INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 1551927 T/C 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:C T C 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000477990:exon_1551888_1554590:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514363:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000502470:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507082:exon_1551888_1553278:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000463492:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000510793:exon_1551654_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1551690_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1551691_1551994:MIB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 2337194 C/T 1 8 16 24 3.76391333660372 8.47217332679256 -4.70825999018884 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0654353604302778 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2336236_2337273:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2336258_2337273:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2336277_2337267:PEX10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 2441358 T/C 1 10 6 16 4.70489167075465 3.17706499754721 1.52782667320744 T:C T C 10 0.529510832924535 0.46714284442011 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2441232_2441369:PANK4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 48 63 111 22.5834800196223 33.3591824742457 -10.7757024546234 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0455792791754256 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 3701663 T/C 1 14 17 31 6.58684833905651 9.0016841597171 -2.41483582066059 T:C T C 10 0.529510832924535 0.472439231356365 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3701651_3701767:LRRC47 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 3745924 G/A 1 16 19 35 7.52782667320744 10.0607058255662 -2.53287915235873 A:G G A 10 0.529510832924535 0.402816305864415 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000461667:exon_3745830_3745937:KIAA0562 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 3746484 T/C 1 7 8 15 3.29342416952825 4.23608666339628 -0.942662493868026 T:C T C 10 0.529510832924535 0.797047341083576 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3746355_3746561:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3746355_3746561:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000495701:exon_3746256_3746561:KIAA0562 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 3755675 T/C 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:C T C 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3755528_3755683:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3755647_3755683:KIAA0562 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 20 29 49 9.4097833415093 15.3558141548115 -5.94603081330222 A:G A G 10 0.529510832924535 0.114556502401989 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 40 49 89 18.8195666830186 25.9460308133022 -7.12646413028362 A:G G A 10 0.529510832924535 0.137860479114949 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 6705874 G/C 1 16 7 23 7.52782667320744 3.70657583047175 3.82125084273569 C:G G C 10 0.529510832924535 0.143299201177607 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 7909737 C/T 0 0 48 48 0 25.4165199803777 -25.4165199803777 T C T 10 0.529510832924535 1.91594112642096e-16 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000400910:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000361696:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7909700_7909743:UTS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 9790606 T/C 1 18 16 34 8.46880500735837 8.47217332679256 -0.00336831943419114 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9789084_9790763:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9789086_9790763:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9789086_9790763:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000477264:exon_9789086_9790763:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9789086_9790763:CLSTN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 10460485 T/C 1 48 73 121 22.5834800196223 38.6542908034911 -16.0708107838687 T:C T C 10 0.529510832924535 0.00352193209827166 ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000477958:exon_10460433_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10460450_10460629:PGD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 82 98 180 38.5801117001881 51.8920616266044 -13.3119499264163 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0520163394479994 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 10521569 C/T 1 42 69 111 19.7605450171695 36.5362474717929 -16.7757024546234 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00160925180976192 ENSG00000160049:ENST00000377038:exon_10516579_10521759:DFFA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 10521649 C/T 1 30 29 59 14.1146750122639 15.3558141548115 -1.24113914254757 T:C C T 10 0.529510832924535 0.794845824631893 ENSG00000160049:ENST00000377038:exon_10516579_10521759:DFFA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 10596341 C/T 1 13 21 34 6.11635917198104 11.1197274914152 -5.00336831943419 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0888839677216021 ENSG00000142655:ENST00000472851:exon_10596270_10596629:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000491661:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000492696:exon_10596270_10596346:PEX14 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 13 12 25 6.11635917198104 6.35412999509442 -0.237770823113376 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 10 7 17 4.70489167075465 3.70657583047175 0.998315840282904 T:C C T 10 0.529510832924535 0.808990208344625 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 12009956 G/A 1 7 10 17 3.29342416952825 5.29510832924535 -2.0016841597171 A:G G A 10 0.529510832924535 0.344125043526582 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 25 22 47 11.7622291768866 11.6492383243398 0.112990852546853 T:C:G T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 12252573 C/T 1 11 18 29 5.17538083783011 9.53119499264163 -4.35581415481152 T:C C T 10 0.529510832924535 0.135839017259835 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252488_12252581:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252488_12252581:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252488_12252581:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252405_12252581:TNFRSF1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 40 31 71 18.8195666830186 16.4148358206606 2.40473086235802 A:G G A 10 0.529510832924535 0.634854441912491 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 14107629 G/A 1 12 17 29 5.64587000490558 9.0016841597171 -3.35581415481152 A:G G A 10 0.529510832924535 0.264593278715465 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 33 32 65 15.5261425134903 16.9443466535851 -1.41820414009478 A:G A G 10 0.529510832924535 0.803994967550798 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 15755248 C/T 1 157 138 295 73.866799230848 73.0724949435858 0.794304287262165 T:C C T 10 0.529510832924535 0.953521009490774 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 17314702 C/T 1 11 8 19 5.17538083783011 4.23608666339628 0.939294174433834 T:C C T 10 0.529510832924535 0.81917282175653 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314633_17314729:ATP13A2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 24 26 50 11.2917400098112 13.7672816560379 -2.47554164622675 A:G G A 10 0.529510832924535 0.483457890260999 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 19408017 T/A 1 115 95 210 54.1062542136785 50.3035291278308 3.80272508584764 A:T:G T A 10 0.529510832924535 0.62873269444842 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19407843_19408067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19407843_19408067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19407843_19408067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19407843_19408067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19407843_19408067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375225:exon_19407843_19408734:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19407843_19408067:UBR4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 19422060 G/A 1 16 28 44 7.52782667320744 14.826303321887 -7.29847664867954 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0336687637370098 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000467272:exon_19422039_19422146:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000483922:exon_19422039_19422416:UBR4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 19423048 C/T 1 30 17 47 14.1146750122639 9.0016841597171 5.11299085254685 T:C C T 10 0.529510832924535 0.145844545916529 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19423017_19423144:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19423017_19423144:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19423017_19423144:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19423017_19423144:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19423017_19423144:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19423017_19423144:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000467272:exon_19423017_19423144:UBR4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 19584004 G/A 1 110 101 211 51.7538083783011 53.480594125378 -1.7267857470769 A:G G A 10 0.529510832924535 0.836248216830985 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 19585207 G/A 1 149 136 285 70.1028858942443 72.0134732777368 -1.91058738349248 A:G G A 10 0.529510832924535 0.85875396527778 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19585175_19586622:MRTO4;ENSG00000053372:ENST00000479559:exon_19585175_19585233:MRTO4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 20009737 G/A 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20008706_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20008735_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20008754_20009937:TMCO4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 20977221 A/T 1 13 5 18 6.11635917198104 2.64755416462268 3.46880500735837 A:T A T 10 0.529510832924535 0.154754113990996 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 22852904 G/A 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 A:G G A 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000184677:ENST00000374651:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000404138:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000375647:exon_22852695_22857647:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000374649:exon_22852695_22857647:ZBTB40 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 43 44 87 20.231034184245 23.2984766486795 -3.06744246443455 T:C C T 10 0.529510832924535 0.521141186807474 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 26496651 T/C 1 258 271 529 121.38620510547 143.497435722549 -22.111230617079 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0553573322294784 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 26496870 A/G 1 3 7 10 1.41146750122639 3.70657583047175 -2.29510832924535 A:G A G 10 0.529510832924535 0.206417065723492 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 26582091 G/A 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000130695:ENST00000476272:exon_26581662_26582356:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000252992:exon_26581662_26582356:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000451429:exon_26581662_26582356:CCDC21 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 26608782 C/T 0 15 0 15 7.05733750613197 0 7.05733750613197 C C 10 0.529510832924535 8.43841872588016e-05 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26607819_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26608772_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26608773_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26608773_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26608775_26608846:UBXN11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 19 16 35 8.93929417443383 8.47217332679256 0.467120847641274 T:C:G C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 26610891 A/C 1 29 21 50 13.6441858451885 11.1197274914152 2.52445835377325 A:C A C 10 0.529510832924535 0.571381390842839 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26610853_26612032:UBXN11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 2122 1727 3849 998.378012534137 914.465208460672 83.9128040734646 A:T:G A G 10 0.529510832924535 0.00699957666444578 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 2135 1750 3885 1004.49437170612 926.643957617936 77.8504140881814 A:T:C:G A G 10 0.529510832924535 0.0127248696901546 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 27679797 A/G 1 40 33 73 18.8195666830186 17.4738574865097 1.34570919650894 A:G A G 10 0.529510832924535 0.814968098125882 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 28206588 T/C 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 T:C T C 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 43 17 60 20.231034184245 9.0016841597171 11.2293500245279 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00410594343239937 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 44 12 56 20.7015233513205 6.35412999509442 14.347393356226 T:C T C 10 0.529510832924535 0.000128827524170172 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 51 9 60 23.9949475208487 4.76559749632082 19.2293500245279 A:G A G 10 0.529510832924535 3.35662386191265e-07 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 28598301 C/T 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 T:C C T 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000130766:ENST00000253063:exon_28598185_28598382:SESN2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 28861636 G/A 1 21 18 39 9.88027250858476 9.53119499264163 0.349077515943133 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000180198:ENST00000398962:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000398958:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373834:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000427469:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000434290:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373833:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000419074:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373832:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000439292:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373831:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000411533:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000430407:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000429051:exon_28861562_28861658:RCC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 28906966 C/G 1 54 21 75 25.4064150220751 11.1197274914152 14.2866875306599 C:G C G 10 0.529510832924535 0.00106330673854747 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 102 115 217 47.9898950416974 60.8937457863215 -12.9038507446241 T:G T G 10 0.529510832924535 0.0889087891427747 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 29529699 T/C 1 16 11 27 7.52782667320744 5.82461916216989 1.70320751103755 T:C T C 10 0.529510832924535 0.566839782462308 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475773:exon_29529643_29529713:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463412:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000453185:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29529654_29529745:MECR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 13 18 31 6.11635917198104 9.53119499264163 -3.41483582066059 A:G A G 10 0.529510832924535 0.280312149032782 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 31214468 G/A 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.295900852930508 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 157 129 286 73.866799230848 68.306897447265 5.55990178358299 T:C T C 10 0.529510832924535 0.515379557694513 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 144 156 300 67.750440058867 82.6036899362275 -14.8532498773605 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0933746162190526 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 83 95 178 39.0506008672636 50.3035291278308 -11.2529282605672 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0985165142220931 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 32557486 A/G 1 18 11 29 8.46880500735837 5.82461916216989 2.64418584518848 A:G A G 10 0.529510832924535 0.357241115671972 ENSG00000121775:ENST00000487305:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000336294:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000456834:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373633:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373634:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000441402:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000472503:exon_32557276_32557610:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000468135:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000427288:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000476968:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000498613:exon_32557276_32557612:TMEM39B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 32672908 T/G 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:G T G 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000160051:ENST00000291358:exon_32672841_32674288:IQCC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 32696628 A/C 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 A:C A C 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000084623:ENST00000474371:exon_32696528_32696655:EIF3I HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 33248032 C/T 1 85 87 172 39.9915792014145 46.0674424644345 -6.07586326302003 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.360300916371964 ENSG00000134684:ENST00000373477:exon_33248005_33248140:YARS;ENSG00000134684:ENST00000487404:exon_33248005_33249356:YARS;ENSG00000134684:ENST00000478828:exon_33248005_33248140:YARS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 33409693 G/A 1 5 10 15 2.35244583537732 5.29510832924535 -2.94266249386803 A:G G A 10 0.529510832924535 0.194474740642524 ENSG00000116514:ENST00000373456:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000401899:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000356990:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000405457:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000235150:exon_33409620_33409760:RNF19B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 33790496 G/A 1 15 16 31 7.05733750613197 8.47217332679256 -1.41483582066059 A:G G A 10 0.529510832924535 0.719675534707041 ENSG00000134686:ENST00000431992:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000419414:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000307890:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000361167:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000257118:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373422:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373418:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000485928:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000467894:exon_33790290_33790620:PHC2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 31 18 49 14.5851641793394 9.53119499264163 5.05396918669778 A:G A G 10 0.529510832924535 0.155177980603943 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 24 16 40 11.2917400098112 8.47217332679256 2.8195666830186 T:C T C 10 0.529510832924535 0.429725367700234 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 36557619 G/A 1 37 33 70 17.4080991817922 17.4738574865097 -0.0657583047174555 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36557511_36557695:ADPRHL2;ENSG00000116863:ENST00000468594:exon_36557511_36557695:ADPRHL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 36643783 C/T 1 39 46 85 18.3490775159431 24.3574983145286 -6.00842079858548 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.194379698334980 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373148:exon_36643474_36643802:MAP7D1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 36752410 C/T 1 38 25 63 17.8785883488677 13.2377708231134 4.64081752575429 T:C C T 10 0.529510832924535 0.257968638095679 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 36886117 C/T 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000116885:ENST00000468441:exon_36886077_36886216:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000235532:exon_36886077_36886216:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000356637:exon_36886077_36886216:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000315643:exon_36886081_36886216:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000433045:exon_36886077_36886216:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000475160:exon_36885934_36886216:OSCP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 36929673 C/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C C T 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 94 66 160 44.2259817050937 34.9477149730193 9.27826673207439 T:G G T 10 0.529510832924535 0.154062025603847 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 38338795 A/G 1 20 12 32 9.4097833415093 6.35412999509442 3.05565334641488 A:G A G 10 0.529510832924535 0.294309831651362 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 12 20 32 5.64587000490558 10.5902166584907 -4.94434665358512 T:C C T 10 0.529510832924535 0.109594536031492 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 40435157 A/G 1 10 1 11 4.70489167075465 0.529510832924535 4.17538083783012 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0132312338126181 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 40704793 T/C 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 40704937 C/G 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 C:G C G 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 40705399 T/C 1 10 6 16 4.70489167075465 3.17706499754721 1.52782667320744 T:C T C 10 0.529510832924535 0.46714284442011 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 40705522 C/T 1 11 16 27 5.17538083783011 8.47217332679256 -3.29679248896245 T:C C T 10 0.529510832924535 0.248146889531717 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 40768344 C/T 1 38 35 73 17.8785883488677 18.5328791523587 -0.654290803491058 T:C C T 10 0.529510832924535 0.90702299480463 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000466267:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000427563:exon_40768293_40768481:COL9A2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 40773149 T/C 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 40777804 T/C 0 8 0 8 3.76391333660372 0 3.76391333660372 T T 10 0.529510832924535 0.00858117377180446 ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40777731_40778151:COL9A2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 40881041 C/G 1 69 85 154 32.4637525282071 45.0084207985855 -12.5446682703784 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0438267734599997 ENSG00000084070:ENST00000435168:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000372718:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000372708:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000487871:exon_40880944_40881041:SMAP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 17 13 30 7.9983158402829 6.88364082801896 1.11467501226395 A:G G A 10 0.529510832924535 0.718250953485475 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 169 139 308 79.5126692357536 73.6020057765104 5.91066345924321 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.530185733264477 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 175 133 308 82.3356042382064 70.4249407789632 11.9106634592432 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.189179969605751 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 46086077 C/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000159588:ENST00000372044:exon_46085716_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000482416:exon_46085716_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000491755:exon_46085716_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000421127:exon_46085717_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000343901:exon_46085717_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000446027:exon_46085717_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000528266:exon_46085783_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000445048:exon_46085895_46086105:CCDC17;ENSG00000159588:ENST00000479529:exon_46086025_46086105:CCDC17 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 88 80 168 41.4030467026409 42.3608666339628 -0.957819931321886 A:G A G 10 0.529510832924535 0.938425967687854 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 93 98 191 43.7554925380182 51.8920616266044 -8.1365690885862 T:C T C 10 0.529510832924535 0.246678331460577 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 46159018 A/G 1 65 45 110 30.5817958599052 23.8279874816041 6.75380837830114 A:G A G 10 0.529510832924535 0.214737241005409 ENSG00000159596:ENST00000372025:exon_46158876_46160115:TMEM69;ENSG00000159596:ENST00000496366:exon_46158876_46159517:TMEM69 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 46195375 T/C 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000197429:ENST00000359942:exon_46195286_46195441:IPP;ENSG00000197429:ENST00000396478:exon_46195286_46195441:IPP;ENSG00000197429:ENST00000396474:exon_46195286_46195441:IPP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 11 11 22 5.17538083783011 5.82461916216989 -0.649238324339771 A:G A G 10 0.529510832924535 0.833021301127803 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 46521517 G/A 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 A:G G A 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 46521559 A/T 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:T A T 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 14 16 30 6.58684833905651 8.47217332679256 -1.88532498773605 A:G A G 10 0.529510832924535 0.58418180440881 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 6 9 15 2.82293500245279 4.76559749632082 -1.94266249386803 A:G A G 10 0.529510832924535 0.439062493647043 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 47799639 G/C 1 2 8 10 0.94097833415093 4.23608666339628 -3.29510832924535 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0539366762210793 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47799481_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000471289:exon_47799551_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47799586_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47799613_47799788:CMPK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 53442376 A/G 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 A:G A G 10 0.529510832924535 0.159283336846293 ENSG00000116171:ENST00000371514:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000408941:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000478631:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528311:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371509:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000407246:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371513:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528809:exon_53442355_53442384:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000473584:exon_53442355_53442441:SCP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 53676401 T/G 1 24 14 38 11.2917400098112 7.41315166094349 3.87858834886767 T:G T G 10 0.529510832924535 0.255505476181789 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 28 19 47 13.173696678113 10.0607058255662 3.11299085254685 A:G G A 10 0.529510832924535 0.384224653602232 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 190 222 412 89.3929417443383 117.551404909247 -28.1584631649084 C:G G C 10 0.529510832924535 0.00568427487972904 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 499 394 893 234.774094370657 208.627268172267 26.1468261983902 A:C:G C G 10 0.529510832924535 0.0813336589621172 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 173 153 326 81.3946259040554 81.0151574374539 0.379468466601566 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 63902619 C/T 1 26 34 60 12.2327183439621 18.0033683194342 -5.7706499754721 T:C C T 10 0.529510832924535 0.15493480987145 ENSG00000088035:ENST00000371108:exon_63902494_63904233:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000431147:exon_63902494_63904233:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000405765:exon_63902494_63904233:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000423077:exon_63902494_63904233:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000263440:exon_63902494_63902848:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000494765:exon_63902494_63902804:ALG6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 64114301 T/C 1 30 41 71 14.1146750122639 21.7099441499059 -7.59526913764199 T:C T C 10 0.529510832924535 0.075151362796314 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 65890990 C/T 1 8 3 11 3.76391333660372 1.58853249877361 2.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.235512259698034 ENSG00000213625:ENST00000371065:exon_65890986_65891061:LEPROT;ENSG00000213625:ENST00000475108:exon_65890986_65891061:LEPROT;ENSG00000213625:ENST00000497874:exon_65890986_65891061:LEPROT;ENSG00000213625:ENST00000488747:exon_65890986_65891061:LEPROT;ENSG00000213625:ENST00000484243:exon_65890986_65891061:LEPROT;ENSG00000116678:ENST00000349533:exon_65890986_65891061:LEPR;ENSG00000116678:ENST00000371060:exon_65890986_65891061:LEPR;ENSG00000116678:ENST00000371059:exon_65890986_65891061:LEPR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 38 10 48 17.8785883488677 5.29510832924535 12.5834800196223 T:C T C 10 0.529510832924535 0.000230642929952471 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 75190452 C/T 1 26 11 37 12.2327183439621 5.82461916216989 6.4080991817922 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0467123127319429 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75190395_75190518:CRYZ HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 66 37 103 31.0522850269807 19.5919008182078 11.4603842087729 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0293944256386482 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 77558057 G/C 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 C:G G C 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000142892:ENST00000370812:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000445065:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000370813:exon_77557389_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000487906:exon_77557887_77558175:PIGK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 79095526 G/A 1 130 173 303 61.1635917198104 91.6053740959446 -30.4417823761341 A:G G A 10 0.529510832924535 0.000534211617402328 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 79095581 T/C 1 241 172 413 113.387889265187 91.07586326302 22.312026002167 T:C:G T C 10 0.529510832924535 0.0299911654643201 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 79102726 C/T 1 67 79 146 31.5227741940562 41.8313558010383 -10.3085816069821 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0971230162289132 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79102717_79102846:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000494910:exon_79102377_79102888:IFI44L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 84944989 A/G 1 81 78 159 38.1096225331127 41.3018449681137 -3.19222243500107 A:G A G 10 0.529510832924535 0.634074910990534 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 85029077 C/T 1 10 11 21 4.70489167075465 5.82461916216989 -1.11972749141524 T:C C T 10 0.529510832924535 0.66667332357797 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85028940_85029101:CTBS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 16 9 25 7.52782667320744 4.76559749632082 2.76222917688662 T:C C T 10 0.529510832924535 0.319086576710391 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 86355212 C/A 1 2 11 13 0.94097833415093 5.82461916216989 -4.88364082801896 A:C C A 10 0.529510832924535 0.00956286367176584 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 26 26 52 12.2327183439621 13.7672816560379 -1.53456331207582 T:C T C 10 0.529510832924535 0.679486098664135 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 29 29 58 13.6441858451885 15.3558141548115 -1.71162830962303 T:C C T 10 0.529510832924535 0.694164040435948 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 90493298 G/A 1 79 66 145 37.1686441989617 34.9477149730193 2.22092922594241 A:G G A 10 0.529510832924535 0.739768967121818 ENSG00000162664:ENST00000394590:exon_90492913_90494094:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000394583:exon_90492913_90493785:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000340281:exon_90492913_90494097:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000370447:exon_90492913_90494097:ZNF326 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 101704532 G/T 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 T:G G T 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000170989:ENST00000305352:exon_101704378_101707074:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000424264:exon_101704378_101705491:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475821:exon_101704378_101705075:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475289:exon_101704378_101704720:S1PR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 4 11 15 1.88195666830186 5.82461916216989 -3.94266249386803 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0666655440918002 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 109486196 A/G 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:G A G 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369976:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000482889:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369972:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109486097_109486237:CLCC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 110091339 C/T 1 33 23 56 15.5261425134903 12.1787491572643 3.34739335622604 T:C C T 10 0.529510832924535 0.422633133371755 ENSG00000065135:ENST00000369851:exon_110091233_110091460:GNAI3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 110170896 T/C 1 10 14 24 4.70489167075465 7.41315166094349 -2.70825999018884 T:C T C 10 0.529510832924535 0.309537938097369 ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000529299:exon_110170705_110171157:AMPD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 110173775 G/T 1 28 35 63 13.173696678113 18.5328791523587 -5.35918247424571 T:G G T 10 0.529510832924535 0.206793884113014 ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110173565_110174163:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110173565_110173839:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110173565_110174671:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000476688:exon_110173565_110174190:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528958:exon_110173565_110174122:AMPD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 110279701 C/T 0 0 15 15 0 7.94266249386803 -7.94266249386803 T C T 10 0.529510832924535 1.22530561855881e-05 ENSG00000134202:ENST00000256594:exon_110276554_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000361066:exon_110279124_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000486823:exon_110279552_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000476321:exon_110279597_110280189:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000488824:exon_110279598_110279791:GSTM3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 T:C T C 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 110466555 G/A 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 A:C:G C A 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 110883917 A/G 1 14 11 25 6.58684833905651 5.82461916216989 0.762229176886623 A:G A G 10 0.529510832924535 0.842602807462717 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 412 382 794 193.841536835092 202.273138177172 -8.43160134208082 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.56951345475354 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 111661528 T/C 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C T C 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 111726213 A/G 1 12 5 17 5.64587000490558 2.64755416462268 2.9983158402829 A:G A G 10 0.529510832924535 0.223483974880525 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 111957311 G/C 1 9 5 14 4.23440250367918 2.64755416462268 1.58684833905651 C:G G C 10 0.529510832924535 0.435350095576674 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 113236681 C/T 1 10 9 19 4.70489167075465 4.76559749632082 -0.0607058255661652 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113236527_113236794:MOV10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 A:G A G 10 0.529510832924535 0.779088238758133 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 113239382 G/A 1 33 19 52 15.5261425134903 10.0607058255662 5.46543668792418 A:G G A 10 0.529510832924535 0.164180403542157 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113239361_113239468:MOV10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 36 29 65 16.9376100147167 15.3558141548115 1.58179585990522 T:C T C 10 0.529510832924535 0.711326717983689 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 132 88 220 62.1045700539614 46.5969532973591 15.5076167566023 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0364392637077815 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 114354654 T/C 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000081019:ENST00000261441:exon_114354332_114355098:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000434941:exon_114354332_114354662:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000476412:exon_114354332_114354915:RSBN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 29 38 67 13.6441858451885 20.1214116511323 -6.47722580594385 A:G A G 10 0.529510832924535 0.141365438373164 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 114443899 G/A 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 A:G G A 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000484201:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369564:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000489092:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369571:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000472122:exon_114443858_114444005:AP4B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 115280605 A/C 1 38 34 72 17.8785883488677 18.0033683194342 -0.124779970566522 A:C A C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000009307:ENST00000339438:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000438362:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000358528:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369533:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000261443:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000530886:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369530:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000534699:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000529046:exon_115280584_115280693:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000525132:exon_115280584_115280693:CSDE1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 116931628 C/A 1 47 47 94 22.1129908525469 24.8870091474531 -2.77401829490629 A:C C A 10 0.529510832924535 0.605965006243738 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000445896:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000491156:exon_116931524_116931641:ATP1A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 116937809 A/G 1 50 64 114 23.5244583537732 33.8886933071702 -10.364234953397 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0602041371610964 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116937732_116937907:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116937732_116937907:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116937732_116937907:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000445896:exon_116937732_116937907:ATP1A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 116947051 G/A 1 641 542 1183 301.583556095373 286.994871445098 14.588684650275 A:G G A 10 0.529510832924535 0.398480437829373 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116947038_116947394:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116947038_116947396:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116947038_116947396:ATP1A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 117617705 A/G 1 16 23 39 7.52782667320744 12.1787491572643 -4.65092248405687 A:G A G 10 0.529510832924535 0.150311235467875 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 117618067 C/T 1 20 12 32 9.4097833415093 6.35412999509442 3.05565334641488 T:C C T 10 0.529510832924535 0.294309831651362 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 144906508 C/T 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144906421_144906537:PDE4DIP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 144912153 A/G 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 A:G A G 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 1 9 1 10 4.23440250367918 0.529510832924535 3.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0236424935815757 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 144918957 T/A 1 11 1 12 5.17538083783011 0.529510832924535 4.64587000490558 A:T T A 10 0.529510832924535 0.00737270813879148 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000525886:exon_144918833_144919011:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144918833_144918991:PDE4DIP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 0 0 72 72 0 38.1247799705665 -38.1247799705665 A G A 10 0.529510832924535 2.65199829021556e-24 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 65 65 0 34.4182041400948 -34.4182041400948 C T C 10 0.529510832924535 5.19667840461351e-22 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 22 22 0 11.6492383243398 -11.6492383243398 T G T 10 0.529510832924535 6.2530488754598e-08 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 21 21 0 11.1197274914152 -11.1197274914152 A C A 10 0.529510832924535 1.32905267815801e-07 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 59 0 59 27.7588608574524 0 27.7588608574524 G G 10 0.529510832924535 5.43521903018749e-17 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 45 45 0 23.8279874816041 -23.8279874816041 C T C 10 0.529510832924535 1.83964182483290e-15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 88 88 0 46.5969532973591 -46.5969532973591 T C T 10 0.529510832924535 1.52885850306582e-29 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 115 0 115 54.1062542136785 0 54.1062542136785 C C 10 0.529510832924535 2.55470567729631e-32 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 145440921 T/C 1 58 40 98 27.288371690377 21.1804333169814 6.10793837339557 T:C T C 10 0.529510832924535 0.226017309909802 ENSG00000117289:ENST00000369317:exon_145440902_145441053:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000435917:exon_145440902_145441053:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000425134:exon_145440902_145440992:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000488537:exon_145440902_145441548:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000486597:exon_145440853_145441053:TXNIP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 145440941 G/A 1 59 53 112 27.7588608574524 28.0640741450004 -0.305213287547925 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000117289:ENST00000369317:exon_145440902_145441053:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000435917:exon_145440902_145441053:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000425134:exon_145440902_145440992:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000488537:exon_145440902_145441548:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000486597:exon_145440853_145441053:TXNIP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 145585518 A/C 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 A:C A C 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000131788:ENST00000393045:exon_145585356_145586546:PIAS3;ENSG00000131788:ENST00000369298:exon_145585356_145586546:PIAS3;ENSG00000131788:ENST00000475261:exon_145585356_145586546:PIAS3;ENSG00000131788:ENST00000472114:exon_145584799_145586546:PIAS3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 145586839 C/T 1 8 4 12 3.76391333660372 2.11804333169814 1.64587000490558 T:C C T 10 0.529510832924535 0.397734651849528 ENSG00000186364:ENST00000334513:exon_145586804_145586956:NUDT17;ENSG00000186364:ENST00000444015:exon_145586804_145586949:NUDT17;ENSG00000186364:ENST00000467151:exon_145586804_145586956:NUDT17;ENSG00000186364:ENST00000498192:exon_145586804_145586956:NUDT17;ENSG00000186364:ENST00000477878:exon_145586807_145586956:NUDT17 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 146740502 C/G 1 8 13 21 3.76391333660372 6.88364082801896 -3.11972749141524 C:G C G 10 0.529510832924535 0.194145459913548 ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146740441_146740537:CHD1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 146759320 C/G 1 46 60 106 21.6425016854714 31.7706499754721 -10.1281482900007 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0517812684494264 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146759314_146759412:CHD1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 150484987 G/A 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000143369:ENST00000470432:exon_150484828_150485048:ECM1;ENSG00000143369:ENST00000369049:exon_150484828_150485048:ECM1;ENSG00000143369:ENST00000532013:exon_150484828_150485048:ECM1;ENSG00000143369:ENST00000369047:exon_150484828_150485048:ECM1;ENSG00000143369:ENST00000425744:exon_150484828_150485048:ECM1;ENSG00000143369:ENST00000346569:exon_150484828_150485048:ECM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 150737220 A/G 1 22 15 37 10.3507616756602 7.94266249386803 2.4080991817922 A:G A G 10 0.529510832924535 0.510936519453645 ENSG00000163131:ENST00000448301:exon_150737114_150737240:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150737114_150737240:CTSS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 150915361 A/G 1 12 7 19 5.64587000490558 3.70657583047175 1.93929417443383 A:G A G 10 0.529510832924535 0.491992058405047 ENSG00000143379:ENST00000271640:exon_150915328_150915529:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000368960:exon_150915328_150915529:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000368962:exon_150915328_150915529:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000534805:exon_150915328_150915529:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000368969:exon_150915328_150915529:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000498193:exon_150915328_150915529:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000413562:exon_150915328_150915529:SETDB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 151274741 C/T 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151274670_151274774:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151274670_151274774:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151274670_151274774:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151274670_151274774:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151274670_151274774:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151274670_151274774:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000529142:exon_151274670_151274774:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151274670_151274774:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000430800:exon_151274724_151274774:PI4KB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 151372138 G/A 1 121 137 258 56.9291892161313 72.5429841106613 -15.6137948945301 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0532681846769198 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 58 47 105 27.288371690377 24.8870091474531 2.40136254292382 A:C A C 10 0.529510832924535 0.696048920856675 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 151735576 T/C 1 54 41 95 25.4064150220751 21.7099441499059 3.69647087216917 T:C:G T C 10 0.529510832924535 0.473060578061569 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 152883608 G/A 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 153604112 G/A 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000189171:ENST00000469931:exon_153603967_153604301:S100A13;ENSG00000160678:ENST00000368696:exon_153603988_153604280:S100A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 153634744 A/G 1 764 767 1531 359.453723645655 406.134808853118 -46.6810852074632 A:T:C:G A G 10 0.529510832924535 0.0172562203929433 ENSG00000143621:ENST00000361891:exon_153634512_153635032:ILF2;ENSG00000143621:ENST00000480213:exon_153634541_153635032:ILF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 154245917 T/C 1 101 98 199 47.519405874622 51.8920616266044 -4.37265575198248 A:T:C T C 10 0.529510832924535 0.570117958704932 ENSG00000143575:ENST00000328703:exon_154245812_154246074:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000483970:exon_154245812_154246074:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000447768:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000531435:exon_154245812_154246437:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000477780:exon_154245812_154246437:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000453365:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000435087:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000471326:exon_154245344_154246074:HAX1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 154832176 T/C 1 15 8 23 7.05733750613197 4.23608666339628 2.82125084273569 T:C T C 10 0.529510832924535 0.297861335201159 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154832171_154832319:KCNN3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 154904840 T/C 1 57 56 113 26.8178825233015 29.652606643774 -2.83472412047246 T:C T C 10 0.529510832924535 0.637816350357154 ENSG00000163344:ENST00000368467:exon_154904828_154904891:PMVK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 154938235 G/C 1 13 10 23 6.11635917198104 5.29510832924535 0.821250842735695 C:G G C 10 0.529510832924535 0.835734692191848 ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368449:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000490667:exon_154938115_154938238:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444664:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368441:exon_154938019_154938257:SHC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 154938662 T/C 1 18 13 31 8.46880500735837 6.88364082801896 1.58516417933941 T:C T C 10 0.529510832924535 0.594701624173538 ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368449:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444664:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368441:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000414115:exon_154938638_154938707:SHC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 154965113 G/T 1 9 5 14 4.23440250367918 2.64755416462268 1.58684833905651 T:G G T 10 0.529510832924535 0.435350095576674 ENSG00000160688:ENST00000368434:exon_154965041_154965138:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000405236:exon_154965041_154965149:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000295530:exon_154965041_154965149:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000477609:exon_154965041_154965149:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000481758:exon_154965065_154965262:FLAD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 154987526 C/T 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000487542:exon_154987131_154987785:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154986924_154988290:ZBTB7B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 154988957 A/G 1 16 18 34 7.52782667320744 9.53119499264163 -2.00336831943419 A:G A G 10 0.529510832924535 0.498122028363949 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 155030557 A/C 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 A:C A C 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000360674:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368412:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368410:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368413:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000447332:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155030327_155030631:ADAM15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 155033308 G/A 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:G G A 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368410:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368413:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000498481:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461234:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000462116:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000468053:exon_155033239_155033308:ADAM15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 156177735 G/A 1 10 7 17 4.70489167075465 3.70657583047175 0.998315840282904 A:G G A 10 0.529510832924535 0.808990208344625 ENSG00000160785:ENST00000445630:exon_156177677_156177804:SLC25A44;ENSG00000160785:ENST00000359511:exon_156177677_156177804:SLC25A44;ENSG00000160785:ENST00000469537:exon_156177677_156177804:SLC25A44;ENSG00000160785:ENST00000412949:exon_156177677_156177804:SLC25A44 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 156213921 C/T 1 11 9 20 5.17538083783011 4.76559749632082 0.409783341509299 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000160781:ENST00000292291:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000492619:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000360733:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000335852:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000356983:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368271:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000340183:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000491107:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368270:exon_156213214_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000468632:exon_156213214_156214194:PAQR6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 156499969 T/C 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 T:C T C 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000183856:ENST00000361170:exon_156499897_156500109:IQGAP3;ENSG00000183856:ENST00000491900:exon_156499897_156500109:IQGAP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 156565834 G/C 1 14 5 19 6.58684833905651 2.64755416462268 3.93929417443383 C:G G C 10 0.529510832924535 0.105354482370937 ENSG00000160818:ENST00000498641:exon_156565509_156565923:GPATCH4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 157494106 C/T 1 49 28 77 23.0539691866978 14.826303321887 8.2276658648108 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0675839729508568 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157493601_157494347:FCRL5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 157504422 C/T 1 8 3 11 3.76391333660372 1.58853249877361 2.