INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 880436 C/G 1 25 42 67 11.9367579300959 21.9462466774388 -10.0094887473429 C:G C G 10 0.522529682796163 0.0194557365651616 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_880422_880526:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_880422_880526:NOC2L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 881918 G/A 1 16 15 31 7.63952507526139 7.83794524194244 -0.198420166681052 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881782_882440:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881782_881925:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881782_881925:NOC2L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 34 37 71 16.2339907849305 19.333598263458 -3.09960747852757 C:G C G 10 0.522529682796163 0.47803268933165 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 18 8 26 8.59446570966907 4.1802374623693 4.41422824729976 T:C C T 10 0.522529682796163 0.114799439152915 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 1263144 G/A 1 16 14 30 7.63952507526139 7.31541555914628 0.324109516115112 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 1277184 G/A 1 13 6 19 6.20711412364988 3.13517809677698 3.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.175241772830013 ENSG00000107404:ENST00000378891:exon_1277047_1277185:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000378888:exon_1277047_1277185:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000345100:exon_1277047_1277185:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000263743:exon_1277047_1277185:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000472445:exon_1277150_1277536:DVL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 1278132 C/T 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000107404:ENST00000378891:exon_1278069_1278138:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000378888:exon_1278069_1278138:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000345100:exon_1278069_1278138:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000263743:exon_1278069_1278138:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000472445:exon_1278069_1278138:DVL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 123 154 277 58.728849016072 80.4695711506091 -21.7407221345371 C:G G C 10 0.522529682796163 0.00962089837078407 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 1390875 C/T 0 10 0 10 4.77470317203837 0 4.77470317203837 C C 10 0.522529682796163 0.00213326764069245 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000475091:exon_1390840_1390899:ATAD3C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 46 55 101 21.9636345913765 28.739132553789 -6.77549796241246 A:G A G 10 0.522529682796163 0.195525174377290 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 3701663 T/C 1 11 11 22 5.25217348924221 5.74782651075779 -0.495653021515585 T:C T C 10 0.522529682796163 0.835008349106383 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3701651_3701767:LRRC47 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 3745924 G/A 1 7 10 17 3.34229222042686 5.22529682796163 -1.88300460753477 A:G G A 10 0.522529682796163 0.468082532065744 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000461667:exon_3745830_3745937:KIAA0562 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 3755675 T/C 1 7 9 16 3.34229222042686 4.70276714516547 -1.36047492473861 T:C T C 10 0.522529682796163 0.618833530377833 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3755647_3755683:KIAA0562 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 6649277 T/C 1 23 25 48 10.9818172956883 13.0632420699041 -2.08142477421582 T:C T C 10 0.522529682796163 0.566320582114887 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 6659445 C/T 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000162413:ENST00000377658:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000377663:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000467612:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000496707:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000463043:exon_6659107_6659512:KLHL21 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 6704635 A/G 1 19 22 41 9.0719360268729 11.4956530215156 -2.42371699464268 A:G A G 10 0.522529682796163 0.532347718490985 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000472414:exon_6704618_6704734:DNAJC11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 6705874 G/C 1 9 12 21 4.29723285483453 6.27035619355396 -1.97312333871942 C:G G C 10 0.522529682796163 0.513321470356553 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 8418644 C/A 1 11 9 20 5.25217348924221 4.70276714516547 0.549406344076741 A:C C A 10 0.522529682796163 0.827347849665529 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 8418650 T/C 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 8421203 T/C 1 9 16 25 4.29723285483453 8.36047492473861 -4.06324206990407 T:C T C 10 0.522529682796163 0.112781481348924 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8420172_8421550:RERE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 9129620 C/T 1 17 15 32 8.11699539246523 7.83794524194244 0.279050150522785 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000142583:ENST00000377424:exon_9129563_9129775:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000456780:exon_9129563_9129887:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000377414:exon_9129563_9129663:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000474145:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000484798:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000479813:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000486632:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000487835:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000464985:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000473209:exon_9129563_9129653:SLC2A5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 9188876 T/C 1 2 6 8 0.954940634407674 3.13517809677698 -2.1802374623693 T:C T C 10 0.522529682796163 0.163120845582557 ENSG00000180758:ENST00000377411:exon_9188704_9189229:GPR157;ENSG00000180758:ENST00000414642:exon_9188704_9189183:GPR157 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 9305445 A/C 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 A:C A C 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9304984_9305620:H6PD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 9307033 G/A 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9307025_9307142:H6PD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 9307138 T/C 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C T C 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9307025_9307142:H6PD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 9324670 A/G 1 1 7 8 0.477470317203837 3.65770777957314 -3.1802374623693 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0319085925070315 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 9416151 G/A 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 A:G G A 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000171621:ENST00000328089:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000450402:exon_9415802_9416556:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000357898:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000377399:exon_9415766_9416644:SPSB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 11087524 G/A 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000009724:ENST00000400897:exon_11086580_11087705:MASP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 39 17 56 18.6213423709496 8.88300460753477 9.73833776341487 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0105317944163220 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 11140823 G/A 1 31 44 75 14.8015798333189 22.9913060430312 -8.18972620971222 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0643798442304354 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11140821_11140969:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11140821_11140969:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11140821_11140969:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000472078:exon_11140556_11140914:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11140758_11140969:EXOSC10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 11141187 C/G 1 22 18 40 10.5043469784844 9.40553429033093 1.09881268815348 C:G C G 10 0.522529682796163 0.7541595467739 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11141139_11141274:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11141139_11141295:EXOSC10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 11159799 C/G 1 16 13 29 7.63952507526139 6.79288587635012 0.846639198911274 C:G C G 10 0.522529682796163 0.853261309241005 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11159778_11159938:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11159778_11159926:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000460196:exon_11159778_11159911:EXOSC10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 11181327 C/T 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 T:C C T 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11181303_11181425:MTOR;ENSG00000198793:ENST00000376838:exon_11181303_11181425:MTOR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 11288758 G/A 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 A:G G A 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11288725_11288975:MTOR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 16 11 27 7.63952507526139 5.74782651075779 1.8916985645036 T:C C T 10 0.522529682796163 0.564634669250498 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 11 5 16 5.25217348924221 2.61264841398082 2.63952507526139 T:C C T 10 0.522529682796163 0.217533646462459 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 12082334 A/T 1 27 24 51 12.8916985645036 12.5407123871079 0.350986177395688 A:T A T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082279_12082499:MIIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 16 15 31 7.63952507526139 7.83794524194244 -0.198420166681052 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 12090001 T/C 1 3 8 11 1.43241095161151 4.1802374623693 -2.74782651075779 T:C T C 10 0.522529682796163 0.131967912623333 ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 30 23 53 14.3241095161151 12.0181827043117 2.30592681180336 A:G G A 10 0.522529682796163 0.583393334522656 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 40 38 78 19.0988126881535 19.8561279462542 -0.757315258100714 A:G A G 10 0.522529682796163 0.909965192490881 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 15844615 A/G 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 A:G A G 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000132906:ENST00000333868:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000348549:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375890:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375874:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000400777:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000447522:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000474305:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000440484:exon_15844605_15844890:CASP9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 15892415 A/C 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 A:T:C:G A C 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000116138:ENST00000375847:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375838:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000475133:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375849:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000483270:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000472665:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000479655:exon_15892313_15892494:DNAJC16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 15904318 C/T 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 T:C C T 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15904180_15904359:AGMAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 15905471 G/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G G A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15905354_15905549:AGMAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 15905501 G/A 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15905354_15905549:AGMAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 15909744 C/T 1 2 7 9 0.954940634407674 3.65770777957314 -2.70276714516547 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0963891685915122 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 15909850 C/G 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 C:G C G 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 15959977 C/T 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 T:C C T 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000197312:ENST00000480945:exon_15959934_15960060:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000486680:exon_15959934_15960801:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000320153:exon_15959934_15960060:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000483899:exon_15959934_15960060:DDI2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 15986547 T/C 1 9 14 23 4.29723285483453 7.31541555914628 -3.01818270431175 T:C T C 10 0.522529682796163 0.218336616351306 ENSG00000197312:ENST00000480945:exon_15986332_15995539:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000320153:exon_15986332_15987552:DDI2;ENSG00000215695:ENST00000345034:exon_15986364_15988217:RSC1A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 16042766 T/C 1 17 20 37 8.11699539246523 10.4505936559233 -2.33359826345803 T:C T C 10 0.522529682796163 0.511423752828459 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000462455:exon_16042732_16042838:PLEKHM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 16044401 G/A 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 A:G G A 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000462455:exon_16044388_16044487:PLEKHM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 16046324 C/T 1 15 15 30 7.16205475805756 7.83794524194244 -0.675890483884888 T:C C T 10 0.522529682796163 0.856233772119583 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16046229_16046415:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16046229_16046415:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16046229_16046415:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000462455:exon_16046229_16046364:PLEKHM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 16056364 G/A 1 32 24 56 15.2790501505228 12.5407123871079 2.73833776341487 A:G G A 10 0.522529682796163 0.505159199366776 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 16255644 C/T 1 10 10 20 4.77470317203837 5.22529682796163 -0.45059365592326 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN;ENSG00000065526:ENST00000375753:exon_16254586_16255713:SPEN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 16256007 T/C 1 16 10 26 7.63952507526139 5.22529682796163 2.41422824729976 T:C T C 10 0.522529682796163 0.433314383592609 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 16259813 A/G 1 25 19 44 11.9367579300959 9.9280639731271 2.00869395696883 A:C:G A G 10 0.522529682796163 0.651254012401917 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 16260916 C/T 1 8 12 20 3.8197625376307 6.27035619355396 -2.45059365592326 T:C C T 10 0.522529682796163 0.371173578167092 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 16262404 C/T 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C C T 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 16265155 T/A 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:T T A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000065526:ENST00000487496:exon_16265078_16265371:SPEN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 16272250 A/G 1 10 7 17 4.77470317203837 3.65770777957314 1.11699539246523 A:G A G 10 0.522529682796163 0.63504130808849 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 16641899 C/T 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 T:C C T 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16641664_16641930:FBXO42 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 17319011 G/A 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000503552:exon_17318981_17319076:ATP13A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 17326540 G/A 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17326506_17326637:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17326506_17326637:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17326506_17326637:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000463860:exon_17326506_17326637:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502860:exon_17326506_17326637:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000375508:exon_17326506_17326637:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000506174:exon_17326506_17326637:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000510069:exon_17326506_17326637:ATP13A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 19201928 C/T 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 T:C C T 10 0.522529682796163 0.568106121039098 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19201876_19201997:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19201876_19201997:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19201876_19201997:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19201876_19201997:ALDH4A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 19201956 A/G 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19201876_19201997:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19201876_19201997:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19201876_19201997:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19201876_19201997:ALDH4A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 19202896 G/A 1 8 2 10 3.8197625376307 1.04505936559233 2.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.11294395461013 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19202809_19202961:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19202809_19202961:ALDH4A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 19202917 T/C 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19202809_19202961:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19202809_19202961:ALDH4A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 19202926 T/C 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19202809_19202961:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19202809_19202961:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19202809_19202961:ALDH4A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 19411129 A/G 1 35 39 74 16.7114611021343 20.3786576290504 -3.66719652691606 A:G A G 10 0.522529682796163 0.416752606004585 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19410998_19411192:UBR4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 19413261 T/A 1 33 32 65 15.7565204677266 16.7209498494772 -0.964429381750593 A:T T A 10 0.522529682796163 0.901314250215728 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19413173_19413315:UBR4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 19415304 C/T 1 51 52 103 24.3509861773957 27.1715435054005 -2.82055732800479 T:C C T 10 0.522529682796163 0.62228009416507 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 19433449 A/G 1 31 34 65 14.8015798333189 17.7660092150695 -2.96442938175059 A:G A G 10 0.522529682796163 0.535060727601276 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000494503:exon_19433331_19433460:UBR4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 19447843 C/G 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000425413:exon_19447694_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000417040:exon_19447707_19447928:UBR4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 19565344 C/G 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 C:G C G 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19565289_19565351:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19565289_19565348:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19565289_19565351:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375197:exon_19565289_19565348:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19565289_19565351:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000467423:exon_19565121_19566479:KIAA0090 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 19652063 G/A 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000040487:ENST00000234646:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000430100:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375155:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375153:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000469076:exon_19652020_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000400548:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000497827:exon_19652020_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000432465:exon_19651989_19652076:PQLC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 20977221 A/T 1 5 11 16 2.38735158601918 5.74782651075779 -3.36047492473861 A:T A T 10 0.522529682796163 0.131585770979384 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 84 87 171 40.1075066451223 45.4600824032662 -5.35257575814386 A:G G A 10 0.522529682796163 0.444156645186499 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 22852904 G/A 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000184677:ENST00000374651:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000404138:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000375647:exon_22852695_22857647:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000374649:exon_22852695_22857647:ZBTB40 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 23399824 T/C 1 13 6 19 6.20711412364988 3.13517809677698 3.0719360268729 T:C T C 10 0.522529682796163 0.175241772830013 ENSG00000004487:ENST00000356634:exon_23399785_23399896:KDM1A;ENSG00000004487:ENST00000400181:exon_23399785_23399896:KDM1A;ENSG00000004487:ENST00000465864:exon_23399767_23399896:KDM1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 29 19 48 13.8466391989113 9.9280639731271 3.91857522578418 T:C C T 10 0.522529682796163 0.312013123487917 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 24180962 T/C 1 7 9 16 3.34229222042686 4.70276714516547 -1.36047492473861 T:C T C 10 0.522529682796163 0.618833530377833 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24180850_24181050:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24180850_24181050:FUCA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 T:C T C 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 T:C C T 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 24201094 G/C 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 C:G G C 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 24201109 C/T 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 T:C C T 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G A G 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 A:G G A 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 24201919 T/C 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 T:C T C 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 24201920 T/C 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 T:C T C 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 26497122 G/T 1 69 69 138 32.9454518870648 36.0545481129352 -3.10909622587049 T:G G T 10 0.522529682796163 0.610028844150935 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26497066_26498551:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496909_26498551:ZNF593 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 10 4 14 4.77470317203837 2.09011873118465 2.68458444085372 T:C C T 10 0.522529682796163 0.185755143276423 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 5 18 23 2.38735158601918 9.40553429033093 -7.01818270431175 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00536287317039971 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 77 55 132 36.7652144246955 28.739132553789 8.02608187090649 T:C T C 10 0.522529682796163 0.164540245048344 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 27676925 G/A 1 10 10 20 4.77470317203837 5.22529682796163 -0.45059365592326 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27676463_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27676463_27676976:SYTL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 27679797 A/G 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 A:G A G 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 27679954 G/A 1 14 15 29 6.68458444085372 7.83794524194244 -1.15336080108873 A:G G A 10 0.522529682796163 0.712748058622428 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 11 5 16 5.25217348924221 2.61264841398082 2.63952507526139 A:G A G 10 0.522529682796163 0.217533646462459 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 28206588 T/C 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C T C 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 79 37 116 37.7201550591031 19.333598263458 18.3865567956451 A:G A G 10 0.522529682796163 0.000748360947981005 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 83 22 105 39.6300363279185 11.4956530215156 28.1343833064029 T:C T C 10 0.522529682796163 2.03377436236082e-08 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 90 26 116 42.9723285483453 13.5857717527002 29.3865567956451 A:G A G 10 0.522529682796163 2.21904644120647e-08 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 355 297 652 169.501962607362 155.19131579046 14.3106468169017 T:C T C 10 0.522529682796163 0.272392046402666 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 19 24 43 9.0719360268729 12.5407123871079 -3.46877636023501 A:G A G 10 0.522529682796163 0.359884023639214 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 47 67 114 22.4411049085803 35.0094887473429 -12.5683838387626 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0191180575212147 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 68 56 124 32.4679815698609 29.2616622365851 3.20631933327579 A:G A G 10 0.522529682796163 0.590404350987674 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 33409693 G/A 1 14 16 30 6.68458444085372 8.36047492473861 -1.67589048388489 A:G G A 10 0.522529682796163 0.586538190836893 ENSG00000116514:ENST00000373456:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000401899:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000356990:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000405457:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000235150:exon_33409620_33409760:RNF19B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 33790496 G/A 1 27 18 45 12.8916985645036 9.40553429033093 3.48616427417267 A:G G A 10 0.522529682796163 0.370822227936037 ENSG00000134686:ENST00000431992:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000419414:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000307890:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000361167:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000257118:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373422:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373418:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000485928:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000467894:exon_33790290_33790620:PHC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 35921764 G/C 1 6 14 20 2.86482190322302 7.31541555914628 -4.45059365592326 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0707120772788425 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000485551:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000335883:exon_35921614_35921842:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000440579:exon_35921614_35921842:KIAA0319L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 36557619 G/A 1 36 20 56 17.1889314193381 10.4505936559233 6.73833776341487 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0818650144881366 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36557511_36557695:ADPRHL2;ENSG00000116863:ENST00000468594:exon_36557511_36557695:ADPRHL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 36643685 C/A 1 30 36 66 14.3241095161151 18.8110685806619 -4.48695906454676 A:C C A 10 0.522529682796163 0.270931599083722 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373148:exon_36643474_36643802:MAP7D1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 36643783 C/T 1 23 41 64 10.9818172956883 21.4237169946427 -10.4418996989544 A:T:C C T 10 0.522529682796163 0.0117430063924784 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373148:exon_36643474_36643802:MAP7D1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 38148765 A/G 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 A:G A G 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000116922:ENST00000358011:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000494120:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000464178:exon_38148408_38148832:C1orf109 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 21 20 41 10.0268766612806 10.4505936559233 -0.423716994642682 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 40030823 C/T 1 195 165 360 93.1067118547482 86.2173976613669 6.88931419338134 A:T:C C T 10 0.522529682796163 0.492896452807813 ENSG00000090621:ENST00000441204:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372862:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372858:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372857:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372856:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000421687:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000525045:exon_40030778_40030905:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000527718:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000483770:exon_40030778_40030855:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000525669:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000470443:exon_40030778_40031050:PABPC4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 40315888 A/T 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:T A T 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000469476:exon_40315795_40315933:TRIT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 40349131 G/A 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 A:G G A 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40348990_40349145:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40348990_40349176:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40348990_40349183:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000491865:exon_40348990_40349152:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40348990_40349153:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40348990_40349147:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40348990_40349168:TRIT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 40705726 A/T 1 13 18 31 6.20711412364988 9.40553429033093 -3.19842016668105 A:T A T 10 0.522529682796163 0.283091271832841 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 40879808 G/C 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 C:G G C 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000084070:ENST00000487871:exon_40879649_40879912:SMAP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 40881041 C/G 1 89 119 208 42.4948582311415 62.1810322527434 -19.6861740216019 C:G C G 10 0.522529682796163 0.00671406214791785 ENSG00000084070:ENST00000435168:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000372718:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000372708:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000487871:exon_40880944_40881041:SMAP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 40980668 T/C 1 12 4 16 5.72964380644604 2.09011873118465 3.63952507526139 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0815537992618656 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000415550:exon_40980187_40980699:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 14 15 29 6.68458444085372 7.83794524194244 -1.15336080108873 T:C C T 10 0.522529682796163 0.712748058622428 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 41979156 A/G 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 A:G A G 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 42046613 G/T 1 15 11 26 7.16205475805756 5.74782651075779 1.41422824729976 T:G G T 10 0.522529682796163 0.695674855368122 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_42045408_42050989:HIVEP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 15 27 42 7.16205475805756 14.1083014354964 -6.94624667743884 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0433749425869528 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 43215930 C/T 1 7 11 18 3.34229222042686 5.74782651075779 -2.40553429033093 T:C C T 10 0.522529682796163 0.346003571297567 ENSG00000117385:ENST00000460031:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000495874:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000296388:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000431412:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000481465:exon_43215572_43216007:LEPRE1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 43395635 C/T 1 15 13 28 7.16205475805756 6.79288587635012 0.369168881707437 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43395544_43395646:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43395544_43395706:SLC2A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 43396414 G/A 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 A:G G A 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000475162:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43396297_43396611:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43395990_43396537:SLC2A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 43408966 G/A 1 21 12 33 10.0268766612806 6.27035619355396 3.75652046772662 A:G G A 10 0.522529682796163 0.223833280245822 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000415851:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43408897_43408992:SLC2A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 43824865 C/T 1 19 24 43 9.0719360268729 12.5407123871079 -3.46877636023501 A:T:C C T 10 0.522529682796163 0.359884023639214 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43824684_43825067:CDC20 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 45205598 T/C 1 9 2 11 4.29723285483453 1.04505936559233 3.25217348924221 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0683780529325207 ENSG00000142945:ENST00000452259:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000493027:exon_45205497_45205674:KIF2C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 45218895 A/T 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 A:T A T 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 45224998 A/C 1 24 34 58 11.4592876128921 17.7660092150695 -6.30672160217745 A:C A C 10 0.522529682796163 0.114402022129983 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45224878_45225020:KIF2C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 45226084 G/A 1 18 26 44 8.59446570966907 13.5857717527002 -4.99130604303117 A:G G A 10 0.522529682796163 0.173721697119302 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45225952_45226156:KIF2C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 45270024 G/C 1 14 16 30 6.68458444085372 8.36047492473861 -1.67589048388489 C:G G C 10 0.522529682796163 0.586538190836893 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45270011_45270451:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461769:exon_45270011_45270173:PLK3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 45444038 G/A 1 9 9 18 4.29723285483453 4.70276714516547 -0.405534290330934 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000480675:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000477953:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372182:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000487532:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000497010:exon_45443987_45444132:EIF2B3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 45476663 G/A 1 6 13 19 2.86482190322302 6.79288587635012 -3.9280639731271 A:T:G G A 10 0.522529682796163 0.105642831319947 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45476561_45477001:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45476561_45477027:HECTD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 45797505 C/G 1 7 13 20 3.34229222042686 6.79288587635012 -3.45059365592326 C:G C G 10 0.522529682796163 0.177936173075919 ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45797333_45797544:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45797333_45797755:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45797406_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45797419_45797758:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000466231:exon_45797442_45797521:MUTYH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 45808589 G/C 1 14 14 28 6.68458444085372 7.31541555914628 -0.630831118292562 C:G G C 10 0.522529682796163 0.85163607998196 ENSG00000132773:ENST00000372090:exon_45808515_45808674:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000471337:exon_45808407_45808650:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000495703:exon_45808407_45808674:TOE1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 45973928 G/A 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 A:G G A 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000132763:ENST00000401061:exon_45973884_45974036:MMACHC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 10 10 20 4.77470317203837 5.22529682796163 -0.45059365592326 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 59 30 89 28.1707487150264 15.6758904838849 12.4948582311415 A:G A G 10 0.522529682796163 0.00794528011049587 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 67 33 100 31.9905112526571 17.2434795322734 14.7470317203837 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00351356360089154 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 44 42 86 21.0086939569688 21.9462466774388 -0.937552720470013 A:G A G 10 0.522529682796163 0.91412721784246 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 47 42 89 22.4411049085803 21.9462466774388 0.494858231141496 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46159018 A/G 1 34 42 76 16.2339907849305 21.9462466774388 -5.71225589250838 A:G A G 10 0.522529682796163 0.20718797895843 ENSG00000159596:ENST00000372025:exon_46158876_46160115:TMEM69;ENSG00000159596:ENST00000496366:exon_46158876_46159517:TMEM69 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 A:G A G 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 11 6 17 5.25217348924221 3.13517809677698 2.11699539246523 A:G A G 10 0.522529682796163 0.340698354211182 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46521517 G/A 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46521559 A/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:T A T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46660295 T/C 1 12 11 23 5.72964380644604 5.74782651075779 -0.018182704311748 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000085998:ENST00000371984:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371992:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000396420:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371986:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000477114:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000497439:exon_46660254_46660323:POMGNT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46714242 A/G 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G A G 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000085999:ENST00000463715:exon_46714184_46714270:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000442598:exon_46714184_46714270:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000493985:exon_46714184_46714270:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000371975:exon_46714184_46714270:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000469835:exon_46714184_46714270:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000487700:exon_46714184_46714270:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000493032:exon_46714184_46714270:RAD54L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46806550 C/T 1 15 8 23 7.16205475805756 4.1802374623693 2.98181729568825 T:C C T 10 0.522529682796163 0.296627250051809 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46805849_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46806397_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46806461_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46806474_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46806492_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000472157:exon_46806501_46806591:NSUN4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46810670 T/C 1 22 16 38 10.5043469784844 8.36047492473861 2.14387205374581 T:C T C 10 0.522529682796163 0.519621537216951 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 46827485 C/T 1 32 21 53 15.2790501505228 10.9731233387194 4.30592681180336 T:C C T 10 0.522529682796163 0.271963911749009 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 47078637 T/C 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C T C 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000142961:ENST00000396291:exon_47078576_47079043:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000319928:exon_47078576_47079043:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000271139:exon_47078576_47079043:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000371940:exon_47078576_47082137:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000477318:exon_47078576_47079043:MOBKL2C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 16 16 32 7.63952507526139 8.36047492473861 -0.720949849477215 A:G A G 10 0.522529682796163 0.86046417845866 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 47726087 T/C 1 2 7 9 0.954940634407674 3.65770777957314 -2.70276714516547 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0963891685915122 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47725961_47726211:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47725961_47726211:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47725961_47726211:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47725961_47726211:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47725961_47726211:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47725961_47726211:STIL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 47799639 G/C 1 30 27 57 14.3241095161151 14.1083014354964 0.215808080618711 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47799481_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000471289:exon_47799551_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47799586_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47799613_47799788:CMPK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 51873951 G/A 1 33 33 66 15.7565204677266 17.2434795322734 -1.48695906454675 A:G G A 10 0.522529682796163 0.713941033994362 ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51873807_51874004:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51873807_51874004:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000493793:exon_51873807_51874004:EPS15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 41 54 95 19.5762830053573 28.2166028709928 -8.64031986563548 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0811054957975999 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 53153432 T/C 1 25 36 61 11.9367579300959 18.8110685806619 -6.87431065056594 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0950349426401468 ENSG00000162377:ENST00000371538:exon_53152508_53153840:C1orf163;ENSG00000162377:ENST00000486918:exon_53153234_53153840:C1orf163 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 53387379 G/C 1 13 4 17 6.20711412364988 2.09011873118465 4.11699539246523 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0528875086287521 ENSG00000121310:ENST00000460612:exon_53387225_53387434:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000358358:exon_53387225_53387398:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000476477:exon_53387225_53387446:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000467988:exon_53387225_53387390:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000495920:exon_53387225_53387386:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000474789:exon_53387225_53387393:ECHDC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 29 18 47 13.8466391989113 9.40553429033093 4.44110490858034 A:G G A 10 0.522529682796163 0.242573366356421 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 53679229 A/G 1 39 42 81 18.6213423709496 21.9462466774388 -3.3249043064892 A:G A G 10 0.522529682796163 0.505053545960147 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53678936_53679869:CPT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 53681699 T/G 1 42 49 91 20.0537533225612 25.603954457012 -5.55020113445083 T:G T G 10 0.522529682796163 0.25022813415573 ENSG00000162384:ENST00000294360:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000483739:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000470385:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000478839:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000371480:exon_53681663_53681728:C1orf123 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 53712727 C/T 1 16 10 26 7.63952507526139 5.22529682796163 2.41422824729976 T:C C T 10 0.522529682796163 0.433314383592609 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53711217_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53712628_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53712225_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53712240_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53712240_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53712630_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53712690_53712728:LRP8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 53716416 G/A 1 13 8 21 6.20711412364988 4.1802374623693 2.02687666128058 A:G G A 10 0.522529682796163 0.393482202967395 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 53732315 G/T 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 T:G G T 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000459674:exon_53732145_53734270:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000475501:exon_53732145_53732319:LRP8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 49 47 96 23.396045542988 24.5588950914197 -1.16284954843164 C:G G C 10 0.522529682796163 0.8385555671079 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 131 125 256 62.5486115537026 65.3162103495204 -2.76759879581773 C:G C G 10 0.522529682796163 0.754570993741040 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 55182300 T/A 1 10 10 20 4.77470317203837 5.22529682796163 -0.45059365592326 A:T T A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000486621:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55182273_55182390:TTC4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 58971831 G/A 1 6 9 15 2.86482190322302 4.70276714516547 -1.83794524194244 A:G G A 10 0.522529682796163 0.440567980680144 ENSG00000173406:ENST00000485760:exon_58971732_58971881:DAB1;ENSG00000162600:ENST00000467509:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000460671:exon_58971732_58971871:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58971732_58971881:OMA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 59142713 T/C 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C T C 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59142598_59142728:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59142598_59142728:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59142598_59142728:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000481973:exon_59142444_59142728:MYSM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 59147926 T/C 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 T:C T C 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59147457_59148217:MYSM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 62960101 A/G 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000116641:ENST00000371140:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000395441:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000251157:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000340370:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000454575:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000479983:exon_62959946_62960969:DOCK7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 65310489 T/C 1 15 10 25 7.16205475805756 5.22529682796163 1.93675793009593 T:C T C 10 0.522529682796163 0.549238895463454 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 70881670 C/T 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C C T 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70881639_70881720:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70881639_70881720:CTH;ENSG00000116761:ENST00000464926:exon_70881639_70881720:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70881639_70881720:CTH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 51 14 65 24.3509861773957 7.31541555914628 17.0355706182494 T:G G T 10 0.522529682796163 1.66574229485815e-05 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 75172001 T/A 1 87 35 122 41.5399175967338 18.2885388978657 23.2513786988681 A:T:G T A 10 0.522529682796163 2.47744283531923e-05 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000492102:exon_75171172_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75171174_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75171656_75172141:CRYZ HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 75190452 C/T 1 45 18 63 21.4861642741727 9.40553429033093 12.0806299838417 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00230932430862355 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75190395_75190518:CRYZ HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 78098403 T/C 1 3 9 12 1.43241095161151 4.70276714516547 -3.27035619355396 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0813542896879837 ENSG00000036549:ENST00000370801:exon_78097535_78099090:ZZZ3;ENSG00000036549:ENST00000476275:exon_78097535_78098561:ZZZ3;ENSG00000036549:ENST00000420374:exon_78097535_78099090:ZZZ3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 A:G A G 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 79093818 A/G 1 51 191 242 24.3509861773957 99.8031694140671 -75.4521832366714 A:G A G 10 0.522529682796163 3.04907474309464e-23 ENSG00000137959:ENST00000452835:exon_79093591_79093892:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 79094081 T/A 1 18 17 35 8.59446570966907 8.88300460753477 -0.288538897865704 A:T T A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 79095526 G/A 1 65 102 167 31.0355706182494 53.2980276452086 -22.2624570269592 A:G G A 10 0.522529682796163 0.000619436827808744 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 86173943 C/T 1 22 14 36 10.5043469784844 7.31541555914628 3.18893141933813 T:C C T 10 0.522529682796163 0.319698622060239 ENSG00000117174:ENST00000370574:exon_86173312_86174101:ZNHIT6;ENSG00000117174:ENST00000431532:exon_86173737_86173967:ZNHIT6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 89474818 A/G 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 A:G A G 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000461384:exon_89474527_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000445969:exon_89474618_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89474782_89474823:GBP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 89522646 G/C 1 28 6 34 13.3691688817074 3.13517809677698 10.2339907849305 C:G G C 10 0.522529682796163 0.000416867993222911 ENSG00000117228:ENST00000422952:exon_89522537_89522728:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89522537_89522817:GBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 89732237 G/A 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 A:G G A 10 0.522529682796163 0.568106121039098 ENSG00000154451:ENST00000481145:exon_89732029_89732262:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000343435:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000417291:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000370459:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000443807:exon_89732029_89732271:GBP5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 91403508 A/T 1 4 12 16 1.90988126881535 6.27035619355396 -4.36047492473861 A:T A T 10 0.522529682796163 0.0423626055068108 ENSG00000122482:ENST00000370440:exon_91403042_91403647:ZNF644;ENSG00000122482:ENST00000337393:exon_91403042_91403647:ZNF644 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 93306317 G/A 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.534231980874486 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 55 49 104 26.260867446211 25.603954457012 0.656912989199053 A:G G A 10 0.522529682796163 0.922068338190376 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C C T 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 93730416 G/A 1 3 7 10 1.43241095161151 3.65770777957314 -2.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.209802689107094 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000447456:exon_93730258_93730504:CCDC18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 93826178 A/T 1 28 32 60 13.3691688817074 16.7209498494772 -3.35178096776978 A:T A T 10 0.522529682796163 0.438632606342615 ENSG00000117505:ENST00000370272:exon_93826050_93828149:DR1;ENSG00000117505:ENST00000370267:exon_93826050_93826725:DR1;ENSG00000117505:ENST00000481583:exon_93826050_93826492:DR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 94343233 T/C 1 47 55 102 22.4411049085803 28.739132553789 -6.29802764520862 T:C T C 10 0.522529682796163 0.234461357544485 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94343029_94343439:DNTTIP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 94944082 A/C 1 3 10 13 1.43241095161151 5.22529682796163 -3.79288587635012 A:C A C 10 0.522529682796163 0.0492990438494871 ENSG00000117528:ENST00000315713:exon_94944080_94944279:ABCD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 100336361 C/T 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100336314_100336425:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100336314_100336425:AGL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 100715348 C/A 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 A:C C A 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000137992:ENST00000370132:exon_100715326_100715390:DBT;ENSG00000137992:ENST00000370131:exon_100715326_100715376:DBT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 101704532 G/T 1 23 22 45 10.9818172956883 11.4956530215156 -0.513835725827333 T:G G T 10 0.522529682796163 0.882699624435944 ENSG00000170989:ENST00000305352:exon_101704378_101707074:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000424264:exon_101704378_101705491:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475821:exon_101704378_101705075:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475289:exon_101704378_101704720:S1PR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 107599918 C/T 1 3 10 13 1.43241095161151 5.22529682796163 -3.79288587635012 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0492990438494871 ENSG00000198890:ENST00000370078:exon_107599301_107601916:PRMT6;ENSG00000198890:ENST00000361318:exon_107599319_107601663:PRMT6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 107600279 G/A 1 11 11 22 5.25217348924221 5.74782651075779 -0.495653021515585 A:G G A 10 0.522529682796163 0.835008349106383 ENSG00000198890:ENST00000370078:exon_107599301_107601916:PRMT6;ENSG00000198890:ENST00000361318:exon_107599319_107601663:PRMT6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 109482304 G/A 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 A:G G A 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109482258_109482404:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109482258_109482404:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369969:exon_109482258_109482404:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109482258_109482404:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369968:exon_109482258_109482404:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109482258_109482404:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000482889:exon_109482258_109482404:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109482258_109482404:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000348264:exon_109482258_109482404:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000302500:exon_109482258_109482404:CLCC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 109486196 A/G 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 A:G A G 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369976:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000482889:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369972:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109486097_109486237:CLCC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 109486594 T/C 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C T C 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109486458_109486679:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109486458_109486679:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109486458_109486679:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369976:exon_109486458_109486679:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369972:exon_109486458_109486679:CLCC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 34 27 61 16.2339907849305 14.1083014354964 2.12568934943406 T:C T C 10 0.522529682796163 0.610369534296766 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 27 19 46 12.8916985645036 9.9280639731271 2.9636345913765 A:C C A 10 0.522529682796163 0.460986550916598 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/T 1 191 23 214 91.1968305859329 12.0181827043117 79.1786478816211 T:C C T 10 0.522529682796163 4.35269297492385e-31 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 111991768 G/A 1 15 14 29 7.16205475805756 7.31541555914628 -0.153360801088725 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000116455:ENST00000235090:exon_111991677_111991998:WDR77;ENSG00000116455:ENST00000411751:exon_111991677_111991878:WDR77;ENSG00000116455:ENST00000421211:exon_111991677_111991878:WDR77;ENSG00000116459:ENST00000369722:exon_111991558_111992203:ATP5F1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 113236681 C/T 1 13 14 27 6.20711412364988 7.31541555914628 -1.1083014354964 T:C C T 10 0.522529682796163 0.703625443243212 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113236527_113236794:MOV10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 9 13 22 4.29723285483453 6.79288587635012 -2.49565302151559 A:G A G 10 0.522529682796163 0.296166428569315 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 113239382 G/A 1 23 13 36 10.9818172956883 6.79288587635012 4.18893141933813 A:G G A 10 0.522529682796163 0.183708341091536 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113239361_113239468:MOV10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 25 22 47 11.9367579300959 11.4956530215156 0.441104908580341 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 44 29 73 21.0086939569688 15.1533608010887 5.85533315588011 T:C C T 10 0.522529682796163 0.197439330401913 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 114301335 C/T 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114301281_114301470:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000446739:exon_114301281_114301780:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000493212:exon_114301281_114302111:PHTF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 114354654 T/C 1 8 14 22 3.8197625376307 7.31541555914628 -3.49565302151558 T:C T C 10 0.522529682796163 0.142300185361340 ENSG00000081019:ENST00000261441:exon_114354332_114355098:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000434941:exon_114354332_114354662:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000476412:exon_114354332_114354915:RSBN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 114443899 G/A 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000484201:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369564:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000489092:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369571:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000472122:exon_114443858_114444005:AP4B1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 114448389 C/T 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 T:C C T 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114447763_114448397:DCLRE1B;ENSG00000118655:ENST00000466480:exon_114448031_114448397:DCLRE1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 114515717 G/A 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 A:G G A 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000163349:ENST00000426820:exon_114515646_114516270:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000468363:exon_114515646_114516270:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369554:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000443627:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000411639:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369555:exon_114515646_114516503:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369558:exon_114515646_114520426:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369561:exon_114515646_114516193:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000340480:exon_114515646_114520426:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369553:exon_114515646_114516503:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000406344:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000361587:exon_114515646_114520426:HIPK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 114973429 T/C 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 T:C T C 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114973420_114973534:TRIM33 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 115280605 A/C 1 138 138 276 65.8909037741295 72.1090962258705 -6.21819245174098 A:C A C 10 0.522529682796163 0.469935956821893 ENSG00000009307:ENST00000339438:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000438362:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000358528:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369533:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000261443:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000530886:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369530:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000534699:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000529046:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000525132:exon_115280584_115280693:CSDE1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 116931628 C/A 1 132 126 258 63.0260818709065 65.8387400323165 -2.81265816141005 A:C C A 10 0.522529682796163 0.755461445207607 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000445896:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000491156:exon_116931524_116931641:ATP1A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 116947051 G/A 1 246 271 517 117.457698032144 141.60554403776 -24.1478460056162 A:T:G G A 10 0.522529682796163 0.0345760306232144 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116947038_116947394:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116947038_116947396:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116947038_116947396:ATP1A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 118483474 C/G 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118483450_118483563:WDR3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 118491102 G/A 1 10 7 17 4.77470317203837 3.65770777957314 1.11699539246523 A:G G A 10 0.522529682796163 0.63504130808849 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118491028_118491129:WDR3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 118495153 T/G 1 18 19 37 8.59446570966907 9.9280639731271 -1.33359826345803 T:G T G 10 0.522529682796163 0.74284768069353 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118495151_118495285:WDR3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 32 18 50 15.2790501505228 9.40553429033093 5.87351586019185 A:G G A 10 0.522529682796163 0.118791683658829 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 144931330 C/T 1 11 1 12 5.25217348924221 0.522529682796163 4.72964380644604 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00694152157969735 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 89 89 0 46.5051417688585 -46.5051417688585 C T C 10 0.522529682796163 2.66825694109449e-29 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 1 1 39 40 0.477470317203837 20.3786576290504 -19.9011873118465 T:G G T 10 0.522529682796163 1.17420358466584e-11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 39 39 0 20.3786576290504 -20.3786576290504 A C A 10 0.522529682796163 3.01237298762019e-13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 88 0 88 42.0173879139377 0 42.0173879139377 G G 10 0.522529682796163 1.61667902074628e-25 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 69 69 0 36.0545481129352 -36.0545481129352 C T C 10 0.522529682796163 7.035582930129e-23 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 97 97 0 50.6853792312278 -50.6853792312278 T C T 10 0.522529682796163 7.20773269995932e-32 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 118 0 118 56.3414974300528 0 56.3414974300528 C C 10 0.522529682796163 6.55479024303762e-34 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 146714427 G/C 1 2 7 9 0.954940634407674 3.65770777957314 -2.70276714516547 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0963891685915122 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000492728:exon_146714396_146714480:CHD1L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 146759320 C/G 1 30 29 59 14.3241095161151 15.1533608010887 -0.829251284973614 C:G C G 10 0.522529682796163 0.896533552092361 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146759314_146759412:CHD1L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 150443168 G/A 1 6 8 14 2.86482190322302 4.1802374623693 -1.31541555914628 A:G G A 10 0.522529682796163 0.595734183488216 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 150445819 A/G 1 11 15 26 5.25217348924221 7.83794524194244 -2.58577175270024 A:G A G 10 0.522529682796163 0.332278501659484 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 150471157 T/A 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 A:T T A 10 0.522529682796163 0.250581192216089 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 151006537 G/A 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_151006282_151007683:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_151006282_151006589:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_151006282_151008187:PRUNE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 151006539 C/A 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 A:C C A 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_151006282_151007683:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_151006282_151006589:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_151006282_151008187:PRUNE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 151026815 C/T 1 13 15 28 6.20711412364988 7.83794524194244 -1.63083111829256 T:C C T 10 0.522529682796163 0.574460764427649 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 151209063 C/T 1 14 10 24 6.68458444085372 5.22529682796163 1.45928761289209 T:C C T 10 0.522529682796163 0.683803771305971 ENSG00000143398:ENST00000414290:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000464105:exon_151209034_151209223:PIP5K1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 201 210 411 95.9715337579712 109.731233387194 -13.759699629223 A:T:C T C 10 0.522529682796163 0.182521600052812 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 151259043 C/T 1 14 9 23 6.68458444085372 4.70276714516547 1.98181729568825 T:C C T 10 0.522529682796163 0.532235624487875 ENSG00000143373:ENST00000443959:exon_151258751_151259181:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000528005:exon_151258751_151259181:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 151259543 G/A 1 10 15 25 4.77470317203837 7.83794524194244 -3.06324206990407 A:G G A 10 0.522529682796163 0.235738342127358 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 29 21 50 13.8466391989113 10.9731233387194 2.87351586019185 A:G G A 10 0.522529682796163 0.479803941653865 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 151374025 T/C 1 233 188 421 111.250583908494 98.2355803656786 13.0150035428154 A:T:C T C 10 0.522529682796163 0.205110756209187 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151374018_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151374018_151374410:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151373715_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000466425:exon_151374018_151374106:PSMB4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 27 39 66 12.8916985645036 20.3786576290504 -7.48695906454676 A:C A C 10 0.522529682796163 0.0837393722855712 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 153921054 C/T 1 37 33 70 17.666401736542 17.2434795322734 0.422922204268595 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920934_153921120:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920934_153921120:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920934_153921120:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920934_153921120:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920934_153921120:CRTC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 154247435 G/A 1 142 159 301 67.8007850429449 83.0822195645899 -15.2814345216451 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0833908431316268 ENSG00000143575:ENST00000328703:exon_154247426_154247477:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000457918:exon_154247426_154247477:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000483970:exon_154247426_154247477:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000447768:exon_154247426_154247477:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000531435:exon_154247426_154247477:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000477780:exon_154247426_154247748:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000453365:exon_154247426_154247477:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000435087:exon_154247426_154247477:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000532105:exon_154247426_154247477:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000471326:exon_154247426_154247477:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000492550:exon_154247426_154247477:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000459914:exon_154247426_154247736:HAX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 154938797 A/G 1 17 14 31 8.11699539246523 7.31541555914628 0.801579833318948 A:G A G 10 0.522529682796163 0.858135513379526 ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154938795_154938993:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154938795_154938993:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368449:exon_154938795_154938993:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154938795_154938993:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154938795_154938993:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154938795_154938993:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154938795_154938993:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154938795_154938993:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444664:exon_154938795_154938966:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368441:exon_154938795_154938993:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000414115:exon_154938795_154938993:SHC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 154941263 G/A 1 11 12 23 5.25217348924221 6.27035619355396 -1.01818270431175 A:G G A 10 0.522529682796163 0.682750321629788 ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154941247_154941310:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154941247_154941310:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154941247_154941310:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154941247_154941310:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154941247_154941310:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154941247_154941310:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154941247_154941310:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368441:exon_154941247_154941310:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000414115:exon_154941247_154941369:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444179:exon_154941247_154941350:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000412170:exon_154941247_154941310:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000366442:exon_154941247_154941310:SHC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 155110158 T/A 1 19 21 40 9.0719360268729 10.9731233387194 -1.90118731184652 A:T T A 10 0.522529682796163 0.63557898252467 ENSG00000169241:ENST00000484157:exon_155110037_155110198:RAG1AP1;ENSG00000169241:ENST00000490770:exon_155110055_155110198:RAG1AP1;ENSG00000169241:ENST00000475824:exon_155110037_155110198:RAG1AP1;ENSG00000169241:ENST00000490276:exon_155110037_155110198:RAG1AP1;ENSG00000169241:ENST00000368404:exon_155110037_155110198:RAG1AP1;ENSG00000169241:ENST00000368401:exon_155110037_155110198:RAG1AP1;ENSG00000169241:ENST00000488609:exon_155110037_155110198:RAG1AP1;ENSG00000169241:ENST00000303332:exon_155110037_155110198:RAG1AP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 156144971 G/A 1 19 21 40 9.0719360268729 10.9731233387194 -1.90118731184652 A:G G A 10 0.522529682796163 0.63557898252467 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156144877_156145034:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156144877_156145034:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156144877_156145034:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156144877_156145034:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156144877_156145034:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156144877_156145034:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000487358:exon_156144877_156145023:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000462892:exon_156144877_156145034:SEMA4A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 156206121 G/A 1 56 47 103 26.7383377634149 24.5588950914197 2.17944267199521 A:G G A 10 0.522529682796163 0.694046302405661 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156206079_156206274:PMF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 156206205 C/T 1 45 43 88 21.4861642741727 22.468776360235 -0.982612086062343 T:C C T 10 0.522529682796163 0.832072169366896 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368279:exon_156206140_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368276:exon_156206140_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156206079_156206274:PMF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 156213701 C/A 1 10 9 19 4.77470317203837 4.70276714516547 0.071936026872903 A:C C A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000160781:ENST00000292291:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000492619:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000360733:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000335852:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000356983:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368271:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000340183:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000491107:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368270:exon_156213214_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000468632:exon_156213214_156214194:PAQR6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 156233189 C/T 1 17 18 35 8.11699539246523 9.40553429033093 -1.2885388978657 T:C C T 10 0.522529682796163 0.736128234715988 ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156233186_156233361:SMG5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 156263940 T/C 1 9 3 12 4.29723285483453 1.56758904838849 2.72964380644604 T:C T C 10 0.522529682796163 0.150898424576211 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 156264000 G/A 1 20 18 38 9.54940634407674 9.40553429033093 0.143872053745806 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 156278968 T/G 1 145 125 270 69.2331959945564 65.3162103495204 3.91698564503599 T:G T G 10 0.522529682796163 0.669890739027513 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156278752_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000465714:exon_156278759_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156278759_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156278759_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156278760_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156278760_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000480049:exon_156278783_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156278805_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156278956_156279094:CCT3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 156280969 G/A 1 251 129 380 119.845049618163 67.406329080705 52.4387205374581 A:G G A 10 0.522529682796163 5.88632766180865e-08 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 156280971 G/A 1 248 132 380 118.412638666552 68.9739181290935 49.4387205374581 A:G G A 10 0.522529682796163 3.25452076963280e-07 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156280741_156280986:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156280741_156280986:CCT3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 156446903 T/C 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 T:C T C 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000353795:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000340875:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000454816:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000493077:exon_156446721_156446994:MEF2D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 19 13 32 9.0719360268729 6.79288587635012 2.27905015052278 A:G G A 10 0.522529682796163 0.481230502871409 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 16 21 37 7.63952507526139 10.9731233387194 -3.33359826345803 A:G G A 10 0.522529682796163 0.324096827995904 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 157497597 C/T 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 T:C:G C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157497407_157497685:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157497407_157498459:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157497407_157497685:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157497407_157497641:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157497407_157497685:FCRL5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 157508882 C/T 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 T:C C T 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 157509025 C/T 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 133 121 254 63.5035521881103 63.2260916183357 0.277460569774611 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 82 74 156 39.1525660107146 38.6671965269161 0.485369483798578 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 60 57 117 28.6482190322302 29.7841919193813 -1.13597288715107 A:C C A 10 0.522529682796163 0.853548415709795 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 57 48 105 27.2158080806187 25.0814247742158 2.13438330640289 A:T T A 10 0.522529682796163 0.696992397245979 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 159024668 A/T 1 245 228 473 116.98022771494 119.136767677525 -2.15653996258509 A:T A T 10 0.522529682796163 0.854016822856277 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159024611_159024945:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159024611_159024918:IFI16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 160275229 G/A 1 76 80 156 36.2877441074916 41.802374623693 -5.51463051620143 A:G G A 10 0.522529682796163 0.379391176042923 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160275223_160275388:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160275223_160275361:COPA;ENSG00000122218:ENST00000481522:exon_160275021_160275361:COPA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 22 22 44 10.5043469784844 11.4956530215156 -0.99130604303117 A:G G A 10 0.522529682796163 0.76562812350394 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 160461060 C/T 1 22 22 44 10.5043469784844 11.4956530215156 -0.99130604303117 T:C C T 10 0.522529682796163 0.76562812350394 ENSG00000162739:ENST00000368059:exon_160460915_160461178:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368057:exon_160460915_160461178:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368055:exon_160460915_160461178:SLAMF6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 160793442 A/G 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 A:G A G 10 0.522529682796163 0.393562228098845 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 160793560 A/G 1 10 4 14 4.77470317203837 2.09011873118465 2.68458444085372 A:G A G 10 0.522529682796163 0.185755143276423 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 161023073 C/T 1 58 55 113 27.6932783978225 28.739132553789 -1.04585415596641 T:C C T 10 0.522529682796163 0.851203425487515 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161022416_161023175:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161023048_161023175:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161023048_161023175:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161023048_161023175:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161023048_161023175:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161023048_161023175:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000417117:exon_161022980_161023175:ARHGAP30 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 161145612 C/T 1 23 21 44 10.9818172956883 10.9731233387194 0.00869395696883046 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000158850:ENST00000319769:exon_161145598_161145864:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000470882:exon_161145598_161147210:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000407555:exon_161145598_161145745:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000310413:exon_161145598_161145864:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367998:exon_161145598_161145885:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367997:exon_161145598_161145864:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000466504:exon_161145598_161145683:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000465740:exon_161145598_161145946:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000493164:exon_161145598_161145864:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000496313:exon_161145598_161145885:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000487004:exon_161145598_161145885:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000482288:exon_161145598_161145864:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000460415:exon_161145598_161145885:B4GALT3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 71 60 131 33.9003925214724 31.3517809677698 2.54861155370265 A:G A G 10 0.522529682796163 0.663136644694022 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 101 98 199 48.2245020375875 51.207908914024 -2.98340687643643 A:G G A 10 0.522529682796163 0.671151610765248 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 161721707 C/T 1 12 14 26 5.72964380644604 7.31541555914628 -1.58577175270024 T:C C T 10 0.522529682796163 0.561386502703927 ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 161722204 C/T 1 20 14 34 9.54940634407674 7.31541555914628 2.23399078493046 T:C C T 10 0.522529682796163 0.494919628726952 ENSG00000081721:ENST00000484291:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000463365:exon_161722189_161722254:DUSP12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 161751741 A/G 1 9 8 17 4.29723285483453 4.1802374623693 0.116995392465229 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161751702_161751789:ATF6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 165667781 T/G 1 13 8 21 6.20711412364988 4.1802374623693 2.02687666128058 T:G T G 10 0.522529682796163 0.393482202967395 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165667615_165668100:ALDH9A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 166818566 A/G 1 18 19 37 8.59446570966907 9.9280639731271 -1.33359826345803 A:G A G 10 0.522529682796163 0.74284768069353 ENSG00000143157:ENST00000367876:exon_166818175_166819660:POGK;ENSG00000143157:ENST00000367875:exon_166818175_166823710:POGK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 53 50 103 25.3059268118034 26.1264841398081 -0.820557328004785 A:G G A 10 0.522529682796163 0.921529896726993 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 167973976 C/T 1 27 34 61 12.8916985645036 17.7660092150695 -4.87431065056594 T:C C T 10 0.522529682796163 0.248693640025992 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000470721:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_167973771_167974031:DCAF6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 168013850 T/C 1 30 25 55 14.3241095161151 13.0632420699041 1.26086744621104 T:C T C 10 0.522529682796163 0.788002591598577 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168013823_168013909:DCAF6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 169676486 A/G 1 18 10 28 8.59446570966907 5.22529682796163 3.36916888170744 A:G A G 10 0.522529682796163 0.256699726213295 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169676483_169676590:SELL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 169823660 C/T 1 16 13 29 7.63952507526139 6.79288587635012 0.846639198911274 T:C C T 10 0.522529682796163 0.853261309241005 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 169823718 T/C 1 14 10 24 6.68458444085372 5.22529682796163 1.45928761289209 T:C T C 10 0.522529682796163 0.683803771305971 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 169951997 C/T 1 8 18 26 3.8197625376307 9.40553429033093 -5.58577175270024 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0311966047479063 ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 170521376 G/A 1 17 15 32 8.11699539246523 7.83794524194244 0.279050150522785 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000120370:ENST00000367763:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498166:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000464798:exon_170521156_170522974:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498600:exon_170521156_170522583:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000475113:exon_170521156_170521417:GORAB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 27 18 45 12.8916985645036 9.40553429033093 3.48616427417267 T:C T C 10 0.522529682796163 0.370822227936037 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 20 27 47 9.54940634407674 14.1083014354964 -4.55889509141966 A:G A G 10 0.522529682796163 0.191752679623454 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 14 23 37 6.68458444085372 12.0181827043117 -5.33359826345803 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0990152020047615 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 21 18 39 10.0268766612806 9.40553429033093 0.621342370949645 A:G G A 10 0.522529682796163 0.873943181511761 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 11 9 20 5.25217348924221 4.70276714516547 0.549406344076741 T:C T C 10 0.522529682796163 0.827347849665529 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 172558524 A/G 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 A:G A G 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000094975:ENST00000367723:exon_172557900_172559066:C1orf9;ENSG00000094975:ENST00000392073:exon_172557900_172559066:C1orf9;ENSG00000094975:ENST00000263688:exon_172557900_172559066:C1orf9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 122 105 227 58.2513786988681 54.8656166935971 3.385762005271 T:C C T 10 0.522529682796163 0.690297388019584 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 173743555 C/T 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 T:C C T 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000076321:ENST00000209884:exon_173743444_173743577:KLHL20 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 179051300 T/C 1 48 46 94 22.9185752257842 24.0363654086235 -1.11779018283932 T:C T C 10 0.522529682796163 0.83698428087113 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179050512_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000367625:exon_179051205_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179051213_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179051221_179051522:TOR3A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 179310262 C/T 1 17 6 23 8.11699539246523 3.13517809677698 4.98181729568825 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0578950473537175 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 179312752 C/T 1 3 7 10 1.43241095161151 3.65770777957314 -2.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 0.209802689107094 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179312725_179312770:SOAT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 179319541 C/G 1 11 12 23 5.25217348924221 6.27035619355396 -1.01818270431175 C:G C G 10 0.522529682796163 0.682750321629788 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179319431_179319566:SOAT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 179320578 A/G 1 26 24 50 12.4142282472998 12.5407123871079 -0.126484139808149 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179320452_179320597:SOAT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 180063526 T/C 1 22 12 34 10.5043469784844 6.27035619355396 4.23399078493046 T:C T C 10 0.522529682796163 0.170625176329978 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000429851:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490141:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000417046:exon_180062849_180063751:CEP350 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 180165699 A/C 1 18 15 33 8.59446570966907 7.83794524194244 0.756520467726622 A:C A C 10 0.522529682796163 0.862587560743927 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180165397_180165734:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180165397_180173165:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180165397_180165734:QSOX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 183072701 C/T 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:C C T 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183072463_183072767:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000484114:exon_183072462_183072767:LAMC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 183099560 G/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G G A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183099479_183099684:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000478064:exon_183099479_183099684:LAMC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 10 14 24 4.77470317203837 7.31541555914628 -2.54071238710791 A:G G A 10 0.522529682796163 0.314811911172675 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 183876182 C/T 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 T:C C T 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000143344:ENST00000304685:exon_183876146_183876235:RGL1;ENSG00000143344:ENST00000367531:exon_183876146_183876235:RGL1;ENSG00000143344:ENST00000360851:exon_183876146_183876235:RGL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 184023529 A/C 1 12 11 23 5.72964380644604 5.74782651075779 -0.018182704311748 A:C A C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000457455:exon_184023495_184023569:TSEN15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 184663581 T/C 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 T:C T C 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184663178_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184659637_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184663197_184663606:EDEM3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 184677464 G/A 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184677287_184677478:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184677287_184677478:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184677287_184677478:EDEM3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 185267114 A/G 1 41 68 109 19.5762830053573 35.5320184301391 -15.9557354247818 A:G A G 10 0.522529682796163 0.00278784753912586 ENSG00000116679:ENST00000367498:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000480769:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000459929:exon_185266147_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000475046:exon_185266903_185267420:IVNS1ABP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 186316488 C/T 1 24 11 35 11.4592876128921 5.74782651075779 5.7114611021343 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0623845704149827 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186316424_186316590:TPR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 192545099 G/A 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 A:G G A 10 0.522529682796163 0.408632555469948 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 197070776 C/T 1 5 12 17 2.38735158601918 6.27035619355396 -3.88300460753477 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0867299489543397 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 197094030 C/T 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 T:C C T 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197094000_197094085:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000294732:exon_197094000_197094085:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367408:exon_197094000_197094085:ASPM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 200522621 G/A 1 12 6 18 5.72964380644604 3.13517809677698 2.59446570966907 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.246476394158893 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200520628_200522895:KIF14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 200534248 C/T 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C C T 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200534197_200534381:KIF14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 200558363 T/C 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C T C 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200558345_200558497:KIF14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 200635550 T/C 1 18 15 33 8.59446570966907 7.83794524194244 0.756520467726622 T:C T C 10 0.522529682796163 0.862587560743927 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 200635560 T/C 1 20 18 38 9.54940634407674 9.40553429033093 0.143872053745806 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 200867492 C/G 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000163362:ENST00000532631:exon_200867435_200867583:C1orf106;ENSG00000163362:ENST00000367342:exon_200867435_200867583:C1orf106;ENSG00000163362:ENST00000413687:exon_200867435_200867583:C1orf106 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 200877977 G/A 1 11 8 19 5.25217348924221 4.1802374623693 1.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.653993185631586 ENSG00000163362:ENST00000367342:exon_200877858_200878068:C1orf106;ENSG00000163362:ENST00000413687:exon_200877858_200878068:C1orf106;ENSG00000163362:ENST00000526172:exon_200877858_200878068:C1orf106 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 200880869 A/C 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 A:C A C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000163362:ENST00000367342:exon_200880581_200881265:C1orf106;ENSG00000163362:ENST00000413687:exon_200880581_200881265:C1orf106 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 201458080 T/C 1 19 27 46 9.0719360268729 14.1083014354964 -5.0363654086235 T:C T C 10 0.522529682796163 0.142745156742737 ENSG00000159176:ENST00000367306:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000533402:exon_201454411_201461627:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000527662:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000532313:exon_201454411_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000340006:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000531916:exon_201458001_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000532460:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000533432:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000530120:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000526723:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000524951:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000458271:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000527573:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000529975:exon_201457983_201458112:CSRP1;ENSG00000159176:ENST00000533188:exon_201457755_201458112:CSRP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 201844057 T/C 1 17 21 38 8.11699539246523 10.9731233387194 -2.85612794625419 T:C T C 10 0.522529682796163 0.417593957491987 ENSG00000198700:ENST00000361565:exon_201843960_201844064:IPO9;ENSG00000198700:ENST00000456707:exon_201843960_201844064:IPO9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 201934578 G/A 1 42 41 83 20.0537533225612 21.4237169946427 -1.36996367208152 A:G G A 10 0.522529682796163 0.82627713482199 ENSG00000134375:ENST00000367287:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000478378:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000482943:exon_201934561_201934671:TIMM17A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 201965329 C/T 1 20 19 39 9.54940634407674 9.9280639731271 -0.378657629050357 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201965275_201965391:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201965275_201965391:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000487116:exon_201965275_201965391:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201965275_201965391:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201965275_201965537:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201965275_201965391:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201965275_201965391:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479726:exon_201965275_201965537:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201965275_201965391:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000449524:exon_201965300_201965391:RNPEP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 41 30 71 19.5762830053573 15.6758904838849 3.90039252147243 A:T:G G A 10 0.522529682796163 0.405996498567300 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 25 35 60 11.9367579300959 18.2885388978657 -6.35178096776978 A:G G A 10 0.522529682796163 0.120484469436452 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 12 14 26 5.72964380644604 7.31541555914628 -1.58577175270024 T:C T C 10 0.522529682796163 0.561386502703927 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 205589574 C/T 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 207269919 C/T 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 T:C C T 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000123843:ENST00000367078:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000391924:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000452902:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000243611:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000367076:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000391923:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000469326:exon_207268279_207269960:C4BPB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 209933528 G/A 1 20 17 37 9.54940634407674 8.88300460753477 0.666401736541969 A:G G A 10 0.522529682796163 0.870447919793445 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 39 27 66 18.6213423709496 14.1083014354964 4.51304093545324 T:C T C 10 0.522529682796163 0.324287960215613 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 212985592 G/A 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000203705:ENST00000532324:exon_212985569_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000366974:exon_212985590_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000526641:exon_212985590_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000531963:exon_212985569_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000533650:exon_212985590_212985624:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000525574:exon_212985590_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000527693:exon_212985590_212985670:TATDN3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 212988540 G/C 1 15 7 22 7.16205475805756 3.65770777957314 3.50434697848442 A:C:G G C 10 0.522529682796163 0.199333101930616 ENSG00000203705:ENST00000532324:exon_212988355_212988939:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000366974:exon_212988355_212989968:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000526641:exon_212988355_212988757:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000531963:exon_212988389_212988939:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000366973:exon_212988355_212989959:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000526997:exon_212988355_212988567:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000525574:exon_212988355_212989968:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000527693:exon_212988355_212989186:TATDN3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 14 11 25 6.68458444085372 5.74782651075779 0.936757930095927 T:C C T 10 0.522529682796163 0.841937992643628 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 214787130 G/A 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000464322:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000495259:exon_214787057_214787236:CENPF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 214814571 C/T 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 214820099 A/G 1 29 29 58 13.8466391989113 15.1533608010887 -1.30672160217745 A:G A G 10 0.522529682796163 0.793121183688861 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 16 12 28 7.63952507526139 6.27035619355396 1.36916888170744 A:G G A 10 0.522529682796163 0.706382469889948 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 30 25 55 14.3241095161151 13.0632420699041 1.26086744621104 A:G A G 10 0.522529682796163 0.788002591598577 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 214837110 C/G 1 33 26 59 15.7565204677266 13.5857717527002 2.17074871502638 C:G C G 10 0.522529682796163 0.604042804545608 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 220156704 T/C 1 45 41 86 21.4861642741727 21.4237169946427 0.0624472795299837 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220156531_220156740:EPRS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 220156729 C/T 1 60 54 114 28.6482190322302 28.2166028709928 0.431616161237422 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220156531_220156740:EPRS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 220162004 C/T 1 53 39 92 25.3059268118034 20.3786576290504 4.92726918275301 T:C C T 10 0.522529682796163 0.347729137339241 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220161932_220162165:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220161932_220162165:EPRS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 220928313 T/C 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 T:C T C 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000117791:ENST00000469583:exon_220928289_220928402:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220928289_220928462:MOSC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 220928334 A/G 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 A:G A G 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000117791:ENST00000469583:exon_220928289_220928402:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220928314_220928462:MOSC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 220928376 T/C 1 4 12 16 1.90988126881535 6.27035619355396 -4.36047492473861 T:C:G T C 10 0.522529682796163 0.0423626055068108 ENSG00000117791:ENST00000469583:exon_220928289_220928402:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220928314_220928462:MOSC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 220936372 G/A 1 7 10 17 3.34229222042686 5.22529682796163 -1.88300460753477 A:G G A 10 0.522529682796163 0.468082532065744 ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220936252_220936392:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220936252_220936392:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220936252_220936392:MOSC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 220955168 A/G 1 21 20 41 10.0268766612806 10.4505936559233 -0.423716994642682 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220955120_220955274:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000472447:exon_220955120_220955274:MOSC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 222833538 C/G 1 16 24 40 7.63952507526139 12.5407123871079 -4.90118731184652 C:G C G 10 0.522529682796163 0.153601482866593 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000340535:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000284471:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000475451:exon_222833519_222833656:MIA3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 223905532 G/A 1 1 7 8 0.477470317203837 3.65770777957314 -3.1802374623693 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0319085925070315 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223905464_223905533:CAPN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 223933094 C/T 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 T:C C T 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223933008_223933141:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223933008_223933141:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223933008_223933141:CAPN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 224492746 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000143748:ENST00000281701:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000391875:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000469968:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000340871:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000361463:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000469075:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000482491:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000467882:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000492281:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000488718:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000436927:exon_224492736_224492868:NVL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 224495852 C/T 1 8 11 19 3.8197625376307 5.74782651075779 -1.9280639731271 T:C C T 10 0.522529682796163 0.492106910577732 ENSG00000143748:ENST00000281701:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000391875:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000361463:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000467882:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000492281:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000436927:exon_224495693_224495919:NVL;ENSG00000143748:ENST00000470903:exon_224495688_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000461466:exon_224495695_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000498767:exon_224495710_224495965:NVL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 226033030 G/C 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 C:G G C 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226032847_226033260:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226032847_226033260:EPHX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 226034774 C/T 1 3 8 11 1.43241095161151 4.1802374623693 -2.74782651075779 T:C C T 10 0.522529682796163 0.131967912623333 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226034735_226034914:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000496025:exon_226034735_226035166:TMEM63A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 226048680 T/C 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226048560_226048697:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000474478:exon_226047363_226050051:TMEM63A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 14 22 36 6.68458444085372 11.4956530215156 -4.81106858066187 T:G T G 10 0.522529682796163 0.132820322993118 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 226555302 A/G 1 126 115 241 60.1612599676835 60.0909135215587 0.0703464461247236 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226555181_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226555181_226555309:PARP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 226570840 T/C 1 102 117 219 48.7019723547914 61.1359728871511 -12.4340005323597 T:C T C 10 0.522529682796163 0.104295189917152 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 108 100 208 51.5667942580144 52.2529682796163 -0.6861740216019 A:G G A 10 0.522529682796163 0.944731822758566 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 226595647 C/G 1 47 46 93 22.4411049085803 24.0363654086235 -1.59526050004316 C:G C G 10 0.522529682796163 0.756429140200735 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 227069737 C/T 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 T:C C T 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227069589_227069749:PSEN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 227077809 C/T 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000460775:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227077736_227077834:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000472139:exon_227077736_227077834:PSEN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 227923195 C/T 1 3 12 15 1.43241095161151 6.27035619355396 -4.83794524194244 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0173534416682307 ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227922697_227923200:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000418653:exon_227923132_227923200:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227923137_227923200:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227923154_227923200:SNAP47 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 227935762 G/A 1 16 12 28 7.63952507526139 6.27035619355396 1.36916888170744 A:G G A 10 0.522529682796163 0.706382469889948 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 228588680 A/C 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 A:C A C 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228588665_228588895:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228588640_228588892:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000366699:exon_228588665_228588895:TRIM11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 229461024 C/T 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C C T 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000154429:ENST00000366687:exon_229456758_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000284617:exon_229456763_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000366686:exon_229457262_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000483092:exon_229459286_229461158:C1orf96 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 229738170 T/G 1 16 11 27 7.63952507526139 5.74782651075779 1.8916985645036 T:G T G 10 0.522529682796163 0.564634669250498 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 229772693 T/G 1 10 7 17 4.77470317203837 3.65770777957314 1.11699539246523 T:G T G 10 0.522529682796163 0.63504130808849 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 229790048 A/G 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229789996_229790135:URB2;ENSG00000135763:ENST00000434387:exon_229789996_229790135:URB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 230384937 T/C 1 33 32 65 15.7565204677266 16.7209498494772 -0.964429381750593 T:C T C 10 0.522529682796163 0.901314250215728 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230384930_230385017:GALNT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 231488524 C/T 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 T:C C T 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000010072:ENST00000391858:exon_231487050_231488878:C1orf124;ENSG00000010072:ENST00000295050:exon_231488356_231490769:C1orf124 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 233086456 T/C 1 12 18 30 5.72964380644604 9.40553429033093 -3.67589048388489 T:C T C 10 0.522529682796163 0.202974205829589 ENSG00000135778:ENST00000494689:exon_233086351_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233086360_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233086370_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000496662:exon_233086379_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233086386_233086490:C1orf57 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 21 20 41 10.0268766612806 10.4505936559233 -0.423716994642682 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 11 13 24 5.25217348924221 6.79288587635012 -1.54071238710791 T:C T C 10 0.522529682796163 0.54717203422613 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236208773 C/T 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236208757_236208983:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236208757_236208983:NID1;ENSG00000116962:ENST00000419010:exon_236208757_236208983:NID1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236381825 G/C 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236378855_236381876:ERO1LB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236413230 T/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:T T A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236413185_236413267:ERO1LB;ENSG00000086619:ENST00000366589:exon_236413185_236413267:ERO1LB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 30 10 40 14.3241095161151 5.22529682796163 9.09881268815348 A:T:G T A 10 0.522529682796163 0.00404759323142375 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 26 6 32 12.4142282472998 3.13517809677698 9.27905015052279 T:C T C 10 0.522529682796163 0.00109335757096517 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 26 1 27 12.4142282472998 0.522529682796163 11.8916985645036 T:C C T 10 0.522529682796163 6.94254983507829e-07 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 13 6 19 6.20711412364988 3.13517809677698 3.0719360268729 T:C C T 10 0.522529682796163 0.175241772830013 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236702210 A/G 1 14 6 20 6.68458444085372 3.13517809677698 3.54940634407674 A:G A G 10 0.522529682796163 0.122665667036276 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 21 14 35 10.0268766612806 7.31541555914628 2.7114611021343 A:G G A 10 0.522529682796163 0.400403410066618 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236706352 A/C 1 2 7 9 0.954940634407674 3.65770777957314 -2.70276714516547 A:C A C 10 0.522529682796163 0.0963891685915122 ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 12 12 24 5.72964380644604 6.27035619355396 -0.540712387107911 C:G G C 10 0.522529682796163 0.84110056521342 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 23 31 54 10.9818172956883 16.1984201666811 -5.2166028709928 T:C T C 10 0.522529682796163 0.173771289269557 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 16 17 33 7.63952507526139 8.88300460753477 -1.24347953227338 T:C C T 10 0.522529682796163 0.728916278367981 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 14 15 29 6.68458444085372 7.83794524194244 -1.15336080108873 T:C T C 10 0.522529682796163 0.712748058622428 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 35 22 57 16.7114611021343 11.4956530215156 5.21580808061871 T:C T C 10 0.522529682796163 0.185730799802724 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 45 40 85 21.4861642741727 20.9011873118465 0.584976962326145 A:G A G 10 0.522529682796163 0.914007885094974 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 17 17 34 8.11699539246523 8.88300460753477 -0.766009215069541 A:G G A 10 0.522529682796163 0.86437385210619 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 12 17 29 5.72964380644604 8.88300460753477 -3.15336080108873 T:C T C 10 0.522529682796163 0.268071850620001 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236746443 C/T 1 11 7 18 5.25217348924221 3.65770777957314 1.59446570966907 T:C C T 10 0.522529682796163 0.48876143429335 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236746313_236746496:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236746313_236746496:HEATR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236748505 T/C 1 5 10 15 2.38735158601918 5.22529682796163 -2.83794524194245 T:C T C 10 0.522529682796163 0.196087541104941 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236749649 T/C 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236751262 T/C 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 T:C T C 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236751248_236751343:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236751248_236751343:HEATR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236755837 C/T 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 T:C C T 10 0.522529682796163 0.568106121039098 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236755823_236755933:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236755823_236755933:HEATR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236758887 T/C 1 6 11 17 2.86482190322302 5.74782651075779 -2.88300460753477 A:T:C T C 10 0.522529682796163 0.224425269329800 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236758840_236758973:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236758840_236758973:HEATR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 236767330 A/G 1 12 6 18 5.72964380644604 3.13517809677698 2.59446570966907 A:G A G 10 0.522529682796163 0.246476394158893 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366579:exon_236767254_236767427:HEATR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 241755348 C/T 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C C T 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241755255_241755590:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366555:exon_241755255_241755451:KMO;ENSG00000054277:ENST00000462265:exon_241755312_241755422:OPN3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 242030151 A/G 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 A:G A G 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242030132_242030357:EXO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:G A G 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 242048674 C/T 1 9 2 11 4.29723285483453 1.04505936559233 3.25217348924221 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0683780529325207 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518741:exon_242048659_242048809:EXO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 249142169 C/T 1 15 22 37 7.16205475805756 11.4956530215156 -4.33359826345803 T:C C T 10 0.522529682796163 0.187866992100144 ENSG00000171161:ENST00000306562:exon_249141251_249143716:ZNF672;ENSG00000171161:ENST00000394454:exon_249141474_249142832:ZNF672 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 1 249150116 G/C 1 15 24 39 7.16205475805756 12.5407123871079 -5.37865762905036 C:G G C 10 0.522529682796163 0.108013128297088 ENSG00000171163:ENST00000463519:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000306601:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000427146:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366471:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000533927:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000476503:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366469:exon_249149924_249150138:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000477070:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000412341:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000451251:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000315492:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000470787:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000474351:exon_249149924_249150285:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000478107:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000491971:exon_249149794_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000496411:exon_249149927_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000468455:exon_249149981_249150142:ZNF692 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 48 35 83 22.9185752257842 18.2885388978657 4.63003632791848 A:G A G 10 0.522529682796163 0.324463154569646 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 23 36 59 10.9818172956883 18.8110685806619 -7.82925128497362 T:C T C 10 0.522529682796163 0.049919000504418 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 3181107 G/A 1 15 26 41 7.16205475805756 13.5857717527002 -6.42371699464268 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0593962998347728 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000455371:exon_3180883_3181241:PITRM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 13 19 32 6.20711412364988 9.9280639731271 -3.72094984947722 T:C C T 10 0.522529682796163 0.216904561562158 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 5772920 A/T 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 A:T A T 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5772450_5773166:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5772450_5772956:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000380270:exon_5772625_5773166:C10orf18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 5789418 T/G 1 14 10 24 6.68458444085372 5.22529682796163 1.45928761289209 T:G T G 10 0.522529682796163 0.683803771305971 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 5790729 C/T 1 26 13 39 12.4142282472998 6.79288587635012 5.62134237094964 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0787205662135874 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 5791578 G/T 1 10 9 19 4.77470317203837 4.70276714516547 0.071936026872903 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 6002518 G/A 1 10 3 13 4.77470317203837 1.56758904838849 3.20711412364988 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0965395810160095 ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 6008172 C/T 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 T:C C T 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6008108_6008302:IL15RA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 6061449 C/T 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 T:C C T 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000134460:ENST00000379959:exon_6061391_6061462:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000397240:exon_6061391_6061462:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000379954:exon_6061391_6061462:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000256876:exon_6061391_6061462:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000447847:exon_6061416_6061462:IL2RA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 6063508 G/A 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 A:G G A 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000134460:ENST00000379959:exon_6063441_6063656:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000256876:exon_6063468_6063656:IL2RA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 15 5 20 7.16205475805756 2.61264841398082 4.54940634407674 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0454598983886916 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 11 13 24 5.25217348924221 6.79288587635012 -1.54071238710791 A:T A T 10 0.522529682796163 0.54717203422613 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 T:C C T 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 11505175 A/G 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 A:G A G 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 47 44 91 22.4411049085803 22.9913060430312 -0.55020113445083 A:G G A 10 0.522529682796163 0.916834663711412 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 12131081 T/G 1 7 11 18 3.34229222042686 5.74782651075779 -2.40553429033093 T:G T G 10 0.522529682796163 0.346003571297567 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 12197259 A/G 1 2 9 11 0.954940634407674 4.70276714516547 -3.74782651075779 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0319652475797756 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 41 62 103 19.5762830053573 32.3968403333621 -12.8205573280048 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0133543797531456 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 82 77 159 39.1525660107146 40.2347855753045 -1.08221956458991 A:G A G 10 0.522529682796163 0.874157906821703 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 12292348 G/T 1 76 77 153 36.2877441074916 40.2347855753045 -3.94704146781294 T:G G T 10 0.522529682796163 0.571207481954234 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 13151224 G/A 1 36 37 73 17.1889314193381 19.333598263458 -2.1446668441199 A:G G A 10 0.522529682796163 0.64064723407341 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000487935:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13151097_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13151112_13151288:OPTN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 13735947 A/G 1 15 3 18 7.16205475805756 1.56758904838849 5.59446570966907 A:G A G 10 0.522529682796163 0.00859335318552677 ENSG00000151474:ENST00000358621:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378502:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000357447:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378503:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000264546:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000492155:exon_13734169_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000342409:exon_13735703_13736039:FRMD4A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 16794623 C/T 1 19 29 48 9.0719360268729 15.1533608010887 -6.08142477421582 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0841395407501043 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16794533_16794652:RSU1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 13 17 30 6.20711412364988 8.88300460753477 -2.67589048388489 A:C C A 10 0.522529682796163 0.364089214287968 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 18828371 C/T 1 6 10 16 2.86482190322302 5.22529682796163 -2.36047492473861 T:C C T 10 0.522529682796163 0.317915137228048 