INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 881627 G/A 1 34 41 75 15.7893766452452 21.9598693395573 -6.17049269431212 A:G G A 10 0.535606569257495 0.165473582350496 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 887801 A/G 1 41 37 78 19.0401306604427 19.8174430625273 -0.777312402084608 A:G A G 10 0.535606569257495 0.909796517302044 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_887792_887980:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_887792_887980:NOC2L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 888639 T/C 1 17 14 31 7.89468832262259 7.49849196960493 0.396196353017657 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_888555_888668:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_888555_888668:NOC2L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 888659 T/C 1 11 13 24 5.10832773816756 6.96288540034743 -1.85455766217988 T:C T C 10 0.535606569257495 0.540621078426603 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_888555_888668:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_888555_888668:NOC2L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 889238 G/A 1 18 14 32 8.35908175336509 7.49849196960493 0.860589783760162 A:G G A 10 0.535606569257495 0.859952664418775 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_889162_889272:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_889162_889272:NOC2L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 897325 G/C 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 C:G G C 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_897206_897427:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_897206_897427:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000455747:exon_897206_897652:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000463212:exon_897206_897858:KLHL17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 897738 C/T 1 8 11 19 3.71514744594004 5.89167226183244 -2.1765248158924 T:C C T 10 0.535606569257495 0.362403407231352 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_897735_897851:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_897735_897851:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000463212:exon_897206_897858:KLHL17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 949608 G/A 1 621 434 1055 288.388320491096 232.453251057753 55.9350694333428 A:G G A 10 0.535606569257495 0.000542988587474017 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 1390875 C/T 0 9 0 9 4.17954087668255 0 4.17954087668255 C C 10 0.535606569257495 0.00463210411669919 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000475091:exon_1390840_1390899:ATAD3C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 9 1 10 4.17954087668255 0.535606569257495 3.64393430742505 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0246360115647308 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 21 16 37 9.75226204559261 8.56970510811992 1.18255693747269 T:C T C 10 0.535606569257495 0.74382946670773 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 1562536 G/A 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1562217_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562454_1562587:MIB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 1635004 T/C 1 21 9 30 9.75226204559261 4.82045912331745 4.93180292227515 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0979585450853748 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1634915_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000467737:exon_1634915_1635011:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000478901:exon_1634527_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1634915_1635063:CDK11A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 48 23 71 22.2908846756402 12.3189510929224 9.97193358271786 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0174930602896738 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 1686040 G/T 1 23 49 72 10.6810489070776 26.2447218936173 -15.5636729865396 T:G G T 10 0.535606569257495 0.000324137521052089 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000469045:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000480499:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497747:exon_1685983_1686305:NADK;ENSG00000008130:ENST00000477235:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000489538:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497615:exon_1685983_1686335:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497186:exon_1685983_1686137:NADK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 7 12 19 3.25075401519754 6.42727883108994 -3.1765248158924 T:C C T 10 0.535606569257495 0.170258554353078 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 2340200 T/C 1 14 15 29 6.50150803039507 8.03409853886242 -1.53259050846735 T:C T C 10 0.535606569257495 0.582160963982168 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000510434:exon_2339895_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000508384:exon_2339969_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000515760:exon_2340022_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000502666:exon_2340043_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000504111:exon_2340074_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000514502:exon_2340194_2340297:PEX10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 3638674 C/T 1 4 12 16 1.85757372297002 6.42727883108994 -4.56970510811992 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0247475125779134 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3638585_3638771:TP73 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 3745924 G/A 1 11 12 23 5.10832773816756 6.42727883108994 -1.31895109292238 A:G G A 10 0.535606569257495 0.677398717546528 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000461667:exon_3745830_3745937:KIAA0562 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 3754043 C/T 1 10 9 19 4.64393430742505 4.82045912331745 -0.176524815892404 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3753856_3754083:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3753856_3754083:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3753856_3754083:KIAA0562 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 3755675 T/C 1 14 10 24 6.50150803039507 5.35606569257495 1.14544233782012 T:C T C 10 0.535606569257495 0.686918776217185 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3755647_3755683:KIAA0562 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 3761479 C/T 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 T:C C T 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494951:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378223:exon_3761471_3761547:KIAA0562 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 3800242 A/G 1 6 13 19 2.78636058445503 6.96288540034743 -4.1765248158924 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0659965969592849 ENSG00000169598:ENST00000378209:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000491998:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000430539:exon_3800071_3801984:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000468793:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000477548:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000339350:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000378206:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000475969:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000448632:exon_3800071_3800305:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000461150:exon_3800071_3800364:DFFB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 6705874 G/C 1 15 20 35 6.96590146113758 10.7121313851499 -3.74622992401232 C:G G C 10 0.535606569257495 0.236559322539850 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 7909737 C/T 0 0 41 41 0 21.9598693395573 -21.9598693395573 T C T 10 0.535606569257495 2.19952434267548e-14 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000400910:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000361696:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7909700_7909743:UTS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 7913430 G/A 0 45 0 45 20.8977043834127 0 20.8977043834127 G G 10 0.535606569257495 6.82269752202945e-13 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7913367_7913572:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7913367_7913491:UTS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 8421092 C/T 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8420172_8421550:RERE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 8425900 T/C 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 T:C T C 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8425872_8426034:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8425872_8426034:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8425872_8426034:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400907:exon_8425872_8426034:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8425872_8426034:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8425872_8426034:RERE;ENSG00000142599:ENST00000488215:exon_8425872_8426034:RERE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 9992024 C/G 1 6 11 17 2.78636058445503 5.89167226183244 -3.10531167737741 C:G C G 10 0.535606569257495 0.149431785983435 ENSG00000162441:ENST00000486804:exon_9991949_9992030:LZIC;ENSG00000162441:ENST00000488540:exon_9991949_9992030:LZIC;ENSG00000162441:ENST00000377223:exon_9991949_9992030:LZIC;ENSG00000162441:ENST00000400903:exon_9991949_9992030:LZIC;ENSG00000162441:ENST00000377213:exon_9991949_9992030:LZIC;ENSG00000162441:ENST00000471853:exon_9991949_9992238:LZIC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 10195185 A/G 1 4 7 11 1.85757372297002 3.74924598480246 -1.89167226183244 A:G A G 10 0.535606569257495 0.36607342785591 ENSG00000130939:ENST00000253251:exon_10195046_10195244:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000377157:exon_10195046_10195244:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000343090:exon_10195046_10195244:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000414346:exon_10195046_10195244:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000470736:exon_10195046_10195244:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000466379:exon_10195046_10195244:UBE4B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 10725498 G/A 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10725140_10725628:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10725140_10725628:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10725140_10725628:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000478728:exon_10725140_10725628:CASZ1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 27 25 52 12.5386226300476 13.3901642314374 -0.851541601389737 A:G G A 10 0.535606569257495 0.889655019147133 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 11141187 C/G 1 23 29 52 10.6810489070776 15.5325905084674 -4.85154160138974 C:G C G 10 0.535606569257495 0.210726411275746 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11141139_11141274:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11141139_11141295:EXOSC10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 11190646 G/A 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11190586_11190834:MTOR;ENSG00000198793:ENST00000376838:exon_11190586_11191615:MTOR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 11205058 C/T 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11205025_11205102:MTOR;ENSG00000198793:ENST00000495435:exon_11204705_11205082:MTOR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 11288758 G/A 1 8 10 18 3.71514744594004 5.35606569257495 -1.64091824663491 A:G G A 10 0.535606569257495 0.484651981913674 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11288725_11288975:MTOR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 11708736 T/C 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 T:C T C 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000116661:ENST00000354287:exon_11708424_11708885:FBXO2;ENSG00000116661:ENST00000376779:exon_11708450_11708885:FBXO2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 28 22 50 13.0030160607901 11.7833445236649 1.21967153712525 A:G G A 10 0.535606569257495 0.777936932990307 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 11728934 C/T 1 19 13 32 8.8234751841076 6.96288540034743 1.86058978376016 T:C C T 10 0.535606569257495 0.596333954023765 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 11856378 G/A 1 4 10 14 1.85757372297002 5.35606569257495 -3.49849196960493 A:G G A 10 0.535606569257495 0.104522536584723 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11856263_11856456:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11856263_11856456:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11856263_11856456:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11856263_11856456:MTHFR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 12 17 29 5.57272116891006 9.10531167737741 -3.53259050846735 T:C C T 10 0.535606569257495 0.197911784817732 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 11 7 18 5.10832773816756 3.74924598480246 1.35908175336509 T:C C T 10 0.535606569257495 0.638915092572894 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 12082334 A/T 1 35 31 66 16.2537700759877 16.6038036469823 -0.350033570994665 A:T A T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082279_12082499:MIIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 12090001 T/C 1 5 10 15 2.32196715371253 5.35606569257495 -3.03409853886242 T:C T C 10 0.535606569257495 0.128072258736022 ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 63 42 105 29.2567861367778 22.4954759088148 6.76131022796303 T:C T C 10 0.535606569257495 0.203745511100323 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 12248942 A/G 1 42 42 84 19.5045240911852 22.4954759088148 -2.99095181762958 A:G A G 10 0.535606569257495 0.514148267641498 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 12252955 T/G 1 88 76 164 40.8666219053404 40.7060992635696 0.160522641770832 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 12253062 G/A 1 81 55 136 37.6158678901429 29.4583613091622 8.15750658098069 A:G G A 10 0.535606569257495 0.16954213247903 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 14109023 C/T 1 35 42 77 16.2537700759877 22.4954759088148 -6.24170583282711 T:C C T 10 0.535606569257495 0.170627042247747 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 15850603 G/A 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 A:G G A 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000132906:ENST00000333868:exon_15850564_15850790:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000348549:exon_15850564_15850716:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375890:exon_15850564_15850790:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375874:exon_15850564_15850790:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000400777:exon_15850564_15850721:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000474305:exon_15850564_15850687:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000440484:exon_15850564_15850712:CASP9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 15892415 A/C 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 A:C A C 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000116138:ENST00000375847:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375838:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000475133:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375849:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000483270:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000472665:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000479655:exon_15892313_15892494:DNAJC16 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 15904318 C/T 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 T:C C T 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15904180_15904359:AGMAT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 15905501 G/A 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 A:G G A 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15905354_15905549:AGMAT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 15909744 C/T 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 15986547 T/C 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000197312:ENST00000480945:exon_15986332_15995539:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000320153:exon_15986332_15987552:DDI2;ENSG00000215695:ENST00000345034:exon_15986364_15988217:RSC1A1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 16042766 T/C 1 8 15 23 3.71514744594004 8.03409853886242 -4.31895109292238 T:C T C 10 0.535606569257495 0.093185649776015 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000462455:exon_16042732_16042838:PLEKHM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 16044401 G/A 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000462455:exon_16044388_16044487:PLEKHM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 16255644 C/T 1 11 4 15 5.10832773816756 2.14242627702998 2.96590146113758 T:C C T 10 0.535606569257495 0.194138829836023 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN;ENSG00000065526:ENST00000375753:exon_16254586_16255713:SPEN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 16256007 T/C 1 14 7 21 6.50150803039507 3.74924598480246 2.75226204559261 T:C T C 10 0.535606569257495 0.277038580102749 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 16259813 A/G 1 18 20 38 8.35908175336509 10.7121313851499 -2.35304963178481 A:G A G 10 0.535606569257495 0.516185836987251 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 16260916 C/T 1 13 9 22 6.03711459965257 4.82045912331745 1.21665547633511 T:C C T 10 0.535606569257495 0.672817163244646 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 16262047 G/A 1 18 14 32 8.35908175336509 7.49849196960493 0.860589783760162 A:G G A 10 0.535606569257495 0.859952664418775 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 16262404 C/T 1 11 7 18 5.10832773816756 3.74924598480246 1.35908175336509 T:C C T 10 0.535606569257495 0.638915092572894 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 16272250 A/G 1 12 12 24 5.57272116891006 6.42727883108994 -0.854557662179879 A:G A G 10 0.535606569257495 0.838559306298216 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 16577908 G/C 1 33 22 55 15.3249832145027 11.7833445236649 3.54163869083778 C:G G C 10 0.535606569257495 0.348179220802054 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 16641899 C/T 1 9 13 22 4.17954087668255 6.96288540034743 -2.78334452366489 T:C C T 10 0.535606569257495 0.286635935669917 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16641664_16641930:FBXO42 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 17312743 C/T 1 26 31 57 12.0742291993051 16.6038036469823 -4.52957444767721 T:C C T 10 0.535606569257495 0.235095694646223 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312454_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17312476_17312853:ATP13A2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 17313343 G/A 1 11 14 25 5.10832773816756 7.49849196960493 -2.39016423143737 A:G G A 10 0.535606569257495 0.423378530112683 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312958_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313300_17313451:ATP13A2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 17313654 C/T 1 10 12 22 4.64393430742505 6.42727883108994 -1.78334452366489 T:C C T 10 0.535606569257495 0.523642698847636 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313541_17313764:ATP13A2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 17314702 C/T 1 16 13 29 7.43029489188008 6.96288540034743 0.467409491532647 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314633_17314729:ATP13A2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 17314942 G/A 1 23 8 31 10.6810489070776 4.28485255405996 6.39619635301766 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0290859918434833 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314817_17314969:ATP13A2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 17319011 G/A 1 6 12 18 2.78636058445503 6.42727883108994 -3.64091824663491 A:G G A 10 0.535606569257495 0.100181682544637 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000503552:exon_17318981_17319076:ATP13A2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 17982559 G/A 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 A:G G A 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000074964:ENST00000361221:exon_17982374_17982597:ARHGEF10L;ENSG00000074964:ENST00000452522:exon_17982374_17982597:ARHGEF10L;ENSG00000074964:ENST00000375420:exon_17982374_17982597:ARHGEF10L;ENSG00000074964:ENST00000434513:exon_17982374_17982597:ARHGEF10L;ENSG00000074964:ENST00000375415:exon_17982374_17982597:ARHGEF10L;ENSG00000074964:ENST00000469726:exon_17982374_17982597:ARHGEF10L;ENSG00000074964:ENST00000375408:exon_17982374_17982597:ARHGEF10L;ENSG00000074964:ENST00000457829:exon_17982374_17982597:ARHGEF10L;ENSG00000074964:ENST00000167825:exon_17982374_17982597:ARHGEF10L;ENSG00000074964:ENST00000475356:exon_17982374_17982597:ARHGEF10L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 19499560 T/C 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 T:C T C 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19499358_19499587:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000419533:exon_19499358_19499587:UBR4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 20072082 C/T 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 T:C C T 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20072025_20072144:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20072025_20072144:TMCO4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 20073019 C/T 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20072949_20073092:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20072949_20073092:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20072949_20073092:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20072949_20073092:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489135:exon_20072949_20073092:TMCO4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 22149935 T/C 1 2 8 10 0.92878686148501 4.28485255405996 -3.35606569257495 T:C T C 10 0.535606569257495 0.052560989900699 ENSG00000187942:ENST00000344642:exon_22148695_22151714:LDLRAD2;ENSG00000142798:ENST00000486901:exon_22148738_22149981:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000374695:exon_22148738_22149981:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000457597:exon_22148738_22149981:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000481644:exon_22149794_22149981:HSPG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 25233815 G/A 1 71 67 138 32.9719335827179 35.8856401402522 -2.9137065575343 A:T:G G A 10 0.535606569257495 0.669753464258273 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25233750_25233908:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000308873:exon_25233750_25233908:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25233750_25233908:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000496967:exon_25233750_25233908:RUNX3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 26644537 C/A 1 1124 1256 2380 521.978216154576 672.721850987414 -150.743634832838 A:C:G C A 10 0.535606569257495 6.7022282943011e-10 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26644448_26644562:CD52;ENSG00000169442:ENST00000492808:exon_26644449_26644562:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26644449_26644562:CD52 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 16 21 37 7.43029489188008 11.2477379544074 -3.81744306252731 A:G G A 10 0.535606569257495 0.248942126758230 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 26883511 A/C 1 71 60 131 32.9719335827179 32.1363941554497 0.835539427268166 A:T:C A C 10 0.535606569257495 0.930286400174493 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000488985:exon_26883489_26883527:RPS6KA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 54 64 118 25.0772452600953 34.2788204324797 -9.2015751723844 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0967385377248624 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 26900735 C/G 1 129 143 272 59.9067525657832 76.5917394038218 -16.6849868380386 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0448236812602304 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 28206588 T/C 1 10 9 19 4.64393430742505 4.82045912331745 -0.176524815892404 T:C T C 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 181 74 255 84.0552109643934 39.6348861250546 44.4203248393388 A:G A G 10 0.535606569257495 1.67030785081291e-08 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 168 50 218 78.0180963647408 26.7803284628747 51.2377679018661 T:C T C 10 0.535606569257495 9.89855535381026e-13 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 165 51 216 76.6249160725133 27.3159350321322 49.3089810403811 A:G A G 10 0.535606569257495 6.05553272370087e-12 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 468 258 726 217.336125587492 138.186494868434 79.1496307190587 T:C T C 10 0.535606569257495 2.91991230676782e-09 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 31898234 T/C 1 80 40 120 37.1514744594004 21.4242627702998 15.7272116891006 A:T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.00438249120109093 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31898177_31898256:SERINC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 33245802 C/G 1 80 71 151 37.1514744594004 38.0280664172821 -0.876591957881736 C:G C G 10 0.535606569257495 0.935017739839587 ENSG00000134684:ENST00000469100:exon_33245686_33245879:YARS;ENSG00000134684:ENST00000373477:exon_33245686_33245879:YARS;ENSG00000134684:ENST00000490826:exon_33244983_33246312:YARS;ENSG00000134684:ENST00000487404:exon_33245686_33245879:YARS;ENSG00000134684:ENST00000478828:exon_33245686_33245879:YARS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 33402515 C/T 1 101 79 180 46.903736504993 42.3129189713421 4.59081753365091 T:C C T 10 0.535606569257495 0.502273641059567 ENSG00000116514:ENST00000373456:exon_33402046_33402860:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000401899:exon_33402050_33402860:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000356990:exon_33402055_33402910:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000405457:exon_33402057_33402910:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000235150:exon_33402269_33402860:RNF19B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 33402542 G/C 1 100 94 194 46.4393430742505 50.3470175102045 -3.90767443595402 C:G G C 10 0.535606569257495 0.614491251402843 ENSG00000116514:ENST00000373456:exon_33402046_33402860:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000401899:exon_33402050_33402860:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000356990:exon_33402055_33402910:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000405457:exon_33402057_33402910:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000235150:exon_33402269_33402860:RNF19B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 33409693 G/A 1 44 36 80 20.4333109526702 19.2818364932698 1.1514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.823431028678214 ENSG00000116514:ENST00000373456:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000401899:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000356990:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000405457:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000235150:exon_33409620_33409760:RNF19B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 30 20 50 13.9318029222752 10.7121313851499 3.21967153712525 A:G A G 10 0.535606569257495 0.396951250710927 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 36039962 T/G 1 7 1 8 3.25075401519754 0.535606569257495 2.71514744594004 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0758732255235235 ENSG00000116819:ENST00000373235:exon_36039528_36040010:TFAP2E;ENSG00000116819:ENST00000263543:exon_36039528_36040010:TFAP2E HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 36359669 A/G 1 8 5 13 3.71514744594004 2.67803284628747 1.03711459965257 A:G A G 10 0.535606569257495 0.593641770478394 ENSG00000092847:ENST00000373206:exon_36359638_36359772:EIF2C1;ENSG00000092847:ENST00000373204:exon_36359638_36359772:EIF2C1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 36557619 G/A 1 35 31 66 16.2537700759877 16.6038036469823 -0.350033570994665 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36557511_36557695:ADPRHL2;ENSG00000116863:ENST00000468594:exon_36557511_36557695:ADPRHL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 36638206 G/A 1 62 71 133 28.7923927060353 38.0280664172821 -9.23567371124683 A:G G A 10 0.535606569257495 0.117666337125505 ENSG00000116871:ENST00000429533:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36638065_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000462118:exon_36637569_36638228:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36638070_36638228:MAP7D1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 36752152 C/T 1 106 132 238 49.2257036587055 70.7000671419893 -21.4743634832838 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00622825512713173 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 36766603 C/T 1 93 102 195 43.188589059053 54.6318700642645 -11.4432810052115 T:C C T 10 0.535606569257495 0.114003806540425 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36766487_36766685:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36766487_36766685:THRAP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 38148765 A/G 1 6 10 16 2.78636058445503 5.35606569257495 -2.56970510811992 A:G A G 10 0.535606569257495 0.218581872606213 ENSG00000116922:ENST00000358011:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000494120:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000464178:exon_38148408_38148832:C1orf109 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 38 28 66 17.6469503682152 14.9969839392099 2.64996642900534 T:G G T 10 0.535606569257495 0.539323406003466 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 38338795 A/G 1 16 10 26 7.43029489188008 5.35606569257495 2.07422919930513 A:G A G 10 0.535606569257495 0.439420946397761 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 38449910 T/C 1 28 29 57 13.0030160607901 15.5325905084674 -2.52957444767721 T:C T C 10 0.535606569257495 0.509936478228601 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000489537:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000461869:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000470585:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000462258:exon_38449790_38449932:SF3A3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 13 6 19 6.03711459965257 3.21363941554497 2.8234751841076 T:C C T 10 0.535606569257495 0.251503218843434 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 39801815 A/C 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 A:C A C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 39835817 A/G 1 12 5 17 5.57272116891006 2.67803284628747 2.89468832262259 A:G A G 10 0.535606569257495 0.223927516543577 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000476350:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39835702_39835858:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39835702_39835858:MACF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 39908506 G/A 1 14 29 43 6.50150803039507 15.5325905084674 -9.03108247807228 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00853915254378337 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 24 22 46 11.1454423378201 11.7833445236649 -0.637902185844768 C:G G C 10 0.535606569257495 0.88322902719274 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 40928731 G/A 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 A:G G A 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000187801:ENST00000469416:exon_40928093_40929386:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000484445:exon_40928093_40929352:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000411995:exon_40928093_40929390:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000361584:exon_40928093_40929388:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000431552:exon_40928093_40929261:ZNF643 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 42654473 T/C 1 8 10 18 3.71514744594004 5.35606569257495 -1.64091824663491 T:C T C 10 0.535606569257495 0.484651981913674 ENSG00000198815:ENST00000372573:exon_42654408_42654599:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000372572:exon_42654408_42654599:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000372571:exon_42654408_42655480:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000361346:exon_42654408_42654599:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000361776:exon_42654408_42654599:FOXJ3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 43825644 T/C 1 28 11 39 13.0030160607901 5.89167226183244 7.1113437989577 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0243228285384507 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000478882:exon_43825438_43825768:CDC20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 43917637 G/A 1 11 8 19 5.10832773816756 4.28485255405996 0.823475184107596 A:G G A 10 0.535606569257495 0.819697348092054 ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43916008_43918304:KIAA0467;ENSG00000198198:ENST00000460536:exon_43916008_43918321:KIAA0467;ENSG00000178922:ENST00000372433:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000470662:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000487366:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372430:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372432:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372427:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000403034:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372426:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000486909:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000496142:exon_43917606_43917890:HYI HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 44137257 C/A 1 13 20 33 6.03711459965257 10.7121313851499 -4.67501678549733 A:C C A 10 0.535606569257495 0.117153333314120 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44137176_44137546:KDM4A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 44415415 C/T 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 T:C C T 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000117408:ENST00000372343:exon_44415089_44415825:IPO13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 45806768 T/G 1 8 11 19 3.71514744594004 5.89167226183244 -2.1765248158924 T:G T G 10 0.535606569257495 0.362403407231352 ENSG00000132773:ENST00000372090:exon_45806745_45806887:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000477731:exon_45806745_45806887:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000471337:exon_45806745_45806887:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000495703:exon_45806745_45806887:TOE1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 45973928 G/A 1 10 8 18 4.64393430742505 4.28485255405996 0.359081753365091 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000132763:ENST00000401061:exon_45973884_45974036:MMACHC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 14 13 27 6.50150803039507 6.96288540034743 -0.461377369952364 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 69 47 116 32.0431467212329 25.1735087551023 6.86963796613059 A:G A G 10 0.535606569257495 0.226261336332536 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 82 58 140 38.0802613208854 31.0651810169347 7.0150803039507 T:C C T 10 0.535606569257495 0.270615219954553 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 38 40 78 17.6469503682152 21.4242627702998 -3.7773124020846 A:G A G 10 0.535606569257495 0.42746712385262 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 71 86 157 32.9719335827179 46.0621649561446 -13.0902313734267 A:T:C T C 10 0.535606569257495 0.0375994474896845 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46195375 T/C 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 T:C T C 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000197429:ENST00000359942:exon_46195286_46195441:IPP;ENSG00000197429:ENST00000396478:exon_46195286_46195441:IPP;ENSG00000197429:ENST00000396474:exon_46195286_46195441:IPP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46493460 T/G 1 3 8 11 1.39318029222752 4.28485255405996 -2.89167226183244 T:G T G 10 0.535606569257495 0.127650256211486 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000498364:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372008:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46493403_46493535:MAST2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 7 10 17 3.25075401519754 5.35606569257495 -2.10531167737741 A:G A G 10 0.535606569257495 0.338652205084508 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 27 17 44 12.5386226300476 9.10531167737741 3.43331095267022 A:G A G 10 0.535606569257495 0.364851067911095 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46500744 G/C 1 14 20 34 6.50150803039507 10.7121313851499 -4.21062335475483 C:G G C 10 0.535606569257495 0.169967005226398 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46521517 G/A 1 12 2 14 5.57272116891006 1.07121313851499 4.50150803039507 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0160379660597638 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46521559 A/T 1 10 3 13 4.64393430742505 1.60681970777248 3.03711459965257 A:T A T 10 0.535606569257495 0.102916600745183 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46743900 C/T 1 13 10 23 6.03711459965257 5.35606569257495 0.681048907077616 T:C C T 10 0.535606569257495 0.836732692537685 ENSG00000085999:ENST00000442598:exon_46743744_46744145:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000371975:exon_46743744_46744144:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000488942:exon_46743744_46744111:RAD54L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46746164 C/T 1 66 71 137 30.6499664290053 38.0280664172821 -7.37809998827681 T:C C T 10 0.535606569257495 0.230415109892665 ENSG00000132128:ENST00000496156:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000343304:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000472710:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000254454:exon_46746068_46746232:LRRC41 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 19 29 48 8.8234751841076 15.5325905084674 -6.70911532435976 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0597531169011971 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 46827456 A/G 1 80 54 134 37.1514744594004 28.9227547399047 8.22871971949568 A:G A G 10 0.535606569257495 0.166101911046643 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 60 58 118 27.8636058445503 31.0651810169347 -3.20157517238441 A:G G A 10 0.535606569257495 0.580388106135505 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 53716416 G/A 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 53732315 G/T 1 19 29 48 8.8234751841076 15.5325905084674 -6.70911532435976 T:G G T 10 0.535606569257495 0.0597531169011971 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000459674:exon_53732145_53734270:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000475501:exon_53732145_53732319:LRP8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 55182300 T/A 1 6 10 16 2.78636058445503 5.35606569257495 -2.56970510811992 A:T T A 10 0.535606569257495 0.218581872606213 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000486621:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55182273_55182390:TTC4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 48 38 86 22.2908846756402 20.3530496317848 1.93783504385544 A:G A G 10 0.535606569257495 0.74595978195561 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 62579907 C/T 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 62676091 C/A 0 66 0 66 30.6499664290053 0 30.6499664290053 C C 10 0.535606569257495 1.57305136535643e-18 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 62677048 G/T 0 0 25 25 0 13.3901642314374 -13.3901642314374 T G T 10 0.535606569257495 4.70058262258651e-09 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 62677050 C/T 0 0 25 25 0 13.3901642314374 -13.3901642314374 T C T 10 0.535606569257495 4.70058262258651e-09 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 62677118 A/G 0 0 39 39 0 20.8886562010423 -20.8886562010423 G A G 10 0.535606569257495 1.01989775901461e-13 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 62960101 A/G 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 A:G A G 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000116641:ENST00000371140:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000395441:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000251157:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000340370:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000454575:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000479983:exon_62959946_62960969:DOCK7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 32 34 66 14.8605897837602 18.2106233547548 -3.35003357099467 T:C C T 10 0.535606569257495 0.459493282321043 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 64114301 T/C 1 62 72 134 28.7923927060353 38.5636729865396 -9.77128028050432 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0997529447736028 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 65311214 G/C 1 13 12 25 6.03711459965257 6.42727883108994 -0.390164231437374 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 65311262 G/A 1 13 11 24 6.03711459965257 5.89167226183244 0.145442337820121 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 65321250 G/A 1 6 10 16 2.78636058445503 5.35606569257495 -2.56970510811992 A:G G A 10 0.535606569257495 0.218581872606213 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65321192_65321381:JAK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 75172001 T/A 1 111 105 216 51.5476708124181 56.238689772037 -4.69101895961891 A:T T A 10 0.535606569257495 0.53964653502785 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000492102:exon_75171172_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75171174_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75171656_75172141:CRYZ HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 29 43 72 13.4674094915326 23.0310824780723 -9.56367298653964 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0249508560430232 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 40 32 72 18.5757372297002 17.1394102162398 1.43632701346036 A:G A G 10 0.535606569257495 0.813448045189642 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 77558057 G/C 1 7 10 17 3.25075401519754 5.35606569257495 -2.10531167737741 C:G G C 10 0.535606569257495 0.338652205084508 ENSG00000142892:ENST00000370812:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000445065:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000370813:exon_77557389_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000487906:exon_77557887_77558175:PIGK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 10 8 18 4.64393430742505 4.28485255405996 0.359081753365091 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 78201745 G/T 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:G G T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78201741_78201843:USP33;ENSG00000077254:ENST00000524536:exon_78201741_78201843:USP33 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 85113229 A/G 1 19 8 27 8.8234751841076 4.28485255405996 4.53862263004764 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0854897429602086 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 85724294 T/C 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 T:C T C 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 2 7 9 0.92878686148501 3.74924598480246 -2.82045912331745 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0914723743517246 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 89474818 A/G 1 22 2 24 10.2166554763351 1.07121313851499 9.14544233782012 A:G A G 10 0.535606569257495 0.000106672803106081 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000461384:exon_89474527_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000445969:exon_89474618_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89474782_89474823:GBP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 89475135 C/T 1 18 3 21 8.35908175336509 1.60681970777248 6.75226204559261 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0034181698094201 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000461384:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000445969:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89475075_89475177:GBP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 89522646 G/C 1 22 3 25 10.2166554763351 1.60681970777248 8.60983576856263 C:G G C 10 0.535606569257495 0.000414576367300623 ENSG00000117228:ENST00000422952:exon_89522537_89522728:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89522537_89522817:GBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 89579941 T/C 1 72 72 144 33.4363270134604 38.5636729865396 -5.12734597307927 T:C T C 10 0.535606569257495 0.404320401213992 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89579699_89579979:GBP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 89582690 G/C 1 62 50 112 28.7923927060353 26.7803284628747 2.01206424316057 A:C:G G C 10 0.535606569257495 0.776410756882592 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 93306317 G/A 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:G G A 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 93826178 A/T 1 32 43 75 14.8605897837602 23.0310824780723 -8.17049269431212 A:T A T 10 0.535606569257495 0.0640651202059878 ENSG00000117505:ENST00000370272:exon_93826050_93828149:DR1;ENSG00000117505:ENST00000370267:exon_93826050_93826725:DR1;ENSG00000117505:ENST00000481583:exon_93826050_93826492:DR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 50 55 105 23.2196715371253 29.4583613091622 -6.23868977203697 A:G A G 10 0.535606569257495 0.240750301682515 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 94342564 C/A 1 130 84 214 60.3711459965257 44.9909518176296 15.3801941788961 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0395527788043139 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 94343023 A/G 1 97 110 207 45.046162782023 58.9167226183244 -13.8705598363015 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0596971377109508 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 94344716 C/T 1 35 20 55 16.2537700759877 10.7121313851499 5.54163869083778 T:C C T 10 0.535606569257495 0.139437539103638 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 94930345 G/A 1 4 10 14 1.85757372297002 5.35606569257495 -3.49849196960493 A:G G A 10 0.535606569257495 0.104522536584723 ENSG00000117528:ENST00000454898:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000394233:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000370214:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000315713:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000468860:exon_94930331_94930429:ABCD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 100316589 A/G 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:G A G 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100316531_100316680:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100316531_100316680:AGL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 100336361 C/T 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100336314_100336425:AGL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 100361925 G/A 1 4 10 14 1.85757372297002 5.35606569257495 -3.49849196960493 A:G G A 10 0.535606569257495 0.104522536584723 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100361842_100361944:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100361842_100361944:AGL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 14 6 20 6.50150803039507 3.21363941554497 3.2878686148501 C:G G C 10 0.535606569257495 0.179439517734263 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 109486196 A/G 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 A:G A G 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369976:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000482889:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369972:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109486097_109486237:CLCC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 110170896 T/C 1 18 29 47 8.35908175336509 15.5325905084674 -7.17350875510226 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0404733089349167 ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000529299:exon_110170705_110171157:AMPD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 110466555 G/A 1 100 91 191 46.4393430742505 48.740197802432 -2.30085472818154 A:G G A 10 0.535606569257495 0.771839180645414 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 102 81 183 47.3681299357355 43.3841321098571 3.98399782587843 A:T:C C A 10 0.535606569257495 0.604047329116212 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 110883569 A/T 1 18 17 35 8.35908175336509 9.10531167737741 -0.746229924012324 A:T A T 10 0.535606569257495 0.866104025326506 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 110950277 G/A 1 65 81 146 30.1855729982628 43.3841321098571 -13.1985591115943 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0308699871071535 ENSG00000134248:ENST00000483260:exon_110950208_110950290:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000474861:exon_110949655_110950293:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000464240:exon_110948940_110950316:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000369775:exon_110950208_110950560:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000256644:exon_110950208_110950564:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000531779:exon_110950208_110950286:HBXIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 403 392 795 187.15055258923 209.957775148938 -22.8072225597085 T:C C T 10 0.535606569257495 0.109560415941267 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 111726869 G/A 1 41 40 81 19.0401306604427 21.4242627702998 -2.38413210985709 A:G G A 10 0.535606569257495 0.656221959751725 ENSG00000134255:ENST00000498239:exon_111726813_111727430:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000357172:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000478042:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000473474:exon_111726813_111726953:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000467362:exon_111726813_111727722:CEPT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 111730901 C/T 1 95 49 144 44.117375920538 26.2447218936173 17.8726540269207 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00331319941772897 ENSG00000162777:ENST00000468692:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111730753_111730992:DENND2D HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 112298582 A/G 1 8 11 19 3.71514744594004 5.89167226183244 -2.1765248158924 A:G A G 10 0.535606569257495 0.362403407231352 ENSG00000064703:ENST00000533164:exon_112298435_112298847:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112297927_112298847:DDX20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 112309123 C/A 1 39 35 74 18.1113437989577 18.7462299240123 -0.634886125054624 A:C C A 10 0.535606569257495 0.907593421717696 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 112309331 T/C 1 36 29 65 16.7181635067302 15.5325905084674 1.18557299826283 T:C T C 10 0.535606569257495 0.80454184826672 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 114301335 C/T 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 T:C C T 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114301281_114301470:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000446739:exon_114301281_114301780:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000493212:exon_114301281_114302111:PHTF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 114448197 A/G 1 6 12 18 2.78636058445503 6.42727883108994 -3.64091824663491 A:G A G 10 0.535606569257495 0.100181682544637 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114447763_114448397:DCLRE1B;ENSG00000118655:ENST00000466480:exon_114448031_114448397:DCLRE1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 114448389 C/T 1 14 10 24 6.50150803039507 5.35606569257495 1.14544233782012 T:C C T 10 0.535606569257495 0.686918776217185 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114447763_114448397:DCLRE1B;ENSG00000118655:ENST00000466480:exon_114448031_114448397:DCLRE1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 114449662 T/C 1 7 8 15 3.25075401519754 4.28485255405996 -1.03409853886242 T:C T C 10 0.535606569257495 0.614879753164389 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114449618_114449783:DCLRE1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 119469188 G/T 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 T:G G T 10 0.535606569257495 0.193170376367493 ENSG00000092607:ENST00000344218:exon_119469133_119469234:TBX15;ENSG00000092607:ENST00000207157:exon_119469133_119469234:TBX15;ENSG00000092607:ENST00000369429:exon_119469133_119469234:TBX15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 15 24 39 6.96590146113758 12.8545576621799 -5.8886562010423 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0762361846174624 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 144909956 G/A 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 A:G G A 10 0.535606569257495 0.193170376367493 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144909869_144909960:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 0 11 0 11 5.10832773816756 0 5.10832773816756 C C 10 0.535606569257495 0.00125729441466232 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 144915463 G/C 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 C:G G C 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144915445_144915639:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144915445_144915639:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144915445_144915639:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144915445_144915639:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144915445_144915639:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144915445_144915639:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144915445_144915639:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144915445_144915639:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144915445_144915639:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144915445_144915639:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144915445_144915639:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144915445_144915639:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 144916748 C/G 0 11 0 11 5.10832773816756 0 5.10832773816756 C C 10 0.535606569257495 0.00125729441466232 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144916705_144916749:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 144917546 A/G 0 11 0 11 5.10832773816756 0 5.10832773816756 A A 10 0.535606569257495 0.00125729441466232 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144917499_144917636:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 144918957 T/A 1 9 1 10 4.17954087668255 0.535606569257495 3.64393430742505 A:T T A 10 0.535606569257495 0.0246360115647308 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000525886:exon_144918833_144919011:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144918833_144918991:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 144921924 G/A 0 10 0 10 4.64393430742505 0 4.64393430742505 G G 10 0.535606569257495 0.00240944773358457 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144921835_144922065:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000532801:exon_144921835_144922020:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 144922583 G/A 1 9 1 10 4.17954087668255 0.535606569257495 3.64393430742505 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0246360115647308 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144922519_144922638:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 144930596 C/A 1 12 2 14 5.57272116891006 1.07121313851499 4.50150803039507 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0160379660597638 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 144930940 T/C 1 14 2 16 6.50150803039507 1.07121313851499 5.43029489188008 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0096783964524247 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 144931330 C/T 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 144931392 G/A 1 8 2 10 3.71514744594004 1.07121313851499 2.64393430742505 A:G G A 10 0.535606569257495 0.118289200524796 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 144931581 C/G 0 8 0 8 3.71514744594004 0 3.71514744594004 C C 10 0.535606569257495 0.00893594247670414 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 144994658 C/A 0 8 0 8 3.71514744594004 0 3.71514744594004 C C 10 0.535606569257495 0.00893594247670414 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144994591_144994921:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144994591_144995022:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144994591_144994840:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144994591_144994876:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496572:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530078:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000497529:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000533845:exon_144994591_144994925:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000534536:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369347:exon_144994591_144994909:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000527063:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369348:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000528129:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000526445:exon_144994591_144994925:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530472:exon_144994591_144994925:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000464103:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000532803:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000533163:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000528552:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530822:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000531369:exon_144994591_144994701:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000533396:exon_144994591_144994701:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 145039633 C/T 1 9 1 10 4.17954087668255 0.535606569257495 3.64393430742505 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0246360115647308 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_145039590_145040002:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000532801:exon_145039590_145039779:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530078:exon_145039590_145039955:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000497529:exon_145039590_145039943:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000532803:exon_145039590_145039942:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000533163:exon_145039590_145039944:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000533259:exon_145039590_145039848:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530822:exon_145039590_145039792:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000493130:exon_145039590_145039771:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000478649:exon_145039590_145039786:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000485062:exon_145039590_145039865:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530940:exon_145039590_145039851:PDE4DIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 0 0 115 115 0 61.5947554646119 -61.5947554646119 A G A 10 0.535606569257495 4.91923734804484e-39 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 117 117 0 62.6659686031269 -62.6659686031269 C T C 10 0.535606569257495 1.06088891742218e-39 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 60 60 0 32.1363941554497 -32.1363941554497 T G T 10 0.535606569257495 1.03077542942177e-20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 51 51 0 27.3159350321322 -27.3159350321322 A C A 10 0.535606569257495 1.02609943640965e-17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 124 0 124 57.5847854120706 0 57.5847854120706 G G 10 0.535606569257495 3.22604132503136e-34 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 1 2 101 103 0.92878686148501 54.096263495007 -53.167476633522 T:C T C 10 0.535606569257495 3.47515704625859e-31 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 139 139 0 74.4493131267918 -74.4493131267918 T C T 10 0.535606569257495 4.979243904813e-47 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 146740502 C/G 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 C:G C G 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146740441_146740537:CHD1L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 149915754 G/A 1 8 9 17 3.71514744594004 4.82045912331745 -1.10531167737741 A:G G A 10 0.535606569257495 0.633230727718346 ENSG00000163113:ENST00000369135:exon_149912231_149916964:OTUD7B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 98 93 191 45.5105562127655 49.811410940947 -4.30085472818153 T:C:G G T 10 0.535606569257495 0.561915967074241 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 150445819 A/G 1 17 5 22 7.89468832262259 2.67803284628747 5.21665547633511 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0312471224326523 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 150471056 C/T 1 8 13 21 3.71514744594004 6.96288540034743 -3.24773795440739 T:C C T 10 0.535606569257495 0.190432172043740 ENSG00000143374:ENST00000369054:exon_150470978_150471140:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369064:exon_150470978_150471140:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000438568:exon_150470978_150471140:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369052:exon_150470978_150471140:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369051:exon_150470978_150471140:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000467982:exon_150470978_150471140:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000480070:exon_150470978_150471140:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000463555:exon_150470978_150471140:TARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 1 66 86 152 30.6499664290053 46.0621649561446 -15.4121985271392 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0144538014137636 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 150808889 C/G 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 C:G C G 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000143437:ENST00000358595:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000322733:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000342710:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000394700:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000368975:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000471844:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000354396:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000515192:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000505755:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000468970:exon_150808756_150808975:ARNT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 28 46 74 13.0030160607901 24.6379021858448 -11.6348861250546 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00721102937896529 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 151374025 T/C 1 294 251 545 136.531668638296 134.437248883631 2.09441975466524 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.863728940412162 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151374018_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151374018_151374410:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151373715_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000466425:exon_151374018_151374106:PSMB4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 32 33 65 14.8605897837602 17.6750167854973 -2.81442700173717 A:C A C 10 0.535606569257495 0.534725089286702 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 152882610 A/G 1 14 33 47 6.50150803039507 17.6750167854973 -11.1735087551023 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0011574924457203 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 152883608 G/A 1 8 22 30 3.71514744594004 11.7833445236649 -8.06819707772485 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00509670932833296 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 152883680 A/G 1 12 16 28 5.57272116891006 8.56970510811992 -2.99698393920986 A:G A G 10 0.535606569257495 0.263118689191783 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 152883711 G/C 1 11 11 22 5.10832773816756 5.89167226183244 -0.783344523664889 C:G G C 10 0.535606569257495 0.831857301870848 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 153587308 C/T 1 15 5 20 6.96590146113758 2.67803284628747 4.2878686148501 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0714762006587093 ENSG00000189334:ENST00000476873:exon_153586731_153587498:S100A14;ENSG00000189334:ENST00000368701:exon_153586731_153587498:S100A14;ENSG00000189334:ENST00000368702:exon_153586731_153587498:S100A14;ENSG00000189334:ENST00000344616:exon_153586757_153587498:S100A14;ENSG00000189334:ENST00000368700:exon_153587253_153587498:S100A14 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 153588340 C/T 1 4 12 16 1.85757372297002 6.42727883108994 -4.56970510811992 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0247475125779134 ENSG00000189334:ENST00000476873:exon_153588305_153588414:S100A14;ENSG00000189334:ENST00000368701:exon_153588305_153588412:S100A14;ENSG00000189334:ENST00000368702:exon_153588305_153588412:S100A14;ENSG00000189334:ENST00000344616:exon_153588305_153588412:S100A14;ENSG00000189334:ENST00000469571:exon_153588305_153588412:S100A14 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 153604112 G/A 1 4 6 10 1.85757372297002 3.21363941554497 -1.35606569257495 A:G G A 10 0.535606569257495 0.529494183528195 ENSG00000189171:ENST00000469931:exon_153603967_153604301:S100A13;ENSG00000160678:ENST00000368696:exon_153603988_153604280:S100A1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 153909069 G/C 1 8 9 17 3.71514744594004 4.82045912331745 -1.10531167737741 C:G G C 10 0.535606569257495 0.633230727718346 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000477746:exon_153909018_153909118:DENND4B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 138 122 260 64.0862934424657 65.3440014494144 -1.25770800694868 A:G A G 10 0.535606569257495 0.901100856315499 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 31 24 55 14.3961963530177 12.8545576621799 1.54163869083778 T:C T C 10 0.535606569257495 0.688051526861313 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 153941514 C/T 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000143578:ENST00000449724:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368607:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000271889:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000461688:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368601:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368603:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368600:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000479010:exon_153941406_153941787:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000492729:exon_153941406_153941931:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000473340:exon_153940998_153941830:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000431292:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000405694:exon_153941406_153941652:CREB3L4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 56 36 92 26.0060321215803 19.2818364932698 6.72419562831046 C:G C G 10 0.535606569257495 0.174665755078046 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 156107534 C/T 0 0 182 182 0 97.4803956048641 -97.4803956048641 T C T 10 0.535606569257495 2.36191524023478e-61 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156107499_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156107445_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156107445_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156107445_156107952:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000506981:exon_156107253_156107534:LMNA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 156146218 C/T 1 36 27 63 16.7181635067302 14.4613773699524 2.25678613677782 T:C C T 10 0.535606569257495 0.614598338422256 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000484155:exon_156146196_156146447:SEMA4A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 156202173 A/G 1 28 22 50 13.0030160607901 11.7833445236649 1.21967153712525 A:G A G 10 0.535606569257495 0.777936932990307 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368279:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000466489:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368276:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000320139:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156202111_156202216:PMF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 156233189 C/T 1 20 12 32 9.2878686148501 6.42727883108994 2.86058978376016 T:C C T 10 0.535606569257495 0.376661791108923 ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156233186_156233361:SMG5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 156263940 T/C 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 156264000 G/A 1 15 16 31 6.96590146113758 8.56970510811992 -1.60380364698234 A:G G A 10 0.535606569257495 0.592923006525255 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 156280969 G/A 1 349 181 530 162.073307329134 96.9447890356066 65.1285182935277 A:G G A 10 0.535606569257495 1.27347710770524e-08 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 156280971 G/A 1 344 183 527 159.751340175422 98.0160021741216 61.7353380013002 A:T:G G A 10 0.535606569257495 5.45198375777816e-08 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 156697056 T/C 1 46 52 98 21.3620978141552 27.8515416013897 -6.4894437872345 T:C T C 10 0.535606569257495 0.189933480358025 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156696698_156698227:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156696698_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000496538:exon_156696698_156697178:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000470713:exon_156697003_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000469074:exon_156697034_156697600:ISG20L2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 156713623 C/T 1 178 193 371 82.6620306721659 103.372067866697 -20.7100371945306 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0327892247800125 ENSG00000143321:ENST00000357325:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000368209:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000465180:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000482651:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000477306:exon_156713099_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000368206:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000469145:exon_156713501_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000471377:exon_156713595_156713670:HDGF HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 156737969 C/T 1 28 31 59 13.0030160607901 16.6038036469823 -3.6007875861922 T:C C T 10 0.535606569257495 0.363281657808285 ENSG00000143294:ENST00000353233:exon_156737274_156738031:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000271526:exon_156737292_156738031:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156737346_156738031:PRCC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 156760887 C/A 1 1 8 9 0.464393430742505 4.28485255405996 -3.82045912331745 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0150595260113486 ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156760859_156760954:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000454659:exon_156760859_156760954:PRCC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 157508882 C/T 1 9 14 23 4.17954087668255 7.49849196960493 -3.31895109292238 T:C C T 10 0.535606569257495 0.209886792025538 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 157509025 C/T 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 T:C C T 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 11 7 18 5.10832773816756 3.74924598480246 1.35908175336509 A:T:G A G 10 0.535606569257495 0.638915092572894 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 160062472 C/T 1 10 6 16 4.64393430742505 3.21363941554497 1.43029489188008 T:C C T 10 0.535606569257495 0.618142335020353 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062376_160062485:IGSF8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 160062727 A/G 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062714_160063121:IGSF8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 160461060 C/T 1 19 22 41 8.8234751841076 11.7833445236649 -2.95986933955729 T:C C T 10 0.535606569257495 0.434088039067657 ENSG00000162739:ENST00000368059:exon_160460915_160461178:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368057:exon_160460915_160461178:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368055:exon_160460915_160461178:SLAMF6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 160616703 G/T 1 188 155 343 87.305964979591 83.0190182349117 4.28694674467924 T:G G T 10 0.535606569257495 0.665144621567283 ENSG00000117090:ENST00000302035:exon_160616660_160617085:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000235739:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000497223:exon_160616660_160616869:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000392208:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000355199:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000494463:exon_160616660_160616811:SLAMF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 1945 1290 3235 903.245222794172 690.932474342168 212.312748452004 A:T:C:G G A 10 0.535606569257495 6.28476400207807e-14 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 160990875 T/C 1 24 1 25 11.1454423378201 0.535606569257495 10.6098357685626 T:C T C 10 0.535606569257495 5.78930518164972e-06 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 160990876 C/A 0 26 0 26 12.0742291993051 0 12.0742291993051 C C 10 0.535606569257495 1.56765868784770e-07 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 160990878 C/T 0 24 0 24 11.1454423378201 0 11.1454423378201 C C 10 0.535606569257495 6.00973247897102e-07 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 84 10 94 39.0090481823704 5.35606569257495 33.6529824897955 A:G A G 10 0.535606569257495 1.27134558693763e-13 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 161721707 C/T 1 10 14 24 4.64393430742505 7.49849196960493 -2.85455766217988 T:C C T 10 0.535606569257495 0.306768141328979 ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 161748056 C/T 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 T:C C T 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161748034_161748110:ATF6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 161751741 A/G 1 10 9 19 4.64393430742505 4.82045912331745 -0.176524815892404 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161751702_161751789:ATF6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 161753802 T/C 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 161753841 G/A 1 12 13 25 5.57272116891006 6.96288540034743 -1.39016423143737 A:G G A 10 0.535606569257495 0.689399952434429 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 161761276 G/C 1 7 15 22 3.25075401519754 8.03409853886242 -4.78334452366489 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0529765719617484 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 161761312 C/T 1 19 35 54 8.8234751841076 18.7462299240123 -9.92275473990473 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00893033911396503 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 48 32 80 22.2908846756402 17.1394102162398 5.1514744594004 A:G A G 10 0.535606569257495 0.263841115739394 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 165652273 A/G 1 9 13 22 4.17954087668255 6.96288540034743 -2.78334452366489 A:G A G 10 0.535606569257495 0.286635935669917 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000461664:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000471457:exon_165652062_165652347:ALDH9A1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 165667781 T/G 1 12 5 17 5.57272116891006 2.67803284628747 2.89468832262259 T:G T G 10 0.535606569257495 0.223927516543577 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165667615_165668100:ALDH9A1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 166039898 C/G 1 26 8 34 12.0742291993051 4.28485255405996 7.78937664524517 C:G C G 10 0.535606569257495 0.00897077800765184 ENSG00000188859:ENST00000435676:exon_166039069_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000456900:exon_166039072_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000441649:exon_166038749_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000354422:exon_166039256_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000338353:exon_166039257_166040000:FAM78B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 166818566 A/G 1 20 26 46 9.2878686148501 13.9257708006949 -4.63790218584477 A:G A G 10 0.535606569257495 0.185093900029521 ENSG00000143157:ENST00000367876:exon_166818175_166819660:POGK;ENSG00000143157:ENST00000367875:exon_166818175_166823710:POGK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 60 55 115 27.8636058445503 29.4583613091622 -1.59475546461192 A:G G A 10 0.535606569257495 0.779776601386664 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 167973976 C/T 1 31 47 78 14.3961963530177 25.1735087551023 -10.7773124020846 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0167548209758154 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000470721:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_167973771_167974031:DCAF6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 76 61 137 35.2939007364304 32.6720007247072 2.6219000117232 A:G A G 10 0.535606569257495 0.669381016864092 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 169823718 T/C 1 28 37 65 13.0030160607901 19.8174430625273 -6.81442700173717 T:C T C 10 0.535606569257495 0.105592976651350 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 171486912 G/A 1 36 30 66 16.7181635067302 16.0681970777248 0.649966429005335 A:G G A 10 0.535606569257495 0.902345065079884 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171486730_171486953:BAT2L2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 30 22 52 13.9318029222752 11.7833445236649 2.14845839861026 T:C T C 10 0.535606569257495 0.580695934075432 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 171752946 A/T 1 20 19 39 9.2878686148501 10.1765248158924 -0.888656201042302 A:T A T 10 0.535606569257495 0.872763077008478 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 22 22 44 10.2166554763351 11.7833445236649 -1.56668904732978 A:G A G 10 0.535606569257495 0.653088089453632 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 14 19 33 6.50150803039507 10.1765248158924 -3.67501678549733 A:T:G G A 10 0.535606569257495 0.223916512924208 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 171763549 C/T 1 22 19 41 10.2166554763351 10.1765248158924 0.0401306604427081 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000466643:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000476386:exon_171763534_171763667:METTL13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 174188285 G/A 1 13 9 22 6.03711459965257 4.82045912331745 1.21665547633511 A:G G A 10 0.535606569257495 0.672817163244646 ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174188263_174188433:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174188263_174188433:RABGAP1L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 60 68 128 27.8636058445503 36.4212467095097 -8.55764086495936 T:C C T 10 0.535606569257495 0.132775024561531 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 180124061 G/C 1 6 10 16 2.78636058445503 5.35606569257495 -2.56970510811992 C:G G C 10 0.535606569257495 0.218581872606213 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180123968_180124307:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180123969_180124307:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180124032_180124307:QSOX1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 180159654 C/T 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 T:C C T 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180159568_180159715:QSOX1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 180159657 C/T 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 T:C C T 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180159568_180159715:QSOX1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 180953853 A/G 1 6 15 21 2.78636058445503 8.03409853886242 -5.24773795440739 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0273627820397729 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180953813_180953907:STX6;ENSG00000135823:ENST00000469135:exon_180953813_180953907:STX6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 181018236 A/G 1 14 22 36 6.50150803039507 11.7833445236649 -5.28183649326982 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0942056875493876 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 181018258 G/A 1 25 17 42 11.6098357685626 9.10531167737741 2.50452409118521 A:G G A 10 0.535606569257495 0.536582630303524 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 30 34 64 13.9318029222752 18.2106233547548 -4.27882043247968 A:G G A 10 0.535606569257495 0.31666379745502 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 181058313 G/A 1 35 40 75 16.2537700759877 21.4242627702998 -5.17049269431212 A:G G A 10 0.535606569257495 0.248039565486257 ENSG00000162783:ENST00000367577:exon_181057638_181059977:IER5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 13 28 41 6.03711459965257 14.9969839392099 -8.95986933955729 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00702053433195899 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 182844020 C/T 1 34 41 75 15.7893766452452 21.9598693395573 -6.17049269431212 T:C C T 10 0.535606569257495 0.165473582350496 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182843989_182844089:DHX9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 182845346 C/T 1 30 32 62 13.9318029222752 17.1394102162398 -3.20760729396469 T:C C T 10 0.535606569257495 0.446174527079597 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182845185_182845398:DHX9;ENSG00000135829:ENST00000490519:exon_182845264_182845398:DHX9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 183072701 C/T 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 T:C C T 10 0.535606569257495 0.193170376367493 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183072463_183072767:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000484114:exon_183072462_183072767:LAMC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 30 21 51 13.9318029222752 11.2477379544074 2.68406496786776 A:G G A 10 0.535606569257495 0.485140281593003 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 183212548 T/G 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000058085:ENST00000264144:exon_183212282_183214035:LAMC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 183515428 G/A 1 29 28 57 13.4674094915326 14.9969839392099 -1.52957444767721 A:G G A 10 0.535606569257495 0.692663470020653 ENSG00000116698:ENST00000367537:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000458370:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000367539:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000392015:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000413782:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000508461:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000347615:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000507469:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000515829:exon_183515101_183515472:SMG7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 183542387 T/C 1 127 114 241 58.9779657042981 61.0591488953544 -2.08118319105628 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.79646867462735 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183542320_183542427:NCF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 186316488 C/T 1 18 24 42 8.35908175336509 12.8545576621799 -4.49547590881479 T:C C T 10 0.535606569257495 0.167933697369805 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186316424_186316590:TPR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 192545099 G/A 1 12 6 18 5.57272116891006 3.21363941554497 2.35908175336509 A:G G A 10 0.535606569257495 0.346395564026953 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 192613475 G/A 1 17 9 26 7.89468832262259 4.82045912331745 3.07422919930513 A:T:G G A 10 0.535606569257495 0.244740828501064 ENSG00000127074:ENST00000391995:exon_192613461_192613529:RGS13;ENSG00000127074:ENST00000462955:exon_192613461_192613529:RGS13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 192780268 T/C 1 166 133 299 77.0893095032558 71.2356737112468 5.853635792009 T:C T C 10 0.535606569257495 0.523780483501299 ENSG00000116741:ENST00000235382:exon_192780111_192780277:RGS2;ENSG00000116741:ENST00000464302:exon_192780111_192780369:RGS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 197070442 G/T 1 6 8 14 2.78636058445503 4.28485255405996 -1.49849196960493 T:G G T 10 0.535606569257495 0.436988882100625 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197069561_197070645:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 197070697 T/C 1 12 14 26 5.57272116891006 7.49849196960493 -1.92577080069487 T:C T C 10 0.535606569257495 0.556217330538579 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 197070707 G/A 1 12 16 28 5.57272116891006 8.56970510811992 -2.99698393920986 A:G G A 10 0.535606569257495 0.263118689191783 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 197070776 C/T 1 11 11 22 5.10832773816756 5.89167226183244 -0.783344523664889 T:C C T 10 0.535606569257495 0.831857301870848 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 197072420 T/C 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 T:C T C 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 198671653 A/G 1 17 15 32 7.89468832262259 8.03409853886242 -0.139410216239837 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367367:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000391970:exon_198671516_198671659:PTPRC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 200558363 T/C 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 T:C T C 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200558345_200558497:KIF14 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 200867492 C/G 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000163362:ENST00000532631:exon_200867435_200867583:C1orf106;ENSG00000163362:ENST00000367342:exon_200867435_200867583:C1orf106;ENSG00000163362:ENST00000413687:exon_200867435_200867583:C1orf106 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 201355522 T/C 0 40 0 40 18.5757372297002 0 18.5757372297002 T T 10 0.535606569257495 1.64831061330203e-11 ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201355463_201356306:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201355463_201356306:LAD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 201355669 T/C 0 55 0 55 25.5416386908378 0 25.5416386908378 T T 10 0.535606569257495 2.19392591219359e-15 ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201355463_201356306:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201355463_201356306:LAD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 201355943 C/T 0 42 0 42 19.5045240911852 0 19.5045240911852 C C 10 0.535606569257495 4.59316515337248e-12 ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201355463_201356306:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201355463_201356306:LAD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 31 33 64 14.3961963530177 17.6750167854973 -3.27882043247968 A:T A T 10 0.535606569257495 0.452881521900124 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 201934578 G/A 1 67 61 128 31.1143598597478 32.6720007247072 -1.55764086495935 A:G G A 10 0.535606569257495 0.79101534590534 ENSG00000134375:ENST00000367287:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000478378:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000482943:exon_201934561_201934671:TIMM17A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 59 63 122 27.3992124138078 33.7432138632222 -6.34400144941438 A:C:G G A 10 0.535606569257495 0.276144867512202 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 65 83 148 30.1855729982628 44.4553452483721 -14.2697722501093 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0208293346196318 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 201981862 T/C 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 T:C T C 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000163435:ENST00000359651:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000367284:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000367283:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000490203:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000446188:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000470384:exon_201981573_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000479874:exon_201981697_201981887:ELF3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 12 16 28 5.57272116891006 8.56970510811992 -2.99698393920986 T:C T C 10 0.535606569257495 0.263118689191783 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 202888947 T/C 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 T:C T C 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000117153:ENST00000367261:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000435533:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367260:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367258:exon_202888883_202889036:KLHL12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 202935911 T/C 1 12 6 18 5.57272116891006 3.21363941554497 2.35908175336509 T:C T C 10 0.535606569257495 0.346395564026953 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000473599:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000478009:exon_202935877_202936026:CYB5R1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 204403659 A/G 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:G A G 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204403567_204403736:PIK3C2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 204511924 T/C 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 T:C T C 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000198625:ENST00000367182:exon_204511912_204512072:MDM4;ENSG00000198625:ENST00000454264:exon_204511912_204512072:MDM4;ENSG00000198625:ENST00000463049:exon_204511912_204512072:MDM4;ENSG00000198625:ENST00000470908:exon_204511912_204512072:MDM4;ENSG00000198625:ENST00000471783:exon_204511912_204512072:MDM4;ENSG00000198625:ENST00000367179:exon_204511912_204512072:MDM4;ENSG00000198625:ENST00000462012:exon_204511912_204512059:MDM4;ENSG00000198625:ENST00000391947:exon_204511912_204512072:MDM4;ENSG00000198625:ENST00000444261:exon_204511917_204512072:MDM4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 205589574 C/T 1 12 21 33 5.57272116891006 11.2477379544074 -5.67501678549733 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0548679181404862 ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 A:G G A 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 206669465 C/T 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 T:C C T 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206669445_206670223:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206669445_206670220:IKBKE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 206711610 G/A 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 A:G G A 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000136653:ENST00000355294:exon_206711501_206711622:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367117:exon_206711501_206711622:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000338603:exon_206711501_206711622:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367118:exon_206711501_206711622:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000435226:exon_206711501_206711622:RASSF5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 206821545 C/T 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 T:C C T 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000143479:ENST00000391931:exon_206820733_206822541:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367109:exon_206820733_206822538:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367105:exon_206820733_206822538:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367108:exon_206820733_206822542:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367106:exon_206820733_206822459:DYRK3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 206905043 C/T 1 47 48 95 21.8264912448977 25.7091153243598 -3.88262407946202 T:C C T 10 0.535606569257495 0.471773469066934 ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000479009:exon_206904633_206905070:MAPKAPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 208391254 C/T 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000076356:ENST00000367033:exon_208390080_208391347:PLXNA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 209791929 G/T 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 T:G G T 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000196878:ENST00000391911:exon_209791797_209792004:LAMB3;ENSG00000196878:ENST00000451182:exon_209791797_209792004:LAMB3;ENSG00000196878:ENST00000356082:exon_209791797_209792004:LAMB3;ENSG00000196878:ENST00000367030:exon_209791797_209792004:LAMB3;ENSG00000196878:ENST00000455193:exon_209791797_209792143:LAMB3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 209797198 A/G 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000196878:ENST00000391911:exon_209797185_209797345:LAMB3;ENSG00000196878:ENST00000451182:exon_209797185_209797345:LAMB3;ENSG00000196878:ENST00000356082:exon_209797185_209797345:LAMB3;ENSG00000196878:ENST00000367030:exon_209797185_209797345:LAMB3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 209948711 A/C 1 90 81 171 41.7954087668255 43.3841321098571 -1.58872334303164 A:C A C 10 0.535606569257495 0.818469316978438 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209948694_209948940:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000487271:exon_209948635_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209948694_209949081:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000480569:exon_209948635_209948786:TRAF3IP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 209950848 G/A 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 A:G G A 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 209956542 C/A 1 8 1 9 3.71514744594004 0.535606569257495 3.17954087668255 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0433666493567438 ENSG00000162757:ENST00000294811:exon_209955661_209957054:C1orf74 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 19 21 40 8.8234751841076 11.2477379544074 -2.4242627702998 T:C T C 10 0.535606569257495 0.526606941530924 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 211840498 T/C 1 14 9 23 6.50150803039507 4.82045912331745 1.68104890707762 T:C T C 10 0.535606569257495 0.535839092641956 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000489633:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211839772_211840573:NEK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 212515613 C/T 1 21 12 33 9.75226204559261 6.42727883108994 3.32498321450267 T:C C T 10 0.535606569257495 0.296093943625254 ENSG00000066027:ENST00000261461:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000498129:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000479259:exon_212515530_212515622:PPP2R5A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 124 103 227 57.5847854120706 55.167476633522 2.41730877854865 T:C T C 10 0.535606569257495 0.790205926762082 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 212788567 C/T 1 24 18 42 11.1454423378201 9.64091824663491 1.50452409118521 T:C C T 10 0.535606569257495 0.757462164880615 ENSG00000162772:ENST00000366981:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366987:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000426071:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000391902:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000341491:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000465155:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366985:exon_212788494_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000464547:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366983:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000336937:exon_212788490_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366984:exon_212788490_212788603:ATF3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 53 43 96 24.6128518293528 23.0310824780723 1.58176935128049 T:C T C 10 0.535606569257495 0.760046379707926 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 213415564 A/G 1 8 12 20 3.71514744594004 6.42727883108994 -2.7121313851499 A:G A G 10 0.535606569257495 0.265275049326689 ENSG00000136643:ENST00000366960:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000366959:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000490299:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000491616:exon_213415403_213416001:RPS6KC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 214492286 G/A 1 12 12 24 5.57272116891006 6.42727883108994 -0.854557662179879 A:G G A 10 0.535606569257495 0.838559306298216 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214492202_214492326:SMYD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 214510115 T/G 1 27 28 55 12.5386226300476 14.9969839392099 -2.45836130916222 T:G T G 10 0.535606569257495 0.589095638674620 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214510047_214510473:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214510047_214510445:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000416415:exon_214510047_214510474:SMYD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 214542819 T/C 0 0 9 9 0 4.82045912331745 -4.82045912331745 C T C 10 0.535606569257495 0.00100455705640818 ENSG00000152104:ENST00000366956:exon_214542800_214543034:PTPN14 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 214787130 G/A 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 A:G G A 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000464322:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000495259:exon_214787057_214787236:CENPF HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 214814571 C/T 1 10 14 24 4.64393430742505 7.49849196960493 -2.85455766217988 T:C C T 10 0.535606569257495 0.306768141328979 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 214820099 A/G 1 47 52 99 21.8264912448977 27.8515416013897 -6.025050356492 A:G A G 10 0.535606569257495 0.228395914285266 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 35 26 61 16.2537700759877 13.9257708006949 2.32799927529281 A:G G A 10 0.535606569257495 0.608489975484017 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 53 41 94 24.6128518293528 21.9598693395573 2.65298248979547 A:G A G 10 0.535606569257495 0.606476642166774 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 214837110 C/G 1 33 34 67 15.3249832145027 18.2106233547548 -2.88564014025216 C:G C G 10 0.535606569257495 0.540669608187366 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 11 23 34 5.10832773816756 12.3189510929224 -7.21062335475483 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.0154600930434484 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 220156704 T/C 1 60 42 102 27.8636058445503 22.4954759088148 5.36812993573551 T:C T C 10 0.535606569257495 0.321105055513761 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220156531_220156740:EPRS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 220156729 C/T 1 74 52 126 34.3651138749454 27.8515416013897 6.51357227355563 T:C C T 10 0.535606569257495 0.283773690113137 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220156531_220156740:EPRS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 220321023 A/G 1 151 171 322 70.1234080421183 91.5887233430316 -21.4653153009134 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0188117477732405 ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220320835_220321380:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220320835_220321380:IARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 222903369 T/C 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 T:C T C 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000162819:ENST00000340934:exon_222903369_222903519:C1orf58 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 226032229 C/T 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 T:C C T 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226032199_226032324:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226032199_226032324:EPHX1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 226040404 C/T 1 4 7 11 1.85757372297002 3.74924598480246 -1.89167226183244 T:C C T 10 0.535606569257495 0.36607342785591 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226040365_226040470:TMEM63A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 226108200 C/T 1 76 84 160 35.2939007364304 44.9909518176296 -9.69705108119919 T:C C T 10 0.535606569257495 0.13225196909684 ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226107608_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316918:exon_226108155_226108313:PYCR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 13 24 37 6.03711459965257 12.8545576621799 -6.81744306252731 T:G T G 10 0.535606569257495 0.031095634797314 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 226555302 A/G 1 144 135 279 66.8726540269207 72.3068868497618 -5.4342328228411 A:G A G 10 0.535606569257495 0.548445362066888 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226555181_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226555181_226555309:PARP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 226570840 T/C 1 181 207 388 84.0552109643934 110.870559836301 -26.815348871908 T:C T C 10 0.535606569257495 0.00692519608657879 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 99 98 197 45.974949643508 52.4894437872345 -6.51449414372651 A:G G A 10 0.535606569257495 0.354174673406483 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 226595647 C/G 1 44 59 103 20.4333109526702 31.6007875861922 -11.167476633522 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0296614752610242 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 227172290 C/T 1 11 15 26 5.10832773816756 8.03409853886242 -2.92577080069487 T:C C T 10 0.535606569257495 0.325754731828897 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227172249_227172356:ADCK3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 227174210 T/C 1 15 11 26 6.96590146113758 5.89167226183244 1.07422919930513 T:C T C 10 0.535606569257495 0.69956771663553 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 227182575 A/G 1 5 16 21 2.32196715371253 8.56970510811992 -6.24773795440739 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00761527282627285 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227182524_227182681:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227182524_227182681:CDC42BPA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 227216662 T/C 1 36 37 73 16.7181635067302 19.8174430625273 -3.09927955579713 T:C T C 10 0.535606569257495 0.483309384932854 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000429440:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000441725:exon_227216358_227216951:CDC42BPA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 227216775 C/T 1 20 32 52 9.2878686148501 17.1394102162398 -7.85154160138974 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0361920853147125 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000429440:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000441725:exon_227216358_227216951:CDC42BPA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 227504794 T/C 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 T:C T C 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227504706_227506175:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227504706_227504883:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227504706_227505826:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227504706_227505826:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227504706_227505826:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227504706_227505826:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227504706_227505415:CDC42BPA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 227920103 G/A 1 26 29 55 12.0742291993051 15.5325905084674 -3.45836130916222 A:G G A 10 0.535606569257495 0.417555674464472 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 227920665 A/G 1 12 9 21 5.57272116891006 4.82045912331745 0.752262045592606 A:G A G 10 0.535606569257495 0.828765731707361 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227920582_227922078:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227920582_227920728:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227920630_227920728:JMJD4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 228335125 C/T 1 248 227 475 115.169570824141 121.582691221451 -6.4131203973101 T:C C T 10 0.535606569257495 0.580998612637535 ENSG00000143774:ENST00000366730:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000462807:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485838:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000312726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000492871:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366728:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366727:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000453943:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366723:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366729:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000391865:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366722:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498092:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000435153:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366721:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000460224:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000472939:exon_228335107_228335146:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000412265:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366719:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366720:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366718:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366715:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470040:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366716:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485168:exon_228335107_228335188:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000478725:exon_228335107_228335260:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000420445:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000495999:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000486668:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000464858:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470155:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000481341:exon_228335111_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498115:exon_228335107_228335400:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470740:exon_228335107_228335239:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000465025:exon_228335125_228335245:GUK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 228336342 A/G 1 1 9 10 0.464393430742505 4.82045912331745 -4.35606569257495 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00778992131964651 ENSG00000143774:ENST00000498115:exon_228336072_228336474:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000465025:exon_228336072_228336648:GUK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 228362682 G/A 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000181873:ENST00000366711:exon_228362393_228362730:C1orf69;ENSG00000181873:ENST00000484749:exon_228362393_228362730:C1orf69 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 228582643 C/T 1 26 20 46 12.0742291993051 10.7121313851499 1.36209781415523 T:C C T 10 0.535606569257495 0.76817749711952 ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228581377_228582953:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000493030:exon_228581817_228582714:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228582157_228582953:TRIM11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 228588680 A/C 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 A:C A C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228588665_228588895:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228588640_228588892:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000366699:exon_228588665_228588895:TRIM11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 229622162 A/G 1 13 8 21 6.03711459965257 4.28485255405996 1.75226204559261 A:G A G 10 0.535606569257495 0.515721370266415 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229622118_229622275:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229622118_229622275:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229622118_229622275:NUP133 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 229623338 T/C 1 18 8 26 8.35908175336509 4.28485255405996 4.07422919930513 T:C T C 10 0.535606569257495 0.119333524518674 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229623213_229623360:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229623213_229623360:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229623213_229623360:NUP133 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 229631734 T/C 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229631639_229631794:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229631639_229631794:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229631639_229631794:NUP133 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 229683264 G/A 1 7 11 18 3.25075401519754 5.89167226183244 -2.64091824663491 A:G G A 10 0.535606569257495 0.242609580355471 ENSG00000135776:ENST00000344517:exon_229683246_229683448:ABCB10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 229738170 T/G 1 22 19 41 10.2166554763351 10.1765248158924 0.0401306604427081 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 229772693 T/G 1 12 9 21 5.57272116891006 4.82045912331745 0.752262045592606 T:G T G 10 0.535606569257495 0.828765731707361 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 229772932 A/G 1 9 5 14 4.17954087668255 2.67803284628747 1.50150803039507 A:G A G 10 0.535606569257495 0.593847168610995 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 229773441 C/T 1 18 8 26 8.35908175336509 4.28485255405996 4.07422919930513 T:C C T 10 0.535606569257495 0.119333524518674 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 230384937 T/C 1 15 17 32 6.96590146113758 9.10531167737741 -2.13941021623984 T:C T C 10 0.535606569257495 0.481944050368973 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230384930_230385017:GALNT2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 230415148 G/A 1 31 39 70 14.3961963530177 20.8886562010423 -6.49245984802464 A:G G A 10 0.535606569257495 0.149926772555824 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 13 21 34 6.03711459965257 11.2477379544074 -5.21062335475483 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0855764851443026 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 15 13 28 6.96590146113758 6.96288540034743 0.00301606079014149 A:T T A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 231377081 C/T 1 17 11 28 7.89468832262259 5.89167226183244 2.00301606079014 T:C C T 10 0.535606569257495 0.57060730700733 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231376919_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000436239:exon_231376953_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231376956_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231376962_231377202:GNPAT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 231401902 G/A 1 28 23 51 13.0030160607901 12.3189510929224 0.684064967867759 A:G G A 10 0.535606569257495 0.88906684204058 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231401760_231401911:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000492459:exon_231401880_231401911:GNPAT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 231488524 C/T 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 T:C C T 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000010072:ENST00000391858:exon_231487050_231488878:C1orf124;ENSG00000010072:ENST00000295050:exon_231488356_231490769:C1orf124 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 233091463 T/A 1 28 6 34 13.0030160607901 3.21363941554497 9.78937664524517 A:T T A 10 0.535606569257495 0.000801101369885668 ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000479125:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000487953:exon_233091404_233091465:C1orf57 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 234744413 C/A 1 36 53 89 16.7181635067302 28.3871481706472 -11.6689846639171 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0143517265233456 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 234745009 A/G 1 16 14 30 7.43029489188008 7.49849196960493 -0.0681970777248484 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 235324298 T/C 1 52 31 83 24.1484583986103 16.6038036469823 7.54465475162792 T:C T C 10 0.535606569257495 0.099942611603811 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000447801:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000468751:exon_235324208_235324486:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000485019:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324208_235324382:ARID4B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 235324545 T/A 1 35 29 64 16.2537700759877 15.5325905084674 0.721179567520323 A:T T A 10 0.535606569257495 0.900703331377726 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324489_235324772:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324489_235324571:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324489_235324561:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324489_235324561:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324489_235324549:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324489_235324547:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324489_235324573:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324489_235324598:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324489_235324772:ARID4B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 235345346 C/T 1 15 12 27 6.96590146113758 6.42727883108994 0.538622630047636 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.850150419291182 ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000444620:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235343454_235346108:ARID4B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 11 18 29 5.10832773816756 9.64091824663491 -4.53259050846735 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0970767002827596 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 11 17 28 5.10832773816756 9.10531167737741 -3.99698393920986 T:C T C 10 0.535606569257495 0.134872699384411 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236141174 T/C 1 21 21 42 9.75226204559261 11.2477379544074 -1.49547590881479 T:C T C 10 0.535606569257495 0.646574759194259 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236139130_236141288:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236139130_236141288:NID1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236144951 A/G 1 20 11 31 9.2878686148501 5.89167226183244 3.39619635301766 A:G A G 10 0.535606569257495 0.280275295421213 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236144911_236145082:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236144911_236145082:NID1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236175339 T/C 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 T:C T C 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236175221_236175343:NID1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236208773 C/T 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 T:C C T 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236208757_236208983:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236208757_236208983:NID1;ENSG00000116962:ENST00000419010:exon_236208757_236208983:NID1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236389999 C/T 1 11 7 18 5.10832773816756 3.74924598480246 1.35908175336509 T:C C T 10 0.535606569257495 0.638915092572894 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236389947_236390039:ERO1LB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 27 13 40 12.5386226300476 6.96288540034743 5.5757372297002 A:T T A 10 0.535606569257495 0.082678485356273 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 18 9 27 8.35908175336509 4.82045912331745 3.53862263004764 T:C T C 10 0.535606569257495 0.183063497330438 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 17 2 19 7.89468832262259 1.07121313851499 6.8234751841076 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00184322429886184 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 11 5 16 5.10832773816756 2.67803284628747 2.43029489188008 T:C C T 10 0.535606569257495 0.316760693759888 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 17 18 35 7.89468832262259 9.64091824663491 -1.74622992401232 A:G G A 10 0.535606569257495 0.612809759315648 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236706278 G/T 1 15 2 17 6.96590146113758 1.07121313851499 5.89468832262259 T:G G T 10 0.535606569257495 0.00560348211099565 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236706215_236706290:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236706300 T/A 1 21 1 22 9.75226204559261 0.535606569257495 9.21665547633511 A:T T A 10 0.535606569257495 3.74000293562103e-05 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 50 72 122 23.2196715371253 38.5636729865396 -15.3440014494144 T:C T C 10 0.535606569257495 0.00627138607470456 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 4 20 24 1.85757372297002 10.7121313851499 -8.85455766217988 T:C C T 10 0.535606569257495 0.000296988559019857 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 21 28 49 9.75226204559261 14.9969839392099 -5.24472189361725 T:C T C 10 0.535606569257495 0.15234240406947 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 30 29 59 13.9318029222752 15.5325905084674 -1.6007875861922 T:C T C 10 0.535606569257495 0.697027368198187 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 29 44 73 13.4674094915326 23.5666890473298 -10.0992795557971 A:T:G A G 10 0.535606569257495 0.0189249899260322 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236723074 G/C 1 8 10 18 3.71514744594004 5.35606569257495 -1.64091824663491 C:G G C 10 0.535606569257495 0.484651981913674 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236737983 A/G 1 38 27 65 17.6469503682152 14.4613773699524 3.18557299826283 A:G A G 10 0.535606569257495 0.457495861451802 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236737961_236738203:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000490339:exon_236737961_236738075:HEATR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236748433 G/A 1 13 5 18 6.03711459965257 2.67803284628747 3.35908175336509 A:G G A 10 0.535606569257495 0.155428393933381 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236749730 C/T 1 9 9 18 4.17954087668255 4.82045912331745 -0.640918246634909 T:C C T 10 0.535606569257495 0.816090164780621 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 236755856 T/C 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236755823_236755933:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236755823_236755933:HEATR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 237054569 A/G 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 A:G A G 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237054433_237054629:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237054433_237054629:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237054433_237054629:MTR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 237058744 C/A 1 9 2 11 4.17954087668255 1.07121313851499 3.10832773816756 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0728086494533878 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 241798451 T/G 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 T:G T G 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000203668:ENST00000366553:exon_241792155_241799232:CHML HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 241798631 C/T 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 T:C C T 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000203668:ENST00000366553:exon_241792155_241799232:CHML HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 246922390 A/G 1 34 31 65 15.7893766452452 16.6038036469823 -0.814427001737171 A:G A G 10 0.535606569257495 0.901229810820976 ENSG00000143653:ENST00000366510:exon_246922336_246922453:SCCPDH;ENSG00000143653:ENST00000366509:exon_246922336_246922453:SCCPDH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 1 249144610 G/A 1 43 21 64 19.9689175219277 11.2477379544074 8.72117956752032 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0326880525020980 ENSG00000171163:ENST00000463519:exon_249144205_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000306601:exon_249144205_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000427146:exon_249144205_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366470:exon_249144205_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366471:exon_249144207_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000533927:exon_249144208_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000476503:exon_249144223_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366469:exon_249144239_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000477070:exon_249144241_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000482023:exon_249144244_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000412341:exon_249144244_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000451251:exon_249144265_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000315492:exon_249144265_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000470787:exon_249144481_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000462037:exon_249144576_249144715:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000474351:exon_249144583_249144715:ZNF692 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 91 83 174 42.259802197568 44.4553452483721 -2.19554305080413 A:T:G G A 10 0.535606569257495 0.761412734489084 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 3150898 C/T 1 111 82 193 51.5476708124181 43.9197386791146 7.62793213330347 T:C C T 10 0.535606569257495 0.279779622394252 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 101 101 202 46.903736504993 54.096263495007 -7.19252699001397 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.323763709526657 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 3155353 C/T 1 147 162 309 68.2658343191482 86.7682642197142 -18.5024299005659 A:T:C C T 10 0.535606569257495 0.0398803223140988 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155311_3155380:PFKP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 3155698 C/T 1 195 169 364 90.5567189947885 90.5175102045166 0.039208790271843 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 3167465 A/G 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 36 79 115 16.7181635067302 42.3129189713421 -25.5947554646119 T:C T C 10 0.535606569257495 2.04487443929424e-06 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 T:C C T 10 0.535606569257495 0.824415845788285 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 5498223 T/C 1 10 9 19 4.64393430742505 4.82045912331745 -0.176524815892404 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498050_5498236:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498050_5498236:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498050_5498236:NET1;ENSG00000173848:ENST00000484741:exon_5498050_5498493:NET1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 5498693 A/G 1 18 8 26 8.35908175336509 4.28485255405996 4.07422919930513 A:G A G 10 0.535606569257495 0.119333524518674 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 5498724 G/A 1 11 15 26 5.10832773816756 8.03409853886242 -2.92577080069487 A:G G A 10 0.535606569257495 0.325754731828897 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 5498752 C/T 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 5498810 A/G 1 12 12 24 5.57272116891006 6.42727883108994 -0.854557662179879 A:G A G 10 0.535606569257495 0.838559306298216 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 6002368 T/G 1 15 16 31 6.96590146113758 8.56970510811992 -1.60380364698234 T:G T G 10 0.535606569257495 0.592923006525255 ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 6008172 C/T 1 13 7 20 6.03711459965257 3.74924598480246 2.2878686148501 T:C C T 10 0.535606569257495 0.37307358781869 ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6008108_6008302:IL15RA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 8 1 9 3.71514744594004 0.535606569257495 3.17954087668255 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0433666493567438 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 11805357 G/A 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 12131218 C/T 1 18 18 36 8.35908175336509 9.64091824663491 -1.28183649326982 T:C C T 10 0.535606569257495 0.739235820904023 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000415935:exon_12131174_12131254:DHTKD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 12143105 C/G 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 C:G C G 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12143041_12143180:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12143041_12143180:DHTKD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 12149939 C/T 1 13 4 17 6.03711459965257 2.14242627702998 3.89468832262259 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0861319747680826 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12149908_12150014:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12149908_12150014:DHTKD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 53 49 102 24.6128518293528 26.2447218936173 -1.63187006426449 T:C T C 10 0.535606569257495 0.766517614331743 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 12292348 G/T 1 74 76 150 34.3651138749454 40.7060992635696 -6.34098538862424 T:G G T 10 0.535606569257495 0.326080005058585 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 12867598 C/G 1 12 12 24 5.57272116891006 6.42727883108994 -0.854557662179879 C:G C G 10 0.535606569257495 0.838559306298216 ENSG00000183049:ENST00000378847:exon_12867572_12867689:CAMK1D;ENSG00000183049:ENST00000378845:exon_12867572_12868142:CAMK1D HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 13151224 G/A 1 82 60 142 38.0802613208854 32.1363941554497 5.94386716543572 A:G G A 10 0.535606569257495 0.354814465817632 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000487935:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13151097_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13151112_13151288:OPTN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 17 18 35 7.89468832262259 9.64091824663491 -1.74622992401232 A:G A G 10 0.535606569257495 0.612809759315648 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 18828371 C/T 1 1 20 21 0.464393430742505 10.7121313851499 -10.2477379544074 T:C C T 10 0.535606569257495 4.5708455541291e-06 ENSG00000165995:ENST00000324631:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000352115:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377328:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000282343:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377331:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000396576:exon_18828159_18830798:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000340194:exon_18828159_18830791:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377319:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377329:exon_18828159_18830038:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377315:exon_18828159_18830056:CACNB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 23408278 C/T 1 10 6 16 4.64393430742505 3.21363941554497 1.43029489188008 T:C C T 10 0.535606569257495 0.618142335020353 ENSG00000148450:ENST00000376510:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000277598:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000376513:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000472663:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000468633:exon_23408073_23408380:MSRB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 24813282 G/C 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 C:G G C 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24813252_24813693:KIAA1217 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 24832283 C/G 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 C:G C G 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24831812_24833101:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000492009:exon_24831812_24832637:KIAA1217 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 24832885 C/T 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 T:C C T 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24831812_24833101:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24831812_24833410:KIAA1217 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 24833137 C/T 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 T:C C T 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24831812_24833410:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24831812_24833410:KIAA1217 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 24908686 T/C 1 10 8 18 4.64393430742505 4.28485255405996 0.359081753365091 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000376410:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000445703:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000446003:exon_24908402_24910298:ARHGAP21 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 5 11 16 2.32196715371253 5.89167226183244 -3.56970510811992 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0832026742777677 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 26998637 T/G 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 T:G T G 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000148459:ENST00000376215:exon_26998567_26998697:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000376203:exon_26998567_26998697:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000396343:exon_26998567_26998697:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000473224:exon_26998567_26998697:PDSS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 27303605 A/T 1 11 3 14 5.10832773816756 1.60681970777248 3.50150803039507 