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.235512259698034 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157501754_157504682:FCRL5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 157504433 C/G 1 9 3 12 4.23440250367918 1.58853249877361 2.64587000490558 C:G C G 10 0.529510832924535 0.154401063622286 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157501754_157504682:FCRL5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 157508882 C/T 1 7 9 16 3.29342416952825 4.76559749632082 -1.47217332679256 T:C C T 10 0.529510832924535 0.617975933604282 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 47 31 78 22.1129908525469 16.4148358206606 5.69815503188627 A:G A G 10 0.529510832924535 0.213050895138177 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 158813911 C/T 1 56 54 110 26.347393356226 28.5935849779249 -2.24619162169886 T:C C T 10 0.529510832924535 0.702867999888052 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 199 183 382 93.6273442480175 96.9004824251899 -3.27313817717238 A:G A G 10 0.529510832924535 0.758539386849152 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 159043196 C/T 1 32 25 57 15.0556533464149 13.2377708231134 1.8178825233015 T:C C T 10 0.529510832924535 0.691408244633164 ENSG00000163568:ENST00000368130:exon_159043028_159043309:AIM2;ENSG00000163568:ENST00000411768:exon_159043028_159043309:AIM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 160062340 G/A 1 17 14 31 7.9983158402829 7.41315166094349 0.585164179339413 A:G G A 10 0.529510832924535 0.85934843118329 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 160062472 C/T 1 17 11 28 7.9983158402829 5.82461916216989 2.17369667811302 T:C C T 10 0.529510832924535 0.453454999245345 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062376_160062485:IGSF8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 160062727 A/G 1 10 11 21 4.70489167075465 5.82461916216989 -1.11972749141524 A:G A G 10 0.529510832924535 0.66667332357797 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062714_160063121:IGSF8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 10 15 25 4.70489167075465 7.94266249386803 -3.23777082311338 A:G G A 10 0.529510832924535 0.230939624838663 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 160793442 A/G 1 22 7 29 10.3507616756602 3.70657583047175 6.64418584518848 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0148777228962612 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 160793560 A/G 1 25 12 37 11.7622291768866 6.35412999509442 5.4080991817922 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0984282263625165 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 161013121 C/T 1 59 50 109 27.7588608574524 26.4755416462268 1.28331921122568 T:C C T 10 0.529510832924535 0.848097567676259 ENSG00000158773:ENST00000368020:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368021:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000442467:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000435396:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368019:exon_161013058_161013149:USF1;ENSG00000158773:ENST00000473969:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000531842:exon_161013058_161013132:USF1;ENSG00000158773:ENST00000496363:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000491629:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000534633:exon_161013043_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000529476:exon_161013058_161013150:USF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 161017556 C/T 1 161 165 326 75.7487558991499 87.3692874325483 -11.6205315333984 T:C C T 10 0.529510832924535 0.202226064078746 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 161019040 G/C 1 119 138 257 55.9882108819803 73.0724949435858 -17.0842840616055 T:C:G G C 10 0.529510832924535 0.0336763558197390 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 226 207 433 106.330551759055 109.608742415379 -3.27819065632367 A:G G A 10 0.529510832924535 0.772776548306203 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 161697319 G/A 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000162746:ENST00000367948:exon_161697037_161697933:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367946:exon_161697037_161697454:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367945:exon_161697037_161697454:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000336830:exon_161697037_161697454:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367944:exon_161697037_161697454:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000392158:exon_161697037_161697932:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000495397:exon_161697037_161697932:FCRLB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 161721707 C/T 1 16 9 25 7.52782667320744 4.76559749632082 2.76222917688662 T:C C T 10 0.529510832924535 0.319086576710391 ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 161753802 T/C 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 T:C T C 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 161753841 G/A 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 A:G G A 10 0.529510832924535 0.779088238758133 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 161761276 G/C 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 C:G G C 10 0.529510832924535 0.556631979728114 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 161761312 C/T 1 11 7 18 5.17538083783011 3.70657583047175 1.46880500735837 T:C C T 10 0.529510832924535 0.638208767464486 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 40 43 83 18.8195666830186 22.768965815755 -3.94939913273641 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.441678490801809 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 163309219 A/T 1 9 3 12 4.23440250367918 1.58853249877361 2.64587000490558 A:T A T 10 0.529510832924535 0.154401063622286 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000442820:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163309071_163309267:NUF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 165667781 T/G 1 7 1 8 3.29342416952825 0.529510832924535 2.76391333660372 T:G T G 10 0.529510832924535 0.0741292491828888 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165667615_165668100:ALDH9A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 166826773 C/T 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 T:C C T 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166825747_166826956:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166825747_166826956:TADA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 85 78 163 39.9915792014145 41.3018449681137 -1.31026576669921 A:G A G 10 0.529510832924535 0.87540375331153 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 174188285 G/A 1 13 9 22 6.11635917198104 4.76559749632082 1.35076167566023 A:T:G G A 10 0.529510832924535 0.671166937576677 ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174188263_174188433:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174188263_174188433:RABGAP1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 181018236 A/G 1 12 3 15 5.64587000490558 1.58853249877361 4.05733750613197 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0398320046822122 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 23 22 45 10.8212508427357 11.6492383243398 -0.827987481604078 A:G G A 10 0.529510832924535 0.881613859608674 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 183542387 T/C 1 26 26 52 12.2327183439621 13.7672816560379 -1.53456331207582 T:C T C 10 0.529510832924535 0.679486098664135 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183542320_183542427:NCF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 184020945 G/A 1 6 11 17 2.82293500245279 5.82461916216989 -3.0016841597171 A:G G A 10 0.529510832924535 0.154173856512779 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184020811_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184020813_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184020860_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184020867_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184020880_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184020894_184021024:TSEN15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 184023529 A/C 1 25 22 47 11.7622291768866 11.6492383243398 0.112990852546853 A:C A C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000457455:exon_184023495_184023569:TSEN15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 185267114 A/G 1 89 123 212 41.8735358697164 65.1298324497178 -23.2562965800014 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00150738103787 ENSG00000116679:ENST00000367498:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000480769:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000459929:exon_185266147_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000475046:exon_185266903_185267420:IVNS1ABP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 193066727 G/A 1 79 63 142 37.1686441989617 33.3591824742457 3.80946172471602 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.556640088821515 ENSG00000023572:ENST00000367439:exon_193066714_193066890:GLRX2;ENSG00000023572:ENST00000367440:exon_193066714_193066890:GLRX2;ENSG00000023572:ENST00000472197:exon_193066714_193066890:GLRX2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 201934578 G/A 1 53 65 118 24.9359258549996 34.4182041400948 -9.48227828509514 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0965107741627834 ENSG00000134375:ENST00000367287:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000478378:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000482943:exon_201934561_201934671:TIMM17A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 203276546 G/A 1 21 13 34 9.88027250858476 6.88364082801896 2.99663168056581 A:G G A 10 0.529510832924535 0.390699618302272 ENSG00000159388:ENST00000475157:exon_203276232_203276816:BTG2;ENSG00000159388:ENST00000290551:exon_203276232_203278730:BTG2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 205589574 C/T 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 11 8 19 5.17538083783011 4.23608666339628 0.939294174433834 A:G G A 10 0.529510832924535 0.81917282175653 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 206651107 G/A 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206651092_206651202:IKBKE HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 206665052 C/T 1 11 4 15 5.17538083783011 2.11804333169814 3.05733750613197 T:C C T 10 0.529510832924535 0.128035315987776 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000162888:ENST00000367119:exon_206664449_206666409:C1orf147 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 207087435 C/T 1 96 121 217 45.1669600392446 64.0708107838687 -18.9038507446241 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0117039349829336 ENSG00000162894:ENST00000420007:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000367091:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000463473:exon_207087207_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000525793:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000529560:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000533312:exon_207086977_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000530505:exon_207087146_207087439:FAIM3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 207646322 G/A 1 11 8 19 5.17538083783011 4.23608666339628 0.939294174433834 A:G G A 10 0.529510832924535 0.81917282175653 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 209933528 G/A 1 27 27 54 12.7032075110376 14.2967924889624 -1.59358497792489 A:G G A 10 0.529510832924535 0.684532874281158 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 210006603 C/T 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 T:C C T 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210006530_210006703:C1orf107 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 212515613 C/T 1 8 3 11 3.76391333660372 1.58853249877361 2.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.235512259698034 ENSG00000066027:ENST00000261461:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000498129:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000479259:exon_212515530_212515622:PPP2R5A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 212526288 C/T 1 1 7 8 0.470489167075465 3.70657583047175 -3.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0301990106165060 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214492286 G/A 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 A:G G A 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214492202_214492326:SMYD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214811244 C/G 1 16 11 27 7.52782667320744 5.82461916216989 1.70320751103755 C:G C G 10 0.529510832924535 0.566839782462308 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214811209_214811344:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214813487 A/G 1 42 35 77 19.7605450171695 18.5328791523587 1.2276658648108 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.819997326803776 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214813782 A/G 1 22 16 38 10.3507616756602 8.47217332679256 1.87858834886767 A:G A G 10 0.529510832924535 0.626888529069802 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214813941 C/G 1 23 35 58 10.8212508427357 18.5328791523587 -7.71162830962303 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0482340227088283 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214814125 G/A 1 9 17 26 4.23440250367918 9.0016841597171 -4.76728165603791 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0762485810939982 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214814571 C/T 1 5 16 21 2.35244583537732 8.47217332679256 -6.11972749141524 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0082282689911091 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214814582 G/A 1 14 5 19 6.58684833905651 2.64755416462268 3.93929417443383 A:G G A 10 0.529510832924535 0.105354482370937 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214814733 T/G 1 15 12 27 7.05733750613197 6.35412999509442 0.703207511037554 T:G T G 10 0.529510832924535 0.848752855647907 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214814778 G/A 1 12 10 22 5.64587000490558 5.29510832924535 0.350761675660229 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214814995 C/T 1 5 10 15 2.35244583537732 5.29510832924535 -2.94266249386803 T:C C T 10 0.529510832924535 0.194474740642524 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214815916 T/C 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214816297 A/G 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 A:G A G 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214818215 G/A 1 6 9 15 2.82293500245279 4.76559749632082 -1.94266249386803 A:G G A 10 0.529510832924535 0.439062493647043 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214818223 T/A 1 6 10 16 2.82293500245279 5.29510832924535 -2.47217332679256 A:T T A 10 0.529510832924535 0.316631120754283 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214818846 A/G 1 11 14 25 5.17538083783011 7.41315166094349 -2.23777082311338 A:G A G 10 0.529510832924535 0.42559887349422 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214818945 A/C 1 15 20 35 7.05733750613197 10.5902166584907 -3.53287915235873 A:C A C 10 0.529510832924535 0.240916033451795 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214819328 G/A 1 27 37 64 12.7032075110376 19.5919008182078 -6.88869330717024 A:G G A 10 0.529510832924535 0.102933630717713 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214819587 A/G 1 22 22 44 10.3507616756602 11.6492383243398 -1.29847664867954 A:G A G 10 0.529510832924535 0.763334929239984 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214819980 C/T 1 29 29 58 13.6441858451885 15.3558141548115 -1.71162830962303 T:C C T 10 0.529510832924535 0.694164040435948 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214820099 A/G 1 31 28 59 14.5851641793394 14.826303321887 -0.241139142547569 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214820299 A/G 1 29 20 49 13.6441858451885 10.5902166584907 3.05396918669778 A:G A G 10 0.529510832924535 0.394982804718428 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214820494 G/A 1 27 43 70 12.7032075110376 22.768965815755 -10.0657583047175 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0166827606294037 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214820524 T/C 1 34 43 77 15.9966316805658 22.768965815755 -6.7723341351892 T:C T C 10 0.529510832924535 0.137767336559088 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 37 30 67 17.4080991817922 15.8853249877361 1.52277419405615 A:G G A 10 0.529510832924535 0.806861528960444 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 52 49 101 24.4654366879242 25.9460308133022 -1.48059412537804 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.766168309840936 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 214837110 C/G 1 78 107 185 36.6981550318863 56.6576591229253 -19.959504091039 T:C:G C G 10 0.529510832924535 0.00395604193550175 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 215793834 G/A 1 1 7 8 0.470489167075465 3.70657583047175 -3.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0301990106165060 ENSG00000136636:ENST00000259154:exon_215793399_215795073:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000444044:exon_215793399_215795147:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000495537:exon_215793399_215795073:KCTD3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 38 39 77 17.8785883488677 20.6509224840569 -2.7723341351892 T:C C T 10 0.529510832924535 0.568825673418529 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 24 18 42 11.2917400098112 9.53119499264163 1.76054501716953 T:C T C 10 0.529510832924535 0.644496300827347 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 222802926 C/T 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 222803204 A/G 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 A:G A G 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 226048680 T/C 1 10 1 11 4.70489167075465 0.529510832924535 4.17538083783012 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0132312338126181 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226048560_226048697:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000474478:exon_226047363_226050051:TMEM63A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 226555302 A/G 1 109 95 204 51.2833192112257 50.3035291278308 0.979790083394853 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.944109084341598 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226555181_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226555181_226555309:PARP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 226570840 T/C 1 82 79 161 38.5801117001881 41.8313558010383 -3.25124410085014 T:C T C 10 0.529510832924535 0.636059713790503 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 113 89 202 53.1652758795275 47.1264641302836 6.03881174924392 A:G A G 10 0.529510832924535 0.398817304924861 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 77 83 160 36.2276658648108 43.9493991327364 -7.72173326792561 A:G G A 10 0.529510832924535 0.235164690198446 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 226595647 C/G 1 37 27 64 17.4080991817922 14.2967924889624 3.11130669282976 A:C:G C G 10 0.529510832924535 0.455123470619328 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 A:G G A 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 226924642 C/T 1 8 4 12 3.76391333660372 2.11804333169814 1.64587000490558 T:C C T 10 0.529510832924535 0.397734651849528 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 228285645 C/T 1 264 254 518 124.209140107923 134.495751562832 -10.2866114549092 A:T:C:G C T 10 0.529510832924535 0.378789331154848 ENSG00000143761:ENST00000272102:exon_228285553_228286910:ARF1;ENSG00000143761:ENST00000470670:exon_228285553_228285728:ARF1;ENSG00000143761:ENST00000478424:exon_228285553_228286080:ARF1;ENSG00000143761:ENST00000470558:exon_228285553_228285889:ARF1;ENSG00000143761:ENST00000478336:exon_228285553_228285823:ARF1;ENSG00000143761:ENST00000469235:exon_228285553_228285649:ARF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 228288809 C/T 1 52 42 94 24.4654366879242 22.2394549828305 2.22598170509371 T:C C T 10 0.529510832924535 0.680202921505987 ENSG00000143793:ENST00000469781:exon_228288427_228288955:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000272139:exon_228288432_228288955:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000485896:exon_228288432_228288955:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000472617:exon_228288434_228288955:C1orf35 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 228295523 C/T 1 60 41 101 28.2293500245279 21.7099441499059 6.51940587462196 T:C C T 10 0.529510832924535 0.196952168453438 ENSG00000162910:ENST00000366747:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391866:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366746:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465397:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336300:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000295008:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336520:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000348259:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366744:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366742:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366741:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366740:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366739:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366738:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366735:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465268:exon_228295369_228295976:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366736:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366734:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366733:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366732:exon_228295369_228295561:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000459783:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000430433:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391867:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000411464:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366731:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000457264:exon_228295368_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000463898:exon_228295468_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000497758:exon_228295486_228295570:MRPL55 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 228295582 T/C 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 0.159283336846293 ENSG00000162910:ENST00000465268:exon_228295369_228295976:MRPL55 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 228295944 G/A 1 68 52 120 31.9932633611316 27.5345633120758 4.4587000490558 A:G G A 10 0.529510832924535 0.464605154531258 ENSG00000162910:ENST00000366747:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391866:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366746:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465397:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336300:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000295008:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336520:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000348259:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366744:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366742:exon_228295936_228296022:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366741:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366740:exon_228295936_228296022:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366739:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366738:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366735:exon_228295936_228296705:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465268:exon_228295369_228295976:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366736:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366734:exon_228295936_228296022:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366733:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366732:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000459783:exon_228295936_228296026:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000430433:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391867:exon_228295936_228296022:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000411464:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366731:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000457264:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000463898:exon_228295936_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000497758:exon_228295936_228296022:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000464148:exon_228295936_228296022:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000475832:exon_228295760_228296022:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000473066:exon_228295815_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000492170:exon_228295927_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000476267:exon_228295933_228296019:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000495434:exon_228295936_228296019:MRPL55 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 228335125 C/T 1 310 295 605 145.851641793394 156.205695712738 -10.3540539193437 T:C C T 10 0.529510832924535 0.415382325126019 ENSG00000143774:ENST00000366730:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000462807:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485838:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000312726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000492871:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366728:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366727:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000453943:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366723:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366729:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000391865:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366722:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498092:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000435153:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366721:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000460224:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000472939:exon_228335107_228335146:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000412265:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366719:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366720:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366718:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366715:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470040:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366716:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485168:exon_228335107_228335188:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000478725:exon_228335107_228335260:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000420445:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000495999:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000486668:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000464858:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470155:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000481341:exon_228335111_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498115:exon_228335107_228335400:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470740:exon_228335107_228335239:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000465025:exon_228335125_228335245:GUK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 228336416 C/T 1 417 408 825 196.193982670469 216.04041983321 -19.8464371627414 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.173757419389671 ENSG00000143774:ENST00000366730:exon_228336366_228336541:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485838:exon_228336366_228336583:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366726:exon_228336366_228336581:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000312726:exon_228336366_228336647:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000492871:exon_228336366_228336647:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366728:exon_228336366_228336656:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366723:exon_228336366_228336534:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000493138:exon_228336366_228336578:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366729:exon_228336366_228336642:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000391865:exon_228336366_228336642:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366722:exon_228336366_228336509:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000435153:exon_228336366_228336510:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366721:exon_228336366_228336453:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366719:exon_228336366_228336642:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366720:exon_228336366_228336642:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366718:exon_228336366_228336652:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366715:exon_228336366_228336652:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470040:exon_228336366_228336647:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366716:exon_228336366_228336685:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000420445:exon_228336366_228336642:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000486668:exon_228336366_228336651:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000464858:exon_228336366_228336425:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498115:exon_228336072_228336474:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470740:exon_228336366_228336647:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000465025:exon_228336072_228336648:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000477206:exon_228336366_228336634:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000471270:exon_228336366_228336656:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000480056:exon_228336366_228336656:GUK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 229790048 A/G 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 A:G A G 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229789996_229790135:URB2;ENSG00000135763:ENST00000434387:exon_229789996_229790135:URB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 230384937 T/C 1 12 3 15 5.64587000490558 1.58853249877361 4.05733750613197 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0398320046822122 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230384930_230385017:GALNT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 230384970 G/A 1 4 10 14 1.88195666830186 5.29510832924535 -3.41315166094349 A:G G A 10 0.529510832924535 0.105177291482310 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230384930_230385017:GALNT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 230415244 T/C 1 26 28 54 12.2327183439621 14.826303321887 -2.59358497792489 T:C T C 10 0.529510832924535 0.4981576455005 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 30 23 53 14.1146750122639 12.1787491572643 1.93592585499964 A:G A G 10 0.529510832924535 0.680249323670917 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 21 11 32 9.88027250858476 5.82461916216989 4.05565334641488 A:T T A 10 0.529510832924535 0.160891288140652 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 12 4 16 5.64587000490558 2.11804333169814 3.52782667320744 C:G G C 10 0.529510832924535 0.084952853321743 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 22 24 46 10.3507616756602 12.7082599901888 -2.35749831452861 T:C T C 10 0.529510832924535 0.555364792856892 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 236767330 A/G 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:G A G 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366579:exon_236767254_236767427:HEATR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 241712134 C/T 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484628:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000480967:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484229:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241712129_241712198:KMO HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 242030151 A/G 1 10 11 21 4.70489167075465 5.82461916216989 -1.11972749141524 A:G A G 10 0.529510832924535 0.66667332357797 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242030132_242030357:EXO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 242042301 G/A 1 25 9 34 11.7622291768866 4.76559749632082 6.99663168056581 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0163222039550056 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 242045275 C/T 1 13 17 30 6.11635917198104 9.0016841597171 -2.88532498773605 T:C C T 10 0.529510832924535 0.361005199197405 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 242045283 T/A 1 19 14 33 8.93929417443383 7.41315166094349 1.52614251349034 A:T T A 10 0.529510832924535 0.727867490735252 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 242048674 C/T 1 13 26 39 6.11635917198104 13.7672816560379 -7.65092248405687 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0157952639843798 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518741:exon_242048659_242048809:EXO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 243349348 C/A 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 A:C C A 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000143702:ENST00000366542:exon_243349081_243349374:CEP170;ENSG00000143702:ENST00000272037:exon_243349081_243349374:CEP170;ENSG00000143702:ENST00000321628:exon_243349081_243349724:CEP170;ENSG00000143702:ENST00000336415:exon_243349081_243349724:CEP170;ENSG00000143702:ENST00000461671:exon_243349081_243349374:CEP170;ENSG00000143702:ENST00000521911:exon_243349081_243349374:CEP170;ENSG00000143702:ENST00000424081:exon_243349198_243349374:CEP170 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 243579112 G/A 1 7 9 16 3.29342416952825 4.76559749632082 -1.47217332679256 A:G G A 10 0.529510832924535 0.617975933604282 ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000493334:exon_243579004_243579131:SDCCAG8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 245245402 C/T 0 0 14 14 0 7.41315166094349 -7.41315166094349 T C T 10 0.529510832924535 2.60432270136045e-05 ENSG00000203666:ENST00000391837:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000366523:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000366522:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000421886:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000366520:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000497591:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000447569:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000473686:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000366521:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000487845:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000391838:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000495271:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000425550:exon_245245385_245245464:EFCAB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 246755124 T/C 1 4 8 12 1.88195666830186 4.23608666339628 -2.35412999509442 T:C T C 10 0.529510832924535 0.247834349729258 ENSG00000162852:ENST00000483271:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366513:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366512:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366511:exon_246754814_246755243:CNST HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 247006051 G/C 1 27 12 39 12.7032075110376 6.35412999509442 6.34907751594313 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0530788807168481 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 1 249150116 G/C 1 23 18 41 10.8212508427357 9.53119499264163 1.29005585009406 C:G G C 10 0.529510832924535 0.755460251874888 ENSG00000171163:ENST00000463519:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000306601:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000427146:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366471:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000533927:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000476503:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366469:exon_249149924_249150138:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000477070:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000412341:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000451251:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000315492:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000470787:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000474351:exon_249149924_249150285:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000478107:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000491971:exon_249149794_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000496411:exon_249149927_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000468455:exon_249149981_249150142:ZNF692 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 26 26 52 12.2327183439621 13.7672816560379 -1.53456331207582 A:G G A 10 0.529510832924535 0.679486098664135 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 3167465 A/G 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 A:G A G 10 0.529510832924535 0.321803815351283 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 3178804 G/A 1 321 270 591 151.027022631224 142.967924889624 8.05909774159977 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.510047247966955 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 3179738 G/A 1 12 2 14 5.64587000490558 1.05902166584907 4.58684833905651 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0150557366008361 ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3179735_3179762:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000433193:exon_3179735_3179904:PFKP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 82 100 182 38.5801117001881 52.9510832924535 -14.3709715922654 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0373548743535641 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 55 42 97 25.8769041891506 22.2394549828305 3.6374492063201 T:C C T 10 0.529510832924535 0.478021834434721 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 58 51 109 27.288371690377 27.0050524791513 0.283319211225677 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 3181107 G/A 1 59 81 140 27.7588608574524 42.8903774668873 -15.1315166094349 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0110122828256703 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000455371:exon_3180883_3181241:PITRM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 33 44 77 15.5261425134903 23.2984766486795 -7.7723341351892 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0865809582588909 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 5799613 A/G 1 10 6 16 4.70489167075465 3.17706499754721 1.52782667320744 A:G A G 10 0.529510832924535 0.46714284442011 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5799483_5799636:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5799483_5799636:C10orf18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 12 16 28 5.64587000490558 8.47217332679256 -2.82630332188698 A:G A G 10 0.529510832924535 0.344853719729691 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 11312691 C/T 1 6 9 15 2.82293500245279 4.76559749632082 -1.94266249386803 T:C C T 10 0.529510832924535 0.439062493647043 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11312629_11312787:CELF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 8 3 11 3.76391333660372 1.58853249877361 2.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.235512259698034 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 11504752 T/C 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 12143105 C/G 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 C:G C G 10 0.529510832924535 0.186533779694549 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12143041_12143180:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12143041_12143180:DHTKD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 212 279 491 99.7437034199986 147.733522385945 -47.9898189659467 A:T:C:G T C 10 0.529510832924535 1.653104595267e-05 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 12867598 C/G 1 13 3 16 6.11635917198104 1.58853249877361 4.52782667320744 A:C:G C G 10 0.529510832924535 0.0247917218023686 ENSG00000183049:ENST00000378847:exon_12867572_12867689:CAMK1D;ENSG00000183049:ENST00000378845:exon_12867572_12868142:CAMK1D HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 13152400 T/A 1 43 71 114 20.231034184245 37.595269137642 -17.364234953397 A:T T A 10 0.529510832924535 0.00132914369623748 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13152180_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13152274_13152476:OPTN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 13330402 T/C 1 5 13 18 2.35244583537732 6.88364082801896 -4.53119499264163 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0353717025263609 ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000453759:exon_13330360_13330541:PHYH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 27 21 48 12.7032075110376 11.1197274914152 1.58348001962232 A:G A G 10 0.529510832924535 0.66746709766796 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 13658436 G/A 1 11 7 18 5.17538083783011 3.70657583047175 1.46880500735837 A:G G A 10 0.529510832924535 0.638208767464486 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13658398_13658553:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13658398_13658553:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000298451:exon_13658398_13658553:PRPF18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 13708245 G/A 1 2 8 10 0.94097833415093 4.23608666339628 -3.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0539366762210793 ENSG00000151474:ENST00000358621:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378502:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000357447:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378503:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000264546:exon_13708224_13708325:FRMD4A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 14976727 G/C 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000152457:ENST00000378289:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378275:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000449101:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000453695:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378246:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000357717:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378249:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000396817:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378255:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378254:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378258:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378278:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000418843:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378241:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000456122:exon_14976722_14976774:DCLRE1C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 29 23 52 13.6441858451885 12.1787491572643 1.46543668792418 A:C C A 10 0.529510832924535 0.781492453927733 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 22830817 C/T 1 30 31 61 14.1146750122639 16.4148358206606 -2.30016080839664 T:C C T 10 0.529510832924535 0.608636127515367 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22830733_22830976:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22830733_22830976:PIP4K2A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 23408278 C/T 1 24 25 49 11.2917400098112 13.2377708231134 -1.94603081330222 T:C C T 10 0.529510832924535 0.668140459023759 ENSG00000148450:ENST00000376510:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000277598:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000376513:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000472663:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000468633:exon_23408073_23408380:MSRB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 26998637 T/G 1 11 15 26 5.17538083783011 7.94266249386803 -2.76728165603791 T:G T G 10 0.529510832924535 0.327727272541139 ENSG00000148459:ENST00000376215:exon_26998567_26998697:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000376203:exon_26998567_26998697:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000396343:exon_26998567_26998697:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000473224:exon_26998567_26998697:PDSS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 27303605 A/T 1 5 14 19 2.35244583537732 7.41315166094349 -5.06070582556617 A:T A T 10 0.529510832924535 0.0220338063903689 ENSG00000107890:ENST00000445828:exon_27303423_27303608:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27303423_27303640:ANKRD26 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 27306659 C/A 1 14 9 23 6.58684833905651 4.76559749632082 1.82125084273569 A:C C A 10 0.529510832924535 0.533349006667712 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27306431_27306721:ANKRD26 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 27317840 C/T 1 10 5 15 4.70489167075465 2.64755416462268 2.05733750613197 T:C C T 10 0.529510832924535 0.314439025315697 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27317781_27317874:ANKRD26 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 27322303 C/G 1 9 12 21 4.23440250367918 6.35412999509442 -2.11972749141524 C:G C G 10 0.529510832924535 0.388145875482006 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27322154_27322306:ANKRD26 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 13 21 34 6.11635917198104 11.1197274914152 -5.00336831943419 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0888839677216021 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 27459746 C/G 1 14 15 29 6.58684833905651 7.94266249386803 -1.35581415481152 C:G C G 10 0.529510832924535 0.71082694647542 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 28 35 63 13.173696678113 18.5328791523587 -5.35918247424571 T:C T C 10 0.529510832924535 0.206793884113014 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 35 35 70 16.4671208476413 18.5328791523587 -2.06575830471746 T:C T C 10 0.529510832924535 0.633905283510688 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 30728101 T/C 1 173 230 403 81.3946259040554 121.787491572643 -40.3928656685876 T:C T C 10 0.529510832924535 6.24206077549098e-05 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 32635834 G/A 1 20 6 26 9.4097833415093 3.17706499754721 6.23271834396209 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0171585087529402 ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32635691_32636146:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32635691_32636113:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000480402:exon_32635691_32636146:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000469059:exon_32635691_32636049:EPC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 35772402 G/A 1 17 17 34 7.9983158402829 9.0016841597171 -1.00336831943419 A:G G A 10 0.529510832924535 0.734980712954295 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 43281089 T/C 1 8 8 16 3.76391333660372 4.23608666339628 -0.472173326792561 T:C T C 10 0.529510832924535 0.80894998850296 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43280930_43281120:BMS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 43318574 T/G 1 34 37 71 15.9966316805658 19.5919008182078 -3.59526913764199 T:G T G 10 0.529510832924535 0.407392203552829 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43318566_43318713:BMS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 43319197 G/A 1 92 69 161 43.2850033709428 36.5362474717929 6.74875589914986 A:G G A 10 0.529510832924535 0.305159928243448 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43319057_43319232:BMS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 121 100 221 56.9291892161313 52.9510832924535 3.97810592367775 A:T T A 10 0.529510832924535 0.637250891266903 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 45939617 A/G 1 35 32 67 16.4671208476413 16.9443466535851 -0.477225805943849 A:G A G 10 0.529510832924535 0.903411563934284 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45939564_45939734:ALOX5;ENSG00000012779:ENST00000481117:exon_45939564_45939680:ALOX5;ENSG00000012779:ENST00000498461:exon_45939176_45939662:ALOX5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 46224381 C/T 1 7 7 14 3.29342416952825 3.70657583047175 -0.413151660943491 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000172661:ENST00000374362:exon_46224310_46224474:FAM21C;ENSG00000172661:ENST00000336378:exon_46224310_46224474:FAM21C;ENSG00000172661:ENST00000399588:exon_46224310_46224474:FAM21C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 51582894 C/T 1 7 1 8 3.29342416952825 0.529510832924535 2.76391333660372 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0741292491828888 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000330923:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000498586:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000431200:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51582796_51582939:NCOA4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 58118375 C/T 1 98 95 193 46.1079383733956 50.3035291278308 -4.19559075443527 T:C C T 10 0.529510832924535 0.564458702057763 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58118317_58118485:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58118317_58118485:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58118317_58118485:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000318387:exon_58118317_58118485:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000460654:exon_58118317_58118448:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58118317_58118448:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000478181:exon_58118317_58118448:ZWINT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 58118630 T/C 1 72 82 154 33.8752200294335 43.4198882998119 -9.54466827037839 T:C T C 10 0.529510832924535 0.125807385653931 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000318387:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000460654:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000467523:exon_58118566_58118708:ZWINT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 69684903 C/T 1 23 19 42 10.8212508427357 10.0607058255662 0.760545017169528 T:C C T 10 0.529510832924535 0.877812645675207 ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69684842_69684944:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69684842_69684944:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69684842_69684944:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69684842_69684944:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69684842_69684944:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69684842_69684944:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69684842_69684944:HERC4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 70105560 G/A 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:G G A 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000204130:ENST00000466493:exon_70105459_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000466187:exon_70103183_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000388768:exon_70103266_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000265865:exon_70104902_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000473398:exon_70105490_70105668:RUFY2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 303 337 640 142.558217623866 178.445150695568 -35.8869330717024 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00489685586954301 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 70892791 C/T 1 29 24 53 13.6441858451885 12.7082599901888 0.935925854999642 T:C C T 10 0.529510832924535 0.890761870617593 ENSG00000122958:ENST00000373382:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000477667:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000263559:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000395098:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000489656:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000490696:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000467852:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000489794:exon_70892654_70892803:VPS26A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 71103597 C/G 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 C:G C G 10 0.529510832924535 0.779088238758133 ENSG00000156515:ENST00000450646:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000464803:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000480047:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483077:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000476368:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483054:exon_71103583_71103646:HK1;ENSG00000156515:ENST00000421088:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000436817:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000493591:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000450557:exon_71103583_71103745:HK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 71142420 G/A 1 23 24 47 10.8212508427357 12.7082599901888 -1.88700914745315 A:T:G G A 10 0.529510832924535 0.661687005600974 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 9 13 22 4.23440250367918 6.88364082801896 -2.64923832433977 T:C C T 10 0.529510832924535 0.290191579780574 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 73520632 A/C 1 1 8 9 0.470489167075465 4.23608666339628 -3.76559749632082 A:C A C 10 0.529510832924535 0.0158444396711090 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73520288_73520681:C10orf54 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 73533177 A/G 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 A:G A G 