ENSG00000165995:ENST00000324631:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000352115:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377328:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000282343:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377331:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000396576:exon_18828159_18830798:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000340194:exon_18828159_18830791:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377319:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377329:exon_18828159_18830038:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377315:exon_18828159_18830056:CACNB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 22048330 C/T 1 30 29 59 14.3241095161151 15.1533608010887 -0.829251284973614 T:C C T 10 0.522529682796163 0.896533552092361 ENSG00000136770:ENST00000376980:exon_22048099_22048547:DNAJC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 22839628 T/C 1 23 22 45 10.9818172956883 11.4956530215156 -0.513835725827333 T:C T C 10 0.522529682796163 0.882699624435944 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22839588_22839701:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22839588_22839701:PIP4K2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 24762960 G/A 0 8 0 8 3.8197625376307 0 3.8197625376307 G G 10 0.522529682796163 0.00825889449847131 ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24762157_24762989:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24762157_24762989:KIAA1217 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 24835213 C/G 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 C:G C G 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24834756_24836772:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24834756_24836771:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24834756_24836771:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24834756_24836771:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24834756_24836771:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24834756_24836771:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24834756_24836771:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24834756_24836772:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24834756_24836771:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24833910_24836772:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24833910_24836772:KIAA1217 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 24908686 T/C 1 9 15 24 4.29723285483453 7.83794524194244 -3.54071238710791 T:C T C 10 0.522529682796163 0.158191944334635 ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000376410:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000445703:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000446003:exon_24908402_24910298:ARHGAP21 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 27322303 C/G 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27322154_27322306:ANKRD26 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 18 23 41 8.59446570966907 12.0181827043117 -3.42371699464268 A:G G A 10 0.522529682796163 0.348472402673288 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 11 13 24 5.25217348924221 6.79288587635012 -1.54071238710791 T:C C T 10 0.522529682796163 0.54717203422613 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 27459746 C/G 1 16 14 30 7.63952507526139 7.31541555914628 0.324109516115112 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 12 14 26 5.72964380644604 7.31541555914628 -1.58577175270024 T:C T C 10 0.522529682796163 0.561386502703927 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 14 16 30 6.68458444085372 8.36047492473861 -1.67589048388489 T:C T C 10 0.522529682796163 0.586538190836893 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 30749641 C/T 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 T:C C T 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30749635_30750762:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30749635_30750761:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30749635_30750762:MAP3K8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 32304440 T/C 1 45 37 82 21.4861642741727 19.333598263458 2.15256601071464 T:C T C 10 0.522529682796163 0.659679971065478 ENSG00000170759:ENST00000302418:exon_32304437_32304587:KIF5B;ENSG00000170759:ENST00000403329:exon_32304437_32304587:KIF5B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 35302705 C/T 1 16 20 36 7.63952507526139 10.4505936559233 -2.81106858066187 T:C C T 10 0.522529682796163 0.405302601829828 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35302627_35302728:CUL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 38344700 C/G 1 10 9 19 4.77470317203837 4.70276714516547 0.071936026872903 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 38407519 A/G 1 9 4 13 4.29723285483453 2.09011873118465 2.20711412364988 A:G A G 10 0.522529682796163 0.273205822586663 ENSG00000075407:ENST00000361085:exon_38406318_38411511:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000351773:exon_38406318_38412276:ZNF37A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 43281089 T/C 1 15 17 32 7.16205475805756 8.88300460753477 -1.72094984947721 T:C T C 10 0.522529682796163 0.597738714995898 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43280930_43281120:BMS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 43292647 A/G 1 31 32 63 14.8015798333189 16.7209498494772 -1.91937001615827 A:G A G 10 0.522529682796163 0.705526249415585 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43291922_43292679:BMS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 43319197 G/A 1 44 42 86 21.0086939569688 21.9462466774388 -0.937552720470013 A:G G A 10 0.522529682796163 0.91412721784246 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43319057_43319232:BMS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 43678796 C/T 1 14 12 26 6.68458444085372 6.27035619355396 0.414228247299763 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000169826:ENST00000374466:exon_43678698_43680756:CSGALNACT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 135 124 259 64.458492822518 64.7936806667242 -0.335187844206217 A:T T A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 45473317 C/T 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:C C T 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000165507:ENST00000298295:exon_45471577_45473503:C10orf10;ENSG00000165507:ENST00000432283:exon_45473233_45473478:C10orf10;ENSG00000165507:ENST00000448778:exon_45473227_45473667:C10orf10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 45478092 A/G 1 14 8 22 6.68458444085372 4.1802374623693 2.50434697848442 A:G A G 10 0.522529682796163 0.39388166009814 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374414:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000427758:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000462822:exon_45477973_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000428466:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000472561:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45476487_45478111:RASSF4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 45499009 A/G 1 49 48 97 23.396045542988 25.0814247742158 -1.68537923122781 A:G A G 10 0.522529682796163 0.761021971834011 ENSG00000165512:ENST00000298299:exon_45498728_45500774:ZNF22 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 45499272 C/G 1 53 53 106 25.3059268118034 27.6940731881966 -2.38814637639327 C:G C G 10 0.522529682796163 0.697580490740511 ENSG00000165512:ENST00000298299:exon_45498728_45500774:ZNF22 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 50740600 C/T 1 9 2 11 4.29723285483453 1.04505936559233 3.25217348924221 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0683780529325207 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000462247:exon_50740589_50741024:ERCC6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 50740876 G/C 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50740589_50741024:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000462247:exon_50740589_50741024:ERCC6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 9 23 32 4.29723285483453 12.0181827043117 -7.72094984947721 A:G A G 10 0.522529682796163 0.00731626660782005 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 12 14 26 5.72964380644604 7.31541555914628 -1.58577175270024 A:G G A 10 0.522529682796163 0.561386502703927 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 64974380 G/C 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 70502288 G/A 1 25 19 44 11.9367579300959 9.9280639731271 2.00869395696883 A:G G A 10 0.522529682796163 0.651254012401917 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70502133_70502326:CCAR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 70748784 G/A 1 14 12 26 6.68458444085372 6.27035619355396 0.414228247299763 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 70940191 C/T 1 12 9 21 5.72964380644604 4.70276714516547 1.02687666128058 T:C C T 10 0.522529682796163 0.670391349361465 ENSG00000156502:ENST00000359655:exon_70939988_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000395093:exon_70939993_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000471069:exon_70940006_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000483572:exon_70940037_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000422378:exon_70940044_70940318:SUPV3L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 71142420 G/A 1 26 42 68 12.4142282472998 21.9462466774388 -9.53201843013908 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0212976219328414 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 71874683 G/A 1 43 44 87 20.531223639765 22.9913060430312 -2.46008240326618 A:G G A 10 0.522529682796163 0.667967772216361 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 71874734 G/A 1 32 27 59 15.2790501505228 14.1083014354964 1.17074871502638 A:G G A 10 0.522529682796163 0.79546904839066 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 71874784 C/T 1 16 7 23 7.63952507526139 3.65770777957314 3.98181729568825 T:C C T 10 0.522529682796163 0.142379051974171 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 22 49 71 10.5043469784844 25.603954457012 -15.0996074785276 T:C C T 10 0.522529682796163 0.000328136118330756 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 73520632 A/C 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 A:C A C 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73520288_73520681:C10orf54 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 73533177 A/G 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G A G 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73533115_73533255:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73533115_73533196:C10orf54 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 75148116 A/G 1 66 42 108 31.5130409354532 21.9462466774388 9.5667942580144 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0676756872875742 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75148070_75148172:ANXA7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 75865065 G/A 1 12 9 21 5.72964380644604 4.70276714516547 1.02687666128058 A:G G A 10 0.522529682796163 0.670391349361465 ENSG00000035403:ENST00000372755:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000211998:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000436396:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000472585:exon_75864686_75865111:VCL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 75884157 G/T 1 26 23 49 12.4142282472998 12.0181827043117 0.396045542988015 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000185009:ENST00000425908:exon_75884138_75884282:AP3M1;ENSG00000185009:ENST00000355264:exon_75884138_75884282:AP3M1;ENSG00000185009:ENST00000372745:exon_75884138_75884282:AP3M1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 75936611 C/T 1 9 4 13 4.29723285483453 2.09011873118465 2.20711412364988 T:C C T 10 0.522529682796163 0.273205822586663 ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_75936444_75936644:ADK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 91 76 167 43.4497988655492 39.7122558925084 3.73754297304078 A:G G A 10 0.522529682796163 0.58815101381117 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 86131059 A/G 1 2 9 11 0.954940634407674 4.70276714516547 -3.74782651075779 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0319652475797756 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 T:C T C 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 88277457 C/T 1 21 14 35 10.0268766612806 7.31541555914628 2.7114611021343 T:C C T 10 0.522529682796163 0.400403410066618 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88277328_88277848:WAPAL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 88730312 T/C 1 10 20 30 4.77470317203837 10.4505936559233 -5.67589048388489 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0441490175766215 ENSG00000148671:ENST00000372013:exon_88730233_88730672:C10orf116;ENSG00000148671:ENST00000372012:exon_88730233_88730487:C10orf116 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 88930249 A/T 1 9 6 15 4.29723285483453 3.13517809677698 1.16205475805756 A:T A T 10 0.522529682796163 0.612786973154986 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 89624218 C/G 1 41 29 70 19.5762830053573 15.1533608010887 4.42292220426859 T:C:G C G 10 0.522529682796163 0.338661998538163 ENSG00000171862:ENST00000371953:exon_89622870_89624305:PTEN;ENSG00000171862:ENST00000487939:exon_89624206_89624305:PTEN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 2 8 10 0.954940634407674 4.1802374623693 -3.22529682796163 C:G C G 10 0.522529682796163 0.0559284466504964 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 91007360 T/G 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 T:G T G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000107798:ENST00000336233:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000371829:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000456827:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000425287:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000428800:exon_91007295_91007588:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000282673:exon_91007295_91007406:LIPA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 91066446 G/C 1 21 9 30 10.0268766612806 4.70276714516547 5.32410951611511 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0663514633963495 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 91099630 T/C 1 108 106 214 51.5667942580144 55.3881463763933 -3.82135211837888 T:C T C 10 0.522529682796163 0.632122246547308 ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91098418_91100728:IFIT3;ENSG00000119917:ENST00000371811:exon_91098418_91100728:IFIT3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 22 18 40 10.5043469784844 9.40553429033093 1.09881268815348 T:C C T 10 0.522529682796163 0.7541595467739 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 91468925 C/G 1 15 6 21 7.16205475805756 3.13517809677698 4.02687666128058 C:G C G 10 0.522529682796163 0.0846643570295337 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000447580:exon_91468924_91469010:KIF20B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 91487649 A/T 1 11 4 15 5.25217348924221 2.09011873118465 3.16205475805756 A:T A T 10 0.522529682796163 0.124047501512051 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91487613_91487653:KIF20B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 91488979 A/T 1 10 4 14 4.77470317203837 2.09011873118465 2.68458444085372 A:T A T 10 0.522529682796163 0.185755143276423 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91488885_91489004:KIF20B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 7 23 30 3.34229222042686 12.0181827043117 -8.67589048388489 A:T T A 10 0.522529682796163 0.00159106318304033 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 15 9 24 7.16205475805756 4.70276714516547 2.45928761289209 A:G A G 10 0.522529682796163 0.414495787724859 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 8 12 20 3.8197625376307 6.27035619355396 -2.45059365592326 A:G A G 10 0.522529682796163 0.371173578167092 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 9 6 15 4.29723285483453 3.13517809677698 1.16205475805756 A:G A G 10 0.522529682796163 0.612786973154986 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 93608142 G/A 1 6 11 17 2.86482190322302 5.74782651075779 -2.88300460753477 A:G G A 10 0.522529682796163 0.224425269329800 ENSG00000107854:ENST00000371627:exon_93608140_93608392:TNKS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 16 18 34 7.63952507526139 9.40553429033093 -1.76600921506954 A:T A T 10 0.522529682796163 0.608163381004269 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 95720490 C/T 0 10 0 10 4.77470317203837 0 4.77470317203837 C C 10 0.522529682796163 0.00213326764069245 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 95720501 T/C 0 11 0 11 5.25217348924221 0 5.25217348924221 T T 10 0.522529682796163 0.00108694656670985 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 96104665 T/G 1 15 7 22 7.16205475805756 3.65770777957314 3.50434697848442 T:G T G 10 0.522529682796163 0.199333101930616 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96104610_96104690:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96104610_96104690:NOC3L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 96114835 G/A 1 6 10 16 2.86482190322302 5.22529682796163 -2.36047492473861 A:G G A 10 0.522529682796163 0.317915137228048 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96114720_96114850:NOC3L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 A:C A C 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 97447373 A/T 1 19 15 34 9.0719360268729 7.83794524194244 1.23399078493046 A:T A T 10 0.522529682796163 0.733153130187491 ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371209:exon_97447349_97447476:TCTN3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 97599537 G/C 1 57 88 145 27.2158080806187 45.9826120860623 -18.7668040054436 C:G G C 10 0.522529682796163 0.00201737632003324 ENSG00000138185:ENST00000453258:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371206:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000481316:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371205:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371203:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000483213:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371207:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000490659:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000494070:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000461927:exon_97599057_97599565:ENTPD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 97605057 C/G 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 C:G C G 10 0.522529682796163 0.491321069758129 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 97920062 G/A 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 A:G G A 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 99116903 C/T 1 20 29 49 9.54940634407674 15.1533608010887 -5.60395445701199 T:C C T 10 0.522529682796163 0.117097132073311 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99116115_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000465394:exon_99116863_99116953:RRP12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 37 13 50 17.666401736542 6.79288587635012 10.8735158601919 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00258131428238061 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 24 33 57 11.4592876128921 17.2434795322734 -5.78419191938129 A:G G A 10 0.522529682796163 0.14466800732104 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 99141205 A/G 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 A:G A G 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141143_99141240:RRP12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 99141484 C/T 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C C T 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141472_99141583:RRP12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 99160152 A/G 1 3 9 12 1.43241095161151 4.70276714516547 -3.27035619355396 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0813542896879837 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99160062_99160291:RRP12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 20 15 35 9.54940634407674 7.83794524194244 1.7114611021343 A:G G A 10 0.522529682796163 0.614301013041636 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 5 12 17 2.38735158601918 6.27035619355396 -3.88300460753477 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0867299489543397 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 100179851 T/C 1 11 14 25 5.25217348924221 7.31541555914628 -2.06324206990407 T:C T C 10 0.522529682796163 0.430248665069756 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000462743:exon_100179802_100180126:HPS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 100183570 G/C 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 C:G G C 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000470095:exon_100183510_100183644:HPS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 103908080 G/A 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 A:G G A 10 0.522529682796163 0.491321069758129 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 103908085 C/T 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.491321069758129 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 104161967 T/C 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 T:C T C 10 0.522529682796163 0.512157551421997 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 104184901 G/C 1 37 8 45 17.666401736542 4.1802374623693 13.4861642741727 C:G G C 10 0.522529682796163 3.68547343538966e-05 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 18 6 24 8.59446570966907 3.13517809677698 5.45928761289209 C:G C G 10 0.522529682796163 0.038735723930301 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 104572963 T/C 1 8 11 19 3.8197625376307 5.74782651075779 -1.9280639731271 T:C T C 10 0.522529682796163 0.492106910577732 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 104573017 G/T 1 6 9 15 2.86482190322302 4.70276714516547 -1.83794524194244 T:G G T 10 0.522529682796163 0.440567980680144 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 105138047 C/G 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 C:G C G 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000148835:ENST00000369839:exon_105137992_105138307:TAF5;ENSG00000148835:ENST00000351396:exon_105137992_105138307:TAF5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 23 28 51 10.9818172956883 14.6308311182926 -3.64901382260431 T:C C T 10 0.522529682796163 0.328667617186064 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 22 41 63 10.5043469784844 21.4237169946427 -10.9193700161583 A:C A C 10 0.522529682796163 0.00760046893571699 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 14 30 44 6.68458444085372 15.6758904838849 -8.99130604303117 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0094870129482716 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 105362179 G/A 1 3 7 10 1.43241095161151 3.65770777957314 -2.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.209802689107094 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 105362287 C/G 1 5 11 16 2.38735158601918 5.74782651075779 -3.36047492473861 C:G C G 10 0.522529682796163 0.131585770979384 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 129 93 222 61.593670919295 48.5952605000432 12.9984104192518 A:C C A 10 0.522529682796163 0.092810731578384 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 115668149 A/G 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000196865:ENST00000369301:exon_115668039_115676953:NHLRC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 119134058 T/C 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 T:C T C 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119133867_119134978:PDZD8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 120810098 C/T 1 97 112 209 46.3146207687722 58.5233244731702 -12.2087037043981 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0965848417507235 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120810033_120810186:EIF3A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 120828969 A/G 1 66 62 128 31.5130409354532 32.3968403333621 -0.883799397908863 A:G A G 10 0.522529682796163 0.929551751407527 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120828958_120829166:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120828958_120828985:EIF3A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 122665459 C/G 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122665388_122666367:WDR11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 123549691 T/G 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 T:G T G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000485281:exon_123549684_123549741:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123549378_123549804:ATE1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 9 14 23 4.29723285483453 7.31541555914628 -3.01818270431175 A:G G A 10 0.522529682796163 0.218336616351306 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 126089434 G/A 1 16 8 24 7.63952507526139 4.1802374623693 3.45928761289209 A:G G A 10 0.522529682796163 0.219555714324787 ENSG00000065154:ENST00000368845:exon_126089409_126089553:OAT;ENSG00000065154:ENST00000471127:exon_126089409_126089553:OAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 127441439 G/A 1 8 12 20 3.8197625376307 6.27035619355396 -2.45059365592326 A:G G A 10 0.522529682796163 0.371173578167092 ENSG00000107938:ENST00000419769:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000481600:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000356792:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368815:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000337623:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000433226:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000450404:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368812:exon_127441368_127441483:C10orf137 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 18 14 32 8.59446570966907 7.31541555914628 1.27905015052279 T:C T C 10 0.522529682796163 0.724992015605387 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129900858 C/T 1 91 79 170 43.4497988655492 41.2798449408969 2.1699539246523 T:C C T 10 0.522529682796163 0.759212326543613 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129901066 C/A 1 71 83 154 33.9003925214724 43.3699636720815 -9.4695711506091 A:C C A 10 0.522529682796163 0.146272858774683 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 94 84 178 44.8822098171607 43.8924933548777 0.989716462282992 T:C T C 10 0.522529682796163 0.940219849271073 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129901501 G/C 1 52 94 146 24.8284564945995 49.1177901828393 -24.2893336882398 C:G G C 10 0.522529682796163 6.17280504097435e-05 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 73 71 144 34.8553331558801 37.0996074785276 -2.24427432264747 A:T:G G A 10 0.522529682796163 0.738947483658716 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129901747 C/T 1 78 78 156 37.2426847418993 40.7573152581007 -3.51463051620142 T:C C T 10 0.522529682796163 0.575983115563006 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 100 97 197 47.7470317203837 50.6853792312278 -2.9383475108441 T:C T C 10 0.522529682796163 0.721496000748659 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129901946 T/G 1 99 78 177 47.2695614031799 40.7573152581007 6.51224614507915 A:T:G T G 10 0.522529682796163 0.366624528642571 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129902158 C/T 1 80 92 172 38.197625376307 48.072730817247 -9.87510544094003 T:C C T 10 0.522529682796163 0.146848207649449 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129902368 T/A 1 125 106 231 59.6837896504796 55.3881463763933 4.29564327408636 A:T T A 10 0.522529682796163 0.598520613252612 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129903465 A/G 1 88 82 170 42.0173879139377 42.8474339892854 -0.830046075347703 A:G A G 10 0.522529682796163 0.938848295072591 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129904119 G/A 1 78 79 157 37.2426847418993 41.2798449408969 -4.03716019899758 A:G G A 10 0.522529682796163 0.523914930468447 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129904477 C/T 1 55 42 97 26.260867446211 21.9462466774388 4.31462076877219 T:C C T 10 0.522529682796163 0.416692826335101 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129905896 T/A 1 54 46 100 25.7833971290072 24.0363654086235 1.7470317203837 A:T:G T A 10 0.522529682796163 0.764463708875884 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 54 53 107 25.7833971290072 27.6940731881966 -1.91067605918944 T:C C T 10 0.522529682796163 0.771752639611153 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129906980 C/T 1 38 45 83 18.1438720537458 23.5138357258273 -5.36996367208153 T:C C T 10 0.522529682796163 0.271932495487802 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 44 39 83 21.0086939569688 20.3786576290504 0.630036327918475 C:G G C 10 0.522529682796163 0.912915751670998 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 129911856 C/G 1 27 19 46 12.8916985645036 9.9280639731271 2.9636345913765 C:G C G 10 0.522529682796163 0.460986550916598 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129911691_129911866:MKI67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 1 11 2 13 5.25217348924221 1.04505936559233 4.20711412364988 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0241707667952083 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 11 2 13 5.25217348924221 1.04505936559233 4.20711412364988 C:G C G 10 0.522529682796163 0.0241707667952083 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 1 8 1 9 3.8197625376307 0.522529682796163 3.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0407796571976411 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 T:G G T 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 233067 C/T 1 13 16 29 6.20711412364988 8.36047492473861 -2.15336080108873 T:C C T 10 0.522529682796163 0.461071503182053 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 233212 C/A 1 16 22 38 7.63952507526139 11.4956530215156 -3.85612794625419 A:C:G C A 10 0.522529682796163 0.255806176333722 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525776:exon_233192_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_233209_233215:SIRT3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 290891 T/C 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 290918 G/A 1 12 11 23 5.72964380644604 5.74782651075779 -0.018182704311748 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 320772 A/G 1 11 4 15 5.25217348924221 2.09011873118465 3.16205475805756 A:G A G 10 0.522529682796163 0.124047501512051 ENSG00000142089:ENST00000399808:exon_320565_321050:IFITM3;ENSG00000142089:ENST00000526811:exon_320565_320772:IFITM3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 614864 C/T 1 81 99 180 38.6750956935108 51.7304385968201 -13.0553429033093 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0526226392723674 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614797_614984:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614797_614952:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532788:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614797_614887:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 654043 G/A 1 7 13 20 3.34229222042686 6.79288587635012 -3.45059365592326 A:G G A 10 0.522529682796163 0.177936173075919 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_653941_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_653962_654051:DEAF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 13 14 27 6.20711412364988 7.31541555914628 -1.1083014354964 A:G A G 10 0.522529682796163 0.703625443243212 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 802379 T/C 1 9 12 21 4.29723285483453 6.27035619355396 -1.97312333871942 T:C T C 10 0.522529682796163 0.513321470356553 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 804212 C/A 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:C C A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_804094_804675:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_804094_805103:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_804094_804469:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534649:exon_804094_804463:LRDD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 823809 C/G 1 30 26 56 14.3241095161151 13.5857717527002 0.738337763414874 C:G C G 10 0.522529682796163 0.894046002035037 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_823694_823855:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_823527_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_823694_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000526083:exon_823648_823855:PNPLA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 824789 T/C 1 31 26 57 14.8015798333189 13.5857717527002 1.21580808061871 T:C T C 10 0.522529682796163 0.791821633214219 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_824523_825573:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_824523_825219:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_824523_825218:PNPLA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 837582 G/A 1 28 24 52 13.3691688817074 12.5407123871079 0.828456494599527 A:G G A 10 0.522529682796163 0.889928355265603 ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_837460_837613:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528143:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_837460_837612:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532075:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_837356_837605:POLR2L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 840363 C/T 1 82 64 146 39.1525660107146 33.4418996989544 5.71066631176021 T:C C T 10 0.522529682796163 0.362802516455778 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 840477 A/G 1 187 120 307 89.2869493171175 62.7035619355396 26.583387381578 A:T:G A G 10 0.522529682796163 0.00242930345051130 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 1501670 G/C 1 14 12 26 6.68458444085372 6.27035619355396 0.414228247299763 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000182208:ENST00000399693:exon_1501623_1501716:AC091196.1;ENSG00000182208:ENST00000329957:exon_1501623_1501716:AC091196.1;ENSG00000182208:ENST00000526462:exon_1501623_1501716:AC091196.1;ENSG00000182208:ENST00000427202:exon_1501623_1501716:AC091196.1;ENSG00000182208:ENST00000526698:exon_1501623_1502115:AC091196.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 2924610 G/A 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2924344_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000492567:exon_2924606_2924719:SLC22A18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 3714489 C/T 1 9 14 23 4.29723285483453 7.31541555914628 -3.01818270431175 T:C C T 10 0.522529682796163 0.218336616351306 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000429801:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000524563:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000530345:exon_3714287_3714605:NUP98 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 3723781 G/C 1 16 13 29 7.63952507526139 6.79288587635012 0.846639198911274 C:G G C 10 0.522529682796163 0.853261309241005 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3723693_3724122:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3723693_3724122:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3723693_3724122:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000529063:exon_3723693_3723881:NUP98 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 24 15 39 11.4592876128921 7.83794524194244 3.62134237094964 A:C C A 10 0.522529682796163 0.265358787133781 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 57 53 110 27.2158080806187 27.6940731881966 -0.478265107577926 A:G A G 10 0.522529682796163 0.924361074208599 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 4411241 C/T 1 36 29 65 17.1889314193381 15.1533608010887 2.03557061824941 T:C C T 10 0.522529682796163 0.622296783960728 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 5664684 T/G 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 T:G T G 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 3 8 11 1.43241095161151 4.1802374623693 -2.74782651075779 A:C C A 10 0.522529682796163 0.131967912623333 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 5688940 C/T 1 12 7 19 5.72964380644604 3.65770777957314 2.0719360268729 T:C C T 10 0.522529682796163 0.368592887865543 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5688919_5688941:TRIM5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 5701001 C/T 1 24 26 50 11.4592876128921 13.5857717527002 -2.12648413980815 T:C C T 10 0.522529682796163 0.573564285012866 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700991_5701037:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700991_5701087:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700991_5701063:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700991_5701161:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 105 122 227 50.1343833064029 63.7486213011319 -13.614237994729 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0729785152770199 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 97 122 219 46.3146207687722 63.7486213011319 -17.4340005323597 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0212511507133057 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 123 98 221 58.728849016072 51.207908914024 7.52094010204799 C:G G C 10 0.522529682796163 0.313543380435353 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 6232653 C/T 1 10 13 23 4.77470317203837 6.79288587635012 -2.01818270431175 T:C C T 10 0.522529682796163 0.413003311192827 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6232565_6233097:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6232565_6233097:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000529360:exon_6232575_6233097:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6232575_6233097:FAM160A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 6239890 G/A 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 A:G G A 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6239830_6239993:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6239830_6239993:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6239788_6239993:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6239830_6239993:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000532797:exon_6239830_6239971:FAM160A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 6588228 G/A 1 12 4 16 5.72964380644604 2.09011873118465 3.63952507526139 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0815537992618656 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6588155_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525080:exon_6588155_6588582:DNHD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 7673029 T/C 1 12 2 14 5.72964380644604 1.04505936559233 4.68458444085372 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0141664242543076 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 7690873 C/T 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7689709_7693754:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000527542:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532920:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000524608:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000436351:exon_7690856_7690962:CYB5R2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 8009241 C/T 1 6 26 32 2.86482190322302 13.5857717527002 -10.7209498494772 T:C C T 10 0.522529682796163 0.000130796820726155 ENSG00000175390:ENST00000533626:exon_8008445_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000449102:exon_8008855_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000309828:exon_8008867_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000531329:exon_8008884_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000528653:exon_8008903_8009263:EIF3F HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 8936464 T/C 1 5 9 14 2.38735158601918 4.70276714516547 -2.31541555914628 T:C T C 10 0.522529682796163 0.286340857888341 ENSG00000166452:ENST00000299576:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309377:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309357:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000426510:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529876:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000525005:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000524577:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534506:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000530281:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000396648:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534147:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529942:exon_8936373_8936477:C11orf17 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 9 3 12 4.29723285483453 1.56758904838849 2.72964380644604 A:G A G 10 0.522529682796163 0.150898424576211 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 9225486 C/G 1 3 12 15 1.43241095161151 6.27035619355396 -4.83794524194244 C:G C G 10 0.522529682796163 0.0173534416682307 ENSG00000184014:ENST00000328194:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000530044:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000526707:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000532696:exon_9225079_9225864:DENND5A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 9537904 G/C 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 C:G G C 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000166478:ENST00000396604:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396602:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000530463:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396597:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000299606:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000447186:exon_9537748_9537909:ZNF143 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 9749554 T/G 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 T:G T G 10 0.522529682796163 0.18368068114947 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 9749645 A/C 1 36 28 64 17.1889314193381 14.6308311182926 2.55810030104557 A:C A C 10 0.522529682796163 0.53459684756262 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9749600_9749746:SWAP70 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 10521764 T/C 1 6 8 14 2.86482190322302 4.1802374623693 -1.31541555914628 T:C T C 10 0.522529682796163 0.595734183488216 ENSG00000133805:ENST00000256183:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000444303:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396554:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000534047:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396553:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529834:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529507:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000530864:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529744:exon_10521732_10521796:AMPD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 10555589 A/G 1 10 9 19 4.77470317203837 4.70276714516547 0.071936026872903 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000110315:ENST00000265981:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000528665:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000533412:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000530156:exon_10555563_10555752:RNF141 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 10820948 T/C 1 320 305 625 152.790501505228 159.37155325283 -6.58105174760186 T:C T C 10 0.522529682796163 0.602914507441098 ENSG00000110321:ENST00000429377:exon_10820760_10820971:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000526148:exon_10820760_10820971:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000525681:exon_10820760_10820971:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000532383:exon_10820760_10820971:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000339995:exon_10820760_10820971:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000396525:exon_10820760_10820971:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000525606:exon_10820760_10821173:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000534272:exon_10820760_10820971:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000528839:exon_10820760_10820971:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000379653:exon_10820760_10820971:EIF4G2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 11354346 T/C 1 9 10 19 4.29723285483453 5.22529682796163 -0.928063973127097 T:C T C 10 0.522529682796163 0.819201169042762 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 11976628 G/A 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 A:G G A 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11976581_11976711:USP47 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 13410371 A/G 1 13 21 34 6.20711412364988 10.9731233387194 -4.76600921506954 A:G A G 10 0.522529682796163 0.122223674636380 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13409548_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13409571_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13410230_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13410249_13410688:BTBD10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 17111272 A/G 1 14 11 25 6.68458444085372 5.74782651075779 0.936757930095927 A:G A G 10 0.522529682796163 0.841937992643628 ENSG00000011405:ENST00000265970:exon_17108119_17111467:PIK3C2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 17191019 A/G 1 2 6 8 0.954940634407674 3.13517809677698 -2.1802374623693 A:G A G 10 0.522529682796163 0.163120845582557 ENSG00000011405:ENST00000265970:exon_17190224_17191288:PIK3C2A;ENSG00000011405:ENST00000533645:exon_17190224_17191353:PIK3C2A;ENSG00000011405:ENST00000532035:exon_17190899_17191353:PIK3C2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 18318354 C/T 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:C C T 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18318345_18318531:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18318345_18318531:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18318345_18318531:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18318345_18318531:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000531848:exon_18317709_18318531:HPS5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 18633897 T/C 1 6 10 16 2.86482190322302 5.22529682796163 -2.36047492473861 T:C T C 10 0.522529682796163 0.317915137228048 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 18633971 G/A 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 A:G G A 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 28057957 T/C 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 28110151 T/C 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 T:C T C 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28110071_28110268:KIF18A;ENSG00000121621:ENST00000533466:exon_28110071_28110268:KIF18A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 32956620 A/G 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 A:G A G 10 0.522529682796163 0.393562228098845 ENSG00000060749:ENST00000399302:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000078652:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000428421:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000527788:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000524678:exon_32956130_32956981:QSER1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 33065394 C/T 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 T:C C T 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 33076191 T/C 1 2 7 9 0.954940634407674 3.65770777957314 -2.70276714516547 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0963891685915122 ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 33308175 G/A 1 10 7 17 4.77470317203837 3.65770777957314 1.11699539246523 A:G G A 10 0.522529682796163 0.63504130808849 ENSG00000110422:ENST00000525975:exon_33307959_33309057:HIPK3;ENSG00000110422:ENST00000303296:exon_33307959_33309057:HIPK3;ENSG00000110422:ENST00000379016:exon_33307959_33309057:HIPK3;ENSG00000110422:ENST00000531504:exon_33307959_33308189:HIPK3;ENSG00000110422:ENST00000456517:exon_33307959_33309057:HIPK3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 33308593 A/G 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000110422:ENST00000525975:exon_33307959_33309057:HIPK3;ENSG00000110422:ENST00000303296:exon_33307959_33309057:HIPK3;ENSG00000110422:ENST00000379016:exon_33307959_33309057:HIPK3;ENSG00000110422:ENST00000456517:exon_33307959_33309057:HIPK3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 T:C T C 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 12 13 25 5.72964380644604 6.79288587635012 -1.06324206990407 T:C C T 10 0.522529682796163 0.693670722544485 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 34916657 C/T 1 11 18 29 5.25217348924221 9.40553429033093 -4.15336080108873 T:C C T 10 0.522529682796163 0.138802783884069 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34916557_34916657:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34916557_34916657:APIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 14 10 24 6.68458444085372 5.22529682796163 1.45928761289209 A:G G A 10 0.522529682796163 0.683803771305971 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 34969112 A/G 1 11 22 33 5.25217348924221 11.4956530215156 -6.24347953227338 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0357128574386041 ENSG00000110435:ENST00000533550:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34969053_34969153:PDHX HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 35201842 C/T 1 77 72 149 36.7652144246955 37.6221371613237 -0.856922736628285 T:C C T 10 0.522529682796163 0.934690506814036 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528086:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526669:exon_35201821_35201876:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531118:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528455:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531873:exon_35201826_35201954:CD44 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 43876698 C/T 1 60 33 93 28.6482190322302 17.2434795322734 11.4047394999568 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0218986622335037 ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 46339011 G/A 1 9 11 20 4.29723285483453 5.74782651075779 -1.45059365592326 A:G G A 10 0.522529682796163 0.655579202774615 ENSG00000157613:ENST00000529193:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000446415:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000288400:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000534616:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000530244:exon_46338912_46339038:CREB3L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 47303275 T/C 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 T:C T C 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47303126_47303304:MADD;ENSG00000110514:ENST00000489415:exon_47303126_47303304:MADD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 47306509 G/A 1 13 15 28 6.20711412364988 7.83794524194244 -1.63083111829256 A:G G A 10 0.522529682796163 0.574460764427649 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000524530:exon_47306497_47306616:MADD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 47772545 T/C 1 23 26 49 10.9818172956883 13.5857717527002 -2.60395445701199 A:T:C T C 10 0.522529682796163 0.477525137411706 ENSG00000109920:ENST00000263773:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000526109:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000532646:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000534003:exon_47772468_47772588:FNBP4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 57077132 C/T 1 11 19 30 5.25217348924221 9.9280639731271 -4.67589048388489 T:C C T 10 0.522529682796163 0.100755669830112 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 57157405 A/G 1 7 15 22 3.34229222042686 7.83794524194244 -4.49565302151558 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0854182011035238 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000529411:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000528835:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 57428528 C/T 1 16 12 28 7.63952507526139 6.27035619355396 1.36916888170744 T:C C T 10 0.522529682796163 0.706382469889948 ENSG00000172409:ENST00000529430:exon_57428237_57429321:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000533682:exon_57428237_57429340:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000525602:exon_57428237_57428908:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000302731:exon_57428237_57429336:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000438099:exon_57428237_57429334:CLP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 57463500 T/C 1 15 16 31 7.16205475805756 8.36047492473861 -1.19842016668105 T:C T C 10 0.522529682796163 0.721148115439186 ENSG00000156599:ENST00000527985:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000287169:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529480:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529447:exon_57463392_57463515:ZDHHC5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 57509690 G/A 1 319 296 615 152.313031188024 154.668786107664 -2.35575491964022 A:G G A 10 0.522529682796163 0.87175428836461 ENSG00000211450:ENST00000534355:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000533321:exon_57509281_57510529:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000388857:exon_57509589_57510129:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000528798:exon_57509589_57509699:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000534386:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000254732:ENST00000531074:exon_57509635_57509719:RP11-691N7.6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 57563991 C/T 1 8 11 19 3.8197625376307 5.74782651075779 -1.9280639731271 T:C C T 10 0.522529682796163 0.492106910577732 ENSG00000198561:ENST00000524630:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529919:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000399039:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361796:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000360682:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529526:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000426142:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000399050:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361391:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361332:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532463:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529986:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000358694:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532787:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532649:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000528621:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530748:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000428599:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000528232:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529873:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532844:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526357:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530094:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000415361:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532245:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000534579:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526938:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530068:exon_57563929_57564056:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000534647:exon_57563929_57564464:CTNND1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 58378424 A/G 1 14 17 31 6.68458444085372 8.88300460753477 -2.19842016668105 A:G A G 10 0.522529682796163 0.474916459833262 ENSG00000186660:ENST00000316059:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000186660:ENST00000389918:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000255073:ENST00000389919:exon_58378423_58378527:AP001350.3;ENSG00000255073:ENST00000422974:exon_58378423_58378527:AP001350.3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 58893761 C/G 1 32 34 66 15.2790501505228 17.7660092150695 -2.48695906454676 C:G C G 10 0.522529682796163 0.541135514556116 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 58940278 G/T 1 9 9 18 4.29723285483453 4.70276714516547 -0.405534290330934 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000110042:ENST00000227451:exon_58939965_58940279:DTX4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 58979393 G/A 1 11 7 18 5.25217348924221 3.65770777957314 1.59446570966907 A:G G A 10 0.522529682796163 0.48876143429335 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 59405833 A/G 1 40 22 62 19.0988126881535 11.4956530215156 7.60315966663789 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0568811042721312 ENSG00000166889:ENST00000300146:exon_59404189_59405884:PATL1;ENSG00000166889:ENST00000428532:exon_59404194_59405884:PATL1;ENSG00000166889:ENST00000435054:exon_59404550_59405884:PATL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 59405837 A/T 1 41 16 57 19.5762830053573 8.36047492473861 11.2158080806187 A:T A T 10 0.522529682796163 0.00323505501663751 ENSG00000166889:ENST00000300146:exon_59404189_59405884:PATL1;ENSG00000166889:ENST00000428532:exon_59404194_59405884:PATL1;ENSG00000166889:ENST00000435054:exon_59404550_59405884:PATL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 62285721 G/T 1 41 46 87 19.5762830053573 24.0363654086235 -4.46008240326618 T:G G T 10 0.522529682796163 0.390710327141542 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 62290979 T/C 1 15 21 36 7.16205475805756 10.9731233387194 -3.81106858066187 T:C T C 10 0.522529682796163 0.243306117385944 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 62293948 G/A 1 9 9 18 4.29723285483453 4.70276714516547 -0.405534290330934 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 62298597 C/A 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 A:C C A 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62296097_62301147:AHNAK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 62378687 G/T 1 12 16 28 5.72964380644604 8.36047492473861 -2.63083111829256 T:G G T 10 0.522529682796163 0.348672207955825 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 63585804 C/A 1 28 14 42 13.3691688817074 7.31541555914628 6.05375332256116 A:C C A 10 0.522529682796163 0.0650263125848042 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63585688_63585837:C11orf84 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 63988045 G/A 1 90 91 181 42.9723285483453 47.5502011344508 -4.5778725861055 A:G G A 10 0.522529682796163 0.503957352046388 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 63988102 C/T 1 152 119 271 72.5754882149832 62.1810322527434 10.3944559622398 T:C C T 10 0.522529682796163 0.223906044279462 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 63991801 T/C 1 43 45 88 20.531223639765 23.5138357258273 -2.98261208606234 T:C T C 10 0.522529682796163 0.524574225962882 ENSG00000149743:ENST00000394547:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63991757_63991813:TRPT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 64081445 G/A 1 25 23 48 11.9367579300959 12.0181827043117 -0.0814247742158223 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000173153:ENST00000406310:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000000442:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000405666:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000467987:exon_64081243_64081539:ESRRA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 64109208 G/C 1 37 34 71 17.666401736542 17.7660092150695 -0.0996074785275702 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 64622869 G/C 1 128 90 218 61.1162006020911 47.0276714516547 14.0885291504365 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0577839374524707 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 64645871 A/G 1 113 81 194 53.9541458440336 42.3249043064892 11.6292415375444 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0985662771065508 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 64680819 G/A 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 A:G G A 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64680738_64680867:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64680738_64680873:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64680738_64680873:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000227459:exon_64680738_64680873:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000461701:exon_64680738_64681972:ATG2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 58 39 97 27.6932783978225 20.3786576290504 7.31462076877219 T:C T C 10 0.522529682796163 0.154709083180505 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 64807235 C/T 1 14 10 24 6.68458444085372 5.22529682796163 1.45928761289209 T:C C T 10 0.522529682796163 0.683803771305971 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 64812857 G/A 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G G A 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64812295_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355369:exon_64812297_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000339885:exon_64812297_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526799:exon_64812698_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529274:exon_64812708_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64812708_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526516:exon_64812776_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000532802:exon_64812785_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530995:exon_64812823_64812929:NAALADL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 64884052 G/A 1 6 9 15 2.86482190322302 4.70276714516547 -1.83794524194244 A:G G A 10 0.522529682796163 0.440567980680144 ENSG00000174276:ENST00000310597:exon_64883876_64885170:ZNHIT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 42 50 92 20.0537533225612 26.1264841398081 -6.07273081724699 T:C C T 10 0.522529682796163 0.211927002715728 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65064690 G/A 1 7 9 16 3.34229222042686 4.70276714516547 -1.36047492473861 A:G G A 10 0.522529682796163 0.618833530377833 ENSG00000014138:ENST00000265465:exon_65064591_65066156:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000527618:exon_65064591_65065087:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000534785:exon_65064591_65065023:POLA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65161129 C/T 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000528854:exon_65161044_65161226:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65161044_65161145:FRMD8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65168281 C/T 1 2 6 8 0.954940634407674 3.13517809677698 -2.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.163120845582557 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65168195_65168338:FRMD8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65211940 C/A 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:C C A 10 0.522529682796163 0.75639440366831 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65269349 C/G 1 507 527 1034 242.077450822345 275.373142833578 -33.2956920112325 A:T:C:G C G 10 0.522529682796163 0.0398844360061328 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65271832 C/T 1 172 151 323 82.12489455906 78.9019821022206 3.22291245683935 T:C C T 10 0.522529682796163 0.7384343437776 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65338034 A/G 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:G A G 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65337931_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527920:exon_65337956_65338226:SSSCA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65338944 T/G 1 44 56 100 21.0086939569688 29.2616622365851 -8.25296827961629 T:G T G 10 0.522529682796163 0.109195671594407 ENSG00000173465:ENST00000309328:exon_65338862_65339241:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65338862_65339359:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000526877:exon_65338862_65339329:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000533115:exon_65338862_65339250:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527413:exon_65338862_65339239:SSSCA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 24 31 55 11.4592876128921 16.1984201666811 -4.73913255378896 A:G G A 10 0.522529682796163 0.225165266096053 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 23 39 62 10.9818172956883 20.3786576290504 -9.3968403333621 A:T:G T G 10 0.522529682796163 0.0214106447621449 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65380916 G/A 1 19 26 45 9.0719360268729 13.5857717527002 -4.51383572582733 A:G G A 10 0.522529682796163 0.183040191036825 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65380489_65381713:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524856:exon_65380489_65382853:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000527304:exon_65376103_65381707:MAP3K11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65386206 C/G 1 13 4 17 6.20711412364988 2.09011873118465 4.11699539246523 C:G C G 10 0.522529682796163 0.0528875086287521 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65385411_65386538:PCNXL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65387378 T/A 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 A:T T A 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387225_65387403:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000531045:exon_65387329_65387403:PCNXL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65392695 C/T 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65392642_65392751:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000530174:exon_65392598_65392751:PCNXL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65404018 G/A 1 20 16 36 9.54940634407674 8.36047492473861 1.18893141933813 A:G G A 10 0.522529682796163 0.740684882472253 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65403862_65404160:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000439247:exon_65403862_65404160:PCNXL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65546857 A/C 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 A:C A C 10 0.522529682796163 0.586132476918336 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65547333 G/A 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.75639440366831 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65623739 A/G 1 2 8 10 0.954940634407674 4.1802374623693 -3.22529682796163 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0559284466504964 ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172803:ENST00000530101:exon_65623600_65624367:SNX32 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65824472 C/T 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C C T 10 0.522529682796163 0.74489974815786 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 65826704 G/A 1 164 131 295 78.3051320214293 68.4513884462973 9.85374357513193 A:G G A 10 0.522529682796163 0.268195174081960 ENSG00000087365:ENST00000528302:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000322535:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000355456:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000529994:exon_65826672_65826809:SF3B2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 66031660 C/T 1 16 16 32 7.63952507526139 8.36047492473861 -0.720949849477215 T:C C T 10 0.522529682796163 0.86046417845866 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031517_66031690:KLC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 66392169 C/T 1 28 20 48 13.3691688817074 10.4505936559233 2.91857522578418 T:C C T 10 0.522529682796163 0.470605505708964 ENSG00000239306:ENST00000310137:exon_66391685_66393149:RBM14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 67198906 T/C 1 20 31 51 9.54940634407674 16.1984201666811 -6.64901382260431 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0687302279535203 ENSG00000175634:ENST00000530623:exon_67198839_67199053:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67198839_67198986:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67198839_67198986:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67196998_67200128:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67198839_67198986:RPS6KB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 67235051 G/A 1 9 3 12 4.29723285483453 1.56758904838849 2.72964380644604 A:G G A 10 0.522529682796163 0.150898424576211 ENSG00000172663:ENST00000393877:exon_67234972_67235061:TMEM134;ENSG00000172663:ENST00000308022:exon_67234972_67235061:TMEM134;ENSG00000172663:ENST00000452789:exon_67234972_67235061:TMEM134 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 67351585 C/G 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 C:G C G 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 67378838 C/G 1 8 11 19 3.8197625376307 5.74782651075779 -1.9280639731271 C:G C G 10 0.522529682796163 0.492106910577732 ENSG00000167792:ENST00000527923:exon_67378619_67379040:NDUFV1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 18 6 24 8.59446570966907 3.13517809677698 5.45928761289209 T:C C T 10 0.522529682796163 0.038735723930301 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 67833919 G/A 1 15 13 28 7.16205475805756 6.79288587635012 0.369168881707437 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000110721:ENST00000265689:exon_67833896_67833983:CHKA;ENSG00000110721:ENST00000525155:exon_67833896_67833927:CHKA;ENSG00000110721:ENST00000356135:exon_67833896_67833983:CHKA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 68030015 C/T 1 19 27 46 9.0719360268729 14.1083014354964 -5.0363654086235 T:C C T 10 0.522529682796163 0.142745156742737 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 68030173 C/A 1 15 13 28 7.16205475805756 6.79288587635012 0.369168881707437 A:C C A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 68183986 C/T 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68183796_68183995:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68183796_68183995:LRP5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 68192690 G/A 1 15 3 18 7.16205475805756 1.56758904838849 5.59446570966907 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00859335318552677 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 68201295 C/T 1 3 8 11 1.43241095161151 4.1802374623693 -2.74782651075779 T:C C T 10 0.522529682796163 0.131967912623333 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68201070_68201306:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68201070_68201306:LRP5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 70263190 G/A 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G G A 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70263119_70263229:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70263119_70263229:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70263119_70263229:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000415461:exon_70263119_70263229:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000532334:exon_70262846_70263229:CTTN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 21 29 50 10.0268766612806 15.1533608010887 -5.12648413980815 A:G G A 10 0.522529682796163 0.158416511693814 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 71155171 C/T 1 20 21 41 9.54940634407674 10.9731233387194 -1.42371699464268 T:C C T 10 0.522529682796163 0.755017185627608 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 12 9 21 5.72964380644604 4.70276714516547 1.02687666128058 C:G G C 10 0.522529682796163 0.670391349361465 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 71714526 G/C 1 43 34 77 20.531223639765 17.7660092150695 2.76521442469545 C:G G C 10 0.522529682796163 0.569355040218986 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 71714528 T/G 1 43 34 77 20.531223639765 17.7660092150695 2.76521442469545 T:G T G 10 0.522529682796163 0.569355040218986 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 71715218 T/C 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C T C 10 0.522529682796163 0.534231980874486 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 71941033 G/C 1 49 46 95 23.396045542988 24.0363654086235 -0.64031986563548 C:G G C 10 0.522529682796163 0.918464263914362 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71940968_71941063:INPPL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 71941212 A/G 1 27 33 60 12.8916985645036 17.2434795322734 -4.35178096776978 A:G A G 10 0.522529682796163 0.301456845353128 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71941165_71941315:INPPL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 71945332 A/G 1 54 51 105 25.7833971290072 26.6490138226043 -0.865616693597111 A:G A G 10 0.522529682796163 0.92225875117924 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71945325_71945438:INPPL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 71948536 C/G 1 45 30 75 21.4861642741727 15.6758904838849 5.81027379028778 C:G C G 10 0.522529682796163 0.203740693111987 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71948168_71948840:INPPL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 72040784 T/C 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C T C 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72040751_72040848:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72040751_72040848:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72040751_72040848:CLPB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 72408055 G/C 1 54 50 104 25.7833971290072 26.1264841398081 -0.34308701080095 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72407594_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408028_72408240:ARAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 72535885 C/T 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 T:C C T 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000168010:ENST00000321297:exon_72535779_72535887:ATG16L2;ENSG00000168010:ENST00000435507:exon_72535779_72535887:ATG16L2;ENSG00000168010:ENST00000439504:exon_72533893_72535887:ATG16L2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 73021084 C/T 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 T:C C T 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000110237:ENST00000263674:exon_73019663_73022875:ARHGEF17 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 73073580 C/T 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000110237:ENST00000263674:exon_73073478_73073779:ARHGEF17 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 73106237 A/C 1 26 18 44 12.4142282472998 9.40553429033093 3.00869395696883 A:C A C 10 0.522529682796163 0.450914289784342 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 73106294 A/C 1 29 19 48 13.8466391989113 9.9280639731271 3.91857522578418 A:C A C 10 0.522529682796163 0.312013123487917 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 73120653 A/G 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000054965:ENST00000064778:exon_73120532_73120706:FAM168A;ENSG00000054965:ENST00000356467:exon_73120532_73120706:FAM168A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 60 69 129 28.6482190322302 36.0545481129352 -7.40632908070502 A:G G A 10 0.522529682796163 0.217138545391693 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 73785326 T/C 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000168014:ENST00000334126:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313663:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313681:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000289350:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000414160:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000442398:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000415191:exon_73785298_73785645:C2CD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 9 13 22 4.29723285483453 6.79288587635012 -2.49565302151559 T:C T C 10 0.522529682796163 0.296166428569315 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 74546905 G/A 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 A:G G A 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000166439:ENST00000299563:exon_74546591_74553458:RNF169 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 75110589 A/G 1 610 512 1122 291.256893494341 267.535197591635 23.7216959027052 A:G A G 10 0.522529682796163 0.160180352071441 ENSG00000149273:ENST00000531188:exon_75110530_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000529173:exon_75110559_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000531810:exon_75110561_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000528439:exon_75110562_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530164:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530689:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530721:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000405680:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000422465:exon_75110564_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000278572:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000532872:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000534440:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527446:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000526608:exon_75110581_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527273:exon_75110586_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000524851:exon_75110587_75110621:RPS3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 75277628 A/G 1 17 6 23 8.11699539246523 3.13517809677698 4.98181729568825 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0578950473537175 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277512_75277726:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277395_75277700:SERPINH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 20 14 34 9.54940634407674 7.31541555914628 2.23399078493046 C:G C G 10 0.522529682796163 0.494919628726952 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 15 14 29 7.16205475805756 7.31541555914628 -0.153360801088725 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 38 33 71 18.1438720537458 17.2434795322734 0.90039252147243 A:G G A 10 0.522529682796163 0.905584237839264 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 13 10 23 6.20711412364988 5.22529682796163 0.981817295688251 T:C T C 10 0.522529682796163 0.835281075870211 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 77378388 T/C 1 32 22 54 15.2790501505228 11.4956530215156 3.7833971290072 T:C T C 10 0.522529682796163 0.341356691578049 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 77378505 A/G 1 26 22 48 12.4142282472998 11.4956530215156 0.918575225784178 A:G A G 10 0.522529682796163 0.885367034849682 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 77409568 T/C 1 8 13 21 3.8197625376307 6.79288587635012 -2.97312333871942 T:C T C 10 0.522529682796163 0.274479547020565 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531026:exon_77409532_77409573:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531768:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000532556:exon_77409532_77409738:RSF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 10 2 12 4.77470317203837 1.04505936559233 3.72964380644604 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0408712623846239 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 77884782 C/T 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C C T 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000188997:ENST00000340067:exon_77882295_77885629:KCTD21 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 77921527 G/C 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 C:G G C 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77920494_77921790:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77920494_77921790:USP35 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 82535963 C/T 1 35 26 61 16.7114611021343 13.5857717527002 3.12568934943406 T:C C T 10 0.522529682796163 0.444448435375435 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82534544_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532767:exon_82535409_82542480:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82535410_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82535415_82536164:PRCP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 A:G G A 10 0.522529682796163 0.568106121039098 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 24 23 47 11.4592876128921 12.0181827043117 -0.558895091419659 T:C C T 10 0.522529682796163 0.88495976855092 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 14 12 26 6.68458444085372 6.27035619355396 0.414228247299763 A:C A C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 87908448 A/G 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000123892:ENST00000243662:exon_87908351_87908635:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000531138:exon_87908351_87908601:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000526372:exon_87908406_87908602:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000441495:exon_87908351_87908635:RAB38 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 93464290 T/C 1 4 9 13 1.90988126881535 4.70276714516547 -2.79288587635012 T:C T C 10 0.522529682796163 0.165288727116232 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 94861862 A/G 1 7 15 22 3.34229222042686 7.83794524194244 -4.49565302151558 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0854182011035238 ENSG00000149218:ENST00000278505:exon_94861541_94865815:ENDOD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 94862725 C/T 1 14 15 29 6.68458444085372 7.83794524194244 -1.15336080108873 T:C C T 10 0.522529682796163 0.712748058622428 ENSG00000149218:ENST00000278505:exon_94861541_94865815:ENDOD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 95512060 A/G 1 9 8 17 4.29723285483453 4.1802374623693 0.116995392465229 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000077458:ENST00000358780:exon_95511986_95512121:FAM76B;ENSG00000077458:ENST00000398187:exon_95511986_95512121:FAM76B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 36 49 85 17.1889314193381 25.603954457012 -8.41502303767385 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0817907016091456 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 95580926 G/A 1 9 23 32 4.29723285483453 12.0181827043117 -7.72094984947721 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00731626660782005 ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000393223:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000444541:exon_95580878_95581063:MTMR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 96116444 T/C 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 T:C T C 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96113701_96116637:CCDC82 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 102201848 G/A 1 59 62 121 28.1707487150264 32.3968403333621 -4.22609161833572 A:G G A 10 0.522529682796163 0.467230332258988 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102201730_102201972:BIRC3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 72 53 125 34.3778628386763 27.6940731881966 6.68378965047963 A:G G A 10 0.522529682796163 0.245154022982876 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 102272277 G/T 1 35 77 112 16.7114611021343 40.2347855753045 -23.5233244731703 T:G G T 10 0.522529682796163 1.02339626270164e-05 ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272270_102272423:TMEM123 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 102272839 C/A 1 49 57 106 23.396045542988 29.7841919193813 -6.38814637639327 A:C C A 10 0.522529682796163 0.243274515350827 ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000529492:exon_102272475_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000525577:exon_102272656_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000531103:exon_102272765_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000526676:exon_102272830_102272937:TMEM123 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 104900488 G/A 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000137752:ENST00000532439:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000526568:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000527979:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000533400:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000436863:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000415981:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000393136:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000446369:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000525825:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000534497:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000529871:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000528974:exon_104900392_104900626:CASP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 107299623 A/C 1 8 15 23 3.8197625376307 7.83794524194244 -4.01818270431175 A:C A C 10 0.522529682796163 0.0995395512560875 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 107917087 A/G 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000166266:ENST00000299351:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000393094:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000526303:exon_107916997_107917220:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000531427:exon_107916997_107917096:CUL5;ENSG00000166266:ENST00000532782:exon_107916997_107917096:CUL5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 8 17 25 3.8197625376307 8.88300460753477 -5.06324206990407 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0465550022550560 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 44 26 70 21.0086939569688 13.5857717527002 7.42292220426859 A:C A C 10 0.522529682796163 0.093275445218911 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 111896242 G/A 1 28 30 58 13.3691688817074 15.6758904838849 -2.30672160217745 A:G G A 10 0.522529682796163 0.59981582190577 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 111896324 C/T 1 13 10 23 6.20711412364988 5.22529682796163 0.981817295688251 T:C C T 10 0.522529682796163 0.835281075870211 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111896320_111896475:DLAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 12 20 32 5.72964380644604 10.4505936559233 -4.72094984947722 T:C T C 10 0.522529682796163 0.111523671734892 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 111916647 G/A 1 13 8 21 6.20711412364988 4.1802374623693 2.02687666128058 A:G G A 10 0.522529682796163 0.393482202967395 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111916587_111916694:DLAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 4 11 15 1.90988126881535 5.74782651075779 -3.83794524194244 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0677953951072992 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 117063003 G/A 1 19 15 34 9.0719360268729 7.83794524194244 1.23399078493046 A:G G A 10 0.522529682796163 0.733153130187491 ENSG00000149577:ENST00000324225:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000278951:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000529441:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000431081:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000529484:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000525065:exon_117062970_117063078:SIDT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 10 13 23 4.77470317203837 6.79288587635012 -2.01818270431175 A:G A G 10 0.522529682796163 0.413003311192827 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 117691386 G/A 1 139 49 188 66.3683740913334 25.603954457012 40.7644196343214 A:G G A 10 0.522529682796163 1.2747296371497e-09 ENSG00000137731:ENST00000532119:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000528014:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000292079:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000260287:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000534383:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000533281:exon_117691275_117691411:FXYD2;ENSG00000254844:ENST00000531850:exon_117691176_117691436:RP11-728F11.3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 118771747 A/G 1 7 1 8 3.34229222042686 0.522529682796163 2.8197625376307 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0725354402980475 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000525300:exon_118771328_118772335:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000392849:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118771328_118773617:BCL9L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 118772516 T/C 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 T:C T C 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000392849:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118771328_118773617:BCL9L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 118919132 G/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G G A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 118925341 G/A 1 39 37 76 18.6213423709496 19.333598263458 -0.712255892508384 A:G G A 10 0.522529682796163 0.908850697582994 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925211_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925249_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925280_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925297_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925333_118925387:HYOU1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 118940957 C/G 1 11 13 24 5.25217348924221 6.79288587635012 -1.54071238710791 C:G C G 10 0.522529682796163 0.54717203422613 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 118942333 C/T 1 6 12 18 2.86482190322302 6.27035619355396 -3.40553429033093 T:C C T 10 0.522529682796163 0.155342186917693 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 118947634 C/T 1 7 15 22 3.34229222042686 7.83794524194244 -4.49565302151558 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0854182011035238 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 118949331 C/T 1 12 23 35 5.72964380644604 12.0181827043117 -6.2885388978657 T:C C T 10 0.522529682796163 0.04132523785845 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 42 47 89 20.0537533225612 24.5588950914197 -4.5051417688585 A:T:G A G 10 0.522529682796163 0.342121244311585 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 15 16 31 7.16205475805756 8.36047492473861 -1.19842016668105 T:C T C 10 0.522529682796163 0.721148115439186 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 119005132 C/T 1 9 11 20 4.29723285483453 5.74782651075779 -1.45059365592326 T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.655579202774615 ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119004794_119005764:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119004794_119006752:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119004794_119005764:HINFP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 120347940 A/G 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000196914:ENST00000397843:exon_120347928_120348014:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000356641:exon_120347928_120348014:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000532993:exon_120347928_120348014:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000529970:exon_120347928_120348014:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000526067:exon_120347928_120348014:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000528681:exon_120347709_120348014:ARHGEF12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 121367626 T/C 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 T:C T C 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121367578_121367758:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532451:exon_121367578_121367758:SORL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 121393684 G/A 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 A:G G A 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121393625_121393698:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532451:exon_121393625_121393698:SORL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 121456962 C/T 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 T:C C T 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121456931_121457038:SORL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 121460846 C/T 1 14 7 21 6.68458444085372 3.65770777957314 3.02687666128058 T:C C T 10 0.522529682796163 0.198668287049760 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121460749_121460883:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121460749_121460883:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121460749_121460883:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121460749_121460883:SORL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 716 878 1594 341.868747117947 458.781061495031 -116.912314377084 A:T:G A G 10 0.522529682796163 4.87668763967848e-09 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 124496774 C/T 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 T:C C T 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000154144:ENST00000473629:exon_124496709_124496946:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000491010:exon_124496695_124496946:TBRG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 46 41 87 21.9636345913765 21.4237169946427 0.539917596733822 T:C T C 10 0.522529682796163 0.915067897746988 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 124955032 T/C 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 T:C T C 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000134955:ENST00000403796:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000407458:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000298280:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000526405:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000308074:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000525837:exon_124954962_124955035:SLC37A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 11 16 27 5.25217348924221 8.36047492473861 -3.1083014354964 A:T T A 10 0.522529682796163 0.252302553779524 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 14 14 28 6.68458444085372 7.31541555914628 -0.630831118292562 A:G A G 10 0.522529682796163 0.85163607998196 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 41 36 77 19.5762830053573 18.8110685806619 0.765214424695451 A:G G A 10 0.522529682796163 0.909429090593982 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 19 27 46 9.0719360268729 14.1083014354964 -5.0363654086235 C:G C G 10 0.522529682796163 0.142745156742737 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 125769354 T/C 1 18 9 27 8.59446570966907 4.70276714516547 3.8916985645036 T:C T C 10 0.522529682796163 0.176868029794727 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 37 45 82 17.666401736542 23.5138357258273 -5.84743398928536 T:C T C 10 0.522529682796163 0.223992619857650 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 11 134047243 T/C 1 15 16 31 7.16205475805756 8.36047492473861 -1.19842016668105 T:C T C 10 0.522529682796163 0.721148115439186 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 427340 A/C 1 15 17 32 7.16205475805756 8.88300460753477 -1.72094984947721 A:C A C 10 0.522529682796163 0.597738714995898 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 1702561 G/A 1 2 8 10 0.954940634407674 4.1802374623693 -3.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0559284466504964 ENSG00000171823:ENST00000339235:exon_1702039_1703331:FBXL14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 1893170 C/T 1 8 12 20 3.8197625376307 6.27035619355396 -2.45059365592326 T:C C T 10 0.522529682796163 0.371173578167092 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1893046_1893239:ADIPOR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 2061956 G/A 1 12 9 21 5.72964380644604 4.70276714516547 1.02687666128058 A:G G A 10 0.522529682796163 0.670391349361465 ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2061582_2062454:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2061582_2062454:DCP1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 3147203 C/T 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:C C T 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000197905:ENST00000358409:exon_3147134_3147274:TEAD4;ENSG00000197905:ENST00000359864:exon_3147134_3147274:TEAD4;ENSG00000197905:ENST00000443986:exon_3147134_3147274:TEAD4;ENSG00000197905:ENST00000397122:exon_3147134_3147274:TEAD4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 16 19 35 7.63952507526139 9.9280639731271 -2.2885388978657 A:G G A 10 0.522529682796163 0.500007018553045 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6450945 T/C 1 2 8 10 0.954940634407674 4.1802374623693 -3.22529682796163 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0559284466504964 ENSG00000067182:ENST00000162749:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A;ENSG00000067182:ENST00000440083:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 30 13 43 14.3241095161151 6.79288587635012 7.53122363976499 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0221977419910713 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 24 14 38 11.4592876128921 7.31541555914628 4.14387205374581 A:G A G 10 0.522529682796163 0.196413888222871 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 36 28 64 17.1889314193381 14.6308311182926 2.55810030104557 A:G A G 10 0.522529682796163 0.53459684756262 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 42 34 76 20.0537533225612 17.7660092150695 2.28774410749162 T:C C T 10 0.522529682796163 0.646778963174573 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6639981 C/G 1 39 46 85 18.6213423709496 24.0363654086235 -5.41502303767385 C:G C G 10 0.522529682796163 0.277562481781558 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6639857_6639983:NCAPD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6643991 C/G 1 3939 4102 8041 1880.75557946591 2143.41675882986 -262.661179363947 A:T:C:G C G 10 0.522529682796163 4.8716935027621e-09 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000496049:exon_6643976_6644307:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6643976_6644157:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6643958_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6643985_6644027:GAPDH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4159 3705 7864 1985.79904925076 1935.97247475978 49.8265744909745 A:T:C:G T C 10 0.522529682796163 0.263775563795476 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 3962 3770 7732 1891.7373967616 1969.93690414153 -78.1995073799319 A:T:C T C 10 0.522529682796163 0.075748458768263 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6657538 T/G 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 T:G T G 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000010295:ENST00000488007:exon_6657231_6657711:IFFO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6839913 C/T 1 38 26 64 18.1438720537458 13.5857717527002 4.55810030104557 T:C C T 10 0.522529682796163 0.263026781103735 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6839835_6839986:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6839835_6839986:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6839835_6839986:COPS7A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 19 21 40 9.0719360268729 10.9731233387194 -1.90118731184652 A:G G A 10 0.522529682796163 0.63557898252467 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6858126 G/A 1 99 91 190 47.2695614031799 47.5502011344508 -0.280639731270966 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000089693:ENST00000435120:exon_6857936_6858148:MLF2;ENSG00000089693:ENST00000203630:exon_6857936_6858148:MLF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6887020 T/C 1 17 10 27 8.11699539246523 5.22529682796163 2.8916985645036 T:C T C 10 0.522529682796163 0.336152240727391 ENSG00000089692:ENST00000203629:exon_6886957_6887087:LAG3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6954875 C/T 1 2 6 8 0.954940634407674 3.13517809677698 -2.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.163120845582557 ENSG00000111664:ENST00000229264:exon_6954750_6954966:GNB3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 32 42 74 15.2790501505228 21.9462466774388 -6.66719652691606 A:G A G 10 0.522529682796163 0.130900449569484 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 4 9 13 1.90988126881535 4.70276714516547 -2.79288587635012 A:G A G 10 0.522529682796163 0.165288727116232 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 10865873 G/A 1 49 52 101 23.396045542988 27.1715435054005 -3.77549796241246 A:G G A 10 0.522529682796163 0.486206986070928 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10865810_10865932:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10865810_10865932:CSDA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 12871099 T/G 1 24 27 51 11.4592876128921 14.1083014354964 -2.64901382260431 T:G T G 10 0.522529682796163 0.485646556660980 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 14577892 A/T 1 3 9 12 1.43241095161151 4.70276714516547 -3.27035619355396 A:T A T 10 0.522529682796163 0.0813542896879837 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14576843_14578407:ATF7IP;ENSG00000171681:ENST00000396279:exon_14576850_14578391:ATF7IP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 14587301 A/G 1 14 14 28 6.68458444085372 7.31541555914628 -0.630831118292562 A:G A G 10 0.522529682796163 0.85163607998196 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14587271_14587357:ATF7IP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 16189694 T/A 1 18 29 47 8.59446570966907 15.1533608010887 -6.55889509141966 A:T T A 10 0.522529682796163 0.0586441094705406 ENSG00000023697:ENST00000428559:exon_16189624_16190220:DERA;ENSG00000023697:ENST00000526530:exon_16189624_16190214:DERA;ENSG00000023697:ENST00000025429:exon_16189624_16190209:DERA;ENSG00000023697:ENST00000530274:exon_16189624_16189747:DERA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 16516994 G/A 1 80 87 167 38.197625376307 45.4600824032662 -7.26245702695922 A:G G A 10 0.522529682796163 0.278409293419396 ENSG00000008394:ENST00000010404:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396210:exon_16516729_16517342:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396209:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396207:exon_16516729_16517343:MGST1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 16 16 32 7.63952507526139 8.36047492473861 -0.720949849477215 T:G T G 10 0.522529682796163 0.86046417845866 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 21623969 A/G 1 43 38 81 20.531223639765 19.8561279462542 0.675095693510798 A:G A G 10 0.522529682796163 0.911789808349989 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21623903_21624032:RECQL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 21630868 G/C 1 21 23 44 10.0268766612806 12.0181827043117 -1.99130604303117 C:G G C 10 0.522529682796163 0.550881595818085 ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21630737_21630903:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21630737_21630903:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21630737_21630903:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21630737_21630903:RECQL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 22602796 A/G 1 12 12 24 5.72964380644604 6.27035619355396 -0.540712387107911 A:G A G 10 0.522529682796163 0.84110056521342 ENSG00000111731:ENST00000333957:exon_22601541_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000446597:exon_22602479_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000396028:exon_22602479_22602825:KIAA0528 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 26806955 G/A 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26806909_26807059:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26806909_26807059:ITPR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 27788021 G/A 1 2 7 9 0.954940634407674 3.65770777957314 -2.70276714516547 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0963891685915122 ENSG00000110841:ENST00000318304:exon_27787843_27788048:PPFIBP1;ENSG00000110841:ENST00000228425:exon_27787843_27788048:PPFIBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 28605426 G/A 1 11 15 26 5.25217348924221 7.83794524194244 -2.58577175270024 A:G G A 10 0.522529682796163 0.332278501659484 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28605411_28605587:CCDC91 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 31255405 C/T 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 T:C C T 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31255361_31255461:DDX11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 32136750 T/C 1 20 28 48 9.54940634407674 14.6308311182926 -5.08142477421582 T:C T C 10 0.522529682796163 0.150617046500085 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 40758652 T/C 1 6 8 14 2.86482190322302 4.1802374623693 -1.31541555914628 T:C T C 10 0.522529682796163 0.595734183488216 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40758644_40763087:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40758644_40758935:LRRK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 42707759 C/T 1 87 67 154 41.5399175967338 35.0094887473429 6.5304288493909 T:C C T 10 0.522529682796163 0.295788622756564 ENSG00000139168:ENST00000266529:exon_42707676_42707788:ZCRB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 46322449 C/T 1 36 22 58 17.1889314193381 11.4956530215156 5.69327839782255 T:C C T 10 0.522529682796163 0.148970872684160 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 48177906 C/T 1 10 4 14 4.77470317203837 2.09011873118465 2.68458444085372 T:C C T 10 0.522529682796163 0.185755143276423 ENSG00000061273:ENST00000080059:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000354334:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000470668:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000459625:exon_48177862_48179254:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000419356:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000310824:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000380610:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000477203:exon_48177862_48178000:HDAC7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 48190044 C/T 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C C T 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000061273:ENST00000080059:exon_48189990_48190081:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000354334:exon_48189990_48190081:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000470668:exon_48189990_48190081:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000419356:exon_48189990_48190081:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000310824:exon_48189990_48190081:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000380610:exon_48189990_48190081:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000477203:exon_48189990_48190081:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000485796:exon_48189990_48190081:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000430670:exon_48189990_48190081:HDAC7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 48238757 A/G 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 A:G A G 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000111424:ENST00000395324:exon_48235322_48238788:VDR;ENSG00000111424:ENST00000229022:exon_48235322_48238788:VDR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 11 6 17 5.25217348924221 3.13517809677698 2.11699539246523 T:C C T 10 0.522529682796163 0.340698354211182 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 48539482 T/G 1 40 40 80 19.0988126881535 20.9011873118465 -1.80237462369304 T:G T G 10 0.522529682796163 0.737489323126676 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000312352:exon_48539347_48539488:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000443538:exon_48539347_48539887:PFKM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 6 15 21 2.86482190322302 7.83794524194244 -4.97312333871942 T:G G T 10 0.522529682796163 0.0466581471430304 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 49086963 G/A 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 A:G G A 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000129315:ENST00000261900:exon_49086752_49088219:CCNT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 49087528 G/A 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 A:G G A 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000129315:ENST00000261900:exon_49086752_49088219:CCNT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 41 31 72 19.5762830053573 16.1984201666811 3.37786283867626 T:G T G 10 0.522529682796163 0.479555355686822 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 49425978 T/C 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49424958_49427747:MLL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 49434074 C/A 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:C C A 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49433507_49435318:MLL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 50189807 C/A 0 0 10 10 0 5.22529682796163 -5.22529682796163 A C A 10 0.522529682796163 0.000615834167563621 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 50189834 T/G 0 0 15 15 0 7.83794524194244 -7.83794524194244 G T G 10 0.522529682796163 1.52825445681417e-05 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 52639302 G/C 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 C:G G C 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000135480:ENST00000331817:exon_52639196_52639416:KRT7;ENSG00000135480:ENST00000422319:exon_52639196_52639416:KRT7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 52642518 G/A 1 7 15 22 3.34229222042686 7.83794524194244 -4.49565302151558 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0854182011035238 ENSG00000135480:ENST00000331817:exon_52642375_52642709:KRT7;ENSG00000135480:ENST00000422319:exon_52642375_52642709:KRT7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 19 14 33 9.0719360268729 7.31541555914628 1.75652046772662 T:C T C 10 0.522529682796163 0.603353342673582 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 53682986 C/T 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682874_53683087:ESPL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 54115875 C/T 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54115809_54115967:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54115809_54115967:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54115809_54115967:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54115809_54115967:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54115809_54115967:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54115809_54115967:CALCOCO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 54448106 A/G 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G A G 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000198353:ENST00000303406:exon_54447701_54448145:HOXC4;ENSG00000198353:ENST00000430889:exon_54447661_54448145:HOXC4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 54675113 G/A 1 16 12 28 7.63952507526139 6.27035619355396 1.36916888170744 A:G G A 10 0.522529682796163 0.706382469889948 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 55355033 C/T 1 19 8 27 9.0719360268729 4.1802374623693 4.8916985645036 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0812872834898839 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55354989_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 55806238 A/G 0 8 0 8 3.8197625376307 0 3.8197625376307 A A 10 0.522529682796163 0.00825889449847131 ENSG00000179899:ENST00000326184:exon_55805506_55808295:PHC1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 56364973 G/A 1 62 33 95 29.6031596666379 17.2434795322734 12.3596801343645 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0133095878144495 ENSG00000123374:ENST00000266970:exon_56364828_56365031:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000440311:exon_56364828_56365031:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000354056:exon_56364828_56365031:CDK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 18 12 30 8.59446570966907 6.27035619355396 2.32410951611511 A:G G A 10 0.522529682796163 0.466497716719164 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 22 16 38 10.5043469784844 8.36047492473861 2.14387205374581 T:C C T 10 0.522529682796163 0.519621537216951 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 56822378 T/A 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 A:T T A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 56825311 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56825255_56825388:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56825255_56825388:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56825255_56825388:TIMELESS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 56827694 C/G 1 11 6 17 5.25217348924221 3.13517809677698 2.11699539246523 C:G C G 10 0.522529682796163 0.340698354211182 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56827557_56827710:TIMELESS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 56992630 C/G 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 C:G C G 10 0.522529682796163 0.586132476918336 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 56994493 C/T 1 24 20 44 11.4592876128921 10.4505936559233 1.00869395696883 T:C C T 10 0.522529682796163 0.880274360748163 ENSG00000076108:ENST00000379441:exon_56994465_56994616:BAZ2A;ENSG00000076108:ENST00000179765:exon_56994465_56994616:BAZ2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 57106660 A/T 1 1618 1567 3185 772.546973235808 818.804012941587 -46.2570397057791 A:T:C:G A T 10 0.522529682796163 0.102713118758202 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57106570_57106692:NACA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 1440 1371 2811 687.557256773525 716.388195113539 -28.8309383400141 A:G A G 10 0.522529682796163 0.281851699640229 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 57114307 A/T 1 2 8 10 0.954940634407674 4.1802374623693 -3.22529682796163 A:T A T 10 0.522529682796163 0.0559284466504964 ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57109655_57115243:NACA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 10 12 22 4.77470317203837 6.27035619355396 -1.49565302151559 T:G T G 10 0.522529682796163 0.531644723723978 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 57499258 C/T 1 75 80 155 35.8102737902878 41.802374623693 -5.99210083340526 T:C C T 10 0.522529682796163 0.336151937164962 ENSG00000166888:ENST00000300134:exon_57499251_57499382:STAT6;ENSG00000166888:ENST00000454075:exon_57499251_57499382:STAT6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 57499432 C/T 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 T:C C T 10 0.522529682796163 0.568106121039098 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 57500108 T/C 1 60 44 104 28.6482190322302 22.9913060430312 5.65691298919905 T:C T C 10 0.522529682796163 0.281376170207047 ENSG00000166888:ENST00000300134:exon_57499974_57500122:STAT6;ENSG00000166888:ENST00000454075:exon_57499974_57500122:STAT6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 57627074 G/T 1 168 181 349 80.2150132902446 94.5778725861055 -14.3628592958609 T:G G T 10 0.522529682796163 0.133450670991003 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57626963_57627128:SHMT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 57926791 T/G 1 62 46 108 29.6031596666379 24.0363654086235 5.5667942580144 T:G T G 10 0.522529682796163 0.291091308970579 ENSG00000175203:ENST00000434715:exon_57926767_57926805:DCTN2;ENSG00000175203:ENST00000354743:exon_57926767_57926805:DCTN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 57985204 C/T 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C C T 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000166908:ENST00000422156:exon_57985073_57985246:PIP4K2C;ENSG00000166908:ENST00000354947:exon_57985073_57985246:PIP4K2C;ENSG00000166908:ENST00000436866:exon_57985073_57985246:PIP4K2C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 58010163 A/G 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G A G 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000240771:ENST00000333972:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000286494:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000471370:exon_58010067_58010278:ARHGEF25 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 104 131 235 49.656912989199 68.4513884462973 -18.7944754570983 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0155551746363279 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 A:T A T 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 30 12 42 14.3241095161151 6.27035619355396 8.05375332256116 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0132956246078573 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 64173807 G/A 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:G G A 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000118600:ENST00000261234:exon_64173664_64173909:TMEM5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 69042495 A/G 1 14 16 30 6.68458444085372 8.36047492473861 -1.67589048388489 A:G A G 10 0.522529682796163 0.586538190836893 ENSG00000127314:ENST00000460800:exon_69042479_69042561:RAP1B;ENSG00000127314:ENST00000485252:exon_69042479_69042561:RAP1B;ENSG00000127314:ENST00000450214:exon_69042479_69042561:RAP1B;ENSG00000127314:ENST00000456697:exon_69042479_69042561:RAP1B;ENSG00000127314:ENST00000250559:exon_69042479_69042561:RAP1B;ENSG00000127314:ENST00000393436:exon_69042479_69042561:RAP1B;ENSG00000127314:ENST00000425247:exon_69042479_69042561:RAP1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 69986788 A/G 1 57 68 125 27.2158080806187 35.5320184301391 -8.31621034952037 A:G A G 10 0.522529682796163 0.151905691935421 ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 72307637 C/G 1 10 9 19 4.77470317203837 4.70276714516547 0.071936026872903 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 76453966 G/A 1 309 246 555 147.538328015986 128.542301967856 18.9960260481296 A:G G A 10 0.522529682796163 0.115832506561587 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76453918_76454059:NAP1L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 31 22 53 14.8015798333189 11.4956530215156 3.30592681180336 C:G C G 10 0.522529682796163 0.410407891429777 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 7 9 16 3.34229222042686 4.70276714516547 -1.36047492473861 C:G G C 10 0.522529682796163 0.618833530377833 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 88500847 T/C 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88500773_88500875:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88500773_88500875:CEP290 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 94772742 C/T 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94772567_94772818:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94772567_94772818:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397807:exon_94772567_94772818:CCDC41 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 95694394 G/A 1 51 41 92 24.3509861773957 21.4237169946427 2.92726918275301 A:G G A 10 0.522529682796163 0.602108969399326 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95693941_95696566:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95693941_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95692870_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95693941_95694944:VEZT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 99007356 T/C 1 32 35 67 15.2790501505228 18.2885388978657 -3.00948874734292 T:C T C 10 0.522529682796163 0.466309872880144 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 99007623 C/T 1 42 42 84 20.0537533225612 21.9462466774388 -1.89249335487769 T:C C T 10 0.522529682796163 0.743433609008171 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 102295218 T/C 1 11 17 28 5.25217348924221 8.88300460753477 -3.63083111829256 T:C T C 10 0.522529682796163 0.188544692376854 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 105388476 C/T 1 7 13 20 3.34229222042686 6.79288587635012 -3.45059365592326 T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.177936173075919 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105388256_105388505:C12orf45 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 105433523 T/A 1 2 6 8 0.954940634407674 3.13517809677698 -2.1802374623693 A:T T A 10 0.522529682796163 0.163120845582557 ENSG00000136010:ENST00000258494:exon_105433491_105433584:ALDH1L2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 105434467 C/T 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 T:C C T 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000136010:ENST00000258494:exon_105434385_105434472:ALDH1L2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 108912299 G/A 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000198855:ENST00000361549:exon_108912177_108913380:FICD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 112460147 T/G 1 140 120 260 66.8458444085372 62.7035619355396 4.14228247299764 T:G T G 10 0.522529682796163 0.619910437881225 ENSG00000089248:ENST00000261735:exon_112459954_112461024:ERP29;ENSG00000089248:ENST00000455836:exon_112459954_112461024:ERP29 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 112477055 T/C 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C T C 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000111300:ENST00000261745:exon_112477033_112477143:NAA25 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 112638486 G/T 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 T:G G T 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000173064:ENST00000430131:exon_112638442_112638602:C12orf51;ENSG00000173064:ENST00000377560:exon_112638442_112638602:C12orf51 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 225 145 370 107.430821370863 75.7668040054436 31.6640173654197 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00102180989309637 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 113386779 C/G 1 35 30 65 16.7114611021343 15.6758904838849 1.03557061824941 C:G C G 10 0.522529682796163 0.805502495080784 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113386666_113387010:OAS3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 113398919 G/A 1 49 41 90 23.396045542988 21.4237169946427 1.97232854834533 A:G G A 10 0.522529682796163 0.751800576375407 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113398876_113399051:OAS3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 113403684 C/T 1 44 35 79 21.0086939569688 18.2885388978657 2.72015505910313 T:C C T 10 0.522529682796163 0.574505608302565 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113403549_113403834:OAS3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 15 14 29 7.16205475805756 7.31541555914628 -0.153360801088725 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 120171995 T/C 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 T:C T C 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120171969_120172162:CIT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 120589064 G/C 1 15 17 32 7.16205475805756 8.88300460753477 -1.72094984947721 C:G G C 10 0.522529682796163 0.597738714995898 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 120591143 A/G 1 14 10 24 6.68458444085372 5.22529682796163 1.45928761289209 A:G A G 10 0.522529682796163 0.683803771305971 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120591017_120591211:GCN1L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 120608031 A/G 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 A:G A G 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120607973_120608125:GCN1L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 120636549 C/A 1 42 15 57 20.0537533225612 7.83794524194244 12.2158080806187 A:C C A 10 0.522529682796163 0.00127615547490105 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 121151093 C/T 1 18 14 32 8.59446570966907 7.31541555914628 1.27905015052279 T:C C T 10 0.522529682796163 0.724992015605387 ENSG00000175970:ENST00000344651:exon_121151077_121151190:UNC119B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 23 35 58 10.9818172956883 18.2885388978657 -7.30672160217745 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0651690602454507 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 18 14 32 8.59446570966907 7.31541555914628 1.27905015052279 C:G G C 10 0.522529682796163 0.724992015605387 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 121442199 T/A 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 A:T T A 10 0.522529682796163 0.393562228098845 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 121442214 G/A 1 9 1 10 4.29723285483453 0.522529682796163 3.