INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 881627 G/A 1 77 71 148 35.6098229308549 38.1649684663546 -2.55514553549973 A:G G A 10 0.537534767131755 0.681044859561404 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 900505 G/C 1 15 23 38 6.93697849302368 12.3632996440304 -5.42632115100669 C:G G C 10 0.537534767131755 0.102589905124565 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_900343_901095:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_900343_901095:KLHL17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 1139565 G/A 1 12 19 31 5.54958279441894 10.2131605755033 -4.6635777810844 A:G G A 10 0.537534767131755 0.105964213494322 ENSG00000186891:ENST00000379268:exon_1139414_1139616:TNFRSF18;ENSG00000186891:ENST00000486728:exon_1139414_1139616:TNFRSF18;ENSG00000186891:ENST00000379265:exon_1139435_1139616:TNFRSF18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 1277184 G/A 1 24 16 40 11.0991655888379 8.60055627410808 2.4986093147298 A:G G A 10 0.537534767131755 0.526471660943444 ENSG00000107404:ENST00000378891:exon_1277047_1277185:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000378888:exon_1277047_1277185:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000345100:exon_1277047_1277185:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000263743:exon_1277047_1277185:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000472445:exon_1277150_1277536:DVL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 111 110 221 51.3336408483752 59.128824384493 -7.79518353611785 A:G A G 10 0.537534767131755 0.311737306808892 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 52 45 97 24.0481921091487 24.189064520929 -0.140872411780229 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 1686040 G/T 1 47 77 124 21.7358659448075 41.3901770691451 -19.6543111243376 T:G G T 10 0.537534767131755 0.000419761605240959 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000469045:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000480499:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497747:exon_1685983_1686305:NADK;ENSG00000008130:ENST00000477235:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000489538:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497615:exon_1685983_1686335:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497186:exon_1685983_1686137:NADK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 27 15 42 12.4865612874426 8.06302150697632 4.42353978046629 T:C C T 10 0.537534767131755 0.215456357269818 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 2452569 T/C 1 22 25 47 10.1742351231014 13.4383691782939 -3.26413405519248 T:C T C 10 0.537534767131755 0.381193670252001 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000486396:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502770:exon_2452540_2453380:PANK4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 3638674 C/T 1 12 5 17 5.54958279441894 2.68767383565877 2.86190895876017 T:C C T 10 0.537534767131755 0.224313779580088 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3638585_3638771:TP73 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 3649562 G/A 0 50 0 50 23.1232616434123 0 23.1232616434123 G G 10 0.537534767131755 6.3898244440665e-14 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3649311_3649856:TP73 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 3659742 C/T 1 10 15 25 4.62465232868245 8.06302150697632 -3.43836917829387 T:C C T 10 0.537534767131755 0.228213554923661 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 3731965 G/A 1 19 10 29 8.78683942449666 5.37534767131755 3.41149175317911 A:G G A 10 0.537534767131755 0.263942639118946 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3728645_3732081:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3731344_3732081:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000484420:exon_3731803_3732081:KIAA0562 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 3745924 G/A 1 10 6 16 4.62465232868245 3.22520860279053 1.39944372589192 A:G G A 10 0.537534767131755 0.618373054653884 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000461667:exon_3745830_3745937:KIAA0562 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 3755675 T/C 1 11 15 26 5.08711756155069 8.06302150697632 -2.97590394542563 T:C T C 10 0.537534767131755 0.325523153112396 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3755647_3755683:KIAA0562 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 131 147 278 60.5829455057401 79.017610768368 -18.4346652626279 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0301920984341705 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 6278414 A/G 1 18 32 50 8.32437419162841 17.2011125482162 -8.87673835658775 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0151536114198599 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6278349_6278429:RNF207 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 6279370 G/C 1 16 27 43 7.39944372589192 14.5134387125574 -7.11399498666546 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0323906825080759 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6279296_6281351:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6279296_6281359:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6279296_6280865:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6279296_6279403:RNF207 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 6313938 C/T 1 19 22 41 8.78683942449666 11.8257648768986 -3.03892545240195 T:C C T 10 0.537534767131755 0.351912696931157 ENSG00000158292:ENST00000377893:exon_6313778_6314207:GPR153 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 6314822 T/C 1 24 39 63 11.0991655888379 20.9638559181384 -9.86469032930056 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0157795519661526 ENSG00000158292:ENST00000377893:exon_6314610_6315074:GPR153 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 6614535 G/A 1 11 12 23 5.08711756155069 6.45041720558106 -1.36329964403036 A:G G A 10 0.537534767131755 0.677013887550826 ENSG00000162408:ENST00000377705:exon_6614167_6614595:NOL9;ENSG00000162408:ENST00000464665:exon_6614167_6614560:NOL9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 6692837 C/T 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 6704635 A/G 1 37 37 74 17.1112136161251 19.8887863838749 -2.77757276774987 A:G A G 10 0.537534767131755 0.560639460231963 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000472414:exon_6704618_6704734:DNAJC11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 6705874 G/C 1 26 29 55 12.0240960545744 15.5885082468209 -3.56441219224652 C:G G C 10 0.537534767131755 0.346874296254549 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 7909737 C/T 0 0 13 13 0 6.98795197271281 -6.98795197271281 T C T 10 0.537534767131755 4.42617067837284e-05 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000400910:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000361696:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7909700_7909743:UTS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 7913430 G/A 0 27 0 27 12.4865612874426 0 12.4865612874426 G G 10 0.537534767131755 8.19382265183036e-08 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7913367_7913572:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7913367_7913491:UTS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 8418644 C/A 1 86 57 143 39.7720100266691 30.63948172651 9.13252830015904 A:T:C C A 10 0.537534767131755 0.131649250814996 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 8418650 T/C 1 83 63 146 38.3846143280643 33.8646903293006 4.51992399876377 T:C T C 10 0.537534767131755 0.506850117012308 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 8421092 C/T 1 42 18 60 19.4235397804663 9.67562580837159 9.7479139720947 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0133622642328350 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8420172_8421550:RERE HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 8421203 T/C 1 40 36 76 18.4986093147298 19.3512516167432 -0.852642302013376 T:C T C 10 0.537534767131755 0.908546404719293 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8420172_8421550:RERE HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 8923012 A/G 1 10 8 18 4.62465232868245 4.30027813705404 0.324374191628411 A:G A G 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 8928125 G/T 1 8 12 20 3.69972186294596 6.45041720558106 -2.7506953426351 T:G G T 10 0.537534767131755 0.264201895405952 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 9165685 G/A 1 6 9 15 2.77479139720947 4.83781290418579 -2.06302150697632 A:G G A 10 0.537534767131755 0.311071565735570 ENSG00000180758:ENST00000377411:exon_9165545_9165739:GPR157;ENSG00000180758:ENST00000377408:exon_9165545_9165739:GPR157 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 9307033 G/A 1 14 11 25 6.47451326015543 5.91288243844931 0.561630821706125 A:G G A 10 0.537534767131755 0.844309277033242 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9307025_9307142:H6PD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 9307138 T/C 1 8 11 19 3.69972186294596 5.91288243844931 -2.21316057550334 T:C T C 10 0.537534767131755 0.361207681506224 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9307025_9307142:H6PD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 9784423 C/T 1 114 111 225 52.7210365469799 59.6663591516248 -6.94532260464487 T:C C T 10 0.537534767131755 0.384824657853527 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9784334_9784479:PIK3CD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 9804693 C/T 1 61 33 94 28.2103792049629 17.7386473153479 10.471731889615 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0380010325250149 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 9811541 A/G 1 42 36 78 19.4235397804663 19.3512516167432 0.0722881637231154 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9811531_9811639:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9811531_9811739:CLSTN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 10218439 T/C 1 4 9 13 1.84986093147298 4.83781290418579 -2.98795197271281 T:C T C 10 0.537534767131755 0.161862439396256 ENSG00000130939:ENST00000253251:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000377157:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000343090:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000414346:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000488228:exon_10218412_10218540:UBE4B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 88 76 164 40.6969404924056 40.8526423020134 -0.15570180960782 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 10473200 G/A 1 86 73 159 39.7720100266691 39.2400380006181 0.531972026050958 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 10479791 G/A 1 192 212 404 88.793324710703 113.957370631932 -25.164045921229 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0125748337211606 ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10479687_10480200:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10479687_10480201:PGD;ENSG00000142657:ENST00000498356:exon_10479687_10479887:PGD;ENSG00000142657:ENST00000496718:exon_10479474_10479865:PGD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 10596341 C/T 1 13 16 29 6.01204802728719 8.60055627410808 -2.58850824682089 T:C C T 10 0.537534767131755 0.356879843182363 ENSG00000142655:ENST00000472851:exon_10596270_10596629:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000491661:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000492696:exon_10596270_10596346:PEX14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 10708028 G/A 1 9 4 13 4.16218709581421 2.15013906852702 2.01204802728719 A:G G A 10 0.537534767131755 0.405252718730477 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10707858_10708196:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10707270_10708196:CASZ1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 10708142 A/G 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 A:G A G 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10707858_10708196:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10707270_10708196:CASZ1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 10709441 C/T 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10709340_10709494:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10709340_10709494:CASZ1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 10713765 T/C 1 13 13 26 6.01204802728719 6.98795197271281 -0.975903945425628 T:C T C 10 0.537534767131755 0.700055875569719 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10713041_10714275:CASZ1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 10725498 G/A 1 10 9 19 4.62465232868245 4.83781290418579 -0.213160575503344 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10725140_10725628:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10725140_10725628:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10725140_10725628:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000478728:exon_10725140_10725628:CASZ1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 11087524 G/A 1 11 6 17 5.08711756155069 3.22520860279053 1.86190895876017 A:G G A 10 0.537534767131755 0.4682435751469 ENSG00000009724:ENST00000400897:exon_11086580_11087705:MASP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 11159799 C/G 1 14 24 38 6.47451326015543 12.9008344111621 -6.42632115100669 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0495359999709492 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11159778_11159938:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11159778_11159926:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000460196:exon_11159778_11159911:EXOSC10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 23 19 42 10.6367003559696 10.2131605755033 0.423539780466291 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 11854476 T/G 1 10 13 23 4.62465232868245 6.98795197271281 -2.36329964403036 T:G T G 10 0.537534767131755 0.403957046543287 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11854415_11854595:MTHFR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 19 22 41 8.78683942449666 11.8257648768986 -3.03892545240195 T:C C T 10 0.537534767131755 0.351912696931157 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 16 18 34 7.39944372589192 9.67562580837159 -2.27618208247967 T:C C T 10 0.537534767131755 0.492998675593706 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 21 28 49 9.71176989023315 15.0509734796891 -5.33920358945599 A:G A G 10 0.537534767131755 0.151593639346189 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 69 66 135 31.9101010679089 35.4772946306958 -3.56719356278692 T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.546836863037057 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 12248942 A/G 1 51 41 92 23.5857268762805 22.038925452402 1.54680142387854 A:G A G 10 0.537534767131755 0.755211304923678 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 12252955 T/G 1 92 69 161 42.5468014238785 37.0898989320911 5.45690249178745 T:G T G 10 0.537534767131755 0.429445378822085 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 12253062 G/A 1 82 72 154 37.9221490951961 38.7025032334864 -0.780354138290264 A:G G A 10 0.537534767131755 0.93565456281328 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 12401868 A/C 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 A:C A C 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000048707:ENST00000358136:exon_12401837_12401942:VPS13D;ENSG00000048707:ENST00000356315:exon_12401837_12401942:VPS13D;ENSG00000048707:ENST00000011700:exon_12401840_12401942:VPS13D;ENSG00000048707:ENST00000460333:exon_12401837_12401942:VPS13D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 14143003 A/G 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 A:G A G 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000116731:ENST00000376048:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000503842:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000505823:exon_14142922_14143065:PRDM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 15755248 C/T 1 122 127 249 56.4207584099259 68.2669154257329 -11.846157015807 T:C C T 10 0.537534767131755 0.143736004981204 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 15892415 A/C 1 9 15 24 4.16218709581421 8.06302150697632 -3.90083441116212 A:C A C 10 0.537534767131755 0.150631669869192 ENSG00000116138:ENST00000375847:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375838:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000475133:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375849:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000483270:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000472665:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000479655:exon_15892313_15892494:DNAJC16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 15904318 C/T 1 26 14 40 12.0240960545744 7.52548673984457 4.4986093147298 T:C C T 10 0.537534767131755 0.204051357106377 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15904180_15904359:AGMAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 15905501 G/A 1 15 15 30 6.93697849302368 8.06302150697632 -1.12604301395265 A:G G A 10 0.537534767131755 0.716938089677859 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15905354_15905549:AGMAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 15909744 C/T 1 22 12 34 10.1742351231014 6.45041720558106 3.72381791752033 T:C C T 10 0.537534767131755 0.230539902704082 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 15911349 G/A 1 14 18 32 6.47451326015543 9.67562580837159 -3.20111254821616 A:G G A 10 0.537534767131755 0.289607831440422 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15911191_15911605:AGMAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 15959977 C/T 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000197312:ENST00000480945:exon_15959934_15960060:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000486680:exon_15959934_15960801:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000320153:exon_15959934_15960060:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000483899:exon_15959934_15960060:DDI2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 15986547 T/C 1 20 29 49 9.2493046573649 15.5885082468209 -6.33920358945599 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0848566945066893 ENSG00000197312:ENST00000480945:exon_15986332_15995539:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000320153:exon_15986332_15987552:DDI2;ENSG00000215695:ENST00000345034:exon_15986364_15988217:RSC1A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 16042766 T/C 1 25 17 42 11.5616308217061 9.13809104123983 2.42353978046629 T:C T C 10 0.537534767131755 0.536683339793605 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000462455:exon_16042732_16042838:PLEKHM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 16044401 G/A 1 25 17 42 11.5616308217061 9.13809104123983 2.42353978046629 A:G G A 10 0.537534767131755 0.536683339793605 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16044388_16044487:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000462455:exon_16044388_16044487:PLEKHM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 16056364 G/A 1 56 44 100 25.8980530406217 23.6515297537972 2.2465232868245 A:G G A 10 0.537534767131755 0.689020673719914 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 16059018 C/T 1 63 53 116 29.1353096706994 28.489342657983 0.645967012716426 T:C C T 10 0.537534767131755 0.926063166225783 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16058845_16059024:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16058845_16059024:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16058845_16059024:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16058845_16059024:PLEKHM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 16255644 C/T 1 27 19 46 12.4865612874426 10.2131605755033 2.27340071193927 T:C C T 10 0.537534767131755 0.55585873821522 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN;ENSG00000065526:ENST00000375753:exon_16254586_16255713:SPEN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 16256007 T/C 1 19 25 44 8.78683942449666 13.4383691782939 -4.65152975379722 T:C T C 10 0.537534767131755 0.175118219550385 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 16259813 A/G 1 63 59 122 29.1353096706994 31.7145512607735 -2.5792415900741 A:G A G 10 0.537534767131755 0.650828707037056 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 16260916 C/T 1 24 20 44 11.0991655888379 10.7506953426351 0.348470246202782 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 16262404 C/T 1 28 29 57 12.9490265203109 15.5885082468209 -2.63948172651003 T:C C T 10 0.537534767131755 0.508547427746685 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 16272250 A/G 1 18 8 26 8.32437419162841 4.30027813705404 4.02409605457437 A:G A G 10 0.537534767131755 0.120546606575642 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 16577908 G/C 1 15 23 38 6.93697849302368 12.3632996440304 -5.42632115100669 C:G G C 10 0.537534767131755 0.102589905124565 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 16641899 C/T 1 17 6 23 7.86190895876017 3.22520860279053 4.63670035596964 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0603267109023344 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16641664_16641930:FBXO42 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 17312743 C/T 1 36 24 60 16.6487483832568 12.9008344111621 3.7479139720947 T:C C T 10 0.537534767131755 0.366170534268106 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312454_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17312476_17312853:ATP13A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 17395521 G/A 1 3 12 15 1.38739569860474 6.45041720558106 -5.06302150697632 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00953783143503242 ENSG00000117115:ENST00000375486:exon_17393256_17395772:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000444885:exon_17393256_17395772:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000479534:exon_17394095_17395772:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000466151:exon_17394281_17395772:PADI2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 17396703 T/C 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000117115:ENST00000375486:exon_17396583_17396711:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000444885:exon_17396583_17396711:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000479534:exon_17396583_17396711:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000466151:exon_17396583_17396711:PADI2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 17419024 G/A 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 A:G G A 10 0.537534767131755 0.190750883746296 ENSG00000117115:ENST00000375486:exon_17418903_17419028:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000375481:exon_17418903_17419028:PADI2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 69 69 138 31.9101010679089 37.0898989320911 -5.17979786418219 A:G G A 10 0.537534767131755 0.393948436667189 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 19422060 G/A 1 30 36 66 13.8739569860474 19.3512516167432 -5.47729463069583 A:G G A 10 0.537534767131755 0.216742806859828 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000467272:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000483922:exon_19422039_19422416:UBR4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 19471388 A/G 1 19 16 35 8.78683942449666 8.60055627410808 0.186283150388576 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19471280_19471401:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19471280_19471401:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19471280_19471401:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19471280_19471401:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19471280_19471401:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000425413:exon_19471280_19471401:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000417040:exon_19471280_19471401:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000465036:exon_19471346_19471401:UBR4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 19566382 A/G 1 6 8 14 2.77479139720947 4.30027813705404 -1.52548673984457 A:G A G 10 0.537534767131755 0.435196015554607 ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19566312_19566479:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19566312_19566479:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19566312_19566479:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375197:exon_19566312_19566468:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19566312_19566479:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000467423:exon_19565121_19566479:KIAA0090 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 19570146 G/A 1 8 15 23 3.69972186294596 8.06302150697632 -4.36329964403036 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0926796024565271 ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19570108_19570201:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19570108_19570201:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19570108_19570201:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19570108_19570201:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000475079:exon_19570114_19570201:KIAA0090 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 19583602 G/A 1 86 76 162 39.7720100266691 40.8526423020134 -1.08063227534431 A:G G A 10 0.537534767131755 0.875073383691588 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583558_19583639:MRTO4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 19583636 C/T 1 70 87 157 32.3725663007772 46.7655247404627 -14.3929584396855 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0247463481383902 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583558_19583639:MRTO4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 19584004 G/A 1 77 66 143 35.6098229308549 35.4772946306958 0.132528300159038 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 19585207 G/A 1 104 101 205 48.0963842182975 54.2910114803073 -6.19462726200977 A:G G A 10 0.537534767131755 0.401040379163475 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19585175_19586622:MRTO4;ENSG00000053372:ENST00000479559:exon_19585175_19585233:MRTO4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 19950062 T/C 1 28 59 87 12.9490265203109 31.7145512607735 -18.7655247404627 T:C T C 10 0.537534767131755 5.75246355605373e-05 ENSG00000173436:ENST00000486890:exon_19949968_19950284:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000322753:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000467029:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000481464:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000498642:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000485362:exon_19949968_19950077:C1orf151 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 20009737 G/A 1 25 17 42 11.5616308217061 9.13809104123983 2.42353978046629 A:G G A 10 0.537534767131755 0.536683339793605 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20008706_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20008735_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20008754_20009937:TMCO4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 20020993 A/G 1 14 11 25 6.47451326015543 5.91288243844931 0.561630821706125 A:G A G 10 0.537534767131755 0.844309277033242 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000494342:exon_20020985_20021044:TMCO4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 21205933 T/A 1 8 7 15 3.69972186294596 3.76274336992228 -0.0630215069763245 A:T T A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21205816_21206013:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21205816_21206013:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21205816_21206013:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374935:exon_21205816_21206013:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21205816_21206013:EIF4G3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 21267993 G/C 1 18 25 43 8.32437419162841 13.4383691782939 -5.11399498666546 C:G G C 10 0.537534767131755 0.127728199299585 ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000356916:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374927:exon_21267984_21268823:EIF4G3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 22109370 G/A 1 71 90 161 32.8350315336454 48.3781290418579 -15.5430975082125 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0143262863311490 ENSG00000090686:ENST00000400301:exon_22109317_22109688:USP48;ENSG00000090686:ENST00000308271:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000529637:exon_22109317_22109484:USP48;ENSG00000090686:ENST00000421625:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000532737:exon_22109317_22109384:USP48;ENSG00000090686:ENST00000489108:exon_22109317_22109436:USP48 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 22846657 C/T 1 7 8 15 3.23725663007772 4.30027813705404 -1.06302150697632 T:C C T 10 0.537534767131755 0.61360765893613 ENSG00000184677:ENST00000374651:exon_22846554_22846768:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000404138:exon_22846554_22846768:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000375647:exon_22846554_22846768:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000374649:exon_22846554_22846768:ZBTB40 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 22852715 G/C 1 14 9 23 6.47451326015543 4.83781290418579 1.63670035596964 C:G G C 10 0.537534767131755 0.536918781286691 ENSG00000184677:ENST00000374651:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000404138:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000375647:exon_22852695_22857647:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000374649:exon_22852695_22857647:ZBTB40 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 22852724 G/A 1 11 6 17 5.08711756155069 3.22520860279053 1.86190895876017 A:G G A 10 0.537534767131755 0.4682435751469 ENSG00000184677:ENST00000374651:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000404138:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000375647:exon_22852695_22857647:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000374649:exon_22852695_22857647:ZBTB40 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 22852904 G/A 1 7 12 19 3.23725663007772 6.45041720558106 -3.21316057550334 A:G G A 10 0.537534767131755 0.169147725225653 ENSG00000184677:ENST00000374651:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000404138:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000375647:exon_22852695_22857647:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000374649:exon_22852695_22857647:ZBTB40 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 24201717 G/A 1 12 12 24 5.54958279441894 6.45041720558106 -0.900834411162119 A:G G A 10 0.537534767131755 0.83840612934176 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 25291010 A/T 1 59 58 117 27.2854487392265 31.1770164936418 -3.89156775441533 A:T A T 10 0.537534767131755 0.516561234488238 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000428150:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25291005_25291159:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000479341:exon_25291005_25291070:RUNX3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 26496651 T/C 1 130 139 269 60.1204802728719 74.7173326313139 -14.5968523584421 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0763636965940169 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 26582091 G/A 1 17 9 26 7.86190895876017 4.83781290418579 3.02409605457437 A:G G A 10 0.537534767131755 0.246341934149751 ENSG00000130695:ENST00000476272:exon_26581662_26582356:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000252992:exon_26581662_26582356:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000451429:exon_26581662_26582356:CCDC21 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 26608782 C/T 0 8 0 8 3.69972186294596 0 3.69972186294596 C C 10 0.537534767131755 0.00906265828433196 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26607819_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26608772_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26608773_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26608773_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26608775_26608846:UBXN11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 24 22 46 11.0991655888379 11.8257648768986 -0.726599288060729 T:C C T 10 0.537534767131755 0.882940962147627 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 26610891 A/C 1 22 17 39 10.1742351231014 9.13809104123983 1.03614408186156 A:C A C 10 0.537534767131755 0.872690301634875 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26610853_26612032:UBXN11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 683 663 1346 315.863754049011 356.385550608354 -40.5217965593422 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0287246108414203 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 676 670 1346 312.626497418934 360.148293978276 -47.5217965593422 A:T:G A G 10 0.537534767131755 0.0101609666230045 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 27480757 A/G 1 17 11 28 7.86190895876017 5.91288243844931 1.94902652031086 A:G A G 10 0.537534767131755 0.570669312486509 ENSG00000090020:ENST00000263980:exon_27480474_27481401:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000374086:exon_27480474_27481089:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000374084:exon_27480473_27480852:SLC9A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 27676925 G/A 1 21 29 50 9.71176989023315 15.5885082468209 -5.87673835658775 A:G G A 10 0.537534767131755 0.118051965258774 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27676463_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27676463_27676976:SYTL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 27679797 A/G 1 8 17 25 3.69972186294596 9.13809104123983 -5.43836917829387 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0427483104876967 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 27679954 G/A 1 15 21 36 6.93697849302368 11.2882301097669 -4.35125161674318 A:G G A 10 0.537534767131755 0.180816508722453 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 16 18 34 7.39944372589192 9.67562580837159 -2.27618208247967 A:G A G 10 0.537534767131755 0.492998675593706 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 27876482 C/A 1 6 11 17 2.77479139720947 5.91288243844931 -3.13809104123983 A:C C A 10 0.537534767131755 0.148136675277047 ENSG00000126705:ENST00000247087:exon_27873772_27878700:AHDC1;ENSG00000126705:ENST00000374011:exon_27873772_27878700:AHDC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 28206588 T/C 1 19 9 28 8.78683942449666 4.83781290418579 3.94902652031086 T:C T C 10 0.537534767131755 0.183784224314788 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 180 65 245 83.2437419162841 34.9397598635641 48.30398205272 A:G A G 10 0.537534767131755 3.042793209623e-10 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 162 61 223 74.9193677246557 32.7896207950371 42.1297469296186 T:C T C 10 0.537534767131755 8.07806162763297e-09 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 160 57 217 73.9944372589192 30.63948172651 43.3549555324092 A:G A G 10 0.537534767131755 1.94301369171727e-09 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 29344869 G/A 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000159023:ENST00000343067:exon_29344736_29344954:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398863:exon_29344736_29344954:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398861:exon_29344736_29344954:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000356093:exon_29344736_29344954:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398865:exon_29344736_29344954:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000358989:exon_29344736_29344954:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373800:exon_29344736_29344954:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000349460:exon_29344736_29344954:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000347529:exon_29344736_29344954:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373798:exon_29344736_29344954:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373797:exon_29344736_29344954:EPB41 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 154 148 302 71.2196458617097 79.5551455354997 -8.33549967379 T:G T G 10 0.537534767131755 0.355927241991941 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 29529699 T/C 1 25 20 45 11.5616308217061 10.7506953426351 0.810935479071027 T:C T C 10 0.537534767131755 0.881646646503372 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475773:exon_29529643_29529713:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463412:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000453185:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29529654_29529745:MECR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 26 24 50 12.0240960545744 12.9008344111621 -0.876738356587747 A:G A G 10 0.537534767131755 0.887437482628127 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 600 955 1555 277.479139720947 513.345702610826 -235.866562889879 A:T:C T C 10 0.537534767131755 3.90817226560291e-33 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 76 60 136 35.1473576979866 32.2520860279053 2.89527167008132 A:G G A 10 0.537534767131755 0.667469190386614 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 31898234 T/C 1 126 57 183 58.2706193413989 30.63948172651 27.6311376148888 T:C T C 10 0.537534767131755 4.03205756755061e-05 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31898177_31898256:SERINC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 31898687 C/T 1 78 41 119 36.0722881637231 22.038925452402 14.0333627113212 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.00997770237952025 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31898623_31898760:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31898623_31898705:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31898623_31898760:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31898623_31898760:SERINC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 31906882 A/G 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 A:G A G 10 0.537534767131755 0.357514540525421 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 130 114 244 60.1204802728719 61.2789634530201 -1.15848318014822 A:G A G 10 0.537534767131755 0.89794381769589 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 32797708 C/G 1 222 185 407 102.66728169675 99.4439319193747 3.22334977737573 C:G C G 10 0.537534767131755 0.765663586583191 ENSG00000116478:ENST00000373548:exon_32797691_32797843:HDAC1;ENSG00000116478:ENST00000373541:exon_32797691_32797843:HDAC1;ENSG00000116478:ENST00000476391:exon_32797691_32797843:HDAC1;ENSG00000116478:ENST00000471488:exon_32797277_32797843:HDAC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 33409693 G/A 1 10 21 31 4.62465232868245 11.2882301097669 -6.6635777810844 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0187839138109486 ENSG00000116514:ENST00000373456:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000401899:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000356990:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000405457:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000235150:exon_33409620_33409760:RNF19B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 10 13 23 4.62465232868245 6.98795197271281 -2.36329964403036 T:C T C 10 0.537534767131755 0.403957046543287 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 36359669 A/G 1 11 9 20 5.08711756155069 4.83781290418579 0.249304657364901 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000092847:ENST00000373206:exon_36359638_36359772:EIF2C1;ENSG00000092847:ENST00000373204:exon_36359638_36359772:EIF2C1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 36556867 C/T 1 19 25 44 8.78683942449666 13.4383691782939 -4.65152975379722 T:C C T 10 0.537534767131755 0.175118219550385 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36556845_36556941:ADPRHL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 36602943 C/T 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 T:C C T 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000054116:ENST00000462715:exon_36602182_36603579:TRAPPC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 36642149 C/T 1 96 104 200 44.3966623553515 55.9036157817025 -11.506953426351 T:C C T 10 0.537534767131755 0.103486748952661 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36641800_36642182:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36642019_36642182:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36641800_36642182:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36641800_36642182:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36642019_36642182:MAP7D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 36643685 C/A 1 123 120 243 56.8832236427941 64.5041720558106 -7.62094841301646 A:C C A 10 0.537534767131755 0.335064286590594 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373148:exon_36643474_36643802:MAP7D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 36643783 C/T 1 103 109 212 47.6339189854292 58.5912896173613 -10.9573706319321 T:C C T 10 0.537534767131755 0.147899401618754 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373148:exon_36643474_36643802:MAP7D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 36752410 C/T 1 139 103 242 64.2826673686861 55.3660810145708 8.9165863541153 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.273133228401873 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 36807452 G/A 1 50 57 107 23.1232616434123 30.63948172651 -7.51622008309778 A:G G A 10 0.537534767131755 0.147225193673280 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36805225_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36805225_36807574:STK40 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 36921848 G/A 1 137 132 269 63.3577369029496 70.9545892613917 -7.59685235844209 A:G G A 10 0.537534767131755 0.359589909977494 ENSG00000116898:ENST00000373116:exon_36921788_36921979:MRPS15;ENSG00000116898:ENST00000488606:exon_36921788_36921979:MRPS15;ENSG00000116898:ENST00000477040:exon_36921788_36922167:MRPS15;ENSG00000116898:ENST00000462067:exon_36921788_36921979:MRPS15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 4 26 30 1.84986093147298 13.9759039454256 -12.1260430139526 T:C C T 10 0.537534767131755 7.95910308370718e-06 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 39748921 G/A 1 10 11 21 4.62465232868245 5.91288243844931 -1.28823010976685 A:G G A 10 0.537534767131755 0.663607311505883 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000524432:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000404645:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000496804:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000530262:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39748861_39748973:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000485063:exon_39748798_39748973:MACF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 39797055 A/G 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 39847730 G/A 1 18 10 28 8.32437419162841 5.37534767131755 2.94902652031086 A:G G A 10 0.537534767131755 0.343730457745997 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39847625_39847824:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39847625_39847824:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39847625_39847824:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39847625_39847824:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39847625_39847824:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39847625_39847824:MACF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 39908506 G/A 1 24 44 68 11.0991655888379 23.6515297537972 -12.5523641649593 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00320863779737131 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 31 26 57 14.3364222189156 13.9759039454256 0.360518273489967 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 40557033 A/G 1 39 59 98 18.0361440818616 31.7145512607735 -13.678407178912 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00609818762950229 ENSG00000131238:ENST00000433473:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372783:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372776:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000529905:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000530704:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000439754:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527311:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372779:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527107:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000526547:exon_40557001_40557071:PPT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 40737589 T/C 1 1 7 8 0.462465232868245 3.76274336992228 -3.30027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0285185064817781 ENSG00000084073:ENST00000372759:exon_40737566_40737707:ZMPSTE24 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 40771432 C/T 1 20 17 37 9.2493046573649 9.13809104123983 0.111213616125067 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40771387_40771440:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40771387_40771440:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40771387_40771440:COL9A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 40773150 G/A 1 13 5 18 6.01204802728719 2.68767383565877 3.32437419162841 A:G G A 10 0.537534767131755 0.155872428250262 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 12 11 23 5.54958279441894 5.91288243844931 -0.363299644030365 T:G G T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 41493811 C/T 1 20 15 35 9.2493046573649 8.06302150697632 1.18628315038858 T:C C T 10 0.537534767131755 0.736906280800669 ENSG00000010803:ENST00000372597:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372596:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000337495:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372595:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000326197:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361191:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361705:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397174:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397171:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000456518:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000402904:exon_41492877_41493991:SCMH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 43131653 G/A 1 27 30 57 12.4865612874426 16.1260430139526 -3.63948172651003 A:G G A 10 0.537534767131755 0.354448455410502 ENSG00000171960:ENST00000304979:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000372550:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000440068:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000455203:exon_43131651_43131738:PPIH;ENSG00000171960:ENST00000461351:exon_43131651_43131738:PPIH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 43212869 A/T 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:T A T 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43212046_43213083:LEPRE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 43296118 G/A 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000164010:ENST00000372517:exon_43296115_43296204:ERMAP;ENSG00000164010:ENST00000372514:exon_43296115_43296204:ERMAP;ENSG00000164010:ENST00000328249:exon_43295586_43296786:ERMAP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 43392819 G/T 1 43 46 89 19.8860050133345 24.7265992880607 -4.84059427472619 T:G G T 10 0.537534767131755 0.338945938885788 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43391519_43392912:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43391519_43392912:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43391826_43392912:SLC2A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 43393384 G/A 1 21 20 41 9.71176989023315 10.7506953426351 -1.03892545240195 A:G G A 10 0.537534767131755 0.756605398595916 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43393276_43393479:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43393276_43393479:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43393276_43393479:SLC2A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 43394612 T/C 1 50 43 93 23.1232616434123 23.1139949866655 0.00926665674678873 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43394603_43394704:SLC2A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 43916932 C/T 1 31 22 53 14.3364222189156 11.8257648768986 2.51065734201699 T:C C T 10 0.537534767131755 0.582059602256385 ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43916008_43918304:KIAA0467;ENSG00000198198:ENST00000460536:exon_43916008_43918321:KIAA0467;ENSG00000178922:ENST00000483618:exon_43916824_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372433:exon_43916825_43916982:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43916825_43916982:HYI;ENSG00000178922:ENST00000470662:exon_43916829_43916982:HYI;ENSG00000178922:ENST00000487366:exon_43916829_43916982:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372430:exon_43916829_43916982:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372432:exon_43916829_43916982:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372427:exon_43916831_43916982:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43916831_43916982:HYI;ENSG00000178922:ENST00000403034:exon_43916831_43916982:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372426:exon_43916831_43916982:HYI HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 44137257 C/A 1 8 13 21 3.69972186294596 6.98795197271281 -3.28823010976685 A:C C A 10 0.537534767131755 0.189542373698344 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44137176_44137546:KDM4A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 44415415 C/T 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000117408:ENST00000372343:exon_44415089_44415825:IPO13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 44442521 A/C 1 8 2 10 3.69972186294596 1.07506953426351 2.62465232868245 A:C A C 10 0.537534767131755 0.119280745126671 ENSG00000117410:ENST00000496131:exon_44442445_44442786:ATP6V0B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 44468235 G/A 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 A:G G A 10 0.537534767131755 0.760762761058777 ENSG00000196517:ENST00000372307:exon_44468184_44468318:SLC6A9;ENSG00000196517:ENST00000372306:exon_44468184_44468318:SLC6A9;ENSG00000196517:ENST00000372310:exon_44468184_44468318:SLC6A9;ENSG00000196517:ENST00000475075:exon_44468184_44468318:SLC6A9;ENSG00000196517:ENST00000360584:exon_44468184_44468318:SLC6A9;ENSG00000196517:ENST00000357730:exon_44468184_44468318:SLC6A9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45205598 T/C 1 8 13 21 3.69972186294596 6.98795197271281 -3.28823010976685 T:C T C 10 0.537534767131755 0.189542373698344 ENSG00000142945:ENST00000452259:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000493027:exon_45205497_45205674:KIF2C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45218895 A/T 1 32 25 57 14.7988874517838 13.4383691782939 1.36051827348997 A:T A T 10 0.537534767131755 0.791005023816092 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45223255 A/G 1 32 31 63 14.7988874517838 16.6635777810844 -1.86469032930056 A:G A G 10 0.537534767131755 0.705068895966606 ENSG00000142945:ENST00000452259:exon_45223228_45223318:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45223228_45223318:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45223228_45223318:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45223228_45223318:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000493027:exon_45223228_45223318:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45223228_45223318:KIF2C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45224998 A/C 1 45 36 81 20.810935479071 19.3512516167432 1.45968386232785 A:C A C 10 0.537534767131755 0.823845797453172 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45224878_45225020:KIF2C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45226084 G/A 1 50 48 98 23.1232616434123 25.8016688223242 -2.67840717891199 A:G G A 10 0.537534767131755 0.613321058724126 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45225952_45226156:KIF2C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45266592 C/T 1 16 13 29 7.39944372589192 6.98795197271281 0.411491753179106 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45266512_45266619:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45266512_45266619:PLK3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45270024 G/C 1 7 22 29 3.23725663007772 11.8257648768986 -8.5885082468209 C:G G C 10 0.537534767131755 0.00224108480664985 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45270011_45270451:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461769:exon_45270011_45270173:PLK3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45444038 G/A 1 11 14 25 5.08711756155069 7.52548673984457 -2.43836917829387 A:G G A 10 0.537534767131755 0.423037845947577 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000480675:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000477953:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372182:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000487532:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000497010:exon_45443987_45444132:EIF2B3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45475886 C/T 1 21 15 36 9.71176989023315 8.06302150697632 1.64874838325682 T:C C T 10 0.537534767131755 0.619585238970854 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45475873_45475965:HECTD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45476368 G/C 1 32 20 52 14.7988874517838 10.7506953426351 4.04819210914874 C:G G C 10 0.537534767131755 0.269865259424571 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45476218_45476378:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45476325_45476378:HECTD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45476663 G/A 1 18 25 43 8.32437419162841 13.4383691782939 -5.11399498666546 A:G G A 10 0.537534767131755 0.127728199299585 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45476561_45477001:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45476561_45477027:HECTD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45479439 G/A 1 50 37 87 23.1232616434123 19.8887863838749 3.23447525953732 A:G G A 10 0.537534767131755 0.519954499784537 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491773:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000463092:exon_45478808_45479561:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479247_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372139:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479247_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479247_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000428106:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD;ENSG00000126088:ENST00000473012:exon_45479247_45479463:UROD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45793885 A/G 1 9 14 23 4.16218709581421 7.52548673984457 -3.36329964403036 A:G A G 10 0.537534767131755 0.209243218264062 ENSG00000186603:ENST00000334815:exon_45792545_45794347:HPDL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45796899 C/G 1 22 21 43 10.1742351231014 11.2882301097669 -1.11399498666546 C:G C G 10 0.537534767131755 0.761428471804822 ENSG00000132781:ENST00000529984:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000485271:exon_45796854_45796942:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000488731:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000529892:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45796854_45797006:MUTYH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45805880 G/A 1 9 6 15 4.16218709581421 3.22520860279053 0.936978493023676 A:G G A 10 0.537534767131755 0.797066078642493 ENSG00000132781:ENST00000467940:exon_45805875_45806059:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000534453:exon_45805648_45805907:MUTYH;ENSG00000132773:ENST00000372090:exon_45805342_45805976:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000477731:exon_45805724_45805994:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000471337:exon_45805847_45805976:TOE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45808589 G/C 1 26 18 44 12.0240960545744 9.67562580837159 2.34847024620278 C:G G C 10 0.537534767131755 0.546470267269541 ENSG00000132773:ENST00000372090:exon_45808515_45808674:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000471337:exon_45808407_45808650:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000495703:exon_45808407_45808674:TOE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45810531 T/C 1 14 17 31 6.47451326015543 9.13809104123983 -2.6635777810844 T:C T C 10 0.537534767131755 0.371006982111436 ENSG00000070759:ENST00000372084:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372086:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000341771:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372083:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000486676:exon_45809556_45811230:TESK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 45810797 C/T 1 14 15 29 6.47451326015543 8.06302150697632 -1.58850824682089 T:C C T 10 0.537534767131755 0.580849764907506 ENSG00000070759:ENST00000372084:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372086:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000341771:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372083:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000486676:exon_45809556_45811230:TESK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 46049849 G/C 1 32 29 61 14.7988874517838 15.5885082468209 -0.789620795037052 C:G G C 10 0.537534767131755 0.898068334777582 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46049780_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46049661_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000464190:exon_46049713_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528084:exon_46049714_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46049714_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530840:exon_46049717_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531532:exon_46049717_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000529333:exon_46049717_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527470:exon_46049717_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46049717_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46049717_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46049717_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46049730_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000534101:exon_46049732_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46049732_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46049733_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46049735_46049877:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46049737_46049877:NASP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 46073597 A/G 1 19 15 34 8.78683942449666 8.06302150697632 0.72381791752033 A:G A G 10 0.537534767131755 0.864547358513853 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 46082330 C/T 1 194 180 374 89.7182551764395 96.7562580837159 -7.03800290727635 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.468345185071704 ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46082298_46082375:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46082298_46082375:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46082298_46082375:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46082298_46082375:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46082298_46082375:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46082298_46082375:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46082298_46082375:NASP;ENSG00000132780:ENST00000534450:exon_46082298_46082375:NASP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 68 54 122 31.4476358350407 29.0268774251148 2.4207584099259 T:C T C 10 0.537534767131755 0.716697537157545 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 46159001 G/A 1 55 57 112 25.4355878077535 30.63948172651 -5.20389391875656 A:G G A 10 0.537534767131755 0.344000734416356 ENSG00000159596:ENST00000372025:exon_46158876_46160115:TMEM69;ENSG00000159596:ENST00000496366:exon_46158876_46159517:TMEM69 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 46159018 A/G 1 66 63 129 30.5227053693042 33.8646903293006 -3.34198495999639 A:G A G 10 0.537534767131755 0.596529786548121 ENSG00000159596:ENST00000372025:exon_46158876_46160115:TMEM69;ENSG00000159596:ENST00000496366:exon_46158876_46159517:TMEM69 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 46159244 A/G 1 50 57 107 23.1232616434123 30.63948172651 -7.51622008309778 A:G A G 10 0.537534767131755 0.147225193673280 ENSG00000159596:ENST00000372025:exon_46158876_46160115:TMEM69;ENSG00000159596:ENST00000496366:exon_46158876_46159517:TMEM69 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 12 10 22 5.54958279441894 5.37534767131755 0.174235123101391 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 19 24 43 8.78683942449666 12.9008344111621 -4.11399498666546 A:G A G 10 0.537534767131755 0.223617250077911 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 46521517 G/A 1 11 3 14 5.08711756155069 1.61260430139526 3.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 0.104465203629206 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 46521559 A/T 1 9 3 12 4.16218709581421 1.61260430139526 2.54958279441894 A:T A T 10 0.537534767131755 0.159578115428333 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 46660295 T/C 1 23 29 52 10.6367003559696 15.5885082468209 -4.95180789085126 T:C T C 10 0.537534767131755 0.210306766298917 ENSG00000085998:ENST00000371984:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371992:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000396420:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371986:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000477114:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000497439:exon_46660254_46660323:POMGNT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 46739464 C/T 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 T:C C T 10 0.537534767131755 0.518813828738763 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 12 9 21 5.54958279441894 4.83781290418579 0.711769890233146 A:G A G 10 0.537534767131755 0.829121193760437 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 47746678 G/C 1 10 13 23 4.62465232868245 6.98795197271281 -2.36329964403036 C:G G C 10 0.537534767131755 0.403957046543287 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47746618_47746728:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000447475:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000418131:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000436811:exon_47746618_47746729:STIL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 47799639 G/C 1 82 69 151 37.9221490951961 37.0898989320911 0.832250163104995 C:G G C 10 0.537534767131755 0.935028917525749 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47799481_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000471289:exon_47799551_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47799586_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47799613_47799788:CMPK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 19 13 32 8.78683942449666 6.98795197271281 1.79888745178384 T:C C T 10 0.537534767131755 0.596815376088155 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 53792651 A/C 1 2 7 9 0.92493046573649 3.76274336992228 -2.83781290418579 A:C A C 10 0.537534767131755 0.0909104192397482 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53792545_53792664:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000496580:exon_53792545_53792664:LRP8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 78 61 139 36.0722881637231 32.7896207950371 3.28266736868606 C:G G C 10 0.537534767131755 0.610285991842489 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 167 135 302 77.2316938889969 72.5671935627869 4.66450032620999 C:G C G 10 0.537534767131755 0.603911615601194 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 55224131 T/C 1 2 7 9 0.92493046573649 3.76274336992228 -2.83781290418579 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0909104192397482 ENSG00000162396:ENST00000371279:exon_55222571_55224863:PARS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 55224751 C/A 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 A:C C A 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000162396:ENST00000371279:exon_55222571_55224863:PARS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 58 78 136 26.8229835063582 41.9277118362769 -15.1047283299187 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0098407290291408 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 58971831 G/A 1 14 7 21 6.47451326015543 3.76274336992228 2.71176989023315 A:G G A 10 0.537534767131755 0.278003094604447 ENSG00000173406:ENST00000485760:exon_58971732_58971881:DAB1;ENSG00000162600:ENST00000467509:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000460671:exon_58971732_58971871:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58971732_58971881:OMA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 59142713 T/C 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59142598_59142728:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59142598_59142728:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59142598_59142728:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000481973:exon_59142444_59142728:MYSM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 59147926 T/C 1 4 9 13 1.84986093147298 4.83781290418579 -2.98795197271281 T:C T C 10 0.537534767131755 0.161862439396256 ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59147457_59148217:MYSM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 62232130 T/C 1 3 10 13 1.38739569860474 5.37534767131755 -3.98795197271281 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0471272182048252 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62231951_62232145:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62231951_62232145:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62231951_62232145:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62231951_62232145:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62231951_62232145:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62231951_62232145:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62231951_62232145:INADL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 62380298 G/A 1 11 2 13 5.08711756155069 1.07506953426351 4.01204802728719 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0272490390470393 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000494842:exon_62380259_62380336:INADL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 62456014 G/A 1 17 6 23 7.86190895876017 3.22520860279053 4.63670035596964 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0603267109023344 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000494842:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000490547:exon_62455840_62456108:INADL;ENSG00000132849:ENST00000307297:exon_62455840_62456036:INADL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 41 29 70 18.961074547598 15.5885082468209 3.37256630077715 T:C C T 10 0.537534767131755 0.472610290024224 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 65311262 G/A 1 22 20 42 10.1742351231014 10.7506953426351 -0.576460219533709 A:G G A 10 0.537534767131755 0.878117117357435 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 75172001 T/A 1 69 47 116 31.9101010679089 25.2641340551925 6.64596701271643 A:T T A 10 0.537534767131755 0.227072646465088 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000492102:exon_75171172_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75171174_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75171656_75172141:CRYZ HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 75190452 C/T 1 55 21 76 25.4355878077535 11.2882301097669 14.1473576979866 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00115406393564165 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75190395_75190518:CRYZ HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 76227022 A/G 1 57 107 164 26.36051827349 57.5162200830978 -31.1557018096078 A:G A G 10 0.537534767131755 1.35006638697661e-06 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76226807_76227300:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76226807_76227055:ACADM HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 76252011 G/A 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 0.484098982011234 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 76255228 G/A 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 A:G G A 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000137955:ENST00000496055:exon_76253182_76256202:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000461653:exon_76254844_76256202:RABGGTB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 78098003 A/T 1 9 16 25 4.16218709581421 8.60055627410808 -4.43836917829387 A:T A T 10 0.537534767131755 0.106790655888092 ENSG00000036549:ENST00000370801:exon_78097535_78099090:ZZZ3;ENSG00000036549:ENST00000476275:exon_78097535_78098561:ZZZ3;ENSG00000036549:ENST00000420374:exon_78097535_78099090:ZZZ3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 79093818 A/G 1 78 113 191 36.0722881637231 60.7414286858883 -24.6691405221652 A:G A G 10 0.537534767131755 0.000362100558992747 ENSG00000137959:ENST00000452835:exon_79093591_79093892:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 79094081 T/A 1 6 11 17 2.77479139720947 5.91288243844931 -3.13809104123983 A:T T A 10 0.537534767131755 0.148136675277047 ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 79095526 G/A 1 108 169 277 49.9462451497705 90.8433756452666 -40.8971304954961 A:G G A 10 0.537534767131755 9.0927516948506e-07 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 79102726 C/T 1 112 75 187 51.7961060812434 40.3151075348816 11.4809985463618 T:C C T 10 0.537534767131755 0.106414857035756 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79102717_79102846:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000494910:exon_79102377_79102888:IFI44L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 85124084 T/C 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 T:C T C 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85124001_85124151:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85124001_85124151:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85124001_85124151:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85124001_85124151:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000370612:exon_85124001_85124151:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000460500:exon_85123890_85124151:SSX2IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 85733374 C/T 1 10 16 26 4.62465232868245 8.60055627410808 -3.97590394542563 T:C C T 10 0.537534767131755 0.167381271298725 ENSG00000142867:ENST00000394761:exon_85731464_85733665:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000370580:exon_85731931_85733665:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000271015:exon_85731931_85733665:BCL10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 87379773 G/A 1 24 32 56 11.0991655888379 17.2011125482162 -6.10194695937828 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.108925647074496 ENSG00000183291:ENST00000499679:exon_87379711_87379801:RP4-604K5.1;ENSG00000183291:ENST00000361154:exon_87379711_87379801:RP4-604K5.1;ENSG00000183291:ENST00000331835:exon_87379711_87380048:RP4-604K5.1;ENSG00000183291:ENST00000370554:exon_87379711_87379817:RP4-604K5.1;ENSG00000183291:ENST00000401030:exon_87379711_87379809:RP4-604K5.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 11 20 31 5.08711756155069 10.7506953426351 -5.6635777810844 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0475396172192115 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 89579941 T/C 1 15 9 24 6.93697849302368 4.83781290418579 2.09916558883788 T:C T C 10 0.537534767131755 0.420607042022665 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89579699_89579979:GBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 89582690 G/C 1 9 11 20 4.16218709581421 5.91288243844931 -1.7506953426351 C:G G C 10 0.537534767131755 0.504150670545082 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 91980447 A/G 1 10 14 24 4.62465232868245 7.52548673984457 -2.90083441116212 A:G A G 10 0.537534767131755 0.306252553826296 ENSG00000097046:ENST00000430031:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000370415:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000234626:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000428239:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000486509:exon_91980376_91980554:CDC7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 23 18 41 10.6367003559696 9.67562580837159 0.961074547598047 A:G G A 10 0.537534767131755 0.875830565397781 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 93646207 T/C 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93645611_93646285:TMED5;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 93646433 T/C 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 C:G C G 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 32 38 70 14.7988874517838 20.4263211510067 -5.62743369922285 A:G A G 10 0.537534767131755 0.188561250205047 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 94342564 C/A 1 46 35 81 21.2734007119393 18.8137168496114 2.45968386232785 A:C C A 10 0.537534767131755 0.65612162666766 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 94343023 A/G 1 41 51 92 18.961074547598 27.4142731237195 -8.45319857612146 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0938259836236351 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 94344716 C/T 1 17 20 37 7.86190895876017 10.7506953426351 -2.88878638387493 T:C C T 10 0.537534767131755 0.410276871941077 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 94930345 G/A 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000117528:ENST00000454898:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000394233:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000370214:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000315713:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000468860:exon_94930331_94930429:ABCD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 100340787 G/A 1 6 2 8 2.77479139720947 1.07506953426351 1.69972186294596 A:G G A 10 0.537534767131755 0.300105198743785 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100340710_100340812:AGL;ENSG00000162688:ENST00000477753:exon_100340710_100340812:AGL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 101704532 G/T 1 42 74 116 19.4235397804663 39.7775727677499 -20.3540329872836 A:T:G G T 10 0.537534767131755 0.000173325845803769 ENSG00000170989:ENST00000305352:exon_101704378_101707074:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000424264:exon_101704378_101705491:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475821:exon_101704378_101705075:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475289:exon_101704378_101704720:S1PR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 12 14 26 5.54958279441894 7.52548673984457 -1.97590394542563 C:G G C 10 0.537534767131755 0.440566012205601 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 109486196 A/G 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369976:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000482889:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369972:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109486097_109486237:CLCC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 110882444 A/G 1 16 16 32 7.39944372589192 8.60055627410808 -1.20111254821616 A:G A G 10 0.537534767131755 0.724666023024225 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 110883569 A/T 1 35 29 64 16.1862831503886 15.5885082468209 0.597774903567682 A:T A T 10 0.537534767131755 0.90096518386916 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 111726869 G/A 1 22 24 46 10.1742351231014 12.9008344111621 -2.72659928806073 A:G G A 10 0.537534767131755 0.461241107508186 ENSG00000134255:ENST00000498239:exon_111726813_111727430:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000357172:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000478042:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000473474:exon_111726813_111726953:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000467362:exon_111726813_111727722:CEPT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/T 1 420 16 436 194.235397804663 8.60055627410808 185.634841530555 T:C C T 10 0.537534767131755 1.81319257406227e-90 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 112991698 T/C 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 T:C T C 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000143079:ENST00000271277:exon_112991564_112991794:CTTNBP2NL;ENSG00000143079:ENST00000441739:exon_112991564_112991794:CTTNBP2NL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 113197203 A/G 1 84 79 163 38.8470795609326 42.4652466034086 -3.61816704247606 A:G A G 10 0.537534767131755 0.583126235242666 ENSG00000116489:ENST00000263168:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000393426:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000498626:exon_113197087_113197293:CAPZA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 113236681 C/T 1 41 37 78 18.961074547598 19.8887863838749 -0.927711836276888 T:C C T 10 0.537534767131755 0.909693300887096 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113236527_113236794:MOV10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 46 50 96 21.2734007119393 26.8767383565877 -5.60333764464848 A:G A G 10 0.537534767131755 0.261508392959075 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 60 46 106 27.7479139720947 24.7265992880607 3.02131468403397 T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.626451723070736 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 99 87 186 45.7840580539563 46.7655247404627 -0.981466686506423 T:C C T 10 0.537534767131755 0.88342226193532 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 114301335 C/T 1 7 9 16 3.23725663007772 4.83781290418579 -1.60055627410808 T:C C T 10 0.537534767131755 0.460588608389532 ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114301281_114301470:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000446739:exon_114301281_114301780:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000493212:exon_114301281_114302111:PHTF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 19 20 39 8.78683942449666 10.7506953426351 -1.96385591813844 A:G A G 10 0.537534767131755 0.630559943550738 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 114448389 C/T 1 12 12 24 5.54958279441894 6.45041720558106 -0.900834411162119 T:C C T 10 0.537534767131755 0.83840612934176 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114447763_114448397:DCLRE1B;ENSG00000118655:ENST00000466480:exon_114448031_114448397:DCLRE1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 114449662 T/C 1 6 12 18 2.77479139720947 6.45041720558106 -3.67562580837159 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0991754162193756 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114449618_114449783:DCLRE1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 114515717 G/A 1 15 9 24 6.93697849302368 4.83781290418579 2.09916558883788 A:G G A 10 0.537534767131755 0.420607042022665 ENSG00000163349:ENST00000426820:exon_114515646_114516270:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000468363:exon_114515646_114516270:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369554:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000443627:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000411639:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369555:exon_114515646_114516503:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369558:exon_114515646_114520426:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369561:exon_114515646_114516193:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000340480:exon_114515646_114520426:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369553:exon_114515646_114516503:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000406344:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000361587:exon_114515646_114520426:HIPK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 116670774 A/G 1 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 0.155642553042637 ENSG00000173212:ENST00000369500:exon_116670766_116670960:C1orf161;ENSG00000173212:ENST00000464946:exon_116670766_116670868:C1orf161 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 117659352 C/T 1 6 2 8 2.77479139720947 1.07506953426351 1.69972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.300105198743785 ENSG00000134253:ENST00000256649:exon_117659238_117659367:TRIM45;ENSG00000134253:ENST00000369464:exon_117659238_117659367:TRIM45;ENSG00000134253:ENST00000369461:exon_117659238_117659367:TRIM45 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 144918957 T/A 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:T T A 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000525886:exon_144918833_144919011:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144918833_144918991:PDE4DIP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 144921924 G/A 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144921835_144922065:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000532801:exon_144921835_144922020:PDE4DIP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 144922583 G/A 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 A:G G A 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144922519_144922638:PDE4DIP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 144930940 T/C 1 9 1 10 4.16218709581421 0.537534767131755 3.62465232868245 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0249904918483396 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 144931330 C/T 0 15 0 15 6.93697849302368 0 6.93697849302368 C C 10 0.537534767131755 9.985185379709e-05 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 0 0 76 76 0 40.8526423020134 -40.8526423020134 A G A 10 0.537534767131755 3.51569153231699e-26 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 75 75 0 40.3151075348816 -40.3151075348816 C T C 10 0.537534767131755 7.60206666890913e-26 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 60 60 0 32.2520860279053 -32.2520860279053 T G T 10 0.537534767131755 8.03055090095943e-21 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 56 56 0 30.1019469593783 -30.1019469593783 A C A 10 0.537534767131755 1.75561378899870e-19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 85 0 85 39.3095447938008 0 39.3095447938008 G G 10 0.537534767131755 1.75932534064351e-23 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 69 69 0 37.0898989320911 -37.0898989320911 C T C 10 0.537534767131755 7.77064627541308e-24 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 97 97 0 52.1408724117802 -52.1408724117802 T C T 10 0.537534767131755 3.25590430287693e-33 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 116 0 116 53.6459670127164 0 53.6459670127164 C C 10 0.537534767131755 7.2352472071172e-32 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 146714392 G/C 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146714334_146714480:CHD1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 146714427 G/C 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000492728:exon_146714396_146714480:CHD1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 146759320 C/G 1 29 40 69 13.4114917531791 21.5013906852702 -8.08989893209109 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0538346828566648 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146759314_146759412:CHD1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 137 84 221 63.3577369029496 45.1529204390674 18.2048164638822 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0150345058422387 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 150445819 A/G 1 8 23 31 3.69972186294596 12.3632996440304 -8.6635777810844 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00193596881506931 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 1 47 62 109 21.7358659448075 33.3271555621688 -11.5912896173613 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0272275422677148 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 150808889 C/G 1 12 3 15 5.54958279441894 1.61260430139526 3.93697849302368 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0663367408872343 ENSG00000143437:ENST00000358595:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000322733:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000342710:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000394700:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000368975:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000471844:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000354396:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000515192:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000505755:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000468970:exon_150808756_150808975:ARNT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 151006539 C/A 1 14 7 21 6.47451326015543 3.76274336992228 2.71176989023315 A:C C A 10 0.537534767131755 0.278003094604447 ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_151006282_151007683:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_151006282_151006589:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_151006282_151008187:PRUNE HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 151026815 C/T 1 24 16 40 11.0991655888379 8.60055627410808 2.4986093147298 T:C C T 10 0.537534767131755 0.526471660943444 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 151209063 C/T 1 17 8 25 7.86190895876017 4.30027813705404 3.56163082170613 T:C C T 10 0.537534767131755 0.165892476302183 ENSG00000143398:ENST00000414290:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000464105:exon_151209034_151209223:PIP5K1A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 243 256 499 112.379051586984 137.608900385729 -25.2298487987457 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0247436510763198 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 151259043 C/T 1 22 29 51 10.1742351231014 15.5885082468209 -5.4142731237195 T:C C T 10 0.537534767131755 0.159656769716678 ENSG00000143373:ENST00000443959:exon_151258751_151259181:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000528005:exon_151258751_151259181:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 151259543 G/A 1 22 33 55 10.1742351231014 17.7386473153479 -7.56441219224653 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.0430743330113414 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 151259581 C/T 1 43 24 67 19.8860050133345 12.9008344111621 6.98517060217242 T:C C T 10 0.537534767131755 0.110534852697844 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 60 62 122 27.7479139720947 33.3271555621688 -5.5792415900741 A:G G A 10 0.537534767131755 0.319175511479641 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 151374025 T/C 1 356 282 638 164.637622901095 151.584804331155 13.0528185699403 T:C T C 10 0.537534767131755 0.302281981903159 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151374018_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151374018_151374410:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151373715_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000466425:exon_151374018_151374106:PSMB4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 51 42 93 23.5857268762805 22.5764602195337 1.00926665674679 A:T:C A C 10 0.537534767131755 0.917252439413493 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 153909069 G/C 1 27 29 56 12.4865612874426 15.5885082468209 -3.10194695937828 C:G G C 10 0.537534767131755 0.423853717302054 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000477746:exon_153909018_153909118:DENND4B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 162 150 312 74.9193677246557 80.6302150697632 -5.71084734510754 A:T:G A G 10 0.537534767131755 0.53252786655741 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 41 38 79 18.961074547598 20.4263211510067 -1.46524660340864 T:C T C 10 0.537534767131755 0.736832198349312 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 153941514 C/T 1 17 6 23 7.86190895876017 3.22520860279053 4.63670035596964 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0603267109023344 ENSG00000143578:ENST00000449724:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368607:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000271889:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000461688:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368601:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368603:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368600:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000479010:exon_153941406_153941787:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000492729:exon_153941406_153941931:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000473340:exon_153940998_153941830:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000431292:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000405694:exon_153941406_153941652:CREB3L4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 154317153 C/T 1 13 12 25 6.01204802728719 6.45041720558106 -0.438369178293874 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000143515:ENST00000368489:exon_154317117_154317261:ATP8B2;ENSG00000143515:ENST00000341831:exon_154317117_154317261:ATP8B2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 154561925 C/T 1 108 114 222 49.9462451497705 61.2789634530201 -11.3327183032496 T:C C T 10 0.537534767131755 0.138588109776750 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154561845_154561938:ADAR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 154573967 T/C 1 241 239 480 111.454121121247 128.470809344489 -17.0166882232424 T:C T C 10 0.537534767131755 0.119901588740540 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000463920:exon_154572653_154574724:ADAR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 35 21 56 16.1862831503886 11.2882301097669 4.89805304062172 C:G C G 10 0.537534767131755 0.227713284794524 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 79 82 161 36.5347533965914 44.0778509048039 -7.54309750821255 T:C C T 10 0.537534767131755 0.236828106541423 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 154936318 G/A 1 40 48 88 18.4986093147298 25.8016688223242 -7.30305950759444 A:G G A 10 0.537534767131755 0.134335497145982 ENSG00000163348:ENST00000483463:exon_154935995_154936329:PYGO2;ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154934774_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154934774_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368449:exon_154934774_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154934774_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154934774_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154934774_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154934774_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154934775_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000490667:exon_154935805_154936407:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444664:exon_154936153_154936844:SHC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 154987526 C/T 1 46 43 89 21.2734007119393 23.1139949866655 -1.84059427472619 T:C C T 10 0.537534767131755 0.750086703613274 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000487542:exon_154987131_154987785:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154986924_154988290:ZBTB7B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 154988957 A/G 1 58 51 109 26.8229835063582 27.4142731237195 -0.591289617361291 A:G A G 10 0.537534767131755 0.923727509363721 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 155028450 C/A 1 15 9 24 6.93697849302368 4.83781290418579 2.09916558883788 A:C C A 10 0.537534767131755 0.420607042022665 ENSG00000143537:ENST00000473905:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000480331:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000360674:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368412:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000487956:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000447332:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000534019:exon_155028408_155028476:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000470779:exon_155028408_155028737:ADAM15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 155030557 A/C 1 14 17 31 6.47451326015543 9.13809104123983 -2.6635777810844 A:C A C 10 0.537534767131755 0.371006982111436 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000360674:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368412:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368410:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368413:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000447332:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155030327_155030631:ADAM15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 160 159 319 73.9944372589192 85.468027973949 -11.4735907150298 T:C C T 10 0.537534767131755 0.216671830969609 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 155289545 T/G 1 2 14 16 0.92493046573649 7.52548673984457 -6.60055627410808 T:G T G 10 0.537534767131755 0.00151292543059894 ENSG00000160752:ENST00000492887:exon_155289402_155289676:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489324:exon_155289446_155289719:FDPS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 155448878 G/A 1 8 1 9 3.69972186294596 0.537534767131755 3.16218709581421 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0438485425040058 ENSG00000116539:ENST00000368346:exon_155447677_155452240:ASH1L;ENSG00000116539:ENST00000392403:exon_155447677_155452240:ASH1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 16 18 34 7.39944372589192 9.67562580837159 -2.27618208247967 T:C T C 10 0.537534767131755 0.492998675593706 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 155829511 C/T 1 13 10 23 6.01204802728719 5.37534767131755 0.636700355969636 T:C C T 10 0.537534767131755 0.837163996404797 ENSG00000132718:ENST00000368324:exon_155829300_155829586:SYT11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 156011444 T/C 1 8 5 13 3.69972186294596 2.68767383565877 1.01204802728719 T:C T C 10 0.537534767131755 0.782310374824685 ENSG00000160803:ENST00000368309:exon_156011276_156011462:UBQLN4;ENSG00000160803:ENST00000368307:exon_156011276_156011462:UBQLN4;ENSG00000160803:ENST00000368308:exon_156011276_156011462:UBQLN4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 156105028 T/C 1 119 161 280 55.0333627113212 86.5430975082126 -31.5097347968914 T:C T C 10 0.537534767131755 0.000191666134294501 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000515824:exon_156104978_156105199:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156104904_156105103:LMNA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 156106185 T/C 1 212 290 502 98.0426293680679 155.885082468209 -57.842453100141 T:C T C 10 0.537534767131755 2.40223755210651e-07 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156106005_156106188:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156106005_156107058:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000508500:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000459904:exon_156106084_156106819:LMNA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 156107534 C/T 1 52 32 84 24.0481921091487 17.2011125482162 6.84707956093258 T:C C T 10 0.537534767131755 0.154743661489919 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156107499_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156107445_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156107445_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156107445_156107952:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000506981:exon_156107253_156107534:LMNA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 156146218 C/T 1 37 71 108 17.1112136161251 38.1649684663546 -21.0537548502295 T:C C T 10 0.537534767131755 6.25597480414887e-05 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000484155:exon_156146196_156146447:SEMA4A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 156202173 A/G 1 77 70 147 35.6098229308549 37.6274336992228 -2.01761076836798 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.74156015219172 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368279:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000466489:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368276:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000320139:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156202111_156202216:PMF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 156261290 G/T 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 T:G G T 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000163472:ENST00000463670:exon_156261176_156262234:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000295694:exon_156261176_156262234:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000357501:exon_156261176_156261739:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000495881:exon_156261176_156262234:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000456810:exon_156261176_156261316:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000416130:exon_156261176_156262234:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000405535:exon_156261176_156262234:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000485135:exon_156261176_156261493:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000491392:exon_156261176_156261561:TMEM79;ENSG00000198715:ENST00000497831:exon_156261194_156261341:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000480968:exon_156261194_156261297:C1orf85 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 156278968 T/G 1 150 140 290 69.3697849302368 75.2548673984457 -5.88508246820894 A:T:G T G 10 0.537534767131755 0.517221032351214 ENSG00000163468:ENST00000443745:exon_156278752_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000465714:exon_156278759_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000295688:exon_156278759_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368261:exon_156278759_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368259:exon_156278760_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368258:exon_156278760_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000480049:exon_156278783_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000368262:exon_156278805_156279094:CCT3;ENSG00000163468:ENST00000472765:exon_156278956_156279094:CCT3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 156446903 T/C 1 13 21 34 6.01204802728719 11.2882301097669 -5.27618208247967 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0848552883526125 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000353795:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000340875:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000454816:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000493077:exon_156446721_156446994:MEF2D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 53 38 91 24.510657342017 20.4263211510067 4.0843361910103 A:G G A 10 0.537534767131755 0.402517114443712 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 50 47 97 23.1232616434123 25.2641340551925 -2.14087241178023 A:G G A 10 0.537534767131755 0.684652854193705 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 156518379 G/A 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000183856:ENST00000361170:exon_156518373_156518540:IQGAP3;ENSG00000183856:ENST00000491900:exon_156518373_156518540:IQGAP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 157489535 G/A 1 11 7 18 5.08711756155069 3.76274336992228 1.32437419162841 A:G G A 10 0.537534767131755 0.639329189576991 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157489533_157489560:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000461387:exon_157489533_157489560:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157489533_157489560:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157489533_157489560:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157489533_157489560:FCRL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 157494106 C/T 1 50 52 102 23.1232616434123 27.9518078908513 -4.828546247439 T:C C T 10 0.537534767131755 0.371774895039082 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157493601_157494347:FCRL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 157504422 C/T 1 50 8 58 23.1232616434123 4.30027813705404 18.8229835063582 T:C C T 10 0.537534767131755 2.16850253558224e-07 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157501754_157504682:FCRL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 157504433 C/G 1 50 8 58 23.1232616434123 4.30027813705404 18.8229835063582 C:G C G 10 0.537534767131755 2.16850253558224e-07 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157501754_157504682:FCRL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 157508882 C/T 1 18 37 55 8.32437419162841 19.8887863838749 -11.5644121922465 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00258914856484266 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 269 214 483 124.403147641558 115.032440166196 9.37070747536235 C:G G C 10 0.537534767131755 0.411522558921566 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 164 193 357 75.8442981903922 103.744210056429 -27.8999118660365 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00345704922821001 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 178 130 308 82.3188114505476 69.8795197271281 12.4392917234195 A:C C A 10 0.537534767131755 0.170161953985288 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 169 118 287 78.1566243547334 63.4291025215471 14.7275218331863 A:T:C T A 10 0.537534767131755 0.0860250984678952 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 159021445 A/G 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 A:G A G 10 0.537534767131755 0.74134570348407 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 159024668 A/T 1 135 126 261 62.4328064372131 67.7293806586011 -5.29657422138805 A:T:G A T 10 0.537534767131755 0.534942555269278 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159024611_159024945:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159024611_159024918:IFI16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 161017445 A/C 1 105 110 215 48.5588494511657 59.128824384493 -10.5699749333273 A:C A C 10 0.537534767131755 0.151430155560315 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 161183516 C/T 1 85 74 159 39.3095447938008 39.7775727677499 -0.468027973949042 T:C C T 10 0.537534767131755 0.936838308502585 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161183439_161184086:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000492153:exon_161183439_161183522:NDUFS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 162 69 231 74.9193677246557 37.0898989320911 37.8294687925646 A:G A G 10 0.537534767131755 4.33762100392365e-07 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 107 212 319 49.4837799169022 113.957370631932 -64.4735907150298 A:G G A 10 0.537534767131755 4.87505044898018e-13 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 161696782 G/C 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 C:G G C 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000162746:ENST00000367948:exon_161696493_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367946:exon_161696638_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367945:exon_161696638_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000336830:exon_161696597_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367944:exon_161696597_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000392158:exon_161696493_161696783:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000495397:exon_161695691_161696783:FCRLB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 161748056 C/T 1 2 7 9 0.92493046573649 3.76274336992228 -2.83781290418579 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0909104192397482 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161748034_161748110:ATF6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 161753802 T/C 1 6 9 15 2.77479139720947 4.83781290418579 -2.06302150697632 T:C T C 10 0.537534767131755 0.311071565735570 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 161753841 G/A 1 8 12 20 3.69972186294596 6.45041720558106 -2.7506953426351 A:G G A 10 0.537534767131755 0.264201895405952 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 161761276 G/C 1 11 13 24 5.08711756155069 6.98795197271281 -1.90083441116212 C:G G C 10 0.537534767131755 0.540217717608162 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 161761312 C/T 1 29 35 64 13.4114917531791 18.8137168496114 -5.40222509643232 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.209753508037512 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 49 31 80 22.660796410544 16.6635777810844 5.9972186294596 A:G A G 10 0.537534767131755 0.217205249075202 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 165667781 T/G 1 16 7 23 7.39944372589192 3.76274336992228 3.63670035596964 T:G T G 10 0.537534767131755 0.146568942838849 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165667615_165668100:ALDH9A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 166818452 T/C 1 46 44 90 21.2734007119393 23.6515297537972 -2.37812904185795 T:C T C 10 0.537534767131755 0.672702777897425 ENSG00000143157:ENST00000367876:exon_166818175_166819660:POGK;ENSG00000143157:ENST00000367875:exon_166818175_166823710:POGK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 166829522 C/T 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 T:C C T 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166829423_166829574:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166829423_166829574:TADA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 56 51 107 25.8980530406217 27.4142731237195 -1.51622008309778 A:G G A 10 0.537534767131755 0.772158587860134 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 167973976 C/T 1 48 37 85 22.1983311776758 19.8887863838749 2.30954479380083 T:C C T 10 0.537534767131755 0.664125538203065 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000470721:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_167973771_167974031:DCAF6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 169345868 A/G 1 4 10 14 1.84986093147298 5.37534767131755 -3.52548673984457 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0654879889218514 ENSG00000117475:ENST00000367808:exon_169345778_169346217:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000329281:exon_169345778_169346217:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000367807:exon_169345778_169346621:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000420531:exon_169345778_169346132:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000426663:exon_169345778_169346217:BLZF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 171505321 A/G 1 33 34 67 15.2613526846521 18.2761820824797 -3.01482939782758 A:G A G 10 0.537534767131755 0.465285499657060 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171505168_171505417:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171505168_171505417:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171505168_171505417:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171505168_171505417:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171505168_171505417:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171505168_171505417:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171505168_171505417:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171505168_171505417:BAT2L2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 22 26 48 10.1742351231014 13.9759039454256 -3.80166882232424 T:C T C 10 0.537534767131755 0.311537521411182 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 20 34 54 9.2493046573649 18.2761820824797 -9.02687742511477 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0194733680165187 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 17 35 52 7.86190895876017 18.8137168496114 -10.9518078908513 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00311284315747082 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 101 94 195 46.7089885196927 50.528268110385 -3.81927959069222 T:C C T 10 0.537534767131755 0.615364175711566 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 183515428 G/A 1 33 25 58 15.2613526846521 13.4383691782939 1.82298350635821 A:G G A 10 0.537534767131755 0.693625384651883 ENSG00000116698:ENST00000367537:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000458370:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000367539:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000392015:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000413782:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000508461:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000347615:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000507469:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000515829:exon_183515101_183515472:SMG7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 183536358 G/A 1 93 121 214 43.0092666567468 65.0417068229423 -22.0324401661956 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00310936113877537 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183536339_183536480:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183536339_183536645:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183536339_183536480:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000418089:exon_183536339_183536480:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183536339_183536480:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000419402:exon_183536339_183536480:NCF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 184663537 A/C 0 0 8 8 0 4.30027813705404 -4.30027813705404 C A C 10 0.537534767131755 0.00209234218822997 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184663178_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184659637_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184663197_184663606:EDEM3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 184663581 T/C 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 ENSG00000116406:ENST00000439962:exon_184663178_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000318130:exon_184659637_184663606:EDEM3;ENSG00000116406:ENST00000367512:exon_184663197_184663606:EDEM3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 184765072 A/G 1 10 3 13 4.62465232868245 1.61260430139526 3.01204802728719 A:G A G 10 0.537534767131755 0.104100192392772 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 184787943 C/T 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 T:C C T 10 0.537534767131755 0.241009480668847 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184787772_184787959:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184787772_184787959:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184787772_184787959:FAM129A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 186375381 T/G 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 T:G T G 10 0.537534767131755 0.190750883746296 ENSG00000157181:ENST00000287859:exon_186375215_186375400:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000367470:exon_186375215_186375400:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000419367:exon_186375215_186375400:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000478571:exon_186375215_186375400:C1orf27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 192780268 T/C 1 12 24 36 5.54958279441894 12.9008344111621 -7.35125161674318 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0182182607315997 ENSG00000116741:ENST00000235382:exon_192780111_192780277:RGS2;ENSG00000116741:ENST00000464302:exon_192780111_192780369:RGS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 198671653 A/G 1 20 21 41 9.2493046573649 11.2882301097669 -2.03892545240195 A:G A G 10 0.537534767131755 0.535160252763515 ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367367:exon_198671516_198671659:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000391970:exon_198671516_198671659:PTPRC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 200534248 C/T 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200534197_200534381:KIF14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 200558363 T/C 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200558345_200558497:KIF14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 200635550 T/C 1 16 20 36 7.39944372589192 10.7506953426351 -3.35125161674318 T:C T C 10 0.537534767131755 0.316355438624169 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 200635560 T/C 1 19 21 40 8.78683942449666 11.2882301097669 -2.5013906852702 T:C T C 10 0.537534767131755 0.433287382227075 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 200867492 C/G 1 13 13 26 6.01204802728719 6.98795197271281 -0.975903945425628 C:G C G 10 0.537534767131755 0.700055875569719 ENSG00000163362:ENST00000532631:exon_200867435_200867583:C1orf106;ENSG00000163362:ENST00000367342:exon_200867435_200867583:C1orf106;ENSG00000163362:ENST00000413687:exon_200867435_200867583:C1orf106 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 27 37 64 12.4865612874426 19.8887863838749 -7.40222509643232 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0785290710504902 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 201355522 T/C 1 3 14 17 1.38739569860474 7.52548673984457 -6.13809104123983 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00298401702858089 ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201355463_201356306:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201355463_201356306:LAD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 201966486 A/C 1 37 35 72 17.1112136161251 18.8137168496114 -1.70250323348636 A:C A C 10 0.537534767131755 0.723693084896203 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201966447_201966682:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201966447_201966682:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201966447_201966682:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000487116:exon_201966447_201966682:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201966447_201966682:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201966447_201966682:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479726:exon_201966447_201966682:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201966447_201966682:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000449524:exon_201966447_201966682:RNPEP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 203008286 C/G 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 C:G C G 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000143847:ENST00000367240:exon_203007738_203008370:PPFIA4;ENSG00000143847:ENST00000367238:exon_203008075_203008370:PPFIA4;ENSG00000143847:ENST00000447715:exon_203008075_203008370:PPFIA4;ENSG00000143847:ENST00000414050:exon_203008075_203008370:PPFIA4;ENSG00000143847:ENST00000295706:exon_203008075_203008370:PPFIA4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 203024767 C/T 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 T:C C T 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000143847:ENST00000367240:exon_203024560_203024800:PPFIA4;ENSG00000143847:ENST00000367238:exon_203024560_203024800:PPFIA4;ENSG00000143847:ENST00000447715:exon_203024560_203024800:PPFIA4;ENSG00000143847:ENST00000414050:exon_203024560_203024800:PPFIA4;ENSG00000143847:ENST00000295706:exon_203024560_203024800:PPFIA4;ENSG00000143847:ENST00000272198:exon_203024560_203024800:PPFIA4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 203028371 G/T 1 6 2 8 2.77479139720947 1.07506953426351 1.69972186294596 T:G G T 10 0.537534767131755 0.300105198743785 ENSG00000143847:ENST00000367240:exon_203028306_203028399:PPFIA4;ENSG00000143847:ENST00000367238:exon_203028306_203028399:PPFIA4;ENSG00000143847:ENST00000447715:exon_203028306_203028399:PPFIA4;ENSG00000143847:ENST00000414050:exon_203028306_203028399:PPFIA4;ENSG00000143847:ENST00000295706:exon_203028306_203028399:PPFIA4;ENSG00000143847:ENST00000272198:exon_203028306_203028399:PPFIA4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 204400886 G/A 1 21 9 30 9.71176989023315 4.83781290418579 4.87395698604735 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0981287638681262 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204400797_204400921:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000462752:exon_204400468_204400921:PIK3C2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 204438334 C/T 1 8 10 18 3.69972186294596 5.37534767131755 -1.67562580837159 T:C C T 10 0.537534767131755 0.483452727703955 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204437998_204439014:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000424712:exon_204437998_204439014:PIK3C2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 204438643 G/T 1 15 13 28 6.93697849302368 6.98795197271281 -0.050973479689139 T:G G T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204437998_204439014:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000424712:exon_204437998_204439014:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000415899:exon_204438538_204439014:PIK3C2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 205500543 T/C 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 T:C T C 10 0.537534767131755 0.190750883746296 ENSG00000117266:ENST00000504648:exon_205500472_205500890:CDK18;ENSG00000117266:ENST00000506784:exon_205500472_205500914:CDK18;ENSG00000117266:ENST00000360066:exon_205500472_205501921:CDK18;ENSG00000117266:ENST00000509056:exon_205500472_205501915:CDK18;ENSG00000117266:ENST00000515494:exon_205500472_205501913:CDK18;ENSG00000117266:ENST00000437052:exon_205500472_205501913:CDK18;ENSG00000117266:ENST00000489617:exon_205500472_205501921:CDK18;ENSG00000117266:ENST00000484080:exon_205500472_205501070:CDK18;ENSG00000117266:ENST00000515514:exon_205500472_205500680:CDK18;ENSG00000117266:ENST00000459862:exon_205500472_205500794:CDK18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 207646462 G/A 1 8 10 18 3.69972186294596 5.37534767131755 -1.67562580837159 A:G G A 10 0.537534767131755 0.483452727703955 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 209948711 A/C 1 64 95 159 29.5977749035677 51.0658028775167 -21.468027973949 A:C A C 10 0.537534767131755 0.000785668879177637 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209948694_209948940:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000487271:exon_209948635_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209948694_209949081:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000480569:exon_209948635_209948786:TRAF3IP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 11 11 22 5.08711756155069 5.91288243844931 -0.82576487689861 T:C T C 10 0.537534767131755 0.831602284580484 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 209950848 G/A 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 A:G G A 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 209956542 C/A 1 7 9 16 3.23725663007772 4.83781290418579 -1.60055627410808 A:C C A 10 0.537534767131755 0.460588608389532 ENSG00000162757:ENST00000294811:exon_209955661_209957054:C1orf74 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 210004332 G/A 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 A:G G A 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210004148_210004388:C1orf107 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 211451467 T/C 1 11 15 26 5.08711756155069 8.06302150697632 -2.97590394542563 T:C T C 10 0.537534767131755 0.325523153112396 ENSG00000117625:ENST00000533469:exon_211451459_211451565:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367006:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452325:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000435653:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452621:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000528926:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000419091:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000529572:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367005:exon_211451459_211451583:RCOR3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 14 13 27 6.47451326015543 6.98795197271281 -0.513438712557384 A:G A G 10 0.537534767131755 0.849618756712184 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 24 29 53 11.0991655888379 15.5885082468209 -4.48934265798301 T:C T C 10 0.537534767131755 0.218884215389587 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 212985592 G/A 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 A:G G A 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000203705:ENST00000532324:exon_212985569_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000366974:exon_212985590_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000526641:exon_212985590_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000531963:exon_212985569_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000533650:exon_212985590_212985624:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000525574:exon_212985590_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000527693:exon_212985590_212985670:TATDN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 212988540 G/C 1 9 17 26 4.16218709581421 9.13809104123983 -4.97590394542563 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0746576418474675 ENSG00000203705:ENST00000532324:exon_212988355_212988939:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000366974:exon_212988355_212989968:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000526641:exon_212988355_212988757:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000531963:exon_212988389_212988939:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000366973:exon_212988355_212989959:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000526997:exon_212988355_212988567:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000525574:exon_212988355_212989968:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000527693:exon_212988355_212989186:TATDN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 24 4 28 11.0991655888379 2.15013906852702 8.94902652031086 T:C C T 10 0.537534767131755 0.000490182546195782 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 213124871 G/A 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 A:G G A 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000143494:ENST00000427709:exon_213124681_213125160:VASH2;ENSG00000143494:ENST00000366965:exon_213124681_213125160:VASH2;ENSG00000143494:ENST00000493155:exon_213124870_213125160:VASH2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 214505498 G/T 1 42 32 74 19.4235397804663 17.2011125482162 2.22242723225013 T:G G T 10 0.537534767131755 0.642167468159082 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214505361_214507651:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214504293_214507651:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214505361_214505535:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214505361_214505535:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214505361_214505535:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000416415:exon_214505361_214505535:SMYD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 36 22 58 16.6487483832568 11.8257648768986 4.82298350635821 A:G G A 10 0.537534767131755 0.236331494392785 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 36 26 62 16.6487483832568 13.9759039454256 2.67284443783119 T:C C T 10 0.537534767131755 0.526314764550682 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 220156585 C/T 1 54 39 93 24.9731225748852 20.9638559181384 4.00926665674679 T:C C T 10 0.537534767131755 0.466851219687949 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220156531_220156740:EPRS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 223905532 G/A 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 A:G G A 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223905464_223905533:CAPN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 223980207 G/C 1 8 7 15 3.69972186294596 3.76274336992228 -0.0630215069763245 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000143514:ENST00000391879:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000447749:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000391878:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000343537:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000360391:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000483398:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000498843:exon_223980091_223980224:TP53BP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 223989966 C/T 1 3 8 11 1.38739569860474 4.30027813705404 -2.9128824384493 T:C C T 10 0.537534767131755 0.127253645182292 ENSG00000143514:ENST00000391879:exon_223989818_223990046:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000447749:exon_223989818_223990046:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000391878:exon_223989818_223990046:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000343537:exon_223989818_223990046:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000360391:exon_223989818_223990046:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000498843:exon_223989818_223990046:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000489310:exon_223989818_223990046:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000490896:exon_223989818_223990359:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000481128:exon_223989641_223990046:TP53BP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 224415342 A/G 1 9 18 27 4.16218709581421 9.67562580837159 -5.51343871255738 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0515307468505229 ENSG00000143748:ENST00000281701:exon_224415036_224415372:NVL;ENSG00000143748:ENST00000391875:exon_224415036_224415372:NVL;ENSG00000143748:ENST00000469968:exon_224415036_224415372:NVL;ENSG00000143748:ENST00000481213:exon_224415036_224415372:NVL;ENSG00000143748:ENST00000483094:exon_224415036_224415372:NVL;ENSG00000143748:ENST00000489194:exon_224415036_224415372:NVL;ENSG00000143748:ENST00000493060:exon_224415036_224415372:NVL;ENSG00000143748:ENST00000340871:exon_224415048_224415372:NVL;ENSG00000143748:ENST00000361463:exon_224415048_224415372:NVL;ENSG00000143748:ENST00000469075:exon_224415071_224415372:NVL;ENSG00000143748:ENST00000482491:exon_224415156_224415372:NVL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 225607144 C/T 1 33 44 77 15.2613526846521 23.6515297537972 -8.39017706914513 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0668540263548056 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225606965_225607154:LBR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 225609884 A/G 1 53 55 108 24.510657342017 29.5644121922465 -5.05375485022953 A:G A G 10 0.537534767131755 0.336162949950194 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225609813_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225609779_225609979:LBR;ENSG00000143815:ENST00000488632:exon_225609779_225610129:LBR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 225611661 C/T 1 38 38 76 17.5736788489933 20.4263211510067 -2.85264230201338 T:C C T 10 0.537534767131755 0.565596984576226 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000421383:exon_225611623_225611791:LBR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 14 39 53 6.47451326015543 20.9638559181384 -14.489342657983 T:G T G 10 0.537534767131755 7.92773696540908e-05 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 226555302 A/G 1 265 220 485 122.553286710085 118.257648768986 4.29563794109885 A:G A G 10 0.537534767131755 0.715746685541613 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226555181_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226555181_226555309:PARP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 226570840 T/C 1 238 340 578 110.066725422642 182.761820824797 -72.6950954021544 T:C:G T C 10 0.537534767131755 1.57312277238135e-09 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 302 198 500 139.66450032621 106.431883892087 33.2326164341225 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00304274299354875 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 184 222 406 85.0936028477571 119.33271830325 -34.2391154554925 A:G G A 10 0.537534767131755 0.000700393692895747 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 226595647 C/G 1 96 73 169 44.3966623553515 39.2400380006181 5.15662435473341 C:G C G 10 0.537534767131755 0.441310124392538 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 8 12 20 3.69972186294596 6.45041720558106 -2.7506953426351 A:G G A 10 0.537534767131755 0.264201895405952 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 226923938 A/C 1 13 10 23 6.01204802728719 5.37534767131755 0.636700355969636 A:C A C 10 0.537534767131755 0.837163996404797 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 227069677 T/C 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227069589_227069749:PSEN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 227069737 C/T 1 10 9 19 4.62465232868245 4.83781290418579 -0.213160575503344 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227069589_227069749:PSEN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 227076719 G/C 1 6 10 16 2.77479139720947 5.37534767131755 -2.60055627410808 C:G G C 10 0.537534767131755 0.217010442931191 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227076530_227076750:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227076530_227076750:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227076530_227076750:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000460775:exon_227076530_227076750:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227076530_227076750:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227076530_227076750:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227076530_227076750:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000472139:exon_227076530_227076750:PSEN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 227149203 G/A 1 6 12 18 2.77479139720947 6.45041720558106 -3.67562580837159 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0991754162193756 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227149078_227149263:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227149078_227149263:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227149078_227149203:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227149078_227149203:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227149078_227149203:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000489044:exon_227149078_227149263:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227149087_227149263:ADCK3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 227172290 C/T 1 23 16 39 10.6367003559696 8.60055627410808 2.03614408186156 T:C C T 10 0.537534767131755 0.526406833519165 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227172249_227172356:ADCK3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 227174210 T/C 1 21 27 48 9.71176989023315 14.5134387125574 -4.80166882232424 T:C T C 10 0.537534767131755 0.192740925807013 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 227216662 T/C 1 42 25 67 19.4235397804663 13.4383691782939 5.98517060217242 T:C T C 10 0.537534767131755 0.177326920378949 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000429440:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000441725:exon_227216358_227216951:CDC42BPA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 227920357 C/T 1 40 32 72 18.4986093147298 17.2011125482162 1.29749676651364 T:C C T 10 0.537534767131755 0.813637101897296 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 227922918 A/C 1 12 26 38 5.54958279441894 13.9759039454256 -8.42632115100669 A:C A C 10 0.537534767131755 0.00838696850958565 ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227922697_227923200:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922713_227923112:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922713_227923090:JMJD4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 16 22 38 7.39944372589192 11.8257648768986 -4.42632115100669 A:G A G 10 0.537534767131755 0.192498536355526 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 227954677 C/T 1 25 30 55 11.5616308217061 16.1260430139526 -4.56441219224652 T:C C T 10 0.537534767131755 0.226192657944459 ENSG00000143740:ENST00000366760:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000418653:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000478768:exon_227954660_227954784:SNAP47 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 227954742 C/T 1 23 12 35 10.6367003559696 6.45041720558106 4.18628315038858 T:C C T 10 0.537534767131755 0.176898245575950 ENSG00000143740:ENST00000366760:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000418653:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000478768:exon_227954660_227954784:SNAP47 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 228433217 A/G 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000154358:ENST00000284548:exon_228433114_228433389:OBSCN;ENSG00000154358:ENST00000422127:exon_228433114_228433389:OBSCN;ENSG00000154358:ENST00000359599:exon_228433114_228433389:OBSCN;ENSG00000154358:ENST00000366707:exon_228433114_228433389:OBSCN;ENSG00000154358:ENST00000366709:exon_228433114_228433389:OBSCN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 228871693 C/T 1 8 4 12 3.69972186294596 2.15013906852702 1.54958279441894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.403872211149876 ENSG00000116574:ENST00000366691:exon_228870824_228871751:RHOU HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 229461024 C/T 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000154429:ENST00000366687:exon_229456758_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000284617:exon_229456763_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000366686:exon_229457262_229461158:C1orf96;ENSG00000154429:ENST00000483092:exon_229459286_229461158:C1orf96 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 229738170 T/G 1 32 32 64 14.7988874517838 17.2011125482162 -2.40222509643232 T:G T G 10 0.537534767131755 0.616466408438257 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 229738236 G/A 1 25 24 49 11.5616308217061 12.9008344111621 -1.33920358945599 A:G G A 10 0.537534767131755 0.77495876251657 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 229772693 T/G 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 T:G T G 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 229772932 A/G 1 18 15 33 8.32437419162841 8.06302150697632 0.261352684652087 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 229773441 C/T 1 12 10 22 5.54958279441894 5.37534767131755 0.174235123101391 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 229790048 A/G 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229789996_229790135:URB2;ENSG00000135763:ENST00000434387:exon_229789996_229790135:URB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 230814668 A/G 1 8 15 23 3.69972186294596 8.06302150697632 -4.36329964403036 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0926796024565271 ENSG00000135775:ENST00000494371:exon_230814659_230819174:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230814659_230814798:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230814659_230814798:COG2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 233086456 T/C 1 7 21 28 3.23725663007772 11.2882301097669 -8.05097347968914 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00361115869541955 ENSG00000135778:ENST00000494689:exon_233086351_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233086360_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233086370_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000496662:exon_233086379_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233086386_233086490:C1orf57 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 234529446 T/C 1 55 44 99 25.4355878077535 23.6515297537972 1.78405805395626 T:C T C 10 0.537534767131755 0.762845258078474 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 234582651 T/C 1 10 11 21 4.62465232868245 5.91288243844931 -1.28823010976685 T:C T C 10 0.537534767131755 0.663607311505883 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234582549_234582721:TARBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 234584231 C/T 1 12 8 20 5.54958279441894 4.30027813705404 1.2493046573649 T:C C T 10 0.537534767131755 0.657534137938504 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234584226_234584325:TARBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 234744250 G/A 1 291 273 564 134.577382764659 146.746991426969 -12.1696086623098 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.311006603861064 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 234744413 C/A 1 237 193 430 109.604260189774 103.744210056429 5.86005013334535 A:C C A 10 0.537534767131755 0.594849905190564 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 14 8 22 6.47451326015543 4.30027813705404 2.17423512310139 A:G A G 10 0.537534767131755 0.398340723938621 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 11 11 22 5.08711756155069 5.91288243844931 -0.82576487689861 T:C T C 10 0.537534767131755 0.831602284580484 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236141174 T/C 1 27 28 55 12.4865612874426 15.0509734796891 -2.56441219224652 T:C T C 10 0.537534767131755 0.501853357079519 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236139130_236141288:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236139130_236141288:NID1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236144951 A/G 1 17 29 46 7.86190895876017 15.5885082468209 -7.72659928806073 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0260534560280840 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236144911_236145082:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236144911_236145082:NID1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236208773 C/T 1 8 12 20 3.69972186294596 6.45041720558106 -2.7506953426351 T:C C T 10 0.537534767131755 0.264201895405952 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236208757_236208983:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236208757_236208983:NID1;ENSG00000116962:ENST00000419010:exon_236208757_236208983:NID1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236389999 C/T 1 8 7 15 3.69972186294596 3.76274336992228 -0.0630215069763245 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236389947_236390039:ERO1LB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 44 12 56 20.3484702462028 6.45041720558106 13.8980530406217 A:T T A 10 0.537534767131755 0.000143201254923642 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 33 10 43 15.2613526846521 5.37534767131755 9.88600501333454 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00316836652753719 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 22 2 24 10.1742351231014 1.07506953426351 9.09916558883788 T:C C T 10 0.537534767131755 0.000109309757586760 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 26 11 37 12.0240960545744 5.91288243844931 6.11121361612507 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0481368061873531 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236702210 A/G 1 25 12 37 11.5616308217061 6.45041720558106 5.11121361612507 A:G A G 10 0.537534767131755 0.100751602344161 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 22 20 42 10.1742351231014 10.7506953426351 -0.576460219533709 A:G G A 10 0.537534767131755 0.878117117357435 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236706352 A/C 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 A:C A C 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 31 37 68 14.3364222189156 19.8887863838749 -5.55236416495934 C:G G C 10 0.537534767131755 0.182968739716469 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 25 33 58 11.5616308217061 17.7386473153479 -6.17701649364179 T:C T C 10 0.537534767131755 0.114544932768403 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 23 24 47 10.6367003559696 12.9008344111621 -2.26413405519248 T:C C T 10 0.537534767131755 0.559616274993939 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 31 46 77 14.3364222189156 24.7265992880607 -10.3901770691451 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0217169099435476 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 37 42 79 17.1112136161251 22.5764602195337 -5.46524660340864 T:C T C 10 0.537534767131755 0.259063559253145 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 55 46 101 25.4355878077535 24.7265992880607 0.708988519692749 A:G A G 10 0.537534767131755 0.920747890048354 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 56 55 111 25.8980530406217 29.5644121922465 -3.6663591516248 A:G G A 10 0.537534767131755 0.506097223415339 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 40 41 81 18.4986093147298 22.038925452402 -3.54031613767215 T:C T C 10 0.537534767131755 0.437674569087394 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236746443 C/T 1 11 17 28 5.08711756155069 9.13809104123983 -4.05097347968914 T:C C T 10 0.537534767131755 0.133350668026399 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236746313_236746496:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236746313_236746496:HEATR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236748505 T/C 1 14 10 24 6.47451326015543 5.37534767131755 1.09916558883788 T:C T C 10 0.537534767131755 0.68779414869778 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236755837 C/T 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 T:C C T 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236755823_236755933:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236755823_236755933:HEATR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236758887 T/C 1 19 22 41 8.78683942449666 11.8257648768986 -3.03892545240195 T:C T C 10 0.537534767131755 0.351912696931157 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236758840_236758973:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236758840_236758973:HEATR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236760181 G/A 1 7 10 17 3.23725663007772 5.37534767131755 -2.13809104123983 A:G G A 10 0.537534767131755 0.337166426523694 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236760136_236760276:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236760136_236760276:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000483073:exon_236760136_236760276:HEATR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 236767330 A/G 1 15 6 21 6.93697849302368 3.22520860279053 3.71176989023315 A:G A G 10 0.537534767131755 0.126762028126778 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366579:exon_236767254_236767427:HEATR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 237048500 A/G 1 6 8 14 2.77479139720947 4.30027813705404 -1.52548673984457 A:G A G 10 0.537534767131755 0.435196015554607 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237048421_237048519:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237048421_237048519:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237048421_237048519:MTR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 237054569 A/G 1 14 16 30 6.47451326015543 8.60055627410808 -2.12604301395265 A:G A G 10 0.537534767131755 0.468003746372143 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237054433_237054629:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237054433_237054629:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237054433_237054629:MTR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 237058744 C/A 1 21 13 34 9.71176989023315 6.98795197271281 2.72381791752033 A:C C A 10 0.537534767131755 0.392737558683748 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 241667523 C/T 1 46 41 87 21.2734007119393 22.038925452402 -0.765524740462684 T:C C T 10 0.537534767131755 0.914536667562242 ENSG00000091483:ENST00000366560:exon_241667342_241667545:FH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 241798631 C/T 1 10 4 14 4.62465232868245 2.15013906852702 2.47451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 0.283621077619465 ENSG00000203668:ENST00000366553:exon_241792155_241799232:CHML HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 242035382 C/T 1 8 8 16 3.69972186294596 4.30027813705404 -0.600556274108079 T:C C T 10 0.537534767131755 0.806072821048815 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242035334_242035580:EXO1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 1 245861571 C/T 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245861408_245861610:KIF26B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 1060218 G/A 1 156 164 320 72.1445763274462 88.1557018096078 -16.0111254821616 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.0730939678995911 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1060187_1060252:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000483839:exon_1060193_1060252:GTPBP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 1061767 G/A 1 79 73 152 36.5347533965914 39.2400380006181 -2.70528460402676 A:G G A 10 0.537534767131755 0.684626123503869 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1061693_1061836:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000483839:exon_1061693_1061836:GTPBP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 112 127 239 51.7961060812434 68.2669154257329 -16.4708093444894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0376941874138885 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3154461 G/A 1 189 162 351 87.4059290120983 87.0806322753443 0.325296736754012 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3154414_3154478:PFKP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 100 111 211 46.2465232868245 59.6663591516248 -13.4198358648003 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0724204667475262 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3155698 C/T 1 187 189 376 86.4809985463618 101.594070987902 -15.1130724415399 T:C C T 10 0.537534767131755 0.120947524751288 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3167465 A/G 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 A:G A G 10 0.537534767131755 0.357514540525421 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3171995 G/T 1 7 9 16 3.23725663007772 4.83781290418579 -1.60055627410808 T:G G T 10 0.537534767131755 0.460588608389532 ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 131 123 254 60.5829455057401 66.1167763572059 -5.53383085146577 T:C C T 10 0.537534767131755 0.489560307880893 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3172145 C/T 1 149 130 279 68.9073196973685 69.8795197271281 -0.972200029759634 T:C C T 10 0.537534767131755 0.90461502685835 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3178814 T/A 1 239 202 441 110.529190655511 108.582022960615 1.94716769489605 A:T T A 10 0.537534767131755 0.88610846528601 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 63 55 118 29.1353096706994 29.5644121922465 -0.429102521547083 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 42 37 79 19.4235397804663 19.8887863838749 -0.465246603408641 T:C T C 10 0.537534767131755 0.910816366330946 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3191823 C/T 1 28 29 57 12.9490265203109 15.5885082468209 -2.63948172651003 T:C C T 10 0.537534767131755 0.508547427746685 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3191813_3191945:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3191813_3191945:PITRM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 17 18 35 7.86190895876017 9.67562580837159 -1.81371684961142 A:G G A 10 0.537534767131755 0.612189199573914 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 30 27 57 13.8739569860474 14.5134387125574 -0.639481726510034 T:C T C 10 0.537534767131755 0.894861337970316 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3206027 A/G 1 13 16 29 6.01204802728719 8.60055627410808 -2.58850824682089 A:G A G 10 0.537534767131755 0.356879843182363 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 3207632 A/G 1 12 17 29 5.54958279441894 9.13809104123983 -3.58850824682089 A:G A G 10 0.537534767131755 0.196303716694424 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3207605_3207719:PITRM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 5496260 T/C 1 15 8 23 6.93697849302368 4.30027813705404 2.63670035596964 T:C T C 10 0.537534767131755 0.301970044035753 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5496228_5496485:NET1;ENSG00000173848:ENST00000449083:exon_5496228_5496485:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5496228_5496485:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5496228_5496485:NET1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 5498223 T/C 1 13 6 19 6.01204802728719 3.22520860279053 2.78683942449666 T:C T C 10 0.537534767131755 0.252178981986345 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498050_5498236:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498050_5498236:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498050_5498236:NET1;ENSG00000173848:ENST00000484741:exon_5498050_5498493:NET1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 5498693 A/G 1 15 20 35 6.93697849302368 10.7506953426351 -3.81371684961142 A:G A G 10 0.537534767131755 0.235686232316037 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 5498752 C/T 1 10 16 26 4.62465232868245 8.60055627410808 -3.97590394542563 T:C C T 10 0.537534767131755 0.167381271298725 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 5781628 T/G 1 5 9 14 2.31232616434123 4.83781290418579 -2.52548673984457 T:G T G 10 0.537534767131755 0.191403008406876 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5781581_5782460:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000380270:exon_5781581_5781776:C10orf18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 5781969 A/T 1 12 22 34 5.54958279441894 11.8257648768986 -6.27618208247967 A:T A T 10 0.537534767131755 0.0380996243040869 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5781581_5782460:C10orf18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 5788608 G/C 1 14 15 29 6.47451326015543 8.06302150697632 -1.58850824682089 C:G G C 10 0.537534767131755 0.580849764907506 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 5855225 G/A 1 119 129 248 55.0333627113212 69.3419849599964 -14.3086222486752 A:G G A 10 0.537534767131755 0.074453090247976 ENSG00000057608:ENST00000380191:exon_5855177_5855512:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000435969:exon_5855177_5855512:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380153:exon_5855177_5855512:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380181:exon_5855177_5855374:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380132:exon_5855177_5855374:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000456041:exon_5855177_5855350:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000418688:exon_5855177_5855392:GDI2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 6008172 C/T 1 10 14 24 4.62465232868245 7.52548673984457 -2.90083441116212 T:C C T 10 0.537534767131755 0.306252553826296 ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6008108_6008302:IL15RA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 6263457 C/T 1 20 40 60 9.2493046573649 21.5013906852702 -12.2520860279053 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00172117983299948 ENSG00000170525:ENST00000379784:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379789:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379781:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000490474:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000467491:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000477914:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379785:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000461744:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000317350:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379782:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000360521:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379775:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000358499:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000444592:exon_6263344_6263490:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000450232:exon_6263367_6263490:PFKFB3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 9 12 21 4.16218709581421 6.45041720558106 -2.28823010976685 A:G A G 10 0.537534767131755 0.383405862328562 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 16 23 39 7.39944372589192 12.3632996440304 -4.96385591813844 A:T A T 10 0.537534767131755 0.147444815523230 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 27 14 41 12.4865612874426 7.52548673984457 4.96107454759805 T:C C T 10 0.537534767131755 0.157881674831018 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 12043790 T/G 1 11 16 27 5.08711756155069 8.60055627410808 -3.51343871255738 T:G T G 10 0.537534767131755 0.182777781405979 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12043675_12043824:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12043675_12043824:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12043675_12043824:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12043675_12043824:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12043675_12043824:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12043675_12043824:UPF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 33 42 75 15.2613526846521 22.5764602195337 -7.31510753488162 A:G G A 10 0.537534767131755 0.104645930350184 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 12131081 T/G 1 23 29 52 10.6367003559696 15.5885082468209 -4.95180789085126 T:C:G T G 10 0.537534767131755 0.210306766298917 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 12143105 C/G 1 17 17 34 7.86190895876017 9.13809104123983 -1.27618208247967 C:G C G 10 0.537534767131755 0.731966346241064 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12143041_12143180:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12143041_12143180:DHTKD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 13152400 T/A 1 83 52 135 38.3846143280643 27.9518078908513 10.4328064372131 A:T T A 10 0.537534767131755 0.083946397354218 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13152180_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13152274_13152476:OPTN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 20 19 39 9.2493046573649 10.2131605755033 -0.963855918138444 T:C T C 10 0.537534767131755 0.751619676840612 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 12 12 24 5.54958279441894 6.45041720558106 -0.900834411162119 A:G A G 10 0.537534767131755 0.83840612934176 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 51 39 90 23.5857268762805 20.9638559181384 2.62187095814205 A:C C A 10 0.537534767131755 0.598751039609667 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 16858993 T/C 1 91 89 180 42.0843361910103 47.8405942747262 -5.75625808371589 T:C T C 10 0.537534767131755 0.411262994884901 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16858972_16859083:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16858972_16859382:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16858972_16859083:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16858972_16859083:RSU1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 18828371 C/T 1 22 36 58 10.1742351231014 19.3512516167432 -9.17701649364179 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0175106553099244 ENSG00000165995:ENST00000324631:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000352115:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377328:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000282343:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377331:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000396576:exon_18828159_18830798:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000340194:exon_18828159_18830791:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377319:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377329:exon_18828159_18830038:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377315:exon_18828159_18830056:CACNB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 22839628 T/C 1 72 51 123 33.2974967665136 27.4142731237195 5.88322364279414 T:C T C 10 0.537534767131755 0.320067810309586 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22839588_22839701:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22839588_22839701:PIP4K2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 24813282 G/C 1 9 1 10 4.16218709581421 0.537534767131755 3.62465232868245 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0249904918483396 ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24813252_24813693:KIAA1217 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 24813327 A/G 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 A:G A G 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24813252_24813693:KIAA1217 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 24908686 T/C 1 7 17 24 3.23725663007772 9.13809104123983 -5.90083441116212 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0224326911767401 ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000376410:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000445703:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000446003:exon_24908402_24910298:ARHGAP21 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 2 7 9 0.92493046573649 3.76274336992228 -2.83781290418579 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0909104192397482 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 30727996 A/G 1 39 61 100 18.0361440818616 32.7896207950371 -14.7534767131755 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00349011377212255 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 31138817 G/A 1 7 9 16 3.23725663007772 4.83781290418579 -1.60055627410808 A:G G A 10 0.537534767131755 0.460588608389532 ENSG00000183621:ENST00000331737:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000361310:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000413025:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000436087:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000442986:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000452305:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000444692:exon_31137460_31139296:ZNF438 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 33209266 G/T 1 15 22 37 6.93697849302368 11.8257648768986 -4.88878638387494 T:G G T 10 0.537534767131755 0.137001686137713 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33209173_33209313:ITGB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 33211227 T/G 1 16 8 24 7.39944372589192 4.30027813705404 3.09916558883788 T:G T G 10 0.537534767131755 0.225397508916271 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33211185_33211274:ITGB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 33217110 G/A 1 32 17 49 14.7988874517838 9.13809104123983 5.66079641054401 A:G G A 10 0.537534767131755 0.115917950432227 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000480226:exon_33217078_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000474568:exon_33217102_33217192:ITGB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 34620220 C/T 1 15 39 54 6.93697849302368 20.9638559181384 -14.0268774251148 T:C C T 10 0.537534767131755 0.000168577811587713 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000466092:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34620045_34620272:PARD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 34649146 G/C 1 8 25 33 3.69972186294596 13.4383691782939 -9.73864731534791 C:G G C 10 0.537534767131755 0.000723250723428054 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374768:exon_34648999_34649187:PARD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 35302705 C/T 1 15 19 34 6.93697849302368 10.2131605755033 -3.27618208247967 T:C C T 10 0.537534767131755 0.30317916916678 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35302627_35302728:CUL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 43292647 A/G 1 31 33 64 14.3364222189156 17.7386473153479 -3.40222509643232 A:G A G 10 0.537534767131755 0.45229530774979 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43291922_43292679:BMS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 45478092 A/G 1 43 17 60 19.8860050133345 9.13809104123983 10.7479139720947 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00613401221970853 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374414:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000427758:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000462822:exon_45477973_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000428466:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000472561:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45476487_45478111:RASSF4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 45869748 C/T 0 41 0 41 18.961074547598 0 18.961074547598 C C 10 0.537534767131755 9.74675682818126e-12 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45869675_45869877:ALOX5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 45924023 G/A 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 A:G G A 10 0.537534767131755 0.74134570348407 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 50374930 C/T 