A:T A T 10 0.535606569257495 0.0660918331472145 ENSG00000107890:ENST00000445828:exon_27303423_27303608:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27303423_27303640:ANKRD26 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 27322303 C/G 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27322154_27322306:ANKRD26 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 27400861 G/A 1 107 102 209 49.690097089448 54.6318700642645 -4.94177297481644 A:G G A 10 0.535606569257495 0.532644048363741 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27399383_27401049:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27399383_27401049:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27399383_27401049:YME1L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 43 46 89 19.9689175219277 24.6379021858448 -4.66898466391705 A:G G A 10 0.535606569257495 0.339910038335645 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 27444329 T/C 1 12 7 19 5.57272116891006 3.74924598480246 1.8234751841076 T:C T C 10 0.535606569257495 0.493225271714711 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27443753_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27444299_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27444299_27444541:MASTL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 27444344 T/G 1 14 8 22 6.50150803039507 4.28485255405996 2.21665547633511 T:G T G 10 0.535606569257495 0.39723941481764 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27443753_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27444299_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27444299_27444541:MASTL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 27459746 C/G 1 18 23 41 8.35908175336509 12.3189510929224 -3.95986933955729 C:G C G 10 0.535606569257495 0.272895670375295 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 27497191 G/A 1 17 5 22 7.89468832262259 2.67803284628747 5.21665547633511 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0312471224326523 ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27497175_27497374:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27497175_27497374:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27497175_27497374:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27497175_27497374:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27497175_27497374:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27497175_27497374:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27497175_27497374:ACBD5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 29747417 C/T 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 T:C C T 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000197321:ENST00000375400:exon_29747363_29747518:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000497265:exon_29747363_29747518:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000375398:exon_29747363_29747518:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000355867:exon_29747363_29747518:SVIL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 29754609 T/C 1 4 10 14 1.85757372297002 5.35606569257495 -3.49849196960493 T:C T C 10 0.535606569257495 0.104522536584723 ENSG00000197321:ENST00000375400:exon_29754524_29754679:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000497265:exon_29754524_29754679:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000375398:exon_29754524_29754679:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000355867:exon_29754524_29754679:SVIL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 29759225 A/G 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000197321:ENST00000375400:exon_29759205_29759412:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000497265:exon_29759205_29759412:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000375398:exon_29759205_29759412:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000355867:exon_29759205_29759412:SVIL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 29839787 A/G 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 A:G A G 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000197321:ENST00000375400:exon_29839526_29840192:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000375398:exon_29839526_29840192:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000355867:exon_29839526_29840192:SVIL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 29839864 A/C 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 A:C A C 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000197321:ENST00000375400:exon_29839526_29840192:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000375398:exon_29839526_29840192:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000355867:exon_29839526_29840192:SVIL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 29840038 A/G 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000197321:ENST00000375400:exon_29839526_29840192:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000375398:exon_29839526_29840192:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000355867:exon_29839526_29840192:SVIL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 29840164 A/G 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000197321:ENST00000375400:exon_29839526_29840192:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000375398:exon_29839526_29840192:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000355867:exon_29839526_29840192:SVIL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 30728101 T/C 1 172 242 414 79.8756700877109 129.616789760314 -49.7411196726029 T:C T C 10 0.535606569257495 1.22875240015534e-06 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 32304440 T/C 1 58 60 118 26.9348189830653 32.1363941554497 -5.2015751723844 T:C T C 10 0.535606569257495 0.356704386454377 ENSG00000170759:ENST00000302418:exon_32304437_32304587:KIF5B;ENSG00000170759:ENST00000403329:exon_32304437_32304587:KIF5B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 34408636 T/C 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 T:C T C 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34408541_34408668:PARD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 34620220 C/T 1 40 35 75 18.5757372297002 18.7462299240123 -0.17049269431212 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000466092:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34620045_34620272:PARD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 34630570 C/T 1 38 31 69 17.6469503682152 16.6038036469823 1.04314672123285 T:C C T 10 0.535606569257495 0.810770877579699 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34630555_34630744:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34630555_34630744:PARD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 35625957 A/C 1 6 11 17 2.78636058445503 5.89167226183244 -3.10531167737741 A:C A C 10 0.535606569257495 0.149431785983435 ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35625802_35626135:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000339497:exon_35625802_35626135:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35625802_35626135:CCNY HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 38404188 G/C 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000075407:ENST00000361085:exon_38404123_38404218:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000351773:exon_38404123_38404218:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000479469:exon_38404123_38404313:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000463776:exon_38404123_38404250:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000477790:exon_38404123_38404621:ZNF37A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 43089156 C/T 1 4 9 13 1.85757372297002 4.82045912331745 -2.96288540034743 T:C C T 10 0.535606569257495 0.162027045980107 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 43281089 T/C 1 29 18 47 13.4674094915326 9.64091824663491 3.82649124489774 T:C T C 10 0.535606569257495 0.306762156095718 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43280930_43281120:BMS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 43289407 G/A 1 28 31 59 13.0030160607901 16.6038036469823 -3.6007875861922 A:G G A 10 0.535606569257495 0.363281657808285 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43289300_43289439:BMS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 43292647 A/G 1 37 46 83 17.1825569374727 24.6379021858448 -7.45534524837208 A:G A G 10 0.535606569257495 0.122896451450871 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43291922_43292679:BMS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 50667105 T/C 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50663414_50667280:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50664491_50667280:ERCC6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 50678369 T/C 1 10 13 23 4.64393430742505 6.96288540034743 -2.31895109292238 T:C T C 10 0.535606569257495 0.404576740411981 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 50678717 T/C 1 11 7 18 5.10832773816756 3.74924598480246 1.35908175336509 T:C T C 10 0.535606569257495 0.638915092572894 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 51584644 A/G 1 44 31 75 20.4333109526702 16.6038036469823 3.82950730568788 A:G A G 10 0.535606569257495 0.418405997062578 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51584616_51585466:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000498586:exon_51584616_51584817:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51584616_51585463:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000431200:exon_51584616_51584947:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51584616_51585599:NCOA4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 51585223 G/A 1 77 64 141 35.7582941671729 34.2788204324797 1.47947373469322 A:G G A 10 0.535606569257495 0.865988830714254 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51584616_51585466:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51584616_51585463:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51584616_51585599:NCOA4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 51585385 C/T 1 100 89 189 46.4393430742505 47.6689846639171 -1.22964158966655 T:C C T 10 0.535606569257495 0.884157004425443 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51584616_51585466:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51584616_51585463:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51584616_51585599:NCOA4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 51585425 C/G 1 119 99 218 55.2628182583581 53.025050356492 2.2377679018661 C:G C G 10 0.535606569257495 0.786168883426247 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51584616_51585466:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51584616_51585463:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51584616_51585599:NCOA4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 61552692 G/T 1 8 11 19 3.71514744594004 5.89167226183244 -2.1765248158924 T:G G T 10 0.535606569257495 0.362403407231352 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552607_61552732:CCDC6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 62553763 A/G 1 16 27 43 7.43029489188008 14.4613773699524 -7.03108247807228 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0330421390419391 ENSG00000170312:ENST00000395284:exon_62553635_62554610:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000316629:exon_62553635_62554601:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000448257:exon_62553635_62554586:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000373809:exon_62553635_62554610:CDK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 64564892 G/T 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 T:G G T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000181915:ENST00000373783:exon_64564516_64568238:ADO HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 64573312 T/G 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 T:G T G 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000122877:ENST00000242480:exon_64571756_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000439032:exon_64571763_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000437594:exon_64571763_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000411732:exon_64571763_64574228:EGR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 13 15 28 6.03711459965257 8.03409853886242 -1.99698393920986 A:G G A 10 0.535606569257495 0.456308012833315 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 64974537 A/T 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 A:T A T 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 69714796 C/T 1 9 3 12 4.17954087668255 1.60681970777248 2.57272116891006 T:C C T 10 0.535606569257495 0.158222040248362 ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69714720_69714887:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69714720_69714887:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69714720_69714887:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69714720_69714887:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69714720_69714887:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69714720_69714887:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69714720_69714887:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000480158:exon_69714720_69716618:HERC4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 70748784 G/A 1 16 20 36 7.43029489188008 10.7121313851499 -3.28183649326982 A:G G A 10 0.535606569257495 0.317098320507134 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 70863699 C/T 1 3270 2518 5788 1518.56651852799 1348.65734139037 169.909177137619 A:T:C C T 10 0.535606569257495 7.41471215811205e-06 ENSG00000122862:ENST00000462445:exon_70863627_70864297:SRGN;ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70863627_70864567:SRGN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 71142420 G/A 1 51 50 101 23.6840649678678 26.7803284628747 -3.09626349500699 A:G G A 10 0.535606569257495 0.550781205209682 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 71874683 G/A 1 69 54 123 32.0431467212329 28.9227547399047 3.12039198132813 A:G G A 10 0.535606569257495 0.588763504308696 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 71874734 G/A 1 42 30 72 19.5045240911852 16.0681970777248 3.43632701346036 A:G G A 10 0.535606569257495 0.478741924994308 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 71874784 C/T 1 14 12 26 6.50150803039507 6.42727883108994 0.0742291993051314 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 38 55 93 17.6469503682152 29.4583613091622 -11.811410940947 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0164458358853327 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 72358577 G/A 1 43 191 234 19.9689175219277 102.300854728182 -82.3319372062538 A:G G A 10 0.535606569257495 1.94317831032895e-28 ENSG00000180644:ENST00000373209:exon_72357104_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000441259:exon_72357105_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000318971:exon_72357105_72358937:PRF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 73520632 A/C 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 A:C A C 10 0.535606569257495 0.824415845788285 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73520288_73520681:C10orf54 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 81841692 G/T 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 T:G G T 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000133678:ENST00000472622:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372281:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000528687:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372277:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372275:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372274:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000411627:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372273:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000467529:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000463029:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000476173:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000483732:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000463209:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000450179:exon_81841597_81841700:C10orf57 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 182 107 289 84.5196043951359 57.309902910552 27.209701484584 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00141210494970951 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 81926718 A/G 1 102 173 275 47.3681299357355 92.6599364815466 -45.2918065458111 A:G A G 10 0.535606569257495 5.69392489169048e-08 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 86130899 C/T 1 4 8 12 1.85757372297002 4.28485255405996 -2.42727883108994 T:C C T 10 0.535606569257495 0.246342614793183 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 C:G C G 10 0.535606569257495 0.824415845788285 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 91007360 T/G 1 16 6 22 7.43029489188008 3.21363941554497 4.21665547633511 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0873058941370847 ENSG00000107798:ENST00000336233:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000371829:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000456827:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000425287:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000428800:exon_91007295_91007588:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000282673:exon_91007295_91007406:LIPA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 91066769 C/A 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 A:C C A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 91479211 G/T 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 T:G G T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91479176_91479463:KIF20B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 A:G G A 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 12 15 27 5.57272116891006 8.03409853886242 -2.46137736995236 A:T T A 10 0.535606569257495 0.440874576584086 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 16 8 24 7.43029489188008 4.28485255405996 3.14544233782012 A:G A G 10 0.535606569257495 0.224088576462827 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 9 12 21 4.17954087668255 6.42727883108994 -2.24773795440739 A:G A G 10 0.535606569257495 0.384311420828178 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 91522548 A/G 1 19 16 35 8.8234751841076 8.56970510811992 0.253770075987678 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91522395_91522592:KIF20B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 91528504 C/T 1 13 9 22 6.03711459965257 4.82045912331745 1.21665547633511 T:C C T 10 0.535606569257495 0.672817163244646 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91528495_91528645:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91528495_91528645:KIF20B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 20 9 29 9.2878686148501 4.82045912331745 4.46740949153265 A:T A T 10 0.535606569257495 0.135055713773349 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 38 27 65 17.6469503682152 14.4613773699524 3.18557299826283 C:G G C 10 0.535606569257495 0.457495861451802 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 31 27 58 14.3961963530177 14.4613773699524 -0.0651810169347051 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 95459817 C/T 1 30 24 54 13.9318029222752 12.8545576621799 1.07724526009527 T:C C T 10 0.535606569257495 0.786872553309693 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95459787_95459863:FRA10AC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 96997670 A/G 1 758 744 1502 352.010220502819 398.491287527576 -46.4810670247574 A:C:G A G 10 0.535606569257495 0.0172889885970021 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 96997820 A/G 1 422 451 873 195.974027773337 241.55856273513 -45.5845349617931 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00201150729916552 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000492511:exon_96997697_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_96997767_96997868:PDLIM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 97023630 T/C 1 276 226 502 128.172586884931 121.047084652194 7.12550223273755 T:C T C 10 0.535606569257495 0.531335955052366 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_97023621_97023820:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_97023621_97023820:PDLIM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 97423944 G/A 1 65 71 136 30.1855729982628 38.0280664172821 -7.84249341901931 A:G G A 10 0.535606569257495 0.197164941409707 ENSG00000119977:ENST00000430368:exon_97423153_97424057:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97423153_97424057:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97423153_97424057:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97423158_97424057:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97423173_97424057:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97423650_97424057:TCTN3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 97919011 A/G 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 98287792 G/T 1 51 39 90 23.6840649678678 20.8886562010423 2.79540876682546 T:G G T 10 0.535606569257495 0.597930594113174 ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98287788_98287934:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000485093:exon_98287788_98287930:TM9SF3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 98369536 A/G 1 32 31 63 14.8605897837602 16.6038036469823 -1.74321386322218 A:G A G 10 0.535606569257495 0.705501742145422 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000467625:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98369469_98369624:PIK3AP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 98380137 T/C 1 49 59 108 22.7552781063827 31.6007875861922 -8.84550947980945 T:C T C 10 0.535606569257495 0.100699119555579 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98380109_98380168:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000461252:exon_98380109_98380191:PIK3AP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 45 41 86 20.8977043834127 21.9598693395573 -1.06216495614457 T:C C T 10 0.535606569257495 0.829607599114898 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 98469507 C/A 1 15 8 23 6.96590146113758 4.28485255405996 2.68104890707762 A:C C A 10 0.535606569257495 0.300721382047396 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 99116903 C/T 1 25 31 56 11.6098357685626 16.6038036469823 -4.99396787841972 T:C C T 10 0.535606569257495 0.183597397785334 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99116115_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000465394:exon_99116863_99116953:RRP12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 39 27 66 18.1113437989577 14.4613773699524 3.64996642900534 T:C C T 10 0.535606569257495 0.389873481130521 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 22 28 50 10.2166554763351 14.9969839392099 -4.78032846287475 A:G G A 10 0.535606569257495 0.202214087908662 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 99141205 A/G 1 5 10 15 2.32196715371253 5.35606569257495 -3.03409853886242 A:G A G 10 0.535606569257495 0.128072258736022 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141143_99141240:RRP12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 99141484 C/T 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141472_99141583:RRP12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 99155984 G/A 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 A:G G A 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99155975_99156058:RRP12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 99160152 A/G 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 A:G A G 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99160062_99160291:RRP12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 99410790 T/C 1 5 11 16 2.32196715371253 5.89167226183244 -3.56970510811992 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0832026742777677 ENSG00000155252:ENST00000416867:exon_99410698_99410898:PI4K2A;ENSG00000155252:ENST00000370631:exon_99410698_99410898:PI4K2A;ENSG00000249967:ENST00000370649:exon_99410698_99410898:RP11-548K23.11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 100183570 G/C 1 16 13 29 7.43029489188008 6.96288540034743 0.467409491532647 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000470095:exon_100183510_100183644:HPS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 100190920 G/A 1 11 15 26 5.10832773816756 8.03409853886242 -2.92577080069487 A:G G A 10 0.535606569257495 0.325754731828897 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100190888_100191039:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000414009:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100190888_100191048:HPS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 101502968 A/G 1 35 28 63 16.2537700759877 14.9969839392099 1.25678613677782 A:T:G A G 10 0.535606569257495 0.801282809489105 ENSG00000119929:ENST00000493385:exon_101502910_101503080:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370476:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000471520:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370472:exon_101502910_101503119:CUTC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 101639796 G/A 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 A:G G A 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 102107251 C/G 1 89 95 184 41.3310153360829 50.882624079462 -9.55160874337907 A:C:G C G 10 0.535606569257495 0.160920968471596 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102107233_102107288:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102106881_102107288:SCD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 102116311 A/C 1 102 87 189 47.3681299357355 46.5977715254021 0.770358410333458 A:C A C 10 0.535606569257495 0.94193461902475 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102116289_102116367:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102116289_102116521:SCD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 102762256 C/T 1 4 7 11 1.85757372297002 3.74924598480246 -1.89167226183244 T:C C T 10 0.535606569257495 0.36607342785591 ENSG00000107816:ENST00000426584:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000489526:exon_102762254_102762934:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000429732:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000481129:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102759233_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000454422:exon_102762254_102762703:LZTS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 104161967 T/C 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 T:C T C 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 11 11 22 5.10832773816756 5.89167226183244 -0.783344523664889 C:G C G 10 0.535606569257495 0.831857301870848 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 104436641 C/T 1 47 41 88 21.8264912448977 21.9598693395573 -0.133378094659555 A:T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000138175:ENST00000260746:exon_104436315_104436698:ARL3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 105174869 G/A 1 24 18 42 11.1454423378201 9.64091824663491 1.50452409118521 A:G G A 10 0.535606569257495 0.757462164880615 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105174762_105174908:PDCD11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 25 24 49 11.6098357685626 12.8545576621799 -1.24472189361725 T:C C T 10 0.535606569257495 0.775315484446398 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 26 30 56 12.0742291993051 16.0681970777248 -3.99396787841972 A:C A C 10 0.535606569257495 0.287743002275495 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 60 82 142 27.8636058445503 43.9197386791146 -16.0561328345643 T:C T C 10 0.535606569257495 0.00708398672407231 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 105363289 T/C 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 T:C T C 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 112258209 C/G 1 42 31 73 19.5045240911852 16.6038036469823 2.90072044420287 C:G C G 10 0.535606569257495 0.55788802239887 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112257596_112258258:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112257839_112258258:DUSP5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 114154815 C/T 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 T:C C T 10 0.535606569257495 0.824415845788285 ENSG00000197142:ENST00000354655:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000479936:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000393081:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000356116:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000433418:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000369410:exon_114154676_114154860:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000354273:exon_114154676_114154860:ACSL5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 114169276 A/G 1 24 27 51 11.1454423378201 14.4613773699524 -3.31593503213224 A:G A G 10 0.535606569257495 0.400295461499866 ENSG00000197142:ENST00000354655:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000393081:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000356116:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000433418:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000369410:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000354273:exon_114169265_114169443:ACSL5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 115489152 C/G 1 24 16 40 11.1454423378201 8.56970510811992 2.5757372297002 C:G C G 10 0.535606569257495 0.433090933174964 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 115489167 G/A 1 20 13 33 9.2878686148501 6.96288540034743 2.32498321450267 A:G G A 10 0.535606569257495 0.486822164537258 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 116060387 T/C 1 19 20 39 8.8234751841076 10.7121313851499 -1.8886562010423 T:C T C 10 0.535606569257495 0.630763939446426 ENSG00000169129:ENST00000369271:exon_116060204_116060449:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000304129:exon_116060204_116060449:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000491814:exon_116060204_116060449:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000392974:exon_116060204_116060449:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000486300:exon_116060275_116060449:AFAP1L2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 116073696 C/T 1 8 13 21 3.71514744594004 6.96288540034743 -3.24773795440739 T:C C T 10 0.535606569257495 0.190432172043740 ENSG00000169129:ENST00000369271:exon_116073630_116073809:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000304129:exon_116073630_116073809:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000392974:exon_116073630_116073809:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000419268:exon_116073630_116073809:AFAP1L2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 116073801 T/C 1 25 12 37 11.6098357685626 6.42727883108994 5.18255693747269 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0999004018368744 ENSG00000169129:ENST00000369271:exon_116073630_116073809:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000304129:exon_116073630_116073809:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000392974:exon_116073630_116073809:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000419268:exon_116073630_116073809:AFAP1L2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 121196335 G/A 1 27 36 63 12.5386226300476 19.2818364932698 -6.74321386322218 A:G G A 10 0.535606569257495 0.100507915989371 ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000369108:exon_121196163_121196353:GRK5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 121436068 T/G 1 9 1 10 4.17954087668255 0.535606569257495 3.64393430742505 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0246360115647308 ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121435976_121437331:BAG3;ENSG00000151929:ENST00000450186:exon_121435979_121436219:BAG3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 122624679 G/A 1 10 11 21 4.64393430742505 5.89167226183244 -1.24773795440739 A:G G A 10 0.535606569257495 0.66418868541406 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000462529:exon_122624559_122624703:WDR11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 122645376 A/T 1 11 15 26 5.10832773816756 8.03409853886242 -2.92577080069487 A:T A T 10 0.535606569257495 0.325754731828897 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122645326_122645450:WDR11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 122649482 A/G 1 11 16 27 5.10832773816756 8.56970510811992 -3.46137736995236 A:G A G 10 0.535606569257495 0.246551169931367 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000478567:exon_122649407_122649521:WDR11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 123503187 T/C 1 8 19 27 3.71514744594004 10.1765248158924 -6.46137736995236 A:T:C T C 10 0.535606569257495 0.0188699154795809 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123502626_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123502710_123503373:ATE1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 123549691 T/G 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 T:G T G 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000485281:exon_123549684_123549741:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123549378_123549804:ATE1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 18 6 24 8.35908175336509 3.21363941554497 5.14544233782012 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0404032241527609 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 124742792 G/A 1 4 8 12 1.85757372297002 4.28485255405996 -2.42727883108994 A:G G A 10 0.535606569257495 0.246342614793183 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 124742895 G/C 1 2 10 12 0.92878686148501 5.35606569257495 -4.42727883108994 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0166824326952732 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000496079:exon_124742806_124742986:PSTK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 124800853 C/T 1 14 10 24 6.50150803039507 5.35606569257495 1.14544233782012 T:C C T 10 0.535606569257495 0.686918776217185 ENSG00000196177:ENST00000358776:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000368869:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000496730:exon_124800725_124800895:ACADSB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 126089434 G/A 1 14 4 18 6.50150803039507 2.14242627702998 4.35908175336509 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0560876578011619 ENSG00000065154:ENST00000368845:exon_126089409_126089553:OAT;ENSG00000065154:ENST00000471127:exon_126089409_126089553:OAT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 126670356 G/A 1 11 7 18 5.10832773816756 3.74924598480246 1.35908175336509 A:G G A 10 0.535606569257495 0.638915092572894 ENSG00000019995:ENST00000359653:exon_126670278_126670398:ZRANB1;ENSG00000019995:ENST00000471421:exon_126669980_126670398:ZRANB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 14 18 32 6.50150803039507 9.64091824663491 -3.13941021623984 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.290906509339366 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129866449 C/G 1 9 11 20 4.17954087668255 5.89167226183244 -1.7121313851499 C:G C G 10 0.535606569257495 0.505071075446385 ENSG00000132334:ENST00000254667:exon_129866387_129866550:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000419012:exon_129866387_129866550:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000439034:exon_129866387_129866550:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000306042:exon_129866387_129866550:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000495530:exon_129866387_129866550:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000479896:exon_129866387_129866550:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000492479:exon_129866387_129866550:PTPRE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129871690 A/G 1 11 12 23 5.10832773816756 6.42727883108994 -1.31895109292238 A:G A G 10 0.535606569257495 0.677398717546528 ENSG00000132334:ENST00000254667:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000419012:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000439034:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000306042:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000479896:exon_129871601_129871735:PTPRE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129899543 C/T 1 143 125 268 66.4082605961782 66.9508211571869 -0.542560561008642 T:C C T 10 0.535606569257495 0.951247659213592 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 186 146 332 86.3771781181059 78.1985591115943 8.17861900651168 T:C T C 10 0.535606569257495 0.379043762692464 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 209 170 379 97.0582270251836 91.0531167737741 6.00511025140942 C:G G C 10 0.535606569257495 0.571131610922202 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 158 113 271 73.3741620573158 60.5235423260969 12.8506197312189 T:C T C 10 0.535606569257495 0.127794544594981 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 101 55 156 46.903736504993 29.4583613091622 17.4453751958308 A:T:G G A 10 0.535606569257495 0.00493970601183991 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 154 131 285 71.5165883343458 70.1644605727318 1.35212776161394 T:C T C 10 0.535606569257495 0.90550549480016 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129901946 T/G 1 124 116 240 57.5847854120706 62.1303620338694 -4.54557662179879 A:T:G T G 10 0.535606569257495 0.560952988013174 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129902158 C/T 1 142 126 268 65.9438671654357 67.4864277264444 -1.54256056100864 T:C C T 10 0.535606569257495 0.854467308845815 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 168 155 323 78.0180963647408 83.0190182349117 -5.00092187017087 A:G G A 10 0.535606569257495 0.577541855143465 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 143 83 226 66.4082605961782 44.4553452483721 21.9529153478061 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.00331829636959756 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129903802 A/G 1 98 84 182 45.5105562127655 44.9909518176296 0.519604395135914 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129904474 G/A 1 79 62 141 36.6870810286579 33.2076072939647 3.47947373469322 A:G G A 10 0.535606569257495 0.6126196937478 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129904477 C/T 1 80 63 143 37.1514744594004 33.7432138632222 3.40826059617822 T:C C T 10 0.535606569257495 0.615177023938786 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129904560 C/T 1 74 79 153 34.3651138749454 42.3129189713421 -7.94780509639673 T:C C T 10 0.535606569257495 0.223956154071004 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129905429 C/T 1 59 59 118 27.3992124138078 31.6007875861922 -4.2015751723844 T:C C T 10 0.535606569257495 0.461003452741448 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129906364 G/A 1 95 57 152 44.117375920538 30.5295744476772 13.5878014728608 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0281074173303130 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 55 40 95 25.5416386908378 21.4242627702998 4.11737592053798 T:C C T 10 0.535606569257495 0.412370057035044 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 41 35 76 19.0401306604427 18.7462299240123 0.293900736430384 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129910475 T/G 1 35 30 65 16.2537700759877 16.0681970777248 0.185572998262831 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000484853:exon_129910397_129910713:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129911856 C/G 1 31 26 57 14.3961963530177 13.9257708006949 0.470425552322789 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129911691_129911866:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129913960 A/T 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 A:T A T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129913192_129914271:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129913774_129914271:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 129921195 A/T 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 A:T A T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129921145_129921260:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129921145_129921260:MKI67 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 131506192 C/T 1 25 45 70 11.6098357685626 24.1022956165873 -12.4924598480246 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00371303668791125 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 131506283 C/T 1 17 28 45 7.89468832262259 14.9969839392099 -7.10229561658727 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0366643702585225 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 131959150 C/T 1 87 75 162 40.4022284745979 40.1704926943121 0.231735780285817 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000108010:ENST00000331244:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000368644:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000481034:exon_131959060_131959261:GLRX3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 133761285 G/A 1 50 64 114 23.2196715371253 34.2788204324797 -11.0591488953544 A:C:G G A 10 0.535606569257495 0.0390991614141007 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000470416:exon_133761034_133761295:PPP2R2D HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 133786586 T/C 1 21 61 82 9.75226204559261 32.6720007247072 -22.9197386791146 T:C T C 10 0.535606569257495 3.39530645508117e-07 ENSG00000176171:ENST00000368636:exon_133786538_133786622:BNIP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 1 18 2 20 8.35908175336509 1.07121313851499 7.2878686148501 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00104931336565893 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 18 2 20 8.35908175336509 1.07121313851499 7.2878686148501 C:G C G 10 0.535606569257495 0.00104931336565893 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 134145153 G/A 0 16 0 16 7.43029489188008 0 7.43029489188008 G G 10 0.535606569257495 5.05498483720302e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 1 15 3 18 6.96590146113758 1.60681970777248 5.35908175336509 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0156857633316973 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 18 5 23 8.35908175336509 2.67803284628747 5.68104890707762 T:G G T 10 0.535606569257495 0.0203427708671881 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 134161560 C/T 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000148814:ENST00000368615:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000392638:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000432555:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000344079:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368614:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000462656:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368613:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000356571:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368612:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000450442:exon_134161488_134161853:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368610:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000490055:exon_134161488_134161596:LRRC27 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 135076523 C/A 1 225 178 403 104.488521917064 95.3379693278341 9.15055258922953 A:C C A 10 0.535606569257495 0.369045568120976 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 129 106 235 59.9067525657832 56.7742963412945 3.13245622448868 T:C T C 10 0.535606569257495 0.695251425288177 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 135082346 A/G 1 50 50 100 23.2196715371253 26.7803284628747 -3.5606569257495 A:G A G 10 0.535606569257495 0.484463834212932 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 135084322 A/G 1 1 7 8 0.464393430742505 3.74924598480246 -3.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0288949230486104 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 135085321 C/T 1 54 40 94 25.0772452600953 21.4242627702998 3.65298248979548 T:C C T 10 0.535606569257495 0.47069386964711 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 135085426 A/G 1 109 86 195 50.6188839509331 46.0621649561446 4.55671899478849 A:G A G 10 0.535606569257495 0.519253618370496 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 135087521 G/A 1 53 38 91 24.6128518293528 20.3530496317848 4.25980219756796 A:G G A 10 0.535606569257495 0.401346907952693 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 135089035 A/G 1 40 31 71 18.5757372297002 16.6038036469823 1.97193358271786 A:G A G 10 0.535606569257495 0.721439052793199 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 135097434 A/G 1 18 13 31 8.35908175336509 6.96288540034743 1.39619635301766 A:G A G 10 0.535606569257495 0.719730647046148 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135097386_135097506:TUBGCP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 135098672 G/A 1 15 24 39 6.96590146113758 12.8545576621799 -5.8886562010423 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0762361846174624 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135098589_135098717:TUBGCP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 10 135112940 C/T 1 19 18 37 8.8234751841076 9.64091824663491 -0.817443062527312 T:C C T 10 0.535606569257495 0.869525755309081 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000487796:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135112939_135113107:TUBGCP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 198 144 342 91.949899287016 77.1273459730793 14.8225533139367 A:C:G G A 10 0.535606569257495 0.115859142212499 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 3028140 G/A 1 48 43 91 22.2908846756402 23.0310824780723 -0.740197802432039 A:G G A 10 0.535606569257495 0.916467054461231 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3028109_3028240:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3028109_3030127:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3028109_3028189:CARS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 4410902 T/C 1 46 42 88 21.3620978141552 22.4954759088148 -1.13337809465956 T:C T C 10 0.535606569257495 0.83131129362042 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4410884_4410979:TRIM21 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 4411241 C/T 1 47 46 93 21.8264912448977 24.6379021858448 -2.81141094094703 T:C C T 10 0.535606569257495 0.603630477391468 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 5688940 C/T 1 9 12 21 4.17954087668255 6.42727883108994 -2.24773795440739 T:C C T 10 0.535606569257495 0.384311420828178 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5688919_5688941:TRIM5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 5701074 C/A 1 19 19 38 8.8234751841076 10.1765248158924 -1.35304963178481 A:C C A 10 0.535606569257495 0.745630156270472 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700991_5701087:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700991_5701161:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 5701409 G/C 1 21 21 42 9.75226204559261 11.2477379544074 -1.49547590881479 C:G G C 10 0.535606569257495 0.646574759194259 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 157 165 322 72.9097686265733 88.3750839274867 -15.4653153009134 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0935663591836938 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 6239344 G/A 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000532797:exon_6239035_6239380:FAM160A2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 6243804 A/G 1 3 10 13 1.39318029222752 5.35606569257495 -3.96288540034743 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0472642919377538 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6243672_6243839:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6243672_6243839:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6243672_6243839:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6243672_6243839:FAM160A2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 6520164 T/A 1 2 7 9 0.92878686148501 3.74924598480246 -2.82045912331745 A:T T A 10 0.535606569257495 0.0914723743517246 ENSG00000179532:ENST00000473019:exon_6519953_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6519001_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6518815_6520191:DNHD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 6703334 A/G 1 300 252 552 139.318029222752 134.972855452889 4.34517376986278 A:C:G A G 10 0.535606569257495 0.732892561044484 ENSG00000158042:ENST00000288937:exon_6702013_6703633:MRPL17;ENSG00000158042:ENST00000529958:exon_6703182_6703633:MRPL17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 6704051 G/A 1 8 2 10 3.71514744594004 1.07121313851499 2.64393430742505 A:G G A 10 0.535606569257495 0.118289200524796 ENSG00000158042:ENST00000529958:exon_6703978_6704527:MRPL17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 7662732 C/T 1 11 9 20 5.10832773816756 4.82045912331745 0.287868614850101 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534409:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530081:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532172:exon_7662710_7663387:PPFIBP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 7673015 G/A 1 26 26 52 12.0742291993051 13.9257708006949 -1.85154160138974 A:G G A 10 0.535606569257495 0.677176838890062 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 7686584 A/T 1 35 2 37 16.2537700759877 1.07121313851499 15.1825569374727 A:T A T 10 0.535606569257495 5.55809837235348e-08 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 7686596 G/A 1 25 2 27 11.6098357685626 1.07121313851499 10.5386226300476 A:G G A 10 0.535606569257495 1.88160849394513e-05 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 7686674 T/C 1 29 1 30 13.4674094915326 0.535606569257495 12.9318029222751 T:C T C 10 0.535606569257495 2.60479109256246e-07 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 7687715 T/C 0 22 0 22 10.2166554763351 0 10.2166554763351 T T 10 0.535606569257495 1.12988784393952e-06 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7687682_7687915:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7687682_7687781:CYB5R2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 9225486 C/G 1 9 9 18 4.17954087668255 4.82045912331745 -0.640918246634909 C:G C G 10 0.535606569257495 0.816090164780621 ENSG00000184014:ENST00000328194:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000530044:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000526707:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000532696:exon_9225079_9225864:DENND5A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 9537904 G/C 1 12 8 20 5.57272116891006 4.28485255405996 1.2878686148501 C:G G C 10 0.535606569257495 0.65695311160528 ENSG00000166478:ENST00000396604:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396602:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000530463:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396597:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000299606:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000447186:exon_9537748_9537909:ZNF143 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 9749645 A/C 1 48 23 71 22.2908846756402 12.3189510929224 9.97193358271786 A:C A C 10 0.535606569257495 0.0174930602896738 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9749600_9749746:SWAP70 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 9754221 C/T 1 51 33 84 23.6840649678678 17.6750167854973 6.00904818237042 T:C C T 10 0.535606569257495 0.228666482815621 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9754076_9754257:SWAP70 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 11974407 T/C 1 29 32 61 13.4674094915326 17.1394102162398 -3.67200072470719 T:C T C 10 0.535606569257495 0.370451147858163 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11974288_11974418:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11974288_11974418:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11974288_11974418:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11974288_11974418:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11972420_11974418:USP47 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 13441126 A/G 1 19 31 50 8.8234751841076 16.6038036469823 -7.78032846287475 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0327869860807523 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13441040_13441292:BTBD10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 13443250 C/T 1 21 16 37 9.75226204559261 8.56970510811992 1.18255693747269 T:C C T 10 0.535606569257495 0.74382946670773 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13443189_13443362:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13443189_13443385:BTBD10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 17351683 C/G 1 35 33 68 16.2537700759877 17.6750167854973 -1.42124670950966 C:G C G 10 0.535606569257495 0.808114669909956 ENSG00000070081:ENST00000532658:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000533773:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000405119:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000323688:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000529010:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000458064:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000527580:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000531242:exon_17351674_17351844:NUCB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 T:C C T 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 18319180 G/T 1 12 7 19 5.57272116891006 3.74924598480246 1.8234751841076 T:G G T 10 0.535606569257495 0.493225271714711 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18319106_18319264:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000531848:exon_18319106_18319264:HPS5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 18505552 G/A 1 19 21 40 8.8234751841076 11.2477379544074 -2.4242627702998 A:G G A 10 0.535606569257495 0.526606941530924 ENSG00000074319:ENST00000357193:exon_18505417_18505619:TSG101;ENSG00000074319:ENST00000251968:exon_18505417_18505619:TSG101 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 18633971 G/A 1 11 11 22 5.10832773816756 5.89167226183244 -0.783344523664889 A:G G A 10 0.535606569257495 0.831857301870848 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 20404613 T/G 1 62 50 112 28.7923927060353 26.7803284628747 2.01206424316057 T:G T G 10 0.535606569257495 0.776410756882592 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 20404757 T/C 1 106 91 197 49.2257036587055 48.740197802432 0.485505856273491 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 22647261 G/A 1 19 26 45 8.8234751841076 13.9257708006949 -5.10229561658727 A:G G A 10 0.535606569257495 0.136779894590734 ENSG00000183161:ENST00000327470:exon_22644079_22647387:FANCF;ENSG00000148935:ENST00000528582:exon_22647188_22647359:GAS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 27362359 T/G 1 11 18 29 5.10832773816756 9.64091824663491 -4.53259050846735 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0970767002827596 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 32852167 C/T 1 19 12 31 8.8234751841076 6.42727883108994 2.39619635301766 T:C C T 10 0.535606569257495 0.472483748496831 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32852054_32852178:PRRG4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 32874926 G/A 1 6 11 17 2.78636058445503 5.89167226183244 -3.10531167737741 A:G G A 10 0.535606569257495 0.149431785983435 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 33053107 C/T 1 12 10 22 5.57272116891006 5.35606569257495 0.216655476335111 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000121690:ENST00000241051:exon_33052924_33053135:DEPDC7;ENSG00000121690:ENST00000311388:exon_33052924_33053135:DEPDC7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 33065394 C/T 1 4 15 19 1.85757372297002 8.03409853886242 -6.1765248158924 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00505731673625181 ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 33076191 T/C 1 12 18 30 5.57272116891006 9.64091824663491 -4.06819707772485 T:C T C 10 0.535606569257495 0.146608455877534 ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 34378381 G/C 1 4 8 12 1.85757372297002 4.28485255405996 -2.42727883108994 C:G G C 10 0.535606569257495 0.246342614793183 ENSG00000166016:ENST00000435224:exon_34378248_34379555:ABTB2;ENSG00000166016:ENST00000298992:exon_34378248_34378802:ABTB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 35201842 C/T 1 78 108 186 36.2226875979154 57.8455094798095 -21.6228218818941 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00154234850186262 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528086:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526669:exon_35201821_35201876:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531118:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528455:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531873:exon_35201826_35201954:CD44 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 43876698 C/T 1 100 50 150 46.4393430742505 26.7803284628747 19.6590146113758 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00134403362698482 ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 43913604 G/A 1 23 14 37 10.6810489070776 7.49849196960493 3.18255693747269 A:G G A 10 0.535606569257495 0.325801108266624 ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43913591_43913679:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529366:exon_43913591_43913679:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530754:exon_43913591_43913679:ALKBH3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 44636833 G/A 1 349 427 776 162.073307329134 228.70400507295 -66.6306977438161 A:G G A 10 0.535606569257495 1.92042690745287e-06 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 546 469 1015 253.558813185408 251.199480981765 2.35933220364262 A:G A G 10 0.535606569257495 0.899846831202799 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 18 21 39 8.35908175336509 11.2477379544074 -2.8886562010423 A:G A G 10 0.535606569257495 0.422689700861272 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 45975130 C/T 1 7 10 17 3.25075401519754 5.35606569257495 -2.10531167737741 T:C C T 10 0.535606569257495 0.338652205084508 ENSG00000135365:ENST00000257821:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527401:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000323180:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000418153:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527753:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000534766:exon_45975078_45975166:PHF21A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 46332703 C/T 1 9 13 22 4.17954087668255 6.96288540034743 -2.78334452366489 T:C C T 10 0.535606569257495 0.286635935669917 ENSG00000157613:ENST00000529193:exon_46332583_46332740:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000446415:exon_46332583_46332740:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000288400:exon_46332583_46332740:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000527342:exon_46332465_46332740:CREB3L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 47303275 T/C 1 7 15 22 3.25075401519754 8.03409853886242 -4.78334452366489 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0529765719617484 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000489415:exon_47303126_47303304:MADD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 47306585 G/A 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000524530:exon_47306497_47306616:MADD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 47640429 G/C 1 59 68 127 27.3992124138078 36.4212467095097 -9.02203429570186 C:G G C 10 0.535606569257495 0.110195279609844 ENSG00000109919:ENST00000302503:exon_47638868_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000534074:exon_47640256_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000531669:exon_47640262_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000525649:exon_47640391_47640471:MTCH2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 48145166 G/A 1 1 9 10 0.464393430742505 4.82045912331745 -4.35606569257495 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00778992131964651 ENSG00000149177:ENST00000278456:exon_48145165_48145422:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000418331:exon_48145165_48145422:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000440289:exon_48145165_48145422:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000527952:exon_48145165_48145252:PTPRJ HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 57077556 T/C 1 22 14 36 10.2166554763351 7.49849196960493 2.71816350673018 T:C T C 10 0.535606569257495 0.406300371907785 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 57080882 C/T 1 9 10 19 4.17954087668255 5.35606569257495 -1.1765248158924 T:C C T 10 0.535606569257495 0.649555257001445 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 57509690 G/A 1 283 364 647 131.423340900129 194.960791209728 -63.5374503095993 A:G G A 10 0.535606569257495 6.33160154278601e-07 ENSG00000211450:ENST00000534355:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000533321:exon_57509281_57510529:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000388857:exon_57509589_57510129:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000528798:exon_57509589_57509699:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000534386:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000254732:ENST00000531074:exon_57509635_57509719:RP11-691N7.6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 58318619 C/G 1 76 71 147 35.2939007364304 38.0280664172821 -2.73416568085175 A:C:G C G 10 0.535606569257495 0.679644803301171 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58318538_58318705:LPXN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 58959633 G/A 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 A:G G A 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000110042:ENST00000532982:exon_58959571_58959723:DTX4;ENSG00000110042:ENST00000227451:exon_58959571_58959723:DTX4;ENSG00000110042:ENST00000531902:exon_58959571_58959724:DTX4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 58978940 C/T 1 52 21 73 24.1484583986103 11.2477379544074 12.9007204442029 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00307461427766225 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 60610056 G/C 1 40 33 73 18.5757372297002 17.6750167854973 0.900720444202868 C:G G C 10 0.535606569257495 0.906742178604224 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 60610065 G/A 1 31 37 68 14.3961963530177 19.8174430625273 -5.42124670950966 A:G G A 10 0.535606569257495 0.223846973015934 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 60673868 T/C 1 43 57 100 19.9689175219277 30.5295744476772 -10.5606569257495 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0355001334212447 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60673836_60674056:PRPF19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 60701136 C/G 1 10 6 16 4.64393430742505 3.21363941554497 1.43029489188008 C:G C G 10 0.535606569257495 0.618142335020353 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60701014_60701216:TMEM132A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 60703777 G/A 1 7 11 18 3.25075401519754 5.89167226183244 -2.64091824663491 A:G G A 10 0.535606569257495 0.242609580355471 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 T:C C T 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 60899767 A/G 1 11 14 25 5.10832773816756 7.49849196960493 -2.39016423143737 A:G A G 10 0.535606569257495 0.423378530112683 ENSG00000167987:ENST00000301765:exon_60897730_60900011:VPS37C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 61111413 G/A 1 19 20 39 8.8234751841076 10.7121313851499 -1.8886562010423 A:G G A 10 0.535606569257495 0.630763939446426 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61111328_61111447:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61111328_61111447:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61111328_61111447:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61111328_61111437:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534370:exon_61111328_61111438:DAK;ENSG00000149476:ENST00000528061:exon_61111088_61111447:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534084:exon_61111393_61111447:DAK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 61906374 T/C 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 T:C T C 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61906360_61906477:INCENP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 63721920 C/T 1 8 3 11 3.71514744594004 1.60681970777248 2.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.239570670048551 ENSG00000110583:ENST00000377793:exon_63721810_63724444:NAA40;ENSG00000110583:ENST00000338447:exon_63721810_63724444:NAA40;ENSG00000110583:ENST00000456907:exon_63721810_63724444:NAA40 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 63970625 G/A 1 120 89 209 55.7272116891006 47.6689846639171 8.05822702518356 A:T:G G A 10 0.535606569257495 0.268125809653987 ENSG00000168439:ENST00000358794:exon_63970597_63970700:STIP1;ENSG00000168439:ENST00000305218:exon_63970597_63970700:STIP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 63979162 C/T 1 157 162 319 72.9097686265733 86.7682642197142 -13.8584955931409 T:C C T 10 0.535606569257495 0.129541432652129 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63979117_63979219:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63979117_63979219:FERMT3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 63987339 C/T 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 T:C C T 10 0.535606569257495 0.76441497343657 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 64026144 G/A 1 7 11 18 3.25075401519754 5.89167226183244 -2.64091824663491 A:G G A 10 0.535606569257495 0.242609580355471 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64025945_64026185:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64025945_64026185:PLCB3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 64026639 G/A 1 3 8 11 1.39318029222752 4.28485255405996 -2.89167226183244 A:G G A 10 0.535606569257495 0.127650256211486 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64026530_64026716:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64026530_64026716:PLCB3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 64039175 G/A 1 14 10 24 6.50150803039507 5.35606569257495 1.14544233782012 A:G G A 10 0.535606569257495 0.686918776217185 ENSG00000002330:ENST00000394532:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000309032:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000394531:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000493798:exon_64039085_64039340:BAD;ENSG00000002330:ENST00000492141:exon_64039085_64039275:BAD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 64109208 G/C 1 32 33 65 14.8605897837602 17.6750167854973 -2.81442700173717 C:G G C 10 0.535606569257495 0.534725089286702 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 64572018 T/C 1 41 19 60 19.0401306604427 10.1765248158924 8.8636058445503 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0270046128638000 ENSG00000133895:ENST00000377316:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64571806_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64571847_64572288:MEN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 64572602 G/A 1 17 9 26 7.89468832262259 4.82045912331745 3.07422919930513 A:G G A 10 0.535606569257495 0.244740828501064 ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 64695360 G/A 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000068971:ENST00000526559:exon_64695274_64695375:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000164133:exon_64695274_64695375:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000532850:exon_64695274_64695375:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000527441:exon_64695274_64695375:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000359279:exon_64695274_64695375:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000528530:exon_64695206_64695375:PPP2R5B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 64806270 C/T 1 6 15 21 2.78636058445503 8.03409853886242 -5.24773795440739 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0273627820397729 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802992_64806301:SNX15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 64807235 C/T 1 10 15 25 4.64393430742505 8.03409853886242 -3.39016423143737 T:C C T 10 0.535606569257495 0.228594195909264 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 64812857 G/A 1 12 4 16 5.57272116891006 2.14242627702998 3.43029489188008 A:G G A 10 0.535606569257495 0.130383593597072 ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64812295_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355369:exon_64812297_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000339885:exon_64812297_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526799:exon_64812698_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529274:exon_64812708_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64812708_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526516:exon_64812776_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000532802:exon_64812785_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530995:exon_64812823_64812929:NAALADL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 65380916 G/A 1 43 26 69 19.9689175219277 13.9257708006949 6.04314672123285 A:G G A 10 0.535606569257495 0.149574454118614 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65380489_65381713:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524856:exon_65380489_65382853:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000527304:exon_65376103_65381707:MAP3K11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 65384727 C/T 1 6 10 16 2.78636058445503 5.35606569257495 -2.56970510811992 T:C C T 10 0.535606569257495 0.218581872606213 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65384721_65384820:PCNXL3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 65387012 C/T 1 11 9 20 5.10832773816756 4.82045912331745 0.287868614850101 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387008_65387131:PCNXL3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 65387378 T/A 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 A:T T A 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387225_65387403:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000531045:exon_65387329_65387403:PCNXL3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 65826704 G/A 1 206 241 447 95.665046732956 129.081183191056 -33.4161364581002 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00172173757420507 ENSG00000087365:ENST00000528302:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000322535:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000355456:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000529994:exon_65826672_65826809:SF3B2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 66031660 C/T 1 27 39 66 12.5386226300476 20.8886562010423 -8.35003357099466 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0476673472463689 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031517_66031690:KLC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 66105194 G/A 1 77 89 166 35.7582941671729 47.6689846639171 -11.9106904967442 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0732094832280673 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66104804_66105278:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66104840_66105360:BRMS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 66999278 G/T 1 17 14 31 7.89468832262259 7.49849196960493 0.396196353017657 T:G G T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000173120:ENST00000398645:exon_66999037_66999431:KDM2A;ENSG00000173120:ENST00000529006:exon_66999037_66999431:KDM2A;ENSG00000173120:ENST00000401583:exon_66999037_66999431:KDM2A;ENSG00000173120:ENST00000308783:exon_66999037_66999431:KDM2A;ENSG00000173120:ENST00000526258:exon_66999037_66999431:KDM2A;ENSG00000173120:ENST00000531696:exon_66999037_66999431:KDM2A;ENSG00000173120:ENST00000525041:exon_66999236_66999431:KDM2A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 67351585 C/G 0 0 24 24 0 12.8545576621799 -12.8545576621799 G C G 10 0.535606569257495 1.01219834550004e-08 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 68030015 C/T 1 40 50 90 18.5757372297002 26.7803284628747 -8.20459123317455 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0909258304892615 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 68030173 C/A 1 29 32 61 13.4674094915326 17.1394102162398 -3.67200072470719 A:C C A 10 0.535606569257495 0.370451147858163 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 68705820 G/A 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68705650_68705822:IGHMBP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 77 91 168 35.7582941671729 48.740197802432 -12.9819036352592 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0528236587608812 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 71146691 A/G 1 65 62 127 30.1855729982628 33.2076072939647 -3.02203429570186 A:G A G 10 0.535606569257495 0.59482627203303 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 71152461 A/G 1 109 64 173 50.6188839509331 34.2788204324797 16.3400635184534 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0145015652602541 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71152406_71152486:DHCR7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 71155153 A/G 1 40 20 60 18.5757372297002 10.7121313851499 7.8636058445503 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0514111957763874 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155039_71155165:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 71155171 C/T 1 38 30 68 17.6469503682152 16.0681970777248 1.57875329049035 T:C C T 10 0.535606569257495 0.717251867477318 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 14 15 29 6.50150803039507 8.03409853886242 -1.53259050846735 C:G G C 10 0.535606569257495 0.582160963982168 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 71185479 T/C 1 18 11 29 8.35908175336509 5.89167226183244 2.46740949153265 T:C T C 10 0.535606569257495 0.457202867215174 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 71185518 T/C 1 18 16 34 8.35908175336509 8.56970510811992 -0.210623354754828 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 71941212 A/G 1 40 24 64 18.5757372297002 12.8545576621799 5.72117956752032 A:G A G 10 0.535606569257495 0.168685058545592 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71941165_71941315:INPPL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 71949064 C/G 1 3 9 12 1.39318029222752 4.82045912331745 -3.42727883108994 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0782949617348295 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 72397200 C/T 1 73 44 117 33.9007204442029 23.5666890473298 10.3340313968731 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0634310920309182 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72397087_72397236:ARAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 72415329 G/A 1 26 20 46 12.0742291993051 10.7121313851499 1.36209781415523 A:G G A 10 0.535606569257495 0.76817749711952 ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72415197_72415379:ARAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 72554311 C/T 1 28 20 48 13.0030160607901 10.7121313851499 2.29088467564024 T:C C T 10 0.535606569257495 0.56410800496454 ENSG00000137478:ENST00000311172:exon_72554196_72554373:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000409418:exon_72554196_72554373:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000409314:exon_72554196_72554373:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000432043:exon_72554196_72554373:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000458644:exon_72554196_72554373:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000409263:exon_72554196_72554373:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000409853:exon_72553999_72554373:FCHSD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 73104927 T/C 1 24 21 45 11.1454423378201 11.2477379544074 -0.102295616587273 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73104882_73104962:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73104882_73104962:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73104851_73104962:RELT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 73620537 C/G 1 9 5 14 4.17954087668255 2.67803284628747 1.50150803039507 C:G C G 10 0.535606569257495 0.593847168610995 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73620444_73620638:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73620444_73620638:PAAF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 132 128 260 61.2999328580107 68.5576408649594 -7.25770800694869 A:G G A 10 0.535606569257495 0.384257735767534 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 73785326 T/C 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 T:C T C 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000168014:ENST00000334126:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313663:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313681:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000289350:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000414160:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000442398:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000415191:exon_73785298_73785645:C2CD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 75110589 A/G 1 346 267 613 160.680127036907 143.006953991751 17.6731730451556 A:G A G 10 0.535606569257495 0.156511806624739 ENSG00000149273:ENST00000531188:exon_75110530_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000529173:exon_75110559_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000531810:exon_75110561_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000528439:exon_75110562_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530164:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530689:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530721:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000405680:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000422465:exon_75110564_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000278572:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000532872:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000534440:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527446:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000526608:exon_75110581_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527273:exon_75110586_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000524851:exon_75110587_75110621:RPS3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 75152243 C/T 1 10 11 21 4.64393430742505 5.89167226183244 -1.24773795440739 T:C C T 10 0.535606569257495 0.66418868541406 ENSG00000158555:ENST00000526177:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000527820:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533784:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000529721:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000336898:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533805:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000376282:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443415:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443276:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000534322:exon_75152208_75152355:GDPD5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 75160575 G/A 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 A:G G A 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000158555:ENST00000526177:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000527820:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533784:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000529721:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000336898:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533805:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000376282:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443415:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443276:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000527322:exon_75160562_75160655:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533911:exon_75160562_75160655:GDPD5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 75277992 C/T 1 42 22 64 19.5045240911852 11.7833445236649 7.72117956752032 T:C C T 10 0.535606569257495 0.059879281110059 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277764_75278016:SERPINH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 76257215 T/C 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 T:C T C 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000158636:ENST00000524490:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000334736:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000393457:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000524767:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000533248:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525919:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525038:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000529032:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000531793:exon_76256992_76257341:C11orf30 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 77920563 G/T 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 T:G G T 10 0.535606569257495 0.824415845788285 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530521:exon_77920494_77920597:USP35 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 77920863 C/A 1 18 20 38 8.35908175336509 10.7121313851499 -2.35304963178481 A:C C A 10 0.535606569257495 0.516185836987251 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 77920930 A/G 1 12 17 29 5.57272116891006 9.10531167737741 -3.53259050846735 A:G A G 10 0.535606569257495 0.197911784817732 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 21 17 38 9.75226204559261 9.10531167737741 0.64695036821519 T:C C T 10 0.535606569257495 0.872084859978277 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 77930345 T/C 1 6 8 14 2.78636058445503 4.28485255405996 -1.49849196960493 T:C T C 10 0.535606569257495 0.436988882100625 ENSG00000033327:ENST00000304401:exon_77926342_77930461:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000340149:exon_77926343_77930461:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000361507:exon_77926343_77930461:GAB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 77936166 A/G 1 9 3 12 4.17954087668255 1.60681970777248 2.57272116891006 A:G A G 10 0.535606569257495 0.158222040248362 ENSG00000033327:ENST00000304401:exon_77936154_77936248:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000340149:exon_77936154_77936248:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000361507:exon_77936154_77936248:GAB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 77937800 G/A 1 14 6 20 6.50150803039507 3.21363941554497 3.2878686148501 A:G G A 10 0.535606569257495 0.179439517734263 ENSG00000033327:ENST00000304401:exon_77937511_77938097:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000340149:exon_77937511_77938097:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000361507:exon_77937511_77938097:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000528329:exon_77937666_77938097:GAB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 77961419 C/A 1 10 7 17 4.64393430742505 3.74924598480246 0.894688322622586 A:C C A 10 0.535606569257495 0.809240333218704 ENSG00000033327:ENST00000304401:exon_77961203_77961446:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000340149:exon_77961203_77961446:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000361507:exon_77961203_77961446:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000528886:exon_77961317_77961446:GAB2;ENSG00000033327:ENST00000530915:exon_77961403_77961446:GAB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 78277277 A/G 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000525345:exon_78277178_78277313:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78277178_78277318:NARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 78279790 T/G 1 6 10 16 2.78636058445503 5.35606569257495 -2.56970510811992 T:G T G 10 0.535606569257495 0.218581872606213 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000526709:exon_78279761_78279798:NARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 82644764 C/G 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 C:G C G 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 3 9 12 1.39318029222752 4.82045912331745 -3.42727883108994 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0782949617348295 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 45 40 85 20.8977043834127 21.4242627702998 -0.526558386887071 T:C C T 10 0.535606569257495 0.913877637039137 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 31 21 52 14.3961963530177 11.2477379544074 3.14845839861026 A:C A C 10 0.535606569257495 0.407010661996596 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 85445365 G/C 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 C:G G C 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000137501:ENST00000316356:exon_85444982_85445785:SYTL2;ENSG00000137501:ENST00000436296:exon_85444982_85445785:SYTL2;ENSG00000137501:ENST00000389960:exon_85444982_85445785:SYTL2;ENSG00000137501:ENST00000528231:exon_85444982_85445785:SYTL2;ENSG00000137501:ENST00000527523:exon_85444982_85445785:SYTL2;ENSG00000137501:ENST00000524452:exon_85444982_85445785:SYTL2;ENSG00000137501:ENST00000438197:exon_85444638_85445785:SYTL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 9 12 21 4.17954087668255 6.42727883108994 -2.24773795440739 T:C C T 10 0.535606569257495 0.384311420828178 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 86161388 C/G 1 4 7 11 1.85757372297002 3.74924598480246 -1.89167226183244 C:G C G 10 0.535606569257495 0.36607342785591 ENSG00000151376:ENST00000359636:exon_86161343_86161440:ME3;ENSG00000151376:ENST00000393324:exon_86161343_86161440:ME3;ENSG00000151376:ENST00000524826:exon_86161343_86161440:ME3;ENSG00000151376:ENST00000530520:exon_86161343_86161440:ME3;ENSG00000151376:ENST00000526504:exon_86161343_86161440:ME3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 86267633 C/T 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 T:C C T 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000151376:ENST00000359636:exon_86267595_86267744:ME3;ENSG00000151376:ENST00000393324:exon_86267595_86267744:ME3;ENSG00000151376:ENST00000524826:exon_86267595_86267744:ME3;ENSG00000151376:ENST00000530520:exon_86267595_86267744:ME3;ENSG00000151376:ENST00000526504:exon_86267595_86267744:ME3;ENSG00000151376:ENST00000323418:exon_86267595_86267744:ME3;ENSG00000151376:ENST00000530335:exon_86267607_86267744:ME3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 86267714 C/A 1 12 8 20 5.57272116891006 4.28485255405996 1.2878686148501 A:C:G C A 10 0.535606569257495 0.65695311160528 ENSG00000151376:ENST00000359636:exon_86267595_86267744:ME3;ENSG00000151376:ENST00000393324:exon_86267595_86267744:ME3;ENSG00000151376:ENST00000524826:exon_86267595_86267744:ME3;ENSG00000151376:ENST00000530520:exon_86267595_86267744:ME3;ENSG00000151376:ENST00000526504:exon_86267595_86267744:ME3;ENSG00000151376:ENST00000323418:exon_86267595_86267744:ME3;ENSG00000151376:ENST00000530335:exon_86267607_86267744:ME3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 87908563 G/A 1 43 35 78 19.9689175219277 18.7462299240123 1.2226875979154 A:G G A 10 0.535606569257495 0.821017354630051 ENSG00000123892:ENST00000243662:exon_87908351_87908635:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000531138:exon_87908351_87908601:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000526372:exon_87908406_87908602:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000441495:exon_87908351_87908635:RAB38 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 21 17 38 9.75226204559261 9.10531167737741 0.64695036821519 T:G G T 10 0.535606569257495 0.872084859978277 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 93212161 A/G 1 5 19 24 2.32196715371253 10.1765248158924 -7.85455766217988 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00158484579560273 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 93212254 C/T 1 6 11 17 2.78636058445503 5.89167226183244 -3.10531167737741 T:C C T 10 0.535606569257495 0.149431785983435 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 93480545 T/C 1 6 7 13 2.78636058445503 3.74924598480246 -0.962885400347434 T:C T C 10 0.535606569257495 0.782351862796383 ENSG00000182919:ENST00000528288:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000331239:exon_93480468_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000533585:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000528099:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000354421:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000527003:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000531650:exon_93480463_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000530279:exon_93480468_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000527363:exon_93480468_93480614:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000526335:exon_93479651_93480614:C11orf54 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 93517874 C/G 1 20 14 34 9.2878686148501 7.49849196960493 1.78937664524517 C:G C G 10 0.535606569257495 0.607899514877059 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 93517886 G/C 1 21 13 34 9.75226204559261 6.96288540034743 2.78937664524517 C:G G C 10 0.535606569257495 0.391865967418225 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93517884_93517929:MED17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 16 14 30 7.43029489188008 7.49849196960493 -0.0681970777248484 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 94533373 C/T 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000166025:ENST00000317837:exon_94532556_94533477:AMOTL1;ENSG00000166025:ENST00000317829:exon_94532556_94533477:AMOTL1;ENSG00000166025:ENST00000433060:exon_94532556_94533477:AMOTL1;ENSG00000166025:ENST00000299004:exon_94532556_94533477:AMOTL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 68 76 144 31.5787532904903 40.7060992635696 -9.12734597307927 A:G A G 10 0.535606569257495 0.133056483954320 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 95580926 G/A 1 15 15 30 6.96590146113758 8.03409853886242 -1.06819707772485 A:G G A 10 0.535606569257495 0.71779496149159 ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000393223:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000444541:exon_95580878_95581063:MTMR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 95712897 G/T 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 T:G G T 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95709762_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95711440_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95712112_95713127:MAML2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 102272884 C/T 1 67 50 117 31.1143598597478 26.7803284628747 4.33403139687309 T:C C T 10 0.535606569257495 0.458835003378676 ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000529492:exon_102272475_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000525577:exon_102272656_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000531103:exon_102272765_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000526676:exon_102272830_102272937:TMEM123 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 108043988 C/T 1 8 10 18 3.71514744594004 5.35606569257495 -1.64091824663491 T:C C T 10 0.535606569257495 0.484651981913674 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000533535:exon_108041859_108044578:NPAT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 27 18 45 12.5386226300476 9.64091824663491 2.89770438341273 T:C C T 10 0.535606569257495 0.455634772284132 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 116633947 G/A 1 18 13 31 8.35908175336509 6.96288540034743 1.39619635301766 A:G G A 10 0.535606569257495 0.719730647046148 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 116734530 T/C 1 11 8 19 5.10832773816756 4.28485255405996 0.823475184107596 T:C T C 10 0.535606569257495 0.819697348092054 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116734384_116734534:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116734384_116734534:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116734384_116734534:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116734384_116734534:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116734384_116734534:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116734384_116735784:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116734384_116734534:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116734384_116734534:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116734384_116734534:SIK3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 117063003 G/A 1 16 24 40 7.43029489188008 12.8545576621799 -5.4242627702998 A:G G A 10 0.535606569257495 0.111860800810562 ENSG00000149577:ENST00000324225:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000278951:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000529441:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000431081:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000529484:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000525065:exon_117062970_117063078:SIDT2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 117222592 G/A 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 A:G G A 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000110274:ENST00000525734:exon_117222506_117222658:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533153:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000525416:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527324:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527609:exon_117222506_117222675:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533570:exon_117222506_117222676:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117222506_117222704:CEP164 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 117266312 C/G 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117266263_117266438:CEP164 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 117267303 G/A 1 9 9 18 4.17954087668255 4.82045912331745 -0.640918246634909 A:G G A 10 0.535606569257495 0.816090164780621 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267266_117267327:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267266_117267327:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267266_117267327:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267266_117267327:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267266_117267327:CEP164 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 6 12 18 2.78636058445503 6.42727883108994 -3.64091824663491 A:G A G 10 0.535606569257495 0.100181682544637 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 117389327 C/T 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000177103:ENST00000527706:exon_117389181_117389477:DSCAML1;ENSG00000177103:ENST00000321322:exon_117389181_117389477:DSCAML1;ENSG00000177103:ENST00000446508:exon_117389181_117389477:DSCAML1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 117691386 G/A 1 181 157 338 84.0552109643934 84.0902313734267 -0.0350204090332937 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000137731:ENST00000532119:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000528014:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000292079:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000260287:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000534383:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000533281:exon_117691275_117691411:FXYD2;ENSG00000254844:ENST00000531850:exon_117691176_117691436:RP11-728F11.3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 118404804 G/A 1 9 5 14 4.17954087668255 2.67803284628747 1.50150803039507 A:G G A 10 0.535606569257495 0.593847168610995 ENSG00000149582:ENST00000411589:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000442938:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000359862:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526465:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000354284:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000532762:exon_118404744_118404835:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526973:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000354064:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000533627:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000533102:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000524522:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000313236:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000524725:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526853:exon_118404744_118404844:TMEM25 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 118765267 G/C 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000160683:ENST00000292174:exon_118764305_118768508:CXCR5;ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 118769442 A/G 1 6 11 17 2.78636058445503 5.89167226183244 -3.10531167737741 A:G A G 10 0.535606569257495 0.149431785983435 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118766849_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118768455_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000525300:exon_118768459_118769773:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118769124_118769771:BCL9L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 14 13 27 6.50150803039507 6.96288540034743 -0.461377369952364 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 34 59 93 15.7893766452452 31.6007875861922 -15.811410940947 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00117270956015482 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 118919206 T/C 1 228 188 416 105.881702209291 100.694035020409 5.1876671888821 T:C T C 10 0.535606569257495 0.623297050012458 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919184_118919275:HYOU1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 118940182 G/A 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 A:G G A 10 0.535606569257495 0.560152843364079 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 118940957 C/G 1 11 16 27 5.10832773816756 8.56970510811992 -3.46137736995236 C:G C G 10 0.535606569257495 0.246551169931367 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 118949331 C/T 1 19 11 30 8.8234751841076 5.89167226183244 2.93180292227515 T:C C T 10 0.535606569257495 0.360623116199509 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 44 32 76 20.4333109526702 17.1394102162398 3.29390073643038 A:G A G 10 0.535606569257495 0.491079745270601 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 121367626 T/C 1 11 5 16 5.10832773816756 2.67803284628747 2.43029489188008 T:C T C 10 0.535606569257495 0.316760693759888 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121367578_121367758:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532451:exon_121367578_121367758:SORL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 121393684 G/A 1 17 12 29 7.89468832262259 6.42727883108994 1.46740949153265 A:G G A 10 0.535606569257495 0.710437247251719 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121393625_121393698:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532451:exon_121393625_121393698:SORL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 121448090 T/G 1 7 16 23 3.25075401519754 8.56970510811992 -5.31895109292238 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0348486029386976 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121447990_121448109:SORL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 121456962 C/T 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 T:C C T 10 0.535606569257495 0.193170376367493 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121456931_121457038:SORL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 121475922 T/A 1 38 16 54 17.6469503682152 8.56970510811992 9.07724526009527 A:T T A 10 0.535606569257495 0.0138337586296492 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 1267 1185 2452 588.386476750754 634.693784570131 -46.3073078193776 A:T:G A G 10 0.535606569257495 0.0624974598771446 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 123596703 A/C 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:C A C 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000166261:ENST00000336139:exon_123594885_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000530393:exon_123595488_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000529691:exon_123595488_123597699:ZNF202 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 125446159 G/A 1 18 12 30 8.35908175336509 6.42727883108994 1.93180292227515 A:G G A 10 0.535606569257495 0.583938206470959 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534546:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531636:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000524723:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000529765:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527842:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527520:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527131:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527235:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125446151_125446211:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125446151_125446211:EI24 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 34 30 64 15.7893766452452 16.0681970777248 -0.278820432479675 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 57 63 120 26.4704255523228 33.7432138632222 -7.27278831089939 A:G G A 10 0.535606569257495 0.200227211286900 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 10 17 27 4.64393430742505 9.10531167737741 -4.46137736995236 A:C C A 10 0.535606569257495 0.121108055706691 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 126074192 A/G 1 12 16 28 5.57272116891006 8.56970510811992 -2.99698393920986 A:G A G 10 0.535606569257495 0.263118689191783 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000530903:exon_126074126_126074223:RPUSD4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 126162468 G/A 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000150455:ENST00000488598:exon_126162372_126162582:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000438974:exon_126162372_126163012:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392678:exon_126162372_126163139:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126162372_126162950:TIRAP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 126174038 C/T 1 50 40 90 23.2196715371253 21.4242627702998 1.79540876682545 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.751723165038023 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 126174164 C/T 1 73 86 159 33.9007204442029 46.0621649561446 -12.1614445119417 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0563976180418182 ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 126201403 T/C 1 55 41 96 25.5416386908378 21.9598693395573 3.58176935128049 T:C T C 10 0.535606569257495 0.475865789862271 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126201300_126201445:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000530860:exon_126201299_126201445:DCPS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 128675292 T/A 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 A:T T A 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000151702:ENST00000525560:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000344954:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000429175:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000527786:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000534087:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000281428:exon_128675261_128675326:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000528790:exon_128673771_128677134:FLI1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 11 129754644 A/G 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 A:G A G 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000170322:ENST00000304521:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000446488:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524794:exon_129754640_129754777:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524746:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000531755:exon_129754640_129754777:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000530278:exon_129754639_129754777:NFRKB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 863505 A/C 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 A:C A C 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 863517 G/A 1 6 10 16 2.78636058445503 5.35606569257495 -2.56970510811992 A:G G A 10 0.535606569257495 0.218581872606213 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 993930 C/T 1 59 52 111 27.3992124138078 27.8515416013897 -0.452329187581938 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 998338 A/G 1 11 14 25 5.10832773816756 7.49849196960493 -2.39016423143737 A:G A G 10 0.535606569257495 0.423378530112683 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_998306_998389:WNK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 1022569 A/C 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 A:C A C 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000002016:ENST00000358495:exon_1021243_1022618:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000228345:exon_1021255_1022618:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000430095:exon_1021255_1022618:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000468231:exon_1021655_1022618:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000481052:exon_1021661_1022618:RAD52;ENSG00000002016:ENST00000488642:exon_1021924_1022618:RAD52 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 32 22 54 14.8605897837602 11.7833445236649 3.07724526009527 A:G A G 10 0.535606569257495 0.416770816821298 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 39 56 95 18.1113437989577 29.9939678784197 -11.882624079462 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0175757885565825 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 4388084 C/G 1 117 78 195 54.3340313968731 41.7773124020846 12.5567189947885 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0729769740852914 ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4387926_4388085:CCND2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 29 25 54 13.4674094915326 13.3901642314374 0.0772452600952711 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 6450945 T/C 0 0 8 8 0 4.28485255405996 -4.28485255405996 C T C 10 0.535606569257495 0.002163159489147 ENSG00000067182:ENST00000162749:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A;ENSG00000067182:ENST00000440083:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 6500089 A/G 1 7 18 25 3.25075401519754 9.64091824663491 -6.39016423143737 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0145392771583492 ENSG00000111321:ENST00000228918:exon_6499826_6500733:LTBR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 6567981 G/A 1 38 26 64 17.6469503682152 13.9257708006949 3.72117956752033 A:G G A 10 0.535606569257495 0.38189556855976 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6567811_6568113:TAPBPL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4139 3510 7649 1922.12440984323 1879.97905809381 42.1453517494213 A:T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.33561646835334 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 3966 3918 7884 1841.78434632478 2098.50653835087 -256.72219202609 A:T:C:G T C 10 0.535606569257495 7.34092831431992e-09 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 52 50 102 24.1484583986103 26.7803284628747 -2.63187006426449 A:G G A 10 0.535606569257495 0.620642760266766 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 7343113 C/T 1 11 20 31 5.10832773816756 10.7121313851499 -5.60380364698234 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0482624162035106 ENSG00000139197:ENST00000455147:exon_7342958_7343120:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000434354:exon_7342958_7343165:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000420616:exon_7342958_7343120:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000266563:exon_7342958_7343120:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000412720:exon_7342958_7343120:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000266564:exon_7342958_7343120:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000396637:exon_7342974_7343120:PEX5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 9822387 C/G 1 116 53 169 53.8696379661306 28.3871481706472 25.4824897954833 C:G C G 10 0.535606569257495 7.63027494660208e-05 ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9822313_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9822324_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9822325_9822391:CLEC2D HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 9833524 C/G 1 44 60 104 20.4333109526702 32.1363941554497 -11.7030832027795 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0235679941649818 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 9906067 T/C 1 39 59 98 18.1113437989577 31.6007875861922 -13.4894437872345 T:C T C 10 0.535606569257495 0.00813014995916983 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 12967127 C/T 1 38 34 72 17.6469503682152 18.2106233547548 -0.563672986539636 T:C C T 10 0.535606569257495 0.906469069509154 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000426619:exon_12967065_12967158:DDX47 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 14577892 A/T 1 23 11 34 10.6810489070776 5.89167226183244 4.78937664524517 A:T A T 10 0.535606569257495 0.121527966269489 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14576843_14578407:ATF7IP;ENSG00000171681:ENST00000396279:exon_14576850_14578391:ATF7IP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 14587301 A/G 1 13 15 28 6.03711459965257 8.03409853886242 -1.99698393920986 A:G A G 10 0.535606569257495 0.456308012833315 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14587271_14587357:ATF7IP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 14649196 A/G 1 13 16 29 6.03711459965257 8.56970510811992 -2.53259050846735 A:G A G 10 0.535606569257495 0.358571526558961 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14649165_14649277:ATF7IP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 6 9 15 2.78636058445503 4.82045912331745 -2.03409853886242 T:G T G 10 0.535606569257495 0.312839743181367 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 22602796 A/G 1 8 9 17 3.71514744594004 4.82045912331745 -1.10531167737741 A:G A G 10 0.535606569257495 0.633230727718346 ENSG00000111731:ENST00000333957:exon_22601541_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000446597:exon_22602479_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000396028:exon_22602479_22602825:KIAA0528 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 25242595 C/G 1 16 6 22 7.43029489188008 3.21363941554497 4.21665547633511 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0873058941370847 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242548_25242611:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242548_25242611:LRMP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 21 16 37 9.75226204559261 8.56970510811992 1.18255693747269 C:G G C 10 0.535606569257495 0.74382946670773 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 26784850 G/A 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 A:G G A 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26784799_26784992:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26784799_26784992:ITPR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 26809316 G/A 1 7 9 16 3.25075401519754 4.82045912331745 -1.56970510811992 A:G G A 10 0.535606569257495 0.462079525679044 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26809230_26809481:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26809230_26809481:ITPR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 26810777 T/C 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 T:C T C 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26810640_26810825:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26810640_26810825:ITPR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 26810816 T/G 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 T:G T G 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26810640_26810825:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26810640_26810825:ITPR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 27863859 C/T 1 25 12 37 11.6098357685626 6.42727883108994 5.18255693747269 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0999004018368744 ENSG00000061794:ENST00000081029:exon_27863729_27863888:MRPS35;ENSG00000061794:ENST00000321446:exon_27863777_27863888:MRPS35 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 29486745 T/C 1 22 13 35 10.2166554763351 6.96288540034743 3.25377007598768 T:C T C 10 0.535606569257495 0.311258240223386 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 29521193 A/G 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 A:G A G 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000087502:ENST00000360150:exon_29521174_29521220:ERGIC2;ENSG00000087502:ENST00000201023:exon_29521174_29521220:ERGIC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 30816541 C/T 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 T:C C T 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000133704:ENST00000256079:exon_30816423_30816588:IPO8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 31135579 T/C 1 17 6 23 7.89468832262259 3.21363941554497 4.68104890707762 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0597251465228825 ENSG00000110900:ENST00000261177:exon_31135467_31135625:TSPAN11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 32137901 A/G 1 40 22 62 18.5757372297002 11.7833445236649 6.79239270603531 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0975702826656896 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 39087609 G/A 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 A:G G A 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000139117:ENST00000331366:exon_39087459_39087640:CPNE8;ENSG00000139117:ENST00000360449:exon_39087459_39087640:CPNE8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 39695445 G/A 1 27 20 47 12.5386226300476 10.7121313851499 1.82649124489774 A:G G A 10 0.535606569257495 0.661909572342206 ENSG00000139116:ENST00000341813:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000395670:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361418:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361961:exon_39695282_39695481:KIF21A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 39698641 G/C 1 19 12 31 8.8234751841076 6.42727883108994 2.39619635301766 A:C:G G C 10 0.535606569257495 0.472483748496831 ENSG00000139116:ENST00000341813:exon_39698623_39698740:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000395670:exon_39698623_39698740:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361418:exon_39698623_39698740:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361961:exon_39698623_39698740:KIF21A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 31 28 59 14.3961963530177 14.9969839392099 -0.600787586192201 A:T A T 10 0.535606569257495 0.896756783136644 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 46322449 C/T 1 45 34 79 20.8977043834127 18.2106233547548 2.6870810286579 T:C C T 10 0.535606569257495 0.574198482680171 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 46760866 G/A 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000134294:ENST00000256689:exon_46760859_46760951:SLC38A2;ENSG00000134294:ENST00000395444:exon_46760859_46760951:SLC38A2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 15 18 33 6.96590146113758 9.64091824663491 -2.67501678549733 A:T:G G T 10 0.535606569257495 0.385729991177765 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 49086963 G/A 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 A:G G A 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000129315:ENST00000261900:exon_49086752_49088219:CCNT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 49169219 T/C 1 11 5 16 5.10832773816756 2.67803284628747 2.43029489188008 T:C T C 10 0.535606569257495 0.316760693759888 ENSG00000174233:ENST00000357869:exon_49169086_49169233:ADCY6;ENSG00000174233:ENST00000307885:exon_49169086_49169233:ADCY6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 54 57 111 25.0772452600953 30.5295744476772 -5.45232918758194 T:G T G 10 0.535606569257495 0.3413477069304 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 49425879 T/G 1 8 14 22 3.71514744594004 7.49849196960493 -3.78334452366489 T:G T G 10 0.535606569257495 0.134296367934504 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49424958_49427747:MLL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 49666815 C/T 1 389 388 777 180.649044558834 207.815348871908 -27.1663043130736 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0521172745590895 ENSG00000167553:ENST00000321665:exon_49666447_49666853:TUBA1C;ENSG00000167553:ENST00000301072:exon_49666036_49667114:TUBA1C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 50190653 C/T 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 T:C C T 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 50190667 A/T 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 A:T A T 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 50232169 A/T 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 A:T A T 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50231560_50232798:BCDIN3D HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 50529736 G/A 1 15 8 23 6.96590146113758 4.28485255405996 2.68104890707762 A:G G A 10 0.535606569257495 0.300721382047396 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50529724_50529852:LASS5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 51213433 A/G 1 51 37 88 23.6840649678678 19.8174430625273 3.86662190534044 A:G A G 10 0.535606569257495 0.454855663335734 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51213418_51214907:ATF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 51442944 G/A 1 24 17 41 11.1454423378201 9.10531167737741 2.04013066044271 A:G G A 10 0.535606569257495 0.536421902381782 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51442817_51442968:LETMD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 51773557 G/A 1 10 6 16 4.64393430742505 3.21363941554497 1.43029489188008 A:G G A 10 0.535606569257495 0.618142335020353 ENSG00000139629:ENST00000356317:exon_51773075_51773668:GALNT6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 52448409 C/T 1 20 26 46 9.2878686148501 13.9257708006949 -4.63790218584477 T:C C T 10 0.535606569257495 0.185093900029521 ENSG00000123358:ENST00000360284:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000478250:exon_52448111_52449745:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394825:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000243050:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394824:exon_52448111_52448988:NR4A1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 45 22 67 20.8977043834127 11.7833445236649 9.11435985974784 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0273384672108152 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 13 16 29 6.03711459965257 8.56970510811992 -2.53259050846735 A:G G A 10 0.535606569257495 0.358571526558961 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 53682457 G/A 1 8 9 17 3.71514744594004 4.82045912331745 -1.10531167737741 A:G G A 10 0.535606569257495 0.633230727718346 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 53682986 C/T 1 6 11 17 2.78636058445503 5.89167226183244 -3.10531167737741 T:C C T 10 0.535606569257495 0.149431785983435 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682874_53683087:ESPL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 53777171 A/G 1 14 12 26 6.50150803039507 6.42727883108994 0.0742291993051314 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000185591:ENST00000327443:exon_53775894_53777406:SP1;ENSG00000185591:ENST00000426431:exon_53775894_53777406:SP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 54109659 C/T 1 10 19 29 4.64393430742505 10.1765248158924 -5.53259050846735 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0419714289237075 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 31 27 58 14.3961963530177 14.4613773699524 -0.0651810169347051 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 54675113 G/A 1 13 11 24 6.03711459965257 5.89167226183244 0.145442337820121 A:G G A 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 54767812 G/A 0 16 0 16 7.43029489188008 0 7.43029489188008 G G 10 0.535606569257495 5.05498483720302e-05 ENSG00000161642:ENST00000352268:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000338010:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000394313:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000413859:exon_54767757_54767919:ZNF385A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 54767863 A/G 1 1 11 12 0.464393430742505 5.89167226183244 -5.42727883108994 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00205041889200729 ENSG00000161642:ENST00000352268:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000338010:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000394313:exon_54767757_54767919:ZNF385A;ENSG00000161642:ENST00000413859:exon_54767757_54767919:ZNF385A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 54905815 C/G 1 19 26 45 8.8234751841076 13.9257708006949 -5.10229561658727 C:G C G 10 0.535606569257495 0.136779894590734 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54905733_54905889:NCKAP1L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 54970454 T/C 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 T:C T C 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000123360:ENST00000243052:exon_54970355_54970485:PDE1B;ENSG00000123360:ENST00000394277:exon_54970355_54970485:PDE1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 56360876 G/A 1 104 117 221 48.2969167972205 62.6659686031269 -14.3690518059064 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0587836217436435 ENSG00000123374:ENST00000266970:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000440311:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000354056:exon_56360556_56360908:CDK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 56396396 C/T 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000139531:ENST00000266971:exon_56396327_56396504:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394115:exon_56396327_56396504:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000356124:exon_56396327_56396504:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394109:exon_56396327_56396504:SUOX HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 56711371 C/T 1 17 17 34 7.89468832262259 9.10531167737741 -1.21062335475483 T:C C T 10 0.535606569257495 0.732486001530963 ENSG00000135473:ENST00000425394:exon_56710718_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000379495:exon_56710721_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000257931:exon_56710721_56711427:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000440411:exon_56710721_56711427:PAN2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 23 16 39 10.6810489070776 8.56970510811992 2.1113437989577 A:G G A 10 0.535606569257495 0.525043442262861 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 16 14 30 7.43029489188008 7.49849196960493 -0.0681970777248484 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 56822378 T/A 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:T T A 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 56825311 C/T 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56825255_56825388:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56825255_56825388:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56825255_56825388:TIMELESS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 56827694 C/G 1 14 8 22 6.50150803039507 4.28485255405996 2.21665547633511 C:G C G 10 0.535606569257495 0.39723941481764 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56827557_56827710:TIMELESS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 57132236 C/T 1 13 12 25 6.03711459965257 6.42727883108994 -0.390164231437374 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57132218_57132309:PRIM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 57146069 T/G 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57145980_57146146:PRIM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 57493727 T/G 1 4 8 12 1.85757372297002 4.28485255405996 -2.42727883108994 T:G T G 10 0.535606569257495 0.246342614793183 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 57649840 C/T 1 12 10 22 5.57272116891006 5.35606569257495 0.216655476335111 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57649773_57649857:R3HDM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 57869582 T/C 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 T:C T C 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57869559_57869714:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57869559_57869714:ARHGAP9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 47 32 79 21.8264912448977 17.1394102162398 4.6870810286579 A:C A C 10 0.535606569257495 0.311402535273636 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 57906688 G/A 1 85 73 158 39.4734416131129 39.0992795557971 0.3741620573158 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000166986:ENST00000262027:exon_57906534_57906747:MARS;ENSG00000166986:ENST00000315473:exon_57906637_57906701:MARS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 57985204 C/T 1 8 5 13 3.71514744594004 2.67803284628747 1.03711459965257 T:C C T 10 0.535606569257495 0.593641770478394 ENSG00000166908:ENST00000422156:exon_57985073_57985246:PIP4K2C;ENSG00000166908:ENST00000354947:exon_57985073_57985246:PIP4K2C;ENSG00000166908:ENST00000436866:exon_57985073_57985246:PIP4K2C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 58009372 G/A 1 29 21 50 13.4674094915326 11.2477379544074 2.21967153712525 A:G G A 10 0.535606569257495 0.572563707512243 ENSG00000240771:ENST00000333972:exon_58009295_58009495:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000300189:exon_58009295_58009488:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000286494:exon_58009295_58009495:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000471370:exon_58009295_58009495:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000469072:exon_58009295_58009495:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000466399:exon_58009295_58009495:ARHGEF25 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 58010163 A/G 1 13 13 26 6.03711459965257 6.96288540034743 -0.925770800694869 A:G A G 10 0.535606569257495 0.844636479883657 ENSG00000240771:ENST00000333972:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000286494:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000471370:exon_58010067_58010278:ARHGEF25 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 256 280 536 118.884718270081 149.969839392099 -31.0851211220173 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00724766346124049 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 58126234 C/A 1 8 3 11 3.71514744594004 1.60681970777248 2.10832773816756 A:C C A 10 0.535606569257495 0.239570670048551 ENSG00000135439:ENST00000257897:exon_58126186_58126295:AGAP2;ENSG00000135439:ENST00000328568:exon_58126186_58126295:AGAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 25 4 29 11.6098357685626 2.14242627702998 9.46740949153265 A:T A T 10 0.535606569257495 0.000284488092328073 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 20 12 32 9.2878686148501 6.42727883108994 2.86058978376016 T:C C T 10 0.535606569257495 0.376661791108923 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 62696599 C/T 1 16 10 26 7.43029489188008 5.35606569257495 2.07422919930513 T:C C T 10 0.535606569257495 0.439420946397761 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000312635:exon_62696571_62696701:USP15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 62926398 G/A 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62926218_62926450:MON2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 62928633 G/A 1 4 7 11 1.85757372297002 3.74924598480246 -1.89167226183244 A:G G A 10 0.535606569257495 0.36607342785591 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62928625_62928706:MON2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 64202890 C/G 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 C:G C G 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000118600:ENST00000261234:exon_64202455_64203300:TMEM5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 64803798 A/C 1 12 15 27 5.57272116891006 8.03409853886242 -2.46137736995236 A:C A C 10 0.535606569257495 0.440874576584086 ENSG00000184575:ENST00000332707:exon_64803742_64803875:XPOT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 65004520 A/G 1 20 14 34 9.2878686148501 7.49849196960493 1.78937664524517 A:G A G 10 0.535606569257495 0.607899514877059 ENSG00000153179:ENST00000336061:exon_65004293_65004523:RASSF3;ENSG00000153179:ENST00000283172:exon_65004293_65004523:RASSF3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 66725160 C/T 1 8 5 13 3.71514744594004 2.67803284628747 1.03711459965257 T:C C T 10 0.535606569257495 0.593641770478394 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 66725202 C/T 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 T:C C T 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 80 86 166 37.1514744594004 46.0621649561446 -8.91069049674416 A:G G A 10 0.535606569257495 0.185756163730367 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 68052178 G/T 1 9 3 12 4.17954087668255 1.60681970777248 2.57272116891006 T:G G T 10 0.535606569257495 0.158222040248362 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 68708761 C/T 1 9 13 22 4.17954087668255 6.96288540034743 -2.78334452366489 T:C C T 10 0.535606569257495 0.286635935669917 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68708728_68709045:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68708728_68709045:MDM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 68709892 C/T 1 4 7 11 1.85757372297002 3.74924598480246 -1.89167226183244 T:C C T 10 0.535606569257495 0.36607342785591 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68709858_68710033:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68709858_68710033:MDM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 68720627 G/A 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68720437_68720801:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68720437_68720801:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000430606:exon_68718787_68720801:MDM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 69103039 A/T 1 7 10 17 3.25075401519754 5.35606569257495 -2.10531167737741 A:T A T 10 0.535606569257495 0.338652205084508 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69103018_69103089:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69103018_69103089:NUP107 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 69115698 G/A 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 A:G G A 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69115621_69115766:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69115621_69115766:NUP107 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 72164395 C/T 1 32 31 63 14.8605897837602 16.6038036469823 -1.74321386322218 T:C C T 10 0.535606569257495 0.705501742145422 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 72307616 A/G 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 A:G A G 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 75900588 A/G 1 17 19 36 7.89468832262259 10.1765248158924 -2.28183649326982 A:G A G 10 0.535606569257495 0.505289503245558 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75900562_75900696:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75900562_75900696:KRR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 75902186 T/C 1 34 14 48 15.7893766452452 7.49849196960493 8.29088467564024 T:C T C 10 0.535606569257495 0.019788074641445 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75902054_75902226:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75902054_75902226:KRR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 5 17 22 2.32196715371253 9.10531167737741 -6.78334452366489 A:C:G G C 10 0.535606569257495 0.00455328134482592 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 88500847 T/C 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 T:C T C 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88500773_88500875:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88500773_88500875:CEP290 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 93202801 C/T 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93202793_93202932:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93202793_93202932:EEA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 94543506 C/T 0 0 11 11 0 5.89167226183244 -5.89167226183244 T C T 10 0.535606569257495 0.000216644039036914 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94542748_94543809:PLXNC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 94673277 G/A 1 6 8 14 2.78636058445503 4.28485255405996 -1.49849196960493 A:G G A 10 0.535606569257495 0.436988882100625 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94673248_94673425:PLXNC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 94761701 T/C 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 T:C T C 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94761570_94761719:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94761570_94761719:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397807:exon_94761570_94761719:CCDC41 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 94972290 C/T 1 16 8 24 7.43029489188008 4.28485255405996 3.14544233782012 T:C C T 10 0.535606569257495 0.224088576462827 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94972170_94972305:TMCC3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 94975799 G/A 1 20 11 31 9.2878686148501 5.89167226183244 3.39619635301766 A:G G A 10 0.535606569257495 0.280275295421213 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 94976084 T/C 1 18 24 42 8.35908175336509 12.8545576621799 -4.49547590881479 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.167933697369805 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 94976159 T/C 1 11 24 35 5.10832773816756 12.8545576621799 -7.74622992401232 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0103588509751943 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 100691876 A/T 1 16 16 32 7.43029489188008 8.56970510811992 -1.13941021623984 A:T A T 10 0.535606569257495 0.72535006961681 ENSG00000136021:ENST00000360820:exon_100691809_100691953:SCYL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 101732655 C/T 1 8 3 11 3.71514744594004 1.60681970777248 2.