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0227385828445189 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 14 13 27 6.68458444085372 6.79288587635012 -0.1083014354964 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 121686494 G/A 1 15 14 29 7.16205475805756 7.31541555914628 -0.153360801088725 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121686409_121686537:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121686409_121686537:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121686409_121686537:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121686409_121686537:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121686409_121686537:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121686409_121686537:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121686409_121686537:CAMKK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 51 41 92 24.3509861773957 21.4237169946427 2.92726918275301 T:C T C 10 0.522529682796163 0.602108969399326 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 122218808 G/A 1 121 112 233 57.7739083816643 58.5233244731702 -0.749416091505964 A:G G A 10 0.522529682796163 0.947755006179813 ENSG00000188735:ENST00000449592:exon_122213515_122219974:TMEM120B;ENSG00000139725:ENST00000267205:exon_122218778_122218912:RHOF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 23 22 45 10.9818172956883 11.4956530215156 -0.513835725827333 A:G A G 10 0.522529682796163 0.882699624435944 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 16 16 32 7.63952507526139 8.36047492473861 -0.720949849477215 T:C:G G C 10 0.522529682796163 0.86046417845866 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 123105143 C/T 1 12 14 26 5.72964380644604 7.31541555914628 -1.58577175270024 T:C C T 10 0.522529682796163 0.561386502703927 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000196917:ENST00000356987:exon_123104824_123105249:GPR81 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 123107101 G/A 1 6 10 16 2.86482190322302 5.22529682796163 -2.36047492473861 A:G G A 10 0.522529682796163 0.317915137228048 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123107009_123107154:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123107009_123107154:KNTC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 11 6 17 5.25217348924221 3.13517809677698 2.11699539246523 T:C C T 10 0.522529682796163 0.340698354211182 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 123705962 C/T 1 3 8 11 1.43241095161151 4.1802374623693 -2.74782651075779 T:C C T 10 0.522529682796163 0.131967912623333 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123705919_123706441:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123705919_123706441:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000392425:exon_123705919_123706441:MPHOSPH9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 123738494 C/T 1 49 54 103 23.396045542988 28.2166028709928 -4.82055732800479 T:C C T 10 0.522529682796163 0.37503205836956 ENSG00000130921:ENST00000253233:exon_123738194_123738503:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000425637:exon_123738194_123739580:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000366329:exon_123738194_123738503:C12orf65 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 123794104 G/T 1 30 25 55 14.3241095161151 13.0632420699041 1.26086744621104 T:G G T 10 0.522529682796163 0.788002591598577 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123794036_123794130:SBNO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 123799938 C/T 1 9 13 22 4.29723285483453 6.79288587635012 -2.49565302151559 T:C C T 10 0.522529682796163 0.296166428569315 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 26 21 47 12.4142282472998 10.9731233387194 1.44110490858034 A:G G A 10 0.522529682796163 0.770698949855164 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 124104049 A/G 1 21 17 38 10.0268766612806 8.88300460753477 1.14387205374581 A:G A G 10 0.522529682796163 0.747665320324482 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103979_124104271:DDX55 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 124104686 G/A 1 29 26 55 13.8466391989113 13.5857717527002 0.260867446211037 A:T:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 124144395 A/G 1 12 12 24 5.72964380644604 6.27035619355396 -0.540712387107911 A:G A G 10 0.522529682796163 0.84110056521342 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 124209332 T/C 1 11 1 12 5.25217348924221 0.522529682796163 4.72964380644604 T:C T C 10 0.522529682796163 0.00694152157969735 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124209201_124209338:ATP6V0A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 124229429 T/C 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 T:C T C 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124229429_124229519:ATP6V0A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 124826462 C/T 1 21 19 40 10.0268766612806 9.9280639731271 0.0988126881534814 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 124856618 A/G 1 30 29 59 14.3241095161151 15.1533608010887 -0.829251284973614 A:G A G 10 0.522529682796163 0.896533552092361 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 124856660 T/A 1 25 26 51 11.9367579300959 13.5857717527002 -1.64901382260431 A:T T A 10 0.522529682796163 0.6758269959157 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 124904584 G/T 1 9 4 13 4.29723285483453 2.09011873118465 2.20711412364988 A:T:G G T 10 0.522529682796163 0.273205822586663 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124904503_124904601:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124904503_124904601:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124904503_124904601:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124904503_124904601:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124904503_124904601:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124904503_124904601:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124904503_124904601:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124904503_124904601:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124904505_124904601:NCOR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 124957627 C/T 1 11 15 26 5.25217348924221 7.83794524194244 -2.58577175270024 T:C C T 10 0.522529682796163 0.332278501659484 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124957498_124957677:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000448008:exon_124957498_124957677:NCOR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 124979789 T/G 1 9 4 13 4.29723285483453 2.09011873118465 2.20711412364988 T:G T G 10 0.522529682796163 0.273205822586663 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124979693_124979798:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124979693_124979914:NCOR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 125298877 G/A 1 45 43 88 21.4861642741727 22.468776360235 -0.982612086062343 A:G G A 10 0.522529682796163 0.832072169366896 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125298748_125298951:SCARB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 125621251 G/A 1 18 18 36 8.59446570966907 9.40553429033093 -0.811068580661868 A:G G A 10 0.522529682796163 0.868001561467127 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125621208_125621410:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125621208_125621410:AACS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 40 52 92 19.0988126881535 27.1715435054005 -8.072730817247 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0957268135739847 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 34 40 74 16.2339907849305 20.9011873118465 -4.66719652691606 T:C C T 10 0.522529682796163 0.296237752669528 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 129299385 G/A 1 20 35 55 9.54940634407674 18.2885388978657 -8.73913255378896 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0212644435114295 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129299320_129299615:SLC15A4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 132549395 G/A 1 13 16 29 6.20711412364988 8.36047492473861 -2.15336080108873 A:G G A 10 0.522529682796163 0.461071503182053 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132549213_132549431:EP400 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 132635581 C/T 1 18 7 25 8.59446570966907 3.65770777957314 4.93675793009593 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0694898655857537 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132635526_132635586:NOC4L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 133212582 G/A 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133212478_133212610:POLE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 133219831 T/C 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133219810_133219916:POLE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 133236000 C/T 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 T:C C T 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133235881_133236095:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133235881_133236095:POLE;ENSG00000177084:ENST00000376577:exon_133235881_133236095:POLE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 133242016 C/T 1 3 11 14 1.43241095161151 5.74782651075779 -4.31541555914628 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0294366142381707 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133241888_133242036:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133241888_133242036:POLE;ENSG00000177084:ENST00000376577:exon_133241888_133242036:POLE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 133272470 G/T 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 T:G G T 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000176894:ENST00000317479:exon_133272470_133272632:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000428960:exon_133272470_133272632:PGAM5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 133294333 C/T 1 40 23 63 19.0988126881535 12.0181827043117 7.08062998384173 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0782850997492981 ENSG00000176894:ENST00000454808:exon_133294296_133294384:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000317555:exon_133294296_133294384:PGAM5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 133306710 C/T 1 57 45 102 27.2158080806187 23.5138357258273 3.70197235479138 T:C C T 10 0.522529682796163 0.488844089038833 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 133384887 C/T 1 14 21 35 6.68458444085372 10.9731233387194 -4.2885388978657 T:C C T 10 0.522529682796163 0.176028958540217 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133384477_133385135:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133384477_133385135:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133384477_133385135:GOLGA3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 133389998 T/C 1 19 13 32 9.0719360268729 6.79288587635012 2.27905015052278 T:C T C 10 0.522529682796163 0.481230502871409 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133389893_133390005:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133389893_133390005:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133389893_133390005:GOLGA3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 133393323 C/T 1 8 18 26 3.8197625376307 9.40553429033093 -5.58577175270024 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0311966047479063 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133393246_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133393126_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133393126_133393398:GOLGA3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 12 133683020 C/T 1 7 10 17 3.34229222042686 5.22529682796163 -1.88300460753477 T:C C T 10 0.522529682796163 0.468082532065744 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140;ENSG00000196387:ENST00000433577:exon_133682901_133683171:ZNF140 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 1 130 4 134 62.0711412364988 2.09011873118465 59.9810225053142 T:C:G T C 10 0.522529682796163 1.80837103119813e-31 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 23905711 A/G 1 16 9 25 7.63952507526139 4.70276714516547 2.93675793009593 A:G A G 10 0.522529682796163 0.317125505244083 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 23907909 A/G 1 6 12 18 2.86482190322302 6.27035619355396 -3.40553429033093 A:G A G 10 0.522529682796163 0.155342186917693 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 23909162 A/G 1 9 10 19 4.29723285483453 5.22529682796163 -0.928063973127097 A:G A G 10 0.522529682796163 0.819201169042762 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 25049676 G/A 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25049610_25049734:PARP4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 25825889 T/C 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 T:C T C 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25825787_25825913:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25825787_25825913:MTMR6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 25828007 G/T 1 2 7 9 0.954940634407674 3.65770777957314 -2.70276714516547 T:G G T 10 0.522529682796163 0.0963891685915122 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25827902_25828102:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25827902_25828102:MTMR6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 25831888 T/C 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25831874_25831983:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25831874_25831983:MTMR6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 25876011 G/A 1 12 17 29 5.72964380644604 8.88300460753477 -3.15336080108873 A:G G A 10 0.522529682796163 0.268071850620001 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25875662_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000313619:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381745:exon_25875666_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000481980:exon_25875694_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000490231:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000480187:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000460326:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000465068:exon_25875763_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000466694:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000463407:exon_25875769_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25875771_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000495460:exon_25875783_25876018:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381747:exon_25875785_25876018:NUPL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 25914221 A/G 1 29 18 47 13.8466391989113 9.40553429033093 4.44110490858034 A:G A G 10 0.522529682796163 0.242573366356421 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25914103_25916544:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25914103_25914856:NUPL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 28009920 G/C 1 31 24 55 14.8015798333189 12.5407123871079 2.26086744621104 C:G G C 10 0.522529682796163 0.59057508075681 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 28197365 G/T 1 146 119 265 69.7106663117602 62.1810322527434 7.52963405901681 A:T:G G T 10 0.522529682796163 0.357212307398252 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 81 82 163 38.6750956935108 42.8474339892854 -4.17233829577457 T:C C T 10 0.522529682796163 0.531103687464334 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 28239940 G/C 1 100 74 174 47.7470317203837 38.6671965269161 9.07983519346764 C:G G C 10 0.522529682796163 0.172679653369754 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 137 111 248 65.4134334569257 58.0007947903741 7.41263866655159 A:G G A 10 0.522529682796163 0.373591587431557 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 41382711 A/T 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 A:T A T 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000102743:ENST00000443985:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000379523:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000426521:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000338625:exon_41382574_41382732:SLC25A15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 41834744 C/T 1 9 4 13 4.29723285483453 2.09011873118465 2.20711412364988 T:C C T 10 0.522529682796163 0.273205822586663 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 42032572 T/C 1 2 6 8 0.954940634407674 3.13517809677698 -2.1802374623693 T:C T C 10 0.522529682796163 0.163120845582557 ENSG00000102760:ENST00000379359:exon_42032421_42032606:C13orf15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 42877265 G/C 1 21 6 27 10.0268766612806 3.13517809677698 6.8916985645036 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0108498760599228 ENSG00000023516:ENST00000025301:exon_42873499_42877999:AKAP11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 42882620 C/T 1 12 12 24 5.72964380644604 6.27035619355396 -0.540712387107911 T:C C T 10 0.522529682796163 0.84110056521342 ENSG00000023516:ENST00000025301:exon_42882590_42882745:AKAP11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 43462352 T/C 1 60 47 107 28.6482190322302 24.5588950914197 4.08932394081056 T:C T C 10 0.522529682796163 0.440540244059701 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 43469157 G/A 1 14 18 32 6.68458444085372 9.40553429033093 -2.72094984947721 A:G G A 10 0.522529682796163 0.378616157656249 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 43469211 G/A 1 12 14 26 5.72964380644604 7.31541555914628 -1.58577175270024 A:G G A 10 0.522529682796163 0.561386502703927 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 43597865 A/G 1 17 10 27 8.11699539246523 5.22529682796163 2.8916985645036 A:G A G 10 0.522529682796163 0.336152240727391 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43597339_43597870:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43597339_43597870:DNAJC15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 46103935 A/G 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 A:G A G 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46103926_46104053:COG3;ENSG00000136152:ENST00000486940:exon_46103926_46104053:COG3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 49070345 C/T 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000136161:ENST00000344532:exon_49070327_49070457:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000450343:exon_49070327_49070457:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000452987:exon_49070327_49070457:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000430805:exon_49070327_49070457:RCBTB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 52602919 A/C 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 A:C A C 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 52603194 G/T 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:G G T 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 18 10 28 8.59446570966907 5.22529682796163 3.36916888170744 T:C C T 10 0.522529682796163 0.256699726213295 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 77574983 A/G 1 5 9 14 2.38735158601918 4.70276714516547 -2.31541555914628 A:G A G 10 0.522529682796163 0.286340857888341 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 77738664 A/G 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:G A G 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77738589_77738676:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77738589_77738676:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77738589_77738676:MYCBP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 77751892 C/T 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 T:C C T 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77751883_77752089:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77751883_77752089:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77751883_77752089:MYCBP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 95264604 C/T 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C C T 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000152749:ENST00000376958:exon_95264444_95264644:GPR180 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 99100547 T/C 1 8 1 9 3.8197625376307 0.522529682796163 3.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0407796571976411 ENSG00000152767:ENST00000376586:exon_99100490_99102016:FARP1;ENSG00000152767:ENST00000319562:exon_99100490_99102023:FARP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 79 61 140 37.7201550591031 31.8743106505659 5.84584440853719 A:G G A 10 0.522529682796163 0.352290861017952 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 68 79 147 32.4679815698609 41.2798449408969 -8.81186337103595 T:C C T 10 0.522529682796163 0.16040338957668 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 103275386 T/C 1 16 13 29 7.63952507526139 6.79288587635012 0.846639198911274 T:C T C 10 0.522529682796163 0.853261309241005 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103275227_103275390:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103275227_103275390:TPP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 23 18 41 10.9818172956883 9.40553429033093 1.57628300535732 A:G A G 10 0.522529682796163 0.642801477166661 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 21 18 39 10.0268766612806 9.40553429033093 0.621342370949645 T:C T C 10 0.522529682796163 0.873943181511761 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 111340342 G/A 1 14 10 24 6.68458444085372 5.22529682796163 1.45928761289209 A:G G A 10 0.522529682796163 0.683803771305971 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111340294_111340365:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111340294_111340365:CARS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 111870037 T/C 1 16 25 41 7.63952507526139 13.0632420699041 -5.42371699464268 T:C T C 10 0.522529682796163 0.116983998255258 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000449979:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491775:exon_111870026_111870147:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000467053:exon_111870026_111870212:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426768:exon_111870026_111870232:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111870026_111870227:ARHGEF7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 114157846 G/A 1 3 13 16 1.43241095161151 6.79288587635012 -5.36047492473861 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0101167898008487 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114157811_114157903:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114157811_114157903:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114157811_114157903:TMCO3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 115002305 G/A 1 15 12 27 7.16205475805756 6.27035619355396 0.8916985645036 A:G G A 10 0.522529682796163 0.847892523515759 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115002277_115002371:CDC16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 115004914 C/T 1 17 13 30 8.11699539246523 6.79288587635012 1.32410951611511 T:C C T 10 0.522529682796163 0.716107033674038 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 115004935 T/C 1 27 27 54 12.8916985645036 14.1083014354964 -1.2166028709928 T:C T C 10 0.522529682796163 0.786109915404218 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 13 115030714 T/C 1 51 51 102 24.3509861773957 26.6490138226043 -2.29802764520862 T:C T C 10 0.522529682796163 0.692153136512938 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 20784431 G/A 1 100 102 202 47.7470317203837 53.2980276452086 -5.55099592482492 A:G G A 10 0.522529682796163 0.439407355814486 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20784386_20784731:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 24 28 52 11.4592876128921 14.6308311182926 -3.17154350540047 T:C T C 10 0.522529682796163 0.406883491224910 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 15 17 32 7.16205475805756 8.88300460753477 -1.72094984947721 C:G G C 10 0.522529682796163 0.597738714995898 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 20841707 C/T 1 6 9 15 2.86482190322302 4.70276714516547 -1.83794524194244 T:C C T 10 0.522529682796163 0.440567980680144 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20841666_20841742:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20841666_20841742:TEP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 20845879 G/A 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 A:G G A 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20845759_20845912:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20845759_20845912:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000471684:exon_20845759_20845903:TEP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 20852029 A/G 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 A:G A G 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20851902_20852077:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20851902_20852077:TEP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 20852817 G/A 1 5 9 14 2.38735158601918 4.70276714516547 -2.31541555914628 A:G G A 10 0.522529682796163 0.286340857888341 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20852759_20852872:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20852759_20852872:TEP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 21 29 50 10.0268766612806 15.1533608010887 -5.12648413980815 T:C T C 10 0.522529682796163 0.158416511693814 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 13 14 27 6.20711412364988 7.31541555914628 -1.1083014354964 T:C T C 10 0.522529682796163 0.703625443243212 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 21945415 A/G 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21945281_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21945335_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21945341_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21945362_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000447695:exon_21945383_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000457430:exon_21945383_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000494242:exon_21945392_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455138:exon_21945397_21945443:TOX4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 26 20 46 12.4142282472998 10.4505936559233 1.9636345913765 T:C T C 10 0.522529682796163 0.658453984663438 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 28 29 57 13.3691688817074 15.1533608010887 -1.78419191938129 A:G G A 10 0.522529682796163 0.691556814294924 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 21967438 G/A 1 15 12 27 7.16205475805756 6.27035619355396 0.8916985645036 A:G G A 10 0.522529682796163 0.847892523515759 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 30 29 59 14.3241095161151 15.1533608010887 -0.829251284973614 A:G A G 10 0.522529682796163 0.896533552092361 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 22961854 A/G 0 0 8 8 0 4.1802374623693 -4.1802374623693 G A G 10 0.522529682796163 0.00270128884102245 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23020706 C/A 1 151 225 376 72.0980178977794 117.569178629137 -45.4711607313573 A:C C A 10 0.522529682796163 3.05537444794393e-06 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23020919 C/T 1 165 80 245 78.7826023386331 41.802374623693 36.9802277149401 T:C C T 10 0.522529682796163 1.91064414159284e-06 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23020921 G/C 1 192 89 281 91.6743009031367 46.5051417688585 45.1691591342782 C:G G C 10 0.522529682796163 5.96039731967981e-08 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23020970 G/T 1 212 87 299 101.223707247213 45.4600824032662 55.7636248439473 T:G G T 10 0.522529682796163 5.6230751439418e-11 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23021039 G/A 1 124 72 196 59.2063193332758 37.6221371613237 21.5841821719521 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00205952768809988 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23248112 A/G 1 16 10 26 7.63952507526139 5.22529682796163 2.41422824729976 A:G A G 10 0.522529682796163 0.433314383592609 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23248002_23248146:SLC7A7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23282110 A/G 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 A:G A G 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23282109_23282416:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23282449 C/T 1 18 18 36 8.59446570966907 9.40553429033093 -0.811068580661868 T:C C T 10 0.522529682796163 0.868001561467127 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000488800:exon_23282184_23282649:SLC7A7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 29 31 60 13.8466391989113 16.1984201666811 -2.35178096776978 T:G G T 10 0.522529682796163 0.605779141393833 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 23 19 42 10.9818172956883 9.9280639731271 1.05375332256116 C:G G C 10 0.522529682796163 0.760222357470147 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23374435 G/A 1 18 21 39 8.59446570966907 10.9731233387194 -2.37865762905036 A:G G A 10 0.522529682796163 0.522183815680855 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374303_23374455:RBM23 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23374862 C/T 1 27 18 45 12.8916985645036 9.40553429033093 3.48616427417267 T:C C T 10 0.522529682796163 0.370822227936037 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374815_23374868:RBM23 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23549285 G/A 1 40 34 74 19.0988126881535 17.7660092150695 1.33280347308394 A:G G A 10 0.522529682796163 0.816338564275905 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 37 23 60 17.666401736542 12.0181827043117 5.64821903223022 A:G A G 10 0.522529682796163 0.156361458242063 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23549383 G/T 1 40 26 66 19.0988126881535 13.5857717527002 5.51304093545324 T:G G T 10 0.522529682796163 0.178067168277877 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 80 70 150 38.197625376307 36.5770777957314 1.62054758057555 T:C T C 10 0.522529682796163 0.806809105406937 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23745533 C/T 1 12 6 18 5.72964380644604 3.13517809677698 2.59446570966907 T:C C T 10 0.522529682796163 0.246476394158893 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 23777099 G/A 1 14 11 25 6.68458444085372 5.74782651075779 0.936757930095927 A:G G A 10 0.522529682796163 0.841937992643628 ENSG00000129473:ENST00000250405:exon_23776969_23777408:BCL2L2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 28 8 36 13.3691688817074 4.1802374623693 9.18893141933813 A:G A G 10 0.522529682796163 0.00227639108752514 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24572812 G/A 1 52 26 78 24.8284564945995 13.5857717527002 11.2426847418993 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.0122697092084725 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24572719_24573339:PCK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 10 16 26 4.77470317203837 8.36047492473861 -3.58577175270024 T:C C T 10 0.522529682796163 0.173614440209318 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 25 18 43 11.9367579300959 9.40553429033093 2.53122363976499 T:C C T 10 0.522529682796163 0.450659581558187 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24629744 G/A 1 32 28 60 15.2790501505228 14.6308311182926 0.648219032230223 A:G G A 10 0.522529682796163 0.897788639236382 ENSG00000092098:ENST00000382682:exon_24629729_24629870:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000491351:exon_24629729_24629869:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24629729_24629866:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000382687:exon_24629729_24629870:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000483895:exon_24629729_24629814:RNF31 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24642348 C/T 1 23 24 47 10.9818172956883 12.5407123871079 -1.55889509141966 T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.664170975831398 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24642335_24642407:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24642335_24642407:REC8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 16 16 32 7.63952507526139 8.36047492473861 -0.720949849477215 A:G G A 10 0.522529682796163 0.86046417845866 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24653965 C/T 1 13 18 31 6.20711412364988 9.40553429033093 -3.19842016668105 T:C C T 10 0.522529682796163 0.283091271832841 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 84 84 168 40.1075066451223 43.8924933548777 -3.78498670975537 T:C C T 10 0.522529682796163 0.589074494317372 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24702789 C/T 1 53 31 84 25.3059268118034 16.1984201666811 9.10750664512231 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0494638366613301 ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24702685_24702804:GMPR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 21 16 37 10.0268766612806 8.36047492473861 1.66640173654197 A:G G A 10 0.522529682796163 0.624467280752172 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 29 25 54 13.8466391989113 13.0632420699041 0.7833971290072 T:C T C 10 0.522529682796163 0.89203796797713 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24761805 A/C 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:C A C 10 0.522529682796163 0.74489974815786 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 19 11 30 9.0719360268729 5.74782651075779 3.32410951611511 A:C A C 10 0.522529682796163 0.273757088952871 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24901276 G/T 1 33 11 44 15.7565204677266 5.74782651075779 10.0086939569688 T:G G T 10 0.522529682796163 0.00237156374676404 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24909281 C/T 1 51 76 127 24.3509861773957 39.7122558925084 -15.3612697151127 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00748540421587163 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24909362 T/C 1 52 68 120 24.8284564945995 35.5320184301391 -10.7035619355396 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0549010552312542 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24909475 C/G 1 62 62 124 29.6031596666379 32.3968403333621 -2.79368066672421 T:C:G C G 10 0.522529682796163 0.653446125434317 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24909731 C/T 1 34 28 62 16.2339907849305 14.6308311182926 1.6031596666379 T:C C T 10 0.522529682796163 0.704826598716671 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24910846 C/T 1 11 1 12 5.25217348924221 0.522529682796163 4.72964380644604 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00694152157969735 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24910876 G/A 0 12 0 12 5.72964380644604 0 5.72964380644604 G G 10 0.522529682796163 0.000554712474620077 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24910973 T/G 1 26 22 48 12.4142282472998 11.4956530215156 0.918575225784178 T:G T G 10 0.522529682796163 0.885367034849682 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 24910974 T/A 1 25 22 47 11.9367579300959 11.4956530215156 0.441104908580341 A:T T A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 31099738 A/G 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:G A G 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31099683_31099771:SCFD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 15 22 37 7.16205475805756 11.4956530215156 -4.33359826345803 C:G C G 10 0.522529682796163 0.187866992100144 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 31578762 C/T 1 21 24 45 10.0268766612806 12.5407123871079 -2.51383572582733 T:C C T 10 0.522529682796163 0.460318642914684 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 31582526 T/C 1 16 19 35 7.63952507526139 9.9280639731271 -2.2885388978657 T:C T C 10 0.522529682796163 0.500007018553045 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31582483_31582690:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31582483_31582690:HECTD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 31598248 A/G 1 13 26 39 6.20711412364988 13.5857717527002 -7.37865762905036 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0236942593078806 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31597818_31598654:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31597818_31598654:HECTD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 31619392 T/C 1 17 14 31 8.11699539246523 7.31541555914628 0.801579833318948 T:C T C 10 0.522529682796163 0.858135513379526 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31619205_31619427:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31619205_31619427:HECTD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 31647241 G/A 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 A:G G A 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 43 36 79 20.531223639765 18.8110685806619 1.72015505910312 A:G G A 10 0.522529682796163 0.73628431716786 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 15 15 30 7.16205475805756 7.83794524194244 -0.675890483884888 A:G G A 10 0.522529682796163 0.856233772119583 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 35497285 T/C 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C T C 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 35592428 A/G 1 18 15 33 8.59446570966907 7.83794524194244 0.756520467726622 A:G A G 10 0.522529682796163 0.862587560743927 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 500 495 995 238.735158601919 258.652192984101 -19.9170343821822 A:T:C:G G A 10 0.522529682796163 0.215833491823452 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 35873770 G/A 1 247 233 480 117.935168349348 121.749416091506 -3.81424774215822 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.749162194257055 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35873624_35873952:NFKBIA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 18 14 32 8.59446570966907 7.31541555914628 1.27905015052279 A:G G A 10 0.522529682796163 0.724992015605387 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 6 11 17 2.86482190322302 5.74782651075779 -2.88300460753477 C:G G C 10 0.522529682796163 0.224425269329800 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 50092471 T/C 1 8 17 25 3.8197625376307 8.88300460753477 -5.06324206990407 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0465550022550560 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50091907_50092766:C14orf104 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 23 16 39 10.9818172956883 8.36047492473861 2.62134237094964 T:C T C 10 0.522529682796163 0.42695432266037 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 50769717 G/A 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G G A 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000087299:ENST00000261699:exon_50769620_50769735:L2HGDH;ENSG00000087299:ENST00000267436:exon_50769620_50769735:L2HGDH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 51192659 G/A 1 8 9 17 3.8197625376307 4.70276714516547 -0.883004607534771 A:G G A 10 0.522529682796163 0.809298250481776 ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 51202311 G/C 1 19 23 42 9.0719360268729 12.0181827043117 -2.94624667743884 C:G G C 10 0.522529682796163 0.440352402046650 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51202234_51202335:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51202234_51202335:NIN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 42 35 77 20.0537533225612 18.2885388978657 1.76521442469545 T:C C T 10 0.522529682796163 0.732864454126422 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 51219349 G/A 1 20 19 39 9.54940634407674 9.9280639731271 -0.378657629050357 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51219236_51219451:NIN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 51223789 C/T 1 6 8 14 2.86482190322302 4.1802374623693 -1.31541555914628 T:C C T 10 0.522529682796163 0.595734183488216 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 51224374 T/G 1 14 3 17 6.68458444085372 1.56758904838849 5.11699539246523 T:G T G 10 0.522529682796163 0.0142139655520718 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 51224658 T/A 1 14 8 22 6.68458444085372 4.1802374623693 2.50434697848442 A:T T A 10 0.522529682796163 0.39388166009814 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 51225132 G/T 1 9 6 15 4.29723285483453 3.13517809677698 1.16205475805756 T:G G T 10 0.522529682796163 0.612786973154986 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 52433420 C/T 1 47 32 79 22.4411049085803 16.7209498494772 5.72015505910312 T:C C T 10 0.522529682796163 0.216127698439525 ENSG00000186469:ENST00000335281:exon_52433277_52436517:GNG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 55310492 G/A 1 22 12 34 10.5043469784844 6.27035619355396 4.23399078493046 A:G G A 10 0.522529682796163 0.170625176329978 ENSG00000131979:ENST00000254299:exon_55308735_55310861:GCH1;ENSG00000131979:ENST00000491895:exon_55309096_55310861:GCH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 38 41 79 18.1438720537458 21.4237169946427 -3.27984494089688 A:C A C 10 0.522529682796163 0.499893128228363 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 55643908 A/G 1 11 17 28 5.25217348924221 8.88300460753477 -3.63083111829256 A:C:G A G 10 0.522529682796163 0.188544692376854 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 55655692 C/T 1 38 29 67 18.1438720537458 15.1533608010887 2.99051125265708 T:C C T 10 0.522529682796163 0.541221869763456 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 57857879 G/A 0 12 0 12 5.72964380644604 0 5.72964380644604 G G 10 0.522529682796163 0.000554712474620077 ENSG00000139977:ENST00000298406:exon_57857675_57858446:NAA30 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 57938124 C/T 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000100557:ENST00000216445:exon_57936019_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534126:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000530417:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534528:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000422976:exon_57937973_57938308:C14orf105 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 58831142 A/G 1 12 11 23 5.72964380644604 5.74782651075779 -0.018182704311748 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 58838668 A/G 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 A:G A G 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 58838701 C/T 1 4 10 14 1.90988126881535 5.22529682796163 -3.31541555914628 T:C C T 10 0.522529682796163 0.106809303346196 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 59939727 T/C 1 9 9 18 4.29723285483453 4.70276714516547 -0.405534290330934 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 59951278 T/C 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 T:C T C 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000050130:ENST00000425728:exon_59951161_59951311:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000261247:exon_59951161_59951311:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000442454:exon_59951244_59951311:JKAMP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 60582053 G/A 1 9 1 10 4.29723285483453 0.522529682796163 3.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0227385828445189 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60581692_60582179:C14orf135 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 60585131 A/G 1 8 9 17 3.8197625376307 4.70276714516547 -0.883004607534771 A:G A G 10 0.522529682796163 0.809298250481776 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60585095_60585410:C14orf135 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 60591829 T/C 1 14 7 21 6.68458444085372 3.65770777957314 3.02687666128058 T:C T C 10 0.522529682796163 0.198668287049760 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 60591887 G/A 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 60611648 C/T 1 32 15 47 15.2790501505228 7.83794524194244 7.44110490858034 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0397976375358768 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60610838_60611731:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60611502_60611731:DHRS7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 64447776 T/C 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64447704_64447891:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64447704_64447891:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64447704_64447891:SYNE2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 64496749 C/T 1 6 9 15 2.86482190322302 4.70276714516547 -1.83794524194244 T:C C T 10 0.522529682796163 0.440567980680144 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64496613_64496777:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64496613_64496777:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64496613_64496777:SYNE2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 64497930 G/A 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 A:G G A 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64497734_64498075:SYNE2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 64519035 A/G 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 A:G A G 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 64519455 A/G 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 A:G A G 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 64522674 G/C 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 C:G G C 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64522662_64522984:SYNE2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 64522843 A/G 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64522662_64522984:SYNE2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 64612845 C/T 1 9 20 29 4.29723285483453 10.4505936559233 -6.15336080108873 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0253326479422021 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64612786_64612941:SYNE2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 64630230 C/G 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 C:G C G 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64630120_64630299:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64630120_64630299:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64630120_64630299:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64630120_64630299:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64630120_64630299:SYNE2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 64637147 C/A 1 13 25 38 6.20711412364988 13.0632420699041 -6.85612794625419 A:C C A 10 0.522529682796163 0.0335968346912396 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64636946_64637180:SYNE2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 64954683 A/G 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000089775:ENST00000261683:exon_64953555_64954775:ZBTB25;ENSG00000089775:ENST00000394715:exon_64953557_64954775:ZBTB25 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 65390804 C/T 1 90 52 142 42.9723285483453 27.1715435054005 15.8007850429449 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00900070122501088 ENSG00000125954:ENST00000359118:exon_65390709_65390844:FNTB;ENSG00000125954:ENST00000447296:exon_65390709_65390844:FNTB;ENSG00000125954:ENST00000448390:exon_65390709_65390844:FNTB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 67610127 T/C 1 7 12 19 3.34229222042686 6.27035619355396 -2.9280639731271 T:C T C 10 0.522529682796163 0.250483788158122 ENSG00000171723:ENST00000315266:exon_67610079_67610166:GPHN;ENSG00000171723:ENST00000478722:exon_67610079_67610166:GPHN;ENSG00000171723:ENST00000305960:exon_67610079_67610166:GPHN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 68249499 C/T 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000072121:ENST00000347230:exon_68249497_68250242:ZFYVE26;ENSG00000072121:ENST00000411699:exon_68249497_68250242:ZFYVE26 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 69256886 A/G 1 84 85 169 40.1075066451223 44.4150230376739 -4.30751639255154 A:T:G A G 10 0.522529682796163 0.538155501550737 ENSG00000185650:ENST00000439696:exon_69254375_69257209:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000336440:exon_69256244_69257209:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000435246:exon_69256691_69257209:ZFP36L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 69257119 G/T 1 84 109 193 40.1075066451223 56.9557354247818 -16.8482287796595 T:G G T 10 0.522529682796163 0.0172230963675992 ENSG00000185650:ENST00000439696:exon_69254375_69257209:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000336440:exon_69256244_69257209:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000435246:exon_69256691_69257209:ZFP36L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 71199452 G/A 1 1 7 8 0.477470317203837 3.65770777957314 -3.1802374623693 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0319085925070315 ENSG00000006432:ENST00000005198:exon_71199256_71200059:MAP3K9;ENSG00000006432:ENST00000381250:exon_71199256_71200059:MAP3K9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 73425462 G/A 1 8 9 17 3.8197625376307 4.70276714516547 -0.883004607534771 A:G G A 10 0.522529682796163 0.809298250481776 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73425320_73426300:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73425320_73426411:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73425320_73425654:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73425320_73426356:DCAF4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 73440864 C/T 1 7 9 16 3.34229222042686 4.70276714516547 -1.36047492473861 T:C C T 10 0.522529682796163 0.618833530377833 ENSG00000165861:ENST00000394207:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73440788_73440901:ZFYVE1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 74203789 G/A 1 12 14 26 5.72964380644604 7.31541555914628 -1.58577175270024 A:G G A 10 0.522529682796163 0.561386502703927 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74203701_74204000:C14orf43 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 74205878 C/T 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74205263_74206177:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 74206658 G/A 1 15 14 29 7.16205475805756 7.31541555914628 -0.153360801088725 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74205263_74206958:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000421708:exon_74206515_74206958:C14orf43 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 74388908 T/C 1 8 20 28 3.8197625376307 10.4505936559233 -6.63083111829256 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0135142618303548 ENSG00000119725:ENST00000334521:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000458102:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000442160:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000398139:exon_74388769_74388909:ZNF410 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 74428000 A/T 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:T A T 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74427876_74428078:COQ6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 15 13 28 7.16205475805756 6.79288587635012 0.369168881707437 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 17 29 46 8.11699539246523 15.1533608010887 -7.0363654086235 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0395544721351078 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 88477413 C/T 1 35 16 51 16.7114611021343 8.36047492473861 8.35098617739569 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0240454648734161 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 89629194 C/T 1 15 26 41 7.16205475805756 13.5857717527002 -6.42371699464268 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0593962998347728 ENSG00000053254:ENST00000345097:exon_89622529_89629313:FOXN3;ENSG00000053254:ENST00000261302:exon_89622529_89629313:FOXN3;ENSG00000053254:ENST00000444927:exon_89627744_89629313:FOXN3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 90744672 G/A 1 9 3 12 4.29723285483453 1.56758904838849 2.72964380644604 A:G G A 10 0.522529682796163 0.150898424576211 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90744398_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90744402_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90744402_90744805:C14orf102 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 90745422 T/C 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 T:C T C 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90745406_90745477:C14orf102 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 91666131 C/T 1 18 7 25 8.59446570966907 3.65770777957314 4.93675793009593 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0694898655857537 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91666101_91666249:C14orf159 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 91666248 T/C 1 30 10 40 14.3241095161151 5.22529682796163 9.09881268815348 T:C T C 10 0.522529682796163 0.00404759323142375 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91666101_91666249:C14orf159 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 91760522 C/T 1 8 2 10 3.8197625376307 1.04505936559233 2.77470317203837 T:C C T 10 0.522529682796163 0.11294395461013 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91760517_91760662:CCDC88C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 91773568 T/C 1 10 8 18 4.77470317203837 4.1802374623693 0.594465709669066 T:C T C 10 0.522529682796163 0.817891150332414 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 11 3 14 5.25217348924221 1.56758904838849 3.68458444085372 T:C C T 10 0.522529682796163 0.060853356111844 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 92548785 C/T 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 T:C C T 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 92549586 G/A 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92549470_92549602:ATXN3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 255 164 419 121.754930886978 85.6948679785707 36.0600629084077 T:G T G 10 0.522529682796163 0.000420658567592913 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 210 159 369 100.268766612806 83.0822195645899 17.1865470482159 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0764460257875474 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 22 11 33 10.5043469784844 5.74782651075779 4.75652046772662 C:G C G 10 0.522529682796163 0.116836858779311 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 17 9 26 8.11699539246523 4.70276714516547 3.41422824729976 A:G A G 10 0.522529682796163 0.238656053250706 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 96 76 172 45.8371504515684 39.7122558925084 6.12489455905997 T:C T C 10 0.522529682796163 0.360600963120394 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 95910933 T/C 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 T:C T C 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95910822_95910965:C14orf49 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 99967186 A/T 1 30 32 62 14.3241095161151 16.7209498494772 -2.3968403333621 A:T A T 10 0.522529682796163 0.611530737663248 ENSG00000090061:ENST00000389879:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000216279:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000411691:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000380246:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000437596:exon_99967103_99967208:CCNK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 100759277 C/T 1 16 11 27 7.63952507526139 5.74782651075779 1.8916985645036 T:C C T 10 0.522529682796163 0.564634669250498 ENSG00000197119:ENST00000359232:exon_100757448_100759369:SLC25A29;ENSG00000197119:ENST00000392908:exon_100757448_100759369:SLC25A29 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 209 101 310 99.7912962956019 52.7754979624125 47.0157983331895 A:G G A 10 0.522529682796163 7.35265566742442e-08 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 102391577 G/C 1 15 6 21 7.16205475805756 3.13517809677698 4.02687666128058 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0846643570295337 ENSG00000078304:ENST00000328724:exon_102391478_102394022:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334743:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000350249:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334756:exon_102391478_102394075:PPP2R5C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 102446161 G/A 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102446056_102446311:DYNC1H1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 102463407 A/G 1 6 8 14 2.86482190322302 4.1802374623693 -1.31541555914628 A:G A G 10 0.522529682796163 0.595734183488216 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102463372_102463611:DYNC1H1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 102493761 A/G 1 20 19 39 9.54940634407674 9.9280639731271 -0.378657629050357 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102493720_102493881:DYNC1H1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 27 38 65 12.8916985645036 19.8561279462542 -6.96442938175059 A:T:C T C 10 0.522529682796163 0.105792649507499 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 293 319 612 139.898802940724 166.686968811976 -26.7881658712517 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0319303879328308 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 102808330 C/T 1 16 11 27 7.63952507526139 5.74782651075779 1.8916985645036 T:C C T 10 0.522529682796163 0.564634669250498 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 102814945 G/A 1 59 58 117 28.1707487150264 30.3067216021775 -2.13597288715107 A:T:G G A 10 0.522529682796163 0.711971867142988 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 102815042 C/T 1 53 42 95 25.3059268118034 21.9462466774388 3.35968013436452 T:C C T 10 0.522529682796163 0.538196516660377 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 105179194 T/C 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000480763:exon_105179170_105179270:INF2;ENSG00000203485:ENST00000477497:exon_105179050_105179329:INF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/C 1 17 16 33 8.11699539246523 8.36047492473861 -0.243479532273378 A:C A C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 30 36 66 14.3241095161151 18.8110685806619 -4.48695906454676 T:C C T 10 0.522529682796163 0.270931599083722 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 105239894 C/T 1 66 52 118 31.5130409354532 27.1715435054005 4.34149743005277 T:C C T 10 0.522529682796163 0.461379019892266 ENSG00000142208:ENST00000349310:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000407796:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000402615:exon_105239792_105239917:AKT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 105716034 C/T 1 17 7 24 8.11699539246523 3.65770777957314 4.45928761289209 T:C C T 10 0.522529682796163 0.100163972563145 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715977_105716298:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392553:exon_105715977_105716633:BTBD6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 105848891 T/C 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000179364:ENST00000430725:exon_105848814_105848918:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000325438:exon_105848814_105848918:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000447393:exon_105848814_105848918:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000458164:exon_105848814_105848918:PACS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 105930406 G/A 1 24 40 64 11.4592876128921 20.9011873118465 -9.44189969895443 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0235623150572144 ENSG00000182979:ENST00000435036:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930369_105930484:MTA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 14 106791131 A/G 0 44 0 44 21.0086939569688 0 21.0086939569688 A A 10 0.522529682796163 7.62698207154021e-13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 21937964 A/G 0 14 0 14 6.68458444085372 0 6.68458444085372 A A 10 0.522529682796163 0.000145130998430063 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 23049045 C/T 1 14 10 24 6.68458444085372 5.22529682796163 1.45928761289209 T:C C T 10 0.522529682796163 0.683803771305971 ENSG00000170113:ENST00000337435:exon_23043277_23049340:NIPA1;ENSG00000170113:ENST00000437912:exon_23043279_23049340:NIPA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 A:G G A 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 34542872 C/G 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 C:G C G 10 0.522529682796163 0.568106121039098 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34542832_34542930:SLC12A6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 34651297 C/T 1 19 36 55 9.0719360268729 18.8110685806619 -9.73913255378896 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00990695559578172 ENSG00000176454:ENST00000314891:exon_34651089_34651503:LPCAT4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 34651983 T/C 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.511797587312082 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 40259848 A/C 1 25 25 50 11.9367579300959 13.0632420699041 -1.12648413980815 A:C A C 10 0.522529682796163 0.778473464626011 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40259545_40260080:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40259545_40260080:EIF2AK4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 40265799 A/G 1 21 16 37 10.0268766612806 8.36047492473861 1.66640173654197 A:G A G 10 0.522529682796163 0.624467280752172 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40265793_40265950:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40265793_40265950:EIF2AK4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 40327290 A/G 1 31 34 65 14.8015798333189 17.7660092150695 -2.96442938175059 A:G A G 10 0.522529682796163 0.535060727601276 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 33 29 62 15.7565204677266 15.1533608010887 0.603159666637897 A:G G A 10 0.522529682796163 0.899536846651567 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 40330564 C/T 1 156 131 287 74.4853694837986 68.4513884462973 6.03398103750123 T:C C T 10 0.522529682796163 0.479072225030466 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 40477831 G/A 1 14 21 35 6.68458444085372 10.9731233387194 -4.2885388978657 A:G G A 10 0.522529682796163 0.176028958540217 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40477752_40477843:BUB1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 40581543 T/C 1 15 16 31 7.16205475805756 8.36047492473861 -1.19842016668105 T:C T C 10 0.522529682796163 0.721148115439186 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40581473_40581559:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40581473_40581559:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40581473_40581559:PLCB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 40685797 A/C 1 23 14 37 10.9818172956883 7.31541555914628 3.66640173654197 A:C A C 10 0.522529682796163 0.252081861478934 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40685670_40686488:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40685394_40686488:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40685670_40686488:C15orf23 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 40914177 T/C 1 9 1 10 4.29723285483453 0.522529682796163 3.77470317203837 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0227385828445189 ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000527044:exon_40912838_40915357:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 40914772 C/T 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 T:C C T 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000527044:exon_40912838_40915357:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 40915894 T/C 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 T:C T C 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000526913:exon_40915330_40917838:CASC5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 71 10 81 33.9003925214724 5.22529682796163 28.6750956935108 A:G A G 10 0.522529682796163 1.55963051214572e-11 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 72 10 82 34.3778628386763 5.22529682796163 29.1525660107146 A:C C A 10 0.522529682796163 9.1725000368916e-12 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 42459034 T/C 1 12 13 25 5.72964380644604 6.79288587635012 -1.06324206990407 T:C T C 10 0.522529682796163 0.693670722544485 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42458970_42459111:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42458970_42459111:VPS39 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 42565588 C/A 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 A:C C A 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000103978:ENST00000389834:exon_42565453_42565755:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000448392:exon_42565453_42565638:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000307216:exon_42565453_42565755:TMEM87A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 42742464 A/G 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 A:G A G 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42741969_42744152:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42741969_42744152:ZFP106 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 43023482 T/C 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C T C 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43023409_43023529:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43023409_43023529:CDAN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 43237572 T/C 1 5 9 14 2.38735158601918 4.70276714516547 -2.31541555914628 T:C T C 10 0.522529682796163 0.286340857888341 ENSG00000159459:ENST00000290650:exon_43235095_43237668:UBR1;ENSG00000159459:ENST00000382177:exon_43235106_43237668:UBR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 43653251 C/T 1 10 10 20 4.77470317203837 5.22529682796163 -0.45059365592326 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43650370_43654139:ZSCAN29 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 44066400 G/A 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000128886:ENST00000319359:exon_44066380_44066551:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000467869:exon_44066380_44066551:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000497465:exon_44066380_44066551:ELL3;ENSG00000184716:ENST00000417761:exon_44066380_44066551:SERINC4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 44887483 T/G 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 T:G T G 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44887457_44887657:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44887457_44887657:SPG11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 45047134 G/A 1 10 3 13 4.77470317203837 1.56758904838849 3.20711412364988 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0965395810160095 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 45047573 C/T 1 15 13 28 7.16205475805756 6.79288587635012 0.369168881707437 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 1 10 4 14 4.77470317203837 2.09011873118465 2.68458444085372 A:T A T 10 0.522529682796163 0.185755143276423 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 49285001 G/C 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000138593:ENST00000261847:exon_49280967_49285123:SECISBP2L;ENSG00000138593:ENST00000380927:exon_49284327_49285123:SECISBP2L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 49429410 A/G 1 26 30 56 12.4142282472998 15.6758904838849 -3.26166223658513 A:G A G 10 0.522529682796163 0.423264591766979 ENSG00000166200:ENST00000388901:exon_49429347_49429424:COPS2;ENSG00000166200:ENST00000299259:exon_49429347_49429424:COPS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 49620200 C/T 1 13 5 18 6.20711412364988 2.61264841398082 3.59446570966907 T:C C T 10 0.522529682796163 0.102291148092561 ENSG00000156958:ENST00000327171:exon_49620149_49622002:GALK2;ENSG00000156958:ENST00000396509:exon_49620149_49622002:GALK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 49917341 G/A 1 11 17 28 5.25217348924221 8.88300460753477 -3.63083111829256 A:G G A 10 0.522529682796163 0.188544692376854 ENSG00000104047:ENST00000403028:exon_49917310_49917628:DTWD1;ENSG00000104047:ENST00000329873:exon_49917310_49917628:DTWD1;ENSG00000104047:ENST00000251250:exon_49917310_49917628:DTWD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 51294832 G/A 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G G A 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000081014:ENST00000261842:exon_51294699_51298097:AP4E1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 52254682 T/C 1 20 17 37 9.54940634407674 8.88300460753477 0.666401736541969 T:C T C 10 0.522529682796163 0.870447919793445 ENSG00000166477:ENST00000299601:exon_52254586_52254690:LEO1;ENSG00000166477:ENST00000315141:exon_52254586_52254690:LEO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 20 9 29 9.54940634407674 4.70276714516547 4.84663919891127 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0931678408178994 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 52901283 T/C 1 6 11 17 2.86482190322302 5.74782651075779 -2.88300460753477 T:C T C 10 0.522529682796163 0.224425269329800 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 52901284 T/C 1 6 11 17 2.86482190322302 5.74782651075779 -2.88300460753477 T:C T C 10 0.522529682796163 0.224425269329800 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 52901433 C/T 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 T:C C T 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 52901638 T/C 1 6 8 14 2.86482190322302 4.1802374623693 -1.31541555914628 T:C T C 10 0.522529682796163 0.595734183488216 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 52901977 G/A 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 A:G G A 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 55619796 T/C 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 T:C T C 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55619729_55619833:PIGB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 10 16 26 4.77470317203837 8.36047492473861 -3.58577175270024 A:G A G 10 0.522529682796163 0.173614440209318 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 55669169 A/G 1 16 10 26 7.63952507526139 5.22529682796163 2.41422824729976 A:G A G 10 0.522529682796163 0.433314383592609 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55669147_55669348:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55669147_55669348:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000425574:exon_55669147_55669348:CCPG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 58000981 C/T 1 13 13 26 6.20711412364988 6.79288587635012 -0.585771752700238 T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.846614688948765 ENSG00000137878:ENST00000460962:exon_58000912_58001556:GCOM1;ENSG00000255529:ENST00000380563:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000299638:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000494490:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464277:exon_58000912_58001382:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000482852:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464308:exon_58000912_58001531:GRINL1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 59368167 G/A 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59368153_59368414:RNF111 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 16 13 29 7.63952507526139 6.79288587635012 0.846639198911274 A:G G A 10 0.522529682796163 0.853261309241005 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 13 9 22 6.20711412364988 4.70276714516547 1.50434697848441 A:G A G 10 0.522529682796163 0.670538633660278 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 18 25 43 8.59446570966907 13.0632420699041 -4.46877636023501 T:G T G 10 0.522529682796163 0.221579403404899 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 62165553 T/C 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 T:C T C 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62165445_62165608:VPS13C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 62165577 G/A 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 A:G G A 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62165445_62165608:VPS13C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 62172907 T/C 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62172808_62172921:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62172808_62172921:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62172808_62172921:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62172808_62172921:VPS13C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 62174894 A/G 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:G A G 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62174795_62174935:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62174795_62174935:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62174795_62174935:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62174795_62174935:VPS13C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 62212781 T/C 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62212697_62212846:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62212697_62212846:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62212697_62212846:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62212697_62212846:VPS13C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 62214607 C/T 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62214596_62214961:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62214596_62214961:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62214596_62214961:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62214596_62214961:VPS13C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 62253791 T/C 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62253788_62254092:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62253788_62254092:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62253788_62254092:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62253788_62254092:VPS13C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 62299603 T/G 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 T:G T G 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62299507_62299678:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62299507_62299678:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62299507_62299678:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62299507_62299678:VPS13C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 7 13 20 3.34229222042686 6.79288587635012 -3.45059365592326 A:G G A 10 0.522529682796163 0.177936173075919 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 65108479 T/C 1 21 11 32 10.0268766612806 5.74782651075779 4.27905015052279 T:C T C 10 0.522529682796163 0.157170705562104 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 65153690 G/A 1 18 19 37 8.59446570966907 9.9280639731271 -1.33359826345803 A:G G A 10 0.522529682796163 0.74284768069353 ENSG00000249240:ENST00000502574:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000249240:ENST00000437723:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65153676_65153774:PLEKHO2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 65157482 C/T 1 32 19 51 15.2790501505228 9.9280639731271 5.35098617739569 T:C C T 10 0.522529682796163 0.160751792742683 ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65157098_65160206:PLEKHO2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 66612965 T/C 1 2 6 8 0.954940634407674 3.13517809677698 -2.1802374623693 T:C T C 10 0.522529682796163 0.163120845582557 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000441424:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000524795:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66612909_66613070:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66612909_66613070:DIS3L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 66641732 G/C 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 C:G G C 10 0.522529682796163 0.568106121039098 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66641653_66641775:TIPIN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 67528374 T/G 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:G T G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67528317_67528406:AAGAB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 73027478 T/C 1 11 8 19 5.25217348924221 4.1802374623693 1.0719360268729 T:C T C 10 0.522529682796163 0.653993185631586 ENSG00000140463:ENST00000268057:exon_73027454_73027523:BBS4;ENSG00000140463:ENST00000395205:exon_73027454_73027523:BBS4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 40 25 65 19.0988126881535 13.0632420699041 6.03557061824941 A:G A G 10 0.522529682796163 0.138311680688223 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 33 21 54 15.7565204677266 10.9731233387194 4.7833971290072 T:G G T 10 0.522529682796163 0.220741687283579 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 74948095 C/T 1 15 20 35 7.16205475805756 10.4505936559233 -3.2885388978657 T:C C T 10 0.522529682796163 0.311060526879098 ENSG00000179151:ENST00000315127:exon_74948074_74948409:EDC3;ENSG00000179151:ENST00000426797:exon_74948074_74948409:EDC3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 75631587 A/T 1 8 2 10 3.8197625376307 1.04505936559233 2.77470317203837 A:T A T 10 0.522529682796163 0.11294395461013 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 75648650 C/T 1 33 40 73 15.7565204677266 20.9011873118465 -5.1446668441199 T:C C T 10 0.522529682796163 0.242677496030521 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75648642_75648790:MAN2C1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 75650836 G/A 1 53 40 93 25.3059268118034 20.9011873118465 4.40473949995684 A:G G A 10 0.522529682796163 0.406571301633971 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75650803_75650959:MAN2C1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 75652963 C/G 1 20 22 42 9.54940634407674 11.4956530215156 -1.94624667743884 C:G C G 10 0.522529682796163 0.643642755889531 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75652906_75653029:MAN2C1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 75893532 G/A 1 12 7 19 5.72964380644604 3.65770777957314 2.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.368592887865543 ENSG00000169371:ENST00000308588:exon_75893479_75893559:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000371091:exon_75893479_75893559:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000432476:exon_75893479_75893559:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000394932:exon_75893479_75893559:SNUPN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 78789488 C/T 1 17 10 27 8.11699539246523 5.22529682796163 2.8916985645036 T:C C T 10 0.522529682796163 0.336152240727391 ENSG00000136381:ENST00000258886:exon_78789468_78789653:IREB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 79058572 T/G 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 T:G T G 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000136378:ENST00000258883:exon_79057978_79059393:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000388820:exon_79057987_79059393:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000438137:exon_79057987_79059393:ADAMTS7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 79215311 A/C 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:C A C 10 0.522529682796163 0.728776437395601 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 79224747 C/T 1 126 130 256 60.1612599676835 67.9288587635012 -7.76759879581772 T:C C T 10 0.522529682796163 0.348206245817163 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 80452172 G/C 1 8 9 17 3.8197625376307 4.70276714516547 -0.883004607534771 C:G G C 10 0.522529682796163 0.809298250481776 ENSG00000103876:ENST00000407106:exon_80452098_80452219:FAH;ENSG00000103876:ENST00000261755:exon_80452098_80452219:FAH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 82443939 G/A 1 16 12 28 7.63952507526139 6.27035619355396 1.36916888170744 A:G G A 10 0.522529682796163 0.706382469889948 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 82512429 C/G 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82512419_82512570:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82512419_82512570:EFTUD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 83481880 A/G 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 A:G A G 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83481855_83482028:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83481855_83482028:WHAMM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 83499766 G/A 1 11 4 15 5.25217348924221 2.09011873118465 3.16205475805756 A:G G A 10 0.522529682796163 0.124047501512051 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83499351_83499831:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83499351_83499831:WHAMM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 85188994 T/C 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 85189464 T/G 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 T:G T G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000419751:exon_85189293_85189579:WDR73 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 85333953 A/G 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 A:G A G 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85333936_85334114:ZNF592 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 86122779 T/C 1 8 1 9 3.8197625376307 0.522529682796163 3.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0407796571976411 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 86122916 T/C 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 86123833 T/C 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C T C 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 86123988 G/A 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 A:G G A 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 86124419 C/T 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 86124483 C/G 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 86124555 G/A 1 10 8 18 4.77470317203837 4.1802374623693 0.594465709669066 A:G G A 10 0.522529682796163 0.817891150332414 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 86124946 T/C 1 10 5 15 4.77470317203837 2.61264841398082 2.16205475805755 T:C T C 10 0.522529682796163 0.309170426805168 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 86124968 G/A 1 10 5 15 4.77470317203837 2.61264841398082 2.16205475805755 A:G G A 10 0.522529682796163 0.309170426805168 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 86125031 G/A 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 A:G G A 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 86125304 C/T 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 86278309 G/A 1 16 14 30 7.63952507526139 7.31541555914628 0.324109516115112 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86278223_86278381:AKAP13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 22 35 57 10.5043469784844 18.2885388978657 -7.78419191938129 A:T:C C T 10 0.522529682796163 0.0461458034673150 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 89169614 A/G 1 19 20 39 9.0719360268729 10.4505936559233 -1.37865762905036 A:T:G A G 10 0.522529682796163 0.749128625546109 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 89421249 G/A 1 10 3 13 4.77470317203837 1.56758904838849 3.20711412364988 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0965395810160095 ENSG00000140511:ENST00000359595:exon_89420519_89421487:HAPLN3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 89421327 A/G 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 A:G A G 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000140511:ENST00000359595:exon_89420519_89421487:HAPLN3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 89804043 C/T 1 6 9 15 2.86482190322302 4.70276714516547 -1.83794524194244 T:C C T 10 0.522529682796163 0.440567980680144 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 18 17 35 8.59446570966907 8.88300460753477 -0.288538897865704 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 90630372 T/C 1 62 72 134 29.6031596666379 37.6221371613237 -8.01897749468584 T:C T C 10 0.522529682796163 0.167658345715979 ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90630344_90630495:IDH2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 90785060 C/T 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 T:C C T 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000183208:ENST00000448438:exon_90784132_90785312:C15orf58;ENSG00000183208:ENST00000329600:exon_90784132_90785312:C15orf58 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 5 9 14 2.38735158601918 4.70276714516547 -2.31541555914628 A:G G A 10 0.522529682796163 0.286340857888341 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 91337479 G/A 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91337397_91337587:BLM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 91346923 C/A 1 9 12 21 4.29723285483453 6.27035619355396 -1.97312333871942 A:C C A 10 0.522529682796163 0.513321470356553 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91346751_91346950:BLM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 91354505 C/T 1 7 10 17 3.34229222042686 5.22529682796163 -1.88300460753477 T:C C T 10 0.522529682796163 0.468082532065744 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 91354634 G/A 1 20 17 37 9.54940634407674 8.88300460753477 0.666401736541969 A:G G A 10 0.522529682796163 0.870447919793445 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 91454424 C/T 1 15 11 26 7.16205475805756 5.74782651075779 1.41422824729976 T:C C T 10 0.522529682796163 0.695674855368122 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91454401_91454468:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91454401_91454468:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91454401_91454468:MAN2A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101109677 C/A 1 9 15 24 4.29723285483453 7.83794524194244 -3.54071238710791 A:C C A 10 0.522529682796163 0.158191944334635 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101109794 C/G 1 13 7 20 6.20711412364988 3.65770777957314 2.54940634407674 C:G C G 10 0.522529682796163 0.272883112161240 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 12 5 17 5.72964380644604 2.61264841398082 3.11699539246523 A:G G A 10 0.522529682796163 0.150352896781338 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101109893 C/A 1 6 12 18 2.86482190322302 6.27035619355396 -3.40553429033093 A:C C A 10 0.522529682796163 0.155342186917693 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101110265 T/A 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 A:T T A 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101110302 C/G 1 11 8 19 5.25217348924221 4.1802374623693 1.0719360268729 C:G C G 10 0.522529682796163 0.653993185631586 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101113950 A/G 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 A:G A G 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101114418 G/A 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101120963 T/C 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101120649_101121152:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101120649_101121150:LINS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101464915 T/C 1 11 6 17 5.25217348924221 3.13517809677698 2.11699539246523 T:C T C 10 0.522529682796163 0.340698354211182 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101529012 A/G 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 A:G A G 10 0.522529682796163 0.393562228098845 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101528839_101529018:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101528839_101529018:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101528825_101529018:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101528839_101529018:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101528839_101529018:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101528839_101529018:LRRK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101595257 G/A 1 11 7 18 5.25217348924221 3.65770777957314 1.59446570966907 A:G G A 10 0.522529682796163 0.48876143429335 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101595151_101595428:LRRK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 13 17 30 6.20711412364988 8.88300460753477 -2.67589048388489 T:C C T 10 0.522529682796163 0.364089214287968 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101606889 G/A 1 23 13 36 10.9818172956883 6.79288587635012 4.18893141933813 A:G G A 10 0.522529682796163 0.183708341091536 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101606890 C/A 1 25 12 37 11.9367579300959 6.27035619355396 5.66640173654197 A:C C A 10 0.522529682796163 0.0704948873836704 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 15 101717680 G/T 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 T:G G T 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 304514 C/T 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 T:C C T 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000419173:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000426695:exon_304328_304564:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000438220:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000447499:exon_304380_304673:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000453430:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000449945:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420046:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420500:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000417499:exon_304328_304618:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000496874:exon_304121_304680:ITFG3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 347184 A/G 1 15 18 33 7.16205475805756 9.40553429033093 -2.24347953227338 A:G A G 10 0.522529682796163 0.487864411911794 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347056_347226:AXIN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 396264 A/G 1 8 19 27 3.8197625376307 9.9280639731271 -6.1083014354964 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0206501125888714 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_396148_396322:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_396148_396444:AXIN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 26 21 47 12.4142282472998 10.9731233387194 1.44110490858034 T:C T C 10 0.522529682796163 0.770698949855164 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 11 17 28 5.25217348924221 8.88300460753477 -3.63083111829256 T:C T C 10 0.522529682796163 0.188544692376854 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 7 13 20 3.34229222042686 6.79288587635012 -3.45059365592326 T:C T C 10 0.522529682796163 0.177936173075919 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 427784 G/A 1 12 15 27 5.72964380644604 7.83794524194244 -2.1083014354964 A:G G A 10 0.522529682796163 0.446223384334079 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427671_427805:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427671_427807:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 427820 C/T 1 12 13 25 5.72964380644604 6.79288587635012 -1.06324206990407 T:C C T 10 0.522529682796163 0.693670722544485 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 72 78 150 34.3778628386763 40.7573152581007 -6.37945241942445 A:G G A 10 0.522529682796163 0.326776694626739 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 115 89 204 54.9090864784413 46.5051417688585 8.40394470958276 T:C C T 10 0.522529682796163 0.262138271039496 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 570471 C/T 1 23 19 42 10.9818172956883 9.9280639731271 1.05375332256116 T:C C T 10 0.522529682796163 0.760222357470147 ENSG00000090565:ENST00000262305:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000457159:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000434585:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000450428:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000448401:exon_570459_570599:RAB11FIP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 778820 G/A 1 17 19 36 8.11699539246523 9.9280639731271 -1.81106858066187 A:G G A 10 0.522529682796163 0.61789790541559 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_778794_779715:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_778794_778868:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_778794_778895:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_778794_779168:HAGHL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 13 27 40 6.20711412364988 14.1083014354964 -7.90118731184652 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0165539705594750 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 784765 C/T 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 T:C C T 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_784737_784871:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_784737_784871:NARFL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 845742 G/A 1 11 6 17 5.25217348924221 3.13517809677698 2.11699539246523 A:G G A 10 0.522529682796163 0.340698354211182 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 845819 A/G 1 7 9 16 3.34229222042686 4.70276714516547 -1.36047492473861 A:G A G 10 0.522529682796163 0.618833530377833 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 1416355 C/T 1 10 10 20 4.77470317203837 5.22529682796163 -0.45059365592326 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000059145:ENST00000248104:exon_1413206_1416396:UNKL;ENSG00000059145:ENST00000389221:exon_1413206_1416396:UNKL;ENSG00000059145:ENST00000403703:exon_1413206_1416396:UNKL;ENSG00000059145:ENST00000391893:exon_1413206_1416396:UNKL;ENSG00000059145:ENST00000397464:exon_1415000_1416396:UNKL;ENSG00000059145:ENST00000402641:exon_1415666_1416396:UNKL;ENSG00000059145:ENST00000508903:exon_1415809_1416396:UNKL;ENSG00000059145:ENST00000511095:exon_1416279_1416396:UNKL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 1503879 T/A 1 8 20 28 3.8197625376307 10.4505936559233 -6.63083111829256 A:T T A 10 0.522529682796163 0.0135142618303548 ENSG00000103249:ENST00000448525:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000428756:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000262318:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000382745:exon_1503835_1503895:CLCN7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 21 10 31 10.0268766612806 5.22529682796163 4.80157983331895 A:G A G 10 0.522529682796163 0.105040569336742 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 1724043 G/A 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000007545:ENST00000397412:exon_1723882_1727909:CRAMP1L;ENSG00000007545:ENST00000436138:exon_1723882_1724046:CRAMP1L;ENSG00000007545:ENST00000293925:exon_1723882_1727907:CRAMP1L;ENSG00000007545:ENST00000447969:exon_1723882_1727907:CRAMP1L;ENSG00000007545:ENST00000359804:exon_1723882_1727909:CRAMP1L;ENSG00000007545:ENST00000454337:exon_1723882_1725700:CRAMP1L;ENSG00000007545:ENST00000262317:exon_1723882_1727907:CRAMP1L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 1814440 A/G 1 23 27 50 10.9818172956883 14.1083014354964 -3.12648413980815 A:G A G 10 0.522529682796163 0.398280201904762 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 1823444 C/G 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 C:G C G 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000197774:ENST00000454910:exon_1823229_1823475:EME2;ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1823229_1823475:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1823327_1823475:EME2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 32 34 66 15.2790501505228 17.7660092150695 -2.48695906454676 A:C C A 10 0.522529682796163 0.541135514556116 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 1838640 T/C 1 34 33 67 16.2339907849305 17.2434795322734 -1.00948874734292 T:C T C 10 0.522529682796163 0.808225925705453 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 1877494 T/C 1 16 15 31 7.63952507526139 7.83794524194244 -0.198420166681052 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 1877558 G/A 1 21 28 49 10.0268766612806 14.6308311182926 -4.60395445701198 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.200323509128986 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2009697 C/T 1 57 45 102 27.2158080806187 23.5138357258273 3.70197235479138 T:C C T 10 0.522529682796163 0.488844089038833 ENSG00000140990:ENST00000268668:exon_2009519_2009755:NDUFB10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2014424 C/G 1 11 25 36 5.25217348924221 13.0632420699041 -7.81106858066187 C:G C G 10 0.522529682796163 0.0114668747114236 ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 19 24 43 9.0719360268729 12.5407123871079 -3.46877636023501 A:C A C 10 0.522529682796163 0.359884023639214 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2025604 G/C 1 21 25 46 10.0268766612806 13.0632420699041 -3.0363654086235 C:G G C 10 0.522529682796163 0.38017572494339 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2025678 C/A 1 14 16 30 6.68458444085372 8.36047492473861 -1.67589048388489 A:C C A 10 0.522529682796163 0.586538190836893 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2035868 C/T 1 55 60 115 26.260867446211 31.3517809677698 -5.09091352155874 T:C C T 10 0.522529682796163 0.351924622994699 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 56 57 113 26.7383377634149 29.7841919193813 -3.04585415596641 T:C T C 10 0.522529682796163 0.573538774887125 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2048796 C/T 1 38 41 79 18.1438720537458 21.4237169946427 -3.27984494089688 T:C C T 10 0.522529682796163 0.499893128228363 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2049728 C/T 1 31 26 57 14.8015798333189 13.5857717527002 1.21580808061871 T:C C T 10 0.522529682796163 0.791821633214219 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2049849 T/C 1 32 26 58 15.2790501505228 13.5857717527002 1.69327839782255 T:C T C 10 0.522529682796163 0.694775132952013 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2050192 G/T 1 26 35 61 12.4142282472998 18.2885388978657 -5.87431065056594 T:G G T 10 0.522529682796163 0.158215778645234 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2138533 C/T 1 26 24 50 12.4142282472998 12.5407123871079 -0.126484139808149 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138447_2138703:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138447_2138721:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138447_2138712:TSC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2160494 C/T 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C C T 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2158253_2161872:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2158253_2161872:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2158253_2161872:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2158253_2161872:PKD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2205117 G/A 1 23 30 53 10.9818172956883 15.6758904838849 -4.69407318819664 A:G G A 10 0.522529682796163 0.217030894420542 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2257105 C/G 1 25 14 39 11.9367579300959 7.31541555914628 4.62134237094964 C:G C G 10 0.522529682796163 0.151319768195027 ENSG00000167965:ENST00000382450:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301724:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000397124:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301725:exon_2257036_2257111:MLST8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2285357 C/T 1 19 21 40 9.0719360268729 10.9731233387194 -1.90118731184652 T:C C T 10 0.522529682796163 0.63557898252467 ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2305624 C/G 1 9 39 48 4.29723285483453 20.3786576290504 -16.0814247742158 C:G C G 10 0.522529682796163 3.23299776215789e-06 ENSG00000205937:ENST00000320225:exon_2305586_2305727:RNPS1;ENSG00000205937:ENST00000397086:exon_2305586_2305727:RNPS1;ENSG00000205937:ENST00000301730:exon_2305586_2305727:RNPS1;ENSG00000167970:ENST00000454671:exon_2305586_2305729:AC009065.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2512523 G/A 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 A:G G A 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000162062:ENST00000361837:exon_2512416_2512527:C16orf59;ENSG00000162062:ENST00000483320:exon_2512416_2512527:C16orf59 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 155 125 280 74.0078991665947 65.3162103495204 8.69168881707436 A:G A G 10 0.522529682796163 0.309519874548656 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 156 130 286 74.4853694837986 67.9288587635012 6.5565107202974 A:C C A 10 0.522529682796163 0.442338109668726 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2813626 C/G 1 156 164 320 74.4853694837986 85.6948679785707 -11.2094984947721 C:G C G 10 0.522529682796163 0.218452316320956 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2814162 G/A 1 159 176 335 75.9177804354101 91.9652241721247 -16.0474437367146 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0803120614941326 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2815237 A/C 1 225 199 424 107.430821370863 103.983406876436 3.44741449442689 A:C A C 10 0.522529682796163 0.770575497649934 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 2983483 C/G 1 8 27 35 3.8197625376307 14.1083014354964 -10.2885388978657 C:G C G 10 0.522529682796163 0.000536002018185853 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 3073240 G/T 1 44 21 65 21.0086939569688 10.9731233387194 10.0355706182494 A:T:G G T 10 0.522529682796163 0.0129556279909444 ENSG00000103145:ENST00000354679:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000396916:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000248089:exon_3073234_3073362:HCFC1R1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 3487201 G/A 0 9 0 9 4.29723285483453 0 4.29723285483453 G G 10 0.522529682796163 0.00419379916107509 ENSG00000167981:ENST00000301744:exon_3486104_3487538:ZNF597 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 3639139 A/G 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:G A G 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 45 62 107 21.4861642741727 32.3968403333621 -10.9106760591894 T:C:G G C 10 0.522529682796163 0.041662836062084 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 4409546 C/T 1 17 18 35 8.11699539246523 9.40553429033093 -1.2885388978657 T:C C T 10 0.522529682796163 0.736128234715988 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4409481_4409622:CORO7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 2 12 14 0.954940634407674 6.27035619355396 -5.31541555914628 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00557103121402613 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 36 21 57 17.1889314193381 10.9731233387194 6.21580808061871 T:C T C 10 0.522529682796163 0.1118398960542 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 34 20 54 16.2339907849305 10.4505936559233 5.7833971290072 A:T A T 10 0.522529682796163 0.133988817583858 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 14 14 28 6.68458444085372 7.31541555914628 -0.630831118292562 A:T T A 10 0.522529682796163 0.85163607998196 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 4930100 C/T 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 T:C C T 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4930084_4932361:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4930084_4932361:UBN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 8722629 G/C 1 11 11 22 5.25217348924221 5.74782651075779 -0.495653021515585 C:G G C 10 0.522529682796163 0.835008349106383 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 8953081 C/G 1 30 31 61 14.3241095161151 16.1984201666811 -1.87431065056594 C:G C G 10 0.522529682796163 0.701044946936684 ENSG00000153048:ENST00000396593:exon_8953028_8953192:CARHSP1;ENSG00000153048:ENST00000311052:exon_8953028_8953192:CARHSP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 10574796 C/T 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10574736_10574821:ATF7IP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 10574813 G/A 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 A:G G A 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10574736_10574821:ATF7IP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 56 56 112 26.7383377634149 29.2616622365851 -2.52332447317025 A:G A G 10 0.522529682796163 0.637700023880069 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 11001421 C/A 1 36 22 58 17.1889314193381 11.4956530215156 5.69327839782255 A:C C A 10 0.522529682796163 0.148970872684160 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 11001743 G/A 1 17 22 39 8.11699539246523 11.4956530215156 -3.37865762905036 A:G G A 10 0.522529682796163 0.336554969793601 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 11016045 C/T 1 24 20 44 11.4592876128921 10.4505936559233 1.00869395696883 T:C C T 10 0.522529682796163 0.880274360748163 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11016024_11016107:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11016024_11016107:CIITA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 11154770 G/A 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000465491:exon_11154759_11154879:CLEC16A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 11769948 C/T 1 24 19 43 11.4592876128921 9.9280639731271 1.53122363976499 T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.651110301177106 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 27 20 47 12.8916985645036 10.4505936559233 2.44110490858034 T:C C T 10 0.522529682796163 0.559763224190013 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 11933678 G/C 1 207 276 483 98.8363556611943 144.218192451741 -45.3818367905467 T:C:G G C 10 0.522529682796163 3.96021270024945e-05 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11933552_11933842:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11933552_11933842:RSL1D1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 56 53 109 26.7383377634149 27.6940731881966 -0.955735424781761 C:G G C 10 0.522529682796163 0.923674493520458 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 12061626 G/A 1 60 118 178 28.6482190322302 61.6585025699472 -33.010283537717 A:G G A 10 0.522529682796163 8.20769771077458e-07 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 12758966 T/C 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C T C 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12756937_12758972:CPPED1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 10 15 25 4.77470317203837 7.83794524194244 -3.06324206990407 A:C:G C A 10 0.522529682796163 0.235738342127358 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 15098047 C/G 1 16 22 38 7.63952507526139 11.4956530215156 -3.85612794625419 C:G C G 10 0.522529682796163 0.255806176333722 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15098044_15098190:PDXDC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 24 29 53 11.4592876128921 15.1533608010887 -3.69407318819664 A:G G A 10 0.522529682796163 0.337395568849209 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 28145165 T/A 1 24 28 52 11.4592876128921 14.6308311182926 -3.17154350540047 A:T T A 10 0.522529682796163 0.406883491224910 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28145162_28145254:XPO6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 28222690 G/A 1 20 17 37 9.54940634407674 8.88300460753477 0.666401736541969 A:G G A 10 0.522529682796163 0.870447919793445 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28222687_28223190:XPO6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 28507644 C/G 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 28846840 T/G 1 9 4 13 4.29723285483453 2.09011873118465 2.20711412364988 T:G T G 10 0.522529682796163 0.273205822586663 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 28846866 G/A 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.348733043074597 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 28847246 T/C 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C T C 10 0.522529682796163 0.534231980874486 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 28883241 A/G 1 15 10 25 7.16205475805756 5.22529682796163 1.93675793009593 A:G A G 10 0.522529682796163 0.549238895463454 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 28944700 G/T 1 45 44 89 21.4861642741727 22.9913060430312 -1.5051417688585 T:C:G G T 10 0.522529682796163 0.751649161849462 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944555_28944830:CD19 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 29821295 C/T 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 T:C C T 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:G A G 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 30000901 G/A 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 A:G G A 10 0.522529682796163 0.37096815956878 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 30081367 G/T 1 6 9 15 2.86482190322302 4.70276714516547 -1.83794524194244 T:G G T 10 0.522529682796163 0.440567980680144 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 30093779 C/G 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 C:G C G 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 30900235 G/A 1 44 42 86 21.0086939569688 21.9462466774388 -0.937552720470013 A:G G A 10 0.522529682796163 0.91412721784246 ENSG00000099385:ENST00000380317:exon_30900181_30900266:BCL7C;ENSG00000099385:ENST00000215115:exon_30900181_30900266:BCL7C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 46723598 T/C 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 T:C T C 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000091651:ENST00000219097:exon_46723558_46723682:ORC6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 47497874 G/A 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000102893:ENST00000455779:exon_47497793_47497904:PHKB;ENSG00000102893:ENST00000299167:exon_47497793_47497904:PHKB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 50106594 T/C 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C T C 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000155393:ENST00000285767:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000483299:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000299192:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000405152:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000401635:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000456734:exon_50106516_50106625:HEATR3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 50784086 C/T 1 33 38 71 15.7565204677266 19.8561279462542 -4.09960747852757 T:C C T 10 0.522529682796163 0.34397884476212 ENSG00000083799:ENST00000427738:exon_50783487_50784113:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000311559:exon_50783487_50784113:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000398568:exon_50783487_50784113:CYLD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 53283966 G/A 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G G A 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53283783_53283978:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53283783_53283978:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53283783_53283978:CHD9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 53358439 A/G 1 15 10 25 7.16205475805756 5.22529682796163 1.93675793009593 A:G A G 10 0.522529682796163 0.549238895463454 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53357932_53358807:CHD9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 57601792 C/T 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 66861966 G/A 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 A:G G A 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000159593:ENST00000379463:exon_66861883_66861980:NAE1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 67691515 C/A 1 28 24 52 13.3691688817074 12.5407123871079 0.828456494599527 A:C C A 10 0.522529682796163 0.889928355265603 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691433_67691587:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691435_67691587:ACD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 67691668 A/G 1 14 21 35 6.68458444085372 10.9731233387194 -4.2885388978657 A:G A G 10 0.522529682796163 0.176028958540217 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 67865937 T/C 1 23 24 47 10.9818172956883 12.5407123871079 -1.55889509141966 T:C T C 10 0.522529682796163 0.664170975831398 ENSG00000102901:ENST00000219172:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000440851:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000436104:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000445712:exon_67865915_67866011:CENPT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 67976969 C/T 1 10 8 18 4.77470317203837 4.1802374623693 0.594465709669066 T:C C T 10 0.522529682796163 0.817891150332414 ENSG00000213398:ENST00000264005:exon_67976959_67977115:LCAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 68336360 A/G 1 16 11 27 7.63952507526139 5.74782651075779 1.8916985645036 A:G A G 10 0.522529682796163 0.564634669250498 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68336284_68336404:SLC7A6OS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 T:C C T 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 68379679 C/T 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68379578_68379705:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68379578_68379705:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68379578_68379705:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68379578_68379705:PRMT7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 68380183 C/T 1 11 1 12 5.25217348924221 0.522529682796163 4.72964380644604 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00694152157969735 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68380048_68380183:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68380048_68380183:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68380048_68380183:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68380048_68380183:PRMT7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 8 12 20 3.8197625376307 6.27035619355396 -2.45059365592326 T:C C T 10 0.522529682796163 0.371173578167092 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 20 24 44 9.54940634407674 12.5407123871079 -2.99130604303117 A:G G A 10 0.522529682796163 0.370643188501956 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 70190401 C/T 1 20 4 24 9.54940634407674 2.09011873118465 7.45928761289209 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00194001882221269 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70190378_70195205:PDPR;ENSG00000090857:ENST00000205055:exon_70190378_70190765:PDPR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 70316658 A/C 1 143 150 293 68.2782553601487 78.3794524194244 -10.1011970592757 A:C A C 10 0.522529682796163 0.242592691323109 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70316523_70316687:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70316523_70316687:AARS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 14 34 48 6.68458444085372 17.7660092150695 -11.0814247742158 A:T A T 10 0.522529682796163 0.00136992378996956 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 70599146 A/C 1 82 76 158 39.1525660107146 39.7122558925084 -0.559689881793751 A:C A C 10 0.522529682796163 0.936698900129122 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70598968_70599173:SF3B3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 98 70 168 46.792091085976 36.5770777957314 10.2150132902446 T:C C T 10 0.522529682796163 0.122558500406071 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 71318759 A/T 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 A:T A T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 71773190 G/T 1 14 14 28 6.68458444085372 7.31541555914628 -0.630831118292562 T:G G T 10 0.522529682796163 0.85163607998196 ENSG00000166747:ENST00000299980:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000423132:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000393512:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000425422:exon_71773137_71773244:AP1G1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 71950450 C/T 1 12 23 35 5.72964380644604 12.0181827043117 -6.2885388978657 T:C C T 10 0.522529682796163 0.04132523785845 ENSG00000182149:ENST00000378799:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000378798:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000439924:exon_71950365_71950511:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000424485:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000329908:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000456820:exon_71950365_71950545:KIAA0174 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 72130203 C/G 1 23 29 52 10.9818172956883 15.1533608010887 -4.17154350540047 C:G C G 10 0.522529682796163 0.268426236577195 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 72130815 C/A 1 16 23 39 7.63952507526139 12.0181827043117 -4.37865762905036 A:C C A 10 0.522529682796163 0.199405165199645 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 72135014 T/C 1 24 12 36 11.4592876128921 6.27035619355396 5.18893141933813 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0956895452565143 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 72137561 G/A 1 21 27 48 10.0268766612806 14.1083014354964 -4.08142477421582 A:G G A 10 0.522529682796163 0.250711137597627 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 72137681 C/T 1 34 24 58 16.2339907849305 12.5407123871079 3.69327839782255 T:C C T 10 0.522529682796163 0.359372065578888 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 72139184 C/A 1 31 35 66 14.8015798333189 18.2885388978657 -3.48695906454675 A:C C A 10 0.522529682796163 0.392080663266083 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 31 0 31 14.8015798333189 0 14.8015798333189 C C 10 0.522529682796163 1.93726040596222e-09 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 74537591 C/T 1 7 18 25 3.34229222042686 9.40553429033093 -6.06324206990407 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0163652041814929 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74537429_74537644:GLG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 74664743 T/C 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 74664810 A/T 1 9 3 12 4.29723285483453 1.56758904838849 2.72964380644604 A:T A T 10 0.522529682796163 0.150898424576211 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 T:C C T 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 74695079 G/T 1 21 11 32 10.0268766612806 5.74782651075779 4.27905015052279 T:G G T 10 0.522529682796163 0.157170705562104 ENSG00000168411:ENST00000444004:exon_74694988_74695347:RFWD3;ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74694830_74695349:RFWD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 75204282 C/A 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 A:C C A 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000184517:ENST00000332307:exon_75203151_75206129:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000464850:exon_75203151_75205898:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000393430:exon_75203151_75206114:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000378686:exon_75203151_75206129:ZFP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 75646576 G/T 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 75646685 G/T 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 T:G G T 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 12 5 17 5.72964380644604 2.61264841398082 3.11699539246523 T:C T C 10 0.522529682796163 0.150352896781338 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 72 66 138 34.3778628386763 34.4869590645468 -0.109096225870488 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 81735375 G/A 1 12 9 21 5.72964380644604 4.70276714516547 1.02687666128058 A:G G A 10 0.522529682796163 0.670391349361465 ENSG00000153815:ENST00000398040:exon_81735265_81735405:AC099480.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 81941319 C/T 1 55 55 110 26.260867446211 28.739132553789 -2.47826510757793 T:C C T 10 0.522529682796163 0.702814227575383 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81941290_81941379:PLCG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 51 64 115 24.3509861773957 33.4418996989544 -9.09091352155874 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0934303257060574 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 18 15 33 8.59446570966907 7.83794524194244 0.756520467726622 T:C C T 10 0.522529682796163 0.862587560743927 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 84115483 G/A 1 14 8 22 6.68458444085372 4.1802374623693 2.50434697848442 A:G G A 10 0.522529682796163 0.39388166009814 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84115352_84115513:MBTPS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 22 17 39 10.5043469784844 8.88300460753477 1.62134237094964 A:C C A 10 0.522529682796163 0.63394207999485 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 25 17 42 11.9367579300959 8.88300460753477 3.05375332256116 T:C C T 10 0.522529682796163 0.359076047709428 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 16 7 23 7.63952507526139 3.65770777957314 3.98181729568825 A:T A T 10 0.522529682796163 0.142379051974171 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 84215390 T/C 1 21 11 32 10.0268766612806 5.74782651075779 4.27905015052279 T:C T C 10 0.522529682796163 0.157170705562104 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84215352_84215664:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84215352_84215469:TAF1C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 84516309 G/A 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84516198_84516316:KIAA1609 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 84695280 A/G 1 9 13 22 4.29723285483453 6.79288587635012 -2.49565302151559 A:G A G 10 0.522529682796163 0.296166428569315 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 84695490 C/T 1 22 19 41 10.5043469784844 9.9280639731271 0.576283005357318 T:C C T 10 0.522529682796163 0.877194379558022 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 88 62 150 42.0173879139377 32.3968403333621 9.62054758057555 A:G A G 10 0.522529682796163 0.120881365243074 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 76 68 144 36.2877441074916 35.5320184301391 0.75572567735253 T:C C T 10 0.522529682796163 0.933622668068315 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 18 15 33 8.59446570966907 7.83794524194244 0.756520467726622 T:G T G 10 0.522529682796163 0.862587560743927 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 54 49 103 25.7833971290072 25.603954457012 0.179442671995215 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 85711860 C/T 1 44 39 83 21.0086939569688 20.3786576290504 0.630036327918475 T:C C T 10 0.522529682796163 0.912915751670998 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 17 13 30 8.11699539246523 6.79288587635012 1.32410951611511 A:G G A 10 0.522529682796163 0.716107033674038 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 88724347 G/T 1 18 26 44 8.59446570966907 13.5857717527002 -4.99130604303117 T:G G T 10 0.522529682796163 0.173721697119302 ENSG00000167508:ENST00000301012:exon_88724323_88724437:MVD;ENSG00000167508:ENST00000378400:exon_88724323_88724437:MVD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 88779032 G/C 1 17 13 30 8.11699539246523 6.79288587635012 1.32410951611511 C:G G C 10 0.522529682796163 0.716107033674038 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 15 17 32 7.16205475805756 8.88300460753477 -1.72094984947721 A:G A G 10 0.522529682796163 0.597738714995898 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 22 40 62 10.5043469784844 20.9011873118465 -10.3968403333621 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0104503166289344 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 40 40 80 19.0988126881535 20.9011873118465 -1.80237462369304 C:G C G 10 0.522529682796163 0.737489323126676 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 88884466 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000141012:ENST00000268695:exon_88884415_88884532:GALNS;ENSG00000141012:ENST00000439266:exon_88884415_88884532:GALNS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 89167140 G/C 1 3 15 18 1.43241095161151 7.83794524194244 -6.40553429033093 C:G G C 10 0.522529682796163 0.00334293636135881 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 89348997 G/C 1 29 24 53 13.8466391989113 12.5407123871079 1.30592681180336 C:G G C 10 0.522529682796163 0.783997724704117 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 54 42 96 25.7833971290072 21.9462466774388 3.83715045156836 A:G G A 10 0.522529682796163 0.475002519025666 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 89662063 T/C 0 9 0 9 4.29723285483453 0 4.29723285483453 T T 10 0.522529682796163 0.00419379916107509 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 89663025 C/T 1 49 6 55 23.396045542988 3.13517809677698 20.260867446211 T:C C T 10 0.522529682796163 7.02577564414928e-09 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 89760652 C/T 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 T:C C T 10 0.522529682796163 0.37096815956878 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 89782989 A/G 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 A:G A G 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000075399:ENST00000389386:exon_89782870_89783032:C16orf7;ENSG00000075399:ENST00000261625:exon_89782870_89783032:C16orf7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 89789898 T/C 1 9 14 23 4.29723285483453 7.31541555914628 -3.01818270431175 T:C T C 10 0.522529682796163 0.218336616351306 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89789668_89790117:ZNF276 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 89799950 C/T 1 13 7 20 6.20711412364988 3.65770777957314 2.54940634407674 T:C C T 10 0.522529682796163 0.272883112161240 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89799890_89799965:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89799890_89799965:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89799890_89799965:ZNF276 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 89805977 G/A 1 10 14 24 4.77470317203837 7.31541555914628 -2.54071238710791 A:G G A 10 0.522529682796163 0.314811911172675 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 89807233 C/G 1 16 23 39 7.63952507526139 12.0181827043117 -4.37865762905036 C:G C G 10 0.522529682796163 0.199405165199645 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89807212_89807274:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89807212_89807274:FANCA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 89809319 T/C 1 6 12 18 2.86482190322302 6.27035619355396 -3.40553429033093 T:C T C 10 0.522529682796163 0.155342186917693 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89809208_89809346:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89809208_89809346:FANCA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 89825065 G/A 1 2 6 8 0.954940634407674 3.13517809677698 -2.1802374623693 A:G G A 10 0.522529682796163 0.163120845582557 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89824985_89825113:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89824985_89825113:FANCA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 16 90075226 C/T 0 0 14 14 0 7.31541555914628 -7.31541555914628 T C T 10 0.522529682796163 3.20073186070275e-05 ENSG00000003249:ENST00000304733:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000002501:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000392973:exon_90075192_90075332:DBNDD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 505129 A/C 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 A:C A C 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_505035_505136:VPS53 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 526907 G/T 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_526773_526914:VPS53 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 32 36 68 15.2790501505228 18.8110685806619 -3.53201843013908 T:C C T 10 0.522529682796163 0.398447812411673 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 650206 C/T 1 20 28 48 9.54940634407674 14.6308311182926 -5.08142477421582 T:C C T 10 0.522529682796163 0.150617046500085 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 25 19 44 11.9367579300959 9.9280639731271 2.00869395696883 T:G G T 10 0.522529682796163 0.651254012401917 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 52 45 97 24.8284564945995 23.5138357258273 1.31462076877219 T:C T C 10 0.522529682796163 0.839191839335925 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 1531043 T/C 0 32 0 32 15.2790501505228 0 15.2790501505228 T T 10 0.522529682796163 1.00725121899628e-09 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1531009_1531214:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1531009_1531214:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1531009_1531214:SLC43A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 1639350 C/T 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 T:C C T 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1638866_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1639333_1639512:WDR81 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 1703543 G/C 1 6 10 16 2.86482190322302 5.22529682796163 -2.36047492473861 C:G G C 10 0.522529682796163 0.317915137228048 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1703151_1704099:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000495309:exon_1703510_1704011:SMYD4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 1704296 C/A 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:C C A 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 1795180 T/C 1 33 41 74 15.7565204677266 21.4237169946427 -5.66719652691606 T:C T C 10 0.522529682796163 0.201482045539010 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 2268311 G/A 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2268191_2268351:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2268191_2268351:SGSM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 39 32 71 18.6213423709496 16.7209498494772 1.90039252147243 A:G G A 10 0.522529682796163 0.721930831923307 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 2597436 C/T 1 43 25 68 20.531223639765 13.0632420699041 7.46798156986092 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0884921243679748 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2597417_2597570:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2597417_2597570:KIAA0664 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3559823 G/A 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G G A 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3559781_3559880:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3559781_3559880:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3559781_3559880:CTNS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3564068 G/A 1 8 1 9 3.8197625376307 0.522529682796163 3.