1 24 16 40 11.0991655888379 8.60055627410808 2.4986093147298 T:C C T 10 0.537534767131755 0.526471660943444 ENSG00000204161:ENST00000374156:exon_50374490_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374151:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374153:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000488276:exon_50374914_50375038:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000474718:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000453436:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374149:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374148:exon_50374914_50375054:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000470884:exon_50374813_50375054:C10orf128 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 50667105 T/C 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 T:C T C 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50663414_50667280:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50664491_50667280:ERCC6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 50678369 T/C 1 7 13 20 3.23725663007772 6.98795197271281 -3.7506953426351 T:C T C 10 0.537534767131755 0.116404989692958 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 50678717 T/C 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 50681033 G/A 1 5 11 16 2.31232616434123 5.91288243844931 -3.60055627410808 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0821156190636971 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50680955_50681074:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50680955_50681074:ERCC6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 51827763 A/G 1 16 14 30 7.39944372589192 7.52548673984457 -0.126043013952649 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000099290:ENST00000434114:exon_51827684_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000282633:exon_51827721_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000351071:exon_51827721_51827768:FAM21A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 22 13 35 10.1742351231014 6.98795197271281 3.18628315038858 A:G A G 10 0.537534767131755 0.312273786037830 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 58118630 T/C 1 56 56 112 25.8980530406217 30.1019469593783 -4.20389391875656 T:C T C 10 0.537534767131755 0.4491222266689 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000318387:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000460654:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000467523:exon_58118566_58118708:ZWINT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 58120988 C/A 1 36 24 60 16.6487483832568 12.9008344111621 3.7479139720947 A:C C A 10 0.537534767131755 0.366170534268106 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58120957_58121036:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58120957_58121020:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58120957_58121034:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58120957_58121023:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58120957_58121003:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58120957_58121027:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58120957_58121018:ZWINT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 59956041 C/T 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 T:C C T 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000151151:ENST00000373935:exon_59951278_59956459:IPMK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 61665886 C/A 1 18 14 32 8.32437419162841 7.52548673984457 0.798887451783842 A:C C A 10 0.537534767131755 0.86013744379098 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61665880_61666414:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61665880_61666818:CCDC6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 64573312 T/G 1 10 19 29 4.62465232868245 10.2131605755033 -5.58850824682089 T:G T G 10 0.537534767131755 0.0411985220852713 ENSG00000122877:ENST00000242480:exon_64571756_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000439032:exon_64571763_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000437594:exon_64571763_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000411732:exon_64571763_64574228:EGR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 64927823 C/G 1 19 15 34 8.78683942449666 8.06302150697632 0.72381791752033 C:G C G 10 0.537534767131755 0.864547358513853 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000467356:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64926990_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64926990_64927894:JMJD1C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 64974380 G/C 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 C:G G C 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 64974537 A/T 1 9 12 21 4.16218709581421 6.45041720558106 -2.28823010976685 A:T A T 10 0.537534767131755 0.383405862328562 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 69666598 T/C 1 9 1 10 4.16218709581421 0.537534767131755 3.62465232868245 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0249904918483396 ENSG00000096717:ENST00000212015:exon_69666547_69666694:SIRT1;ENSG00000096717:ENST00000432464:exon_69666547_69666694:SIRT1;ENSG00000096717:ENST00000473922:exon_69666547_69666636:SIRT1;ENSG00000096717:ENST00000406900:exon_69666547_69666694:SIRT1;ENSG00000096717:ENST00000403579:exon_69666547_69666694:SIRT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 22 42 64 10.1742351231014 22.5764602195337 -12.4022250964323 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0023751931061543 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 70748784 G/A 1 20 14 34 9.2493046573649 7.52548673984457 1.72381791752033 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.60857531545722 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 1494 1625 3119 690.923057905158 873.493996589102 -182.570938683944 A:G G A 10 0.537534767131755 6.04133982896438e-11 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 71103597 C/G 1 47 36 83 21.7358659448075 19.3512516167432 2.38461432806434 C:G C G 10 0.537534767131755 0.660150838155876 ENSG00000156515:ENST00000450646:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000464803:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000480047:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483077:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000476368:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483054:exon_71103583_71103646:HK1;ENSG00000156515:ENST00000421088:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000436817:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000493591:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000450557:exon_71103583_71103745:HK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 71142420 G/A 1 121 85 206 55.9582931770576 45.6904552061992 10.2678379708585 A:G G A 10 0.537534767131755 0.162371220341145 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 71149024 G/A 1 58 61 119 26.8229835063582 32.7896207950371 -5.96663728867884 A:G G A 10 0.537534767131755 0.311897937599919 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71148953_71149052:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71148953_71149052:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71148953_71149052:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71148953_71149052:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71148953_71149052:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71148953_71149052:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71148953_71149052:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71148953_71149052:HK1;ENSG00000156515:ENST00000467710:exon_71148953_71149052:HK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 71874683 G/A 1 78 61 139 36.0722881637231 32.7896207950371 3.28266736868606 A:G G A 10 0.537534767131755 0.610285991842489 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 71874734 G/A 1 76 35 111 35.1473576979866 18.8137168496114 16.3336408483752 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00217572591479807 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 71874784 C/T 1 47 32 79 21.7358659448075 17.2011125482162 4.53475339659136 T:C C T 10 0.537534767131755 0.312820873879903 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 69 74 143 31.9101010679089 39.7775727677499 -7.86747169984096 T:C C T 10 0.537534767131755 0.208347237567696 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 72164214 C/G 1 62 59 121 28.6728444378312 31.7145512607735 -3.04170682294235 C:G C G 10 0.537534767131755 0.585676658929319 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72164135_72164302:EIF4EBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 75865065 G/A 1 13 21 34 6.01204802728719 11.2882301097669 -5.27618208247967 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0848552883526125 ENSG00000035403:ENST00000372755:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000211998:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000436396:exon_75864809_75865111:VCL;ENSG00000035403:ENST00000472585:exon_75864686_75865111:VCL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 79760818 A/G 1 10 4 14 4.62465232868245 2.15013906852702 2.47451326015543 A:G A G 10 0.537534767131755 0.283621077619465 ENSG00000148606:ENST00000372371:exon_79760734_79760852:POLR3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 79762028 G/A 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 0.593874685143272 ENSG00000148606:ENST00000372371:exon_79761955_79762066:POLR3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 81841692 G/T 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:G G T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000133678:ENST00000472622:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372281:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000528687:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372277:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372275:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372274:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000411627:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372273:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000467529:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000463029:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000476173:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000483732:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000463209:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000450179:exon_81841597_81841700:C10orf57 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 181 165 346 83.7062071491523 88.6932365767396 -4.98702942758722 A:G G A 10 0.537534767131755 0.590357778655255 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 85974236 T/C 1 12 7 19 5.54958279441894 3.76274336992228 1.78683942449666 T:C T C 10 0.537534767131755 0.493873626093778 ENSG00000148600:ENST00000372117:exon_85973838_85977122:CDHR1;ENSG00000148600:ENST00000440770:exon_85973838_85977119:CDHR1;ENSG00000148600:ENST00000459673:exon_85973838_85977122:CDHR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 85974381 A/G 1 11 4 15 5.08711756155069 2.15013906852702 2.93697849302368 A:G A G 10 0.537534767131755 0.194241334120294 ENSG00000148600:ENST00000372117:exon_85973838_85977122:CDHR1;ENSG00000148600:ENST00000440770:exon_85973838_85977119:CDHR1;ENSG00000148600:ENST00000459673:exon_85973838_85977122:CDHR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 32 30 62 14.7988874517838 16.1260430139526 -1.32715556216881 T:C C T 10 0.537534767131755 0.799303764735326 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 91468925 C/G 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 C:G C G 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000447580:exon_91468924_91469010:KIF20B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 91470834 A/C 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:C A C 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000447580:exon_91470718_91470847:KIF20B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 A:G G A 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 A:T T A 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 4 9 13 1.84986093147298 4.83781290418579 -2.98795197271281 A:G A G 10 0.537534767131755 0.161862439396256 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 10 15 25 4.62465232868245 8.06302150697632 -3.43836917829387 A:G A G 10 0.537534767131755 0.228213554923661 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 12 8 20 5.54958279441894 4.30027813705404 1.2493046573649 A:G A G 10 0.537534767131755 0.657534137938504 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 93608142 G/A 1 10 11 21 4.62465232868245 5.91288243844931 -1.28823010976685 A:G G A 10 0.537534767131755 0.663607311505883 ENSG00000107854:ENST00000371627:exon_93608140_93608392:TNKS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 93668110 T/A 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 A:T T A 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000174721:ENST00000311575:exon_93666346_93668804:FGFBP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 96104665 T/G 1 14 23 37 6.47451326015543 12.3632996440304 -5.88878638387493 T:G T G 10 0.537534767131755 0.0684765260749639 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96104610_96104690:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96104610_96104690:NOC3L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 96114835 G/A 1 13 8 21 6.01204802728719 4.30027813705404 1.71176989023315 A:G G A 10 0.537534767131755 0.516592621941706 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96114720_96114850:NOC3L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 7 10 17 3.23725663007772 5.37534767131755 -2.13809104123983 A:C A C 10 0.537534767131755 0.337166426523694 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 96997670 A/G 1 922 890 1812 426.392944704522 478.405942747262 -52.01299804274 A:T:G A G 10 0.537534767131755 0.0152209972160017 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 96997820 A/G 1 574 618 1192 265.455043666373 332.196486087425 -66.7414424210519 A:T:G A G 10 0.537534767131755 0.000110703273954279 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000492511:exon_96997697_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_96997767_96997868:PDLIM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 97366578 G/T 1 105 78 183 48.5588494511657 41.9277118362769 6.63113761488884 T:G G T 10 0.537534767131755 0.336031386591958 ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97365696_97366700:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97365702_97366700:ALDH18A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 97447373 A/T 1 17 26 43 7.86190895876017 13.9759039454256 -6.11399498666546 A:T A T 10 0.537534767131755 0.0671657559439316 ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371209:exon_97447349_97447476:TCTN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 97599537 G/C 1 129 138 267 59.6580150400036 74.1797978641822 -14.5217828241786 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0754165183674046 ENSG00000138185:ENST00000453258:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371206:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000481316:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371205:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371203:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000483213:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371207:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000490659:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000494070:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000461927:exon_97599057_97599565:ENTPD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 97605057 C/G 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 C:G C G 10 0.537534767131755 0.795222451542679 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 97920062 G/A 1 5 11 16 2.31232616434123 5.91288243844931 -3.60055627410808 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0821156190636971 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 97987144 C/G 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 C:G C G 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 98002522 A/T 1 109 90 199 50.4087103826387 48.3781290418579 2.03058134078076 A:T A T 10 0.537534767131755 0.831184861551243 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_98002491_98002540:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_98002491_98002540:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_98002491_98002540:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_98002491_98002540:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_98002491_98002540:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_98002491_98002540:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_98002491_98002540:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_98002491_98002540:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000495266:exon_98002491_98002540:BLNK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 98741293 A/G 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000155640:ENST00000286067:exon_98741041_98745582:C10orf12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 99006083 G/A 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 0.593874685143272 ENSG00000213390:ENST00000358531:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000492211:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000487035:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000371027:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000479633:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000316676:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000358308:exon_99006029_99006094:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000355366:exon_99006029_99006094:ARHGAP19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 99019177 A/G 1 12 6 18 5.54958279441894 3.22520860279053 2.32437419162841 A:G A G 10 0.537534767131755 0.34696272979013 ENSG00000213390:ENST00000358531:exon_99019159_99019385:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000492211:exon_99019159_99019385:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000371027:exon_99019159_99019385:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000479633:exon_99019159_99019385:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000316676:exon_99019159_99019385:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000358308:exon_99019159_99019385:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000355366:exon_99019159_99019385:ARHGAP19;ENSG00000213390:ENST00000393817:exon_99019159_99019385:ARHGAP19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 55 33 88 25.4355878077535 17.7386473153479 7.69694049240556 T:C C T 10 0.537534767131755 0.109053693407511 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 99160965 A/G 1 12 13 25 5.54958279441894 6.98795197271281 -1.43836917829387 A:G A G 10 0.537534767131755 0.689197984829322 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99160850_99161100:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99160850_99161040:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99160850_99161127:RRP12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 99502897 G/A 1 6 16 22 2.77479139720947 8.60055627410808 -5.82576487689861 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0170330021381137 ENSG00000155256:ENST00000393677:exon_99502851_99502921:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370610:exon_99502851_99502921:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370613:exon_99502851_99502921:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000337540:exon_99502851_99502921:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000497994:exon_99502851_99502921:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000356257:exon_99502851_99502921:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000453958:exon_99502851_99502921:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000359980:exon_99502851_99502921:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000423811:exon_99502851_99502921:ZFYVE27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 99504630 G/T 1 13 13 26 6.01204802728719 6.98795197271281 -0.975903945425628 T:G G T 10 0.537534767131755 0.700055875569719 ENSG00000155256:ENST00000393677:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370610:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370613:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000337540:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000497994:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000356257:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000453958:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000359980:exon_99504486_99504672:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000423811:exon_99504486_99504672:ZFYVE27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 100190920 G/A 1 30 16 46 13.8739569860474 8.60055627410808 5.27340071193927 A:G G A 10 0.537534767131755 0.139362223244993 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100190888_100191039:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000414009:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100190888_100191048:HPS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 101502968 A/G 1 34 33 67 15.7238179175203 17.7386473153479 -2.01482939782758 A:G A G 10 0.537534767131755 0.62650515710583 ENSG00000119929:ENST00000493385:exon_101502910_101503080:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370476:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000471520:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370472:exon_101502910_101503119:CUTC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 101639796 G/A 1 18 9 27 8.32437419162841 4.83781290418579 3.48656128744262 A:G G A 10 0.537534767131755 0.246443933683272 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 101715899 G/A 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 A:G G A 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101714971_101716962:DNMBP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 101716112 G/C 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 C:G G C 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101714971_101716962:DNMBP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 101912064 T/C 1 12 11 23 5.54958279441894 5.91288243844931 -0.363299644030365 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000107566:ENST00000370410:exon_101909848_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000421367:exon_101909851_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000407654:exon_101911565_101912109:ERLIN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 101977883 C/T 1 12 11 23 5.54958279441894 5.91288243844931 -0.363299644030365 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000213341:ENST00000370397:exon_101977752_101977887:CHUK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 102107251 C/G 1 108 104 212 49.9462451497705 55.9036157817025 -5.95737063193205 C:G C G 10 0.537534767131755 0.448751374905938 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102107233_102107288:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102106881_102107288:SCD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 102116311 A/C 1 136 137 273 62.8952716700813 73.6422630970504 -10.7469914269691 A:C:G A C 10 0.537534767131755 0.202555215523493 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102116289_102116367:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102116289_102116521:SCD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 102766604 A/C 1 18 13 31 8.32437419162841 6.98795197271281 1.3364222189156 A:C A C 10 0.537534767131755 0.720009446141645 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 103368654 T/C 1 25 17 42 11.5616308217061 9.13809104123983 2.42353978046629 T:C T C 10 0.537534767131755 0.536683339793605 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103368592_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103368624_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103368624_103368659:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103368624_103368801:DPCD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 103558701 G/A 1 76 76 152 35.1473576979866 40.8526423020134 -5.70528460402676 A:G G A 10 0.537534767131755 0.371423174290348 ENSG00000198408:ENST00000439817:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000361464:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000357797:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000482611:exon_103558599_103559089:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000370094:exon_103558599_103559212:MGEA5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 103577726 G/A 1 50 47 97 23.1232616434123 25.2641340551925 -2.14087241178023 A:G G A 10 0.537534767131755 0.684652854193705 ENSG00000198408:ENST00000439817:exon_103577581_103578222:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000361464:exon_103577581_103578175:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000357797:exon_103577581_103578175:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000370094:exon_103577581_103578175:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000419011:exon_103577581_103578180:MGEA5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 103900729 G/A 1 66 53 119 30.5227053693042 28.489342657983 2.03336271132116 A:G G A 10 0.537534767131755 0.782846613818454 ENSG00000148840:ENST00000278070:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000413464:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000412852:exon_103898857_103901761:PPRC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 103907055 C/T 1 65 57 122 30.0602401364359 30.63948172651 -0.579241590074108 T:C C T 10 0.537534767131755 0.927879619613731 ENSG00000148840:ENST00000278070:exon_103906429_103907149:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000412852:exon_103906429_103907149:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000370012:exon_103906429_103907149:PPRC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 103920172 T/G 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 T:G T G 10 0.537534767131755 0.518813828738763 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 103920475 T/C 1 164 121 285 75.8442981903922 65.0417068229423 10.8025913674498 T:C T C 10 0.537534767131755 0.212303818342485 ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103920209_103920850:NOLC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 103922063 G/C 1 157 132 289 72.6070415603145 70.9545892613917 1.65245229892281 C:G G C 10 0.537534767131755 0.859712896005399 ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103921868_103923627:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103921868_103923627:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103921868_103923623:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103921868_103922356:NOLC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 104161967 T/C 1 15 16 31 6.93697849302368 8.60055627410808 -1.6635777810844 T:C T C 10 0.537534767131755 0.591851170939278 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 104184081 G/A 1 115 109 224 53.1835017798482 58.5912896173613 -5.40778783751311 A:G G A 10 0.537534767131755 0.502928482880882 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000486762:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104183788_104184151:CUEDC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 12 27 39 5.54958279441894 14.5134387125574 -8.96385591813844 C:G C G 10 0.537534767131755 0.00561907710330336 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 104572963 T/C 1 17 17 34 7.86190895876017 9.13809104123983 -1.27618208247967 T:C T C 10 0.537534767131755 0.731966346241064 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 104679371 C/T 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000148842:ENST00000457502:exon_104678071_104679858:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000433628:exon_104678071_104679858:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000369875:exon_104678074_104679858:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000369878:exon_104678114_104679858:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000345419:exon_104678114_104679858:CNNM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 105362104 G/A 1 37 13 50 17.1112136161251 6.98795197271281 10.1232616434123 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00423328369709169 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 105362179 G/A 1 19 33 52 8.78683942449666 17.7386473153479 -8.95180789085126 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0172318534179652 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 105362287 C/G 1 8 32 40 3.69972186294596 17.2011125482162 -13.5013906852702 C:G C G 10 0.537534767131755 1.89004462176771e-05 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 112270103 C/G 1 193 189 382 89.2557899435713 101.594070987902 -12.3382810443304 C:G C G 10 0.537534767131755 0.218160430030006 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112269778_112271302:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112269778_112270195:DUSP5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 115457264 T/G 1 19 32 51 8.78683942449666 17.2011125482162 -8.4142731237195 T:G T G 10 0.537534767131755 0.0237503791696886 ENSG00000165806:ENST00000429617:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369319:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369316:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115457184_115457362:CASP7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 115489152 C/G 1 30 30 60 13.8739569860474 16.1260430139526 -2.2520860279053 C:G C G 10 0.537534767131755 0.60546995959549 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 115489167 G/A 1 32 25 57 14.7988874517838 13.4383691782939 1.36051827348997 A:G G A 10 0.537534767131755 0.791005023816092 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 115668149 A/G 1 12 7 19 5.54958279441894 3.76274336992228 1.78683942449666 A:G A G 10 0.537534767131755 0.493873626093778 ENSG00000196865:ENST00000369301:exon_115668039_115676953:NHLRC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 116602805 A/G 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000151553:ENST00000369248:exon_116602692_116602985:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000369250:exon_116602692_116602985:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000392942:exon_116602692_116602985:FAM160B1;ENSG00000151553:ENST00000455766:exon_116602692_116602985:FAM160B1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 120828969 A/G 1 61 73 134 28.2103792049629 39.2400380006181 -11.0296587956552 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.0571052918515736 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120828958_120829166:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120828958_120828985:EIF3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 10 17 27 4.62465232868245 9.13809104123983 -4.51343871255738 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0859309769353234 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 120928705 G/A 1 230 167 397 106.367003559696 89.7683061110031 16.5986974486933 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.0968828596535487 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120928689_120928854:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120928689_120928854:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000494433:exon_120928689_120930500:PRDX3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 120933324 G/A 1 93 54 147 43.0092666567468 29.0268774251148 13.982389231632 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0206578506690826 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000463322:exon_120933257_120933384:PRDX3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 121586827 A/G 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000198825:ENST00000361976:exon_121586143_121588652:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369080:exon_121586143_121587837:INPP5F HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 121586882 A/G 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 A:G A G 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000198825:ENST00000361976:exon_121586143_121588652:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369080:exon_121586143_121587837:INPP5F HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 121671651 T/C 1 12 18 30 5.54958279441894 9.67562580837159 -4.12604301395265 T:C T C 10 0.537534767131755 0.145257349054755 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121671556_121671676:SEC23IP;ENSG00000107651:ENST00000446561:exon_121671556_121671676:SEC23IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 121679013 A/G 1 14 12 26 6.47451326015543 6.45041720558106 0.0240960545743709 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121678956_121679108:SEC23IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 121685559 G/A 1 22 28 50 10.1742351231014 15.0509734796891 -4.87673835658775 A:G G A 10 0.537534767131755 0.201537967454812 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121685548_121685739:SEC23IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 121693246 A/G 1 33 30 63 15.2613526846521 16.1260430139526 -0.864690329300563 A:G A G 10 0.537534767131755 0.899619329709575 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121693198_121693299:SEC23IP;ENSG00000107651:ENST00000475542:exon_121693198_121693282:SEC23IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 122624679 G/A 1 14 9 23 6.47451326015543 4.83781290418579 1.63670035596964 A:G G A 10 0.537534767131755 0.536918781286691 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122624559_122624724:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000462529:exon_122624559_122624703:WDR11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 122645376 A/T 1 18 30 48 8.32437419162841 16.1260430139526 -7.80166882232424 A:T A T 10 0.537534767131755 0.0291679656635758 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122645326_122645450:WDR11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 122663585 G/A 1 36 25 61 16.6487483832568 13.4383691782939 3.21037920496295 A:G G A 10 0.537534767131755 0.442850303155823 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122663559_122663654:WDR11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 122665459 C/G 1 13 22 35 6.01204802728719 11.8257648768986 -5.81371684961142 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0612142841928713 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122665388_122666367:WDR11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 122665489 C/T 1 12 11 23 5.54958279441894 5.91288243844931 -0.363299644030365 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122665388_122666367:WDR11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 123503187 T/C 1 8 13 21 3.69972186294596 6.98795197271281 -3.28823010976685 T:C T C 10 0.537534767131755 0.189542373698344 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123502626_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123502710_123503373:ATE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 123549691 T/G 1 8 12 20 3.69972186294596 6.45041720558106 -2.7506953426351 T:G T G 10 0.537534767131755 0.264201895405952 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000485281:exon_123549684_123549741:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123549378_123549804:ATE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 123596254 T/C 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123596233_123596332:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123596233_123596332:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123596233_123596332:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123596233_123596332:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123596233_123596332:ATE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 123673339 T/C 1 3 12 15 1.38739569860474 6.45041720558106 -5.06302150697632 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00953783143503242 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123673305_123673408:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000455628:exon_123673305_123673408:ATE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 123687456 G/A 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 A:G G A 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123687359_123687551:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123687359_123687551:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123687359_123687550:ATE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 0 11 0 11 5.08711756155069 0 5.08711756155069 G G 10 0.537534767131755 0.00128956245765823 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 126089434 G/A 1 6 16 22 2.77479139720947 8.60055627410808 -5.82576487689861 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0170330021381137 ENSG00000065154:ENST00000368845:exon_126089409_126089553:OAT;ENSG00000065154:ENST00000471127:exon_126089409_126089553:OAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 126670356 G/A 1 15 24 39 6.93697849302368 12.9008344111621 -5.96385591813844 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0759750643305305 ENSG00000019995:ENST00000359653:exon_126670278_126670398:ZRANB1;ENSG00000019995:ENST00000471421:exon_126669980_126670398:ZRANB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 127441439 G/A 1 15 15 30 6.93697849302368 8.06302150697632 -1.12604301395265 A:G G A 10 0.537534767131755 0.716938089677859 ENSG00000107938:ENST00000419769:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000481600:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000356792:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368815:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000337623:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000433226:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000450404:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368812:exon_127441368_127441483:C10orf137 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 11 21 32 5.08711756155069 11.2882301097669 -6.20111254821616 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0328630728341302 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 242 237 479 111.916586354115 127.395739810226 -15.4791534561106 T:C T C 10 0.537534767131755 0.169183210886591 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 312 276 588 144.289152654892 148.359595728364 -4.07044307347192 C:G G C 10 0.537534767131755 0.740922213133515 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 129900858 C/T 1 210 164 374 97.1176989023315 88.1557018096078 8.96199709272364 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.378059990464495 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 129901501 G/C 1 184 201 385 85.0936028477571 108.044488193483 -22.9508853457257 T:C:G G C 10 0.537534767131755 0.0213354456958487 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 129901747 C/T 1 172 196 368 79.5440200533381 105.356814357824 -25.8127943044858 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00760806431682016 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 259 235 494 119.778495312875 126.320670275962 -6.54217496308695 A:G G A 10 0.537534767131755 0.55783512416681 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 201 175 376 92.9555118065173 94.0685842480571 -1.11307244153987 T:C T C 10 0.537534767131755 0.917689704257265 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 129903465 A/G 1 157 217 374 72.6070415603145 116.645044467591 -44.0380029072764 A:G A G 10 0.537534767131755 5.88407082914024e-06 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 129903802 A/G 1 175 154 329 80.9314157519429 82.7803541382903 -1.84893838634738 A:G A G 10 0.537534767131755 0.86830633072004 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 129904560 C/T 1 156 151 307 72.1445763274462 81.167749836895 -9.02317350944877 T:C C T 10 0.537534767131755 0.303543191099507 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 129905896 T/A 1 154 133 287 71.2196458617097 71.4921240285234 -0.27247816681367 A:T:G T A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 129906980 C/T 1 151 128 279 69.832250163105 68.8044501928646 1.02779997024037 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.95213950843461 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 133761285 G/A 1 50 43 93 23.1232616434123 23.1139949866655 0.00926665674678873 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000470416:exon_133761034_133761295:PPP2R2D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 1 57 49 106 26.36051827349 26.339203589456 0.0213146840339711 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 10 134013974 C/A 1 18 1 19 8.32437419162841 0.537534767131755 7.78683942449666 A:C C A 10 0.537534767131755 0.000240930623396211 ENSG00000151640:ENST00000338492:exon_134013860_134014016:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368629:exon_134013860_134014016:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368627:exon_134013860_134014016:DPYSL4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 212479 C/T 1 96 80 176 44.3966623553515 43.0027813705404 1.39388098481113 T:C C T 10 0.537534767131755 0.87991424148507 ENSG00000177963:ENST00000526104:exon_212416_212511:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000325207:exon_212416_212511:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527696:exon_212416_212511:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527728:exon_212416_212511:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527039:exon_212416_212591:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000530149:exon_210364_213780:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000532241:exon_212468_212511:RIC8A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 30 31 61 13.8739569860474 16.6635777810844 -2.78962079503705 A:G A G 10 0.537534767131755 0.521640352820449 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 198 393 591 91.5681161079125 211.25116348278 -119.683047374867 A:G A G 10 0.537534767131755 5.46999653854115e-23 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 985547 C/T 1 29 24 53 13.4114917531791 12.9008344111621 0.510657342016987 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_985435_985586:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_985435_985597:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_983146_987654:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527917:exon_985384_985582:AP2A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 993907 C/G 1 28 33 61 12.9490265203109 17.7386473153479 -4.78962079503705 C:G C G 10 0.537534767131755 0.248182549522131 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528195:exon_993863_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_993754_993985:AP2A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 993919 C/T 1 45 48 93 20.810935479071 25.8016688223242 -4.99073334325321 T:C C T 10 0.537534767131755 0.300802932430656 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528195:exon_993863_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_993754_993985:AP2A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 1974029 G/A 1 136 142 278 62.8952716700813 76.3299369327092 -13.4346652626279 A:G G A 10 0.537534767131755 0.117713528966922 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1974012_1974552:MRPL23 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 311 237 548 143.826687422024 127.395739810226 16.4309476117983 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.170376563879543 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 3033504 G/A 1 72 60 132 33.2974967665136 32.2520860279053 1.04541073860835 A:G G A 10 0.537534767131755 0.862002236646232 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3033425_3033506:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3033425_3033506:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3033425_3033506:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3033425_3033506:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3033425_3033506:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3033425_3033506:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3033425_3033506:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3033425_3033506:CARS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 3714489 C/T 1 29 17 46 13.4114917531791 9.13809104123983 4.27340071193927 T:C C T 10 0.537534767131755 0.237768250698952 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000429801:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000524563:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000530345:exon_3714287_3714605:NUP98 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 4103524 A/G 1 18 11 29 8.32437419162841 5.91288243844931 2.41149175317911 A:G A G 10 0.537534767131755 0.457394669306004 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 44 33 77 20.3484702462028 17.7386473153479 2.60982293085486 A:C C A 10 0.537534767131755 0.569799390124396 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 94 89 183 43.471731889615 47.8405942747262 -4.36886238511116 A:G A G 10 0.537534767131755 0.553303347726785 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 180 176 356 83.2437419162841 94.6061190151889 -11.3623770989048 C:G G C 10 0.537534767131755 0.242277240488667 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 6340525 A/T 1 8 16 24 3.69972186294596 8.60055627410808 -4.90083441116212 A:T A T 10 0.537534767131755 0.0633610479446073 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 6340706 A/G 1 7 16 23 3.23725663007772 8.60055627410808 -5.36329964403036 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0345350413095283 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 6519642 G/A 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 A:G G A 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6519001_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6518815_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000477562:exon_6519538_6519919:DNHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 6520015 G/T 1 2 7 9 0.92493046573649 3.76274336992228 -2.83781290418579 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0909104192397482 ENSG00000179532:ENST00000473019:exon_6519953_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6519001_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6518815_6520191:DNHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 6520164 T/A 1 2 9 11 0.92493046573649 4.83781290418579 -3.9128824384493 A:T T A 10 0.537534767131755 0.0295587298456249 ENSG00000179532:ENST00000473019:exon_6519953_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6519001_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6518815_6520191:DNHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 6532519 C/T 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6532503_6532659:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6532503_6532659:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000472080:exon_6532503_6532659:DNHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 6588228 G/A 1 14 11 25 6.47451326015543 5.91288243844931 0.561630821706125 A:G G A 10 0.537534767131755 0.844309277033242 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6588155_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525080:exon_6588155_6588582:DNHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 6622714 G/A 1 23 36 59 10.6367003559696 19.3512516167432 -8.71455126077354 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0260970276750395 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 124 111 235 57.3456888756624 59.6663591516248 -2.32067027596242 T:C C T 10 0.537534767131755 0.793676623024766 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 132 117 249 61.0454107386083 62.8915677544153 -1.84615701580699 A:T:C:G G A 10 0.537534767131755 0.848859405194385 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 6631016 C/T 1 139 137 276 64.2826673686861 73.6422630970504 -9.35959572836437 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.277259652792919 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630955_6631046:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 6632450 C/T 1 291 260 551 134.577382764659 139.759039454256 -5.18165668959696 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.669347610144915 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000299424:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000527248:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000531760:exon_6632419_6632534:TAF10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 6636106 T/A 1 70 52 122 32.3725663007772 27.9518078908513 4.4207584099259 A:T T A 10 0.537534767131755 0.467862054673212 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000429085:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000524611:exon_6636097_6636222:TPP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 7662732 C/T 1 20 11 31 9.2493046573649 5.91288243844931 3.3364222189156 T:C C T 10 0.537534767131755 0.280729124843917 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534409:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530081:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532172:exon_7662710_7663387:PPFIBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 7673015 G/A 1 37 37 74 17.1112136161251 19.8887863838749 -2.77757276774987 A:G G A 10 0.537534767131755 0.560639460231963 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 7686596 G/A 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 A:G G A 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 7686674 T/C 1 10 14 24 4.62465232868245 7.52548673984457 -2.90083441116212 T:C T C 10 0.537534767131755 0.306252553826296 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 7687715 T/C 1 8 16 24 3.69972186294596 8.60055627410808 -4.90083441116212 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0633610479446073 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7687682_7687915:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7687682_7687781:CYB5R2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 7694002 G/A 1 11 14 25 5.08711756155069 7.52548673984457 -2.43836917829387 A:G G A 10 0.537534767131755 0.423037845947577 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7693979_7694686:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7693979_7694121:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000527542:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532920:exon_7693979_7694037:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000524608:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000436351:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000525307:exon_7693859_7694122:CYB5R2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 8707083 G/A 1 19 13 32 8.78683942449666 6.98795197271281 1.79888745178384 A:G G A 10 0.537534767131755 0.596815376088155 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 8707233 C/T 1 984 1125 2109 455.065789142353 604.726613023224 -149.660823880871 A:T:C C T 10 0.537534767131755 7.15261354680232e-11 ENSG00000166441:ENST00000314138:exon_8707225_8711419:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000524496:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000534599:exon_8707225_8707392:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000532359:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530022:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000526562:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000525981:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530913:exon_8707225_8707395:RPL27A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 17 13 30 7.86190895876017 6.98795197271281 0.873956986047352 A:G A G 10 0.537534767131755 0.85537468378439 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 9225326 T/C 1 9 8 17 4.16218709581421 4.30027813705404 -0.138091041239834 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000184014:ENST00000328194:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000530044:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000526707:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000532696:exon_9225079_9225864:DENND5A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 9225486 C/G 1 12 14 26 5.54958279441894 7.52548673984457 -1.97590394542563 C:G C G 10 0.537534767131755 0.440566012205601 ENSG00000184014:ENST00000328194:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000530044:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000526707:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000532696:exon_9225079_9225864:DENND5A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 9321173 A/G 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 A:G A G 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000166471:ENST00000299596:exon_9321131_9321248:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000524543:exon_9321131_9321248:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000429086:exon_9321131_9321248:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000528080:exon_9321131_9321248:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000527813:exon_9321131_9321248:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000533723:exon_9321131_9321248:TMEM41B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 9607032 A/G 1 28 23 51 12.9490265203109 12.3632996440304 0.585726876280496 A:G A G 10 0.537534767131755 0.889380467031684 ENSG00000166483:ENST00000450114:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000299613:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000524612:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530712:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530175:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000532275:exon_9606989_9607074:WEE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 9749645 A/C 1 24 30 54 11.0991655888379 16.1260430139526 -5.02687742511477 A:C A C 10 0.537534767131755 0.175138481783256 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9749600_9749746:SWAP70 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 17111272 A/G 1 12 10 22 5.54958279441894 5.37534767131755 0.174235123101391 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000011405:ENST00000265970:exon_17108119_17111467:PIK3C2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 17190260 T/C 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 T:C T C 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000011405:ENST00000265970:exon_17190224_17191288:PIK3C2A;ENSG00000011405:ENST00000533645:exon_17190224_17191353:PIK3C2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 17351683 C/G 1 12 2 14 5.54958279441894 1.07506953426351 4.47451326015543 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0163896060017328 ENSG00000070081:ENST00000532658:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000533773:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000405119:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000323688:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000529010:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000458064:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000527580:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000531242:exon_17351674_17351844:NUCB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 18418428 A/C 1 463 529 992 214.121402817997 284.355891812698 -70.2344889947009 A:T:C:G A C 10 0.537534767131755 8.09487789001488e-06 ENSG00000134333:ENST00000422447:exon_18418366_18418515:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000430553:exon_18418366_18418515:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000469976:exon_18418366_18418772:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000396222:exon_18418366_18418515:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000494573:exon_18418366_18418515:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000379412:exon_18418366_18418515:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000445376:exon_18418366_18418515:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000227157:exon_18418366_18418515:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000478970:exon_18418366_18418515:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000495052:exon_18418366_18418515:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000486690:exon_18418366_18418515:LDHA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 18505552 G/A 1 32 26 58 14.7988874517838 13.9759039454256 0.822983506358213 A:G G A 10 0.537534767131755 0.895550644536932 ENSG00000074319:ENST00000357193:exon_18505417_18505619:TSG101;ENSG00000074319:ENST00000251968:exon_18505417_18505619:TSG101 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 22696451 A/G 1 15 7 22 6.93697849302368 3.76274336992228 3.17423512310139 A:G A G 10 0.537534767131755 0.203346468273651 ENSG00000148935:ENST00000528582:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000533092:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000454584:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000533363:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000278187:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000524701:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000534801:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000532398:exon_22696319_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000433790:exon_22696319_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000432939:exon_22696416_22696565:GAS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 32417945 T/C 1 4 7 11 1.84986093147298 3.76274336992228 -1.9128824384493 T:C T C 10 0.537534767131755 0.365659915960336 ENSG00000184937:ENST00000379079:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000379077:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000332351:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000448076:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000530998:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000452863:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000527882:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000526685:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000184937:ENST00000527775:exon_32417912_32417953:WT1;ENSG00000254439:ENST00000526998:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000254611:ENST00000524721:exon_32417803_32417953:WT1;ENSG00000254922:ENST00000527201:exon_32417803_32417953:AL049692.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 32874926 G/A 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 A:G G A 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 33106616 C/T 1 28 29 57 12.9490265203109 15.5885082468209 -2.63948172651003 T:C C T 10 0.537534767131755 0.508547427746685 ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 34378381 G/C 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 C:G G C 10 0.537534767131755 0.190750883746296 ENSG00000166016:ENST00000435224:exon_34378248_34379555:ABTB2;ENSG00000166016:ENST00000298992:exon_34378248_34378802:ABTB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 34460541 T/C 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34460472_34460626:CAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 34482908 C/T 1 34 25 59 15.7238179175203 13.4383691782939 2.28544873922646 T:C C T 10 0.537534767131755 0.602645525728992 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34482798_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000530343:exon_34482280_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000525707:exon_34482750_34482936:CAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 28 28 56 12.9490265203109 15.0509734796891 -2.10194695937828 T:G T G 10 0.537534767131755 0.594067644372278 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 12 20 32 5.54958279441894 10.7506953426351 -5.20111254821616 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0762753359001116 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 22 15 37 10.1742351231014 8.06302150697632 2.11121361612506 A:G G A 10 0.537534767131755 0.514173464877861 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 34938265 C/T 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 T:C C T 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 34991727 T/C 1 16 12 28 7.39944372589192 6.45041720558106 0.949026520310861 T:C T C 10 0.537534767131755 0.850208407116058 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34991686_34991833:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34991686_34991833:PDHX HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 35827958 A/G 1 77 71 148 35.6098229308549 38.1649684663546 -2.55514553549973 A:G A G 10 0.537534767131755 0.681044859561404 ENSG00000166326:ENST00000299413:exon_35827908_35829775:TRIM44;ENSG00000166326:ENST00000532066:exon_35827908_35828171:TRIM44 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 43472746 C/T 1 23 20 43 10.6367003559696 10.7506953426351 -0.113994986665464 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000052841:ENST00000039989:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525135:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525543:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000533554:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000418561:exon_43472730_43472815:TTC17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 28 24 52 12.9490265203109 12.9008344111621 0.0481921091487418 T:G G T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 44102818 C/T 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 T:C C T 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44102729_44102870:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44102729_44102870:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44102729_44102870:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44102729_44102870:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000532122:exon_44102729_44102870:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000531190:exon_44102729_44102870:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527557:exon_44102729_44102870:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000531505:exon_44102060_44102870:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000534035:exon_44102729_44102870:ACCS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 44636839 C/T 1 464 376 840 214.583868050866 202.11307244154 12.4707956093258 T:C C T 10 0.537534767131755 0.406317456449461 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 44639932 G/A 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 A:G G A 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 45827350 A/G 1 13 18 31 6.01204802728719 9.67562580837159 -3.6635777810844 A:G A G 10 0.537534767131755 0.209649914232361 ENSG00000181830:ENST00000314134:exon_45825957_45827887:SLC35C1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 40 39 79 18.4986093147298 20.9638559181384 -2.46524660340864 A:G A G 10 0.537534767131755 0.65203868152598 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 45975130 C/T 1 25 13 38 11.5616308217061 6.98795197271281 4.57367884899331 T:C C T 10 0.537534767131755 0.146220045523152 ENSG00000135365:ENST00000257821:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527401:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000323180:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000418153:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527753:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000534766:exon_45975078_45975166:PHF21A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 46387800 G/A 0 20 0 20 9.2493046573649 0 9.2493046573649 G G 10 0.537534767131755 4.25656468884935e-06 ENSG00000149091:ENST00000525434:exon_46387794_46388076:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000454345:exon_46387794_46388534:DGKZ HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 46387868 A/G 1 9 12 21 4.16218709581421 6.45041720558106 -2.28823010976685 A:G A G 10 0.537534767131755 0.383405862328562 ENSG00000149091:ENST00000525434:exon_46387794_46388076:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000454345:exon_46387794_46388534:DGKZ;ENSG00000149091:ENST00000318201:exon_46387807_46388534:DGKZ HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 46403649 G/A 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 A:G G A 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000110492:ENST00000405308:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000441869:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000490240:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000405994:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000359803:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000533952:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395569:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395566:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000481047:exon_46403261_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000405098:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000430827:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000489525:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000407067:exon_46403303_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395565:exon_46403607_46403683:MDK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 25 25 50 11.5616308217061 13.4383691782939 -1.87673835658775 T:C T C 10 0.537534767131755 0.671018640075743 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 57157405 A/G 1 15 10 25 6.93697849302368 5.37534767131755 1.56163082170613 A:G A G 10 0.537534767131755 0.555250283480734 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000529411:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000528835:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 57176628 C/T 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C C T 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 57193653 A/G 1 112 104 216 51.7961060812434 55.9036157817025 -4.10750970045907 A:G A G 10 0.537534767131755 0.58570147558842 ENSG00000134802:ENST00000395123:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000395124:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000352187:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000428603:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529554:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533524:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530005:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528098:exon_57193462_57193952:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000442654:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000525474:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529112:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526125:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528187:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529494:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533245:exon_57193462_57193845:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533235:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000524863:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532795:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533051:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529896:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526621:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530316:exon_57193513_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529748:exon_57193580_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532278:exon_57193641_57193825:SLC43A3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 58378424 A/G 1 15 15 30 6.93697849302368 8.06302150697632 -1.12604301395265 A:G A G 10 0.537534767131755 0.716938089677859 ENSG00000186660:ENST00000316059:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000186660:ENST00000389918:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000255073:ENST00000389919:exon_58378423_58378527:AP001350.3;ENSG00000255073:ENST00000422974:exon_58378423_58378527:AP001350.3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 58892558 C/T 1 24 17 41 11.0991655888379 9.13809104123983 1.96107454759805 T:C C T 10 0.537534767131755 0.639094020728528 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 58919813 A/G 1 23 27 50 10.6367003559696 14.5134387125574 -3.87673835658775 A:G A G 10 0.537534767131755 0.321027574988137 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 60610065 G/A 1 43 46 89 19.8860050133345 24.7265992880607 -4.84059427472619 A:G G A 10 0.537534767131755 0.338945938885788 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 192 141 333 88.793324710703 75.7924021655775 13.0009225451256 A:G G A 10 0.537534767131755 0.169385313855933 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 60673868 T/C 1 72 88 160 33.2974967665136 47.3030595075944 -14.0055627410808 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0319811141688785 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60673836_60674056:PRPF19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 60689534 C/T 1 56 50 106 25.8980530406217 26.8767383565877 -0.978685315966025 T:C C T 10 0.537534767131755 0.846330578489018 ENSG00000110108:ENST00000227525:exon_60689246_60690913:TMEM109 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 60698054 G/A 1 11 7 18 5.08711756155069 3.76274336992228 1.32437419162841 A:G G A 10 0.537534767131755 0.639329189576991 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60697982_60698131:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60697982_60698131:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60698001_60698131:TMEM132A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 60699230 G/A 1 14 9 23 6.47451326015543 4.83781290418579 1.63670035596964 A:G G A 10 0.537534767131755 0.536918781286691 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60699158_60699356:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60699161_60699356:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60699158_60699356:TMEM132A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 60701136 C/G 1 14 14 28 6.47451326015543 7.52548673984457 -1.05097347968914 C:G C G 10 0.537534767131755 0.708746900580582 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60701014_60701216:TMEM132A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 60703777 G/A 1 24 10 34 11.0991655888379 5.37534767131755 5.72381791752033 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.0579717447496075 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 11 14 25 5.08711756155069 7.52548673984457 -2.43836917829387 T:C C T 10 0.537534767131755 0.423037845947577 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 61895741 A/G 1 23 13 36 10.6367003559696 6.98795197271281 3.64874838325682 A:G A G 10 0.537534767131755 0.245254118408594 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61895623_61895773:INCENP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 61897359 C/T 1 39 31 70 18.0361440818616 16.6635777810844 1.37256630077716 T:C C T 10 0.537534767131755 0.81089685888198 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 61913196 G/T 1 38 38 76 17.5736788489933 20.4263211510067 -2.85264230201338 T:G G T 10 0.537534767131755 0.565596984576226 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61913101_61913223:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61913101_61913223:INCENP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 62285721 G/T 1 15 21 36 6.93697849302368 11.2882301097669 -4.35125161674318 T:G G T 10 0.537534767131755 0.180816508722453 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 62288649 G/C 1 19 20 39 8.78683942449666 10.7506953426351 -1.96385591813844 C:G G C 10 0.537534767131755 0.630559943550738 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 62290979 T/C 1 12 13 25 5.54958279441894 6.98795197271281 -1.43836917829387 T:C T C 10 0.537534767131755 0.689197984829322 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 62293084 A/G 1 8 17 25 3.69972186294596 9.13809104123983 -5.43836917829387 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0427483104876967 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 62298597 C/A 1 10 6 16 4.62465232868245 3.22520860279053 1.39944372589192 A:C C A 10 0.537534767131755 0.618373054653884 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62296097_62301147:AHNAK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 62378687 G/T 1 45 38 83 20.810935479071 20.4263211510067 0.384614328064337 T:G G T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 62543357 G/C 1 7 10 17 3.23725663007772 5.37534767131755 -2.13809104123983 C:G G C 10 0.537534767131755 0.337166426523694 ENSG00000162227:ENST00000294168:exon_62543243_62543402:TAF6L;ENSG00000162227:ENST00000526261:exon_62543122_62543402:TAF6L;ENSG00000162227:ENST00000525405:exon_62543243_62543402:TAF6L;ENSG00000162227:ENST00000524976:exon_62543243_62543402:TAF6L;ENSG00000162227:ENST00000532915:exon_62543243_62543402:TAF6L;ENSG00000162227:ENST00000529509:exon_62543243_62543402:TAF6L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 62564009 T/C 1 48 46 94 22.1983311776758 24.7265992880607 -2.52826811038497 T:C T C 10 0.537534767131755 0.606735103094253 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533440:exon_62563932_62564035:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531872:exon_62563932_62564039:NXF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 62652779 C/T 1 201 209 410 92.9555118065173 112.344766330537 -19.3892545240195 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0597197433818432 ENSG00000168003:ENST00000377891:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377892:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377889:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377890:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000338663:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000422606:exon_62652649_62652829:SLC3A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 63978067 C/G 1 1 7 8 0.462465232868245 3.76274336992228 -3.30027813705404 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0285185064817781 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 63987339 C/T 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 T:C C T 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 63988045 G/A 1 262 286 548 121.16589101148 153.734943399682 -32.5690523882017 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00535367342989142 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 64026144 G/A 1 13 8 21 6.01204802728719 4.30027813705404 1.71176989023315 A:G G A 10 0.537534767131755 0.516592621941706 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64025945_64026185:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64025945_64026185:PLCB3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 64026639 G/A 1 10 6 16 4.62465232868245 3.22520860279053 1.39944372589192 A:G G A 10 0.537534767131755 0.618373054653884 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64026530_64026716:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64026530_64026716:PLCB3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 64034911 G/A 1 16 15 31 7.39944372589192 8.06302150697632 -0.663577781084404 A:G G A 10 0.537534767131755 0.858236752595722 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64034825_64035394:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64034825_64035394:PLCB3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 58 49 107 26.8229835063582 26.339203589456 0.483779916902218 T:G T G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 83 100 183 38.3846143280643 53.7534767131755 -15.3688623851112 T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.025919640426981 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 64124515 T/C 1 171 161 332 79.0815548204699 86.5430975082126 -7.46154268774265 A:T:C T C 10 0.537534767131755 0.441033545487666 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64124511_64125006:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64124511_64124958:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64124511_64124997:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64124511_64125002:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64122666_64125000:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64124511_64124842:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000472524:exon_64124511_64125003:CCDC88B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 25 30 55 11.5616308217061 16.1260430139526 -4.56441219224652 T:C T C 10 0.537534767131755 0.226192657944459 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 64138905 T/G 1 19 20 39 8.78683942449666 10.7506953426351 -1.96385591813844 T:G T G 10 0.537534767131755 0.630559943550738 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 64533443 C/T 1 138 119 257 63.8202021358178 63.9666372886788 -0.146435152861024 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000168066:ENST00000377390:exon_64532078_64533627:SF1;ENSG00000168066:ENST00000334944:exon_64533423_64533627:SF1;ENSG00000168066:ENST00000413725:exon_64533076_64533627:SF1;ENSG00000168066:ENST00000433274:exon_64533124_64533627:SF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 64622869 G/C 1 173 160 333 80.0064852862064 86.0055627410808 -5.99907745487441 C:G G C 10 0.537534767131755 0.510221066219107 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 64645871 A/G 1 236 157 393 109.141794956906 84.3929584396855 24.7488365172203 A:G A G 10 0.537534767131755 0.013105567843058 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 64680819 G/A 1 8 5 13 3.69972186294596 2.68767383565877 1.01204802728719 A:G G A 10 0.537534767131755 0.782310374824685 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64680738_64680867:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64680738_64680873:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64680738_64680873:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000227459:exon_64680738_64680873:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000461701:exon_64680738_64681972:ATG2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 64950633 G/C 1 119 115 234 55.0333627113212 61.8164982201518 -6.78313550883066 C:G G C 10 0.537534767131755 0.394266914430229 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950599_64950668:CAPN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 65064690 G/A 1 34 23 57 15.7238179175203 12.3632996440304 3.36051827348997 A:G G A 10 0.537534767131755 0.426182714929442 ENSG00000014138:ENST00000265465:exon_65064591_65066156:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000527618:exon_65064591_65065087:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000534785:exon_65064591_65065023:POLA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 65161129 C/T 1 16 19 35 7.39944372589192 10.2131605755033 -2.81371684961142 T:C C T 10 0.537534767131755 0.397687197999873 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000528854:exon_65161044_65161226:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65161044_65161145:FRMD8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 65266764 A/G 1 1375 1495 2870 635.889695193837 803.614476861974 -167.724781668137 A:T:G A G 10 0.537534767131755 3.87583951974655e-10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 65338034 A/G 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 A:G A G 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65337931_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527920:exon_65337956_65338226:SSSCA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 55 39 94 25.4355878077535 20.9638559181384 4.47173188961504 A:G G A 10 0.537534767131755 0.408129577096705 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 53 40 93 24.510657342017 21.5013906852702 3.00926665674679 T:G T G 10 0.537534767131755 0.603342669473562 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 46 63 109 21.2734007119393 33.8646903293006 -12.5912896173613 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0163290878438021 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 65387012 C/T 1 30 25 55 13.8739569860474 13.4383691782939 0.435587807753476 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65387008_65387131:PCNXL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 65408708 G/T 1 106 107 213 49.021314684034 57.5162200830978 -8.4949053990638 T:G G T 10 0.537534767131755 0.243732037562735 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65408300_65409071:SIPA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 65408937 C/T 1 92 125 217 42.5468014238785 67.1918458914694 -24.6450444675908 T:C C T 10 0.537534767131755 0.000830434690681521 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65408300_65409071:SIPA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 65664346 T/C 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000175592:ENST00000455710:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000312562:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000531493:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000532401:exon_65664280_65664477:FOSL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 58 62 120 26.8229835063582 33.3271555621688 -6.50417205581059 A:G G A 10 0.537534767131755 0.235642885127651 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 77 103 180 35.6098229308549 55.3660810145708 -19.7562580837159 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.00347549120303735 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 65826704 G/A 1 240 238 478 110.991655888379 127.933274577358 -16.9416186889789 A:G G A 10 0.537534767131755 0.130028551859392 ENSG00000087365:ENST00000528302:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000322535:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000355456:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000529994:exon_65826672_65826809:SF3B2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 66031660 C/T 1 45 26 71 20.810935479071 13.9759039454256 6.8350315336454 T:C C T 10 0.537534767131755 0.121513116179292 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031517_66031690:KLC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 66043253 T/C 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 T:C T C 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 66240882 T/C 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 T:C T C 10 0.537534767131755 0.190750883746296 ENSG00000174516:ENST00000349459:exon_66240712_66240906:PELI3;ENSG00000174516:ENST00000320740:exon_66240712_66240906:PELI3;ENSG00000174516:ENST00000532970:exon_66240712_66240906:PELI3;ENSG00000174516:ENST00000524466:exon_66240712_66240906:PELI3;ENSG00000174516:ENST00000526296:exon_66240712_66240906:PELI3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 66254085 G/T 1 18 20 38 8.32437419162841 10.7506953426351 -2.42632115100669 T:G G T 10 0.537534767131755 0.515807132301838 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531354:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532019:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526515:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533725:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66254011_66254148:DPP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 41 48 89 18.961074547598 25.8016688223242 -6.84059427472619 A:G A G 10 0.537534767131755 0.166836482087326 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 66272237 G/A 1 63 52 115 29.1353096706994 27.9518078908513 1.18350177984818 A:G G A 10 0.537534767131755 0.85205818891606 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 66282095 G/A 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000174483:ENST00000419755:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000526760:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000533644:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000318312:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000527251:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000335157:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000533557:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000455748:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529955:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000526035:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000534730:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000532908:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529766:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000393994:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000524907:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000524705:exon_66281977_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000524458:exon_66281877_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000533430:exon_66281940_66282149:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529953:exon_66282066_66282149:BBS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 66297363 C/T 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000174483:ENST00000419755:exon_66297290_66297423:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000526760:exon_66297290_66297423:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000318312:exon_66297290_66297423:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000335157:exon_66297290_66297423:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000455748:exon_66297290_66297423:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529955:exon_66297290_66297423:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000393994:exon_66297290_66297423:BBS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 66299515 A/G 1 12 9 21 5.54958279441894 4.83781290418579 0.711769890233146 A:G A G 10 0.537534767131755 0.829121193760437 ENSG00000174483:ENST00000419755:exon_66299422_66301084:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000526760:exon_66299127_66301084:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000318312:exon_66299422_66301098:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000455748:exon_66299422_66299551:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529955:exon_66299127_66299676:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000393994:exon_66299127_66299690:BBS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67050292 G/A 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 A:G G A 10 0.537534767131755 0.74134570348407 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67068859 T/C 1 54 34 88 24.9731225748852 18.2761820824797 6.69694049240556 T:C T C 10 0.537534767131755 0.165200325686428 ENSG00000172932:ENST00000447274:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000511455:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000308440:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000514166:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000512231:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000513750:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000507915:exon_67068753_67069294:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000515828:exon_67068753_67068869:ANKRD13D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67163628 A/G 1 17 22 39 7.86190895876017 11.8257648768986 -3.96385591813844 A:G A G 10 0.537534767131755 0.260722504893214 ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67163582_67163646:RAD9A;ENSG00000172613:ENST00000530934:exon_67163383_67163646:RAD9A;ENSG00000172613:ENST00000529100:exon_67163582_67163642:RAD9A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67164791 T/C 1 15 11 26 6.93697849302368 5.91288243844931 1.02409605457437 T:C T C 10 0.537534767131755 0.84457724361591 ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67164650_67164857:RAD9A;ENSG00000172613:ENST00000529100:exon_67164650_67164861:RAD9A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67166337 G/A 1 6 10 16 2.77479139720947 5.37534767131755 -2.60055627410808 A:G G A 10 0.537534767131755 0.217010442931191 ENSG00000172531:ENST00000532279:exon_67166193_67166634:PPP1CA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67171736 C/T 1 54 42 96 24.9731225748852 22.5764602195337 2.39666235535152 T:C C T 10 0.537534767131755 0.682579364269224 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67171662_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67171600_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67171658_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67171660_67171825:TBC1D10C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67172911 C/T 1 66 74 140 30.5227053693042 39.7775727677499 -9.25486739844569 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.127113130852078 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67172870_67172977:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67172870_67172977:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67172870_67172977:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67172870_67172977:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000533745:exon_67172870_67172977:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529132:exon_67172870_67172977:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000526474:exon_67172719_67172977:TBC1D10C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67176898 A/G 1 91 106 197 42.0843361910103 56.978685315966 -14.8943491249557 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0380204914605249 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67176878_67177560:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67176878_67177560:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67176878_67177557:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000526474:exon_67176878_67177559:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000524662:exon_67176878_67176925:TBC1D10C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 106 99 205 49.021314684034 53.2159419460437 -4.19462726200977 T:C C T 10 0.537534767131755 0.575637395235983 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 69 78 147 31.9101010679089 41.9277118362769 -10.017610768368 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0987989968430578 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67205978 G/A 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 A:G G A 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67259723 C/T 1 71 71 142 32.8350315336454 38.1649684663546 -5.3299369327092 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.40024576101312 ENSG00000110697:ENST00000534749:exon_67259239_67259767:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000436757:exon_67259239_67259767:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000527370:exon_67259240_67259767:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000356404:exon_67259240_67259767:PITPNM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67264679 C/T 1 9 6 15 4.16218709581421 3.22520860279053 0.936978493023676 T:C C T 10 0.537534767131755 0.797066078642493 ENSG00000110697:ENST00000527370:exon_67263649_67264907:PITPNM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67265814 C/A 1 8 7 15 3.69972186294596 3.76274336992228 -0.0630215069763245 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000110697:ENST00000527370:exon_67265604_67266108:PITPNM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67351585 C/G 1 5 12 17 2.31232616434123 6.45041720558106 -4.13809104123983 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0522959192114914 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67352256 C/A 1 21 14 35 9.71176989023315 7.52548673984457 2.18628315038858 A:C C A 10 0.537534767131755 0.501231301658046 ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000489040:exon_67352156_67352535:GSTP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 1843 1512 3355 852.323424176176 812.752567903214 39.5708562729621 A:T:C:G A G 10 0.537534767131755 0.171429950942768 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67353844 C/T 1 15 18 33 6.93697849302368 9.67562580837159 -2.73864731534791 T:C C T 10 0.537534767131755 0.384603784880895 ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 2340 1969 4309 1082.16864491169 1058.40595648243 23.7626884292679 A:T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.472763525659053 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67378838 C/G 1 10 13 23 4.62465232868245 6.98795197271281 -2.36329964403036 C:G C G 10 0.537534767131755 0.403957046543287 ENSG00000167792:ENST00000527923:exon_67378619_67379040:NDUFV1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67397251 G/C 1 19 25 44 8.78683942449666 13.4383691782939 -4.65152975379722 C:G G C 10 0.537534767131755 0.175118219550385 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67397189_67397401:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67397189_67397392:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67396390_67397392:NUDT8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67810297 C/T 1 79 84 163 36.5347533965914 45.1529204390674 -8.61816704247606 T:C C T 10 0.537534767131755 0.182318733774877 ENSG00000110719:ENST00000265686:exon_67810110_67810330:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000534673:exon_67810110_67810330:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000524598:exon_67810110_67810330:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000529657:exon_67810110_67810330:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000533947:exon_67810110_67810330:TCIRG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 67814863 G/T 1 15 7 22 6.93697849302368 3.76274336992228 3.17423512310139 T:G G T 10 0.537534767131755 0.203346468273651 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 68030015 C/T 1 56 60 116 25.8980530406217 32.2520860279053 -6.35403298728358 T:C C T 10 0.537534767131755 0.263891209574531 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 68030173 C/A 1 33 30 63 15.2613526846521 16.1260430139526 -0.864690329300563 A:C C A 10 0.537534767131755 0.899619329709575 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 68115489 A/G 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68115315_68115711:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68115315_68115711:LRP5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 68705674 C/A 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 A:C C A 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68705650_68705822:IGHMBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 68840160 A/G 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 A:G A G 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000162341:ENST00000294309:exon_68840095_68840176:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000442692:exon_68840095_68840176:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000450354:exon_68840095_68840176:TPCN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 68851414 T/C 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 T:C T C 10 0.537534767131755 0.241009480668847 ENSG00000162341:ENST00000294309:exon_68851413_68851484:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000356782:exon_68851413_68851484:TPCN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 71146841 G/A 1 42 42 84 19.4235397804663 22.5764602195337 -3.15292043906742 A:G G A 10 0.537534767131755 0.512728495583757 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 71152461 A/G 1 81 74 155 37.4596838623279 39.7775727677499 -2.31788890542202 A:G A G 10 0.537534767131755 0.74748630998593 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71152406_71152486:DHCR7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 71155153 A/G 1 49 43 92 22.660796410544 23.1139949866655 -0.453198576121459 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155039_71155165:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 71185479 T/C 1 14 12 26 6.47451326015543 6.45041720558106 0.0240960545743709 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 71185518 T/C 1 19 12 31 8.78683942449666 6.45041720558106 2.3364222189156 T:C T C 10 0.537534767131755 0.47292802889 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 71714526 G/C 1 121 93 214 55.9582931770576 49.9907333432532 5.96755983380444 C:G G C 10 0.537534767131755 0.450895545928229 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 71714528 T/G 1 118 96 214 54.5708974784529 51.6033376446485 2.96755983380444 T:G T G 10 0.537534767131755 0.731877290289955 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 71728822 G/C 1 51 56 107 23.5857268762805 30.1019469593783 -6.51622008309778 C:G G C 10 0.537534767131755 0.209195100733679 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71728733_71728873:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71728733_71728873:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71728733_71728873:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71728733_71728873:NUMA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 71941212 A/G 1 59 55 114 27.2854487392265 29.5644121922465 -2.27896345302007 A:G A G 10 0.537534767131755 0.707485105106406 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71941165_71941315:INPPL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 71949064 C/G 1 4 10 14 1.84986093147298 5.37534767131755 -3.52548673984457 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0654879889218514 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 72145384 C/A 1 12 17 29 5.54958279441894 9.13809104123983 -3.58850824682089 A:C C A 10 0.537534767131755 0.196303716694424 ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72145116_72145568:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72145116_72145571:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72145116_72145571:CLPB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 72415329 G/A 1 24 35 59 11.0991655888379 18.8137168496114 -7.71455126077354 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0499392803234633 ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72415197_72415379:ARAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 73620537 C/G 1 11 5 16 5.08711756155069 2.68767383565877 2.39944372589192 C:G C G 10 0.537534767131755 0.317045039600351 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73620444_73620638:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73620444_73620638:PAAF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 222 184 406 102.66728169675 98.9063971522429 3.76088454450748 A:G G A 10 0.537534767131755 0.727693500379997 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 73760413 G/T 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:G G T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000168014:ENST00000334126:exon_73760382_73760587:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313663:exon_73760382_73760587:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313681:exon_73760382_73760587:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000289350:exon_73760382_73760587:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000414160:exon_73760382_73760587:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000442398:exon_73760382_73760587:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000415191:exon_73760382_73760587:C2CD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 73789332 C/T 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000168014:ENST00000334126:exon_73789160_73789762:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313663:exon_73789160_73789762:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313681:exon_73789160_73789613:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000289350:exon_73789160_73789762:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000414160:exon_73789160_73789762:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000442398:exon_73789160_73789762:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000415191:exon_73789160_73789762:C2CD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 73806443 C/T 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 T:C C T 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000168014:ENST00000334126:exon_73806273_73806453:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313663:exon_73806273_73806453:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313681:exon_73806273_73806453:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000289350:exon_73806273_73806453:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000414160:exon_73806273_73806453:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000442398:exon_73806273_73806453:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000415191:exon_73806273_73806453:C2CD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 74546905 G/A 1 10 8 18 4.62465232868245 4.30027813705404 0.324374191628411 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000166439:ENST00000299563:exon_74546591_74553458:RNF169 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 74554922 C/T 1 4 10 14 1.84986093147298 5.37534767131755 -3.52548673984457 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0654879889218514 ENSG00000166435:ENST00000340360:exon_74554899_74555004:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000321448:exon_74554899_74555004:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000398418:exon_74554899_74555004:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000344880:exon_74554899_74555004:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531849:exon_74551976_74555004:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531449:exon_74554899_74555004:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000431210:exon_74554015_74555328:XRRA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 74559446 G/C 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000166435:ENST00000530562:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000340360:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000321448:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000398418:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000344880:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531849:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531449:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000527087:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000431210:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000530280:exon_74559170_74559507:XRRA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 74559481 C/T 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 T:C C T 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000166435:ENST00000530562:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000340360:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000321448:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000398418:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000344880:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531849:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531449:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000527087:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000431210:exon_74559160_74559507:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000530280:exon_74559170_74559507:XRRA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 74705696 T/C 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 T:C T C 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000162139:ENST00000294064:exon_74705554_74705765:NEU3;ENSG00000162139:ENST00000531509:exon_74705554_74705765:NEU3;ENSG00000162139:ENST00000531619:exon_74705554_74705765:NEU3;ENSG00000162139:ENST00000534628:exon_74705554_74706088:NEU3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 75277628 A/G 1 36 34 70 16.6487483832568 18.2761820824797 -1.62743369922284 A:G A G 10 0.537534767131755 0.720301540394459 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277512_75277726:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277395_75277700:SERPINH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 75277992 C/T 1 31 37 68 14.3364222189156 19.8887863838749 -5.55236416495934 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.182968739716469 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277764_75278016:SERPINH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 75511469 G/A 1 11 5 16 5.08711756155069 2.68767383565877 2.39944372589192 A:G G A 10 0.537534767131755 0.317045039600351 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 12 12 24 5.54958279441894 6.45041720558106 -0.900834411162119 T:C T C 10 0.537534767131755 0.83840612934176 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 75851997 T/C 1 51 76 127 23.5857268762805 40.8526423020134 -17.2669154257329 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00238562775100205 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75851755_75854239:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75851755_75852838:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75851755_75852544:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75851755_75853695:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75851755_75852827:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000525183:exon_75851755_75852704:UVRAG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 76257215 T/C 1 11 7 18 5.08711756155069 3.76274336992228 1.32437419162841 T:C T C 10 0.537534767131755 0.639329189576991 ENSG00000158636:ENST00000524490:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000334736:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000393457:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000524767:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000533248:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525919:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525038:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000529032:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000531793:exon_76256992_76257341:C11orf30 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 77838424 T/C 1 13 9 22 6.01204802728719 4.83781290418579 1.17423512310139 T:C T C 10 0.537534767131755 0.67355127074083 ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77838404_77838482:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77838404_77838482:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77838404_77838482:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77838404_77838482:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530454:exon_77838404_77838485:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525870:exon_77838404_77838482:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532050:exon_77838404_77838482:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000527099:exon_77838404_77838482:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530910:exon_77838404_77838482:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525761:exon_77838404_77838482:ALG8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 78279790 T/G 1 12 13 25 5.54958279441894 6.98795197271281 -1.43836917829387 T:G T G 10 0.537534767131755 0.689197984829322 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000526709:exon_78279761_78279798:NARS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 82878197 T/A 1 21 15 36 9.71176989023315 8.06302150697632 1.64874838325682 A:T:G T A 10 0.537534767131755 0.619585238970854 ENSG00000165494:ENST00000298281:exon_82878167_82878350:PCF11;ENSG00000165494:ENST00000530660:exon_82878167_82878350:PCF11;ENSG00000165494:ENST00000530304:exon_82878167_82878350:PCF11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 17 10 27 7.86190895876017 5.37534767131755 2.48656128744262 T:C C T 10 0.537534767131755 0.440804629998576 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 87013438 G/A 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 A:G G A 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000166575:ENST00000340353:exon_87013338_87013484:TMEM135;ENSG00000166575:ENST00000532959:exon_87013338_87013484:TMEM135;ENSG00000166575:ENST00000305494:exon_87013338_87013484:TMEM135 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 87032287 G/C 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000166575:ENST00000340353:exon_87032243_87034756:TMEM135;ENSG00000166575:ENST00000532959:exon_87032243_87032401:TMEM135;ENSG00000166575:ENST00000305494:exon_87032243_87033392:TMEM135;ENSG00000166575:ENST00000531643:exon_87032243_87033392:TMEM135;ENSG00000166575:ENST00000528861:exon_87032243_87033077:TMEM135 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 87908448 A/G 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 A:G A G 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000123892:ENST00000243662:exon_87908351_87908635:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000531138:exon_87908351_87908601:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000526372:exon_87908406_87908602:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000441495:exon_87908351_87908635:RAB38 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 88027209 T/C 1 88 102 190 40.6969404924056 54.828546247439 -14.1316057550334 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0416731433489276 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 88027393 A/C 1 134 140 274 61.9703412043448 75.2548673984457 -13.2845261941009 A:C A C 10 0.537534767131755 0.115168380063147 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88026778_88027676:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533897:exon_88026956_88027676:CTSC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 93862493 A/C 1 14 10 24 6.47451326015543 5.37534767131755 1.09916558883788 A:C A C 10 0.537534767131755 0.68779414869778 ENSG00000110218:ENST00000227638:exon_93862094_93862659:PANX1;ENSG00000110218:ENST00000436171:exon_93862094_93862659:PANX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 94533373 C/T 1 11 5 16 5.08711756155069 2.68767383565877 2.39944372589192 T:C C T 10 0.537534767131755 0.317045039600351 ENSG00000166025:ENST00000317837:exon_94532556_94533477:AMOTL1;ENSG00000166025:ENST00000317829:exon_94532556_94533477:AMOTL1;ENSG00000166025:ENST00000433060:exon_94532556_94533477:AMOTL1;ENSG00000166025:ENST00000299004:exon_94532556_94533477:AMOTL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 94602414 C/T 1 11 19 30 5.08711756155069 10.2131605755033 -5.12604301395265 T:C C T 10 0.537534767131755 0.067942965012914 ENSG00000166025:ENST00000317837:exon_94602363_94602638:AMOTL1;ENSG00000166025:ENST00000317829:exon_94602363_94602638:AMOTL1;ENSG00000166025:ENST00000433060:exon_94602363_94602638:AMOTL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 95512060 A/G 1 13 7 20 6.01204802728719 3.76274336992228 2.2493046573649 A:G A G 10 0.537534767131755 0.373913522529313 ENSG00000077458:ENST00000358780:exon_95511986_95512121:FAM76B;ENSG00000077458:ENST00000398187:exon_95511986_95512121:FAM76B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 95712897 G/T 1 11 5 16 5.08711756155069 2.68767383565877 2.39944372589192 T:G G T 10 0.537534767131755 0.317045039600351 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95709762_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95711440_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95712112_95713127:MAML2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 95713024 G/A 1 10 3 13 4.62465232868245 1.61260430139526 3.01204802728719 A:G G A 10 0.537534767131755 0.104100192392772 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95709762_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95711440_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95712112_95713127:MAML2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 95825940 C/T 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95825056_95826681:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95825056_95826684:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95825056_95826681:MAML2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 102201848 G/A 1 66 73 139 30.5227053693042 39.2400380006181 -8.71733263131394 A:G G A 10 0.537534767131755 0.148337148558123 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102201730_102201972:BIRC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 13 15 28 6.01204802728719 8.06302150697632 -2.05097347968914 C:G G C 10 0.537534767131755 0.454605168209296 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 107197640 T/C 1 12 8 20 5.54958279441894 4.30027813705404 1.2493046573649 T:C T C 10 0.537534767131755 0.657534137938504 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 107992325 T/A 1 17 15 32 7.86190895876017 8.06302150697632 -0.201112548216159 A:T T A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000075239:ENST00000265838:exon_107992243_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000524833:exon_107992294_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000299355:exon_107992294_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000531813:exon_107992311_107992405:ACAT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 107992346 G/C 1 21 16 37 9.71176989023315 8.60055627410808 1.11121361612507 C:G G C 10 0.537534767131755 0.744509553421204 ENSG00000075239:ENST00000265838:exon_107992243_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000524833:exon_107992294_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000299355:exon_107992294_107992405:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000531813:exon_107992311_107992405:ACAT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 111896324 C/T 1 26 22 48 12.0240960545744 11.8257648768986 0.198331177675762 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111896320_111896475:DLAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 47 40 87 21.7358659448075 21.5013906852702 0.234475259537319 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 111916647 G/A 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 A:G G A 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111916587_111916694:DLAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 18 13 31 8.32437419162841 6.98795197271281 1.3364222189156 T:C C T 10 0.537534767131755 0.720009446141645 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 116729196 T/C 1 16 11 27 7.39944372589192 5.91288243844931 1.48656128744262 T:C T C 10 0.537534767131755 0.700334466477321 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 117163824 C/G 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 C:G C G 10 0.537534767131755 0.760762761058777 ENSG00000186318:ENST00000313005:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000392937:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000528053:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510630:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000428381:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000513780:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000445823:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000292095:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530824:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530844:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510915:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000504995:exon_117163787_117163904:BACE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 8 8 16 3.69972186294596 4.30027813705404 -0.600556274108079 A:G A G 10 0.537534767131755 0.806072821048815 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 117281566 C/T 1 11 17 28 5.08711756155069 9.13809104123983 -4.05097347968914 T:C C T 10 0.537534767131755 0.133350668026399 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117281544_117281610:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117281544_117281610:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117281544_117281610:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117281544_117281610:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000528706:exon_117281544_117281610:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000532187:exon_117281544_117281610:CEP164 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 117282800 G/T 1 22 16 38 10.1742351231014 8.60055627410808 1.57367884899331 T:G G T 10 0.537534767131755 0.629922467162815 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117282788_117283984:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117282788_117283984:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117282788_117283059:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117282788_117283982:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000528706:exon_117282788_117283055:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533433:exon_117282788_117283546:CEP164 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 118068752 T/C 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:C T C 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000160593:ENST00000356289:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000292067:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118067450_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000533261:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526595:exon_118068683_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000531530:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526620:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000529164:exon_118068324_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000414357:exon_118068683_118068806:AMICA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 118471423 T/C 1 37 46 83 17.1112136161251 24.7265992880607 -7.61538567193566 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0993088029282495 ENSG00000095139:ENST00000392859:exon_118471340_118471708:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000359415:exon_118471340_118473643:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000264028:exon_118471340_118473643:ARCN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 118769604 C/T 1 24 19 43 11.0991655888379 10.2131605755033 0.886005013334536 T:C C T 10 0.537534767131755 0.878811819236514 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118766849_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118768455_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000525300:exon_118768459_118769773:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118769124_118769771:BCL9L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 118828942 A/G 1 6 16 22 2.77479139720947 8.60055627410808 -5.82576487689861 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0170330021381137 ENSG00000110375:ENST00000534788:exon_118828807_118829264:UPK2;ENSG00000110375:ENST00000264031:exon_118828807_118829269:UPK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 30 26 56 13.8739569860474 13.9759039454256 -0.101946959378278 A:T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 118886656 G/A 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 A:G G A 10 0.537534767131755 0.241009480668847 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 118890022 C/T 1 52 62 114 24.0481921091487 33.3271555621688 -9.27896345302006 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0907356522191987 ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000527680:exon_118889853_118890213:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118889476_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525079:exon_118889853_118890134:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533012:exon_118889853_118890027:TRAPPC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 43 33 76 19.8860050133345 17.7386473153479 2.14735769798662 T:C C T 10 0.537534767131755 0.647008331333996 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 31 28 59 14.3364222189156 15.0509734796891 -0.714551260773543 T:C T C 10 0.537534767131755 0.896482361312868 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 119005132 C/T 1 16 11 27 7.39944372589192 5.91288243844931 1.48656128744262 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.700334466477321 ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119004794_119005764:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119004794_119006752:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119004794_119005764:HINFP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 119043656 C/T 1 4 9 13 1.84986093147298 4.83781290418579 -2.98795197271281 T:C C T 10 0.537534767131755 0.161862439396256 ENSG00000160703:ENST00000482180:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000454811:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000449394:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000422249:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000474751:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000468765:exon_119043610_119043698:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119043610_119043698:NLRX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 119045951 C/T 1 14 14 28 6.47451326015543 7.52548673984457 -1.05097347968914 T:C C T 10 0.537534767131755 0.708746900580582 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119045162_119045983:NLRX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 119050896 C/T 1 13 16 29 6.01204802728719 8.60055627410808 -2.58850824682089 T:C C T 10 0.537534767131755 0.356879843182363 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119050402_119050997:NLRX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 18 18 36 8.32437419162841 9.67562580837159 -1.35125161674318 A:C C A 10 0.537534767131755 0.738872694606124 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 119181170 T/C 1 2 17 19 0.92493046573649 9.13809104123983 -8.21316057550334 T:C T C 10 0.537534767131755 0.000117577328369152 ENSG00000076706:ENST00000264036:exon_119181059_119181176:MCAM;ENSG00000076706:ENST00000528533:exon_119181059_119181176:MCAM;ENSG00000076706:ENST00000525586:exon_119181059_119181176:MCAM;ENSG00000076706:ENST00000392814:exon_119181059_119181176:MCAM;ENSG00000076706:ENST00000527913:exon_119181059_119181176:MCAM;ENSG00000076706:ENST00000528976:exon_119181059_119181176:MCAM HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 119206375 G/A 1 45 32 77 20.810935479071 17.2011125482162 3.60982293085487 A:G G A 10 0.537534767131755 0.426020766239019 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 120099679 G/A 1 3 9 12 1.38739569860474 4.83781290418579 -3.45041720558106 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0780478267108081 ENSG00000184232:ENST00000328965:exon_120099577_120101001:OAF;ENSG00000184232:ENST00000531220:exon_120099577_120099949:OAF HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 121448090 T/G 1 30 34 64 13.8739569860474 18.2761820824797 -4.40222509643232 T:G T G 10 0.537534767131755 0.316015182275011 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121447990_121448109:SORL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 121456962 C/T 1 27 19 46 12.4865612874426 10.2131605755033 2.27340071193927 T:C C T 10 0.537534767131755 0.55585873821522 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121456931_121457038:SORL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 121475922 T/A 1 34 38 72 15.7238179175203 20.4263211510067 -4.70250323348636 A:T T A 10 0.537534767131755 0.288410474072378 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 123600475 A/G 1 5 10 15 2.31232616434123 5.37534767131755 -3.06302150697632 A:G A G 10 0.537534767131755 0.126645309084573 ENSG00000166261:ENST00000336139:exon_123600323_123600533:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000530393:exon_123600323_123600533:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000529691:exon_123600323_123600533:ZNF202 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 124502114 C/T 1 16 16 32 7.39944372589192 8.60055627410808 -1.20111254821616 T:C C T 10 0.537534767131755 0.724666023024225 ENSG00000154144:ENST00000473629:exon_124501989_124502330:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000530731:exon_124501989_124502348:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000284290:exon_124501989_124505287:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000441174:exon_124501989_124504698:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000375005:exon_124501989_124502331:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000529543:exon_124501989_124503320:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000438907:exon_124501989_124502134:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000491010:exon_124500284_124502339:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000531033:exon_124501989_124502301:TBRG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 82 89 171 37.9221490951961 47.8405942747262 -9.9184451795301 T:C T C 10 0.537534767131755 0.144892773393359 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 17 13 30 7.86190895876017 6.98795197271281 0.873956986047352 A:T T A 10 0.537534767131755 0.85537468378439 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 125465862 T/C 1 10 14 24 4.62465232868245 7.52548673984457 -2.90083441116212 T:C T C 10 0.537534767131755 0.306252553826296 ENSG00000134910:ENST00000527606:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525652:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529886:exon_125465776_125465898:STT3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 125476252 C/G 1 40 32 72 18.4986093147298 17.2011125482162 1.29749676651364 C:G C G 10 0.537534767131755 0.813637101897296 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526213:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000527456:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525431:exon_125476105_125476360:STT3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 125484044 A/G 1 62 67 129 28.6728444378312 36.0148293978276 -7.34198495999639 A:G A G 10 0.537534767131755 0.216390597710605 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125483982_125484098:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125483982_125484098:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125483982_125484098:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525946:exon_125483579_125484098:STT3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 125488404 C/T 1 66 70 136 30.5227053693042 37.6274336992228 -7.10472832991868 T:C C T 10 0.537534767131755 0.229470427655826 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525946:exon_125488268_125488456:STT3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 25 9 34 11.5616308217061 4.83781290418579 6.72381791752033 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0244324190985559 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 8 14 22 3.69972186294596 7.52548673984457 -3.82576487689861 A:C C A 10 0.537534767131755 0.133605422521882 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 125766173 A/C 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 A:C A C 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 125766204 G/C 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 C:G G C 10 0.537534767131755 0.241009480668847 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 125769354 T/C 1 9 16 25 4.16218709581421 8.60055627410808 -4.43836917829387 T:C T C 10 0.537534767131755 0.106790655888092 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 100 102 202 46.2465232868245 54.828546247439 -8.5820229606145 T:C T C 10 0.537534767131755 0.23098084848042 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 129754644 A/G 1 13 10 23 6.01204802728719 5.37534767131755 0.636700355969636 A:G A G 10 0.537534767131755 0.837163996404797 ENSG00000170322:ENST00000304521:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000446488:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524794:exon_129754640_129754777:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524746:exon_129754640_129754741:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000531755:exon_129754640_129754777:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000530278:exon_129754639_129754777:NFRKB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 130010313 G/A 1 13 9 22 6.01204802728719 4.83781290418579 1.17423512310139 A:G G A 10 0.537534767131755 0.67355127074083 ENSG00000084234:ENST00000533616:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000528499:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000263574:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000345598:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000338167:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000278756:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000533860:exon_130010293_130010378:APLP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 11 130784843 T/A 1 15 6 21 6.93697849302368 3.22520860279053 3.71176989023315 A:T T A 10 0.537534767131755 0.126762028126778 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 60 42 102 27.7479139720947 22.5764602195337 5.17145375256099 A:G G A 10 0.537534767131755 0.321927493854721 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 3788188 C/T 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 T:C C T 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3788081_3788264:EFCAB4B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 3788222 G/A 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3788081_3788264:EFCAB4B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 3789452 C/T 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3789404_3789515:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3789404_3789515:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3789404_3789515:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3789404_3789515:EFCAB4B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 3806147 T/C 1 8 8 16 3.69972186294596 4.30027813705404 -0.600556274108079 T:C T C 10 0.537534767131755 0.806072821048815 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3805938_3806201:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3805938_3806201:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3805938_3806201:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3805938_3806201:EFCAB4B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 18 21 39 8.32437419162841 11.2882301097669 -2.96385591813844 A:G G A 10 0.537534767131755 0.422393901428919 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 4461485 G/A 1 20 10 30 9.2493046573649 5.37534767131755 3.87395698604735 A:G G A 10 0.537534767131755 0.199794757676518 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4461426_4469188:C12orf5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 4716513 C/T 1 8 15 23 3.69972186294596 8.06302150697632 -4.36329964403036 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0926796024565271 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4716493_4716553:DYRK4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 154 164 318 71.2196458617097 88.1557018096078 -16.9360559478981 T:G G T 10 0.537534767131755 0.063320148006529 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 6782451 G/A 1 41 38 79 18.961074547598 20.4263211510067 -1.46524660340864 A:G G A 10 0.537534767131755 0.736832198349312 ENSG00000126746:ENST00000355772:exon_6782382_6782606:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000319770:exon_6782382_6782606:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000361959:exon_6782382_6782606:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396795:exon_6782382_6782606:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000436774:exon_6782382_6782606:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396799:exon_6782382_6782606:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000417772:exon_6782382_6782606:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396801:exon_6782382_6782606:ZNF384 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 44 45 89 20.3484702462028 24.189064520929 -3.84059427472619 A:G G A 10 0.537534767131755 0.457168880467265 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 7047143 C/A 1 34 28 62 15.7238179175203 15.0509734796891 0.672844437831193 A:T:C C A 10 0.537534767131755 0.899218248958223 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7047008_7047230:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7047008_7047230:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000229279:exon_7047008_7047230:ATN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 9833524 C/G 1 46 49 95 21.2734007119393 26.339203589456 -5.06580287751672 C:G C G 10 0.537534767131755 0.305218501896321 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 106 103 209 49.021314684034 55.3660810145708 -6.34476633053679 T:C C T 10 0.537534767131755 0.405305702799144 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 10854625 G/A 1 334 372 706 154.463387777994 199.962933373013 -45.499545595019 A:G G A 10 0.537534767131755 0.000671538111347719 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10854559_10854733:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10854559_10854733:CSDA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 11992168 G/A 1 14 13 27 6.47451326015543 6.98795197271281 -0.513438712557384 A:G G A 10 0.537534767131755 0.849618756712184 ENSG00000139083:ENST00000266427:exon_11992074_11992238:ETV6;ENSG00000139083:ENST00000396373:exon_11992074_11992238:ETV6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 14927825 C/G 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 C:G C G 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000111332:ENST00000389078:exon_14927349_14927957:H2AFJ HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 16189694 T/A 1 8 18 26 3.69972186294596 9.67562580837159 -5.97590394542563 A:T T A 10 0.537534767131755 0.0284972590280339 ENSG00000023697:ENST00000428559:exon_16189624_16190220:DERA;ENSG00000023697:ENST00000526530:exon_16189624_16190214:DERA;ENSG00000023697:ENST00000025429:exon_16189624_16190209:DERA;ENSG00000023697:ENST00000530274:exon_16189624_16189747:DERA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 21654831 G/T 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 T:G G T 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000111711:ENST00000229314:exon_21654699_21654882:GOLT1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 19 26 45 8.78683942449666 13.9759039454256 -5.18906452092897 T:C C T 10 0.537534767131755 0.13561238085745 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 22680711 T/C 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 T:C T C 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000111731:ENST00000333957:exon_22680655_22680826:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000446597:exon_22680655_22680826:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000396028:exon_22680655_22680826:KIAA0528 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 22814023 A/G 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 ENSG00000139163:ENST00000381409:exon_22813997_22814139:ETNK1;ENSG00000139163:ENST00000266517:exon_22813997_22814139:ETNK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 26784850 G/A 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26784799_26784992:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26784799_26784992:ITPR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 26809316 G/A 1 15 10 25 6.93697849302368 5.37534767131755 1.56163082170613 A:G G A 10 0.537534767131755 0.555250283480734 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26809230_26809481:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26809230_26809481:ITPR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 26810777 T/C 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 T:C T C 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26810640_26810825:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26810640_26810825:ITPR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 26810816 T/G 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 T:G T G 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26810640_26810825:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26810640_26810825:ITPR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 27064232 C/T 1 63 49 112 29.1353096706994 26.339203589456 2.79610608124344 T:C C T 10 0.537534767131755 0.63618435487861 ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27064111_27064250:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27064111_27064250:C12orf11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 27143508 G/A 1 24 23 47 11.0991655888379 12.3632996440304 -1.26413405519248 A:G G A 10 0.537534767131755 0.770600413711711 ENSG00000064115:ENST00000343028:exon_27143383_27143560:TM7SF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 27800769 G/A 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000110841:ENST00000318304:exon_27800662_27800775:PPFIBP1;ENSG00000110841:ENST00000228425:exon_27800662_27800775:PPFIBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 28605426 G/A 1 23 23 46 10.6367003559696 12.3632996440304 -1.72659928806073 A:G G A 10 0.537534767131755 0.65860138354317 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28605411_28605587:CCDC91 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 30823971 A/G 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000133704:ENST00000256079:exon_30823896_30824030:IPO8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 30881809 T/C 1 9 14 23 4.16218709581421 7.52548673984457 -3.36329964403036 T:C T C 10 0.537534767131755 0.209243218264062 ENSG00000110888:ENST00000298892:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000251071:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000433722:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000308433:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000438006:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000454014:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000417045:exon_30881582_30882259:CAPRIN2;ENSG00000110888:ENST00000395805:exon_30881582_30882259:CAPRIN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 31249861 C/G 1 25 28 53 11.5616308217061 15.0509734796891 -3.48934265798301 C:G C G 10 0.537534767131755 0.339248997526732 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31249793_31249924:DDX11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 31253995 C/T 1 25 19 44 11.5616308217061 10.2131605755033 1.34847024620278 T:C C T 10 0.537534767131755 0.763143132347552 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31253961_31254064:DDX11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 31254752 C/T 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 0.484098982011234 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 31255405 C/T 1 33 24 57 15.2613526846521 12.9008344111621 2.36051827348997 T:C C T 10 0.537534767131755 0.595978705381566 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31255361_31255461:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31255361_31255461:DDX11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 32134240 C/T 1 23 23 46 10.6367003559696 12.3632996440304 -1.72659928806073 T:C C T 10 0.537534767131755 0.65860138354317 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 32134638 T/C 1 19 30 49 8.78683942449666 16.1260430139526 -7.33920358945599 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0440317927125019 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 32134943 A/G 1 17 13 30 7.86190895876017 6.98795197271281 0.873956986047352 A:G A G 10 0.537534767131755 0.85537468378439 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 32137447 C/T 1 30 36 66 13.8739569860474 19.3512516167432 -5.47729463069583 T:C C T 10 0.537534767131755 0.216742806859828 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 32137512 C/G 1 27 25 52 12.4865612874426 13.4383691782939 -0.951807890851258 C:G C G 10 0.537534767131755 0.889570859481929 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 40716260 T/C 1 3 7 10 1.38739569860474 3.76274336992228 -2.37534767131755 T:C T C 10 0.537534767131755 0.203605394966440 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40716121_40716312:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40716121_40716312:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40716121_40716312:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40716121_40716312:LRRK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 40742254 G/A 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40742211_40742311:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40742211_40742311:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40742211_40742311:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40742211_40742311:LRRK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 40758652 T/C 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40758644_40763087:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40758644_40758935:LRRK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 42554505 A/G 1 27 19 46 12.4865612874426 10.2131605755033 2.27340071193927 A:G A G 10 0.537534767131755 0.55585873821522 ENSG00000015153:ENST00000327791:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000380790:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000442791:exon_42552837_42554628:YAF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 44148773 A/C 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 A:C A C 10 0.537534767131755 0.760762761058777 ENSG00000129317:ENST00000416848:exon_44148139_44149064:PUS7L;ENSG00000129317:ENST00000344862:exon_44148139_44149064:PUS7L;ENSG00000129317:ENST00000431332:exon_44148139_44149064:PUS7L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 46321144 G/T 1 35 36 71 16.1862831503886 19.3512516167432 -3.1649684663546 T:G G T 10 0.537534767131755 0.476571457891615 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 46321146 T/G 1 32 35 67 14.7988874517838 18.8137168496114 -4.01482939782758 T:G T G 10 0.537534767131755 0.330094774632867 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 27 25 52 12.4865612874426 13.4383691782939 -0.951807890851258 A:T A T 10 0.537534767131755 0.889570859481929 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 48238757 A/G 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000111424:ENST00000395324:exon_48235322_48238788:VDR;ENSG00000111424:ENST00000229022:exon_48235322_48238788:VDR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 16 18 34 7.39944372589192 9.67562580837159 -2.27618208247967 T:C C T 10 0.537534767131755 0.492998675593706 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 48526659 G/A 1 43 44 87 19.8860050133345 23.6515297537972 -3.76552474046268 A:G G A 10 0.537534767131755 0.452305230977496 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48526651_48526840:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48526651_48526840:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48526651_48526840:PFKM HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 48543584 G/C 1 32 29 61 14.7988874517838 15.5885082468209 -0.789620795037052 C:G G C 10 0.537534767131755 0.898068334777582 ENSG00000177981:ENST00000317697:exon_48541574_48543781:ASB8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 48736830 G/A 1 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 0.155642553042637 ENSG00000167528:ENST00000301042:exon_48733911_48737510:ZNF641;ENSG00000167528:ENST00000448928:exon_48733911_48737510:ZNF641 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 49390677 T/C 1 10 6 16 4.62465232868245 3.22520860279053 1.39944372589192 T:C T C 10 0.537534767131755 0.618373054653884 ENSG00000181418:ENST00000421952:exon_49388932_49392449:DDN;ENSG00000181418:ENST00000313194:exon_49388933_49392449:DDN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 49425978 T/C 1 19 17 36 8.78683942449666 9.13809104123983 -0.351251616743179 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49424958_49427747:MLL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 49434074 C/A 1 17 14 31 7.86190895876017 7.52548673984457 0.336422218915597 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49433507_49435318:MLL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 49445028 G/A 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 A:G G A 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49444669_49446207:MLL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 49952668 G/A 1 56 34 90 25.8980530406217 18.2761820824797 7.62187095814205 A:G G A 10 0.537534767131755 0.113505398397501 ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49952626_49952753:MCRS1;ENSG00000187778:ENST00000357123:exon_49952626_49952753:MCRS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 49960551 C/A 1 40 23 63 18.4986093147298 12.3632996440304 6.13530967069944 A:C C A 10 0.537534767131755 0.130530770932300 ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49960505_49960624:MCRS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 49993678 C/T 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000135436:ENST00000533372:exon_49993252_49994917:FAM186B;ENSG00000135436:ENST00000532262:exon_49993252_49994261:FAM186B;ENSG00000135436:ENST00000257894:exon_49993252_49994917:FAM186B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 50152193 G/A 1 202 153 355 93.4179770393855 82.2428193711585 11.175157668227 A:G G A 10 0.537534767131755 0.241895925553481 ENSG00000139644:ENST00000267115:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000395006:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000423828:exon_50152166_50152263:TMBIM6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 50189807 C/A 1 11 11 22 5.08711756155069 5.91288243844931 -0.82576487689861 A:C C A 10 0.537534767131755 0.831602284580484 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 50189834 T/G 1 12 11 23 5.54958279441894 5.91288243844931 -0.363299644030365 T:G T G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 50393456 C/T 1 27 19 46 12.4865612874426 10.2131605755033 2.27340071193927 T:C C T 10 0.537534767131755 0.55585873821522 ENSG00000161800:ENST00000454520:exon_50393399_50393516:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000434422:exon_50393399_50393516:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000427314:exon_50393399_50393516:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000312377:exon_50393399_50393516:RACGAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 51442944 G/A 1 29 13 42 13.4114917531791 6.98795197271281 6.42353978046629 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0620749639180222 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51442817_51442968:LETMD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 52448157 G/A 1 25 34 59 11.5616308217061 18.2761820824797 -6.71455126077354 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0896668571078602 ENSG00000123358:ENST00000360284:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000478250:exon_52448111_52449745:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394825:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000243050:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394824:exon_52448111_52448988:NR4A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 53581383 G/T 1 6 12 18 2.77479139720947 6.45041720558106 -3.67562580837159 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0991754162193756 ENSG00000139651:ENST00000416904:exon_53581285_53584654:ZNF740;ENSG00000139651:ENST00000267122:exon_53581285_53584654:ZNF740 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 53586536 C/T 1 205 160 365 94.8053727379902 86.0055627410808 8.79980999690943 T:C C T 10 0.537534767131755 0.372367985614263 ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53586475_53586694:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53586475_53586694:ITGB7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 53605496 C/T 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 T:C C T 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000172819:ENST00000425354:exon_53604354_53605647:RARG;ENSG00000172819:ENST00000327550:exon_53604354_53605647:RARG;ENSG00000172819:ENST00000394426:exon_53604354_53605647:RARG;ENSG00000172819:ENST00000338561:exon_53604354_53605647:RARG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 35 31 66 16.1862831503886 16.6635777810844 -0.477294630695827 T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.902571107688407 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 53682986 C/T 1 29 36 65 13.4114917531791 19.3512516167432 -5.93975986356407 T:C C T 10 0.537534767131755 0.170774481683783 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682874_53683087:ESPL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 54109659 C/T 1 12 15 27 5.54958279441894 8.06302150697632 -2.51343871255738 T:C C T 10 0.537534767131755 0.342209914399933 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 15 25 40 6.93697849302368 13.4383691782939 -6.5013906852702 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0556814771656535 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 54110197 A/G 1 20 15 35 9.2493046573649 8.06302150697632 1.18628315038858 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.736906280800669 ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54110044_54110199:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54110044_54110199:CALCOCO1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 19 8 27 8.78683942449666 4.30027813705404 4.48656128744262 T:C T C 10 0.537534767131755 0.120983959944011 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 42 40 82 19.4235397804663 21.5013906852702 -2.07785090480391 A:G A G 10 0.537534767131755 0.659208180693845 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 54675113 G/A 1 35 21 56 16.1862831503886 11.2882301097669 4.89805304062172 A:G G A 10 0.537534767131755 0.227713284794524 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 54911426 C/T 1 57 61 118 26.36051827349 32.7896207950371 -6.42910252154709 T:C C T 10 0.537534767131755 0.267878026333002 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54911317_54911426:NCKAP1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 55806134 T/C 0 23 0 23 10.6367003559696 0 10.6367003559696 T T 10 0.537534767131755 1.17933220127446e-06 ENSG00000179899:ENST00000326184:exon_55805506_55808295:PHC1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 55806238 A/G 0 8 0 8 3.69972186294596 0 3.69972186294596 A A 10 0.537534767131755 0.00906265828433196 ENSG00000179899:ENST00000326184:exon_55805506_55808295:PHC1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 56151291 T/C 1 26 32 58 12.0240960545744 17.2011125482162 -5.17701649364179 T:C T C 10 0.537534767131755 0.188880432759332 ENSG00000205323:ENST00000444631:exon_56151167_56151337:SARNP;ENSG00000205323:ENST00000336133:exon_56151058_56151337:SARNP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 56334185 A/G 1 18 17 35 8.32437419162841 9.13809104123983 -0.813716849611422 A:G A G 10 0.537534767131755 0.865875387186721 ENSG00000065357:ENST00000331886:exon_56334098_56334217:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394145:exon_56334098_56334217:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394147:exon_56334098_56334217:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000402956:exon_56334098_56334217:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000415755:exon_56334098_56334418:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000412897:exon_56334098_56334217:DGKA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 56360876 G/A 1 86 106 192 39.7720100266691 56.978685315966 -17.206675289297 A:G G A 10 0.537534767131755 0.01376583925811 ENSG00000123374:ENST00000266970:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000440311:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000354056:exon_56360556_56360908:CDK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 56398454 G/C 1 17 8 25 7.86190895876017 4.30027813705404 3.56163082170613 C:G G C 10 0.537534767131755 0.165892476302183 ENSG00000139531:ENST00000266971:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394115:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000356124:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394109:exon_56397402_56399309:SUOX HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 56435920 C/G 1 10 5 15 4.62465232868245 2.68767383565877 1.93697849302368 C:G C G 10 0.537534767131755 0.43901451829475 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 56435929 C/G 1 5 10 15 2.31232616434123 5.37534767131755 -3.06302150697632 C:G C G 10 0.537534767131755 0.126645309084573 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 56510637 A/G 1 143 93 236 66.132528300159 49.9907333432532 16.1417949569058 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0366755520963809 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 56531154 T/C 1 71 65 136 32.8350315336454 34.9397598635641 -2.10472832991867 T:C T C 10 0.537534767131755 0.731498725057013 ENSG00000139641:ENST00000394048:exon_56531002_56531157:ESYT1;ENSG00000139641:ENST00000267113:exon_56531002_56531157:ESYT1;ENSG00000139641:ENST00000402331:exon_56531002_56531157:ESYT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 56994855 C/T 1 81 78 159 37.4596838623279 41.9277118362769 -4.46802797394903 T:C C T 10 0.537534767131755 0.52474836679079 ENSG00000076108:ENST00000379441:exon_56994727_56994882:BAZ2A;ENSG00000076108:ENST00000179765:exon_56994727_56994882:BAZ2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 57004268 G/A 1 27 41 68 12.4865612874426 22.038925452402 -9.55236416495934 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0210288298737955 ENSG00000076108:ENST00000379441:exon_57004193_57004301:BAZ2A;ENSG00000076108:ENST00000179765:exon_57004193_57004301:BAZ2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 57648644 C/T 1 32 39 71 14.7988874517838 20.9638559181384 -6.1649684663546 T:C C T 10 0.537534767131755 0.153947146937560 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57647547_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57647547_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57647547_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57647548_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57647548_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57647563_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57648556_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57648556_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57648556_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57648556_57648896:R3HDM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 57648772 C/A 1 23 20 43 10.6367003559696 10.7506953426351 -0.113994986665464 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57647547_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57647547_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57647547_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57647548_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57647548_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57647563_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57648556_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57648556_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57648556_57648896:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57648556_57648896:R3HDM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 57867885 G/A 1 62 64 126 28.6728444378312 34.4022250964323 -5.72938065860113 A:G G A 10 0.537534767131755 0.326208426879313 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57867825_57867959:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57867825_57867959:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57867825_57867959:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57867825_57867959:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57867825_57867959:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57867825_57867959:ARHGAP9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 90 98 188 41.6218709581421 52.678407178912 -11.0565362207699 A:C:G A C 10 0.537534767131755 0.108075602846139 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 57985204 C/T 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000166908:ENST00000422156:exon_57985073_57985246:PIP4K2C;ENSG00000166908:ENST00000354947:exon_57985073_57985246:PIP4K2C;ENSG00000166908:ENST00000436866:exon_57985073_57985246:PIP4K2C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 275 304 579 127.177939038767 163.410569208054 -36.2326301692861 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00267373843535594 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 58126234 C/A 1 11 9 20 5.08711756155069 4.83781290418579 0.249304657364901 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000135439:ENST00000257897:exon_58126186_58126295:AGAP2;ENSG00000135439:ENST00000328568:exon_58126186_58126295:AGAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 28 30 58 12.9490265203109 16.1260430139526 -3.17701649364179 A:G A G 10 0.537534767131755 0.431098929989536 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 62696599 C/T 1 18 13 31 8.32437419162841 6.98795197271281 1.3364222189156 T:C C T 10 0.537534767131755 0.720009446141645 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000312635:exon_62696571_62696701:USP15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 62926398 G/A 1 14 9 23 6.47451326015543 4.83781290418579 1.63670035596964 A:G G A 10 0.537534767131755 0.536918781286691 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62926218_62926450:MON2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 62928633 G/A 1 7 10 17 3.23725663007772 5.37534767131755 -2.13809104123983 A:G G A 10 0.537534767131755 0.337166426523694 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62928625_62928706:MON2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 62959137 A/G 1 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 0.155642553042637 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62959017_62959160:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62959017_62959160:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62959017_62959160:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62959017_62959160:MON2;ENSG00000061987:ENST00000261188:exon_62959017_62959160:MON2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 64803798 A/C 1 44 29 73 20.3484702462028 15.5885082468209 4.75996199938189 A:C A C 10 0.537534767131755 0.291662762972591 ENSG00000184575:ENST00000332707:exon_64803742_64803875:XPOT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 8 15 23 3.69972186294596 8.06302150697632 -4.36329964403036 A:T T A 10 0.537534767131755 0.0926796024565271 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 66725160 C/T 1 16 6 22 7.39944372589192 3.22520860279053 4.17423512310139 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0879809941679776 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 68707287 G/A 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68707223_68707332:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68707223_68707332:MDM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 68708761 C/T 1 14 12 26 6.47451326015543 6.45041720558106 0.0240960545743709 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68708728_68709045:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68708728_68709045:MDM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 68720627 G/A 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68720437_68720801:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68720437_68720801:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000430606:exon_68718787_68720801:MDM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 69082805 G/A 1 6 12 18 2.77479139720947 6.45041720558106 -3.67562580837159 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0991754162193756 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69082742_69082833:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69082742_69082833:NUP107 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 69115698 G/A 1 9 15 24 4.16218709581421 8.06302150697632 -3.90083441116212 A:G G A 10 0.537534767131755 0.150631669869192 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69115621_69115766:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69115621_69115766:NUP107 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 46 50 96 21.2734007119393 26.8767383565877 -5.60333764464848 A:G G A 10 0.537534767131755 0.261508392959075 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 72164395 C/T 1 13 26 39 6.01204802728719 13.9759039454256 -7.96385591813844 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0149205484093465 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 77419341 A/T 1 8 10 18 3.69972186294596 5.37534767131755 -1.67562580837159 A:T A T 10 0.537534767131755 0.483452727703955 ENSG00000165891:ENST00000322886:exon_77419338_77419762:E2F7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 77419593 A/G 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 A:G A G 10 0.537534767131755 0.190750883746296 ENSG00000165891:ENST00000322886:exon_77419338_77419762:E2F7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 80014907 A/C,T 0 0 14 14 0 7.52548673984457 -7.52548673984457 T:C A C 10 0.537534767131755 2.04695005348829e-05 ENSG00000177425:ENST00000328827:exon_80014856_80014987:PAWR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 46 26 72 21.2734007119393 13.9759039454256 7.29749676651364 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0977193742773687 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 94642023 C/T 1 12 14 26 5.54958279441894 7.52548673984457 -1.97590394542563 T:C C T 10 0.537534767131755 0.440566012205601 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94642003_94642188:PLXNC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 94645255 A/G 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94645202_94645304:PLXNC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 94772742 C/T 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 T:C C T 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94772567_94772818:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94772567_94772818:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397807:exon_94772567_94772818:CCDC41 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 94975900 G/A 1 16 19 35 7.39944372589192 