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.239570670048551 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101732591_101732735:UTP20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 102455729 G/A 1 50 38 88 23.2196715371253 20.3530496317848 2.86662190534044 A:G G A 10 0.535606569257495 0.593572758578191 ENSG00000120860:ENST00000240079:exon_102455690_102455899:CCDC53 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 104327979 C/T 1 718 600 1318 333.434483273119 321.363941554497 12.0705417186217 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.507634390420675 ENSG00000166598:ENST00000299767:exon_104327734_104328065:HSP90B1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 105583877 G/A 1 3 11 14 1.39318029222752 5.89167226183244 -4.49849196960493 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0281547067215341 ENSG00000136044:ENST00000258530:exon_105583769_105583933:APPL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 106633569 C/T 1 18 11 29 8.35908175336509 5.89167226183244 2.46740949153265 T:C C T 10 0.535606569257495 0.457202867215174 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 109968427 C/T 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000151148:ENST00000342494:exon_109968352_109968463:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000434735:exon_109968352_109968463:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000449510:exon_109968352_109968463:UBE3B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 54 58 112 25.0772452600953 31.0651810169347 -5.98793575683943 A:T A T 10 0.535606569257495 0.257580658798766 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 T:G G T 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 110937404 T/C 1 7 2 9 3.25075401519754 1.07121313851499 2.17954087668255 T:C T C 10 0.535606569257495 0.189646242107253 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 110974890 T/C 1 26 22 48 12.0742291993051 11.7833445236649 0.290884675640243 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000196850:ENST00000354300:exon_110972237_110974900:PPTC7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 112191641 G/A 1 8 5 13 3.71514744594004 2.67803284628747 1.03711459965257 A:G G A 10 0.535606569257495 0.593641770478394 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000512792:exon_112191511_112191719:ACAD10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 112460147 T/G 1 173 183 356 80.3400635184534 98.0160021741216 -17.6759386556682 A:T:C:G T G 10 0.535606569257495 0.0629333899791295 ENSG00000089248:ENST00000261735:exon_112459954_112461024:ERP29;ENSG00000089248:ENST00000455836:exon_112459954_112461024:ERP29 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 112477055 T/C 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 T:C T C 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000111300:ENST00000261745:exon_112477033_112477143:NAA25 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 112667675 T/G 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 T:G T G 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000173064:ENST00000430131:exon_112667502_112667684:C12orf51;ENSG00000173064:ENST00000377560:exon_112667502_112667684:C12orf51 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 113386779 C/G 1 48 63 111 22.2908846756402 33.7432138632222 -11.4523291875819 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0358397446827369 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113386666_113387010:OAS3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 113398919 G/A 1 60 77 137 27.8636058445503 41.2417058328271 -13.3780999882768 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0256307834475654 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113398876_113399051:OAS3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 113403684 C/T 1 48 63 111 22.2908846756402 33.7432138632222 -11.4523291875819 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0358397446827369 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113403549_113403834:OAS3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 113424893 C/G 1 75 77 152 34.8295073056879 41.2417058328271 -6.41219852713923 C:G C G 10 0.535606569257495 0.329194964776037 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 114377885 G/C 1 20 31 51 9.2878686148501 16.6038036469823 -7.31593503213224 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0486239192531454 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 117160873 G/T 1 28 31 59 13.0030160607901 16.6038036469823 -3.6007875861922 T:G G T 10 0.535606569257495 0.363281657808285 ENSG00000111412:ENST00000261318:exon_117160872_117161028:C12orf49 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 117465981 T/C 1 10 6 16 4.64393430742505 3.21363941554497 1.43029489188008 T:C T C 10 0.535606569257495 0.618142335020353 ENSG00000174989:ENST00000309909:exon_117465833_117468953:FBXW8;ENSG00000174989:ENST00000455858:exon_117465833_117468953:FBXW8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 24 15 39 11.1454423378201 8.03409853886242 3.1113437989577 T:C T C 10 0.535606569257495 0.339755497812456 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 120615546 G/A 1 23 15 38 10.6810489070776 8.03409853886242 2.64695036821519 A:G G A 10 0.535606569257495 0.420024100820254 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120615487_120615555:GCN1L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 120637199 G/A 1 1502 1928 3430 697.518932975243 1032.64946552845 -335.130532553208 A:C:G G A 10 0.535606569257495 2.26475607760903e-30 ENSG00000089157:ENST00000313104:exon_120637113_120637288:RPLP0;ENSG00000089157:ENST00000228306:exon_120637113_120637288:RPLP0;ENSG00000089157:ENST00000392514:exon_120637113_120637288:RPLP0 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 120884328 C/T 1 12 14 26 5.57272116891006 7.49849196960493 -1.92577080069487 T:C C T 10 0.535606569257495 0.556217330538579 ENSG00000111780:ENST00000229384:exon_120884284_120884364:GATC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 120954473 A/C 1 16 13 29 7.43029489188008 6.96288540034743 0.467409491532647 A:C A C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120954370_120954591:COQ5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 120966921 A/G 1 17 16 33 7.89468832262259 8.56970510811992 -0.675016785497333 A:G A G 10 0.535606569257495 0.862481166268759 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120966743_120966964:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120966743_120966953:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120966743_120966953:COQ5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 18 14 32 8.35908175336509 7.49849196960493 0.860589783760162 T:C T C 10 0.535606569257495 0.859952664418775 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 42 27 69 19.5045240911852 14.4613773699524 5.04314672123285 A:G G A 10 0.535606569257495 0.230258298333565 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 36 27 63 16.7181635067302 14.4613773699524 2.25678613677782 T:C C T 10 0.535606569257495 0.614598338422256 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 39 22 61 18.1113437989577 11.7833445236649 6.32799927529281 C:G G C 10 0.535606569257495 0.123158859159563 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 122497001 T/C 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 T:C T C 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000110987:ENST00000261822:exon_122496998_122499950:BCL7A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 19 20 39 8.8234751841076 10.7121313851499 -1.8886562010423 C:G G C 10 0.535606569257495 0.630763939446426 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 14 10 24 6.50150803039507 5.35606569257495 1.14544233782012 T:C C T 10 0.535606569257495 0.686918776217185 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 123664514 G/A 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123664473_123664537:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123664473_123664537:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000392425:exon_123664473_123664537:MPHOSPH9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 124826462 C/T 1 26 21 47 12.0742291993051 11.2477379544074 0.826491244897737 T:C C T 10 0.535606569257495 0.884149972016554 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 124957627 C/T 1 14 21 35 6.50150803039507 11.2477379544074 -4.74622992401232 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.127327106092558 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000448008:exon_124957498_124957677:NCOR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 125398039 G/C 1 1676 1959 3635 778.323389924439 1049.25326917543 -270.929879250994 A:T:C:G G C 10 0.535606569257495 2.36851232854649e-19 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 125434716 G/A 1 12 9 21 5.57272116891006 4.82045912331745 0.752262045592606 A:G G A 10 0.535606569257495 0.828765731707361 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434695_125434789:DHX37 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 125448960 C/T 1 12 18 30 5.57272116891006 9.64091824663491 -4.06819707772485 T:C C T 10 0.535606569257495 0.146608455877534 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 125467158 C/T 1 9 13 22 4.17954087668255 6.96288540034743 -2.78334452366489 T:C C T 10 0.535606569257495 0.286635935669917 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125467057_125467169:DHX37 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 125626785 G/C 1 12 27 39 5.57272116891006 14.4613773699524 -8.8886562010423 C:G G C 10 0.535606569257495 0.00568453098540941 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125626638_125627871:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125626638_125627861:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125626638_125627861:AACS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 60 50 110 27.8636058445503 26.7803284628747 1.08327738167555 A:G A G 10 0.535606569257495 0.849049267884242 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 59 72 131 27.3992124138078 38.5636729865396 -11.1644605727318 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0539911330935146 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 131438971 G/T 1 19 2 21 8.8234751841076 1.07121313851499 7.75226204559261 T:G G T 10 0.535606569257495 0.000595042113509295 ENSG00000111452:ENST00000261654:exon_131438452_131439076:GPR133 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 14 6 20 6.50150803039507 3.21363941554497 3.2878686148501 T:C T C 10 0.535606569257495 0.179439517734263 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 133219831 T/C 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 T:C T C 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133219810_133219916:POLE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 133236000 C/T 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 T:C C T 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133235881_133236095:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133235881_133236095:POLE;ENSG00000177084:ENST00000376577:exon_133235881_133236095:POLE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 133306589 C/T 1 107 88 195 49.690097089448 47.1333780946596 2.55671899478848 T:C C T 10 0.535606569257495 0.720345032872764 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 133331537 G/A 1 46 31 77 21.3620978141552 16.6038036469823 4.75829416717289 A:G G A 10 0.535606569257495 0.304680506068578 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 133357412 T/C 1 8 16 24 3.71514744594004 8.56970510811992 -4.85455766217988 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0637114810029004 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133357384_133357500:GOLGA3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 133363006 G/A 1 8 3 11 3.71514744594004 1.60681970777248 2.10832773816756 A:G G A 10 0.535606569257495 0.239570670048551 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133362925_133363141:GOLGA3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 133378440 C/T 1 11 7 18 5.10832773816756 3.74924598480246 1.35908175336509 T:C C T 10 0.535606569257495 0.638915092572894 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133378353_133378555:GOLGA3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 133428242 G/A 1 16 16 32 7.43029489188008 8.56970510811992 -1.13941021623984 A:G G A 10 0.535606569257495 0.72535006961681 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133428204_133428323:CHFR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 25 20 45 11.6098357685626 10.7121313851499 0.897704383412727 T:C T C 10 0.535606569257495 0.881512869961034 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 12 133778796 C/T 1 12 10 22 5.57272116891006 5.35606569257495 0.216655476335111 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133778730_133778955:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133778730_133781730:ZNF268 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 21086599 G/A 1 13 15 28 6.03711459965257 8.03409853886242 -1.99698393920986 A:G G A 10 0.535606569257495 0.456308012833315 ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21086582_21086689:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21086582_21086689:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21086582_21086689:CRYL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 21562371 C/T 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000150457:ENST00000382592:exon_21562020_21563443:LATS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 21562948 G/A 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000150457:ENST00000382592:exon_21562020_21563443:LATS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 21720956 C/T 1 141 115 256 65.4794737346932 61.5947554646119 3.88471827008129 T:C C T 10 0.535606569257495 0.661078585062322 ENSG00000150459:ENST00000382533:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000425456:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000450573:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000467636:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000471009:exon_21720603_21721066:SAP18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 23905711 A/G 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 A:T:G A G 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 23907909 A/G 1 7 9 16 3.25075401519754 4.82045912331745 -1.56970510811992 A:G A G 10 0.535606569257495 0.462079525679044 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 23908034 A/G 1 4 8 12 1.85757372297002 4.28485255405996 -2.42727883108994 A:G A G 10 0.535606569257495 0.246342614793183 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 23909162 A/G 1 7 10 17 3.25075401519754 5.35606569257495 -2.10531167737741 A:G A G 10 0.535606569257495 0.338652205084508 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 25052261 C/T 1 13 13 26 6.03711459965257 6.96288540034743 -0.925770800694869 T:C C T 10 0.535606569257495 0.844636479883657 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25052231_25052414:PARP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 25075859 C/T 1 5 12 17 2.32196715371253 6.42727883108994 -4.10531167737741 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0530860535659699 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25075771_25075972:PARP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 25876011 G/A 1 24 19 43 11.1454423378201 10.1765248158924 0.968917521927718 A:G G A 10 0.535606569257495 0.878743629729628 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25875662_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000481980:exon_25875694_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000490231:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000480187:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000460326:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000465068:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25875771_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000495460:exon_25875783_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25875785_25876018:NUPL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 25901165 C/G 1 15 13 28 6.96590146113758 6.96288540034743 0.00301606079014149 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25901054_25901172:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000394327:exon_25901054_25901172:NUPL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 28009031 G/C 1 141 152 293 65.4794737346932 81.4121985271392 -15.932724792446 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0692490000530935 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 28009920 G/C 1 40 58 98 18.5757372297002 31.0651810169347 -12.4894437872345 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0146518778006666 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 28964198 C/T 1 10 15 25 4.64393430742505 8.03409853886242 -3.39016423143737 T:C C T 10 0.535606569257495 0.228594195909264 ENSG00000102755:ENST00000282397:exon_28963933_28964241:FLT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 30107067 G/C 1 6 13 19 2.78636058445503 6.96288540034743 -4.1765248158924 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0659965969592849 ENSG00000139514:ENST00000380752:exon_30106961_30107119:SLC7A1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 31722171 G/C 1 26 24 50 12.0742291993051 12.8545576621799 -0.780328462874747 C:G G C 10 0.535606569257495 0.887587042400105 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31722096_31722229:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31722096_31722229:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31722096_31722229:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31722096_31722229:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31722096_31722229:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31722096_31722229:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31722096_31722229:HSPH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 31735675 G/T 1 19 18 37 8.8234751841076 9.64091824663491 -0.817443062527312 T:G G T 10 0.535606569257495 0.869525755309081 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31735613_31736064:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31735613_31736064:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31735613_31736064:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31735613_31736117:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31735613_31735761:HSPH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 32929232 A/G 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32928998_32929425:BRCA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 33249986 T/C 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 T:C T C 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000083642:ENST00000315596:exon_33249981_33250096:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000400481:exon_33249981_33250096:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000421084:exon_33249981_33250096:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000456898:exon_33249981_33250096:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000498550:exon_33249981_33250096:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000450460:exon_33249981_33250096:PDS5B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 33700374 T/G 1 9 5 14 4.17954087668255 2.67803284628747 1.50150803039507 T:G T G 10 0.535606569257495 0.593847168610995 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33700218_33700377:STARD13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 33703656 T/C 1 15 4 19 6.96590146113758 2.14242627702998 4.8234751841076 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0360687097984019 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 33704065 T/C 1 8 2 10 3.71514744594004 1.07121313851499 2.64393430742505 T:C T C 10 0.535606569257495 0.118289200524796 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 34395385 A/G 1 16 7 23 7.43029489188008 3.74924598480246 3.68104890707762 A:G A G 10 0.535606569257495 0.145567531076242 ENSG00000133119:ENST00000380071:exon_34395269_34395406:RFC3;ENSG00000133119:ENST00000434425:exon_34395269_34395406:RFC3;ENSG00000133119:ENST00000399354:exon_34395269_34395406:RFC3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 36886469 T/C 1 13 11 24 6.03711459965257 5.89167226183244 0.145442337820121 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000133104:ENST00000438666:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000355182:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000451493:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000423217:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000494062:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000491805:exon_36886456_36886721:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000460126:exon_36886456_36886548:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000475603:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000482146:exon_36886456_36886614:SPG20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 41382711 A/T 1 5 12 17 2.32196715371253 6.42727883108994 -4.10531167737741 A:T A T 10 0.535606569257495 0.0530860535659699 ENSG00000102743:ENST00000443985:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000379523:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000426521:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000338625:exon_41382574_41382732:SLC25A15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 41515286 T/A 1 35 43 78 16.2537700759877 23.0310824780723 -6.7773124020846 A:T T A 10 0.535606569257495 0.139977861515268 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41515057_41515506:ELF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 41517985 A/G 1 50 40 90 23.2196715371253 21.4242627702998 1.79540876682545 A:G A G 10 0.535606569257495 0.751723165038023 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41517978_41518061:ELF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 41533052 T/C 1 12 19 31 5.57272116891006 10.1765248158924 -4.60380364698234 T:C T C 10 0.535606569257495 0.107056097599885 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41532972_41533152:ELF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 43462607 G/A 1 51 51 102 23.6840649678678 27.3159350321322 -3.63187006426448 A:G G A 10 0.535606569257495 0.488295239062348 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 22 17 39 10.2166554763351 9.10531167737741 1.1113437989577 A:C A C 10 0.535606569257495 0.750830704480835 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 61 0 61 28.3279992752928 0 28.3279992752928 G G 10 0.535606569257495 4.08078465822628e-17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 46067593 G/A 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 A:G G A 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46067482_46067621:COG3;ENSG00000136152:ENST00000465942:exon_46067482_46067621:COG3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 46584600 G/A 1 23 29 52 10.6810489070776 15.5325905084674 -4.85154160138974 A:G G A 10 0.535606569257495 0.210726411275746 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46584483_46584640:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46584483_46584640:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46584483_46584640:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46584483_46584640:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000470308:exon_46584483_46584640:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000464597:exon_46584285_46584640:ZC3H13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 127 151 278 58.9779657042981 80.8765919578817 -21.8986262535836 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00960846853677052 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 48830390 A/G 1 70 68 138 32.5075401519754 36.4212467095097 -3.9137065575343 A:T:G A G 10 0.535606569257495 0.550412408061676 ENSG00000136156:ENST00000378565:exon_48830313_48830519:ITM2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 50283819 T/C 1 25 25 50 11.6098357685626 13.3901642314374 -1.78032846287475 T:C T C 10 0.535606569257495 0.671437816138516 ENSG00000102753:ENST00000261667:exon_50283708_50283836:KPNA3;ENSG00000102753:ENST00000457886:exon_50283708_50283836:KPNA3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 52301830 C/T 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 T:C C T 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000139668:ENST00000298125:exon_52301814_52301926:WDFY2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 52598189 A/G 1 4 8 12 1.85757372297002 4.28485255405996 -2.42727883108994 A:G A G 10 0.535606569257495 0.246342614793183 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52598142_52599073:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52598142_52599073:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000519151:exon_52598142_52599073:ALG11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 52603194 G/T 1 4 8 12 1.85757372297002 4.28485255405996 -2.42727883108994 T:G G T 10 0.535606569257495 0.246342614793183 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 9 9 18 4.17954087668255 4.82045912331745 -0.640918246634909 T:C C T 10 0.535606569257495 0.816090164780621 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 53049267 T/C 1 27 24 51 12.5386226300476 12.8545576621799 -0.315935032132241 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000136108:ENST00000258607:exon_53049030_53050484:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378037:exon_53049030_53050485:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000490903:exon_53049030_53050484:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000459902:exon_53049030_53049277:CKAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 71 49 120 32.9719335827179 26.2447218936173 6.72721168910061 C:G G C 10 0.535606569257495 0.234670249665011 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 73350079 T/C 1 47 48 95 21.8264912448977 25.7091153243598 -3.88262407946202 T:C T C 10 0.535606569257495 0.471773469066934 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 73369642 A/G 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000083535:ENST00000326291:exon_73369497_73369695:PIBF1;ENSG00000083535:ENST00000489797:exon_73369497_73369695:PIBF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 75876389 G/A 1 13 29 42 6.03711459965257 15.5325905084674 -9.49547590881479 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00474003469709873 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000478591:exon_75876379_75876537:TBC1D4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 76423248 T/C 1 7 1 8 3.25075401519754 0.535606569257495 2.71514744594004 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0758732255235235 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76423112_76423428:LMO7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 77574983 A/G 1 10 4 14 4.64393430742505 2.14242627702998 2.50150803039507 A:G A G 10 0.535606569257495 0.283626359522875 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 77575137 A/G 1 14 12 26 6.50150803039507 6.42727883108994 0.0742291993051314 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 77632470 C/T 1 5 17 22 2.32196715371253 9.10531167737741 -6.78334452366489 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00455328134482592 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77632353_77632541:MYCBP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 79940811 T/C 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 95273447 G/A 1 11 5 16 5.10832773816756 2.67803284628747 2.43029489188008 A:G G A 10 0.535606569257495 0.316760693759888 ENSG00000152749:ENST00000376958:exon_95273332_95273489:GPR180 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 95858978 T/C 1 2 7 9 0.92878686148501 3.74924598480246 -2.82045912331745 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0914723743517246 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95858786_95859035:ABCC4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 95858996 T/C 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 T:C T C 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95858786_95859035:ABCC4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 44 49 93 20.4333109526702 26.2447218936173 -5.81141094094703 T:C C T 10 0.535606569257495 0.252964188579645 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 103275386 T/C 1 18 12 30 8.35908175336509 6.42727883108994 1.93180292227515 T:C T C 10 0.535606569257495 0.583938206470959 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103275227_103275390:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103275227_103275390:TPP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 14 14 28 6.50150803039507 7.49849196960493 -0.996983939209859 T:C T C 10 0.535606569257495 0.709785628768718 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 111176519 G/T 1 5 11 16 2.32196715371253 5.89167226183244 -3.56970510811992 T:G G T 10 0.535606569257495 0.0832026742777677 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 111290630 T/C 1 7 14 21 3.25075401519754 7.49849196960493 -4.24773795440739 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0794265593904473 ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 111293915 T/G 1 60 52 112 27.8636058445503 27.8515416013897 0.012064243160566 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000375781:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000490421:exon_111293764_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111293764_111293957:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111293787_111293955:CARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 23 14 37 10.6810489070776 7.49849196960493 3.18255693747269 T:C T C 10 0.535606569257495 0.325801108266624 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 111870037 T/C 1 30 34 64 13.9318029222752 18.2106233547548 -4.27882043247968 T:C T C 10 0.535606569257495 0.31666379745502 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000449979:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491775:exon_111870026_111870147:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000467053:exon_111870026_111870212:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426768:exon_111870026_111870232:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111870026_111870227:ARHGEF7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 25 29 54 11.6098357685626 15.5325905084674 -3.92275473990473 T:C C T 10 0.535606569257495 0.339690798202847 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 34 49 83 15.7893766452452 26.2447218936173 -10.4553452483721 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0271491075527046 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 114542858 G/A 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 0.156441901581586 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 13 114748709 G/A 1 41 39 80 19.0401306604427 20.8886562010423 -1.8485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 0.736991768339007 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114747194_114748833:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114747201_114748833:RASA3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 20837511 G/A 1 9 14 23 4.17954087668255 7.49849196960493 -3.31895109292238 A:G G A 10 0.535606569257495 0.209886792025538 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837503_20837631:TEP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 26 19 45 12.0742291993051 10.1765248158924 1.89770438341273 C:G G C 10 0.535606569257495 0.654648500853097 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 20841707 C/T 1 6 8 14 2.78636058445503 4.28485255405996 -1.49849196960493 T:C C T 10 0.535606569257495 0.436988882100625 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20841666_20841742:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20841666_20841742:TEP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 20847202 A/G 1 13 6 19 6.03711459965257 3.21363941554497 2.8234751841076 A:G A G 10 0.535606569257495 0.251503218843434 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20847140_20847264:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20847140_20847264:TEP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 20872881 G/T 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:G G T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20872770_20872931:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20872770_20872931:TEP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 27 29 56 12.5386226300476 15.5325905084674 -2.99396787841972 T:C T C 10 0.535606569257495 0.4255128383419 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 11 9 20 5.10832773816756 4.82045912331745 0.287868614850101 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 231 180 411 107.274882501519 96.4091824663491 10.8657000351696 T:G T G 10 0.535606569257495 0.299090505851544 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 20926699 A/G 1 31 44 75 14.3961963530177 23.5666890473298 -9.17049269431212 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0370765389165394 ENSG00000165782:ENST00000250489:exon_20926012_20926861:TMEM55B;ENSG00000165782:ENST00000398020:exon_20926017_20926861:TMEM55B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 20940515 C/T 1 39 28 67 18.1113437989577 14.9969839392099 3.11435985974784 T:C C T 10 0.535606569257495 0.464961998121943 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 20940606 G/A 1 67 49 116 31.1143598597478 26.2447218936173 4.86963796613059 A:G G A 10 0.535606569257495 0.402467608436813 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 20940626 C/T 1 71 58 129 32.9719335827179 31.0651810169347 1.90675256578315 T:C C T 10 0.535606569257495 0.791330962801423 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 21871653 C/T 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000100888:ENST00000430710:exon_21871612_21871822:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000399982:exon_21871612_21871822:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000262707:exon_21871612_21871822:CHD8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 21928338 C/T 1 31 18 49 14.3961963530177 9.64091824663491 4.75527810638275 T:C C T 10 0.535606569257495 0.198147525873058 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 21928383 T/C 1 24 4 28 11.1454423378201 2.14242627702998 9.00301606079014 T:C T C 10 0.535606569257495 0.00047245144193417 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 21928397 A/G 0 18 0 18 8.35908175336509 0 8.35908175336509 A A 10 0.535606569257495 1.41682325542054e-05 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 21928398 T/C 0 18 0 18 8.35908175336509 0 8.35908175336509 T T 10 0.535606569257495 1.41682325542054e-05 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 21967438 G/A 1 21 19 40 9.75226204559261 10.1765248158924 -0.424262770299798 A:G G A 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 21968619 A/G 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 A:G A G 10 0.535606569257495 0.76441497343657 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 22961854 A/G 1 5 21 26 2.32196715371253 11.2477379544074 -8.92577080069487 A:G A G 10 0.535606569257495 0.000535418422961444 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 45 37 82 20.8977043834127 19.8174430625273 1.08026132088541 C:G G C 10 0.535606569257495 0.82579235337302 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 55 47 102 25.5416386908378 25.1735087551023 0.368129935735517 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 95 102 197 44.117375920538 54.6318700642645 -10.5144941437265 T:C T C 10 0.535606569257495 0.134306955066298 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 23777099 G/A 1 10 12 22 4.64393430742505 6.42727883108994 -1.78334452366489 A:G G A 10 0.535606569257495 0.523642698847636 ENSG00000129473:ENST00000250405:exon_23776969_23777408:BCL2L2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 24026493 A/G 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 A:G A G 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000157306:ENST00000288014:exon_24025198_24026513:THTPA;ENSG00000157306:ENST00000404535:exon_24025952_24026513:THTPA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 27 7 34 12.5386226300476 3.74924598480246 8.78937664524517 A:T A T 10 0.535606569257495 0.00289164842954184 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 24459407 G/A 1 35 13 48 16.2537700759877 6.96288540034743 9.29088467564024 A:G G A 10 0.535606569257495 0.008554593295965 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24459391_24459568:DHRS4L2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 26 20 46 12.0742291993051 10.7121313851499 1.36209781415523 A:G G A 10 0.535606569257495 0.76817749711952 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 18 13 31 8.35908175336509 6.96288540034743 1.39619635301766 T:C C T 10 0.535606569257495 0.719730647046148 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 24613142 C/T 1 10 8 18 4.64393430742505 4.28485255405996 0.359081753365091 T:C C T 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 15 13 28 6.96590146113758 6.96288540034743 0.00301606079014149 A:C A C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 25281843 C/T 1 10 2 12 4.64393430742505 1.07121313851499 3.57272116891006 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0443375191883964 ENSG00000168952:ENST00000396700:exon_25278862_25281938:STXBP6;ENSG00000168952:ENST00000323944:exon_25278868_25281938:STXBP6;ENSG00000168952:ENST00000419632:exon_25281308_25281938:STXBP6;ENSG00000168952:ENST00000445298:exon_25281308_25281938:STXBP6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 26 10 36 12.0742291993051 5.35606569257495 6.71816350673018 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0290208169939622 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 31381351 T/C 1 6 7 13 2.78636058445503 3.74924598480246 -0.962885400347434 T:C T C 10 0.535606569257495 0.782351862796383 ENSG00000196792:ENST00000355683:exon_31381213_31381388:STRN3;ENSG00000196792:ENST00000357479:exon_31381213_31381388:STRN3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 31578762 C/T 1 38 26 64 17.6469503682152 13.9257708006949 3.72117956752033 T:C C T 10 0.535606569257495 0.38189556855976 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 31583173 G/A 1 12 6 18 5.57272116891006 3.21363941554497 2.35908175336509 A:G G A 10 0.535606569257495 0.346395564026953 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31583083_31583265:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31583083_31583265:HECTD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 31598248 A/G 1 23 22 45 10.6810489070776 11.7833445236649 -1.10229561658727 A:G A G 10 0.535606569257495 0.766721221206037 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31597818_31598654:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31597818_31598654:HECTD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 31619392 T/C 1 20 11 31 9.2878686148501 5.89167226183244 3.39619635301766 T:C T C 10 0.535606569257495 0.280275295421213 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31619205_31619427:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31619205_31619427:HECTD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 77 73 150 35.7582941671729 39.0992795557971 -3.34098538862424 A:G G A 10 0.535606569257495 0.623541925553332 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 39777676 G/C 1 2 9 11 0.92878686148501 4.82045912331745 -3.89167226183244 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0297809744140687 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000382245:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39777653_39777791:CTAGE5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 35 39 74 16.2537700759877 20.8886562010423 -4.63488612505462 A:G G A 10 0.535606569257495 0.29570186919234 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 45658449 A/G 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000187790:ENST00000267430:exon_45658005_45658565:FANCM HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 45700409 C/T 1 6 9 15 2.78636058445503 4.82045912331745 -2.03409853886242 T:C C T 10 0.535606569257495 0.312839743181367 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45700344_45700501:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45700344_45700501:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45700344_45700501:C14orf106 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 45711340 G/C 1 12 8 20 5.57272116891006 4.28485255405996 1.2878686148501 C:G G C 10 0.535606569257495 0.65695311160528 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45711237_45711683:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000492652:exon_45711237_45711589:C14orf106 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 15 26 41 6.96590146113758 13.9257708006949 -6.95986933955729 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0404940139716017 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 50092471 T/C 1 21 19 40 9.75226204559261 10.1765248158924 -0.424262770299798 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50091907_50092766:C14orf104 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 27 20 47 12.5386226300476 10.7121313851499 1.82649124489774 T:C T C 10 0.535606569257495 0.661909572342206 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 50100683 C/G 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 C:G C G 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 50298962 T/A 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 A:T T A 10 0.535606569257495 0.193170376367493 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50298925_50298995:SDCCAG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 50583083 G/T 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 T:G G T 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000100483:ENST00000395859:exon_50583005_50583297:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000491402:exon_50583005_50583318:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000395860:exon_50583005_50583275:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000484763:exon_50582798_50583276:C14orf138 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 24 19 43 11.1454423378201 10.1765248158924 0.968917521927718 T:C C T 10 0.535606569257495 0.878743629729628 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 50616878 G/A 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50616726_50616948:SOS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 50907128 A/G 1 8 10 18 3.71514744594004 5.35606569257495 -1.64091824663491 A:G A G 10 0.535606569257495 0.484651981913674 ENSG00000012983:ENST00000429500:exon_50907080_50907159:MAP4K5;ENSG00000012983:ENST00000013125:exon_50907080_50907159:MAP4K5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 51192659 G/A 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 A:G G A 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 51202311 G/C 1 30 20 50 13.9318029222752 10.7121313851499 3.21967153712525 C:G G C 10 0.535606569257495 0.396951250710927 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51202234_51202335:NIN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 51 56 107 23.6840649678678 29.9939678784197 -6.30990291055196 T:C C T 10 0.535606569257495 0.244936755373182 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 51224374 T/G 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 T:G T G 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 51225132 G/T 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 T:G G T 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 58678057 G/A 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 A:G G A 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000131966:ENST00000254286:exon_58678010_58678117:ACTR10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 59112475 C/T 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000165617:ENST00000421793:exon_59111976_59112574:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000395151:exon_59111976_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000395153:exon_59112087_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000335867:exon_59111976_59113888:DACT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 59113430 G/A 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000165617:ENST00000395151:exon_59111976_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000395153:exon_59112087_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000335867:exon_59111976_59113888:DACT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 59797235 A/G 1 19 8 27 8.8234751841076 4.28485255405996 4.53862263004764 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0854897429602086 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59797219_59797406:DAAM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 59950690 A/C 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 A:C A C 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59950527_59951086:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000481608:exon_59950398_59950724:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000527981:exon_59950398_59951126:C14orf149 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 60581863 G/A 1 9 3 12 4.17954087668255 1.60681970777248 2.57272116891006 A:G G A 10 0.535606569257495 0.158222040248362 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60581692_60582179:C14orf135 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 60581906 A/G 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60581692_60582179:C14orf135 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 60591829 T/C 1 11 5 16 5.10832773816756 2.67803284628747 2.43029489188008 T:C T C 10 0.535606569257495 0.316760693759888 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 64408852 G/C 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 C:G G C 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64408769_64408861:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64408769_64408861:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64408769_64408861:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000341472:exon_64408769_64408861:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000356081:exon_64408769_64408861:SYNE2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 64612845 C/T 1 7 2 9 3.25075401519754 1.07121313851499 2.17954087668255 T:C C T 10 0.535606569257495 0.189646242107253 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64612786_64612941:SYNE2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 64612858 C/A 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 A:C C A 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64612786_64612941:SYNE2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 64656855 T/C 1 16 4 20 7.43029489188008 2.14242627702998 5.2878686148501 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0229425638741549 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64656789_64656955:SYNE2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 64954683 A/G 1 8 11 19 3.71514744594004 5.89167226183244 -2.1765248158924 A:G A G 10 0.535606569257495 0.362403407231352 ENSG00000089775:ENST00000261683:exon_64953555_64954775:ZBTB25;ENSG00000089775:ENST00000394715:exon_64953557_64954775:ZBTB25 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 64989703 C/A 1 84 66 150 39.0090481823704 35.3500335709947 3.65901461137575 A:C:G C A 10 0.535606569257495 0.567504847388737 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 66096297 G/A 1 12 17 29 5.57272116891006 9.10531167737741 -3.53259050846735 A:G G A 10 0.535606569257495 0.197911784817732 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000358307:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394581:exon_66096210_66096324:FUT8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 68117421 T/C 1 17 14 31 7.89468832262259 7.49849196960493 0.396196353017657 T:C T C 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 68118132 C/T 1 59 72 131 27.3992124138078 38.5636729865396 -11.1644605727318 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0539911330935146 ENSG00000081181:ENST00000261783:exon_68117432_68118437:ARG2;ENSG00000100568:ENST00000216456:exon_68117869_68118198:VTI1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 69352230 G/A 1 25 30 55 11.6098357685626 16.0681970777248 -4.45836130916222 A:G G A 10 0.535606569257495 0.2793716135845 ENSG00000072110:ENST00000193403:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000438964:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000394419:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000376839:exon_69352142_69352292:ACTN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 71444788 G/A 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000100731:ENST00000238570:exon_71443659_71445365:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000304743:exon_71443659_71445365:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000439984:exon_71443659_71445365:PCNX HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 75245368 C/T 1 18 16 34 8.35908175336509 8.56970510811992 -0.210623354754828 T:C:G C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75245150_75245386:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75245150_75245386:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75245150_75245386:YLPM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 75248669 G/T 1 25 22 47 11.6098357685626 11.7833445236649 -0.173508755102263 T:G G T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75248037_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75248626_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75248626_75249028:YLPM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 75359670 G/A 1 21 21 42 9.75226204559261 11.2477379544074 -1.49547590881479 A:G G A 10 0.535606569257495 0.646574759194259 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75359537_75359689:DLST HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 75558152 C/T 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75557973_75558181:NEK9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 77794283 T/C 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77794123_77794380:GSTZ1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 88431898 C/T 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 T:C C T 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000054983:ENST00000261304:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393568:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393569:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000474294:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000445021:exon_88431849_88431973:GALC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 88442712 C/T 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 T:C C T 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000054983:ENST00000261304:exon_88442702_88442832:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393568:exon_88442702_88442832:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393569:exon_88442702_88442832:GALC;ENSG00000054983:ENST00000474294:exon_88442702_88442832:GALC;ENSG00000054983:ENST00000445021:exon_88442702_88442832:GALC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 90397912 G/A 1 7 10 17 3.25075401519754 5.35606569257495 -2.10531167737741 A:G G A 10 0.535606569257495 0.338652205084508 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90397885_90397975:C14orf143 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 90398907 G/A 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90398870_90398971:C14orf143 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 91739081 A/G 1 14 13 27 6.50150803039507 6.96288540034743 -0.461377369952364 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000427583:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000334448:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000331194:exon_91738969_91739562:CCDC88C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 91773568 T/C 1 12 6 18 5.57272116891006 3.21363941554497 2.35908175336509 T:C T C 10 0.535606569257495 0.346395564026953 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 92251587 A/G 1 9 10 19 4.17954087668255 5.35606569257495 -1.1765248158924 A:G A G 10 0.535606569257495 0.649555257001445 ENSG00000165929:ENST00000340892:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000435962:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000360594:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000416692:exon_92251506_92251705:TC2N HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 92549586 G/A 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 A:G G A 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92549470_92549602:ATXN3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 379 252 631 176.005110251409 134.972855452889 41.0322547985207 T:G T G 10 0.535606569257495 0.00105496763125377 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 93043786 G/A 1 21 5 26 9.75226204559261 2.67803284628747 7.07422919930513 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00534403258991645 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93043705_93043822:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93043705_93043822:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93043705_93043822:RIN3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 93118198 C/T 1 32 24 56 14.8605897837602 12.8545576621799 2.00603212158028 T:C C T 10 0.535606569257495 0.68812823653879 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 103 97 200 47.832523366478 51.953837217977 -4.12131385149899 T:C C T 10 0.535606569257495 0.571199920448685 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 97 103 200 45.046162782023 55.167476633522 -10.121313851499 A:G G A 10 0.535606569257495 0.156627376538931 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 37 46 83 17.1825569374727 24.6379021858448 -7.45534524837208 C:G C G 10 0.535606569257495 0.122896451450871 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 15 30 45 6.96590146113758 16.0681970777248 -9.10229561658727 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00698350213770748 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 93276654 T/C 1 20 14 34 9.2878686148501 7.49849196960493 1.78937664524517 T:C T C 10 0.535606569257495 0.607899514877059 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93276599_93276722:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93276599_93276722:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93276599_93276722:GOLGA5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 139 102 241 64.5506868732082 54.6318700642645 9.91881680894372 A:T:C T C 10 0.535606569257495 0.219771446446327 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 94563265 C/T 1 12 9 21 5.57272116891006 4.82045912331745 0.752262045592606 T:C C T 10 0.535606569257495 0.828765731707361 ENSG00000165948:ENST00000298901:exon_94563233_94563311:IFI27L1;ENSG00000165948:ENST00000393115:exon_94563187_94563311:IFI27L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 95884323 G/A 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95883831_95884363:C14orf49 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 95918625 T/C 1 5 16 21 2.32196715371253 8.56970510811992 -6.24773795440739 T:C T C 10 0.535606569257495 0.00761527282627285 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95918584_95918720:C14orf49 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 95921741 C/T 1 11 12 23 5.10832773816756 6.42727883108994 -1.31895109292238 T:C C T 10 0.535606569257495 0.677398717546528 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95921714_95922061:C14orf49 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 95923670 A/C 1 1 10 11 0.464393430742505 5.35606569257495 -4.89167226183244 A:C A C 10 0.535606569257495 0.00400581666107812 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95923514_95923675:C14orf49 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 96010424 G/A 1 87 82 169 40.4022284745979 43.9197386791146 -3.51751020451665 A:G G A 10 0.535606569257495 0.590334407441064 ENSG00000182512:ENST00000331334:exon_96010284_96011055:GLRX5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 102463407 A/G 1 14 10 24 6.50150803039507 5.35606569257495 1.14544233782012 A:G A G 10 0.535606569257495 0.686918776217185 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102463372_102463611:DYNC1H1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 102493761 A/G 1 41 22 63 19.0401306604427 11.7833445236649 7.25678613677782 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0767145117188376 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102493720_102493881:DYNC1H1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 102504838 C/T 1 29 28 57 13.4674094915326 14.9969839392099 -1.52957444767721 T:C C T 10 0.535606569257495 0.692663470020653 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102504797_102504943:DYNC1H1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 30 42 72 13.9318029222752 22.4954759088148 -8.56367298653964 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0450275484492564 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 330 349 679 153.249832145027 186.926692670866 -33.6768605258391 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00992172384683002 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 102675350 G/C 1 14 14 28 6.50150803039507 7.49849196960493 -0.996983939209859 C:G G C 10 0.535606569257495 0.709785628768718 ENSG00000140153:ENST00000335263:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000454394:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000342702:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000299135:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000401892:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000424963:exon_102674936_102676863:WDR20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 102792386 T/C 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 T:C T C 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 102792631 G/A 1 9 9 18 4.17954087668255 4.82045912331745 -0.640918246634909 A:G G A 10 0.535606569257495 0.816090164780621 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 102815042 C/T 1 154 95 249 71.5165883343458 50.882624079462 20.6339642548838 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.00911193643017957 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 102901201 A/G 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 A:G A G 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000196663:ENST00000359520:exon_102900572_102901548:TECPR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 103342049 T/C 1 77 79 156 35.7582941671729 42.3129189713421 -6.55462480416921 T:C T C 10 0.535606569257495 0.2978076038048 ENSG00000131323:ENST00000392745:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000347662:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000351691:exon_103341961_103342065:TRAF3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 103440473 G/C 1 8 9 17 3.71514744594004 4.82045912331745 -1.10531167737741 C:G G C 10 0.535606569257495 0.633230727718346 ENSG00000198752:ENST00000361246:exon_103440353_103440486:CDC42BPB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 104194196 C/G 1 11 12 23 5.10832773816756 6.42727883108994 -1.31895109292238 C:G C G 10 0.535606569257495 0.677398717546528 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104194083_104194251:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104194083_104194251:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000392675:exon_104193791_104194251:ZFYVE21 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 26 25 51 12.0742291993051 13.3901642314374 -1.31593503213224 T:C C T 10 0.535606569257495 0.779400233234565 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 104381502 T/C 1 112 93 205 52.0120642431606 49.811410940947 2.20065330221354 T:C T C 10 0.535606569257495 0.779727268973565 ENSG00000156411:ENST00000414262:exon_104381403_104381526:C14orf2;ENSG00000156411:ENST00000286953:exon_104381403_104381526:C14orf2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 105178858 G/A 1 11 11 22 5.10832773816756 5.89167226183244 -0.783344523664889 A:G G A 10 0.535606569257495 0.831857301870848 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105178770_105178894:INF2;ENSG00000203485:ENST00000480763:exon_105178770_105178894:INF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/C,G 0 0 17 17 0 9.10531167737741 -9.10531167737741 C:G A C 10 0.535606569257495 2.17301712895894e-06 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 105180903 C/T 1 8 10 18 3.71514744594004 5.35606569257495 -1.64091824663491 T:C C T 10 0.535606569257495 0.484651981913674 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 105477507 G/A 1 95 62 157 44.117375920538 33.2076072939647 10.9097686265733 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0926229079371977 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 105477613 T/C 1 91 82 173 42.259802197568 43.9197386791146 -1.65993648154663 T:C T C 10 0.535606569257495 0.819399546227058 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 105518336 G/T 1 18 12 30 8.35908175336509 6.42727883108994 1.93180292227515 T:G G T 10 0.535606569257495 0.583938206470959 ENSG00000183484:ENST00000392585:exon_105515728_105518439:GPR132;ENSG00000183484:ENST00000329797:exon_105515739_105518439:GPR132 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 106330079 T/A 1 22 1 23 10.2166554763351 0.535606569257495 9.68104890707762 A:T T A 10 0.535606569257495 2.00824259231487e-05 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 107170005 T/C 1 29 2 31 13.4674094915326 1.07121313851499 12.3961963530177 T:C T C 10 0.535606569257495 1.83883086053430e-06 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 107170077 C/T 1 2 26 28 0.92878686148501 13.9257708006949 -12.9969839392099 T:C C T 10 0.535606569257495 2.77953613639249e-07 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 107170128 C/T 0 14 0 14 6.50150803039507 0 6.50150803039507 C C 10 0.535606569257495 0.000181595078137057 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 107170207 C/T 0 15 0 15 6.96590146113758 0 6.96590146113758 C C 10 0.535606569257495 9.57183866225583e-05 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 14 107170219 C/G 0 0 18 18 0 9.64091824663491 -9.64091824663491 G C G 10 0.535606569257495 1.00913487957947e-06 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 21937964 A/G 0 12 0 12 5.57272116891006 0 5.57272116891006 A A 10 0.535606569257495 0.000657987246023511 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 46 35 81 21.3620978141552 18.7462299240123 2.61586789014291 T:C C T 10 0.535606569257495 0.5794393004074 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 31197564 G/A 1 11 7 18 5.10832773816756 3.74924598480246 1.35908175336509 A:G G A 10 0.535606569257495 0.638915092572894 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31196715_31198100:FAN1;ENSG00000198690:ENST00000441675:exon_31196715_31198100:FAN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 31229420 T/C 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 T:C T C 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31229322_31229462:FAN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 31267147 C/T 1 9 2 11 4.17954087668255 1.07121313851499 3.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0728086494533878 ENSG00000166912:ENST00000435680:exon_31267134_31267206:MTMR10;ENSG00000166912:ENST00000425768:exon_31267134_31267206:MTMR10;ENSG00000166912:ENST00000340566:exon_31267134_31267206:MTMR10;ENSG00000166912:ENST00000314404:exon_31267134_31267206:MTMR10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 35273620 C/T 1 12 19 31 5.57272116891006 10.1765248158924 -4.60380364698234 A:T:C C T 10 0.535606569257495 0.107056097599885 ENSG00000198146:ENST00000356321:exon_35270542_35275691:ZNF770 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 41148163 C/T 1 18 16 34 8.35908175336509 8.56970510811992 -0.210623354754828 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148090_41148260:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148090_41148260:SPINT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 61 8 69 28.3279992752928 4.28485255405996 24.0431467212328 A:G A G 10 0.535606569257495 1.22332369643300e-09 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 63 8 71 29.2567861367778 4.28485255405996 24.9719335827179 A:C C A 10 0.535606569257495 4.12291135928575e-10 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 41679765 A/G 1 18 9 27 8.35908175336509 4.82045912331745 3.53862263004764 A:G A G 10 0.535606569257495 0.183063497330438 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41679547_41679791:NDUFAF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/T 1 8 15 23 3.71514744594004 8.03409853886242 -4.31895109292238 T:C C T 10 0.535606569257495 0.093185649776015 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 41819716 C/T 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 T:C C T 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41819621_41819803:RPAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 41829230 A/G 1 12 21 33 5.57272116891006 11.2477379544074 -5.67501678549733 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0548679181404862 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41829143_41829399:RPAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 42109223 T/C 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 T:C T C 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000137802:ENST00000457542:exon_42109108_42109233:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000512970:exon_42109108_42109233:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000389931:exon_42109108_42109233:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000221214:exon_42109108_42109233:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000397324:exon_42109108_42109233:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000260357:exon_42109108_42109233:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000505373:exon_42109108_42109233:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000456763:exon_42109108_42109233:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000514566:exon_42109108_42109233:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000505061:exon_42109108_42109233:MAPKBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 42115747 G/C 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 C:G G C 10 0.535606569257495 0.824415845788285 ENSG00000137802:ENST00000457542:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000512970:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000389931:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000221214:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000260357:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000505373:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000456763:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000505061:exon_42115645_42116259:MAPKBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 42453963 T/C 1 30 31 61 13.9318029222752 16.6038036469823 -2.67200072470719 T:C T C 10 0.535606569257495 0.522529839545491 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42453880_42453971:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42453880_42453971:VPS39 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 42459034 T/C 1 13 7 20 6.03711459965257 3.74924598480246 2.2878686148501 T:C T C 10 0.535606569257495 0.37307358781869 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42458970_42459111:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42458970_42459111:VPS39 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 42565588 C/A 1 4 7 11 1.85757372297002 3.74924598480246 -1.89167226183244 A:C C A 10 0.535606569257495 0.36607342785591 ENSG00000103978:ENST00000389834:exon_42565453_42565755:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000448392:exon_42565453_42565638:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000307216:exon_42565453_42565755:TMEM87A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 42643529 T/C 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 T:C T C 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42643527_42643630:GANC;ENSG00000092529:ENST00000495723:exon_42643527_42643630:CAPN3;ENSG00000092529:ENST00000356316:exon_42643527_42643630:CAPN3;ENSG00000092529:ENST00000466369:exon_42643527_42643630:CAPN3;ENSG00000092529:ENST00000483208:exon_42643527_42643630:CAPN3;ENSG00000092529:ENST00000337522:exon_42643527_42643630:CAPN3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 42643538 A/G 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42643527_42643630:GANC;ENSG00000092529:ENST00000495723:exon_42643527_42643630:CAPN3;ENSG00000092529:ENST00000356316:exon_42643527_42643630:CAPN3;ENSG00000092529:ENST00000466369:exon_42643527_42643630:CAPN3;ENSG00000092529:ENST00000483208:exon_42643527_42643630:CAPN3;ENSG00000092529:ENST00000337522:exon_42643527_42643630:CAPN3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 42731301 G/A 1 16 11 27 7.43029489188008 5.89167226183244 1.53862263004764 A:G G A 10 0.535606569257495 0.57043982842636 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42731231_42732011:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42731231_42731750:ZFP106 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 42740369 C/T 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 T:C C T 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42740270_42740903:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42740270_42740903:ZFP106 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 42742464 A/G 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42741969_42744152:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42741969_42744152:ZFP106 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 43486658 A/G 1 69 53 122 32.0431467212329 28.3871481706472 3.65599855058562 A:G A G 10 0.535606569257495 0.526312489795561 ENSG00000166946:ENST00000300213:exon_43486613_43486659:CCNDBP1;ENSG00000166946:ENST00000356633:exon_43486613_43486659:CCNDBP1;ENSG00000166946:ENST00000444658:exon_43486613_43486659:CCNDBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 44705556 A/C 1 27 29 56 12.5386226300476 15.5325905084674 -2.99396787841972 A:C A C 10 0.535606569257495 0.4255128383419 ENSG00000166734:ENST00000299957:exon_44705534_44707956:CASC4;ENSG00000166734:ENST00000360824:exon_44705534_44707955:CASC4;ENSG00000166734:ENST00000345795:exon_44705534_44707955:CASC4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 44943757 A/G 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 1 21 15 36 9.75226204559261 8.03409853886242 1.71816350673018 A:T A T 10 0.535606569257495 0.618724336355263 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 48626647 A/G 1 94 104 198 43.6529824897955 55.7030832027795 -12.050100712984 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0876637724242652 ENSG00000128951:ENST00000331200:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000450740:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000249783:exon_48626614_48626705:DUT;ENSG00000128951:ENST00000455976:exon_48626614_48626705:DUT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 49170742 A/C 1 356 343 699 165.324061344332 183.713053255321 -18.388991910989 A:C A C 10 0.535606569257495 0.172184441213444 ENSG00000255302:ENST00000530028:exon_49170298_49172190:EID1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 50867082 G/A 1 28 21 49 13.0030160607901 11.2477379544074 1.75527810638275 A:G G A 10 0.535606569257495 0.668860373240167 ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50867049_50867332:TRPM7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 51012201 G/C 1 21 13 34 9.75226204559261 6.96288540034743 2.78937664524517 C:G G C 10 0.535606569257495 0.391865967418225 ENSG00000138600:ENST00000261854:exon_51012137_51012297:AC012100.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 20 18 38 9.2878686148501 9.64091824663491 -0.353049631784808 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 52900871 T/C 1 11 13 24 5.10832773816756 6.96288540034743 -1.85455766217988 T:C T C 10 0.535606569257495 0.540621078426603 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 52901283 T/C 1 12 10 22 5.57272116891006 5.35606569257495 0.216655476335111 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 52901284 T/C 1 12 10 22 5.57272116891006 5.35606569257495 0.216655476335111 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 52901433 C/T 1 10 12 22 4.64393430742505 6.42727883108994 -1.78334452366489 T:C C T 10 0.535606569257495 0.523642698847636 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 52901638 T/C 1 16 14 30 7.43029489188008 7.49849196960493 -0.0681970777248484 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 52901977 G/A 1 14 7 21 6.50150803039507 3.74924598480246 2.75226204559261 A:G G A 10 0.535606569257495 0.277038580102749 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 54919047 A/G 1 12 24 36 5.57272116891006 12.8545576621799 -7.28183649326982 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0184524706737686 ENSG00000137766:ENST00000260323:exon_54919026_54920806:UNC13C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 56388033 T/C 1 13 12 25 6.03711459965257 6.42727883108994 -0.390164231437374 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 57524982 G/A 1 7 9 16 3.25075401519754 4.82045912331745 -1.56970510811992 A:G G A 10 0.535606569257495 0.462079525679044 ENSG00000140262:ENST00000267811:exon_57524910_57525054:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000438423:exon_57524910_57525054:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000452095:exon_57524910_57525054:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000333725:exon_57524910_57525054:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000343827:exon_57524910_57525054:TCF12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 58467196 A/T 1 10 4 14 4.64393430742505 2.14242627702998 2.50150803039507 A:T A T 10 0.535606569257495 0.283626359522875 ENSG00000103569:ENST00000219919:exon_58467117_58467235:AQP9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 59368167 G/A 1 6 15 21 2.78636058445503 8.03409853886242 -5.24773795440739 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0273627820397729 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59368153_59368414:RNF111 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 20 17 37 9.2878686148501 9.10531167737741 0.182556937472686 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 14 18 32 6.50150803039507 9.64091824663491 -3.13941021623984 A:G A G 10 0.535606569257495 0.290906509339366 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 62199580 T/A 1 10 8 18 4.64393430742505 4.28485255405996 0.359081753365091 A:T T A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62199463_62199589:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62199463_62199589:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62199463_62199589:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62199463_62199589:VPS13C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 62212781 T/C 1 8 2 10 3.71514744594004 1.07121313851499 2.64393430742505 T:C T C 10 0.535606569257495 0.118289200524796 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62212697_62212846:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62212697_62212846:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62212697_62212846:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62212697_62212846:VPS13C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 63918307 G/C 1 11 7 18 5.10832773816756 3.74924598480246 1.35908175336509 C:G G C 10 0.535606569257495 0.638915092572894 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63918184_63918353:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63918184_63918353:HERC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 63922752 T/A 1 5 13 18 2.32196715371253 6.96288540034743 -4.64091824663491 A:T T A 10 0.535606569257495 0.0333310131801400 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63922665_63922834:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63922665_63922834:HERC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 63932513 G/C 1 18 13 31 8.35908175336509 6.96288540034743 1.39619635301766 C:G G C 10 0.535606569257495 0.719730647046148 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63932351_63932644:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63932351_63932644:HERC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 63937209 C/G 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 C:G C G 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63937191_63937296:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63937191_63937296:HERC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 63954029 C/T 1 6 7 13 2.78636058445503 3.74924598480246 -0.962885400347434 T:C C T 10 0.535606569257495 0.782351862796383 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63953952_63954220:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63953952_63954220:HERC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 63970456 T/C 1 8 2 10 3.71514744594004 1.07121313851499 2.64393430742505 T:C T C 10 0.535606569257495 0.118289200524796 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63970044_63970564:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63970044_63970564:HERC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 63988357 C/G 1 7 1 8 3.25075401519754 0.535606569257495 2.71514744594004 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0758732255235235 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63988323_63988538:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63988323_63988538:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000425434:exon_63988323_63988538:HERC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 25 18 43 11.6098357685626 9.64091824663491 1.96891752192772 A:G G A 10 0.535606569257495 0.647054275327297 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 64455123 G/T 1 93 143 236 43.188589059053 76.5917394038218 -33.4031503447688 A:T:G G T 10 0.535606569257495 1.47978148588132e-05 ENSG00000166794:ENST00000300026:exon_64455051_64455404:PPIB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 64966526 C/T 1 13 15 28 6.03711459965257 8.03409853886242 -1.99698393920986 T:C C T 10 0.535606569257495 0.456308012833315 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64966115_64968455:ZNF609 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 65108479 T/C 1 20 17 37 9.2878686148501 9.10531167737741 0.182556937472686 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 65153690 G/A 1 18 26 44 8.35908175336509 13.9257708006949 -5.56668904732978 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0981130251876548 ENSG00000249240:ENST00000502574:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000249240:ENST00000437723:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65153676_65153774:PLEKHO2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 65157482 C/T 1 49 57 106 22.7552781063827 30.5295744476772 -7.77429634129447 T:C C T 10 0.535606569257495 0.144103399973680 ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65157098_65160206:PLEKHO2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 65856653 G/A 1 6 7 13 2.78636058445503 3.74924598480246 -0.962885400347434 A:G G A 10 0.535606569257495 0.782351862796383 ENSG00000074696:ENST00000261875:exon_65856553_65856680:PTPLAD1;ENSG00000074696:ENST00000442729:exon_65856553_65856680:PTPLAD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 66618342 A/G 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 A:G A G 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 66625470 G/A 1 19 14 33 8.8234751841076 7.49849196960493 1.32498321450267 A:G G A 10 0.535606569257495 0.728342224580128 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66625342_66626236:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66625342_66626082:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66625342_66626066:DIS3L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 66641732 G/C 1 5 11 16 2.32196715371253 5.89167226183244 -3.56970510811992 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0832026742777677 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66641653_66641775:TIPIN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 66793677 G/C 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 C:G G C 10 0.535606569257495 0.796989647696743 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 67528374 T/G 1 10 20 30 4.64393430742505 10.7121313851499 -6.06819707772485 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0285467930167507 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67528317_67528406:AAGAB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 36 35 71 16.7181635067302 18.7462299240123 -2.02806641728214 T:C C T 10 0.535606569257495 0.636266346827349 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 30 36 66 13.9318029222752 19.2818364932698 -5.35003357099467 T:C C T 10 0.535606569257495 0.217119707277429 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 70352968 C/G 1 11 15 26 5.10832773816756 8.03409853886242 -2.92577080069487 C:G C G 10 0.535606569257495 0.325754731828897 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70352869_70352988:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70352869_70352988:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70352869_70352988:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70352869_70352988:TLE3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 72499193 C/T 1 1235 933 2168 573.525886966994 499.720929117243 73.804957849751 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.00154444475790703 ENSG00000067225:ENST00000319622:exon_72499069_72499221:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000335181:exon_72499069_72499221:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000419739:exon_72499069_72499221:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000449901:exon_72499069_72499221:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000438234:exon_72499069_72499221:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000327974:exon_72499069_72499221:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000434220:exon_72499069_72499221:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000389093:exon_72499069_72499221:PKM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 73027478 T/C 1 10 8 18 4.64393430742505 4.28485255405996 0.359081753365091 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000140463:ENST00000268057:exon_73027454_73027523:BBS4;ENSG00000140463:ENST00000395205:exon_73027454_73027523:BBS4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 74709975 G/A 1 323 289 612 149.999078129829 154.790298515416 -4.79122038558688 A:G G A 10 0.535606569257495 0.715372108958256 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709932_74710016:SEMA7A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 74710305 G/A 1 214 214 428 99.3801941788961 114.619805821104 -15.2396116422078 A:G G A 10 0.535606569257495 0.146031698495358 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74710218_74710310:SEMA7A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 75093222 C/T 1 252 167 419 117.027144547111 89.4462970660017 27.5808474811096 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00703050157028249 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093164_75093263:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093164_75093263:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093164_75093263:CSK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 255 225 480 118.420324839339 120.511478082936 -2.09115324359757 T:C C T 10 0.535606569257495 0.854874958615626 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 75131661 A/G 1 8 17 25 3.71514744594004 9.10531167737741 -5.39016423143737 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0429772965518088 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131609_75131714:ULK3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 75146366 G/T 1 38 39 77 17.6469503682152 20.8886562010423 -3.24170583282711 T:G G T 10 0.535606569257495 0.493855582925954 ENSG00000140497:ENST00000268099:exon_75146362_75146460:SCAMP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 75188584 C/T 1 18 12 30 8.35908175336509 6.42727883108994 1.93180292227515 T:C C T 10 0.535606569257495 0.583938206470959 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75188493_75188666:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75188493_75188666:MPI;ENSG00000178802:ENST00000379693:exon_75188493_75188842:MPI HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 75189930 A/G 1 47 36 83 21.8264912448977 19.2818364932698 2.54465475162792 A:G A G 10 0.535606569257495 0.584584753174138 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189853_75191798:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189853_75190569:MPI HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 75336729 A/G 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000138621:ENST00000342932:exon_75336727_75336855:PPCDC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 75498744 G/C 1 43 39 82 19.9689175219277 20.8886562010423 -0.919738679114584 C:G G C 10 0.535606569257495 0.911936340676929 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 75648650 C/T 1 44 45 89 20.4333109526702 24.1022956165873 -3.66898466391705 T:C C T 10 0.535606569257495 0.458050938395393 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75648642_75648790:MAN2C1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 76017452 C/T 1 9 3 12 4.17954087668255 1.60681970777248 2.57272116891006 T:C C T 10 0.535606569257495 0.158222040248362 ENSG00000182950:ENST00000332145:exon_76017449_76017559:ODF3L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 78337303 C/T 1 15 6 21 6.96590146113758 3.21363941554497 3.75226204559261 T:C C T 10 0.535606569257495 0.126040587665888 ENSG00000167202:ENST00000418039:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000409931:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000300584:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000420639:exon_78337242_78337410:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000435468:exon_78337242_78337410:TBC1D2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 78441769 T/C 1 28 23 51 13.0030160607901 12.3189510929224 0.684064967867759 T:C T C 10 0.535606569257495 0.88906684204058 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78441663_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78441719_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000379576:exon_78441720_78441772:IDH3A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 78789488 C/T 1 24 15 39 11.1454423378201 8.03409853886242 3.1113437989577 T:C C T 10 0.535606569257495 0.339755497812456 ENSG00000136381:ENST00000258886:exon_78789468_78789653:IREB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 79215311 A/C 1 1 7 8 0.464393430742505 3.74924598480246 -3.28485255405996 A:C A C 10 0.535606569257495 0.0288949230486104 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 79217691 G/A 1 529 289 818 245.664124862785 154.790298515416 90.8738263473691 A:T:C:G G A 10 0.535606569257495 1.49793850093094e-10 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000527715:exon_79217676_79219246:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534237:exon_79217676_79217782:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79217676_79217782:CTSH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 79606186 G/A 1 109 81 190 50.6188839509331 43.3841321098571 7.23475184107596 A:G G A 10 0.535606569257495 0.308972840181584 ENSG00000166557:ENST00000299705:exon_79606099_79606347:TMED3;ENSG00000166557:ENST00000424155:exon_79606099_79606347:TMED3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 80452172 G/C 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 C:G G C 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000103876:ENST00000407106:exon_80452098_80452219:FAH;ENSG00000103876:ENST00000261755:exon_80452098_80452219:FAH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 82443824 C/T 1 21 17 38 9.75226204559261 9.10531167737741 0.64695036821519 A:T:C C T 10 0.535606569257495 0.872084859978277 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 83502065 A/C 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 A:C A C 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83501981_83503613:WHAMM HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 83502066 C/G 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 C:G C G 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83501981_83503613:WHAMM HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 86122779 T/C 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 T:C T C 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 86123833 T/C 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 86123924 C/T 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 T:C C T 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 86123988 G/A 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 86124419 C/T 1 8 5 13 3.71514744594004 2.67803284628747 1.03711459965257 T:C C T 10 0.535606569257495 0.593641770478394 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 86124483 C/G 1 10 7 17 4.64393430742505 3.74924598480246 0.894688322622586 C:G C G 10 0.535606569257495 0.809240333218704 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 86124555 G/A 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 86125031 G/A 1 4 6 10 1.85757372297002 3.21363941554497 -1.35606569257495 A:G G A 10 0.535606569257495 0.529494183528195 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 86125304 C/T 1 3 9 12 1.39318029222752 4.82045912331745 -3.42727883108994 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0782949617348295 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 86182670 G/A 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 A:G G A 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86182605_86182680:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86182605_86182680:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86182605_86182680:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86182605_86182680:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86182605_86182680:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86182605_86182680:AKAP13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 31 23 54 14.3961963530177 12.3189510929224 2.07724526009527 T:C C T 10 0.535606569257495 0.588524028343485 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 86286787 C/T 1 24 31 55 11.1454423378201 16.6038036469823 -5.45836130916222 T:C C T 10 0.535606569257495 0.175889663980193 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86286723_86287056:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86286723_86287056:AKAP13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 86287910 C/T 1 25 34 59 11.6098357685626 18.2106233547548 -6.6007875861922 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0906140119073217 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 89169858 A/G 1 57 40 97 26.4704255523228 21.4242627702998 5.04616278202299 A:G A G 10 0.535606569257495 0.310969120809381 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 89172558 G/C 1 14 13 27 6.50150803039507 6.96288540034743 -0.461377369952364 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89172457_89172657:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89172457_89172657:AEN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 191 135 326 88.6991452718185 72.3068868497618 16.3922584220566 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0754531501535726 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 89804043 C/T 1 5 10 15 2.32196715371253 5.35606569257495 -3.03409853886242 T:C C T 10 0.535606569257495 0.128072258736022 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 13 19 32 6.03711459965257 10.1765248158924 -4.13941021623984 C:G G C 10 0.535606569257495 0.158318922859624 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 29 32 61 13.4674094915326 17.1394102162398 -3.67200072470719 T:C T C 10 0.535606569257495 0.370451147858163 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 89867424 C/T 1 17 18 35 7.89468832262259 9.64091824663491 -1.74622992401232 T:C C T 10 0.535606569257495 0.612809759315648 ENSG00000140521:ENST00000268124:exon_89867338_89867458:POLG;ENSG00000140521:ENST00000442287:exon_89867338_89867458:POLG;ENSG00000140521:ENST00000532584:exon_89867338_89867458:POLG;ENSG00000140521:ENST00000526314:exon_89867338_89867458:POLG;ENSG00000140521:ENST00000526573:exon_89867338_89867458:POLG;ENSG00000140521:ENST00000533857:exon_89867338_89867522:POLG HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 90611818 C/A 1 11 11 22 5.10832773816756 5.89167226183244 -0.783344523664889 A:C C A 10 0.535606569257495 0.831857301870848 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90610342_90611827:ZNF710 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 90628537 G/A 1 222 176 398 103.095341624836 94.2667561893191 8.82858543551701 A:G G A 10 0.535606569257495 0.393056571505221 ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 91010776 T/C 1 33 37 70 15.3249832145027 19.8174430625273 -4.49245984802465 T:C T C 10 0.535606569257495 0.283982763814941 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91010682_91010824:IQGAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 A:G G A 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 91449654 T/C 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91449600_91449727:MAN2A2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 91449702 A/T 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 A:T A T 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91449600_91449727:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91449600_91449727:MAN2A2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 91454424 C/T 1 5 14 19 2.32196715371253 7.49849196960493 -5.1765248158924 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0206298058842502 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91454401_91454468:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91454401_91454468:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91454401_91454468:MAN2A2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 91491922 G/A 1 17 8 25 7.89468832262259 4.28485255405996 3.60983576856263 A:G G A 10 0.535606569257495 0.164601117941781 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91491884_91492024:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91491884_91492024:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91491884_91492024:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000487875:exon_91491372_91492024:UNC45A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 99678145 G/A 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000103852:ENST00000459771:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394132:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000434186:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394136:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000262074:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000427087:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000421732:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000413876:exon_99676528_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000494567:exon_99676611_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394135:exon_99677781_99678332:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000480371:exon_99677845_99678332:TTC23 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 100246936 T/C 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000068305:ENST00000354410:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000346108:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000449277:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000338042:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000453228:exon_100246934_100247060:MEF2A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 100269635 G/C 1 13 8 21 6.03711459965257 4.28485255405996 1.75226204559261 C:G G C 10 0.535606569257495 0.515721370266415 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 100269737 G/A 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 A:G G A 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000484050:exon_100269703_100269936:LYSMD4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 100269749 G/A 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000484050:exon_100269703_100269936:LYSMD4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 24 15 39 11.1454423378201 8.03409853886242 3.1113437989577 A:G G A 10 0.535606569257495 0.339755497812456 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 101110096 T/C 1 21 16 37 9.75226204559261 8.56970510811992 1.18255693747269 T:C T C 10 0.535606569257495 0.74382946670773 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 101591923 A/G 1 9 9 18 4.17954087668255 4.82045912331745 -0.640918246634909 A:G A G 10 0.535606569257495 0.816090164780621 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101591916_101592165:LRRK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 101595257 G/A 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 A:G G A 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101595151_101595428:LRRK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 101598200 G/A 1 12 11 23 5.57272116891006 5.89167226183244 -0.318951092922384 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 101598314 C/T 1 7 9 16 3.25075401519754 4.82045912331745 -1.56970510811992 T:C C T 10 0.535606569257495 0.462079525679044 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 101606889 G/A 1 21 16 37 9.75226204559261 8.56970510811992 1.18255693747269 A:G G A 10 0.535606569257495 0.74382946670773 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 101606890 C/A 1 22 16 38 10.2166554763351 8.56970510811992 1.64695036821519 A:C C A 10 0.535606569257495 0.628885094880109 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 101718927 G/A 1 14 18 32 6.50150803039507 9.64091824663491 -3.13941021623984 A:G G A 10 0.535606569257495 0.290906509339366 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 102192540 T/G 1 34 24 58 15.7893766452452 12.8545576621799 2.93481898306529 T:G T G 10 0.535606569257495 0.510888175679854 ENSG00000184277:ENST00000428002:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000347970:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102192474_102192570:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000453041:exon_102192474_102192594:TM2D3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 15 102264476 C/A 1 3 12 15 1.39318029222752 6.42727883108994 -5.03409853886242 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0165850572920139 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102264294_102264807:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102264294_102264645:TARSL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 97541 G/A 1 71 56 127 32.9719335827179 29.9939678784197 2.97796570429814 A:G G A 10 0.535606569257495 0.656641622472353 ENSG00000161980:ENST00000293860:exon_96407_97557:POLR3K;ENSG00000161980:ENST00000481810:exon_97236_97557:POLR3K HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 129654 C/T 1 84 70 154 39.0090481823704 37.4924598480246 1.51658833434578 T:C C T 10 0.535606569257495 0.871707576417586 ENSG00000103152:ENST00000436333:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397817:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000356432:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000428050:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000475280:exon_129424_129843:MPG;ENSG00000103152:ENST00000219431:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397818:exon_129424_129699:MPG HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 304514 C/T 1 26 21 47 12.0742291993051 11.2477379544074 0.826491244897737 T:C C T 10 0.535606569257495 0.884149972016554 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000419173:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000426695:exon_304328_304564:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000438220:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000447499:exon_304380_304673:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000453430:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000449945:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420046:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420500:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000417499:exon_304328_304618:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000496874:exon_304121_304680:ITFG3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 315008 A/G 1 40 32 72 18.5757372297002 17.1394102162398 1.43632701346036 A:G A G 10 0.535606569257495 0.813448045189642 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_314810_316124:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_314810_316119:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_314810_316090:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000424016:exon_314810_315089:ITFG3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 396264 A/G 1 18 14 32 8.35908175336509 7.49849196960493 0.860589783760162 A:G A G 10 0.535606569257495 0.859952664418775 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_396148_396322:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_396148_396444:AXIN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 131 92 223 60.8355394272682 49.2758043716895 11.5597350555786 A:C:G A G 10 0.535606569257495 0.123039921775135 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 59 35 94 27.3992124138078 18.7462299240123 8.65298248979548 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0789739514165 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 48 37 85 22.2908846756402 19.8174430625273 2.47344161311293 T:C T C 10 0.535606569257495 0.663864338128537 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 34 24 58 15.7893766452452 12.8545576621799 2.93481898306529 T:C T C 10 0.535606569257495 0.510888175679854 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 427784 G/A 1 28 19 47 13.0030160607901 10.1765248158924 2.82649124489774 A:G G A 10 0.535606569257495 0.465825429729469 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427671_427805:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427671_427807:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 427820 C/T 1 28 13 41 13.0030160607901 6.96288540034743 6.04013066044271 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0615420571584368 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 67 77 144 31.1143598597478 41.2417058328271 -10.1273459730793 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0950242515699644 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 136 150 286 63.1575065809807 80.3409853886242 -17.1834788076436 A:T:C C T 10 0.535606569257495 0.0438141740378188 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 840599 C/T 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_840531_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840525_842367:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_840525_840805:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840525_842347:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_840525_840671:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_840525_840666:CHTF18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 845754 C/T 1 8 14 22 3.71514744594004 7.49849196960493 -3.78334452366489 T:C C T 10 0.535606569257495 0.134296367934504 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 845797 G/C 1 3 12 15 1.39318029222752 6.42727883108994 -5.03409853886242 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0165850572920139 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 845819 A/G 1 9 2 11 4.17954087668255 1.07121313851499 3.10832773816756 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0728086494533878 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 847936 C/T 1 15 17 32 6.96590146113758 9.10531167737741 -2.13941021623984 T:C C T 10 0.535606569257495 0.481944050368973 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847839_847975:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847839_848063:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847839_848072:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847839_847975:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847839_848074:CHTF18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 848013 G/A 1 16 15 31 7.43029489188008 8.03409853886242 -0.603803646982342 A:G G A 10 0.535606569257495 0.858638851870196 ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847839_848063:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847839_848072:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847839_848074:CHTF18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 1814440 A/G 1 16 26 42 7.43029489188008 13.9257708006949 -6.49547590881479 A:G A G 10 0.535606569257495 0.062088815771268 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 2282899 C/T 1 16 20 36 7.43029489188008 10.7121313851499 -3.28183649326982 T:C C T 10 0.535606569257495 0.317098320507134 ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2282757_2282909:E4F1;ENSG00000167967:ENST00000448358:exon_2282757_2282909:E4F1;ENSG00000167967:ENST00000421893:exon_2282757_2282909:E4F1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 2285271 G/A 1 41 35 76 19.0401306604427 18.7462299240123 0.293900736430384 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 2812647 C/T 1 91 81 172 42.259802197568 43.3841321098571 -1.12432991228913 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.878706258176707 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 162 139 301 75.2317357802858 74.4493131267918 0.782422653494024 A:G A G 10 0.535606569257495 0.953951445520993 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 182 150 332 84.5196043951359 80.3409853886242 4.17861900651167 A:C C A 10 0.535606569257495 0.66011620408309 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 2814162 G/A 1 114 110 224 52.9408511046456 58.9167226183244 -5.97587151367887 A:G G A 10 0.535606569257495 0.422579658812440 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 2820882 G/T 1 349 274 623 162.073307329134 146.756199976554 15.3171073525806 T:G G T 10 0.535606569257495 0.228240733435930 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382300:exon_2820859_2821411:SRRM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 2880299 C/A 1 44 24 68 20.4333109526702 12.8545576621799 7.57875329049034 A:T:C C A 10 0.535606569257495 0.0688372200407265 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2880170_2880329:ZG16B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 3073240 G/T 1 70 77 147 32.5075401519754 41.2417058328271 -8.73416568085175 T:G G T 10 0.535606569257495 0.15994272175988 ENSG00000103145:ENST00000354679:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000396916:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000248089:exon_3073234_3073362:HCFC1R1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 3339435 G/C 1 21 18 39 9.75226204559261 9.64091824663491 0.111343798957696 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000006194:ENST00000219069:exon_3339393_3341460:ZNF263 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 3367229 T/C 1 13 4 17 6.03711459965257 2.14242627702998 3.89468832262259 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0861319747680826 ENSG00000162086:ENST00000293995:exon_3367190_3368574:ZNF75A;ENSG00000162086:ENST00000498240:exon_3367190_3368574:ZNF75A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 34 35 69 15.7893766452452 18.7462299240123 -2.95685327876715 C:G C G 10 0.535606569257495 0.546511420602956 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 3586230 C/T 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000103351:ENST00000341633:exon_3586122_3586581:CLUAP1;ENSG00000103351:ENST00000417763:exon_3586122_3586581:CLUAP1;ENSG00000103351:ENST00000445795:exon_3586122_3587669:CLUAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 93 111 204 43.188589059053 59.4523291875819 -16.263740128529 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0245501258272989 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 T:C C T 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 4751045 C/T 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4750971_4751135:ANKS3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 5128799 C/T 1 14 10 24 6.50150803039507 5.35606569257495 1.14544233782012 T:C C T 10 0.535606569257495 0.686918776217185 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5128758_5128879:ALG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 8997188 A/G 1 37 36 73 17.1825569374727 19.2818364932698 -2.09927955579713 A:G A G 10 0.535606569257495 0.640348010798636 ENSG00000187555:ENST00000344836:exon_8997125_8997259:USP7;ENSG00000187555:ENST00000381886:exon_8997125_8997259:USP7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 10989219 C/G 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 C:G C G 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_10989139_10989285:CIITA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 11000848 G/C 1 16 18 34 7.43029489188008 9.64091824663491 -2.21062335475483 C:G G C 10 0.535606569257495 0.493886486229954 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 11001770 G/T 1 12 12 24 5.57272116891006 6.42727883108994 -0.854557662179879 T:G G T 10 0.535606569257495 0.838559306298216 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 11002904 G/A 1 15 7 22 6.96590146113758 3.74924598480246 3.21665547633511 A:G G A 10 0.535606569257495 0.202330577542265 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 11154770 G/A 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 A:G G A 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000465491:exon_11154759_11154879:CLEC16A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 11940655 C/A 1 188 160 348 87.305964979591 85.6970510811992 1.60891389839176 A:C C A 10 0.535606569257495 0.872077384147844 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11940552_11940700:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11940552_11940700:RSL1D1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 12162969 A/G 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 A:G A G 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12162914_12162989:SNX29;ENSG00000048471:ENST00000323433:exon_12162914_12162989:SNX29 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 14742400 T/G 1 43 27 70 19.9689175219277 14.4613773699524 5.50754015197536 A:T:G T G 10 0.535606569257495 0.230565515335178 ENSG00000103429:ENST00000261658:exon_14742245_14742449:BFAR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 12 11 23 5.57272116891006 5.89167226183244 -0.318951092922384 A:C C A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 15098047 C/G 1 10 12 22 4.64393430742505 6.42727883108994 -1.78334452366489 C:G C G 10 0.535606569257495 0.523642698847636 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15098044_15098190:PDXDC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 15129970 A/G 1 64 39 103 29.7211795675203 20.8886562010423 8.83252336647802 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0927830715878162 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 15131962 A/G 1 63 48 111 29.2567861367778 25.7091153243598 3.54767081241806 A:G A G 10 0.535606569257495 0.507307627627702 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 15131974 G/T 1 57 34 91 26.4704255523228 18.2106233547548 8.25980219756796 T:G G T 10 0.535606569257495 0.0925302181707695 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 15133889 T/G 1 19 29 48 8.8234751841076 15.5325905084674 -6.70911532435976 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0597531169011971 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 15961351 T/C 0 33 0 33 15.3249832145027 0 15.3249832145027 T T 10 0.535606569257495 1.52414647235143e-09 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 15961356 C/T 1 35 1 36 16.2537700759877 0.535606569257495 15.7181635067302 T:C C T 10 0.535606569257495 6.4748645015087e-09 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 15961369 G/A 1 42 9 51 19.5045240911852 4.82045912331745 14.6840649678678 A:G G A 10 0.535606569257495 2.83305411234707e-05 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 16228242 G/A 1 17 13 30 7.89468832262259 6.96288540034743 0.931802922275152 A:G G A 10 0.535606569257495 0.855265722884923 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16228207_16228365:ABCC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 18823379 T/C 1 9 18 27 4.17954087668255 9.64091824663491 -5.46137736995236 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0516421185738133 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18823270_18823449:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18823270_18823449:SMG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 18839362 T/C 1 9 11 20 4.17954087668255 5.89167226183244 -1.7121313851499 T:C T C 10 0.535606569257495 0.505071075446385 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18839353_18839490:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18839353_18839493:SMG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 18861335 A/G 1 8 11 19 3.71514744594004 5.89167226183244 -2.1765248158924 A:G A G 10 0.535606569257495 0.362403407231352 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18861271_18861448:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18861271_18861448:SMG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 19547357 A/G 1 12 2 14 5.57272116891006 1.07121313851499 4.50150803039507 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0160379660597638 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 19547503 C/T 1 26 5 31 12.0742291993051 2.67803284628747 9.39619635301766 T:C C T 10 0.535606569257495 0.000510962362249671 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 19548116 G/A 1 16 16 32 7.43029489188008 8.56970510811992 -1.13941021623984 A:G G A 10 0.535606569257495 0.72535006961681 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 19548290 G/A 1 17 12 29 7.89468832262259 6.42727883108994 1.46740949153265 A:G G A 10 0.535606569257495 0.710437247251719 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 19680546 T/C 1 8 2 10 3.71514744594004 1.07121313851499 2.64393430742505 T:C T C 10 0.535606569257495 0.118289200524796 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 23847575 C/A 1 14 12 26 6.50150803039507 6.42727883108994 0.0742291993051314 A:C C A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_23847322_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_23847345_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000498058:exon_23847403_23847669:PRKCB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 43 33 76 19.9689175219277 17.6750167854973 2.29390073643038 T:C T C 10 0.535606569257495 0.646297973595934 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 28145165 T/A 1 13 18 31 6.03711459965257 9.64091824663491 -3.60380364698234 A:T T A 10 0.535606569257495 0.211027479808991 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28145162_28145254:XPO6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 28222690 G/A 1 22 12 34 10.2166554763351 6.42727883108994 3.78937664524517 A:G G A 10 0.535606569257495 0.229712278190520 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28222687_28223190:XPO6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 28499044 T/C 1 15 14 29 6.96590146113758 7.49849196960493 -0.532590508467353 T:C T C 10 0.535606569257495 0.854557239223409 ENSG00000188603:ENST00000359984:exon_28498983_28499062:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000360019:exon_28498983_28499062:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357857:exon_28498983_28499062:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000354630:exon_28498983_28499062:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000355477:exon_28498983_28499062:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000395653:exon_28498983_28499062:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357076:exon_28498983_28499062:CLN3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 28506872 A/G 1 18 12 30 8.35908175336509 6.42727883108994 1.93180292227515 A:G A G 10 0.535606569257495 0.583938206470959 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28506420_28507410:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28506420_28507410:AC138894.