450320_3450503:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000340165:exon_3450172_3450503:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000343820:exon_3450182_3450503:TGIF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 3457606 C/T 1 9 3 12 4.09132531186411 1.6362248960453 2.45510041581881 T:C C T 10 0.545408298681766 0.245731957393402 ENSG00000177426:ENST00000401449:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000345133:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000405385:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000407501:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000340165:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000343820:exon_3457363_3458388:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000457420:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000330513:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000400167:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000472042:exon_3457363_3458409:TGIF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 5292030 A/G 1 4 13 17 1.81836680527294 7.09030788286296 -5.27194107759002 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0132274194655084 ENSG00000198081:ENST00000357006:exon_5289018_5292203:ZFP161;ENSG00000198081:ENST00000400143:exon_5289019_5292203:ZFP161 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 9117867 T/C 1 55 39 94 25.0025435725029 21.2709236485889 3.731619923914 T:C T C 10 0.545408298681766 0.469526121421309 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9117385_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9117836_9117901:NDUFV2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 9254857 C/G 1 53 60 113 24.0933601698664 32.724497920906 -8.63113775103956 C:G C G 10 0.545408298681766 0.108710376118986 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000359158:exon_9254209_9255428:ANKRD12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 9562042 C/T 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 T:C C T 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9561978_9562073:PPP4R1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 10691357 G/A 1 9 2 11 4.09132531186411 1.09081659736353 3.00050871450057 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0774548990144863 ENSG00000154864:ENST00000503781:exon_10691223_10691381:FAM38B;ENSG00000154864:ENST00000285141:exon_10691223_10691381:FAM38B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 10696227 C/T 1 8 1 9 3.63673361054587 0.545408298681766 3.09132531186411 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0460880501374676 ENSG00000154864:ENST00000503781:exon_10696072_10696286:FAM38B;ENSG00000154864:ENST00000285141:exon_10696072_10696286:FAM38B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 12308793 G/C 1 35 92 127 15.9107095461382 50.1775634787225 -34.2668539325843 C:G G C 10 0.545408298681766 9.66965737407918e-10 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12308686_12308794:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12308686_12308794:TUBB6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 76 83 159 34.5489693001858 45.2688887905866 -10.7199194904008 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0944636554360498 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 12817203 G/A 1 12 12 24 5.45510041581881 6.54489958418119 -1.08979916836238 A:G G A 10 0.545408298681766 0.686028395996258 ENSG00000175354:ENST00000327283:exon_12817155_12817364:PTPN2;ENSG00000175354:ENST00000353319:exon_12817155_12817364:PTPN2;ENSG00000175354:ENST00000399900:exon_12817155_12817364:PTPN2;ENSG00000175354:ENST00000341361:exon_12817155_12817364:PTPN2;ENSG00000175354:ENST00000309660:exon_12817155_12817364:PTPN2;ENSG00000175354:ENST00000533284:exon_12817155_12817364:PTPN2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 42 34 76 19.0928514553658 18.54388215518 0.548969300185785 A:C C A 10 0.545408298681766 0.908986090913217 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 13056333 C/T 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 T:C C T 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13055779_13056697:CEP192 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 13068132 T/C 1 13 11 24 5.90969211713704 5.99949128549943 -0.0897991683623838 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13068093_13068236:CEP192 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 13095609 T/C 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13095502_13095680:CEP192 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 T:G G T 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 19154143 G/A 1 21 16 37 9.54642572768291 8.72653277890826 0.819892948774658 A:G G A 10 0.545408298681766 0.869519945016435 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 21100240 C/T 1 11 6 17 5.00050871450057 3.2724497920906 1.72805892240998 T:C C T 10 0.545408298681766 0.471102205741298 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 21109250 T/C 1 17 14 31 7.72805892240998 7.63571618154472 0.0923427408652548 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 21120444 T/C 1 2 7 9 0.909183402636468 3.81785809077236 -2.90867468813589 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0890512388728988 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21120412_21120501:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21120412_21120501:NPC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 21739725 T/C 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 T:C T C 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000154040:ENST00000399496:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399478:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000463087:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000486759:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000327201:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399499:exon_21739436_21740033:CABYR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 23873463 T/C 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 T:C T C 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23873390_23873495:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23873390_23873495:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23873390_23873495:TAF4B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 24035675 T/C 1 10 4 14 4.54591701318234 2.18163319472706 2.36428381845528 T:C T C 10 0.545408298681766 0.284657873718901 ENSG00000134504:ENST00000317932:exon_24034874_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000417602:exon_24034877_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000408011:exon_24034877_24035865:KCTD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 29104698 C/T 1 14 14 28 6.36428381845528 7.63571618154472 -1.27143236308945 T:C C T 10 0.545408298681766 0.70569768807638 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29104666_29104851:DSG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 29122799 G/A 1 21 28 49 9.54642572768291 15.2714323630894 -5.72500663540653 A:G G A 10 0.545408298681766 0.114700126160969 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29122483_29122815:DSG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 29126670 T/C 1 34 29 63 15.45611784482 15.8168406617712 -0.360722816951256 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 32834095 T/C 1 7 10 17 3.18214190922764 5.45408298681766 -2.27194107759002 T:C T C 10 0.545408298681766 0.332347257730029 ENSG00000186814:ENST00000333206:exon_32832819_32834345:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000420878:exon_32833423_32834187:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000360932:exon_32833423_32834285:ZSCAN30 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 32834186 T/G 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 T:G T G 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000186814:ENST00000333206:exon_32832819_32834345:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000420878:exon_32833423_32834187:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000360932:exon_32833423_32834285:ZSCAN30 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 30 26 56 13.637751039547 14.1806157657259 -0.542864726178896 T:C T C 10 0.545408298681766 0.89404709578787 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 33048554 C/T 1 39 24 63 17.7290763514111 13.0897991683624 4.63927718304874 T:C C T 10 0.545408298681766 0.256943672375032 ENSG00000153391:ENST00000441607:exon_33048293_33048706:INO80C;ENSG00000153391:ENST00000334598:exon_33048297_33048706:INO80C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 43678225 T/C 1 84 64 148 38.1857029107317 34.906131115633 3.27957179509863 T:C T C 10 0.545408298681766 0.620898236402886 ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43678138_43678245:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43678138_43678319:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43678138_43678261:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000484856:exon_43678138_43678245:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000475026:exon_43678138_43678239:ATP5A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 46447817 G/C 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000101665:ENST00000262158:exon_46446223_46448280:SMAD7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 46448129 G/A 1 10 9 19 4.54591701318234 4.90867468813589 -0.362757674953554 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000101665:ENST00000262158:exon_46446223_46448280:SMAD7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 47017820 A/G 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 A:G A G 10 0.545408298681766 0.628918711033401 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 47800179 G/C 1 18 13 31 8.18265062372821 7.09030788286296 1.09234274086525 C:G G C 10 0.545408298681766 0.722444112386434 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47799934_47800233:MBD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 47908556 G/A 1 13 17 30 5.90969211713704 9.27194107759002 -3.36224896045298 A:G G A 10 0.545408298681766 0.271442971826853 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000488454:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47908499_47908596:SKA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 10 21 31 4.54591701318234 11.4535742723171 -6.90765725913475 A:C A C 10 0.545408298681766 0.0176793051147699 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 55221648 T/C 1 9 2 11 4.09132531186411 1.09081659736353 3.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0774548990144863 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55221492_55221656:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55221492_55221656:FECH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 55226383 G/C 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 C:G G C 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55226377_55226475:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55226377_55226475:FECH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 55247336 C/A 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 A:C C A 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55247305_55247431:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55247287_55247431:FECH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 59768375 A/G 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 A:G A G 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000197563:ENST00000400334:exon_59768308_59768416:PIGN;ENSG00000197563:ENST00000357637:exon_59768308_59768416:PIGN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 59770033 C/T 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000197563:ENST00000400334:exon_59770027_59770135:PIGN;ENSG00000197563:ENST00000357637:exon_59770027_59770135:PIGN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 59774037 C/T 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 T:C C T 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000197563:ENST00000400334:exon_59774022_59774114:PIGN;ENSG00000197563:ENST00000357637:exon_59774022_59774114:PIGN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 59780424 A/G 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G A G 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000197563:ENST00000400334:exon_59780367_59780549:PIGN;ENSG00000197563:ENST00000357637:exon_59780367_59780549:PIGN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 59942691 T/C 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000134444:ENST00000398130:exon_59942607_59942706:KIAA1468;ENSG00000134444:ENST00000256858:exon_59942607_59942706:KIAA1468 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 60237388 A/G 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 A:G A G 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60237336_60237464:ZCCHC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 60241732 C/T 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 T:C C T 10 0.545408298681766 0.823095632852268 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 15 11 26 6.81887551977351 5.99949128549943 0.819384234274084 T:C C T 10 0.545408298681766 0.844962722330158 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 61582751 T/G 1 24 36 60 10.9102008316376 19.6346987525436 -8.72449792090596 T:G T G 10 0.545408298681766 0.0271706968565326 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 61582867 A/G 1 14 23 37 6.36428381845528 12.5443908696806 -6.18010705122534 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0474509922336889 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 61585260 T/C 1 1 7 8 0.454591701318234 3.81785809077236 -3.36326638945413 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0271590031820889 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61585199_61585336:SERPINB10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 61587067 C/T 1 6 17 23 2.7275502079094 9.27194107759002 -6.54439086968062 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0102618161929670 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 61600384 C/T 1 12 40 52 5.45510041581881 21.8163319472706 -16.3612315314518 T:C C T 10 0.545408298681766 4.70447073732127e-06 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 61602360 G/A 1 97 25 122 44.0953950278687 13.6352074670442 30.4601875608245 A:G G A 10 0.545408298681766 1.42474524043094e-08 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61602072_61603345:SERPINB10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 61647069 G/A 1 7 12 19 3.18214190922764 6.54489958418119 -3.36275767495355 A:G G A 10 0.545408298681766 0.165845385921528 ENSG00000221887:ENST00000481726:exon_61647035_61647172:HMSD;ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000448851:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61647042_61647172:SERPINB8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 61650865 G/A 1 16 10 26 7.27346722109174 5.45408298681766 1.81938423427408 A:G G A 10 0.545408298681766 0.556992721605183 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61650813_61650881:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61650813_61650955:SERPINB8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 61654329 C/T 1 32 14 46 14.5469344421835 7.63571618154472 6.91121826063876 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0531127216690116 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 67718688 A/G 1 3 7 10 1.3637751039547 3.81785809077236 -2.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 0.201980178309513 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67718647_67718784:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67718647_67718784:RTTN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 71816106 G/A 1 42 33 75 19.0928514553658 17.9984738564983 1.09437759886755 A:G G A 10 0.545408298681766 0.817774338110568 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 71928150 C/T 1 76 62 138 34.5489693001858 33.8153145182695 0.733654781916293 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.932016449859195 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71928150_71928179:CYB5A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 61 41 102 27.7300937804123 22.3617402459524 5.36835353445987 A:G G A 10 0.545408298681766 0.320344299256594 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 43 33 76 19.5474431566841 17.9984738564983 1.54896930018578 T:C T C 10 0.545408298681766 0.731594101793 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 47 33 80 21.365809961957 17.9984738564983 3.36733610545872 T:C T C 10 0.545408298681766 0.501115123290234 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 72185688 G/A 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:G G A 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 72346494 C/G 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 C:G C G 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000215421:ENST00000299687:exon_72342919_72347662:ZNF407;ENSG00000215421:ENST00000309902:exon_72342919_72347662:ZNF407 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 72998268 T/C 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 T:C T C 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 72998886 T/C 1 4 10 14 1.81836680527294 5.45408298681766 -3.63571618154472 T:C T C 10 0.545408298681766 0.061538052903825 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 74728823 C/T 1 11 15 26 5.00050871450057 8.18112448022649 -3.18061576572592 T:C C T 10 0.545408298681766 0.239917577897468 ENSG00000197971:ENST00000382582:exon_74728788_74729051:MBP;ENSG00000197971:ENST00000355994:exon_74728788_74729224:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397875:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397866:exon_74728788_74729018:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397865:exon_74728788_74729042:MBP;ENSG00000197971:ENST00000527041:exon_74728788_74729021:MBP;ENSG00000197971:ENST00000359645:exon_74728788_74728998:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397869:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000354542:exon_74728788_74729217:MBP;ENSG00000197971:ENST00000526111:exon_74728788_74728869:MBP;ENSG00000197971:ENST00000529144:exon_74728788_74728869:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397868:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000473302:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000483025:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000493623:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000484548:exon_74728788_74728998:MBP;ENSG00000197971:ENST00000467108:exon_74728788_74729014:MBP;ENSG00000197971:ENST00000459948:exon_74728788_74729017:MBP;ENSG00000197971:ENST00000482445:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000498683:exon_74728788_74729224:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397863:exon_74724735_74729224:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397860:exon_74724735_74729224:MBP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 77067000 T/G 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 T:G T G 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000166377:ENST00000426216:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000359184:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000440332:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000307671:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000490210:exon_77066986_77067234:ATP9B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 77227476 A/G 1 20 23 43 9.09183402636468 12.5443908696806 -3.45255684331594 A:G A G 10 0.545408298681766 0.358350515482876 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77227450_77227582:NFATC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 77246444 C/T 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 T:C C T 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 77473086 G/A 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 A:G G A 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77472972_77473138:CTDP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 77474711 A/G 0 21 0 21 9.54642572768291 0 9.54642572768291 A A 10 0.545408298681766 4.65059056829628e-06 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77474491_77475528:CTDP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 77474921 G/A 1 5 10 15 2.27295850659117 5.45408298681766 -3.18112448022649 A:G G A 10 0.545408298681766 0.121647049471624 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77474491_77475528:CTDP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 18 77894133 T/C 1 11 11 22 5.00050871450057 5.99949128549943 -0.998982570998852 T:C T C 10 0.545408298681766 0.675286531050552 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 579627 C/T 1 127 251 378 57.7331460674157 136.897482969123 -79.1643369017076 T:C C T 10 0.545408298681766 2.97594897431449e-16 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 580388 C/G 1 180 357 537 81.8265062372821 194.71076262939 -112.884256392108 C:G C G 10 0.545408298681766 1.56552746868181e-22 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 651852 C/T 1 23 42 65 10.4556091303194 22.9071485446342 -12.4515394143148 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00253165189826782 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_651611_651855:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_651611_651855:RNF126 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 804085 C/T 1 166 165 331 75.4622224188268 89.9923692824914 -14.5301468636645 T:C C T 10 0.545408298681766 0.109786267547114 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804036_804208:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804036_804208:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804036_804208:PTBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 804396 C/T 1 181 166 347 82.2810979386004 90.5377775811732 -8.25667964257281 T:C C T 10 0.545408298681766 0.388564213628345 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 804642 C/T 1 150 135 285 68.1887551977351 73.6301203220384 -5.4413651243033 T:C C T 10 0.545408298681766 0.552045198163117 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 808586 C/G 1 135 105 240 61.3698796779616 57.2678713615854 4.10200831637616 C:G C G 10 0.545408298681766 0.604754388057028 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 808742 G/T 1 167 145 312 75.9168141201451 79.0842033088561 -3.167389188711 T:G G T 10 0.545408298681766 0.733230619619333 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 929741 C/T 1 13 5 18 5.90969211713704 2.72704149340883 3.18265062372821 T:C C T 10 0.545408298681766 0.158835868694104 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 984533 T/C 1 57 33 90 25.9117269751393 17.9984738564983 7.91325311864106 T:C T C 10 0.545408298681766 0.111904193465894 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 984554 C/G 1 59 33 92 26.8209103777758 17.9984738564983 8.82243652127753 C:G C G 10 0.545408298681766 0.074729582353812 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 990281 G/A 1 36 15 51 16.3653012474564 8.18112448022649 8.18417676722994 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0239478600215497 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_990223_990364:WDR18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 990819 G/A 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G G A 10 0.545408298681766 0.735472382770589 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1036444 G/A 1 121 96 217 55.0055958595063 52.3591966734495 2.64639918605678 A:G G A 10 0.545408298681766 0.733690650875913 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1065044 C/T 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000524383:exon_1064930_1065170:ABCA7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 18 19 37 8.18265062372821 10.3627576749536 -2.18010705122534 T:C T C 10 0.545408298681766 0.511375414673015 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 20 25 45 9.09183402636468 13.6352074670442 -4.54337344067947 A:G G A 10 0.545408298681766 0.180975732897204 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 49 44 93 22.2749933645935 23.9979651419977 -1.72297177740424 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.755219371088336 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1095352 C/G 1 13 9 22 5.90969211713704 4.90867468813589 1.00101742900115 C:G C G 10 0.545408298681766 0.83113387846694 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1095355 C/T 1 10 7 17 4.54591701318234 3.81785809077236 0.728058922409978 T:C C T 10 0.545408298681766 0.810655514815455 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1110829 G/A 1 11 10 21 5.00050871450057 5.45408298681766 -0.453574272317086 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1110711_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1110744_1110887:SBNO2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1119019 C/T 1 12 5 17 5.45510041581881 2.72704149340883 2.72805892240998 T:C C T 10 0.545408298681766 0.227116627671435 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1119010_1119163:SBNO2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 17 20 37 7.72805892240998 10.9081659736353 -3.18010705122534 T:C C T 10 0.545408298681766 0.324135071278555 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1278861 C/T 1 93 71 164 42.2770282225958 38.7239892064054 3.55303901619038 T:C C T 10 0.545408298681766 0.584316763773937 ENSG00000228300:ENST00000409293:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000492647:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000513897:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000518332:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000530634:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000469144:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000485191:exon_1278776_1279221:C19orf24;ENSG00000226593:ENST00000416408:exon_1278776_1279242:AC004258.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1370675 C/G 1 15 8 23 6.81887551977351 4.36326638945413 2.45560913031938 C:G C G 10 0.545408298681766 0.403117218653481 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1370641_1371077:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1370641_1371077:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1370641_1371077:MUM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1397443 G/A 1 24 28 52 10.9102008316376 15.2714323630894 -4.36123153145183 A:G G A 10 0.545408298681766 0.265309796508155 ENSG00000130005:ENST00000252288:exon_1397089_1397498:GAMT;ENSG00000130005:ENST00000455182:exon_1397092_1397498:GAMT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1615796 G/A 1 61 67 128 27.7300937804123 36.5423560116783 -8.81226223126605 A:G G A 10 0.545408298681766 0.131198822919642 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1615284_1615820:TCF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1619339 T/C 1 50 53 103 22.7295850659117 28.9066398301336 -6.1770547642219 T:C T C 10 0.545408298681766 0.235758864441380 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1819125 T/C 1 20 14 34 9.09183402636468 7.63571618154472 1.45611784481996 T:C T C 10 0.545408298681766 0.731212887929503 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1827565 A/G 1 18 20 38 8.18265062372821 10.9081659736353 -2.72551534990711 A:G A G 10 0.545408298681766 0.417110767640708 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1854557 A/G 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 A:G A G 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1914980 G/A 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000227500:ENST00000452128:exon_1914978_1915025:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000316097:exon_1914978_1915025:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000460767:exon_1914978_1915025:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000489554:exon_1914978_1915025:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000409472:exon_1914978_1915025:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000411971:exon_1914978_1915025:SCAMP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1969882 G/T 1 23 23 46 10.4556091303194 12.5443908696806 -2.08878173936123 T:G G T 10 0.545408298681766 0.556524391457977 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1969507_1969958:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1969507_1969958:CSNK1G2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1979811 A/G 1 50 51 101 22.7295850659117 27.8158232327701 -5.08623816685837 A:G A G 10 0.545408298681766 0.319119624846343 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1979751_1979834:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1979751_1979819:CSNK1G2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 63 49 112 28.6392771830487 26.7250066354065 1.91427054764221 A:G A G 10 0.545408298681766 0.776124488314571 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 58 59 117 26.3663186764576 32.1790896222242 -5.81277094576662 A:G G A 10 0.545408298681766 0.307355493185943 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 30 20 50 13.637751039547 10.9081659736353 2.7295850659117 A:G A G 10 0.545408298681766 0.479713162907400 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2041017 C/T 1 16 9 25 7.27346722109174 4.90867468813589 2.36479253295585 T:C C T 10 0.545408298681766 0.423463149171332 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2078221 G/C 1 62 55 117 28.1846854817305 29.9974564274971 -1.81277094576662 C:G G C 10 0.545408298681766 0.780839650963339 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 46 67 113 20.9112182606388 36.5423560116783 -15.6311377510396 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00334367647716684 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 59 58 117 26.8209103777758 31.6336813235424 -4.81277094576662 A:T:C T C 10 0.545408298681766 0.403714378613874 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2098015 T/C 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 T:C T C 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2099250 G/A 1 11 13 24 5.00050871450057 7.09030788286296 -2.08979916836238 A:G G A 10 0.545408298681766 0.418235923516124 ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2337468 G/A 1 8 12 20 3.63673361054587 6.54489958418119 -2.90816597363532 A:G G A 10 0.545408298681766 0.261293206047355 ENSG00000005206:ENST00000382189:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000432705:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2337442_2337624:AC004410.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 9 10 19 4.09132531186411 5.45408298681766 -1.36275767495355 A:C C A 10 0.545408298681766 0.646488798036141 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2427266 G/A 1 172 133 305 78.1897726267362 72.5393037246749 5.65046890206136 A:G G A 10 0.545408298681766 0.527555379649768 ENSG00000099800:ENST00000215570:exon_2427254_2427322:TIMM13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2732741 G/A 1 30 34 64 13.637751039547 18.54388215518 -4.90613111563302 A:G G A 10 0.545408298681766 0.258498800691641 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 22 23 45 10.0010174290011 12.5443908696806 -2.54337344067947 T:C T C 10 0.545408298681766 0.458063612156695 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 22 15 37 10.0010174290011 8.18112448022649 1.81989294877466 A:C A C 10 0.545408298681766 0.621954129017817 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 31 16 47 14.0923427408653 8.72653277890826 5.365809961957 T:G G T 10 0.545408298681766 0.142540036598735 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2917186 T/C 1 11 7 18 5.00050871450057 3.81785809077236 1.18265062372821 T:C T C 10 0.545408298681766 0.641965040336765 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2917287 C/A 1 10 13 23 4.54591701318234 7.09030788286296 -2.54439086968062 A:C C A 10 0.545408298681766 0.302592597377063 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2917612 T/C 1 14 6 20 6.36428381845528 3.2724497920906 3.09183402636468 T:C T C 10 0.545408298681766 0.184468819237692 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2933480 C/T 1 14 5 19 6.36428381845528 2.72704149340883 3.63724232504645 T:C C T 10 0.545408298681766 0.109502725206357 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 2934282 T/C 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 T:C T C 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000175691:ENST00000444249:exon_2933536_2934388:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000341064:exon_2933536_2934393:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 14 22 36 6.36428381845528 11.9989825709989 -5.63469875254358 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0661978396966578 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 3186085 G/T 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 T:G G T 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3185875_3186212:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3185875_3186212:NCLN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 3633115 C/A 1 13 10 23 5.90969211713704 5.45408298681766 0.455609130319382 A:C C A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3630182_3633167:PIP5K1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 3778310 G/A 1 14 16 30 6.36428381845528 8.72653277890826 -2.36224896045298 A:G G A 10 0.545408298681766 0.464241697645823 ENSG00000007264:ENST00000315548:exon_3777968_3778420:MATK;ENSG00000007264:ENST00000395045:exon_3777968_3778420:MATK;ENSG00000007264:ENST00000310132:exon_3777968_3778420:MATK;ENSG00000007264:ENST00000395040:exon_3777968_3778420:MATK;ENSG00000007264:ENST00000420907:exon_3777968_3778420:MATK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 4028783 C/T 1 12 12 24 5.45510041581881 6.54489958418119 -1.08979916836238 T:C C T 10 0.545408298681766 0.686028395996258 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4028718_4028846:PIAS4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 195 190 385 88.6453817570556 103.627576749536 -14.9821949924799 A:G G A 10 0.545408298681766 0.137673593586444 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 163 171 334 74.0984473148721 93.264819074582 -19.1663717597098 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0367893297563876 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 14 12 26 6.36428381845528 6.54489958418119 -0.180615765725915 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 13 25 38 5.90969211713704 13.6352074670442 -7.72551534990711 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0139821717217304 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 4818114 C/T 1 12 20 32 5.45510041581881 10.9081659736353 -5.45306555781651 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0742248918341754 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 4847713 A/G 1 31 29 60 14.0923427408653 15.8168406617712 -1.72449792090596 A:G A G 10 0.545408298681766 0.698195447024749 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 4847874 A/G 1 58 49 107 26.3663186764576 26.7250066354065 -0.358687958948959 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 4852106 A/G 1 42 23 65 19.0928514553658 12.5443908696806 6.54846058568521 A:G A G 10 0.545408298681766 0.106947536650752 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 4929413 T/C 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 T:C T C 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 4929473 A/G 1 10 15 25 4.54591701318234 8.18112448022649 -3.63520746704415 A:G A G 10 0.545408298681766 0.162508278459262 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 5212380 C/T 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 T:C C T 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5212348_5212502:PTPRS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 5212482 G/A 0 14 0 14 6.36428381845528 0 6.36428381845528 G G 10 0.545408298681766 0.000222207897951029 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5212348_5212502:PTPRS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 15 15 30 6.81887551977351 8.18112448022649 -1.36224896045298 A:G G A 10 0.545408298681766 0.714695541216207 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 5789565 T/C 1 14 11 25 6.36428381845528 5.99949128549943 0.364792532955851 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 5789609 C/A 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 A:C C A 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 20 18 38 9.09183402636468 9.81734937627179 -0.725515349907107 T:G G T 10 0.545408298681766 0.87122541036102 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 407 384 791 185.018822436521 209.436786693798 -24.4179642572769 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0865111708395739 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 6731057 T/C 1 36 32 68 16.3653012474564 17.4530655578165 -1.08776431036009 T:C T C 10 0.545408298681766 0.808545983984987 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 6763718 A/G 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6763691_6763827:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6763691_6763827:SH2D3A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 7166376 C/T 1 16 18 34 7.27346722109174 9.81734937627179 -2.54388215518004 T:C C T 10 0.545408298681766 0.394439936472409 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 7685843 G/A 1 25 33 58 11.3647925329558 17.9984738564983 -6.63368132354243 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0870841048366141 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7685732_7685922:XAB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 7687428 G/A 1 42 35 77 19.0928514553658 19.0892904538618 0.00356100150401772 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7687416_7687547:XAB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 7708058 C/T 1 27 30 57 12.2739759355923 16.362248960453 -4.08827302486066 T:C C T 10 0.545408298681766 0.289704972161249 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7708051_7708131:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7708051_7708131:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7708051_7708131:STXBP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 47 38 85 21.365809961957 20.7255153499071 0.640294612049889 T:C T C 10 0.545408298681766 0.913684880783109 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 7712193 G/A 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.763888703612766 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 7712577 C/G 0 0 9 9 0 4.90867468813589 -4.90867468813589 G C G 10 0.545408298681766 0.000829074446773646 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 7975586 C/T 1 24 16 40 10.9102008316376 8.72653277890826 2.18366805272936 T:C C T 10 0.545408298681766 0.528502949406548 ENSG00000076984:ENST00000397981:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397983:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000468058:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397979:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000425613:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000494348:exon_7975145_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000465324:exon_7975581_7975620:MAP2K7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 8121360 A/G 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G A G 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000131142:ENST00000253451:exon_8121250_8121383:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000405803:exon_8121250_8121383:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000390669:exon_8121250_8121383:CCL25 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 8326866 C/T 1 28 25 53 12.7285676369106 13.6352074670442 -0.906639830133598 T:C C T 10 0.545408298681766 0.890471696813186 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 39 30 69 17.7290763514111 16.362248960453 1.36682739095815 A:G G A 10 0.545408298681766 0.809339831953809 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 8326944 G/A 1 29 35 64 13.1831593382288 19.0892904538618 -5.90613111563302 A:G G A 10 0.545408298681766 0.166928752944264 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 8326999 C/T 1 18 17 35 8.18265062372821 9.27194107759002 -1.08929045386181 T:C C T 10 0.545408298681766 0.736735697725999 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 8376431 G/A 1 60 61 121 27.275502079094 33.2699062195877 -5.99440414049369 A:G G A 10 0.545408298681766 0.275074215864152 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8376234_8376479:NDUFA7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 8386998 T/C 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 T:C T C 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000233927:ENST00000445365:exon_8386540_8387376:RPS28 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 8468337 C/T 1 76 79 155 34.5489693001858 43.0872555958595 -8.53828629567373 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.171220296399954 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 8468485 C/T 1 47 48 95 21.365809961957 26.1795983367248 -4.81378837476777 T:C C T 10 0.545408298681766 0.354105721986452 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 8486884 G/A 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8486607_8486900:MARCH2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 8503345 G/C 1 6 10 16 2.7275502079094 5.45408298681766 -2.72653277890826 C:G G C 10 0.545408298681766 0.211691046173674 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8503272_8503895:MARCH2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 8553773 C/T 1 431 381 812 195.929023268159 207.800561797753 -11.871538529594 A:T:C:G C T 10 0.545408298681766 0.417682733285575 ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8553575_8553885:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8553575_8553885:HNRNPM HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 9267292 G/A 1 11 7 18 5.00050871450057 3.81785809077236 1.18265062372821 A:G G A 10 0.545408298681766 0.641965040336765 ENSG00000130803:ENST00000419608:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9267288_9267424:ZNF317 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 9271969 C/A 1 17 23 40 7.72805892240998 12.5443908696806 -4.81633194727064 A:C C A 10 0.545408298681766 0.152697094851348 ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9270790_9274089:ZNF317 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 86 64 150 39.0948863133681 34.906131115633 4.1887551977351 C:G C G 10 0.545408298681766 0.512704705979034 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 21 14 35 9.54642572768291 7.63571618154472 1.91070954613819 C:G C G 10 0.545408298681766 0.611600345766383 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 47 47 94 21.365809961957 25.634190038043 -4.268380076086 T:C C T 10 0.545408298681766 0.407860310716973 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10224548 G/A 1 48 50 98 21.8204016632752 27.2704149340883 -5.45001327081307 A:G G A 10 0.545408298681766 0.310399928380011 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 272 326 598 123.64894275856 177.803105370256 -54.1541626116961 A:G A G 10 0.545408298681766 1.05781442061644e-05 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 157 173 330 71.3708971069627 94.3556356719455 -22.9847385649828 A:C:G A G 10 0.545408298681766 0.0127489006138959 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10291181 T/C 1 25 18 43 11.3647925329558 9.81734937627179 1.54744315668406 T:C T C 10 0.545408298681766 0.65017499705898 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10291026_10291245:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10291026_10291245:DNMT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10334663 T/G 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10370444 A/C 1 137 144 281 62.2790630805981 78.5387950101743 -16.2597319295762 A:C A C 10 0.545408298681766 0.0551654618367133 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10394439 C/T 1 75 79 154 34.0943775988676 43.0872555958595 -8.99287799699196 T:C C T 10 0.545408298681766 0.146286734582917 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10394189_10394462:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10394157_10394462:ICAM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 78 73 151 35.4581527028223 39.8148058037689 -4.35665310094667 A:G A G 10 0.545408298681766 0.513472338137945 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10403368 G/A 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000105376:ENST00000221980:exon_10403288_10403542:ICAM5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10426422 A/C 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 A:C A C 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10449392 A/G 1 187 173 360 85.0086481465098 94.3556356719455 -9.34698752543576 A:G A G 10 0.545408298681766 0.340828922561282 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 32 32 64 14.5469344421835 17.4530655578165 -2.90613111563302 A:G A G 10 0.545408298681766 0.530625658685181 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 10668673 A/G 1 31 24 55 14.0923427408653 13.0897991683624 1.00254357250287 A:G A G 10 0.545408298681766 0.892461297916145 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 11039724 C/G 1 5 11 16 2.27295850659117 5.99949128549943 -3.72653277890826 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0783914597682892 ENSG00000142444:ENST00000270502:exon_11039690_11040914:C19orf52 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 11227602 C/T 1 9 3 12 4.09132531186411 1.6362248960453 2.45510041581881 T:C C T 10 0.545408298681766 0.245731957393402 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 11319491 G/A 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 A:G G A 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11319362_11319505:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11319362_11319505:DOCK6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 11319628 C/T 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11319587_11319779:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11319587_11319779:DOCK6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 11327608 T/C 0 8 0 8 3.63673361054587 0 3.63673361054587 T T 10 0.545408298681766 0.00965399767040904 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11327590_11327772:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11327590_11327772:DOCK6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 C:G G C 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 12430135 G/T 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 T:G G T 10 0.545408298681766 0.40572272702491 ENSG00000188868:ENST00000293725:exon_12428291_12430647:ZNF563 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 12763007 G/A 1 126 126 252 57.2785543660975 68.7214456339025 -11.442891267805 A:G G A 10 0.545408298681766 0.163906611965169 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12762967_12763084:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12762967_12763084:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12762967_12763084:MAN2B1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 12780213 G/A 1 44 36 80 20.0020348580023 19.6346987525436 0.367336105458723 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000105583:ENST00000222190:exon_12780168_12780465:C19orf56 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 46 31 77 20.9112182606388 16.9076572591347 4.00356100150402 A:G G A 10 0.545408298681766 0.423295401941039 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 13008607 G/T 1 17 14 31 7.72805892240998 7.63571618154472 0.0923427408652548 T:G G T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 13035006 G/A 1 55 67 122 25.0025435725029 36.5423560116783 -11.5398124391755 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0368104677644499 ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13034965_13035079:FARSA;ENSG00000179115:ENST00000423140:exon_13034965_13035079:FARSA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 486 450 936 220.931566840662 245.433734406795 -24.502167566133 A:T:G G T 10 0.545408298681766 0.107910154038386 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 13211843 C/T 0 24 0 24 10.9102008316376 0 10.9102008316376 C C 10 0.545408298681766 6.60828956736528e-07 ENSG00000104903:ENST00000264824:exon_13211651_13212009:LYL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 14030689 T/C 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 T:C T C 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 14040896 G/A 1 22 32 54 10.0010174290011 17.4530655578165 -7.45204812881536 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0547345563392524 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14040891_14040967:CC2D1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 14142705 C/T 1 4 10 14 1.81836680527294 5.45408298681766 -3.63571618154472 T:C C T 10 0.545408298681766 0.061538052903825 ENSG00000104998:ENST00000263379:exon_14142262_14142784:IL27RA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 14231256 T/C 1 78 75 153 35.4581527028223 40.9056224011324 -5.44746969831019 A:T:C T C 10 0.545408298681766 0.416983797201949 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 14492265 T/C 1 15 11 26 6.81887551977351 5.99949128549943 0.819384234274084 T:C T C 10 0.545408298681766 0.844962722330158 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 22 16 38 10.0010174290011 8.72653277890826 1.27448465009289 T:C T C 10 0.545408298681766 0.746004537752306 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 14512489 G/A 1 47 47 94 21.365809961957 25.634190038043 -4.268380076086 A:G G A 10 0.545408298681766 0.407860310716973 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 14582468 G/A 1 91 113 204 41.3678448199593 61.6311377510396 -20.2632929310803 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00483883180695477 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 13 13 26 5.90969211713704 7.09030788286296 -1.18061576572592 T:C C T 10 0.545408298681766 0.696154695081167 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 25 22 47 11.3647925329558 11.9989825709989 -0.634190038043002 A:G G A 10 0.545408298681766 0.884249875841472 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 14884751 G/A 1 16 1 17 7.27346722109174 0.545408298681766 6.72805892240998 A:G G A 10 0.545408298681766 0.000835626696628304 ENSG00000127507:ENST00000353005:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000353876:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392967:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000346057:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392965:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000315576:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000360222:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392964:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392962:exon_14884750_14884866:EMR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 14884841 G/A 0 9 0 9 4.09132531186411 0 4.09132531186411 G G 10 0.545408298681766 0.00509974111202672 ENSG00000127507:ENST00000353005:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000353876:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392967:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000346057:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392965:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000315576:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000360222:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392964:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392962:exon_14884750_14884866:EMR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 20 18 38 9.09183402636468 9.81734937627179 -0.725515349907107 A:G G A 10 0.545408298681766 0.87122541036102 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 30 31 61 13.637751039547 16.9076572591347 -3.26990621958772 A:G G A 10 0.545408298681766 0.44126959467236 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 15 12 27 6.81887551977351 6.54489958418119 0.273975935592318 A:C C A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 15565226 G/C 1 59 42 101 26.8209103777758 22.9071485446342 3.91376183314163 C:G G C 10 0.545408298681766 0.484603105632564 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15565172_15565373:RASAL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 21 31 52 9.54642572768291 16.9076572591347 -7.36123153145183 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0503662608245788 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 16666101 G/C 1 9 10 19 4.09132531186411 5.45408298681766 -1.36275767495355 C:G G C 10 0.545408298681766 0.646488798036141 ENSG00000127526:ENST00000436494:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000409648:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000248069:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000421082:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000469055:exon_16665963_16666412:SLC35E1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 16687753 G/A 1 10 14 24 4.54591701318234 7.63571618154472 -3.08979916836238 A:G G A 10 0.545408298681766 0.223719116182242 ENSG00000141979:ENST00000409035:exon_16687454_16688493:CALR3;ENSG00000105085:ENST00000263390:exon_16685718_16688493:MED26;ENSG00000105085:ENST00000453758:exon_16686841_16688059:MED26 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17173588 G/A 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 A:G G A 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17173508_17173589:HAUS8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17330060 T/C 1 12 9 21 5.45510041581881 4.90867468813589 0.546425727682915 T:C T C 10 0.545408298681766 0.831119559812142 ENSG00000053501:ENST00000263897:exon_17330022_17330196:USE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 15 10 25 6.81887551977351 5.45408298681766 1.36479253295585 A:G A G 10 0.545408298681766 0.689530950640826 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 11 11 22 5.00050871450057 5.99949128549943 -0.998982570998852 C:G C G 10 0.545408298681766 0.675286531050552 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 16 22 38 7.27346722109174 11.9989825709989 -4.72551534990711 A:G G A 10 0.545408298681766 0.143050788663091 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17393504 G/C 1 9 3 12 4.09132531186411 1.6362248960453 2.45510041581881 C:G G C 10 0.545408298681766 0.245731957393402 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17393465_17393570:ANKLE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17393530 T/A 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 A:T T A 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17393465_17393570:ANKLE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17394124 T/G 1 7 13 20 3.18214190922764 7.09030788286296 -3.90816597363532 T:G T G 10 0.545408298681766 0.113964264894792 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394034_17394693:ANKLE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17394504 A/C 1 6 13 19 2.7275502079094 7.09030788286296 -4.36275767495355 A:C A C 10 0.545408298681766 0.062974453261368 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394034_17394693:ANKLE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17395003 A/G 1 6 11 17 2.7275502079094 5.99949128549943 -3.27194107759002 A:G A G 10 0.545408298681766 0.14387918634876 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394898_17395075:ANKLE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17395055 C/G 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 C:G C G 10 0.545408298681766 0.823095632852268 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394898_17395075:ANKLE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17396549 T/C 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17396490_17396628:ANKLE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17412399 G/A 1 7 2 9 3.18214190922764 1.09081659736353 2.09132531186411 A:G G A 10 0.545408298681766 0.19585774268132 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17448961 A/C 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:C A C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17448817_17449064:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17448817_17449064:GTPBP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 16 16 32 7.27346722109174 8.72653277890826 -1.45306555781651 T:C T C 10 0.545408298681766 0.723187770815947 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 42 44 86 19.0928514553658 23.9979651419977 -4.90511368663187 A:G A G 10 0.545408298681766 0.32985574783448 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17660300 G/A 1 17 2 19 7.72805892240998 1.09081659736353 6.63724232504645 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00195644946032807 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17660253_17660494:FAM129C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17664090 C/T 1 7 24 31 3.18214190922764 13.0897991683624 -9.90765725913474 T:C C T 10 0.545408298681766 0.000419543521405726 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 17670201 C/T 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 T:C C T 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000130309:ENST00000252599:exon_17670120_17670230:GLT25D1;ENSG00000130309:ENST00000379714:exon_17670120_17670230:GLT25D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 18234163 G/A 1 2 8 10 0.909183402636468 4.36326638945413 -3.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 0.051055470816189 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18234027_18234184:MAST3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 18497024 G/C 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 C:G G C 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 18538742 A/C 1 7 10 17 3.18214190922764 5.45408298681766 -2.27194107759002 A:C A C 10 0.545408298681766 0.332347257730029 ENSG00000130511:ENST00000348495:exon_18538708_18538792:SSBP4;ENSG00000130511:ENST00000270061:exon_18538708_18538792:SSBP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 18545786 G/T 1 26 24 50 11.8193842342741 13.0897991683624 -1.2704149340883 T:G G T 10 0.545408298681766 0.777025189110751 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18545625_18545927:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18545625_18545927:ISYNA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 18546678 T/C 1 48 35 83 21.8204016632752 19.0892904538618 2.73111120941342 T:C T C 10 0.545408298681766 0.582699062467623 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18546567_18546731:ISYNA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 19017862 G/A 1 74 59 133 33.6397858975493 32.1790896222242 1.46069627532512 A:G G A 10 0.545408298681766 0.861850118465682 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19017769_19017921:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19017769_19017921:COPE HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 65 60 125 29.5484605856852 32.724497920906 -3.17603733522075 T:C T C 10 0.545408298681766 0.590614804513153 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 19032491 G/T 1 20 10 30 9.09183402636468 5.45408298681766 3.63775103954702 T:G G T 10 0.545408298681766 0.203010938958958 ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19032472_19032557:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19032472_19032557:DDX49 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 19304899 G/C 1 50 69 119 22.7295850659117 37.6331726090418 -14.9035875431302 C:G G C 10 0.545408298681766 0.00735990565333805 ENSG00000064490:ENST00000353145:exon_19304748_19304942:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000303088:exon_19304748_19304942:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000456252:exon_19304748_19304942:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000407360:exon_19304748_19304942:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000392324:exon_19304748_19304942:RFXANK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 19414177 G/A 1 18 17 35 8.18265062372821 9.27194107759002 -1.08929045386181 A:G G A 10 0.545408298681766 0.736735697725999 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19414157_19414257:SUGP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 20 15 35 9.09183402636468 8.18112448022649 0.91070954613819 A:G G A 10 0.545408298681766 0.865669207088407 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 21910539 G/C 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000197020:ENST00000358296:exon_21906844_21910791:ZNF100;ENSG00000197020:ENST00000445015:exon_21906844_21910791:ZNF100 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 21910621 A/G 1 4 16 20 1.81836680527294 8.72653277890826 -6.90816597363532 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00256007046164318 ENSG00000197020:ENST00000358296:exon_21906844_21910791:ZNF100;ENSG00000197020:ENST00000445015:exon_21906844_21910791:ZNF100 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 33117666 T/C 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 T:C T C 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33117618_33117733:ANKRD27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 33183352 G/C 1 10 7 17 4.54591701318234 3.81785809077236 0.728058922409978 C:G G C 10 0.545408298681766 0.810655514815455 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 33467515 T/C 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 T:C T C 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 33600764 T/C 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 T:C T C 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33600623_33600922:GPATCH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 33605300 A/G 0 14 0 14 6.36428381845528 0 6.36428381845528 A A 10 0.545408298681766 0.000222207897951029 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 33878198 A/G 1 16 30 46 7.27346722109174 16.362248960453 -9.08878173936124 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00761236692715515 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33877865_33878387:PEPD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 33878837 G/A 1 12 7 19 5.45510041581881 3.81785809077236 1.63724232504645 A:G G A 10 0.545408298681766 0.497799653196701 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33878796_33878987:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33878796_33878987:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33878796_33878987:PEPD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 34868642 A/G 1 202 194 396 91.8275236662833 105.809209944263 -13.9816862779793 A:G A G 10 0.545408298681766 0.172980652696641 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34868640_34868786:GPI HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 34884857 C/A 1 278 246 524 126.376492966469 134.170441475714 -7.79394850924537 A:T:C C A 10 0.545408298681766 0.510621310315535 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34884819_34884971:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34884819_34884971:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34884819_34884971:GPI HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 34959979 A/G 1 171 145 316 77.735180925418 79.0842033088561 -1.34902238343805 A:G A G 10 0.545408298681766 0.91007886992217 ENSG00000126261:ENST00000246548:exon_34959945_34960795:UBA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 35741456 T/C 1 18 10 28 8.18265062372821 5.45408298681766 2.72856763691055 T:C T C 10 0.545408298681766 0.346049266596729 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 35757427 G/A 1 20 16 36 9.09183402636468 8.72653277890826 0.365301247456424 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35757262_35757435:LSR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 35770056 G/A 1 15 11 26 6.81887551977351 5.99949128549943 0.819384234274084 A:G G A 10 0.545408298681766 0.844962722330158 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 35941519 C/A 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 A:C C A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000126262:ENST00000246549:exon_35940617_35941609:FFAR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 239 199 438 108.647416615058 108.536251437671 0.111165177386496 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 36207077 G/A 1 57 51 108 25.9117269751393 27.8158232327701 -1.90409625763073 A:G G A 10 0.545408298681766 0.77207759525074 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36207035_36207199:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36207035_36207199:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36207035_36207199:ZBTB32 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 36259415 G/A 1 3 10 13 1.3637751039547 5.45408298681766 -4.09030788286296 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0265238704491956 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36259306_36260077:C19orf55;ENSG00000167595:ENST00000396908:exon_36259306_36259447:C19orf55 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 36430798 A/G 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:G A G 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000126243:ENST00000246529:exon_36430312_36431742:LRFN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 17 18 35 7.72805892240998 9.81734937627179 -2.08929045386181 T:G G T 10 0.545408298681766 0.501106521181595 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 37879589 A/G 1 7 2 9 3.18214190922764 1.09081659736353 2.09132531186411 A:G A G 10 0.545408298681766 0.19585774268132 ENSG00000189164:ENST00000317566:exon_37879208_37883966:ZNF527;ENSG00000189164:ENST00000356178:exon_37879208_37883966:ZNF527;ENSG00000189164:ENST00000436120:exon_37879208_37883968:ZNF527 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 38055612 A/T 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:T A T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000180479:ENST00000328550:exon_38054726_38057193:ZNF571;ENSG00000180479:ENST00000451802:exon_38055156_38057193:ZNF571 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 38189440 T/C 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000198182:ENST00000355202:exon_38187276_38190796:ZNF607 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 38189616 T/C 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:C T C 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000198182:ENST00000355202:exon_38187276_38190796:ZNF607 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 38682920 C/T 1 11 11 22 5.00050871450057 5.99949128549943 -0.998982570998852 T:C C T 10 0.545408298681766 0.675286531050552 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38682785_38682950:SIPA1L3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 50 47 97 22.7295850659117 25.634190038043 -2.9046049721313 T:C C T 10 0.545408298681766 0.610448184830619 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 38800176 G/A 1 41 44 85 18.6382597540476 23.9979651419977 -5.35970538795011 A:G G A 10 0.545408298681766 0.276130571120267 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 38817486 T/C 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000099337:ENST00000263372:exon_38817233_38817628:KCNK6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 38872778 C/T 1 72 64 136 32.7306024949129 34.906131115633 -2.17552862072017 T:C C T 10 0.545408298681766 0.73096716623693 ENSG00000099341:ENST00000215071:exon_38872757_38872868:PSMD8;ENSG00000099341:ENST00000404323:exon_38872757_38872868:PSMD8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 38893856 G/C 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 C:G G C 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38893775_38893858:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38893775_38893858:FAM98C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 69 71 140 31.3668273909581 38.7239892064054 -7.35716181544724 T:C T C 10 0.545408298681766 0.234754632277184 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39100594 G/A 1 45 26 71 20.4566265593205 14.1806157657259 6.27601079359461 A:G G A 10 0.545408298681766 0.152848837225212 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39100549_39100665:MAP4K1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39100688 G/A 1 2 7 9 0.909183402636468 3.81785809077236 -2.90867468813589 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0890512388728988 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 50 50 100 22.7295850659117 27.2704149340883 -4.5408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 0.367945956244062 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39207791 G/A 1 46 59 105 20.9112182606388 32.1790896222242 -11.2678713615854 A:G G A 10 0.545408298681766 0.030808696120996 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39207726_39207956:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39207726_39207956:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39207726_39207932:ACTN4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39215172 T/C 1 81 76 157 36.821927806777 41.4510306998142 -4.62910289303726 T:C T C 10 0.545408298681766 0.471487629145438 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39215071_39215205:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39215071_39215205:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39215099_39215205:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39215071_39215205:ACTN4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39219780 T/C 1 133 110 243 60.4606962753251 59.9949128549943 0.465783420330865 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000497637:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000477174:exon_39219636_39219794:ACTN4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39416887 C/T 1 18 6 24 8.18265062372821 3.2724497920906 4.91020083163762 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0629016077293885 ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39416845_39416940:FBXO17 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39907036 C/T 1 11 3 14 5.00050871450057 1.6362248960453 3.36428381845528 T:C C T 10 0.545408298681766 0.104979576849638 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000451354:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39906988_39907054:PLEKHG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39908574 C/T 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000478523:exon_39908485_39908745:PLEKHG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 24 28 52 10.9102008316376 15.2714323630894 -4.36123153145183 A:G G A 10 0.545408298681766 0.265309796508155 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 13 13 26 5.90969211713704 7.09030788286296 -1.18061576572592 A:G G A 10 0.545408298681766 0.696154695081167 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 30 33 63 13.637751039547 17.9984738564983 -4.36072281695126 C:G C G 10 0.545408298681766 0.311651947353321 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39923952 G/A 1 4112 3756 7868 1869.28107582058 2048.55356984871 -179.272494028135 A:T:C:G G A 10 0.545408298681766 5.05175498624111e-05 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39923852_39924058:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39923852_39924058:RPS16 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 16 20 36 7.27346722109174 10.9081659736353 -3.63469875254358 T:C T C 10 0.545408298681766 0.244017272256093 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 40030704 C/T 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 40719076 T/C 1 12 5 17 5.45510041581881 2.72704149340883 2.72805892240998 T:C T C 10 0.545408298681766 0.227116627671435 ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40718983_40719095:MAP3K10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 40719497 A/G 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40719424_40720128:MAP3K10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 66 58 124 30.0030522870034 31.6336813235424 -1.63062903653898 A:G A G 10 0.545408298681766 0.787237149728631 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 40928944 A/G 1 10 16 26 4.54591701318234 8.72653277890826 -4.18061576572592 A:G A G 10 0.545408298681766 0.116134696463967 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 40928968 A/G 1 13 13 26 5.90969211713704 7.09030788286296 -1.18061576572592 A:G A G 10 0.545408298681766 0.696154695081167 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 41096189 A/G 1 21 23 44 9.54642572768291 12.5443908696806 -2.9979651419977 A:G A G 10 0.545408298681766 0.368660718109055 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41096150_41096328:SHKBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 41822589 G/A 1 5 11 16 2.27295850659117 5.99949128549943 -3.72653277890826 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0783914597682892 ENSG00000142039:ENST00000269967:exon_41822289_41822744:CCDC97 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 40 51 91 18.1836680527294 27.8158232327701 -9.63215518004071 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.0455979542103817 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 42703833 A/G 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 A:G A G 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42702752_42703981:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42702752_42703981:DEDD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 42728836 T/C 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 T:C T C 10 0.545408298681766 0.609212519966719 ENSG00000167625:ENST00000301215:exon_42728539_42732353:ZNF526 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 42753283 G/A 1 41 26 67 18.6382597540476 14.1806157657259 4.45764398832168 A:G G A 10 0.545408298681766 0.326479638336494 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 42753649 G/C 1 25 25 50 11.3647925329558 13.6352074670442 -2.2704149340883 C:G G C 10 0.545408298681766 0.570990852674232 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 43979563 C/T 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 43979589 G/T 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 T:G G T 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44015619 G/A 1 15 11 26 6.81887551977351 5.99949128549943 0.819384234274084 A:G G A 10 0.545408298681766 0.844962722330158 ENSG00000105755:ENST00000292147:exon_44015589_44015718:ETHE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44418680 G/C 1 12 12 24 5.45510041581881 6.54489958418119 -1.08979916836238 C:G G C 10 0.545408298681766 0.686028395996258 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44418776 G/A 1 11 9 20 5.00050871450057 4.90867468813589 0.0918340263646806 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44418824 C/T 1 6 13 19 2.7275502079094 7.09030788286296 -4.36275767495355 T:C C T 10 0.545408298681766 0.062974453261368 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44501518 G/A 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 A:G G A 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44515074 C/A 1 14 5 19 6.36428381845528 2.72704149340883 3.63724232504645 A:C C A 10 0.545408298681766 0.109502725206357 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44515352 T/G 1 10 11 21 4.54591701318234 5.99949128549943 -1.45357427231709 T:G T G 10 0.545408298681766 0.662270617460159 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44515341_44515400:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44515514 C/A 1 14 5 19 6.36428381845528 2.72704149340883 3.63724232504645 A:C C A 10 0.545408298681766 0.109502725206357 