10.2131605755033 -2.81371684961142 A:G G A 10 0.537534767131755 0.397687197999873 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 94976159 T/C 1 15 15 30 6.93697849302368 8.06302150697632 -1.12604301395265 T:C T C 10 0.537534767131755 0.716938089677859 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 96676330 C/A 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000059758:ENST00000261211:exon_96676287_96676377:CDK17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 100708367 C/T 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 T:C C T 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000136021:ENST00000360820:exon_100708267_100708392:SCYL2;ENSG00000136021:ENST00000258506:exon_100708267_100708392:SCYL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 101732655 C/T 1 6 8 14 2.77479139720947 4.30027813705404 -1.52548673984457 T:C C T 10 0.537534767131755 0.435196015554607 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101732591_101732735:UTP20 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 102158763 T/C 1 24 20 44 11.0991655888379 10.7506953426351 0.348470246202782 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000111670:ENST00000299314:exon_102157980_102159082:GNPTAB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 102455729 G/A 1 38 13 51 17.5736788489933 6.98795197271281 10.5857268762805 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00293668767721518 ENSG00000120860:ENST00000240079:exon_102455690_102455899:CCDC53 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 104851112 T/C 1 86 74 160 39.7720100266691 39.7775727677499 -0.00556274108079435 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000171310:ENST00000303694:exon_104851048_104851307:CHST11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 105380152 A/C 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 A:C A C 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 105550565 C/T 1 12 2 14 5.54958279441894 1.07506953426351 4.47451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0163896060017328 ENSG00000136051:ENST00000332180:exon_105550504_105550570:KIAA1033 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 108912521 C/T 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 T:C C T 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000198855:ENST00000361549:exon_108912177_108913380:FICD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 109520769 A/G 1 13 10 23 6.01204802728719 5.37534767131755 0.636700355969636 A:G A G 10 0.537534767131755 0.837163996404797 ENSG00000135093:ENST00000392784:exon_109520648_109520867:USP30;ENSG00000135093:ENST00000377883:exon_109520648_109520867:USP30;ENSG00000135093:ENST00000257548:exon_109520648_109520867:USP30;ENSG00000135093:ENST00000479219:exon_109520648_109520867:USP30;ENSG00000135093:ENST00000491362:exon_109520500_109520867:USP30 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 109894028 A/G 1 14 14 28 6.47451326015543 7.52548673984457 -1.05097347968914 A:G A G 10 0.537534767131755 0.708746900580582 ENSG00000110906:ENST00000228495:exon_109893923_109894118:KCTD10;ENSG00000110906:ENST00000440541:exon_109893923_109894049:KCTD10;ENSG00000110906:ENST00000424763:exon_109893923_109894171:KCTD10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 45 28 73 20.810935479071 15.0509734796891 5.75996199938189 A:T A T 10 0.537534767131755 0.197136813390048 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 110019338 C/T 1 32 14 46 14.7988874517838 7.52548673984457 7.27340071193927 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0376440777646012 ENSG00000110921:ENST00000392727:exon_110019200_110019355:MVK;ENSG00000110921:ENST00000447878:exon_110019200_110019355:MVK;ENSG00000110921:ENST00000228510:exon_110019200_110019355:MVK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 110340852 G/A 1 10 11 21 4.62465232868245 5.91288243844931 -1.28823010976685 A:G G A 10 0.537534767131755 0.663607311505883 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110340832_110341019:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110340832_110341019:TCHP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 110341933 A/G 1 17 8 25 7.86190895876017 4.30027813705404 3.56163082170613 A:G A G 10 0.537534767131755 0.165892476302183 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110341742_110341952:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110341742_110341952:TCHP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 110456175 A/G 1 17 25 42 7.86190895876017 13.4383691782939 -5.57646021953371 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0902492390766182 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110456150_110456293:ANKRD13A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 110974890 T/C 1 32 21 53 14.7988874517838 11.2882301097669 3.51065734201699 T:C T C 10 0.537534767131755 0.408764131660531 ENSG00000196850:ENST00000354300:exon_110972237_110974900:PPTC7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 112471090 G/T 1 12 5 17 5.54958279441894 2.68767383565877 2.86190895876017 T:G G T 10 0.537534767131755 0.224313779580088 ENSG00000111300:ENST00000261745:exon_112471037_112471183:NAA25 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 112580071 C/T 1 36 39 75 16.6487483832568 20.9638559181384 -4.31510753488162 T:C C T 10 0.537534767131755 0.354643268380814 ENSG00000135148:ENST00000257604:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000412615:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000432758:exon_112579893_112580099:TRAFD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 410 348 758 189.61074547598 187.062098961851 2.54864651412973 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.855592172237985 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 113424893 C/G 1 112 101 213 51.7961060812434 54.2910114803073 -2.49490539906381 C:G C G 10 0.537534767131755 0.731796331540886 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 114261053 G/A 1 35 21 56 16.1862831503886 11.2882301097669 4.89805304062172 A:G G A 10 0.537534767131755 0.227713284794524 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114259863_114261126:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114261014_114261126:RBM19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 114377885 G/C 1 23 28 51 10.6367003559696 15.0509734796891 -4.4142731237195 C:G G C 10 0.537534767131755 0.261138141377190 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 116421119 C/T 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 T:C C T 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000123066:ENST00000281928:exon_116420922_116421345:MED13L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 117465981 T/C 1 10 20 30 4.62465232868245 10.7506953426351 -6.12604301395265 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0279811984198652 ENSG00000174989:ENST00000309909:exon_117465833_117468953:FBXW8;ENSG00000174989:ENST00000455858:exon_117465833_117468953:FBXW8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 120171995 T/C 1 20 13 33 9.2493046573649 6.98795197271281 2.26135268465209 T:C T C 10 0.537534767131755 0.487509641879293 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120171969_120172162:CIT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 120189879 A/G 1 17 10 27 7.86190895876017 5.37534767131755 2.48656128744262 A:G A G 10 0.537534767131755 0.440804629998576 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120189855_120190052:CIT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 120189888 T/C 1 14 9 23 6.47451326015543 4.83781290418579 1.63670035596964 T:C T C 10 0.537534767131755 0.536918781286691 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120189855_120190052:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120189855_120190052:CIT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 120535169 G/A 1 178 183 361 82.3188114505476 98.3688623851112 -16.0500509345635 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.0914454600362083 ENSG00000111737:ENST00000432953:exon_120532899_120535177:RAB35;ENSG00000111737:ENST00000229340:exon_120532906_120535177:RAB35 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 120649838 A/G 1 52 38 90 24.0481921091487 20.4263211510067 3.62187095814205 A:G A G 10 0.537534767131755 0.461182015963143 ENSG00000089159:ENST00000424649:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000228307:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000267257:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000458477:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000397506:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000323871:exon_120648254_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000440827:exon_120649695_120649883:PXN;ENSG00000089159:ENST00000331257:exon_120649695_120649842:PXN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 120960057 C/T 1 16 24 40 7.39944372589192 12.9008344111621 -5.5013906852702 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0836534363924484 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120960017_120960166:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120960017_120960166:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120960017_120960166:COQ5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 121442199 T/A 1 22 11 33 10.1742351231014 5.91288243844931 4.26135268465208 A:T T A 10 0.537534767131755 0.163167276617690 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 8 26 34 3.69972186294596 13.9759039454256 -10.2761820824797 A:G G A 10 0.537534767131755 0.000437231017287338 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 121600253 T/C 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 T:C T C 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000089041:ENST00000261826:exon_121600227_121600323:P2RX7;ENSG00000089041:ENST00000443520:exon_121600227_121600323:P2RX7;ENSG00000089041:ENST00000377162:exon_121600227_121600323:P2RX7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 121622563 G/A 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000089041:ENST00000261826:exon_121622108_121623856:P2RX7;ENSG00000089041:ENST00000328963:exon_121622108_121623856:P2RX7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 23 29 52 10.6367003559696 15.5885082468209 -4.95180789085126 T:C T C 10 0.537534767131755 0.210306766298917 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 121712077 T/A 1 29 19 48 13.4114917531791 10.2131605755033 3.19833117767576 A:T T A 10 0.537534767131755 0.387494600064193 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121711859_121712388:CAMKK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 79 92 171 36.5347533965914 49.4531985761215 -12.9184451795301 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0549119790818953 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 111 116 227 51.3336408483752 62.3540329872836 -11.0203921389084 A:G G A 10 0.537534767131755 0.143712963433274 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 123 92 215 56.8832236427941 49.4531985761215 7.43002506667268 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.338371652340316 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 127 99 226 58.7330845742671 53.2159419460437 5.51714262822338 T:C C T 10 0.537534767131755 0.50481113898954 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 117 122 239 54.1084322455847 65.5792415900741 -11.4708093444894 T:C T C 10 0.537534767131755 0.153402667372899 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 122186268 C/T 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 T:C C T 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000188735:ENST00000449592:exon_122186232_122186348:TMEM120B;ENSG00000188735:ENST00000342607:exon_122186232_122186348:TMEM120B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 122186317 G/A 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 A:G G A 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000188735:ENST00000449592:exon_122186232_122186348:TMEM120B;ENSG00000188735:ENST00000342607:exon_122186232_122186348:TMEM120B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 122497001 T/C 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000110987:ENST00000261822:exon_122496998_122499950:BCL7A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 122623000 T/C 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 T:C T C 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122622971_122623098:MLXIP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 15 10 25 6.93697849302368 5.37534767131755 1.56163082170613 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.555250283480734 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 123645803 G/A 1 10 8 18 4.62465232868245 4.30027813705404 0.324374191628411 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 123738265 G/A 1 18 28 46 8.32437419162841 15.0509734796891 -6.72659928806073 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0542254476297257 ENSG00000130921:ENST00000253233:exon_123738194_123738503:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000425637:exon_123738194_123739580:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000366329:exon_123738194_123738503:C12orf65 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 123799974 A/G 1 13 5 18 6.01204802728719 2.68767383565877 3.32437419162841 A:G A G 10 0.537534767131755 0.155872428250262 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 123806219 C/T 1 12 14 26 5.54958279441894 7.52548673984457 -1.97590394542563 T:C C T 10 0.537534767131755 0.440566012205601 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123806082_123806279:SBNO1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 16 22 38 7.39944372589192 11.8257648768986 -4.42632115100669 A:G G A 10 0.537534767131755 0.192498536355526 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 123825559 C/T 1 8 5 13 3.69972186294596 2.68767383565877 1.01204802728719 T:C C T 10 0.537534767131755 0.782310374824685 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123825535_123825635:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123825535_123825635:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123825535_123825635:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123825535_123825635:SBNO1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 124104551 A/G 1 29 30 59 13.4114917531791 16.1260430139526 -2.71455126077354 A:G A G 10 0.537534767131755 0.515144417722252 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 124496864 T/G 0 25 0 25 11.5616308217061 0 11.5616308217061 T T 10 0.537534767131755 3.09371230034442e-07 ENSG00000179195:ENST00000337815:exon_124496093_124499951:ZNF664;ENSG00000179195:ENST00000392404:exon_124496093_124499965:ZNF664 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 124826598 T/C 1 64 96 160 29.5977749035677 51.6033376446485 -22.0055627410808 T:C T C 10 0.537534767131755 0.000607875714247567 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 124829234 C/T 1 102 66 168 47.171453752561 35.4772946306958 11.6941591218652 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0751603539609641 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124829143_124829497:NCOR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 124829255 A/G 1 96 54 150 44.3966623553515 29.0268774251148 15.3697849302368 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0137715679812367 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124829143_124829497:NCOR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 124856660 T/A 1 49 60 109 22.660796410544 32.2520860279053 -9.59128961736129 A:T T A 10 0.537534767131755 0.0683680889358903 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 125298877 G/A 1 88 67 155 40.6969404924056 36.0148293978276 4.68211109457798 A:G G A 10 0.537534767131755 0.469297393058919 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125298748_125298951:SCARB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 125398039 G/C 1 1501 1770 3271 694.160314535236 951.436537823206 -257.276223287971 A:T:C:G G C 10 0.537534767131755 2.34627879391577e-19 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 125434716 G/A 1 41 24 65 18.961074547598 12.9008344111621 6.06024013643593 A:G G A 10 0.537534767131755 0.137363156295055 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434695_125434789:DHX37 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 125448960 C/T 1 56 36 92 25.8980530406217 19.3512516167432 6.54680142387855 T:C C T 10 0.537534767131755 0.175814116051226 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 125587278 G/A 1 18 18 36 8.32437419162841 9.67562580837159 -1.35125161674318 A:G G A 10 0.537534767131755 0.738872694606124 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125587225_125587339:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125587225_125587339:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125587225_125587339:AACS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 125626685 C/T 1 40 51 91 18.4986093147298 27.4142731237195 -8.9156638089897 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0733732555584214 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125626638_125627871:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125626638_125627861:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125626638_125627861:AACS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 56 89 145 25.8980530406217 47.8405942747262 -21.9425412341045 A:G A G 10 0.537534767131755 0.000312622170522315 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 98 59 157 45.321592821088 31.7145512607735 13.6070415603145 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0306674023305903 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 130884347 A/G 0 0 8 8 0 4.30027813705404 -4.30027813705404 G A G 10 0.537534767131755 0.00209234218822997 ENSG00000060709:ENST00000261655:exon_130884224_130884358:RIMBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 130912757 C/T 1 2 16 18 0.92493046573649 8.60055627410808 -7.67562580837159 T:C C T 10 0.537534767131755 0.000228103902922197 ENSG00000060709:ENST00000261655:exon_130912724_130912882:RIMBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 130921471 T/C 1 29 1 30 13.4114917531791 0.537534767131755 12.8739569860474 T:C T C 10 0.537534767131755 2.74906529965498e-07 ENSG00000060709:ENST00000261655:exon_130921387_130921836:RIMBP2;ENSG00000060709:ENST00000392375:exon_130921387_130921836:RIMBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 130935796 C/G 0 0 12 12 0 6.45041720558106 -6.45041720558106 G C G 10 0.537534767131755 9.57081822328867e-05 ENSG00000060709:ENST00000261655:exon_130935740_130935885:RIMBP2;ENSG00000060709:ENST00000392375:exon_130935740_130935885:RIMBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 132250831 A/C 1 53 38 91 24.510657342017 20.4263211510067 4.0843361910103 A:C A C 10 0.537534767131755 0.402517114443712 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132250663_132250853:SFSWAP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 132326298 G/A 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000198598:ENST00000360564:exon_132326169_132326345:MMP17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 132402020 T/C 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 T:C T C 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000177169:ENST00000321867:exon_132401956_132402099:ULK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 132508389 A/G 1 6 13 19 2.77479139720947 6.98795197271281 -4.21316057550334 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0652517560612217 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132508322_132508486:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132508322_132508486:EP400 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 132514288 C/G 1 20 8 28 9.2493046573649 4.30027813705404 4.94902652031086 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0862818543262596 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132514246_132514448:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132514246_132514448:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132514246_132514448:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132514246_132514448:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132514246_132514448:EP400 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 132547162 G/A 1 15 16 31 6.93697849302368 8.60055627410808 -1.6635777810844 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.591851170939278 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132547011_132547246:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132547011_132547246:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132547011_132547246:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132547011_132547246:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132547011_132547246:EP400 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 132561987 C/T 1 22 21 43 10.1742351231014 11.2882301097669 -1.11399498666546 T:C C T 10 0.537534767131755 0.761428471804822 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132561946_132565005:EP400 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 132624252 G/A 1 27 28 55 12.4865612874426 15.0509734796891 -2.56441219224652 A:G G A 10 0.537534767131755 0.501853357079519 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132624180_132624314:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132624180_132624314:DDX51 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 28 34 62 12.9490265203109 18.2761820824797 -5.32715556216881 A:G G A 10 0.537534767131755 0.202774186123451 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 30 24 54 13.8739569860474 12.9008344111621 0.973122574885231 T:C T C 10 0.537534767131755 0.891632023764868 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 132627365 G/A 1 15 9 24 6.93697849302368 4.83781290418579 2.09916558883788 A:G G A 10 0.537534767131755 0.420607042022665 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132627273_132627423:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132627273_132627423:DDX51 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 132635521 T/C 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 T:C T C 10 0.537534767131755 0.318386975483931 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 132635989 A/G 1 5 10 15 2.31232616434123 5.37534767131755 -3.06302150697632 A:G A G 10 0.537534767131755 0.126645309084573 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 132636937 G/A 0 64 1 65 29.5977749035677 0.537534767131755 29.0602401364359 T:G G T 10 0.537534767131755 1.82636731106968e-16 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132636827_132636986:NOC4L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 133294728 C/T 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C C T 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 133295353 C/T 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 T:C C T 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000176894:ENST00000317555:exon_133295348_133295746:PGAM5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 133683020 C/T 1 8 20 28 3.69972186294596 10.7506953426351 -7.05097347968914 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0122693315802945 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140;ENSG00000196387:ENST00000433577:exon_133682901_133683171:ZNF140 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 T:C T C 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 21063524 A/G 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000480748:exon_21063509_21063575:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21063509_21063635:CRYL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 23907909 A/G 1 5 10 15 2.31232616434123 5.37534767131755 -3.06302150697632 A:G A G 10 0.537534767131755 0.126645309084573 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 23908034 A/G 1 6 12 18 2.77479139720947 6.45041720558106 -3.67562580837159 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0991754162193756 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 23909162 A/G 1 8 8 16 3.69972186294596 4.30027813705404 -0.600556274108079 A:G A G 10 0.537534767131755 0.806072821048815 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 24876752 T/C 1 5 11 16 2.31232616434123 5.91288243844931 -3.60055627410808 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0821156190636971 ENSG00000182957:ENST00000466831:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382095:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000424834:exon_24876736_24881207:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382108:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000438694:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000434675:exon_24876736_24877259:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000399949:exon_24876736_24878042:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000409126:exon_24876736_24877344:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000343003:exon_24876736_24881204:SPATA13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 25075859 C/T 1 8 10 18 3.69972186294596 5.37534767131755 -1.67562580837159 T:C C T 10 0.537534767131755 0.483452727703955 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25075771_25075972:PARP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 13 9 22 6.01204802728719 4.83781290418579 1.17423512310139 T:C T C 10 0.537534767131755 0.67355127074083 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 25480145 G/A 1 13 11 24 6.01204802728719 5.91288243844931 0.0991655888378808 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 25487103 T/A,C 0 0 16 16 0 8.60055627410808 -8.60055627410808 A:C T A 10 0.537534767131755 4.37789583264698e-06 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25486720_25487229:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25486720_25487229:CENPJ HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 70 76 146 32.3725663007772 40.8526423020134 -8.48007600123623 T:C C T 10 0.537534767131755 0.184008613442058 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 174 138 312 80.4689505190746 74.1797978641822 6.28915265489245 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.495911638951414 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 28239999 A/G 1 171 151 322 79.0815548204699 81.167749836895 -2.08619501642509 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.823309500641813 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 33232435 A/G 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 A:G A G 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000083642:ENST00000315596:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000482955:exon_33232376_33232486:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000400481:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000421084:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000456898:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000498550:exon_33232376_33232462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000450460:exon_33232376_33232462:PDS5B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 33700374 T/G 1 15 30 45 6.93697849302368 16.1260430139526 -9.18906452092897 T:G T G 10 0.537534767131755 0.006790703994505 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33700218_33700377:STARD13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 33703656 T/C 1 16 20 36 7.39944372589192 10.7506953426351 -3.35125161674318 T:C T C 10 0.537534767131755 0.316355438624169 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 33704065 T/C 1 13 16 29 6.01204802728719 8.60055627410808 -2.58850824682089 T:C T C 10 0.537534767131755 0.356879843182363 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 33704290 G/A 1 20 12 32 9.2493046573649 6.45041720558106 2.79888745178384 A:G G A 10 0.537534767131755 0.377265601273927 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 40229891 G/A 1 7 9 16 3.23725663007772 4.83781290418579 -1.60055627410808 A:G G A 10 0.537534767131755 0.460588608389532 ENSG00000133103:ENST00000255468:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000416691:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000422759:exon_40229799_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000455146:exon_40229814_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000356576:exon_40229881_40230016:COG6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 40229957 T/A 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 A:T T A 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000133103:ENST00000255468:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000416691:exon_40229764_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000422759:exon_40229799_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000455146:exon_40229814_40230016:COG6;ENSG00000133103:ENST00000356576:exon_40229881_40230016:COG6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 41331026 C/G 1 30 27 57 13.8739569860474 14.5134387125574 -0.639481726510034 C:G C G 10 0.537534767131755 0.894861337970316 ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41331009_41331149:MRPS31 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 41834744 C/T 1 10 6 16 4.62465232868245 3.22520860279053 1.39944372589192 T:C C T 10 0.537534767131755 0.618373054653884 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 45563531 C/G 1 13 15 28 6.01204802728719 8.06302150697632 -2.05097347968914 C:G C G 10 0.537534767131755 0.454605168209296 ENSG00000083635:ENST00000379161:exon_45563160_45563618:NUFIP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 4 28 32 1.84986093147298 15.0509734796891 -13.2011125482162 T:C C T 10 0.537534767131755 2.35477838894557e-06 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 83 77 160 38.3846143280643 41.3901770691451 -3.00556274108079 T:C C T 10 0.537534767131755 0.63532931277746 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 48528283 C/T 1 15 29 44 6.93697849302368 15.5885082468209 -8.65152975379722 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00988658584168112 ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000467222:exon_48528275_48528689:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48528278_48528417:SUCLA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 48619855 C/T 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 T:C C T 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000136159:ENST00000258662:exon_48619796_48621282:NUDT15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 48947611 C/T 1 4 10 14 1.84986093147298 5.37534767131755 -3.52548673984457 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0654879889218514 ENSG00000139687:ENST00000267163:exon_48947541_48947628:RB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 49070345 C/T 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 T:C C T 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000136161:ENST00000344532:exon_49070327_49070457:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000450343:exon_49070327_49070457:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000452987:exon_49070327_49070457:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000430805:exon_49070327_49070457:RCBTB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 50123622 G/C 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50123594_50123784:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50123594_50123784:RCBTB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 50204880 G/A 1 27 16 43 12.4865612874426 8.60055627410808 3.88600501333454 A:G G A 10 0.537534767131755 0.284681469135887 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 51941943 T/C 1 2 9 11 0.92493046573649 4.83781290418579 -3.9128824384493 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0295587298456249 ENSG00000102786:ENST00000476666:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000440606:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000469430:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000311234:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000398119:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000497989:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000420668:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000483441:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000425000:exon_51941941_51942034:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000490542:exon_51941941_51942034:INTS6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 51956225 T/G 1 17 17 34 7.86190895876017 9.13809104123983 -1.27618208247967 T:G T G 10 0.537534767131755 0.731966346241064 ENSG00000102786:ENST00000440606:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000469430:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000311234:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000398119:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000497989:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000420668:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000483441:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000490542:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000493153:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000483746:exon_51956165_51956259:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000460868:exon_51956165_51956259:INTS6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 60566644 T/C 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 T:C T C 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000139734:ENST00000400324:exon_60566607_60566717:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400329:exon_60566607_60566717:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400330:exon_60566607_60566717:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000413168:exon_60566607_60566717:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400327:exon_60566607_60566717:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400326:exon_60566607_60566717:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000377908:exon_60566607_60566717:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400319:exon_60566607_60566717:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400320:exon_60566607_60566717:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000267215:exon_60566607_60566717:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000465066:exon_60566607_60566717:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000267214:exon_60566607_60566717:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000498416:exon_60566607_60566717:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000453990:exon_60566607_60566717:DIAPH3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 73320892 A/C 1 14 15 29 6.47451326015543 8.06302150697632 -1.58850824682089 A:C A C 10 0.537534767131755 0.580849764907506 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73320639_73321249:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73320639_73321249:C13orf34 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 73409497 G/A 1 10 10 20 4.62465232868245 5.37534767131755 -0.750695342635099 A:G G A 10 0.537534767131755 0.824049778597606 ENSG00000083535:ENST00000326291:exon_73409381_73409506:PIBF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 75876389 G/A 1 6 42 48 2.77479139720947 22.5764602195337 -19.8016688223242 A:G G A 10 0.537534767131755 4.23981468556169e-09 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000478591:exon_75876379_75876537:TBC1D4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 75884216 C/T 1 65 3 68 30.0602401364359 1.61260430139526 28.4476358350407 T:C C T 10 0.537534767131755 2.05920162978069e-14 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000493487:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000413735:exon_75884171_75884287:TBC1D4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 76055602 G/A 0 11 0 11 5.08711756155069 0 5.08711756155069 G G 10 0.537534767131755 0.00128956245765823 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_76055406_76056250:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_76055406_76056250:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_76055406_76056250:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_76055406_76056250:TBC1D4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 76395620 C/T 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000532377:exon_76395313_76395649:LMO7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 95273447 G/A 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 ENSG00000152749:ENST00000376958:exon_95273332_95273489:GPR180 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 95861804 A/G 1 7 11 18 3.23725663007772 5.91288243844931 -2.67562580837159 A:G A G 10 0.537534767131755 0.241274942947926 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95861688_95861851:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95861688_95861851:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95861688_95861851:ABCC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 98645253 A/G 1 65 49 114 30.0602401364359 26.339203589456 3.72103654697993 A:G A G 10 0.537534767131755 0.511772686249254 ENSG00000065150:ENST00000261574:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000357602:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000490680:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000389591:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000469360:exon_98645146_98645268:IPO5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 99064244 T/C 1 8 16 24 3.69972186294596 8.60055627410808 -4.90083441116212 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0633610479446073 ENSG00000152767:ENST00000376586:exon_99064155_99064288:FARP1;ENSG00000152767:ENST00000376584:exon_99064155_99064288:FARP1;ENSG00000152767:ENST00000319562:exon_99064155_99064288:FARP1;ENSG00000152767:ENST00000457029:exon_99064155_99064288:FARP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 99100547 T/C 1 24 14 38 11.0991655888379 7.52548673984457 3.57367884899331 T:C T C 10 0.537534767131755 0.259528828670956 ENSG00000152767:ENST00000376586:exon_99100490_99102016:FARP1;ENSG00000152767:ENST00000319562:exon_99100490_99102023:FARP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 101278385 T/C 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101278325_101278404:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101278325_101278404:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101278325_101278404:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101278325_101278404:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101278325_101278404:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101278325_101278404:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101278325_101278404:TMTC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 101287340 C/T 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 101287404 G/A 1 15 2 17 6.93697849302368 1.07506953426351 5.86190895876017 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00561304661646287 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 103275386 T/C 1 31 16 47 14.3364222189156 8.60055627410808 5.73586594480752 T:C T C 10 0.537534767131755 0.107695515210021 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103275227_103275390:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103275227_103275390:TPP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 103307322 A/G 1 2 11 13 0.92493046573649 5.91288243844931 -4.98795197271281 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00918874023791195 ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103307292_103307357:TPP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 103307360 G/A 1 1 9 10 0.462465232868245 4.83781290418579 -4.37534767131755 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00766290351586349 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 22 25 47 10.1742351231014 13.4383691782939 -3.26413405519248 T:C T C 10 0.537534767131755 0.381193670252001 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 103506686 C/G 1 3 10 13 1.38739569860474 5.37534767131755 -3.98795197271281 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0471272182048252 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103506638_103506724:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103506638_103506724:ERCC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 103510736 C/T 1 14 14 28 6.47451326015543 7.52548673984457 -1.05097347968914 T:C C T 10 0.537534767131755 0.708746900580582 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103510625_103510768:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103510625_103510768:ERCC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 103513951 A/G 1 19 21 40 8.78683942449666 11.2882301097669 -2.5013906852702 A:G A G 10 0.537534767131755 0.433287382227075 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103513857_103514064:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103513857_103514064:ERCC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 57 57 114 26.36051827349 30.63948172651 -4.27896345302007 C:G G C 10 0.537534767131755 0.452846474090664 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 108882504 A/C 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 A:C A C 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000139826:ENST00000375898:exon_108881547_108886603:ABHD13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 111279817 A/G 1 9 11 20 4.16218709581421 5.91288243844931 -1.7506953426351 A:G A G 10 0.537534767131755 0.504150670545082 ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111279786_111279899:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000424185:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000397191:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000439607:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111279786_111279894:CARKD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 111290630 T/C 1 22 13 35 10.1742351231014 6.98795197271281 3.18628315038858 T:C T C 10 0.537534767131755 0.312273786037830 ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 58 35 93 26.8229835063582 18.8137168496114 8.00926665674679 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0973737745528392 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 111293915 T/G 1 42 73 115 19.4235397804663 39.2400380006181 -19.8164982201518 T:G T G 10 0.537534767131755 0.000238353904409325 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000375781:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000490421:exon_111293764_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111293764_111293957:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111293787_111293955:CARS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 111870069 A/G 1 30 45 75 13.8739569860474 24.189064520929 -10.3151075348816 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0200937400296894 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000449979:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491775:exon_111870026_111870147:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000467053:exon_111870026_111870212:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426768:exon_111870026_111870232:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111870026_111870227:ARHGEF7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 111870148 G/C 1 34 38 72 15.7238179175203 20.4263211510067 -4.70250323348636 C:G G C 10 0.537534767131755 0.288410474072378 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000449979:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000467053:exon_111870026_111870212:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426768:exon_111870026_111870232:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111870026_111870227:ARHGEF7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 42 39 81 19.4235397804663 20.9638559181384 -1.54031613767215 T:C C T 10 0.537534767131755 0.739510749333277 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 42 40 82 19.4235397804663 21.5013906852702 -2.07785090480391 A:G A G 10 0.537534767131755 0.659208180693845 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 113973832 C/T 1 126 106 232 58.2706193413989 56.978685315966 1.29193402543285 T:C C T 10 0.537534767131755 0.895329370916634 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113973784_113973971:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113973784_113973971:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113973784_113973971:LAMP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 113975768 T/C 1 94 88 182 43.471731889615 47.3030595075944 -3.8313276179794 T:C T C 10 0.537534767131755 0.603015315905229 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113974660_113975785:LAMP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 113975894 C/T 1 54 49 103 24.9731225748852 26.339203589456 -1.36608101457076 T:C C T 10 0.537534767131755 0.843486774456697 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113975872_113976042:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113975872_113976042:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113975872_113977745:LAMP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 114780764 A/G 1 14 13 27 6.47451326015543 6.98795197271281 -0.513438712557384 A:G A G 10 0.537534767131755 0.849618756712184 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114780685_114780808:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114780685_114780808:RASA3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 115002305 G/A 1 39 29 68 18.0361440818616 15.5885082468209 2.44763583504066 A:G G A 10 0.537534767131755 0.627051357592503 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115002277_115002371:CDC16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 115004914 C/T 1 21 28 49 9.71176989023315 15.0509734796891 -5.33920358945599 T:C C T 10 0.537534767131755 0.151593639346189 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 115004935 T/C 1 38 37 75 17.5736788489933 19.8887863838749 -2.31510753488162 T:C T C 10 0.537534767131755 0.643716375580684 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 13 115030714 T/C 1 35 58 93 16.1862831503886 31.1770164936418 -14.9907333432532 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00238171447861501 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20757804 C/A 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20757290_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20757304_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20757688_20757905:TTC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20770036 T/C 1 3 12 15 1.38739569860474 6.45041720558106 -5.06302150697632 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00953783143503242 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20769992_20770124:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20769992_20770124:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20769992_20770124:TTC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20784431 G/A 1 112 119 231 51.7961060812434 63.9666372886788 -12.1705312074354 A:G G A 10 0.537534767131755 0.113423881240803 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20784386_20784731:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 40 23 63 18.4986093147298 12.3632996440304 6.13530967069944 T:C T C 10 0.537534767131755 0.130530770932300 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 7 11 18 3.23725663007772 5.91288243844931 -2.67562580837159 A:C A C 10 0.537534767131755 0.241274942947926 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20837033 T/C 1 19 15 34 8.78683942449666 8.06302150697632 0.72381791752033 T:C T C 10 0.537534767131755 0.864547358513853 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20836957_20837061:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20836957_20837061:TEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 27 44 71 12.4865612874426 23.6515297537972 -11.1649684663546 C:G G C 10 0.537534767131755 0.00864628906212352 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20841707 C/T 1 14 13 27 6.47451326015543 6.98795197271281 -0.513438712557384 T:C C T 10 0.537534767131755 0.849618756712184 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20841666_20841742:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20841666_20841742:TEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20844383 C/T 1 22 12 34 10.1742351231014 6.45041720558106 3.72381791752033 T:C C T 10 0.537534767131755 0.230539902704082 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20844263_20844423:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20844263_20844423:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000471684:exon_20844263_20844423:TEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20845521 A/C 1 15 7 22 6.93697849302368 3.76274336992228 3.17423512310139 A:C A C 10 0.537534767131755 0.203346468273651 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20845439_20845651:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20845439_20845651:TEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20845879 G/A 1 7 17 24 3.23725663007772 9.13809104123983 -5.90083441116212 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0224326911767401 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20845759_20845912:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20845759_20845912:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000471684:exon_20845759_20845903:TEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20846950 C/T 1 15 6 21 6.93697849302368 3.22520860279053 3.71176989023315 T:C C T 10 0.537534767131755 0.126762028126778 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20846913_20847012:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20846913_20847012:TEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20849169 G/A 1 13 7 20 6.01204802728719 3.76274336992228 2.2493046573649 A:G G A 10 0.537534767131755 0.373913522529313 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20849090_20849204:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20849090_20849204:TEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20850093 C/T 1 9 6 15 4.16218709581421 3.22520860279053 0.936978493023676 T:C C T 10 0.537534767131755 0.797066078642493 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20850072_20850222:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20850072_20850222:TEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20852267 C/T 1 10 9 19 4.62465232868245 4.83781290418579 -0.213160575503344 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20852197_20852391:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20852197_20852391:TEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20864049 A/G 1 6 9 15 2.77479139720947 4.83781290418579 -2.06302150697632 A:G A G 10 0.537534767131755 0.311071565735570 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20864018_20864108:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20864018_20864108:TEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 36 19 55 16.6487483832568 10.2131605755033 6.43558780775348 T:C T C 10 0.537534767131755 0.103846171026240 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 15 17 32 6.93697849302368 9.13809104123983 -2.20111254821616 T:C T C 10 0.537534767131755 0.480790906838619 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20920340 A/G 1 3 8 11 1.38739569860474 4.30027813705404 -2.9128824384493 A:G A G 10 0.537534767131755 0.127253645182292 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 292 323 615 135.039847997528 173.623729783557 -38.5838817860293 T:G T G 10 0.537534767131755 0.00209201647140128 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 20928359 C/A 1 33 36 69 15.2613526846521 19.3512516167432 -4.08989893209109 A:C C A 10 0.537534767131755 0.336240941304398 ENSG00000165782:ENST00000250489:exon_20928351_20928457:TMEM55B;ENSG00000165782:ENST00000398020:exon_20928351_20928457:TMEM55B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 21250124 G/A 1 14 19 33 6.47451326015543 10.2131605755033 -3.73864731534791 A:G G A 10 0.537534767131755 0.222785253283888 ENSG00000169413:ENST00000304677:exon_21249854_21250626:RNASE6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 21463050 G/C 1 58 34 92 26.8229835063582 18.2761820824797 8.54680142387855 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0762308122844056 ENSG00000165792:ENST00000339374:exon_21462953_21463060:METT11D1;ENSG00000165792:ENST00000382985:exon_21462953_21463060:METT11D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 23282110 A/G 1 26 18 44 12.0240960545744 9.67562580837159 2.34847024620278 A:G A G 10 0.537534767131755 0.546470267269541 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23282109_23282416:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 23282449 C/T 1 43 34 77 19.8860050133345 18.2761820824797 1.60982293085487 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.733169093216226 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000488800:exon_23282184_23282649:SLC7A7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 23467664 G/A 0 17 0 17 7.86190895876017 0 7.86190895876017 G G 10 0.537534767131755 2.81409160202432e-05 ENSG00000100802:ENST00000299088:exon_23467636_23468611:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000341470:exon_23467636_23468611:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397382:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397380:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397379:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397377:exon_23467636_23467950:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397376:exon_23467636_23467950:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000406429:exon_23467636_23468365:C14orf93 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 23944505 G/A 1 22 8 30 10.1742351231014 4.30027813705404 5.87395698604735 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0423344392736491 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 22 17 39 10.1742351231014 9.13809104123983 1.03614408186156 A:C C A 10 0.537534767131755 0.872690301634875 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 27 10 37 12.4865612874426 5.37534767131755 7.11121361612507 A:T A T 10 0.537534767131755 0.0206147473132289 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24567508 T/C 1 37 44 81 17.1112136161251 23.6515297537972 -6.54031613767215 T:C T C 10 0.537534767131755 0.149024516042084 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24567412_24567596:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24567412_24567596:PCK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24569418 A/G 1 59 30 89 27.2854487392265 16.1260430139526 11.1594057252738 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0191032754208132 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24569204_24569422:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24569204_24569758:PCK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 397 387 784 183.598697448693 208.025954879989 -24.4272574312959 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0855274879604548 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 51 39 90 23.5857268762805 20.9638559181384 2.62187095814205 T:C C T 10 0.537534767131755 0.598751039609667 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24642348 C/T 1 51 52 103 23.5857268762805 27.9518078908513 -4.36608101457076 T:C C T 10 0.537534767131755 0.429472302267313 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24642335_24642407:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24642335_24642407:REC8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24653523 G/C 1 61 53 114 28.2103792049629 28.489342657983 -0.278963453020065 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653504_24653624:IPO4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 22 36 58 10.1742351231014 19.3512516167432 -9.17701649364179 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0175106553099244 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24653965 C/T 1 36 21 57 16.6487483832568 11.2882301097669 5.36051827348997 T:C C T 10 0.537534767131755 0.183959661707739 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24901433 C/T 1 28 34 62 12.9490265203109 18.2761820824797 -5.32715556216881 T:C C T 10 0.537534767131755 0.202774186123451 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24906515 C/T 1 30 33 63 13.8739569860474 17.7386473153479 -3.86469032930056 T:C C T 10 0.537534767131755 0.37678295092532 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24906534 G/A 1 26 30 56 12.0240960545744 16.1260430139526 -4.10194695937828 A:G G A 10 0.537534767131755 0.285995069768124 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24909281 C/T 1 104 97 201 48.0963842182975 52.1408724117802 -4.04448819348274 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.572268556756665 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24909362 T/C 1 114 116 230 52.7210365469799 62.3540329872836 -9.63299644030364 A:T:C T C 10 0.537534767131755 0.209368450328771 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24909475 C/G 1 98 95 193 45.321592821088 51.0658028775167 -5.74421005642871 C:G C G 10 0.537534767131755 0.427489192087346 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24909629 C/A 1 113 95 208 52.2585713141117 51.0658028775167 1.19276843659497 A:C:G C A 10 0.537534767131755 0.889565008828553 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24909731 C/T 1 47 47 94 21.7358659448075 25.2641340551925 -3.52826811038496 T:C C T 10 0.537534767131755 0.47106080032788 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24910846 C/T 1 13 4 17 6.01204802728719 2.15013906852702 3.86190895876017 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0863507386644088 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24910876 G/A 1 12 2 14 5.54958279441894 1.07506953426351 4.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0163896060017328 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24910973 T/G 1 52 22 74 24.0481921091487 11.8257648768986 12.2224272322501 T:G T G 10 0.537534767131755 0.00485246703254535 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24910974 T/A 1 52 22 74 24.0481921091487 11.8257648768986 12.2224272322501 A:T T A 10 0.537534767131755 0.00485246703254535 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 24911452 T/C 1 29 35 64 13.4114917531791 18.8137168496114 -5.40222509643232 T:C T C 10 0.537534767131755 0.209753508037512 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24911384_24911466:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24911384_24911466:SDR39U1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 31099738 A/G 1 12 10 22 5.54958279441894 5.37534767131755 0.174235123101391 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31099683_31099771:SCFD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 29 34 63 13.4114917531791 18.2761820824797 -4.86469032930056 C:G C G 10 0.537534767131755 0.255501019754702 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 31381351 T/C 1 7 8 15 3.23725663007772 4.30027813705404 -1.06302150697632 T:C T C 10 0.537534767131755 0.61360765893613 ENSG00000196792:ENST00000355683:exon_31381213_31381388:STRN3;ENSG00000196792:ENST00000357479:exon_31381213_31381388:STRN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 31647241 G/A 1 10 3 13 4.62465232868245 1.61260430139526 3.01204802728719 A:G G A 10 0.537534767131755 0.104100192392772 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 37 42 79 17.1112136161251 22.5764602195337 -5.46524660340864 A:G G A 10 0.537534767131755 0.259063559253145 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 35062312 C/T 1 6 18 24 2.77479139720947 9.67562580837159 -6.90083441116212 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00656118219123253 ENSG00000129515:ENST00000396526:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000396534:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000355110:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000362031:exon_35062251_35062356:SNX6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 35230980 C/T 1 28 43 71 12.9490265203109 23.1139949866655 -10.1649684663546 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0171086482348714 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35230963_35231429:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35230963_35231429:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35230963_35231429:BAZ1A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 35231108 A/T 1 52 22 74 24.0481921091487 11.8257648768986 12.2224272322501 A:T A T 10 0.537534767131755 0.00485246703254535 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35230963_35231429:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35230963_35231429:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35230963_35231429:BAZ1A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 23 19 42 10.6367003559696 10.2131605755033 0.423539780466291 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 35331288 G/A 1 29 20 49 13.4114917531791 10.7506953426351 2.66079641054401 A:G G A 10 0.537534767131755 0.476639382729198 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35331250_35331528:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35331250_35331528:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35331250_35331528:BAZ1A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 35546373 T/C 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 T:C T C 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000151327:ENST00000396472:exon_35546356_35546422:FAM177A1;ENSG00000151327:ENST00000382406:exon_35546356_35546422:FAM177A1;ENSG00000151327:ENST00000280987:exon_35546356_35546422:FAM177A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 13 24 37 6.01204802728719 12.9008344111621 -6.88878638387493 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0308225975904359 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 35871960 G/A 1 57 57 114 26.36051827349 30.63948172651 -4.27896345302007 A:G G A 10 0.537534767131755 0.452846474090664 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 35872926 G/A 1 517 526 1043 239.094525392883 282.743287511303 -43.6487621184204 A:T:C:G G A 10 0.537534767131755 0.00689212202919925 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35872896_35873004:NFKBIA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 39685330 C/T 0 28 0 28 12.9490265203109 0 12.9490265203109 C C 10 0.537534767131755 4.23291744722808e-08 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 32 34 66 14.7988874517838 18.2761820824797 -3.47729463069583 A:G G A 10 0.537534767131755 0.391201064492292 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 45432870 G/C 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000198718:ENST00000361577:exon_45431411_45433670:FAM179B;ENSG00000198718:ENST00000361462:exon_45431442_45433670:FAM179B;ENSG00000198718:ENST00000382233:exon_45431442_45433670:FAM179B;ENSG00000198718:ENST00000429476:exon_45431442_45433670:FAM179B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 13 13 26 6.01204802728719 6.98795197271281 -0.975903945425628 C:G G C 10 0.537534767131755 0.700055875569719 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 50074122 T/A 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:T T A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 50074520 C/T 1 12 12 24 5.54958279441894 6.45041720558106 -0.900834411162119 T:C C T 10 0.537534767131755 0.83840612934176 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 50085571 G/A 1 783 932 1715 362.110277335836 500.982402966796 -138.87212563096 A:G G A 10 0.537534767131755 2.11727816304132e-11 ENSG00000165502:ENST00000298289:exon_50085407_50085858:RPL36AL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 50088754 T/G 1 90 91 181 41.6218709581421 48.9156638089897 -7.29379285084764 T:G T G 10 0.537534767131755 0.296844425588391 ENSG00000168282:ENST00000305386:exon_50087489_50090198:MGAT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 42 31 73 19.4235397804663 16.6635777810844 2.75996199938189 T:C T C 10 0.537534767131755 0.558396159192329 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 50121507 G/C 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 C:G G C 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000100479:ENST00000216367:exon_50121502_50121556:POLE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 50140880 T/C 1 7 9 16 3.23725663007772 4.83781290418579 -1.60055627410808 T:C T C 10 0.537534767131755 0.460588608389532 ENSG00000100479:ENST00000216367:exon_50140841_50140934:POLE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 50616878 G/A 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 0.593874685143272 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50616726_50616948:SOS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 50769717 G/A 1 10 4 14 4.62465232868245 2.15013906852702 2.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 0.283621077619465 ENSG00000087299:ENST00000261699:exon_50769620_50769735:L2HGDH;ENSG00000087299:ENST00000267436:exon_50769620_50769735:L2HGDH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 55310492 G/A 1 12 20 32 5.54958279441894 10.7506953426351 -5.20111254821616 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0762753359001116 ENSG00000131979:ENST00000254299:exon_55308735_55310861:GCH1;ENSG00000131979:ENST00000491895:exon_55309096_55310861:GCH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 55458040 A/G 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 A:G A G 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000198554:ENST00000360586:exon_55457931_55458118:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000359167:exon_55457931_55458118:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000421192:exon_55457931_55458118:WDHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 55531358 C/T 1 74 56 130 34.2224272322501 30.1019469593783 4.12048027287186 T:C C T 10 0.537534767131755 0.482940717703534 ENSG00000168175:ENST00000395468:exon_55531334_55536912:MAPK1IP1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 65 80 145 30.0602401364359 43.0027813705404 -12.9425412341045 A:C A C 10 0.537534767131755 0.0369854644018892 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 55636259 G/A 1 11 21 32 5.08711756155069 11.2882301097669 -6.20111254821616 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0328630728341302 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55636117_55636277:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55636117_55636277:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55636117_55636277:DLGAP5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 55643857 T/G 1 24 22 46 11.0991655888379 11.8257648768986 -0.726599288060729 T:G T G 10 0.537534767131755 0.882940962147627 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 55643908 A/G 1 31 27 58 14.3364222189156 14.5134387125574 -0.177016493641789 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 55655692 C/T 1 22 25 47 10.1742351231014 13.4383691782939 -3.26413405519248 T:C C T 10 0.537534767131755 0.381193670252001 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 57938124 C/T 1 10 16 26 4.62465232868245 8.60055627410808 -3.97590394542563 T:C C T 10 0.537534767131755 0.167381271298725 ENSG00000100557:ENST00000216445:exon_57936019_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534126:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000530417:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534528:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000422976:exon_57937973_57938308:C14orf105 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 58814423 C/G 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 C:G C G 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58814365_58814596:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58814365_58814596:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58814365_58814596:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000456010:exon_58814365_58814440:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58814365_58814596:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000427979:exon_58814365_58814481:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58814365_58814596:ARID4A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 58814519 G/A 1 10 6 16 4.62465232868245 3.22520860279053 1.39944372589192 A:G G A 10 0.537534767131755 0.618373054653884 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58814365_58814596:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58814365_58814596:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58814365_58814596:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58814365_58814596:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58814365_58814596:ARID4A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 64491695 T/C 1 12 13 25 5.54958279441894 6.98795197271281 -1.43836917829387 T:C T C 10 0.537534767131755 0.689197984829322 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64491630_64491749:SYNE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 64496749 C/T 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 0.593874685143272 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64496613_64496777:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64496613_64496777:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64496613_64496777:SYNE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 64496763 T/C 1 6 11 17 2.77479139720947 5.91288243844931 -3.13809104123983 T:C T C 10 0.537534767131755 0.148136675277047 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64496613_64496777:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64496613_64496777:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64496613_64496777:SYNE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 64497930 G/A 1 9 9 18 4.16218709581421 4.83781290418579 -0.675625808371588 A:G G A 10 0.537534767131755 0.815602186334409 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64497734_64498075:SYNE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 64518321 A/G 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 A:G A G 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 64519455 A/G 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 A:T:G A G 10 0.537534767131755 0.241009480668847 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 64519709 A/T 1 5 9 14 2.31232616434123 4.83781290418579 -2.52548673984457 A:T A T 10 0.537534767131755 0.191403008406876 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 64522674 G/C 1 12 13 25 5.54958279441894 6.98795197271281 -1.43836917829387 C:G G C 10 0.537534767131755 0.689197984829322 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64522662_64522984:SYNE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 64522843 A/G 1 4 10 14 1.84986093147298 5.37534767131755 -3.52548673984457 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0654879889218514 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64522662_64522984:SYNE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 64612845 C/T 1 18 19 37 8.32437419162841 10.2131605755033 -1.88878638387493 T:C C T 10 0.537534767131755 0.6216025772515 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64612786_64612941:SYNE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 64612858 C/A 1 17 14 31 7.86190895876017 7.52548673984457 0.336422218915597 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64612786_64612941:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64612786_64612941:SYNE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 64637147 C/A 1 13 44 57 6.01204802728719 23.6515297537972 -17.63948172651 A:C C A 10 0.537534767131755 3.10994583497030e-06 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64636946_64637180:SYNE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 64882380 A/G 1 57 40 97 26.36051827349 21.5013906852702 4.85912758821977 A:G A G 10 0.537534767131755 0.359800801615029 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64882357_64882457:MTHFD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 65417070 C/A 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 ENSG00000139998:ENST00000267512:exon_65417043_65417132:RAB15;ENSG00000139998:ENST00000436278:exon_65417043_65417132:RAB15;ENSG00000139998:ENST00000533601:exon_65417043_65417132:RAB15;ENSG00000139998:ENST00000426039:exon_65417043_65417132:RAB15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 69703158 A/G 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000081177:ENST00000409018:exon_69703124_69703259:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000193422:exon_69703124_69703259:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000492815:exon_69703124_69703259:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000409014:exon_69703124_69703259:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000312994:exon_69703124_69703259:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000409675:exon_69703124_69703259:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000409949:exon_69703124_69703259:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000409242:exon_69703124_69703259:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000449989:exon_69703124_69703259:EXD2;ENSG00000081177:ENST00000465286:exon_69703124_69703260:EXD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 71374702 G/A 1 8 4 12 3.69972186294596 2.15013906852702 1.54958279441894 A:G G A 10 0.537534767131755 0.403872211149876 ENSG00000100731:ENST00000238570:exon_71374122_71374720:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000304743:exon_71374122_71374720:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000439984:exon_71374122_71374720:PCNX HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 71444788 G/A 1 16 12 28 7.39944372589192 6.45041720558106 0.949026520310861 A:G G A 10 0.537534767131755 0.850208407116058 ENSG00000100731:ENST00000238570:exon_71443659_71445365:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000304743:exon_71443659_71445365:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000439984:exon_71443659_71445365:PCNX HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 72176267 G/A 1 82 80 162 37.9221490951961 43.0027813705404 -5.08063227534431 A:G G A 10 0.537534767131755 0.431708186180054 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72175939_72176381:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72175939_72176381:SIPA1L1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 73404680 A/C 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 A:C A C 10 0.537534767131755 0.190750883746296 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000514191:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000505361:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000510612:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000508412:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000514486:exon_73404679_73404778:DCAF4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 73425432 G/A 1 12 9 21 5.54958279441894 4.83781290418579 0.711769890233146 A:G G A 10 0.537534767131755 0.829121193760437 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73425320_73426300:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73425320_73426411:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73425320_73425654:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73425320_73426356:DCAF4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 73440864 C/T 1 17 18 35 7.86190895876017 9.67562580837159 -1.81371684961142 T:C C T 10 0.537534767131755 0.612189199573914 ENSG00000165861:ENST00000394207:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73440788_73440901:ZFYVE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 73491270 C/T 1 11 16 27 5.08711756155069 8.60055627410808 -3.51343871255738 T:C C T 10 0.537534767131755 0.182777781405979 ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73490734_73491650:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73490734_73491650:ZFYVE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 74058832 C/T 1 7 8 15 3.23725663007772 4.30027813705404 -1.06302150697632 T:C C T 10 0.537534767131755 0.61360765893613 ENSG00000177465:ENST00000326303:exon_74058410_74059120:ACOT4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 74061989 C/T 1 17 7 24 7.86190895876017 3.76274336992228 4.09916558883788 T:C C T 10 0.537534767131755 0.104256192462200 ENSG00000177465:ENST00000326303:exon_74061753_74062468:ACOT4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 74428000 A/T 1 12 11 23 5.54958279441894 5.91288243844931 -0.363299644030365 A:T A T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74427876_74428078:COQ6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 75142606 G/A 1 17 16 33 7.86190895876017 8.60055627410808 -0.738647315347913 A:G G A 10 0.537534767131755 0.862168191265843 ENSG00000119682:ENST00000356357:exon_75142402_75142649:KIAA0317;ENSG00000119682:ENST00000469797:exon_75142402_75142649:KIAA0317;ENSG00000119682:ENST00000490805:exon_75142402_75142727:KIAA0317 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 75516232 C/T 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 76231034 G/A 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 A:G G A 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76230958_76231115:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76230958_76231115:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000418433:exon_76230958_76231115:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76230958_76231115:TTLL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 19 10 29 8.78683942449666 5.37534767131755 3.41149175317911 A:G G A 10 0.537534767131755 0.263942639118946 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 12 2 14 5.54958279441894 1.07506953426351 4.47451326015543 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0163896060017328 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 77269788 A/C 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:C A C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000013523:ENST00000251089:exon_77269714_77269824:ANGEL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 11 12 23 5.08711756155069 6.45041720558106 -1.36329964403036 A:G G A 10 0.537534767131755 0.677013887550826 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 88414211 G/A 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 A:G G A 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000054983:ENST00000261304:exon_88414072_88414222:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393568:exon_88414072_88414222:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393569:exon_88414072_88414222:GALC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 88431898 C/T 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000054983:ENST00000261304:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393568:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393569:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000474294:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000445021:exon_88431849_88431973:GALC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 88477413 C/T 1 13 15 28 6.01204802728719 8.06302150697632 -2.05097347968914 T:C C T 10 0.537534767131755 0.454605168209296 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 90744672 G/A 1 12 10 22 5.54958279441894 5.37534767131755 0.174235123101391 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90744398_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90744402_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90744402_90744805:C14orf102 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 90745422 T/C 1 7 10 17 3.23725663007772 5.37534767131755 -2.13809104123983 T:C T C 10 0.537534767131755 0.337166426523694 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90745406_90745477:C14orf102 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 31 24 55 14.3364222189156 12.9008344111621 1.43558780775348 A:G G A 10 0.537534767131755 0.787189976004427 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 91681888 G/A 1 30 28 58 13.8739569860474 15.0509734796891 -1.17701649364179 A:G G A 10 0.537534767131755 0.793115963280092 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91681749_91681900:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91681749_91682137:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91681749_91681900:C14orf159 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 92471957 T/C 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 T:C T C 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92469763_92472792:TRIP11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 93118038 A/G 1 33 26 59 15.2613526846521 13.9759039454256 1.28544873922646 A:G A G 10 0.537534767131755 0.794698520800986 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 93118198 C/T 1 27 25 52 12.4865612874426 13.4383691782939 -0.951807890851258 T:C C T 10 0.537534767131755 0.889570859481929 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 81 107 188 37.4596838623279 57.5162200830978 -20.0565362207699 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00421445856370144 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 93199080 C/T 1 45 39 84 20.810935479071 20.9638559181384 -0.152920439067415 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93198994_93199160:LGMN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 93276654 T/C 1 12 9 21 5.54958279441894 4.83781290418579 0.711769890233146 T:C T C 10 0.537534767131755 0.829121193760437 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93276599_93276722:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93276599_93276722:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93276599_93276722:GOLGA5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 93673655 G/A 1 52 29 81 24.0481921091487 15.5885082468209 8.45968386232785 A:G G A 10 0.537534767131755 0.07396380223867 ENSG00000012963:ENST00000013070:exon_93673401_93673786:UBR7;ENSG00000012963:ENST00000416753:exon_93673401_93673786:UBR7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 94405871 G/C 1 32 23 55 14.7988874517838 12.3632996440304 2.43558780775348 T:C:G G C 10 0.537534767131755 0.589119036750366 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94405454_94406018:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94405454_94406018:ASB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 94417421 G/A 1 31 24 55 14.3364222189156 12.9008344111621 1.43558780775348 A:G G A 10 0.537534767131755 0.787189976004427 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 94417541 A/G 1 44 34 78 20.3484702462028 18.2761820824797 2.07228816372311 A:G A G 10 0.537534767131755 0.651753076027788 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 94417586 G/A 1 54 40 94 24.9731225748852 21.5013906852702 3.47173188961503 A:G G A 10 0.537534767131755 0.535112473120672 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 94546047 G/C 1 116 97 213 53.6459670127164 52.1408724117802 1.5050946009362 C:G G C 10 0.537534767131755 0.890736546992415 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94545625_94546088:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94545371_94546093:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94545706_94546088:DDX24 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 95884323 G/A 1 8 10 18 3.69972186294596 5.37534767131755 -1.67562580837159 A:G G A 10 0.537534767131755 0.483452727703955 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95883831_95884363:C14orf49 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 99967186 A/T 1 27 28 55 12.4865612874426 15.0509734796891 -2.56441219224652 A:T A T 10 0.537534767131755 0.501853357079519 ENSG00000090061:ENST00000389879:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000216279:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000411691:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000380246:exon_99967103_99967208:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000437596:exon_99967103_99967208:CCNK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 100563943 G/A 1 229 219 448 105.904538326828 117.720114001854 -11.8155756750262 A:G G A 10 0.537534767131755 0.27587271526639 ENSG00000196405:ENST00000402714:exon_100563818_100563995:EVL;ENSG00000196405:ENST00000392920:exon_100563818_100563995:EVL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 100847707 A/G 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100847247_100848083:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100847247_100848083:WDR25 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 100996312 T/C 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100996157_100996625:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100996157_100996640:WDR25 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 102391577 G/C 1 21 20 41 9.71176989023315 10.7506953426351 -1.03892545240195 C:G G C 10 0.537534767131755 0.756605398595916 ENSG00000078304:ENST00000328724:exon_102391478_102394022:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334743:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000350249:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334756:exon_102391478_102394075:PPP2R5C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 102446161 G/A 1 10 5 15 4.62465232868245 2.68767383565877 1.93697849302368 A:G G A 10 0.537534767131755 0.43901451829475 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102446056_102446311:DYNC1H1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 103593950 C/G 1 92 59 151 42.5468014238785 31.7145512607735 10.832250163105 C:G C G 10 0.537534767131755 0.086343502733223 ENSG00000185215:ENST00000333007:exon_103593342_103593966:TNFAIP2;ENSG00000185215:ENST00000451723:exon_103593342_103593966:TNFAIP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 123 115 238 56.8832236427941 61.8164982201518 -4.93327457735768 A:G G A 10 0.537534767131755 0.5586166006348 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 105517706 G/T 1 47 49 96 21.7358659448075 26.339203589456 -4.60333764464848 T:G G T 10 0.537534767131755 0.358396999956912 ENSG00000183484:ENST00000392585:exon_105515728_105518439:GPR132;ENSG00000183484:ENST00000329797:exon_105515739_105518439:GPR132 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 106092383 C/G 0 8 0 8 3.69972186294596 0 3.69972186294596 C C 10 0.537534767131755 0.00906265828433196 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 14 106174261 C/G 1 24 6 30 11.0991655888379 3.22520860279053 7.87395698604735 C:G C G 10 0.537534767131755 0.00509621135714939 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 21937964 A/G 0 25 0 25 11.5616308217061 0 11.5616308217061 A A 10 0.537534767131755 3.09371230034442e-07 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 31197564 G/A 1 10 12 22 4.62465232868245 6.45041720558106 -1.82576487689861 A:G G A 10 0.537534767131755 0.522987558786596 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31196715_31198100:FAN1;ENSG00000198690:ENST00000441675:exon_31196715_31198100:FAN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 31233934 T/A 1 36 25 61 16.6487483832568 13.4383691782939 3.21037920496295 A:T T A 10 0.537534767131755 0.442850303155823 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31233769_31235308:FAN1;ENSG00000166912:ENST00000435680:exon_31231144_31234275:MTMR10;ENSG00000166912:ENST00000425768:exon_31231144_31234275:MTMR10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 14 6 20 6.47451326015543 3.22520860279053 3.2493046573649 A:G G A 10 0.537534767131755 0.180165257217980 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 34634124 C/G 1 226 2 228 104.517142628223 1.07506953426351 103.44207309396 C:G C G 10 0.537534767131755 1.06303003647172e-57 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 34634138 G/A 1 242 19 261 111.916586354115 10.2131605755033 101.703425778612 A:G G A 10 0.537534767131755 1.43693155392803e-43 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 34634139 T/C 1 240 21 261 110.991655888379 11.2882301097669 99.7034257786119 T:C:G T C 10 0.537534767131755 1.274543220716e-41 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 36946303 C/G 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 C:G C G 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000186073:ENST00000437989:exon_36946299_36946359:C15orf41;ENSG00000186073:ENST00000338183:exon_36946299_36946359:C15orf41 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 42211486 A/G 1 126 120 246 58.2706193413989 64.5041720558106 -6.23355271441172 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.443196971405901 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 42235316 C/T 1 126 116 242 58.2706193413989 62.3540329872836 -4.0834136458847 T:C C T 10 0.537534767131755 0.606578895827430 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42235265_42235362:EHD4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 42453963 T/C 1 41 35 76 18.961074547598 18.8137168496114 0.147357697986621 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42453880_42453971:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42453880_42453971:VPS39 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 42459034 T/C 1 44 38 82 20.3484702462028 20.4263211510067 -0.0778509048039098 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42458970_42459111:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42458970_42459111:VPS39 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 42565588 C/A 1 10 8 18 4.62465232868245 4.30027813705404 0.324374191628411 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000103978:ENST00000389834:exon_42565453_42565755:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000448392:exon_42565453_42565638:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000307216:exon_42565453_42565755:TMEM87A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 42570718 A/G 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 A:G A G 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000214013:ENST00000440615:exon_42570680_42570788:GANC;ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42570680_42570788:GANC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 42579984 G/A 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 A:G G A 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42579889_42580016:GANC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 42729508 G/A 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 A:G G A 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42729430_42729575:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42729430_42729575:ZFP106 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 42740369 C/T 1 19 5 24 8.78683942449666 2.68767383565877 6.09916558883788 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0133461825031756 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42740270_42740903:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42740270_42740903:ZFP106 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 43017426 T/G 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 T:G T G 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43017342_43017449:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43017342_43017449:CDAN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 43023482 T/C 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43023409_43023529:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43023409_43023529:CDAN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 43027835 G/T 1 10 6 16 4.62465232868245 3.22520860279053 1.39944372589192 T:G G T 10 0.537534767131755 0.618373054653884 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43027708_43027879:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43027708_43027877:CDAN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 43621947 A/G 1 5 10 15 2.31232616434123 5.37534767131755 -3.06302150697632 A:G A G 10 0.537534767131755 0.126645309084573 ENSG00000168806:ENST00000305641:exon_43619976_43622891:LCMT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 43632549 T/C 1 5 12 17 2.31232616434123 6.45041720558106 -4.13809104123983 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0522959192114914 ENSG00000168803:ENST00000428046:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000422466:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000389651:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000305605:exon_43632463_43632550:ADAL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 43661802 T/C 1 14 34 48 6.47451326015543 18.2761820824797 -11.8016688223242 T:C T C 10 0.537534767131755 0.000728412155292589 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43661794_43662246:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43661794_43662258:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43661794_43662258:ZSCAN29 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 43724646 T/G 1 29 20 49 13.4114917531791 10.7506953426351 2.66079641054401 T:G T G 10 0.537534767131755 0.476639382729198 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43724392_43724875:TP53BP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 43748304 A/G 1 25 13 38 11.5616308217061 6.98795197271281 4.57367884899331 A:G A G 10 0.537534767131755 0.146220045523152 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43748090_43748529:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000480860:exon_43748090_43748350:TP53BP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 43762196 C/T 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43762056_43762264:TP53BP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 43767774 G/C 1 12 9 21 5.54958279441894 4.83781290418579 0.711769890233146 C:G G C 10 0.537534767131755 0.829121193760437 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43767763_43767892:TP53BP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 104 193 297 48.0963842182975 103.744210056429 -55.6478258381312 T:C C T 10 0.537534767131755 9.7143535598594e-11 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 33 51 84 15.2613526846521 27.4142731237195 -12.1529204390674 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00849398576172871 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 44069069 G/C 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 C:G G C 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000128886:ENST00000319359:exon_44068968_44069741:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000486851:exon_44068968_44069164:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000433927:exon_44068968_44069162:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000497700:exon_44068968_44069166:ELL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 90 63 153 41.6218709581421 33.8646903293006 7.75718062884149 T:C T C 10 0.537534767131755 0.224234919026123 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 28 25 53 12.9490265203109 13.4383691782939 -0.489342657983013 A:C A C 10 0.537534767131755 0.891515392288072 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 44849698 G/A 1 29 31 60 13.4114917531791 16.6635777810844 -3.2520860279053 A:G G A 10 0.537534767131755 0.438257415196493 ENSG00000104131:ENST00000261868:exon_44849687_44849848:EIF3J HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 44864894 C/T 1 23 25 48 10.6367003559696 13.4383691782939 -2.80166882232424 T:C C T 10 0.537534767131755 0.470116802236024 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44864881_44865018:SPG11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 44943757 A/G 1 20 15 35 9.2493046573649 8.06302150697632 1.18628315038858 A:G A G 10 0.537534767131755 0.736906280800669 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 44943797 T/C 1 19 20 39 8.78683942449666 10.7506953426351 -1.96385591813844 T:C T C 10 0.537534767131755 0.630559943550738 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 44943798 G/A 1 19 20 39 8.78683942449666 10.7506953426351 -1.96385591813844 A:G G A 10 0.537534767131755 0.630559943550738 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 49048705 G/C 1 12 5 17 5.54958279441894 2.68767383565877 2.86190895876017 C:G G C 10 0.537534767131755 0.224313779580088 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49048100_49048750:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49048100_49048750:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49048100_49048750:CEP152 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 49325289 A/C 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 A:C A C 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000138593:ENST00000261847:exon_49325162_49325297:SECISBP2L;ENSG00000138593:ENST00000380927:exon_49325162_49325297:SECISBP2L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 49917341 G/A 1 12 2 14 5.54958279441894 1.07506953426351 4.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0163896060017328 ENSG00000104047:ENST00000403028:exon_49917310_49917628:DTWD1;ENSG00000104047:ENST00000329873:exon_49917310_49917628:DTWD1;ENSG00000104047:ENST00000251250:exon_49917310_49917628:DTWD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 51012201 G/C 1 17 7 24 7.86190895876017 3.76274336992228 4.09916558883788 C:G G C 10 0.537534767131755 0.104256192462200 ENSG00000138600:ENST00000261854:exon_51012137_51012297:AC012100.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 52664408 G/A 1 3 7 10 1.38739569860474 3.76274336992228 -2.37534767131755 A:G G A 10 0.537534767131755 0.203605394966440 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52664321_52664560:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52664321_52664560:MYO5A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 56387859 T/C 1 13 6 19 6.01204802728719 3.22520860279053 2.78683942449666 T:C T C 10 0.537534767131755 0.252178981986345 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 56388033 T/C 1 10 10 20 4.62465232868245 5.37534767131755 -0.750695342635099 T:C T C 10 0.537534767131755 0.824049778597606 ENSG00000181827:ENST00000422057:exon_56385831_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000423270:exon_56382732_56388818:RFX7;ENSG00000181827:ENST00000317318:exon_56382732_56388818:RFX7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 57213283 A/G 1 16 4 20 7.39944372589192 2.15013906852702 5.2493046573649 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0231288404845339 ENSG00000140262:ENST00000267811:exon_57213224_57213296:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000438423:exon_57213224_57213296:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000452095:exon_57213224_57213296:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000333725:exon_57213224_57213296:TCF12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 59347929 C/A 1 11 5 16 5.08711756155069 2.68767383565877 2.39944372589192 A:C C A 10 0.537534767131755 0.317045039600351 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59347881_59348044:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59347881_59348044:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59347881_59348044:RNF111 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 59368167 G/A 1 16 15 31 7.39944372589192 8.06302150697632 -0.663577781084404 A:G G A 10 0.537534767131755 0.858236752595722 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59368153_59368414:RNF111 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 22 16 38 10.1742351231014 8.60055627410808 1.57367884899331 T:G T G 10 0.537534767131755 0.629922467162815 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 62212781 T/C 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62212697_62212846:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62212697_62212846:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62212697_62212846:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62212697_62212846:VPS13C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 11 12 23 5.08711756155069 6.45041720558106 -1.36329964403036 A:G G A 10 0.537534767131755 0.677013887550826 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 63922752 T/A 1 12 14 26 5.54958279441894 7.52548673984457 -1.97590394542563 A:T T A 10 0.537534767131755 0.440566012205601 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63922665_63922834:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63922665_63922834:HERC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 63937209 C/G 1 12 13 25 5.54958279441894 6.98795197271281 -1.43836917829387 C:G C G 10 0.537534767131755 0.689197984829322 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63937191_63937296:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63937191_63937296:HERC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 63954029 C/T 1 17 7 24 7.86190895876017 3.76274336992228 4.09916558883788 T:C C T 10 0.537534767131755 0.104256192462200 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63953952_63954220:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63953952_63954220:HERC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 63988357 C/G 1 7 10 17 3.23725663007772 5.37534767131755 -2.13809104123983 C:G C G 10 0.537534767131755 0.337166426523694 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63988323_63988538:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63988323_63988538:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000425434:exon_63988323_63988538:HERC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 64710827 T/C 1 14 10 24 6.47451326015543 5.37534767131755 1.09916558883788 T:C T C 10 0.537534767131755 0.68779414869778 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64710740_64710927:TRIP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 64962630 A/C 1 17 24 41 7.86190895876017 12.9008344111621 -5.03892545240195 A:C A C 10 0.537534767131755 0.119939508366236 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64962545_64962632:ZNF609 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 65108504 A/T 1 57 57 114 26.36051827349 30.63948172651 -4.27896345302007 A:T A T 10 0.537534767131755 0.452846474090664 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 65110472 G/A 1 32 32 64 14.7988874517838 17.2011125482162 -2.40222509643232 A:G G A 10 0.537534767131755 0.616466408438257 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65110456_65110543:PIF1;ENSG00000140451:ENST00000333425:exon_65110456_65110543:PIF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 65113493 G/A 1 4 8 12 1.84986093147298 4.30027813705404 -2.45041720558106 A:G G A 10 0.537534767131755 0.246047854304642 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 65553246 C/T 1 10 12 22 4.62465232868245 6.45041720558106 -1.82576487689861 T:C C T 10 0.537534767131755 0.522987558786596 ENSG00000138617:ENST00000261888:exon_65553223_65553364:PARP16;ENSG00000138617:ENST00000444347:exon_65553223_65553364:PARP16;ENSG00000138617:ENST00000432843:exon_65553223_65553364:PARP16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 66629403 C/A 1 13 17 30 6.01204802728719 9.13809104123983 -3.12604301395265 A:C C A 10 0.537534767131755 0.275642214828244 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66629052_66629519:TIPIN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 66641732 G/C 1 17 11 28 7.86190895876017 5.91288243844931 1.94902652031086 C:G G C 10 0.537534767131755 0.570669312486509 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66641653_66641775:TIPIN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 66679684 A/G 1 106 137 243 49.021314684034 73.6422630970504 -24.6209484130165 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.00159755146203639 ENSG00000169032:ENST00000307102:exon_66679155_66679765:MAP2K1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 66793480 C/T 1 9 8 17 4.16218709581421 4.30027813705404 -0.138091041239834 T:C C T 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 69709748 C/A 1 14 21 35 6.47451326015543 11.2882301097669 -4.81371684961142 A:C C A 10 0.537534767131755 0.126582816053195 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69709722_69709850:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69709722_69709850:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69709722_69709850:KIF23 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 69728949 A/G 1 16 20 36 7.39944372589192 10.7506953426351 -3.35125161674318 A:G A G 10 0.537534767131755 0.316355438624169 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728903_69729061:KIF23 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 69732736 C/T 1 27 18 45 12.4865612874426 9.67562580837159 2.81093547907103 T:C C T 10 0.537534767131755 0.456125253323194 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 70351788 T/C 1 59 24 83 27.2854487392265 12.9008344111621 14.3846143280643 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00187303976378866 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 70352968 C/G 1 35 16 51 16.1862831503886 8.60055627410808 7.5857268762805 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0352660117826453 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70352869_70352988:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70352869_70352988:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70352869_70352988:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70352869_70352988:TLE3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 74277795 T/C 1 11 7 18 5.08711756155069 3.76274336992228 1.32437419162841 T:C T C 10 0.537534767131755 0.639329189576991 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74277659_74277854:STOML1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 56 36 92 25.8980530406217 19.3512516167432 6.54680142387855 A:G A G 10 0.537534767131755 0.175814116051226 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 62 46 108 28.6728444378312 24.7265992880607 3.94624514977046 T:G G T 10 0.537534767131755 0.499605033373169 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 438 436 874 202.559771996291 234.365158469445 -31.8053864731538 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.0325535427772541 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 75130093 T/C 1 30 2 32 13.8739569860474 1.07506953426351 12.7988874517838 T:C T C 10 0.537534767131755 1.09683698618906e-06 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 75131661 A/G 1 28 27 55 12.9490265203109 14.5134387125574 -1.56441219224652 A:G A G 10 0.537534767131755 0.687085212956317 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131609_75131714:ULK3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 75932172 G/A 1 84 100 184 38.8470795609326 53.7534767131755 -14.9063971522429 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0317765072415535 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 77021058 C/T 1 6 11 17 2.77479139720947 5.91288243844931 -3.13809104123983 T:C C T 10 0.537534767131755 0.148136675277047 ENSG00000140386:ENST00000324767:exon_77020936_77021078:SCAPER;ENSG00000140386:ENST00000303521:exon_77020936_77021078:SCAPER HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 77329400 G/A 1 19 7 26 8.78683942449666 3.76274336992228 5.02409605457437 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0509553127398684 ENSG00000140368:ENST00000379595:exon_77329386_77329671:PSTPIP1;ENSG00000140368:ENST00000267939:exon_77329386_77329671:PSTPIP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 77329568 G/A 1 9 8 17 4.16218709581421 4.30027813705404 -0.138091041239834 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000140368:ENST00000379595:exon_77329386_77329671:PSTPIP1;ENSG00000140368:ENST00000267939:exon_77329386_77329671:PSTPIP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 40 50 90 18.4986093147298 26.8767383565877 -8.37812904185795 A:T T A 10 0.537534767131755 0.0903122991381845 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 78317837 C/G 1 22 11 33 10.1742351231014 5.91288243844931 4.26135268465208 C:G C G 10 0.537534767131755 0.163167276617690 ENSG00000167202:ENST00000418039:exon_78317601_78317839:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000409931:exon_78317601_78317839:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000300584:exon_78317601_78317839:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000420639:exon_78317601_78317839:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000486703:exon_78317601_78317970:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000435468:exon_78317601_78317839:TBC1D2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 78885574 T/A 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 A:T T A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000169684:ENST00000299565:exon_78885434_78887611:CHRNA5;ENSG00000169684:ENST00000394802:exon_78885434_78887611:CHRNA5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 79054900 C/G 1 14 1 15 6.47451326015543 0.537534767131755 5.93697849302368 C:G C G 10 0.537534767131755 0.00143133726482341 ENSG00000136378:ENST00000258883:exon_79054745_79054907:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000388820:exon_79054745_79054907:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000438137:exon_79054745_79054907:ADAMTS7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 79215311 A/C 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:C A C 10 0.537534767131755 0.732674349299313 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 79224747 C/T 1 236 212 448 109.141794956906 113.957370631932 -4.81557567502622 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.66988383919149 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 80215146 C/T 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 T:C C T 10 0.537534767131755 0.74134570348407 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 80215300 T/C 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 T:C T C 10 0.537534767131755 0.190750883746296 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 82443824 C/T 1 24 13 37 11.0991655888379 6.98795197271281 4.11121361612507 T:C C T 10 0.537534767131755 0.190401096726678 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 82512429 C/G 1 14 19 33 6.47451326015543 10.2131605755033 -3.73864731534791 A:C:G C G 10 0.537534767131755 0.222785253283888 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82512419_82512570:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82512419_82512570:EFTUD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 83499766 G/A 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 A:G G A 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83499351_83499831:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83499351_83499831:WHAMM HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 83680287 A/G 1 10 9 19 4.62465232868245 4.83781290418579 -0.213160575503344 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000169609:ENST00000514272:exon_83680238_83680356:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000510873:exon_83680238_83680343:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000512638:exon_83680238_83680301:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000513601:exon_83680249_83680391:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000304177:exon_83680249_83680358:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000508990:exon_83680238_83680337:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000505341:exon_83678989_83680346:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000506912:exon_83680238_83680362:C15orf40 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 85188775 G/A 1 24 28 52 11.0991655888379 15.0509734796891 -3.95180789085126 A:G G A 10 0.537534767131755 0.330367827822785 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 85326955 G/A 1 11 6 17 5.08711756155069 3.22520860279053 1.86190895876017 A:G G A 10 0.537534767131755 0.4682435751469 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85325885_85328126:ZNF592 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 85333953 A/G 1 24 14 38 11.0991655888379 7.52548673984457 3.57367884899331 A:G A G 10 0.537534767131755 0.259528828670956 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85333936_85334114:ZNF592 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 85341519 C/G 1 1 7 8 0.462465232868245 3.76274336992228 -3.30027813705404 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0285185064817781 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 85341859 G/A 1 25 18 43 11.5616308217061 9.67562580837159 1.88600501333454 A:G G A 10 0.537534767131755 0.647234984169326 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85341819_85342106:ZNF592 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86122654 T/C 1 12 10 22 5.54958279441894 5.37534767131755 0.174235123101391 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86122779 T/C 1 16 11 27 7.39944372589192 5.91288243844931 1.48656128744262 T:C T C 10 0.537534767131755 0.700334466477321 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86122916 T/C 1 12 3 15 5.54958279441894 1.61260430139526 3.93697849302368 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0663367408872343 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86123019 C/T 1 10 6 16 4.62465232868245 3.22520860279053 1.39944372589192 T:C C T 10 0.537534767131755 0.618373054653884 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86123462 T/C 1 17 7 24 7.86190895876017 3.76274336992228 4.09916558883788 T:C T C 10 0.537534767131755 0.104256192462200 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86123833 T/C 1 11 5 16 5.08711756155069 2.68767383565877 2.39944372589192 T:C T C 10 0.537534767131755 0.317045039600351 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86123924 C/T 1 18 13 31 8.32437419162841 6.98795197271281 1.3364222189156 T:C C T 10 0.537534767131755 0.720009446141645 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86123988 G/A 1 10 9 19 4.62465232868245 4.83781290418579 -0.213160575503344 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86124419 C/T 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86124483 C/G 1 13 6 19 6.01204802728719 3.22520860279053 2.78683942449666 C:G C G 10 0.537534767131755 0.252178981986345 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86124555 G/A 1 13 21 34 6.01204802728719 11.2882301097669 -5.27618208247967 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.0848552883526125 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86124946 T/C 1 12 13 25 5.54958279441894 6.98795197271281 -1.43836917829387 T:C T C 10 0.537534767131755 0.689197984829322 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86124968 G/A 1 10 11 21 4.62465232868245 5.91288243844931 -1.28823010976685 A:G G A 10 0.537534767131755 0.663607311505883 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86125031 G/A 1 24 9 33 11.0991655888379 4.83781290418579 6.26135268465209 A:G G A 10 0.537534767131755 0.035100879890367 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86125304 C/T 1 15 14 29 6.93697849302368 7.52548673984457 -0.588508246820894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.854060782439014 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 64 45 109 29.5977749035677 24.189064520929 5.40871038263871 T:C C T 10 0.537534767131755 0.336931551572244 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 86287867 G/A 1 40 38 78 18.4986093147298 20.4263211510067 -1.92771183627689 A:G G A 10 0.537534767131755 0.73362082596045 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 89169614 A/G 1 41 30 71 18.961074547598 16.1260430139526 2.8350315336454 A:G A G 10 0.537534767131755 0.552536884296701 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 89169858 A/G 1 50 35 85 23.1232616434123 18.8137168496114 4.30954479380083 A:G A G 10 0.537534767131755 0.384849145021701 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 89172558 G/C 1 17 14 31 7.86190895876017 7.52548673984457 0.336422218915597 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89172457_89172657:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89172457_89172657:AEN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 414 312 726 191.460606407453 167.710847345108 23.7497590623459 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0802239197501168 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 280 237 517 129.490265203109 127.395739810226 2.09452539288267 A:G A G 10 0.537534767131755 0.860092533012126 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 89421249 G/A 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 A:G G A 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000140511:ENST00000359595:exon_89420519_89421487:HAPLN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 89450587 G/T 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:G G T 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000140545:ENST00000268150:exon_89450426_89450607:MFGE8;ENSG00000140545:ENST00000268151:exon_89450426_89450607:MFGE8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 89695055 C/T 1 22 15 37 10.1742351231014 8.06302150697632 2.11121361612506 T:C C T 10 0.537534767131755 0.514173464877861 ENSG00000140526:ENST00000352732:exon_89694908_89695083:ABHD2;ENSG00000140526:ENST00000355100:exon_89694908_89695083:ABHD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 91010776 T/C 1 44 44 88 20.3484702462028 23.6515297537972 -3.30305950759444 T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.521739743200161 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91010682_91010824:IQGAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 91303411 T/C 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 T:C T C 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91303377_91303509:BLM HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 91354521 G/A 1 13 20 33 6.01204802728719 10.7506953426351 -4.73864731534791 A:G G A 10 0.537534767131755 0.116223539844059 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 91424574 G/C 1 22 34 56 10.1742351231014 18.2761820824797 -8.10194695937828 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0321712554464643 ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91424516_91426688:FURIN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 91452595 A/G 1 14 6 20 6.47451326015543 3.22520860279053 3.2493046573649 A:G A G 10 0.537534767131755 0.180165257217980 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91452557_91452734:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91452557_91452734:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91452557_91452734:MAN2A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 91474738 G/C 1 4 12 16 1.84986093147298 6.45041720558106 -4.60055627410808 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0242209614480061 ENSG00000184508:ENST00000330334:exon_91474155_91474786:HDDC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 91478544 A/C 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 A:C A C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91478174_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000495068:exon_91478515_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000497152:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91478516_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000439771:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000486253:exon_91478540_91478605:UNC45A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 93567740 T/C 1 56 45 101 25.8980530406217 24.189064520929 1.70898851969275 T:C T C 10 0.537534767131755 0.765322838258376 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 99759194 T/C 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 T:C T C 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000103852:ENST00000459771:exon_99759103_99759253:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394132:exon_99759103_99759253:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000434186:exon_99759103_99759253:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394136:exon_99759103_99759253:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000262074:exon_99759103_99759253:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000427087:exon_99759103_99759253:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000421732:exon_99759103_99759253:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000413876:exon_99759103_99759253:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000494567:exon_99758793_99759253:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394135:exon_99759103_99759253:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394130:exon_99759103_99759253:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000394129:exon_99759103_99759253:TTC23;ENSG00000103852:ENST00000431450:exon_99759103_99759253:TTC23 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 100246936 T/C 1 23 19 42 10.6367003559696 10.2131605755033 0.423539780466291 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000068305:ENST00000354410:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000346108:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000449277:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000338042:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000453228:exon_100246934_100247060:MEF2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 101109677 C/A 1 17 11 28 7.86190895876017 5.91288243844931 1.94902652031086 A:C C A 10 0.537534767131755 0.570669312486509 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 101109794 C/G 1 19 19 38 8.78683942449666 10.2131605755033 -1.42632115100669 C:G C G 10 0.537534767131755 0.745416232968685 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 15 20 35 6.93697849302368 10.7506953426351 -3.81371684961142 A:G G A 10 0.537534767131755 0.235686232316037 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 101109893 C/A 1 15 16 31 6.93697849302368 8.60055627410808 -1.6635777810844 A:C C A 10 0.537534767131755 0.591851170939278 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 101110265 T/A 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 A:T T A 10 0.537534767131755 0.760762761058777 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 101110302 C/G 1 11 4 15 5.08711756155069 2.15013906852702 2.93697849302368 C:G C G 10 0.537534767131755 0.194241334120294 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 101113950 A/G 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 A:G A G 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 101120963 T/C 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 T:C T C 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101120649_101121152:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101120649_101121150:LINS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 101562793 G/A 1 24 23 47 11.0991655888379 12.3632996440304 -1.26413405519248 A:G G A 10 0.537534767131755 0.770600413711711 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101562588_101562802:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101562588_101562802:LRRK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 101595257 G/A 1 15 27 42 6.93697849302368 14.5134387125574 -7.57646021953371 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0204134363416753 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101595151_101595428:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101595151_101595428:LRRK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 44 52 96 20.3484702462028 27.9518078908513 -7.60333764464848 T:C C T 10 0.537534767131755 0.125460849879078 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 101718927 G/A 1 17 24 41 7.86190895876017 12.9008344111621 -5.03892545240195 A:G G A 10 0.537534767131755 0.119939508366236 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 102192540 T/G 1 14 8 22 6.47451326015543 4.30027813705404 2.17423512310139 T:G T G 10 0.537534767131755 0.398340723938621 ENSG00000184277:ENST00000428002:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000347970:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102192474_102192570:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000453041:exon_102192474_102192594:TM2D3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 15 102264304 G/C 1 16 13 29 7.39944372589192 6.98795197271281 0.411491753179106 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102264294_102264807:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102264294_102264645:TARSL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 105444 C/T 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000161981:ENST00000466183:exon_104960_105549:SNRNP25 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 129654 C/T 1 117 95 212 54.1084322455847 51.0658028775167 3.04262936806794 T:C C T 10 0.537534767131755 0.68021662331253 ENSG00000103152:ENST00000436333:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397817:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000356432:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000428050:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000475280:exon_129424_129843:MPG;ENSG00000103152:ENST00000219431:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397818:exon_129424_129699:MPG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 180529 G/A 1 15 23 38 6.93697849302368 12.3632996440304 -5.42632115100669 A:G G A 10 0.537534767131755 0.102589905124565 ENSG00000103148:ENST00000405960:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000445810:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000428323:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399957:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399953:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000262313:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399951:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000457916:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000468260:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000456528:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000419636:exon_180521_180590:NPRL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 315008 A/G 1 51 39 90 23.5857268762805 20.9638559181384 2.62187095814205 A:G A G 10 0.537534767131755 0.598751039609667 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_314810_316124:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_314810_316119:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_314810_316090:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000424016:exon_314810_315089:ITFG3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 347184 A/G 1 43 44 87 19.8860050133345 23.6515297537972 -3.76552474046268 A:G A G 10 0.537534767131755 0.452305230977496 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347056_347226:AXIN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 397044 G/T 1 13 14 27 6.01204802728719 7.52548673984457 -1.51343871255738 T:G G T 10 0.537534767131755 0.569240590365238 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_396148_397106:AXIN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 424277 G/A 1 47 40 87 21.7358659448075 21.5013906852702 0.234475259537319 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 426761 G/A 1 33 36 69 15.2613526846521 19.3512516167432 -4.08989893209109 A:G G A 10 0.537534767131755 0.336240941304398 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426544_426812:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426544_426812:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426544_426812:TMEM8A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 449345 G/C 1 3 9 12 1.38739569860474 4.83781290418579 -3.45041720558106 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0780478267108081 ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449295_449480:NME4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 179 185 364 82.7812766834159 99.4439319193747 -16.6626552359588 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0828677680599025 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 450165 T/C 1 8 7 15 3.69972186294596 3.76274336992228 -0.0630215069763245 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_450109_450190:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 266 238 504 123.015751942953 127.933274577358 -4.91752263440451 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.687707313195593 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 570471 C/T 1 21 44 65 9.71176989023315 23.6515297537972 -13.9397598635641 T:C C T 10 0.537534767131755 0.000667129951554953 ENSG00000090565:ENST00000262305:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000457159:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000434585:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000450428:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000448401:exon_570459_570599:RAB11FIP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 601632 T/C 1 31 32 63 14.3364222189156 17.2011125482162 -2.86469032930056 T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.528032442419527 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_601512_601664:SOLH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 602595 G/C 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 C:G G C 10 0.537534767131755 0.760762761058777 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 63 64 127 29.1353096706994 34.4022250964323 -5.26691542573288 A:G A G 10 0.537534767131755 0.373915808358931 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 723650 C/T 1 69 62 131 31.9101010679089 33.3271555621688 -1.4170544942599 T:C C T 10 0.537534767131755 0.860983010519551 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 772061 C/T 1 12 4 16 5.54958279441894 2.15013906852702 3.39944372589192 T:C C T 10 0.537534767131755 0.130562570499175 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 774520 C/T 1 29 12 41 13.4114917531791 6.45041720558106 6.96107454759805 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0404107590443571 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482152:exon_774322_774635:CCDC78 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 774692 A/G 1 13 9 22 6.01204802728719 4.83781290418579 1.17423512310139 A:G A G 10 0.537534767131755 0.67355127074083 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 839269 G/A 1 19 15 34 8.78683942449666 8.06302150697632 0.72381791752033 A:G G A 10 0.537534767131755 0.864547358513853 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_839210_839362:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_838931_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_839214_839360:CHTF18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 840378 A/G 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 A:G A G 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_840331_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000484349:exon_840347_840399:CHTF18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 840597 C/T 1 7 9 16 3.23725663007772 4.83781290418579 -1.60055627410808 T:C C T 10 0.537534767131755 0.460588608389532 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_840531_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840525_842367:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_840525_840805:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840525_842347:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_840525_840671:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_840525_840666:CHTF18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 845742 G/A 1 42 34 76 19.4235397804663 18.2761820824797 1.14735769798662 A:G G A 10 0.537534767131755 0.818936777801775 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 845819 A/G 1 32 33 65 14.7988874517838 17.7386473153479 -2.93975986356407 A:G A G 10 0.537534767131755 0.534318863442262 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 1004554 C/T 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 T:C C T 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_1004357_1004666:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_1004357_1004666:LMF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 1416355 C/T 1 27 42 69 12.4865612874426 22.5764602195337 -10.0898989320911 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0157436740368462 ENSG00000059145:ENST00000248104:exon_1413206_1416396:UNKL;ENSG00000059145:ENST00000389221:exon_1413206_1416396:UNKL;ENSG00000059145:ENST00000403703:exon_1413206_1416396:UNKL;ENSG00000059145:ENST00000391893:exon_1413206_1416396:UNKL;ENSG00000059145:ENST00000397464:exon_1415000_1416396:UNKL;ENSG00000059145:ENST00000402641:exon_1415666_1416396:UNKL;ENSG00000059145:ENST00000508903:exon_1415809_1416396:UNKL;ENSG00000059145:ENST00000511095:exon_1416279_1416396:UNKL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 1544301 G/C 1 18 6 24 8.32437419162841 3.22520860279053 5.09916558883788 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0409179166547511 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 1544302 A/G 1 18 6 24 8.32437419162841 3.22520860279053 5.09916558883788 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0409179166547511 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 1545448 A/G 1 22 15 37 10.1742351231014 8.06302150697632 2.11121361612506 A:G A G 10 0.537534767131755 0.514173464877861 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1545347_1545624:TELO2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 48 39 87 22.1983311776758 20.9638559181384 1.23447525953732 A:G A G 10 0.537534767131755 0.830248550109529 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 40 36 76 18.4986093147298 19.3512516167432 -0.852642302013376 T:C T C 10 0.537534767131755 0.908546404719293 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 1657284 C/G 1 3 8 11 1.38739569860474 4.30027813705404 -2.9128824384493 C:G C G 10 0.537534767131755 0.127253645182292 ENSG00000187535:ENST00000397417:exon_1657121_1657298:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000426508:exon_1657121_1657298:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000458658:exon_1657121_1657300:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000361339:exon_1657121_1657300:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000439987:exon_1657121_1657300:IFT140 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 1814440 A/G 1 36 42 78 16.6487483832568 22.5764602195337 -5.92771183627688 A:G A G 10 0.537534767131755 0.211407317605627 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 1823444 C/G 1 14 6 20 6.47451326015543 3.22520860279053 3.2493046573649 C:G C G 10 0.537534767131755 0.180165257217980 ENSG00000197774:ENST00000454910:exon_1823229_1823475:EME2;ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1823229_1823475:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1823327_1823475:EME2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 65 56 121 30.0602401364359 30.1019469593783 -0.0417068229423521 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 1838640 T/C 1 74 80 154 34.2224272322501 43.0027813705404 -8.78035413829026 T:C T C 10 0.537534767131755 0.169536451118623 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 1877494 T/C 1 19 41 60 8.78683942449666 22.038925452402 -13.2520860279053 T:C T C 10 0.537534767131755 0.000667482081473126 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 1877558 G/A 1 24 37 61 11.0991655888379 19.8887863838749 -8.78962079503705 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0284952848418387 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 42 45 87 19.4235397804663 24.189064520929 -4.76552474046268 A:C A C 10 0.537534767131755 0.333736770768006 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2025604 G/C 1 71 63 134 32.8350315336454 33.8646903293006 -1.02965879565517 C:G G C 10 0.537534767131755 0.862906921748977 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2025678 C/A 1 38 35 73 17.5736788489933 18.8137168496114 -1.24003800061811 A:C C A 10 0.537534767131755 0.814849439690752 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 89 81 170 41.1594057252738 43.5403161376721 -2.38091041239834 A:C A C 10 0.537534767131755 0.758466613824766 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 52 46 98 24.0481921091487 24.7265992880607 -0.678407178911986 T:C T C 10 0.537534767131755 0.919510546751203 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2048796 C/T 1 67 81 148 30.9851706021724 43.5403161376721 -12.5551455354997 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0395256236173982 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2048826 C/G 1 46 62 108 21.2734007119393 33.3271555621688 -12.0537548502295 A:C:G C G 10 0.537534767131755 0.0206653197721721 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 85 88 173 39.3095447938008 47.3030595075944 -7.99351471379362 A:G A G 10 0.537534767131755 0.223666250156043 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2049728 C/T 1 89 101 190 41.1594057252738 54.2910114803073 -13.1316057550334 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0586353744398522 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2049849 T/C 1 72 93 165 33.2974967665136 49.9907333432532 -16.6932365767396 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00988428041850565 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2050192 G/T 1 64 76 140 29.5977749035677 40.8526423020134 -11.2548673984457 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0620826581210621 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2256461 C/G 1 3 16 19 1.38739569860474 8.60055627410808 -7.21316057550334 C:G C G 10 0.537534767131755 0.000899814497223144 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2285357 C/T 1 38 41 79 17.5736788489933 22.038925452402 -4.46524660340864 T:C C T 10 0.537534767131755 0.366819192549602 ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2305624 C/G 1 37 89 126 17.1112136161251 47.8405942747262 -30.7293806586011 C:G C G 10 0.537534767131755 4.57341716059198e-08 ENSG00000205937:ENST00000320225:exon_2305586_2305727:RNPS1;ENSG00000205937:ENST00000397086:exon_2305586_2305727:RNPS1;ENSG00000205937:ENST00000301730:exon_2305586_2305727:RNPS1;ENSG00000167970:ENST00000454671:exon_2305586_2305729:AC009065.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2813626 C/G 1 267 274 541 123.478217175821 147.284526194101 -23.8063090182794 A:T:C:G C G 10 0.537534767131755 0.0426558676066109 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 2946433 C/T 1 29 30 59 13.4114917531791 16.1260430139526 -2.71455126077354 T:C C T 10 0.537534767131755 0.515144417722252 ENSG00000162076:ENST00000396958:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000431751:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000293981:exon_2946353_2946772:FLYWCH2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 3074336 A/C 1 26 28 54 12.0240960545744 15.0509734796891 -3.02687742511477 A:T:C A C 10 0.537534767131755 0.416528165008286 ENSG00000131652:ENST00000253952:exon_3074032_3074366:THOC6;ENSG00000131652:ENST00000326266:exon_3074032_3074366:THOC6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 3170188 C/T 1 22 11 33 10.1742351231014 5.91288243844931 4.26135268465208 T:C C T 10 0.537534767131755 0.163167276617690 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 32 35 67 14.7988874517838 18.8137168496114 -4.01482939782758 C:G C G 10 0.537534767131755 0.330094774632867 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 3613126 C/T 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000167984:ENST00000448023:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000301749:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000359128:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000419350:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000324659:exon_3611703_3614613:NLRC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 3613150 A/G 1 9 9 18 4.16218709581421 4.83781290418579 -0.675625808371588 A:G A G 10 0.537534767131755 0.815602186334409 ENSG00000167984:ENST00000448023:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000301749:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000359128:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000419350:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000324659:exon_3611703_3614613:NLRC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 3639139 A/G 1 10 10 20 4.62465232868245 5.37534767131755 -0.750695342635099 A:G A G 10 0.537534767131755 0.824049778597606 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 3656482 C/T 1 6 10 16 2.77479139720947 5.37534767131755 -2.60055627410808 T:C C T 10 0.537534767131755 0.217010442931191 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3656475_3656699:SLX4;ENSG00000188827:ENST00000466154:exon_3656475_3656699:SLX4;ENSG00000188827:ENST00000486524:exon_3656475_3656699:SLX4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 3781313 G/A 1 23 22 45 10.6367003559696 11.8257648768986 -1.18906452092897 A:G G A 10 0.537534767131755 0.766092023705327 ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3781193_3781474:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3781193_3781474:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3781193_3781474:CREBBP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 4386814 T/C 1 13 5 18 6.01204802728719 2.68767383565877 3.32437419162841 T:C T C 10 0.537534767131755 0.155872428250262 ENSG00000126603:ENST00000262366:exon_4386726_4389598:GLIS2;ENSG00000126603:ENST00000433375:exon_4386726_4389598:GLIS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 17 29 46 7.86190895876017 15.5885082468209 -7.72659928806073 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0260534560280840 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 34 31 65 15.7238179175203 16.6635777810844 -0.93975986356407 T:C T C 10 0.537534767131755 0.901135637321606 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 25 28 53 11.5616308217061 15.0509734796891 -3.48934265798301 A:T A T 10 0.537534767131755 0.339248997526732 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 36 28 64 16.6487483832568 15.0509734796891 1.59777490356768 A:T T A 10 0.537534767131755 0.708849299154523 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 13 10 23 6.01204802728719 5.37534767131755 0.636700355969636 T:C C T 10 0.537534767131755 0.837163996404797 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 4751045 C/T 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4750971_4751135:ANKS3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 4752134 A/G 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 A:G A G 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4752103_4752243:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4752103_4752243:ANKS3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 4764117 A/C 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 A:C A C 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4764052_4764187:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4764052_4764187:ANKS3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 8722629 G/C 1 7 20 27 3.23725663007772 10.7506953426351 -7.51343871255738 C:G G C 10 0.537534767131755 0.00577636741592833 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 10989219 C/G 1 28 26 54 12.9490265203109 13.9759039454256 -1.02687742511477 C:G C G 10 0.537534767131755 0.78666637674601 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_10989139_10989285:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_10989139_10989285:CIITA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 10995850 G/T 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 T:G G T 10 0.537534767131755 0.592540852178834 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 11017058 G/A 1 9 11 20 4.16218709581421 5.91288243844931 -1.7506953426351 A:G G A 10 0.537534767131755 0.504150670545082 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 80 76 156 36.9972186294596 40.8526423020134 -3.85542367255378 A:C:G C G 10 0.537534767131755 0.574289984179627 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 11862282 T/A 1 9 10 19 4.16218709581421 5.37534767131755 -1.21316057550334 A:T T A 10 0.537534767131755 0.648761877832002 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11862171_11862357:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11862171_11862357:ZC3H7A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 11933678 G/C 1 489 527 1016 226.145498872572 283.280822278435 -57.135323405863 A:C:G G C 10 0.537534767131755 0.000332657425154934 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11933552_11933842:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11933552_11933842:RSL1D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 54 69 123 24.9731225748852 37.0898989320911 -12.1167763572059 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0300193462194929 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 12009304 C/A 1 19 17 36 8.78683942449666 9.13809104123983 -0.351251616743179 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_12009226_12009762:GSPT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 12061626 G/A 1 91 106 197 42.0843361910103 56.978685315966 -14.8943491249557 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0380204914605249 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 15129940 C/T 1 48 55 103 22.1983311776758 29.5644121922465 -7.36608101457076 T:C C T 10 0.537534767131755 0.166351226928482 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 15703380 T/C 1 15 12 27 6.93697849302368 6.45041720558106 0.486561287442616 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000166783:ENST00000396368:exon_15703380_15703582:KIAA0430;ENSG00000166783:ENST00000321370:exon_15703380_15703582:KIAA0430;ENSG00000166783:ENST00000344181:exon_15703380_15703582:KIAA0430 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 15711335 G/A 1 10 10 20 4.62465232868245 5.37534767131755 -0.750695342635099 A:G G A 10 0.537534767131755 0.824049778597606 ENSG00000166783:ENST00000396368:exon_15711156_15711392:KIAA0430;ENSG00000166783:ENST00000321370:exon_15711156_15711392:KIAA0430;ENSG00000166783:ENST00000344181:exon_15711156_15711392:KIAA0430 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 15793639 C/T 1 51 48 99 23.5857268762805 25.8016688223242 -2.21594194604374 T:C C T 10 0.537534767131755 0.687411756876035 ENSG00000072864:ENST00000396353:exon_15793586_15793679:NDE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 15818653 G/A 1 55 61 116 25.4355878077535 32.7896207950371 -7.35403298728357 A:G G A 10 0.537534767131755 0.192287567862669 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818504_15818656:MYH11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 16162019 T/C 1 37 32 69 17.1112136161251 17.2011125482162 -0.0898989320910921 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16162013_16162159:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16162013_16162159:ABCC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 18839362 T/C 1 24 10 34 11.0991655888379 5.37534767131755 5.72381791752033 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0579717447496075 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18839353_18839490:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18839353_18839493:SMG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 18861335 A/G 1 22 25 47 10.1742351231014 13.4383691782939 -3.26413405519248 A:G A G 10 0.537534767131755 0.381193670252001 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18861271_18861448:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18861271_18861448:SMG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 19547357 A/G 1 4 7 11 1.84986093147298 3.76274336992228 -1.9128824384493 A:G A G 10 0.537534767131755 0.365659915960336 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 19547503 C/T 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 T:C C T 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 19547747 C/G 1 11 5 16 5.08711756155069 2.68767383565877 2.39944372589192 C:G C G 10 0.537534767131755 0.317045039600351 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 19548740 A/G 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 A:G A G 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 21272591 G/C 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 C:G G C 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000103316:ENST00000219599:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000396023:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000415987:exon_21272575_21272659:CRYM HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 22237118 A/G 1 28 20 48 12.9490265203109 10.7506953426351 2.19833117767576 A:G A G 10 0.537534767131755 0.564873253003489 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22236975_22237296:EEF2K HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 22237273 C/G 1 28 17 45 12.9490265203109 9.13809104123983 3.81093547907103 C:G C G 10 0.537534767131755 0.296249081187902 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22236975_22237296:EEF2K HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 22277965 T/C 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:C T C 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 22319517 T/G 1 27 27 54 12.4865612874426 14.5134387125574 -2.02687742511477 T:G T G 10 0.537534767131755 0.588219967373995 ENSG00000058600:ENST00000299853:exon_22319469_22319546:POLR3E;ENSG00000058600:ENST00000359210:exon_22319469_22319546:POLR3E;ENSG00000058600:ENST00000431699:exon_22319469_22319546:POLR3E;ENSG00000058600:ENST00000418581:exon_22319469_22319546:POLR3E HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 23080634 C/A 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000103404:ENST00000219689:exon_23072727_23080937:USP31;ENSG00000103404:ENST00000381162:exon_23080144_23080937:USP31 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 23489711 C/G 1 70 68 138 32.3725663007772 36.5523641649593 -4.17979786418218 T:C:G C G 10 0.537534767131755 0.495306047194946 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 23535680 A/C 1 15 42 57 6.93697849302368 22.5764602195337 -15.63948172651 A:C A C 10 0.537534767131755 4.46206529825824e-05 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23533335_23535775:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23534832_23535775:EARS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 23536684 T/C 1 8 13 21 3.69972186294596 6.98795197271281 -3.28823010976685 T:C T C 10 0.537534767131755 0.189542373698344 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23536448_23536700:EARS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 23546561 G/C 1 10 12 22 4.62465232868245 6.45041720558106 -1.82576487689861 C:G G C 10 0.537534767131755 0.522987558786596 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23546209_23546681:EARS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 23563501 C/T 1 12 11 23 5.54958279441894 5.91288243844931 -0.363299644030365 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23563470_23563625:EARS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 23607504 G/C 1 84 67 151 38.8470795609326 36.0148293978276 2.832250163105 C:G G C 10 0.537534767131755 0.683540020793786 ENSG00000004779:ENST00000007516:exon_23607444_23607677:NDUFAB1;ENSG00000004779:ENST00000484769:exon_23607444_23607624:NDUFAB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 23677006 A/G 1 36 53 89 16.6487483832568 28.489342657983 -11.8405942747262 A:T:G A G 10 0.537534767131755 0.0141101868843600 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23676947_23677049:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23676996_23677049:DCTN5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 23847575 C/A 1 39 24 63 18.0361440818616 12.9008344111621 5.13530967069944 A:C C A 10 0.537534767131755 0.208184505802091 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_23847322_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_23847345_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000498058:exon_23847403_23847669:PRKCB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 24231252 G/A 1 45 52 97 20.810935479071 27.9518078908513 -7.14087241178023 A:G G A 10 0.537534767131755 0.154665881973841 ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24225979_24231932:PRKCB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 72 77 149 33.2974967665136 41.3901770691451 -8.09268030263149 A:G A G 10 0.537534767131755 0.18941282346065 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 24980079 G/A 1 62 83 145 28.6728444378312 44.6153856719357 -15.9425412341045 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0095999929718885 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24980024_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24979982_24980093:ARHGAP17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 64 75 139 29.5977749035677 40.3151075348816 -10.7173326313139 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0740151562042784 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 50 38 88 23.1232616434123 20.4263211510067 2.69694049240556 T:C T C 10 0.537534767131755 0.594190223910553 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 28181225 G/A 1 36 36 72 16.6487483832568 19.3512516167432 -2.70250323348635 A:G G A 10 0.537534767131755 0.555633281810188 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28181071_28181230:XPO6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 28508447 A/G 1 2 14 16 0.92493046573649 7.52548673984457 -6.60055627410808 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00151292543059894 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 28602991 A/G 1 10 8 18 4.62465232868245 4.30027813705404 0.324374191628411 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 28847246 T/C 1 19 30 49 8.78683942449666 16.1260430139526 -7.33920358945599 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0440317927125019 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 28944700 G/T 1 94 86 180 43.471731889615 46.2279899733309 -2.75625808371589 T:G G T 10 0.537534767131755 0.708845809282279 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944555_28944830:CD19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 28997537 C/T 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 ENSG00000213658:ENST00000395461:exon_28997456_28997537:LAT;ENSG00000213658:ENST00000354453:exon_28997456_28997537:LAT;ENSG00000213658:ENST00000454369:exon_28997456_28997537:LAT;ENSG00000213658:ENST00000395456:exon_28997456_28997537:LAT;ENSG00000213658:ENST00000360872:exon_28997456_28997537:LAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 29675928 C/T 1 205 218 423 94.8053727379902 117.182579234723 -22.3772064967324 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0318137806577621 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 30081367 G/T 1 7 15 22 3.23725663007772 8.06302150697632 -4.82576487689861 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0525164826134578 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 30408765 C/T 1 4 7 11 1.84986093147298 3.76274336992228 -1.9128824384493 T:C C T 10 0.537534767131755 0.365659915960336 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000528032:exon_30408651_30409012:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000524644:exon_30408651_30409001:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 30409241 A/G 1 18 9 27 8.32437419162841 4.83781290418579 3.48656128744262 A:G A G 10 0.537534767131755 0.246443933683272 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 30409699 C/T 1 23 24 47 10.6367003559696 12.9008344111621 -2.26413405519248 T:C C T 10 0.537534767131755 0.559616274993939 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 30536348 C/T 1 53 70 123 24.510657342017 37.6274336992228 -13.1167763572059 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0186903914390263 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 30536672 A/G 1 62 70 132 28.6728444378312 37.6274336992228 -8.95458926139166 A:G A G 10 0.537534767131755 0.137551122319733 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 30536918 C/G 1 44 67 111 20.3484702462028 36.0148293978276 -15.6663591516248 C:G C G 10 0.537534767131755 0.00308329532488606 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 30566747 G/A 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000169951:ENST00000252797:exon_30565085_30567431:ZNF764;ENSG00000169951:ENST00000395091:exon_30565085_30567428:ZNF764 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 30616538 G/A 1 15 12 27 6.93697849302368 6.45041720558106 0.486561287442616 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000156853:ENST00000287461:exon_30613879_30616768:ZNF689 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 30975492 C/T 1 13 19 32 6.01204802728719 10.2131605755033 -4.20111254821616 T:C C T 10 0.537534767131755 0.157163927051232 ENSG00000099381:ENST00000262519:exon_30975415_30975644:SETD1A;ENSG00000099381:ENST00000452917:exon_30975415_30975516:SETD1A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 31072909 G/A 1 20 17 37 9.2493046573649 9.13809104123983 0.111213616125067 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000232748:ENST00000417110:exon_31070902_31073948:AC135050.1;ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31072171_31073601:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31072171_31073601:ZNF668 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 31075175 G/A 1 6 13 19 2.77479139720947 6.98795197271281 -4.21316057550334 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0652517560612217 ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31075134_31075802:ZNF668 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 31088347 G/A 1 19 18 37 8.78683942449666 9.67562580837159 -0.888786383874933 A:G G A 10 0.537534767131755 0.869377065179406 ENSG00000167395:ENST00000428260:exon_31087567_31088365:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 31088625 A/G 1 15 11 26 6.93697849302368 5.91288243844931 1.02409605457437 A:G A G 10 0.537534767131755 0.84457724361591 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 31121793 G/A 1 63 62 125 29.1353096706994 33.3271555621688 -4.19184589146937 A:G G A 10 0.537534767131755 0.473707701708347 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31121722_31121801:BCKDK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 464 425 889 214.583868050866 228.452276030996 -13.8684079801301 A:C C A 10 0.537534767131755 0.363836942670801 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 50402695 G/A 1 5 29 34 2.31232616434123 15.5885082468209 -13.2761820824797 A:G G A 10 0.537534767131755 3.11237139687528e-06 ENSG00000166164:ENST00000394688:exon_50402637_50402845:BRD7;ENSG00000166164:ENST00000401491:exon_50402637_50402831:BRD7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 50733859 C/G 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 C:G C G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000167207:ENST00000526417:exon_50733399_50733865:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000300589:exon_50733399_50733865:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000527070:exon_50733399_50733865:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000532206:exon_50733399_50733865:NOD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 56396486 C/T 1 86 69 155 39.7720100266691 37.0898989320911 2.68211109457798 T:C C T 10 0.537534767131755 0.687744486923961 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 56518760 C/T 1 8 10 18 3.69972186294596 5.37534767131755 -1.67562580837159 T:C C T 10 0.537534767131755 0.483452727703955 ENSG00000125124:ENST00000245157:exon_56518366_56518779:BBS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 56839439 C/T 1 32 45 77 14.7988874517838 24.189064520929 -9.39017706914513 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0390524926987658 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56839416_56839544:NUP93 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 56870627 A/C 1 53 57 110 24.510657342017 30.63948172651 -6.12882438449305 A:C A C 10 0.537534767131755 0.252159656752842 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56870513_56870629:NUP93 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 56969148 G/A 1 321 212 533 148.451339750707 113.957370631932 34.4939691187746 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.00270994730316880 ENSG00000051108:ENST00000439977:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000379792:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000300302:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000344114:exon_56969147_56969224:HERPUD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 57015091 G/C 1 8 1 9 3.69972186294596 0.537534767131755 3.16218709581421 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0438485425040058 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57015070_57015137:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57015070_57015137:CETP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 57017319 G/A 1 35 25 60 16.1862831503886 13.4383691782939 2.7479139720947 A:G G A 10 0.537534767131755 0.518888651281361 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57017238_57017323:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57017238_57017323:CETP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 57060340 T/C 1 43 43 86 19.8860050133345 23.1139949866655 -3.22798997333093 T:C T C 10 0.537534767131755 0.517241356438645 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 57060353 T/C 1 49 41 90 22.660796410544 22.038925452402 0.621870958142051 T:C T C 10 0.537534767131755 0.916211317042915 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 57062177 T/A 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 A:T T A 10 0.537534767131755 0.760762761058777 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 57068106 A/G 1 18 5 23 8.32437419162841 2.68767383565877 5.63670035596964 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0206177205691347 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57068080_57068163:NLRC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 57068107 C/T 1 18 5 23 8.32437419162841 2.68767383565877 5.63670035596964 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0206177205691347 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57068080_57068163:NLRC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 57392733 A/C 1 104 215 319 48.0963842182975 115.569974933327 -67.4735907150298 A:C A C 10 0.537534767131755 3.45873308063934e-14 ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57392684_57392801:CCL22 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 57499902 T/C 1 62 57 119 28.6728444378312 30.63948172651 -1.96663728867884 T:C T C 10 0.537534767131755 0.714386318064657 ENSG00000102978:ENST00000219252:exon_57499865_57499933:POLR2C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 57786711 C/T 1 21 17 38 9.71176989023315 9.13809104123983 0.573678848993312 T:C C T 10 0.537534767131755 0.872470805174994 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786690_57786840:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786690_57786840:KATNB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 57787027 C/T 1 37 32 69 17.1112136161251 17.2011125482162 -0.0898989320910921 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786989_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786989_57787179:KATNB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 58030401 T/C 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 T:C T C 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000166188:ENST00000299237:exon_58028573_58032426:ZNF319 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 58030634 C/T 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000166188:ENST00000299237:exon_58028573_58032426:ZNF319 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 58032026 G/A 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 A:G G A 10 0.537534767131755 0.241009480668847 ENSG00000166188:ENST00000299237:exon_58028573_58032426:ZNF319 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 58575489 G/A 1 103 74 177 47.6339189854292 39.7775727677499 7.85634621767937 A:G G A 10 0.537534767131755 0.258279183331507 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58575405_58575524:CNOT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 58579274 C/T 1 102 90 192 47.171453752561 48.3781290418579 -1.20667528929695 T:C C T 10 0.537534767131755 0.885037328814308 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58579265_58579395:CNOT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 58587737 C/T 1 46 36 82 21.2734007119393 19.3512516167432 1.92214909519609 T:C C T 10 0.537534767131755 0.740019217152066 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58587686_58587764:CNOT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 58743454 A/C 1 99 55 154 45.7840580539563 29.5644121922465 16.2196458617097 A:C A C 10 0.537534767131755 0.00953644008904143 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000494627:exon_58742953_58743471:GOT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 58750604 G/A 1 102 61 163 47.171453752561 32.7896207950371 14.3818329575239 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0275602638140450 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58750567_58750717:GOT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 58757668 A/C 1 85 58 143 39.3095447938008 31.1770164936418 8.13252830015904 A:C A C 10 0.537534767131755 0.180357347405879 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 58757683 A/G 1 82 56 138 37.9221490951961 30.1019469593783 7.82020213581781 A:G A G 10 0.537534767131755 0.200444785792815 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 67199736 G/A 1 19 8 27 8.78683942449666 4.30027813705404 4.48656128744262 A:G G A 10 0.537534767131755 0.120983959944011 ENSG00000102878:ENST00000421453:exon_67199622_67199749:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000264009:exon_67199622_67199749:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000522870:exon_67199425_67199749:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000522295:exon_67199622_67199749:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000434833:exon_67199622_67199749:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000522023:exon_67199622_67199749:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000521314:exon_67199622_67199749:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000521624:exon_67199622_67199749:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000523562:exon_67199622_67199749:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000517685:exon_67199622_67199749:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000521374:exon_67199622_67199749:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000517729:exon_67199622_67199749:HSF4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 67214416 C/T 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000196123:ENST00000290881:exon_67213944_67214569:KIAA0895L;ENSG00000196123:ENST00000394016:exon_67213944_67214569:KIAA0895L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 67685900 C/T 1 106 60 166 49.021314684034 32.2520860279053 16.7692286561287 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0100286944417317 ENSG00000159753:ENST00000334583:exon_67685824_67685911:RLTPR;ENSG00000159753:ENST00000398282:exon_67685824_67685911:RLTPR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 67691515 C/A 1 40 30 70 18.4986093147298 16.1260430139526 2.37256630077715 A:C C A 10 0.537534767131755 0.63219047794507 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691433_67691587:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691435_67691587:ACD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 67691668 A/G 1 38 45 83 17.5736788489933 24.189064520929 -6.61538567193566 A:G A G 10 0.537534767131755 0.153378629157571 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 68055495 G/C 1 27 32 59 12.4865612874426 17.2011125482162 -4.71455126077354 C:G G C 10 0.537534767131755 0.240852215468084 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 68088485 A/G 1 18 16 34 8.32437419162841 8.60055627410808 -0.276182082479668 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000167264:ENST00000358896:exon_68088477_68088520:DUS2L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 68336360 A/G 1 22 22 44 10.1742351231014 11.8257648768986 -1.65152975379722 A:G A G 10 0.537534767131755 0.652091302972313 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68336284_68336404:SLC7A6OS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 68344363 A/C 1 10 17 27 4.62465232868245 9.13809104123983 -4.51343871255738 A:C A C 10 0.537534767131755 0.0859309769353234 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344238_68344516:SLC7A6OS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 68387457 C/T 1 32 33 65 14.7988874517838 17.7386473153479 -2.93975986356407 T:C C T 10 0.537534767131755 0.534318863442262 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68387395_68387469:PRMT7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 28 16 44 12.9490265203109 8.60055627410808 4.34847024620278 A:G G A 10 0.537534767131755 0.226699012191174 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 173 165 338 80.0064852862064 88.6932365767396 -8.68675129053318 T:C C T 10 0.537534767131755 0.354022338510124 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 69973825 G/A 1 36 40 76 16.6487483832568 21.5013906852702 -4.85264230201338 A:G G A 10 0.537534767131755 0.300681974193162 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 70164334 A/G 0 31 0 31 14.3364222189156 0 14.3364222189156 A A 10 0.537534767131755 5.92612533728618e-09 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70164326_70164447:PDPR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 70190401 C/T 1 37 8 45 17.1112136161251 4.30027813705404 12.810935479071 T:C C T 10 0.537534767131755 0.000123276919129460 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70190378_70195205:PDPR;ENSG00000090857:ENST00000205055:exon_70190378_70190765:PDPR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 87 94 181 40.2344752595373 50.528268110385 -10.2937928508476 A:G G A 10 0.537534767131755 0.135957748640539 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 70395387 C/T 1 22 25 47 10.1742351231014 13.4383691782939 -3.26413405519248 T:C C T 10 0.537534767131755 0.381193670252001 ENSG00000168872:ENST00000302243:exon_70395321_70395413:DDX19A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 18 35 53 8.32437419162841 18.8137168496114 -10.489342657983 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00535681701727786 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 0.593874685143272 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 46 40 86 21.2734007119393 21.5013906852702 -0.227989973330928 A:T A T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 74 86 160 34.2224272322501 46.2279899733309 -12.0055627410808 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0678943420003506 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 71318577 T/C 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 71319170 T/C 1 14 14 28 6.47451326015543 7.52548673984457 -1.05097347968914 T:C T C 10 0.537534767131755 0.708746900580582 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 71319539 C/T 1 11 6 17 5.08711756155069 3.22520860279053 1.86190895876017 T:C C T 10 0.537534767131755 0.4682435751469 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 71319646 G/A 1 11 3 14 5.08711756155069 1.61260430139526 3.