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73533115_73533255:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73533115_73533196:C10orf54 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 75533448 A/G 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 A:G A G 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000196968:ENST00000372841:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000394790:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000465695:exon_75532952_75534881:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000489264:exon_75533363_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000462704:exon_75533396_75533573:FUT11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 79769647 C/A 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:C C A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000148606:ENST00000372371:exon_79769622_79769749:POLR3A;ENSG00000148606:ENST00000473588:exon_79769622_79769749:POLR3A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 85944516 G/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:G G T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000188373:ENST00000372126:exon_85944437_85945050:C10orf99 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 90771829 T/C 1 35 22 57 16.4671208476413 11.6492383243398 4.8178825233015 T:C T C 10 0.529510832924535 0.232769297449856 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000484444:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000479522:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494799:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90771756_90771838:FAS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 91066075 A/G 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 91162677 C/T 1 37 17 54 17.4080991817922 9.0016841597171 8.40641502207511 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0282541112802235 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 91468925 C/G 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000447580:exon_91468924_91469010:KIF20B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 91470834 A/C 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 A:C A C 10 0.529510832924535 0.779088238758133 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000447580:exon_91470718_91470847:KIF20B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 37 47 84 17.4080991817922 24.8870091474531 -7.47890996566094 A:G G A 10 0.529510832924535 0.125460445310247 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 91487649 A/T 1 32 27 59 15.0556533464149 14.2967924889624 0.758860857452433 A:T A T 10 0.529510832924535 0.896635612547144 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91487613_91487653:KIF20B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 91488979 A/T 1 45 21 66 21.1720125183959 11.1197274914152 10.0522850269807 A:T A T 10 0.529510832924535 0.0135442625430145 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91488885_91489004:KIF20B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 19 25 44 8.93929417443383 13.2377708231134 -4.29847664867954 A:T T A 10 0.529510832924535 0.227322916822683 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 16 26 42 7.52782667320744 13.7672816560379 -6.23945498283047 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0632046451589165 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 28 24 52 13.173696678113 12.7082599901888 0.465436687924177 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 27 25 52 12.7032075110376 13.2377708231134 -0.534563312075822 A:T:G A G 10 0.529510832924535 0.890481177621378 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 95259979 C/G 1 20 17 37 9.4097833415093 9.0016841597171 0.408099181792204 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95259797_95259991:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95259797_95259991:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95259797_95259991:CEP55 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 96104665 T/G 1 4 9 13 1.88195666830186 4.76559749632082 -2.88364082801896 T:G T G 10 0.529510832924535 0.163083153099282 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96104610_96104690:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96104610_96104690:NOC3L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 96114835 G/A 1 10 7 17 4.70489167075465 3.70657583047175 0.998315840282904 A:G G A 10 0.529510832924535 0.808990208344625 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96114720_96114850:NOC3L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 97447373 A/T 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:T A T 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371209:exon_97447349_97447476:TCTN3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 97599537 G/C 1 41 68 109 19.2900558500941 36.0067366388684 -16.7166807887743 C:G G C 10 0.529510832924535 0.00146546962967848 ENSG00000138185:ENST00000453258:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371206:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000481316:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371205:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371203:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000483213:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371207:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000490659:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000494070:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000461927:exon_97599057_97599565:ENTPD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 97605057 C/G 1 9 15 24 4.23440250367918 7.94266249386803 -3.70825999018884 C:G C G 10 0.529510832924535 0.153584329941182 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 98287792 G/T 1 8 8 16 3.76391333660372 4.23608666339628 -0.472173326792561 T:G G T 10 0.529510832924535 0.80894998850296 ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98287788_98287934:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000485093:exon_98287788_98287930:TM9SF3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 98369536 A/G 1 17 13 30 7.9983158402829 6.88364082801896 1.11467501226395 A:G A G 10 0.529510832924535 0.718250953485475 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000467625:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98369469_98369624:PIK3AP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 98380137 T/C 1 11 9 20 5.17538083783011 4.76559749632082 0.409783341509299 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98380109_98380168:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000461252:exon_98380109_98380191:PIK3AP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 5 10 15 2.35244583537732 5.29510832924535 -2.94266249386803 T:C C T 10 0.529510832924535 0.194474740642524 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 51 72 123 23.9949475208487 38.1247799705665 -14.1298324497178 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.0113512584277205 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 99129230 T/C 1 12 6 18 5.64587000490558 3.17706499754721 2.46880500735837 T:C T C 10 0.529510832924535 0.345463610504387 ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99129182_99129339:RRP12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 99225846 C/T 1 9 3 12 4.23440250367918 1.58853249877361 2.64587000490558 T:C C T 10 0.529510832924535 0.154401063622286 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99225816_99225913:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434392:exon_99225816_99225916:MMS19 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 99969475 A/C 1 9 9 18 4.23440250367918 4.76559749632082 -0.53119499264163 A:C A C 10 0.529510832924535 0.817944843022877 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 100190920 G/A 1 11 9 20 5.17538083783011 4.76559749632082 0.409783341509299 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100190888_100191039:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000414009:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100190888_100191048:HPS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 101157438 G/C 1 53 59 112 24.9359258549996 31.2411391425476 -6.30521328754793 A:C:G G C 10 0.529510832924535 0.25617359234438 ENSG00000120053:ENST00000370508:exon_101156627_101157443:GOT1;ENSG00000120053:ENST00000489349:exon_101157222_101157443:GOT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 101639616 C/T 1 19 4 23 8.93929417443383 2.11804333169814 6.82125084273569 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00540275458652324 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 101639796 G/A 1 14 4 18 6.58684833905651 2.11804333169814 4.46880500735837 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0557969737722274 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 101639877 A/C 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 A:C A C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 102006681 C/T 1 13 14 27 6.11635917198104 7.41315166094349 -1.29679248896245 T:C C T 10 0.529510832924535 0.701228237889621 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000468709:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000482452:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000466955:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102006552_102006692:CWF19L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 103899887 A/C 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 A:C A C 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000148840:ENST00000278070:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000413464:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000412852:exon_103898857_103901761:PPRC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 104436641 C/T 1 68 65 133 31.9932633611316 34.4182041400948 -2.42494077896316 T:C C T 10 0.529510832924535 0.728405252004907 ENSG00000138175:ENST00000260746:exon_104436315_104436698:ARL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 26 24 50 12.2327183439621 12.7082599901888 -0.475541646226752 T:C C T 10 0.529510832924535 0.888606450992799 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 93 77 170 43.7554925380182 40.7723341351892 2.98315840282904 A:C A C 10 0.529510832924535 0.700990608299964 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 33 31 64 15.5261425134903 16.4148358206606 -0.888693307170241 T:C T C 10 0.529510832924535 0.900499342423962 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 105362179 G/A 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 105882765 A/G 1 1 8 9 0.470489167075465 4.23608666339628 -3.76559749632082 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0158444396711090 ENSG00000156384:ENST00000369729:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000463224:exon_105882723_105883121:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000369727:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000336358:exon_105882524_105882844:C10orf78 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 112262561 G/C 1 12 24 36 5.64587000490558 12.7082599901888 -7.06238998528326 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0195993566330937 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112262479_112262627:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112262479_112262627:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112262505_112262627:DUSP5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 114427978 G/A 1 15 9 24 7.05733750613197 4.76559749632082 2.29174000981116 A:G G A 10 0.529510832924535 0.4160778721084 ENSG00000151532:ENST00000393077:exon_114427977_114428047:VTI1A;ENSG00000151532:ENST00000432306:exon_114427977_114428047:VTI1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 120810098 C/T 1 128 116 244 60.2226133856595 61.4232566192461 -1.20064323358655 T:C C T 10 0.529510832924535 0.898037287055423 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120810033_120810186:EIF3A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 120828969 A/G 1 31 32 63 14.5851641793394 16.9443466535851 -2.35918247424571 A:G A G 10 0.529510832924535 0.614174106445738 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120828958_120829166:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120828958_120828985:EIF3A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 121196335 G/A 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 A:G G A 10 0.529510832924535 0.129310521443327 ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000369108:exon_121196163_121196353:GRK5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 121336289 G/A 1 8 10 18 3.76391333660372 5.29510832924535 -1.53119499264163 A:G G A 10 0.529510832924535 0.489195304177666 ENSG00000151923:ENST00000489822:exon_121336123_121336715:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000470781:exon_121336123_121336715:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000369087:exon_121336288_121336715:TIAL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 124800853 C/T 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 T:C C T 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000196177:ENST00000358776:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000368869:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000496730:exon_124800725_124800895:ACADSB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 127484721 A/C 1 35 44 79 16.4671208476413 23.2984766486795 -6.83135580103827 A:C A C 10 0.529510832924535 0.142646654032767 ENSG00000188690:ENST00000368797:exon_127484672_127484757:UROS;ENSG00000188690:ENST00000368781:exon_127484672_127484757:UROS;ENSG00000188690:ENST00000484541:exon_127484672_127484759:UROS;ENSG00000188690:ENST00000368786:exon_127484672_127484757:UROS;ENSG00000188690:ENST00000465577:exon_127484672_127484757:UROS;ENSG00000188690:ENST00000464267:exon_127484672_127484757:UROS;ENSG00000188690:ENST00000465260:exon_127484672_127484757:UROS;ENSG00000188690:ENST00000462490:exon_127484672_127484757:UROS;ENSG00000188690:ENST00000420761:exon_127484672_127484757:UROS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 26 29 55 12.2327183439621 15.3558141548115 -3.12309581084943 T:C T C 10 0.529510832924535 0.420035821963334 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129899543 C/T 1 480 309 789 225.834800196223 163.618847373681 62.2159528225419 T:C C T 10 0.529510832924535 9.38684349577269e-06 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 500 336 836 235.244583537732 177.915639862644 57.3289436750887 T:C T C 10 0.529510832924535 7.63924805221558e-05 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 358 302 660 168.435121813016 159.91227154321 8.52285026980687 C:G G C 10 0.529510832924535 0.532732899913746 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 168 122 290 79.0421800686781 64.6003216167933 14.4418584518848 T:C T C 10 0.529510832924535 0.099380011374241 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 93 62 155 43.7554925380182 32.8296716413212 10.9258208966971 A:G G A 10 0.529510832924535 0.090781543219846 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 122 111 233 57.3996783832067 58.7757024546234 -1.37602407141667 A:T:C T C 10 0.529510832924535 0.89561920869937 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129901946 T/G 1 91 73 164 42.8145142038673 38.6542908034911 4.16022340037625 T:G T G 10 0.529510832924535 0.532249742511709 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129902158 C/T 1 94 83 177 44.2259817050937 43.9493991327364 0.276582572357299 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 103 89 192 48.4603842087729 47.1264641302836 1.33392007848927 A:G G A 10 0.529510832924535 0.885128495279966 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 75 60 135 35.2866875306599 31.7706499754721 3.51603755518776 T:C:G T C 10 0.529510832924535 0.605110098562458 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129904474 G/A 1 25 21 46 11.7622291768866 11.1197274914152 0.642501685471387 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.883537625320194 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129904477 C/T 1 26 22 48 12.2327183439621 11.6492383243398 0.583480019622318 T:C C T 10 0.529510832924535 0.886163543227794 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129905429 C/T 1 11 18 29 5.17538083783011 9.53119499264163 -4.35581415481152 T:C C T 10 0.529510832924535 0.135839017259835 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129906364 G/A 1 25 15 40 11.7622291768866 7.94266249386803 3.8195666830186 A:G G A 10 0.529510832924535 0.268273426851986 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 21 13 34 9.88027250858476 6.88364082801896 2.99663168056581 T:C C T 10 0.529510832924535 0.390699618302272 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 15 25 40 7.05733750613197 13.2377708231134 -6.1804333169814 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0573023751511733 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129910475 T/G 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:G T G 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000484853:exon_129910397_129910713:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129911856 C/G 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129911691_129911866:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 129913960 A/T 1 9 2 11 4.23440250367918 1.05902166584907 3.17538083783011 A:T A T 10 0.529510832924535 0.070493162541885 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129913192_129914271:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129913774_129914271:MKI67 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 134021576 C/T 1 9 3 12 4.23440250367918 1.58853249877361 2.64587000490558 T:C C T 10 0.529510832924535 0.154401063622286 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134020994_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368622:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000298630:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000462160:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368625:exon_134020996_134021655:STK32C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 1 32 7 39 15.0556533464149 3.70657583047175 11.3490775159431 A:G A G 10 0.529510832924535 0.000286530786208271 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 32 6 38 15.0556533464149 3.17706499754721 11.8785883488677 C:G C G 10 0.529510832924535 6.71111093567922e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 1 26 3 29 12.2327183439621 1.58853249877361 10.6441858451885 T:C T C 10 0.529510832924535 4.25955112965517e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 19 8 27 8.93929417443383 4.23608666339628 4.70320751103755 T:G G T 10 0.529510832924535 0.0828338368378422 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 134145336 G/T 1 10 2 12 4.70489167075465 1.05902166584907 3.64587000490558 T:G G T 10 0.529510832924535 0.0425238621817513 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 10 134161633 A/G 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000148814:ENST00000368615:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000392638:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000432555:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000344079:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368614:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000462656:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368613:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000356571:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368612:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000450442:exon_134161488_134161853:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368610:exon_134161488_134161860:LRRC27 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 218874 C/G 1 30 31 61 14.1146750122639 16.4148358206606 -2.30016080839664 C:G C G 10 0.529510832924535 0.608636127515367 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_218832_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529937:exon_218778_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_218832_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_218832_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_218778_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_218832_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_218832_219041:SIRT3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 290816 A/G 1 8 4 12 3.76391333660372 2.11804333169814 1.64587000490558 A:G A G 10 0.529510832924535 0.397734651849528 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 114 46 160 53.635765046603 24.3574983145286 29.2782667320744 A:G A G 10 0.529510832924535 3.41823263473393e-06 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 251 317 568 118.092780935942 167.854934037078 -49.7621531011359 A:T:G A G 10 0.529510832924535 3.05726939573875e-05 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 490036 G/A 1 9 22 31 4.23440250367918 11.6492383243398 -7.41483582066059 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0106047208978861 ENSG00000174915:ENST00000308020:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000526878:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000531411:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000530029:exon_489791_490068:PTDSS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 144 140 284 67.750440058867 74.1315166094349 -6.38107655056795 C:G G C 10 0.529510832924535 0.475742418198249 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 499059 C/T 1 105 130 235 49.4013625429238 68.8364082801896 -19.4350457372657 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0128611254802217 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_499015_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_499031_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_499047_499185:RNH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 534242 A/G 1 35 29 64 16.4671208476413 15.3558141548115 1.11130669282976 A:G A G 10 0.529510832924535 0.803533683515902 ENSG00000174775:ENST00000397594:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000397596:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000493230:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000451590:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000417302:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000311189:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000468682:exon_534212_534375:HRAS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 562421 G/A 1 7 11 18 3.29342416952825 5.82461916216989 -2.53119499264163 A:G G A 10 0.529510832924535 0.247634630922160 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_562385_562776:RASSF7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 563257 G/A 1 12 13 25 5.64587000490558 6.88364082801896 -1.23777082311338 A:G G A 10 0.529510832924535 0.690766577028411 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563189_563478:RASSF7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 563649 C/T 1 23 14 37 10.8212508427357 7.41315166094349 3.4080991817922 T:C C T 10 0.529510832924535 0.323472396712987 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563558_564018:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563558_564021:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563558_563685:RASSF7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 608593 G/A 1 41 30 71 19.2900558500941 15.8853249877361 3.40473086235801 A:G G A 10 0.529510832924535 0.476088300613972 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 614864 C/T 1 89 94 183 41.8735358697164 49.7740182949063 -7.90048242518991 T:C C T 10 0.529510832924535 0.266650179583881 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614797_614984:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614797_614952:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532788:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614797_614887:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 644568 C/G 1 51 38 89 23.9949475208487 20.1214116511323 3.87353586971638 C:G C G 10 0.529510832924535 0.457722011136355 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_644225_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_644225_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_644233_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_644233_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527658:exon_644234_644654:DEAF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 653968 T/C 1 39 35 74 18.3490775159431 18.5328791523587 -0.183801636415595 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_653941_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_653962_654051:DEAF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 674454 G/T 1 1 12 13 0.470489167075465 6.35412999509442 -5.88364082801896 T:G G T 10 0.529510832924535 0.00112248104368015 ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 772490 G/A 1 11 10 21 5.17538083783011 5.29510832924535 -0.119727491415236 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000177225:ENST00000528309:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000397472:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000526650:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000526325:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_772427_772614:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532839:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000442059:exon_772427_772521:PDDC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 802379 T/C 1 11 14 25 5.17538083783011 7.41315166094349 -2.23777082311338 T:C T C 10 0.529510832924535 0.42559887349422 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 804212 C/A 1 10 11 21 4.70489167075465 5.82461916216989 -1.11972749141524 A:C C A 10 0.529510832924535 0.66667332357797 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_804094_804675:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_804094_805103:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_804094_804469:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534649:exon_804094_804463:LRDD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 811853 C/T 1 18 17 35 8.46880500735837 9.0016841597171 -0.532879152358726 T:C C T 10 0.529510832924535 0.867280533607478 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 840363 C/T 1 287 240 527 135.030390950658 127.082599901888 7.94779104877003 T:C C T 10 0.529510832924535 0.512803593160671 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 870446 G/A 1 57 65 122 26.8178825233015 34.4182041400948 -7.60032161679328 A:G G A 10 0.529510832924535 0.174515195649304 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 904809 G/C 1 13 19 32 6.11635917198104 10.0607058255662 -3.94434665358512 C:G G C 10 0.529510832924535 0.214546608356418 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_904706_904816:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_904706_904864:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000531859:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534254:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528426:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000533056:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000533059:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000530939:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000525225:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000525840:exon_904701_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528154:exon_904737_904859:CHID1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 993907 C/G 1 14 16 30 6.58684833905651 8.47217332679256 -1.88532498773605 C:G C G 10 0.529510832924535 0.58418180440881 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528195:exon_993863_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_993754_993985:AP2A2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 1874404 C/T 1 504 334 838 237.126540206034 176.856618196795 60.2699220092397 T:C C T 10 0.529510832924535 3.1926421034167e-05 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1874200_1874427:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1874200_1874427:LSP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 453 401 854 213.131592685186 212.333844002739 0.797748682447093 A:G G A 10 0.529510832924535 0.972660706350746 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 4103524 A/G 1 14 6 20 6.58684833905651 3.17706499754721 3.4097833415093 A:G A G 10 0.529510832924535 0.177997080950173 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 23 20 43 10.8212508427357 10.5902166584907 0.231034184244994 A:C C A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 204 155 359 95.9797900833948 82.0741791033029 13.9056109800919 A:G A G 10 0.529510832924535 0.153361667690782 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 5688940 C/T 1 11 9 20 5.17538083783011 4.76559749632082 0.409783341509299 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5688919_5688941:TRIM5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 16 9 25 7.52782667320744 4.76559749632082 2.76222917688662 T:C T C 10 0.529510832924535 0.319086576710391 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 5701281 G/A 1 16 12 28 7.52782667320744 6.35412999509442 1.17369667811302 A:G G A 10 0.529510832924535 0.708183978146927 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 5701409 G/C 1 14 10 24 6.58684833905651 5.29510832924535 1.29174000981116 C:G G C 10 0.529510832924535 0.684850962838789 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 112 125 237 52.6947867124521 66.1888541155669 -13.4940674031148 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0904644325046083 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 119 111 230 55.9882108819803 58.7757024546234 -2.78749157264306 A:G G A 10 0.529510832924535 0.741352303817189 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 8707083 G/A 1 42 24 66 19.7605450171695 12.7082599901888 7.05228502698069 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0854174689445526 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 8707233 C/T 1 3912 3949 7861 1840.55362159922 2091.03827921899 -250.48465761977 A:T:C:G C T 10 0.529510832924535 1.59559605163260e-08 ENSG00000166441:ENST00000314138:exon_8707225_8711419:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000524496:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000534599:exon_8707225_8707392:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000532359:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530022:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000526562:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000525981:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530913:exon_8707225_8707395:RPL27A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 9305051 T/C 1 9 2 11 4.23440250367918 1.05902166584907 3.17538083783011 T:C T C 10 0.529510832924535 0.070493162541885 ENSG00000166471:ENST00000299596:exon_9304918_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000524543:exon_9302201_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000429086:exon_9304918_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000528080:exon_9302218_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000533867:exon_9304686_9305140:TMEM41B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 9607032 A/G 1 16 19 35 7.52782667320744 10.0607058255662 -2.53287915235873 A:G A G 10 0.529510832924535 0.402816305864415 ENSG00000166483:ENST00000450114:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000299613:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000524612:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530712:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530175:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000532275:exon_9606989_9607074:WEE1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 9749645 A/C 1 23 23 46 10.8212508427357 12.1787491572643 -1.35749831452861 A:C A C 10 0.529510832924535 0.76819401671838 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9749600_9749746:SWAP70 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 9754221 C/T 1 15 17 32 7.05733750613197 9.0016841597171 -1.94434665358512 T:C C T 10 0.529510832924535 0.595977363885404 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9754076_9754257:SWAP70 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 9769562 C/G 1 57 63 120 26.8178825233015 33.3591824742457 -6.5412999509442 C:G C G 10 0.529510832924535 0.235913856119338 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 11354346 T/C 1 8 6 14 3.76391333660372 3.17706499754721 0.586848339056509 T:C T C 10 0.529510832924535 0.795582240516341 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 13443250 C/T 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 T:C C T 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13443189_13443362:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13443189_13443385:BTBD10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 17351683 C/G 1 71 45 116 33.404730862358 23.8279874816041 9.57674338075394 A:C:G C G 10 0.529510832924535 0.077656278624967 ENSG00000070081:ENST00000532658:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000533773:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000405119:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000323688:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000529010:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000458064:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000527580:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000531242:exon_17351674_17351844:NUCB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 14 15 29 6.58684833905651 7.94266249386803 -1.35581415481152 T:C C T 10 0.529510832924535 0.71082694647542 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 18118368 G/A 1 9 5 14 4.23440250367918 2.64755416462268 1.58684833905651 A:G G A 10 0.529510832924535 0.435350095576674 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18118318_18118401:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18118318_18118401:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18118318_18118401:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18118318_18118401:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000533851:exon_18118318_18118401:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530180:exon_18118318_18118401:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530736:exon_18118318_18118401:SAAL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 18505552 G/A 1 30 28 58 14.1146750122639 14.826303321887 -0.711628309623034 A:G G A 10 0.529510832924535 0.895737693864948 ENSG00000074319:ENST00000357193:exon_18505417_18505619:TSG101;ENSG00000074319:ENST00000251968:exon_18505417_18505619:TSG101 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 22647366 G/A 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 A:G G A 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000183161:ENST00000327470:exon_22644079_22647387:FANCF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 27362359 T/G 1 30 28 58 14.1146750122639 14.826303321887 -0.711628309623034 T:G T G 10 0.529510832924535 0.895737693864948 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 23 31 54 10.8212508427357 16.4148358206606 -5.59358497792489 T:C T C 10 0.529510832924535 0.135289135690168 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 35827958 A/G 1 14 4 18 6.58684833905651 2.11804333169814 4.46880500735837 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0557969737722274 ENSG00000166326:ENST00000299413:exon_35827908_35829775:TRIM44;ENSG00000166326:ENST00000532066:exon_35827908_35828171:TRIM44 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 44636839 C/T 1 140 128 268 65.8684833905651 67.7773866143405 -1.9089032237754 T:C:G C T 10 0.529510832924535 0.854394511086991 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 217 189 406 102.096149255376 100.077547422737 2.01860183263877 A:G A G 10 0.529510832924535 0.881460670548248 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 44640640 C/G 1 202 214 416 95.0388117492439 113.315318245851 -18.2765064966066 T:C:G C G 10 0.529510832924535 0.0769844198395028 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640599_44641913:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640599_44641313:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640599_44640676:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640599_44640884:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640599_44640933:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640599_44640825:CD82;ENSG00000085117:ENST00000524750:exon_44640599_44641259:CD82 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 35 38 73 16.4671208476413 20.1214116511323 -3.65429080349106 A:G A G 10 0.529510832924535 0.413312769943153 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 45975130 C/T 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 T:C C T 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000135365:ENST00000257821:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527401:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000323180:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000418153:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527753:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000534766:exon_45975078_45975166:PHF21A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 47869806 G/C 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 C:G G C 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000030066:ENST00000378460:exon_47869771_47870019:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000426372:exon_47869771_47870057:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000530326:exon_47869771_47869865:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000263764:exon_47869771_47870057:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000532747:exon_47869771_47869882:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000526870:exon_47869771_47870107:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000529863:exon_47869771_47869886:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000458312:exon_47869771_47870057:NUP160 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 57509690 G/A 1 1018 1007 2025 478.957972082823 533.217408755007 -54.2594366721834 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.0161947798094897 ENSG00000211450:ENST00000534355:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000533321:exon_57509281_57510529:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000388857:exon_57509589_57510129:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000528798:exon_57509589_57509699:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000534386:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000254732:ENST00000531074:exon_57509635_57509719:RP11-691N7.6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 58318619 C/G 1 44 55 99 20.7015233513205 29.1230958108494 -8.42157245952897 C:G C G 10 0.529510832924535 0.106770081929020 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58318538_58318705:LPXN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 58378424 A/G 1 15 11 26 7.05733750613197 5.82461916216989 1.23271834396209 A:G A G 10 0.529510832924535 0.697111831856919 ENSG00000186660:ENST00000316059:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000186660:ENST00000389918:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000255073:ENST00000389919:exon_58378423_58378527:AP001350.3;ENSG00000255073:ENST00000422974:exon_58378423_58378527:AP001350.3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 58893761 C/G 1 55 40 95 25.8769041891506 21.1804333169814 4.69647087216917 C:G C G 10 0.529510832924535 0.356098711962604 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 58978940 C/T 1 3 9 12 1.41146750122639 4.76559749632082 -3.35412999509442 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0794211024472422 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 128 116 244 60.2226133856595 61.4232566192461 -1.20064323358655 A:T:G G A 10 0.529510832924535 0.898037287055423 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 60673868 T/C 1 57 37 94 26.8178825233015 19.5919008182078 7.22598170509371 T:C T C 10 0.529510832924535 0.148331863713519 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60673836_60674056:PRPF19 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 60701136 C/G 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60701014_60701216:TMEM132A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 60703777 G/A 1 16 12 28 7.52782667320744 6.35412999509442 1.17369667811302 A:G G A 10 0.529510832924535 0.708183978146927 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 10 9 19 4.70489167075465 4.76559749632082 -0.0607058255661652 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 61906453 G/C 1 9 12 21 4.23440250367918 6.35412999509442 -2.11972749141524 C:G G C 10 0.529510832924535 0.388145875482006 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61906360_61906477:INCENP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 62284468 A/C 1 40 49 89 18.8195666830186 25.9460308133022 -7.12646413028362 A:C A C 10 0.529510832924535 0.137860479114949 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 62285441 A/G 1 28 19 47 13.173696678113 10.0607058255662 3.11299085254685 A:G A G 10 0.529510832924535 0.384224653602232 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 62285665 C/T 1 26 17 43 12.2327183439621 9.0016841597171 3.23103418424499 T:C C T 10 0.529510832924535 0.361402517437889 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 62620487 G/A 1 41 51 92 19.2900558500941 27.0050524791513 -7.71499662905723 A:G G A 10 0.529510832924535 0.117348623955482 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 63987989 G/A 0 233 0 233 109.623975928583 0 109.623975928583 G G 10 0.529510832924535 6.79301703607353e-65 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 63988045 G/A 1 140 140 280 65.8684833905651 74.1315166094349 -8.26303321886982 A:G G A 10 0.529510832924535 0.338309293514575 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 10 14 24 4.70489167075465 7.41315166094349 -2.70825999018884 T:G T G 10 0.529510832924535 0.309537938097369 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 64111794 G/A 1 33 31 64 15.5261425134903 16.4148358206606 -0.888693307170241 A:G G A 10 0.529510832924535 0.900499342423962 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 64119681 C/T 1 43 42 85 20.231034184245 22.2394549828305 -2.00842079858548 T:C C T 10 0.529510832924535 0.665677919873629 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64119602_64119858:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64119602_64119858:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64119602_64119858:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64119602_64119858:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64119602_64119858:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64119602_64119858:CCDC88B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 64124515 T/C 1 297 225 522 139.735282621413 119.13993740802 20.5953452133927 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0723067208602714 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64124511_64125006:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64124511_64124958:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64124511_64124997:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64124511_64125002:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64122666_64125000:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64124511_64124842:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000472524:exon_64124511_64125003:CCDC88B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 64127744 A/G 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 A:G A G 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64127635_64127853:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64127635_64127853:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64127635_64127853:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000531659:exon_64127635_64127853:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64127635_64127853:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64127635_64127853:RPS6KA4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 14 21 35 6.58684833905651 11.1197274914152 -4.53287915235873 T:C T C 10 0.529510832924535 0.130972362234130 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 64138905 T/G 1 10 7 17 4.70489167075465 3.70657583047175 0.998315840282904 T:G T G 10 0.529510832924535 0.808990208344625 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 64572602 G/A 1 13 24 37 6.11635917198104 12.7082599901888 -6.5919008182078 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0325623880992635 ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 64622869 G/C 1 106 103 209 49.8718517099993 54.5396157912271 -4.66776408122782 C:G G C 10 0.529510832924535 0.533337448160539 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 64645871 A/G 1 40 41 81 18.8195666830186 21.7099441499059 -2.89037746688734 A:G A G 10 0.529510832924535 0.578187299800291 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 78 61 139 36.6981550318863 32.3001608083966 4.39799422348963 T:C T C 10 0.529510832924535 0.496909323972603 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 65271832 C/T 1 429 400 829 201.839852675374 211.804333169814 -9.96448049443956 T:C C T 10 0.529510832924535 0.508603989106518 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 65338034 A/G 1 5 11 16 2.35244583537732 5.82461916216989 -3.47217332679256 A:G A G 10 0.529510832924535 0.130420532691613 ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65337931_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527920:exon_65337956_65338226:SSSCA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 20 22 42 9.4097833415093 11.6492383243398 -2.23945498283047 T:G T G 10 0.529510832924535 0.537954208235939 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 1797 1974 3771 845.46903323461 1045.25438419303 -199.785350958422 A:C:G G A 10 0.529510832924535 8.11688657013065e-11 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 65623739 A/G 1 2 11 13 0.94097833415093 5.82461916216989 -4.88364082801896 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00956286367176584 ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172803:ENST00000530101:exon_65623600_65624367:SNX32 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 65629932 T/C 1 10 3 13 4.70489167075465 1.58853249877361 3.11635917198104 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0995863157160923 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 65629934 G/C 1 10 2 12 4.70489167075465 1.05902166584907 3.64587000490558 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0425238621817513 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 20 13 33 9.4097833415093 6.88364082801896 2.52614251349034 T:C C T 10 0.529510832924535 0.390602689905416 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 12 19 31 5.64587000490558 10.0607058255662 -4.41483582066059 A:G G A 10 0.529510832924535 0.149025268406671 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 27 24 51 12.7032075110376 12.7082599901888 -0.0050524791512867 T:G G T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 65651864 G/A 1 121 84 205 56.9291892161313 44.4789099656609 12.4502792504703 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0928844024946114 ENSG00000172500:ENST00000534032:exon_65651863_65651960:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000338369:exon_65651863_65651960:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000357519:exon_65651863_65651960:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000525765:exon_65651863_65651960:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000531115:exon_65651782_65651960:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000533045:exon_65651863_65651979:FIBP;ENSG00000172500:ENST00000533037:exon_65651863_65651960:FIBP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 65664346 T/C 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 T:C T C 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000175592:ENST00000455710:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000312562:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000531493:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000532401:exon_65664280_65664477:FOSL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 50 41 91 23.5244583537732 21.7099441499059 1.81451420386731 A:G G A 10 0.529510832924535 0.753173178222988 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 62 74 136 29.1703283586788 39.1838016364156 -10.0134732777368 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0865165568098874 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 66033430 C/T 1 11 17 28 5.17538083783011 9.0016841597171 -3.82630332188698 T:C C T 10 0.529510832924535 0.184953401348688 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66033325_66033483:KLC2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 66105194 G/A 1 76 90 166 35.7571766977353 47.6559749632082 -11.8987982654728 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0734486131268698 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66104804_66105278:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66104840_66105360:BRMS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 66134085 C/T 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 T:C C T 10 0.529510832924535 0.367903952777456 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 66206169 C/T 1 67 52 119 31.5227741940562 27.5345633120758 3.98821088198033 T:C C T 10 0.529510832924535 0.520528150151834 ENSG00000174547:ENST00000310999:exon_66206103_66206319:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000534488:exon_66206103_66206297:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000329819:exon_66206103_66206305:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000394025:exon_66206103_66206295:MRPL11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 24 40 64 11.2917400098112 21.1804333169814 -9.88869330717024 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0167279564042256 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 66610645 G/C 1 29 21 50 13.6441858451885 11.1197274914152 2.52445835377325 C:G G C 10 0.529510832924535 0.571381390842839 ENSG00000173715:ENST00000360962:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000346672:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000527634:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000528340:exon_66610640_66610793:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532565:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000525449:exon_66610640_66610795:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532727:exon_66610640_66610763:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000531415:exon_66610640_66610744:C11orf80;ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66610306_66611332:RCE1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 66626234 T/C 1 9 3 12 4.23440250367918 1.58853249877361 2.64587000490558 T:C T C 10 0.529510832924535 0.154401063622286 ENSG00000173621:ENST00000393952:exon_66625206_66626347:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000309602:exon_66624973_66626564:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000525479:exon_66624996_66626528:LRFN4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 67166000 C/T 1 350 303 653 164.671208476413 160.441782376134 4.22942610027863 T:C C T 10 0.529510832924535 0.753909060361304 ENSG00000172531:ENST00000312989:exon_67165654_67166116:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000451458:exon_67165654_67166116:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000532446:exon_67165672_67166116:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000526510:exon_67165672_67166116:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000376745:exon_67165672_67166116:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000358239:exon_67165902_67166116:PPP1CA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 67412771 G/C 1 6 8 14 2.82293500245279 4.23608666339628 -1.41315166094349 C:G G C 10 0.529510832924535 0.594278475296019 ENSG00000132744:ENST00000255082:exon_67412758_67412851:ACY3;ENSG00000132744:ENST00000529256:exon_67412758_67412851:ACY3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 68030040 A/G 1 19 12 31 8.93929417443383 6.35412999509442 2.58516417933941 A:G A G 10 0.529510832924535 0.374459447746206 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 68030173 C/A 1 8 14 22 3.76391333660372 7.41315166094349 -3.64923832433977 A:C C A 10 0.529510832924535 0.137310126362436 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 68192690 G/A 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 68204445 C/T 1 8 3 11 3.76391333660372 1.58853249877361 2.