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44570551 G/A 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 A:G G A 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44610665 A/G 1 18 11 29 8.18265062372821 5.99949128549943 2.18315933822879 A:G A G 10 0.545408298681766 0.46021652389844 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44610798 A/T 1 15 14 29 6.81887551977351 7.63571618154472 -0.816840661771214 A:T A T 10 0.545408298681766 0.852678436276024 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44611162 G/T 1 21 24 45 9.54642572768291 13.0897991683624 -3.54337344067947 T:G G T 10 0.545408298681766 0.298548392309109 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 19 17 36 8.63724232504645 9.27194107759002 -0.634698752543576 T:C T C 10 0.545408298681766 0.868122767399527 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44660967 A/G 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000159905:ENST00000426739:exon_44660405_44664462:ZNF234;ENSG00000159905:ENST00000244316:exon_44660405_44664462:ZNF234 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44680489 G/A 1 10 6 16 4.54591701318234 3.2724497920906 1.27346722109174 A:G G A 10 0.545408298681766 0.62020159802431 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44732658 C/G 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 C:G C G 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44732599_44732725:ZNF227 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44739303 T/C 1 15 20 35 6.81887551977351 10.9081659736353 -4.08929045386181 T:C T C 10 0.545408298681766 0.177456662008176 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44740602 G/A 1 14 13 27 6.36428381845528 7.09030788286296 -0.726024064407682 A:G G A 10 0.545408298681766 0.84779448787691 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 44792701 T/G 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000159917:ENST00000391957:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000433015:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000291182:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000359844:exon_44792291_44793353:ZNF235 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 45868309 T/G 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 T:G T G 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391940:exon_45868300_45868416:ERCC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 45909934 G/A 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 A:G G A 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45909467_45909976:CD3EAP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 27 17 44 12.2739759355923 9.27194107759002 3.0020348580023 A:C A C 10 0.545408298681766 0.449495937783786 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 14 19 33 6.36428381845528 10.3627576749536 -3.99847385649828 A:G A G 10 0.545408298681766 0.167008656421679 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 21 17 38 9.54642572768291 9.27194107759002 0.274484650092893 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 11 13 24 5.00050871450057 7.09030788286296 -2.08979916836238 A:C C A 10 0.545408298681766 0.418235923516124 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 46216642 G/T 1 10 11 21 4.54591701318234 5.99949128549943 -1.45357427231709 T:G G T 10 0.545408298681766 0.662270617460159 ENSG00000177051:ENST00000317683:exon_46213887_46216831:FBXO46 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 46275976 G/C 1 8 12 20 3.63673361054587 6.54489958418119 -2.90816597363532 C:G G C 10 0.545408298681766 0.261293206047355 ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46275899_46276010:DMPK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 46341824 C/T 1 36 21 57 16.3653012474564 11.4535742723171 4.91172697513934 T:C C T 10 0.545408298681766 0.231194601063238 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46341719_46341873:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46341719_46341873:SYMPK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 46352122 A/G 1 33 23 56 15.0015261435017 12.5443908696806 2.45713527382111 A:G A G 10 0.545408298681766 0.591929380935694 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46352008_46352134:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46352008_46352134:SYMPK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 9 13 22 4.09132531186411 7.09030788286296 -2.99898257099885 T:C T C 10 0.545408298681766 0.207313306024605 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 10 13 23 4.54591701318234 7.09030788286296 -2.54439086968062 C:G C G 10 0.545408298681766 0.302592597377063 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 65 93 158 29.5484605856852 50.7229717774042 -21.174511191719 A:G G A 10 0.545408298681766 0.000765432561742982 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 47570207 G/A 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 A:G G A 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47567449_47571126:ZC3H4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 47858424 G/A 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47858296_47858607:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47858296_47858607:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47858296_47858607:DHX34 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 47865911 A/G 1 13 8 21 5.90969211713704 4.36326638945413 1.54642572768291 A:G A G 10 0.545408298681766 0.521510664210594 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 47879279 G/A 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 A:G G A 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47879181_47879354:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47879181_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47879181_47879354:DHX34 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 47978671 G/A 1 8 7 15 3.63673361054587 3.81785809077236 -0.18112448022649 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 48205725 T/C 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 T:C T C 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000063169:ENST00000396720:exon_48204585_48206534:GLTSCR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 152 192 344 69.0979386003716 104.718393346899 -35.6204547465275 A:C:G A G 10 0.545408298681766 0.000143354969901778 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 48622427 A/G 1 21 31 52 9.54642572768291 16.9076572591347 -7.36123153145183 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0503662608245788 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48622394_48622447:LIG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 48654553 G/T 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 T:G G T 10 0.545408298681766 0.823095632852268 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48654489_48654596:LIG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 48668830 G/A 1 17 16 33 7.72805892240998 8.72653277890826 -0.998473856498277 A:G G A 10 0.545408298681766 0.730494475947213 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48668807_48668880:LIG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 T:C C T 10 0.545408298681766 0.40572272702491 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 48836673 G/T 1 7 13 20 3.18214190922764 7.09030788286296 -3.90816597363532 T:G G T 10 0.545408298681766 0.113964264894792 ENSG00000161558:ENST00000435956:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000377431:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48835613_48836690:TMEM143 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 11 2 13 5.00050871450057 1.09081659736353 3.90969211713704 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0470013625842131 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 958 1059 2017 435.498849862868 577.58738830399 -142.088538441122 T:C T C 10 0.545408298681766 2.35190263578060e-10 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 49497155 A/G 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 A:C:G A G 10 0.545408298681766 0.740303996198617 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 49842667 C/G 1 265 255 520 120.466800849332 139.07911616385 -18.6123153145183 C:G C G 10 0.545408298681766 0.103353200231961 ENSG00000104894:ENST00000323906:exon_49842587_49842670:CD37;ENSG00000104894:ENST00000426897:exon_49842587_49842670:CD37 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 49950298 C/T 1 52 42 94 23.6387684685482 22.9071485446342 0.731619923913996 T:C C T 10 0.545408298681766 0.917753474459872 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 49950356 C/G 1 45 44 89 20.4566265593205 23.9979651419977 -3.54133858267717 C:G C G 10 0.545408298681766 0.458204980434044 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 73 70 143 33.1851941962311 38.1785809077236 -4.99338671149254 T:C C T 10 0.545408298681766 0.402615996511759 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 68 68 136 30.9122356896399 37.0877643103601 -6.17552862072017 T:G T G 10 0.545408298681766 0.302075707522091 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 50157946 T/C 1 44 21 65 20.0020348580023 11.4535742723171 8.54846058568521 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0344425256263647 ENSG00000126461:ENST00000360565:exon_50157909_50158127:SCAF1;ENSG00000126461:ENST00000447618:exon_50157909_50158127:SCAF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 93 110 203 42.2770282225958 59.9949128549943 -17.7178846323985 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0135378552507894 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 50310466 G/A 1 3 8 11 1.3637751039547 4.36326638945413 -2.99949128549943 A:G G A 10 0.545408298681766 0.126277531853182 ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50310126_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50310150_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50310154_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50310177_50310631:FUZ HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 50322482 C/G 1 17 18 35 7.72805892240998 9.81734937627179 -2.08929045386181 C:G C G 10 0.545408298681766 0.501106521181595 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312881:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50322429_50322553:MED25 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 50387750 G/C 1 34 27 61 15.45611784482 14.7260240644077 0.730093780412275 T:C:G G C 10 0.545408298681766 0.898164841591406 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50387716_50387816:TBC1D17 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 25 11 36 11.3647925329558 5.99949128549943 5.36530124745642 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0931512567153025 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 50905042 G/A 1 11 16 27 5.00050871450057 8.72653277890826 -3.72602406440768 A:G G A 10 0.545408298681766 0.177124759497704 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 50905074 G/A 1 12 9 21 5.45510041581881 4.90867468813589 0.546425727682915 A:G G A 10 0.545408298681766 0.831119559812142 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 140 146 286 63.6428381845528 79.6296116075378 -15.9867734229851 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0654777003962672 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 118 167 285 53.6418207555516 91.0831858798549 -37.4413651243033 A:G G A 10 0.545408298681766 9.73883011626156e-06 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 51 87 138 23.1841767672299 47.4505219853136 -24.2663452180837 C:G C G 10 0.545408298681766 3.60190825626871e-05 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 67 96 163 30.4576439883217 52.3591966734495 -21.9015526851279 A:G A G 10 0.545408298681766 0.000677754114964456 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 52468203 T/A 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 A:T T A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 52468587 G/T 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 T:G G T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 52468998 A/G 1 9 5 14 4.09132531186411 2.72704149340883 1.36428381845528 A:G A G 10 0.545408298681766 0.594806597584705 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 52471872 A/G 1 14 8 22 6.36428381845528 4.36326638945413 2.00101742900115 A:G A G 10 0.545408298681766 0.521743237801811 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 52519608 C/T 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 52520607 C/T 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000142556:ENST00000356322:exon_52520370_52520612:ZNF614;ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 52537576 T/G 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 T:G T G 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 52887437 A/C 1 3 10 13 1.3637751039547 5.45408298681766 -4.09030788286296 A:C A C 10 0.545408298681766 0.0265238704491956 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 1 8 9 0.454591701318234 4.36326638945413 -3.90867468813589 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0140520751288088 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 52918622 C/T 1 7 1 8 3.18214190922764 0.545408298681766 2.63673361054587 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0793702040361015 ENSG00000167555:ENST00000391788:exon_52918377_52921656:ZNF528;ENSG00000167555:ENST00000360465:exon_52918377_52921657:ZNF528 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 53057925 C/A 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 A:C C A 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000198482:ENST00000487863:exon_53056360_53059303:ZNF808;ENSG00000198482:ENST00000359798:exon_53056360_53059589:ZNF808 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 53085813 T/C 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 T:C T C 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 53117531 C/T 1 29 14 43 13.1831593382288 7.63571618154472 5.54744315668406 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0941013152449004 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 53117809 C/A 1 23 19 42 10.4556091303194 10.3627576749536 0.0928514553658282 A:C:G C A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 53303527 A/G 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G A G 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000198538:ENST00000360272:exon_53300659_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000438150:exon_53300661_53304940:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000457749:exon_53300662_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000391783:exon_53303301_53304955:ZNF28 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 53384185 C/T 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000182986:ENST00000331416:exon_53379425_53385236:ZNF320;ENSG00000182986:ENST00000391781:exon_53383849_53385236:ZNF320 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 53577419 G/C 1 17 7 24 7.72805892240998 3.81785809077236 3.91020083163762 C:G G C 10 0.545408298681766 0.150191116982183 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000355147:exon_53577393_53577521:ZNF160 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 53959343 G/A 1 19 11 30 8.63724232504645 5.99949128549943 2.63775103954702 A:G G A 10 0.545408298681766 0.364545047610998 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 53959568 G/C 1 24 6 30 10.9102008316376 3.2724497920906 7.63775103954702 C:G G C 10 0.545408298681766 0.00529373436217388 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 53959804 T/C 1 12 21 33 5.45510041581881 11.4535742723171 -5.99847385649828 T:C T C 10 0.545408298681766 0.052799048038848 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 0 0 16 16 0 8.72653277890826 -8.72653277890826 G A G 10 0.545408298681766 3.32616701914945e-06 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 54705317 C/G 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 C:G C G 10 0.545408298681766 0.52782144426649 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 54705340 C/G 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 C:G C G 10 0.545408298681766 0.152877514803084 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 54966557 G/C 1 24 17 41 10.9102008316376 9.27194107759002 1.6382597540476 C:G G C 10 0.545408298681766 0.641208132845721 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 18 21 39 8.18265062372821 11.4535742723171 -3.27092364858887 T:C T C 10 0.545408298681766 0.335698443993020 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55143187 G/C 1 30 27 57 13.637751039547 14.7260240644077 -1.08827302486066 C:G G C 10 0.545408298681766 0.7914726677892 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 28 28 56 12.7285676369106 15.2714323630894 -2.54286472617889 T:C T C 10 0.545408298681766 0.50527297468746 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 26 32 58 11.8193842342741 17.4530655578165 -5.63368132354243 T:G G T 10 0.545408298681766 0.148046044283102 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55179364 A/G 1 13 12 25 5.90969211713704 6.54489958418119 -0.635207467044149 A:G A G 10 0.545408298681766 0.842593548431809 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55494651 A/G 1 27 47 74 12.2739759355923 25.634190038043 -13.3602141024507 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00221530902020287 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55494740 T/C 1 34 45 79 15.45611784482 24.5433734406795 -9.08725559585951 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0422753805962000 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55494881 C/G 1 22 56 78 10.0010174290011 30.5428647261789 -20.5418472971777 C:G C G 10 0.545408298681766 3.37338595225918e-06 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55501579 A/C 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:C A C 10 0.545408298681766 0.481573233711665 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55512137 C/A 1 64 91 155 29.093868884367 49.6321551800407 -20.5382862956737 A:C:G C A 10 0.545408298681766 0.00118340756533616 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55512232 C/A 1 64 88 152 29.093868884367 47.9959302839954 -18.9020613996284 A:C C A 10 0.545408298681766 0.00247954402323325 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55512316 T/G 1 49 53 102 22.2749933645935 28.9066398301336 -6.63164646554013 T:G T G 10 0.545408298681766 0.196986536925473 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55568084 C/T 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 T:C C T 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55568085 G/T 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 T:G G T 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55624113 G/A 1 11 6 17 5.00050871450057 3.2724497920906 1.72805892240998 A:G G A 10 0.545408298681766 0.471102205741298 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55624033_55624163:PPP1R12C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55857679 C/G 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000133247:ENST00000255613:exon_55857581_55857717:SUV420H2;ENSG00000133247:ENST00000445196:exon_55857581_55857717:SUV420H2;ENSG00000133247:ENST00000460956:exon_55857581_55857717:SUV420H2;ENSG00000133247:ENST00000474492:exon_55857441_55857717:SUV420H2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55899470 A/G 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000108107:ENST00000426763:exon_55899298_55903449:RPL28 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55967848 C/T 1 31 42 73 14.0923427408653 22.9071485446342 -8.81480580376892 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0452033029984643 ENSG00000063241:ENST00000438389:exon_55967716_55967856:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000085068:exon_55967716_55967856:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000425675:exon_55967716_55967856:ISOC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55992899 G/A 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 T:C C T 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55995148 C/G 1 6 15 21 2.7275502079094 8.18112448022649 -5.45357427231709 C:G C G 10 0.545408298681766 0.02600045769419 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 19 8 27 8.63724232504645 4.36326638945413 4.27397593559232 A:G G A 10 0.545408298681766 0.122032486533752 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 55998330 A/G 1 15 13 28 6.81887551977351 7.09030788286296 -0.271432363089448 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000090971:ENST00000205194:exon_55997775_55998935:NAT14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 56089353 C/T 1 14 11 25 6.36428381845528 5.99949128549943 0.364792532955851 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 26 27 53 11.8193842342741 14.7260240644077 -2.9066398301336 A:G G A 10 0.545408298681766 0.490813445476131 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 56170657 G/A 0 129 0 129 58.6423294700522 0 58.6423294700522 G G 10 0.545408298681766 1.13738724157402e-34 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56170576_56170711:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56170576_56170711:U2AF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 56935527 A/G 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 A:G A G 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000198440:ENST00000291598:exon_56934260_56936400:ZNF583 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 57132968 G/A 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 58199291 C/T 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000204519:ENST00000356715:exon_58197849_58201167:ZNF551;ENSG00000204519:ENST00000282296:exon_58197849_58201167:ZNF551;ENSG00000204519:ENST00000359821:exon_58198706_58199560:ZNF551 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 58233008 G/A 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 A:G G A 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231855_58233065:ZNF671 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 58319906 C/G 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000178935:ENST00000391701:exon_58318450_58320471:ZNF552 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 9 15 24 4.09132531186411 8.18112448022649 -4.08979916836238 T:C T C 10 0.545408298681766 0.103758116307969 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 58455381 C/T 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 T:C C T 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58455302_58455428:ZNF256 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 58724380 G/A 1 56 54 110 25.4571352738211 29.4520481288154 -3.99491285499426 A:G G A 10 0.545408298681766 0.445672936200643 ENSG00000171606:ENST00000326804:exon_58723527_58724927:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000424679:exon_58723527_58724509:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000345813:exon_58723527_58724509:ZNF274 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 58755366 G/A 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58755331_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58755328_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000333581:exon_58755328_58755422:ZNF544 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 58772579 C/G 1 25 20 45 11.3647925329558 10.9081659736353 0.456626559320529 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 30 23 53 13.637751039547 12.5443908696806 1.0933601698664 A:G A G 10 0.545408298681766 0.784574586230343 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 58904396 G/A 1 1992 1909 3901 905.546669025922 1041.18444218349 -135.637773157569 A:T:C:G G A 10 0.545408298681766 1.40876490940040e-05 ENSG00000083845:ENST00000196551:exon_58904343_58904552:RPS5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 59010593 A/G 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 A:G A G 10 0.545408298681766 0.609212519966719 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 59028414 C/T 1 9 15 24 4.09132531186411 8.18112448022649 -4.08979916836238 T:C C T 10 0.545408298681766 0.103758116307969 ENSG00000119574:ENST00000354590:exon_59027762_59029040:ZBTB45 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 59059729 G/A 1 240 247 487 109.102008316376 134.715849774396 -25.61384145802 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0203044671090932 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59059661_59059775:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59059661_59059775:TRIM28 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 59061357 C/T 1 219 226 445 99.5555825886932 123.262275502079 -23.7066929133859 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.0252274445340327 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59061316_59061402:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59061316_59061402:TRIM28 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 59073613 A/G 1 19 10 29 8.63724232504645 5.45408298681766 3.18315933822879 A:G A G 10 0.545408298681766 0.266802247655899 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 59074429 C/T 1 13 13 26 5.90969211713704 7.09030788286296 -1.18061576572592 T:C C T 10 0.545408298681766 0.696154695081167 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 19 59074653 T/C 1 12 10 22 5.45510041581881 5.45408298681766 0.00101742900114843 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 10050947 T/C 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000492648:exon_10050865_10051042:TAF1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 10059770 G/T 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 T:G G T 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 10059844 C/T 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 509 435 944 231.387175970981 237.252609926568 -5.86543395558709 A:G G A 10 0.545408298681766 0.719241916160283 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 10584190 G/C 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 C:G G C 10 0.545408298681766 0.763908722486136 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 15747393 C/T 1 31 31 62 14.0923427408653 16.9076572591347 -2.81531451826949 T:C C T 10 0.545408298681766 0.524316896949048 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15747299_15747437:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15747299_15747437:DDX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 20101487 G/A 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 A:G G A 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000183891:ENST00000402414:exon_20101467_20101717:TTC32;ENSG00000183891:ENST00000333610:exon_20101467_20101747:TTC32 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 20240668 C/A 1 44 24 68 20.0020348580023 13.0897991683624 6.91223568963991 A:C C A 10 0.545408298681766 0.112827292410876 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20240652_20240772:LAPTM4A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 24929851 A/T 1 21 8 29 9.54642572768291 4.36326638945413 5.18315933822879 A:T A T 10 0.545408298681766 0.0620778492599737 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24929437_24930757:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24929437_24930757:NCOA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 25064157 G/C 1 12 15 27 5.45510041581881 8.18112448022649 -2.72602406440768 C:G G C 10 0.545408298681766 0.336126149245224 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 27838058 C/A 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 A:C C A 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000243943:ENST00000416005:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000379717:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000355467:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000505973:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27838035_27838136:ZNF512 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 27887034 C/A 1 17 19 36 7.72805892240998 10.3627576749536 -2.63469875254358 A:C C A 10 0.545408298681766 0.405871052078179 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 54 43 97 24.5479518711846 23.4525568433159 1.0953950278687 T:C T C 10 0.545408298681766 0.83921431690701 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 32822957 G/A 1 16 18 34 7.27346722109174 9.81734937627179 -2.54388215518004 A:G G A 10 0.545408298681766 0.394439936472409 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 T:C C T 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 33759395 C/T 1 57 45 102 25.9117269751393 24.5433734406795 1.36835353445987 T:C C T 10 0.545408298681766 0.842594093581494 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33756792_33759467:RASGRP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 33764176 A/G 1 34 21 55 15.45611784482 11.4535742723171 4.00254357250287 A:G A G 10 0.545408298681766 0.343313180453562 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33764161_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33764164_33764277:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33764161_33764416:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33764161_33764390:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33764161_33765248:RASGRP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 36810586 T/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C T C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36810496_36810612:FEZ2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 37076594 T/C 1 10 5 15 4.54591701318234 2.72704149340883 1.81887551977351 T:C T C 10 0.545408298681766 0.440723047905603 ENSG00000115808:ENST00000263918:exon_37070783_37076768:STRN;ENSG00000115808:ENST00000379213:exon_37075472_37076768:STRN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 37230728 T/C 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 T:C T C 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37230685_37230829:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37230685_37230829:HEATR5B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 37471114 C/A 1 12 13 25 5.45510041581881 7.09030788286296 -1.63520746704415 A:C C A 10 0.545408298681766 0.551039108147693 ENSG00000003509:ENST00000455230:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37471054_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000431821:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000483999:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000439218:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474257:exon_37471006_37471116:C2orf56 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 38536626 T/G 1 11 11 22 5.00050871450057 5.99949128549943 -0.998982570998852 T:G T G 10 0.545408298681766 0.675286531050552 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38536520_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38536573_38536648:ATL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 38604351 A/G 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G A G 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38604285_38604404:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38604285_38604427:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38604285_38604432:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38604285_38604403:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38604285_38604398:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000456736:exon_38604285_38604404:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000474535:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000472097:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000451483:exon_38604285_38604421:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000416222:exon_38604285_38604415:ATL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 43452183 A/G 1 27 20 47 12.2739759355923 10.9081659736353 1.365809961957 A:G A G 10 0.545408298681766 0.770232276057536 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 43519977 C/T 1 23 11 34 10.4556091303194 5.99949128549943 4.45611784481996 T:C C T 10 0.545408298681766 0.167434474264231 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485018:exon_43519973_43520205:THADA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 44201376 T/C 1 63 79 142 28.6392771830487 43.0872555958595 -14.4479784128108 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0179973657511894 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44201289_44201434:LRPPRC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 44547574 G/A 1 27 18 45 12.2739759355923 9.81734937627179 2.45662655932053 A:G G A 10 0.545408298681766 0.549931162252618 ENSG00000138079:ENST00000260649:exon_44547338_44548633:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409380:exon_44547338_44547960:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409740:exon_44547338_44547937:SLC3A1;ENSG00000138078:ENST00000425263:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000426481:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409957:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409411:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409936:exon_44545905_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000444696:exon_44547405_44547782:PREPL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 46739157 A/G 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000250565:ENST00000306448:exon_46738986_46739951:ATP6V1E2;ENSG00000250565:ENST00000522587:exon_46739006_46739951:ATP6V1E2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 46839477 T/C 1 7 12 19 3.18214190922764 6.54489958418119 -3.36275767495355 T:C T C 10 0.545408298681766 0.165845385921528 ENSG00000151665:ENST00000281382:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000306465:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000412717:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000495933:exon_46839367_46839483:PIGF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 47251469 G/C 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 C:G G C 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000440051:exon_47251426_47251498:TTC7A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 47278901 G/A 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 A:G G A 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484337:exon_47278885_47279019:TTC7A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 54135936 T/C 1 18 17 35 8.18265062372821 9.27194107759002 -1.08929045386181 T:C T C 10 0.545408298681766 0.736735697725999 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54135921_54135938:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54135921_54135938:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000461810:exon_54135921_54135980:PSME4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 55277226 C/T 1 51 40 91 23.1841767672299 21.8163319472706 1.36784481995929 T:C C T 10 0.545408298681766 0.833510969061812 ENSG00000115310:ENST00000337526:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000317610:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000357732:exon_55276881_55277680:RTN4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 33 17 50 15.0015261435017 9.27194107759002 5.7295850659117 T:C C T 10 0.545408298681766 0.118522074207983 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 55481322 T/A 1 49 54 103 22.2749933645935 29.4520481288154 -7.1770547642219 A:T T A 10 0.545408298681766 0.166447443866579 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55481177_55481337:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55481177_55481337:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55481177_55481337:MTIF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 29 24 53 13.1831593382288 13.0897991683624 0.0933601698664042 T:G G T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 55812256 A/G 1 13 12 25 5.90969211713704 6.54489958418119 -0.635207467044149 A:G A G 10 0.545408298681766 0.842593548431809 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55812187_55812303:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55812187_55812303:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55812187_55812303:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55812187_55812303:SMEK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 25 27 52 11.3647925329558 14.7260240644077 -3.36123153145183 T:C T C 10 0.545408298681766 0.403848243759171 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 55883317 G/T 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 T:G G T 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415489:exon_55883266_55883355:PNPT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 55912120 T/C 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 T:C T C 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000429805:exon_55912078_55912183:PNPT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 27 33 60 12.2739759355923 17.9984738564983 -5.72449792090596 A:G A G 10 0.545408298681766 0.154202787963713 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 48 39 87 21.8204016632752 21.2709236485889 0.549478014686361 A:G A G 10 0.545408298681766 0.914829347524777 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 117 97 214 53.1872290542334 52.9046049721313 0.282624082102075 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 61647901 A/G 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 A:G A G 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000453133:exon_61647881_61647968:USP34 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 62066927 A/G 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 A:G A G 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000170264:ENST00000450831:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000456262:exon_62066556_62067660:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000418113:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000404929:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000405894:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000307507:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000478822:exon_62066556_62067716:FAM161A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 64327544 G/T 1 41 20 61 18.6382597540476 10.9081659736353 7.73009378041228 T:G G T 10 0.545408298681766 0.0534103881227576 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 64327592 T/C 1 27 16 43 12.2739759355923 8.72653277890826 3.54744315668406 T:C T C 10 0.545408298681766 0.288806936840592 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 68592496 C/T 1 251 281 532 114.102517030877 153.259731929576 -39.1572148986995 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.000677409871775192 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68592305_68592525:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68592322_68592525:PLEK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 193 131 324 87.7361983544192 71.4484871273113 16.2877112271078 A:T:G G T 10 0.545408298681766 0.0741486107542285 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 69642390 A/G 1 14 15 29 6.36428381845528 8.18112448022649 -1.81684066177121 A:G A G 10 0.545408298681766 0.57718202619655 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000474230:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000462320:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69642317_69642431:NFU1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 11 16 27 5.00050871450057 8.72653277890826 -3.72602406440768 A:T A T 10 0.545408298681766 0.177124759497704 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 91 103 194 41.3678448199593 56.1770547642219 -14.8092099442626 A:T A T 10 0.545408298681766 0.036363702689606 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 46 31 77 20.9112182606388 16.9076572591347 4.00356100150402 A:G G A 10 0.545408298681766 0.423295401941039 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 34 50 84 15.45611784482 27.2704149340883 -11.8142970892683 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0113963266835951 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 130 65 195 59.0969211713704 35.4515394143148 23.6453817570556 A:C C A 10 0.545408298681766 0.000690276217928967 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 74710491 C/T 1 17 13 30 7.72805892240998 7.09030788286296 0.637751039547021 T:C C T 10 0.545408298681766 0.856490370798262 ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 74763258 C/G 1 10 6 16 4.54591701318234 3.2724497920906 1.27346722109174 C:G C G 10 0.545408298681766 0.62020159802431 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000481835:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000420535:exon_74763123_74763277:LOXL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 85553784 C/T 1 31 37 68 14.0923427408653 20.1801070512253 -6.08776431036009 T:C C T 10 0.545408298681766 0.145266398465488 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000282120:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000398263:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 85554080 G/A 1 37 27 64 16.8198929487747 14.7260240644077 2.09386888436698 A:G G A 10 0.545408298681766 0.618160765243602 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 85617327 C/T 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 T:C C T 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000115459:ENST00000409013:exon_85617261_85617388:ELMOD3;ENSG00000115459:ENST00000409890:exon_85617261_85617388:ELMOD3;ENSG00000115459:ENST00000490508:exon_85617261_85617388:ELMOD3;ENSG00000115459:ENST00000446464:exon_85617261_85618871:ELMOD3;ENSG00000115459:ENST00000423095:exon_85617261_85617388:ELMOD3;ENSG00000115459:ENST00000409344:exon_85617261_85617388:ELMOD3;ENSG00000115459:ENST00000393852:exon_85617261_85617388:ELMOD3;ENSG00000115459:ENST00000393856:exon_85617261_85617621:ELMOD3;ENSG00000115459:ENST00000315658:exon_85617261_85618871:ELMOD3;ENSG00000115459:ENST00000414593:exon_85617261_85617388:ELMOD3;ENSG00000115459:ENST00000410106:exon_85617261_85617388:ELMOD3;ENSG00000115459:ENST00000444108:exon_85617261_85617388:ELMOD3;ENSG00000115459:ENST00000496957:exon_85617261_85617388:ELMOD3;ENSG00000115459:ENST00000486908:exon_85617261_85617777:ELMOD3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 85622059 T/C 1 20 9 29 9.09183402636468 4.90867468813589 4.18315933822879 T:C T C 10 0.545408298681766 0.137337488735895 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85621871_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85621876_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85621890_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85621951_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85622016_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85622018_85622081:CAPG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 85625222 T/G 1 15 6 21 6.81887551977351 3.2724497920906 3.54642572768291 T:G T G 10 0.545408298681766 0.130926508572863 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85625143_85625254:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85625143_85625475:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85625143_85625275:CAPG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 85628745 C/T 1 44 26 70 20.0020348580023 14.1806157657259 5.82141909227638 T:C C T 10 0.545408298681766 0.186858140607616 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85628652_85628794:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000439385:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000449030:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000447219:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000459793:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409275:exon_85628652_85628806:CAPG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 85628983 C/T 1 23 21 44 10.4556091303194 11.4535742723171 -0.997965141997703 T:C C T 10 0.545408298681766 0.764637470510808 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000439385:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000449030:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000447219:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000459793:exon_85628908_85629281:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409275:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000415012:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000491267:exon_85628768_85629281:CAPG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 88879131 T/C 1 9 12 21 4.09132531186411 6.54489958418119 -2.45357427231709 T:C T C 10 0.545408298681766 0.381262320809038 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000478003:exon_88879036_88879487:EIF2AK3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 88895123 T/C 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 T:C T C 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88894987_88895181:EIF2AK3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 89156948 C/G 1 6551 1052 7603 2978.03023533575 573.769530213218 2404.26070512253 A:C:G C G 10 0.545408298681766 0 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 89161043 T/C 0 252 0 252 114.557108732195 0 114.557108732195 T T 10 0.545408298681766 6.62308148140402e-67 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 89161398 G/T 1 149 489 638 67.7341634964169 266.704658055384 -198.970494558967 T:C:G G T 10 0.545408298681766 7.77682580443953e-58 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 97527490 C/T 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 T:C C T 10 0.545408298681766 0.40572272702491 ENSG00000168758:ENST00000305476:exon_97527474_97527631:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000474420:exon_97527474_97528184:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000482925:exon_97527474_97527631:SEMA4C;ENSG00000168758:ENST00000467747:exon_97527474_97529065:SEMA4C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 99149946 G/A 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G G A 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99149840_99149958:INPP4A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 99226173 T/A 1 3 9 12 1.3637751039547 4.90867468813589 -3.54489958418119 A:T T A 10 0.545408298681766 0.0458142407340025 ENSG00000115446:ENST00000409975:exon_99225042_99226502:UNC50;ENSG00000115446:ENST00000409347:exon_99226106_99226502:UNC50 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 99226516 T/A 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 A:T T A 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 T:C T C 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 11 19 30 5.00050871450057 10.3627576749536 -5.36224896045298 T:C T C 10 0.545408298681766 0.065281714411376 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 32 29 61 14.5469344421835 15.8168406617712 -1.26990621958772 A:G G A 10 0.545408298681766 0.797546513662278 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 99995517 C/T 1 166 154 320 75.4622224188268 83.992877996992 -8.53065557816512 T:C C T 10 0.545408298681766 0.340535026866722 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995482_99995589:EIF5B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 57 59 116 25.9117269751393 32.1790896222242 -6.26736264708486 A:T:C T C 10 0.545408298681766 0.263482474755471 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 17 24 41 7.72805892240998 13.0897991683624 -5.3617402459524 A:G A G 10 0.545408298681766 0.116015498210352 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 100020945 C/T 1 21 18 39 9.54642572768291 9.81734937627179 -0.270923648588873 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100020907_100021140:REV1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 T:C T C 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 16 11 27 7.27346722109174 5.99949128549943 1.27397593559232 A:G A G 10 0.545408298681766 0.701415732858495 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 100058870 C/T 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 T:C C T 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100058779_100058931:REV1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 101010082 G/C 1 11 17 28 5.00050871450057 9.27194107759002 -4.27143236308945 C:G G C 10 0.545408298681766 0.128767570080049 ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 101910532 C/G 1 10 12 22 4.54591701318234 6.54489958418119 -1.99898257099885 C:G C G 10 0.545408298681766 0.401540564367046 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101910476_101910544:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101910476_101910544:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000478404:exon_101910476_101911124:RNF149 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 103334969 G/A 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000135953:ENST00000258436:exon_103332299_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000438943:exon_103333497_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000437075:exon_103334030_103335666:MFSD9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 105889349 G/A 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 A:G G A 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 105924510 A/G 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 A:G A G 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105924071_105924775:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105924071_105924778:TGFBRAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 105977776 G/A 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:G G A 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000115641:ENST00000409177:exon_105974169_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000344213:exon_105977269_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393353:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000530340:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393352:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000322142:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000336660:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000358129:exon_105977287_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000409807:exon_105977314_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000408995:exon_105977318_105977891:FHL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 45 48 93 20.4566265593205 26.1795983367248 -5.72297177740424 T:C T C 10 0.545408298681766 0.252555447366469 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 113940730 T/C 1 38 48 86 17.2744846500929 26.1795983367248 -8.90511368663187 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0650789771899401 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 29 36 65 13.1831593382288 19.6346987525436 -6.45153941431479 C:G G C 10 0.545408298681766 0.134398710017660 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 36 18 54 16.3653012474564 9.81734937627179 6.54795187118464 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0768966921713766 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 38 26 64 17.2744846500929 14.1806157657259 3.09386888436697 T:C T C 10 0.545408298681766 0.454407712313776 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 14 24 38 6.36428381845528 13.0897991683624 -6.72551534990711 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0336412219745849 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 120129886 G/A 1 660 610 1270 300.030522870034 332.699062195877 -32.6685393258428 A:T:C:G G A 10 0.545408298681766 0.0670301714121393 ENSG00000155368:ENST00000355857:exon_120129821_120130126:DBI;ENSG00000155368:ENST00000409094:exon_120129821_120130057:DBI;ENSG00000155368:ENST00000311521:exon_120129821_120130122:DBI;ENSG00000155368:ENST00000460901:exon_120129821_120130030:DBI;ENSG00000155368:ENST00000393103:exon_120129821_120129983:DBI;ENSG00000155368:ENST00000475783:exon_120129821_120130076:DBI HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 120438515 G/C 1 5 13 18 2.27295850659117 7.09030788286296 -4.81734937627179 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0309826429768608 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000445518:exon_120438408_120438771:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000409951:exon_120438408_120438699:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120438430_120439035:TMEM177 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 120438523 A/G 1 13 6 19 5.90969211713704 3.2724497920906 2.63724232504645 A:G A G 10 0.545408298681766 0.25633390279836 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000445518:exon_120438408_120438771:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000409951:exon_120438408_120438699:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120438430_120439035:TMEM177 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 120439230 C/G 1 11 12 23 5.00050871450057 6.54489958418119 -1.54439086968062 C:G C G 10 0.545408298681766 0.536899606886051 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120439135_120439242:TMEM177 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 122106262 T/G 1 14 9 23 6.36428381845528 4.90867468813589 1.45560913031938 T:G T G 10 0.545408298681766 0.676543181314199 ENSG00000074054:ENST00000429969:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000442289:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000263710:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000455322:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000397587:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000376194:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000409078:exon_122106088_122106294:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000452274:exon_122106088_122106294:CLASP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 122125373 G/T 1 10 12 22 4.54591701318234 6.54489958418119 -1.99898257099885 T:G G T 10 0.545408298681766 0.401540564367046 ENSG00000074054:ENST00000429969:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000442289:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000263710:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000455322:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000397587:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000376194:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000409078:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000452274:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000472776:exon_122125164_122125407:CLASP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 127816695 C/T 1 15 7 22 6.81887551977351 3.81785809077236 3.00101742900115 T:C:G C T 10 0.545408298681766 0.284228668887522 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127816587_127816731:BIN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 127821207 G/A 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 A:G G A 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127821147_127821222:BIN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 9 5 14 4.09132531186411 2.72704149340883 1.36428381845528 A:G A G 10 0.545408298681766 0.594806597584705 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 128934400 T/C 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 T:C T C 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128934388_128934472:UGGT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 128939799 C/T 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 0.609212519966719 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 12 7 19 5.45510041581881 3.81785809077236 1.63724232504645 A:G G A 10 0.545408298681766 0.497799653196701 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 T:C C T 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 135711516 C/T 1 17 13 30 7.72805892240998 7.09030788286296 0.637751039547021 T:C C T 10 0.545408298681766 0.856490370798262 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 135711657 G/A 1 7 19 26 3.18214190922764 10.3627576749536 -7.18061576572592 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00534271043841662 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 135893372 A/G 1 38 42 80 17.2744846500929 22.9071485446342 -5.63266389454128 A:G A G 10 0.545408298681766 0.217963540492945 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 135911422 T/C 1 46 55 101 20.9112182606388 29.9974564274971 -9.08623816685837 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0725535093264095 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 136393658 A/G 1 16 22 38 7.27346722109174 11.9989825709989 -4.72551534990711 A:G A G 10 0.545408298681766 0.143050788663091 ENSG00000048991:ENST00000422577:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000456040:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000486532:exon_136393658_136393753:R3HDM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 148716428 T/C 1 11 9 20 5.00050871450057 4.90867468813589 0.0918340263646806 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000461711:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148716161_148716435:ORC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 152132031 C/T 1 103 81 184 46.8229452357781 44.178072193223 2.64487304255506 T:C C T 10 0.545408298681766 0.711864938009307 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152131998_152132184:NMI HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 152314385 G/A 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 A:G G A 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152314275_152314477:RIF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 12 21 33 5.45510041581881 11.4535742723171 -5.99847385649828 A:G G A 10 0.545408298681766 0.052799048038848 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 36 39 75 16.3653012474564 21.2709236485889 -4.90562240113245 A:T A T 10 0.545408298681766 0.296691947881998 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 152331418 C/G 1 27 9 36 12.2739759355923 4.90867468813589 7.36530124745642 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0178945868715162 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152331371_152332136:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152331371_152332419:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152331371_152333863:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152331371_152331733:RIF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 160604514 C/T 1 52 46 98 23.6387684685482 25.0887817393612 -1.45001327081307 T:C C T 10 0.545408298681766 0.839364404003761 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 160604812 C/T 1 44 27 71 20.0020348580023 14.7260240644077 5.27601079359462 T:C C T 10 0.545408298681766 0.233950050901245 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 160639970 T/C 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 T:C T C 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000241399:ENST00000429078:exon_160639870_160639980:CD302;ENSG00000241399:ENST00000259053:exon_160639870_160639980:CD302;ENSG00000241399:ENST00000480212:exon_160639870_160639980:CD302;ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160639870_160639980:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160639870_160639980:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160639870_160639980:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160639870_160639980:RP11-357L2.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 160676427 C/A 1 37 29 66 16.8198929487747 15.8168406617712 1.00305228700345 A:C C A 10 0.545408298681766 0.901755835120494 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160676237_160676431:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160676237_160676431:RP11-357L2.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 160710922 T/C 1 20 24 44 9.09183402636468 13.0897991683624 -3.9979651419977 A:T:C T C 10 0.545408298681766 0.230305834018183 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 160711045 G/C 1 31 25 56 14.0923427408653 13.6352074670442 0.457135273821104 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 160729005 C/T 1 14 9 23 6.36428381845528 4.90867468813589 1.45560913031938 T:C C T 10 0.545408298681766 0.676543181314199 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160728330_160729104:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 160737621 C/T 1 17 6 23 7.72805892240998 3.2724497920906 4.45560913031938 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0917657569763353 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 160738677 G/A 1 23 12 35 10.4556091303194 6.54489958418119 3.91070954613819 A:G G A 10 0.545408298681766 0.234665003070601 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 170402752 T/C 1 33 23 56 15.0015261435017 12.5443908696806 2.45713527382111 T:C T C 10 0.545408298681766 0.591929380935694 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 170403030 T/C 1 32 35 67 14.5469344421835 19.0892904538618 -4.54235601167832 T:C T C 10 0.545408298681766 0.272073044740230 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 170411693 T/C 1 19 21 40 8.63724232504645 11.4535742723171 -2.81633194727064 T:C T C 10 0.545408298681766 0.428137170927263 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170411634_170411765:FASTKD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 154 196 350 70.007122003008 106.900026541626 -36.8929045386181 A:T T A 10 0.545408298681766 8.49808431386588e-05 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 171822576 C/T 1 67 73 140 30.4576439883217 39.8148058037689 -9.35716181544724 T:C C T 10 0.545408298681766 0.126399215955595 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 171850329 T/G 1 80 80 160 36.3673361054587 43.6326638945413 -7.26532778908256 A:T:C:G T G 10 0.545408298681766 0.26659387611736 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171850202_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000356075:exon_171850007_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171850017_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171850237_171850466:TLK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 49 51 100 22.2749933645935 27.8158232327701 -5.5408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 0.271047918532265 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 172725301 A/G 1 12 8 20 5.45510041581881 4.36326638945413 1.09183402636468 A:G A G 10 0.545408298681766 0.660903045813617 ENSG00000115840:ENST00000422440:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000392592:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000263812:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000426896:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000475360:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000472748:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000484227:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000464063:exon_172725191_172725333:SLC25A12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 175260355 G/T 1 17 17 34 7.72805892240998 9.27194107759002 -1.54388215518004 T:G G T 10 0.545408298681766 0.609659374880455 ENSG00000138433:ENST00000414336:exon_175260279_175260429:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000342016:exon_175260279_175260443:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000362053:exon_175260279_175260397:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000425101:exon_175260279_175260412:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000461454:exon_175260279_175260434:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000472169:exon_175260279_175260437:CIR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 179403593 G/A 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 A:G G A 10 0.545408298681766 0.561582513166177 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 179403750 C/T 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000155657:ENST00000473181:exon_179403673_179403978:TTN;ENSG00000155657:ENST00000460472:exon_179403673_179403978:TTN;ENSG00000155657:ENST00000359218:exon_179403673_179403978:TTN;ENSG00000155657:ENST00000356127:exon_179403673_179403978:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342175:exon_179403673_179403978:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342992:exon_179403673_179403978:TTN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 182374534 A/G 1 20 15 35 9.09183402636468 8.18112448022649 0.91070954613819 A:G A G 10 0.545408298681766 0.865669207088407 ENSG00000115232:ENST00000425522:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000490435:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000476824:exon_182374385_182374534:ITGA4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 182399097 T/C 1 23 26 49 10.4556091303194 14.1806157657259 -3.72500663540653 A:T:C T C 10 0.545408298681766 0.316472655951376 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 182780126 G/A 1 13 13 26 5.90969211713704 7.09030788286296 -1.18061576572592 A:G G A 10 0.545408298681766 0.696154695081167 ENSG00000138434:ENST00000431877:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000320370:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409001:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000261006:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000428267:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000454579:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000440623:exon_182779943_182781732:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000416081:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000491720:exon_182779943_182783402:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409136:exon_182779943_182781154:SSFA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 184025875 G/T 1 16 11 27 7.27346722109174 5.99949128549943 1.27397593559232 T:G G T 10 0.545408298681766 0.701415732858495 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_184025782_184026166:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_184025782_184026408:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_184025782_184025972:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_184024216_184026408:NUP35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 184025876 A/T 1 16 11 27 7.27346722109174 5.99949128549943 1.27397593559232 A:T A T 10 0.545408298681766 0.701415732858495 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_184025782_184026166:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_184025782_184026408:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_184025782_184025972:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_184024216_184026408:NUP35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 190788123 G/T 0 809 0 809 367.764686366451 0 367.764686366451 G G 10 0.545408298681766 1.08379790817358e-213 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 191064753 C/T 1 13 2 15 5.90969211713704 1.09081659736353 4.81887551977351 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0167123385626709 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 191161622 T/C 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 T:C T C 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000409934:exon_191161539_191161679:HIBCH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 191224927 C/T 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 T:C C T 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 T:G G T 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 191301700 G/A 1 15 19 34 6.81887551977351 10.3627576749536 -3.54388215518004 A:G G A 10 0.545408298681766 0.232628088714879 ENSG00000151690:ENST00000392328:exon_191300703_191302287:MFSD6;ENSG00000151690:ENST00000281416:exon_191300638_191302287:MFSD6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 198001319 A/G 1 10 4 14 4.54591701318234 2.18163319472706 2.36428381845528 A:G A G 10 0.545408298681766 0.284657873718901 ENSG00000065413:ENST00000282272:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000328737:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000450567:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000337207:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409153:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409919:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000447713:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000443014:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000463879:exon_197998695_198001386:ANKRD44 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 198327314 G/A 1 15 10 25 6.81887551977351 5.45408298681766 1.36479253295585 A:G G A 10 0.545408298681766 0.689530950640826 ENSG00000115520:ENST00000263960:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409398:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409010:exon_198327263_198327455:COQ10B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 79 81 160 35.9127444041405 44.178072193223 -8.26532778908255 A:G A G 10 0.545408298681766 0.204134595986837 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 198365788 C/T 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 T:C C T 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000115541:ENST00000463841:exon_198365606_198365962:HSPE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 198571709 T/C 1 16 9 25 7.27346722109174 4.90867468813589 2.36479253295585 T:C T C 10 0.545408298681766 0.423463149171332 ENSG00000152428:ENST00000282276:exon_198570087_198573109:MARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 201253956 A/G 1 21 4 25 9.54642572768291 2.18163319472706 7.36479253295585 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00391298195450678 ENSG00000196141:ENST00000439084:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000439395:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000444012:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000451764:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000423749:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000471601:exon_201253946_201255577:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000457757:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000428692:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000453663:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000459656:exon_201253946_201255591:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409397:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000421573:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000449647:exon_201253946_201254006:SPATS2L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 18 19 37 8.18265062372821 10.3627576749536 -2.18010705122534 C:G C G 10 0.545408298681766 0.511375414673015 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 201736068 A/G 1 75 77 152 34.0943775988676 41.996438998496 -7.90206139962843 A:G A G 10 0.545408298681766 0.221718336427415 ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 201741683 G/A 1 41 41 82 18.6382597540476 22.3617402459524 -3.72348049190481 A:G G A 10 0.545408298681766 0.438435514239069 ENSG00000240344:ENST00000422134:exon_201741642_201741760:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201741642_201741760:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201741642_201741760:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201741642_201741760:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201741642_201741760:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201741642_201741760:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201741642_201741760:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201741642_201741760:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201741642_201741760:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201741642_201741760:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000497263:exon_201741665_201741760:PPIL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 202025550 C/G 1 25 16 41 11.3647925329558 8.72653277890826 2.63825975404759 C:G C G 10 0.545408298681766 0.436884372319219 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 202149906 G/A 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 A:G G A 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000064012:ENST00000392263:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392264:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000303385:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392266:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000264274:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392259:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000432109:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000264275:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000358485:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000339403:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000323492:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000444430:exon_202149539_202150040:CASP8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 207008763 C/A 1 33 30 63 15.0015261435017 16.362248960453 -1.36072281695126 A:C C A 10 0.545408298681766 0.800545745443923 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 207012483 A/G 1 20 21 41 9.09183402636468 11.4535742723171 -2.36174024595241 A:G A G 10 0.545408298681766 0.531170282862538 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000456284:exon_207012477_207012558:NDUFS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 207025444 T/C 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000114942:ENST00000479587:exon_207025312_207025841:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000460760:exon_207025312_207025914:EEF1B2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 207169731 G/A 0 12 0 12 5.45510041581881 0 5.45510041581881 G G 10 0.545408298681766 0.000770770342157052 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 207172627 A/G 0 11 0 11 5.00050871450057 0 5.00050871450057 A A 10 0.545408298681766 0.00144172735090439 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 207174316 T/C 0 13 0 13 5.90969211713704 0 5.90969211713704 T T 10 0.545408298681766 0.000413311221647668 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 22 17 39 10.0010174290011 9.27194107759002 0.729076351411127 A:T:G A G 10 0.545408298681766 0.873163637120494 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 9 5 14 4.09132531186411 2.72704149340883 1.36428381845528 A:C C A 10 0.545408298681766 0.594806597584705 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 215593573 C/T 1 10 14 24 4.54591701318234 7.63571618154472 -3.08979916836238 T:C C T 10 0.545408298681766 0.223719116182242 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215590370_215593732:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000432456:exon_215593148_215593732:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000471590:exon_215593262_215593732:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215593277_215593732:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215593428_215593732:BARD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 215645464 C/G 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 C:G C G 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215645284_215646233:BARD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 216190020 C/G 1 80 62 142 36.3673361054587 33.8153145182695 2.55202158718923 A:C:G C G 10 0.545408298681766 0.674703142492616 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216189903_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000427397:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000413174:exon_216189964_216190052:ATIC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 218940259 C/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C C T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000188282:ENST00000457754:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000344321:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000374155:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000463872:exon_218939816_218940443:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000441828:exon_218939816_218940463:RUFY4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 