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0407796571976411 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3564073 A/G 1 8 1 9 3.8197625376307 0.522529682796163 3.29723285483453 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0407796571976411 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3568012 A/G 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 A:G A G 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3567973_3568092:TAX1BP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3577146 C/T 1 27 14 41 12.8916985645036 7.31541555914628 5.57628300535732 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0870200830196702 ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3576521_3577171:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3576524_3577171:P2RX5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3627473 C/T 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C C T 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3627840 G/A 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3628212 T/C 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 T:C T C 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3628362 T/C 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 T:C T C 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 23 25 48 10.9818172956883 13.0632420699041 -2.08142477421582 T:C T C 10 0.522529682796163 0.566320582114887 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3844787 C/G 1 18 15 33 8.59446570966907 7.83794524194244 0.756520467726622 C:G C G 10 0.522529682796163 0.862587560743927 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3844730_3844948:ATP2A3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3845927 A/G 1 17 12 29 8.11699539246523 6.27035619355396 1.84663919891127 A:G A G 10 0.522529682796163 0.578663103203533 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3845900_3846025:ATP2A3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3846802 A/G 1 18 10 28 8.59446570966907 5.22529682796163 3.36916888170744 A:G A G 10 0.522529682796163 0.256699726213295 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3846685_3846816:ATP2A3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3848013 A/C 1 19 17 36 9.0719360268729 8.88300460753477 0.188931419338132 A:C:G A C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3847998_3848100:ATP2A3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 3851111 G/A 1 13 21 34 6.20711412364988 10.9731233387194 -4.76600921506954 A:G G A 10 0.522529682796163 0.122223674636380 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3850685_3851149:ATP2A3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 4446457 G/A 1 33 29 62 15.7565204677266 15.1533608010887 0.603159666637897 A:G G A 10 0.522529682796163 0.899536846651567 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 4449228 C/T 1 17 35 52 8.11699539246523 18.2885388978657 -10.1715435054005 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0052258377497804 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4449141_4449237:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4449141_4449237:MYBBP1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 4451453 C/T 1 14 17 31 6.68458444085372 8.88300460753477 -2.19842016668105 T:C C T 10 0.522529682796163 0.474916459833262 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4451438_4451605:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4451438_4451605:MYBBP1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 4451576 T/C 1 36 17 53 17.1889314193381 8.88300460753477 8.30592681180336 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0270399785363744 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4451438_4451605:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4451438_4451605:MYBBP1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 4453508 C/T 1 18 19 37 8.59446570966907 9.9280639731271 -1.33359826345803 T:C C T 10 0.522529682796163 0.74284768069353 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4453353_4453648:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4453353_4453648:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4453353_4453648:MYBBP1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 4700993 C/G 1 109 83 192 52.0442645752182 43.3699636720815 8.67430090313671 A:C:G C G 10 0.522529682796163 0.219846833289397 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 4712617 C/T 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 A:T:C C T 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4712593_4712658:PLD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 29 34 63 13.8466391989113 17.7660092150695 -3.91937001615827 T:C T C 10 0.522529682796163 0.377545646800947 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 15 17 32 7.16205475805756 8.88300460753477 -1.72094984947721 T:C C T 10 0.522529682796163 0.597738714995898 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 49 52 101 23.396045542988 27.1715435054005 -3.77549796241246 T:C C T 10 0.522529682796163 0.486206986070928 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 44 56 100 21.0086939569688 29.2616622365851 -8.25296827961629 C:G C G 10 0.522529682796163 0.109195671594407 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 5336791 G/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:G G T 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 5347576 G/A 1 12 5 17 5.72964380644604 2.61264841398082 3.11699539246523 A:G G A 10 0.522529682796163 0.150352896781338 ENSG00000005100:ENST00000225296:exon_5344232_5347833:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000457531:exon_5345596_5347833:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000433302:exon_5345596_5347833:DHX33 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 5356913 C/T 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 T:C C T 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000005100:ENST00000225296:exon_5356900_5356988:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000457531:exon_5356900_5356988:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000433302:exon_5356900_5356988:DHX33 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 5392161 C/T 1 11 15 26 5.25217348924221 7.83794524194244 -2.58577175270024 T:C C T 10 0.522529682796163 0.332278501659484 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 5418107 G/A 1 25 32 57 11.9367579300959 16.7209498494772 -4.78419191938129 A:G G A 10 0.522529682796163 0.233153296600261 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5417439_5418393:NLRP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 5418799 G/A 1 46 46 92 21.9636345913765 24.0363654086235 -2.07273081724699 A:G G A 10 0.522529682796163 0.677664011324184 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5418793_5418837:NLRP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 22 36 58 10.5043469784844 18.8110685806619 -8.30672160217745 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0348108744321827 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 5436263 C/T 1 12 19 31 5.72964380644604 9.9280639731271 -4.19842016668105 T:C C T 10 0.522529682796163 0.151481718613018 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5436142_5436304:NLRP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 6943266 G/A 1 4 9 13 1.90988126881535 4.70276714516547 -2.79288587635012 A:G G A 10 0.522529682796163 0.165288727116232 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6943082_6943438:SLC16A13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7162001 C/T 1 13 8 21 6.20711412364988 4.1802374623693 2.02687666128058 T:C C T 10 0.522529682796163 0.393482202967395 ENSG00000170291:ENST00000354429:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396627:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396628:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000356683:exon_7161907_7163250:C17orf81 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7220881 C/T 1 9 9 18 4.29723285483453 4.70276714516547 -0.405534290330934 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7220780_7220892:GPS2;ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7220780_7220892:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7220780_7220892:NEURL4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7297121 G/A 1 12 9 21 5.72964380644604 4.70276714516547 1.02687666128058 A:G G A 10 0.522529682796163 0.670391349361465 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7296920_7297155:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7296920_7297155:PLSCR3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7405937 C/T 1 15 25 40 7.16205475805756 13.0632420699041 -5.90118731184652 T:C C T 10 0.522529682796163 0.080522046380089 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7405837_7406020:POLR2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7460517 G/C 1 5 11 16 2.38735158601918 5.74782651075779 -3.36047492473861 C:G G C 10 0.522529682796163 0.131585770979384 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7460416_7460549:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7460685 G/A 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G G A 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7462555 G/A 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 A:T:G G A 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000161955:ENST00000380535:exon_7461609_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396542:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7461793_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7461914_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462104_7462614:TNFSF13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7478213 C/T 1 10 17 27 4.77470317203837 8.88300460753477 -4.1083014354964 T:C C T 10 0.522529682796163 0.125888769648125 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7479892 C/T 1 327 237 564 156.132793725655 123.839534822691 32.2932589029641 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00693701146370778 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7479842_7480010:EIF4A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7484101 C/A 1 10 8 18 4.77470317203837 4.1802374623693 0.594465709669066 A:C C A 10 0.522529682796163 0.817891150332414 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484029_7484101:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484029_7484101:CD68 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7490379 G/C 1 3 10 13 1.43241095161151 5.22529682796163 -3.79288587635012 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0492990438494871 ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490217_7490589:MPDU1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7490810 G/A 1 45 50 95 21.4861642741727 26.1264841398081 -4.64031986563548 A:G G A 10 0.522529682796163 0.356576497987569 ENSG00000129255:ENST00000250124:exon_7490744_7491523:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490744_7491504:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000359822:exon_7490744_7491027:MPDU1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7579472 G/C 1 49 51 100 23.396045542988 26.6490138226043 -3.25296827961629 C:G G C 10 0.522529682796163 0.548726041179048 ENSG00000141510:ENST00000413465:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000269305:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000455263:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000420246:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000445888:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000419024:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000359597:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000505014:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000414315:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000508793:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000503591:exon_7579312_7579590:TP53 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7592560 C/T 1 17 8 25 8.11699539246523 4.1802374623693 3.93675793009593 T:C C T 10 0.522529682796163 0.159934997919704 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7592542_7592640:WRAP53 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 6 10 16 2.86482190322302 5.22529682796163 -2.36047492473861 C:G C G 10 0.522529682796163 0.317915137228048 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7750232 T/C 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 T:C T C 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750137_7750334:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750137_7750334:KDM6B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7750436 C/T 1 8 11 19 3.8197625376307 5.74782651075779 -1.9280639731271 T:C C T 10 0.522529682796163 0.492106910577732 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750423_7750770:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750423_7750770:KDM6B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7754460 C/A 1 15 14 29 7.16205475805756 7.31541555914628 -0.153360801088725 A:C C A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7754339_7754544:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7754339_7754544:KDM6B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 20 30 50 9.54940634407674 15.6758904838849 -6.12648413980815 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0901401534084989 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8046772 C/G 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8048169 T/C 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 T:C T C 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 9 9 18 4.29723285483453 4.70276714516547 -0.405534290330934 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8064083 T/G 1 40 29 69 19.0988126881535 15.1533608010887 3.94545188706475 T:G T G 10 0.522529682796163 0.399157948647956 ENSG00000220205:ENST00000316509:exon_8062467_8064189:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8077581 T/C 1 7 10 17 3.34229222042686 5.22529682796163 -1.88300460753477 T:C T C 10 0.522529682796163 0.468082532065744 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107;ENSG00000179029:ENST00000532998:exon_8077060_8079175:TMEM107;ENSG00000179029:ENST00000437139:exon_8077285_8077590:TMEM107;ENSG00000179029:ENST00000533070:exon_8077317_8077590:TMEM107;ENSG00000179029:ENST00000316425:exon_8077319_8077590:TMEM107;ENSG00000179029:ENST00000431792:exon_8077321_8077590:TMEM107;ENSG00000179029:ENST00000526920:exon_8077420_8077934:TMEM107;ENSG00000179029:ENST00000529756:exon_8077489_8077590:TMEM107 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8092694 T/G 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 T:C:G T G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000196544:ENST00000389017:exon_8091652_8093564:C17orf59;ENSG00000196544:ENST00000357939:exon_8092385_8093056:C17orf59 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8108331 A/G 1 90 61 151 42.9723285483453 31.8743106505659 11.0980178977794 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0733679462288795 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 88 56 144 42.0173879139377 29.2616622365851 12.7557256773525 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0368032937863031 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 13 25 38 6.20711412364988 13.0632420699041 -6.85612794625419 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0335968346912396 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8157310 C/T 1 17 13 30 8.11699539246523 6.79288587635012 1.32410951611511 T:C C T 10 0.522529682796163 0.716107033674038 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8157177_8157397:PFAS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8161149 C/T 1 17 12 29 8.11699539246523 6.27035619355396 1.84663919891127 T:C C T 10 0.522529682796163 0.578663103203533 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8161125_8161256:PFAS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8167600 T/C 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C T C 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8167530_8167655:PFAS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8168224 T/C 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C T C 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8168213_8168443:PFAS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8192277 C/T 1 50 39 89 23.8735158601919 20.3786576290504 3.4948582311415 A:T:C C T 10 0.522529682796163 0.524595585523561 ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000108961:ENST00000226105:exon_8192274_8192390:RANGRF;ENSG00000108961:ENST00000407006:exon_8192274_8192390:RANGRF;ENSG00000108961:ENST00000439238:exon_8192274_8192390:RANGRF;ENSG00000108961:ENST00000314193:exon_8192274_8192376:RANGRF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 8736223 G/A 1 24 17 41 11.4592876128921 8.88300460753477 2.57628300535732 A:G G A 10 0.522529682796163 0.439130447903885 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 9395231 G/A 1 27 28 55 12.8916985645036 14.6308311182926 -1.73913255378896 A:G G A 10 0.522529682796163 0.686526580129989 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9395146_9395238:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9395146_9395238:STX8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 10608518 T/G 1 12 7 19 5.72964380644604 3.65770777957314 2.0719360268729 T:G T G 10 0.522529682796163 0.368592887865543 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10608227_10608844:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10608227_10608932:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000527582:exon_10608227_10609245:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10608244_10608844:C17orf48 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 22 20 42 10.5043469784844 10.4505936559233 0.0537533225611551 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 3 8 11 1.43241095161151 4.1802374623693 -2.74782651075779 T:C T C 10 0.522529682796163 0.131967912623333 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 16842912 A/G 1 118 151 269 56.3414974300528 78.9019821022206 -22.5604846721678 A:G A G 10 0.522529682796163 0.00600529101988015 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 16842991 G/A 1 85 82 167 40.5849769623261 42.8474339892854 -2.26245702695922 A:G G A 10 0.522529682796163 0.756916859997554 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16842970_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 17046024 C/A 1 8 9 17 3.8197625376307 4.70276714516547 -0.883004607534771 A:C C A 10 0.522529682796163 0.809298250481776 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17045941_17046079:MPRIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 17062241 C/G 1 12 18 30 5.72964380644604 9.40553429033093 -3.67589048388489 C:G C G 10 0.522529682796163 0.202974205829589 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000423885:exon_17061811_17062316:MPRIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 32 20 52 15.2790501505228 10.4505936559233 4.82845649459952 A:G G A 10 0.522529682796163 0.211722415520129 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 72 61 133 34.3778628386763 31.8743106505659 2.50355218811032 A:G G A 10 0.522529682796163 0.728589045183657 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 18193941 G/A 1 9 10 19 4.29723285483453 5.22529682796163 -0.928063973127097 A:G G A 10 0.522529682796163 0.819201169042762 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18193871_18194000:TOP3A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 18219835 T/C 1 3 8 11 1.43241095161151 4.1802374623693 -2.74782651075779 T:C T C 10 0.522529682796163 0.131967912623333 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 18220674 C/T 1 8 9 17 3.8197625376307 4.70276714516547 -0.883004607534771 T:C C T 10 0.522529682796163 0.809298250481776 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 18221010 A/G 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 A:G A G 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 18221134 C/T 1 6 8 14 2.86482190322302 4.1802374623693 -1.31541555914628 T:C C T 10 0.522529682796163 0.595734183488216 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 18226177 G/T 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18225931_18226517:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18225931_18226384:SMCR8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 13 21 34 6.20711412364988 10.9731233387194 -4.76600921506954 A:G G A 10 0.522529682796163 0.122223674636380 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 18874720 C/G 1 10 12 22 4.77470317203837 6.27035619355396 -1.49565302151559 C:G C G 10 0.522529682796163 0.531644723723978 ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18872102_18875061:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000345041:exon_18874381_18875061:FAM83G HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 18907029 A/G 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G A G 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18906833_18907381:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000345041:exon_18906833_18907482:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000399096:exon_18906833_18907482:FAM83G HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 19578873 A/T 1 19 16 35 9.0719360268729 8.36047492473861 0.711461102134296 A:T A T 10 0.522529682796163 0.866675817943547 ENSG00000072210:ENST00000176643:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000395575:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000339618:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000472059:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000476965:exon_19578871_19579060:ALDH3A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 19812541 T/C 1 3 12 15 1.43241095161151 6.27035619355396 -4.83794524194244 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0173534416682307 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19812494_19812589:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19812494_19812589:AKAP10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 19839625 G/A 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19839599_19839743:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19839599_19839743:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000460046:exon_19839315_19839743:AKAP10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 19861458 C/T 1 2 11 13 0.954940634407674 5.74782651075779 -4.79288587635012 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0100711280734656 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 20107773 T/C 1 5 11 16 2.38735158601918 5.74782651075779 -3.36047492473861 T:C T C 10 0.522529682796163 0.131585770979384 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 20108239 A/T 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 A:T A T 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 12 14 26 5.72964380644604 7.31541555914628 -1.58577175270024 T:C C T 10 0.522529682796163 0.561386502703927 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 20163529 A/G 1 3 8 11 1.43241095161151 4.1802374623693 -2.74782651075779 A:G A G 10 0.522529682796163 0.131967912623333 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20163505_20163607:SPECC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 37 0 37 17.666401736542 0 17.666401736542 T T 10 0.522529682796163 3.84839144127408e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 46 0 46 21.9636345913765 0 21.9636345913765 G G 10 0.522529682796163 1.95418652899247e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 47 0 47 22.4411049085803 0 22.4411049085803 C C 10 0.522529682796163 9.90599622979953e-14 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 37 0 37 17.666401736542 0 17.666401736542 C C 10 0.522529682796163 3.84839144127408e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 66 0 66 31.5130409354532 0 31.5130409354532 C C 10 0.522529682796163 2.9582898294823e-19 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 37 0 37 17.666401736542 0 17.666401736542 C C 10 0.522529682796163 3.84839144127408e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 24 0 24 11.4592876128921 0 11.4592876128921 C C 10 0.522529682796163 1.91368858777286e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 40 0 40 19.0988126881535 0 19.0988126881535 C C 10 0.522529682796163 5.44581863991873e-12 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 44 0 44 21.0086939569688 0 21.0086939569688 G G 10 0.522529682796163 7.62698207154021e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 81 0 81 38.6750956935108 0 38.6750956935108 G G 10 0.522529682796163 1.55743438905918e-23 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 27075423 C/T 1 113 99 212 53.9541458440336 51.7304385968201 2.22370724721345 T:C C T 10 0.522529682796163 0.783569626180006 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075280_27075441:TRAF4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 27085564 A/G 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 A:G A G 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000173065:ENST00000452648:exon_27082996_27086894:C17orf63;ENSG00000173065:ENST00000341217:exon_27082996_27086894:C17orf63 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 53 54 107 25.3059268118034 28.2166028709928 -2.91067605918944 T:C C T 10 0.522529682796163 0.628721624553766 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 57 57 114 27.2158080806187 29.7841919193813 -2.56838383876258 T:C C T 10 0.522529682796163 0.64041367524116 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 15 16 31 7.16205475805756 8.36047492473861 -1.19842016668105 T:C C T 10 0.522529682796163 0.721148115439186 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 27425410 G/A 1 27 31 58 12.8916985645036 16.1984201666811 -3.30672160217745 A:G G A 10 0.522529682796163 0.43106904008667 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000532143:exon_27425389_27425463:MYO18A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 27438469 G/A 1 11 11 22 5.25217348924221 5.74782651075779 -0.495653021515585 A:G G A 10 0.522529682796163 0.835008349106383 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438442_27438601:MYO18A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 27441077 C/G 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 C:G C G 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533399:exon_27441029_27441286:MYO18A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 29553485 G/A 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000196712:ENST00000358273:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000356175:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000444181:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000495910:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000456735:exon_29553453_29553702:NF1;ENSG00000196712:ENST00000493220:exon_29553453_29553702:NF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 22 26 48 10.5043469784844 13.5857717527002 -3.08142477421582 A:G G A 10 0.522529682796163 0.389382705479001 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 29855643 C/T 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 T:C C T 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000131242:ENST00000394744:exon_29855638_29855796:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000325874:exon_29855638_29855796:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000394742:exon_29855638_29855796:RAB11FIP4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 30183857 T/C 1 11 15 26 5.25217348924221 7.83794524194244 -2.58577175270024 T:C T C 10 0.522529682796163 0.332278501659484 ENSG00000172301:ENST00000302362:exon_30183818_30183884:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000378634:exon_30183818_30183884:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000496655:exon_30183818_30183884:C17orf79 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 7 14 21 3.34229222042686 7.31541555914628 -3.97312333871942 T:C T C 10 0.522529682796163 0.124249396105681 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 30533970 A/G 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 A:G A G 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000126858:ENST00000333942:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000394692:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000358365:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000354266:exon_30533929_30534048:RHOT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 33460367 G/A 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 33460431 C/T 1 6 15 21 2.86482190322302 7.83794524194244 -4.97312333871942 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0466581471430304 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 33460516 A/G 1 11 22 33 5.25217348924221 11.4956530215156 -6.24347953227338 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0357128574386041 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 33592621 C/T 0 0 12 12 0 6.27035619355396 -6.27035619355396 T C T 10 0.522529682796163 0.000140396582616182 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 33749546 A/G 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 A:G A G 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 33749919 A/C 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 A:C A C 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000447040:exon_33749664_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000445092:exon_33749840_33750087:SLFN12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 33768199 G/A 1 26 26 52 12.4142282472998 13.5857717527002 -1.17154350540048 A:T:G G A 10 0.522529682796163 0.782375480967989 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 33966629 C/T 1 20 18 38 9.54940634407674 9.40553429033093 0.143872053745806 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33966614_33966779:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33966614_33966779:AP2B1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 24 19 43 11.4592876128921 9.9280639731271 1.53122363976499 C:G G C 10 0.522529682796163 0.651110301177106 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 35771468 C/T 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000108264:ENST00000394395:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000490992:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000225396:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000417170:exon_35771356_35771477:TADA2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 36873149 C/T 1 19 24 43 9.0719360268729 12.5407123871079 -3.46877636023501 T:C C T 10 0.522529682796163 0.359884023639214 ENSG00000108292:ENST00000325718:exon_36872620_36873234:MLLT6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 36909499 A/T 1 92 75 167 43.927269182753 39.1897262097122 4.73754297304079 A:T A T 10 0.522529682796163 0.486234769535829 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909403_36909587:PSMB3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 36926731 T/G 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 T:G T G 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 36926767 G/A 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 A:G G A 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 36966701 G/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:G G T 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 37034365 C/T 1 53 52 105 25.3059268118034 27.1715435054005 -1.86561669359711 T:C C T 10 0.522529682796163 0.76968751870432 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37034339_37034433:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37034339_37034433:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37034339_37034433:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000443937:exon_37034339_37034433:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37034339_37034433:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37034339_37034433:LASP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 30 33 63 14.3241095161151 17.2434795322734 -2.91937001615826 A:G A G 10 0.522529682796163 0.528699123968334 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 39912145 T/A 1 11 6 17 5.25217348924221 3.13517809677698 2.11699539246523 A:T T A 10 0.522529682796163 0.340698354211182 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39910856_39912147:JUP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 40255812 C/T 1 11 4 15 5.25217348924221 2.09011873118465 3.16205475805756 T:C C T 10 0.522529682796163 0.124047501512051 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40255626_40255816:DHX58 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 40257163 T/C 1 15 5 20 7.16205475805756 2.61264841398082 4.54940634407674 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0454598983886916 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 40280291 G/A 1 22 33 55 10.5043469784844 17.2434795322734 -6.73913255378896 A:G G A 10 0.522529682796163 0.079107395133397 ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40280279_40280401:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40280279_40280401:RAB5C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 40344455 C/T 1 17 17 34 8.11699539246523 8.88300460753477 -0.766009215069541 T:C C T 10 0.522529682796163 0.86437385210619 ENSG00000167925:ENST00000454210:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000393854:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000428494:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000301671:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000414034:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000377472:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000436923:exon_40344259_40344760:GHDC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 40362471 G/A 1 19 16 35 9.0719360268729 8.36047492473861 0.711461102134296 A:G G A 10 0.522529682796163 0.866675817943547 ENSG00000173757:ENST00000293328:exon_40362421_40362515:STAT5B;ENSG00000173757:ENST00000481253:exon_40362421_40362610:STAT5B;ENSG00000173757:ENST00000468496:exon_40362189_40362515:STAT5B;ENSG00000173757:ENST00000481517:exon_40362435_40362515:STAT5B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 42225547 A/C 1 9 3 12 4.29723285483453 1.56758904838849 2.72964380644604 A:C A C 10 0.522529682796163 0.150898424576211 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42225226_42226395:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42225226_42226395:C17orf53 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 81 81 162 38.6750956935108 42.3249043064892 -3.6498086129784 T:C C T 10 0.522529682796163 0.582596640914141 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 43003484 T/C 1 24 12 36 11.4592876128921 6.27035619355396 5.18893141933813 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0956895452565143 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43003360_43003554:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43003448_43003554:KIF18B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 43013460 C/G 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43013400_43013728:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43013400_43013726:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000376982:exon_43013400_43013728:KIF18B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 43216472 A/G 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 A:G A G 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000181513:ENST00000431281:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000321854:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000428033:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000398322:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000376955:exon_43216388_43216527:ACBD4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 43311620 A/G 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G A G 10 0.522529682796163 0.728776437395601 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 43342141 G/C 1 19 10 29 9.0719360268729 5.22529682796163 3.84663919891127 C:G G C 10 0.522529682796163 0.193159511154280 ENSG00000006062:ENST00000344686:exon_43340488_43342167:MAP3K14;ENSG00000006062:ENST00000376926:exon_43340495_43342167:MAP3K14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 44109474 G/A 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44109413_44109665:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44109413_44109665:KIAA1267 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 44117135 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44117068_44117250:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44117068_44117250:KIAA1267 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 44248499 G/C 1 18 8 26 8.59446570966907 4.1802374623693 4.41422824729976 C:G G C 10 0.522529682796163 0.114799439152915 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 45198343 C/T 1 20 33 53 9.54940634407674 17.2434795322734 -7.69407318819664 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0388857610291987 ENSG00000004897:ENST00000066544:exon_45195069_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000446365:exon_45195310_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000441612:exon_45196583_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000525495:exon_45197352_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000531206:exon_45197621_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000533415:exon_45198137_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000527547:exon_45198246_45198383:CDC27 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 45214685 T/C 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000004897:ENST00000066544:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000441612:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000525495:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000531206:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000533415:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000527547:exon_45214518_45214726:CDC27 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 45811210 A/G 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 A:G A G 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45810610_45811311:TBX21 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 46052883 G/A 1 67 61 128 31.9905112526571 31.8743106505659 0.116200602091141 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000108465:ENST00000338399:exon_46052880_46053019:CDK5RAP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 46136463 T/G 1 100 89 189 47.7470317203837 46.5051417688585 1.2418899515252 T:G T G 10 0.522529682796163 0.88436136602496 ENSG00000082641:ENST00000362042:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000361665:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000357480:exon_46135657_46138906:NFE2L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 46262171 C/T 1 17 25 42 8.11699539246523 13.0632420699041 -4.94624667743884 T:C C T 10 0.522529682796163 0.163750215642684 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 47293906 G/A 1 33 39 72 15.7565204677266 20.3786576290504 -4.62213716132373 A:G G A 10 0.522529682796163 0.290057053996103 ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47293893_47294060:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47293893_47294042:ABI3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 47783602 G/A 1 19 22 41 9.0719360268729 11.4956530215156 -2.42371699464268 A:G G A 10 0.522529682796163 0.532347718490985 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47782486_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47783228_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000503334:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508520:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000435059:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000514907:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000515850:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000511763:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508926:exon_47783566_47783717:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000511657:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000509781:exon_47783230_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508607:exon_47783438_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000505765:exon_47783564_47783671:SLC35B1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 48431032 G/A 1 6 11 17 2.86482190322302 5.74782651075779 -2.88300460753477 A:G G A 10 0.522529682796163 0.224425269329800 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000509778:exon_48430991_48431035:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48430991_48431483:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48430991_48431483:XYLT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 48452776 A/C 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 A:C A C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48452546_48453344:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48452546_48453344:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511711:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48452546_48453344:EME1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 48455985 A/T 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:T A T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48455956_48456042:EME1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 48456193 T/C 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 T:C T C 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 48457722 G/C 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48457673_48457862:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48457673_48457862:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48457673_48457862:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48457673_48457862:EME1;ENSG00000154920:ENST00000507616:exon_48457120_48457862:EME1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 48549791 C/G 1 14 9 23 6.68458444085372 4.70276714516547 1.98181729568825 C:G C G 10 0.522529682796163 0.532235624487875 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000508245:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000510262:exon_48549789_48549807:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512119:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512537:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000503295:exon_48549492_48549940:ACSF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 48557326 G/A 1 10 2 12 4.77470317203837 1.04505936559233 3.72964380644604 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0408712623846239 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 48557348 T/C 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 48940422 T/C 1 18 10 28 8.59446570966907 5.22529682796163 3.36916888170744 T:C T C 10 0.522529682796163 0.256699726213295 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1;ENSG00000141232:ENST00000268957:exon_48940341_48941524:TOB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 49350802 A/C 1 6 14 20 2.86482190322302 7.31541555914628 -4.45059365592326 A:C A C 10 0.522529682796163 0.0707120772788425 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49350723_49350811:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000508506:exon_49350723_49350811:UTP18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 54978794 G/A 1 14 15 29 6.68458444085372 7.83794524194244 -1.15336080108873 A:G G A 10 0.522529682796163 0.712748058622428 ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54978780_54978939:TRIM25 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 55062822 C/T 1 33 22 55 15.7565204677266 11.4956530215156 4.26086744621104 T:C C T 10 0.522529682796163 0.281232693193415 ENSG00000121064:ENST00000262288:exon_55062739_55062828:SCPEP1;ENSG00000121064:ENST00000393142:exon_55062739_55062828:SCPEP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 56584205 A/C 1 8 16 24 3.8197625376307 8.36047492473861 -4.54071238710791 A:C A C 10 0.522529682796163 0.0685617456623926 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56584104_56584232:MTMR4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 56585872 G/C 1 15 14 29 7.16205475805756 7.31541555914628 -0.153360801088725 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56585829_56585925:MTMR4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 57287454 A/G 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 A:G A G 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57287371_57289171:C17orf71 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 17 22 39 8.11699539246523 11.4956530215156 -3.37865762905036 A:G G A 10 0.522529682796163 0.336554969793601 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 58031412 A/G 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:G A G 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000189050:ENST00000305783:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000482446:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000343124:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000442346:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000466544:exon_58031406_58031507:RNFT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 59763347 A/G 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G A G 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59763197_59763526:BRIP1;ENSG00000136492:ENST00000416542:exon_59763117_59763526:BRIP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 59763465 T/C 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 T:C T C 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59763197_59763526:BRIP1;ENSG00000136492:ENST00000416542:exon_59763117_59763526:BRIP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 132 142 274 63.0260818709065 74.1992149570551 -11.1731330861487 T:C C T 10 0.522529682796163 0.183599655929707 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 54 76 130 25.7833971290072 39.7122558925084 -13.9288587635012 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0174398406562176 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 65717525 T/C 1 15 7 22 7.16205475805756 3.65770777957314 3.50434697848442 T:C T C 10 0.522529682796163 0.199333101930616 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65717494_65717642:NOL11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 18 26 44 8.59446570966907 13.5857717527002 -4.99130604303117 A:G A G 10 0.522529682796163 0.173721697119302 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 66267650 T/G 1 6 9 15 2.86482190322302 4.70276714516547 -1.83794524194244 T:G T G 10 0.522529682796163 0.440567980680144 ENSG00000108932:ENST00000327268:exon_66266980_66267795:SLC16A6;ENSG00000108932:ENST00000344066:exon_66267095_66267795:SLC16A6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 67081830 T/C 1 7 10 17 3.34229222042686 5.22529682796163 -1.88300460753477 T:C T C 10 0.522529682796163 0.468082532065744 ENSG00000154262:ENST00000284425:exon_67081766_67081857:ABCA6;ENSG00000154262:ENST00000446604:exon_67081766_67081857:ABCA6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 67260926 A/G 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 A:G A G 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67260876_67261046:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67260876_67261046:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67260876_67261046:ABCA5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 67267317 T/C 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C T C 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67267303_67267433:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67267303_67267430:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67267303_67267430:ABCA5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 70118935 C/T 1 5 24 29 2.38735158601918 12.5407123871079 -10.1533608010887 T:C C T 10 0.522529682796163 0.000131537687666361 ENSG00000125398:ENST00000245479:exon_70118860_70119113:SOX9;ENSG00000125398:ENST00000455872:exon_70118860_70119113:SOX9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 71192663 G/A 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 A:G G A 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71192646_71192890:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71192646_71192890:COG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 71196809 A/G 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:G A G 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196705_71196915:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196705_71196915:COG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 71197323 G/C 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 C:G G C 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 16 19 35 7.63952507526139 9.9280639731271 -2.2885388978657 A:G G A 10 0.522529682796163 0.500007018553045 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 71232687 T/C 1 2 6 8 0.954940634407674 3.13517809677698 -2.1802374623693 T:C T C 10 0.522529682796163 0.163120845582557 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 71232807 T/C 1 11 6 17 5.25217348924221 3.13517809677698 2.11699539246523 T:C T C 10 0.522529682796163 0.340698354211182 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 C:G G C 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 71233130 A/G 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 A:G A G 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 72859038 C/T 1 11 28 39 5.25217348924221 14.6308311182926 -9.37865762905036 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00339103303697309 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72858623_72859069:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72858623_72859069:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72858623_72859069:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72858623_72859069:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72858623_72859069:FDXR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 73488794 C/T 1 14 13 27 6.68458444085372 6.79288587635012 -0.1083014354964 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 73489567 C/G 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 C:G C G 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 73518203 G/C 1 24 16 40 11.4592876128921 8.36047492473861 3.09881268815348 C:G G C 10 0.522529682796163 0.346589196230518 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 10 8 18 4.77470317203837 4.1802374623693 0.594465709669066 T:C C T 10 0.522529682796163 0.817891150332414 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 73774841 G/A 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 A:G G A 10 0.522529682796163 0.393562228098845 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 73775148 C/G 1 425 375 800 202.924884811631 195.948631048561 6.97625376306962 C:G C G 10 0.522529682796163 0.645482523605697 ENSG00000132475:ENST00000254810:exon_73775128_73775265:H3F3B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 73812909 A/G 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73812851_73812993:UNK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 73816026 A/G 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:G A G 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73816001_73816189:UNK;ENSG00000178932:ENST00000326348:exon_73815663_73816134:AC087289.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 73819525 C/T 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73819346_73819603:UNK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 73824121 T/C 1 39 26 65 18.6213423709496 13.5857717527002 5.03557061824941 T:C T C 10 0.522529682796163 0.217260241307386 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73823310_73824167:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73824079_73824167:UNC13D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 73827205 T/C 1 38 30 68 18.1438720537458 15.6758904838849 2.46798156986092 T:C T C 10 0.522529682796163 0.627632299912693 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73827203_73827250:UNC13D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 20 27 47 9.54940634407674 14.1083014354964 -4.55889509141966 T:C C T 10 0.522529682796163 0.191752679623454 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 28 34 62 13.3691688817074 17.7660092150695 -4.3968403333621 C:G G C 10 0.522529682796163 0.309243479759776 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 75494746 A/G 1 95 51 146 45.3596801343645 26.6490138226043 18.7106663117602 A:G A G 10 0.522529682796163 0.00208518572839931 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 75495397 T/C 1 206 187 393 98.3588853439904 97.7130506828825 0.645834661107955 T:C T C 10 0.522529682796163 0.959765764666846 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 76115353 T/C 1 14 2 16 6.68458444085372 1.04505936559233 5.63952507526139 T:C T C 10 0.522529682796163 0.00476099610344447 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 76121318 G/A 0 138 0 138 65.8909037741295 0 65.8909037741295 G G 10 0.522529682796163 1.31372903154384e-39 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76121239_76121344:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76121239_76121344:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76121239_76121344:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76121239_76121344:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76121239_76121344:TMC6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 13 3 16 6.20711412364988 1.56758904838849 4.63952507526139 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0233136227465848 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 21 11 32 10.0268766612806 5.74782651075779 4.27905015052279 A:G G A 10 0.522529682796163 0.157170705562104 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 76993546 A/G 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 A:G A G 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76993074_76994045:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76993074_76993726:CANT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 77078109 A/G 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 A:G A G 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77077980_77078145:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77077980_77078145:ENGASE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 77078133 C/T 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 T:C C T 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77077980_77078145:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77077980_77078145:ENGASE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 77083019 G/A 0 19 0 19 9.0719360268729 0 9.0719360268729 G G 10 0.522529682796163 5.20094175007908e-06 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77082015_77084681:ENGASE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 78087041 G/A 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78087017_78087165:GAA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 78319136 G/A 1 18 13 31 8.59446570966907 6.79288587635012 1.80157983331895 A:G G A 10 0.522529682796163 0.591517046321414 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 78319380 G/C 1 21 18 39 10.0268766612806 9.40553429033093 0.621342370949645 C:G G C 10 0.522529682796163 0.873943181511761 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 78327358 G/A 1 11 8 19 5.25217348924221 4.1802374623693 1.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.653993185631586 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78327312_78327466:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78327312_78327466:RNF213;ENSG00000234591:ENST00000434136:exon_78327100_78327744:AC124319.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 78354661 C/T 1 27 28 55 12.8916985645036 14.6308311182926 -1.73913255378896 A:T:C C T 10 0.522529682796163 0.686526580129989 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78354631_78354787:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78354631_78354787:RNF213 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79169641 G/A 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 A:G G A 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79169635_79169751:AZI1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79170578 C/T 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 T:C C T 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170501_79170626:AZI1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79170832 C/T 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170730_79170855:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170730_79170855:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170730_79170855:AZI1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79202956 T/C 1 17 7 24 8.11699539246523 3.65770777957314 4.45928761289209 T:C T C 10 0.522529682796163 0.100163972563145 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79220016 T/C 1 36 34 70 17.1889314193381 17.7660092150695 -0.577077795731409 T:C T C 10 0.522529682796163 0.905306821700318 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79220224 G/C 1 26 31 57 12.4142282472998 16.1984201666811 -3.78419191938129 C:G G C 10 0.522529682796163 0.354125941483376 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79226362 G/A 1 31 25 56 14.8015798333189 13.0632420699041 1.73833776341487 A:G G A 10 0.522529682796163 0.689413301682807 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79244802 T/C 1 18 3 21 8.59446570966907 1.56758904838849 7.02687666128058 T:C T C 10 0.522529682796163 0.00182172923646834 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79244718_79244824:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79244718_79244824:SLC38A10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79632363 C/T 1 47 32 79 22.4411049085803 16.7209498494772 5.72015505910312 T:C C T 10 0.522529682796163 0.216127698439525 ENSG00000204237:ENST00000374741:exon_79632067_79632614:C17orf90 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79637367 C/G 1 22 14 36 10.5043469784844 7.31541555914628 3.18893141933813 C:G C G 10 0.522529682796163 0.319698622060239 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79639550 G/A 1 11 7 18 5.25217348924221 3.65770777957314 1.59446570966907 A:G G A 10 0.522529682796163 0.48876143429335 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79639708 C/T 1 17 7 24 8.11699539246523 3.65770777957314 4.45928761289209 T:C C T 10 0.522529682796163 0.100163972563145 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79662067 A/G 1 28 24 52 13.3691688817074 12.5407123871079 0.828456494599527 A:G A G 10 0.522529682796163 0.889928355265603 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79661954_79662097:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79661954_79662097:HGS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79663880 T/C 1 30 26 56 14.3241095161151 13.5857717527002 0.738337763414874 T:C T C 10 0.522529682796163 0.894046002035037 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79663931 T/C 1 11 13 24 5.25217348924221 6.79288587635012 -1.54071238710791 T:C T C 10 0.522529682796163 0.54717203422613 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79668135 G/T 1 41 39 80 19.5762830053573 20.3786576290504 -0.802374623693037 T:G G T 10 0.522529682796163 0.911048766327225 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668075_79668161:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668075_79668161:HGS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79668552 C/T 1 46 30 76 21.9636345913765 15.6758904838849 6.28774410749162 T:C C T 10 0.522529682796163 0.168363716011190 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668538_79669143:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668538_79669149:HGS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79671714 T/C 1 148 129 277 70.6656069461679 67.406329080705 3.25927786546286 T:C T C 10 0.522529682796163 0.7183997428142 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79671663_79671746:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79671663_79671746:MRPL12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79682558 T/C 1 9 2 11 4.29723285483453 1.04505936559233 3.25217348924221 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0683780529325207 ENSG00000183048:ENST00000331531:exon_79682508_79682622:SLC25A10;ENSG00000183048:ENST00000350690:exon_79682508_79682622:SLC25A10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 356 404 760 169.979432924566 211.10199184965 -41.1225589250838 A:T:G A G 10 0.522529682796163 0.00289511438841666 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 80006957 A/C 1 3 14 17 1.43241095161151 7.31541555914628 -5.88300460753477 A:C A C 10 0.522529682796163 0.00584057070479749 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 80008392 G/T 1 14 23 37 6.68458444085372 12.0181827043117 -5.33359826345803 T:G G T 10 0.522529682796163 0.0990152020047615 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80008278_80008431:RFNG;ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 80017902 C/T 1 27 48 75 12.8916985645036 25.0814247742158 -12.1897262097122 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00533138711269664 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80017824_80017969:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80017824_80017969:DUS1L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 80020812 C/T 1 29 45 74 13.8466391989113 23.5138357258273 -9.66719652691606 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0268631156790106 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80020737_80020849:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80020737_80020820:DUS1L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 80039481 G/A 1 69 69 138 32.9454518870648 36.0545481129352 -3.10909622587049 A:G G A 10 0.522529682796163 0.610028844150935 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80039477_80039719:FASN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 80059596 T/C 1 71 66 137 33.9003925214724 34.4869590645468 -0.586566543074326 T:C T C 10 0.522529682796163 0.932038014615332 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80059566_80059742:CCDC57 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 80373452 C/T 1 9 14 23 4.29723285483453 7.31541555914628 -3.01818270431175 T:C C T 10 0.522529682796163 0.218336616351306 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 23 13 36 10.9818172956883 6.79288587635012 4.18893141933813 T:C T C 10 0.522529682796163 0.183708341091536 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 23 11 34 10.9818172956883 5.74782651075779 5.23399078493046 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0858441622809743 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 691266 A/G 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 A:G A G 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_691204_691276:ENOSF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 693828 A/C 1 9 4 13 4.29723285483453 2.09011873118465 2.20711412364988 A:C A C 10 0.522529682796163 0.273205822586663 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 2616457 G/C 1 8 12 20 3.8197625376307 6.27035619355396 -2.45059365592326 C:G G C 10 0.522529682796163 0.371173578167092 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2616436_2616634:NDC80 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 2891478 T/C 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C T C 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2890559_2892484:EMILIN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 2891847 C/T 1 3 10 13 1.43241095161151 5.22529682796163 -3.79288587635012 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0492990438494871 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2890559_2892484:EMILIN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 9117867 T/C 1 52 15 67 24.8284564945995 7.83794524194244 16.9905112526571 T:C T C 10 0.522529682796163 2.34046405562959e-05 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9117385_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9117836_9117901:NDUFV2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 9255003 C/A 1 36 32 68 17.1889314193381 16.7209498494772 0.467981569860918 A:C C A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000359158:exon_9254209_9255428:ANKRD12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 9255718 G/A 1 43 51 94 20.531223639765 26.6490138226043 -6.11779018283932 A:G G A 10 0.522529682796163 0.216488243243739 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255630_9255795:ANKRD12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 49 38 87 23.396045542988 19.8561279462542 3.53991759673382 A:G A G 10 0.522529682796163 0.455067204567138 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 11886563 C/G 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 C:G C G 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 11889467 C/T 1 2 7 9 0.954940634407674 3.65770777957314 -2.70276714516547 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0963891685915122 ENSG00000154889:ENST00000317235:exon_11889386_11889489:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11889386_11889489:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11889386_11889489:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11889386_11889489:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11889386_11889489:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000317251:exon_11889386_11889489:MPPE1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 12718593 A/G 1 40 33 73 19.0988126881535 17.2434795322734 1.8553331558801 A:G A G 10 0.522529682796163 0.725693862622887 ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 47 20 67 22.4411049085803 10.4505936559233 11.9905112526571 A:C C A 10 0.522529682796163 0.00323648095159224 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 13056333 C/T 1 10 7 17 4.77470317203837 3.65770777957314 1.11699539246523 T:C C T 10 0.522529682796163 0.63504130808849 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13055779_13056697:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13055779_13056697:CEP192 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 13068132 T/C 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 T:C T C 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13068093_13068236:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13068093_13068236:CEP192 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 13069782 C/T 1 9 4 13 4.29723285483453 2.09011873118465 2.20711412364988 T:C C T 10 0.522529682796163 0.273205822586663 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13069737_13069855:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000507254:exon_13069749_13069855:CEP192 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 T:G G T 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 21100240 C/T 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 21109250 T/C 1 16 15 31 7.63952507526139 7.83794524194244 -0.198420166681052 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 29122799 G/A 1 3 7 10 1.43241095161151 3.65770777957314 -2.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.209802689107094 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29122483_29122815:DSG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 29126670 T/C 1 2 7 9 0.954940634407674 3.65770777957314 -2.70276714516547 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0963891685915122 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 29672748 G/C 0 12 0 12 5.72964380644604 0 5.72964380644604 G G 10 0.522529682796163 0.000554712474620077 ENSG00000134758:ENST00000261593:exon_29672663_29672849:RNF138;ENSG00000134758:ENST00000399230:exon_29672663_29672849:RNF138;ENSG00000134758:ENST00000257190:exon_29672653_29672849:RNF138 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 32822382 G/T 1 7 16 23 3.34229222042686 8.36047492473861 -5.01818270431175 T:G G T 10 0.522529682796163 0.0385905673739683 ENSG00000186812:ENST00000330501:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000261333:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000355632:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000421371:exon_32822355_32822848:ZNF397 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 17 17 34 8.11699539246523 8.88300460753477 -0.766009215069541 T:C T C 10 0.522529682796163 0.86437385210619 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 33557466 A/G 1 9 8 17 4.29723285483453 4.1802374623693 0.116995392465229 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000141428:ENST00000333234:exon_33557373_33557563:C18orf21;ENSG00000141428:ENST00000269194:exon_33557373_33557563:C18orf21 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 33702162 G/A 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33702015_33702233:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33702015_33702233:SLC39A6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 33754507 A/G 1 36 41 77 17.1889314193381 21.4237169946427 -4.23478557530455 A:G A G 10 0.522529682796163 0.362308421264255 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33754448_33757909:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33754448_33754618:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33754448_33754618:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33754448_33754618:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33754448_33754618:ELP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 34398914 C/T 1 25 25 50 11.9367579300959 13.0632420699041 -1.12648413980815 T:C C T 10 0.522529682796163 0.778473464626011 ENSG00000134779:ENST00000334295:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000383056:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000415958:exon_34398857_34398936:C18orf10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 47017820 A/G 1 9 14 23 4.29723285483453 7.31541555914628 -3.01818270431175 A:G A G 10 0.522529682796163 0.218336616351306 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 47800179 G/C 1 17 13 30 8.11699539246523 6.79288587635012 1.32410951611511 C:G G C 10 0.522529682796163 0.716107033674038 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47799934_47800233:MBD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 47803354 C/T 1 12 26 38 5.72964380644604 13.5857717527002 -7.85612794625419 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0138983701308941 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803202_47803368:MBD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 47810351 A/G 1 27 25 52 12.8916985645036 13.0632420699041 -0.171543505400475 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47810264_47810471:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47810264_47810471:CXXC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 9 14 23 4.29723285483453 7.31541555914628 -3.01818270431175 A:C A C 10 0.522529682796163 0.218336616351306 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 48510894 C/T 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000141642:ENST00000269466:exon_48510466_48510933:ELAC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 51820805 G/A 1 15 15 30 7.16205475805756 7.83794524194244 -0.675890483884888 A:G G A 10 0.522529682796163 0.856233772119583 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 57000469 T/A 1 43 46 89 20.531223639765 24.0363654086235 -3.5051417688585 A:T T A 10 0.522529682796163 0.460105882707799 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57000323_57000476:LMAN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 59814268 G/A 1 2 8 10 0.954940634407674 4.1802374623693 -3.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0559284466504964 ENSG00000197563:ENST00000400334:exon_59814204_59814334:PIGN;ENSG00000197563:ENST00000357637:exon_59814204_59814334:PIGN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 59814324 G/C 1 2 8 10 0.954940634407674 4.1802374623693 -3.22529682796163 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0559284466504964 ENSG00000197563:ENST00000400334:exon_59814204_59814334:PIGN;ENSG00000197563:ENST00000357637:exon_59814204_59814334:PIGN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 61582751 T/G 1 17 31 48 8.11699539246523 16.1984201666811 -8.08142477421582 T:G T G 10 0.522529682796163 0.0208374276885049 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 61582867 A/G 1 16 22 38 7.63952507526139 11.4956530215156 -3.85612794625419 A:G A G 10 0.522529682796163 0.255806176333722 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 61585260 T/C 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 T:C T C 10 0.522529682796163 0.568106121039098 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61585199_61585336:SERPINB10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 61587067 C/T 1 3 13 16 1.43241095161151 6.79288587635012 -5.36047492473861 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0101167898008487 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 61600384 C/T 1 4 27 31 1.90988126881535 14.1083014354964 -12.1984201666811 T:C C T 10 0.522529682796163 6.51836476843281e-06 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 61627428 A/G 1 22 74 96 10.5043469784844 38.6671965269161 -28.1628495484316 A:G A G 10 0.522529682796163 7.06995523192474e-09 ENSG00000221887:ENST00000408945:exon_61627392_61627646:HMSD;ENSG00000221887:ENST00000481726:exon_61627392_61627509:HMSD;ENSG00000221887:ENST00000526932:exon_61627392_61627434:HMSD;ENSG00000221887:ENST00000498680:exon_61627416_61627509:HMSD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 61647069 G/A 1 7 14 21 3.34229222042686 7.31541555914628 -3.97312333871942 A:G G A 10 0.522529682796163 0.124249396105681 ENSG00000221887:ENST00000481726:exon_61647035_61647172:HMSD;ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000448851:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61647042_61647172:SERPINB8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 61650865 G/A 1 9 9 18 4.29723285483453 4.70276714516547 -0.405534290330934 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61650813_61650881:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61650813_61650955:SERPINB8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 61654297 A/G 1 20 10 30 9.54940634407674 5.22529682796163 4.32410951611511 A:G A G 10 0.522529682796163 0.143360175017623 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 71816278 G/A 1 14 15 29 6.68458444085372 7.83794524194244 -1.15336080108873 A:G G A 10 0.522529682796163 0.712748058622428 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 69 51 120 32.9454518870648 26.6490138226043 6.29643806446045 A:G G A 10 0.522529682796163 0.273144398641784 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 83 48 131 39.6300363279185 25.0814247742158 14.5486115537027 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0111446929959912 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 49 36 85 23.396045542988 18.8110685806619 4.58497696232615 T:C T C 10 0.522529682796163 0.330610580708896 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 72913950 C/T 1 14 13 27 6.68458444085372 6.79288587635012 -0.1083014354964 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 14 5 19 6.68458444085372 2.61264841398082 4.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0686216289829668 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 C:G G C 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 880066 G/A 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:G G A 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 12 24 36 5.72964380644604 12.5407123871079 -6.81106858066187 A:G A G 10 0.522529682796163 0.029025626092483 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 929678 G/A 1 23 20 43 10.9818172956883 10.4505936559233 0.531223639764992 A:G G A 10 0.522529682796163 0.880229087567347 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 34 23 57 16.2339907849305 12.0181827043117 4.21580808061871 T:C C T 10 0.522529682796163 0.290251717899555 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 984533 T/C 1 52 16 68 24.8284564945995 8.36047492473861 16.4679815698609 T:C T C 10 0.522529682796163 4.84135896658272e-05 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 984554 C/G 1 59 17 76 28.1707487150264 8.88300460753477 19.2877441074916 C:G C G 10 0.522529682796163 8.2752062057592e-06 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 990281 G/A 1 31 20 51 14.8015798333189 10.4505936559233 4.35098617739569 A:G G A 10 0.522529682796163 0.262436725587443 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_990223_990364:WDR18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1036456 C/G 1 136 89 225 64.9359631397218 46.5051417688585 18.4308213708633 C:G C G 10 0.522529682796163 0.0160979652942364 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1036468 A/G 1 132 89 221 63.0260818709065 46.5051417688585 16.520940102048 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0263481598504195 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1062192 T/C 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 T:C:G T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1062171_1062312:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1062171_1062312:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1062171_1062312:ABCA7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 32 16 48 15.2790501505228 8.36047492473861 6.91857522578418 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0592607845349128 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 32 18 50 15.2790501505228 9.40553429033093 5.87351586019185 A:G G A 10 0.522529682796163 0.118791683658829 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1077985 A/G 1 56 28 84 26.7383377634149 14.6308311182926 12.1075066451223 A:G A G 10 0.522529682796163 0.00857504659745836 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1077856_1078044:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1077856_1078044:HMHA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 21 34 55 10.0268766612806 17.7660092150695 -7.73913255378896 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0424652951130575 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1095352 C/G 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 C:G C G 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1095355 C/T 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 T:C C T 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1127615 G/C 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1127603_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1127603_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1127523_1127764:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1127603_1127764:SBNO2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1223125 C/G 1 28 40 68 13.3691688817074 20.9011873118465 -7.53201843013908 C:G C G 10 0.522529682796163 0.0696514456112744 ENSG00000118046:ENST00000326873:exon_1222984_1223171:STK11;ENSG00000118046:ENST00000405031:exon_1222984_1223171:STK11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 12 17 29 5.72964380644604 8.88300460753477 -3.15336080108873 T:C C T 10 0.522529682796163 0.268071850620001 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1360575 G/A 1 14 10 24 6.68458444085372 5.22529682796163 1.45928761289209 A:G G A 10 0.522529682796163 0.683803771305971 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1391059 G/T 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:G G T 10 0.522529682796163 0.534231980874486 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1615796 G/A 1 47 59 106 22.4411049085803 30.8292512849736 -8.38814637639328 A:T:G G A 10 0.522529682796163 0.119459076225561 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1615284_1615820:TCF3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1619339 T/C 1 36 49 85 17.1889314193381 25.603954457012 -8.41502303767385 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0817907016091456 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1819125 T/C 1 23 18 41 10.9818172956883 9.40553429033093 1.57628300535732 T:C T C 10 0.522529682796163 0.642801477166661 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1821637 A/G 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 A:G A G 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1821518_1821681:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1821518_1821681:REXO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 20 20 40 9.54940634407674 10.4505936559233 -0.90118731184652 A:C:G A G 10 0.522529682796163 0.87453632499247 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 1997393 C/T 1 21 21 42 10.0268766612806 10.9731233387194 -0.946246677438843 T:C C T 10 0.522529682796163 0.877494434563837 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 2073354 C/A 1 81 65 146 38.6750956935108 33.9644293817506 4.71066631176021 A:T:C C A 10 0.522529682796163 0.456605886012722 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2071037_2073423:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2073140_2073423:MOBKL2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 2073412 G/A 1 93 122 215 44.4047394999568 63.7486213011319 -19.343881801175 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00934353965710228 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2071037_2073423:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2073140_2073423:MOBKL2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 86 89 175 41.06244727953 46.5051417688585 -5.44269448932852 A:C:G A G 10 0.522529682796163 0.449331129853714 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 98 96 194 46.792091085976 50.1628495484316 -3.37075846245561 T:C T C 10 0.522529682796163 0.666460782300085 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 18 27 45 8.59446570966907 14.1083014354964 -5.51383572582733 A:G A G 10 0.522529682796163 0.103204145430369 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 2223327 G/A 1 37 27 64 17.666401736542 14.1083014354964 3.55810030104557 A:G G A 10 0.522529682796163 0.384360098698308 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000440640:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2223280_2223485:DOT1L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 2226772 G/C 1 37 33 70 17.666401736542 17.2434795322734 0.422922204268595 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 47 59 106 22.4411049085803 30.8292512849736 -8.38814637639328 A:G A G 10 0.522529682796163 0.119459076225561 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 11 11 22 5.25217348924221 5.74782651075779 -0.495653021515585 T:C T C 10 0.522529682796163 0.835008349106383 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 22 26 48 10.5043469784844 13.5857717527002 -3.08142477421582 A:C A C 10 0.522529682796163 0.389382705479001 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 21 14 35 10.0268766612806 7.31541555914628 2.7114611021343 T:G G T 10 0.522529682796163 0.400403410066618 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 2917287 C/A 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 A:C C A 10 0.522529682796163 0.393562228098845 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 2994903 T/C 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 2994921 G/A 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 3119239 C/T 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000088256:ENST00000078429:exon_3119204_3119357:GNA11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 14 20 34 6.68458444085372 10.4505936559233 -3.76600921506954 A:G G A 10 0.522529682796163 0.230344202936716 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 3186085 G/T 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 T:G G T 10 0.522529682796163 0.568106121039098 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3185875_3186212:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3185875_3186212:NCLN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 45 37 82 21.4861642741727 19.333598263458 2.15256601071464 T:C T C 10 0.522529682796163 0.659679971065478 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 48 28 76 22.9185752257842 14.6308311182926 8.28774410749162 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0657834065317117 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 3534842 G/A 1 15 12 27 7.16205475805756 6.27035619355396 0.8916985645036 A:G G A 10 0.522529682796163 0.847892523515759 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3534793_3536755:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3534793_3538325:FZR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 3578773 C/T 0 135 0 135 64.458492822518 0 64.458492822518 C C 10 0.522529682796163 9.30946004615737e-39 ENSG00000064961:ENST00000333651:exon_3578507_3579086:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000402569:exon_3578507_3579079:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000488973:exon_3578507_3579086:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000405446:exon_3578729_3578782:HMG20B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 3611972 G/A 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 A:G G A 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3610626_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3611925_3612411:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3611729_3612412:C19orf29OS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 3633115 C/A 1 14 11 25 6.68458444085372 5.74782651075779 0.936757930095927 A:C C A 10 0.522529682796163 0.841937992643628 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3630182_3633167:PIP5K1C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 3653525 C/T 1 11 7 18 5.25217348924221 3.65770777957314 1.59446570966907 T:C C T 10 0.522529682796163 0.48876143429335 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3653288_3653587:PIP5K1C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 3752515 G/A 1 22 13 35 10.5043469784844 6.79288587635012 3.7114611021343 A:G G A 10 0.522529682796163 0.238248944143098 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752506_3752718:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752506_3752718:APBA3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 3752563 G/A 1 6 14 20 2.86482190322302 7.31541555914628 -4.45059365592326 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0707120772788425 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752506_3752718:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752506_3752718:APBA3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 3753769 C/T 1 13 10 23 6.20711412364988 5.22529682796163 0.981817295688251 T:C C T 10 0.522529682796163 0.835281075870211 ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3753763_3753924:APBA3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 3961028 C/T 1 14 17 31 6.68458444085372 8.88300460753477 -2.19842016668105 T:C C T 10 0.522529682796163 0.474916459833262 ENSG00000167657:ENST00000301264:exon_3961007_3961159:DAPK3;ENSG00000167657:ENST00000442766:exon_3961007_3961159:DAPK3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 4028783 C/T 1 8 13 21 3.8197625376307 6.79288587635012 -2.97312333871942 T:C C T 10 0.522529682796163 0.274479547020565 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4028718_4028846:PIAS4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 4101062 G/T 1 19 25 44 9.0719360268729 13.0632420699041 -3.99130604303117 T:G G T 10 0.522529682796163 0.232150481769485 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4100962_4101141:MAP2K2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 4233095 T/C 0 21 0 21 10.0268766612806 0 10.0268766612806 T T 10 0.522529682796163 1.38426055816641e-06 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 4233096 G/A 0 21 0 21 10.0268766612806 0 10.0268766612806 G G 10 0.522529682796163 1.38426055816641e-06 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 4233107 C/T 1 21 2 23 10.0268766612806 1.04505936559233 8.98181729568825 T:C C T 10 0.522529682796163 9.02194124805029e-05 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 4234856 T/A 1 9 3 12 4.29723285483453 1.56758904838849 2.72964380644604 A:T T A 10 0.522529682796163 0.150898424576211 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 22 17 39 10.5043469784844 8.88300460753477 1.62134237094964 A:G G A 10 0.522529682796163 0.63394207999485 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 32 28 60 15.2790501505228 14.6308311182926 0.648219032230223 T:C T C 10 0.522529682796163 0.897788639236382 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 38 26 64 18.1438720537458 13.5857717527002 4.55810030104557 T:C C T 10 0.522529682796163 0.263026781103735 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 42 37 79 20.0537533225612 19.333598263458 0.720155059103128 T:C T C 10 0.522529682796163 0.910628239474724 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 5041178 T/C 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 T:C T C 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5041148_5041262:KDM4B;ENSG00000127663:ENST00000381759:exon_5041148_5041262:KDM4B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 62 58 120 29.6031596666379 30.3067216021775 -0.703561935539554 A:G G A 10 0.522529682796163 0.927331242015877 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 15 11 26 7.16205475805756 5.74782651075779 1.41422824729976 A:G G A 10 0.522529682796163 0.695674855368122 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 5789565 T/C 1 14 8 22 6.68458444085372 4.1802374623693 2.50434697848442 T:C T C 10 0.522529682796163 0.39388166009814 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 6535065 G/A 1 66 73 139 31.5130409354532 38.1446668441199 -6.63162590866665 A:G G A 10 0.522529682796163 0.270500114339828 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 6535080 T/C 1 52 72 124 24.8284564945995 37.6221371613237 -12.7936806667242 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0243378544329653 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 496 465 961 236.825277333103 242.976302500216 -6.15102516711261 A:G G A 10 0.522529682796163 0.698478324001196 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 7141775 G/A 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 A:G G A 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7141688_7141827:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7141688_7141827:INSR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 7524855 C/T 1 12 12 24 5.72964380644604 6.27035619355396 -0.540712387107911 T:C C T 10 0.522529682796163 0.84110056521342 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7524789_7524880:ARHGEF18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 7623700 G/A 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:G G A 10 0.522529682796163 0.766632882539292 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 8321562 C/T 1 19 12 31 9.0719360268729 6.27035619355396 2.80157983331895 T:C C T 10 0.522529682796163 0.370399479781320 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8321502_8321594:LASS4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 8326866 C/T 1 33 19 52 15.7565204677266 9.9280639731271 5.82845649459952 T:C C T 10 0.522529682796163 0.126412395814895 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 30 42 72 14.3241095161151 21.9462466774388 -7.62213716132373 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0772506793784143 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 8326944 G/A 1 29 24 53 13.8466391989113 12.5407123871079 1.30592681180336 A:G G A 10 0.522529682796163 0.783997724704117 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 8468337 C/T 1 53 59 112 25.3059268118034 30.8292512849736 -5.52332447317025 T:C C T 10 0.522529682796163 0.299939768378017 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 8468485 C/T 1 49 51 100 23.396045542988 26.6490138226043 -3.25296827961629 T:C C T 10 0.522529682796163 0.548726041179048 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 9267319 G/T 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 T:G G T 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000130803:ENST00000419608:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9267288_9267424:ZNF317 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10221015 A/G 1 123 121 244 58.728849016072 63.2260916183357 -4.49724260226376 A:G A G 10 0.522529682796163 0.56493903114859 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10221000_10221078:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10221000_10221078:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10221000_10221078:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10221000_10221078:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10221000_10221078:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000468881:exon_10221000_10221078:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000444703:exon_10221000_10221078:PPAN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10224937 G/A 0 58 0 58 27.6932783978225 0 27.6932783978225 G G 10 0.522529682796163 6.01398670437154e-17 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10385743 C/G 1 11 19 30 5.25217348924221 9.9280639731271 -4.67589048388489 C:G C G 10 0.522529682796163 0.100755669830112 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10426422 A/C 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:C A C 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10450285 G/A 1 58 50 108 27.6932783978225 26.1264841398081 1.5667942580144 A:G G A 10 0.522529682796163 0.773605836256344 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10450215_10450345:ICAM3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10463235 G/A 1 10 18 28 4.77470317203837 9.40553429033093 -4.63083111829256 A:G G A 10 0.522529682796163 0.089965085565081 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 25 46 71 11.9367579300959 24.0363654086235 -12.0996074785276 A:G A G 10 0.522529682796163 0.00423786893529438 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 21 22 43 10.0268766612806 11.4956530215156 -1.46877636023501 A:C C A 10 0.522529682796163 0.76055299397303 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10504091 G/A 1 135 124 259 64.458492822518 64.7936806667242 -0.335187844206217 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000105401:ENST00000222005:exon_10503935_10504117:CDC37 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10599965 G/A 1 27 15 42 12.8916985645036 7.83794524194244 5.05375332256116 A:G G A 10 0.522529682796163 0.125068128867268 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10599868_10600044:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10599868_10600044:KEAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 17 14 31 8.11699539246523 7.31541555914628 0.801579833318948 C:G G C 10 0.522529682796163 0.858135513379526 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 21 18 39 10.0268766612806 9.40553429033093 0.621342370949645 A:G A G 10 0.522529682796163 0.873943181511761 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10668452 A/G 1 28 27 55 13.3691688817074 14.1083014354964 -0.739132553788963 A:G A G 10 0.522529682796163 0.893009132790287 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668445_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668445_10668571:KRI1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10668673 A/G 1 23 27 50 10.9818172956883 14.1083014354964 -3.12648413980815 A:G A G 10 0.522529682796163 0.398280201904762 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 9 13 22 4.29723285483453 6.79288587635012 -2.49565302151559 A:G G A 10 0.522529682796163 0.296166428569315 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10738639 C/T 1 25 20 45 11.9367579300959 10.4505936559233 1.48616427417267 A:T:C C T 10 0.522529682796163 0.765770317490704 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10738596_10738680:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10738596_10738680:SLC44A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10742170 A/G 1 39 20 59 18.6213423709496 10.4505936559233 8.17074871502638 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0368086032989889 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10742151_10742211:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10742151_10742211:SLC44A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10794630 G/T 1 158 152 310 75.4403101182063 79.4245117850168 -3.98420166681052 T:G G T 10 0.522529682796163 0.6498164770476 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10800167 G/C 1 116 108 224 55.3865567956451 56.4332057419856 -1.0466489463405 C:G G C 10 0.522529682796163 0.89380081574311 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10800078_10800307:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10799855_10803093:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10799855_10803093:ILF3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 40 48 88 19.0988126881535 25.0814247742158 -5.98261208606234 T:C T C 10 0.522529682796163 0.240309733527322 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 18 20 38 8.59446570966907 10.4505936559233 -1.85612794625419 T:C T C 10 0.522529682796163 0.627015478727312 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 11223961 C/T 1 11 14 25 5.25217348924221 7.31541555914628 -2.06324206990407 T:C C T 10 0.522529682796163 0.430248665069756 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11223954_11224125:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11223954_11224125:LDLR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 11224265 A/G 1 15 23 38 7.16205475805756 12.0181827043117 -4.85612794625419 A:G A G 10 0.522529682796163 0.143286443954653 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11224211_11224438:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11224211_11224438:LDLR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 11227602 C/T 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 T:C C T 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 11230881 T/C 1 22 11 33 10.5043469784844 5.74782651075779 4.75652046772662 T:C T C 10 0.522529682796163 0.116836858779311 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11230768_11230909:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11230768_11230909:LDLR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 11326119 A/G 1 10 2 12 4.77470317203837 1.04505936559233 3.72964380644604 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0408712623846239 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11326063_11326147:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11326063_11326147:DOCK6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 11326125 C/T 1 10 2 12 4.77470317203837 1.04505936559233 3.72964380644604 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0408712623846239 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11326063_11326147:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11326063_11326147:DOCK6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 11332570 T/A 1 3 8 11 1.43241095161151 4.1802374623693 -2.74782651075779 A:T T A 10 0.522529682796163 0.131967912623333 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11332527_11332696:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11332527_11332696:DOCK6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 11348960 G/A 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11348863_11348980:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11348863_11348980:DOCK6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 11358799 G/A 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11358742_11358827:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11358742_11358827:DOCK6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 C:G G C 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 12060081 A/G 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 12502787 G/A 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000196466:ENST00000460935:exon_12500830_12503020:ZNF799;ENSG00000196466:ENST00000419318:exon_12500830_12503020:ZNF799;ENSG00000196466:ENST00000430385:exon_12501280_12503020:ZNF799;ENSG00000196466:ENST00000357979:exon_12501280_12503020:ZNF799 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 13008607 G/T 1 19 15 34 9.0719360268729 7.83794524194244 1.23399078493046 T:G G T 10 0.522529682796163 0.733153130187491 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 18 16 34 8.59446570966907 8.36047492473861 0.233990784930459 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 67 50 117 31.9905112526571 26.1264841398081 5.86402711284893 T:C C T 10 0.522529682796163 0.308861712118897 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 216 174 390 103.133588516029 90.9201648065324 12.2134237094964 A:G A G 10 0.522529682796163 0.223948953072125 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 14030689 T/C 1 2 7 9 0.954940634407674 3.65770777957314 -2.70276714516547 T:C:G T C 10 0.522529682796163 0.0963891685915122 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 14153293 T/C 1 10 22 32 4.77470317203837 11.4956530215156 -6.72094984947721 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0206575005966019 ENSG00000104998:ENST00000263379:exon_14153265_14153424:IL27RA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 14231256 T/C 1 43 63 106 20.531223639765 32.9193700161583 -12.3881463763933 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0192315455005678 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 14492265 T/C 1 10 8 18 4.77470317203837 4.1802374623693 0.594465709669066 T:C T C 10 0.522529682796163 0.817891150332414 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 27 16 43 12.8916985645036 8.36047492473861 4.53122363976499 T:C T C 10 0.522529682796163 0.173293894688009 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 14676972 C/T 1 42 85 127 20.0537533225612 44.4150230376739 -24.3612697151127 T:C C T 10 0.522529682796163 1.63495426011468e-05 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14676892_14677077:NDUFB7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 44 29 73 21.0086939569688 15.1533608010887 5.85533315588011 C:G G C 10 0.522529682796163 0.197439330401913 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 15226132 G/A 1 33 40 73 15.7565204677266 20.9011873118465 -5.1446668441199 A:G G A 10 0.522529682796163 0.242677496030521 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15225795_15226732:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15225798_15226241:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15225827_15226241:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000269733:exon_15225965_15226133:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226083_15226241:ILVBL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 26 26 52 12.4142282472998 13.5857717527002 -1.17154350540048 A:G G A 10 0.522529682796163 0.782375480967989 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 32 30 62 15.2790501505228 15.6758904838849 -0.396840333362103 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 15233732 G/A 1 17 10 27 8.11699539246523 5.22529682796163 2.8916985645036 A:G G A 10 0.522529682796163 0.336152240727391 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233703_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233703_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233703_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233703_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233703_15233841:ILVBL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 16238279 C/T 1 58 48 106 27.6932783978225 25.0814247742158 2.61185362360673 T:C C T 10 0.522529682796163 0.628160965336738 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 16611978 T/C 1 2 7 9 0.954940634407674 3.65770777957314 -2.70276714516547 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0963891685915122 ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16611603_16612362:C19orf44 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 16631322 T/C 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16630905_16632163:C19orf44 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 16666101 G/C 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 C:G G C 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000127526:ENST00000436494:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000409648:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000248069:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000421082:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000469055:exon_16665963_16666412:SLC35E1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 83 65 148 39.6300363279185 33.9644293817506 5.66560694616788 T:C T C 10 0.522529682796163 0.366251309920882 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 112 64 176 53.4766755268298 33.4418996989544 20.0347758278753 T:C T C 10 0.522529682796163 0.00249561633753745 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 81 57 138 38.6750956935108 29.7841919193813 8.89090377412951 T:C C T 10 0.522529682796163 0.147256031639060 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 55 52 107 26.260867446211 27.1715435054005 -0.910676059189438 T:C T C 10 0.522529682796163 0.922973476545867 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 57 47 104 27.2158080806187 24.5588950914197 2.65691298919905 A:G A G 10 0.522529682796163 0.624668447568533 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 17321487 A/G 1 12 7 19 5.72964380644604 3.65770777957314 2.0719360268729 A:G A G 10 0.522529682796163 0.368592887865543 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 17337555 C/A 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 A:C C A 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 17451981 G/A 1 7 11 18 3.34229222042686 5.74782651075779 -2.40553429033093 A:G G A 10 0.522529682796163 0.346003571297567 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17451853_17452131:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17451853_17452131:GTPBP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 37 28 65 17.666401736542 14.6308311182926 3.03557061824941 A:G A G 10 0.522529682796163 0.459766673573725 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 17692140 T/G 1 22 22 44 10.5043469784844 11.4956530215156 -0.99130604303117 T:G T G 10 0.522529682796163 0.76562812350394 ENSG00000130309:ENST00000252599:exon_17691986_17693965:GLT25D1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 17972889 C/T 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 T:C C T 10 0.522529682796163 0.293052983203674 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 17973573 G/A 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.18368068114947 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 18234441 C/T 1 6 10 16 2.86482190322302 5.22529682796163 -2.36047492473861 T:C C T 10 0.522529682796163 0.317915137228048 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18234390_18234465:MAST3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 18245512 C/T 1 9 9 18 4.29723285483453 4.70276714516547 -0.405534290330934 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18245389_18245521:MAST3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 18285944 G/A 1 552 535 1087 263.563615096518 279.553380295947 -15.9897651994291 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.331481742733370 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18285850_18286032:IFI30 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 631 624 1255 301.283770155621 326.058522064806 -24.7747519091845 A:C:G A G 10 0.522529682796163 0.166189180053859 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 18304700 A/G 1 14 12 26 6.68458444085372 6.27035619355396 0.414228247299763 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000254858:ENST00000534421:exon_18304674_18304970:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18304674_18304828:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18304674_18304833:MPV17L2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 18305824 C/T 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 T:C C T 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18305768_18305896:MPV17L2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 18497024 G/C 1 4 18 22 1.90988126881535 9.40553429033093 -7.49565302151559 C:G G C 10 0.522529682796163 0.00198101227775643 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 18499422 C/G 0 0 8 8 0 4.1802374623693 -4.1802374623693 G C G 10 0.522529682796163 0.00270128884102245 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 18499780 A/G 1 4 16 20 1.90988126881535 8.36047492473861 -6.45059365592326 A:G A G 10 0.522529682796163 0.00570969131285865 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 84 75 159 40.1075066451223 39.1897262097122 0.917780435410094 T:C T C 10 0.522529682796163 0.936767381561614 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 19136541 C/T 1 36 29 65 17.1889314193381 15.1533608010887 2.03557061824941 T:C C T 10 0.522529682796163 0.622296783960728 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 19153612 G/A 1 12 12 24 5.72964380644604 6.27035619355396 -0.540712387107911 A:G G A 10 0.522529682796163 0.84110056521342 ENSG00000105676:ENST00000392335:exon_19153520_19153686:ARMC6;ENSG00000105676:ENST00000269932:exon_19153520_19153686:ARMC6;ENSG00000105676:ENST00000392336:exon_19153520_19153686:ARMC6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 19230816 T/C 1 16 17 33 7.63952507526139 8.88300460753477 -1.24347953227338 T:C T C 10 0.522529682796163 0.728916278367981 ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 19230868 A/G 1 12 11 23 5.72964380644604 5.74782651075779 -0.018182704311748 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 19243175 C/T 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19243161_19243317:TMEM161A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 19312496 C/G 1 65 72 137 31.0355706182494 37.6221371613237 -6.58656654307433 C:G C G 10 0.522529682796163 0.267275955408843 ENSG00000064490:ENST00000353145:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000303088:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000456252:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000407360:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000392324:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000184162:ENST00000331552:exon_19312226_19312850:NR2C2AP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 19675769 C/T 1 7 10 17 3.34229222042686 5.22529682796163 -1.88300460753477 T:C C T 10 0.522529682796163 0.468082532065744 ENSG00000105717:ENST00000251203:exon_19675742_19675898:PBX4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 20044041 G/T 1 8 2 10 3.8197625376307 1.04505936559233 2.77470317203837 T:G G T 10 0.522529682796163 0.11294395461013 ENSG00000213988:ENST00000427325:exon_20043991_20045259:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000343769:exon_20043991_20045766:ZNF90 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 21477379 C/T 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 T:C C T 10 0.522529682796163 0.393562228098845 ENSG00000182141:ENST00000356929:exon_21473963_21477541:ZNF708 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 21 17 38 10.0268766612806 8.88300460753477 1.14387205374581 A:G G A 10 0.522529682796163 0.747665320324482 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 32873488 G/A 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 A:G G A 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000168813:ENST00000355898:exon_32873373_32873507:ZNF507;ENSG00000168813:ENST00000311921:exon_32873373_32873507:ZNF507 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 33095313 G/A 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 A:G G A 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33095169_33095330:ANKRD27 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 33183352 G/C 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 C:G G C 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 33467620 T/C 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 T:C T C 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 33953912 A/G 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 A:T:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33953901_33953947:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33953901_33953947:PEPD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 34842488 T/C 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000166398:ENST00000299505:exon_34842419_34842497:KIAA0355 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 34872382 G/A 1 187 180 367 89.2869493171175 94.0553429033093 -4.76839358619181 A:G G A 10 0.522529682796163 0.63829976283912 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34872371_34872424:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34872371_34872424:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34872371_34872424:GPI HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 34959979 A/G 1 82 101 183 39.1525660107146 52.7754979624125 -13.6229319516978 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0457791014962244 ENSG00000126261:ENST00000246548:exon_34959945_34960795:UBA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 35175775 C/T 1 11 15 26 5.25217348924221 7.83794524194244 -2.58577175270024 T:C C T 10 0.522529682796163 0.332278501659484 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 35506729 G/A 1 41 24 65 19.5762830053573 12.5407123871079 7.03557061824941 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.0834164955456829 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 35510102 G/C 1 50 44 94 23.8735158601919 22.9913060430312 0.882209817160682 C:G G C 10 0.522529682796163 0.917873478347505 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 52 51 103 24.8284564945995 26.6490138226043 -1.82055732800479 T:G T G 10 0.522529682796163 0.767583063454174 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 108 86 194 51.5667942580144 44.93755272047 6.62924153754438 A:G A G 10 0.522529682796163 0.350921172747375 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 35822884 C/T 1 20 36 56 9.54940634407674 18.8110685806619 -9.26166223658513 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0155378757627843 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 35828635 C/T 1 28 11 39 13.3691688817074 5.74782651075779 7.62134237094965 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0157923121471932 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 35829381 A/G 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:G A G 10 0.522529682796163 0.534231980874486 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 35836600 C/A 1 147 109 256 70.188136628964 56.9557354247818 13.2324012041823 A:C C A 10 0.522529682796163 0.103822409209445 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35836505_35836623:CD22 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 36259494 C/A 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:C C A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36259306_36260077:C19orf55 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 36594659 A/T 1 6 9 15 2.86482190322302 4.70276714516547 -1.83794524194244 A:T A T 10 0.522529682796163 0.440567980680144 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 37005786 G/C 1 18 19 37 8.59446570966907 9.9280639731271 -1.33359826345803 C:G G C 10 0.522529682796163 0.74284768069353 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 37005998 A/G 1 8 9 17 3.8197625376307 4.70276714516547 -0.883004607534771 A:G A G 10 0.522529682796163 0.809298250481776 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 37210634 G/A 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 37368887 T/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:T T A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000251247:ENST00000420450:exon_37367687_37369503:ZNF345;ENSG00000251247:ENST00000529555:exon_37367687_37370471:ZNF345;ENSG00000251247:ENST00000299672:exon_37367733_37369199:ZNF345 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 37733732 T/C 1 2 8 10 0.954940634407674 4.1802374623693 -3.22529682796163 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0559284466504964 ENSG00000188283:ENST00000392155:exon_37733371_37734823:ZNF383;ENSG00000188283:ENST00000352998:exon_37733371_37734566:ZNF383 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 29 22 51 13.8466391989113 11.4956530215156 2.35098617739569 T:G G T 10 0.522529682796163 0.575882168468254 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 38573139 G/T 1 17 10 27 8.11699539246523 5.22529682796163 2.8916985645036 T:G G T 10 0.522529682796163 0.336152240727391 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38571896_38573739:SIPA1L3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 38652993 C/T 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 T:C C T 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38652893_38653011:SIPA1L3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 33 36 69 15.7565204677266 18.8110685806619 -3.05454811293525 T:C T C 10 0.522529682796163 0.472241164267188 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 38800176 G/A 1 33 33 66 15.7565204677266 17.2434795322734 -1.48695906454675 A:G G A 10 0.522529682796163 0.713941033994362 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 38893856 G/C 1 3 8 11 1.43241095161151 4.1802374623693 -2.74782651075779 C:G G C 10 0.522529682796163 0.131967912623333 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38893775_38893858:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38893775_38893858:FAM98C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39086383 G/C 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 C:G G C 10 0.522529682796163 0.511797587312082 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39086580 A/G 1 45 54 99 21.4861642741727 28.2166028709928 -6.73043859682014 A:G A G 10 0.522529682796163 0.191255286295521 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 67 69 136 31.9905112526571 36.0545481129352 -4.06403686027816 T:C T C 10 0.522529682796163 0.493521185135464 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39098766 G/A 1 35 37 72 16.7114611021343 19.333598263458 -2.62213716132373 A:G G A 10 0.522529682796163 0.556988368530127 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39098752_39098810:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39098752_39098810:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39098752_39098810:MAP4K1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 84 64 148 40.1075066451223 33.4418996989544 6.66560694616788 T:C C T 10 0.522529682796163 0.285514796631434 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39306529 C/T 1 208 185 393 99.3138259783981 96.6679913172901 2.64583466110795 A:T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.800854529204747 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39306497_39306647:ECH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39308190 C/T 1 156 133 289 74.4853694837986 69.4964478118897 4.9889216719089 T:C C T 10 0.522529682796163 0.596224942568435 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39308091_39308215:ECH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 93 95 188 44.4047394999568 49.6403198656355 -5.23558036567864 T:G T G 10 0.522529682796163 0.465728417634824 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39329516 C/T 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C C T 10 0.522529682796163 0.74489974815786 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39329517 C/T 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C C T 10 0.522529682796163 0.74489974815786 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39338125 G/A 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 A:G G A 10 0.522529682796163 0.491321069758129 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39913634 G/A 1 11 12 23 5.25217348924221 6.27035619355396 -1.01818270431175 A:G G A 10 0.522529682796163 0.682750321629788 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 19 33 52 9.0719360268729 17.2434795322734 -8.17154350540047 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0260721949695729 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 A:G G A 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 17 19 36 8.11699539246523 9.9280639731271 -1.81106858066187 C:G C G 10 0.522529682796163 0.61789790541559 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 10 16 26 4.77470317203837 8.36047492473861 -3.58577175270024 T:C T C 10 0.522529682796163 0.173614440209318 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39926509 A/C 1 1597 1273 2870 762.520096574528 665.180286199515 97.3398103750123 A:C:G A C 10 0.522529682796163 0.000287605284845295 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 39926521 G/A 1 1558 1245 2803 743.898754203578 650.549455081223 93.3492991223552 A:T:C:G G A 10 0.522529682796163 0.000434915987385134 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 40030654 G/C 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 C:G G C 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 40480456 G/A 1 65 71 136 31.0355706182494 37.0996074785276 -6.06403686027816 A:G G A 10 0.522529682796163 0.304236445071797 ENSG00000013275:ENST00000157812:exon_40480431_40480540:PSMC4;ENSG00000013275:ENST00000455878:exon_40480431_40480540:PSMC4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 40719076 T/C 1 9 14 23 4.29723285483453 7.31541555914628 -3.01818270431175 T:C T C 10 0.522529682796163 0.218336616351306 ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40718983_40719095:MAP3K10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 40720079 C/T 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 T:C C T 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40719424_40720128:MAP3K10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 63 57 120 30.0806299838417 29.7841919193813 0.296438064460443 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 40827881 G/A 1 9 22 31 4.29723285483453 11.4956530215156 -7.19842016668105 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0111805707741693 ENSG00000160392:ENST00000357884:exon_40826973_40828283:C19orf47;ENSG00000160392:ENST00000392035:exon_40826973_40828283:C19orf47 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 18 10 28 8.59446570966907 5.22529682796163 3.36916888170744 T:C T C 10 0.522529682796163 0.256699726213295 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 41082868 T/C 1 37 39 76 17.666401736542 20.3786576290504 -2.71225589250838 T:C T C 10 0.522529682796163 0.56690229833032 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41082757_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000418276:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41082790_41082891:SHKBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 41096189 A/G 1 20 29 49 9.54940634407674 15.1533608010887 -5.60395445701199 A:G A G 10 0.522529682796163 0.117097132073311 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41096150_41096328:SHKBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 41128309 C/T 1 9 15 24 4.29723285483453 7.83794524194244 -3.54071238710791 T:C C T 10 0.522529682796163 0.158191944334635 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41128306_41128572:LTBP4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 41129842 C/T 1 6 10 16 2.86482190322302 5.22529682796163 -2.36047492473861 T:C C T 10 0.522529682796163 0.317915137228048 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41129841_41129987:LTBP4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 41135475 G/A 1 7 11 18 3.34229222042686 5.74782651075779 -2.40553429033093 A:G G A 10 0.522529682796163 0.346003571297567 ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41135301_41135725:LTBP4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 0 0 18 18 0 9.40553429033093 -9.40553429033093 C T C 10 0.522529682796163 1.66354596475996e-06 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 2 7 9 0.954940634407674 3.65770777957314 -2.70276714516547 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0963891685915122 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 41889748 T/C 1 13 13 26 6.20711412364988 6.79288587635012 -0.585771752700238 T:C T C 10 0.522529682796163 0.846614688948765 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41889620_41889985:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41889466_41889985:TMEM91 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 29 27 56 13.8466391989113 14.1083014354964 -0.261662236585126 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 33 42 75 15.7565204677266 21.9462466774388 -6.18972620971222 T:C C T 10 0.522529682796163 0.166024782324028 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 43 45 88 20.531223639765 23.5138357258273 -2.98261208606234 A:G A G 10 0.522529682796163 0.524574225962882 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 12 11 23 5.72964380644604 5.74782651075779 -0.018182704311748 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 22 19 41 10.5043469784844 9.9280639731271 0.576283005357318 T:C T C 10 0.522529682796163 0.877194379558022 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 39 43 82 18.6213423709496 22.468776360235 -3.84743398928536 T:C C T 10 0.522529682796163 0.439436693479871 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 42799049 C/T 1 21 13 34 10.0268766612806 6.79288587635012 3.23399078493046 T:C C T 10 0.522529682796163 0.30519106144782 ENSG00000079432:ENST00000160740:exon_42798976_42799949:CIC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 42911769 G/A 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42911758_42911943:LIPE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 13 10 23 6.20711412364988 5.22529682796163 0.981817295688251 A:G A G 10 0.522529682796163 0.835281075870211 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44418077 C/T 1 10 8 18 4.77470317203837 4.1802374623693 0.594465709669066 T:C C T 10 0.522529682796163 0.817891150332414 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44417970_44418263:ZNF45 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44418343 C/T 1 11 6 17 5.25217348924221 3.13517809677698 2.11699539246523 T:C C T 10 0.522529682796163 0.340698354211182 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44418544 A/G 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 A:G A G 10 0.522529682796163 0.393562228098845 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44418680 G/C 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 C:G G C 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44418693 T/C 1 8 12 20 3.8197625376307 6.27035619355396 -2.45059365592326 T:C T C 10 0.522529682796163 0.371173578167092 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44418824 C/T 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 T:C C T 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44500701 C/T 1 11 4 15 5.25217348924221 2.09011873118465 3.16205475805756 T:C C T 10 0.522529682796163 0.124047501512051 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44515074 C/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:C C A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44515352 T/G 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 T:G T G 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44515341_44515400:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44515514 C/A 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:C C A 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44536833 A/G 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G A G 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000159885:ENST00000391960:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000187879:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000251272:exon_44535970_44537260:ZNF222 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 T:C T C 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44611162 G/T 1 13 11 24 6.20711412364988 5.74782651075779 0.459287612892089 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 A:G A G 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 18 8 26 8.59446570966907 4.1802374623693 4.41422824729976 A:G A G 10 0.522529682796163 0.114799439152915 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 17 8 25 8.11699539246523 4.1802374623693 3.93675793009593 A:T A T 10 0.522529682796163 0.159934997919704 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 7 14 21 3.34229222042686 7.31541555914628 -3.97312333871942 A:G A G 10 0.522529682796163 0.124249396105681 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44679167 A/G 1 16 30 46 7.63952507526139 15.6758904838849 -8.0363654086235 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0184165905741996 ENSG00000167380:ENST00000413984:exon_44679137_44679582:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000300823:exon_44679137_44679582:ZNF226 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44680489 G/A 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 A:G G A 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44732658 C/G 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 C:G C G 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44732599_44732725:ZNF227 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44739399 T/C 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C T C 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44740602 G/A 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44981318 G/A 1 3 7 10 1.43241095161151 3.65770777957314 -2.