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 0.104465203629206 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 72828403 A/G 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000140836:ENST00000268489:exon_72827154_72832613:ZFHX3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 13 0 13 6.01204802728719 0 6.01204802728719 C C 10 0.537534767131755 0.000357075049496152 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 74537591 C/T 1 40 36 76 18.4986093147298 19.3512516167432 -0.852642302013376 T:C C T 10 0.537534767131755 0.908546404719293 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74537429_74537644:GLG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 74664810 A/T 1 25 11 36 11.5616308217061 5.91288243844931 5.64874838325682 A:T A T 10 0.537534767131755 0.0663005087186211 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 30 27 57 13.8739569860474 14.5134387125574 -0.639481726510034 T:C C T 10 0.537534767131755 0.894861337970316 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 74708886 A/G 1 16 4 20 7.39944372589192 2.15013906852702 5.2493046573649 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0231288404845339 ENSG00000168404:ENST00000306247:exon_74708858_74708998:MLKL;ENSG00000168404:ENST00000308807:exon_74708858_74708998:MLKL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 75269534 C/T 1 15 8 23 6.93697849302368 4.30027813705404 2.63670035596964 T:C C T 10 0.537534767131755 0.301970044035753 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 75590092 G/C 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 C:G G C 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000205084:ENST00000258173:exon_75589969_75590170:TMEM231;ENSG00000205084:ENST00000398114:exon_75589702_75590136:TMEM231 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 75646576 G/T 1 16 18 34 7.39944372589192 9.67562580837159 -2.27618208247967 T:G G T 10 0.537534767131755 0.492998675593706 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 75646685 G/T 1 15 7 22 6.93697849302368 3.76274336992228 3.17423512310139 T:G G T 10 0.537534767131755 0.203346468273651 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 75664372 T/C 1 134 135 269 61.9703412043448 72.5671935627869 -10.5968523584421 A:T:C T C 10 0.537534767131755 0.199543606480196 ENSG00000065427:ENST00000302445:exon_75664321_75664406:KARS;ENSG00000065427:ENST00000319410:exon_75664321_75664406:KARS;ENSG00000065427:ENST00000378668:exon_75664321_75664406:KARS;ENSG00000065427:ENST00000393395:exon_75664321_75664406:KARS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 37 39 76 17.1112136161251 20.9638559181384 -3.85264230201338 T:C T C 10 0.537534767131755 0.421033746122283 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 77228971 C/T 1 39 34 73 18.0361440818616 18.2761820824797 -0.24003800061811 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 46 50 96 21.2734007119393 26.8767383565877 -5.60333764464848 T:C C T 10 0.537534767131755 0.261508392959075 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 81061827 G/A 1 11 6 17 5.08711756155069 3.22520860279053 1.86190895876017 A:G G A 10 0.537534767131755 0.4682435751469 ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000393335:exon_81061776_81061902:CENPN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 81076821 T/C 1 38 36 74 17.5736788489933 19.3512516167432 -1.77757276774987 T:C T C 10 0.537534767131755 0.727044716875601 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 81077915 T/C 1 33 31 64 15.2613526846521 16.6635777810844 -1.40222509643232 T:C T C 10 0.537534767131755 0.802298943450247 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 81929488 C/T 1 79 94 173 36.5347533965914 50.528268110385 -13.9935147137936 T:C C T 10 0.537534767131755 0.039222788118248 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 84 93 177 38.8470795609326 49.9907333432532 -11.1436537823206 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0974509468283427 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 138 136 274 63.8202021358178 73.1047283299187 -9.28452619410086 A:G A G 10 0.537534767131755 0.275594256244667 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 98 113 211 45.321592821088 60.7414286858883 -15.4198358648003 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0381086868945073 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 45 34 79 20.810935479071 18.2761820824797 2.53475339659136 T:G T G 10 0.537534767131755 0.575345910886914 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 49 68 117 22.660796410544 36.5523641649593 -13.8915677544153 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0120092345713415 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 84808824 C/G 1 40 65 105 18.4986093147298 34.9397598635641 -16.4411505488343 A:C:G C G 10 0.537534767131755 0.00161500185883976 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84808766_84808831:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84808766_84808831:USP10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 85834818 G/A 1 347 355 702 160.475435805281 190.824842331773 -30.349406526492 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.0230931000357768 ENSG00000131143:ENST00000253452:exon_85834811_85834884:COX4I1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 86565882 G/C 1 7 19 26 3.23725663007772 10.2131605755033 -6.97590394542563 C:G G C 10 0.537534767131755 0.00916492866598259 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 86575737 C/T 1 12 10 22 5.54958279441894 5.37534767131755 0.174235123101391 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86575707_86575819:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86575707_86575819:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86575707_86575819:MTHFSD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 87446368 C/T 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000140948:ENST00000268616:exon_87445122_87446582:ZCCHC14;ENSG00000140948:ENST00000412336:exon_87445027_87446582:ZCCHC14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 87493737 T/C 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:C T C 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000140948:ENST00000268616:exon_87493614_87493737:ZCCHC14;ENSG00000140948:ENST00000412336:exon_87493614_87493737:ZCCHC14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 88724347 G/T 1 54 48 102 24.9731225748852 25.8016688223242 -0.828546247439007 T:G G T 10 0.537534767131755 0.920994945896528 ENSG00000167508:ENST00000301012:exon_88724323_88724437:MVD;ENSG00000167508:ENST00000378400:exon_88724323_88724437:MVD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 88767769 G/C 1 17 20 37 7.86190895876017 10.7506953426351 -2.88878638387493 C:G G C 10 0.537534767131755 0.410276871941077 ENSG00000158717:ENST00000312838:exon_88767670_88767826:RNF166 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 88767861 C/G 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 C:G C G 10 0.537534767131755 0.484098982011234 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 88779032 G/C 1 47 41 88 21.7358659448075 22.038925452402 -0.303059507594437 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 31 31 62 14.3364222189156 16.6635777810844 -2.32715556216881 A:G A G 10 0.537534767131755 0.61101954654823 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 58 39 97 26.8229835063582 20.9638559181384 5.85912758821977 A:G A G 10 0.537534767131755 0.262848185169117 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 88781558 G/A 1 2 7 9 0.92493046573649 3.76274336992228 -2.83781290418579 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0909104192397482 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 88781642 G/A 0 83 0 83 38.3846143280643 0 38.3846143280643 G G 10 0.537534767131755 6.57441518130156e-23 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000103335:ENST00000301015:exon_88781588_88782262:FAM38A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 88871908 A/G 1 96 81 177 44.3966623553515 43.5403161376721 0.856346217679373 A:G A G 10 0.537534767131755 0.9399644777326 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88871848_88872045:CDT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 122 93 215 56.4207584099259 49.9907333432532 6.43002506667268 A:G A G 10 0.537534767131755 0.411910819187694 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 88872511 T/C 1 125 135 260 57.8081541085306 72.5671935627869 -14.7590394542563 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0712180251942356 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872429_88872529:CDT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 88873790 C/T 1 56 69 125 25.8980530406217 37.0898989320911 -11.1918458914694 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0483897662938429 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88873689_88873890:CDT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 118 101 219 54.5708974784529 54.2910114803073 0.279885998145659 C:G C G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 88902199 G/C 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 C:G G C 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000141012:ENST00000268695:exon_88902133_88902257:GALNS;ENSG00000141012:ENST00000439266:exon_88902133_88902257:GALNS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 89346774 G/T 1 34 40 74 15.7238179175203 21.5013906852702 -5.77757276774987 T:G G T 10 0.537534767131755 0.199902619366059 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 89348038 G/C 1 51 53 104 23.5857268762805 28.489342657983 -4.90361578170252 C:G G C 10 0.537534767131755 0.376267206051027 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 89656251 T/C 1 2 7 9 0.92493046573649 3.76274336992228 -2.83781290418579 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0909104192397482 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 89657510 C/T 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 0.484098982011234 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 89661807 C/T 1 64 29 93 29.5977749035677 15.5885082468209 14.0092666567468 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00349499755668874 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000529800:exon_89661775_89661831:CPNE7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 89662063 T/C 1 14 32 46 6.47451326015543 17.2011125482162 -10.7265992880607 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00169744051016884 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 89662875 G/C 1 7 16 23 3.23725663007772 8.60055627410808 -5.36329964403036 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0345350413095283 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 116 37 153 53.6459670127164 19.8887863838749 33.7571806288415 A:G G A 10 0.537534767131755 2.17692316577105e-08 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 89789073 G/A 1 22 16 38 10.1742351231014 8.60055627410808 1.57367884899331 A:G G A 10 0.537534767131755 0.629922467162815 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89788939_89789242:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89788939_89789242:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89788939_89789242:ZNF276 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 90032296 T/G 1 5 12 17 2.31232616434123 6.45041720558106 -4.13809104123983 T:G T G 10 0.537534767131755 0.0522959192114914 ENSG00000140995:ENST00000268676:exon_90032269_90034468:DEF8;ENSG00000140995:ENST00000428717:exon_90032269_90032474:DEF8;ENSG00000140995:ENST00000430201:exon_90032269_90032474:DEF8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 16 90097748 C/T 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 T:C C T 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90097707_90097904:GAS8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 23 16 39 10.6367003559696 8.60055627410808 2.03614408186156 A:G G A 10 0.537534767131755 0.526406833519165 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 465782 C/T 1 23 16 39 10.6367003559696 8.60055627410808 2.03614408186156 T:C C T 10 0.537534767131755 0.526406833519165 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 505129 A/C 1 18 15 33 8.32437419162841 8.06302150697632 0.261352684652087 A:C A C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_505035_505136:VPS53 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 59 62 121 27.2854487392265 33.3271555621688 -6.04170682294235 T:C C T 10 0.537534767131755 0.275396593444243 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 650206 C/T 1 42 48 90 19.4235397804663 25.8016688223242 -6.37812904185795 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.204469668955400 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 1384031 C/T 1 92 88 180 42.5468014238785 47.3030595075944 -4.7562580837159 T:C C T 10 0.537534767131755 0.501445444078284 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1384000_1384179:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1384000_1384179:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1384000_1384179:MYO1C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 1494567 G/A 1 59 40 99 27.2854487392265 21.5013906852702 5.78405805395626 A:G G A 10 0.537534767131755 0.268025806564243 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 1637074 A/G 1 9 31 40 4.16218709581421 16.6635777810844 -12.5013906852702 A:G A G 10 0.537534767131755 8.6971692073092e-05 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 1637458 G/A 1 19 10 29 8.78683942449666 5.37534767131755 3.41149175317911 A:G G A 10 0.537534767131755 0.263942639118946 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 1640709 C/T 1 20 27 47 9.2493046573649 14.5134387125574 -5.26413405519248 T:C C T 10 0.537534767131755 0.143573391563197 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 1640793 C/T 1 35 15 50 16.1862831503886 8.06302150697632 8.12326164341225 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0229655445764591 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 1684605 G/T 1 8 8 16 3.69972186294596 4.30027813705404 -0.600556274108079 T:G G T 10 0.537534767131755 0.806072821048815 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1682829_1684733:SMYD4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 1703543 G/C 1 14 7 21 6.47451326015543 3.76274336992228 2.71176989023315 C:G G C 10 0.537534767131755 0.278003094604447 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1703151_1704099:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000495309:exon_1703510_1704011:SMYD4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 1731268 T/C 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1731155_1731300:SMYD4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 1972209 T/C 1 7 22 29 3.23725663007772 11.8257648768986 -8.5885082468209 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00224108480664985 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_1972072_1972225:SMG6;ENSG00000070366:ENST00000354901:exon_1972072_1972225:SMG6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 84 61 145 38.8470795609326 32.7896207950371 6.05745876589553 A:G G A 10 0.537534767131755 0.319078539310513 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 2600186 G/A 1 74 74 148 34.2224272322501 39.7775727677499 -5.55514553549973 A:G G A 10 0.537534767131755 0.365713940394703 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2600013_2600236:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2600013_2600236:KIAA0664 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 2601836 T/C 1 45 49 94 20.810935479071 26.339203589456 -5.52826811038497 T:C T C 10 0.537534767131755 0.257141613355099 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2601190_2601884:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2601190_2601884:KIAA0664 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 2606715 G/A 1 31 45 76 14.3364222189156 24.189064520929 -9.85264230201338 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0282902004991529 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2606612_2606783:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2606612_2606783:KIAA0664 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 3526637 C/T 1 23 8 31 10.6367003559696 4.30027813705404 6.3364222189156 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0291828853491080 ENSG00000197417:ENST00000225519:exon_3526633_3526785:SHPK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 3568012 A/G 1 10 10 20 4.62465232868245 5.37534767131755 -0.750695342635099 A:G A G 10 0.537534767131755 0.824049778597606 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3567973_3568092:TAX1BP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 3775916 T/C 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 A:T:C T C 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000004660:ENST00000381769:exon_3775848_3775921:CAMKK1;ENSG00000004660:ENST00000348335:exon_3775848_3775921:CAMKK1;ENSG00000004660:ENST00000381771:exon_3775848_3775921:CAMKK1;ENSG00000004660:ENST00000158166:exon_3775848_3775921:CAMKK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 3845993 G/A 1 55 56 111 25.4355878077535 30.1019469593783 -4.6663591516248 A:G G A 10 0.537534767131755 0.39251917761225 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3845900_3846025:ATP2A3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 3947644 T/C 1 12 9 21 5.54958279441894 4.83781290418579 0.711769890233146 T:C T C 10 0.537534767131755 0.829121193760437 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3947518_3947668:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3947518_3947668:ZZEF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 3953083 T/C 1 13 12 25 6.01204802728719 6.45041720558106 -0.438369178293874 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3953002_3953153:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3953002_3953153:ZZEF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 3953102 A/G 1 10 11 21 4.62465232868245 5.91288243844931 -1.28823010976685 A:G A G 10 0.537534767131755 0.663607311505883 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3953002_3953153:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3953002_3953153:ZZEF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 3966064 A/G 1 7 8 15 3.23725663007772 4.30027813705404 -1.06302150697632 A:G A G 10 0.537534767131755 0.61360765893613 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3966047_3966211:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3966047_3966211:ZZEF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 3977532 G/A 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 A:G G A 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3977444_3977645:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3977444_3977645:ZZEF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 3979949 G/A 1 8 5 13 3.69972186294596 2.68767383565877 1.01204802728719 A:G G A 10 0.537534767131755 0.782310374824685 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3979931_3980053:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3979931_3980053:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000418156:exon_3979910_3980053:ZZEF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 3989025 T/C 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:C T C 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3988964_3989097:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3988964_3989097:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000418156:exon_3988964_3989097:ZZEF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 4446457 G/A 1 63 69 132 29.1353096706994 37.0898989320911 -7.95458926139166 A:G G A 10 0.537534767131755 0.190239978957173 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 4449228 C/T 1 50 70 120 23.1232616434123 37.6274336992228 -14.5041720558106 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0100707305869323 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4449141_4449237:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4449141_4449237:MYBBP1A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 4451453 C/T 1 65 47 112 30.0602401364359 25.2641340551925 4.79610608124344 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.394304948661056 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4451438_4451605:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4451438_4451605:MYBBP1A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 4700993 C/G 1 170 145 315 78.6190895876016 77.9425412341045 0.676548353497182 A:C:G C G 10 0.537534767131755 0.954990070568703 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 154 139 293 71.2196458617097 74.7173326313139 -3.4976867696042 T:C C T 10 0.537534767131755 0.682249796934079 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 4701402 C/T 1 225 213 438 104.054677395355 114.494905399064 -10.4402280037087 T:C C T 10 0.537534767131755 0.337898667325823 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4701304_4701448:PSMB6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 4712395 A/T 1 14 2 16 6.47451326015543 1.07506953426351 5.39944372589192 A:T A T 10 0.537534767131755 0.00967820628712213 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4712395_4712500:PLD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 4712617 C/T 1 7 10 17 3.23725663007772 5.37534767131755 -2.13809104123983 T:C C T 10 0.537534767131755 0.337166426523694 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4712593_4712658:PLD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 4718776 G/A 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 A:G G A 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4718771_4718881:PLD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 4722785 G/A 1 14 15 29 6.47451326015543 8.06302150697632 -1.58850824682089 A:G G A 10 0.537534767131755 0.580849764907506 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4722724_4722877:PLD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 4722876 G/A 1 3 7 10 1.38739569860474 3.76274336992228 -2.37534767131755 A:G G A 10 0.537534767131755 0.203605394966440 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4722724_4722877:PLD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 4797305 G/A 1 65 52 117 30.0602401364359 27.9518078908513 2.10843224558467 A:G G A 10 0.537534767131755 0.71178121601943 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4797283_4797388:MINK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 54 56 110 24.9731225748852 30.1019469593783 -5.12882438449305 A:T:C T C 10 0.537534767131755 0.340064949058485 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 36 22 58 16.6487483832568 11.8257648768986 4.82298350635821 T:C C T 10 0.537534767131755 0.236331494392785 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 52 71 123 24.0481921091487 38.1649684663546 -14.1167763572059 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.0112866329400241 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 50 67 117 23.1232616434123 36.0148293978276 -12.8915677544153 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0201033762627710 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 5347576 G/A 1 13 25 38 6.01204802728719 13.4383691782939 -7.42632115100669 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0215437868743779 ENSG00000005100:ENST00000225296:exon_5344232_5347833:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000457531:exon_5345596_5347833:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000433302:exon_5345596_5347833:DHX33 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 5356913 C/T 1 15 9 24 6.93697849302368 4.83781290418579 2.09916558883788 T:C C T 10 0.537534767131755 0.420607042022665 ENSG00000005100:ENST00000225296:exon_5356900_5356988:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000457531:exon_5356900_5356988:DHX33;ENSG00000005100:ENST00000433302:exon_5356900_5356988:DHX33 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 5392161 C/T 1 18 27 45 8.32437419162841 14.5134387125574 -6.18906452092897 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0728937953595564 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 5418107 G/A 1 28 48 76 12.9490265203109 25.8016688223242 -12.8526423020134 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0037779771947039 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5417439_5418393:NLRP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 5418799 G/A 1 42 65 107 19.4235397804663 34.9397598635641 -15.5162200830978 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00343604754668409 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5418793_5418837:NLRP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 32 42 74 14.7988874517838 22.5764602195337 -7.77757276774987 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0800476456709438 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 5436263 C/T 1 17 21 38 7.86190895876017 11.2882301097669 -3.42632115100669 T:C C T 10 0.537534767131755 0.329140236576102 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5436142_5436304:NLRP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 5487164 C/G 1 36 73 109 16.6487483832568 39.2400380006181 -22.5912896173613 C:G C G 10 0.537534767131755 1.8374226908678e-05 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5487007_5487832:NLRP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 6493198 T/C 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6493099_6493323:KIAA0753 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 6511781 A/G 1 6 10 16 2.77479139720947 5.37534767131755 -2.60055627410808 A:G A G 10 0.537534767131755 0.217010442931191 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6511668_6511784:KIAA0753 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 6515454 C/T 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6515239_6515468:KIAA0753 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 6531648 A/G 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 A:G A G 10 0.537534767131755 0.593874685143272 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6531437_6532061:KIAA0753 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 6538355 G/A 1 11 5 16 5.08711756155069 2.68767383565877 2.39944372589192 A:G G A 10 0.537534767131755 0.317045039600351 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6538331_6538491:KIAA0753 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 6919093 T/C 1 206 196 402 95.2678379708585 105.356814357824 -10.0889763869655 T:C T C 10 0.537534767131755 0.317507922151588 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 6920257 C/T 1 225 189 414 104.054677395355 101.594070987902 2.46060640745344 T:C C T 10 0.537534767131755 0.843747256498737 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6920229_6920333:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000455303:exon_6920229_6920333:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6920229_6920333:C17orf49 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 6942108 C/T 1 4 8 12 1.84986093147298 4.30027813705404 -2.45041720558106 T:C C T 10 0.537534767131755 0.246047854304642 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7127718 T/C 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 T:C T C 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 28 18 46 12.9490265203109 9.67562580837159 3.27340071193927 T:C T C 10 0.537534767131755 0.376530096010549 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 29 27 56 13.4114917531791 14.5134387125574 -1.10194695937828 T:C C T 10 0.537534767131755 0.789923489459426 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 37 33 70 17.1112136161251 17.7386473153479 -0.627433699222848 A:G G A 10 0.537534767131755 0.905006713210969 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7133609 G/A 1 33 27 60 15.2613526846521 14.5134387125574 0.747913972094702 A:G G A 10 0.537534767131755 0.897414338111254 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133604_7133749:DVL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7140781 G/T 1 19 31 50 8.78683942449666 16.6635777810844 -7.87673835658775 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0324745449663331 ENSG00000040633:ENST00000320316:exon_7140704_7140796:PHF23;ENSG00000040633:ENST00000454255:exon_7140704_7140796:PHF23;ENSG00000040633:ENST00000043410:exon_7140704_7140796:PHF23 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 177 122 299 81.8563462176794 65.5792415900741 16.2771046276053 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0633767993729857 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7216540 G/A 1 82 78 160 37.9221490951961 41.9277118362769 -4.00556274108079 A:G G A 10 0.537534767131755 0.527151320719188 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7216531_7216610:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7216531_7216610:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7216531_7216610:GPS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7217463 T/C 1 46 33 79 21.2734007119393 17.7386473153479 3.53475339659136 T:C T C 10 0.537534767131755 0.432690155735678 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7224921 C/G 1 26 25 51 12.0240960545744 13.4383691782939 -1.4142731237195 C:G C G 10 0.537534767131755 0.779172624362904 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7224879_7225106:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7224879_7225106:NEURL4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7254274 G/A 1 193 165 358 89.2557899435713 88.6932365767396 0.562553366831722 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.957793956435009 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7254269_7254318:ACAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7399866 G/A 1 61 54 115 28.2103792049629 29.0268774251148 -0.816498220151821 A:G G A 10 0.537534767131755 0.925575225014373 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7399759_7399932:POLR2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7402600 T/C 1 50 57 107 23.1232616434123 30.63948172651 -7.51622008309778 A:T:C T C 10 0.537534767131755 0.147225193673280 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7402600_7402810:POLR2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7405937 C/T 1 26 32 58 12.0240960545744 17.2011125482162 -5.17701649364179 T:C C T 10 0.537534767131755 0.188880432759332 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7405837_7406020:POLR2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7411770 C/T 1 93 84 177 43.0092666567468 45.1529204390674 -2.14365378232063 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.763389069224853 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7411570_7411794:POLR2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7412403 T/C 1 55 51 106 25.4355878077535 27.4142731237195 -1.97868531596603 T:C T C 10 0.537534767131755 0.698290587918742 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7412263_7412509:POLR2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7460517 G/C 1 16 24 40 7.39944372589192 12.9008344111621 -5.5013906852702 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0836534363924484 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7460416_7460549:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7460685 G/A 1 22 43 65 10.1742351231014 23.1139949866655 -12.9397598635641 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00166548042198453 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7462555 G/A 1 24 20 44 11.0991655888379 10.7506953426351 0.348470246202782 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000161955:ENST00000380535:exon_7461609_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396542:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7461793_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7461914_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462104_7462614:TNFSF13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7478213 C/T 1 16 11 27 7.39944372589192 5.91288243844931 1.48656128744262 T:C C T 10 0.537534767131755 0.700334466477321 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7484101 C/A 1 24 23 47 11.0991655888379 12.3632996440304 -1.26413405519248 A:C C A 10 0.537534767131755 0.770600413711711 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484029_7484101:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484029_7484101:CD68 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7490810 G/A 1 115 92 207 53.1835017798482 49.4531985761215 3.73030320372672 A:G G A 10 0.537534767131755 0.626027118196893 ENSG00000129255:ENST00000250124:exon_7490744_7491523:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490744_7491504:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000359822:exon_7490744_7491027:MPDU1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7530147 G/C 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 C:G G C 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7530271 C/T 1 48 25 73 22.1983311776758 13.4383691782939 8.75996199938189 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0455639878634492 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7530261_7530362:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7530261_7530362:SAT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7579472 G/C 1 122 120 242 56.4207584099259 64.5041720558106 -8.0834136458847 C:G G C 10 0.537534767131755 0.302943032036703 ENSG00000141510:ENST00000413465:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000269305:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000455263:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000420246:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000445888:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000419024:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000359597:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000505014:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000414315:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000508793:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000503591:exon_7579312_7579590:TP53 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7592560 C/T 1 19 22 41 8.78683942449666 11.8257648768986 -3.03892545240195 T:C C T 10 0.537534767131755 0.351912696931157 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7592542_7592640:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7592542_7592640:WRAP53 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7843053 C/T 1 27 30 57 12.4865612874426 16.1260430139526 -3.63948172651003 T:C C T 10 0.537534767131755 0.354448455410502 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000419170:exon_7842831_7843067:CNTROB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7847955 C/A 1 41 53 94 18.961074547598 28.489342657983 -9.52826811038497 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0499377047131025 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7847794_7847956:CNTROB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 7849087 C/G 1 34 42 76 15.7238179175203 22.5764602195337 -6.85264230201338 C:G C G 10 0.537534767131755 0.134460040215183 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 8048169 T/C 1 31 24 55 14.3364222189156 12.9008344111621 1.43558780775348 T:C T C 10 0.537534767131755 0.787189976004427 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 48 41 89 22.1983311776758 22.038925452402 0.159405725273807 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 8053085 T/G 1 30 21 51 13.8739569860474 11.2882301097669 2.5857268762805 T:G T G 10 0.537534767131755 0.486363396107849 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000413754:exon_8053073_8053194:PER1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 8092694 T/G 1 27 19 46 12.4865612874426 10.2131605755033 2.27340071193927 T:G T G 10 0.537534767131755 0.55585873821522 ENSG00000196544:ENST00000389017:exon_8091652_8093564:C17orf59;ENSG00000196544:ENST00000357939:exon_8092385_8093056:C17orf59 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 8700982 C/T 1 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 0.155642553042637 ENSG00000185156:ENST00000329805:exon_8700481_8702586:MFSD6L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 8701423 A/G 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:G A G 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000185156:ENST00000329805:exon_8700481_8702586:MFSD6L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 1 14 15 0.462465232868245 7.52548673984457 -7.06302150697632 A:G G A 10 0.537534767131755 0.000264897876846915 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 15554504 G/A 1 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 0.155642553042637 ENSG00000251537:ENST00000455584:exon_15554405_15554967:CDRT1;ENSG00000221926:ENST00000336708:exon_15554405_15555260:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000402781:exon_15554405_15554946:TRIM16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 8 8 16 3.69972186294596 4.30027813705404 -0.600556274108079 T:C T C 10 0.537534767131755 0.806072821048815 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 15950400 C/T 1 55 54 109 25.4355878077535 29.0268774251148 -3.59128961736129 T:C C T 10 0.537534767131755 0.502634453099736 ENSG00000141027:ENST00000268712:exon_15950265_15950407:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395851:exon_15950265_15950407:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395849:exon_15950265_15950407:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000470782:exon_15950265_15950407:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000464381:exon_15950265_15950407:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395857:exon_15950265_15950407:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000455704:exon_15950265_15950407:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000458113:exon_15950265_15950407:NCOR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 101 84 185 46.7089885196927 45.1529204390674 1.55606808062533 A:T:G A G 10 0.537534767131755 0.82544913289559 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 95 92 187 43.9341971224833 49.4531985761215 -5.51900145363818 A:C A C 10 0.537534767131755 0.420938481998818 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 16336828 G/A 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 A:G G A 10 0.537534767131755 0.190750883746296 ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 16336992 C/G 1 72 47 119 33.2974967665136 25.2641340551925 8.03336271132116 A:C:G C G 10 0.537534767131755 0.142530031349347 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 16342813 T/C 1 19 19 38 8.78683942449666 10.2131605755033 -1.42632115100669 T:C T C 10 0.537534767131755 0.745416232968685 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 16342833 T/C 1 15 18 33 6.93697849302368 9.67562580837159 -2.73864731534791 T:C T C 10 0.537534767131755 0.384603784880895 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 16344601 G/C 1 11 6 17 5.08711756155069 3.22520860279053 1.86190895876017 C:G G C 10 0.537534767131755 0.4682435751469 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 16842991 G/A 1 363 278 641 167.874879531173 149.434665262628 18.4402142685451 A:G G A 10 0.537534767131755 0.153836017580092 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16842970_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 17061804 A/G 1 50 30 80 23.1232616434123 16.1260430139526 6.9972186294596 A:G A G 10 0.537534767131755 0.144483002661709 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17061746_17062316:MPRIP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 145 107 252 67.0574587658955 57.5162200830978 9.54123868279775 A:G G A 10 0.537534767131755 0.230812063695050 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 18167505 T/C 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 T:C T C 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 18219835 T/C 1 11 17 28 5.08711756155069 9.13809104123983 -4.05097347968914 T:C T C 10 0.537534767131755 0.133350668026399 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 18220770 G/A 1 15 11 26 6.93697849302368 5.91288243844931 1.02409605457437 A:G G A 10 0.537534767131755 0.84457724361591 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 18221010 A/G 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 A:T:G A G 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000176994:ENST00000406438:exon_18218716_18221463:SMCR8;ENSG00000176994:ENST00000316811:exon_18218716_18221467:SMCR8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 18907029 A/G 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 A:G A G 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18906833_18907381:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000345041:exon_18906833_18907482:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000399096:exon_18906833_18907482:FAM83G HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 19578873 A/T 1 13 9 22 6.01204802728719 4.83781290418579 1.17423512310139 A:T A T 10 0.537534767131755 0.67355127074083 ENSG00000072210:ENST00000176643:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000395575:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000339618:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000472059:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000476965:exon_19578871_19579060:ALDH3A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 19812541 T/C 1 9 8 17 4.16218709581421 4.30027813705404 -0.138091041239834 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19812494_19812589:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19812494_19812589:AKAP10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 19839625 G/A 1 9 11 20 4.16218709581421 5.91288243844931 -1.7506953426351 A:G G A 10 0.537534767131755 0.504150670545082 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19839599_19839743:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19839599_19839743:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000460046:exon_19839315_19839743:AKAP10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 19861458 C/T 1 15 14 29 6.93697849302368 7.52548673984457 -0.588508246820894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.854060782439014 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 20107773 T/C 1 15 8 23 6.93697849302368 4.30027813705404 2.63670035596964 T:C T C 10 0.537534767131755 0.301970044035753 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 20108239 A/T 1 20 6 26 9.2493046573649 3.22520860279053 6.02409605457437 A:T A T 10 0.537534767131755 0.0183011714254074 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 20 12 32 9.2493046573649 6.45041720558106 2.79888745178384 T:C C T 10 0.537534767131755 0.377265601273927 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 20163529 A/G 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:G A G 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20163505_20163607:SPECC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 20924523 G/A 1 41 49 90 18.961074547598 26.339203589456 -7.37812904185795 A:G G A 10 0.537534767131755 0.138563391368816 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000476111:exon_20924426_20924539:USP22 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 120 0 120 55.4958279441894 0 55.4958279441894 T T 10 0.537534767131755 5.45035815153606e-33 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 132 0 132 61.0454107386083 0 61.0454107386083 G G 10 0.537534767131755 2.73200658144008e-36 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 1 145 1 146 67.0574587658955 0.537534767131755 66.5199239987638 A:G G A 10 0.537534767131755 5.91049327223763e-38 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 1 137 1 138 63.3577369029496 0.537534767131755 62.8202021358178 T:C C T 10 0.537534767131755 8.81745149096968e-36 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21203964 C/G 0 119 1 120 55.0333627113212 0.537534767131755 54.4958279441894 A:C C A 10 0.537534767131755 4.91400087264e-31 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 59 1 60 27.2854487392265 0.537534767131755 26.7479139720947 C:G C G 10 0.537534767131755 3.96326212409788e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 116 0 116 53.6459670127164 0 53.6459670127164 C C 10 0.537534767131755 7.2352472071172e-32 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21215424 G/A 1 10 1 11 4.62465232868245 0.537534767131755 4.08711756155069 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0141811635261139 ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21215446 C/T 0 9 0 9 4.16218709581421 0 4.16218709581421 C C 10 0.537534767131755 0.00471442275687274 ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 106 0 106 49.021314684034 0 49.021314684034 C C 10 0.537534767131755 2.7469317849717e-29 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 1 79 1 80 36.5347533965914 0.537534767131755 35.9972186294596 A:C C A 10 0.537534767131755 2.37606540881746e-20 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 119 0 119 55.0333627113212 0 55.0333627113212 C C 10 0.537534767131755 1.03690589278471e-32 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 123 1 124 56.8832236427941 0.537534767131755 56.3456888756624 T:G G T 10 0.537534767131755 7.39887874509372e-32 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 203 0 203 93.8804422722537 0 93.8804422722537 G G 10 0.537534767131755 2.64280442784345e-55 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21319230 G/C 0 8 0 8 3.69972186294596 0 3.69972186294596 G G 10 0.537534767131755 0.00906265828433196 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 21319251 C/T 0 9 0 9 4.16218709581421 0 4.16218709581421 C C 10 0.537534767131755 0.00471442275687274 ENSG00000184185:ENST00000331718:exon_21318599_21320404:KCNJ12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 25909816 C/T 1 43 42 85 19.8860050133345 22.5764602195337 -2.69045520619917 T:C C T 10 0.537534767131755 0.58746032124817 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 25909850 G/T 1 42 45 87 19.4235397804663 24.189064520929 -4.76552474046268 T:G G T 10 0.537534767131755 0.333736770768006 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 25932609 C/T 1 31 26 57 14.3364222189156 13.9759039454256 0.360518273489967 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398988:exon_25932460_25932839:KSR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 71 75 146 32.8350315336454 40.3151075348816 -7.48007600123622 A:G G A 10 0.537534767131755 0.245165391958165 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 11 44 55 5.08711756155069 23.6515297537972 -18.5644121922465 A:G G A 10 0.537534767131755 4.24249261233757e-07 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 25974258 T/C 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 T:C T C 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000168961:ENST00000486774:exon_25974056_25974458:LGALS9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 26676135 C/T 1 127 94 221 58.7330845742671 50.528268110385 8.20481646388215 T:C C T 10 0.537534767131755 0.280853459041 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 26686416 G/A 1 24 8 32 11.0991655888379 4.30027813705404 6.79888745178384 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0199269200280238 ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000509083:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000457710:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000483505:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000395404:exon_26686338_26686427:TMEM199 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 27009749 C/T 1 72 74 146 33.2974967665136 39.7775727677499 -6.48007600123622 T:C C T 10 0.537534767131755 0.282200646735760 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27009745_27009874:SUPT6H;ENSG00000109111:ENST00000347486:exon_27009745_27009874:SUPT6H HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 27075423 C/T 1 208 170 378 96.192768436595 91.3809104123984 4.81185802419662 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.642634137855625 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075280_27075441:TRAF4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 27085564 A/G 1 18 20 38 8.32437419162841 10.7506953426351 -2.42632115100669 A:G A G 10 0.537534767131755 0.515807132301838 ENSG00000173065:ENST00000452648:exon_27082996_27086894:C17orf63;ENSG00000173065:ENST00000341217:exon_27082996_27086894:C17orf63 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 69 77 146 31.9101010679089 41.3901770691451 -9.48007600123622 T:C C T 10 0.537534767131755 0.134919684539150 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 43 47 90 19.8860050133345 25.2641340551925 -5.37812904185795 T:C C T 10 0.537534767131755 0.290522399088456 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 27441077 C/G 1 40 19 59 18.4986093147298 10.2131605755033 8.28544873922646 T:C:G C G 10 0.537534767131755 0.0360522042374554 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533399:exon_27441029_27441286:MYO18A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 27613677 G/A 1 27 24 51 12.4865612874426 12.9008344111621 -0.414273123719504 A:T:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000108256:ENST00000225388:exon_27613010_27614734:NUFIP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 27869968 G/A 1 10 18 28 4.62465232868245 9.67562580837159 -5.05097347968914 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0599027784438721 ENSG00000160551:ENST00000261716:exon_27869579_27871502:TAOK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 27889578 T/C 1 11 16 27 5.08711756155069 8.60055627410808 -3.51343871255738 T:C T C 10 0.537534767131755 0.182777781405979 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 27889986 T/C 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 27898828 T/C 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 T:C T C 10 0.537534767131755 0.564681673647354 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 27904711 G/A 1 23 29 52 10.6367003559696 15.5885082468209 -4.95180789085126 A:G G A 10 0.537534767131755 0.210306766298917 ENSG00000108262:ENST00000225394:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394868:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000473217:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394869:exon_27904663_27904760:GIT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 28576076 T/C 1 56 37 93 25.8980530406217 19.8887863838749 6.00926665674679 T:C T C 10 0.537534767131755 0.252539440250255 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28575223_28576186:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28575223_28576186:BLMH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 28612448 G/C 1 18 26 44 8.32437419162841 13.9759039454256 -5.65152975379722 C:G G C 10 0.537534767131755 0.097004242262568 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28612406_28612498:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28612406_28612498:BLMH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 29111125 T/G 1 12 10 22 5.54958279441894 5.37534767131755 0.174235123101391 T:G T G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 29113016 A/G 1 16 19 35 7.39944372589192 10.2131605755033 -2.81371684961142 A:G A G 10 0.537534767131755 0.397687197999873 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29112937_29113049:CRLF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 29159404 G/C 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 C:G G C 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29158988_29159431:ATAD5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 29161202 A/T 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 A:T A T 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 29161845 G/A 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 A:G G A 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 29214387 T/C 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29214210_29214390:ATAD5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 29855661 G/A 1 13 16 29 6.01204802728719 8.60055627410808 -2.58850824682089 A:G G A 10 0.537534767131755 0.356879843182363 ENSG00000131242:ENST00000394744:exon_29855638_29855796:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000325874:exon_29855638_29855796:RAB11FIP4;ENSG00000131242:ENST00000394742:exon_29855638_29855796:RAB11FIP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 30183857 T/C 1 20 26 46 9.2493046573649 13.9759039454256 -4.72659928806073 T:C T C 10 0.537534767131755 0.183929238150012 ENSG00000172301:ENST00000302362:exon_30183818_30183884:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000378634:exon_30183818_30183884:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000496655:exon_30183818_30183884:C17orf79 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 24 26 50 11.0991655888379 13.9759039454256 -2.87673835658775 T:C T C 10 0.537534767131755 0.478772610168917 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 30228656 G/A 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30228555_30228731:UTP6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 33331456 G/A 1 24 21 45 11.0991655888379 11.2882301097669 -0.189064520928973 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000005156:ENST00000378526:exon_33331292_33332083:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000474860:exon_33329687_33331823:LIG3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 33690466 C/A 1 8 11 19 3.69972186294596 5.91288243844931 -2.21316057550334 A:C C A 10 0.537534767131755 0.361207681506224 ENSG00000172716:ENST00000308377:exon_33689758_33690845:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000394566:exon_33689758_33690845:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000321335:exon_33689758_33690845:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000442678:exon_33689758_33690849:SLFN11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 33749919 A/C 0 12 0 12 5.54958279441894 0 5.54958279441894 A A 10 0.537534767131755 0.000677648852566775 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000447040:exon_33749664_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000445092:exon_33749840_33750087:SLFN12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 33768199 G/A 1 27 38 65 12.4865612874426 20.4263211510067 -7.93975986356407 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0612578059228214 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 33772658 G/T 1 21 19 40 9.71176989023315 10.2131605755033 -0.501390685270199 T:G G T 10 0.537534767131755 0.875575656246707 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33772392_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33771634_33773029:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000524511:exon_33772381_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000531588:exon_33772467_33772712:SLFN13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 34842521 A/G 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000108278:ENST00000225410:exon_34842479_34842629:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000490126:exon_34842501_34842629:ZNHIT3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 25 23 48 11.5616308217061 12.3632996440304 -0.801668822324238 A:G G A 10 0.537534767131755 0.88522860381015 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 29 28 57 13.4114917531791 15.0509734796891 -1.63948172651003 A:G G A 10 0.537534767131755 0.691713246223695 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 35771468 C/T 1 15 10 25 6.93697849302368 5.37534767131755 1.56163082170613 T:C C T 10 0.537534767131755 0.555250283480734 ENSG00000108264:ENST00000394395:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000490992:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000225396:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000417170:exon_35771356_35771477:TADA2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 35896123 T/C 1 17 10 27 7.86190895876017 5.37534767131755 2.48656128744262 T:C T C 10 0.537534767131755 0.440804629998576 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000508220:exon_35896081_35897580:SYNRG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 54 29 83 24.9731225748852 15.5885082468209 9.38461432806434 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0469449304077053 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 35956391 G/C 1 7 10 17 3.23725663007772 5.37534767131755 -2.13809104123983 C:G G C 10 0.537534767131755 0.337166426523694 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35956270_35956391:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000378189:exon_35956270_35956391:SYNRG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 5 11 16 2.31232616434123 5.91288243844931 -3.60055627410808 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0821156190636971 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 16 18 34 7.39944372589192 9.67562580837159 -2.27618208247967 T:C C T 10 0.537534767131755 0.492998675593706 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 36909499 A/T 1 135 138 273 62.4328064372131 74.1797978641822 -11.7469914269691 A:T A T 10 0.537534767131755 0.162778726742350 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909403_36909587:PSMB3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 61 70 131 28.2103792049629 37.6274336992228 -9.4170544942599 A:G A G 10 0.537534767131755 0.114450417569758 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 37074932 C/T 1 120 120 240 55.4958279441894 64.5041720558106 -9.0083441116212 T:C C T 10 0.537534767131755 0.244758919843369 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37074858_37075031:LASP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 37334243 G/A 1 11 9 20 5.08711756155069 4.83781290418579 0.249304657364901 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000067191:ENST00000394303:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000344140:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000394310:exon_37334237_37334332:CACNB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 37922259 G/A 1 34 27 61 15.7238179175203 14.5134387125574 1.21037920496295 A:G G A 10 0.537534767131755 0.798275906402628 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37913968_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37921198_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37922043_37922746:IKZF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 37944519 C/G 1 29 14 43 13.4114917531791 7.52548673984457 5.88600501333454 C:G C G 10 0.537534767131755 0.091549307367989 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37944511_37944627:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37944511_37944627:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37944511_37944627:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37944511_37944627:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37944511_37944627:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37944511_37944627:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37944511_37944627:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37944511_37944627:IKZF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 24 12 36 11.0991655888379 6.45041720558106 4.64874838325682 T:C C T 10 0.537534767131755 0.134209537332264 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 38062503 T/C 1 20 12 32 9.2493046573649 6.45041720558106 2.79888745178384 T:C T C 10 0.537534767131755 0.377265601273927 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062364_38063992:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062364_38062524:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062364_38062524:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062364_38062524:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062364_38062524:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062364_38063240:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062364_38062524:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062364_38062524:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062364_38062524:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062364_38062524:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062364_38062524:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062364_38062524:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062364_38062524:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062364_38062524:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062364_38062524:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000468820:exon_38062364_38062524:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000519429:exon_38062448_38062524:GSDMB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 27 21 48 12.4865612874426 11.2882301097669 1.19833117767576 A:G A G 10 0.537534767131755 0.773606113711342 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 38991003 T/C 1 12 10 22 5.54958279441894 5.37534767131755 0.174235123101391 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 15 13 28 6.93697849302368 6.98795197271281 -0.050973479689139 A:T T A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 42152103 G/A 1 44 28 72 20.3484702462028 15.0509734796891 5.29749676651364 A:G G A 10 0.537534767131755 0.237695150569225 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 42225547 A/C 1 16 6 22 7.39944372589192 3.22520860279053 4.17423512310139 A:C A C 10 0.537534767131755 0.0879809941679776 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42225226_42226395:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42225226_42226395:C17orf53 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 12 7 19 5.54958279441894 3.76274336992228 1.78683942449666 C:G C G 10 0.537534767131755 0.493873626093778 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 42254281 A/G 1 9 9 18 4.16218709581421 4.83781290418579 -0.675625808371588 A:G A G 10 0.537534767131755 0.815602186334409 ENSG00000161664:ENST00000293414:exon_42254106_42254598:ASB16;ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 42268274 C/T 1 31 25 56 14.3364222189156 13.4383691782939 0.898053040621722 T:C C T 10 0.537534767131755 0.893624227980979 ENSG00000168591:ENST00000357984:exon_42267869_42269098:TMUB2;ENSG00000168591:ENST00000319511:exon_42267869_42269098:TMUB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 140 132 272 64.7451326015543 70.9545892613917 -6.20945665983736 T:C C T 10 0.537534767131755 0.465877679034252 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 42429780 C/T 1 323 326 649 149.376270216443 175.236334084952 -25.860063868509 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.0446181544851163 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42429709_42429939:GRN;ENSG00000030582:ENST00000446061:exon_42429709_42429939:GRN;ENSG00000030582:ENST00000393566:exon_42429709_42429939:GRN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 43 42 85 19.8860050133345 22.5764602195337 -2.69045520619917 C:G G C 10 0.537534767131755 0.58746032124817 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 42949808 G/A 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 A:G G A 10 0.537534767131755 0.318386975483931 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 43111558 G/A 1 31 15 46 14.3364222189156 8.06302150697632 6.27340071193927 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0754989003206936 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 125 98 223 57.8081541085306 52.678407178912 5.12974692961864 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.502581054991746 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 140 133 273 64.7451326015543 71.4921240285234 -6.7469914269691 A:G G A 10 0.537534767131755 0.430318363938528 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 43319770 C/T 1 95 84 179 43.9341971224833 45.1529204390674 -1.21872331658414 T:C C T 10 0.537534767131755 0.880967331358016 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43319708_43319832:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43319708_43319832:FMNL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 43342141 G/C 1 31 32 63 14.3364222189156 17.2011125482162 -2.86469032930056 C:G G C 10 0.537534767131755 0.528032442419527 ENSG00000006062:ENST00000344686:exon_43340488_43342167:MAP3K14;ENSG00000006062:ENST00000376926:exon_43340495_43342167:MAP3K14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 44117135 C/T 1 16 9 25 7.39944372589192 4.83781290418579 2.56163082170613 T:C C T 10 0.537534767131755 0.324259669272264 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44117068_44117250:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44117068_44117250:KIAA1267 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 44248499 G/C 1 13 16 29 6.01204802728719 8.60055627410808 -2.58850824682089 C:G G C 10 0.537534767131755 0.356879843182363 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 53 63 116 24.510657342017 33.8646903293006 -9.35403298728358 A:G G A 10 0.537534767131755 0.093423050643729 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 45266579 C/G 1 16 18 34 7.39944372589192 9.67562580837159 -2.27618208247967 C:G C G 10 0.537534767131755 0.492998675593706 ENSG00000004897:ENST00000066544:exon_45266512_45266632:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000446365:exon_45266512_45266665:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000441612:exon_45266512_45266624:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000525495:exon_45266512_45266764:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000533415:exon_45266512_45266617:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000527547:exon_45266512_45266590:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000526866:exon_45266512_45266630:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000532893:exon_45266512_45266627:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000528147:exon_45266512_45266618:CDC27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 45369777 A/G 1 14 12 26 6.47451326015543 6.45041720558106 0.0240960545743709 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000056345:ENST00000262017:exon_45369505_45369934:ITGB3;ENSG00000056345:ENST00000435993:exon_45369505_45369934:ITGB3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 45369789 G/A 1 14 11 25 6.47451326015543 5.91288243844931 0.561630821706125 A:G G A 10 0.537534767131755 0.844309277033242 ENSG00000056345:ENST00000262017:exon_45369505_45369934:ITGB3;ENSG00000056345:ENST00000435993:exon_45369505_45369934:ITGB3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 45385012 C/T 1 11 2 13 5.08711756155069 1.07506953426351 4.01204802728719 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0272490390470393 ENSG00000056345:ENST00000435993:exon_45384837_45385045:ITGB3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 45811210 A/G 0 63 0 63 29.1353096706994 0 29.1353096706994 A A 10 0.537534767131755 1.25207576120163e-17 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45810610_45811311:TBX21 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 46629593 G/T 1 14 10 24 6.47451326015543 5.37534767131755 1.09916558883788 T:G G T 10 0.537534767131755 0.68779414869778 ENSG00000120093:ENST00000470495:exon_46629389_46631284:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000472863:exon_46629389_46629722:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000311626:exon_46629389_46629994:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000498678:exon_46629389_46629994:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000489475:exon_46629389_46629722:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000476342:exon_46629389_46629849:HOXB3;ENSG00000120093:ENST00000471459:exon_46629389_46629722:HOXB3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 46926615 G/A 1 81 71 152 37.4596838623279 38.1649684663546 -0.705284604026751 A:G G A 10 0.537534767131755 0.935262429456214 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509415:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000505071:exon_46926614_46926631:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000502761:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46926614_46926739:CALCOCO2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 40 56 96 18.4986093147298 30.1019469593783 -11.6033376446485 A:C:G C G 10 0.537534767131755 0.0185527324878509 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 47000251 C/T 1 71 60 131 32.8350315336454 32.2520860279053 0.582945505740099 T:C C T 10 0.537534767131755 0.930443406992224 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 47007963 C/T 1 108 76 184 49.9462451497705 40.8526423020134 9.09360284775708 T:C C T 10 0.537534767131755 0.183971853795711 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 167 169 336 77.2316938889969 90.8433756452666 -13.6116817562697 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.139858359499527 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 62492582 C/T 1 11 5 16 5.08711756155069 2.68767383565877 2.39944372589192 T:C C T 10 0.537534767131755 0.317045039600351 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62492525_62493169:POLG2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 62528179 A/G 1 9 17 26 4.16218709581421 9.13809104123983 -4.97590394542563 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0746576418474675 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 65362552 T/A 1 21 20 41 9.71176989023315 10.7506953426351 -1.03892545240195 A:T T A 10 0.537534767131755 0.756605398595916 ENSG00000197170:ENST00000356126:exon_65362528_65362743:PSMD12;ENSG00000197170:ENST00000357146:exon_65362528_65362721:PSMD12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 65908403 G/A 1 13 8 21 6.01204802728719 4.30027813705404 1.71176989023315 A:G G A 10 0.537534767131755 0.516592621941706 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65906993_65909303:BPTF HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 65988049 T/C 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000186665:ENST00000449250:exon_65987218_65988219:C17orf58;ENSG00000186665:ENST00000334461:exon_65987218_65988219:C17orf58 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 157 171 328 72.6070415603145 91.9184451795301 -19.3114036192156 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0352526637822146 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 56 69 125 25.8980530406217 37.0898989320911 -11.1918458914694 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0483897662938429 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 38 41 79 17.5736788489933 22.038925452402 -4.46524660340864 A:T T A 10 0.537534767131755 0.366819192549602 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 66422256 G/A 1 18 20 38 8.32437419162841 10.7506953426351 -2.42632115100669 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.515807132301838 ENSG00000070540:ENST00000262139:exon_66422216_66422316:WIPI1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 70645032 G/A 1 6 11 17 2.77479139720947 5.91288243844931 -3.13809104123983 A:G G A 10 0.537534767131755 0.148136675277047 ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_70644942_70645100:SLC39A11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 71192663 G/A 1 12 14 26 5.54958279441894 7.52548673984457 -1.97590394542563 A:G G A 10 0.537534767131755 0.440566012205601 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71192646_71192890:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71192646_71192890:COG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 71204440 C/T 1 74 64 138 34.2224272322501 34.4022250964323 -0.179797864182184 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000133193:ENST00000405159:exon_71203492_71205907:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000403627:exon_71203492_71205907:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000255557:exon_71203493_71205907:FAM104A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 71232658 C/T 1 15 20 35 6.93697849302368 10.7506953426351 -3.81371684961142 T:C C T 10 0.537534767131755 0.235686232316037 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 71243508 C/T 1 14 12 26 6.47451326015543 6.45041720558106 0.0240960545743709 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71243380_71245091:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71243380_71245091:C17orf80 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 72521897 G/A 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:G G A 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000178789:ENST00000392621:exon_72521887_72522216:CD300LB;ENSG00000178789:ENST00000314401:exon_72521887_72522216:CD300LB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 72859078 A/G 1 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 0.155642553042637 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 72862593 C/T 1 40 25 65 18.4986093147298 13.4383691782939 5.06024013643593 T:C C T 10 0.537534767131755 0.21619782516621 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72862568_72862690:FDXR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73127110 A/T 1 15 16 31 6.93697849302368 8.60055627410808 -1.6635777810844 A:T A T 10 0.537534767131755 0.591851170939278 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73488794 C/T 1 50 42 92 23.1232616434123 22.5764602195337 0.546801423878545 T:C C T 10 0.537534767131755 0.91723710070591 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73489567 C/G 1 14 7 21 6.47451326015543 3.76274336992228 2.71176989023315 C:G C G 10 0.537534767131755 0.278003094604447 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73518203 G/C 1 34 34 68 15.7238179175203 18.2761820824797 -2.55236416495934 C:G G C 10 0.537534767131755 0.545490197209809 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73518284 G/C 1 25 16 41 11.5616308217061 8.60055627410808 2.96107454759805 C:G G C 10 0.537534767131755 0.434059951809793 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 13 8 21 6.01204802728719 4.30027813705404 1.71176989023315 T:C C T 10 0.537534767131755 0.516592621941706 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73627539 T/C 1 24 13 37 11.0991655888379 6.98795197271281 4.11121361612507 T:C T C 10 0.537534767131755 0.190401096726678 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73627530_73627748:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73627530_73627748:RECQL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73774841 G/A 1 4 8 12 1.84986093147298 4.30027813705404 -2.45041720558106 A:G G A 10 0.537534767131755 0.246047854304642 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73812909 A/G 1 13 7 20 6.01204802728719 3.76274336992228 2.2493046573649 A:G A G 10 0.537534767131755 0.373913522529313 ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73812851_73812993:UNK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73816026 A/G 1 19 8 27 8.78683942449666 4.30027813705404 4.48656128744262 A:G A G 10 0.537534767131755 0.120983959944011 ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73816001_73816189:UNK;ENSG00000178932:ENST00000326348:exon_73815663_73816134:AC087289.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73819525 C/T 1 15 15 30 6.93697849302368 8.06302150697632 -1.12604301395265 T:C C T 10 0.537534767131755 0.716938089677859 ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73819346_73819603:UNK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73824121 T/C 1 83 78 161 38.3846143280643 41.9277118362769 -3.54309750821255 T:C T C 10 0.537534767131755 0.581076659237902 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73823310_73824167:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73824079_73824167:UNC13D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73827205 T/C 1 73 66 139 33.7599619993819 35.4772946306958 -1.71733263131394 T:C T C 10 0.537534767131755 0.798866936015925 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73827203_73827250:UNC13D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73831016 G/A 1 63 48 111 29.1353096706994 25.8016688223242 3.3336408483752 A:G G A 10 0.537534767131755 0.568399570929584 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73831001_73831144:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73831001_73831144:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73831001_73831144:UNC13D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73836162 C/G 1 70 80 150 32.3725663007772 43.0027813705404 -10.6302150697632 C:G C G 10 0.537534767131755 0.085751202424362 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73836099_73836191:UNC13D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73839137 G/A 1 60 40 100 27.7479139720947 21.5013906852702 6.2465232868245 A:G G A 10 0.537534767131755 0.229340922670920 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73839095_73839154:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73839095_73839154:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73839095_73839154:UNC13D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73840272 C/T 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 T:C C T 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73886888 A/G 1 34 20 54 15.7238179175203 10.7506953426351 4.97312257488523 A:G A G 10 0.537534767131755 0.219035355567889 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73885041_73887428:TRIM65 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73888423 A/G 1 9 6 15 4.16218709581421 3.22520860279053 0.936978493023676 A:G A G 10 0.537534767131755 0.797066078642493 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73888348_73888581:TRIM65 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73888427 A/C 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 A:C A C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73888348_73888581:TRIM65 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73900688 T/C 1 57 67 124 26.36051827349 36.0148293978276 -9.65431112433762 T:C T C 10 0.537534767131755 0.087260330734594 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493383:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000461602:exon_73900307_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000464758:exon_73900303_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000410030:exon_73900621_73900800:MRPL38 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 73949540 G/C 1 16 7 23 7.39944372589192 3.76274336992228 3.63670035596964 C:G G C 10 0.537534767131755 0.146568942838849 ENSG00000161533:ENST00000293217:exon_73949532_73949701:ACOX1;ENSG00000161533:ENST00000301608:exon_73949532_73949701:ACOX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 74077797 C/T 1 43 51 94 19.8860050133345 27.4142731237195 -7.52826811038497 T:C C T 10 0.537534767131755 0.122024077632160 ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000421794:exon_74077681_74077836:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 25 26 51 11.5616308217061 13.9759039454256 -2.4142731237195 T:C T C 10 0.537534767131755 0.574793601899611 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 74387284 C/T 1 42 48 90 19.4235397804663 25.8016688223242 -6.37812904185795 T:C C T 10 0.537534767131755 0.204469668955400 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74385614_74387694:UBE2O HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 74392342 G/A 1 32 33 65 14.7988874517838 17.7386473153479 -2.93975986356407 A:G G A 10 0.537534767131755 0.534318863442262 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74392209_74392902:UBE2O HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 75483528 C/T 1 712 670 1382 329.27524580219 360.148293978276 -30.8730481760854 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0998346673444185 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75483506_75483634:SEPT9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 75488768 G/A 1 388 417 805 179.436510352879 224.151997893942 -44.7154875410627 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00164641702815505 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75488703_75488798:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75488703_75488798:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75488703_75488798:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75488703_75488798:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75488703_75488798:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75488703_75488798:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75488703_75488798:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75488703_75488798:SEPT9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 75494746 A/G 1 277 278 555 128.102869504504 149.434665262628 -21.331795758124 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.0737346933186708 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 75494780 A/T 1 417 369 786 192.848002106058 198.350329071618 -5.5023269655594 A:T:C:G A T 10 0.537534767131755 0.69415835023292 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 76115353 T/C 1 26 22 48 12.0240960545744 11.8257648768986 0.198331177675762 T:C T C 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 76420085 T/C 1 4 10 14 1.84986093147298 5.37534767131755 -3.52548673984457 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0654879889218514 ENSG00000187775:ENST00000442057:exon_76419778_76420234:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76419778_76420234:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76419783_76420234:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000374939:exon_76419783_76420234:DNAH17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 76970879 A/G 1 13 5 18 6.01204802728719 2.68767383565877 3.32437419162841 A:G A G 10 0.537534767131755 0.155872428250262 ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76970770_76970901:LGALS3BP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 19 21 40 8.78683942449666 11.2882301097669 -2.5013906852702 A:G G A 10 0.537534767131755 0.433287382227075 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 76989782 G/A 1 47 26 73 21.7358659448075 13.9759039454256 7.75996199938189 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0780509882541863 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 76993546 A/G 1 26 24 50 12.0240960545744 12.9008344111621 -0.876738356587747 A:G A G 10 0.537534767131755 0.887437482628127 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76993074_76994045:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76993074_76993726:CANT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 77073566 G/A 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 A:G G A 10 0.537534767131755 0.190750883746296 ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77073512_77073579:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77073512_77073579:ENGASE HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 77076440 G/T 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 T:G G T 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77076289_77076446:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77076289_77076446:ENGASE HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 77768654 C/A 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77765931_77769357:CBX8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 77808489 C/T 1 46 39 85 21.2734007119393 20.9638559181384 0.309544793800828 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000141582:ENST00000269397:exon_77806955_77809194:CBX4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 78854223 A/G 1 7 8 15 3.23725663007772 4.30027813705404 -1.06302150697632 A:G A G 10 0.537534767131755 0.61360765893613 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78854215_78854289:RPTOR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 78857700 G/A 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78857581_78857772:RPTOR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 78865546 T/C 1 9 6 15 4.16218709581421 3.22520860279053 0.936978493023676 T:C T C 10 0.537534767131755 0.797066078642493 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78865520_78865637:RPTOR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 78865630 A/G 1 14 7 21 6.47451326015543 3.76274336992228 2.71176989023315 A:G A G 10 0.537534767131755 0.278003094604447 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78865520_78865637:RPTOR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 78896529 C/T 1 15 10 25 6.93697849302368 5.37534767131755 1.56163082170613 T:C C T 10 0.537534767131755 0.555250283480734 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78896524_78896627:RPTOR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 78921117 C/T 1 9 6 15 4.16218709581421 3.22520860279053 0.936978493023676 T:C C T 10 0.537534767131755 0.797066078642493 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78921027_78921151:RPTOR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 79220224 G/C 1 45 58 103 20.810935479071 31.1770164936418 -10.3660810145708 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0476850392936296 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 79226230 C/T 1 44 56 100 20.3484702462028 30.1019469593783 -9.7534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0565021701286594 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 79249922 G/A 1 23 20 43 10.6367003559696 10.7506953426351 -0.113994986665464 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79249769_79249951:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79249769_79249951:SLC38A10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 79478019 G/A 1 3820 3970 7790 1766.6171895567 2134.01302551307 -367.395835956371 A:T:C:G G A 10 0.537534767131755 7.80629220357226e-17 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 79478870 C/A 1 21 7 28 9.71176989023315 3.76274336992228 5.94902652031086 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0351555844620455 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 79478871 C/T 1 22 7 29 10.1742351231014 3.76274336992228 6.4114917531791 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0237302700851877 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 79478916 G/T 1 18 5 23 8.32437419162841 2.68767383565877 5.63670035596964 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0206177205691347 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 79526402 G/C 1 48 51 99 22.1983311776758 27.4142731237195 -5.21594194604374 C:G G C 10 0.537534767131755 0.314157372421981 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79523915_79526442:NPLOC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 79671455 C/T 1 139 156 295 64.2826673686861 83.8554236725538 -19.5727563038677 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0228098893189427 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79671274_79671460:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79671274_79671460:MRPL12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 79952784 C/A 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 A:C C A 10 0.537534767131755 0.318386975483931 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 16 23 39 7.39944372589192 12.3632996440304 -4.96385591813844 A:G G A 10 0.537534767131755 0.147444815523230 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 80373452 C/T 1 19 17 36 8.78683942449666 9.13809104123983 -0.351251616743179 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 80377690 T/G 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 T:G T G 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80377625_80377759:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80377665_80377759:HEXDC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 80402045 T/C 1 9 10 19 4.16218709581421 5.37534767131755 -1.21316057550334 T:C T C 10 0.537534767131755 0.648761877832002 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 80708601 C/G 1 9 3 12 4.16218709581421 1.61260430139526 2.54958279441894 C:G C G 10 0.537534767131755 0.159578115428333 ENSG00000167363:ENST00000300784:exon_80708293_80709073:FN3K HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 80828203 C/T 1 27 18 45 12.4865612874426 9.67562580837159 2.81093547907103 T:C C T 10 0.537534767131755 0.456125253323194 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80828100_80828256:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80828100_80828256:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80828100_80828256:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80828100_80828256:TBCD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 80863857 T/C 1 23 21 44 10.6367003559696 11.2882301097669 -0.651529753797218 A:T:C T C 10 0.537534767131755 0.880571422369327 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80863812_80863929:TBCD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 75 97 172 34.6848924651184 52.1408724117802 -17.4559799466618 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00913478217692006 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 17 80904844 C/T 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80904755_80904859:B3GNTL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 672836 A/G 1 15 18 33 6.93697849302368 9.67562580837159 -2.73864731534791 A:G A G 10 0.537534767131755 0.384603784880895 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 2705700 A/G 1 8 11 19 3.69972186294596 5.91288243844931 -2.21316057550334 A:G A G 10 0.537534767131755 0.361207681506224 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2705692_2705805:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2705692_2705805:SMCHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 2707619 G/A 1 18 8 26 8.32437419162841 4.30027813705404 4.02409605457437 A:G G A 10 0.537534767131755 0.120546606575642 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2707561_2707643:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2707561_2707643:SMCHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 2740714 A/G 1 3 7 10 1.38739569860474 3.76274336992228 -2.37534767131755 A:G A G 10 0.537534767131755 0.203605394966440 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2740701_2740819:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2740701_2740819:SMCHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 2750477 A/G 1 8 7 15 3.69972186294596 3.76274336992228 -0.0630215069763245 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2750348_2750505:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2750348_2750505:SMCHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 2891478 T/C 1 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 0.155642553042637 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2890559_2892484:EMILIN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 3729175 C/T 1 1 12 13 0.462465232868245 6.45041720558106 -5.98795197271281 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00102587923033521 ENSG00000170579:ENST00000315677:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400147:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400150:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400149:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400155:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000400145:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000485480:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000498188:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000478161:exon_3729135_3729375:DLGAP1;ENSG00000170579:ENST00000486430:exon_3729135_3729378:DLGAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 5292030 A/G 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000198081:ENST00000357006:exon_5289018_5292203:ZFP161;ENSG00000198081:ENST00000400143:exon_5289019_5292203:ZFP161 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 9117867 T/C 1 31 21 52 14.3364222189156 11.2882301097669 3.04819210914874 T:C T C 10 0.537534767131755 0.408449106109430 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9117385_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9117836_9117901:NDUFV2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 29 29 58 13.4114917531791 15.5885082468209 -2.17701649364179 A:G A G 10 0.537534767131755 0.599818675934273 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 9936132 T/C 1 40 44 84 18.4986093147298 23.6515297537972 -5.15292043906742 T:C T C 10 0.537534767131755 0.274983172267824 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9936107_9936210:VAPA;ENSG00000101558:ENST00000400000:exon_9936107_9936210:VAPA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 9944956 T/C 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:C T C 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9944921_9945055:VAPA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 9944960 A/G 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9944921_9945055:VAPA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 11886563 C/G 1 22 24 46 10.1742351231014 12.9008344111621 -2.72659928806073 C:G C G 10 0.537534767131755 0.461241107508186 ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 11889467 C/T 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000154889:ENST00000317235:exon_11889386_11889489:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11889386_11889489:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11889386_11889489:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11889386_11889489:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11889386_11889489:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000317251:exon_11889386_11889489:MPPE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 24035675 T/C 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 T:C T C 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000134504:ENST00000317932:exon_24034874_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000417602:exon_24034877_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000408011:exon_24034877_24035865:KCTD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 33557466 A/G 1 21 21 42 9.71176989023315 11.2882301097669 -1.57646021953371 A:G A G 10 0.537534767131755 0.645373193253824 ENSG00000141428:ENST00000333234:exon_33557373_33557563:C18orf21;ENSG00000141428:ENST00000269194:exon_33557373_33557563:C18orf21 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 46447817 G/C 1 18 9 27 8.32437419162841 4.83781290418579 3.48656128744262 C:G G C 10 0.537534767131755 0.246443933683272 ENSG00000101665:ENST00000262158:exon_46446223_46448280:SMAD7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 46448129 G/A 1 20 16 36 9.2493046573649 8.60055627410808 0.648748383256821 A:G G A 10 0.537534767131755 0.868646651133528 ENSG00000101665:ENST00000262158:exon_46446223_46448280:SMAD7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 47017820 A/G 1 11 15 26 5.08711756155069 8.06302150697632 -2.97590394542563 A:G A G 10 0.537534767131755 0.325523153112396 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 47803354 C/T 1 34 50 84 15.7238179175203 26.8767383565877 -11.1529204390674 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0159356625542944 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803202_47803368:MBD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 47812587 C/T 1 99 94 193 45.7840580539563 50.528268110385 -4.74421005642871 T:C C T 10 0.537534767131755 0.516226587752643 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47812392_47812627:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47812392_47812627:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000445672:exon_47812392_47812627:CXXC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 51820805 G/A 1 6 12 18 2.77479139720947 6.45041720558106 -3.67562580837159 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0991754162193756 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 55221648 T/C 1 12 17 29 5.54958279441894 9.13809104123983 -3.58850824682089 T:C T C 10 0.537534767131755 0.196303716694424 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55221492_55221656:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55221492_55221656:FECH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 55226383 G/C 1 11 13 24 5.08711756155069 6.98795197271281 -1.90083441116212 C:G G C 10 0.537534767131755 0.540217717608162 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55226377_55226475:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55226377_55226475:FECH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 56202982 A/T 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 A:T A T 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 14 17 31 6.47451326015543 9.13809104123983 -2.6635777810844 C:G G C 10 0.537534767131755 0.371006982111436 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 14 16 30 6.47451326015543 8.60055627410808 -2.12604301395265 A:G A G 10 0.537534767131755 0.468003746372143 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 23 11 34 10.6367003559696 5.91288243844931 4.72381791752033 T:G G T 10 0.537534767131755 0.12215756143552 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 15 11 26 6.93697849302368 5.91288243844931 1.02409605457437 T:G T G 10 0.537534767131755 0.84457724361591 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 A:C A C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 56204644 T/G 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 T:G T G 10 0.537534767131755 0.760762761058777 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 56204747 G/A 1 10 3 13 4.62465232868245 1.61260430139526 3.01204802728719 A:G G A 10 0.537534767131755 0.104100192392772 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 67992684 C/T 1 4 8 12 1.84986093147298 4.30027813705404 -2.45041720558106 T:C C T 10 0.537534767131755 0.246047854304642 ENSG00000170677:ENST00000397942:exon_67991779_67997436:SOCS6;ENSG00000170677:ENST00000302056:exon_67991778_67994308:SOCS6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 71816278 G/A 1 38 28 66 17.5736788489933 15.0509734796891 2.52270536930417 A:G G A 10 0.537534767131755 0.621810249921331 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 95 86 181 43.9341971224833 46.2279899733309 -2.29379285084765 A:G G A 10 0.537534767131755 0.765748211687798 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 114 97 211 52.7210365469799 52.1408724117802 0.580164135199702 T:C T C 10 0.537534767131755 0.945090002165932 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 72345890 A/C 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 A:C A C 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000215421:ENST00000299687:exon_72342919_72347662:ZNF407;ENSG00000215421:ENST00000309902:exon_72342919_72347662:ZNF407 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 18 16 34 8.32437419162841 8.60055627410808 -0.276182082479668 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 72997677 C/T 1 8 14 22 3.69972186294596 7.52548673984457 -3.82576487689861 T:C C T 10 0.537534767131755 0.133605422521882 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 72998004 T/C 1 10 14 24 4.62465232868245 7.52548673984457 -2.90083441116212 T:C T C 10 0.537534767131755 0.306252553826296 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 72998268 T/C 1 9 14 23 4.16218709581421 7.52548673984457 -3.36329964403036 T:C T C 10 0.537534767131755 0.209243218264062 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 72998886 T/C 1 15 15 30 6.93697849302368 8.06302150697632 -1.12604301395265 T:C T C 10 0.537534767131755 0.716938089677859 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 72999359 T/C 1 16 22 38 7.39944372589192 11.8257648768986 -4.42632115100669 T:C T C 10 0.537534767131755 0.192498536355526 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 77067000 T/G 1 10 4 14 4.62465232868245 2.15013906852702 2.47451326015543 T:G T G 10 0.537534767131755 0.283621077619465 ENSG00000166377:ENST00000426216:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000359184:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000440332:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000307671:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000490210:exon_77066986_77067234:ATP9B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 77156197 C/T 1 2 16 18 0.92493046573649 8.60055627410808 -7.67562580837159 T:C C T 10 0.537534767131755 0.000228103902922197 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77155772_77156351:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77155856_77156351:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77155944_77156351:NFATC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 77171061 T/G 1 32 29 61 14.7988874517838 15.5885082468209 -0.789620795037052 T:G T G 10 0.537534767131755 0.898068334777582 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 77246527 C/T 1 23 9 32 10.6367003559696 4.83781290418579 5.79888745178384 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0499623183238552 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 77473086 G/A 1 22 16 38 10.1742351231014 8.60055627410808 1.57367884899331 A:G G A 10 0.537534767131755 0.629922467162815 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77472972_77473138:CTDP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 77474626 C/T 1 17 24 41 7.86190895876017 12.9008344111621 -5.03892545240195 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.119939508366236 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77474491_77475528:CTDP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 77474921 G/A 1 38 27 65 17.5736788489933 14.5134387125574 3.06024013643593 A:G G A 10 0.537534767131755 0.458793530275788 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77474491_77475528:CTDP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 18 77895898 G/A 1 33 35 68 15.2613526846521 18.8137168496114 -3.55236416495934 A:G G A 10 0.537534767131755 0.397209696256307 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 332 302 634 153.538457312257 162.33549967379 -8.79704236153265 T:C T C 10 0.537534767131755 0.498432823285412 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 12 4 16 5.54958279441894 2.15013906852702 3.39944372589192 C:G G C 10 0.537534767131755 0.130562570499175 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 622336 T/G 1 16 23 39 7.39944372589192 12.3632996440304 -4.96385591813844 T:G T G 10 0.537534767131755 0.147444815523230 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622149_622373:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622149_622373:POLRMT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 897433 G/A 1 136 2 138 62.8952716700813 1.07506953426351 61.8202021358178 A:G G A 10 0.537534767131755 4.74399634046425e-34 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_896503_897540:C19orf22 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 67 56 123 30.9851706021724 30.1019469593783 0.883223642794139 T:C C T 10 0.537534767131755 0.928027373215518 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1010807 G/T 1 180 187 367 83.2437419162841 100.519001453638 -17.2752595373541 A:T:G G T 10 0.537534767131755 0.0750438528385056 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1009650_1010894:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1009650_1010894:C19orf6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1011338 C/T 1 37 36 73 17.1112136161251 19.3512516167432 -2.24003800061811 T:C C T 10 0.537534767131755 0.639480429217038 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1012120 G/A 1 173 161 334 80.0064852862064 86.5430975082126 -6.53661222200617 A:G G A 10 0.537534767131755 0.476181967787223 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1012065_1012187:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1012065_1012187:C19orf6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1014377 A/G 1 148 129 277 68.4448544645003 69.3419849599964 -0.897130495496128 A:G A G 10 0.537534767131755 0.951968795600592 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 148 116 264 68.4448544645003 62.3540329872836 6.09082147721669 A:G A G 10 0.537534767131755 0.459634669330941 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1036456 C/G 1 288 205 493 133.189987066055 110.19462726201 22.9953598040448 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0378240756647296 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1036468 A/G 1 286 196 482 132.265056600318 105.356814357824 26.9082422424941 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0153952542427645 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1036575 G/A 1 15 3 18 6.93697849302368 1.61260430139526 5.32437419162841 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0157595601610924 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1042809 A/G 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1042745_1042825:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1042745_1042825:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000534541:exon_1042745_1042825:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1042661_1042825:ABCA7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1043748 A/G 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1043724_1043840:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1043724_1043840:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1043724_1043840:ABCA7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1047161 A/G 1 2 7 9 0.92493046573649 3.76274336992228 -2.83781290418579 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0909104192397482 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1047156_1047377:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1047156_1047377:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1047156_1047377:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000533574:exon_1047156_1047377:ABCA7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1047537 A/C 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 A:C A C 10 0.537534767131755 0.760762761058777 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1047452_1047653:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1047452_1047653:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1047452_1047653:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000533574:exon_1047452_1047553:ABCA7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1052005 C/T 1 7 8 15 3.23725663007772 4.30027813705404 -1.06302150697632 T:C C T 10 0.537534767131755 0.61360765893613 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1051941_1052125:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1051941_1052125:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1051941_1052125:ABCA7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1053524 C/G 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 C:G C G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1053328_1053530:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1053328_1053530:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1053328_1053530:ABCA7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1054060 A/G 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1054005_1054109:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1054005_1054109:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1054005_1054109:ABCA7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1055191 G/A 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000530092:exon_1055096_1055350:ABCA7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1058176 A/G 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 A:G A G 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1058145_1058268:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1058145_1058268:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1058145_1058268:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000524728:exon_1058145_1058268:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000525073:exon_1058145_1058268:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000532194:exon_1058145_1058268:ABCA7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1062192 T/C 1 12 9 21 5.54958279441894 4.83781290418579 0.711769890233146 T:C T C 10 0.537534767131755 0.829121193760437 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1062171_1062312:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1062171_1062312:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1062171_1062312:ABCA7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1064193 G/A 1 6 9 15 2.77479139720947 4.83781290418579 -2.06302150697632 A:G G A 10 0.537534767131755 0.311071565735570 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064051_1064252:ABCA7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 93 47 140 43.0092666567468 25.2641340551925 17.7451326015543 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00289035638122774 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 99 47 146 45.7840580539563 25.2641340551925 20.5199239987638 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.000632167173534098 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 136 122 258 62.8952716700813 65.5792415900741 -2.68396991999278 A:G A G 10 0.537534767131755 0.755125435136001 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 42 42 84 19.4235397804663 22.5764602195337 -3.15292043906742 T:C C T 10 0.537534767131755 0.512728495583757 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1095352 C/G 1 10 16 26 4.62465232868245 8.60055627410808 -3.97590394542563 C:G C G 10 0.537534767131755 0.167381271298725 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1095355 C/T 1 8 10 18 3.69972186294596 5.37534767131755 -1.67562580837159 T:C C T 10 0.537534767131755 0.483452727703955 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1106477 G/C 1 8 8 16 3.69972186294596 4.30027813705404 -0.600556274108079 C:G G C 10 0.537534767131755 0.806072821048815 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1109215 G/A 1 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 0.155642553042637 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1119019 C/T 1 21 20 41 9.71176989023315 10.7506953426351 -1.03892545240195 T:C C T 10 0.537534767131755 0.756605398595916 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1119010_1119163:SBNO2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1242048 C/T 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1357082 T/C 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1357008_1357093:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1357063_1357093:MUM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1360575 G/A 1 17 22 39 7.86190895876017 11.8257648768986 -3.96385591813844 A:G G A 10 0.537534767131755 0.260722504893214 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1391059 G/T 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 T:G G T 10 0.537534767131755 0.74134570348407 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1615796 G/A 1 125 161 286 57.8081541085306 86.5430975082126 -28.7349433996819 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.000706192575587202 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1615284_1615820:TCF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1619333 G/A 1 165 20 185 76.3067634232604 10.7506953426351 65.5560680806253 A:G G A 10 0.537534767131755 4.66078974129869e-25 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1619348 G/A 1 158 14 172 73.0695067931827 7.52548673984457 65.5440200533381 A:G G A 10 0.537534767131755 9.5980215113131e-28 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1619350 C/T 1 157 17 174 72.6070415603145 9.13809104123983 63.4689505190746 T:C C T 10 0.537534767131755 2.92311134082575e-25 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1821637 A/G 1 20 15 35 9.2493046573649 8.06302150697632 1.18628315038858 A:G A G 10 0.537534767131755 0.736906280800669 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1821518_1821681:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1821518_1821681:REXO1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1969882 G/T 1 58 57 115 26.8229835063582 30.63948172651 -3.81649822015182 T:G G T 10 0.537534767131755 0.513063737588233 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1969507_1969958:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1969507_1969958:CSNK1G2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1979811 A/G 1 122 124 246 56.4207584099259 66.6543111243376 -10.2335527144117 A:G A G 10 0.537534767131755 0.201109124193562 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1979751_1979834:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1979751_1979819:CSNK1G2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1979907 C/T 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.732674349299313 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 141 123 264 65.2075978344225 66.1167763572059 -0.909178522783321 A:G A G 10 0.537534767131755 0.950802139083108 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2037842 A/C 1 963 895 1858 445.35401925212 481.093616582921 -35.7395973308007 A:C A C 10 0.537534767131755 0.0985687610575129 ENSG00000099875:ENST00000250896:exon_2037481_2039855:MKNK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2041032 T/C 1 46 66 112 21.2734007119393 35.4772946306958 -14.2038939187566 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0078225456354139 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2073466 T/C 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 T:C T C 10 0.537534767131755 0.518813828738763 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2078221 G/C 1 280 244 524 129.490265203109 131.158483180148 -1.6682179770396 C:G G C 10 0.537534767131755 0.895488417444383 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 235 218 453 108.679329724038 117.182579234723 -8.503249510685 A:G A G 10 0.537534767131755 0.423615123344327 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 244 260 504 112.841516819852 139.759039454256 -26.9175226344045 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0178271588065165 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2097986 T/C 1 4 18 22 1.84986093147298 9.67562580837159 -7.82576487689861 T:C T C 10 0.537534767131755 0.000913660417064246 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2098015 T/C 1 7 10 17 3.23725663007772 5.37534767131755 -2.13809104123983 T:C T C 10 0.537534767131755 0.337166426523694 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2099288 C/T 1 31 26 57 14.3364222189156 13.9759039454256 0.360518273489967 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000099840:ENST00000395307:exon_2099254_2099579:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000300960:exon_2099254_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000395301:exon_2099254_2099344:IZUMO4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2109834 G/A 1 2 7 9 0.92493046573649 3.76274336992228 -2.83781290418579 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0909104192397482 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 94 87 181 43.471731889615 46.7655247404627 -3.29379285084764 A:G G A 10 0.537534767131755 0.65492413707367 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 49 45 94 22.660796410544 24.189064520929 -1.52826811038497 A:G A G 10 0.537534767131755 0.757466315624281 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2226772 G/C 1 104 93 197 48.0963842182975 49.9907333432532 -1.89434912495572 C:G G C 10 0.537534767131755 0.830351624384988 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2226855 C/T 1 105 93 198 48.5588494511657 49.9907333432532 -1.43188389208748 T:C C T 10 0.537534767131755 0.886703403333385 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2344034 C/A 1 17 38 55 7.86190895876017 20.4263211510067 -12.5644121922465 A:C C A 10 0.537534767131755 0.00098091617975608 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2343963_2344037:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2343963_2344037:AC004410.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2353148 T/C 1 16 39 55 7.39944372589192 20.9638559181384 -13.5644121922465 T:C T C 10 0.537534767131755 0.000341344896750155 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2418031 C/T 1 6 2 8 2.77479139720947 1.07506953426351 1.69972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.300105198743785 ENSG00000178297:ENST00000332578:exon_2418000_2418136:TMPRSS9;ENSG00000178297:ENST00000425079:exon_2418000_2418136:TMPRSS9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2427266 G/A 1 222 241 463 102.66728169675 129.545878878753 -26.8785971820026 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0134318240222871 ENSG00000099800:ENST00000215570:exon_2427254_2427322:TIMM13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 109 116 225 50.4087103826387 62.3540329872836 -11.9453226046449 A:G A G 10 0.537534767131755 0.123941697992577 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 69 55 124 31.9101010679089 29.5644121922465 2.34568887566239 A:C A C 10 0.537534767131755 0.718990349190954 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 3382176 C/T 1 26 23 49 12.0240960545744 12.3632996440304 -0.339203589455993 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000141905:ENST00000443272:exon_3381710_3382241:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000395111:exon_3381710_3382241:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000346156:exon_3381710_3382241:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000341919:exon_3381710_3382241:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000343825:exon_3381710_3382241:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000269778:exon_3381710_3382241:NFIC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 3546289 C/T 1 25 16 41 11.5616308217061 8.60055627410808 2.96107454759805 T:C C T 10 0.537534767131755 0.434059951809793 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3546253_3546423:C19orf28 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 3624140 C/T 1 15 12 27 6.93697849302368 6.45041720558106 0.486561287442616 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3623686_3624160:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3623686_3624160:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3623686_3624160:C19orf29 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 4028783 C/T 1 21 29 50 9.71176989023315 15.5885082468209 -5.87673835658775 T:C C T 10 0.537534767131755 0.118051965258774 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4028718_4028846:PIAS4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 4216910 G/A 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 A:G G A 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000089847:ENST00000318934:exon_4216547_4218160:ANKRD24;ENSG00000089847:ENST00000262969:exon_4216547_4217257:ANKRD24;ENSG00000089847:ENST00000262970:exon_4216547_4218160:ANKRD24 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 4233095 T/C 0 36 0 36 16.6487483832568 0 16.6487483832568 T T 10 0.537534767131755 2.34637818685570e-10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 4233096 G/A 0 34 0 34 15.7238179175203 0 15.7238179175203 G G 10 0.537534767131755 8.4815246989132e-10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 4233107 C/T 1 30 3 33 13.8739569860474 1.61260430139526 12.2613526846521 T:C C T 10 0.537534767131755 5.68648045738814e-06 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 4234856 T/A 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 A:T T A 10 0.537534767131755 0.357514540525421 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 43 30 73 19.8860050133345 16.1260430139526 3.75996199938189 T:C T C 10 0.537534767131755 0.412402205692775 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 4847713 A/G 1 55 67 122 25.4355878077535 36.0148293978276 -10.5792415900741 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0568676970775445 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 4847874 A/G 1 56 69 125 25.8980530406217 37.0898989320911 -11.1918458914694 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0483897662938429 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 4852106 A/G 1 39 60 99 18.0361440818616 32.2520860279053 -14.2159419460437 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00462467845642077 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 5110794 A/G 1 20 14 34 9.2493046573649 7.52548673984457 1.72381791752033 A:G A G 10 0.537534767131755 0.60857531545722 ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5110633_5110829:KDM4B;ENSG00000127663:ENST00000381759:exon_5110633_5110829:KDM4B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 5206775 A/G 1 18 51 69 8.32437419162841 27.4142731237195 -19.0898989320911 A:G A G 10 0.537534767131755 4.66559183500494e-06 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5205519_5206853:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5205519_5206853:PTPRS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 5604875 T/C 1 38 42 80 17.5736788489933 22.5764602195337 -5.0027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 0.264771620538205 ENSG00000130254:ENST00000252542:exon_5604798_5604947:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000434962:exon_5604798_5604947:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000394625:exon_5604798_5604947:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000415313:exon_5604798_5604947:SAFB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 103 88 191 47.6339189854292 47.3030595075944 0.3308594778348 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 5696245 A/G 1 10 6 16 4.62465232868245 3.22520860279053 1.39944372589192 A:G A G 10 0.537534767131755 0.618373054653884 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 5783905 G/A 1 9 6 15 4.16218709581421 3.22520860279053 0.936978493023676 A:G G A 10 0.537534767131755 0.797066078642493 ENSG00000212123:ENST00000390672:exon_5782971_5784610:PRR22;ENSG00000212123:ENST00000419421:exon_5782971_5784064:PRR22 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 20 24 44 9.2493046573649 12.9008344111621 -3.65152975379722 A:G G A 10 0.537534767131755 0.292132245239101 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 5789565 T/C 1 37 24 61 17.1112136161251 12.9008344111621 4.21037920496295 T:C T C 10 0.537534767131755 0.305859589739509 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 6222552 C/T 1 66 55 121 30.5227053693042 29.5644121922465 0.958293177057651 T:C C T 10 0.537534767131755 0.927416893058212 ENSG00000130382:ENST00000252674:exon_6222132_6222695:MLLT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 6419275 A/G 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 A:G A G 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 8 10 18 3.69972186294596 5.37534767131755 -1.67562580837159 A:G A G 10 0.537534767131755 0.483452727703955 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 756 672 1428 349.623716048393 361.223363512539 -11.5996474641461 A:G G A 10 0.537534767131755 0.541709951740694 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 6731057 T/C 1 40 36 76 18.4986093147298 19.3512516167432 -0.852642302013376 T:C T C 10 0.537534767131755 0.908546404719293 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 6732982 G/A 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 A:G G A 10 0.537534767131755 0.781935053048792 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 6737481 T/C 1 16 5 21 7.39944372589192 2.68767383565877 4.71176989023315 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0479148988789245 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6737468_6737633:GPR108 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 6737509 G/A 1 14 4 18 6.47451326015543 2.15013906852702 4.32437419162841 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0563146448740562 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6737468_6737633:GPR108 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 12 14 26 5.54958279441894 7.52548673984457 -1.97590394542563 T:C T C 10 0.537534767131755 0.440566012205601 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 6755155 T/C 1 12 10 22 5.54958279441894 5.37534767131755 0.174235123101391 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 6759631 C/T 1 9 6 15 4.16218709581421 3.22520860279053 0.936978493023676 T:C C T 10 0.537534767131755 0.797066078642493 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6759605_6759681:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6759605_6759681:SH2D3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 6760974 T/C 1 8 5 13 3.69972186294596 2.68767383565877 1.01204802728719 T:C T C 10 0.537534767131755 0.782310374824685 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6760649_6760998:SH2D3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 6763718 A/G 1 1 7 8 0.462465232868245 3.76274336992228 -3.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0285185064817781 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6763691_6763827:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6763691_6763827:SH2D3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 7083010 G/A 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 A:G G A 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000130544:ENST00000439035:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000414706:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000252840:exon_7082889_7087979:ZNF557 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 7125297 G/A 1 19 3 22 8.78683942449666 1.61260430139526 7.17423512310139 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00206309063922382 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7125294_7125538:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7125294_7125538:INSR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 7524846 C/T 1 17 12 29 7.86190895876017 6.45041720558106 1.41149175317911 T:C C T 10 0.537534767131755 0.710565874391974 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7524789_7524880:ARHGEF18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 7622226 G/A 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 A:G G A 10 0.537534767131755 0.357514540525421 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 7623700 G/A 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 A:G G A 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 7685351 A/G 1 12 10 22 5.54958279441894 5.37534767131755 0.174235123101391 A:G A G 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 106 59 165 49.021314684034 31.7145512607735 17.3067634232604 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00776740049322193 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 131 81 212 60.5829455057401 43.5403161376721 17.0426293680679 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0191871631871784 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 7712417 A/G 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:G A G 10 0.537534767131755 0.732674349299313 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 7712585 T/G 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 T:G T G 10 0.537534767131755 0.241009480668847 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 7976127 C/G 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 C:G C G 10 0.537534767131755 0.190750883746296 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 7992052 A/C 1 72 99 171 33.2974967665136 53.2159419460437 -19.9184451795301 A:C A C 10 0.537534767131755 0.00268353723234238 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7991604_7992191:TIMM44 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 7992126 G/A 1 54 50 104 24.9731225748852 26.8767383565877 -1.90361578170252 A:G G A 10 0.537534767131755 0.768167485835498 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7991604_7992191:TIMM44 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 7992959 T/C 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 8000001 C/T 1 48 72 120 22.1983311776758 38.7025032334864 -16.5041720558106 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00322777203320426 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7999950_8000030:TIMM44 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 8028544 A/G 1 166 146 312 76.7692286561287 78.4800760012362 -1.71084734510755 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.864845533474267 ENSG00000066044:ENST00000351593:exon_8023458_8028691:ELAVL1;ENSG00000066044:ENST00000407627:exon_8023458_8028691:ELAVL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 8319455 C/T 1 30 34 64 13.8739569860474 18.2761820824797 -4.40222509643232 T:C C T 10 0.537534767131755 0.316015182275011 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8319383_8319500:LASS4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 8320555 G/A 1 31 27 58 14.3364222189156 14.5134387125574 -0.177016493641789 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8320491_8320609:LASS4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 8376431 G/A 1 70 70 140 32.3725663007772 37.6274336992228 -5.2548673984457 A:G G A 10 0.537534767131755 0.397082764142508 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8376234_8376479:NDUFA7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 8468485 C/T 1 119 129 248 55.0333627113212 69.3419849599964 -14.3086222486752 T:C C T 10 0.537534767131755 0.074453090247976 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 9267319 G/T 1 12 17 29 5.54958279441894 9.13809104123983 -3.58850824682089 T:G G T 10 0.537534767131755 0.196303716694424 ENSG00000130803:ENST00000419608:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9267288_9267424:ZNF317 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 22 38 60 10.1742351231014 20.4263211510067 -10.2520860279053 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00924456425046073 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 10224548 G/A 1 66 45 111 30.5227053693042 24.189064520929 6.3336408483752 A:G G A 10 0.537534767131755 0.253554089419065 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 10291181 T/C 1 42 55 97 19.4235397804663 29.5644121922465 -10.1408724117802 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0417382960799526 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10291026_10291245:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10291026_10291245:DNMT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 10444826 G/A 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 46 58 104 21.2734007119393 31.1770164936418 -9.90361578170252 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0612334781861229 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 54 46 100 24.9731225748852 24.7265992880607 0.246523286824502 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 10599965 G/A 1 29 38 67 13.4114917531791 20.4263211510067 -7.01482939782758 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0877588853795902 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10599868_10600044:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10599868_10600044:KEAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 27 30 57 12.4865612874426 16.1260430139526 -3.63948172651003 C:G G C 10 0.537534767131755 0.354448455410502 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 10668673 A/G 1 49 53 102 22.660796410544 28.489342657983 -5.82854624743901 A:G A G 10 0.537534767131755 0.274852808823721 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 10738639 C/T 1 69 68 137 31.9101010679089 36.5523641649593 -4.64226309705043 T:C C T 10 0.537534767131755 0.441474813129874 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10738596_10738680:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10738596_10738680:SLC44A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 10742170 A/G 1 128 142 270 59.1955498071354 76.3299369327092 -17.1343871255738 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0379943065770999 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10742151_10742211:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10742151_10742211:SLC44A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 10793749 A/G 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:G A G 10 0.537534767131755 0.732674349299313 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 10794630 G/T 1 287 273 560 132.727521833186 146.746991426969 -14.0194695937828 A:T:G G T 10 0.537534767131755 0.235726078823126 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 55 75 130 25.4355878077535 40.3151075348816 -14.8795197271281 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0105032135073016 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 11227602 C/T 1 14 21 35 6.47451326015543 11.2882301097669 -4.81371684961142 T:C C T 10 0.537534767131755 0.126582816053195 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 11230881 T/C 1 35 26 61 16.1862831503886 13.9759039454256 2.21037920496295 T:C T C 10 0.537534767131755 0.609126419963489 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11230768_11230909:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11230768_11230909:LDLR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 11303943 A/G 1 12 7 19 5.54958279441894 3.76274336992228 1.78683942449666 A:G A G 10 0.537534767131755 0.493873626093778 ENSG00000197256:ENST00000355150:exon_11303507_11304718:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000432929:exon_11303507_11304718:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000439675:exon_11303507_11304718:KANK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 11319491 G/A 1 13 9 22 6.01204802728719 4.83781290418579 1.17423512310139 A:G G A 10 0.537534767131755 0.67355127074083 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11319362_11319505:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11319362_11319505:DOCK6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 11326119 A/G 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 A:G A G 10 0.537534767131755 0.241009480668847 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11326063_11326147:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11326063_11326147:DOCK6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 11326125 C/T 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 T:C C T 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11326063_11326147:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11326063_11326147:DOCK6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 11332570 T/A 1 7 8 15 3.23725663007772 4.30027813705404 -1.06302150697632 A:T T A 10 0.537534767131755 0.61360765893613 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11332527_11332696:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11332527_11332696:DOCK6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 11358799 G/A 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 A:G G A 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11358742_11358827:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11358742_11358827:DOCK6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 11558275 G/A 1 182 243 425 84.1686723820206 130.620948413016 -46.4522760309959 A:G G A 10 0.537534767131755 7.09379992424857e-06 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11558254_11558433:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11558254_11558412:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11558254_11558433:PRKCSH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 11617079 C/T 1 78 64 142 36.0722881637231 34.4022250964323 1.6700630672908 T:C C T 10 0.537534767131755 0.801155701789838 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11616745_11617243:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000417981:exon_11616745_11617243:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000252440:exon_11616745_11617243:ECSIT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 11625029 C/T 1 38 34 72 17.5736788489933 18.2761820824797 -0.702503233486357 T:C C T 10 0.537534767131755 0.906202586864615 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11624619_11625036:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000252440:exon_11624619_11625036:ECSIT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 11942362 A/G 1 13 2 15 6.01204802728719 1.07506953426351 4.93697849302368 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0165626117342854 ENSG00000171295:ENST00000304060:exon_11942183_11946016:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000457526:exon_11942183_11942516:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000427505:exon_11942183_11942798:ZNF440;ENSG00000171295:ENST00000414255:exon_11942183_11942493:ZNF440 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 12845190 C/T 1 289 325 614 133.652452298923 174.69879931782 -41.0463470188976 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00102888108363892 ENSG00000123144:ENST00000242784:exon_12845127_12845529:C19orf43 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 12917520 A/G 1 48 48 96 22.1983311776758 25.8016688223242 -3.60333764464848 A:T:G A G 10 0.537534767131755 0.475122642237504 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12917428_12917614:RNASEH2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 12920935 G/A 1 74 77 151 34.2224272322501 41.3901770691451 -7.167749836895 A:G G A 10 0.537534767131755 0.253760188876798 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12920885_12921022:RNASEH2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 12921186 T/C 1 87 76 163 40.2344752595373 40.8526423020134 -0.61816704247606 T:C T C 10 0.537534767131755 0.93751459081637 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12921131_12921218:RNASEH2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 12924157 C/T 1 68 55 123 31.4476358350407 29.5644121922465 1.88322364279414 T:C C T 10 0.537534767131755 0.786395576199831 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12924142_12924462:RNASEH2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 13218462 C/T 1 43 29 72 19.8860050133345 15.5885082468209 4.29749676651364 T:C C T 10 0.537534767131755 0.345176176265578 ENSG00000104907:ENST00000221504:exon_13218388_13218464:TRMT1;ENSG00000104907:ENST00000437766:exon_13218388_13218464:TRMT1;ENSG00000104907:ENST00000357720:exon_13218388_13218464:TRMT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 13264398 C/T 1 335 314 649 154.925853010862 168.785916879371 -13.860063868509 T:C C T 10 0.537534767131755 0.287864430790208 ENSG00000160888:ENST00000292433:exon_13263758_13265716:IER2;ENSG00000160888:ENST00000393152:exon_13263893_13265716:IER2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 40 39 79 18.4986093147298 20.9638559181384 -2.46524660340864 A:G A G 10 0.537534767131755 0.65203868152598 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 87 65 152 40.2344752595373 34.9397598635641 5.29471539597325 T:C C T 10 0.537534767131755 0.416408878344847 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 290 262 552 134.114917531791 140.83410898852 -6.71919145672874 A:G A G 10 0.537534767131755 0.579097850028402 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 14153293 T/C 1 31 45 76 14.3364222189156 24.189064520929 -9.85264230201338 A:T:C T C 10 0.537534767131755 0.0282902004991529 ENSG00000104998:ENST00000263379:exon_14153265_14153424:IL27RA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 14512489 G/A 1 161 83 244 74.4569024917874 44.6153856719357 29.8415168198518 A:G G A 10 0.537534767131755 0.000141507248591617 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 14574959 G/A 1 229 239 468 105.904538326828 128.470809344489 -22.5662710176613 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0370284508559669 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14574872_14574965:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14574872_14574965:PKN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 14580328 A/G 1 161 205 366 74.4569024917874 110.19462726201 -35.7377247702223 A:G A G 10 0.537534767131755 0.000191842614136740 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 14582468 G/A 1 149 157 306 68.9073196973685 84.3929584396855 -15.485638742317 A:G G A 10 0.537534767131755 0.085292373032576 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 14589378 C/T 1 14 14 28 6.47451326015543 7.52548673984457 -1.05097347968914 T:C C T 10 0.537534767131755 0.708746900580582 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14588574_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14588574_14589379:GIPC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 26 26 52 12.0240960545744 13.9759039454256 -1.95180789085126 A:G G A 10 0.537534767131755 0.676938439103836 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 14629171 C/T 1 24 19 43 11.0991655888379 10.2131605755033 0.886005013334536 T:C C T 10 0.537534767131755 0.878811819236514 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 14847013 G/C 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000127507:ENST00000353005:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000353876:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392967:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000346057:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392965:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000315576:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000360222:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392964:exon_14843205_14847056:EMR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 16631147 G/A 1 12 15 27 5.54958279441894 8.06302150697632 -2.51343871255738 A:G G A 10 0.537534767131755 0.342209914399933 ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16630905_16632163:C19orf44 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 16631322 T/C 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16630905_16632163:C19orf44 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 16666101 G/C 1 34 35 69 15.7238179175203 18.8137168496114 -3.08989893209109 C:G G C 10 0.537534767131755 0.470943831791945 ENSG00000127526:ENST00000436494:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000409648:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000248069:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000421082:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000469055:exon_16665963_16666412:SLC35E1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 16974541 G/A 1 17 15 32 7.86190895876017 8.06302150697632 -0.201112548216159 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000127511:ENST00000379803:exon_16974491_16974607:SIN3B;ENSG00000127511:ENST00000248054:exon_16974491_16974607:SIN3B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 16976289 T/C 1 9 9 18 4.16218709581421 4.83781290418579 -0.675625808371588 T:C T C 10 0.537534767131755 0.815602186334409 ENSG00000127511:ENST00000379803:exon_16976221_16976459:SIN3B;ENSG00000127511:ENST00000248054:exon_16976221_16976459:SIN3B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 17000632 G/A 1 11 6 17 5.08711756155069 3.22520860279053 1.86190895876017 A:G G A 10 0.537534767131755 0.4682435751469 ENSG00000127533:ENST00000248076:exon_17000384_17002830:F2RL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 16 8 24 7.39944372589192 4.30027813705404 3.09916558883788 T:C C T 10 0.537534767131755 0.225397508916271 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 17303774 T/G 1 67 62 129 30.9851706021724 33.3271555621688 -2.34198495999639 T:G T G 10 0.537534767131755 0.724164455869761 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17303555_17303871:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17303555_17303871:MYO9B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 117 133 250 54.1084322455847 71.4921240285234 -17.3836917829387 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0308677375294406 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 216 158 374 99.8924902995409 84.9304932068173 14.9619970927236 T:C T C 10 0.537534767131755 0.132526659537635 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 128 104 232 59.1955498071354 55.9036157817025 3.29193402543285 T:C C T 10 0.537534767131755 0.693054135311347 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 112 102 214 51.7961060812434 54.828546247439 -3.03244016619556 T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.681466379721715 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 82 77 159 37.9221490951961 41.3901770691451 -3.46802797394904 A:G A G 10 0.537534767131755 0.579051054585642 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 17321487 A/G 1 13 16 29 6.01204802728719 8.60055627410808 -2.58850824682089 A:G A G 10 0.537534767131755 0.356879843182363 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 17330060 T/C 1 12 19 31 5.54958279441894 10.2131605755033 -4.6635777810844 T:C T C 10 0.537534767131755 0.105964213494322 ENSG00000053501:ENST00000263897:exon_17330022_17330196:USE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 17337555 C/A 1 20 15 35 9.2493046573649 8.06302150697632 1.18628315038858 A:C C A 10 0.537534767131755 0.736906280800669 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 17670201 C/T 1 15 17 32 6.93697849302368 9.13809104123983 -2.20111254821616 T:C C T 10 0.537534767131755 0.480790906838619 ENSG00000130309:ENST00000252599:exon_17670120_17670230:GLT25D1;ENSG00000130309:ENST00000379714:exon_17670120_17670230:GLT25D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 17942005 A/G 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 A:G A G 10 0.537534767131755 0.190750883746296 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18047283 T/G 1 91 93 184 42.0843361910103 49.9907333432532 -7.90639715224291 T:G T G 10 0.537534767131755 0.267426700150147 ENSG00000007080:ENST00000445755:exon_18047219_18047388:CCDC124;ENSG00000007080:ENST00000262801:exon_18047217_18047388:CCDC124 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18121154 G/A 1 5 11 16 2.31232616434123 5.91288243844931 -3.60055627410808 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0821156190636971 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18121005_18121167:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18121005_18121167:ARRDC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18121466 C/T 1 12 20 32 5.54958279441894 10.7506953426351 -5.20111254821616 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0762753359001116 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18121381_18121538:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18121381_18121538:ARRDC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18123738 T/C 1 13 18 31 6.01204802728719 9.67562580837159 -3.6635777810844 T:C T C 10 0.537534767131755 0.209649914232361 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18123722_18124903:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18123722_18124903:ARRDC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18186575 G/A 1 13 3 16 6.01204802728719 1.61260430139526 4.39944372589192 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0415474502850317 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18186618 T/C 1 12 6 18 5.54958279441894 3.22520860279053 2.32437419162841 T:C T C 10 0.537534767131755 0.34696272979013 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18188408 C/T 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 T:C C T 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18188326_18188465:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18188326_18188465:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18188326_18188465:IL12RB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18197635 G/A 1 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 0.155642553042637 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18197570_18197697:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18197570_18197697:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18197570_18197697:IL12RB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18234441 C/T 1 9 14 23 4.16218709581421 7.52548673984457 -3.36329964403036 T:C C T 10 0.537534767131755 0.209243218264062 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18234390_18234465:MAST3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18245512 C/T 1 23 9 32 10.6367003559696 4.83781290418579 5.79888745178384 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0499623183238552 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18245389_18245521:MAST3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18255359 G/A 1 21 8 29 9.71176989023315 4.30027813705404 5.41149175317911 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0607799717012766 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18255276_18255503:MAST3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18285944 G/A 1 1124 1005 2129 519.810921743907 540.222440967414 -20.4115192235063 A:T:C:G G A 10 0.537534767131755 0.384656316080631 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18285850_18286032:IFI30 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 1346 1545 2891 622.478203440658 830.491215218561 -208.013011777904 A:T:G A G 10 0.537534767131755 1.03795695828050e-14 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18304700 A/G 1 16 25 41 7.39944372589192 13.4383691782939 -6.03892545240195 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0616258952100223 ENSG00000254858:ENST00000534421:exon_18304674_18304970:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18304674_18304828:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18304674_18304833:MPV17L2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18305824 C/T 1 24 31 55 11.0991655888379 16.6635777810844 -5.56441219224652 T:C C T 10 0.537534767131755 0.138773264841873 ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18305768_18305896:MPV17L2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18538742 A/C 1 27 17 44 12.4865612874426 9.13809104123983 3.34847024620278 A:C A C 10 0.537534767131755 0.365224212569033 ENSG00000130511:ENST00000348495:exon_18538708_18538792:SSBP4;ENSG00000130511:ENST00000270061:exon_18538708_18538792:SSBP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18545786 G/T 1 68 63 131 31.4476358350407 33.8646903293006 -2.4170544942599 T:G G T 10 0.537534767131755 0.726139113467853 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18545625_18545927:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18545625_18545927:ISYNA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18546678 T/C 1 85 117 202 39.3095447938008 62.8915677544153 -23.5820229606145 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00111884558018467 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18546567_18546731:ISYNA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18547305 T/A 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 A:T T A 10 0.537534767131755 0.564681673647354 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18679379 C/G 1 104 94 198 48.0963842182975 50.528268110385 -2.43188389208748 C:G C G 10 0.537534767131755 0.775674177096905 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 1 65 2 67 30.0602401364359 1.07506953426351 28.9851706021724 A:T:C C A 10 0.537534767131755 2.26518669336529e-15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18685653 C/T 0 11 0 11 5.08711756155069 0 5.08711756155069 C C 10 0.537534767131755 0.00128956245765823 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18685964 G/T 1 1425 1208 2633 659.012956837249 649.34199869516 9.67095814208915 T:C:G G T 10 0.537534767131755 0.710430200263509 ENSG00000221983:ENST00000430157:exon_18685867_18688269:UBA52;ENSG00000221983:ENST00000442744:exon_18685867_18688269:UBA52 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18779113 C/T 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 T:C C T 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000167487:ENST00000300976:exon_18778474_18781302:KLHL26 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 18971194 C/T 1 55 54 109 25.4355878077535 29.0268774251148 -3.59128961736129 T:C C T 10 0.537534767131755 0.502634453099736 ENSG00000005007:ENST00000262803:exon_18971130_18971247:UPF1;ENSG00000005007:ENST00000418384:exon_18971130_18971247:UPF1;ENSG00000005007:ENST00000447615:exon_18971130_18971247:UPF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 19017862 G/A 1 164 195 359 75.8442981903922 104.819279590692 -28.9749814003 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00250741148335773 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19017769_19017921:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19017769_19017921:COPE HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 158 133 291 73.0695067931827 71.4921240285234 1.5773827646593 T:C T C 10 0.537534767131755 0.860250082614087 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 19449686 G/T 1 4 10 14 1.84986093147298 5.37534767131755 -3.52548673984457 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0654879889218514 ENSG00000129933:ENST00000392313:exon_19449654_19449748:MAU2;ENSG00000129933:ENST00000262815:exon_19449654_19449748:MAU2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 82 81 163 37.9221490951961 43.5403161376721 -5.61816704247606 A:G G A 10 0.537534767131755 0.388361936055424 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 19609434 A/T 1 42 44 86 19.4235397804663 23.6515297537972 -4.22798997333093 A:T A T 10 0.537534767131755 0.387749697367609 