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.235512259698034 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68204357_68204467:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68204357_68204467:LRP5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 68705674 C/A 1 11 3 14 5.17538083783011 1.58853249877361 3.58684833905651 A:C C A 10 0.529510832924535 0.0633528876970293 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68705650_68705822:IGHMBP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 69462910 G/A 1 4 8 12 1.88195666830186 4.23608666339628 -2.35412999509442 A:G G A 10 0.529510832924535 0.247834349729258 ENSG00000110092:ENST00000227507:exon_69462762_69462910:CCND1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 71728822 G/C 1 11 8 19 5.17538083783011 4.23608666339628 0.939294174433834 C:G G C 10 0.529510832924535 0.81917282175653 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71728733_71728873:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71728733_71728873:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71728733_71728873:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71728733_71728873:NUMA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 71941033 G/C 1 8 2 10 3.76391333660372 1.05902166584907 2.70489167075465 C:G G C 10 0.529510832924535 0.115498370857198 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71940968_71941063:INPPL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 72406614 G/A 1 62 60 122 29.1703283586788 31.7706499754721 -2.60032161679328 A:G G A 10 0.529510832924535 0.651126390438936 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72406587_72406673:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72406587_72406673:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72406587_72406673:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72406587_72406673:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72406587_72406673:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72406587_72406673:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72406587_72406673:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72406587_72406673:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72406587_72406673:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72406587_72406673:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72406587_72406673:ARAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 72408055 G/C 1 44 42 86 20.7015233513205 22.2394549828305 -1.53793163151002 C:G G C 10 0.529510832924535 0.747168436557445 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72407594_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408028_72408240:ARAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 72539899 G/C 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 C:G G C 10 0.529510832924535 0.556631979728114 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 73106165 A/C 1 10 15 25 4.70489167075465 7.94266249386803 -3.23777082311338 A:C A C 10 0.529510832924535 0.230939624838663 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 73620537 C/G 1 13 20 33 6.11635917198104 10.5902166584907 -4.47385748650966 C:G C G 10 0.529510832924535 0.162000968884620 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73620444_73620638:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73620444_73620638:PAAF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 103 72 175 48.4603842087729 38.1247799705665 10.3356042382064 A:G G A 10 0.529510832924535 0.129789395566724 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 10 7 17 4.70489167075465 3.70657583047175 0.998315840282904 T:C T C 10 0.529510832924535 0.808990208344625 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 75277628 A/G 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 A:G A G 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277512_75277726:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277395_75277700:SERPINH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 17 14 31 7.9983158402829 7.41315166094349 0.585164179339413 T:C T C 10 0.529510832924535 0.85934843118329 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 75851997 T/C 1 26 23 49 12.2327183439621 12.1787491572643 0.0539691866977829 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75851755_75854239:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75851755_75852838:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75851755_75852544:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75851755_75853695:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75851755_75852827:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000525183:exon_75851755_75852704:UVRAG HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 7 7 14 3.29342416952825 3.70657583047175 -0.413151660943491 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 78279790 T/G 1 11 5 16 5.17538083783011 2.64755416462268 2.52782667320744 T:G T G 10 0.529510832924535 0.222816733853050 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000526709:exon_78279761_78279798:NARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 72 54 126 33.8752200294335 28.5935849779249 5.28163505150859 T:C C T 10 0.529510832924535 0.372665514600207 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 16 14 30 7.52782667320744 7.41315166094349 0.114675012263948 A:C A C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 14 15 29 6.58684833905651 7.94266249386803 -1.35581415481152 T:C C T 10 0.529510832924535 0.71082694647542 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 93212245 C/T 1 40 38 78 18.8195666830186 20.1214116511323 -1.30184496811373 T:C C T 10 0.529510832924535 0.8208475571209 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 93212254 C/T 1 46 42 88 21.6425016854714 22.2394549828305 -0.596953297359086 T:C C T 10 0.529510832924535 0.915304665850486 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 14 9 23 6.58684833905651 4.76559749632082 1.82125084273569 C:G C G 10 0.529510832924535 0.533349006667712 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 94861862 A/G 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:G A G 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000149218:ENST00000278505:exon_94861541_94865815:ENDOD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 95546226 G/C 1 12 24 36 5.64587000490558 12.7082599901888 -7.06238998528326 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0195993566330937 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95546096_95546275:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95546096_95546275:CEP57 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 95562327 G/A 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 0.487573754416657 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 74 67 141 34.8161983635844 35.4772258059438 -0.66102744235944 A:G A G 10 0.529510832924535 0.93289847828285 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 107197640 T/C 1 13 9 22 6.11635917198104 4.76559749632082 1.35076167566023 T:C T C 10 0.529510832924535 0.671166937576677 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 107200682 T/A 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 A:T T A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107200644_107200745:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107200644_107200745:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107200644_107200745:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107200644_107200745:CWF19L2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 110118364 A/C 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 A:C A C 10 0.529510832924535 0.565981457468987 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 T:C C T 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 139 113 252 65.3979942234896 59.8347241204725 5.56327010301717 A:C:G A C 10 0.529510832924535 0.488401233811398 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 111896242 G/A 1 11 12 23 5.17538083783011 6.35412999509442 -1.17874915726431 A:G G A 10 0.529510832924535 0.679304562332551 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 9 5 14 4.23440250367918 2.64755416462268 1.58684833905651 T:C T C 10 0.529510832924535 0.435350095576674 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 111916647 G/A 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111916587_111916694:DLAT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 26 26 52 12.2327183439621 13.7672816560379 -1.53456331207582 A:G A G 10 0.529510832924535 0.679486098664135 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 117163824 C/G 1 3 9 12 1.41146750122639 4.76559749632082 -3.35412999509442 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0794211024472422 ENSG00000186318:ENST00000313005:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000392937:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000528053:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510630:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000428381:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000513780:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000445823:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000292095:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530824:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530844:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510915:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000504995:exon_117163787_117163904:BACE1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 117281566 C/T 0 24 0 24 11.2917400098112 0 11.2917400098112 C C 10 0.529510832924535 2.49887612492125e-07 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117281544_117281610:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117281544_117281610:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117281544_117281610:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117281544_117281610:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000528706:exon_117281544_117281610:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000532187:exon_117281544_117281610:CEP164 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 118769442 A/G 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 A:G A G 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118766849_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118768455_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000525300:exon_118768459_118769773:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118769124_118769771:BCL9L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 121448090 T/G 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 T:G T G 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121447990_121448109:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121447990_121448109:SORL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 1662 1974 3636 781.952995679423 1045.25438419303 -263.301388513609 A:T:C:G A G 10 0.529510832924535 2.41347835736747e-18 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 1111 1070 2181 522.713464620842 566.576591229252 -43.8631266084109 A:T:G T G 10 0.529510832924535 0.0619986317869355 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 124502114 C/T 1 50 44 94 23.5244583537732 23.2984766486795 0.225981705093705 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000154144:ENST00000473629:exon_124501989_124502330:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000530731:exon_124501989_124502348:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000284290:exon_124501989_124505287:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000441174:exon_124501989_124504698:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000375005:exon_124501989_124502331:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000529543:exon_124501989_124503320:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000438907:exon_124501989_124502134:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000491010:exon_124500284_124502339:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000531033:exon_124501989_124502301:TBRG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 23 22 45 10.8212508427357 11.6492383243398 -0.827987481604078 T:C T C 10 0.529510832924535 0.881613859608674 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 21 14 35 9.88027250858476 7.41315166094349 2.46712084764127 A:T T A 10 0.529510832924535 0.498877287546952 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 126162862 C/T 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 T:C C T 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000438974:exon_126162372_126163012:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392678:exon_126162372_126163139:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126162372_126162950:TIRAP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 126163612 T/G 1 3 7 10 1.41146750122639 3.70657583047175 -2.29510832924535 T:G T G 10 0.529510832924535 0.206417065723492 ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126163563_126164828:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126163582_126163687:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126163563_126164579:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126163563_126164534:TIRAP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 126174038 C/T 1 51 52 103 23.9949475208487 27.5345633120758 -3.53961579122711 T:C C T 10 0.529510832924535 0.491384298883805 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 19 15 34 8.93929417443383 7.94266249386803 0.996631680565809 T:C T C 10 0.529510832924535 0.863935342116717 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 11 134114938 G/C 1 18 15 33 8.46880500735837 7.94266249386803 0.526142513490344 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000151502:ENST00000281187:exon_134114832_134114974:VPS26B;ENSG00000151502:ENST00000525095:exon_134114832_134114974:VPS26B;ENSG00000151502:ENST00000531741:exon_134113746_134114974:VPS26B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 406292 G/A 1 12 10 22 5.64587000490558 5.29510832924535 0.350761675660229 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 427575 A/G 1 15 10 25 7.05733750613197 5.29510832924535 1.76222917688662 A:G A G 10 0.529510832924535 0.550913585527032 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 993930 C/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 994014 C/T 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 T:C C T 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 1893170 C/T 1 10 2 12 4.70489167075465 1.05902166584907 3.64587000490558 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0425238621817513 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1893046_1893239:ADIPOR2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 11 5 16 5.17538083783011 2.64755416462268 2.52782667320744 A:G G A 10 0.529510832924535 0.222816733853050 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 4796244 T/C 1 145 140 285 68.2209292259424 74.1315166094349 -5.9105873834925 T:C T C 10 0.529510832924535 0.514017291615556 ENSG00000139180:ENST00000266544:exon_4796104_4796397:NDUFA9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 30 9 39 14.1146750122639 4.76559749632082 9.34907751594313 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0033336065799047 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 27 1 28 12.7032075110376 0.529510832924535 12.173696678113 A:G A G 10 0.529510832924535 8.27011894331167e-07 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 6562823 C/T 1 35 4 39 16.4671208476413 2.11804333169814 14.3490775159431 T:C C T 10 0.529510832924535 1.19368910121681e-06 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 6562836 G/A 1 32 5 37 15.0556533464149 2.64755416462268 12.4080991817922 A:G G A 10 0.529510832924535 2.18376378878285e-05 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 60 45 105 28.2293500245279 23.8279874816041 4.40136254292382 A:G A G 10 0.529510832924535 0.434437536613935 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 6575044 G/T 1 13 18 31 6.11635917198104 9.53119499264163 -3.41483582066059 T:G G T 10 0.529510832924535 0.280312149032782 ENSG00000139190:ENST00000400911:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000355479:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396308:exon_6575008_6575166:VAMP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 6631169 C/A 1 23 23 46 10.8212508427357 12.1787491572643 -1.35749831452861 A:C C A 10 0.529510832924535 0.76819401671838 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6630964_6631203:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6630964_6631203:NCAPD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 6637845 T/C 1 78 59 137 36.6981550318863 31.2411391425476 5.4570158893387 T:C T C 10 0.529510832924535 0.392186068306124 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6637845_6638022:NCAPD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 68 59 127 31.9932633611316 31.2411391425476 0.752124218584051 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.929300084003994 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 6639088 A/G 1 83 110 193 39.0506008672636 58.2461916216989 -19.1955907544353 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00606229197756455 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638941_6639124:NCAPD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 6675767 A/G 1 42 19 61 19.7605450171695 10.0607058255662 9.69983919160336 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0143673644456319 ENSG00000111641:ENST00000322166:exon_6675695_6675783:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000382421:exon_6675695_6675783:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000399466:exon_6675695_6675783:NOP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 42 34 76 19.7605450171695 18.0033683194342 1.75717669773534 A:G G A 10 0.529510832924535 0.731052457679115 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 6954875 C/T 1 8 6 14 3.76391333660372 3.17706499754721 0.586848339056509 T:C C T 10 0.529510832924535 0.795582240516341 ENSG00000111664:ENST00000229264:exon_6954750_6954966:GNB3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 31 34 65 14.5851641793394 18.0033683194342 -3.41820414009478 A:G A G 10 0.529510832924535 0.456270920969081 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 A:T T A 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 2 18 20 0.94097833415093 9.53119499264163 -8.5902166584907 A:G A G 10 0.529510832924535 0.000130984170176769 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 7592035 G/T 0 58 0 58 27.288371690377 0 27.288371690377 G G 10 0.529510832924535 1.03296474982770e-16 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 109 121 230 51.2833192112257 64.0708107838687 -12.7874915726431 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0985873850268339 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 9906067 T/C 1 19 20 39 8.93929417443383 10.5902166584907 -1.65092248405687 T:C T C 10 0.529510832924535 0.632721672477926 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 11803042 G/C 1 72 43 115 33.8752200294335 22.768965815755 11.1062542136785 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0399076843749835 ENSG00000139083:ENST00000266427:exon_11802788_11803094:ETV6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 12814330 T/C 1 13 7 20 6.11635917198104 3.70657583047175 2.4097833415093 T:C T C 10 0.529510832924535 0.371363290052013 ENSG00000183150:ENST00000332427:exon_12813995_12815404:GPR19 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 12870938 G/A 1 18 25 43 8.46880500735837 13.2377708231134 -4.76896581575501 A:G G A 10 0.529510832924535 0.169394237056324 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000442489:exon_12870795_12870987:CDKN1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 1153 1049 2202 542.474009638011 555.456863737837 -12.9828540998261 A:T:C:G C G 10 0.529510832924535 0.578961909970953 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 23 28 51 10.8212508427357 14.826303321887 -4.00505247915129 T:G T G 10 0.529510832924535 0.265852835777356 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 41 53 94 19.2900558500941 28.0640741450004 -8.77401829490629 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0787758932694766 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 22814036 A/G 1 12 9 21 5.64587000490558 4.76559749632082 0.880272508584764 A:G A G 10 0.529510832924535 0.827993527930512 ENSG00000139163:ENST00000381409:exon_22813997_22814139:ETNK1;ENSG00000139163:ENST00000266517:exon_22813997_22814139:ETNK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 25242595 C/G 1 53 42 95 24.9359258549996 22.2394549828305 2.69647087216917 C:G C G 10 0.529510832924535 0.608388408177302 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242548_25242611:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242548_25242611:LRMP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 79 57 136 37.1686441989617 30.1821174766985 6.98652672226323 C:G G C 10 0.529510832924535 0.264059938633785 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 27867706 C/T 1 10 4 14 4.70489167075465 2.11804333169814 2.58684833905651 T:C C T 10 0.529510832924535 0.19016988576375 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 31249861 C/G 1 7 15 22 3.29342416952825 7.94266249386803 -4.64923832433977 C:G C G 10 0.529510832924535 0.05493206250743 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31249793_31249924:DDX11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 31253995 C/T 1 13 9 22 6.11635917198104 4.76559749632082 1.35076167566023 T:C C T 10 0.529510832924535 0.671166937576677 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31253961_31254064:DDX11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 31944985 T/G 0 64 0 64 30.1113066928298 0 30.1113066928298 T T 10 0.529510832924535 2.20875392202634e-18 ENSG00000188375:ENST00000340398:exon_31944119_31945175:H3F3C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 32134943 A/G 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 A:G A G 10 0.529510832924535 0.159283336846293 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 32137447 C/T 1 14 15 29 6.58684833905651 7.94266249386803 -1.35581415481152 T:C C T 10 0.529510832924535 0.71082694647542 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 32137512 C/G 1 16 13 29 7.52782667320744 6.88364082801896 0.644185845188484 C:G C G 10 0.529510832924535 0.854303742578924 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 42554505 A/G 1 48 28 76 22.5834800196223 14.826303321887 7.75717669773534 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0845829675553792 ENSG00000015153:ENST00000327791:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000380790:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000442791:exon_42552837_42554628:YAF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 44148259 T/C 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:C T C 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000129317:ENST00000416848:exon_44148139_44149064:PUS7L;ENSG00000129317:ENST00000344862:exon_44148139_44149064:PUS7L;ENSG00000129317:ENST00000431332:exon_44148139_44149064:PUS7L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 48527186 C/T 1 12 9 21 5.64587000490558 4.76559749632082 0.880272508584764 T:C C T 10 0.529510832924535 0.827993527930512 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48527098_48527263:PFKM HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 37 35 72 17.4080991817922 18.5328791523587 -1.12477997056653 T:G T G 10 0.529510832924535 0.814150305533724 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 51203371 C/T 1 12 8 20 5.64587000490558 4.23608666339628 1.4097833415093 T:C C T 10 0.529510832924535 0.655754725288894 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 51639899 A/G 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000183283:ENST00000425012:exon_51639845_51640501:DAZAP2;ENSG00000170545:ENST00000380103:exon_51639133_51639903:SMAGP;ENSG00000170545:ENST00000398453:exon_51639133_51639903:SMAGP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 14 24 38 6.58684833905651 12.7082599901888 -6.12141165113233 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0515701683725476 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 5 9 14 2.35244583537732 4.76559749632082 -2.41315166094349 A:G G A 10 0.529510832924535 0.28431222286612 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 53682457 G/A 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 53682986 C/T 1 8 6 14 3.76391333660372 3.17706499754721 0.586848339056509 T:C C T 10 0.529510832924535 0.795582240516341 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682874_53683087:ESPL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 54109659 C/T 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 T:C C T 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 15 13 28 7.05733750613197 6.88364082801896 0.173696678113019 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 55355033 C/T 1 24 9 33 11.2917400098112 4.76559749632082 6.52614251349034 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0236592704384707 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55354989_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 55368368 G/A 1 13 3 16 6.11635917198104 1.58853249877361 4.52782667320744 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0247917218023686 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 56151291 T/C 1 140 153 293 65.8684833905651 81.0151574374539 -15.1466740468888 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0792215792430447 ENSG00000205323:ENST00000444631:exon_56151167_56151337:SARNP;ENSG00000205323:ENST00000336133:exon_56151058_56151337:SARNP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 34 29 63 15.9966316805658 15.3558141548115 0.640817525754292 A:G G A 10 0.529510832924535 0.90017253462914 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 56822378 T/A 1 7 8 15 3.29342416952825 4.23608666339628 -0.942662493868026 A:T T A 10 0.529510832924535 0.797047341083576 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 56992630 C/G 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 C:G C G 10 0.529510832924535 0.159283336846293 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 57106660 A/T 1 4210 3786 7996 1980.75939338771 2004.72801345229 -23.9686200645822 A:T:C:G A T 10 0.529510832924535 0.598525991526878 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57106570_57106692:NACA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 57106810 G/A 1 13 7 20 6.11635917198104 3.70657583047175 2.4097833415093 A:G G A 10 0.529510832924535 0.371363290052013 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 2246 2306 4552 1056.71866925149 1221.05198072398 -164.333311472484 A:T:C:G A G 10 0.529510832924535 1.10610410417679e-06 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 38 30 68 17.8785883488677 15.8853249877361 1.99326336113162 T:G T G 10 0.529510832924535 0.715831807391709 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 218 226 444 102.566638422451 119.669448240945 -17.1028098184936 A:G A G 10 0.529510832924535 0.106148223299042 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 58163704 G/A 1 16 16 32 7.52782667320744 8.47217332679256 -0.944346653585121 A:G G A 10 0.529510832924535 0.859808885917593 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58163555_58163739:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58163555_58163739:METTL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 8 2 10 3.76391333660372 1.05902166584907 2.70489167075465 A:T A T 10 0.529510832924535 0.115498370857198 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 64202890 C/G 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 C:G C G 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000118600:ENST00000261234:exon_64202455_64203300:TMEM5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 A:T T A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 22 25 47 10.3507616756602 13.2377708231134 -2.88700914745315 A:G A G 10 0.529510832924535 0.465553137512157 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 66731864 C/A 1 14 5 19 6.58684833905651 2.64755416462268 3.93929417443383 A:C C A 10 0.529510832924535 0.105354482370937 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66731781_66732003:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66731781_66732003:HELB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 75902186 T/C 1 33 25 58 15.5261425134903 13.2377708231134 2.28837169037697 T:C T C 10 0.529510832924535 0.599887463885947 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75902054_75902226:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75902054_75902226:KRR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 80014907 A/T 1 10 5 15 4.70489167075465 2.64755416462268 2.05733750613197 A:T A T 10 0.529510832924535 0.314439025315697 ENSG00000177425:ENST00000328827:exon_80014856_80014987:PAWR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 57 60 117 26.8178825233015 31.7706499754721 -4.9527674521706 C:G C G 10 0.529510832924535 0.404666704228793 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 29 19 48 13.6441858451885 10.0607058255662 3.58348001962232 C:G G C 10 0.529510832924535 0.315294494484327 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 88500847 T/C 1 13 14 27 6.11635917198104 7.41315166094349 -1.29679248896245 T:C T C 10 0.529510832924535 0.701228237889621 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88500773_88500875:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88500773_88500875:CEP290 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 90028901 T/C 1 41 36 77 19.2900558500941 19.0623899852833 0.227665864810803 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000070961:ENST00000428670:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000261173:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000348959:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000359142:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000393164:exon_90028774_90029028:ATP2B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 94729373 G/A 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94729365_94729440:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94729365_94729440:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397807:exon_94729365_94729440:CCDC41 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 95694394 G/A 1 123 77 200 57.8701675502822 40.7723341351892 17.097833415093 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.0159598918415949 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95693941_95696566:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95693941_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95692870_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95693941_95694944:VEZT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 104341015 T/C 1 15 8 23 7.05733750613197 4.23608666339628 2.82125084273569 T:C T C 10 0.529510832924535 0.297861335201159 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 104341398 T/A 1 11 27 38 5.17538083783011 14.2967924889624 -9.12141165113233 A:T T A 10 0.529510832924535 0.00321829821185648 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 104373600 G/A 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 104851127 C/G 1 20 17 37 9.4097833415093 9.0016841597171 0.408099181792204 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000171310:ENST00000303694:exon_104851048_104851307:CHST11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 105380152 A/C 1 22 16 38 10.3507616756602 8.47217332679256 1.87858834886767 A:C A C 10 0.529510832924535 0.626888529069802 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 105440719 C/T 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000136010:ENST00000258494:exon_105440677_105440747:ALDH1L2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 106633569 C/T 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 T:C C T 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 9 21 30 4.23440250367918 11.1197274914152 -6.88532498773605 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0160786150613221 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 108127965 A/G 1 16 8 24 7.52782667320744 4.23608666339628 3.29174000981116 A:G A G 10 0.529510832924535 0.221030946982489 ENSG00000110851:ENST00000228437:exon_108126644_108128299:PRDM4;ENSG00000110851:ENST00000446655:exon_108126644_108128299:PRDM4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 108941679 G/A 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 A:G G A 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108941663_108941767:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108941663_108941767:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108941663_108941767:SART3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 107 113 220 50.3423408770747 59.8347241204725 -9.49238324339771 A:T A T 10 0.529510832924535 0.200305212034396 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 23 12 35 10.8212508427357 6.35412999509442 4.46712084764127 T:G G T 10 0.529510832924535 0.174736495718946 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 110341933 A/G 1 8 19 27 3.76391333660372 10.0607058255662 -6.29679248896245 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0194276351975914 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110341742_110341952:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110341742_110341952:TCHP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 110383141 G/A 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 A:G G A 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000139436:ENST00000338373:exon_110383065_110383154:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000360185:exon_110383065_110383154:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000355312:exon_110383065_110383154:GIT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 110386611 G/A 1 21 12 33 9.88027250858476 6.35412999509442 3.52614251349034 A:G G A 10 0.529510832924535 0.228371025861787 ENSG00000139436:ENST00000320063:exon_110385871_110386651:GIT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 110474070 T/C 1 9 13 22 4.23440250367918 6.88364082801896 -2.64923832433977 T:C T C 10 0.529510832924535 0.290191579780574 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110474066_110474133:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110474066_110474133:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110474066_110474133:ANKRD13A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 110656022 A/G 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000122970:ENST00000242591:exon_110655849_110656590:IFT81;ENSG00000122970:ENST00000439773:exon_110655849_110656590:IFT81 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 110922929 G/T 1 31 24 55 14.5851641793394 12.7082599901888 1.87690418915057 T:G G T 10 0.529510832924535 0.685939712815982 ENSG00000204856:ENST00000377673:exon_110922883_110923004:C12orf24 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 111160003 G/A 1 56 62 118 26.347393356226 32.8296716413212 -6.48227828509513 A:G G A 10 0.529510832924535 0.268380574371453 ENSG00000186298:ENST00000335007:exon_111159940_111160074:PPP1CC;ENSG00000186298:ENST00000340766:exon_111159940_111160074:PPP1CC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 112191641 G/A 1 19 6 25 8.93929417443383 3.17706499754721 5.76222917688662 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0260745492861238 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000512792:exon_112191511_112191719:ACAD10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 112221055 C/T 1 9 5 14 4.23440250367918 2.64755416462268 1.58684833905651 T:C C T 10 0.529510832924535 0.435350095576674 ENSG00000111275:ENST00000261733:exon_112220962_112221102:ALDH2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 112230431 G/T 1 29 16 45 13.6441858451885 8.47217332679256 5.17201251839592 T:G G T 10 0.529510832924535 0.136435292643782 ENSG00000111275:ENST00000261733:exon_112230402_112230586:ALDH2;ENSG00000111275:ENST00000416293:exon_112230402_112230586:ALDH2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 112460147 T/G 1 360 337 697 169.376100147167 178.445150695568 -9.06905054840092 A:T:C:G T G 10 0.529510832924535 0.494845157119198 ENSG00000089248:ENST00000261735:exon_112459954_112461024:ERP29;ENSG00000089248:ENST00000455836:exon_112459954_112461024:ERP29 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 112477055 T/C 1 12 13 25 5.64587000490558 6.88364082801896 -1.23777082311338 T:C T C 10 0.529510832924535 0.690766577028411 ENSG00000111300:ENST00000261745:exon_112477033_112477143:NAA25 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 112580071 C/T 1 11 11 22 5.17538083783011 5.82461916216989 -0.649238324339771 T:C C T 10 0.529510832924535 0.833021301127803 ENSG00000135148:ENST00000257604:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000412615:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000432758:exon_112579893_112580099:TRAFD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 320 224 544 150.556533464149 118.610426575096 31.9461068890529 A:T:G G A 10 0.529510832924535 0.00675954296408902 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 113875765 C/A 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 A:C C A 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000139410:ENST00000345635:exon_113875691_113876080:SDSL;ENSG00000139410:ENST00000403593:exon_113875691_113876080:SDSL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 14 11 25 6.58684833905651 5.82461916216989 0.762229176886623 T:C C T 10 0.529510832924535 0.842602807462717 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 120171995 T/C 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120171969_120172162:CIT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 120884328 C/T 1 15 5 20 7.05733750613197 2.64755416462268 4.4097833415093 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0706446444015717 ENSG00000111780:ENST00000229384:exon_120884284_120884364:GATC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 120966921 A/G 1 30 34 64 14.1146750122639 18.0033683194342 -3.88869330717024 A:G A G 10 0.529510832924535 0.381008382524789 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120966743_120966964:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120966743_120966953:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120966743_120966953:COQ5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 121017171 A/G 1 120 85 205 56.4587000490558 45.0084207985855 11.4502792504703 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.123547746457091 ENSG00000167272:ENST00000357500:exon_121016849_121017215:POP5;ENSG00000167272:ENST00000341039:exon_121016849_121017215:POP5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 13 16 29 6.11635917198104 8.47217332679256 -2.35581415481152 T:C T C 10 0.529510832924535 0.457889314355892 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 22 17 39 10.3507616756602 9.0016841597171 1.34907751594313 A:G G A 10 0.529510832924535 0.74922553917381 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 23 30 53 10.8212508427357 15.8853249877361 -5.06407414500036 T:C C T 10 0.529510832924535 0.171135310822027 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 32 30 62 15.0556533464149 15.8853249877361 -0.829671641321173 C:G G C 10 0.529510832924535 0.898962842083434 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 121454257 T/A 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:T T A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121454133_121454300:C12orf43 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 121458400 C/T 1 32 44 76 15.0556533464149 23.2984766486795 -8.24282330226466 T:C C T 10 0.529510832924535 0.065756966677261 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121458121_121458861:OASL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 11 18 29 5.17538083783011 9.53119499264163 -4.35581415481152 A:G G A 10 0.529510832924535 0.135839017259835 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 49 64 113 23.0539691866978 33.8886933071702 -10.8347241204725 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0474553339807264 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 122618131 A/G 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 A:G A G 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122618129_122618689:MLXIP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 122734569 C/T 1 3 12 15 1.41146750122639 6.35412999509442 -4.94266249386803 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0168091869377073 ENSG00000139719:ENST00000267199:exon_122734418_122734592:VPS33A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 123105143 C/T 1 36 53 89 16.9376100147167 28.0640741450004 -11.1264641302836 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0194095437153697 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000196917:ENST00000356987:exon_123104824_123105249:GPR81 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 124826462 C/T 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 125284748 A/G 1 25 21 46 11.7622291768866 11.1197274914152 0.642501685471387 A:G A G 10 0.529510832924535 0.883537625320194 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125284670_125284788:SCARB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 125298877 G/A 1 9 13 22 4.23440250367918 6.88364082801896 -2.64923832433977 A:G G A 10 0.529510832924535 0.290191579780574 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125298748_125298951:SCARB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 39 42 81 18.3490775159431 22.2394549828305 -3.89037746688734 A:G A G 10 0.529510832924535 0.436169623441378 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 9 11 20 4.23440250367918 5.82461916216989 -1.5902166584907 T:C C T 10 0.529510832924535 0.508807175217642 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 129299385 G/A 1 16 11 27 7.52782667320744 5.82461916216989 1.70320751103755 A:G G A 10 0.529510832924535 0.566839782462308 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129299320_129299615:SLC15A4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 132237750 C/T 1 9 10 19 4.23440250367918 5.29510832924535 -1.06070582556617 T:C C T 10 0.529510832924535 0.65266342372252 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132237668_132237908:SFSWAP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 132250712 G/C 1 39 53 92 18.3490775159431 28.0640741450004 -9.71499662905723 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0470407310703719 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132250663_132250853:SFSWAP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 132635581 C/T 1 23 24 47 10.8212508427357 12.7082599901888 -1.88700914745315 T:C C T 10 0.529510832924535 0.661687005600974 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132635526_132635586:NOC4L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133202004 C/T 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.556631979728114 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 14 20 34 6.58684833905651 10.5902166584907 -4.00336831943419 T:C T C 10 0.529510832924535 0.174339867028717 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133219831 T/C 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 T:C T C 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133219810_133219916:POLE HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133236000 C/T 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 T:C C T 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133235881_133236095:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133235881_133236095:POLE;ENSG00000177084:ENST00000376577:exon_133235881_133236095:POLE HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133306589 C/T 1 65 62 127 30.5817958599052 32.8296716413212 -2.24787578141595 T:C C T 10 0.529510832924535 0.722529884517188 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133306808 C/T 1 36 31 67 16.9376100147167 16.4148358206606 0.522774194056154 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133357412 T/C 1 9 13 22 4.23440250367918 6.88364082801896 -2.64923832433977 T:C T C 10 0.529510832924535 0.290191579780574 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133357384_133357500:GOLGA3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133363006 G/A 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133362925_133363141:GOLGA3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133384864 G/A 1 4 10 14 1.88195666830186 5.29510832924535 -3.41315166094349 A:G G A 10 0.529510832924535 0.105177291482310 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133384477_133385135:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133384477_133385135:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133384477_133385135:GOLGA3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133393323 C/T 1 5 12 17 2.35244583537732 6.35412999509442 -4.0016841597171 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0859595749856374 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133393246_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133393126_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133393126_133393398:GOLGA3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133423695 A/G 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G A G 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133423629_133423716:CHFR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133428242 G/A 1 2 9 11 0.94097833415093 4.76559749632082 -3.82461916216989 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0306516707381973 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133428204_133428323:CHFR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133435716 T/G 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 T:G T G 10 0.529510832924535 0.779088238758133 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133435654_133435813:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133435654_133435813:CHFR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 19 21 40 8.93929417443383 11.1197274914152 -2.1804333169814 T:C T C 10 0.529510832924535 0.528665131795966 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 12 133768553 A/T 1 8 6 14 3.76391333660372 3.17706499754721 0.586848339056509 A:T A T 10 0.529510832924535 0.795582240516341 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133768494_133768589:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133768494_133768589:ZNF268 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 19271676 A/T 0 21 0 21 9.88027250858476 0 9.88027250858476 A A 10 0.529510832924535 1.72281269909499e-06 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 20641084 G/A 1 4 13 17 1.88195666830186 6.88364082801896 -5.0016841597171 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0256522869308762 ENSG00000121741:ENST00000382883:exon_20640991_20641159:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382869:exon_20640991_20641159:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000456228:exon_20640991_20641159:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000418722:exon_20640991_20641159:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382874:exon_20640991_20641159:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382871:exon_20640991_20641159:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382870:exon_20640991_20641159:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000494061:exon_20640718_20641159:ZMYM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 23905711 A/G 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 A:G A G 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 23929842 T/C 1 5 8 13 2.35244583537732 4.23608666339628 -1.88364082801896 T:C T C 10 0.529510832924535 0.406366482999609 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 25029295 C/T 1 1 7 8 0.470489167075465 3.70657583047175 -3.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0301990106165060 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 15 12 27 7.05733750613197 6.35412999509442 0.703207511037554 T:C T C 10 0.529510832924535 0.848752855647907 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 26788114 A/G 1 20 16 36 9.4097833415093 8.47217332679256 0.937610014716739 A:G A G 10 0.529510832924535 0.867767613934243 ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 28008980 C/T 1 256 183 439 120.445226771319 96.9004824251899 23.5447443461291 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0246464753475741 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 28240021 C/T 1 236 191 427 111.03544342981 101.136569088586 9.89887434122353 T:C C T 10 0.529510832924535 0.35705541307967 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 31036642 C/G 1 8 17 25 3.76391333660372 9.0016841597171 -5.23777082311338 C:G C G 10 0.529510832924535 0.044204604125891 ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 32972584 A/G 1 29 18 47 13.6441858451885 9.53119499264163 4.11299085254685 A:G A G 10 0.529510832924535 0.245387810139443 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32972299_32973347:BRCA2;ENSG00000139618:ENST00000533776:exon_32972299_32972585:BRCA2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 34404912 A/G 1 8 10 18 3.76391333660372 5.29510832924535 -1.53119499264163 A:G A G 10 0.529510832924535 0.489195304177666 ENSG00000133119:ENST00000380071:exon_34404856_34404992:RFC3;ENSG00000133119:ENST00000434425:exon_34404856_34404992:RFC3;ENSG00000133119:ENST00000399354:exon_34404856_34404992:RFC3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 41834744 C/T 1 12 6 18 5.64587000490558 3.17706499754721 2.46880500735837 T:C C T 10 0.529510832924535 0.345463610504387 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 37 0 37 17.4080991817922 0 17.4080991817922 G G 10 0.529510832924535 9.33967828301675e-11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 46108854 G/A 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:G G A 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46108837_46110765:COG3;ENSG00000165837:ENST00000504261:exon_46108657_46109001:FAM194B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 46559703 T/C 1 38 32 70 17.8785883488677 16.9443466535851 0.934241695282548 T:C T C 10 0.529510832924535 0.904832285095606 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46559432_46559896:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46559432_46559896:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46559432_46559896:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46559432_46559896:ZC3H13 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 11 11 22 5.17538083783011 5.82461916216989 -0.649238324339771 T:C C T 10 0.529510832924535 0.833021301127803 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 47308109 A/G 1 15 14 29 7.05733750613197 7.41315166094349 -0.355814154811517 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47308056_47308133:LRCH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 151 129 280 71.0438642283952 68.306897447265 2.73696678113019 T:C C T 10 0.529510832924535 0.764889235288009 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 50057097 G/A 1 20 7 27 9.4097833415093 3.70657583047175 5.70320751103755 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0330349372635184 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 50057633 A/G 1 18 7 25 8.46880500735837 3.70657583047175 4.76222917688662 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0704751327099111 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 50080847 A/G 1 29 21 50 13.6441858451885 11.1197274914152 2.52445835377325 A:G A G 10 0.529510832924535 0.571381390842839 ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000496623:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000467763:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000485919:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000442195:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50080771_50080892:PHF11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 226 167 393 106.330551759055 88.4283090983973 17.9022426606577 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0768400476075466 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 50283819 T/C 1 14 15 29 6.58684833905651 7.94266249386803 -1.35581415481152 T:C T C 10 0.529510832924535 0.71082694647542 ENSG00000102753:ENST00000261667:exon_50283708_50283836:KPNA3;ENSG00000102753:ENST00000457886:exon_50283708_50283836:KPNA3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 50296115 C/T 1 7 11 18 3.29342416952825 5.82461916216989 -2.53119499264163 T:C C T 10 0.529510832924535 0.247634630922160 ENSG00000102753:ENST00000261667:exon_50296091_50296260:KPNA3;ENSG00000102753:ENST00000457886:exon_50296091_50296260:KPNA3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 52603194 G/T 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 T:G G T 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 52603241 A/G 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 A:G A G 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 23 17 40 10.8212508427357 9.0016841597171 1.8195666830186 T:C C T 10 0.529510832924535 0.635952191783907 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 40 53 93 18.8195666830186 28.0640741450004 -9.24450746198176 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0613084027522885 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 73343039 C/T 1 13 12 25 6.11635917198104 6.35412999509442 -0.237770823113376 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73342923_73343050:DIS3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 73345991 C/A 1 8 10 18 3.76391333660372 5.29510832924535 -1.53119499264163 A:C C A 10 0.529510832924535 0.489195304177666 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73345933_73346034:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73345933_73346034:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73345933_73346034:DIS3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 8 13 21 3.76391333660372 6.88364082801896 -3.11972749141524 C:G G C 10 0.529510832924535 0.194145459913548 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 76423248 T/C 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 T:C T C 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76423112_76423428:LMO7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 79940811 T/C 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 T:C T C 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 63 43 106 29.6408175257543 22.768965815755 6.87185170999929 A:G G A 10 0.529510832924535 0.205871907501556 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 59 78 137 27.7588608574524 41.3018449681137 -13.5429841106613 T:C C T 10 0.529510832924535 0.020936365102576 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 101287404 G/A 0 8 0 8 3.76391333660372 0 3.76391333660372 G G 10 0.529510832924535 0.00858117377180446 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 111176519 G/T 1 4 8 12 1.88195666830186 4.23608666339628 -2.35412999509442 T:G G T 10 0.529510832924535 0.247834349729258 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 37 35 72 17.4080991817922 18.5328791523587 -1.12477997056653 A:G G A 10 0.529510832924535 0.814150305533724 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 56 47 103 26.347393356226 24.8870091474531 1.46038420877289 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.843641000223177 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 36 46 82 16.9376100147167 24.3574983145286 -7.41988829981187 T:C T C 10 0.529510832924535 0.120957823718966 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 13 113889474 C/T 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 T:C C T 10 0.529510832924535 0.295900852930508 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 20784431 G/A 1 97 114 211 45.6374492063201 60.364234953397 -14.7267857470769 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0454143956249823 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20784386_20784731:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 25 31 56 11.7622291768866 16.4148358206606 -4.65260664377396 T:C T C 10 0.529510832924535 0.229813212179658 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 25 43 68 11.7622291768866 22.768965815755 -11.0067366388684 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0102017863845373 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 20841707 C/T 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 T:C C T 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20841666_20841742:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20841666_20841742:TEP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 21464336 T/C 1 10 15 25 4.70489167075465 7.94266249386803 -3.23777082311338 T:C T C 10 0.529510832924535 0.230939624838663 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 23346025 G/A 1 55 58 113 25.8769041891506 30.711628309623 -4.83472412047246 A:G G A 10 0.529510832924535 0.396633952931096 