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.209802689107094 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 44981525 G/A 1 6 9 15 2.86482190322302 4.70276714516547 -1.83794524194244 A:G G A 10 0.522529682796163 0.440567980680144 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 32 36 68 15.2790501505228 18.8110685806619 -3.53201843013908 A:T:C T C 10 0.522529682796163 0.398447812411673 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 45396144 C/T 1 33 37 70 15.7565204677266 19.333598263458 -3.57707779573141 T:C C T 10 0.522529682796163 0.404679691243012 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45396094_45396186:TOMM40 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 45490570 A/G 1 17 14 31 8.11699539246523 7.31541555914628 0.801579833318948 A:G A G 10 0.522529682796163 0.858135513379526 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 25 17 42 11.9367579300959 8.88300460753477 3.05375332256116 T:C T C 10 0.522529682796163 0.359076047709428 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 46142053 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 88 86 174 42.0173879139377 44.93755272047 -2.92016480653236 A:G G A 10 0.522529682796163 0.704491793074084 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 47285707 C/T 1 52 36 88 24.8284564945995 18.8110685806619 6.01738791393766 T:C C T 10 0.522529682796163 0.202586040285625 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47285640_47285806:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47285640_47285806:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47285640_47285806:SLC1A5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 47865947 G/A 1 2 8 10 0.954940634407674 4.1802374623693 -3.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0559284466504964 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 47978671 G/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G G A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 123 119 242 58.728849016072 62.1810322527434 -3.45218323667144 A:G A G 10 0.522529682796163 0.69951761584736 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 48601454 T/C 1 20 4 24 9.54940634407674 2.09011873118465 7.45928761289209 T:C T C 10 0.522529682796163 0.00194001882221269 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48601396_48601516:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48601364_48601516:PLA2G4C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 48602948 T/C 1 16 5 21 7.63952507526139 2.61264841398082 5.02687666128058 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0297781149323547 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48602928_48603117:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48602928_48603117:PLA2G4C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 48608598 C/G 1 5 20 25 2.38735158601918 10.4505936559233 -8.06324206990407 C:G C G 10 0.522529682796163 0.00116971087891708 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48608590_48608701:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48608590_48608701:PLA2G4C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 16 14 30 7.63952507526139 7.31541555914628 0.324109516115112 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 T:C C T 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 48863386 C/T 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 T:C C T 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48863329_48863433:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48863329_48863433:TMEM143 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 48949286 G/T 1 30 28 58 14.3241095161151 14.6308311182926 -0.306721602177451 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48949062_48949449:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48949251_48949449:GRWD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 48954421 G/A 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48954291_48954488:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48954291_48954488:GRWD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 49377242 G/C 1 186 196 382 88.8094789999137 102.415817828048 -13.6063388281342 A:C:G G C 10 0.522529682796163 0.166957962421361 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 49377319 A/G 1 184 160 344 87.854538365506 83.6047492473861 4.24978911811993 A:G A G 10 0.522529682796163 0.666104771050328 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 49377424 G/A 1 140 116 256 66.8458444085372 60.6134432043549 6.23240120418229 A:G G A 10 0.522529682796163 0.453148034285111 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 49377436 G/C 1 139 108 247 66.3683740913334 56.4332057419856 9.93516834934775 C:G G C 10 0.522529682796163 0.226161886736329 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 87 81 168 41.5399175967338 42.3249043064892 -0.78498670975538 A:C:G A G 10 0.522529682796163 0.93849780367722 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 80 66 146 38.197625376307 34.4869590645468 3.71066631176021 T:C C T 10 0.522529682796163 0.56263349652131 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 83 69 152 39.6300363279185 36.0545481129352 3.57548821498323 C:G G C 10 0.522529682796163 0.570940479972905 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 10 5 15 4.77470317203837 2.61264841398082 2.16205475805755 A:G A G 10 0.522529682796163 0.309170426805168 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 1152 1290 2442 550.04580541882 674.06329080705 -124.01748538823 T:C T C 10 0.522529682796163 5.51593706189899e-07 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 A:G G A 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 49964977 C/G 1 7 13 20 3.34229222042686 6.79288587635012 -3.45059365592326 C:G C G 10 0.522529682796163 0.177936173075919 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 49969020 G/A 1 9 8 17 4.29723285483453 4.1802374623693 0.116995392465229 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49968995_49969162:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49968995_49969162:ALDH16A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 50156329 A/G 1 63 69 132 30.0806299838417 36.0545481129352 -5.97391812909351 A:G A G 10 0.522529682796163 0.337886686324965 ENSG00000126461:ENST00000360565:exon_50154125_50156962:SCAF1;ENSG00000126461:ENST00000447618:exon_50154125_50156962:SCAF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 19 21 40 9.0719360268729 10.9731233387194 -1.90118731184652 T:G T G 10 0.522529682796163 0.63557898252467 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 18 15 33 8.59446570966907 7.83794524194244 0.756520467726622 T:C T C 10 0.522529682796163 0.862587560743927 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 50412309 C/G 1 55 46 101 26.260867446211 24.0363654086235 2.22450203758754 C:G C G 10 0.522529682796163 0.691036348030481 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 50412650 C/T 1 51 42 93 24.3509861773957 21.9462466774388 2.40473949995685 T:C C T 10 0.522529682796163 0.678309630744774 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 118 77 195 56.3414974300528 40.2347855753045 16.1067118547482 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0217467854999076 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 50435978 G/C 1 91 90 181 43.4497988655492 47.0276714516547 -3.5778725861055 A:C:G G C 10 0.522529682796163 0.603248758304817 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 14 12 26 6.68458444085372 6.27035619355396 0.414228247299763 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 50905042 G/A 1 19 8 27 9.0719360268729 4.1802374623693 4.8916985645036 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0812872834898839 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 50905074 G/A 1 20 9 29 9.54940634407674 4.70276714516547 4.84663919891127 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0931678408178994 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 50926264 T/C 1 92 37 129 43.927269182753 19.333598263458 24.593670919295 T:C T C 10 0.522529682796163 1.27180086119993e-05 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 50967640 G/A 1 23 7 30 10.9818172956883 3.65770777957314 7.32410951611511 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0093948593519842 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50967603_50967789:MYBPC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 50979801 G/A 1 9 6 15 4.29723285483453 3.13517809677698 1.16205475805756 A:G G A 10 0.522529682796163 0.612786973154986 ENSG00000142530:ENST00000391816:exon_50979387_50980003:FAM71E1;ENSG00000142530:ENST00000270620:exon_50979387_50980003:FAM71E1;ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50979387_50979915:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50979736_50979915:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50979736_50979915:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50979736_50979915:C19orf63 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 84 92 176 40.1075066451223 48.072730817247 -7.96522417212468 T:C C T 10 0.522529682796163 0.257649811749116 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 96 111 207 45.8371504515684 58.0007947903741 -12.1636443388057 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0950762280647611 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 51301538 T/C 1 107 110 217 51.0893239408106 57.4782651075779 -6.38894116676736 T:C T C 10 0.522529682796163 0.414916910660410 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 147 157 304 70.188136628964 82.0371601989976 -11.8490235700335 T:C T C 10 0.522529682796163 0.186641656876478 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 108 104 212 51.5667942580144 54.343087010801 -2.77629275278655 C:G C G 10 0.522529682796163 0.73122274969479 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 113 113 226 53.9541458440336 59.0458541559664 -5.09170831193283 A:C:G A G 10 0.522529682796163 0.506153239226647 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 53085659 C/T 1 1 7 8 0.477470317203837 3.65770777957314 -3.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0319085925070315 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391786:exon_53085455_53085751:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 53117461 C/T 1 10 12 22 4.77470317203837 6.27035619355396 -1.49565302151559 T:C C T 10 0.522529682796163 0.531644723723978 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 53117531 C/T 1 11 11 22 5.25217348924221 5.74782651075779 -0.495653021515585 T:C C T 10 0.522529682796163 0.835008349106383 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 53117809 C/A 1 17 18 35 8.11699539246523 9.40553429033093 -1.2885388978657 A:C C A 10 0.522529682796163 0.736128234715988 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 53209553 G/A 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000213020:ENST00000319783:exon_53207472_53210117:ZNF611 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 53209554 G/T 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:G G T 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000213020:ENST00000319783:exon_53207472_53210117:ZNF611 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 53384185 C/T 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000182986:ENST00000331416:exon_53379425_53385236:ZNF320;ENSG00000182986:ENST00000391781:exon_53383849_53385236:ZNF320 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 53432414 T/C 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 T:C T C 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000221874:ENST00000313956:exon_53430388_53432667:ZNF321 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 53453873 T/C 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 T:C T C 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 53571306 T/C 1 3 11 14 1.43241095161151 5.74782651075779 -4.31541555914628 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0294366142381707 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 53958126 T/G 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:G T G 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 53958263 G/A 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.348733043074597 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 53959343 G/A 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G G A 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 53959568 G/C 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 C:G G C 10 0.522529682796163 0.793486385682659 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 54080067 T/C 0 9 0 9 4.29723285483453 0 4.29723285483453 T T 10 0.522529682796163 0.00419379916107509 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514374:exon_54079951_54080113:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000509047:exon_54079951_54080074:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511567:exon_54079951_54080129:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513265:exon_54079951_54080107:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000502616:exon_54079951_54080071:ZNF331 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 54610170 C/T 1 68 80 148 32.4679815698609 41.802374623693 -9.33439305383212 T:C C T 10 0.522529682796163 0.138450196760591 ENSG00000170906:ENST00000417903:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000419113:exon_54610118_54610285:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000485876:exon_54610118_54610875:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391762:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000451517:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391763:exon_54610118_54610272:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000484103:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000303553:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000422029:exon_54610118_54610277:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000420296:exon_54610071_54610268:NDUFA3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 54656709 A/T 1 18 22 40 8.59446570966907 11.4956530215156 -2.90118731184652 A:T A T 10 0.522529682796163 0.429260571211704 ENSG00000088038:ENST00000221232:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000358389:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000411507:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000445408:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000482247:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000406403:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000447684:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000457463:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000496327:exon_54656604_54656736:CNOT3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 54677897 G/A 1 18 17 35 8.59446570966907 8.88300460753477 -0.288538897865704 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000125505:ENST00000437868:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000245615:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000494142:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000431666:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000338624:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000449249:exon_54677768_54678125:MBOAT7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 54696167 C/A 1 9 8 17 4.29723285483453 4.1802374623693 0.116995392465229 A:C C A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000170892:ENST00000455798:exon_54695967_54696206:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000456872:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54695967_54696224:TSEN34 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 25 47 72 11.9367579300959 24.5588950914197 -12.6221371613237 T:G T G 10 0.522529682796163 0.00306122764927471 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 54711329 C/T 1 1388 1425 2813 662.728800278926 744.604797984532 -81.8759977056063 A:T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.00209012660115807 ENSG00000170889:ENST00000302907:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000436445:exon_54711266_54711390:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000391752:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000445961:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000391751:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000495002:exon_54711266_54711512:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000391753:exon_54711266_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 54720958 C/T 1 10 2 12 4.77470317203837 1.04505936559233 3.72964380644604 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0408712623846239 ENSG00000204577:ENST00000391750:exon_54720147_54721108:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000424807:exon_54720147_54721108:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000440558:exon_54720147_54721108:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000414379:exon_54720543_54721108:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000346401:exon_54720753_54721108:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000407860:exon_54720797_54721108:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000270464:exon_54720797_54721108:LILRB3;ENSG00000204577:ENST00000245620:exon_54720797_54721108:LILRB3;ENSG00000244482:ENST00000419410:exon_54720797_54721108:LILRA6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 25 27 52 11.9367579300959 14.1083014354964 -2.17154350540048 T:C T C 10 0.522529682796163 0.580518030739767 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 35 30 65 16.7114611021343 15.6758904838849 1.03557061824941 T:G G T 10 0.522529682796163 0.805502495080784 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 55148267 C/T 1 54 11 65 25.7833971290072 5.74782651075779 20.0355706182494 T:C C T 10 0.522529682796163 2.92382555721281e-07 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55148183_55148641:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55148183_55148979:LILRB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 55148331 C/T 1 42 14 56 20.0537533225612 7.31541555914628 12.7383377634149 T:C C T 10 0.522529682796163 0.000689087659613897 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55148183_55148641:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55148183_55148979:LILRB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 55174498 T/C 1 35 2 37 16.7114611021343 1.04505936559233 15.666401736542 T:C T C 10 0.522529682796163 3.65245696229269e-08 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 3 25 28 1.43241095161151 13.0632420699041 -11.6308311182926 A:G A G 10 0.522529682796163 9.27419973771305e-06 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 44 14 58 21.0086939569688 7.31541555914628 13.6932783978225 A:G A G 10 0.522529682796163 0.000310854418359097 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 55179364 A/G 1 12 40 52 5.72964380644604 20.9011873118465 -15.1715435054005 A:G A G 10 0.522529682796163 2.11586606005078e-05 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 55485899 G/A 1 9 22 31 4.29723285483453 11.4956530215156 -7.19842016668105 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0111805707741693 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55485868_55485912:NLRP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 55494881 C/G 1 34 8 42 16.2339907849305 4.1802374623693 12.0537533225612 C:G C G 10 0.522529682796163 0.000152046245692726 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 15 11 26 7.16205475805756 5.74782651075779 1.41422824729976 T:C T C 10 0.522529682796163 0.695674855368122 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 55756980 A/G 1 45 33 78 21.4861642741727 17.2434795322734 4.24268474189929 A:G A G 10 0.522529682796163 0.365558833361601 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 55995413 A/G 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 56114237 G/A 1 13 7 20 6.20711412364988 3.65770777957314 2.54940634407674 A:G G A 10 0.522529682796163 0.272883112161240 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 14 13 27 6.68458444085372 6.79288587635012 -0.1083014354964 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 24 37 61 11.4592876128921 19.333598263458 -7.87431065056594 T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.0537769020318607 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 56172525 C/T 1 61 40 101 29.1256893494341 20.9011873118465 8.22450203758754 T:C C T 10 0.522529682796163 0.111104853658675 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56172404_56172555:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56172404_56172555:U2AF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 56180968 C/T 1 120 98 218 57.2964380644604 51.207908914024 6.08852915043648 T:C C T 10 0.522529682796163 0.416739156695288 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 57703258 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000083844:ENST00000263095:exon_57702869_57703314:ZNF264 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 58058739 T/C 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000251369:ENST00000506609:exon_58058343_58059361:ZNF550 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 6 8 14 2.86482190322302 4.1802374623693 -1.31541555914628 A:G A G 10 0.522529682796163 0.595734183488216 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 58319906 C/G 1 4 9 13 1.90988126881535 4.70276714516547 -2.79288587635012 C:G C G 10 0.522529682796163 0.165288727116232 ENSG00000178935:ENST00000391701:exon_58318450_58320471:ZNF552 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 58904396 G/A 1 1341 1131 2472 640.287695370345 590.98107124246 49.3066241278851 A:T:C:G G A 10 0.522529682796163 0.0484715584344798 ENSG00000083845:ENST00000196551:exon_58904343_58904552:RPS5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 59010569 C/T 1 12 5 17 5.72964380644604 2.61264841398082 3.11699539246523 T:C C T 10 0.522529682796163 0.150352896781338 ENSG00000083807:ENST00000415559:exon_59010490_59010587:SLC27A5;ENSG00000083807:ENST00000263093:exon_59010490_59010587:SLC27A5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 59058682 C/G 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 C:G C G 10 0.522529682796163 0.74489974815786 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 19 59059729 G/A 1 164 139 303 78.3051320214293 72.6316259086666 5.67350611276262 A:G G A 10 0.522529682796163 0.527404949302971 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59059661_59059775:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59059661_59059775:TRIM28 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 3391539 G/A 1 41 40 81 19.5762830053573 20.9011873118465 -1.3249043064892 A:G G A 10 0.522529682796163 0.824235100137328 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 11 15 26 5.25217348924221 7.83794524194244 -2.58577175270024 T:C T C 10 0.522529682796163 0.332278501659484 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 8870862 T/C 1 12 9 21 5.72964380644604 4.70276714516547 1.02687666128058 T:C T C 10 0.522529682796163 0.670391349361465 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 10050947 T/C 1 9 3 12 4.29723285483453 1.56758904838849 2.72964380644604 T:C T C 10 0.522529682796163 0.150898424576211 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000492648:exon_10050865_10051042:TAF1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 10059770 G/T 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 T:G G T 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 10059844 C/T 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 T:C C T 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 10262920 T/G 1 74 98 172 35.3328034730839 51.207908914024 -15.87510544094 T:G T G 10 0.522529682796163 0.0177451127001111 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10262839_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10262866_10263184:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10262879_10263024:RRM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 252 207 459 120.322519935367 108.163644338806 12.1588755965612 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.262371783483507 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 15378808 C/G 1 11 19 30 5.25217348924221 9.9280639731271 -4.67589048388489 C:G C G 10 0.522529682796163 0.100755669830112 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15378592_15378810:NBAS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 15614404 T/C 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C T C 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15614191_15614448:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15614191_15614448:NBAS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 15743344 T/C 1 12 13 25 5.72964380644604 6.79288587635012 -1.06324206990407 T:C T C 10 0.522529682796163 0.693670722544485 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15743316_15743399:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15743316_15743399:DDX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 17962450 A/G 1 7 12 19 3.34229222042686 6.27035619355396 -2.9280639731271 A:G A G 10 0.522529682796163 0.250483788158122 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 20403949 C/T 1 4 10 14 1.90988126881535 5.22529682796163 -3.31541555914628 T:C C T 10 0.522529682796163 0.106809303346196 ENSG00000115884:ENST00000254351:exon_20403574_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000381150:exon_20403574_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000403076:exon_20403723_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000482879:exon_20403763_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000429035:exon_20403579_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000447124:exon_20403913_20404052:SDC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 20818764 C/T 1 10 7 17 4.77470317203837 3.65770777957314 1.11699539246523 T:C C T 10 0.522529682796163 0.63504130808849 ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20817582_20819005:HS1BP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 20824498 C/T 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000415264:exon_20824492_20824533:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 20838222 C/T 1 2 8 10 0.954940634407674 4.1802374623693 -3.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0559284466504964 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20838196_20838275:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 20838318 G/A 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 24439048 A/G 1 12 6 18 5.72964380644604 3.13517809677698 2.59446570966907 A:G A G 10 0.522529682796163 0.246476394158893 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24438918_24439101:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24438918_24439101:ITSN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 24905927 G/C 1 8 2 10 3.8197625376307 1.04505936559233 2.77470317203837 C:G G C 10 0.522529682796163 0.11294395461013 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24905820_24905997:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24905820_24905997:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24905820_24905997:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24905820_24905997:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24905820_24905997:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24905820_24905997:NCOA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 24974945 T/G 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:G T G 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24974851_24975025:NCOA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 25046090 T/C 1 34 36 70 16.2339907849305 18.8110685806619 -2.57707779573141 T:C T C 10 0.522529682796163 0.551840106874848 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 37 30 67 17.666401736542 15.6758904838849 1.99051125265708 T:C T C 10 0.522529682796163 0.714014837273508 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 25064193 G/A 1 12 9 21 5.72964380644604 4.70276714516547 1.02687666128058 A:G G A 10 0.522529682796163 0.670391349361465 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 25141538 A/G 1 11 9 20 5.25217348924221 4.70276714516547 0.549406344076741 A:G A G 10 0.522529682796163 0.827347849665529 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25141182_25142708:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25141182_25142055:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25141182_25142055:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25141182_25142053:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000438445:exon_25141521_25142053:ADCY3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 25469502 C/T 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 T:C C T 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000119772:ENST00000264709:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380746:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000321117:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380756:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000402667:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000434249:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000474807:exon_25469489_25469645:DNMT3A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 26455127 G/A 1 65 64 129 31.0355706182494 33.4418996989544 -2.40632908070502 A:G G A 10 0.522529682796163 0.724605698448827 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000457468:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000461025:exon_26455070_26455147:HADHA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 26502875 T/C 1 63 46 109 30.0806299838417 24.0363654086235 6.04426457521824 T:C T C 10 0.522529682796163 0.251704472305988 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502862_26502983:HADHB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 33759395 C/T 1 14 39 53 6.68458444085372 20.3786576290504 -13.6940731881966 T:C C T 10 0.522529682796163 0.000162668193136764 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33756792_33759467:RASGRP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 33774761 T/C 1 30 12 42 14.3241095161151 6.27035619355396 8.05375332256116 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0132956246078573 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33774671_33774818:RASGRP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 36782886 G/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G G A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36782805_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000414288:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000475815:exon_36782826_36786398:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000441005:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000432869:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487919:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487282:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000484205:exon_36782432_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36782831_36782891:FEZ2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 37227864 G/A 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 A:G G A 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37227729_37227956:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37227729_37227956:HEATR5B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 38298150 A/G 1 59 1 60 28.1707487150264 0.522529682796163 27.6482190322302 A:G A G 10 0.522529682796163 8.00815265824404e-16 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38294652_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000494864:exon_38297209_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38297625_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000492443:exon_38298130_38298453:CYP1B1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 38298203 C/G 1 73 3 76 34.8553331558801 1.56758904838849 33.2877441074916 C:G C G 10 0.522529682796163 3.34630012763504e-17 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38294652_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000494864:exon_38297209_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38297625_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000492443:exon_38298130_38298453:CYP1B1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 38302177 C/A 0 0 11 11 0 5.74782651075779 -5.74782651075779 A C A 10 0.522529682796163 0.000294042535331563 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38301489_38302532:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38301489_38302532:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000490576:exon_38302102_38302532:CYP1B1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 39008949 G/A 1 24 18 42 11.4592876128921 9.40553429033093 2.05375332256116 A:G G A 10 0.522529682796163 0.541354295144428 ENSG00000152147:ENST00000409011:exon_39008659_39009107:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000281950:exon_39008659_39009598:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000409566:exon_39008659_39009089:GEMIN6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 39009025 T/A 1 21 30 51 10.0268766612806 15.6758904838849 -5.64901382260431 A:T T A 10 0.522529682796163 0.12403110763284 ENSG00000152147:ENST00000409011:exon_39008659_39009107:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000281950:exon_39008659_39009598:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000409566:exon_39008659_39009089:GEMIN6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 7 14 21 3.34229222042686 7.31541555914628 -3.97312333871942 A:G G A 10 0.522529682796163 0.124249396105681 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 39050141 A/C 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 A:C A C 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39050135_39050411:DHX57 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 39082344 T/C 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 T:C T C 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39082199_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39081196_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39082199_39082417:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000474104:exon_39080187_39082394:DHX57 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 42396722 A/G 1 5 12 17 2.38735158601918 6.27035619355396 -3.88300460753477 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0867299489543397 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42396490_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42396490_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42396493_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000409040:exon_42396521_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000482660:exon_42396531_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42396601_42396776:EML4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 42515388 A/G 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 42515437 A/G 1 14 14 28 6.68458444085372 7.31541555914628 -0.630831118292562 A:G A G 10 0.522529682796163 0.85163607998196 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 44209477 C/T 1 13 8 21 6.20711412364988 4.1802374623693 2.02687666128058 T:C C T 10 0.522529682796163 0.393482202967395 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44209377_44209573:LRPPRC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 45640374 C/A 1 6 12 18 2.86482190322302 6.27035619355396 -3.40553429033093 A:C C A 10 0.522529682796163 0.155342186917693 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 46313481 C/T 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000171132:ENST00000306156:exon_46313347_46313501:PRKCE;ENSG00000171132:ENST00000469753:exon_46313347_46313501:PRKCE;ENSG00000171132:ENST00000480633:exon_46313347_46313501:PRKCE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 47132712 G/T 1 24 29 53 11.4592876128921 15.1533608010887 -3.69407318819664 T:G G T 10 0.522529682796163 0.337395568849209 ENSG00000180398:ENST00000409105:exon_47129013_47132733:MCFD2;ENSG00000180398:ENST00000409913:exon_47129013_47132733:MCFD2;ENSG00000180398:ENST00000319466:exon_47129013_47132733:MCFD2;ENSG00000180398:ENST00000409800:exon_47129013_47132733:MCFD2;ENSG00000180398:ENST00000493804:exon_47131994_47132733:MCFD2;ENSG00000180398:ENST00000409207:exon_47132097_47132733:MCFD2;ENSG00000180398:ENST00000444761:exon_47132097_47132733:MCFD2;ENSG00000180398:ENST00000470873:exon_47132384_47132733:MCFD2;ENSG00000180398:ENST00000409973:exon_47132410_47132733:MCFD2;ENSG00000180398:ENST00000409147:exon_47132507_47132733:MCFD2;ENSG00000180398:ENST00000409218:exon_47132533_47132733:MCFD2;ENSG00000180398:ENST00000412438:exon_47132605_47132733:MCFD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 47233184 G/A 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 A:G G A 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47233061_47233198:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47233061_47233198:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47233061_47233198:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47233061_47233198:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47233061_47233198:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47233061_47233198:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47233061_47233198:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47233061_47233198:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47233061_47233198:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47233061_47233198:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000440051:exon_47233071_47233198:TTC7A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 47251469 G/C 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 C:G G C 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000440051:exon_47251426_47251498:TTC7A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 47301029 A/G 1 39 14 53 18.6213423709496 7.31541555914628 11.3059268118034 A:G A G 10 0.522529682796163 0.00218516236268821 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47300841_47301062:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 14 13 27 6.68458444085372 6.79288587635012 -0.1083014354964 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 11 19 30 5.25217348924221 9.9280639731271 -4.67589048388489 A:T A T 10 0.522529682796163 0.100755669830112 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 16 26 42 7.63952507526139 13.5857717527002 -5.94624667743884 A:G G A 10 0.522529682796163 0.088137426612212 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 54127041 C/T 1 15 9 24 7.16205475805756 4.70276714516547 2.45928761289209 T:C C T 10 0.522529682796163 0.414495787724859 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54127018_54127154:PSME4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 54135936 T/C 1 16 7 23 7.63952507526139 3.65770777957314 3.98181729568825 T:C T C 10 0.522529682796163 0.142379051974171 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54135921_54135938:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54135921_54135938:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000461810:exon_54135921_54135980:PSME4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 55771161 A/G 1 32 18 50 15.2790501505228 9.40553429033093 5.87351586019185 A:G A G 10 0.522529682796163 0.118791683658829 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 34 31 65 16.2339907849305 16.1984201666811 0.0355706182494053 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 55883317 G/T 1 18 6 24 8.59446570966907 3.13517809677698 5.45928761289209 T:G G T 10 0.522529682796163 0.038735723930301 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415489:exon_55883266_55883355:PNPT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 55912120 T/C 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C T C 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000429805:exon_55912078_55912183:PNPT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 55 48 103 26.260867446211 25.0814247742158 1.17944267199521 A:G A G 10 0.522529682796163 0.844090244892653 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 2 7 9 0.954940634407674 3.65770777957314 -2.70276714516547 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0963891685915122 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 61508333 G/A 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61508225_61508377:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61508225_61508377:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61508225_61508377:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61508225_61508377:USP34 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 61647901 A/G 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 A:G A G 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000453133:exon_61647881_61647968:USP34 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 64114553 G/A 1 44 46 90 21.0086939569688 24.0363654086235 -3.02767145165467 A:G G A 10 0.522529682796163 0.528773854652106 ENSG00000169764:ENST00000394417:exon_64114536_64114778:UGP2;ENSG00000169764:ENST00000467648:exon_64114536_64114778:UGP2;ENSG00000169764:ENST00000337130:exon_64114536_64114778:UGP2;ENSG00000169764:ENST00000475550:exon_64114536_64117319:UGP2;ENSG00000169764:ENST00000445915:exon_64114536_64114778:UGP2;ENSG00000169764:ENST00000394418:exon_64114536_64114778:UGP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 46 35 81 21.9636345913765 18.2885388978657 3.6750956935108 A:G G A 10 0.522529682796163 0.43775200596683 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 67630980 G/A 1 13 11 24 6.20711412364988 5.74782651075779 0.459287612892089 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 67631831 G/A 1 12 7 19 5.72964380644604 3.65770777957314 2.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.368592887865543 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 67632125 C/T 1 10 12 22 4.77470317203837 6.27035619355396 -1.49565302151559 T:C C T 10 0.522529682796163 0.531644723723978 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 68385097 A/G 1 26 32 58 12.4142282472998 16.7209498494772 -4.30672160217745 A:G A G 10 0.522529682796163 0.293486962365659 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68384928_68385254:PPP3R1;ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68384976_68385273:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68385049_68385273:PNO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 36 27 63 17.1889314193381 14.1083014354964 3.08062998384173 A:G A G 10 0.522529682796163 0.452236250013591 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 68415767 G/A 1 12 11 23 5.72964380644604 5.74782651075779 -0.018182704311748 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000234310:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409752:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409377:exon_68415646_68415822:PPP3R1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 143 135 278 68.2782553601487 70.541507177482 -2.26325181733331 T:G G T 10 0.522529682796163 0.81032960028613 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 49 67 116 23.396045542988 35.0094887473429 -11.6134432043549 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0325726457882602 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 241 229 470 115.070346446125 119.659297360321 -4.58895091419659 C:G G C 10 0.522529682796163 0.677972222674264 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 A:T A T 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 71220864 T/C 1 5 11 16 2.38735158601918 5.74782651075779 -3.36047492473861 T:C T C 10 0.522529682796163 0.131585770979384 ENSG00000144043:ENST00000453130:exon_71220826_71220905:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000272438:exon_71220826_71220905:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000450386:exon_71220826_71220905:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000433258:exon_71220826_71220905:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000466731:exon_71220826_71220905:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000489894:exon_71220826_71220905:TEX261;ENSG00000144043:ENST00000473055:exon_71220826_71220905:TEX261 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 28 22 50 13.3691688817074 11.4956530215156 1.87351586019185 A:C A C 10 0.522529682796163 0.67176051695715 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 45 37 82 21.4861642741727 19.333598263458 2.15256601071464 T:G G T 10 0.522529682796163 0.659679971065478 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 18 29 47 8.59446570966907 15.1533608010887 -6.55889509141966 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0586441094705406 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 71366957 C/A 1 15 16 31 7.16205475805756 8.36047492473861 -1.19842016668105 A:C C A 10 0.522529682796163 0.721148115439186 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 46 42 88 21.9636345913765 21.9462466774388 0.0173879139376609 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 71649966 A/G 1 20 12 32 9.54940634407674 6.27035619355396 3.27905015052278 A:G A G 10 0.522529682796163 0.28989836988987 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000462695:exon_71649944_71650438:ZNF638 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 73447833 A/G 1 8 11 19 3.8197625376307 5.74782651075779 -1.9280639731271 A:G A G 10 0.522529682796163 0.492106910577732 ENSG00000135632:ENST00000413491:exon_73447789_73447910:SMYD5;ENSG00000135632:ENST00000389501:exon_73447789_73447910:SMYD5;ENSG00000135632:ENST00000258100:exon_73447789_73447910:SMYD5;ENSG00000135632:ENST00000443900:exon_73447789_73447910:SMYD5;ENSG00000135632:ENST00000474652:exon_73447789_73447910:SMYD5;ENSG00000135632:ENST00000491204:exon_73447789_73447849:SMYD5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 73478536 C/T 1 288 220 508 137.511451354705 114.956530215156 22.5549211395492 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0457103886480875 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 73 68 141 34.8553331558801 35.5320184301391 -0.676685274258979 A:T A T 10 0.522529682796163 0.932942329498366 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 74300717 T/C 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C T C 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000187605:ENST00000475405:exon_74300676_74300766:TET3;ENSG00000187605:ENST00000409262:exon_74300676_74300766:TET3;ENSG00000187605:ENST00000233310:exon_74300676_74300766:TET3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 74682512 C/T 0 8 0 8 3.8197625376307 0 3.8197625376307 C C 10 0.522529682796163 0.00825889449847131 ENSG00000115274:ENST00000471577:exon_74682235_74682725:INO80B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 41 39 80 19.5762830053573 20.3786576290504 -0.802374623693037 A:G G A 10 0.522529682796163 0.911048766327225 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 55 43 98 26.260867446211 22.468776360235 3.79209108597603 A:T:C C T 10 0.522529682796163 0.479702564775951 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 132 59 191 63.0260818709065 30.8292512849736 32.1968305859329 A:C C A 10 0.522529682796163 2.90284173489159e-06 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 74710491 C/T 1 9 21 30 4.29723285483453 10.9731233387194 -6.67589048388489 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0169184604953877 ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 74758934 G/A 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G G A 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000115317:ENST00000482331:exon_74758466_74759039:HTRA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 75915035 C/T 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C C T 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75914953_75915103:C2orf3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 75923413 T/C 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 T:C T C 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000442309:exon_75923378_75923441:C2orf3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 85553784 C/T 1 26 36 62 12.4142282472998 18.8110685806619 -6.39684033336211 T:C C T 10 0.522529682796163 0.126557911992527 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000282120:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000398263:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 85554080 G/A 1 30 27 57 14.3241095161151 14.1083014354964 0.215808080618711 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 85570388 G/T 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85569079_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85569079_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85569211_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85569211_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85569805_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85570114_85570504:RETSAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 85571433 G/A 0 0 8 8 0 4.1802374623693 -4.1802374623693 A G A 10 0.522529682796163 0.00270128884102245 ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000475624:exon_85571362_85571444:RETSAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 85622059 T/C 1 22 10 32 10.5043469784844 5.22529682796163 5.27905015052279 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0760448392928853 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85621871_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85621876_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85621890_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85621951_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85622016_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85622018_85622081:CAPG HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 151 138 289 72.0980178977794 72.1090962258705 -0.0110783280911022 T:C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 85769975 A/G 1 35 25 60 16.7114611021343 13.0632420699041 3.64821903223022 A:G A G 10 0.522529682796163 0.367959622795324 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 85806266 C/T 1 154 88 242 73.5304288493909 45.9826120860623 27.5478167633286 T:C C T 10 0.522529682796163 0.000386467263012648 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 165 129 294 78.7826023386331 67.406329080705 11.3762732579281 A:G A G 10 0.522529682796163 0.198983597874712 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 151 119 270 72.0980178977794 62.1810322527434 9.91698564503599 T:C C T 10 0.522529682796163 0.247058388102128 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 85824251 T/C 1 166 137 303 79.260072655837 71.5865665430743 7.67350611276262 T:C T C 10 0.522529682796163 0.388757981487235 ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85824227_85824704:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85824076_85824301:RNF181 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 85852667 G/A 1 21 30 51 10.0268766612806 15.6758904838849 -5.64901382260431 A:G G A 10 0.522529682796163 0.12403110763284 ENSG00000168883:ENST00000459775:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000448971:exon_85852662_85852712:USP39;ENSG00000168883:ENST00000442708:exon_85852662_85852740:USP39;ENSG00000168883:ENST00000450066:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85852662_85852719:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000487400:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85852662_85852813:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000493829:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000467885:exon_85852662_85852814:USP39 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 86260785 C/T 1 10 4 14 4.77470317203837 2.09011873118465 2.68458444085372 T:C C T 10 0.522529682796163 0.185755143276423 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86260784_86260910:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86260784_86260910:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000496892:exon_86260784_86260910:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000492034:exon_86260784_86260910:POLR1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 86344237 A/G 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409326:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000465560:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409783:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000418628:exon_86344178_86344243:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409277:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000483925:exon_86344178_86344282:PTCD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 86364653 A/G 1 70 69 139 33.4229222042686 36.0545481129352 -2.63162590866665 A:G A G 10 0.522529682796163 0.671869846431508 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86364592_86369280:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409277:exon_86364592_86365316:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000455260:exon_86364592_86369280:PTCD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 86400791 T/C 1 53 29 82 25.3059268118034 15.1533608010887 10.1525660107146 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0268496784715740 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 86400824 G/A 1 29 54 83 13.8466391989113 28.2166028709928 -14.3699636720815 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00192667231368800 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 88327531 G/A 1 37 41 78 17.666401736542 21.4237169946427 -3.75731525810071 A:G G A 10 0.522529682796163 0.428328827585116 ENSG00000172086:ENST00000347055:exon_88326724_88328104:KRCC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 88874891 C/A 1 43 30 73 20.531223639765 15.6758904838849 4.8553331558801 A:C C A 10 0.522529682796163 0.291957969865676 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000470706:exon_88874879_88874926:EIF2AK3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 88879131 T/C 1 12 7 19 5.72964380644604 3.65770777957314 2.0719360268729 T:C T C 10 0.522529682796163 0.368592887865543 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000478003:exon_88879036_88879487:EIF2AK3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 88895123 T/C 1 8 15 23 3.8197625376307 7.83794524194244 -4.01818270431175 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0995395512560875 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88894987_88895181:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88894987_88895181:EIF2AK3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 88913273 G/C 1 11 14 25 5.25217348924221 7.31541555914628 -2.06324206990407 C:G G C 10 0.522529682796163 0.430248665069756 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88913242_88913371:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88913242_88913371:EIF2AK3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 96920688 C/T 1 10 12 22 4.77470317203837 6.27035619355396 -1.49565302151559 T:C C T 10 0.522529682796163 0.531644723723978 ENSG00000135956:ENST00000258439:exon_96920571_96920735:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000432959:exon_96920571_96920735:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000435268:exon_96920571_96920735:TMEM127 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 97493877 T/C 1 8 2 10 3.8197625376307 1.04505936559233 2.77470317203837 T:C T C 10 0.522529682796163 0.11294395461013 ENSG00000168763:ENST00000377060:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000424641:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000305510:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000465224:exon_97493468_97494871:CNNM3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 98274527 G/C 1 36 38 74 17.1889314193381 19.8561279462542 -2.66719652691606 T:C:G G C 10 0.522529682796163 0.562007469013121 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98274406_98274580:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274441_98274580:ACTR1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 98277090 T/C 1 19 23 42 9.0719360268729 12.0181827043117 -2.94624667743884 T:C T C 10 0.522529682796163 0.440352402046650 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98277034_98277109:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98277034_98277109:ACTR1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 99149946 G/A 1 14 6 20 6.68458444085372 3.13517809677698 3.54940634407674 A:G G A 10 0.522529682796163 0.122665667036276 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99149840_99149958:INPP4A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 99193496 C/T 1 17 9 26 8.11699539246523 4.70276714516547 3.41422824729976 T:C C T 10 0.522529682796163 0.238656053250706 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409463:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000498026:exon_99193452_99193606:INPP4A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 99226173 T/A 1 3 10 13 1.43241095161151 5.22529682796163 -3.79288587635012 A:T:C T A 10 0.522529682796163 0.0492990438494871 ENSG00000115446:ENST00000409975:exon_99225042_99226502:UNC50;ENSG00000115446:ENST00000409347:exon_99226106_99226502:UNC50 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 99778735 A/G 1 9 8 17 4.29723285483453 4.1802374623693 0.116995392465229 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000449211:exon_99778420_99778826:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000415142:exon_99778420_99778738:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 10 14 24 4.77470317203837 7.31541555914628 -2.54071238710791 T:C T C 10 0.522529682796163 0.314811911172675 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 99978048 G/A 1 176 141 317 84.0347758278753 73.676685274259 10.3580905536163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.260858947697246 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99977611_99978283:EIF5B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 58 56 114 27.6932783978225 29.2616622365851 -1.56838383876257 T:C T C 10 0.522529682796163 0.779287188769963 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 18 17 35 8.59446570966907 8.88300460753477 -0.288538897865704 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 3 7 10 1.43241095161151 3.65770777957314 -2.22529682796163 T:C T C 10 0.522529682796163 0.209802689107094 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 7 10 17 3.34229222042686 5.22529682796163 -1.88300460753477 A:G A G 10 0.522529682796163 0.468082532065744 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 101010082 G/C 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 C:G G C 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 105885961 T/C 1 12 19 31 5.72964380644604 9.9280639731271 -4.19842016668105 T:C T C 10 0.522529682796163 0.151481718613018 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 105889349 G/A 1 10 3 13 4.77470317203837 1.56758904838849 3.20711412364988 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0965395810160095 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105889312_105889471:TGFBRAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 105915128 G/A 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 A:G G A 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105914968_105915162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105914968_105915162:TGFBRAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 105924510 A/G 1 15 4 19 7.16205475805756 2.09011873118465 5.0719360268729 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0214805659249842 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105924071_105924775:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105924071_105924778:TGFBRAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 111907691 T/C 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000153094:ENST00000308659:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000357757:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000393253:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000393256:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000428038:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000433098:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000437029:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000452231:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000361493:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000431217:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000439718:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000422765:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000357682:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000452033:exon_111907526_111908532:BCL2L11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 113089267 T/C 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C T C 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000188177:ENST00000409871:exon_113088582_113097634:ZC3H6;ENSG00000188177:ENST00000343936:exon_113088582_113097640:ZC3H6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 113346480 G/A 1 33 57 90 15.7565204677266 29.7841919193813 -14.0276714516547 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00412574730382569 ENSG00000125611:ENST00000324913:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000454841:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000409719:exon_113343777_113346852:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000469030:exon_113346443_113346617:CHCHD5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 113404708 G/A 1 11 8 19 5.25217348924221 4.1802374623693 1.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.653993185631586 ENSG00000144136:ENST00000272542:exon_113404140_113404739:SLC20A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 48 36 84 22.9185752257842 18.8110685806619 4.10750664512231 T:C T C 10 0.522529682796163 0.384258891704279 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 23 28 51 10.9818172956883 14.6308311182926 -3.64901382260431 C:G G C 10 0.522529682796163 0.328667617186064 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 19 23 42 9.0719360268729 12.0181827043117 -2.94624667743884 A:G A G 10 0.522529682796163 0.440352402046650 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 113956371 G/C 1 43 32 75 20.531223639765 16.7209498494772 3.81027379028778 C:G G C 10 0.522529682796163 0.41916724456558 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113956317_113956407:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000464559:exon_113956135_113956803:PSD4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 114220055 T/C 1 7 12 19 3.34229222042686 6.27035619355396 -2.9280639731271 T:C T C 10 0.522529682796163 0.250483788158122 ENSG00000136682:ENST00000259199:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000448780:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000426479:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000358604:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000456188:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000492566:exon_114219985_114220411:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000472995:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000486174:exon_114219985_114220071:CBWD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 59 47 106 28.1707487150264 24.5588950914197 3.61185362360672 C:G C G 10 0.522529682796163 0.497657095371699 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 17 18 35 8.11699539246523 9.40553429033093 -1.2885388978657 T:C T C 10 0.522529682796163 0.736128234715988 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 19 18 37 9.0719360268729 9.40553429033093 -0.333598263458031 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 223 198 421 106.475880736456 103.46087719364 3.01500354281539 A:C A C 10 0.522529682796163 0.807317864722645 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 56 27 83 26.7383377634149 14.1083014354964 12.6300363279185 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0058178407522226 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 14 5 19 6.68458444085372 2.61264841398082 4.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0686216289829668 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 136409574 A/C 1 11 14 25 5.25217348924221 7.31541555914628 -2.06324206990407 A:C A C 10 0.522529682796163 0.430248665069756 ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000429703:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000487294:exon_136409300_136409591:R3HDM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 136511842 C/A 1 47 41 88 22.4411049085803 21.4237169946427 1.01738791393766 A:C C A 10 0.522529682796163 0.915100001922738 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136511109_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000470687:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136511722_136511847:UBXN4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 136598357 A/G 1 95 88 183 45.3596801343645 45.9826120860623 -0.622931951697822 A:G A G 10 0.522529682796163 0.941119857455642 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136597196_136598521:MCM6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 136623717 C/T 1 28 29 57 13.3691688817074 15.1533608010887 -1.78419191938129 T:C C T 10 0.522529682796163 0.691556814294924 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136623702_136623847:MCM6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 136624155 G/A 1 41 26 67 19.5762830053573 13.5857717527002 5.99051125265708 A:G G A 10 0.522529682796163 0.178118280741680 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136624133_136624298:MCM6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 148716428 T/C 1 12 5 17 5.72964380644604 2.61264841398082 3.11699539246523 T:C T C 10 0.522529682796163 0.150352896781338 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000461711:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148716161_148716435:ORC4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 32 42 74 15.2790501505228 21.9462466774388 -6.66719652691606 T:C T C 10 0.522529682796163 0.130900449569484 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 152139416 G/A 1 49 67 116 23.396045542988 35.0094887473429 -11.6134432043549 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0325726457882602 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000414946:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000477072:exon_152139285_152139468:NMI HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 152314385 G/A 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152314275_152314477:RIF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 152698480 C/T 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000182389:ENST00000360283:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000339254:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000439467:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000397327:exon_152698417_152698602:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000427385:exon_152698417_152698602:CACNB4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 158178245 C/T 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000136541:ENST00000410096:exon_158175137_158178303:ERMN;ENSG00000136541:ENST00000397283:exon_158175151_158178303:ERMN;ENSG00000136541:ENST00000409395:exon_158177509_158178303:ERMN;ENSG00000136541:ENST00000420719:exon_158177514_158178303:ERMN;ENSG00000136541:ENST00000423880:exon_158177783_158178262:ERMN;ENSG00000136541:ENST00000420317:exon_158178157_158178303:ERMN;ENSG00000136541:ENST00000411762:exon_158178181_158178303:ERMN;ENSG00000136541:ENST00000409216:exon_158178197_158178303:ERMN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 160105007 A/G 1 6 11 17 2.86482190322302 5.74782651075779 -2.88300460753477 A:G A G 10 0.522529682796163 0.224425269329800 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160104883_160105023:WDSUB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 8 14 22 3.8197625376307 7.31541555914628 -3.49565302151558 T:G G T 10 0.522529682796163 0.142300185361340 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 160114315 G/A 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 A:G G A 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160114269_160114375:WDSUB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 160132089 T/G 1 4 10 14 1.90988126881535 5.22529682796163 -3.31541555914628 T:G T G 10 0.522529682796163 0.106809303346196 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160132057_160132149:WDSUB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 160710922 T/C 1 41 34 75 19.5762830053573 17.7660092150695 1.81027379028778 T:C T C 10 0.522529682796163 0.729336276725253 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 160711045 G/C 1 53 52 105 25.3059268118034 27.1715435054005 -1.86561669359711 C:G G C 10 0.522529682796163 0.76968751870432 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 160729005 C/T 1 21 26 47 10.0268766612806 13.5857717527002 -3.55889509141966 T:C C T 10 0.522529682796163 0.310437565425114 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160728330_160729104:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 160743040 T/A 1 32 35 67 15.2790501505228 18.2885388978657 -3.00948874734292 A:T T A 10 0.522529682796163 0.466309872880144 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160742931_160743041:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160742931_160743041:RP11-357L2.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 162091932 G/A 1 40 31 71 19.0988126881535 16.1984201666811 2.90039252147243 A:G G A 10 0.522529682796163 0.552982908533628 ENSG00000136560:ENST00000259075:exon_162091853_162092698:TANK;ENSG00000136560:ENST00000392749:exon_162091853_162092683:TANK;ENSG00000136560:ENST00000405852:exon_162091853_162092732:TANK;ENSG00000136560:ENST00000437623:exon_162091853_162092677:TANK;ENSG00000136560:ENST00000439442:exon_162091853_162092159:TANK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 116 94 210 55.3865567956451 49.1177901828393 6.26876661280578 T:C C T 10 0.522529682796163 0.407483476805224 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 51 58 109 24.3509861773957 30.3067216021775 -5.95573542478176 T:C T C 10 0.522529682796163 0.291538802350239 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 171822576 C/T 1 63 72 135 30.0806299838417 37.6221371613237 -7.541507177482 T:C C T 10 0.522529682796163 0.197400329544449 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 171850329 T/G 1 55 40 95 26.260867446211 20.9011873118465 5.35968013436452 T:G T G 10 0.522529682796163 0.304633733886058 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171850202_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000356075:exon_171850007_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171850017_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171850237_171850466:TLK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 171910313 C/T 1 28 40 68 13.3691688817074 20.9011873118465 -7.53201843013908 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0696514456112744 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000409443:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000478683:exon_171910271_171911639:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000486857:exon_171910227_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000453628:exon_171910292_171910363:TLK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 16 11 27 7.63952507526139 5.74782651075779 1.8916985645036 A:G G A 10 0.522529682796163 0.564634669250498 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 173460640 T/C 1 12 17 29 5.72964380644604 8.88300460753477 -3.15336080108873 T:C T C 10 0.522529682796163 0.268071850620001 ENSG00000152256:ENST00000282077:exon_173460557_173461193:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000392571:exon_173460557_173460697:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000410055:exon_173460557_173460751:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000466437:exon_173460557_173460690:PDK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 175436384 C/T 1 21 12 33 10.0268766612806 6.27035619355396 3.75652046772662 T:C C T 10 0.522529682796163 0.223833280245822 ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 179403593 G/A 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 A:G G A 10 0.522529682796163 0.586132476918336 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 29 32 61 13.8466391989113 16.7209498494772 -2.87431065056594 T:C C T 10 0.522529682796163 0.522126112347459 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 180810202 C/T 1 33 32 65 15.7565204677266 16.7209498494772 -0.964429381750593 T:C C T 10 0.522529682796163 0.901314250215728 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 190323530 A/G 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 A:G A G 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190323479_190323598:WDR75 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 190331262 T/C 1 16 16 32 7.63952507526139 8.36047492473861 -0.720949849477215 T:C T C 10 0.522529682796163 0.86046417845866 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190331151_190331308:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190331151_190331308:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190331151_190331308:WDR75 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 190531615 T/C 1 27 23 50 12.8916985645036 12.0181827043117 0.873515860191851 T:C T C 10 0.522529682796163 0.887708116878343 ENSG00000138381:ENST00000260952:exon_190530767_190532322:ASNSD1;ENSG00000138381:ENST00000420250:exon_190530767_190532322:ASNSD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 191301368 A/G 1 18 14 32 8.59446570966907 7.31541555914628 1.27905015052279 A:G A G 10 0.522529682796163 0.724992015605387 ENSG00000151690:ENST00000392328:exon_191300703_191302287:MFSD6;ENSG00000151690:ENST00000281416:exon_191300638_191302287:MFSD6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 191765365 T/C 1 22 14 36 10.5043469784844 7.31541555914628 3.18893141933813 T:C T C 10 0.522529682796163 0.319698622060239 ENSG00000115419:ENST00000320717:exon_191765290_191765419:GLS;ENSG00000115419:ENST00000338435:exon_191765290_191765419:GLS;ENSG00000115419:ENST00000469774:exon_191765290_191765419:GLS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 191874667 A/G 1 114 98 212 54.4316161612374 51.207908914024 3.22370724721345 A:G A G 10 0.522529682796163 0.680323151795928 ENSG00000115415:ENST00000361099:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000409465:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392322:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000452281:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392323:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000424722:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000454414:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000432058:exon_191874602_191874730:STAT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 192160875 C/T 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000128641:ENST00000418908:exon_192160837_192160952:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000339514:exon_192160837_192160952:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000439452:exon_192160837_192160952:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000439065:exon_192160837_192160952:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000392318:exon_192160837_192160952:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000304164:exon_192160837_192160952:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000438652:exon_192160837_192160952:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000451437:exon_192160837_192160952:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000471904:exon_192160837_192160952:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000420448:exon_192160837_192160952:MYO1B;ENSG00000128641:ENST00000392316:exon_192160837_192160952:MYO1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 198327314 G/A 1 16 7 23 7.63952507526139 3.65770777957314 3.98181729568825 A:G G A 10 0.522529682796163 0.142379051974171 ENSG00000115520:ENST00000263960:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409398:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409010:exon_198327263_198327455:COQ10B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 72 86 158 34.3778628386763 44.93755272047 -10.5596898817938 A:G A G 10 0.522529682796163 0.094943676371650 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 198365788 C/T 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000115541:ENST00000463841:exon_198365606_198365962:HSPE1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 203139844 T/C 1 67 73 140 31.9905112526571 38.1446668441199 -6.15415559146281 T:C T C 10 0.522529682796163 0.310751200357736 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000426814:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000488403:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492740:exon_203139836_203140406:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000472050:exon_203139836_203139912:NOP58 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 203155936 A/C 1 48 47 95 22.9185752257842 24.5588950914197 -1.64031986563548 A:C A C 10 0.522529682796163 0.758748283666089 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203155848_203155993:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203155848_203155993:NOP58 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 207008763 C/A 1 27 19 46 12.8916985645036 9.9280639731271 2.9636345913765 A:C C A 10 0.522529682796163 0.460986550916598 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 207012483 A/G 1 15 14 29 7.16205475805756 7.31541555914628 -0.153360801088725 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000456284:exon_207012477_207012558:NDUFS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 207169731 G/A 0 12 0 12 5.72964380644604 0 5.72964380644604 G G 10 0.522529682796163 0.000554712474620077 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 207174316 T/C 0 9 0 9 4.29723285483453 0 4.29723285483453 T T 10 0.522529682796163 0.00419379916107509 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 10 10 20 4.77470317203837 5.22529682796163 -0.45059365592326 A:C C A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 217012901 A/G 1 85 61 146 40.5849769623261 31.8743106505659 8.7106663117602 A:G A G 10 0.522529682796163 0.159294334953261 ENSG00000079246:ENST00000392133:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000392132:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000328063:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000460284:exon_217012806_217012999:XRCC5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 219130802 T/C 1 25 50 75 11.9367579300959 26.1264841398081 -14.1897262097122 T:C T C 10 0.522529682796163 0.00111429867701599 ENSG00000127837:ENST00000248450:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000444053:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000475678:exon_219130302_219131310:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000420660:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000489767:exon_219130787_219130870:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000422731:exon_219130778_219130804:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000465442:exon_219130787_219130870:AAMP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 219563807 C/T 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 T:C C T 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000163482:ENST00000295709:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000392106:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000392105:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000440309:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000431040:exon_219563325_219564071:STK36;ENSG00000163482:ENST00000419433:exon_219563325_219564071:STK36 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 220037444 G/A 1 37 24 61 17.666401736542 12.5407123871079 5.12568934943406 A:G G A 10 0.522529682796163 0.201755029926291 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 220037738 G/A 1 29 38 67 13.8466391989113 19.8561279462542 -6.00948874734292 A:G G A 10 0.522529682796163 0.144462747491509 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 220045454 G/A 1 16 15 31 7.63952507526139 7.83794524194244 -0.198420166681052 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443757:exon_220045392_220045473:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452293:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430747:exon_220045392_220045472:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045390_220045476:FAM134A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 220046840 G/A 1 28 19 47 13.3691688817074 9.9280639731271 3.44110490858034 A:G G A 10 0.522529682796163 0.381317015329648 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220046735_220046842:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 17 24 41 8.11699539246523 12.5407123871079 -4.42371699464268 T:C C T 10 0.522529682796163 0.210642056040574 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 14 22 36 6.68458444085372 11.4956530215156 -4.81106858066187 A:G G A 10 0.522529682796163 0.132820322993118 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 7 11 18 3.34229222042686 5.74782651075779 -2.40553429033093 A:G G A 10 0.522529682796163 0.346003571297567 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 220473355 G/A 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 A:G G A 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000426736:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000475396:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000473899:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220473305_220473510:STK11IP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 224630044 A/G 1 9 8 17 4.29723285483453 4.1802374623693 0.116995392465229 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000152056:ENST00000443700:exon_224629930_224630067:AP1S3;ENSG00000152056:ENST00000415298:exon_224629930_224630067:AP1S3;ENSG00000152056:ENST00000334271:exon_224629930_224630067:AP1S3;ENSG00000152056:ENST00000396654:exon_224629930_224630067:AP1S3;ENSG00000152056:ENST00000323968:exon_224629930_224630067:AP1S3;ENSG00000152056:ENST00000396653:exon_224629795_224630067:AP1S3;ENSG00000152056:ENST00000446015:exon_224629894_224630067:AP1S3;ENSG00000152056:ENST00000444408:exon_224629985_224630067:AP1S3;ENSG00000152056:ENST00000409375:exon_224630027_224630067:AP1S3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 224765956 C/T 1 18 8 26 8.59446570966907 4.1802374623693 4.41422824729976 T:C C T 10 0.522529682796163 0.114799439152915 ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000429915:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000483061:exon_224765572_224766050:WDFY1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 224866387 G/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G G A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000135919:ENST00000409304:exon_224866359_224866639:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000258405:exon_224866359_224866639:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000409840:exon_224866359_224866639:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000447280:exon_224866359_224866639:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000457690:exon_224866359_224866639:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000432738:exon_224866359_224866639:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000489065:exon_224866269_224866639:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000454956:exon_224866358_224866639:SERPINE2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 228221725 A/G 1 47 56 103 22.4411049085803 29.2616622365851 -6.82055732800479 A:G A G 10 0.522529682796163 0.199777323171974 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228221702_228222550:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228221702_228221970:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228221702_228221931:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228221702_228222515:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228221702_228221867:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228221702_228221847:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228221702_228222528:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228221702_228222543:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228221702_228222524:MFF;ENSG00000168958:ENST00000456345:exon_228221702_228222097:MFF;ENSG00000168958:ENST00000490857:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476262:exon_228221702_228222547:MFF;ENSG00000168958:ENST00000477362:exon_228221702_228221897:MFF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 228384735 A/G 1 17 19 36 8.11699539246523 9.9280639731271 -1.81106858066187 A:G A G 10 0.522529682796163 0.61789790541559 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228384664_228384779:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228384664_228384779:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228384664_228384779:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228384664_228384779:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228384664_228384779:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000456594:exon_228384664_228384779:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000486932:exon_228384664_228384779:AGFG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 230668858 T/C 1 17 20 37 8.11699539246523 10.4505936559233 -2.33359826345803 T:C T C 10 0.522529682796163 0.511423752828459 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000487178:exon_230668715_230668943:TRIP12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 35 36 71 16.7114611021343 18.8110685806619 -2.09960747852757 A:G A G 10 0.522529682796163 0.636322047113791 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 8 9 17 3.8197625376307 4.70276714516547 -0.883004607534771 T:C T C 10 0.522529682796163 0.809298250481776 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 231774844 G/A 1 10 10 20 4.77470317203837 5.22529682796163 -0.45059365592326 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 231775297 T/G 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 T:G T G 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000438398:exon_231774952_231775811:GPR55 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 232072912 T/C 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000482392:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000440107:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232072840_232072965:ARMC9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 232196564 C/T 1 8 9 17 3.8197625376307 4.70276714516547 -0.883004607534771 T:C C T 10 0.522529682796163 0.809298250481776 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 232196597 G/A 1 8 11 19 3.8197625376307 5.74782651075779 -1.9280639731271 A:G G A 10 0.522529682796163 0.492106910577732 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 232263127 G/A 1 21 16 37 10.0268766612806 8.36047492473861 1.66640173654197 A:G G A 10 0.522529682796163 0.624467280752172 ENSG00000156966:ENST00000287590:exon_232262442_232265875:B3GNT7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 233201328 A/G 1 2 6 8 0.954940634407674 3.13517809677698 -2.1802374623693 A:G A G 10 0.522529682796163 0.163120845582557 ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_233201179_233201907:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_233201179_233201908:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_233200924_233201687:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_233201179_233201340:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000429283:exon_233199079_233201686:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000418143:exon_233201020_233201684:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000417808:exon_233200851_233201683:DIS3L2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 234113057 G/A 1 42 54 96 20.0537533225612 28.2166028709928 -8.16284954843164 A:G G A 10 0.522529682796163 0.102424744406672 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 235404901 C/T 1 23 27 50 10.9818172956883 14.1083014354964 -3.12648413980815 T:C C T 10 0.522529682796163 0.398280201904762 ENSG00000188042:ENST00000390645:exon_235401685_235405697:ARL4C;ENSG00000188042:ENST00000339728:exon_235404656_235405244:ARL4C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 238671609 A/G 1 131 131 262 62.5486115537026 68.4513884462973 -5.90277689259469 A:G A G 10 0.522529682796163 0.496424696625695 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 238671889 G/A 1 118 118 236 56.3414974300528 61.6585025699472 -5.31700513989446 A:T:G G A 10 0.522529682796163 0.514835535432502 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 238671940 C/T 1 146 140 286 69.7106663117602 73.1541555914628 -3.4434892797026 T:C C T 10 0.522529682796163 0.722548355671699 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 238672795 C/T 1 118 115 233 56.3414974300528 60.0909135215587 -3.74941609150597 A:T:C C T 10 0.522529682796163 0.646438996420481 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 238990388 G/A 1 9 13 22 4.29723285483453 6.79288587635012 -2.49565302151559 A:G G A 10 0.522529682796163 0.296166428569315 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238990350_238990477:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000413463:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000443532:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000482031:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000431487:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238987206_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238990376_238990477:SCLY HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 13 10 23 6.20711412364988 5.22529682796163 0.981817295688251 T:C T C 10 0.522529682796163 0.835281075870211 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 239006879 C/T 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 T:C C T 10 0.522529682796163 0.393562228098845 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 239237974 T/C 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 240961728 T/C 1 32 30 62 15.2790501505228 15.6758904838849 -0.396840333362103 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 241569864 C/T 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 T:C C T 10 0.522529682796163 0.393562228098845 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 241570249 A/C 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 A:C A C 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 242046785 A/C 1 97 83 180 46.3146207687722 43.3699636720815 2.94465709669067 A:C A C 10 0.522529682796163 0.709234931842411 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242046768_242046914:PASK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 242047750 A/G 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 A:G A G 10 0.522529682796163 0.783741934444505 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 242051777 G/A 1 71 52 123 33.9003925214724 27.1715435054005 6.72884901607195 A:G G A 10 0.522529682796163 0.241145662795057 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000489256:exon_242051655_242052201:PASK;ENSG00000115687:ENST00000475666:exon_242051655_242051840:PASK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 242054403 G/A 1 9 10 19 4.29723285483453 5.22529682796163 -0.928063973127097 A:G G A 10 0.522529682796163 0.819201169042762 ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242052722_242054592:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242053050_242054592:PASK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 242062162 C/T 1 26 35 61 12.4142282472998 18.2885388978657 -5.87431065056594 T:C C T 10 0.522529682796163 0.158215778645234 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242062147_242062314:PASK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 242066156 C/T 1 18 42 60 8.59446570966907 21.9462466774388 -13.3517809677698 T:C C T 10 0.522529682796163 0.000659117154888208 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 25 47 72 11.9367579300959 24.5588950914197 -12.6221371613237 T:C T C 10 0.522529682796163 0.00306122764927471 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 242066789 A/G 1 20 25 45 9.54940634407674 13.0632420699041 -3.51383572582733 A:G A G 10 0.522529682796163 0.300915506118065 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000459710:exon_242066401_242066866:PASK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 242075362 G/A 1 7 9 16 3.34229222042686 4.70276714516547 -1.36047492473861 A:G G A 10 0.522529682796163 0.618833530377833 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242075286_242075454:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242075291_242075454:PASK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 242573211 T/C 1 43 27 70 20.531223639765 14.1083014354964 6.42292220426859 T:C T C 10 0.522529682796163 0.150643607617464 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 21 21 42 10.0268766612806 10.9731233387194 -0.946246677438843 T:C T C 10 0.522529682796163 0.877494434563837 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 278806 C/T 1 30 23 53 14.3241095161151 12.0181827043117 2.30592681180336 T:C C T 10 0.522529682796163 0.583393334522656 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 51 61 112 24.3509861773957 31.8743106505659 -7.52332447317025 T:C C T 10 0.522529682796163 0.157273365447539 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 55 54 109 26.260867446211 28.2166028709928 -1.95573542478176 T:C:G T G 10 0.522529682796163 0.773779544966685 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 44 55 99 21.0086939569688 28.739132553789 -7.73043859682013 A:G A G 10 0.522529682796163 0.131404360027805 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 29 25 54 13.8466391989113 13.0632420699041 0.7833971290072 T:C C T 10 0.522529682796163 0.89203796797713 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 2633296 G/C 1 11 8 19 5.25217348924221 4.1802374623693 1.0719360268729 C:G G C 10 0.522529682796163 0.653993185631586 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2632791_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2633178_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2633278_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000470143:exon_2633279_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2633292_2633577:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2633295_2633309:NOP56 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 2635212 A/G 1 80 85 165 38.197625376307 44.4150230376739 -6.2173976613669 A:G A G 10 0.522529682796163 0.350157139433853 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000496775:exon_2634880_2635221:NOP56 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 117 123 240 55.8640271128489 64.271150983928 -8.40712387107911 T:C T C 10 0.522529682796163 0.301220799737855 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 2638492 G/A 1 30 32 62 14.3241095161151 16.7209498494772 -2.3968403333621 A:G G A 10 0.522529682796163 0.611530737663248 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 279 251 530 133.214218499871 131.154950381837 2.05926811803363 T:C T C 10 0.522529682796163 0.862055322080723 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 3784110 C/T 1 21 15 36 10.0268766612806 7.83794524194244 2.18893141933813 T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.507683181290909 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3784051_3784184:CDC25B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 3838441 C/G 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3838282_3838456:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000441852:exon_3838282_3838581:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3838282_3838456:MAVS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C T C 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 11 9 20 5.25217348924221 4.70276714516547 0.549406344076741 A:G A G 10 0.522529682796163 0.827347849665529 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 5939214 A/C 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 A:C A C 10 0.522529682796163 0.393562228098845 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5939174_5939372:MCM8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 5943956 G/C 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 C:G G C 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5943920_5944005:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5943920_5944005:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5943920_5944005:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5943920_5944005:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5943920_5944005:MCM8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 5948542 G/A 1 10 3 13 4.77470317203837 1.56758904838849 3.20711412364988 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0965395810160095 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5948476_5948671:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5948524_5948671:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5948476_5948671:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5948476_5948671:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5948524_5948671:MCM8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 5953833 A/G 1 10 4 14 4.77470317203837 2.09011873118465 2.68458444085372 A:G A G 10 0.522529682796163 0.185755143276423 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5953702_5953842:MCM8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 7980390 C/T 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 T:C C T 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7980379_7980469:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7980379_7980507:TMX4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 10386013 C/A 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 A:C C A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 10386059 G/A 1 15 12 27 7.16205475805756 6.27035619355396 0.8916985645036 A:G G A 10 0.522529682796163 0.847892523515759 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 10620386 A/G 1 14 7 21 6.68458444085372 3.65770777957314 3.02687666128058 A:G A G 10 0.522529682796163 0.198668287049760 ENSG00000101384:ENST00000254958:exon_10618332_10620603:JAG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 13695680 C/T 1 33 28 61 15.7565204677266 14.6308311182926 1.12568934943406 T:C C T 10 0.522529682796163 0.79895755949939 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 9 11 20 4.29723285483453 5.74782651075779 -1.45059365592326 A:C C A 10 0.522529682796163 0.655579202774615 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 15 17 32 7.16205475805756 8.88300460753477 -1.72094984947721 A:G G A 10 0.522529682796163 0.597738714995898 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 17932210 C/T 1 63 80 143 30.0806299838417 41.802374623693 -11.7217446398513 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0540796545337645 ENSG00000089006:ENST00000377768:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000490175:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377759:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000483485:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377739:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000476648:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000431277:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000419004:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000494401:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000474883:exon_17932170_17932239:SNX5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 17943492 A/T 1 3 9 12 1.43241095161151 4.70276714516547 -3.27035619355396 A:T A T 10 0.522529682796163 0.0813542896879837 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 16 13 29 7.63952507526139 6.79288587635012 0.846639198911274 T:C T C 10 0.522529682796163 0.853261309241005 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 18462421 A/G 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 A:G A G 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000132664:ENST00000377603:exon_18462263_18462454:POLR3F;ENSG00000132664:ENST00000462997:exon_18462263_18462454:POLR3F HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 18523002 C/G 1 32 39 71 15.2790501505228 20.3786576290504 -5.09960747852757 C:G C G 10 0.522529682796163 0.236604629087863 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18522940_18523046:SEC23B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 21142523 C/G 1 2 8 10 0.954940634407674 4.1802374623693 -3.22529682796163 C:G C G 10 0.522529682796163 0.0559284466504964 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 21142813 T/C 1 12 11 23 5.72964380644604 5.74782651075779 -0.018182704311748 T:C T C 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 23345844 A/C 1 12 13 25 5.72964380644604 6.79288587635012 -1.06324206990407 A:C A C 10 0.522529682796163 0.693670722544485 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 25038484 G/T 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_25038405_25038818:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376726:exon_25038405_25039616:ACSS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 25187213 G/A 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000425813:exon_25187158_25187226:ENTPD6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 25193949 G/A 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:G G A 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000197586:ENST00000354989:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000525986:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000439162:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433417:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25193899_25194012:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000447877:exon_25193899_25194042:ENTPD6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 25260931 A/G 1 13 16 29 6.20711412364988 8.36047492473861 -2.15336080108873 A:G A G 10 0.522529682796163 0.461071503182053 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25260902_25261048:PYGB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 25264814 T/C 1 10 20 30 4.77470317203837 10.4505936559233 -5.67589048388489 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0441490175766215 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25264740_25264887:PYGB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 25276297 G/A 1 23 27 50 10.9818172956883 14.1083014354964 -3.12648413980815 A:G G A 10 0.522529682796163 0.398280201904762 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 25282944 A/G 1 15 23 38 7.16205475805756 12.0181827043117 -4.85612794625419 A:G A G 10 0.522529682796163 0.143286443954653 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 25288632 G/A 1 17 8 25 8.11699539246523 4.1802374623693 3.93675793009593 A:G G A 10 0.522529682796163 0.159934997919704 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000491682:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000481556:exon_25288602_25288681:ABHD12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 25398790 G/A 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 A:G G A 10 0.522529682796163 0.568106121039098 ENSG00000101003:ENST00000429262:exon_25398741_25398831:GINS1;ENSG00000101003:ENST00000262460:exon_25398741_25398831:GINS1;ENSG00000101003:ENST00000484893:exon_25398741_25398831:GINS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 30729665 C/T 1 33 27 60 15.7565204677266 14.1083014354964 1.64821903223022 T:C C T 10 0.522529682796163 0.69990749382059 ENSG00000101337:ENST00000398022:exon_30729569_30729698:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000421148:exon_30729569_30729698:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000217315:exon_30729569_30729698:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000413032:exon_30729569_30729698:TM9SF4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 30915461 T/C 1 20 17 37 9.54940634407674 8.88300460753477 0.666401736541969 T:C T C 10 0.522529682796163 0.870447919793445 ENSG00000101350:ENST00000375712:exon_30915359_30915464:KIF3B;ENSG00000101350:ENST00000418717:exon_30915359_30915464:KIF3B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 31024274 T/C 1 45 34 79 21.4861642741727 17.7660092150695 3.72015505910312 T:C T C 10 0.522529682796163 0.431705348531319 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 31025163 A/G 1 6 15 21 2.86482190322302 7.83794524194244 -4.97312333871942 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0466581471430304 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 31291161 C/T 1 19 23 42 9.0719360268729 12.0181827043117 -2.94624667743884 T:C C T 10 0.522529682796163 0.440352402046650 ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31290493_31291260:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31290494_31291260:COMMD7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 33345835 G/C 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33345023_33345907:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33345023_33345907:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33345023_33345907:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000397669:exon_33345362_33345907:NCOA6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 33470694 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000131069:ENST00000490046:exon_33470597_33470793:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000481971:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000488172:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000336325:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000497927:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000481284:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000475459:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000461051:exon_33470597_33470799:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000360596:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000484354:exon_33470621_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000374693:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000480274:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000477932:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000493805:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000473172:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000480978:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000467019:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000253382:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000476922:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000464399:exon_33470630_33470792:ACSS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 33591013 G/C 1 35 34 69 16.7114611021343 17.7660092150695 -1.05454811293524 C:G G C 10 0.522529682796163 0.810716969222737 ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33590207_33591086:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33590215_33591086:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33590215_33591086:TRPC4AP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 37396120 A/G 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 A:G A G 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37396107_37396239:ACTR5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 37534665 C/T 1 24 19 43 11.4592876128921 9.9280639731271 1.53122363976499 T:C C T 10 0.522529682796163 0.651110301177106 ENSG00000101445:ENST00000299824:exon_37534612_37534737:PPP1R16B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 37555116 G/C 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 C:G G C 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37554955_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37555069_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37555086_37555451:FAM83D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 37570725 C/T 1 2 6 8 0.954940634407674 3.13517809677698 -2.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.163120845582557 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37570602_37570769:FAM83D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 37601243 A/G 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:G A G 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37601202_37601294:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37601202_37601294:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37601202_37601294:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37601202_37601294:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37601202_37601294:DHX35 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 42089511 T/C 1 129 142 271 61.593670919295 74.1992149570551 -12.6055440377602 A:T:C T C 10 0.522529682796163 0.12873748722967 ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42089343_42092245:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42089343_42092245:SRSF6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 42225114 G/A 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 A:G G A 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000486243:exon_42225075_42225162:IFT52 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 42328639 T/C 1 58 43 101 27.6932783978225 22.468776360235 5.22450203758754 T:C T C 10 0.522529682796163 0.320040685031116 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42328397_42328684:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42328397_42328684:MYBL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 42825929 C/T 1 52 56 108 24.8284564945995 29.2616622365851 -4.4332057419856 T:C C T 10 0.522529682796163 0.44111882683016 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 29 38 67 13.8466391989113 19.8561279462542 -6.00948874734292 A:C A C 10 0.522529682796163 0.144462747491509 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 42826379 C/T 1 35 41 76 16.7114611021343 21.4237169946427 -4.71225589250838 T:C C T 10 0.522529682796163 0.302322961164900 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 43252915 T/C 1 30 45 75 14.3241095161151 23.5138357258273 -9.18972620971222 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0372853795013499 ENSG00000196839:ENST00000372874:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000464097:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000492931:exon_43252843_43252970:ADA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 20 7 27 9.54940634407674 3.65770777957314 5.8916985645036 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0322184674980244 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 14 13 27 6.68458444085372 6.79288587635012 -0.1083014354964 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 44511257 G/A 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 A:G G A 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 44512082 G/A 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 A:G G A 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 44581348 G/A 1 17 9 26 8.11699539246523 4.70276714516547 3.41422824729976 A:G G A 10 0.522529682796163 0.238656053250706 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44581237_44581348:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44581237_44581348:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44581237_44581348:ZNF335 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 45315346 C/T 1 32 25 57 15.2790501505228 13.0632420699041 2.21580808061871 T:C C T 10 0.522529682796163 0.597451107026221 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 45867852 A/G 1 14 22 36 6.68458444085372 11.4956530215156 -4.81106858066187 A:G A G 10 0.522529682796163 0.132820322993118 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45866054_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45867242_45867882:ZMYND8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 47244450 G/A 1 33 23 56 15.7565204677266 12.0181827043117 3.73833776341487 A:G G A 10 0.522529682796163 0.350509047443879 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47244399_47244501:PREX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 47246077 C/G 1 25 20 45 11.9367579300959 10.4505936559233 1.48616427417267 C:G C G 10 0.522529682796163 0.765770317490704 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47245987_47246159:PREX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 47246127 G/A 1 26 19 45 12.4142282472998 9.9280639731271 2.48616427417267 A:G G A 10 0.522529682796163 0.55109327810532 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47245987_47246159:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47245987_47246159:PREX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 47249116 G/A 1 52 30 82 24.8284564945995 15.6758904838849 9.15256601071464 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0465718371338457 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47248815_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47248815_47249177:PREX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 47249170 G/A 1 48 39 87 22.9185752257842 20.3786576290504 2.53991759673382 A:G G A 10 0.522529682796163 0.593753615622095 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47248815_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47248815_47249177:PREX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 47261017 T/C 1 45 57 102 21.4861642741727 29.7841919193813 -8.29802764520862 T:C T C 10 0.522529682796163 0.112604169480532 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 47361610 G/A 1 11 8 19 5.25217348924221 4.1802374623693 1.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.653993185631586 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47361562_47361684:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47361562_47361684:PREX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 13 16 29 6.20711412364988 8.36047492473861 -2.15336080108873 A:G G A 10 0.522529682796163 0.461071503182053 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 10 9 19 4.77470317203837 4.70276714516547 0.071936026872903 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 48524827 A/G 1 11 7 18 5.25217348924221 3.65770777957314 1.59446570966907 A:G A G 10 0.522529682796163 0.48876143429335 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48524692_48525129:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48524692_48525129:SPATA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 50769183 G/A 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 50769379 C/T 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 50769549 A/G 1 14 13 27 6.68458444085372 6.79288587635012 -0.1083014354964 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 50803444 C/T 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 50803573 G/A 1 6 12 18 2.86482190322302 6.27035619355396 -3.40553429033093 A:G G A 10 0.522529682796163 0.155342186917693 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 52192408 C/T 1 17 16 33 8.11699539246523 8.36047492473861 -0.243479532273378 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000437222:exon_52192266_52192566:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 52193368 C/T 1 20 17 37 9.54940634407674 8.88300460753477 0.666401736541969 T:C C T 10 0.522529682796163 0.870447919793445 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 52193660 G/A 1 27 20 47 12.8916985645036 10.4505936559233 2.44110490858034 A:G G A 10 0.522529682796163 0.559763224190013 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 52193698 G/A 1 20 10 30 9.54940634407674 5.22529682796163 4.32410951611511 A:G G A 10 0.522529682796163 0.143360175017623 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 52198340 T/A 1 16 18 34 7.63952507526139 9.40553429033093 -1.76600921506954 A:T T A 10 0.522529682796163 0.608163381004269 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52198000_52199707:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52198000_52199636:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52198000_52199707:ZNF217 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 52561469 A/G 1 16 5 21 7.63952507526139 2.61264841398082 5.02687666128058 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0297781149323547 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52561322_52561535:BCAS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 52645166 A/G 1 5 10 15 2.38735158601918 5.22529682796163 -2.83794524194245 A:G A G 10 0.522529682796163 0.196087541104941 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52644931_52645239:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52645080_52645289:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000411563:exon_52644411_52645511:BCAS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 54961541 A/T 1 18 20 38 8.59446570966907 10.4505936559233 -1.85612794625419 A:T A T 10 0.522529682796163 0.627015478727312 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 56179586 G/A 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56178906_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56179111_56179825:ZBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 56190634 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56190568_56193137:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56190568_56191524:ZBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 24 27 51 11.4592876128921 14.1083014354964 -2.64901382260431 A:C:G C G 10 0.522529682796163 0.485646556660980 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 318 292 610 151.83556087082 152.57866737648 -0.743106505659398 T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.967680808129012 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 60883273 A/C 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 A:C A C 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000130702:ENST00000492698:exon_60883011_60883502:LAMA5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 60963494 C/T 1 31 8 39 14.8015798333189 4.1802374623693 10.6213423709496 T:C C T 10 0.522529682796163 0.000602666293829967 ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 60968596 A/G 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60968496_60968661:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60968496_60968661:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60968496_60968661:CABLES2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 61443870 C/G 1 55 45 100 26.260867446211 23.5138357258273 2.7470317203837 C:G C G 10 0.522529682796163 0.617464727056161 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 61528074 T/C 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C T C 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61527883_61528348:DIDO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 61528306 A/G 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G A G 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61527883_61528348:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61527883_61528348:DIDO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 61588159 A/G 1 29 22 51 13.8466391989113 11.4956530215156 2.35098617739569 A:G A G 10 0.522529682796163 0.575882168468254 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000411611:exon_61588117_61588314:SLC17A9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 61595636 C/T 1 33 14 47 15.7565204677266 7.31541555914628 8.44110490858034 T:C C T 10 0.522529682796163 0.01850657879128 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 23 31 54 10.9818172956883 16.1984201666811 -5.2166028709928 A:G A G 10 0.522529682796163 0.173771289269557 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62191919 G/A 1 8 22 30 3.8197625376307 11.4956530215156 -7.67589048388489 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00561120047900839 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62193019 C/T 1 15 17 32 7.16205475805756 8.88300460753477 -1.72094984947721 T:C C T 10 0.522529682796163 0.597738714995898 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62194030 G/C 1 9 4 13 4.29723285483453 2.09011873118465 2.20711412364988 C:G G C 10 0.522529682796163 0.273205822586663 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62194103 A/G 1 11 5 16 5.25217348924221 2.61264841398082 2.63952507526139 A:G A G 10 0.522529682796163 0.217533646462459 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62195087 A/G 1 15 14 29 7.16205475805756 7.31541555914628 -0.153360801088725 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62195220 C/T 1 8 11 19 3.8197625376307 5.74782651075779 -1.9280639731271 T:C C T 10 0.522529682796163 0.492106910577732 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62195672 C/T 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 T:C C T 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62196033 C/T 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 T:C C T 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62196182 G/C 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62196253 C/A 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 A:C C A 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62197370 G/A 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62198686 G/A 1 20 5 25 9.54940634407674 2.61264841398082 6.93675793009592 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00785998148825142 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62200576 G/A 1 12 7 19 5.72964380644604 3.65770777957314 2.