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19609252_19609531:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19609252_19609531:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19609252_19609531:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19609252_19609531:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19609252_19609531:GATAD2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 19648346 G/C 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 C:G G C 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000250067:ENST00000458210:exon_19648121_19648387:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000514277:exon_19648121_19648390:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000436027:exon_19648128_19648393:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000397179:exon_19648128_19648393:YJEFN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 19675696 C/T 1 12 8 20 5.54958279441894 4.30027813705404 1.2493046573649 T:C C T 10 0.537534767131755 0.657534137938504 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 19746151 G/T 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 T:G G T 10 0.537534767131755 0.74134570348407 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 21990464 G/T 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 T:G G T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000198521:ENST00000397148:exon_21990085_21992609:ZNF43;ENSG00000198521:ENST00000354959:exon_21990128_21992609:ZNF43 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 23542697 G/C 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 C:G G C 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 38 33 71 17.5736788489933 17.7386473153479 -0.164968466354605 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 33183352 G/C 1 33 14 47 15.2613526846521 7.52548673984457 7.73586594480752 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0275241793094078 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 33444707 C/T 1 6 8 14 2.77479139720947 4.30027813705404 -1.52548673984457 T:C C T 10 0.537534767131755 0.435196015554607 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000427840:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000415324:exon_33444521_33444707:CCDC123 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 33467620 T/C 1 15 15 30 6.93697849302368 8.06302150697632 -1.12604301395265 T:C T C 10 0.537534767131755 0.716938089677859 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 33487071 G/T 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 T:G G T 10 0.537534767131755 0.760762761058777 ENSG00000131941:ENST00000254260:exon_33486932_33487126:RHPN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 34842488 T/C 1 11 20 31 5.08711756155069 10.7506953426351 -5.6635777810844 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0475396172192115 ENSG00000166398:ENST00000299505:exon_34842419_34842497:KIAA0355 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 34843633 G/A 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000166398:ENST00000299505:exon_34843552_34846471:KIAA0355 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 34843761 C/A 1 14 12 26 6.47451326015543 6.45041720558106 0.0240960545743709 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000166398:ENST00000299505:exon_34843552_34846471:KIAA0355 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 223 226 449 103.129746929619 121.482857371777 -18.353110442158 T:G T G 10 0.537534767131755 0.0883431129524437 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 35660508 G/A 1 505 442 947 233.544942598464 237.590367072236 -4.04542447377196 A:G G A 10 0.537534767131755 0.794413945380494 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35660469_35660536:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 35769561 T/G 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 T:G T G 10 0.537534767131755 0.760762761058777 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 35770056 G/A 1 43 17 60 19.8860050133345 9.13809104123983 10.7479139720947 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00613401221970853 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 35770064 C/T 1 17 42 59 7.86190895876017 22.5764602195337 -14.7145512607735 T:C C T 10 0.537534767131755 0.000124199386337460 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 35843086 G/A 1 11 18 29 5.08711756155069 9.67562580837159 -4.58850824682089 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0958501387441293 ENSG00000126266:ENST00000246553:exon_35842455_35843357:FFAR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 36033825 G/A 1 24 22 46 11.0991655888379 11.8257648768986 -0.726599288060729 A:G G A 10 0.537534767131755 0.882940962147627 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 16 17 33 7.39944372589192 9.13809104123983 -1.73864731534791 A:G A G 10 0.537534767131755 0.602284572105899 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 36207077 G/A 1 222 198 420 102.66728169675 106.431883892087 -3.76460219533709 A:G G A 10 0.537534767131755 0.732043970525125 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36207035_36207199:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36207035_36207199:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36207035_36207199:ZBTB32 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 14 12 26 6.47451326015543 6.45041720558106 0.0240960545743709 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 36255965 C/G 1 4 7 11 1.84986093147298 3.76274336992228 -1.9128824384493 C:G C G 10 0.537534767131755 0.365659915960336 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36255935_36256077:C19orf55;ENSG00000167595:ENST00000396908:exon_36255935_36256077:C19orf55 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 36259415 G/A 1 13 2 15 6.01204802728719 1.07506953426351 4.93697849302368 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0165626117342854 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36259306_36260077:C19orf55;ENSG00000167595:ENST00000396908:exon_36259306_36259447:C19orf55 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 36268771 C/T 1 9 8 17 4.16218709581421 4.30027813705404 -0.138091041239834 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36268726_36268810:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36268726_36268810:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36268726_36268810:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000221905:exon_36268726_36268810:ARHGAP33 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 36271139 C/T 1 5 11 16 2.31232616434123 5.91288243844931 -3.60055627410808 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0821156190636971 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36271113_36271235:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36271113_36271235:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36271113_36271235:ARHGAP33 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 36593915 T/G 1 13 12 25 6.01204802728719 6.45041720558106 -0.438369178293874 T:G T G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36593850_36593976:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36593850_36593976:WDR62 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 36594369 C/T 1 16 18 34 7.39944372589192 9.67562580837159 -2.27618208247967 T:C C T 10 0.537534767131755 0.492998675593706 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 36594659 A/T 1 31 29 60 14.3364222189156 15.5885082468209 -1.2520860279053 A:T:G A T 10 0.537534767131755 0.79624282937359 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 36605647 T/C 1 3 10 13 1.38739569860474 5.37534767131755 -3.98795197271281 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0471272182048252 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 41 63 104 18.961074547598 33.8646903293006 -14.9036157817025 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0041422780679064 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 37037816 A/T 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 A:T A T 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 37038092 T/C 1 6 14 20 2.77479139720947 7.52548673984457 -4.7506953426351 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0422683308370645 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 37038584 T/C 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 37039069 A/C 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 A:C A C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 37210529 A/G 1 9 10 19 4.16218709581421 5.37534767131755 -1.21316057550334 A:G A G 10 0.537534767131755 0.648761877832002 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 37854580 C/T 1 24 17 41 11.0991655888379 9.13809104123983 1.96107454759805 T:C C T 10 0.537534767131755 0.639094020728528 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 38655235 C/A 1 35 35 70 16.1862831503886 18.8137168496114 -2.62743369922285 A:C C A 10 0.537534767131755 0.550582065629617 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38655119_38655546:SIPA1L3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 76 76 152 35.1473576979866 40.8526423020134 -5.70528460402676 T:C T C 10 0.537534767131755 0.371423174290348 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 38870027 C/T 1 219 183 402 101.279885998146 98.3688623851112 2.9110236130345 T:C C T 10 0.537534767131755 0.80257526076392 ENSG00000099341:ENST00000215071:exon_38869880_38870045:PSMD8;ENSG00000099341:ENST00000404323:exon_38869880_38870045:PSMD8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 38899544 C/T 1 7 9 16 3.23725663007772 4.83781290418579 -1.60055627410808 T:C C T 10 0.537534767131755 0.460588608389532 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38899391_38899728:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38899391_38899728:FAM98C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 39092142 C/T 1 159 120 279 73.531972026051 64.5041720558106 9.02779997024037 T:C C T 10 0.537534767131755 0.280661009049869 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39092081_39092165:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39092081_39092165:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39092081_39092165:MAP4K1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 39307103 C/T 1 270 238 508 124.865612874426 127.933274577358 -3.06766170293152 T:C C T 10 0.537534767131755 0.78965760550737 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39307093_39307163:ECH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 39322092 T/C 1 239 254 493 110.529190655511 136.533830851466 -26.0046401959552 T:C T C 10 0.537534767131755 0.021159986580471 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 39416887 C/T 1 14 21 35 6.47451326015543 11.2882301097669 -4.81371684961142 T:C C T 10 0.537534767131755 0.126582816053195 ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39416845_39416940:FBXO17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 39888390 G/C 1 46 57 103 21.2734007119393 30.63948172651 -9.36608101457076 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0748883618662 ENSG00000063322:ENST00000315588:exon_39888097_39891201:MED29;ENSG00000063322:ENST00000435462:exon_39888167_39888397:MED29 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 39907036 C/T 1 20 17 37 9.2493046573649 9.13809104123983 0.111213616125067 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000451354:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39906988_39907054:PLEKHG2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 39908574 C/T 1 28 38 66 12.9490265203109 20.4263211510067 -7.47729463069583 T:C C T 10 0.537534767131755 0.083170848587519 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000478523:exon_39908485_39908745:PLEKHG2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 39915958 A/G 1 46 36 82 21.2734007119393 19.3512516167432 1.92214909519609 A:G A G 10 0.537534767131755 0.740019217152066 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39915878_39916156:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 39923952 G/A 1 3106 3198 6304 1436.41701328877 1719.03618528735 -282.619171998583 A:T:G G A 10 0.537534767131755 1.02006489490129e-12 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39923852_39924058:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39923852_39924058:RPS16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 39955533 G/A 1 110 87 197 50.871175615507 46.7655247404627 4.10565087504428 A:G G A 10 0.537534767131755 0.56842937407239 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39955438_39955689:SUPT5H HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 39963828 T/A 1 2 13 15 0.92493046573649 6.98795197271281 -6.06302150697632 A:T T A 10 0.537534767131755 0.00277419675960341 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 40023308 A/G 1 10 1 11 4.62465232868245 0.537534767131755 4.08711756155069 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0141811635261139 ENSG00000176401:ENST00000326282:exon_40021630_40023494:EID2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 13 12 25 6.01204802728719 6.45041720558106 -0.438369178293874 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 40947448 A/G 1 17 8 25 7.86190895876017 4.30027813705404 3.56163082170613 A:G A G 10 0.537534767131755 0.165892476302183 ENSG00000167565:ENST00000322354:exon_40946749_40947993:SERTAD3;ENSG00000167565:ENST00000392028:exon_40946749_40947993:SERTAD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 40947751 G/A 1 12 16 28 5.54958279441894 8.60055627410808 -3.05097347968914 A:G G A 10 0.537534767131755 0.261288988317515 ENSG00000167565:ENST00000322354:exon_40946749_40947993:SERTAD3;ENSG00000167565:ENST00000392028:exon_40946749_40947993:SERTAD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 41096189 A/G 1 61 87 148 28.2103792049629 46.7655247404627 -18.5551455354997 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00287340522111766 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41096150_41096328:SHKBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 41118056 A/G 1 4 10 14 1.84986093147298 5.37534767131755 -3.52548673984457 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0654879889218514 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41117979_41118098:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41117979_41118098:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41117979_41118098:LTBP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 41119829 C/T 1 24 21 45 11.0991655888379 11.2882301097669 -0.189064520928973 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41119822_41119944:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41119822_41119944:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41119822_41119944:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41119770_41119944:LTBP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 41129842 C/T 1 13 23 36 6.01204802728719 12.3632996440304 -6.35125161674318 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0436661752388857 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41129841_41129987:LTBP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 41173372 G/A 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 A:G G A 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000105245:ENST00000252891:exon_41171810_41174043:NUMBL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 15 8 23 6.93697849302368 4.30027813705404 2.63670035596964 T:C T C 10 0.537534767131755 0.301970044035753 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 41211339 C/T 1 9 13 22 4.16218709581421 6.98795197271281 -2.82576487689861 T:C C T 10 0.537534767131755 0.285838202231404 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211230_41211352:ADCK4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 41220529 C/T 1 12 10 22 5.54958279441894 5.37534767131755 0.174235123101391 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41220436_41220540:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41220436_41220540:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41220436_41220540:ADCK4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 41838206 G/A 1 3 7 10 1.38739569860474 3.76274336992228 -2.37534767131755 A:G G A 10 0.537534767131755 0.203605394966440 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 42083849 C/A 1 1 7 8 0.462465232868245 3.76274336992228 -3.30027813705404 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0285185064817781 ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000426865:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42083552_42083911:CEACAM21 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 42085873 A/G 1 2 11 13 0.92493046573649 5.91288243844931 -4.98795197271281 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00918874023791195 ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000419449:exon_42085666_42085981:CEACAM21 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 31 38 69 14.3364222189156 20.4263211510067 -6.08989893209109 T:C C T 10 0.537534767131755 0.148747317252192 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 42703833 A/G 1 17 23 40 7.86190895876017 12.3632996440304 -4.5013906852702 A:G A G 10 0.537534767131755 0.157568215414119 ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42702752_42703981:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42702752_42703981:DEDD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 42728836 T/C 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 T:C T C 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000167625:ENST00000301215:exon_42728539_42732353:ZNF526 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 42799049 C/T 1 40 31 71 18.4986093147298 16.6635777810844 1.8350315336454 T:C C T 10 0.537534767131755 0.721636914385412 ENSG00000079432:ENST00000160740:exon_42798976_42799949:CIC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44098963 C/G 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 ENSG00000167378:ENST00000422989:exon_44098961_44099492:IRGQ;ENSG00000167378:ENST00000300809:exon_44098961_44099676:IRGQ HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44153100 A/G 1 25 3 28 11.5616308217061 1.61260430139526 9.94902652031086 A:G A G 10 0.537534767131755 8.5647589981064e-05 ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44152732_44153295:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44152732_44153295:PLAUR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44470147 G/A 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:G G A 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000159882:ENST00000251269:exon_44469956_44471861:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000322979:exon_44469956_44471752:ZNF230 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44515352 T/G 1 3 9 12 1.38739569860474 4.83781290418579 -3.45041720558106 T:G T G 10 0.537534767131755 0.0780478267108081 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44515341_44515400:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44610665 A/G 1 10 9 19 4.62465232868245 4.83781290418579 -0.213160575503344 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44610798 A/T 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 A:T A T 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 T:C T C 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 9 14 23 4.16218709581421 7.52548673984457 -3.36329964403036 A:G A G 10 0.537534767131755 0.209243218264062 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 8 12 20 3.69972186294596 6.45041720558106 -2.7506953426351 A:G A G 10 0.537534767131755 0.264201895405952 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 8 11 19 3.69972186294596 5.91288243844931 -2.21316057550334 A:T A T 10 0.537534767131755 0.361207681506224 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 19 18 37 8.78683942449666 9.67562580837159 -0.888786383874933 A:G A G 10 0.537534767131755 0.869377065179406 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44660967 A/G 1 4 8 12 1.84986093147298 4.30027813705404 -2.45041720558106 A:G A G 10 0.537534767131755 0.246047854304642 ENSG00000159905:ENST00000426739:exon_44660405_44664462:ZNF234;ENSG00000159905:ENST00000244316:exon_44660405_44664462:ZNF234 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44739303 T/C 1 13 12 25 6.01204802728719 6.45041720558106 -0.438369178293874 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44739399 T/C 1 10 10 20 4.62465232868245 5.37534767131755 -0.750695342635099 T:C T C 10 0.537534767131755 0.824049778597606 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 44981516 C/T 1 10 3 13 4.62465232868245 1.61260430139526 3.01204802728719 T:C C T 10 0.537534767131755 0.104100192392772 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 45260971 G/T 1 64 53 117 29.5977749035677 28.489342657983 1.10843224558467 T:G G T 10 0.537534767131755 0.853452128535961 ENSG00000069399:ENST00000164227:exon_45260903_45260980:BCL3;ENSG00000069399:ENST00000403534:exon_45260903_45260980:BCL3;ENSG00000069399:ENST00000444487:exon_45260903_45260980:BCL3;ENSG00000069399:ENST00000474300:exon_45260846_45260980:BCL3;ENSG00000069399:ENST00000477832:exon_45260914_45260980:BCL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 45490570 A/G 1 45 34 79 20.810935479071 18.2761820824797 2.53475339659136 A:G A G 10 0.537534767131755 0.575345910886914 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 43 37 80 19.8860050133345 19.8887863838749 -0.00278137054039718 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 46025388 G/A 1 7 8 15 3.23725663007772 4.30027813705404 -1.06302150697632 A:G G A 10 0.537534767131755 0.61360765893613 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 46057081 A/G 1 20 11 31 9.2493046573649 5.91288243844931 3.3364222189156 A:G A G 10 0.537534767131755 0.280729124843917 ENSG00000125741:ENST00000263275:exon_46052412_46057169:OPA3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 46205050 T/C 1 8 2 10 3.69972186294596 1.07506953426351 2.62465232868245 T:C T C 10 0.537534767131755 0.119280745126671 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 46341824 C/T 1 83 79 162 38.3846143280643 42.4652466034086 -4.08063227534431 T:C C T 10 0.537534767131755 0.529373680499625 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46341719_46341873:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46341719_46341873:SYMPK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 46352122 A/G 1 42 44 86 19.4235397804663 23.6515297537972 -4.22798997333093 A:G A G 10 0.537534767131755 0.387749697367609 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46352008_46352134:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46352008_46352134:SYMPK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 46404579 A/G 1 10 14 24 4.62465232868245 7.52548673984457 -2.90083441116212 A:G A G 10 0.537534767131755 0.306252553826296 ENSG00000176182:ENST00000322217:exon_46404533_46405083:MYPOP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 46518651 A/G 1 16 16 32 7.39944372589192 8.60055627410808 -1.20111254821616 A:G A G 10 0.537534767131755 0.724666023024225 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 46518682 G/A 1 18 19 37 8.32437419162841 10.2131605755033 -1.88878638387493 A:G G A 10 0.537534767131755 0.6216025772515 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 47124714 T/G 1 3 10 13 1.38739569860474 5.37534767131755 -3.98795197271281 T:G T G 10 0.537534767131755 0.0471272182048252 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 47223949 G/A 1 73 49 122 33.7599619993819 26.339203589456 7.42075840992589 A:G G A 10 0.537534767131755 0.203570717017383 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47223793_47224028:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47223793_47224028:STRN4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 47258842 C/T 1 10 8 18 4.62465232868245 4.30027813705404 0.324374191628411 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000181027:ENST00000391909:exon_47258669_47261832:FKRP;ENSG00000181027:ENST00000318584:exon_47258669_47261832:FKRP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 47278938 G/A 1 185 207 392 85.5560680806253 111.269696796273 -25.7136287156479 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.00974177167449588 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47278142_47279004:SLC1A5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 47768128 G/C 1 14 15 29 6.47451326015543 8.06302150697632 -1.58850824682089 C:G G C 10 0.537534767131755 0.580849764907506 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47768030_47768203:CCDC9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 24 20 44 11.0991655888379 10.7506953426351 0.348470246202782 A:C A C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 47770032 C/T 1 29 25 54 13.4114917531791 13.4383691782939 -0.0268774251147672 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 26 21 47 12.0240960545744 11.2882301097669 0.735865944807518 T:C T C 10 0.537534767131755 0.884346383891486 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 47980153 G/A 0 0 10 10 0 5.37534767131755 -5.37534767131755 A G A 10 0.537534767131755 0.000447497784848899 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47980060_47980195:KPTN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 48198204 C/T 0 16 0 16 7.39944372589192 0 7.39944372589192 C C 10 0.537534767131755 5.29632023122255e-05 ENSG00000063169:ENST00000396720:exon_48198157_48198337:GLTSCR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 274 337 611 126.715473805899 181.149216523401 -54.4337427175023 A:G A G 10 0.537534767131755 1.12539669004946e-05 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 48551546 A/T 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 A:T A T 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48551104_48551645:PLA2G4C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 48601454 T/C 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48601396_48601516:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48601364_48601516:PLA2G4C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 48602948 T/C 1 8 5 13 3.69972186294596 2.68767383565877 1.01204802728719 T:C T C 10 0.537534767131755 0.782310374824685 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48602928_48603117:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48602928_48603117:PLA2G4C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 47 43 90 21.7358659448075 23.1139949866655 -1.37812904185795 C:G C G 10 0.537534767131755 0.832734468596953 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 48622427 A/G 1 46 37 83 21.2734007119393 19.8887863838749 1.38461432806434 A:G A G 10 0.537534767131755 0.82601331125751 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48622394_48622447:LIG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 48733756 G/C 1 31 14 45 14.3364222189156 7.52548673984457 6.81093547907103 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0510694353284438 ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523668:exon_48733695_48733904:CARD8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 48733863 A/G 1 33 20 53 15.2613526846521 10.7506953426351 4.51065734201699 A:G A G 10 0.537534767131755 0.270301861415341 ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523668:exon_48733695_48733904:CARD8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 48734195 T/G 1 21 18 39 9.71176989023315 9.67562580837159 0.0361440818615577 T:G T G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48734034_48734263:CARD8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 48734942 T/C 1 17 23 40 7.86190895876017 12.3632996440304 -4.5013906852702 T:C T C 10 0.537534767131755 0.157568215414119 ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48734917_48735371:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48734917_48735067:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519302:exon_48734917_48735067:CARD8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 48737706 A/T 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 A:T A T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48735710_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519302:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522068:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523750:exon_48737660_48737721:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518596:exon_48737078_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517778:exon_48737660_48737800:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521092:exon_48737535_48737800:CARD8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 48845890 G/A 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000161558:ENST00000435956:exon_48845787_48846066:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000377431:exon_48845787_48846066:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48845787_48846066:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48845787_48846066:TMEM143 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 48949286 G/T 1 30 34 64 13.8739569860474 18.2761820824797 -4.40222509643232 T:G G T 10 0.537534767131755 0.316015182275011 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48949062_48949449:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48949251_48949449:GRWD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 49376584 G/A 1 75 82 157 34.6848924651184 44.0778509048039 -9.39295843968553 A:G G A 10 0.537534767131755 0.149500754680910 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 17 9 26 7.86190895876017 4.83781290418579 3.02409605457437 A:G A G 10 0.537534767131755 0.246341934149751 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 32 30 62 14.7988874517838 16.1260430139526 -1.32715556216881 A:G G A 10 0.537534767131755 0.799303764735326 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50097784 T/C 1 18 18 36 8.32437419162841 9.67562580837159 -1.35125161674318 T:C T C 10 0.537534767131755 0.738872694606124 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50097711_50097872:PRR12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50098423 G/A 1 9 9 18 4.16218709581421 4.83781290418579 -0.675625808371588 A:G G A 10 0.537534767131755 0.815602186334409 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50097954_50101270:PRR12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50191506 C/T 1 482 454 936 222.908242242494 244.040784277817 -21.1325420353226 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.168685158987928 ENSG00000126457:ENST00000532489:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000391851:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000351853:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000419451:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000454376:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000408976:exon_50191419_50191585:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000391849:exon_50191419_50191585:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000530361:exon_50191419_50191676:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000527866:exon_50191419_50192286:PRMT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50312801 C/T 1 12 11 23 5.54958279441894 5.91288243844931 -0.363299644030365 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000529634:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000445575:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000527973:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000529004:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528043:exon_50312652_50312832:FUZ HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50321858 G/A 1 36 36 72 16.6487483832568 19.3512516167432 -2.70250323348635 A:G G A 10 0.537534767131755 0.555633281810188 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312881:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50321828_50321873:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50321828_50321873:MED25 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50334631 A/G 1 25 26 51 11.5616308217061 13.9759039454256 -2.4142731237195 A:G A G 10 0.537534767131755 0.574793601899611 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50334590_50334718:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50334590_50334718:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312881:exon_50334590_50334718:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50334590_50334718:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50334590_50334718:MED25 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 85 76 161 39.3095447938008 40.8526423020134 -1.54309750821255 T:G T G 10 0.537534767131755 0.813069136600385 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50381837 C/G 1 44 14 58 20.3484702462028 7.52548673984457 12.8229835063582 C:G C G 10 0.537534767131755 0.000832958421732378 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 40 47 87 18.4986093147298 25.2641340551925 -6.76552474046268 T:C T C 10 0.537534767131755 0.162289089174080 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50387883 G/T 1 41 12 53 18.961074547598 6.45041720558106 12.510657342017 T:G G T 10 0.537534767131755 0.000486027543238528 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50393269 A/G 1 292 226 518 135.039847997528 121.482857371777 13.5569906257509 A:G A G 10 0.537534767131755 0.234532490251268 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50399354 G/C 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 C:G G C 10 0.537534767131755 0.241009480668847 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50412309 C/G 1 138 99 237 63.8202021358178 53.2159419460437 10.6042601897741 C:G C G 10 0.537534767131755 0.171801577415327 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50412650 C/T 1 113 101 214 52.2585713141117 54.2910114803073 -2.03244016619556 T:C C T 10 0.537534767131755 0.784365452013419 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 91 49 140 42.0843361910103 26.339203589456 15.7451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00840785099915937 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 166 154 320 76.7692286561287 82.7803541382903 -6.01112548216159 T:C C T 10 0.537534767131755 0.501745802407364 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 177 180 357 81.8563462176794 96.7562580837159 -14.8999118660365 A:G G A 10 0.537534767131755 0.123654115467129 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 56 53 109 25.8980530406217 28.489342657983 -2.59128961736129 A:G G A 10 0.537534767131755 0.632109727499624 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 52090014 C/T 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000105497:ENST00000262259:exon_52089880_52092993:ZNF175 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 52090100 T/C 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:C T C 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000105497:ENST00000262259:exon_52089880_52092993:ZNF175 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 52130488 G/A 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000105501:ENST00000222107:exon_52130402_52130501:SIGLEC14;ENSG00000105501:ENST00000429354:exon_52130402_52130501:SIGLEC14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 52376507 T/C 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 T:C T C 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000161551:ENST00000301399:exon_52374535_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000440236:exon_52374555_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000420592:exon_52375252_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000451628:exon_52375710_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000342582:exon_52375785_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000458390:exon_52375803_52376959:ZNF577 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 52468587 G/T 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 T:G G T 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 52468998 A/G 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 52471872 A/G 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 52496149 C/T 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000197619:ENST00000376716:exon_52494588_52498090:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000354939:exon_52494748_52498090:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391793:exon_52496133_52496567:ZNF615 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 52519608 C/T 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 52793713 C/T 1 21 15 36 9.71176989023315 8.06302150697632 1.64874838325682 T:C C T 10 0.537534767131755 0.619585238970854 ENSG00000196214:ENST00000439461:exon_52793319_52795976:ZNF766;ENSG00000196214:ENST00000359102:exon_52793319_52795976:ZNF766 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 53058356 T/C 1 8 5 13 3.69972186294596 2.68767383565877 1.01204802728719 T:C T C 10 0.537534767131755 0.782310374824685 ENSG00000198482:ENST00000487863:exon_53056360_53059303:ZNF808;ENSG00000198482:ENST00000359798:exon_53056360_53059589:ZNF808 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 53085813 T/C 1 1 10 11 0.462465232868245 5.37534767131755 -4.91288243844931 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00393556425093625 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 53117461 C/T 1 14 9 23 6.47451326015543 4.83781290418579 1.63670035596964 T:C C T 10 0.537534767131755 0.536918781286691 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 53303705 T/G 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:G T G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000198538:ENST00000360272:exon_53300659_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000438150:exon_53300661_53304940:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000457749:exon_53300662_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000391783:exon_53303301_53304955:ZNF28 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 53344701 A/G 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000204604:ENST00000243639:exon_53341786_53345404:ZNF468;ENSG00000204604:ENST00000396409:exon_53343932_53345404:ZNF468 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 53384185 C/T 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 T:C C T 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000182986:ENST00000331416:exon_53379425_53385236:ZNF320;ENSG00000182986:ENST00000391781:exon_53383849_53385236:ZNF320 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 53453873 T/C 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 53571306 T/C 1 12 23 35 5.54958279441894 12.3632996440304 -6.81371684961142 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0264802440821511 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 53577419 G/C 1 18 11 29 8.32437419162841 5.91288243844931 2.41149175317911 C:G G C 10 0.537534767131755 0.457394669306004 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000355147:exon_53577393_53577521:ZNF160 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 53959343 G/A 1 6 12 18 2.77479139720947 6.45041720558106 -3.67562580837159 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0991754162193756 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 53959568 G/C 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 C:G G C 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 53959804 T/C 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 T:C T C 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 53994061 A/G 1 4 7 11 1.84986093147298 3.76274336992228 -1.9128824384493 A:G A G 10 0.537534767131755 0.365659915960336 ENSG00000198346:ENST00000396403:exon_53993629_53999509:ZNF813 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 1 13 3 16 6.01204802728719 1.61260430139526 4.39944372589192 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0415474502850317 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54610170 C/T 1 102 119 221 47.171453752561 63.9666372886788 -16.7951835361178 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0258534970376285 ENSG00000170906:ENST00000417903:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000419113:exon_54610118_54610285:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000485876:exon_54610118_54610875:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391762:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000451517:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391763:exon_54610118_54610272:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000484103:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000303553:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000422029:exon_54610118_54610277:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000420296:exon_54610071_54610268:NDUFA3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54656709 A/T 1 20 26 46 9.2493046573649 13.9759039454256 -4.72659928806073 A:T A T 10 0.537534767131755 0.183929238150012 ENSG00000088038:ENST00000221232:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000358389:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000411507:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000445408:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000482247:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000406403:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000447684:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000457463:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000496327:exon_54656604_54656736:CNOT3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54677897 G/A 1 31 45 76 14.3364222189156 24.189064520929 -9.85264230201338 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0282902004991529 ENSG00000125505:ENST00000437868:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000245615:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000494142:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000431666:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000338624:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000449249:exon_54677768_54678125:MBOAT7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54696167 C/A 1 22 21 43 10.1742351231014 11.2882301097669 -1.11399498666546 A:C C A 10 0.537534767131755 0.761428471804822 ENSG00000170892:ENST00000455798:exon_54695967_54696206:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000456872:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54695967_54696224:TSEN34 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54697079 C/T 1 55 29 84 25.4355878077535 15.5885082468209 9.84707956093258 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0370660655346765 ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54697030_54697173:TSEN34 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54705317 C/G 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 C:G C G 10 0.537534767131755 0.74134570348407 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54705340 C/G 1 4 10 14 1.84986093147298 5.37534767131755 -3.52548673984457 A:C:G C G 10 0.537534767131755 0.0654879889218514 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 35 42 77 16.1862831503886 22.5764602195337 -6.39017706914513 T:G T G 10 0.537534767131755 0.169936350248982 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54848684 G/A 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 A:G G A 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000239961:ENST00000291759:exon_54848671_54848967:LILRA4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54848741 T/C 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000239961:ENST00000291759:exon_54848671_54848967:LILRA4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54849463 C/T 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000239961:ENST00000291759:exon_54849207_54849506:LILRA4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54962467 G/A 1 47 56 103 21.7358659448075 30.1019469593783 -8.36608101457076 A:G G A 10 0.537534767131755 0.113547958822864 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376514:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000443957:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54962467_54962559:LENG8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54965860 G/A 1 92 81 173 42.5468014238785 43.5403161376721 -0.993514713793608 A:G G A 10 0.537534767131755 0.879164295254608 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54965609_54965861:LENG8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54966579 C/G 1 83 82 165 38.3846143280643 44.0778509048039 -5.69323657673957 C:G C G 10 0.537534767131755 0.39097153282973 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54974038 A/G 1 15 14 29 6.93697849302368 7.52548673984457 -0.588508246820894 A:G A G 10 0.537534767131755 0.854060782439014 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 54974318 T/C 1 13 6 19 6.01204802728719 3.22520860279053 2.78683942449666 T:C T C 10 0.537534767131755 0.252178981986345 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 55174498 T/C 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 T:C T C 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 10 13 23 4.62465232868245 6.98795197271281 -2.36329964403036 T:C C T 10 0.537534767131755 0.403957046543287 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 55559715 G/A 1 9 4 13 4.16218709581421 2.15013906852702 2.01204802728719 A:G G A 10 0.537534767131755 0.405252718730477 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55559697_55559909:RDH13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 55624113 G/A 1 16 13 29 7.39944372589192 6.98795197271281 0.411491753179106 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55624033_55624163:PPP1R12C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 55738746 G/A 1 8 2 10 3.69972186294596 1.07506953426351 2.62465232868245 A:G G A 10 0.537534767131755 0.119280745126671 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55738116_55738931:TMEM86B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 55739605 C/T 1 9 3 12 4.16218709581421 1.61260430139526 2.54958279441894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.159578115428333 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55739559_55739805:TMEM86B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 55739689 G/A 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 A:G G A 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55739559_55739805:TMEM86B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 55739813 G/A 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 A:G G A 10 0.537534767131755 0.357514540525421 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 55741961 G/C 1 8 2 10 3.69972186294596 1.07506953426351 2.62465232868245 C:G G C 10 0.537534767131755 0.119280745126671 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 55964720 G/A 1 124 125 249 57.3456888756624 67.1918458914694 -9.84615701580699 A:G G A 10 0.537534767131755 0.227238980407143 ENSG00000063241:ENST00000438389:exon_55964345_55964755:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000085068:exon_55964345_55964755:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000425675:exon_55964345_55964755:ISOC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 56104136 T/C 1 17 6 23 7.86190895876017 3.22520860279053 4.63670035596964 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0603267109023344 ENSG00000179943:ENST00000221665:exon_56102738_56105012:FIZ1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 32 21 53 14.7988874517838 11.2882301097669 3.51065734201699 T:C C T 10 0.537534767131755 0.408764131660531 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 56114237 G/A 1 25 27 52 11.5616308217061 14.5134387125574 -2.95180789085126 A:G G A 10 0.537534767131755 0.48721157192913 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 38 47 85 17.5736788489933 25.2641340551925 -7.69045520619917 A:G G A 10 0.537534767131755 0.102956710104917 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 56185250 G/A 1 2 7 9 0.92493046573649 3.76274336992228 -2.83781290418579 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0909104192397482 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 57802806 C/T 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 T:C C T 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000197714:ENST00000360338:exon_57802067_57805436:ZNF460 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 57802824 G/A 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000197714:ENST00000360338:exon_57802067_57805436:ZNF460 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 57839150 A/G 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000178229:ENST00000321545:exon_57839072_57842144:ZNF543 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 57839567 T/A 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 A:T T A 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000178229:ENST00000321545:exon_57839072_57842144:ZNF543 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 57931553 C/T 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 T:C C T 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 57946924 G/C 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57946693_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57946697_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000415248:exon_57946711_57946961:ZNF749 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58004346 G/C 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000105136:ENST00000524372:exon_58004224_58004367:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000427558:exon_58004224_58005153:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000354197:exon_58004224_58005151:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000424930:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000426954:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000284020:exon_58004278_58004600:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000442920:exon_58004224_58005588:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000523439:exon_58004224_58005621:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000517598:exon_58004224_58005255:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000347466:exon_58004224_58006032:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000415379:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000521754:exon_58004224_58004423:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000221735:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000521137:exon_58004224_58004544:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000522346:exon_58004224_58006033:ZNF419 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58018618 A/G 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 A:G A G 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000152439:ENST00000282292:exon_58017726_58019508:ZNF773;ENSG00000152439:ENST00000430084:exon_58017726_58019508:ZNF773 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58131576 T/C 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 T:C T C 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000213762:ENST00000396161:exon_58131528_58134372:ZNF134 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58132106 A/C 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 A:C A C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000213762:ENST00000396161:exon_58131528_58134372:ZNF134 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58152361 T/A 1 5 12 17 2.31232616434123 6.45041720558106 -4.13809104123983 A:T T A 10 0.537534767131755 0.0522959192114914 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58152795 C/T 1 11 7 18 5.08711756155069 3.76274336992228 1.32437419162841 T:C C T 10 0.537534767131755 0.639329189576991 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58152817 G/C 1 11 12 23 5.08711756155069 6.45041720558106 -1.36329964403036 C:G G C 10 0.537534767131755 0.677013887550826 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58153000 T/C 1 4 9 13 1.84986093147298 4.83781290418579 -2.98795197271281 T:C T C 10 0.537534767131755 0.161862439396256 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58153009 C/T 1 6 8 14 2.77479139720947 4.30027813705404 -1.52548673984457 T:C C T 10 0.537534767131755 0.435196015554607 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58153577 T/C 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 T:C T C 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 9 6 15 4.16218709581421 3.22520860279053 0.936978493023676 A:G A G 10 0.537534767131755 0.797066078642493 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58233008 G/A 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 A:G G A 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231855_58233065:ZNF671 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58291037 T/C 1 10 14 24 4.62465232868245 7.52548673984457 -2.90083441116212 T:C T C 10 0.537534767131755 0.306252553826296 ENSG00000083828:ENST00000396154:exon_58290119_58291984:ZNF586 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 27 38 65 12.4865612874426 20.4263211510067 -7.93975986356407 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0612578059228214 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58904396 G/A 1 2501 2386 4887 1156.62554740348 1282.55795437637 -125.932406972887 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.000316599425899649 ENSG00000083845:ENST00000196551:exon_58904343_58904552:RPS5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58928299 A/T 0 9 0 9 4.16218709581421 0 4.16218709581421 A A 10 0.537534767131755 0.00471442275687274 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58928309 C/T 1 6 2 8 2.77479139720947 1.07506953426351 1.69972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.300105198743785 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 11 3 14 5.08711756155069 1.61260430139526 3.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 0.104465203629206 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 10 3 13 4.62465232868245 1.61260430139526 3.01204802728719 A:G G A 10 0.537534767131755 0.104100192392772 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58929194 A/G 0 12 0 12 5.54958279441894 0 5.54958279441894 A A 10 0.537534767131755 0.000677648852566775 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58929200 A/C 0 12 0 12 5.54958279441894 0 5.54958279441894 A A 10 0.537534767131755 0.000677648852566775 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58945089 A/G 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:G A G 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000131849:ENST00000254166:exon_58944182_58946578:ZNF132;ENSG00000131849:ENST00000391695:exon_58944768_58945214:ZNF132;ENSG00000131849:ENST00000418193:exon_58944768_58945209:ZNF132 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 58989495 A/C 1 13 12 25 6.01204802728719 6.45041720558106 -0.438369178293874 A:C A C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58989454_58989548:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58989454_58989548:ZNF446 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 59028562 C/T 1 17 18 35 7.86190895876017 9.67562580837159 -1.81371684961142 T:C C T 10 0.537534767131755 0.612189199573914 ENSG00000119574:ENST00000354590:exon_59027762_59029040:ZBTB45 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 59028585 G/A 1 19 18 37 8.78683942449666 9.67562580837159 -0.888786383874933 A:G G A 10 0.537534767131755 0.869377065179406 ENSG00000119574:ENST00000354590:exon_59027762_59029040:ZBTB45 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 59059729 G/A 1 390 305 695 180.361440818616 163.948103975185 16.4133368434303 A:T:C:G G A 10 0.537534767131755 0.223490545412089 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59059661_59059775:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59059661_59059775:TRIM28 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 59060733 T/G 1 298 288 586 137.814639394737 154.810012933945 -16.9953735392084 A:T:G T G 10 0.537534767131755 0.159268793997267 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59060698_59061017:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59060698_59061017:TRIM28 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 59067425 T/C 1 105 107 212 48.5588494511657 57.5162200830978 -8.95737063193205 T:C T C 10 0.537534767131755 0.241580919612105 ENSG00000130725:ENST00000253023:exon_59067080_59067596:UBE2M HGDP00950_parsed_pileup.txt . 19 59074653 T/C 1 16 16 32 7.39944372589192 8.60055627410808 -1.20111254821616 T:C T C 10 0.537534767131755 0.724666023024225 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 6990033 T/C 1 7 18 25 3.23725663007772 9.67562580837159 -6.43836917829387 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0144105501035811 ENSG00000134326:ENST00000256722:exon_6988447_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000478738:exon_6988449_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000491738:exon_6990020_6990104:CMPK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 10050947 T/C 1 6 2 8 2.77479139720947 1.07506953426351 1.69972186294596 T:C T C 10 0.537534767131755 0.300105198743785 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10050865_10051042:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000492648:exon_10050865_10051042:TAF1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 10059770 G/T 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 T:G G T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 10059844 C/T 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 456 424 880 210.88414618792 227.914741263864 -17.0305950759444 A:G G A 10 0.537534767131755 0.250600154789933 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 10717806 C/T 1 30 21 51 13.8739569860474 11.2882301097669 2.5857268762805 T:C C T 10 0.537534767131755 0.486363396107849 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10717762_10717864:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10717762_10717864:NOL10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 10930903 T/C 1 192 151 343 88.793324710703 81.167749836895 7.62557487380805 T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.417148881988001 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10930845_10930959:PDIA6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 177 144 321 81.8563462176794 77.4050064669727 4.45133975070667 T:C C T 10 0.537534767131755 0.654391691353661 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 28 22 50 12.9490265203109 11.8257648768986 1.12326164341225 T:C C T 10 0.537534767131755 0.778489586155896 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 15614404 T/C 1 14 5 19 6.47451326015543 2.68767383565877 3.78683942449666 T:C T C 10 0.537534767131755 0.106612876634271 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15614191_15614448:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15614191_15614448:NBAS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 15735648 T/C 1 19 18 37 8.78683942449666 9.67562580837159 -0.888786383874933 T:C T C 10 0.537534767131755 0.869377065179406 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15735614_15735677:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15735614_15735677:DDX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 15743344 T/C 1 19 12 31 8.78683942449666 6.45041720558106 2.3364222189156 T:C T C 10 0.537534767131755 0.47292802889 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15743316_15743399:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15743316_15743399:DDX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 20240668 C/A 1 36 30 66 16.6487483832568 16.1260430139526 0.522705369304173 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20240652_20240772:LAPTM4A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 20824559 C/T 1 10 11 21 4.62465232868245 5.91288243844931 -1.28823010976685 T:C C T 10 0.537534767131755 0.663607311505883 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 25022598 A/G 1 4 8 12 1.84986093147298 4.30027813705404 -2.45041720558106 A:G A G 10 0.537534767131755 0.246047854304642 ENSG00000138092:ENST00000473476:exon_25022544_25022663:CENPO;ENSG00000138092:ENST00000380834:exon_25022544_25022713:CENPO;ENSG00000138092:ENST00000473706:exon_25022544_25022713:CENPO;ENSG00000138092:ENST00000491031:exon_25022544_25022713:CENPO;ENSG00000138092:ENST00000486527:exon_25022544_25022713:CENPO;ENSG00000138092:ENST00000260662:exon_25022544_25022713:CENPO;ENSG00000138092:ENST00000498362:exon_25022544_25022713:CENPO HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 25064157 G/C 1 35 38 73 16.1862831503886 20.4263211510067 -4.24003800061811 C:G G C 10 0.537534767131755 0.348521940729087 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 25064193 G/A 1 24 24 48 11.0991655888379 12.9008344111621 -1.80166882232424 A:G G A 10 0.537534767131755 0.664908489546432 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 25141538 A/G 1 27 32 59 12.4865612874426 17.2011125482162 -4.71455126077354 A:G A G 10 0.537534767131755 0.240852215468084 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25141182_25142708:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25141182_25142055:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25141182_25142055:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25141182_25142053:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000438445:exon_25141521_25142053:ADCY3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 25384169 G/A 0 31 0 31 14.3364222189156 0 14.3364222189156 G G 10 0.537534767131755 5.92612533728618e-09 ENSG00000115138:ENST00000380794:exon_25383722_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000405623:exon_25383784_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000264708:exon_25383854_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000395826:exon_25383922_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000449220:exon_25384015_25384621:POMC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 26590084 T/G 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:G T G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000138018:ENST00000442141:exon_26590014_26590088:EPT1;ENSG00000138018:ENST00000407686:exon_26590014_26590088:EPT1;ENSG00000138018:ENST00000260585:exon_26590014_26590088:EPT1;ENSG00000138018:ENST00000447170:exon_26590014_26590088:EPT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 29356669 A/G 1 12 8 20 5.54958279441894 4.30027813705404 1.2493046573649 A:G A G 10 0.537534767131755 0.657534137938504 ENSG00000115295:ENST00000426642:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401605:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401617:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000415891:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000404424:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000402240:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000456385:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000320081:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000530644:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000379543:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000450018:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000449202:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000438819:exon_29356521_29356682:CLIP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 32713706 A/T 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 A:T A T 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32713655_32713781:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32713655_32713781:BIRC6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 32983480 G/A 1 8 11 19 3.69972186294596 5.91288243844931 -2.21316057550334 A:G G A 10 0.537534767131755 0.361207681506224 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 7 9 16 3.23725663007772 4.83781290418579 -1.60055627410808 T:C C T 10 0.537534767131755 0.460588608389532 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 33759395 C/T 1 52 41 93 24.0481921091487 22.038925452402 2.00926665674679 T:C C T 10 0.537534767131755 0.755260536256683 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33756792_33759467:RASGRP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 36583461 G/T 1 23 14 37 10.6367003559696 7.52548673984457 3.11121361612507 T:G G T 10 0.537534767131755 0.327093403154074 ENSG00000150938:ENST00000280527:exon_36583069_36583766:CRIM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 36704144 C/T 1 24 15 39 11.0991655888379 8.06302150697632 3.03614408186156 T:C C T 10 0.537534767131755 0.341320372229906 ENSG00000150938:ENST00000280527:exon_36704032_36704214:CRIM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 36739486 C/G 1 32 21 53 14.7988874517838 11.2882301097669 3.51065734201699 C:G C G 10 0.537534767131755 0.408764131660531 ENSG00000150938:ENST00000280527:exon_36739416_36739537:CRIM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 37076594 T/C 1 12 11 23 5.54958279441894 5.91288243844931 -0.363299644030365 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000115808:ENST00000263918:exon_37070783_37076768:STRN;ENSG00000115808:ENST00000379213:exon_37075472_37076768:STRN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 37230728 T/C 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 T:C T C 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37230685_37230829:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37230685_37230829:HEATR5B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 37241050 G/A 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37240984_37241163:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37240984_37241163:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000471051:exon_37240984_37241138:HEATR5B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 37873734 G/C 1 83 90 173 38.3846143280643 48.3781290418579 -9.99351471379361 C:G G C 10 0.537534767131755 0.128140308097658 ENSG00000163171:ENST00000295324:exon_37869032_37873965:CDC42EP3;ENSG00000163171:ENST00000457889:exon_37873084_37873965:CDC42EP3;ENSG00000163171:ENST00000453555:exon_37873627_37873965:CDC42EP3;ENSG00000163171:ENST00000422687:exon_37873689_37873965:CDC42EP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 38536626 T/G 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 T:G T G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38536520_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38536573_38536648:ATL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 38604351 A/G 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 A:G A G 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38604285_38604404:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38604285_38604427:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38604285_38604432:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38604285_38604403:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38604285_38604398:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000456736:exon_38604285_38604404:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000474535:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000472097:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000451483:exon_38604285_38604421:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000416222:exon_38604285_38604415:ATL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 39008949 G/A 1 35 26 61 16.1862831503886 13.9759039454256 2.21037920496295 A:G G A 10 0.537534767131755 0.609126419963489 ENSG00000152147:ENST00000409011:exon_39008659_39009107:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000281950:exon_39008659_39009598:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000409566:exon_39008659_39009089:GEMIN6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 39009025 T/A 1 19 26 45 8.78683942449666 13.9759039454256 -5.18906452092897 A:T T A 10 0.537534767131755 0.13561238085745 ENSG00000152147:ENST00000409011:exon_39008659_39009107:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000281950:exon_39008659_39009598:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000409566:exon_39008659_39009089:GEMIN6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 42396722 A/G 1 14 25 39 6.47451326015543 13.4383691782939 -6.96385591813844 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0354725274363484 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42396490_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42396490_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42396493_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000409040:exon_42396521_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000482660:exon_42396531_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42396601_42396776:EML4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 42515437 A/G 1 15 19 34 6.93697849302368 10.2131605755033 -3.27618208247967 A:G A G 10 0.537534767131755 0.30317916916678 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 42522571 A/G 1 13 22 35 6.01204802728719 11.8257648768986 -5.81371684961142 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0612142841928713 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42522521_42522656:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42522521_42522656:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42522521_42522656:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42522521_42522656:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42522521_42522656:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42522521_42522656:EML4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 13 19 32 6.01204802728719 10.2131605755033 -4.20111254821616 A:C C A 10 0.537534767131755 0.157163927051232 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 8 21 29 3.69972186294596 11.2882301097669 -7.58850824682089 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0050117734665027 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 42990522 C/T 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 7 13 20 3.23725663007772 6.98795197271281 -3.7506953426351 A:T T A 10 0.537534767131755 0.116404989692958 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 43452183 A/G 1 42 28 70 19.4235397804663 15.0509734796891 4.37256630077715 A:G A G 10 0.537534767131755 0.337984641014109 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 43452618 C/T 1 53 40 93 24.510657342017 21.5013906852702 3.00926665674679 T:C C T 10 0.537534767131755 0.603342669473562 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 43452793 C/G 1 41 46 87 18.961074547598 24.7265992880607 -5.76552474046268 C:G C G 10 0.537534767131755 0.237254567150808 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 44004010 T/C 1 8 10 18 3.69972186294596 5.37534767131755 -1.67562580837159 T:C T C 10 0.537534767131755 0.483452727703955 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000496980:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000406852:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000479242:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000398823:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000462426:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44003962_44004038:DYNC2LI1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 44036913 T/C 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 46609572 A/C 1 1 9 10 0.462465232868245 4.83781290418579 -4.37534767131755 A:C A C 10 0.537534767131755 0.00766290351586349 ENSG00000116016:ENST00000263734:exon_46609564_46609737:EPAS1;ENSG00000116016:ENST00000443288:exon_46609564_46609737:EPAS1;ENSG00000116016:ENST00000466465:exon_46609564_46609737:EPAS1;ENSG00000116016:ENST00000465318:exon_46609564_46609643:EPAS1;ENSG00000116016:ENST00000468530:exon_46609564_46609737:EPAS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 46986416 A/G 1 2 9 11 0.92493046573649 4.83781290418579 -3.9128824384493 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0295587298456249 ENSG00000171150:ENST00000306503:exon_46985658_46990268:SOCS5;ENSG00000171150:ENST00000394861:exon_46985658_46989452:SOCS5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 47251469 G/C 1 25 21 46 11.5616308217061 11.2882301097669 0.273400711939273 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000440051:exon_47251426_47251498:TTC7A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 47278901 G/A 1 17 8 25 7.86190895876017 4.30027813705404 3.56163082170613 A:G G A 10 0.537534767131755 0.165892476302183 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484337:exon_47278885_47279019:TTC7A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 47301029 A/G 1 58 44 102 26.8229835063582 23.6515297537972 3.17145375256099 A:G A G 10 0.537534767131755 0.552557135120698 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47300841_47301062:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 48030692 T/A 1 39 41 80 18.0361440818616 22.038925452402 -4.0027813705404 A:T T A 10 0.537534767131755 0.372472788643304 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48030559_48030824:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48030559_48030824:MSH6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 48602252 C/T 1 11 9 20 5.08711756155069 4.83781290418579 0.249304657364901 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000170802:ENST00000340553:exon_48602059_48606433:FOXN2;ENSG00000170802:ENST00000304367:exon_48602059_48602582:FOXN2;ENSG00000170802:ENST00000495290:exon_48602059_48602289:FOXN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 53992593 A/T 1 8 8 16 3.69972186294596 4.30027813705404 -0.600556274108079 A:T A T 10 0.537534767131755 0.806072821048815 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53992514_53992686:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000446049:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000470916:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000480522:exon_53992514_53992698:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000489508:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000414369:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482134:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000459916:exon_53992514_53992722:ASB3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 54093956 G/A 1 25 24 49 11.5616308217061 12.9008344111621 -1.33920358945599 A:G G A 10 0.537534767131755 0.77495876251657 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000476586:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000488687:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000466539:exon_54093884_54094017:PSME4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 16 12 28 7.39944372589192 6.45041720558106 0.949026520310861 A:G G A 10 0.537534767131755 0.850208407116058 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 54127041 C/T 1 27 21 48 12.4865612874426 11.2882301097669 1.19833117767576 T:C C T 10 0.537534767131755 0.773606113711342 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54127018_54127154:PSME4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 54135936 T/C 1 20 15 35 9.2493046573649 8.06302150697632 1.18628315038858 T:C T C 10 0.537534767131755 0.736906280800669 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54135921_54135938:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54135921_54135938:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000461810:exon_54135921_54135980:PSME4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 54858511 C/T 1 382 291 673 176.66171895567 156.422617235341 20.2391017203289 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.122059013945485 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 184 173 357 85.0936028477571 92.9935147137936 -7.89991186603653 A:G G A 10 0.537534767131755 0.426006301033824 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 81 67 148 37.4596838623279 36.0148293978276 1.44485446450027 T:C T C 10 0.537534767131755 0.86913603075044 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 55883317 G/T 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 T:G G T 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415489:exon_55883266_55883355:PNPT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 55912120 T/C 1 4 8 12 1.84986093147298 4.30027813705404 -2.45041720558106 T:C T C 10 0.537534767131755 0.246047854304642 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000429805:exon_55912078_55912183:PNPT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 15 19 34 6.93697849302368 10.2131605755033 -3.27618208247967 A:G A G 10 0.537534767131755 0.30317916916678 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 10 19 29 4.62465232868245 10.2131605755033 -5.58850824682089 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0411985220852713 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 63176139 A/C 1 3 8 11 1.38739569860474 4.30027813705404 -2.9128824384493 A:C A C 10 0.537534767131755 0.127253645182292 ENSG00000115504:ENST00000405015:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000431489:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000263991:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000354487:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000405289:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000454124:exon_63176068_63176297:EHBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 64327544 G/T 1 25 23 48 11.5616308217061 12.3632996440304 -0.801668822324238 T:G G T 10 0.537534767131755 0.88522860381015 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 64327592 T/C 1 20 18 38 9.2493046573649 9.67562580837159 -0.426321151006688 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 65216798 C/A 1 60 87 147 27.7479139720947 46.7655247404627 -19.017610768368 A:C C A 10 0.537534767131755 0.00210411840339144 ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65216535_65217304:SLC1A4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 33 24 57 15.2613526846521 12.9008344111621 2.36051827348997 A:G A G 10 0.537534767131755 0.595978705381566 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 10 12 22 4.62465232868245 6.45041720558106 -1.82576487689861 A:T A T 10 0.537534767131755 0.522987558786596 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 71351487 G/A 1 10 23 33 4.62465232868245 12.3632996440304 -7.73864731534791 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0082005688514232 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000494660:exon_71351477_71351673:MCEE HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 71366957 C/A 1 23 23 46 10.6367003559696 12.3632996440304 -1.72659928806073 A:C C A 10 0.537534767131755 0.65860138354317 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 26 26 52 12.0240960545744 13.9759039454256 -1.95180789085126 A:G G A 10 0.537534767131755 0.676938439103836 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 73339708 G/A 1 10 1 11 4.62465232868245 0.537534767131755 4.08711756155069 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0141811635261139 ENSG00000135631:ENST00000258098:exon_73339475_73340146:RAB11FIP5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 73461483 C/A 1 51 158 209 23.5857268762805 84.9304932068173 -61.3447663305368 A:C C A 10 0.537534767131755 9.12972812061993e-18 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73461366_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73461397_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73461435_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73461448_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473786:exon_73461464_73461512:CCT7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 73478461 A/T 1 249 245 494 115.153842984193 131.69601794728 -16.5421749630869 A:T:G A T 10 0.537534767131755 0.136740828916487 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 73490412 A/G 1 16 14 30 7.39944372589192 7.52548673984457 -0.126043013952649 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000163013:ENST00000295133:exon_73490341_73490436:FBXO41;ENSG00000163013:ENST00000521871:exon_73490341_73490436:FBXO41 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 73492614 A/T 1 14 18 32 6.47451326015543 9.67562580837159 -3.20111254821616 A:T:G A T 10 0.537534767131755 0.289607831440422 ENSG00000163013:ENST00000295133:exon_73492410_73492768:FBXO41;ENSG00000163013:ENST00000521871:exon_73492410_73492768:FBXO41;ENSG00000163013:ENST00000519873:exon_73492611_73492768:FBXO41 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 2 9 11 0.92493046573649 4.83781290418579 -3.9128824384493 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0295587298456249 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 66 69 135 30.5227053693042 37.0898989320911 -6.56719356278692 A:T A T 10 0.537534767131755 0.262967251282887 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 74300717 T/C 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000187605:ENST00000475405:exon_74300676_74300766:TET3;ENSG00000187605:ENST00000409262:exon_74300676_74300766:TET3;ENSG00000187605:ENST00000233310:exon_74300676_74300766:TET3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 74682512 C/T 0 8 0 8 3.69972186294596 0 3.69972186294596 C C 10 0.537534767131755 0.00906265828433196 ENSG00000115274:ENST00000471577:exon_74682235_74682725:INO80B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 69 54 123 31.9101010679089 29.0268774251148 2.88322364279414 A:G G A 10 0.537534767131755 0.651484712850812 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 54 67 121 24.9731225748852 36.0148293978276 -11.0417068229424 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0452329664461583 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 106 69 175 49.021314684034 37.0898989320911 11.9314157519429 A:C C A 10 0.537534767131755 0.080951648360911 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 74710491 C/T 1 33 31 64 15.2613526846521 16.6635777810844 -1.40222509643232 T:C C T 10 0.537534767131755 0.802298943450247 ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 75113657 C/T 1 45 59 104 20.810935479071 31.7145512607735 -10.9036157817025 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0384459906888918 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 75113789 C/G 1 41 40 81 18.961074547598 21.5013906852702 -2.54031613767215 C:G C G 10 0.537534767131755 0.579406636037964 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 75115108 A/G 1 24 16 40 11.0991655888379 8.60055627410808 2.4986093147298 A:G A G 10 0.537534767131755 0.526471660943444 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75115030_75115185:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75115030_75115185:HK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 75907351 T/C 1 6 2 8 2.77479139720947 1.07506953426351 1.69972186294596 T:C T C 10 0.537534767131755 0.300105198743785 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75907319_75907440:C2orf3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 75923413 T/C 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000442309:exon_75923378_75923441:C2orf3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 75937801 C/T 1 6 11 17 2.77479139720947 5.91288243844931 -3.13809104123983 T:C C T 10 0.537534767131755 0.148136675277047 ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75937717_75938115:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75937717_75938018:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000442309:exon_75937717_75938067:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000470503:exon_75937717_75938025:C2orf3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 96688990 C/T 1 1 36 37 0.462465232868245 19.3512516167432 -18.8887863838749 T:C C T 10 0.537534767131755 1.78417860541265e-11 ENSG00000186281:ENST00000335448:exon_96688706_96689040:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000484440:exon_96688706_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000482704:exon_96688854_96689748:GPAT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 97267418 C/T 1 19 12 31 8.78683942449666 6.45041720558106 2.3364222189156 T:C C T 10 0.537534767131755 0.47292802889 ENSG00000114982:ENST00000354204:exon_97267380_97267513:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000447759:exon_97267380_97267513:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000487070:exon_97267380_97267513:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000431828:exon_97267380_97267513:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000420155:exon_97267380_97267513:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000421845:exon_97267380_97267513:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000441706:exon_97267380_97267513:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000432113:exon_97267380_97267513:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000484020:exon_97267380_97267648:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000440133:exon_97267380_97267513:KIAA1310;ENSG00000114982:ENST00000444759:exon_97267380_97267513:KIAA1310 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 T:C T C 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 9 6 15 4.16218709581421 3.22520860279053 0.936978493023676 T:C T C 10 0.537534767131755 0.797066078642493 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 27 37 64 12.4865612874426 19.8887863838749 -7.40222509643232 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0785290710504902 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 99978048 G/A 1 142 118 260 65.6700630672908 63.4291025215471 2.24096054574371 A:G G A 10 0.537534767131755 0.80372432405407 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99977611_99978283:EIF5B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 100058870 C/T 1 11 9 20 5.08711756155069 4.83781290418579 0.249304657364901 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100058779_100058931:REV1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 101635538 C/T 1 49 8 57 22.660796410544 4.30027813705404 18.36051827349 T:C C T 10 0.537534767131755 3.57546283945567e-07 ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 110373197 G/A 0 18 0 18 8.32437419162841 0 8.32437419162841 G G 10 0.537534767131755 1.49747331128553e-05 ENSG00000198142:ENST00000356454:exon_110371911_110376563:ANKRD57 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 113277949 T/C 1 1 8 9 0.462465232868245 4.30027813705404 -3.83781290418579 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0148367827950640 ENSG00000114999:ENST00000233336:exon_113277859_113278002:TTL;ENSG00000114999:ENST00000476615:exon_113277859_113278257:TTL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 113308516 T/A 1 10 3 13 4.62465232868245 1.61260430139526 3.01204802728719 A:T T A 10 0.537534767131755 0.104100192392772 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113308443_113308579:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113308284_113308579:POLR1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 113309473 C/T 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 T:C C T 10 0.537534767131755 0.241009480668847 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113309352_113309556:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113309352_113309575:POLR1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 113346512 A/C 1 30 29 59 13.8739569860474 15.5885082468209 -1.71455126077354 A:C A C 10 0.537534767131755 0.696253976873683 ENSG00000125611:ENST00000324913:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000454841:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000409719:exon_113343777_113346852:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000469030:exon_113346443_113346617:CHCHD5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 113590390 G/A 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000125538:ENST00000263341:exon_113590239_113590403:IL1B;ENSG00000125538:ENST00000491056:exon_113590239_113590403:IL1B;ENSG00000125538:ENST00000487639:exon_113590239_113590403:IL1B;ENSG00000125538:ENST00000418817:exon_113590276_113590403:IL1B;ENSG00000125538:ENST00000432018:exon_113590329_113590403:IL1B;ENSG00000125538:ENST00000416750:exon_113590372_113590403:IL1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 113956371 G/C 1 87 50 137 40.2344752595373 26.8767383565877 13.3577369029496 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0255722455994103 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113956317_113956407:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000464559:exon_113956135_113956803:PSD4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 120060039 G/A 1 7 9 16 3.23725663007772 4.83781290418579 -1.60055627410808 A:G G A 10 0.537534767131755 0.460588608389532 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 T:C T C 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 5 9 14 2.31232616434123 4.83781290418579 -2.52548673984457 T:C T C 10 0.537534767131755 0.191403008406876 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 120848049 C/T 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 T:C C T 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000115109:ENST00000263713:exon_120847923_120848092:EPB41L5;ENSG00000115109:ENST00000443902:exon_120847923_120848092:EPB41L5;ENSG00000115109:ENST00000448107:exon_120847923_120848092:EPB41L5;ENSG00000115109:ENST00000331393:exon_120847923_120848092:EPB41L5;ENSG00000115109:ENST00000443124:exon_120847923_120848092:EPB41L5;ENSG00000115109:ENST00000452780:exon_120847923_120848092:EPB41L5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 122216419 A/G 1 6 2 8 2.77479139720947 1.07506953426351 1.69972186294596 A:G A G 10 0.537534767131755 0.300105198743785 ENSG00000074054:ENST00000429969:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000263710:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000455322:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000397587:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000376194:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000409078:exon_122216416_122216551:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000452274:exon_122216416_122216551:CLASP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 128744457 G/A 1 10 13 23 4.62465232868245 6.98795197271281 -2.36329964403036 A:G G A 10 0.537534767131755 0.403957046543287 ENSG00000136715:ENST00000259235:exon_128744359_128744536:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000357702:exon_128744359_128744536:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000259234:exon_128744359_128744533:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000409388:exon_128744359_128744536:SAP130 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 128757995 A/C 1 18 10 28 8.32437419162841 5.37534767131755 2.94902652031086 A:C A C 10 0.537534767131755 0.343730457745997 ENSG00000136715:ENST00000259235:exon_128757881_128758028:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000357702:exon_128757881_128758028:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000259234:exon_128757881_128758028:SAP130 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 128870808 T/C 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000136731:ENST00000438277:exon_128870658_128870832:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128870658_128870832:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128870658_128870832:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128870658_128870832:UGGT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 128934400 T/C 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128934388_128934472:UGGT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 13 15 28 6.01204802728719 8.06302150697632 -2.05097347968914 A:G G A 10 0.537534767131755 0.454605168209296 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 132258593 A/G 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 A:G A G 10 0.537534767131755 0.760762761058777 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 132277686 C/T 1 30 23 53 13.8739569860474 12.3632996440304 1.51065734201699 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.783247759335598 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 135893372 A/G 1 51 51 102 23.5857268762805 27.4142731237195 -3.82854624743901 A:G A G 10 0.537534767131755 0.487362086656098 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 136393658 A/G 1 21 23 44 9.71176989023315 12.3632996440304 -2.65152975379722 A:G A G 10 0.537534767131755 0.452143828054077 ENSG00000048991:ENST00000422577:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000456040:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000486532:exon_136393658_136393753:R3HDM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 136409574 A/C 1 29 19 48 13.4114917531791 10.2131605755033 3.19833117767576 A:C A C 10 0.537534767131755 0.387494600064193 ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000429703:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000487294:exon_136409300_136409591:R3HDM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 136873084 G/A 1 228 154 382 105.44207309396 82.7803541382903 22.6617189556696 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0208902699242138 ENSG00000121966:ENST00000409817:exon_136871919_136873813:CXCR4;ENSG00000121966:ENST00000241393:exon_136871921_136873482:CXCR4;ENSG00000121966:ENST00000466288:exon_136872207_136873482:CXCR4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 143798189 A/G 1 35 48 83 16.1862831503886 25.8016688223242 -9.61538567193566 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0365816888853006 ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143797997_143798227:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143797997_143798227:KYNU HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 148716428 T/C 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000461711:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148716161_148716435:ORC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 152302942 C/T 1 8 4 12 3.69972186294596 2.15013906852702 1.54958279441894 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.403872211149876 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152302940_152303089:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152302940_152303089:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152302940_152303089:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152302940_152303089:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152302940_152303089:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000414861:exon_152302940_152303089:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152302940_152303089:RIF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 152311570 G/A 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:G G A 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000414861:exon_152311409_152311624:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152311409_152311673:RIF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 19 9 28 8.78683942449666 4.83781290418579 3.94902652031086 A:G G A 10 0.537534767131755 0.183784224314788 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 152321090 C/G 1 7 9 16 3.23725663007772 4.83781290418579 -1.60055627410808 C:G C G 10 0.537534767131755 0.460588608389532 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 152321272 C/T 1 15 10 25 6.93697849302368 5.37534767131755 1.56163082170613 T:C C T 10 0.537534767131755 0.555250283480734 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 22 17 39 10.1742351231014 9.13809104123983 1.03614408186156 A:T A T 10 0.537534767131755 0.872690301634875 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 152331418 C/G 1 11 7 18 5.08711756155069 3.76274336992228 1.32437419162841 C:G C G 10 0.537534767131755 0.639329189576991 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152331371_152332136:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152331371_152332419:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152331371_152333863:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152331371_152331733:RIF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 157406249 G/A 1 9 2 11 4.16218709581421 1.07506953426351 3.0871175615507 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0736324692983549 ENSG00000115159:ENST00000310454:exon_157406120_157406284:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000438166:exon_157406120_157406284:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000409674:exon_157406120_157406284:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000409125:exon_157406120_157406284:GPD2;ENSG00000115159:ENST00000409861:exon_157406120_157406284:GPD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 8 10 18 3.69972186294596 5.37534767131755 -1.67562580837159 T:G G T 10 0.537534767131755 0.483452727703955 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 160604452 C/T 1 34 42 76 15.7238179175203 22.5764602195337 -6.85264230201338 T:C C T 10 0.537534767131755 0.134460040215183 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 160604812 C/T 1 38 27 65 17.5736788489933 14.5134387125574 3.06024013643593 T:C C T 10 0.537534767131755 0.458793530275788 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 160673526 A/G 1 43 47 90 19.8860050133345 25.2641340551925 -5.37812904185795 A:G A G 10 0.537534767131755 0.290522399088456 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 160676427 C/A 1 35 49 84 16.1862831503886 26.339203589456 -10.1529204390674 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0285582360810039 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160676237_160676431:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160676237_160676431:RP11-357L2.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 78 65 143 36.0722881637231 34.9397598635641 1.13252830015904 T:C C T 10 0.537534767131755 0.867178204754872 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 69 62 131 31.9101010679089 33.3271555621688 -1.4170544942599 T:C T C 10 0.537534767131755 0.860983010519551 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 170402770 T/C 1 9 14 23 4.16218709581421 7.52548673984457 -3.36329964403036 T:C T C 10 0.537534767131755 0.209243218264062 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 100 98 198 46.2465232868245 52.678407178912 -6.43188389208748 A:T T A 10 0.537534767131755 0.392488958502757 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 170592709 A/G 1 11 11 22 5.08711756155069 5.91288243844931 -0.82576487689861 A:G A G 10 0.537534767131755 0.831602284580484 ENSG00000213160:ENST00000272797:exon_170591523_170592737:KLHL23;ENSG00000213160:ENST00000392647:exon_170591523_170592737:KLHL23;ENSG00000213160:ENST00000437875:exon_170592062_170592737:KLHL23 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 170676105 G/A 1 35 16 51 16.1862831503886 8.60055627410808 7.5857268762805 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0352660117826453 ENSG00000138382:ENST00000409837:exon_170676071_170676153:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000260953:exon_170676071_170676153:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000392640:exon_170676071_170676153:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000409965:exon_170676071_170676153:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000409340:exon_170676071_170676153:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000442181:exon_170676071_170676153:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000410097:exon_170676071_170676153:METTL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 170885930 C/A 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 A:C C A 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000144357:ENST00000272793:exon_170885856_170885958:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000442603:exon_170885856_170885958:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000418381:exon_170885856_170885958:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000421104:exon_170885856_170885958:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000430321:exon_170885861_170885958:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392632:exon_170885856_170885958:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392631:exon_170885856_170885958:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000439681:exon_170885856_170885958:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000444475:exon_170885856_170885958:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000465630:exon_170885856_170885945:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000474426:exon_170885856_170885958:UBR3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 171850329 T/G 1 51 37 88 23.5857268762805 19.8887863838749 3.69694049240556 T:G T G 10 0.537534767131755 0.455598386664484 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171847333_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171850202_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000356075:exon_171850007_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171850017_171850466:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171850237_171850466:TLK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 174820750 T/C 1 33 27 60 15.2613526846521 14.5134387125574 0.747913972094702 T:C T C 10 0.537534767131755 0.897414338111254 ENSG00000172845:ENST00000310015:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000416195:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000418194:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000455789:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000462904:exon_174820545_174820956:SP3;ENSG00000172845:ENST00000475175:exon_174820658_174820960:SP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 178416658 T/G 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:G T G 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000196659:ENST00000408939:exon_178414973_178417742:TTC30B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 180815329 C/T 1 21 16 37 9.71176989023315 8.60055627410808 1.11121361612507 T:C C T 10 0.537534767131755 0.744509553421204 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180815239_180815459:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180815239_180815459:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000404136:exon_180815239_180815459:CWC22 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 183593697 C/T 1 16 14 30 7.39944372589192 7.52548673984457 -0.126043013952649 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000494462:exon_183593303_183593834:DNAJC10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 183605077 C/A 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 A:C C A 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183605026_183605115:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183605026_183605115:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183604272_183605115:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183605026_183605115:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000444005:exon_183605026_183605111:DNAJC10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 183622547 T/G 1 12 17 29 5.54958279441894 9.13809104123983 -3.58850824682089 T:G T G 10 0.537534767131755 0.196303716694424 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183622419_183622552:DNAJC10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 18 11 29 8.32437419162841 5.91288243844931 2.41149175317911 A:G A G 10 0.537534767131755 0.457394669306004 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 190323530 A/G 1 11 13 24 5.08711756155069 6.98795197271281 -1.90083441116212 A:G A G 10 0.537534767131755 0.540217717608162 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190323479_190323598:WDR75 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 197021276 T/C 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 12 25 37 5.54958279441894 13.4383691782939 -7.88878638387493 A:T T A 10 0.537534767131755 0.0124157822345633 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 198338579 A/T 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 A:T A T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000115520:ENST00000263960:exon_198338481_198340032:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409398:exon_198338481_198338892:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409010:exon_198338481_198339134:COQ10B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 200820505 T/G 1 8 1 9 3.69972186294596 0.537534767131755 3.16218709581421 T:G T G 10 0.537534767131755 0.0438485425040058 ENSG00000178074:ENST00000491721:exon_200820091_200820658:C2orf69;ENSG00000162972:ENST00000295079:exon_200820220_200820971:C2orf47;ENSG00000162972:ENST00000392290:exon_200820326_200820971:C2orf47 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 201253956 A/G 1 43 20 63 19.8860050133345 10.7506953426351 9.13530967069944 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0226824182297418 ENSG00000196141:ENST00000439084:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000439395:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000444012:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000451764:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000423749:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000471601:exon_201253946_201255577:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000457757:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000428692:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000453663:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000459656:exon_201253946_201255591:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409397:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000421573:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000449647:exon_201253946_201254006:SPATS2L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 201736112 T/C 1 34 14 48 15.7238179175203 7.52548673984457 8.19833117767576 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0199719769945301 ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 201736166 A/C 1 56 16 72 25.8980530406217 8.60055627410808 17.2974967665136 A:C A C 10 0.537534767131755 4.21102731791757e-05 ENSG00000240344:ENST00000422134:exon_201736166_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 201768238 C/T 1 11 21 32 5.08711756155069 11.2882301097669 -6.20111254821616 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0328630728341302 ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 201785837 G/A 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 A:G G A 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000115942:ENST00000234296:exon_201785716_201785862:ORC2;ENSG00000115942:ENST00000464147:exon_201785716_201785862:ORC2;ENSG00000115942:ENST00000487853:exon_201785716_201786461:ORC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 0 0 9 9 0 4.83781290418579 -4.83781290418579 A G A 10 0.537534767131755 0.000967635517319827 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 202245423 A/T 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 A:T A T 10 0.537534767131755 0.241009480668847 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 202625615 C/T 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 T:C C T 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000003393:ENST00000264276:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000457679:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000482891:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000482789:exon_202625604_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000467448:exon_202624183_202626541:ALS2;ENSG00000003393:ENST00000409666:exon_202625526_202626541:ALS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 207008763 C/A 1 42 40 82 19.4235397804663 21.5013906852702 -2.07785090480391 A:T:C C A 10 0.537534767131755 0.659208180693845 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 207012483 A/G 1 31 26 57 14.3364222189156 13.9759039454256 0.360518273489967 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207012477_207012558:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000456284:exon_207012477_207012558:NDUFS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 207025444 T/C 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000114942:ENST00000479587:exon_207025312_207025841:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000460760:exon_207025312_207025914:EEF1B2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 25 15 40 11.5616308217061 8.06302150697632 3.4986093147298 A:C C A 10 0.537534767131755 0.341540349303831 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 208811097 C/T 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 T:C C T 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000178385:ENST00000408943:exon_208811091_208811236:PLEKHM3;ENSG00000178385:ENST00000427836:exon_208811091_208811236:PLEKHM3;ENSG00000178385:ENST00000447645:exon_208811091_208811236:PLEKHM3;ENSG00000178385:ENST00000389247:exon_208811091_208811236:PLEKHM3;ENSG00000178385:ENST00000457206:exon_208811091_208811236:PLEKHM3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 215645464 C/G 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 C:G C G 10 0.537534767131755 0.593874685143272 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215645284_215646233:BARD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 230668858 T/C 1 22 35 57 10.1742351231014 18.8137168496114 -8.63948172651003 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0238294117832926 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000487178:exon_230668715_230668943:TRIP12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 230675696 A/G 1 19 25 44 8.78683942449666 13.4383691782939 -4.65152975379722 A:G A G 10 0.537534767131755 0.175118219550385 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230675596_230675761:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230675596_230675761:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230675596_230675761:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000479037:exon_230675596_230675761:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000477441:exon_230675673_230675761:TRIP12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 231248261 C/T 1 9 8 17 4.16218709581421 4.30027813705404 -0.138091041239834 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231248225_231248290:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231248225_231248290:SP140L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 231258150 C/T 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231258129_231258176:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231258129_231258176:SP140L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 13 9 22 6.01204802728719 4.83781290418579 1.17423512310139 T:C T C 10 0.537534767131755 0.67355127074083 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 128 81 209 59.1955498071354 43.5403161376721 15.6552336694632 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0314483642682802 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 8 12 20 3.69972186294596 6.45041720558106 -2.7506953426351 T:C T C 10 0.537534767131755 0.264201895405952 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 19 18 37 8.78683942449666 9.67562580837159 -0.888786383874933 T:C C T 10 0.537534767131755 0.869377065179406 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 25 24 49 11.5616308217061 12.9008344111621 -1.33920358945599 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.77495876251657 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 65 21 86 30.0602401364359 11.2882301097669 18.7720100266691 T:C C T 10 0.537534767131755 4.83028162696237e-05 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 61 5 66 28.2103792049629 2.68767383565877 25.5227053693042 A:G G A 10 0.537534767131755 9.16550627808008e-12 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 231774844 G/A 1 4 12 16 1.84986093147298 6.45041720558106 -4.60055627410808 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0242209614480061 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 231775094 C/A 1 4 12 16 1.84986093147298 6.45041720558106 -4.60055627410808 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0242209614480061 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000438398:exon_231774952_231775811:GPR55 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 231775297 T/G 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 T:G T G 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000438398:exon_231774952_231775811:GPR55 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 232072912 T/C 1 7 12 19 3.23725663007772 6.45041720558106 -3.21316057550334 T:C T C 10 0.537534767131755 0.169147725225653 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000482392:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000440107:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232072840_232072965:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232072840_232072965:ARMC9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 232127090 G/A 1 16 15 31 7.39944372589192 8.06302150697632 -0.663577781084404 A:G G A 10 0.537534767131755 0.858236752595722 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232127019_232127111:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232127019_232127111:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232127019_232127111:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000436339:exon_232127019_232127111:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000467698:exon_232127019_232127111:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000424740:exon_232127019_232127111:ARMC9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 233201328 A/G 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 A:G A G 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_233201179_233201907:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_233201179_233201908:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_233200924_233201687:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_233201179_233201340:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000429283:exon_233199079_233201686:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000418143:exon_233201020_233201684:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000417808:exon_233200851_233201683:DIS3L2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 233599904 A/C 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 A:C A C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000204120:ENST00000476995:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000427233:exon_233599865_233599947:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373566:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373563:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000428883:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409480:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000456491:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000484409:exon_233599865_233600161:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000492910:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409547:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000475359:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000488629:exon_233599865_233600298:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000490612:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000464402:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000421433:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000425040:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000430720:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000423659:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409196:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000488734:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409451:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000463554:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000440945:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000429187:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000482666:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000490229:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000483164:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000464805:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000489328:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000424038:exon_233599865_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000414511:exon_233599858_233599948:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000452341:exon_233599858_233599948:GIGYF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 233925166 G/A 1 68 60 128 31.4476358350407 32.2520860279053 -0.804450192864635 A:G G A 10 0.537534767131755 0.929441663790259 ENSG00000168918:ENST00000422935:exon_233924677_233925322:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000451407:exon_233925062_233925322:INPP5D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 234113057 G/A 1 142 123 265 65.6700630672908 66.1167763572059 -0.446713289915067 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 234749258 T/C 1 59 35 94 27.2854487392265 18.8137168496114 8.47173188961503 T:C T C 10 0.537534767131755 0.097414754160454 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 234749269 G/A 1 56 32 88 25.8980530406217 17.2011125482162 8.69694049240556 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.0691204759813123 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 234749354 G/A 1 49 46 95 22.660796410544 24.7265992880607 -2.06580287751672 A:G G A 10 0.537534767131755 0.681891544327267 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 234749780 G/C 1 65 68 133 30.0602401364359 36.5523641649593 -6.49212402852341 C:G G C 10 0.537534767131755 0.259904938077148 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 42 52 94 19.4235397804663 27.9518078908513 -8.52826811038496 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0795550331791423 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 234761225 C/T 1 17 12 29 7.86190895876017 6.45041720558106 1.41149175317911 T:C C T 10 0.537534767131755 0.710565874391974 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234761211_234761266:HJURP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 235404901 C/T 1 68 39 107 31.4476358350407 20.9638559181384 10.4837799169022 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0519912406900336 ENSG00000188042:ENST00000390645:exon_235401685_235405697:ARL4C;ENSG00000188042:ENST00000339728:exon_235404656_235405244:ARL4C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 138 140 278 63.8202021358178 75.2548673984457 -11.4346652626279 A:G A G 10 0.537534767131755 0.185672201330697 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 208 206 414 96.192768436595 110.732162029142 -14.5393935925465 A:G A G 10 0.537534767131755 0.153229507358043 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 238672633 C/T 1 242 230 472 111.916586354115 123.632996440304 -11.7164100861883 T:C C T 10 0.537534767131755 0.288517726996587 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 275 270 545 127.177939038767 145.134387125574 -17.9564480868065 C:G C G 10 0.537534767131755 0.132641107171193 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 239006879 C/T 1 46 33 79 21.2734007119393 17.7386473153479 3.53475339659136 T:C C T 10 0.537534767131755 0.432690155735678 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 239155053 C/T 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 ENSG00000132326:ENST00000254657:exon_239152679_239155165:PER2;ENSG00000132326:ENST00000254658:exon_239152679_239155165:PER2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 239237974 T/C 1 10 8 18 4.62465232868245 4.30027813705404 0.324374191628411 A:T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 241463639 C/T 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000144504:ENST00000373318:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000272972:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000361678:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000391987:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000403283:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000401804:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000373320:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405523:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405002:exon_241461355_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000480230:exon_241461356_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000484526:exon_241461356_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000459901:exon_241462675_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000496300:exon_241463240_241463798:ANKMY1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 241500896 C/T 1 11 9 20 5.08711756155069 4.83781290418579 0.249304657364901 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000188542:ENST00000343217:exon_241500747_241500936:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000405954:exon_241500747_241503431:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000438823:exon_241500747_241500936:DUSP28 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 241516094 G/C 1 109 84 193 50.4087103826387 45.1529204390674 5.25578994357129 A:T:C:G G C 10 0.537534767131755 0.470823436729059 ENSG00000142327:ENST00000451363:exon_241515952_241516144:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241513530_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000493398:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000464550:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000471657:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000437406:exon_241515985_241516182:RNPEPL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 241531479 A/G 1 11 12 23 5.08711756155069 6.45041720558106 -1.36329964403036 A:G A G 10 0.537534767131755 0.677013887550826 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391982:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241529301_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000432084:exon_241531350_241531567:CAPN10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 241536053 C/T 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000142330:ENST00000483602:exon_241535736_241536119:CAPN10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 241536126 A/G 1 16 12 28 7.39944372589192 6.45041720558106 0.949026520310861 A:G A G 10 0.537534767131755 0.850208407116058 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241536098_241536359:CAPN10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 11 11 22 5.08711756155069 5.91288243844931 -0.82576487689861 A:G G A 10 0.537534767131755 0.831602284580484 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 241569849 C/T 1 28 13 41 12.9490265203109 6.98795197271281 5.96107454759805 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0836764540040618 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 241570092 C/T 1 28 10 38 12.9490265203109 5.37534767131755 7.57367884899331 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0143682075739682 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 241570127 C/T 1 24 8 32 11.0991655888379 4.30027813705404 6.79888745178384 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0199269200280238 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 241991875 G/A 1 9 3 12 4.16218709581421 1.61260430139526 2.54958279441894 A:G G A 10 0.537534767131755 0.159578115428333 ENSG00000162804:ENST00000310397:exon_241991772_241991885:SNED1;ENSG00000162804:ENST00000405547:exon_241991772_241991885:SNED1;ENSG00000162804:ENST00000401884:exon_241991772_241991885:SNED1;ENSG00000162804:ENST00000342631:exon_241991772_241991885:SNED1;ENSG00000162804:ENST00000469006:exon_241991772_241991885:SNED1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 242036797 A/G 1 36 43 79 16.6487483832568 23.1139949866655 -6.46524660340864 A:G A G 10 0.537534767131755 0.1753752433038 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000455202:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000493169:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000414146:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000406593:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000439144:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000460915:exon_242036341_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242036602_242036842:MTERFD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 242046785 A/C 1 95 77 172 43.9341971224833 41.3901770691451 2.54402005333814 A:C A C 10 0.537534767131755 0.70313320414491 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242046768_242046914:PASK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 242047750 A/G 1 10 1 11 4.62465232868245 0.537534767131755 4.08711756155069 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0141811635261139 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 242051777 G/A 1 56 33 89 25.8980530406217 17.7386473153479 8.15940572527381 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0892530360241094 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000489256:exon_242051655_242052201:PASK;ENSG00000115687:ENST00000475666:exon_242051655_242051840:PASK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 242054403 G/A 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 A:G G A 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242052722_242054592:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242053050_242054592:PASK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 242062162 C/T 1 29 28 57 13.4114917531791 15.0509734796891 -1.63948172651003 T:C C T 10 0.537534767131755 0.691713246223695 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242062147_242062314:PASK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 242077496 C/T 1 11 15 26 5.08711756155069 8.06302150697632 -2.97590394542563 T:C C T 10 0.537534767131755 0.325523153112396 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000433589:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000415234:exon_242077368_242077502:PASK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 242350466 A/G 1 13 6 19 6.01204802728719 3.22520860279053 2.78683942449666 A:G A G 10 0.537534767131755 0.252178981986345 ENSG00000006607:ENST00000264042:exon_242350448_242350545:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000373287:exon_242350448_242350545:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000471447:exon_242350356_242350545:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000485051:exon_242350360_242350545:FARP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 242572846 A/G 1 82 92 174 37.9221490951961 49.4531985761215 -11.5310494809254 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0808368577802547 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 242607924 A/G 1 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.155642553042637 ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242607674_242608100:ATG4B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 52 32 84 24.0481921091487 17.2011125482162 6.84707956093258 T:C T C 10 0.537534767131755 0.154743661489919 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 2 242793273 A/G 1 3 17 20 1.38739569860474 9.13809104123983 -7.7506953426351 A:G A G 10 0.537534767131755 0.000488594897228961 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 371972 T/C 1 60 44 104 27.7479139720947 23.6515297537972 4.09638421829748 T:C T C 10 0.537534767131755 0.433269854309185 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 53 51 104 24.510657342017 27.4142731237195 -2.90361578170252 T:C C T 10 0.537534767131755 0.623181190959373 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 825678 T/C 1 26 13 39 12.0240960545744 6.98795197271281 5.03614408186156 T:C T C 10 0.537534767131755 0.111154140369151 ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 102 98 200 47.171453752561 52.678407178912 -5.506953426351 T:G T G 10 0.537534767131755 0.436438739454705 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 58 45 103 26.8229835063582 24.189064520929 2.63391898542924 T:C C T 10 0.537534767131755 0.622561861325681 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 2443441 G/A 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 A:G G A 10 0.537534767131755 0.74134570348407 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 2840929 G/A 1 31 17 48 14.3364222189156 9.13809104123983 5.19833117767576 A:G G A 10 0.537534767131755 0.148659540868302 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2840885_2841013:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2840885_2841013:VPS16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 2844911 C/T 1 43 42 85 19.8860050133345 22.5764602195337 -2.69045520619917 T:C C T 10 0.537534767131755 0.58746032124817 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000458279:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380443:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000487461:exon_2844595_2844933:VPS16;ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2844830_2844933:PTPRA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 2945759 C/T 1 40 42 82 18.4986093147298 22.5764602195337 -4.07785090480391 T:C C T 10 0.537534767131755 0.377554177923985 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000455631:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000431048:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000418580:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000430705:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2945507_2945848:PTPRA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 2996497 C/T 1 29 18 47 13.4114917531791 9.67562580837159 3.73586594480752 T:C C T 10 0.537534767131755 0.307542982653534 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2996495_2996531:PTPRA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 3008448 C/T 1 65 55 120 30.0602401364359 29.5644121922465 0.495827944189404 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_3008353_3008487:PTPRA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 3018782 G/A 1 21 23 44 9.71176989023315 12.3632996440304 -2.65152975379722 A:G G A 10 0.537534767131755 0.452143828054077 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_3018705_3019320:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_3018705_3019320:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_3018705_3019314:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_3018705_3019314:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_3018705_3019314:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_3018705_3019320:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_3018705_3019314:PTPRA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 3090848 T/G 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 T:G T G 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000185019:ENST00000217173:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000348031:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000440298:exon_3088219_3090960:UBOX5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 4837826 C/T 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 T:C C T 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000089057:ENST00000379333:exon_4833002_4837850:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000338244:exon_4833002_4837850:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000379324:exon_4833002_4837850:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000424750:exon_4833002_4837850:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000437886:exon_4835743_4837850:SLC23A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 4854682 A/G 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 A:G A G 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000089057:ENST00000379333:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000338244:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000379324:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000424750:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000437886:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000423430:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000468355:exon_4854582_4854738:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000496331:exon_4854523_4854738:SLC23A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 4880308 G/A 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:G G A 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000089057:ENST00000379333:exon_4880201_4880358:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000338244:exon_4880201_4880358:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000379324:exon_4880201_4880358:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000424750:exon_4880201_4880358:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000437886:exon_4880201_4880358:SLC23A2;ENSG00000089057:ENST00000468355:exon_4880201_4880358:SLC23A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 5556512 G/A 1 29 47 76 13.4114917531791 25.2641340551925 -11.8526423020134 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00779093673929917 ENSG00000125772:ENST00000378992:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000379019:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000481038:exon_5556462_5556624:GPCPD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 5753579 C/T 1 9 11 20 4.16218709581421 5.91288243844931 -1.7506953426351 T:C C T 10 0.537534767131755 0.504150670545082 ENSG00000171984:ENST00000378979:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5753508_5753689:C20orf196 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 13 12 25 6.01204802728719 6.45041720558106 -0.438369178293874 T:C:G C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 13 14 27 6.01204802728719 7.52548673984457 -1.51343871255738 A:G A G 10 0.537534767131755 0.569240590365238 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 5939214 A/C 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 A:C A C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5939174_5939372:MCM8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 5943956 G/C 1 7 9 16 3.23725663007772 4.83781290418579 -1.60055627410808 C:G G C 10 0.537534767131755 0.460588608389532 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5943920_5944005:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5943920_5944005:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5943920_5944005:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5943920_5944005:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5943920_5944005:MCM8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 5953833 A/G 1 14 17 31 6.47451326015543 9.13809104123983 -2.6635777810844 A:G A G 10 0.537534767131755 0.371006982111436 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5953702_5953842:MCM8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 10386059 G/A 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 A:G G A 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 10393629 G/A 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 A:G G A 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10393178_10394162:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10393178_10394579:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10393178_10394579:MKKS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 13695680 C/T 1 25 19 44 11.5616308217061 10.2131605755033 1.34847024620278 T:C C T 10 0.537534767131755 0.763143132347552 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 15967719 T/C 1 7 21 28 3.23725663007772 11.2882301097669 -8.05097347968914 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00361115869541955 ENSG00000172264:ENST00000217246:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000310348:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000402914:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000378058:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000486914:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000407045:exon_15967711_15967803:MACROD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 16486698 G/A 1 5 9 14 2.31232616434123 4.83781290418579 -2.52548673984457 A:G G A 10 0.537534767131755 0.191403008406876 ENSG00000089177:ENST00000354981:exon_16486667_16486835:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000355755:exon_16486667_16486835:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000358562:exon_16486667_16486835:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000377997:exon_16486667_16486835:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000378003:exon_16486667_16486835:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000408042:exon_16486667_16486835:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000251847:exon_16486667_16486835:KIF16B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 11 27 38 5.08711756155069 14.5134387125574 -9.42632115100669 A:C C A 10 0.537534767131755 0.00290294207070345 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 17596587 G/A 1 22 8 30 10.1742351231014 4.30027813705404 5.87395698604735 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0423344392736491 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596571_17596654:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596571_17596654:RRBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 17608233 C/T 1 32 25 57 14.7988874517838 13.4383691782939 1.36051827348997 T:C C T 10 0.537534767131755 0.791005023816092 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000495501:exon_17608149_17608327:RRBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 17932210 C/T 1 85 68 153 39.3095447938008 36.5523641649593 2.75718062884149 T:C C T 10 0.537534767131755 0.685641272520357 ENSG00000089006:ENST00000377768:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000490175:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377759:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000483485:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377739:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000476648:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000431277:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000419004:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000494401:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000474883:exon_17932170_17932239:SNX5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 17943492 A/T 1 16 12 28 7.39944372589192 6.45041720558106 0.949026520310861 A:T A T 10 0.537534767131755 0.850208407116058 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 14 18 32 6.47451326015543 9.67562580837159 -3.20111254821616 T:C T C 10 0.537534767131755 0.289607831440422 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 18143355 C/T 1 12 9 21 5.54958279441894 4.83781290418579 0.711769890233146 T:C C T 10 0.537534767131755 0.829121193760437 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18143021_18143589:CSRP2BP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 T:C T C 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 20493550 T/C 1 4 7 11 1.84986093147298 3.76274336992228 -1.9128824384493 T:C T C 10 0.537534767131755 0.365659915960336 ENSG00000188559:ENST00000430436:exon_20493157_20493928:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000334388:exon_20493157_20493928:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000202677:exon_20493157_20493928:RALGAPA2;ENSG00000188559:ENST00000418184:exon_20493157_20493928:RALGAPA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 25038484 G/T 1 35 17 52 16.1862831503886 9.13809104123983 7.04819210914874 T:G G T 10 0.537534767131755 0.052258266424544 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_25038405_25038818:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376726:exon_25038405_25039616:ACSS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 25187213 G/A 1 11 9 20 5.08711756155069 4.83781290418579 0.249304657364901 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000425813:exon_25187158_25187226:ENTPD6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 25193949 G/A 1 13 16 29 6.01204802728719 8.60055627410808 -2.58850824682089 A:G G A 10 0.537534767131755 0.356879843182363 ENSG00000197586:ENST00000354989:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000525986:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000439162:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433417:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25193899_25194012:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000447877:exon_25193899_25194042:ENTPD6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 25260931 A/G 1 24 21 45 11.0991655888379 11.2882301097669 -0.189064520928973 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25260902_25261048:PYGB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 25264814 T/C 1 19 20 39 8.78683942449666 10.7506953426351 -1.96385591813844 T:C T C 10 0.537534767131755 0.630559943550738 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25264740_25264887:PYGB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 25276297 G/A 1 32 40 72 14.7988874517838 21.5013906852702 -6.70250323348636 A:G G A 10 0.537534767131755 0.124718675134830 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 25282944 A/G 1 31 37 68 14.3364222189156 19.8887863838749 -5.55236416495934 A:G A G 10 0.537534767131755 0.182968739716469 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 25288632 G/A 1 29 32 61 13.4114917531791 17.2011125482162 -3.78962079503705 A:G G A 10 0.537534767131755 0.369409534948659 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000491682:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000481556:exon_25288602_25288681:ABHD12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 25398790 G/A 1 4 10 14 1.84986093147298 5.37534767131755 -3.52548673984457 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0654879889218514 ENSG00000101003:ENST00000429262:exon_25398741_25398831:GINS1;ENSG00000101003:ENST00000262460:exon_25398741_25398831:GINS1;ENSG00000101003:ENST00000484893:exon_25398741_25398831:GINS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 25667074 C/T 1 10 15 25 4.62465232868245 8.06302150697632 -3.43836917829387 T:C C T 10 0.537534767131755 0.228213554923661 ENSG00000130684:ENST00000376436:exon_25667027_25667593:ZNF337;ENSG00000130684:ENST00000252979:exon_25667027_25667102:ZNF337;ENSG00000130684:ENST00000376412:exon_25667027_25667102:ZNF337;ENSG00000130684:ENST00000481610:exon_25667027_25667102:ZNF337 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 121 118 239 55.9582931770576 63.4291025215471 -7.47080934448944 T:C C T 10 0.537534767131755 0.363826418335507 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 33148743 C/T 1 4 22 26 1.84986093147298 11.8257648768986 -9.97590394542563 T:C C T 10 0.537534767131755 8.82035622438225e-05 ENSG00000101464:ENST00000217446:exon_33148346_33148783:PIGU;ENSG00000101464:ENST00000374820:exon_33148347_33148783:PIGU;ENSG00000101464:ENST00000438215:exon_33148707_33148783:PIGU HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 33337751 T/C 1 21 12 33 9.71176989023315 6.45041720558106 3.26135268465209 T:C T C 10 0.537534767131755 0.296829551547054 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33337206_33338322:NCOA6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 33451148 G/A 1 20 11 31 9.2493046573649 5.91288243844931 3.3364222189156 A:G G A 10 0.537534767131755 0.280729124843917 ENSG00000131067:ENST00000356042:exon_33451116_33451351:GGT7;ENSG00000131067:ENST00000336431:exon_33451116_33451351:GGT7;ENSG00000131067:ENST00000253380:exon_33451116_33451351:GGT7;ENSG00000131067:ENST00000429091:exon_33451116_33451351:GGT7;ENSG00000131067:ENST00000457617:exon_33451116_33451351:GGT7;ENSG00000131067:ENST00000439668:exon_33451116_33451351:GGT7;ENSG00000131067:ENST00000427420:exon_33451116_33451351:GGT7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 33657126 G/A 1 12 13 25 5.54958279441894 6.98795197271281 -1.43836917829387 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.689197984829322 ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33657099_33657215:TRPC4AP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 33872311 G/C 1 24 20 44 11.0991655888379 10.7506953426351 0.348470246202782 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000242372:ENST00000440766:exon_33872184_33872326:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000374436:exon_33872184_33872518:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000462894:exon_33872184_33872505:EIF6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 16 16 32 7.39944372589192 8.60055627410808 -1.20111254821616 T:C C T 10 0.537534767131755 0.724666023024225 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 34092055 G/A 1 22 29 51 10.1742351231014 15.5885082468209 -5.4142731237195 A:G G A 10 0.537534767131755 0.159656769716678 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000422671:exon_34090734_34092833:CEP250 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 34214173 G/A 1 143 117 260 66.132528300159 62.8915677544153 3.2409605457437 A:G G A 10 0.537534767131755 0.709292869162414 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34213953_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000415920:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000462352:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000498814:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000473373:exon_34213966_34214725:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34213980_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34213988_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34214008_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34214081_34214303:CPNE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 131 117 248 60.5829455057401 62.8915677544153 -2.30862224867523 T:C T C 10 0.537534767131755 0.79903884593784 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 34220755 C/T 1 75 39 114 34.6848924651184 20.9638559181384 13.7210365469799 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0109667785784348 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000420363:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000434795:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000440240:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000458038:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437100:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414711:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000435747:exon_34220717_34220845:CPNE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 34243017 C/T 1 69 60 129 31.9101010679089 32.2520860279053 -0.341984959996392 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000431148:exon_34242815_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000435161:exon_34242843_34243266:RBM12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 36784455 C/T 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 T:C C T 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000198959:ENST00000361475:exon_36784249_36784491:TGM2;ENSG00000198959:ENST00000468262:exon_36784249_36784491:TGM2;ENSG00000198959:ENST00000474777:exon_36784249_36784491:TGM2;ENSG00000198959:ENST00000373403:exon_36784249_36784491:TGM2;ENSG00000198959:ENST00000453095:exon_36784249_36784491:TGM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 40050646 T/C 1 16 10 26 7.39944372589192 5.37534767131755 2.02409605457437 T:C T C 10 0.537534767131755 0.556052782665225 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 42089140 T/A 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 A:T T A 10 0.537534767131755 0.764236388540224 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 42225114 G/A 1 7 9 16 3.23725663007772 4.83781290418579 -1.60055627410808 A:G G A 10 0.537534767131755 0.460588608389532 ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000486243:exon_42225075_42225162:IFT52 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 42328639 T/C 1 182 98 280 84.1686723820206 52.678407178912 31.4902652031086 T:C T C 10 0.537534767131755 0.000152382541866942 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42328397_42328684:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42328397_42328684:MYBL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 43530234 A/C 1 129 122 251 59.6580150400036 65.5792415900741 -5.92122655007049 A:C A C 10 0.537534767131755 0.486334054174144 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 43629135 G/A 1 69 61 130 31.9101010679089 32.7896207950371 -0.879519727128145 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.929964577686763 ENSG00000101109:ENST00000372806:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000396731:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000372801:exon_43629033_43629161:STK4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 44526619 G/T 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 T:G G T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000064601:ENST00000484855:exon_44526420_44526748:CTSA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 44534990 A/T 1 17 5 22 7.86190895876017 2.68767383565877 5.17423512310139 A:T A T 10 0.537534767131755 0.0315816885143343 ENSG00000100979:ENST00000372420:exon_44534907_44534998:PLTP;ENSG00000100979:ENST00000372431:exon_44534907_44534998:PLTP;ENSG00000100979:ENST00000354050:exon_44534907_44534998:PLTP;ENSG00000100979:ENST00000477313:exon_44534907_44534998:PLTP;ENSG00000100979:ENST00000420868:exon_44534907_44534998:PLTP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 44596207 C/G 1 5 15 20 2.31232616434123 8.06302150697632 -5.7506953426351 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0123613354383304 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44595506_44596273:ZNF335 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 45131618 A/G 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 A:G A G 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000198185:ENST00000396380:exon_45129709_45131736:ZNF334;ENSG00000198185:ENST00000331711:exon_45129709_45131736:ZNF334;ENSG00000198185:ENST00000418827:exon_45129709_45131736:ZNF334;ENSG00000198185:ENST00000457685:exon_45129709_45131736:ZNF334;ENSG00000198185:ENST00000347606:exon_45129731_45131736:ZNF334 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 45315346 C/T 1 9 8 17 4.16218709581421 4.30027813705404 -0.138091041239834 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 45318042 G/A 1 20 11 31 9.2493046573649 5.91288243844931 3.3364222189156 A:G G A 10 0.537534767131755 0.280729124843917 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 45318069 C/G 1 25 16 41 11.5616308217061 8.60055627410808 2.96107454759805 C:G C G 10 0.537534767131755 0.434059951809793 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 46265291 G/A 1 67 67 134 30.9851706021724 36.0148293978276 -5.02965879565517 A:G G A 10 0.537534767131755 0.387776235214808 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46264635_46265506:NCOA3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47258763 C/T 1 77 65 142 35.6098229308549 34.9397598635641 0.670063067290798 T:C C T 10 0.537534767131755 0.933098430020882 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000496915:exon_47258651_47258796:PREX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47261017 T/C 1 122 112 234 56.4207584099259 60.2038939187566 -3.78313550883066 T:C T C 10 0.537534767131755 0.646490623056393 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47267480 A/G 1 64 68 132 29.5977749035677 36.5523641649593 -6.95458926139165 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.256410354234697 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267432_47267593:PREX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47267940 G/A 1 79 71 150 36.5347533965914 38.1649684663546 -1.63021506976325 A:G G A 10 0.537534767131755 0.806338182707703 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267934_47268121:PREX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47269233 C/G 1 67 38 105 30.9851706021724 20.4263211510067 10.5588494511657 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0400372348217183 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47269124_47269244:PREX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47273726 C/T 1 49 46 95 22.660796410544 24.7265992880607 -2.06580287751672 T:C C T 10 0.537534767131755 0.681891544327267 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47273578_47273726:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47273578_47273726:PREX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47351095 G/A 1 55 19 74 25.4355878077535 10.2131605755033 15.2224272322501 A:G G A 10 0.537534767131755 0.000396822829067681 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47351083_47351187:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47351083_47351187:PREX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47630449 C/T 1 12 13 25 5.54958279441894 6.98795197271281 -1.43836917829387 T:C C T 10 0.537534767131755 0.689197984829322 ENSG00000124198:ENST00000371917:exon_47630368_47630497:ARFGEF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47712930 G/T 1 86 78 164 39.7720100266691 41.9277118362769 -2.15570180960781 T:G G T 10 0.537534767131755 0.754487526002881 ENSG00000124207:ENST00000449004:exon_47712886_47713484:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000417408:exon_47712886_47713484:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000262982:exon_47712886_47713489:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000476393:exon_47712345_47713069:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000469700:exon_47712713_47713489:CSE1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 56 48 104 25.8980530406217 25.8016688223242 0.0963842182974837 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47865011 C/T 1 50 49 99 23.1232616434123 26.339203589456 -3.21594194604374 T:C C T 10 0.537534767131755 0.546081363908225 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47865372 G/A 1 37 33 70 17.1112136161251 17.7386473153479 -0.627433699222848 A:G G A 10 0.537534767131755 0.905006713210969 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 30 48 78 13.8739569860474 25.8016688223242 -11.9277118362769 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00860231036849202 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 35 29 64 16.1862831503886 15.5885082468209 0.597774903567682 C:G C G 10 0.537534767131755 0.90096518386916 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47886684 G/A 1 18 9 27 8.32437419162841 4.83781290418579 3.48656128744262 A:G G A 10 0.537534767131755 0.246443933683272 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47886479_47887760:ZNFX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 47886791 C/G 1 26 27 53 12.0240960545744 14.5134387125574 -2.48934265798301 C:G C G 10 0.537534767131755 0.495067626942265 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47886479_47887760:ZNFX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 48746189 C/T 1 17 19 36 7.86190895876017 10.2131605755033 -2.35125161674318 T:C C T 10 0.537534767131755 0.504659923745868 ENSG00000240849:ENST00000522930:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371650:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371656:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371652:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000453505:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371658:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000124208:ENST00000341698:exon_48746083_48746227:TMEM189-UBE2V1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 50092027 T/G 1 3 15 18 1.38739569860474 8.06302150697632 -6.67562580837159 T:G T G 10 0.537534767131755 0.00164527063716986 ENSG00000101096:ENST00000371564:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000396009:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000371567:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000414705:exon_50091995_50092197:NFATC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 50092193 T/C 1 1 13 14 0.462465232868245 6.98795197271281 -6.52548673984457 T:C T C 10 0.537534767131755 0.000521708435349348 ENSG00000101096:ENST00000371564:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000396009:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000371567:exon_50091995_50092197:NFATC2;ENSG00000101096:ENST00000414705:exon_50091995_50092197:NFATC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 52192408 C/T 1 41 37 78 18.961074547598 19.8887863838749 -0.927711836276888 T:C C T 10 0.537534767131755 0.909693300887096 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000437222:exon_52192266_52192566:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 52193368 C/T 1 38 28 66 17.5736788489933 15.0509734796891 2.52270536930417 T:C C T 10 0.537534767131755 0.621810249921331 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 52193660 G/A 1 32 9 41 14.7988874517838 4.83781290418579 9.96107454759805 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00157567812861842 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 52193698 G/A 1 36 12 48 16.6487483832568 6.45041720558106 10.1983311776758 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00341371559814937 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 52198340 T/A 1 50 32 82 23.1232616434123 17.2011125482162 5.92214909519609 A:T T A 10 0.537534767131755 0.223025904291726 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52198000_52199707:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52198000_52199636:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52198000_52199707:ZNF217 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 52561469 A/G 0 0 19 19 0 10.2131605755033 -10.2131605755033 G A G 10 0.537534767131755 4.33014750541740e-07 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52561322_52561535:BCAS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 55093178 C/T 1 135 126 261 62.4328064372131 67.7293806586011 -5.29657422138805 T:C C T 10 0.537534767131755 0.534942555269278 ENSG00000022277:ENST00000023939:exon_55093143_55093943:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000395881:exon_55093143_55093943:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000357348:exon_55093143_55093938:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000435342:exon_55093143_55093938:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000477485:exon_55093143_55093301:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000477573:exon_55093143_55093943:C20orf43;ENSG00000124103:ENST00000481560:exon_55093143_55093353:C20orf106 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 55966904 C/T 1 1 8 9 0.462465232868245 4.30027813705404 -3.83781290418579 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0148367827950640 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 55982579 T/C 1 14 8 22 6.47451326015543 4.30027813705404 2.17423512310139 T:C T C 10 0.537534767131755 0.398340723938621 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 56190634 C/T 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56190568_56193137:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56190568_56191524:ZBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 57244493 G/A 1 43 54 97 19.8860050133345 29.0268774251148 -9.14087241178023 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0670210746888803 ENSG00000254995:ENST00000371138:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000435446:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000124222:ENST00000355957:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000312283:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000359617:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371141:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371132:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000358029:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000464640:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361830:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361770:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000468590:exon_57244358_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000438253:exon_57244347_57244509:STX16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 57268867 C/A 1 20 20 40 9.2493046573649 10.7506953426351 -1.5013906852702 A:C:G C A 10 0.537534767131755 0.638443496437183 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57268793_57268978:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57268225_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57268235_57268978:NPEPL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 24 25 49 11.0991655888379 13.4383691782939 -2.33920358945599 C:G C G 10 0.537534767131755 0.567314507896408 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 617 564 1181 285.341048679707 303.16960866231 -17.8285599826027 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.307108894060545 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 57564070 C/T 1 28 28 56 12.9490265203109 15.0509734796891 -2.10194695937828 T:C C T 10 0.537534767131755 0.594067644372278 ENSG00000101158:ENST00000344018:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000482747:exon_57563969_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000460601:exon_57563969_57564076:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000477741:exon_57563969_57564076:TH1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 57565943 G/C 1 4 7 11 1.84986093147298 3.76274336992228 -1.9128824384493 C:G G C 10 0.537534767131755 0.365659915960336 ENSG00000101158:ENST00000478389:exon_57565150_57567075:TH1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 83 96 179 38.3846143280643 51.6033376446485 -13.2187233165841 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0512300894816209 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 60768497 C/T 1 25 21 46 11.5616308217061 11.2882301097669 0.273400711939273 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 60966318 G/T 1 26 18 44 12.0240960545744 9.67562580837159 2.34847024620278 T:G G T 10 0.537534767131755 0.546470267269541 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60966305_60966509:CABLES2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 61299501 C/T 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 0.593874685143272 