219103580 A/G 1 1 11 12 0.454591701318234 5.99949128549943 -5.54489958418119 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00189211604765191 ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 219130802 T/C 1 45 55 100 20.4566265593205 29.9974564274971 -9.5408298681766 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0569491568732607 ENSG00000127837:ENST00000248450:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000444053:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000475678:exon_219130302_219131310:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000420660:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000489767:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000422731:exon_219130778_219130804:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000465442:exon_219130787_219130870:AAMP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 19 11 30 8.63724232504645 5.99949128549943 2.63775103954702 C:G G C 10 0.545408298681766 0.364545047610998 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 219146803 G/A 1 2 9 11 0.909183402636468 4.90867468813589 -3.99949128549943 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0289147202703354 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 219146868 T/C 1 17 4 21 7.72805892240998 2.18163319472706 5.54642572768291 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0155492903001028 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 219146882 G/C 1 20 4 24 9.09183402636468 2.18163319472706 6.91020083163762 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0063604176980734 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 219266423 C/A 1 29 27 56 13.1831593382288 14.7260240644077 -1.54286472617889 A:C C A 10 0.545408298681766 0.68944141709458 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000494067:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000496785:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000431127:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219265890_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219266287_219266435:CTDSP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 219526634 G/A 1 20 10 30 9.09183402636468 5.45408298681766 3.63775103954702 A:G G A 10 0.545408298681766 0.203010938958958 ENSG00000074582:ENST00000430322:exon_219526482_219526639:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000456050:exon_219526482_219526639:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000443791:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000471576:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219526389_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219526574_219526676:BCS1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 220037666 A/G 1 35 30 65 15.9107095461382 16.362248960453 -0.451539414314791 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 220037756 A/G 1 38 37 75 17.2744846500929 20.1801070512253 -2.90562240113245 A:G A G 10 0.545408298681766 0.562397721979183 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 220040330 A/G 1 34 48 82 15.45611784482 26.1795983367248 -10.7234804919048 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0196080957508930 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000451647:exon_220040313_220040394:C2orf24 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 220046975 C/A 1 23 15 38 10.4556091303194 8.18112448022649 2.27448465009289 A:C C A 10 0.545408298681766 0.516754282489672 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 220047173 A/T 1 27 19 46 12.2739759355923 10.3627576749536 1.91121826063876 A:T A T 10 0.545408298681766 0.657632938359347 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220047136_220047351:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 220047393 C/T 1 20 28 48 9.09183402636468 15.2714323630894 -6.17959833672477 T:C C T 10 0.545408298681766 0.082217169361124 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 220115026 C/T 1 50 47 97 22.7295850659117 25.634190038043 -2.9046049721313 T:C C T 10 0.545408298681766 0.610448184830619 ENSG00000115661:ENST00000409638:exon_220113143_220115059:STK16;ENSG00000127824:ENST00000248437:exon_220114433_220116045:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000392088:exon_220114433_220116045:TUBA4A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 224765956 C/T 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 T:C C T 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000429915:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000483061:exon_224765572_224766050:WDFY1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 225346646 T/C 1 64 69 133 29.093868884367 37.6331726090418 -8.53930372467487 T:C:G T C 10 0.545408298681766 0.139719005260130 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225346609_225346795:CUL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 225362478 C/T 1 61 54 115 27.7300937804123 29.4520481288154 -1.72195434840309 T:C C T 10 0.545408298681766 0.779123051562463 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225362470_225362566:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000451538:exon_225362470_225362536:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000487558:exon_225362470_225362566:CUL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 228398422 A/G 1 33 31 64 15.0015261435017 16.9076572591347 -1.90613111563302 A:G A G 10 0.545408298681766 0.706834197664909 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228398265_228398474:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228398265_228398474:AGFG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 230668858 T/C 1 22 19 41 10.0010174290011 10.3627576749536 -0.361740245952406 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000487178:exon_230668715_230668943:TRIP12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 115 95 210 52.2780456515969 51.8137883747678 0.464257276829144 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 231072709 C/T 1 34 35 69 15.45611784482 19.0892904538618 -3.63317260904185 T:C C T 10 0.545408298681766 0.399105066766783 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231072706_231072774:SP110 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 231077112 G/A 1 53 46 99 24.0933601698664 25.0887817393612 -0.99542156949483 A:G G A 10 0.545408298681766 0.840838087215201 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 231077725 A/G 1 74 80 154 33.6397858975493 43.6326638945413 -9.99287799699196 A:G A G 10 0.545408298681766 0.123904366897682 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000462232:exon_231077476_231077742:SP110 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 231256812 A/G 1 9 10 19 4.09132531186411 5.45408298681766 -1.36275767495355 A:G A G 10 0.545408298681766 0.646488798036141 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231256802_231256944:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231256802_231256944:SP140L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 16 16 32 7.27346722109174 8.72653277890826 -1.45306555781651 T:C T C 10 0.545408298681766 0.723187770815947 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 93 83 176 42.2770282225958 45.2688887905866 -2.99186056799082 A:G G A 10 0.545408298681766 0.650652822408693 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 18 28 46 8.18265062372821 15.2714323630894 -7.08878173936123 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0385987465654849 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 20 21 41 9.09183402636468 11.4535742723171 -2.36174024595241 A:G G A 10 0.545408298681766 0.531170282862538 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 66 19 85 30.0030522870034 10.3627576749536 19.6402946120499 T:C C T 10 0.545408298681766 1.53264948458903e-05 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 63 6 69 28.6392771830487 3.2724497920906 25.3668273909582 A:G G A 10 0.545408298681766 3.65839501171655e-11 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 232263127 G/A 1 8 13 21 3.63673361054587 7.09030788286296 -3.45357427231709 A:G G A 10 0.545408298681766 0.187341762630804 ENSG00000156966:ENST00000287590:exon_232262442_232265875:B3GNT7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 232602730 G/A 1 28 26 54 12.7285676369106 14.1806157657259 -1.45204812881536 A:G G A 10 0.545408298681766 0.784924417495986 ENSG00000156973:ENST00000287600:exon_232602723_232602848:PDE6D;ENSG00000156973:ENST00000392030:exon_232602723_232602848:PDE6D;ENSG00000156973:ENST00000409772:exon_232602723_232602848:PDE6D;ENSG00000156973:ENST00000428104:exon_232602723_232602848:PDE6D;ENSG00000156973:ENST00000486044:exon_232602132_232602848:PDE6D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 233925166 G/A 1 36 27 63 16.3653012474564 14.7260240644077 1.63927718304874 A:G G A 10 0.545408298681766 0.706062731995767 ENSG00000168918:ENST00000422935:exon_233924677_233925322:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000451407:exon_233925062_233925322:INPP5D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 234371351 G/A 1 21 19 40 9.54642572768291 10.3627576749536 -0.816331947270641 A:G G A 10 0.545408298681766 0.874222536565282 ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234371289_234371381:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234371289_234371381:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234371289_234371381:DGKD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 50 48 98 22.7295850659117 26.1795983367248 -3.45001327081307 C:G G C 10 0.545408298681766 0.542995185941744 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 15 18 33 6.81887551977351 9.81734937627179 -2.99847385649828 T:C T C 10 0.545408298681766 0.300665631885240 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 234761225 C/T 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234761211_234761266:HJURP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 234763137 T/C 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 T:C T C 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234763030_234763212:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234763030_234763212:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234763030_234763212:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234763030_234763212:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234763030_234763181:HJURP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 237489307 T/C 1 9 10 19 4.09132531186411 5.45408298681766 -1.36275767495355 T:C T C 10 0.545408298681766 0.646488798036141 ENSG00000144476:ENST00000447924:exon_237489083_237489740:CXCR7;ENSG00000144476:ENST00000272928:exon_237489083_237491001:CXCR7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 128 88 216 58.187737768734 47.9959302839954 10.1918074847385 A:G A G 10 0.545408298681766 0.172064200763479 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 238671609 A/G 1 146 102 248 66.3703883924622 55.6316464655401 10.738741926922 A:G A G 10 0.545408298681766 0.180714652380934 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 238671940 C/T 1 175 123 298 79.553547730691 67.0852207378572 12.4683269928337 T:C C T 10 0.545408298681766 0.162588888276403 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 238672144 G/T 1 191 122 313 86.8270149517827 66.5398124391754 20.2872025126073 T:G G T 10 0.545408298681766 0.0230623343825442 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 238672253 A/G 1 157 92 249 71.3708971069627 50.1775634787225 21.1933336282403 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00742836393324022 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 238672290 C/T 1 190 108 298 86.3724232504645 58.9040962576307 27.4683269928337 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00135607044085078 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 141 131 272 64.097429885871 71.4484871273113 -7.35105724144034 C:G C G 10 0.545408298681766 0.394074541943476 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 238990388 G/A 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 A:G G A 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238990350_238990477:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000413463:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000443532:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000482031:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000431487:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238987206_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238990376_238990477:SCLY HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 239155053 C/T 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000132326:ENST00000254657:exon_239152679_239155165:PER2;ENSG00000132326:ENST00000254658:exon_239152679_239155165:PER2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 240961728 T/C 1 34 18 52 15.45611784482 9.81734937627179 5.63876846854817 T:C T C 10 0.545408298681766 0.126778836390362 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 241463595 T/C 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000144504:ENST00000373318:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000272972:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000361678:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000391987:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000403283:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000401804:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000373320:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405523:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405002:exon_241461355_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000480230:exon_241461356_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000484526:exon_241461356_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000459901:exon_241462675_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000496300:exon_241463240_241463798:ANKMY1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 241500896 C/T 1 9 5 14 4.09132531186411 2.72704149340883 1.36428381845528 T:C C T 10 0.545408298681766 0.594806597584705 ENSG00000188542:ENST00000343217:exon_241500747_241500936:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000405954:exon_241500747_241503431:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000438823:exon_241500747_241500936:DUSP28 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 241531479 A/G 1 10 6 16 4.54591701318234 3.2724497920906 1.27346722109174 A:G A G 10 0.545408298681766 0.62020159802431 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391982:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241529301_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000432084:exon_241531350_241531567:CAPN10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 241536053 C/T 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:C C T 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000142330:ENST00000483602:exon_241535736_241536119:CAPN10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 241536126 A/G 1 7 13 20 3.18214190922764 7.09030788286296 -3.90816597363532 A:G A G 10 0.545408298681766 0.113964264894792 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241536098_241536359:CAPN10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 A:G G A 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 241570249 A/C 0 0 11 11 0 5.99949128549943 -5.99949128549943 C A C 10 0.545408298681766 0.000171331231453132 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 242054718 G/A 1 12 7 19 5.45510041581881 3.81785809077236 1.63724232504645 A:G G A 10 0.545408298681766 0.497799653196701 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242054703_242054828:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242054703_242054828:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242054703_242054828:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242054703_242054828:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242054703_242054828:PASK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 22 14 36 10.0010174290011 7.63571618154472 2.36530124745642 T:C T C 10 0.545408298681766 0.504485277520847 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 242077496 C/T 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000433589:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000415234:exon_242077368_242077502:PASK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 242082262 T/C 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 T:C T C 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000452907:exon_242082252_242082489:PASK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 242179134 G/A 1 109 145 254 49.5504954436875 79.0842033088561 -29.5337078651686 A:G G A 10 0.545408298681766 0.000243396231229507 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000483086:exon_242179017_242179151:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000479169:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427487:exon_242179017_242179235:HDLBP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 242192848 T/C 1 51 73 124 23.1841767672299 39.8148058037689 -16.630629036539 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00286741793323966 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000453141:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000467435:exon_242192808_242192912:HDLBP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 21 17 38 9.54642572768291 9.27194107759002 0.274484650092893 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 242610773 T/A 0 0 46 46 0 25.0887817393612 -25.0887817393612 A T A 10 0.545408298681766 1.78069341330509e-16 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 27 35 62 12.2739759355923 19.0892904538618 -6.81531451826949 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0968940738558893 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 242690675 G/A 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 A:G G A 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 2 242793273 A/G 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 A:T T A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 A:G A G 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 259818 G/A 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 A:G G A 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 5 10 15 2.27295850659117 5.45408298681766 -3.18112448022649 C:G G C 10 0.545408298681766 0.121647049471624 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 278806 C/T 1 29 23 52 13.1831593382288 12.5443908696806 0.63876846854817 T:C C T 10 0.545408298681766 0.89011795175493 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 49 36 85 22.2749933645935 19.6346987525436 2.64029461204989 T:C T C 10 0.545408298681766 0.587713491199419 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 87 70 157 39.5494780146864 38.1785809077236 1.37089710696274 T:C C T 10 0.545408298681766 0.872773446204153 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 25 20 45 11.3647925329558 10.9081659736353 0.456626559320529 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 2097688 T/C 1 10 5 15 4.54591701318234 2.72704149340883 1.81887551977351 T:C T C 10 0.545408298681766 0.440723047905603 ENSG00000125834:ENST00000381482:exon_2097312_2098061:STK35;ENSG00000125834:ENST00000246032:exon_2097312_2098061:STK35;ENSG00000125834:ENST00000493263:exon_2097312_2098061:STK35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 206 172 378 93.6458904715562 93.8102273732638 -0.164336901707557 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 2840773 C/T 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 T:C C T 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2840700_2840797:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2840700_2840797:VPS16 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 2967430 G/A 1 17 12 29 7.72805892240998 6.54489958418119 1.18315933822879 A:G G A 10 0.545408298681766 0.71234601175556 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000455631:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000418580:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000430705:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2967411_2967495:PTPRA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 3090848 T/G 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:G T G 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000185019:ENST00000217173:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000348031:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000440298:exon_3088219_3090960:UBOX5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 3765373 G/A 1 91 124 215 41.3678448199593 67.630629036539 -26.2627842165797 A:G G A 10 0.545408298681766 0.000353445812107982 ENSG00000125817:ENST00000379751:exon_3764500_3767337:CENPB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 3838441 C/G 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 C:G C G 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3838282_3838456:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000441852:exon_3838282_3838581:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3838282_3838456:MAVS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 5169799 C/T 1 8 1 9 3.63673361054587 0.545408298681766 3.09132531186411 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0460880501374676 ENSG00000101290:ENST00000460006:exon_5169713_5169832:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000379062:exon_5169713_5169832:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000379070:exon_5169713_5169832:CDS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 5924828 A/G 1 14 8 22 6.36428381845528 4.36326638945413 2.00101742900115 A:G A G 10 0.545408298681766 0.521743237801811 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000493972:exon_5924808_5924899:TRMT6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 5935303 A/C 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:C A C 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5935254_5935336:MCM8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 5935325 T/G 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:G T G 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5935254_5935336:MCM8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 5974265 A/G 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 A:G A G 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5974152_5974341:MCM8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 10594363 G/A 0 46 0 46 20.9112182606388 0 20.9112182606388 G G 10 0.545408298681766 1.05011996403920e-12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 10620386 A/G 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 A:G A G 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000101384:ENST00000254958:exon_10618332_10620603:JAG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 13695680 C/T 1 45 39 84 20.4566265593205 21.2709236485889 -0.814297089268344 T:C C T 10 0.545408298681766 0.912881366892866 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 13779113 T/C 1 14 12 26 6.36428381845528 6.54489958418119 -0.180615765725915 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000101247:ENST00000378106:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000378081:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000463598:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000485738:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000477732:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000475968:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000481249:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000476536:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000464269:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000479716:exon_13779107_13779146:C20orf7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 18143355 C/T 1 12 9 21 5.45510041581881 4.90867468813589 0.546425727682915 T:C C T 10 0.545408298681766 0.831119559812142 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18143021_18143589:CSRP2BP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 21142523 C/G 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 C:G C G 10 0.545408298681766 0.40572272702491 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 21142813 T/C 1 9 12 21 4.09132531186411 6.54489958418119 -2.45357427231709 T:C:G T C 10 0.545408298681766 0.381262320809038 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 23345844 A/C 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 A:C A C 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 25187213 G/A 1 7 2 9 3.18214190922764 1.09081659736353 2.09132531186411 A:G G A 10 0.545408298681766 0.19585774268132 ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000425813:exon_25187158_25187226:ENTPD6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 25193949 G/A 1 7 10 17 3.18214190922764 5.45408298681766 -2.27194107759002 A:G G A 10 0.545408298681766 0.332347257730029 ENSG00000197586:ENST00000354989:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000525986:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000439162:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433417:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25193899_25194012:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000447877:exon_25193899_25194042:ENTPD6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 T:C T C 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 32212690 C/T 1 2 8 10 0.909183402636468 4.36326638945413 -3.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 0.051055470816189 ENSG00000078699:ENST00000375279:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000342704:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000346541:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397800:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000492345:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000359606:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397803:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000491618:exon_32212570_32212823:CBFA2T2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 32264533 C/A 1 31 25 56 14.0923427408653 13.6352074670442 0.457135273821104 A:C C A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000101412:ENST00000343380:exon_32263489_32264785:E2F1;ENSG00000101412:ENST00000402461:exon_32263489_32264785:E2F1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 34129837 G/T 1 13 14 27 5.90969211713704 7.63571618154472 -1.72602406440768 T:G G T 10 0.545408298681766 0.564456320968141 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34129770_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34129787_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000476926:exon_34129818_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000486268:exon_34129828_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000438317:exon_34129828_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34129830_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34129830_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34129830_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000492184:exon_34129831_34129934:ERGIC3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 34129838 C/T 1 15 15 30 6.81887551977351 8.18112448022649 -1.36224896045298 T:C C T 10 0.545408298681766 0.714695541216207 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34129770_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34129787_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000476926:exon_34129818_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000486268:exon_34129828_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000438317:exon_34129828_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34129830_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34129830_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34129830_34129934:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000492184:exon_34129831_34129934:ERGIC3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 34218673 G/C 1 76 24 100 34.5489693001858 13.0897991683624 21.4591701318234 T:C:G G C 10 0.545408298681766 1.1947217654746e-05 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34218361_34218956:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34218663_34218717:CPNE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 114 23 137 51.8234539502787 12.5443908696806 39.2790630805981 T:C T C 10 0.545408298681766 1.67322676897649e-12 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 34243017 C/T 1 55 57 112 25.0025435725029 31.0882730248607 -6.08572945235779 T:C C T 10 0.545408298681766 0.256043240136421 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000431148:exon_34242815_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000435161:exon_34242843_34243266:RBM12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 34502107 G/A 1 9 26 35 4.09132531186411 14.1806157657259 -10.0892904538618 A:G G A 10 0.545408298681766 0.000943588628486286 ENSG00000025293:ENST00000374012:exon_34501955_34502119:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000439301:exon_34501955_34502119:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000373994:exon_34501955_34502119:PHF20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 37394884 G/A 1 9 5 14 4.09132531186411 2.72704149340883 1.36428381845528 A:G G A 10 0.545408298681766 0.594806597584705 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37394881_37395020:ACTR5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 37396120 A/G 1 24 8 32 10.9102008316376 4.36326638945413 6.54693444218349 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0209481240185409 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37396107_37396239:ACTR5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 37400490 G/A 1 12 11 23 5.45510041581881 5.99949128549943 -0.544390869680617 A:G G A 10 0.545408298681766 0.837052105141715 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 37534665 C/T 1 19 3 22 8.63724232504645 1.6362248960453 7.00101742900115 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00226288954251699 ENSG00000101445:ENST00000299824:exon_37534612_37534737:PPP1R16B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 37555116 G/C 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 C:G G C 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37554955_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37555069_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37555086_37555451:FAM83D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 37570725 C/T 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 T:C C T 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37570602_37570769:FAM83D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 37667182 C/T 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 T:C C T 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37667142_37668363:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000449559:exon_37667142_37667289:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000493450:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000482619:exon_37667142_37667279:DHX35 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 40045247 A/G 1 10 7 17 4.54591701318234 3.81785809077236 0.728058922409978 A:G A G 10 0.545408298681766 0.810655514815455 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40045228_40045434:CHD6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 42225114 G/A 1 11 11 22 5.00050871450057 5.99949128549943 -0.998982570998852 A:G G A 10 0.545408298681766 0.675286531050552 ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000486243:exon_42225075_42225162:IFT52 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 42328639 T/C 1 110 54 164 50.0050871450057 29.4520481288154 20.5530390161904 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00125500958087421 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42328397_42328684:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42328397_42328684:MYBL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 43566787 A/G 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43566743_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000482486:exon_43566484_43566832:PABPC1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 22 29 51 10.0010174290011 15.8168406617712 -5.81582323277006 A:G G A 10 0.545408298681766 0.121512352253840 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 44577868 G/A 1 30 18 48 13.637751039547 9.81734937627179 3.82040166327523 A:G G A 10 0.545408298681766 0.311176669161335 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44577809_44577890:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44577809_44577890:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44577809_44577890:ZNF335 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 44578674 T/A 1 11 13 24 5.00050871450057 7.09030788286296 -2.08979916836238 A:T T A 10 0.545408298681766 0.418235923516124 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44578605_44578708:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44578605_44578708:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44578605_44578708:ZNF335 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 44578961 A/G 1 16 17 33 7.27346722109174 9.27194107759002 -1.99847385649828 A:G A G 10 0.545408298681766 0.490611458768862 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44578858_44579012:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44578858_44579012:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44578858_44579012:ZNF335 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 44596207 C/G 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 C:G C G 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44595506_44596273:ZNF335 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 18 27 45 8.18265062372821 14.7260240644077 -6.54337344067947 T:G T G 10 0.545408298681766 0.0527431063918925 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 44746982 T/C 1 37 29 66 16.8198929487747 15.8168406617712 1.00305228700345 T:C T C 10 0.545408298681766 0.901755835120494 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44746911_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44746955_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44746976_44747033:CD40 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 45315346 C/T 1 21 37 58 9.54642572768291 20.1801070512253 -10.6336813235424 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00547643174262276 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 45315786 C/T 1 24 22 46 10.9102008316376 11.9989825709989 -1.08878173936123 T:C C T 10 0.545408298681766 0.768829741939571 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 45853037 A/G 1 20 7 27 9.09183402636468 3.81785809077236 5.27397593559232 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0520437306019237 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45852970_45853209:ZMYND8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 45867852 A/G 1 15 12 27 6.81887551977351 6.54489958418119 0.273975935592318 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45866054_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45867242_45867882:ZMYND8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47258763 C/T 1 38 33 71 17.2744846500929 17.9984738564983 -0.723989206405388 T:C C T 10 0.545408298681766 0.905388791049062 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000496915:exon_47258651_47258796:PREX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47261017 T/C 1 63 48 111 28.6392771830487 26.1795983367248 2.45967884632398 T:C T C 10 0.545408298681766 0.703239156658766 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47267480 A/G 1 24 24 48 10.9102008316376 13.0897991683624 -2.17959833672477 A:G A G 10 0.545408298681766 0.563800902624110 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267432_47267593:PREX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47267940 G/A 1 30 20 50 13.637751039547 10.9081659736353 2.7295850659117 A:G G A 10 0.545408298681766 0.479713162907400 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267934_47268121:PREX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47269233 C/G 1 12 15 27 5.45510041581881 8.18112448022649 -2.72602406440768 C:G C G 10 0.545408298681766 0.336126149245224 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47269124_47269244:PREX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47273726 C/T 1 16 9 25 7.27346722109174 4.90867468813589 2.36479253295585 T:C C T 10 0.545408298681766 0.423463149171332 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47273578_47273726:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47273578_47273726:PREX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47630449 C/T 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 T:C C T 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000124198:ENST00000371917:exon_47630368_47630497:ARFGEF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47685320 G/C 1 13 12 25 5.90969211713704 6.54489958418119 -0.635207467044149 C:G G C 10 0.545408298681766 0.842593548431809 ENSG00000124207:ENST00000396192:exon_47685252_47685359:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000417408:exon_47685252_47685359:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000262982:exon_47685252_47685359:CSE1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47841660 G/T 1 19 9 28 8.63724232504645 4.90867468813589 3.72856763691055 T:C:G G T 10 0.545408298681766 0.185730168235214 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000462328:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000493252:exon_47841650_47841736:DDX27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 28 28 56 12.7285676369106 15.2714323630894 -2.54286472617889 T:C C T 10 0.545408298681766 0.50527297468746 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47865372 G/A 1 32 16 48 14.5469344421835 8.72653277890826 5.82040166327523 A:G G A 10 0.545408298681766 0.110411204326231 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 26 22 48 11.8193842342741 11.9989825709989 -0.179598336724768 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47865784 C/T 1 20 21 41 9.09183402636468 11.4535742723171 -2.36174024595241 T:C C T 10 0.545408298681766 0.531170282862538 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47871197 G/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 C:G G C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 6 13 19 2.7275502079094 7.09030788286296 -4.36275767495355 C:G C G 10 0.545408298681766 0.062974453261368 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47874005 A/G 1 10 9 19 4.54591701318234 4.90867468813589 -0.362757674953554 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47873954_47874201:ZNFX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 47886684 G/A 1 16 8 24 7.27346722109174 4.36326638945413 2.91020083163762 A:G G A 10 0.545408298681766 0.305959560181242 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47886479_47887760:ZNFX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 48257149 C/T 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000158470:ENST00000371711:exon_48257015_48257202:B4GALT5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 50769379 C/T 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 57244493 G/A 1 16 19 35 7.27346722109174 10.3627576749536 -3.08929045386181 A:G G A 10 0.545408298681766 0.312446243194695 ENSG00000254995:ENST00000371138:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000435446:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000124222:ENST00000355957:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000312283:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000359617:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371141:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371132:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000358029:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000464640:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361830:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361770:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000468590:exon_57244358_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000438253:exon_57244347_57244509:STX16 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 16 20 36 7.27346722109174 10.9081659736353 -3.63469875254358 C:G C G 10 0.545408298681766 0.244017272256093 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 295 384 679 134.104551888879 209.436786693798 -75.3322348049191 A:T:C C T 10 0.545408298681766 8.18373486893244e-09 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 57564070 C/T 1 22 29 51 10.0010174290011 15.8168406617712 -5.81582323277006 T:C C T 10 0.545408298681766 0.121512352253840 ENSG00000101158:ENST00000344018:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000482747:exon_57563969_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000460601:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000477741:exon_57563969_57564076:TH1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 57565943 G/C 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000101158:ENST00000478389:exon_57565150_57567075:TH1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 83 93 176 37.7311112094134 50.7229717774042 -12.9918605679908 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0581412146583275 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 57572614 T/C 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000101160:ENST00000488395:exon_57572447_57572808:CTSZ HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 60572663 C/A 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 A:C C A 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000130699:ENST00000474089:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60572606_60572725:TAF4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 60713332 A/G 1 153 130 283 69.5525303016898 70.9030788286296 -1.35054852693978 A:G A G 10 0.545408298681766 0.905007483177803 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 60881330 G/A 1 30 29 59 13.637751039547 15.8168406617712 -2.17908962222419 A:G G A 10 0.545408298681766 0.60235970223008 ENSG00000130706:ENST00000423787:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000370744:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000253003:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000462554:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000465805:exon_60881253_60881376:ADRM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 61440971 G/A 1 19 23 42 8.63724232504645 12.5443908696806 -3.90714854463417 A:T:G G A 10 0.545408298681766 0.278013727824563 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000450048:exon_61440937_61441015:OGFR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 61488785 T/C 1 7 13 20 3.18214190922764 7.09030788286296 -3.90816597363532 T:C T C 10 0.545408298681766 0.113964264894792 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61488747_61488990:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61488747_61488990:TCFL5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62191937 G/A 1 21 11 32 9.54642572768291 5.99949128549943 3.54693444218349 A:G G A 10 0.545408298681766 0.219897929913113 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62194030 G/C 1 8 10 18 3.63673361054587 5.45408298681766 -1.81734937627179 C:G G C 10 0.545408298681766 0.479767431495367 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62194103 A/G 1 3 7 10 1.3637751039547 3.81785809077236 -2.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 0.201980178309513 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62194128 G/A 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62196661 C/T 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62196884 A/G 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 A:G A G 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62198236 G/A 1 10 9 19 4.54591701318234 4.90867468813589 -0.362757674953554 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62198348 C/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C C T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62198662 A/G 1 4 11 15 1.81836680527294 5.99949128549943 -4.18112448022649 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0374068965367827 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62200575 T/C 1 10 3 13 4.54591701318234 1.6362248960453 2.90969211713704 T:C T C 10 0.545408298681766 0.162038106908021 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62200860 A/G 1 8 1 9 3.63673361054587 0.545408298681766 3.09132531186411 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0460880501374676 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62221610 T/C 1 5 10 15 2.27295850659117 5.45408298681766 -3.18112448022649 T:C T C 10 0.545408298681766 0.121647049471624 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62218955_62222082:GMEB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62227081 A/G 1 2 9 11 0.909183402636468 4.90867468813589 -3.99949128549943 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0289147202703354 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62226963_62227120:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62226963_62227120:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62226963_62227120:GMEB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62293272 A/G 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G A G 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62293203_62293296:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62293203_62293296:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62293203_62293296:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62293203_62293296:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000356810:exon_62293203_62293296:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62293203_62293296:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62293203_62293296:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62293203_62293296:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62293203_62293296:RTEL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62324289 C/T 1 10 8 18 4.54591701318234 4.36326638945413 0.182650623728212 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62326110 A/C 1 6 10 16 2.7275502079094 5.45408298681766 -2.72653277890826 A:C A C 10 0.545408298681766 0.211691046173674 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62326094_62326331:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62326094_62326327:RTEL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62327199 A/G 1 10 16 26 4.54591701318234 8.72653277890826 -4.18061576572592 A:G A G 10 0.545408298681766 0.116134696463967 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62327131_62327606:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62327131_62327207:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62327131_62327333:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62327131_62327606:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62327131_62327207:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62327131_62327207:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62327131_62327207:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62327131_62327207:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62327131_62328544:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62327131_62328544:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62327131_62327598:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62327131_62327601:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000369993:exon_62327131_62327207:RTEL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62331989 T/G 1 20 14 34 9.09183402636468 7.63571618154472 1.45611784481996 T:G T G 10 0.545408298681766 0.731212887929503 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62331954_62332129:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62331954_62332054:ARFRP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 30 37 67 13.637751039547 20.1801070512253 -6.54235601167832 T:G G T 10 0.545408298681766 0.112242328321955 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62595547 C/T 1 11 12 23 5.00050871450057 6.54489958418119 -1.54439086968062 T:C C T 10 0.545408298681766 0.536899606886051 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62595424_62595570:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62595424_62595570:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62595424_62595570:ZNF512B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62595990 T/C 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62595843_62596069:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62595843_62596069:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62595843_62596069:ZNF512B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62607160 C/T 1 11 23 34 5.00050871450057 12.5443908696806 -7.54388215518004 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0146225970321939 ENSG00000130590:ENST00000369886:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000498830:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000478694:exon_62607045_62607185:SAMD10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62641575 G/A 1 15 54 69 6.81887551977351 29.4520481288154 -22.6331726090419 A:G G A 10 0.545408298681766 3.56727057720672e-08 ENSG00000101161:ENST00000266079:exon_62641553_62641671:PRPF6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 20 62664365 C/T 1 96 55 151 43.6408033265505 29.9974564274971 13.6433468990533 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0272463420165195 ENSG00000101161:ENST00000266079:exon_62664194_62664453:PRPF6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 39 37 76 17.7290763514111 20.1801070512253 -2.45103069981421 C:G G C 10 0.545408298681766 0.645268928258305 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 26965071 G/A 1 7 2 9 3.18214190922764 1.09081659736353 2.09132531186411 A:G G A 10 0.545408298681766 0.19585774268132 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 26965148 G/A 1 48 57 105 21.8204016632752 31.0882730248607 -9.26787136158543 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0775489495433278 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 26965205 T/C 1 77 60 137 35.003561001504 32.724497920906 2.27906308059806 T:C T C 10 0.545408298681766 0.731877071864543 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 26969703 T/C 1 32 28 60 14.5469344421835 15.2714323630894 -0.724497920905959 T:C T C 10 0.545408298681766 0.897173646147032 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 26976222 C/T 1 63 63 126 28.6392771830487 34.3607228169513 -5.72144563390252 T:C C T 10 0.545408298681766 0.325578462940176 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 26976237 C/T 1 72 65 137 32.7306024949129 35.4515394143148 -2.72093691940194 T:C C T 10 0.545408298681766 0.668364239077284 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 36 17 53 16.3653012474564 9.27194107759002 7.0933601698664 C:G G C 10 0.545408298681766 0.053863413074094 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 39 42 81 17.7290763514111 22.9071485446342 -5.17807219322304 A:G A G 10 0.545408298681766 0.265442035191808 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 35890409 C/T 1 11 13 24 5.00050871450057 7.09030788286296 -2.08979916836238 T:C C T 10 0.545408298681766 0.418235923516124 ENSG00000159200:ENST00000487990:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000313806:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000489903:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381132:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000399272:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000481448:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000482533:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381135:exon_35888788_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000443408:exon_35888788_35890554:RCAN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 37442632 G/C 1 21 19 40 9.54642572768291 10.3627576749536 -0.816331947270641 C:G G C 10 0.545408298681766 0.874222536565282 ENSG00000159228:ENST00000466328:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000439427:exon_37442313_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000399191:exon_37442333_37442702:CBR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 37444973 C/T 1 27 51 78 12.2739759355923 27.8158232327701 -15.5418472971777 T:C:G C T 10 0.545408298681766 0.000557538147631532 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 37741352 G/A 1 5 13 18 2.27295850659117 7.09030788286296 -4.81734937627179 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0309826429768608 ENSG00000159256:ENST00000400485:exon_37741286_37742174:MORC3;ENSG00000159256:ENST00000290384:exon_37741286_37742174:MORC3;ENSG00000159256:ENST00000487909:exon_37741286_37742174:MORC3;ENSG00000159256:ENST00000484028:exon_37741286_37741413:MORC3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 40191431 T/G 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 T:G T G 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 40191638 A/G 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:G A G 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 43 47 90 19.5474431566841 25.634190038043 -6.08674688135894 A:G A G 10 0.545408298681766 0.205315022652588 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 40670460 G/C 1 17 5 22 7.72805892240998 2.72704149340883 5.00101742900115 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0335108329057887 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380783:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000341322:exon_40668363_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000470108:exon_40670016_40670508:BRWD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 42812891 C/T 1 110 150 260 50.0050871450057 81.8112448022649 -31.8061576572592 T:C C T 10 0.545408298681766 8.23885755960301e-05 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42812814_42812952:MX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 382 423 805 173.654029903565 230.707710342387 -57.0536804388216 A:G G A 10 0.545408298681766 6.19265942222511e-05 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 43985955 G/A 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 A:G G A 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000160190:ENST00000398341:exon_43985937_43985985:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000352133:exon_43985937_43985985:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000496416:exon_43985937_43985985:SLC37A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 44430325 T/C 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 T:C T C 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000160199:ENST00000291547:exon_44430163_44430334:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000432907:exon_44430163_44430334:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000480179:exon_44430163_44430334:PKNOX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 45168884 G/A 1 28 25 53 12.7285676369106 13.6352074670442 -0.906639830133598 A:G G A 10 0.545408298681766 0.890471696813186 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398085:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45168876_45168961:PDXK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 45379560 G/A 1 12 11 23 5.45510041581881 5.99949128549943 -0.544390869680617 A:G G A 10 0.545408298681766 0.837052105141715 ENSG00000160216:ENST00000291572:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000438598:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000448287:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398061:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000327505:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000445582:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398063:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398058:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000457068:exon_45379515_45379740:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000448845:exon_45379515_45379677:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000422850:exon_45379515_45379740:AGPAT3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 45523416 C/T 1 15 31 46 6.81887551977351 16.9076572591347 -10.0887817393612 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00435787656101385 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45523174_45524614:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000459741:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000468864:exon_45523174_45524932:TRAPPC10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 45544594 T/C 1 24 42 66 10.9102008316376 22.9071485446342 -11.9969477129966 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00411625290899848 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 45547913 C/A 1 25 26 51 11.3647925329558 14.1806157657259 -2.81582323277007 A:C C A 10 0.545408298681766 0.482748596261773 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 45564766 C/G 1 95 64 159 43.1862116252322 34.906131115633 8.28008050959921 C:G C G 10 0.545408298681766 0.202787397689024 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45564702_45564894:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45564702_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000419699:exon_45564703_45564798:C21orf33 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 25 14 39 11.3647925329558 7.63571618154472 3.72907635141113 T:C C T 10 0.545408298681766 0.262256685898951 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 45732116 C/T 1 68 56 124 30.9122356896399 30.5428647261789 0.369370963461019 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000491298:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45731988_45732177:PFKL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 45750145 T/C 1 20 32 52 9.09183402636468 17.4530655578165 -8.36123153145183 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0250737400669627 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 45750168 A/G 1 26 30 56 11.8193842342741 16.362248960453 -4.5428647261789 A:G A G 10 0.545408298681766 0.229981504501609 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 46950863 C/T 1 15 7 22 6.81887551977351 3.81785809077236 3.00101742900115 T:C C T 10 0.545408298681766 0.284228668887522 ENSG00000173638:ENST00000417954:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46950684_46950885:SLC19A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 47777063 G/A 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47776889_47777106:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000337772:exon_47776889_47777106:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47776889_47777106:PCNT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 47783796 T/C 1 2 7 9 0.909183402636468 3.81785809077236 -2.90867468813589 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0890512388728988 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47783395_47783849:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47783395_47783849:PCNT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 47786817 C/G 1 9 2 11 4.09132531186411 1.09081659736353 3.00050871450057 T:C:G C G 10 0.545408298681766 0.0774548990144863 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 47787002 T/C 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 T:C T C 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 47808679 C/T 1 9 2 11 4.09132531186411 1.09081659736353 3.00050871450057 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0774548990144863 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47808657_47808799:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47808657_47808799:PCNT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 47821588 A/G 1 9 8 17 4.09132531186411 4.36326638945413 -0.271941077590022 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47821465_47821635:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47821465_47821635:PCNT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 47850484 G/C 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 C:G G C 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47850421_47850571:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47850421_47850571:PCNT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 22 7 29 10.0010174290011 3.81785809077236 6.18315933822879 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0243361041719753 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 47851796 G/A 1 22 7 29 10.0010174290011 3.81785809077236 6.18315933822879 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0243361041719753 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 21 47855876 A/G 1 17 8 25 7.72805892240998 4.36326638945413 3.36479253295585 A:G A G 10 0.545408298681766 0.228470955877391 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47855817_47856061:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47855817_47856061:PCNT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 17669306 T/C 1 11 5 16 5.00050871450057 2.72704149340883 2.27346722109174 T:C T C 10 0.545408298681766 0.319419221699540 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000469063:exon_17669229_17669617:CECR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 18111431 T/C 1 37 24 61 16.8198929487747 13.0897991683624 3.73009378041228 T:C T C 10 0.545408298681766 0.369697835198526 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18111369_18111584:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18111369_18111513:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18111369_18111499:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18111369_18111514:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000460085:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 18165995 T/G 1 24 8 32 10.9102008316376 4.36326638945413 6.54693444218349 T:G T G 10 0.545408298681766 0.0209481240185409 ENSG00000099968:ENST00000399781:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000337612:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18165980_18166087:BCL2L13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 18209613 A/G 1 20 14 34 9.09183402636468 7.63571618154472 1.45611784481996 A:G A G 10 0.545408298681766 0.731212887929503 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 18209718 C/T 1 27 38 65 12.2739759355923 20.7255153499071 -8.45153941431479 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0454561724147031 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 18220831 A/G 1 135 122 257 61.3698796779616 66.5398124391754 -5.16993276121386 A:G A G 10 0.545408298681766 0.531419809208123 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399765:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000494097:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18220824_18220995:BID HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 18300574 C/G 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 C:G C G 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000093100:ENST00000252134:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000425874:exon_18300077_18301895:MICAL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 19026613 A/G 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000070413:ENST00000263196:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000389262:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000467659:exon_19025350_19026634:DGCR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 19789541 A/C 1 23 15 38 10.4556091303194 8.18112448022649 2.27448465009289 A:C A C 10 0.545408298681766 0.516754282489672 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000481086:exon_19789522_19789739:GNB1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 44 36 80 20.0020348580023 19.6346987525436 0.367336105458723 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 19950263 G/T 1 48 77 125 21.8204016632752 41.996438998496 -20.1760373352207 T:G G T 10 0.545408298681766 0.000307730898890804 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 92 67 159 41.8224365212775 36.5423560116783 5.28008050959921 A:G G A 10 0.545408298681766 0.426298460979417 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 20113777 T/C 1 3 7 10 1.3637751039547 3.81785809077236 -2.45408298681766 T:C T C 10 0.545408298681766 0.201980178309513 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 20941012 C/T 1 29 32 61 13.1831593382288 17.4530655578165 -4.26990621958772 T:C C T 10 0.545408298681766 0.304282034333382 ENSG00000099917:ENST00000433831:exon_20940855_20941906:MED15;ENSG00000099917:ENST00000437399:exon_20940855_20941904:MED15;ENSG00000099917:ENST00000425759:exon_20940855_20941918:MED15;ENSG00000099917:ENST00000292733:exon_20940855_20941919:MED15;ENSG00000099917:ENST00000263205:exon_20940855_20941906:MED15;ENSG00000099917:ENST00000406969:exon_20940855_20941904:MED15;ENSG00000099917:ENST00000382974:exon_20940855_20941154:MED15;ENSG00000099917:ENST00000492381:exon_20940855_20941904:MED15;ENSG00000099917:ENST00000489651:exon_20940855_20941904:MED15;ENSG00000099917:ENST00000473244:exon_20940855_20941919:MED15;ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20940855_20941904:MED15 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 21067659 G/A 1 2 31 33 0.909183402636468 16.9076572591347 -15.9984738564983 A:G G A 10 0.545408298681766 6.07692302880988e-09 ENSG00000241973:ENST00000255882:exon_21067569_21067678:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000492581:exon_21066981_21067678:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000477245:exon_21067569_21067678:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000466772:exon_21067569_21067678:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000399213:exon_21067569_21067678:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000414196:exon_21067569_21067678:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000437178:exon_21067569_21067678:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000466394:exon_21067569_21067678:PI4KA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 25 11 36 11.3647925329558 5.99949128549943 5.36530124745642 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0931512567153025 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 23101523 G/A 1 13 1 14 5.90969211713704 0.545408298681766 5.36428381845528 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0050060054352632 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 23114993 G/A 0 158 1 159 71.825488808281 0.545408298681766 71.2800805095992 T:G G T 10 0.545408298681766 1.97653947047293e-40 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 23627238 C/A 1 11 11 22 5.00050871450057 5.99949128549943 -0.998982570998852 A:C C A 10 0.545408298681766 0.675286531050552 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000427791:exon_23627220_23627301:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 23631801 T/C 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 T:C T C 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23631704_23633318:BCR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 23632547 A/G 1 11 5 16 5.00050871450057 2.72704149340883 2.27346722109174 A:G A G 10 0.545408298681766 0.319419221699540 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23632526_23632600:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23632526_23632600:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23632526_23632600:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23632526_23632600:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23632526_23632600:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23632526_23632600:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23632526_23632600:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23631704_23633318:BCR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 24224655 G/A 1 9 1 10 4.09132531186411 0.545408298681766 3.