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 28507644 C/G 1 19 10 29 8.8234751841076 5.35606569257495 3.46740949153265 C:G C G 10 0.535606569257495 0.263770590080562 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 28508048 A/G 1 13 13 26 6.03711459965257 6.96288540034743 -0.925770800694869 A:G A G 10 0.535606569257495 0.844636479883657 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 28508069 C/T 1 14 12 26 6.50150803039507 6.42727883108994 0.0742291993051314 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 28508447 A/G 1 18 15 33 8.35908175336509 8.03409853886242 0.324983214502668 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 28883241 A/G 1 6 16 22 2.78636058445503 8.56970510811992 -5.78334452366489 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0172729085887099 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 28944396 C/G 1 84 76 160 39.0090481823704 40.7060992635696 -1.69705108119919 C:G C G 10 0.535606569257495 0.812310982616944 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944232_28944435:CD19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 28993369 C/T 1 16 7 23 7.43029489188008 3.74924598480246 3.68104890707762 T:C C T 10 0.535606569257495 0.145567531076242 ENSG00000169682:ENST00000311008:exon_28993222_28993377:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000452515:exon_28993222_28993377:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000323081:exon_28993222_28993377:SPNS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 28995145 C/T 1 11 4 15 5.10832773816756 2.14242627702998 2.96590146113758 T:C C T 10 0.535606569257495 0.194138829836023 ENSG00000169682:ENST00000311008:exon_28995107_28995278:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000334536:exon_28995107_28995278:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000352260:exon_28995107_28995278:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000452515:exon_28995107_28995278:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000323081:exon_28995107_28995278:SPNS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 29675846 C/T 1 116 127 243 53.8696379661306 68.0220342957019 -14.1523963295713 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0718059953125135 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 29675928 C/T 1 135 149 284 62.6931131502382 79.8053788193668 -17.1122656691286 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0431536476133493 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 29999224 C/T 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 30081476 C/T 1 4064 3622 7686 1887.29490253754 1939.96699385065 -52.6720913131062 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.229867652288374 ENSG00000149925:ENST00000395248:exon_30081438_30081741:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000338110:exon_30081438_30081734:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000436540:exon_30081438_30081734:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000412304:exon_30081438_30081734:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000395240:exon_30081438_30081741:ALDOA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 31075175 G/A 1 7 10 17 3.25075401519754 5.35606569257495 -2.10531167737741 A:G G A 10 0.535606569257495 0.338652205084508 ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31075134_31075802:ZNF668 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 31088347 G/A 1 5 11 16 2.32196715371253 5.89167226183244 -3.56970510811992 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0832026742777677 ENSG00000167395:ENST00000428260:exon_31087567_31088365:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 31088625 A/G 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 31090407 G/C 1 4 9 13 1.85757372297002 4.82045912331745 -2.96288540034743 C:G G C 10 0.535606569257495 0.162027045980107 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 31091209 T/C 1 16 19 35 7.43029489188008 10.1765248158924 -2.74622992401232 T:C T C 10 0.535606569257495 0.398532874739113 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 31092075 G/A 1 11 12 23 5.10832773816756 6.42727883108994 -1.31895109292238 A:G G A 10 0.535606569257495 0.677398717546528 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 31121793 G/A 1 30 39 69 13.9318029222752 20.8886562010423 -6.95685327876715 A:G G A 10 0.535606569257495 0.116004361255465 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31121722_31121801:BCKDK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 274 287 561 127.243800023446 153.719085376901 -26.4752853534547 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0276451712563090 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 56855496 C/G 1 11 18 29 5.10832773816756 9.64091824663491 -4.53259050846735 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0970767002827596 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56855416_56855505:NUP93 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 56873495 C/T 1 18 22 40 8.35908175336509 11.7833445236649 -3.4242627702998 T:C C T 10 0.535606569257495 0.341722039370342 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56873433_56873516:NUP93 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 56969148 G/A 1 337 223 560 156.500586160224 119.440264944421 37.0603212158028 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00170252680518298 ENSG00000051108:ENST00000439977:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000379792:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000300302:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000344114:exon_56969147_56969224:HERPUD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 57060340 T/C 1 29 26 55 13.4674094915326 13.9257708006949 -0.458361309162223 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 57060353 T/C 1 32 28 60 14.8605897837602 14.9969839392099 -0.136394155449697 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 57068106 A/G 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:G A G 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57068080_57068163:NLRC5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 57068107 C/T 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 T:C C T 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57068080_57068163:NLRC5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 57392733 A/C 1 553 474 1027 256.809567200605 253.877513828053 2.93205337255267 A:C A C 10 0.535606569257495 0.875715101044071 ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57392684_57392801:CCL22 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 57499902 T/C 1 58 53 111 26.9348189830653 28.3871481706472 -1.45232918758194 T:C T C 10 0.535606569257495 0.849169933667267 ENSG00000102978:ENST00000219252:exon_57499865_57499933:POLR2C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 57595999 A/G 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 A:G A G 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57595968_57596069:GPR114 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 57601792 C/T 1 12 7 19 5.57272116891006 3.74924598480246 1.8234751841076 T:C C T 10 0.535606569257495 0.493225271714711 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 58559256 T/C 1 132 112 244 61.2999328580107 59.9879357568394 1.31199710117123 T:C T C 10 0.535606569257495 0.8979371718801 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58559083_58559263:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58559083_58559263:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58559083_58559263:CNOT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 58743454 A/C 1 120 87 207 55.7272116891006 46.5977715254021 9.12944016369855 A:T:C A C 10 0.535606569257495 0.210299458339477 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000494627:exon_58742953_58743471:GOT2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 58750604 G/A 1 67 74 141 31.1143598597478 39.6348861250546 -8.52052626530679 A:T:G G A 10 0.535606569257495 0.152218311080062 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58750567_58750717:GOT2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 58757668 A/C 1 68 62 130 31.5787532904903 33.2076072939647 -1.62885400347434 A:C A C 10 0.535606569257495 0.79241706508106 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 66583994 G/C 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000166548:ENST00000451102:exon_66583841_66584315:TK2;ENSG00000166548:ENST00000299697:exon_66583841_66584315:TK2;ENSG00000166548:ENST00000417693:exon_66583841_66584315:TK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 66584002 T/C 1 6 7 13 2.78636058445503 3.74924598480246 -0.962885400347434 T:C T C 10 0.535606569257495 0.782351862796383 ENSG00000166548:ENST00000451102:exon_66583841_66584315:TK2;ENSG00000166548:ENST00000299697:exon_66583841_66584315:TK2;ENSG00000166548:ENST00000417693:exon_66583841_66584315:TK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 67272154 G/A 1 15 10 25 6.96590146113758 5.35606569257495 1.60983576856263 A:G G A 10 0.535606569257495 0.553975210119156 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67272105_67272210:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000439787:exon_67272105_67272210:FHOD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 67691477 A/T 1 26 28 54 12.0742291993051 14.9969839392099 -2.92275473990473 A:T A T 10 0.535606569257495 0.495540905951554 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691433_67691587:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691435_67691587:ACD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 67691668 A/G 1 27 26 53 12.5386226300476 13.9257708006949 -1.38714817064723 A:T:G A G 10 0.535606569257495 0.783350733399413 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 67697633 C/T 1 12 11 23 5.57272116891006 5.89167226183244 -0.318951092922384 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000124074:ENST00000243878:exon_67697560_67697723:C16orf48;ENSG00000124074:ENST00000414445:exon_67697560_67697723:C16orf48 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 67942833 C/T 1 12 13 25 5.57272116891006 6.96288540034743 -1.39016423143737 T:C C T 10 0.535606569257495 0.689399952434429 ENSG00000159792:ENST00000291041:exon_67942583_67943609:PSKH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 202 189 391 93.807473009986 101.229641589667 -7.42216857968052 A:G A G 10 0.535606569257495 0.477870448974186 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 68055495 G/C 1 27 23 50 12.5386226300476 12.3189510929224 0.219671537125254 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 68056703 G/A 1 33 22 55 15.3249832145027 11.7833445236649 3.54163869083778 A:G G A 10 0.535606569257495 0.348179220802054 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 68293320 T/C 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000103066:ENST00000219345:exon_68293049_68294965:PLA2G15;ENSG00000103066:ENST00000444212:exon_68293049_68294959:PLA2G15;ENSG00000103066:ENST00000413021:exon_68293049_68294959:PLA2G15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 68338083 C/T 1 13 16 29 6.03711459965257 8.56970510811992 -2.53259050846735 T:C C T 10 0.535606569257495 0.358571526558961 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68337929_68338135:SLC7A6OS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 68344363 A/C 1 9 11 20 4.17954087668255 5.89167226183244 -1.7121313851499 A:C A C 10 0.535606569257495 0.505071075446385 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344238_68344516:SLC7A6OS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 9 5 14 4.17954087668255 2.67803284628747 1.50150803039507 T:C C T 10 0.535606569257495 0.593847168610995 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 68387457 C/T 1 11 17 28 5.10832773816756 9.10531167737741 -3.99698393920986 T:C C T 10 0.535606569257495 0.134872699384411 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68387395_68387469:PRMT7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 24 6 30 11.1454423378201 3.21363941554497 7.93180292227515 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00323619248044718 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 17 8 25 7.89468832262259 4.28485255405996 3.60983576856263 A:G G A 10 0.535606569257495 0.164601117941781 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 89 107 196 41.3310153360829 57.309902910552 -15.978887574469 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0261719983371626 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 69963355 G/A 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69963351_69963432:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69963351_69963432:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69963351_69963432:WWP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 69967897 T/C 1 6 15 21 2.78636058445503 8.03409853886242 -5.24773795440739 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0273627820397729 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69967873_69968032:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69967873_69968032:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69967873_69968032:WWP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 69970329 A/G 1 12 11 23 5.57272116891006 5.89167226183244 -0.318951092922384 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69970215_69970355:WWP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 69973825 G/A 1 14 17 31 6.50150803039507 9.10531167737741 -2.60380364698234 A:G G A 10 0.535606569257495 0.372415799031098 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 70287177 A/G 1 94 93 187 43.6529824897955 49.811410940947 -6.15842845115155 A:G A G 10 0.535606569257495 0.379541355911647 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70287171_70287284:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70287171_70287284:AARS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 70506907 T/C 1 10 6 16 4.64393430742505 3.21363941554497 1.43029489188008 T:C T C 10 0.535606569257495 0.618142335020353 ENSG00000157353:ENST00000288078:exon_70506886_70507256:FUK;ENSG00000157353:ENST00000378912:exon_70506886_70507256:FUK;ENSG00000157353:ENST00000464499:exon_70506886_70507256:FUK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 70548297 G/A 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 A:G G A 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70548238_70548412:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70548238_70548386:COG4;ENSG00000103051:ENST00000524584:exon_70548238_70548412:COG4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 27 17 44 12.5386226300476 9.10531167737741 3.43331095267022 A:T A T 10 0.535606569257495 0.364851067911095 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 76 65 141 35.2939007364304 34.8144270017372 0.479473734693215 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 70726795 C/A 1 4 10 14 1.85757372297002 5.35606569257495 -3.49849196960493 A:C C A 10 0.535606569257495 0.104522536584723 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 71318577 T/C 1 11 14 25 5.10832773816756 7.49849196960493 -2.39016423143737 T:C T C 10 0.535606569257495 0.423378530112683 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 71319539 C/T 1 13 9 22 6.03711459965257 4.82045912331745 1.21665547633511 T:C C T 10 0.535606569257495 0.672817163244646 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 71509588 G/A 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000157429:ENST00000288177:exon_71507486_71510175:ZNF19;ENSG00000157429:ENST00000408023:exon_71508725_71510175:ZNF19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 71509634 G/C 1 8 2 10 3.71514744594004 1.07121313851499 2.64393430742505 C:G G C 10 0.535606569257495 0.118289200524796 ENSG00000157429:ENST00000288177:exon_71507486_71510175:ZNF19;ENSG00000157429:ENST00000408023:exon_71508725_71510175:ZNF19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 71683718 A/G 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000040199:ENST00000393524:exon_71678852_71683947:PHLPP2;ENSG00000040199:ENST00000356272:exon_71678852_71683947:PHLPP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 72146368 G/A 1 27 24 51 12.5386226300476 12.8545576621799 -0.315935032132241 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72146312_72146811:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72146312_72146810:DHX38 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 74499589 G/A 1 29 18 47 13.4674094915326 9.64091824663491 3.82649124489774 A:G G A 10 0.535606569257495 0.306762156095718 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74499574_74499711:GLG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 74537591 C/T 1 7 21 28 3.25075401519754 11.2477379544074 -7.99698393920986 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00363436658317667 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74537429_74537644:GLG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 74664810 A/T 1 7 9 16 3.25075401519754 4.82045912331745 -1.56970510811992 A:T A T 10 0.535606569257495 0.462079525679044 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 14 15 29 6.50150803039507 8.03409853886242 -1.53259050846735 T:C C T 10 0.535606569257495 0.582160963982168 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 74695079 G/T 1 17 15 32 7.89468832262259 8.03409853886242 -0.139410216239837 T:G G T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000168411:ENST00000444004:exon_74694988_74695347:RFWD3;ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74694830_74695349:RFWD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 75574030 C/T 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 T:C C T 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000205084:ENST00000258173:exon_75572017_75574072:TMEM231;ENSG00000205084:ENST00000398114:exon_75572017_75574072:TMEM231 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 75646576 G/T 1 11 15 26 5.10832773816756 8.03409853886242 -2.92577080069487 T:G G T 10 0.535606569257495 0.325754731828897 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 75646685 G/T 1 6 8 14 2.78636058445503 4.28485255405996 -1.49849196960493 T:G G T 10 0.535606569257495 0.436988882100625 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 18 13 31 8.35908175336509 6.96288540034743 1.39619635301766 T:C T C 10 0.535606569257495 0.719730647046148 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 93 102 195 43.188589059053 54.6318700642645 -11.4432810052115 T:C C T 10 0.535606569257495 0.114003806540425 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 81056441 T/G 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 T:G T G 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000166451:ENST00000299572:exon_81056360_81056490:CENPN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 81061827 G/A 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000393335:exon_81061776_81061902:CENPN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 81076821 T/C 1 37 50 87 17.1825569374727 26.7803284628747 -9.59777152540206 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.0413216532141097 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 81077915 T/C 1 37 36 73 17.1825569374727 19.2818364932698 -2.09927955579713 T:C T C 10 0.535606569257495 0.640348010798636 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 81929488 C/T 1 52 50 102 24.1484583986103 26.7803284628747 -2.63187006426449 T:C C T 10 0.535606569257495 0.620642760266766 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 75 64 139 34.8295073056879 34.2788204324797 0.5506868732082 T:C T C 10 0.535606569257495 0.932501850525925 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 82182286 C/G 1 13 17 30 6.03711459965257 9.10531167737741 -3.06819707772485 C:G C G 10 0.535606569257495 0.27721112568876 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 82182354 G/A 1 9 17 26 4.17954087668255 9.10531167737741 -4.92577080069487 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0748630120018127 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 83933193 C/T 0 15 0 15 6.96590146113758 0 6.96590146113758 C C 10 0.535606569257495 9.57183866225583e-05 ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83932730_83933277:MLYCD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 17 15 32 7.89468832262259 8.03409853886242 -0.139410216239837 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 84115393 G/A 1 15 11 26 6.96590146113758 5.89167226183244 1.07422919930513 A:G G A 10 0.535606569257495 0.69956771663553 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84115352_84115513:MBTPS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 84115483 G/A 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 A:G G A 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84115352_84115513:MBTPS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 84158248 G/C 1 9 1 10 4.17954087668255 0.535606569257495 3.64393430742505 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0246360115647308 ENSG00000103160:ENST00000219439:exon_84155746_84158333:HSDL1;ENSG00000103160:ENST00000434463:exon_84155888_84158333:HSDL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 26 25 51 12.0742291993051 13.3901642314374 -1.31593503213224 A:C C A 10 0.535606569257495 0.779400233234565 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 32 17 49 14.8605897837602 9.10531167737741 5.75527810638275 T:C C T 10 0.535606569257495 0.115172296028967 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 20 16 36 9.2878686148501 8.56970510811992 0.718163506730182 A:T A T 10 0.535606569257495 0.86832383544209 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 84215390 T/C 1 11 9 20 5.10832773816756 4.82045912331745 0.287868614850101 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84215352_84215664:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84215352_84215469:TAF1C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 84520292 C/T 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 T:C C T 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84520237_84520665:KIAA1609 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 84522897 G/C 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 C:G G C 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84522884_84523028:KIAA1609 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 108 121 229 50.1544905201905 64.8083948801569 -14.6539043599663 A:C:G A G 10 0.535606569257495 0.0547268397136262 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 112 89 201 52.0120642431606 47.6689846639171 4.34307957924351 T:C C T 10 0.535606569257495 0.571832022234039 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 39 20 59 18.1113437989577 10.7121313851499 7.3992124138078 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0668189416582437 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 63 61 124 29.2567861367778 32.6720007247072 -3.41521458792937 A:C:G A G 10 0.535606569257495 0.589259266598804 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 85015541 G/A 1 10 12 22 4.64393430742505 6.42727883108994 -1.78334452366489 A:G G A 10 0.535606569257495 0.523642698847636 ENSG00000153786:ENST00000313732:exon_85015476_85015600:ZDHHC7;ENSG00000153786:ENST00000344861:exon_85015476_85015600:ZDHHC7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 85834818 G/A 1 561 596 1157 260.524714646545 319.221515277467 -58.6968006309216 A:G G A 10 0.535606569257495 0.000560237178696723 ENSG00000131143:ENST00000253452:exon_85834811_85834884:COX4I1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 85945231 C/T 1 70 73 143 32.5075401519754 39.0992795557971 -6.59173940382178 A:T:C C T 10 0.535606569257495 0.276715830159309 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85945176_85945264:IRF8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 86565882 G/C 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 T:C:G G C 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 10 16 26 4.64393430742505 8.56970510811992 -3.92577080069487 A:G G A 10 0.535606569257495 0.167625217677948 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 39 35 74 18.1113437989577 18.7462299240123 -0.634886125054624 A:G A G 10 0.535606569257495 0.907593421717696 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 42 41 83 19.5045240911852 21.9598693395573 -2.45534524837208 C:G C G 10 0.535606569257495 0.660068580068539 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 89293593 C/T 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 89661807 C/T 1 15 2 17 6.96590146113758 1.07121313851499 5.89468832262259 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00560348211099565 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000529800:exon_89661775_89661831:CPNE7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 89662990 T/C 1 9 1 10 4.17954087668255 0.535606569257495 3.64393430742505 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0246360115647308 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 18 1 19 8.35908175336509 0.535606569257495 7.8234751841076 A:G G A 10 0.535606569257495 0.000240493682033055 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 293138 G/A 1 22 45 67 10.2166554763351 24.1022956165873 -13.8856401402522 A:G G A 10 0.535606569257495 0.000820446001783048 ENSG00000183688:ENST00000329099:exon_289769_293285:FAM101B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 293274 A/G 1 18 32 50 8.35908175336509 17.1394102162398 -8.78032846287475 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0153505686040625 ENSG00000183688:ENST00000329099:exon_289769_293285:FAM101B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 14 15 29 6.50150803039507 8.03409853886242 -1.53259050846735 A:G G A 10 0.535606569257495 0.582160963982168 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 617869 G/A 1 12 8 20 5.57272116891006 4.28485255405996 1.2878686148501 A:G G A 10 0.535606569257495 0.65695311160528 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_617863_618096:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_617863_618096:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_617863_618096:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_617863_618096:VPS53 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 648157 G/A 1 57 63 120 26.4704255523228 33.7432138632222 -7.27278831089939 A:G G A 10 0.535606569257495 0.200227211286900 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 62 53 115 28.7923927060353 28.3871481706472 0.405244535388082 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 62 53 115 28.7923927060353 28.3871481706472 0.405244535388082 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 649505 T/A 1 51 47 98 23.6840649678678 25.1735087551023 -1.4894437872345 A:T T A 10 0.535606569257495 0.762510183425382 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 29 32 61 13.4674094915326 17.1394102162398 -3.67200072470719 C:G G C 10 0.535606569257495 0.370451147858163 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 650206 C/T 1 27 25 52 12.5386226300476 13.3901642314374 -0.851541601389737 T:C C T 10 0.535606569257495 0.889655019147133 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 24 29 53 11.1454423378201 15.5325905084674 -4.38714817064723 T:G G T 10 0.535606569257495 0.270588558101027 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 685752 G/A 1 24 16 40 11.1454423378201 8.56970510811992 2.5757372297002 A:G G A 10 0.535606569257495 0.433090933174964 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685696_685794:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 1359363 T/G 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000167193:ENST00000300574:exon_1359171_1359552:CRK;ENSG00000167193:ENST00000398970:exon_1359171_1359517:CRK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 38 47 85 17.6469503682152 25.1735087551023 -7.52655838688707 T:C T C 10 0.535606569257495 0.104094216359592 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 1373612 C/T 1 61 60 121 28.3279992752928 32.1363941554497 -3.80839488015689 T:C C T 10 0.535606569257495 0.52382861740507 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 1637074 A/G 1 6 7 13 2.78636058445503 3.74924598480246 -0.962885400347434 A:G A G 10 0.535606569257495 0.782351862796383 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 1640709 C/T 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 T:C C T 10 0.535606569257495 0.193170376367493 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 1640793 C/T 1 18 4 22 8.35908175336509 2.14242627702998 6.21665547633511 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00903025678056172 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 1940232 A/G 1 14 18 32 6.50150803039507 9.64091824663491 -3.13941021623984 A:G A G 10 0.535606569257495 0.290906509339366 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1940129_1940250:DPH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 2202943 T/C 1 12 8 20 5.57272116891006 4.28485255405996 1.2878686148501 T:C T C 10 0.535606569257495 0.65695311160528 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 2203025 T/G 1 9 2 11 4.17954087668255 1.07121313851499 3.10832773816756 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0728086494533878 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 2203167 T/G 1 11 15 26 5.10832773816756 8.03409853886242 -2.92577080069487 T:G T G 10 0.535606569257495 0.325754731828897 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 2203175 C/G 1 16 10 26 7.43029489188008 5.35606569257495 2.07422919930513 C:G C G 10 0.535606569257495 0.439420946397761 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 2268311 G/A 1 4 6 10 1.85757372297002 3.21363941554497 -1.35606569257495 A:G G A 10 0.535606569257495 0.529494183528195 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2268191_2268351:SGSM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 2275734 C/G 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 C:G C G 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2275637_2275782:SGSM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 2585113 C/T 1 55 58 113 25.5416386908378 31.0651810169347 -5.52354232609693 T:C C T 10 0.535606569257495 0.301268714265958 ENSG00000007168:ENST00000397195:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000451360:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000006951:exon_2585023_2585201:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000397193:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 110 125 235 51.0832773816756 66.9508211571869 -15.8675437755113 A:T:C C T 10 0.535606569257495 0.0424311990919183 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 4722785 G/A 1 10 9 19 4.64393430742505 4.82045912331745 -0.176524815892404 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4722724_4722877:PLD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 4722876 G/A 1 8 14 22 3.71514744594004 7.49849196960493 -3.78334452366489 A:G G A 10 0.535606569257495 0.134296367934504 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4722724_4722877:PLD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 4849284 G/A 1 1772 2019 3791 822.905159275719 1081.38966333088 -258.484504055163 A:T:C:G G A 10 0.535606569257495 4.53910836202477e-17 ENSG00000108518:ENST00000225655:exon_4848947_4849292:PFN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 4875566 T/C 1 18 26 44 8.35908175336509 13.9257708006949 -5.56668904732978 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0981130251876548 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 4875628 A/G 1 36 20 56 16.7181635067302 10.7121313851499 6.00603212158028 A:G A G 10 0.535606569257495 0.110239420453196 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 4883045 C/T 1 27 17 44 12.5386226300476 9.10531167737741 3.43331095267022 T:C C T 10 0.535606569257495 0.364851067911095 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4882979_4883916:CAMTA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 4926882 A/G 1 60 61 121 27.8636058445503 32.6720007247072 -4.80839488015689 A:G A G 10 0.535606569257495 0.412374977979718 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 6353679 A/C 1 16 1 17 7.43029489188008 0.535606569257495 6.89468832262259 A:C A C 10 0.535606569257495 0.000431481723997140 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 6513329 G/A 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6513314_6513480:KIAA0753 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 6661584 T/C 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 T:C T C 10 0.535606569257495 0.484851690384515 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 10 6 16 4.64393430742505 3.21363941554497 1.43029489188008 C:G C G 10 0.535606569257495 0.618142335020353 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 19 11 30 8.8234751841076 5.89167226183244 2.93180292227515 T:C T C 10 0.535606569257495 0.360623116199509 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 19 27 46 8.8234751841076 14.4613773699524 -5.63790218584477 T:C C T 10 0.535606569257495 0.104850442749434 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 23 17 40 10.6810489070776 9.10531167737741 1.5757372297002 A:G G A 10 0.535606569257495 0.638447894751665 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 141 100 241 65.4794737346932 53.5606569257495 11.9188168089437 A:G G A 10 0.535606569257495 0.137315436868654 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 7366651 C/G 1 17 14 31 7.89468832262259 7.49849196960493 0.396196353017657 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000174282:ENST00000311403:exon_7362685_7367209:ZBTB4;ENSG00000174282:ENST00000380599:exon_7362688_7367209:ZBTB4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 7405937 C/T 1 23 23 46 10.6810489070776 12.3189510929224 -1.63790218584477 T:C C T 10 0.535606569257495 0.659399596589616 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7405837_7406020:POLR2A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 7412403 T/C 1 35 34 69 16.2537700759877 18.2106233547548 -1.95685327876715 T:C T C 10 0.535606569257495 0.717579256863573 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7412263_7412509:POLR2A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 7579472 G/C 1 49 50 99 22.7552781063827 26.7803284628747 -4.025050356492 C:G G C 10 0.535606569257495 0.422207114353798 ENSG00000141510:ENST00000413465:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000269305:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000455263:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000420246:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000445888:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000419024:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000359597:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000505014:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000414315:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000508793:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000503591:exon_7579312_7579590:TP53 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 7592560 C/T 1 9 10 19 4.17954087668255 5.35606569257495 -1.1765248158924 T:C C T 10 0.535606569257495 0.649555257001445 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7592542_7592640:WRAP53 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 8 5 13 3.71514744594004 2.67803284628747 1.03711459965257 C:G C G 10 0.535606569257495 0.593641770478394 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 7750436 C/T 1 13 12 25 6.03711459965257 6.42727883108994 -0.390164231437374 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750423_7750770:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750423_7750770:KDM6B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 7751778 G/A 1 13 13 26 6.03711459965257 6.96288540034743 -0.925770800694869 A:G G A 10 0.535606569257495 0.844636479883657 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 7754460 C/A 1 33 25 58 15.3249832145027 13.3901642314374 1.93481898306529 A:C C A 10 0.535606569257495 0.693354315313962 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7754339_7754544:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7754339_7754544:KDM6B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 146 93 239 67.8014408884057 49.811410940947 17.9900299474587 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0196119577336082 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 8792003 C/T 1 27 20 47 12.5386226300476 10.7121313851499 1.82649124489774 T:C C T 10 0.535606569257495 0.661909572342206 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 8792029 A/G 1 29 16 45 13.4674094915326 8.56970510811992 4.89770438341273 A:G A G 10 0.535606569257495 0.178214335683329 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 8792093 G/A 1 16 7 23 7.43029489188008 3.74924598480246 3.68104890707762 A:G G A 10 0.535606569257495 0.145567531076242 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 8792171 T/C 1 10 11 21 4.64393430742505 5.89167226183244 -1.24773795440739 T:C T C 10 0.535606569257495 0.66418868541406 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 8792514 G/A 1 11 7 18 5.10832773816756 3.74924598480246 1.35908175336509 A:G G A 10 0.535606569257495 0.638915092572894 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8792456_8792539:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8792456_8792539:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8792456_8792539:PIK3R5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 13980058 A/T 1 16 16 32 7.43029489188008 8.56970510811992 -1.13941021623984 A:T A T 10 0.535606569257495 0.72535006961681 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 20 19 39 9.2878686148501 10.1765248158924 -0.888656201042302 A:G G A 10 0.535606569257495 0.872763077008478 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 15341183 A/C 1 1 7 8 0.464393430742505 3.74924598480246 -3.28485255405996 A:C A C 10 0.535606569257495 0.0288949230486104 ENSG00000239704:ENST00000520956:exon_15339332_15341517:CDRT4;ENSG00000239704:ENST00000312177:exon_15339332_15341517:CDRT4;ENSG00000239704:ENST00000395926:exon_15339338_15341520:CDRT4;ENSG00000239704:ENST00000519354:exon_15341049_15341517:CDRT4;ENSG00000239704:ENST00000395924:exon_15341090_15341517:CDRT4;ENSG00000175106:ENST00000522212:exon_15339338_15341517:FAM18B2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 2 18 20 0.92878686148501 9.64091824663491 -8.7121313851499 T:C T C 10 0.535606569257495 6.4016768141954e-05 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 16842912 A/G 1 265 259 524 123.064259146764 138.722101437691 -15.6578422909273 A:G A G 10 0.535606569257495 0.174681425223066 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 16852027 T/G 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 T:G T G 10 0.535606569257495 0.484851690384515 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 17394611 G/A 1 35 34 69 16.2537700759877 18.2106233547548 -1.95685327876715 A:G G A 10 0.535606569257495 0.717579256863573 ENSG00000141026:ENST00000268711:exon_17394593_17396535:MED9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 17696531 G/C 1 4 7 11 1.85757372297002 3.74924598480246 -1.89167226183244 C:G G C 10 0.535606569257495 0.36607342785591 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17696263_17696878:RAI1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 17696755 C/A 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 A:C C A 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17696263_17696878:RAI1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 17772723 T/C 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 T:C T C 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17772654_17772787:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17772654_17772787:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17772654_17773228:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17772654_17772787:TOM1L2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 17997209 G/A 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 76 68 144 35.2939007364304 36.4212467095097 -1.12734597307927 A:G A G 10 0.535606569257495 0.867579219421059 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 18874720 C/G 1 10 6 16 4.64393430742505 3.21363941554497 1.43029489188008 C:G C G 10 0.535606569257495 0.618142335020353 ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18872102_18875061:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000345041:exon_18874381_18875061:FAM83G HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 20911204 G/T 1 11 19 30 5.10832773816756 10.1765248158924 -5.06819707772485 T:G G T 10 0.535606569257495 0.0688988177718336 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20911183_20911309:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20911183_20911309:USP22;ENSG00000124422:ENST00000478443:exon_20911183_20911309:USP22 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 95 0 95 44.117375920538 0 44.117375920538 T T 10 0.535606569257495 2.23291467449975e-26 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 87 0 87 40.4022284745979 0 40.4022284745979 G G 10 0.535606569257495 4.32027751439996e-24 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 46 0 46 21.3620978141552 0 21.3620978141552 C C 10 0.535606569257495 3.62122243086443e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 115 0 115 53.4052445353881 0 53.4052445353881 C C 10 0.535606569257495 1.27739719343262e-31 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 80 0 80 37.1514744594004 0 37.1514744594004 C C 10 0.535606569257495 2.12720881924493e-22 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 46 1 47 21.3620978141552 0.535606569257495 20.8264912448977 C:G C G 10 0.535606569257495 1.33413350225535e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 78 0 78 36.2226875979154 0 36.2226875979154 C C 10 0.535606569257495 7.50410694755946e-22 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 86 0 86 39.9378350438554 0 39.9378350438554 G G 10 0.535606569257495 8.43905478743932e-24 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 186 0 186 86.3771781181059 0 86.3771781181059 G G 10 0.535606569257495 5.08671000807467e-51 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21318698 C/T 0 9 0 9 4.17954087668255 0 4.17954087668255 C C 10 0.535606569257495 0.00463210411669919 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21318770 G/A 0 13 0 13 6.03711459965257 0 6.03711459965257 G G 10 0.535606569257495 0.000345257675137299 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21318773 G/A 0 13 0 13 6.03711459965257 0 6.03711459965257 G G 10 0.535606569257495 0.000345257675137299 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21318821 A/C 0 16 0 16 7.43029489188008 0 7.43029489188008 A A 10 0.535606569257495 5.05498483720302e-05 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21318897 G/C 0 25 0 25 11.6098357685626 0 11.6098357685626 G G 10 0.535606569257495 3.0663332515218e-07 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21319007 G/A 0 15 0 15 6.96590146113758 0 6.96590146113758 G G 10 0.535606569257495 9.57183866225583e-05 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21319008 G/C 0 14 0 14 6.50150803039507 0 6.50150803039507 G G 10 0.535606569257495 0.000181595078137057 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21319121 C/T 0 14 0 14 6.50150803039507 0 6.50150803039507 C C 10 0.535606569257495 0.000181595078137057 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21319230 G/C 0 14 0 14 6.50150803039507 0 6.50150803039507 G G 10 0.535606569257495 0.000181595078137057 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21319251 C/T 0 13 0 13 6.03711459965257 0 6.03711459965257 C C 10 0.535606569257495 0.000345257675137299 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21319302 T/C 0 17 0 17 7.89468832262259 0 7.89468832262259 T T 10 0.535606569257495 2.67416061454608e-05 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21319473 G/A 0 36 0 36 16.7181635067302 0 16.7181635067302 G G 10 0.535606569257495 2.1646271506413e-10 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21319767 C/T 0 21 0 21 9.75226204559261 0 9.75226204559261 C C 10 0.535606569257495 2.12298574193573e-06 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21319860 C/A,T 0 19 0 19 8.8234751841076 0 8.8234751841076 C C 10 0.535606569257495 7.5167347688405e-06 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 21319943 A/G 0 23 0 23 10.6810489070776 0 10.6810489070776 A A 10 0.535606569257495 1.18001851915872e-06 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 25628820 T/C 1 28 22 50 13.0030160607901 11.7833445236649 1.21967153712525 T:C T C 10 0.535606569257495 0.777936932990307 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25628814_25628982:WSB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 26676135 C/T 1 101 102 203 46.903736504993 54.6318700642645 -7.72813355927147 T:C C T 10 0.535606569257495 0.29147961798949 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 27613677 G/A 1 20 22 42 9.2878686148501 11.7833445236649 -2.49547590881479 A:G G A 10 0.535606569257495 0.444500672029971 ENSG00000108256:ENST00000225388:exon_27613010_27614734:NUFIP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 27835138 C/T 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 T:C C T 10 0.535606569257495 0.193170376367493 ENSG00000160551:ENST00000261716:exon_27834914_27835150:TAOK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 27889578 T/C 1 9 3 12 4.17954087668255 1.60681970777248 2.57272116891006 T:C T C 10 0.535606569257495 0.158222040248362 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 27959903 G/A 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000141298:ENST00000269033:exon_27952956_27959949:SSH2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 28511978 G/A 1 115 139 254 53.4052445353881 74.4493131267918 -21.0440685914037 A:T:C:G G A 10 0.535606569257495 0.00976674623341223 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 28576076 T/C 1 52 41 93 24.1484583986103 21.9598693395573 2.18858905905297 T:C T C 10 0.535606569257495 0.678531191007298 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28575223_28576186:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28575223_28576186:BLMH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 28612448 G/C 1 28 31 59 13.0030160607901 16.6038036469823 -3.6007875861922 C:G G C 10 0.535606569257495 0.363281657808285 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28612406_28612498:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28612406_28612498:BLMH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 29553485 G/A 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 A:G G A 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000196712:ENST00000358273:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000356175:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000444181:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000495910:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000456735:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000493220:exon_29553453_29553702:NF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 29844674 C/T 1 10 4 14 4.64393430742505 2.14242627702998 2.50150803039507 T:C C T 10 0.535606569257495 0.283626359522875 ENSG00000131242:ENST00000394744:exon_29844669_29844895:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000325874:exon_29844669_29844895:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000394742:exon_29844669_29844895:RAB11FIP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 29857460 G/A 1 23 12 35 10.6810489070776 6.42727883108994 4.25377007598768 A:G G A 10 0.535606569257495 0.176022698434224 ENSG00000131242:ENST00000394744:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000325874:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000394742:exon_29857344_29857487:RAB11FIP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 30183857 T/C 1 5 15 20 2.32196715371253 8.03409853886242 -5.7121313851499 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0126060909259614 ENSG00000172301:ENST00000302362:exon_30183818_30183884:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000378634:exon_30183818_30183884:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000496655:exon_30183818_30183884:C17orf79 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 33289046 G/C 1 20 16 36 9.2878686148501 8.56970510811992 0.718163506730182 C:G G C 10 0.535606569257495 0.86832383544209 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 33592621 C/T 1 13 19 32 6.03711459965257 10.1765248158924 -4.13941021623984 T:C C T 10 0.535606569257495 0.158318922859624 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 33679616 T/C 1 20 16 36 9.2878686148501 8.56970510811992 0.718163506730182 T:C T C 10 0.535606569257495 0.86832383544209 ENSG00000172716:ENST00000308377:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000394566:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000321335:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000442678:exon_33677331_33680158:SLFN11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 33690466 C/A 1 10 21 31 4.64393430742505 11.2477379544074 -6.60380364698234 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0191879122091785 ENSG00000172716:ENST00000308377:exon_33689758_33690845:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000394566:exon_33689758_33690845:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000321335:exon_33689758_33690845:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000442678:exon_33689758_33690849:SLFN11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 33768383 T/A 1 17 11 28 7.89468832262259 5.89167226183244 2.00301606079014 A:T T A 10 0.535606569257495 0.57060730700733 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 33772550 C/T 1 23 12 35 10.6810489070776 6.42727883108994 4.25377007598768 T:C C T 10 0.535606569257495 0.176022698434224 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33772392_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33771634_33773029:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000524511:exon_33772381_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000531588:exon_33772467_33772712:SLFN13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 34416537 G/A 1 2874 1500 4374 1334.66671995396 803.409853886242 531.256866067717 A:C:G G A 10 0.535606569257495 1.55701863260594e-59 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 34432581 T/C 1 39 8 47 18.1113437989577 4.28485255405996 13.8264912448977 T:C T C 10 0.535606569257495 2.93555569238677e-05 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 34432586 A/G 1 43 7 50 19.9689175219277 3.74924598480246 16.2196715371253 A:G A G 10 0.535606569257495 2.42769132547146e-06 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 34432663 A/G 1 2197 605 2802 1020.27236734128 324.041974400784 696.230392940499 A:T:C:G A G 10 0.535606569257495 1.76830932671463e-164 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 34432664 T/A 1 2206 596 2802 1024.45190821797 319.221515277467 705.230392940499 A:T:C T A 10 0.535606569257495 4.40631281226221e-169 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 34856706 C/G 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 C:G C G 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34856670_34856799:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34856670_34856799:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34856670_34856799:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34856670_34856799:MYO19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 35346641 T/C 1 20 33 53 9.2878686148501 17.6750167854973 -8.38714817064723 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0267146939116023 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35346546_35346710:AATF HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 35771468 C/T 1 8 3 11 3.71514744594004 1.60681970777248 2.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.239570670048551 ENSG00000108264:ENST00000394395:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000490992:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000225396:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000417170:exon_35771356_35771477:TADA2A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 22 52 74 10.2166554763351 27.8515416013897 -17.6348861250546 C:G C G 10 0.535606569257495 5.48230895782976e-05 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 35937637 T/C 1 4 12 16 1.85757372297002 6.42727883108994 -4.56970510811992 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0247475125779134 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35937478_35937711:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000378189:exon_35937478_35937711:SYNRG HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 35981285 A/G 1 21 18 39 9.75226204559261 9.64091824663491 0.111343798957696 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35981172_35981322:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35981172_35981322:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35981172_35981322:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35981172_35981322:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35980918_35981565:DDX52 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 35981317 A/C 1 17 15 32 7.89468832262259 8.03409853886242 -0.139410216239837 A:C A C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35981172_35981322:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35981172_35981322:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35981172_35981322:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35981172_35981322:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35980918_35981565:DDX52 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 10 9 19 4.64393430742505 4.82045912331745 -0.176524815892404 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 16 16 32 7.43029489188008 8.56970510811992 -1.13941021623984 T:C C T 10 0.535606569257495 0.72535006961681 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 65 74 139 30.1855729982628 39.6348861250546 -9.4493131267918 A:G G A 10 0.535606569257495 0.125560953457917 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 36909061 A/G 1 239 224 463 110.990029947459 119.975871513679 -8.98584156622016 A:T:G A G 10 0.535606569257495 0.402167420248558 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909003_36909082:PSMB3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 36926731 T/G 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 36926767 G/A 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 A:G G A 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 36 27 63 16.7181635067302 14.4613773699524 2.25678613677782 A:G A G 10 0.535606569257495 0.614598338422256 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 37922259 G/A 1 21 13 34 9.75226204559261 6.96288540034743 2.78937664524517 A:G G A 10 0.535606569257495 0.391865967418225 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37913968_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37921198_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37922043_37922746:IKZF3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 38062196 G/A 1 13 3 16 6.03711459965257 1.60681970777248 4.43029489188008 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0414908822217374 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 16 3 19 7.43029489188008 1.60681970777248 5.8234751841076 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00950891844459937 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 38137364 G/A 1 192 146 338 89.163538702561 78.1985591115943 10.9649795909667 A:G G A 10 0.535606569257495 0.252113838203836 ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38137050_38137443:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38137312_38137443:PSMD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 22 15 37 10.2166554763351 8.03409853886242 2.18255693747269 A:G A G 10 0.535606569257495 0.51302671601214 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 38991003 T/C 1 28 24 52 13.0030160607901 12.8545576621799 0.148458398610263 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 24 20 44 11.1454423378201 10.7121313851499 0.433310952670222 A:T:C T A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 39912145 T/A 1 7 18 25 3.25075401519754 9.64091824663491 -6.39016423143737 A:T:G T A 10 0.535606569257495 0.0145392771583492 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39910856_39912147:JUP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 39925925 A/G 1 3 17 20 1.39318029222752 9.10531167737741 -7.7121313851499 A:G A G 10 0.535606569257495 0.000510110928222428 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000449889:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437187:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000420370:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000424457:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437369:exon_39925878_39925929:JUP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 40125864 G/A 1 29 46 75 13.4674094915326 24.6379021858448 -11.1704926943121 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0106738407124709 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 40459737 C/T 1 109 91 200 50.6188839509331 48.740197802432 1.87868614850101 T:C C T 10 0.535606569257495 0.831688583674813 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40459611_40459741:STAT5A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 31 39 70 14.3961963530177 20.8886562010423 -6.49245984802464 A:C C A 10 0.535606569257495 0.149926772555824 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 58 74 132 26.9348189830653 39.6348861250546 -12.7000671419893 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0290113397684743 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 40722029 A/G 1 55 37 92 25.5416386908378 19.8174430625273 5.72419562831046 A:G A G 10 0.535606569257495 0.251009971131705 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 13 6 19 6.03711459965257 3.21363941554497 2.8234751841076 A:G G A 10 0.535606569257495 0.251503218843434 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 17 14 31 7.89468832262259 7.49849196960493 0.396196353017657 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 40822678 C/T 1 22 23 45 10.2166554763351 12.3189510929224 -2.10229561658727 T:C C T 10 0.535606569257495 0.552806536195651 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000412503:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000445882:exon_40822591_40822723:PLEKHH3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 41131645 C/A 1 10 3 13 4.64393430742505 1.60681970777248 3.03711459965257 A:C C A 10 0.535606569257495 0.102916600745183 ENSG00000108825:ENST00000360221:exon_41131567_41131680:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000409399:exon_41131567_41131680:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000421990:exon_41131567_41131680:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000409103:exon_41131567_41131680:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000423601:exon_41131645_41131702:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000452752:exon_41131645_41131680:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000454303:exon_41131567_41131790:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000424284:exon_41131645_41131681:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000453594:exon_41131567_41131680:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000462157:exon_41131395_41132366:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000451885:exon_41131595_41131680:AARSD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 41174025 A/C 1 13 3 16 6.03711459965257 1.60681970777248 4.43029489188008 A:C A C 10 0.535606569257495 0.0414908822217374 ENSG00000108828:ENST00000355653:exon_41173953_41174459:VAT1;ENSG00000108828:ENST00000315674:exon_41173953_41174397:VAT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 T:C T C 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 41234470 A/G 1 7 9 16 3.25075401519754 4.82045912331745 -1.56970510811992 A:G A G 10 0.535606569257495 0.462079525679044 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000487825:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461574:exon_41234421_41234592:BRCA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 41244000 T/C 1 3 8 11 1.39318029222752 4.28485255405996 -2.89167226183244 T:C T C 10 0.535606569257495 0.127650256211486 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 41244435 T/C 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 T:C T C 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 41245237 A/G 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 A:G A G 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 A:G G A 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 41245471 C/T 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 41352643 C/T 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 T:C C T 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 38 35 73 17.6469503682152 18.7462299240123 -1.09927955579713 T:C:G G C 10 0.535606569257495 0.81531737864484 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 43010064 G/A 1 12 4 16 5.57272116891006 2.14242627702998 3.43029489188008 A:G G A 10 0.535606569257495 0.130383593597072 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43010041_43010141:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43010041_43010141:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000376982:exon_43010041_43010141:KIF18B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 110 91 201 51.0832773816756 48.740197802432 2.34307957924351 T:C C T 10 0.535606569257495 0.777447824431354 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 44109474 G/A 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 A:G G A 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44109413_44109665:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44109413_44109665:KIAA1267 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 45369777 A/G 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000056345:ENST00000262017:exon_45369505_45369934:ITGB3;ENSG00000056345:ENST00000435993:exon_45369505_45369934:ITGB3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 45735975 G/A 1 46 35 81 21.3620978141552 18.7462299240123 2.61586789014291 A:G G A 10 0.535606569257495 0.5794393004074 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45735874_45736026:KPNB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 45750468 T/C 1 60 53 113 27.8636058445503 28.3871481706472 -0.52354232609693 T:C T C 10 0.535606569257495 0.925172863359051 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45750384_45750531:KPNB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 45994044 C/T 1 25 11 36 11.6098357685626 5.89167226183244 5.71816350673018 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0657154399963215 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 45994094 T/C 1 33 21 54 15.3249832145027 11.2477379544074 4.07724526009527 T:C T C 10 0.535606569257495 0.278459021720363 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 45994154 G/A 1 17 26 43 7.89468832262259 13.9257708006949 -6.03108247807228 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0681644594109765 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 46002744 G/T 1 11 11 22 5.10832773816756 5.89167226183244 -0.783344523664889 T:G G T 10 0.535606569257495 0.831857301870848 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46002714_46002907:SP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 46020698 C/T 1 12 11 23 5.57272116891006 5.89167226183244 -0.318951092922384 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000108439:ENST00000225573:exon_46020672_46020796:PNPO;ENSG00000108439:ENST00000434554:exon_46020672_46020796:PNPO HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 46474118 G/T 1 23 10 33 10.6810489070776 5.35606569257495 5.32498321450267 T:G G T 10 0.535606569257495 0.0799142705876007 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46474042_46474147:SKAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 46926615 G/A 1 117 110 227 54.3340313968731 58.9167226183244 -4.58269122145135 A:G G A 10 0.535606569257495 0.5498755471824 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509415:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000505071:exon_46926614_46926631:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000502761:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46926614_46926739:CALCOCO2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 69 64 133 32.0431467212329 34.2788204324797 -2.23567371124683 A:C:G C G 10 0.535606569257495 0.728395268154573 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 47000251 C/T 1 62 45 107 28.7923927060353 24.1022956165873 4.69009708944804 T:C C T 10 0.535606569257495 0.384151603837784 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 47007963 C/T 1 88 70 158 40.8666219053404 37.4924598480246 3.3741620573158 T:C C T 10 0.535606569257495 0.632504524060122 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 47903381 C/T 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000136504:ENST00000259021:exon_47903362_47903508:MYST2;ENSG00000136504:ENST00000454930:exon_47903362_47903508:MYST2;ENSG00000136504:ENST00000509773:exon_47903362_47903508:MYST2;ENSG00000136504:ENST00000510819:exon_47903362_47903508:MYST2;ENSG00000136504:ENST00000424009:exon_47903362_47903508:MYST2;ENSG00000136504:ENST00000435742:exon_47903362_47903508:MYST2;ENSG00000136504:ENST00000513171:exon_47903362_47903508:MYST2;ENSG00000136504:ENST00000514540:exon_47903362_47903508:MYST2;ENSG00000136504:ENST00000513980:exon_47903362_47903508:MYST2;ENSG00000136504:ENST00000512616:exon_47903362_47903508:MYST2;ENSG00000136504:ENST00000509794:exon_47903362_47903508:MYST2;ENSG00000136504:ENST00000513075:exon_47903362_47903739:MYST2;ENSG00000136504:ENST00000503101:exon_47903362_47903508:MYST2;ENSG00000136504:ENST00000503635:exon_47903364_47903508:MYST2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 48356260 G/C 1 9 1 10 4.17954087668255 0.535606569257495 3.64393430742505 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0246360115647308 ENSG00000167105:ENST00000300433:exon_48356162_48356357:TMEM92;ENSG00000167105:ENST00000507382:exon_48356162_48356357:TMEM92;ENSG00000167105:ENST00000511882:exon_48356162_48356477:TMEM92 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 48431032 G/A 1 6 10 16 2.78636058445503 5.35606569257495 -2.56970510811992 A:G G A 10 0.535606569257495 0.218581872606213 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000509778:exon_48430991_48431035:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 48431197 C/T 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 T:C C T 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 48432324 G/C 1 4 7 11 1.85757372297002 3.74924598480246 -1.89167226183244 C:G G C 10 0.535606569257495 0.36607342785591 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48432215_48432417:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48432215_48432417:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48432215_48432417:XYLT2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 48433958 T/C 1 10 9 19 4.64393430742505 4.82045912331745 -0.176524815892404 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48433872_48434134:XYLT2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 48452776 A/C 1 8 9 17 3.71514744594004 4.82045912331745 -1.10531167737741 A:C A C 10 0.535606569257495 0.633230727718346 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48452546_48453344:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48452546_48453344:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511711:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48452546_48453344:EME1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 48455985 A/T 1 6 7 13 2.78636058445503 3.74924598480246 -0.962885400347434 A:T A T 10 0.535606569257495 0.782351862796383 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48455956_48456042:EME1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 48456193 T/C 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 T:C T C 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 48539903 A/C 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 A:C A C 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48539781_48539946:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48539781_48539946:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48539781_48539946:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48539781_48539946:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539781_48539946:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506052:exon_48539781_48540402:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000513101:exon_48539897_48539946:ACSF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 55028170 C/T 1 37 28 65 17.1825569374727 14.9969839392099 2.18557299826283 T:C C T 10 0.535606569257495 0.620539567902111 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 60072704 G/T 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 T:G G T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000108510:ENST00000262436:exon_60072513_60072726:MED13;ENSG00000108510:ENST00000397786:exon_60072513_60072726:MED13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 62479069 A/C 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 A:C A C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62479036_62479116:POLG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 62492582 C/T 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 T:C C T 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62492525_62493169:POLG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 62528179 A/G 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 A:G A G 10 0.535606569257495 0.795995898872401 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 63149586 G/A 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 A:G G A 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000108370:ENST00000262406:exon_63149540_63149636:RGS9;ENSG00000108370:ENST00000449996:exon_63149540_63149636:RGS9;ENSG00000108370:ENST00000443584:exon_63149540_63149636:RGS9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 154 155 309 71.5165883343458 83.0190182349117 -11.5024299005659 A:C:G A G 10 0.535606569257495 0.190184177251119 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 94 97 191 43.6529824897955 51.953837217977 -8.30085472818153 A:T T A 10 0.535606569257495 0.245862140814430 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 66267691 A/T 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 A:T A T 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000108932:ENST00000327268:exon_66266980_66267795:SLC16A6;ENSG00000108932:ENST00000344066:exon_66267095_66267795:SLC16A6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 67108362 C/G 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000154262:ENST00000284425:exon_67108324_67108414:ABCA6;ENSG00000154262:ENST00000446604:exon_67108324_67108414:ABCA6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 67109833 T/A 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 A:T T A 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000154262:ENST00000284425:exon_67109759_67109878:ABCA6;ENSG00000154262:ENST00000446604:exon_67109759_67109878:ABCA6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 71192663 G/A 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 A:G G A 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71192646_71192890:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71192646_71192890:COG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 71196809 A/G 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 A:G A G 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196705_71196915:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196705_71196915:COG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 27 31 58 12.5386226300476 16.6038036469823 -4.06518101693471 A:G G A 10 0.535606569257495 0.295034338383500 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 71232687 T/C 1 13 11 24 6.03711459965257 5.89167226183244 0.145442337820121 T:C:G T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 71232807 T/C 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 20 9 29 9.2878686148501 4.82045912331745 4.46740949153265 C:G G C 10 0.535606569257495 0.135055713773349 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 71233130 A/G 1 8 1 9 3.71514744594004 0.535606569257495 3.17954087668255 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0433666493567438 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 72436370 G/A 1 18 29 47 8.35908175336509 15.5325905084674 -7.17350875510226 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0404733089349167 ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72435884_72436966:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72435884_72436966:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000420926:exon_72435884_72436966:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000392629:exon_72435884_72436966:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000392628:exon_72435884_72436966:GPRC5C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 72758210 C/T 1 21 28 49 9.75226204559261 14.9969839392099 -5.24472189361725 T:C C T 10 0.535606569257495 0.15234240406947 ENSG00000109062:ENST00000262613:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1;ENSG00000109062:ENST00000413388:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 72769739 A/G 1 9 9 18 4.17954087668255 4.82045912331745 -0.640918246634909 A:G A G 10 0.535606569257495 0.816090164780621 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72769715_72769827:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72769715_72769824:NAT9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 72771766 C/G 1 7 10 17 3.25075401519754 5.35606569257495 -2.10531167737741 C:G C G 10 0.535606569257495 0.338652205084508 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72771761_72771846:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72771761_72771846:NAT9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 72771825 G/T 1 8 5 13 3.71514744594004 2.67803284628747 1.03711459965257 T:G G T 10 0.535606569257495 0.593641770478394 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72771761_72771846:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72771761_72771846:NAT9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 72815981 C/T 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000109066:ENST00000335464:exon_72815889_72815982:TMEM104;ENSG00000109066:ENST00000417024:exon_72815889_72815982:TMEM104 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 73127110 A/T 0 14 0 14 6.50150803039507 0 6.50150803039507 A A 10 0.535606569257495 0.000181595078137057 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 0 11 0 11 5.10832773816756 0 5.10832773816756 G G 10 0.535606569257495 0.00125729441466232 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 73127683 T/C 1 36 37 73 16.7181635067302 19.8174430625273 -3.09927955579713 T:C T C 10 0.535606569257495 0.483309384932854 ENSG00000125458:ENST00000245552:exon_73127629_73127877:NT5C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 73221439 C/T 1 23 21 44 10.6810489070776 11.2477379544074 -0.566689047329778 T:C C T 10 0.535606569257495 0.880932867784594 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73221437_73221559:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000449421:exon_73221437_73221559:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73221437_73221559:NUP85 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 73230796 T/C 1 23 18 41 10.6810489070776 9.64091824663491 1.04013066044271 T:C T C 10 0.535606569257495 0.757405555420661 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 73236124 A/G 1 18 18 36 8.35908175336509 9.64091824663491 -1.28183649326982 A:G A G 10 0.535606569257495 0.739235820904023 ENSG00000125447:ENST00000245541:exon_73235870_73236189:GGA3;ENSG00000125447:ENST00000351904:exon_73235870_73236189:GGA3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 73257986 C/T 1 29 52 81 13.4674094915326 27.8515416013897 -14.3841321098571 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00165940597845019 ENSG00000125445:ENST00000245539:exon_73257749_73258064:MRPS7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 73263012 C/T 1 43 58 101 19.9689175219277 31.0651810169347 -11.096263495007 A:T:C C T 10 0.535606569257495 0.0282549067077679 ENSG00000125457:ENST00000245551:exon_73262313_73263048:MIF4GD;ENSG00000125457:ENST00000325102:exon_73263000_73263035:MIF4GD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 73269676 C/T 1 16 22 38 7.43029489188008 11.7833445236649 -4.35304963178481 T:C C T 10 0.535606569257495 0.192957172333194 ENSG00000125454:ENST00000375261:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73269062_73269720:SLC25A19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 73279624 A/G 1 11 22 33 5.10832773816756 11.7833445236649 -6.67501678549733 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0228439093383 ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73279504_73279674:SLC25A19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 73488794 C/T 1 9 16 25 4.17954087668255 8.56970510811992 -4.39016423143737 T:C C T 10 0.535606569257495 0.107119974760568 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 74261677 T/C 1 135 98 233 62.6931131502382 52.4894437872345 10.2036693630037 T:C T C 10 0.535606569257495 0.189240244732344 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74261283_74261706:FAM100B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 26 30 56 12.0742291993051 16.0681970777248 -3.99396787841972 T:C T C 10 0.535606569257495 0.287743002275495 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 14 19 33 6.50150803039507 10.1765248158924 -3.67501678549733 T:C C T 10 0.535606569257495 0.223916512924208 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 76993546 A/G 1 17 15 32 7.89468832262259 8.03409853886242 -0.139410216239837 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76993074_76994045:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76993074_76993726:CANT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 77081788 G/A 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77081702_77081816:ENGASE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 T:C C T 10 0.535606569257495 0.193170376367493 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 78264445 C/T 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 T:C C T 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78264369_78264527:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78264369_78264527:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78264369_78264527:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78264369_78264527:RNF213 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 78319136 G/A 1 2 7 9 0.92878686148501 3.74924598480246 -2.82045912331745 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0914723743517246 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 78319380 G/C 1 5 10 15 2.32196715371253 5.35606569257495 -3.03409853886242 T:C:G G C 10 0.535606569257495 0.128072258736022 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 78327358 G/A 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78327312_78327466:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78327312_78327466:RNF213;ENSG00000234591:ENST00000434136:exon_78327100_78327744:AC124319.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 78354661 C/T 1 7 12 19 3.25075401519754 6.42727883108994 -3.1765248158924 T:C C T 10 0.535606569257495 0.170258554353078 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78354631_78354787:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78354631_78354787:RNF213 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 79478019 G/A 1 4119 3782 7901 1912.83654122838 2025.66404493185 -112.827503703468 A:T:C:G G A 10 0.535606569257495 0.0111536431780276 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 79478870 C/A 1 12 6 18 5.57272116891006 3.21363941554497 2.35908175336509 A:C C A 10 0.535606569257495 0.346395564026953 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 79478871 C/T 1 12 6 18 5.57272116891006 3.21363941554497 2.35908175336509 T:C C T 10 0.535606569257495 0.346395564026953 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 79478916 G/T 0 10 0 10 4.64393430742505 0 4.64393430742505 G G 10 0.535606569257495 0.00240944773358457 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 79571637 C/G 1 19 12 31 8.8234751841076 6.42727883108994 2.39619635301766 C:G C G 10 0.535606569257495 0.472483748496831 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79571574_79571753:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79571574_79571753:NPLOC4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 489 483 972 227.088387633085 258.69797295137 -31.6095853182851 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0427922329593118 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 79803433 G/A 1 7 2 9 3.25075401519754 1.07121313851499 2.17954087668255 A:T:G G A 10 0.535606569257495 0.189646242107253 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 79805134 G/A 1 356 328 684 165.324061344332 175.678954716458 -10.3548933721266 A:G G A 10 0.535606569257495 0.443320300929881 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79805119_79805203:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79805119_79805206:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000478034:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000472244:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000484286:exon_79805119_79805724:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000477607:exon_79805119_79805223:P4HB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 79845968 C/T 1 49 43 92 22.7552781063827 23.0310824780723 -0.275804371689535 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000183684:ENST00000505490:exon_79845717_79846021:THOC4;ENSG00000183684:ENST00000331204:exon_79845721_79846021:THOC4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 79980756 C/A 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:C C A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000169689:ENST00000306704:exon_79980702_79980794:STRA13;ENSG00000169689:ENST00000392359:exon_79980702_79980794:STRA13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 80017902 C/T 1 40 45 85 18.5757372297002 24.1022956165873 -5.52655838688707 T:C C T 10 0.535606569257495 0.233711672020664 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80017824_80017969:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80017824_80017969:DUS1L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 80020812 C/T 1 31 50 81 14.3961963530177 26.7803284628747 -12.3841321098571 A:T:C C T 10 0.535606569257495 0.00716410269345372 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80020737_80020849:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80020737_80020820:DUS1L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 80684432 A/G 1 21 9 30 9.75226204559261 4.82045912331745 4.93180292227515 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0979585450853748 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80684356_80684478:FN3KRP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 31 18 49 14.3961963530177 9.64091824663491 4.75527810638275 T:C T C 10 0.535606569257495 0.198147525873058 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 693828 A/C 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 A:C A C 10 0.535606569257495 0.484851690384515 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 2595443 G/T 1 14 21 35 6.50150803039507 11.2477379544074 -4.74622992401232 T:G G T 10 0.535606569257495 0.127327106092558 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2595415_2595620:NDC80 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 2705700 A/G 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 A:G A G 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2705692_2705805:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2705692_2705805:SMCHD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 2707619 G/A 1 6 12 18 2.78636058445503 6.42727883108994 -3.64091824663491 A:G G A 10 0.535606569257495 0.100181682544637 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2707561_2707643:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2707561_2707643:SMCHD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 2750477 A/G 1 10 11 21 4.64393430742505 5.89167226183244 -1.24773795440739 A:G A G 10 0.535606569257495 0.66418868541406 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2750348_2750505:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2750348_2750505:SMCHD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 2885118 C/T 1 1 8 9 0.464393430742505 4.28485255405996 -3.82045912331745 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0150595260113486 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2884962_2885137:EMILIN2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 2891478 T/C 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 T:C T C 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2890559_2892484:EMILIN2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 2891847 C/T 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 T:C C T 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2890559_2892484:EMILIN2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 3596818 T/A 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 A:T T A 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000177337:ENST00000317114:exon_3596577_3598350:AP002478.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 5292030 A/G 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000198081:ENST00000357006:exon_5289018_5292203:ZFP161;ENSG00000198081:ENST00000400143:exon_5289019_5292203:ZFP161 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 9117867 T/C 1 60 34 94 27.8636058445503 18.2106233547548 9.65298248979547 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0494185332047016 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9117385_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9117836_9117901:NDUFV2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 9254857 C/G 1 49 36 85 22.7552781063827 19.2818364932698 3.47344161311293 C:G C G 10 0.535606569257495 0.514379962435942 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000359158:exon_9254209_9255428:ANKRD12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 50 66 116 23.2196715371253 35.3500335709947 -12.1303620338694 A:G A G 10 0.535606569257495 0.025450176609617 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 9257791 T/C 1 17 16 33 7.89468832262259 8.56970510811992 -0.675016785497333 T:C T C 10 0.535606569257495 0.862481166268759 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 12308273 G/T 1 49 41 90 22.7552781063827 21.9598693395573 0.795408766825453 T:G G T 10 0.535606569257495 0.916021794823421 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12308070_12308348:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12308257_12308348:TUBB6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 12308793 G/C 1 76 69 145 35.2939007364304 36.9568532787671 -1.66295254233676 C:G G C 10 0.535606569257495 0.803110662376444 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12308686_12308794:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12308686_12308794:TUBB6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 93 82 175 43.188589059053 43.9197386791146 -0.731149620061615 C:G C G 10 0.535606569257495 0.939655594968072 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 29 24 53 13.4674094915326 12.8545576621799 0.612851829352767 T:C T C 10 0.535606569257495 0.891363813446225 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 34 36 70 15.7893766452452 19.2818364932698 -3.49245984802465 T:C C T 10 0.535606569257495 0.404844912414508 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 44 29 73 20.4333109526702 15.5325905084674 4.90072044420287 A:C C A 10 0.535606569257495 0.291074644486974 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 13056333 C/T 1 14 10 24 6.50150803039507 5.35606569257495 1.14544233782012 T:C C T 10 0.535606569257495 0.686918776217185 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13055779_13056697:CEP192 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 13068132 T/C 1 12 7 19 5.57272116891006 3.74924598480246 1.8234751841076 T:C T C 10 0.535606569257495 0.493225271714711 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13068093_13068236:CEP192 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 13069782 C/T 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 T:C C T 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000507254:exon_13069749_13069855:CEP192 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 13095609 T/C 1 3 8 11 1.39318029222752 4.28485255405996 -2.89167226183244 T:C T C 10 0.535606569257495 0.127650256211486 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13095502_13095680:CEP192 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:G G T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 21739725 T/C 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 T:C T C 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000154040:ENST00000399496:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399478:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000463087:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000486759:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000327201:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399499:exon_21739436_21740033:CABYR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 23873463 T/C 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23873390_23873495:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23873390_23873495:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23873390_23873495:TAF4B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 24035675 T/C 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 T:C T C 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000134504:ENST00000317932:exon_24034874_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000417602:exon_24034877_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000408011:exon_24034877_24035865:KCTD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 28649042 T/C 1 11 16 27 5.10832773816756 8.56970510811992 -3.46137736995236 T:C T C 10 0.535606569257495 0.246551169931367 ENSG00000134755:ENST00000251081:exon_28648860_28649117:DSC2;ENSG00000134755:ENST00000438199:exon_28648860_28649117:DSC2;ENSG00000134755:ENST00000280904:exon_28648860_28649117:DSC2;ENSG00000134755:ENST00000399347:exon_28648860_28649117:DSC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 32834186 T/G 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000186814:ENST00000333206:exon_32832819_32834345:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000420878:exon_32833423_32834187:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000360932:exon_32833423_32834285:ZSCAN30 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 26 18 44 12.0742291993051 9.64091824663491 2.43331095267022 T:C T C 10 0.535606569257495 0.546140908607352 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 34324091 G/A 1 20 13 33 9.2878686148501 6.96288540034743 2.32498321450267 A:G G A 10 0.535606569257495 0.486822164537258 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34323995_34324156:FHOD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 43565380 A/G 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 A:G A G 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 43565399 C/A 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 A:C C A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 43568717 T/C 1 3 8 11 1.39318029222752 4.28485255405996 -2.89167226183244 T:C T C 10 0.535606569257495 0.127650256211486 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43568668_43568725:PSTPIP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 43678225 T/C 1 127 139 266 58.9779657042981 74.4493131267918 -15.4713474224937 T:C T C 10 0.535606569257495 0.064965691680167 ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43678138_43678245:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43678138_43678319:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43678138_43678261:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000484856:exon_43678138_43678245:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000475026:exon_43678138_43678239:ATP5A1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 46284587 T/C 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 T:C T C 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000134030:ENST00000256413:exon_46284290_46284776:KIAA0427;ENSG00000134030:ENST00000382998:exon_46284290_46284782:KIAA0427;ENSG00000134030:ENST00000435190:exon_46284290_46284776:KIAA0427;ENSG00000134030:ENST00000420275:exon_46284290_46284776:KIAA0427 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 46447817 G/C 1 11 8 19 5.10832773816756 4.28485255405996 0.823475184107596 C:G G C 10 0.535606569257495 0.819697348092054 ENSG00000101665:ENST00000262158:exon_46446223_46448280:SMAD7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 46448129 G/A 1 14 16 30 6.50150803039507 8.56970510811992 -2.06819707772485 A:G G A 10 0.535606569257495 0.46942883980578 ENSG00000101665:ENST00000262158:exon_46446223_46448280:SMAD7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 47017820 A/G 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 A:G A G 10 0.535606569257495 0.193170376367493 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 47318626 T/C 1 17 27 44 7.89468832262259 14.4613773699524 -6.56668904732978 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0502453246914004 ENSG00000167315:ENST00000285093:exon_47318522_47318697:ACAA2;ENSG00000167315:ENST00000398549:exon_47318522_47318697:ACAA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 55247336 C/A 1 7 15 22 3.25075401519754 8.03409853886242 -4.78334452366489 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0529765719617484 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55247305_55247431:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55247287_55247431:FECH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 55268866 C/T 1 117 101 218 54.3340313968731 54.096263495007 0.237767901866107 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 55862847 G/A 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 A:G G A 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000049759:ENST00000456173:exon_55862637_55862965:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000256832:exon_55862724_55862965:NEDD4L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 A:C C A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56202982 A/T 1 10 4 14 4.64393430742505 2.14242627702998 2.50150803039507 A:T A T 10 0.535606569257495 0.283626359522875 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56203074 G/A 1 12 9 21 5.57272116891006 4.82045912331745 0.752262045592606 A:G G A 10 0.535606569257495 0.828765731707361 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56203120 C/T 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 T:C C T 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 19 10 29 8.8234751841076 5.35606569257495 3.46740949153265 C:G G C 10 0.535606569257495 0.263770590080562 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 17 6 23 7.89468832262259 3.21363941554497 4.68104890707762 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0597251465228825 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 17 9 26 7.89468832262259 4.82045912331745 3.07422919930513 T:G G T 10 0.535606569257495 0.244740828501064 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 7 9 16 3.25075401519754 4.82045912331745 -1.56970510811992 T:G T G 10 0.535606569257495 0.462079525679044 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 14 3 17 6.50150803039507 1.60681970777248 4.89468832262259 A:C A C 10 0.535606569257495 0.0256442537609362 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56204489 C/G 1 12 12 24 5.57272116891006 6.42727883108994 -0.854557662179879 C:G C G 10 0.535606569257495 0.838559306298216 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56204671 A/T 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 A:T A T 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56204747 G/A 1 18 3 21 8.35908175336509 1.60681970777248 6.75226204559261 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0034181698094201 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 1 14 3 17 6.50150803039507 1.60681970777248 4.89468832262259 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0256442537609362 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 1 17 3 20 7.89468832262259 1.60681970777248 6.2878686148501 C:G C G 10 0.535606569257495 0.00572013483129375 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56204977 C/T 1 19 2 21 8.8234751841076 1.07121313851499 7.75226204559261 T:C C T 10 0.535606569257495 0.000595042113509295 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56204991 C/T 1 20 3 23 9.2878686148501 1.60681970777248 7.68104890707762 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00120070534962865 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56205262 A/C 1 11 8 19 5.10832773816756 4.28485255405996 0.823475184107596 A:C A C 10 0.535606569257495 0.819697348092054 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 56205481 G/A 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 A:G G A 10 0.535606569257495 0.467834070566303 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 59814268 G/A 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 A:G G A 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000197563:ENST00000400334:exon_59814204_59814334:PIGN;ENSG00000197563:ENST00000357637:exon_59814204_59814334:PIGN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 60241732 C/T 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 T:C C T 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 60242740 T/C 1 13 14 27 6.03711459965257 7.49849196960493 -1.46137736995236 T:C T C 10 0.535606569257495 0.700365719696074 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 61582751 T/G 1 8 9 17 3.71514744594004 4.82045912331745 -1.10531167737741 T:G T G 10 0.535606569257495 0.633230727718346 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 61585260 T/C 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61585199_61585336:SERPINB10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 61587053 G/A 1 11 5 16 5.10832773816756 2.67803284628747 2.43029489188008 A:G G A 10 0.535606569257495 0.316760693759888 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 61602495 C/T 1 10 12 22 4.64393430742505 6.42727883108994 -1.78334452366489 T:C C T 10 0.535606569257495 0.523642698847636 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61602072_61603345:SERPINB10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 53 44 97 24.6128518293528 23.5666890473298 1.04616278202299 T:C T C 10 0.535606569257495 0.839588163629605 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 71920855 G/A 1 119 104 223 55.2628182583581 55.7030832027795 -0.440264944421372 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71920531_71920900:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71920628_71920900:CYB5A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 72998004 T/C 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 72998211 C/G 1 12 7 19 5.57272116891006 3.74924598480246 1.8234751841076 C:G C G 10 0.535606569257495 0.493225271714711 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 72998268 T/C 1 9 9 18 4.17954087668255 4.82045912331745 -0.640918246634909 T:C T C 10 0.535606569257495 0.816090164780621 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 72998886 T/C 1 9 10 19 4.17954087668255 5.35606569257495 -1.1765248158924 T:C T C 10 0.535606569257495 0.649555257001445 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 72999359 T/C 1 11 12 23 5.10832773816756 6.42727883108994 -1.31895109292238 T:C T C 10 0.535606569257495 0.677398717546528 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 77067000 T/G 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000166377:ENST00000426216:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000359184:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000440332:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000307671:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000490210:exon_77066986_77067234:ATP9B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 77211764 T/C 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77211676_77211816:NFATC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 77246406 T/G 1 11 9 20 5.10832773816756 4.82045912331745 0.287868614850101 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 18 77246444 C/T 1 10 14 24 4.64393430742505 7.49849196960493 -2.85455766217988 T:C C T 10 0.535606569257495 0.306768141328979 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 412 365 777 191.330093465912 195.496397778986 -4.16630431307357 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.773626392179209 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 617614 G/A 1 47 44 91 21.8264912448977 23.5666890473298 -1.74019780243204 A:G G A 10 0.535606569257495 0.753006795671035 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_617570_617655:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_617570_617655:POLRMT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 621063 A/G 1 10 8 18 4.64393430742505 4.28485255405996 0.359081753365091 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 621070 G/A 1 6 9 15 2.78636058445503 4.82045912331745 -2.03409853886242 A:G G A 10 0.535606569257495 0.312839743181367 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 629846 G/A 1 29 25 54 13.4674094915326 13.3901642314374 0.0772452600952711 A:T:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_629540_630168:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_629540_630168:POLRMT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 804396 C/T 1 178 155 333 82.6620306721659 83.0190182349117 -0.356987562745815 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 804642 C/T 1 158 150 308 73.3741620573158 80.3409853886242 -6.96682333130845 T:C C T 10 0.535606569257495 0.45775869738453 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 808586 C/G 1 157 147 304 72.9097686265733 78.7341656808518 -5.82439705427846 A:C:G C G 10 0.535606569257495 0.527183908569313 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 808742 G/T 1 199 190 389 92.4142927177585 101.765248158924 -9.35095544116554 T:G G T 10 0.535606569257495 0.360265498764621 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 880066 G/A 1 8 9 17 3.71514744594004 4.82045912331745 -1.10531167737741 A:G G A 10 0.535606569257495 0.633230727718346 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 36 41 77 16.7181635067302 21.9598693395573 -5.24170583282711 A:G A G 10 0.535606569257495 0.253782139190819 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 886001 G/C 1 24 26 50 11.1454423378201 13.9257708006949 -2.78032846287475 C:G G C 10 0.535606569257495 0.479382031695544 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 929753 A/G 1 55 45 100 25.5416386908378 24.1022956165873 1.43934307425051 A:G A G 10 0.535606569257495 0.841235934078882 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 43 43 86 19.9689175219277 23.0310824780723 -3.06216495614456 T:C C T 10 0.535606569257495 0.518414238068116 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 990281 G/A 1 18 13 31 8.35908175336509 6.96288540034743 1.39619635301766 A:G G A 10 0.535606569257495 0.719730647046148 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_990223_990364:WDR18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1036444 G/A 1 108 122 230 50.1544905201905 65.3440014494144 -15.1895109292238 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0473097184021402 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1050996 G/A 1 1 8 9 0.464393430742505 4.28485255405996 -3.82045912331745 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0150595260113486 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1050920_1051051:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1050920_1051051:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1050920_1051051:ABCA7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1065044 C/T 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000524383:exon_1064930_1065170:ABCA7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 27 16 43 12.5386226300476 8.56970510811992 3.96891752192772 T:C T C 10 0.535606569257495 0.284459330159204 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 27 15 42 12.5386226300476 8.03409853886242 4.50452409118521 A:G G A 10 0.535606569257495 0.215393507170077 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 40 53 93 18.5757372297002 28.3871481706472 -9.81141094094703 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.0478433125209592 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1095352 C/G 1 24 15 39 11.1454423378201 8.03409853886242 3.1113437989577 C:G C G 10 0.535606569257495 0.339755497812456 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1095355 C/T 1 20 6 26 9.2878686148501 3.21363941554497 6.07422919930513 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0179596952277292 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1110829 G/A 1 17 20 37 7.89468832262259 10.7121313851499 -2.81744306252731 A:G G A 10 0.535606569257495 0.410845427536736 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1110711_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1110744_1110887:SBNO2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1119019 C/T 1 12 15 27 5.57272116891006 8.03409853886242 -2.46137736995236 T:C C T 10 0.535606569257495 0.440874576584086 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1119010_1119163:SBNO2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1127615 G/C 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 C:G G C 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1127603_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1127603_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1127523_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1127603_1127764:SBNO2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1127720 G/A 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1127603_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1127603_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1127523_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1127603_1127764:SBNO2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 28 18 46 13.0030160607901 9.64091824663491 3.36209781415523 T:C C T 10 0.535606569257495 0.375884253069819 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1278861 C/T 1 107 110 217 49.690097089448 58.9167226183244 -9.2266255288764 T:C C T 10 0.535606569257495 0.220750613769862 ENSG00000228300:ENST00000409293:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000492647:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000513897:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000518332:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000530634:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000469144:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000485191:exon_1278776_1279221:C19orf24;ENSG00000226593:ENST00000416408:exon_1278776_1279242:AC004258.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1360575 G/A 1 17 17 34 7.89468832262259 9.10531167737741 -1.21062335475483 A:G G A 10 0.535606569257495 0.732486001530963 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1370675 C/G 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 C:G C G 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1370641_1371077:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1370641_1371077:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1370641_1371077:MUM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1912817 C/T 1 10 6 16 4.64393430742505 3.21363941554497 1.43029489188008 T:C C T 10 0.535606569257495 0.618142335020353 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1912986 C/T 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 T:C C T 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 66 63 129 30.6499664290053 33.7432138632222 -3.09324743421685 A:G A G 10 0.535606569257495 0.597344756924796 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 69 54 123 32.0431467212329 28.9227547399047 3.12039198132813 A:G G A 10 0.535606569257495 0.588763504308696 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 37 38 75 17.1825569374727 20.3530496317848 -3.17049269431212 A:G A G 10 0.535606569257495 0.48860372683458 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 2099250 G/A 1 21 10 31 9.75226204559261 5.35606569257495 4.39619635301766 A:C:G G A 10 0.535606569257495 0.148891051636974 ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 2252712 A/C 1 15 32 47 6.96590146113758 17.1394102162398 -10.1735087551023 A:C A C 10 0.535606569257495 0.00322030185987079 ENSG00000167476:ENST00000300961:exon_2252252_2252795:JSRP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 19 8 27 8.8234751841076 4.28485255405996 4.53862263004764 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0854897429602086 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 2917287 C/A 1 10 9 19 4.64393430742505 4.82045912331745 -0.176524815892404 A:C C A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 2994921 G/A 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 45 47 92 20.8977043834127 25.1735087551023 -4.27580437168954 A:G G A 10 0.535606569257495 0.403574129357873 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 3179828 C/T 1 48 43 91 22.2908846756402 23.0310824780723 -0.740197802432039 T:C C T 10 0.535606569257495 0.916467054461231 ENSG00000125910:ENST00000246115:exon_3178766_3180329:S1PR4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 3186085 G/T 1 9 10 19 4.17954087668255 5.35606569257495 -1.1765248158924 T:G G T 10 0.535606569257495 0.649555257001445 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3185875_3186212:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3185875_3186212:NCLN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 3198817 G/A 1 19 9 28 8.8234751841076 4.82045912331745 4.00301606079014 A:G G A 10 0.535606569257495 0.183775055330621 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3198815_3198895:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3198815_3198895:NCLN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 48 22 70 22.2908846756402 11.7833445236649 10.5075401519754 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0118093608731181 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 74 40 114 34.3651138749454 21.4242627702998 12.9408511046456 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0185065404479064 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 3542983 C/T 1 4 8 12 1.85757372297002 4.28485255405996 -2.42727883108994 T:C C T 10 0.535606569257495 0.246342614793183 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 3548231 A/G 1 34 19 53 15.7893766452452 10.1765248158924 5.61285182935277 A:G A G 10 0.535606569257495 0.131318986089184 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3548121_3548265:C19orf28 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 3573792 G/A 0 106 0 106 49.2257036587055 0 49.2257036587055 G G 10 0.535606569257495 1.95856546542277e-29 ENSG00000064961:ENST00000416526:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000470356:exon_3573690_3574267:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000333651:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000417382:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000453933:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000435022:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000402569:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000262949:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000488973:exon_3573690_3574584:HMG20B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 3752563 G/A 1 21 15 36 9.75226204559261 8.03409853886242 1.71816350673018 A:G G A 10 0.535606569257495 0.618724336355263 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752506_3752718:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752506_3752718:APBA3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 3753769 C/T 1 29 29 58 13.4674094915326 15.5325905084674 -2.06518101693471 T:C C T 10 0.535606569257495 0.600904414776436 ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3753763_3753924:APBA3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 4 8 12 1.85757372297002 4.28485255405996 -2.42727883108994 A:G G A 10 0.535606569257495 0.246342614793183 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 4352959 A/G 1 14 10 24 6.50150803039507 5.35606569257495 1.14544233782012 A:G A G 10 0.535606569257495 0.686918776217185 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 21 29 50 9.75226204559261 15.5325905084674 -5.78032846287475 C:G G C 10 0.535606569257495 0.118633742692167 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 4792049 G/A 1 8 16 24 3.71514744594004 8.56970510811992 -4.85455766217988 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0637114810029004 ENSG00000141965:ENST00000269856:exon_4791728_4795571:FEM1A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 48 37 85 22.2908846756402 19.8174430625273 2.47344161311293 A:G G A 10 0.535606569257495 0.663864338128537 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 4818133 G/T 1 21 31 52 9.75226204559261 16.6038036469823 -6.85154160138974 T:G G T 10 0.535606569257495 0.0699123593584925 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 49 49 98 22.7552781063827 26.2447218936173 -3.48944378723451 T:C T C 10 0.535606569257495 0.480638083348412 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 5041178 T/C 1 5 12 17 2.32196715371253 6.42727883108994 -4.10531167737741 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0530860535659699 ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5041148_5041262:KDM4B;ENSG00000127663:ENST00000381759:exon_5041148_5041262:KDM4B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 5210782 G/A 1 12 3 15 5.57272116891006 1.60681970777248 3.96590146113758 A:G G A 10 0.535606569257495 0.066321047069073 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5210690_5210816:PTPRS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 5212002 C/T 1 16 2 18 7.43029489188008 1.07121313851499 6.35908175336509 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00322275981857776 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5211976_5212261:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5211976_5212261:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5211976_5212261:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5211976_5212261:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5211976_5212261:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5211976_5212261:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5211976_5212261:PTPRS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 5212380 C/T 1 11 3 14 5.10832773816756 1.60681970777248 3.50150803039507 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0660918331472145 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5212348_5212502:PTPRS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 5212482 G/A 1 10 4 14 4.64393430742505 2.14242627702998 2.50150803039507 A:G G A 10 0.535606569257495 0.283626359522875 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5212348_5212502:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5212348_5212502:PTPRS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 5789609 C/A 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:C C A 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 15 13 28 6.96590146113758 6.96288540034743 0.00301606079014149 T:G G T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 6535080 T/C 1 119 141 260 55.2628182583581 75.5205262653068 -20.2577080069487 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0127856816880130 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 965 837 1802 448.139660666517 448.302698468523 -0.163037802005874 A:T:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 6669934 G/A 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000125735:ENST00000245912:exon_6669862_6670169:TNFSF14 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 6731057 T/C 1 20 25 45 9.2878686148501 13.3901642314374 -4.10229561658727 T:C T C 10 0.535606569257495 0.234462863045820 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 6735929 C/T 1 4 8 12 1.85757372297002 4.28485255405996 -2.42727883108994 T:C C T 10 0.535606569257495 0.246342614793183 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6735919_6735969:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6735919_6735969:GPR108 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 7528734 A/G 1 10 14 24 4.64393430742505 7.49849196960493 -2.85455766217988 A:G A G 10 0.535606569257495 0.306768141328979 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7528704_7528841:ARHGEF18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 7533767 T/G 1 13 6 19 6.03711459965257 3.21363941554497 2.8234751841076 T:G T G 10 0.535606569257495 0.251503218843434 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 7533850 A/G 1 9 12 21 4.17954087668255 6.42727883108994 -2.24773795440739 A:G A G 10 0.535606569257495 0.384311420828178 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 7605566 C/T 1 28 32 60 13.0030160607901 17.1394102162398 -4.1363941554497 T:C C T 10 0.535606569257495 0.302289679494145 ENSG00000032444:ENST00000221249:exon_7605516_7605596:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000414982:exon_7605516_7605596:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000450331:exon_7605516_7605596:PNPLA6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 7685843 G/A 1 40 46 86 18.5757372297002 24.6379021858448 -6.06216495614456 A:G G A 10 0.535606569257495 0.196088170647913 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7685732_7685922:XAB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 7687428 G/A 1 73 40 113 33.9007204442029 21.4242627702998 12.4764576739031 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0184929181641860 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7687416_7687547:XAB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 63 43 106 29.2567861367778 23.0310824780723 6.22570365870554 T:C T C 10 0.535606569257495 0.243231805013656 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 7763703 A/G 1 69 110 179 32.0431467212329 58.9167226183244 -26.8735758970916 A:C:G A G 10 0.535606569257495 6.43790457437597e-05 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763627_7763740:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763627_7763740:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763627_7763740:FCER2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 7986638 C/G 1 29 18 47 13.4674094915326 9.64091824663491 3.82649124489774 C:G C G 10 0.535606569257495 0.306762156095718 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7986590_7986658:SNAPC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 8326866 C/T 1 43 36 79 19.9689175219277 19.2818364932698 0.6870810286579 T:C C T 10 0.535606569257495 0.910559392464674 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 48 48 96 22.2908846756402 25.7091153243598 -3.41823064871951 A:C:G G A 10 0.535606569257495 0.539499505303451 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 8326944 G/A 1 49 44 93 22.7552781063827 23.5666890473298 -0.811410940947031 A:G G A 10 0.535606569257495 0.917315886509728 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 8326999 C/T 1 19 14 33 8.8234751841076 7.49849196960493 1.32498321450267 T:C C T 10 0.535606569257495 0.728342224580128 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 8468337 C/T 1 96 108 204 44.5817693512805 57.8455094798095 -13.263740128529 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0678919894671308 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 8486884 G/A 1 10 3 13 4.64393430742505 1.60681970777248 3.03711459965257 A:G G A 10 0.535606569257495 0.102916600745183 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8486607_8486900:MARCH2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 8503345 G/C 1 11 17 28 5.10832773816756 9.10531167737741 -3.99698393920986 C:G G C 10 0.535606569257495 0.134872699384411 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8503272_8503895:MARCH2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 111 110 221 51.5476708124181 58.9167226183244 -7.36905180590638 C:G C G 10 0.535606569257495 0.345164320370171 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 10221111 T/C 1 9 9 18 4.17954087668255 4.82045912331745 -0.640918246634909 T:C T C 10 0.535606569257495 0.816090164780621 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 10 9 19 4.64393430742505 4.82045912331745 -0.176524815892404 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 10222410 G/A 1 38 27 65 17.6469503682152 14.4613773699524 3.18557299826283 A:G G A 10 0.535606569257495 0.457495861451802 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10222214_10222416:P2RY11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 24 40 64 11.1454423378201 21.4242627702998 -10.2788204324797 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0117772449323268 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 10224548 G/A 1 44 24 68 20.4333109526702 12.8545576621799 7.57875329049034 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0688372200407265 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 354 347 701 164.395274482847 185.855479532351 -21.460205049504 A:C:G A G 10 0.535606569257495 0.111689452255521 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 250 255 505 116.098357685626 136.579675160661 -20.481317475035 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0742357660811788 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 10267077 T/C 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 T:C T C 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10267067_10267185:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10267067_10267185:DNMT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 10394792 G/A 1 135 118 253 62.6931131502382 63.2015751723844 -0.508462022146219 A:G G A 10 0.535606569257495 0.949841829917132 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10394709_10394996:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10394709_10394996:ICAM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 10449392 A/G 1 377 347 724 175.076323389924 185.855479532351 -10.7791561424264 A:C:G A G 10 0.535606569257495 0.434019556740448 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 21 19 40 9.75226204559261 10.1765248158924 -0.424262770299798 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 10664691 C/T 1 14 11 25 6.50150803039507 5.89167226183244 0.609835768562626 T:C C T 10 0.535606569257495 0.843808338313289 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 10746955 C/A 1 1 7 8 0.464393430742505 3.74924598480246 -3.28485255405996 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0288949230486104 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 11319491 G/A 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11319362_11319505:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11319362_11319505:DOCK6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 13 6 19 6.03711459965257 3.21363941554497 2.8234751841076 C:G G C 10 0.535606569257495 0.251503218843434 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 11598483 T/C 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 T:C T C 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000161914:ENST00000293771:exon_11598107_11598718:ZNF653 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 12256358 T/G 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 T:G T G 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000213297:ENST00000434822:exon_12256073_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000455799:exon_12255705_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000355738:exon_12255711_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000439556:exon_12256080_12257039:ZNF625 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 12384422 T/C 1 7 9 16 3.25075401519754 4.82045912331745 -1.56970510811992 T:C T C 10 0.535606569257495 0.462079525679044 ENSG00000197857:ENST00000397742:exon_12383302_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000356109:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000457673:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000355684:exon_12383144_12384878:ZNF44 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 85 95 180 39.4734416131129 50.882624079462 -11.4091824663491 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0999414320581894 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 13008607 G/T 1 18 18 36 8.35908175336509 9.64091824663491 -1.28183649326982 T:G G T 10 0.535606569257495 0.739235820904023 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 13035522 C/A 1 116 121 237 53.8696379661306 64.8083948801569 -10.9387569140263 A:C C A 10 0.535606569257495 0.171320735984289 ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13035453_13035621:FARSA;ENSG00000179115:ENST00000423140:exon_13035453_13035621:FARSA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 884 906 1790 410.523792776374 485.25955174729 -74.7357589709159 A:T:G G T 10 0.535606569257495 0.000412336943712835 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 13264549 C/T 1 142 155 297 65.9438671654357 83.0190182349117 -17.075151069476 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0480422610167722 ENSG00000160888:ENST00000292433:exon_13263758_13265716:IER2;ENSG00000160888:ENST00000393152:exon_13263893_13265716:IER2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14030689 T/C 1 10 13 23 4.64393430742505 6.96288540034743 -2.31895109292238 T:C T C 10 0.535606569257495 0.404576740411981 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14231243 C/T 1 83 55 138 38.5446547516279 29.4583613091622 9.0862934424657 T:C C T 10 0.535606569257495 0.125160034684988 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14231325 C/G 1 65 53 118 30.1855729982628 28.3871481706472 1.79842482761559 C:G C G 10 0.535606569257495 0.782214426047408 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14231330 A/G 1 60 53 113 27.8636058445503 28.3871481706472 -0.52354232609693 A:G A G 10 0.535606569257495 0.925172863359051 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14492265 T/C 1 17 9 26 7.89468832262259 4.82045912331745 3.07422919930513 T:C T C 10 0.535606569257495 0.244740828501064 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 23 16 39 10.6810489070776 8.56970510811992 2.1113437989577 T:C T C 10 0.535606569257495 0.525043442262861 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14517875 C/T 1 57 74 131 26.4704255523228 39.6348861250546 -13.1644605727318 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.0226681986077944 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14517873_14518041:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14517873_14518041:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14517873_14518041:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14517873_14518041:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14517873_14518041:CD97 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14574897 C/A 1 120 115 235 55.7272116891006 61.5947554646119 -5.86754377551132 A:C C A 10 0.535606569257495 0.472015672240191 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14574872_14574965:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14574872_14574965:PKN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14580328 A/G 1 148 129 277 68.7302277498907 69.0932474342168 -0.363019684326105 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14581063 A/G 1 83 70 153 38.5446547516279 37.4924598480246 1.05219490360327 A:G A G 10 0.535606569257495 0.87168158356894 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580975_14581117:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580975_14581117:PKN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14582468 G/A 1 79 92 171 36.6870810286579 49.2758043716895 -12.5887233430316 A:G G A 10 0.535606569257495 0.055463448670009 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14589378 C/T 1 26 17 43 12.0742291993051 9.10531167737741 2.96891752192772 T:C C T 10 0.535606569257495 0.445062552705244 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14588574_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14588574_14589379:GIPC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 13 16 29 6.03711459965257 8.56970510811992 -2.53259050846735 T:C C T 10 0.535606569257495 0.358571526558961 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 16 9 25 7.43029489188008 4.82045912331745 2.60983576856263 A:G G A 10 0.535606569257495 0.322733716281633 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14629171 C/T 1 7 14 21 3.25075401519754 7.49849196960493 -4.24773795440739 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0794265593904473 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 14884841 G/A 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 A:G G A 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000127507:ENST00000353005:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000353876:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392967:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000346057:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392965:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000315576:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000360222:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392964:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392962:exon_14884750_14884866:EMR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 37 21 58 17.1825569374727 11.2477379544074 5.93481898306529 A:G G A 10 0.535606569257495 0.1470360013879 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 28 24 52 13.0030160607901 12.8545576621799 0.148458398610263 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 20 33 53 9.2878686148501 17.6750167854973 -8.38714817064723 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0267146939116023 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 12 19 31 5.57272116891006 10.1765248158924 -4.60380364698234 A:C C A 10 0.535606569257495 0.107056097599885 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 36 44 80 16.7181635067302 23.5666890473298 -6.8485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 0.144797865413339 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 16980489 C/T 1 17 7 24 7.89468832262259 3.74924598480246 4.14544233782012 T:C C T 10 0.535606569257495 0.103320064157444 ENSG00000127511:ENST00000379803:exon_16980271_16980886:SIN3B;ENSG00000127511:ENST00000248054:exon_16980271_16980886:SIN3B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 11 14 25 5.10832773816756 7.49849196960493 -2.39016423143737 T:C C T 10 0.535606569257495 0.423378530112683 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 17173563 G/C 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17173508_17173589:HAUS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 17173588 G/A 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 A:G G A 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17173508_17173589:HAUS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 17337555 C/A 1 9 12 21 4.17954087668255 6.42727883108994 -2.24773795440739 A:C C A 10 0.535606569257495 0.384311420828178 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 17844132 G/A 0 46 0 46 21.3620978141552 0 21.3620978141552 G G 10 0.535606569257495 3.62122243086443e-13 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17844002_17844237:MAP1S HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 17844227 G/A 0 119 0 119 55.2628182583581 0 55.2628182583581 G G 10 0.535606569257495 8.71633067128535e-33 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17844002_17844237:MAP1S HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 17886940 G/A 1 10 13 23 4.64393430742505 6.96288540034743 -2.31895109292238 A:G G A 10 0.535606569257495 0.404576740411981 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17886792_17886970:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17886792_17886970:FCHO1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 17892591 A/G 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 A:G A G 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17892521_17892629:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17892521_17892629:FCHO1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 18497137 G/A 1 97 86 183 45.046162782023 46.0621649561446 -1.01600217412157 A:G G A 10 0.535606569257495 0.882477351511888 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 18497141 T/A 1 88 97 185 40.8666219053404 51.953837217977 -11.0872153126366 A:T T A 10 0.535606569257495 0.105262302369392 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 18499151 C/T 1 106 82 188 49.2257036587055 43.9197386791146 5.30596497959095 T:C C T 10 0.535606569257495 0.464995417762684 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 18499238 G/T 1 47 57 104 21.8264912448977 30.5295744476772 -8.70308320277947 T:G G T 10 0.535606569257495 0.0947482462676043 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 18538742 A/C 1 4 11 15 1.85757372297002 5.89167226183244 -4.03409853886242 A:C A C 10 0.535606569257495 0.0409218294036399 ENSG00000130511:ENST00000348495:exon_18538708_18538792:SSBP4;ENSG00000130511:ENST00000270061:exon_18538708_18538792:SSBP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 18545786 G/T 1 39 3 42 18.1113437989577 1.60681970777248 16.5045240911852 T:G G T 10 0.535606569257495 5.33376276344625e-08 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18545625_18545927:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18545625_18545927:ISYNA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 18546678 T/C 1 31 2 33 14.3961963530177 1.07121313851499 13.3249832145027 T:C T C 10 0.535606569257495 5.73354628530678e-07 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18546567_18546731:ISYNA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 18572405 C/T 1 19 17 36 8.8234751841076 9.10531167737741 -0.281836493269818 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000105656:ENST00000262809:exon_18572388_18572662:ELL;ENSG00000105656:ENST00000392395:exon_18572388_18572662:ELL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 18679379 C/G 1 93 76 169 43.188589059053 40.7060992635696 2.48248979548336 C:G C G 10 0.535606569257495 0.757831418779643 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 1 58 2 60 26.9348189830653 1.07121313851499 25.8636058445503 A:T:C C T 10 0.535606569257495 8.38951715306865e-14 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 18685964 G/T 1 1477 1122 2599 685.90909720668 600.950570706909 84.9585264997706 A:T:G G T 10 0.535606569257495 0.000826718081961843 ENSG00000221983:ENST00000430157:exon_18685867_18688269:UBA52;ENSG00000221983:ENST00000442744:exon_18685867_18688269:UBA52 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 19638101 T/G 1 258 206 464 119.813505131566 110.334953267044 9.47855186452234 T:G T G 10 0.535606569257495 0.402196146649245 ENSG00000186010:ENST00000252576:exon_19638090_19638161:NDUFA13;ENSG00000186010:ENST00000507754:exon_19638090_19638161:NDUFA13;ENSG00000186010:ENST00000436926:exon_19638090_19638161:NDUFA13;ENSG00000186010:ENST00000503283:exon_19638090_19638161:NDUFA13;ENSG00000186010:ENST00000512771:exon_19638090_19638161:NDUFA13;ENSG00000186010:ENST00000428459:exon_19638090_19638161:NDUFA13;ENSG00000186010:ENST00000450144:exon_19638090_19638161:NDUFA13;ENSG00000186010:ENST00000502506:exon_19638090_19638161:NDUFA13;ENSG00000186010:ENST00000511180:exon_19638090_19638583:NDUFA13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 21300462 A/G 0 9 0 9 4.17954087668255 0 4.17954087668255 A A 10 0.535606569257495 0.00463210411669919 ENSG00000160352:ENST00000343332:exon_21299613_21301019:ZNF714;ENSG00000160352:ENST00000291770:exon_21299613_21307879:ZNF714 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 24310413 G/C 1 7 2 9 3.25075401519754 1.07121313851499 2.17954087668255 C:G G C 10 0.535606569257495 0.189646242107253 ENSG00000213096:ENST00000357002:exon_24309056_24312643:ZNF254 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 30165639 C/T 1 15 12 27 6.96590146113758 6.42727883108994 0.538622630047636 T:C C T 10 0.535606569257495 0.850150419291182 ENSG00000166289:ENST00000299373:exon_30164731_30166364:PLEKHF1;ENSG00000166289:ENST00000436066:exon_30164731_30166364:PLEKHF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 5 12 17 2.32196715371253 6.42727883108994 -4.10531167737741 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0530860535659699 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 33110204 T/C 1 14 9 23 6.50150803039507 4.82045912331745 1.68104890707762 T:C T C 10 0.535606569257495 0.535839092641956 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33110166_33110285:ANKRD27 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 33110259 G/A 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 A:G G A 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33110166_33110285:ANKRD27 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 33183352 G/C 1 12 27 39 5.57272116891006 14.4613773699524 -8.8886562010423 C:G G C 10 0.535606569257495 0.00568453098540941 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 33467576 G/A 1 15 8 23 6.96590146113758 4.28485255405996 2.68104890707762 A:G G A 10 0.535606569257495 0.300721382047396 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 33470874 A/G 1 6 17 23 2.78636058445503 9.10531167737741 -6.31895109292238 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0107790121502123 ENSG00000131941:ENST00000254260:exon_33469499_33471162:RHPN2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 33579128 T/C 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 T:C T C 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33579040_33579174:GPATCH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 33600764 T/C 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33600623_33600922:GPATCH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 33602757 C/T 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33602630_33602808:GPATCH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 33605300 A/G 1 9 1 10 4.17954087668255 0.535606569257495 3.64393430742505 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0246360115647308 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 35232677 G/A 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000197841:ENST00000392232:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000448715:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000425140:exon_35231516_35233774:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000492450:exon_35231516_35233091:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000459757:exon_35231516_35233091:ZNF181 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 35660546 T/C 1 288 329 617 133.745308053841 176.214561285716 -42.4692532318744 T:C T C 10 0.535606569257495 0.000686308380792074 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 35770056 G/A 1 15 8 23 6.96590146113758 4.28485255405996 2.68104890707762 A:T:G G A 10 0.535606569257495 0.300721382047396 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 219 220 439 101.702161332609 117.833445236649 -16.1312839040403 A:G A G 10 0.535606569257495 0.125856072017976 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 324 309 633 150.463471560572 165.502429900566 -15.0389583399943 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.232182096064337 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 36205695 G/T 1 141 129 270 65.4794737346932 69.0932474342168 -3.61377369952363 T:G G T 10 0.535606569257495 0.669677543059594 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36205529_36206409:ZBTB32 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 18 13 31 8.35908175336509 6.96288540034743 1.39619635301766 A:G A G 10 0.535606569257495 0.719730647046148 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 36230174 T/C 1 93 113 206 43.188589059053 60.5235423260969 -17.334953267044 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0173807277962135 ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36230153_36230527:TMEM149;ENSG00000126246:ENST00000344990:exon_36230153_36230527:TMEM149 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 36278470 C/G 1 11 5 16 5.10832773816756 2.67803284628747 2.43029489188008 C:G C G 10 0.535606569257495 0.316760693759888 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36278070_36279724:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36278070_36279724:ARHGAP33 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 36530428 G/A 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000161277:ENST00000292894:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000392182:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000522483:exon_36530225_36530620:THAP8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 36530913 C/T 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000161277:ENST00000292894:exon_36530846_36531038:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000392182:exon_36530846_36531038:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000524106:exon_36530863_36531038:THAP8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 37038092 T/C 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 T:C T C 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 37039069 A/C 1 2 7 9 0.92878686148501 3.74924598480246 -2.82045912331745 A:C A C 10 0.535606569257495 0.0914723743517246 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 37129768 A/G 1 8 2 10 3.71514744594004 1.07121313851499 2.64393430742505 A:G A G 10 0.535606569257495 0.118289200524796 ENSG00000197808:ENST00000360357:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396893:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396896:exon_37129686_37130439:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396892:exon_37129591_37129890:ZNF461 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 37853366 G/C 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853011_37853489:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 37853375 T/C 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853011_37853489:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 37854040 G/A 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 A:G G A 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 7 10 17 3.25075401519754 5.35606569257495 -2.10531167737741 T:G G T 10 0.535606569257495 0.338652205084508 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 77 104 181 35.7582941671729 55.7030832027795 -19.9447890356066 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00354614783820465 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 38800176 G/A 1 91 63 154 42.259802197568 33.7432138632222 8.51658833434578 A:G G A 10 0.535606569257495 0.170798317925921 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 38872778 C/T 1 154 126 280 71.5165883343458 67.4864277264444 4.03016060790142 T:C C T 10 0.535606569257495 0.675001375546088 ENSG00000099341:ENST00000215071:exon_38872757_38872868:PSMD8;ENSG00000099341:ENST00000404323:exon_38872757_38872868:PSMD8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 38893856 G/C 1 13 9 22 6.03711459965257 4.82045912331745 1.21665547633511 C:G G C 10 0.535606569257495 0.672817163244646 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38893775_38893858:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38893775_38893858:FAM98C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 86 99 185 39.9378350438554 53.025050356492 -13.0872153126366 T:C T C 10 0.535606569257495 0.055483631260425 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 39100594 G/A 1 70 90 160 32.5075401519754 48.2045912331745 -15.6970510811992 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0138944090404659 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39100549_39100665:MAP4K1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 152 162 314 70.5878014728608 86.7682642197142 -16.1804627468534 A:T:G T G 10 0.535606569257495 0.0702396317176952 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 39360720 G/A 1 17 16 33 7.89468832262259 8.56970510811992 -0.675016785497333 A:G G A 10 0.535606569257495 0.862481166268759 ENSG00000187994:ENST00000340740:exon_39360583_39360900:RINL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 39416887 C/T 1 12 11 23 5.57272116891006 5.89167226183244 -0.318951092922384 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39416845_39416940:FBXO17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 39913634 G/A 1 17 29 46 7.89468832262259 15.5325905084674 -7.63790218584477 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0264979585530651 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 11 31 42 5.10832773816756 16.6038036469823 -11.4954759088148 A:G G A 10 0.535606569257495 0.000499588649096805 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 9 15 24 4.17954087668255 8.03409853886242 -3.85455766217988 A:G G A 10 0.535606569257495 0.151111171765549 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 11 22 33 5.10832773816756 11.7833445236649 -6.67501678549733 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0228439093383 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 14 15 29 6.50150803039507 8.03409853886242 -1.53259050846735 T:C T C 10 0.535606569257495 0.582160963982168 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 39926509 A/C 1 3013 2606 5619 1399.21740682717 1395.79071948503 3.42668734213589 A:T:C A C 10 0.535606569257495 0.936042449820161 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 39926521 G/A 1 2919 2544 5463 1355.56442433737 1362.58311219107 -7.01868785369493 A:T:C:G G A 10 0.535606569257495 0.849403445679188 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 39963828 T/A 1 1 7 8 0.464393430742505 3.74924598480246 -3.28485255405996 A:T T A 10 0.535606569257495 0.0288949230486104 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 40030654 G/C 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 C:G G C 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 41096189 A/G 1 20 32 52 9.2878686148501 17.1394102162398 -7.85154160138974 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0361920853147125 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41096150_41096328:SHKBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 42085873 A/G 1 6 8 14 2.78636058445503 4.28485255405996 -1.49849196960493 A:G A G 10 0.535606569257495 0.436988882100625 ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000419449:exon_42085666_42085981:CEACAM21 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 42364904 C/G 1 1913 1444 3357 888.384633010412 773.415886007823 114.968747002589 A:C:G C G 10 0.535606569257495 6.86585881736942e-05 ENSG00000105372:ENST00000221975:exon_42364845_42364915:RPS19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 34 38 72 15.7893766452452 20.3530496317848 -4.56367298653963 T:C C T 10 0.535606569257495 0.28983996075879 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 42795744 G/A 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 A:G G A 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000079432:ENST00000160740:exon_42795710_42795897:CIC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 42911769 G/A 1 7 10 17 3.25075401519754 5.35606569257495 -2.10531167737741 A:G G A 10 0.535606569257495 0.338652205084508 ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42911758_42911943:LIPE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 43979589 G/T 1 9 9 18 4.17954087668255 4.82045912331745 -0.640918246634909 T:G G T 10 0.535606569257495 0.816090164780621 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 12 11 23 5.57272116891006 5.89167226183244 -0.318951092922384 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 44153100 A/G 1 17 17 34 7.89468832262259 9.10531167737741 -1.21062335475483 A:G A G 10 0.535606569257495 0.732486001530963 ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44152732_44153295:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44152732_44153295:PLAUR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 44156472 T/C 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 T:C T C 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000011422:ENST00000339082:exon_44156377_44156523:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44156377_44156523:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44156377_44156523:PLAUR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 44515074 C/A 1 4 12 16 1.85757372297002 6.42727883108994 -4.56970510811992 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0247475125779134 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 44515352 T/G 1 3 14 17 1.39318029222752 7.49849196960493 -6.10531167737741 T:G T G 10 0.535606569257495 0.00309159875031242 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44515341_44515400:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 44610665 A/G 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 44610798 A/T 1 10 7 17 4.64393430742505 3.74924598480246 0.894688322622586 A:T A T 10 0.535606569257495 0.809240333218704 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 44611162 G/T 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 T:G G T 10 0.535606569257495 0.824415845788285 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 13 10 23 6.03711459965257 5.35606569257495 0.681048907077616 T:C T C 10 0.535606569257495 0.836732692537685 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 44660967 A/G 1 4 6 10 1.85757372297002 3.21363941554497 -1.35606569257495 A:G A G 10 0.535606569257495 0.529494183528195 ENSG00000159905:ENST00000426739:exon_44660405_44664462:ZNF234;ENSG00000159905:ENST00000244316:exon_44660405_44664462:ZNF234 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 44680489 G/A 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 A:G G A 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 44732658 C/G 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44732599_44732725:ZNF227 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 44739303 T/C 1 9 13 22 4.17954087668255 6.96288540034743 -2.78334452366489 T:C T C 10 0.535606569257495 0.286635935669917 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 44740602 G/A 1 18 15 33 8.35908175336509 8.03409853886242 0.324983214502668 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 31 40 71 14.3961963530177 21.4242627702998 -7.02806641728214 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0971436536620175 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 45490570 A/G 1 15 24 39 6.96590146113758 12.8545576621799 -5.8886562010423 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0762361846174624 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 50 29 79 23.2196715371253 15.5325905084674 7.6870810286579 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0908317697372685 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 45854919 T/G 1 12 4 16 5.57272116891006 2.14242627702998 3.43029489188008 T:G T G 10 0.535606569257495 0.130383593597072 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 45867259 C/T 1 22 28 50 10.2166554763351 14.9969839392099 -4.78032846287475 T:C C T 10 0.535606569257495 0.202214087908662 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391940:exon_45867244_45867377:ERCC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 46024584 T/G 1 188 176 364 87.305964979591 94.2667561893191 -6.96079120972816 T:C:G T G 10 0.535606569257495 0.494582459424551 ENSG00000125753:ENST00000245932:exon_46024580_46024664:VASP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 24 19 43 11.1454423378201 10.1765248158924 0.968917521927718 T:C T C 10 0.535606569257495 0.878743629729628 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 17 16 33 7.89468832262259 8.56970510811992 -0.675016785497333 C:G C G 10 0.535606569257495 0.862481166268759 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 46394187 C/T 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 T:C C T 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000176182:ENST00000322217:exon_46393285_46394581:MYPOP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 47225265 G/A 1 25 49 74 11.6098357685626 26.2447218936173 -14.6348861250546 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00067225078384124 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47225243_47225329:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47225243_47225329:STRN4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 47865947 G/A 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 A:G G A 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 17 11 28 7.89468832262259 5.89167226183244 2.00301606079014 T:C T C 10 0.535606569257495 0.57060730700733 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 48836673 G/T 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 T:G G T 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000161558:ENST00000435956:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000377431:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48835613_48836690:TMEM143 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 48954421 G/A 1 8 13 21 3.71514744594004 6.96288540034743 -3.24773795440739 A:G G A 10 0.535606569257495 0.190432172043740 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48954291_48954488:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48954291_48954488:GRWD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 49129393 C/T 1 13 16 29 6.03711459965257 8.56970510811992 -2.53259050846735 T:C C T 10 0.535606569257495 0.358571526558961 ENSG00000063176:ENST00000245222:exon_49129148_49129619:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000340932:exon_49129148_49129619:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000443164:exon_49128218_49129619:SPHK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 10 3 13 4.64393430742505 1.60681970777248 3.03711459965257 A:G A G 10 0.535606569257495 0.102916600745183 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 49950298 C/T 1 51 51 102 23.6840649678678 27.3159350321322 -3.63187006426448 T:C C T 10 0.535606569257495 0.488295239062348 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 49950356 C/G 1 46 39 85 21.3620978141552 20.8886562010423 0.473441613112932 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 97 59 156 45.046162782023 31.6007875861922 13.4453751958308 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0365516662372899 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 96 56 152 44.5817693512805 29.9939678784197 14.5878014728608 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0182935277087048 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 50100484 G/A 1 6 7 13 2.78636058445503 3.74924598480246 -0.962885400347434 A:G G A 10 0.535606569257495 0.782351862796383 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50097954_50101270:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000314734:exon_50100116_50101270:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000246798:exon_50100116_50101270:PRR12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 50124798 C/T 1 7 9 16 3.25075401519754 4.82045912331745 -1.56970510811992 T:C C T 10 0.535606569257495 0.462079525679044 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50124782_50124879:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000246798:exon_50124782_50124879:PRR12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 50128905 C/T 1 16 16 32 7.43029489188008 8.56970510811992 -1.13941021623984 T:C C T 10 0.535606569257495 0.72535006961681 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50128718_50129695:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000314734:exon_50128718_50129695:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000246798:exon_50128718_50129695:PRR12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 50140092 G/A 1 6 8 14 2.78636058445503 4.28485255405996 -1.49849196960493 A:G G A 10 0.535606569257495 0.436988882100625 ENSG00000126458:ENST00000246792:exon_50140081_50140183:RRAS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 50157946 T/C 1 45 58 103 20.8977043834127 31.0651810169347 -10.167476633522 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0481743832129662 ENSG00000126461:ENST00000360565:exon_50157909_50158127:SCAF1;ENSG00000126461:ENST00000447618:exon_50157909_50158127:SCAF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 106 84 190 49.2257036587055 44.9909518176296 4.23475184107595 C:G C G 10 0.535606569257495 0.561137993543041 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 22 17 39 10.2166554763351 9.10531167737741 1.1113437989577 T:C T C 10 0.535606569257495 0.750830704480835 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 50387750 G/C 1 22 22 44 10.2166554763351 11.7833445236649 -1.56668904732978 C:G G C 10 0.535606569257495 0.653088089453632 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50387716_50387816:TBC1D17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 50436371 G/A 1 75 133 208 34.8295073056879 71.2356737112468 -36.406166405559 A:G G A 10 0.535606569257495 4.44378749245737e-07 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 32 24 56 14.8605897837602 12.8545576621799 2.00603212158028 A:G G A 10 0.535606569257495 0.68812823653879 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 51850304 G/A 1 66 58 124 30.6499664290053 31.0651810169347 -0.415214587929377 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 52537576 T/G 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 53268810 G/A 1 6 8 14 2.78636058445503 4.28485255405996 -1.49849196960493 A:G G A 10 0.535606569257495 0.436988882100625 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 53269614 G/A 1 5 10 15 2.32196715371253 5.35606569257495 -3.03409853886242 A:G G A 10 0.535606569257495 0.128072258736022 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 53303745 T/C 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 T:C T C 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000198538:ENST00000360272:exon_53300659_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000438150:exon_53300661_53304940:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000457749:exon_53300662_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000391783:exon_53303301_53304955:ZNF28 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 53958798 G/T 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 T:G G T 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 53959343 G/A 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 A:G G A 10 0.535606569257495 0.204175008278816 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 53959568 G/C 1 6 8 14 2.78636058445503 4.28485255405996 -1.49849196960493 C:G G C 10 0.535606569257495 0.436988882100625 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 54080067 T/C 0 11 0 11 5.10832773816756 0 5.10832773816756 T T 10 0.535606569257495 0.00125729441466232 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514374:exon_54079951_54080113:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000509047:exon_54079951_54080074:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511567:exon_54079951_54080129:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513265:exon_54079951_54080107:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000502616:exon_54079951_54080071:ZNF331 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 23 30 53 10.6810489070776 16.0681970777248 -5.38714817064723 T:G T G 10 0.535606569257495 0.168030929307095 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 54848732 G/A 1 3 10 13 1.39318029222752 5.35606569257495 -3.96288540034743 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0472642919377538 ENSG00000239961:ENST00000291759:exon_54848671_54848967:LILRA4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 54962467 G/A 1 36 28 64 16.7181635067302 14.9969839392099 1.72117956752032 A:G G A 10 0.535606569257495 0.7081142508232 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376514:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000443957:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54962467_54962559:LENG8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 54965860 G/A 1 49 23 72 22.7552781063827 12.3189510929224 10.4363270134604 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0175045264774092 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54965609_54965861:LENG8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 54966579 C/G 1 30 26 56 13.9318029222752 13.9257708006949 0.00603212158028299 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 54973280 C/G 1 22 17 39 10.2166554763351 9.10531167737741 1.1113437989577 C:G C G 10 0.535606569257495 0.750830704480835 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 54974318 T/C 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 T:C T C 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 55175009 G/T 1 12 31 43 5.57272116891006 16.6038036469823 -11.0310824780723 T:G G T 10 0.535606569257495 0.00106056535192360 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174990_55175025:LILRB4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 17 38 55 7.89468832262259 20.3530496317848 -12.4583613091622 T:C C T 10 0.535606569257495 0.000992476728076742 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 8 15 23 3.71514744594004 8.03409853886242 -4.31895109292238 A:G A G 10 0.535606569257495 0.093185649776015 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 55559715 G/A 1 6 7 13 2.78636058445503 3.74924598480246 -0.962885400347434 A:G G A 10 0.535606569257495 0.782351862796383 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55559697_55559909:RDH13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 55568084 C/T 1 10 1 11 4.64393430742505 0.535606569257495 4.