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.368592887865543 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62200738 G/A 1 6 9 15 2.86482190322302 4.70276714516547 -1.83794524194244 A:G G A 10 0.522529682796163 0.440567980680144 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62200860 A/G 1 10 7 17 4.77470317203837 3.65770777957314 1.11699539246523 A:G A G 10 0.522529682796163 0.63504130808849 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62221766 C/T 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 T:C C T 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000447518:exon_62221638_62221772:GMEB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62236148 T/C 1 2 9 11 0.954940634407674 4.70276714516547 -3.74782651075779 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0319652475797756 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62236096_62236193:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62236096_62236255:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62236096_62236193:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000447518:exon_62236096_62236193:GMEB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62324289 C/T 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62326110 A/C 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 A:C A C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62326094_62326331:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62326094_62326327:RTEL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62364973 C/A 1 15 17 32 7.16205475805756 8.88300460753477 -1.72094984947721 A:C C A 10 0.522529682796163 0.597738714995898 ENSG00000197114:ENST00000448100:exon_62364939_62365091:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000355969:exon_62364939_62365091:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000477340:exon_62364939_62366176:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000490623:exon_62364939_62365091:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000357119:exon_62364939_62365064:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000369967:exon_62364939_62365091:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000328969:exon_62364939_62365091:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000486025:exon_62364939_62365091:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000472711:exon_62364939_62365127:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000478385:exon_62364939_62365091:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000468235:exon_62364939_62365322:ZGPAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62372706 G/A 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62372605_62372832:SLC2A4RG HGDP00948_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 36 34 70 17.1889314193381 17.7660092150695 -0.577077795731409 T:G G T 10 0.522529682796163 0.905306821700318 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 19169155 G/C 1 21 14 35 10.0268766612806 7.31541555914628 2.7114611021343 C:G G C 10 0.522529682796163 0.400403410066618 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 26965148 G/A 1 32 32 64 15.2790501505228 16.7209498494772 -1.44189969895443 A:G G A 10 0.522529682796163 0.802638253925678 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 26965205 T/C 1 43 43 86 20.531223639765 22.468776360235 -1.93755272047002 T:C T C 10 0.522529682796163 0.746292849748288 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 26969703 T/C 1 22 21 43 10.5043469784844 10.9731233387194 -0.468776360235006 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 34128717 G/A 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000159086:ENST00000466846:exon_34127524_34129105:GCFC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 34614250 T/C 1 18 15 33 8.59446570966907 7.83794524194244 0.756520467726622 T:C:G T C 10 0.522529682796163 0.862587560743927 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 18 10 28 8.59446570966907 5.22529682796163 3.36916888170744 T:G T G 10 0.522529682796163 0.256699726213295 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 34640788 A/G 1 28 15 43 13.3691688817074 7.83794524194244 5.53122363976499 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0953585716651787 ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34640699_34640822:AP000295.9;ENSG00000243646:ENST00000290200:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000422891:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000493295:exon_34640233_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000498371:exon_34640587_34640822:IL10RB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 9 17 26 4.29723285483453 8.88300460753477 -4.58577175270024 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0792096106269262 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 37 40 77 17.666401736542 20.9011873118465 -3.23478557530455 A:G A G 10 0.522529682796163 0.494615028998545 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 34883618 T/C 1 13 20 33 6.20711412364988 10.4505936559233 -4.24347953227338 T:C T C 10 0.522529682796163 0.163896745013365 ENSG00000159131:ENST00000414353:exon_34883559_34883664:GART;ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34883559_34883765:GART HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 34924243 T/C 1 55 75 130 26.260867446211 39.1897262097122 -12.9288587635012 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0278010698944394 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 34925689 G/A 1 54 64 118 25.7833971290072 33.4418996989544 -7.65850256994723 A:G G A 10 0.522529682796163 0.167416813251326 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 34926043 G/A 1 71 106 177 33.9003925214724 55.3881463763933 -21.4877538549208 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00150537658253602 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 103 89 192 49.1794426719952 46.5051417688585 2.67430090313671 T:C C T 10 0.522529682796163 0.718382258852534 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 6 33 39 2.86482190322302 17.2434795322734 -14.3786576290504 T:C T C 10 0.522529682796163 2.65928255551209e-06 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 121 140 261 57.7739083816643 73.1541555914628 -15.3802472097985 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0628723116079798 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 35890409 C/T 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000159200:ENST00000487990:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000313806:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000489903:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381132:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000399272:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000481448:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000482533:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381135:exon_35888788_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000443408:exon_35888788_35890554:RCAN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 37442632 G/C 1 16 8 24 7.63952507526139 4.1802374623693 3.45928761289209 C:G G C 10 0.522529682796163 0.219555714324787 ENSG00000159228:ENST00000466328:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000439427:exon_37442313_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000399191:exon_37442333_37442702:CBR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 37444973 C/T 1 47 28 75 22.4411049085803 14.6308311182926 7.81027379028778 T:C C T 10 0.522529682796163 0.082556640462605 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 38538018 T/C 1 37 43 80 17.666401736542 22.468776360235 -4.80237462369304 T:C T C 10 0.522529682796163 0.314211888391736 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38537852_38538053:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38537852_38538067:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38537852_38538067:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000487711:exon_38537852_38538067:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000472398:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000469939:exon_38537852_38538067:TTC3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 24 20 44 11.4592876128921 10.4505936559233 1.00869395696883 A:G G A 10 0.522529682796163 0.880274360748163 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 38568215 C/T 1 12 12 24 5.72964380644604 6.27035619355396 -0.540712387107911 T:C C T 10 0.522529682796163 0.84110056521342 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 38568259 C/T 1 7 13 20 3.34229222042686 6.79288587635012 -3.45059365592326 T:C C T 10 0.522529682796163 0.177936173075919 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 17 31 48 8.11699539246523 16.1984201666811 -8.08142477421582 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0208374276885049 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 32 26 58 15.2790501505228 13.5857717527002 1.69327839782255 A:G A G 10 0.522529682796163 0.694775132952013 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 40670460 G/C 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380783:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000341322:exon_40668363_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000470108:exon_40670016_40670508:BRWD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 122 115 237 58.2513786988681 60.0909135215587 -1.83953482269062 A:G A G 10 0.522529682796163 0.845414985422778 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 44840138 G/A 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000142178:ENST00000270162:exon_44840114_44840337:SIK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 21 13 34 10.0268766612806 6.79288587635012 3.23399078493046 T:C C T 10 0.522529682796163 0.30519106144782 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 45750145 T/C 1 26 26 52 12.4142282472998 13.5857717527002 -1.17154350540048 T:C T C 10 0.522529682796163 0.782375480967989 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 45750248 G/A 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 A:G G A 10 0.522529682796163 0.37096815956878 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 46271460 T/C 1 37 26 63 17.666401736542 13.5857717527002 4.08062998384173 T:C T C 10 0.522529682796163 0.315896315925016 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 46705621 G/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G G A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000186866:ENST00000331343:exon_46705593_46705843:POFUT2;ENSG00000186866:ENST00000334538:exon_46705593_46705843:POFUT2;ENSG00000186866:ENST00000349485:exon_46705593_46705843:POFUT2;ENSG00000186866:ENST00000493524:exon_46705593_46705843:POFUT2;ENSG00000186866:ENST00000468360:exon_46705593_46705843:POFUT2;ENSG00000186866:ENST00000493811:exon_46705593_46705843:POFUT2;ENSG00000186866:ENST00000476653:exon_46705398_46705843:POFUT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 47786524 A/G 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 47786817 C/G 1 8 2 10 3.8197625376307 1.04505936559233 2.77470317203837 C:G C G 10 0.522529682796163 0.11294395461013 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 47787002 T/C 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 47808679 C/T 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47808657_47808799:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47808657_47808799:PCNT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 47811272 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47811079_47811291:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47811079_47811291:PCNT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 47821588 A/G 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:G A G 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47821465_47821635:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47821465_47821635:PCNT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 47851796 G/A 1 14 8 22 6.68458444085372 4.1802374623693 2.50434697848442 A:G G A 10 0.522529682796163 0.39388166009814 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 47855876 A/G 1 14 6 20 6.68458444085372 3.13517809677698 3.54940634407674 A:G A G 10 0.522529682796163 0.122665667036276 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47855817_47856061:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47855817_47856061:PCNT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 21 47863757 A/C 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:C A C 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47863723_47863861:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47863723_47863861:PCNT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 18165995 T/G 1 22 22 44 10.5043469784844 11.4956530215156 -0.99130604303117 T:G T G 10 0.522529682796163 0.76562812350394 ENSG00000099968:ENST00000399781:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000337612:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18165980_18166087:BCL2L13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 18209613 A/G 1 21 15 36 10.0268766612806 7.83794524194244 2.18893141933813 A:G A G 10 0.522529682796163 0.507683181290909 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 18209718 C/T 1 23 23 46 10.9818172956883 12.0181827043117 -1.0363654086235 T:C C T 10 0.522529682796163 0.770114531218573 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 18220831 A/G 1 97 124 221 46.3146207687722 64.7936806667242 -18.479059897952 A:T:G A G 10 0.522529682796163 0.0151590898534612 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399765:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000494097:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18220824_18220995:BID HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 18226612 A/G 1 45 57 102 21.4861642741727 29.7841919193813 -8.29802764520862 A:G A G 10 0.522529682796163 0.112604169480532 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000458454:exon_18226569_18226779:BID HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 18226764 T/C 1 53 50 103 25.3059268118034 26.1264841398081 -0.820557328004785 T:C T C 10 0.522529682796163 0.921529896726993 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000458454:exon_18226569_18226779:BID HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 18609642 C/T 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 T:C C T 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000215193:ENST00000474897:exon_18609121_18609801:PEX26;ENSG00000183785:ENST00000316027:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000330423:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000416740:exon_18609121_18609801:TUBA8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 19026613 A/G 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000070413:ENST00000263196:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000389262:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000467659:exon_19025350_19026634:DGCR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 19949952 A/G 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 34 23 57 16.2339907849305 12.0181827043117 4.21580808061871 C:G C G 10 0.522529682796163 0.290251717899555 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 19951804 G/A 1 46 51 97 21.9636345913765 26.6490138226043 -4.68537923122781 A:G G A 10 0.522529682796163 0.361276916687244 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951691_19953168:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951633_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951691_19951823:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951691_19951822:COMT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 20102750 C/T 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C C T 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000099899:ENST00000471040:exon_20102488_20102962:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000463710:exon_20102488_20102915:TRMT2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 20307256 G/A 0 26 0 26 12.4142282472998 0 12.4142282472998 G G 10 0.522529682796163 5.13626564637783e-08 ENSG00000128185:ENST00000248879:exon_20307162_20307322:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000405465:exon_20307162_20307309:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000443409:exon_20307162_20307322:DGCR6L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 20800835 A/G 1 12 9 21 5.72964380644604 4.70276714516547 1.02687666128058 A:G A G 10 0.522529682796163 0.670391349361465 ENSG00000099910:ENST00000429594:exon_20800730_20800907:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000328879:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000399308:exon_20800766_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000451094:exon_20800772_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000440659:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000417168:exon_20800771_20800963:KLHL22 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 20940085 G/A 1 30 22 52 14.3241095161151 11.4956530215156 2.82845649459953 A:G G A 10 0.522529682796163 0.488611519623501 ENSG00000099917:ENST00000433831:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000437399:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000425759:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000292733:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000263205:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000406969:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000382974:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000492381:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000489651:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000473244:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20937617_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000461076:exon_20939388_20940090:MED15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 21167787 G/A 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000241973:ENST00000255882:exon_21167646_21167794:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000437178:exon_21167646_21167794:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000485963:exon_21167646_21167794:PI4KA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 21337325 G/A 1 10 2 12 4.77470317203837 1.04505936559233 3.72964380644604 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0408712623846239 ENSG00000099949:ENST00000479606:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000215739:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000414985:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000389355:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000493460:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000443265:exon_21337316_21337378:LZTR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 21354970 C/G 1 28 16 44 13.3691688817074 8.36047492473861 5.00869395696883 C:G C G 10 0.522529682796163 0.134705717304314 ENSG00000184436:ENST00000498406:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000215742:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000471073:exon_21354936_21356084:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000438917:exon_21354936_21355019:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000399133:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000476667:exon_21354936_21355700:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000466670:exon_21354936_21355700:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000488975:exon_21354936_21355018:THAP7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 22730635 C/T 0 48 0 48 22.9185752257842 0 22.9185752257842 C C 10 0.522529682796163 5.02643646351143e-14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 22730855 T/A 0 8 0 8 3.8197625376307 0 3.8197625376307 T T 10 0.522529682796163 0.00825889449847131 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 23627369 A/G 1 4 11 15 1.90988126881535 5.74782651075779 -3.83794524194244 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0677953951072992 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 24717518 G/A 1 15 4 19 7.16205475805756 2.09011873118465 5.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0214805659249842 ENSG00000100014:ENST00000398280:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000437398:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000421374:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000314328:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000440893:exon_24717256_24717656:SPECC1L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 24837262 C/T 0 76 0 76 36.2877441074916 0 36.2877441074916 C C 10 0.522529682796163 4.10583676844386e-22 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 45 24 69 21.4861642741727 12.5407123871079 8.94545188706475 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0397243886242811 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 26859942 C/T 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26859883_26859981:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26859883_26860158:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 26862212 T/C 1 12 6 18 5.72964380644604 3.13517809677698 2.59446570966907 T:C T C 10 0.522529682796163 0.246476394158893 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26861421_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26862192_26864589:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26861421_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000459918:exon_26862192_26862228:HPS4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 26866723 C/T 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26866685_26866779:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26866685_26866779:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26866685_26866888:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26866685_26866779:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26866685_26866779:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26866685_26866779:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26866685_26866888:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26866685_26866779:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26866685_26866779:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26866685_26866779:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26866685_26866779:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26866685_26866779:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26866685_26866779:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000459918:exon_26866685_26866779:HPS4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 26884039 G/A 1 18 8 26 8.59446570966907 4.1802374623693 4.41422824729976 A:G G A 10 0.522529682796163 0.114799439152915 ENSG00000100104:ENST00000215917:exon_26883995_26884254:SRRD;ENSG00000100104:ENST00000477945:exon_26883948_26884254:SRRD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 26888060 G/A 1 39 30 69 18.6213423709496 15.6758904838849 2.94545188706476 A:G G A 10 0.522529682796163 0.547192755895445 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26887191_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26887893_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26887893_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000492137:exon_26887893_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000412662:exon_26887897_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26887897_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26887897_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26887897_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26887952_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26887952_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26887977_26888334:TFIP11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 26895337 G/A 1 23 12 35 10.9818172956883 6.27035619355396 4.7114611021343 A:G G A 10 0.522529682796163 0.128505520911844 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26895070_26895348:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26895070_26895357:TFIP11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 29621128 C/G 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429226:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29621122_29621205:EMID1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 29630337 G/A 1 9 12 21 4.29723285483453 6.27035619355396 -1.97312333871942 A:G G A 10 0.522529682796163 0.513321470356553 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000433143:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000487477:exon_29630294_29630338:EMID1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 29908072 C/T 1 18 17 35 8.59446570966907 8.88300460753477 -0.288538897865704 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 29925221 C/T 1 9 10 19 4.29723285483453 5.22529682796163 -0.928063973127097 T:C C T 10 0.522529682796163 0.819201169042762 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29924926_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000484924:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000443089:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000492707:exon_29925151_29925228:THOC5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 29957570 G/A 1 61 60 121 29.1256893494341 31.3517809677698 -2.22609161833572 A:G G A 10 0.522529682796163 0.71630133479798 ENSG00000184117:ENST00000216121:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000437094:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000415100:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 49 40 89 23.396045542988 20.9011873118465 2.4948582311415 A:G A G 10 0.522529682796163 0.671496827208931 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 30221201 G/A 1 16 17 33 7.63952507526139 8.88300460753477 -1.24347953227338 A:T:G G A 10 0.522529682796163 0.728916278367981 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000431535:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000495967:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000412689:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000465667:exon_30221075_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000463203:exon_30221076_30221347:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000495681:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000462454:exon_30221092_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000453160:exon_30221097_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000460313:exon_30221150_30221246:ASCC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 30403996 C/T 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C C T 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000100330:ENST00000401950:exon_30403890_30404021:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000333027:exon_30403890_30404021:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000323630:exon_30403890_30404021:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000351488:exon_30403890_30404021:MTMR3;ENSG00000100330:ENST00000406629:exon_30403890_30404021:MTMR3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 30689998 G/A 1 17 11 28 8.11699539246523 5.74782651075779 2.36916888170744 A:G G A 10 0.522529682796163 0.450581355727128 ENSG00000248751:ENST00000330168:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434987:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434291:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000418047:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000447976:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30689974_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30689640_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000466666:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000437122:exon_30689910_30690099:TBC1D10A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 30973025 G/A 1 41 55 96 19.5762830053573 28.739132553789 -9.16284954843164 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.0660089364698325 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30972615_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30972615_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30972617_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30972619_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30972623_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30972652_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30972822_30973116:PES1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 30975861 C/T 1 72 71 143 34.3778628386763 37.0996074785276 -2.72174463985131 T:C C T 10 0.522529682796163 0.67597695665915 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30975738_30975910:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30974824_30976061:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30975738_30975922:PES1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 30987861 G/C 1 14 14 28 6.68458444085372 7.31541555914628 -0.630831118292562 C:G G C 10 0.522529682796163 0.85163607998196 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 10 5 15 4.77470317203837 2.61264841398082 2.16205475805755 T:C T C 10 0.522529682796163 0.309170426805168 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 31342376 G/C 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 C:G G C 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000476152:exon_31342328_31342436:MORC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 31722886 T/G 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 T:G T G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000100105:ENST00000266269:exon_31721790_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000405309:exon_31721795_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000351933:exon_31721795_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000440325:exon_31721795_31723295:PATZ1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 31998612 G/A 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 A:G G A 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_31998593_31998771:SFI1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 32058147 G/A 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 A:G G A 10 0.522529682796163 0.393562228098845 ENSG00000241878:ENST00000460723:exon_32058130_32058201:PISD;ENSG00000241878:ENST00000437808:exon_32058130_32058207:PISD;ENSG00000241878:ENST00000435900:exon_32058130_32058166:PISD;ENSG00000241878:ENST00000439502:exon_32058130_32058418:PISD;ENSG00000241878:ENST00000336566:exon_32058130_32058194:PISD;ENSG00000241878:ENST00000422296:exon_32058130_32058418:PISD;ENSG00000241878:ENST00000474017:exon_32058130_32058189:PISD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 35660875 G/T 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 35806815 T/C 1 57 51 108 27.2158080806187 26.6490138226043 0.566794258014401 T:C T C 10 0.522529682796163 0.923615175242897 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444582:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444778:exon_35806737_35806865:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000464908:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35806402_35806903:MCM5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 35812788 A/G 1 134 142 276 63.9810225053142 74.1992149570551 -10.218192451741 A:G A G 10 0.522529682796163 0.228353506851696 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35812631_35812807:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35812631_35812807:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35812631_35812807:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35812631_35812807:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35812631_35812807:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35812631_35812807:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000402457:exon_35812631_35812807:MCM5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 35815880 G/A 1 118 89 207 56.3414974300528 46.5051417688585 9.83635566119427 A:G G A 10 0.522529682796163 0.186184288601935 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000402457:exon_35815877_35816005:MCM5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 36537893 A/G 1 18 10 28 8.59446570966907 5.22529682796163 3.36916888170744 A:G A G 10 0.522529682796163 0.256699726213295 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 36900271 T/C 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 T:C T C 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900145_36900414:FOXRED2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 36900806 A/G 1 4 10 14 1.90988126881535 5.22529682796163 -3.31541555914628 A:G A G 10 0.522529682796163 0.106809303346196 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900562_36900813:FOXRED2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 37699377 T/C 1 2 6 8 0.954940634407674 3.13517809677698 -2.1802374623693 T:C T C 10 0.522529682796163 0.163120845582557 ENSG00000100055:ENST00000248901:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000422721:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000443914:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000417357:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000462927:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000427572:exon_37699295_37699443:CYTH4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 39148537 T/C 1 21 32 53 10.0268766612806 16.7209498494772 -6.69407318819664 T:C T C 10 0.522529682796163 0.073888098259786 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39148512_39148637:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000417595:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000438058:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000456894:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000420859:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000452294:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000494273:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000433561:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000417332:exon_39148512_39148670:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000439339:exon_39148512_39148670:SUN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 T:C C T 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 A:G G A 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 16 14 30 7.63952507526139 7.31541555914628 0.324109516115112 A:C C A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 39477123 T/C 1 94 90 184 44.8822098171607 47.0276714516547 -2.14546163449399 T:C T C 10 0.522529682796163 0.768217207283935 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000486357:exon_39476938_39477199:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39475667_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39476640_39477232:APOBEC3G HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 14 7 21 6.68458444085372 3.65770777957314 3.02687666128058 T:G G T 10 0.522529682796163 0.198668287049760 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 26 13 39 12.4142282472998 6.79288587635012 5.62134237094964 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0787205662135874 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 C:G G C 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 39497452 A/G 0 10 0 10 4.77470317203837 0 4.77470317203837 A A 10 0.522529682796163 0.00213326764069245 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 39497454 G/C 0 10 0 10 4.77470317203837 0 4.77470317203837 G G 10 0.522529682796163 0.00213326764069245 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 21 12 33 10.0268766612806 6.27035619355396 3.75652046772662 C:G G C 10 0.522529682796163 0.223833280245822 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 39713612 C/T 1 2954 2795 5749 1410.44731702013 1460.47046341528 -50.0231463951409 A:T:C C T 10 0.522529682796163 0.186791470969697 ENSG00000100316:ENST00000401609:exon_39713466_39713634:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000216146:exon_39713466_39713634:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000465618:exon_39713466_39713634:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000495832:exon_39713466_39713634:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000437815:exon_39713464_39713634:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000402527:exon_39713466_39713634:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000453303:exon_39713466_39713634:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000427905:exon_39713466_39713634:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000420536:exon_39713466_39713634:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000484615:exon_39713056_39713634:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000460589:exon_39713401_39713634:RPL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 39883514 C/T 1 12 7 19 5.72964380644604 3.65770777957314 2.0719360268729 T:C C T 10 0.522529682796163 0.368592887865543 ENSG00000128268:ENST00000341184:exon_39883352_39888199:MGAT3;ENSG00000128268:ENST00000429786:exon_39883352_39888199:MGAT3;ENSG00000128268:ENST00000429402:exon_39883352_39883835:MGAT3;ENSG00000128268:ENST00000418314:exon_39883352_39883593:MGAT3;ENSG00000128268:ENST00000439236:exon_39883352_39885213:MGAT3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 40814636 C/T 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 T:C C T 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 41195082 G/A 1 16 17 33 7.63952507526139 8.88300460753477 -1.24347953227338 A:G G A 10 0.522529682796163 0.728916278367981 ENSG00000100372:ENST00000263255:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000491545:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000435456:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000420970:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000458600:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000443810:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000412879:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000426396:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000434193:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000449676:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000434185:exon_41195027_41195087:SLC25A17 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 41527552 G/A 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:G G A 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000100393:ENST00000263253:exon_41527392_41527637:EP300 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 41548008 A/G 1 13 15 28 6.20711412364988 7.83794524194244 -1.63083111829256 A:G A G 10 0.522529682796163 0.574460764427649 ENSG00000100393:ENST00000263253:exon_41547837_41548016:EP300 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 41613188 C/T 1 4 11 15 1.90988126881535 5.74782651075779 -3.83794524194244 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0677953951072992 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41613127_41615540:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000449635:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41613127_41613206:L3MBTL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 9 10 19 4.29723285483453 5.22529682796163 -0.928063973127097 C:G C G 10 0.522529682796163 0.819201169042762 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 41726053 G/A 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000100403:ENST00000352645:exon_41726027_41726107:ZC3H7B;ENSG00000100403:ENST00000351589:exon_41726027_41726107:ZC3H7B;ENSG00000100403:ENST00000486331:exon_41726027_41726107:ZC3H7B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 41752747 G/A 1 23 17 40 10.9818172956883 8.88300460753477 2.09881268815348 A:G G A 10 0.522529682796163 0.530820589301863 ENSG00000100403:ENST00000352645:exon_41752649_41752812:ZC3H7B;ENSG00000100403:ENST00000351589:exon_41752649_41752812:ZC3H7B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 41833116 C/T 1 20 17 37 9.54940634407674 8.88300460753477 0.666401736541969 T:C C T 10 0.522529682796163 0.870447919793445 ENSG00000183864:ENST00000327492:exon_41829496_41833411:TOB2;ENSG00000183864:ENST00000434408:exon_41833046_41833411:TOB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 41903813 A/C 1 63 44 107 30.0806299838417 22.9913060430312 7.08932394081056 A:C A C 10 0.522529682796163 0.176621812837603 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000471094:exon_41903795_41904053:ACO2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 41911525 C/T 1 34 56 90 16.2339907849305 29.2616622365851 -13.0276714516547 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00798004168554947 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000478010:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000481310:exon_41911517_41911539:ACO2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 42073134 C/T 1 4 52 56 1.90988126881535 27.1715435054005 -25.2616622365851 T:C C T 10 0.522529682796163 8.1217366899324e-13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 42221846 C/T 1 1 8 9 0.477470317203837 4.1802374623693 -3.70276714516547 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0168973315722376 ENSG00000100147:ENST00000402061:exon_42221702_42221897:CCDC134;ENSG00000100147:ENST00000255784:exon_42221702_42222303:CCDC134 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 42293140 G/C 1 59 59 118 28.1707487150264 30.8292512849736 -2.65850256994723 C:G G C 10 0.522529682796163 0.645732164013105 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000463741:exon_42293072_42293165:SREBF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 42300948 C/A 1 43 71 114 20.531223639765 37.0996074785276 -16.5683838387626 A:C C A 10 0.522529682796163 0.00192920424831758 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000435061:exon_42300867_42300977:SREBF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 42341934 A/G 1 12 15 27 5.72964380644604 7.83794524194244 -2.1083014354964 A:G A G 10 0.522529682796163 0.446223384334079 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42341917_42342009:CENPM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 14 18 32 6.68458444085372 9.40553429033093 -2.72094984947721 T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.378616157656249 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 111 149 260 52.9992052096259 77.8569227366283 -24.8577175270024 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00229411140329717 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 33 51 84 15.7565204677266 26.6490138226043 -10.8924933548777 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0212971282435025 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 37 45 82 17.666401736542 23.5138357258273 -5.84743398928536 C:G G C 10 0.522529682796163 0.223992619857650 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 43089849 T/C 1 18 18 36 8.59446570966907 9.40553429033093 -0.811068580661868 T:C T C 10 0.522529682796163 0.868001561467127 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 10 14 24 4.77470317203837 7.31541555914628 -2.54071238710791 C:G G C 10 0.522529682796163 0.314811911172675 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 44368122 A/G 1 15 8 23 7.16205475805756 4.1802374623693 2.98181729568825 A:G A G 10 0.522529682796163 0.296627250051809 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 18 21 39 8.59446570966907 10.9731233387194 -2.37865762905036 T:C C T 10 0.522529682796163 0.522183815680855 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 44386281 C/T 1 48 68 116 22.9185752257842 35.5320184301391 -12.6134432043549 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0201059990667121 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000494795:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000465768:exon_44386208_44386286:SAMM50 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 44489868 T/C 1 67 71 138 31.9905112526571 37.0996074785276 -5.10909622587049 T:C T C 10 0.522529682796163 0.395181213110713 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 44489896 T/C 1 88 73 161 42.0173879139377 38.1446668441199 3.87272106981776 T:C T C 10 0.522529682796163 0.581023625334867 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 44586522 C/T 1 7 21 28 3.34229222042686 10.9731233387194 -7.63083111829256 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00415673547842017 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44586431_44586546:PARVG HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 44594584 C/G 1 19 35 54 9.0719360268729 18.2885388978657 -9.2166028709928 C:G C G 10 0.522529682796163 0.0137850933893556 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000472551:exon_44594501_44594602:PARVG HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 47 57 104 22.4411049085803 29.7841919193813 -7.34308701080095 A:C A C 10 0.522529682796163 0.169253207875308 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 9 24 33 4.29723285483453 12.5407123871079 -8.24347953227338 T:C T C 10 0.522529682796163 0.00474365878971314 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 144 133 277 68.7557256773525 69.4964478118897 -0.740722134537151 T:C:G T C 10 0.522529682796163 0.952073619659764 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 36 51 87 17.1889314193381 26.6490138226043 -9.46008240326618 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0527686824797075 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 22 15 37 10.5043469784844 7.83794524194244 2.66640173654197 T:C T C 10 0.522529682796163 0.414068873145021 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50682865 G/A 1 11 8 19 5.25217348924221 4.1802374623693 1.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.653993185631586 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50682148_50682993:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50682148_50683421:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50682148_50683400:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50682148_50683400:TUBGCP6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50684312 G/A 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:G G A 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50696678 G/A 1 10 13 23 4.77470317203837 6.79288587635012 -2.01818270431175 A:G G A 10 0.522529682796163 0.413003311192827 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000492218:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50696672_50696730:MAPK12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50699668 A/G 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 A:G A G 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50699596_50699737:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50699596_50700137:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50699596_50699725:MAPK12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50704661 T/C 1 6 12 18 2.86482190322302 6.27035619355396 -3.40553429033093 T:C T C 10 0.522529682796163 0.155342186917693 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 0 0 79 79 0 41.2798449408969 -41.2798449408969 G A G 10 0.522529682796163 4.3327523571008e-26 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50721844 C/T 1 39 26 65 18.6213423709496 13.5857717527002 5.03557061824941 T:C C T 10 0.522529682796163 0.217260241307386 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50721766_50721874:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50721766_50721874:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50721766_50721874:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50721766_50721874:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50721767_50721874:PLXNB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50722134 T/C 1 24 20 44 11.4592876128921 10.4505936559233 1.00869395696883 T:C T C 10 0.522529682796163 0.880274360748163 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50728062 T/C 1 5 11 16 2.38735158601918 5.74782651075779 -3.36047492473861 T:C T C 10 0.522529682796163 0.131585770979384 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000414275:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000432455:exon_50727946_50729026:PLXNB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 47 40 87 22.4411049085803 20.9011873118465 1.53991759673382 A:T:C C T 10 0.522529682796163 0.74898521056265 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50879447 T/G 0 28 0 28 13.3691688817074 0 13.3691688817074 T T 10 0.522529682796163 1.38214353811165e-08 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50879251_50879503:PPP6R2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50893287 T/C 1 48 42 90 22.9185752257842 21.9462466774388 0.972328548345335 T:C T C 10 0.522529682796163 0.916047965169173 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50893243_50893373:SBF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 12 19 31 5.72964380644604 9.9280639731271 -4.19842016668105 A:G G A 10 0.522529682796163 0.151481718613018 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 74 68 142 35.3328034730839 35.5320184301391 -0.19921495705514 T:G T G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 47 43 90 22.4411049085803 22.468776360235 -0.027671451654669 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50964236 G/A 1 102 55 157 48.7019723547914 28.739132553789 19.9628398010024 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.00136507611149351 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 50964862 G/A 1 64 95 159 30.5581003010456 49.6403198656355 -19.0822195645899 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00251598260244182 ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50964675_50964868:SCO2;ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964430_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964675_50964905:TYMP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 22 51015838 T/C 1 14 3 17 6.68458444085372 1.56758904838849 5.11699539246523 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0142139655520718 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000460853:exon_51015785_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000461117:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000417176:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51015753_51015892:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51015753_51015892:CTA-384D8.32 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 3189279 A/G 1 22 20 42 10.5043469784844 10.4505936559233 0.0537533225611551 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3189134_3189387:TRNT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 3197918 A/G 1 3 10 13 1.43241095161151 5.22529682796163 -3.79288587635012 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0492990438494871 ENSG00000113851:ENST00000491834:exon_3195108_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000231948:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000432408:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000424814:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000488263:exon_3195108_3198468:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000482844:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000480249:exon_3197774_3197965:CRBN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 4842231 C/T 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000467545:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000490572:exon_4842109_4842284:ITPR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 5021403 C/T 1 200 168 368 95.4940634407674 87.7849867097554 7.70907673101203 T:C C T 10 0.522529682796163 0.434067563198789 ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5020801_5021483:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000457655:exon_5021097_5021483:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5021122_5021483:BHLHE40 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 5024771 T/C 1 227 196 423 108.385762005271 102.415817828048 5.96994417722307 A:T:C T C 10 0.522529682796163 0.592441787143472 ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5024521_5027008:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5024521_5024953:BHLHE40 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 8590313 T/C 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C T C 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000071282:ENST00000157600:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000415597:exon_8590254_8590549:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000397386:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000454244:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000456506:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000426878:exon_8590254_8590589:LMCD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 C:G C G 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 9867625 C/T 1 16 16 32 7.63952507526139 8.36047492473861 -0.720949849477215 T:C C T 10 0.522529682796163 0.86046417845866 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9867484_9867632:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000482269:exon_9867090_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000492440:exon_9867250_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9867545_9867632:TTLL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 9870857 G/A 1 16 17 33 7.63952507526139 8.88300460753477 -1.24347953227338 A:G G A 10 0.522529682796163 0.728916278367981 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 9871030 T/G 1 20 17 37 9.54940634407674 8.88300460753477 0.666401736541969 T:G T G 10 0.522529682796163 0.870447919793445 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 9883709 C/T 1 17 19 36 8.11699539246523 9.9280639731271 -1.81106858066187 T:C C T 10 0.522529682796163 0.61789790541559 ENSG00000156990:ENST00000433535:exon_9883667_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000383820:exon_9883667_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000287624:exon_9883667_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000424438:exon_9883667_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000427174:exon_9883667_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000475470:exon_9883667_9885255:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000484134:exon_9881585_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000418713:exon_9883667_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000472381:exon_9883667_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433972:exon_9882941_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433555:exon_9883092_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000451405:exon_9883382_9883927:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000485705:exon_9883420_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000473522:exon_9883538_9883766:RPUSD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 55 54 109 26.260867446211 28.2166028709928 -1.95573542478176 T:C T C 10 0.522529682796163 0.773779544966685 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 10302045 C/T 1 20 18 38 9.54940634407674 9.40553429033093 0.143872053745806 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 10302056 A/G 1 23 18 41 10.9818172956883 9.40553429033093 1.57628300535732 A:G A G 10 0.522529682796163 0.642801477166661 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 10311939 C/T 1 19 11 30 9.0719360268729 5.74782651075779 3.32410951611511 T:C C T 10 0.522529682796163 0.273757088952871 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 10312507 A/G 1 30 34 64 14.3241095161151 17.7660092150695 -3.44189969895443 A:G A G 10 0.522529682796163 0.453082456686993 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 10320592 T/C 1 45 38 83 21.4861642741727 19.8561279462542 1.63003632791847 T:C T C 10 0.522529682796163 0.742820740285474 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10320569_10320718:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10320569_10320747:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10320569_10320718:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10320569_10320718:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000426850:exon_10320569_10320849:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000496355:exon_10320569_10320718:TATDN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 11596302 T/C 1 10 17 27 4.77470317203837 8.88300460753477 -4.1083014354964 T:C T C 10 0.522529682796163 0.125888769648125 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 11871215 T/C 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 T:C T C 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11871188_11871338:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11871188_11871338:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11871188_11871338:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11871188_11871338:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000460246:exon_11871188_11871384:C3orf31 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 11880760 T/C 1 14 2 16 6.68458444085372 1.04505936559233 5.63952507526139 T:C T C 10 0.522529682796163 0.00476099610344447 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11880696_11880788:C3orf31 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 12613866 T/C 1 39 47 86 18.6213423709496 24.5588950914197 -5.93755272047002 T:C T C 10 0.522529682796163 0.234925848642972 ENSG00000075975:ENST00000170447:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000411987:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000448482:exon_12613568_12613872:MKRN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 33 14 47 15.7565204677266 7.31541555914628 8.44110490858034 T:C C T 10 0.522529682796163 0.01850657879128 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 33 41 74 15.7565204677266 21.4237169946427 -5.66719652691606 T:C C T 10 0.522529682796163 0.201482045539010 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 29 31 60 13.8466391989113 16.1984201666811 -2.35178096776978 T:G G T 10 0.522529682796163 0.605779141393833 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 32 27 59 15.2790501505228 14.1083014354964 1.17074871502638 T:C C T 10 0.522529682796163 0.79546904839066 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 45 34 79 21.4861642741727 17.7660092150695 3.72015505910312 A:G G A 10 0.522529682796163 0.431705348531319 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 13379400 C/T 1 26 21 47 12.4142282472998 10.9731233387194 1.44110490858034 T:C C T 10 0.522529682796163 0.770698949855164 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13379337_13379417:NUP210 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 13395475 G/C 1 16 12 28 7.63952507526139 6.27035619355396 1.36916888170744 C:G G C 10 0.522529682796163 0.706382469889948 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 13421150 C/T 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13421063_13421221:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13421063_13421221:NUP210 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 15116437 C/T 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15111580_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15115112_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000418832:exon_15116402_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000435849:exon_15116058_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000426541:exon_15116412_15116437:ZFYVE20 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 165 137 302 78.7826023386331 71.5865665430743 7.19603579555879 A:C A C 10 0.522529682796163 0.420358771489195 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 19992432 G/T 1 18 16 34 8.59446570966907 8.36047492473861 0.233990784930459 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000144566:ENST00000273047:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000443878:exon_19992298_19992436:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000412966:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000446547:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000422242:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000476544:exon_19992298_19992717:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000455772:exon_19992298_19992553:RAB5A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 23930669 T/C 1 80 104 184 38.197625376307 54.343087010801 -16.145461634494 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0181376175000389 ENSG00000170142:ENST00000306627:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000346855:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000442670:exon_23930603_23930707:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000424381:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000467766:exon_23930603_23930917:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000475680:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000452012:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000493707:exon_23930603_23930750:UBE2E1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 23932105 T/A 1 111 126 237 52.9992052096259 65.8387400323165 -12.8395348226906 A:T T A 10 0.522529682796163 0.103911547636410 ENSG00000170142:ENST00000306627:exon_23932000_23932807:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000346855:exon_23932000_23932807:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000424381:exon_23932000_23932805:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000475680:exon_23932000_23932580:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000452012:exon_23932000_23932807:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000493707:exon_23932000_23932363:UBE2E1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 27442336 G/A 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 A:G G A 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000033867:ENST00000419036:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000295736:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000428386:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000425128:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000349751:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000435667:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000388777:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000454389:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000440156:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000457377:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000438530:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437179:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000446700:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000455077:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000445684:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437266:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000428179:exon_27442255_27442360:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000475120:exon_27442255_27442535:SLC4A7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 33138549 G/A 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33138503_33138722:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000482097:exon_33138503_33138610:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000485698:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000498537:exon_33138503_33138634:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000415454:exon_33138503_33138613:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000438227:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000440656:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000436768:exon_33138503_33138694:GLB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 33434831 G/A 1 26 12 38 12.4142282472998 6.27035619355396 6.14387205374581 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0514126676287688 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000492136:exon_33429830_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000466441:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000486388:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000464787:exon_33434804_33434946:UBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 33458266 T/C 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000481761:exon_33458250_33458312:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000418410:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000456378:exon_33458250_33458326:UBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 36897630 C/A 1 9 3 12 4.29723285483453 1.56758904838849 2.72964380644604 A:C C A 10 0.522529682796163 0.150898424576211 ENSG00000168016:ENST00000428977:exon_36896664_36899540:TRANK1;ENSG00000168016:ENST00000429976:exon_36896664_36899540:TRANK1;ENSG00000168016:ENST00000301807:exon_36896664_36899540:TRANK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 39111140 C/A 1 8 2 10 3.8197625376307 1.04505936559233 2.77470317203837 A:C C A 10 0.522529682796163 0.11294395461013 ENSG00000114742:ENST00000302313:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000413099:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000396258:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000418020:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000433841:exon_39111134_39111181:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000420940:exon_39111134_39111235:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000441361:exon_39111134_39111235:WDR48 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 39180099 T/C 1 5 10 15 2.38735158601918 5.22529682796163 -2.83794524194245 T:C T C 10 0.522529682796163 0.196087541104941 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 39180263 G/A 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 A:G G A 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180202_39180394:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180202_39180391:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180202_39180350:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180202_39180370:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180202_39180390:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180202_39180393:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 26 20 46 12.4142282472998 10.4505936559233 1.9636345913765 T:C C T 10 0.522529682796163 0.658453984663438 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 33 35 68 15.7565204677266 18.2885388978657 -2.53201843013908 A:G G A 10 0.522529682796163 0.546557588773731 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 39185248 A/G 1 33 38 71 15.7565204677266 19.8561279462542 -4.09960747852757 A:G A G 10 0.522529682796163 0.34397884476212 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 39186728 C/T 1 28 18 46 13.3691688817074 9.40553429033093 3.9636345913765 T:C C T 10 0.522529682796163 0.301549062710222 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39186488_39186747:CSRNP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 39450065 C/T 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000168028:ENST00000490490:exon_39449695_39450215:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39450028_39450215:RPSA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 39453160 G/A 1 118 129 247 56.3414974300528 67.406329080705 -11.0648316506523 A:T:G G A 10 0.522529682796163 0.161623111626670 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 T:C C T 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 23 23 46 10.9818172956883 12.0181827043117 -1.0363654086235 A:G A G 10 0.522529682796163 0.770114531218573 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 42610515 G/A 1 14 22 36 6.68458444085372 11.4956530215156 -4.81106858066187 A:G G A 10 0.522529682796163 0.132820322993118 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 76 43 119 36.2877441074916 22.468776360235 13.8189677472566 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0129314107785694 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 47043238 C/T 1 31 22 53 14.8015798333189 11.4956530215156 3.30592681180336 T:C C T 10 0.522529682796163 0.410407891429777 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47043179_47043316:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000475689:exon_47043179_47043316:NBEAL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 94 76 170 44.8822098171607 39.7122558925084 5.16995392465229 C:G C G 10 0.522529682796163 0.443380854300411 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 47045846 C/T 1 36 42 78 17.1889314193381 21.9462466774388 -4.75731525810071 T:C C T 10 0.522529682796163 0.308313901586867 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 47049193 A/G 1 7 12 19 3.34229222042686 6.27035619355396 -2.9280639731271 A:G A G 10 0.522529682796163 0.250483788158122 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 35 27 62 16.7114611021343 14.1083014354964 2.6031596666379 A:G G A 10 0.522529682796163 0.527647027718943 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 47162886 C/T 1 17 14 31 8.11699539246523 7.31541555914628 0.801579833318948 T:C C T 10 0.522529682796163 0.858135513379526 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 47448825 G/A 1 12 17 29 5.72964380644604 8.88300460753477 -3.15336080108873 A:G G A 10 0.522529682796163 0.268071850620001 ENSG00000076201:ENST00000456408:exon_47448799_47448857:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47448799_47448857:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47448799_47448857:PTPN23 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 13 11 24 6.20711412364988 5.74782651075779 0.459287612892089 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 47459679 C/T 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47459624_47459739:SCAP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 18 18 36 8.59446570966907 9.40553429033093 -0.811068580661868 A:T:C T C 10 0.522529682796163 0.868001561467127 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 70 67 137 33.4229222042686 35.0094887473429 -1.58656654307433 T:C C T 10 0.522529682796163 0.798066146335006 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 85 78 163 40.5849769623261 40.7573152581007 -0.172338295774566 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 48669447 C/T 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 T:C C T 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000225697:ENST00000420764:exon_48669313_48669477:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000489483:exon_48668426_48670517:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000395550:exon_48669313_48669477:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000383733:exon_48669313_48669477:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000307364:exon_48669313_48669477:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000480524:exon_48669313_48669477:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000455886:exon_48669313_48669525:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000358747:exon_48669313_48669477:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000421649:exon_48669313_48669477:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000444531:exon_48669313_48669477:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000414944:exon_48669313_48669477:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000482282:exon_48669313_48669477:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000431213:exon_48669313_48669477:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000431739:exon_48669371_48669477:SLC26A6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 48727112 G/A 1 31 14 45 14.8015798333189 7.31541555914628 7.48616427417267 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0257326741635560 ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000479914:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000491686:exon_48727043_48727146:IP6K2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 49051059 G/A 1 44 57 101 21.0086939569688 29.7841919193813 -8.77549796241246 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0902215441911008 ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49049068_49051549:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000420783:exon_49049068_49051726:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49049068_49051549:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000415265:exon_49050724_49051549:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000452875:exon_49048854_49051549:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000471162:exon_49049068_49051726:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000448293:exon_49049068_49051549:WDR6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 49135733 T/C 1 14 11 25 6.68458444085372 5.74782651075779 0.936757930095927 T:C T C 10 0.522529682796163 0.841937992643628 ENSG00000172053:ENST00000482248:exon_49135625_49135913:QARS;ENSG00000172053:ENST00000459870:exon_49135425_49135913:QARS;ENSG00000172053:ENST00000470113:exon_49135425_49135913:QARS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 17 24 41 8.11699539246523 12.5407123871079 -4.42371699464268 A:G A G 10 0.522529682796163 0.210642056040574 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 49847623 A/G 1 10 3 13 4.77470317203837 1.56758904838849 3.20711412364988 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0965395810160095 ENSG00000182179:ENST00000473992:exon_49847411_49847783:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000489826:exon_49847412_49847861:UBA7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 50326020 G/A 1 62 36 98 29.6031596666379 18.8110685806619 10.792091085976 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0333185016184612 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000426499:exon_50326014_50326070:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000486322:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000492387:exon_50325943_50326142:IFRD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 50327429 A/G 1 11 15 26 5.25217348924221 7.83794524194244 -2.58577175270024 A:G A G 10 0.522529682796163 0.332278501659484 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50327360_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000483071:exon_50327143_50327501:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000489569:exon_50327360_50327517:IFRD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 50334231 T/A 1 4 13 17 1.90988126881535 6.79288587635012 -4.88300460753477 A:T T A 10 0.522529682796163 0.0261078505748337 ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 50336661 T/C 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 T:C T C 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000186792:ENST00000336307:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000415204:exon_50336644_50336832:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000513170:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000450982:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000066014:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50336644_50336847:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50336644_50336852:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50336644_50336831:NAT6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 50355730 T/G 1 8 14 22 3.8197625376307 7.31541555914628 -3.49565302151558 T:G T G 10 0.522529682796163 0.142300185361340 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50355221_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50355227_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50355240_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50355243_50355970:HYAL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 50378176 T/G 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:G T G 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000068028:ENST00000362008:exon_50377987_50378367:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000357043:exon_50377987_50378272:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395117:exon_50377987_50378272:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000359365:exon_50377987_50378343:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000482447:exon_50377987_50378343:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395129:exon_50377987_50378272:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000478619:exon_50377987_50378411:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000488024:exon_50377987_50378261:RASSF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 T:G T G 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 51430657 A/C 1 72 59 131 34.3778628386763 30.8292512849736 3.54861155370265 A:C:G A C 10 0.522529682796163 0.541925628833403 ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 51737965 G/A 1 14 22 36 6.68458444085372 11.4956530215156 -4.81106858066187 A:G G A 10 0.522529682796163 0.132820322993118 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 52282664 G/A 1 8 16 24 3.8197625376307 8.36047492473861 -4.54071238710791 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0685617456623926 ENSG00000164088:ENST00000457454:exon_52282653_52282716:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000296487:exon_52282653_52282716:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000409502:exon_52282653_52282716:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000323588:exon_52282653_52282716:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000489606:exon_52282653_52282716:PPM1M;ENSG00000164088:ENST00000482724:exon_52282442_52282716:PPM1M HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 52526535 G/A 1 16 21 37 7.63952507526139 10.9731233387194 -3.33359826345803 A:G G A 10 0.522529682796163 0.324096827995904 ENSG00000010322:ENST00000479054:exon_52525888_52527084:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000433196:exon_52525888_52527087:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000345716:exon_52525888_52527087:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000489895:exon_52525888_52527084:NISCH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 52729960 C/T 1 27 24 51 12.8916985645036 12.5407123871079 0.350986177395688 T:C:G C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000016864:ENST00000478968:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000394783:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000266014:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000407584:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000491606:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000481643:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000394786:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000484163:exon_52729206_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000463827:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000344678:exon_52729944_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000480080:exon_52729256_52730056:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000344383:exon_52729809_52730056:GLT8D1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 9 4 13 4.29723285483453 2.09011873118465 2.20711412364988 T:C C T 10 0.522529682796163 0.273205822586663 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 53856653 C/T 1 3 7 10 1.43241095161151 3.65770777957314 -2.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 0.209802689107094 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53856518_53856669:CHDH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 53857676 C/T 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53857333_53858094:CHDH;ENSG00000016391:ENST00000481668:exon_53857571_53858094:CHDH;ENSG00000016391:ENST00000467802:exon_53857658_53858094:CHDH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 53905308 T/C 1 25 19 44 11.9367579300959 9.9280639731271 2.00869395696883 T:C T C 10 0.522529682796163 0.651254012401917 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 53906513 G/A 1 19 7 26 9.0719360268729 3.65770777957314 5.41422824729976 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0475959636105501 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53906411_53906551:ACTR8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 56628055 A/G 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 A:G A G 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484623:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000468108:exon_56627972_56628056:CCDC66 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 56658871 T/C 1 35 24 59 16.7114611021343 12.5407123871079 4.17074871502639 T:C T C 10 0.522529682796163 0.299029641219247 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 58191266 C/T 1 6 8 14 2.86482190322302 4.1802374623693 -1.31541555914628 T:C C T 10 0.522529682796163 0.595734183488216 ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58191217_58191287:DNASE1L3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 58196639 C/T 1 24 7 31 11.4592876128921 3.65770777957314 7.80157983331895 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00611869882152677 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58196493_58196696:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58196493_58196950:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000463694:exon_58196493_58196647:DNASE1L3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 58410554 C/T 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 T:C C T 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58410479_58411748:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58410479_58411746:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58410479_58411601:PXK;ENSG00000168297:ENST00000493474:exon_58410479_58410902:PXK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 58414382 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 58416535 C/T 1 41 37 78 19.5762830053573 19.333598263458 0.242684741899289 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000168291:ENST00000302746:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000383714:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000469364:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000479945:exon_58416384_58417520:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000474765:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000461692:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000480626:exon_58416384_58416669:PDHB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 59908126 A/G 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:G A G 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000189283:ENST00000492590:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000476844:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000466788:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000468189:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000341848:exon_59908072_59908140:FHIT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 63982082 G/A 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 67426281 T/C 1 8 39 47 3.8197625376307 20.3786576290504 -16.5588950914197 T:C T C 10 0.522529682796163 1.05520728983864e-06 ENSG00000172340:ENST00000307227:exon_67425143_67426283:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000460567:exon_67425143_67426283:SUCLG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 69096614 G/A 1 14 7 21 6.68458444085372 3.65770777957314 3.02687666128058 A:G G A 10 0.522529682796163 0.198668287049760 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 69151152 C/A 1 42 41 83 20.0537533225612 21.4237169946427 -1.36996367208152 A:C C A 10 0.522529682796163 0.82627713482199 ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000435015:exon_69151060_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69151110_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000470936:exon_69150990_69151381:ARL6IP5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 28 23 51 13.3691688817074 12.0181827043117 1.35098617739569 T:C T C 10 0.522529682796163 0.779791130122117 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 87295049 T/C 1 20 30 50 9.54940634407674 15.6758904838849 -6.12648413980815 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0901401534084989 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87294864_87295058:CHMP2B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 98250862 C/A 1 141 126 267 67.323314725741 65.8387400323165 1.48457469342449 A:C C A 10 0.522529682796163 0.902516049185483 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 41 37 78 19.5762830053573 19.333598263458 0.242684741899289 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 100463651 T/G 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 T:G T G 10 0.522529682796163 0.393562228098845 ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100461320_100463775:TFG HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 52 50 102 24.8284564945995 26.1264841398081 -1.29802764520862 T:C T C 10 0.522529682796163 0.843084483417932 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 105260520 C/T 1 17 8 25 8.11699539246523 4.1802374623693 3.93675793009593 T:C C T 10 0.522529682796163 0.159934997919704 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000481337:exon_105260477_105260609:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105260477_105260609:ALCAM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 105266331 A/G 1 24 16 40 11.4592876128921 8.36047492473861 3.09881268815348 A:G A G 10 0.522529682796163 0.346589196230518 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000389927:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000465413:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000491388:exon_105266234_105266371:ALCAM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G A G 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 108396420 C/T 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 T:C C T 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000198919:ENST00000361582:exon_108396344_108396445:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000495008:exon_108396344_108396445:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000463306:exon_108396344_108396445:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000437062:exon_108396344_108396445:DZIP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 112066562 G/A 1 9 8 17 4.29723285483453 4.1802374623693 0.116995392465229 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112066410_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112066410_112066677:CD200 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 113286405 C/T 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C C T 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000491730:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000483946:exon_113286387_113286763:SIDT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 118948716 G/A 1 13 14 27 6.20711412364988 7.31541555914628 -1.1083014354964 A:G G A 10 0.522529682796163 0.703625443243212 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 119133183 G/A 1 25 19 44 11.9367579300959 9.9280639731271 2.00869395696883 A:G G A 10 0.522529682796163 0.651254012401917 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 119133554 G/A 1 29 18 47 13.8466391989113 9.40553429033093 4.44110490858034 A:G G A 10 0.522529682796163 0.242573366356421 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 120500093 C/T 1 11 7 18 5.25217348924221 3.65770777957314 1.59446570966907 T:C C T 10 0.522529682796163 0.48876143429335 ENSG00000153767:ENST00000283875:exon_120499890_120501916:GTF2E1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 26 29 55 12.4142282472998 15.1533608010887 -2.73913255378896 T:C C T 10 0.522529682796163 0.501016687866983 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 121526204 G/A 1 15 12 27 7.16205475805756 6.27035619355396 0.8916985645036 A:G G A 10 0.522529682796163 0.847892523515759 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000460108:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000498104:exon_121526191_121526290:IQCB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 121563355 T/C 1 24 13 37 11.4592876128921 6.79288587635012 4.66640173654197 T:C T C 10 0.522529682796163 0.140008889435527 ENSG00000145088:ENST00000490434:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000273668:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000451944:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000490477:exon_121563300_121563394:EAF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 121838319 G/A 1 40 32 72 19.0988126881535 16.7209498494772 2.37786283867626 A:G G A 10 0.522529682796163 0.637508004638074 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121838285_121838921:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121838285_121839175:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121838285_121839982:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121838285_121838667:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121838285_121838440:CD86 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 37 31 68 17.666401736542 16.1984201666811 1.46798156986092 T:C T C 10 0.522529682796163 0.808410188650404 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 24 48 72 11.4592876128921 25.0814247742158 -13.6221371613237 C:G G C 10 0.522529682796163 0.00135887539009051 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 122869147 G/C 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 C:G G C 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122869081_122869211:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122869081_122869211:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122869081_122869211:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122869081_122869211:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122869081_122869212:PDIA5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 123665902 T/G 1 20 13 33 9.54940634407674 6.79288587635012 2.75652046772662 T:G T G 10 0.522529682796163 0.385877521411919 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000426152:exon_123665651_123665904:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000435910:exon_123665860_123666166:CCDC14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 124456742 G/C 1 30 32 62 14.3241095161151 16.7209498494772 -2.3968403333621 C:G G C 10 0.522529682796163 0.611530737663248 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 124462808 C/T 1 43 37 80 20.531223639765 19.333598263458 1.19762537630696 T:C C T 10 0.522529682796163 0.823515714333237 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 124515308 A/G 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 A:G A G 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 124515314 G/A 1 8 2 10 3.8197625376307 1.04505936559233 2.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.11294395461013 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 124515395 G/A 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 A:G G A 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000474838:exon_124515387_124515664:ITGB5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 124627024 T/G 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:G T G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124626994_124627195:MUC13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 124646594 A/G 1 3 8 11 1.43241095161151 4.1802374623693 -2.74782651075779 A:G A G 10 0.522529682796163 0.131967912623333 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124646379_124646837:MUC13;ENSG00000173702:ENST00000490147:exon_124646379_124646618:MUC13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 124692689 C/T 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124692575_124692749:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000487661:exon_124692575_124692749:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000482699:exon_124692575_124692751:HEG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 125786852 C/T 1 11 15 26 5.25217348924221 7.83794524194244 -2.58577175270024 T:C C T 10 0.522529682796163 0.332278501659484 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125786790_125786858:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514677:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513723:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514023:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513464:exon_125786790_125787023:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512470:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000510651:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514333:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000504035:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000507280:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509064:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000505996:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509452:exon_125786806_125787089:SLC41A3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 127292333 G/A 1 32 27 59 15.2790501505228 14.1083014354964 1.17074871502638 A:G G A 10 0.522529682796163 0.79546904839066 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 128603562 C/T 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 T:C C T 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128603500_128603589:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128603496_128603589:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128603518_128603589:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128603496_128603589:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000515429:exon_128603496_128603589:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128603496_128603589:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128603496_128603589:ACAD9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 128614185 A/C 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 A:C A C 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 130449222 A/G 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 A:G A G 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000196455:ENST00000356763:exon_130449152_130449286:PIK3R4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 131102053 A/G 1 24 10 34 11.4592876128921 5.22529682796163 6.23399078493046 A:G A G 10 0.522529682796163 0.038564824784341 ENSG00000198585:ENST00000521288:exon_131102006_131107674:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000502852:exon_131100890_131102283:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000359850:exon_131102006_131107674:NUDT16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 132338346 T/G 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:G T G 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000507705:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000487024:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000481970:exon_132338312_132338389:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132338312_132338389:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132338312_132338389:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132338312_132338389:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132338312_132338389:NPHP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 133342218 C/T 1 15 9 24 7.16205475805756 4.70276714516547 2.45928761289209 T:C C T 10 0.522529682796163 0.414495787724859 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133342155_133342301:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133342155_133342301:TOPBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 133524717 G/C 1 15 11 26 7.16205475805756 5.74782651075779 1.41422824729976 C:G G C 10 0.522529682796163 0.695674855368122 ENSG00000144867:ENST00000466490:exon_133524520_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000484684:exon_133524459_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000273406:exon_133524665_133524846:SRPRB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 134825438 A/G 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000154928:ENST00000398015:exon_134825290_134825445:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000482618:exon_134825290_134825445:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000360935:exon_134825290_134825445:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000425716:exon_134825290_134825445:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000488154:exon_134825290_134825445:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000493838:exon_134825290_134825445:EPHB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 18 15 33 8.59446570966907 7.83794524194244 0.756520467726622 A:T:C C T 10 0.522529682796163 0.862587560743927 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 71 0 71 33.9003925214724 0 33.9003925214724 T T 10 0.522529682796163 1.09423919729050e-20 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 47 45 92 22.4411049085803 23.5138357258273 -1.072730817247 C:G C G 10 0.522529682796163 0.835380606741501 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 160119711 A/G 1 31 27 58 14.8015798333189 14.1083014354964 0.693278397822548 A:G A G 10 0.522529682796163 0.895960500127353 ENSG00000113810:ENST00000497311:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000465903:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000485645:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000468653:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469858:exon_160119703_160119711:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000489573:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000490207:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000485867:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000392788:exon_160119703_160119881:SMC4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 160143943 A/G 1 25 39 64 11.9367579300959 20.3786576290504 -8.44189969895443 A:G A G 10 0.522529682796163 0.044454957786588 ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160143862_160143988:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160143862_160143988:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469762:exon_160143862_160143988:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160143862_160143988:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160143862_160143988:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462668:exon_160143862_160143988:SMC4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 169492101 C/T 1 6 9 15 2.86482190322302 4.70276714516547 -1.83794524194244 T:C C T 10 0.522529682796163 0.440567980680144 ENSG00000085274:ENST00000349841:exon_169492053_169492349:MYNN;ENSG00000085274:ENST00000356716:exon_169492053_169492349:MYNN;ENSG00000085274:ENST00000392733:exon_169492053_169492349:MYNN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 169710839 T/G 1 152 146 298 72.5754882149832 76.2893336882398 -3.71384547325657 T:G T G 10 0.522529682796163 0.685017411705547 ENSG00000008952:ENST00000337002:exon_169710382_169716161:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000480708:exon_169710382_169710889:SEC62 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 171969077 C/G 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 C:G C G 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000075420:ENST00000415807:exon_171969050_171969331:FNDC3B;ENSG00000075420:ENST00000469491:exon_171969050_171969331:FNDC3B;ENSG00000075420:ENST00000336824:exon_171969050_171969331:FNDC3B;ENSG00000075420:ENST00000416957:exon_171969050_171969331:FNDC3B;ENSG00000075420:ENST00000443501:exon_171969050_171969246:FNDC3B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 174951756 T/C 1 3 9 12 1.43241095161151 4.70276714516547 -3.27035619355396 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0813542896879837 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 187088926 G/A 1 7 15 22 3.34229222042686 7.83794524194244 -4.49565302151558 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0854182011035238 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 57 50 107 27.2158080806187 26.1264841398081 1.08932394081056 T:C C T 10 0.522529682796163 0.847175014804125 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 191093053 T/C 1 10 4 14 4.77470317203837 2.09011873118465 2.68458444085372 T:C T C 10 0.522529682796163 0.185755143276423 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 191093175 T/A 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 A:T T A 10 0.522529682796163 0.568106121039098 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 191093310 A/G 1 13 6 19 6.20711412364988 3.13517809677698 3.0719360268729 A:G A G 10 0.522529682796163 0.175241772830013 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 191100561 C/A 1 89 85 174 42.4948582311415 44.4150230376739 -1.92016480653236 A:C C A 10 0.522529682796163 0.819997189757258 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191100535_191100614:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191100535_191100614:CCDC50 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 194387300 C/T 1 12 14 26 5.72964380644604 7.31541555914628 -1.58577175270024 T:C C T 10 0.522529682796163 0.561386502703927 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 194790799 C/G 1 2 7 9 0.954940634407674 3.65770777957314 -2.70276714516547 C:G C G 10 0.522529682796163 0.0963891685915122 ENSG00000173950:ENST00000310380:exon_194789008_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000437101:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000355729:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000460582:exon_194790322_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000473200:exon_194790360_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000429994:exon_194790406_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000356740:exon_194790444_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000418940:exon_194790699_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000491138:exon_194790766_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000496644:exon_194790767_194790840:C3orf21 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 195778972 C/T 1 86 104 190 41.06244727953 54.343087010801 -13.280639731271 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0588517245149072 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195776155_195779055:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195776155_195779055:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195776347_195779055:TFRC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 82 108 190 39.1525660107146 56.4332057419856 -17.280639731271 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0133920800605968 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 196613075 C/T 1 11 14 25 5.25217348924221 7.31541555914628 -2.06324206990407 T:C C T 10 0.522529682796163 0.430248665069756 ENSG00000119231:ENST00000323460:exon_196612022_196613565:SENP5;ENSG00000119231:ENST00000445299:exon_196612022_196613565:SENP5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 196735687 C/T 1 12 6 18 5.72964380644604 3.13517809677698 2.59446570966907 T:C C T 10 0.522529682796163 0.246476394158893 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196735680_196735836:MFI2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 196742290 T/C 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196742236_196742387:MFI2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 196743130 T/C 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 T:C T C 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196743060_196743240:MFI2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 196743994 G/A 1 12 15 27 5.72964380644604 7.83794524194244 -2.1083014354964 A:G G A 10 0.522529682796163 0.446223384334079 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196743974_196744161:MFI2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 196746629 T/C 1 12 4 16 5.72964380644604 2.09011873118465 3.63952507526139 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0815537992618656 ENSG00000163975:ENST00000296351:exon_196745824_196746672:MFI2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 196865242 C/T 1 7 9 16 3.34229222042686 4.70276714516547 -1.36047492473861 T:C C T 10 0.522529682796163 0.618833530377833 ENSG00000075711:ENST00000346964:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000357674:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000381807:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000314062:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000359922:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419354:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000452595:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000422288:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000448528:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000443183:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392382:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000450955:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419227:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392381:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000471733:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000447466:exon_196865093_196865262:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000477312:exon_196865093_196865262:DLG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 197428713 G/A 1 13 14 27 6.20711412364988 7.31541555914628 -1.1083014354964 A:G G A 10 0.522529682796163 0.703625443243212 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197428579_197428735:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197428579_197428735:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197428579_197428735:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197428579_197428735:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197428579_197428735:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197428579_197428735:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197428579_197428735:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000467303:exon_197428607_197428735:KIAA0226 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 197495334 G/A 1 33 32 65 15.7565204677266 16.7209498494772 -0.964429381750593 A:G G A 10 0.522529682796163 0.901314250215728 ENSG00000122068:ENST00000428738:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000494309:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000415708:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000241502:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000392374:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000412924:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000418169:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000426031:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000424384:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000428395:exon_197495306_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000463136:exon_197495310_197495458:FYTTD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 197566254 T/C 1 8 11 19 3.8197625376307 5.74782651075779 -1.9280639731271 T:C T C 10 0.522529682796163 0.492106910577732 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000494069:exon_197566192_197566268:LRCH3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 3 197579466 C/T 1 9 3 12 4.29723285483453 1.56758904838849 2.72964380644604 T:C C T 10 0.522529682796163 0.150898424576211 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000481048:exon_197579199_197579491:LRCH3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:G A G 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 755129 C/T 1 10 20 30 4.77470317203837 10.4505936559233 -5.67589048388489 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0441490175766215 ENSG00000185619:ENST00000362003:exon_755067_755204:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000505655:exon_755067_755204:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000521023:exon_755067_755204:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000470161:exon_755067_755204:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000430644:exon_755067_755204:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000440452:exon_755067_755204:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000488032:exon_755067_755152:PCGF3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 941518 C/T 1 9 4 13 4.29723285483453 2.09011873118465 2.20711412364988 T:C C T 10 0.522529682796163 0.273205822586663 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000507319:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505734:exon_941497_942377:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504744:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513682:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504505:exon_941497_941942:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514546:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504850:exon_941497_942298:TMEM175 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 A:G A G 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 1330759 T/C 1 20 24 44 9.54940634407674 12.5407123871079 -2.99130604303117 T:C T C 10 0.522529682796163 0.370643188501956 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 1343405 T/C 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C T C 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000163945:ENST00000511216:exon_1343312_1343642:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000296312:exon_1343312_1343642:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000389851:exon_1343312_1343642:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000507531:exon_1343312_1343642:KIAA1530 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 1349029 G/A 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000163945:ENST00000511216:exon_1348905_1349033:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000296312:exon_1348905_1349033:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000389851:exon_1348905_1349033:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000507531:exon_1348905_1349033:KIAA1530 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 1389534 C/T 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000179979:ENST00000324803:exon_1388152_1389776:CRIPAK;ENSG00000179979:ENST00000382944:exon_1388967_1389640:CRIPAK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 1729953 G/A 0 115 0 115 54.9090864784413 0 54.9090864784413 G G 10 0.522529682796163 4.78266798601487e-33 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1729435_1729959:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 2233709 A/G 1 6 8 14 2.86482190322302 4.1802374623693 -1.31541555914628 A:G A G 10 0.522529682796163 0.595734183488216 ENSG00000130997:ENST00000506518:exon_2233672_2233870:POLN;ENSG00000214367:ENST00000243706:exon_2230076_2233887:HAUS3;ENSG00000214367:ENST00000443786:exon_2233568_2233887:HAUS3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 2252845 C/T 1 17 13 30 8.11699539246523 6.79288587635012 1.32410951611511 T:C C T 10 0.522529682796163 0.716107033674038 ENSG00000123933:ENST00000337190:exon_2252811_2252973:MXD4;ENSG00000123933:ENST00000513372:exon_2252811_2252973:MXD4;ENSG00000123933:ENST00000513380:exon_2252811_2252973:MXD4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 52 72 124 24.8284564945995 37.6221371613237 -12.7936806667242 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0243378544329653 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 2746285 A/C 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 A:C A C 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2746114_2746590:TNIP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 2746400 G/A 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 A:G G A 10 0.522529682796163 0.393562228098845 ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2746114_2746590:TNIP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 10 4 14 4.77470317203837 2.09011873118465 2.68458444085372 T:G G T 10 0.522529682796163 0.185755143276423 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 2826472 G/T 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:G G T 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2826340_2826644:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2826340_2826641:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2826340_2826828:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826392_2826486:SH3BP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 2826912 C/G 1 15 9 24 7.16205475805756 4.70276714516547 2.45928761289209 C:G C G 10 0.522529682796163 0.414495787724859 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826853_2826947:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2826478_2826923:SH3BP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 17 22 39 8.11699539246523 11.4956530215156 -3.37865762905036 T:G T G 10 0.522529682796163 0.336554969793601 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 2906707 G/T 1 92 72 164 43.927269182753 37.6221371613237 6.30513202142927 T:G G T 10 0.522529682796163 0.348537553854482 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2906491_2907448:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2906491_2906835:ADD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 56 68 124 26.7383377634149 35.5320184301391 -8.79368066672421 C:G C G 10 0.522529682796163 0.126369622986453 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 2933271 G/A 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000109736:ENST00000508276:exon_2933102_2933663:MFSD10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 2934308 G/A 1 10 4 14 4.77470317203837 2.09011873118465 2.68458444085372 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.185755143276423 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 24 31 55 11.4592876128921 16.1984201666811 -4.73913255378896 T:C T C 10 0.522529682796163 0.225165266096053 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 19 21 40 9.0719360268729 10.9731233387194 -1.90118731184652 A:G G A 10 0.522529682796163 0.63557898252467 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 46 55 101 21.9636345913765 28.739132553789 -6.77549796241246 A:G A G 10 0.522529682796163 0.195525174377290 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 4276475 C/A 1 71 75 146 33.9003925214724 39.1897262097122 -5.28933368823979 A:T:C C A 10 0.522529682796163 0.40774102612233 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 6596290 G/A 1 6 8 14 2.86482190322302 4.1802374623693 -1.31541555914628 A:G G A 10 0.522529682796163 0.595734183488216 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6596261_6596459:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6596261_6596459:MAN2B2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 6925237 C/G 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000132405:ENST00000444368:exon_6925100_6925498:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000448507:exon_6925100_6925838:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000340816:exon_6925100_6925838:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000446947:exon_6925100_6925838:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000409757:exon_6925100_6925838:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000427736:exon_6925100_6925286:TBC1D14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 8229140 G/T 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000514274:exon_8228707_8229196:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 16 22 38 7.63952507526139 11.4956530215156 -3.85612794625419 A:G A G 10 0.522529682796163 0.255806176333722 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 8229774 C/T 1 16 25 41 7.63952507526139 13.0632420699041 -5.42371699464268 T:C C T 10 0.522529682796163 0.116983998255258 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 27 7 34 12.8916985645036 3.65770777957314 9.23399078493046 A:T:C T C 10 0.522529682796163 0.00161567688692548 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 12 12 24 5.72964380644604 6.27035619355396 -0.540712387107911 T:C T C 10 0.522529682796163 0.84110056521342 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 113 114 227 53.9541458440336 59.5683838387626 -5.614237994729 T:C T C 10 0.522529682796163 0.46548427580542 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 10446906 A/G 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 A:G A G 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 10447168 C/G 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 C:G C G 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 17506042 G/A 1 18 19 37 8.59446570966907 9.9280639731271 -1.33359826345803 A:G G A 10 0.522529682796163 0.74284768069353 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17506002_17506098:QDPR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 17818885 T/C 1 11 12 23 5.25217348924221 6.27035619355396 -1.01818270431175 T:C T C 10 0.522529682796163 0.682750321629788 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000509719:exon_17818855_17819076:NCAPG HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 20 22 42 9.54940634407674 11.4956530215156 -1.94624667743884 T:C C T 10 0.522529682796163 0.643642755889531 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 T:C T C 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 25823624 G/A 1 8 9 17 3.8197625376307 4.70276714516547 -0.883004607534771 A:G G A 10 0.522529682796163 0.809298250481776 ENSG00000091490:ENST00000399878:exon_25823618_25823750:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000264868:exon_25823618_25823750:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000502949:exon_25823618_25823750:SEL1L3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 37903669 A/G 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 37903756 T/C 1 7 13 20 3.34229222042686 6.79288587635012 -3.45059365592326 T:C T C 10 0.522529682796163 0.177936173075919 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 37904082 T/C 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 T:G T G 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 38776235 A/G 1 26 28 54 12.4142282472998 14.6308311182926 -2.2166028709928 A:G A G 10 0.522529682796163 0.587200177183922 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 38776320 C/T 1 19 16 35 9.0719360268729 8.36047492473861 0.711461102134296 T:C C T 10 0.522529682796163 0.866675817943547 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 38776725 C/A 1 51 31 82 24.3509861773957 16.1984201666811 8.15256601071464 A:C C A 10 0.522529682796163 0.077171004278869 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 38777059 C/T 1 47 48 95 22.4411049085803 25.0814247742158 -2.64031986563548 T:C C T 10 0.522529682796163 0.608692541293161 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 27 20 47 12.8916985645036 10.4505936559233 2.44110490858034 A:T A T 10 0.522529682796163 0.559763224190013 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 38 27 65 18.1438720537458 14.1083014354964 4.03557061824941 T:G T G 10 0.522529682796163 0.324001705982686 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 38972691 T/C 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:C T C 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_38972652_38972757:TMEM156 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 39463903 C/A 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 A:C C A 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000121897:ENST00000340169:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000261434:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000424936:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000381846:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000515061:exon_39463816_39463909:LIAS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 20 13 33 9.54940634407674 6.79288587635012 2.75652046772662 A:G A G 10 0.522529682796163 0.385877521411919 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 39921942 A/G 1 12 13 25 5.72964380644604 6.79288587635012 -1.06324206990407 A:G A G 10 0.522529682796163 0.693670722544485 ENSG00000121892:ENST00000303538:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000412404:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000399797:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000503396:exon_39921939_39922019:PDS5A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 40138676 A/G 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 A:G A G 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000078177:ENST00000261435:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000381804:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000511480:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000513269:exon_40138564_40138702:N4BP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 40428010 T/C 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 T:C T C 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40425272_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40425698_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40426355_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40427429_40428160:RBM47 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 40440215 T/C 1 12 6 18 5.72964380644604 3.13517809677698 2.59446570966907 T:C T C 10 0.522529682796163 0.246476394158893 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40439788_40440814:RBM47 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 40440854 G/C 1 11 8 19 5.25217348924221 4.1802374623693 1.0719360268729 C:G G C 10 0.522529682796163 0.653993185631586 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000515053:exon_40440259_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000513473:exon_40440332_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000505414:exon_40440435_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514782:exon_40440499_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000507180:exon_40440540_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000511598:exon_40440570_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000511902:exon_40440732_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000505220:exon_40440733_40440941:RBM47 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 41258970 A/G 1 9 9 18 4.29723285483453 4.70276714516547 -0.405534290330934 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000154277:ENST00000514924:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000503431:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000284440:exon_41258850_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381760:exon_41258925_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512419:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381762:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000505232:exon_41258949_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000504818:exon_41258950_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000508768:exon_41258957_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512788:exon_41258962_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000472501:exon_41258963_41259037:UCHL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 41258978 C/T 1 11 16 27 5.25217348924221 8.36047492473861 -3.1083014354964 T:C C T 10 0.522529682796163 0.252302553779524 ENSG00000154277:ENST00000514924:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000503431:exon_41258967_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000284440:exon_41258850_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381760:exon_41258925_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512419:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000381762:exon_41258928_41259037:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000505232:exon_41258949_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000504818:exon_41258950_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000508768:exon_41258957_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000512788:exon_41258962_41259026:UCHL1;ENSG00000154277:ENST00000472501:exon_41258963_41259037:UCHL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 57797100 G/T 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 57797308 A/C 1 13 3 16 6.20711412364988 1.56758904838849 4.63952507526139 A:C A C 10 0.522529682796163 0.0233136227465848 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 57845091 C/T 1 10 15 25 4.77470317203837 7.83794524194244 -3.06324206990407 T:C C T 10 0.522529682796163 0.235738342127358 ENSG00000047315:ENST00000450656:exon_57844806_57845170:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57844806_57845170:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000495311:exon_57844806_57845127:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57845030_57845170:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57845035_57845170:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57845048_57845170:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000433463:exon_57845062_57845170:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000497845:exon_57845070_57845170:POLR2B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 35 42 77 16.7114611021343 21.9462466774388 -5.23478557530455 A:G G A 10 0.522529682796163 0.254601444206774 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 38 30 68 18.1438720537458 15.6758904838849 2.46798156986092 A:G G A 10 0.522529682796163 0.627632299912693 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 57887150 C/T 1 13 27 40 6.20711412364988 14.1083014354964 -7.90118731184652 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0165539705594750 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57887065_57887161:POLR2B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 69 47 116 32.9454518870648 24.5588950914197 8.3865567956451 T:C C T 10 0.522529682796163 0.136748473102746 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 68497597 C/A 1 6 9 15 2.86482190322302 4.70276714516547 -1.83794524194244 A:C C A 10 0.522529682796163 0.440567980680144 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68497575_68497626:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000505673:exon_68497575_68497626:UBA6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 68500171 A/G 1 3 8 11 1.43241095161151 4.1802374623693 -2.74782651075779 A:G A G 10 0.522529682796163 0.131967912623333 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68500147_68500236:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000505673:exon_68500147_68500236:UBA6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 68534392 C/T 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68534269_68534392:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000420827:exon_68534269_68534392:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000429659:exon_68534269_68534392:UBA6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 38 45 83 18.1438720537458 23.5138357258273 -5.36996367208153 A:G G A 10 0.522529682796163 0.271932495487802 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 79800080 G/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G G A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79799888_79800589:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79799888_79801123:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79799888_79800083:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000507670:exon_79799888_79800586:BMP2K HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 10 9 19 4.77470317203837 4.70276714516547 0.071936026872903 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 84383810 C/T 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 T:C C T 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000163322:ENST00000321945:exon_84382092_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000475656:exon_84382098_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000506553:exon_84383162_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000504777:exon_84383228_84384055:FAM175A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 89319296 T/C 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000380265:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89319294_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000506714:exon_89319260_89319361:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000515365:exon_89319294_89319361:HERC6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 100825046 C/T 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 T:C C T 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000164031:ENST00000442697:exon_100824883_100825055:DNAJB14;ENSG00000164031:ENST00000420137:exon_100824883_100825055:DNAJB14;ENSG00000164031:ENST00000471101:exon_100824883_100825055:DNAJB14;ENSG00000164031:ENST00000334223:exon_100824883_100825055:DNAJB14;ENSG00000164031:ENST00000455208:exon_100824883_100825055:DNAJB14;ENSG00000164031:ENST00000398991:exon_100824935_100825055:DNAJB14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 103611845 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103611753_103611928:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103611753_103611928:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103611753_103611928:MANBA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 104059542 G/A 1 9 11 20 4.29723285483453 5.74782651075779 -1.45059365592326 A:G G A 10 0.522529682796163 0.655579202774615 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104059508_104059606:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104059508_104059606:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104059508_104059609:CENPE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 104066461 A/G 1 8 15 23 3.8197625376307 7.83794524194244 -4.01818270431175 A:T:G A G 10 0.522529682796163 0.0995395512560875 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000515478:exon_104066460_104066491:CENPE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 T:C C T 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 104102563 T/C 1 7 1 8 3.34229222042686 0.522529682796163 2.8197625376307 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0725354402980475 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104102494_104102613:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104102494_104102613:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104102494_104102613:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104102494_104102613:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000509120:exon_104102494_104103120:CENPE HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 106157703 T/G 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:G T G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000168769:ENST00000305737:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000513237:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000265149:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000380013:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000394764:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000413648:exon_106155054_106158508:TET2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 106621169 C/T 1 39 32 71 18.6213423709496 16.7209498494772 1.90039252147243 T:C C T 10 0.522529682796163 0.721930831923307 ENSG00000138785:ENST00000394735:exon_106621007_106621171:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000340139:exon_106621007_106621171:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000451321:exon_106621007_106621171:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000265150:exon_106621007_106621173:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000506967:exon_106621007_106621171:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000503746:exon_106621007_106621171:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000420368:exon_106621007_106621171:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000416543:exon_106621007_106621171:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000433009:exon_106621007_106621171:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000510876:exon_106621030_106621171:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000515819:exon_106621108_106621171:INTS12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 110384790 A/G 1 12 16 28 5.72964380644604 8.36047492473861 -2.63083111829256 A:G A G 10 0.522529682796163 0.348672207955825 ENSG00000138802:ENST00000504968:exon_110384057_110384800:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000399100:exon_110384057_110384800:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000265175:exon_110384057_110384800:SEC24B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 113189560 C/T 1 17 12 29 8.11699539246523 6.27035619355396 1.84663919891127 T:C C T 10 0.522529682796163 0.578663103203533 ENSG00000138660:ENST00000274000:exon_113189300_113191203:AP1AR;ENSG00000138660:ENST00000309703:exon_113189300_113190833:AP1AR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 134 126 260 63.9810225053142 65.8387400323165 -1.85771752700237 A:G A G 10 0.522529682796163 0.852316778595144 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 113539620 T/C 1 1 7 8 0.477470317203837 3.65770777957314 -3.1802374623693 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0319085925070315 ENSG00000138658:ENST00000505019:exon_113538596_113540846:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000473015:exon_113538596_113540846:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000309071:exon_113538596_113540846:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000264370:exon_113538596_113540846:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000514770:exon_113538596_113540846:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000445203:exon_113538596_113540846:C4orf21 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 113565835 G/A 1 71 79 150 33.9003925214724 41.2798449408969 -7.37945241942445 A:G G A 10 0.522529682796163 0.252508308068707 ENSG00000174720:ENST00000344442:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000512589:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509061:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509622:exon_113565824_113565924:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000508577:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000513553:exon_113565824_113565855:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505034:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000324052:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505216:exon_113565824_113565924:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000507443:exon_113565460_113566027:LARP7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 113568544 G/A 1 68 73 141 32.4679815698609 38.1446668441199 -5.67668527425898 A:G G A 10 0.522529682796163 0.354450058758621 ENSG00000174720:ENST00000344442:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509061:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509622:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505034:exon_113568355_113568605:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000324052:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000511529:exon_113568367_113568705:LARP7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 119200331 T/C 1 11 11 22 5.25217348924221 5.74782651075779 -0.495653021515585 T:C T C 10 0.522529682796163 0.835008349106383 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 123192383 T/C 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 T:C T C 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000441681:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000455637:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000423315:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000446180:exon_123192173_123192879:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000419325:exon_123192173_123192879:KIAA1109 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 128814492 G/A 1 10 5 15 4.77470317203837 2.61264841398082 2.16205475805755 A:G G A 10 0.522529682796163 0.309170426805168 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814355_128814573:PLK4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 128949799 C/T 1 9 10 19 4.29723285483453 5.22529682796163 -0.928063973127097 T:C C T 10 0.522529682796163 0.819201169042762 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 128949850 A/G 1 17 12 29 8.11699539246523 6.27035619355396 1.84663919891127 A:G A G 10 0.522529682796163 0.578663103203533 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 128949929 C/A 1 12 5 17 5.72964380644604 2.61264841398082 3.11699539246523 A:C C A 10 0.522529682796163 0.150352896781338 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 129012638 A/G 1 15 13 28 7.16205475805756 6.79288587635012 0.369168881707437 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000394288:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000432347:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129012502_129012667:LARP1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 129043204 C/G 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 C:G C G 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 129043286 C/T 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507259:exon_129043272_129043343:LARP1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 1 288 1 289 137.511451354705 0.522529682796163 136.988921671909 A:G G A 10 0.522529682796163 9.28753985006697e-80 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 144130750 T/C 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144130717_144130810:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144130717_144130810:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144130717_144130810:USP38 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 17 19 36 8.11699539246523 9.9280639731271 -1.81106858066187 A:G G A 10 0.522529682796163 0.61789790541559 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 148944467 A/G 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000071205:ENST00000336498:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000414545:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506054:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000507661:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506020:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000513548:exon_148944205_148944564:ARHGAP10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 154478222 C/T 1 9 8 17 4.29723285483453 4.1802374623693 0.116995392465229 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000462540:exon_154478118_154478234:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154478118_154478234:KIAA0922 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 154479430 T/C 1 12 7 19 5.72964380644604 3.65770777957314 2.0719360268729 T:C T C 10 0.522529682796163 0.368592887865543 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000462540:exon_154479410_154479923:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154479410_154479520:KIAA0922 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 154513627 A/G 1 13 19 32 6.20711412364988 9.9280639731271 -3.72094984947722 A:G A G 10 0.522529682796163 0.216904561562158 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 154513722 C/T 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 T:C C T 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 154514965 T/C 1 16 15 31 7.63952507526139 7.83794524194244 -0.198420166681052 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154514951_154515023:KIAA0922 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 156723683 C/T 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 T:C C T 10 0.522529682796163 0.568106121039098 ENSG00000061918:ENST00000505154:exon_156723494_156723731:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000502959:exon_156723494_156723731:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000505764:exon_156723494_156723731:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000507146:exon_156723365_156723731:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000264424:exon_156723494_156723731:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000503520:exon_156723593_156723731:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000513437:exon_156723494_156723731:GUCY1B3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 25 48 73 11.9367579300959 25.0814247742158 -13.1446668441199 A:T:C:G A C 10 0.522529682796163 0.00219820290399223 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 41 35 76 19.5762830053573 18.2885388978657 1.28774410749162 T:C T C 10 0.522529682796163 0.818808304553209 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 166231868 A/G 1 11 4 15 5.25217348924221 2.09011873118465 3.16205475805756 A:G A G 10 0.522529682796163 0.124047501512051 ENSG00000109466:ENST00000226725:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000514860:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506824:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000421009:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506541:exon_166231705_166231904:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506761:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000509028:exon_166231705_166231902:KLHL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 169176996 G/A 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169176862_169177020:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000505393:exon_169176862_169177020:DDX60 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 169197297 C/T 1 3 7 10 1.43241095161151 3.65770777957314 -2.