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.026642084489569 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24224646_24224733:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473357:exon_24222596_24224833:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24224646_24224833:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000502845:exon_24224646_24224833:AP000350.10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 24224659 C/A 1 8 1 9 3.63673361054587 0.545408298681766 3.09132531186411 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0460880501374676 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24224646_24224733:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473357:exon_24222596_24224833:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24224646_24224833:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000502845:exon_24224646_24224833:AP000350.10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 24459438 T/C 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24459422_24459609:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24459422_24459609:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24459422_24459609:CABIN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 24717976 A/T 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 A:T A T 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000100014:ENST00000398280:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000437398:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000421374:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000314328:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24717256_24718886:SPECC1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 25747749 G/A 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 A:G G A 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25747385_25747869:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25747388_25747869:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25747424_25747781:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25747579_25747869:LRP5L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 26884039 G/A 1 19 22 41 8.63724232504645 11.9989825709989 -3.36174024595241 A:G G A 10 0.545408298681766 0.347110233601756 ENSG00000100104:ENST00000215917:exon_26883995_26884254:SRRD;ENSG00000100104:ENST00000477945:exon_26883948_26884254:SRRD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 26895337 G/A 1 15 13 28 6.81887551977351 7.09030788286296 -0.271432363089448 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26895070_26895348:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26895070_26895357:TFIP11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 29886413 A/G 1 11 24 35 5.00050871450057 13.0897991683624 -8.08929045386181 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00648419735566985 ENSG00000100285:ENST00000310624:exon_29884838_29887379:NEFH;ENSG00000100285:ENST00000328842:exon_29886042_29886692:NEFH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 30975861 C/T 1 71 74 145 32.2760107935946 40.3602141024507 -8.08420330885607 T:C C T 10 0.545408298681766 0.182878829502409 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30975738_30975910:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30974824_30976061:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30975738_30975922:PES1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 30987861 G/C 1 6 19 25 2.7275502079094 10.3627576749536 -7.63520746704415 C:G G C 10 0.545408298681766 0.00231440659648628 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 30987864 C/T 1 19 6 25 8.63724232504645 3.2724497920906 5.36479253295585 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0426056892034127 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 31345821 A/C 0 8 0 8 3.63673361054587 0 3.63673361054587 A A 10 0.545408298681766 0.00965399767040904 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31345738_31345828:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31345738_31345828:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000476152:exon_31345738_31345828:MORC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 31621792 G/A 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 A:G G A 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000182541:ENST00000462625:exon_31621706_31621805:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000444929:exon_31621706_31621805:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31621706_31621805:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000331728:exon_31621706_31621805:LIMK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 31679110 G/C 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000100100:ENST00000215912:exon_31677579_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000480654:exon_31677580_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000416925:exon_31677599_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000441972:exon_31677599_31679274:PIK3IP1;ENSG00000100100:ENST00000493034:exon_31677665_31679274:PIK3IP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 31741067 G/A 1 8 26 34 3.63673361054587 14.1806157657259 -10.54388215518 A:G G A 10 0.545408298681766 0.000387768393320020 ENSG00000100105:ENST00000266269:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000405309:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000351933:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000440325:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000215919:exon_31740318_31741762:PATZ1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 31971282 T/C 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 T:C T C 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476010:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000484806:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31971217_31971378:SFI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 32007137 C/T 1 20 13 33 9.09183402636468 7.09030788286296 2.00152614350172 T:C C T 10 0.545408298681766 0.600713439083214 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000466991:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000491973:exon_32007129_32007289:SFI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 13 18 31 5.90969211713704 9.81734937627179 -3.90765725913475 T:C T C 10 0.545408298681766 0.206191318588596 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 36684331 C/T 1 170 182 352 77.2805892240998 99.2643103600814 -21.9837211359816 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0212355443391471 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 36684980 G/A 1 292 294 586 132.740776784924 160.350039812439 -27.6092630275149 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0225230618454672 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684773_36684985:MYH9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 36900271 T/C 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 T:C T C 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900145_36900414:FOXRED2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 36900806 A/G 1 13 4 17 5.90969211713704 2.18163319472706 3.72805892240998 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0880646543978223 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900562_36900813:FOXRED2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 36900812 C/T 1 13 4 17 5.90969211713704 2.18163319472706 3.72805892240998 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0880646543978223 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900562_36900813:FOXRED2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 37271802 C/T 1 22 14 36 10.0010174290011 7.63571618154472 2.36530124745642 T:C C T 10 0.545408298681766 0.504485277520847 ENSG00000100365:ENST00000447071:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37271695_37271825:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000439078:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 37273742 G/A 1 30 38 68 13.637751039547 20.7255153499071 -7.08776431036009 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0890684322804304 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 37603021 G/A 1 10 4 14 4.54591701318234 2.18163319472706 2.36428381845528 A:G G A 10 0.545408298681766 0.284657873718901 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 37603051 C/T 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 37603744 C/T 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 T:C C T 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 8 4 12 3.63673361054587 2.18163319472706 1.45510041581881 T:C C T 10 0.545408298681766 0.564607771258684 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 A:G G A 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 A:C:G C A 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 9 11 20 4.09132531186411 5.99949128549943 -1.90816597363532 T:C T C 10 0.545408298681766 0.501718810318948 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 21 2 23 9.54642572768291 1.09081659736353 8.45560913031938 T:G G T 10 0.545408298681766 0.000218521009583890 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 35 10 45 15.9107095461382 5.45408298681766 10.4566265593205 C:G G C 10 0.545408298681766 0.00151662612440387 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 11 5 16 5.00050871450057 2.72704149340883 2.27346722109174 C:G G C 10 0.545408298681766 0.319419221699540 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 39497452 A/G 0 8 0 8 3.63673361054587 0 3.63673361054587 A A 10 0.545408298681766 0.00965399767040904 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 39497454 G/C 0 9 0 9 4.09132531186411 0 4.09132531186411 G G 10 0.545408298681766 0.00509974111202672 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 37 13 50 16.8198929487747 7.09030788286296 9.7295850659117 C:G G C 10 0.545408298681766 0.00645913401827215 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 39709009 G/A 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 A:G G A 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000100316:ENST00000473638:exon_39708889_39709315:RPL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 39711351 A/G 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 A:G A G 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 39714580 G/A 1 550 715 1265 250.025435725029 389.966933557463 -139.941497832434 A:T:G G A 10 0.545408298681766 3.32314500720684e-15 ENSG00000100316:ENST00000401609:exon_39714405_39714619:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000216146:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000465618:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000495832:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000437815:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000402527:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000453303:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000427905:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000420536:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000484615:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000460589:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000461967:exon_39713860_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000498462:exon_39714117_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000459859:exon_39714405_39714597:RPL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 40661005 G/C 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 C:G G C 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000100354:ENST00000454349:exon_40660692_40663040:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000400140:exon_40660692_40663040:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000429399:exon_40660692_40663040:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000445835:exon_40660692_40663040:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000335727:exon_40660692_40663040:TNRC6B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 42059828 C/T 1 525 455 980 238.660643192073 248.160775900204 -9.50013270813068 T:C C T 10 0.545408298681766 0.542421595794793 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 42073134 C/T 1 4 100 104 1.81836680527294 54.5408298681766 -52.7224630629037 T:C C T 10 0.545408298681766 2.43258530752463e-29 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 42076330 G/A 1 73 109 182 33.1851941962311 59.4495045563125 -26.2643103600814 A:C:G G A 10 0.545408298681766 0.000100913548995469 ENSG00000100138:ENST00000355257:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000215956:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000401959:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000463675:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000402458:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000488571:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000469028:exon_42076250_42076368:NHP2L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 42177816 C/A 1 23 16 39 10.4556091303194 8.72653277890826 1.72907635141113 A:C C A 10 0.545408298681766 0.631811857537628 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000300398:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000462450:exon_42177689_42177828:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000498456:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42177355_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42177403_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42177450_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000403492:exon_42177739_42177849:MEI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 42191540 C/T 1 30 11 41 13.637751039547 5.99949128549943 7.63825975404759 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0181414065617583 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42191415_42191546:MEI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 42221846 C/T 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000100147:ENST00000402061:exon_42221702_42221897:CCDC134;ENSG00000100147:ENST00000255784:exon_42221702_42222303:CCDC134 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 42341308 A/G 1 35 18 53 15.9107095461382 9.81734937627179 6.0933601698664 A:G A G 10 0.545408298681766 0.099119664544864 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42340925_42341308:CENPM HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 42343091 G/A 1 25 15 40 11.3647925329558 8.18112448022649 3.18366805272936 A:G G A 10 0.545408298681766 0.343809288118244 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42343024_42343168:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42343024_42343140:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42343024_42343148:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42343024_42343155:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000460824:exon_42343024_42343137:CENPM HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 38 21 59 17.2744846500929 11.4535742723171 5.8209103777758 T:C C T 10 0.545408298681766 0.150316633396565 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 234 128 362 106.374458108467 69.812262231266 36.5621958772007 A:G G A 10 0.545408298681766 0.000111615950207478 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 29 39 68 13.1831593382288 21.2709236485889 -8.08776431036009 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0518085829090331 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 42912106 C/T 1 99 61 160 45.0045784305052 33.2699062195877 11.7346722109174 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0677651488611754 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 11 22 33 5.00050871450057 11.9989825709989 -6.99847385649828 C:G G C 10 0.545408298681766 0.021573072412104 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 43465814 A/G 1 7 1 8 3.18214190922764 0.545408298681766 2.63673361054587 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0793702040361015 ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43465642_43465850:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43465610_43465850:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43465642_43465850:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43465642_43465850:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43465642_43465850:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43465642_43465850:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43465642_43465850:TTLL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 24 23 47 10.9102008316376 12.5443908696806 -1.634190038043 C:G G C 10 0.545408298681766 0.662218976126322 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 45132704 T/C 1 7 11 18 3.18214190922764 5.99949128549943 -2.81734937627179 T:C T C 10 0.545408298681766 0.237114548756310 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45132652_45132754:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 45577231 T/C 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 T:C T C 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000093000:ENST00000347635:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000432759:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000425733:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000355253:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000407019:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000493456:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000396096:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000440908:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000422489:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000469163:exon_45577167_45577248:NUP50 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50277835 T/C 1 3 11 14 1.3637751039547 5.99949128549943 -4.63571618154472 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0151242027682239 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50277883 A/G 1 8 13 21 3.63673361054587 7.09030788286296 -3.45357427231709 A:G A G 10 0.545408298681766 0.187341762630804 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50278438 A/G 1 14 8 22 6.36428381845528 4.36326638945413 2.00101742900115 A:G A G 10 0.545408298681766 0.521743237801811 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50278568 A/G 1 5 11 16 2.27295850659117 5.99949128549943 -3.72653277890826 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0783914597682892 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50278642 C/T 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 T:C C T 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50279035 A/G 1 9 16 25 4.09132531186411 8.72653277890826 -4.63520746704415 A:G A G 10 0.545408298681766 0.071626048179444 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50280136 T/C 1 15 17 32 6.81887551977351 9.27194107759002 -2.45306555781651 T:C T C 10 0.545408298681766 0.478260491529797 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50297888 T/C 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 T:C T C 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50297827_50297902:ALG12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50301476 T/C 1 10 8 18 4.54591701318234 4.36326638945413 0.182650623728212 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50301369_50301566:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50301369_50301592:ALG12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50313438 T/C 1 10 9 19 4.54591701318234 4.90867468813589 -0.362757674953554 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313378_50313488:CRELD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50319079 T/G 1 75 24 99 34.0943775988676 13.0897991683624 21.0045784305052 T:G T G 10 0.545408298681766 1.72414967774971e-05 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50319065_50320153:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50319170 A/G 1 105 41 146 47.7321286384146 22.3617402459524 25.3703883924622 A:G A G 10 0.545408298681766 1.93747639545176e-05 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50319065_50320153:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50356302 C/T 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 T:C C T 10 0.545408298681766 0.792480799523164 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50644960 G/C 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 C:G G C 10 0.545408298681766 0.481573233711665 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50659094 C/T 1 24 10 34 10.9102008316376 5.45408298681766 5.45611784481996 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.0835338197941243 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50684296 T/C 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 T:C T C 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50696678 G/A 1 29 14 43 13.1831593382288 7.63571618154472 5.54744315668406 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0941013152449004 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000492218:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50696672_50696730:MAPK12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50699668 A/G 1 9 5 14 4.09132531186411 2.72704149340883 1.36428381845528 A:G A G 10 0.545408298681766 0.594806597584705 ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50699596_50699737:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50699596_50700137:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50699596_50699725:MAPK12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50704661 T/C 1 15 4 19 6.81887551977351 2.18163319472706 4.63724232504645 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0376877739096181 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 10 37 47 4.54591701318234 20.1801070512253 -15.634190038043 A:G G A 10 0.545408298681766 5.11189001605325e-06 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 11 31 42 5.00050871450057 16.9076572591347 -11.9071485446342 A:G A G 10 0.545408298681766 0.000267376331375291 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50722134 T/C 1 2 13 15 0.909183402636468 7.09030788286296 -6.18112448022649 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00135730155937728 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50751529 G/C 1 31 32 63 14.0923427408653 17.4530655578165 -3.36072281695126 C:G G C 10 0.545408298681766 0.448210302914781 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50751428_50751537:FAM116B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50752133 C/T 1 16 29 45 7.27346722109174 15.8168406617712 -8.54337344067947 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0156356232573261 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 44 20 64 20.0020348580023 10.9081659736353 9.09386888436698 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0237153163655897 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50878196 G/A 1 16 16 32 7.27346722109174 8.72653277890826 -1.45306555781651 A:G G A 10 0.545408298681766 0.723187770815947 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50878182_50878478:PPP6R2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 68 65 133 30.9122356896399 35.4515394143148 -4.53930372467487 A:G A G 10 0.545408298681766 0.434608018464805 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50895020 C/T 1 19 20 39 8.63724232504645 10.9081659736353 -2.27092364858887 T:C C T 10 0.545408298681766 0.521400139870112 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000476293:exon_50895018_50895102:SBF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50901009 C/T 1 16 27 43 7.27346722109174 14.7260240644077 -7.45255684331594 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0308495159945091 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000356279:exon_50900988_50901146:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50900988_50901146:SBF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 22 50987287 A/G 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 4403837 A/G 0 9 0 9 4.09132531186411 0 4.09132531186411 A A 10 0.545408298681766 0.00509974111202672 ENSG00000144455:ENST00000272902:exon_4402830_4403938:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000383843:exon_4403450_4403938:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000458465:exon_4403479_4403938:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000405420:exon_4403793_4403938:SUMF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 4856234 G/A 1 3 11 14 1.3637751039547 5.99949128549943 -4.63571618154472 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0151242027682239 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 9791953 G/T 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 T:G G T 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9791628_9792107:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9791628_9792107:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000302036:exon_9791628_9792107:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000457221:exon_9791628_9792107:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000349503:exon_9791628_9792107:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000359753:exon_9791628_9792107:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9791628_9792107:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9791665_9792107:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000436092:exon_9791702_9792107:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000449570:exon_9791756_9792107:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000302008:exon_9791757_9792107:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9791767_9792107:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383826:exon_9791771_9792107:OGG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 9847907 G/A 1 357 265 622 162.28923737061 144.533199150668 17.7560382199416 A:G G A 10 0.545408298681766 0.158810817381389 ENSG00000241553:ENST00000498623:exon_9847894_9848126:ARPC4;ENSG00000241553:ENST00000287613:exon_9847894_9848789:ARPC4;ENSG00000241553:ENST00000397261:exon_9847894_9848789:ARPC4;ENSG00000241553:ENST00000417500:exon_9847894_9848120:ARPC4;ENSG00000241553:ENST00000440787:exon_9847894_9848101:ARPC4;ENSG00000241553:ENST00000433034:exon_9847894_9848256:ARPC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 9867625 C/T 1 33 8 41 15.0015261435017 4.36326638945413 10.6382597540476 T:C C T 10 0.545408298681766 0.000787707531548923 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9867484_9867632:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000482269:exon_9867090_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000492440:exon_9867250_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9867545_9867632:TTLL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 9871030 T/G 1 38 25 63 17.2744846500929 13.6352074670442 3.63927718304874 T:G T G 10 0.545408298681766 0.378337927892599 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 9876919 G/A 1 48 6 54 21.8204016632752 3.2724497920906 18.5479518711846 A:C:G G A 10 0.545408298681766 1.19883839205750e-07 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9876365_9877085:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9876778_9878037:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9876778_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9876778_9877087:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9876778_9877016:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9876365_9877042:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9876778_9877087:TTLL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 9876987 G/A 1 39 13 52 17.7290763514111 7.09030788286296 10.6387684685482 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00314514679566000 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9876365_9877085:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9876778_9878037:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9876778_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9876778_9877087:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9876778_9877016:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9876365_9877042:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9876778_9877087:TTLL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 42 45 87 19.0928514553658 24.5433734406795 -5.45052198531364 T:C T C 10 0.545408298681766 0.281596194563878 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 16 6 22 7.27346722109174 3.2724497920906 4.00101742900115 C:G G C 10 0.545408298681766 0.132099344893526 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 11 10 21 5.00050871450057 5.45408298681766 -0.453574272317086 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 13 7 20 5.90969211713704 3.81785809077236 2.09183402636468 A:G A G 10 0.545408298681766 0.37882271700965 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 10067794 A/G 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 A:G A G 10 0.545408298681766 0.609212519966719 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 10067797 T/C 1 8 7 15 3.63673361054587 3.81785809077236 -0.18112448022649 T:C T C 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 T:G T G 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 11596348 C/T 1 14 11 25 6.36428381845528 5.99949128549943 0.364792532955851 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 11643465 T/C 1 9 8 17 4.09132531186411 4.36326638945413 -0.271941077590022 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000144560:ENST00000273038:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000413604:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000426568:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000404339:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000445411:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000418000:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000458499:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417206:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417466:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424709:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000419541:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000437722:exon_11643307_11643496:VGLL4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 11684957 C/T 1 17 10 27 7.72805892240998 5.45408298681766 2.27397593559232 T:C C T 10 0.545408298681766 0.442451269997159 ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11684911_11685398:VGLL4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 14174427 A/T 1 7 13 20 3.18214190922764 7.09030788286296 -3.90816597363532 A:T A T 10 0.545408298681766 0.113964264894792 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14174366_14174435:TMEM43 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 14175262 T/C 1 7 13 20 3.18214190922764 7.09030788286296 -3.90816597363532 T:C T C 10 0.545408298681766 0.113964264894792 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14175239_14175309:TMEM43 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 37 50 87 16.8198929487747 27.2704149340883 -10.4505219853136 T:G G T 10 0.545408298681766 0.030727010351948 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 14193889 C/T 1 17 21 38 7.72805892240998 11.4535742723171 -3.72551534990711 T:C C T 10 0.545408298681766 0.255400684108038 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14193835_14193916:XPC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 14526538 G/A 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 A:G G A 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000131389:ENST00000454876:exon_14526375_14530857:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000458124:exon_14526375_14530857:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000360861:exon_14526375_14530855:SLC6A6;ENSG00000131389:ENST00000451687:exon_14526375_14530855:SLC6A6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 13 18 31 5.90969211713704 9.81734937627179 -3.90765725913475 A:G G A 10 0.545408298681766 0.206191318588596 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 15115478 C/T 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 T:C C T 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15111580_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15115112_15116437:ZFYVE20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 15115872 A/G 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 A:G A G 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15111580_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15115112_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000418832:exon_15115869_15115958:ZFYVE20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 15298460 G/A 1 15 10 25 6.81887551977351 5.45408298681766 1.36479253295585 A:G G A 10 0.545408298681766 0.689530950640826 ENSG00000131370:ENST00000448619:exon_15298360_15298620:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000383791:exon_15298360_15298620:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000412806:exon_15298360_15298620:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000426925:exon_15298360_15298620:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000253688:exon_15298360_15298620:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000408919:exon_15298360_15298620:SH3BP5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 15476011 C/G 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 C:G C G 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000144597:ENST00000396842:exon_15475855_15476045:EAF1;ENSG00000144597:ENST00000432764:exon_15475855_15476045:EAF1;ENSG00000144597:ENST00000449565:exon_15475855_15476045:EAF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 15737689 G/A 1 12 4 16 5.45510041581881 2.18163319472706 3.27346722109174 A:G G A 10 0.545408298681766 0.132245501357764 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15737641_15737738:ANKRD28 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 15737698 T/C 1 14 4 18 6.36428381845528 2.18163319472706 4.18265062372821 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0579173231641151 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15737641_15737738:ANKRD28 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 21 10 31 9.54642572768291 5.45408298681766 4.09234274086525 C:G C G 10 0.545408298681766 0.15261533738701 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 318 296 614 144.560161019198 161.440856409803 -16.8806953906043 A:T:C T C 10 0.545408298681766 0.181090866368487 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 191 178 369 86.8270149517827 97.0826771653543 -10.2556622135716 A:C A C 10 0.545408298681766 0.295910110184545 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 17051328 T/C 1 10 18 28 4.54591701318234 9.81734937627179 -5.27143236308945 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0567637556834024 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 17051450 C/A 1 18 30 48 8.18265062372821 16.362248960453 -8.17959833672477 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0200918730717751 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 17208267 T/C 1 10 6 16 4.54591701318234 3.2724497920906 1.27346722109174 T:C T C 10 0.545408298681766 0.62020159802431 ENSG00000131374:ENST00000450163:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000437885:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000253692:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000429383:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000414318:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000446818:exon_17208259_17208420:TBC1D5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 20189472 C/A 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 A:C C A 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000114166:ENST00000263754:exon_20189455_20189491:KAT2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 23848835 A/C 1 37 58 95 16.8198929487747 31.6336813235424 -14.8137883747678 A:C A C 10 0.545408298681766 0.00266205660882474 ENSG00000170142:ENST00000306627:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000484048:exon_23848728_23849379:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000346855:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000495141:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000481622:exon_23848728_23848912:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000442670:exon_23848580_23848912:UBE2E1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 23934772 G/A 1 17 4 21 7.72805892240998 2.18163319472706 5.54642572768291 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0155492903001028 ENSG00000197885:ENST00000388759:exon_23933151_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000443659:exon_23933552_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000421515:exon_23933555_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000425478:exon_23933572_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000418853:exon_23933574_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000437230:exon_23933588_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000412028:exon_23933798_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000415901:exon_23933801_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000416026:exon_23934556_23934828:NKIRAS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 33174156 T/G 1 14 3 17 6.36428381845528 1.6362248960453 4.72805892240998 T:G T G 10 0.545408298681766 0.0263941457139192 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 33174168 G/A 1 12 3 15 5.45510041581881 1.6362248960453 3.81887551977351 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0670236061210686 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 33434831 G/A 1 19 22 41 8.63724232504645 11.9989825709989 -3.36174024595241 A:G G A 10 0.545408298681766 0.347110233601756 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000492136:exon_33429830_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000466441:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000486388:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000464787:exon_33434804_33434946:UBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 33458266 T/C 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 T:C T C 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000481761:exon_33458250_33458312:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000418410:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000456378:exon_33458250_33458326:UBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 33879770 G/A 1 22 15 37 10.0010174290011 8.18112448022649 1.81989294877466 A:G G A 10 0.545408298681766 0.621954129017817 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33879696_33879819:PDCD6IP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 37053568 A/G 1 16 15 31 7.27346722109174 8.18112448022649 -0.907657259134746 A:G A G 10 0.545408298681766 0.857269904474793 ENSG00000076242:ENST00000231790:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000457004:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000432299:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000396438:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000456676:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000458205:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000455445:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000435176:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000441265:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000383761:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000421440:exon_37053532_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000447829:exon_37053533_37053590:MLH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 37107470 G/A 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 A:G G A 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000093167:ENST00000496479:exon_37107301_37110254:LRRFIP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 38038982 T/C 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 T:C T C 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38038974_38039176:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38038974_38039176:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38038974_38039176:VILL;ENSG00000136059:ENST00000484717:exon_38038974_38039176:VILL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 38047680 G/A 1 9 5 14 4.09132531186411 2.72704149340883 1.36428381845528 A:G G A 10 0.545408298681766 0.594806597584705 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000488209:exon_38047672_38047695:VILL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 C:G G C 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 38170810 C/G 1 18 17 35 8.18265062372821 9.27194107759002 -1.08929045386181 C:G C G 10 0.545408298681766 0.736735697725999 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000418880:exon_38170781_38170879:ACAA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 39111140 C/A 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 A:C C A 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000114742:ENST00000302313:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000413099:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000396258:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000418020:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000433841:exon_39111134_39111181:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000420940:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000441361:exon_39111134_39111235:WDR48 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 7 17 24 3.18214190922764 9.27194107759002 -6.08979916836238 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0138736076082817 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 42610515 G/A 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 A:G G A 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 44541669 G/C 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000178917:ENST00000436261:exon_44540462_44542126:ZNF852;ENSG00000178917:ENST00000420423:exon_44540462_44542126:ZNF852;ENSG00000178917:ENST00000313378:exon_44540793_44542126:ZNF852;ENSG00000178917:ENST00000489411:exon_44541015_44542129:ZNF852;ENSG00000178917:ENST00000463067:exon_44541068_44544602:ZNF852 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 44612050 C/T 1 9 1 10 4.09132531186411 0.545408298681766 3.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.026642084489569 ENSG00000196345:ENST00000426540:exon_44611414_44612986:ZNF167;ENSG00000196345:ENST00000273320:exon_44611414_44613650:ZNF167;ENSG00000196345:ENST00000447279:exon_44611417_44612157:ZNF167 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 9 3 12 4.09132531186411 1.6362248960453 2.45510041581881 A:C C A 10 0.545408298681766 0.245731957393402 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 57 49 106 25.9117269751393 26.7250066354065 -0.813279660267195 A:C:G G C 10 0.545408298681766 0.92239249357696 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 45436102 T/C 1 7 16 23 3.18214190922764 8.72653277890826 -5.54439086968062 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0219686793794964 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45435925_45436179:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45435925_45436179:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45435925_45436179:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000431023:exon_45435925_45436179:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000430399:exon_45435925_45436179:LARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 45441819 C/A 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:C C A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45441737_45441865:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45441737_45441865:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000430399:exon_45441737_45441845:LARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 45637253 C/T 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 T:C C T 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 45637439 T/C 1 11 9 20 5.00050871450057 4.90867468813589 0.0918340263646806 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 46009491 C/T 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 46965111 C/T 1 54 41 95 24.5479518711846 22.3617402459524 2.18621162523223 T:C C T 10 0.545408298681766 0.681295447474147 ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_46965097_46965158:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_46965097_46965158:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_46964533_46965158:CCDC12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47036565 G/A 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000296147:exon_47036522_47037091:NBEAL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47036578 G/A 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47036522_47037123:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000296147:exon_47036522_47037091:NBEAL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47043238 C/T 1 18 11 29 8.18265062372821 5.99949128549943 2.18315933822879 T:C C T 10 0.545408298681766 0.46021652389844 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000475689:exon_47043179_47043316:NBEAL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 60 38 98 27.275502079094 20.7255153499071 6.54998672918693 C:G C G 10 0.545408298681766 0.188997936001181 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47045846 C/T 1 31 40 71 14.0923427408653 21.8163319472706 -7.72398920640539 T:C C T 10 0.545408298681766 0.073723909519126 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47049193 A/G 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 A:C:G A G 10 0.545408298681766 0.157468107643023 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 34 33 67 15.45611784482 17.9984738564983 -2.54235601167832 A:G G A 10 0.545408298681766 0.542038869542138 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47162886 C/T 1 31 29 60 14.0923427408653 15.8168406617712 -1.72449792090596 T:C C T 10 0.545408298681766 0.698195447024749 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47448825 G/A 1 15 12 27 6.81887551977351 6.54489958418119 0.273975935592318 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000076201:ENST00000456408:exon_47448799_47448857:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47448799_47448857:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47448799_47448857:PTPN23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47452772 C/T 1 15 13 28 6.81887551977351 7.09030788286296 -0.271432363089448 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 11 15 26 5.00050871450057 8.18112448022649 -3.18061576572592 A:G G A 10 0.545408298681766 0.239917577897468 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47459679 C/T 1 10 21 31 4.54591701318234 11.4535742723171 -6.90765725913475 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0176793051147699 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47459624_47459739:SCAP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 41 28 69 18.6382597540476 15.2714323630894 3.36682739095815 T:C T C 10 0.545408298681766 0.468885032217787 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 85 88 173 38.6402946120499 47.9959302839954 -9.35563567194551 T:C C T 10 0.545408298681766 0.169271675803158 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 100 74 174 45.4591701318234 40.3602141024507 5.09895602937272 T:G G T 10 0.545408298681766 0.447603718344406 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 48309828 C/G 1 20 27 47 9.09183402636468 14.7260240644077 -5.634190038043 C:G C G 10 0.545408298681766 0.108077738618487 ENSG00000164048:ENST00000354698:exon_48309405_48312477:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000448461:exon_48309405_48312459:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000457782:exon_48309408_48312480:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000296437:exon_48309408_48310234:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000431517:exon_48309408_48310276:ZNF589 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 22 22 44 10.0010174290011 11.9989825709989 -1.9979651419977 A:G A G 10 0.545408298681766 0.54917812353393 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 102 104 206 46.3683535344599 56.7224630629037 -10.3541095284438 T:C C T 10 0.545408298681766 0.161638449984607 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 48573853 C/T 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 T:C C T 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000114268:ENST00000232375:exon_48573689_48573896:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000416568:exon_48573689_48573896:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000417753:exon_48573689_48573896:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000445633:exon_48573689_48573896:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000383734:exon_48573689_48573896:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000490115:exon_48573689_48573896:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000452531:exon_48573689_48573896:PFKFB4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 48636507 G/T 1 49 61 110 22.2749933645935 33.2699062195877 -10.9949128549943 T:C:G G T 10 0.545408298681766 0.0438696710145561 ENSG00000010256:ENST00000471189:exon_48636435_48636625:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000203407:exon_48636436_48636625:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000480561:exon_48636467_48637143:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000415995:exon_48636487_48636625:UQCRC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 49343175 G/A 1 11 12 23 5.00050871450057 6.54489958418119 -1.54439086968062 A:G G A 10 0.545408298681766 0.536899606886051 ENSG00000114316:ENST00000351842:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000265560:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000485450:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000431357:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000486549:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000488520:exon_49343148_49343321:USP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 49362369 C/T 1 8 14 22 3.63673361054587 7.63571618154472 -3.99898257099885 T:C:G C T 10 0.545408298681766 0.091726310756609 ENSG00000114316:ENST00000351842:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000265560:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000416417:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000415188:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000464168:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000491791:exon_49362327_49362472:USP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 49455330 C/T 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 T:C C T 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000145020:ENST00000465925:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000427987:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000458307:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000476226:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000273588:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000454938:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000395338:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000476127:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000399379:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000473163:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000430521:exon_49455328_49455406:AMT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 49570200 C/T 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 T:C C T 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000173402:ENST00000308775:exon_49568230_49573044:DAG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 49714225 T/C 1 44 57 101 20.0020348580023 31.0882730248607 -11.0862381668584 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0280444054008004 ENSG00000164062:ENST00000296456:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000449966:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000446089:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000442186:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000438011:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000463995:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447436:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000457042:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447541:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000482301:exon_49714210_49714250:APEH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 49721532 G/A 1 3 11 14 1.3637751039547 5.99949128549943 -4.63571618154472 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0151242027682239 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721381_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721482_49721622:MST1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 49721798 C/A 1 18 18 36 8.18265062372821 9.81734937627179 -1.63469875254357 A:C C A 10 0.545408298681766 0.618256262605604 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484144:exon_49721758_49721886:MST1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 49737954 G/A 1 9 3 12 4.09132531186411 1.6362248960453 2.45510041581881 A:G G A 10 0.545408298681766 0.245731957393402 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49737905_49737997:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49737905_49737997:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000432042:exon_49737905_49737997:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49737905_49737997:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49737905_49737997:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49737101_49737997:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000494005:exon_49737933_49737997:RNF123 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 50326020 G/A 1 72 64 136 32.7306024949129 34.906131115633 -2.17552862072017 A:G G A 10 0.545408298681766 0.73096716623693 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000426499:exon_50326014_50326070:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000486322:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000492387:exon_50325943_50326142:IFRD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 50327429 A/G 1 21 21 42 9.54642572768291 11.4535742723171 -1.90714854463417 A:G A G 10 0.545408298681766 0.642610157471559 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50327360_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000483071:exon_50327143_50327501:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000489569:exon_50327360_50327517:IFRD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 50334231 T/A 1 11 7 18 5.00050871450057 3.81785809077236 1.18265062372821 A:T T A 10 0.545408298681766 0.641965040336765 ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 50336661 T/C 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 T:C T C 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000186792:ENST00000336307:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000415204:exon_50336644_50336832:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000513170:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000450982:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000066014:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50336644_50336847:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50336644_50336852:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50336644_50336831:NAT6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 50355730 T/G 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50355221_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50355227_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50355240_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50355243_50355970:HYAL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 50369151 C/T 1 26 23 49 11.8193842342741 12.5443908696806 -0.725006635406533 T:C C T 10 0.545408298681766 0.886364092929424 ENSG00000068028:ENST00000362008:exon_50368990_50369287:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000327761:exon_50368990_50369287:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395126:exon_50368990_50369287:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000357043:exon_50368990_50369287:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395117:exon_50368990_50369287:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000359365:exon_50368990_50369287:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000482447:exon_50368990_50369287:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395129:exon_50368990_50369287:RASSF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 50617319 A/G 1 21 10 31 9.54642572768291 5.45408298681766 4.09234274086525 A:G A G 10 0.545408298681766 0.15261533738701 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50617275_50617370:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50617275_50617370:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50617275_50617660:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50617275_50617370:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000482974:exon_50617275_50618104:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000443894:exon_50617275_50617370:HEMK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 52283774 G/A 1 25 20 45 11.3647925329558 10.9081659736353 0.456626559320529 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000164088:ENST00000467471:exon_52283686_52284611:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000296487:exon_52283190_52284611:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000409502:exon_52283686_52284613:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000323588:exon_52283686_52284609:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000489606:exon_52283686_52284613:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000482724:exon_52283686_52284611:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000443681:exon_52283661_52283806:PPM1M HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 52610651 T/A 1 10 5 15 4.54591701318234 2.72704149340883 1.81887551977351 A:T T A 10 0.545408298681766 0.440723047905603 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52610557_52610714:PBRM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 52643307 A/G 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 A:G A G 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000163939:ENST00000480064:exon_52643102_52643971:PBRM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 52643685 T/C 1 12 11 23 5.45510041581881 5.99949128549943 -0.544390869680617 T:C T C 10 0.545408298681766 0.837052105141715 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000446103:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000480064:exon_52643102_52643971:PBRM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 52720080 A/C 1 39 28 67 17.7290763514111 15.2714323630894 2.45764398832168 A:C A C 10 0.545408298681766 0.624031177503916 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 52721305 G/A 1 192 172 364 87.2816066531009 93.8102273732638 -6.52862072016282 A:G G A 10 0.545408298681766 0.494338355520834 ENSG00000163938:ENST00000479230:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000474423:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000460073:exon_52721262_52721399:GNL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 52726974 C/T 1 167 172 339 75.9168141201451 93.8102273732638 -17.8934132531187 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0561406883163702 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52726888_52727062:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52726888_52727062:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52726888_52727062:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52726888_52727062:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52726888_52727062:GNL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 52727257 G/A 1 255 261 516 115.92088383615 142.351565955941 -26.4306821197912 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0214373007505139 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 52797634 G/C 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 C:G G C 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000114904:ENST00000233027:exon_52797486_52797640:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000383721:exon_52797486_52797640:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000461689:exon_52797486_52797640:NEK4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 52800284 T/C 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000114904:ENST00000233027:exon_52800194_52800391:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000383721:exon_52800194_52800391:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000461689:exon_52800194_52800391:NEK4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 52802402 A/C 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:C A C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000114904:ENST00000233027:exon_52802354_52802620:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000383721:exon_52802354_52802620:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000496822:exon_52802354_52802582:NEK4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 96 80 176 43.6408033265505 43.6326638945413 0.00813943200918743 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 55 43 98 25.0025435725029 23.4525568433159 1.54998672918693 T:C C T 10 0.545408298681766 0.762226098446293 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 8 10 18 3.63673361054587 5.45408298681766 -1.81734937627179 A:C A C 10 0.545408298681766 0.479767431495367 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 53856653 C/T 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53856518_53856669:CHDH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 53857803 A/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:C A C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53857333_53858094:CHDH;ENSG00000016391:ENST00000481668:exon_53857571_53858094:CHDH;ENSG00000016391:ENST00000467802:exon_53857658_53858094:CHDH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 53899178 T/C 1 27 17 44 12.2739759355923 9.27194107759002 3.0020348580023 T:C T C 10 0.545408298681766 0.449495937783786 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 53905308 T/C 1 37 17 54 16.8198929487747 9.27194107759002 7.54795187118464 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0407983006737278 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 53906513 G/A 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 A:G G A 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53906411_53906551:ACTR8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 56763316 G/A 1 16 8 24 7.27346722109174 4.36326638945413 2.91020083163762 A:G G A 10 0.545408298681766 0.305959560181242 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 56763328 T/C 1 17 10 27 7.72805892240998 5.45408298681766 2.27397593559232 T:C T C 10 0.545408298681766 0.442451269997159 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 T:C C T 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 66430811 T/G 1 16 7 23 7.27346722109174 3.81785809077236 3.45560913031938 T:G T G 10 0.545408298681766 0.208241264648541 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 66430877 G/C 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 C:G G C 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 66434675 G/A 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G G A 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66434415_66434696:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66434556_66434696:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66434415_66434696:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66434415_66434696:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66434415_66434696:LRIG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 69151152 C/A 1 57 44 101 25.9117269751393 23.9979651419977 1.91376183314163 A:C C A 10 0.545408298681766 0.764613369270579 ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000435015:exon_69151060_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69151110_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000470936:exon_69150990_69151381:ARL6IP5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 78717343 C/T 1 7 12 19 3.18214190922764 6.54489958418119 -3.36275767495355 T:C C T 10 0.545408298681766 0.165845385921528 ENSG00000169855:ENST00000398414:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000398412:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000343019:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000436010:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000464233:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000495273:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000467549:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000498428:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000484514:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000495961:exon_78717284_78717452:ROBO1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 81810590 C/T 1 16 13 29 7.27346722109174 7.09030788286296 0.183159338228786 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81810526_81811312:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81810526_81811312:GBE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 97664725 C/T 1 13 15 28 5.90969211713704 8.18112448022649 -2.27143236308945 T:C C T 10 0.545408298681766 0.449579236151987 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97664182_97664731:MINA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 98250986 C/T 1 125 98 223 56.8239626647793 53.4500132708131 3.37394939396619 T:C C T 10 0.545408298681766 0.686778419121777 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 98304467 T/C 1 38 41 79 17.2744846500929 22.3617402459524 -5.08725559585951 T:C T C 10 0.545408298681766 0.260238122672383 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 98307630 C/T 1 31 21 52 14.0923427408653 11.4535742723171 2.63876846854817 T:C C T 10 0.545408298681766 0.489297497349205 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 113286405 C/T 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000491730:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000483946:exon_113286387_113286763:SIDT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 113329886 G/A 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 A:G G A 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113329855_113329991:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113329855_113329991:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000463226:exon_113329855_113329991:SIDT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 113330953 A/G 1 7 1 8 3.18214190922764 0.545408298681766 2.63673361054587 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0793702040361015 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113330933_113331041:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113330933_113331041:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000463226:exon_113330933_113331041:SIDT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 113683967 C/T 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 T:C C T 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000163617:ENST00000295878:exon_113682984_113684206:KIAA1407 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 118931389 C/T 1 21 12 33 9.54642572768291 6.54489958418119 3.00152614350172 T:C C T 10 0.545408298681766 0.382440419770291 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118930579_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118930587_118935191:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118930589_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118930589_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118930626_118931528:B4GALT4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 118945796 G/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 C:G G C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000460321:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000491906:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118945733_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118945786_118945888:B4GALT4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 118948716 G/A 1 16 22 38 7.27346722109174 11.9989825709989 -4.72551534990711 A:G G A 10 0.545408298681766 0.143050788663091 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 119013714 C/A 1 2 7 9 0.909183402636468 3.81785809077236 -2.90867468813589 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0890512388728988 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119013220_119013851:ARHGAP31 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 119301139 C/T 1 22 13 35 10.0010174290011 7.09030788286296 2.91070954613819 T:C C T 10 0.545408298681766 0.396807608459019 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119300912_119301314:ADPRH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 119305379 T/A 1 11 10 21 5.00050871450057 5.45408298681766 -0.453574272317086 A:T T A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 119327653 T/C 1 10 19 29 4.54591701318234 10.3627576749536 -5.81684066177121 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0389144129899596 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119327617_119327746:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119327617_119327794:PLA1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 119331874 C/T 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 119331892 C/G 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 121154974 T/C 1 12 7 19 5.45510041581881 3.81785809077236 1.63724232504645 T:C T C 10 0.545408298681766 0.497799653196701 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121154969_121155122:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121154969_121155122:POLQ HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 121208176 T/C 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121206149_121209255:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121206149_121209255:POLQ HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 121208833 G/C 1 9 3 12 4.09132531186411 1.6362248960453 2.45510041581881 C:G G C 10 0.545408298681766 0.245731957393402 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121206149_121209255:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121206149_121209255:POLQ HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 121712051 A/C 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 A:C A C 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 121712805 G/C 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 C:G G C 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000383663:exon_121712627_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 45 24 69 20.4566265593205 13.0897991683624 7.36682739095815 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0899966327962454 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 36 22 58 16.3653012474564 11.9989825709989 4.36631867645757 C:G G C 10 0.545408298681766 0.291865126284488 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 122288170 A/G 1 8 10 18 3.63673361054587 5.45408298681766 -1.81734937627179 A:G A G 10 0.545408298681766 0.479767431495367 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122287336_122288871:DTX3L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 122288210 G/A 1 10 7 17 4.54591701318234 3.81785809077236 0.728058922409978 A:G G A 10 0.545408298681766 0.810655514815455 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122287336_122288871:DTX3L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 124449406 A/G 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124449213_124449474:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124449280_124449474:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124449292_124449474:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124449299_124449474:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124449299_124449474:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124449299_124449474:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124449299_124449474:UMPS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 124456742 G/C 1 52 45 97 23.6387684685482 24.5433734406795 -0.904604972131303 C:G G C 10 0.545408298681766 0.918863320557976 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 124456805 C/A 1 48 53 101 21.8204016632752 28.9066398301336 -7.08623816685836 A:C C A 10 0.545408298681766 0.162846075887078 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124456762_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 124462808 C/T 1 48 48 96 21.8204016632752 26.1795983367248 -4.35919667344953 T:C C T 10 0.545408298681766 0.412514274485472 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 124627024 T/G 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 T:G T G 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124626994_124627195:MUC13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 124646594 A/G 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 A:G A G 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124646379_124646837:MUC13;ENSG00000173702:ENST00000490147:exon_124646379_124646618:MUC13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 124728626 A/G 1 2 7 9 0.909183402636468 3.81785809077236 -2.90867468813589 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0890512388728988 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124728549_124728668:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000488654:exon_124728359_124728668:HEG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 124731689 T/A 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 A:T T A 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 124732618 A/G 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 A:G A G 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124732316_124732834:HEG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 124738107 C/T 1 10 11 21 4.54591701318234 5.99949128549943 -1.45357427231709 T:C C T 10 0.545408298681766 0.662270617460159 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124738106_124738340:HEG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 124746049 A/G 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 A:G A G 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 124802677 A/G 1 114 72 186 51.8234539502787 39.2693975050871 12.5540564451915 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0659390866029028 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 74 34 108 33.6397858975493 18.54388215518 15.0959037423693 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00361198588630721 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 77 41 118 35.003561001504 22.3617402459524 12.6418207555516 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0206616756315517 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 126180820 G/A 1 13 14 27 5.90969211713704 7.63571618154472 -1.72602406440768 A:G G A 10 0.545408298681766 0.564456320968141 ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126180378_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000515545:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000336332:exon_126179926_126181063:ZXDC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 126451937 G/T 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 T:G G T 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000514908:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126451921_126452065:CHCHD6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 127292333 G/A 1 30 27 57 13.637751039547 14.7260240644077 -1.08827302486066 A:G G A 10 0.545408298681766 0.7914726677892 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 59 61 120 26.8209103777758 33.2699062195877 -6.44899584181192 T:C C T 10 0.545408298681766 0.271260758286025 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 127379270 C/T 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 T:C C T 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000114631:ENST00000342480:exon_127379221_127380002:PODXL2;ENSG00000114631:ENST00000302192:exon_127379221_127379876:PODXL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 104 99 203 47.2775369370963 53.9954215694948 -6.71788463239849 T:C C T 10 0.545408298681766 0.359879866029888 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 128614185 A/C 1 7 12 19 3.18214190922764 6.54489958418119 -3.36275767495355 A:C A C 10 0.545408298681766 0.165845385921528 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 128890350 G/A 1 329 278 607 149.560669733699 151.623507033531 -2.06283729983195 A:G G A 10 0.545408298681766 0.870577932178345 ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 37 30 67 16.8198929487747 16.362248960453 0.457643988321678 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 128976451 C/G 1 27 33 60 12.2739759355923 17.9984738564983 -5.72449792090596 C:G C G 10 0.545408298681766 0.154202787963713 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 129034758 A/G 1 54 53 107 24.5479518711846 28.9066398301336 -4.35868795894896 A:G A G 10 0.545408298681766 0.437623611664617 ENSG00000184897:ENST00000333762:exon_129033615_129035117:H1FX HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 129150301 G/C 1 39 48 87 17.7290763514111 26.1795983367248 -8.45052198531364 C:G G C 10 0.545408298681766 0.084392244173615 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129149787_129150421:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129149793_129150421:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000393278:exon_129149793_129150421:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129150109_129150421:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000509828:exon_129150298_129150421:MBD4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 130449222 A/G 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000196455:ENST00000356763:exon_130449152_130449286:PIK3R4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 130452500 C/T 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000196455:ENST00000356763:exon_130452392_130452974:PIK3R4;ENSG00000196455:ENST00000504834:exon_130452392_130452782:PIK3R4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 130718472 G/A 1 42 33 75 19.0928514553658 17.9984738564983 1.09437759886755 A:T:G G A 10 0.545408298681766 0.817774338110568 ENSG00000017260:ENST00000504381:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000505330:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507488:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000510168:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000508532:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000513801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504948:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000328560:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000533801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000428331:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000393221:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000422190:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000359644:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000347421:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504612:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000514654:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507194:exon_130718362_130718503:ATP2C1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 132218623 G/T 1 10 12 22 4.54591701318234 6.54489958418119 -1.99898257099885 T:G G T 10 0.545408298681766 0.401540564367046 ENSG00000138246:ENST00000260818:exon_132218578_132218652:DNAJC13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 132257069 G/A 1 17 13 30 7.72805892240998 7.09030788286296 0.637751039547021 A:G G A 10 0.545408298681766 0.856490370798262 ENSG00000138246:ENST00000260818:exon_132257020_132257876:DNAJC13;ENSG00000138246:ENST00000509279:exon_132257020_132257352:DNAJC13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 132277866 G/A 1 19 12 31 8.63724232504645 6.54489958418119 2.09234274086525 A:G G A 10 0.545408298681766 0.476878416492098 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132276988_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000485198:exon_132277316_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132277668_132277929:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132276986_132277929:NPHP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 132338346 T/G 1 12 10 22 5.45510041581881 5.45408298681766 0.00101742900114843 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000507705:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000487024:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000481970:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132338312_132338389:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132338312_132338389:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132338312_132338389:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132338312_132338389:NPHP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 134225969 T/C 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 T:C T C 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000182923:ENST00000332047:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000354446:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000511574:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000413794:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000438820:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000383229:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000504013:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000512894:exon_134225951_134226095:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134225951_134226128:CEP63 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 136016902 G/A 1 23 18 41 10.4556091303194 9.81734937627179 0.638259754047596 A:G G A 10 0.545408298681766 0.876617208699921 ENSG00000114054:ENST00000251654:exon_136016794_136016914:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000490504:exon_136016794_136016914:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000483687:exon_136016794_136016914:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000468777:exon_136016794_136016914:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000462637:exon_136016794_136016914:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000466072:exon_136016794_136016914:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000484181:exon_136016794_136016914:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000482086:exon_136016794_136016914:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000471595:exon_136016794_136016914:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000469217:exon_136016794_136016914:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000478469:exon_136016794_136016914:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000474833:exon_136016794_136016914:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000475214:exon_136016794_136016914:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000473073:exon_136016794_136016914:PCCB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 