ENSG00000197324:ENST00000359591:exon_23345898_23346027:LRP10;ENSG00000197324:ENST00000470660:exon_23345926_23346027:LRP10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 15 17 32 7.05733750613197 9.0016841597171 -1.94434665358512 C:G G C 10 0.529510832924535 0.595977363885404 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 23374435 G/A 1 11 13 24 5.17538083783011 6.88364082801896 -1.70825999018884 A:G G A 10 0.529510832924535 0.542854194228007 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374303_23374455:RBM23 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 23374862 C/T 1 18 7 25 8.46880500735837 3.70657583047175 4.76222917688662 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0704751327099111 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374815_23374868:RBM23 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 23746269 C/G 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 23777081 G/A 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000129473:ENST00000250405:exon_23776969_23777408:BCL2L2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 23792215 G/A 1 274 137 411 128.914031778677 72.5429841106613 56.3710476680161 A:G G A 10 0.529510832924535 1.96028275101296e-08 ENSG00000100836:ENST00000216727:exon_23792208_23792275:PABPN1;ENSG00000100836:ENST00000397276:exon_23792208_23792275:PABPN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24033070 C/T 1 4 9 13 1.88195666830186 4.76559749632082 -2.88364082801896 T:C C T 10 0.529510832924535 0.163083153099282 ENSG00000213983:ENST00000465445:exon_24032925_24033430:AP1G2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 32 18 50 15.0556533464149 9.53119499264163 5.52445835377325 A:G A G 10 0.529510832924535 0.121719299471862 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24567508 T/C 1 21 38 59 9.88027250858476 20.1214116511323 -10.2411391425476 T:C T C 10 0.529510832924535 0.00872921681283062 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24567412_24567596:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24567412_24567596:PCK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24569418 A/G 1 66 42 108 31.0522850269807 22.2394549828305 8.81283004415021 A:G A G 10 0.529510832924535 0.101060372703334 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24569204_24569422:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24569204_24569758:PCK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 11 7 18 5.17538083783011 3.70657583047175 1.46880500735837 A:G G A 10 0.529510832924535 0.638208767464486 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24642348 C/T 1 36 15 51 16.9376100147167 7.94266249386803 8.99494752084871 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0115593047316552 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24642335_24642407:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24642335_24642407:REC8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24651561 C/G 0 44 0 44 20.7015233513205 0 20.7015233513205 C C 10 0.529510832924535 9.06285611275464e-13 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24651484_24651609:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24651484_24651609:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24651484_24651609:IPO4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24653523 G/C 1 37 36 73 17.4080991817922 19.0623899852833 -1.65429080349106 C:G G C 10 0.529510832924535 0.726023474800383 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653504_24653624:IPO4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 8 17 25 3.76391333660372 9.0016841597171 -5.23777082311338 A:G G A 10 0.529510832924535 0.044204604125891 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24653965 C/T 1 16 8 24 7.52782667320744 4.23608666339628 3.29174000981116 T:C C T 10 0.529510832924535 0.221030946982489 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24702789 C/T 1 30 21 51 14.1146750122639 11.1197274914152 2.99494752084871 T:C C T 10 0.529510832924535 0.483465186906548 ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24702685_24702804:GMPR2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24705295 T/C 1 37 31 68 17.4080991817922 16.4148358206606 0.993263361131618 T:C T C 10 0.529510832924535 0.903431897728429 ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24705173_24705346:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24705173_24705346:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24705173_24705346:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24705173_24705346:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24705173_24705346:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24705173_24705346:GMPR2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24718515 G/A 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000092295:ENST00000206765:exon_24718322_24718747:TGM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24845841 T/C 1 10 5 15 4.70489167075465 2.64755416462268 2.05733750613197 T:C T C 10 0.529510832924535 0.314439025315697 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24909281 C/T 1 49 77 126 23.0539691866978 40.7723341351892 -17.7183649484914 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00171328069582361 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24909362 T/C 1 59 104 163 27.7588608574524 55.0691266241516 -27.3102657666992 T:C T C 10 0.529510832924535 1.96367257614220e-05 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24909475 C/G 1 58 85 143 27.288371690377 45.0084207985855 -17.7200491082085 C:G C G 10 0.529510832924535 0.00327660767546958 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24910876 G/A 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.730352777445792 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24910973 T/G 1 26 27 53 12.2327183439621 14.2967924889624 -2.06407414500036 T:G T G 10 0.529510832924535 0.584825526424954 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 24910974 T/A 1 26 28 54 12.2327183439621 14.826303321887 -2.59358497792489 A:T T A 10 0.529510832924535 0.4981576455005 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 31359024 A/T 1 44 45 89 20.7015233513205 23.8279874816041 -3.12646413028362 A:T A T 10 0.529510832924535 0.525409550173511 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31358822_31359824:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31358822_31359347:COCH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 31578762 C/T 1 17 24 41 7.9983158402829 12.7082599901888 -4.70994414990594 T:C C T 10 0.529510832924535 0.159893263728009 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 31598248 A/G 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 A:G A G 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31597818_31598654:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31597818_31598654:HECTD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 31647439 T/C 1 7 8 15 3.29342416952825 4.23608666339628 -0.942662493868026 T:C T C 10 0.529510832924535 0.797047341083576 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 33 30 63 15.5261425134903 15.8853249877361 -0.359182474245708 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 19 46 65 8.93929417443383 24.3574983145286 -15.4182041400948 T:C T C 10 0.529510832924535 0.000150783696837042 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 35592538 C/G 1 5 8 13 2.35244583537732 4.23608666339628 -1.88364082801896 C:G C G 10 0.529510832924535 0.406366482999609 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 35735967 A/G 1 35 16 51 16.4671208476413 8.47217332679256 7.99494752084871 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0251892183406159 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35735933_35736081:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35735933_35736081:KIAA0391 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 155 176 331 72.9258208966971 93.1939065947182 -20.2680856980211 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0275414292095602 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 406 461 867 191.018601832639 244.104493978211 -53.0858921455719 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.000348507344620753 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 35873770 G/A 1 167 207 374 78.5716909016027 109.608742415379 -31.0370515137761 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00154477252054531 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35873624_35873952:NFKBIA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 36 31 67 16.9376100147167 16.4148358206606 0.522774194056154 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 45665468 C/G 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 C:G C G 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000187790:ENST00000267430:exon_45665375_45665750:FANCM HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 45696037 T/G 1 22 16 38 10.3507616756602 8.47217332679256 1.87858834886767 T:G T G 10 0.529510832924535 0.626888529069802 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45695946_45696039:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45696029_45696039:C14orf106 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 45711594 T/C 1 8 8 16 3.76391333660372 4.23608666339628 -0.472173326792561 T:C T C 10 0.529510832924535 0.80894998850296 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45711237_45711683:C14orf106 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 50262548 T/G 1 73 59 132 34.3457091965089 31.2411391425476 3.10457005396137 T:G T G 10 0.529510832924535 0.602021351915969 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50262509_50262662:SDCCAG1;ENSG00000165525:ENST00000382135:exon_50262509_50262662:SDCCAG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 51192659 G/A 1 42 40 82 19.7605450171695 21.1804333169814 -1.41988829981187 A:G G A 10 0.529510832924535 0.8250766542072 ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 51223789 C/T 1 14 8 22 6.58684833905651 4.23608666339628 2.35076167566023 T:C C T 10 0.529510832924535 0.394779767186122 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 51224374 T/G 1 10 4 14 4.70489167075465 2.11804333169814 2.58684833905651 T:G T G 10 0.529510832924535 0.19016988576375 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 51227000 A/G 1 55 46 101 25.8769041891506 24.3574983145286 1.51940587462196 A:G A G 10 0.529510832924535 0.842108949265064 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51226575_51227077:NIN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 53325090 C/T 1 8 12 20 3.76391333660372 6.35412999509442 -2.5902166584907 T:C C T 10 0.529510832924535 0.269589908278233 ENSG00000073712:ENST00000341590:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000395631:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000343279:exon_53323993_53325268:FERMT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 55817375 G/T 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 T:G G T 10 0.529510832924535 0.556631979728114 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 60591829 T/C 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 T:C T C 10 0.529510832924535 0.186533779694549 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 60591887 G/A 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 60611648 C/T 1 82 51 133 38.5801117001881 27.0050524791513 11.5750592210368 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0458896731650588 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60610838_60611731:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60611502_60611731:DHRS7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 60616241 G/A 1 101 82 183 47.519405874622 43.4198882998119 4.09951757481009 A:G G A 10 0.529510832924535 0.554480924282276 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60616071_60616286:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60616116_60616286:DHRS7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 64491695 T/C 1 10 6 16 4.70489167075465 3.17706499754721 1.52782667320744 T:C T C 10 0.529510832924535 0.46714284442011 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64491630_64491749:SYNE2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 64519455 A/G 1 4 11 15 1.88195666830186 5.82461916216989 -3.94266249386803 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0666655440918002 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 64519709 A/T 1 22 10 32 10.3507616756602 5.29510832924535 5.05565334641488 A:T A T 10 0.529510832924535 0.078606009497036 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 64656855 T/C 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 T:C T C 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64656789_64656955:SYNE2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 64686125 G/T 1 46 48 94 21.6425016854714 25.4165199803777 -3.77401829490629 T:G G T 10 0.529510832924535 0.470093646271677 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64685926_64686128:SYNE2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 64692155 G/A 1 29 36 65 13.6441858451885 19.0623899852833 -5.41820414009478 A:G G A 10 0.529510832924535 0.213790012250458 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64692037_64693165:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64692037_64693165:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64692037_64693165:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64692037_64693150:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64692037_64693151:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64692037_64693165:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64692037_64693165:SYNE2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 64954683 A/G 1 6 12 18 2.82293500245279 6.35412999509442 -3.53119499264163 A:G A G 10 0.529510832924535 0.103938094519762 ENSG00000089775:ENST00000261683:exon_64953555_64954775:ZBTB25;ENSG00000089775:ENST00000394715:exon_64953557_64954775:ZBTB25 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 64988279 A/G 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 A:G A G 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 64988924 T/C 1 19 16 35 8.93929417443383 8.47217332679256 0.467120847641274 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 65390804 C/T 1 125 102 227 58.8111458844331 54.0101049583026 4.80104092613054 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.549848088683558 ENSG00000125954:ENST00000359118:exon_65390709_65390844:FNTB;ENSG00000125954:ENST00000447296:exon_65390709_65390844:FNTB;ENSG00000125954:ENST00000448390:exon_65390709_65390844:FNTB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 65550947 G/A 1 7 15 22 3.29342416952825 7.94266249386803 -4.64923832433977 A:G G A 10 0.529510832924535 0.05493206250743 ENSG00000125952:ENST00000246163:exon_65550462_65551017:MAX HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 69256886 A/G 1 26 32 58 12.2327183439621 16.9443466535851 -4.71162830962303 A:G A G 10 0.529510832924535 0.23741639335978 ENSG00000185650:ENST00000439696:exon_69254375_69257209:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000336440:exon_69256244_69257209:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000435246:exon_69256691_69257209:ZFP36L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 69257119 G/T 1 33 36 69 15.5261425134903 19.0623899852833 -3.53624747179292 T:G G T 10 0.529510832924535 0.401389573441864 ENSG00000185650:ENST00000439696:exon_69254375_69257209:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000336440:exon_69256244_69257209:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000435246:exon_69256691_69257209:ZFP36L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 71137844 G/T 1 29 29 58 13.6441858451885 15.3558141548115 -1.71162830962303 T:G G T 10 0.529510832924535 0.694164040435948 ENSG00000133985:ENST00000256367:exon_71137793_71142077:TTC9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 72055468 A/C 1 10 6 16 4.70489167075465 3.17706499754721 1.52782667320744 A:C:G A C 10 0.529510832924535 0.46714284442011 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72054288_72056087:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72054288_72056087:SIPA1L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 73422350 T/G 1 8 9 17 3.76391333660372 4.76559749632082 -1.0016841597171 T:G T G 10 0.529510832924535 0.637013022123958 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73422231_73422404:DCAF4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 74036370 G/T 1 12 6 18 5.64587000490558 3.17706499754721 2.46880500735837 T:G G T 10 0.529510832924535 0.345463610504387 ENSG00000119673:ENST00000238651:exon_74035772_74036587:ACOT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 75245368 C/T 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75245150_75245386:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75245150_75245386:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75245150_75245386:YLPM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 75248669 G/T 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:G G T 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75248037_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75248626_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75248626_75249028:YLPM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 75359670 G/A 1 14 6 20 6.58684833905651 3.17706499754721 3.4097833415093 A:G G A 10 0.529510832924535 0.177997080950173 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75359537_75359689:DLST HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 75514266 T/C 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 13 7 20 6.11635917198104 3.70657583047175 2.4097833415093 A:G A G 10 0.529510832924535 0.371363290052013 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 9 6 15 4.23440250367918 3.17706499754721 1.05733750613197 T:C T C 10 0.529510832924535 0.61671670096814 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 24 19 43 11.2917400098112 10.0607058255662 1.23103418424499 A:G G A 10 0.529510832924535 0.761326844638213 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 78184566 C/A 1 106 95 201 49.8718517099993 50.3035291278308 -0.431677417831544 A:T:C C A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78183946_78184629:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78183946_78184629:SNW1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 74 84 158 34.8161983635844 44.4789099656609 -9.66271160207654 T:C C T 10 0.529510832924535 0.130242982063908 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 91883129 G/A 1 11 9 20 5.17538083783011 4.76559749632082 0.409783341509299 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91883082_91883182:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000389856:exon_91883082_91883182:CCDC88C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 92251587 A/G 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 A:G A G 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000165929:ENST00000340892:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000435962:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000360594:exon_92251506_92251705:TC2N;ENSG00000165929:ENST00000416692:exon_92251506_92251705:TC2N HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 3 15 18 1.41146750122639 7.94266249386803 -6.53119499264163 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00323441148744634 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 92548785 C/T 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 T:C C T 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 92549586 G/A 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:G G A 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92549470_92549602:ATXN3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 809 558 1367 380.625736164051 295.467044771891 85.1586913921606 T:C:G T G 10 0.529510832924535 3.99710545387658e-06 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 19 15 34 8.93929417443383 7.94266249386803 0.996631680565809 A:G G A 10 0.529510832924535 0.863935342116717 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 93118674 G/A 1 17 18 35 7.9983158402829 9.53119499264163 -1.53287915235873 A:G G A 10 0.529510832924535 0.615985907778022 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 93199080 C/T 1 20 18 38 9.4097833415093 9.53119499264163 -0.12141165113233 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93198994_93199160:LGMN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 93276654 T/C 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93276599_93276722:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93276599_93276722:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93276599_93276722:GOLGA5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 102508056 C/A 1 13 12 25 6.11635917198104 6.35412999509442 -0.237770823113376 A:C C A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102507911_102508071:DYNC1H1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 102675401 C/A 1 4 8 12 1.88195666830186 4.23608666339628 -2.35412999509442 A:C C A 10 0.529510832924535 0.247834349729258 ENSG00000140153:ENST00000335263:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000454394:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000342702:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000299135:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000401892:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000424963:exon_102674936_102676863:WDR20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 103986255 C/T 1 46 21 67 21.6425016854714 11.1197274914152 10.5227741940562 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0100754833636671 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103985996_103986379:CKB;ENSG00000166165:ENST00000428256:exon_103985996_103986379:CKB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 103988180 G/T 1 11 1 12 5.17538083783011 0.529510832924535 4.64587000490558 T:G G T 10 0.529510832924535 0.00737270813879148 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103988155_103988287:CKB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 104165753 G/A 1 11 19 30 5.17538083783011 10.0607058255662 -4.88532498773605 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0984062165532483 ENSG00000126215:ENST00000445556:exon_104165701_104165913:XRCC3;ENSG00000126215:ENST00000352127:exon_104165701_104165913:XRCC3;ENSG00000126215:ENST00000440302:exon_104165701_104165913:XRCC3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 104167075 C/T 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 T:C C T 10 0.529510832924535 0.779088238758133 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/C 0 0 28 28 0 14.826303321887 -14.826303321887 C A C 10 0.529510832924535 6.78249673282141e-10 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 105930406 G/A 1 26 22 48 12.2327183439621 11.6492383243398 0.583480019622318 A:G G A 10 0.529510832924535 0.886163543227794 ENSG00000182979:ENST00000435036:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930369_105930484:MTA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 106110966 C/T 0 62 0 62 29.1703283586788 0 29.1703283586788 C C 10 0.529510832924535 7.94314239148022e-18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 106306841 C/T 1 184 166 350 86.5700067418855 87.8987982654728 -1.32879152358727 T:C C T 10 0.529510832924535 0.914746201523589 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 106307418 G/A 1 161 139 300 75.7487558991499 73.6020057765104 2.14675012263949 A:T:G G A 10 0.529510832924535 0.817270007853952 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 106321663 T/C 1 2463 2137 4600 1158.81481850687 1131.56464995973 27.2501685471386 T:C:G T C 10 0.529510832924535 0.425134004271531 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 106321913 G/A 1 2394 2210 4604 1126.35106597866 1170.21894076322 -43.8678747845593 A:T:C:G G A 10 0.529510832924535 0.198989998172227 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 106330070 G/A 0 22 2 24 10.3507616756602 1.05902166584907 9.29174000981116 C:G G C 10 0.529510832924535 0.000101868077198805 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 106385332 G/C 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 C:G G C 10 0.529510832924535 0.295900852930508 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 106667810 C/A 0 618 0 618 290.762305252637 0 290.762305252637 C C 10 0.529510832924535 2.38565110446254e-171 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 14 107078567 T/C 0 0 20 20 0 10.5902166584907 -10.5902166584907 G T G 10 0.529510832924535 2.82483162453948e-07 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 25 24 49 11.7622291768866 12.7082599901888 -0.946030813302217 T:C C T 10 0.529510832924535 0.886399837881199 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 23049045 C/T 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 T:C C T 10 0.529510832924535 0.129310521443327 ENSG00000170113:ENST00000337435:exon_23043277_23049340:NIPA1;ENSG00000170113:ENST00000437912:exon_23043279_23049340:NIPA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 14 11 25 6.58684833905651 5.82461916216989 0.762229176886623 A:G G A 10 0.529510832924535 0.842602807462717 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 40327290 A/G 1 54 56 110 25.4064150220751 29.652606643774 -4.24619162169886 A:G A G 10 0.529510832924535 0.445386389455871 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 59 60 119 27.7588608574524 31.7706499754721 -4.01178911801967 A:G G A 10 0.529510832924535 0.464318509921038 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 40330564 C/T 1 293 259 552 137.853325953111 137.143305727455 0.710020225656649 T:C C T 10 0.529510832924535 0.96600843526832 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 40849408 C/T 1 17 13 30 7.9983158402829 6.88364082801896 1.11467501226395 T:C C T 10 0.529510832924535 0.718250953485475 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 41611874 G/A 1 11 4 15 5.17538083783011 2.11804333169814 3.05733750613197 A:G G A 10 0.529510832924535 0.128035315987776 ENSG00000104147:ENST00000220514:exon_41611856_41611978:OIP5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 41688801 T/G 1 62 44 106 29.1703283586788 23.2984766486795 5.87185170999928 T:G T G 10 0.529510832924535 0.284631877839369 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/T 1 9 6 15 4.23440250367918 3.17706499754721 1.05733750613197 T:C C T 10 0.529510832924535 0.61671670096814 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 41819696 T/C 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 T:C T C 10 0.529510832924535 0.129310521443327 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41819621_41819803:RPAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 41829230 A/G 1 9 4 13 4.23440250367918 2.11804333169814 2.11635917198104 A:G A G 10 0.529510832924535 0.277734246411223 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41829143_41829399:RPAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 42453963 T/C 1 27 22 49 12.7032075110376 11.6492383243398 1.05396918669778 T:C T C 10 0.529510832924535 0.777050580933311 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42453880_42453971:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42453880_42453971:VPS39 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 43017426 T/G 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:G T G 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43017342_43017449:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43017342_43017449:CDAN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 43020983 G/A 1 5 11 16 2.35244583537732 5.82461916216989 -3.47217332679256 A:G G A 10 0.529510832924535 0.130420532691613 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43020850_43021008:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43020850_43021008:CDAN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 43023482 T/C 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43023409_43023529:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43023409_43023529:CDAN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 43621947 A/G 1 7 1 8 3.29342416952825 0.529510832924535 2.76391333660372 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0741292491828888 ENSG00000168806:ENST00000305641:exon_43619976_43622891:LCMT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 43632549 T/C 1 11 4 15 5.17538083783011 2.11804333169814 3.05733750613197 T:C T C 10 0.529510832924535 0.128035315987776 ENSG00000168803:ENST00000428046:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000422466:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000389651:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000305605:exon_43632463_43632550:ADAL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 43661802 T/C 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 T:C T C 10 0.529510832924535 0.186533779694549 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43661794_43662246:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43661794_43662258:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43661794_43662258:ZSCAN29 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 43724646 T/G 1 8 15 23 3.76391333660372 7.94266249386803 -4.17874915726431 T:G T G 10 0.529510832924535 0.095514454463493 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43724392_43724875:TP53BP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 43748304 A/G 1 11 4 15 5.17538083783011 2.11804333169814 3.05733750613197 A:G A G 10 0.529510832924535 0.128035315987776 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43748090_43748529:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000480860:exon_43748090_43748350:TP53BP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 42 96 138 19.7605450171695 50.8330399607554 -31.0724949435858 T:C C T 10 0.529510832924535 1.23907799032212e-07 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 104 153 257 48.9308733758484 81.0151574374539 -32.0842840616055 T:C C T 10 0.529510832924535 7.6332929408613e-05 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 277 266 543 130.325499279904 140.849881557926 -10.5243822780225 T:C T C 10 0.529510832924535 0.367025536272229 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 43 45 88 20.231034184245 23.8279874816041 -3.59695329735908 A:C A C 10 0.529510832924535 0.456414997873604 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 A:T A T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 45706862 G/A 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 A:G G A 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45706769_45706978:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45706769_45706978:SPATA5L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 49054772 C/A 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 A:C C A 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49054588_49054869:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49054588_49054869:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49054588_49054869:CEP152 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 50867082 G/A 1 10 6 16 4.70489167075465 3.17706499754721 1.52782667320744 A:G G A 10 0.529510832924535 0.46714284442011 ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50867049_50867332:TRPM7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 7 11 18 3.29342416952825 5.82461916216989 -2.53119499264163 A:G A G 10 0.529510832924535 0.247634630922160 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 55652719 A/G 1 43 57 100 20.231034184245 30.1821174766985 -9.9510832924535 A:G A G 10 0.529510832924535 0.056464159372822 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 55652845 A/G 1 36 21 57 16.9376100147167 11.1197274914152 5.8178825233015 A:G A G 10 0.529510832924535 0.144267062696069 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 20 18 38 9.4097833415093 9.53119499264163 -0.12141165113233 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 56739063 C/T 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000138587:ENST00000260453:exon_56739039_56739141:MNS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 63433785 G/A 1 83 59 142 39.0506008672636 31.2411391425476 7.80946172471602 A:G G A 10 0.529510832924535 0.207428021229081 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 63597857 T/G 1 15 16 31 7.05733750613197 8.47217332679256 -1.41483582066059 T:G T G 10 0.529510832924535 0.719675534707041 ENSG00000138613:ENST00000380343:exon_63597813_63601324:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000261879:exon_63597813_63601325:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000380340:exon_63597813_63598754:APH1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 65255898 G/A 1 66 61 127 31.0522850269807 32.3001608083966 -1.24787578141595 A:G G A 10 0.529510832924535 0.859092107435612 ENSG00000090487:ENST00000204566:exon_65255362_65256077:SPG21;ENSG00000090487:ENST00000416889:exon_65255364_65256077:SPG21;ENSG00000090487:ENST00000433215:exon_65255364_65256077:SPG21 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 68506670 G/C 1 13 12 25 6.11635917198104 6.35412999509442 -0.237770823113376 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000128973:ENST00000249806:exon_68506628_68506726:CLN6;ENSG00000128973:ENST00000418702:exon_68506628_68506726:CLN6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 69728949 A/G 1 8 12 20 3.76391333660372 6.35412999509442 -2.5902166584907 A:G A G 10 0.529510832924535 0.269589908278233 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728903_69729061:KIF23 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 69732736 C/T 1 19 10 29 8.93929417443383 5.29510832924535 3.64418584518848 T:C C T 10 0.529510832924535 0.196206016705251 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 72511415 G/A 1 541 583 1124 254.534639387827 308.704815595004 -54.1701762071774 A:T:G G A 10 0.529510832924535 0.00124517165345126 ENSG00000067225:ENST00000319622:exon_72511285_72511451:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000335181:exon_72511285_72511451:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000419739:exon_72511285_72511451:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000449901:exon_72511285_72511451:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000438234:exon_72511285_72511451:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000327974:exon_72511320_72511438:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000434220:exon_72511285_72511451:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000389093:exon_72511285_72511451:PKM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 73027478 T/C 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 T:C T C 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000140463:ENST00000268057:exon_73027454_73027523:BBS4;ENSG00000140463:ENST00000395205:exon_73027454_73027523:BBS4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 73047912 G/T 1 11 8 19 5.17538083783011 4.23608666339628 0.939294174433834 T:G G T 10 0.529510832924535 0.81917282175653 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73047897_73047995:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73047897_73047995:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000456471:exon_73047897_73047995:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73047897_73047995:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73047897_73047995:ADPGK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 73052840 T/C 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C T C 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 73052845 A/G 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 48 42 90 22.5834800196223 22.2394549828305 0.344025036791844 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 74836815 G/A 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000179361:ENST00000346246:exon_74836201_74836829:ARID3B;ENSG00000179361:ENST00000395077:exon_74836201_74836829:ARID3B;ENSG00000179361:ENST00000382537:exon_74836201_74836829:ARID3B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 75091247 C/T 1 217 164 381 102.096149255376 86.8397765996237 15.2563726557521 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.12365989224797 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75091167_75091279:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75091167_75091279:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75091167_75091279:CSK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 75091664 G/A 1 187 195 382 87.9814742431119 103.254612420284 -15.2731381771724 A:G G A 10 0.529510832924535 0.124125728604756 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75091613_75091832:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75091613_75091832:CSK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 326 293 619 153.379468466602 155.146674046889 -1.7672055802872 T:C C T 10 0.529510832924535 0.903882132527995 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 75189556 C/T 1 20 20 40 9.4097833415093 10.5902166584907 -1.1804333169814 T:C C T 10 0.529510832924535 0.752871272158077 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189352_75189560:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189352_75189560:MPI HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 75189930 A/G 1 56 55 111 26.347393356226 29.1230958108494 -2.77570245462339 A:G A G 10 0.529510832924535 0.634928866835933 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189853_75191798:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189853_75190569:MPI HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 75498580 C/T 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.556631979728114 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 75501158 C/T 1 59 51 110 27.7588608574524 27.0050524791513 0.753808378301144 T:C:G C T 10 0.529510832924535 0.924068914459585 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000446981:exon_75500022_75501217:C15orf39 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 75648617 G/A 0 12 0 12 5.64587000490558 0 5.64587000490558 G G 10 0.529510832924535 0.00060349648793141 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 75932172 G/A 1 56 68 124 26.347393356226 36.0067366388684 -9.65934328264235 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0875880986728384 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 76578762 G/A 1 83 69 152 39.0506008672636 36.5362474717929 2.51435339547067 A:G G A 10 0.529510832924535 0.745294575473712 ENSG00000140374:ENST00000267950:exon_76578712_76578822:ETFA;ENSG00000140374:ENST00000433983:exon_76578712_76578822:ETFA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 76726465 G/T 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 T:G G T 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000140386:ENST00000324767:exon_76726419_76726651:SCAPER;ENSG00000140386:ENST00000303521:exon_76726419_76726651:SCAPER HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 78441769 T/C 1 10 7 17 4.70489167075465 3.70657583047175 0.998315840282904 T:C T C 10 0.529510832924535 0.808990208344625 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78441663_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78441719_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000379576:exon_78441720_78441772:IDH3A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 79187225 A/G 1 9 113 122 4.23440250367918 59.8347241204725 -55.6003216167933 A:G A G 10 0.529510832924535 5.43951158896267e-27 ENSG00000185787:ENST00000379535:exon_79187162_79187246:MORF4L1;ENSG00000185787:ENST00000426013:exon_79187162_79187246:MORF4L1;ENSG00000185787:ENST00000331268:exon_79187162_79187246:MORF4L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 79215311 A/C 1 9 12 21 4.23440250367918 6.35412999509442 -2.11972749141524 A:C A C 10 0.529510832924535 0.388145875482006 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 79237247 C/G 1 105 80 185 49.4013625429238 42.3608666339628 7.04049590896102 C:G C G 10 0.529510832924535 0.303678876322394 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79237233_79237433:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79237233_79237260:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79237233_79237256:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79237233_79237404:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79237233_79237388:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79237120_79237436:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79237233_79237388:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000530010:exon_79237233_79237340:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534268:exon_79236880_79237363:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528436:exon_79237233_79237384:CTSH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 79237324 C/A 1 63 56 119 29.6408175257543 29.652606643774 -0.0117891180196708 A:C C A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79237233_79237433:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79237293_79237420:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79237233_79237404:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79237233_79237388:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79237120_79237436:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79237233_79237388:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000530010:exon_79237233_79237340:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534268:exon_79236880_79237363:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528436:exon_79237233_79237384:CTSH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 38 81 119 17.8785883488677 42.8903774668873 -25.0117891180197 T:C T C 10 0.529510832924535 5.0594895350841e-06 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 80263217 C/T 1 278 251 529 130.795988446979 132.907219064058 -2.11123061707903 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.86178282070535 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 177 198 375 83.2765825723573 104.843144919058 -21.5665623467006 A:C:G A C 10 0.529510832924535 0.0261542702025095 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 130 129 259 61.1635917198104 68.306897447265 -7.14330572745457 T:C C T 10 0.529510832924535 0.383962911141363 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 81294774 G/C 1 10 9 19 4.70489167075465 4.76559749632082 -0.0607058255661652 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000140406:ENST00000267984:exon_81293295_81296342:MESDC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 82443939 G/A 1 23 16 39 10.8212508427357 8.47217332679256 2.34907751594313 A:G G A 10 0.529510832924535 0.522318756140582 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 82444437 A/G 1 16 15 31 7.52782667320744 7.94266249386803 -0.414835820660587 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 82444663 T/C 1 15 11 26 7.05733750613197 5.82461916216989 1.23271834396209 T:C T C 10 0.529510832924535 0.697111831856919 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 82456227 T/C 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82456194_82456325:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82456194_82456325:EFTUD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 83502065 A/C 1 14 10 24 6.58684833905651 5.29510832924535 1.29174000981116 A:C A C 10 0.529510832924535 0.684850962838789 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83501981_83503613:WHAMM HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 83502066 C/G 1 14 10 24 6.58684833905651 5.29510832924535 1.29174000981116 C:G C G 10 0.529510832924535 0.684850962838789 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83501981_83503613:WHAMM HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 86125304 C/T 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 T:C C T 10 0.529510832924535 0.186533779694549 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 16 15 31 7.52782667320744 7.94266249386803 -0.414835820660587 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 760 643 1403 357.571766977353 340.475465570476 17.0963014068773 A:T:G A G 10 0.529510832924535 0.363319578890423 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 696 525 1221 327.460460284524 277.993187285381 49.4672729991427 A:T:C:G A G 10 0.529510832924535 0.00453354225316329 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 89862237 C/T 1 38 33 71 17.8785883488677 17.4738574865097 0.404730862358011 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000140521:ENST00000268124:exon_89862162_89862330:POLG;ENSG00000140521:ENST00000442287:exon_89862162_89862330:POLG;ENSG00000140521:ENST00000530292:exon_89862162_89862330:POLG HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 90168873 T/C 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 90617539 C/T 1 11 6 17 5.17538083783011 3.17706499754721 1.9983158402829 T:C C T 10 0.529510832924535 0.467294043415163 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 90623052 T/C 1 4 10 14 1.88195666830186 5.29510832924535 -3.41315166094349 T:C T C 10 0.529510832924535 0.105177291482310 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90622892_90625432:ZNF710 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 90814664 C/T 1 56 66 122 26.347393356226 34.9477149730193 -8.60032161679328 T:C C T 10 0.529510832924535 0.123722918111903 ENSG00000182768:ENST00000331497:exon_90814420_90816463:NGRN;ENSG00000182768:ENST00000379095:exon_90814420_90815440:NGRN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 100269635 G/C 1 16 5 21 7.52782667320744 2.64755416462268 4.88027250858476 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0467329952614361 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 100269737 G/A 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 A:G G A 10 0.529510832924535 0.779088238758133 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000484050:exon_100269703_100269936:LYSMD4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 100269749 G/A 1 10 4 14 4.70489167075465 2.11804333169814 2.58684833905651 A:G G A 10 0.529510832924535 0.19016988576375 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000484050:exon_100269703_100269936:LYSMD4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 101569467 T/C 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 0.159283336846293 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 101598200 G/A 1 8 3 11 3.76391333660372 1.58853249877361 2.17538083783011 A:G G A 10 0.529510832924535 0.235512259698034 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.556631979728114 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 15 102224341 G/A 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 129654 C/T 1 79 83 162 37.1686441989617 43.9493991327364 -6.78075493377468 T:C C T 10 0.529510832924535 0.306457581129681 ENSG00000103152:ENST00000436333:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397817:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000356432:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000428050:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000475280:exon_129424_129843:MPG;ENSG00000103152:ENST00000219431:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397818:exon_129424_129699:MPG HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 180529 G/A 1 13 9 22 6.11635917198104 4.76559749632082 1.35076167566023 A:G G A 10 0.529510832924535 0.671166937576677 ENSG00000103148:ENST00000405960:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000445810:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000428323:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399957:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399953:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000262313:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399951:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000457916:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000468260:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000456528:exon_180521_180590:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000419636:exon_180521_180590:NPRL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 304514 C/T 1 10 3 13 4.70489167075465 1.58853249877361 3.11635917198104 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0995863157160923 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000419173:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000426695:exon_304328_304564:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000438220:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000447499:exon_304380_304673:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000453430:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000449945:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420046:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420500:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000417499:exon_304328_304618:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000496874:exon_304121_304680:ITFG3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 419154 G/A 1 144 106 250 67.750440058867 56.1281482900007 11.6222917688662 A:G G A 10 0.529510832924535 0.145394057716487 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 420140 G/A 1 159 114 273 74.8077775649989 60.364234953397 14.4435426116019 A:G G A 10 0.529510832924535 0.08940541432065 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 424277 G/A 1 11 11 22 5.17538083783011 5.82461916216989 -0.649238324339771 A:G G A 10 0.529510832924535 0.833021301127803 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 601632 T/C 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 T:C T C 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_601512_601664:SOLH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 602313 C/A 1 21 10 31 9.88027250858476 5.29510832924535 4.58516417933941 A:C C A 10 0.529510832924535 0.107859965484981 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 735921 T/C 1 15 17 32 7.05733750613197 9.0016841597171 -1.94434665358512 T:C T C 10 0.529510832924535 0.595977363885404 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735869_735990:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735869_735990:WDR24 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 772141 G/C 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 C:G G C 10 0.529510832924535 0.352283066981699 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 774520 C/T 1 16 17 33 7.52782667320744 9.0016841597171 -1.47385748650966 T:C C T 10 0.529510832924535 0.606947069732728 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482152:exon_774322_774635:CCDC78 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 774692 A/G 1 9 18 27 4.23440250367918 9.53119499264163 -5.29679248896245 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0526074098364202 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 778820 G/A 1 27 34 61 12.7032075110376 18.0033683194342 -5.30016080839664 A:G G A 10 0.529510832924535 0.199746023307792 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_778794_779715:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_778794_778868:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_778794_778895:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_778794_779168:HAGHL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 50 43 93 23.5244583537732 22.768965815755 0.755492538018242 A:G A G 10 0.529510832924535 0.917473198357387 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 781633 G/A 1 8 8 16 3.76391333660372 4.23608666339628 -0.472173326792561 A:G G A 10 0.529510832924535 0.80894998850296 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_781565_781702:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_781565_781702:NARFL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 837116 C/G 1 18 16 34 8.46880500735837 8.47217332679256 -0.00336831943419114 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_837077_837179:RPUSD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 904551 G/C 1 13 5 18 6.11635917198104 2.64755416462268 3.46880500735837 C:G G C 10 0.529510832924535 0.154754113990996 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_903638_904706:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_903638_904706:LMF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 1374818 A/G 1 209 186 395 98.3322359187722 98.4890149239635 -0.156779005191353 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1374731_1375351:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1374731_1375215:UBE2I HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 23 15 38 10.8212508427357 7.94266249386803 2.87858834886767 A:G A G 10 0.529510832924535 0.417373527175481 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 119 111 230 55.9882108819803 58.7757024546234 -2.78749157264306 A:T T A 10 0.529510832924535 0.741352303817189 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 1826113 G/A 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000197774:ENST00000454910:exon_1826069_1826116:EME2;ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1826069_1830628:EME2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 1838640 T/C 1 57 54 111 26.8178825233015 28.5935849779249 -1.77570245462339 T:C T C 10 0.529510832924535 0.775757117357377 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 1877494 T/C 1 32 27 59 15.0556533464149 14.2967924889624 0.758860857452433 T:C T C 10 0.529510832924535 0.896635612547144 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 1877558 G/A 1 28 37 65 13.173696678113 19.5919008182078 -6.41820414009478 A:G G A 10 0.529510832924535 0.135402576288870 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2014424 C/G 1 4 15 19 1.88195666830186 7.94266249386803 -6.06070582556617 C:G C G 10 0.529510832924535 0.00557338074892173 ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2014591 C/T 1 1688 974 2662 794.185714023385 515.743551268497 278.442162754888 T:C:G C T 10 0.529510832924535 1.25312761064359e-27 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 16 16 32 7.52782667320744 8.47217332679256 -0.944346653585121 A:C A C 10 0.529510832924535 0.859808885917593 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2025604 G/C 1 21 21 42 9.88027250858476 11.1197274914152 -1.23945498283047 C:G G C 10 0.529510832924535 0.758233996771047 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2025678 C/A 1 19 18 37 8.93929417443383 9.53119499264163 -0.591900818207796 A:C C A 10 0.529510832924535 0.870465810362237 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 164 142 306 77.1602234003763 75.190538275284 1.96968512509228 T:C T C 10 0.529510832924535 0.863634767669498 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2042650 C/A 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:C C A 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000127561:ENST00000248121:exon_2042637_2042779:SYNGR3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2048796 C/T 1 43 41 84 20.231034184245 21.7099441499059 -1.47890996566094 T:C C T 10 0.529510832924535 0.744630037149507 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2049728 C/T 1 31 36 67 