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0139309809228071 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 55568085 G/T 1 10 1 11 4.64393430742505 0.535606569257495 4.10832773816756 T:G G T 10 0.535606569257495 0.0139309809228071 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 13 18 31 6.03711459965257 9.64091824663491 -3.60380364698234 T:C T C 10 0.535606569257495 0.211027479808991 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 A:G G A 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 57132968 G/A 1 11 5 16 5.10832773816756 2.67803284628747 2.43029489188008 A:G G A 10 0.535606569257495 0.316760693759888 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 57133333 T/C 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 57802806 C/T 1 9 2 11 4.17954087668255 1.07121313851499 3.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0728086494533878 ENSG00000197714:ENST00000360338:exon_57802067_57805436:ZNF460 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 57802824 G/A 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 A:G G A 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000197714:ENST00000360338:exon_57802067_57805436:ZNF460 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 A:G A G 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 58724380 G/A 1 47 73 120 21.8264912448977 39.0992795557971 -17.2727883108994 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00177220322202884 ENSG00000171606:ENST00000326804:exon_58723527_58724927:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000424679:exon_58723527_58724509:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000345813:exon_58723527_58724509:ZNF274 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 58755366 G/A 1 5 10 15 2.32196715371253 5.35606569257495 -3.03409853886242 A:G G A 10 0.535606569257495 0.128072258736022 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58755331_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58755328_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000333581:exon_58755328_58755422:ZNF544 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 58772579 C/G 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 C:G C G 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 14 12 26 6.50150803039507 6.42727883108994 0.0742291993051314 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 58806083 T/C 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 T:C T C 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 58850341 G/C 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000182318:ENST00000329665:exon_58849620_58853692:ZSCAN22;ENSG00000182318:ENST00000405739:exon_58849620_58853695:ZSCAN22 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 58904396 G/A 1 1906 1900 3806 885.133878995215 1017.65248158924 -132.518602594026 A:T:C:G G A 10 0.535606569257495 1.77274568792043e-05 ENSG00000083845:ENST00000196551:exon_58904343_58904552:RPS5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 59059729 G/A 1 248 217 465 115.169570824141 116.226625528876 -1.05705470473514 A:G G A 10 0.535606569257495 0.92598218416294 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59059661_59059775:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59059661_59059775:TRIM28 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 59061357 C/T 1 255 266 521 118.420324839339 142.471347422494 -24.0510225831549 A:T:C C T 10 0.535606569257495 0.0350589630702344 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59061316_59061402:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59061316_59061402:TRIM28 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 59073613 A/G 1 12 15 27 5.57272116891006 8.03409853886242 -2.46137736995236 A:G A G 10 0.535606569257495 0.440874576584086 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 59074429 C/T 1 15 9 24 6.96590146113758 4.82045912331745 2.14544233782012 T:C C T 10 0.535606569257495 0.419256106369884 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 19 59074653 T/C 1 10 4 14 4.64393430742505 2.14242627702998 2.50150803039507 T:C T C 10 0.535606569257495 0.283626359522875 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 224919 A/G 1 8 1 9 3.71514744594004 0.535606569257495 3.17954087668255 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0433666493567438 ENSG00000035115:ENST00000463865:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000405430:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000415006:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000356150:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000468321:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000472012:exon_224868_224920:SH3YL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 9 18 27 4.17954087668255 9.64091824663491 -5.46137736995236 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0516421185738133 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 165 151 316 76.6249160725133 80.8765919578817 -4.25167588536841 A:G A G 10 0.535606569257495 0.652021705349457 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 34 31 65 15.7893766452452 16.6038036469823 -0.814427001737171 T:C T C 10 0.535606569257495 0.901229810820976 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 3392295 A/G 1 26 36 62 12.0742291993051 19.2818364932698 -7.20760729396469 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0746186279211113 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 26 23 49 12.0742291993051 12.3189510929224 -0.244721893617251 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 56 61 117 26.0060321215803 32.6720007247072 -6.66596860312691 T:C C T 10 0.535606569257495 0.228878354641331 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 9634856 A/G 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000134330:ENST00000481367:exon_9634831_9634989:IAH1;ENSG00000151694:ENST00000310823:exon_9634766_9634896:ADAM17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 10050947 T/C 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 T:C T C 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000492648:exon_10050865_10051042:TAF1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 10050960 A/G 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000492648:exon_10050865_10051042:TAF1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 10059770 G/T 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 T:G G T 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 10059844 C/T 1 4 10 14 1.85757372297002 5.35606569257495 -3.49849196960493 T:C C T 10 0.535606569257495 0.104522536584723 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 10712278 C/T 1 28 36 64 13.0030160607901 19.2818364932698 -6.27882043247968 T:C C T 10 0.535606569257495 0.13253012369605 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10710892_10712316:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10711781_10712316:NOL10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 10784491 A/G 1 19 23 42 8.8234751841076 12.3189510929224 -3.49547590881479 A:G A G 10 0.535606569257495 0.284027730988555 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000431319:exon_10784446_10784498:NOL10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 10930903 T/C 1 202 144 346 93.807473009986 77.1273459730793 16.6801270369068 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0753215248229902 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10930845_10930959:PDIA6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 137 126 263 63.6219000117232 67.4864277264444 -3.86452771472117 T:C C T 10 0.535606569257495 0.665310103744306 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 25 23 48 11.6098357685626 12.3189510929224 -0.709115324359757 T:C C T 10 0.535606569257495 0.885446087317048 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 15747393 C/T 1 20 28 48 9.2878686148501 14.9969839392099 -5.70911532435976 T:C C T 10 0.535606569257495 0.111695704780918 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15747299_15747437:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15747299_15747437:DDX1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 20234122 C/A 1 65 49 114 30.1855729982628 26.2447218936173 3.94085110464557 A:C C A 10 0.535606569257495 0.511234220858266 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20234078_20234176:LAPTM4A;ENSG00000068697:ENST00000483117:exon_20234078_20234176:LAPTM4A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 20403949 C/T 0 0 11 11 0 5.89167226183244 -5.89167226183244 T C T 10 0.535606569257495 0.000216644039036914 ENSG00000115884:ENST00000254351:exon_20403574_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000381150:exon_20403574_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000403076:exon_20403723_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000482879:exon_20403763_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000429035:exon_20403579_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000447124:exon_20403913_20404052:SDC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 20824498 C/T 1 19 13 32 8.8234751841076 6.96288540034743 1.86058978376016 T:C C T 10 0.535606569257495 0.596333954023765 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000415264:exon_20824492_20824533:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 25141646 T/C 1 12 11 23 5.57272116891006 5.89167226183244 -0.318951092922384 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25141182_25142708:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25141182_25142055:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25141182_25142055:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25141182_25142053:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000438445:exon_25141521_25142053:ADCY3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 27000993 G/A 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000213699:ENST00000429494:exon_27000910_27004008:C2orf18;ENSG00000213699:ENST00000344420:exon_27000910_27004099:C2orf18;ENSG00000213699:ENST00000416475:exon_27000910_27001784:C2orf18;ENSG00000213699:ENST00000433694:exon_27000910_27001784:C2orf18;ENSG00000213699:ENST00000482746:exon_27000910_27001087:C2orf18;ENSG00000213699:ENST00000414029:exon_27000910_27004015:C2orf18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 27246285 C/T 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000084764:ENST00000233121:exon_27246200_27246345:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000405074:exon_27246200_27246345:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000475633:exon_27246200_27247089:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000481222:exon_27246200_27246813:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000474367:exon_27246200_27246402:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000458529:exon_27246200_27246345:MAPRE3;ENSG00000084764:ENST00000402218:exon_27246200_27246345:MAPRE3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 27260469 G/A 1 43 49 92 19.9689175219277 26.2447218936173 -6.27580437168954 A:G G A 10 0.535606569257495 0.209927538263978 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000475258:exon_27260429_27260532:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460904:exon_27260429_27260683:TMEM214 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 27355991 G/T 1 75 37 112 34.8295073056879 19.8174430625273 15.0120642431606 T:G G T 10 0.535606569257495 0.00440109144347287 ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 18 31 49 8.35908175336509 16.6038036469823 -8.24472189361725 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0213898236129819 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 27429367 T/C 1 7 2 9 3.25075401519754 1.07121313851499 2.17954087668255 T:C T C 10 0.535606569257495 0.189646242107253 ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27429351_27429402:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27429351_27429402:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27429351_27429402:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000412471:exon_27429351_27429402:SLC5A6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 27435374 G/A 1 14 8 22 6.50150803039507 4.28485255405996 2.21665547633511 A:G G A 10 0.535606569257495 0.39723941481764 ENSG00000138074:ENST00000428518:exon_27435331_27435390:SLC5A6;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27435238_27435475:C2orf28 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 13 3 16 6.03711459965257 1.60681970777248 4.43029489188008 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0414908822217374 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 23 13 36 10.6810489070776 6.96288540034743 3.71816350673018 T:C C T 10 0.535606569257495 0.244144740015931 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 36 22 58 16.7181635067302 11.7833445236649 4.93481898306529 A:G A G 10 0.535606569257495 0.23594973971638 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 27838058 C/A 1 6 12 18 2.78636058445503 6.42727883108994 -3.64091824663491 A:C C A 10 0.535606569257495 0.100181682544637 ENSG00000243943:ENST00000416005:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000379717:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000355467:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000505973:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27838035_27838136:ZNF512 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 27887034 C/A 1 33 52 85 15.3249832145027 27.8515416013897 -12.5265583868871 A:C C A 10 0.535606569257495 0.00866031088260645 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 68 70 138 31.5787532904903 37.4924598480246 -5.9137065575343 T:C T C 10 0.535606569257495 0.347907778165676 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 8 9 17 3.71514744594004 4.82045912331745 -1.10531167737741 T:C C T 10 0.535606569257495 0.633230727718346 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 37076594 T/C 1 12 10 22 5.57272116891006 5.35606569257495 0.216655476335111 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000115808:ENST00000263918:exon_37070783_37076768:STRN;ENSG00000115808:ENST00000379213:exon_37075472_37076768:STRN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 37241050 G/A 1 10 3 13 4.64393430742505 1.60681970777248 3.03711459965257 A:G G A 10 0.535606569257495 0.102916600745183 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37240984_37241163:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37240984_37241163:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000471051:exon_37240984_37241138:HEATR5B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 50 35 85 23.2196715371253 18.7462299240123 4.47344161311293 A:G G A 10 0.535606569257495 0.384480810269137 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 37458668 G/A 1 21 27 48 9.75226204559261 14.4613773699524 -4.70911532435976 A:G G A 10 0.535606569257495 0.193665927639916 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 16 13 29 7.43029489188008 6.96288540034743 0.467409491532647 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 37471114 C/A 1 7 10 17 3.25075401519754 5.35606569257495 -2.10531167737741 A:C C A 10 0.535606569257495 0.338652205084508 ENSG00000003509:ENST00000455230:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37471054_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000431821:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000483999:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000439218:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474257:exon_37471006_37471116:C2orf56 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 37505105 T/G 1 12 5 17 5.57272116891006 2.67803284628747 2.89468832262259 T:G T G 10 0.535606569257495 0.223927516543577 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37505009_37505132:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37505009_37505132:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37505009_37506533:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000494667:exon_37505009_37505132:PRKD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 37506939 A/G 1 9 5 14 4.17954087668255 2.67803284628747 1.50150803039507 A:G A G 10 0.535606569257495 0.593847168610995 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37506889_37507072:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37506889_37507072:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000494667:exon_37506889_37507072:PRKD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 37518045 G/C 1 4 7 11 1.85757372297002 3.74924598480246 -1.89167226183244 C:G G C 10 0.535606569257495 0.36607342785591 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37518011_37518142:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37518011_37518142:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000494667:exon_37518011_37518142:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000475912:exon_37518011_37518105:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000443187:exon_37518011_37518142:PRKD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 37599963 A/C 0 8 0 8 3.71514744594004 0 3.71514744594004 A A 10 0.535606569257495 0.00893594247670414 ENSG00000115828:ENST00000338415:exon_37599825_37600465:QPCT;ENSG00000115828:ENST00000469098:exon_37599825_37600173:QPCT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 38536626 T/G 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38536520_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38536573_38536648:ATL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 39008949 G/A 1 54 42 96 25.0772452600953 22.4954759088148 2.58176935128049 A:G G A 10 0.535606569257495 0.610664690724743 ENSG00000152147:ENST00000409011:exon_39008659_39009107:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000281950:exon_39008659_39009598:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000409566:exon_39008659_39009089:GEMIN6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 14 11 25 6.50150803039507 5.89167226183244 0.609835768562626 A:G G A 10 0.535606569257495 0.843808338313289 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 39050141 A/C 1 17 14 31 7.89468832262259 7.49849196960493 0.396196353017657 A:C A C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39050135_39050411:DHX57 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 39082344 T/C 1 9 5 14 4.17954087668255 2.67803284628747 1.50150803039507 T:C T C 10 0.535606569257495 0.593847168610995 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39082199_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39081196_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39082199_39082417:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000474104:exon_39080187_39082394:DHX57 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 39250339 C/T 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 T:C C T 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000115904:ENST00000426016:exon_39249711_39250366:SOS1;ENSG00000115904:ENST00000402219:exon_39249711_39250366:SOS1;ENSG00000115904:ENST00000395038:exon_39249711_39250366:SOS1;ENSG00000115904:ENST00000263879:exon_39249711_39250366:SOS1;ENSG00000115904:ENST00000472480:exon_39250017_39250366:SOS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 44209477 C/T 1 10 12 22 4.64393430742505 6.42727883108994 -1.78334452366489 T:C C T 10 0.535606569257495 0.523642698847636 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44209377_44209573:LRPPRC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 46739157 A/G 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000250565:ENST00000306448:exon_46738986_46739951:ATP6V1E2;ENSG00000250565:ENST00000522587:exon_46739006_46739951:ATP6V1E2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 46986416 A/G 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 A:G A G 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000171150:ENST00000306503:exon_46985658_46990268:SOCS5;ENSG00000171150:ENST00000394861:exon_46985658_46989452:SOCS5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 53955850 C/T 1 3 13 16 1.39318029222752 6.96288540034743 -5.56970510811992 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00554034475850392 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 54035447 A/G 1 33 20 53 15.3249832145027 10.7121313851499 4.61285182935277 A:G A G 10 0.535606569257495 0.217661565986059 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 20 12 32 9.2878686148501 6.42727883108994 2.86058978376016 A:G A G 10 0.535606569257495 0.376661791108923 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 12 17 29 5.57272116891006 9.10531167737741 -3.53259050846735 A:T A T 10 0.535606569257495 0.197911784817732 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 20 19 39 9.2878686148501 10.1765248158924 -0.888656201042302 A:G G A 10 0.535606569257495 0.872763077008478 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 54127041 C/T 1 17 18 35 7.89468832262259 9.64091824663491 -1.74622992401232 T:C C T 10 0.535606569257495 0.612809759315648 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54127018_54127154:PSME4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 54133744 T/C 1 9 21 30 4.17954087668255 11.2477379544074 -7.06819707772485 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0103420488662303 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54133735_54133830:PSME4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 54858439 C/T 1 143 104 247 66.4082605961782 55.7030832027795 10.7051773933987 T:C C T 10 0.535606569257495 0.180594733302107 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 54882291 C/A 1 75 67 142 34.8295073056879 35.8856401402522 -1.05613283456429 A:C C A 10 0.535606569257495 0.866761388498234 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54882207_54882345:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54882207_54882345:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54882207_54882345:SPTBN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 54887228 C/T 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54887073_54889445:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54887073_54887427:SPTBN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 55544723 C/T 1 15 19 34 6.96590146113758 10.1765248158924 -3.21062335475483 T:C C T 10 0.535606569257495 0.304201610600924 ENSG00000115355:ENST00000336838:exon_55544700_55544977:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000263630:exon_55544700_55544977:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000436346:exon_55544700_55544977:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000413716:exon_55544700_55544977:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000422883:exon_55544700_55544977:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000412148:exon_55544700_55544977:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000426576:exon_55544700_55544977:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000456975:exon_55544700_55544977:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000474059:exon_55544700_55544889:CCDC88A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 48 54 102 22.2908846756402 28.9227547399047 -6.63187006426448 T:C T C 10 0.535606569257495 0.19773294683886 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 55883317 G/T 1 7 2 9 3.25075401519754 1.07121313851499 2.17954087668255 T:G G T 10 0.535606569257495 0.189646242107253 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415489:exon_55883266_55883355:PNPT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 55912120 T/C 1 10 8 18 4.64393430742505 4.28485255405996 0.359081753365091 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000429805:exon_55912078_55912183:PNPT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 38 32 70 17.6469503682152 17.1394102162398 0.507540151975356 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 19 29 48 8.8234751841076 15.5325905084674 -6.70911532435976 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0597531169011971 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 2 10 12 0.92878686148501 5.35606569257495 -4.42727883108994 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0166824326952732 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 64327544 G/T 1 30 32 62 13.9318029222752 17.1394102162398 -3.20760729396469 T:G G T 10 0.535606569257495 0.446174527079597 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 64327592 T/C 1 36 23 59 16.7181635067302 12.3189510929224 4.3992124138078 T:C T C 10 0.535606569257495 0.296598805947747 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 67630980 G/A 1 13 13 26 6.03711459965257 6.96288540034743 -0.925770800694869 A:G G A 10 0.535606569257495 0.844636479883657 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 67631831 G/A 1 24 21 45 11.1454423378201 11.2477379544074 -0.102295616587273 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 67632125 C/T 1 18 17 35 8.35908175336509 9.10531167737741 -0.746229924012324 T:C C T 10 0.535606569257495 0.866104025326506 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 68385097 A/G 1 51 46 97 23.6840649678678 24.6379021858448 -0.953837217977007 A:G A G 10 0.535606569257495 0.918989424777777 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68384928_68385254:PPP3R1;ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68384976_68385273:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68385049_68385273:PNO1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 26 39 65 12.0742291993051 20.8886562010423 -8.81442700173717 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0339313625861406 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 68415767 G/A 1 14 8 22 6.50150803039507 4.28485255405996 2.21665547633511 A:G G A 10 0.535606569257495 0.39723941481764 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000234310:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409752:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409377:exon_68415646_68415822:PPP3R1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 69642390 A/G 1 19 25 44 8.8234751841076 13.3901642314374 -4.56668904732978 A:G A G 10 0.535606569257495 0.176511485806986 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000474230:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000462320:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69642317_69642431:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69642317_69642431:NFU1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 75 72 147 34.8295073056879 38.5636729865396 -3.73416568085176 A:G G A 10 0.535606569257495 0.563146892272401 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 71305456 C/T 1 78 79 157 36.2226875979154 42.3129189713421 -6.0902313734267 T:C C T 10 0.535606569257495 0.337914966421725 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71305448_71305484:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 71337203 C/T 1 28 29 57 13.0030160607901 15.5325905084674 -2.52957444767721 T:C C T 10 0.535606569257495 0.509936478228601 ENSG00000124370:ENST00000413592:exon_71336814_71337252:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71336814_71337252:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000462609:exon_71336944_71337252:MCEE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 71351487 G/A 1 14 14 28 6.50150803039507 7.49849196960493 -0.996983939209859 A:G G A 10 0.535606569257495 0.709785628768718 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000494660:exon_71351477_71351673:MCEE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 39 24 63 18.1113437989577 12.8545576621799 5.25678613677782 A:C A C 10 0.535606569257495 0.207175069979026 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 93 61 154 43.188589059053 32.6720007247072 10.5165883343458 T:G G T 10 0.535606569257495 0.0904410556681315 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 38 43 81 17.6469503682152 23.0310824780723 -5.38413210985709 A:G G A 10 0.535606569257495 0.265288083728149 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 43 32 75 19.9689175219277 17.1394102162398 2.82950730568788 A:G G A 10 0.535606569257495 0.563424287203028 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 71377014 G/A 1 21 26 47 9.75226204559261 13.9257708006949 -4.17350875510226 A:G G A 10 0.535606569257495 0.243627490653636 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 71577190 G/A 1 15 15 30 6.96590146113758 8.03409853886242 -1.06819707772485 A:G G A 10 0.535606569257495 0.71779496149159 ENSG00000075292:ENST00000410075:exon_71575883_71577401:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71575883_71577401:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71575883_71577401:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000377802:exon_71575883_71577401:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71575883_71577401:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71575557_71577401:ZNF638 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 73457287 C/T 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 T:C C T 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000135617:ENST00000258083:exon_73457241_73457341:C2orf7;ENSG00000135617:ENST00000480093:exon_73457241_73457341:C2orf7;ENSG00000135617:ENST00000470391:exon_73456927_73457341:C2orf7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 73461483 C/A 1 51 177 228 23.6840649678678 94.8023627585766 -71.1182977907089 A:T:C C A 10 0.535606569257495 7.08725272594667e-22 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73461366_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73461397_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73461435_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73461448_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473786:exon_73461464_73461512:CCT7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 73478461 A/T 1 175 167 342 81.2688503799384 89.4462970660017 -8.17744668606328 A:T A T 10 0.535606569257495 0.386002724823833 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 73717656 A/G 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 A:G A G 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73716761_73718625:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73716761_73718625:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73716761_73718625:ALMS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 18 40 58 8.35908175336509 21.4242627702998 -13.0651810169347 A:G A G 10 0.535606569257495 0.000834420295075338 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 92 91 183 42.7241956283105 48.740197802432 -6.01600217412157 A:T:C A T 10 0.535606569257495 0.374968234807657 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 74274415 C/T 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000187605:ENST00000305799:exon_74273405_74275538:TET3;ENSG00000187605:ENST00000409262:exon_74273450_74275538:TET3;ENSG00000187605:ENST00000233310:exon_74273450_74275538:TET3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 74652086 C/T 1 80 61 141 37.1514744594004 32.6720007247072 4.47947373469322 T:C C T 10 0.535606569257495 0.499549299961595 ENSG00000005448:ENST00000461531:exon_74652002_74652102:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000409791:exon_74652002_74652102:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000348227:exon_74652002_74652102:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000480089:exon_74652002_74652102:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000482880:exon_74652002_74652103:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000468778:exon_74652002_74652102:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000482605:exon_74652000_74652364:WDR54 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 74687438 G/A 1 59 44 103 27.3992124138078 23.5666890473298 3.83252336647802 A:T:G G A 10 0.535606569257495 0.489770402548401 ENSG00000115274:ENST00000452361:exon_74687348_74688011:INO80B;ENSG00000115274:ENST00000441673:exon_74687348_74687973:INO80B;ENSG00000239779:ENST00000233615:exon_74687348_74688018:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000393972:exon_74687348_74688018:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000470536:exon_74687348_74687744:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000484744:exon_74687348_74688010:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000409737:exon_74687348_74687983:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000428943:exon_74687348_74687570:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000494741:exon_74687348_74687823:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000473467:exon_74687000_74687559:WBP1;ENSG00000239779:ENST00000490120:exon_74687348_74687555:WBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 74729892 G/A 1 4 8 12 1.85757372297002 4.28485255405996 -2.42727883108994 A:G G A 10 0.535606569257495 0.246342614793183 ENSG00000179528:ENST00000460508:exon_74729794_74731805:LBX2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 74761539 T/A 1 24 11 35 11.1454423378201 5.89167226183244 5.25377007598768 A:T T A 10 0.535606569257495 0.0898358202874434 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74761443_74761558:LOXL3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 87303060 C/G 0 16 0 16 7.43029489188008 0 7.43029489188008 C C 10 0.535606569257495 5.05498483720302e-05 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 88874891 C/A 1 42 16 58 19.5045240911852 8.56970510811992 10.9348189830653 A:C C A 10 0.535606569257495 0.00370141274288149 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000470706:exon_88874879_88874926:EIF2AK3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 88879131 T/C 1 10 1 11 4.64393430742505 0.535606569257495 4.10832773816756 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0139309809228071 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000478003:exon_88879036_88879487:EIF2AK3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 88895123 T/C 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88894987_88895181:EIF2AK3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 88913273 G/C 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88913242_88913371:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88913242_88913371:EIF2AK3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 89160457 T/C 1 10 18 28 4.64393430742505 9.64091824663491 -4.99698393920986 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0863120390025252 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 89160701 A/C 1 11 1 12 5.10832773816756 0.535606569257495 4.57272116891006 A:C A C 10 0.535606569257495 0.00784967326968918 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 89160715 T/C 1 11 1 12 5.10832773816756 0.535606569257495 4.57272116891006 T:C T C 10 0.535606569257495 0.00784967326968918 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 89161042 A/C 1 30 3 33 13.9318029222752 1.60681970777248 12.3249832145027 A:C A C 10 0.535606569257495 5.31741857703129e-06 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 89161069 G/C 1 20 9 29 9.2878686148501 4.82045912331745 4.46740949153265 C:G G C 10 0.535606569257495 0.135055713773349 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 89161073 A/T 1 8 21 29 3.71514744594004 11.2477379544074 -7.53259050846735 A:T A T 10 0.535606569257495 0.00795373459296077 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 89161083 G/A 1 8 22 30 3.71514744594004 11.7833445236649 -8.06819707772485 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00509670932833296 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 89161095 T/C 1 25 1 26 11.6098357685626 0.535606569257495 11.0742291993051 T:C T C 10 0.535606569257495 3.1096049167013e-06 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 96684975 C/T 1 11 13 24 5.10832773816756 6.96288540034743 -1.85455766217988 T:C C T 10 0.535606569257495 0.540621078426603 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 96685021 A/G 1 10 6 16 4.64393430742505 3.21363941554497 1.43029489188008 A:G A G 10 0.535606569257495 0.618142335020353 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 96685307 G/A 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 A:G G A 10 0.535606569257495 0.824415845788285 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 96688990 C/T 1 11 9 20 5.10832773816756 4.82045912331745 0.287868614850101 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000186281:ENST00000335448:exon_96688706_96689040:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000484440:exon_96688706_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000482704:exon_96688854_96689748:GPAT2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 96795608 T/G 1 12 16 28 5.57272116891006 8.56970510811992 -2.99698393920986 T:G T G 10 0.535606569257495 0.263118689191783 ENSG00000188886:ENST00000342380:exon_96795563_96795717:ASTL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 96795714 G/A 1 6 10 16 2.78636058445503 5.35606569257495 -2.56970510811992 A:G G A 10 0.535606569257495 0.218581872606213 ENSG00000188886:ENST00000342380:exon_96795563_96795717:ASTL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 96952833 A/G 1 61 87 148 28.3279992752928 46.5977715254021 -18.2697722501093 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00291665760236717 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96952744_96952898:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000480615:exon_96952744_96952898:SNRNP200 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 96993757 C/T 1 12 7 19 5.57272116891006 3.74924598480246 1.8234751841076 T:C C T 10 0.535606569257495 0.493225271714711 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 96993884 A/G 1 15 19 34 6.96590146113758 10.1765248158924 -3.21062335475483 A:G A G 10 0.535606569257495 0.304201610600924 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 97020049 T/C 1 11 13 24 5.10832773816756 6.96288540034743 -1.85455766217988 T:C T C 10 0.535606569257495 0.540621078426603 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000477409:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97019921_97020126:NCAPH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 97030247 T/C 1 25 22 47 11.6098357685626 11.7833445236649 -0.173508755102263 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435349:exon_97030218_97030329:NCAPH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 97166296 A/G 1 20 19 39 9.2878686148501 10.1765248158924 -0.888656201042302 A:G A G 10 0.535606569257495 0.872763077008478 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 97213229 G/T 1 122 68 190 56.6559985505856 36.4212467095097 20.234751841076 T:G G T 10 0.535606569257495 0.00352530669692593 ENSG00000196843:ENST00000359765:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000470579:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000357485:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000412735:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000467498:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000454558:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000497920:exon_97213127_97213254:ARID5A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 97268597 C/T 1 4 7 11 1.85757372297002 3.74924598480246 -1.89167226183244 T:C C T 10 0.535606569257495 0.36607342785591 ENSG00000114982:ENST00000354204:exon_97268490_97268599:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000447759:exon_97268490_97268599:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000487070:exon_97268490_97268599:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000431828:exon_97268490_97268599:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000420155:exon_97268490_97268599:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000421845:exon_97268490_97268599:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000441706:exon_97268490_97268599:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000432113:exon_97268490_97268599:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000440133:exon_97268490_97268599:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000444759:exon_97268490_97268599:KIAA1310 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 99193496 C/T 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409463:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000498026:exon_99193452_99193606:INPP4A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 99226173 T/A 1 7 11 18 3.25075401519754 5.89167226183244 -2.64091824663491 A:T T A 10 0.535606569257495 0.242609580355471 ENSG00000115446:ENST00000409975:exon_99225042_99226502:UNC50;ENSG00000115446:ENST00000409347:exon_99226106_99226502:UNC50 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 20 20 40 9.2878686148501 10.7121313851499 -1.4242627702998 T:C T C 10 0.535606569257495 0.751697080345037 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 28 29 57 13.0030160607901 15.5325905084674 -2.52957444767721 T:C T C 10 0.535606569257495 0.509936478228601 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 46 42 88 21.3620978141552 22.4954759088148 -1.13337809465956 A:G G A 10 0.535606569257495 0.83131129362042 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 99978048 G/A 1 244 186 430 113.311997101171 99.6228218818941 13.6891752192772 A:G G A 10 0.535606569257495 0.191925383213103 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99977611_99978283:EIF5B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 99995517 C/T 1 161 140 301 74.7673423495433 74.9849196960493 -0.217577346505976 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995482_99995589:EIF5B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 100020945 C/T 1 22 20 42 10.2166554763351 10.7121313851499 -0.495475908814788 T:C C T 10 0.535606569257495 0.878554888979615 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100020907_100021140:REV1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 101624471 T/C 1 5 10 15 2.32196715371253 5.35606569257495 -3.03409853886242 T:C T C 10 0.535606569257495 0.128072258736022 ENSG00000204634:ENST00000463751:exon_101622395_101624492:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101624079_101624735:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101624079_101624735:TBC1D8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 101638888 A/G 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000204634:ENST00000463751:exon_101638743_101638970:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101638743_101638983:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101638743_101638983:TBC1D8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 101646144 G/A 0 0 11 11 0 5.89167226183244 -5.89167226183244 A G A 10 0.535606569257495 0.000216644039036914 ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101645953_101646238:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101645953_101646238:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000473937:exon_101645953_101646238:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000485875:exon_101645953_101646434:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000481317:exon_101645953_101646238:TBC1D8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 105889349 G/A 1 12 10 22 5.57272116891006 5.35606569257495 0.216655476335111 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 105924510 A/G 1 9 11 20 4.17954087668255 5.89167226183244 -1.7121313851499 A:G A G 10 0.535606569257495 0.505071075446385 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105924071_105924775:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105924071_105924778:TGFBRAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 105977776 G/A 1 23 25 48 10.6810489070776 13.3901642314374 -2.70911532435976 A:G G A 10 0.535606569257495 0.470986547988651 ENSG00000115641:ENST00000409177:exon_105974169_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000344213:exon_105977269_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393353:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000530340:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393352:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000322142:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000336660:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000358129:exon_105977287_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000409807:exon_105977314_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000408995:exon_105977318_105977891:FHL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 106739534 G/C 1 30 14 44 13.9318029222752 7.49849196960493 6.43331095267022 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0685394950092076 ENSG00000115652:ENST00000283148:exon_106739426_106739547:UXS1;ENSG00000115652:ENST00000409501:exon_106739426_106739547:UXS1;ENSG00000115652:ENST00000409032:exon_106739426_106739547:UXS1;ENSG00000115652:ENST00000428048:exon_106739426_106739547:UXS1;ENSG00000115652:ENST00000441952:exon_106739426_106739547:UXS1;ENSG00000115652:ENST00000416298:exon_106739426_106739547:UXS1;ENSG00000115652:ENST00000444193:exon_106739426_106739547:UXS1;ENSG00000115652:ENST00000457835:exon_106739427_106739547:UXS1;ENSG00000115652:ENST00000436241:exon_106739508_106739547:UXS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 111598958 C/T 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000153093:ENST00000389811:exon_111598948_111598982:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000439055:exon_111598948_111598982:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000283065:exon_111598948_111598982:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000340561:exon_111598948_111598982:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000422487:exon_111598948_111598982:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000417074:exon_111598948_111598982:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000433706:exon_111598948_111598982:ACOXL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 113498566 A/G 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 A:G A G 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113498395_113498584:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113498395_113498584:CKAP2L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 113537223 C/A 0 0 46 46 0 24.6379021858448 -24.6379021858448 A C A 10 0.535606569257495 4.75071646006014e-16 ENSG00000115008:ENST00000263339:exon_113537073_113537243:IL1A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 113956371 G/C 1 41 35 76 19.0401306604427 18.7462299240123 0.293900736430384 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113956317_113956407:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000464559:exon_113956135_113956803:PSD4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 120438515 G/C 1 10 6 16 4.64393430742505 3.21363941554497 1.43029489188008 C:G G C 10 0.535606569257495 0.618142335020353 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000445518:exon_120438408_120438771:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000409951:exon_120438408_120438699:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120438430_120439035:TMEM177 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 120438523 A/G 1 5 11 16 2.32196715371253 5.89167226183244 -3.56970510811992 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0832026742777677 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000445518:exon_120438408_120438771:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000409951:exon_120438408_120438699:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120438430_120439035:TMEM177 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 120439230 C/G 1 18 17 35 8.35908175336509 9.10531167737741 -0.746229924012324 C:G C G 10 0.535606569257495 0.866104025326506 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120439135_120439242:TMEM177 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 122125373 G/T 1 12 14 26 5.57272116891006 7.49849196960493 -1.92577080069487 T:G G T 10 0.535606569257495 0.556217330538579 ENSG00000074054:ENST00000429969:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000442289:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000263710:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000455322:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000397587:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000376194:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000409078:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000452274:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000472776:exon_122125164_122125407:CLASP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 246 292 538 114.240783962656 156.397118223189 -42.1563342605323 A:C A C 10 0.535606569257495 0.000278302982347539 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 127816695 C/T 1 45 46 91 20.8977043834127 24.6379021858448 -3.74019780243204 T:C C T 10 0.535606569257495 0.462641197513612 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127816587_127816731:BIN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 127821207 G/A 1 34 49 83 15.7893766452452 26.2447218936173 -10.4553452483721 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0271491075527046 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127821147_127821222:BIN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 28 42 70 13.0030160607901 22.4954759088148 -9.49245984802465 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0302719962879384 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 133539566 G/A 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000176771:ENST00000317721:exon_133539513_133543291:NCKAP5;ENSG00000176771:ENST00000409261:exon_133539513_133543291:NCKAP5;ENSG00000176771:ENST00000473859:exon_133539513_133539596:NCKAP5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 42 39 81 19.5045240911852 20.8886562010423 -1.38413210985709 T:C T C 10 0.535606569257495 0.82389735977334 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 152139416 G/A 1 70 54 124 32.5075401519754 28.9227547399047 3.58478541207063 A:G G A 10 0.535606569257495 0.530039628466197 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000414946:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000477072:exon_152139285_152139468:NMI HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 152314385 G/A 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152314275_152314477:RIF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 152321090 C/G 1 27 17 44 12.5386226300476 9.10531167737741 3.43331095267022 A:T:C:G C G 10 0.535606569257495 0.364851067911095 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 152321272 C/T 1 18 15 33 8.35908175336509 8.03409853886242 0.324983214502668 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 152698480 C/T 1 10 4 14 4.64393430742505 2.14242627702998 2.50150803039507 T:C C T 10 0.535606569257495 0.283626359522875 ENSG00000182389:ENST00000360283:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000339254:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000439467:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000397327:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000427385:exon_152698417_152698602:CACNB4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 157352585 C/A 1 4 10 14 1.85757372297002 5.35606569257495 -3.49849196960493 A:C C A 10 0.535606569257495 0.104522536584723 ENSG00000115159:ENST00000415049:exon_157352556_157352727:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000310454:exon_157352556_157352727:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000438166:exon_157352556_157352727:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000495851:exon_157352556_157352727:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000416888:exon_157352556_157352727:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000409674:exon_157352556_157352727:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000409125:exon_157352556_157352727:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000409861:exon_157352556_157352727:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000430992:exon_157352556_157352727:GPD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 159389762 C/T 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 T:C C T 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000144283:ENST00000426248:exon_159389692_159389828:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000389757:exon_159389692_159389828:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000389759:exon_159389692_159389828:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000428353:exon_159389692_159389828:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000457109:exon_159389692_159389828:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000452162:exon_159389692_159389828:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000411900:exon_159389692_159389828:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000421462:exon_159389692_159389828:PKP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 9 13 22 4.17954087668255 6.96288540034743 -2.78334452366489 T:G G T 10 0.535606569257495 0.286635935669917 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 160604452 C/T 1 53 41 94 24.6128518293528 21.9598693395573 2.65298248979547 T:C C T 10 0.535606569257495 0.606476642166774 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 160605268 T/C 1 53 58 111 24.6128518293528 31.0651810169347 -6.45232918758194 T:C T C 10 0.535606569257495 0.253393149361601 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 160673526 A/G 1 57 83 140 26.4704255523228 44.4553452483721 -17.9849196960493 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00288795829532985 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 216 189 405 100.308981040381 101.229641589667 -0.920660549285444 T:C C T 10 0.535606569257495 0.960276702597264 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 163124637 T/C 1 121 121 242 56.1916051198431 64.8083948801569 -8.61678976031377 A:T:C T C 10 0.535606569257495 0.273746131461297 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163124597_163124787:IFIH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 95 67 162 44.117375920538 35.8856401402522 8.23173578028582 T:C T C 10 0.535606569257495 0.207885434614690 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 170402752 T/C 1 32 17 49 14.8605897837602 9.10531167737741 5.75527810638275 T:C T C 10 0.535606569257495 0.115172296028967 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 170493863 A/G 1 92 91 183 42.7241956283105 48.740197802432 -6.01600217412157 A:G A G 10 0.535606569257495 0.374968234807657 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 170917648 A/G 1 8 3 11 3.71514744594004 1.60681970777248 2.10832773816756 A:G A G 10 0.535606569257495 0.239570670048551 ENSG00000144357:ENST00000272793:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000442603:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000418381:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000421104:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000430321:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392632:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392631:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000439681:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000444475:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000474426:exon_170917589_170917696:UBR3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 171822466 C/T 1 97 103 200 45.046162782023 55.167476633522 -10.121313851499 T:C C T 10 0.535606569257495 0.156627376538931 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 172291616 C/T 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000115827:ENST00000468592:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000375255:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000436317:exon_172291593_172291696:DCAF17;ENSG00000115827:ENST00000490217:exon_172291593_172291696:DCAF17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 11 30 41 5.10832773816756 16.0681970777248 -10.9598693395573 A:G G A 10 0.535606569257495 0.000786551003745707 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 172725301 A/G 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 A:G A G 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000115840:ENST00000422440:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000392592:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000263812:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000426896:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000475360:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000472748:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000484227:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000464063:exon_172725191_172725333:SLC25A12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 174131392 T/C 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 T:C T C 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000091436:ENST00000409176:exon_174130778_174131511:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000375213:exon_174130778_174132738:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000431503:exon_174130778_174131478:AC013461.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 175260355 G/T 1 19 17 36 8.8234751841076 9.10531167737741 -0.281836493269818 T:G G T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000138433:ENST00000414336:exon_175260279_175260429:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000342016:exon_175260279_175260443:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000362053:exon_175260279_175260397:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000425101:exon_175260279_175260412:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000461454:exon_175260279_175260434:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000472169:exon_175260279_175260437:CIR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 175289314 T/C 1 10 6 16 4.64393430742505 3.21363941554497 1.43029489188008 T:C T C 10 0.535606569257495 0.618142335020353 ENSG00000144306:ENST00000437944:exon_175289203_175289377:SCRN3;ENSG00000144306:ENST00000456879:exon_175289203_175289377:SCRN3;ENSG00000144306:ENST00000272732:exon_175289203_175289377:SCRN3;ENSG00000144306:ENST00000409673:exon_175289203_175289377:SCRN3;ENSG00000144306:ENST00000475928:exon_175289203_175289377:SCRN3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 175436576 A/C 1 71 72 143 32.9719335827179 38.5636729865396 -5.59173940382178 A:C A C 10 0.535606569257495 0.357445605799346 ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 81 77 158 37.6158678901429 41.2417058328271 -3.6258379426842 T:C C T 10 0.535606569257495 0.577335624574792 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 180810358 C/T 1 53 55 108 24.6128518293528 29.4583613091622 -4.84550947980945 T:C C T 10 0.535606569257495 0.38549880842609 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000404136:exon_180810348_180810442:CWC22 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 182374534 A/G 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 A:G A G 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000115232:ENST00000425522:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000490435:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000476824:exon_182374385_182374534:ITGA4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 182399097 T/C 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 182468803 T/G 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 T:G T G 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000188452:ENST00000374972:exon_182468564_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000410087:exon_182468564_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000409440:exon_182468564_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000374969:exon_182468564_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000452174:exon_182468564_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000339098:exon_182468564_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000374970:exon_182468564_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000374967:exon_182468564_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000494398:exon_182468564_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000421817:exon_182468564_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000479558:exon_182468564_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000466715:exon_182468564_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000460319:exon_182468564_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000476070:exon_182468564_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000497337:exon_182468590_182468806:CERKL;ENSG00000188452:ENST00000456282:exon_182468623_182468806:CERKL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 183584755 G/A 1 12 16 28 5.57272116891006 8.56970510811992 -2.99698393920986 A:G G A 10 0.535606569257495 0.263118689191783 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000469118:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183584734_183584896:DNAJC10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 183593697 C/T 1 12 13 25 5.57272116891006 6.96288540034743 -1.39016423143737 T:C C T 10 0.535606569257495 0.689399952434429 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000494462:exon_183593303_183593834:DNAJC10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 183622547 T/G 1 20 7 27 9.2878686148501 3.74924598480246 5.53862263004764 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0344851320394945 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183622419_183622552:DNAJC10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 14 26 40 6.50150803039507 13.9257708006949 -7.4242627702998 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0252767038649333 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 185802243 C/A 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:C C A 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 185802363 A/G 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 A:G A G 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 190323530 A/G 1 7 19 26 3.25075401519754 10.1765248158924 -6.92577080069487 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00924210964082018 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190323479_190323598:WDR75 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 190788123 G/T 0 1172 0 1172 544.269100830216 0 544.269100830216 G G 10 0.535606569257495 2.75392685057557e-318 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 197021276 T/C 1 19 3 22 8.8234751841076 1.60681970777248 7.21665547633511 T:C T C 10 0.535606569257495 0.00203090749059820 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 198001319 A/G 1 14 17 31 6.50150803039507 9.10531167737741 -2.60380364698234 A:G A G 10 0.535606569257495 0.372415799031098 ENSG00000065413:ENST00000282272:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000328737:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000450567:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000337207:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409153:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409919:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000447713:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000443014:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000463879:exon_197998695_198001386:ANKRD44 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 61 72 133 28.3279992752928 38.5636729865396 -10.2356737112468 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0820293021915962 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 86 88 174 39.9378350438554 47.1333780946596 -7.19554305080412 A:G A G 10 0.535606569257495 0.287719610098852 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 80 68 148 37.1514744594004 36.4212467095097 0.730227749890744 T:C T C 10 0.535606569257495 0.934440516108162 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 292 229 521 135.602881776811 122.653904359966 12.9489774168451 T:C T C 10 0.535606569257495 0.272171490111778 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 201253956 A/G 1 16 16 32 7.43029489188008 8.56970510811992 -1.13941021623984 A:G A G 10 0.535606569257495 0.72535006961681 ENSG00000196141:ENST00000439084:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000439395:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000444012:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000451764:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000423749:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000471601:exon_201253946_201255577:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000457757:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000428692:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000453663:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000459656:exon_201253946_201255591:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409397:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000421573:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000449647:exon_201253946_201254006:SPATS2L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 201371768 G/T 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 T:G G T 10 0.535606569257495 0.824415845788285 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000468413:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000478816:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000458583:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000447556:exon_201371580_201371814:KCTD18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 17 24 41 7.89468832262259 12.8545576621799 -4.95986933955729 T:C T C 10 0.535606569257495 0.157963000017993 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 202025486 G/A 1 71 59 130 32.9719335827179 31.6007875861922 1.37114599652566 A:G G A 10 0.535606569257495 0.86054774293919 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 74 75 149 34.3651138749454 40.1704926943121 -5.80537881936675 A:G A G 10 0.535606569257495 0.366516589783772 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 202050549 A/G 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000003400:ENST00000286186:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000360132:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000460140:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000272879:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000438843:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000374650:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000346817:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000313728:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000448480:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000484926:exon_202050494_202051103:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000492363:exon_202050501_202050847:CASP10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 202050677 A/G 1 11 5 16 5.10832773816756 2.67803284628747 2.43029489188008 A:G A G 10 0.535606569257495 0.316760693759888 ENSG00000003400:ENST00000286186:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000360132:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000460140:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000272879:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000438843:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000374650:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000346817:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000313728:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000448480:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000484926:exon_202050494_202051103:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000492363:exon_202050501_202050847:CASP10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 202082459 T/A 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:T T A 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000003400:ENST00000286186:exon_202082311_202086388:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000360132:exon_202082311_202086383:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000346817:exon_202082311_202086388:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000313728:exon_202082311_202082493:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000492363:exon_202082311_202082464:CASP10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 13 16 29 6.03711459965257 8.56970510811992 -2.53259050846735 A:C C A 10 0.535606569257495 0.358571526558961 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 215595164 G/A 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215595135_215595232:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000432456:exon_215595135_215595232:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000471590:exon_215595135_215595234:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215595139_215595232:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215595135_215595232:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000421162:exon_215595135_215595232:BARD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 216904019 A/T 1 23 13 36 10.6810489070776 6.96288540034743 3.71816350673018 A:T A T 10 0.535606569257495 0.244144740015931 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216903914_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216903112_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216903132_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216903979_216904083:PECR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 216923679 C/T 1 13 18 31 6.03711459965257 9.64091824663491 -3.60380364698234 T:C C T 10 0.535606569257495 0.211027479808991 ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000497889:exon_216923618_216923699:PECR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 48 55 103 22.2908846756402 29.4583613091622 -7.16747663352198 C:G G C 10 0.535606569257495 0.167199003499364 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 25 39 64 11.6098357685626 20.8886562010423 -9.27882043247968 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0235908634228717 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 26 30 56 12.0742291993051 16.0681970777248 -3.99396787841972 A:G G A 10 0.535606569257495 0.287743002275495 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 17 19 36 7.89468832262259 10.1765248158924 -2.28183649326982 A:G G A 10 0.535606569257495 0.505289503245558 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 220473355 G/A 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 A:G G A 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000426736:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000475396:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000473899:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220473305_220473510:STK11IP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 230632268 G/A 1 119 114 233 55.2628182583581 61.0591488953544 -5.79633063699632 A:G G A 10 0.535606569257495 0.47019601808739 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230631930_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230632157_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230632157_230632466:TRIP12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 230668858 T/C 1 22 20 42 10.2166554763351 10.7121313851499 -0.495475908814788 T:C T C 10 0.535606569257495 0.878554888979615 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000487178:exon_230668715_230668943:TRIP12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 T:C T C 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 75 72 147 34.8295073056879 38.5636729865396 -3.73416568085176 A:G G A 10 0.535606569257495 0.563146892272401 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 12 15 27 5.57272116891006 8.03409853886242 -2.46137736995236 T:C C T 10 0.535606569257495 0.440874576584086 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 39 40 79 18.1113437989577 21.4242627702998 -3.3129189713421 A:G G A 10 0.535606569257495 0.499061656533247 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 167 30 197 77.5537029339983 16.0681970777248 61.4855058562735 T:C C T 10 0.535606569257495 2.09533158198408e-20 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 162 3 165 75.2317357802858 1.60681970777248 73.6249160725133 A:G G A 10 0.535606569257495 9.72436880228639e-40 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 232079570 C/T 1 38 10 48 17.6469503682152 5.35606569257495 12.2908846756402 T:C C T 10 0.535606569257495 0.000391768705018394 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232079544_232079714:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000482392:exon_232079544_232079993:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000440107:exon_232079544_232079714:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232079544_232079714:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232079544_232079714:ARMC9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 233127939 G/A 1 9 5 14 4.17954087668255 2.67803284628747 1.50150803039507 A:G G A 10 0.535606569257495 0.593847168610995 ENSG00000144535:ENST00000273009:exon_233127917_233128072:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_233127917_233128150:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_233127917_233128150:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000445090:exon_233127917_233128150:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_233127917_233128150:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_233127917_233128150:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000424049:exon_233127917_233128150:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000498319:exon_233127917_233128150:DIS3L2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 233599904 A/C 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 A:C A C 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000204120:ENST00000476995:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000427233:exon_233599865_233599947:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373566:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373563:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000428883:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409480:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000456491:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000484409:exon_233599865_233600161:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000492910:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409547:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000475359:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000488629:exon_233599865_233600298:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000490612:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000464402:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000421433:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000425040:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000430720:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000423659:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409196:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000488734:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409451:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000463554:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000440945:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000429187:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000482666:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000490229:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000483164:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000464805:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000489328:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000424038:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000414511:exon_233599858_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000452341:exon_233599858_233599948:GIGYF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 233925166 G/A 1 21 33 54 9.75226204559261 17.6750167854973 -7.92275473990473 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0397637201607061 ENSG00000168918:ENST00000422935:exon_233924677_233925322:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000451407:exon_233925062_233925322:INPP5D HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 5 10 15 2.32196715371253 5.35606569257495 -3.03409853886242 T:C T C 10 0.535606569257495 0.128072258736022 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 239006879 C/T 1 13 10 23 6.03711459965257 5.35606569257495 0.681048907077616 T:C C T 10 0.535606569257495 0.836732692537685 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 239098594 T/C 1 13 5 18 6.03711459965257 2.67803284628747 3.35908175336509 T:C T C 10 0.535606569257495 0.155428393933381 ENSG00000132323:ENST00000254654:exon_239098494_239098613:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000463129:exon_239098504_239098613:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000457149:exon_239098500_239098613:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000498727:exon_239098332_239098613:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000467133:exon_239098339_239098613:ILKAP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 240961728 T/C 1 22 23 45 10.2166554763351 12.3189510929224 -2.10229561658727 T:C T C 10 0.535606569257495 0.552806536195651 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 241463461 T/C 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 T:C T C 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000144504:ENST00000373318:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000272972:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000361678:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000391987:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000403283:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000401804:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000373320:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405523:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405002:exon_241461355_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000480230:exon_241461356_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000484526:exon_241461356_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000459901:exon_241462675_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000496300:exon_241463240_241463798:ANKMY1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 241500896 C/T 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000188542:ENST00000343217:exon_241500747_241500936:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000405954:exon_241500747_241503431:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000438823:exon_241500747_241500936:DUSP28 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 241531479 A/G 1 7 11 18 3.25075401519754 5.89167226183244 -2.64091824663491 A:G A G 10 0.535606569257495 0.242609580355471 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391982:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241529301_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000432084:exon_241531350_241531567:CAPN10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 241536053 C/T 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 T:C C T 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000142330:ENST00000483602:exon_241535736_241536119:CAPN10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 241536126 A/G 1 9 13 22 4.17954087668255 6.96288540034743 -2.78334452366489 A:G A G 10 0.535606569257495 0.286635935669917 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241536098_241536359:CAPN10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 A:G G A 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 241570249 A/C 1 1 19 20 0.464393430742505 10.1765248158924 -9.7121313851499 A:C A C 10 0.535606569257495 9.01272572236462e-06 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 242035544 G/C 1 64 118 182 29.7211795675203 63.2015751723844 -33.4803956048641 C:G G C 10 0.535606569257495 7.23822622147051e-07 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242034545_242035853:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242034981_242035853:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000406593:exon_242035284_242035853:MTERFD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 242039198 T/C 1 32 47 79 14.8605897837602 25.1735087551023 -10.3129189713421 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0236185170391150 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000495694:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000401626:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000475860:exon_242038583_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000434791:exon_242038814_242039309:MTERFD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 242063448 G/A 1 3 9 12 1.39318029222752 4.82045912331745 -3.42727883108994 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0782949617348295 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242063364_242063548:PASK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 242065624 A/G 1 12 21 33 5.57272116891006 11.2477379544074 -5.67501678549733 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0548679181404862 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 242066830 G/A 1 24 31 55 11.1454423378201 16.6038036469823 -5.45836130916222 A:G G A 10 0.535606569257495 0.175889663980193 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000459710:exon_242066401_242066866:PASK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 242312543 A/C 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 A:C A C 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000006607:ENST00000264042:exon_242312499_242312705:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000478489:exon_242312499_242312705:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000373287:exon_242312499_242312705:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000479427:exon_242312499_242312705:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000492868:exon_242312499_242312705:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000418082:exon_242312499_242312705:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000445489:exon_242312264_242312705:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000464142:exon_242312497_242312705:FARP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 242572846 A/G 1 90 67 157 41.7954087668255 35.8856401402522 5.90976862657329 A:G A G 10 0.535606569257495 0.378925398814310 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 242573211 T/C 1 48 53 101 22.2908846756402 28.3871481706472 -6.09626349500699 T:C T C 10 0.535606569257495 0.232476546575707 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 25 25 50 11.6098357685626 13.3901642314374 -1.78032846287475 A:G A G 10 0.535606569257495 0.671437816138516 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 242674803 G/A 1 14 6 20 6.50150803039507 3.21363941554497 3.2878686148501 A:G G A 10 0.535606569257495 0.179439517734263 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000342518:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000463932:exon_242674547_242674931:D2HGDH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 242690675 G/A 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 2 242793273 A/G 1 50 50 100 23.2196715371253 26.7803284628747 -3.5606569257495 A:G A G 10 0.535606569257495 0.484463834212932 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 2443441 G/A 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 A:G G A 10 0.535606569257495 0.319105578626484 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 2633296 G/C 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2632791_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2633178_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2633278_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000470143:exon_2633279_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2633292_2633577:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2633295_2633309:NOP56 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 2636218 C/A 1 8 15 23 3.71514744594004 8.03409853886242 -4.31895109292238 A:C C A 10 0.535606569257495 0.093185649776015 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 127 130 257 58.9779657042981 69.6288540034743 -10.6508882991762 T:C T C 10 0.535606569257495 0.189367824343239 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 392 365 757 182.042224851062 195.496397778986 -13.4541729279237 T:C T C 10 0.535606569257495 0.343444227481761 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 2840773 C/T 1 12 6 18 5.57272116891006 3.21363941554497 2.35908175336509 T:C C T 10 0.535606569257495 0.346395564026953 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2840700_2840797:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2840700_2840797:VPS16 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 2840929 G/A 1 15 12 27 6.96590146113758 6.42727883108994 0.538622630047636 A:G G A 10 0.535606569257495 0.850150419291182 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2840885_2841013:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2840885_2841013:VPS16 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 2844911 C/T 1 36 32 68 16.7181635067302 17.1394102162398 -0.421246709509656 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000458279:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380443:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000487461:exon_2844595_2844933:VPS16;ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2844830_2844933:PTPRA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 2967430 G/A 1 12 15 27 5.57272116891006 8.03409853886242 -2.46137736995236 A:G G A 10 0.535606569257495 0.440874576584086 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000455631:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000418580:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000430705:exon_2967411_2967495:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2967411_2967495:PTPRA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 2996497 C/T 1 16 8 24 7.43029489188008 4.28485255405996 3.14544233782012 T:C C T 10 0.535606569257495 0.224088576462827 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2996495_2996531:PTPRA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 3008448 C/T 1 37 24 61 17.1825569374727 12.8545576621799 4.32799927529281 T:C C T 10 0.535606569257495 0.305035862974407 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_3008353_3008487:PTPRA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 3018782 G/A 1 26 28 54 12.0742291993051 14.9969839392099 -2.92275473990473 A:G G A 10 0.535606569257495 0.495540905951554 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_3018705_3019320:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_3018705_3019320:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_3018705_3019314:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_3018705_3019314:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_3018705_3019314:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_3018705_3019320:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_3018705_3019314:PTPRA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 3090848 T/G 1 12 10 22 5.57272116891006 5.35606569257495 0.216655476335111 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000185019:ENST00000217173:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000348031:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000440298:exon_3088219_3090960:UBOX5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 3129497 C/T 1 23 34 57 10.6810489070776 18.2106233547548 -7.52957444767721 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0472275649136591 ENSG00000215251:ENST00000380266:exon_3127165_3129906:FASTKD5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 3765373 G/A 1 136 115 251 63.1575065809807 61.5947554646119 1.56275111636877 A:G G A 10 0.535606569257495 0.849746129130357 ENSG00000125817:ENST00000379751:exon_3764500_3767337:CENPB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 4680251 A/G 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 A:G A G 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000171867:ENST00000420824:exon_4679862_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000455665:exon_4679862_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000379440:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000531860:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000430350:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000525336:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000424424:exon_4679862_4680613:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000444805:exon_4680216_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000379436:exon_4679857_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000457586:exon_4679857_4680517:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000431433:exon_4679857_4680516:PRNP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 5166418 G/A 1 11 17 28 5.10832773816756 9.10531167737741 -3.99698393920986 A:G G A 10 0.535606569257495 0.134872699384411 ENSG00000101290:ENST00000460006:exon_5166404_5166472:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000379062:exon_5166404_5166472:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000450570:exon_5166404_5166472:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000468817:exon_5166404_5166472:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000379070:exon_5166404_5166472:CDS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 21 10 31 9.75226204559261 5.35606569257495 4.39619635301766 T:C T C 10 0.535606569257495 0.148891051636974 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 12 10 22 5.57272116891006 5.35606569257495 0.216655476335111 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 44 28 72 20.4333109526702 14.9969839392099 5.43632701346036 T:C T C 10 0.535606569257495 0.237269497037959 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 44 28 72 20.4333109526702 14.9969839392099 5.43632701346036 T:C T C 10 0.535606569257495 0.237269497037959 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 5924828 A/G 1 17 18 35 7.89468832262259 9.64091824663491 -1.74622992401232 A:G A G 10 0.535606569257495 0.612809759315648 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000493972:exon_5924808_5924899:TRMT6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 5935303 A/C 1 7 8 15 3.25075401519754 4.28485255405996 -1.03409853886242 A:C A C 10 0.535606569257495 0.614879753164389 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5935254_5935336:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5935254_5935336:MCM8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 5974265 A/G 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5974152_5974341:MCM8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 6751034 A/G 1 11 12 23 5.10832773816756 6.42727883108994 -1.31895109292238 A:G A G 10 0.535606569257495 0.677398717546528 ENSG00000125845:ENST00000378827:exon_6750767_6751119:BMP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 6759115 A/T 1 34 33 67 15.7893766452452 17.6750167854973 -1.88564014025216 A:T A T 10 0.535606569257495 0.713637175411483 ENSG00000125845:ENST00000378827:exon_6758892_6760910:BMP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 6759706 C/T 1 29 18 47 13.4674094915326 9.64091824663491 3.82649124489774 T:C C T 10 0.535606569257495 0.306762156095718 ENSG00000125845:ENST00000378827:exon_6758892_6760910:BMP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 33 54 87 15.3249832145027 28.9227547399047 -13.5977715254021 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00363267476303029 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 7980390 C/T 1 19 7 26 8.8234751841076 3.74924598480246 5.07422919930513 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0502330532950512 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7980379_7980469:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7980379_7980507:TMX4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 10639222 G/A 1 1 15 16 0.464393430742505 8.03409853886242 -7.56970510811992 A:G G A 10 0.535606569257495 0.000136898764807670 ENSG00000101384:ENST00000254958:exon_10639116_10639370:JAG1;ENSG00000101384:ENST00000423891:exon_10639116_10639370:JAG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 10653469 C/T 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 T:C C T 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000101384:ENST00000254958:exon_10653349_10653654:JAG1;ENSG00000101384:ENST00000423891:exon_10653349_10653654:JAG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 15967719 T/C 1 7 8 15 3.25075401519754 4.28485255405996 -1.03409853886242 T:C T C 10 0.535606569257495 0.614879753164389 ENSG00000172264:ENST00000217246:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000310348:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000402914:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000378058:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000486914:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000407045:exon_15967711_15967803:MACROD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 17597482 G/A 1 29 26 55 13.4674094915326 13.9257708006949 -0.458361309162223 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17597377_17597484:RRBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 22 19 41 10.2166554763351 10.1765248158924 0.0401306604427081 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 17608233 C/T 1 18 18 36 8.35908175336509 9.64091824663491 -1.28183649326982 T:C C T 10 0.535606569257495 0.739235820904023 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000495501:exon_17608149_17608327:RRBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 18143355 C/T 1 7 13 20 3.25075401519754 6.96288540034743 -3.7121313851499 T:C C T 10 0.535606569257495 0.117274980565469 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18143021_18143589:CSRP2BP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 23065209 G/A 1 11 3 14 5.10832773816756 1.60681970777248 3.50150803039507 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0660918331472145 ENSG00000125810:ENST00000246006:exon_23064896_23066977:CD93 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 23065342 A/G 1 15 6 21 6.96590146113758 3.21363941554497 3.75226204559261 A:G A G 10 0.535606569257495 0.126040587665888 ENSG00000125810:ENST00000246006:exon_23064896_23066977:CD93 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 31023500 C/T 1 27 21 48 12.5386226300476 11.2477379544074 1.29088467564024 T:C C T 10 0.535606569257495 0.77316784325406 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 31024034 G/A 1 36 37 73 16.7181635067302 19.8174430625273 -3.09927955579713 A:G G A 10 0.535606569257495 0.483309384932854 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 31024207 C/T 1 41 39 80 19.0401306604427 20.8886562010423 -1.8485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 0.736991768339007 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 31024274 T/C 1 46 38 84 21.3620978141552 20.3530496317848 1.00904818237043 T:C T C 10 0.535606569257495 0.912982029905851 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 31025163 A/G 1 15 16 31 6.96590146113758 8.56970510811992 -1.60380364698234 A:G A G 10 0.535606569257495 0.592923006525255 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 31291161 C/T 1 48 35 83 22.2908846756402 18.7462299240123 3.54465475162792 T:C C T 10 0.535606569257495 0.443878265012862 ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31290493_31291260:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31290494_31291260:COMMD7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 86 95 181 39.9378350438554 50.882624079462 -10.9447890356066 T:C C T 10 0.535606569257495 0.117368528293935 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 32212690 C/T 1 9 3 12 4.17954087668255 1.60681970777248 2.57272116891006 T:C C T 10 0.535606569257495 0.158222040248362 ENSG00000078699:ENST00000375279:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000342704:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000346541:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397800:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000492345:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000359606:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397803:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000491618:exon_32212570_32212823:CBFA2T2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 32264533 C/A 1 13 29 42 6.03711459965257 15.5325905084674 -9.49547590881479 A:C C A 10 0.535606569257495 0.00474003469709873 ENSG00000101412:ENST00000343380:exon_32263489_32264785:E2F1;ENSG00000101412:ENST00000402461:exon_32263489_32264785:E2F1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 18 17 35 8.35908175336509 9.10531167737741 -0.746229924012324 T:C C T 10 0.535606569257495 0.866104025326506 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 33719520 C/T 1 8 2 10 3.71514744594004 1.07121313851499 2.64393430742505 T:C C T 10 0.535606569257495 0.118289200524796 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33719445_33719586:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33719445_33719586:EDEM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 34240787 C/T 1 47 41 88 21.8264912448977 21.9598693395573 -0.133378094659555 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 39797465 T/C 1 11 17 28 5.10832773816756 9.10531167737741 -3.99698393920986 T:C T C 10 0.535606569257495 0.134872699384411 ENSG00000124181:ENST00000244007:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373271:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373272:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000477870:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000483175:exon_39797396_39797510:PLCG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 40034097 A/G 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 A:G A G 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40030741_40034129:CHD6;ENSG00000124177:ENST00000480022:exon_40033163_40034129:CHD6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 40043913 C/T 1 8 3 11 3.71514744594004 1.60681970777248 2.