142078759 C/T 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 T:C C T 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000114127:ENST00000264951:exon_142078704_142078773:XRN1;ENSG00000114127:ENST00000498077:exon_142078704_142078773:XRN1;ENSG00000114127:ENST00000392981:exon_142078704_142078773:XRN1;ENSG00000114127:ENST00000467077:exon_142078704_142078773:XRN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 142168331 C/T 1 30 20 50 13.637751039547 10.9081659736353 2.7295850659117 T:C C T 10 0.545408298681766 0.479713162907400 ENSG00000175054:ENST00000504521:exon_142168077_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515810:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142168080_142172075:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142168080_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515107:exon_142168160_142168444:ATR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 142178144 C/T 1 15 22 37 6.81887551977351 11.9989825709989 -5.18010705122534 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0992719117790899 ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142178069_142178225:ATR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 148727133 G/A 1 13 10 23 5.90969211713704 5.45408298681766 0.455609130319382 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000163754:ENST00000345003:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000296048:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000353986:exon_148727063_148727187:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000484197:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000461191:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000497528:exon_148727063_148727176:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000479119:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000469873:exon_148726668_148727189:GYG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 148759325 T/C 1 7 14 21 3.18214190922764 7.63571618154472 -4.45357427231709 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0770912319259954 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000467858:exon_148759277_148759467:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000471807:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000497427:exon_148759277_148759831:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000483382:exon_148759288_148759455:HLTF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 148786108 C/T 1 20 15 35 9.09183402636468 8.18112448022649 0.91070954613819 T:C C T 10 0.545408298681766 0.865669207088407 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392913:exon_148786027_148786122:HLTF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 148863151 A/G 1 8 10 18 3.63673361054587 5.45408298681766 -1.81734937627179 A:G A G 10 0.545408298681766 0.479767431495367 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148863141_148863333:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000462030:exon_148863141_148863333:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148863141_148863333:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000486530:exon_148863141_148863333:HPS3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 148872987 G/A 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:G G A 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148872894_148873002:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148872894_148873002:HPS3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 149459413 C/T 1 16 25 41 7.27346722109174 13.6352074670442 -6.36174024595241 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0587627657917865 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149459362_149459505:COMMD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 49 57 106 22.2749933645935 31.0882730248607 -8.8132796602672 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0970496767394695 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 156870816 A/G 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 A:G A G 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000163660:ENST00000464316:exon_156869966_156872455:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000474539:exon_156868071_156871617:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000467081:exon_156870529_156870945:CCNL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 157920970 A/G 1 6 12 18 2.7275502079094 6.54489958418119 -3.81734937627179 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0959765577209017 ENSG00000174891:ENST00000480820:exon_157920861_157921034:RSRC1;ENSG00000174891:ENST00000494002:exon_157920861_157921034:RSRC1;ENSG00000174891:ENST00000295930:exon_157920861_157921034:RSRC1;ENSG00000174891:ENST00000471994:exon_157920861_157921034:RSRC1;ENSG00000174891:ENST00000475278:exon_157920861_157921034:RSRC1;ENSG00000174891:ENST00000480119:exon_157920861_157921034:RSRC1;ENSG00000174891:ENST00000476899:exon_157920861_157921034:RSRC1;ENSG00000174891:ENST00000477788:exon_157920861_157921034:RSRC1;ENSG00000174891:ENST00000482822:exon_157920861_157921034:RSRC1;ENSG00000174891:ENST00000496268:exon_157920927_157921034:RSRC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 61 57 118 27.7300937804123 31.0882730248607 -3.35817924444839 T:C C T 10 0.545408298681766 0.579388279470397 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 169492101 C/T 1 9 5 14 4.09132531186411 2.72704149340883 1.36428381845528 T:C C T 10 0.545408298681766 0.594806597584705 ENSG00000085274:ENST00000349841:exon_169492053_169492349:MYNN;ENSG00000085274:ENST00000356716:exon_169492053_169492349:MYNN;ENSG00000085274:ENST00000392733:exon_169492053_169492349:MYNN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 170078232 C/T 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:C C T 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000136603:ENST00000476188:exon_170078109_170078488:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000259119:exon_170077487_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000426052:exon_170078156_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000413427:exon_170077411_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000458537:exon_170077411_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000431185:exon_170078120_170079217:SKIL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 16 17 33 7.27346722109174 9.27194107759002 -1.99847385649828 A:G G A 10 0.545408298681766 0.490611458768862 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 24 22 46 10.9102008316376 11.9989825709989 -1.08878173936123 A:C:G A G 10 0.545408298681766 0.768829741939571 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 179298999 C/T 1 64 50 114 29.093868884367 27.2704149340883 1.82345395027868 T:C C T 10 0.545408298681766 0.778162826341453 ENSG00000136518:ENST00000429709:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000450518:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000392662:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000259034:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000484312:exon_179298952_179299008:ACTL6A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 179306648 A/G 1 31 28 59 14.0923427408653 15.2714323630894 -1.17908962222419 A:G A G 10 0.545408298681766 0.794520234123064 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 179306775 C/T 1 34 46 80 15.45611784482 25.0887817393612 -9.63266389454128 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0329340258652426 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 179322385 A/C 1 54 64 118 24.5479518711846 34.906131115633 -10.3581792444484 A:C A C 10 0.545408298681766 0.0641210249807323 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179322315_179322442:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179322315_179322428:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179322315_179322434:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179322315_179322437:MRPL47 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 180325487 T/C 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 T:C T C 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000163728:ENST00000296015:exon_180325436_180325553:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000412756:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000465065:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000470669:exon_180325436_180326059:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000382584:exon_180325436_180325553:TTC14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 180334623 C/T 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000145075:ENST00000476379:exon_180334614_180334754:CCDC39;ENSG00000145075:ENST00000273654:exon_180334614_180334754:CCDC39;ENSG00000145075:ENST00000442201:exon_180334614_180334754:CCDC39 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 182631792 C/A 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:C C A 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000058063:ENST00000490303:exon_182631649_182631891:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000491699:exon_182631649_182632393:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000484691:exon_182631649_182631884:ATP11B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 183211906 A/G 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:G A G 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000172578:ENST00000341319:exon_183211867_183212069:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000468734:exon_183211867_183212069:KLHL6;ENSG00000172578:ENST00000489245:exon_183208798_183212069:KLHL6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 183904049 A/G 1 22 18 40 10.0010174290011 9.81734937627179 0.183668052729361 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183903811_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000421340:exon_183903883_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000485921:exon_183903892_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000463685:exon_183903948_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000478288:exon_183903949_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183903962_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183903964_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000481116:exon_183903979_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000498136:exon_183903984_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466416:exon_183903987_183904068:ABCF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 183911465 C/T 1 41 39 80 18.6382597540476 21.2709236485889 -2.63266389454128 T:C C T 10 0.545408298681766 0.575853516850159 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183911328_183911795:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183911328_183911793:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183911328_183911800:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000468892:exon_183911328_183911790:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466742:exon_183911328_183911794:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000480562:exon_183911328_183911794:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000480539:exon_183911328_183911557:ABCF3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 184039666 A/G 1 102 88 190 46.3683535344599 47.9959302839954 -1.62757674953554 A:G A G 10 0.545408298681766 0.827266027655097 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 184766301 T/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C T C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184766267_184766347:VPS8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 1 924 7 931 420.042732018048 3.81785809077236 416.224873927276 A:T:C:G G T 10 0.545408298681766 4.25717147282821e-229 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 A:C C A 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 186793423 C/T 1 101 81 182 45.9137618331416 44.178072193223 1.73568963991859 T:C C T 10 0.545408298681766 0.82356066898984 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000457772:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186793350_186793640:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000470633:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000392479:exon_186793350_186796341:ST6GAL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 187089031 C/A 1 25 13 38 11.3647925329558 7.09030788286296 4.27448465009289 A:C C A 10 0.545408298681766 0.193252388738601 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 191100561 C/A 1 75 45 120 34.0943775988676 24.5433734406795 9.55100415818808 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0821629947537478 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191100535_191100614:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191100535_191100614:CCDC50 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 194387186 C/T 1 13 7 20 5.90969211713704 3.81785809077236 2.09183402636468 T:C C T 10 0.545408298681766 0.37882271700965 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 194387253 A/G 1 5 10 15 2.27295850659117 5.45408298681766 -3.18112448022649 A:G A G 10 0.545408298681766 0.121647049471624 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 194408704 A/G 1 10 6 16 4.54591701318234 3.2724497920906 1.27346722109174 A:G A G 10 0.545408298681766 0.62020159802431 ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 194408821 G/C 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 C:G G C 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 195453064 T/G 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195453052_195453443:MUC20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 196457870 G/C 1 23 20 43 10.4556091303194 10.9081659736353 -0.452556843315937 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000163964:ENST00000426755:exon_196457863_196457964:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196457863_196457963:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196457863_196457963:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196457863_196457963:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196457863_196457963:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196457863_196457963:PIGX HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 196534706 T/C 1 19 11 30 8.63724232504645 5.99949128549943 2.63775103954702 T:C T C 10 0.545408298681766 0.364545047610998 ENSG00000180370:ENST00000327134:exon_196534653_196534785:PAK2;ENSG00000180370:ENST00000488224:exon_196534653_196534785:PAK2;ENSG00000180370:ENST00000481344:exon_196534653_196534915:PAK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 196865242 C/T 1 6 13 19 2.7275502079094 7.09030788286296 -4.36275767495355 T:C C T 10 0.545408298681766 0.062974453261368 ENSG00000075711:ENST00000346964:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000357674:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000381807:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000314062:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000359922:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419354:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000452595:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000422288:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000448528:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000443183:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392382:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000450955:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419227:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392381:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000471733:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000447466:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000477312:exon_196865093_196865262:DLG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 3 197566254 T/C 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 T:C T C 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000494069:exon_197566192_197566268:LRCH3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 843695 A/G 1 61 54 115 27.7300937804123 29.4520481288154 -1.72195434840309 A:G A G 10 0.545408298681766 0.779123051562463 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843680_844197:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843680_843856:GAK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 15 16 31 6.81887551977351 8.72653277890826 -1.90765725913475 A:G A G 10 0.545408298681766 0.589254202403613 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 951947 T/C 1 9 10 19 4.09132531186411 5.45408298681766 -1.36275767495355 T:C T C 10 0.545408298681766 0.646488798036141 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_951612_952363:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_951612_952297:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_951612_952427:TMEM175 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 1330759 T/C 1 18 17 35 8.18265062372821 9.27194107759002 -1.08929045386181 T:C T C 10 0.545408298681766 0.736735697725999 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 1332175 A/G 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 A:G A G 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 147 134 281 66.8249800937804 73.0847120233566 -6.25973192957625 A:G G A 10 0.545408298681766 0.47243505439123 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 20 14 34 9.09183402636468 7.63571618154472 1.45611784481996 T:C C T 10 0.545408298681766 0.731212887929503 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 2233709 A/G 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000130997:ENST00000506518:exon_2233672_2233870:POLN;ENSG00000214367:ENST00000243706:exon_2230076_2233887:HAUS3;ENSG00000214367:ENST00000443786:exon_2233568_2233887:HAUS3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 2743999 A/G 1 89 66 155 40.4586614173228 35.9969477129966 4.46171370432627 A:G A G 10 0.545408298681766 0.518928466195942 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 82 51 133 37.2765195080952 27.8158232327701 9.46069627532513 A:G G A 10 0.545408298681766 0.116718290776118 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 2746285 A/C 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:C A C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2746114_2746590:TNIP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 T:G G T 10 0.545408298681766 0.823095632852268 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 2826400 T/C 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2826340_2826644:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2826340_2826641:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2826340_2826429:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2826340_2826828:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826392_2826486:SH3BP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 19 7 26 8.63724232504645 3.81785809077236 4.81938423427408 T:G T G 10 0.545408298681766 0.0749820404617132 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 2941267 G/A 1 37 39 76 16.8198929487747 21.2709236485889 -4.45103069981421 A:G G A 10 0.545408298681766 0.35687699203849 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2941254_2941372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2941254_2941372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2941254_2941372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2941262_2941372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2941266_2941372:NOP14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 2941279 G/C 1 42 37 79 19.0928514553658 20.1801070512253 -1.08725559585951 C:G G C 10 0.545408298681766 0.822012868009318 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2941254_2941372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2941254_2941372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2941254_2941372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2941262_2941372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2941266_2941372:NOP14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 28 20 48 12.7285676369106 10.9081659736353 1.82040166327523 T:C T C 10 0.545408298681766 0.664791788596371 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 71 49 120 32.2760107935946 26.7250066354065 5.55100415818808 A:G A G 10 0.545408298681766 0.31514644679232 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 21 22 43 9.54642572768291 11.9989825709989 -2.45255684331594 A:G G A 10 0.545408298681766 0.540680933575845 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 56 40 96 25.4571352738211 21.8163319472706 3.64080332655046 A:T:G A G 10 0.545408298681766 0.474763579976279 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 3521837 C/T 1 49 36 85 22.2749933645935 19.6346987525436 2.64029461204989 T:C C T 10 0.545408298681766 0.587713491199419 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3521799_3521920:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3521799_3521920:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3521799_3521920:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3521799_3521956:LRPAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 4304522 A/C 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 A:C A C 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4304038_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000504302:exon_4304354_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000511458:exon_4304459_4304818:ZBTB49 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 6302545 C/T 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000506362:exon_6302384_6302644:WFS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 6303022 C/T 1 1 8 9 0.454591701318234 4.36326638945413 -3.90867468813589 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0140520751288088 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 6303844 G/A 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 A:G G A 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 6616056 C/T 1 7 1 8 3.18214190922764 0.545408298681766 2.63673361054587 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0793702040361015 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6615945_6616082:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6615945_6616082:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6615945_6616082:MAN2B2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 6925237 C/G 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000132405:ENST00000444368:exon_6925100_6925498:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000448507:exon_6925100_6925838:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000340816:exon_6925100_6925838:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000446947:exon_6925100_6925838:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000409757:exon_6925100_6925838:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000427736:exon_6925100_6925286:TBC1D14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 8407766 C/T 1 17 8 25 7.72805892240998 4.36326638945413 3.36479253295585 T:C C T 10 0.545408298681766 0.228470955877391 ENSG00000087008:ENST00000413009:exon_8407682_8407770:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8407682_8407770:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8407682_8407770:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000510365:exon_8407682_8407770:ACOX3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 10446906 A/G 1 10 6 16 4.54591701318234 3.2724497920906 1.27346722109174 A:G A G 10 0.545408298681766 0.62020159802431 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 10447168 C/G 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 10669522 A/C 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:C A C 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000109684:ENST00000226951:exon_10669483_10669535:CLNK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 17503433 C/T 1 18 30 48 8.18265062372821 16.362248960453 -8.17959833672477 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0200918730717751 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 17581449 C/T 1 57 45 102 25.9117269751393 24.5433734406795 1.36835353445987 T:C C T 10 0.545408298681766 0.842594093581494 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17581447_17581562:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508497:exon_17581447_17581562:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000512397:exon_17581447_17581562:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17581447_17581562:LAP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 17819695 G/A 1 27 30 57 12.2739759355923 16.362248960453 -4.08827302486066 A:G G A 10 0.545408298681766 0.289704972161249 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17819562_17819711:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17819562_17819711:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000509719:exon_17819562_17819711:NCAPG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 25759334 C/G 1 30 22 52 13.637751039547 11.9989825709989 1.63876846854817 C:G C G 10 0.545408298681766 0.67843835374151 ENSG00000091490:ENST00000399878:exon_25759310_25759412:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000264868:exon_25759310_25759412:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000513416:exon_25759310_25759412:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000512286:exon_25759310_25759474:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000502949:exon_25759310_25759412:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000510448:exon_25759310_25759412:SEL1L3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 37903669 A/G 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 A:G A G 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 37903756 T/C 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 T:C T C 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 37904082 T/C 1 9 8 17 4.09132531186411 4.36326638945413 -0.271941077590022 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 T:G T G 10 0.545408298681766 0.823095632852268 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 38023302 C/G 1 8 10 18 3.63673361054587 5.45408298681766 -1.81734937627179 C:G C G 10 0.545408298681766 0.479767431495367 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38023207_38023339:TBC1D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 38799710 T/C 1 17 10 27 7.72805892240998 5.45408298681766 2.27397593559232 T:C T C 10 0.545408298681766 0.442451269997159 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 38829832 T/C 1 10 13 23 4.54591701318234 7.09030788286296 -2.54439086968062 T:C T C 10 0.545408298681766 0.302592597377063 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 38830012 G/C 1 18 13 31 8.18265062372821 7.09030788286296 1.09234274086525 C:G G C 10 0.545408298681766 0.722444112386434 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 6 13 19 2.7275502079094 7.09030788286296 -4.36275767495355 T:C T C 10 0.545408298681766 0.062974453261368 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 39122697 C/T 1 12 9 21 5.45510041581881 4.90867468813589 0.546425727682915 T:C C T 10 0.545408298681766 0.831119559812142 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39122630_39123829:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39122630_39123828:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39122630_39122825:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39122630_39123826:KLHL5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 44 34 78 20.0020348580023 18.54388215518 1.45815270282225 T:C T C 10 0.545408298681766 0.820327022906144 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 39921942 A/G 1 9 13 22 4.09132531186411 7.09030788286296 -2.99898257099885 A:G A G 10 0.545408298681766 0.207313306024605 ENSG00000121892:ENST00000303538:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000412404:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000399797:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000503396:exon_39921939_39922019:PDS5A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 40440025 G/T 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 T:G G T 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40439788_40440814:RBM47 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 40440215 T/C 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40439788_40440814:RBM47 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 41258970 A/G 1 15 2 17 6.81887551977351 1.09081659736353 5.72805892240998 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00577077447654033 ENSG00000154277:ENST00000514924:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000503431:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000284440:exon_41258850_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381760:exon_41258925_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512419:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381762:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000505232:exon_41258949_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000504818:exon_41258950_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000508768:exon_41258957_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512788:exon_41258962_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000472501:exon_41258963_41259037:UCHL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 41258978 C/T 1 18 2 20 8.18265062372821 1.09081659736353 7.09183402636468 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00113405313931507 ENSG00000154277:ENST00000514924:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000503431:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000284440:exon_41258850_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381760:exon_41258925_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512419:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381762:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000505232:exon_41258949_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000504818:exon_41258950_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000508768:exon_41258957_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512788:exon_41258962_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000472501:exon_41258963_41259037:UCHL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 47589203 G/A 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 A:G G A 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000505476:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000505277:exon_47589036_47589223:ATP10D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 54265989 T/A 1 28 20 48 12.7285676369106 10.9081659736353 1.82040166327523 A:T:C T A 10 0.545408298681766 0.664791788596371 ENSG00000145216:ENST00000337488:exon_54265897_54266006:FIP1L1;ENSG00000145216:ENST00000358575:exon_54265897_54266006:FIP1L1;ENSG00000145216:ENST00000507922:exon_54265897_54266006:FIP1L1;ENSG00000145216:ENST00000306932:exon_54265897_54266006:FIP1L1;ENSG00000145216:ENST00000505125:exon_54265897_54266006:FIP1L1;ENSG00000145216:ENST00000507166:exon_54265897_54266006:FIP1L1;ENSG00000145216:ENST00000513975:exon_54265897_54266006:FIP1L1;ENSG00000145216:ENST00000514543:exon_54265897_54266006:FIP1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 56883987 C/G 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 C:G C G 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000174799:ENST00000257287:exon_56883814_56884023:CEP135;ENSG00000174799:ENST00000506202:exon_56883814_56884023:CEP135 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 56885581 T/C 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000174799:ENST00000257287:exon_56885519_56885721:CEP135;ENSG00000174799:ENST00000506202:exon_56885519_56885721:CEP135 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 20 15 35 9.09183402636468 8.18112448022649 0.91070954613819 A:C A C 10 0.545408298681766 0.865669207088407 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 57211352 T/C 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57211293_57211456:AASDH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 57333822 G/T 1 12 9 21 5.45510041581881 4.90867468813589 0.546425727682915 T:G G T 10 0.545408298681766 0.831119559812142 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57333081_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57333783_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57333784_57333910:SRP72 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 71 75 146 32.2760107935946 40.9056224011324 -8.62961160753783 A:G G A 10 0.545408298681766 0.158202445703278 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 51 57 108 23.1841767672299 31.0882730248607 -7.90409625763073 A:G G A 10 0.545408298681766 0.146930265967396 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 106 95 201 48.1867203397328 51.8137883747678 -3.62706803503496 T:C C T 10 0.545408298681766 0.620531008228978 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 71702024 T/C 1 34 30 64 15.45611784482 16.362248960453 -0.906131115633023 T:C T C 10 0.545408298681766 0.900246077111763 ENSG00000132463:ENST00000254799:exon_71701875_71702031:GRSF1;ENSG00000132463:ENST00000439371:exon_71701875_71702031:GRSF1;ENSG00000132463:ENST00000505068:exon_71701875_71702031:GRSF1;ENSG00000132463:ENST00000499044:exon_71701875_71702031:GRSF1;ENSG00000132463:ENST00000502323:exon_71701875_71702031:GRSF1;ENSG00000132463:ENST00000514161:exon_71701875_71702031:GRSF1;ENSG00000132463:ENST00000508091:exon_71701875_71702031:GRSF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 71891560 G/A 1 12 4 16 5.45510041581881 2.18163319472706 3.27346722109174 A:G G A 10 0.545408298681766 0.132245501357764 ENSG00000156136:ENST00000286648:exon_71891533_71891648:DCK;ENSG00000156136:ENST00000503359:exon_71891533_71891648:DCK;ENSG00000156136:ENST00000504952:exon_71891533_71891648:DCK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 73942678 C/T 1 32 31 63 14.5469344421835 16.9076572591347 -2.36072281695126 T:C C T 10 0.545408298681766 0.613276770356751 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 76857388 C/T 1 3 8 11 1.3637751039547 4.36326638945413 -2.99949128549943 T:C C T 10 0.545408298681766 0.126277531853182 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507940:exon_76857317_76857388:NAAA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 48 34 82 21.8204016632752 18.54388215518 3.27651950809519 A:G G A 10 0.545408298681766 0.506783845381232 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 77039174 G/C 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000138750:ENST00000508604:exon_77038817_77039347:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77039099_77039347:NUP54 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 77055474 A/G 1 29 10 39 13.1831593382288 5.45408298681766 7.72907635141113 A:T:G A G 10 0.545408298681766 0.0150326133103874 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77055329_77055515:NUP54 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 77057501 A/G 1 21 9 30 9.54642572768291 4.90867468813589 4.63775103954702 A:G A G 10 0.545408298681766 0.100381400752583 ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77057341_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77057474_77057565:NUP54 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 77065580 T/C 1 24 11 35 10.9102008316376 5.99949128549943 4.91070954613819 T:C T C 10 0.545408298681766 0.125592828818817 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508583:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514901:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510569:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510884:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000513352:exon_77065543_77065626:NUP54 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 79786856 G/A 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000335016:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000505725:exon_79786711_79786927:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502613:exon_79786711_79786874:BMP2K HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 79800080 G/A 1 29 29 58 13.1831593382288 15.8168406617712 -2.63368132354243 A:G G A 10 0.545408298681766 0.511627221853868 ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79799888_79800589:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79799888_79801123:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79799888_79800083:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000507670:exon_79799888_79800586:BMP2K HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 95186055 A/G 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 A:G A G 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000506089:exon_95185679_95186057:SMARCAD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 95561459 A/G 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 A:G A G 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000503974:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000506632:exon_95561427_95561601:PDLIM5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 103571854 G/A 1 13 13 26 5.90969211713704 7.09030788286296 -1.18061576572592 A:G G A 10 0.545408298681766 0.696154695081167 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103571694_103571858:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103571694_103571858:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103571694_103571858:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000508141:exon_103571694_103571995:MANBA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 108575989 G/A 1 8 4 12 3.63673361054587 2.18163319472706 1.45510041581881 A:G G A 10 0.545408298681766 0.564607771258684 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108575851_108576056:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108575851_108576056:PAPSS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 108641317 G/A 1 14 13 27 6.36428381845528 7.09030788286296 -0.726024064407682 A:G G A 10 0.545408298681766 0.84779448787691 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 108969883 G/A 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000138795:ENST00000265165:exon_108968701_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000379951:exon_108968701_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000503879:exon_108968729_108969930:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000504426:exon_108968748_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000505379:exon_108969325_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000514444:exon_108969456_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000505297:exon_108969510_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000510135:exon_108969533_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000438313:exon_108969573_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000507470:exon_108969683_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000509428:exon_108969753_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000512407:exon_108969791_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000510624:exon_108969795_108969907:LEF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 113351822 G/A 1 5 11 16 2.27295850659117 5.99949128549943 -3.72653277890826 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0783914597682892 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 8 12 20 3.63673361054587 6.54489958418119 -2.90816597363532 A:C A C 10 0.545408298681766 0.261293206047355 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 122732758 C/T 1 60 46 106 27.275502079094 25.0887817393612 2.1867203397328 T:C C T 10 0.545408298681766 0.697323574079717 ENSG00000123737:ENST00000243498:exon_122732738_122732826:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000509980:exon_122732738_122732826:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000379663:exon_122732738_122732826:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000513654:exon_122732738_122732826:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000511454:exon_122732738_122732796:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000509800:exon_122732738_122732815:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000512454:exon_122732738_122732826:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000508212:exon_122732738_122732826:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000511132:exon_122732738_122732826:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503139:exon_122732738_122732826:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503236:exon_122732738_122732826:EXOSC9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 23 19 42 10.4556091303194 10.3627576749536 0.0928514553658282 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 26 30 56 11.8193842342741 16.362248960453 -4.5428647261789 T:C T C 10 0.545408298681766 0.229981504501609 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 32 31 63 14.5469344421835 16.9076572591347 -2.36072281695126 T:C C T 10 0.545408298681766 0.613276770356751 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 156276289 C/T 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156276223_156276312:MAP9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 159601676 C/T 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000436096:exon_159601619_159601759:ETFDH HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 160277276 C/T 1 13 9 22 5.90969211713704 4.90867468813589 1.00101742900115 T:C C T 10 0.545408298681766 0.83113387846694 ENSG00000109756:ENST00000264431:exon_160277005_160277310:RAPGEF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 169158489 G/C 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169158437_169158578:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000507815:exon_169158437_169158639:DDX60 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 169158531 T/C 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 T:C T C 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169158437_169158578:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000507815:exon_169158437_169158639:DDX60 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 169176996 G/A 1 15 15 30 6.81887551977351 8.18112448022649 -1.36224896045298 A:G G A 10 0.545408298681766 0.714695541216207 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169176862_169177020:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000505393:exon_169176862_169177020:DDX60 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 169195109 C/A 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 A:C C A 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169195085_169195234:DDX60 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 169197297 C/T 1 12 1 13 5.45510041581881 0.545408298681766 4.90969211713704 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00903562293581201 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169197166_169197332:DDX60 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 169282355 T/C 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:C T C 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000181381:ENST00000510590:exon_169282300_169282362:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000511577:exon_169282300_169282362:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000260184:exon_169282300_169282362:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000513103:exon_169282300_169282590:DDX60L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 170345713 G/A 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 A:G G A 10 0.545408298681766 0.40572272702491 ENSG00000137601:ENST00000439128:exon_170345704_170345951:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000379072:exon_170345704_170345951:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000511633:exon_170345704_170345951:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000510533:exon_170345704_170345951:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000507142:exon_170345704_170345951:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000512193:exon_170345704_170345951:NEK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 11 19 30 5.00050871450057 10.3627576749536 -5.36224896045298 A:G A G 10 0.545408298681766 0.065281714411376 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 184600601 A/G 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 A:G A G 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184600506_184600639:C4orf41 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 184612553 G/C 1 13 9 22 5.90969211713704 4.90867468813589 1.00101742900115 C:G G C 10 0.545408298681766 0.83113387846694 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184612469_184612624:C4orf41 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 185599489 G/A 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G G A 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185599386_185599548:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185599386_185599548:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185599386_185599548:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185599386_185599548:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000506278:exon_185599386_185599540:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000508001:exon_185599431_185599548:CCDC111 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 185615764 C/A 1 23 9 32 10.4556091303194 4.90867468813589 5.54693444218349 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0520019713410137 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 185615768 T/G 1 20 10 30 9.09183402636468 5.45408298681766 3.63775103954702 T:G T G 10 0.545408298681766 0.203010938958958 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 185634144 T/C 1 27 14 41 12.2739759355923 7.63571618154472 4.63825975404759 T:C T C 10 0.545408298681766 0.160195512659391 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000506535:exon_185634098_185634167:MLF1IP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 185637699 A/G 1 20 12 32 9.09183402636468 6.54489958418119 2.54693444218349 A:G A G 10 0.545408298681766 0.382100303850759 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185637551_185637787:MLF1IP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 185650154 G/A 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185650072_185650189:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185650072_185650189:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185650072_185650189:MLF1IP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 185655171 C/T 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185655170_185655287:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185655170_185655284:MLF1IP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 4 185687863 A/G 1 6 10 16 2.7275502079094 5.45408298681766 -2.72653277890826 A:G A G 10 0.545408298681766 0.211691046173674 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687776_185687910:ACSL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 422955 C/G 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 C:G C G 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000510910:exon_422492_422973:AHRR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 434722 G/C 1 18 17 35 8.18265062372821 9.27194107759002 -1.08929045386181 C:G G C 10 0.545408298681766 0.736735697725999 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_433968_434972:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 434998 C/T 1 26 13 39 11.8193842342741 7.09030788286296 4.72907635141113 T:C C T 10 0.545408298681766 0.148599990290362 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 442571 A/C 1 5 13 18 2.27295850659117 7.09030788286296 -4.81734937627179 A:C A C 10 0.545408298681766 0.0309826429768608 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 29 30 59 13.1831593382288 16.362248960453 -3.17908962222419 A:C:G G A 10 0.545408298681766 0.434324328565220 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 462465 C/A 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 A:C C A 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_462272_462644:EXOC3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 476353 C/T 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_476317_476493:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_476317_476493:SLC9A3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 477479 C/T 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 T:C C T 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_477447_477559:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_477447_477559:SLC9A3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 6600150 G/A 1 119 99 218 54.0964124568698 53.9954215694948 0.100990887375019 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6600143_6600345:NSUN2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 6605532 C/A 1 12 5 17 5.45510041581881 2.72704149340883 2.72805892240998 A:C C A 10 0.545408298681766 0.227116627671435 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 6651970 A/G 1 8 4 12 3.63673361054587 2.18163319472706 1.45510041581881 A:G A G 10 0.545408298681766 0.564607771258684 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 6652009 G/A 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 A:G G A 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 6656210 G/A 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G G A 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6656191_6656292:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6656191_6656292:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6656191_6656292:SRD5A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 7878192 T/C 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 T:C T C 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7878057_7878262:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514220:exon_7878057_7878348:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 7885959 A/G 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 A:G A G 10 0.545408298681766 0.823095632852268 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7885898_7885967:MTRR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 7889216 G/A 1 13 4 17 5.90969211713704 2.18163319472706 3.72805892240998 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0880646543978223 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7889208_7889276:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 7889304 C/T 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 7897191 C/T 1 22 12 34 10.0010174290011 6.54489958418119 3.45611784481996 T:C C T 10 0.545408298681766 0.301556362796936 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508354:exon_7897178_7897213:MTRR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 7897283 G/A 1 27 23 50 12.2739759355923 12.5443908696806 -0.270414934088299 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 14420027 A/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:C A C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509354:exon_14419887_14420295:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512979:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000507714:exon_14419923_14420130:TRIO HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 14508040 G/T 1 26 16 42 11.8193842342741 8.72653277890826 3.09285145536583 T:G G T 10 0.545408298681766 0.357108709788699 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14507989_14510313:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14507989_14508785:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000344135:exon_14507989_14510312:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508717:exon_14507989_14508442:TRIO HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 14687731 G/C 1 16 13 29 7.27346722109174 7.09030788286296 0.183159338228786 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000154124:ENST00000503023:exon_14687630_14687755:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000284274:exon_14687630_14687755:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000514913:exon_14687630_14687755:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000508678:exon_14687630_14688049:FAM105B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 9 14 23 4.09132531186411 7.63571618154472 -3.54439086968062 A:G A G 10 0.545408298681766 0.147937741171306 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 8 15 23 3.63673361054587 8.18112448022649 -4.54439086968062 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0619742792817211 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 33448739 A/C 1 52 39 91 23.6387684685482 21.2709236485889 2.36784481995929 A:C A C 10 0.545408298681766 0.674149929581211 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33448647_33448837:TARS;ENSG00000113407:ENST00000514259:exon_33448647_33448837:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33448647_33448837:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33448647_33448837:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33448647_33448837:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33448647_33448837:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33448647_33448837:TARS;ENSG00000113407:ENST00000505012:exon_33448647_33448837:TARS;ENSG00000113407:ENST00000513066:exon_33448647_33448837:TARS;ENSG00000113407:ENST00000506040:exon_33448647_33448836:TARS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 33455121 C/T 1 39 31 70 17.7290763514111 16.9076572591347 0.821419092276383 T:C C T 10 0.545408298681766 0.904714436071678 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33455050_33455171:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33455050_33455171:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33455087_33455171:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33455050_33455171:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33455050_33455171:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33455087_33455171:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33455050_33455171:TARS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 36171780 A/G 1 8 17 25 3.63673361054587 9.27194107759002 -5.63520746704415 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0270581853548481 ENSG00000145604:ENST00000274254:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000274255:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000308927:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000509692:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000513151:exon_36171705_36171835:SKP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 42800808 C/T 1 22 13 35 10.0010174290011 7.09030788286296 2.91070954613819 T:C C T 10 0.545408298681766 0.396807608459019 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 50057729 G/A,T 0 0 9 9 0 4.90867468813589 -4.90867468813589 A:T G A 10 0.545408298681766 0.000829074446773646 ENSG00000151883:ENST00000505697:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000511363:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503888:exon_50057655_50057736:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000510303:exon_50057655_50057736:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000281631:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503707:exon_50057655_50057734:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000514067:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000423185:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503193:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000515166:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000505554:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000505180:exon_50057655_50057734:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503561:exon_50057655_50057732:PARP8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 56178111 A/G 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000095015:ENST00000399503:exon_56177397_56178693:MAP3K1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 57751443 A/G 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:G A G 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000145632:ENST00000274289:exon_57751366_57751606:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000442330:exon_57751366_57751606:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000503378:exon_57751366_57751606:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000505244:exon_57751438_57751606:PLK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 61694379 T/C 1 18 20 38 8.18265062372821 10.9081659736353 -2.72551534990711 T:C T C 10 0.545408298681766 0.417110767640708 ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61694256_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61694338_61694387:DIMT1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 61772535 G/T 1 8 4 12 3.63673361054587 2.18163319472706 1.45510041581881 T:G G T 10 0.545408298681766 0.564607771258684 ENSG00000086200:ENST00000424533:exon_61772510_61772580:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000325324:exon_61772510_61772580:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000409296:exon_61772510_61772580:IPO11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 32 36 68 14.5469344421835 19.6346987525436 -5.08776431036009 C:G C G 10 0.545408298681766 0.225120092034933 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 64267595 T/C 1 24 11 35 10.9102008316376 5.99949128549943 4.91070954613819 T:C T C 10 0.545408298681766 0.125592828818817 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 64875380 G/C 1 28 16 44 12.7285676369106 8.72653277890826 4.0020348580023 C:G G C 10 0.545408298681766 0.289189081151564 ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64875251_64875440:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64875251_64875440:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64875251_64875440:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000514172:exon_64875312_64875440:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511334:exon_64875251_64875440:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000515151:exon_64875123_64875440:PPWD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 65321311 C/T 1 5 10 15 2.27295850659117 5.45408298681766 -3.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 0.121647049471624 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000416865:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000515185:exon_65321134_65321380:ERBB2IP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 65350374 A/G 1 45 53 98 20.4566265593205 28.9066398301336 -8.45001327081307 A:G A G 10 0.545408298681766 0.104117138027092 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 65350481 C/T 1 43 34 77 19.5474431566841 18.54388215518 1.00356100150402 T:C C T 10 0.545408298681766 0.908993807595767 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511671:exon_65350461_65350779:ERBB2IP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 66481777 G/C 1 5 12 17 2.27295850659117 6.54489958418119 -4.27194107759002 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0496545389818462 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66481679_66481845:CD180;ENSG00000134061:ENST00000515027:exon_66481679_66482125:CD180 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 67588148 G/A 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G G A 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000523807:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000522084:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000320694:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000336483:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518292:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518813:exon_67586628_67588189:PIK3R1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 1 12 9 21 5.45510041581881 4.90867468813589 0.546425727682915 T:C C T 10 0.545408298681766 0.831119559812142 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 28 28 56 12.7285676369106 15.2714323630894 -2.54286472617889 A:T A T 10 0.545408298681766 0.50527297468746 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 22 17 39 10.0010174290011 9.27194107759002 0.729076351411127 T:G G T 10 0.545408298681766 0.873163637120494 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 16 14 30 7.27346722109174 7.63571618154472 -0.362248960452979 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 13 12 25 5.90969211713704 6.54489958418119 -0.635207467044149 A:G G A 10 0.545408298681766 0.842593548431809 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 7 13 20 3.18214190922764 7.09030788286296 -3.90816597363532 A:T T A 10 0.545408298681766 0.113964264894792 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 70818130 C/A 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 A:C C A 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70818116_70818317:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70818116_70818317:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70818116_70818317:BDP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 70858194 C/T 1 11 9 20 5.00050871450057 4.90867468813589 0.0918340263646806 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70858101_70858347:BDP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 72184098 C/T 1 16 13 29 7.27346722109174 7.09030788286296 0.183159338228786 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000083312:ENST00000337273:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000454282:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000415341:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000523768:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000396346:exon_72183954_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000447967:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000506351:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000519220:exon_72184065_72184130:TNPO1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 75884734 G/A 1 3 9 12 1.3637751039547 4.90867468813589 -3.54489958418119 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0458142407340025 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75884731_75884798:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75884731_75884798:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75884731_75884798:IQGAP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 77298682 C/T 1 49 41 90 22.2749933645935 22.3617402459524 -0.0867468813589376 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77296349_77298879:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77298150_77298879:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000522901:exon_77298162_77298901:AP3B1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 77425028 A/T 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 A:T A T 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77424945_77425131:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77424945_77425131:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517561:exon_77424945_77425131:AP3B1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 77684726 G/A 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.763888703612766 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 94860229 G/A 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 A:G G A 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94860169_94860295:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000513232:exon_94860169_94860295:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000514952:exon_94860169_94860295:TTC37 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 95084131 G/A 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000164292:ENST00000504949:exon_95084037_95084191:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000506959:exon_95084037_95084145:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000379982:exon_95084037_95084191:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000510623:exon_95084037_95084191:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000502541:exon_95084037_95084191:RHOBTB3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 95091194 C/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C C T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000164292:ENST00000504949:exon_95091100_95091797:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000379982:exon_95091100_95091465:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000502541:exon_95091100_95091465:RHOBTB3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 95091201 A/G 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 A:G A G 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000164292:ENST00000504949:exon_95091100_95091797:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000379982:exon_95091100_95091465:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000502541:exon_95091100_95091465:RHOBTB3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 96124296 C/G 1 17 8 25 7.72805892240998 4.36326638945413 3.36479253295585 C:G C G 10 0.545408298681766 0.228470955877391 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96124234_96124388:ERAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 99897866 G/A 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 A:G G A 10 0.545408298681766 0.40572272702491 ENSG00000174132:ENST00000312637:exon_99897758_99897892:FAM174A;ENSG00000174132:ENST00000505792:exon_99897756_99897892:FAM174A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 112179022 A/G 1 11 12 23 5.00050871450057 6.54489958418119 -1.54439086968062 A:G A G 10 0.545408298681766 0.536899606886051 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 112889374 G/A 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000503857:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000515883:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112889287_112889383:YTHDC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 112917278 T/G 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 T:G T G 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112917114_112917406:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112917114_112917406:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112916963_112920176:YTHDC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 25 16 41 11.3647925329558 8.72653277890826 2.63825975404759 A:T T A 10 0.545408298681766 0.436884372319219 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 121309893 T/C 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 T:C T C 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121309891_121309979:SRFBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 121356189 T/A 1 27 15 42 12.2739759355923 8.18112448022649 4.09285145536583 A:T T A 10 0.545408298681766 0.218707973567663 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 122165317 C/T 1 75 66 141 34.0943775988676 35.9969477129966 -1.90257011412901 T:C C T 10 0.545408298681766 0.799845486641865 ENSG00000205302:ENST00000379516:exon_122165293_122165803:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000514949:exon_122165293_122165450:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000510372:exon_122165293_122165366:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000506847:exon_122165293_122165468:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000507321:exon_122165293_122165450:SNX2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 122682348 A/G 1 19 16 35 8.63724232504645 8.72653277890826 -0.0892904538618104 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 122685727 C/G 1 6 10 16 2.7275502079094 5.45408298681766 -2.72653277890826 C:G C G 10 0.545408298681766 0.211691046173674 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122685638_122685783:CEP120 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 122718736 G/C 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122718713_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122718719_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122718680_122718776:CEP120 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 122727026 G/A 1 13 8 21 5.90969211713704 4.36326638945413 1.54642572768291 A:G G A 10 0.545408298681766 0.521510664210594 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000395431:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000503049:exon_122726603_122727031:CEP120 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 125939409 C/T 1 45 46 91 20.4566265593205 25.0887817393612 -4.63215518004071 T:C C T 10 0.545408298681766 0.344685891094398 ENSG00000164902:ENST00000297540:exon_125939262_125939875:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000514725:exon_125939266_125939756:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000456348:exon_125939262_125939534:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000505674:exon_125939253_125939875:PHAX HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 131008194 T/C 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 T:C T C 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000217128:ENST00000307968:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000307954:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000510461:exon_131007198_131008617:FNIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 32 37 69 14.5469344421835 20.1801070512253 -5.63317260904185 T:C T C 10 0.545408298681766 0.18473244018199 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 132099999 A/G 1 6 21 27 2.7275502079094 11.4535742723171 -8.72602406440768 A:G A G 10 0.545408298681766 0.000794163958075445 ENSG00000164402:ENST00000378719:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378721:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132099951_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378701:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000458488:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371478:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000453480:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000414594:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371493:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000481794:exon_132099653_132100111:SEPT8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 133887780 G/A 1 14 8 22 6.36428381845528 4.36326638945413 2.00101742900115 A:G G A 10 0.545408298681766 0.521743237801811 ENSG00000043143:ENST00000512386:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000282605:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000361895:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000432594:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000413974:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000433412:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000458562:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000448712:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000402835:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000395003:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000431355:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000453515:exon_133887742_133887899:PHF15 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 134076812 G/A 1 37 34 71 16.8198929487747 18.54388215518 -1.72398920640538 A:G G A 10 0.545408298681766 0.721383882955254 ENSG00000164615:ENST00000297156:exon_134076753_134077213:CAMLG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 134364996 G/T 1 6 12 18 2.7275502079094 6.54489958418119 -3.81734937627179 T:G G T 10 0.545408298681766 0.0959765577209017 ENSG00000069011:ENST00000265340:exon_134363424_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000506438:exon_134364243_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000503586:exon_134364912_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000504936:exon_134364977_134365011:PITX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 137661568 T/C 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137661504_137661593:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000357274:exon_137661504_137661593:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137661504_137661593:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137661504_137661593:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137661504_137661593:CDC25C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 137717213 G/A 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000512928:exon_137717205_137717437:KDM3B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 A:G A G 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 139574050 G/A 1 54 41 95 24.5479518711846 22.3617402459524 2.18621162523223 A:G G A 10 0.545408298681766 0.681295447474147 ENSG00000120306:ENST00000261811:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000509589:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000504227:exon_139574031_139574237:C5orf32 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 139682663 G/C 1 20 11 31 9.09183402636468 5.99949128549943 3.09234274086525 C:G G C 10 0.545408298681766 0.284898217962211 ENSG00000113068:ENST00000261813:exon_139682626_139682706:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000510217:exon_139682626_139682698:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000524074:exon_139682626_139682668:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000507185:exon_139682626_139682671:PFDN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 12 10 22 5.45510041581881 5.45408298681766 0.00101742900114843 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 140048544 C/T 1 19 12 31 8.63724232504645 6.54489958418119 2.09234274086525 T:C C T 10 0.545408298681766 0.476878416492098 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048476_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511364:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140048506_140048575:WDR55 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 140052271 A/G 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 A:G A G 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140051963_140053709:WDR55;ENSG00000255017:ENST00000533480:exon_140052030_140052491:AC116353.1;ENSG00000254679:ENST00000523844:exon_140052030_140052491:DND1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 140057535 G/A 1 50 47 97 22.7295850659117 25.634190038043 -2.9046049721313 A:T:G G A 10 0.545408298681766 0.610448184830619 ENSG00000170445:ENST00000504156:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000457527:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000431330:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000504366:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000307633:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000448240:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000438307:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000415192:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512655:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000506579:exon_140057240_140058712:HARS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 141016383 C/A 1 20 10 30 9.09183402636468 5.45408298681766 3.63775103954702 A:C C A 10 0.545408298681766 0.203010938958958 ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141016303_141016437:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141016303_141016409:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523088:exon_141016303_141016400:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000519474:exon_141016303_141016405:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141016303_141016392:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000492506:exon_141016303_141016410:HDAC3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 141391532 G/A 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000113552:ENST00000513454:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000311337:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000500692:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000458112:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000508177:exon_141391477_141392359:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503794:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504139:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000505689:exon_141391414_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000510194:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503229:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000507107:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504424:exon_141391514_141391606:GNPDA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 147805120 T/C 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 T:C T C 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000514832:exon_147805085_147805264:FBXO38 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 148747902 G/C 1 12 7 19 5.45510041581881 3.81785809077236 1.63724232504645 C:G G C 10 0.545408298681766 0.497799653196701 ENSG00000145882:ENST00000274569:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000511945:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000505669:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000503240:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000514349:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000507621:exon_148747556_148749216:PCYOX1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 207 206 413 94.1004821728744 112.354109528444 -18.2536273555694 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0752312144642143 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 23 14 37 10.4556091303194 7.63571618154472 2.81989294877466 T:C C T 10 0.545408298681766 0.410658794157108 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 150578574 A/G 1 25 16 41 11.3647925329558 8.72653277890826 2.63825975404759 A:G A G 10 0.545408298681766 0.436884372319219 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 150632832 G/A 1 49 32 81 22.2749933645935 17.4530655578165 4.82192780677696 A:T:G G A 10 0.545408298681766 0.315814079239409 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150632453_150632858:GM2A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 151043103 G/C 1 17 26 43 7.72805892240998 14.1806157657259 -6.45255684331594 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0648711645959133 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151040657_151043160:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000520687:exon_151042049_151043160:SPARC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 154275786 G/A 1 11 11 22 5.00050871450057 5.99949128549943 -0.998982570998852 A:C:G G A 10 0.545408298681766 0.675286531050552 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154275652_154275903:GEMIN5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 154282235 T/C 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154282099_154282236:GEMIN5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 154291409 C/T 1 13 7 20 5.90969211713704 3.81785809077236 2.09183402636468 T:C C T 10 0.545408298681766 0.37882271700965 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 154300940 A/C 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 A:C A C 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154300903_154300985:GEMIN5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 154306972 T/C 1 19 12 31 8.63724232504645 6.54489958418119 2.09234274086525 T:C T C 10 0.545408298681766 0.476878416492098 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154306945_154307110:GEMIN5;ENSG00000082516:ENST00000523355:exon_154306946_154307110:GEMIN5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 154346259 A/G 1 78 89 167 35.4581527028223 48.5413385826772 -13.0831858798549 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0435006446021111 ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154346246_154346526:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154346246_154346528:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154346246_154346453:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000520040:exon_154346246_154346505:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000518364:exon_154346246_154346531:MRPL22 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 157166419 C/T 1 23 28 51 10.4556091303194 15.2714323630894 -4.81582323277006 T:C C T 10 0.545408298681766 0.205708974037705 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157166329_157168456:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157166329_157166586:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157166329_157167443:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157166329_157166706:THG1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 159912418 C/G 1 13 24 37 5.90969211713704 13.0897991683624 -7.18010705122534 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0204282393643407 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 169267784 G/A 1 33 30 63 15.0015261435017 16.362248960453 -1.36072281695126 A:G G A 10 0.545408298681766 0.800545745443923 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520836:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520181:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519628:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169267761_169267856:DOCK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 171520790 G/C 1 48 53 101 21.8204016632752 28.9066398301336 -7.08623816685836 C:G G C 10 0.545408298681766 0.162846075887078 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171520416_171520964:STK10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 171523436 G/A 1 42 34 76 19.0928514553658 18.54388215518 0.548969300185785 A:G G A 10 0.545408298681766 0.908986090913217 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171523430_171523564:STK10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 172750392 G/A 1 22 8 30 10.0010174290011 4.36326638945413 5.63775103954702 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0435968127475374 ENSG00000113739:ENST00000265087:exon_172750222_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000520593:exon_172750222_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000520648:exon_172749972_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000518455:exon_172750313_172750433:STC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 176915143 C/T 1 15 12 27 6.81887551977351 6.54489958418119 0.273975935592318 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176914898_176915249:PDLIM7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 176918080 G/A 1 8 11 19 3.63673361054587 5.99949128549943 -2.36275767495355 A:G G A 10 0.545408298681766 0.357731776873343 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000505074:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355572:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393546:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000506161:exon_176918026_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000504318:exon_176918073_176918421:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000503346:exon_176918074_176918147:PDLIM7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 176931594 G/C 1 55 48 103 25.0025435725029 26.1795983367248 -1.1770547642219 C:G G C 10 0.545408298681766 0.843486343704838 ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176930751_176931661:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000501403:exon_176930785_176931661:DOK3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 176931706 G/C 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 C:G G C 10 0.545408298681766 0.823095632852268 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 56 62 118 25.4571352738211 33.8153145182695 -8.35817924444838 A:G G A 10 0.545408298681766 0.138901791053339 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 176958397 G/A 1 7 10 17 3.18214190922764 5.45408298681766 -2.27194107759002 A:G G A 10 0.545408298681766 0.332347257730029 ENSG00000146067:ENST00000510479:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506955:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000329540:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000510163:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000524677:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000442143:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000443375:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000513502:exon_176958283_176958835:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506064:exon_176958339_176958522:FAM193B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 13 4 17 5.90969211713704 2.18163319472706 3.72805892240998 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0880646543978223 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 22 14 36 10.0010174290011 7.63571618154472 2.36530124745642 T:C T C 10 0.545408298681766 0.504485277520847 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 179045142 G/A 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 A:G G A 10 0.545408298681766 0.399082180852789 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 70 76 146 31.8214190922764 41.4510306998142 -9.62961160753784 A:G A G 10 0.545408298681766 0.114682383892259 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 180218820 C/A 1 63 60 123 28.6392771830487 32.724497920906 -4.08522073785722 A:C C A 10 0.545408298681766 0.470031707883834 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 180218831 G/A 1 52 45 97 23.6387684685482 24.5433734406795 -0.904604972131303 A:G G A 10 0.545408298681766 0.918863320557976 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 180219304 C/T 1 52 47 99 23.6387684685482 25.634190038043 -1.99542156949483 T:C C T 10 0.545408298681766 0.68792677494357 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 180651231 G/A 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 5 180665065 G/C 1 20 17 37 9.09183402636468 9.27194107759002 -0.180107051225342 C:G G C 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 107 96 203 48.641312041051 52.3591966734495 -3.71788463239849 A:G G A 10 0.545408298681766 0.622074266588919 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 564145 A/G 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 A:G A G 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_564033_564154:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_564033_564154:EXOC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 1742794 A/G 1 11 15 26 5.00050871450057 8.18112448022649 -3.18061576572592 A:G A G 10 0.545408298681766 0.239917577897468 ENSG00000112699:ENST00000530927:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380815:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380805:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000531690:exon_1742702_1742820:GMDS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 2785315 C/T 1 36 34 70 16.3653012474564 18.54388215518 -2.17858090772362 T:C C T 10 0.545408298681766 0.632239889020562 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2785241_2785979:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2785241_2785979:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000415856:exon_2785303_2785516:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2785241_2786927:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2785241_2785979:WRNIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 6174856 T/C 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 T:C T C 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000124491:ENST00000264870:exon_6174813_6175100:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000441301:exon_6174813_6175100:F13A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 6318795 C/A 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 A:C C A 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000124491:ENST00000264870:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000441301:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000379960:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000414279:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000431222:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000451619:exon_6318768_6318915:F13A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 7231770 A/G 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 A:G A G 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7230073_7232140:RREB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 7246998 G/A 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:G G A 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7246998_7247099:RREB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 7313338 G/C 1 14 21 35 6.36428381845528 11.4535742723171 -5.08929045386181 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0912742261267931 ENSG00000124783:ENST00000474597:exon_7313275_7313440:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000244763:exon_7313275_7313440:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000397511:exon_7313275_7313431:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000489567:exon_7313275_7313407:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000479365:exon_7313275_7313415:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000462112:exon_7313275_7313421:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000483409:exon_7313275_7313464:SSR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 12122773 T/C 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 T:C T C 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 12124587 C/G 1 9 8 17 4.09132531186411 4.36326638945413 -0.271941077590022 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 12163575 G/A 1 10 13 23 4.54591701318234 7.09030788286296 -2.54439086968062 A:G G A 10 0.545408298681766 0.302592597377063 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12163516_12165232:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000399469:exon_12163516_12164808:HIVEP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 17688694 G/A 1 11 17 28 5.00050871450057 9.27194107759002 -4.27143236308945 A:G G A 10 0.545408298681766 0.128767570080049 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17688627_17688849:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17688627_17688849:NUP153 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 17688798 G/A 1 9 19 28 4.09132531186411 10.3627576749536 -6.27143236308945 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0216966412049147 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17688627_17688849:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17688627_17688849:NUP153 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 26 22 48 11.8193842342741 11.9989825709989 -0.179598336724768 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 24780892 A/C 1 24 21 45 10.9102008316376 11.4535742723171 -0.543373440679469 A:C A C 10 0.545408298681766 0.882099628476873 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24780891_24780968:GMNN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 24875993 C/G 1 13 7 20 5.90969211713704 3.81785809077236 2.09183402636468 C:G C G 10 0.545408298681766 0.37882271700965 ENSG00000111913:ENST00000259698:exon_24875919_24876045:FAM65B;ENSG00000111913:ENST00000378023:exon_24875919_24876045:FAM65B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 26197493 C/A 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 A:C C A 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26197012_26197497:HIST1H3D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 26216584 C/T 1 2 7 9 0.909183402636468 3.81785809077236 -2.90867468813589 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0890512388728988 ENSG00000187990:ENST00000339812:exon_26216491_26216871:HIST1H2BG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 26234883 A/G 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 26234952 A/G 1 2 12 14 0.909183402636468 6.54489958418119 -5.63571618154472 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00260091073771191 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 26285560 A/G 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 A:G A G 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 26285683 T/C 1 10 8 18 4.54591701318234 4.36326638945413 0.182650623728212 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 24 28 52 10.9102008316376 15.2714323630894 -4.36123153145183 T:C T C 10 0.545408298681766 0.265309796508155 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 26370660 G/A 1 19 17 36 8.63724232504645 9.27194107759002 -0.634698752543576 A:G G A 10 0.545408298681766 0.868122767399527 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 26393021 G/A 1 20 19 39 9.09183402636468 10.3627576749536 -1.27092364858887 A:G G A 10 0.545408298681766 0.748656616025534 ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 27833174 A/G 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 A:G A G 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000198374:ENST00000357320:exon_27833034_27833606:HIST1H2AL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 27925827 A/G 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 A:G A G 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000124657:ENST00000244623:exon_27925019_27925960:OR2B6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 28097193 G/A 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 A:G G A 10 0.545408298681766 0.779258042281529 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 32 25 57 14.5469344421835 13.6352074670442 0.911726975139338 T:C T C 10 0.545408298681766 0.894406818224314 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 481 554 1035 218.658608334071 302.156197469698 -83.4975891356278 A:G G A 10 0.545408298681766 2.09319433073018e-07 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30460232 C/T 1 15 18 33 6.81887551977351 9.81734937627179 -2.99847385649828 T:C C T 10 0.545408298681766 0.300665631885240 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 36 24 60 16.3653012474564 13.0897991683624 3.27550207909404 A:G G A 10 0.545408298681766 0.437968593155197 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30530245 T/C 1 14 11 25 6.36428381845528 5.99949128549943 0.364792532955851 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30652872 G/A 1 78 88 166 35.4581527028223 47.9959302839954 -12.5377775811732 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0516680728190305 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30652185_30655672:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30652185_30653823:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000376424:exon_30652794_30653795:KIAA1949 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30865204 A/C 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:C A C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30865138_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30865156_30865374:DDR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 9 12 21 4.09132531186411 6.54489958418119 -2.45357427231709 T:C C T 10 0.545408298681766 0.381262320809038 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 12 8 20 5.45510041581881 4.36326638945413 1.09183402636468 A:C A C 10 0.545408298681766 0.660903045813617 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30882689 C/T 1 14 4 18 6.36428381845528 2.18163319472706 4.18265062372821 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0579173231641151 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30882803 G/A 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 A:G G A 10 0.545408298681766 0.823095632852268 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30887972 C/T 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 T:C C T 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30888161 T/C 1 13 9 22 5.90969211713704 4.90867468813589 1.00101742900115 T:C T C 10 0.545408298681766 0.83113387846694 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 16 20 36 7.27346722109174 10.9081659736353 -3.63469875254358 T:C T C 10 0.545408298681766 0.244017272256093 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 9 14 23 4.09132531186411 7.63571618154472 -3.54439086968062 A:G G A 10 0.545408298681766 0.147937741171306 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 30893728 C/T 1 20 36 56 9.09183402636468 19.6346987525436 -10.5428647261789 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00672987510806178 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893657_30893785:VARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 42 35 77 19.0928514553658 19.0892904538618 0.00356100150401772 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 27 24 51 12.2739759355923 13.0897991683624 -0.815823232770065 T:C T C 10 0.545408298681766 0.88843880926409 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31112484 C/T 1 23 16 39 10.4556091303194 8.72653277890826 1.72907635141113 T:C C T 10 0.545408298681766 0.631811857537628 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112406_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31113030 A/G 1 22 16 38 10.0010174290011 8.72653277890826 1.27448465009289 A:G A G 10 0.545408298681766 0.746004537752306 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 18 20 38 8.18265062372821 10.9081659736353 -2.72551534990711 A:G G A 10 0.545408298681766 0.417110767640708 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31116210 G/A 1 11 10 21 5.00050871450057 5.45408298681766 -0.453574272317086 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 8 7 15 3.63673361054587 3.81785809077236 -0.18112448022649 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 21 22 43 9.54642572768291 11.9989825709989 -2.45255684331594 C:G C G 10 0.545408298681766 0.540680933575845 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31118898 A/T 1 22 11 33 10.0010174290011 5.99949128549943 4.00152614350172 A:T A T 10 0.545408298681766 0.220523989139066 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118732_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31118644_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31118662_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31118752_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31118847_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31118869_31118899:CCHCR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 19 8 27 8.63724232504645 4.36326638945413 4.27397593559232 A:G A G 10 0.545408298681766 0.122032486533752 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C 1 25 11 36 11.3647925329558 5.99949128549943 5.36530124745642 A:C A C 10 0.545408298681766 0.0931512567153025 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31129707 C/T 1 36 21 57 16.3653012474564 11.4535742723171 4.91172697513934 T:C C T 10 0.545408298681766 0.231194601063238 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 38 40 78 17.2744846500929 21.8163319472706 -4.54184729717775 T:C T C 10 0.545408298681766 0.308426027262348 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 72 17 89 32.7306024949129 9.27194107759002 23.4586614173228 T:C T C 10 0.545408298681766 2.96695407189397e-07 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 72 9 81 32.7306024949129 4.90867468813589 27.821927806777 C:G C G 10 0.545408298681766 5.63452703956588e-11 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 111 11 122 50.459678846324 5.99949128549943 44.4601875608246 T:C C T 10 0.545408298681766 2.14637265134874e-18 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31239501 G/T 1 89 5 94 40.4586614173228 2.72704149340883 37.731619923914 T:G G T 10 0.545408298681766 7.98042534988233e-18 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31239518 C/T 1 80 5 85 36.3673361054587 2.72704149340883 33.6402946120499 A:T:C C T 10 0.545408298681766 7.66502676724242e-16 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 0 63 0 63 28.6392771830487 0 28.6392771830487 G G 10 0.545408298681766 4.51534117293229e-17 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31322340 G/A 1 63 41 104 28.6392771830487 22.3617402459524 6.27753693709634 A:G G A 10 0.545408298681766 0.237767041075902 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31322888 A/G 1 2686 796 3482 1221.03330974078 434.145005750686 786.888303990091 A:T:C:G A G 10 0.545408298681766 7.13909097825271e-169 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 2352 547 2899 1069.19968150049 298.338339378926 770.86134212156 T:C:G C T 10 0.545408298681766 6.1782042495003e-199 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31323203 A/G 1 1086 1599 2685 493.686587631602 872.107869592144 -378.421281960542 A:T:G A G 10 0.545408298681766 1.77441550257824e-48 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 357 284 641 162.28923737061 154.895956825622 7.39328054498802 A:G G A 10 0.545408298681766 0.578774455087115 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31473546 A/G 1 9 16 25 4.09132531186411 8.72653277890826 -4.63520746704415 A:G A G 10 0.545408298681766 0.071626048179444 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31477681 A/G 1 13 11 24 5.90969211713704 5.99949128549943 -0.0897991683623838 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31477559_31478901:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31477559_31478901:MICB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31506624 T/C 1 104 103 207 47.2775369370963 56.1770547642219 -8.89951782712556 T:C T C 10 0.545408298681766 0.235373802648525 ENSG00000254870:ENST00000376185:exon_31506540_31506632:XXbac-BPG296P20.16;ENSG00000198563:ENST00000376177:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000458640:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000396172:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376174:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000525098:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000417556:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000449461:exon_31506540_31506716:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376163:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000436533:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000481456:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000427214:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000453105:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000428098:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000419338:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000456662:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000428450:exon_31506540_31506716:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000449757:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000456976:exon_31506596_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000418897:exon_31506608_31506632:BAT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31515442 G/C 1 7 1 8 3.18214190922764 0.545408298681766 2.63673361054587 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0793702040361015 ENSG00000204498:ENST00000376148:exon_31515358_31515528:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376145:exon_31515390_31515528:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000496233:exon_31515417_31515528:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000473655:exon_31515438_31515528:NFKBIL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31549656 G/C 1 10 2 12 4.54591701318234 1.09081659736353 3.45510041581881 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0775833003018699 ENSG00000227507:ENST00000482429:exon_31549336_31550183:LTB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 31599360 A/G 1 67 62 129 30.4576439883217 33.8153145182695 -3.35767052994781 A:G A G 10 0.545408298681766 0.596014686475082 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598916_31599597:BAT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 1079 870 1949 490.504445722374 474.505219853136 15.9992258692381 A:C:G C A 10 0.545408298681766 0.480753980077151 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32410941 T/C 1 6 10 16 2.7275502079094 5.45408298681766 -2.72653277890826 T:C T C 10 0.545408298681766 0.211691046173674 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 1578 1388 2966 717.345704680173 757.026718570291 -39.6810138901179 A:T:C:G A C 10 0.545408298681766 0.145239579649189 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 20 11 31 9.09183402636468 5.99949128549943 3.09234274086525 T:C T C 10 0.545408298681766 0.284898217962211 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 3906 2509 6415 1775.63518534902 1368.42942139255 407.205763956471 A:T:C:G T G 10 0.545408298681766 1.10440615034008e-24 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32411726 G/A 1 15 3 18 6.81887551977351 1.6362248960453 5.18265062372821 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0163417451705557 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32632832 A/T 0 0 9 9 0 4.90867468813589 -4.90867468813589 T A T 10 0.545408298681766 0.000829074446773646 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000529407:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 56 66 122 25.4571352738211 35.9969477129966 -10.5398124391755 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0566912171676585 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32800412 C/T 1 74 71 145 33.6397858975493 38.7239892064054 -5.08420330885607 T:C C T 10 0.545408298681766 0.405356363731137 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800404_32800510:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32818678 G/A 1 9 8 17 4.09132531186411 4.36326638945413 -0.271941077590022 A:G G A 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 152 163 315 69.0979386003716 88.9015526851279 -19.8036140847563 A:G G A 10 0.545408298681766 0.027236875797421 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32917544 C/T 1 287 300 587 130.467818278333 163.62248960453 -33.1546713261966 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.00621229990190816 ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32917388_32917564:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32917388_32918580:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000456800:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000422832:exon_32917434_32917666:HLA-DMA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 26 33 59 11.8193842342741 17.9984738564983 -6.1790896222242 A:G G A 10 0.545408298681766 0.117154919279541 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 27 27 54 12.2739759355923 14.7260240644077 -2.45204812881536 A:G G A 10 0.545408298681766 0.585063321541413 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 119 139 258 54.0964124568698 75.8117535167655 -21.7153410598956 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00712152594668164 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32948462 G/A 1 200 227 427 90.9183402636468 123.807683800761 -32.8893435371141 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00155858179302990 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32948359_32949063:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482838:exon_32948359_32948543:BRD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 32974551 G/T 1 118 110 228 53.6418207555516 59.9949128549943 -6.35309209944265 T:G G T 10 0.545408298681766 0.424967254663847 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32971955_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32971959_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32973372_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974384_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974523_32974618:HLA-DOA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 33179689 C/T 1 12 16 28 5.45510041581881 8.72653277890826 -3.27143236308945 T:C C T 10 0.545408298681766 0.255841661593369 ENSG00000204227:ENST00000374656:exon_33179506_33179779:RING1;ENSG00000204227:ENST00000478431:exon_33179506_33179779:RING1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 12 10 22 5.45510041581881 5.45408298681766 0.00101742900114843 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 33256471 T/C 1 89 53 142 40.4586614173228 28.9066398301336 11.5520215871892 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0528591520141536 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256341_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256391_33256471:WDR46 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 33636907 C/T 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:C C T 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33636751_33636933:ITPR3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 33641379 T/C 1 12 6 18 5.45510041581881 3.2724497920906 2.18265062372821 T:C T C 10 0.545408298681766 0.350631698949064 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33641368_33641497:ITPR3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 33651129 C/T 1 3 7 10 1.3637751039547 3.81785809077236 -2.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 0.201980178309513 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33650984_33651174:ITPR3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 33665458 T/C 1 70 56 126 31.8214190922764 30.5428647261789 1.27855436609748 T:C T C 10 0.545408298681766 0.858252307038784 ENSG00000137288:ENST00000374231:exon_33665345_33665527:C6orf125;ENSG00000137288:ENST00000374214:exon_33665345_33665527:C6orf125 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 22 21 43 10.0010174290011 11.4535742723171 -1.45255684331594 A:G G A 10 0.545408298681766 0.759814246368948 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 34214322 C/G 1 21 20 41 9.54642572768291 10.9081659736353 -1.36174024595241 C:G C G 10 0.545408298681766 0.754330123216359 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 36341294 C/T 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 T:C C T 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000010030:ENST00000339796:exon_36341230_36341355:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36341230_36341355:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373737:exon_36341230_36341355:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36341230_36341355:ETV7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 36437849 G/T 1 22 18 40 10.0010174290011 9.81734937627179 0.183668052729361 T:G G T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000112078:ENST00000373731:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000483557:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000498267:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000481911:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000449081:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000265344:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000460983:exon_36437829_36438034:KCTD20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 155 174 329 70.4617137043263 94.9010439706273 -24.439330266301 A:C C A 10 0.545408298681766 0.00778581804979084 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 163 133 296 74.0984473148721 72.5393037246749 1.55914359019727 A:T:C C T 10 0.545408298681766 0.861261962452847 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 36713263 A/G 1 5 11 16 2.27295850659117 5.99949128549943 -3.72653277890826 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0783914597682892 ENSG00000124772:ENST00000459703:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000244751:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000493411:exon_36713164_36713292:CPNE5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 28 21 49 12.7285676369106 11.4535742723171 1.27499336459347 A:G A G 10 0.545408298681766 0.775177794344407 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 11 9 20 5.00050871450057 4.90867468813589 0.0918340263646806 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 41038845 C/T 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 T:C C T 10 0.545408298681766 0.152877514803084 ENSG00000124596:ENST00000469104:exon_41038564_41039015:C6orf130;ENSG00000124596:ENST00000471367:exon_41038780_41039015:C6orf130 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 41162518 T/C 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 A:T:C T C 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000112195:ENST00000373108:exon_41162163_41162571:TREML2;ENSG00000112195:ENST00000483722:exon_41162163_41162571:TREML2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 68 85 153 30.9122356896399 46.3597053879501 -15.4474696983102 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0146130789668285 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 80 81 161 36.3673361054587 44.178072193223 -7.81073608776433 T:C T C 10 0.545408298681766 0.235251739435213 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 41889409 C/A 1 25 7 32 11.3647925329558 3.81785809077236 7.54693444218349 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0073275986044256 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41888926_41889568:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000494032:exon_41889268_41889568:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000489290:exon_41889272_41889568:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000475702:exon_41889288_41889568:BYSL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 42 34 76 19.0928514553658 18.54388215518 0.548969300185785 A:C A C 10 0.545408298681766 0.908986090913217 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 42906487 G/A 1 181 186 367 82.2810979386004 101.445943554808 -19.1648456162081 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0463883214286424 ENSG00000137161:ENST00000372836:exon_42906306_42907025:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000394142:exon_42906306_42907007:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000336842:exon_42906450_42906549:CNPY3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 43307861 G/A 1 35 51 86 15.9107095461382 27.8158232327701 -11.9051136866319 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0123413347159047 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 43968814 A/G 1 7 12 19 3.18214190922764 6.54489958418119 -3.36275767495355 A:G A G 10 0.545408298681766 0.165845385921528 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43968317_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43968754_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43968711_43968880:C6orf223 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 64 62 126 29.093868884367 33.8153145182695 -4.72144563390251 T:G G T 10 0.545408298681766 0.421292703732985 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 44360533 G/A 1 17 13 30 7.72805892240998 7.09030788286296 0.637751039547021 A:G G A 10 0.545408298681766 0.856490370798262 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44360404_44360565:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44360404_44360565:CDC5L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 49403282 T/C 1 15 12 27 6.81887551977351 6.54489958418119 0.273975935592318 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 49403301 C/T 1 14 14 28 6.36428381845528 7.63571618154472 -1.27143236308945 T:C C T 10 0.545408298681766 0.70569768807638 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 49412433 C/T 1 9 13 22 4.09132531186411 7.09030788286296 -2.99898257099885 T:C C T 10 0.545408298681766 0.207313306024605 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 49425521 C/T 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49425404_49425771:MUT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 49439805 G/A 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 A:G G A 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 17 0 17 7.72805892240998 0 7.72805892240998 G G 10 0.545408298681766 6.57923297009578e-05 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 57246847 C/T 1 4 11 15 1.81836680527294 5.99949128549943 -4.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0374068965367827 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 57246884 A/G 0 8 0 8 3.63673361054587 0 3.63673361054587 A A 10 0.545408298681766 0.00965399767040904 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 57393112 T/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C T C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 12 12 0 6.54489958418119 -6.54489958418119 A G A 10 0.545408298681766 7.78857559952273e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 11 11 0 5.99949128549943 -5.99949128549943 G T G 10 0.545408298681766 0.000171331231453132 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 10 10 0 5.45408298681766 -5.45408298681766 C T C 10 0.545408298681766 0.000376890363278306 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 57512678 G/A 0 0 11 11 0 5.99949128549943 -5.99949128549943 A G A 10 0.545408298681766 0.000171331231453132 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 28 37 65 12.7285676369106 20.1801070512253 -7.45153941431479 A:T A T 10 0.545408298681766 0.0804158208279573 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 71377711 C/T 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000422334:exon_71377659_71377844:SMAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 74190448 T/C 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 T:C T C 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000135297:ENST00000498286:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415954:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000357845:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370305:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370308:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370300:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415228:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000462039:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000445187:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000520366:exon_74190398_74190485:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000487960:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000524046:exon_74190398_74190528:MTO1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 74229792 A/G 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 A:G A G 10 0.545408298681766 0.609212519966719 ENSG00000156508:ENST00000316292:exon_74229606_74230741:EEF1A1;ENSG00000156508:ENST00000456206:exon_74229606_74230741:EEF1A1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 82933309 C/T 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 T:C C T 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000005700:ENST00000306270:exon_82933157_82933337:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000505222:exon_82933157_82933337:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503400:exon_82933157_82933337:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503631:exon_82933157_82933337:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000510291:exon_82933157_82933337:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000369751:exon_82933157_82933337:IBTK HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 87969480 G/A 1 31 26 57 14.0923427408653 14.1806157657259 -0.088273024860662 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 88224164 T/C 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 T:C T C 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88224098_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000493269:exon_88224125_88224217:RARS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 238 247 485 108.19282491374 134.715849774396 -26.5230248606565 C:G G C 10 0.545408298681766 0.017648565349604 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 90039670 G/C 1 204 245 449 92.7367070689197 133.625033177033 -40.8883261081129 C:G G C 10 0.545408298681766 0.000119576687122379 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90039279_90039676:UBE2J1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 96034330 G/A 1 20 10 30 9.09183402636468 5.45408298681766 3.63775103954702 A:G G A 10 0.545408298681766 0.203010938958958 ENSG00000172469:ENST00000358812:exon_96034278_96034859:MANEA;ENSG00000172469:ENST00000369293:exon_96034278_96035257:MANEA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 96034560 C/T 1 23 21 44 10.4556091303194 11.4535742723171 -0.997965141997703 T:C C T 10 0.545408298681766 0.764637470510808 ENSG00000172469:ENST00000358812:exon_96034278_96034859:MANEA;ENSG00000172469:ENST00000369293:exon_96034278_96035257:MANEA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 96034612 G/A 1 15 20 35 6.81887551977351 10.9081659736353 -4.08929045386181 A:G G A 10 0.545408298681766 0.177456662008176 ENSG00000172469:ENST00000358812:exon_96034278_96034859:MANEA;ENSG00000172469:ENST00000369293:exon_96034278_96035257:MANEA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 97613163 T/C 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:C T C 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000146263:ENST00000275053:exon_97613122_97613333:MMS22L;ENSG00000146263:ENST00000369251:exon_97613122_97613333:MMS22L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 99819379 T/C 1 7 10 17 3.18214190922764 5.45408298681766 -2.27194107759002 T:C T C 10 0.545408298681766 0.332347257730029 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369240:exon_99819304_99819463:COQ3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 99930593 C/T 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000123552:ENST00000329966:exon_99930137_99930759:USP45;ENSG00000123552:ENST00000472914:exon_99930390_99930759:USP45 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 31 44 75 14.0923427408653 23.9979651419977 -9.90562240113245 T:C C T 10 0.545408298681766 0.026973609266597 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 107076696 G/A 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 A:G G A 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 107077550 G/A 1 13 10 23 5.90969211713704 5.45408298681766 0.455609130319382 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107077453_107077580:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000467262:exon_107077474_107077580:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107077489_107077580:QRSL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 107088231 C/T 1 7 13 20 3.18214190922764 7.09030788286296 -3.90816597363532 T:C C T 10 0.545408298681766 0.113964264894792 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107088224_107088383:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000467262:exon_107088224_107088383:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107088224_107088383:QRSL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 108233929 G/A 1 5 11 16 2.27295850659117 5.99949128549943 -3.72653277890826 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0783914597682892 ENSG00000025796:ENST00000369002:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000423697:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000429168:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000484803:exon_108233920_108233978:SEC63 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 109762332 C/T 1 17 18 35 7.72805892240998 9.81734937627179 -2.08929045386181 T:C C T 10 0.545408298681766 0.501106521181595 ENSG00000185250:ENST00000440797:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000521072:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000368958:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109761966_109762374:SMPD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 19 36 55 8.63724232504645 19.6346987525436 -10.9974564274971 T:G G T 10 0.545408298681766 0.00403746871322183 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 47 10 57 21.365809961957 5.45408298681766 15.9117269751393 T:G G T 10 0.545408298681766 1.31092937415723e-05 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 48 10 58 21.8204016632752 5.45408298681766 16.3663186764576 T:C C T 10 0.545408298681766 8.34309495592413e-06 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 51 27 78 23.1841767672299 14.7260240644077 8.45815270282225 A:G G A 10 0.545408298681766 0.068192894229116 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 109775436 T/C 1 9 11 20 4.09132531186411 5.99949128549943 -1.90816597363532 T:C T C 10 0.545408298681766 0.501718810318948 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 12 8 20 5.45510041581881 4.36326638945413 1.09183402636468 T:C T C 10 0.545408298681766 0.660903045813617 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 110107517 T/C 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 T:C T C 10 0.545408298681766 0.40572272702491 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110107505_110107652:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110107505_110107652:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000419951:exon_110107209_110107652:FIG4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 111346806 C/T 1 4 13 17 1.81836680527294 7.09030788286296 -5.27194107759002 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0132274194655084 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 111346808 G/A 1 3 13 16 1.3637751039547 7.09030788286296 -5.72653277890826 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00473755130360825 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 111587266 T/C 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000173214:ENST00000368847:exon_111587079_111592370:KIAA1919 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 111588142 G/T 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 T:G G T 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000173214:ENST00000368847:exon_111587079_111592370:KIAA1919 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 111628597 C/G 1 13 15 28 5.90969211713704 8.18112448022649 -2.27143236308945 C:G C G 10 0.545408298681766 0.449579236151987 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000462119:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111628564_111628773:REV3L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 111628626 C/T 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 T:C C T 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000462119:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111628564_111628773:REV3L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 111695073 C/T 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 111695887 G/A 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 A:G G A 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 111696129 T/A 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 A:T T A 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 111696257 G/A 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 A:G G A 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 111901453 G/T 1 14 7 21 6.36428381845528 3.81785809077236 2.54642572768291 T:G G T 10 0.545408298681766 0.283494118559072 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 123 0 123 55.9147792621428 0 55.9147792621428 C C 10 0.545408298681766 4.56729146663292e-33 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 126210395 T/G 1 22 18 40 10.0010174290011 9.81734937627179 0.183668052729361 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000413085:exon_126210118_126211127:NCOA7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 131179302 C/G 1 31 36 67 14.0923427408653 19.6346987525436 -5.54235601167832 C:G C G 10 0.545408298681766 0.179256816026592 ENSG00000079819:ENST00000452150:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000531410:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000528282:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000530481:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000445890:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000337057:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000357633:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000425439:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368127:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000257986:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000530757:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000392427:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368128:exon_131179276_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527411:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000524581:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000525271:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000526782:exon_131179271_131179468:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368126:exon_131179271_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000525193:exon_131179276_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527659:exon_131179276_131179383:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529208:exon_131179276_131179383:EPB41L2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 131190838 G/A 1 24 21 45 10.9102008316376 11.4535742723171 -0.543373440679469 A:G G A 10 0.545408298681766 0.882099628476873 ENSG00000079819:ENST00000337057:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000257986:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368128:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527411:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000524581:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529208:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527423:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000456097:exon_131190799_131191266:EPB41L2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 135287533 A/G 1 21 24 45 9.54642572768291 13.0897991683624 -3.54337344067947 A:G A G 10 0.545408298681766 0.298548392309109 ENSG00000112339:ENST00000367837:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000445176:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367824:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527005:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527578:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000415177:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367826:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000533274:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000526100:exon_135287467_135287611:HBS1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 136554628 G/A 1 43 38 81 19.5474431566841 20.7255153499071 -1.17807219322305 A:G G A 10 0.545408298681766 0.823918571771218 ENSG00000146410:ENST00000451457:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000367784:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000420702:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000275229:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000532282:exon_136554463_136554637:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000532958:exon_136554282_136554637:FAM54A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 213 0 213 96.8280323807838 0 96.8280323807838 T T 10 0.545408298681766 9.67719845525741e-57 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 249 1 250 113.19333362824 0.545408298681766 112.647925329559 A:G A G 10 0.545408298681766 3.39683443758483e-64 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 252 0 252 114.557108732195 0 114.557108732195 A A 10 0.545408298681766 6.62308148140402e-67 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 126 0 126 57.2785543660975 0 57.2785543660975 G G 10 0.545408298681766 7.16894925728004e-34 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 141 0 141 64.097429885871 0 64.097429885871 T T 10 0.545408298681766 9.1558781581556e-38 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 136944063 A/G 1 13 8 21 5.90969211713704 4.36326638945413 1.54642572768291 A:G A G 10 0.545408298681766 0.521510664210594 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136943986_136944119:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136943986_136944119:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136943986_136944119:MAP3K5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 137026266 T/G 1 21 18 39 9.54642572768291 9.81734937627179 -0.270923648588873 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137026248_137026271:MAP3K5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 143074700 T/C 1 11 6 17 5.00050871450057 3.2724497920906 1.72805892240998 T:C T C 10 0.545408298681766 0.471102205741298 ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143072604_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143072605_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143072606_143075068:HIVEP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 36 24 60 16.3653012474564 13.0897991683624 3.27550207909404 A:G G A 10 0.545408298681766 0.437968593155197 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 30 19 49 13.637751039547 10.3627576749536 3.27499336459347 A:G G A 10 0.545408298681766 0.390913447991449 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 151336739 C/G 1 4 11 15 1.81836680527294 5.99949128549943 -4.18112448022649 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0374068965367827 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 153296370 G/A 1 34 34 68 15.45611784482 18.54388215518 -3.08776431036009 A:G G A 10 0.545408298681766 0.467096924640692 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 26 30 56 11.8193842342741 16.362248960453 -4.5428647261789 C:G G C 10 0.545408298681766 0.229981504501609 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 153323594 C/T 1 8 9 17 3.63673361054587 4.90867468813589 -1.27194107759002 T:C C T 10 0.545408298681766 0.628918711033401 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000482526:exon_153323562_153323671:MTRF1L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 159065758 C/G 1 13 18 31 5.90969211713704 9.81734937627179 -3.90765725913475 C:G C G 10 0.545408298681766 0.206191318588596 ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159065714_159065771:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159065714_159065770:DYNLT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 10 6 16 4.54591701318234 3.2724497920906 1.27346722109174 A:G A G 10 0.545408298681766 0.62020159802431 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 18 14 32 8.18265062372821 7.63571618154472 0.546934442183489 A:T T A 10 0.545408298681766 0.861580977164548 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 6 13 19 2.7275502079094 7.09030788286296 -4.36275767495355 A:G A G 10 0.545408298681766 0.062974453261368 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 160174456 T/G 1 13 8 21 5.90969211713704 4.36326638945413 1.54642572768291 T:G T G 10 0.545408298681766 0.521510664210594 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 83 87 170 37.7311112094134 47.4505219853136 -9.71941077590022 A:G A G 10 0.545408298681766 0.143498520937997 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 46 62 108 20.9112182606388 33.8153145182695 -12.9040962576307 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0153499413800180 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 160199687 T/C 1 42 33 75 19.0928514553658 17.9984738564983 1.09437759886755 T:C:G T C 10 0.545408298681766 0.817774338110568 ENSG00000120438:ENST00000321394:exon_160199530_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000392168:exon_160199531_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000420894:exon_160199531_160200293:TCP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 160201295 C/A 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:C C A 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 160453978 A/G 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 A:G A G 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160453974_160454139:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160453974_160454139:IGF2R HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 160468278 A/G 1 7 2 9 3.18214190922764 1.09081659736353 2.09132531186411 A:G A G 10 0.545408298681766 0.19585774268132 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160468191_160468368:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160468191_160468368:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000479434:exon_160468191_160468368:IGF2R HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 160505207 A/G 1 28 17 45 12.7285676369106 9.27194107759002 3.45662655932053 A:G A G 10 0.545408298681766 0.369404427438976 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160504982_160505216:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160504982_160505216:IGF2R HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 27 16 43 12.2739759355923 8.72653277890826 3.54744315668406 T:C C T 10 0.545408298681766 0.288806936840592 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 166571935 C/T 1 13 3 16 5.90969211713704 1.6362248960453 4.27346722109174 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0422731120670685 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166570795_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166571086_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166571086_166572076:T HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 166579270 C/T 1 12 9 21 5.45510041581881 4.90867468813589 0.546425727682915 T:C C T 10 0.545408298681766 0.831119559812142 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166579194_166579328:T HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 128 106 234 58.187737768734 57.8132796602672 0.374458108466762 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 166739646 T/C 1 25 30 55 11.3647925329558 16.362248960453 -4.99745642749713 T:C T C 10 0.545408298681766 0.178895062168508 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000494682:exon_166739361_166739655:SFT2D1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 170058374 C/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C C T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000184465:ENST00000423258:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000443144:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000420344:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000441385:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000467418:exon_170058372_170058454:WDR27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 170176146 G/A 1 12 17 29 5.45510041581881 9.27194107759002 -3.81684066177121 A:G G A 10 0.545408298681766 0.191707546875996 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000492738:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170175974_170176161:C6orf70 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 121 95 216 55.0055958595063 51.8137883747678 3.19180748473855 C:G G C 10 0.545408298681766 0.68228664485868 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 5 9 14 2.27295850659117 4.90867468813589 -2.63571618154472 T:C T C 10 0.545408298681766 0.185085810189955 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 13 8 21 5.90969211713704 4.36326638945413 1.54642572768291 T:C T C 10 0.545408298681766 0.521510664210594 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 550467 G/A 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 A:G G A 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000197461:ENST00000402802:exon_550446_550633:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000344323:exon_550446_550633:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000354513:exon_550446_550633:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000482462:exon_550446_550633:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000400761:exon_550446_550633:PDGFA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 552046 A/G 1 3 9 12 1.3637751039547 4.90867468813589 -3.54489958418119 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0458142407340025 ENSG00000197461:ENST00000402802:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000344323:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000354513:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000482462:exon_551988_553104:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000400761:exon_551988_552092:PDGFA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 618938 A/G 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 A:G A G 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 810219 T/C 1 8 10 18 3.63673361054587 5.45408298681766 -1.81734937627179 T:C T C 10 0.545408298681766 0.479767431495367 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 814788 G/A 1 16 13 29 7.27346722109174 7.09030788286296 0.183159338228786 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 897492 A/G 1 11 7 18 5.00050871450057 3.81785809077236 1.18265062372821 A:G A G 10 0.545408298681766 0.641965040336765 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000475971:exon_897465_897594:SUN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 925717 G/A 1 24 14 38 10.9102008316376 7.63571618154472 3.27448465009289 A:G G A 10 0.545408298681766 0.330119381885145 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_925693_925771:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_925693_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_925693_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_923180_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000441491:exon_925693_925771:GET4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 1131356 T/C 1 15 16 31 6.81887551977351 8.72653277890826 -1.90765725913475 T:C T C 10 0.545408298681766 0.589254202403613 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 1533513 A/G 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 A:G A G 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1533390_1533547:INTS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 1542697 G/A 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 1542814 T/C 1 8 1 9 3.63673361054587 0.545408298681766 3.09132531186411 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0460880501374676 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 1938001 G/A 1 20 20 40 9.09183402636468 10.9081659736353 -1.81633194727064 A:G G A 10 0.545408298681766 0.634736264508819 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1937848_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1937836_1938026:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1937836_1938026:MAD1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 1976432 C/T 1 10 6 16 4.54591701318234 3.2724497920906 1.27346722109174 T:C C T 10 0.545408298681766 0.62020159802431 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 1976457 C/T 1 8 14 22 3.63673361054587 7.63571618154472 -3.99898257099885 T:C C T 10 0.545408298681766 0.091726310756609 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 31 15 46 14.0923427408653 8.18112448022649 5.91121826063876 A:G G A 10 0.545408298681766 0.102469889020417 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 2290522 C/T 1 75 64 139 34.0943775988676 34.906131115633 -0.811753516765471 T:C C T 10 0.545408298681766 0.932184840178034 ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000487426:exon_2290464_2290781:NUDT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 2577691 C/G 1 20 27 47 9.09183402636468 14.7260240644077 -5.634190038043 C:G C G 10 0.545408298681766 0.108077738618487 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 46 42 88 20.9112182606388 22.9071485446342 -1.99593028399541 T:C T C 10 0.545408298681766 0.670267901432435 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 23 15 38 10.4556091303194 8.18112448022649 2.27448465009289 T:C T C 10 0.545408298681766 0.516754282489672 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 2578238 C/T 1 22 15 37 10.0010174290011 8.18112448022649 1.81989294877466 T:C C T 10 0.545408298681766 0.621954129017817 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 2578246 C/T 1 13 19 32 5.90969211713704 10.3627576749536 -4.45306555781651 T:C C T 10 0.545408298681766 0.1544847549312 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 2583328 C/T 1 17 17 34 7.72805892240998 9.27194107759002 -1.54388215518004 T:C C T 10 0.545408298681766 0.609659374880455 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2583224_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2583224_2583596:C7orf27 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 2951824 A/G 1 25 43 68 11.3647925329558 23.4525568433159 -12.0877643103601 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00340397089100011 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2951806_2951930:CARD11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 20 13 33 9.09183402636468 7.09030788286296 2.00152614350172 T:C T C 10 0.545408298681766 0.600713439083214 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 2959172 G/A 1 28 29 57 12.7285676369106 15.8168406617712 -3.08827302486066 A:G G A 10 0.545408298681766 0.427389550926796 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2959006_2959246:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2959006_2959246:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2959114_2959246:CARD11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 2962293 C/G 1 22 23 45 10.0010174290011 12.5443908696806 -2.54337344067947 C:G C G 10 0.545408298681766 0.458063612156695 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2962268_2962394:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2962268_2962674:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2962268_2962394:CARD11 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 4830463 G/A 0 50 0 50 22.7295850659117 0 22.7295850659117 G G 10 0.545408298681766 8.24358371756787e-14 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4830304_4830518:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4830304_4830518:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4830304_4830518:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4830304_4830518:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000469614:exon_4830304_4830518:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000490487:exon_4830441_4830518:KIAA0415 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 5347914 G/A 1 8 12 20 3.63673361054587 6.54489958418119 -2.90816597363532 A:G G A 10 0.545408298681766 0.261293206047355 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 5399044 C/G 1 24 17 41 10.9102008316376 9.27194107759002 1.6382597540476 C:G C G 10 0.545408298681766 0.641208132845721 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5399029_5399200:TNRC18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 5417609 G/A 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 A:G G A 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5417553_5417655:TNRC18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 5427517 G/A 1 12 6 18 5.45510041581881 3.2724497920906 2.18265062372821 A:G G A 10 0.545408298681766 0.350631698949064 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 5427652 G/A 1 8 4 12 3.63673361054587 2.18163319472706 1.45510041581881 A:G G A 10 0.545408298681766 0.564607771258684 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 86 88 174 39.0948863133681 47.9959302839954 -8.90104397062728 A:G A G 10 0.545408298681766 0.195505503367806 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 37 30 67 16.8198929487747 16.362248960453 0.457643988321678 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 5643145 T/C 1 145 144 289 65.9157966911439 78.5387950101743 -12.6229983190304 T:C T C 10 0.545408298681766 0.139986279876599 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000444748:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000447103:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000405801:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5643127_5643248:FSCN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 14 23 37 6.36428381845528 12.5443908696806 -6.18010705122534 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0474509922336889 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 85 67 152 38.6402946120499 36.5423560116783 2.09793860037157 T:C C T 10 0.545408298681766 0.745348261071588 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 6066461 T/C 1 52 35 87 23.6387684685482 19.0892904538618 4.54947801468636 T:C T C 10 0.545408298681766 0.335203347738473 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 8 4 12 3.63673361054587 2.18163319472706 1.45510041581881 T:C T C 10 0.545408298681766 0.564607771258684 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 6193464 T/G 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 A:T:G T G 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193387_6193513:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 12 22 34 5.45510041581881 11.9989825709989 -6.54388215518004 A:G G A 10 0.545408298681766 0.025775682248351 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 6456302 C/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C C T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6456299_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000497308:exon_6456258_6456342:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000454738:exon_6455890_6456385:DAGLB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 6647738 T/C 1 10 4 14 4.54591701318234 2.18163319472706 2.36428381845528 T:C T C 10 0.545408298681766 0.284657873718901 ENSG00000146576:ENST00000344417:exon_6647591_6648357:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000359073:exon_6647591_6648355:C7orf26 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 8008970 C/G 1 1 8 9 0.454591701318234 4.36326638945413 -3.90867468813589 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0140520751288088 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8008423_8009438:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8008425_8009438:GLCCI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 12727826 G/C 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 T:C:G G C 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000439721:exon_12727791_12728031:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000399303:exon_12727722_12728432:ARL4A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 17379110 G/A 1 12 4 16 5.45510041581881 2.18163319472706 3.27346722109174 A:G G A 10 0.545408298681766 0.132245501357764 ENSG00000106546:ENST00000242057:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000463496:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000401808:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000492120:exon_17378610_17379151:AHR HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 19744417 T/C 1 17 10 27 7.72805892240998 5.45408298681766 2.27397593559232 T:C T C 10 0.545408298681766 0.442451269997159 ENSG00000105849:ENST00000222567:exon_19744402_19744543:TWISTNB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 21940823 A/G 1 41 27 68 18.6382597540476 14.7260240644077 3.91223568963991 A:G A G 10 0.545408298681766 0.394352615009623 ENSG00000105877:ENST00000409508:exon_21940625_21941186:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000328843:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000424253:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21940518_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000488845:exon_21940519_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21940519_21941970:CDCA7L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 23164701 C/T 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000122550:ENST00000521082:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322231:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000339077:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322275:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000459661:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000491352:exon_23164667_23164821:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000409689:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000410047:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000479700:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000477076:exon_23164599_23164791:KLHL7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 23235483 A/G 1 20 9 29 9.09183402636468 4.90867468813589 4.18315933822879 A:G A G 10 0.545408298681766 0.137337488735895 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000487595:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000486136:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23234022_23235534:NUPL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 23239133 C/T 1 37 19 56 16.8198929487747 10.3627576749536 6.4571352738211 T:C C T 10 0.545408298681766 0.106521233718880 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000489145:exon_23239043_23239161:NUPL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 24742436 T/C 1 80 38 118 36.3673361054587 20.7255153499071 15.6418207555516 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00401652854543317 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 24758753 C/T 1 24 13 37 10.9102008316376 7.09030788286296 3.81989294877466 T:C C T 10 0.545408298681766 0.248583514795441 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 24758818 G/T 1 41 16 57 18.6382597540476 8.72653277890826 9.91172697513934 T:G G T 10 0.545408298681766 0.0108367804574408 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 32909182 G/A 1 14 14 28 6.36428381845528 7.63571618154472 -1.27143236308945 A:G G A 10 0.545408298681766 0.70569768807638 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 33060946 A/G 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:G A G 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000122643:ENST00000456458:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000381626:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000396152:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000242210:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000405342:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409467:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409787:exon_33060884_33060969:NT5C3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 36445856 G/A 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 A:G G A 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36445790_36446175:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36445790_36446175:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000424865:exon_36445790_36445875:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000460598:exon_36445790_36446175:ANLN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 13 9 22 5.90969211713704 4.90867468813589 1.00101742900115 T:C C T 10 0.545408298681766 0.83113387846694 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 191 138 329 86.8270149517827 75.2663452180837 11.560669733699 A:G G A 10 0.545408298681766 0.203425150913619 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 44147485 C/A 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 A:C C A 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000106624:ENST00000223357:exon_44147408_44147530:AEBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 44507668 T/C 0 7197 0 7197 3271.69647438733 0 3271.69647438733 T T 10 0.545408298681766 4.94065645841247e-324 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 44606098 C/T 1 55 36 91 25.0025435725029 19.6346987525436 5.36784481995929 T:C C T 10 0.545408298681766 0.292726607276562 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000479602:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000448192:exon_44605737_44606123:DDX56 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 44612229 G/A 1 66 44 110 30.0030522870034 23.9979651419977 6.00508714500574 A:G G A 10 0.545408298681766 0.292222074374555 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44612162_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44612173_44612343:DDX56 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 44620836 C/A 1 32 29 61 14.5469344421835 15.8168406617712 -1.26990621958772 A:C C A 10 0.545408298681766 0.797546513662278 ENSG00000158604:ENST00000457408:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000419520:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000481238:exon_44619496_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000477639:exon_44619503_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000444131:exon_44620692_44620838:TMED4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 44800176 G/T 1 26 28 54 11.8193842342741 15.2714323630894 -3.45204812881536 T:G G T 10 0.545408298681766 0.412513350579577 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 24 16 40 10.9102008316376 8.72653277890826 2.18366805272936 A:G G A 10 0.545408298681766 0.528502949406548 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 45004063 T/C 1 74 75 149 33.6397858975493 40.9056224011324 -7.26583650358313 T:C T C 10 0.545408298681766 0.249634625300823 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45004014_45004118:MYO1G HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 45009341 A/G 1 138 117 255 62.7336547819163 63.8127709457666 -1.07911616385033 A:G A G 10 0.545408298681766 0.900060120326272 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 139 104 243 63.1882464832345 56.7224630629037 6.46578342033087 A:G G A 10 0.545408298681766 0.439602836242304 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 45104131 G/A 1 18 17 35 8.18265062372821 9.27194107759002 -1.08929045386181 A:G G A 10 0.545408298681766 0.736735697725999 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000478582:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000482714:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000492883:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000472223:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000476594:exon_45104062_45104221:CCM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 45113170 G/A 1 47 51 98 21.365809961957 27.8158232327701 -6.45001327081307 A:G G A 10 0.545408298681766 0.223327982261156 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 45115581 G/A 1 119 98 217 54.0964124568698 53.4500132708131 0.646399186056783 A:G G A 10 0.545408298681766 0.945753552234515 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45115376_45115951:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45115376_45116066:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45115376_45116013:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45115376_45116050:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45115376_45116068:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45115376_45116030:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45115376_45116052:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45115376_45116036:CCM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 45139892 G/A 1 45 45 90 20.4566265593205 24.5433734406795 -4.08674688135894 A:G G A 10 0.545408298681766 0.398743278196452 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 45139919 A/C 1 44 49 93 20.0020348580023 26.7250066354065 -6.72297177740424 A:C A C 10 0.545408298681766 0.17614788143578 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 45148667 G/A 1 92 75 167 41.8224365212775 40.9056224011324 0.916814120145084 A:G G A 10 0.545408298681766 0.938106173530174 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148426_45148682:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 45148773 C/A 1 49 29 78 22.2749933645935 15.8168406617712 6.45815270282225 A:C C A 10 0.545408298681766 0.172079058885450 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 48004962 C/T 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 50467767 C/A 1 10 5 15 4.54591701318234 2.72704149340883 1.81887551977351 A:C C A 10 0.545408298681766 0.440723047905603 ENSG00000185811:ENST00000331340:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000359197:exon_50467616_50470223:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000343574:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000346667:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000349824:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000357364:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000438033:exon_50467616_50468574:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000439701:exon_50467616_50470264:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000471793:exon_50467616_50468325:IKZF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 A:G A G 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 24 33 57 10.9102008316376 17.9984738564983 -7.08827302486066 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0632659760185674 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 56125757 A/G 1 155 157 312 70.4617137043263 85.6291028930373 -15.167389188711 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0881673729742393 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56125686_56125796:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56125686_56125796:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56125686_56125796:CCT6A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 64168806 T/C 1 14 10 24 6.36428381845528 5.45408298681766 0.910200831637616 T:C T C 10 0.545408298681766 0.83838234018214 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 64291976 G/A 1 11 16 27 5.00050871450057 8.72653277890826 -3.72602406440768 A:G G A 10 0.545408298681766 0.177124759497704 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 64439613 T/G 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:G T G 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000152926:ENST00000398695:exon_64439109_64439914:ZNF117;ENSG00000152926:ENST00000282869:exon_64438360_64439914:ZNF117 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 64439701 C/T 1 8 7 15 3.63673361054587 3.81785809077236 -0.