ENSG00000101187:ENST00000370512:exon_61299490_61299536:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000217159:exon_61299364_61299536:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000497209:exon_61299097_61299893:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000370507:exon_61299364_61299536:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000342674:exon_61299364_61299536:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000470412:exon_61299364_61299536:SLCO4A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 62198339 C/T 1 14 11 25 6.47451326015543 5.91288243844931 0.561630821706125 T:C C T 10 0.537534767131755 0.844309277033242 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 62200682 G/C 1 19 14 33 8.78683942449666 7.52548673984457 1.26135268465209 C:G G C 10 0.537534767131755 0.728762453910667 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 62320929 C/T 1 9 4 13 4.16218709581421 2.15013906852702 2.01204802728719 T:C C T 10 0.537534767131755 0.405252718730477 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62320855_62321001:RTEL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 62320968 T/C 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 T:C T C 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62320855_62321001:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62320855_62321001:RTEL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 62321655 G/A 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 A:G G A 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000425905:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62321647_62321794:RTEL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 62324289 C/T 1 18 11 29 8.32437419162841 5.91288243844931 2.41149175317911 T:C C T 10 0.537534767131755 0.457394669306004 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 62326770 G/A 1 20 15 35 9.2493046573649 8.06302150697632 1.18628315038858 A:G G A 10 0.537534767131755 0.736906280800669 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62326681_62326833:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62326681_62326833:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62326681_62326833:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62326681_62326833:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000369993:exon_62326681_62326833:RTEL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 62372706 G/A 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 A:G G A 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62372605_62372832:SLC2A4RG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 74 50 124 34.2224272322501 26.8767383565877 7.34568887566239 T:G G T 10 0.537534767131755 0.207414819349501 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 62373983 G/A 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000125520:ENST00000496425:exon_62373881_62374143:SLC2A4RG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 62378349 C/T 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000130584:ENST00000245663:exon_62375019_62378654:ZBTB46;ENSG00000130584:ENST00000302995:exon_62378225_62378654:ZBTB46;ENSG00000130584:ENST00000395104:exon_62375878_62378654:ZBTB46 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 20 62378364 C/T 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000130584:ENST00000245663:exon_62375019_62378654:ZBTB46;ENSG00000130584:ENST00000302995:exon_62378225_62378654:ZBTB46;ENSG00000130584:ENST00000395104:exon_62375878_62378654:ZBTB46 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 14 44 58 6.47451326015543 23.6515297537972 -17.1770164936418 C:G G C 10 0.537534767131755 7.69953773490929e-06 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 18966406 C/T 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 T:C C T 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000154640:ENST00000339775:exon_18965971_18966650:BTG3;ENSG00000154640:ENST00000348354:exon_18965971_18966650:BTG3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 26976222 C/T 1 65 45 110 30.0602401364359 24.189064520929 5.87117561550695 T:C C T 10 0.537534767131755 0.293063195263223 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 26976237 C/T 1 69 52 121 31.9101010679089 27.9518078908513 3.95829317705765 T:C C T 10 0.537534767131755 0.523570858553436 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 30339120 C/A 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000198862:ENST00000389194:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000361371:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000446611:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000389195:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000452100:exon_30338692_30339501:LTN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 30714776 T/C 1 15 17 32 6.93697849302368 9.13809104123983 -2.20111254821616 T:C T C 10 0.537534767131755 0.480790906838619 ENSG00000156273:ENST00000286800:exon_30714720_30718469:BACH1;ENSG00000156273:ENST00000399921:exon_30714720_30718469:BACH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 33044408 A/G 1 30 30 60 13.8739569860474 16.1260430139526 -2.2520860279053 A:G A G 10 0.537534767131755 0.60546995959549 ENSG00000156304:ENST00000435228:exon_33043313_33044667:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000419806:exon_33043313_33044667:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000434667:exon_33043313_33044667:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000286835:exon_33043346_33044667:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000399804:exon_33043346_33044667:SFRS15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 33068962 T/C 1 17 16 33 7.86190895876017 8.60055627410808 -0.738647315347913 T:C T C 10 0.537534767131755 0.862168191265843 ENSG00000156304:ENST00000435228:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000419806:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000434667:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000286835:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000399804:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000467731:exon_33068882_33069049:SFRS15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 33068965 G/A 1 16 18 34 7.39944372589192 9.67562580837159 -2.27618208247967 A:G G A 10 0.537534767131755 0.492998675593706 ENSG00000156304:ENST00000435228:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000419806:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000434667:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000286835:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000399804:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000467731:exon_33068882_33069049:SFRS15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 34614250 T/C 1 19 8 27 8.78683942449666 4.30027813705404 4.48656128744262 T:C T C 10 0.537534767131755 0.120983959944011 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 19 9 28 8.78683942449666 4.83781290418579 3.94902652031086 T:G T G 10 0.537534767131755 0.183784224314788 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 34883618 T/C 1 44 37 81 20.3484702462028 19.8887863838749 0.459683862327847 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000159131:ENST00000414353:exon_34883559_34883664:GART;ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34883559_34883765:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34883559_34883765:GART HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 34924243 T/C 1 99 96 195 45.7840580539563 51.6033376446485 -5.81927959069222 T:C T C 10 0.537534767131755 0.429732567983977 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 34925689 G/A 1 126 100 226 58.2706193413989 53.7534767131755 4.51714262822338 A:G G A 10 0.537534767131755 0.593674224580596 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 34926043 G/A 1 64 86 150 29.5977749035677 46.2279899733309 -16.6302150697632 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0068276835170809 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 81 70 151 37.4596838623279 37.6274336992228 -0.167749836894998 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 12 40 52 5.54958279441894 21.5013906852702 -15.9518078908513 T:C T C 10 0.537534767131755 9.07053434049585e-06 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 35890409 C/T 1 6 10 16 2.77479139720947 5.37534767131755 -2.60055627410808 T:C C T 10 0.537534767131755 0.217010442931191 ENSG00000159200:ENST00000487990:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000313806:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000489903:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381132:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000399272:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000481448:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000482533:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381135:exon_35888788_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000443408:exon_35888788_35890554:RCAN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 37759957 C/T 1 19 17 36 8.78683942449666 9.13809104123983 -0.351251616743179 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000159259:ENST00000314103:exon_37759896_37760028:CHAF1B;ENSG00000159259:ENST00000480486:exon_37759896_37760028:CHAF1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 38126528 G/A 0 16 0 16 7.39944372589192 0 7.39944372589192 G G 10 0.537534767131755 5.29632023122255e-05 ENSG00000159267:ENST00000336648:exon_38123493_38126718:HLCS;ENSG00000159267:ENST00000399120:exon_38123493_38126718:HLCS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 38568009 G/C 1 40 64 104 18.4986093147298 34.4022250964323 -15.9036157817025 C:G G C 10 0.537534767131755 0.00215824110599362 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 40191431 T/G 1 13 12 25 6.01204802728719 6.45041720558106 -0.438369178293874 T:G T G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 40191638 A/G 1 4 9 13 1.84986093147298 4.83781290418579 -2.98795197271281 A:G A G 10 0.537534767131755 0.161862439396256 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 40768856 G/T 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 T:G G T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000182093:ENST00000333781:exon_40768792_40769815:WRB;ENSG00000182093:ENST00000398753:exon_40768792_40769042:WRB;ENSG00000182093:ENST00000380708:exon_40768792_40769815:WRB;ENSG00000182093:ENST00000466787:exon_40768792_40769180:WRB;ENSG00000182093:ENST00000490860:exon_40768792_40769030:WRB;ENSG00000182093:ENST00000417111:exon_40768792_40769081:WRB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 42778676 G/A 1 72 36 108 33.2974967665136 19.3512516167432 13.9462451497705 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00687791785289968 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42778671_42778925:MX2;ENSG00000183486:ENST00000482953:exon_42778671_42778925:MX2;ENSG00000183486:ENST00000481838:exon_42778671_42778925:MX2;ENSG00000183486:ENST00000398632:exon_42778671_42778925:MX2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 353 418 771 163.25022720249 224.689532661074 -61.4393054585831 A:G G A 10 0.537534767131755 1.01375005055022e-05 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 42821113 T/C 1 309 253 562 142.901756956288 135.996296084334 6.90546087195372 A:T:C T C 10 0.537534767131755 0.582431805556550 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42821064_42821712:MX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 290 359 649 134.114917531791 192.9749814003 -58.860063868509 A:T:G A G 10 0.537534767131755 3.91537156128688e-06 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 43236176 G/A 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43236061_43236192:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000495217:exon_43236061_43236192:PRDM15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 43256252 C/T 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43256222_43256316:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43256222_43256316:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43256222_43256316:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43256222_43256316:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43256222_43256316:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43256222_43256316:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43256222_43256316:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43256222_43256316:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43256222_43256316:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000489661:exon_43256222_43256316:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000496124:exon_43256222_43256316:PRDM15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 45168884 G/A 1 82 57 139 37.9221490951961 30.63948172651 7.28266736868606 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.233980474939174 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398085:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45168876_45168961:PDXK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 47 47 94 21.7358659448075 25.2641340551925 -3.52826811038496 T:C C T 10 0.537534767131755 0.47106080032788 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 21 46271460 T/C 1 44 48 92 20.3484702462028 25.8016688223242 -5.45319857612146 T:C T C 10 0.537534767131755 0.29574059711408 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 17589297 G/A 1 11 19 30 5.08711756155069 10.2131605755033 -5.12604301395265 A:G G A 10 0.537534767131755 0.067942965012914 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 17589794 C/A 1 14 15 29 6.47451326015543 8.06302150697632 -1.58850824682089 A:C C A 10 0.537534767131755 0.580849764907506 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 17662793 A/G 1 19 17 36 8.78683942449666 9.13809104123983 -0.351251616743179 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17662710_17662912:CECR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 17669306 T/C 1 25 26 51 11.5616308217061 13.9759039454256 -2.4142731237195 T:C T C 10 0.537534767131755 0.574793601899611 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000469063:exon_17669229_17669617:CECR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 17690430 C/G 1 17 13 30 7.86190895876017 6.98795197271281 0.873956986047352 C:G C G 10 0.537534767131755 0.85537468378439 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17690246_17690575:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17690246_17690779:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17690246_17690614:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17690246_17690613:CECR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 18300775 G/A 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000093100:ENST00000252134:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000425874:exon_18300077_18301895:MICAL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 18304821 G/A 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000093100:ENST00000252134:exon_18304796_18304936:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18304796_18304936:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000425874:exon_18304796_18304936:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000498573:exon_18304796_18304936:MICAL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 18354766 C/T 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 T:C C T 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000429452:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000400561:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000444520:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000495076:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000414725:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000383094:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000207726:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000461307:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000462645:exon_18354603_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000465886:exon_18354696_18354789:MICAL3;ENSG00000243156:ENST00000498345:exon_18354700_18354789:MICAL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 18609642 C/T 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 T:C C T 10 0.537534767131755 0.241009480668847 ENSG00000215193:ENST00000474897:exon_18609121_18609801:PEX26;ENSG00000183785:ENST00000316027:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000330423:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000416740:exon_18609121_18609801:TUBA8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 19026435 T/C 1 7 16 23 3.23725663007772 8.60055627410808 -5.36329964403036 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0345350413095283 ENSG00000070413:ENST00000263196:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000389262:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000467659:exon_19025350_19026634:DGCR2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 19132061 C/T 1 16 9 25 7.39944372589192 4.83781290418579 2.56163082170613 T:C C T 10 0.537534767131755 0.324259669272264 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19132019_19132197:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19132019_19132197:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19131570_19132146:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000469466:exon_19131637_19132172:DGCR14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 19365538 C/T 1 21 22 43 9.71176989023315 11.8257648768986 -2.11399498666546 T:C C T 10 0.537534767131755 0.543542434675425 ENSG00000100084:ENST00000340170:exon_19365392_19365589:HIRA;ENSG00000100084:ENST00000263208:exon_19365392_19365589:HIRA;ENSG00000242259:ENST00000509549:exon_19365392_19365589:C22orf39 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 19789541 A/C 1 38 31 69 17.5736788489933 16.6635777810844 0.910101067908908 A:C A C 10 0.537534767131755 0.90406614155943 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000481086:exon_19789522_19789739:GNB1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 19951804 G/A 1 117 118 235 54.1084322455847 63.4291025215471 -9.32067027596242 A:G G A 10 0.537534767131755 0.239024167683030 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951691_19953168:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951633_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951691_19951823:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951691_19951822:COMT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 20307256 G/A 1 33 26 59 15.2613526846521 13.9759039454256 1.28544873922646 A:G G A 10 0.537534767131755 0.794698520800986 ENSG00000128185:ENST00000248879:exon_20307162_20307322:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000405465:exon_20307162_20307309:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000443409:exon_20307162_20307322:DGCR6L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 20761063 G/A 1 6 14 20 2.77479139720947 7.52548673984457 -4.7506953426351 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0422683308370645 ENSG00000185252:ENST00000400451:exon_20759667_20761968:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000403682:exon_20759667_20761697:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000357502:exon_20759667_20761971:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000493734:exon_20759667_20761970:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000356671:exon_20759667_20762752:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000437275:exon_20759667_20762745:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000405993:exon_20759667_20761258:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000476678:exon_20759667_20761683:ZNF74 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 21141300 T/C 0 17 0 17 7.86190895876017 0 7.86190895876017 T T 10 0.537534767131755 2.81409160202432e-05 ENSG00000099937:ENST00000215727:exon_21141163_21142008:SERPIND1;ENSG00000099937:ENST00000406799:exon_21141163_21141520:SERPIND1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 21167787 G/A 1 24 23 47 11.0991655888379 12.3632996440304 -1.26413405519248 A:G G A 10 0.537534767131755 0.770600413711711 ENSG00000241973:ENST00000255882:exon_21167646_21167794:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000437178:exon_21167646_21167794:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000485963:exon_21167646_21167794:PI4KA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 21213380 C/T 1 25 19 44 11.5616308217061 10.2131605755033 1.34847024620278 T:C C T 10 0.537534767131755 0.763143132347552 ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 21213416 A/G 1 40 32 72 18.4986093147298 17.2011125482162 1.29749676651364 A:G A G 10 0.537534767131755 0.813637101897296 ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 21354970 C/G 1 63 45 108 29.1353096706994 24.189064520929 4.94624514977047 T:C:G C G 10 0.537534767131755 0.385278827625026 ENSG00000184436:ENST00000498406:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000215742:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000471073:exon_21354936_21356084:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000438917:exon_21354936_21355019:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000399133:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000476667:exon_21354936_21355700:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000466670:exon_21354936_21355700:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000488975:exon_21354936_21355018:THAP7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 22287862 G/A 1 8 2 10 3.69972186294596 1.07506953426351 2.62465232868245 A:G G A 10 0.537534767131755 0.119280745126671 ENSG00000100034:ENST00000406981:exon_22287763_22287951:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000263212:exon_22287763_22287951:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000407142:exon_22287763_22287951:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000397495:exon_22287763_22287951:PPM1F;ENSG00000100034:ENST00000445205:exon_22287763_22287951:PPM1F HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 22318538 C/T 1 17 16 33 7.86190895876017 8.60055627410808 -0.738647315347913 T:C C T 10 0.537534767131755 0.862168191265843 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 22318671 G/A 1 26 15 41 12.0240960545744 8.06302150697632 3.96107454759805 A:G G A 10 0.537534767131755 0.272838954623041 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 22330082 T/C 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 T:C T C 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22330012_22330087:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449517:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000424393:exon_22330012_22330116:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437929:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000430142:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000489581:exon_22330012_22330168:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000456075:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449704:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000442653:exon_22330012_22330341:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437103:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000434517:exon_22330018_22330179:TOP3B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 22550458 T/G 1 3 1442 1445 1.38739569860474 775.125134203991 -773.737738505386 T:G T G 10 0.537534767131755 0 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 22550465 A/G 1 2 1431 1433 0.92493046573649 769.212251765541 -768.287321299805 A:G A G 10 0.537534767131755 0 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 23627369 A/G 1 2 10 12 0.92493046573649 5.37534767131755 -4.45041720558106 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0165545198603437 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 24036563 G/A 1 11 13 24 5.08711756155069 6.98795197271281 -1.90083441116212 A:G G A 10 0.537534767131755 0.540217717608162 ENSG00000159496:ENST00000441897:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000401461:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000290691:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382833:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382834:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000382831:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000460003:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000467354:exon_24036534_24036637:RGL4;ENSG00000159496:ENST00000423392:exon_24036534_24036637:RGL4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 187 169 356 86.4809985463618 90.8433756452666 -4.36237709890477 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.670767985739432 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 24468386 G/A 1 12 4 16 5.54958279441894 2.15013906852702 3.39944372589192 A:G G A 10 0.537534767131755 0.130562570499175 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24468304_24468460:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24468304_24468460:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24468304_24468460:CABIN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 24564477 C/T 1 42 24 66 19.4235397804663 12.9008344111621 6.52270536930417 T:C C T 10 0.537534767131755 0.110364274491794 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000403176:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000337989:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000485008:exon_24564415_24564489:CABIN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 24717518 G/A 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 A:G G A 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000100014:ENST00000398280:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000437398:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000421374:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000314328:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24717256_24718886:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000440893:exon_24717256_24717656:SPECC1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 49 28 77 22.660796410544 15.0509734796891 7.60982293085487 A:T:C T C 10 0.537534767131755 0.0870751945596103 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 29196306 G/A 1 273 254 527 126.253008573031 136.533830851466 -10.2808222784349 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.382375536205644 ENSG00000100219:ENST00000216037:exon_29196286_29196585:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000403532:exon_29196286_29196546:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000344347:exon_29196286_29196544:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000415306:exon_29196286_29196535:XBP1;ENSG00000100219:ENST00000482720:exon_29196286_29196557:XBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 29656389 G/T 1 20 29 49 9.2493046573649 15.5885082468209 -6.33920358945599 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0848566945066893 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29656315_29656602:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000413137:exon_29656315_29656602:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29656315_29656602:RHBDD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 29925221 C/T 1 18 17 35 8.32437419162841 9.13809104123983 -0.813716849611422 T:C C T 10 0.537534767131755 0.865875387186721 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29924926_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000484924:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000443089:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000492707:exon_29925151_29925228:THOC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 30975861 C/T 1 95 94 189 43.9341971224833 50.528268110385 -6.59407098790169 T:C C T 10 0.537534767131755 0.343739512198858 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30975738_30975910:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30974824_30976061:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30975738_30975922:PES1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 18 23 41 8.32437419162841 12.3632996440304 -4.03892545240195 T:C T C 10 0.537534767131755 0.214080933634143 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 31342376 G/C 1 8 8 16 3.69972186294596 4.30027813705404 -0.600556274108079 C:G G C 10 0.537534767131755 0.806072821048815 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000476152:exon_31342328_31342436:MORC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 31486099 G/A 1 21 9 30 9.71176989023315 4.83781290418579 4.87395698604735 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0981287638681262 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31486094_31486166:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31486094_31486166:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31486094_31486166:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31486094_31486166:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31486094_31486166:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31486094_31486166:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31486094_31486166:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31486094_31486166:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31486094_31486166:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31486094_31486166:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31486094_31486166:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31486094_31486166:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000466272:exon_31486094_31486166:SMTN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 31663842 C/G 1 8 11 19 3.69972186294596 5.91288243844931 -2.21316057550334 C:G C G 10 0.537534767131755 0.361207681506224 ENSG00000182541:ENST00000444929:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000331728:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000333611:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31663762_31663893:LIMK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 31741067 G/A 1 31 33 64 14.3364222189156 17.7386473153479 -3.40222509643232 A:G G A 10 0.537534767131755 0.45229530774979 ENSG00000100105:ENST00000266269:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000405309:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000351933:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000440325:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000215919:exon_31740318_31741762:PATZ1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 31859859 A/G 1 24 17 41 11.0991655888379 9.13809104123983 1.96107454759805 A:G A G 10 0.537534767131755 0.639094020728528 ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000423097:exon_31859686_31859953:EIF4ENIF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 32017296 A/G 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000241878:ENST00000473770:exon_32016982_32017458:PISD;ENSG00000241878:ENST00000474017:exon_32016982_32017871:PISD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 32194581 A/G 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 A:G A G 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000100150:ENST00000400242:exon_32194568_32194642:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382109:exon_32194568_32194642:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000400249:exon_32194568_32194642:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000266091:exon_32194568_32194642:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000400246:exon_32194568_32194642:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382105:exon_32194568_32194642:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382112:exon_32194568_32194642:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382111:exon_32194568_32194642:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000400248:exon_32194568_32194642:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000469974:exon_32194568_32194642:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000473802:exon_32194568_32194642:DEPDC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 32217539 C/T 1 9 4 13 4.16218709581421 2.15013906852702 2.01204802728719 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.405252718730477 ENSG00000100150:ENST00000400249:exon_32217488_32217623:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000266091:exon_32217488_32217623:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000400246:exon_32217488_32217623:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382112:exon_32217488_32217623:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382111:exon_32217488_32217623:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000400248:exon_32217488_32217623:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000433147:exon_32217488_32217623:DEPDC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 34022284 G/A 0 0 9 9 0 4.83781290418579 -4.83781290418579 A G A 10 0.537534767131755 0.000967635517319827 ENSG00000133424:ENST00000452586:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000354992:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000337431:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000397394:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000402320:exon_34022228_34022310:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000437602:exon_34022228_34022310:LARGE HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 35660875 G/T 1 20 17 37 9.2493046573649 9.13809104123983 0.111213616125067 T:G G T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 35802661 C/G 1 113 111 224 52.2585713141117 59.6663591516248 -7.40778783751311 C:G C G 10 0.537534767131755 0.348249462668974 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444582:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000416905:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444778:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35802546_35802718:MCM5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 35815880 G/A 1 155 159 314 71.682111094578 85.468027973949 -13.7859168793711 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.126475547779515 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000402457:exon_35815877_35816005:MCM5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 36537763 C/T 1 36 59 95 16.6487483832568 31.7145512607735 -15.0658028775167 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00265306161325763 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 36661330 G/A 1 48 30 78 22.1983311776758 16.1260430139526 6.07228816372311 A:G G A 10 0.537534767131755 0.1747842138651 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36661197_36661361:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 36661536 C/A 1 73 51 124 33.7599619993819 27.4142731237195 6.34568887566238 A:C C A 10 0.537534767131755 0.28002448307348 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 36661566 G/A 1 75 47 122 34.6848924651184 25.2641340551925 9.4207584099259 A:G G A 10 0.537534767131755 0.101845300283948 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 36661646 G/A 1 51 40 91 23.5857268762805 21.5013906852702 2.0843361910103 A:G G A 10 0.537534767131755 0.675718653601503 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 36661842 G/A 1 54 35 89 24.9731225748852 18.8137168496114 6.15940572527381 A:G G A 10 0.537534767131755 0.203132996388389 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 308 277 585 142.439291723419 148.897130495496 -6.45783877207666 T:C T C 10 0.537534767131755 0.618842905841728 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 324 229 553 149.838735449311 123.095461673172 26.7432737761395 A:C:G C A 10 0.537534767131755 0.0237501516193108 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 37524640 G/A 1 168 118 286 77.6941591218652 63.4291025215471 14.2650566003181 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.0968011187192626 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37524133_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37524562_37524888:IL2RB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 37578214 T/C 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000133466:ENST00000397110:exon_37578192_37578775:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000337843:exon_37576207_37578775:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000470655:exon_37578192_37578622:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000493023:exon_37576211_37578775:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000434784:exon_37578214_37578775:C1QTNF6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 37578579 C/T 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 T:C C T 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000133466:ENST00000397110:exon_37578192_37578775:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000337843:exon_37576207_37578775:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000470655:exon_37578192_37578622:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000493023:exon_37576211_37578775:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000434784:exon_37578214_37578775:C1QTNF6;ENSG00000133466:ENST00000255836:exon_37578228_37578622:C1QTNF6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 38046695 C/A 1 43 42 85 19.8860050133345 22.5764602195337 -2.69045520619917 A:C C A 10 0.537534767131755 0.58746032124817 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 14 9 23 6.47451326015543 4.83781290418579 1.63670035596964 T:C C T 10 0.537534767131755 0.536918781286691 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 13 15 28 6.01204802728719 8.06302150697632 -2.05097347968914 A:G G A 10 0.537534767131755 0.454605168209296 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 28 17 45 12.9490265203109 9.13809104123983 3.81093547907103 A:C C A 10 0.537534767131755 0.296249081187902 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 24 18 42 11.0991655888379 9.67562580837159 1.42353978046629 T:C T C 10 0.537534767131755 0.757526619731723 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 39477566 A/G 1 129 94 223 59.6580150400036 50.528268110385 9.12974692961865 A:G A G 10 0.537534767131755 0.227299140412726 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39477476_39477692:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39477476_39478684:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39477476_39479219:APOBEC3G HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 21 7 28 9.71176989023315 3.76274336992228 5.94902652031086 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0351555844620455 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 40 9 49 18.4986093147298 4.83781290418579 13.660796410544 C:G G C 10 0.537534767131755 7.2811945161702e-05 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 26 6 32 12.0240960545744 3.22520860279053 8.79888745178384 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0020553623937489 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 39497452 A/G 0 11 0 11 5.08711756155069 0 5.08711756155069 A A 10 0.537534767131755 0.00128956245765823 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 39497454 G/C 0 11 0 11 5.08711756155069 0 5.08711756155069 G G 10 0.537534767131755 0.00128956245765823 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 28 15 43 12.9490265203109 8.06302150697632 4.88600501333454 C:G G C 10 0.537534767131755 0.168286171091427 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 39709009 G/A 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 A:G G A 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000100316:ENST00000473638:exon_39708889_39709315:RPL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 39711351 A/G 1 9 12 21 4.16218709581421 6.45041720558106 -2.28823010976685 A:G A G 10 0.537534767131755 0.383405862328562 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 39918046 T/C 1 710 668 1378 328.350315336454 359.073224444012 -30.7229091075583 T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.0993731614521232 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917778_39918688:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39917778_39918688:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917778_39918691:ATF4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 41195082 G/A 1 14 23 37 6.47451326015543 12.3632996440304 -5.88878638387493 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0684765260749639 ENSG00000100372:ENST00000263255:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000491545:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000435456:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000420970:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000458600:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000443810:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000412879:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000426396:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000434193:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000449676:exon_41195027_41195087:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000434185:exon_41195027_41195087:SLC25A17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 41548008 A/G 1 26 26 52 12.0240960545744 13.9759039454256 -1.95180789085126 A:G A G 10 0.537534767131755 0.676938439103836 ENSG00000100393:ENST00000263253:exon_41547837_41548016:EP300 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 41613188 C/T 1 31 15 46 14.3364222189156 8.06302150697632 6.27340071193927 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0754989003206936 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41613127_41615540:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000449635:exon_41613127_41613206:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41613127_41613206:L3MBTL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 57 58 115 26.36051827349 31.1770164936418 -4.81649822015182 C:G C G 10 0.537534767131755 0.40028715036193 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 41911525 C/T 1 95 97 192 43.9341971224833 52.1408724117802 -8.20667528929695 T:C C T 10 0.537534767131755 0.247170024117575 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000478010:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000481310:exon_41911517_41911539:ACO2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 42059768 G/T 1 354 311 665 163.712692435359 167.173312577976 -3.46062014261705 T:G G T 10 0.537534767131755 0.815527405731043 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 172 198 370 79.5440200533381 106.431883892087 -26.8878638387493 C:G G C 10 0.537534767131755 0.00565944527727531 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 42293140 G/C 1 99 105 204 45.7840580539563 56.4411505488343 -10.657092494878 C:G G C 10 0.537534767131755 0.140597204276311 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000463741:exon_42293072_42293165:SREBF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 42294751 G/C 1 143 130 273 66.132528300159 69.8795197271281 -3.7469914269691 C:G G C 10 0.537534767131755 0.671123736549645 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42294653_42294785:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42294653_42294785:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42294653_42294785:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42294653_42294785:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42294653_42294785:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000463741:exon_42294653_42295192:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000435061:exon_42294680_42294785:SREBF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 42300948 C/A 1 180 201 381 83.2437419162841 108.044488193483 -24.8007462771986 A:T:C C A 10 0.537534767131755 0.0117470703792636 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000435061:exon_42300867_42300977:SREBF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 42341308 A/G 1 95 85 180 43.9341971224833 45.6904552061992 -1.7562580837159 A:G A G 10 0.537534767131755 0.822729394134133 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42340925_42341308:CENPM HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 42341934 A/G 1 99 92 191 45.7840580539563 49.4531985761215 -3.6691405221652 A:G A G 10 0.537534767131755 0.611939950911241 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42341917_42342009:CENPM HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 42343091 G/A 1 54 56 110 24.9731225748852 30.1019469593783 -5.12882438449305 A:G G A 10 0.537534767131755 0.340064949058485 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42343024_42343168:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42343024_42343140:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42343024_42343148:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42343024_42343155:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000460824:exon_42343024_42343137:CENPM HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 42456234 T/C 1 53 46 99 24.510657342017 24.7265992880607 -0.215941946043742 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42454358_42456417:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42455800_42456417:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42455806_42456417:NAGA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 39 31 70 18.0361440818616 16.6635777810844 1.37256630077716 T:C C T 10 0.537534767131755 0.81089685888198 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 80 80 160 36.9972186294596 43.0027813705404 -6.00556274108079 A:G G A 10 0.537534767131755 0.342763850710564 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 42538029 A/G 1 4 7 11 1.84986093147298 3.76274336992228 -1.9128824384493 A:G A G 10 0.537534767131755 0.365659915960336 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 46 47 93 21.2734007119393 25.2641340551925 -3.99073334325321 T:C C T 10 0.537534767131755 0.407914830444996 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 59 46 105 27.2854487392265 24.7265992880607 2.55884945116573 C:G G C 10 0.537534767131755 0.626304902274678 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 23 25 48 10.6367003559696 13.4383691782939 -2.80166882232424 C:G G C 10 0.537534767131755 0.470116802236024 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 43575935 C/T 1 71 69 140 32.8350315336454 37.0898989320911 -4.2548673984457 T:C C T 10 0.537534767131755 0.498162831420149 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43575847_43576006:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43575847_43576006:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43575847_43576006:TTLL12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 43576904 G/A 1 54 63 117 24.9731225748852 33.8646903293006 -8.89156775441533 A:G G A 10 0.537534767131755 0.114676023212490 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000357017:exon_43576762_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43576748_43576946:TTLL12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 44368122 A/G 1 18 16 34 8.32437419162841 8.60055627410808 -0.276182082479668 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 35 49 84 16.1862831503886 26.339203589456 -10.1529204390674 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0285582360810039 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 44386281 C/T 1 90 103 193 41.6218709581421 55.3660810145708 -13.7442100564287 T:C C T 10 0.537534767131755 0.051181220266155 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000494795:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000465768:exon_44386208_44386286:SAMM50 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 114 127 241 52.7210365469799 68.2669154257329 -15.5458788787529 A:C A C 10 0.537534767131755 0.0453919748633807 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 45128232 T/C 1 11 11 22 5.08711756155069 5.91288243844931 -0.82576487689861 T:C T C 10 0.537534767131755 0.831602284580484 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000457960:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000241484:ENST00000517296:exon_45128131_45128271:ARHGAP8;ENSG00000248405:ENST00000352766:exon_45128131_45128271:PRR5-ARHGAP8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 45132704 T/C 1 23 35 58 10.6367003559696 18.8137168496114 -8.17701649364179 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0349519120945326 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45132652_45132754:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 45132785 T/C 1 20 31 51 9.2493046573649 16.6635777810844 -7.4142731237195 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0483001284737233 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 47116905 G/A 1 16 16 32 7.39944372589192 8.60055627410808 -1.20111254821616 A:G G A 10 0.537534767131755 0.724666023024225 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47116799_47116912:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47116799_47116912:CERK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50297453 G/A 1 28 31 59 12.9490265203109 16.6635777810844 -3.71455126077354 A:G G A 10 0.537534767131755 0.361962660881855 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50296867_50297714:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50296902_50297642:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50297298_50297527:ALG12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50297591 G/A 1 35 27 62 16.1862831503886 14.5134387125574 1.67284443783119 A:G G A 10 0.537534767131755 0.703926005573046 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50296867_50297714:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50296902_50297642:ALG12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50354819 C/A 1 178 149 327 82.3188114505476 80.0926803026315 2.22613114791612 A:C C A 10 0.537534767131755 0.824592418877519 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50354773_50354882:PIM3;ENSG00000198355:ENST00000467480:exon_50354416_50354882:PIM3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 80 74 154 36.9972186294596 39.7775727677499 -2.78035413829026 C:G G C 10 0.537534767131755 0.686437899968051 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50719976 C/T 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719789_50720171:PLXNB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50720622 C/T 1 34 35 69 15.7238179175203 18.8137168496114 -3.08989893209109 T:C C T 10 0.537534767131755 0.470943831791945 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720613_50720991:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720613_50720742:PLXNB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50722134 T/C 1 46 35 81 21.2734007119393 18.8137168496114 2.45968386232785 T:C T C 10 0.537534767131755 0.65612162666766 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50728062 T/C 1 26 17 43 12.0240960545744 9.13809104123983 2.88600501333454 T:C T C 10 0.537534767131755 0.445296663275039 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000414275:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000432455:exon_50727946_50729026:PLXNB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 103 63 166 47.6339189854292 33.8646903293006 13.7692286561287 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0353744510224927 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50869692 G/C 1 19 19 38 8.78683942449666 10.2131605755033 -1.42632115100669 C:G G C 10 0.537534767131755 0.745416232968685 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50869602_50869811:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50869602_50869811:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50869602_50869811:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50869602_50869811:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50869602_50869811:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50869602_50869811:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50869594_50869811:PPP6R2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50876662 T/G 1 36 31 67 16.6487483832568 16.6635777810844 -0.0148293978275795 T:G T G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50876603_50876727:PPP6R2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 78 107 185 36.0722881637231 57.5162200830978 -21.4439319193747 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00188194029409787 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50941985 T/C 1 63 72 135 29.1353096706994 38.7025032334864 -9.56719356278692 T:C T C 10 0.537534767131755 0.101602848660614 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 40 41 81 18.4986093147298 22.038925452402 -3.54031613767215 A:G G A 10 0.537534767131755 0.437674569087394 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 32 42 74 14.7988874517838 22.5764602195337 -7.77757276774987 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0800476456709438 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 120 88 208 55.4958279441894 47.3030595075944 8.19276843659496 T:G T G 10 0.537534767131755 0.266357802486349 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 63 51 114 29.1353096706994 27.4142731237195 1.72103654697993 C:G C G 10 0.537534767131755 0.778640320051558 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 50964236 G/A 1 189 111 300 87.4059290120983 59.6663591516248 27.7395698604735 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00141279943839497 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 51011371 C/G 1 6 2 8 2.77479139720947 1.07506953426351 1.69972186294596 C:G C G 10 0.537534767131755 0.300105198743785 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000475238:exon_51011304_51011529:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 51011470 G/A 1 11 5 16 5.08711756155069 2.68767383565877 2.39944372589192 A:G G A 10 0.537534767131755 0.317045039600351 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000475238:exon_51011304_51011529:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 22 51064039 G/C 1 39 30 69 18.0361440818616 16.1260430139526 1.91010106790891 C:G G C 10 0.537534767131755 0.717625522534943 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 4712413 G/A 1 10 16 26 4.62465232868245 8.60055627410808 -3.97590394542563 A:G G A 10 0.537534767131755 0.167381271298725 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4712413_4712610:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000477577:exon_4712413_4712610:ITPR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 4716886 G/A 1 9 9 18 4.16218709581421 4.83781290418579 -0.675625808371588 A:G G A 10 0.537534767131755 0.815602186334409 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4716752_4716905:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4716752_4716905:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4716752_4716905:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4716752_4716932:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4716752_4716905:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4716752_4716932:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4716752_4716932:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4716752_4716932:ITPR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 4842231 C/T 1 35 30 65 16.1862831503886 16.1260430139526 0.060240136435926 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000467545:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000490572:exon_4842109_4842284:ITPR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 9512198 C/T 1 43 37 80 19.8860050133345 19.8887863838749 -0.00278137054039718 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000168137:ENST00000402198:exon_9512143_9512613:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000402466:exon_9512143_9512613:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000406341:exon_9512143_9512613:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000407969:exon_9512143_9512613:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000302463:exon_9512143_9512613:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000493918:exon_9512143_9512613:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000399686:exon_9512143_9512613:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000413704:exon_9512143_9512613:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000466242:exon_9512143_9512613:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000421188:exon_9512143_9512613:SETD5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 9831424 C/T 1 67 54 121 30.9851706021724 29.0268774251148 1.95829317705765 T:C C T 10 0.537534767131755 0.784623433059118 ENSG00000171148:ENST00000301964:exon_9831397_9831647:TADA3;ENSG00000171148:ENST00000440161:exon_9831397_9831647:TADA3;ENSG00000171148:ENST00000343450:exon_9831397_9831647:TADA3;ENSG00000171148:ENST00000492635:exon_9831387_9831647:TADA3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 9885615 G/C 1 8 11 19 3.69972186294596 5.91288243844931 -2.21316057550334 C:G G C 10 0.537534767131755 0.361207681506224 ENSG00000156990:ENST00000433535:exon_9885574_9885698:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000383820:exon_9885574_9885700:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000287624:exon_9885574_9885678:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000424438:exon_9885409_9885626:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000427174:exon_9885574_9885670:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000484134:exon_9885574_9885700:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000418713:exon_9885574_9885686:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000472381:exon_9885149_9885702:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433972:exon_9885574_9885743:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433555:exon_9885574_9885660:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000451405:exon_9885409_9885679:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000460909:exon_9885574_9885700:RPUSD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 9974809 G/A 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 A:G G A 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000163702:ENST00000383812:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000466046:exon_9974637_9975277:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000295981:exon_9974637_9975304:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000451231:exon_9974637_9975304:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000483582:exon_9974504_9975314:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000494365:exon_9974637_9975300:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000498214:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000403601:exon_9974637_9975305:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000416074:exon_9974637_9975304:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000451271:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000455057:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000413608:exon_9974637_9975300:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000461995:exon_9974637_9974832:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000497387:exon_9974637_9975304:IL17RC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 10067794 A/G 1 9 6 15 4.16218709581421 3.22520860279053 0.936978493023676 A:G A G 10 0.537534767131755 0.797066078642493 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 10067797 T/C 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 T:C T C 10 0.537534767131755 0.593874685143272 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 24 13 37 11.0991655888379 6.98795197271281 4.11121361612507 T:G T G 10 0.537534767131755 0.190401096726678 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 10251340 C/G 1 19 7 26 8.78683942449666 3.76274336992228 5.02409605457437 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0509553127398684 ENSG00000134070:ENST00000256458:exon_10251273_10251376:IRAK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 10302045 C/T 1 41 30 71 18.961074547598 16.1260430139526 2.8350315336454 T:C C T 10 0.537534767131755 0.552536884296701 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 10302056 A/G 1 39 28 67 18.0361440818616 15.0509734796891 2.98517060217242 A:G A G 10 0.537534767131755 0.540498582875945 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 10311939 C/T 1 43 35 78 19.8860050133345 18.8137168496114 1.07228816372311 T:C C T 10 0.537534767131755 0.821499092914497 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 10312507 A/G 1 32 21 53 14.7988874517838 11.2882301097669 3.51065734201699 A:G A G 10 0.537534767131755 0.408764131660531 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 11596302 T/C 1 16 15 31 7.39944372589192 8.06302150697632 -0.663577781084404 T:C T C 10 0.537534767131755 0.858236752595722 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 11596348 C/T 1 10 14 24 4.62465232868245 7.52548673984457 -2.90083441116212 T:C C T 10 0.537534767131755 0.306252553826296 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 12475557 C/T 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 T:C C T 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000132170:ENST00000397010:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000309576:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397015:exon_12475397_12475810:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397012:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397026:exon_12475397_12475838:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397000:exon_12475397_12475715:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000287820:exon_12475397_12475855:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397023:exon_12475397_12475843:PPARG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 12611719 G/A 1 21 31 52 9.71176989023315 16.6635777810844 -6.95180789085126 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0696071771757797 ENSG00000075975:ENST00000170447:exon_12611570_12611751:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000411987:exon_12611570_12611751:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000448482:exon_12611570_12611751:MKRN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 12962074 G/A 1 60 53 113 27.7479139720947 28.489342657983 -0.741428685888312 A:G G A 10 0.537534767131755 0.924959321955285 ENSG00000144711:ENST00000273221:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000435445:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000450726:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000429247:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000452608:exon_12961930_12962096:IQSEC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 127 120 247 58.7330845742671 64.5041720558106 -5.77108748154348 T:C C T 10 0.537534767131755 0.482956292441853 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 75 56 131 34.6848924651184 30.1019469593783 4.5829455057401 T:G G T 10 0.537534767131755 0.431885300234300 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 107 81 188 49.4837799169022 43.5403161376721 5.94346377923007 T:C C T 10 0.537534767131755 0.421198136334372 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 13368741 C/T 1 123 122 245 56.8832236427941 65.5792415900741 -8.69601794727996 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.276359305155427 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 124 104 228 57.3456888756624 55.9036157817025 1.44207309395987 A:G G A 10 0.537534767131755 0.894374867381347 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 13379394 C/G 1 107 82 189 49.4837799169022 44.0778509048039 5.40592901209831 A:C:G C G 10 0.537534767131755 0.465888465499923 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13379337_13379417:NUP210 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 13379400 C/T 1 82 106 188 37.9221490951961 56.978685315966 -19.0565362207699 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00664981956322039 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13379337_13379417:NUP210 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 13383540 A/G 1 106 116 222 49.021314684034 62.3540329872836 -13.3327183032496 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0799674385873793 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13383496_13383623:NUP210 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 13395475 G/C 1 47 59 106 21.7358659448075 31.7145512607735 -9.97868531596603 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0637035955684995 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 13395579 C/A 1 44 46 90 20.3484702462028 24.7265992880607 -4.37812904185795 A:C C A 10 0.537534767131755 0.397953442136244 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 13407556 T/C 1 51 40 91 23.5857268762805 21.5013906852702 2.0843361910103 T:C T C 10 0.537534767131755 0.675718653601503 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13407446_13407591:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13407446_13407591:NUP210 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 13421150 C/T 1 17 26 43 7.86190895876017 13.9759039454256 -6.11399498666546 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0671657559439316 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13421063_13421221:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13421063_13421221:NUP210 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 14193889 C/T 1 26 30 56 12.0240960545744 16.1260430139526 -4.10194695937828 T:C C T 10 0.537534767131755 0.285995069768124 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14193835_14193916:XPC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 14199887 G/A 1 53 29 82 24.510657342017 15.5885082468209 8.92214909519609 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0591060068240436 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 32 17 49 14.7988874517838 9.13809104123983 5.66079641054401 A:G G A 10 0.537534767131755 0.115917950432227 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 15115270 G/T 1 11 12 23 5.08711756155069 6.45041720558106 -1.36329964403036 T:G G T 10 0.537534767131755 0.677013887550826 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15111580_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15115112_15116437:ZFYVE20 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 15311325 A/G 1 9 22 31 4.16218709581421 11.8257648768986 -7.6635777810844 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0064823340712377 ENSG00000131370:ENST00000448619:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000383791:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000426925:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000253688:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000408919:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000366391:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000450625:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000417936:exon_15311220_15311384:SH3BP5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 15737689 G/A 1 16 7 23 7.39944372589192 3.76274336992228 3.63670035596964 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.146568942838849 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15737641_15737738:ANKRD28 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 15737698 T/C 1 15 9 24 6.93697849302368 4.83781290418579 2.09916558883788 T:C T C 10 0.537534767131755 0.420607042022665 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15737641_15737738:ANKRD28 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 15 11 26 6.93697849302368 5.91288243844931 1.02409605457437 C:G C G 10 0.537534767131755 0.84457724361591 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 16327855 T/G 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 T:G T G 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16327849_16327955:OXNAD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 237 268 505 109.604260189774 144.05931759131 -34.4550574015363 A:T:C T C 10 0.537534767131755 0.00237755536575056 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 19992432 G/T 1 14 19 33 6.47451326015543 10.2131605755033 -3.73864731534791 T:G G T 10 0.537534767131755 0.222785253283888 ENSG00000144566:ENST00000273047:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000443878:exon_19992298_19992436:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000412966:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000446547:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000422242:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000476544:exon_19992298_19992717:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000455772:exon_19992298_19992553:RAB5A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 20113830 G/A 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000114166:ENST00000263754:exon_20113825_20113951:KAT2B;ENSG00000114166:ENST00000426228:exon_20113825_20113951:KAT2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 27424718 A/G 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 A:G A G 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000033867:ENST00000419036:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000295736:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000428386:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000425128:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000349751:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000435667:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000388777:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000454389:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000440156:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000457377:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000438530:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437179:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000446700:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000455077:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000445684:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000465487:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437266:exon_27424644_27424741:SLC4A7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 33138549 G/A 1 10 10 20 4.62465232868245 5.37534767131755 -0.750695342635099 A:G G A 10 0.537534767131755 0.824049778597606 ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33138503_33138722:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000482097:exon_33138503_33138610:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000485698:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000498537:exon_33138503_33138634:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000415454:exon_33138503_33138613:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000438227:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000440656:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000436768:exon_33138503_33138694:GLB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 33155782 G/A 1 52 49 101 24.0481921091487 26.339203589456 -2.29101148030725 A:G G A 10 0.537534767131755 0.690165611455175 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33155471_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33155531_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33155546_33156040:CRTAP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 33161898 C/T 1 27 34 61 12.4865612874426 18.2761820824797 -5.78962079503705 T:C C T 10 0.537534767131755 0.15779423727605 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000485310:exon_33161836_33161985:CRTAP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 33434831 G/A 1 12 12 24 5.54958279441894 6.45041720558106 -0.900834411162119 A:G G A 10 0.537534767131755 0.83840612934176 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000492136:exon_33429830_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000466441:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000486388:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000464787:exon_33434804_33434946:UBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 33458266 T/C 1 19 17 36 8.78683942449666 9.13809104123983 -0.351251616743179 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000481761:exon_33458250_33458312:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000418410:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000456378:exon_33458250_33458326:UBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 33557623 T/C 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000163539:ENST00000468888:exon_33557515_33557643:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000399362:exon_33557515_33557643:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000359576:exon_33557515_33557643:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000307312:exon_33557515_33557643:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000480013:exon_33557515_33557643:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000461133:exon_33557515_33557643:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000487553:exon_33557515_33557643:CLASP2;ENSG00000163539:ENST00000476251:exon_33557515_33557643:CLASP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 35 24 59 16.1862831503886 12.9008344111621 3.28544873922646 A:G G A 10 0.537534767131755 0.434608875085522 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 81 68 149 37.4596838623279 36.5523641649593 0.907319697368514 T:C C T 10 0.537534767131755 0.934574160045156 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 88 84 172 40.6969404924056 45.1529204390674 -4.45597994666186 A:G A G 10 0.537534767131755 0.540843048203795 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 37053568 A/G 1 9 10 19 4.16218709581421 5.37534767131755 -1.21316057550334 A:G A G 10 0.537534767131755 0.648761877832002 ENSG00000076242:ENST00000231790:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000457004:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000432299:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000396438:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000456676:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000458205:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000455445:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000435176:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000441265:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000383761:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000421440:exon_37053532_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000447829:exon_37053533_37053590:MLH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 38170810 C/G 1 18 30 48 8.32437419162841 16.1260430139526 -7.80166882232424 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0291679656635758 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000418880:exon_38170781_38170879:ACAA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 39431081 G/A 1 4 12 16 1.84986093147298 6.45041720558106 -4.60055627410808 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0242209614480061 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39430986_39431107:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39430986_39431107:SLC25A38 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 95 29 124 43.9341971224833 15.5885082468209 28.3456888756624 T:C T C 10 0.537534767131755 1.81053955040741e-07 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 42251263 C/T 1 41 27 68 18.961074547598 14.5134387125574 4.44763583504066 T:C C T 10 0.537534767131755 0.330724625302431 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 21 26 47 9.71176989023315 13.9759039454256 -4.26413405519248 T:C C T 10 0.537534767131755 0.242529784911058 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 24 24 48 11.0991655888379 12.9008344111621 -1.80166882232424 A:G A G 10 0.537534767131755 0.664908489546432 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 42679497 C/T 1 40 38 78 18.4986093147298 20.4263211510067 -1.92771183627689 T:C C T 10 0.537534767131755 0.73362082596045 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 42679777 T/G 1 35 33 68 16.1862831503886 17.7386473153479 -1.55236416495934 T:G T G 10 0.537534767131755 0.716872603930542 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 42680000 C/T 1 61 48 109 28.2103792049629 25.8016688223242 2.40871038263871 T:C C T 10 0.537534767131755 0.701087293844406 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 44692564 C/G 1 8 5 13 3.69972186294596 2.68767383565877 1.01204802728719 C:G C G 10 0.537534767131755 0.782310374824685 ENSG00000169981:ENST00000396056:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000415571:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000432115:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000296092:exon_44692433_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000399560:exon_44692436_44692751:ZNF35;ENSG00000169981:ENST00000453164:exon_44692433_44692751:ZNF35 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 44856499 A/G 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:G A G 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000481166:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000429516:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44856463_44856568:KIF15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 44867592 C/G 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 C:G C G 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44867531_44867681:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44867531_44867681:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44867531_44867681:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000481166:exon_44867531_44867681:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000429516:exon_44867531_44867681:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44867531_44867681:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44867531_44867681:KIF15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 44872450 A/G 1 3 9 12 1.38739569860474 4.83781290418579 -3.45041720558106 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0780478267108081 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44872388_44872510:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44872388_44872510:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44872388_44872510:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000429516:exon_44872388_44872510:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44872388_44872510:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44872388_44872510:KIF15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 44882586 C/G 1 12 7 19 5.54958279441894 3.76274336992228 1.78683942449666 C:G C G 10 0.537534767131755 0.493873626093778 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44882566_44882730:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44882566_44882730:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44882566_44882730:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000429516:exon_44882566_44882730:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44882566_44882730:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44882566_44882730:KIF15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 4 10 14 1.84986093147298 5.37534767131755 -3.52548673984457 A:C:G C A 10 0.537534767131755 0.0654879889218514 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 44893288 A/C 1 17 10 27 7.86190895876017 5.37534767131755 2.48656128744262 A:C A C 10 0.537534767131755 0.440804629998576 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44893279_44893444:KIF15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 57 63 120 26.36051827349 33.8646903293006 -7.5041720558106 C:G G C 10 0.537534767131755 0.171087820063145 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 47452118 G/A 1 19 10 29 8.78683942449666 5.37534767131755 3.41149175317911 A:G G A 10 0.537534767131755 0.263942639118946 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 26 39 65 12.0240960545744 20.9638559181384 -8.93975986356407 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0336816442496122 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 47459679 C/T 1 25 36 61 11.5616308217061 19.3512516167432 -7.78962079503705 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0535801669984698 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47459624_47459739:SCAP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 47702865 C/T 1 39 53 92 18.0361440818616 28.489342657983 -10.4531985761215 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0359573295419430 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47702784_47702945:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47702784_47702945:SMARCC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 37 45 82 17.1112136161251 24.189064520929 -7.07785090480391 T:C T C 10 0.537534767131755 0.122072772933614 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 48474024 C/T 1 30 30 60 13.8739569860474 16.1260430139526 -2.2520860279053 T:C C T 10 0.537534767131755 0.60546995959549 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 49343175 G/A 1 31 22 53 14.3364222189156 11.8257648768986 2.51065734201699 A:G G A 10 0.537534767131755 0.582059602256385 ENSG00000114316:ENST00000351842:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000265560:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000485450:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000431357:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000486549:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000488520:exon_49343148_49343321:USP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 49362369 C/T 1 25 20 45 11.5616308217061 10.7506953426351 0.810935479071027 T:C C T 10 0.537534767131755 0.881646646503372 ENSG00000114316:ENST00000351842:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000265560:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000416417:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000415188:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000464168:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000491791:exon_49362327_49362472:USP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 49455330 C/T 1 7 8 15 3.23725663007772 4.30027813705404 -1.06302150697632 T:C C T 10 0.537534767131755 0.61360765893613 ENSG00000145020:ENST00000465925:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000427987:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000458307:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000476226:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000273588:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000454938:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000395338:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000476127:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000399379:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000473163:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000430521:exon_49455328_49455406:AMT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 49466594 G/A 1 14 8 22 6.47451326015543 4.30027813705404 2.17423512310139 A:G G A 10 0.537534767131755 0.398340723938621 ENSG00000145029:ENST00000273598:exon_49466541_49466757:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000421969:exon_49466541_49466674:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000430622:exon_49466541_49466754:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000423832:exon_49466541_49466741:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000497742:exon_49466541_49466708:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000436744:exon_49466541_49466759:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000422593:exon_49466541_49466721:NICN1;ENSG00000145029:ENST00000494057:exon_49466541_49466727:NICN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 49570200 C/T 1 21 13 34 9.71176989023315 6.98795197271281 2.72381791752033 T:C C T 10 0.537534767131755 0.392737558683748 ENSG00000173402:ENST00000308775:exon_49568230_49573044:DAG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 49714225 T/C 1 104 84 188 48.0963842182975 45.1529204390674 2.94346377923007 T:C T C 10 0.537534767131755 0.714721000451224 ENSG00000164062:ENST00000296456:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000449966:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000446089:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000442186:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000438011:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000463995:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447436:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000457042:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447541:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000482301:exon_49714210_49714250:APEH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 49721532 G/A 1 6 10 16 2.77479139720947 5.37534767131755 -2.60055627410808 A:G G A 10 0.537534767131755 0.217010442931191 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721381_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721482_49721622:MST1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 49721798 C/A 1 9 14 23 4.16218709581421 7.52548673984457 -3.36329964403036 A:C C A 10 0.537534767131755 0.209243218264062 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484144:exon_49721758_49721886:MST1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 49738945 C/T 1 14 5 19 6.47451326015543 2.68767383565877 3.78683942449666 T:C C T 10 0.537534767131755 0.106612876634271 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000432042:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000494005:exon_49738924_49739041:RNF123 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 49749976 G/A 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49749912_49750089:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49749912_49750089:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000432042:exon_49749912_49750263:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49749912_49750325:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49749912_49750089:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49749912_49751020:RNF123 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 49751585 C/T 1 18 11 29 8.32437419162841 5.91288243844931 2.41149175317911 T:C C T 10 0.537534767131755 0.457394669306004 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000469978:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000444689:exon_49751523_49751607:RNF123 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 10 27 37 4.62465232868245 14.5134387125574 -9.88878638387493 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00140436955028976 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 49847623 A/G 1 35 16 51 16.1862831503886 8.60055627410808 7.5857268762805 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0352660117826453 ENSG00000182179:ENST00000473992:exon_49847411_49847783:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000489826:exon_49847412_49847861:UBA7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 50103917 G/A 1 77 76 153 35.6098229308549 40.8526423020134 -5.24281937115851 A:G G A 10 0.537534767131755 0.417914679019378 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000434592:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50103825_50103935:RBM6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 50143127 G/A 1 19 16 35 8.78683942449666 8.60055627410808 0.186283150388576 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50142982_50143142:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50142982_50143142:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000395174:exon_50142982_50143142:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000496179:exon_50142982_50143142:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000471995:exon_50142982_50143142:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000474818:exon_50142982_50143142:RBM5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 50326020 G/A 1 95 102 197 43.9341971224833 54.828546247439 -10.8943491249557 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.133331429835484 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000426499:exon_50326014_50326070:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000486322:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000492387:exon_50325943_50326142:IFRD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 50327429 A/G 1 32 24 56 14.7988874517838 12.9008344111621 1.89805304062172 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.688234777736507 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50327360_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000483071:exon_50327143_50327501:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000489569:exon_50327360_50327517:IFRD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 50334231 T/A 1 12 21 33 5.54958279441894 11.2882301097669 -5.73864731534791 A:T T A 10 0.537534767131755 0.0542233675774478 ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 50336661 T/C 1 7 10 17 3.23725663007772 5.37534767131755 -2.13809104123983 T:C T C 10 0.537534767131755 0.337166426523694 ENSG00000186792:ENST00000336307:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000415204:exon_50336644_50336832:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000513170:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000450982:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000066014:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50336644_50336847:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50336644_50336852:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50336644_50336831:NAT6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 50355730 T/G 1 10 21 31 4.62465232868245 11.2882301097669 -6.6635777810844 A:T:G T G 10 0.537534767131755 0.0187839138109486 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50355221_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50355227_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50355240_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50355243_50355970:HYAL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 50357869 A/C 1 8 8 16 3.69972186294596 4.30027813705404 -0.600556274108079 A:C A C 10 0.537534767131755 0.806072821048815 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50357000_50360213:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000481597:exon_50357000_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000458018:exon_50357558_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000424190:exon_50357568_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000426286:exon_50357677_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000428028:exon_50357691_50357966:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000415028:exon_50357778_50357966:HYAL2;ENSG00000114383:ENST00000462137:exon_50357458_50357966:TUSC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 44 36 80 20.3484702462028 19.3512516167432 0.997218629459603 T:C C T 10 0.537534767131755 0.910823070458821 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 52256331 G/T 1 33 34 67 15.2613526846521 18.2761820824797 -3.01482939782758 T:G G T 10 0.537534767131755 0.465285499657060 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 50 25 75 23.1232616434123 13.4383691782939 9.68489246511838 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0274761193393387 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 52264907 T/C 1 104 106 210 48.0963842182975 56.978685315966 -8.88230109766854 T:C T C 10 0.537534767131755 0.239389501219919 ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52264886_52265011:RP11-330H6.5;ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52264886_52265011:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52264886_52265011:TWF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 52265215 G/A 1 109 101 210 50.4087103826387 54.2910114803073 -3.88230109766855 A:G G A 10 0.537534767131755 0.62821770393591 ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52265143_52265247:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52265143_52265247:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000472755:exon_52265143_52265247:TWF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 52325106 C/G 1 3 8 11 1.38739569860474 4.30027813705404 -2.9128824384493 C:G C G 10 0.537534767131755 0.127253645182292 ENSG00000168237:ENST00000461183:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000486393:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000473032:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000404703:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000305690:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000358709:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000340877:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000354773:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000471180:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000436784:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000473583:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000477382:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000489173:exon_52324976_52325938:GLYCTK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 52429665 C/T 1 9 11 20 4.16218709581421 5.91288243844931 -1.7506953426351 T:C C T 10 0.537534767131755 0.504150670545082 ENSG00000114841:ENST00000486752:exon_52429563_52429694:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000420323:exon_52429563_52429694:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000273600:exon_52429563_52429694:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000488988:exon_52429563_52429694:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000490713:exon_52429563_52429694:DNAH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 52430526 G/A 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000114841:ENST00000486752:exon_52430384_52430554:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000420323:exon_52430384_52430554:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000273600:exon_52430384_52430554:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000488988:exon_52430384_52430554:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000490713:exon_52430384_52430554:DNAH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 52492707 T/C 1 17 14 31 7.86190895876017 7.52548673984457 0.336422218915597 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000010322:ENST00000479054:exon_52492678_52492860:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000433196:exon_52492678_52492800:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000345716:exon_52492678_52492860:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000414197:exon_52492678_52492860:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000488380:exon_52492678_52492860:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000420808:exon_52492678_52492860:NISCH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 52521920 C/T 1 48 38 86 22.1983311776758 20.4263211510067 1.77201002666907 T:C C T 10 0.537534767131755 0.746234521843339 ENSG00000010322:ENST00000479054:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000345716:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000414197:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000489895:exon_52521212_52522621:NISCH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 52720080 A/C 1 15 14 29 6.93697849302368 7.52548673984457 -0.588508246820894 A:C A C 10 0.537534767131755 0.854060782439014 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 53856653 C/T 1 11 14 25 5.08711756155069 7.52548673984457 -2.43836917829387 T:C C T 10 0.537534767131755 0.423037845947577 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53856518_53856669:CHDH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 53857917 T/G 1 7 13 20 3.23725663007772 6.98795197271281 -3.7506953426351 T:G T G 10 0.537534767131755 0.116404989692958 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53857333_53858094:CHDH;ENSG00000016391:ENST00000481668:exon_53857571_53858094:CHDH;ENSG00000016391:ENST00000467802:exon_53857658_53858094:CHDH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 53886912 C/T 1 10 4 14 4.62465232868245 2.15013906852702 2.47451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 0.283621077619465 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53886898_53887024:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53886898_53887024:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53886898_53887024:IL17RB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 53899276 C/T 1 13 25 38 6.01204802728719 13.4383691782939 -7.42632115100669 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0215437868743779 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 53925849 C/T 1 25 21 46 11.5616308217061 11.2882301097669 0.273400711939273 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53925797_53926015:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53925797_53925892:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000487571:exon_53925797_53925882:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000485414:exon_53925797_53925912:RP11-884K10.5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 56667480 C/T 1 21 29 50 9.71176989023315 15.5885082468209 -5.87673835658775 T:C C T 10 0.537534767131755 0.118051965258774 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56667072_56668000:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56667072_56667871:C3orf63 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 59908126 A/G 1 5 15 20 2.31232616434123 8.06302150697632 -5.7506953426351 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0123613354383304 ENSG00000189283:ENST00000492590:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000476844:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000466788:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000468189:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000341848:exon_59908072_59908140:FHIT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 63981635 C/T 1 10 15 25 4.62465232868245 8.06302150697632 -3.43836917829387 T:C C T 10 0.537534767131755 0.228213554923661 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 64009102 G/T 1 54 48 102 24.9731225748852 25.8016688223242 -0.828546247439007 T:G G T 10 0.537534767131755 0.920994945896528 ENSG00000163636:ENST00000295901:exon_64008951_64009236:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000476464:exon_64007994_64009113:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000492933:exon_64008951_64009148:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000482510:exon_64009068_64009134:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000475036:exon_64008727_64009154:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000497323:exon_64009068_64009134:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000478185:exon_64008951_64009132:PSMD6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 66293721 C/G 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 C:G C G 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66293627_66293736:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66293627_66293736:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66293627_66293736:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66293627_66293736:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66293627_66293736:SLC25A26 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 66419942 A/G 1 9 9 18 4.16218709581421 4.83781290418579 -0.675625808371588 A:G A G 10 0.537534767131755 0.815602186334409 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 66430811 T/G 1 34 27 61 15.7238179175203 14.5134387125574 1.21037920496295 T:G T G 10 0.537534767131755 0.798275906402628 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 66431059 G/C 1 28 32 60 12.9490265203109 17.2011125482162 -4.2520860279053 C:G G C 10 0.537534767131755 0.301087424543154 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66431001_66431285:LRIG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 66434643 T/C 1 25 14 39 11.5616308217061 7.52548673984457 4.03614408186156 T:C T C 10 0.537534767131755 0.203653351133285 ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66434415_66434696:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66434556_66434696:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66434415_66434696:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66434415_66434696:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66434415_66434696:LRIG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 66436538 G/A 1 11 21 32 5.08711756155069 11.2882301097669 -6.20111254821616 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0328630728341302 ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66436405_66436725:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66436405_66436725:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66436405_66436725:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66436405_66436725:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66436405_66436725:LRIG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 66444615 G/A 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66444464_66444627:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66444464_66444627:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66444464_66444627:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66444464_66444627:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66444464_66444627:LRIG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 66550756 G/C 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 C:G G C 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66550614_66551356:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66550614_66551435:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66550614_66551351:LRIG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 66550762 G/C 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 C:G G C 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66550614_66551356:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66550614_66551435:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66550614_66551351:LRIG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 69096614 G/A 1 5 10 15 2.31232616434123 5.37534767131755 -3.06302150697632 A:G G A 10 0.537534767131755 0.126645309084573 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 31 24 55 14.3364222189156 12.9008344111621 1.43558780775348 T:C T C 10 0.537534767131755 0.787189976004427 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 81698130 T/C 1 41 24 65 18.961074547598 12.9008344111621 6.06024013643593 T:C T C 10 0.537534767131755 0.137363156295055 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 87276699 C/T 1 33 40 73 15.2613526846521 21.5013906852702 -6.24003800061811 T:C C T 10 0.537534767131755 0.159216168754521 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87276421_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87276435_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87276452_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87276459_87276706:CHMP2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 87299075 A/C 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 A:C A C 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87299025_87299127:CHMP2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 88189580 T/G 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 T:G T G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000175105:ENST00000309495:exon_88188254_88190198:ZNF654 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 35 38 73 16.1862831503886 20.4263211510067 -4.24003800061811 A:G G A 10 0.537534767131755 0.348521940729087 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 103 74 177 47.6339189854292 39.7775727677499 7.85634621767937 T:C T C 10 0.537534767131755 0.258279183331507 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 11 15 26 5.08711756155069 8.06302150697632 -2.97590394542563 A:G A G 10 0.537534767131755 0.325523153112396 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 10 6 16 4.62465232868245 3.22520860279053 1.39944372589192 T:C C T 10 0.537534767131755 0.618373054653884 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 105438957 T/G 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 T:G T G 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 105439026 G/A 1 10 5 15 4.62465232868245 2.68767383565877 1.93697849302368 A:G G A 10 0.537534767131755 0.43901451829475 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 111904703 C/A 0 9 0 9 4.16218709581421 0 4.16218709581421 C C 10 0.537534767131755 0.00471442275687274 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 112185025 G/A 1 62 35 97 28.6728444378312 18.8137168496114 9.85912758821977 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0525523403941043 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112184955_112185230:BTLA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 112188609 T/G 1 37 48 85 17.1112136161251 25.8016688223242 -8.69045520619917 T:G T G 10 0.537534767131755 0.0644232766303605 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000496584:exon_112188603_112188651:BTLA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 113286405 C/T 1 12 14 26 5.54958279441894 7.52548673984457 -1.97590394542563 T:C C T 10 0.537534767131755 0.440566012205601 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000491730:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000483946:exon_113286387_113286763:SIDT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 118948716 G/A 1 15 10 25 6.93697849302368 5.37534767131755 1.56163082170613 A:G G A 10 0.537534767131755 0.555250283480734 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 119305379 T/A 1 37 39 76 17.1112136161251 20.9638559181384 -3.85264230201338 A:T:C T A 10 0.537534767131755 0.421033746122283 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 121712051 A/C 1 9 10 19 4.16218709581421 5.37534767131755 -1.21316057550334 A:C A C 10 0.537534767131755 0.648761877832002 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 121712805 G/C 1 8 10 18 3.69972186294596 5.37534767131755 -1.67562580837159 C:G G C 10 0.537534767131755 0.483452727703955 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000383663:exon_121712627_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 121838319 G/A 1 41 41 82 18.961074547598 22.038925452402 -3.07785090480391 A:G G A 10 0.537534767131755 0.508205452146083 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121838285_121838921:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121838285_121839175:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121838285_121839982:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121838285_121838667:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121838285_121838440:CD86 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 47 61 108 21.7358659448075 32.7896207950371 -11.0537548502295 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0339899636599161 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 37 40 77 17.1112136161251 21.5013906852702 -4.39017706914513 C:G G C 10 0.537534767131755 0.360744028310903 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 122288210 G/A 1 8 13 21 3.69972186294596 6.98795197271281 -3.28823010976685 A:G G A 10 0.537534767131755 0.189542373698344 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122287336_122288871:DTX3L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 122288314 A/G 1 25 13 38 11.5616308217061 6.98795197271281 4.57367884899331 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.146220045523152 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122287336_122288871:DTX3L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 122418750 G/A 1 39 66 105 18.0361440818616 35.4772946306958 -17.4411505488343 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.000797951275259182 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 122419083 C/A 1 28 44 72 12.9490265203109 23.6515297537972 -10.7025032334864 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0128063927773684 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 122446642 C/T 1 2 16 18 0.92493046573649 8.60055627410808 -7.67562580837159 T:C C T 10 0.537534767131755 0.000228103902922197 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 122459477 A/G 1 14 10 24 6.47451326015543 5.37534767131755 1.09916558883788 A:G A G 10 0.537534767131755 0.68779414869778 ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122458846_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000471534:exon_122458850_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122458850_122459722:HSPBAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 123665902 T/G 1 25 19 44 11.5616308217061 10.2131605755033 1.34847024620278 T:G T G 10 0.537534767131755 0.763143132347552 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000426152:exon_123665651_123665904:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000435910:exon_123665860_123666166:CCDC14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 124692689 C/T 1 12 12 24 5.54958279441894 6.45041720558106 -0.900834411162119 T:C C T 10 0.537534767131755 0.83840612934176 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124692575_124692749:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000487661:exon_124692575_124692749:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000482699:exon_124692575_124692751:HEG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 124728626 A/G 1 8 5 13 3.69972186294596 2.68767383565877 1.01204802728719 A:G A G 10 0.537534767131755 0.782310374824685 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124728549_124728668:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000488654:exon_124728359_124728668:HEG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 124731485 C/G 1 12 8 20 5.54958279441894 4.30027813705404 1.2493046573649 C:G C G 10 0.537534767131755 0.657534137938504 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 124731689 T/A 1 11 17 28 5.08711756155069 9.13809104123983 -4.05097347968914 A:T T A 10 0.537534767131755 0.133350668026399 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 124746347 T/C 1 17 14 31 7.86190895876017 7.52548673984457 0.336422218915597 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 125250737 T/C 1 8 11 19 3.69972186294596 5.91288243844931 -2.21316057550334 T:C T C 10 0.537534767131755 0.361207681506224 ENSG00000144909:ENST00000296220:exon_125250705_125250858:OSBPL11;ENSG00000144909:ENST00000393455:exon_125250705_125250858:OSBPL11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 126180820 G/A 1 22 26 48 10.1742351231014 13.9759039454256 -3.80166882232424 A:G G A 10 0.537534767131755 0.311537521411182 ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126180378_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000515545:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126180113_126181063:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000336332:exon_126179926_126181063:ZXDC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 126194076 T/C 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126193802_126194762:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126193802_126194708:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000336332:exon_126193802_126194708:ZXDC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 126451937 G/T 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:G G T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000514908:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126451921_126452065:CHCHD6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 126741011 G/A 1 12 17 29 5.54958279441894 9.13809104123983 -3.58850824682089 A:G G A 10 0.537534767131755 0.196303716694424 ENSG00000114554:ENST00000393409:exon_126740928_126741184:PLXNA1;ENSG00000114554:ENST00000251772:exon_126740928_126741184:PLXNA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 127323592 G/A 1 132 124 256 61.0454107386083 66.6543111243376 -5.60890038572926 A:G G A 10 0.537534767131755 0.491053728104958 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000480910:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323451_127323626:MCM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 127394820 C/T 1 16 6 22 7.39944372589192 3.22520860279053 4.17423512310139 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0879809941679776 ENSG00000114626:ENST00000483857:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000361019:exon_127394813_127394903:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000393363:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000232744:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475265:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000493365:exon_127394813_127395278:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000453791:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475042:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000479280:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000467179:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000468137:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000464431:exon_127394329_127395274:ABTB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 128344786 G/A 1 104 100 204 48.0963842182975 53.7534767131755 -5.65709249487801 A:G G A 10 0.537534767131755 0.440429029008023 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344717_128344855:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344717_128344855:RPN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 128614185 A/C 1 19 27 46 8.78683942449666 14.5134387125574 -5.72659928806073 A:C A C 10 0.537534767131755 0.103901121647414 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 128627753 T/C 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 T:C T C 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 24 18 42 11.0991655888379 9.67562580837159 1.42353978046629 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.757526619731723 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 130718472 G/A 1 51 34 85 23.5857268762805 18.2761820824797 5.30954479380083 A:G G A 10 0.537534767131755 0.277143069843504 ENSG00000017260:ENST00000504381:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000505330:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507488:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000510168:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000508532:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000513801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504948:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000328560:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000533801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000428331:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000393221:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000422190:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000359644:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000347421:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504612:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000514654:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507194:exon_130718362_130718503:ATP2C1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 131220550 G/A 1 102 101 203 47.171453752561 54.2910114803073 -7.11955772774626 A:G G A 10 0.537534767131755 0.325038576020516 ENSG00000114686:ENST00000264995:exon_131220375_131220559:MRPL3;ENSG00000114686:ENST00000511168:exon_131220375_131220559:MRPL3;ENSG00000114686:ENST00000425847:exon_131220375_131220559:MRPL3;ENSG00000114686:ENST00000507669:exon_131220375_131220559:MRPL3;ENSG00000114686:ENST00000512877:exon_131220375_131220559:MRPL3;ENSG00000114686:ENST00000510923:exon_131220375_131220559:MRPL3;ENSG00000114686:ENST00000510154:exon_131220375_131220559:MRPL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 132166266 T/G 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 T:G T G 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000138246:ENST00000260818:exon_132166165_132166314:DNAJC13;ENSG00000138246:ENST00000486798:exon_132166165_132166314:DNAJC13;ENSG00000138246:ENST00000439030:exon_132166165_132166314:DNAJC13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 132438619 G/A 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132438549_132438674:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132438549_132438674:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132438549_132438674:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132438549_132438674:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000465756:exon_132438549_132438674:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000337331:exon_132438549_132438674:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000469232:exon_132438549_132438674:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000471145:exon_132438549_132438674:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000343113:exon_132438549_132438674:NPHP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 133329943 G/A 1 24 30 54 11.0991655888379 16.1260430139526 -5.02687742511477 A:G G A 10 0.537534767131755 0.175138481783256 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133329848_133329985:TOPBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 133342218 C/T 1 18 17 35 8.32437419162841 9.13809104123983 -0.813716849611422 T:C C T 10 0.537534767131755 0.865875387186721 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133342155_133342301:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133342155_133342301:TOPBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 133368362 T/G 1 16 13 29 7.39944372589192 6.98795197271281 0.411491753179106 T:G T G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000511439:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000509162:exon_133368227_133368786:TOPBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 134670524 C/T 1 1 15 16 0.462465232868245 8.06302150697632 -7.60055627410808 T:C C T 10 0.537534767131755 0.000134379786294855 ENSG00000154928:ENST00000398015:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000482618:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000360935:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000425716:exon_134670213_134670560:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000488154:exon_134670213_134670560:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000474732:exon_134670213_134670604:EPHB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 141162128 C/G 1 68 49 117 31.4476358350407 26.339203589456 5.10843224558467 C:G C G 10 0.537534767131755 0.355354335547576 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 141162185 T/G 1 70 57 127 32.3725663007772 30.63948172651 1.73308457426712 T:C:G T G 10 0.537534767131755 0.789921917238348 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 142078759 C/T 1 9 8 17 4.16218709581421 4.30027813705404 -0.138091041239834 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000114127:ENST00000264951:exon_142078704_142078773:XRN1;ENSG00000114127:ENST00000498077:exon_142078704_142078773:XRN1;ENSG00000114127:ENST00000392981:exon_142078704_142078773:XRN1;ENSG00000114127:ENST00000467077:exon_142078704_142078773:XRN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 142178144 C/T 1 11 3 14 5.08711756155069 1.61260430139526 3.47451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 0.104465203629206 ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142178069_142178225:ATR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 142222284 A/G 1 2 10 12 0.92493046573649 5.37534767131755 -4.45041720558106 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0165545198603437 ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142222204_142222295:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142222204_142222295:ATR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 54 0 54 24.9731225748852 0 24.9731225748852 G G 10 0.537534767131755 4.40595041794827e-15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 148786108 C/T 1 24 18 42 11.0991655888379 9.67562580837159 1.42353978046629 T:C C T 10 0.537534767131755 0.757526619731723 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392913:exon_148786027_148786122:HLTF HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 27 23 50 12.4865612874426 12.3632996440304 0.123261643412251 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 121 0 121 55.9582931770576 0 55.9582931770576 T T 10 0.537534767131755 2.87061609058357e-33 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 158363463 A/G 1 19 20 39 8.78683942449666 10.7506953426351 -1.96385591813844 A:G A G 10 0.537534767131755 0.630559943550738 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158363418_158363570:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158363418_158363570:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158363418_158363570:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158363418_158363570:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158363418_158363570:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158363418_158363570:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000464732:exon_158363418_158363570:GFM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 158520011 C/T 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 T:C C T 10 0.537534767131755 0.190750883746296 ENSG00000118855:ENST00000415822:exon_158519654_158520104:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000264266:exon_158519654_158520104:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000484166:exon_158519840_158520104:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000480292:exon_158519846_158520104:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000392813:exon_158519912_158520104:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000437603:exon_158519912_158520104:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000471266:exon_158519926_158520104:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000361159:exon_158519942_158520104:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000471500:exon_158519945_158520073:MFSD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 158524831 G/A 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000118855:ENST00000486568:exon_158524829_158524871:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000415822:exon_158524829_158524871:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000264266:exon_158524829_158524871:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000484166:exon_158524829_158524871:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000480292:exon_158524829_158524871:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000392813:exon_158524829_158524871:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000471266:exon_158524829_158524871:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000361159:exon_158524829_158524871:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000471500:exon_158524829_158524871:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000474670:exon_158524829_158524871:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000482835:exon_158524829_158524871:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000476860:exon_158524829_158524871:MFSD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 160119730 G/A 1 60 46 106 27.7479139720947 24.7265992880607 3.02131468403397 A:G G A 10 0.537534767131755 0.626451723070736 ENSG00000113810:ENST00000497311:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000465903:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000485645:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000468653:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000489573:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000490207:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000485867:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160119703_160119881:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000392788:exon_160119703_160119881:SMC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 160156951 C/T 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_160156020_160156974:RP11-432B6.3;ENSG00000213186:ENST00000309784:exon_160153291_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000479460:exon_160156439_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000471396:exon_160156507_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000496222:exon_160156519_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000471155:exon_160156629_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000494486:exon_160156637_160156974:TRIM59;ENSG00000213186:ENST00000468542:exon_160156789_160156974:TRIM59 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 169492101 C/T 1 3 7 10 1.38739569860474 3.76274336992228 -2.37534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 0.203605394966440 ENSG00000085274:ENST00000349841:exon_169492053_169492349:MYNN;ENSG00000085274:ENST00000356716:exon_169492053_169492349:MYNN;ENSG00000085274:ENST00000392733:exon_169492053_169492349:MYNN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 170078232 C/T 1 16 7 23 7.39944372589192 3.76274336992228 3.63670035596964 T:C C T 10 0.537534767131755 0.146568942838849 ENSG00000136603:ENST00000476188:exon_170078109_170078488:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000259119:exon_170077487_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000426052:exon_170078156_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000413427:exon_170077411_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000458537:exon_170077411_170079217:SKIL;ENSG00000136603:ENST00000431185:exon_170078120_170079217:SKIL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 170893070 G/A 1 15 17 32 6.93697849302368 9.13809104123983 -2.20111254821616 A:G G A 10 0.537534767131755 0.480790906838619 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000468757:exon_170893041_170893119:TNIK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 12 19 31 5.54958279441894 10.2131605755033 -4.6635777810844 A:G G A 10 0.537534767131755 0.105964213494322 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 171338237 T/G 1 9 16 25 4.16218709581421 8.60055627410808 -4.43836917829387 T:G T G 10 0.537534767131755 0.106790655888092 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000446289:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000465816:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000467432:exon_171338176_171338310:PLD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 171395468 A/G 1 12 12 24 5.54958279441894 6.45041720558106 -0.900834411162119 A:G A G 10 0.537534767131755 0.83840612934176 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000471075:exon_171395356_171395643:PLD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 171404478 C/A 1 7 13 20 3.23725663007772 6.98795197271281 -3.7506953426351 A:C C A 10 0.537534767131755 0.116404989692958 ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171404475_171404588:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171404475_171404588:PLD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 178785549 G/A 1 28 39 67 12.9490265203109 20.9638559181384 -8.01482939782758 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0508447744889331 ENSG00000172667:ENST00000311417:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000432729:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000441601:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000443441:exon_178785271_178785598:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000416402:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000414084:exon_178785271_178785597:ZMAT3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 179051472 A/G 1 27 23 50 12.4865612874426 12.3632996440304 0.123261643412251 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000121864:ENST00000496856:exon_179051057_179052402:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000326361:exon_179051057_179053323:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466264:exon_179051057_179051617:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000484866:exon_179051057_179052400:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466663:exon_179051057_179051518:ZNF639 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 179298999 C/T 1 33 30 63 15.2613526846521 16.1260430139526 -0.864690329300563 T:C C T 10 0.537534767131755 0.899619329709575 ENSG00000136518:ENST00000429709:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000450518:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000392662:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000259034:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000484312:exon_179298952_179299008:ACTL6A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 182681740 C/T 1 9 10 19 4.16218709581421 5.37534767131755 -1.21316057550334 T:C C T 10 0.537534767131755 0.648761877832002 ENSG00000043093:ENST00000292782:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000469954:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000492563:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000497606:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000460412:exon_182681719_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000487822:exon_182681736_182681837:DCUN1D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 182755209 T/G 1 37 53 90 17.1112136161251 28.489342657983 -11.3781290418579 T:G T G 10 0.537534767131755 0.0195901793903203 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755202_182755222:MCCC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 183476685 G/A 1 7 11 18 3.23725663007772 5.91288243844931 -2.67562580837159 A:G G A 10 0.537534767131755 0.241274942947926 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183476650_183476753:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183476650_183476753:YEATS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 183861243 A/G 1 53 66 119 24.510657342017 35.4772946306958 -10.9666372886788 A:G A G 10 0.537534767131755 0.053085748114305 ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 183904049 A/G 1 32 23 55 14.7988874517838 12.3632996440304 2.43558780775348 A:G A G 10 0.537534767131755 0.589119036750366 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183903811_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000421340:exon_183903883_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000485921:exon_183903892_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000463685:exon_183903948_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000478288:exon_183903949_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183903962_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183903964_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000481116:exon_183903979_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000498136:exon_183903984_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466416:exon_183903987_183904068:ABCF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 183976108 T/C 1 18 31 49 8.32437419162841 16.6635777810844 -8.33920358945599 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0211106115149918 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 183976241 A/G 1 17 25 42 7.86190895876017 13.4383691782939 -5.57646021953371 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0902492390766182 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 184046470 C/T 1 119 111 230 55.0333627113212 59.6663591516248 -4.63299644030364 T:C C T 10 0.537534767131755 0.55223923550135 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382362:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000422614:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000460829:exon_184045905_184046923:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000475721:exon_184046404_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000464548:exon_184046457_184046544:EIF4G1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 23 28 51 10.6367003559696 15.0509734796891 -4.4142731237195 A:C C A 10 0.537534767131755 0.261138141377190 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 185135338 T/A 0 1368 1 1369 632.652438563759 0.537534767131755 632.114903796627 T:C:G T C 10 0.537534767131755 0 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 1 1097 12 1109 507.324360456465 6.45041720558106 500.873943250884 A:T:C:G G T 10 0.537534767131755 1.39014929197203e-272 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 16 12 28 7.39944372589192 6.45041720558106 0.949026520310861 A:C C A 10 0.537534767131755 0.850208407116058 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 186518935 C/T 1 29 22 51 13.4114917531791 11.8257648768986 1.5857268762805 T:C C T 10 0.537534767131755 0.676388011165332 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186518906_186518984:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186518906_186518984:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186518906_186518984:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186518906_186518984:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000418288:exon_186518906_186518984:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000449502:exon_186518906_186518984:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000447345:exon_186518906_186518984:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000489028:exon_186518906_186519246:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000427785:exon_186518906_186518984:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000448497:exon_186518906_186518984:RFC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 187088812 C/T 1 15 20 35 6.93697849302368 10.7506953426351 -3.81371684961142 T:C C T 10 0.537534767131755 0.235686232316037 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 187088903 C/A 1 14 15 29 6.47451326015543 8.06302150697632 -1.58850824682089 A:C C A 10 0.537534767131755 0.580849764907506 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 187089031 C/A 1 9 11 20 4.16218709581421 5.91288243844931 -1.7506953426351 A:C:G C A 10 0.537534767131755 0.504150670545082 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 97 78 175 44.8591275882198 41.9277118362769 2.93141575194289 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.704810578050579 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 191093080 A/G 1 11 6 17 5.08711756155069 3.22520860279053 1.86190895876017 A:G A G 10 0.537534767131755 0.4682435751469 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 194373832 T/C 1 32 20 52 14.7988874517838 10.7506953426351 4.04819210914874 T:C T C 10 0.537534767131755 0.269865259424571 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 194373833 G/A 1 32 20 52 14.7988874517838 10.7506953426351 4.04819210914874 A:G G A 10 0.537534767131755 0.269865259424571 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 194790422 G/A 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 A:G G A 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000173950:ENST00000310380:exon_194789008_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000437101:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000355729:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000458652:exon_194790020_194790677:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000460582:exon_194790322_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000473200:exon_194790360_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000429994:exon_194790406_194790840:C3orf21 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 194790434 C/G 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 C:G C G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000173950:ENST00000310380:exon_194789008_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000437101:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000355729:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000458652:exon_194790020_194790677:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000460582:exon_194790322_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000473200:exon_194790360_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000429994:exon_194790406_194790840:C3orf21 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 195452951 G/C 0 9 0 9 4.16218709581421 0 4.16218709581421 G G 10 0.537534767131755 0.00471442275687274 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 195453064 T/G 1 12 3 15 5.54958279441894 1.61260430139526 3.93697849302368 T:C:G T G 10 0.537534767131755 0.0663367408872343 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195453052_195453443:MUC20 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 195611844 G/A 1 17 22 39 7.86190895876017 11.8257648768986 -3.96385591813844 A:G G A 10 0.537534767131755 0.260722504893214 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000481865:exon_195610028_195613144:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000316664:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000430929:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000468819:exon_195611683_195611904:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000447060:exon_195611716_195611904:TNK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 195965679 G/A 1 29 34 63 13.4114917531791 18.2761820824797 -4.86469032930056 A:G G A 10 0.537534767131755 0.255501019754702 ENSG00000161217:ENST00000419333:exon_195965579_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000292823:exon_195961239_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000431016:exon_195965422_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000460827:exon_195965662_195965765:PCYT1A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 3 197495334 G/A 1 53 55 108 24.510657342017 29.5644121922465 -5.05375485022953 A:G G A 10 0.537534767131755 0.336162949950194 ENSG00000122068:ENST00000428738:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000494309:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000415708:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000241502:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000392374:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000412924:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000418169:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000426031:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000424384:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000428395:exon_197495306_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000463136:exon_197495310_197495458:FYTTD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 86798 C/T 1 6 10 16 2.77479139720947 5.37534767131755 -2.60055627410808 T:C C T 10 0.537534767131755 0.217010442931191 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 87113 T/C 1 12 8 20 5.54958279441894 4.30027813705404 1.2493046573649 T:C T C 10 0.537534767131755 0.657534137938504 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 515489 G/A 1 18 9 27 8.32437419162841 4.83781290418579 3.48656128744262 A:G G A 10 0.537534767131755 0.246443933683272 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504187:exon_515449_515750:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503111:exon_515449_516631:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506402:exon_515449_515641:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000509768:exon_515449_516632:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506898:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000507493:exon_515449_515730:PIGG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 517376 T/C 1 4 18 22 1.84986093147298 9.67562580837159 -7.82576487689861 T:C T C 10 0.537534767131755 0.000913660417064246 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 517461 T/C 1 6 13 19 2.77479139720947 6.98795197271281 -4.21316057550334 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0652517560612217 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 517622 C/T 1 13 7 20 6.01204802728719 3.76274336992228 2.2493046573649 T:C C T 10 0.537534767131755 0.373913522529313 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_517621_517702:PIGG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 520853 G/A 1 9 8 17 4.16218709581421 4.30027813705404 -0.138091041239834 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_520828_521329:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000510235:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_520739_521019:PIGG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 527677 T/C 1 2 9 11 0.92493046573649 4.83781290418579 -3.9128824384493 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0295587298456249 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_524629_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_525903_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504879:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_527421_527770:PIGG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 533001 T/C 1 9 19 28 4.16218709581421 10.2131605755033 -6.05097347968914 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0234751838167625 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_532942_533154:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_532942_533985:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000515237:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000505800:exon_532942_533312:PIGG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 843720 T/C 1 73 91 164 33.7599619993819 48.9156638089897 -15.1557018096078 T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.0187419885267724 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843680_844197:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843680_843856:GAK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 961538 C/G 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 C:G C G 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000145214:ENST00000273814:exon_961516_961590:DGKQ;ENSG00000145214:ENST00000509465:exon_961516_961590:DGKQ;ENSG00000145214:ENST00000405681:exon_961516_961585:DGKQ HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 4 12 16 1.84986093147298 6.45041720558106 -4.60055627410808 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0242209614480061 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 1330759 T/C 1 33 36 69 15.2613526846521 19.3512516167432 -4.08989893209109 T:C T C 10 0.537534767131755 0.336240941304398 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 1343405 T/C 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000163945:ENST00000511216:exon_1343312_1343642:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000296312:exon_1343312_1343642:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000389851:exon_1343312_1343642:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000507531:exon_1343312_1343642:KIAA1530 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 1349029 G/A 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 A:G G A 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000163945:ENST00000511216:exon_1348905_1349033:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000296312:exon_1348905_1349033:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000389851:exon_1348905_1349033:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000507531:exon_1348905_1349033:KIAA1530 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 156 129 285 72.1445763274462 69.3419849599964 2.80259136744984 A:G G A 10 0.537534767131755 0.766603557700696 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 37 40 77 17.1112136161251 21.5013906852702 -4.39017706914513 T:C C T 10 0.537534767131755 0.360744028310903 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 1746229 G/T 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:G G T 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000013810:ENST00000484264:exon_1746166_1746351:TACC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 2240484 C/T 0 9 0 9 4.16218709581421 0 4.16218709581421 C C 10 0.537534767131755 0.00471442275687274 ENSG00000214367:ENST00000506763:exon_2240331_2240770:HAUS3;ENSG00000214367:ENST00000243706:exon_2240331_2240770:HAUS3;ENSG00000214367:ENST00000443786:exon_2240331_2240770:HAUS3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 2252845 C/T 1 26 47 73 12.0240960545744 25.2641340551925 -13.2400380006181 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00212715353491394 ENSG00000123933:ENST00000337190:exon_2252811_2252973:MXD4;ENSG00000123933:ENST00000513372:exon_2252811_2252973:MXD4;ENSG00000123933:ENST00000513380:exon_2252811_2252973:MXD4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 132 112 244 61.0454107386083 60.2038939187566 0.84151681985179 A:G G A 10 0.537534767131755 0.948844541851904 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 2746285 A/C 1 11 14 25 5.08711756155069 7.52548673984457 -2.43836917829387 A:C A C 10 0.537534767131755 0.423037845947577 ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2746114_2746590:TNIP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 2826472 G/T 1 10 6 16 4.62465232868245 3.22520860279053 1.39944372589192 T:G G T 10 0.537534767131755 0.618373054653884 ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2826340_2826644:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2826340_2826641:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2826340_2826828:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826392_2826486:SH3BP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 2933271 G/A 1 8 12 20 3.69972186294596 6.45041720558106 -2.7506953426351 A:G G A 10 0.537534767131755 0.264201895405952 ENSG00000109736:ENST00000508276:exon_2933102_2933663:MFSD10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 109 118 227 50.4087103826387 63.4291025215471 -13.0203921389084 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0839297934233738 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 3162056 C/T 1 25 16 41 11.5616308217061 8.60055627410808 2.96107454759805 T:C C T 10 0.537534767131755 0.434059951809793 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3162009_3162119:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3162009_3162119:HTT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 3213832 G/A 1 38 36 74 17.5736788489933 19.3512516167432 -1.77757276774987 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.727044716875601 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000509751:exon_3213639_3213869:HTT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 38 33 71 17.5736788489933 17.7386473153479 -0.164968466354605 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 3227419 A/G 1 33 44 77 15.2613526846521 23.6515297537972 -8.39017706914513 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0668540263548056 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 34 39 73 15.7238179175203 20.9638559181384 -5.24003800061811 A:G G A 10 0.537534767131755 0.241038028627298 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 3234980 G/A 1 40 53 93 18.4986093147298 28.489342657983 -9.99073334325321 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0475874118902275 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3234890_3235080:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3234890_3235080:HTT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 3514689 T/C 1 89 72 161 41.1594057252738 38.7025032334864 2.45690249178745 T:C T C 10 0.537534767131755 0.752028058649634 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 3516559 C/T 1 63 64 127 29.1353096706994 34.4022250964323 -5.26691542573288 T:C C T 10 0.537534767131755 0.373915808358931 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3516479_3516655:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3516479_3516655:LRPAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 3526645 C/T 1 95 87 182 43.9341971224833 46.7655247404627 -2.8313276179794 T:C C T 10 0.537534767131755 0.710297008976155 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3526634_3526873:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3526634_3526778:LRPAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 4861974 C/T 1 13 7 20 6.01204802728719 3.76274336992228 2.2493046573649 T:C C T 10 0.537534767131755 0.373913522529313 ENSG00000163132:ENST00000382723:exon_4861393_4862095:MSX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 6302519 G/A 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 A:G G A 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000506362:exon_6302384_6302644:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000513395:exon_6302384_6302534:WFS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 6302707 C/T 1 8 4 12 3.69972186294596 2.15013906852702 1.54958279441894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.403872211149876 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 6302889 G/A 1 3 7 10 1.38739569860474 3.76274336992228 -2.37534767131755 A:G G A 10 0.537534767131755 0.203605394966440 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 6303022 C/T 1 3 7 10 1.38739569860474 3.76274336992228 -2.37534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 0.203605394966440 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 6303680 A/G 1 10 6 16 4.62465232868245 3.22520860279053 1.39944372589192 A:G A G 10 0.537534767131755 0.618373054653884 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 6303955 G/A 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:G G A 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 7032083 G/C 1 34 17 51 15.7238179175203 9.13809104123983 6.5857268762805 C:G G C 10 0.537534767131755 0.068697746454106 ENSG00000132405:ENST00000448507:exon_7032054_7034845:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000340816:exon_7032054_7034845:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000446947:exon_7032054_7034845:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000409757:exon_7032054_7034838:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000410031:exon_7032054_7034841:TBC1D14;ENSG00000132405:ENST00000451522:exon_7032054_7034841:TBC1D14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 8229140 G/T 1 26 25 51 12.0240960545744 13.4383691782939 -1.4142731237195 T:G G T 10 0.537534767131755 0.779172624362904 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000514274:exon_8228707_8229196:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 221 228 449 102.204816463882 122.55792690604 -20.353110442158 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0582544088271049 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 13601206 C/T 1 35 37 72 16.1862831503886 19.8887863838749 -3.70250323348636 T:C C T 10 0.537534767131755 0.409176507628107 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 13606576 A/T 1 24 23 47 11.0991655888379 12.3632996440304 -1.26413405519248 A:T A T 10 0.537534767131755 0.770600413711711 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 17579114 C/T 1 9 2 11 4.16218709581421 1.07506953426351 3.0871175615507 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0736324692983549 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17578815_17579190:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508497:exon_17579049_17579190:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000512397:exon_17579075_17579190:LAP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 17829990 G/C 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 C:G G C 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000510063:exon_17829901_17830011:NCAPG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 11 16 27 5.08711756155069 8.60055627410808 -3.51343871255738 T:C T C 10 0.537534767131755 0.182777781405979 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 36069805 G/A 1 19 13 32 8.78683942449666 6.98795197271281 1.79888745178384 A:G G A 10 0.537534767131755 0.596815376088155 ENSG00000047365:ENST00000303965:exon_36067620_36069900:ARAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 37903669 A/G 1 12 2 14 5.54958279441894 1.07506953426351 4.47451326015543 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0163896060017328 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 37903756 T/C 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 T:C T C 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 37904082 T/C 1 8 12 20 3.69972186294596 6.45041720558106 -2.7506953426351 T:C T C 10 0.537534767131755 0.264201895405952 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 37904089 C/T 1 8 8 16 3.69972186294596 4.30027813705404 -0.600556274108079 T:C C T 10 0.537534767131755 0.806072821048815 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 28 30 58 12.9490265203109 16.1260430139526 -3.17701649364179 T:G T G 10 0.537534767131755 0.431098929989536 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 76 83 159 35.1473576979866 44.6153856719357 -9.46802797394904 A:T:G A G 10 0.537534767131755 0.152048451146901 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 41 35 76 18.961074547598 18.8137168496114 0.147357697986621 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 23 11 34 10.6367003559696 5.91288243844931 4.72381791752033 T:G T G 10 0.537534767131755 0.12215756143552 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 15 8 23 6.93697849302368 4.30027813705404 2.63670035596964 A:C C A 10 0.537534767131755 0.301970044035753 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 14 16 30 6.47451326015543 8.60055627410808 -2.12604301395265 T:G T G 10 0.537534767131755 0.468003746372143 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 38829163 A/C 1 15 5 20 6.93697849302368 2.68767383565877 4.2493046573649 A:C A C 10 0.537534767131755 0.071912384591121 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 38829832 T/C 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 38830012 G/C 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 C:G G C 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 38972691 T/C 1 8 5 13 3.69972186294596 2.68767383565877 1.01204802728719 T:C T C 10 0.537534767131755 0.782310374824685 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_38972652_38972757:TMEM156 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 13 19 32 6.01204802728719 10.2131605755033 -4.20111254821616 T:C T C 10 0.537534767131755 0.157163927051232 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 39122697 C/T 1 15 9 24 6.93697849302368 4.83781290418579 2.09916558883788 T:C C T 10 0.537534767131755 0.420607042022665 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39122630_39123829:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39122630_39123828:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39122630_39122825:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39122630_39123826:KLHL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 34 34 68 15.7238179175203 18.2761820824797 -2.55236416495934 T:C T C 10 0.537534767131755 0.545490197209809 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 39303925 A/G 1 29 32 61 13.4114917531791 17.2011125482162 -3.78962079503705 A:G A G 10 0.537534767131755 0.369409534948659 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39303898_39303996:RFC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 39921942 A/G 1 11 7 18 5.08711756155069 3.76274336992228 1.32437419162841 A:G A G 10 0.537534767131755 0.639329189576991 ENSG00000121892:ENST00000303538:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000412404:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000399797:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000503396:exon_39921939_39922019:PDS5A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 40428010 T/C 1 17 13 30 7.86190895876017 6.98795197271281 0.873956986047352 T:C T C 10 0.537534767131755 0.85537468378439 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40425272_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40425698_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40426355_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40427429_40428160:RBM47 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 40438576 A/G 1 9 4 13 4.16218709581421 2.15013906852702 2.01204802728719 A:G A G 10 0.537534767131755 0.405252718730477 ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40438458_40438664:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40438458_40438902:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40438458_40438664:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40438458_40438664:RBM47 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 40440215 T/C 1 27 28 55 12.4865612874426 15.0509734796891 -2.56441219224652 T:C T C 10 0.537534767131755 0.501853357079519 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40439788_40440814:RBM47 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 40440854 G/C 1 11 13 24 5.08711756155069 6.98795197271281 -1.90083441116212 C:G G C 10 0.537534767131755 0.540217717608162 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000515053:exon_40440259_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000513473:exon_40440332_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000505414:exon_40440435_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514782:exon_40440499_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000507180:exon_40440540_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000511598:exon_40440570_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000511902:exon_40440732_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000505220:exon_40440733_40440941:RBM47 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 41015899 C/T 1 13 21 34 6.01204802728719 11.2882301097669 -5.27618208247967 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0848552883526125 ENSG00000163697:ENST00000295974:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513140:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513611:exon_41015600_41016402:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000508593:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000316212:exon_41015600_41016419:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000506352:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000509475:exon_41015600_41016402:APBB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 47589203 G/A 1 9 13 22 4.16218709581421 6.98795197271281 -2.82576487689861 A:G G A 10 0.537534767131755 0.285838202231404 ENSG00000145246:ENST00000273859:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000434825:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000503288:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000505476:exon_47589036_47589223:ATP10D;ENSG00000145246:ENST00000505277:exon_47589036_47589223:ATP10D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 47887536 T/C 1 6 9 15 2.77479139720947 4.83781290418579 -2.06302150697632 T:C T C 10 0.537534767131755 0.311071565735570 ENSG00000170448:ENST00000381538:exon_47887515_47887674:NFXL1;ENSG00000170448:ENST00000464756:exon_47887515_47887674:NFXL1;ENSG00000170448:ENST00000507489:exon_47887515_47887674:NFXL1;ENSG00000170448:ENST00000507131:exon_47887515_47887674:NFXL1;ENSG00000170448:ENST00000329043:exon_47887515_47887674:NFXL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 47887991 G/A 1 6 10 16 2.77479139720947 5.37534767131755 -2.60055627410808 A:G G A 10 0.537534767131755 0.217010442931191 ENSG00000170448:ENST00000381538:exon_47887896_47888016:NFXL1;ENSG00000170448:ENST00000464756:exon_47887896_47888016:NFXL1;ENSG00000170448:ENST00000507489:exon_47887896_47888016:NFXL1;ENSG00000170448:ENST00000507131:exon_47887896_47888016:NFXL1;ENSG00000170448:ENST00000329043:exon_47887896_47888016:NFXL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 48140831 T/A 1 14 26 40 6.47451326015543 13.9759039454256 -7.5013906852702 A:T T A 10 0.537534767131755 0.0251613412639554 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48140682_48140839:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48140682_48140839:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48140682_48140839:TEC;ENSG00000135605:ENST00000515146:exon_48140682_48140839:TEC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 48588742 C/T 1 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 0.155642553042637 ENSG00000075539:ENST00000503238:exon_48588638_48588745:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000358350:exon_48588638_48588745:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000264319:exon_48588638_48588745:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000507711:exon_48588638_48588745:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000506685:exon_48588638_48588745:FRYL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 54011576 T/C 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 T:C T C 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 14 6 20 6.47451326015543 3.22520860279053 3.2493046573649 T:C T C 10 0.537534767131755 0.180165257217980 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 57356588 A/G 1 46 56 102 21.2734007119393 30.1019469593783 -8.82854624743901 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0910932710629334 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57356499_57356602:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57356499_57356602:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000505314:exon_57356499_57356602:SRP72 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 57796900 G/A 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 A:G G A 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 57798174 C/G 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 C:G C G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 57830663 T/C 1 33 29 62 15.2613526846521 15.5885082468209 -0.327155562168807 T:C:G T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57830572_57830692:C4orf14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 46 48 94 21.2734007119393 25.8016688223242 -4.52826811038497 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.353984964785323 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 21 39 60 9.71176989023315 20.9638559181384 -11.2520860279053 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00413052664309945 