14.5851641793394 19.0623899852833 -4.47722580594385 T:C C T 10 0.529510832924535 0.327576356312965 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2049849 T/C 1 19 28 47 8.93929417443383 14.826303321887 -5.88700914745315 T:C T C 10 0.529510832924535 0.107160835199849 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2050192 G/T 1 13 27 40 6.11635917198104 14.2967924889624 -8.1804333169814 T:G G T 10 0.529510832924535 0.0108430071674951 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2051638 C/T 1 22 28 50 10.3507616756602 14.826303321887 -4.47554164622675 T:C C T 10 0.529510832924535 0.256848957041371 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2051584_2051701:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2051584_2051701:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2051593_2051701:ZNF598 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2285357 C/T 1 52 41 93 24.4654366879242 21.7099441499059 2.75549253801824 T:C C T 10 0.529510832924535 0.60430452124214 ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2313343 C/T 1 22 6 28 10.3507616756602 3.17706499754721 7.17369667811302 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00723782097851174 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2809122 C/T 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 T:C C T 10 0.529510832924535 0.779088238758133 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2813626 C/G 1 29 29 58 13.6441858451885 15.3558141548115 -1.71162830962303 C:G C G 10 0.529510832924535 0.694164040435948 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 2821573 C/T 1 8 11 19 3.76391333660372 5.82461916216989 -2.06070582556617 T:C C T 10 0.529510832924535 0.367060340223589 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 3339435 G/C 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 C:G G C 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000006194:ENST00000219069:exon_3339393_3341460:ZNF263 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 3367229 T/C 1 18 8 26 8.46880500735837 4.23608666339628 4.23271834396209 T:C T C 10 0.529510832924535 0.116418578208414 ENSG00000162086:ENST00000293995:exon_3367190_3368574:ZNF75A;ENSG00000162086:ENST00000498240:exon_3367190_3368574:ZNF75A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 18 9 27 8.46880500735837 4.76559749632082 3.70320751103755 C:G C G 10 0.529510832924535 0.179182503083520 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 80 85 165 37.6391333660372 45.0084207985855 -7.36928743254828 C:G G C 10 0.529510832924535 0.274945603500634 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 3778337 G/A 1 13 10 23 6.11635917198104 5.29510832924535 0.821250842735695 A:G G A 10 0.529510832924535 0.835734692191848 ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3775055_3779875:CREBBP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 12 13 25 5.64587000490558 6.88364082801896 -1.23777082311338 T:C C T 10 0.529510832924535 0.690766577028411 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 4476085 G/A 1 19 1 20 8.93929417443383 0.529510832924535 8.4097833415093 A:G G A 10 0.529510832924535 6.30017518093815e-05 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 4511926 G/A 1 211 198 409 99.2732142529231 104.843144919058 -5.56993066613482 A:G G A 10 0.529510832924535 0.586198124855749 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4511695_4511960:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4511696_4511960:NMRAL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 4855279 A/G 1 54 39 93 25.4064150220751 20.6509224840569 4.75549253801824 A:G A G 10 0.529510832924535 0.350632176310458 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4853204_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4855102_4855311:GLYR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 4930100 C/T 1 4 9 13 1.88195666830186 4.76559749632082 -2.88364082801896 T:C C T 10 0.529510832924535 0.163083153099282 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4930084_4932361:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4930084_4932361:UBN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 5132636 C/T 1 4 8 12 1.88195666830186 4.23608666339628 -2.35412999509442 T:C C T 10 0.529510832924535 0.247834349729258 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5132560_5132674:ALG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 8729124 G/A 1 7 10 17 3.29342416952825 5.29510832924535 -2.0016841597171 A:G G A 10 0.529510832924535 0.344125043526582 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 8952196 C/T 0 22 0 22 10.3507616756602 0 10.3507616756602 C C 10 0.529510832924535 9.04403696964151e-07 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 137 119 256 64.4570158893387 63.0117891180197 1.44522677131902 A:G A G 10 0.529510832924535 0.900387721761442 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 11001743 G/A 1 12 17 29 5.64587000490558 9.0016841597171 -3.35581415481152 A:G G A 10 0.529510832924535 0.264593278715465 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 11017058 G/A 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 A:G G A 10 0.529510832924535 0.556631979728114 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 11769948 C/T 1 8 12 20 3.76391333660372 6.35412999509442 -2.5902166584907 T:C C T 10 0.529510832924535 0.269589908278233 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 9 15 24 4.23440250367918 7.94266249386803 -3.70825999018884 T:C C T 10 0.529510832924535 0.153584329941182 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 11933678 G/C 1 492 509 1001 231.480670201129 269.521013958588 -38.0403437574596 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0161218350867268 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11933552_11933842:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11933552_11933842:RSL1D1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 64 74 138 30.1113066928298 39.1838016364156 -9.07249494358584 C:G G C 10 0.529510832924535 0.125460674914943 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 11981487 G/A 1 29 25 54 13.6441858451885 13.2377708231134 0.406415022075107 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11981427_11981607:GSPT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 12009277 C/A 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:C C A 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_12009226_12009762:GSPT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 12009304 C/A 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 A:C C A 10 0.529510832924535 0.129310521443327 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_12009226_12009762:GSPT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 12061626 G/A 1 326 398 724 153.379468466602 210.745311503965 -57.3658430373634 A:C:G G A 10 0.529510832924535 2.12213474152299e-05 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 12162969 A/G 1 11 15 26 5.17538083783011 7.94266249386803 -2.76728165603791 A:G A G 10 0.529510832924535 0.327727272541139 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12162914_12162989:SNX29;ENSG00000048471:ENST00000323433:exon_12162914_12162989:SNX29 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 12662420 C/T 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12662363_12668145:SNX29 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 12897578 G/T 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:G G T 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12897564_12897744:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12897564_12897744:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12897564_12897728:CPPED1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 11 4 15 5.17538083783011 2.11804333169814 3.05733750613197 A:C C A 10 0.529510832924535 0.128035315987776 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 15098047 C/G 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 C:G C G 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15098044_15098190:PDXDC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 15116625 G/T 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 T:G G T 10 0.529510832924535 0.531350440107521 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 15129970 A/G 1 14 32 46 6.58684833905651 16.9443466535851 -10.3574983145286 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0027642142426138 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 15131962 A/G 1 120 102 222 56.4587000490558 54.0101049583026 2.44859509075322 A:G A G 10 0.529510832924535 0.788066088194904 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 15131974 G/T 1 116 86 202 54.5767433807539 45.53793163151 9.03881174924392 T:G G T 10 0.529510832924535 0.205450906624627 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 15133889 T/G 1 40 31 71 18.8195666830186 16.4148358206606 2.40473086235802 T:G T G 10 0.529510832924535 0.634854441912491 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 18908268 C/T 1 8 8 16 3.76391333660372 4.23608666339628 -0.472173326792561 T:C C T 10 0.529510832924535 0.80894998850296 ENSG00000157106:ENST00000446231:exon_18908115_18908278:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000389467:exon_18908115_18908278:SMG1;ENSG00000157106:ENST00000532700:exon_18908115_18908278:SMG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 19680546 T/C 1 14 6 20 6.58684833905651 3.17706499754721 3.4097833415093 T:C T C 10 0.529510832924535 0.177997080950173 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 19726275 C/T 1 121 95 216 56.9291892161313 50.3035291278308 6.62566008830043 T:C C T 10 0.529510832924535 0.376305974246347 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 20748331 C/A 1 25 16 41 11.7622291768866 8.47217332679256 3.29005585009406 A:C C A 10 0.529510832924535 0.349282843478996 ENSG00000066654:ENST00000381337:exon_20748182_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000396083:exon_20744991_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000431224:exon_20746723_20748608:THUMPD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 20796387 G/C 1 11 12 23 5.17538083783011 6.35412999509442 -1.17874915726431 C:G G C 10 0.529510832924535 0.679304562332551 ENSG00000005187:ENST00000289416:exon_20796306_20796429:ACSM3;ENSG00000005187:ENST00000440284:exon_20796306_20796429:ACSM3;ENSG00000005187:ENST00000450120:exon_20796306_20796429:ACSM3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 20855309 A/G 1 8 10 18 3.76391333660372 5.29510832924535 -1.53119499264163 A:G A G 10 0.529510832924535 0.489195304177666 ENSG00000005189:ENST00000261377:exon_20855256_20855348:AC004381.6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 23079501 G/A 1 8 4 12 3.76391333660372 2.11804333169814 1.64587000490558 A:G G A 10 0.529510832924535 0.397734651849528 ENSG00000103404:ENST00000219689:exon_23072727_23080937:USP31;ENSG00000103404:ENST00000381162:exon_23079303_23079901:USP31 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 23403744 A/G 1 13 32 45 6.11635917198104 16.9443466535851 -10.8279874816041 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00145900354047167 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23403701_23403844:COG7;ENSG00000168434:ENST00000429391:exon_23403701_23403844:COG7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 23409440 G/A 1 18 9 27 8.46880500735837 4.76559749632082 3.70320751103755 A:G G A 10 0.529510832924535 0.179182503083520 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23409367_23409450:COG7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 23619235 A/C 1 10 13 23 4.70489167075465 6.88364082801896 -2.17874915726431 A:C A C 10 0.529510832924535 0.407596227656326 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23619185_23619333:PALB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 23641461 C/G 1 3 9 12 1.41146750122639 4.76559749632082 -3.35412999509442 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0794211024472422 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23640961_23641790:PALB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 23672560 A/T 1 5 12 17 2.35244583537732 6.35412999509442 -4.0016841597171 A:T A T 10 0.529510832924535 0.0859595749856374 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23672491_23672602:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23672491_23672563:DCTN5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 23701458 G/A 1 133 121 254 62.5750592210368 64.0708107838687 -1.4957515628319 A:G G A 10 0.529510832924535 0.850742326621178 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 8 4 12 3.76391333660372 2.11804333169814 1.64587000490558 T:C T C 10 0.529510832924535 0.397734651849528 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 24202458 C/T 1 24 29 53 11.2917400098112 15.3558141548115 -4.06407414500036 T:C C T 10 0.529510832924535 0.273986901248959 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000466124:exon_24202411_24202909:PRKCB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 24226064 A/G 1 30 14 44 14.1146750122639 7.41315166094349 6.70152335132046 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0492453111586547 ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24225979_24231932:PRKCB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 24834233 C/T 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834195_24834334:TNRC6A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 28508447 A/G 1 6 9 15 2.82293500245279 4.76559749632082 -1.94266249386803 A:G A G 10 0.529510832924535 0.439062493647043 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 28602991 A/G 1 22 20 42 10.3507616756602 10.5902166584907 -0.239454982830472 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 28993369 C/T 1 11 12 23 5.17538083783011 6.35412999509442 -1.17874915726431 T:C C T 10 0.529510832924535 0.679304562332551 ENSG00000169682:ENST00000311008:exon_28993222_28993377:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000452515:exon_28993222_28993377:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000323081:exon_28993222_28993377:SPNS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 29675928 C/T 1 209 195 404 98.3322359187722 103.254612420284 -4.92237650151216 T:C C T 10 0.529510832924535 0.653813879128047 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 29841904 C/A 1 28 31 59 13.173696678113 16.4148358206606 -3.24113914254757 A:C C A 10 0.529510832924535 0.435037528966530 ENSG00000013364:ENST00000357402:exon_29841836_29841995:MVP;ENSG00000013364:ENST00000395353:exon_29841795_29841995:MVP;ENSG00000013364:ENST00000424666:exon_29841836_29841995:MVP;ENSG00000013364:ENST00000452209:exon_29841836_29841995:MVP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 30081367 G/T 1 12 16 28 5.64587000490558 8.47217332679256 -2.82630332188698 T:G G T 10 0.529510832924535 0.344853719729691 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 30199584 G/A 1 40 32 72 18.8195666830186 16.9443466535851 1.87522002943348 A:G G A 10 0.529510832924535 0.723653597378455 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 30536994 A/G 1 24 18 42 11.2917400098112 9.53119499264163 1.76054501716953 A:G A G 10 0.529510832924535 0.644496300827347 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 46642286 G/A 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000171241:ENST00000303383:exon_46642209_46642301:SHCBP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 53262964 C/T 1 37 33 70 17.4080991817922 17.4738574865097 -0.0657583047174555 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53262895_53263012:CHD9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 56870627 A/C 1 112 73 185 52.6947867124521 38.6542908034911 14.040495908961 A:T:C:G A C 10 0.529510832924535 0.0393256612147442 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56870513_56870629:NUP93 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 56969148 G/A 1 155 130 285 72.9258208966971 68.8364082801896 4.0894126165075 A:G G A 10 0.529510832924535 0.635527575618816 ENSG00000051108:ENST00000439977:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000379792:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000300302:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000344114:exon_56969147_56969224:HERPUD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 57017292 A/G 1 32 22 54 15.0556533464149 11.6492383243398 3.40641502207511 A:G A G 10 0.529510832924535 0.413883598039945 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57017238_57017323:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57017238_57017323:CETP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 57060340 T/C 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 57060353 T/C 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 57067595 A/T 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 A:T A T 10 0.529510832924535 0.186533779694549 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 57068106 A/G 1 7 7 14 3.29342416952825 3.70657583047175 -0.413151660943491 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57068080_57068163:NLRC5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 57068107 C/T 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57068080_57068163:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57068080_57068163:NLRC5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 57080528 C/A 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 A:C C A 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57080464_57080553:NLRC5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 57085465 C/T 1 6 8 14 2.82293500245279 4.23608666339628 -1.41315166094349 T:C C T 10 0.529510832924535 0.594278475296019 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57085450_57085533:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57085450_57085533:NLRC5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 57787027 C/T 1 9 11 20 4.23440250367918 5.82461916216989 -1.5902166584907 T:C C T 10 0.529510832924535 0.508807175217642 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786989_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786989_57787179:KATNB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 58552921 G/A 1 39 29 68 18.3490775159431 15.3558141548115 2.99326336113162 A:G G A 10 0.529510832924535 0.543914683379923 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 58575489 G/A 1 13 11 24 6.11635917198104 5.82461916216989 0.291740009811159 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58575405_58575524:CNOT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 58587737 C/T 1 3 7 10 1.41146750122639 3.70657583047175 -2.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 0.206417065723492 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58587686_58587764:CNOT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 67265360 C/A 1 19 18 37 8.93929417443383 9.53119499264163 -0.591900818207796 A:C C A 10 0.529510832924535 0.870465810362237 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265333_67265452:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265333_67265452:FHOD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 67268008 G/A 1 12 14 26 5.64587000490558 7.41315166094349 -1.76728165603791 A:G G A 10 0.529510832924535 0.557753688524909 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67267560_67268170:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67267560_67268170:FHOD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 67578257 C/T 1 13 7 20 6.11635917198104 3.70657583047175 2.4097833415093 T:C C T 10 0.529510832924535 0.371363290052013 ENSG00000039523:ENST00000379312:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000042381:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000422602:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000428437:exon_67578202_67578334:FAM65A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 67691477 A/T 1 58 31 89 27.288371690377 16.4148358206606 10.8735358697164 A:T A T 10 0.529510832924535 0.0252343256753911 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691433_67691587:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691435_67691587:ACD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 67691668 A/G 1 68 54 122 31.9932633611316 28.5935849779249 3.39967838320673 A:G A G 10 0.529510832924535 0.586607603552654 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 67763355 C/T 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 T:C C T 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000141084:ENST00000317506:exon_67763183_67763387:RANBP10;ENSG00000141084:ENST00000448631:exon_67763183_67763387:RANBP10;ENSG00000141084:ENST00000411657:exon_67763183_67763387:RANBP10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 67865937 T/C 1 20 25 45 9.4097833415093 13.2377708231134 -3.82798748160408 T:C T C 10 0.529510832924535 0.29630362962754 ENSG00000102901:ENST00000219172:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000440851:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000436104:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000445712:exon_67865915_67866011:CENPT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 67911517 T/C 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C T C 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 67964203 T/C 1 2 9 11 0.94097833415093 4.76559749632082 -3.82461916216989 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0306516707381973 ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964088_67964221:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67963848_67964221:CTRL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 276 251 527 129.855010112828 132.907219064058 -3.05220895122997 A:G A G 10 0.529510832924535 0.793623869740513 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 41 34 75 19.2900558500941 18.0033683194342 1.28668753065987 A:G G A 10 0.529510832924535 0.817518000338132 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 114 106 220 53.635765046603 56.1281482900007 -2.49238324339771 T:C:G C T 10 0.529510832924535 0.736213454520362 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 69963355 G/A 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 A:T:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69963351_69963432:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69963351_69963432:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69963351_69963432:WWP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 69967897 T/C 1 4 9 13 1.88195666830186 4.76559749632082 -2.88364082801896 T:C T C 10 0.529510832924535 0.163083153099282 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69967873_69968032:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69967873_69968032:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69967873_69968032:WWP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 69970329 A/G 1 17 14 31 7.9983158402829 7.41315166094349 0.585164179339413 A:G A G 10 0.529510832924535 0.85934843118329 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69970215_69970355:WWP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 69973825 G/A 1 11 12 23 5.17538083783011 6.35412999509442 -1.17874915726431 A:G G A 10 0.529510832924535 0.679304562332551 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 70287177 A/G 1 187 193 380 87.9814742431119 102.195590754435 -14.2141165113233 A:G A G 10 0.529510832924535 0.150252767059732 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70287171_70287284:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70287171_70287284:AARS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 70316658 A/C 1 168 152 320 79.0421800686781 80.4856466045293 -1.44346653585121 A:C A C 10 0.529510832924535 0.910847503471386 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70316523_70316687:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70316523_70316687:AARS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 70726795 C/A 1 8 18 26 3.76391333660372 9.53119499264163 -5.76728165603791 A:C C A 10 0.529510832924535 0.0294796117760212 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 72133672 C/T 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.556631979728114 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72133631_72133786:DHX38 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 72133708 C/T 1 10 3 13 4.70489167075465 1.58853249877361 3.11635917198104 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0995863157160923 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72133631_72133786:DHX38 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 74499589 G/A 1 18 8 26 8.46880500735837 4.23608666339628 4.23271834396209 A:G G A 10 0.529510832924535 0.116418578208414 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74499574_74499711:GLG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 74695079 G/T 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 T:G G T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000168411:ENST00000444004:exon_74694988_74695347:RFWD3;ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74694830_74695349:RFWD3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 74708886 A/G 1 11 2 13 5.17538083783011 1.05902166584907 4.11635917198104 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0254051261214490 ENSG00000168404:ENST00000306247:exon_74708858_74708998:MLKL;ENSG00000168404:ENST00000308807:exon_74708858_74708998:MLKL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 75646460 T/G 1 7 1 8 3.29342416952825 0.529510832924535 2.76391333660372 T:G T G 10 0.529510832924535 0.0741292491828888 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 81062264 G/A 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81062174_81062927:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81062174_81065090:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81062174_81065090:CENPN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 81077384 T/C 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C T C 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 81077915 T/C 1 20 14 34 9.4097833415093 7.41315166094349 1.99663168056581 T:C T C 10 0.529510832924535 0.606970772196423 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 81078081 A/G 1 16 22 38 7.52782667320744 11.6492383243398 -4.12141165113233 A:G A G 10 0.529510832924535 0.196062898787779 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 81914583 C/T 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 T:C C T 10 0.529510832924535 0.742993974261161 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 81941319 C/T 1 57 53 110 26.8178825233015 28.0640741450004 -1.24619162169886 T:C C T 10 0.529510832924535 0.848751368364895 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81941290_81941379:PLCG2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 89 118 207 41.8735358697164 62.4822782850951 -20.6087424153788 T:C T C 10 0.529510832924535 0.00426919484635258 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 82203742 T/C 0 25 0 25 11.7622291768866 0 11.7622291768866 T T 10 0.529510832924535 1.31501234536618e-07 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 82203758 C/T 0 25 0 25 11.7622291768866 0 11.7622291768866 C C 10 0.529510832924535 1.31501234536618e-07 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 82203768 G/T 0 22 0 22 10.3507616756602 0 10.3507616756602 G G 10 0.529510832924535 9.04403696964151e-07 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 84088026 T/C 1 24 17 41 11.2917400098112 9.0016841597171 2.29005585009406 T:C T C 10 0.529510832924535 0.533085115396517 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 84100173 C/T 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 T:C C T 10 0.529510832924535 0.779088238758133 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84100094_84100218:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84100094_84100218:MBTPS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 84115483 G/A 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84115352_84115513:MBTPS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 84212779 G/A 1 28 18 46 13.173696678113 9.53119499264163 3.64250168547139 A:G G A 10 0.529510832924535 0.304115292478031 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 84212928 G/A 1 36 24 60 16.9376100147167 12.7082599901888 4.2293500245279 A:G G A 10 0.529510832924535 0.302167129492345 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 84691044 C/T 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 T:C C T 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84690477_84691550:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84690477_84691519:KLHL36 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 85706047 A/C 1 11 17 28 5.17538083783011 9.0016841597171 -3.82630332188698 A:C A C 10 0.529510832924535 0.184953401348688 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 85711860 C/T 1 90 82 172 42.3440250367918 43.4198882998119 -1.07586326302003 T:C C T 10 0.529510832924535 0.878858322770373 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 85834818 G/A 1 1142 1152 2294 537.298628800181 609.996479529064 -72.6978507288834 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00241931047842540 ENSG00000131143:ENST00000253452:exon_85834811_85834884:COX4I1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 88724347 G/T 1 43 27 70 20.231034184245 14.2967924889624 5.93424169528255 A:T:G G T 10 0.529510832924535 0.187511231482544 ENSG00000167508:ENST00000301012:exon_88724323_88724437:MVD;ENSG00000167508:ENST00000378400:exon_88724323_88724437:MVD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 88767769 G/C 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 C:G G C 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000158717:ENST00000312838:exon_88767670_88767826:RNF166 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 88779032 G/C 1 21 21 42 9.88027250858476 11.1197274914152 -1.23945498283047 C:G G C 10 0.529510832924535 0.758233996771047 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 88780923 C/G 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 C:G C G 10 0.529510832924535 0.531350440107521 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 88781125 T/C 1 34 46 80 15.9966316805658 24.3574983145286 -8.3608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0726099108322249 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 88781558 G/A 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 0.531350440107521 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89167138 G/C 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 C:G G C 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89167140 G/C 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 C:G G C 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89167395 C/T 1 13 3 16 6.11635917198104 1.58853249877361 4.52782667320744 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0247917218023686 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89167404 T/C 1 15 3 18 7.05733750613197 1.58853249877361 5.46880500735837 T:C:G T C 10 0.529510832924535 0.00936442999978817 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89167431 G/C 0 14 0 14 6.58684833905651 0 6.58684833905651 G G 10 0.529510832924535 0.000162265427935967 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89167443 T/C 1 12 1 13 5.64587000490558 0.529510832924535 5.11635917198104 T:C T C 10 0.529510832924535 0.00409408668739921 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89167458 C/A 1 8 1 9 3.76391333660372 0.529510832924535 3.23440250367918 A:C C A 10 0.529510832924535 0.0420136690367002 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89294381 T/C 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 T:C T C 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89348997 G/C 1 38 36 74 17.8785883488677 19.0623899852833 -1.18380163641559 A:C:G G C 10 0.529510832924535 0.816431448045228 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89644001 T/C 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C T C 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89643947_89644129:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89643947_89644129:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000525982:exon_89643947_89644129:CPNE7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89661807 C/T 1 29 14 43 13.6441858451885 7.41315166094349 6.23103418424499 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0664132638698743 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000529800:exon_89661775_89661831:CPNE7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89662875 G/C 1 11 24 35 5.17538083783011 12.7082599901888 -7.53287915235873 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0164713718996589 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 111 37 148 52.2242975453766 19.5919008182078 32.6323967271688 A:G G A 10 0.529510832924535 5.28091983502402e-08 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89712374 A/C 1 19 13 32 8.93929417443383 6.88364082801896 2.05565334641488 A:C A C 10 0.529510832924535 0.485297135983152 ENSG00000131165:ENST00000253475:exon_89710846_89712495:CHMP1A;ENSG00000131165:ENST00000397901:exon_89710846_89712495:CHMP1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89712380 G/A 1 18 13 31 8.46880500735837 6.88364082801896 1.58516417933941 A:G G A 10 0.529510832924535 0.594701624173538 ENSG00000131165:ENST00000253475:exon_89710846_89712495:CHMP1A;ENSG00000131165:ENST00000397901:exon_89710846_89712495:CHMP1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89713563 C/G 1 9 1 10 4.23440250367918 0.529510832924535 3.70489167075465 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0236424935815757 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89760652 C/T 1 15 5 20 7.05733750613197 2.64755416462268 4.4097833415093 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0706446444015717 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89954138 G/C 1 8 6 14 3.76391333660372 3.17706499754721 0.586848339056509 C:G G C 10 0.529510832924535 0.795582240516341 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89965055 G/A 1 50 42 92 23.5244583537732 22.2394549828305 1.28500337094277 A:G G A 10 0.529510832924535 0.834894993394929 ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89964965_89965057:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89964965_89965057:TCF25 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 89967217 T/C 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 T:C T C 10 0.529510832924535 0.556631979728114 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 16 90103659 G/A 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90103640_90103807:GAS8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 526907 G/T 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 T:G G T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_526773_526914:VPS53 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 648157 G/A 1 78 103 181 36.6981550318863 54.5396157912271 -17.8414607593408 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0090009504566611 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 105 90 195 49.4013625429238 47.6559749632082 1.74538757971567 A:T:G G A 10 0.529510832924535 0.829810250634621 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 649505 T/A 1 18 40 58 8.46880500735837 21.1804333169814 -12.711628309623 A:T T A 10 0.529510832924535 0.000895274618193896 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 28 17 45 13.173696678113 9.0016841597171 4.17201251839592 C:G G C 10 0.529510832924535 0.234319677529679 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 22 32 54 10.3507616756602 16.9443466535851 -6.59358497792489 T:G G T 10 0.529510832924535 0.077213145848676 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 1494567 G/A 1 17 12 29 7.9983158402829 6.35412999509442 1.64418584518848 A:G G A 10 0.529510832924535 0.581370651083963 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 1680002 T/C 1 3 7 10 1.41146750122639 3.70657583047175 -2.29510832924535 T:C T C 10 0.529510832924535 0.206417065723492 ENSG00000132386:ENST00000254722:exon_1679826_1680036:SERPINF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 1684643 C/T 1 8 17 25 3.76391333660372 9.0016841597171 -5.23777082311338 T:C C T 10 0.529510832924535 0.044204604125891 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1682829_1684733:SMYD4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 1684772 T/C 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 T:C T C 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 1703543 G/C 1 6 10 16 2.82293500245279 5.29510832924535 -2.47217332679256 C:G G C 10 0.529510832924535 0.316631120754283 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1703151_1704099:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000495309:exon_1703510_1704011:SMYD4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 1795180 T/C 1 33 25 58 15.5261425134903 13.2377708231134 2.28837169037697 T:C T C 10 0.529510832924535 0.599887463885947 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 1940232 A/G 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 A:G A G 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1940129_1940250:DPH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 2202943 T/C 1 9 10 19 4.23440250367918 5.29510832924535 -1.06070582556617 T:C T C 10 0.529510832924535 0.65266342372252 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 2203025 T/G 1 9 6 15 4.23440250367918 3.17706499754721 1.05733750613197 T:G T G 10 0.529510832924535 0.61671670096814 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 2203167 T/G 1 8 11 19 3.76391333660372 5.82461916216989 -2.06070582556617 A:T:G T G 10 0.529510832924535 0.367060340223589 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 2203175 C/G 1 12 7 19 5.64587000490558 3.70657583047175 1.93929417443383 C:G C G 10 0.529510832924535 0.491992058405047 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 2236404 T/C 1 49 50 99 23.0539691866978 26.4755416462268 -3.42157245952897 T:C T C 10 0.529510832924535 0.546030127062619 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2236255_2236418:TSR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 3564068 G/A 0 10 0 10 4.70489167075465 0 4.70489167075465 G G 10 0.529510832924535 0.00226429167281657 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 3564073 A/G 0 10 0 10 4.70489167075465 0 4.70489167075465 A A 10 0.529510832924535 0.00226429167281657 ENSG00000040531:ENST00000046640:exon_3563530_3564832:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000381870:exon_3563911_3564836:CTNS;ENSG00000040531:ENST00000441220:exon_3563911_3564451:CTNS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 3568012 A/G 1 13 6 19 6.11635917198104 3.17706499754721 2.93929417443383 A:G A G 10 0.529510832924535 0.25025489550222 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3567973_3568092:TAX1BP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 3577146 C/T 1 39 46 85 18.3490775159431 24.3574983145286 -6.00842079858548 T:C C T 10 0.529510832924535 0.194379698334980 ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3576521_3577171:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3576524_3577171:P2RX5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 25 36 61 11.7622291768866 19.0623899852833 -7.30016080839664 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0720550341469714 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 4351560 G/A 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 A:G G A 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4351450_4351598:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4351450_4351598:SPNS3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 4352539 C/T 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4352530_4352682:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4352530_4352682:SPNS3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 4442818 G/A 1 141 104 245 66.3389725576406 55.0691266241516 11.2698459334889 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.159191760339434 ENSG00000183018:ENST00000329078:exon_4440748_4443228:SPNS2;ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4442734_4443262:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4442199_4443262:MYBBP1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 4446457 G/A 1 28 28 56 13.173696678113 14.826303321887 -1.65260664377396 A:G G A 10 0.529510832924535 0.689423397429448 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 4451576 T/C 1 37 26 63 17.4080991817922 13.7672816560379 3.64081752575429 T:C T C 10 0.529510832924535 0.379328068280671 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4451438_4451605:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4451438_4451605:MYBBP1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 4453508 C/T 1 17 10 27 7.9983158402829 5.29510832924535 2.70320751103755 T:C C T 10 0.529510832924535 0.338828655163755 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4453353_4453648:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4453353_4453648:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4453353_4453648:MYBBP1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 4457571 C/T 1 9 18 27 4.23440250367918 9.53119499264163 -5.29679248896245 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0526074098364202 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4457490_4457573:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4457490_4457573:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4457490_4457573:MYBBP1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 4458598 G/C 1 14 15 29 6.58684833905651 7.94266249386803 -1.35581415481152 C:G G C 10 0.529510832924535 0.71082694647542 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4458422_4458681:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4458422_4458679:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4458422_4458681:MYBBP1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 156 190 346 73.3963100637725 100.607058255662 -27.2107481918891 A:T:C:G C T 10 0.529510832924535 0.00359798383277884 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 4701402 C/T 1 638 564 1202 300.172088594147 298.644109769438 1.5279788247089 T:C C T 10 0.529510832924535 0.953920863269382 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4701304_4701448:PSMB6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 4860157 G/A 1 39 34 73 18.3490775159431 18.0033683194342 0.345709196508942 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4860126_4860184:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4860126_4860184:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4860126_4860184:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4860126_4860184:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519584:exon_4860126_4860184:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4860126_4860184:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522425:exon_4860126_4860184:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522954:exon_4860126_4860184:ENO3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 12 17 29 5.64587000490558 9.0016841597171 -3.35581415481152 T:C T C 10 0.529510832924535 0.264593278715465 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 5290414 G/A 1 117 101 218 55.0472325478294 53.480594125378 1.56663842245136 A:G G A 10 0.529510832924535 0.839082400293975 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290304_5290430:NUP88 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 41 29 70 19.2900558500941 15.3558141548115 3.93424169528255 T:C C T 10 0.529510832924535 0.402237593648528 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 125 152 277 58.8111458844331 80.4856466045293 -21.6745007200962 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0095934562538795 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 124 125 249 58.3406567173577 66.1888541155669 -7.84819739820923 A:C:G C G 10 0.529510832924535 0.34105221293238 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 5392161 C/T 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 5392173 A/C 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 A:C A C 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 17 15 32 7.9983158402829 7.94266249386803 0.0556533464148785 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 5436263 C/T 1 12 11 23 5.64587000490558 5.82461916216989 -0.178749157264306 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5436142_5436304:NLRP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 5485367 A/T 1 9 3 12 4.23440250367918 1.58853249877361 2.64587000490558 A:T A T 10 0.529510832924535 0.154401063622286 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5485179_5485382:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5485179_5485382:NLRP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 5487164 C/G 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 C:G C G 10 0.529510832924535 0.159283336846293 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5487007_5487832:NLRP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 6483046 T/C 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C T C 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6481646_6483184:KIAA0753 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 6663753 A/G 1 14 10 24 6.58684833905651 5.29510832924535 1.29174000981116 A:G A G 10 0.529510832924535 0.684850962838789 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 6942108 C/T 1 14 4 18 6.58684833905651 2.11804333169814 4.46880500735837 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0557969737722274 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7127718 T/C 1 5 8 13 2.35244583537732 4.23608666339628 -1.88364082801896 T:C T C 10 0.529510832924535 0.406366482999609 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 6 16 22 2.82293500245279 8.47217332679256 -5.64923832433977 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0182641780908693 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 7 9 16 3.29342416952825 4.76559749632082 -1.47217332679256 T:C C T 10 0.529510832924535 0.617975933604282 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7144146 C/A 1 256 265 521 120.445226771319 140.320370725002 -19.8751439536828 A:C:G C A 10 0.529510832924535 0.0868897493663278 ENSG00000170296:ENST00000302386:exon_7143333_7144238:GABARAP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 65 40 105 30.5817958599052 21.1804333169814 9.40136254292382 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0780120983274042 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7216540 G/A 1 66 93 159 31.0522850269807 49.2445074619818 -18.1922224350011 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00415399983379292 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7216531_7216610:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7216531_7216610:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7216531_7216610:GPS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7217463 T/C 1 52 25 77 24.4654366879242 13.2377708231134 11.2276658648108 T:C:G T C 10 0.529510832924535 0.0116503206908785 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7224728 G/T 1 16 10 26 7.52782667320744 5.29510832924535 2.23271834396209 T:G G T 10 0.529510832924535 0.435554956053702 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7224680_7224778:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7224680_7224778:NEURL4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7224921 C/G 1 11 9 20 5.17538083783011 4.76559749632082 0.409783341509299 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7224879_7225106:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7224879_7225106:NEURL4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7246851 C/T 1 111 106 217 52.2242975453766 56.1281482900007 -3.90385074462411 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.634174062990528 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7246698_7246881:ACAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7251605 G/C 1 13 16 29 6.11635917198104 8.47217332679256 -2.35581415481152 C:G G C 10 0.529510832924535 0.457889314355892 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7460685 G/A 1 16 12 28 7.52782667320744 6.35412999509442 1.17369667811302 A:G G A 10 0.529510832924535 0.708183978146927 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7462969 A/G 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 A:G A G 10 0.529510832924535 0.129310521443327 ENSG00000239697:ENST00000518220:exon_7462941_7463019:TNFSF12;ENSG00000248871:ENST00000293826:exon_7462941_7463019:TNFSF12-TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462941_7463019:TNFSF13 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7477938 G/C 1 211 218 429 99.2732142529231 115.433361577549 -16.1601473246255 T:C:G G C 10 0.529510832924535 0.121793267324054 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7477864_7477996:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7477864_7477996:EIF4A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7490379 G/C 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490217_7490589:MPDU1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7530147 G/C 1 15 8 23 7.05733750613197 4.23608666339628 2.82125084273569 C:G G C 10 0.529510832924535 0.297861335201159 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7530271 C/T 1 58 54 112 27.288371690377 28.5935849779249 -1.30521328754793 T:C C T 10 0.529510832924535 0.85002668387535 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7530261_7530362:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7530261_7530362:SAT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7579472 G/C 1 36 34 70 16.9376100147167 18.0033683194342 -1.06575830471745 C:G G C 10 0.529510832924535 0.81181895232532 ENSG00000141510:ENST00000413465:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000269305:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000455263:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000420246:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000445888:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000419024:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000359597:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000505014:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000414315:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000508793:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000503591:exon_7579312_7579590:TP53 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7751388 C/A 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 A:C C A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 7754460 C/A 1 7 7 14 3.29342416952825 3.70657583047175 -0.413151660943491 A:C C A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7754339_7754544:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7754339_7754544:KDM6B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 8046772 C/G 1 13 8 21 6.11635917198104 4.23608666339628 1.88027250858476 C:G C G 10 0.529510832924535 0.513839468737654 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 8048169 T/C 1 4 10 14 1.88195666830186 5.29510832924535 -3.41315166094349 T:C T C 10 0.529510832924535 0.105177291482310 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 8064083 T/G 1 37 47 84 17.4080991817922 24.8870091474531 -7.47890996566094 T:G T G 10 0.529510832924535 0.125460445310247 ENSG00000220205:ENST00000316509:exon_8062467_8064189:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 8076716 T/C 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 T:C T C 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 8076778 C/T 1 8 3 11 3.76391333660372 1.58853249877361 2.17538083783011 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.235512259698034 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 8076802 T/A 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 A:T T A 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 8092694 T/G 1 9 9 18 4.23440250367918 4.76559749632082 -0.53119499264163 T:G T G 10 0.529510832924535 0.817944843022877 ENSG00000196544:ENST00000389017:exon_8091652_8093564:C17orf59;ENSG00000196544:ENST00000357939:exon_8092385_8093056:C17orf59 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 8108331 A/G 1 244 163 407 114.799356766413 86.3102657666992 28.4890909997142 A:T:G A G 10 0.529510832924535 0.00463390612609710 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 241 144 385 113.387889265187 76.249559941133 37.138329324054 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.000152006963812217 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 8192922 C/T 1 53 42 95 24.9359258549996 22.2394549828305 2.69647087216917 T:C C T 10 0.529510832924535 0.608388408177302 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8192892_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8192892_8192961:SLC25A35 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 8408032 C/T 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 T:C C T 10 0.529510832924535 0.779088238758133 ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8408012_8408224:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8408012_8408224:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8408012_8408224:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8408012_8408224:MYH10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 9395231 G/A 1 66 69 135 31.0522850269807 36.5362474717929 -5.48396244481223 A:G G A 10 0.529510832924535 0.344717654680607 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9395146_9395238:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9395146_9395238:STX8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 12899963 T/C 1 16 16 32 7.52782667320744 8.47217332679256 -0.944346653585121 T:C T C 10 0.529510832924535 0.859808885917593 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 12915009 G/A 1 13 11 24 6.11635917198104 5.82461916216989 0.291740009811159 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12914980_12915099:ELAC2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 16842912 A/G 1 362 437 799 170.317078481318 231.396233988022 -61.0791555067035 A:T:C:G A G 10 0.529510832924535 1.73940962796608e-05 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 16842991 G/A 1 253 283 536 119.033759270093 149.851565717643 -30.8178064475508 A:T:C:G G A 10 0.529510832924535 0.00825678648274656 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16842970_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 16852027 T/G 1 12 8 20 5.64587000490558 4.23608666339628 1.4097833415093 T:G T G 10 0.529510832924535 0.655754725288894 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 17394611 G/A 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000141026:ENST00000268711:exon_17394593_17396535:MED9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 17409560 C/T 1 14 9 23 6.58684833905651 4.76559749632082 1.82125084273569 T:C C T 10 0.529510832924535 0.533349006667712 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000490392:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000484838:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000477595:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000482906:exon_17409541_17409615:PEMT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 157 137 294 73.866799230848 72.5429841106613 1.32381512018669 A:G G A 10 0.529510832924535 0.907034341002971 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 18193941 G/A 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18193871_18194000:TOP3A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 35 24 59 16.4671208476413 12.7082599901888 3.75886085745243 A:G G A 10 0.529510832924535 0.362527968621373 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 42 27 69 19.7605450171695 14.2967924889624 5.46375252820708 A:G A G 10 0.529510832924535 0.227612222632236 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 19812541 T/C 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 T:C T C 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19812494_19812589:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19812494_19812589:AKAP10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 19861458 C/T 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 T:C C T 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 31 0 31 14.5851641793394 0 14.5851641793394 T T 10 0.529510832924535 5.2901105031506e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 37 0 37 17.4080991817922 0 17.4080991817922 G G 10 0.529510832924535 9.33967828301675e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 35 0 35 16.4671208476413 0 16.4671208476413 C C 10 0.529510832924535 3.56384158932442e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 33 0 33 15.5261425134903 0 15.5261425134903 C C 10 0.529510832924535 1.36881934430769e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 40 0 40 18.8195666830186 0 18.8195666830186 C C 10 0.529510832924535 1.26876644997877e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 38 0 38 17.8785883488677 0 17.8785883488677 C C 10 0.529510832924535 4.79319866517822e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 30 0 30 14.1146750122639 0 14.1146750122639 C C 10 0.529510832924535 1.04221895947246e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 33 0 33 15.5261425134903 0 15.5261425134903 C C 10 0.529510832924535 1.36881934430769e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 35 0 35 16.4671208476413 0 16.4671208476413 G G 10 0.529510832924535 3.56384158932442e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 68 0 68 31.9932633611316 0 31.9932633611316 G G 10 0.529510832924535 3.27656999193046e-19 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 25628820 T/C 1 6 10 16 2.82293500245279 5.29510832924535 -2.47217332679256 T:C T C 10 0.529510832924535 0.316631120754283 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25628814_25628982:WSB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 171 86 257 80.4536475699045 45.53793163151 34.9157159383945 A:G G A 10 0.529510832924535 1.11110203832614e-05 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 21 24 45 9.88027250858476 12.7082599901888 -2.82798748160408 A:G G A 10 0.529510832924535 0.456087423267675 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 25974258 T/C 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 0.159283336846293 ENSG00000168961:ENST00000486774:exon_25974056_25974458:LGALS9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 26959103 C/T 1 11 4 15 5.17538083783011 2.11804333169814 3.05733750613197 T:C C T 10 0.529510832924535 0.128035315987776 ENSG00000007202:ENST00000389003:exon_26959067_26959257:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000005905:exon_26959067_26959257:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000528896:exon_26959067_26959257:KIAA0100 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 27424316 G/A 1 12 14 26 5.64587000490558 7.41315166094349 -1.76728165603791 A:G G A 10 0.529510832924535 0.557753688524909 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533652:exon_27423915_27424371:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527686:exon_27424164_27424368:MYO18A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 28530193 T/G 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 T:G T G 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000108576:ENST00000394821:exon_28530190_28530357:SLC6A4;ENSG00000108576:ENST00000401766:exon_28530190_28530357:SLC6A4;ENSG00000108576:ENST00000261707:exon_28530190_28530357:SLC6A4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 28576076 T/C 1 53 52 105 24.9359258549996 27.5345633120758 -2.59863745707618 T:C T C 10 0.529510832924535 0.62610987115073 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28575223_28576186:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28575223_28576186:BLMH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 28612448 G/C 1 11 14 25 5.17538083783011 7.41315166094349 -2.23777082311338 C:G G C 10 0.529510832924535 0.42559887349422 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28612406_28612498:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28612406_28612498:BLMH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 29111125 T/G 1 24 13 37 11.2917400098112 6.88364082801896 4.4080991817922 T:G T G 10 0.529510832924535 0.187211545095096 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 29113016 A/G 1 7 10 17 3.29342416952825 5.29510832924535 -2.0016841597171 A:G A G 10 0.529510832924535 0.344125043526582 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29112937_29113049:CRLF3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 29161202 A/T 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 A:T A T 10 0.529510832924535 0.186533779694549 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 29161358 C/T 1 9 1 10 4.23440250367918 0.529510832924535 3.