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 0.209802689107094 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169197166_169197332:DDX60 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 170077789 A/G 1 5 14 19 2.38735158601918 7.31541555914628 -4.9280639731271 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0359786009964205 ENSG00000154447:ENST00000284637:exon_170077555_170077830:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000511421:exon_170077555_170077808:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000508685:exon_170077555_170077830:SH3RF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 175237408 T/C 1 1 8 9 0.477470317203837 4.1802374623693 -3.70276714516547 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0168973315722376 ENSG00000164118:ENST00000503780:exon_175237317_175237441:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000457424:exon_175237317_175237441:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000396791:exon_175237317_175237441:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000426172:exon_175237317_175237441:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000296519:exon_175237317_175237441:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000508483:exon_175237317_175237837:KIAA1712 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 11 18 29 5.25217348924221 9.40553429033093 -4.15336080108873 A:G A G 10 0.522529682796163 0.138802783884069 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 42 31 73 20.0537533225612 16.1984201666811 3.8553331558801 A:G A G 10 0.522529682796163 0.412664064053911 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 184366145 C/T 1 5 10 15 2.38735158601918 5.22529682796163 -2.83794524194245 T:C C T 10 0.522529682796163 0.196087541104941 ENSG00000168564:ENST00000504169:exon_184365744_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000302350:exon_184365788_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000510928:exon_184365850_184366222:CDKN2AIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 184426387 C/T 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C C T 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000168556:ENST00000302327:exon_184426147_184426520:ING2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 184612553 G/C 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184612469_184612624:C4orf41 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 184614874 C/T 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184614742_184614890:C4orf41 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 50 63 113 23.8735158601919 32.9193700161583 -9.04585415596642 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0907994027969382 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 185552135 C/T 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:C C T 10 0.522529682796163 0.511797587312082 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 185655171 C/T 1 15 12 27 7.16205475805756 6.27035619355396 0.8916985645036 T:C C T 10 0.522529682796163 0.847892523515759 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185655170_185655287:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185655170_185655284:MLF1IP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 185687863 A/G 1 11 13 24 5.25217348924221 6.79288587635012 -1.54071238710791 A:G A G 10 0.522529682796163 0.54717203422613 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687776_185687910:ACSL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 186097045 C/T 1 22 19 41 10.5043469784844 9.9280639731271 0.576283005357318 T:C C T 10 0.522529682796163 0.877194379558022 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 33 33 66 15.7565204677266 17.2434795322734 -1.48695906454675 T:C T C 10 0.522529682796163 0.713941033994362 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 18 16 34 8.59446570966907 8.36047492473861 0.233990784930459 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 422955 C/G 1 13 11 24 6.20711412364988 5.74782651075779 0.459287612892089 A:C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000510910:exon_422492_422973:AHRR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 1057615 A/G 1 18 16 34 8.59446570966907 8.36047492473861 0.233990784930459 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000514994:exon_1057326_1057764:SLC12A7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 30 64 94 14.3241095161151 33.4418996989544 -19.1177901828393 A:G G A 10 0.522529682796163 7.61248606627922e-05 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 47 48 95 22.4411049085803 25.0814247742158 -2.64031986563548 A:G A G 10 0.522529682796163 0.608692541293161 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 1479678 G/C 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 C:G G C 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000153395:ENST00000513757:exon_1479591_1479790:LPCAT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 31 26 57 14.8015798333189 13.5857717527002 1.21580808061871 T:C C T 10 0.522529682796163 0.791821633214219 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 5460569 C/T 1 11 8 19 5.25217348924221 4.1802374623693 1.0719360268729 T:C C T 10 0.522529682796163 0.653993185631586 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 5460619 G/C 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 C:G G C 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 5462148 G/A 1 17 14 31 8.11699539246523 7.31541555914628 0.801579833318948 A:G G A 10 0.522529682796163 0.858135513379526 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 5462607 A/G 1 15 15 30 7.16205475805756 7.83794524194244 -0.675890483884888 A:G A G 10 0.522529682796163 0.856233772119583 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 5462620 G/A 1 10 16 26 4.77470317203837 8.36047492473861 -3.58577175270024 A:G G A 10 0.522529682796163 0.173614440209318 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 5463668 C/T 1 12 15 27 5.72964380644604 7.83794524194244 -2.1083014354964 T:C C T 10 0.522529682796163 0.446223384334079 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 6600150 G/A 1 89 101 190 42.4948582311415 52.7754979624125 -10.280639731271 A:G G A 10 0.522529682796163 0.146377463556594 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6600143_6600345:NSUN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 6623354 C/T 1 27 12 39 12.8916985645036 6.27035619355396 6.62134237094964 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0371410281897422 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6623327_6623398:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6623327_6623398:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6623327_6623398:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505264:exon_6623327_6623398:NSUN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 7878179 C/T 1 2 10 12 0.954940634407674 5.22529682796163 -4.27035619355396 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0180391364277980 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7878057_7878262:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514220:exon_7878057_7878348:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508890:exon_7878057_7878188:MTRR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 7897319 G/A 1 13 11 24 6.20711412364988 5.74782651075779 0.459287612892089 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 14368975 C/T 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 T:C C T 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14368817_14369008:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14368817_14369008:TRIO HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 14397238 T/C 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000502490:exon_14397152_14397450:TRIO HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 33462034 G/A 1 61 63 124 29.1256893494341 32.9193700161583 -3.79368066672421 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.529579358897449 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33462011_33462111:TARS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 33989518 C/T 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 36985303 A/G 1 16 18 34 7.63952507526139 9.40553429033093 -1.76600921506954 A:G A G 10 0.522529682796163 0.608163381004269 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 37333727 A/G 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000113569:ENST00000231498:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000381843:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000434056:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000513532:exon_37333565_37333735:NUP155 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 52096889 C/A 1 13 27 40 6.20711412364988 14.1083014354964 -7.90118731184652 A:C C A 10 0.522529682796163 0.0165539705594750 ENSG00000152684:ENST00000274311:exon_52095719_52096954:PELO;ENSG00000152684:ENST00000381463:exon_52095956_52096954:PELO HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 56178111 A/G 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G A G 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000095015:ENST00000399503:exon_56177397_56178693:MAP3K1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 61694379 T/C 1 9 16 25 4.29723285483453 8.36047492473861 -4.06324206990407 T:C T C 10 0.522529682796163 0.112781481348924 ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61694256_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61694338_61694387:DIMT1L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 13 9 22 6.20711412364988 4.70276714516547 1.50434697848441 A:G G A 10 0.522529682796163 0.670538633660278 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 65084048 G/C 1 8 9 17 3.8197625376307 4.70276714516547 -0.883004607534771 C:G G C 10 0.522529682796163 0.809298250481776 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506539:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65083945_65084311:NLN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 65108215 A/G 1 18 14 32 8.59446570966907 7.31541555914628 1.27905015052279 A:G A G 10 0.522529682796163 0.724992015605387 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 65321311 C/T 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 T:C C T 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000416865:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65321308_65321380:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000515185:exon_65321134_65321380:ERBB2IP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 65350374 A/G 1 42 31 73 20.0537533225612 16.1984201666811 3.8553331558801 A:G A G 10 0.522529682796163 0.412664064053911 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 17 9 26 8.11699539246523 4.70276714516547 3.41422824729976 T:C T C 10 0.522529682796163 0.238656053250706 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 66478729 A/G 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 A:G A G 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 66480374 G/C 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 C:G G C 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180;ENSG00000134061:ENST00000515027:exon_66480350_66480413:CD180 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 67588148 G/A 1 5 9 14 2.38735158601918 4.70276714516547 -2.31541555914628 A:G G A 10 0.522529682796163 0.286340857888341 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000523807:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000522084:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000320694:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000336483:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518292:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518813:exon_67586628_67588189:PIK3R1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 16 15 31 7.63952507526139 7.83794524194244 -0.198420166681052 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 68616331 C/T 1 6 10 16 2.86482190322302 5.22529682796163 -2.36047492473861 T:C C T 10 0.522529682796163 0.317915137228048 ENSG00000183323:ENST00000396496:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000396499:exon_68616064_68616410:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000342578:exon_68616064_68616367:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000453797:exon_68616064_68616367:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000460090:exon_68616292_68616410:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000383374:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000511257:exon_68616292_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000512045:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000513172:exon_68616064_68616407:CCDC125 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 71654202 T/A 1 9 8 17 4.29723285483453 4.1802374623693 0.116995392465229 A:T T A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000049883:ENST00000380639:exon_71654030_71654998:PTCD2;ENSG00000049883:ENST00000486995:exon_71654030_71655055:PTCD2;ENSG00000049883:ENST00000308077:exon_71654030_71654650:PTCD2;ENSG00000049883:ENST00000503868:exon_71654030_71655060:PTCD2;ENSG00000049883:ENST00000510676:exon_71654030_71654211:PTCD2;ENSG00000049883:ENST00000503315:exon_71654030_71654739:PTCD2;ENSG00000049883:ENST00000460837:exon_71654030_71654665:PTCD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 72184098 C/T 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000083312:ENST00000337273:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000454282:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000415341:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000523768:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000396346:exon_72183954_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000447967:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000506351:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000519220:exon_72184065_72184130:TNPO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 73981299 C/T 1 23 10 33 10.9818172956883 5.22529682796163 5.75652046772662 T:C C T 10 0.522529682796163 0.054438823165379 ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73980969_73981384:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73981021_73981384:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000515528:exon_73981031_73981384:HEXB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 73985215 A/G 1 9 13 22 4.29723285483453 6.79288587635012 -2.49565302151559 A:G A G 10 0.522529682796163 0.296166428569315 ENSG00000049860:ENST00000511181:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000515528:exon_73985153_73985674:HEXB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 82648977 T/G 1 14 17 31 6.68458444085372 8.88300460753477 -2.19842016668105 T:G T G 10 0.522529682796163 0.474916459833262 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82648950_82649577:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82648944_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82648950_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82648944_82649606:XRCC4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 86564477 A/G 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 A:G A G 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000145715:ENST00000274376:exon_86563705_86564807:RASA1;ENSG00000145715:ENST00000515800:exon_86563705_86564807:RASA1;ENSG00000145715:ENST00000534133:exon_86563705_86564807:RASA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 94050487 T/A 1 11 6 17 5.25217348924221 3.13517809677698 2.11699539246523 A:T T A 10 0.522529682796163 0.340698354211182 ENSG00000175471:ENST00000514040:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94050482_94050591:MCTP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 94278129 T/C 1 13 9 22 6.20711412364988 4.70276714516547 1.50434697848441 T:C T C 10 0.522529682796163 0.670538633660278 ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512425:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505208:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000415885:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000503301:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000507214:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000514780:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512568:exon_94278054_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000510732:exon_94278089_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000513695:exon_94278098_94278131:MCTP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 94826655 C/A 1 16 6 22 7.63952507526139 3.13517809677698 4.50434697848442 A:C C A 10 0.522529682796163 0.057697202062676 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94826612_94826740:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000502768:exon_94826612_94826740:TTC37 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 94861118 G/C 1 11 13 24 5.25217348924221 6.79288587635012 -1.54071238710791 C:G G C 10 0.522529682796163 0.54717203422613 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94861102_94861205:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000513232:exon_94861102_94861168:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000514952:exon_94861102_94861205:TTC37 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 94939193 A/G 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G A G 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000164291:ENST00000380009:exon_94938941_94940768:ARSK;ENSG00000164291:ENST00000513814:exon_94938941_94939384:ARSK;ENSG00000164291:ENST00000504873:exon_94938941_94939384:ARSK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 82 92 174 39.1525660107146 48.072730817247 -8.92016480653236 A:G A G 10 0.522529682796163 0.196905351080535 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 96031569 A/G 1 6 17 23 2.86482190322302 8.88300460753477 -6.01818270431175 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0195638832039345 ENSG00000153113:ENST00000505143:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511097:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515160:exon_96031540_96031998:CAST;ENSG00000153113:ENST00000507487:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000421689:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512620:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000514845:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000506811:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000514055:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96031489_96031611:CAST HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 14 3 17 6.68458444085372 1.56758904838849 5.11699539246523 T:G G T 10 0.522529682796163 0.0142139655520718 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 1 16 3 19 7.63952507526139 1.56758904838849 6.0719360268729 A:T:G T A 10 0.522529682796163 0.00515676312167146 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 96237326 G/A 1 15 3 18 7.16205475805756 1.56758904838849 5.59446570966907 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00859335318552677 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96237210_96237385:ERAP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 38 6 44 18.1438720537458 3.13517809677698 15.0086939569688 T:C C T 10 0.522529682796163 2.58293455426538e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 41 4 45 19.5762830053573 2.09011873118465 17.4861642741727 T:C C T 10 0.522529682796163 3.15483598758805e-08 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 21 4 25 10.0268766612806 2.09011873118465 7.93675793009593 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00196076523004242 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 16 9 25 7.63952507526139 4.70276714516547 2.93675793009593 T:C C T 10 0.522529682796163 0.317125505244083 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 108713970 C/T 1 36 26 62 17.1889314193381 13.5857717527002 3.60315966663789 T:C C T 10 0.522529682796163 0.3762848378638 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 18 14 32 8.59446570966907 7.31541555914628 1.27905015052279 A:C:G G C 10 0.522529682796163 0.724992015605387 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 112176325 G/A 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 112176559 T/G 1 10 8 18 4.77470317203837 4.1802374623693 0.594465709669066 T:G T G 10 0.522529682796163 0.817891150332414 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 112176756 T/A 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:T T A 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 112177171 G/A 1 9 4 13 4.29723285483453 2.09011873118465 2.20711412364988 A:G G A 10 0.522529682796163 0.273205822586663 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 14 12 26 6.68458444085372 6.27035619355396 0.414228247299763 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 112899573 T/C 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112899556_112899828:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112899556_112899828:YTHDC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 7 12 19 3.34229222042686 6.27035619355396 -2.9280639731271 A:T T A 10 0.522529682796163 0.250483788158122 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 118506603 A/C 1 10 7 17 4.77470317203837 3.65770777957314 1.11699539246523 A:C A C 10 0.522529682796163 0.63504130808849 ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118505885_118506975:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000507552:exon_118506411_118506975:DMXL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 118506685 G/A 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118505885_118506975:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000507552:exon_118506411_118506975:DMXL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 118506805 A/T 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:T A T 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118505885_118506975:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000507552:exon_118506411_118506975:DMXL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 118811533 G/A 1 9 14 23 4.29723285483453 7.31541555914628 -3.01818270431175 A:G G A 10 0.522529682796163 0.218336616351306 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000511186:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512841:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503168:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507695:exon_118811519_118811568:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515250:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504051:exon_118811519_118811565:HSD17B4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 16 5 21 7.63952507526139 2.61264841398082 5.02687666128058 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0297781149323547 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 121355961 G/A 1 9 8 17 4.29723285483453 4.1802374623693 0.116995392465229 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 122165317 C/T 1 56 29 85 26.7383377634149 15.1533608010887 11.5849769623262 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0123763963222818 ENSG00000205302:ENST00000379516:exon_122165293_122165803:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000514949:exon_122165293_122165450:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000510372:exon_122165293_122165366:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000506847:exon_122165293_122165468:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000507321:exon_122165293_122165450:SNX2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 125939409 C/T 1 35 36 71 16.7114611021343 18.8110685806619 -2.09960747852757 T:C C T 10 0.522529682796163 0.636322047113791 ENSG00000164902:ENST00000297540:exon_125939262_125939875:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000514725:exon_125939266_125939756:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000456348:exon_125939262_125939534:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000505674:exon_125939253_125939875:PHAX HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 28 35 63 13.3691688817074 18.2885388978657 -4.91937001615826 A:G G A 10 0.522529682796163 0.256248767984147 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 131607494 C/T 1 2 9 11 0.954940634407674 4.70276714516547 -3.74782651075779 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0319652475797756 ENSG00000131435:ENST00000253754:exon_131607484_131607601:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000474421:exon_131606608_131607566:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000484620:exon_131607484_131607526:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000462597:exon_131606996_131607601:PDLIM4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 132099999 A/G 1 18 21 39 8.59446570966907 10.9731233387194 -2.37865762905036 A:G A G 10 0.522529682796163 0.522183815680855 ENSG00000164402:ENST00000378719:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378721:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132099951_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378701:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000458488:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371478:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000453480:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000414594:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371493:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000481794:exon_132099653_132100111:SEPT8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 132232037 T/C 1 5 9 14 2.38735158601918 4.70276714516547 -2.31541555914628 T:C T C 10 0.522529682796163 0.286340857888341 ENSG00000072364:ENST00000265343:exon_132232015_132232932:AFF4;ENSG00000072364:ENST00000378595:exon_132232015_132232932:AFF4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 132437531 C/T 1 75 73 148 35.8102737902878 38.1446668441199 -2.33439305383212 T:C C T 10 0.522529682796163 0.742250142060426 ENSG00000170606:ENST00000304858:exon_132437451_132437570:HSPA4;ENSG00000170606:ENST00000514825:exon_132437288_132437570:HSPA4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 133956668 G/A 1 16 20 36 7.63952507526139 10.4505936559233 -2.81106858066187 A:G G A 10 0.522529682796163 0.405302601829828 ENSG00000152700:ENST00000402673:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000507419:exon_133956623_133956691:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000394992:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000282606:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000439578:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000503318:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000505758:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000502286:exon_133956623_133956742:SAR1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 134191089 A/G 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:T:G A G 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000181904:ENST00000338051:exon_134190588_134194799:C5orf24;ENSG00000181904:ENST00000394976:exon_134190588_134195427:C5orf24;ENSG00000181904:ENST00000435259:exon_134190588_134191178:C5orf24 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 134223593 A/G 1 25 33 58 11.9367579300959 17.2434795322734 -5.30672160217745 A:G A G 10 0.522529682796163 0.188767369839737 ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134223465_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506916:exon_134223391_134223752:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508810:exon_134223385_134223870:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134223385_134223872:TXNDC15 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 134364518 C/G 0 0 10 10 0 5.22529682796163 -5.22529682796163 G C G 10 0.522529682796163 0.000615834167563621 ENSG00000069011:ENST00000265340:exon_134363424_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000506438:exon_134364243_134365011:PITX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 17 13 30 8.11699539246523 6.79288587635012 1.32410951611511 A:G A G 10 0.522529682796163 0.716107033674038 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 138856982 C/T 1 10 9 19 4.77470317203837 4.70276714516547 0.071936026872903 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138856953_138857100:TMEM173 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 138857925 C/G 1 10 5 15 4.77470317203837 2.61264841398082 2.16205475805755 C:G C G 10 0.522529682796163 0.309170426805168 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 138861078 C/T 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 T:C C T 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 138861146 C/G 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 C:G C G 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 139936760 G/A,T 0 0 44 44 0 22.9913060430312 -22.9913060430312 A:T G A 10 0.522529682796163 7.47550669708751e-15 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 139940233 G/A 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 A:G G A 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 139941228 A/G 1 15 6 21 7.16205475805756 3.13517809677698 4.02687666128058 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0846643570295337 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000358580:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139941172_139941307:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139941172_139941307:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511201:exon_139941172_139941292:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139941172_139941434:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000506289:exon_139941172_139941286:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000508496:exon_139941172_139941310:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511463:exon_139941228_139941580:APBB3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 139941318 A/G 1 8 13 21 3.8197625376307 6.79288587635012 -2.97312333871942 A:G A G 10 0.522529682796163 0.274479547020565 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139941172_139941434:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511463:exon_139941228_139941580:APBB3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 140041960 T/G 1 45 32 77 21.4861642741727 16.7209498494772 4.76521442469545 T:G T G 10 0.522529682796163 0.305325036280171 ENSG00000113141:ENST00000417647:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000261812:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000515592:exon_140041764_140042064:IK;ENSG00000113141:ENST00000518969:exon_140041887_140042012:IK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 19 10 29 9.0719360268729 5.22529682796163 3.84663919891127 T:C T C 10 0.522529682796163 0.193159511154280 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 141309824 G/A 1 32 15 47 15.2790501505228 7.83794524194244 7.44110490858034 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0397976375358768 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000502729:exon_141309812_141309839:KIAA0141 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 141391532 G/A 1 7 9 16 3.34229222042686 4.70276714516547 -1.36047492473861 A:G G A 10 0.522529682796163 0.618833530377833 ENSG00000113552:ENST00000513454:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000311337:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000500692:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000458112:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000508177:exon_141391477_141392359:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503794:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504139:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000505689:exon_141391414_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000510194:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503229:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000507107:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504424:exon_141391514_141391606:GNPDA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 143200053 C/T 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 T:C C T 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000158497:ENST00000289448:exon_143200045_143200284:HMHB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 149740732 C/T 1 18 10 28 8.59446570966907 5.22529682796163 3.36916888170744 T:C C T 10 0.522529682796163 0.256699726213295 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515516:exon_149740719_149740774:TCOF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 149826526 C/T 1 2988 3136 6124 1426.68130780506 1638.65308524877 -211.971777443702 A:T:C:G C T 10 0.522529682796163 6.20359100966877e-08 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 149827098 G/A 1 13 9 22 6.20711412364988 4.70276714516547 1.50434697848441 A:G G A 10 0.522529682796163 0.670538633660278 ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 149907533 T/G 1 9 9 18 4.29723285483453 4.70276714516547 -0.405534290330934 T:G T G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149907366_149907860:NDST1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 149907641 C/T 1 9 4 13 4.29723285483453 2.09011873118465 2.20711412364988 T:C C T 10 0.522529682796163 0.273205822586663 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149907366_149907860:NDST1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 149912527 C/T 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149912507_149912594:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149912507_149912594:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149912507_149912594:NDST1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 149932934 G/A 1 5 11 16 2.38735158601918 5.74782651075779 -3.36047492473861 A:G G A 10 0.522529682796163 0.131585770979384 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149932775_149933276:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149932775_149937773:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000521752:exon_149932775_149933273:NDST1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 150029415 C/T 1 27 32 59 12.8916985645036 16.7209498494772 -3.82925128497362 T:C C T 10 0.522529682796163 0.362147061609446 ENSG00000171992:ENST00000394243:exon_150027506_150033794:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000522122:exon_150027506_150031896:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000314840:exon_150027506_150031896:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000307662:exon_150027506_150029865:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000519664:exon_150027506_150031899:SYNPO HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 150415196 G/A 1 140 140 280 66.8458444085372 73.1541555914628 -6.30831118292562 A:T:C:G G A 10 0.522529682796163 0.472997752574805 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000517504:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522574:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000517329:exon_150415143_150415215:TNIP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 150429444 G/A 1 137 83 220 65.4134334569257 43.3699636720815 22.0434697848441 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00294165710419181 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521423:exon_150429385_150429464:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150429385_150429508:TNIP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 150429452 G/A 1 134 84 218 63.9810225053142 43.8924933548777 20.0885291504365 A:T:G G A 10 0.522529682796163 0.00662828403449033 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521423:exon_150429385_150429464:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150429385_150429508:TNIP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 262 191 453 125.097223107405 99.8031694140671 25.2940536933382 A:C:G A G 10 0.522529682796163 0.0186124890220728 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 145 108 253 69.2331959945564 56.4332057419856 12.7999902525708 A:G G A 10 0.522529682796163 0.115583256828591 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 150578574 A/G 1 21 34 55 10.0268766612806 17.7660092150695 -7.73913255378896 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0424652951130575 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 150647012 A/G 1 60 58 118 28.6482190322302 30.3067216021775 -1.65850256994723 A:G A G 10 0.522529682796163 0.782704539158839 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 64 58 122 30.5581003010456 30.3067216021775 0.25137869886812 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 15 12 27 7.16205475805756 6.27035619355396 0.8916985645036 T:C T C 10 0.522529682796163 0.847892523515759 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 20 21 41 9.54940634407674 10.9731233387194 -1.42371699464268 A:G A G 10 0.522529682796163 0.755017185627608 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 162902516 T/C 1 13 20 33 6.20711412364988 10.4505936559233 -4.24347953227338 T:C T C 10 0.522529682796163 0.163896745013365 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162902464_162902678:HMMR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 44 29 73 21.0086939569688 15.1533608010887 5.85533315588011 C:G C G 10 0.522529682796163 0.197439330401913 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 62 51 113 29.6031596666379 26.6490138226043 2.95414584403359 T:C C T 10 0.522529682796163 0.637976595044371 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 27 38 65 12.8916985645036 19.8561279462542 -6.96442938175059 A:G A G 10 0.522529682796163 0.105792649507499 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 174937193 C/T 1 15 9 24 7.16205475805756 4.70276714516547 2.45928761289209 T:C C T 10 0.522529682796163 0.414495787724859 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174937112_174937315:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174937112_174937210:SFXN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 174953743 G/A 1 44 43 87 21.0086939569688 22.468776360235 -1.46008240326618 A:G G A 10 0.522529682796163 0.830203033549605 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174953641_174956745:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174953641_174953886:SFXN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 175772208 C/T 1 10 7 17 4.77470317203837 3.65770777957314 1.11699539246523 T:C C T 10 0.522529682796163 0.63504130808849 ENSG00000170085:ENST00000345702:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000430704:exon_175772186_175772569:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000443967:exon_175772186_175772994:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000341199:exon_175772186_175772992:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000420396:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000332772:exon_175772186_175772992:C5orf25 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176382995 G/A 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176382960_176383036:UIMC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 22 18 40 10.5043469784844 9.40553429033093 1.09881268815348 A:G G A 10 0.522529682796163 0.7541595467739 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176636882 C/T 1 9 9 18 4.29723285483453 4.70276714516547 -0.405534290330934 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176637149 G/A 1 15 8 23 7.16205475805756 4.1802374623693 2.98181729568825 A:G G A 10 0.522529682796163 0.296627250051809 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176637240 G/T 1 7 10 17 3.34229222042686 5.22529682796163 -1.88300460753477 T:G G T 10 0.522529682796163 0.468082532065744 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176637576 T/C 1 10 3 13 4.77470317203837 1.56758904838849 3.20711412364988 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0965395810160095 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176721198 T/C 1 12 18 30 5.72964380644604 9.40553429033093 -3.67589048388489 T:C T C 10 0.522529682796163 0.202974205829589 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176733116 A/G 1 87 80 167 41.5399175967338 41.802374623693 -0.262457026959218 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000511309:exon_176732872_176733148:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510797:exon_176733099_176733154:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503853:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510701:exon_176733099_176733164:PRELID1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176733616 T/C 1 157 169 326 74.9628398010024 88.3075163925515 -13.3446765915491 T:C T C 10 0.522529682796163 0.149393684115683 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733423_176733960:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733423_176733670:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733456_176733950:PRELID1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176737720 A/G 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176737427_176738485:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176737427_176738485:MXD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176761336 T/C 1 80 81 161 38.197625376307 42.3249043064892 -4.12727893018224 T:C T C 10 0.522529682796163 0.528722539164398 ENSG00000169223:ENST00000303127:exon_176761285_176761404:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000504071:exon_176761285_176761553:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000515209:exon_176761285_176761404:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000514458:exon_176761285_176761337:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000502560:exon_176761310_176761404:LMAN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 56 64 120 26.7383377634149 33.4418996989544 -6.70356193553955 C:G G C 10 0.522529682796163 0.235355543206566 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 22 30 52 10.5043469784844 15.6758904838849 -5.17154350540047 A:G A G 10 0.522529682796163 0.166136518885048 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 13 14 27 6.20711412364988 7.31541555914628 -1.1083014354964 T:C T C 10 0.522529682796163 0.703625443243212 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 176931706 G/C 1 10 9 19 4.77470317203837 4.70276714516547 0.071936026872903 C:G G C 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 12 13 25 5.72964380644604 6.79288587635012 -1.06324206990407 T:C T C 10 0.522529682796163 0.693670722544485 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 14 15 29 6.68458444085372 7.83794524194244 -1.15336080108873 T:C T C 10 0.522529682796163 0.712748058622428 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 1 1078 1 1079 514.713001945736 0.522529682796163 514.19047226294 T:C T C 10 0.522529682796163 8.91395771579262e-302 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 178140090 C/T 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 T:C C T 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 179291128 C/T 1 44 17 61 21.0086939569688 8.88300460753477 12.1256893494341 A:T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.00191933250263 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 180218613 C/A 1 27 35 62 12.8916985645036 18.2885388978657 -5.3968403333621 A:C C A 10 0.522529682796163 0.203378122859718 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 180651231 G/A 1 10 9 19 4.77470317203837 4.70276714516547 0.071936026872903 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 5 180665065 G/C 1 20 20 40 9.54940634407674 10.4505936559233 -0.90118731184652 C:G G C 10 0.522529682796163 0.87453632499247 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 53 112 165 25.3059268118034 58.5233244731702 -33.2173976613669 A:G G A 10 0.522529682796163 2.0018854110527e-07 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 397290 T/C 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 T:C T C 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000137265:ENST00000495137:exon_397108_397546:IRF4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 7 15 22 3.34229222042686 7.83794524194244 -4.49565302151558 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0854182011035238 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 45 38 83 21.4861642741727 19.8561279462542 1.63003632791847 A:G A G 10 0.522529682796163 0.742820740285474 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 34 17 51 16.2339907849305 8.88300460753477 7.35098617739569 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0488209411499201 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 6174866 G/A 1 3 8 11 1.43241095161151 4.1802374623693 -2.74782651075779 A:G G A 10 0.522529682796163 0.131967912623333 ENSG00000124491:ENST00000264870:exon_6174813_6175100:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000441301:exon_6174813_6175100:F13A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 7247248 T/C 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 T:C T C 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7247244_7247454:RREB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 7601720 C/T 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 T:C C T 10 0.522529682796163 0.568106121039098 ENSG00000168566:ENST00000342415:exon_7601569_7601757:SNRNP48;ENSG00000168566:ENST00000496946:exon_7599906_7601757:SNRNP48 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 7889088 A/G 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G A G 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000239264:ENST00000460138:exon_7888938_7889678:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000475802:exon_7888938_7889194:TXNDC5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 11213832 T/C 1 20 17 37 9.54940634407674 8.88300460753477 0.666401736541969 T:C T C 10 0.522529682796163 0.870447919793445 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 12122773 T/C 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 12123249 A/G 1 14 12 26 6.68458444085372 6.27035619355396 0.414228247299763 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 12125772 A/G 1 19 15 34 9.0719360268729 7.83794524194244 1.23399078493046 A:G A G 10 0.522529682796163 0.733153130187491 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 12294258 A/G 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 A:G A G 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12294174_12294329:EDN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 17629616 G/A 1 38 31 69 18.1438720537458 16.1984201666811 1.94545188706475 A:G G A 10 0.522529682796163 0.718040302041699 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17628886_17629770:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17628886_17629770:NUP153 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 17665479 G/C 1 24 19 43 11.4592876128921 9.9280639731271 1.53122363976499 C:G G C 10 0.522529682796163 0.651110301177106 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17665470_17665616:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17665470_17665616:NUP153 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 24403377 C/T 1 12 5 17 5.72964380644604 2.61264841398082 3.11699539246523 T:C C T 10 0.522529682796163 0.150352896781338 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24403182_24403464:MRS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 24403455 C/T 1 20 19 39 9.54940634407674 9.9280639731271 -0.378657629050357 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24403420_24403464:MRS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 24412530 G/T 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:G G T 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24412514_24412623:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24412450_24412623:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24412450_24412623:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24412450_24412623:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24412450_24412623:MRS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 24418786 T/C 1 11 24 35 5.25217348924221 12.5407123871079 -7.2885388978657 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0169121962443327 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418689_24419469:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418689_24418791:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418689_24418789:MRS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 25967068 C/T 1 15 16 31 7.16205475805756 8.36047492473861 -1.19842016668105 T:C C T 10 0.522529682796163 0.721148115439186 ENSG00000112343:ENST00000349458:exon_25966563_25967161:TRIM38;ENSG00000112343:ENST00000357085:exon_25966744_25967161:TRIM38 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26056072 G/C 1 38 54 92 18.1438720537458 28.2166028709928 -10.072730817247 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0370760040089987 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26056390 G/A 1 133 8 141 63.5035521881103 4.1802374623693 59.323314725741 A:G G A 10 0.522529682796163 4.33227070434546e-28 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26104280 T/C 1 49 57 106 23.396045542988 29.7841919193813 -6.38814637639327 T:C T C 10 0.522529682796163 0.243274515350827 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26124430 C/T 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 T:C C T 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000180573:ENST00000377791:exon_26124373_26124969:HIST1H2AC;ENSG00000180573:ENST00000314088:exon_26124418_26124977:HIST1H2AC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 30 22 52 14.3241095161151 11.4956530215156 2.82845649459953 T:C T C 10 0.522529682796163 0.488611519623501 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26370707 T/C 1 21 15 36 10.0268766612806 7.83794524194244 2.18893141933813 T:C T C 10 0.522529682796163 0.507683181290909 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26370748 G/A 1 29 20 49 13.8466391989113 10.4505936559233 3.39604554298801 A:G G A 10 0.522529682796163 0.391396126383108 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26370719_26370831:BTN3A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26374549 T/C 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 T:C T C 10 0.522529682796163 0.491321069758129 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26405835 G/A 1 12 11 23 5.72964380644604 5.74782651075779 -0.018182704311748 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000026950:ENST00000476549:exon_26405770_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000289361:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000396934:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000450085:exon_26405732_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000425234:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000427334:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000506698:exon_26405586_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000414912:exon_26405600_26405876:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000082468:exon_26405600_26405876:BTN3A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26413368 T/G 1 8 11 19 3.8197625376307 5.74782651075779 -1.9280639731271 T:G T G 10 0.522529682796163 0.492106910577732 ENSG00000026950:ENST00000476549:exon_26412933_26413474:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000513047:exon_26412933_26413445:BTN3A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26413744 C/A 1 20 18 38 9.54940634407674 9.40553429033093 0.143872053745806 A:C:G C A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000026950:ENST00000289361:exon_26413397_26415444:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000414912:exon_26413397_26414301:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000082468:exon_26413397_26415432:BTN3A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26446209 C/T 1 13 10 23 6.20711412364988 5.22529682796163 0.981817295688251 T:C C T 10 0.522529682796163 0.835281075870211 ENSG00000111801:ENST00000244519:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000361232:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000496719:exon_26445932_26446211:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000480110:exon_26444185_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000457225:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000339789:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000396921:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000487272:exon_26445932_26446213:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000483179:exon_26445766_26446213:BTN3A3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 131 130 261 62.5486115537026 67.9288587635012 -5.38024720979853 A:G G A 10 0.522529682796163 0.535623247935362 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 24 30 54 11.4592876128921 15.6758904838849 -4.2166028709928 A:G A G 10 0.522529682796163 0.276976700611027 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 42 43 85 20.0537533225612 22.468776360235 -2.41502303767385 A:G A G 10 0.522529682796163 0.664352621486475 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29523670 C/A 1 11 8 19 5.25217348924221 4.1802374623693 1.0719360268729 A:C C A 10 0.522529682796163 0.653993185631586 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29523859 G/C 1 35 27 62 16.7114611021343 14.1083014354964 2.6031596666379 C:G G C 10 0.522529682796163 0.527647027718943 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29523872 A/G 1 27 28 55 12.8916985645036 14.6308311182926 -1.73913255378896 A:G A G 10 0.522529682796163 0.686526580129989 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29524003 A/G 1 22 28 50 10.5043469784844 14.6308311182926 -4.12648413980815 A:G A G 10 0.522529682796163 0.25967250744081 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 214 257 471 102.178647881621 134.290128478614 -32.1114805969928 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00314016191746127 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29691713 A/C 1 9 23 32 4.29723285483453 12.0181827043117 -7.72094984947721 A:C A C 10 0.522529682796163 0.00731626660782005 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29691744 C/G 1 3 21 24 1.43241095161151 10.9731233387194 -9.54071238710791 C:G C G 10 0.522529682796163 0.000102837799591831 ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29691717_29692225:HLA-F HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 5 9 14 2.38735158601918 4.70276714516547 -2.31541555914628 A:C A C 10 0.522529682796163 0.286340857888341 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 5 9 14 2.38735158601918 4.70276714516547 -2.31541555914628 A:T A T 10 0.522529682796163 0.286340857888341 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29695713 C/T 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 T:C C T 10 0.522529682796163 0.231786359083755 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29695854 G/A 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 A:G G A 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29695734_29695883:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000475996:exon_29695734_29697128:HLA-F HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29795657 G/A 0 8 0 8 3.8197625376307 0 3.8197625376307 G G 10 0.522529682796163 0.00825889449847131 ENSG00000204632:ENST00000376828:exon_29795613_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000428701:exon_29795510_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000360323:exon_29795598_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000442051:exon_29795620_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478355:exon_29795622_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000376818:exon_29795622_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478519:exon_29795622_29795694:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000376815:exon_29795622_29795694:HLA-G HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29795993 G/A 0 11 0 11 5.25217348924221 0 5.25217348924221 G G 10 0.522529682796163 0.00108694656670985 ENSG00000204632:ENST00000376828:exon_29795824_29796093:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000428701:exon_29795824_29796093:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000360323:exon_29795824_29796093:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000442051:exon_29795824_29796093:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478355:exon_29795824_29796093:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000376818:exon_29795824_29796093:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478519:exon_29795824_29796093:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000376815:exon_29795824_29796093:HLA-G HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29797696 A/G 0 9 0 9 4.29723285483453 0 4.29723285483453 A A 10 0.522529682796163 0.00419379916107509 ENSG00000204632:ENST00000376828:exon_29797593_29797709:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000428701:exon_29797593_29797709:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000360323:exon_29797593_29797709:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478355:exon_29797195_29797709:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000376818:exon_29797593_29797709:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000478519:exon_29797593_29797709:HLA-G;ENSG00000204632:ENST00000376815:exon_29797593_29797709:HLA-G HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 1 507 1 508 242.077450822345 0.522529682796163 241.554921139549 A:C A C 10 0.522529682796163 5.82441190928089e-141 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 37 45 82 17.666401736542 23.5138357258273 -5.84743398928536 A:G A G 10 0.522529682796163 0.223992619857650 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 44 28 72 21.0086939569688 14.6308311182926 6.37786283867627 A:C C A 10 0.522529682796163 0.156589204082393 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30164467 C/A 1 35 33 68 16.7114611021343 17.2434795322734 -0.532018430139079 A:C C A 10 0.522529682796163 0.904053335235756 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30164313_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30164356_30164523:TRIM26 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30164497 G/A 1 42 28 70 20.0537533225612 14.6308311182926 5.42292220426859 A:G G A 10 0.522529682796163 0.231392444725900 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30164313_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30164356_30164523:TRIM26 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30313340 G/C 1 50 61 111 23.8735158601919 31.8743106505659 -8.00079479037409 C:G G C 10 0.522529682796163 0.12976953400999 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30457283 G/T 1 10 8 18 4.77470317203837 4.1802374623693 0.594465709669066 T:G G T 10 0.522529682796163 0.817891150332414 ENSG00000204592:ENST00000427226:exon_30457231_30457372:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457231_30457372:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457244_30457372:HLA-E HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 537 519 1056 256.401560338461 271.192905371209 -14.791345032748 A:G G A 10 0.522529682796163 0.371726294918742 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30458222 C/T 1 608 537 1145 290.301952859933 280.598439661539 9.70351319839341 T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.57415278573333 ENSG00000204592:ENST00000427226:exon_30458070_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 22 13 35 10.5043469784844 6.79288587635012 3.7114611021343 A:G G A 10 0.522529682796163 0.238248944143098 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30529816 G/A 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 A:G G A 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30527808_30529901:PRR3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30530203 A/G 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30569951 G/A 1 13 10 23 6.20711412364988 5.22529682796163 0.981817295688251 A:G G A 10 0.522529682796163 0.835281075870211 ENSG00000204569:ENST00000376511:exon_30569713_30570468:PPP1R10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30656509 G/A 1 25 31 56 11.9367579300959 16.1984201666811 -4.26166223658513 A:G G A 10 0.522529682796163 0.285328621215404 ENSG00000137404:ENST00000259953:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000470733:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000482141:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000462857:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376420:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000474864:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000444096:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000495946:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376421:exon_30655829_30656719:NRM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30672326 T/C 1 18 9 27 8.59446570966907 4.70276714516547 3.8916985645036 T:C T C 10 0.522529682796163 0.176868029794727 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30672342 A/G 1 21 13 34 10.0268766612806 6.79288587635012 3.23399078493046 A:G A G 10 0.522529682796163 0.30519106144782 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30695920 C/T 1 198 199 397 94.5391228063597 103.983406876436 -9.44428407007671 T:C C T 10 0.522529682796163 0.365851152747402 ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000432446:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000422641:exon_30695513_30695922:FLOT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 T:C C T 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 A:C A C 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30882634 C/T 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30882781 G/T 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30887972 C/T 1 5 9 14 2.38735158601918 4.70276714516547 -2.31541555914628 T:C C T 10 0.522529682796163 0.286340857888341 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30887988 C/T 1 13 4 17 6.20711412364988 2.09011873118465 4.11699539246523 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0528875086287521 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30888169 G/A 1 15 3 18 7.16205475805756 1.56758904838849 5.59446570966907 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00859335318552677 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 11 21 32 5.25217348924221 10.9731233387194 -5.72094984947721 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0510674435816706 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30890483 G/T 1 24 20 44 11.4592876128921 10.4505936559233 1.00869395696883 T:G G T 10 0.522529682796163 0.880274360748163 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30890360_30890551:VARS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30892322 C/T 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30892131_30892341:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 11 10 21 5.25217348924221 5.22529682796163 0.0268766612805775 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 30893428 G/A 1 7 9 16 3.34229222042686 4.70276714516547 -1.36047492473861 A:G G A 10 0.522529682796163 0.618833530377833 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30893321_30893451:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893321_30893496:VARS2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31110786 T/A 1 12 26 38 5.72964380644604 13.5857717527002 -7.85612794625419 A:T T A 10 0.522529682796163 0.0138983701308941 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110740_31110911:CCHCR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31118511 T/G 1 14 8 22 6.68458444085372 4.1802374623693 2.50434697848442 T:G T G 10 0.522529682796163 0.39388166009814 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 6 8 14 2.86482190322302 4.1802374623693 -1.31541555914628 C:G G C 10 0.522529682796163 0.595734183488216 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31122330 G/A 1 11 15 26 5.25217348924221 7.83794524194244 -2.58577175270024 A:G G A 10 0.522529682796163 0.332278501659484 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31124849 C/T 1 18 11 29 8.59446570966907 5.74782651075779 2.84663919891127 T:C C T 10 0.522529682796163 0.353864410903891 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31322367 T/G 1 47 14 61 22.4411049085803 7.31541555914628 15.1256893494341 T:G T G 10 0.522529682796163 9.0912006561101e-05 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 39 14 53 18.6213423709496 7.31541555914628 11.3059268118034 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00218516236268821 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 59 5 64 28.1707487150264 2.61264841398082 25.5581003010456 T:C T C 10 0.522529682796163 8.56722805646386e-12 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31322855 C/T 1 54 31 85 25.7833971290072 16.1984201666811 9.58497696232615 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0392515700160524 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 1954 715 2669 932.976999816298 373.608723199257 559.368276617041 T:C C T 10 0.522529682796163 8.04483322857052e-109 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31431757 A/G 1 61 66 127 29.1256893494341 34.4869590645468 -5.36126971511269 A:G A G 10 0.522529682796163 0.3745802397964 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31473957 C/G 1 14 10 24 6.68458444085372 5.22529682796163 1.45928761289209 C:G C G 10 0.522529682796163 0.683803771305971 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31498737 G/A 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 A:G G A 10 0.522529682796163 0.827769696334975 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31525448 C/T 1 10 14 24 4.77470317203837 7.31541555914628 -2.54071238710791 T:C C T 10 0.522529682796163 0.314811911172675 ENSG00000204498:ENST00000376146:exon_31525405_31525626:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376148:exon_31525405_31525626:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376145:exon_31525405_31525581:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000496233:exon_31525405_31525482:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000473655:exon_31525405_31525736:NFKBIL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31540556 T/C 1 85 120 205 40.5849769623261 62.7035619355396 -22.1185849732134 T:C T C 10 0.522529682796163 0.00206073614084371 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 135 116 251 64.458492822518 60.6134432043549 3.8450496181631 A:C C A 10 0.522529682796163 0.658446954757092 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31598489 A/G 1 39 34 73 18.6213423709496 17.7660092150695 0.855333155880103 A:G A G 10 0.522529682796163 0.906909457136618 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 117 105 222 55.8640271128489 54.8656166935971 0.998410419251819 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.946455579656385 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 168 126 294 80.2150132902446 65.8387400323165 14.3762732579281 A:G A G 10 0.522529682796163 0.101995285291205 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 100 137 237 47.7470317203837 71.5865665430743 -23.8395348226906 A:C:G C G 10 0.522529682796163 0.00218363533226629 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 80 93 173 38.197625376307 48.5952605000432 -10.3976351237362 T:C C T 10 0.522529682796163 0.127777615355378 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 7 16 23 3.34229222042686 8.36047492473861 -5.01818270431175 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0385905673739683 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31609272 T/C 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C T C 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000204463:ENST00000462875:exon_31608602_31609369:BAT3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 25 21 46 11.9367579300959 10.9731233387194 0.963634591376504 A:G A G 10 0.522529682796163 0.882893518803629 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31612866 G/A 1 44 36 80 21.0086939569688 18.8110685806619 2.19762537630696 A:G G A 10 0.522529682796163 0.655504899342975 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000439687:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000469182:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000453833:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000435080:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000462682:exon_31612723_31612962:BAT3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 47 45 92 22.4411049085803 23.5138357258273 -1.072730817247 T:C C T 10 0.522529682796163 0.835380606741501 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 29 33 62 13.8466391989113 17.2434795322734 -3.3968403333621 A:C C A 10 0.522529682796163 0.445966797680052 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31639979 C/T 1 24 21 45 11.4592876128921 10.9731233387194 0.486164274172667 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31655438 G/A 1 17 14 31 8.11699539246523 7.31541555914628 0.801579833318948 A:G G A 10 0.522529682796163 0.858135513379526 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000468205:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000490209:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000474007:exon_31655352_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31655430_31655517:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31655419_31655517:XXbac-BPG32J3.20 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 49 42 91 23.396045542988 21.9462466774388 1.44979886554917 A:G G A 10 0.522529682796163 0.83393241308066 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31762843 G/C 1 14 7 21 6.68458444085372 3.65770777957314 3.02687666128058 C:G G C 10 0.522529682796163 0.198668287049760 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31762844 G/T 1 14 5 19 6.68458444085372 2.61264841398082 4.0719360268729 T:G G T 10 0.522529682796163 0.0686216289829668 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31864547 G/T 1 14 4 18 6.68458444085372 2.09011873118465 4.59446570966907 T:G G T 10 0.522529682796163 0.0338861088349796 ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000465429:exon_31864383_31864601:EHMT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 A:G A G 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 32088854 G/C 1 32 34 66 15.2790501505228 17.7660092150695 -2.48695906454676 C:G G C 10 0.522529682796163 0.541135514556116 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32088766_32088901:ATF6B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 32150296 C/A 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:C C A 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 32157639 C/T 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 T:C C T 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000204304:ENST00000375050:exon_32157472_32157963:PBX2;ENSG00000204304:ENST00000478678:exon_32157472_32157719:PBX2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 9 34 43 4.29723285483453 17.7660092150695 -13.468776360235 T:C T C 10 0.522529682796163 4.18760820261261e-05 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 19 50 69 9.0719360268729 26.1264841398081 -17.0545481129352 A:C C A 10 0.522529682796163 5.02486291891148e-05 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 163 194 357 77.8276617042254 101.370758462456 -23.5430967582302 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0127802905846517 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 32826233 A/G 1 245 206 451 116.98022771494 107.64111465601 9.33911305893049 A:G A G 10 0.522529682796163 0.396278565292264 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32826141_32826677:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000395333:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32826141_32826499:PSMB9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 87 97 184 41.5399175967338 50.6853792312278 -9.14546163449398 A:G G A 10 0.522529682796163 0.184486653589540 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 37 38 75 17.666401736542 19.8561279462542 -2.18972620971222 A:G G A 10 0.522529682796163 0.644858076027232 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 32944094 G/C 1 74 59 133 35.3328034730839 30.8292512849736 4.50355218811033 C:G G C 10 0.522529682796163 0.487579034352381 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944027_32944241:BRD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 17 25 42 8.11699539246523 13.0632420699041 -4.94624667743884 A:G G A 10 0.522529682796163 0.163750215642684 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 128 107 235 61.1162006020911 55.9106760591894 5.20552454290171 T:C T C 10 0.522529682796163 0.514199942330549 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 32948426 C/T 1 191 160 351 91.1968305859329 83.6047492473861 7.59208133854679 T:C C T 10 0.522529682796163 0.42338637700703 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32948359_32949063:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482838:exon_32948359_32948543:BRD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 42 30 72 20.0537533225612 15.6758904838849 4.37786283867627 T:C C T 10 0.522529682796163 0.345610308231388 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 1 453 167 620 216.294053693338 87.2624570269592 129.031596666379 A:C:G A G 10 0.522529682796163 3.99389360405689e-26 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33173842 G/A 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:G G A 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33232521 C/T 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 T:C C T 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000223501:ENST00000493379:exon_33232151_33232677:VPS52 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 13 11 24 6.20711412364988 5.74782651075779 0.459287612892089 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 A:G G A 10 0.522529682796163 0.568106121039098 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33272712 C/A 1 10 16 26 4.77470317203837 8.36047492473861 -3.58577175270024 A:C C A 10 0.522529682796163 0.173614440209318 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 97 89 186 46.3146207687722 46.5051417688585 -0.190521000086306 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33281842 G/T 1 23 6 29 10.9818172956883 3.13517809677698 7.84663919891127 T:G G T 10 0.522529682796163 0.00443160895633357 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33281843 A/T 1 21 6 27 10.0268766612806 3.13517809677698 6.8916985645036 A:T A T 10 0.522529682796163 0.0108498760599228 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 7 14 21 3.34229222042686 7.31541555914628 -3.97312333871942 T:C T C 10 0.522529682796163 0.124249396105681 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 57 69 126 27.2158080806187 36.0545481129352 -8.83874003231653 A:G A G 10 0.522529682796163 0.129331289211767 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33359716 G/C 1 15 18 33 7.16205475805756 9.40553429033093 -2.24347953227338 C:G G C 10 0.522529682796163 0.487864411911794 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000450504:exon_33359638_33359774:KIFC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33636907 C/T 1 9 25 34 4.29723285483453 13.0632420699041 -8.76600921506954 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00304923082429929 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33636751_33636933:ITPR3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33638180 C/T 1 6 12 18 2.86482190322302 6.27035619355396 -3.40553429033093 T:C C T 10 0.522529682796163 0.155342186917693 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33638102_33638353:ITPR3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 33641379 T/C 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33641368_33641497:ITPR3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 16 9 25 7.63952507526139 4.70276714516547 2.93675793009593 A:C C A 10 0.522529682796163 0.317125505244083 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 36437849 G/T 1 22 25 47 10.5043469784844 13.0632420699041 -2.55889509141966 T:G G T 10 0.522529682796163 0.469089013019323 ENSG00000112078:ENST00000373731:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000483557:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000498267:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000481911:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000449081:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000265344:exon_36437829_36438034:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000460983:exon_36437829_36438034:KCTD20 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 147 216 363 70.188136628964 112.866411483971 -42.6782748550072 A:C C A 10 0.522529682796163 7.44300479918865e-06 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 131 117 248 62.5486115537026 61.1359728871511 1.41263866655158 T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.898881061499795 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 36713263 A/G 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G A G 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000124772:ENST00000459703:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000244751:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000493411:exon_36713164_36713292:CPNE5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 22 12 34 10.5043469784844 6.27035619355396 4.23399078493046 A:G A G 10 0.522529682796163 0.170625176329978 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 36938432 G/A 1 35 27 62 16.7114611021343 14.1083014354964 2.6031596666379 A:G G A 10 0.522529682796163 0.527647027718943 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000490662:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36938423_36938692:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000460219:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000492754:exon_36938182_36938470:MTCH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 T:C C T 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 37349033 G/A 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 A:G G A 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 38650628 T/G 1 83 64 147 39.6300363279185 33.4418996989544 6.18813662896405 T:G T G 10 0.522529682796163 0.322517501387764 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 41 41 82 19.5762830053573 21.4237169946427 -1.84743398928536 A:G G A 10 0.522529682796163 0.740500157981846 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 77 114 191 36.7652144246955 59.5683838387626 -22.8031694140671 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00107125529600605 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 66 60 126 31.5130409354532 31.3517809677698 0.161259967683467 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 41895150 G/A 1 20 23 43 9.54940634407674 12.0181827043117 -2.46877636023501 A:G G A 10 0.522529682796163 0.541968593007101 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000494032:exon_41895112_41895382:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000489290:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000475702:exon_41895112_41895274:BYSL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 41900406 C/T 1 35 25 60 16.7114611021343 13.0632420699041 3.64821903223022 T:C C T 10 0.522529682796163 0.367959622795324 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41900099_41900784:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000372996:exon_41900099_41900734:BYSL HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 56 34 90 26.7383377634149 17.7660092150695 8.97232854834533 A:C A C 10 0.522529682796163 0.0722586795037337 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 43184132 A/C 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 A:C A C 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000508656:exon_43183896_43184241:CUL9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 43488144 A/G 1 41 29 70 19.5762830053573 15.1533608010887 4.42292220426859 A:G A G 10 0.522529682796163 0.338661998538163 ENSG00000171453:ENST00000372389:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000372373:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000436688:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000481352:exon_43487444_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000372344:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000304004:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000488601:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000455605:exon_43487444_43488786:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000495762:exon_43488054_43488165:POLR1C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 44081510 C/T 1 90 58 148 42.9723285483453 30.3067216021775 12.6656069461679 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0396000304523129 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 44371714 C/T 1 25 20 45 11.9367579300959 10.4505936559233 1.48616427417267 T:C C T 10 0.522529682796163 0.765770317490704 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 56327849 C/T 1 11 12 23 5.25217348924221 6.27035619355396 -1.01818270431175 T:C C T 10 0.522529682796163 0.682750321629788 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 56417282 C/T 1 23 16 39 10.9818172956883 8.36047492473861 2.62134237094964 T:C C T 10 0.522529682796163 0.42695432266037 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56416982_56418453:DST HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 56417545 T/C 1 12 12 24 5.72964380644604 6.27035619355396 -0.540712387107911 T:C T C 10 0.522529682796163 0.84110056521342 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56416982_56418453:DST HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 56420538 C/T 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 T:C C T 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000520144:exon_56420406_56420638:DST HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 56426246 A/G 1 9 2 11 4.29723285483453 1.04505936559233 3.25217348924221 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0683780529325207 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56426106_56426347:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56426106_56426347:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56426106_56426347:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56426106_56426347:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56426106_56426347:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56426106_56426347:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56426106_56426347:DST HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 56505063 A/G 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 A:G A G 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000446842:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000439203:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000520645:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000370765:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000281662:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000518935:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000523967:exon_56504941_56505403:DST;ENSG00000151914:ENST00000521104:exon_56504941_56505403:DST HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 56917538 G/A 1 12 9 21 5.72964380644604 4.70276714516547 1.02687666128058 A:G G A 10 0.522529682796163 0.670391349361465 ENSG00000168116:ENST00000370733:exon_56917484_56920023:KIAA1586;ENSG00000168116:ENST00000488682:exon_56917484_56917844:KIAA1586 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 57012930 C/T 1 10 9 19 4.77470317203837 4.70276714516547 0.071936026872903 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000112200:ENST00000370706:exon_57011888_57013491:ZNF451;ENSG00000112200:ENST00000357489:exon_57011888_57013491:ZNF451;ENSG00000112200:ENST00000444273:exon_57011888_57013491:ZNF451;ENSG00000112200:ENST00000491832:exon_57011888_57013491:ZNF451 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 57467175 A/G 0 0 8 8 0 4.1802374623693 -4.1802374623693 G A G 10 0.522529682796163 0.00270128884102245 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57467101_57467206:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57467080_57467206:PRIM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 13 13 0 6.79288587635012 -6.79288587635012 A G A 10 0.522529682796163 6.7035200836083e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 12 12 0 6.27035619355396 -6.27035619355396 G T G 10 0.522529682796163 0.000140396582616182 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 8 0 8 3.8197625376307 0 3.8197625376307 C C 10 0.522529682796163 0.00825889449847131 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 12 12 0 6.27035619355396 -6.27035619355396 C T C 10 0.522529682796163 0.000140396582616182 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 T:C C T 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 73332121 C/T 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000185760:ENST00000342056:exon_73331520_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370398:exon_73331809_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370392:exon_73331834_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000403813:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000355635:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000402622:exon_73331918_73332315:KCNQ5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 74155346 G/T 1 6 4 10 2.86482190322302 2.09011873118465 0.77470317203837 T:G G T 10 0.522529682796163 0.75639440366831 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000459924:exon_74155251_74155408:C6orf150 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 74228049 A/G 1 30 43 73 14.3241095161151 22.468776360235 -8.1446668441199 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0610246153934282 ENSG00000156508:ENST00000490569:exon_74227753_74228333:EEF1A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 74229258 G/T 1 19 8 27 9.0719360268729 4.1802374623693 4.8916985645036 T:G G T 10 0.522529682796163 0.0812872834898839 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 76576290 C/T 1 16 14 30 7.63952507526139 7.31541555914628 0.324109516115112 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000196586:ENST00000428345:exon_76576243_76576338:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369981:exon_76576243_76576338:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369985:exon_76576243_76576338:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369977:exon_76576243_76576338:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369978:exon_76576243_76576338:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369975:exon_76576243_76576338:MYO6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 A:T A T 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 10 10 20 4.77470317203837 5.22529682796163 -0.45059365592326 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 79657391 G/A 1 15 14 29 7.16205475805756 7.31541555914628 -0.153360801088725 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79657340_79657492:PHIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 79675701 A/G 1 6 8 14 2.86482190322302 4.1802374623693 -1.31541555914628 A:G A G 10 0.522529682796163 0.595734183488216 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79675662_79675773:PHIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 10 2 12 4.77470317203837 1.04505936559233 3.72964380644604 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0408712623846239 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 80741243 A/T 1 9 10 19 4.29723285483453 5.22529682796163 -0.928063973127097 A:T A T 10 0.522529682796163 0.819201169042762 ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80741184_80741276:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80741184_80741276:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80741184_80741276:TTK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 80749972 A/C 1 3 7 10 1.43241095161151 3.65770777957314 -2.22529682796163 A:C A C 10 0.522529682796163 0.209802689107094 ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80749913_80749997:TTK;ENSG00000112742:ENST00000504590:exon_80749913_80749988:TTK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 83949261 T/C 0 15 0 15 7.16205475805756 0 7.16205475805756 T T 10 0.522529682796163 7.43930251028075e-05 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83949258_83949355:ME1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 84865063 G/T 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:G G T 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000135315:ENST00000257766:exon_84865017_84865229:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000461137:exon_84865017_84865229:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000403245:exon_84865017_84865229:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000369671:exon_84865017_84865229:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000418491:exon_84865017_84865229:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000487999:exon_84865017_84865313:KIAA1009 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 87969480 G/A 1 31 25 56 14.8015798333189 13.0632420699041 1.73833776341487 A:G G A 10 0.522529682796163 0.689413301682807 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 31 34 65 14.8015798333189 17.7660092150695 -2.96442938175059 A:G A G 10 0.522529682796163 0.535060727601276 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 99858695 T/C 1 40 44 84 19.0988126881535 22.9913060430312 -3.89249335487769 T:C T C 10 0.522529682796163 0.444823488657778 ENSG00000132424:ENST00000369239:exon_99858617_99858840:SFRS18;ENSG00000132424:ENST00000438806:exon_99858617_99858840:SFRS18;ENSG00000132424:ENST00000478777:exon_99858617_99858840:SFRS18;ENSG00000132424:ENST00000463021:exon_99857049_99858868:SFRS18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 99893938 T/C 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 T:C T C 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000513344:exon_99893838_99894339:USP45 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 100964147 G/C 1 8 7 15 3.8197625376307 3.65770777957314 0.162054758057556 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100964056_100964203:ASCC3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 105776792 G/A 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 A:G G A 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 106536253 G/A 1 9 6 15 4.29723285483453 3.13517809677698 1.16205475805756 A:G G A 10 0.522529682796163 0.612786973154986 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106536076_106536324:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106536076_106536324:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106536076_106536324:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000424894:exon_106536076_106536324:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000489365:exon_106536229_106536324:PRDM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 107077550 G/A 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107077453_107077580:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000467262:exon_107077474_107077580:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107077489_107077580:QRSL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 40 8 48 19.0988126881535 4.1802374623693 14.9185752257842 T:C C T 10 0.522529682796163 8.6374646563595e-06 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 109770808 T/C 1 2 6 8 0.954940634407674 3.13517809677698 -2.1802374623693 T:C T C 10 0.522529682796163 0.163120845582557 ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 109775366 C/T 1 12 18 30 5.72964380644604 9.40553429033093 -3.67589048388489 T:C C T 10 0.522529682796163 0.202974205829589 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 8 16 24 3.8197625376307 8.36047492473861 -4.54071238710791 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0685617456623926 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 116973182 T/C 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C T C 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 118320421 G/A 0 20 0 20 9.54940634407674 0 9.54940634407674 G G 10 0.522529682796163 2.68185606731060e-06 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 119515005 C/T 1 9 14 23 4.29723285483453 7.31541555914628 -3.01818270431175 T:C C T 10 0.522529682796163 0.218336616351306 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119514942_119515057:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119514942_119515057:MAN1A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 126210395 T/G 1 9 15 24 4.29723285483453 7.83794524194244 -3.54071238710791 T:G T G 10 0.522529682796163 0.158191944334635 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000413085:exon_126210118_126211127:NCOA7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 126249914 T/G 1 13 3 16 6.20711412364988 1.56758904838849 4.63952507526139 T:G T G 10 0.522529682796163 0.0233136227465848 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000368353:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000438495:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000444128:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000229634:exon_126249782_126252266:NCOA7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 130031215 T/C 1 13 6 19 6.20711412364988 3.13517809677698 3.0719360268729 T:C T C 10 0.522529682796163 0.175241772830013 ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_130031169_130031370:ARHGAP18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 133072650 A/G 1 13 6 19 6.20711412364988 3.13517809677698 3.0719360268729 A:G A G 10 0.522529682796163 0.175241772830013 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 133077063 T/C 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525289:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000531279:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526157:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526192:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000524919:exon_133077021_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000530536:exon_133077053_133077174:VNN2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 133136410 C/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:C C A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 160 0 160 76.3952507526139 0 76.3952507526139 T T 10 0.522529682796163 1.17261016713562e-45 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 176 0 176 84.0347758278753 0 84.0347758278753 A A 10 0.522529682796163 2.8122070965035e-50 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 176 0 176 84.0347758278753 0 84.0347758278753 A A 10 0.522529682796163 2.8122070965035e-50 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 86 0 86 41.06244727953 0 41.06244727953 G G 10 0.522529682796163 5.95509040790888e-25 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 98 0 98 46.792091085976 0 46.792091085976 T T 10 0.522529682796163 4.36697719559155e-28 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 136944063 A/G 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G A G 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136943986_136944119:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136943986_136944119:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136943986_136944119:MAP3K5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 137026266 T/G 1 12 7 19 5.72964380644604 3.65770777957314 2.0719360268729 T:G T G 10 0.522529682796163 0.368592887865543 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137026248_137026271:MAP3K5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 137519238 A/G 1 91 60 151 43.4497988655492 31.3517809677698 12.0980178977794 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0506931528010712 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 139266402 G/A 1 12 13 25 5.72964380644604 6.79288587635012 -1.06324206990407 A:G G A 10 0.522529682796163 0.693670722544485 ENSG00000135597:ENST00000450536:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367672:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367668:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409553:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367663:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529597:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000445570:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000483468:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409812:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000258062:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000415951:exon_139266356_139266509:REPS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 139695061 G/T 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 T:G G T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000164442:ENST00000367651:exon_139693393_139695089:CITED2;ENSG00000164442:ENST00000392312:exon_139694608_139695081:CITED2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 143074549 G/A 1 13 7 20 6.20711412364988 3.65770777957314 2.54940634407674 A:G G A 10 0.522529682796163 0.272883112161240 ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143072604_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143072605_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143072606_143075068:HIVEP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 143080915 C/G 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143080909_143081804:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143080909_143081804:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143080909_143081804:HIVEP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 5 13 18 2.38735158601918 6.79288587635012 -4.40553429033093 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0562597775203475 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 144181619 A/G 1 17 20 37 8.11699539246523 10.4505936559233 -2.33359826345803 A:G A G 10 0.522529682796163 0.511423752828459 ENSG00000135521:ENST00000367576:exon_144181563_144181690:LTV1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 144269265 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000118495:ENST00000360537:exon_144269122_144269597:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000354765:exon_144269122_144269597:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000429150:exon_144269122_144269597:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000423789:exon_144269122_144269597:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000444202:exon_144269122_144269597:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000416623:exon_144269122_144269597:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000392309:exon_144269122_144269597:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000325773:exon_144269122_144269597:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000367571:exon_144269122_144269597:PLAGL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 145115037 T/C 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000152818:ENST00000367545:exon_145114970_145115127:UTRN;ENSG00000152818:ENST00000367526:exon_145114970_145115127:UTRN;ENSG00000152818:ENST00000367524:exon_145114970_145115127:UTRN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 146125793 A/T 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 A:T A T 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000118496:ENST00000237281:exon_146125508_146127557:FBXO30 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 146126419 C/T 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000118496:ENST00000237281:exon_146125508_146127557:FBXO30 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 23 22 45 10.9818172956883 11.4956530215156 -0.513835725827333 A:G G A 10 0.522529682796163 0.882699624435944 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 14 14 28 6.68458444085372 7.31541555914628 -0.630831118292562 A:G G A 10 0.522529682796163 0.85163607998196 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 149795692 G/A 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000178199:ENST00000416573:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000389942:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409806:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409948:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000462655:exon_149795375_149795749:ZC3H12D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 150048181 A/G 1 18 19 37 8.59446570966907 9.9280639731271 -1.33359826345803 A:G A G 10 0.522529682796163 0.74284768069353 ENSG00000120253:ENST00000460354:exon_150046692_150048334:NUP43;ENSG00000120253:ENST00000367404:exon_150045459_150048334:NUP43;ENSG00000120253:ENST00000340413:exon_150045459_150048334:NUP43;ENSG00000120253:ENST00000367403:exon_150045459_150048334:NUP43;ENSG00000120253:ENST00000403890:exon_150046725_150048334:NUP43 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 25 20 45 11.9367579300959 10.4505936559233 1.48616427417267 T:C C T 10 0.522529682796163 0.765770317490704 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 29 23 52 13.8466391989113 12.0181827043117 1.82845649459953 C:G G C 10 0.522529682796163 0.677927203001527 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 151766552 G/A 1 15 8 23 7.16205475805756 4.1802374623693 2.98181729568825 A:G G A 10 0.522529682796163 0.296627250051809 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 151789709 A/G 1 10 21 31 4.77470317203837 10.9731233387194 -6.19842016668105 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0303681321317061 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 151789912 C/T 1 21 22 43 10.0268766612806 11.4956530215156 -1.46877636023501 T:C C T 10 0.522529682796163 0.76055299397303 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 152443756 C/T 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C C T 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000460912:exon_152443195_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152443528_152443811:SYNE1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 155153230 G/C 1 25 25 50 11.9367579300959 13.0632420699041 -1.12648413980815 C:G G C 10 0.522529682796163 0.778473464626011 ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155153073_155155190:RBM16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 158927651 A/G 1 9 5 14 4.29723285483453 2.61264841398082 1.68458444085372 A:G A G 10 0.522529682796163 0.430617045345095 ENSG00000130338:ENST00000367097:exon_158927610_158932860:TULP4;ENSG00000130338:ENST00000367094:exon_158927610_158929408:TULP4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 159065758 C/G 1 22 31 53 10.5043469784844 16.1984201666811 -5.69407318819664 C:G C G 10 0.522529682796163 0.130943131452568 ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159065714_159065771:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159065714_159065770:DYNLT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 159178345 C/T 1 10 8 18 4.77470317203837 4.1802374623693 0.594465709669066 T:C C T 10 0.522529682796163 0.817891150332414 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159178243_159178413:SYTL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 18 7 25 8.59446570966907 3.65770777957314 4.93675793009593 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0694898655857537 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 34 30 64 16.2339907849305 15.6758904838849 0.55810030104557 A:T T A 10 0.522529682796163 0.90121089758487 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 159188128 A/G 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 A:G A G 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 160505207 A/G 1 33 29 62 15.7565204677266 15.1533608010887 0.603159666637897 A:G A G 10 0.522529682796163 0.899536846651567 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160504982_160505216:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160504982_160505216:IGF2R HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 23 30 53 10.9818172956883 15.6758904838849 -4.69407318819664 T:C C T 10 0.522529682796163 0.217030894420542 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 63 65 128 30.0806299838417 33.9644293817506 -3.88379939790886 T:C C T 10 0.522529682796163 0.535911065888789 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 166737980 G/A 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:G G A 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166737849_166738083:SFT2D1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 167343199 C/T 1 395 435 830 188.600775295516 227.300412016331 -38.6996367208152 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00744228004808876 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167343004_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167343006_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167343013_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167343028_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167343033_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167343086_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167343121_167343279:RNASET2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 167352104 C/A 1 10 7 17 4.77470317203837 3.65770777957314 1.11699539246523 A:C C A 10 0.522529682796163 0.63504130808849 ENSG00000026297:ENST00000358165:exon_167352084_167352496:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000477674:exon_167351486_167352475:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000310843:exon_167352100_167352141:RNASET2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 170162537 C/T 1 10 5 15 4.77470317203837 2.61264841398082 2.16205475805755 T:C C T 10 0.522529682796163 0.309170426805168 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170162525_170162627:C6orf70 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 170176146 G/A 1 15 5 20 7.16205475805756 2.61264841398082 4.54940634407674 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0454598983886916 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000492738:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170175974_170176161:C6orf70 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 170176647 C/T 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 T:C C T 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 170176648 A/G 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 A:G A G 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 126 64 190 60.1612599676835 33.4418996989544 26.719360268729 A:C:G G C 10 0.522529682796163 0.000108183897850670 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 2 12 14 0.954940634407674 6.27035619355396 -5.31541555914628 T:C T C 10 0.522529682796163 0.00557103121402613 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 170878886 A/G 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 A:G A G 10 0.522529682796163 0.293052983203674 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 9 9 18 4.29723285483453 4.70276714516547 -0.405534290330934 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 552046 A/G 1 3 10 13 1.43241095161151 5.22529682796163 -3.79288587635012 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0492990438494871 ENSG00000197461:ENST00000402802:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000344323:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000354513:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000482462:exon_551988_553104:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000400761:exon_551988_552092:PDGFA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 590199 A/G 1 8 11 19 3.8197625376307 5.74782651075779 -1.9280639731271 A:G A G 10 0.522529682796163 0.492106910577732 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 618938 A/G 1 9 2 11 4.29723285483453 1.04505936559233 3.25217348924221 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0683780529325207 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 814788 G/A 1 9 17 26 4.29723285483453 8.88300460753477 -4.58577175270024 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0792096106269262 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 881668 C/T 1 6 16 22 2.86482190322302 8.36047492473861 -5.49565302151558 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0303905644677924 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000427969:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450538:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000407944:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457378:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000435699:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000439679:exon_881583_881723:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457598:exon_881583_881672:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000340926:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000403868:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000467483:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000469755:exon_881583_881710:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450881:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000493681:exon_881453_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000477950:exon_881549_881767:SUN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 889169 A/G 1 15 11 26 7.16205475805756 5.74782651075779 1.41422824729976 A:G A G 10 0.522529682796163 0.695674855368122 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000407944:exon_889157_889326:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000340926:exon_889157_890404:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000419312:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_889157_889240:SUN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 909048 G/A 1 13 15 28 6.20711412364988 7.83794524194244 -1.63083111829256 A:G G A 10 0.522529682796163 0.574460764427649 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000475971:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000497943:exon_908111_909153:SUN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 940181 C/T 1 11 11 22 5.25217348924221 5.74782651075779 -0.495653021515585 T:C C T 10 0.522529682796163 0.835008349106383 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000495809:exon_940170_941036:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000437486:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000454383:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453823:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_940170_940253:COX19 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 1008966 C/T 1 9 12 21 4.29723285483453 6.27035619355396 -1.97312333871942 T:C C T 10 0.522529682796163 0.513321470356553 ENSG00000240230:ENST00000344111:exon_1005711_1009092:COX19 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 1533513 A/G 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 A:G A G 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1533390_1533547:INTS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 1542697 G/A 1 10 14 24 4.77470317203837 7.31541555914628 -2.54071238710791 A:G G A 10 0.522529682796163 0.314811911172675 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 1542814 T/C 1 16 18 34 7.63952507526139 9.40553429033093 -1.76600921506954 T:C T C 10 0.522529682796163 0.608163381004269 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 1543981 C/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:C C A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1543959_1544003:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1543959_1544243:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1543959_1544018:INTS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 2472429 C/A 1 28 13 41 13.3691688817074 6.79288587635012 6.57628300535732 A:C C A 10 0.522529682796163 0.0425470485767587 ENSG00000136213:ENST00000258711:exon_2472198_2474242:CHST12;ENSG00000136213:ENST00000432336:exon_2472198_2473010:CHST12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 2472455 A/T 1 27 24 51 12.8916985645036 12.5407123871079 0.350986177395688 A:T A T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000136213:ENST00000258711:exon_2472198_2474242:CHST12;ENSG00000136213:ENST00000432336:exon_2472198_2473010:CHST12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 40 31 71 19.0988126881535 16.1984201666811 2.90039252147243 T:C T C 10 0.522529682796163 0.552982908533628 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 2578181 C/T 1 18 18 36 8.59446570966907 9.40553429033093 -0.811068580661868 T:C C T 10 0.522529682796163 0.868001561467127 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 17 13 30 8.11699539246523 6.79288587635012 1.32410951611511 T:C T C 10 0.522529682796163 0.716107033674038 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 2578371 G/A 1 12 12 24 5.72964380644604 6.27035619355396 -0.540712387107911 A:G G A 10 0.522529682796163 0.84110056521342 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 2582907 C/T 1 13 7 20 6.20711412364988 3.65770777957314 2.54940634407674 T:C C T 10 0.522529682796163 0.272883112161240 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2582838_2582957:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2582838_2582957:C7orf27 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 18 14 32 8.59446570966907 7.31541555914628 1.27905015052279 T:C T C 10 0.522529682796163 0.724992015605387 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 2962364 T/C 1 11 17 28 5.25217348924221 8.88300460753477 -3.63083111829256 T:C T C 10 0.522529682796163 0.188544692376854 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2962268_2962394:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2962268_2962674:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2962268_2962394:CARD11 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 8125964 C/T 1 11 20 31 5.25217348924221 10.4505936559233 -5.19842016668105 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0721774419071778 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8125823_8126968:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8125823_8128710:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000489405:exon_8125823_8126569:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000482540:exon_8125823_8128707:GLCCI1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 17378858 A/G 1 23 29 52 10.9818172956883 15.1533608010887 -4.17154350540047 A:G A G 10 0.522529682796163 0.268426236577195 ENSG00000106546:ENST00000242057:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000463496:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000401808:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000492120:exon_17378610_17379151:AHR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 17379110 G/A 1 29 16 45 13.8466391989113 8.36047492473861 5.48616427417267 A:G G A 10 0.522529682796163 0.134755173139361 ENSG00000106546:ENST00000242057:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000463496:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000401808:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000492120:exon_17378610_17379151:AHR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 20180717 C/G 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 C:G C G 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20176020_20180781:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20180248_20180781:MACC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 20193979 T/G 1 20 11 31 9.54940634407674 5.74782651075779 3.80157983331895 T:G T G 10 0.522529682796163 0.208810262685018 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20193816_20194004:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20193816_20194004:MACC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 20197911 C/T 1 13 5 18 6.20711412364988 2.61264841398082 3.59446570966907 T:C C T 10 0.522529682796163 0.102291148092561 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 20198440 G/A 1 14 19 33 6.68458444085372 9.9280639731271 -3.24347953227338 A:G G A 10 0.522529682796163 0.297406103340157 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 20198953 A/G 1 7 10 17 3.34229222042686 5.22529682796163 -1.88300460753477 A:G A G 10 0.522529682796163 0.468082532065744 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 20201458 G/A 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20201371_20201493:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20201371_20201493:MACC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 21956405 G/A 1 17 14 31 8.11699539246523 7.31541555914628 0.801579833318948 A:G G A 10 0.522529682796163 0.858135513379526 ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000373934:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000405437:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000465490:exon_21956372_21956515:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000396561:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000447180:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000435031:exon_21956372_21956512:CDCA7L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 23357321 C/T 1 2 6 8 0.954940634407674 3.13517809677698 -2.