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 68374597 C/T 1 10 14 24 4.62465232868245 7.52548673984457 -2.90083441116212 T:C C T 10 0.537534767131755 0.306252553826296 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 68380215 G/A 1 20 11 31 9.2493046573649 5.91288243844931 3.3364222189156 A:G G A 10 0.537534767131755 0.280729124843917 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68379792_68380405:CENPC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 68384008 C/T 1 8 2 10 3.69972186294596 1.07506953426351 2.62465232868245 T:C C T 10 0.537534767131755 0.119280745126671 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68383874_68384086:CENPC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 68442968 A/G 1 45 39 84 20.810935479071 20.9638559181384 -0.152920439067415 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 68497597 C/A 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68497575_68497626:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000505673:exon_68497575_68497626:UBA6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 68500171 A/G 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 A:G A G 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68500147_68500236:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000505673:exon_68500147_68500236:UBA6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 68534392 C/T 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 T:C C T 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68534269_68534392:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000420827:exon_68534269_68534392:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000429659:exon_68534269_68534392:UBA6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 71554971 G/C 1 65 75 140 30.0602401364359 40.3151075348816 -10.2548673984457 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0899671828870357 ENSG00000132467:ENST00000254803:exon_71554196_71556267:UTP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 73930552 G/A 1 10 11 21 4.62465232868245 5.91288243844931 -1.28823010976685 A:G G A 10 0.537534767131755 0.663607311505883 ENSG00000163626:ENST00000295890:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000449739:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000520291:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000533586:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000507544:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000510031:exon_73930495_73930616:COX18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 33 45 78 15.2613526846521 24.189064520929 -8.92771183627689 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0528978003094813 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 75937971 C/T 1 14 11 25 6.47451326015543 5.91288243844931 0.561630821706125 T:C C T 10 0.537534767131755 0.844309277033242 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 75938179 G/A 1 10 6 16 4.62465232868245 3.22520860279053 1.39944372589192 A:G G A 10 0.537534767131755 0.618373054653884 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 75938236 A/G 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:G A G 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 53 48 101 24.510657342017 25.8016688223242 -1.29101148030725 A:G G A 10 0.537534767131755 0.842029995061673 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 79786856 G/A 1 11 7 18 5.08711756155069 3.76274336992228 1.32437419162841 A:G G A 10 0.537534767131755 0.639329189576991 ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000335016:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79786711_79786874:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000505725:exon_79786711_79786927:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502613:exon_79786711_79786874:BMP2K HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 83375935 C/T 1 36 37 73 16.6487483832568 19.8887863838749 -3.24003800061811 T:C C T 10 0.537534767131755 0.482162634434936 ENSG00000145293:ENST00000273920:exon_83375875_83376007:ENOPH1;ENSG00000145293:ENST00000509635:exon_83375875_83376007:ENOPH1;ENSG00000145293:ENST00000505846:exon_83375875_83376007:ENOPH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 83795806 T/C 1 25 33 58 11.5616308217061 17.7386473153479 -6.17701649364179 T:C T C 10 0.537534767131755 0.114544932768403 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000436790:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503058:exon_83795764_83795904:SEC31A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 89649659 A/G 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 A:G A G 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000138640:ENST00000395002:exon_89647106_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000264344:exon_89647106_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000341818:exon_89647106_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000511573:exon_89648220_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000509478:exon_89648220_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000503556:exon_89648577_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000511976:exon_89648580_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000508369:exon_89648806_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000513837:exon_89649330_89649810:FAM13A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 90035549 A/G 1 12 8 20 5.54958279441894 4.30027813705404 1.2493046573649 A:G A G 10 0.537534767131755 0.657534137938504 ENSG00000180346:ENST00000317005:exon_90033968_90036050:TIGD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 95496882 C/T 1 6 8 14 2.77479139720947 4.30027813705404 -1.52548673984457 T:C C T 10 0.537534767131755 0.435196015554607 ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95496767_95497185:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000510099:exon_95496767_95497089:PDLIM5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 95561459 A/G 1 17 8 25 7.86190895876017 4.30027813705404 3.56163082170613 A:G A G 10 0.537534767131755 0.165892476302183 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000503974:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000506632:exon_95561427_95561601:PDLIM5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 15 14 29 6.93697849302368 7.52548673984457 -0.588508246820894 A:G A G 10 0.537534767131755 0.854060782439014 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 103557077 G/A 1 7 11 18 3.23725663007772 5.91288243844931 -2.67562580837159 A:G G A 10 0.537534767131755 0.241274942947926 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000508141:exon_103557063_103557164:MANBA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 103968379 C/G 1 12 4 16 5.54958279441894 2.15013906852702 3.39944372589192 C:G C G 10 0.537534767131755 0.130562570499175 ENSG00000164038:ENST00000362026:exon_103968208_103968383:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000506288:exon_103968208_103968383:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000339611:exon_103968208_103968383:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000394785:exon_103968208_103968383:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000503103:exon_103968208_103968383:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000503230:exon_103968208_103968383:NHEDC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 107249244 C/G 1 66 48 114 30.5227053693042 25.8016688223242 4.72103654697993 C:G C G 10 0.537534767131755 0.398816258786779 ENSG00000164022:ENST00000510207:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000442366:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000358008:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394701:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000432345:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394699:exon_107249233_107249400:AIMP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 108575989 G/A 1 20 16 36 9.2493046573649 8.60055627410808 0.648748383256821 A:G G A 10 0.537534767131755 0.868646651133528 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108575851_108576056:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108575851_108576056:PAPSS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 109084821 G/A 1 7 14 21 3.23725663007772 7.52548673984457 -4.28823010976685 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0787793233479286 ENSG00000138795:ENST00000265165:exon_109084724_109084857:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000379951:exon_109084724_109084857:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000510135:exon_109084724_109084857:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000438313:exon_109084724_109084857:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000509428:exon_109084724_109084857:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000510624:exon_109084724_109084857:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000506680:exon_109084724_109084857:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000504775:exon_109084724_109084857:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000415535:exon_109084724_109084857:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000504950:exon_109084724_109084857:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000515500:exon_109084724_109084857:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000510717:exon_109084724_109084857:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000512172:exon_109084724_109084857:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000505293:exon_109084724_109084857:LEF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 35 35 70 16.1862831503886 18.8137168496114 -2.62743369922285 T:C T C 10 0.537534767131755 0.550582065629617 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 156 94 250 72.1445763274462 50.528268110385 21.6163082170613 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0063174951193118 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 113351822 G/A 1 15 10 25 6.93697849302368 5.37534767131755 1.56163082170613 A:G G A 10 0.537534767131755 0.555250283480734 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 113352446 T/A 1 13 16 29 6.01204802728719 8.60055627410808 -2.58850824682089 A:T T A 10 0.537534767131755 0.356879843182363 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 124323738 T/C 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 T:C T C 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000164056:ENST00000339241:exon_124322692_124324907:SPRY1;ENSG00000164056:ENST00000394339:exon_124322692_124324910:SPRY1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 128723042 T/C 1 7 10 17 3.23725663007772 5.37534767131755 -2.13809104123983 T:C T C 10 0.537534767131755 0.337166426523694 ENSG00000164070:ENST00000508776:exon_128722940_128723073:HSPA4L;ENSG00000164070:ENST00000296464:exon_128722940_128723073:HSPA4L;ENSG00000164070:ENST00000508549:exon_128722940_128723073:HSPA4L;ENSG00000164070:ENST00000505726:exon_128722940_128723073:HSPA4L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 128807219 T/A 1 12 9 21 5.54958279441894 4.83781290418579 0.711769890233146 A:T T A 10 0.537534767131755 0.829121193760437 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128806863_128807781:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128806863_128807883:PLK4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 128807874 A/G 1 17 11 28 7.86190895876017 5.91288243844931 1.94902652031086 A:G A G 10 0.537534767131755 0.570669312486509 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128806863_128807883:PLK4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 128814964 G/T 1 14 11 25 6.47451326015543 5.91288243844931 0.561630821706125 T:G G T 10 0.537534767131755 0.844309277033242 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000508113:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814889_128815036:PLK4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 129012638 A/G 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 A:G A G 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000394288:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000432347:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129012502_129012667:LARP1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 129043204 C/G 1 6 8 14 2.77479139720947 4.30027813705404 -1.52548673984457 C:G C G 10 0.537534767131755 0.435196015554607 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 129043286 C/T 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 T:C C T 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507259:exon_129043272_129043343:LARP1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 129100643 G/A 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 A:G G A 10 0.537534767131755 0.760762761058777 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129100561_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129100561_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129100561_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129100561_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507259:exon_129100561_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508648:exon_129100469_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000506199:exon_129100469_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000503725:exon_129100502_129100667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000417169:exon_129100502_129100667:LARP1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 129924977 C/A 0 0 8 8 0 4.30027813705404 -4.30027813705404 A C A 10 0.537534767131755 0.00209234218822997 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129924896_129925031:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000434680:exon_129924896_129925031:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000503215:exon_129924896_129925031:SCLT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 130030644 C/T 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 T:C C T 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 130032843 A/G 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130032841_130034487:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130032841_130033842:C4orf33 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 13 14 27 6.01204802728719 7.52548673984457 -1.51343871255738 A:G G A 10 0.537534767131755 0.569240590365238 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 46 48 94 21.2734007119393 25.8016688223242 -4.52826811038497 T:C T C 10 0.537534767131755 0.353984964785323 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 66 54 120 30.5227053693042 29.0268774251148 1.4958279441894 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.854826231100818 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 146048735 G/C 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 C:G G C 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000164163:ENST00000296577:exon_146048678_146050331:ABCE1;ENSG00000164163:ENST00000455563:exon_146048678_146050676:ABCE1;ENSG00000164163:ENST00000504683:exon_146048678_146048795:ABCE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 148605099 C/A 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 A:C C A 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000164169:ENST00000322396:exon_148604950_148605381:PRMT10;ENSG00000164169:ENST00000514886:exon_148604950_148605276:PRMT10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 148944467 A/G 1 15 14 29 6.93697849302368 7.52548673984457 -0.588508246820894 A:G A G 10 0.537534767131755 0.854060782439014 ENSG00000071205:ENST00000336498:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000414545:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506054:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000507661:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506020:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000513548:exon_148944205_148944564:ARHGAP10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 164085425 T/C 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 A:T:C T C 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000145414:ENST00000422287:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000274054:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000509232:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000502973:exon_164085369_164085543:NAF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 45 25 70 20.810935479071 13.4383691782939 7.37256630077715 A:C:G A C 10 0.537534767131755 0.0927728614252453 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 30 18 48 13.8739569860474 9.67562580837159 4.19833117767576 T:C T C 10 0.537534767131755 0.248655892381401 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 169176996 G/A 1 15 9 24 6.93697849302368 4.83781290418579 2.09916558883788 A:G G A 10 0.537534767131755 0.420607042022665 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169176862_169177020:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000505393:exon_169176862_169177020:DDX60 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 169195109 C/A 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 A:C C A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169195085_169195234:DDX60 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 169197297 C/T 1 3 7 10 1.38739569860474 3.76274336992228 -2.37534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 0.203605394966440 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169197166_169197332:DDX60 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 169928842 G/T 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 T:G G T 10 0.537534767131755 0.593874685143272 ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 169931268 G/A 1 15 3 18 6.93697849302368 1.61260430139526 5.32437419162841 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0157595601610924 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 169931274 G/A 1 15 2 17 6.93697849302368 1.07506953426351 5.86190895876017 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00561304661646287 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 170077789 A/G 1 11 13 24 5.08711756155069 6.98795197271281 -1.90083441116212 A:G A G 10 0.537534767131755 0.540217717608162 ENSG00000154447:ENST00000284637:exon_170077555_170077830:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000511421:exon_170077555_170077808:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000508685:exon_170077555_170077830:SH3RF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 175229911 A/G 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000164118:ENST00000503780:exon_175229840_175230010:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000457424:exon_175229840_175230010:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000396791:exon_175229840_175230010:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000515299:exon_175229840_175229926:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000426172:exon_175229840_175230010:KIAA1712;ENSG00000164118:ENST00000296519:exon_175229840_175230010:KIAA1712 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 4 7 11 1.84986093147298 3.76274336992228 -1.9128824384493 A:G A G 10 0.537534767131755 0.365659915960336 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 184600601 A/G 1 18 9 27 8.32437419162841 4.83781290418579 3.48656128744262 A:G A G 10 0.537534767131755 0.246443933683272 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184600506_184600639:C4orf41 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 184614874 C/T 1 12 8 20 5.54958279441894 4.30027813705404 1.2493046573649 T:C C T 10 0.537534767131755 0.657534137938504 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184614742_184614890:C4orf41 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 184615117 A/C 1 13 6 19 6.01204802728719 3.22520860279053 2.78683942449666 A:C A C 10 0.537534767131755 0.252178981986345 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184615070_184615191:C4orf41 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 154 132 286 71.2196458617097 70.9545892613917 0.265056600318076 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 185686032 C/T 1 28 23 51 12.9490265203109 12.3632996440304 0.585726876280496 T:C C T 10 0.537534767131755 0.889380467031684 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000503407:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185686007_185686079:ACSL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 185687863 A/G 1 18 20 38 8.32437419162841 10.7506953426351 -2.42632115100669 A:G A G 10 0.537534767131755 0.515807132301838 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687776_185687910:ACSL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 185701549 G/T 1 15 18 33 6.93697849302368 9.67562580837159 -2.73864731534791 T:G G T 10 0.537534767131755 0.384603784880895 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504900:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000509038:exon_185701486_185701587:ACSL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 186097045 C/T 1 27 32 59 12.4865612874426 17.2011125482162 -4.71455126077354 T:C C T 10 0.537534767131755 0.240852215468084 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 49 36 85 22.660796410544 19.3512516167432 3.30954479380083 T:C T C 10 0.537534767131755 0.514718898142105 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 20 24 44 9.2493046573649 12.9008344111621 -3.65152975379722 A:G G A 10 0.537534767131755 0.292132245239101 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 3 8 11 1.38739569860474 4.30027813705404 -2.9128824384493 A:G A G 10 0.537534767131755 0.127253645182292 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 187078819 C/G 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 C:G C G 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000109794:ENST00000503432:exon_187078719_187078873:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000356371:exon_187078719_187078873:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000450739:exon_187078719_187078873:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000451202:exon_187078719_187078873:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000515078:exon_187078719_187078873:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000514829:exon_187078719_187078873:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000513030:exon_187078719_187078873:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000227065:exon_187078719_187078873:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000389354:exon_187078719_187078873:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000455421:exon_187078719_187078873:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000502970:exon_187078719_187078873:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000514153:exon_187078719_187078873:FAM149A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 4 187113041 C/G 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 ENSG00000145476:ENST00000378802:exon_187112674_187113191:CYP4V2;ENSG00000145476:ENST00000274118:exon_187112978_187113097:CYP4V2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 231111 T/C 1 130 110 240 60.1204802728719 59.128824384493 0.991655888378808 T:C T C 10 0.537534767131755 0.948405514279915 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_231058_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_231058_231115:SDHA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 126 143 269 58.2706193413989 76.867471699841 -18.5968523584421 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0236908121517252 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 1057615 A/G 1 20 25 45 9.2493046573649 13.4383691782939 -4.18906452092897 A:G A G 10 0.537534767131755 0.233105284269855 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000514994:exon_1057326_1057764:SLC12A7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 1063998 G/A 1 25 19 44 11.5616308217061 10.2131605755033 1.34847024620278 A:G G A 10 0.537534767131755 0.763143132347552 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1063959_1064090:SLC12A7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 1065399 C/T 1 37 31 68 17.1112136161251 16.6635777810844 0.447635835040664 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1065398_1065593:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1065398_1065593:SLC12A7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 1076245 G/A 1 2 7 9 0.92493046573649 3.76274336992228 -2.83781290418579 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0909104192397482 ENSG00000113504:ENST00000504576:exon_1076006_1076351:SLC12A7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 1081702 A/G 1 22 14 36 10.1742351231014 7.52548673984457 2.64874838325682 A:G A G 10 0.537534767131755 0.407433075138691 ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1081692_1081859:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000510943:exon_1081692_1081773:SLC12A7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 1081767 C/T 1 10 17 27 4.62465232868245 9.13809104123983 -4.51343871255738 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0859309769353234 ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1081692_1081859:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000510943:exon_1081692_1081773:SLC12A7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 1479678 G/C 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 C:G G C 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000153395:ENST00000513757:exon_1479591_1479790:LPCAT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 82 60 142 37.9221490951961 32.2520860279053 5.67006306729079 T:C C T 10 0.537534767131755 0.355497960258403 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 5460569 C/T 1 14 10 24 6.47451326015543 5.37534767131755 1.09916558883788 T:C C T 10 0.537534767131755 0.68779414869778 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 5460619 G/C 1 10 5 15 4.62465232868245 2.68767383565877 1.93697849302368 C:G G C 10 0.537534767131755 0.43901451829475 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 5462148 G/A 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 0.593874685143272 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 5463668 C/T 1 14 13 27 6.47451326015543 6.98795197271281 -0.513438712557384 T:C C T 10 0.537534767131755 0.849618756712184 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 5469047 A/G 1 9 15 24 4.16218709581421 8.06302150697632 -3.90083441116212 A:G A G 10 0.537534767131755 0.150631669869192 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5468941_5469101:KIAA0947 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 6600150 G/A 1 162 142 304 74.9193677246557 76.3299369327092 -1.4105692080535 A:G G A 10 0.537534767131755 0.908445238246687 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6600143_6600345:NSUN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 6633779 C/G 1 16 36 52 7.39944372589192 19.3512516167432 -11.9518078908513 C:G C G 10 0.537534767131755 0.00116601661051391 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 7870973 A/G 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 A:G A G 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508047:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000503550:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000502550:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000506877:exon_7870883_7871030:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512217:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7870883_7871036:MTRR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 7878192 T/C 1 9 12 21 4.16218709581421 6.45041720558106 -2.28823010976685 T:C T C 10 0.537534767131755 0.383405862328562 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7878057_7878262:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514220:exon_7878057_7878348:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 7885959 A/G 1 9 13 22 4.16218709581421 6.98795197271281 -2.82576487689861 A:G A G 10 0.537534767131755 0.285838202231404 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7885898_7885967:MTRR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 7897191 C/T 1 20 18 38 9.2493046573649 9.67562580837159 -0.426321151006688 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508354:exon_7897178_7897213:MTRR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 7897283 G/A 1 21 42 63 9.71176989023315 22.5764602195337 -12.8646903293006 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00140758057101497 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 7897319 G/A 1 32 15 47 14.7988874517838 8.06302150697632 6.73586594480752 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0567476052788784 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 10239261 G/A 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 A:G G A 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 10761182 A/G 1 38 33 71 17.5736788489933 17.7386473153479 -0.164968466354605 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000112977:ENST00000230895:exon_10761126_10761384:DAP;ENSG00000112977:ENST00000360512:exon_10761126_10761344:DAP;ENSG00000112977:ENST00000432074:exon_10761126_10761340:DAP;ENSG00000112977:ENST00000514882:exon_10761126_10761248:DAP;ENSG00000112977:ENST00000508253:exon_10761126_10761337:DAP;ENSG00000112977:ENST00000510546:exon_10761126_10761311:DAP;ENSG00000112977:ENST00000508646:exon_10761126_10761213:DAP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 14420027 A/C 1 14 23 37 6.47451326015543 12.3632996440304 -5.88878638387493 A:C A C 10 0.537534767131755 0.0684765260749639 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509354:exon_14419887_14420295:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512979:exon_14419887_14420130:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000507714:exon_14419923_14420130:TRIO HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 14498727 G/A 1 28 21 49 12.9490265203109 11.2882301097669 1.66079641054401 A:G G A 10 0.537534767131755 0.66956482405961 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000344135:exon_14498628_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508343:exon_14498628_14499290:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508283:exon_14498625_14498749:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508717:exon_14498625_14498749:TRIO HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 14508347 A/T 1 59 47 106 27.2854487392265 25.2641340551925 2.02131468403397 A:T A T 10 0.537534767131755 0.770285855792986 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14507989_14510313:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14507989_14508785:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000344135:exon_14507989_14510312:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508717:exon_14507989_14508442:TRIO HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 17353999 T/A 0 427 0 427 197.472654434741 0 197.472654434741 T T 10 0.537534767131755 8.15965497781937e-116 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 17354033 C/T 0 50 0 50 23.1232616434123 0 23.1232616434123 C C 10 0.537534767131755 6.3898244440665e-14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 17 16 33 7.86190895876017 8.60055627410808 -0.738647315347913 A:G A G 10 0.537534767131755 0.862168191265843 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 32263226 A/T 1 10 10 20 4.62465232868245 5.37534767131755 -0.750695342635099 A:T A T 10 0.537534767131755 0.824049778597606 ENSG00000150712:ENST00000280285:exon_32263219_32263348:MTMR12;ENSG00000150712:ENST00000382142:exon_32263219_32263348:MTMR12;ENSG00000150712:ENST00000264934:exon_32263219_32263348:MTMR12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 32400266 A/G 1 24 28 52 11.0991655888379 15.0509734796891 -3.95180789085126 A:G A G 10 0.537534767131755 0.330367827822785 ENSG00000056097:ENST00000265069:exon_32400112_32400308:ZFR;ENSG00000056097:ENST00000382126:exon_32400112_32400308:ZFR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 32403346 C/T 1 18 22 40 8.32437419162841 11.8257648768986 -3.5013906852702 T:C C T 10 0.537534767131755 0.272221699943599 ENSG00000056097:ENST00000265069:exon_32403211_32403502:ZFR;ENSG00000056097:ENST00000382126:exon_32403211_32403502:ZFR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 33998768 C/A 1 14 4 18 6.47451326015543 2.15013906852702 4.32437419162841 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0563146448740562 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33998746_33998887:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33998746_33998932:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33998746_33998932:C1QTNF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 43175103 C/T 1 18 15 33 8.32437419162841 8.06302150697632 0.261352684652087 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000172262:ENST00000510026:exon_43174549_43175836:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000509156:exon_43174549_43175390:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000306938:exon_43174549_43175821:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000399534:exon_43174549_43175821:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000505606:exon_43174549_43176342:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000509634:exon_43174549_43176349:ZNF131 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 43645557 A/G 1 23 28 51 10.6367003559696 15.0509734796891 -4.4142731237195 A:G A G 10 0.537534767131755 0.261138141377190 ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43645459_43645612:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43645459_43645612:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43645459_43645612:NNT;ENSG00000112992:ENST00000506893:exon_43645459_43645767:NNT;ENSG00000112992:ENST00000503651:exon_43645459_43645612:NNT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 50057729 G/A 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 A:G G A 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000151883:ENST00000505697:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000511363:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503888:exon_50057655_50057736:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000510303:exon_50057655_50057736:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000281631:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503707:exon_50057655_50057734:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000514067:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000423185:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503193:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000515166:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000505554:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000505180:exon_50057655_50057734:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503561:exon_50057655_50057732:PARP8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 5 9 14 2.31232616434123 4.83781290418579 -2.52548673984457 C:G G C 10 0.537534767131755 0.191403008406876 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 55264153 C/G 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 C:G C G 10 0.537534767131755 0.190750883746296 ENSG00000134352:ENST00000381298:exon_55264104_55264224:IL6ST;ENSG00000134352:ENST00000336909:exon_55264104_55264224:IL6ST;ENSG00000134352:ENST00000381294:exon_55264104_55264224:IL6ST;ENSG00000134352:ENST00000381287:exon_55264104_55264224:IL6ST;ENSG00000134352:ENST00000503773:exon_55264104_55264224:IL6ST;ENSG00000134352:ENST00000502326:exon_55264104_55264224:IL6ST;ENSG00000134352:ENST00000522633:exon_55264104_55264224:IL6ST HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 56178111 A/G 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 A:G A G 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000095015:ENST00000399503:exon_56177397_56178693:MAP3K1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 64267595 T/C 1 18 16 34 8.32437419162841 8.60055627410808 -0.276182082479668 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 18 13 31 8.32437419162841 6.98795197271281 1.3364222189156 A:G G A 10 0.537534767131755 0.720009446141645 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 65108215 A/G 1 20 23 43 9.2493046573649 12.3632996440304 -3.11399498666546 A:G A G 10 0.537534767131755 0.36185668546171 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 65350374 A/G 1 65 45 110 30.0602401364359 24.189064520929 5.87117561550695 A:G A G 10 0.537534767131755 0.293063195263223 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 65350481 C/T 1 36 35 71 16.6487483832568 18.8137168496114 -2.1649684663546 T:C C T 10 0.537534767131755 0.635197727553521 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511671:exon_65350461_65350779:ERBB2IP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 65474723 A/G 1 18 20 38 8.32437419162841 10.7506953426351 -2.42632115100669 A:G A G 10 0.537534767131755 0.515807132301838 ENSG00000153914:ENST00000334121:exon_65474547_65479443:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000520953:exon_65474547_65475007:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000380918:exon_65474547_65474942:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000284041:exon_65474547_65476639:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000519259:exon_65474547_65476707:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000522214:exon_65474547_65474865:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000519205:exon_65474547_65474767:SREK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 67522722 C/T 1 14 13 27 6.47451326015543 6.98795197271281 -0.513438712557384 T:C C T 10 0.537534767131755 0.849618756712184 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67522118_67522837:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67522118_67522837:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000517412:exon_67522265_67522837:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67522462_67522837:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67522462_67522837:PIK3R1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 67588148 G/A 1 8 4 12 3.69972186294596 2.15013906852702 1.54958279441894 A:G G A 10 0.537534767131755 0.403872211149876 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000523807:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000522084:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000320694:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000336483:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518292:exon_67588087_67588189:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518813:exon_67586628_67588189:PIK3R1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 68695940 T/G 1 25 29 54 11.5616308217061 15.5885082468209 -4.02687742511477 T:G T G 10 0.537534767131755 0.278408641129857 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000513214:exon_68695876_68695996:RAD17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 18 9 27 8.32437419162841 4.83781290418579 3.48656128744262 A:G G A 10 0.537534767131755 0.246443933683272 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 A:T T A 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 70809169 A/G 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70809012_70809234:BDP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 70840233 C/T 1 11 4 15 5.08711756155069 2.15013906852702 2.93697849302368 T:C C T 10 0.537534767131755 0.194241334120294 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70840184_70840334:BDP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 70858194 C/T 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70858101_70858347:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70858101_70858347:BDP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 72801012 C/G 1 14 2 16 6.47451326015543 1.07506953426351 5.39944372589192 C:G C G 10 0.537534767131755 0.00967820628712213 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 73985215 A/G 1 15 23 38 6.93697849302368 12.3632996440304 -5.42632115100669 A:G A G 10 0.537534767131755 0.102589905124565 ENSG00000049860:ENST00000511181:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000515528:exon_73985153_73985674:HEXB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 75003678 T/C 1 5 16 21 2.31232616434123 8.60055627410808 -6.28823010976685 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00745893511257336 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000507421:exon_75003309_75003700:POC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 19 19 38 8.78683942449666 10.2131605755033 -1.42632115100669 T:C T C 10 0.537534767131755 0.745416232968685 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 78181423 C/T 1 8 1 9 3.69972186294596 0.537534767131755 3.16218709581421 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0438485425040058 ENSG00000113273:ENST00000264914:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000341088:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000396151:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000521800:exon_78181407_78181653:ARSB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 79950508 C/T 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000228716:ENST00000439211:exon_79950223_79950802:DHFR;ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_79950467_79950783:MSH3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 79950512 A/G 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000228716:ENST00000439211:exon_79950223_79950802:DHFR;ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_79950467_79950783:MSH3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 94050487 T/A 1 15 6 21 6.93697849302368 3.22520860279053 3.71176989023315 A:T T A 10 0.537534767131755 0.126762028126778 ENSG00000175471:ENST00000514040:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94050482_94050591:MCTP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 95234350 A/G 1 17 3 20 7.86190895876017 1.61260430139526 6.2493046573649 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00577471116463532 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 95234377 C/T 1 20 1 21 9.2493046573649 0.537534767131755 8.71176989023315 T:C C T 10 0.537534767131755 7.02020271182279e-05 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 95234392 A/C 0 15 0 15 6.93697849302368 0 6.93697849302368 A A 10 0.537534767131755 9.985185379709e-05 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 95236415 G/A 1 19 15 34 8.78683942449666 8.06302150697632 0.72381791752033 A:G G A 10 0.537534767131755 0.864547358513853 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 95236459 C/T 1 9 10 19 4.16218709581421 5.37534767131755 -1.21316057550334 T:C C T 10 0.537534767131755 0.648761877832002 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 96076487 G/A 1 57 2 59 26.36051827349 1.07506953426351 25.2854487392265 A:G G A 10 0.537534767131755 1.79026056932223e-13 ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000421689:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512620:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96076449_96076487:CAST HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 37 1 38 17.1112136161251 0.537534767131755 16.5736788489933 T:G G T 10 0.537534767131755 2.10517498024854e-09 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 1 42 5 47 19.4235397804663 2.68767383565877 16.7358659448075 A:T T A 10 0.537534767131755 2.15664182835859e-07 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 96237326 G/A 1 29 3 32 13.4114917531791 1.61260430139526 11.7988874517838 A:G G A 10 0.537534767131755 9.81083435500798e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96237210_96237385:ERAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 96244638 A/G 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 0.484098982011234 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 40 4 44 18.4986093147298 2.15013906852702 16.3484702462028 T:C C T 10 0.537534767131755 1.51421378277791e-07 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 47 9 56 21.7358659448075 4.83781290418579 16.8980530406217 T:C C T 10 0.537534767131755 2.74883373271623e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 44 5 49 20.3484702462028 2.68767383565877 17.660796410544 T:C C T 10 0.537534767131755 7.4413310612214e-08 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 11 11 22 5.08711756155069 5.91288243844931 -0.82576487689861 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.831602284580484 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 28 15 43 12.9490265203109 8.06302150697632 4.88600501333454 T:C C T 10 0.537534767131755 0.168286171091427 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 8 5 13 3.69972186294596 2.68767383565877 1.01204802728719 C:G G C 10 0.537534767131755 0.782310374824685 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 98199204 C/T 1 7 12 19 3.23725663007772 6.45041720558106 -3.21316057550334 T:C C T 10 0.537534767131755 0.169147725225653 ENSG00000153922:ENST00000514344:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000284049:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000505657:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000511067:exon_98199112_98199290:CHD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 102203082 G/T 1 10 11 21 4.62465232868245 5.91288243844931 -1.28823010976685 T:G G T 10 0.537534767131755 0.663607311505883 ENSG00000145730:ENST00000511839:exon_102202977_102203092:PAM;ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102202977_102203097:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102202977_102203097:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102202977_102203097:PAM;ENSG00000145730:ENST00000513648:exon_102202977_102203097:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102202977_102203097:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102202977_102203097:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102202977_102203097:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102202977_102203097:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102202977_102203097:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102202977_102203097:PAM;ENSG00000145730:ENST00000509636:exon_102202977_102203097:PAM;ENSG00000145730:ENST00000432578:exon_102202975_102203097:PAM HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 107197502 G/A 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 A:G G A 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000145743:ENST00000359660:exon_107194736_107197561:FBXL17 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 108672946 C/T 1 11 16 27 5.08711756155069 8.60055627410808 -3.51343871255738 T:C C T 10 0.537534767131755 0.182777781405979 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108670410_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108670411_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108670411_108673057:PJA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 112868693 C/A 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 A:C C A 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112868576_112868742:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000503857:exon_112868576_112868742:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000515883:exon_112868576_112868742:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112868576_112868742:YTHDC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 112889374 G/A 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000503857:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000515883:exon_112889287_112889383:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112889287_112889383:YTHDC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 112899702 A/G 1 7 8 15 3.23725663007772 4.30027813705404 -1.06302150697632 A:G A G 10 0.537534767131755 0.61360765893613 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112899556_112899828:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112899556_112899828:YTHDC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 112917278 T/G 1 8 12 20 3.69972186294596 6.45041720558106 -2.7506953426351 T:G T G 10 0.537534767131755 0.264201895405952 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112917114_112917406:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112917114_112917406:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112916963_112920176:YTHDC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 20 19 39 9.2493046573649 10.2131605755033 -0.963855918138444 A:T:C T A 10 0.537534767131755 0.751619676840612 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 115428381 T/G 1 7 8 15 3.23725663007772 4.30027813705404 -1.06302150697632 T:G T G 10 0.537534767131755 0.61360765893613 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 121309893 T/C 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 T:C T C 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121309891_121309979:SRFBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 121356189 T/A 1 19 15 34 8.78683942449666 8.06302150697632 0.72381791752033 A:T T A 10 0.537534767131755 0.864547358513853 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 122682334 C/T 1 9 15 24 4.16218709581421 8.06302150697632 -3.90083441116212 T:C C T 10 0.537534767131755 0.150631669869192 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 122685727 C/G 1 13 6 19 6.01204802728719 3.22520860279053 2.78683942449666 C:G C G 10 0.537534767131755 0.252178981986345 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122685638_122685783:CEP120 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 122718736 G/C 1 17 7 24 7.86190895876017 3.76274336992228 4.09916558883788 C:G G C 10 0.537534767131755 0.104256192462200 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122718713_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122718719_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122718680_122718776:CEP120 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 122727026 G/A 1 10 6 16 4.62465232868245 3.22520860279053 1.39944372589192 A:G G A 10 0.537534767131755 0.618373054653884 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000395431:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000503049:exon_122726603_122727031:CEP120 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 40 49 89 18.4986093147298 26.339203589456 -7.84059427472619 A:G G A 10 0.537534767131755 0.110489444545303 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 128430757 T/C 1 62 53 115 28.6728444378312 28.489342657983 0.183501779848179 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000066583:ENST00000506986:exon_128430529_128430768:ISOC1;ENSG00000066583:ENST00000173527:exon_128430444_128430768:ISOC1;ENSG00000066583:ENST00000513879:exon_128430530_128430768:ISOC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 130766662 T/C 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000158987:ENST00000509018:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000512611:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000507093:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000296859:exon_130766552_130767042:RAPGEF6;ENSG00000158987:ENST00000358714:exon_130766547_130767042:RAPGEF6;ENSG00000217128:ENST00000514667:exon_130766552_130767042:FNIP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 131602166 T/C 0 10 0 10 4.62465232868245 0 4.62465232868245 T T 10 0.537534767131755 0.00246152619115420 ENSG00000131435:ENST00000253754:exon_131602157_131602238:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000463615:exon_131602157_131602454:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000379018:exon_131602157_131602238:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000418373:exon_131602157_131602238:PDLIM4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 132083458 G/C 1 37 55 92 17.1112136161251 29.5644121922465 -12.4531985761215 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0116940676197730 ENSG00000205089:ENST00000378731:exon_132083137_132083616:CCNI2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 132096477 C/T 1 11 11 22 5.08711756155069 5.91288243844931 -0.82576487689861 T:C C T 10 0.537534767131755 0.831602284580484 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 132099999 A/G 1 45 59 104 20.810935479071 31.7145512607735 -10.9036157817025 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0384459906888918 ENSG00000164402:ENST00000378719:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378721:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132099951_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378701:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000458488:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371478:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000453480:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000414594:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371493:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000481794:exon_132099653_132100111:SEPT8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 132159134 C/T 1 8 12 20 3.69972186294596 6.45041720558106 -2.7506953426351 T:C C T 10 0.537534767131755 0.264201895405952 ENSG00000164403:ENST00000378679:exon_132158942_132159214:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000440998:exon_132158942_132159214:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000319854:exon_132158942_132159214:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000378676:exon_132158942_132159214:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000355404:exon_132158942_132159214:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000488072:exon_132158975_132159214:SHROOM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 132160057 C/T 1 18 8 26 8.32437419162841 4.30027813705404 4.02409605457437 T:C C T 10 0.537534767131755 0.120546606575642 ENSG00000164403:ENST00000378679:exon_132159542_132160111:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000440998:exon_132159542_132160111:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000319854:exon_132159542_132160111:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000378676:exon_132159542_132160111:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000355404:exon_132159542_132160111:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000495680:exon_132159973_132160111:SHROOM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 132161294 G/A 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 A:G G A 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000164403:ENST00000378679:exon_132160855_132161874:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000440998:exon_132160855_132161874:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000319854:exon_132160855_132162002:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000378676:exon_132160855_132161832:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000355404:exon_132160855_132161874:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000440118:exon_132160861_132161874:SHROOM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 132232315 G/A 1 12 4 16 5.54958279441894 2.15013906852702 3.39944372589192 A:G G A 10 0.537534767131755 0.130562570499175 ENSG00000072364:ENST00000265343:exon_132232015_132232932:AFF4;ENSG00000072364:ENST00000378595:exon_132232015_132232932:AFF4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 133897913 G/A 1 56 77 133 25.8980530406217 41.3901770691451 -15.4921240285234 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00883676027060055 ENSG00000043143:ENST00000282605:exon_133897890_133898057:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000361895:exon_133897890_133898057:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000432594:exon_133897890_133898057:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000413974:exon_133897890_133898057:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000433412:exon_133897890_133898057:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000458562:exon_133897890_133898057:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000448712:exon_133897890_133898057:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000402835:exon_133897890_133898057:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000395003:exon_133897890_133898057:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000431355:exon_133897890_133897970:PHF15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 133956668 G/A 1 17 8 25 7.86190895876017 4.30027813705404 3.56163082170613 A:G G A 10 0.537534767131755 0.165892476302183 ENSG00000152700:ENST00000402673:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000507419:exon_133956623_133956691:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000394992:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000282606:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000439578:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000503318:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000505758:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000502286:exon_133956623_133956742:SAR1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 134191089 A/G 1 13 14 27 6.01204802728719 7.52548673984457 -1.51343871255738 A:G A G 10 0.537534767131755 0.569240590365238 ENSG00000181904:ENST00000338051:exon_134190588_134194799:C5orf24;ENSG00000181904:ENST00000394976:exon_134190588_134195427:C5orf24;ENSG00000181904:ENST00000435259:exon_134190588_134191178:C5orf24 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 137500665 G/A 1 32 28 60 14.7988874517838 15.0509734796891 -0.252086027905298 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000112983:ENST00000254900:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000230901:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000454473:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000418329:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000441656:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000402931:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000411594:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000239899:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000455658:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000512140:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000506167:exon_137500403_137500855:BRD8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 139907810 A/G 1 37 33 70 17.1112136161251 17.7386473153479 -0.627433699222848 A:G A G 10 0.537534767131755 0.905006713210969 ENSG00000131503:ENST00000360839:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000422011:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000253810:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000310356:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000297183:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000431508:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000433049:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000435794:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000432301:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000254996:ENST00000532219:exon_139907769_139909381:ANKHD1-EIF4EBP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 139938369 C/T 1 15 9 24 6.93697849302368 4.83781290418579 2.09916558883788 T:C C T 10 0.537534767131755 0.420607042022665 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139937853_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000358580:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139937979_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139938170_139938406:APBB3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 139940302 G/A 1 19 17 36 8.78683942449666 9.13809104123983 -0.351251616743179 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139940284_139940339:APBB3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 141391532 G/A 1 12 8 20 5.54958279441894 4.30027813705404 1.2493046573649 A:G G A 10 0.537534767131755 0.657534137938504 ENSG00000113552:ENST00000513454:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000311337:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000500692:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000458112:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000508177:exon_141391477_141392359:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503794:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504139:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000505689:exon_141391414_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000510194:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503229:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000507107:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504424:exon_141391514_141391606:GNPDA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 149772287 G/A 1 38 47 85 17.5736788489933 25.2641340551925 -7.69045520619917 A:G G A 10 0.537534767131755 0.102956710104917 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149771520_149774479:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506630:exon_149772268_149772454:TCOF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 149900802 G/T 1 14 7 21 6.47451326015543 3.76274336992228 2.71176989023315 T:G G T 10 0.537534767131755 0.278003094604447 ENSG00000070614:ENST00000522491:exon_149900430_149901020:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149900430_149901329:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000518299:exon_149900430_149900885:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149900430_149901329:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149900430_149901329:NDST1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 149907533 T/G 1 18 27 45 8.32437419162841 14.5134387125574 -6.18906452092897 T:G T G 10 0.537534767131755 0.0728937953595564 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149907366_149907860:NDST1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 149907641 C/T 1 24 17 41 11.0991655888379 9.13809104123983 1.96107454759805 T:C C T 10 0.537534767131755 0.639094020728528 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149907366_149907860:NDST1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 149912527 C/T 1 18 19 37 8.32437419162841 10.2131605755033 -1.88878638387493 T:C C T 10 0.537534767131755 0.6216025772515 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149912507_149912594:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149912507_149912594:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149912507_149912594:NDST1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 150090781 C/T 1 22 21 43 10.1742351231014 11.2882301097669 -1.11399498666546 T:C C T 10 0.537534767131755 0.761428471804822 ENSG00000132912:ENST00000447998:exon_150088002_150090924:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000255263:exon_150088002_150090924:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000424236:exon_150088310_150090924:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000446090:exon_150090420_150090924:DCTN4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 150097883 G/C 1 12 8 20 5.54958279441894 4.30027813705404 1.2493046573649 C:G G C 10 0.537534767131755 0.657534137938504 ENSG00000132912:ENST00000447998:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000255263:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000424236:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000446090:exon_150097838_150097945:DCTN4;ENSG00000132912:ENST00000518909:exon_150097838_150097945:DCTN4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 150425467 G/A 1 322 252 574 148.913804983575 135.458761317202 13.4550436663726 A:G G A 10 0.537534767131755 0.276460278429904 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521782:exon_150425422_150425922:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150425427_150425511:TNIP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 351 430 781 162.325296736754 231.139949866655 -68.8146531299006 A:T:C:G A G 10 0.537534767131755 8.39963891181161e-07 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 150578574 A/G 1 82 94 176 37.9221490951961 50.528268110385 -12.6061190151889 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0589407129967747 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 150584981 C/G 1 57 56 113 26.36051827349 30.1019469593783 -3.74142868588831 C:G C G 10 0.537534767131755 0.509574734522115 ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150584961_150585038:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000421260:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522179:exon_150584961_150585036:CCDC69 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 150632832 G/A 1 123 92 215 56.8832236427941 49.4531985761215 7.43002506667268 A:G G A 10 0.537534767131755 0.338371652340316 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150632453_150632858:GM2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 150639409 A/G 1 111 129 240 51.3336408483752 69.3419849599964 -18.0083441116212 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0232723184546321 ENSG00000196743:ENST00000523466:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000523004:exon_150639360_150639477:GM2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 150647040 C/T 1 180 153 333 83.2437419162841 82.2428193711585 1.0009225451256 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.956185607555495 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 151043103 G/C 1 14 14 28 6.47451326015543 7.52548673984457 -1.05097347968914 C:G G C 10 0.537534767131755 0.708746900580582 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151040657_151043160:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000520687:exon_151042049_151043160:SPARC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 151054227 T/C 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 T:C T C 10 0.537534767131755 0.593874685143272 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151054173_151054235:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000521327:exon_151054173_151054235:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000522348:exon_151054173_151054235:SPARC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 24 25 49 11.0991655888379 13.4383691782939 -2.33920358945599 T:C T C 10 0.537534767131755 0.567314507896408 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 159912418 C/G 1 8 16 24 3.69972186294596 8.60055627410808 -4.90083441116212 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0633610479446073 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 167937607 G/A 1 52 58 110 24.0481921091487 31.1770164936418 -7.12882438449304 A:G G A 10 0.537534767131755 0.181434430036773 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167937586_167937691:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167937586_167937691:RARS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 169435713 A/C 1 83 66 149 38.3846143280643 35.4772946306958 2.90731969736851 A:C A C 10 0.537534767131755 0.681441890390975 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169435692_169435750:DOCK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 96 90 186 44.3966623553515 48.3781290418579 -3.98146668650642 C:G C G 10 0.537534767131755 0.55747966164557 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 88 71 159 40.6969404924056 38.1649684663546 2.53197202605096 T:C C T 10 0.537534767131755 0.75050720245135 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 94 83 177 43.471731889615 44.6153856719357 -1.14365378232063 A:G A G 10 0.537534767131755 0.880360069222925 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 171533629 A/G 1 102 91 193 47.171453752561 48.9156638089897 -1.74421005642871 A:G A G 10 0.537534767131755 0.828706706991412 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 171533656 C/T 1 88 64 152 40.6969404924056 34.4022250964323 6.29471539597324 T:C C T 10 0.537534767131755 0.329372537882558 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 171533782 T/C 1 75 80 155 34.6848924651184 43.0027813705404 -8.31788890542202 T:C T C 10 0.537534767131755 0.197465894950258 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 175958648 C/T 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 T:C C T 10 0.537534767131755 0.357514540525421 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 10 8 18 4.62465232868245 4.30027813705404 0.324374191628411 T:G G T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 35 21 56 16.1862831503886 11.2882301097669 4.89805304062172 A:G G A 10 0.537534767131755 0.227713284794524 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 176520243 G/A 1 8 5 13 3.69972186294596 2.68767383565877 1.01204802728719 A:G G A 10 0.537534767131755 0.782310374824685 ENSG00000160867:ENST00000292408:exon_176520139_176520332:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000502906:exon_176520139_176520332:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000377207:exon_176520069_176520332:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000508139:exon_176520139_176520497:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000511076:exon_176520176_176520332:FGFR4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 176673773 G/T 1 15 10 25 6.93697849302368 5.37534767131755 1.56163082170613 T:G G T 10 0.537534767131755 0.555250283480734 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176673679_176673797:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176673679_176673797:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176673679_176673797:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176673679_176673797:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176673679_176673797:NSD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 90 116 206 41.6218709581421 62.3540329872836 -20.7321620291415 A:C:G G C 10 0.537534767131755 0.00410396999351606 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 55 57 112 25.4355878077535 30.63948172651 -5.20389391875656 A:G A G 10 0.537534767131755 0.344000734416356 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 73 42 115 33.7599619993819 22.5764602195337 11.1835017798482 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0394993498490612 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 176915143 C/T 1 33 22 55 15.2613526846521 11.8257648768986 3.43558780775348 T:C C T 10 0.537534767131755 0.417568668418272 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176914898_176915249:PDLIM7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 176931706 G/C 1 24 40 64 11.0991655888379 21.5013906852702 -10.4022250964323 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0116201150649901 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 176958397 G/A 1 15 15 30 6.93697849302368 8.06302150697632 -1.12604301395265 A:G G A 10 0.537534767131755 0.716938089677859 ENSG00000146067:ENST00000510479:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506955:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000329540:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000510163:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000524677:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000442143:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000443375:exon_176958283_176958522:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000513502:exon_176958283_176958835:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506064:exon_176958339_176958522:FAM193B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 177483154 T/A 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 A:T T A 10 0.537534767131755 0.190750883746296 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 177657120 G/A 1 10 14 24 4.62465232868245 7.52548673984457 -2.90083441116212 A:G G A 10 0.537534767131755 0.306252553826296 ENSG00000175309:ENST00000510991:exon_177656941_177657321:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000506001:exon_177656941_177657307:AGXT2L2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 28 33 61 12.9490265203109 17.7386473153479 -4.78962079503705 A:G G A 10 0.537534767131755 0.248182549522131 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 179045142 G/A 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 A:G G A 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 179195867 G/A 1 16 23 39 7.39944372589192 12.3632996440304 -4.96385591813844 A:G G A 10 0.537534767131755 0.147444815523230 ENSG00000161021:ENST00000292599:exon_179195851_179196090:MAML1;ENSG00000161021:ENST00000376951:exon_179195851_179196090:MAML1;ENSG00000161021:ENST00000503050:exon_179195851_179196090:MAML1;ENSG00000161021:ENST00000507385:exon_179195853_179196090:MAML1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 79 83 162 36.5347533965914 44.6153856719357 -8.08063227534431 T:G T G 10 0.537534767131755 0.208206865497372 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 76 93 169 35.1473576979866 49.9907333432532 -14.8433756452666 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0250457487186551 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 180219984 C/T 1 45 49 94 20.810935479071 26.339203589456 -5.52826811038497 T:C C T 10 0.537534767131755 0.257141613355099 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000504671:exon_180219373_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000506889:exon_180219511_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000514283:exon_180219590_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000512695:exon_180219625_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000506269:exon_180219638_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000514438:exon_180219658_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000502678:exon_180219662_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000513431:exon_180219686_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000507384:exon_180219870_180220097:MGAT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 180622615 C/T 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 T:C C T 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000146054:ENST00000274773:exon_180620924_180622677:TRIM7;ENSG00000146054:ENST00000361809:exon_180620925_180622677:TRIM7;ENSG00000146054:ENST00000393315:exon_180620925_180622677:TRIM7;ENSG00000146054:ENST00000504241:exon_180620930_180625218:TRIM7;ENSG00000146054:ENST00000393319:exon_180621613_180622677:TRIM7;ENSG00000146054:ENST00000422067:exon_180621613_180622677:TRIM7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 180651231 G/A 1 11 20 31 5.08711756155069 10.7506953426351 -5.6635777810844 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0475396172192115 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 180669136 C/T 1 18 13 31 8.32437419162841 6.98795197271281 1.3364222189156 T:C C T 10 0.537534767131755 0.720009446141645 ENSG00000204628:ENST00000513060:exon_180668492_180669345:GNB2L1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 180686958 C/T 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 5 180687212 C/T 1 8 10 18 3.69972186294596 5.37534767131755 -1.67562580837159 T:C C T 10 0.537534767131755 0.483452727703955 ENSG00000183718:ENST00000327767:exon_180687002_180688119:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000510796:exon_180687002_180687258:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000503005:exon_180687002_180687325:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000514805:exon_180687002_180688082:TRIM52 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 73 94 167 33.7599619993819 50.528268110385 -16.7683061110031 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0102966462603362 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 397290 T/C 1 11 9 20 5.08711756155069 4.83781290418579 0.249304657364901 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000137265:ENST00000495137:exon_397108_397546:IRF4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 564145 A/G 1 19 9 28 8.78683942449666 4.83781290418579 3.94902652031086 A:G A G 10 0.537534767131755 0.183784224314788 ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_564033_564154:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_564033_564154:EXOC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 1742794 A/G 1 21 19 40 9.71176989023315 10.2131605755033 -0.501390685270199 A:G A G 10 0.537534767131755 0.875575656246707 ENSG00000112699:ENST00000530927:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380815:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380805:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000531690:exon_1742702_1742820:GMDS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 26 19 45 12.0240960545744 10.2131605755033 1.81093547907103 A:G G A 10 0.537534767131755 0.655010543384384 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 3010337 A/G 1 7 10 17 3.23725663007772 5.37534767131755 -2.13809104123983 A:G A G 10 0.537534767131755 0.337166426523694 ENSG00000124588:ENST00000426637:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380441:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380454:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3010259_3010423:NQO2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 3015865 C/T 1 9 1 10 4.16218709581421 0.537534767131755 3.62465232868245 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0249904918483396 ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3015764_3015877:NQO2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 3077141 T/C 1 2 10 12 0.92493046573649 5.37534767131755 -4.45041720558106 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0165545198603437 ENSG00000137275:ENST00000259808:exon_3076998_3077221:RIPK1;ENSG00000137275:ENST00000380409:exon_3077058_3077221:RIPK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 29 38 67 13.4114917531791 20.4263211510067 -7.01482939782758 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0877588853795902 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 29 18 47 13.4114917531791 9.67562580837159 3.73586594480752 A:G G A 10 0.537534767131755 0.307542982653534 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 4998963 A/G 1 5 9 14 2.31232616434123 4.83781290418579 -2.52548673984457 A:G A G 10 0.537534767131755 0.191403008406876 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 5431340 A/G 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 A:G A G 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000445533:exon_5431274_5431405:FARS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 6318795 C/A 1 18 27 45 8.32437419162841 14.5134387125574 -6.18906452092897 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0728937953595564 ENSG00000124491:ENST00000264870:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000441301:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000379960:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000414279:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000431222:exon_6318768_6318915:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000451619:exon_6318768_6318915:F13A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 7211818 G/A 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7211806_7211942:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7211806_7211942:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7211806_7211942:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7211806_7211942:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000475946:exon_7211806_7219324:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000483150:exon_7211806_7211942:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7211806_7211942:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7211806_7211942:RREB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 7230680 G/T 1 12 9 21 5.54958279441894 4.83781290418579 0.711769890233146 T:G G T 10 0.537534767131755 0.829121193760437 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7230073_7232140:RREB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 7231843 G/A 1 19 22 41 8.78683942449666 11.8257648768986 -3.03892545240195 A:G G A 10 0.537534767131755 0.351912696931157 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000334984:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7229230_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7230073_7232140:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000397521:exon_7231813_7232140:RREB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 7247248 T/C 1 20 17 37 9.2493046573649 9.13809104123983 0.111213616125067 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7247244_7247454:RREB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 7310259 A/G 1 44 41 85 20.3484702462028 22.038925452402 -1.69045520619918 A:G A G 10 0.537534767131755 0.744831548296024 ENSG00000124783:ENST00000474597:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000244763:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000397511:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000489567:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000479365:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000462112:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000488834:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000483409:exon_7310150_7310262:SSR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 7889088 A/G 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000239264:ENST00000460138:exon_7888938_7889678:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000475802:exon_7888938_7889194:TXNDC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 8413890 A/G 1 8 2 10 3.69972186294596 1.07506953426351 2.62465232868245 A:G A G 10 0.537534767131755 0.119280745126671 ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 11190626 A/G 1 37 32 69 17.1112136161251 17.2011125482162 -0.0898989320910921 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11190197_11191438:NEDD9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 12122773 T/C 1 17 7 24 7.86190895876017 3.76274336992228 4.09916558883788 T:C T C 10 0.537534767131755 0.104256192462200 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 12123049 G/A 1 17 13 30 7.86190895876017 6.98795197271281 0.873956986047352 A:G G A 10 0.537534767131755 0.85537468378439 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 12123249 A/G 1 12 19 31 5.54958279441894 10.2131605755033 -4.6635777810844 A:G A G 10 0.537534767131755 0.105964213494322 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 12123538 G/T 1 16 17 33 7.39944372589192 9.13809104123983 -1.73864731534791 T:G G T 10 0.537534767131755 0.602284572105899 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 12125772 A/G 1 19 13 32 8.78683942449666 6.98795197271281 1.79888745178384 A:G A G 10 0.537534767131755 0.596815376088155 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 12164612 C/G 1 36 40 76 16.6487483832568 21.5013906852702 -4.85264230201338 C:G C G 10 0.537534767131755 0.300681974193162 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12163516_12165232:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000399469:exon_12163516_12164808:HIVEP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 12296255 G/T 1 8 11 19 3.69972186294596 5.91288243844931 -2.21316057550334 T:G G T 10 0.537534767131755 0.361207681506224 ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12296195_12297427:EDN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 13616712 A/T 1 93 83 176 43.0092666567468 44.6153856719357 -1.60611901518887 A:T:C A T 10 0.537534767131755 0.820933388901633 ENSG00000225921:ENST00000451315:exon_13616695_13616753:NOL7;ENSG00000225921:ENST00000420088:exon_13616695_13616753:NOL7;ENSG00000225921:ENST00000474485:exon_13616695_13616753:NOL7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 13711279 A/G 1 18 21 39 8.32437419162841 11.2882301097669 -2.96385591813844 A:G A G 10 0.537534767131755 0.422393901428919 ENSG00000010017:ENST00000011619:exon_13711167_13711796:RANBP9;ENSG00000010017:ENST00000283152:exon_13711167_13711953:RANBP9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 16295244 G/A 1 24 22 46 11.0991655888379 11.8257648768986 -0.726599288060729 A:G G A 10 0.537534767131755 0.882940962147627 ENSG00000137198:ENST00000259727:exon_16295237_16295417:GMPR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 16306751 G/A 1 15 19 34 6.93697849302368 10.2131605755033 -3.27618208247967 A:G G A 10 0.537534767131755 0.30317916916678 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 16328068 T/C 1 17 4 21 7.86190895876017 2.15013906852702 5.71176989023315 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0146087042107863 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16326625_16328574:ATXN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 17665479 G/C 1 31 31 62 14.3364222189156 16.6635777810844 -2.32715556216881 C:G G C 10 0.537534767131755 0.61101954654823 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17665470_17665616:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17665470_17665616:NUP153 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 17675246 T/C 1 32 25 57 14.7988874517838 13.4383691782939 1.36051827348997 T:C T C 10 0.537534767131755 0.791005023816092 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17675136_17675264:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17675136_17675264:NUP153 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 24403411 T/C 1 37 13 50 17.1112136161251 6.98795197271281 10.1232616434123 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00423328369709169 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24403182_24403464:MRS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 24403455 C/T 1 29 50 79 13.4114917531791 26.8767383565877 -13.4652466034086 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00310369405047456 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24403420_24403464:MRS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 24418786 T/C 1 17 19 36 7.86190895876017 10.2131605755033 -2.35125161674318 T:C T C 10 0.537534767131755 0.504659923745868 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418689_24419469:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418689_24418791:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418689_24418789:MRS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 25426768 G/A 1 7 2 9 3.23725663007772 1.07506953426351 2.16218709581421 A:G G A 10 0.537534767131755 0.190750883746296 ENSG00000079691:ENST00000461945:exon_25426729_25426788:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000399313:exon_25426729_25426788:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25426729_25426788:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25426729_25426788:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000377969:exon_25426729_25426788:LRRC16A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 25605091 G/A 1 25 17 42 11.5616308217061 9.13809104123983 2.42353978046629 A:G G A 10 0.537534767131755 0.536683339793605 ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25605040_25605121:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25605040_25605121:LRRC16A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 26124634 C/T 1 23 13 36 10.6367003559696 6.98795197271281 3.64874838325682 T:C C T 10 0.537534767131755 0.245254118408594 ENSG00000180573:ENST00000377791:exon_26124373_26124969:HIST1H2AC;ENSG00000180573:ENST00000314088:exon_26124418_26124977:HIST1H2AC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 61 59 120 28.2103792049629 31.7145512607735 -3.5041720558106 T:C T C 10 0.537534767131755 0.523297528753544 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 26370660 G/A 1 45 48 93 20.810935479071 25.8016688223242 -4.99073334325321 A:G G A 10 0.537534767131755 0.300802932430656 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 26393021 G/A 1 52 34 86 24.0481921091487 18.2761820824797 5.77201002666908 A:G G A 10 0.537534767131755 0.234714446394704 ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 166 176 342 76.7692286561287 94.6061190151889 -17.8368903590602 A:G G A 10 0.537534767131755 0.05758604756696 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 32 40 72 14.7988874517838 21.5013906852702 -6.70250323348636 A:G A G 10 0.537534767131755 0.124718675134830 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 59 54 113 27.2854487392265 29.0268774251148 -1.74142868588831 A:G A G 10 0.537534767131755 0.777499802460471 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 26598798 G/A 1 108 102 210 49.9462451497705 54.828546247439 -4.88230109766855 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.533530009515567 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598493_26600278:ABT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 27115069 G/C 1 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 C:G G C 10 0.537534767131755 0.155642553042637 ENSG00000184825:ENST00000377459:exon_27114861_27115317:HIST1H2AH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 27833315 C/G 1 4 9 13 1.84986093147298 4.83781290418579 -2.98795197271281 C:G C G 10 0.537534767131755 0.161862439396256 ENSG00000198374:ENST00000357320:exon_27833034_27833606:HIST1H2AL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 27834677 C/T 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 T:C C T 10 0.537534767131755 0.760762761058777 ENSG00000184357:ENST00000331442:exon_27834570_27835359:HIST1H1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 27858421 A/G 1 2 8 10 0.92493046573649 4.30027813705404 -3.37534767131755 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0521960940781042 ENSG00000197153:ENST00000359303:exon_27858160_27858570:HIST1H3J;ENSG00000197153:ENST00000479986:exon_27858413_27858588:HIST1H3J HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 28120898 G/A 1 10 11 21 4.62465232868245 5.91288243844931 -1.28823010976685 A:G G A 10 0.537534767131755 0.663607311505883 ENSG00000198315:ENST00000330236:exon_28120834_28124089:ZNF192;ENSG00000198315:ENST00000457389:exon_28120834_28121857:ZNF192 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 28121278 A/G 1 10 9 19 4.62465232868245 4.83781290418579 -0.213160575503344 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000198315:ENST00000330236:exon_28120834_28124089:ZNF192;ENSG00000198315:ENST00000457389:exon_28120834_28121857:ZNF192 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 28891423 G/A 1 80 52 132 36.9972186294596 27.9518078908513 9.04541073860835 A:G G A 10 0.537534767131755 0.116993169231939 ENSG00000204713:ENST00000377199:exon_28890990_28891766:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000377194:exon_28890990_28891765:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000481474:exon_28890990_28891690:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000444898:exon_28890990_28891768:TRIM27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 29523952 A/G 1 19 28 47 8.78683942449666 15.0509734796891 -6.26413405519248 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0787957079678907 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 29691390 C/G 1 82 63 145 37.9221490951961 33.8646903293006 4.05745876589553 C:G C G 10 0.537534767131755 0.506712446314286 ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 29691391 T/C 1 81 64 145 37.4596838623279 34.4022250964323 3.05745876589553 T:C T C 10 0.537534767131755 0.618552299969277 ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 29693011 C/T 1 526 336 862 243.256712488697 180.61168175627 62.6450307324272 A:T:C C T 10 0.537534767131755 1.89853910506548e-05 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000489502:exon_29692897_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29692808_29693076:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000429294:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000465459:exon_29692831_29693083:HLA-F HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 19 16 35 8.78683942449666 8.60055627410808 0.186283150388576 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 29910816 G/A 0 226 0 226 104.517142628223 0 104.517142628223 G G 10 0.537534767131755 2.22049340984284e-61 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 29910820 G/C 1 220 2 222 101.742351231014 1.07506953426351 100.66728169675 A:C:G G C 10 0.537534767131755 2.72935526940719e-56 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 29910834 G/C 0 221 0 221 102.204816463882 0 102.204816463882 G G 10 0.537534767131755 2.76078701999836e-60 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 29910839 C/T 0 207 0 207 95.7303032037267 0 95.7303032037267 C C 10 0.537534767131755 1.96796478222482e-56 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 29911003 G/A 1 134 11 145 61.9703412043448 5.91288243844931 56.0574587658955 A:G G A 10 0.537534767131755 3.25237893709250e-24 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 1 2379 1 2380 1100.20478899355 0.537534767131755 1099.66725422642 A:T:C:G A T 10 0.537534767131755 0 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 28 46 74 12.9490265203109 24.7265992880607 -11.7775727677499 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00703953205780482 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 62 73 135 28.6728444378312 39.2400380006181 -10.5671935627869 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0703026851349006 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30229013 A/G 1 9 3 12 4.16218709581421 1.61260430139526 2.54958279441894 A:G A G 10 0.537534767131755 0.159578115428333 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30231071 G/A 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 A:G G A 10 0.537534767131755 0.561398395274424 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30231108 G/T 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 T:G G T 10 0.537534767131755 0.593874685143272 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30297529 T/C 1 7 20 27 3.23725663007772 10.7506953426351 -7.51343871255738 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00577636741592833 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000449040:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000428728:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000420746:exon_30297306_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30297359_30297547:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30297359_30297547:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30309508 T/C 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 T:C T C 10 0.537534767131755 0.593874685143272 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30309489_30311505:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30309489_30309673:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30309489_30309673:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 37 18 55 17.1112136161251 9.67562580837159 7.43558780775348 T:G T G 10 0.537534767131755 0.0573655465514694 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 37 18 55 17.1112136161251 9.67562580837159 7.43558780775348 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0573655465514694 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30457732 T/C 1 1387 1256 2643 641.439277988256 675.143667517484 -33.7043895292284 A:T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.191251453895178 ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 1349 1151 2500 623.865599139263 618.70251696865 5.1630821706126 A:T:C:G G A 10 0.537534767131755 0.841060536987475 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 51 27 78 23.5857268762805 14.5134387125574 9.07228816372311 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0411626528009676 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30530245 T/C 1 25 30 55 11.5616308217061 16.1260430139526 -4.56441219224652 T:C T C 10 0.537534767131755 0.226192657944459 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30545879 A/G 1 44 49 93 20.3484702462028 26.339203589456 -5.99073334325321 A:G A G 10 0.537534767131755 0.214227340688713 ENSG00000204574:ENST00000326195:exon_30545853_30545979:ABCF1;ENSG00000204574:ENST00000376545:exon_30545853_30545979:ABCF1;ENSG00000204574:ENST00000455943:exon_30545850_30545979:ABCF1;ENSG00000204574:ENST00000441867:exon_30545850_30545979:ABCF1;ENSG00000204574:ENST00000468958:exon_30545853_30545979:ABCF1;ENSG00000204574:ENST00000396515:exon_30545853_30545951:ABCF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30570113 T/G 1 26 28 54 12.0240960545744 15.0509734796891 -3.02687742511477 T:G T G 10 0.537534767131755 0.416528165008286 ENSG00000204569:ENST00000376511:exon_30569713_30570468:PPP1R10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30570224 G/T 1 39 35 74 18.0361440818616 18.8137168496114 -0.777572767749867 T:G G T 10 0.537534767131755 0.907382686254157 ENSG00000204569:ENST00000376511:exon_30569713_30570468:PPP1R10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30658579 C/T 0 0 8 8 0 4.30027813705404 -4.30027813705404 T C T 10 0.537534767131755 0.00209234218822997 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30672326 T/C 1 37 37 74 17.1112136161251 19.8887863838749 -2.77757276774987 T:C T C 10 0.537534767131755 0.560639460231963 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30672342 A/G 1 41 39 80 18.961074547598 20.9638559181384 -2.0027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 0.655793893124325 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 30680916 C/T 1 26 25 51 12.0240960545744 13.4383691782939 -1.4142731237195 T:C C T 10 0.537534767131755 0.779172624362904 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30680733_30681131:MDC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 45 29 74 20.810935479071 15.5885082468209 5.22242723225013 T:C T C 10 0.537534767131755 0.244652153905346 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 31 21 52 14.3364222189156 11.2882301097669 3.04819210914874 A:G G A 10 0.537534767131755 0.408449106109430 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31118511 T/G 1 32 18 50 14.7988874517838 9.67562580837159 5.12326164341225 T:G T G 10 0.537534767131755 0.157954051244285 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 38 28 66 17.5736788489933 15.0509734796891 2.52270536930417 C:G C G 10 0.537534767131755 0.621810249921331 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 16 18 34 7.39944372589192 9.67562580837159 -2.27618208247967 C:G G C 10 0.537534767131755 0.492998675593706 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31122502 C/T 1 14 17 31 6.47451326015543 9.13809104123983 -2.6635777810844 T:C C T 10 0.537534767131755 0.371006982111436 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31124849 C/T 1 21 17 38 9.71176989023315 9.13809104123983 0.573678848993312 T:C C T 10 0.537534767131755 0.872470805174994 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 37 44 81 17.1112136161251 23.6515297537972 -6.54031613767215 A:G A G 10 0.537534767131755 0.149024516042084 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C,G 0 0 46 46 0 24.7265992880607 -24.7265992880607 C:G A G 10 0.537534767131755 3.92317872498857e-16 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 72 57 129 33.2974967665136 30.63948172651 2.65801504000361 T:C T C 10 0.537534767131755 0.659740495503095 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31170528 A/G 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 A:G A G 10 0.537534767131755 0.318386975483931 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31239335 G/A 1 3 12 15 1.38739569860474 6.45041720558106 -5.06302150697632 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00953783143503242 ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 154 22 176 71.2196458617097 11.8257648768986 59.3938809848111 T:C C T 10 0.537534767131755 1.11902682429163e-21 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31239518 C/T 1 141 21 162 65.2075978344225 11.2882301097669 53.9193677246557 T:C C T 10 0.537534767131755 2.66755340175734e-19 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 0 17 0 17 7.86190895876017 0 7.86190895876017 G G 10 0.537534767131755 2.81409160202432e-05 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31322367 T/G 1 19 11 30 8.78683942449666 5.91288243844931 2.87395698604735 T:G T G 10 0.537534767131755 0.360953078491918 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 26 9 35 12.0240960545744 4.83781290418579 7.18628315038858 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0168619287199254 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 55 7 62 25.4355878077535 3.76274336992228 21.6728444378312 T:C T C 10 0.537534767131755 4.84308513013909e-09 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31322470 C/G 1 65 7 72 30.0602401364359 3.76274336992228 26.2974967665136 C:G C G 10 0.537534767131755 3.69969276534448e-11 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31322855 C/T 1 54 44 98 24.9731225748852 23.6515297537972 1.32159282108801 T:C C T 10 0.537534767131755 0.839724022723203 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31322888 A/G 1 2579 1697 4276 1192.6978355672 912.196499822588 280.501335744616 A:T:C:G A G 10 0.537534767131755 6.07366413426503e-18 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31379752 C/T 1 14 2 16 6.47451326015543 1.07506953426351 5.39944372589192 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00967820628712213 ENSG00000204520:ENST00000376222:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000484008:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000364810:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000399172:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000376218:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000458313:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000420260:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000449934:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000451012:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000376219:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000421350:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000468458:exon_31379724_31380002:AL645933.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31473546 A/G 1 10 16 26 4.62465232868245 8.60055627410808 -3.97590394542563 A:G A G 10 0.537534767131755 0.167381271298725 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31477681 A/G 1 16 9 25 7.39944372589192 4.83781290418579 2.56163082170613 A:G A G 10 0.537534767131755 0.324259669272264 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31477559_31478901:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31477559_31478901:MICB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31506624 T/C 1 158 163 321 73.0695067931827 87.6181670424761 -14.5486602492933 T:C T C 10 0.537534767131755 0.104830215166447 ENSG00000254870:ENST00000376185:exon_31506540_31506632:XXbac-BPG296P20.16;ENSG00000198563:ENST00000376177:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000458640:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000396172:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376174:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000525098:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000417556:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000449461:exon_31506540_31506716:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376163:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000436533:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000481456:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000427214:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000453105:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000428098:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000419338:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000456662:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000428450:exon_31506540_31506716:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000449757:exon_31506540_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000456976:exon_31506596_31506632:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000418897:exon_31506608_31506632:BAT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 160 126 286 73.9944372589192 67.7293806586011 6.26505660031808 A:C C A 10 0.537534767131755 0.477003419836714 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 220 190 410 101.742351231014 102.131605755033 -0.389254524019535 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 25 12 37 11.5616308217061 6.45041720558106 5.11121361612507 C:G G C 10 0.537534767131755 0.100751602344161 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 75 79 154 34.6848924651184 42.4652466034086 -7.78035413829026 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.225573095534372 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31627449 C/G 1 33 36 69 15.2613526846521 19.3512516167432 -4.08989893209109 C:G C G 10 0.537534767131755 0.336240941304398 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 64 61 125 29.5977749035677 32.7896207950371 -3.19184589146937 T:C C T 10 0.537534767131755 0.591076028367813 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 195 203 398 90.1807204093078 109.119557727746 -18.9388373184385 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0627693238456142 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 16 12 28 7.39944372589192 6.45041720558106 0.949026520310861 A:G A G 10 0.537534767131755 0.850208407116058 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31731881 C/T 1 24 34 58 11.0991655888379 18.2761820824797 -7.17701649364179 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0653213240075971 ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000228727:ENST00000433778:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000415669:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000425424:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000494299:exon_31731397_31731936:C6orf26 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 67 72 139 30.9851706021724 38.7025032334864 -7.71733263131394 A:G G A 10 0.537534767131755 0.202280589757886 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31762843 G/C 1 30 31 61 13.8739569860474 16.6635777810844 -2.78962079503705 C:G G C 10 0.537534767131755 0.521640352820449 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31762844 G/T 1 29 31 60 13.4114917531791 16.6635777810844 -3.2520860279053 T:G G T 10 0.537534767131755 0.438257415196493 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31860337 T/C 1 15 20 35 6.93697849302368 10.7506953426351 -3.81371684961142 T:C T C 10 0.537534767131755 0.235686232316037 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000463484:exon_31860195_31860339:EHMT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31864547 G/T 1 16 29 45 7.39944372589192 15.5885082468209 -8.18906452092897 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0163710335128814 ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000465429:exon_31864383_31864601:EHMT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31868938 C/T 1 11 15 26 5.08711756155069 8.06302150697632 -2.97590394542563 T:C C T 10 0.537534767131755 0.325523153112396 ENSG00000204366:ENST00000375527:exon_31867384_31869102:ZBTB12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31931747 G/A 1 47 45 92 21.7358659448075 24.189064520929 -2.45319857612145 A:G G A 10 0.537534767131755 0.676021695296933 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31931690_31931902:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31931690_31931902:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31931690_31931902:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31931690_31931902:SKIV2L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 A:G A G 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 32164805 C/T 1 3 6 9 1.38739569860474 3.22520860279053 -1.83781290418579 T:C C T 10 0.537534767131755 0.318386975483931 ENSG00000204301:ENST00000474612:exon_32164702_32164849:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000375023:exon_32164702_32164849:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000415698:exon_32164702_32164849:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000444543:exon_32164702_32164849:NOTCH4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 394 393 787 182.211301750089 211.25116348278 -29.0398617326912 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0381855832927226 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 32784645 G/A 1 30 10 40 13.8739569860474 5.37534767131755 8.4986093147298 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00683489000232587 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32784638_32784753:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32784638_32784825:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32784638_32784765:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32784638_32784687:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32784638_32784729:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32784638_32784729:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 32796653 C/A 1 12 64 76 5.54958279441894 34.4022250964323 -28.8526423020134 A:C C A 10 0.537534767131755 1.06492357851241e-11 ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 32796685 A/G 1 18 76 94 8.32437419162841 40.8526423020134 -32.528268110385 A:G A G 10 0.537534767131755 9.82382878709814e-12 ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32796683_32796811:TAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 23 91 114 10.6367003559696 48.9156638089897 -38.2789634530201 T:C T C 10 0.537534767131755 2.42309129514172e-13 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 67 116 183 30.9851706021724 62.3540329872836 -31.3688623851112 A:C C A 10 0.537534767131755 3.59984980692109e-06 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 32805675 G/A 1 17 60 77 7.86190895876017 32.2520860279053 -24.3901770691451 A:G G A 10 0.537534767131755 1.61764145013249e-08 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32805518_32806014:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32805518_32806014:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32805518_32806014:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32805518_32806010:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32805518_32806014:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 32811629 G/T 1 270 248 518 124.865612874426 133.308622248675 -8.44300937424906 T:G G T 10 0.537534767131755 0.480852225989413 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 32821447 C/T 1 92 52 144 42.5468014238785 27.9518078908513 14.5949935330273 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0152733739080664 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32820816_32821755:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000425148:exon_32820816_32821755:TAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 32826233 A/G 1 338 349 687 156.313248709467 187.599633728982 -31.2863850195157 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0176411508086129 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32826141_32826677:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000395333:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32826141_32826499:PSMB9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33036505 G/C 1 1299 842 2141 600.74233749585 452.604273924938 148.138063570913 A:C:G G C 10 0.537534767131755 1.14650600024662e-10 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33036971 C/T 1 1390 1 1391 642.826673686861 0.537534767131755 642.289138919729 A:T:C C A 10 0.537534767131755 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33036977 G/A 1 1397 1 1398 646.063930316938 0.537534767131755 645.526395549807 A:G G A 10 0.537534767131755 4.94065645841247e-324 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33036999 T/C 1 1682 3 1685 777.866521684388 1.61260430139526 776.253917382993 T:C:G T C 10 0.537534767131755 4.94065645841247e-324 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33037061 G/C 1 2376 6 2382 1098.81739329495 3.22520860279053 1095.59218469216 A:T:C:G G C 10 0.537534767131755 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33037080 G/A 0 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 T:G G T 10 0.537534767131755 0.155642553042637 ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33037419 G/A 1 2402 12 2414 1110.84148934952 6.45041720558106 1104.39107214394 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33037424 T/C 1 2289 20 2309 1058.58291803541 10.7506953426351 1047.83222269278 T:C T C 10 0.537534767131755 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33037522 T/C 1 1306 71 1377 603.979594125928 38.1649684663546 565.814625659573 A:T:C T C 10 0.537534767131755 3.41615269646636e-256 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33037579 A/T 1 1073 2 1075 496.225194867627 1.07506953426351 495.150125333363 A:T:C:G A C 10 0.537534767131755 1.06935131517427e-284 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33037639 G/A 1 1296 7 1303 599.354941797246 3.76274336992228 595.592198427323 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33037640 C/T 1 1297 9 1306 599.817407030114 4.83781290418579 594.979594125928 T:C C T 10 0.537534767131755 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 0 514 0 514 237.707129694278 0 237.707129694278 A A 10 0.537534767131755 2.93250225203010e-139 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33053609 G/A 1 239 254 493 110.529190655511 136.533830851466 -26.0046401959552 A:G G A 10 0.537534767131755 0.021159986580471 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33638180 C/T 1 26 44 70 12.0240960545744 23.6515297537972 -11.6274336992228 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0057065555741467 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33638102_33638353:ITPR3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33643558 G/A 1 27 21 48 12.4865612874426 11.2882301097669 1.19833117767576 A:G G A 10 0.537534767131755 0.773606113711342 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33643468_33643633:ITPR3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33653448 C/T 1 32 43 75 14.7988874517838 23.1139949866655 -8.31510753488162 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0634448312530569 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33653420_33653604:ITPR3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33659472 C/G 1 47 49 96 21.7358659448075 26.339203589456 -4.60333764464848 C:G C G 10 0.537534767131755 0.358396999956912 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 47 32 79 21.7358659448075 17.2011125482162 4.53475339659136 A:G G A 10 0.537534767131755 0.312820873879903 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 33740592 C/T 1 9 9 18 4.16218709581421 4.83781290418579 -0.675625808371588 T:C C T 10 0.537534767131755 0.815602186334409 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 36463627 C/T 1 14 10 24 6.47451326015543 5.37534767131755 1.09916558883788 T:C C T 10 0.537534767131755 0.68779414869778 ENSG00000112079:ENST00000229812:exon_36461669_36463691:STK38;ENSG00000112079:ENST00000407753:exon_36461676_36463691:STK38 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 36652339 C/G 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 C:G C G 10 0.537534767131755 0.732674349299313 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 20 16 36 9.2493046573649 8.60055627410808 0.648748383256821 A:G A G 10 0.537534767131755 0.868646651133528 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 36938432 G/A 1 69 65 134 31.9101010679089 34.9397598635641 -3.02965879565516 A:G G A 10 0.537534767131755 0.604401440095649 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000490662:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36938423_36938692:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000460219:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000492754:exon_36938182_36938470:MTCH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 36976637 G/C 1 46 36 82 21.2734007119393 19.3512516167432 1.92214909519609 T:C:G G C 10 0.537534767131755 0.740019217152066 ENSG00000146192:ENST00000489356:exon_36976610_36977807:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000497659:exon_36976610_36976857:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36976610_36976841:FGD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 36978745 G/A 1 6 2 8 2.77479139720947 1.07506953426351 1.69972186294596 A:G G A 10 0.537534767131755 0.300105198743785 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 30 29 59 13.8739569860474 15.5885082468209 -1.71455126077354 T:C C T 10 0.537534767131755 0.696253976873683 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 36995222 G/A 1 28 39 67 12.9490265203109 20.9638559181384 -8.01482939782758 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0508447744889331 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36995205_36996845:FGD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 60 53 113 27.7479139720947 28.489342657983 -0.741428685888312 A:G G A 10 0.537534767131755 0.924959321955285 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 42016246 T/C 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_42016239_42016706:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_42016239_42016632:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_42016239_42016446:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_42016239_42016442:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000513956:exon_42016239_42016428:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000508143:exon_42016239_42016426:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000505672:exon_42016239_42016414:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511161:exon_42016239_42016428:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000505884:exon_42016239_42016428:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000514382:exon_42016239_42016426:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000502771:exon_42016239_42016424:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000514588:exon_42016239_42016426:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000512381:exon_42016239_42016440:CCND3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 42044945 G/A 1 4 8 12 1.84986093147298 4.30027813705404 -2.45041720558106 A:G G A 10 0.537534767131755 0.246047854304642 ENSG00000137413:ENST00000456846:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000494547:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000372982:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000530512:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000320973:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000372977:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000465926:exon_42044838_42044977:TAF8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 42713340 T/A 1 26 41 67 12.0240960545744 22.038925452402 -10.0148293978276 A:T T A 10 0.537534767131755 0.0192297459616791 ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 42906384 G/T 1 216 216 432 99.8924902995409 116.107509700459 -16.2150194009182 T:G G T 10 0.537534767131755 0.122630517292489 ENSG00000137161:ENST00000372836:exon_42906306_42907025:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000394142:exon_42906306_42907007:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000336842:exon_42906306_42906445:CNPY3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 43273604 A/G 1 10 12 22 4.62465232868245 6.45041720558106 -1.82576487689861 A:G A G 10 0.537534767131755 0.522987558786596 ENSG00000146215:ENST00000372569:exon_43273210_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000451294:exon_43273251_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000477866:exon_43273455_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000274990:exon_43273563_43273862:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000449267:exon_43273563_43273862:CRIP3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 43307861 G/A 1 79 76 155 36.5347533965914 40.8526423020134 -4.31788890542202 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.519569105724407 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 43412865 T/C 1 6 12 18 2.77479139720947 6.45041720558106 -3.67562580837159 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0991754162193756 ENSG00000124574:ENST00000372530:exon_43412863_43413052:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000244533:exon_43412863_43413052:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000463024:exon_43412863_43413052:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000372512:exon_43412838_43413052:ABCC10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 44220889 C/T 1 1353 1275 2628 625.715460070736 685.356828092988 -59.6413680222521 A:T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.0199150438923939 ENSG00000096384:ENST00000371646:exon_44220782_44221115:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000353801:exon_44220782_44221115:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371554:exon_44220782_44221115:HSP90AB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 83 65 148 38.3846143280643 34.9397598635641 3.44485446450027 T:G G T 10 0.537534767131755 0.621071713546755 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 44269193 C/T 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 T:C C T 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 44272473 C/T 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44272382_44272554:AARS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 49412433 C/T 1 12 16 28 5.54958279441894 8.60055627410808 -3.05097347968914 T:C C T 10 0.537534767131755 0.261288988317515 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 49439805 G/A 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 52133950 G/A 1 96 81 177 44.3966623553515 43.5403161376721 0.856346217679373 A:G G A 10 0.537534767131755 0.9399644777326 ENSG00000112118:ENST00000229854:exon_52133884_52134024:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000419835:exon_52133884_52134024:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000340349:exon_52133884_52134024:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000421471:exon_52133884_52134024:MCM3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 52268008 T/G 0 9 0 9 4.16218709581421 0 4.16218709581421 T T 10 0.537534767131755 0.00471442275687274 ENSG00000170915:ENST00000512121:exon_52267960_52268347:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000442253:exon_52267960_52272575:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000361841:exon_52267960_52272574:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000360726:exon_52267960_52272489:PAQR8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 52268890 G/A 1 9 17 26 4.16218709581421 9.13809104123983 -4.97590394542563 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0746576418474675 ENSG00000170915:ENST00000442253:exon_52267960_52272575:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000361841:exon_52267960_52272574:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000360726:exon_52267960_52272489:PAQR8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 53159090 G/T 1 32 19 51 14.7988874517838 10.2131605755033 4.5857268762805 A:T:G G T 10 0.537534767131755 0.209189385603422 ENSG00000012660:ENST00000370913:exon_53158886_53159289:ELOVL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 56327849 C/T 1 12 18 30 5.54958279441894 9.67562580837159 -4.12604301395265 T:C C T 10 0.537534767131755 0.145257349054755 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 56417282 C/T 1 20 17 37 9.2493046573649 9.13809104123983 0.111213616125067 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56416982_56418453:DST HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 56417545 T/C 1 14 7 21 6.47451326015543 3.76274336992228 2.71176989023315 T:C T C 10 0.537534767131755 0.278003094604447 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56416982_56418453:DST HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 56420538 C/T 1 10 4 14 4.62465232868245 2.15013906852702 2.47451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 0.283621077619465 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56420143_56420638:DST;ENSG00000151914:ENST00000520144:exon_56420406_56420638:DST HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 56917520 T/C 1 6 14 20 2.77479139720947 7.52548673984457 -4.7506953426351 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0422683308370645 ENSG00000168116:ENST00000370733:exon_56917484_56920023:KIAA1586;ENSG00000168116:ENST00000488682:exon_56917484_56917844:KIAA1586 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 8 0 8 3.69972186294596 0 3.69972186294596 G G 10 0.537534767131755 0.00906265828433196 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 57467175 A/G 0 0 8 8 0 4.30027813705404 -4.30027813705404 G A G 10 0.537534767131755 0.00209234218822997 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57467101_57467206:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57467080_57467206:PRIM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 1 1 13 14 0.462465232868245 6.98795197271281 -6.52548673984457 A:G G A 10 0.537534767131755 0.000521708435349348 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 12 12 0 6.45041720558106 -6.45041720558106 G T G 10 0.537534767131755 9.57081822328867e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 14 0 14 6.47451326015543 0 6.47451326015543 C C 10 0.537534767131755 0.000188617547865511 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 10 10 0 5.37534767131755 -5.37534767131755 C T C 10 0.537534767131755 0.000447497784848899 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 28 37 65 12.9490265203109 19.8887863838749 -6.93975986356407 A:T A T 10 0.537534767131755 0.105170062095833 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 70733547 C/G 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 C:G C G 10 0.537534767131755 0.760762761058777 ENSG00000082293:ENST00000322773:exon_70733519_70733572:COL19A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 70916888 A/C 1 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 A:C A C 10 0.537534767131755 0.155642553042637 ENSG00000082293:ENST00000322773:exon_70916851_70919679:COL19A1;ENSG00000082293:ENST00000393344:exon_70916851_70919679:COL19A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 73332040 C/G 1 9 11 20 4.16218709581421 5.91288243844931 -1.7506953426351 C:G C G 10 0.537534767131755 0.504150670545082 ENSG00000185760:ENST00000342056:exon_73331520_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370398:exon_73331809_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370392:exon_73331834_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000403813:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000355635:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000402622:exon_73331918_73332315:KCNQ5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 74104793 T/G 0 20 0 20 9.2493046573649 0 9.2493046573649 T T 10 0.537534767131755 4.25656468884935e-06 ENSG00000203907:ENST00000370363:exon_74104442_74104816:OOEP;ENSG00000203907:ENST00000441145:exon_74104069_74104856:OOEP;ENSG00000080007:ENST00000370336:exon_74104471_74104878:DDX43;ENSG00000080007:ENST00000464221:exon_74104617_74104878:DDX43 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 74125875 A/G 0 0 14 14 0 7.52548673984457 -7.52548673984457 G A G 10 0.537534767131755 2.04695005348829e-05 ENSG00000080007:ENST00000370336:exon_74125836_74125974:DDX43 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 74125888 A/G 0 0 12 12 0 6.45041720558106 -6.45041720558106 G A G 10 0.537534767131755 9.57081822328867e-05 ENSG00000080007:ENST00000370336:exon_74125836_74125974:DDX43 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 10 8 18 4.62465232868245 4.30027813705404 0.324374191628411 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 74190448 T/C 1 14 14 28 6.47451326015543 7.52548673984457 -1.05097347968914 T:C T C 10 0.537534767131755 0.708746900580582 ENSG00000135297:ENST00000498286:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415954:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000357845:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370305:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370308:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370300:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415228:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000462039:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000445187:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000520366:exon_74190398_74190485:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000487960:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000524046:exon_74190398_74190528:MTO1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 74229792 A/G 1 7 13 20 3.23725663007772 6.98795197271281 -3.7506953426351 A:G A G 10 0.537534767131755 0.116404989692958 ENSG00000156508:ENST00000316292:exon_74229606_74230741:EEF1A1;ENSG00000156508:ENST00000456206:exon_74229606_74230741:EEF1A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 83949261 T/C 1 16 7 23 7.39944372589192 3.76274336992228 3.63670035596964 T:C T C 10 0.537534767131755 0.146568942838849 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83949258_83949355:ME1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 86199233 A/G 1 3 19 22 1.38739569860474 10.2131605755033 -8.82576487689861 A:G A G 10 0.537534767131755 0.000141432388347024 ENSG00000135318:ENST00000369651:exon_86199212_86199317:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000369647:exon_86199212_86199317:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000257770:exon_86199212_86199317:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000416334:exon_86199212_86199317:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000437581:exon_86199212_86199317:NT5E HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 87965528 T/C 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 T:C T C 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 87969737 C/T 1 25 21 46 11.5616308217061 11.2882301097669 0.273400711939273 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 87970301 C/G 1 30 24 54 13.8739569860474 12.9008344111621 0.973122574885231 C:G C G 10 0.537534767131755 0.891632023764868 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000496806:exon_87969793_87970363:ZNF292 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 89868128 A/G 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000146281:ENST00000275072:exon_89868044_89868179:PM20D2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 90362783 A/C 1 15 13 28 6.93697849302368 6.98795197271281 -0.050973479689139 A:C A C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90362711_90362874:MDN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 90408742 C/T 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90408584_90408754:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90408584_90408754:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90408584_90408754:MDN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 90577984 C/T 1 6 9 15 2.77479139720947 4.83781290418579 -2.06302150697632 T:C C T 10 0.537534767131755 0.311071565735570 ENSG00000118412:ENST00000237177:exon_90575672_90578801:CASP8AP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 96999725 C/T 1 15 15 30 6.93697849302368 8.06302150697632 -1.12604301395265 T:C C T 10 0.537534767131755 0.716938089677859 ENSG00000014123:ENST00000369278:exon_96999714_96999799:KIAA0776 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 99374397 A/G 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000112234:ENST00000369244:exon_99374353_99374936:FBXL4;ENSG00000112234:ENST00000229971:exon_99374353_99374936:FBXL4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 99374400 G/A 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 A:G G A 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000112234:ENST00000369244:exon_99374353_99374936:FBXL4;ENSG00000112234:ENST00000229971:exon_99374353_99374936:FBXL4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 100964147 G/C 1 21 7 28 9.71176989023315 3.76274336992228 5.94902652031086 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0351555844620455 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100964056_100964203:ASCC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 101166095 G/A 1 12 6 18 5.54958279441894 3.22520860279053 2.32437419162841 A:G G A 10 0.537534767131755 0.34696272979013 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101165951_101166127:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101165951_101166127:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000522650:exon_101165951_101166127:ASCC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 101296389 G/A 1 15 9 24 6.93697849302368 4.83781290418579 2.09916558883788 A:G G A 10 0.537534767131755 0.420607042022665 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000522650:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000468245:exon_101295880_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324723:exon_101296296_101296583:ASCC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 42 46 88 19.4235397804663 24.7265992880607 -5.30305950759444 T:C C T 10 0.537534767131755 0.285320209702546 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 106960891 G/A 1 18 12 30 8.32437419162841 6.45041720558106 1.87395698604735 A:G G A 10 0.537534767131755 0.584215277547095 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106959730_106960914:AIM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 106999822 G/A 1 74 53 127 34.2224272322501 28.489342657983 5.73308457426712 A:G G A 10 0.537534767131755 0.328315138148043 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106999727_107000189:AIM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 107003810 T/C 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 T:C T C 10 0.537534767131755 0.357514540525421 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 107100396 A/G 1 17 13 30 7.86190895876017 6.98795197271281 0.873956986047352 A:G A G 10 0.537534767131755 0.85537468378439 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107100342_107100457:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107100342_107101698:QRSL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 108233929 G/A 1 9 15 24 4.16218709581421 8.06302150697632 -3.90083441116212 A:G G A 10 0.537534767131755 0.150631669869192 ENSG00000025796:ENST00000369002:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000423697:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000429168:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000484803:exon_108233920_108233978:SEC63 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 109690073 C/T 1 117 119 236 54.1084322455847 63.9666372886788 -9.85820504309417 T:C C T 10 0.537534767131755 0.214834926928236 ENSG00000135535:ENST00000415861:exon_109687717_109690220:CD164;ENSG00000135535:ENST00000324953:exon_109687721_109690220:CD164;ENSG00000135535:ENST00000310786:exon_109687721_109690220:CD164;ENSG00000135535:ENST00000275080:exon_109687721_109690220:CD164;ENSG00000135535:ENST00000368961:exon_109687721_109690220:CD164;ENSG00000135535:ENST00000499860:exon_109688482_109690220:CD164;ENSG00000135535:ENST00000504373:exon_109689268_109690220:CD164;ENSG00000135535:ENST00000506649:exon_109689887_109690220:CD164 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 22 27 49 10.1742351231014 14.5134387125574 -4.33920358945599 T:G G T 10 0.537534767131755 0.251877731556149 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 102 16 118 47.171453752561 8.60055627410808 38.5708974784529 T:G G T 10 0.537534767131755 6.04644765246435e-14 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 102 16 118 47.171453752561 8.60055627410808 38.5708974784529 T:C C T 10 0.537534767131755 6.04644765246435e-14 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 92 44 136 42.5468014238785 23.6515297537972 18.8952716700813 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00137381157414952 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 109770999 G/C 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 C:G G C 10 0.537534767131755 0.764236388540224 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 109775021 C/T 1 57 65 122 26.36051827349 34.9397598635641 -8.5792415900741 T:C C T 10 0.537534767131755 0.123411809580638 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109774841_109775048:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109774841_109775048:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109774841_109775048:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109774841_109775048:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109774841_109775048:MICAL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 109775436 T/C 1 36 27 63 16.6487483832568 14.5134387125574 2.13530967069944 T:C T C 10 0.537534767131755 0.615428233099172 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 9 11 20 4.16218709581421 5.91288243844931 -1.7506953426351 T:C T C 10 0.537534767131755 0.504150670545082 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 9 17 26 4.16218709581421 9.13809104123983 -4.97590394542563 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0746576418474675 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 116600453 C/T 1 48 32 80 22.1983311776758 17.2011125482162 4.9972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.312932329870744 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 116973182 T/C 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 118887303 T/C 1 11 9 20 5.08711756155069 4.83781290418579 0.249304657364901 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000434604:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392500:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000360290:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000419517:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392498:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000483035:exon_118886198_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000472713:exon_118886722_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000476150:exon_118887218_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000462101:exon_118887255_118887479:C6orf204 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 119245024 C/T 1 8 2 10 3.69972186294596 1.07506953426351 2.62465232868245 T:C C T 10 0.537534767131755 0.119280745126671 ENSG00000111877:ENST00000316316:exon_119244976_119245292:MCM9;ENSG00000111877:ENST00000243218:exon_119244976_119245292:MCM9;ENSG00000111877:ENST00000436788:exon_119244976_119245217:MCM9;ENSG00000111877:ENST00000316068:exon_119244976_119245292:MCM9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 126210395 T/G 1 13 16 29 6.01204802728719 8.60055627410808 -2.58850824682089 T:G T G 10 0.537534767131755 0.356879843182363 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126210085_126211127:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000413085:exon_126210118_126211127:NCOA7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 127797179 G/A 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000255330:ENST00000481848:exon_127796438_127797613:RP3-403A15.5;ENSG00000255330:ENST00000473298:exon_127796447_127797209:RP3-403A15.5;ENSG00000214338:ENST00000368268:exon_127796438_127797613:C6orf174;ENSG00000214338:ENST00000525778:exon_127796438_127797613:C6orf174;ENSG00000214338:ENST00000465909:exon_127796447_127797613:C6orf174;ENSG00000214338:ENST00000446168:exon_127796438_127797613:C6orf174 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 127797374 G/A 1 8 1 9 3.69972186294596 0.537534767131755 3.16218709581421 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0438485425040058 ENSG00000255330:ENST00000481848:exon_127796438_127797613:RP3-403A15.5;ENSG00000214338:ENST00000368268:exon_127796438_127797613:C6orf174;ENSG00000214338:ENST00000525778:exon_127796438_127797613:C6orf174;ENSG00000214338:ENST00000465909:exon_127796447_127797613:C6orf174;ENSG00000214338:ENST00000446168:exon_127796438_127797613:C6orf174 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 133072650 A/G 1 14 10 24 6.47451326015543 5.37534767131755 1.09916558883788 A:G A G 10 0.537534767131755 0.68779414869778 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 133077063 T/C 1 12 6 18 5.54958279441894 3.22520860279053 2.32437419162841 T:C T C 10 0.537534767131755 0.34696272979013 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525289:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000531279:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526157:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526192:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000524919:exon_133077021_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000530536:exon_133077053_133077174:VNN2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 1199 641 1840 554.495814209026 344.559785731455 209.936028477571 A:G A G 10 0.537534767131755 3.82930497869314e-23 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 T:C T C 10 0.537534767131755 0.74134570348407 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 184 0 184 85.0936028477571 0 85.0936028477571 T T 10 0.537534767131755 2.78054869234408e-50 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 204 0 204 94.342907505122 0 94.342907505122 A A 10 0.537534767131755 1.37540069347714e-55 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 207 0 207 95.7303032037267 0 95.7303032037267 A A 10 0.537534767131755 1.96796478222482e-56 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 153 0 153 70.7571806288415 0 70.7571806288415 G G 10 0.537534767131755 6.46858424583786e-42 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 159 1 160 73.531972026051 0.537534767131755 72.9944372589192 A:T T A 10 0.537534767131755 1.37578714442432e-41 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 137026266 T/G 1 8 26 34 3.69972186294596 13.9759039454256 -10.2761820824797 T:G T G 10 0.537534767131755 0.000437231017287338 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137026248_137026271:MAP3K5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 137113137 G/A 1 20 13 33 9.2493046573649 6.98795197271281 2.26135268465209 A:G G A 10 0.537534767131755 0.487509641879293 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137112848_137113656:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137112848_137113656:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137112848_137113656:MAP3K5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 137519238 A/G 1 35 38 73 16.1862831503886 20.4263211510067 -4.24003800061811 A:G A G 10 0.537534767131755 0.348521940729087 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 138734029 A/C 1 30 1 31 13.8739569860474 0.537534767131755 13.3364222189156 A:C A C 10 0.537534767131755 1.49083000737959e-07 ENSG00000051620:ENST00000448741:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000058691:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000367697:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000453452:exon_138734017_138734291:HEBP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 139487836 T/C 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 T:C T C 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000112406:ENST00000367658:exon_139487421_139488461:HECA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 10 5 15 4.62465232868245 2.68767383565877 1.93697849302368 T:C T C 10 0.537534767131755 0.43901451829475 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 144263068 C/T 1 23 15 38 10.6367003559696 8.06302150697632 2.57367884899331 T:C C T 10 0.537534767131755 0.421410896307501 ENSG00000118495:ENST00000360537:exon_144261437_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000354765:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000429150:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000423789:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000444202:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000416623:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000392309:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000451709:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000325773:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000437412:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000392307:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000367572:exon_144261475_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000367571:exon_144262421_144263800:PLAGL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 144263532 C/A 1 48 32 80 22.1983311776758 17.2011125482162 4.9972186294596 A:C C A 10 0.537534767131755 0.312932329870744 ENSG00000118495:ENST00000360537:exon_144261437_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000354765:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000429150:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000423789:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000444202:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000416623:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000392309:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000451709:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000325773:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000437412:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000392307:exon_144261439_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000367572:exon_144261475_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000367571:exon_144262421_144263800:PLAGL1;ENSG00000118495:ENST00000417959:exon_144263269_144263800:PLAGL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 144806604 G/A 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000152818:ENST00000367545:exon_144806521_144806655:UTRN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 144812186 A/C 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 A:C A C 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000152818:ENST00000367545:exon_144812065_144812238:UTRN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 146125793 A/T 1 6 14 20 2.77479139720947 7.52548673984457 -4.7506953426351 A:T A T 10 0.537534767131755 0.0422683308370645 ENSG00000118496:ENST00000237281:exon_146125508_146127557:FBXO30 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 146126397 G/C 1 6 6 12 2.77479139720947 3.22520860279053 -0.45041720558106 C:G G C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000118496:ENST00000237281:exon_146125508_146127557:FBXO30 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 146126419 C/T 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000118496:ENST00000237281:exon_146125508_146127557:FBXO30 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 146234644 G/A 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 A:G G A 10 0.537534767131755 0.241009480668847 ENSG00000146414:ENST00000367507:exon_146234614_146234685:SHPRH;ENSG00000146414:ENST00000367505:exon_146234614_146234685:SHPRH;ENSG00000146414:ENST00000367503:exon_146234614_146234685:SHPRH;ENSG00000146414:ENST00000438092:exon_146234614_146234685:SHPRH;ENSG00000146414:ENST00000275233:exon_146234614_146234685:SHPRH;ENSG00000146414:ENST00000433355:exon_146234614_146234685:SHPRH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 152443744 G/T 1 9 9 18 4.16218709581421 4.83781290418579 -0.675625808371588 T:G G T 10 0.537534767131755 0.815602186334409 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000460912:exon_152443195_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152443528_152443811:SYNE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 152469331 C/T 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 T:C C T 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 29 19 48 13.4114917531791 10.2131605755033 3.19833117767576 C:G G C 10 0.537534767131755 0.387494600064193 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 153323594 C/T 1 10 5 15 4.62465232868245 2.68767383565877 1.93697849302368 T:C C T 10 0.537534767131755 0.43901451829475 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000482526:exon_153323562_153323671:MTRF1L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 154763401 G/A 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000153721:ENST00000367209:exon_154763222_154763424:CNKSR3;ENSG00000153721:ENST00000367213:exon_154763222_154763424:CNKSR3;ENSG00000153721:ENST00000479339:exon_154763222_154763424:CNKSR3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 155569168 C/T 1 1 15 16 0.462465232868245 8.06302150697632 -7.60055627410808 T:C C T 10 0.537534767131755 0.000134379786294855 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155569134_155569313:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528535:exon_155569134_155569313:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155569134_155569313:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155569134_155569313:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155569134_155569313:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155569134_155569313:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155569134_155569313:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155569134_155569313:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155569134_155569313:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155569134_155569313:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155569134_155569313:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155569134_155569313:TIAM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 155575607 G/A 1 1 12 13 0.462465232868245 6.45041720558106 -5.98795197271281 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00102587923033521 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155575553_155575707:TIAM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 155577823 C/T 1 29 4 33 13.4114917531791 2.15013906852702 11.2613526846521 T:C C T 10 0.537534767131755 6.28039245471121e-05 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155577618_155578854:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155577618_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155577618_155579221:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155577594_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155577618_155578334:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155577618_155578354:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155577618_155579216:TIAM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 158517308 A/G 1 8 8 16 3.69972186294596 4.30027813705404 -0.600556274108079 A:G A G 10 0.537534767131755 0.806072821048815 ENSG00000078269:ENST00000355585:exon_158516650_158520208:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367122:exon_158516650_158519568:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367112:exon_158516650_158518886:SYNJ2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 53 44 97 24.510657342017 23.6515297537972 0.859127588219767 T:C C T 10 0.537534767131755 0.91901917216863 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 160199687 T/C 1 17 30 47 7.86190895876017 16.1260430139526 -8.26413405519248 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0186506332083655 ENSG00000120438:ENST00000321394:exon_160199530_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000392168:exon_160199531_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000420894:exon_160199531_160200293:TCP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 160468278 A/G 1 21 16 37 9.71176989023315 8.60055627410808 1.11121361612507 A:G A G 10 0.537534767131755 0.744509553421204 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160468191_160468368:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160468191_160468368:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000479434:exon_160468191_160468368:IGF2R HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 166721211 G/T 1 12 17 29 5.54958279441894 9.13809104123983 -3.58850824682089 T:G G T 10 0.537534767131755 0.196303716694424 ENSG00000176381:ENST00000322583:exon_166719168_166721871:PRR18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 166721224 C/G 1 14 21 35 6.47451326015543 11.2882301097669 -4.81371684961142 C:G C G 10 0.537534767131755 0.126582816053195 ENSG00000176381:ENST00000322583:exon_166719168_166721871:PRR18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 32 46 78 14.7988874517838 24.7265992880607 -9.92771183627689 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0303420183744442 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 167344583 A/G 1 618 581 1199 285.803513912575 312.30769970355 -26.5041857909742 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.124910932728313 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167344532_167346537:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167344532_167344606:RNASET2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 167352104 C/A 1 14 9 23 6.47451326015543 4.83781290418579 1.63670035596964 A:C C A 10 0.537534767131755 0.536918781286691 ENSG00000026297:ENST00000358165:exon_167352084_167352496:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000477674:exon_167351486_167352475:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000310843:exon_167352100_167352141:RNASET2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 167550042 C/T 1 32 29 61 14.7988874517838 15.5885082468209 -0.789620795037052 T:C C T 10 0.537534767131755 0.898068334777582 ENSG00000112486:ENST00000400926:exon_167549728_167552629:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000341935:exon_167549728_167553184:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000349984:exon_167549728_167552434:CCR6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 167550824 C/T 1 28 25 53 12.9490265203109 13.4383691782939 -0.489342657983013 T:C C T 10 0.537534767131755 0.891515392288072 ENSG00000112486:ENST00000400926:exon_167549728_167552629:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000341935:exon_167549728_167553184:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000349984:exon_167549728_167552434:CCR6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 168311805 G/A 1 12 10 22 5.54958279441894 5.37534767131755 0.174235123101391 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000423229:exon_168311781_168311842:MLLT4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 170052049 T/C 1 2 7 9 0.92493046573649 3.76274336992228 -2.83781290418579 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0909104192397482 ENSG00000184465:ENST00000423258:exon_170052026_170052104:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170052026_170052104:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170052026_170052104:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000443144:exon_170052026_170052104:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000420344:exon_170052026_170052104:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170052026_170052104:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000441385:exon_170052026_170052104:WDR27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 170058439 C/T 1 16 10 26 7.39944372589192 5.37534767131755 2.02409605457437 T:C C T 10 0.537534767131755 0.556052782665225 ENSG00000184465:ENST00000423258:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000443144:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000420344:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000441385:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000467418:exon_170058372_170058454:WDR27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 170068180 A/G 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170068078_170068191:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170068078_170068281:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170068078_170068281:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000496752:exon_170068078_170068191:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000474869:exon_170068157_170068281:WDR27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 170176647 C/T 1 14 10 24 6.47451326015543 5.37534767131755 1.09916558883788 T:C C T 10 0.537534767131755 0.68779414869778 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 170176648 A/G 1 14 9 23 6.47451326015543 4.83781290418579 1.63670035596964 A:G A G 10 0.537534767131755 0.536918781286691 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 170627586 G/T 1 23 11 34 10.6367003559696 5.91288243844931 4.72381791752033 T:G G T 10 0.537534767131755 0.12215756143552 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 217 136 353 100.354955532409 73.1047283299187 27.2502272024905 C:G G C 10 0.537534767131755 0.00389232579109212 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 T:C T C 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 T:C T C 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 881668 C/T 1 14 14 28 6.47451326015543 7.52548673984457 -1.05097347968914 T:C C T 10 0.537534767131755 0.708746900580582 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000427969:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450538:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000407944:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457378:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000435699:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000439679:exon_881583_881723:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457598:exon_881583_881672:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000340926:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000403868:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000467483:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000469755:exon_881583_881710:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450881:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000493681:exon_881453_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000477950:exon_881549_881767:SUN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 889169 A/G 1 16 14 30 7.39944372589192 7.52548673984457 -0.126043013952649 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000407944:exon_889157_889326:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000340926:exon_889157_890404:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000419312:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_889157_889240:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_889157_889240:SUN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 909048 G/A 1 30 26 56 13.8739569860474 13.9759039454256 -0.101946959378278 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000475971:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000497943:exon_908111_909153:SUN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 938540 G/A 1 57 83 140 26.36051827349 44.6153856719357 -18.2548673984457 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00219896865676524 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_937538_938586:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_937540_938586:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_937546_938586:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_937547_938586:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000495809:exon_937582_938586:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_938415_938586:COX19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 1533513 A/G 1 36 22 58 16.6487483832568 11.8257648768986 4.82298350635821 A:G A G 10 0.537534767131755 0.236331494392785 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1533390_1533547:INTS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 1542697 G/A 1 16 21 37 7.39944372589192 11.2882301097669 -3.88878638387493 A:G G A 10 0.537534767131755 0.248335852850355 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 1542814 T/C 1 24 24 48 11.0991655888379 12.9008344111621 -1.80166882232424 A:T:C T C 10 0.537534767131755 0.664908489546432 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 1976457 C/T 1 33 23 56 15.2613526846521 12.3632996440304 2.89805304062172 T:C C T 10 0.537534767131755 0.503455743387687 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 2566484 C/T 1 6 2 8 2.77479139720947 1.07506953426351 1.69972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.300105198743785 ENSG00000106003:ENST00000402506:exon_2566470_2566555:LFNG;ENSG00000106003:ENST00000402045:exon_2566470_2566555:LFNG;ENSG00000106003:ENST00000338732:exon_2566470_2566555:LFNG;ENSG00000106003:ENST00000222725:exon_2566470_2566555:LFNG;ENSG00000106003:ENST00000359574:exon_2566470_2566555:LFNG;ENSG00000106003:ENST00000493850:exon_2566470_2566505:LFNG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 73 57 130 33.7599619993819 30.63948172651 3.12048027287185 T:C T C 10 0.537534767131755 0.598822225935851 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 2578181 C/T 1 48 38 86 22.1983311776758 20.4263211510067 1.77201002666907 T:C C T 10 0.537534767131755 0.746234521843339 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 48 42 90 22.1983311776758 22.5764602195337 -0.378129041857946 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 2578246 C/T 1 42 48 90 19.4235397804663 25.8016688223242 -6.37812904185795 T:C C T 10 0.537534767131755 0.204469668955400 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 2578371 G/A 1 31 30 61 14.3364222189156 16.1260430139526 -1.78962079503705 A:G G A 10 0.537534767131755 0.700706041497633 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 2582907 C/T 1 25 21 46 11.5616308217061 11.2882301097669 0.273400711939273 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2582838_2582957:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2582838_2582957:C7orf27 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 2698634 G/A 1 53 52 105 24.510657342017 27.9518078908513 -3.44115054883427 A:G G A 10 0.537534767131755 0.557278242914366 ENSG00000136295:ENST00000258796:exon_2698574_2698649:TTYH3;ENSG00000136295:ENST00000407643:exon_2698574_2698649:TTYH3;ENSG00000136295:ENST00000403167:exon_2698574_2698649:TTYH3;ENSG00000136295:ENST00000429448:exon_2698574_2698649:TTYH3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 2946461 T/C 1 101 71 172 46.7089885196927 38.1649684663546 8.54402005333814 