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000152926:ENST00000398695:exon_64439109_64439914:ZNF117;ENSG00000152926:ENST00000282869:exon_64438360_64439914:ZNF117 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 64451558 G/A 1 3 7 10 1.3637751039547 3.81785809077236 -2.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 0.201980178309513 ENSG00000213462:ENST00000394323:exon_64451187_64453792:ERV3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 64452830 C/T 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:C C T 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000213462:ENST00000394323:exon_64451187_64453792:ERV3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 64863392 C/T 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 T:C C T 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 7 14 21 3.18214190922764 7.63571618154472 -4.45357427231709 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0770912319259954 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 15 32 47 6.81887551977351 17.4530655578165 -10.634190038043 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00196790834631415 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 65425894 A/G 1 86 89 175 39.0948863133681 48.5413385826772 -9.44645226930905 A:G A G 10 0.545408298681766 0.171660495144390 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65425671_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65425688_65426050:GUSB HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 65557935 G/A 1 29 18 47 13.1831593382288 9.81734937627179 3.365809961957 A:G G A 10 0.545408298681766 0.380261216067705 ENSG00000126522:ENST00000304874:exon_65557755_65558545:ASL;ENSG00000126522:ENST00000380839:exon_65557755_65558131:ASL;ENSG00000126522:ENST00000488343:exon_65557891_65557941:ASL;ENSG00000126522:ENST00000464970:exon_65557755_65557941:ASL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 13 5 18 5.90969211713704 2.72704149340883 3.18265062372821 T:C T C 10 0.545408298681766 0.158835868694104 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 65842558 G/A 1 11 5 16 5.00050871450057 2.72704149340883 2.27346722109174 A:G G A 10 0.545408298681766 0.319419221699540 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 33 13 46 15.0015261435017 7.09030788286296 7.91121826063876 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0252794498709717 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 72300332 G/A 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:G G A 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 27 36 63 12.2739759355923 19.6346987525436 -7.36072281695126 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0758674064595838 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 33 41 74 15.0015261435017 22.3617402459524 -7.36021410245068 T:C C T 10 0.545408298681766 0.101717674531951 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 73097238 G/A 1 27 24 51 12.2739759355923 13.0897991683624 -0.815823232770065 A:G G A 10 0.545408298681766 0.88843880926409 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 73097720 G/C 1 15 19 34 6.81887551977351 10.3627576749536 -3.54388215518004 C:G G C 10 0.545408298681766 0.232628088714879 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 75051311 T/C 1 27 10 37 12.2739759355923 5.45408298681766 6.81989294877466 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0306539407892437 ENSG00000135213:ENST00000257665:exon_75050792_75052486:POM121C;ENSG00000135213:ENST00000453279:exon_75050792_75052486:POM121C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 17 5 22 7.72805892240998 2.72704149340883 5.00101742900115 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0335108329057887 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 75633160 C/T 1 25 17 42 11.3647925329558 9.27194107759002 2.09285145536583 T:C C T 10 0.545408298681766 0.539761521353372 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000430497:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000454618:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000492053:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75633057_75633173:STYXL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 22 14 36 10.0010174290011 7.63571618154472 2.36530124745642 T:C T C 10 0.545408298681766 0.504485277520847 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 75677504 C/T 1 122 154 276 55.4601875608246 83.992877996992 -28.5326904361674 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00068501967327094 ENSG00000146701:ENST00000461263:exon_75677369_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000315758:exon_75677385_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000443006:exon_75677403_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000461665:exon_75677454_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000490105:exon_75677479_75677840:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000432020:exon_75677479_75677544:MDH2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 76608143 C/T 1 7 2 9 3.18214190922764 1.09081659736353 2.09132531186411 T:C C T 10 0.545408298681766 0.19585774268132 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 76984572 G/A 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000186088:ENST00000449779:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000257626:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000455630:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000334003:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000434084:exon_76984530_76984601:PION HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 34 37 71 15.45611784482 20.1801070512253 -4.72398920640538 A:G G A 10 0.545408298681766 0.284218645891353 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 87537177 A/G 1 65 61 126 29.5484605856852 33.2699062195877 -3.72144563390252 A:C:G A G 10 0.545408298681766 0.531717601862179 ENSG00000006634:ENST00000413643:exon_87536503_87537691:DBF4;ENSG00000006634:ENST00000265728:exon_87536503_87538856:DBF4;ENSG00000006634:ENST00000431138:exon_87536503_87537688:DBF4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 87835811 T/C 1 91 64 155 41.3678448199593 34.906131115633 6.46171370432627 T:C T C 10 0.545408298681766 0.333152118400667 ENSG00000075142:ENST00000265729:exon_87834433_87835819:SRI;ENSG00000075142:ENST00000419179:exon_87834973_87835819:SRI;ENSG00000075142:ENST00000472930:exon_87835601_87835819:SRI;ENSG00000075142:ENST00000490437:exon_87835753_87835819:SRI;ENSG00000075142:ENST00000394641:exon_87835771_87835819:SRI HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 20 16 36 9.09183402636468 8.72653277890826 0.365301247456424 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 15 9 24 6.81887551977351 4.90867468813589 1.91020083163762 T:C T C 10 0.545408298681766 0.540096346477239 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 92027537 C/G 1 17 10 27 7.72805892240998 5.45408298681766 2.27397593559232 C:G C G 10 0.545408298681766 0.442451269997159 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 30 37 67 13.637751039547 20.1801070512253 -6.54235601167832 A:C C A 10 0.545408298681766 0.112242328321955 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 92734451 A/G 1 16 14 30 7.27346722109174 7.63571618154472 -0.362248960452979 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 57 51 108 25.9117269751393 27.8158232327701 -1.90409625763073 A:G G A 10 0.545408298681766 0.77207759525074 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 92762681 A/G 1 42 43 85 19.0928514553658 23.4525568433159 -4.35970538795011 A:G A G 10 0.545408298681766 0.383806979746297 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 29 28 57 13.1831593382288 15.2714323630894 -2.08827302486066 T:C C T 10 0.545408298681766 0.596864260205659 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 92985252 T/C 1 2 9 11 0.909183402636468 4.90867468813589 -3.99949128549943 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0289147202703354 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92985203_92985390:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000443443:exon_92985203_92985498:CCDC132 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 95800820 T/C 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C T C 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000004864:ENST00000265631:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000416240:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000490072:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000484495:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000492869:exon_95800784_95800836:SLC25A13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 97823629 A/G 1 9 3 12 4.09132531186411 1.6362248960453 2.45510041581881 A:G A G 10 0.545408298681766 0.245731957393402 ENSG00000164715:ENST00000297293:exon_97820926_97823884:LMTK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 12 18 30 5.45510041581881 9.81734937627179 -4.36224896045298 T:C C T 10 0.545408298681766 0.141575029470383 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 99500899 T/C 1 11 13 24 5.00050871450057 7.09030788286296 -2.08979916836238 T:C T C 10 0.545408298681766 0.418235923516124 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 99500911 A/G 1 11 13 24 5.00050871450057 7.09030788286296 -2.08979916836238 A:G A G 10 0.545408298681766 0.418235923516124 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 99654600 A/G 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 99654689 G/A 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 A:G G A 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99654630_99654872:ZSCAN21 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 141 118 259 64.097429885871 64.3581792444484 -0.260749358577399 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 99696797 T/C 1 134 137 271 60.9152879766434 74.7209369194019 -13.8056489427586 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0994782116864686 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000477372:exon_99696646_99696968:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000463722:exon_99696646_99697376:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000425308:exon_99696646_99696826:MCM7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 94 80 174 42.731619923914 43.6326638945413 -0.901043970627285 A:G G A 10 0.545408298681766 0.939350255994524 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 99926612 C/T 1 22 16 38 10.0010174290011 8.72653277890826 1.27448465009289 T:C C T 10 0.545408298681766 0.746004537752306 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 100175473 T/C 1 22 35 57 10.0010174290011 19.0892904538618 -9.08827302486066 T:C T C 10 0.545408298681766 0.016689736815489 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100175445_100178496:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000498539:exon_100175445_100175507:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000487697:exon_100175469_100176134:LRCH4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 100285476 C/T 1 12 7 19 5.45510041581881 3.81785809077236 1.63724232504645 T:C C T 10 0.545408298681766 0.497799653196701 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100285411_100285506:GIGYF1;ENSG00000146830:ENST00000471340:exon_100285411_100285506:GIGYF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 100458795 T/C 1 12 5 17 5.45510041581881 2.72704149340883 2.72805892240998 T:C T C 10 0.545408298681766 0.227116627671435 ENSG00000146828:ENST00000448342:exon_100458634_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000418037:exon_100458760_100458802:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000416675:exon_100458760_100458852:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100457772_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100456358_100459206:SLC12A9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 100466441 G/A 1 55 41 96 25.0025435725029 22.3617402459524 2.64080332655046 A:G G A 10 0.545408298681766 0.609776351938942 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000437505:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100465918_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100466433_100466488:TRIP6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 39 30 69 17.7290763514111 16.362248960453 1.36682739095815 A:G A G 10 0.545408298681766 0.809339831953809 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 100468398 T/C 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 100482026 T/C 1 78 56 134 35.4581527028223 30.5428647261789 4.91528797664336 T:C T C 10 0.545408298681766 0.435179675198084 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 100482526 C/G 1 2 6 8 0.909183402636468 3.2724497920906 -2.36326638945413 C:G C G 10 0.545408298681766 0.152877514803084 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 100486035 C/A 1 21 28 49 9.54642572768291 15.2714323630894 -5.72500663540653 A:C C A 10 0.545408298681766 0.114700126160969 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 100486088 C/T 1 28 14 42 12.7285676369106 7.63571618154472 5.09285145536583 T:C C T 10 0.545408298681766 0.123340520754616 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 100486656 T/G 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000176125:ENST00000388761:exon_100486346_100487339:UFSP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 100731505 C/G 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 C:G C G 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 100731829 T/C 1 19 20 39 8.63724232504645 10.9081659736353 -2.27092364858887 T:C T C 10 0.545408298681766 0.521400139870112 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 101917521 G/A 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101917445_101917581:CUX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 102107848 C/T 1 13 6 19 5.90969211713704 3.2724497920906 2.63724232504645 T:C C T 10 0.545408298681766 0.25633390279836 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102107786_102107926:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102107786_102107926:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102107786_102107926:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102107786_102107926:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485417:exon_102107789_102107926:LRWD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 102953539 G/C 1 79 106 185 35.9127444041405 57.8132796602672 -21.9005352561267 C:G G C 10 0.545408298681766 0.00144068868937967 ENSG00000105819:ENST00000249269:exon_102952654_102953682:PMPCB;ENSG00000105821:ENST00000249270:exon_102953394_102953548:DNAJC2;ENSG00000105821:ENST00000379263:exon_102953394_102953548:DNAJC2;ENSG00000105821:ENST00000475065:exon_102953394_102953548:DNAJC2;ENSG00000105821:ENST00000492497:exon_102952969_102953548:DNAJC2;ENSG00000105821:ENST00000464253:exon_102953394_102953548:DNAJC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 106513011 C/T 1 4 10 14 1.81836680527294 5.45408298681766 -3.63571618154472 T:C C T 10 0.545408298681766 0.061538052903825 ENSG00000105851:ENST00000440650:exon_106512982_106513047:PIK3CG;ENSG00000105851:ENST00000496166:exon_106512982_106513047:PIK3CG;ENSG00000105851:ENST00000473541:exon_106512982_106513047:PIK3CG;ENSG00000105851:ENST00000359195:exon_106512982_106513047:PIK3CG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 107559722 A/T 1 113 110 223 51.3688622489604 59.9949128549943 -8.62605060603382 A:T:G A T 10 0.545408298681766 0.253444823135428 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107559639_107560360:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107559639_107560038:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107559639_107559828:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107559639_107560158:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107559639_107560100:DLD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 41 33 74 18.6382597540476 17.9984738564983 0.639785897549316 C:G G C 10 0.545408298681766 0.90758519141572 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 116528240 C/T 1 30 14 44 13.637751039547 7.63571618154472 6.0020348580023 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0711839021143764 ENSG00000198898:ENST00000464223:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000484325:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000449080:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000490693:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000461878:exon_116528181_116528753:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000417431:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000464669:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116528181_116528244:CAPZA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 116557939 C/T 1 86 67 153 39.0948863133681 36.5423560116783 2.5525303016898 T:C C T 10 0.545408298681766 0.68588575498128 ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116557781_116559315:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116557781_116558242:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116557781_116559312:CAPZA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 120428799 C/A 1 3 9 12 1.3637751039547 4.90867468813589 -3.54489958418119 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0458142407340025 ENSG00000106025:ENST00000222747:exon_120427376_120428951:TSPAN12;ENSG00000106025:ENST00000450414:exon_120428376_120428951:TSPAN12;ENSG00000106025:ENST00000415871:exon_120428428_120428951:TSPAN12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 128108916 T/C 1 2 8 10 0.909183402636468 4.36326638945413 -3.45408298681766 T:C T C 10 0.545408298681766 0.051055470816189 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 128409225 A/G 1 21 16 37 9.54642572768291 8.72653277890826 0.819892948774658 A:G A G 10 0.545408298681766 0.869519945016435 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128409117_128411528:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128409117_128409990:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000493278:exon_128409117_128409250:CALU HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 13 16 29 5.90969211713704 8.72653277890826 -2.81684066177121 T:C T C 10 0.545408298681766 0.352105502963958 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 129813738 T/C 1 7 11 18 3.18214190922764 5.99949128549943 -2.81734937627179 T:C T C 10 0.545408298681766 0.237114548756310 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129813665_129813779:TMEM209 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 130144943 G/C 1 5 12 17 2.27295850659117 6.54489958418119 -4.27194107759002 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0496545389818462 ENSG00000106484:ENST00000341441:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000416162:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000378576:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000393187:exon_130144780_130146127:MEST;ENSG00000106484:ENST00000223215:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000437945:exon_130144780_130145194:MEST;ENSG00000106484:ENST00000463263:exon_130144780_130145139:MEST HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 131347009 T/C 1 632 1 633 287.301955233124 0.545408298681766 286.756546934442 T:C:G T C 10 0.545408298681766 1.56514244204262e-164 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 132719349 G/A 1 6004 3 6007 2729.36857471468 1.6362248960453 2727.73234981863 A:C:G G A 10 0.545408298681766 0 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 133749164 G/A 1 22 24 46 10.0010174290011 13.0897991683624 -3.08878173936123 A:G G A 10 0.545408298681766 0.377497591498940 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 0 9 0 9 4.09132531186411 0 4.09132531186411 C C 10 0.545408298681766 0.00509974111202672 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 133979578 A/G 0 9 0 9 4.09132531186411 0 4.09132531186411 A A 10 0.545408298681766 0.00509974111202672 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 A:G G A 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 12 6 18 5.45510041581881 3.2724497920906 2.18265062372821 A:G G A 10 0.545408298681766 0.350631698949064 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 138761034 G/C 1 10 17 27 4.54591701318234 9.27194107759002 -4.72602406440768 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0817558899817688 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000460845:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 138764233 C/T 1 18 6 24 8.18265062372821 3.2724497920906 4.91020083163762 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0629016077293885 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 139415775 G/C 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 C:G G C 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 139415943 G/A 1 11 6 17 5.00050871450057 3.2724497920906 1.72805892240998 A:G G A 10 0.545408298681766 0.471102205741298 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 44 19 63 20.0020348580023 10.3627576749536 9.63927718304874 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0158844949582180 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 18 9 27 8.18265062372821 4.90867468813589 3.27397593559232 T:C C T 10 0.545408298681766 0.247994952889908 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 10 6 16 4.54591701318234 3.2724497920906 1.27346722109174 A:G G A 10 0.545408298681766 0.62020159802431 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 142495126 G/A 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 0.52782144426649 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 142495127 G/T 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 T:G G T 10 0.545408298681766 0.52782144426649 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 1 73 56 129 33.1851941962311 30.5428647261789 2.64232947005219 A:G G A 10 0.545408298681766 0.65940948892567 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 162 1 163 73.6438556135539 0.545408298681766 73.0984473148721 A:T T A 10 0.545408298681766 3.17324501619359e-41 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 142991361 G/C 1 5 9 14 2.27295850659117 4.90867468813589 -2.63571618154472 C:G G C 10 0.545408298681766 0.185085810189955 ENSG00000106144:ENST00000310447:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000392923:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000493642:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000481483:exon_142991323_142991574:CASP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 143085638 C/G 1 67 56 123 30.4576439883217 30.5428647261789 -0.0852207378572167 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143085582_143085751:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143085582_143085751:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143085582_143085751:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143085582_143085751:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143085582_143085751:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000446634:exon_143085582_143085751:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000497119:exon_143085582_143085690:ZYX HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 148506396 A/C 1 4 12 16 1.81836680527294 6.54489958418119 -4.72653277890826 A:C A C 10 0.545408298681766 0.0223922515293241 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 149129893 C/G 1 11 7 18 5.00050871450057 3.81785809077236 1.18265062372821 C:G C G 10 0.545408298681766 0.641965040336765 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149128454_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149129360_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149128867_149130026:ZNF777 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150093701 A/C 1 14 14 28 6.36428381845528 7.63571618154472 -1.27143236308945 A:C A C 10 0.545408298681766 0.70569768807638 ENSG00000196456:ENST00000478789:exon_150093601_150094003:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000490973:exon_150093601_150094067:ZNF775 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150094851 A/G 1 10 8 18 4.54591701318234 4.36326638945413 0.182650623728212 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150217089 G/A 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150217309 C/T 1 17 11 28 7.72805892240998 5.99949128549943 1.72856763691055 T:C C T 10 0.545408298681766 0.572612553515050 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150324976 T/C 1 23 28 51 10.4556091303194 15.2714323630894 -4.81582323277006 T:C T C 10 0.545408298681766 0.205708974037705 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150325175 C/T 1 26 17 43 11.8193842342741 9.27194107759002 2.54744315668406 T:C C T 10 0.545408298681766 0.449297848654812 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150325177 C/T 1 18 26 44 8.18265062372821 14.1806157657259 -5.9979651419977 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0947229957564516 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 39 35 74 17.7290763514111 19.0892904538618 -1.36021410245068 C:G G C 10 0.545408298681766 0.815638338952293 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150418045 G/A 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 A:G G A 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 21 18 39 9.54642572768291 9.81734937627179 -0.270923648588873 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 15 21 36 6.81887551977351 11.4535742723171 -4.63469875254358 T:C C T 10 0.545408298681766 0.133568745000621 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150730712 G/A 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 A:G G A 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000197150:ENST00000461373:exon_150730692_150730929:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000488826:exon_150730692_150730837:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000489192:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150730692_150730773:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000488370:exon_150730692_150730785:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000493338:exon_150730692_150731004:ABCB8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150730999 G/A 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 A:G G A 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000489192:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150730825_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000493338:exon_150730692_150731004:ABCB8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150733025 T/A 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 A:T T A 10 0.545408298681766 0.40572272702491 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150732668_150733257:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000491920:exon_150732969_150733054:ABCB8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150739054 G/A 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150739048_150739195:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150739048_150739195:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150739048_150739117:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150739048_150739195:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150739048_150739195:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150739048_150739195:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150739048_150739195:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150739048_150739195:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482899:exon_150739048_150739195:ABCB8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150742388 A/C 1 8 15 23 3.63673361054587 8.18112448022649 -4.54439086968062 A:T:C A C 10 0.545408298681766 0.0619742792817211 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150742296_150744869:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150742296_150742496:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150742296_150742650:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482899:exon_150742296_150742649:ABCB8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150761314 G/A 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 A:G G A 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000488420:exon_150761289_150761448:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761289_150761454:SLC4A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150763655 T/A 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 A:T T A 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150763604_150763848:SLC4A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 6 16 22 2.7275502079094 8.72653277890826 -5.99898257099885 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0164148546667643 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150768849 C/T 1 20 18 38 9.09183402636468 9.81734937627179 -0.725515349907107 T:C C T 10 0.545408298681766 0.87122541036102 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482697:exon_150768816_150768924:SLC4A2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150815630 C/T 1 2 8 10 0.909183402636468 4.36326638945413 -3.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 0.051055470816189 ENSG00000133612:ENST00000463381:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000335355:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000428334:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000397232:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000473312:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000479901:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000397238:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000335367:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000467724:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000468796:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000480106:exon_150815561_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000498559:exon_150815381_150815719:AGAP3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 51 40 91 23.1841767672299 21.8163319472706 1.36784481995929 A:T:G G A 10 0.545408298681766 0.833510969061812 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 38 33 71 17.2744846500929 17.9984738564983 -0.723989206405388 C:G C G 10 0.545408298681766 0.905388791049062 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 50 42 92 22.7295850659117 22.9071485446342 -0.177563478722472 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 156742749 G/A 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 156742796 A/C 1 8 4 12 3.63673361054587 2.18163319472706 1.45510041581881 A:C A C 10 0.545408298681766 0.564607771258684 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 156742965 G/C 1 7 7 14 3.18214190922764 3.81785809077236 -0.635716181544724 C:G G C 10 0.545408298681766 0.792480799523164 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 11 3 14 5.00050871450057 1.6362248960453 3.36428381845528 A:G G A 10 0.545408298681766 0.104979576849638 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 14 9 23 6.36428381845528 4.90867468813589 1.45560913031938 C:G G C 10 0.545408298681766 0.676543181314199 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 14 11 25 6.36428381845528 5.99949128549943 0.364792532955851 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 1514009 C/A 0 9 0 9 4.09132531186411 0 4.09132531186411 C C 10 0.545408298681766 0.00509974111202672 ENSG00000198010:ENST00000421627:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000356067:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000357934:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000520901:exon_1513849_1514060:DLGAP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 6302601 C/T 1 18 20 38 8.18265062372821 10.9081659736353 -2.72551534990711 T:C C T 10 0.545408298681766 0.417110767640708 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 6303025 G/A 1 35 38 73 15.9107095461382 20.7255153499071 -4.81480580376892 A:G G A 10 0.545408298681766 0.290420563361407 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 6478986 C/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C C T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 6479042 C/T 1 7 1 8 3.18214190922764 0.545408298681766 2.63673361054587 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0793702040361015 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 11 5 16 5.00050871450057 2.72704149340883 2.27346722109174 T:C C T 10 0.545408298681766 0.319419221699540 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 8175868 C/T 1 18 11 29 8.18265062372821 5.99949128549943 2.18315933822879 T:C C T 10 0.545408298681766 0.46021652389844 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 8176051 G/A 1 11 12 23 5.00050871450057 6.54489958418119 -1.54439086968062 A:G G A 10 0.545408298681766 0.536899606886051 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 8176540 C/T 1 13 11 24 5.90969211713704 5.99949128549943 -0.0897991683623838 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 8234077 G/C 1 15 5 20 6.81887551977351 2.72704149340883 4.09183402636468 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0745597941389375 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 8234113 G/A 1 7 22 29 3.18214190922764 11.9989825709989 -8.81684066177121 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00118772408058011 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 8234192 G/C 0 13 0 13 5.90969211713704 0 5.90969211713704 G G 10 0.545408298681766 0.000413311221647668 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 8234218 C/T 0 12 0 12 5.45510041581881 0 5.45510041581881 C C 10 0.545408298681766 0.000770770342157052 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 8234219 G/A 0 12 0 12 5.45510041581881 0 5.45510041581881 G G 10 0.545408298681766 0.000770770342157052 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 8234714 C/T 1 21 12 33 9.54642572768291 6.54489958418119 3.00152614350172 T:C C T 10 0.545408298681766 0.382440419770291 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 8869199 T/G 1 3 10 13 1.3637751039547 5.45408298681766 -4.09030788286296 T:G T G 10 0.545408298681766 0.0265238704491956 ENSG00000104626:ENST00000523898:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000250263:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000519292:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000520684:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000520332:exon_8869173_8869262:ERI1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 10285810 T/C 1 9 1 10 4.09132531186411 0.545408298681766 3.54591701318234 T:C T C 10 0.545408298681766 0.026642084489569 ENSG00000175806:ENST00000317173:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000527408:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000441698:exon_10285658_10285875:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000528246:exon_10285658_10286395:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000425987:exon_10285658_10286399:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000382490:exon_10285658_10286399:MSRA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 10623138 T/A 1 44 43 87 20.0020348580023 23.4525568433159 -3.45052198531364 A:T T A 10 0.545408298681766 0.518547349481875 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:C T C 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 15 7 22 6.81887551977351 3.81785809077236 3.00101742900115 T:C C T 10 0.545408298681766 0.284228668887522 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 17796382 A/G 1 22 17 39 10.0010174290011 9.27194107759002 0.729076351411127 A:G A G 10 0.545408298681766 0.873163637120494 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 17796383 C/T 1 22 16 38 10.0010174290011 8.72653277890826 1.27448465009289 T:C C T 10 0.545408298681766 0.746004537752306 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 17814915 A/G 1 24 25 49 10.9102008316376 13.6352074670442 -2.72500663540653 A:G A G 10 0.545408298681766 0.474591758339355 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17814773_17814930:PCM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 17819572 C/T 1 52 45 97 23.6387684685482 24.5433734406795 -0.904604972131303 T:C C T 10 0.545408298681766 0.918863320557976 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 17915126 C/T 1 36 31 67 16.3653012474564 16.9076572591347 -0.542356011678319 T:C C T 10 0.545408298681766 0.902970993267651 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17913925_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17913934_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17913935_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17913961_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17914707_17915132:ASAH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 21837672 T/C 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 T:C T C 10 0.545408298681766 0.40572272702491 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21837595_21837714:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21837595_21837714:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21837595_21837714:XPO7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 21846586 G/C 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000518808:exon_21845859_21846594:XPO7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 30 37 67 13.637751039547 20.1801070512253 -6.54235601167832 A:G A G 10 0.545408298681766 0.112242328321955 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 22107986 A/G 1 29 25 54 13.1831593382288 13.6352074670442 -0.452048128815363 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22107909_22108680:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22107909_22109485:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000518039:exon_22107909_22108409:POLR3D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 22262418 A/G 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 A:G A G 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520644:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000524285:exon_22262209_22262490:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000519960:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000522881:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517552:exon_22262030_22262493:SLC39A14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 22273687 T/C 1 14 12 26 6.36428381845528 6.54489958418119 -0.180615765725915 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517370:exon_22273586_22273782:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000518348:exon_22273586_22273793:SLC39A14 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 22548790 G/T 1 5 8 13 2.27295850659117 4.36326638945413 -2.09030788286296 T:G G T 10 0.545408298681766 0.275319682750414 ENSG00000179388:ENST00000317216:exon_22545172_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000522910:exon_22547556_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000519492:exon_22547937_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000524088:exon_22547985_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000518773:exon_22548678_22548995:EGR3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 23290451 C/T 1 16 6 22 7.27346722109174 3.2724497920906 4.00101742900115 T:C C T 10 0.545408298681766 0.132099344893526 ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23286665_23290667:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522255:exon_23290159_23290667:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23290439_23290667:ENTPD4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 23292985 A/G 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 A:G A G 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000197217:ENST00000518471:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000521321:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522913:exon_23292905_23292990:ENTPD4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 23294761 T/C 1 15 7 22 6.81887551977351 3.81785809077236 3.00101742900115 T:C T C 10 0.545408298681766 0.284228668887522 ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000520936:exon_23294547_23294771:ENTPD4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 23423669 A/G 1 10 2 12 4.54591701318234 1.09081659736353 3.45510041581881 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0775833003018699 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 23423758 G/A 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 23429329 T/C 1 14 14 28 6.36428381845528 7.63571618154472 -1.27143236308945 T:C T C 10 0.545408298681766 0.70569768807638 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 25287397 T/C 1 14 15 29 6.36428381845528 8.18112448022649 -1.81684066177121 T:C T C 10 0.545408298681766 0.57718202619655 ENSG00000104756:ENST00000221200:exon_25285366_25287489:KCTD9;ENSG00000104756:ENST00000519665:exon_25286778_25287489:KCTD9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 25364331 G/A 1 60 30 90 27.275502079094 16.362248960453 10.9132531186411 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0256810856529248 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 25364834 A/T 1 34 48 82 15.45611784482 26.1795983367248 -10.7234804919048 A:T A T 10 0.545408298681766 0.0196080957508930 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 25364960 A/G 1 29 42 71 13.1831593382288 22.9071485446342 -9.72398920640538 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0232470299432213 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 23 15 38 10.4556091303194 8.18112448022649 2.27448465009289 A:G G A 10 0.545408298681766 0.516754282489672 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 86 92 178 39.0948863133681 50.1775634787225 -11.0826771653543 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0981291682129142 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 27311703 T/C 1 59 56 115 26.8209103777758 30.5428647261789 -3.72195434840309 T:C T C 10 0.545408298681766 0.512758019342698 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 133 92 225 60.4606962753251 50.1775634787225 10.2831327966027 A:G A G 10 0.545408298681766 0.180696278655532 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 142 95 237 64.5520215871892 51.8137883747678 12.7382332124215 A:G A G 10 0.545408298681766 0.102963902854569 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 27315936 A/G 1 109 157 266 49.5504954436875 85.6291028930373 -36.0786074493497 A:G A G 10 0.545408298681766 1.10251211644359e-05 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 35 28 63 15.9107095461382 15.2714323630894 0.639277183048742 C:G G C 10 0.545408298681766 0.899977820815421 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 30999280 G/T 1 13 12 25 5.90969211713704 6.54489958418119 -0.635207467044149 T:G G T 10 0.545408298681766 0.842593548431809 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 31024638 C/T 1 11 10 21 5.00050871450057 5.45408298681766 -0.453574272317086 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 33246538 A/G 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 A:G A G 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 33246591 G/C 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 C:G G C 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 33246685 G/A 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 34 38 72 15.45611784482 20.7255153499071 -5.26939750508715 A:G A G 10 0.545408298681766 0.236975514657743 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 37730368 G/A 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 A:G G A 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37728796_37730697:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37728796_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 38095662 C/T 1 13 7 20 5.90969211713704 3.81785809077236 2.09183402636468 T:C C T 10 0.545408298681766 0.37882271700965 ENSG00000085788:ENST00000397166:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000519857:exon_38095607_38096576:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000526237:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000532222:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000520272:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000319246:exon_38095607_38095727:DDHD2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 38176435 T/G 1 15 19 34 6.81887551977351 10.3627576749536 -3.54388215518004 T:G T G 10 0.545408298681766 0.232628088714879 ENSG00000147548:ENST00000433384:exon_38176413_38176458:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000317025:exon_38176413_38176458:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000446459:exon_38176413_38176458:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000527502:exon_38176413_38176458:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000316985:exon_38176413_38176458:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000525081:exon_38176413_38176809:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000419340:exon_38176413_38176458:WHSC1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 41355096 C/T 1 31 27 58 14.0923427408653 14.7260240644077 -0.633681323542428 T:C C T 10 0.545408298681766 0.895615591805283 ENSG00000147533:ENST00000518270:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000520817:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000276530:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000405786:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000523420:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000357743:exon_41355028_41355180:GOLGA7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 48701786 A/T 1 49 60 109 22.2749933645935 32.724497920906 -10.4495045563125 A:T A T 10 0.545408298681766 0.0539105141108417 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48701712_48701799:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48701712_48701799:AC103686.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 53537316 A/G 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 A:G A G 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 18 15 33 8.18265062372821 8.18112448022649 0.00152614350172264 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 53586706 A/G 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 A:G A G 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53586405_53586834:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53586405_53586834:RB1CC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 56668879 A/G 1 2 11 13 0.909183402636468 5.99949128549943 -5.09030788286296 A:G A G 10 0.545408298681766 0.00494088835888572 ENSG00000167904:ENST00000434581:exon_56668803_56668970:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000334667:exon_56668803_56668970:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000519784:exon_56668803_56668970:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000517576:exon_56668803_56668944:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000523073:exon_56668803_56668970:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000519780:exon_56668803_56668970:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000522090:exon_56668803_56668970:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000520061:exon_56668803_56668970:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000524121:exon_56668803_56668961:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000523423:exon_56668804_56668970:TMEM68 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 59329438 A/G 1 7 1 8 3.18214190922764 0.545408298681766 2.63673361054587 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0793702040361015 ENSG00000215114:ENST00000399598:exon_59329409_59329512:UBXN2B;ENSG00000215114:ENST00000522978:exon_59329409_59329512:UBXN2B;ENSG00000215114:ENST00000520732:exon_59329409_59329512:UBXN2B;ENSG00000215114:ENST00000523409:exon_59329409_59329512:UBXN2B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 19 19 38 8.63724232504645 10.3627576749536 -1.72551534990711 A:T:C T C 10 0.545408298681766 0.626617643778788 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 67341378 G/A 1 23 27 50 10.4556091303194 14.7260240644077 -4.2704149340883 A:G G A 10 0.545408298681766 0.256475048729669 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 67342077 G/A 1 32 24 56 14.5469344421835 13.0897991683624 1.45713527382111 A:G G A 10 0.545408298681766 0.788753738629413 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 71039118 C/G 1 8 4 12 3.63673361054587 2.18163319472706 1.45510041581881 C:G C G 10 0.545408298681766 0.564607771258684 ENSG00000140396:ENST00000267974:exon_71039048_71039282:NCOA2;ENSG00000140396:ENST00000452400:exon_71039048_71039282:NCOA2;ENSG00000140396:ENST00000518287:exon_71039048_71039282:NCOA2;ENSG00000140396:ENST00000518363:exon_71039048_71039282:NCOA2;ENSG00000140396:ENST00000521239:exon_71038844_71039282:NCOA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 74888616 G/C 1 15 13 28 6.81887551977351 7.09030788286296 -0.271432363089448 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000175606:ENST00000523794:exon_74888540_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74888430_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74888442_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74888444_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517614:exon_74888454_74888726:TMEM70 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 124 105 229 56.369370963461 57.2678713615854 -0.898500398124412 A:G A G 10 0.545408298681766 0.947114422912616 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 71 78 149 32.2760107935946 42.5418472971777 -10.2658365035831 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0998250752800485 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 80976799 C/T 1 20 25 45 9.09183402636468 13.6352074670442 -4.54337344067947 T:C C T 10 0.545408298681766 0.180975732897204 ENSG00000076554:ENST00000379096:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000518937:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000520527:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000517427:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000517462:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000379097:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000448733:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000425513:exon_80976713_80976836:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000523319:exon_80976713_80976905:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000519303:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000518517:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000521241:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000523753:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000522364:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000519250:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000520795:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000520741:exon_80976698_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000521561:exon_80976710_80976828:TPD52 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 26 30 56 11.8193842342741 16.362248960453 -4.5428647261789 A:T:C T C 10 0.545408298681766 0.229981504501609 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 31 34 65 14.0923427408653 18.54388215518 -4.45153941431479 A:G A G 10 0.545408298681766 0.319055622487171 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 28 33 61 12.7285676369106 17.9984738564983 -5.26990621958773 C:G C G 10 0.545408298681766 0.198787122177997 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 90995019 C/T 1 10 9 19 4.54591701318234 4.90867468813589 -0.362757674953554 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000519426:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000523444:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517337:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000494804:exon_90994632_90995083:NBN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 92083424 A/G 1 10 11 21 4.54591701318234 5.99949128549943 -1.45357427231709 A:G A G 10 0.545408298681766 0.662270617460159 ENSG00000155100:ENST00000285420:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000404789:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000522894:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000524027:exon_92083366_92083517:OTUD6B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 95419698 A/G 1 2 9 11 0.909183402636468 4.90867468813589 -3.99949128549943 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0289147202703354 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95419667_95419948:RAD54B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 95479680 G/C 1 10 4 14 4.54591701318234 2.18163319472706 2.36428381845528 C:G G C 10 0.545408298681766 0.284657873718901 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95479633_95479783:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95479633_95479783:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000518998:exon_95479633_95479783:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000523839:exon_95479633_95479783:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000297592:exon_95479633_95479783:RAD54B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 95518762 C/T 1 17 5 22 7.72805892240998 2.72704149340883 5.00101742900115 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0335108329057887 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95518728_95518945:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95518728_95518945:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95518728_95518945:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000521080:exon_95518728_95518945:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95518728_95518945:KIAA1429 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 95531419 T/C 1 22 21 43 10.0010174290011 11.4535742723171 -1.45255684331594 T:C T C 10 0.545408298681766 0.759814246368948 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95531213_95531704:KIAA1429 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 95538468 T/C 1 12 18 30 5.45510041581881 9.81734937627179 -4.36224896045298 T:C T C 10 0.545408298681766 0.141575029470383 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95538451_95538530:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95538451_95539591:KIAA1429 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 95541302 A/G 1 9 13 22 4.09132531186411 7.09030788286296 -2.99898257099885 A:G A G 10 0.545408298681766 0.207313306024605 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95541298_95541570:KIAA1429 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 95893915 T/C 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 T:C T C 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95892346_95893974:INTS8;ENSG00000175305:ENST00000520509:exon_95891998_95893973:CCNE2;ENSG00000175305:ENST00000308108:exon_95892455_95893973:CCNE2;ENSG00000175305:ENST00000396133:exon_95893842_95893997:CCNE2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 98827623 G/A 1 12 6 18 5.45510041581881 3.2724497920906 2.18265062372821 A:G G A 10 0.545408298681766 0.350631698949064 ENSG00000104341:ENST00000445593:exon_98827556_98827629:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000220781:exon_98827556_98827629:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000378722:exon_98827556_98827629:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000517924:exon_98827532_98827629:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000521545:exon_98827556_98827629:LAPTM4B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 103276753 T/G 1 38 51 89 17.2744846500929 27.8158232327701 -10.5413385826772 T:C:G T G 10 0.545408298681766 0.0256407770219583 ENSG00000104517:ENST00000522784:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000518205:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103276702_103276786:UBR5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 103307533 T/C 1 30 34 64 13.637751039547 18.54388215518 -4.90613111563302 T:C T C 10 0.545408298681766 0.258498800691641 ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103307432_103307558:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103307432_103307558:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103307432_103307558:UBR5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 103663814 G/A 1 44 27 71 20.0020348580023 14.7260240644077 5.27601079359462 A:G G A 10 0.545408298681766 0.233950050901245 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 103663912 T/G 1 31 44 75 14.0923427408653 23.9979651419977 -9.90562240113245 T:G T G 10 0.545408298681766 0.026973609266597 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 104337096 A/G 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000164930:ENST00000522566:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000522484:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523739:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000358755:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000521195:exon_104336709_104337726:FZD6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 104337367 A/C 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:C A C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000164930:ENST00000522566:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000522484:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523933:exon_104337263_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523739:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000358755:exon_104336709_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000519011:exon_104337282_104337726:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000521195:exon_104336709_104337726:FZD6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 104343686 G/A 1 11 7 18 5.00050871450057 3.81785809077236 1.18265062372821 A:G G A 10 0.545408298681766 0.641965040336765 ENSG00000164930:ENST00000522566:exon_104343569_104345045:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000522484:exon_104343569_104345094:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000523739:exon_104343569_104344222:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000358755:exon_104343569_104345087:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000519011:exon_104343569_104344120:FZD6;ENSG00000164930:ENST00000521195:exon_104343569_104344014:FZD6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 57 40 97 25.9117269751393 21.8163319472706 4.0953950278687 A:G A G 10 0.545408298681766 0.416697499351663 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 109215368 T/C 1 1 12 13 0.454591701318234 6.54489958418119 -6.09030788286296 T:C T C 10 0.545408298681766 0.000965545211343369 ENSG00000104408:ENST00000523674:exon_109215212_109215575:EIF3E HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 110301998 T/C 1 39 24 63 17.7290763514111 13.0897991683624 4.63927718304874 T:C T C 10 0.545408298681766 0.256943672375032 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 110302047 T/G 1 10 9 19 4.54591701318234 4.90867468813589 -0.362757674953554 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 110539186 G/A 1 8 22 30 3.63673361054587 11.9989825709989 -8.36224896045298 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00277795396654110 ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000534623:exon_110539013_110539256:PKHD1L1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 56 65 121 25.4571352738211 35.4515394143148 -9.99440414049368 A:G A G 10 0.545408298681766 0.082403072088673 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 123963856 G/T 1 8 7 15 3.63673361054587 3.81785809077236 -0.18112448022649 T:G G T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000534247:exon_123963532_123964249:ZHX2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 123964431 G/A 1 13 12 25 5.90969211713704 6.54489958418119 -0.635207467044149 A:G G A 10 0.545408298681766 0.842593548431809 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 123964953 C/T 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 131124559 T/C 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 T:C T C 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000153317:ENST00000524124:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000357668:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000521075:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000518721:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000343135:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000519483:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000520189:exon_131124340_131124660:ASAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 10 12 22 4.54591701318234 6.54489958418119 -1.99898257099885 A:G A G 10 0.545408298681766 0.401540564367046 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 141310644 G/A 1 8 4 12 3.63673361054587 2.18163319472706 1.45510041581881 A:G G A 10 0.545408298681766 0.564607771258684 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521167:exon_141310568_141310713:TRAPPC9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 141525327 A/G 1 33 27 60 15.0015261435017 14.7260240644077 0.275502079094041 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000104472:ENST00000220913:exon_141525225_141527236:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519533:exon_141525225_141526566:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519618:exon_141525225_141525864:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000523569:exon_141525225_141525640:CHRAC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 141551407 G/A 1 6 2 8 2.7275502079094 1.09081659736353 1.63673361054587 A:G G A 10 0.545408298681766 0.305188591449900 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000520412:exon_141551263_141551556:EIF2C2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 141559358 G/A 1 4 8 12 1.81836680527294 4.36326638945413 -2.54489958418119 A:G G A 10 0.545408298681766 0.157468107643023 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141559213_141559397:EIF2C2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 141566311 C/T 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000521325:exon_141566266_141566337:EIF2C2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 141568622 G/A 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141568584_141568671:EIF2C2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 142146708 T/C 1 9 11 20 4.09132531186411 5.99949128549943 -1.90816597363532 T:C T C 10 0.545408298681766 0.501718810318948 ENSG00000105339:ENST00000519291:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518347:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518198:exon_142146657_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142146657_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142146657_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142146657_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000395213:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000395207:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523058:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142146608_142146890:DENND3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 142154291 G/A 1 6 14 20 2.7275502079094 7.63571618154472 -4.90816597363532 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0407239199494458 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523058:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523015:exon_142154013_142154358:DENND3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 142161032 A/C 1 8 10 18 3.63673361054587 5.45408298681766 -1.81734937627179 A:C A C 10 0.545408298681766 0.479767431495367 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142160933_142161052:DENND3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 142161873 C/T 1 8 11 19 3.63673361054587 5.99949128549943 -2.36275767495355 T:C C T 10 0.545408298681766 0.357731776873343 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142161718_142161936:DENND3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 142161888 G/A 1 12 15 27 5.45510041581881 8.18112448022649 -2.72602406440768 A:G G A 10 0.545408298681766 0.336126149245224 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142161718_142161936:DENND3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 144103125 C/T 1 290 287 577 131.831593382288 156.532181721667 -24.700588339379 T:C:G C T 10 0.545408298681766 0.0405010453803203 ENSG00000160932:ENST00000517503:exon_144102983_144103827:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000292494:exon_144102983_144103829:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000429120:exon_144102983_144103827:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521699:exon_144102983_144103828:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000520466:exon_144102983_144103826:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521003:exon_144102983_144103319:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522528:exon_144102983_144103341:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522971:exon_144102983_144103599:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519611:exon_144102966_144103217:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521182:exon_144102983_144103826:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519546:exon_144102966_144103672:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522024:exon_144102983_144103309:LY6E HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 17 7 24 7.72805892240998 3.81785809077236 3.91020083163762 T:C T C 10 0.545408298681766 0.150191116982183 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 144620342 T/C 1 16 14 30 7.27346722109174 7.63571618154472 -0.362248960452979 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 144620855 C/A 1 15 6 21 6.81887551977351 3.2724497920906 3.54642572768291 A:C C A 10 0.545408298681766 0.130926508572863 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 144621084 T/G 1 8 6 14 3.63673361054587 3.2724497920906 0.364283818455276 T:G T G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 144643169 C/T 1 8 7 15 3.63673361054587 3.81785809077236 -0.