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.163120845582557 ENSG00000136231:ENST00000258729:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000421467:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000417854:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000435131:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000498363:exon_23357258_23357452:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000467592:exon_23357312_23357332:IGF2BP3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 23728916 G/A 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 A:G G A 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000188732:ENST00000409192:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000344962:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000429719:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000462546:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000409994:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000409653:exon_23728888_23729078:C7orf46;ENSG00000188732:ENST00000446234:exon_23728888_23729078:C7orf46 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 24742436 T/C 1 54 47 101 25.7833971290072 24.5588950914197 1.22450203758754 T:C T C 10 0.522529682796163 0.84249499397009 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 24854765 G/A 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 A:G G A 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000070882:ENST00000313367:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000353930:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000352860:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409863:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396431:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409452:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409759:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409555:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396429:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409069:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000486214:exon_24854732_24854822:OSBPL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 25181912 T/C 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C T C 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000153790:ENST00000409280:exon_25181860_25181951:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000283905:exon_25181860_25181951:C7orf31 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 25194665 G/C 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000153790:ENST00000409280:exon_25194630_25194811:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000283905:exon_25194630_25194811:C7orf31 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 25 39 64 11.9367579300959 20.3786576290504 -8.44189969895443 A:G G A 10 0.522529682796163 0.044454957786588 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 33060946 A/G 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 A:G A G 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000122643:ENST00000456458:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000381626:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000396152:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000242210:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000405342:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409467:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409787:exon_33060884_33060969:NT5C3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 35709842 C/T 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 T:C C T 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000122557:ENST00000396081:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000311350:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000413517:exon_35709825_35709938:HERPUD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 36459076 G/A 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:G G A 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36458853_36459088:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36458853_36459088:ANLN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 10 12 22 4.77470317203837 6.27035619355396 -1.49565302151559 T:C C T 10 0.522529682796163 0.531644723723978 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 40027484 A/G 1 18 17 35 8.59446570966907 8.88300460753477 -0.288538897865704 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000326351:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000484589:exon_40027435_40027857:CDK13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 40127767 G/A 1 18 18 36 8.59446570966907 9.40553429033093 -0.811068580661868 A:G G A 10 0.522529682796163 0.868001561467127 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000478563:exon_40127725_40127930:CDK13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 64168806 T/C 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 64169019 G/A 1 10 5 15 4.77470317203837 2.61264841398082 2.16205475805755 A:G G A 10 0.522529682796163 0.309170426805168 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 64169061 G/A 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 A:G G A 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 64291987 G/A 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 A:G G A 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 65429359 G/A 1 39 27 66 18.6213423709496 14.1083014354964 4.51304093545324 A:G G A 10 0.522529682796163 0.324287960215613 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000461622:exon_65429133_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000462371:exon_65429317_65429445:GUSB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 65617284 G/A 1 20 8 28 9.54940634407674 4.1802374623693 5.36916888170744 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0568381521859327 ENSG00000241258:ENST00000422170:exon_65617195_65617884:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000360415:exon_65617195_65619555:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000395326:exon_65617195_65619548:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000431089:exon_65617195_65617857:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000398684:exon_65617195_65617498:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000338592:exon_65617195_65618276:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000415001:exon_65617195_65617884:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000492264:exon_65617195_65617639:CRCP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C T C 10 0.522529682796163 0.728776437395601 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 66098384 G/A 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000243335:ENST00000275532:exon_66098262_66098431:KCTD7;ENSG00000243335:ENST00000443322:exon_66098262_66098431:KCTD7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 24 19 43 11.4592876128921 9.9280639731271 1.53122363976499 A:C C A 10 0.522529682796163 0.651110301177106 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 31 19 50 14.8015798333189 9.9280639731271 4.87351586019185 A:T:C C T 10 0.522529682796163 0.202510523252255 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 35 16 51 16.7114611021343 8.36047492473861 8.35098617739569 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0240454648734161 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 73753250 T/C 1 25 20 45 11.9367579300959 10.4505936559233 1.48616427417267 T:C T C 10 0.522529682796163 0.765770317490704 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 75614953 T/C 1 14 21 35 6.68458444085372 10.9731233387194 -4.2885388978657 T:C T C 10 0.522529682796163 0.176028958540217 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 19 8 27 9.0719360268729 4.1802374623693 4.8916985645036 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0812872834898839 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 75959188 G/A 1 96 81 177 45.8371504515684 42.3249043064892 3.51224614507915 A:G G A 10 0.522529682796163 0.651790240684606 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 15 11 26 7.16205475805756 5.74782651075779 1.41422824729976 T:C C T 10 0.522529682796163 0.695674855368122 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 76984572 G/A 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000186088:ENST00000449779:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000257626:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000455630:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000334003:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000434084:exon_76984530_76984601:PION HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 77256407 A/G 1 28 17 45 13.3691688817074 8.88300460753477 4.48616427417267 A:G A G 10 0.522529682796163 0.232221263921858 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 22 20 42 10.5043469784844 10.4505936559233 0.0537533225611551 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 86800351 A/G 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G A G 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000135164:ENST00000331242:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000413276:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000447863:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000414194:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000394702:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000411766:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000425406:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000420131:exon_86800311_86800373:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000449088:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000430405:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000432937:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000394703:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000434534:exon_86800311_86800367:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000412139:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000425705:exon_86800311_86800405:DMTF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 91632306 C/T 1 7 10 17 3.34229222042686 5.22529682796163 -1.88300460753477 T:C C T 10 0.522529682796163 0.468082532065744 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 91708898 A/G 1 15 9 24 7.16205475805756 4.70276714516547 2.45928761289209 A:G A G 10 0.522529682796163 0.414495787724859 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91708393_91709424:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91708393_91709466:AKAP9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 94173803 T/C 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 T:C T C 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000127995:ENST00000297273:exon_94173723_94173842:CASD1;ENSG00000127995:ENST00000265739:exon_94173723_94173842:CASD1;ENSG00000127995:ENST00000394380:exon_94173723_94173842:CASD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 95800820 T/C 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 T:C T C 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000004864:ENST00000265631:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000416240:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000490072:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000484495:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000492869:exon_95800784_95800836:SLC25A13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 100280624 G/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G G A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 100285888 C/T 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 T:C C T 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100285827_100287071:GIGYF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 100458795 T/C 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 T:C T C 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000146828:ENST00000448342:exon_100458634_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000418037:exon_100458760_100458802:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000416675:exon_100458760_100458852:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100457772_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100456358_100459206:SLC12A9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 100466441 G/A 1 35 18 53 16.7114611021343 9.40553429033093 7.30592681180336 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0535165992517695 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000437505:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100465918_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100466433_100466488:TRIP6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 31 16 47 14.8015798333189 8.36047492473861 6.44110490858034 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0786707537182341 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 100468398 T/C 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 T:C T C 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 100482026 T/C 1 68 52 120 32.4679815698609 27.1715435054005 5.29643806446044 T:C T C 10 0.522529682796163 0.361265256508937 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 100486035 C/A 1 19 17 36 9.0719360268729 8.88300460753477 0.188931419338132 A:C C A 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 100486088 C/T 1 13 17 30 6.20711412364988 8.88300460753477 -2.67589048388489 T:C C T 10 0.522529682796163 0.364089214287968 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 100486656 T/G 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:G T G 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000176125:ENST00000388761:exon_100486346_100487339:UFSP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 100850982 G/A 1 9 10 19 4.29723285483453 5.22529682796163 -0.928063973127097 A:G G A 10 0.522529682796163 0.819201169042762 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100850859_100851005:PLOD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 101837149 G/A 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000360264:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000425244:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000393824:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000338990:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000292535:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000412016:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000415720:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000436903:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000431850:exon_101837122_101837170:CUX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 101926407 G/A 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101926313_101927249:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101926313_101927249:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101926313_101927250:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101926313_101927224:CUX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 105206088 T/C 1 23 22 45 10.9818172956883 11.4956530215156 -0.513835725827333 T:C T C 10 0.522529682796163 0.882699624435944 ENSG00000135249:ENST00000257700:exon_105205977_105206095:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000497979:exon_105205977_105206095:RINT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 105752691 G/A 1 11 8 19 5.25217348924221 4.1802374623693 1.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.653993185631586 ENSG00000008282:ENST00000455385:exon_105752586_105752777:SYPL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 6 11 17 2.86482190322302 5.74782651075779 -2.88300460753477 T:C T C 10 0.522529682796163 0.224425269329800 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 112102071 C/G 1 12 17 29 5.72964380644604 8.88300460753477 -3.15336080108873 C:G C G 10 0.522529682796163 0.268071850620001 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102056_112102234:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102056_112102234:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000466459:exon_112102056_112102234:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000486688:exon_112102056_112102177:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102056_112102234:IFRD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 112102355 T/G 1 10 20 30 4.77470317203837 10.4505936559233 -5.67589048388489 T:G T G 10 0.522529682796163 0.0441490175766215 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102325_112102433:IFRD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 18 21 39 8.59446570966907 10.9731233387194 -2.37865762905036 A:G G A 10 0.522529682796163 0.522183815680855 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 40 37 77 19.0988126881535 19.333598263458 -0.234785575304549 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 116528240 C/T 1 34 17 51 16.2339907849305 8.88300460753477 7.35098617739569 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0488209411499201 ENSG00000198898:ENST00000464223:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000484325:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000449080:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000490693:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000461878:exon_116528181_116528753:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000417431:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000464669:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116528181_116528244:CAPZA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 116557939 C/T 1 47 53 100 22.4411049085803 27.6940731881966 -5.2529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 0.31733973001996 ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116557781_116559315:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116557781_116558242:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116557781_116559312:CAPZA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 128409225 A/G 1 28 15 43 13.3691688817074 7.83794524194244 5.53122363976499 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0953585716651787 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128409117_128411528:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128409117_128409990:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000493278:exon_128409117_128409250:CALU HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 31 24 55 14.8015798333189 12.5407123871079 2.26086744621104 A:G G A 10 0.522529682796163 0.59057508075681 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 128641226 G/C 1 10 15 25 4.77470317203837 7.83794524194244 -3.06324206990407 C:G G C 10 0.522529682796163 0.235738342127358 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128641113_128641288:TNPO3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 129813738 T/C 1 18 20 38 8.59446570966907 10.4505936559233 -1.85612794625419 T:C T C 10 0.522529682796163 0.627015478727312 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129813665_129813779:TMEM209 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 129832520 T/C 1 6 14 20 2.86482190322302 7.31541555914628 -4.45059365592326 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0707120772788425 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129832462_129832663:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129832462_129832663:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129832462_129832663:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129832462_129832663:TMEM209 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 130144943 G/C 1 18 8 26 8.59446570966907 4.1802374623693 4.41422824729976 C:G G C 10 0.522529682796163 0.114799439152915 ENSG00000106484:ENST00000341441:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000416162:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000378576:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000393187:exon_130144780_130146127:MEST;ENSG00000106484:ENST00000223215:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000437945:exon_130144780_130145194:MEST;ENSG00000106484:ENST00000463263:exon_130144780_130145139:MEST HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 133580447 G/A 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 A:G G A 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000469115:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000482089:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000460346:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000472020:exon_133580352_133580488:EXOC4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 133682265 A/G 1 17 17 34 8.11699539246523 8.88300460753477 -0.766009215069541 A:G A G 10 0.522529682796163 0.86437385210619 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133682245_133682386:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000478265:exon_133682245_133682387:EXOC4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 133979545 A/T 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 A:T A T 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 1 7 1 8 3.34229222042686 0.522529682796163 2.8197625376307 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0725354402980475 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 133979578 A/G 0 8 0 8 3.8197625376307 0 3.8197625376307 A A 10 0.522529682796163 0.00825889449847131 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 133979711 G/A 1 3 10 13 1.43241095161151 5.22529682796163 -3.79288587635012 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0492990438494871 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 134879830 G/A 1 27 37 64 12.8916985645036 19.333598263458 -6.44189969895443 A:G G A 10 0.522529682796163 0.132615922376436 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134879814_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134879686_134879836:WDR91 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 134880931 C/T 1 27 22 49 12.8916985645036 11.4956530215156 1.39604554298801 T:C C T 10 0.522529682796163 0.775364930827653 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134880896_134881089:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134880896_134881089:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134880896_134881089:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134880896_134881089:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134880896_134880995:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134880896_134881069:WDR91 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 134889141 G/A 1 16 16 32 7.63952507526139 8.36047492473861 -0.720949849477215 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.86046417845866 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000485942:exon_134889020_134889217:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000431482:exon_134889020_134889185:WDR91 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 135282820 T/A 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 A:T T A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135282746_135282955:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000448354:exon_135282746_135282955:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000451477:exon_135282746_135282955:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000462316:exon_135282746_135282955:NUP205 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 139415943 G/A 1 22 21 43 10.5043469784844 10.9731233387194 -0.468776360235006 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 29 21 50 13.8466391989113 10.9731233387194 2.87351586019185 A:G G A 10 0.522529682796163 0.479803941653865 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 22 12 34 10.5043469784844 6.27035619355396 4.23399078493046 T:C C T 10 0.522529682796163 0.170625176329978 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 13 7 20 6.20711412364988 3.65770777957314 2.54940634407674 A:G G A 10 0.522529682796163 0.272883112161240 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 141333733 C/G 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 C:G C G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000006530:ENST00000355413:exon_141333701_141333780:AGK;ENSG00000006530:ENST00000473247:exon_141333701_141333780:AGK;ENSG00000006530:ENST00000494688:exon_141333701_141333780:AGK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 47 0 47 22.4411049085803 0 22.4411049085803 T T 10 0.522529682796163 9.90599622979953e-14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 142965267 G/A 1 112 7 119 53.4766755268298 3.65770777957314 49.8189677472566 A:G G A 10 0.522529682796163 1.08904069286452e-23 ENSG00000197448:ENST00000409500:exon_142965184_142965277:GSTK1;ENSG00000197448:ENST00000443571:exon_142965184_142965277:GSTK1;ENSG00000197448:ENST00000358406:exon_142965184_142965277:GSTK1;ENSG00000197448:ENST00000479303:exon_142965184_142965277:GSTK1;ENSG00000197448:ENST00000473649:exon_142965184_142965277:GSTK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 148979323 C/T 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000204946:ENST00000434415:exon_148978596_148982082:ZNF783 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 150217089 G/A 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 150217309 C/T 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 150324825 C/T 1 28 16 44 13.3691688817074 8.36047492473861 5.00869395696883 T:C C T 10 0.522529682796163 0.134705717304314 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 150325175 C/T 1 4 15 19 1.90988126881535 7.83794524194244 -5.9280639731271 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00957270453916693 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 20 26 46 9.54940634407674 13.5857717527002 -4.0363654086235 C:G G C 10 0.522529682796163 0.241538223062517 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 T:C C T 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 12 7 19 5.72964380644604 3.65770777957314 2.0719360268729 T:C C T 10 0.522529682796163 0.368592887865543 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 150761314 G/A 1 7 6 13 3.34229222042686 3.13517809677698 0.207114123649882 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000488420:exon_150761289_150761448:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761289_150761454:SLC4A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 150761680 C/A 1 13 15 28 6.20711412364988 7.83794524194244 -1.63083111829256 A:C C A 10 0.522529682796163 0.574460764427649 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761613_150761831:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761613_150761778:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761613_150761847:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761613_150761854:SLC4A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 15 17 32 7.16205475805756 8.88300460753477 -1.72094984947721 A:G G A 10 0.522529682796163 0.597738714995898 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 150773165 C/T 1 20 26 46 9.54940634407674 13.5857717527002 -4.0363654086235 T:C C T 10 0.522529682796163 0.241538223062517 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000469467:exon_150773070_150773273:SLC4A2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 150774308 G/A 1 29 27 56 13.8466391989113 14.1083014354964 -0.261662236585126 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150774245_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150774000_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150774000_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150774188_150774488:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150774000_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150774000_150775179:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000459800:exon_150774188_150774599:FASTK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 151859683 G/A 1 14 11 25 6.68458444085372 5.74782651075779 0.936757930095927 A:G G A 10 0.522529682796163 0.841937992643628 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151859202_151860911:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000424877:exon_151859202_151860419:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151859202_151860911:MLL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 7 9 16 3.34229222042686 4.70276714516547 -1.36047492473861 C:G G C 10 0.522529682796163 0.618833530377833 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 10 8 18 4.77470317203837 4.1802374623693 0.594465709669066 A:G G A 10 0.522529682796163 0.817891150332414 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 158445063 G/C 1 12 13 25 5.72964380644604 6.79288587635012 -1.06324206990407 C:G G C 10 0.522529682796163 0.693670722544485 ENSG00000146918:ENST00000432615:exon_158444985_158445172:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000275830:exon_158444985_158445172:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000356309:exon_158444985_158445172:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409423:exon_158444985_158445172:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000441982:exon_158444985_158445172:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000467785:exon_158444985_158445172:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409339:exon_158444985_158445172:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000449727:exon_158444985_158445172:NCAPG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 158447855 T/G 1 11 18 29 5.25217348924221 9.40553429033093 -4.15336080108873 T:G T G 10 0.522529682796163 0.138802783884069 ENSG00000146918:ENST00000432615:exon_158447810_158447950:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000275830:exon_158447810_158447950:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000356309:exon_158447810_158447950:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409423:exon_158447810_158447950:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000441982:exon_158447810_158447950:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000467785:exon_158447810_158448147:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409339:exon_158447810_158447950:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000449727:exon_158447810_158447950:NCAPG2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 158526880 G/A 1 28 28 56 13.3691688817074 14.6308311182926 -1.26166223658512 A:G G A 10 0.522529682796163 0.789688314745373 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 158528233 A/G 1 20 29 49 9.54940634407674 15.1533608010887 -5.60395445701199 A:G A G 10 0.522529682796163 0.117097132073311 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 158534372 G/A 1 32 23 55 15.2790501505228 12.0181827043117 3.26086744621104 A:G G A 10 0.522529682796163 0.419386096279517 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 32 23 55 15.2790501505228 12.0181827043117 3.26086744621104 C:G G C 10 0.522529682796163 0.419386096279517 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 16 15 31 7.63952507526139 7.83794524194244 -0.198420166681052 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 158536334 G/A 1 15 10 25 7.16205475805756 5.22529682796163 1.93675793009593 A:G G A 10 0.522529682796163 0.549238895463454 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 14 11 25 6.68458444085372 5.74782651075779 0.936757930095927 A:G A G 10 0.522529682796163 0.841937992643628 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 7 158540945 C/T 1 9 13 22 4.29723285483453 6.79288587635012 -2.49565302151559 T:C C T 10 0.522529682796163 0.296166428569315 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158540885_158540971:ESYT2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 381344 C/G 1 9 6 15 4.29723285483453 3.13517809677698 1.16205475805756 C:G C G 10 0.522529682796163 0.612786973154986 ENSG00000147364:ENST00000518240:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000524125:exon_381341_381444:FBXO25 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 8234077 G/C 1 7 7 14 3.34229222042686 3.65770777957314 -0.315415559146281 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 8234113 G/A 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 A:G G A 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 8234192 G/C 1 9 2 11 4.29723285483453 1.04505936559233 3.25217348924221 C:G G C 10 0.522529682796163 0.0683780529325207 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 8234714 C/T 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 T:C C T 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 10285810 T/C 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000175806:ENST00000317173:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000527408:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000441698:exon_10285658_10285875:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000528246:exon_10285658_10286395:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000425987:exon_10285658_10286399:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000382490:exon_10285658_10286399:MSRA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 10623138 T/A 1 44 43 87 21.0086939569688 22.468776360235 -1.46008240326618 A:T T A 10 0.522529682796163 0.830203033549605 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 11637276 G/A 1 8 8 16 3.8197625376307 4.1802374623693 -0.360474924738607 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000154328:ENST00000530433:exon_11637107_11637461:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11637254_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11637107_11637459:NEIL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 11643803 C/T 1 13 20 33 6.20711412364988 10.4505936559233 -4.24347953227338 T:C C T 10 0.522529682796163 0.163896745013365 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 11667179 C/T 1 114 114 228 54.4316161612374 59.5683838387626 -5.13676767752516 T:C C T 10 0.522529682796163 0.507896313819755 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531733:exon_11667176_11667485:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531249:exon_11667176_11667448:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11666765_11667359:FDFT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 11706581 T/G 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 T:G T G 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 11710888 G/C 1 9 9 18 4.29723285483453 4.70276714516547 -0.405534290330934 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11710838_11711023:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526645:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525315:exon_11710838_11710971:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530573:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532370:exon_11710838_11711328:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000505496:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524500:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531502:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527215:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532656:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534382:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000528965:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524654:exon_11710867_11710988:CTSB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 T:C T C 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 10 10 20 4.77470317203837 5.22529682796163 -0.45059365592326 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 17796382 A/G 1 14 19 33 6.68458444085372 9.9280639731271 -3.24347953227338 A:G A G 10 0.522529682796163 0.297406103340157 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 17796383 C/T 1 14 19 33 6.68458444085372 9.9280639731271 -3.24347953227338 T:C C T 10 0.522529682796163 0.297406103340157 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 17814915 A/G 1 10 18 28 4.77470317203837 9.40553429033093 -4.63083111829256 A:G A G 10 0.522529682796163 0.089965085565081 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17814773_17814930:PCM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 17819572 C/T 1 24 24 48 11.4592876128921 12.5407123871079 -1.08142477421582 T:C C T 10 0.522529682796163 0.774391153653587 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 37 51 88 17.666401736542 26.6490138226043 -8.98261208606234 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0690605835593883 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 46 45 91 21.9636345913765 23.5138357258273 -1.55020113445083 T:C C T 10 0.522529682796163 0.754063217298893 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 21955116 C/T 1 9 3 12 4.29723285483453 1.56758904838849 2.72964380644604 T:C C T 10 0.522529682796163 0.150898424576211 ENSG00000158863:ENST00000427751:exon_21955027_21955131:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000450006:exon_21955027_21955131:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000289921:exon_21955027_21955131:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000464226:exon_21955077_21955350:FAM160B2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 21956108 A/G 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 A:G A G 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000158863:ENST00000450006:exon_21955934_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000289921:exon_21955934_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000464226:exon_21955934_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000436711:exon_21955985_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000356512:exon_21956057_21956130:FAM160B2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 11 6 17 5.25217348924221 3.13517809677698 2.11699539246523 T:C T C 10 0.522529682796163 0.340698354211182 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 22105502 T/C 1 20 15 35 9.54940634407674 7.83794524194244 1.7114611021343 T:C T C 10 0.522529682796163 0.614301013041636 ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000519237:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000518039:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000517789:exon_22105370_22105521:POLR3D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 22262321 T/C 1 6 12 18 2.86482190322302 6.27035619355396 -3.40553429033093 T:C T C 10 0.522529682796163 0.155342186917693 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520644:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000524285:exon_22262209_22262490:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520832:exon_22262209_22262383:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000519960:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000522881:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517552:exon_22262030_22262493:SLC39A14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 22273687 T/C 1 13 11 24 6.20711412364988 5.74782651075779 0.459287612892089 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22273586_22273793:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517370:exon_22273586_22273782:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000518348:exon_22273586_22273793:SLC39A14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 22548790 G/T 1 13 9 22 6.20711412364988 4.70276714516547 1.50434697848441 T:G G T 10 0.522529682796163 0.670538633660278 ENSG00000179388:ENST00000317216:exon_22545172_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000522910:exon_22547556_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000519492:exon_22547937_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000524088:exon_22547985_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000518773:exon_22548678_22548995:EGR3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 23423758 G/A 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 A:G G A 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 25319653 C/T 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 T:C C T 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25319570_25319724:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25319570_25319724:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25319570_25319724:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000519087:exon_25319601_25319724:CDCA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 26223857 C/T 1 33 38 71 15.7565204677266 19.8561279462542 -4.09960747852757 T:C C T 10 0.522529682796163 0.34397884476212 ENSG00000221914:ENST00000380737:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000524169:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000315985:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518215:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518890:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000517754:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518208:exon_26222614_26223922:PPP2R2A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 26510792 T/C 1 5 7 12 2.38735158601918 3.65770777957314 -1.27035619355396 T:C:G T C 10 0.522529682796163 0.568106121039098 ENSG00000092964:ENST00000521913:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000311151:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000522745:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000523027:exon_26510748_26510913:DPYSL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 33 29 62 15.7565204677266 15.1533608010887 0.603159666637897 A:G G A 10 0.522529682796163 0.899536846651567 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 86 70 156 41.06244727953 36.5770777957314 4.48536948379858 T:C C T 10 0.522529682796163 0.521553665962652 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 27311703 T/C 1 74 73 147 35.3328034730839 38.1446668441199 -2.81186337103595 T:C T C 10 0.522529682796163 0.680000823047848 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 137 106 243 65.4134334569257 55.3881463763933 10.0252870805324 A:G A G 10 0.522529682796163 0.199805320633154 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 140 107 247 66.8458444085372 55.9106760591894 10.9351683493478 A:G A G 10 0.522529682796163 0.180943166531417 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 3 13 16 1.43241095161151 6.79288587635012 -5.36047492473861 A:C A C 10 0.522529682796163 0.0101167898008487 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 20 14 34 9.54940634407674 7.31541555914628 2.23399078493046 C:G C G 10 0.522529682796163 0.494919628726952 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 12 16 28 5.72964380644604 8.36047492473861 -2.63083111829256 C:G G C 10 0.522529682796163 0.348672207955825 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 28574803 G/A 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000012232:ENST00000523149:exon_28574756_28575724:EXTL3;ENSG00000012232:ENST00000220562:exon_28573102_28575724:EXTL3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 29005093 A/G 1 6 8 14 2.86482190322302 4.1802374623693 -1.31541555914628 A:G A G 10 0.522529682796163 0.595734183488216 ENSG00000197892:ENST00000524189:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000357808:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000355514:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000404075:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000522355:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000521515:exon_29004909_29005119:KIF13B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 30567332 G/A 1 17 17 34 8.11699539246523 8.88300460753477 -0.766009215069541 A:G G A 10 0.522529682796163 0.86437385210619 ENSG00000104687:ENST00000221130:exon_30567331_30567419:GSR;ENSG00000104687:ENST00000414019:exon_30567331_30567419:GSR;ENSG00000104687:ENST00000523295:exon_30567331_30567419:GSR;ENSG00000104687:ENST00000520888:exon_30567331_30567419:GSR;ENSG00000104687:ENST00000521479:exon_30567331_30567419:GSR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 30973957 G/T 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 T:G G T 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30973870_30974044:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30973870_30974044:WRN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 30999280 G/T 1 18 7 25 8.59446570966907 3.65770777957314 4.93675793009593 T:G G T 10 0.522529682796163 0.0694898655857537 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 31024638 C/T 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C C T 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 33246538 A/G 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 A:G A G 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 33246591 G/C 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 C:G G C 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 10 12 22 4.77470317203837 6.27035619355396 -1.49565302151559 A:G A G 10 0.522529682796163 0.531644723723978 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 7 9 16 3.34229222042686 4.70276714516547 -1.36047492473861 T:C T C 10 0.522529682796163 0.618833530377833 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 9 16 25 4.29723285483453 8.36047492473861 -4.06324206990407 A:G A G 10 0.522529682796163 0.112781481348924 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 37702472 G/A 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 A:G G A 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000104221:ENST00000220659:exon_37700786_37702731:BRF2;ENSG00000104221:ENST00000520601:exon_37702220_37702731:BRF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 38095662 C/T 1 12 8 20 5.72964380644604 4.1802374623693 1.54940634407674 T:C C T 10 0.522529682796163 0.512157551421997 ENSG00000085788:ENST00000397166:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000519857:exon_38095607_38096576:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000526237:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000532222:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000520272:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000319246:exon_38095607_38095727:DDHD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 38677932 A/G 1 65 49 114 31.0355706182494 25.603954457012 5.43161616123743 A:G A G 10 0.522529682796163 0.348585718003204 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 38684853 T/C 1 15 23 38 7.16205475805756 12.0181827043117 -4.85612794625419 T:C T C 10 0.522529682796163 0.143286443954653 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521642:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521050:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38684686_38685585:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38684686_38684893:TACC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 38695996 T/C 1 20 32 52 9.54940634407674 16.7209498494772 -7.17154350540048 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0519264509758897 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522752:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38695988_38696025:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38695988_38696028:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38695988_38696064:TACC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 38852950 T/C 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 T:C T C 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000169490:ENST00000456845:exon_38852837_38853212:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000412303:exon_38852837_38853313:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000397070:exon_38852837_38853313:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000316221:exon_38852837_38853022:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000522142:exon_38852837_38853313:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000517872:exon_38852835_38853313:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000520152:exon_38852888_38853212:TM2D2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 38874910 C/G 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 C:G C G 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000168615:ENST00000487273:exon_38874738_38874933:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000481873:exon_38874738_38874933:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000468065:exon_38874738_38874933:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000379917:exon_38874738_38874933:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000481058:exon_38874555_38874933:ADAM9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 41552222 T/A 0 11 0 11 5.25217348924221 0 5.25217348924221 T T 10 0.522529682796163 0.00108694656670985 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41552110_41552321:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41552110_41552321:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41552110_41552321:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41552110_41552321:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41552110_41552321:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41552110_41552321:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41552110_41552321:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41552110_41552321:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41552110_41552321:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41552110_41552321:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41552110_41552321:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41552110_41552321:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524069:exon_41552110_41552305:ANK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 41553928 C/G 1 4 11 15 1.90988126881535 5.74782651075779 -3.83794524194244 C:G C G 10 0.522529682796163 0.0677953951072992 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41553881_41554105:ANK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 48710955 A/G 1 46 27 73 21.9636345913765 14.1083014354964 7.8553331558801 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0782998081032215 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48710798_48710958:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48710798_48710958:AC103686.1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 59512334 G/A 1 13 10 23 6.20711412364988 5.22529682796163 0.981817295688251 A:G G A 10 0.522529682796163 0.835281075870211 ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523982:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000519227:exon_59512309_59512429:NSMAF HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 61654081 G/A 1 2 9 11 0.954940634407674 4.70276714516547 -3.74782651075779 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0319652475797756 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000526846:exon_61653818_61654089:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000524602:exon_61653924_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61653992_61655656:CHD7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 67341743 A/G 1 9 10 19 4.29723285483453 5.22529682796163 -0.928063973127097 A:G A G 10 0.522529682796163 0.819201169042762 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 67577670 G/A 1 8 3 11 3.8197625376307 1.56758904838849 2.25217348924221 A:G G A 10 0.522529682796163 0.231786359083755 ENSG00000175073:ENST00000310421:exon_67576484_67579452:VCPIP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 67577966 A/G 1 5 4 9 2.38735158601918 2.09011873118465 0.297232854834533 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000175073:ENST00000310421:exon_67576484_67579452:VCPIP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 67971452 T/C 1 47 56 103 22.4411049085803 29.2616622365851 -6.82055732800479 T:C T C 10 0.522529682796163 0.199777323171974 ENSG00000121022:ENST00000357849:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521509:exon_67971446_67974259:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517736:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521386:exon_67971446_67973864:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518374:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000523890:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518747:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517793:exon_67971446_67971680:COPS5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 68074137 G/A 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 A:G G A 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521168:exon_68074046_68074150:CSPP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 68102977 T/C 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C T C 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521168:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521324:exon_68102885_68102994:CSPP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 74527996 C/T 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 T:C C T 10 0.522529682796163 0.18368068114947 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 81897200 C/T 1 12 5 17 5.72964380644604 2.61264841398082 3.11699539246523 T:C C T 10 0.522529682796163 0.150352896781338 ENSG00000076641:ENST00000220597:exon_81897011_81897612:PAG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 86389403 T/C 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 T:C T C 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000104267:ENST00000285379:exon_86389349_86389504:CA2;ENSG00000104267:ENST00000520127:exon_86389349_86389504:CA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 16 14 30 7.63952507526139 7.31541555914628 0.324109516115112 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 87520894 C/A 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:C C A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87520721_87520910:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87520721_87520904:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87520721_87520913:FAM82B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 30 22 52 14.3241095161151 11.4956530215156 2.82845649459953 T:C T C 10 0.522529682796163 0.488611519623501 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 32 37 69 15.2790501505228 19.333598263458 -4.05454811293524 A:G A G 10 0.522529682796163 0.337639310754502 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 19 19 38 9.0719360268729 9.9280639731271 -0.856127946254194 C:G C G 10 0.522529682796163 0.871379865985763 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 90995019 C/T 1 15 8 23 7.16205475805756 4.1802374623693 2.98181729568825 T:C C T 10 0.522529682796163 0.296627250051809 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000519426:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000523444:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517337:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000494804:exon_90994632_90995083:NBN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 92033502 T/C 1 7 4 11 3.34229222042686 2.09011873118465 1.25217348924221 T:C T C 10 0.522529682796163 0.553389740058569 ENSG00000155099:ENST00000285419:exon_92033484_92033632:TMEM55A;ENSG00000155099:ENST00000518359:exon_92033484_92033632:TMEM55A;ENSG00000155099:ENST00000520014:exon_92033484_92033650:TMEM55A;ENSG00000155099:ENST00000518869:exon_92033484_92033632:TMEM55A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 92083424 A/G 1 11 5 16 5.25217348924221 2.61264841398082 2.63952507526139 A:G A G 10 0.522529682796163 0.217533646462459 ENSG00000155100:ENST00000285420:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000404789:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000522894:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000524027:exon_92083366_92083517:OTUD6B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 95419698 A/G 1 6 6 12 2.86482190322302 3.13517809677698 -0.270356193553956 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95419667_95419948:RAD54B HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 95541302 A/G 1 13 9 22 6.20711412364988 4.70276714516547 1.50434697848441 A:G A G 10 0.522529682796163 0.670538633660278 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95541298_95541570:KIAA1429 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 8 5 13 3.8197625376307 2.61264841398082 1.20711412364988 T:C T C 10 0.522529682796163 0.586132476918336 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 17 11 28 8.11699539246523 5.74782651075779 2.36916888170744 T:C C T 10 0.522529682796163 0.450581355727128 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 14 10 24 6.68458444085372 5.22529682796163 1.45928761289209 T:C T C 10 0.522529682796163 0.683803771305971 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 21 22 43 10.0268766612806 11.4956530215156 -1.46877636023501 A:G G A 10 0.522529682796163 0.76055299397303 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 103306033 T/C 1 19 28 47 9.0719360268729 14.6308311182926 -5.55889509141966 T:C T C 10 0.522529682796163 0.110151067094297 ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103305833_103306072:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103305833_103306072:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103305833_103306072:UBR5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 103663912 T/G 1 22 26 48 10.5043469784844 13.5857717527002 -3.08142477421582 T:G T G 10 0.522529682796163 0.389382705479001 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 103845372 G/A 1 25 22 47 11.9367579300959 11.4956530215156 0.441104908580341 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000155096:ENST00000337198:exon_103845284_103845446:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000347770:exon_103845284_103845446:AZIN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 109215368 T/C 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000104408:ENST00000523674:exon_109215212_109215575:EIF3E HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 110301998 T/C 1 20 15 35 9.54940634407674 7.83794524194244 1.7114611021343 T:C T C 10 0.522529682796163 0.614301013041636 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 110302047 T/G 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 T:G T G 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 110539186 G/A 1 2 12 14 0.954940634407674 6.27035619355396 -5.31541555914628 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00557103121402613 ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000534623:exon_110539013_110539256:PKHD1L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 110542337 T/C 1 7 5 12 3.34229222042686 2.61264841398082 0.729643806446044 T:C T C 10 0.522529682796163 0.777148256802181 ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110542309_110542559:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110542309_110543500:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110542309_110542489:PKHD1L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 120790304 T/C 1 2 9 11 0.954940634407674 4.70276714516547 -3.74782651075779 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0319652475797756 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120790259_120790369:TAF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 120847188 T/C 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 T:C T C 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000136982:ENST00000313655:exon_120846216_120847241:DSCC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 123966085 G/A 1 13 11 24 6.20711412364988 5.74782651075779 0.459287612892089 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 57 50 107 27.2158080806187 26.1264841398081 1.08932394081056 T:C T C 10 0.522529682796163 0.847175014804125 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 124142489 T/C 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518866:exon_124142438_124142573:WDR67 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:T T A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 125499363 G/A 1 20 20 40 9.54940634407674 10.4505936559233 -0.90118731184652 A:T:G G A 10 0.522529682796163 0.87453632499247 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 125528135 G/A 1 25 21 46 11.9367579300959 10.9731233387194 0.963634591376504 A:G G A 10 0.522529682796163 0.882893518803629 ENSG00000147687:ENST00000276692:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523214:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519548:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522810:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000517678:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519776:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521546:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521973:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520321:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522310:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519232:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520938:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523888:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523152:exon_125528128_125528271:TATDN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 126448497 C/T 1 28 24 52 13.3691688817074 12.5407123871079 0.828456494599527 T:C C T 10 0.522529682796163 0.889928355265603 ENSG00000173334:ENST00000311922:exon_126448248_126450647:TRIB1;ENSG00000173334:ENST00000520847:exon_126448248_126449170:TRIB1;ENSG00000173334:ENST00000519576:exon_126448248_126449433:TRIB1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 131124559 T/C 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 T:C T C 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000153317:ENST00000524124:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000357668:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000521075:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000518721:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000343135:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000519483:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000520189:exon_131124340_131124660:ASAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 132982824 A/G 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 A:G A G 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000132294:ENST00000254624:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000407309:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000377917:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000334503:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000519656:exon_132982723_132982890:EFR3A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 132999936 A/G 1 3 7 10 1.43241095161151 3.65770777957314 -2.22529682796163 A:G A G 10 0.522529682796163 0.209802689107094 ENSG00000132294:ENST00000254624:exon_132999822_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000407309:exon_132999822_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000377917:exon_132999873_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000334503:exon_132999822_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000519656:exon_132999822_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000519920:exon_132999822_132999949:EFR3A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 133844508 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 133854970 A/G 1 14 8 22 6.68458444085372 4.1802374623693 2.50434697848442 A:G A G 10 0.522529682796163 0.39388166009814 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133854760_133855120:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133854760_133855120:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133854760_133855120:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133854760_133855120:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000477051:exon_133853798_133855120:PHF20L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 141559358 G/A 1 7 8 15 3.34229222042686 4.1802374623693 -0.837945241942444 A:G G A 10 0.522529682796163 0.797669699908133 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141559213_141559397:EIF2C2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 141566311 C/T 1 13 8 21 6.20711412364988 4.1802374623693 2.02687666128058 T:C C T 10 0.522529682796163 0.393482202967395 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000521325:exon_141566266_141566337:EIF2C2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 142148144 C/T 1 10 9 19 4.77470317203837 4.70276714516547 0.071936026872903 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000105339:ENST00000519291:exon_142148121_142148236:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518347:exon_142148121_142148236:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518198:exon_142148121_142148236:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142148121_142148236:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142148121_142148236:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142148121_142148236:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142148121_142148236:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142148121_142148236:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000395213:exon_142148121_142148236:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000395207:exon_142148121_142148232:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523058:exon_142148121_142148236:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142148121_142148236:DENND3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 142170884 C/T 1 24 14 38 11.4592876128921 7.31541555914628 4.14387205374581 T:C C T 10 0.522529682796163 0.196413888222871 ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521477:exon_142170731_142170886:DENND3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 142185580 G/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G G A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000105339:ENST00000520482:exon_142185299_142186365:DENND3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 18 14 32 8.59446570966907 7.31541555914628 1.27905015052279 T:C T C 10 0.522529682796163 0.724992015605387 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 144893084 G/A 1 22 16 38 10.5043469784844 8.36047492473861 2.14387205374581 A:G G A 10 0.522529682796163 0.519621537216951 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144893076_144893242:SCRIB HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 7 10 17 3.34229222042686 5.22529682796163 -1.88300460753477 T:C T C 10 0.522529682796163 0.468082532065744 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 144994566 G/A 1 22 19 41 10.5043469784844 9.9280639731271 0.576283005357318 A:G G A 10 0.522529682796163 0.877194379558022 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 144994581 G/A 1 19 21 40 9.0719360268729 10.9731233387194 -1.90118731184652 A:G G A 10 0.522529682796163 0.63557898252467 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 145008605 C/T 1 13 10 23 6.20711412364988 5.22529682796163 0.981817295688251 T:C C T 10 0.522529682796163 0.835281075870211 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145008486_145008613:PLEC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 145066886 A/G 1 320 364 684 152.790501505228 190.200804537803 -37.4103030325755 A:C:G A G 10 0.522529682796163 0.00458771333809451 ENSG00000178719:ENST00000313269:exon_145066860_145067583:GRINA;ENSG00000178719:ENST00000395068:exon_145066860_145067583:GRINA;ENSG00000178719:ENST00000534791:exon_145066860_145067007:GRINA;ENSG00000178719:ENST00000533044:exon_145066860_145066990:GRINA;ENSG00000178719:ENST00000527194:exon_145066860_145067262:GRINA;ENSG00000178719:ENST00000533377:exon_145066860_145067142:GRINA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 145662149 G/A 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 A:G G A 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145662140_145662303:NFKBIL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 145665407 C/T 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C C T 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665404_145665456:NFKBIL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 145665516 T/C 1 4 6 10 1.90988126881535 3.13517809677698 -1.22529682796163 T:C T C 10 0.522529682796163 0.534231980874486 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665462_145665551:NFKBIL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 145665761 G/A 1 3 9 12 1.43241095161151 4.70276714516547 -3.27035619355396 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0813542896879837 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665734_145665812:NFKBIL2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 145689915 G/A 1 4 8 12 1.90988126881535 4.1802374623693 -2.27035619355396 A:G G A 10 0.522529682796163 0.250581192216089 ENSG00000187954:ENST00000438911:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000292543:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000403000:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000424149:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000306145:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000533764:exon_145689658_145689995:CYHR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 145737636 A/G 1 16 12 28 7.63952507526139 6.27035619355396 1.36916888170744 A:G A G 10 0.522529682796163 0.706382469889948 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737527_145737707:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737527_145737707:RECQL4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 16 16 32 7.63952507526139 8.36047492473861 -0.720949849477215 T:C C T 10 0.522529682796163 0.86046417845866 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 13 14 27 6.20711412364988 7.31541555914628 -1.1083014354964 C:G C G 10 0.522529682796163 0.703625443243212 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 10 14 24 4.77470317203837 7.31541555914628 -2.54071238710791 A:G G A 10 0.522529682796163 0.314811911172675 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 145745182 T/C 1 9 12 21 4.29723285483453 6.27035619355396 -1.97312333871942 T:C T C 10 0.522529682796163 0.513321470356553 ENSG00000160959:ENST00000527730:exon_145745085_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000529022:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000292524:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000530854:exon_145745085_145745369:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000525766:exon_145744999_145745438:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000531310:exon_145744651_145745438:LRRC14 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 145747920 T/G 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 T:G T G 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000160959:ENST00000292524:exon_145746295_145750557:LRRC14;ENSG00000177021:ENST00000343593:exon_145747773_145748793:AC084125.1;ENSG00000254402:ENST00000529415:exon_145747788_145748793:LRRC24;ENSG00000254402:ENST00000533758:exon_145747823_145748793:LRRC24 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 145947776 G/A 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 A:G G A 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000198169:ENST00000292562:exon_145946514_145948767:ZNF251 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 8 146156247 C/A 1 10 2 12 4.77470317203837 1.04505936559233 3.72964380644604 A:C C A 10 0.522529682796163 0.0408712623846239 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 286593 C/A 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 A:C C A 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000107099:ENST00000469197:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000479404:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000487230:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_286461_286636:DOCK8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 312124 T/C 1 21 20 41 10.0268766612806 10.4505936559233 -0.423716994642682 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_311954_312941:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000474772:exon_311958_312166:DOCK8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 334337 A/G 1 15 15 30 7.16205475805756 7.83794524194244 -0.675890483884888 A:G A G 10 0.522529682796163 0.856233772119583 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_334225_334384:DOCK8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 370244 A/G 1 8 23 31 3.8197625376307 12.0181827043117 -8.19842016668105 A:G A G 10 0.522529682796163 0.00356497814686623 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_368018_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_370230_370300:DOCK8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 377111 G/C 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 C:G G C 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_376977_377211:DOCK8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 390512 C/T 1 5 8 13 2.38735158601918 4.1802374623693 -1.79288587635012 T:C C T 10 0.522529682796163 0.408632555469948 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_390471_390566:DOCK8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 441952 G/A 1 18 24 42 8.59446570966907 12.5407123871079 -3.94624667743884 A:G G A 10 0.522529682796163 0.279491894752423 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_441875_442009:DOCK8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 2029199 G/A 1 24 23 47 11.4592876128921 12.0181827043117 -0.558895091419659 A:G G A 10 0.522529682796163 0.88495976855092 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000457226:exon_2028987_2029221:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2029006_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2029019_2029247:SMARCA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 2073292 A/G 1 15 24 39 7.16205475805756 12.5407123871079 -5.37865762905036 A:G A G 10 0.522529682796163 0.108013128297088 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2073212_2073342:SMARCA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 2191309 C/G 1 34 36 70 16.2339907849305 18.8110685806619 -2.57707779573141 C:G C G 10 0.522529682796163 0.551840106874848 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000302401:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382186:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000417599:exon_2191266_2191428:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382185:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382183:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000324954:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382182:exon_2191266_2191408:SMARCA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 4572254 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000106688:ENST00000262352:exon_4572204_4572388:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000381910:exon_4572204_4572388:SLC1A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 4576710 T/C 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 T:C T C 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000106688:ENST00000262352:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000381910:exon_4576569_4576763:SLC1A1;ENSG00000106688:ENST00000422398:exon_4576569_4576763:SLC1A1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 5081780 G/A 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5081725_5081861:JAK2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 5762600 G/A 1 18 13 31 8.59446570966907 6.79288587635012 1.80157983331895 A:G G A 10 0.522529682796163 0.591517046321414 ENSG00000107036:ENST00000251879:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000381532:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000276898:exon_5762541_5762660:KIAA1432 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 5774225 T/G 1 41 38 79 19.5762830053573 19.8561279462542 -0.279844940896876 T:G T G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 5968416 A/G 1 15 17 32 7.16205475805756 8.88300460753477 -1.72094984947721 A:G A G 10 0.522529682796163 0.597738714995898 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 6506038 C/T 1 13 9 22 6.20711412364988 4.70276714516547 1.50434697848441 T:C C T 10 0.522529682796163 0.670538633660278 ENSG00000147854:ENST00000468435:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000276893:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000485617:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000492853:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000481243:exon_6506033_6506112:UHRF2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 6610326 C/T 1 1 7 8 0.477470317203837 3.65770777957314 -3.1802374623693 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0319085925070315 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6610192_6610356:GLDC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 6645251 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6645245_6645650:GLDC HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 6984236 G/A 1 6 10 16 2.86482190322302 5.22529682796163 -2.36047492473861 A:G G A 10 0.522529682796163 0.317915137228048 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 18 13 31 8.59446570966907 6.79288587635012 1.80157983331895 A:G G A 10 0.522529682796163 0.591517046321414 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 19346710 A/G 1 9 10 19 4.29723285483453 5.22529682796163 -0.928063973127097 A:G A G 10 0.522529682796163 0.819201169042762 ENSG00000137145:ENST00000380437:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000307015:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000453857:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380432:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380427:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000361024:exon_19346554_19347084:DENND4C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 20885204 A/G 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 A:G A G 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20885108_20885229:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20885108_20885229:KIAA1797 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 21816758 G/A 1 16 8 24 7.63952507526139 4.1802374623693 3.45928761289209 A:G G A 10 0.522529682796163 0.219555714324787 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 198 184 382 94.5391228063597 96.145461634494 -1.60633882813426 T:C T C 10 0.522529682796163 0.87799928235919 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 33062128 G/A 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 A:G G A 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000122692:ENST00000397149:exon_33062047_33062175:SMU1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 8 13 21 3.8197625376307 6.79288587635012 -2.97312333871942 A:G A G 10 0.522529682796163 0.274479547020565 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 8 18 26 3.8197625376307 9.40553429033093 -5.58577175270024 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0311966047479063 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 35060746 A/G 1 6 7 13 2.86482190322302 3.65770777957314 -0.792885876350118 A:G A G 10 0.522529682796163 0.783741934444505 ENSG00000165280:ENST00000480327:exon_35060310_35060920:VCP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 35107765 C/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:C C A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35107378_35108271:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378554:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000408010:exon_35107378_35108346:KIAA1539 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 35650208 C/T 1 35 45 80 16.7114611021343 23.5138357258273 -6.80237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 0.145588681144288 ENSG00000137078:ENST00000259608:exon_35650181_35650242:SIT1;ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650181_35650242:SIT1;ENSG00000137078:ENST00000474403:exon_35650181_35650242:SIT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 35705759 G/A 1 78 69 147 37.2426847418993 36.0545481129352 1.18813662896405 A:G G A 10 0.522529682796163 0.86911427667411 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35705747_35705848:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000486788:exon_35705747_35705848:TLN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 35712003 G/A 1 37 33 70 17.666401736542 17.2434795322734 0.422922204268595 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35712002_35712121:TLN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 35749845 G/C 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 C:G G C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000107185:ENST00000456972:exon_35749734_35749868:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000378078:exon_35749734_35749868:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000496906:exon_35749734_35749868:RGP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 36191149 T/C 1 102 141 243 48.7019723547914 73.676685274259 -24.9747129194676 T:C T C 10 0.522529682796163 0.00159862182641013 ENSG00000122705:ENST00000433436:exon_36190892_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000345519:exon_36190920_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000464497:exon_36190928_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000470744:exon_36190929_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000242285:exon_36190934_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000396603:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000466396:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000462562:exon_36190990_36191270:CLTA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 37429814 A/G 1 82 73 155 39.1525660107146 38.1446668441199 1.00789916659474 A:G A G 10 0.522529682796163 0.935950636767298 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000377824:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000491488:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37427703_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000480596:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000438860:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000494290:exon_37428992_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000482603:exon_37429783_37429833:GRHPR HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 30 7 37 14.3241095161151 3.65770777957314 10.666401736542 T:C C T 10 0.522529682796163 0.000402934430097548 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 38396065 G/T 1 25 25 50 11.9367579300959 13.0632420699041 -1.12648413980815 T:G G T 10 0.522529682796163 0.778473464626011 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 71843023 C/A 1 40 42 82 19.0988126881535 21.9462466774388 -2.84743398928536 A:C C A 10 0.522529682796163 0.580887028873164 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71842897_71843030:TJP2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 74975736 T/A 1 10 5 15 4.77470317203837 2.61264841398082 2.16205475805755 A:T T A 10 0.522529682796163 0.309170426805168 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 T:C C T 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 77752510 C/T 1 37 33 70 17.666401736542 17.2434795322734 0.422922204268595 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77752454_77752532:OSTF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 80851350 G/C 1 8 4 12 3.8197625376307 2.09011873118465 1.72964380644604 C:G G C 10 0.522529682796163 0.393562228098845 ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80850991_80851519:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000476652:exon_80851010_80851574:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80851011_80851519:CEP78 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 80919756 T/G 1 31 29 60 14.8015798333189 15.1533608010887 -0.351780967769777 T:G T G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80919651_80919856:PSAT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 82006446 G/A 0 8 0 8 3.8197625376307 0 3.8197625376307 G G 10 0.522529682796163 0.00825889449847131 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 50 55 105 23.8735158601919 28.739132553789 -4.86561669359711 A:C C A 10 0.522529682796163 0.379503875660736 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 86284178 C/A 1 25 28 53 11.9367579300959 14.6308311182926 -2.69407318819664 A:C C A 10 0.522529682796163 0.493471442995363 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86281265_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86284100_86284206:UBQLN1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 88692336 C/T 1 8 1 9 3.8197625376307 0.522529682796163 3.29723285483453 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0407796571976411 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88692327_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88692327_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88692313_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000257504:exon_88692327_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000470762:exon_88692322_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000472919:exon_88692327_88692454:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000486130:exon_88692325_88692506:GOLM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 90262234 C/T 1 23 25 48 10.9818172956883 13.0632420699041 -2.08142477421582 T:C C T 10 0.522529682796163 0.566320582114887 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469067:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90262220_90262318:DAPK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 90321583 C/T 1 29 36 65 13.8466391989113 18.8110685806619 -4.96442938175059 T:C C T 10 0.522529682796163 0.263663011572167 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 91994101 G/A 1 44 48 92 21.0086939569688 25.0814247742158 -4.07273081724699 A:G G A 10 0.522529682796163 0.405614069038533 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 91994433 C/T 1 37 32 69 17.666401736542 16.7209498494772 0.945451887064756 T:C C T 10 0.522529682796163 0.904211932493495 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 93637015 C/T 1 19 17 36 9.0719360268729 8.88300460753477 0.188931419338132 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93636954_93637131:SYK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 93639973 G/C 1 25 16 41 11.9367579300959 8.36047492473861 3.57628300535732 C:G G C 10 0.522529682796163 0.278107262104866 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 93640009 G/A 1 22 17 39 10.5043469784844 8.88300460753477 1.62134237094964 A:G G A 10 0.522529682796163 0.63394207999485 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 93641151 T/C 1 9 7 16 4.29723285483453 3.65770777957314 0.639525075261393 T:C T C 10 0.522529682796163 0.806786574870378 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 93641175 C/T 1 10 7 17 4.77470317203837 3.65770777957314 1.11699539246523 T:C C T 10 0.522529682796163 0.63504130808849 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 93641199 T/C 1 13 13 26 6.20711412364988 6.79288587635012 -0.585771752700238 T:C T C 10 0.522529682796163 0.846614688948765 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 94985637 T/C 1 77 68 145 36.7652144246955 35.5320184301391 1.23319599455637 A:T:C T C 10 0.522529682796163 0.868176126298132 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_94985628_94985711:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_94985628_94985771:IARS;ENSG00000196305:ENST00000421189:exon_94985628_94985771:IARS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 95009708 C/G 1 48 41 89 22.9185752257842 21.4237169946427 1.4948582311415 C:G C G 10 0.522529682796163 0.83209126859468 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000449893:exon_95009659_95009833:IARS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 95018903 A/G 1 3 7 10 1.43241095161151 3.65770777957314 -2.22529682796163 A:G A G 10 0.522529682796163 0.209802689107094 ENSG00000196305:ENST00000472894:exon_95018639_95019082:IARS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 95068046 C/T 1 29 17 46 13.8466391989113 8.88300460753477 4.9636345913765 T:C C T 10 0.522529682796163 0.183508406365247 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000477862:exon_95068035_95068112:NOL8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 10 3 13 4.77470317203837 1.56758904838849 3.20711412364988 A:C C A 10 0.522529682796163 0.0965395810160095 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 95872854 G/A 1 17 18 35 8.11699539246523 9.40553429033093 -1.2885388978657 A:G G A 10 0.522529682796163 0.736128234715988 ENSG00000165233:ENST00000375464:exon_95872850_95873003:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466409:exon_95872850_95874571:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000495641:exon_95872850_95873496:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466929:exon_95872850_95873003:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000468781:exon_95872850_95873003:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000490488:exon_95872850_95873003:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000498243:exon_95872850_95873469:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000475574:exon_95872850_95873003:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000488630:exon_95872174_95874571:C9orf89 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 96209943 T/C 1 13 11 24 6.20711412364988 5.74782651075779 0.459287612892089 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000188938:ENST00000479094:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000423591:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375412:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375409:exon_96208783_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000523407:exon_96208807_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520403:exon_96208815_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520470:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483149:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483056:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000476484:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428152:exon_96209550_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428378:exon_96209917_96209979:FAM120AOS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 96238578 C/T 1 22 26 48 10.5043469784844 13.5857717527002 -3.08142477421582 T:C C T 10 0.522529682796163 0.389382705479001 ENSG00000048828:ENST00000437660:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000375389:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000277165:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000340893:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000333936:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000446420:exon_96238538_96238620:FAM120A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 97062852 A/T 1 7 1 8 3.34229222042686 0.522529682796163 2.8197625376307 A:T A T 10 0.522529682796163 0.0725354402980475 ENSG00000175787:ENST00000395395:exon_97062097_97063736:ZNF169;ENSG00000175787:ENST00000340911:exon_97061730_97063736:ZNF169 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 98775235 T/C 1 1 7 8 0.477470317203837 3.65770777957314 -3.1802374623693 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0319085925070315 ENSG00000182150:ENST00000407474:exon_98774507_98776845:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000320486:exon_98774507_98776842:C9orf102 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 100190780 A/G 1 8 11 19 3.8197625376307 5.74782651075779 -1.9280639731271 A:G A G 10 0.522529682796163 0.492106910577732 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100190742_100190954:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100190742_100190954:TDRD7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 100367810 G/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:G G A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000136925:ENST00000375172:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000341170:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375165:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000354801:exon_100367765_100367923:TSTD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 100367813 A/G 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 A:G A G 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000136925:ENST00000375172:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000341170:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000375165:exon_100367765_100367923:TSTD2;ENSG00000136925:ENST00000354801:exon_100367765_100367923:TSTD2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 100420976 G/A 1 11 8 19 5.25217348924221 4.1802374623693 1.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.653993185631586 ENSG00000136937:ENST00000375147:exon_100420922_100421025:NCBP1;ENSG00000136937:ENST00000375132:exon_100420922_100421025:NCBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 102595069 G/A 1 7 2 9 3.34229222042686 1.04505936559233 2.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.18368068114947 ENSG00000119508:ENST00000395097:exon_102594971_102595100:NR4A3;ENSG00000119508:ENST00000338488:exon_102594971_102595100:NR4A3;ENSG00000119508:ENST00000238459:exon_102594971_102595100:NR4A3;ENSG00000119508:ENST00000395096:exon_102594971_102595100:NR4A3;ENSG00000119508:ENST00000330847:exon_102594971_102595100:NR4A3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 103054951 T/C 1 9 4 13 4.29723285483453 2.09011873118465 2.20711412364988 T:C T C 10 0.522529682796163 0.273205822586663 ENSG00000119509:ENST00000262457:exon_103054608_103055325:INVS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 14 9 23 6.68458444085372 4.70276714516547 1.98181729568825 A:G G A 10 0.522529682796163 0.532235624487875 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 108366734 G/A 1 6 3 9 2.86482190322302 1.56758904838849 1.29723285483453 A:G G A 10 0.522529682796163 0.511797587312082 ENSG00000106692:ENST00000223528:exon_108366496_108366773:FKTN;ENSG00000106692:ENST00000357998:exon_108366496_108366773:FKTN;ENSG00000106692:ENST00000374705:exon_108366496_108366773:FKTN HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 111665215 A/C 1 12 6 18 5.72964380644604 3.13517809677698 2.59446570966907 A:C A C 10 0.522529682796163 0.246476394158893 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111665119_111665222:IKBKAP HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 20 20 40 9.54940634407674 10.4505936559233 -0.90118731184652 T:C T C 10 0.522529682796163 0.87453632499247 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 114190337 G/A 1 15 17 32 7.16205475805756 8.88300460753477 -1.72094984947721 A:G G A 10 0.522529682796163 0.597738714995898 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114190322_114190441:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114190322_114190441:KIAA0368 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 114195587 G/A 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114195513_114195652:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114195513_114195652:KIAA0368 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 47 51 98 22.4411049085803 26.6490138226043 -4.20790891402397 T:C T C 10 0.522529682796163 0.419399627756073 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 43 43 86 20.531223639765 22.468776360235 -1.93755272047002 T:C C T 10 0.522529682796163 0.746292849748288 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 19 21 40 9.0719360268729 10.9731233387194 -1.90118731184652 T:C C T 10 0.522529682796163 0.63557898252467 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 116279880 T/C 1 10 6 16 4.77470317203837 3.13517809677698 1.63952507526139 T:C T C 10 0.522529682796163 0.461898394043015 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000413285:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317613:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000394646:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374136:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000496113:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000460000:exon_116279648_116279904:RGS3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 116346118 G/A 1 28 30 58 13.3691688817074 15.6758904838849 -2.30672160217745 A:G G A 10 0.522529682796163 0.59981582190577 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 116346236 G/A 1 18 14 32 8.59446570966907 7.31541555914628 1.27905015052279 A:G G A 10 0.522529682796163 0.724992015605387 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 116356776 C/T 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 T:C C T 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116356710_116356811:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116356710_116356811:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116356710_116356811:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116356710_116356811:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116356710_116356811:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116356710_116356811:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000394646:exon_116356710_116356811:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000474719:exon_116356710_116356811:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116356710_116356811:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000496275:exon_116356710_116356811:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116356710_116356811:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116356710_116356811:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000467805:exon_116356710_116356811:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462403:exon_116356710_116356811:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000497435:exon_116356424_116356811:RGS3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 26 21 47 12.4142282472998 10.9731233387194 1.44110490858034 A:G A G 10 0.522529682796163 0.770698949855164 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 117139280 T/C 1 25 26 51 11.9367579300959 13.5857717527002 -1.64901382260431 T:C T C 10 0.522529682796163 0.6758269959157 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117138746_117139340:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117138746_117139915:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394574:exon_117138387_117139812:AKNA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 123583192 A/G 1 6 5 11 2.86482190322302 2.61264841398082 0.252173489242207 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000095261:ENST00000373920:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123583117_123583257:PSMD5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 123605126 T/C 1 12 5 17 5.72964380644604 2.61264841398082 3.11699539246523 T:C T C 10 0.522529682796163 0.150352896781338 ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123605015_123605200:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123605015_123605190:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000435107:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000476949:exon_123605015_123605189:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000471789:exon_123605015_123605160:PSMD5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 22 30 52 10.5043469784844 15.6758904838849 -5.17154350540047 A:G A G 10 0.522529682796163 0.166136518885048 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 123850770 G/A 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123850574_123850821:CEP110 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 123860689 C/T 1 8 6 14 3.8197625376307 3.13517809677698 0.684584440853719 T:C C T 10 0.522529682796163 0.793486385682659 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123860664_123860850:CEP110 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 123886324 C/T 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 T:C C T 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373851:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123886209_123886362:CEP110 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 123917020 T/A 1 14 4 18 6.68458444085372 2.09011873118465 4.59446570966907 A:T T A 10 0.522529682796163 0.0338861088349796 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 18 32 50 8.59446570966907 16.7209498494772 -8.12648413980815 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0233913648614817 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 125154602 C/A 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 A:C C A 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000095303:ENST00000362012:exon_125154468_125157982:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000223423:exon_125154468_125155457:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000373698:exon_125154468_125154875:PTGS1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 127643456 T/C 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 T:C T C 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000136935:ENST00000373555:exon_127643450_127643536:GOLGA1;ENSG00000136935:ENST00000475407:exon_127643450_127643536:GOLGA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 127996046 A/G 1 35 42 77 16.7114611021343 21.9462466774388 -5.23478557530455 A:C:G A G 10 0.522529682796163 0.254601444206774 ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127995967_127996334:RABEPK HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 128001119 C/T 1 5 5 10 2.38735158601918 2.61264841398082 -0.22529682796163 T:C C T 10 0.522529682796163 1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 128246786 G/A 1 29 41 70 13.8466391989113 21.4237169946427 -7.57707779573141 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.0734293534578434 ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128246722_128246862:MAPKAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 130164993 C/T 1 5 3 8 2.38735158601918 1.56758904838849 0.819762537630696 T:C C T 10 0.522529682796163 0.728776437395601 ENSG00000136856:ENST00000373371:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000451404:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000476835:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419917:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373354:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373360:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373355:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419132:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000439597:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000423934:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373350:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000430147:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000484617:exon_130164643_130165032:SLC2A8 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 130263351 G/A 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G G A 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000472592:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000479957:exon_130263289_130263371:LRSAM1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 13 9 22 6.20711412364988 4.70276714516547 1.50434697848441 A:G G A 10 0.522529682796163 0.670538633660278 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 130586688 G/A 1 3 6 9 1.43241095161151 3.13517809677698 -1.70276714516547 A:G G A 10 0.522529682796163 0.325681370417300 ENSG00000106991:ENST00000373203:exon_130586583_130586725:ENG;ENSG00000106991:ENST00000344849:exon_130586583_130586725:ENG;ENSG00000106991:ENST00000480266:exon_130586583_130586725:ENG HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 130677112 G/A 1 17 14 31 8.11699539246523 7.31541555914628 0.801579833318948 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.858135513379526 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000361444:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000483438:exon_130676935_130677145:ST6GALNAC4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 23 26 49 10.9818172956883 13.5857717527002 -2.60395445701199 C:G G C 10 0.522529682796163 0.477525137411706 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 130698845 C/T 1 18 16 34 8.59446570966907 8.36047492473861 0.233990784930459 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130698832_130698934:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130698832_130699802:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130698832_130698934:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000373110:exon_130698313_130698934:DPM2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 130707081 A/G 1 7 10 17 3.34229222042686 5.22529682796163 -1.88300460753477 A:G A G 10 0.522529682796163 0.468082532065744 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130707056_130707177:FAM102A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 130941259 G/T 1 36 42 78 17.1889314193381 21.9462466774388 -4.75731525810071 T:G G T 10 0.522529682796163 0.308313901586867 ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130941245_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130941241_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000475471:exon_130940648_130941288:CIZ1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 15 19 34 7.16205475805756 9.9280639731271 -2.76600921506954 A:G A G 10 0.522529682796163 0.39233075831933 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 131196695 C/T 1 15 1 16 7.16205475805756 0.522529682796163 6.63952507526139 T:C C T 10 0.522529682796163 0.000617529270949819 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131196689_131196886:CERCAM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 131196704 G/A 1 14 2 16 6.68458444085372 1.04505936559233 5.63952507526139 A:G G A 10 0.522529682796163 0.00476099610344447 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131196689_131196886:CERCAM HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 12 17 29 5.72964380644604 8.88300460753477 -3.15336080108873 A:G G A 10 0.522529682796163 0.268071850620001 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 12 18 30 5.72964380644604 9.40553429033093 -3.67589048388489 T:C C T 10 0.522529682796163 0.202974205829589 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 131403096 A/G 1 13 10 23 6.20711412364988 5.22529682796163 0.981817295688251 A:G A G 10 0.522529682796163 0.835281075870211 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 131483551 T/A 1 53 55 108 25.3059268118034 28.739132553789 -3.4332057419856 A:T:G T A 10 0.522529682796163 0.56352416764633 ENSG00000160446:ENST00000372663:exon_131483148_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372667:exon_131483149_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000467312:exon_131483159_131483759:ZDHHC12 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 131515547 G/T 1 10 11 21 4.77470317203837 5.74782651075779 -0.973123338719422 T:C:G G T 10 0.522529682796163 0.827769696334975 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131515443_131515879:ZER1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 131565554 T/C 1 13 10 23 6.20711412364988 5.22529682796163 0.981817295688251 T:C T C 10 0.522529682796163 0.835281075870211 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131565529_131565739:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000466056:exon_131565529_131565727:TBC1D13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 131570178 T/C 1 5 11 16 2.38735158601918 5.74782651075779 -3.36047492473861 T:C T C 10 0.522529682796163 0.131585770979384 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131570093_131572711:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131570093_131572703:TBC1D13 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 11 8 19 5.25217348924221 4.1802374623693 1.0719360268729 A:G G A 10 0.522529682796163 0.653993185631586 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 16 10 26 7.63952507526139 5.22529682796163 2.41422824729976 C:G G C 10 0.522529682796163 0.433314383592609 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 15 13 28 7.16205475805756 6.79288587635012 0.369168881707437 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 132594180 T/C 1 56 56 112 26.7383377634149 29.2616622365851 -2.52332447317025 T:C T C 10 0.522529682796163 0.637700023880069 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461539:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000492991:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000495934:exon_132594174_132594251:C9orf78 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 150 122 272 71.6205475805756 63.7486213011319 7.87192627944368 A:G A G 10 0.522529682796163 0.362692277551304 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 134346315 T/C 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 T:C T C 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134346175_134346370:BAT2L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 134350231 C/T 1 19 22 41 9.0719360268729 11.4956530215156 -2.42371699464268 T:C C T 10 0.522529682796163 0.532347718490985 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000456307:exon_134349841_134350234:BAT2L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 134350458 C/T 1 36 32 68 17.1889314193381 16.7209498494772 0.467981569860918 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 134351065 G/T 1 19 25 44 9.0719360268729 13.0632420699041 -3.99130604303117 T:G G T 10 0.522529682796163 0.232150481769485 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 134351500 C/T 1 13 12 25 6.20711412364988 6.27035619355396 -0.0632420699040743 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134351317_134351922:BAT2L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 134358108 A/G 1 12 17 29 5.72964380644604 8.88300460753477 -3.15336080108873 A:G A G 10 0.522529682796163 0.268071850620001 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134358097_134358294:BAT2L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 134371165 C/T 1 26 24 50 12.4142282472998 12.5407123871079 -0.126484139808149 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134371127_134375558:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000320547:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000465931:exon_134371127_134375584:BAT2L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 134385436 A/G 1 4 5 9 1.90988126881535 2.61264841398082 -0.702767145165467 A:G A G 10 0.522529682796163 0.74489974815786 ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134385290_134385449:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134385290_134385449:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000448212:exon_134385290_134385449:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134385290_134385802:POMT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 134386744 T/C 1 6 2 8 2.86482190322302 1.04505936559233 1.8197625376307 T:C T C 10 0.522529682796163 0.293052983203674 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134386724_134386855:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 134387488 T/C 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C T C 10 0.522529682796163 1 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134387428_134387514:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134387279_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 134401335 C/T 1 12 10 22 5.72964380644604 5.22529682796163 0.504346978484414 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000130717:ENST00000372215:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372208:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000491309:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372211:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372210:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000484876:exon_134401316_134401546:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000494584:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000459858:exon_134401332_134401364:UCK1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135139901 T/C 1 28 40 68 13.3691688817074 20.9011873118465 -7.53201843013908 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0696514456112744 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135172412 A/G 1 12 9 21 5.72964380644604 4.70276714516547 1.02687666128058 A:G A G 10 0.522529682796163 0.670391349361465 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135172274_135172441:SETX HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135173685 T/C 1 22 13 35 10.5043469784844 6.79288587635012 3.7114611021343 A:T:C T C 10 0.522529682796163 0.238248944143098 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135173467_135173699:SETX HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135202829 T/C 1 21 14 35 10.0268766612806 7.31541555914628 2.7114611021343 T:C T C 10 0.522529682796163 0.400403410066618 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135203231 C/T 1 16 15 31 7.63952507526139 7.83794524194244 -0.198420166681052 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135203409 A/C 1 24 27 51 11.4592876128921 14.1083014354964 -2.64901382260431 A:C A C 10 0.522529682796163 0.485646556660980 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135203838 G/A 1 20 16 36 9.54940634407674 8.36047492473861 1.18893141933813 A:G G A 10 0.522529682796163 0.740684882472253 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135206460 A/G 1 12 13 25 5.72964380644604 6.79288587635012 -1.06324206990407 A:G A G 10 0.522529682796163 0.693670722544485 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135206439_135206526:SETX;ENSG00000107290:ENST00000419901:exon_135206439_135206526:SETX HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135254512 C/T 1 8 10 18 3.8197625376307 5.22529682796163 -1.40553429033093 T:C C T 10 0.522529682796163 0.638525965900438 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135254446_135254531:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000461970:exon_135254446_135254592:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135254446_135254531:TTF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135273607 C/G 1 11 9 20 5.25217348924221 4.70276714516547 0.549406344076741 C:G C G 10 0.522529682796163 0.827347849665529 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135273528_135273713:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135273528_135273713:TTF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135277341 C/A 1 26 10 36 12.4142282472998 5.22529682796163 7.18893141933813 A:C C A 10 0.522529682796163 0.0188035954054166 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135470176 C/G 1 9 13 22 4.29723285483453 6.79288587635012 -2.49565302151559 C:G C G 10 0.522529682796163 0.296166428569315 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135470414 T/C 1 9 10 19 4.29723285483453 5.22529682796163 -0.928063973127097 T:C T C 10 0.522529682796163 0.819201169042762 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135554566 G/A 1 15 17 32 7.16205475805756 8.88300460753477 -1.72094984947721 A:G G A 10 0.522529682796163 0.597738714995898 ENSG00000125484:ENST00000372146:exon_135553364_135555190:GTF3C4;ENSG00000125484:ENST00000483873:exon_135554265_135554697:GTF3C4 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135781239 A/G 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 A:G A G 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135780968_135781526:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135780968_135781526:TSC1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 135985796 C/T 1 7 10 17 3.34229222042686 5.22529682796163 -1.88300460753477 T:C C T 10 0.522529682796163 0.468082532065744 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135985683_135985876:RALGDS HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 136217376 T/A 1 33 44 77 15.7565204677266 22.9913060430312 -7.23478557530455 A:T:C T A 10 0.522529682796163 0.110285794586078 ENSG00000148303:ENST00000463740:exon_136217095_136217582:RPL7A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 136913355 T/C 1 5 6 11 2.38735158601918 3.13517809677698 -0.747826510757793 T:C T C 10 0.522529682796163 0.766632882539292 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000494743:exon_136913124_136913576:BRD3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 8 12 20 3.8197625376307 6.27035619355396 -2.45059365592326 T:C C T 10 0.522529682796163 0.371173578167092 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 137300003 A/G 1 17 13 30 8.11699539246523 6.79288587635012 1.32410951611511 A:G A G 10 0.522529682796163 0.716107033674038 ENSG00000186350:ENST00000481739:exon_137299995_137300145:RXRA;ENSG00000186350:ENST00000356384:exon_137299995_137300145:RXRA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 138714620 G/A 1 7 9 16 3.34229222042686 4.70276714516547 -1.36047492473861 A:G G A 10 0.522529682796163 0.618833530377833 ENSG00000130559:ENST00000389532:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000389533:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000312405:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000483991:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000409386:exon_138712685_138715106:CAMSAP1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139100889 G/A 1 13 20 33 6.20711412364988 10.4505936559233 -4.24347953227338 A:G G A 10 0.522529682796163 0.163896745013365 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139098179_139101121:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139098185_139101121:QSOX2 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139256468 C/G 1 15 8 23 7.16205475805756 4.1802374623693 2.98181729568825 C:G C G 10 0.522529682796163 0.296627250051809 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139256541 C/T 1 9 2 11 4.29723285483453 1.04505936559233 3.25217348924221 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0683780529325207 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 8 19 27 3.8197625376307 9.9280639731271 -6.1083014354964 A:G A G 10 0.522529682796163 0.0206501125888714 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139301583 T/C 1 4 7 11 1.90988126881535 3.65770777957314 -1.74782651075779 T:C T C 10 0.522529682796163 0.37096815956878 ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139301398_139301660:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139311471 C/T 1 47 34 81 22.4411049085803 17.7660092150695 4.6750956935108 T:C C T 10 0.522529682796163 0.318201645142782 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139326304 G/A 1 2 8 10 0.954940634407674 4.1802374623693 -3.22529682796163 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0559284466504964 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139326276_139326437:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139326276_139326437:INPP5E HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139368953 G/A 1 18 5 23 8.59446570966907 2.61264841398082 5.98181729568825 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0124049610495903 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139369062 C/T 1 24 6 30 11.4592876128921 3.13517809677698 8.32410951611511 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0027987751248686 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139371234 G/A 1 14 9 23 6.68458444085372 4.70276714516547 1.98181729568825 A:G G A 10 0.522529682796163 0.532235624487875 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139371342 G/A 1 14 13 27 6.68458444085372 6.79288587635012 -0.1083014354964 A:G G A 10 0.522529682796163 1 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139371405 G/C 1 12 14 26 5.72964380644604 7.31541555914628 -1.58577175270024 C:G G C 10 0.522529682796163 0.561386502703927 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139391636 G/A 1 16 8 24 7.63952507526139 4.1802374623693 3.45928761289209 A:G G A 10 0.522529682796163 0.219555714324787 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139407932 A/G 1 3 5 8 1.43241095161151 2.61264841398082 -1.1802374623693 A:G A G 10 0.522529682796163 0.491321069758129 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139407844_139407989:NOTCH1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139745264 G/A 1 162 132 294 77.3501913870216 68.9739181290935 8.37627325792809 A:T:G G A 10 0.522529682796163 0.350339519800811 ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139745207_139745474:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139745207_139745474:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139745207_139745474:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139745207_139745476:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139745207_139745479:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000463215:exon_139745207_139745474:PHPT1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139973820 C/T 1 4 18 22 1.90988126881535 9.40553429033093 -7.49565302151559 T:C C T 10 0.522529682796163 0.00198101227775643 ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139974444 C/T 1 4 4 8 1.90988126881535 2.09011873118465 -0.180237462369304 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139983339 A/G 1 14 13 27 6.68458444085372 6.79288587635012 -0.1083014354964 A:G A G 10 0.522529682796163 1 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_139983321_139983457:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000371587:exon_139983321_139983457:MAN1B1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139994161 T/C 1 10 14 24 4.77470317203837 7.31541555914628 -2.54071238710791 T:C T C 10 0.522529682796163 0.314811911172675 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_139994148_139994333:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000371587:exon_139994148_139994333:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_139994148_139994333:MAN1B1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 139994278 C/T 1 14 12 26 6.68458444085372 6.27035619355396 0.414228247299763 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_139994148_139994333:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000371587:exon_139994148_139994333:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_139994148_139994333:MAN1B1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 140001180 A/G 1 11 19 30 5.25217348924221 9.9280639731271 -4.67589048388489 A:G A G 10 0.522529682796163 0.100755669830112 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140001141_140001261:MAN1B1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 140001194 G/A 1 13 16 29 6.20711412364988 8.36047492473861 -2.15336080108873 A:G G A 10 0.522529682796163 0.461071503182053 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140001141_140001261:MAN1B1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 161 141 302 76.8727210698178 73.676685274259 3.19603579555879 A:G G A 10 0.522529682796163 0.729879345912221 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 140007492 G/A 1 92 120 212 43.927269182753 62.7035619355396 -18.7762927527865 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0108411735568286 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140007405_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140007405_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140007405_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140007405_140007564:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140007405_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140007405_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140007405_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000460830:exon_140007405_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000482088:exon_140007269_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140007415_140007571:DPP7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 140007716 T/C 1 88 103 191 42.0173879139377 53.8205573280048 -11.8031694140671 A:T:C T C 10 0.522529682796163 0.0956044590990136 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140007658_140007739:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140007658_140007739:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140007658_140007739:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140007658_140007739:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000482088:exon_140007658_140007739:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140007658_140007739:DPP7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 140007915 C/T 1 57 52 109 27.2158080806187 27.1715435054005 0.0442645752182358 T:C C T 10 0.522529682796163 1 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140007813_140007948:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140007809_140007948:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140007813_140007948:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140007827_140008167:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140007886_140007948:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140007886_140007948:DPP7 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 140100224 A/G 1 13 5 18 6.20711412364988 2.61264841398082 3.59446570966907 A:G A G 10 0.522529682796163 0.102291148092561 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 140135784 C/A 1 24 32 56 11.4592876128921 16.7209498494772 -5.26166223658513 A:C C A 10 0.522529682796163 0.181316145119908 ENSG00000188229:ENST00000340384:exon_140135665_140135869:TUBB2C HGDP00948_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 24 35 59 11.4592876128921 18.2885388978657 -6.82925128497361 A:C:G G A 10 0.522529682796163 0.0896899123951363 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . X 200860 T/C 1 13 35 48 6.20711412364988 18.2885388978657 -12.0814247742158 T:C T C 10 0.522529682796163 0.000460700062648491 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000445062:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000429181:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000443019:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_200401_200981:PLCXD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . X 215944 G/T 1 25 30 55 11.9367579300959 15.6758904838849 -3.73913255378896 T:G G T 10 0.522529682796163 0.345878513280680 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_215764_220020:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_215764_216059:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_215764_220023:PLCXD1 HGDP00948_parsed_pileup.txt . X 229493 G/A 1 17 17 34 8.11699539246523 8.88300460753477 -0.766009215069541 A:G G A 10 0.522529682796163 0.86437385210619 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 10 14 24 4.77470317203837 7.31541555914628 -2.54071238710791 A:G G A 10 0.522529682796163 0.314811911172675 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00948_parsed_pileup.txt . X 295097 C/T 1 12 2 14 5.72964380644604 1.04505936559233 4.68458444085372 T:C C T 10 0.522529682796163 0.0141664242543076 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00948_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 7 3 10 3.34229222042686 1.56758904838849 1.77470317203837 A:G A G 10 0.522529682796163 0.348733043074597 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00948_parsed_pileup.txt . X 299360 G/A 1 10 2 12 4.77470317203837 1.04505936559233 3.72964380644604 A:G G A 10 0.522529682796163 0.0408712623846239 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00948_parsed_pileup.txt . X 1501307 C/T 1 51 55 106 24.3509861773957 28.739132553789 -4.38814637639327 T:C C T 10 0.522529682796163 0.43689586748377 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1501284_1501578:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1501284_1501581:IL3RA HGDP00948_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 40 35 75 19.0988126881535 18.2885388978657 0.810273790287777 T:C C T 10 0.522529682796163 0.908190254752864 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP00948_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 29 19 48 13.8466391989113 9.9280639731271 3.91857522578418 T:C C T 10 0.522529682796163 0.312013123487917 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00948_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 1 31 11 42 14.8015798333189 5.74782651075779 9.05375332256116 T:C T C 10 0.522529682796163 0.0051686562967854 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP00948_parsed_pileup.txt . X 1719988 G/A 1 53 45 98 25.3059268118034 23.5138357258273 1.79209108597603 A:G G A 10 0.522529682796163 0.762047871914145 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00948_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 88 73 161 42.0173879139377 38.1446668441199 3.87272106981776 T:C C T 10 0.522529682796163 0.581023625334867 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP00948_parsed_pileup.txt . X 2644302 C/T 1 83 60 143 39.6300363279185 31.3517809677698 8.2782553601487 T:C:G C T 10 0.522529682796163 0.180580538186725 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99