T:C T C 10 0.537534767131755 0.194642760816061 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 33 35 68 15.2613526846521 18.8137168496114 -3.55236416495934 T:C T C 10 0.537534767131755 0.397209696256307 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 5104275 G/A 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 5104359 G/A 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 5105133 C/T 1 10 5 15 4.62465232868245 2.68767383565877 1.93697849302368 T:C C T 10 0.537534767131755 0.43901451829475 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 5105208 C/T 1 8 8 16 3.69972186294596 4.30027813705404 -0.600556274108079 T:C C T 10 0.537534767131755 0.806072821048815 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 5427652 G/A 1 28 23 51 12.9490265203109 12.3632996440304 0.585726876280496 A:G G A 10 0.537534767131755 0.889380467031684 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 5643145 T/C 1 408 394 802 188.685815010244 211.788698249911 -23.1028832396675 T:C T C 10 0.537534767131755 0.103404547786831 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000444748:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000447103:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000405801:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5643127_5643248:FSCN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 5643479 C/T 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 T:C C T 10 0.537534767131755 0.564681673647354 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 6042242 C/T 1 7 11 18 3.23725663007772 5.91288243844931 -2.67562580837159 T:C C T 10 0.537534767131755 0.241274942947926 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6042084_6042267:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6042084_6042267:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382321:exon_6042084_6042267:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6042084_6042267:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000413462:exon_6042084_6042267:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000380416:exon_6041597_6042267:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000441476:exon_6042084_6042267:PMS2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 12 14 26 5.54958279441894 7.52548673984457 -1.97590394542563 A:G G A 10 0.537534767131755 0.440566012205601 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 6452461 G/A 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 A:G G A 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000497308:exon_6452241_6452514:DAGLB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 6456302 C/T 1 3 7 10 1.38739569860474 3.76274336992228 -2.37534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 0.203605394966440 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6456299_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000497308:exon_6456258_6456342:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000454738:exon_6455890_6456385:DAGLB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 7646687 A/G 1 27 26 53 12.4865612874426 13.9759039454256 -1.48934265798301 A:G A G 10 0.537534767131755 0.682372287279649 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 8008970 C/G 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 C:G C G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8008423_8009438:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8008425_8009438:GLCCI1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 17378858 A/G 1 16 11 27 7.39944372589192 5.91288243844931 1.48656128744262 A:G A G 10 0.537534767131755 0.700334466477321 ENSG00000106546:ENST00000242057:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000463496:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000401808:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000492120:exon_17378610_17379151:AHR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 20198440 G/A 1 18 15 33 8.32437419162841 8.06302150697632 0.261352684652087 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 20418678 C/T 1 9 1 10 4.16218709581421 0.537534767131755 3.62465232868245 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0249904918483396 ENSG00000105855:ENST00000478974:exon_20418674_20418920:ITGB8;ENSG00000105855:ENST00000222573:exon_20418674_20418920:ITGB8;ENSG00000105855:ENST00000477859:exon_20418674_20421704:ITGB8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 23164701 C/T 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000122550:ENST00000521082:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322231:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000339077:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322275:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000459661:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000491352:exon_23164667_23164821:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000409689:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000410047:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000479700:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000477076:exon_23164599_23164791:KLHL7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 24756951 C/T 1 36 6 42 16.6487483832568 3.22520860279053 13.4235397804663 T:C C T 10 0.537534767131755 1.65136820257621e-05 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000446822:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24756088_24756993:DFNA5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 24758753 C/T 1 33 13 46 15.2613526846521 6.98795197271281 8.27340071193927 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0171988866759949 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 24758818 G/T 1 37 12 49 17.1112136161251 6.45041720558106 10.660796410544 T:G G T 10 0.537534767131755 0.00233519711056944 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 25163744 A/C 1 285 313 598 131.80259136745 168.248382112239 -36.4457907447895 A:T:C A C 10 0.537534767131755 0.00311973774329577 ENSG00000172115:ENST00000305786:exon_25163570_25163746:CYCS;ENSG00000172115:ENST00000409409:exon_25163570_25163746:CYCS;ENSG00000172115:ENST00000409764:exon_25163570_25163746:CYCS;ENSG00000172115:ENST00000413447:exon_25163570_25163746:CYCS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 25181912 T/C 1 8 7 15 3.69972186294596 3.76274336992228 -0.0630215069763245 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000153790:ENST00000409280:exon_25181860_25181951:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000283905:exon_25181860_25181951:C7orf31 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 25194665 G/C 1 9 6 15 4.16218709581421 3.22520860279053 0.936978493023676 C:G G C 10 0.537534767131755 0.797066078642493 ENSG00000153790:ENST00000409280:exon_25194630_25194811:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000283905:exon_25194630_25194811:C7orf31 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 25194753 C/T 0 9 0 9 4.16218709581421 0 4.16218709581421 C C 10 0.537534767131755 0.00471442275687274 ENSG00000153790:ENST00000409280:exon_25194630_25194811:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000283905:exon_25194630_25194811:C7orf31 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 30492237 C/T 1 3 7 10 1.38739569860474 3.76274336992228 -2.37534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 0.203605394966440 ENSG00000106100:ENST00000222823:exon_30490832_30492656:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000434755:exon_30490832_30492656:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000439183:exon_30490832_30492656:NOD1;ENSG00000106100:ENST00000423334:exon_30492147_30492313:NOD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 34 39 73 15.7238179175203 20.9638559181384 -5.24003800061811 A:G G A 10 0.537534767131755 0.241038028627298 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 30634630 G/C 1 146 124 270 67.5199239987638 66.6543111243376 0.865612874426162 C:G G C 10 0.537534767131755 0.95136046284951 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 30634661 C/G 1 133 101 234 61.5078759714766 54.2910114803073 7.21686449116933 C:G C G 10 0.537534767131755 0.35914503189777 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 32613020 A/G 1 25 31 56 11.5616308217061 16.6635777810844 -5.10194695937828 A:G A G 10 0.537534767131755 0.181985241568317 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 36445855 A/C 1 12 8 20 5.54958279441894 4.30027813705404 1.2493046573649 A:C A C 10 0.537534767131755 0.657534137938504 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36445790_36446175:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36445790_36446175:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000424865:exon_36445790_36445875:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000460598:exon_36445790_36446175:ANLN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 36459076 G/A 1 11 16 27 5.08711756155069 8.60055627410808 -3.51343871255738 A:G G A 10 0.537534767131755 0.182777781405979 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36458853_36459088:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36458853_36459088:ANLN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 37988589 C/T 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000086289:ENST00000476620:exon_37988442_37988650:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000199448:exon_37988442_37988650:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000425345:exon_37988442_37988650:EPDR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 38807169 C/G 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 C:G C G 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38807137_38807198:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38807137_38807198:VPS41 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 40027484 A/G 1 33 27 60 15.2613526846521 14.5134387125574 0.747913972094702 A:G A G 10 0.537534767131755 0.897414338111254 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000326351:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000484589:exon_40027435_40027857:CDK13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 40127767 G/A 1 36 20 56 16.6487483832568 10.7506953426351 5.89805304062172 A:G G A 10 0.537534767131755 0.139930300548982 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000478563:exon_40127725_40127930:CDK13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 42974714 G/A 1 100 81 181 46.2465232868245 43.5403161376721 2.70620714915236 A:G G A 10 0.537534767131755 0.709814452686807 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42974554_42974735:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42974554_42976840:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42974620_42974735:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000496564:exon_42974642_42974735:MRPL32 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 173 185 358 80.0064852862064 99.4439319193747 -19.4374466331683 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0438590249837554 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 44112873 G/T 1 32 25 57 14.7988874517838 13.4383691782939 1.36051827348997 T:G G T 10 0.537534767131755 0.791005023816092 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 44612229 G/A 1 54 51 105 24.9731225748852 27.4142731237195 -2.44115054883427 A:G G A 10 0.537534767131755 0.695649035870074 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44612162_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44612173_44612343:DDX56 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 44747499 G/A 1 125 151 276 57.8081541085306 81.167749836895 -23.3595957283644 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0054088831035042 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 44800176 G/T 1 149 117 266 68.9073196973685 62.8915677544153 6.01575194295317 T:G G T 10 0.537534767131755 0.498882266676233 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 44806159 C/T 1 173 147 320 80.0064852862064 79.017610768368 0.988874517838411 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.955306148170325 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463931:exon_44806020_44806262:ZMIZ2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 27 34 61 12.4865612874426 18.2761820824797 -5.78962079503705 A:G A G 10 0.537534767131755 0.15779423727605 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 29 14 43 13.4114917531791 7.52548673984457 5.88600501333454 A:G G A 10 0.537534767131755 0.091549307367989 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 308 220 528 142.439291723419 118.257648768986 24.1816429544334 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0361484024983469 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 45113170 G/A 1 77 72 149 35.6098229308549 38.7025032334864 -3.09268030263149 A:G G A 10 0.537534767131755 0.622856738534344 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 45143892 A/G 1 2 9 11 0.92493046573649 4.83781290418579 -3.9128824384493 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0295587298456249 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 45144277 T/C 1 44 48 92 20.3484702462028 25.8016688223242 -5.45319857612146 T:C T C 10 0.537534767131755 0.29574059711408 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45144137_45144308:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45144137_45144308:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45144137_45144308:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45144137_45144308:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45144137_45144308:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000488222:exon_45144137_45144308:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000484326:exon_45144137_45144308:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45144137_45144308:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45144137_45144308:TBRG4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 45144494 T/C 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 T:C T C 10 0.537534767131755 0.357514540525421 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 45148667 G/A 1 87 117 204 40.2344752595373 62.8915677544153 -22.657092494878 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00154803825093773 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148426_45148682:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 45148773 C/A 1 62 69 131 28.6728444378312 37.0898989320911 -8.4170544942599 A:C C A 10 0.537534767131755 0.160717861629265 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 50467767 C/A 1 22 24 46 10.1742351231014 12.9008344111621 -2.72659928806073 A:C C A 10 0.537534767131755 0.461241107508186 ENSG00000185811:ENST00000331340:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000359197:exon_50467616_50470223:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000343574:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000346667:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000349824:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000357364:exon_50467616_50472799:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000438033:exon_50467616_50468574:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000439701:exon_50467616_50470264:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000471793:exon_50467616_50468325:IKZF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 8 6 14 3.69972186294596 3.22520860279053 0.47451326015543 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 32 58 90 14.7988874517838 31.1770164936418 -16.3781290418579 A:G G A 10 0.537534767131755 0.000642877122686245 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 55840888 A/C 0 0 8 8 0 4.30027813705404 -4.30027813705404 C A C 10 0.537534767131755 0.00209234218822997 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 56122076 A/T 1 116 96 212 53.6459670127164 51.6033376446485 2.04262936806795 A:T:C:G A T 10 0.537534767131755 0.78349667719066 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56122062_56122196:CCT6A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 56136194 C/T 1 44 42 86 20.3484702462028 22.5764602195337 -2.22798997333093 T:C C T 10 0.537534767131755 0.665994264542632 ENSG00000129103:ENST00000395436:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000418349:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000434526:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395437:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000275607:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395435:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000420966:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413952:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000342190:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000436782:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000442826:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000437307:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413756:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000483327:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000423763:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000498777:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000438133:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000447501:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000451338:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000529457:exon_56136175_56136331:SUMF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 56147268 G/A 1 99 81 180 45.7840580539563 43.5403161376721 2.24374191628411 A:G G A 10 0.537534767131755 0.765262887910599 ENSG00000129103:ENST00000395436:exon_56147221_56147817:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000418349:exon_56147221_56147817:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000434526:exon_56147221_56148363:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395437:exon_56147221_56148362:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000275607:exon_56147221_56148363:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395435:exon_56147221_56147880:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000420966:exon_56147221_56147880:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000342190:exon_56147221_56148363:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000452216:exon_56147221_56147422:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000436782:exon_56147221_56148358:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000442826:exon_56147221_56148362:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000437307:exon_56147221_56147525:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413756:exon_56147221_56147429:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000423763:exon_56147221_56148331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000438133:exon_56147221_56148362:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000447501:exon_56147046_56147568:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000531229:exon_56147221_56147440:SUMF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 56174115 A/C 1 398 267 665 184.061162681562 143.521782824179 40.5393798573829 A:C A C 10 0.537534767131755 0.00162067568220509 ENSG00000106153:ENST00000395422:exon_56174057_56174269:CHCHD2;ENSG00000106153:ENST00000473095:exon_56174057_56174124:CHCHD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 56174140 G/T 1 109 103 212 50.4087103826387 55.3660810145708 -4.95737063193205 T:G G T 10 0.537534767131755 0.535438710062617 ENSG00000106153:ENST00000395422:exon_56174057_56174269:CHCHD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 64291976 G/A 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 A:G G A 10 0.537534767131755 0.760762761058777 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 64291987 G/A 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 64863392 C/T 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 T:C C T 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 A:G A G 10 0.537534767131755 0.593874685143272 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 65557564 C/T 1 76 46 122 35.1473576979866 24.7265992880607 10.4207584099259 T:C C T 10 0.537534767131755 0.06897592615787 ENSG00000126522:ENST00000304874:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000380839:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395332:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395331:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000493708:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000464970:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000249319:ENST00000450043:exon_65557544_65557650:AC068533.7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 9 10 19 4.16218709581421 5.37534767131755 -1.21316057550334 T:C T C 10 0.537534767131755 0.648761877832002 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 66104003 C/T 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 T:C C T 10 0.537534767131755 0.241009480668847 ENSG00000243335:ENST00000275532:exon_66103843_66108038:KCTD7;ENSG00000243335:ENST00000443322:exon_66103843_66104215:KCTD7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 66774604 G/C 1 10 14 24 4.62465232868245 7.52548673984457 -2.90083441116212 C:G G C 10 0.537534767131755 0.306252553826296 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 72301284 T/C 1 11 9 20 5.08711756155069 4.83781290418579 0.249304657364901 T:C T C 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 79 70 149 36.5347533965914 37.6274336992228 -1.09268030263149 T:C C T 10 0.537534767131755 0.869794174170455 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 47 29 76 21.7358659448075 15.5885082468209 6.14735769798662 T:C C T 10 0.537534767131755 0.16854955398313 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 16 14 30 7.39944372589192 7.52548673984457 -0.126043013952649 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 73097948 G/C 1 14 17 31 6.47451326015543 9.13809104123983 -2.6635777810844 C:G G C 10 0.537534767131755 0.371006982111436 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 73513529 G/C 1 88 65 153 40.6969404924056 34.9397598635641 5.75718062884149 C:G G C 10 0.537534767131755 0.373000875194338 ENSG00000106683:ENST00000418310:exon_73513362_73513568:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000419043:exon_73513362_73513568:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000336180:exon_73513362_73513568:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000435201:exon_73513362_73513568:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000423685:exon_73513362_73513568:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000491052:exon_73513362_73513568:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000483414:exon_73513362_73513568:LIMK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 73753250 T/C 1 59 51 110 27.2854487392265 27.4142731237195 -0.128824384493047 A:T:C:G T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 75048634 G/A 1 37 32 69 17.1112136161251 17.2011125482162 -0.0898989320910921 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000135213:ENST00000476072:exon_75048603_75050568:POM121C;ENSG00000135213:ENST00000257665:exon_75048603_75048725:POM121C;ENSG00000135213:ENST00000453279:exon_75048603_75048725:POM121C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 75616577 G/A 1 50 62 112 23.1232616434123 33.3271555621688 -10.2038939187566 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0579940876902939 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 17 8 25 7.86190895876017 4.30027813705404 3.56163082170613 T:C T C 10 0.537534767131755 0.165892476302183 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 75633160 C/T 1 25 26 51 11.5616308217061 13.9759039454256 -2.4142731237195 T:C C T 10 0.537534767131755 0.574793601899611 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000430497:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000454618:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000492053:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75633057_75633173:STYXL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 75959188 G/A 1 172 178 350 79.5440200533381 95.6811885494524 -16.1371684961142 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.0863771489325612 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 45 31 76 20.810935479071 16.6635777810844 4.14735769798662 T:C C T 10 0.537534767131755 0.359341508045822 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 76608143 C/T 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 0.593874685143272 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 76609944 T/C 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 T:C T C 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 76610095 C/T 1 4 7 11 1.84986093147298 3.76274336992228 -1.9128824384493 T:C C T 10 0.537534767131755 0.365659915960336 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 76984572 G/A 1 15 4 19 6.93697849302368 2.15013906852702 4.78683942449666 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0362817010288072 ENSG00000186088:ENST00000449779:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000257626:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000455630:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000334003:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000434084:exon_76984530_76984601:PION HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 77256713 A/G 1 43 39 82 19.8860050133345 20.9638559181384 -1.07785090480391 A:G A G 10 0.537534767131755 0.825498596592471 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 30 15 45 13.8739569860474 8.06302150697632 5.81093547907103 A:G G A 10 0.537534767131755 0.099564548815671 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 86800351 A/G 1 13 5 18 6.01204802728719 2.68767383565877 3.32437419162841 A:G A G 10 0.537534767131755 0.155872428250262 ENSG00000135164:ENST00000331242:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000413276:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000447863:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000414194:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000394702:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000411766:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000425406:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000420131:exon_86800311_86800373:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000449088:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000430405:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000432937:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000394703:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000434534:exon_86800311_86800367:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000412139:exon_86800311_86800405:DMTF1;ENSG00000135164:ENST00000425705:exon_86800311_86800405:DMTF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 87082292 G/A 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000005471:ENST00000359206:exon_87082260_87082451:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000265723:exon_87082260_87082451:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000358400:exon_87082260_87082451:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000453593:exon_87082260_87082451:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000473795:exon_87081688_87082451:ABCB4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 89982132 T/C 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000477972:exon_89982130_89982546:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89982130_89982323:GTPBP10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 10 4 14 4.62465232868245 2.15013906852702 2.47451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 0.283621077619465 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 17 9 26 7.86190895876017 4.83781290418579 3.02409605457437 T:G G T 10 0.537534767131755 0.246341934149751 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 8 11 19 3.69972186294596 5.91288243844931 -2.21316057550334 T:C C T 10 0.537534767131755 0.361207681506224 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 7 8 15 3.23725663007772 4.30027813705404 -1.06302150697632 A:G A G 10 0.537534767131755 0.61360765893613 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 7 7 14 3.23725663007772 3.76274336992228 -0.52548673984457 T:C C T 10 0.537534767131755 0.795222451542679 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 91715662 C/T 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 T:C C T 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91715542_91715730:AKAP9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 18 12 30 8.32437419162841 6.45041720558106 1.87395698604735 A:C A C 10 0.537534767131755 0.584215277547095 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 56 50 106 25.8980530406217 26.8767383565877 -0.978685315966025 A:G A G 10 0.537534767131755 0.846330578489018 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 6 14 20 2.77479139720947 7.52548673984457 -4.7506953426351 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0422683308370645 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 92027537 C/G 1 27 27 54 12.4865612874426 14.5134387125574 -2.02687742511477 C:G C G 10 0.537534767131755 0.588219967373995 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 92027906 C/A 1 44 42 86 20.3484702462028 22.5764602195337 -2.22798997333093 A:C C A 10 0.537534767131755 0.665994264542632 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 92731586 A/G 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 A:G A G 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 92734451 A/G 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 A:G A G 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 92762681 A/G 1 27 31 58 12.4865612874426 16.6635777810844 -4.17701649364179 A:G A G 10 0.537534767131755 0.293557822909028 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 92764419 A/G 1 20 13 33 9.2493046573649 6.98795197271281 2.26135268465209 A:G A G 10 0.537534767131755 0.487509641879293 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 92985252 T/C 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 T:C T C 10 0.537534767131755 0.74134570348407 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92985203_92985390:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000443443:exon_92985203_92985498:CCDC132 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 97488569 A/T 1 71 48 119 32.8350315336454 25.8016688223242 7.03336271132116 A:T A T 10 0.537534767131755 0.199651850863789 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97488554_97488710:ASNS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 97872831 G/A 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97872779_97872904:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97872779_97872904:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000463648:exon_97872779_97872886:TECPR1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 5 5 10 2.31232616434123 2.68767383565877 -0.37534767131755 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 99097429 C/T 1 37 26 63 17.1112136161251 13.9759039454256 3.13530967069944 T:C C T 10 0.537534767131755 0.450910565729287 ENSG00000160908:ENST00000337673:exon_99097261_99097920:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000394177:exon_99097261_99097920:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000426306:exon_99097261_99097887:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000481881:exon_99097261_99097898:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000485576:exon_99097261_99097920:ZNF394 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 99668826 G/A 1 27 25 52 12.4865612874426 13.4383691782939 -0.951807890851258 A:G G A 10 0.537534767131755 0.889570859481929 ENSG00000166526:ENST00000424697:exon_99667597_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000299667:exon_99667611_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000487620:exon_99667800_99669835:ZNF3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 100028667 C/T 1 56 48 104 25.8980530406217 25.8016688223242 0.0963842182974837 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000146834:ENST00000497759:exon_100028653_100029202:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000414441:exon_100028238_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000470297:exon_100028653_100029027:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000479201:exon_100028653_100029105:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100027901_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100027254_100029312:MEPCE HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 100172813 A/G 1 24 20 44 11.0991655888379 10.7506953426351 0.348470246202782 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100170920_100173405:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100172283_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100172283_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100172283_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100172283_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000476881:exon_100172332_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100172686_100172927:LRCH4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 100280005 C/T 1 37 44 81 17.1112136161251 23.6515297537972 -6.54031613767215 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.149024516042084 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100279945_100280105:GIGYF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 100281768 T/C 0 0 60 60 0 32.2520860279053 -32.2520860279053 C T C 10 0.537534767131755 8.03055090095943e-21 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100281643_100281780:GIGYF1;ENSG00000146830:ENST00000472105:exon_100281643_100281960:GIGYF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 100285476 C/T 1 24 22 46 11.0991655888379 11.8257648768986 -0.726599288060729 T:C C T 10 0.537534767131755 0.882940962147627 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100285411_100285506:GIGYF1;ENSG00000146830:ENST00000471340:exon_100285411_100285506:GIGYF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 100486035 C/A 1 29 20 49 13.4114917531791 10.7506953426351 2.66079641054401 A:C C A 10 0.537534767131755 0.476639382729198 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 100488658 G/C 1 17 11 28 7.86190895876017 5.91288243844931 1.94902652031086 C:G G C 10 0.537534767131755 0.570669312486509 ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100487616_100488709:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100488337_100488709:ACHE HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 100732321 C/T 1 26 32 58 12.0240960545744 17.2011125482162 -5.17701649364179 T:C C T 10 0.537534767131755 0.188880432759332 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 100861452 T/C 1 8 2 10 3.69972186294596 1.07506953426351 2.62465232868245 T:C T C 10 0.537534767131755 0.119280745126671 ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100860949_100861498:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000461205:exon_100861447_100861498:ZNHIT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 100875772 T/G 1 15 10 25 6.93697849302368 5.37534767131755 1.56163082170613 T:G T G 10 0.537534767131755 0.555250283480734 ENSG00000106404:ENST00000308344:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000401528:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000305064:exon_100875374_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000433833:exon_100875686_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000414035:exon_100875769_100875796:CLDN15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 101837149 G/A 1 8 4 12 3.69972186294596 2.15013906852702 1.54958279441894 A:G G A 10 0.537534767131755 0.403872211149876 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000360264:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000425244:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000393824:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000338990:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000292535:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000412016:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000415720:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000436903:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000431850:exon_101837122_101837170:CUX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 101917521 G/A 1 13 10 23 6.01204802728719 5.37534767131755 0.636700355969636 A:G G A 10 0.537534767131755 0.837163996404797 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101917445_101917581:CUX1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 102087202 T/C 1 103 93 196 47.6339189854292 49.9907333432532 -2.35681435782397 T:C T C 10 0.537534767131755 0.774587412063791 ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 102108532 G/A 1 20 19 39 9.2493046573649 10.2131605755033 -0.963855918138444 A:G G A 10 0.537534767131755 0.751619676840612 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102108166_102109509:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485417:exon_102108509_102108634:LRWD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 38 36 74 17.5736788489933 19.3512516167432 -1.77757276774987 T:C C T 10 0.537534767131755 0.727044716875601 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 102949484 G/A 1 64 59 123 29.5977749035677 31.7145512607735 -2.11677635720586 A:G G A 10 0.537534767131755 0.71827136902105 ENSG00000105819:ENST00000249269:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000428154:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000420236:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000456433:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000443722:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000444457:exon_102949399_102949542:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000498530:exon_102949399_102949706:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000453466:exon_102949399_102949542:PMPCB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 102952123 G/T 1 92 82 174 42.5468014238785 44.0778509048039 -1.53104948092537 T:G G T 10 0.537534767131755 0.820049257341373 ENSG00000105819:ENST00000249269:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000428154:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000420236:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000444457:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000453466:exon_102952090_102952175:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000469560:exon_102951025_102952343:PMPCB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 107559722 A/T 1 25 20 45 11.5616308217061 10.7506953426351 0.810935479071027 A:T A T 10 0.537534767131755 0.881646646503372 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107559639_107560360:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107559639_107560038:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107559639_107559828:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107559639_107560158:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107559639_107560100:DLD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 107569517 A/G 1 12 18 30 5.54958279441894 9.67562580837159 -4.12604301395265 A:G A G 10 0.537534767131755 0.145257349054755 ENSG00000091136:ENST00000472714:exon_107569509_107570422:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000393561:exon_107569509_107569650:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000412968:exon_107569509_107569650:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000222399:exon_107569509_107569650:LAMB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 107599806 C/T 1 10 8 18 4.62465232868245 4.30027813705404 0.324374191628411 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000091136:ENST00000393561:exon_107599694_107599925:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000222399:exon_107599694_107599925:LAMB1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 25 16 41 11.5616308217061 8.60055627410808 2.96107454759805 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.434059951809793 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 112102355 T/G 1 13 12 25 6.01204802728719 6.45041720558106 -0.438369178293874 T:G T G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102325_112102433:IFRD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 29 32 61 13.4114917531791 17.2011125482162 -3.78962079503705 A:G G A 10 0.537534767131755 0.369409534948659 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 29 26 55 13.4114917531791 13.9759039454256 -0.564412192246522 C:G G C 10 0.537534767131755 0.893205482738166 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 116862975 C/T 1 9 5 14 4.16218709581421 2.68767383565877 1.47451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 0.593874685143272 ENSG00000004866:ENST00000265437:exon_116862915_116863961:ST7;ENSG00000004866:ENST00000464020:exon_116862915_116863187:ST7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 117825681 A/G 1 8 5 13 3.69972186294596 2.68767383565877 1.01204802728719 A:G A G 10 0.537534767131755 0.782310374824685 ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 120428799 C/A 1 56 24 80 25.8980530406217 12.9008344111621 12.9972186294596 A:C C A 10 0.537534767131755 0.00344757321719016 ENSG00000106025:ENST00000222747:exon_120427376_120428951:TSPAN12;ENSG00000106025:ENST00000450414:exon_120428376_120428951:TSPAN12;ENSG00000106025:ENST00000415871:exon_120428428_120428951:TSPAN12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 120610901 C/T 1 18 12 30 8.32437419162841 6.45041720558106 1.87395698604735 T:C C T 10 0.537534767131755 0.584215277547095 ENSG00000071243:ENST00000315870:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000427726:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000431467:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000497502:exon_120610742_120610934:ING3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 9 12 21 4.16218709581421 6.45041720558106 -2.28823010976685 A:G G A 10 0.537534767131755 0.383405862328562 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 127222453 G/T 1 28 18 46 12.9490265203109 9.67562580837159 3.27340071193927 T:G G T 10 0.537534767131755 0.376530096010549 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 127222521 G/A 1 17 22 39 7.86190895876017 11.8257648768986 -3.96385591813844 A:G G A 10 0.537534767131755 0.260722504893214 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 127224286 A/G 1 13 12 25 6.01204802728719 6.45041720558106 -0.438369178293874 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127224205_127225661:GCC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 127721507 T/C 1 229 209 438 105.904538326828 112.344766330537 -6.44022800370867 T:C T C 10 0.537534767131755 0.565337379904435 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000470463:exon_127721412_127721553:SND1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 128140982 T/C 1 14 12 26 6.47451326015543 6.45041720558106 0.0240960545743709 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000165055:ENST00000262432:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000482555:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000480046:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000481392:exon_128140957_128141022:METTL2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 128388648 G/A 1 18 19 37 8.32437419162841 10.2131605755033 -1.88878638387493 A:G G A 10 0.537534767131755 0.6216025772515 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128388627_128388858:CALU HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 128846328 G/C 1 4 7 11 1.84986093147298 3.76274336992228 -1.9128824384493 C:G G C 10 0.537534767131755 0.365659915960336 ENSG00000128602:ENST00000249373:exon_128846305_128846428:SMO;ENSG00000128602:ENST00000462420:exon_128846305_128846428:SMO;ENSG00000128602:ENST00000495998:exon_128846305_128846428:SMO HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 129297332 T/G 1 11 6 17 5.08711756155069 3.22520860279053 1.86190895876017 T:G T G 10 0.537534767131755 0.4682435751469 ENSG00000106459:ENST00000353868:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393232:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393231:exon_129297186_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000454688:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000223190:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000311967:exon_129297183_129297414:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393230:exon_129297183_129297414:NRF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 26 22 48 12.0240960545744 11.8257648768986 0.198331177675762 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 129813738 T/C 1 21 16 37 9.71176989023315 8.60055627410808 1.11121361612507 T:C T C 10 0.537534767131755 0.744509553421204 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129813665_129813779:TMEM209 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 130144943 G/C 1 7 1 8 3.23725663007772 0.537534767131755 2.69972186294596 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0764935072245147 ENSG00000106484:ENST00000341441:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000416162:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000378576:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000393187:exon_130144780_130146127:MEST;ENSG00000106484:ENST00000223215:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000437945:exon_130144780_130145194:MEST;ENSG00000106484:ENST00000463263:exon_130144780_130145139:MEST HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 131347009 T/C 0 168 0 168 77.6941591218652 0 77.6941591218652 T T 10 0.537534767131755 9.03926425426371e-46 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 133580447 G/A 1 23 26 49 10.6367003559696 13.9759039454256 -3.33920358945599 A:G G A 10 0.537534767131755 0.39057698796442 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000469115:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000482089:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000460346:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000472020:exon_133580352_133580488:EXOC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 133749164 G/A 1 36 16 52 16.6487483832568 8.60055627410808 8.04819210914874 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0261730409329371 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 134879830 G/A 1 60 96 156 27.7479139720947 51.6033376446485 -23.8554236725538 A:G G A 10 0.537534767131755 0.000146345084729415 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134879814_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134879686_134879836:WDR91 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 134880931 C/T 1 69 55 124 31.9101010679089 29.5644121922465 2.34568887566239 T:C C T 10 0.537534767131755 0.718990349190954 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134880896_134881089:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134880896_134881089:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134880896_134881089:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134880896_134881089:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134880896_134880995:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134880896_134881069:WDR91 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 134889141 G/A 1 40 33 73 18.4986093147298 17.7386473153479 0.759961999381886 A:G G A 10 0.537534767131755 0.90686479108556 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000485942:exon_134889020_134889217:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000431482:exon_134889020_134889185:WDR91 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 134890855 T/G 1 4 9 13 1.84986093147298 4.83781290418579 -2.98795197271281 T:G T G 10 0.537534767131755 0.161862439396256 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 135123060 G/C 1 14 15 29 6.47451326015543 8.06302150697632 -1.58850824682089 C:G G C 10 0.537534767131755 0.580849764907506 ENSG00000080802:ENST00000451834:exon_135122906_135123171:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000423368:exon_135122906_135123171:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000262563:exon_135122906_135123171:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000361528:exon_135122906_135123171:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000414802:exon_135122906_135123079:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000356162:exon_135122906_135123171:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000428680:exon_135122906_135123171:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000315544:exon_135122906_135123171:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000491203:exon_135122906_135123171:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000498534:exon_135122906_135123171:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000465721:exon_135122906_135123171:CNOT4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 135279315 A/C 1 42 43 85 19.4235397804663 23.1139949866655 -3.69045520619917 A:C A C 10 0.537534767131755 0.44743184893761 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135279295_135279477:NUP205 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 138602417 G/A 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:G G A 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000122778:ENST00000440172:exon_138601494_138604184:KIAA1549;ENSG00000122778:ENST00000242365:exon_138601494_138604570:KIAA1549;ENSG00000122778:ENST00000422774:exon_138601494_138604184:KIAA1549;ENSG00000122778:ENST00000455787:exon_138601494_138604184:KIAA1549 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 16 15 31 7.39944372589192 8.06302150697632 -0.663577781084404 A:G G A 10 0.537534767131755 0.858236752595722 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 21 14 35 9.71176989023315 7.52548673984457 2.18628315038858 A:G G A 10 0.537534767131755 0.501231301658046 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 138740037 G/C 1 14 11 25 6.47451326015543 5.91288243844931 0.561630821706125 C:G G C 10 0.537534767131755 0.844309277033242 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138739951_138740041:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138739951_138740041:ZC3HAV1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 139415775 G/C 1 11 29 40 5.08711756155069 15.5885082468209 -10.5013906852702 C:G G C 10 0.537534767131755 0.00121179598815592 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 139415943 G/A 1 15 42 57 6.93697849302368 22.5764602195337 -15.63948172651 A:G G A 10 0.537534767131755 4.46206529825824e-05 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 139715641 G/A 1 6 11 17 2.77479139720947 5.91288243844931 -3.13809104123983 A:G G A 10 0.537534767131755 0.148136675277047 ENSG00000059377:ENST00000425687:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000263552:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000336425:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000448866:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000436047:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000416849:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000414508:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000422328:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000458722:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000411653:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000462275:exon_139715523_139715660:TBXAS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 20 34 54 9.2493046573649 18.2761820824797 -9.02687742511477 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0194733680165187 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 41 47 88 18.961074547598 25.2641340551925 -6.30305950759444 T:C C T 10 0.537534767131755 0.199603055640024 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 33 24 57 15.2613526846521 12.9008344111621 2.36051827348997 A:G G A 10 0.537534767131755 0.595978705381566 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 1 112 101 213 51.7961060812434 54.2910114803073 -2.49490539906381 A:G G A 10 0.537534767131755 0.731796331540886 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 119 74 193 55.0333627113212 39.7775727677499 15.2557899435713 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0301632371252275 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 143884103 G/A 1 9 4 13 4.16218709581421 2.15013906852702 2.01204802728719 A:G G A 10 0.537534767131755 0.405252718730477 ENSG00000213214:ENST00000378115:exon_143883176_143885488:ARHGEF35 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 148705221 A/G 1 2 6 8 0.92493046573649 3.22520860279053 -2.30027813705404 A:G A G 10 0.537534767131755 0.155642553042637 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 148979323 C/T 1 13 9 22 6.01204802728719 4.83781290418579 1.17423512310139 T:C C T 10 0.537534767131755 0.67355127074083 ENSG00000204946:ENST00000434415:exon_148978596_148982082:ZNF783 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 149129829 C/T 1 32 26 58 14.7988874517838 13.9759039454256 0.822983506358213 T:C C T 10 0.537534767131755 0.895550644536932 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149128454_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149129360_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149128867_149130026:ZNF777 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 149191568 C/T 1 13 9 22 6.01204802728719 4.83781290418579 1.17423512310139 T:C C T 10 0.537534767131755 0.67355127074083 ENSG00000181220:ENST00000340622:exon_149191295_149191594:ZNF746;ENSG00000181220:ENST00000458143:exon_149191295_149191594:ZNF746;ENSG00000181220:ENST00000461958:exon_149191295_149191595:ZNF746 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 149559465 C/T 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 T:C C T 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000106479:ENST00000223210:exon_149557472_149559583:ZNF862 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 3 250 253 1.38739569860474 134.383691782939 -132.996296084334 T:C C T 10 0.537534767131755 7.78948578823823e-79 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 150095084 C/T 1 27 29 56 12.4865612874426 15.5885082468209 -3.10194695937828 T:C C T 10 0.537534767131755 0.423853717302054 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 150325175 C/T 1 24 36 60 11.0991655888379 19.3512516167432 -8.2520860279053 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0378705710662479 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 150761314 G/A 1 13 24 37 6.01204802728719 12.9008344111621 -6.88878638387493 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0308225975904359 ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000488420:exon_150761289_150761448:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761289_150761454:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761289_150761454:SLC4A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 150761597 C/T 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 T:C C T 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 69 49 118 31.9101010679089 26.339203589456 5.57089747845291 A:G G A 10 0.537534767131755 0.311547878192416 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 66 55 121 30.5227053693042 29.5644121922465 0.958293177057651 C:G C G 10 0.537534767131755 0.927416893058212 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 44 59 103 20.3484702462028 31.7145512607735 -11.3660810145708 A:C:G C G 10 0.537534767131755 0.0292922770351743 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 151873853 C/T 1 9 16 25 4.16218709581421 8.60055627410808 -4.43836917829387 T:C C T 10 0.537534767131755 0.106790655888092 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151873276_151875053:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151873276_151875095:MLL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 151874498 C/T 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 T:C C T 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151873276_151875053:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151873276_151875095:MLL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 151949068 C/G 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 C:G C G 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151949024_151949175:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151949024_151949175:MLL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 8 4 12 3.69972186294596 2.15013906852702 1.54958279441894 A:G G A 10 0.537534767131755 0.403872211149876 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 14 7 21 6.47451326015543 3.76274336992228 2.71176989023315 C:G G C 10 0.537534767131755 0.278003094604447 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 19 13 32 8.78683942449666 6.98795197271281 1.79888745178384 A:G G A 10 0.537534767131755 0.596815376088155 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 156979662 C/T 1 26 26 52 12.0240960545744 13.9759039454256 -1.95180789085126 T:C C T 10 0.537534767131755 0.676938439103836 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_156979528_156979715:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_156979528_156979715:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000389103:exon_156979528_156979715:UBE3C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 157024038 A/G 1 11 17 28 5.08711756155069 9.13809104123983 -4.05097347968914 A:G A G 10 0.537534767131755 0.133350668026399 ENSG00000009335:ENST00000497368:exon_157023774_157024509:UBE3C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 158526880 G/A 1 53 60 113 24.510657342017 32.2520860279053 -7.74142868588831 A:C:G G A 10 0.537534767131755 0.15717964308439 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 158528233 A/G 1 32 55 87 14.7988874517838 29.5644121922465 -14.7655247404627 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00170429406201385 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 158531809 C/T 1 55 59 114 25.4355878077535 31.7145512607735 -6.27896345302007 A:T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.259940392694667 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158531714_158531812:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158531714_158531812:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158531749_158531812:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158531714_158531812:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158531714_158531812:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158531714_158531812:ESYT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 158534372 G/A 1 82 62 144 37.9221490951961 33.3271555621688 4.59499353302729 A:G G A 10 0.537534767131755 0.45328143838946 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 76 57 133 35.1473576979866 30.63948172651 4.50787597147659 A:C:G G C 10 0.537534767131755 0.486788434590788 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 91 42 133 42.0843361910103 22.5764602195337 19.5078759714766 T:C T C 10 0.537534767131755 0.000657603497899104 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 158536334 G/A 1 81 34 115 37.4596838623279 18.2761820824797 19.1835017798482 A:G G A 10 0.537534767131755 0.000340302853653034 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 81 32 113 37.4596838623279 17.2011125482162 20.2585713141117 A:G A G 10 0.537534767131755 0.000137985378417699 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 3 9 12 1.38739569860474 4.83781290418579 -3.45041720558106 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0780478267108081 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 681206 G/C 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 C:G G C 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_681140_681239:ERICH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 8 14 22 3.69972186294596 7.52548673984457 -3.82576487689861 A:C C A 10 0.537534767131755 0.133605422521882 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 7 10 17 3.23725663007772 5.37534767131755 -2.13809104123983 T:C C T 10 0.537534767131755 0.337166426523694 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 1 26 5 31 12.0240960545744 2.68767383565877 9.3364222189156 T:C C T 10 0.537534767131755 0.000846842285727829 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 8176554 C/T 1 24 21 45 11.0991655888379 11.2882301097669 -0.189064520928973 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 8234077 G/C 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 C:G G C 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 8234192 G/C 1 21 2 23 9.71176989023315 1.07506953426351 8.63670035596964 C:G G C 10 0.537534767131755 0.000193481610545573 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 8234218 C/T 0 22 0 22 10.1742351231014 0 10.1742351231014 C C 10 0.537534767131755 2.31006585185955e-06 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 8234219 G/A 0 22 0 22 10.1742351231014 0 10.1742351231014 G G 10 0.537534767131755 2.31006585185955e-06 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 8234714 C/T 1 26 22 48 12.0240960545744 11.8257648768986 0.198331177675762 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 9414049 G/A 1 18 8 26 8.32437419162841 4.30027813705404 4.02409605457437 A:G G A 10 0.537534767131755 0.120546606575642 ENSG00000173273:ENST00000520408:exon_9413424_9414122:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000310430:exon_9413424_9414122:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000522110:exon_9413442_9416341:TNKS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 9609331 G/A 1 7 8 15 3.23725663007772 4.30027813705404 -1.06302150697632 A:G G A 10 0.537534767131755 0.61360765893613 ENSG00000173273:ENST00000310430:exon_9609119_9609356:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000518281:exon_9609119_9609356:TNKS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 10285810 T/C 1 14 9 23 6.47451326015543 4.83781290418579 1.63670035596964 T:C T C 10 0.537534767131755 0.536918781286691 ENSG00000175806:ENST00000317173:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000527408:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000441698:exon_10285658_10285875:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000528246:exon_10285658_10286395:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000425987:exon_10285658_10286399:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000382490:exon_10285658_10286399:MSRA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 38 68 106 17.5736788489933 36.5523641649593 -18.978685315966 T:C T C 10 0.537534767131755 0.000274707476730404 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 11414237 T/C 1 126 83 209 58.2706193413989 44.6153856719357 13.6552336694632 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0611032247085386 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000526778:exon_11414167_11414297:BLK;ENSG00000136573:ENST00000525206:exon_11414166_11414346:BLK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 11418773 C/T 1 36 18 54 16.6487483832568 9.67562580837159 6.97312257488523 T:C C T 10 0.537534767131755 0.075061544622836 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 11637276 G/A 1 15 12 27 6.93697849302368 6.45041720558106 0.486561287442616 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000154328:ENST00000530433:exon_11637107_11637461:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11637254_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11637107_11637459:NEIL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 11643553 G/T 1 24 23 47 11.0991655888379 12.3632996440304 -1.26413405519248 T:G G T 10 0.537534767131755 0.770600413711711 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528113:exon_11643472_11643606:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 11643803 C/T 1 27 30 57 12.4865612874426 16.1260430139526 -3.63948172651003 T:C C T 10 0.537534767131755 0.354448455410502 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 11689119 G/C 1 260 220 480 120.240960545744 118.257648768986 1.98331177675762 T:C:G G C 10 0.537534767131755 0.890798798666353 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11689027_11689176:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529521:exon_11689027_11689303:FDFT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 17915126 C/T 1 102 112 214 47.171453752561 60.2038939187566 -13.0324401661956 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0750449610320159 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17913925_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17913934_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17913935_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17913961_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17914707_17915132:ASAH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 104 86 190 48.0963842182975 46.2279899733309 1.86839424496656 T:C T C 10 0.537534767131755 0.827348430187085 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 103 82 185 47.6339189854292 44.0778509048039 3.55606808062533 T:C C T 10 0.537534767131755 0.606788994456882 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 19677915 G/A 1 7 11 18 3.23725663007772 5.91288243844931 -2.67562580837159 A:G G A 10 0.537534767131755 0.241274942947926 ENSG00000104613:ENST00000397977:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000522114:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000523869:exon_19677890_19678029:INTS10 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 21956108 A/G 1 20 9 29 9.2493046573649 4.83781290418579 4.41149175317911 A:G A G 10 0.537534767131755 0.135159334150032 ENSG00000158863:ENST00000450006:exon_21955934_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000289921:exon_21955934_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000464226:exon_21955934_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000436711:exon_21955985_21956130:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000356512:exon_21956057_21956130:FAM160B2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 21959638 A/G 1 4 7 11 1.84986093147298 3.76274336992228 -1.9128824384493 A:G A G 10 0.537534767131755 0.365659915960336 ENSG00000158863:ENST00000496599:exon_21959219_21959826:FAM160B2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 21959639 C/T 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 T:C C T 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000158863:ENST00000496599:exon_21959219_21959826:FAM160B2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 21996546 C/T 1 30 34 64 13.8739569860474 18.2761820824797 -4.40222509643232 T:C C T 10 0.537534767131755 0.316015182275011 ENSG00000168476:ENST00000306306:exon_21996439_21996574:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000523293:exon_21996439_21996574:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000518664:exon_21996416_21996574:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519074:exon_21996420_21997042:REEP4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 22105502 T/C 1 51 35 86 23.5857268762805 18.8137168496114 4.77201002666907 T:C T C 10 0.537534767131755 0.331180608103073 ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000519237:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000518039:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000517789:exon_22105370_22105521:POLR3D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 22262379 C/T 1 16 9 25 7.39944372589192 4.83781290418579 2.56163082170613 T:C C T 10 0.537534767131755 0.324259669272264 ENSG00000104635:ENST00000359741:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520644:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000240095:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000381237:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000289952:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000524285:exon_22262209_22262490:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000520832:exon_22262209_22262383:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000519960:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000522881:exon_22262209_22262493:SLC39A14;ENSG00000104635:ENST00000517552:exon_22262030_22262493:SLC39A14 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 22459234 C/T 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 T:C C T 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000248235:ENST00000450780:exon_22459225_22459365:AC037459.4;ENSG00000241852:ENST00000409586:exon_22459225_22459365:C8orf58;ENSG00000241852:ENST00000289989:exon_22459225_22459365:C8orf58;ENSG00000241852:ENST00000381191:exon_22459225_22459365:C8orf58 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 22471824 G/A 1 52 48 100 24.0481921091487 25.8016688223242 -1.75347671317549 A:G G A 10 0.537534767131755 0.763903774987044 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521020:exon_22471398_22471827:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 22473725 G/C 1 62 74 136 28.6728444378312 39.7775727677499 -11.1047283299187 C:G G C 10 0.537534767131755 0.0587156747475106 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473525_22473761:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473525_22473761:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473525_22473761:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473525_22473761:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000413738:exon_22473584_22473761:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 22548790 G/T 1 20 10 30 9.2493046573649 5.37534767131755 3.87395698604735 T:G G T 10 0.537534767131755 0.199794757676518 ENSG00000179388:ENST00000317216:exon_22545172_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000522910:exon_22547556_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000519492:exon_22547937_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000524088:exon_22547985_22548995:EGR3;ENSG00000179388:ENST00000518773:exon_22548678_22548995:EGR3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 114 105 219 52.7210365469799 56.4411505488343 -3.72011400185434 C:G G C 10 0.537534767131755 0.635530581681936 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 22900701 G/A 1 59 79 138 27.2854487392265 42.4652466034086 -15.1797978641822 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0103251906879229 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519910:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22900417_22900756:TNFRSF10B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 22926313 G/A 1 65 68 133 30.0602401364359 36.5523641649593 -6.49212402852341 A:G G A 10 0.537534767131755 0.259904938077148 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22926264_22926692:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22926264_22926534:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22926264_22926544:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22926264_22926535:TNFRSF10B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 23423758 G/A 1 30 20 50 13.8739569860474 10.7506953426351 3.12326164341225 A:G G A 10 0.537534767131755 0.39813012386928 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 25364331 G/A 1 16 12 28 7.39944372589192 6.45041720558106 0.949026520310861 A:G G A 10 0.537534767131755 0.850208407116058 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 25364834 A/T 1 28 19 47 12.9490265203109 10.2131605755033 2.73586594480752 A:T A T 10 0.537534767131755 0.466566259757972 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 25364960 A/G 1 24 24 48 11.0991655888379 12.9008344111621 -1.80166882232424 A:G A G 10 0.537534767131755 0.664908489546432 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 8 5 13 3.69972186294596 2.68767383565877 1.01204802728719 A:G G A 10 0.537534767131755 0.782310374824685 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 27145133 G/A 1 12 9 21 5.54958279441894 4.83781290418579 0.711769890233146 A:G G A 10 0.537534767131755 0.829121193760437 ENSG00000104228:ENST00000305364:exon_27142404_27145644:TRIM35;ENSG00000104228:ENST00000380544:exon_27143269_27145644:TRIM35 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 27145262 A/G 1 14 15 29 6.47451326015543 8.06302150697632 -1.58850824682089 A:G A G 10 0.537534767131755 0.580849764907506 ENSG00000104228:ENST00000305364:exon_27142404_27145644:TRIM35;ENSG00000104228:ENST00000380544:exon_27143269_27145644:TRIM35;ENSG00000104228:ENST00000521253:exon_27145218_27145644:TRIM35 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 137 129 266 63.3577369029496 69.3419849599964 -5.98424805704683 T:C C T 10 0.537534767131755 0.461463031221973 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 27308538 G/A 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 A:G G A 10 0.537534767131755 0.357514540525421 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 27311703 T/C 1 134 145 279 61.9703412043448 77.9425412341045 -15.9722000297596 A:T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.0625253450053933 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 27312135 G/A 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 A:G G A 10 0.537534767131755 0.518813828738763 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 259 161 420 119.778495312875 86.5430975082126 33.2353978046629 A:T:G A G 10 0.537534767131755 0.00121530577778324 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 267 173 440 123.478217175821 92.9935147137936 30.4847024620278 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00352484021484166 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 27373865 G/A 1 7 6 13 3.23725663007772 3.22520860279053 0.0120480272871855 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27373837_27373915:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000520623:exon_27373837_27373915:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27373837_27373915:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27373837_27373915:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27373837_27373915:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27373837_27373915:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27373837_27373915:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27373837_27373915:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521684:exon_27373837_27373915:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000523326:exon_27373837_27373915:EPHX2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 63 66 129 29.1353096706994 35.4772946306958 -6.34198495999639 C:G G C 10 0.537534767131755 0.28945008467589 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 28574803 G/A 1 5 7 12 2.31232616434123 3.76274336992228 -1.45041720558106 A:G G A 10 0.537534767131755 0.564681673647354 ENSG00000012232:ENST00000523149:exon_28574756_28575724:EXTL3;ENSG00000012232:ENST00000220562:exon_28573102_28575724:EXTL3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 29005093 A/G 1 7 4 11 3.23725663007772 2.15013906852702 1.0871175615507 A:G A G 10 0.537534767131755 0.561398395274424 ENSG00000197892:ENST00000524189:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000357808:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000355514:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000404075:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000522355:exon_29004909_29005119:KIF13B;ENSG00000197892:ENST00000521515:exon_29004909_29005119:KIF13B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 30924557 C/T 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30924549_30924698:WRN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 30973957 G/T 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:G G T 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30973870_30974044:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30973870_30974044:WRN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 30999280 G/T 1 18 7 25 8.32437419162841 3.76274336992228 4.56163082170613 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0732796465780908 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 31000145 G/A 1 8 16 24 3.69972186294596 8.60055627410808 -4.90083441116212 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0633610479446073 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31000142_31000217:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31000142_31000217:WRN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 31024654 T/C 1 11 7 18 5.08711756155069 3.76274336992228 1.32437419162841 T:C T C 10 0.537534767131755 0.639329189576991 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 33416189 G/A 1 5 12 17 2.31232616434123 6.45041720558106 -4.13809104123983 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0522959192114914 ENSG00000133874:ENST00000256257:exon_33416133_33416289:RNF122 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 33416222 C/T 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000133874:ENST00000256257:exon_33416133_33416289:RNF122 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 37963239 C/T 1 37 30 67 17.1112136161251 16.1260430139526 0.985170602172417 T:C C T 10 0.537534767131755 0.902617714520793 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37962760_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37963011_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517719:exon_37963018_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37963068_37963256:ASH2L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 37985897 A/G 1 18 25 43 8.32437419162841 13.4383691782939 -5.11399498666546 A:G A G 10 0.537534767131755 0.127728199299585 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000428278:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000521652:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000524247:exon_37985858_37985976:ASH2L HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 38848850 C/T 1 18 19 37 8.32437419162841 10.2131605755033 -1.88878638387493 T:C C T 10 0.537534767131755 0.6216025772515 ENSG00000169490:ENST00000456845:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000456397:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000412303:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000397070:exon_38848324_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000316221:exon_38848324_38849064:TM2D2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 41547748 G/A 1 55 29 84 25.4355878077535 15.5885082468209 9.84707956093258 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0370660655346765 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000518061:exon_41547745_41547803:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41547745_41547864:ANK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 41553928 C/G 1 20 29 49 9.2493046573649 15.5885082468209 -6.33920358945599 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0848566945066893 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41553881_41554105:ANK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 41566438 C/T 1 22 8 30 10.1742351231014 4.30027813705404 5.87395698604735 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.0423344392736491 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41566296_41566493:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41566296_41566493:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41566296_41566493:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41566296_41566493:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41566296_41566493:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41566296_41566493:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41566296_41566493:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41566296_41566493:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41566296_41566493:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41566296_41566493:ANK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 52746153 C/T 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 T:C C T 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000168300:ENST00000360540:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519559:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000522514:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519554:exon_52746078_52746249:PCMTD1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 59512334 G/A 1 31 27 58 14.3364222189156 14.5134387125574 -0.177016493641789 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523982:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000519227:exon_59512309_59512429:NSMAF HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 61769195 A/G 1 11 14 25 5.08711756155069 7.52548673984457 -2.43836917829387 A:G A G 10 0.537534767131755 0.423037845947577 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61769004_61769447:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61769004_61769447:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000529472:exon_61769004_61769446:CHD7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 70744812 G/A 1 12 16 28 5.54958279441894 8.60055627410808 -3.05097347968914 A:G G A 10 0.537534767131755 0.261288988317515 ENSG00000137571:ENST00000260126:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000524945:exon_70744002_70745625:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000526750:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000530307:exon_70744002_70744950:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000532388:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000528658:exon_70744002_70745404:SLCO5A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 71039118 C/G 1 19 14 33 8.78683942449666 7.52548673984457 1.26135268465209 C:G C G 10 0.537534767131755 0.728762453910667 ENSG00000140396:ENST00000267974:exon_71039048_71039282:NCOA2;ENSG00000140396:ENST00000452400:exon_71039048_71039282:NCOA2;ENSG00000140396:ENST00000518287:exon_71039048_71039282:NCOA2;ENSG00000140396:ENST00000518363:exon_71039048_71039282:NCOA2;ENSG00000140396:ENST00000521239:exon_71038844_71039282:NCOA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 74205815 A/G 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 A:G A G 10 0.537534767131755 0.764236388540224 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 18 11 29 8.32437419162841 5.91288243844931 2.41149175317911 A:G G A 10 0.537534767131755 0.457394669306004 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 87520894 C/A 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 A:C C A 10 0.537534767131755 0.592540852178834 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87520721_87520910:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87520721_87520904:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87520721_87520913:FAM82B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 92083424 A/G 1 14 12 26 6.47451326015543 6.45041720558106 0.0240960545743709 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000155100:ENST00000285420:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000404789:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000522894:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000524027:exon_92083366_92083517:OTUD6B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 95419698 A/G 1 7 9 16 3.23725663007772 4.83781290418579 -1.60055627410808 A:G A G 10 0.537534767131755 0.460588608389532 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95419667_95419948:RAD54B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 95523385 T/C 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 T:C T C 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95522961_95523957:KIAA1429 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 95541302 A/G 1 17 5 22 7.86190895876017 2.68767383565877 5.17423512310139 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.0315816885143343 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95541298_95541570:KIAA1429 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 98289986 C/T 1 8 2 10 3.69972186294596 1.07506953426351 2.62465232868245 T:C C T 10 0.537534767131755 0.119280745126671 ENSG00000180543:ENST00000322128:exon_98285717_98290176:TSPYL5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 99057150 C/A 1 20 12 32 9.2493046573649 6.45041720558106 2.79888745178384 A:C C A 10 0.537534767131755 0.377265601273927 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 99057526 G/A 1 40 27 67 18.4986093147298 14.5134387125574 3.98517060217242 A:G G A 10 0.537534767131755 0.391290192169022 ENSG00000156482:ENST00000517489:exon_99057171_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 24 16 40 11.0991655888379 8.60055627410808 2.4986093147298 T:C T C 10 0.537534767131755 0.526471660943444 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 12 8 20 5.54958279441894 4.30027813705404 1.2493046573649 A:G G A 10 0.537534767131755 0.657534137938504 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 103293615 T/C 1 41 33 74 18.961074547598 17.7386473153479 1.22242723225013 T:C T C 10 0.537534767131755 0.816316603116017 ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103293517_103293747:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103293517_103293747:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103293517_103293747:UBR5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 34 28 62 15.7238179175203 15.0509734796891 0.672844437831193 A:G A G 10 0.537534767131755 0.899218248958223 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 109491314 C/G 1 23 21 44 10.6367003559696 11.2882301097669 -0.651529753797218 C:G C G 10 0.537534767131755 0.880571422369327 ENSG00000104412:ENST00000220853:exon_109491235_109491339:TTC35;ENSG00000104412:ENST00000520294:exon_109491235_109491339:TTC35;ENSG00000104412:ENST00000519450:exon_109491235_109491339:TTC35 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 125 155 280 57.8081541085306 83.317888905422 -25.5097347968914 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00266733767758426 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 120803637 C/G 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 C:G C G 10 0.537534767131755 0.518813828738763 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120803564_120803699:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000523904:exon_120803564_120803699:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000523734:exon_120803564_120804114:TAF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 120847188 T/C 1 4 8 12 1.84986093147298 4.30027813705404 -2.45041720558106 T:C T C 10 0.537534767131755 0.246047854304642 ENSG00000136982:ENST00000313655:exon_120846216_120847241:DSCC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 123964431 G/A 1 24 28 52 11.0991655888379 15.0509734796891 -3.95180789085126 A:G G A 10 0.537534767131755 0.330367827822785 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 123964953 C/T 1 28 29 57 12.9490265203109 15.5885082468209 -2.63948172651003 T:C C T 10 0.537534767131755 0.508547427746685 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 125463250 T/C 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 T:C T C 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 125463435 C/G 1 4 8 12 1.84986093147298 4.30027813705404 -2.45041720558106 C:G C G 10 0.537534767131755 0.246047854304642 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 125498547 C/T 1 21 23 44 9.71176989023315 12.3632996440304 -2.65152975379722 T:C C T 10 0.537534767131755 0.452143828054077 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 125499363 G/A 1 11 6 17 5.08711756155069 3.22520860279053 1.86190895876017 A:G G A 10 0.537534767131755 0.4682435751469 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 125528135 G/A 1 11 17 28 5.08711756155069 9.13809104123983 -4.05097347968914 A:G G A 10 0.537534767131755 0.133350668026399 ENSG00000147687:ENST00000276692:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523214:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519548:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522810:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000517678:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519776:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521546:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521973:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520321:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522310:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519232:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520938:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523888:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523152:exon_125528128_125528271:TATDN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 128751201 G/A 1 251 215 466 116.078773449929 115.569974933327 0.508798516602184 A:C:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000136997:ENST00000259523:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000528568:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000377970:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000454617:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000524013:exon_128750497_128751265:MYC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 131124559 T/C 1 12 11 23 5.54958279441894 5.91288243844931 -0.363299644030365 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000153317:ENST00000524124:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000357668:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000521075:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000518721:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000343135:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000519483:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000520189:exon_131124340_131124660:ASAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 132982824 A/G 1 14 6 20 6.47451326015543 3.22520860279053 3.2493046573649 A:G A G 10 0.537534767131755 0.180165257217980 ENSG00000132294:ENST00000254624:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000407309:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000377917:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000334503:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000519656:exon_132982723_132982890:EFR3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 132999936 A/G 1 11 12 23 5.08711756155069 6.45041720558106 -1.36329964403036 A:G A G 10 0.537534767131755 0.677013887550826 ENSG00000132294:ENST00000254624:exon_132999822_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000407309:exon_132999822_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000377917:exon_132999873_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000334503:exon_132999822_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000519656:exon_132999822_132999949:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000519920:exon_132999822_132999949:EFR3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 134474148 C/T 1 7 11 18 3.23725663007772 5.91288243844931 -2.67562580837159 T:C C T 10 0.537534767131755 0.241274942947926 ENSG00000008513:ENST00000319914:exon_134474118_134474237:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000395320:exon_134474118_134474237:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000399640:exon_134474118_134474237:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000521180:exon_134474118_134474237:ST3GAL1;ENSG00000008513:ENST00000522652:exon_134474118_134474237:ST3GAL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 135602581 A/G 1 5 3 8 2.31232616434123 1.61260430139526 0.69972186294596 A:T:G A G 10 0.537534767131755 0.732674349299313 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 11 6 17 5.08711756155069 3.22520860279053 1.86190895876017 A:G A G 10 0.537534767131755 0.4682435751469 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 135614972 A/G 1 5 8 13 2.31232616434123 4.30027813705404 -1.98795197271281 A:G A G 10 0.537534767131755 0.282711715868391 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135613720_135615176:ZFAT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 141310644 G/A 1 9 8 17 4.16218709581421 4.30027813705404 -0.138091041239834 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141310568_141310713:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521167:exon_141310568_141310713:TRAPPC9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 142170884 C/T 1 30 21 51 13.8739569860474 11.2882301097669 2.5857268762805 T:C C T 10 0.537534767131755 0.486363396107849 ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521477:exon_142170731_142170886:DENND3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 59 27 86 27.2854487392265 14.5134387125574 12.7720100266691 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00655465980665415 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 143746050 C/T 1 6 4 10 2.77479139720947 2.15013906852702 0.62465232868245 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.760762761058777 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 143746069 T/C 1 4 5 9 1.84986093147298 2.68767383565877 -0.837812904185795 T:C T C 10 0.537534767131755 0.74134570348407 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144351607 C/T 1 9 6 15 4.16218709581421 3.22520860279053 0.936978493023676 T:C C T 10 0.537534767131755 0.797066078642493 ENSG00000250571:ENST00000519876:exon_144351530_144351690:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000521682:exon_144351530_144351690:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144351530_144351690:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000344692:exon_144351528_144351690:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517468:exon_144351528_144351690:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144351528_144351690:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000520021:exon_144351540_144351690:GLI4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144358302 C/T 1 14 12 26 6.47451326015543 6.45041720558106 0.0240960545743709 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000522479:exon_144358067_144358351:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000522033:exon_144358067_144358340:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 25 21 46 11.5616308217061 11.2882301097669 0.273400711939273 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144378184 C/G 1 9 13 22 4.16218709581421 6.98795197271281 -2.82576487689861 C:G C G 10 0.537534767131755 0.285838202231404 ENSG00000185730:ENST00000518575:exon_144377910_144378457:ZNF696;ENSG00000185730:ENST00000330143:exon_144377910_144380231:ZNF696 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 40 35 75 18.4986093147298 18.8137168496114 -0.315107534881623 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144403485 G/C 1 13 15 28 6.01204802728719 8.06302150697632 -2.05097347968914 C:G G C 10 0.537534767131755 0.454605168209296 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144406705 C/T 1 17 15 32 7.86190895876017 8.06302150697632 -0.201112548216159 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144406655_144406799:TOP1MT HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 43 40 83 19.8860050133345 21.5013906852702 -1.61538567193566 T:C:G T C 10 0.537534767131755 0.742178163476431 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144657500 T/G 1 5 29 34 2.31232616434123 15.5885082468209 -13.2761820824797 T:G T G 10 0.537534767131755 3.11237139687528e-06 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657400_144657515:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144656955_144657515:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657361_144657515:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000498076:exon_144657361_144657585:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657361_144657515:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657361_144657515:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657400_144657515:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657361_144657515:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657334_144657515:NAPRT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 1 2 29 31 0.92493046573649 15.5885082468209 -14.6635777810844 A:G G A 10 0.537534767131755 3.19612494182665e-08 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144660257 G/T 0 13 0 13 6.01204802728719 0 6.01204802728719 G G 10 0.537534767131755 0.000357075049496152 ENSG00000147813:ENST00000462059:exon_144659986_144660491:NAPRT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 656 707 1363 303.377192761569 380.037080362151 -76.659887600582 A:T:G G A 10 0.537534767131755 3.58245483653289e-05 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144671922 G/A 1 11 14 25 5.08711756155069 7.52548673984457 -2.43836917829387 A:G G A 10 0.537534767131755 0.423037845947577 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 14 19 33 6.47451326015543 10.2131605755033 -3.73864731534791 T:G G T 10 0.537534767131755 0.222785253283888 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144681928 C/T 1 19 12 31 8.78683942449666 6.45041720558106 2.3364222189156 T:C C T 10 0.537534767131755 0.47292802889 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144687092 T/C 1 28 19 47 12.9490265203109 10.2131605755033 2.73586594480752 T:C T C 10 0.537534767131755 0.466566259757972 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144687077_144687127:PYCRL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144688736 C/G 1 3 9 12 1.38739569860474 4.83781290418579 -3.45041720558106 C:G C G 10 0.537534767131755 0.0780478267108081 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144688637_144688789:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144689146 C/T 1 11 10 21 5.08711756155069 5.37534767131755 -0.288230109766855 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144775871 C/A 1 15 8 23 6.93697849302368 4.30027813705404 2.63670035596964 A:C C A 10 0.537534767131755 0.301970044035753 ENSG00000181135:ENST00000525185:exon_144775841_144776000:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000534303:exon_144775841_144776009:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000528456:exon_144775841_144775942:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530574:exon_144775841_144775997:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531985:exon_144775841_144775893:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527293:exon_144775841_144775926:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531811:exon_144775841_144775918:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000525862:exon_144775841_144775873:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000526315:exon_144775841_144776129:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530341:exon_144775841_144775881:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531254:exon_144775841_144776199:ZNF707 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 17 9 26 7.86190895876017 4.83781290418579 3.02409605457437 A:C A C 10 0.537534767131755 0.246341934149751 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144874957 G/A 1 83 57 140 38.3846143280643 30.63948172651 7.7451326015543 A:G G A 10 0.537534767131755 0.203925457542349 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144874655_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000525051:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144874655_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144874878_144875037:SCRIB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 144886809 C/T 1 33 28 61 15.2613526846521 15.0509734796891 0.210379204962948 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144886738_144886995:SCRIB HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 145603114 A/C 1 8 3 11 3.69972186294596 1.61260430139526 2.0871175615507 A:C A C 10 0.537534767131755 0.241009480668847 ENSG00000173137:ENST00000534714:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000526231:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000533715:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000529654:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000308860:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000532190:exon_145603076_145603179:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000526833:exon_145603076_145603179:ADCK5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 145621556 A/G 1 10 2 12 4.62465232868245 1.07506953426351 3.54958279441894 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0449839205883623 ENSG00000071894:ENST00000527827:exon_145621230_145621715:CPSF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 70 58 128 32.3725663007772 31.1770164936418 1.19554980713536 A:G G A 10 0.537534767131755 0.859631492823696 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 145661675 G/A 1 16 12 28 7.39944372589192 6.45041720558106 0.949026520310861 A:G G A 10 0.537534767131755 0.850208407116058 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145661041_145661801:NFKBIL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 145665407 C/T 1 17 14 31 7.86190895876017 7.52548673984457 0.336422218915597 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665404_145665456:NFKBIL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 145665761 G/A 1 10 19 29 4.62465232868245 10.2131605755033 -5.58850824682089 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0411985220852713 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665734_145665812:NFKBIL2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 145725909 G/A 1 13 13 26 6.01204802728719 6.98795197271281 -0.975903945425628 A:G G A 10 0.537534767131755 0.700055875569719 ENSG00000160972:ENST00000526183:exon_145725479_145726144:PPP1R16A;ENSG00000160972:ENST00000292539:exon_145725870_145725995:PPP1R16A;ENSG00000160972:ENST00000435887:exon_145725870_145725995:PPP1R16A;ENSG00000160972:ENST00000532806:exon_145725870_145725995:PPP1R16A;ENSG00000160972:ENST00000526564:exon_145725650_145725995:PPP1R16A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 145735224 C/T 1 11 8 19 5.08711756155069 4.30027813705404 0.786839424496655 T:C C T 10 0.537534767131755 0.819969557899132 ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145734457_145735398:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145734463_145735398:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000526749:exon_145735002_145735398:MFSD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 145737514 G/A 1 6 3 9 2.77479139720947 1.61260430139526 1.16218709581421 A:G G A 10 0.537534767131755 0.518813828738763 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 25 27 52 11.5616308217061 14.5134387125574 -2.95180789085126 T:C C T 10 0.537534767131755 0.48721157192913 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 145741130 C/T 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 T:C C T 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 30 28 58 13.8739569860474 15.0509734796891 -1.17701649364179 C:G C G 10 0.537534767131755 0.793115963280092 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 27 30 57 12.4865612874426 16.1260430139526 -3.63948172651003 A:G G A 10 0.537534767131755 0.354448455410502 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 145742514 A/G 0 0 26 26 0 13.9759039454256 -13.9759039454256 G A G 10 0.537534767131755 1.95909868740875e-09 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534270:exon_145742217_145742574:RECQL4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 146062872 C/T 1 2 7 9 0.92493046573649 3.76274336992228 -2.83781290418579 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0909104192397482 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146062776_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146062776_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532382:exon_146062776_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146062776_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146062776_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000525266:exon_146062776_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146062779_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325217:exon_146062776_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000529767:exon_146062776_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532051:exon_146062776_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000533314:exon_146062776_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000527218:exon_146062779_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000529819:exon_146062779_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146062779_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530082:exon_146062776_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146062776_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528130:exon_146062776_146062892:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146059118_146062892:ZNF7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 146067054 G/A 1 17 20 37 7.86190895876017 10.7506953426351 -2.88878638387493 A:G G A 10 0.537534767131755 0.410276871941077 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146066740_146067121:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 146068322 C/T 1 16 11 27 7.39944372589192 5.91288243844931 1.48656128744262 T:C C T 10 0.537534767131755 0.700334466477321 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 8 146076708 C/T 1 27 39 66 12.4865612874426 20.9638559181384 -8.47729463069583 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0474325963348262 ENSG00000170619:ENST00000402718:exon_146075559_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000450361:exon_146075573_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000305103:exon_146075604_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000529143:exon_146076210_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000533270:exon_146076211_146076780:COMMD5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 2029018 G/A 1 32 37 69 14.7988874517838 19.8887863838749 -5.08989893209109 A:G G A 10 0.537534767131755 0.229130226833021 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000457226:exon_2028987_2029221:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2029006_2029247:SMARCA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 2029199 G/A 1 37 37 74 17.1112136161251 19.8887863838749 -2.77757276774987 A:G G A 10 0.537534767131755 0.560639460231963 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000457226:exon_2028987_2029221:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2029006_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2029019_2029247:SMARCA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 2039973 C/T 1 12 7 19 5.54958279441894 3.76274336992228 1.78683942449666 T:C C T 10 0.537534767131755 0.493873626093778 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 2073292 A/G 1 16 22 38 7.39944372589192 11.8257648768986 -4.42632115100669 A:G A G 10 0.537534767131755 0.192498536355526 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2073212_2073342:SMARCA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 2191309 C/G 1 54 60 114 24.9731225748852 32.2520860279053 -7.27896345302007 C:G C G 10 0.537534767131755 0.188618407726794 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000302401:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382186:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000417599:exon_2191266_2191428:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382185:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382183:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000324954:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382182:exon_2191266_2191408:SMARCA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 2643875 A/G 1 6 12 18 2.77479139720947 6.45041720558106 -3.67562580837159 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0991754162193756 ENSG00000147852:ENST00000382100:exon_2643837_2643959:VLDLR;ENSG00000147852:ENST00000397921:exon_2643837_2643959:VLDLR;ENSG00000147852:ENST00000382099:exon_2643837_2643959:VLDLR;ENSG00000147852:ENST00000382131:exon_2643837_2643959:VLDLR;ENSG00000147852:ENST00000382092:exon_2643837_2643959:VLDLR;ENSG00000147852:ENST00000276891:exon_2643837_2643959:VLDLR HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 25 18 43 11.5616308217061 9.67562580837159 1.88600501333454 A:G A G 10 0.537534767131755 0.647234984169326 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 5361758 C/G 1 34 10 44 15.7238179175203 5.37534767131755 10.3484702462028 C:G C G 10 0.537534767131755 0.00211373279932456 ENSG00000107020:ENST00000223864:exon_5361758_5361888:C9orf46;ENSG00000107020:ENST00000482696:exon_5361758_5361888:C9orf46 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 6506038 C/T 1 25 17 42 11.5616308217061 9.13809104123983 2.42353978046629 T:C C T 10 0.537534767131755 0.536683339793605 ENSG00000147854:ENST00000468435:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000276893:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000485617:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000492853:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000481243:exon_6506033_6506112:UHRF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 6533010 C/G 1 6 27 33 2.77479139720947 14.5134387125574 -11.7386473153479 C:G C G 10 0.537534767131755 3.43565496134664e-05 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6532464_6533160:GLDC;ENSG00000178445:ENST00000477960:exon_6532899_6533160:GLDC HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 16 19 35 7.39944372589192 10.2131605755033 -2.81371684961142 A:G G A 10 0.537534767131755 0.397687197999873 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 26892654 G/A 1 12 12 24 5.54958279441894 6.45041720558106 -0.900834411162119 A:G G A 10 0.537534767131755 0.83840612934176 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26892411_26892802:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26892411_26892801:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26892257_26892785:C9orf82 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 131 136 267 60.5829455057401 73.1047283299187 -12.5217828241786 T:C T C 10 0.537534767131755 0.125420354914267 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 33941759 T/C 1 19 27 46 8.78683942449666 14.5134387125574 -5.72659928806073 T:C T C 10 0.537534767131755 0.103901121647414 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379225:exon_33941647_33941860:UBAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 18 13 31 8.32437419162841 6.98795197271281 1.3364222189156 A:G A G 10 0.537534767131755 0.720009446141645 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 34017106 C/T 1 14 10 24 6.47451326015543 5.37534767131755 1.09916558883788 T:C C T 10 0.537534767131755 0.68779414869778 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000351580:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000412543:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000480885:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000459988:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000418786:exon_34017048_34017146:UBAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 29 18 47 13.4114917531791 9.67562580837159 3.73586594480752 T:C C T 10 0.537534767131755 0.307542982653534 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 35077023 G/A 1 23 30 53 10.6367003559696 16.1260430139526 -5.48934265798301 A:G G A 10 0.537534767131755 0.167747742206119 ENSG00000221829:ENST00000425676:exon_35076968_35077098:FANCG;ENSG00000221829:ENST00000378643:exon_35076968_35077098:FANCG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 35105257 G/A 1 8 9 17 3.69972186294596 4.83781290418579 -1.13809104123983 A:G G A 10 0.537534767131755 0.632207850144401 ENSG00000005238:ENST00000378566:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35104118_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35104120_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35104139_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000479357:exon_35104827_35105371:KIAA1539 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 35107765 C/A 1 3 5 8 1.38739569860474 2.68767383565877 -1.30027813705404 A:C C A 10 0.537534767131755 0.484098982011234 ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35107378_35108271:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378554:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000408010:exon_35107378_35108346:KIAA1539 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 35704150 C/T 1 255 232 487 117.928634381402 124.708065974567 -6.77943159316466 T:C C T 10 0.537534767131755 0.554785828599531 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35703988_35704171:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000464379:exon_35703988_35704171:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000466916:exon_35703988_35704190:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000465002:exon_35703988_35704412:TLN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 36607660 A/G 1 10 7 17 4.62465232868245 3.76274336992228 0.861908958760166 A:G A G 10 0.537534767131755 0.809420271807075 ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36607572_36607670:MELK;ENSG00000165304:ENST00000495529:exon_36607572_36607670:MELK;ENSG00000165304:ENST00000487398:exon_36607572_36607670:MELK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 36671145 C/T 1 24 17 41 11.0991655888379 9.13809104123983 1.96107454759805 T:C C T 10 0.537534767131755 0.639094020728528 ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36670995_36671163:MELK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 18 6 24 8.32437419162841 3.22520860279053 5.09916558883788 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0409179166547511 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 1 25 10 35 11.5616308217061 5.37534767131755 6.18628315038858 A:G G A 10 0.537534767131755 0.041434981972687 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 14 11 25 6.47451326015543 5.91288243844931 0.561630821706125 T:C C T 10 0.537534767131755 0.844309277033242 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 38396065 G/T 1 68 48 116 31.4476358350407 25.8016688223242 5.64596701271643 T:G G T 10 0.537534767131755 0.306911503397462 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 71840272 G/A 1 49 27 76 22.660796410544 14.5134387125574 8.14735769798662 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0658417280712769 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71840220_71840323:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71840220_71840323:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71840220_71840323:TJP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 71841018 A/G 1 32 18 50 14.7988874517838 9.67562580837159 5.12326164341225 A:G A G 10 0.537534767131755 0.157954051244285 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71840938_71841091:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71840938_71841091:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71840938_71841091:TJP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 71843023 C/A 1 52 85 137 24.0481921091487 45.6904552061992 -21.6422630970504 A:C C A 10 0.537534767131755 0.000215687296944251 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71842897_71843030:TJP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 80 52 132 36.9972186294596 27.9518078908513 9.04541073860835 T:C C T 10 0.537534767131755 0.116993169231939 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 76 47 123 35.1473576979866 25.2641340551925 9.88322364279414 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0854414090427383 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 72897440 T/C 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 74305098 C/T 1 7 5 12 3.23725663007772 2.68767383565877 0.54958279441894 T:C C T 10 0.537534767131755 0.781935053048792 ENSG00000135048:ENST00000377066:exon_74305008_74305162:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000377044:exon_74305008_74305162:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000377057:exon_74305008_74305162:TMEM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 74315560 C/T 1 16 17 33 7.39944372589192 9.13809104123983 -1.73864731534791 T:C C T 10 0.537534767131755 0.602284572105899 ENSG00000135048:ENST00000377066:exon_74315558_74315740:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000377044:exon_74315558_74315740:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000474495:exon_74315558_74315740:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000396272:exon_74315558_74315740:TMEM2;ENSG00000135048:ENST00000377055:exon_74315558_74315740:TMEM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 19 26 45 8.78683942449666 13.9759039454256 -5.18906452092897 T:C C T 10 0.537534767131755 0.13561238085745 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 3 7 10 1.38739569860474 3.76274336992228 -2.37534767131755 A:C A C 10 0.537534767131755 0.203605394966440 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 78 66 144 36.0722881637231 35.4772946306958 0.594993533027285 A:C C A 10 0.537534767131755 0.93361729285952 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 90265015 C/T 1 56 7 63 25.8980530406217 3.76274336992228 22.1353096706994 T:C C T 10 0.537534767131755 2.86602271947075e-09 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469067:exon_90264836_90265426:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000475804:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000495281:exon_90264836_90265394:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000494010:exon_90264905_90265033:DAPK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 93637015 C/T 1 40 45 85 18.4986093147298 24.189064520929 -5.69045520619917 T:C C T 10 0.537534767131755 0.232225444510868 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93636954_93637131:SYK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 93639973 G/C 1 30 27 57 13.8739569860474 14.5134387125574 -0.639481726510034 C:G G C 10 0.537534767131755 0.894861337970316 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 93640009 G/A 1 32 25 57 14.7988874517838 13.4383691782939 1.36051827348997 A:G G A 10 0.537534767131755 0.791005023816092 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 93641151 T/C 1 17 25 42 7.86190895876017 13.4383691782939 -5.57646021953371 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0902492390766182 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 93641175 C/T 1 17 15 32 7.86190895876017 8.06302150697632 -0.201112548216159 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 93641199 T/C 1 26 23 49 12.0240960545744 12.3632996440304 -0.339203589455993 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 95375468 G/A 1 13 12 25 6.01204802728719 6.45041720558106 -0.438369178293874 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000188312:ENST00000375587:exon_95375301_95382815:CENPP;ENSG00000188312:ENST00000375579:exon_95375301_95377446:CENPP;ENSG00000188312:ENST00000375576:exon_95375301_95377446:CENPP;ENSG00000127080:ENST00000287996:exon_95375466_95378339:IPPK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 95396712 G/A 1 14 6 20 6.47451326015543 3.22520860279053 3.2493046573649 A:G G A 10 0.537534767131755 0.180165257217980 ENSG00000127080:ENST00000287996:exon_95396668_95396770:IPPK;ENSG00000127080:ENST00000375522:exon_95396668_95396770:IPPK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 95481230 C/T 1 15 19 34 6.93697849302368 10.2131605755033 -3.27618208247967 T:C C T 10 0.537534767131755 0.30317916916678 ENSG00000185963:ENST00000356884:exon_95480821_95481864:BICD2;ENSG00000185963:ENST00000375512:exon_95480821_95481864:BICD2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 95738723 C/T 1 36 28 64 16.6487483832568 15.0509734796891 1.59777490356768 T:C:G C T 10 0.537534767131755 0.708849299154523 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 33 24 57 15.2613526846521 12.9008344111621 2.36051827348997 A:C C A 10 0.537534767131755 0.595978705381566 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 95838133 C/T 1 29 43 72 13.4114917531791 23.1139949866655 -9.70250323348636 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0244716171454727 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95838066_95838254:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95838066_95838254:SUSD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 99580834 A/C 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:C A C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 99581811 C/T 1 6 5 11 2.77479139720947 2.68767383565877 0.0871175615506954 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000466833:exon_99581690_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000478850:exon_99581690_99582060:ZNF782 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 99581916 C/G 1 7 3 10 3.23725663007772 1.61260430139526 1.62465232868245 C:G C G 10 0.537534767131755 0.357514540525421 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000466833:exon_99581690_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000478850:exon_99581690_99582060:ZNF782 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 104324545 G/A 1 21 20 41 9.71176989023315 10.7506953426351 -1.03892545240195 A:G G A 10 0.537534767131755 0.756605398595916 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104324528_104325622:RNF20 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 18 21 39 8.32437419162841 11.2882301097669 -2.96385591813844 A:G G A 10 0.537534767131755 0.422393901428919 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 111653574 C/G 1 5 10 15 2.31232616434123 5.37534767131755 -3.06302150697632 C:G C G 10 0.537534767131755 0.126645309084573 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111653483_111653684:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111653483_111653684:IKBKAP HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 111727670 C/G 1 16 18 34 7.39944372589192 9.67562580837159 -2.27618208247967 C:G C G 10 0.537534767131755 0.492998675593706 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 111868885 G/A 1 5 6 11 2.31232616434123 3.22520860279053 -0.912882438449305 A:G G A 10 0.537534767131755 0.764236388540224 ENSG00000106771:ENST00000374587:exon_111868788_111868889:C9orf5;ENSG00000106771:ENST00000374586:exon_111868788_111868889:C9orf5;ENSG00000106771:ENST00000491854:exon_111868788_111868889:C9orf5;ENSG00000106771:ENST00000223608:exon_111868788_111868889:C9orf5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 114411945 G/T 1 5 11 16 2.31232616434123 5.91288243844931 -3.60055627410808 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0821156190636971 ENSG00000059769:ENST00000313525:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000463589:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000447096:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000436202:exon_114411733_114412203:DNAJC25 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 48 51 99 22.1983311776758 27.4142731237195 -5.21594194604374 A:G G A 10 0.537534767131755 0.314157372421981 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 115950156 G/A 1 22 20 42 10.1742351231014 10.7506953426351 -0.576460219533709 A:G G A 10 0.537534767131755 0.878117117357435 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950073_115950179:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950073_115950179:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950073_115950179:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115948716_115950179:FKBP15 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 116044998 A/G 1 24 26 50 11.0991655888379 13.9759039454256 -2.87673835658775 A:T:G A G 10 0.537534767131755 0.478772610168917 ENSG00000136875:ENST00000374199:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000374198:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000488937:exon_116044926_116045456:PRPF4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 116153900 A/G 1 8 8 16 3.69972186294596 4.30027813705404 -0.600556274108079 A:G A G 10 0.537534767131755 0.806072821048815 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000448137:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482001:exon_116153807_116153903:ALAD HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 92 88 180 42.5468014238785 47.3030595075944 -4.7562580837159 A:G A G 10 0.537534767131755 0.501445444078284 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 117386719 C/T 1 14 7 21 6.47451326015543 3.76274336992228 2.71176989023315 T:C C T 10 0.537534767131755 0.278003094604447 ENSG00000157693:ENST00000374049:exon_117386630_117386739:C9orf91;ENSG00000157693:ENST00000288502:exon_117386630_117386739:C9orf91;ENSG00000157693:ENST00000471206:exon_117386416_117386739:C9orf91;ENSG00000157693:ENST00000448809:exon_117386587_117386739:C9orf91 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 123220829 A/G 1 27 4 31 12.4865612874426 2.15013906852702 10.3364222189156 A:G A G 10 0.537534767131755 0.000182788605788657 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 123291036 C/G 1 21 13 34 9.71176989023315 6.98795197271281 2.72381791752033 C:G C G 10 0.537534767131755 0.392737558683748 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000482047:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123291022_123291051:CDK5RAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 123301346 T/G 1 17 16 33 7.86190895876017 8.60055627410808 -0.738647315347913 T:G T G 10 0.537534767131755 0.862168191265843 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123301315_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123301319_123301398:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 123583192 A/G 1 6 12 18 2.77479139720947 6.45041720558106 -3.67562580837159 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.0991754162193756 ENSG00000095261:ENST00000373920:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123583117_123583257:PSMD5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 59 47 106 27.2854487392265 25.2641340551925 2.02131468403397 A:G A G 10 0.537534767131755 0.770285855792986 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 123671520 G/A 1 268 245 513 123.94068240869 131.69601794728 -7.75533553859029 A:G G A 10 0.537534767131755 0.506712948242624 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 124065224 G/A 1 12 5 17 5.54958279441894 2.68767383565877 2.86190895876017 A:G G A 10 0.537534767131755 0.224313779580088 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000432226:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449773:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477863:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000456109:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000475428:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477104:exon_124065189_124065343:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124065189_124065343:GSN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 124094800 T/C 1 6 2 8 2.77479139720947 1.07506953426351 1.69972186294596 T:C T C 10 0.537534767131755 0.300105198743785 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124094712_124095121:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373806:exon_124094712_124094940:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373805:exon_124094712_124095016:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477553:exon_124094712_124094867:GSN HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 27 37 64 12.4865612874426 19.8887863838749 -7.40222509643232 T:C C T 10 0.537534767131755 0.0785290710504902 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 125154602 C/A 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 A:C C A 10 0.537534767131755 0.529036632649913 ENSG00000095303:ENST00000362012:exon_125154468_125157982:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000223423:exon_125154468_125155457:PTGS1;ENSG00000095303:ENST00000373698:exon_125154468_125154875:PTGS1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 127177161 A/G 1 74 83 157 34.2224272322501 44.6153856719357 -10.3929584396855 A:G A G 10 0.537534767131755 0.109192066871083 ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 127996046 A/G 1 20 36 56 9.2493046573649 19.3512516167432 -10.1019469593783 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00723762407513946 ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127995967_127996334:RABEPK HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 128246786 G/A 1 54 62 116 24.9731225748852 33.3271555621688 -8.35403298728357 A:G G A 10 0.537534767131755 0.136060454463552 ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128246722_128246862:MAPKAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 130164993 C/T 1 15 5 20 6.93697849302368 2.68767383565877 4.2493046573649 T:C C T 10 0.537534767131755 0.071912384591121 ENSG00000136856:ENST00000373371:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000451404:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000476835:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419917:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373354:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373360:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373355:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419132:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000439597:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000423934:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373350:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000430147:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000484617:exon_130164643_130165032:SLC2A8 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 130206669 C/T 1 10 4 14 4.62465232868245 2.15013906852702 2.47451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 0.283621077619465 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 130206762 C/T 1 9 8 17 4.16218709581421 4.30027813705404 -0.138091041239834 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 130263351 G/A 1 14 16 30 6.47451326015543 8.60055627410808 -2.12604301395265 A:G G A 10 0.537534767131755 0.468003746372143 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000472592:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000479957:exon_130263289_130263371:LRSAM1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 10 30 40 4.62465232868245 16.1260430139526 -11.5013906852702 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.000346989069753633 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 130507125 T/C 1 53 45 98 24.510657342017 24.189064520929 0.321592821088014 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130506843_130507378:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130506843_130507292:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130506843_130507378:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130506843_130507378:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130506843_130507378:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130506843_130507378:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130506843_130507378:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130506843_130507378:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000471939:exon_130506843_130507378:SH2D3C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 130586688 G/A 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000106991:ENST00000373203:exon_130586583_130586725:ENG;ENSG00000106991:ENST00000344849:exon_130586583_130586725:ENG;ENSG00000106991:ENST00000480266:exon_130586583_130586725:ENG HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 130630233 G/T 1 7 18 25 3.23725663007772 9.67562580837159 -6.43836917829387 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0144105501035811 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130628759_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630118_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630169_130630355:AK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 130630749 C/G 1 13 6 19 6.01204802728719 3.22520860279053 2.78683942449666 C:G C G 10 0.537534767131755 0.252178981986345 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130630600_130630791:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630600_130630791:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630600_130630791:AK1;ENSG00000106992:ENST00000373156:exon_130630600_130630791:AK1;ENSG00000106992:ENST00000223836:exon_130630600_130630791:AK1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 62 58 120 28.6728444378312 31.1770164936418 -2.5041720558106 C:G G C 10 0.537534767131755 0.648489074313474 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 60 59 119 27.7479139720947 31.7145512607735 -3.96663728867884 A:G A G 10 0.537534767131755 0.520064458839021 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 130707081 A/G 1 18 20 38 8.32437419162841 10.7506953426351 -2.42632115100669 A:G A G 10 0.537534767131755 0.515807132301838 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130707056_130707177:FAM102A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 130715922 A/G 1 4 6 10 1.84986093147298 3.22520860279053 -1.37534767131755 A:G A G 10 0.537534767131755 0.529036632649913 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 130742282 G/A 1 29 17 46 13.4114917531791 9.13809104123983 4.27340071193927 A:G G A 10 0.537534767131755 0.237768250698952 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130742271_130742792:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000464641:exon_130742271_130742812:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000493175:exon_130742271_130742357:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000494606:exon_130742271_130742740:FAM102A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 34 21 55 15.7238179175203 11.2882301097669 4.43558780775348 A:G A G 10 0.537534767131755 0.279361362117549 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 131028226 G/A 1 5 4 9 2.31232616434123 2.15013906852702 0.162187095814205 A:G G A 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 131285955 A/G 1 33 32 65 15.2613526846521 17.2011125482162 -1.93975986356407 A:G A G 10 0.537534767131755 0.70934263559706 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131285927_131286125:GLE1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 47 44 91 21.7358659448075 23.6515297537972 -1.9156638089897 T:C C T 10 0.537534767131755 0.752684576328617 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 110 129 239 50.871175615507 69.3419849599964 -18.4708093444894 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.0193430190210568 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 131397002 G/A 1 58 63 121 26.8229835063582 33.8646903293006 -7.04170682294235 A:T:G G A 10 0.537534767131755 0.203095181230886 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131396968_131397200:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131396968_131397200:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131396974_131397200:WDR34 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 46 31 77 21.2734007119393 16.6635777810844 4.60982293085487 A:G G A 10 0.537534767131755 0.305822786458130 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 131403096 A/G 1 31 32 63 14.3364222189156 17.2011125482162 -2.86469032930056 A:G A G 10 0.537534767131755 0.528032442419527 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 131476336 C/T 1 24 20 44 11.0991655888379 10.7506953426351 0.348470246202782 T:C C T 10 0.537534767131755 1 ENSG00000160447:ENST00000291906:exon_131476325_131476400:PKN3;ENSG00000160447:ENST00000483521:exon_131476325_131476400:PKN3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 131483749 T/A 1 1 171 172 0.462465232868245 91.9184451795301 -91.4559799466619 A:T T A 10 0.537534767131755 4.97308807425888e-56 ENSG00000160446:ENST00000372663:exon_131483148_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372672:exon_131483699_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372667:exon_131483149_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000467312:exon_131483159_131483759:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372664:exon_131483700_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000452105:exon_131483676_131483809:ZDHHC12 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 131515547 G/T 1 19 32 51 8.78683942449666 17.2011125482162 -8.4142731237195 T:G G T 10 0.537534767131755 0.0237503791696886 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131515443_131515879:ZER1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 76 101 177 35.1473576979866 54.2910114803073 -19.1436537823206 A:C A C 10 0.537534767131755 0.00412565888196799 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 131771505 C/T 1 22 15 37 10.1742351231014 8.06302150697632 2.11121361612506 T:C C T 10 0.537534767131755 0.514173464877861 ENSG00000148341:ENST00000372564:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000479237:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372559:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372554:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000461811:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000417224:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000416629:exon_131771385_131771625:SH3GLB2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 131804785 T/C 1 11 7 18 5.08711756155069 3.76274336992228 1.32437419162841 T:C T C 10 0.537534767131755 0.639329189576991 ENSG00000148343:ENST00000474534:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000439290:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000445183:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000358369:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000413435:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000421332:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000406926:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000277475:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000450073:exon_131804583_131804785:FAM73B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 132395015 A/G 1 30 45 75 13.8739569860474 24.189064520929 -10.3151075348816 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0200937400296894 ENSG00000148335:ENST00000372486:exon_132394929_132395144:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000372483:exon_132394929_132395144:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000481189:exon_132394929_132395080:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000459968:exon_132394929_132395607:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000372481:exon_132394929_132395144:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000372480:exon_132394929_132395144:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000486391:exon_132394929_132395080:METTL11A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 132594180 T/C 1 83 88 171 38.3846143280643 47.3030595075944 -8.9184451795301 T:C T C 10 0.537534767131755 0.192200819731186 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461539:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000492991:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000495934:exon_132594174_132594251:C9orf78 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 132620379 C/G 1 9 8 17 4.16218709581421 4.30027813705404 -0.138091041239834 C:G C G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132620329_132620391:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132620329_132620391:USP20;ENSG00000136878:ENST00000494971:exon_132620329_132620391:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132620329_132620391:USP20 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 132638424 C/T 1 15 10 25 6.93697849302368 5.37534767131755 1.56163082170613 T:C C T 10 0.537534767131755 0.555250283480734 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000496927:exon_132638409_132638517:USP20 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 134020092 C/T 1 17 17 34 7.86190895876017 9.13809104123983 -1.27618208247967 T:C C T 10 0.537534767131755 0.731966346241064 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000530863:exon_134019955_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134020089_134020141:NUP214 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 134021630 A/G 1 14 16 30 6.47451326015543 8.60055627410808 -2.12604301395265 A:G A G 10 0.537534767131755 0.468003746372143 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134021549_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134021516_134021691:NUP214 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 134463200 A/G 1 42 78 120 19.4235397804663 41.9277118362769 -22.5041720558106 A:G A G 10 0.537534767131755 4.68057457755926e-05 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134463123_134463217:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134463123_134463217:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134463123_134463217:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134463123_134463217:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134463123_134463217:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134463123_134463217:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134463123_134463217:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134463123_134463217:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134463123_134463217:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134463123_134463217:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134463123_134463217:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134463123_134463217:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000414781:exon_134463123_134463217:RAPGEF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 134473655 C/T 1 63 47 110 29.1353096706994 25.2641340551925 3.87117561550696 T:C C T 10 0.537534767131755 0.503672556084309 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000414781:exon_134473586_134473697:RAPGEF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 135147182 C/T 1 32 30 62 14.7988874517838 16.1260430139526 -1.32715556216881 T:C C T 10 0.537534767131755 0.799303764735326 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135147097_135147195:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135147097_135147195:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135147097_135147195:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135147097_135147195:SETX HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 135203838 G/A 1 18 17 35 8.32437419162841 9.13809104123983 -0.813716849611422 A:G G A 10 0.537534767131755 0.865875387186721 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 135205006 G/C 1 12 13 25 5.54958279441894 6.98795197271281 -1.43836917829387 C:G G C 10 0.537534767131755 0.689197984829322 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 135206676 T/C 1 12 10 22 5.54958279441894 5.37534767131755 0.174235123101391 T:C T C 10 0.537534767131755 1 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135206664_135206835:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135206664_135206835:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135206664_135206835:SETX;ENSG00000107290:ENST00000419901:exon_135206664_135206835:SETX HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 135276957 G/T 1 39 32 71 18.0361440818616 17.2011125482162 0.835031533645399 T:G G T 10 0.537534767131755 0.905481588872655 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 135277301 A/G 1 31 18 49 14.3364222189156 9.67562580837159 4.66079641054401 A:G A G 10 0.537534767131755 0.199101887355881 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 135985796 C/T 1 14 16 30 6.47451326015543 8.60055627410808 -2.12604301395265 T:C C T 10 0.537534767131755 0.468003746372143 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135985683_135985876:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135985683_135985876:RALGDS HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 136199466 G/A 1 57 41 98 26.36051827349 22.038925452402 4.32159282108801 A:G G A 10 0.537534767131755 0.41824877806018 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 136199503 G/A 1 48 41 89 22.1983311776758 22.038925452402 0.159405725273807 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 136213521 T/C 1 11 13 24 5.08711756155069 6.98795197271281 -1.90083441116212 T:C T C 10 0.537534767131755 0.540217717608162 ENSG00000148297:ENST00000491289:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000486395:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000343730:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000344469:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000476080:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000422801:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000371999:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000446777:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000494177:exon_136213395_136213548:MED22;ENSG00000148297:ENST00000457204:exon_136213395_136213555:MED22;ENSG00000148297:ENST00000482295:exon_136213262_136213555:MED22 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 136215908 A/G 1 4 7 11 1.84986093147298 3.76274336992228 -1.9128824384493 A:G A G 10 0.537534767131755 0.365659915960336 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 136216882 G/A 1 1488 1778 3266 688.148266507949 955.73681596026 -267.588549452312 A:T:C:G G A 10 0.537534767131755 7.0831006166523e-21 ENSG00000148303:ENST00000323345:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000496554:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000463740:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000426651:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000468019:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000485706:exon_136216767_136217238:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000315731:exon_136216856_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000489392:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000412126:exon_136216856_136216907:RPL7A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 136227019 G/C 1 4 4 8 1.84986093147298 2.15013906852702 -0.30027813705404 C:G G C 10 0.537534767131755 1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 30 36 66 13.8739569860474 19.3512516167432 -5.47729463069583 A:G A G 10 0.537534767131755 0.216742806859828 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 136228006 G/A 1 11 14 25 5.08711756155069 7.52548673984457 -2.43836917829387 A:G G A 10 0.537534767131755 0.423037845947577 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227932_136228045:SURF2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 136277482 T/C 1 43 32 75 19.8860050133345 17.2011125482162 2.68489246511838 T:C T C 10 0.537534767131755 0.56414993654102 ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000494045:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136277419_136277612:REXO4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 136279935 C/T 1 26 32 58 12.0240960545744 17.2011125482162 -5.17701649364179 A:T:C C T 10 0.537534767131755 0.188880432759332 ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371935:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000454825:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000445916:exon_136279785_136280131:REXO4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 136340572 C/A 1 24 37 61 11.0991655888379 19.8887863838749 -8.78962079503705 A:C C A 10 0.537534767131755 0.0284952848418387 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136340522_136340733:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136340522_136340733:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136340522_136340733:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000432868:exon_136340522_136340618:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000414172:exon_136340528_136340618:SLC2A6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 136913355 T/C 1 11 7 18 5.08711756155069 3.76274336992228 1.32437419162841 T:C T C 10 0.537534767131755 0.639329189576991 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136913205_136913576:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000494743:exon_136913124_136913576:BRD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 136915508 C/T 1 10 13 23 4.62465232868245 6.98795197271281 -2.36329964403036 T:C C T 10 0.537534767131755 0.403957046543287 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136915496_136915710:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136915496_136915710:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136915496_136915710:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000494743:exon_136915496_136915549:BRD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 35 17 52 16.1862831503886 9.13809104123983 7.04819210914874 T:C C T 10 0.537534767131755 0.052258266424544 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 137711997 G/C 1 13 39 52 6.01204802728719 20.9638559181384 -14.9518078908513 C:G G C 10 0.537534767131755 3.53929961656997e-05 ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137711962_137712069:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137711962_137712069:COL5A1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 138376649 T/C 1 10 12 22 4.62465232868245 6.45041720558106 -1.82576487689861 T:C T C 10 0.537534767131755 0.522987558786596 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649;ENSG00000196422:ENST00000401470:exon_138376295_138376681:KIAA0649 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 138376972 A/G 1 8 16 24 3.69972186294596 8.60055627410808 -4.90083441116212 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0633610479446073 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 138377657 T/C 1 9 12 21 4.16218709581421 6.45041720558106 -2.28823010976685 T:C T C 10 0.537534767131755 0.383405862328562 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 138377853 A/G 1 9 9 18 4.16218709581421 4.83781290418579 -0.675625808371588 A:G A G 10 0.537534767131755 0.815602186334409 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 138377915 G/A 1 12 11 23 5.54958279441894 5.91288243844931 -0.363299644030365 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 138379059 G/T 1 11 12 23 5.08711756155069 6.45041720558106 -1.36329964403036 T:G G T 10 0.537534767131755 0.677013887550826 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 138714620 G/A 1 17 15 32 7.86190895876017 8.06302150697632 -0.201112548216159 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000130559:ENST00000389532:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000389533:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000312405:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000483991:exon_138712685_138715106:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000409386:exon_138712685_138715106:CAMSAP1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 138839708 C/T 1 23 24 47 10.6367003559696 12.9008344111621 -2.26413405519248 T:C C T 10 0.537534767131755 0.559616274993939 ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138839644_138839751:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000471163:exon_138839644_138839890:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000478485:exon_138839362_138839751:UBAC1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 138903671 A/G 1 10 1 11 4.62465232868245 0.537534767131755 4.08711756155069 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0141811635261139 ENSG00000148411:ENST00000371753:exon_138898383_138903870:NACC2;ENSG00000148411:ENST00000277554:exon_138903205_138903870:NACC2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139100889 G/A 1 41 35 76 18.961074547598 18.8137168496114 0.147357697986621 A:G G A 10 0.537534767131755 1 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139098179_139101121:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139098185_139101121:QSOX2 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139256495 G/T 1 16 61 77 7.39944372589192 32.7896207950371 -25.3901770691451 T:G G T 10 0.537534767131755 5.8884484622839e-09 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139265088 C/T 0 42 0 42 19.4235397804663 0 19.4235397804663 C C 10 0.537534767131755 5.18145094086723e-12 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139264974_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139264974_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139264974_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139264974_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000485975:exon_139264202_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139264974_139265153:CARD9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139265870 G/A 0 22 0 22 10.1742351231014 0 10.1742351231014 G G 10 0.537534767131755 2.31006585185955e-06 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139265776_139265913:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139265776_139265913:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139265776_139265913:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139265776_139265913:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139265776_139265913:CARD9 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139270876 G/A 1 30 19 49 13.8739569860474 10.2131605755033 3.66079641054401 A:G G A 10 0.537534767131755 0.318566030179548 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139270801_139270933:SNAPC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 31 24 55 14.3364222189156 12.9008344111621 1.43558780775348 T:C T C 10 0.537534767131755 0.787189976004427 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 37 30 67 17.1112136161251 16.1260430139526 0.985170602172417 T:C C T 10 0.537534767131755 0.902617714520793 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 13 21 34 6.01204802728719 11.2882301097669 -5.27618208247967 A:C:G A G 10 0.537534767131755 0.0848552883526125 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139301960 G/A 1 26 21 47 12.0240960545744 11.2882301097669 0.735865944807518 A:G G A 10 0.537534767131755 0.884346383891486 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371723:exon_139301597_139302013:SDCCAG3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139327034 A/G 1 12 5 17 5.54958279441894 2.68767383565877 2.86190895876017 A:G A G 10 0.537534767131755 0.224313779580088 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139326931_139327038:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139326931_139327038:INPP5E HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139327439 A/G 1 9 7 16 4.16218709581421 3.76274336992228 0.399443725891921 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139327408_139327527:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139327408_139327527:INPP5E HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139371234 G/A 1 13 25 38 6.01204802728719 13.4383691782939 -7.42632115100669 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0215437868743779 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139371786 A/C 1 29 34 63 13.4114917531791 18.2761820824797 -4.86469032930056 A:T:C A C 10 0.537534767131755 0.255501019754702 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139399320 C/T 1 28 23 51 12.9490265203109 12.3632996440304 0.585726876280496 T:C C T 10 0.537534767131755 0.889380467031684 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139399125_139399556:NOTCH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139407932 A/G 1 13 12 25 6.01204802728719 6.45041720558106 -0.438369178293874 A:G A G 10 0.537534767131755 1 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139407844_139407989:NOTCH1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139617626 G/A 1 2 16 18 0.92493046573649 8.60055627410808 -7.67562580837159 A:G G A 10 0.537534767131755 0.000228103902922197 ENSG00000165716:ENST00000371692:exon_139617414_139618502:FAM69B;ENSG00000165716:ENST00000371691:exon_139617414_139618502:FAM69B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139617662 T/C 1 3 22 25 1.38739569860474 11.8257648768986 -10.4383691782939 T:C T C 10 0.537534767131755 2.12415684552039e-05 ENSG00000165716:ENST00000371692:exon_139617414_139618502:FAM69B;ENSG00000165716:ENST00000371691:exon_139617414_139618502:FAM69B HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139620695 C/T 1 6 7 13 2.77479139720947 3.76274336992228 -0.987951972712815 T:C C T 10 0.537534767131755 0.592540852178834 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139621120 A/G 1 18 13 31 8.32437419162841 6.98795197271281 1.3364222189156 A:G A G 10 0.537534767131755 0.720009446141645 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139621168 G/A 1 21 14 35 9.71176989023315 7.52548673984457 2.18628315038858 A:G G A 10 0.537534767131755 0.501231301658046 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139621326 G/A 1 16 9 25 7.39944372589192 4.83781290418579 2.56163082170613 A:G G A 10 0.537534767131755 0.324259669272264 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139973614 T/C 0 11 0 11 5.08711756155069 0 5.08711756155069 T T 10 0.537534767131755 0.00128956245765823 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 139973820 C/T 1 22 23 45 10.1742351231014 12.3632996440304 -2.18906452092897 T:C C T 10 0.537534767131755 0.551693625464198 ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 140002995 C/T 1 44 36 80 20.3484702462028 19.3512516167432 0.997218629459603 T:C C T 10 0.537534767131755 0.910823070458821 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140002840_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001983_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000475449:exon_140002983_140003529:MAN1B1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 223 246 469 103.129746929619 132.233552714412 -29.1038057847931 A:G G A 10 0.537534767131755 0.00722178505862672 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 140006491 C/T 1 17 19 36 7.86190895876017 10.2131605755033 -2.35125161674318 T:C C T 10 0.537534767131755 0.504659923745868 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 140008934 A/G 1 66 41 107 30.5227053693042 22.038925452402 8.48377991690222 A:T:G A G 10 0.537534767131755 0.120452487575933 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008915_140009165:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008915_140008944:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008915_140009170:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008915_140009178:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 140135784 C/A 0 117 1 118 54.1084322455847 0.537534767131755 53.5708974784529 C:G C G 10 0.537534767131755 1.69674216959752e-30 ENSG00000188229:ENST00000340384:exon_140135665_140135869:TUBB2C HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 140262426 C/T 1 11 3 14 5.08711756155069 1.61260430139526 3.47451326015543 T:C C T 10 0.537534767131755 0.104465203629206 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140262017_140262441:EXD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 140267490 G/A 1 4 11 15 1.84986093147298 5.91288243844931 -4.06302150697632 A:G G A 10 0.537534767131755 0.0401472308482814 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140267357_140267524:EXD3 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 140611436 T/C 1 39 36 75 18.0361440818616 19.3512516167432 -1.31510753488162 T:C T C 10 0.537534767131755 0.817146356802134 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 140638416 G/A 1 88 95 183 40.6969404924056 51.0658028775167 -10.3688623851112 A:G G A 10 0.537534767131755 0.138017018314692 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 76 93 169 35.1473576979866 49.9907333432532 -14.8433756452666 T:C T C 10 0.537534767131755 0.0250457487186551 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00950_parsed_pileup.txt . X 221705 G/A 1 142 106 248 65.6700630672908 56.978685315966 8.69137775132477 A:G G A 10 0.537534767131755 0.279402745428892 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP00950_parsed_pileup.txt . X 295069 A/G 1 14 3 17 6.47451326015543 1.61260430139526 4.86190895876017 A:G A G 10 0.537534767131755 0.0257173150813677 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00950_parsed_pileup.txt . X 295097 C/T 1 21 5 26 9.71176989023315 2.68767383565877 7.02409605457437 T:C C T 10 0.537534767131755 0.00547139149489092 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00950_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 21 5 26 9.71176989023315 2.68767383565877 7.02409605457437 T:C T C 10 0.537534767131755 0.00547139149489092 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00950_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 22 4 26 10.1742351231014 2.15013906852702 8.02409605457437 A:G A G 10 0.537534767131755 0.00132511089017876 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00950_parsed_pileup.txt . X 299360 G/A 1 22 3 25 10.1742351231014 1.61260430139526 8.56163082170612 A:G G A 10 0.537534767131755 0.000426103704620603 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00950_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 55 59 114 25.4355878077535 31.7145512607735 -6.27896345302007 T:C C T 10 0.537534767131755 0.259940392694667 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP00950_parsed_pileup.txt . X 1718360 G/A 1 22 22 44 10.1742351231014 11.8257648768986 -1.65152975379722 A:G G A 10 0.537534767131755 0.652091302972313 ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1718085_1719196:AKAP17A HGDP00950_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 57 46 103 26.36051827349 24.7265992880607 1.63391898542924 C:G C G 10 0.537534767131755 0.767774012299981 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00950_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 122 106 228 56.4207584099259 56.978685315966 -0.55792690604013 T:C C T 10 0.537534767131755 0.947143155705257 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP00950_parsed_pileup.txt . X 2644302 C/T 1 131 129 260 60.5829455057401 69.3419849599964 -8.7590394542563 T:C C T 10 0.537534767131755 0.290538970672282 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99