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.239570670048551 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40043826_40044278:CHD6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 42225114 G/A 1 10 17 27 4.64393430742505 9.10531167737741 -4.46137736995236 A:G G A 10 0.535606569257495 0.121108055706691 ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000486243:exon_42225075_42225162:IFT52 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 42328639 T/C 1 88 31 119 40.8666219053404 16.6038036469823 24.2628182583581 T:C T C 10 0.535606569257495 7.7384153311219e-06 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42328397_42328684:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42328397_42328684:MYBL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 43530234 A/C 1 71 59 130 32.9719335827179 31.6007875861922 1.37114599652566 A:C A C 10 0.535606569257495 0.86054774293919 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 43955910 G/A 1 13 4 17 6.03711459965257 2.14242627702998 3.89468832262259 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0861319747680826 ENSG00000124145:ENST00000372733:exon_43953928_43956055:SDC4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 43976991 A/G 1 8 9 17 3.71514744594004 4.82045912331745 -1.10531167737741 A:G A G 10 0.535606569257495 0.633230727718346 ENSG00000124145:ENST00000372733:exon_43976965_43977064:SDC4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 44047974 G/A 1 18 29 47 8.35908175336509 15.5325905084674 -7.17350875510226 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0404733089349167 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44047935_44048035:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000455050:exon_44047935_44048035:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44047935_44048035:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44047874_44048035:PIGT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 32 25 57 14.8605897837602 13.3901642314374 1.47042555232279 A:G G A 10 0.535606569257495 0.790871386983224 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 44592539 C/A 1 1 8 9 0.464393430742505 4.28485255405996 -3.82045912331745 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0150595260113486 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44592377_44592629:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44592377_44592629:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44592377_44592629:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000475002:exon_44592112_44593155:ZNF335 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 44596207 C/G 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 C:G C G 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44595506_44596273:ZNF335 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 44596545 G/A 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596373_44596666:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44596373_44597497:ZNF335 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 45315786 C/T 1 25 23 48 11.6098357685626 12.3189510929224 -0.709115324359757 T:C C T 10 0.535606569257495 0.885446087317048 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 48259034 A/G 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 A:G A G 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000158470:ENST00000371711:exon_48259005_48259121:B4GALT5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 48522124 T/G 1 18 15 33 8.35908175336509 8.03409853886242 0.324983214502668 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 18 21 39 8.35908175336509 11.2477379544074 -2.8886562010423 A:G G A 10 0.535606569257495 0.422689700861272 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 50092193 T/C 1 1 14 15 0.464393430742505 7.49849196960493 -7.03409853886242 T:C T C 10 0.535606569257495 0.000270036333000439 ENSG00000101096:ENST00000371564:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000396009:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000371567:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000414705:exon_50091995_50092197:NFATC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 52198340 T/A 1 17 10 27 7.89468832262259 5.35606569257495 2.53862263004764 A:T T A 10 0.535606569257495 0.343243524231033 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52198000_52199707:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52198000_52199636:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52198000_52199707:ZNF217 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 52198472 A/G 1 6 22 28 2.78636058445503 11.7833445236649 -8.99698393920986 A:G A G 10 0.535606569257495 0.000889907330433782 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52198000_52199707:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52198000_52199636:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52198000_52199707:ZNF217 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 52198967 A/G 1 6 19 25 2.78636058445503 10.1765248158924 -7.39016423143737 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00407326931613447 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52198000_52199707:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52198000_52199636:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52198000_52199707:ZNF217 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 52570229 T/C 1 7 14 21 3.25075401519754 7.49849196960493 -4.24773795440739 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0794265593904473 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52569971_52570234:BCAS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 54961463 T/C 1 23 32 55 10.6810489070776 17.1394102162398 -6.45836130916222 T:C T C 10 0.535606569257495 0.103902964191372 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 54961541 A/T 1 33 30 63 15.3249832145027 16.0681970777248 -0.743213863222181 A:T A T 10 0.535606569257495 0.899771809126861 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 55929860 A/G 1 17 19 36 7.89468832262259 10.1765248158924 -2.28183649326982 A:G A G 10 0.535606569257495 0.505289503245558 ENSG00000101146:ENST00000395841:exon_55929768_55929872:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000371242:exon_55929768_55929872:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000527947:exon_55929768_55929872:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000492498:exon_55929768_55929872:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000411894:exon_55929768_55929872:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000429339:exon_55929768_55929872:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000395840:exon_55929768_55929872:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000452119:exon_55929768_55929872:RAE1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 57244493 G/A 1 12 23 35 5.57272116891006 12.3189510929224 -6.74622992401232 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0268178425820046 ENSG00000254995:ENST00000371138:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000435446:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000124222:ENST00000355957:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000312283:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000359617:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371141:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371132:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000358029:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000464640:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361830:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361770:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000468590:exon_57244358_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000438253:exon_57244347_57244509:STX16 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 57268867 C/A 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 A:C C A 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57268793_57268978:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57268225_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57268235_57268978:NPEPL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 26 8 34 12.0742291993051 4.28485255405996 7.78937664524517 C:G C G 10 0.535606569257495 0.00897077800765184 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 231 262 493 107.274882501519 140.328921145464 -33.054038643945 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00329562403902186 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 57564070 C/T 1 22 14 36 10.2166554763351 7.49849196960493 2.71816350673018 T:C C T 10 0.535606569257495 0.406300371907785 ENSG00000101158:ENST00000344018:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000482747:exon_57563969_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000460601:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000477741:exon_57563969_57564076:TH1L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 34 75 109 15.7893766452452 40.1704926943121 -24.381116049067 A:T:G A G 10 0.535606569257495 2.93624530517425e-06 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 60572663 C/A 1 6 16 22 2.78636058445503 8.56970510811992 -5.78334452366489 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0172729085887099 ENSG00000130699:ENST00000474089:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60572606_60572725:TAF4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 60713311 G/A 1 137 127 264 63.6219000117232 68.0220342957019 -4.40013428397867 A:G G A 10 0.535606569257495 0.621668573165985 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 60713332 A/G 1 128 119 247 59.4423591350406 63.7371817416419 -4.29482260660125 A:G A G 10 0.535606569257495 0.609998641115888 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 60878683 A/G 1 97 122 219 45.046162782023 65.3440014494144 -20.2978386673914 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0066302858097977 ENSG00000130706:ENST00000491935:exon_60878624_60878837:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000423787:exon_60878624_60878837:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000370744:exon_60878624_60878837:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000253003:exon_60878624_60878837:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000462554:exon_60878314_60878837:ADRM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 60881330 G/A 1 32 37 69 14.8605897837602 19.8174430625273 -4.95685327876715 A:G G A 10 0.535606569257495 0.27727493066384 ENSG00000130706:ENST00000423787:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000370744:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000253003:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000462554:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000465805:exon_60881253_60881376:ADRM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 60883273 A/C 1 3 8 11 1.39318029222752 4.28485255405996 -2.89167226183244 A:C A C 10 0.535606569257495 0.127650256211486 ENSG00000130702:ENST00000492698:exon_60883011_60883502:LAMA5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 60963494 C/T 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 60968547 A/G 1 3 8 11 1.39318029222752 4.28485255405996 -2.89167226183244 A:G A G 10 0.535606569257495 0.127650256211486 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60968496_60968661:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60968496_60968661:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60968496_60968661:CABLES2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 61443870 C/G 1 68 49 117 31.5787532904903 26.2447218936173 5.33403139687309 C:G C G 10 0.535606569257495 0.354349766608128 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 61488785 T/C 1 11 36 47 5.10832773816756 19.2818364932698 -14.1735087551023 T:C T C 10 0.535606569257495 4.78133581000038e-05 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61488747_61488990:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61488747_61488990:TCFL5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 61512497 G/A 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61509090_61513766:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61509095_61513766:DIDO1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 61528306 A/G 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61527883_61528348:DIDO1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 61834092 G/A 1 29 25 54 13.4674094915326 13.3901642314374 0.0772452600952711 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 61834695 G/A 1 33 29 62 15.3249832145027 15.5325905084674 -0.207607293964688 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 61834855 G/A 1 31 18 49 14.3961963530177 9.64091824663491 4.75527810638275 A:G G A 10 0.535606569257495 0.198147525873058 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000342761:exon_61834757_61834987:YTHDF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 61867454 A/G 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 A:G A G 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000101197:ENST00000342412:exon_61867235_61867797:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61867235_61867797:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000370327:exon_61867235_61867797:BIRC7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62126185 A/G 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62126158_62126454:EEF1A2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 36 28 64 16.7181635067302 14.9969839392099 1.72117956752032 A:G A G 10 0.535606569257495 0.7081142508232 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62195087 A/G 1 24 21 45 11.1454423378201 11.2477379544074 -0.102295616587273 A:C:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62196253 C/A 1 24 17 41 11.1454423378201 9.10531167737741 2.04013066044271 A:C C A 10 0.535606569257495 0.536421902381782 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62197370 G/A 1 18 9 27 8.35908175336509 4.82045912331745 3.53862263004764 A:G G A 10 0.535606569257495 0.183063497330438 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62198236 G/A 1 14 13 27 6.50150803039507 6.96288540034743 -0.461377369952364 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62198686 G/A 1 21 4 25 9.75226204559261 2.14242627702998 7.60983576856263 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00211384173780864 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62198713 G/A 1 20 4 24 9.2878686148501 2.14242627702998 7.14544233782012 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00345050357196155 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62200738 G/A 1 16 11 27 7.43029489188008 5.89167226183244 1.53862263004764 A:G G A 10 0.535606569257495 0.57043982842636 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62200860 A/G 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 A:G A G 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62236148 T/C 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 T:C T C 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62236096_62236193:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62236096_62236255:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62236096_62236193:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000447518:exon_62236096_62236193:GMEB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62321189 C/T 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 T:C C T 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000425905:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62321103_62321563:RTEL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62324166 C/T 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 T:C C T 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62324289 C/T 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 T:C C T 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62378349 C/T 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 T:C C T 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000130584:ENST00000245663:exon_62375019_62378654:ZBTB46;ENSG00000130584:ENST00000302995:exon_62378225_62378654:ZBTB46;ENSG00000130584:ENST00000395104:exon_62375878_62378654:ZBTB46 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62378364 C/T 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 T:C C T 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000130584:ENST00000245663:exon_62375019_62378654:ZBTB46;ENSG00000130584:ENST00000302995:exon_62378225_62378654:ZBTB46;ENSG00000130584:ENST00000395104:exon_62375878_62378654:ZBTB46 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62378418 C/T 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 T:C C T 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000130584:ENST00000245663:exon_62375019_62378654:ZBTB46;ENSG00000130584:ENST00000302995:exon_62378225_62378654:ZBTB46;ENSG00000130584:ENST00000395104:exon_62375878_62378654:ZBTB46 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62560701 C/T 1 25 27 52 11.6098357685626 14.4613773699524 -2.85154160138974 T:C C T 10 0.535606569257495 0.487565406422855 ENSG00000101152:ENST00000369911:exon_62560665_62560878:DNAJC5;ENSG00000101152:ENST00000360864:exon_62560665_62560878:DNAJC5;ENSG00000101152:ENST00000470551:exon_62560665_62560878:DNAJC5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62595169 A/G 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 A:G A G 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62595142_62595266:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62595142_62595266:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62595142_62595266:ZNF512B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62597694 T/G 1 6 8 14 2.78636058445503 4.28485255405996 -1.49849196960493 T:G T G 10 0.535606569257495 0.436988882100625 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62597494_62598134:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62597494_62598134:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62597494_62598134:ZNF512B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 20 62607160 C/T 1 12 12 24 5.57272116891006 6.42727883108994 -0.854557662179879 T:C C T 10 0.535606569257495 0.838559306298216 ENSG00000130590:ENST00000369886:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000498830:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000478694:exon_62607045_62607185:SAMD10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 19169218 G/C 1 24 16 40 11.1454423378201 8.56970510811992 2.5757372297002 C:G G C 10 0.535606569257495 0.433090933174964 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 26965148 G/A 1 64 65 129 29.7211795675203 34.8144270017372 -5.09324743421685 A:G G A 10 0.535606569257495 0.378538510320971 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 26965205 T/C 1 72 72 144 33.4363270134604 38.5636729865396 -5.12734597307927 T:C T C 10 0.535606569257495 0.404320401213992 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 26969703 T/C 1 20 24 44 9.2878686148501 12.8545576621799 -3.56668904732978 T:C T C 10 0.535606569257495 0.293655926545451 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 26976222 C/T 1 77 70 147 35.7582941671729 37.4924598480246 -1.73416568085175 T:C C T 10 0.535606569257495 0.804323664796257 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 26976237 C/T 1 88 74 162 40.8666219053404 39.6348861250546 1.23173578028582 T:C C T 10 0.535606569257495 0.875026277744222 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 30714776 T/C 1 16 18 34 7.43029489188008 9.64091824663491 -2.21062335475483 T:C T C 10 0.535606569257495 0.493886486229954 ENSG00000156273:ENST00000286800:exon_30714720_30718469:BACH1;ENSG00000156273:ENST00000399921:exon_30714720_30718469:BACH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 20 31 51 9.2878686148501 16.6038036469823 -7.31593503213224 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0486239192531454 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 34652190 T/C 1 31 29 60 14.3961963530177 15.5325905084674 -1.1363941554497 T:C T C 10 0.535606569257495 0.796718348664013 ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34652057_34652223:AP000295.9;ENSG00000249624:ENST00000451624:exon_34652057_34652223:AP000295.9;ENSG00000249624:ENST00000432231:exon_34652057_34652223:AP000295.9;ENSG00000243646:ENST00000290200:exon_34652057_34652223:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000422891:exon_34652057_34652223:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000493295:exon_34652057_34652223:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000498371:exon_34652057_34652223:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000451065:exon_34652057_34652223:IL10RB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 17 22 39 7.89468832262259 11.7833445236649 -3.8886562010423 C:G G C 10 0.535606569257495 0.261055940276911 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 34883618 T/C 1 29 27 56 13.4674094915326 14.4613773699524 -0.993967878419717 T:C T C 10 0.535606569257495 0.790646657603327 ENSG00000159131:ENST00000414353:exon_34883559_34883664:GART;ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34883559_34883765:GART HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 34924243 T/C 1 59 64 123 27.3992124138078 34.2788204324797 -6.87960801867188 T:C T C 10 0.535606569257495 0.239884863518076 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 34925689 G/A 1 57 61 118 26.4704255523228 32.6720007247072 -6.2015751723844 A:G G A 10 0.535606569257495 0.268621526875916 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 216 235 451 100.308981040381 125.867543775511 -25.5585627351302 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0160690530874750 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 37442632 G/C 0 25 0 25 11.6098357685626 0 11.6098357685626 G G 10 0.535606569257495 3.0663332515218e-07 ENSG00000159228:ENST00000466328:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000439427:exon_37442313_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000399191:exon_37442333_37442702:CBR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 40552341 A/G 1 45 30 75 20.8977043834127 16.0681970777248 4.82950730568788 A:G A G 10 0.535606569257495 0.297903563113192 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 112 152 264 52.0120642431606 81.4121985271392 -29.4001342839787 A:G A G 10 0.535606569257495 0.000329328900363557 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 43984831 A/C 0 0 10 10 0 5.35606569257495 -5.35606569257495 C A C 10 0.535606569257495 0.000466509697801987 ENSG00000160190:ENST00000398341:exon_43984818_43984903:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000352133:exon_43984818_43984903:SLC37A1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 43985955 G/A 1 1 13 14 0.464393430742505 6.96288540034743 -6.49849196960493 A:G G A 10 0.535606569257495 0.000531937566170442 ENSG00000160190:ENST00000398341:exon_43985937_43985985:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000352133:exon_43985937_43985985:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000496416:exon_43985937_43985985:SLC37A1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 45168884 G/A 1 48 32 80 22.2908846756402 17.1394102162398 5.1514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.263841115739394 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398085:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45168876_45168961:PDXK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 19 18 37 8.8234751841076 9.64091824663491 -0.817443062527312 T:C T C 10 0.535606569257495 0.869525755309081 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 45220483 A/G 1 40 27 67 18.5757372297002 14.4613773699524 4.11435985974784 A:G A G 10 0.535606569257495 0.329616009451388 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 25 28 53 11.6098357685626 14.9969839392099 -3.38714817064723 A:G G A 10 0.535606569257495 0.409020107961968 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 45506819 T/C 1 15 11 26 6.96590146113758 5.89167226183244 1.07422919930513 T:C T C 10 0.535606569257495 0.69956771663553 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45506683_45506841:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45506683_45506841:TRAPPC10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 45523416 C/T 1 41 40 81 19.0401306604427 21.4242627702998 -2.38413210985709 T:C C T 10 0.535606569257495 0.656221959751725 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45523174_45524614:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000459741:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000468864:exon_45523174_45524932:TRAPPC10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 45528919 G/A 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45528865_45528977:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000456705:exon_45528865_45528977:PWP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 18 9 27 8.35908175336509 4.82045912331745 3.53862263004764 T:C T C 10 0.535606569257495 0.183063497330438 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 34 22 56 15.7893766452452 11.7833445236649 4.00603212158028 A:G A G 10 0.535606569257495 0.348443389354150 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 45547913 C/A 1 25 24 49 11.6098357685626 12.8545576621799 -1.24472189361725 A:C C A 10 0.535606569257495 0.775315484446398 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 22 18 40 10.2166554763351 9.64091824663491 0.575737229700202 T:C T C 10 0.535606569257495 0.875604229083889 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 45564766 C/G 1 79 66 145 36.6870810286579 35.3500335709947 1.33704745766323 C:G C G 10 0.535606569257495 0.867896223301242 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45564702_45564894:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45564702_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000419699:exon_45564703_45564798:C21orf33 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 28 13 41 13.0030160607901 6.96288540034743 6.04013066044271 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0615420571584368 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 45732116 C/T 1 85 88 173 39.4734416131129 47.1333780946596 -7.65993648154662 T:C C T 10 0.535606569257495 0.253390288515068 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000491298:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45731988_45732177:PFKL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 46311813 A/G 1 68 53 121 31.5787532904903 28.3871481706472 3.19160511984311 A:G A G 10 0.535606569257495 0.585385908104479 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46311724_46311911:ITGB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 46320313 C/T 1 105 143 248 48.761310227963 76.5917394038218 -27.8304291758587 T:C C T 10 0.535606569257495 0.000443638850459945 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000320216:exon_46320235_46320390:ITGB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 46387078 G/T 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 T:G G T 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000160256:ENST00000291634:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000397826:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000458015:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000479127:exon_46386949_46387096:C21orf70 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 46396659 G/C 1 18 16 34 8.35908175336509 8.56970510811992 -0.210623354754828 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000160256:ENST00000291634:exon_46396595_46396904:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000397826:exon_46396595_46396904:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000479127:exon_46396595_46396888:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000485207:exon_46396595_46396888:C21orf70 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 47819533 A/G 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 A:G A G 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47819504_47819710:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47819504_47819710:PCNT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 21 47836057 A/G 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 17589246 G/A 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 A:G G A 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 17590180 G/A 1 1 11 12 0.464393430742505 5.89167226183244 -5.42727883108994 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00205041889200729 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 17630486 C/A 1 24 28 52 11.1454423378201 14.9969839392099 -3.85154160138974 A:C C A 10 0.535606569257495 0.330782951142194 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 17662793 A/G 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17662710_17662912:CECR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 17669306 T/C 1 8 9 17 3.71514744594004 4.82045912331745 -1.10531167737741 T:C T C 10 0.535606569257495 0.633230727718346 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000469063:exon_17669229_17669617:CECR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 17690430 C/G 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 C:G C G 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17690246_17690575:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17690246_17690779:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17690246_17690614:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17690246_17690613:CECR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 18209613 A/G 1 16 15 31 7.43029489188008 8.03409853886242 -0.603803646982342 A:G A G 10 0.535606569257495 0.858638851870196 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 18209920 C/T 1 20 28 48 9.2878686148501 14.9969839392099 -5.70911532435976 T:C C T 10 0.535606569257495 0.111695704780918 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 18609642 C/T 1 30 40 70 13.9318029222752 21.4242627702998 -7.49245984802465 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0927077166051968 ENSG00000215193:ENST00000474897:exon_18609121_18609801:PEX26;ENSG00000183785:ENST00000316027:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000330423:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000416740:exon_18609121_18609801:TUBA8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 18912678 A/G 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000100033:ENST00000491604:exon_18912564_18912713:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000420436:exon_18912564_18912713:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000357068:exon_18912564_18912713:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000334029:exon_18912564_18912713:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000482858:exon_18912564_18912713:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000438924:exon_18912564_18912713:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000450579:exon_18912564_18912713:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000457083:exon_18912564_18912713:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000496625:exon_18912238_18912713:PRODH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 19026613 A/G 1 7 8 15 3.25075401519754 4.28485255405996 -1.03409853886242 A:G A G 10 0.535606569257495 0.614879753164389 ENSG00000070413:ENST00000263196:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000389262:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000467659:exon_19025350_19026634:DGCR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 19121872 G/A 1 19 15 34 8.8234751841076 8.03409853886242 0.789376645245174 A:G G A 10 0.535606569257495 0.864291458650162 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19117792_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19121450_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19121481_19121988:DGCR14 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 19950263 G/T 1 83 33 116 38.5446547516279 17.6750167854973 20.8696379661306 T:G G T 10 0.535606569257495 8.3015149891193e-05 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 20302276 A/T 1 26 26 52 12.0742291993051 13.9257708006949 -1.85154160138974 A:T A T 10 0.535606569257495 0.677176838890062 ENSG00000128185:ENST00000248879:exon_20301799_20302347:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000405465:exon_20301806_20302347:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000443409:exon_20301917_20302347:DGCR6L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 20303664 G/A 1 11 5 16 5.10832773816756 2.67803284628747 2.43029489188008 A:G G A 10 0.535606569257495 0.316760693759888 ENSG00000128185:ENST00000248879:exon_20303642_20303742:DGCR6L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 20761192 G/T 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 T:G G T 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000185252:ENST00000400451:exon_20759667_20761968:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000403682:exon_20759667_20761697:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000357502:exon_20759667_20761971:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000493734:exon_20759667_20761970:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000356671:exon_20759667_20762752:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000437275:exon_20759667_20762745:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000405993:exon_20759667_20761258:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000476678:exon_20759667_20761683:ZNF74 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 20761193 C/T 1 9 2 11 4.17954087668255 1.07121313851499 3.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0728086494533878 ENSG00000185252:ENST00000400451:exon_20759667_20761968:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000403682:exon_20759667_20761697:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000357502:exon_20759667_20761971:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000493734:exon_20759667_20761970:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000356671:exon_20759667_20762752:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000437275:exon_20759667_20762745:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000405993:exon_20759667_20761258:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000476678:exon_20759667_20761683:ZNF74 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 21081656 G/A 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 A:G G A 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000241973:ENST00000255882:exon_21081518_21081685:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000477245:exon_21081518_21081685:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000414196:exon_21081518_21081685:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000437178:exon_21081518_21081685:PI4KA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 21337325 G/A 1 8 5 13 3.71514744594004 2.67803284628747 1.03711459965257 A:G G A 10 0.535606569257495 0.593641770478394 ENSG00000099949:ENST00000479606:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000215739:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000414985:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000389355:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000493460:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000443265:exon_21337316_21337378:LZTR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 21982892 C/T 1 65 40 105 30.1855729982628 21.4242627702998 8.76131022796303 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0961600056749961 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 21984205 A/G 1 61 51 112 28.3279992752928 27.3159350321322 1.01206424316057 A:G A G 10 0.535606569257495 0.924583803926993 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 15 5 20 6.96590146113758 2.67803284628747 4.2878686148501 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0714762006587093 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 23523630 C/A 1 13 14 27 6.03711459965257 7.49849196960493 -1.46137736995236 A:C C A 10 0.535606569257495 0.700365719696074 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23522397_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23522552_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23522552_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23523071_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23523071_23524426:BCR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 301 275 576 139.782422653494 147.291806545811 -7.50938389231709 A:G G A 10 0.535606569257495 0.531264993144183 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 24109550 T/C 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 T:C T C 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 24459438 T/C 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 T:C T C 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24459422_24459609:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24459422_24459609:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24459422_24459609:CABIN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 24717518 G/A 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 A:G G A 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000100014:ENST00000398280:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000437398:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000421374:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000314328:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000440893:exon_24717256_24717656:SPECC1L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 46 55 101 21.3620978141552 29.4583613091622 -8.09626349500699 T:C T C 10 0.535606569257495 0.111128757078129 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 24982103 C/G 1 3 13 16 1.39318029222752 6.96288540034743 -5.56970510811992 C:G C G 10 0.535606569257495 0.00554034475850392 ENSG00000178026:ENST00000318753:exon_24981588_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000446942:exon_24981588_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000491910:exon_24981603_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000404045:exon_24981617_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000460524:exon_24981630_24982379:C22orf36 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 29659960 C/T 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000496342:exon_29659824_29660390:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000414672:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000406335:exon_29659946_29660207:RHBDD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 65 62 127 30.1855729982628 33.2076072939647 -3.02203429570186 T:C C T 10 0.535606569257495 0.59482627203303 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 29755888 T/C 1 16 20 36 7.43029489188008 10.7121313851499 -3.28183649326982 T:C T C 10 0.535606569257495 0.317098320507134 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000421126:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000473606:exon_29755662_29755948:AP1B1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 8 13 21 3.71514744594004 6.96288540034743 -3.24773795440739 T:C C T 10 0.535606569257495 0.190432172043740 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 79 81 160 36.6870810286579 43.3841321098571 -6.69705108119919 A:G A G 10 0.535606569257495 0.303298268139737 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 30198025 C/T 1 51 47 98 23.6840649678678 25.1735087551023 -1.4894437872345 T:C C T 10 0.535606569257495 0.762510183425382 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30197983_30198197:ASCC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 30987861 G/C 1 8 16 24 3.71514744594004 8.56970510811992 -4.85455766217988 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0637114810029004 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 31011610 G/C 1 20 18 38 9.2878686148501 9.64091824663491 -0.353049631784808 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31011588_31011774:TCN2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 31022537 C/A 1 51 28 79 23.6840649678678 14.9969839392099 8.6870810286579 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0550517543317952 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31022447_31023265:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31022447_31023033:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31022447_31022992:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31022447_31023047:TCN2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 7 15 22 3.25075401519754 8.03409853886242 -4.78334452366489 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0529765719617484 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 31816384 C/G 1 30 41 71 13.9318029222752 21.9598693395573 -8.02806641728214 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0577988804296374 ENSG00000185721:ENST00000331457:exon_31816242_31816411:DRG1;ENSG00000185721:ENST00000416465:exon_31816242_31816411:DRG1;ENSG00000185721:ENST00000433341:exon_31816242_31816411:DRG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 31998612 G/A 1 12 10 22 5.57272116891006 5.35606569257495 0.216655476335111 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_31998593_31998771:SFI1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 32352791 G/A 1 188 172 360 87.305964979591 92.1243299122891 -4.81836493269817 A:G G A 10 0.535606569257495 0.634496810675954 ENSG00000128245:ENST00000248975:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000397492:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000471374:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000427094:exon_32352126_32353589:YWHAH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 32784051 T/C 1 110 133 243 51.0832773816756 71.2356737112468 -20.1523963295713 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0100445280455648 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32783569_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32783588_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32783588_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32783588_32784086:C22orf28 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 88 79 167 40.8666219053404 42.3129189713421 -1.44629706600166 T:C C T 10 0.535606569257495 0.87675563794235 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 34022284 G/A 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000133424:ENST00000452586:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000354992:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000337431:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000397394:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000402320:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000437602:exon_34022228_34022310:LARGE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 35660875 G/T 1 20 20 40 9.2878686148501 10.7121313851499 -1.4242627702998 T:G G T 10 0.535606569257495 0.751697080345037 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 15 8 23 6.96590146113758 4.28485255405996 2.68104890707762 T:G T G 10 0.535606569257495 0.300721382047396 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 15 16 31 6.96590146113758 8.56970510811992 -1.60380364698234 C:G G C 10 0.535606569257495 0.592923006525255 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 36537500 A/T 1 27 40 67 12.5386226300476 21.4242627702998 -8.88564014025216 A:T A T 10 0.535606569257495 0.0366196431193472 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 36537725 G/A 1 43 25 68 19.9689175219277 13.3901642314374 6.57875329049034 A:G G A 10 0.535606569257495 0.115281515594643 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 36684331 C/T 1 264 261 525 122.599865716021 139.793314576206 -17.1934488601848 T:C C T 10 0.535606569257495 0.136896458877188 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 36900271 T/C 1 11 11 22 5.10832773816756 5.89167226183244 -0.783344523664889 T:C T C 10 0.535606569257495 0.831857301870848 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900145_36900414:FOXRED2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 36900806 A/G 1 5 10 15 2.32196715371253 5.35606569257495 -3.03409853886242 A:G A G 10 0.535606569257495 0.128072258736022 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900562_36900813:FOXRED2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 37271802 C/T 1 43 13 56 19.9689175219277 6.96288540034743 13.0060321215803 T:C C T 10 0.535606569257495 0.000420960325953513 ENSG00000100365:ENST00000447071:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37271695_37271825:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000439078:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 37273742 G/A 1 52 28 80 24.1484583986103 14.9969839392099 9.1514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0435494303271231 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 38051355 G/A 1 8 9 17 3.71514744594004 4.82045912331745 -1.10531167737741 A:C:G G A 10 0.535606569257495 0.633230727718346 ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 45 65 110 20.8977043834127 34.8144270017372 -13.9167226183244 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00955568691461096 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 38151170 G/A 1 11 22 33 5.10832773816756 11.7833445236649 -6.67501678549733 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0228439093383 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38151108_38151197:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000407319:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000428075:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000413051:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000418339:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000452519:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000417857:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000331103:exon_38151108_38151517:TRIOBP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 491 430 921 228.01717449457 230.310824780723 -2.29365028615285 A:T:C T C 10 0.535606569257495 0.894889354919368 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 38710112 G/A 1 21 26 47 9.75226204559261 13.9257708006949 -4.17350875510226 A:G G A 10 0.535606569257495 0.243627490653636 ENSG00000213923:ENST00000359867:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000396832:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000402865:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000400206:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000403904:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000438038:exon_38710087_38710173:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000413574:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000405675:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000398519:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000430335:exon_38710087_38710174:CSNK1E HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 40814636 C/T 1 9 13 22 4.17954087668255 6.96288540034743 -2.78334452366489 T:C C T 10 0.535606569257495 0.286635935669917 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 41195082 G/A 1 29 13 42 13.4674094915326 6.96288540034743 6.50452409118521 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0454158954963127 ENSG00000100372:ENST00000263255:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000491545:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000435456:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000420970:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000458600:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000443810:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000412879:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000426396:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000434193:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000449676:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000434185:exon_41195027_41195087:SLC25A17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 41548008 A/G 1 13 9 22 6.03711459965257 4.82045912331745 1.21665547633511 A:G A G 10 0.535606569257495 0.672817163244646 ENSG00000100393:ENST00000263253:exon_41547837_41548016:EP300 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 41605776 G/C 1 24 11 35 11.1454423378201 5.89167226183244 5.25377007598768 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0898358202874434 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000489136:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000453659:exon_41605700_41606012:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000449635:exon_41605700_41605937:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41605700_41605937:L3MBTL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 41610024 G/A 1 13 8 21 6.03711459965257 4.28485255405996 1.75226204559261 A:G G A 10 0.535606569257495 0.515721370266415 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41609855_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000489136:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41609897_41610030:L3MBTL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 41613188 C/T 1 8 13 21 3.71514744594004 6.96288540034743 -3.24773795440739 T:C C T 10 0.535606569257495 0.190432172043740 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41613127_41615540:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000449635:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41613127_41613206:L3MBTL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 42341308 A/G 1 21 25 46 9.75226204559261 13.3901642314374 -3.63790218584477 A:G A G 10 0.535606569257495 0.30315282275424 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42340925_42341308:CENPM HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 42609148 T/C 1 22 28 50 10.2166554763351 14.9969839392099 -4.78032846287475 T:C T C 10 0.535606569257495 0.202214087908662 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 76 56 132 35.2939007364304 29.9939678784197 5.29993285801067 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.383318891657485 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 65 56 121 30.1855729982628 29.9939678784197 0.191605119843111 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 43089849 T/C 1 52 36 88 24.1484583986103 19.2818364932698 4.86662190534044 T:C T C 10 0.535606569257495 0.336433650852008 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 43213768 T/C 1 33 29 62 15.3249832145027 15.5325905084674 -0.207607293964688 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43213735_43213863:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43213735_43213863:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43213735_43213863:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43213735_43213863:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43213735_43213863:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43213735_43213863:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43213735_43213863:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453516:exon_43213735_43213863:ARFGAP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 21 21 42 9.75226204559261 11.2477379544074 -1.49547590881479 C:G G C 10 0.535606569257495 0.646574759194259 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 89 76 165 41.3310153360829 40.7060992635696 0.624916072513336 A:C A C 10 0.535606569257495 0.937947514399414 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 45128232 T/C 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000457960:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000241484:ENST00000517296:exon_45128131_45128271:ARHGAP8;ENSG00000248405:ENST00000352766:exon_45128131_45128271:PRR5-ARHGAP8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 45132704 T/C 1 35 23 58 16.2537700759877 12.3189510929224 3.93481898306529 T:C T C 10 0.535606569257495 0.357039863816727 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45132652_45132754:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 45132785 T/C 1 20 21 41 9.2878686148501 11.2477379544074 -1.95986933955729 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.639101868614473 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 45577231 T/C 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000093000:ENST00000347635:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000432759:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000425733:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000355253:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000407019:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000493456:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000396096:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000440908:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000422489:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000469163:exon_45577167_45577248:NUP50 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 47059939 G/A 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000075240:ENST00000406902:exon_47059923_47060014:GRAMD4;ENSG00000075240:ENST00000361034:exon_47059923_47060014:GRAMD4;ENSG00000075240:ENST00000424413:exon_47059923_47060014:GRAMD4;ENSG00000075240:ENST00000418035:exon_47059923_47060014:GRAMD4;ENSG00000075240:ENST00000456069:exon_47059923_47060014:GRAMD4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 47083010 T/C 1 6 9 15 2.78636058445503 4.82045912331745 -2.03409853886242 T:C T C 10 0.535606569257495 0.312839743181367 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 47083012 T/A 1 6 9 15 2.78636058445503 4.82045912331745 -2.03409853886242 A:T T A 10 0.535606569257495 0.312839743181367 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 47085924 G/A 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 A:C:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47085889_47086097:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47085889_47086097:CERK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 50356302 C/T 1 21 14 35 9.75226204559261 7.49849196960493 2.25377007598768 T:C C T 10 0.535606569257495 0.500309753279666 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 50684296 T/C 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 50688348 A/G 1 28 22 50 13.0030160607901 11.7833445236649 1.21967153712525 A:G A G 10 0.535606569257495 0.777936932990307 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496909:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000488270:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000489424:exon_50688288_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470965:exon_50688297_50688393:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50688289_50688393:MAPK12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 50694297 A/G 1 24 29 53 11.1454423378201 15.5325905084674 -4.38714817064723 A:G A G 10 0.535606569257495 0.270588558101027 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000496942:exon_50694044_50694628:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000497738:exon_50694239_50694582:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50694239_50694310:MAPK12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 50699668 A/G 1 6 8 14 2.78636058445503 4.28485255405996 -1.49849196960493 A:G A G 10 0.535606569257495 0.436988882100625 ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50699596_50699737:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50699596_50700137:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50699596_50699725:MAPK12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 50704661 T/C 1 13 10 23 6.03711459965257 5.35606569257495 0.681048907077616 T:C T C 10 0.535606569257495 0.836732692537685 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 25 88 113 11.6098357685626 47.1333780946596 -35.5235423260969 A:G G A 10 0.535606569257495 1.57561039216705e-11 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 32 90 122 14.8605897837602 48.2045912331745 -33.3440014494144 A:G A G 10 0.535606569257495 1.42352818355833e-09 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 50720622 C/T 1 15 36 51 6.96590146113758 19.2818364932698 -12.3159350321322 T:C C T 10 0.535606569257495 0.000627941391246614 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720613_50720991:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720613_50720742:PLXNB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 50728062 T/C 1 6 24 30 2.78636058445503 12.8545576621799 -10.0681970777248 T:C T C 10 0.535606569257495 0.000312641973495052 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000414275:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000432455:exon_50727946_50729026:PLXNB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 50752133 C/T 1 57 46 103 26.4704255523228 24.6379021858448 1.83252336647802 T:C C T 10 0.535606569257495 0.767307096054715 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 72 89 161 33.4363270134604 47.6689846639171 -14.2326576504567 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0267927728044895 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 51011376 G/C 1 8 3 11 3.71514744594004 1.60681970777248 2.10832773816756 C:G G C 10 0.535606569257495 0.239570670048551 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000475238:exon_51011304_51011529:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 22 51015838 T/C 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 T:C T C 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000460853:exon_51015785_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000461117:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000417176:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51015753_51015892:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51015753_51015892:CTA-384D8.32 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 3197918 A/G 1 7 17 24 3.25075401519754 9.10531167737741 -5.85455766217988 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0226378372672811 ENSG00000113851:ENST00000491834:exon_3195108_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000231948:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000432408:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000424814:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000488263:exon_3195108_3198468:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000482844:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000480249:exon_3197774_3197965:CRBN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 4403837 A/G 1 10 3 13 4.64393430742505 1.60681970777248 3.03711459965257 A:G A G 10 0.535606569257495 0.102916600745183 ENSG00000144455:ENST00000272902:exon_4402830_4403938:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000383843:exon_4403450_4403938:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000458465:exon_4403479_4403938:SUMF1;ENSG00000144455:ENST00000405420:exon_4403793_4403938:SUMF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 4829711 A/G 1 13 19 32 6.03711459965257 10.1765248158924 -4.13941021623984 A:G A G 10 0.535606569257495 0.158318922859624 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4829631_4829823:ITPR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 4829732 A/G 1 21 29 50 9.75226204559261 15.5325905084674 -5.78032846287475 A:G A G 10 0.535606569257495 0.118633742692167 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4829631_4829823:ITPR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 4856234 G/A 1 28 33 61 13.0030160607901 17.6750167854973 -4.67200072470719 A:G G A 10 0.535606569257495 0.249236931787248 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 8955389 C/T 1 6 14 20 2.78636058445503 7.49849196960493 -4.7121313851499 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0427972984363222 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_8955328_8955404:RAD18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 9005078 C/T 1 12 16 28 5.57272116891006 8.56970510811992 -2.99698393920986 T:C C T 10 0.535606569257495 0.263118689191783 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000415439:exon_9005019_9005115:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000495087:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000418463:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000421052:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000413832:exon_9005019_9005277:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000469793:exon_9005019_9005127:RAD18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 9005085 T/C 1 16 11 27 7.43029489188008 5.89167226183244 1.53862263004764 T:C T C 10 0.535606569257495 0.57043982842636 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000415439:exon_9005019_9005115:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000495087:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000418463:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000421052:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000413832:exon_9005019_9005277:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000469793:exon_9005019_9005127:RAD18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 9425944 G/C 1 43 49 92 19.9689175219277 26.2447218936173 -6.27580437168954 C:G G C 10 0.535606569257495 0.209927538263978 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 9426224 G/A 1 53 60 113 24.6128518293528 32.1363941554497 -7.52354232609693 A:G G A 10 0.535606569257495 0.158445748209253 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9426208_9427386:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9426208_9428475:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9426208_9426344:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9426208_9426554:THUMPD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 9704000 A/G 1 33 4 37 15.3249832145027 2.14242627702998 13.1825569374727 A:G A G 10 0.535606569257495 7.05081022634036e-06 ENSG00000163719:ENST00000353332:exon_9703951_9704059:MTMR14;ENSG00000163719:ENST00000296003:exon_9703951_9704059:MTMR14;ENSG00000163719:ENST00000419048:exon_9703951_9704059:MTMR14;ENSG00000163719:ENST00000430020:exon_9703951_9704059:MTMR14;ENSG00000163719:ENST00000351233:exon_9703951_9704059:MTMR14;ENSG00000163719:ENST00000437997:exon_9703951_9704059:MTMR14;ENSG00000163719:ENST00000449543:exon_9703951_9704059:MTMR14 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 9985656 C/T 1 6 9 15 2.78636058445503 4.82045912331745 -2.03409853886242 T:C C T 10 0.535606569257495 0.312839743181367 ENSG00000163703:ENST00000295982:exon_9985586_9985779:CRELD1;ENSG00000163703:ENST00000326434:exon_9985586_9985779:CRELD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 37 36 73 17.1825569374727 19.2818364932698 -2.09927955579713 C:G G C 10 0.535606569257495 0.640348010798636 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 47 31 78 21.8264912448977 16.6038036469823 5.2226875979154 C:G C G 10 0.535606569257495 0.257243534767918 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 38 25 63 17.6469503682152 13.3901642314374 4.25678613677782 A:G A G 10 0.535606569257495 0.313351984859553 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 10067794 A/G 1 11 9 20 5.10832773816756 4.82045912331745 0.287868614850101 A:G A G 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 10067797 T/C 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 T:C T C 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 14 8 22 6.50150803039507 4.28485255405996 2.21665547633511 T:G T G 10 0.535606569257495 0.39723941481764 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 11684957 C/T 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 T:C C T 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11684911_11685398:VGLL4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 11887991 C/G 1 18 14 32 8.35908175336509 7.49849196960493 0.860589783760162 C:G C G 10 0.535606569257495 0.859952664418775 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11887976_11888393:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11887976_11888246:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11887976_11888355:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11887976_11888253:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11887976_11888366:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11887976_11888359:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000494388:exon_11887976_11888338:C3orf31 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 12475557 C/T 1 6 34 40 2.78636058445503 18.2106233547548 -15.4242627702998 T:C C T 10 0.535606569257495 6.00575396836042e-07 ENSG00000132170:ENST00000397010:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000309576:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397015:exon_12475397_12475810:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397012:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397026:exon_12475397_12475838:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397000:exon_12475397_12475715:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000287820:exon_12475397_12475855:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397023:exon_12475397_12475843:PPARG HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 21 13 34 9.75226204559261 6.96288540034743 2.78937664524517 T:C C T 10 0.535606569257495 0.391865967418225 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 53 56 109 24.6128518293528 29.9939678784197 -5.38111604906695 T:C C T 10 0.535606569257495 0.337025418106466 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 41 23 64 19.0401306604427 12.3189510929224 6.72117956752032 T:G G T 10 0.535606569257495 0.103401201107943 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 31 42 73 14.3961963530177 22.4954759088148 -8.09927955579713 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0608855284191865 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 54 47 101 25.0772452600953 25.1735087551023 -0.0962634950069869 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 13379400 C/T 1 30 31 61 13.9318029222752 16.6038036469823 -2.67200072470719 T:C C T 10 0.535606569257495 0.522529839545491 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13379337_13379417:NUP210 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 13383540 A/G 1 74 63 137 34.3651138749454 33.7432138632222 0.621900011723191 A:G A G 10 0.535606569257495 0.931952669346735 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13383496_13383623:NUP210 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 13395475 G/C 1 23 19 42 10.6810489070776 10.1765248158924 0.504524091185214 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 13395579 C/A 1 27 16 43 12.5386226300476 8.56970510811992 3.96891752192772 A:C C A 10 0.535606569257495 0.284459330159204 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 13407556 T/C 1 17 17 34 7.89468832262259 9.10531167737741 -1.21062335475483 T:C T C 10 0.535606569257495 0.732486001530963 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13407446_13407591:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13407446_13407591:NUP210 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 13421150 C/T 1 10 14 24 4.64393430742505 7.49849196960493 -2.85455766217988 T:C C T 10 0.535606569257495 0.306768141328979 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13421063_13421221:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13421063_13421221:NUP210 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 14174427 A/T 1 13 14 27 6.03711459965257 7.49849196960493 -1.46137736995236 A:T A T 10 0.535606569257495 0.700365719696074 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14174366_14174435:TMEM43 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 14175262 T/C 1 13 13 26 6.03711459965257 6.96288540034743 -0.925770800694869 T:C T C 10 0.535606569257495 0.844636479883657 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14175239_14175309:TMEM43 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 14176378 C/T 1 13 13 26 6.03711459965257 6.96288540034743 -0.925770800694869 T:C C T 10 0.535606569257495 0.844636479883657 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14176270_14176391:TMEM43 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 15276541 A/G 1 9 3 12 4.17954087668255 1.60681970777248 2.57272116891006 A:G A G 10 0.535606569257495 0.158222040248362 ENSG00000131375:ENST00000253693:exon_15276532_15276652:CAPN7;ENSG00000131375:ENST00000415565:exon_15276532_15276652:CAPN7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 37 30 67 17.1825569374727 16.0681970777248 1.11435985974784 C:G C G 10 0.535606569257495 0.807703069776505 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 16312564 C/T 1 10 3 13 4.64393430742505 1.60681970777248 3.03711459965257 T:C C T 10 0.535606569257495 0.102916600745183 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16312452_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16312452_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16312436_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000486267:exon_16312452_16312702:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16312452_16312578:OXNAD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 16327855 T/G 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16327849_16327955:OXNAD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 178 219 397 82.6620306721659 117.297838667391 -34.6358079952255 T:C T C 10 0.535606569257495 0.000508860026312943 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 133 138 271 61.7643262887532 73.9137065575343 -12.1493802687811 A:C A C 10 0.535606569257495 0.144050239984140 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 20216519 T/A 1 7 11 18 3.25075401519754 5.89167226183244 -2.64091824663491 A:T T A 10 0.535606569257495 0.242609580355471 ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000383774:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000443724:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000456624:exon_20216214_20216547:SGOL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 27442336 G/A 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000033867:ENST00000419036:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000295736:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000428386:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000425128:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000349751:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000435667:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000388777:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000454389:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000440156:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000457377:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000438530:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437179:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000446700:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000455077:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000445684:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437266:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000428179:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000475120:exon_27442255_27442535:SLC4A7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 37366459 C/A 1 35 47 82 16.2537700759877 25.1735087551023 -8.91973867911458 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0591950594000503 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 37368755 T/A 1 31 48 79 14.3961963530177 25.7091153243598 -11.3129189713421 A:T T A 10 0.535606569257495 0.0126968686280099 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 50 41 91 23.2196715371253 21.9598693395573 1.25980219756796 T:C C T 10 0.535606569257495 0.833934441910788 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 48 38 86 22.2908846756402 20.3530496317848 1.93783504385544 A:T:G G A 10 0.535606569257495 0.74595978195561 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 39186728 C/T 1 31 32 63 14.3961963530177 17.1394102162398 -2.74321386322218 T:C C T 10 0.535606569257495 0.528678187679901 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39186488_39186747:CSRNP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 39188182 C/T 1 21 31 52 9.75226204559261 16.6038036469823 -6.85154160138974 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0699123593584925 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39187969_39188218:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39188154_39188213:CSRNP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 39225752 C/G 1 35 66 101 16.2537700759877 35.3500335709947 -19.096263495007 C:G C G 10 0.535606569257495 0.000190272995108392 ENSG00000168334:ENST00000396251:exon_39224701_39227152:XIRP1;ENSG00000168334:ENST00000340369:exon_39224706_39231016:XIRP1;ENSG00000168334:ENST00000421646:exon_39224707_39227152:XIRP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 39226436 C/T 1 31 38 69 14.3961963530177 20.3530496317848 -5.95685327876715 T:C C T 10 0.535606569257495 0.183903210679152 ENSG00000168334:ENST00000396251:exon_39224701_39227152:XIRP1;ENSG00000168334:ENST00000340369:exon_39224706_39231016:XIRP1;ENSG00000168334:ENST00000421646:exon_39224707_39227152:XIRP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 39226610 C/T 1 43 54 97 19.9689175219277 28.9227547399047 -8.95383721797701 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0830186097062615 ENSG00000168334:ENST00000396251:exon_39224701_39227152:XIRP1;ENSG00000168334:ENST00000340369:exon_39224706_39231016:XIRP1;ENSG00000168334:ENST00000421646:exon_39224707_39227152:XIRP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 39450065 C/T 1 7 8 15 3.25075401519754 4.28485255405996 -1.03409853886242 T:C C T 10 0.535606569257495 0.614879753164389 ENSG00000168028:ENST00000490490:exon_39449695_39450215:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39450028_39450215:RPSA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 39453160 G/A 1 99 120 219 45.974949643508 64.2727883108994 -18.2978386673914 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0145963161721665 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 40498920 A/T 0 9 0 9 4.17954087668255 0 4.17954087668255 A A 10 0.535606569257495 0.00463210411669919 ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000435633:exon_40498854_40499238:RPL14 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 41280827 C/T 1 69 81 150 32.0431467212329 43.3841321098571 -11.3409853886242 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0714644907739604 ENSG00000168036:ENST00000405570:exon_41280625_41280844:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396183:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000349496:exon_41280625_41281936:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000447363:exon_41280625_41281936:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000453024:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396190:exon_41280625_41281939:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396185:exon_41280625_41280845:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000471014:exon_41280624_41280845:CTNNB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 42251263 C/T 1 21 16 37 9.75226204559261 8.56970510811992 1.18255693747269 T:C C T 10 0.535606569257495 0.74382946670773 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 T:C C T 10 0.535606569257495 0.824415845788285 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 42265166 T/C 1 25 19 44 11.6098357685626 10.1765248158924 1.43331095267022 T:C T C 10 0.535606569257495 0.762948624035709 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42264434_42267381:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42264434_42267260:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42264434_42267381:TRAK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 29 32 61 13.4674094915326 17.1394102162398 -3.67200072470719 A:G A G 10 0.535606569257495 0.370451147858163 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 42679497 C/T 1 23 19 42 10.6810489070776 10.1765248158924 0.504524091185214 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 42679777 T/G 1 23 19 42 10.6810489070776 10.1765248158924 0.504524091185214 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 42679848 A/G 1 17 20 37 7.89468832262259 10.7121313851499 -2.81744306252731 A:G A G 10 0.535606569257495 0.410845427536736 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 42680000 C/T 1 22 18 40 10.2166554763351 9.64091824663491 0.575737229700202 T:C C T 10 0.535606569257495 0.875604229083889 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 45132921 G/A 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000163814:ENST00000296129:exon_45132665_45133030:CDCP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 45557707 G/A 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 A:G G A 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45557586_45557768:LARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 47043238 C/T 1 21 23 44 9.75226204559261 12.3189510929224 -2.56668904732978 T:C C T 10 0.535606569257495 0.453547134047725 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000475689:exon_47043179_47043316:NBEAL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 129 83 212 59.9067525657832 44.4553452483721 15.4514073174111 A:C:G C G 10 0.535606569257495 0.0386091838154716 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 40 42 82 18.5757372297002 22.4954759088148 -3.91973867911459 A:G G A 10 0.535606569257495 0.438559845143822 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 47162886 C/T 1 24 13 37 11.1454423378201 6.96288540034743 4.18255693747269 T:C C T 10 0.535606569257495 0.189250267206679 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 47448825 G/A 1 25 9 34 11.6098357685626 4.82045912331745 6.78937664524517 A:T:G G A 10 0.535606569257495 0.0242276354810891 ENSG00000076201:ENST00000456408:exon_47448799_47448857:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47448799_47448857:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47448799_47448857:PTPN23 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 17 19 36 7.89468832262259 10.1765248158924 -2.28183649326982 A:G G A 10 0.535606569257495 0.505289503245558 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 32 21 53 14.8605897837602 11.2477379544074 3.61285182935277 T:C T C 10 0.535606569257495 0.338210036936438 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 92 92 184 42.7241956283105 49.2758043716895 -6.55160874337906 T:C C T 10 0.535606569257495 0.337605550083564 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 105 83 188 48.761310227963 44.4553452483721 4.30596497959095 T:C:G G T 10 0.535606569257495 0.558910547024015 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 53883722 C/G 1 4 8 12 1.85757372297002 4.28485255405996 -2.42727883108994 C:G C G 10 0.535606569257495 0.246342614793183 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53883682_53883822:IL17RB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 53886912 C/T 1 10 9 19 4.64393430742505 4.82045912331745 -0.176524815892404 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53886898_53887024:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53886898_53887024:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53886898_53887024:IL17RB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 53914093 G/A 1 16 12 28 7.43029489188008 6.42727883108994 1.00301606079014 A:G G A 10 0.535606569257495 0.850180549654168 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53913966_53914099:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000498740:exon_53913966_53914136:ACTR8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 56597954 C/T 1 7 8 15 3.25075401519754 4.28485255405996 -1.03409853886242 T:C C T 10 0.535606569257495 0.614879753164389 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000439445:exon_56597934_56598167:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000460838:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000459746:exon_56597680_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000472582:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000434467:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422788:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000442522:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000469966:exon_56597712_56598184:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000473322:exon_56597544_56598153:CCDC66 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 56627048 A/G 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484623:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000494672:exon_56626998_56627089:CCDC66 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 56628055 A/G 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 A:G A G 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484623:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000468108:exon_56627972_56628056:CCDC66 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 56658871 T/C 1 27 30 57 12.5386226300476 16.0681970777248 -3.52957444767721 T:C T C 10 0.535606569257495 0.356045074172151 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 58191266 C/T 1 41 79 120 19.0401306604427 42.3129189713421 -23.2727883108994 T:C C T 10 0.535606569257495 2.14484257072824e-05 ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58191217_58191287:DNASE1L3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 58196639 C/T 1 155 72 227 71.9809817650883 38.5636729865396 33.4173087785487 T:C C T 10 0.535606569257495 7.3091617137528e-06 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58196493_58196696:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58196493_58196950:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000463694:exon_58196493_58196647:DNASE1L3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 59908126 A/G 1 4 12 16 1.85757372297002 6.42727883108994 -4.56970510811992 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0247475125779134 ENSG00000189283:ENST00000492590:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000476844:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000466788:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000468189:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000341848:exon_59908072_59908140:FHIT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 63976489 G/A 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 A:G G A 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63976414_63976535:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63976414_63976535:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63976414_63976535:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63976414_63976535:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63976414_63976535:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484668:exon_63976414_63976661:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000477516:exon_63976186_63976535:ATXN7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 T:C C T 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 66430877 G/C 1 21 19 40 9.75226204559261 10.1765248158924 -0.424262770299798 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 66431187 C/T 1 16 12 28 7.43029489188008 6.42727883108994 1.00301606079014 T:C C T 10 0.535606569257495 0.850180549654168 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66431001_66431285:LRIG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 67426281 T/C 1 40 44 84 18.5757372297002 23.5666890473298 -4.99095181762958 T:C T C 10 0.535606569257495 0.276635667121052 ENSG00000172340:ENST00000307227:exon_67425143_67426283:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000460567:exon_67425143_67426283:SUCLG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 87295049 T/C 1 53 53 106 24.6128518293528 28.3871481706472 -3.77429634129447 T:C T C 10 0.535606569257495 0.495961898588767 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87294864_87295058:CHMP2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 88188420 G/A 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000175105:ENST00000309495:exon_88188254_88190198:ZNF654 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 88189341 T/C 1 8 5 13 3.71514744594004 2.67803284628747 1.03711459965257 T:C T C 10 0.535606569257495 0.593641770478394 ENSG00000175105:ENST00000309495:exon_88188254_88190198:ZNF654 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 88190809 C/T 1 8 3 11 3.71514744594004 1.60681970777248 2.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.239570670048551 ENSG00000175105:ENST00000309495:exon_88190795_88193815:ZNF654 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 88199179 T/C 1 15 16 31 6.96590146113758 8.56970510811992 -1.60380364698234 T:C T C 10 0.535606569257495 0.592923006525255 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 88199298 T/C 1 26 36 62 12.0742291993051 19.2818364932698 -7.20760729396469 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0746186279211113 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 93780109 G/C 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 C:G G C 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000178700:ENST00000314636:exon_93776766_93780450:DHFRL1;ENSG00000178700:ENST00000394221:exon_93776768_93780450:DHFRL1;ENSG00000178700:ENST00000461173:exon_93778823_93780450:DHFRL1;ENSG00000178700:ENST00000496983:exon_93780013_93780450:DHFRL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 97664725 C/T 1 17 13 30 7.89468832262259 6.96288540034743 0.931802922275152 T:C C T 10 0.535606569257495 0.855265722884923 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97664182_97664731:MINA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 98250862 C/A 1 101 99 200 46.903736504993 53.025050356492 -6.12131385149899 A:T:C C A 10 0.535606569257495 0.395580041451469 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 98250986 C/T 1 118 90 208 54.7984248276156 48.2045912331745 6.59383359444105 T:C C T 10 0.535606569257495 0.367059584509253 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 98304467 T/C 1 46 47 93 21.3620978141552 25.1735087551023 -3.81141094094703 T:C T C 10 0.535606569257495 0.467216395450801 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 98307630 C/T 1 10 19 29 4.64393430742505 10.1765248158924 -5.53259050846735 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0419714289237075 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 98512610 A/G 1 17 29 46 7.89468832262259 15.5325905084674 -7.63790218584477 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0264979585530651 ENSG00000064225:ENST00000483910:exon_98512519_98513206:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000469105:exon_98512519_98514098:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000462152:exon_98512519_98512788:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000486249:exon_98512519_98514689:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000497621:exon_98512519_98513237:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000493584:exon_98512519_98512839:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000394162:exon_98512519_98513234:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000265261:exon_98512519_98513234:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000491912:exon_98512519_98512636:ST3GAL6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 118 87 205 54.7984248276156 46.5977715254021 8.20065330221354 T:C T C 10 0.535606569257495 0.262998223572007 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 105260520 C/T 1 21 20 41 9.75226204559261 10.7121313851499 -0.959869339557294 T:C C T 10 0.535606569257495 0.875831142013124 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000481337:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105260477_105260609:ALCAM HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 105266274 T/C 1 25 21 46 11.6098357685626 11.2477379544074 0.362097814155231 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000389927:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000465413:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000491388:exon_105266234_105266371:ALCAM HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 105266331 A/G 1 40 35 75 18.5757372297002 18.7462299240123 -0.17049269431212 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000389927:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000465413:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000491388:exon_105266234_105266371:ALCAM HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 14 30 44 6.50150803039507 16.0681970777248 -9.56668904732978 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00398149934494147 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 26 28 54 12.0742291993051 14.9969839392099 -2.92275473990473 T:C C T 10 0.535606569257495 0.495540905951554 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 105438957 T/G 1 13 11 24 6.03711459965257 5.89167226183244 0.145442337820121 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 105439026 G/A 1 16 7 23 7.43029489188008 3.74924598480246 3.68104890707762 A:G G A 10 0.535606569257495 0.145567531076242 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 108288408 T/C 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 T:C T C 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000163507:ENST00000491772:exon_108288236_108288454:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000295746:exon_108288236_108288454:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000481530:exon_108288236_108288454:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000487834:exon_108288236_108288454:KIAA1524 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 112063850 C/A 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 A:C C A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112063809_112064135:CD200 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 112185025 G/A 1 35 38 73 16.2537700759877 20.3530496317848 -4.09927955579713 A:G G A 10 0.535606569257495 0.349802280412650 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112184955_112185230:BTLA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 112289505 C/T 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 T:C C T 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000138459:ENST00000484995:exon_112289387_112289517:SLC35A5;ENSG00000138459:ENST00000492406:exon_112289387_112289517:SLC35A5;ENSG00000138459:ENST00000261034:exon_112289387_112289517:SLC35A5;ENSG00000138459:ENST00000494706:exon_112289387_112289517:SLC35A5;ENSG00000138459:ENST00000460615:exon_112289286_112289517:SLC35A5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 113176122 G/A 1 12 9 21 5.57272116891006 4.82045912331745 0.752262045592606 A:G G A 10 0.535606569257495 0.828765731707361 ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113175983_113176204:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000496105:exon_113175983_113176204:SPICE1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 113251935 G/A 1 4 11 15 1.85757372297002 5.89167226183244 -4.03409853886242 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0409218294036399 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113251143_113252090:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113251218_113252090:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000491730:exon_113251402_113252090:SIDT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 113252042 C/T 1 6 8 14 2.78636058445503 4.28485255405996 -1.49849196960493 T:C C T 10 0.535606569257495 0.436988882100625 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113251143_113252090:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113251218_113252090:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000491730:exon_113251402_113252090:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000483946:exon_113252024_113252090:SIDT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 118931389 C/T 1 20 15 35 9.2878686148501 8.03409853886242 1.25377007598768 T:C C T 10 0.535606569257495 0.736352529535451 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118930579_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118930587_118935191:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118930589_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118930589_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118930626_118931528:B4GALT4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 119013714 C/A 1 14 4 18 6.50150803039507 2.14242627702998 4.35908175336509 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0560876578011619 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119013220_119013851:ARHGAP31 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 119196166 T/C 1 2 11 13 0.92878686148501 5.89167226183244 -4.96288540034743 T:C T C 10 0.535606569257495 0.00925841308605916 ENSG00000163389:ENST00000295588:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000419577:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000497447:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000486607:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000476573:exon_119196160_119196295:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000460339:exon_119196160_119196254:POGLUT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 119211294 A/G 1 14 21 35 6.50150803039507 11.2477379544074 -4.74622992401232 A:G A G 10 0.535606569257495 0.127327106092558 ENSG00000163389:ENST00000295588:exon_119211129_119213555:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000486607:exon_119211129_119211324:POGLUT1;ENSG00000163389:ENST00000473648:exon_119211129_119211993:POGLUT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 119301139 C/T 1 34 26 60 15.7893766452452 13.9257708006949 1.8636058445503 T:C C T 10 0.535606569257495 0.698422999985293 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119300912_119301314:ADPRH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 119305379 T/A 1 19 17 36 8.8234751841076 9.10531167737741 -0.281836493269818 A:T:G T A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 119327653 T/C 1 78 78 156 36.2226875979154 41.7773124020846 -5.55462480416921 T:C T C 10 0.535606569257495 0.378393591612273 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119327617_119327746:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119327617_119327794:PLA1A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 119331874 C/T 1 61 47 108 28.3279992752928 25.1735087551023 3.15449052019055 T:C C T 10 0.535606569257495 0.563937529684438 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 119331892 C/G 1 67 42 109 31.1143598597478 22.4954759088148 8.61888395093305 C:G C G 10 0.535606569257495 0.103083493360873 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 119338492 G/A 1 100 71 171 46.4393430742505 38.0280664172821 8.41127665696836 A:G G A 10 0.535606569257495 0.219892291790171 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119338410_119338499:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119338410_119338499:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119338410_119338499:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119338410_119338499:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119338410_119338499:PLA1A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 120500093 C/T 1 16 11 27 7.43029489188008 5.89167226183244 1.53862263004764 T:C C T 10 0.535606569257495 0.57043982842636 ENSG00000153767:ENST00000283875:exon_120499890_120501916:GTF2E1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 121712051 A/C 1 12 11 23 5.57272116891006 5.89167226183244 -0.318951092922384 A:C A C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 121712805 G/C 1 12 6 18 5.57272116891006 3.21363941554497 2.35908175336509 C:G G C 10 0.535606569257495 0.346395564026953 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000383663:exon_121712627_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 62 49 111 28.7923927060353 26.2447218936173 2.54767081241806 T:C T C 10 0.535606569257495 0.63585676166151 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 122277160 G/T 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 T:G G T 10 0.535606569257495 0.732067195068257 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 122277172 G/A 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 122288210 G/A 1 12 10 22 5.57272116891006 5.35606569257495 0.216655476335111 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122287336_122288871:DTX3L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 122351055 G/A 1 17 30 47 7.89468832262259 16.0681970777248 -8.17350875510226 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0189758750883707 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122350933_122351066:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122350933_122351066:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122350933_122351066:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122350933_122351066:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122350933_122351066:PARP15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 34 38 72 15.7893766452452 20.3530496317848 -4.56367298653963 A:G A G 10 0.535606569257495 0.28983996075879 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 122354792 G/A 1 46 28 74 21.3620978141552 14.9969839392099 6.36511387494538 A:C:G G A 10 0.535606569257495 0.161744404087419 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 124351316 G/A 1 6 12 18 2.78636058445503 6.42727883108994 -3.64091824663491 A:G G A 10 0.535606569257495 0.100181682544637 ENSG00000160145:ENST00000360013:exon_124351267_124351550:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000428018:exon_124351267_124351550:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000354186:exon_124351267_124351550:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000393496:exon_124351267_124351550:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000471431:exon_124351267_124351445:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000291478:exon_124351267_124351550:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000454902:exon_124351267_124351550:KALRN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 124351424 T/C 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 T:C T C 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000160145:ENST00000360013:exon_124351267_124351550:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000428018:exon_124351267_124351550:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000354186:exon_124351267_124351550:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000393496:exon_124351267_124351550:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000471431:exon_124351267_124351445:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000291478:exon_124351267_124351550:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000454902:exon_124351267_124351550:KALRN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 124379817 T/C 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 T:C T C 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000160145:ENST00000360013:exon_124379770_124379820:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000428018:exon_124379770_124379820:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000354186:exon_124379770_124379820:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000393496:exon_124379770_124379820:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000291478:exon_124379770_124379820:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000459915:exon_124379770_124379820:KALRN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 124456742 G/C 1 35 33 68 16.2537700759877 17.6750167854973 -1.42124670950966 C:G G C 10 0.535606569257495 0.808114669909956 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 124462808 C/T 1 38 33 71 17.6469503682152 17.6750167854973 -0.0280664172821403 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 124515308 A/G 1 12 7 19 5.57272116891006 3.74924598480246 1.8234751841076 A:G A G 10 0.535606569257495 0.493225271714711 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 124515509 G/A 1 13 3 16 6.03711459965257 1.60681970777248 4.43029489188008 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0414908822217374 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000474838:exon_124515387_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000496703:exon_124515438_124515664:ITGB5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 124627024 T/G 1 14 16 30 6.50150803039507 8.56970510811992 -2.06819707772485 T:G T G 10 0.535606569257495 0.46942883980578 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124626994_124627195:MUC13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 124646837 G/A 1 17 9 26 7.89468832262259 4.82045912331745 3.07422919930513 A:G G A 10 0.535606569257495 0.244740828501064 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124646379_124646837:MUC13;ENSG00000173702:ENST00000497378:exon_124646743_124646837:MUC13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 22 22 44 10.2166554763351 11.7833445236649 -1.56668904732978 T:C C T 10 0.535606569257495 0.653088089453632 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 125249340 G/A 1 10 9 19 4.64393430742505 4.82045912331745 -0.176524815892404 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000144909:ENST00000296220:exon_125247702_125249424:OSBPL11;ENSG00000144909:ENST00000393455:exon_125247713_125249424:OSBPL11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 125266387 G/A 1 11 4 15 5.10832773816756 2.14242627702998 2.96590146113758 A:G G A 10 0.535606569257495 0.194138829836023 ENSG00000144909:ENST00000296220:exon_125266250_125266436:OSBPL11;ENSG00000144909:ENST00000393455:exon_125266250_125266436:OSBPL11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 126451937 G/T 1 11 7 18 5.10832773816756 3.74924598480246 1.35908175336509 T:G G T 10 0.535606569257495 0.638915092572894 ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000514908:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126451921_126452065:CHCHD6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 127292333 G/A 1 53 20 73 24.6128518293528 10.7121313851499 13.9007204442029 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00136111493101812 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 29 54 83 13.4674094915326 28.9227547399047 -15.4553452483721 T:C C T 10 0.535606569257495 0.000855294794624079 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 127800071 A/G 1 41 44 85 19.0401306604427 23.5666890473298 -4.52655838688707 A:G A G 10 0.535606569257495 0.330055301744111 ENSG00000175792:ENST00000322623:exon_127799803_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000417360:exon_127799807_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000478892:exon_127800025_127800252:RUVBL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 128525253 C/T 1 203 195 398 94.2718664407285 104.443281005212 -10.171414564483 T:C C T 10 0.535606569257495 0.315091408594988 ENSG00000075785:ENST00000265062:exon_128525215_128525433:RAB7A;ENSG00000075785:ENST00000482525:exon_128525215_128525292:RAB7A;ENSG00000075785:ENST00000464496:exon_128525215_128525433:RAB7A;ENSG00000075785:ENST00000490093:exon_128525215_128525318:RAB7A;ENSG00000075785:ENST00000430113:exon_128525215_128525433:RAB7A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 128890350 G/A 1 496 379 875 230.339141648283 202.994889748591 27.3442518996919 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0671754333403081 ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 49 57 106 22.7552781063827 30.5295744476772 -7.77429634129447 T:C T C 10 0.535606569257495 0.144103399973680 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 128976451 C/G 1 51 68 119 23.6840649678678 36.4212467095097 -12.7371817416419 T:C:G C G 10 0.535606569257495 0.0213743278320369 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 129034758 A/G 1 20 13 33 9.2878686148501 6.96288540034743 2.32498321450267 A:G A G 10 0.535606569257495 0.486822164537258 ENSG00000184897:ENST00000333762:exon_129033615_129035117:H1FX HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 129152089 G/A 1 40 40 80 18.5757372297002 21.4242627702998 -2.8485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 0.575587006297306 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000393278:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000509828:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000511009:exon_129151941_129152396:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000515266:exon_129151941_129152090:MBD4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 129155670 C/T 1 52 43 95 24.1484583986103 23.0310824780723 1.11737592053798 T:C C T 10 0.535606569257495 0.83773375345122 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 130449222 A/G 1 11 9 20 5.10832773816756 4.82045912331745 0.287868614850101 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000196455:ENST00000356763:exon_130449152_130449286:PIK3R4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 132277866 G/A 1 24 19 43 11.1454423378201 10.1765248158924 0.968917521927718 A:G G A 10 0.535606569257495 0.878743629729628 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132276982_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132276988_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000485198:exon_132277316_132277929:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132277668_132277929:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132276986_132277929:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132276986_132277929:NPHP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 132338346 T/G 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000507705:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000487024:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000481970:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132338312_132338389:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132338312_132338389:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132338312_132338389:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132338312_132338389:NPHP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 133329943 G/A 1 10 21 31 4.64393430742505 11.2477379544074 -6.60380364698234 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0191879122091785 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133329848_133329985:TOPBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 133341988 T/C 1 16 20 36 7.43029489188008 10.7121313851499 -3.28183649326982 T:C T C 10 0.535606569257495 0.317098320507134 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133341935_133342037:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133341935_133342037:TOPBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 133342218 C/T 1 12 22 34 5.57272116891006 11.7833445236649 -6.21062335475483 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0385727914882715 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133342155_133342301:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133342155_133342301:TOPBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 133368362 T/G 1 16 19 35 7.43029489188008 10.1765248158924 -2.74622992401232 T:G T G 10 0.535606569257495 0.398532874739113 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000511439:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000509162:exon_133368227_133368786:TOPBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 141162128 C/G 1 36 33 69 16.7181635067302 17.6750167854973 -0.956853278767152 C:G C G 10 0.535606569257495 0.904048745857493 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 142168331 C/T 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000175054:ENST00000504521:exon_142168077_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515810:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142168080_142172075:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142168080_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515107:exon_142168160_142168444:ATR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 142281612 A/G 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 A:G A G 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142281074_142281951:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142281074_142281951:ATR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 149459341 A/G 1 74 51 125 34.3651138749454 27.3159350321322 7.04917884281313 A:C:G A G 10 0.535606569257495 0.210762059178061 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 149459413 C/T 1 44 27 71 20.4333109526702 14.4613773699524 5.97193358271786 T:C C T 10 0.535606569257495 0.190253154784388 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149459362_149459505:COMMD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 38 32 70 17.6469503682152 17.1394102162398 0.507540151975356 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 95 0 95 44.117375920538 0 44.117375920538 T T 10 0.535606569257495 2.23291467449975e-26 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 45 53 98 20.8977043834127 28.3871481706472 -7.48944378723451 C:G C G 10 0.535606569257495 0.155881916423688 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 150285520 T/C 1 100 77 177 46.4393430742505 41.2417058328271 5.19763724142339 T:C T C 10 0.535606569257495 0.451765886975139 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150285480_150285553:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150285480_150285553:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000494558:exon_150285480_150285553:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150285480_150285553:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150285480_150285553:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150285480_150285553:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150285480_150285553:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000472926:exon_150285186_150285553:EIF2A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 152554357 A/G 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 A:G A G 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000169860:ENST00000305097:exon_152553550_152554714:P2RY1;ENSG00000169860:ENST00000407427:exon_152553728_152554631:P2RY1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 16 14 30 7.43029489188008 7.49849196960493 -0.0681970777248484 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 155481609 G/A 1 8 3 11 3.71514744594004 1.60681970777248 2.10832773816756 A:G G A 10 0.535606569257495 0.239570670048551 ENSG00000174928:ENST00000482061:exon_155480401_155481707:C3orf33;ENSG00000174928:ENST00000340171:exon_155480406_155481707:C3orf33;ENSG00000174928:ENST00000465810:exon_155481317_155481707:C3orf33;ENSG00000174928:ENST00000486435:exon_155481576_155481707:C3orf33 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 158289035 T/A 1 5 19 24 2.32196715371253 10.1765248158924 -7.85455766217988 A:T T A 10 0.535606569257495 0.00158484579560273 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158288952_158289136:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158288952_158289136:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158288953_158289180:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158288962_158289180:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158288973_158289180:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158288980_158289180:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158288983_158289180:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158288983_158289180:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000495452:exon_158288983_158289136:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000477042:exon_158288983_158289180:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158288983_158289180:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158288983_158289180:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158288984_158289180:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158288999_158289136:MLF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 158320703 C/A 1 145 83 228 67.3370474576632 44.4553452483721 22.8817022092911 A:C C A 10 0.535606569257495 0.00273044473652605 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 50 30 80 23.2196715371253 16.0681970777248 7.1514744594004 T:C C T 10 0.535606569257495 0.117190025832309 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 158538056 T/C 1 8 3 11 3.71514744594004 1.60681970777248 2.10832773816756 T:C T C 10 0.535606569257495 0.239570670048551 ENSG00000118855:ENST00000415822:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000264266:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000484166:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000480292:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000392813:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000437603:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000361159:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000471500:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000477743:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000465624:exon_158538004_158538115:MFSD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 170893070 G/A 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 A:G G A 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000468757:exon_170893041_170893119:TNIK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 16 22 38 7.43029489188008 11.7833445236649 -4.35304963178481 A:G G A 10 0.535606569257495 0.192957172333194 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 171338237 T/G 1 1 7 8 0.464393430742505 3.74924598480246 -3.28485255405996 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0288949230486104 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000446289:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000465816:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000467432:exon_171338176_171338310:PLD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 171395468 A/G 1 1 9 10 0.464393430742505 4.82045912331745 -4.35606569257495 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00778992131964651 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000471075:exon_171395356_171395643:PLD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 171405373 G/A 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171405161_171405374:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171405161_171405374:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171405161_171405374:PLD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 172428782 T/C 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000144959:ENST00000475381:exon_172428637_172429008:NCEH1;ENSG00000144959:ENST00000273512:exon_172428637_172429008:NCEH1;ENSG00000144959:ENST00000424772:exon_172428637_172428842:NCEH1;ENSG00000144959:ENST00000421723:exon_172428637_172428902:NCEH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 179306648 A/G 1 19 13 32 8.8234751841076 6.96288540034743 1.86058978376016 A:G A G 10 0.535606569257495 0.596333954023765 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 179306775 C/T 1 57 53 110 26.4704255523228 28.3871481706472 -1.91672261832445 T:C C T 10 0.535606569257495 0.774451641964757 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 179322385 A/C 1 71 67 138 32.9719335827179 35.8856401402522 -2.9137065575343 A:C A C 10 0.535606569257495 0.669753464258273 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179322315_179322442:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179322315_179322428:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179322315_179322434:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179322315_179322437:MRPL47 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 182681740 C/T 1 15 9 24 6.96590146113758 4.82045912331745 2.14544233782012 T:C C T 10 0.535606569257495 0.419256106369884 ENSG00000043093:ENST00000292782:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000469954:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000492563:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000497606:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000460412:exon_182681719_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000487822:exon_182681736_182681837:DCUN1D1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 182751846 C/T 1 12 9 21 5.57272116891006 4.82045912331745 0.752262045592606 T:C C T 10 0.535606569257495 0.828765731707361 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182751779_182751865:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182751779_182751865:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182751779_182751865:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182751779_182751865:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497959:exon_182751779_182751865:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182751779_182751865:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182751779_182751865:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000489909:exon_182751779_182751865:MCCC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 182755209 T/G 1 36 27 63 16.7181635067302 14.4613773699524 2.25678613677782 T:G T G 10 0.535606569257495 0.614598338422256 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755202_182755222:MCCC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 63 40 103 29.2567861367778 21.4242627702998 7.83252336647802 T:C T C 10 0.535606569257495 0.138258265157806 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 183368216 A/T 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 A:T A T 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000114796:ENST00000242810:exon_183368084_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000493074:exon_183368084_183368526:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000437402:exon_183368084_183368326:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000454495:exon_183368084_183368495:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000473045:exon_183368084_183368363:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000468101:exon_183368084_183368378:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000427201:exon_183368084_183368485:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000482138:exon_183368084_183368546:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000454652:exon_183368084_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000468001:exon_183368084_183368521:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000476808:exon_183368145_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000242809:exon_183368145_183368777:KLHL24 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 183368891 C/T 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000114796:ENST00000242810:exon_183368084_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000454652:exon_183368084_183369064:KLHL24;ENSG00000114796:ENST00000476808:exon_183368145_183369064:KLHL24 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 68 48 116 31.5787532904903 25.7091153243598 5.86963796613059 C:G C G 10 0.535606569257495 0.30604768621462 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 28 18 46 13.0030160607901 9.64091824663491 3.36209781415523 A:G A G 10 0.535606569257495 0.375884253069819 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 183861243 A/G 1 41 40 81 19.0401306604427 21.4242627702998 -2.38413210985709 A:G A G 10 0.535606569257495 0.656221959751725 ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 183963381 T/C 1 34 34 68 15.7893766452452 18.2106233547548 -2.42124670950966 T:C T C 10 0.535606569257495 0.627094047855764 ENSG00000214160:ENST00000411922:exon_183963256_183963403:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000397676:exon_183963256_183963403:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000445626:exon_183963256_183963403:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000458439:exon_183963256_183963403:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000418734:exon_183963256_183963403:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000455059:exon_183963256_183963403:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000414845:exon_183963256_183963403:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000423996:exon_183963256_183963403:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000461415:exon_183963256_183963403:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000488976:exon_183963256_183963403:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000482048:exon_183963256_183963403:ALG3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 183976108 T/C 1 13 9 22 6.03711459965257 4.82045912331745 1.21665547633511 T:C T C 10 0.535606569257495 0.672817163244646 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 184026703 C/T 1 59 46 105 27.3992124138078 24.6379021858448 2.76131022796303 T:C C T 10 0.535606569257495 0.625399048465521 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184026496_184026842:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184026496_184026788:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184026496_184026836:PSMD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 184082931 T/C 1 63 72 135 29.2567861367778 38.5636729865396 -9.30688684976182 T:C T C 10 0.535606569257495 0.120252364172234 ENSG00000163882:ENST00000456318:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000438240:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000455712:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000430783:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000443489:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000452961:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000296223:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000429568:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000488213:exon_184082921_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000489043:exon_184082743_184083014:POLR2H;ENSG00000163882:ENST00000490958:exon_184082921_184083311:POLR2H HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 17 12 29 7.89468832262259 6.42727883108994 1.46740949153265 A:C C A 10 0.535606569257495 0.710437247251719 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 184647413 T/C 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 T:C T C 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184647368_184647452:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184647368_184647452:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184647368_184647452:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184647368_184647452:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184647368_184647452:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000463687:exon_184647368_184647452:VPS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 184766301 T/C 1 7 18 25 3.25075401519754 9.64091824663491 -6.39016423143737 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0145392771583492 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184766267_184766347:VPS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 0 1579 18 1597 733.277227142415 9.64091824663491 723.636308895781 T:C:G G T 10 0.535606569257495 0 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 185229464 T/C 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 T:C T C 10 0.535606569257495 0.193170376367493 ENSG00000163898:ENST00000296252:exon_185229312_185229485:LIPH;ENSG00000163898:ENST00000424591:exon_185229312_185229485:LIPH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 7 13 20 3.25075401519754 6.96288540034743 -3.7121313851499 A:C:G C A 10 0.535606569257495 0.117274980565469 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 185798897 C/T 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 T:C C T 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000244405:ENST00000306376:exon_185798835_185798964:ETV5;ENSG00000244405:ENST00000434744:exon_185798835_185798964:ETV5;ENSG00000244405:ENST00000440773:exon_185798835_185798964:ETV5;ENSG00000244405:ENST00000421809:exon_185798835_185798964:ETV5;ENSG00000244405:ENST00000413301:exon_185798835_185798964:ETV5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 56 48 104 26.0060321215803 25.7091153243598 0.296916797220526 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 186793423 C/T 1 38 43 81 17.6469503682152 23.0310824780723 -5.38413210985709 T:C C T 10 0.535606569257495 0.265288083728149 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000457772:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186793350_186793640:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000470633:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000392479:exon_186793350_186796341:ST6GAL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 193334991 G/A 1 10 11 21 4.64393430742505 5.89167226183244 -1.24773795440739 A:G G A 10 0.535606569257495 0.66418868541406 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000419435:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392436:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000487986:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000434811:exon_193334967_193335074:OPA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 31 39 70 14.3961963530177 20.8886562010423 -6.49245984802464 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.149926772555824 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 194387186 C/T 1 13 12 25 6.03711459965257 6.42727883108994 -0.390164231437374 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 194387253 A/G 1 13 18 31 6.03711459965257 9.64091824663491 -3.60380364698234 A:G A G 10 0.535606569257495 0.211027479808991 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 195594950 G/A 1 15 24 39 6.96590146113758 12.8545576621799 -5.8886562010423 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0762361846174624 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 22 28 50 10.2166554763351 14.9969839392099 -4.78032846287475 T:G G T 10 0.535606569257495 0.202214087908662 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 196386964 C/G 1 52 46 98 24.1484583986103 24.6379021858448 -0.489443787234503 C:G C G 10 0.535606569257495 0.919769810673615 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 196435534 T/C 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 T:C T C 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000174007:ENST00000409690:exon_196435399_196435598:C3orf34;ENSG00000174007:ENST00000311566:exon_196435399_196435598:C3orf34 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 196534706 T/C 1 21 19 40 9.75226204559261 10.1765248158924 -0.424262770299798 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000180370:ENST00000327134:exon_196534653_196534785:PAK2;ENSG00000180370:ENST00000488224:exon_196534653_196534785:PAK2;ENSG00000180370:ENST00000481344:exon_196534653_196534915:PAK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 196865107 A/G 1 7 15 22 3.25075401519754 8.03409853886242 -4.78334452366489 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0529765719617484 ENSG00000075711:ENST00000346964:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000357674:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000381807:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000314062:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000359922:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419354:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000452595:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000422288:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000448528:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000443183:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392382:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000450955:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419227:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392381:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000471733:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000447466:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000477312:exon_196865093_196865262:DLG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 196865242 C/T 1 20 27 47 9.2878686148501 14.4613773699524 -5.17350875510226 T:C C T 10 0.535606569257495 0.144538259879571 ENSG00000075711:ENST00000346964:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000357674:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000381807:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000314062:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000359922:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419354:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000452595:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000422288:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000448528:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000443183:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392382:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000450955:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419227:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392381:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000471733:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000447466:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000477312:exon_196865093_196865262:DLG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 3 197566254 T/C 1 9 9 18 4.17954087668255 4.82045912331745 -0.640918246634909 T:C T C 10 0.535606569257495 0.816090164780621 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000494069:exon_197566192_197566268:LRCH3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 14 15 29 6.50150803039507 8.03409853886242 -1.53259050846735 A:G A G 10 0.535606569257495 0.582160963982168 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 843508 C/T 1 56 50 106 26.0060321215803 26.7803284628747 -0.774296341294466 T:C C T 10 0.535606569257495 0.922540302407005 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843064_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843065_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843066_843562:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843096_843562:GAK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 843695 A/G 1 39 45 84 18.1113437989577 24.1022956165873 -5.99095181762958 A:G A G 10 0.535606569257495 0.191561339366617 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843680_844197:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843680_843856:GAK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 843720 T/C 1 42 43 85 19.5045240911852 23.0310824780723 -3.52655838688707 T:C T C 10 0.535606569257495 0.448839398826596 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843680_844197:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843680_843856:GAK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 22 25 47 10.2166554763351 13.3901642314374 -3.17350875510226 A:G A G 10 0.535606569257495 0.382274275676213 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 946226 T/C 1 6 9 15 2.78636058445503 4.82045912331745 -2.03409853886242 T:C T C 10 0.535606569257495 0.312839743181367 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515492:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504180:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000506669:exon_946199_946238:TMEM175 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 955336 G/A 1 11 4 15 5.10832773816756 2.14242627702998 2.96590146113758 A:G G A 10 0.535606569257495 0.194138829836023 ENSG00000145214:ENST00000273814:exon_955255_955366:DGKQ;ENSG00000145214:ENST00000509465:exon_955255_955366:DGKQ;ENSG00000145214:ENST00000405681:exon_955255_955366:DGKQ;ENSG00000145214:ENST00000515182:exon_955255_955366:DGKQ HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 3230454 C/T 1 30 24 54 13.9318029222752 12.8545576621799 1.07724526009527 T:C C T 10 0.535606569257495 0.786872553309693 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3230342_3230472:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3230342_3230472:HTT;ENSG00000197386:ENST00000512068:exon_3230372_3230736:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3230440_3230472:HTT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 23 19 42 10.6810489070776 10.1765248158924 0.504524091185214 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 3417845 G/C 1 12 3 15 5.57272116891006 1.60681970777248 3.96590146113758 C:G G C 10 0.535606569257495 0.066321047069073 ENSG00000159788:ENST00000506631:exon_3417705_3417848:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000511275:exon_3417705_3417848:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000344733:exon_3417705_3417848:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000336727:exon_3417705_3417848:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000514268:exon_3417705_3417848:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000382788:exon_3417705_3417848:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000513784:exon_3417705_3417848:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000306648:exon_3417705_3417848:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000338806:exon_3417705_3417848:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000506998:exon_3417705_3417848:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000508158:exon_3417705_3417848:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000504194:exon_3417705_3417848:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000512266:exon_3417705_3417848:RGS12;ENSG00000159788:ENST00000513991:exon_3417705_3417848:RGS12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 6302889 G/A 1 8 9 17 3.71514744594004 4.82045912331745 -1.10531167737741 A:G G A 10 0.535606569257495 0.633230727718346 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 6303354 G/A 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 A:G G A 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 6303955 G/A 1 8 14 22 3.71514744594004 7.49849196960493 -3.78334452366489 A:G G A 10 0.535606569257495 0.134296367934504 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 6304087 A/G 1 6 15 21 2.78636058445503 8.03409853886242 -5.24773795440739 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0273627820397729 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 6304092 C/T 1 13 7 20 6.03711459965257 3.74924598480246 2.2878686148501 T:C C T 10 0.535606569257495 0.37307358781869 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 6304242 T/C 1 9 11 20 4.17954087668255 5.89167226183244 -1.7121313851499 T:C T C 10 0.535606569257495 0.505071075446385 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 6594947 A/C 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 A:C A C 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6594900_6595077:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6594900_6595011:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6594900_6595077:MAN2B2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 6596360 G/A 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 A:G G A 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6596261_6596459:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6596348_6596459:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6596261_6596459:MAN2B2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 6606864 A/G 1 9 12 21 4.17954087668255 6.42727883108994 -2.24773795440739 A:C:G A G 10 0.535606569257495 0.384311420828178 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6606782_6607056:MAN2B2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 6865521 C/T 1 30 37 67 13.9318029222752 19.8174430625273 -5.88564014025216 T:C C T 10 0.535606569257495 0.177570719496302 ENSG00000170871:ENST00000425103:exon_6862628_6865910:KIAA0232;ENSG00000170871:ENST00000307659:exon_6862628_6865910:KIAA0232 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 10447640 A/G 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 A:G A G 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 10669522 A/C 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 A:C A C 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000109684:ENST00000226951:exon_10669483_10669535:CLNK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 13604163 G/C 1 23 19 42 10.6810489070776 10.1765248158924 0.504524091185214 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 15835844 A/C 1 17 9 26 7.89468832262259 4.82045912331745 3.07422919930513 A:C A C 10 0.535606569257495 0.244740828501064 ENSG00000004468:ENST00000502843:exon_15835840_15835925:CD38;ENSG00000004468:ENST00000226279:exon_15835840_15835925:CD38;ENSG00000004468:ENST00000510674:exon_15835840_15835925:CD38 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 17503433 C/T 1 15 13 28 6.96590146113758 6.96288540034743 0.00301606079014149 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 20714503 T/C 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 T:C T C 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000163138:ENST00000471979:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000510051:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000503585:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000360916:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000295290:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000513861:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000508952:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000502374:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000513590:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000506702:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000506951:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000507634:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000503747:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000513459:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000467997:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000511089:exon_20714411_20714545:PACRGL;ENSG00000163138:ENST00000506552:exon_20714322_20714545:PACRGL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 22390167 C/T 1 36 2 38 16.7181635067302 1.07121313851499 15.6469503682152 T:C C T 10 0.535606569257495 3.09970440002434e-08 ENSG00000152990:ENST00000334304:exon_22389007_22390570:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000499527:exon_22389023_22390570:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000282943:exon_22389331_22390570:GPR125 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 22425877 A/G 1 8 1 9 3.71514744594004 0.535606569257495 3.17954087668255 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0433666493567438 ENSG00000152990:ENST00000334304:exon_22425814_22425975:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000282943:exon_22425814_22425975:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000508133:exon_22425814_22425975:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000502482:exon_22425814_22425975:GPR125 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 37 21 58 17.1825569374727 11.2477379544074 5.93481898306529 T:C C T 10 0.535606569257495 0.1470360013879 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 19 27 46 8.8234751841076 14.4613773699524 -5.63790218584477 T:C T C 10 0.535606569257495 0.104850442749434 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 38138856 G/A 1 45 53 98 20.8977043834127 28.3871481706472 -7.48944378723451 A:G G A 10 0.535606569257495 0.155881916423688 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38138756_38139240:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38138756_38140794:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38138756_38139240:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38138756_38139364:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000401554:exon_38138756_38139165:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000407365:exon_38138756_38140796:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000406664:exon_38138756_38139248:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000405444:exon_38138756_38139023:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000492180:exon_38138756_38138870:TBC1D1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 38776129 T/C 1 17 10 27 7.89468832262259 5.35606569257495 2.53862263004764 T:C T C 10 0.535606569257495 0.343243524231033 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 38776235 A/G 1 19 22 41 8.8234751841076 11.7833445236649 -2.95986933955729 A:G A G 10 0.535606569257495 0.434088039067657 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 38799710 T/C 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 38829815 A/G 1 11 9 20 5.10832773816756 4.82045912331745 0.287868614850101 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 38829832 T/C 1 8 12 20 3.71514744594004 6.42727883108994 -2.7121313851499 T:C T C 10 0.535606569257495 0.265275049326689 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 38830012 G/C 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 38916631 T/C 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000197712:ENST00000515037:exon_38916542_38916694:FAM114A1;ENSG00000197712:ENST00000358869:exon_38916542_38916694:FAM114A1;ENSG00000197712:ENST00000512889:exon_38916240_38916694:FAM114A1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 12 19 31 5.57272116891006 10.1765248158924 -4.60380364698234 T:C T C 10 0.535606569257495 0.107056097599885 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 39122697 C/T 1 14 10 24 6.50150803039507 5.35606569257495 1.14544233782012 T:C C T 10 0.535606569257495 0.686918776217185 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39122630_39123829:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39122630_39123828:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39122630_39122825:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39122630_39123826:KLHL5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 42037294 C/G 1 19 15 34 8.8234751841076 8.03409853886242 0.789376645245174 C:G C G 10 0.535606569257495 0.864291458650162 ENSG00000014824:ENST00000264451:exon_42037292_42037350:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000513699:exon_42037292_42037350:SLC30A9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 46995366 G/T 1 8 12 20 3.71514744594004 6.42727883108994 -2.7121313851499 T:G G T 10 0.535606569257495 0.265275049326689 ENSG00000109158:ENST00000264318:exon_46995356_46996424:GABRA4;ENSG00000109158:ENST00000502874:exon_46995356_46995557:GABRA4;ENSG00000109158:ENST00000509316:exon_46995356_46995565:GABRA4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 47578971 G/A 1 2 9 11 0.92878686148501 4.82045912331745 -3.89167226183244 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0297809744140687 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47578790_47578990:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47578790_47578990:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47578790_47578990:ATP10D HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 47593283 G/C 1 13 13 26 6.03711459965257 6.96288540034743 -0.925770800694869 C:G G C 10 0.535606569257495 0.844636479883657 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47593059_47595503:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47593059_47595503:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47593059_47594892:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000505277:exon_47593059_47593312:ATP10D HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 54011526 A/G 1 13 16 29 6.03711459965257 8.56970510811992 -2.53259050846735 A:G A G 10 0.535606569257495 0.358571526558961 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 54011603 C/T 1 10 4 14 4.64393430742505 2.14242627702998 2.50150803039507 T:C C T 10 0.535606569257495 0.283626359522875 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 54232110 G/A 1 9 3 12 4.17954087668255 1.60681970777248 2.57272116891006 A:G G A 10 0.535606569257495 0.158222040248362 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54231271_54232242:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54231271_54232228:SCFD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 54327584 A/G 1 8 5 13 3.71514744594004 2.67803284628747 1.03711459965257 A:G A G 10 0.535606569257495 0.593641770478394 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 5 15 20 2.32196715371253 8.03409853886242 -5.7121313851499 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0126060909259614 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 9 12 21 4.17954087668255 6.42727883108994 -2.24773795440739 A:C A C 10 0.535606569257495 0.384311420828178 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57211352 T/C 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 T:C T C 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57211293_57211456:AASDH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57215677 G/A 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57215094_57216224:AASDH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57219613 C/T 1 2 8 10 0.92878686148501 4.28485255405996 -3.35606569257495 T:C C T 10 0.535606569257495 0.052560989900699 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57219570_57219762:AASDH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57237683 G/A 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57237617_57237809:AASDH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57273840 C/G 1 24 20 44 11.1454423378201 10.7121313851499 0.433310952670222 T:C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000510643:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507724:exon_57273816_57273882:PPAT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57333822 G/T 1 25 20 45 11.6098357685626 10.7121313851499 0.897704383412727 T:G G T 10 0.535606569257495 0.881512869961034 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57333081_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57333783_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57333784_57333910:SRP72 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57344588 A/G 1 25 15 40 11.6098357685626 8.03409853886242 3.5757372297002 A:G A G 10 0.535606569257495 0.271696404679915 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57344545_57344669:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000505314:exon_57344545_57344669:SRP72 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57796900 G/A 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57798174 C/G 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 C:G C G 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57830663 T/C 1 35 20 55 16.2537700759877 10.7121313851499 5.54163869083778 T:C T C 10 0.535606569257495 0.139437539103638 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57830572_57830692:C4orf14 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57843295 C/A 1 24 14 38 11.1454423378201 7.49849196960493 3.64695036821519 A:C C A 10 0.535606569257495 0.258136950053560 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57842608_57844989:C4orf14 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 70 46 116 32.5075401519754 24.6379021858448 7.86963796613059 A:G G A 10 0.535606569257495 0.162492096055037 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 35 41 76 16.2537700759877 21.9598693395573 -5.70609926356962 A:G G A 10 0.535606569257495 0.206487661500892 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 106 76 182 49.2257036587055 40.7060992635696 8.51960439513592 T:C C T 10 0.535606569257495 0.207580947168024 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 76857388 C/T 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507940:exon_76857317_76857388:NAAA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 52 38 90 24.1484583986103 20.3530496317848 3.79540876682546 A:G G A 10 0.535606569257495 0.460187818502645 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 83795806 T/C 1 22 10 32 10.2166554763351 5.35606569257495 4.86058978376016 T:C T C 10 0.535606569257495 0.109719766560023 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000436790:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503058:exon_83795764_83795904:SEC31A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 84191031 A/G 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000173085:ENST00000311469:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000503915:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000439031:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000311461:exon_84191013_84191146:COQ2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 88303484 T/C 1 19 47 66 8.8234751841076 25.1735087551023 -16.3500335709947 T:C T C 10 0.535606569257495 5.91573345000162e-05 ENSG00000198189:ENST00000358290:exon_88303407_88303514:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507286:exon_88303407_88303514:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000508413:exon_88303407_88303514:HSD17B11 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 89311962 T/C 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 T:C T C 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89311804_89312031:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000380265:exon_89311804_89312031:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89311804_89312031:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000273960:exon_89311804_89312031:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89311804_89312031:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000506714:exon_89311804_89312031:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000502870:exon_89311804_89312030:HERC6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 89397091 A/G 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000138646:ENST00000264350:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000508159:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000510223:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000502913:exon_89396992_89397181:HERC5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 95186055 A/G 1 3 12 15 1.39318029222752 6.42727883108994 -5.03409853886242 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0165850572920139 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000506089:exon_95185679_95186057:SMARCAD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 103225513 T/C 1 31 32 63 14.3961963530177 17.1394102162398 -2.74321386322218 A:T:C T C 10 0.535606569257495 0.528678187679901 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512337:exon_103225474_103225645:SLC39A8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 103228734 C/T 1 21 35 56 9.75226204559261 18.7462299240123 -8.99396787841972 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0218950631473059 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000510255:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512657:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000502903:exon_103228714_103228762:SLC39A8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 106155185 C/G 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 C:G C G 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000168769:ENST00000305737:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000513237:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000265149:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000380013:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000394764:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000413648:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000514870:exon_106155054_106155429:TET2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 108575989 G/A 1 18 12 30 8.35908175336509 6.42727883108994 1.93180292227515 A:G G A 10 0.535606569257495 0.583938206470959 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108575851_108576056:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108575851_108576056:PAPSS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 108641317 G/A 1 15 17 32 6.96590146113758 9.10531167737741 -2.13941021623984 A:G G A 10 0.535606569257495 0.481944050368973 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 108969883 G/A 0 16 0 16 7.43029489188008 0 7.43029489188008 G G 10 0.535606569257495 5.05498483720302e-05 ENSG00000138795:ENST00000265165:exon_108968701_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000379951:exon_108968701_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000503879:exon_108968729_108969930:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000504426:exon_108968748_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000505379:exon_108969325_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000514444:exon_108969456_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000505297:exon_108969510_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000510135:exon_108969533_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000438313:exon_108969573_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000507470:exon_108969683_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000509428:exon_108969753_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000512407:exon_108969791_108969907:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000510624:exon_108969795_108969907:LEF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 32 19 51 14.8605897837602 10.1765248158924 4.68406496786776 T:C T C 10 0.535606569257495 0.207961775647077 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 135 107 242 62.6931131502382 57.309902910552 5.38321023968622 A:T A T 10 0.535606569257495 0.519434094552093 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 21 8 29 9.75226204559261 4.28485255405996 5.46740949153265 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0607441281415314 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 113352628 A/G 1 18 19 37 8.35908175336509 10.1765248158924 -1.81744306252731 A:G A G 10 0.535606569257495 0.622010686795215 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 9 19 28 4.17954087668255 10.1765248158924 -5.99698393920986 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0352011198873243 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 113353285 T/C 1 21 13 34 9.75226204559261 6.96288540034743 2.78937664524517 T:C T C 10 0.535606569257495 0.391865967418225 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 119200331 T/C 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 T:C T C 10 0.535606569257495 0.824415845788285 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 123192383 T/C 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 T:C T C 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000441681:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000455637:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000423315:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000446180:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000419325:exon_123192173_123192879:KIAA1109 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 123814308 C/T 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 T:C C T 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000138685:ENST00000264498:exon_123813366_123819391:FGF2;ENSG00000138685:ENST00000394350:exon_123813366_123819376:FGF2;ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123813730_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123813801_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000510735:exon_123813805_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123813806_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000502270:exon_123813896_123814380:NUDT6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 123838758 A/G 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000513517:exon_123838656_123843752:NUDT6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 128842876 C/G 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 C:G C G 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000164073:ENST00000296468:exon_128842679_128842926:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000515130:exon_128842679_128842926:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000513559:exon_128842679_128842926:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000504126:exon_128842512_128842926:MFSD8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 139964442 T/C 1 13 11 24 6.03711459965257 5.89167226183244 0.145442337820121 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000151014:ENST00000280614:exon_139964228_139964497:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000504378:exon_139964228_139965045:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000515616:exon_139964226_139964497:CCRN4L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 37 25 62 17.1825569374727 13.3901642314374 3.79239270603531 A:G G A 10 0.535606569257495 0.373765024031511 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 33 51 84 15.3249832145027 27.3159350321322 -11.9909518176296 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0114222686872426 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 42 63 105 19.5045240911852 33.7432138632222 -14.238689772037 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00598322951022392 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 147104121 C/T 1 81 66 147 37.6158678901429 35.3500335709947 2.26583431914824 T:C C T 10 0.535606569257495 0.741200067269032 ENSG00000164167:ENST00000296581:exon_147104064_147104167:LSM6;ENSG00000164167:ENST00000515311:exon_147104064_147104167:LSM6;ENSG00000164167:ENST00000503982:exon_147104064_147104798:LSM6;ENSG00000164167:ENST00000502781:exon_147104064_147104167:LSM6;ENSG00000164167:ENST00000504181:exon_147104064_147104167:LSM6;ENSG00000164167:ENST00000507449:exon_147104075_147104167:LSM6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 151199080 G/A 1 21 23 44 9.75226204559261 12.3189510929224 -2.56668904732978 A:G G A 10 0.535606569257495 0.453547134047725 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151199005_151199156:LRBA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 151207127 C/T 1 12 12 24 5.57272116891006 6.42727883108994 -0.854557662179879 A:T:C C T 10 0.535606569257495 0.838559306298216 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000508606:exon_151207085_151207186:LRBA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 151223806 T/A 1 18 9 27 8.35908175336509 4.82045912331745 3.53862263004764 A:T T A 10 0.535606569257495 0.183063497330438 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151223780_151223944:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151223777_151223944:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151223777_151223944:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151223777_151223944:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151223777_151223944:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151223777_151223944:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000508606:exon_151223777_151223863:LRBA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 154513627 A/G 1 20 15 35 9.2878686148501 8.03409853886242 1.25377007598768 A:G A G 10 0.535606569257495 0.736352529535451 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 154513722 C/T 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 T:C C T 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 154514965 T/C 1 8 11 19 3.71514744594004 5.89167226183244 -2.1765248158924 T:C T C 10 0.535606569257495 0.362403407231352 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154514951_154515023:KIAA0922 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 154525138 A/G 1 56 68 124 26.0060321215803 36.4212467095097 -10.4152145879294 A:C:G A G 10 0.535606569257495 0.0713621413223097 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154524954_154525534:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154524954_154525582:KIAA0922 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 154553877 C/T 1 25 15 40 11.6098357685626 8.03409853886242 3.5757372297002 T:C C T 10 0.535606569257495 0.271696404679915 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000478919:exon_154553516_154553990:KIAA0922 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 156721098 G/A 1 45 42 87 20.8977043834127 22.4954759088148 -1.59777152540206 A:G G A 10 0.535606569257495 0.748074368558283 ENSG00000061918:ENST00000505154:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000502959:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000505764:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000507146:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000264424:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000503520:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000513437:exon_156721029_156721226:GUCY1B3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 159601676 C/T 1 12 17 29 5.57272116891006 9.10531167737741 -3.53259050846735 T:C C T 10 0.535606569257495 0.197911784817732 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000436096:exon_159601619_159601759:ETFDH HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 160277276 C/T 1 1 7 8 0.464393430742505 3.74924598480246 -3.