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0236424935815757 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 29161845 G/A 1 11 13 24 5.17538083783011 6.88364082801896 -1.70825999018884 A:G G A 10 0.529510832924535 0.542854194228007 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 29162173 T/C 1 10 9 19 4.70489167075465 4.76559749632082 -0.0607058255661652 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 29167653 A/C 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 A:C A C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29167635_29167799:ATAD5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 29214387 T/C 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29214210_29214390:ATAD5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 29226228 T/C 1 21 23 44 9.88027250858476 12.1787491572643 -2.29847664867954 T:C T C 10 0.529510832924535 0.546845476302343 ENSG00000172171:ENST00000306049:exon_29226001_29226624:C17orf42 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 17 9 26 7.9983158402829 4.76559749632082 3.23271834396209 A:T T A 10 0.529510832924535 0.24086494409280 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 28 29 57 13.173696678113 15.3558141548115 -2.1821174766985 A:G G A 10 0.529510832924535 0.597075589222421 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 30216328 T/C 1 22 19 41 10.3507616756602 10.0607058255662 0.290055850094063 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30216304_30216422:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30216304_30216422:UTP6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 16 18 34 7.52782667320744 9.53119499264163 -2.00336831943419 T:C T C 10 0.529510832924535 0.498122028363949 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 30222010 C/A 1 14 20 34 6.58684833905651 10.5902166584907 -4.00336831943419 A:C C A 10 0.529510832924535 0.174339867028717 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 30696292 C/T 1 16 13 29 7.52782667320744 6.88364082801896 0.644185845188484 T:C C T 10 0.529510832924535 0.854303742578924 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 33331456 G/A 1 12 23 35 5.64587000490558 12.1787491572643 -6.53287915235873 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0283986377988601 ENSG00000005156:ENST00000378526:exon_33331292_33332083:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000474860:exon_33329687_33331823:LIG3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 33772689 T/C 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33772675_33772699:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33772392_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33772675_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33771634_33773029:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000524511:exon_33772381_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000531588:exon_33772467_33772712:SLFN13 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 34432581 T/C 1 12 7 19 5.64587000490558 3.70657583047175 1.93929417443383 T:C T C 10 0.529510832924535 0.491992058405047 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 34432586 A/G 1 12 7 19 5.64587000490558 3.70657583047175 1.93929417443383 A:G A G 10 0.529510832924535 0.491992058405047 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 34432663 A/G 1 526 249 775 247.477301881695 131.848197398209 115.629104483485 A:G A G 10 0.529510832924535 4.05565950055658e-17 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 34432664 T/A 1 524 244 768 246.536323547544 129.200643233587 117.335680313957 A:T:G T A 10 0.529510832924535 8.33526817245179e-18 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 34854089 T/C 1 8 3 11 3.76391333660372 1.58853249877361 2.17538083783011 T:C T C 10 0.529510832924535 0.235512259698034 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 22 23 45 10.3507616756602 12.1787491572643 -1.82798748160408 C:G C G 10 0.529510832924535 0.654941420076411 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 60 43 103 28.2293500245279 22.768965815755 5.46038420877289 A:G G A 10 0.529510832924535 0.323660432612695 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 36909061 A/G 1 221 172 393 103.978105923678 91.07586326302 12.9022426606577 A:G A G 10 0.529510832924535 0.206456661422267 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909003_36909082:PSMB3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 36966701 G/T 1 8 4 12 3.76391333660372 2.11804333169814 1.64587000490558 T:G G T 10 0.529510832924535 0.397734651849528 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 37009072 C/T 1 14 9 23 6.58684833905651 4.76559749632082 1.82125084273569 T:C C T 10 0.529510832924535 0.533349006667712 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 38062196 G/A 1 19 8 27 8.93929417443383 4.23608666339628 4.70320751103755 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0828338368378422 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 25 11 36 11.7622291768866 5.82461916216989 5.93761001471674 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0648080166938698 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 25 24 49 11.7622291768866 12.7082599901888 -0.946030813302217 A:T T A 10 0.529510832924535 0.886399837881199 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 39912145 T/A 1 18 12 30 8.46880500735837 6.35412999509442 2.11467501226395 A:T T A 10 0.529510832924535 0.469979708299931 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39910856_39912147:JUP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 39925925 A/G 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 A:G A G 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000449889:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437187:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000420370:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000424457:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437369:exon_39925878_39925929:JUP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 40269816 G/A 1 5 10 15 2.35244583537732 5.29510832924535 -2.94266249386803 A:G G A 10 0.529510832924535 0.194474740642524 ENSG00000108773:ENST00000225916:exon_40269696_40269832:KAT2A;ENSG00000108773:ENST00000465682:exon_40269696_40269832:KAT2A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 40696233 C/G 1 50 50 100 23.5244583537732 26.4755416462268 -2.9510832924535 C:G C G 10 0.529510832924535 0.616683805236793 ENSG00000108784:ENST00000225927:exon_40695046_40696464:NAGLU;ENSG00000108784:ENST00000377405:exon_40695046_40696464:NAGLU HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 10 15 25 4.70489167075465 7.94266249386803 -3.23777082311338 A:C C A 10 0.529510832924535 0.230939624838663 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 58 59 117 27.288371690377 31.2411391425476 -3.9527674521706 A:G A G 10 0.529510832924535 0.516979380306211 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 11 8 19 5.17538083783011 4.23608666339628 0.939294174433834 A:G G A 10 0.529510832924535 0.81917282175653 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 21 22 43 9.88027250858476 11.6492383243398 -1.76896581575501 A:G A G 10 0.529510832924535 0.647881754255173 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 40847843 C/T 1 1 7 8 0.470489167075465 3.70657583047175 -3.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0301990106165060 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40847539_40847892:CNTNAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 41174025 A/C 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 A:C A C 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000108828:ENST00000355653:exon_41173953_41174459:VAT1;ENSG00000108828:ENST00000315674:exon_41173953_41174397:VAT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 12 10 22 5.64587000490558 5.29510832924535 0.350761675660229 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 13 16 29 6.11635917198104 8.47217332679256 -2.35581415481152 A:G G A 10 0.529510832924535 0.457889314355892 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 18 3 21 8.46880500735837 1.58853249877361 6.88027250858476 C:G C G 10 0.529510832924535 0.00334499185045128 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 42158310 T/G 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 T:C:G T G 10 0.529510832924535 0.765231830293731 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 42225547 A/C 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 A:C A C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42225226_42226395:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42225226_42226395:C17orf53 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 42239292 A/G 1 16 16 32 7.52782667320744 8.47217332679256 -0.944346653585121 A:G A G 10 0.529510832924535 0.859808885917593 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42239239_42239844:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42239239_42239844:C17orf53 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 11 15 26 5.17538083783011 7.94266249386803 -2.76728165603791 C:G C G 10 0.529510832924535 0.327727272541139 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 42268255 G/C 1 31 16 47 14.5851641793394 8.47217332679256 6.11299085254685 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0803417573637626 ENSG00000168591:ENST00000357984:exon_42267869_42269098:TMUB2;ENSG00000168591:ENST00000319511:exon_42267869_42269098:TMUB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 42397660 C/T 1 14 22 36 6.58684833905651 11.6492383243398 -5.06238998528326 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0971450311434139 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 5 8 13 2.35244583537732 4.23608666339628 -1.88364082801896 C:G G C 10 0.529510832924535 0.406366482999609 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 42477189 A/G 1 23 25 48 10.8212508427357 13.2377708231134 -2.41651998037768 A:G A G 10 0.529510832924535 0.563536071188031 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 42953409 A/G 1 11 14 25 5.17538083783011 7.41315166094349 -2.23777082311338 A:G A G 10 0.529510832924535 0.42559887349422 ENSG00000108883:ENST00000426333:exon_42953302_42953468:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000402521:exon_42953302_42953468:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000262414:exon_42953302_42953468:EFTUD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 43008970 T/C 1 9 13 22 4.23440250367918 6.88364082801896 -2.64923832433977 T:C T C 10 0.529510832924535 0.290191579780574 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43008970_43009097:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43008970_43009097:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000376982:exon_43008970_43009097:KIF18B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 43107542 G/A 1 10 12 22 4.70489167075465 6.35412999509442 -1.64923832433977 A:G G A 10 0.529510832924535 0.526608667804835 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43107460_43107547:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43107460_43107547:DCAKD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 55 59 114 25.8769041891506 31.2411391425476 -5.36423495339699 T:C C T 10 0.529510832924535 0.348282863159677 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 131 119 250 61.6340808868859 63.0117891180197 -1.37770823113376 A:G G A 10 0.529510832924535 0.899207885341842 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 43226887 A/G 1 31 27 58 14.5851641793394 14.2967924889624 0.288371690376968 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 43227214 T/C 1 89 53 142 41.8735358697164 28.0640741450004 13.809461724716 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0229391889082146 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 47778793 C/T 1 77 83 160 36.2276658648108 43.9493991327364 -7.72173326792561 T:C C T 10 0.529510832924535 0.235164690198446 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47778305_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47778649_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47778682_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47778683_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508749:exon_47778690_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507477:exon_47778690_47780373:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47778701_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47778701_47778872:SLC35B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 47788755 G/A 1 28 39 67 13.173696678113 20.6509224840569 -7.47722580594385 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0858813654518204 ENSG00000121104:ENST00000240364:exon_47787694_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000513602:exon_47788357_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000503573:exon_47788707_47788917:FAM117A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 48226811 C/T 1 40 44 84 18.8195666830186 23.2984766486795 -4.47890996566094 T:C C T 10 0.529510832924535 0.382014326717856 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 48625928 C/G 1 13 2 15 6.11635917198104 1.05902166584907 5.05733750613197 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0088616695804921 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505085:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000502911:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505456:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508598:exon_48625915_48625942:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515526:exon_48625644_48626064:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511845:exon_48625644_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505336:exon_48625915_48626175:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512416:exon_48625644_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48625915_48625979:SPATA20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 48628092 A/G 1 19 6 25 8.93929417443383 3.17706499754721 5.76222917688662 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0260745492861238 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48627897_48628252:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48628069_48628163:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511347:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505656:exon_48628069_48628212:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508528:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000513618:exon_48627761_48628278:SPATA20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 48628470 T/A 1 10 2 12 4.70489167075465 1.05902166584907 3.64587000490558 A:T T A 10 0.529510832924535 0.0425238621817513 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628359_48628583:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628359_48628745:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628359_48628551:SPATA20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 48629458 A/G 1 18 3 21 8.46880500735837 1.58853249877361 6.88027250858476 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00334499185045128 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48629146_48629541:SPATA20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 48776886 A/G 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 A:G A G 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000154945:ENST00000285243:exon_48776760_48777254:ANKRD40 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 48940422 T/C 1 22 13 35 10.3507616756602 6.88364082801896 3.46712084764127 T:C T C 10 0.529510832924535 0.309714315957545 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1;ENSG00000141232:ENST00000268957:exon_48940341_48941524:TOB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 53851228 C/T 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 T:C C T 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000141179:ENST00000268896:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000417982:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000325214:exon_53851085_53851256:PCTP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 56769979 C/T 1 18 4 22 8.46880500735837 2.11804333169814 6.35076167566023 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00878310155498209 ENSG00000108384:ENST00000461271:exon_56769934_56770046:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000337432:exon_56769934_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487921:exon_56769937_56769993:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000476741:exon_56769963_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000475762:exon_56769963_56771011:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000486827:exon_56769967_56771172:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487525:exon_56769967_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000482007:exon_56769976_56770149:RAD51C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 59760996 A/G 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59759985_59761501:BRIP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 60040329 C/T 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 T:C C T 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000108510:ENST00000262436:exon_60040113_60040332:MED13;ENSG00000108510:ENST00000397786:exon_60040113_60040332:MED13 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 60769803 A/G 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:G A G 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000011028:ENST00000303375:exon_60769592_60770953:MRC2;ENSG00000011028:ENST00000446119:exon_60769592_60770953:MRC2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 61805747 G/A 1 4 9 13 1.88195666830186 4.76559749632082 -2.88364082801896 A:G G A 10 0.529510832924535 0.163083153099282 ENSG00000125695:ENST00000336174:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375840:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000447001:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000392950:exon_61805718_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375841:exon_61805694_61805773:STRADA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 79 97 176 37.1686441989617 51.3625507936799 -14.1939065947182 A:T T A 10 0.529510832924535 0.0344050826335229 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 61903445 G/C 1 12 10 22 5.64587000490558 5.29510832924535 0.350761675660229 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903416_61903495:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903416_61903495:FTSJ3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 237 198 435 111.505932596885 104.843144919058 6.66278767782725 T:C C T 10 0.529510832924535 0.53266676663719 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 305 285 590 143.499195958017 150.910587383492 -7.4113914254757 T:C C T 10 0.529510832924535 0.563725716997918 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 112 117 229 52.6947867124521 61.9527674521706 -9.25798073971853 A:T:G A G 10 0.529510832924535 0.233573865511916 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 49 29 78 23.0539691866978 15.3558141548115 7.69815503188626 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0889748857809634 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 259 226 485 121.856694272545 119.669448240945 2.18724603160051 A:T T A 10 0.529510832924535 0.85571609627676 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 66449122 G/A 1 12 6 18 5.64587000490558 3.17706499754721 2.46880500735837 A:G G A 10 0.529510832924535 0.345463610504387 ENSG00000070540:ENST00000262139:exon_66449051_66449133:WIPI1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 71196809 A/G 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:G A G 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196705_71196915:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196705_71196915:COG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 20 28 48 9.4097833415093 14.826303321887 -5.41651998037768 A:G G A 10 0.529510832924535 0.147525668222606 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 71232687 T/C 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C T C 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 71232807 T/C 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 10 7 17 4.70489167075465 3.70657583047175 0.998315840282904 C:G G C 10 0.529510832924535 0.808990208344625 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 71238433 G/A 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71238383_71238490:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71238383_71238490:C17orf80 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 72859038 C/T 1 38 47 85 17.8785883488677 24.8870091474531 -7.00842079858548 T:C C T 10 0.529510832924535 0.129844059692568 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72858623_72859069:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72858623_72859069:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72858623_72859069:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72858623_72859069:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72858623_72859069:FDXR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 89 78 167 41.8735358697164 41.3018449681137 0.571690901602643 T:C C T 10 0.529510832924535 0.938396771863206 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 157 160 317 73.866799230848 84.7217332679256 -10.8549340370776 T:C T C 10 0.529510832924535 0.237388399641312 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73125173 A/G 1 7 9 16 3.29342416952825 4.76559749632082 -1.47217332679256 A:G A G 10 0.529510832924535 0.617975933604282 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 18 12 30 8.46880500735837 6.35412999509442 2.11467501226395 T:C:G G C 10 0.529510832924535 0.469979708299931 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73127683 T/C 1 48 54 102 22.5834800196223 28.5935849779249 -6.01010495830257 T:C T C 10 0.529510832924535 0.235852304672287 ENSG00000125458:ENST00000245552:exon_73127629_73127877:NT5C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73238509 C/G 1 2 7 9 0.94097833415093 3.70657583047175 -2.76559749632082 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0935246236081911 ENSG00000125447:ENST00000245541:exon_73238417_73238554:GGA3;ENSG00000125447:ENST00000351904:exon_73238417_73238554:GGA3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73274234 A/G 1 28 21 49 13.173696678113 11.1197274914152 2.05396918669778 A:G A G 10 0.529510832924535 0.570979763485987 ENSG00000125454:ENST00000375261:exon_73274233_73274416:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73274233_73274416:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73274233_73274416:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73274233_73274416:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73274233_73274416:SLC25A19 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73627539 T/C 1 12 7 19 5.64587000490558 3.70657583047175 1.93929417443383 T:C T C 10 0.529510832924535 0.491992058405047 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73627530_73627748:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73627530_73627748:RECQL5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73774841 G/A 1 3 9 12 1.41146750122639 4.76559749632082 -3.35412999509442 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0794211024472422 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73816026 A/G 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 A:G A G 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73816001_73816189:UNK;ENSG00000178932:ENST00000326348:exon_73815663_73816134:AC087289.1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73824121 T/C 1 37 32 69 17.4080991817922 16.9443466535851 0.463752528207081 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73823310_73824167:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73824079_73824167:UNC13D HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73827205 T/C 1 24 42 66 11.2917400098112 22.2394549828305 -10.9477149730193 T:C T C 10 0.529510832924535 0.00910174819940829 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73827203_73827250:UNC13D HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73831016 G/A 1 16 14 30 7.52782667320744 7.41315166094349 0.114675012263948 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73831001_73831144:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73831001_73831144:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73831001_73831144:UNC13D HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73836162 C/G 1 18 5 23 8.46880500735837 2.64755416462268 5.82125084273569 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0197453258478573 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73836099_73836191:UNC13D HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 73839137 G/A 1 10 15 25 4.70489167075465 7.94266249386803 -3.23777082311338 A:G G A 10 0.529510832924535 0.230939624838663 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73839095_73839154:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73839095_73839154:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73839095_73839154:UNC13D HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 24 26 50 11.2917400098112 13.7672816560379 -2.47554164622675 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.483457890260999 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 65 63 128 30.5817958599052 33.3591824742457 -2.77738661434049 C:G G C 10 0.529510832924535 0.658329715446358 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 14 21 35 6.58684833905651 11.1197274914152 -4.53287915235873 T:C T C 10 0.529510832924535 0.130972362234130 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 74387284 C/T 1 15 14 29 7.05733750613197 7.41315166094349 -0.355814154811517 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74385614_74387694:UBE2O HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 74477620 C/T 1 11 5 16 5.17538083783011 2.64755416462268 2.52782667320744 T:C C T 10 0.529510832924535 0.222816733853050 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74477457_74477627:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74477457_74477627:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74477457_74477791:RHBDF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 75085434 G/A 1 16 14 30 7.52782667320744 7.41315166094349 0.114675012263948 A:G G A 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 12 9 21 5.64587000490558 4.76559749632082 0.880272508584764 T:C C T 10 0.529510832924535 0.827993527930512 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 28 22 50 13.173696678113 11.6492383243398 1.52445835377325 A:G G A 10 0.529510832924535 0.777257189211731 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 19 17 36 8.93929417443383 9.0016841597171 -0.0623899852832608 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 25 17 42 11.7622291768866 9.0016841597171 2.76054501716953 A:G A G 10 0.529510832924535 0.441487864331347 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 76817090 C/T 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.556631979728114 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76817073_76817143:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76817073_76817143:USP36 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 76968537 G/A 1 10 5 15 4.70489167075465 2.64755416462268 2.05733750613197 A:G G A 10 0.529510832924535 0.314439025315697 ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76967337_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000418895:exon_76967338_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000431152:exon_76967658_76968641:LGALS3BP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 77768654 C/A 1 6 13 19 2.82293500245279 6.88364082801896 -4.06070582556617 A:C C A 10 0.529510832924535 0.0688369807190561 ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77765931_77769357:CBX8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 78247230 C/T 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 78261805 A/G 1 18 21 39 8.46880500735837 11.1197274914152 -2.65092248405687 A:G A G 10 0.529510832924535 0.425404727751142 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78261614_78262162:RNF213 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 78292945 G/A 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.295900852930508 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 78354661 C/T 1 11 9 20 5.17538083783011 4.76559749632082 0.409783341509299 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78354631_78354787:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78354631_78354787:RNF213 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 79202956 T/C 1 7 11 18 3.29342416952825 5.82461916216989 -2.53119499264163 T:C T C 10 0.529510832924535 0.247634630922160 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 79220224 G/C 1 38 31 69 17.8785883488677 16.4148358206606 1.46375252820708 C:G G C 10 0.529510832924535 0.809643390033236 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 79226230 C/T 1 39 38 77 18.3490775159431 20.1214116511323 -1.7723341351892 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.732501800482834 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 79478019 G/A 1 4285 3582 7867 2016.04608091837 1896.70780353568 119.338277382683 A:T:C:G G A 10 0.529510832924535 0.00718440018193833 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 79478870 C/A 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 A:C C A 10 0.529510832924535 0.758162898033516 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 79478871 C/T 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.758162898033516 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 79478916 G/T 1 7 1 8 3.29342416952825 0.529510832924535 2.76391333660372 T:G G T 10 0.529510832924535 0.0741292491828888 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 79511135 A/G 1 15 17 32 7.05733750613197 9.0016841597171 -1.94434665358512 A:G A G 10 0.529510832924535 0.595977363885404 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79511030_79511146:C17orf70 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 79514028 C/G 1 13 6 19 6.11635917198104 3.17706499754721 2.93929417443383 A:C:G C G 10 0.529510832924535 0.25025489550222 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79513935_79514112:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 11 8 19 5.17538083783011 4.23608666339628 0.939294174433834 A:G G A 10 0.529510832924535 0.81917282175653 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 79890818 C/T 1 128 112 240 60.2226133856595 59.3052132875479 0.917400098111585 T:C C T 10 0.529510832924535 0.94846581903077 ENSG00000183010:ENST00000337943:exon_79890269_79890839:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000432920:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000405481:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000329875:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000403172:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000402252:exon_79890756_79890839:PYCR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 79952784 C/A 1 1 11 12 0.470489167075465 5.82461916216989 -5.35412999509442 A:C C A 10 0.529510832924535 0.00219241639848417 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 79993919 C/T 1 137 134 271 64.4570158893387 70.9544516118877 -6.497435722549 T:C C T 10 0.529510832924535 0.429736442496073 ENSG00000169738:ENST00000306869:exon_79993757_79993939:DCXR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 80039481 G/A 1 40 38 78 18.8195666830186 20.1214116511323 -1.30184496811373 A:G G A 10 0.529510832924535 0.8208475571209 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80039477_80039719:FASN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 80059596 T/C 1 165 122 287 77.6307125674517 64.6003216167933 13.0303909506584 A:T:C T C 10 0.529510832924535 0.124638116744362 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80059566_80059742:CCDC57 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 80193928 C/T 1 12 7 19 5.64587000490558 3.70657583047175 1.93929417443383 T:C C T 10 0.529510832924535 0.491992058405047 ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80193859_80194107:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80193859_80194107:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80191563_80194107:SLC16A3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 80615718 G/A 1 6 8 14 2.82293500245279 4.23608666339628 -1.41315166094349 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.594278475296019 ENSG00000141542:ENST00000269347:exon_80614977_80616010:RAB40B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 80895933 A/G 1 27 23 50 12.7032075110376 12.1787491572643 0.524458353773248 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80895925_80896012:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80895925_80896012:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80895925_80896012:TBCD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 51 30 81 23.9949475208487 15.8853249877361 8.10962253311266 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0753694111532744 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 224184 C/G 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 C:G C G 10 0.529510832924535 0.321803815351283 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 304 306 610 143.028706790941 162.030314874908 -19.0016080839664 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.123480658197989 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 2595443 G/T 1 60 52 112 28.2293500245279 27.5345633120758 0.694786712452075 T:G G T 10 0.529510832924535 0.924793183259341 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2595415_2595620:NDC80 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 2892474 G/A 1 3 7 10 1.41146750122639 3.70657583047175 -2.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 0.206417065723492 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2890559_2892484:EMILIN2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 9117867 T/C 1 60 43 103 28.2293500245279 22.768965815755 5.46038420877289 T:C T C 10 0.529510832924535 0.323660432612695 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9117385_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9117836_9117901:NDUFV2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 9255718 G/A 1 145 136 281 68.2209292259424 72.0134732777368 -3.79254405179435 A:G G A 10 0.529510832924535 0.675861655244233 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255630_9255795:ANKRD12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 157 155 312 73.866799230848 82.0741791033029 -8.20737987245494 A:G A G 10 0.529510832924535 0.364441242897459 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 11999115 T/C 1 3 7 10 1.41146750122639 3.70657583047175 -2.29510832924535 T:C T C 10 0.529510832924535 0.206417065723492 ENSG00000141401:ENST00000269159:exon_11999053_11999186:IMPA2;ENSG00000141401:ENST00000383376:exon_11999053_11999186:IMPA2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 141 124 265 66.3389725576406 65.6593432826423 0.67962927499822 C:G C G 10 0.529510832924535 0.950992228605689 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 43 38 81 20.231034184245 20.1214116511323 0.109622533112663 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 28 27 55 13.173696678113 14.2967924889624 -1.12309581084943 T:C C T 10 0.529510832924535 0.788243767898544 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 12718593 A/G 1 84 71 155 39.5210900343391 37.595269137642 1.92582089669707 A:G A G 10 0.529510832924535 0.809375422597995 ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 32822382 G/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:G G T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000186812:ENST00000330501:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000261333:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000355632:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000421371:exon_32822355_32822848:ZNF397 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 6 8 14 2.82293500245279 4.23608666339628 -1.41315166094349 T:C T C 10 0.529510832924535 0.594278475296019 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 44407993 G/A 1 8 10 18 3.76391333660372 5.29510832924535 -1.53119499264163 A:G G A 10 0.529510832924535 0.489195304177666 ENSG00000078043:ENST00000398654:exon_44407922_44408093:PIAS2;ENSG00000078043:ENST00000262161:exon_44407922_44408093:PIAS2;ENSG00000078043:ENST00000398651:exon_44407922_44408093:PIAS2;ENSG00000078043:ENST00000324794:exon_44407922_44408093:PIAS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 47017820 A/G 1 12 7 19 5.64587000490558 3.70657583047175 1.93929417443383 A:G A G 10 0.529510832924535 0.491992058405047 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 47911594 G/T 1 20 1 21 9.4097833415093 0.529510832924535 8.88027250858477 T:G G T 10 0.529510832924535 3.45304212151119e-05 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47911586_47911723:SKA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 47911631 A/G 1 16 3 19 7.52782667320744 1.58853249877361 5.93929417443383 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00942790030879335 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47911586_47911723:SKA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 47918536 C/T 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 T:C C T 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000488454:exon_47918469_47918621:SKA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 10 19 29 4.70489167075465 10.0607058255662 -5.35581415481152 A:C A C 10 0.529510832924535 0.061359401612007 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 48473401 A/G 1 62 41 103 29.1703283586788 21.7099441499059 7.46038420877289 A:G A G 10 0.529510832924535 0.166716214329446 ENSG00000082212:ENST00000321341:exon_48473387_48474691:ME2;ENSG00000082212:ENST00000382927:exon_48473387_48474258:ME2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 51820805 G/A 1 31 21 52 14.5851641793394 11.1197274914152 3.46543668792418 A:G G A 10 0.529510832924535 0.404859559951236 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 59 75 134 27.7588608574524 39.7133124693401 -11.9544516118877 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0461518901301723 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 55240505 C/T 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55240478_55240597:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55240478_55240597:FECH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 56149048 A/G 1 17 8 25 7.9983158402829 4.23608666339628 3.76222917688662 A:G A G 10 0.529510832924535 0.161536990622003 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56148479_56149271:ALPK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 57000469 T/A 1 40 33 73 18.8195666830186 17.4738574865097 1.34570919650894 A:T T A 10 0.529510832924535 0.814968098125882 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57000323_57000476:LMAN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 57022754 T/C 1 11 13 24 5.17538083783011 6.88364082801896 -1.70825999018884 T:C T C 10 0.529510832924535 0.542854194228007 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57022736_57022890:LMAN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 61650865 G/A 1 16 22 38 7.52782667320744 11.6492383243398 -4.12141165113233 A:G G A 10 0.529510832924535 0.196062898787779 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61650813_61650881:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61650813_61650955:SERPINB8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 61654297 A/G 1 30 13 43 14.1146750122639 6.88364082801896 7.23103418424499 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0317553375803058 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 5 15 20 2.35244583537732 7.94266249386803 -5.5902166584907 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0135453328641453 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 77171061 T/G 1 4 10 14 1.88195666830186 5.29510832924535 -3.41315166094349 T:G T G 10 0.529510832924535 0.105177291482310 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 77474626 C/T 1 9 14 23 4.23440250367918 7.41315166094349 -3.17874915726431 T:C C T 10 0.529510832924535 0.212944448586151 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77474491_77475528:CTDP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 87 73 160 40.9325575355655 38.6542908034911 2.27826673207439 A:C A C 10 0.529510832924535 0.75171066349742 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 77895898 G/A 1 10 4 14 4.70489167075465 2.11804333169814 2.58684833905651 A:G G A 10 0.529510832924535 0.19016988576375 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 18 77896242 C/T 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 579627 C/T 1 188 289 477 88.4519634101874 153.028630715191 -64.5766673050032 A:T:C:G C T 10 0.529510832924535 3.5298298008735e-09 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 580388 C/G 1 246 321 567 115.740335100564 169.972977368776 -54.2326422682114 C:G C G 10 0.529510832924535 5.27275794061479e-06 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 580575 C/T 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 T:C C T 10 0.529510832924535 0.321803815351283 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 355 202 557 167.02365431179 106.961188250756 60.062466061034 T:C T C 10 0.529510832924535 3.18737825679500e-07 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 929678 G/A 1 11 13 24 5.17538083783011 6.88364082801896 -1.70825999018884 A:G G A 10 0.529510832924535 0.542854194228007 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 990281 G/A 1 49 47 96 23.0539691866978 24.8870091474531 -1.83303996075536 A:G G A 10 0.529510832924535 0.759332104301353 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_990223_990364:WDR18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 992031 G/T 0 119 0 119 55.9882108819803 0 55.9882108819803 G G 10 0.529510832924535 1.81520340774182e-33 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991955_992121:WDR18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 1011823 A/G 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 A:G A G 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 38 32 70 17.8785883488677 16.9443466535851 0.934241695282548 A:G A G 10 0.529510832924535 0.904832285095606 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 1080681 G/A 1 59 36 95 27.7588608574524 19.0623899852833 8.69647087216917 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0806392434905948 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080681_1080785:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080681_1080785:HMHA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 1112943 G/C 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 C:G G C 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1112817_1112948:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1112817_1112948:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1112817_1112948:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1112817_1112948:SBNO2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 14 13 27 6.58684833905651 6.88364082801896 -0.296792488962446 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 1819125 T/C 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 T:C T C 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 1821637 A/G 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 A:G A G 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1821518_1821681:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1821518_1821681:REXO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 1827565 A/G 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 A:G A G 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 1854557 A/G 1 19 13 32 8.93929417443383 6.88364082801896 2.05565334641488 A:G A G 10 0.529510832924535 0.485297135983152 ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 1912817 C/T 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 9 6 15 4.23440250367918 3.17706499754721 1.05733750613197 A:T:C T C 10 0.529510832924535 0.61671670096814 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 60 70 130 28.2293500245279 37.0657583047175 -8.83640828018956 A:G G A 10 0.529510832924535 0.135114074385322 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 14 12 26 6.58684833905651 6.35412999509442 0.232718343962088 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 2098770 C/T 1 34 26 60 15.9966316805658 13.7672816560379 2.2293500245279 T:C C T 10 0.529510832924535 0.606378710662479 ENSG00000099840:ENST00000481489:exon_2098435_2098803:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 2129352 T/C 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 T:C:G T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2129317_2129456:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2129317_2129456:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2129317_2129456:AP3D1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 23 32 55 10.8212508427357 16.9443466535851 -6.12309581084943 A:G G A 10 0.529510832924535 0.105946769304173 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 2226772 G/C 1 22 20 42 10.3507616756602 10.5902166584907 -0.239454982830472 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 43 47 90 20.231034184245 24.8870091474531 -4.65597496320815 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.343103068474593 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 2732741 G/A 1 62 63 125 29.1703283586788 33.3591824742457 -4.18885411556688 A:G G A 10 0.529510832924535 0.474226029849526 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 51 41 92 23.9949475208487 21.7099441499059 2.28500337094277 T:C T C 10 0.529510832924535 0.676744036841262 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 17 25 42 7.9983158402829 13.2377708231134 -5.23945498283047 A:C A C 10 0.529510832924535 0.122291541862269 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 20 18 38 9.4097833415093 9.53119499264163 -0.12141165113233 T:G G T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 2933480 C/T 1 14 17 31 6.58684833905651 9.0016841597171 -2.41483582066059 T:C C T 10 0.529510832924535 0.472439231356365 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 2934282 T/C 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000175691:ENST00000444249:exon_2933536_2934388:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000341064:exon_2933536_2934393:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 2994903 T/C 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 2994921 G/A 1 9 6 15 4.23440250367918 3.17706499754721 1.05733750613197 A:G G A 10 0.529510832924535 0.61671670096814 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 21 24 45 9.88027250858476 12.7082599901888 -2.82798748160408 A:G G A 10 0.529510832924535 0.456087423267675 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 3193375 A/C 1 8 6 14 3.76391333660372 3.17706499754721 0.586848339056509 A:C A C 10 0.529510832924535 0.795582240516341 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3193282_3193426:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3193282_3193426:NCLN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 3544865 G/A 0 54 0 54 25.4064150220751 0 25.4064150220751 G G 10 0.529510832924535 1.35649989476949e-15 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 3611972 G/A 1 10 13 23 4.70489167075465 6.88364082801896 -2.17874915726431 A:G G A 10 0.529510832924535 0.407596227656326 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3610626_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3611925_3612411:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3611729_3612412:C19orf29OS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 3633115 C/A 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 A:C C A 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3630182_3633167:PIP5K1C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 3752515 G/A 1 28 20 48 13.173696678113 10.5902166584907 2.58348001962232 A:G G A 10 0.529510832924535 0.47366272178497 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752506_3752718:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752506_3752718:APBA3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4180836 C/T 1 18 20 38 8.46880500735837 10.5902166584907 -2.12141165113233 T:C C T 10 0.529510832924535 0.518950365306029 ENSG00000077463:ENST00000337491:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000305232:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000269860:exon_4180779_4180906:SIRT6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4233095 T/C 0 8 0 8 3.76391333660372 0 3.76391333660372 T T 10 0.529510832924535 0.00858117377180446 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4233096 G/A 0 8 0 8 3.76391333660372 0 3.76391333660372 G G 10 0.529510832924535 0.00858117377180446 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4233107 C/T 1 8 1 9 3.76391333660372 0.529510832924535 3.23440250367918 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0420136690367002 