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526051:exon_144643031_144643593:GSDMD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 0 0 9 9 0 4.90867468813589 -4.90867468813589 A:C G A 10 0.545408298681766 0.000829074446773646 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 536 566 1102 243.661151906573 308.70109705388 -65.0399451473061 A:G G A 10 0.545408298681766 9.37623354291768e-05 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 144671244 C/A 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 A:C C A 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 144671922 G/A 1 7 4 11 3.18214190922764 2.18163319472706 1.00050871450057 A:G G A 10 0.545408298681766 0.763908722486136 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 T:G G T 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 144687092 T/C 1 6 16 22 2.7275502079094 8.72653277890826 -5.99898257099885 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0164148546667643 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144687077_144687127:PYCRL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 144689146 C/T 1 7 3 10 3.18214190922764 1.6362248960453 1.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.363824679236588 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 144697041 A/G 1 25 24 49 11.3647925329558 13.0897991683624 -1.72500663540653 A:G A G 10 0.545408298681766 0.668055350776953 ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 145007187 G/A 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 A:G G A 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145006961_145007279:PLEC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 145008560 A/G 1 3 5 8 1.3637751039547 2.72704149340883 -1.36326638945413 A:G A G 10 0.545408298681766 0.481573233711665 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145008486_145008613:PLEC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 145057868 A/G 1 27 26 53 12.2739759355923 14.1806157657259 -1.9066398301336 A:G A G 10 0.545408298681766 0.679447026135616 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 145058037 A/G 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 A:G A G 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058010_145058272:PARP10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 26 38 64 11.8193842342741 20.7255153499071 -8.90613111563303 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0321033431818544 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 39 27 66 17.7290763514111 14.7260240644077 3.00305228700345 A:G G A 10 0.545408298681766 0.536896105664052 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 145535881 C/A 1 26 36 62 11.8193842342741 19.6346987525436 -7.81531451826949 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0551635043567354 ENSG00000185122:ENST00000328245:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000528838:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000400779:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000415363:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000400780:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000532338:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000527328:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000530661:exon_145535828_145535930:HSF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 145603114 A/C 1 3 8 11 1.3637751039547 4.36326638945413 -2.99949128549943 A:C A C 10 0.545408298681766 0.126277531853182 ENSG00000173137:ENST00000534714:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000526231:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000533715:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000529654:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000308860:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000532190:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000526833:exon_145603076_145603179:ADCK5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 145621556 A/G 1 9 2 11 4.09132531186411 1.09081659736353 3.00050871450057 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0774548990144863 ENSG00000071894:ENST00000527827:exon_145621230_145621715:CPSF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 37 10 47 16.8198929487747 5.45408298681766 11.365809961957 A:G G A 10 0.545408298681766 0.000678975957925934 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 23 18 41 10.4556091303194 9.81734937627179 0.638259754047596 T:C C T 10 0.545408298681766 0.876617208699921 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 C:G C G 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 16 7 23 7.27346722109174 3.81785809077236 3.45560913031938 A:G G A 10 0.545408298681766 0.208241264648541 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 146156247 C/A 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 A:C C A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 8 146157339 T/C 1 6 9 15 2.7275502079094 4.90867468813589 -2.18112448022649 T:C T C 10 0.545408298681766 0.304929146615431 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 2029018 G/A 1 33 35 68 15.0015261435017 19.0892904538618 -4.08776431036009 A:G G A 10 0.545408298681766 0.332062635590431 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000457226:exon_2028987_2029221:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2029006_2029247:SMARCA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 2073292 A/G 1 18 16 34 8.18265062372821 8.72653277890826 -0.543882155180043 A:G A G 10 0.545408298681766 0.864915346461896 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2073212_2073342:SMARCA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 2191309 C/G 1 70 64 134 31.8214190922764 34.906131115633 -3.08471202335664 T:C:G C G 10 0.545408298681766 0.603652499872912 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000302401:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382186:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000417599:exon_2191266_2191428:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382185:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382183:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000324954:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382182:exon_2191266_2191408:SMARCA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 2828742 C/A 1 30 32 62 13.637751039547 17.4530655578165 -3.81531451826949 A:C C A 10 0.545408298681766 0.372496282895695 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 37 40 77 16.8198929487747 21.8163319472706 -4.99643899849598 C:G C G 10 0.545408298681766 0.255141355073732 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 2838470 C/T 1 33 34 67 15.0015261435017 18.54388215518 -3.54235601167832 T:C C T 10 0.545408298681766 0.393167576351821 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2838426_2838517:KIAA0020 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 40 57 97 18.1836680527294 31.0882730248607 -12.9046049721313 A:G A G 10 0.545408298681766 0.0104623983954972 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 5050706 C/T 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 T:C C T 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5050686_5050831:JAK2;ENSG00000096968:ENST00000472549:exon_5050686_5050831:JAK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 5081780 G/A 1 6 5 11 2.7275502079094 2.72704149340883 0.000508714500574214 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5081725_5081861:JAK2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 5968416 A/G 1 26 25 51 11.8193842342741 13.6352074670442 -1.81582323277007 A:G A G 10 0.545408298681766 0.673800632131134 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 6012734 A/C 1 24 18 42 10.9102008316376 9.81734937627179 1.09285145536583 A:C A C 10 0.545408298681766 0.759328842149155 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 6595046 C/T 1 3 13 16 1.3637751039547 7.09030788286296 -5.72653277890826 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00473755130360825 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6595014_6595119:GLDC;ENSG00000178445:ENST00000463305:exon_6595014_6595119:GLDC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 6644629 T/C 1 7 10 17 3.18214190922764 5.45408298681766 -2.27194107759002 T:C T C 10 0.545408298681766 0.332347257730029 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6644614_6644692:GLDC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 6645251 C/T 1 8 15 23 3.63673361054587 8.18112448022649 -4.54439086968062 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0619742792817211 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6645245_6645650:GLDC HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 6984236 G/A 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 A:G G A 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 15 20 35 6.81887551977351 10.9081659736353 -4.08929045386181 A:G G A 10 0.545408298681766 0.177456662008176 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 15486870 A/G 1 141 131 272 64.097429885871 71.4484871273113 -7.35105724144034 A:G A G 10 0.545408298681766 0.394074541943476 ENSG00000164985:ENST00000380733:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380738:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380715:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380716:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000397519:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000487363:exon_15486825_15486929:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000463712:exon_15486825_15486929:PSIP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 17273731 A/G 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17273731_17273864:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17273731_17273868:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17273731_17273868:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380641:exon_17273731_17273864:CNTLN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 19346710 A/G 1 9 8 17 4.09132531186411 4.36326638945413 -0.271941077590022 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000137145:ENST00000380437:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000307015:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000453857:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380432:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380427:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000361024:exon_19346554_19347084:DENND4C HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 26892654 G/A 1 16 5 21 7.27346722109174 2.72704149340883 4.54642572768291 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0502218138253225 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26892411_26892802:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26892411_26892801:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26892257_26892785:C9orf82 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 26978170 A/G 0 10 0 10 4.54591701318234 0 4.54591701318234 A A 10 0.545408298681766 0.00270614740341092 ENSG00000096872:ENST00000519968:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517444:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000518614:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000429045:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517866:exon_26978126_26978261:IFT74 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 32457189 T/C 1 6 8 14 2.7275502079094 4.36326638945413 -1.63571618154472 T:C T C 10 0.545408298681766 0.428822200674009 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32455300_32457416:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32455703_32457416:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32455703_32457416:DDX58 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 32552462 C/G 1 36 39 75 16.3653012474564 21.2709236485889 -4.90562240113245 C:G C G 10 0.545408298681766 0.296691947881998 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32552432_32552551:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32552432_32552551:TOPORS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 228 190 418 103.646907900557 103.627576749536 0.0193311510218166 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 11 17 28 5.00050871450057 9.27194107759002 -4.27143236308945 A:G A G 10 0.545408298681766 0.128767570080049 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 9 8 17 4.09132531186411 4.36326638945413 -0.271941077590022 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 34635679 G/A 1 37 41 78 16.8198929487747 22.3617402459524 -5.54184729717775 A:G G A 10 0.545408298681766 0.213008039115133 ENSG00000147955:ENST00000277010:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000378892:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000353468:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000476705:exon_34635392_34635805:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000442847:exon_34634720_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000360710:exon_34634720_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000477726:exon_34635480_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000461426:exon_34635494_34635855:SIGMAR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 35060746 A/G 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 A:G A G 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000165280:ENST00000480327:exon_35060310_35060920:VCP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 35091880 C/T 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 T:C C T 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000165282:ENST00000474436:exon_35088687_35093577:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000378617:exon_35091237_35092764:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000465745:exon_35091237_35094356:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000341666:exon_35091237_35092764:PIGO HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 35606884 G/A 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 A:G G A 10 0.545408298681766 0.609212519966719 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35606834_35606980:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35606834_35606980:TESK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 35650859 G/A 1 79 70 149 35.9127444041405 38.1785809077236 -2.26583650358313 A:G G A 10 0.545408298681766 0.742357875749143 ENSG00000137078:ENST00000259608:exon_35650751_35650937:SIT1;ENSG00000137078:ENST00000474403:exon_35650751_35650907:SIT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 35712003 G/A 1 29 30 59 13.1831593382288 16.362248960453 -3.17908962222419 A:G G A 10 0.545408298681766 0.434324328565220 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35712002_35712121:TLN1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 38395928 C/T 1 23 13 36 10.4556091303194 7.09030788286296 3.36530124745642 T:C C T 10 0.545408298681766 0.316035098052541 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 38396002 C/T 1 29 18 47 13.1831593382288 9.81734937627179 3.365809961957 T:C C T 10 0.545408298681766 0.380261216067705 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 T:C C T 10 0.545408298681766 0.823095632852268 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 10 8 18 4.54591701318234 4.36326638945413 0.182650623728212 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 13 9 22 5.90969211713704 4.90867468813589 1.00101742900115 T:C C T 10 0.545408298681766 0.83113387846694 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 80851350 G/C 1 6 4 10 2.7275502079094 2.18163319472706 0.54591701318234 C:G G C 10 0.545408298681766 0.763888703612766 ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000476652:exon_80851010_80851574:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80851011_80851519:CEP78 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 90321583 C/T 1 17 10 27 7.72805892240998 5.45408298681766 2.27397593559232 T:C C T 10 0.545408298681766 0.442451269997159 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 90322023 G/A 1 20 30 50 9.09183402636468 16.362248960453 -7.2704149340883 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0462176955263731 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 92006275 G/A 1 16 10 26 7.27346722109174 5.45408298681766 1.81938423427408 A:G G A 10 0.545408298681766 0.556992721605183 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92006179_92006330:SEMA4D HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 95036725 C/T 1 36 41 77 16.3653012474564 22.3617402459524 -5.99643899849598 T:C C T 10 0.545408298681766 0.171912073299272 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000449893:exon_95036708_95036799:IARS;ENSG00000196305:ENST00000395554:exon_95036708_95036803:IARS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 96209943 T/C 1 22 23 45 10.0010174290011 12.5443908696806 -2.54337344067947 T:C T C 10 0.545408298681766 0.458063612156695 ENSG00000188938:ENST00000479094:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000423591:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375412:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375409:exon_96208783_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000523407:exon_96208807_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520403:exon_96208815_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520470:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483149:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483056:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000476484:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428152:exon_96209550_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428378:exon_96209917_96209979:FAM120AOS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 97522373 G/A 1 5 5 10 2.27295850659117 2.72704149340883 -0.45408298681766 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000148120:ENST00000428218:exon_97521931_97523015:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000277198:exon_97521931_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000297979:exon_97521931_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000375315:exon_97522066_97522862:C9orf3;ENSG00000148120:ENST00000395357:exon_97522066_97522862:C9orf3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 100190780 A/G 1 9 4 13 4.09132531186411 2.18163319472706 1.90969211713704 A:G A G 10 0.545408298681766 0.40572272702491 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100190742_100190954:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100190742_100190954:TDRD7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 100420976 G/A 1 10 8 18 4.54591701318234 4.36326638945413 0.182650623728212 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000136937:ENST00000375147:exon_100420922_100421025:NCBP1;ENSG00000136937:ENST00000375132:exon_100420922_100421025:NCBP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 7 14 21 3.18214190922764 7.63571618154472 -4.45357427231709 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0770912319259954 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 100684719 A/C 1 8 2 10 3.63673361054587 1.09081659736353 2.54591701318234 A:C A C 10 0.545408298681766 0.123871912729062 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100684700_100684754:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375117:exon_100684700_100684772:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000325350:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000471580:exon_100684700_100684750:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000421165:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000455506:exon_100684700_100684769:C9orf156 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 100823135 G/C 1 37 36 73 16.8198929487747 19.6346987525436 -2.81480580376892 C:G G C 10 0.545408298681766 0.55729224659193 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 104297693 T/A 1 11 8 19 5.00050871450057 4.36326638945413 0.637242325046446 A:T T A 10 0.545408298681766 0.821606304549423 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478347:exon_104297680_104297798:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000488264:exon_104297680_104297729:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000374819:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000479306:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000481046:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000466817:exon_104297680_104297834:RNF20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 104302625 A/G 1 10 13 23 4.54591701318234 7.09030788286296 -2.54439086968062 A:G A G 10 0.545408298681766 0.302592597377063 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478347:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000488264:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000374819:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000479306:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000466817:exon_104302485_104302652:RNF20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 110084328 C/T 1 46 39 85 20.9112182606388 21.2709236485889 -0.359705387950108 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000119318:ENST00000416373:exon_110084264_110084399:RAD23B;ENSG00000119318:ENST00000358015:exon_110084264_110084399:RAD23B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 111653574 C/G 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 C:G C G 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111653483_111653684:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111653483_111653684:IKBKAP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 111727670 C/G 1 34 33 67 15.45611784482 17.9984738564983 -2.54235601167832 C:G C G 10 0.545408298681766 0.542038869542138 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 111755008 C/T 1 3 14 17 1.3637751039547 7.63571618154472 -6.27194107759002 T:C C T 10 0.545408298681766 0.00261134955015915 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374593:exon_111754912_111755099:CTNNAL1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 114411945 G/T 1 13 16 29 5.90969211713704 8.72653277890826 -2.81684066177121 T:G G T 10 0.545408298681766 0.352105502963958 ENSG00000059769:ENST00000313525:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000463589:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000447096:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000436202:exon_114411733_114412203:DNAJC25 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 114694486 A/G 1 18 9 27 8.18265062372821 4.90867468813589 3.27397593559232 A:G A G 10 0.545408298681766 0.247994952889908 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114694450_114694639:UGCG HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 104 74 178 47.2775369370963 40.3602141024507 6.91732283464565 T:C:G T C 10 0.545408298681766 0.327932960903865 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 112 92 204 50.9142705476422 50.1775634787225 0.736707068919742 T:C C T 10 0.545408298681766 0.94402593796353 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 116150633 T/C 1 12 14 26 5.45510041581881 7.63571618154472 -2.18061576572592 T:C T C 10 0.545408298681766 0.434248996287525 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116148597_116150641:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116148599_116150641:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116148599_116150641:ALAD HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 116346287 C/T 1 17 14 31 7.72805892240998 7.63571618154472 0.0923427408652548 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 51 45 96 23.1841767672299 24.5433734406795 -1.35919667344954 A:G A G 10 0.545408298681766 0.837755868720056 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 31 21 52 14.0923427408653 11.4535742723171 2.63876846854817 T:C C T 10 0.545408298681766 0.489297497349205 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 13 19 32 5.90969211713704 10.3627576749536 -4.45306555781651 A:G G A 10 0.545408298681766 0.1544847549312 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 119461275 G/A 1 15 3 18 6.81887551977351 1.6362248960453 5.18265062372821 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0163417451705557 ENSG00000119401:ENST00000394497:exon_119459944_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000450136:exon_119459941_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000373983:exon_119459935_119463579:TRIM32 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 123201733 T/C 1 18 20 38 8.18265062372821 10.9081659736353 -2.72551534990711 T:C T C 10 0.545408298681766 0.417110767640708 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123201677_123202250:CDK5RAP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 123583192 A/G 1 5 6 11 2.27295850659117 3.2724497920906 -0.999491285499426 A:G A G 10 0.545408298681766 0.561582513166177 ENSG00000095261:ENST00000373920:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123583117_123583257:PSMD5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 123605126 T/C 1 10 12 22 4.54591701318234 6.54489958418119 -1.99898257099885 T:C T C 10 0.545408298681766 0.401540564367046 ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123605015_123605200:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123605015_123605190:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000435107:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000476949:exon_123605015_123605189:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000471789:exon_123605015_123605160:PSMD5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 123671520 G/A 1 135 150 285 61.3698796779616 81.8112448022649 -20.4413651243033 A:G G A 10 0.545408298681766 0.017201603026748 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 123860689 C/T 1 3 6 9 1.3637751039547 3.2724497920906 -1.90867468813589 T:C C T 10 0.545408298681766 0.316132234599596 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123860664_123860850:CEP110 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 123917020 T/A 1 13 11 24 5.90969211713704 5.99949128549943 -0.0897991683623838 A:T T A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 123929770 C/T 1 24 28 52 10.9102008316376 15.2714323630894 -4.36123153145183 T:C C T 10 0.545408298681766 0.265309796508155 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123929767_123929955:CEP110 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 124065224 G/A 1 7 5 12 3.18214190922764 2.72704149340883 0.455100415818808 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000432226:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449773:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477863:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000456109:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000475428:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477104:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124065189_124065343:GSN HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 125588940 G/C 1 11 7 18 5.00050871450057 3.81785809077236 1.18265062372821 C:G G C 10 0.545408298681766 0.641965040336765 ENSG00000136940:ENST00000436632:exon_125588895_125588965:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000259467:exon_125588895_125589071:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000394286:exon_125588895_125589071:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000394285:exon_125588895_125589031:PDCL HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 125652757 G/A 1 10 10 20 4.54591701318234 5.45408298681766 -0.90816597363532 A:G G A 10 0.545408298681766 0.823095632852268 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 125673051 T/G 1 14 4 18 6.36428381845528 2.18163319472706 4.18265062372821 T:G T G 10 0.545408298681766 0.0579173231641151 ENSG00000186130:ENST00000373659:exon_125670335_125674360:ZBTB6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 125920376 G/A 1 23 16 39 10.4556091303194 8.72653277890826 1.72907635141113 A:G G A 10 0.545408298681766 0.631811857537628 ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125920291_125920402:STRBP HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 127177161 A/G 1 62 68 130 28.1846854817305 37.0877643103601 -8.90307882862958 A:G A G 10 0.545408298681766 0.134068120788649 ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 127643456 T/C 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 T:C T C 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000136935:ENST00000373555:exon_127643450_127643536:GOLGA1;ENSG00000136935:ENST00000475407:exon_127643450_127643536:GOLGA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 128246786 G/A 1 30 25 55 13.637751039547 13.6352074670442 0.0025435725028693 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128246722_128246862:MAPKAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 129595895 T/C 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 T:C T C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000169155:ENST00000449886:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373464:exon_129594766_129600489:ZBTB43;ENSG00000169155:ENST00000373457:exon_129593688_129599382:ZBTB43 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 130164993 C/T 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000136856:ENST00000373371:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000451404:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000476835:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419917:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373354:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373360:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373355:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419132:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000439597:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000423934:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373350:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000430147:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000484617:exon_130164643_130165032:SLC2A8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 130165995 C/T 1 9 2 11 4.09132531186411 1.09081659736353 3.00050871450057 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0774548990144863 ENSG00000136856:ENST00000373371:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000451404:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000476835:exon_130165936_130165997:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419917:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373352:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373354:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373360:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373355:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000423934:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373350:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000430147:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000484617:exon_130165939_130166026:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000489239:exon_130165557_130166082:SLC2A8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 130206669 C/T 1 12 12 24 5.45510041581881 6.54489958418119 -1.08979916836238 T:C C T 10 0.545408298681766 0.686028395996258 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 130210946 A/G 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 A:G A G 10 0.545408298681766 0.779258042281529 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 130219669 C/T 1 5 3 8 2.27295850659117 1.6362248960453 0.636733610545872 T:C C T 10 0.545408298681766 0.735472382770589 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000485704:exon_130219595_130219692:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130219595_130219672:LRSAM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 130658570 C/A 1 6 14 20 2.7275502079094 7.63571618154472 -4.90816597363532 A:C C A 10 0.545408298681766 0.0407239199494458 ENSG00000160408:ENST00000373146:exon_130658521_130658611:ST6GALNAC6;ENSG00000160408:ENST00000373142:exon_130658521_130658611:ST6GALNAC6;ENSG00000160408:ENST00000373144:exon_130658521_130658611:ST6GALNAC6;ENSG00000160408:ENST00000373141:exon_130658521_130658611:ST6GALNAC6;ENSG00000160408:ENST00000291839:exon_130658521_130658611:ST6GALNAC6;ENSG00000160408:ENST00000485320:exon_130658521_130658611:ST6GALNAC6;ENSG00000160408:ENST00000463086:exon_130658521_130658611:ST6GALNAC6;ENSG00000160408:ENST00000480417:exon_130658521_130658611:ST6GALNAC6;ENSG00000160408:ENST00000447681:exon_130658521_130658611:ST6GALNAC6;ENSG00000160408:ENST00000494541:exon_130658521_130658611:ST6GALNAC6;ENSG00000160408:ENST00000481355:exon_130658521_130658611:ST6GALNAC6;ENSG00000160408:ENST00000478319:exon_130658521_130658611:ST6GALNAC6;ENSG00000160408:ENST00000494611:exon_130658525_130658611:ST6GALNAC6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 38 41 79 17.2744846500929 22.3617402459524 -5.08725559585951 C:G G C 10 0.545408298681766 0.260238122672383 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 42 32 74 19.0928514553658 17.4530655578165 1.63978589754932 A:G A G 10 0.545408298681766 0.727607816994724 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 130707081 A/G 1 11 6 17 5.00050871450057 3.2724497920906 1.72805892240998 A:G A G 10 0.545408298681766 0.471102205741298 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130707056_130707177:FAM102A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131023498 C/T 1 23 21 44 10.4556091303194 11.4535742723171 -0.997965141997703 T:C C T 10 0.545408298681766 0.764637470510808 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131023451_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131023451_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000461031:exon_131023147_131023502:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000470630:exon_131023400_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131023451_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131023471_131023538:GOLGA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 14 11 25 6.36428381845528 5.99949128549943 0.364792532955851 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131285955 A/G 1 9 8 17 4.09132531186411 4.36326638945413 -0.271941077590022 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131285927_131286125:GLE1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131397395 C/T 1 33 31 64 15.0015261435017 16.9076572591347 -1.90613111563302 T:C C T 10 0.545408298681766 0.706834197664909 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131467782 C/T 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 T:C C T 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000160447:ENST00000291906:exon_131467582_131467822:PKN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131475909 G/A 1 4 9 13 1.81836680527294 4.90867468813589 -3.09030788286296 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0994563199423269 ENSG00000160447:ENST00000291906:exon_131475778_131475921:PKN3;ENSG00000160447:ENST00000483521:exon_131475778_131475921:PKN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131482517 A/G 1 17 14 31 7.72805892240998 7.63571618154472 0.0923427408652548 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000160447:ENST00000291906:exon_131482482_131482562:PKN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131482720 C/T 1 8 8 16 3.63673361054587 4.36326638945413 -0.726532778908256 T:C C T 10 0.545408298681766 0.803992710629594 ENSG00000160447:ENST00000291906:exon_131482673_131483197:PKN3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131483668 A/G 1 55 55 110 25.0025435725029 29.9974564274971 -4.99491285499426 A:G A G 10 0.545408298681766 0.340354161829928 ENSG00000160446:ENST00000372663:exon_131483148_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372667:exon_131483149_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000467312:exon_131483159_131483759:ZDHHC12 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131565554 T/C 1 17 11 28 7.72805892240998 5.99949128549943 1.72856763691055 T:C T C 10 0.545408298681766 0.572612553515050 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131565529_131565739:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000466056:exon_131565529_131565727:TBC1D13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131570178 T/C 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 T:C T C 10 0.545408298681766 0.609212519966719 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131570093_131572711:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131570093_131572703:TBC1D13 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131584631 C/T 1 62 74 136 28.1846854817305 40.3602141024507 -12.1755286207202 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0387228513922244 ENSG00000167136:ENST00000372642:exon_131584607_131584956:ENDOG;ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 16 9 25 7.27346722109174 4.90867468813589 2.36479253295585 C:G G C 10 0.545408298681766 0.423463149171332 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131735495 C/T 1 16 9 25 7.27346722109174 4.90867468813589 2.36479253295585 T:C C T 10 0.545408298681766 0.423463149171332 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131735439_131735528:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000411887:exon_131735439_131735528:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131735439_131735528:NUP188 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 59 68 127 26.8209103777758 37.0877643103601 -10.2668539325843 A:C A C 10 0.545408298681766 0.0745682185331307 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131771505 C/T 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 T:C C T 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000148341:ENST00000372564:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000479237:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372559:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372554:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000461811:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000417224:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000416629:exon_131771385_131771625:SH3GLB2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131846957 T/C 1 8 3 11 3.63673361054587 1.6362248960453 2.00050871450057 T:C T C 10 0.545408298681766 0.364803080636778 ENSG00000167130:ENST00000372546:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000406974:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000327812:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000412363:exon_131846947_131847047:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000480255:exon_131846878_131847047:DOLPP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 131909736 C/T 1 25 12 37 11.3647925329558 6.54489958418119 4.81989294877466 T:C C T 10 0.545408298681766 0.137051377517197 ENSG00000119383:ENST00000358994:exon_131909666_131911223:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000393370:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000524946:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000337738:exon_131909666_131911223:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000348141:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000405725:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000347048:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000357197:exon_131909666_131911224:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000355007:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000423100:exon_131909666_131910277:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000414510:exon_131909666_131910566:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000419582:exon_131909666_131910236:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000432651:exon_131909666_131910285:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000435132:exon_131909666_131910051:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000434095:exon_131909666_131910274:PPP2R4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 12 15 27 5.45510041581881 8.18112448022649 -2.72602406440768 A:G G A 10 0.545408298681766 0.336126149245224 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 132566404 A/G 1 6 7 13 2.7275502079094 3.81785809077236 -1.09030788286296 A:G A G 10 0.545408298681766 0.586939443397059 ENSG00000136816:ENST00000259339:exon_132566352_132566617:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000486372:exon_132566352_132566759:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000437263:exon_132566352_132566470:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000427860:exon_132566352_132566617:TOR1B HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 132594180 T/C 1 79 79 158 35.9127444041405 43.0872555958595 -7.17451119171902 T:C T C 10 0.545408298681766 0.26386780014249 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461539:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000492991:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000495934:exon_132594174_132594251:C9orf78 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 132638424 C/T 1 10 9 19 4.54591701318234 4.90867468813589 -0.362757674953554 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000496927:exon_132638409_132638517:USP20 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 134020092 C/T 1 7 9 16 3.18214190922764 4.90867468813589 -1.72653277890826 T:C C T 10 0.545408298681766 0.455586183047937 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000530863:exon_134019955_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134020089_134020141:NUP214 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 134021630 A/G 1 7 6 13 3.18214190922764 3.2724497920906 -0.0903078828629575 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134021549_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134021516_134021691:NUP214 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 135781205 T/C 1 9 6 15 4.09132531186411 3.2724497920906 0.818875519773511 T:C T C 10 0.545408298681766 0.797850343426505 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135780968_135781526:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135780968_135781526:TSC1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 136199466 G/A 1 23 20 43 10.4556091303194 10.9081659736353 -0.452556843315937 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 136199503 G/A 1 24 21 45 10.9102008316376 11.4535742723171 -0.543373440679469 A:G G A 10 0.545408298681766 0.882099628476873 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 136211014 G/A 1 9 10 19 4.09132531186411 5.45408298681766 -1.36275767495355 A:G G A 10 0.545408298681766 0.646488798036141 ENSG00000148297:ENST00000491289:exon_136210980_136211188:MED22;ENSG00000148297:ENST00000486395:exon_136209570_136211188:MED22;ENSG00000148297:ENST00000343730:exon_136210980_136211188:MED22;ENSG00000148297:ENST00000344469:exon_136207755_136211188:MED22;ENSG00000148297:ENST00000476080:exon_136207756_136211188:MED22;ENSG00000148297:ENST00000422801:exon_136207756_136211188:MED22;ENSG00000148297:ENST00000471524:exon_136210545_136211188:MED22;ENSG00000148297:ENST00000371999:exon_136210602_136211188:MED22;ENSG00000148297:ENST00000446777:exon_136210980_136211188:MED22;ENSG00000148297:ENST00000494177:exon_136210988_136211188:MED22 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 38 30 68 17.2744846500929 16.362248960453 0.91223568963991 A:G A G 10 0.545408298681766 0.903245692747032 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 136338580 G/A 1 15 12 27 6.81887551977351 6.54489958418119 0.273975935592318 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136338537_136339210:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136338537_136338722:SLC2A6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 138903635 G/A 1 5 4 9 2.27295850659117 2.18163319472706 0.091325311864106 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000148411:ENST00000371753:exon_138898383_138903870:NACC2;ENSG00000148411:ENST00000277554:exon_138903205_138903870:NACC2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139266405 G/A 1 2 7 9 0.909183402636468 3.81785809077236 -2.90867468813589 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0890512388728988 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139266347_139266546:CARD9 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 20 26 46 9.09183402636468 14.1806157657259 -5.08878173936124 A:G A G 10 0.545408298681766 0.140613338777031 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 19 9 28 8.63724232504645 4.90867468813589 3.72856763691055 T:C T C 10 0.545408298681766 0.185730168235214 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 9 13 22 4.09132531186411 7.09030788286296 -2.99898257099885 T:C C T 10 0.545408298681766 0.207313306024605 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139273402 C/T 1 18 18 36 8.18265062372821 9.81734937627179 -1.63469875254357 T:C C T 10 0.545408298681766 0.618256262605604 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139275204 A/C 1 9 9 18 4.09132531186411 4.90867468813589 -0.817349376271787 A:C A C 10 0.545408298681766 0.8141139036473 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139275294 G/C 1 9 8 17 4.09132531186411 4.36326638945413 -0.271941077590022 C:G G C 10 0.545408298681766 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139279173 G/A 1 14 5 19 6.36428381845528 2.72704149340883 3.63724232504645 A:G G A 10 0.545408298681766 0.109502725206357 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139279172_139279266:SNAPC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139289825 A/G 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139289750_139289875:SNAPC4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139298580 C/T 1 17 11 28 7.72805892240998 5.99949128549943 1.72856763691055 T:C C T 10 0.545408298681766 0.572612553515050 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 13 13 26 5.90969211713704 7.09030788286296 -1.18061576572592 A:G A G 10 0.545408298681766 0.696154695081167 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139299637 C/T 1 20 23 43 9.09183402636468 12.5443908696806 -3.45255684331594 T:C C T 10 0.545408298681766 0.358350515482876 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139299543_139299800:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139299570_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139299570_139299654:SDCCAG3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139301583 T/C 1 4 5 9 1.81836680527294 2.72704149340883 -0.908674688135894 T:C T C 10 0.545408298681766 0.740303996198617 ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139301398_139301660:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139306467 C/T 1 55 64 119 25.0025435725029 34.906131115633 -9.90358754313015 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0798996388065951 ENSG00000165688:ENST00000371720:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000446975:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139306449_139306651:PMPCA HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139326304 G/A 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 A:G G A 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139326276_139326437:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139326276_139326437:INPP5E HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139327034 A/G 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 A:G A G 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139326931_139327038:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139326931_139327038:INPP5E HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139327439 A/G 1 6 6 12 2.7275502079094 3.2724497920906 -0.544899584181191 A:G A G 10 0.545408298681766 0.779258042281529 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139327408_139327527:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139327408_139327527:INPP5E HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139371234 G/A 1 7 8 15 3.18214190922764 4.36326638945413 -1.18112448022649 A:G G A 10 0.545408298681766 0.609212519966719 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139371786 A/C 1 8 4 12 3.63673361054587 2.18163319472706 1.45510041581881 A:C A C 10 0.545408298681766 0.564607771258684 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139391338 C/T 1 14 11 25 6.36428381845528 5.99949128549943 0.364792532955851 T:C C T 10 0.545408298681766 1 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 47 33 80 21.365809961957 17.9984738564983 3.36733610545872 A:G A G 10 0.545408298681766 0.501115123290234 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139733769 C/T 1 72 73 145 32.7306024949129 39.8148058037689 -7.08420330885607 T:C C T 10 0.545408298681766 0.243917336999015 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139733674_139733938:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139733766_139733938:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139733674_139733938:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139733766_139733938:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139733674_139733938:C9orf86 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 139820421 G/A 1 16 20 36 7.27346722109174 10.9081659736353 -3.63469875254358 A:G G A 10 0.545408298681766 0.244017272256093 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 140002989 T/C 1 15 25 40 6.81887551977351 13.6352074670442 -6.81633194727064 T:C T C 10 0.545408298681766 0.038053686462644 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140002840_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001983_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000475449:exon_140002983_140003529:MAN1B1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 140006425 C/G 1 139 144 283 63.1882464832345 78.5387950101743 -15.3505485269398 C:G C G 10 0.545408298681766 0.0731954239744002 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006393_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140006360_140006481:DPP7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 140006491 C/T 1 15 10 25 6.81887551977351 5.45408298681766 1.36479253295585 T:C C T 10 0.545408298681766 0.689530950640826 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 140008750 G/C 1 55 42 97 25.0025435725029 22.9071485446342 2.0953950278687 C:G G C 10 0.545408298681766 0.684849804428807 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008695_140008830:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 140008934 A/G 1 35 30 65 15.9107095461382 16.362248960453 -0.451539414314791 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008915_140009165:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008915_140008944:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008915_140009170:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008915_140009178:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 140100224 A/G 1 6 3 9 2.7275502079094 1.6362248960453 1.09132531186411 A:G A G 10 0.545408298681766 0.523850288987059 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 140115554 G/A 1 8 5 13 3.63673361054587 2.72704149340883 0.909692117137042 A:G G A 10 0.545408298681766 0.782580498758292 ENSG00000212864:ENST00000392827:exon_140114707_140115760:RNF208;ENSG00000212864:ENST00000391553:exon_140114707_140115775:RNF208 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 140611436 T/C 1 20 15 35 9.09183402636468 8.18112448022649 0.91070954613819 T:C T C 10 0.545408298681766 0.865669207088407 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 140638416 G/A 1 26 15 41 11.8193842342741 8.18112448022649 3.63825975404759 A:G G A 10 0.545408298681766 0.275668188860693 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 23 17 40 10.4556091303194 9.27194107759002 1.18366805272936 T:C T C 10 0.545408298681766 0.7528356776381 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 299362 A/G 1 12 13 25 5.45510041581881 7.09030788286296 -1.63520746704415 A:G A G 10 0.545408298681766 0.551039108147693 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 299591 A/G 1 8 7 15 3.63673361054587 3.81785809077236 -0.18112448022649 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 1427 1396 2823 648.70235778112 761.389984959745 -112.687627178625 A:T:C:G G A 10 0.545408298681766 2.27995160499601e-05 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 52 39 91 23.6387684685482 21.2709236485889 2.36784481995929 T:C C T 10 0.545408298681766 0.674149929581211 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 36 26 62 16.3653012474564 14.1806157657259 2.18468548173051 T:C C T 10 0.545408298681766 0.611791903676391 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 1718360 G/A 1 16 2 18 7.27346722109174 1.09081659736353 6.18265062372821 A:G G A 10 0.545408298681766 0.00336603214359489 ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1718085_1719196:AKAP17A HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 37 30 67 16.8198929487747 16.362248960453 0.457643988321678 C:G C G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 2139186 C/T 1 17 7 24 7.72805892240998 3.81785809077236 3.91020083163762 T:C C T 10 0.545408298681766 0.150191116982183 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 2139200 T/C 1 18 8 26 8.18265062372821 4.36326638945413 3.81938423427408 T:C T C 10 0.545408298681766 0.168100884427578 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 2161129 C/G 1 7 13 20 3.18214190922764 7.09030788286296 -3.90816597363532 C:G C G 10 0.545408298681766 0.113964264894792 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2161103_2161271:DHRSX HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 15415583 C/T 1 13 8 21 5.90969211713704 4.36326638945413 1.54642572768291 T:C C T 10 0.545408298681766 0.521510664210594 ENSG00000087842:ENST00000380420:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000380421:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000492432:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000484433:exon_15415571_15415653:PIR HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 18938161 G/T 1 3 15 18 1.3637751039547 8.18112448022649 -6.81734937627179 T:G G T 10 0.545408298681766 0.00142745849794577 ENSG00000044446:ENST00000379942:exon_18938150_18938319:PHKA2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 20204461 G/T 1 5 9 14 2.27295850659117 4.90867468813589 -2.63571618154472 T:G G T 10 0.545408298681766 0.185085810189955 ENSG00000177189:ENST00000379565:exon_20204414_20204484:RPS6KA3;ENSG00000177189:ENST00000379548:exon_20204414_20204484:RPS6KA3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 21861434 A/G 1 4 6 10 1.81836680527294 3.2724497920906 -1.45408298681766 A:G A G 10 0.545408298681766 0.52782144426649 ENSG00000012174:ENST00000379484:exon_21861288_21861436:MBTPS2;ENSG00000012174:ENST00000465888:exon_21861288_21861436:MBTPS2;ENSG00000012174:ENST00000365779:exon_21861288_21861436:MBTPS2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 39922198 T/C 1 3 9 12 1.3637751039547 4.90867468813589 -3.54489958418119 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0458142407340025 ENSG00000183337:ENST00000413905:exon_39921999_39922324:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000378463:exon_39921999_39922324:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000417733:exon_39921999_39922324:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000378455:exon_39921999_39922324:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000397354:exon_39921999_39922324:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000378444:exon_39921999_39922324:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000342274:exon_39921999_39922324:BCOR;ENSG00000183337:ENST00000427012:exon_39921999_39922255:BCOR HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 40460040 T/C 1 10 48 58 4.54591701318234 26.1795983367248 -21.6336813235424 T:C T C 10 0.545408298681766 6.47384789713248e-09 ENSG00000182220:ENST00000378438:exon_40460014_40460133:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000486558:exon_40460014_40460133:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000447485:exon_40460014_40460128:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000423649:exon_40460014_40460133:ATP6AP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 47041626 C/T 1 46 40 86 20.9112182606388 21.8163319472706 -0.905113686631875 T:C C T 10 0.545408298681766 0.913859138728861 ENSG00000182872:ENST00000377604:exon_47041561_47041725:RBM10;ENSG00000182872:ENST00000329236:exon_47041561_47041725:RBM10;ENSG00000182872:ENST00000345781:exon_47041561_47041725:RBM10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 47085673 C/T 1 5 7 12 2.27295850659117 3.81785809077236 -1.54489958418119 T:C C T 10 0.545408298681766 0.399082180852789 ENSG00000102225:ENST00000522234:exon_47085364_47085977:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000428400:exon_47085364_47086102:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000523699:exon_47085495_47085801:CDK16 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 47444985 T/C 1 32 127 159 14.5469344421835 69.2668539325843 -54.7199194904008 T:C T C 10 0.545408298681766 1.12674273506679e-18 ENSG00000102265:ENST00000218388:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377018:exon_47444335_47445482:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000456754:exon_47444604_47445422:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377017:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377013:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000445623:exon_47444741_47445066:TIMP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 47445940 C/T 1 220 53 273 100.010174290011 28.9066398301336 71.1035344598779 T:C C T 10 0.545408298681766 2.79598399099737e-19 ENSG00000102265:ENST00000218388:exon_47445920_47446188:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377017:exon_47445920_47446188:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377013:exon_47445920_47446187:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000445623:exon_47445920_47446188:TIMP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 47483800 G/A 1 4 46 50 1.81836680527294 25.0887817393612 -23.2704149340883 A:G G A 10 0.545408298681766 6.82601504022587e-12 ENSG00000126759:ENST00000478222:exon_47483612_47483839:CFP;ENSG00000126759:ENST00000396992:exon_47483613_47483839:CFP;ENSG00000126759:ENST00000247153:exon_47483625_47483839:CFP HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 47662972 T/G 0 0 23 23 0 12.5443908696806 -12.5443908696806 G T G 10 0.545408298681766 1.33442624873205e-08 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 47663200 G/A 0 0 15 15 0 8.18112448022649 -8.18112448022649 A G A 10 0.545408298681766 7.31682300733641e-06 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 48317386 A/G 1 56 63 119 25.4571352738211 34.3607228169513 -8.90358754313015 A:G A G 10 0.545408298681766 0.117280996008716 ENSG00000017483:ENST00000376876:exon_48316920_48317420:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000376875:exon_48316922_48317420:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000317669:exon_48316928_48317420:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000462359:exon_48317076_48317420:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000453124:exon_48317346_48317420:SLC38A5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 48418126 A/G 1 7 12 19 3.18214190922764 6.54489958418119 -3.36275767495355 A:G A G 10 0.545408298681766 0.165845385921528 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000481090:exon_48418002_48418274:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 48418659 G/A 1 9 11 20 4.09132531186411 5.99949128549943 -1.90816597363532 A:G G A 10 0.545408298681766 0.501718810318948 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 48751471 A/G 1 50 37 87 22.7295850659117 20.1801070512253 2.54947801468636 A:G A G 10 0.545408298681766 0.592694004361236 ENSG00000126768:ENST00000376582:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000466995:exon_48751183_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000396779:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000495490:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000472645:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000465150:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000490755:exon_48751380_48751508:TIMM17B HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 48847497 T/C 1 16 31 47 7.27346722109174 16.9076572591347 -9.634190038043 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00520361662512594 ENSG00000068400:ENST00000376425:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376444:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376441:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000473581:exon_48847338_48847798:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376423:exon_48847338_48847514:GRIPAP1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 48888074 T/C 1 9 11 20 4.09132531186411 5.99949128549943 -1.90816597363532 T:C T C 10 0.545408298681766 0.501718810318948 ENSG00000068323:ENST00000315869:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000493583:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000478476:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000336239:exon_48887729_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000495940:exon_48888024_48888110:TFE3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 48924961 A/G 1 4 4 8 1.81836680527294 2.18163319472706 -0.363266389454128 A:G A G 10 0.545408298681766 1 ENSG00000147144:ENST00000376396:exon_48924712_48927509:CCDC120;ENSG00000147144:ENST00000422185:exon_48924712_48925626:CCDC120 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 48932930 C/T 1 3 12 15 1.3637751039547 6.54489958418119 -5.18112448022649 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0085123178847361 ENSG00000196998:ENST00000465806:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000376372:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000470270:exon_48932814_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000486337:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000322995:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000356463:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000485908:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000367375:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000433252:exon_48932345_48933124:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000376368:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000396681:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000474217:exon_48932795_48933033:WDR45 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 48978769 G/C 1 11 6 17 5.00050871450057 3.2724497920906 1.72805892240998 C:G G C 10 0.545408298681766 0.471102205741298 ENSG00000068394:ENST00000156109:exon_48978748_48978872:GPKOW;ENSG00000068394:ENST00000327905:exon_48978748_48978872:GPKOW HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 49035732 C/T 1 9 11 20 4.09132531186411 5.99949128549943 -1.90816597363532 T:C C T 10 0.545408298681766 0.501718810318948 ENSG00000012211:ENST00000376317:exon_49035600_49035737:PRICKLE3;ENSG00000012211:ENST00000453382:exon_49035600_49035737:PRICKLE3;ENSG00000012211:ENST00000432913:exon_49035600_49035737:PRICKLE3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 49103224 G/A 1 9 7 16 4.09132531186411 3.81785809077236 0.273467221091745 A:G G A 10 0.545408298681766 1 ENSG00000101997:ENST00000376227:exon_49103192_49103386:CCDC22 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 54836361 A/G 1 41 46 87 18.6382597540476 25.0887817393612 -6.45052198531364 A:G A G 10 0.545408298681766 0.196108829467297 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 54836505 A/G 1 25 28 53 11.3647925329558 15.2714323630894 -3.9066398301336 A:G A G 10 0.545408298681766 0.334398250886362 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 54837340 C/T 1 21 43 64 9.54642572768291 23.4525568433159 -13.906131115633 T:C C T 10 0.545408298681766 0.000597203174850292 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54837254_54837563:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54837254_54837562:MAGED2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 54838077 C/T 1 19 17 36 8.63724232504645 9.27194107759002 -0.634698752543576 T:C C T 10 0.545408298681766 0.868122767399527 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54838007_54838077:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000487482:exon_54837965_54838086:MAGED2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 68381912 G/A 1 20 18 38 9.09183402636468 9.81734937627179 -0.725515349907107 A:G G A 10 0.545408298681766 0.87122541036102 ENSG00000181191:ENST00000374584:exon_68380697_68382224:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374583:exon_68380697_68383388:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000361478:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000396010:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374571:exon_68380734_68382983:PJA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 71416721 C/T 1 29 14 43 13.1831593382288 7.63571618154472 5.54744315668406 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0941013152449004 ENSG00000102309:ENST00000373662:exon_71416635_71416951:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000218432:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000423432:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000373669:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000475071:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000439980:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000496835:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000446576:exon_71416635_71417204:PIN4 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 71427056 T/G 1 3 8 11 1.3637751039547 4.36326638945413 -2.99949128549943 T:G T G 10 0.545408298681766 0.126277531853182 ENSG00000186871:ENST00000373657:exon_71424510_71428548:ERCC6L;ENSG00000186871:ENST00000334463:exon_71424510_71428548:ERCC6L HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 71549512 G/C 1 20 4 24 9.09183402636468 2.18163319472706 6.91020083163762 C:G G C 10 0.545408298681766 0.0063604176980734 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71549366_71549559:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71549367_71549926:HDAC8 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 73046366 C/T 1 118 89 207 53.6418207555516 48.5413385826772 5.10048217287444 T:C C T 10 0.545408298681766 0.486116881219554 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 118587003 C/T 1 21 32 53 9.54642572768291 17.4530655578165 -7.9066398301336 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0376128335116295 ENSG00000077713:ENST00000217909:exon_118586828_118588441:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000488158:exon_118586918_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000326714:exon_118586828_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000336249:exon_118586828_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000493093:exon_118586828_118587145:SLC25A43 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 118604436 T/C 1 360 458 818 163.653012474564 249.797000796249 -86.1439883216846 T:C T C 10 0.545408298681766 1.7054658339178e-09 ENSG00000005022:ENST00000317881:exon_118604336_118604476:SLC25A5;ENSG00000005022:ENST00000460013:exon_118604336_118604476:SLC25A5;ENSG00000005022:ENST00000463551:exon_118604225_118604476:SLC25A5 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 118771124 C/T 1 149 99 248 67.7341634964169 53.9954215694948 13.738741926922 T:C C T 10 0.545408298681766 0.0851020245866765 ENSG00000125354:ENST00000360156:exon_118770990_118771158:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394616:exon_118770990_118771158:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000520510:exon_118770990_118771158:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000525360:exon_118770990_118771158:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394617:exon_118770990_118771158:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000354228:exon_118770990_118771158:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000489216:exon_118770990_118771158:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000354416:exon_118770990_118771158:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394612:exon_118770990_118771158:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394610:exon_118770990_118771158:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000343984:exon_118770990_118771158:SEPT6 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 118893413 T/C 1 4 7 11 1.81836680527294 3.81785809077236 -1.99949128549943 T:C T C 10 0.545408298681766 0.243429996522029 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 119005587 T/C 1 20 56 76 9.09183402636468 30.5428647261789 -21.4510306998142 T:C T C 10 0.545408298681766 7.38781518193758e-07 ENSG00000125352:ENST00000371442:exon_119004497_119005791:RNF113A;ENSG00000125356:ENST00000371437:exon_119005450_119005976:NDUFA1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 129058882 T/C 1 33 42 75 15.0015261435017 22.9071485446342 -7.90562240113245 T:C T C 10 0.545408298681766 0.0813587584771508 ENSG00000156697:ENST00000425117:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000371051:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000394422:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000427972:exon_129058771_129058886:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000371042:exon_129058771_129059171:UTP14A HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 129283520 A/G 1 17 30 47 7.72805892240998 16.362248960453 -8.634190038043 A:T:G A G 10 0.545408298681766 0.0125931282364402 ENSG00000156709:ENST00000416073:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000527892:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000319908:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000287295:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000529877:exon_129283444_129283543:AIFM1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 131188749 C/T 1 16 12 28 7.27346722109174 6.54489958418119 0.728567636910553 T:C C T 10 0.545408298681766 0.850972449556202 ENSG00000134602:ENST00000312420:exon_131188659_131188889:AL109749.1;ENSG00000134602:ENST00000361307:exon_131188659_131188889:AL109749.1;ENSG00000134602:ENST00000370887:exon_131188659_131188889:AL109749.1;ENSG00000134602:ENST00000394334:exon_131188659_131188889:AL109749.1;ENSG00000134602:ENST00000481105:exon_131188659_131188889:AL109749.1;ENSG00000134602:ENST00000354719:exon_131188659_131188889:AL109749.1;ENSG00000134602:ENST00000496850:exon_131188659_131188889:AL109749.1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 134185997 T/A 1 13 8 21 5.90969211713704 4.36326638945413 1.54642572768291 A:T T A 10 0.545408298681766 0.521510664210594 ENSG00000203950:ENST00000518153:exon_134185947_134186120:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000370775:exon_134184962_134186205:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000520964:exon_134185947_134186226:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000522309:exon_134185947_134186171:FAM127B HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 135310785 T/C 1 7 21 28 3.18214190922764 11.4535742723171 -8.27143236308945 T:C T C 10 0.545408298681766 0.00197723301042343 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000495432:exon_135310782_135311154:MAP7D3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 135313034 T/G 1 8 17 25 3.63673361054587 9.27194107759002 -5.63520746704415 T:G T G 10 0.545408298681766 0.0270581853548481 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000477124:exon_135312998_135313314:MAP7D3 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 153195393 G/A 1 52 86 138 23.6387684685482 46.9051136866319 -23.2663452180837 A:G G A 10 0.545408298681766 7.58624628056585e-05 ENSG00000102030:ENST00000464845:exon_153194695_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000482485:exon_153195280_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370015:exon_153195367_153195760:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000393712:exon_153195374_153195756:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370009:exon_153195377_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000466877:exon_153195379_153195676:NAA10 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 153248248 G/A 1 1 7 8 0.454591701318234 3.81785809077236 -3.36326638945413 A:G G A 10 0.545408298681766 0.0271590031820889 ENSG00000177854:ENST00000369982:exon_153247301_153248646:TMEM187 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 153284192 A/G 1 19 10 29 8.63724232504645 5.45408298681766 3.18315933822879 A:G A G 10 0.545408298681766 0.266802247655899 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393682:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393687:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000429936:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000463031:exon_153284050_153284396:IRAK1 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 153296046 G/A 1 10 20 30 4.54591701318234 10.9081659736353 -6.36224896045298 A:C:G G A 10 0.545408298681766 0.0263692713371029 ENSG00000169057:ENST00000303391:exon_153287024_153296901:MECP2;ENSG00000169057:ENST00000453960:exon_153295685_153296901:MECP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 153296208 G/A 1 19 19 38 8.63724232504645 10.3627576749536 -1.72551534990711 A:G G A 10 0.545408298681766 0.626617643778788 ENSG00000169057:ENST00000303391:exon_153287024_153296901:MECP2;ENSG00000169057:ENST00000453960:exon_153295685_153296901:MECP2 HGDP00868_parsed_pileup.txt . X 153760654 G/A 1 27 18 45 12.2739759355923 9.81734937627179 2.45662655932053 A:G G A 10 0.545408298681766 0.549931162252618 ENSG00000160211:ENST00000393562:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000291567:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000442162:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000434882:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000393564:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000369620:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000490651:exon_153760601_153760677:G6PD