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0288949230486104 ENSG00000109756:ENST00000264431:exon_160277005_160277310:RAPGEF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 162307000 T/C 1 1 20 21 0.464393430742505 10.7121313851499 -10.2477379544074 T:C T C 10 0.535606569257495 4.5708455541291e-06 ENSG00000168843:ENST00000306100:exon_162305049_162307601:FSTL5;ENSG00000168843:ENST00000379164:exon_162305051_162307601:FSTL5;ENSG00000168843:ENST00000427802:exon_162306899_162307601:FSTL5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 162307312 C/A 1 11 3 14 5.10832773816756 1.60681970777248 3.50150803039507 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0660918331472145 ENSG00000168843:ENST00000306100:exon_162305049_162307601:FSTL5;ENSG00000168843:ENST00000379164:exon_162305051_162307601:FSTL5;ENSG00000168843:ENST00000427802:exon_162306899_162307601:FSTL5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 164085425 T/C 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 T:C T C 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000145414:ENST00000422287:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000274054:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000509232:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000502973:exon_164085369_164085543:NAF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 169176996 G/A 1 10 9 19 4.64393430742505 4.82045912331745 -0.176524815892404 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169176862_169177020:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000505393:exon_169176862_169177020:DDX60 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 169928842 G/T 1 13 9 22 6.03711459965257 4.82045912331745 1.21665547633511 T:G G T 10 0.535606569257495 0.672817163244646 ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 169931268 G/A 1 8 1 9 3.71514744594004 0.535606569257495 3.17954087668255 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0433666493567438 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 169931274 G/A 1 7 1 8 3.25075401519754 0.535606569257495 2.71514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0758732255235235 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 174090004 G/A 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000109586:ENST00000265000:exon_174089904_174090112:GALNT7;ENSG00000109586:ENST00000512285:exon_174089962_174090112:GALNT7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 16 18 34 7.43029489188008 9.64091824663491 -2.21062335475483 A:C:G A G 10 0.535606569257495 0.493886486229954 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 107 94 201 49.690097089448 50.3470175102045 -0.656920420756485 T:C C T 10 0.535606569257495 0.943701188064703 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 185615764 C/A 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 A:C C A 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 185615768 T/G 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 T:G T G 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 185634144 T/C 1 10 13 23 4.64393430742505 6.96288540034743 -2.31895109292238 T:C T C 10 0.535606569257495 0.404576740411981 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000506535:exon_185634098_185634167:MLF1IP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 185637699 A/G 1 15 11 26 6.96590146113758 5.89167226183244 1.07422919930513 A:G A G 10 0.535606569257495 0.69956771663553 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185637551_185637787:MLF1IP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 185650154 G/A 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 A:G G A 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185650072_185650189:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185650072_185650189:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185650072_185650189:MLF1IP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 185655171 C/T 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 T:C C T 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185655170_185655287:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185655170_185655284:MLF1IP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 185687129 G/A 1 14 25 39 6.50150803039507 13.3901642314374 -6.8886562010423 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0356605365230296 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000503407:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687045_185687140:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687045_185687140:ACSL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 185687863 A/G 1 25 10 35 11.6098357685626 5.35606569257495 6.25377007598768 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0410684044732923 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687776_185687910:ACSL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 A:G A G 10 0.535606569257495 0.193170376367493 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 190862126 A/G 0 33 1 34 15.3249832145027 0.535606569257495 14.7893766452452 A:T A T 10 0.535606569257495 2.21115285731050e-08 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 190862142 C/T 0 48 0 48 22.2908846756402 0 22.2908846756402 C C 10 0.535606569257495 1.02291213890208e-13 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 190862154 T/C 1 48 4 52 22.2908846756402 2.14242627702998 20.1484583986103 T:C T C 10 0.535606569257495 1.59404742340247e-09 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 4 190862182 C/T 1 34 5 39 15.7893766452452 2.67803284628747 13.1113437989577 T:C C T 10 0.535606569257495 1.40953388702309e-05 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000514482:exon_190862179_190862226:FRG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 231111 T/C 1 79 81 160 36.6870810286579 43.3841321098571 -6.69705108119919 T:C T C 10 0.535606569257495 0.303298268139737 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_231058_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_231058_231115:SDHA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 92 90 182 42.7241956283105 48.2045912331745 -5.48039560486408 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.414983305104536 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 33 50 83 15.3249832145027 26.7803284628747 -11.4553452483721 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0149831273256039 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 6604787 C/T 1 46 51 97 21.3620978141552 27.3159350321322 -5.95383721797701 T:C C T 10 0.535606569257495 0.262728549298749 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604718_6604995:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6604718_6604821:NSUN2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 6633042 C/T 1 22 24 46 10.2166554763351 12.8545576621799 -2.63790218584477 T:C C T 10 0.535606569257495 0.462375616630313 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6632997_6633404:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6632997_6633404:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6632997_6633155:NSUN2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 6633779 C/G 1 22 27 49 10.2166554763351 14.4613773699524 -4.24472189361725 C:G C G 10 0.535606569257495 0.252709365077025 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 6651970 A/G 1 8 9 17 3.71514744594004 4.82045912331745 -1.10531167737741 A:G A G 10 0.535606569257495 0.633230727718346 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 6652009 G/A 1 7 8 15 3.25075401519754 4.28485255405996 -1.03409853886242 A:G G A 10 0.535606569257495 0.614879753164389 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 6656210 G/A 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6656191_6656292:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6656191_6656292:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6656191_6656292:SRD5A1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 6748659 T/C 1 10 7 17 4.64393430742505 3.74924598480246 0.894688322622586 T:C T C 10 0.535606569257495 0.809240333218704 ENSG00000112941:ENST00000230859:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000511764:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000514697:exon_6748577_6748703:PAPD7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 7866821 T/C 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 T:C T C 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000511261:exon_7866759_7867502:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 7870973 A/G 1 15 10 25 6.96590146113758 5.35606569257495 1.60983576856263 A:G A G 10 0.535606569257495 0.553975210119156 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508047:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000503550:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000502550:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000506877:exon_7870883_7871030:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512217:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7870883_7871036:MTRR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 7878179 C/T 1 15 11 26 6.96590146113758 5.89167226183244 1.07422919930513 T:C C T 10 0.535606569257495 0.69956771663553 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7878057_7878262:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514220:exon_7878057_7878348:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508890:exon_7878057_7878188:MTRR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 7889216 G/A 1 19 8 27 8.8234751841076 4.28485255405996 4.53862263004764 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0854897429602086 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7889208_7889276:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 7889304 C/T 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 7897319 G/A 1 23 15 38 10.6810489070776 8.03409853886242 2.64695036821519 A:G G A 10 0.535606569257495 0.420024100820254 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 9154659 G/C 1 9 1 10 4.17954087668255 0.535606569257495 3.64393430742505 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0246360115647308 ENSG00000112902:ENST00000382496:exon_9154600_9154807:SEMA5A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 10282396 A/G 1 9 10 19 4.17954087668255 5.35606569257495 -1.1765248158924 A:G A G 10 0.535606569257495 0.649555257001445 ENSG00000164237:ENST00000503834:exon_10282309_10282400:CMBL;ENSG00000164237:ENST00000296658:exon_10282309_10282400:CMBL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 14498727 G/A 1 7 14 21 3.25075401519754 7.49849196960493 -4.24773795440739 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0794265593904473 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000344135:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508343:exon_14498628_14499290:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508283:exon_14498625_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508717:exon_14498625_14498749:TRIO HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 9 13 22 4.17954087668255 6.96288540034743 -2.78334452366489 A:G A G 10 0.535606569257495 0.286635935669917 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 T:C T C 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 31538692 A/C 1 8 14 22 3.71514744594004 7.49849196960493 -3.78334452366489 A:C A C 10 0.535606569257495 0.134296367934504 ENSG00000082213:ENST00000325366:exon_31538367_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000355907:exon_31538367_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000510659:exon_31538591_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000513967:exon_31538591_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000517780:exon_31538367_31538793:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000511208:exon_31538588_31538791:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000504464:exon_31538591_31538796:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000510530:exon_31538280_31538796:C5orf22 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 32403346 C/T 1 21 16 37 9.75226204559261 8.56970510811992 1.18255693747269 T:C C T 10 0.535606569257495 0.74382946670773 ENSG00000056097:ENST00000265069:exon_32403211_32403502:ZFR;ENSG00000056097:ENST00000382126:exon_32403211_32403502:ZFR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 33998883 A/G 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33998746_33998887:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33998746_33998932:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33998746_33998932:C1QTNF3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 34008100 C/T 1 5 11 16 2.32196715371253 5.89167226183244 -3.56970510811992 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0832026742777677 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_34007878_34008213:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_34007878_34008133:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_34007878_34008209:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_34007878_34008189:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_34007878_34008133:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_34007878_34008133:AMACR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 36171780 A/G 1 11 17 28 5.10832773816756 9.10531167737741 -3.99698393920986 A:G A G 10 0.535606569257495 0.134872699384411 ENSG00000145604:ENST00000274254:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000274255:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000308927:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000509692:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000513151:exon_36171705_36171835:SKP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 37036492 C/T 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_37036481_37036589:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_37036481_37036589:NIPBL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 39382900 G/A 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000153071:ENST00000320816:exon_39382720_39383373:DAB2;ENSG00000153071:ENST00000509337:exon_39382720_39383373:DAB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 52193287 C/T 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000213949:ENST00000282588:exon_52193286_52193359:ITGA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 52240810 A/G 1 21 12 33 9.75226204559261 6.42727883108994 3.32498321450267 A:G A G 10 0.535606569257495 0.296093943625254 ENSG00000213949:ENST00000282588:exon_52240773_52240865:ITGA1;ENSG00000213949:ENST00000504669:exon_52240773_52240865:ITGA1;ENSG00000213949:ENST00000506275:exon_52240773_52240865:ITGA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 54960673 C/G 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000177058:ENST00000515159:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000505708:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000396865:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000318672:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000416547:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000515629:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000508124:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000512595:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000511233:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000512208:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000524154:exon_54960521_54960960:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000507447:exon_54960388_54960691:SLC38A9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 54960687 C/T 1 6 7 13 2.78636058445503 3.74924598480246 -0.962885400347434 T:C C T 10 0.535606569257495 0.782351862796383 ENSG00000177058:ENST00000515159:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000505708:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000396865:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000318672:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000416547:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000515629:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000508124:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000512595:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000511233:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000512208:exon_54960521_54960691:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000524154:exon_54960521_54960960:SLC38A9;ENSG00000177058:ENST00000507447:exon_54960388_54960691:SLC38A9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 56177743 G/A 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000095015:ENST00000399503:exon_56177397_56178693:MAP3K1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 56178111 A/G 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:G A G 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000095015:ENST00000399503:exon_56177397_56178693:MAP3K1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 56178217 A/C 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:C A C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000095015:ENST00000399503:exon_56177397_56178693:MAP3K1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 57751443 A/G 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 A:G A G 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000145632:ENST00000274289:exon_57751366_57751606:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000442330:exon_57751366_57751606:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000503378:exon_57751366_57751606:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000505244:exon_57751438_57751606:PLK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 57753116 C/T 1 3 8 11 1.39318029222752 4.28485255405996 -2.89167226183244 T:C C T 10 0.535606569257495 0.127650256211486 ENSG00000145632:ENST00000274289:exon_57753008_57753206:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000502671:exon_57753008_57753206:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000442330:exon_57753012_57753206:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000510629:exon_57753008_57753248:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000503115:exon_57753008_57753206:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000515415:exon_57753008_57753206:PLK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 57753149 A/G 1 6 9 15 2.78636058445503 4.82045912331745 -2.03409853886242 A:G A G 10 0.535606569257495 0.312839743181367 ENSG00000145632:ENST00000274289:exon_57753008_57753206:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000502671:exon_57753008_57753206:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000442330:exon_57753012_57753206:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000510629:exon_57753008_57753248:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000503115:exon_57753008_57753206:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000515415:exon_57753008_57753206:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000509555:exon_57753136_57753206:PLK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 57755703 C/T 1 13 7 20 6.03711459965257 3.74924598480246 2.2878686148501 T:C C T 10 0.535606569257495 0.37307358781869 ENSG00000145632:ENST00000274289:exon_57755517_57756087:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000442330:exon_57755628_57755786:PLK2;ENSG00000145632:ENST00000504196:exon_57755517_57755913:PLK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 64020241 T/C 1 73 80 153 33.9007204442029 42.8485255405996 -8.94780509639673 T:C T C 10 0.535606569257495 0.168039425718474 ENSG00000153006:ENST00000513458:exon_64016340_64020400:SREK1IP1;ENSG00000153006:ENST00000396708:exon_64018508_64020400:SREK1IP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 17 18 35 7.89468832262259 9.64091824663491 -1.74622992401232 A:G G A 10 0.535606569257495 0.612809759315648 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 30 39 69 13.9318029222752 20.8886562010423 -6.95685327876715 C:G C G 10 0.535606569257495 0.116004361255465 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 64267595 T/C 1 10 19 29 4.64393430742505 10.1765248158924 -5.53259050846735 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0419714289237075 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 20 20 40 9.2878686148501 10.7121313851499 -1.4242627702998 A:G G A 10 0.535606569257495 0.751697080345037 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 65349887 A/G 1 33 23 56 15.3249832145027 12.3189510929224 3.00603212158028 A:G A G 10 0.535606569257495 0.503313396755326 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 65350374 A/G 1 34 36 70 15.7893766452452 19.2818364932698 -3.49245984802465 A:G A G 10 0.535606569257495 0.404844912414508 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 66478729 A/G 0 22 0 22 10.2166554763351 0 10.2166554763351 A A 10 0.535606569257495 1.12988784393952e-06 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 66480005 C/T 0 0 20 20 0 10.7121313851499 -10.7121313851499 T C T 10 0.535606569257495 2.17631298143301e-07 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 66480374 G/C 1 23 2 25 10.6810489070776 1.07121313851499 9.60983576856263 C:G G C 10 0.535606569257495 5.99034108667194e-05 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180;ENSG00000134061:ENST00000515027:exon_66480350_66480413:CD180 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 67522722 C/T 1 4 7 11 1.85757372297002 3.74924598480246 -1.89167226183244 T:C C T 10 0.535606569257495 0.36607342785591 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67522118_67522837:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67522118_67522837:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000517412:exon_67522265_67522837:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67522462_67522837:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67522462_67522837:PIK3R1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 67588148 G/A 1 16 8 24 7.43029489188008 4.28485255405996 3.14544233782012 A:G G A 10 0.535606569257495 0.224088576462827 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000523807:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000522084:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000320694:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000336483:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518292:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518813:exon_67586628_67588189:PIK3R1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 20 27 47 9.2878686148501 14.4613773699524 -5.17350875510226 T:G G T 10 0.535606569257495 0.144538259879571 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 68471247 G/A 1 59 56 115 27.3992124138078 29.9939678784197 -2.59475546461192 A:G G A 10 0.535606569257495 0.641176969091062 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000505500:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000507798:exon_68471224_68471364:CCNB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 68666967 C/G 1 8 11 19 3.71514744594004 5.89167226183244 -2.1765248158924 C:G C G 10 0.535606569257495 0.362403407231352 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68666862_68666998:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68666862_68666998:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68666862_68666998:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000511349:exon_68666911_68666998:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68666862_68666998:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000504177:exon_68666862_68666998:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68666862_68666998:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000512785:exon_68666862_68666998:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000506564:exon_68666862_68666998:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68666532_68666998:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68666862_68666998:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68666862_68666998:RAD17 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 70800475 C/T 1 4 6 10 1.85757372297002 3.21363941554497 -1.35606569257495 T:C C T 10 0.535606569257495 0.529494183528195 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 70806711 C/G 1 7 10 17 3.25075401519754 5.35606569257495 -2.10531167737741 C:G C G 10 0.535606569257495 0.338652205084508 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 70806958 G/A 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 A:G G A 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 70858194 C/T 1 14 7 21 6.50150803039507 3.74924598480246 2.75226204559261 T:C C T 10 0.535606569257495 0.277038580102749 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70858101_70858347:BDP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 70945075 A/G 1 34 36 70 15.7893766452452 19.2818364932698 -3.49245984802465 A:G A G 10 0.535606569257495 0.404844912414508 ENSG00000131844:ENST00000512218:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000323375:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000340941:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000509539:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000505435:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000508703:exon_70944924_70945080:MCCC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 71519664 C/T 1 32 25 57 14.8605897837602 13.3901642314374 1.47042555232279 T:C C T 10 0.535606569257495 0.790871386983224 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 71524163 A/T 1 16 14 30 7.43029489188008 7.49849196960493 -0.0681970777248484 A:T A T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71522877_71525380:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522042:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515404:exon_71523590_71524195:MRPS27 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 72798845 A/G 1 458 399 857 212.692191280067 213.70702113374 -1.01482985367318 A:G A G 10 0.535606569257495 0.945424516246368 ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 75932869 C/T 1 17 9 26 7.89468832262259 4.82045912331745 3.07422919930513 T:C C T 10 0.535606569257495 0.244740828501064 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75932866_75932929:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000515505:exon_75932859_75932933:IQGAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 75932965 G/C 1 15 7 22 6.96590146113758 3.74924598480246 3.21665547633511 C:G G C 10 0.535606569257495 0.202330577542265 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 75932971 A/G 1 8 15 23 3.71514744594004 8.03409853886242 -4.31895109292238 A:G A G 10 0.535606569257495 0.093185649776015 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 75960865 T/C 1 24 31 55 11.1454423378201 16.6038036469823 -5.45836130916222 T:C T C 10 0.535606569257495 0.175889663980193 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75960851_75961000:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75960851_75960876:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75960851_75961000:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75960851_75961000:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75960851_75961000:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75960851_75961000:IQGAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 75969360 G/T 1 13 10 23 6.03711459965257 5.35606569257495 0.681048907077616 T:G G T 10 0.535606569257495 0.836732692537685 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75969274_75969414:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75969274_75969414:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75969274_75969414:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75969274_75969414:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000512383:exon_75969274_75969414:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000504558:exon_75969274_75969606:IQGAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 12 31 43 5.57272116891006 16.6038036469823 -11.0310824780723 T:C T C 10 0.535606569257495 0.00106056535192360 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 10 14 24 4.64393430742505 7.49849196960493 -2.85455766217988 A:C C A 10 0.535606569257495 0.306768141328979 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 78181477 C/T 1 3 9 12 1.39318029222752 4.82045912331745 -3.42727883108994 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0782949617348295 ENSG00000113273:ENST00000264914:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000341088:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000396151:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000521800:exon_78181407_78181653:ARSB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 82648977 T/G 1 27 28 55 12.5386226300476 14.9969839392099 -2.45836130916222 T:G T G 10 0.535606569257495 0.589095638674620 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82648950_82649577:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82648944_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82648950_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82648944_82649606:XRCC4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 87498849 G/A 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000164180:ENST00000514135:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000511087:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000510089:exon_87493486_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000296595:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000506536:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000511218:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000512429:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000443393:exon_87498789_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000507872:exon_87498501_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000509387:exon_87498760_87498892:TMEM161B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 94050487 T/A 0 11 0 11 5.10832773816756 0 5.10832773816756 T T 10 0.535606569257495 0.00125729441466232 ENSG00000175471:ENST00000514040:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94050482_94050591:MCTP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 95084131 G/A 1 12 15 27 5.57272116891006 8.03409853886242 -2.46137736995236 A:G G A 10 0.535606569257495 0.440874576584086 ENSG00000164292:ENST00000504949:exon_95084037_95084191:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000506959:exon_95084037_95084145:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000379982:exon_95084037_95084191:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000510623:exon_95084037_95084191:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000502541:exon_95084037_95084191:RHOBTB3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 95091194 C/T 1 11 8 19 5.10832773816756 4.28485255405996 0.823475184107596 T:C C T 10 0.535606569257495 0.819697348092054 ENSG00000164292:ENST00000504949:exon_95091100_95091797:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000379982:exon_95091100_95091465:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000502541:exon_95091100_95091465:RHOBTB3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 95091201 A/G 1 11 9 20 5.10832773816756 4.82045912331745 0.287868614850101 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000164292:ENST00000504949:exon_95091100_95091797:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000379982:exon_95091100_95091465:RHOBTB3;ENSG00000164292:ENST00000502541:exon_95091100_95091465:RHOBTB3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 96118852 G/C 1 9 5 14 4.17954087668255 2.67803284628747 1.50150803039507 C:G G C 10 0.535606569257495 0.593847168610995 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96118755_96118939:ERAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 96121524 C/T 1 63 31 94 29.2567861367778 16.6038036469823 12.6529824897955 T:C C T 10 0.535606569257495 0.009504162340397 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96121343_96121675:ERAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 96124330 T/C 1 23 14 37 10.6810489070776 7.49849196960493 3.18255693747269 T:C T C 10 0.535606569257495 0.325801108266624 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96124234_96124388:ERAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 96126308 A/G 1 22 11 33 10.2166554763351 5.89167226183244 4.32498321450267 A:G A G 10 0.535606569257495 0.162560019827318 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96126215_96126329:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503311:exon_96126288_96126346:ERAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 96129512 A/G 1 14 5 19 6.50150803039507 2.67803284628747 3.8234751841076 A:G A G 10 0.535606569257495 0.106155134776713 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 96139250 C/G 1 31 6 37 14.3961963530177 3.21363941554497 11.1825569374727 C:G C G 10 0.535606569257495 0.000188850162654977 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 96139464 C/T 1 64 37 101 29.7211795675203 19.8174430625273 9.90373650499301 T:C C T 10 0.535606569257495 0.057535271401827 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 96350710 G/A 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 A:G G A 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000113441:ENST00000231368:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000489981:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000417755:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000379870:exon_96350643_96350799:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000395770:exon_96350643_96350799:LNPEP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 108713970 C/T 1 35 40 75 16.2537700759877 21.4242627702998 -5.17049269431212 T:C C T 10 0.535606569257495 0.248039565486257 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 108713982 T/C 1 43 45 88 19.9689175219277 24.1022956165873 -4.13337809465956 A:T:C T C 10 0.535606569257495 0.393923513561397 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 108714298 T/C 1 103 66 169 47.832523366478 35.3500335709947 12.4824897954834 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0638674922686127 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 108719151 G/A 1 19 18 37 8.8234751841076 9.64091824663491 -0.817443062527312 A:G G A 10 0.535606569257495 0.869525755309081 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000511624:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000512822:exon_108719097_108719221:PJA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 110439509 A/G 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 A:G A G 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505303:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000504122:exon_110439485_110439559:WDR36 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 110456704 A/T 1 8 11 19 3.71514744594004 5.89167226183244 -2.1765248158924 A:T A T 10 0.535606569257495 0.362403407231352 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456697_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456694_110456839:WDR36 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 22 25 47 10.2166554763351 13.3901642314374 -3.17350875510226 C:G G C 10 0.535606569257495 0.382274275676213 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 112328377 A/G 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 A:G A G 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000172795:ENST00000515408:exon_112328369_112328467:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000513585:exon_112328369_112328467:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000389063:exon_112328369_112328467:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000512751:exon_112328369_112328467:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000502635:exon_112328369_112328467:DCP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 114961396 C/A 1 57 27 84 26.4704255523228 14.4613773699524 12.0090481823704 A:C C A 10 0.535606569257495 0.00857677765191189 ENSG00000251201:ENST00000282382:exon_114961298_114961858:TMED7-TICAM2;ENSG00000251201:ENST00000408996:exon_114961298_114961870:TMED7-TICAM2;ENSG00000251201:ENST00000333314:exon_114961298_114961711:TMED7-TICAM2;ENSG00000134970:ENST00000456936:exon_114961298_114961870:TMED7;ENSG00000134970:ENST00000508420:exon_114961298_114961679:TMED7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 115428334 G/T 1 11 5 16 5.10832773816756 2.67803284628747 2.43029489188008 T:G G T 10 0.535606569257495 0.316760693759888 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 10 7 17 4.64393430742505 3.74924598480246 0.894688322622586 T:C C T 10 0.535606569257495 0.809240333218704 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 115822585 C/T 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000092421:ENST00000343348:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000257414:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000282394:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000510263:exon_115822445_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000503402:exon_115822445_115822925:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000510024:exon_115822337_115822662:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000502996:exon_115822445_115822662:SEMA6A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 115824639 A/G 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000092421:ENST00000343348:exon_115824584_115824703:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000257414:exon_115824584_115824703:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000282394:exon_115824584_115824703:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000510263:exon_115824584_115824703:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000510024:exon_115824584_115824705:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000502996:exon_115824584_115824703:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000503962:exon_115824611_115824703:SEMA6A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 118506685 G/A 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118505885_118506975:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000507552:exon_118506411_118506975:DMXL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 118691784 T/C 1 79 59 138 36.6870810286579 31.6007875861922 5.0862934424657 T:C T C 10 0.535606569257495 0.39483334373662 ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118690009_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118691718_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118691730_118691816:TNFAIP8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 118728953 G/C 1 111 98 209 51.5476708124181 52.4894437872345 -0.941772974816445 C:G G C 10 0.535606569257495 0.944734883135477 ENSG00000145779:ENST00000274456:exon_118728511_118729089:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000513374:exon_118728511_118729438:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504642:exon_118728511_118729141:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118728511_118730294:TNFAIP8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 22 17 39 10.2166554763351 9.10531167737741 1.1113437989577 A:G A G 10 0.535606569257495 0.750830704480835 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 121355961 G/A 1 11 19 30 5.10832773816756 10.1765248158924 -5.06819707772485 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0688988177718336 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 122682334 C/T 1 26 13 39 12.0742291993051 6.96288540034743 5.1113437989577 T:C C T 10 0.535606569257495 0.110058075461033 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 122685727 C/G 1 7 16 23 3.25075401519754 8.56970510811992 -5.31895109292238 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0348486029386976 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122685638_122685783:CEP120 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 122718736 G/C 1 12 12 24 5.57272116891006 6.42727883108994 -0.854557662179879 C:G G C 10 0.535606569257495 0.838559306298216 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122718713_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122718719_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122718680_122718776:CEP120 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 122727026 G/A 1 12 13 25 5.57272116891006 6.96288540034743 -1.39016423143737 A:G G A 10 0.535606569257495 0.689399952434429 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000395431:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000503049:exon_122726603_122727031:CEP120 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 32 30 62 14.8605897837602 16.0681970777248 -1.20760729396468 A:G G A 10 0.535606569257495 0.79966058141001 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 131008194 T/C 1 7 9 16 3.25075401519754 4.82045912331745 -1.56970510811992 T:C T C 10 0.535606569257495 0.462079525679044 ENSG00000217128:ENST00000307968:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000307954:exon_131007198_131008617:FNIP1;ENSG00000217128:ENST00000510461:exon_131007198_131008617:FNIP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 132051559 T/C 1 63 43 106 29.2567861367778 23.0310824780723 6.22570365870554 T:C T C 10 0.535606569257495 0.243231805013656 ENSG00000131437:ENST00000378746:exon_132051449_132051623:KIF3A;ENSG00000131437:ENST00000378735:exon_132051449_132051623:KIF3A;ENSG00000131437:ENST00000403231:exon_132051449_132051623:KIF3A;ENSG00000131437:ENST00000450914:exon_132051450_132051623:KIF3A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 133481467 G/A 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000081059:ENST00000321584:exon_133481432_133481511:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000522653:exon_133479283_133483674:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000518915:exon_133481432_133481876:TCF7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 134364996 G/T 0 0 30 30 0 16.0681970777248 -16.0681970777248 T G T 10 0.535606569257495 1.01527111129086e-10 ENSG00000069011:ENST00000265340:exon_134363424_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000506438:exon_134364243_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000503586:exon_134364912_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000504936:exon_134364977_134365011:PITX1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 137661568 T/C 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137661504_137661593:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000357274:exon_137661504_137661593:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137661504_137661593:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137661504_137661593:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137661504_137661593:CDC25C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 7 9 16 3.25075401519754 4.82045912331745 -1.56970510811992 A:G G A 10 0.535606569257495 0.462079525679044 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 137717213 G/A 1 14 14 28 6.50150803039507 7.49849196960493 -0.996983939209859 A:G G A 10 0.535606569257495 0.709785628768718 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000512928:exon_137717205_137717437:KDM3B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 10 15 25 4.64393430742505 8.03409853886242 -3.39016423143737 A:G A G 10 0.535606569257495 0.228594195909264 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 139682663 G/C 1 11 16 27 5.10832773816756 8.56970510811992 -3.46137736995236 C:G G C 10 0.535606569257495 0.246551169931367 ENSG00000113068:ENST00000261813:exon_139682626_139682706:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000510217:exon_139682626_139682698:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000524074:exon_139682626_139682668:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000507185:exon_139682626_139682671:PFDN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 139938237 C/T 1 13 10 23 6.03711459965257 5.35606569257495 0.681048907077616 T:C C T 10 0.535606569257495 0.836732692537685 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139937853_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000358580:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139937979_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139938170_139938406:APBB3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 139940302 G/A 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139940284_139940339:APBB3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 140057535 G/A 1 47 52 99 21.8264912448977 27.8515416013897 -6.025050356492 A:G G A 10 0.535606569257495 0.228395914285266 ENSG00000170445:ENST00000504156:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000457527:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000431330:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000504366:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000307633:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000448240:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000438307:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000415192:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512655:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000506579:exon_140057240_140058712:HARS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 141016383 C/A 1 19 15 34 8.8234751841076 8.03409853886242 0.789376645245174 A:C C A 10 0.535606569257495 0.864291458650162 ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141016303_141016437:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141016303_141016409:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523088:exon_141016303_141016400:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000519474:exon_141016303_141016405:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141016303_141016392:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000492506:exon_141016303_141016410:HDAC3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 145499996 C/T 1 48 40 88 22.2908846756402 21.4242627702998 0.866621905340445 T:C C T 10 0.535606569257495 0.915024713506606 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145499934_145500066:LARS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 145508340 A/G 1 38 37 75 17.6469503682152 19.8174430625273 -2.17049269431212 A:G A G 10 0.535606569257495 0.644386597872952 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145508235_145508345:LARS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 145519821 G/A 1 40 26 66 18.5757372297002 13.9257708006949 4.64996642900533 A:G G A 10 0.535606569257495 0.268581351035645 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000512412:exon_145519767_145519824:LARS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 145523105 G/A 1 27 30 57 12.5386226300476 16.0681970777248 -3.52957444767721 A:G G A 10 0.535606569257495 0.356045074172151 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000514104:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000504323:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508667:exon_145522807_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000507095:exon_145523050_145523113:LARS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 145539996 T/G 1 16 20 36 7.43029489188008 10.7121313851499 -3.28183649326982 T:G T G 10 0.535606569257495 0.317098320507134 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145539937_145540049:LARS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 145543972 G/A 1 10 4 14 4.64393430742505 2.14242627702998 2.50150803039507 A:G G A 10 0.535606569257495 0.283626359522875 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145543873_145544034:LARS;ENSG00000133706:ENST00000505223:exon_145543961_145544034:LARS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 148747902 G/C 1 6 13 19 2.78636058445503 6.96288540034743 -4.1765248158924 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0659965969592849 ENSG00000145882:ENST00000274569:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000511945:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000505669:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000503240:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000514349:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000507621:exon_148747556_148749216:PCYOX1L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 149212243 G/C 1 7 10 17 3.25075401519754 5.35606569257495 -2.10531167737741 C:G G C 10 0.535606569257495 0.338652205084508 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 149212471 G/A 1 2 10 12 0.92878686148501 5.35606569257495 -4.42727883108994 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0166824326952732 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 149374932 T/C 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 T:C T C 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000164296:ENST00000296736:exon_149372681_149375992:TIGD6;ENSG00000164296:ENST00000515406:exon_149374291_149375992:TIGD6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 149375110 C/T 1 7 2 9 3.25075401519754 1.07121313851499 2.17954087668255 T:C C T 10 0.535606569257495 0.189646242107253 ENSG00000164296:ENST00000296736:exon_149372681_149375992:TIGD6;ENSG00000164296:ENST00000515406:exon_149374291_149375992:TIGD6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 206 258 464 95.665046732956 138.186494868434 -42.5214481354777 A:G A G 10 0.535606569257495 8.87481234972948e-05 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 191 194 385 88.6991452718185 103.907674435954 -15.2085291641356 A:G G A 10 0.535606569257495 0.12536320389363 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 150632832 G/A 1 130 125 255 60.3711459965257 66.9508211571869 -6.57967516066121 A:G G A 10 0.535606569257495 0.415020751673701 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150632453_150632858:GM2A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 151043103 G/C 1 4 26 30 1.85757372297002 13.9257708006949 -12.0681970777248 C:G G C 10 0.535606569257495 8.21465155124686e-06 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151040657_151043160:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000520687:exon_151042049_151043160:SPARC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 157166419 C/T 1 33 37 70 15.3249832145027 19.8174430625273 -4.49245984802465 T:C C T 10 0.535606569257495 0.283982763814941 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157166329_157168456:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157166329_157166586:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157166329_157167443:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157166329_157166706:THG1L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 162901156 G/A 1 12 9 21 5.57272116891006 4.82045912331745 0.752262045592606 A:G G A 10 0.535606569257495 0.828765731707361 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162901063_162901211:HMMR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 169129422 A/G 1 24 20 44 11.1454423378201 10.7121313851499 0.433310952670222 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 169267784 G/A 1 28 29 57 13.0030160607901 15.5325905084674 -2.52957444767721 A:G G A 10 0.535606569257495 0.509936478228601 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520836:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520181:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519628:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169267761_169267856:DOCK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 176636882 C/T 1 8 5 13 3.71514744594004 2.67803284628747 1.03711459965257 T:C C T 10 0.535606569257495 0.593641770478394 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 176637149 G/A 1 9 10 19 4.17954087668255 5.35606569257495 -1.1765248158924 A:G G A 10 0.535606569257495 0.649555257001445 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 176637240 G/T 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 T:G G T 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 176637576 T/C 1 13 8 21 6.03711459965257 4.28485255405996 1.75226204559261 T:C T C 10 0.535606569257495 0.515721370266415 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 176721198 T/C 1 11 28 39 5.10832773816756 14.9969839392099 -9.8886562010423 T:C T C 10 0.535606569257495 0.00191340022822282 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 176733116 A/G 1 191 171 362 88.6991452718185 91.5887233430316 -2.88957807121317 A:G A G 10 0.535606569257495 0.792242834403701 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000511309:exon_176732872_176733148:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510797:exon_176733099_176733154:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503853:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510701:exon_176733099_176733164:PRELID1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 176733616 T/C 1 220 232 452 102.166554763351 124.260724067739 -22.0941693043877 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0380335418916163 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733423_176733960:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733423_176733670:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733456_176733950:PRELID1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 176831826 C/G 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 C:G C G 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000131187:ENST00000253496:exon_176831811_176831915:F12;ENSG00000131187:ENST00000503736:exon_176831811_176831982:F12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 1 2500 1 2501 1160.98357685626 0.535606569257495 1160.44797028701 A:T:C:G T A 10 0.535606569257495 0 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 177547336 G/A 1 14 9 23 6.50150803039507 4.82045912331745 1.68104890707762 A:G G A 10 0.535606569257495 0.535839092641956 ENSG00000145911:ENST00000274605:exon_177547179_177547700:N4BP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 72 60 132 33.4363270134604 32.1363941554497 1.29993285801067 A:G A G 10 0.535606569257495 0.861654463455409 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 180218820 C/A 1 65 55 120 30.1855729982628 29.4583613091622 0.727211689100606 A:C:G C A 10 0.535606569257495 0.927244591943754 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 180218831 G/A 1 53 31 84 24.6128518293528 16.6038036469823 8.00904818237042 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0812049361414312 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 180219304 C/T 1 84 71 155 39.0090481823704 38.0280664172821 0.980981765088281 T:C C T 10 0.535606569257495 0.93585491488744 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 5 180661980 T/C 1 20 32 52 9.2878686148501 17.1394102162398 -7.85154160138974 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0361920853147125 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180661932_180661995:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180661174_180662809:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180661174_180662806:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180661932_180661995:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180657744_180662803:TRIM41 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 3010337 A/G 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 A:G A G 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000124588:ENST00000426637:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380441:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380454:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3010259_3010423:NQO2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 7230680 G/T 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 T:G G T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7230073_7232140:RREB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 7231770 A/G 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 A:G A G 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7230073_7232140:RREB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 7246998 G/A 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7246998_7247099:RREB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 7247248 T/C 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 T:C T C 10 0.535606569257495 0.193170376367493 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7247244_7247454:RREB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 58 39 97 26.9348189830653 20.8886562010423 6.04616278202299 A:G G A 10 0.535606569257495 0.223821502847648 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 11193860 G/A 1 16 15 31 7.43029489188008 8.03409853886242 -0.603803646982342 A:G G A 10 0.535606569257495 0.858638851870196 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11193824_11193925:NEDD9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 11213832 T/C 1 33 33 66 15.3249832145027 17.6750167854973 -2.35003357099467 T:C T C 10 0.535606569257495 0.622052369537578 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 13612078 A/G 1 23 13 36 10.6810489070776 6.96288540034743 3.71816350673018 A:G A G 10 0.535606569257495 0.244144740015931 ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13612022_13612524:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13612022_13612520:SIRT5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 16145325 A/G 1 14 17 31 6.50150803039507 9.10531167737741 -2.60380364698234 A:G A G 10 0.535606569257495 0.372415799031098 ENSG00000007944:ENST00000356840:exon_16145128_16145548:MYLIP;ENSG00000007944:ENST00000349606:exon_16145128_16145548:MYLIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 17688694 G/A 1 17 14 31 7.89468832262259 7.49849196960493 0.396196353017657 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17688627_17688849:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17688627_17688849:NUP153 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 17688798 G/A 1 20 15 35 9.2878686148501 8.03409853886242 1.25377007598768 A:G G A 10 0.535606569257495 0.736352529535451 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17688627_17688849:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17688627_17688849:NUP153 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 25600968 G/A 1 10 13 23 4.64393430742505 6.96288540034743 -2.31895109292238 A:G G A 10 0.535606569257495 0.404576740411981 ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25600542_25600974:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25600542_25600974:LRRC16A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 26045929 T/C 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 T:C T C 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000196532:ENST00000360577:exon_26045612_26047022:HIST1H3C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 26056497 G/A 1 198 163 361 91.949899287016 87.3038707889717 4.64602849804432 A:T:C:G G A 10 0.535606569257495 0.635206291420914 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 26056549 A/G 1 77 59 136 35.7582941671729 31.6007875861922 4.15750658098069 A:G A G 10 0.535606569257495 0.492638495855595 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 26056604 G/A 1 169 175 344 78.4824897954834 93.7311496200616 -15.2486598245783 A:G G A 10 0.535606569257495 0.104871413855624 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 26104217 T/C 1 29 61 90 13.4674094915326 32.6720007247072 -19.2045912331745 A:T:C:G T C 10 0.535606569257495 4.99275051478209e-05 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 26104448 A/G 1 33 60 93 15.3249832145027 32.1363941554497 -16.811410940947 A:G A G 10 0.535606569257495 0.000542909543085742 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 26124430 C/T 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 T:C C T 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000180573:ENST00000377791:exon_26124373_26124969:HIST1H2AC;ENSG00000180573:ENST00000314088:exon_26124418_26124977:HIST1H2AC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 26184102 G/A 1 17 18 35 7.89468832262259 9.64091824663491 -1.74622992401232 A:G G A 10 0.535606569257495 0.612809759315648 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 26285560 A/G 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 26285683 T/C 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30164467 C/A 1 30 42 72 13.9318029222752 22.4954759088148 -8.56367298653964 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0450275484492564 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30164313_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30164356_30164523:TRIM26 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 35 31 66 16.2537700759877 16.6038036469823 -0.350033570994665 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30530245 T/C 1 10 11 21 4.64393430742505 5.89167226183244 -1.24773795440739 T:C T C 10 0.535606569257495 0.66418868541406 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30638831 T/A 1 34 24 58 15.7893766452452 12.8545576621799 2.93481898306529 A:T T A 10 0.535606569257495 0.510888175679854 ENSG00000204560:ENST00000376442:exon_30638813_30639051:DHX16;ENSG00000204560:ENST00000415603:exon_30638813_30639051:DHX16 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30864829 T/C 1 14 5 19 6.50150803039507 2.67803284628747 3.8234751841076 T:C T C 10 0.535606569257495 0.106155134776713 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000514434:exon_30864791_30864918:DDR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30865204 A/C 1 18 8 26 8.35908175336509 4.28485255405996 4.07422919930513 A:C A C 10 0.535606569257495 0.119333524518674 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30865138_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30865156_30865374:DDR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 20 11 31 9.2878686148501 5.89167226183244 3.39619635301766 T:C C T 10 0.535606569257495 0.280275295421213 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 15 7 22 6.96590146113758 3.74924598480246 3.21665547633511 A:C A C 10 0.535606569257495 0.202330577542265 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30882634 C/T 1 11 13 24 5.10832773816756 6.96288540034743 -1.85455766217988 T:C C T 10 0.535606569257495 0.540621078426603 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30882781 G/T 1 12 13 25 5.57272116891006 6.96288540034743 -1.39016423143737 T:G G T 10 0.535606569257495 0.689399952434429 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30887972 C/T 1 3 8 11 1.39318029222752 4.28485255405996 -2.89167226183244 T:C C T 10 0.535606569257495 0.127650256211486 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30887988 C/T 1 10 3 13 4.64393430742505 1.60681970777248 3.03711459965257 T:C C T 10 0.535606569257495 0.102916600745183 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30888169 G/A 1 15 7 22 6.96590146113758 3.74924598480246 3.21665547633511 A:G G A 10 0.535606569257495 0.202330577542265 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 T:C T C 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30890483 G/T 1 19 21 40 8.8234751841076 11.2477379544074 -2.4242627702998 T:C:G G T 10 0.535606569257495 0.526606941530924 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30890360_30890551:VARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30892322 C/T 1 15 13 28 6.96590146113758 6.96288540034743 0.00301606079014149 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30892131_30892341:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 12 20 32 5.57272116891006 10.7121313851499 -5.13941021623984 A:G G A 10 0.535606569257495 0.077127655713695 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 30893428 G/A 1 23 14 37 10.6810489070776 7.49849196960493 3.18255693747269 A:G G A 10 0.535606569257495 0.325801108266624 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30893321_30893451:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893321_30893496:VARS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 58 52 110 26.9348189830653 27.8515416013897 -0.916722618324446 C:G G C 10 0.535606569257495 0.923906729053402 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 42 40 82 19.5045240911852 21.4242627702998 -1.91973867911459 T:C T C 10 0.535606569257495 0.740023888278757 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31112484 C/T 1 29 31 60 13.4674094915326 16.6038036469823 -3.1363941554497 T:C C T 10 0.535606569257495 0.439374895316852 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112406_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31113030 A/G 1 36 34 70 16.7181635067302 18.2106233547548 -1.49245984802465 A:G A G 10 0.535606569257495 0.721221620178917 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 36 31 67 16.7181635067302 16.6038036469823 0.114359859747839 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31116210 G/A 1 29 9 38 13.4674094915326 4.82045912331745 8.64695036821519 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00519609796299027 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 18 5 23 8.35908175336509 2.67803284628747 5.68104890707762 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0203427708671881 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 39 28 67 18.1113437989577 14.9969839392099 3.11435985974784 C:G C G 10 0.535606569257495 0.464961998121943 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31118898 A/T 1 21 13 34 9.75226204559261 6.96288540034743 2.78937664524517 A:T A T 10 0.535606569257495 0.391865967418225 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118732_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31118644_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31118662_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31118752_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31118847_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31118869_31118899:CCHCR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 11 11 22 5.10832773816756 5.89167226183244 -0.783344523664889 A:G A G 10 0.535606569257495 0.831857301870848 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C 1 12 12 24 5.57272116891006 6.42727883108994 -0.854557662179879 A:C A C 10 0.535606569257495 0.838559306298216 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31129707 C/T 1 22 28 50 10.2166554763351 14.9969839392099 -4.78032846287475 T:C C T 10 0.535606569257495 0.202214087908662 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 47 43 90 21.8264912448977 23.0310824780723 -1.20459123317454 T:C T C 10 0.535606569257495 0.833002387959509 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 2202 1572 3774 1022.594334495 841.973526872782 180.620807622214 A:T:C:G T C 10 0.535606569257495 3.39470940427967e-09 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 2173 651 2824 1009.12692500346 348.679876586629 660.447048416834 A:T:C:G C G 10 0.535606569257495 6.71876596713769e-146 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31237333 T/A 0 8 0 8 3.71514744594004 0 3.71514744594004 T T 10 0.535606569257495 0.00893594247670414 ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 1168 21 1189 542.411527107246 11.2477379544074 531.163789152838 T:C C T 10 0.535606569257495 1.36420171119300e-279 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31239501 G/T 1 867 17 884 402.629104453752 9.10531167737741 393.523792776374 T:G G T 10 0.535606569257495 1.00854366276449e-205 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31239518 C/T 1 838 18 856 389.161694962219 9.64091824663491 379.520776715584 T:C C T 10 0.535606569257495 6.61045079824473e-197 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 0 932 0 932 432.814677452015 0 432.814677452015 G G 10 0.535606569257495 2.13477092907962e-253 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31322340 G/A 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 A:G G A 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31322888 A/G 1 1212 915 2127 562.844838059916 490.080010870608 72.7648271893083 A:T:C:G A G 10 0.535606569257495 0.00161570056869895 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 1718 776 2494 797.827914015624 415.630697743816 382.197216271808 A:T:C:G C T 10 0.535606569257495 9.46888141491803e-55 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31323203 A/G 1 1355 1921 3276 629.253098656094 1028.90021954365 -399.647120887553 A:T:C:G A G 10 0.535606569257495 2.14679196772775e-44 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 498 303 801 231.267928509768 162.288790485021 68.9791380247466 A:G G A 10 0.535606569257495 9.61721630533408e-07 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31431820 C/T 1 101 129 230 46.903736504993 69.0932474342168 -22.1895109292238 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00357935931340466 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31515442 G/C 1 17 1 18 7.89468832262259 0.535606569257495 7.35908175336509 C:G G C 10 0.535606569257495 0.000240488957196803 ENSG00000204498:ENST00000376148:exon_31515358_31515528:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376145:exon_31515390_31515528:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000496233:exon_31515417_31515528:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000473655:exon_31515438_31515528:NFKBIL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 375 401 776 174.147536528439 214.778234272255 -40.6306977438161 A:C C A 10 0.535606569257495 0.00354469813828766 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 31548912 G/A 1 20 24 44 9.2878686148501 12.8545576621799 -3.56668904732978 A:G G A 10 0.535606569257495 0.293655926545451 ENSG00000227507:ENST00000483972:exon_31548302_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000429299:exon_31548332_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000446745:exon_31548332_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000482429:exon_31548401_31548940:LTB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 32783086 A/G 1 42 34 76 19.5045240911852 18.2106233547548 1.29390073643038 A:G A G 10 0.535606569257495 0.818549902941228 ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32782821_32783090:HLA-DOB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 32797809 C/T 1 34 26 60 15.7893766452452 13.9257708006949 1.8636058445503 T:C C T 10 0.535606569257495 0.698422999985293 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797707_32797866:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 32811629 G/T 1 386 293 679 179.255864266607 156.932724792446 22.3231394741609 T:C:G G T 10 0.535606569257495 0.090436938318995 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 32811645 A/G 1 268 356 624 124.457439438991 190.675938655668 -66.2184992166768 A:G A G 10 0.535606569257495 1.31648205948464e-07 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 225 222 447 104.488521917064 118.904658375164 -14.4161364581002 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.184213819985041 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 199 191 390 92.4142927177585 102.300854728182 -9.88656201042303 T:C T C 10 0.535606569257495 0.334794364381557 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 32819865 T/C 1 7 9 16 3.25075401519754 4.82045912331745 -1.56970510811992 T:C T C 10 0.535606569257495 0.462079525679044 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 150 157 307 69.6590146113758 84.0902313734267 -14.431216762051 A:G G A 10 0.535606569257495 0.108986765120050 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 23 22 45 10.6810489070776 11.7833445236649 -1.10229561658727 A:G G A 10 0.535606569257495 0.766721221206037 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 6 17 23 2.78636058445503 9.10531167737741 -6.31895109292238 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0107790121502123 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 147 181 328 68.2658343191482 96.9447890356066 -28.6789547164583 T:C T C 10 0.535606569257495 0.00158086321051662 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33232521 C/T 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000223501:ENST00000493379:exon_33232151_33232677:VPS52 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 12 17 29 5.57272116891006 9.10531167737741 -3.53259050846735 A:G G A 10 0.535606569257495 0.197911784817732 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33247322 C/T 1 81 78 159 37.6158678901429 41.7773124020846 -4.1614445119417 T:C C T 10 0.535606569257495 0.525360653948773 ENSG00000227057:ENST00000473611:exon_33246885_33247387:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000461951:exon_33247274_33247387:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33247274_33247387:WDR46 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 A:G G A 10 0.535606569257495 0.76008336910768 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33272712 C/A 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:C C A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 199 217 416 92.4142927177585 116.226625528876 -23.8123328111179 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0207918807372431 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33281842 G/T 1 9 5 14 4.17954087668255 2.67803284628747 1.50150803039507 T:G G T 10 0.535606569257495 0.593847168610995 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33281843 A/T 1 9 5 14 4.17954087668255 2.67803284628747 1.50150803039507 A:T A T 10 0.535606569257495 0.593847168610995 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 13 9 22 6.03711459965257 4.82045912331745 1.21665547633511 T:C T C 10 0.535606569257495 0.672817163244646 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 59 64 123 27.3992124138078 34.2788204324797 -6.87960801867188 A:G A G 10 0.535606569257495 0.239884863518076 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33359716 G/C 1 17 18 35 7.89468832262259 9.64091824663491 -1.74622992401232 C:G G C 10 0.535606569257495 0.612809759315648 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000450504:exon_33359638_33359774:KIFC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33372838 G/C 1 24 22 46 11.1454423378201 11.7833445236649 -0.637902185844768 C:G G C 10 0.535606569257495 0.88322902719274 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33372629_33373408:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33372629_33373408:KIFC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33638180 C/T 1 17 12 29 7.89468832262259 6.42727883108994 1.46740949153265 T:C C T 10 0.535606569257495 0.710437247251719 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33638102_33638353:ITPR3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33643558 G/A 1 15 5 20 6.96590146113758 2.67803284628747 4.2878686148501 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0714762006587093 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33643468_33643633:ITPR3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33651129 C/T 1 6 13 19 2.78636058445503 6.96288540034743 -4.1765248158924 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0659965969592849 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33650984_33651174:ITPR3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33653448 C/T 1 18 16 34 8.35908175336509 8.56970510811992 -0.210623354754828 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33653420_33653604:ITPR3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33659472 C/G 1 19 23 42 8.8234751841076 12.3189510929224 -3.49547590881479 C:G C G 10 0.535606569257495 0.284027730988555 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 33 23 56 15.3249832145027 12.3189510929224 3.00603212158028 A:G G A 10 0.535606569257495 0.503313396755326 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 34214322 C/G 1 35 49 84 16.2537700759877 26.2447218936173 -9.99095181762958 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0370383192843036 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 34850674 G/C 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 C:G G C 10 0.535606569257495 0.299004478445789 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 19 10 29 8.8234751841076 5.35606569257495 3.46740949153265 A:C C A 10 0.535606569257495 0.263770590080562 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 283 267 550 131.423340900129 143.006953991751 -11.5836130916222 A:T:C:G C A 10 0.535606569257495 0.325772137943604 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 244 224 468 113.311997101171 119.975871513679 -6.66387441250764 T:C C T 10 0.535606569257495 0.547075378017199 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 36713263 A/G 1 12 8 20 5.57272116891006 4.28485255405996 1.2878686148501 A:G A G 10 0.535606569257495 0.65695311160528 ENSG00000124772:ENST00000459703:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000244751:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000493411:exon_36713164_36713292:CPNE5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 36824399 C/T 1 28 34 62 13.0030160607901 18.2106233547548 -5.20760729396469 T:C C T 10 0.535606569257495 0.203665195445444 ENSG00000137168:ENST00000373699:exon_36824362_36824430:PPIL1;ENSG00000137168:ENST00000483552:exon_36824362_36824430:PPIL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 16 17 33 7.43029489188008 9.10531167737741 -1.67501678549733 A:G A G 10 0.535606569257495 0.603126270764538 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 18 15 33 8.35908175336509 8.03409853886242 0.324983214502668 A:G A G 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 36976637 G/C 1 23 14 37 10.6810489070776 7.49849196960493 3.18255693747269 C:G G C 10 0.535606569257495 0.325801108266624 ENSG00000146192:ENST00000489356:exon_36976610_36977807:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000497659:exon_36976610_36976857:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36976610_36976841:FGD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 36995222 G/A 1 17 4 21 7.89468832262259 2.14242627702998 5.75226204559261 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0144542104200436 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36995205_36996845:FGD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 70 2 72 32.5075401519754 1.07121313851499 31.4363270134604 A:G G A 10 0.535606569257495 9.1116113655977e-17 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 39865047 T/C 0 9 0 9 4.17954087668255 0 4.17954087668255 T T 10 0.535606569257495 0.00463210411669919 ENSG00000146122:ENST00000274867:exon_39864951_39865058:DAAM2;ENSG00000146122:ENST00000398904:exon_39864951_39865058:DAAM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 41250466 T/A 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 A:T T A 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000124731:ENST00000244709:exon_41250133_41250489:TREM1;ENSG00000124731:ENST00000334475:exon_41250133_41250489:TREM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 41303995 A/G 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 A:G A G 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41303825_41304166:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41303825_41304166:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41303825_41304166:NCR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 41309552 T/C 1 6 10 16 2.78636058445503 5.35606569257495 -2.56970510811992 T:C T C 10 0.535606569257495 0.218581872606213 ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41309532_41309667:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41309532_41309667:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41309532_41309667:NCR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 176 173 349 81.7332438106809 92.6599364815466 -10.9266926708657 T:C C T 10 0.535606569257495 0.25973154455668 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 82 116 198 38.0802613208854 62.1303620338694 -24.050100712984 T:C C T 10 0.535606569257495 0.000770043182195099 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 78 101 179 36.2226875979154 54.096263495007 -17.8735758970916 A:C A C 10 0.535606569257495 0.00856076652090445 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 41903783 G/A 1 79 103 182 36.6870810286579 55.167476633522 -18.4803956048641 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00729982046546395 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 42044945 G/A 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 A:G G A 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000137413:ENST00000456846:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000494547:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000372982:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000530512:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000320973:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000372977:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000465926:exon_42044838_42044977:TAF8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 42532102 C/T 1 14 11 25 6.50150803039507 5.89167226183244 0.609835768562626 T:C C T 10 0.535606569257495 0.843808338313289 ENSG00000024048:ENST00000372903:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372883:exon_42532058_42532135:UBR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 42627430 C/T 1 10 2 12 4.64393430742505 1.07121313851499 3.57272116891006 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0443375191883964 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42627394_42627593:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42627394_42627593:UBR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 42627434 G/A 1 7 2 9 3.25075401519754 1.07121313851499 2.17954087668255 A:G G A 10 0.535606569257495 0.189646242107253 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42627394_42627593:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42627394_42627593:UBR2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 42858363 G/A 1 20 31 51 9.2878686148501 16.6038036469823 -7.31593503213224 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0486239192531454 ENSG00000221821:ENST00000408925:exon_42858005_42858554:C6orf226 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 43020188 G/A 1 10 12 22 4.64393430742505 6.42727883108994 -1.78334452366489 A:G G A 10 0.535606569257495 0.523642698847636 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43019947_43020534:CUL7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 43307861 G/A 1 54 51 105 25.0772452600953 27.3159350321322 -2.23868977203697 A:G G A 10 0.535606569257495 0.696012879457373 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 43535018 C/T 1 10 12 22 4.64393430742505 6.42727883108994 -1.78334452366489 T:C C T 10 0.535606569257495 0.523642698847636 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43534906_43535091:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43534906_43535091:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43534906_43535091:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372252:exon_43534906_43535091:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43534906_43535091:XPO5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 393 308 701 182.506618281804 164.966823331308 17.5397949504961 A:T:C:G G A 10 0.535606569257495 0.185316307939909 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 44219710 A/C 1 2 12 14 0.92878686148501 6.42727883108994 -5.49849196960493 A:C A C 10 0.535606569257495 0.00509930242499915 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 44222718 G/C 1 81 73 154 37.6158678901429 39.0992795557971 -1.48341166565422 C:G G C 10 0.535606569257495 0.809159060971491 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222443_44222810:SLC35B2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 53159090 G/T 1 59 28 87 27.3992124138078 14.9969839392099 12.4022284745979 T:G G T 10 0.535606569257495 0.00948916310225393 ENSG00000012660:ENST00000370913:exon_53158886_53159289:ELOVL5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 56327849 C/T 1 16 15 31 7.43029489188008 8.03409853886242 -0.603803646982342 T:C C T 10 0.535606569257495 0.858638851870196 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 56417282 C/T 1 15 21 36 6.96590146113758 11.2477379544074 -4.28183649326982 T:C C T 10 0.535606569257495 0.181521595798620 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56416982_56418453:DST HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 56417545 T/C 1 11 11 22 5.10832773816756 5.89167226183244 -0.783344523664889 T:C T C 10 0.535606569257495 0.831857301870848 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56416982_56418453:DST HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 56420538 C/T 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000520144:exon_56420406_56420638:DST HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 13 0 13 6.03711459965257 0 6.03711459965257 G G 10 0.535606569257495 0.000345257675137299 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 57246884 A/G 0 8 0 8 3.71514744594004 0 3.71514744594004 A A 10 0.535606569257495 0.00893594247670414 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 57393112 T/C 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 T:C T C 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 57467175 A/G 0 0 8 8 0 4.28485255405996 -4.28485255405996 G A G 10 0.535606569257495 0.002163159489147 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57467101_57467206:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57467080_57467206:PRIM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 14 14 0 7.49849196960493 -7.49849196960493 A G A 10 0.535606569257495 2.16972626779062e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 10 10 0 5.35606569257495 -5.35606569257495 G T G 10 0.535606569257495 0.000466509697801987 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 10 0 10 4.64393430742505 0 4.64393430742505 C C 10 0.535606569257495 0.00240944773358457 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 71377711 C/T 1 8 13 21 3.71514744594004 6.96288540034743 -3.24773795440739 T:C C T 10 0.535606569257495 0.190432172043740 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000422334:exon_71377659_71377844:SMAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 19 4 23 8.8234751841076 2.14242627702998 6.68104890707762 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00560017879216273 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 76564897 T/C 1 11 15 26 5.10832773816756 8.03409853886242 -2.92577080069487 T:C T C 10 0.535606569257495 0.325754731828897 ENSG00000196586:ENST00000428345:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369981:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369985:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369977:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369978:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369975:exon_76564856_76565000:MYO6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 79595097 A/G 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 A:G A G 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000146243:ENST00000369940:exon_79595095_79595160:IRAK1BP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 10 7 17 4.64393430742505 3.74924598480246 0.894688322622586 A:T A T 10 0.535606569257495 0.809240333218704 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 11 9 20 5.10832773816756 4.82045912331745 0.287868614850101 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 79657391 G/A 1 10 6 16 4.64393430742505 3.21363941554497 1.43029489188008 A:G G A 10 0.535606569257495 0.618142335020353 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79657340_79657492:PHIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 2 11 13 0.92878686148501 5.89167226183244 -4.96288540034743 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00925841308605916 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 83667045 C/T 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 T:C C T 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000118420:ENST00000369747:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000237186:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000392921:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000509102:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000430071:exon_83667031_83667169:UBE2CBP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 17 19 36 7.89468832262259 10.1765248158924 -2.28183649326982 T:C C T 10 0.535606569257495 0.505289503245558 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 83881740 T/C 1 7 10 17 3.25075401519754 5.35606569257495 -2.10531167737741 T:C T C 10 0.535606569257495 0.338652205084508 ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83881639_83881778:PGM3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 83949261 T/C 0 0 29 29 0 15.5325905084674 -15.5325905084674 C T C 10 0.535606569257495 2.18623056245127e-10 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83949258_83949355:ME1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 132 112 244 61.2999328580107 59.9879357568394 1.31199710117123 T:C:G G C 10 0.535606569257495 0.8979371718801 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 41 47 88 19.0401306604427 25.1735087551023 -6.13337809465956 A:G A G 10 0.535606569257495 0.200660968947890 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 99883515 G/C 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 C:G G C 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99880190_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99880255_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99880312_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99880315_99883722:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99883420_99883722:USP45 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 99893878 T/C 1 7 8 15 3.25075401519754 4.28485255405996 -1.03409853886242 T:C T C 10 0.535606569257495 0.614879753164389 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000513344:exon_99893838_99894339:USP45 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 99894086 C/G 1 5 10 15 2.32196715371253 5.35606569257495 -3.03409853886242 C:G C G 10 0.535606569257495 0.128072258736022 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000513344:exon_99893838_99894339:USP45 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 100964147 G/C 1 15 14 29 6.96590146113758 7.49849196960493 -0.532590508467353 C:G G C 10 0.535606569257495 0.854557239223409 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100964056_100964203:ASCC3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 101094554 A/G 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 A:G A G 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101094491_101094645:ASCC3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 101166095 G/A 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101165951_101166127:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101165951_101166127:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000522650:exon_101165951_101166127:ASCC3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 101296389 G/A 1 18 13 31 8.35908175336509 6.96288540034743 1.39619635301766 A:G G A 10 0.535606569257495 0.719730647046148 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000522650:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000468245:exon_101295880_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324723:exon_101296296_101296583:ASCC3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 105198267 A/G 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000085382:ENST00000262903:exon_105198216_105198347:HACE1;ENSG00000085382:ENST00000369127:exon_105198216_105198347:HACE1;ENSG00000085382:ENST00000416605:exon_105198216_105198347:HACE1;ENSG00000085382:ENST00000517995:exon_105198216_105198347:HACE1;ENSG00000085382:ENST00000369125:exon_105198216_105198347:HACE1;ENSG00000085382:ENST00000517424:exon_105198216_105198347:HACE1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 107076783 A/T 1 9 7 16 4.17954087668255 3.74924598480246 0.430294891880081 A:T A T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 15 9 24 6.96590146113758 4.82045912331745 2.14544233782012 A:G G A 10 0.535606569257495 0.419256106369884 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 108214694 C/T 1 27 46 73 12.5386226300476 24.6379021858448 -12.0992795557971 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00476647471094615 ENSG00000025796:ENST00000369002:exon_108214686_108214859:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000437345:exon_108214686_108214859:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000423697:exon_108214687_108214782:SEC63 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 109762600 A/C 1 8 12 20 3.71514744594004 6.42727883108994 -2.7121313851499 A:C A C 10 0.535606569257495 0.265275049326689 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109762560_109762656:SMPD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 29 37 66 13.4674094915326 19.8174430625273 -6.35003357099467 T:G G T 10 0.535606569257495 0.138275738539540 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 109766471 T/A 1 91 117 208 42.259802197568 62.6659686031269 -20.4061664055589 A:T T A 10 0.535606569257495 0.00531014067695995 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109766400_109766493:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000335266:exon_109766400_109766493:MICAL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 55 50 105 25.5416386908378 26.7803284628747 -1.23868977203697 T:G G T 10 0.535606569257495 0.845127825978729 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 55 44 99 25.5416386908378 23.5666890473298 1.974949643508 A:G G A 10 0.535606569257495 0.762631230148864 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 109770869 G/A 1 44 34 78 20.4333109526702 18.2106233547548 2.22268759791539 A:G G A 10 0.535606569257495 0.650865286223623 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109770860_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000433205:exon_109770860_109770986:MICAL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 109773731 C/T 1 19 26 45 8.8234751841076 13.9257708006949 -5.10229561658727 T:C C T 10 0.535606569257495 0.136779894590734 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109773714_109773818:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109773714_109773818:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109773714_109773818:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109773714_109773818:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000483856:exon_109773714_109773734:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109773714_109773818:MICAL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 109775366 C/T 1 18 35 53 8.35908175336509 18.7462299240123 -10.3871481706472 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00541497203528966 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 109775436 T/C 1 14 23 37 6.50150803039507 12.3189510929224 -5.81744306252731 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0688880703425863 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 22 12 34 10.2166554763351 6.42727883108994 3.78937664524517 T:C T C 10 0.535606569257495 0.229712278190520 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 109802651 C/T 1 42 21 63 19.5045240911852 11.2477379544074 8.25678613677782 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0427709414973896 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109802278_109803257:ZBTB24 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 26 16 42 12.0742291993051 8.56970510811992 3.50452409118521 A:G G A 10 0.535606569257495 0.353467768617808 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 111689082 C/T 1 6 9 15 2.78636058445503 4.82045912331745 -2.03409853886242 T:C C T 10 0.535606569257495 0.312839743181367 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111688318_111689231:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111688318_111689231:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111688318_111689231:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111688318_111689231:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111688318_111689231:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111688318_111689231:REV3L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 111695073 C/T 1 4 6 10 1.85757372297002 3.21363941554497 -1.35606569257495 T:C C T 10 0.535606569257495 0.529494183528195 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 111695887 G/A 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 A:G G A 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 111696257 G/A 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 116574455 G/A 1 25 18 43 11.6098357685626 9.64091824663491 1.96891752192772 A:G G A 10 0.535606569257495 0.647054275327297 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 116600774 C/G 1 28 27 55 13.0030160607901 14.4613773699524 -1.45836130916222 C:G C G 10 0.535606569257495 0.787172597568688 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 116600810 G/A 1 22 17 39 10.2166554763351 9.10531167737741 1.1113437989577 A:G G A 10 0.535606569257495 0.750830704480835 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 126210395 T/G 1 13 9 22 6.03711459965257 4.82045912331745 1.21665547633511 T:G T G 10 0.535606569257495 0.672817163244646 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000413085:exon_126210118_126211127:NCOA7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 128388799 G/T 1 5 10 15 2.32196715371253 5.35606569257495 -3.03409853886242 T:G G T 10 0.535606569257495 0.128072258736022 ENSG00000152894:ENST00000368226:exon_128388664_128388937:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000368227:exon_128388664_128388937:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000532331:exon_128388664_128388937:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000368213:exon_128388664_128388937:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000368210:exon_128388664_128388937:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000368215:exon_128388664_128388937:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000368207:exon_128388664_128388937:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000531050:exon_128388664_128388937:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000524481:exon_128388664_128388937:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000434424:exon_128388664_128388822:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000524534:exon_128388664_128388937:PTPRK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 128403745 A/G 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 A:G A G 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000152894:ENST00000368226:exon_128403582_128403783:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000368227:exon_128403582_128403783:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000532331:exon_128403582_128403783:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000368213:exon_128403582_128403783:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000368210:exon_128403582_128403783:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000368215:exon_128403582_128403783:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000368207:exon_128403582_128403783:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000531050:exon_128403582_128403783:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000524481:exon_128403582_128403783:PTPRK;ENSG00000152894:ENST00000524534:exon_128403582_128403783:PTPRK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 130031215 T/C 1 10 7 17 4.64393430742505 3.74924598480246 0.894688322622586 T:C T C 10 0.535606569257495 0.809240333218704 ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_130031169_130031370:ARHGAP18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 130761798 T/C 1 10 3 13 4.64393430742505 1.60681970777248 3.03711459965257 T:C T C 10 0.535606569257495 0.102916600745183 ENSG00000164484:ENST00000296978:exon_130761552_130764208:TMEM200A;ENSG00000164484:ENST00000392429:exon_130761552_130764206:TMEM200A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 130761804 C/T 1 3 10 13 1.39318029222752 5.35606569257495 -3.96288540034743 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0472642919377538 ENSG00000164484:ENST00000296978:exon_130761552_130764208:TMEM200A;ENSG00000164484:ENST00000392429:exon_130761552_130764206:TMEM200A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 134493397 G/A 1 9 11 20 4.17954087668255 5.89167226183244 -1.7121313851499 A:G G A 10 0.535606569257495 0.505071075446385 ENSG00000118515:ENST00000367858:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000474427:exon_134490386_134495724:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000413996:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000477460:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000237305:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000367855:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000367857:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000528577:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000475719:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000531782:exon_134493331_134493435:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000525877:exon_134493331_134493454:SGK1;ENSG00000118515:ENST00000489458:exon_134493331_134493454:SGK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 271 0 271 125.850619731219 0 125.850619731219 T T 10 0.535606569257495 3.40155742464517e-74 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 333 0 333 154.643012437254 0 154.643012437254 A A 10 0.535606569257495 5.28198114542295e-91 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 331 1 332 153.714225575769 0.535606569257495 153.178619006512 A:G A G 10 0.535606569257495 3.18516730008615e-88 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 158 0 158 73.3741620573158 0 73.3741620573158 G G 10 0.535606569257495 1.81476247019134e-43 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 163 1 164 75.6961292110283 0.535606569257495 75.1605226417708 A:T T A 10 0.535606569257495 8.53353235812195e-43 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 138195991 A/G 1 193 170 363 89.6279321333035 91.0531167737741 -1.42518464047066 A:G A G 10 0.535606569257495 0.91620475153533 ENSG00000118503:ENST00000420009:exon_138195982_138196172:TNFAIP3;ENSG00000118503:ENST00000237289:exon_138195982_138196172:TNFAIP3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 138413269 A/G 1 17 10 27 7.89468832262259 5.35606569257495 2.53862263004764 A:G A G 10 0.535606569257495 0.343243524231033 ENSG00000112378:ENST00000421351:exon_138411923_138413405:PERP;ENSG00000112378:ENST00000265603:exon_138411926_138413405:PERP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 138413333 G/C 1 23 9 32 10.6810489070776 4.82045912331745 5.86058978376016 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0497382720814281 ENSG00000112378:ENST00000421351:exon_138411923_138413405:PERP;ENSG00000112378:ENST00000265603:exon_138411926_138413405:PERP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 139487836 T/C 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000112406:ENST00000367658:exon_139487421_139488461:HECA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 143074700 T/C 1 5 10 15 2.32196715371253 5.35606569257495 -3.03409853886242 T:C T C 10 0.535606569257495 0.128072258736022 ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143072604_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143072605_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143072606_143075068:HIVEP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 143784092 A/G 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 A:G A G 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000034693:ENST00000344281:exon_143784053_143784134:PEX3;ENSG00000034693:ENST00000367592:exon_143784053_143784134:PEX3;ENSG00000034693:ENST00000367591:exon_143784053_143784134:PEX3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 147830212 G/C 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 C:G G C 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000203727:ENST00000367474:exon_147830063_147830523:SAMD5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 148865257 A/G 1 1 7 8 0.464393430742505 3.74924598480246 -3.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0288949230486104 ENSG00000111961:ENST00000367467:exon_148864816_148865954:SASH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 27 25 52 12.5386226300476 13.3901642314374 -0.851541601389737 A:G G A 10 0.535606569257495 0.889655019147133 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 24 24 48 11.1454423378201 12.8545576621799 -1.70911532435976 A:G G A 10 0.535606569257495 0.665514214980545 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 149795522 G/A 1 10 4 14 4.64393430742505 2.14242627702998 2.50150803039507 A:G G A 10 0.535606569257495 0.283626359522875 ENSG00000178199:ENST00000416573:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000389942:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409806:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409948:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000462655:exon_149795375_149795749:ZC3H12D HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 149953981 C/T 1 18 21 39 8.35908175336509 11.2477379544074 -2.8886562010423 T:C C T 10 0.535606569257495 0.422689700861272 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 149983216 G/A 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 A:G G A 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000131023:ENST00000253339:exon_149982051_149983374:LATS1;ENSG00000131023:ENST00000441107:exon_149982833_149983374:LATS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 150004779 A/G 1 10 12 22 4.64393430742505 6.42727883108994 -1.78334452366489 A:G A G 10 0.535606569257495 0.523642698847636 ENSG00000131023:ENST00000253339:exon_150004215_150005728:LATS1;ENSG00000131023:ENST00000441107:exon_150004215_150005728:LATS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 151336739 C/G 1 10 5 15 4.64393430742505 2.67803284628747 1.96590146113758 C:G C G 10 0.535606569257495 0.43886123622751 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 34 21 55 15.7893766452452 11.2477379544074 4.54163869083778 T:C C T 10 0.535606569257495 0.227239616540709 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 30 37 67 13.9318029222752 19.8174430625273 -5.88564014025216 C:G G C 10 0.535606569257495 0.177570719496302 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 151766552 G/A 1 16 8 24 7.43029489188008 4.28485255405996 3.14544233782012 A:G G A 10 0.535606569257495 0.224088576462827 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 151789912 C/T 1 38 22 60 17.6469503682152 11.7833445236649 5.8636058445503 T:C C T 10 0.535606569257495 0.154237003746764 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 153296370 G/A 1 33 37 70 15.3249832145027 19.8174430625273 -4.49245984802465 A:G G A 10 0.535606569257495 0.283982763814941 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 20 30 50 9.2878686148501 16.0681970777248 -6.78032846287475 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0647568269156096 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 153323594 C/T 1 23 3 26 10.6810489070776 1.60681970777248 9.07422919930513 T:C C T 10 0.535606569257495 0.000242375819197753 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000482526:exon_153323562_153323671:MTRF1L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 153323806 A/G 1 23 6 29 10.6810489070776 3.21363941554497 7.46740949153265 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00501575370980865 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 154763401 G/A 1 10 9 19 4.64393430742505 4.82045912331745 -0.176524815892404 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000153721:ENST00000367209:exon_154763222_154763424:CNKSR3;ENSG00000153721:ENST00000367213:exon_154763222_154763424:CNKSR3;ENSG00000153721:ENST00000479339:exon_154763222_154763424:CNKSR3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 155635527 G/C 1 21 15 36 9.75226204559261 8.03409853886242 1.71816350673018 C:G G C 10 0.535606569257495 0.618724336355263 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000470239:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000475849:exon_155635430_155635627:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000480390:exon_155635430_155635584:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000466349:exon_155635251_155635561:TFB1M HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 158927651 A/G 1 4 6 10 1.85757372297002 3.21363941554497 -1.35606569257495 A:G A G 10 0.535606569257495 0.529494183528195 ENSG00000130338:ENST00000367097:exon_158927610_158932860:TULP4;ENSG00000130338:ENST00000367094:exon_158927610_158929408:TULP4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 159065758 C/G 1 23 26 49 10.6810489070776 13.9257708006949 -3.24472189361725 C:G C G 10 0.535606569257495 0.391380303886533 ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159065714_159065771:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159065714_159065770:DYNLT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 66 76 142 30.6499664290053 40.7060992635696 -10.0561328345643 A:G G A 10 0.535606569257495 0.092992531134413 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 160453978 A/G 1 8 10 18 3.71514744594004 5.35606569257495 -1.64091824663491 A:G A G 10 0.535606569257495 0.484651981913674 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160453974_160454139:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160453974_160454139:IGF2R HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 160464289 G/A 1 12 9 21 5.57272116891006 4.82045912331745 0.752262045592606 A:G G A 10 0.535606569257495 0.828765731707361 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160464180_160464320:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160464180_160464320:IGF2R HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 160468278 A/G 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 A:G A G 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160468191_160468368:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160468191_160468368:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000479434:exon_160468191_160468368:IGF2R HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 160471556 G/A 1 20 21 41 9.2878686148501 11.2477379544074 -1.95986933955729 A:G G A 10 0.535606569257495 0.639101868614473 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160471505_160471684:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160471505_160471684:IGF2R HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 160505207 A/G 1 41 27 68 19.0401306604427 14.4613773699524 4.57875329049034 A:G A G 10 0.535606569257495 0.276527694147673 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160504982_160505216:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160504982_160505216:IGF2R HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 48 50 98 22.2908846756402 26.7803284628747 -4.48944378723451 T:C C T 10 0.535606569257495 0.364425416162983 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 167352104 C/A 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 A:C C A 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000026297:ENST00000358165:exon_167352084_167352496:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000477674:exon_167351486_167352475:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000310843:exon_167352100_167352141:RNASET2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 168315978 G/C 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168315848_168316113:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168315848_168316113:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168315848_168316113:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168315848_168316113:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168315848_168316113:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168315848_168316113:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168315848_168316113:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168315848_168316113:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168315848_168316113:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168315848_168316113:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168315848_168316113:MLLT4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 168317816 A/C 1 15 9 24 6.96590146113758 4.82045912331745 2.14544233782012 A:C A C 10 0.535606569257495 0.419256106369884 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168317769_168317912:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000497596:exon_168317769_168317912:MLLT4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 168343838 T/C 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 T:C T C 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168343809_168343871:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168343809_168343874:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000507679:exon_168343809_168343874:MLLT4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 170858176 C/A 1 194 206 400 90.092325564046 110.334953267044 -20.242627702998 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0448950987989048 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170858094_170858201:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000462957:exon_170858094_170859529:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170858094_170858201:PSMB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 172 131 303 79.8756700877109 70.1644605727318 9.71120951497903 A:C:G G C 10 0.535606569257495 0.274101029890388 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 590199 A/G 1 14 12 26 6.50150803039507 6.42727883108994 0.0742291993051314 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 1008966 C/T 1 11 15 26 5.10832773816756 8.03409853886242 -2.92577080069487 T:C C T 10 0.535606569257495 0.325754731828897 ENSG00000240230:ENST00000344111:exon_1005711_1009092:COX19 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 1131356 T/C 1 13 12 25 6.03711459965257 6.42727883108994 -0.390164231437374 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 1131378 C/T 1 16 10 26 7.43029489188008 5.35606569257495 2.07422919930513 T:C C T 10 0.535606569257495 0.439420946397761 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 1533513 A/G 1 12 7 19 5.57272116891006 3.74924598480246 1.8234751841076 A:G A G 10 0.535606569257495 0.493225271714711 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1533390_1533547:INTS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 1535838 C/T 1 9 3 12 4.17954087668255 1.60681970777248 2.57272116891006 T:C C T 10 0.535606569257495 0.158222040248362 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1535792_1535900:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1535792_1535900:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1535792_1535900:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000496988:exon_1535792_1535848:INTS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 1542697 G/A 1 10 6 16 4.64393430742505 3.21363941554497 1.43029489188008 A:G G A 10 0.535606569257495 0.618142335020353 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 1542814 T/C 1 10 7 17 4.64393430742505 3.74924598480246 0.894688322622586 T:C T C 10 0.535606569257495 0.809240333218704 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 1976457 C/T 1 16 29 45 7.43029489188008 15.5325905084674 -8.10229561658727 T:C C T 10 0.535606569257495 0.016729003222214 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 2297006 A/G 1 229 204 433 106.346095640034 109.263740128529 -2.91764448849531 A:G A G 10 0.535606569257495 0.80967068357733 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2297000_2297149:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000480807:exon_2297000_2297253:SNX8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 2303986 T/C 1 50 40 90 23.2196715371253 21.4242627702998 1.79540876682545 T:C T C 10 0.535606569257495 0.751723165038023 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2303933_2304093:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000479689:exon_2303933_2304093:SNX8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 2472555 C/T 1 28 22 50 13.0030160607901 11.7833445236649 1.21967153712525 T:C C T 10 0.535606569257495 0.777936932990307 ENSG00000136213:ENST00000258711:exon_2472198_2474242:CHST12;ENSG00000136213:ENST00000432336:exon_2472198_2473010:CHST12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 2578246 C/T 1 24 18 42 11.1454423378201 9.64091824663491 1.50452409118521 T:C C T 10 0.535606569257495 0.757462164880615 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 2649819 C/T 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2649678_2654368:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2649678_2654367:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2649678_2649912:IQCE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 5104275 G/A 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 5104359 G/A 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 A:G G A 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 5105208 C/T 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 T:C C T 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 5352949 G/C 1 18 24 42 8.35908175336509 12.8545576621799 -4.49547590881479 C:G G C 10 0.535606569257495 0.167933697369805 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 5353253 G/T 1 17 16 33 7.89468832262259 8.56970510811992 -0.675016785497333 T:G G T 10 0.535606569257495 0.862481166268759 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 5353344 G/A 1 26 20 46 12.0742291993051 10.7121313851499 1.36209781415523 A:G G A 10 0.535606569257495 0.76817749711952 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 5399044 C/G 1 31 46 77 14.3961963530177 24.6379021858448 -10.2417058328271 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0219742998731561 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5399029_5399200:TNRC18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 18 15 33 8.35908175336509 8.03409853886242 0.324983214502668 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 5417609 G/A 1 7 12 19 3.25075401519754 6.42727883108994 -3.1765248158924 A:G G A 10 0.535606569257495 0.170258554353078 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5417553_5417655:TNRC18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 5541009 C/A 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:C C A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000458142:exon_5540119_5541550:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 24 21 45 11.1454423378201 11.2477379544074 -0.102295616587273 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 90 83 173 41.7954087668255 44.4553452483721 -2.65993648154663 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.703542436490209 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 6194274 T/C 1 8 12 20 3.71514744594004 6.42727883108994 -2.7121313851499 T:C T C 10 0.535606569257495 0.265275049326689 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 6204999 A/C 1 13 15 28 6.03711459965257 8.03409853886242 -1.99698393920986 A:C A C 10 0.535606569257495 0.456308012833315 ENSG00000008256:ENST00000350796:exon_6204904_6205058:CYTH3;ENSG00000008256:ENST00000396741:exon_6204904_6205058:CYTH3;ENSG00000008256:ENST00000465320:exon_6204904_6205058:CYTH3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 24 16 40 11.1454423378201 8.56970510811992 2.5757372297002 A:G G A 10 0.535606569257495 0.433090933174964 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 7613039 C/T 1 34 44 78 15.7893766452452 23.5666890473298 -7.77731240208461 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0883626227138656 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7612067_7613400:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7612067_7613400:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000434746:exon_7612067_7613400:MIOS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 8008970 C/G 1 7 2 9 3.25075401519754 1.07121313851499 2.17954087668255 C:G C G 10 0.535606569257495 0.189646242107253 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8008423_8009438:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8008425_8009438:GLCCI1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 17854532 G/T 1 6 2 8 2.78636058445503 1.07121313851499 1.71514744594004 T:G G T 10 0.535606569257495 0.299004478445789 ENSG00000071189:ENST00000417048:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000409389:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000428135:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000242044:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000409076:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000496855:exon_17854457_17854567:SNX13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 18705964 C/T 1 13 5 18 6.03711459965257 2.67803284628747 3.35908175336509 T:C C T 10 0.535606569257495 0.155428393933381 ENSG00000048052:ENST00000417496:exon_18705836_18706546:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000461159:exon_18705836_18706099:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000405010:exon_18705836_18708466:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000406451:exon_18705836_18706099:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000428307:exon_18705836_18706728:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000406072:exon_18705836_18708466:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000401921:exon_18705836_18706099:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000523867:exon_18705836_18706099:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000432645:exon_18705836_18706099:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000441542:exon_18705836_18706099:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000262069:exon_18705836_18706099:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000456174:exon_18705836_18706523:HDAC9;ENSG00000048052:ENST00000524023:exon_18705836_18706602:HDAC9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 20201395 G/C 1 16 13 29 7.43029489188008 6.96288540034743 0.467409491532647 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20201371_20201493:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20201371_20201493:MACC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 21956405 G/A 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 A:G G A 10 0.535606569257495 0.824415845788285 ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000373934:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000405437:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000465490:exon_21956372_21956515:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000396561:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000447180:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000435031:exon_21956372_21956512:CDCA7L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 23240263 G/A 1 68 61 129 31.5787532904903 32.6720007247072 -1.09324743421685 A:G G A 10 0.535606569257495 0.860253015237231 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23239787_23240628:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23239787_23240574:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23239787_23240625:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23239787_23240324:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23239787_23240586:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23239787_23240630:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000489145:exon_23239787_23240443:NUPL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 24703298 G/A 1 7 7 14 3.25075401519754 3.74924598480246 -0.498491969604929 A:G G A 10 0.535606569257495 0.795995898872401 ENSG00000105926:ENST00000222644:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409761:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000396475:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000430180:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409253:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000472674:exon_24703093_24703340:MPP6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 24742436 T/C 1 41 32 73 19.0401306604427 17.1394102162398 1.90072044420287 T:C T C 10 0.535606569257495 0.72521795747658 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 30634630 G/C 1 111 60 171 51.5476708124181 32.1363941554497 19.4112766569684 C:G G C 10 0.535606569257495 0.00345336432692789 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 37988589 C/T 1 28 20 48 13.0030160607901 10.7121313851499 2.29088467564024 T:C C T 10 0.535606569257495 0.56410800496454 ENSG00000086289:ENST00000476620:exon_37988442_37988650:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000199448:exon_37988442_37988650:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000425345:exon_37988442_37988650:EPDR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 295 215 510 136.996062069039 115.155412390361 21.8406496786776 A:G G A 10 0.535606569257495 0.056187130732487 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 66 105 171 30.6499664290053 56.238689772037 -25.5887233430316 T:C T C 10 0.535606569257495 0.000113504957851540 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 43830888 T/C 1 51 35 86 23.6840649678678 18.7462299240123 4.93783504385544 T:C T C 10 0.535606569257495 0.330676787986349 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 43843423 G/A 1 93 101 194 43.188589059053 54.096263495007 -10.907674435954 A:G G A 10 0.535606569257495 0.130459620968394 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000486984:exon_43843275_43843434:BLVRA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 170 148 318 78.9468832262259 79.2697722501093 -0.322889023883391 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 43916727 T/G 1 7 15 22 3.25075401519754 8.03409853886242 -4.78334452366489 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0529765719617484 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 43917013 G/A 1 10 7 17 4.64393430742505 3.74924598480246 0.894688322622586 A:G G A 10 0.535606569257495 0.809240333218704 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 43917274 A/G 1 8 12 20 3.71514744594004 6.42727883108994 -2.7121313851499 A:G A G 10 0.535606569257495 0.265275049326689 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 136 131 267 63.1575065809807 70.1644605727318 -7.00695399175115 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.391168826200819 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 44112873 G/T 1 26 21 47 12.0742291993051 11.2477379544074 0.826491244897737 T:G G T 10 0.535606569257495 0.884149972016554 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 44153780 A/G 0 9 0 9 4.17954087668255 0 4.17954087668255 A A 10 0.535606569257495 0.00463210411669919 ENSG00000106624:ENST00000223357:exon_44153193_44154159:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000450684:exon_44153193_44154161:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000413907:exon_44153193_44154158:AEBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 44802545 C/G 1 29 28 57 13.4674094915326 14.9969839392099 -1.52957444767721 C:G C G 10 0.535606569257495 0.692663470020653 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44802480_44802585:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44802480_44802585:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44802480_44802585:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44802480_44802585:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44802480_44802585:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44802480_44802585:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44802480_44802585:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44802480_44802585:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44802480_44802585:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000480964:exon_44802480_44802585:ZMIZ2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 45008963 C/T 1 10 4 14 4.64393430742505 2.14242627702998 2.50150803039507 T:C C T 10 0.535606569257495 0.283626359522875 ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45008519_45009082:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45008122_45009082:MYO1G HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 207 181 388 96.1294401636985 96.9447890356066 -0.815348871908043 A:G G A 10 0.535606569257495 0.959421171421883 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 45010448 C/T 1 183 167 350 84.9839978258784 89.4462970660017 -4.46229924012324 A:T:C C T 10 0.535606569257495 0.668196308512651 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45010434_45010658:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45010434_45010658:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45010434_45010658:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45010434_45010658:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45010434_45010658:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45010434_45010658:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45010434_45010658:MYO1G HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 45113121 G/A 1 48 33 81 22.2908846756402 17.6750167854973 4.61586789014291 A:G G A 10 0.535606569257495 0.318067120436314 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000470837:exon_45113059_45113161:CCM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 45113137 C/T 1 51 51 102 23.6840649678678 27.3159350321322 -3.63187006426448 T:C C T 10 0.535606569257495 0.488295239062348 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000470837:exon_45113059_45113161:CCM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 45113170 G/A 1 58 64 122 26.9348189830653 34.2788204324797 -7.34400144941439 A:G G A 10 0.535606569257495 0.203775124358028 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 45144494 T/C 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 T:C T C 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 45148667 G/A 1 107 124 231 49.690097089448 66.4152145879294 -16.7251174984813 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0293998201667752 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148426_45148682:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 45148773 C/A 1 41 41 82 19.0401306604427 21.9598693395573 -2.91973867911459 A:C C A 10 0.535606569257495 0.580164940117245 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 45148857 G/C 1 110 94 204 51.0832773816756 50.3470175102045 0.736259871471034 C:G G C 10 0.535606569257495 0.94411221747371 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148822_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 55840888 A/C 0 0 14 14 0 7.49849196960493 -7.49849196960493 C A C 10 0.535606569257495 2.16972626779062e-05 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 56125757 A/G 1 153 142 295 71.0521949036033 76.0561328345643 -5.003937930961 A:G A G 10 0.535606569257495 0.560066404080798 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56125686_56125796:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56125686_56125796:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56125686_56125796:CCT6A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 262 240 502 121.671078854536 128.545576621799 -6.87449776726245 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.560827615147712 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 56147290 G/A 1 58 40 98 26.9348189830653 21.4242627702998 5.51055621276549 A:G G A 10 0.535606569257495 0.311178906797142 ENSG00000129103:ENST00000395436:exon_56147221_56147817:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000418349:exon_56147221_56147817:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000434526:exon_56147221_56148363:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395437:exon_56147221_56148362:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000275607:exon_56147221_56148363:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395435:exon_56147221_56147880:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000420966:exon_56147221_56147880:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000342190:exon_56147221_56148363:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000452216:exon_56147221_56147422:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000436782:exon_56147221_56148358:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000442826:exon_56147221_56148362:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000437307:exon_56147221_56147525:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413756:exon_56147221_56147429:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000423763:exon_56147221_56148331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000438133:exon_56147221_56148362:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000447501:exon_56147046_56147568:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000531229:exon_56147221_56147440:SUMF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 63981563 A/G 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 A:G A G 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000173041:ENST00000309683:exon_63980262_63982878:ZNF680 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 64168806 T/C 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 T:C T C 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 64169061 G/A 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 A:G G A 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 64291976 G/A 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 64389067 G/A 1 4 6 10 1.85757372297002 3.21363941554497 -1.35606569257495 A:G G A 10 0.535606569257495 0.529494183528195 ENSG00000198039:ENST00000527278:exon_64388032_64389502:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000476120:exon_64388032_64389635:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000319636:exon_64388032_64389416:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000395375:exon_64388032_64391344:ZNF273 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 64863392 C/T 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 T:C C T 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 12 7 19 5.57272116891006 3.74924598480246 1.8234751841076 A:G G A 10 0.535606569257495 0.493225271714711 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 15 10 25 6.96590146113758 5.35606569257495 1.60983576856263 A:G A G 10 0.535606569257495 0.553975210119156 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 65425894 A/G 1 138 127 265 64.0862934424657 68.0220342957019 -3.93574085323615 A:T:C:G A G 10 0.535606569257495 0.6664758347995 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65425671_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65425688_65426050:GUSB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 65439879 G/C 1 2 6 8 0.92878686148501 3.21363941554497 -2.28485255405996 C:G G C 10 0.535606569257495 0.156441901581586 ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65439282_65441147:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000489482:exon_65439513_65439993:GUSB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 T:C T C 10 0.535606569257495 0.564881629114876 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 66774604 G/C 1 15 16 31 6.96590146113758 8.56970510811992 -1.60380364698234 C:G G C 10 0.535606569257495 0.592923006525255 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 72300332 G/A 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 A:G G A 10 0.535606569257495 1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 39 20 59 18.1113437989577 10.7121313851499 7.3992124138078 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0668189416582437 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 21 30 51 9.75226204559261 16.0681970777248 -6.31593503213224 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0914942613583174 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 74120721 T/C 1 42 23 65 19.5045240911852 12.3189510929224 7.18557299826283 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0818288355934026 ENSG00000077809:ENST00000324896:exon_74120721_74120764:GTF2I;ENSG00000077809:ENST00000353920:exon_74120721_74120764:GTF2I;ENSG00000077809:ENST00000346152:exon_74120721_74120764:GTF2I;ENSG00000077809:ENST00000416070:exon_74120721_74120764:GTF2I;ENSG00000077809:ENST00000443166:exon_74120721_74120764:GTF2I;ENSG00000077809:ENST00000490431:exon_74120721_74120764:GTF2I HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 75511420 G/A 1 13 17 30 6.03711459965257 9.10531167737741 -3.06819707772485 A:G G A 10 0.535606569257495 0.27721112568876 ENSG00000005486:ENST00000466232:exon_75511147_75511442:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000468644:exon_75511147_75511483:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000006777:exon_75511147_75511554:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000318622:exon_75511147_75511554:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000454791:exon_75511147_75511554:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000413229:exon_75511147_75511554:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000428119:exon_75511362_75511554:RHBDD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 75511493 G/A 1 20 23 43 9.2878686148501 12.3189510929224 -3.03108247807228 A:G G A 10 0.535606569257495 0.363495353638296 ENSG00000005486:ENST00000006777:exon_75511147_75511554:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000318622:exon_75511147_75511554:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000454791:exon_75511147_75511554:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000413229:exon_75511147_75511554:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000428119:exon_75511362_75511554:RHBDD2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 75614953 T/C 1 31 15 46 14.3961963530177 8.03409853886242 6.36209781415523 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0751687877953358 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 75615287 G/A 1 23 18 41 10.6810489070776 9.64091824663491 1.04013066044271 A:G G A 10 0.535606569257495 0.757405555420661 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75615241_75615386:POR HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 16 13 29 7.43029489188008 6.96288540034743 0.467409491532647 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 75677504 C/T 1 195 178 373 90.5567189947885 95.3379693278341 -4.78125033304562 A:T:C C T 10 0.535606569257495 0.640484120426424 ENSG00000146701:ENST00000461263:exon_75677369_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000315758:exon_75677385_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000443006:exon_75677403_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000461665:exon_75677454_75677544:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000490105:exon_75677479_75677840:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000432020:exon_75677479_75677544:MDH2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 20 23 43 9.2878686148501 12.3189510929224 -3.03108247807228 A:T:C C T 10 0.535606569257495 0.363495353638296 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 76990178 C/G 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000186088:ENST00000257626:exon_76990141_76990218:PION;ENSG00000186088:ENST00000455630:exon_76990141_76990218:PION;ENSG00000186088:ENST00000334003:exon_76990141_76990218:PION HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 77256713 A/G 1 55 58 113 25.5416386908378 31.0651810169347 -5.52354232609693 A:G A G 10 0.535606569257495 0.301268714265958 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 42 44 86 19.5045240911852 23.5666890473298 -4.06216495614457 A:C:G G A 10 0.535606569257495 0.389093667383239 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 86800351 A/G 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:G A G 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000135164:ENST00000331242:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000413276:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000447863:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000414194:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000394702:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000411766:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000425406:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000420131:exon_86800311_86800373:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000449088:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000430405:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000432937:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000394703:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000434534:exon_86800311_86800367:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000412139:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000425705:exon_86800311_86800405:DMTF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 92764419 A/G 1 14 14 28 6.50150803039507 7.49849196960493 -0.996983939209859 A:G A G 10 0.535606569257495 0.709785628768718 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 95034775 G/C 1 11 14 25 5.10832773816756 7.49849196960493 -2.39016423143737 C:G G C 10 0.535606569257495 0.423378530112683 ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95034179_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95034185_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95034192_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95034209_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000483292:exon_95034590_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95034651_95034800:PON2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 97488569 A/T 1 61 56 117 28.3279992752928 29.9939678784197 -1.66596860312691 A:T A T 10 0.535606569257495 0.781434385012474 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97488554_97488710:ASNS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 97823629 A/G 1 10 8 18 4.64393430742505 4.28485255405996 0.359081753365091 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000164715:ENST00000297293:exon_97820926_97823884:LMTK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 97847040 G/A 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000490842:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000463402:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97847004_97847123:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000485716:exon_97847004_97847150:TECPR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 97873994 G/A 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 A:G G A 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97873883_97874005:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97873883_97874005:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000472845:exon_97873883_97874005:TECPR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 6 19 25 2.78636058445503 10.1765248158924 -7.39016423143737 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00407326931613447 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 98609987 G/A 0 63 0 63 29.2567861367778 0 29.2567861367778 G G 10 0.535606569257495 1.10238762850515e-17 ENSG00000196367:ENST00000359863:exon_98609694_98610866:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000355540:exon_98609694_98610866:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000446306:exon_98609694_98610866:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000456197:exon_98609694_98610866:TRRAP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 99500899 T/C 1 18 17 35 8.35908175336509 9.10531167737741 -0.746229924012324 T:C T C 10 0.535606569257495 0.866104025326506 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 99500911 A/G 1 17 18 35 7.89468832262259 9.64091824663491 -1.74622992401232 A:G A G 10 0.535606569257495 0.612809759315648 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 99654600 A/G 1 3 11 14 1.39318029222752 5.89167226183244 -4.49849196960493 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0281547067215341 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 99654689 G/A 1 2 7 9 0.92878686148501 3.74924598480246 -2.82045912331745 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0914723743517246 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99654630_99654872:ZSCAN21 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 99669802 A/G 1 12 12 24 5.57272116891006 6.42727883108994 -0.854557662179879 A:G A G 10 0.535606569257495 0.838559306298216 ENSG00000166526:ENST00000303915:exon_99669105_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000424697:exon_99667597_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000299667:exon_99667611_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000487620:exon_99667800_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000412947:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000428683:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000449785:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000441298:exon_99669703_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000415068:exon_99669794_99669835:ZNF3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 93 71 164 43.188589059053 38.0280664172821 5.16052264177083 A:G G A 10 0.535606569257495 0.434559408456931 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 27 25 52 12.5386226300476 13.3901642314374 -0.851541601389737 A:T:G A T 10 0.535606569257495 0.889655019147133 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 28 26 54 13.0030160607901 13.9257708006949 -0.922754739904727 A:G A G 10 0.535606569257495 0.89165318001471 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 100731505 C/G 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 100731829 T/C 1 20 23 43 9.2878686148501 12.3189510929224 -3.03108247807228 T:C T C 10 0.535606569257495 0.363495353638296 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 102760511 A/C 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 A:C A C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000161048:ENST00000455523:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000341533:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000417955:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000422589:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000465647:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000427257:exon_102760024_102760670:NAPEPLD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 102953539 G/C 1 85 72 157 39.4734416131129 38.5636729865396 0.909768626573296 C:G G C 10 0.535606569257495 0.936273883530403 ENSG00000105819:ENST00000249269:exon_102952654_102953682:PMPCB;ENSG00000105821:ENST00000249270:exon_102953394_102953548:DNAJC2;ENSG00000105821:ENST00000379263:exon_102953394_102953548:DNAJC2;ENSG00000105821:ENST00000475065:exon_102953394_102953548:DNAJC2;ENSG00000105821:ENST00000492497:exon_102952969_102953548:DNAJC2;ENSG00000105821:ENST00000464253:exon_102953394_102953548:DNAJC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 104717517 C/T 1 32 29 61 14.8605897837602 15.5325905084674 -0.672000724707193 T:C C T 10 0.535606569257495 0.898280877566396 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000478990:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000476671:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000482560:exon_104717410_104717640:MLL5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 107002806 A/G 1 17 16 33 7.89468832262259 8.56970510811992 -0.675016785497333 A:G A G 10 0.535606569257495 0.862481166268759 ENSG00000164597:ENST00000347053:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000297135:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000393603:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000484237:exon_107002753_107002865:COG5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 19 19 38 8.8234751841076 10.1765248158924 -1.35304963178481 T:C T C 10 0.535606569257495 0.745630156270472 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 116528240 C/T 1 34 38 72 15.7893766452452 20.3530496317848 -4.56367298653963 T:C C T 10 0.535606569257495 0.28983996075879 ENSG00000198898:ENST00000464223:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000484325:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000449080:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000490693:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000461878:exon_116528181_116528753:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000417431:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000464669:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116528181_116528244:CAPZA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 116557939 C/T 1 82 54 136 38.0802613208854 28.9227547399047 9.15750658098069 T:C C T 10 0.535606569257495 0.122114208928477 ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116557781_116559315:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116557781_116558242:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116557781_116559312:CAPZA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 117825681 A/G 1 8 5 13 3.71514744594004 2.67803284628747 1.03711459965257 A:G A G 10 0.535606569257495 0.593641770478394 ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 120428799 C/A 1 45 64 109 20.8977043834127 34.2788204324797 -13.381116049067 A:C C A 10 0.535606569257495 0.0122181570090663 ENSG00000106025:ENST00000222747:exon_120427376_120428951:TSPAN12;ENSG00000106025:ENST00000450414:exon_120428376_120428951:TSPAN12;ENSG00000106025:ENST00000415871:exon_120428428_120428951:TSPAN12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 129297332 T/G 1 9 5 14 4.17954087668255 2.67803284628747 1.50150803039507 T:G T G 10 0.535606569257495 0.593847168610995 ENSG00000106459:ENST00000353868:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393232:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393231:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000454688:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000223190:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000311967:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393230:exon_129297183_129297414:NRF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 21 16 37 9.75226204559261 8.56970510811992 1.18255693747269 A:T:C T C 10 0.535606569257495 0.74382946670773 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 129813738 T/C 1 18 20 38 8.35908175336509 10.7121313851499 -2.35304963178481 T:C T C 10 0.535606569257495 0.516185836987251 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129813665_129813779:TMEM209 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 131347009 T/C 1 331 1 332 153.714225575769 0.535606569257495 153.178619006512 T:C T C 10 0.535606569257495 3.18516730008615e-88 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 133580447 G/A 1 13 11 24 6.03711459965257 5.89167226183244 0.145442337820121 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000469115:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000482089:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000460346:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000472020:exon_133580352_133580488:EXOC4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 135279315 A/C 1 26 22 48 12.0742291993051 11.7833445236649 0.290884675640243 A:C A C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135279295_135279477:NUP205 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 47 20 67 21.8264912448977 10.7121313851499 11.1143598597478 T:C T C 10 0.535606569257495 0.00678652082172419 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 135614740 T/C 1 77 71 148 35.7582941671729 38.0280664172821 -2.26977225010925 T:C T C 10 0.535606569257495 0.741928391071215 ENSG00000105887:ENST00000393085:exon_135611509_135614760:MTPN;ENSG00000105887:ENST00000356707:exon_135613420_135614760:MTPN;ENSG00000105887:ENST00000435723:exon_135614207_135614760:MTPN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 7 8 15 3.25075401519754 4.28485255405996 -1.03409853886242 A:G G A 10 0.535606569257495 0.614879753164389 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 5 11 16 2.32196715371253 5.89167226183244 -3.56970510811992 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0832026742777677 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 138738204 G/A 1 10 7 17 4.64393430742505 3.74924598480246 0.894688322622586 A:G G A 10 0.535606569257495 0.809240333218704 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138738197_138738327:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138738197_138738327:ZC3HAV1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 138740037 G/C 1 10 9 19 4.64393430742505 4.82045912331745 -0.176524815892404 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138739951_138740041:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138739951_138740041:ZC3HAV1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 139415775 G/C 1 2 11 13 0.92878686148501 5.89167226183244 -4.96288540034743 C:G G C 10 0.535606569257495 0.00925841308605916 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 140159721 T/C 1 56 40 96 26.0060321215803 21.4242627702998 4.58176935128049 T:C T C 10 0.535606569257495 0.359140824184132 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000494939:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000498535:exon_140159572_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000473444:exon_140159598_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475180:exon_140159641_140159736:MKRN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 141364712 G/A 1 22 9 31 10.2166554763351 4.82045912331745 5.39619635301766 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0701943255830056 ENSG00000127359:ENST00000297761:exon_141364704_141364854:KIAA1147;ENSG00000127359:ENST00000482493:exon_141364704_141364854:KIAA1147 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 142494606 C/G 1 9 1 10 4.17954087668255 0.535606569257495 3.64393430742505 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0246360115647308 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 88 114 202 40.8666219053404 61.0591488953544 -20.192526990014 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.00471349944427945 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 149545115 T/C 1 7 8 15 3.25075401519754 4.28485255405996 -1.03409853886242 T:C T C 10 0.535606569257495 0.614879753164389 ENSG00000106479:ENST00000223210:exon_149544824_149545521:ZNF862 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 150066900 A/G 1 51 45 96 23.6840649678678 24.1022956165873 -0.418230648719515 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000214022:ENST00000487455:exon_150066760_150067133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150066831_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000473391:exon_150066760_150067691:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150066831_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000495535:exon_150066760_150067223:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150066765_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000469309:exon_150066760_150067500:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150066733_150066957:REPIN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 113 69 182 52.4764576739031 36.9568532787671 15.5196043951359 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0212738273068062 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 134 122 256 62.2287197194957 65.3440014494144 -3.1152817299187 T:C T C 10 0.535606569257495 0.707296607103135 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 150093701 A/C 1 24 21 45 11.1454423378201 11.2477379544074 -0.102295616587273 A:C A C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000196456:ENST00000478789:exon_150093601_150094003:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000490973:exon_150093601_150094067:ZNF775 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 150912750 G/T 1 45 33 78 20.8977043834127 17.6750167854973 3.22268759791539 T:G G T 10 0.535606569257495 0.497100684696555 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150912690_150912818:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150912690_150912818:ABCF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 150912786 T/C 1 56 35 91 26.0060321215803 18.7462299240123 7.25980219756796 T:C T C 10 0.535606569257495 0.141320072442271 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150912690_150912818:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150912690_150912818:ABCF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 58 49 107 26.9348189830653 26.2447218936173 0.690097089448038 A:G G A 10 0.535606569257495 0.923020402121695 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 47 42 89 21.8264912448977 22.4954759088148 -0.668984663917051 C:G C G 10 0.535606569257495 0.915610716069468 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 61 48 109 28.3279992752928 25.7091153243598 2.61888395093305 C:G C G 10 0.535606569257495 0.632404627303915 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 150935430 G/C 1 59 31 90 27.3992124138078 16.6038036469823 10.7954087668255 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0260243521689 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 7 155534653 C/G 1 3 10 13 1.39318029222752 5.35606569257495 -3.96288540034743 C:G C G 10 0.535606569257495 0.0472642919377538 ENSG00000184863:ENST00000401878:exon_155534513_155534800:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000307403:exon_155534513_155534800:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000392761:exon_155534513_155534800:RBM33 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 1728557 C/G 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 C:G C G 10 0.535606569257495 0.824415845788285 ENSG00000182372:ENST00000331222:exon_1728416_1734738:CLN8;ENSG00000182372:ENST00000519254:exon_1728416_1728938:CLN8;ENSG00000182372:ENST00000523237:exon_1728416_1728932:CLN8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 6478986 C/T 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 6479042 C/T 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 T:C C T 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 A:C C A 10 0.535606569257495 0.193170376367493 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 0 8 0 8 3.71514744594004 0 3.71514744594004 C C 10 0.535606569257495 0.00893594247670414 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 8176554 C/T 1 12 3 15 5.57272116891006 1.60681970777248 3.96590146113758 T:C C T 10 0.535606569257495 0.066321047069073 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 8234714 C/T 1 2 9 11 0.92878686148501 4.82045912331745 -3.89167226183244 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0297809744140687 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 10 11 21 4.64393430742505 5.89167226183244 -1.24773795440739 T:C T C 10 0.535606569257495 0.66418868541406 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 18 8 26 8.35908175336509 4.28485255405996 4.07422919930513 T:C C T 10 0.535606569257495 0.119333524518674 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 17796382 A/G 1 33 8 41 15.3249832145027 4.28485255405996 11.0401306604427 A:T:G A G 10 0.535606569257495 0.000452740493889251 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 17796383 C/T 1 34 8 42 15.7893766452452 4.28485255405996 11.5045240911852 T:C C T 10 0.535606569257495 0.000289562354535964 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 17814915 A/G 1 17 16 33 7.89468832262259 8.56970510811992 -0.675016785497333 A:G A G 10 0.535606569257495 0.862481166268759 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17814773_17814930:PCM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 17817553 G/T 1 50 41 91 23.2196715371253 21.9598693395573 1.25980219756796 T:G G T 10 0.535606569257495 0.833934441910788 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17817523_17817612:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17817523_17817674:PCM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 17820714 A/T 1 23 21 44 10.6810489070776 11.2477379544074 -0.566689047329778 A:T A T 10 0.535606569257495 0.880932867784594 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524356:exon_17820462_17820800:PCM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 17868793 G/C 1 31 44 75 14.3961963530177 23.5666890473298 -9.17049269431212 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0370765389165394 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17868746_17868875:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17868746_17868875:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17868746_17868875:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17868746_17868875:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17868746_17868875:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17868746_17868875:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000522275:exon_17868746_17868875:PCM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 21837672 T/C 1 6 7 13 2.78636058445503 3.74924598480246 -0.962885400347434 T:C T C 10 0.535606569257495 0.782351862796383 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21837595_21837714:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21837595_21837714:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21837595_21837714:XPO7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 22442661 A/G 1 28 22 50 13.0030160607901 11.7833445236649 1.21967153712525 A:G A G 10 0.535606569257495 0.777936932990307 ENSG00000120913:ENST00000456545:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000308354:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000397760:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000339162:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000381194:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000452226:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000397761:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000436754:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000426493:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000429812:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000409141:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000265810:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000409417:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000416159:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000448520:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000491330:exon_22442530_22442675:PDLIM2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 22548790 G/T 1 17 27 44 7.89468832262259 14.4613773699524 -6.56668904732978 T:G G T 10 0.535606569257495 0.0502453246914004 ENSG00000179388:ENST00000317216:exon_22545172_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000522910:exon_22547556_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000519492:exon_22547937_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000524088:exon_22547985_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000518773:exon_22548678_22548995:EGR3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 105 79 184 48.761310227963 42.3129189713421 6.44839125662093 C:G G C 10 0.535606569257495 0.375205374970373 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 22886020 A/G 1 23 29 52 10.6810489070776 15.5325905084674 -4.85154160138974 A:G A G 10 0.535606569257495 0.210726411275746 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22885844_22886115:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000518531:exon_22885778_22886115:TNFRSF10B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 26223857 C/T 1 46 56 102 21.3620978141552 29.9939678784197 -8.63187006426448 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0918625904617639 ENSG00000221914:ENST00000380737:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000524169:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000315985:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518215:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518890:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000517754:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518208:exon_26222614_26223922:PPP2R2A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 22 13 35 10.2166554763351 6.96288540034743 3.25377007598768 A:G A G 10 0.535606569257495 0.311258240223386 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 140 74 214 65.0150803039507 39.6348861250546 25.3801941788961 A:G A G 10 0.535606569257495 0.000578859599084058 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 106 59 165 49.2257036587055 31.6007875861922 17.6249160725133 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0061945356059663 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 119 58 177 55.2628182583581 31.0651810169347 24.1976372414234 A:G G A 10 0.535606569257495 0.000275868909200794 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 169 133 302 78.4824897954834 71.2356737112468 7.24681608423653 A:G A G 10 0.535606569257495 0.419572969036851 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 179 140 319 83.1264241029084 74.9849196960493 8.14150440685911 T:C C T 10 0.535606569257495 0.369595431549109 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 248 204 452 115.169570824141 109.263740128529 5.90583069561229 A:C A C 10 0.535606569257495 0.604033914882296 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 27634064 C/T 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 T:C C T 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000171320:ENST00000523566:exon_27633879_27634387:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000305188:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000397418:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000522378:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000519637:exon_27633879_27634224:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000524293:exon_27633879_27637612:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000523910:exon_27634027_27634686:ESCO2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 27 22 49 12.5386226300476 11.7833445236649 0.755278106382749 C:G C G 10 0.535606569257495 0.886664950379352 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 27679981 T/C 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27679836_27680005:PBK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 29961951 C/T 1 38 48 86 17.6469503682152 25.7091153243598 -8.06216495614456 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0844646878450316 ENSG00000104660:ENST00000321250:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000397339:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000518001:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000520682:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000442880:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000523116:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000532394:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000520739:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000518192:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000519466:exon_29961816_29962002:LEPROTL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 30999280 G/T 1 8 3 11 3.71514744594004 1.60681970777248 2.10832773816756 T:G G T 10 0.535606569257495 0.239570670048551 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 31024654 T/C 1 9 3 12 4.17954087668255 1.60681970777248 2.57272116891006 T:C T C 10 0.535606569257495 0.158222040248362 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 28 24 52 13.0030160607901 12.8545576621799 0.148458398610263 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 37730368 G/A 1 4 7 11 1.85757372297002 3.74924598480246 -1.89167226183244 A:G G A 10 0.535606569257495 0.36607342785591 ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37728796_37730697:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37728796_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 38176435 T/G 1 19 23 42 8.8234751841076 12.3189510929224 -3.49547590881479 T:G T G 10 0.535606569257495 0.284027730988555 ENSG00000147548:ENST00000433384:exon_38176413_38176458:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000317025:exon_38176413_38176458:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000446459:exon_38176413_38176458:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000527502:exon_38176413_38176458:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000316985:exon_38176413_38176458:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000525081:exon_38176413_38176809:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000419340:exon_38176413_38176458:WHSC1L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 38677932 A/G 1 52 73 125 24.1484583986103 39.0992795557971 -14.9508211571869 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00904585515491402 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 38684853 T/C 1 28 16 44 13.0030160607901 8.56970510811992 4.43331095267022 T:C T C 10 0.535606569257495 0.226365608036666 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521642:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521050:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38684686_38685585:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38684686_38684893:TACC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 38695996 T/C 1 50 41 91 23.2196715371253 21.9598693395573 1.25980219756796 T:C T C 10 0.535606569257495 0.833934441910788 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522752:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38695988_38696025:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38695988_38696028:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38695988_38696064:TACC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 41553928 C/G 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 C:G C G 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41553881_41554105:ANK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 41559609 G/A 1 7 2 9 3.25075401519754 1.07121313851499 2.17954087668255 A:G G A 10 0.535606569257495 0.189646242107253 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41559570_41559662:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41559570_41559662:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41559570_41559662:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41559570_41559662:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41559570_41559662:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41559570_41559662:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41559570_41559662:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41559570_41559662:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41559570_41559662:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41559570_41559662:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41559570_41559662:ANK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 41563685 G/A 1 9 3 12 4.17954087668255 1.60681970777248 2.57272116891006 A:G G A 10 0.535606569257495 0.158222040248362 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41563661_41563759:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41563661_41563759:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41563661_41563759:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41563661_41563759:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41563661_41563759:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41563661_41563759:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41563661_41563759:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41563661_41563697:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41563661_41563759:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41563661_41563759:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41563661_41563759:ANK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 41583294 C/T 1 3 8 11 1.39318029222752 4.28485255405996 -2.89167226183244 T:C C T 10 0.535606569257495 0.127650256211486 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41583279_41583464:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41583279_41583464:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41583279_41583464:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41583279_41583464:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41583279_41583464:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41583279_41583464:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41583279_41583464:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41583279_41583464:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41583279_41583464:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41583279_41583464:ANK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 41791283 G/A 1 15 12 27 6.96590146113758 6.42727883108994 0.538622630047636 A:G G A 10 0.535606569257495 0.850150419291182 ENSG00000083168:ENST00000265713:exon_41786997_41792385:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000406337:exon_41786997_41792385:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000396930:exon_41786997_41792385:MYST3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 41798417 C/T 1 6 5 11 2.78636058445503 2.67803284628747 0.108327738167556 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000083168:ENST00000265713:exon_41798360_41798962:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000406337:exon_41798360_41798962:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000396930:exon_41798360_41798962:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000418721:exon_41798360_41798962:MYST3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 41906095 A/G 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 A:G A G 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000083168:ENST00000265713:exon_41905896_41906820:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000406337:exon_41905896_41906820:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000396930:exon_41905896_41906820:MYST3;ENSG00000083168:ENST00000485568:exon_41905896_41906820:MYST3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 48701786 A/T 1 21 21 42 9.75226204559261 11.2477379544074 -1.49547590881479 A:T A T 10 0.535606569257495 0.646574759194259 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48701712_48701799:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48701712_48701799:AC103686.1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 52746153 C/T 1 6 7 13 2.78636058445503 3.74924598480246 -0.962885400347434 T:C C T 10 0.535606569257495 0.782351862796383 ENSG00000168300:ENST00000360540:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519559:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000522514:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519554:exon_52746078_52746249:PCMTD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 53537316 A/G 1 13 10 23 6.03711459965257 5.35606569257495 0.681048907077616 A:G A G 10 0.535606569257495 0.836732692537685 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 21 12 33 9.75226204559261 6.42727883108994 3.32498321450267 A:G A G 10 0.535606569257495 0.296093943625254 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 56668879 A/G 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 A:G A G 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000167904:ENST00000434581:exon_56668803_56668970:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000334667:exon_56668803_56668970:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000519784:exon_56668803_56668970:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000517576:exon_56668803_56668944:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000523073:exon_56668803_56668970:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000519780:exon_56668803_56668970:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000522090:exon_56668803_56668970:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000520061:exon_56668803_56668970:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000524121:exon_56668803_56668961:TMEM68;ENSG00000167904:ENST00000523423:exon_56668804_56668970:TMEM68 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 61654207 T/C 1 4 5 9 1.85757372297002 2.67803284628747 -0.820459123317455 T:C T C 10 0.535606569257495 0.741688173206149 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000524602:exon_61653924_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61653992_61655656:CHD7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 18 21 39 8.35908175336509 11.2477379544074 -2.8886562010423 A:T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.422689700861272 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 67341378 G/A 1 36 25 61 16.7181635067302 13.3901642314374 3.32799927529281 A:G G A 10 0.535606569257495 0.442053578986115 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 67342077 G/A 1 23 33 56 10.6810489070776 17.6750167854973 -6.99396787841972 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0806332288284232 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 67592152 T/C 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 T:C T C 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000104205:ENST00000520044:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000104205:ENST00000519289:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000213865:ENST00000521113:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000519561:exon_67591956_67593393:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000390159:exon_67591956_67593235:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000396609:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000518860:exon_67591774_67592259:C8orf44 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 74527996 C/T 1 8 3 11 3.71514744594004 1.60681970777248 2.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.239570670048551 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 74893452 A/G 1 76 58 134 35.2939007364304 31.0651810169347 4.22871971949568 A:G A G 10 0.535606569257495 0.489129014368478 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74893390_74893601:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000519551:exon_74893390_74893716:TMEM70 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 81 90 171 37.6158678901429 48.2045912331745 -10.5887233430316 A:G A G 10 0.535606569257495 0.107804284486851 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 33 52 85 15.3249832145027 27.8515416013897 -12.5265583868871 C:G C G 10 0.535606569257495 0.00866031088260645 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 80976799 C/T 1 26 27 53 12.0742291993051 14.4613773699524 -2.38714817064723 T:C C T 10 0.535606569257495 0.58225182722 ENSG00000076554:ENST00000379096:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000518937:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000520527:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000517427:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000517462:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000379097:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000448733:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000425513:exon_80976713_80976836:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000523319:exon_80976713_80976905:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000519303:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000518517:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000521241:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000523753:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000522364:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000519250:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000520795:exon_80976713_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000520741:exon_80976698_80976828:TPD52;ENSG00000076554:ENST00000521561:exon_80976710_80976828:TPD52 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 83 45 128 38.5446547516279 24.1022956165873 14.4423591350406 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0127852764441256 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 95272598 C/T 1 11 6 17 5.10832773816756 3.21363941554497 1.89468832262259 T:C C T 10 0.535606569257495 0.467834070566303 ENSG00000164949:ENST00000396194:exon_95272401_95272740:GEM;ENSG00000164949:ENST00000297596:exon_95272401_95272740:GEM;ENSG00000164949:ENST00000523660:exon_95272044_95272740:GEM;ENSG00000164949:ENST00000521817:exon_95272231_95272740:GEM;ENSG00000164949:ENST00000523433:exon_95272451_95272740:GEM HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 95518762 C/T 1 15 15 30 6.96590146113758 8.03409853886242 -1.06819707772485 T:C C T 10 0.535606569257495 0.71779496149159 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95518728_95518945:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95518728_95518945:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95518728_95518945:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000521080:exon_95518728_95518945:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95518728_95518945:KIAA1429 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 6 8 14 2.78636058445503 4.28485255405996 -1.49849196960493 T:C T C 10 0.535606569257495 0.436988882100625 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 31 26 57 14.3961963530177 13.9257708006949 0.470425552322789 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 101206391 G/A 1 16 14 30 7.43029489188008 7.49849196960493 -0.0681970777248484 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101206340_101206496:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101206340_101206496:SPAG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 101206531 G/A 1 30 17 47 13.9318029222752 9.10531167737741 4.82649124489774 A:G G A 10 0.535606569257495 0.188227949681495 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 61 61 122 28.3279992752928 32.6720007247072 -4.34400144941438 A:G G A 10 0.535606569257495 0.4680168420755 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 103307434 G/A 1 28 25 53 13.0030160607901 13.3901642314374 -0.387148170647233 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103307432_103307558:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103307432_103307558:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103307432_103307558:UBR5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 103663814 G/A 1 36 34 70 16.7181635067302 18.2106233547548 -1.49245984802465 A:C:G G A 10 0.535606569257495 0.721221620178917 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 103663912 T/G 1 33 44 77 15.3249832145027 23.5666890473298 -8.24170583282711 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0673354033816701 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 107754473 G/A 1 5 11 16 2.32196715371253 5.89167226183244 -3.56970510811992 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0832026742777677 ENSG00000164830:ENST00000445937:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000452423:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000442977:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000531443:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000517566:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000435082:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000336821:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000312046:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000519415:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000449762:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000297447:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000521592:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000521864:exon_107754450_107754712:OXR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 120569877 T/G 1 5 15 20 2.32196715371253 8.03409853886242 -5.7121313851499 T:G T G 10 0.535606569257495 0.0126060909259614 ENSG00000136960:ENST00000259486:exon_120569326_120569931:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000427067:exon_120569326_120569931:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000523861:exon_120569327_120569931:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000522167:exon_120569649_120569931:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000522826:exon_120569761_120569931:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000075322:exon_120569761_120569931:ENPP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 123963996 C/T 1 13 12 25 6.03711459965257 6.42727883108994 -0.390164231437374 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000534247:exon_123963532_123964249:ZHX2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 123964038 T/C 1 12 11 23 5.57272116891006 5.89167226183244 -0.318951092922384 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000534247:exon_123963532_123964249:ZHX2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 123964431 G/A 1 11 5 16 5.10832773816756 2.67803284628747 2.43029489188008 A:G G A 10 0.535606569257495 0.316760693759888 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 123964767 G/A 1 15 12 27 6.96590146113758 6.42727883108994 0.538622630047636 A:G G A 10 0.535606569257495 0.850150419291182 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 123964953 C/T 1 5 10 15 2.32196715371253 5.35606569257495 -3.03409853886242 T:C C T 10 0.535606569257495 0.128072258736022 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 123966114 G/A 1 3 8 11 1.39318029222752 4.28485255405996 -2.89167226183244 A:G G A 10 0.535606569257495 0.127650256211486 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 124448736 A/G 1 6 9 15 2.78636058445503 4.82045912331745 -2.03409853886242 A:G A G 10 0.535606569257495 0.312839743181367 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 22 6 28 10.2166554763351 3.21363941554497 7.00301606079014 A:T T A 10 0.535606569257495 0.00772667003396895 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 24 8 32 11.1454423378201 4.28485255405996 6.86058978376016 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0198246524711459 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 124553222 G/C 1 29 5 34 13.4674094915326 2.67803284628747 10.7893766452452 C:G G C 10 0.535606569257495 0.000187772388251326 ENSG00000156804:ENST00000517956:exon_124553139_124553446:FBXO32;ENSG00000156804:ENST00000443022:exon_124553139_124553446:FBXO32;ENSG00000156804:ENST00000521719:exon_124553139_124553429:FBXO32;ENSG00000156804:ENST00000520511:exon_124553139_124553430:FBXO32 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 126011886 G/A 1 73 71 144 33.9007204442029 38.0280664172821 -4.12734597307927 A:G G A 10 0.535606569257495 0.504729752301461 ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126010748_126011936:SQLE HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 131124559 T/C 1 7 2 9 3.25075401519754 1.07121313851499 2.17954087668255 T:C T C 10 0.535606569257495 0.189646242107253 ENSG00000153317:ENST00000524124:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000357668:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000521075:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000518721:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000343135:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000519483:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000520189:exon_131124340_131124660:ASAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 141310644 G/A 1 2 9 11 0.92878686148501 4.82045912331745 -3.89167226183244 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0297809744140687 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521167:exon_141310568_141310713:TRAPPC9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 141461062 G/A 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 141461185 A/G 1 9 4 13 4.17954087668255 2.14242627702998 2.03711459965257 A:G A G 10 0.535606569257495 0.282659279130513 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 141461266 A/G 1 10 12 22 4.64393430742505 6.42727883108994 -1.78334452366489 A:G A G 10 0.535606569257495 0.523642698847636 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 141551407 G/A 1 6 9 15 2.78636058445503 4.82045912331745 -2.03409853886242 A:G G A 10 0.535606569257495 0.312839743181367 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000520412:exon_141551263_141551556:EIF2C2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 141559358 G/A 1 12 10 22 5.57272116891006 5.35606569257495 0.216655476335111 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141559213_141559397:EIF2C2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 141566311 C/T 1 12 11 23 5.57272116891006 5.89167226183244 -0.318951092922384 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000521325:exon_141566266_141566337:EIF2C2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 141568622 G/A 1 18 8 26 8.35908175336509 4.28485255405996 4.07422919930513 A:G G A 10 0.535606569257495 0.119333524518674 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141568584_141568671:EIF2C2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 142170884 C/T 1 14 10 24 6.50150803039507 5.35606569257495 1.14544233782012 T:C C T 10 0.535606569257495 0.686918776217185 ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521477:exon_142170731_142170886:DENND3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 18 27 45 8.35908175336509 14.4613773699524 -6.10229561658727 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0737775556314696 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 51 36 87 23.6840649678678 19.2818364932698 4.40222847459794 C:G C G 10 0.535606569257495 0.390144487649215 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144358685 A/G 1 18 14 32 8.35908175336509 7.49849196960493 0.860589783760162 A:G A G 10 0.535606569257495 0.859952664418775 ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 31 26 57 14.3961963530177 13.9257708006949 0.470425552322789 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144620342 T/C 1 27 27 54 12.5386226300476 14.4613773699524 -1.92275473990473 T:C T C 10 0.535606569257495 0.682738025879841 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144620871 A/G 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144621035 G/A 1 6 3 9 2.78636058445503 1.60681970777248 1.17954087668255 A:G G A 10 0.535606569257495 0.517720951122863 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144621084 T/G 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144621091 A/T 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 A:T A T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144643169 C/T 1 4 6 10 1.85757372297002 3.21363941554497 -1.35606569257495 T:C C T 10 0.535606569257495 0.529494183528195 ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526051:exon_144643031_144643593:GSDMD HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 0 0 15 15 0 8.03409853886242 -8.03409853886242 A G A 10 0.535606569257495 1.00760662527142e-05 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 544 543 1087 252.630026323923 290.83436710682 -38.204340782897 A:C:G G A 10 0.535606569257495 0.0208138283028636 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 11 7 18 5.10832773816756 3.74924598480246 1.35908175336509 T:G G T 10 0.535606569257495 0.638915092572894 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144687092 T/C 1 8 16 24 3.71514744594004 8.56970510811992 -4.85455766217988 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0637114810029004 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144687077_144687127:PYCRL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144689146 C/T 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144697041 A/G 1 41 27 68 19.0401306604427 14.4613773699524 4.57875329049034 A:G A G 10 0.535606569257495 0.276527694147673 ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144732450 G/A 1 9 10 19 4.17954087668255 5.35606569257495 -1.1765248158924 A:G G A 10 0.535606569257495 0.649555257001445 ENSG00000183309:ENST00000526926:exon_144732068_144734546:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000458270:exon_144732068_144734546:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000532796:exon_144731830_144736872:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000328466:exon_144731954_144733759:ZNF623 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144887373 C/T 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 T:C C T 10 0.535606569257495 0.824415845788285 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144887282_144887605:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144887282_144887605:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144887282_144887605:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144887282_144887605:SCRIB HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 27 13 40 12.5386226300476 6.96288540034743 5.5757372297002 A:G A G 10 0.535606569257495 0.082678485356273 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 77 56 133 35.7582941671729 29.9939678784197 5.76432628875317 T:C T C 10 0.535606569257495 0.339463248596038 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 30 29 59 13.9318029222752 15.5325905084674 -1.6007875861922 T:C T C 10 0.535606569257495 0.697027368198187 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 21 21 42 9.75226204559261 11.2477379544074 -1.49547590881479 T:C T C 10 0.535606569257495 0.646574759194259 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144992862 A/G 1 23 20 43 10.6810489070776 10.7121313851499 -0.0310824780722818 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 45 42 87 20.8977043834127 22.4954759088148 -1.59777152540206 T:C C T 10 0.535606569257495 0.748074368558283 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144993377 A/G 1 33 27 60 15.3249832145027 14.4613773699524 0.863605844550303 A:C:G A G 10 0.535606569257495 0.897259703542717 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144995494 C/T 1 23 27 50 10.6810489070776 14.4613773699524 -3.78032846287475 T:C C T 10 0.535606569257495 0.321721714549243 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144995736 G/A 1 14 10 24 6.50150803039507 5.35606569257495 1.14544233782012 A:G G A 10 0.535606569257495 0.686918776217185 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144996029 A/G 1 11 10 21 5.10832773816756 5.35606569257495 -0.247737954407394 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144996408 T/G 1 23 31 54 10.6810489070776 16.6038036469823 -5.92275473990473 T:G T G 10 0.535606569257495 0.132731009560147 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144996831 G/A 1 20 12 32 9.2878686148501 6.42727883108994 2.86058978376016 A:G G A 10 0.535606569257495 0.376661791108923 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 12 13 25 5.57272116891006 6.96288540034743 -1.39016423143737 T:C C T 10 0.535606569257495 0.689399952434429 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144997927 G/A 1 16 13 29 7.43029489188008 6.96288540034743 0.467409491532647 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144998169 C/T 1 12 4 16 5.57272116891006 2.14242627702998 3.43029489188008 T:C C T 10 0.535606569257495 0.130383593597072 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144998190 A/G 1 10 7 17 4.64393430742505 3.74924598480246 0.894688322622586 A:G A G 10 0.535606569257495 0.809240333218704 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144999417 C/T 1 9 6 15 4.17954087668255 3.21363941554497 0.965901461137576 T:C C T 10 0.535606569257495 0.796989647696743 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144999621 C/T 1 9 5 14 4.17954087668255 2.67803284628747 1.50150803039507 T:C C T 10 0.535606569257495 0.593847168610995 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144999642 A/C 1 12 6 18 5.57272116891006 3.21363941554497 2.35908175336509 A:C A C 10 0.535606569257495 0.346395564026953 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 144999684 A/G 1 12 5 17 5.57272116891006 2.67803284628747 2.89468832262259 A:G A G 10 0.535606569257495 0.223927516543577 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145001031 T/C 1 15 6 21 6.96590146113758 3.21363941554497 3.75226204559261 T:C T C 10 0.535606569257495 0.126040587665888 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_145000952_145001050:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145001588 C/T 1 22 13 35 10.2166554763351 6.96288540034743 3.25377007598768 T:C C T 10 0.535606569257495 0.311258240223386 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145001784 A/G 1 11 14 25 5.10832773816756 7.49849196960493 -2.39016423143737 A:G A G 10 0.535606569257495 0.423378530112683 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145003905 G/A 1 9 15 24 4.17954087668255 8.03409853886242 -3.85455766217988 A:G G A 10 0.535606569257495 0.151111171765549 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145003814_145003997:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145003814_145003997:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145003814_145003997:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145003814_145003997:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145003814_145003997:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145003814_145003997:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145003814_145003997:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145003814_145003997:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145003814_145003997:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145003814_145003997:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145007187 G/A 1 12 9 21 5.57272116891006 4.82045912331745 0.752262045592606 A:G G A 10 0.535606569257495 0.828765731707361 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145006961_145007279:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145008560 A/G 1 4 4 8 1.85757372297002 2.14242627702998 -0.28485255405996 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145008486_145008613:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145011204 A/G 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 A:G A G 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000526416:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527816:exon_145011147_145011239:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528131:exon_145011147_145011239:PLEC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145057868 A/G 1 42 50 92 19.5045240911852 26.7803284628747 -7.27580437168954 A:T:G A G 10 0.535606569257495 0.143359603858204 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145058037 A/G 1 10 7 17 4.64393430742505 3.74924598480246 0.894688322622586 A:G A G 10 0.535606569257495 0.809240333218704 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058010_145058272:PARP10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 39 37 76 18.1113437989577 19.8174430625273 -1.70609926356962 A:G A G 10 0.535606569257495 0.73080207243537 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 50 36 86 23.2196715371253 19.2818364932698 3.93783504385543 A:G G A 10 0.535606569257495 0.449472472429085 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145537633 G/A 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 A:G G A 10 0.535606569257495 0.193170376367493 ENSG00000185122:ENST00000415363:exon_145537509_145537717:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000527328:exon_145537509_145537717:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000528842:exon_145537509_145537867:HSF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 26 19 45 12.0742291993051 10.1765248158924 1.89770438341273 A:G G A 10 0.535606569257495 0.654648500853097 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145665407 C/T 1 3 9 12 1.39318029222752 4.82045912331745 -3.42727883108994 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0782949617348295 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665404_145665456:NFKBIL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145665516 T/C 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665462_145665551:NFKBIL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145665761 G/A 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 A:G G A 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665734_145665812:NFKBIL2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 7 4 11 3.25075401519754 2.14242627702998 1.10832773816756 T:C C T 10 0.535606569257495 0.560152843364079 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 A:G G A 10 0.535606569257495 0.824415845788285 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 145948440 T/C 1 6 7 13 2.78636058445503 3.74924598480246 -0.962885400347434 T:C T C 10 0.535606569257495 0.782351862796383 ENSG00000198169:ENST00000292562:exon_145946514_145948767:ZNF251 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 146016869 T/C 1 2660 3434 6094 1235.28652577506 1839.27295883024 -603.986433055174 A:T:C:G T C 10 0.535606569257495 4.23305506828494e-54 ENSG00000161016:ENST00000531975:exon_146016662_146016880:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000529163:exon_146016662_146016880:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000526668:exon_146016662_146016880:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000394920:exon_146016662_146016880:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000262584:exon_146016662_146016880:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000444860:exon_146016697_146016880:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000528957:exon_146016662_146016880:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000534813:exon_146016662_146016880:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000529920:exon_146016662_146016880:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000533397:exon_146016756_146016880:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000532702:exon_146016662_146016880:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000525232:exon_146016498_146017299:RPL8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 146067054 G/A 1 27 16 43 12.5386226300476 8.56970510811992 3.96891752192772 A:G G A 10 0.535606569257495 0.284459330159204 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146066740_146067121:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 146076708 C/T 1 23 27 50 10.6810489070776 14.4613773699524 -3.78032846287475 T:C C T 10 0.535606569257495 0.321721714549243 ENSG00000170619:ENST00000402718:exon_146075559_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000450361:exon_146075573_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000305103:exon_146075604_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000529143:exon_146076210_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000533270:exon_146076211_146076780:COMMD5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 146156247 C/A 1 5 9 14 2.32196715371253 4.82045912331745 -2.49849196960493 A:C C A 10 0.535606569257495 0.193170376367493 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 146157339 T/C 1 8 7 15 3.71514744594004 3.74924598480246 -0.0340985388624242 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 8 146171437 A/G 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 A:G A G 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000532351:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000532811:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527512:exon_146171299_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527811:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527427:exon_146169475_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000529378:exon_146171310_146171601:ZNF16 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 399255 G/A 1 16 26 42 7.43029489188008 13.9257708006949 -6.49547590881479 A:G G A 10 0.535606569257495 0.062088815771268 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_399146_399259:DOCK8 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 34 25 59 15.7893766452452 13.3901642314374 2.3992124138078 A:G G A 10 0.535606569257495 0.602207899831554 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 46 43 89 21.3620978141552 23.0310824780723 -1.66898466391705 C:G C G 10 0.535606569257495 0.750549469616958 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 5081780 G/A 1 5 7 12 2.32196715371253 3.74924598480246 -1.42727883108994 A:G G A 10 0.535606569257495 0.564881629114876 ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5081725_5081861:JAK2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 5762600 G/A 1 24 15 39 11.1454423378201 8.03409853886242 3.1113437989577 A:G G A 10 0.535606569257495 0.339755497812456 ENSG00000107036:ENST00000251879:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000381532:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000276898:exon_5762541_5762660:KIAA1432 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 6007549 T/A 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 A:T T A 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_6007195_6008003:KIAA2026 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 6645251 C/T 1 1 13 14 0.464393430742505 6.96288540034743 -6.49849196960493 T:C C T 10 0.535606569257495 0.000531937566170442 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6645245_6645650:GLDC HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 6984236 G/A 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 6986589 A/C 1 10 7 17 4.64393430742505 3.74924598480246 0.894688322622586 A:C A C 10 0.535606569257495 0.809240333218704 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6986344_6986666:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6986344_6986666:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6986344_6986666:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6986344_6986666:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000494570:exon_6986344_6986866:KDM4C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 7046901 C/G 1 7 6 13 3.25075401519754 3.21363941554497 0.0371145996525657 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7046862_7046917:KDM4C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 7477141 G/C 0 16 0 16 7.43029489188008 0 7.43029489188008 G G 10 0.535606569257495 5.05498483720302e-05 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 67 54 121 31.1143598597478 28.9227547399047 2.19160511984311 A:C C A 10 0.535606569257495 0.716126617891504 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 110 59 169 51.0832773816756 31.6007875861922 19.4824897954834 T:G G T 10 0.535606569257495 0.00258964728889286 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 17135115 C/T 0 0 12 12 0 6.42727883108994 -6.42727883108994 T C T 10 0.535606569257495 0.000100608068538266 ENSG00000044459:ENST00000484374:exon_17134980_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17134980_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17135034_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17135034_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380641:exon_17135038_17135423:CNTLN HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 19376255 A/C 1 1 10 11 0.464393430742505 5.35606569257495 -4.89167226183244 A:C A C 10 0.535606569257495 0.00400581666107812 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 19376258 G/C 1 1 14 15 0.464393430742505 7.49849196960493 -7.03409853886242 C:G G C 10 0.535606569257495 0.000270036333000439 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 19378391 A/G 1 798 914 1712 370.585957732519 489.54440430135 -118.958446568831 A:T:C:G A G 10 0.535606569257495 8.90073879185098e-09 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19378366_19378512:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000380384:exon_19378366_19378512:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000315377:exon_19378366_19378512:RPS6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 20933030 A/C 1 25 18 43 11.6098357685626 9.64091824663491 1.96891752192772 A:C A C 10 0.535606569257495 0.647054275327297 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20933013_20933102:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20933013_20933102:KIAA1797 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 21816758 G/A 1 7 11 18 3.25075401519754 5.89167226183244 -2.64091824663491 A:G G A 10 0.535606569257495 0.242609580355471 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 26892654 G/A 1 15 9 24 6.96590146113758 4.82045912331745 2.14544233782012 A:G G A 10 0.535606569257495 0.419256106369884 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26892411_26892802:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26892411_26892801:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26892257_26892785:C9orf82 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 26978170 A/G 1 5 4 9 2.32196715371253 2.14242627702998 0.179540876682545 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000096872:ENST00000519968:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517444:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000518614:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000429045:exon_26978126_26978261:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000517866:exon_26978126_26978261:IFT74 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 283 316 599 131.423340900129 169.251675885368 -37.8283349852395 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0021034327792555 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 33062128 G/A 1 9 9 18 4.17954087668255 4.82045912331745 -0.640918246634909 A:G G A 10 0.535606569257495 0.816090164780621 ENSG00000122692:ENST00000397149:exon_33062047_33062175:SMU1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 33941702 C/T 1 9 13 22 4.17954087668255 6.96288540034743 -2.78334452366489 T:C C T 10 0.535606569257495 0.286635935669917 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000488443:exon_33941647_33941709:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379225:exon_33941647_33941860:UBAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 33941759 T/C 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379225:exon_33941647_33941860:UBAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 7 19 26 3.25075401519754 10.1765248158924 -6.92577080069487 A:G A G 10 0.535606569257495 0.00924210964082018 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 34017106 C/T 1 5 10 15 2.32196715371253 5.35606569257495 -3.03409853886242 T:C C T 10 0.535606569257495 0.128072258736022 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000351580:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000412543:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000480885:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000459988:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000418786:exon_34017048_34017146:UBAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 14 20 34 6.50150803039507 10.7121313851499 -4.21062335475483 T:C C T 10 0.535606569257495 0.169967005226398 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 9 8 17 4.17954087668255 4.28485255405996 -0.105311677377414 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 35674053 G/A 1 14 29 43 6.50150803039507 15.5325905084674 -9.03108247807228 A:G G A 10 0.535606569257495 0.00853915254378337 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35673808_35675863:C9orf100;ENSG00000107159:ENST00000378357:exon_35673853_35674359:CA9 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 35712003 G/A 1 17 37 54 7.89468832262259 19.8174430625273 -11.9227547399047 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0014694444654409 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35712002_35712121:TLN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 35749845 G/C 1 3 6 9 1.39318029222752 3.21363941554497 -1.82045912331745 C:G G C 10 0.535606569257495 0.319105578626484 ENSG00000107185:ENST00000456972:exon_35749734_35749868:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000378078:exon_35749734_35749868:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000496906:exon_35749734_35749868:RGP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 38395928 C/T 1 6 27 33 2.78636058445503 14.4613773699524 -11.6750167854973 T:C C T 10 0.535606569257495 6.2812118832462e-05 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 38396002 C/T 1 9 31 40 4.17954087668255 16.6038036469823 -12.4242627702998 T:C C T 10 0.535606569257495 8.97395846267142e-05 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 58 63 121 26.9348189830653 33.7432138632222 -6.80839488015689 T:C C T 10 0.535606569257495 0.236182061447543 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 55 62 117 25.5416386908378 33.2076072939647 -7.66596860312691 A:G G A 10 0.535606569257495 0.164906026825749 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 72897434 G/A 1 12 7 19 5.57272116891006 3.74924598480246 1.8234751841076 A:G G A 10 0.535606569257495 0.493225271714711 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 18 17 35 8.35908175336509 9.10531167737741 -0.746229924012324 T:C C T 10 0.535606569257495 0.866104025326506 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 77752510 C/T 1 24 20 44 11.1454423378201 10.7121313851499 0.433310952670222 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77752454_77752532:OSTF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 80919756 T/G 1 13 6 19 6.03711459965257 3.21363941554497 2.8234751841076 T:G T G 10 0.535606569257495 0.251503218843434 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80919651_80919856:PSAT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 65 44 109 30.1855729982628 23.5666890473298 6.61888395093305 A:T:C C A 10 0.535606569257495 0.213042213869866 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 86284178 C/A 1 49 43 92 22.7552781063827 23.0310824780723 -0.275804371689535 A:C C A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86281265_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86284100_86284206:UBQLN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 88692336 C/T 1 11 8 19 5.10832773816756 4.28485255405996 0.823475184107596 T:C C T 10 0.535606569257495 0.819697348092054 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88692327_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88692327_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88692313_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000257504:exon_88692327_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000470762:exon_88692322_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000472919:exon_88692327_88692454:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000486130:exon_88692325_88692506:GOLM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 88694179 G/T 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 T:G G T 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000470762:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000486130:exon_88694107_88694256:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000466178:exon_88694107_88694256:GOLM1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 91978397 C/T 1 4 7 11 1.85757372297002 3.74924598480246 -1.89167226183244 T:C C T 10 0.535606569257495 0.36607342785591 ENSG00000187764:ENST00000492386:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000420101:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000469653:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000475255:exon_91978345_91980569:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000455551:exon_91978345_91978442:SEMA4D HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 92003679 C/T 1 21 18 39 9.75226204559261 9.64091824663491 0.111343798957696 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92003551_92003707:SEMA4D HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 92017824 C/T 1 13 17 30 6.03711459965257 9.10531167737741 -3.06819707772485 T:C C T 10 0.535606569257495 0.27721112568876 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92017786_92017931:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92017786_92017931:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92017786_92017931:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92017786_92017931:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92017786_92017931:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92017786_92017931:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92017786_92017931:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92017786_92017931:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000420681:exon_92017786_92017931:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000433650:exon_92017811_92017931:SEMA4D HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 93637015 C/T 1 5 13 18 2.32196715371253 6.96288540034743 -4.64091824663491 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0333310131801400 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93636954_93637131:SYK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 93639973 G/C 1 5 12 17 2.32196715371253 6.42727883108994 -4.10531167737741 C:G G C 10 0.535606569257495 0.0530860535659699 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 93640009 G/A 1 6 11 17 2.78636058445503 5.89167226183244 -3.10531167737741 A:G G A 10 0.535606569257495 0.149431785983435 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 93641175 C/T 1 1 11 12 0.464393430742505 5.89167226183244 -5.42727883108994 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00205041889200729 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 93641199 T/C 1 3 18 21 1.39318029222752 9.64091824663491 -8.24773795440739 T:C T C 10 0.535606569257495 0.000275841707158587 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 100190780 A/G 1 16 9 25 7.43029489188008 4.82045912331745 2.60983576856263 A:G A G 10 0.535606569257495 0.322733716281633 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100190742_100190954:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100190742_100190954:TDRD7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 100194406 T/C 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 T:C T C 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100194307_100194520:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100194307_100194520:TDRD7 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 100420976 G/A 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 A:G G A 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000136937:ENST00000375147:exon_100420922_100421025:NCBP1;ENSG00000136937:ENST00000375132:exon_100420922_100421025:NCBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 100819070 T/G 1 13 22 35 6.03711459965257 11.7833445236649 -5.74622992401232 T:G T G 10 0.535606569257495 0.061754373150713 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 49 49 98 22.7552781063827 26.2447218936173 -3.48944378723451 T:C T C 10 0.535606569257495 0.480638083348412 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 100823135 G/C 1 49 44 93 22.7552781063827 23.5666890473298 -0.811410940947031 T:C:G G C 10 0.535606569257495 0.917315886509728 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 101984093 G/C 1 15 13 28 6.96590146113758 6.96288540034743 0.00301606079014149 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101983829_101984224:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101983829_101984238:ALG2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 104297693 T/A 1 13 21 34 6.03711459965257 11.2477379544074 -5.21062335475483 A:T T A 10 0.535606569257495 0.0855764851443026 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478347:exon_104297680_104297798:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000488264:exon_104297680_104297729:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000374819:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000479306:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000481046:exon_104297680_104297834:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000466817:exon_104297680_104297834:RNF20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 104302625 A/G 1 11 25 36 5.10832773816756 13.3901642314374 -8.28183649326982 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0068763451051297 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478347:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000488264:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000374819:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000479306:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000466817:exon_104302485_104302652:RNF20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 104307150 C/T 1 21 13 34 9.75226204559261 6.96288540034743 2.78937664524517 T:C C T 10 0.535606569257495 0.391865967418225 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104307049_104307167:RNF20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 25 27 52 11.6098357685626 14.4613773699524 -2.85154160138974 A:G G A 10 0.535606569257495 0.487565406422855 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 110084328 C/T 1 56 58 114 26.0060321215803 31.0651810169347 -5.05914889535443 A:T:C C T 10 0.535606569257495 0.349247227208611 ENSG00000119318:ENST00000416373:exon_110084264_110084399:RAD23B;ENSG00000119318:ENST00000358015:exon_110084264_110084399:RAD23B HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 111641806 G/A 1 11 7 18 5.10832773816756 3.74924598480246 1.35908175336509 A:G G A 10 0.535606569257495 0.638915092572894 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 111653574 C/G 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111653483_111653684:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111653483_111653684:IKBKAP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 111659439 T/C 1 5 5 10 2.32196715371253 2.67803284628747 -0.356065692574949 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111659428_111659565:IKBKAP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 111659483 T/G 1 8 6 14 3.71514744594004 3.21363941554497 0.501508030395071 T:G T G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111659428_111659565:IKBKAP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 111660851 C/T 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 T:C C T 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111660782_111660861:IKBKAP HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 111727670 C/G 1 24 16 40 11.1454423378201 8.56970510811992 2.5757372297002 C:G C G 10 0.535606569257495 0.433090933174964 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 111755008 C/T 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 T:C C T 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374593:exon_111754912_111755099:CTNNAL1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 112900199 T/C 1 9 10 19 4.17954087668255 5.35606569257495 -1.1765248158924 T:C T C 10 0.535606569257495 0.649555257001445 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 112900785 A/G 1 9 14 23 4.17954087668255 7.49849196960493 -3.31895109292238 A:G A G 10 0.535606569257495 0.209886792025538 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 81 64 145 37.6158678901429 34.2788204324797 3.33704745766323 T:C:G T C 10 0.535606569257495 0.617733812674923 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 87 69 156 40.4022284745979 36.9568532787671 3.44537519583079 T:C C T 10 0.535606569257495 0.630256992702938 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 26 11 37 12.0742291993051 5.89167226183244 6.18255693747269 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0476039268320101 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 115950706 A/C 1 9 1 10 4.17954087668255 0.535606569257495 3.64393430742505 A:C A C 10 0.535606569257495 0.0246360115647308 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950669_115950841:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115950669_115950771:FKBP15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 115968797 C/T 1 3 7 10 1.39318029222752 3.74924598480246 -2.35606569257495 T:C C T 10 0.535606569257495 0.204175008278816 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115968789_115968858:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115968789_115968858:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115968789_115968858:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000493847:exon_115968291_115968858:FKBP15 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 117108971 C/T 1 46 33 79 21.3620978141552 17.6750167854973 3.6870810286579 T:C C T 10 0.535606569257495 0.431322434930897 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117108949_117109054:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117108949_117109064:AKNA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 34 26 60 15.7893766452452 13.9257708006949 1.8636058445503 T:C C T 10 0.535606569257495 0.698422999985293 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 19 19 38 8.8234751841076 10.1765248158924 -1.35304963178481 A:G G A 10 0.535606569257495 0.745630156270472 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 123671520 G/A 1 225 272 497 104.488521917064 145.684986838039 -41.196464920975 A:G G A 10 0.535606569257495 0.000221899977893358 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 123860689 C/T 1 2 8 10 0.92878686148501 4.28485255405996 -3.35606569257495 T:C C T 10 0.535606569257495 0.052560989900699 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123860664_123860850:CEP110 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 123917020 T/A 1 12 8 20 5.57272116891006 4.28485255405996 1.2878686148501 A:T T A 10 0.535606569257495 0.65695311160528 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 123929770 C/T 1 17 26 43 7.89468832262259 13.9257708006949 -6.03108247807228 T:C C T 10 0.535606569257495 0.0681644594109765 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123929767_123929955:CEP110 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 125140732 C/T 1 1 9 10 0.464393430742505 4.82045912331745 -4.35606569257495 T:C C T 10 0.535606569257495 0.00778992131964651 ENSG00000095303:ENST00000362012:exon_125140712_125140852:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000223423:exon_125140712_125140852:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000373698:exon_125140712_125140852:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000426608:exon_125140712_125140852:PTGS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 125145994 C/T 1 4 8 12 1.85757372297002 4.28485255405996 -2.42727883108994 T:C C T 10 0.535606569257495 0.246342614793183 ENSG00000095303:ENST00000362012:exon_125145788_125146034:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000223423:exon_125145788_125146034:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000373698:exon_125145788_125146034:PTGS1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 125582466 G/A 1 36 27 63 16.7181635067302 14.4613773699524 2.25678613677782 A:G G A 10 0.535606569257495 0.614598338422256 ENSG00000136940:ENST00000259467:exon_125580623_125582915:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000394286:exon_125580623_125582915:PDCL HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 127643456 T/C 1 5 6 11 2.32196715371253 3.21363941554497 -0.891672261832444 T:C T C 10 0.535606569257495 0.76441497343657 ENSG00000136935:ENST00000373555:exon_127643450_127643536:GOLGA1;ENSG00000136935:ENST00000475407:exon_127643450_127643536:GOLGA1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 128246786 G/A 1 54 61 115 25.0772452600953 32.6720007247072 -7.59475546461191 A:G G A 10 0.535606569257495 0.161651248184063 ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128246722_128246862:MAPKAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 9 11 20 4.17954087668255 5.89167226183244 -1.7121313851499 A:G G A 10 0.535606569257495 0.505071075446385 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 130536717 G/A 1 21 19 40 9.75226204559261 10.1765248158924 -0.424262770299798 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130536534_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130536269_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000468969:exon_130536631_130536746:SH2D3C HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 130565267 A/G 1 26 13 39 12.0742291993051 6.96288540034743 5.1113437989577 A:G A G 10 0.535606569257495 0.110058075461033 ENSG00000136877:ENST00000373247:exon_130565154_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373245:exon_130565154_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000393706:exon_130565154_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373244:exon_130565154_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000488307:exon_130565172_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373228:exon_130565190_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000481552:exon_130565196_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000460181:exon_130565197_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000475765:exon_130565211_130565341:FPGS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 130630233 G/T 1 9 10 19 4.17954087668255 5.35606569257495 -1.1765248158924 T:G G T 10 0.535606569257495 0.649555257001445 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130628759_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630118_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630169_130630355:AK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131027921 C/G 1 22 30 52 10.2166554763351 16.0681970777248 -5.85154160138974 C:G C G 10 0.535606569257495 0.125650084296872 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131088076 G/A 1 10 10 20 4.64393430742505 5.35606569257495 -0.712131385149899 A:G G A 10 0.535606569257495 0.824415845788285 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131088058_131088160:COQ4;ENSG00000167113:ENST00000372875:exon_131088058_131088679:COQ4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131110892 G/A 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000167114:ENST00000300456:exon_131110824_131110982:SLC27A4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131122794 G/A 1 7 5 12 3.25075401519754 2.67803284628747 0.572721168910061 A:G G A 10 0.535606569257495 0.78119172256529 ENSG00000167114:ENST00000339595:exon_131122613_131123501:SLC27A4;ENSG00000167114:ENST00000372870:exon_131122613_131123496:SLC27A4;ENSG00000167114:ENST00000300456:exon_131122613_131123502:SLC27A4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131394965 C/G 1 140 125 265 65.0150803039507 66.9508211571869 -1.93574085323615 T:C:G C G 10 0.535606569257495 0.85346340725079 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131394851_131394997:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131394851_131394997:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131394851_131394997:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131394851_131394997:SPTAN1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131483551 T/A 1 78 68 146 36.2226875979154 36.4212467095097 -0.198559111594264 A:T T A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000160446:ENST00000372663:exon_131483148_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372667:exon_131483149_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000467312:exon_131483159_131483759:ZDHHC12 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131515547 G/T 1 9 9 18 4.17954087668255 4.82045912331745 -0.640918246634909 T:G G T 10 0.535606569257495 0.816090164780621 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131515443_131515879:ZER1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131565554 T/C 1 15 4 19 6.96590146113758 2.14242627702998 4.8234751841076 T:C T C 10 0.535606569257495 0.0360687097984019 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131565529_131565739:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000466056:exon_131565529_131565727:TBC1D13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131570178 T/C 1 7 3 10 3.25075401519754 1.60681970777248 1.64393430742505 T:C T C 10 0.535606569257495 0.356146005799652 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131570093_131572711:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131570093_131572703:TBC1D13 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131585069 A/G 1 18 23 41 8.35908175336509 12.3189510929224 -3.95986933955729 A:G A G 10 0.535606569257495 0.272895670375295 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 16 4 20 7.43029489188008 2.14242627702998 5.2878686148501 A:G G A 10 0.535606569257495 0.0229425638741549 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 17 15 32 7.89468832262259 8.03409853886242 -0.139410216239837 C:G G C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131670919 T/C 1 8 8 16 3.71514744594004 4.28485255405996 -0.569705108119919 T:C T C 10 0.535606569257495 0.806695682985061 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131752445 C/T 1 16 15 31 7.43029489188008 8.03409853886242 -0.603803646982342 T:C C T 10 0.535606569257495 0.858638851870196 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131752399_131752505:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000411887:exon_131752399_131752505:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131752399_131752505:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000477069:exon_131752399_131752505:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000491502:exon_131752432_131752505:NUP188 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 131857687 C/G 1 15 6 21 6.96590146113758 3.21363941554497 3.75226204559261 C:G C G 10 0.535606569257495 0.126040587665888 ENSG00000095321:ENST00000351352:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000372536:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000440434:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000318080:exon_131857089_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000455396:exon_131857485_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000458362:exon_131857676_131857891:CRAT HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 132638424 C/T 1 8 5 13 3.71514744594004 2.67803284628747 1.03711459965257 T:C C T 10 0.535606569257495 0.593641770478394 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000496927:exon_132638409_132638517:USP20 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 163 147 310 75.6961292110283 78.7341656808518 -3.03803646982344 A:G A G 10 0.535606569257495 0.732982563215868 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 134346315 T/C 1 18 12 30 8.35908175336509 6.42727883108994 1.93180292227515 T:C T C 10 0.535606569257495 0.583938206470959 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134346175_134346370:BAT2L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 134350231 C/T 1 21 18 39 9.75226204559261 9.64091824663491 0.111343798957696 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000456307:exon_134349841_134350234:BAT2L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 134350323 C/G 1 18 15 33 8.35908175336509 8.03409853886242 0.324983214502668 C:G C G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 134350458 C/T 1 20 26 46 9.2878686148501 13.9257708006949 -4.63790218584477 T:C C T 10 0.535606569257495 0.185093900029521 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 134350851 T/C 0 21 0 21 9.75226204559261 0 9.75226204559261 T T 10 0.535606569257495 2.12298574193573e-06 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 134351065 G/T 1 24 21 45 11.1454423378201 11.2477379544074 -0.102295616587273 T:G G T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 134351500 C/T 1 9 12 21 4.17954087668255 6.42727883108994 -2.24773795440739 T:C C T 10 0.535606569257495 0.384311420828178 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134351317_134351922:BAT2L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 134358108 A/G 1 21 18 39 9.75226204559261 9.64091824663491 0.111343798957696 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134358097_134358294:BAT2L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 134371165 C/T 1 30 38 68 13.9318029222752 20.3530496317848 -6.42124670950965 T:C C T 10 0.535606569257495 0.144077026006458 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134371127_134375558:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000320547:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000465931:exon_134371127_134375584:BAT2L1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 134385436 A/G 0 8 0 8 3.71514744594004 0 3.71514744594004 A A 10 0.535606569257495 0.00893594247670414 ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134385290_134385449:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134385290_134385449:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000448212:exon_134385290_134385449:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134385290_134385802:POMT1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 134401335 C/T 1 10 16 26 4.64393430742505 8.56970510811992 -3.92577080069487 T:C C T 10 0.535606569257495 0.167625217677948 ENSG00000130717:ENST00000372215:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372208:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000491309:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372211:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372210:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000484876:exon_134401316_134401546:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000494584:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000459858:exon_134401332_134401364:UCK1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 135205292 A/G 1 17 6 23 7.89468832262259 3.21363941554497 4.68104890707762 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0597251465228825 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000419901:exon_135205119_135205886:SETX HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 135470176 C/G 1 23 11 34 10.6810489070776 5.89167226183244 4.78937664524517 C:G C G 10 0.535606569257495 0.121527966269489 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 135470414 T/C 1 14 14 28 6.50150803039507 7.49849196960493 -0.996983939209859 T:C T C 10 0.535606569257495 0.709785628768718 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 135521303 C/T 1 5 3 8 2.32196715371253 1.60681970777248 0.71514744594004 T:C C T 10 0.535606569257495 0.732067195068257 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000310532:exon_135521282_135521458:DDX31 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 135538050 C/T 1 13 12 25 6.03711459965257 6.42727883108994 -0.390164231437374 T:C C T 10 0.535606569257495 1 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135537826_135538082:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135537826_135538082:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135537826_135538082:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135537826_135538082:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000310532:exon_135537826_135538082:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000480876:exon_135537826_135538082:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000482620:exon_135537826_135538082:DDX31 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 135554566 G/A 1 27 27 54 12.5386226300476 14.4613773699524 -1.92275473990473 A:G G A 10 0.535606569257495 0.682738025879841 ENSG00000125484:ENST00000372146:exon_135553364_135555190:GTF3C4;ENSG00000125484:ENST00000483873:exon_135554265_135554697:GTF3C4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 135771793 G/A 1 8 4 12 3.71514744594004 2.14242627702998 1.57272116891006 A:G G A 10 0.535606569257495 0.402267929648929 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135766735_135772141:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135766736_135772141:TSC1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 54 43 97 25.0772452600953 23.0310824780723 2.04616278202299 A:G G A 10 0.535606569257495 0.685554711782589 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 135982088 A/C 1 12 10 22 5.57272116891006 5.35606569257495 0.216655476335111 A:C A C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000424572:exon_135982032_135982135:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000460587:exon_135982032_135982135:RALGDS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 135983504 T/C 1 9 16 25 4.17954087668255 8.56970510811992 -4.39016423143737 T:C T C 10 0.535606569257495 0.107119974760568 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135983375_135983793:RALGDS HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 136213521 T/C 1 3 5 8 1.39318029222752 2.67803284628747 -1.28485255405996 T:C T C 10 0.535606569257495 0.484851690384515 ENSG00000148297:ENST00000491289:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000486395:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000343730:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000344469:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000476080:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000422801:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000371999:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000446777:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000494177:exon_136213395_136213548:MED22;ENSG00000148297:ENST00000457204:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000482295:exon_136213262_136213555:MED22 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 136216882 G/A 1 1152 1527 2679 534.981232215366 817.871231256195 -282.889999040829 A:T:C:G G A 10 0.535606569257495 8.63686492701593e-28 ENSG00000148303:ENST00000323345:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000496554:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000463740:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000426651:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000468019:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000485706:exon_136216767_136217238:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000315731:exon_136216856_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000489392:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000412126:exon_136216856_136216907:RPL7A HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 33 28 61 15.3249832145027 14.9969839392099 0.327999275292807 A:C:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 136228006 G/A 1 34 28 62 15.7893766452452 14.9969839392099 0.792392706035313 A:G G A 10 0.535606569257495 0.89900907176477 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227932_136228045:SURF2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 136277482 T/C 1 16 12 28 7.43029489188008 6.42727883108994 1.00301606079014 T:C T C 10 0.535606569257495 0.850180549654168 ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000494045:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136277419_136277612:REXO4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 136279935 C/T 1 30 33 63 13.9318029222752 17.6750167854973 -3.74321386322218 T:C C T 10 0.535606569257495 0.377548025615559 ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371935:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000454825:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000445916:exon_136279785_136280131:REXO4 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 136338187 A/C 1 6 4 10 2.78636058445503 2.14242627702998 0.643934307425051 A:C A C 10 0.535606569257495 0.76008336910768 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 136338580 G/A 1 19 27 46 8.8234751841076 14.4613773699524 -5.63790218584477 A:G G A 10 0.535606569257495 0.104850442749434 ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136338537_136339210:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136338537_136338722:SLC2A6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 136339181 C/T 1 18 10 28 8.35908175336509 5.35606569257495 3.00301606079014 T:C C T 10 0.535606569257495 0.343679449440477 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136339102_136339210:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136338537_136339210:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136339102_136339210:SLC2A6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 136643908 G/A 1 6 6 12 2.78636058445503 3.21363941554497 -0.427278831089939 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136643884_136644011:VAV2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 136662928 A/G 1 7 11 18 3.25075401519754 5.89167226183244 -2.64091824663491 A:G A G 10 0.535606569257495 0.242609580355471 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136662832_136662931:VAV2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 136726546 G/A 0 25 0 25 11.6098357685626 0 11.6098357685626 G G 10 0.535606569257495 3.0663332515218e-07 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136726496_136726554:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136726496_136726554:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136726496_136726554:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136726496_136726554:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136726496_136726554:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000486113:exon_136726334_136726554:VAV2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 138710348 G/A 1 7 9 16 3.25075401519754 4.82045912331745 -1.56970510811992 A:G G A 10 0.535606569257495 0.462079525679044 ENSG00000130559:ENST00000389532:exon_138710254_138710462:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000389533:exon_138710254_138710462:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000312405:exon_138710254_138710462:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000483991:exon_138710254_138710462:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000409386:exon_138710254_138710462:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000482664:exon_138710254_138710493:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000493088:exon_138710254_138710462:CAMSAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 138712846 C/T 1 9 13 22 4.17954087668255 6.96288540034743 -2.78334452366489 T:C C T 10 0.535606569257495 0.286635935669917 ENSG00000130559:ENST00000389532:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000389533:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000312405:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000483991:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000409386:exon_138712685_138715106:CAMSAP1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 138903635 G/A 1 20 17 37 9.2878686148501 9.10531167737741 0.182556937472686 A:G G A 10 0.535606569257495 1 ENSG00000148411:ENST00000371753:exon_138898383_138903870:NACC2;ENSG00000148411:ENST00000277554:exon_138903205_138903870:NACC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 138903671 A/G 1 10 17 27 4.64393430742505 9.10531167737741 -4.46137736995236 A:G A G 10 0.535606569257495 0.121108055706691 ENSG00000148411:ENST00000371753:exon_138898383_138903870:NACC2;ENSG00000148411:ENST00000277554:exon_138903205_138903870:NACC2 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 43 38 81 19.9689175219277 20.3530496317848 -0.384132109857088 A:G A G 10 0.535606569257495 1 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 139731969 C/T 1 60 53 113 27.8636058445503 28.3871481706472 -0.52354232609693 T:C:G C T 10 0.535606569257495 0.925172863359051 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139731798_139732067:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139731798_139732042:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139729623_139732114:C9orf86 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 140100224 A/G 1 5 8 13 2.32196715371253 4.28485255405996 -1.96288540034743 A:G A G 10 0.535606569257495 0.405373971524186 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1 HGDP00877_parsed_pileup.txt . 9 140115554 G/A 1 20 12 32 9.2878686148501 6.42727883108994 2.86058978376016 A:G G A 10 0.535606569257495 0.376661791108923 ENSG00000212864:ENST00000392827:exon_140114707_140115760:RNF208;ENSG00000212864:ENST00000391553:exon_140114707_140115775:RNF208 HGDP00877_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 4 9 13 1.85757372297002 4.82045912331745 -2.96288540034743 T:C T C 10 0.535606569257495 0.162027045980107 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00877_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 6 14 20 2.78636058445503 7.49849196960493 -4.7121313851499 A:G A G 10 0.535606569257495 0.0427972984363222 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00877_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 1192 1284 2476 553.556969445066 687.718834926623 -134.161865481557 A:T:G G A 10 0.535606569257495 7.265336140729e-08 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00877_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 1 17 13 30 7.89468832262259 6.96288540034743 0.931802922275152 T:C T C 10 0.535606569257495 0.855265722884923 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP00877_parsed_pileup.txt . X 2139186 C/T 1 21 16 37 9.75226204559261 8.56970510811992 1.18255693747269 T:C C T 10 0.535606569257495 0.74382946670773 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00877_parsed_pileup.txt . X 2139200 T/C 1 19 16 35 8.8234751841076 8.56970510811992 0.253770075987678 T:C T C 10 0.535606569257495 1 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00877_parsed_pileup.txt . X 2161129 C/G 1 18 18 36 8.35908175336509 9.64091824663491 -1.28183649326982 C:G C G 10 0.535606569257495 0.739235820904023 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2161103_2161271:DHRSX HGDP00877_parsed_pileup.txt . X 13397397 C/T 0 196 0 196 91.021112425531 0 91.021112425531 C C 10 0.535606569257495 8.04527977530309e-54