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4234856 T/A 1 4 13 17 1.88195666830186 6.88364082801896 -5.0016841597171 A:T T A 10 0.529510832924535 0.0256522869308762 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 3 11 14 1.41146750122639 5.82461916216989 -4.41315166094349 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0285693609958318 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 14 17 31 6.58684833905651 9.0016841597171 -2.41483582066059 C:G G C 10 0.529510832924535 0.472439231356365 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4493708 A/G 1 44 51 95 20.7015233513205 27.0050524791513 -6.30352912783083 A:G A G 10 0.529510832924535 0.217562764369318 ENSG00000167674:ENST00000429822:exon_4493700_4493859:AC011498.1;ENSG00000167674:ENST00000301284:exon_4493700_4493859:AC011498.1;ENSG00000167674:ENST00000398364:exon_4493700_4493859:AC011498.1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 51 31 82 23.9949475208487 16.4148358206606 7.58011170018813 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0979063212947733 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 21 21 42 9.88027250858476 11.1197274914152 -1.23945498283047 T:C T C 10 0.529510832924535 0.758233996771047 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 34 26 60 15.9966316805658 13.7672816560379 2.2293500245279 T:C C T 10 0.529510832924535 0.606378710662479 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 39 30 69 18.3490775159431 15.8853249877361 2.46375252820708 T:C T C 10 0.529510832924535 0.62989339404706 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4929413 T/C 1 5 9 14 2.35244583537732 4.76559749632082 -2.41315166094349 T:C T C 10 0.529510832924535 0.28431222286612 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4929473 A/G 1 14 17 31 6.58684833905651 9.0016841597171 -2.41483582066059 A:G A G 10 0.529510832924535 0.472439231356365 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 4950770 C/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4950623_4950785:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4950623_4950785:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4950623_4950785:UHRF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 115 75 190 54.1062542136785 39.7133124693401 14.3929417443383 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0415975262209334 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 5707628 G/A 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 A:G G A 10 0.529510832924535 0.589735300550817 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 5783634 T/C 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000212123:ENST00000390672:exon_5782971_5784610:PRR22;ENSG00000212123:ENST00000419421:exon_5782971_5784064:PRR22 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 17 15 32 7.9983158402829 7.94266249386803 0.0556533464148785 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 5789565 T/C 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 T:C T C 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 5914605 A/G 1 18 9 27 8.46880500735837 4.76559749632082 3.70320751103755 A:G A G 10 0.529510832924535 0.179182503083520 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 5914625 G/A 1 14 9 23 6.58684833905651 4.76559749632082 1.82125084273569 A:G G A 10 0.529510832924535 0.533349006667712 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 6222552 C/T 1 18 12 30 8.46880500735837 6.35412999509442 2.11467501226395 T:C C T 10 0.529510832924535 0.469979708299931 ENSG00000130382:ENST00000252674:exon_6222132_6222695:MLLT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 772 680 1452 363.217636982259 360.067366388684 3.15027059357516 A:G G A 10 0.529510832924535 0.874697823444816 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 6737481 T/C 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:C T C 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6737468_6737633:GPR108 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 7125297 G/A 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7125294_7125538:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7125294_7125538:INSR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 7533767 T/G 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 T:G T G 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 7533850 A/G 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 A:G A G 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 7623700 G/A 1 7 8 15 3.29342416952825 4.23608666339628 -0.942662493868026 A:G G A 10 0.529510832924535 0.797047341083576 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 8319455 C/T 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 T:C C T 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8319383_8319500:LASS4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 8320555 G/A 1 8 11 19 3.76391333660372 5.82461916216989 -2.06070582556617 A:G G A 10 0.529510832924535 0.367060340223589 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8320491_8320609:LASS4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 8326866 C/T 1 53 33 86 24.9359258549996 17.4738574865097 7.46206836848998 T:C C T 10 0.529510832924535 0.129991336501202 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 31 43 74 14.5851641793394 22.768965815755 -8.18380163641559 A:G G A 10 0.529510832924535 0.062428933906577 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 8326944 G/A 1 45 25 70 21.1720125183959 13.2377708231134 7.93424169528255 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0717634621702455 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 8326999 C/T 1 24 13 37 11.2917400098112 6.88364082801896 4.4080991817922 T:C C T 10 0.529510832924535 0.187211545095096 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 8468337 C/T 1 73 93 166 34.3457091965089 49.2445074619818 -14.8987982654728 T:C:G C T 10 0.529510832924535 0.0238799279312558 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 8468485 C/T 1 80 98 178 37.6391333660372 51.8920616266044 -14.2529282605672 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0353663228107491 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 8551028 C/T 1 226 223 449 106.330551759055 118.080915742171 -11.7503639831162 T:C:G C T 10 0.529510832924535 0.27698757098514 ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8550487_8551289:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8550487_8551289:HNRNPM HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 8551112 G/T 1 303 271 574 142.558217623866 143.497435722549 -0.939218098683114 T:G G T 10 0.529510832924535 0.966653390218 ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8550487_8551289:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8550487_8551289:HNRNPM HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 9523973 G/A 1 23 24 47 10.8212508427357 12.7082599901888 -1.88700914745315 A:G G A 10 0.529510832924535 0.661687005600974 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 9524420 C/T 1 18 16 34 8.46880500735837 8.47217332679256 -0.00336831943419114 T:C:G C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524224_9525396:ZNF266 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 9922223 G/A 1 8 12 20 3.76391333660372 6.35412999509442 -2.5902166584907 A:G G A 10 0.529510832924535 0.269589908278233 ENSG00000127452:ENST00000247977:exon_9920947_9922393:FBXL12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 10394792 G/A 1 19 21 40 8.93929417443383 11.1197274914152 -2.1804333169814 A:G G A 10 0.529510832924535 0.528665131795966 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10394709_10394996:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10394709_10394996:ICAM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 10426422 A/C 1 14 18 32 6.58684833905651 9.53119499264163 -2.94434665358512 A:C A C 10 0.529510832924535 0.3762625903731 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 15 18 33 7.05733750613197 9.53119499264163 -2.47385748650966 T:C T C 10 0.529510832924535 0.486071411674079 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 10449392 A/G 1 137 118 255 64.4570158893387 62.4822782850951 1.97473760424356 A:G A G 10 0.529510832924535 0.850773039713252 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 10668673 A/G 1 44 34 78 20.7015233513205 18.0033683194342 2.69815503188627 A:G A G 10 0.529510832924535 0.571969144813385 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 10738639 C/T 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.556631979728114 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10738596_10738680:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10738596_10738680:SLC44A2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 10742170 A/G 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10742151_10742211:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10742151_10742211:SLC44A2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 10793295 C/G 1 56 43 99 26.347393356226 22.768965815755 3.57842754047103 C:G C G 10 0.529510832924535 0.482909260062432 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10793213_10793380:ILF3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 10794630 G/T 1 233 187 420 109.623975928583 99.0185257568881 10.6054501716953 T:G G T 10 0.529510832924535 0.305052159197892 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 44 28 72 20.7015233513205 14.826303321887 5.87522002943347 T:C T C 10 0.529510832924535 0.193951669689049 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 59 98 157 27.7588608574524 51.8920616266044 -24.133200769152 T:C T C 10 0.529510832924535 0.000115912017243966 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 11224265 A/G 1 9 6 15 4.23440250367918 3.17706499754721 1.05733750613197 A:G A G 10 0.529510832924535 0.61671670096814 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11224211_11224438:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11224211_11224438:LDLR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 11226800 C/T 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 0.159283336846293 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11226770_11226888:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11226770_11226888:LDLR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 11277232 G/A 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000197256:ENST00000355150:exon_11274943_11277287:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000432929:exon_11274943_11277287:KANK2;ENSG00000197256:ENST00000439675:exon_11276266_11277287:KANK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 11558275 G/A 1 128 118 246 60.2226133856595 62.4822782850951 -2.25966489943562 A:T:G G A 10 0.529510832924535 0.798489066380168 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11558254_11558433:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11558254_11558412:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11558254_11558433:PRKCSH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 12383540 G/C 1 10 12 22 4.70489167075465 6.35412999509442 -1.64923832433977 C:G G C 10 0.529510832924535 0.526608667804835 ENSG00000197857:ENST00000397742:exon_12383302_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000356109:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000457673:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000355684:exon_12383144_12384878:ZNF44 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 12384580 T/C 1 8 2 10 3.76391333660372 1.05902166584907 2.70489167075465 T:C T C 10 0.529510832924535 0.115498370857198 ENSG00000197857:ENST00000397742:exon_12383302_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000356109:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000457673:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000355684:exon_12383144_12384878:ZNF44 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 12845190 C/T 1 200 195 395 94.097833415093 103.254612420284 -9.15677900519134 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.364538114077762 ENSG00000123144:ENST00000242784:exon_12845127_12845529:C19orf43 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 12917520 A/G 1 69 43 112 32.4637525282071 22.768965815755 9.69478671245207 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0720940535617084 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12917428_12917614:RNASEH2A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 12920935 G/A 1 71 83 154 33.404730862358 43.9493991327364 -10.5446682703784 A:G G A 10 0.529510832924535 0.090576741627636 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12920885_12921022:RNASEH2A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 12921186 T/C 1 92 80 172 43.2850033709428 42.3608666339628 0.924136736979975 T:C T C 10 0.529510832924535 0.939151787247522 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12921131_12921218:RNASEH2A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 12924157 C/T 1 80 87 167 37.6391333660372 46.0674424644345 -8.42830909839735 T:C C T 10 0.529510832924535 0.214764228547723 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12924142_12924462:RNASEH2A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 39 41 80 18.3490775159431 21.7099441499059 -3.3608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 0.501972930227625 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 13035006 G/A 1 103 143 246 48.4603842087729 75.7200491082085 -27.2596648994356 A:G G A 10 0.529510832924535 0.000542546806567338 ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13034965_13035079:FARSA;ENSG00000179115:ENST00000423140:exon_13034965_13035079:FARSA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 1089 1171 2260 512.362702945181 620.057185354631 -107.694482409449 A:T:C:G G T 10 0.529510832924535 5.82024839449221e-06 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 13220676 G/A 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:G G A 10 0.529510832924535 0.742993974261161 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 167 136 303 78.5716909016027 72.0134732777368 6.55821762386589 T:C C T 10 0.529510832924535 0.455079574238244 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 528 516 1044 248.418280215845 273.22758978906 -24.8093095732146 A:G A G 10 0.529510832924535 0.128706516857684 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 14020733 G/A 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 A:G G A 10 0.529510832924535 0.779088238758133 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14020636_14020771:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14020636_14020771:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14020636_14020771:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14020636_14020771:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14020664_14020771:CC2D1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 14030689 T/C 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 14492265 T/C 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 5 8 13 2.35244583537732 4.23608666339628 -1.88364082801896 T:C T C 10 0.529510832924535 0.406366482999609 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 14582468 G/A 1 167 155 322 78.5716909016027 82.0741791033029 -3.50248820170029 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.69642121069991 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 14589378 C/T 1 18 18 36 8.46880500735837 9.53119499264163 -1.06238998528326 T:C C T 10 0.529510832924535 0.741270102583595 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14588574_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14588574_14589379:GIPC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 26 14 40 12.2327183439621 7.41315166094349 4.8195666830186 A:G G A 10 0.529510832924535 0.153873109003923 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 143 110 253 67.2799508917915 58.2461916216989 9.03375927009263 C:G G C 10 0.529510832924535 0.257785078344759 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 24 33 57 11.2917400098112 17.4738574865097 -6.1821174766985 A:G A G 10 0.529510832924535 0.111765719502838 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 15233732 G/A 1 12 11 23 5.64587000490558 5.82461916216989 -0.178749157264306 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233703_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233703_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233703_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233703_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233703_15233841:ILVBL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 15574858 C/T 0 55 0 55 25.8769041891506 0 25.8769041891506 C C 10 0.529510832924535 7.11804782853397e-16 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15574842_15575188:RASAL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 16236354 G/A 1 49 67 116 23.0539691866978 35.4772258059438 -12.4232566192461 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0251957916120225 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16236280_16236357:RAB8A;ENSG00000167461:ENST00000412859:exon_16236280_16236507:RAB8A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 16666101 G/C 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000127526:ENST00000436494:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000409648:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000248069:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000421082:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000469055:exon_16665963_16666412:SLC35E1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 16677289 C/A 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 A:C C A 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000127526:ENST00000488894:exon_16676039_16677468:SLC35E1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17283657 C/T 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 T:C C T 10 0.529510832924535 0.186533779694549 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17283568_17283772:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17283568_17283772:MYO9B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 22 20 42 10.3507616756602 10.5902166584907 -0.239454982830472 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 31 30 61 14.5851641793394 15.8853249877361 -1.30016080839664 T:C T C 10 0.529510832924535 0.797991444405207 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 24 27 51 11.2917400098112 14.2967924889624 -3.00505247915129 T:C C T 10 0.529510832924535 0.404319228661105 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 23 39 62 10.8212508427357 20.6509224840569 -9.82967164132117 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0150849439119416 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 45 36 81 21.1720125183959 19.0623899852833 2.10962253311266 A:G A G 10 0.529510832924535 0.657807007338896 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17321487 A/G 1 12 8 20 5.64587000490558 4.23608666339628 1.4097833415093 A:G A G 10 0.529510832924535 0.655754725288894 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17330060 T/C 1 31 24 55 14.5851641793394 12.7082599901888 1.87690418915057 T:C T C 10 0.529510832924535 0.685939712815982 ENSG00000053501:ENST00000263897:exon_17330022_17330196:USE1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17451981 G/A 1 23 14 37 10.8212508427357 7.41315166094349 3.4080991817922 A:G G A 10 0.529510832924535 0.323472396712987 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17451853_17452131:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17451853_17452131:GTPBP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17533126 A/G 1 7 8 15 3.29342416952825 4.23608666339628 -0.942662493868026 A:G A G 10 0.529510832924535 0.797047341083576 ENSG00000141971:ENST00000524382:exon_17533094_17533267:FAM125A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 102 89 191 47.9898950416974 47.1264641302836 0.863430911413801 A:G A G 10 0.529510832924535 0.942258411061838 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17648350 T/C 1 14 12 26 6.58684833905651 6.35412999509442 0.232718343962088 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17648185_17648352:FAM129C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17651370 A/G 1 13 18 31 6.11635917198104 9.53119499264163 -3.41483582066059 A:G A G 10 0.529510832924535 0.280312149032782 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17651201_17651391:FAM129C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17664418 G/A 1 21 16 37 9.88027250858476 8.47217332679256 1.4080991817922 A:G G A 10 0.529510832924535 0.742581671935698 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17664122_17664647:FAM129C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17886940 G/A 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 A:G G A 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17886792_17886970:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17886792_17886970:FCHO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17892591 A/G 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17892521_17892629:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17892521_17892629:FCHO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17972889 C/T 1 7 12 19 3.29342416952825 6.35412999509442 -3.06070582556617 T:C C T 10 0.529510832924535 0.174545004364366 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 17973573 G/A 1 14 10 24 6.58684833905651 5.29510832924535 1.29174000981116 A:G G A 10 0.529510832924535 0.684850962838789 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 18047283 T/G 1 152 144 296 71.5143533954707 76.249559941133 -4.73520654566236 T:G T G 10 0.529510832924535 0.600472165614585 ENSG00000007080:ENST00000445755:exon_18047219_18047388:CCDC124;ENSG00000007080:ENST00000262801:exon_18047217_18047388:CCDC124 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 18123738 T/C 1 5 9 14 2.35244583537732 4.76559749632082 -2.41315166094349 T:C T C 10 0.529510832924535 0.28431222286612 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18123722_18124903:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18123722_18124903:ARRDC2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 18170384 G/A 1 22 14 36 10.3507616756602 7.41315166094349 2.93761001471674 A:G G A 10 0.529510832924535 0.404383124064166 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 18679379 C/G 1 49 52 101 23.0539691866978 27.5345633120758 -4.48059412537804 C:G C G 10 0.529510832924535 0.372088321631267 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 1 92 5 97 43.2850033709428 2.64755416462268 40.6374492063201 A:T:C C A 10 0.529510832924535 6.93670430074009e-20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 18685964 G/T 1 3846 3686 7532 1809.50133657224 1951.77693015984 -142.275593587598 A:T:C:G G T 10 0.529510832924535 0.00104409682432725 ENSG00000221983:ENST00000430157:exon_18685867_18688269:UBA52;ENSG00000221983:ENST00000442744:exon_18685867_18688269:UBA52 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 19017862 G/A 1 10 166 176 4.70489167075465 87.8987982654728 -83.1939065947182 A:G G A 10 0.529510832924535 5.0348987502476e-42 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19017769_19017921:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19017769_19017921:COPE HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 21 11 32 9.88027250858476 5.82461916216989 4.05565334641488 A:G G A 10 0.529510832924535 0.160891288140652 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 19648346 G/C 1 14 20 34 6.58684833905651 10.5902166584907 -4.00336831943419 C:G G C 10 0.529510832924535 0.174339867028717 ENSG00000250067:ENST00000458210:exon_19648121_19648387:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000514277:exon_19648121_19648390:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000436027:exon_19648128_19648393:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000397179:exon_19648128_19648393:YJEFN3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 19737686 C/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19737352_19738093:LPAR2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 19740729 C/G 1 135 119 254 63.5160375551878 63.0117891180197 0.504248437168101 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 21909733 C/T 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000197020:ENST00000358296:exon_21906844_21910791:ZNF100;ENSG00000197020:ENST00000445015:exon_21906844_21910791:ZNF100 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 24310032 A/T 1 7 8 15 3.29342416952825 4.23608666339628 -0.942662493868026 A:T A T 10 0.529510832924535 0.797047341083576 ENSG00000213096:ENST00000357002:exon_24309056_24312643:ZNF254 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 33098632 G/C 1 8 3 11 3.76391333660372 1.58853249877361 2.17538083783011 C:G G C 10 0.529510832924535 0.235512259698034 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33098541_33098738:ANKRD27 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 33110204 T/C 1 11 11 22 5.17538083783011 5.82461916216989 -0.649238324339771 T:C T C 10 0.529510832924535 0.833021301127803 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33110166_33110285:ANKRD27 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 33183534 A/G 1 9 5 14 4.23440250367918 2.64755416462268 1.58684833905651 A:G A G 10 0.529510832924535 0.435350095576674 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 33370070 A/G 1 11 5 16 5.17538083783011 2.64755416462268 2.52782667320744 A:G A G 10 0.529510832924535 0.222816733853050 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 33370084 T/A 1 12 7 19 5.64587000490558 3.70657583047175 1.93929417443383 A:T T A 10 0.529510832924535 0.491992058405047 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 33370161 A/C 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 A:C A C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 33444707 C/T 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 T:C C T 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000427840:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000415324:exon_33444521_33444707:CCDC123 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 16 8 24 7.52782667320744 4.23608666339628 3.29174000981116 A:G G A 10 0.529510832924535 0.221030946982489 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 33600764 T/C 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33600623_33600922:GPATCH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 33602757 C/T 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33602630_33602808:GPATCH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 33608733 C/A 1 9 2 11 4.23440250367918 1.05902166584907 3.17538083783011 A:C C A 10 0.529510832924535 0.070493162541885 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33608731_33608947:GPATCH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 34868642 A/G 1 307 305 612 144.440174292168 161.500804041983 -17.0606297498155 A:G A G 10 0.529510832924535 0.168787276810741 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34868640_34868786:GPI HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 34959979 A/G 1 118 106 224 55.5177217149049 56.1281482900007 -0.61042657509585 A:G A G 10 0.529510832924535 0.946717073382932 ENSG00000126261:ENST00000246548:exon_34959945_34960795:UBA2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 35510102 G/C 1 51 35 86 23.9949475208487 18.5328791523587 5.46206836848998 C:G G C 10 0.529510832924535 0.280004752758525 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 35660508 G/A 1 342 285 627 160.907295139809 150.910587383492 9.99670775631651 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.447213413245693 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35660469_35660536:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 35741456 T/C 1 15 9 24 7.05733750613197 4.76559749632082 2.29174000981116 T:C T C 10 0.529510832924535 0.4160778721084 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 35757427 G/A 1 27 24 51 12.7032075110376 12.7082599901888 -0.0050524791512867 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35757262_35757435:LSR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 138 120 258 64.9275050564142 63.5412999509442 1.38620510546995 A:G A G 10 0.529510832924535 0.900782560388048 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 35836600 C/A 1 200 215 415 94.097833415093 113.844829078775 -19.746995663682 A:C C A 10 0.529510832924535 0.055086521309127 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35836505_35836623:CD22 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 36210925 C/T 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36210686_36212706:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36210686_36212706:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36210686_36212706:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000341701:exon_36210686_36211842:AD000671.3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 36231370 C/T 1 9 14 23 4.23440250367918 7.41315166094349 -3.17874915726431 T:C C T 10 0.529510832924535 0.212944448586151 ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36231281_36231465:TMEM149 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 36594659 A/T 1 13 20 33 6.11635917198104 10.5902166584907 -4.47385748650966 A:T A T 10 0.529510832924535 0.162000968884620 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 36605647 T/C 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 T:C T C 10 0.529510832924535 0.782760397275129 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 36640769 T/C 1 227 233 460 106.801040926131 123.376024071417 -16.5749831452861 T:C T C 10 0.529510832924535 0.123431378222972 ENSG00000126247:ENST00000457326:exon_36640715_36641254:CAPNS1;ENSG00000126247:ENST00000246533:exon_36640715_36641254:CAPNS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 25 25 50 11.7622291768866 13.2377708231134 -1.47554164622675 A:G G A 10 0.529510832924535 0.674276672486304 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 37005998 A/G 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G A G 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 51 62 113 23.9949475208487 32.8296716413212 -8.83472412047246 T:C T C 10 0.529510832924535 0.108900402490600 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 38871622 C/T 1 142 191 333 66.809461724716 101.136569088586 -34.3271073638702 T:C C T 10 0.529510832924535 0.000181563939159170 ENSG00000099341:ENST00000215071:exon_38871539_38871639:PSMD8;ENSG00000099341:ENST00000404323:exon_38871539_38871639:PSMD8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 38893856 G/C 1 8 11 19 3.76391333660372 5.82461916216989 -2.06070582556617 C:G G C 10 0.529510832924535 0.367060340223589 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38893775_38893858:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38893775_38893858:FAM98C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39086240 T/C 1 9 11 20 4.23440250367918 5.82461916216989 -1.5902166584907 T:C T C 10 0.529510832924535 0.508807175217642 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39086383 G/C 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 C:G G C 10 0.529510832924535 0.730352777445792 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39086580 A/G 1 91 93 184 42.8145142038673 49.2445074619818 -6.42999325811445 A:G A G 10 0.529510832924535 0.375568241167123 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 97 86 183 45.6374492063201 45.53793163151 0.0995175748100863 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39100594 G/A 1 27 28 55 12.7032075110376 14.826303321887 -2.12309581084943 A:G G A 10 0.529510832924535 0.591040046308657 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39100549_39100665:MAP4K1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39100688 G/A 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 A:G G A 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39196736 G/A 1 71 70 141 33.404730862358 37.0657583047175 -3.66102744235944 A:G G A 10 0.529510832924535 0.555531504251147 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39219780 T/C 1 241 230 471 113.387889265187 121.787491572643 -8.39960230745601 T:C T C 10 0.529510832924535 0.460239525965958 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000497637:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000477174:exon_39219636_39219794:ACTN4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39308190 C/T 1 315 280 595 148.204087628771 148.26303321887 -0.0589455900983751 T:C:G C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39308091_39308215:ECH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 155 145 300 72.9258208966971 76.7790707740576 -3.85324987736053 T:G T G 10 0.529510832924535 0.685683431522066 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39329517 C/T 1 10 17 27 4.70489167075465 9.0016841597171 -4.29679248896245 T:C C T 10 0.529510832924535 0.122483857632165 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39338125 G/A 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 A:G G A 10 0.529510832924535 0.556631979728114 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39360720 G/A 1 8 11 19 3.76391333660372 5.82461916216989 -2.06070582556617 A:G G A 10 0.529510832924535 0.367060340223589 ENSG00000187994:ENST00000340740:exon_39360583_39360900:RINL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39880011 G/A 1 49 57 106 23.0539691866978 30.1821174766985 -7.12814829000072 A:G G A 10 0.529510832924535 0.173908220421633 ENSG00000006712:ENST00000221265:exon_39879922_39880023:PAF1;ENSG00000006712:ENST00000221266:exon_39879922_39880023:PAF1;ENSG00000006712:ENST00000416728:exon_39879922_39880023:PAF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39888390 G/C 1 31 43 74 14.5851641793394 22.768965815755 -8.18380163641559 C:G G C 10 0.529510832924535 0.062428933906577 ENSG00000063322:ENST00000315588:exon_39888097_39891201:MED29;ENSG00000063322:ENST00000435462:exon_39888167_39888397:MED29 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 17 17 34 7.9983158402829 9.0016841597171 -1.00336831943419 A:G G A 10 0.529510832924535 0.734980712954295 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 26 28 54 12.2327183439621 14.826303321887 -2.59358497792489 A:G G A 10 0.529510832924535 0.4981576455005 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39915731 C/T 1 36 26 62 16.9376100147167 13.7672816560379 3.17032835867883 T:C C T 10 0.529510832924535 0.44735475182858 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 30 41 71 14.1146750122639 21.7099441499059 -7.59526913764199 C:G C G 10 0.529510832924535 0.075151362796314 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39915958 A/G 1 75 75 150 35.2866875306599 39.7133124693401 -4.42662493868026 A:G A G 10 0.529510832924535 0.513039691087864 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39915878_39916156:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39923952 G/A 1 3754 4094 7848 1766.2163332013 2167.81734999305 -401.601016791751 A:T:C:G G A 10 0.529510832924535 1.24239007126996e-19 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39923852_39924058:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39923852_39924058:RPS16 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 29 46 75 13.6441858451885 24.3574983145286 -10.7133124693401 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0148469237100938 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39926509 A/C 1 4114 3208 7322 1935.59243334846 1698.67075202191 236.921681326555 A:T:C:G A C 10 0.529510832924535 2.84313661242622e-08 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39926521 G/A 1 3943 3114 7057 1855.13878577856 1648.896733727 206.242052051556 A:T:G G A 10 0.529510832924535 8.90894197442305e-07 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 39963828 T/A 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 A:T T A 10 0.529510832924535 0.159283336846293 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 40197924 T/C 1 11 11 22 5.17538083783011 5.82461916216989 -0.649238324339771 T:C T C 10 0.529510832924535 0.833021301127803 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40197818_40198028:LGALS14 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 40199914 C/G 1 16 21 37 7.52782667320744 11.1197274914152 -3.5919008182078 C:G C G 10 0.529510832924535 0.252571712298235 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40199837_40200087:LGALS14 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 40480501 C/T 1 59 46 105 27.7588608574524 24.3574983145286 3.40136254292382 T:C C T 10 0.529510832924535 0.557819400577584 ENSG00000013275:ENST00000157812:exon_40480431_40480540:PSMC4;ENSG00000013275:ENST00000455878:exon_40480431_40480540:PSMC4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 40486136 G/A 1 6 14 20 2.82293500245279 7.41315166094349 -4.5902166584907 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0448627607802242 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 40719076 T/C 1 21 8 29 9.88027250858476 4.23608666339628 5.64418584518848 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0405206067598885 ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40718983_40719095:MAP3K10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 40719410 C/T 1 11 4 15 5.17538083783011 2.11804333169814 3.05733750613197 T:C C T 10 0.529510832924535 0.128035315987776 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 79 71 150 37.1686441989617 37.595269137642 -0.426624938680256 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 17 19 36 7.9983158402829 10.0607058255662 -2.06238998528326 T:C T C 10 0.529510832924535 0.508779973476558 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 41086528 G/A 1 49 45 94 23.0539691866978 23.8279874816041 -0.774018294906295 A:G G A 10 0.529510832924535 0.91784618930441 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41086472_41086562:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41086472_41086562:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000418276:exon_41086472_41086562:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41086472_41086562:SHKBP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 41096189 A/G 1 47 37 84 22.1129908525469 19.5919008182078 2.52109003433906 A:G A G 10 0.529510832924535 0.662223499774391 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41096150_41096328:SHKBP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 41129842 C/T 1 15 15 30 7.05733750613197 7.94266249386803 -0.885324987736052 T:C C T 10 0.529510832924535 0.855347975085585 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41129841_41129987:LTBP4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 41135475 G/A 1 26 18 44 12.2327183439621 9.53119499264163 2.70152335132046 A:G G A 10 0.529510832924535 0.452705453727843 ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41135301_41135725:LTBP4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 12 14 26 5.64587000490558 7.41315166094349 -1.76728165603791 T:C T C 10 0.529510832924535 0.557753688524909 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 41889748 T/C 1 22 13 35 10.3507616756602 6.88364082801896 3.46712084764127 T:C T C 10 0.529510832924535 0.309714315957545 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41889620_41889985:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41889466_41889985:TMEM91 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 55 67 122 25.8769041891506 35.4772258059438 -9.60032161679327 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0852511982835054 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 62 36 98 29.1703283586788 19.0623899852833 10.1079383733956 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0430553031013056 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 84 64 148 39.5210900343391 33.8886933071702 5.63239672716881 A:G A G 10 0.529510832924535 0.366084846576871 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 6 15 21 2.82293500245279 7.94266249386803 -5.11972749141524 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0288150252561382 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 16 19 35 7.52782667320744 10.0607058255662 -2.53287915235873 T:C T C 10 0.529510832924535 0.402816305864415 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 42626699 C/T 0 32 0 32 15.0556533464149 0 15.0556533464149 C C 10 0.529510832924535 2.68894749206773e-09 ENSG00000028277:ENST00000389341:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000342301:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000292077:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000533720:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000526816:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000529067:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000534559:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000529952:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000530982:exon_42626663_42626732:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000531773:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000524801:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000532176:exon_42626663_42626728:POU2F2;ENSG00000028277:ENST00000526933:exon_42626663_42626732:POU2F2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 42703833 A/G 1 6 11 17 2.82293500245279 5.82461916216989 -3.0016841597171 A:G A G 10 0.529510832924535 0.154173856512779 ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42702752_42703981:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42702752_42703981:DEDD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 42728836 T/C 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:C T C 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000167625:ENST00000301215:exon_42728539_42732353:ZNF526 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 42753283 G/A 1 33 37 70 15.5261425134903 19.5919008182078 -4.06575830471745 A:G G A 10 0.529510832924535 0.340543251002091 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 42753649 G/C 1 30 20 50 14.1146750122639 10.5902166584907 3.52445835377325 C:G G C 10 0.529510832924535 0.326116252654756 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 18 18 36 8.46880500735837 9.53119499264163 -1.06238998528326 A:G A G 10 0.529510832924535 0.741270102583595 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44418343 C/T 1 9 6 15 4.23440250367918 3.17706499754721 1.05733750613197 T:C C T 10 0.529510832924535 0.61671670096814 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44418544 A/G 1 10 4 14 4.70489167075465 2.11804333169814 2.58684833905651 A:G A G 10 0.529510832924535 0.19016988576375 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44418680 G/C 1 19 6 25 8.93929417443383 3.17706499754721 5.76222917688662 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0260745492861238 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44418693 T/C 1 17 7 24 7.9983158402829 3.70657583047175 4.29174000981116 T:C T C 10 0.529510832924535 0.101156594830765 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44418824 C/T 1 9 2 11 4.23440250367918 1.05902166584907 3.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.070493162541885 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44515074 C/A 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:C C A 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44515352 T/G 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 T:G T G 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44515341_44515400:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44515514 C/A 1 13 8 21 6.11635917198104 4.23608666339628 1.88027250858476 A:C C A 10 0.529510832924535 0.513839468737654 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 10 5 15 4.70489167075465 2.64755416462268 2.05733750613197 T:C T C 10 0.529510832924535 0.314439025315697 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44611162 G/T 1 12 9 21 5.64587000490558 4.76559749632082 0.880272508584764 T:G G T 10 0.529510832924535 0.827993527930512 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 10 12 22 4.70489167075465 6.35412999509442 -1.64923832433977 A:G A G 10 0.529510832924535 0.526608667804835 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 8 14 22 3.76391333660372 7.41315166094349 -3.64923832433977 T:C T C 10 0.529510832924535 0.137310126362436 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 14 13 27 6.58684833905651 6.88364082801896 -0.296792488962446 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 15 16 31 7.05733750613197 8.47217332679256 -1.41483582066059 A:T A T 10 0.529510832924535 0.719675534707041 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 18 30 48 8.46880500735837 15.8853249877361 -7.41651998037768 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0418788952042015 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44680489 G/A 1 8 9 17 3.76391333660372 4.76559749632082 -1.0016841597171 A:G G A 10 0.529510832924535 0.637013022123958 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44732658 C/G 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 C:G C G 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44732599_44732725:ZNF227 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44739399 T/C 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 T:C T C 10 0.529510832924535 0.779088238758133 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44740602 G/A 1 28 21 49 13.173696678113 11.1197274914152 2.05396918669778 A:G G A 10 0.529510832924535 0.570979763485987 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44981318 G/A 1 6 8 14 2.82293500245279 4.23608666339628 -1.41315166094349 A:G G A 10 0.529510832924535 0.594278475296019 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 44981525 G/A 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 A:G G A 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 46181392 G/C 1 11 12 23 5.17538083783011 6.35412999509442 -1.17874915726431 C:G G C 10 0.529510832924535 0.679304562332551 ENSG00000010310:ENST00000263281:exon_46181346_46181484:GIPR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 46205050 T/C 1 8 12 20 3.76391333660372 6.35412999509442 -2.5902166584907 T:C T C 10 0.529510832924535 0.269589908278233 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 46216642 G/T 1 17 10 27 7.9983158402829 5.29510832924535 2.70320751103755 T:G G T 10 0.529510832924535 0.338828655163755 ENSG00000177051:ENST00000317683:exon_46213887_46216831:FBXO46 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 46269076 G/A 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 A:G G A 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 26 22 48 12.2327183439621 11.6492383243398 0.583480019622318 T:C T C 10 0.529510832924535 0.886163543227794 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 26 14 40 12.2327183439621 7.41315166094349 4.8195666830186 C:G C G 10 0.529510832924535 0.153873109003923 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 46518651 A/G 1 20 5 25 9.4097833415093 2.64755416462268 6.76222917688662 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0080221326518716 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 46518682 G/A 1 16 5 21 7.52782667320744 2.64755416462268 4.88027250858476 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0467329952614361 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 46857015 C/T 1 31 34 65 14.5851641793394 18.0033683194342 -3.41820414009478 T:C C T 10 0.529510832924535 0.456270920969081 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46857005_46857164:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46857005_46857246:PPP5C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 46878989 G/A 1 48 52 100 22.5834800196223 27.5345633120758 -4.9510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 0.367365435171453 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000467902:exon_46878860_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000527193:exon_46878884_46879008:PPP5C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 46890480 C/T 1 57 82 139 26.8178825233015 43.4198882998119 -16.6020057765104 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00499256607000405 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46890350_46890492:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46890350_46890492:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46890350_46890492:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46890350_46890492:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000487483:exon_46890350_46890492:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000486994:exon_46890350_46890492:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000467502:exon_46890350_46890492:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000491003:exon_46890350_46890492:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000492109:exon_46890350_46890492:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000525507:exon_46889975_46890492:PPP5C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 67 52 119 31.5227741940562 27.5345633120758 3.98821088198033 A:G G A 10 0.529510832924535 0.520528150151834 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 47585517 G/C 1 5 8 13 2.35244583537732 4.23608666339628 -1.88364082801896 C:G G C 10 0.529510832924535 0.406366482999609 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47585441_47585552:ZC3H4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 47588325 G/A 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47588313_47588452:ZC3H4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 41 21 62 19.2900558500941 11.1197274914152 8.17032835867883 A:C A C 10 0.529510832924535 0.0415932844816598 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 34 21 55 15.9966316805658 11.1197274914152 4.87690418915057 T:C T C 10 0.529510832924535 0.224096604984688 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 47980153 G/A 1 3 7 10 1.41146750122639 3.70657583047175 -2.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 0.206417065723492 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47980060_47980195:KPTN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 157 201 358 73.866799230848 106.431677417832 -32.5648781869835 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.000681783702430213 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 33 32 65 15.5261425134903 16.9443466535851 -1.41820414009478 C:G C G 10 0.529510832924535 0.803994967550798 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 48622427 A/G 1 41 32 73 19.2900558500941 16.9443466535851 2.34570919650894 A:G A G 10 0.529510832924535 0.639685318646434 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48622394_48622447:LIG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 48654553 G/T 1 8 20 28 3.76391333660372 10.5902166584907 -6.82630332188698 T:G G T 10 0.529510832924535 0.0126639116228094 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48654489_48654596:LIG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 11 9 20 5.17538083783011 4.76559749632082 0.409783341509299 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 10 11 21 4.70489167075465 5.82461916216989 -1.11972749141524 T:C C T 10 0.529510832924535 0.66667332357797 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49300605 T/C 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 0.487573754416657 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49377242 G/C 1 156 165 321 73.3963100637725 87.3692874325483 -13.9729773687757 T:C:G G C 10 0.529510832924535 0.131010321209741 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49377319 A/G 1 114 139 253 53.635765046603 73.6020057765104 -19.9662407299074 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0138844699985747 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49377424 G/A 1 124 123 247 58.3406567173577 65.1298324497178 -6.78917573236016 A:G G A 10 0.529510832924535 0.407504981261376 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49377436 G/C 1 130 105 235 61.1635917198104 55.5986374570762 5.56495426273426 C:G G C 10 0.529510832924535 0.473126877404933 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 60 88 148 28.2293500245279 46.5969532973591 -18.3676032728312 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00291853524091216 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 113 144 257 53.1652758795275 76.249559941133 -23.0842840616055 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00402334841671352 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 143 170 313 67.2799508917915 90.016841597171 -22.7368907053795 A:C:G G C 10 0.529510832924535 0.0107628617668910 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 15 8 23 7.05733750613197 4.23608666339628 2.82125084273569 A:G A G 10 0.529510832924535 0.297861335201159 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 662 880 1542 311.463828603958 465.969532973591 -154.505704369633 T:C T C 10 0.529510832924535 3.91615682174275e-15 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 11 7 18 5.17538083783011 3.70657583047175 1.46880500735837 A:G G A 10 0.529510832924535 0.638208767464486 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49840500 C/A 1 16 14 30 7.52782667320744 7.41315166094349 0.114675012263948 A:C C A 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49949589 A/T 1 15 15 30 7.05733750613197 7.94266249386803 -0.885324987736052 A:T:C A T 10 0.529510832924535 0.855347975085585 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49950298 C/T 1 129 103 232 60.693102552735 54.5396157912271 6.15348676150787 T:C C T 10 0.529510832924535 0.430592628125782 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49950356 C/G 1 81 91 172 38.1096225331127 48.1854857961327 -10.07586326302 A:C:G C G 10 0.529510832924535 0.127124357107072 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 88 74 162 41.4030467026409 39.1838016364156 2.21924506622532 T:C C T 10 0.529510832924535 0.753291722964701 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 90 74 164 42.3440250367918 39.1838016364156 3.16022340037625 T:G T G 10 0.529510832924535 0.639510011794397 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 49967680 G/A 1 26 23 49 12.2327183439621 12.1787491572643 0.0539691866977829 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967674_49967779:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967674_49967779:ALDH16A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 50140092 G/A 1 16 9 25 7.52782667320744 4.76559749632082 2.76222917688662 A:G G A 10 0.529510832924535 0.319086576710391 ENSG00000126458:ENST00000246792:exon_50140081_50140183:RRAS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 50189818 G/C 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 C:G G C 10 0.529510832924535 0.321803815351283 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 50364517 G/A 1 29 23 52 13.6441858451885 12.1787491572643 1.46543668792418 A:G G A 10 0.529510832924535 0.781492453927733 ENSG00000039650:ENST00000322344:exon_50364462_50364622:PNKP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 50435998 C/T 1 220 76 296 103.507616756602 40.2428233022647 63.2647934543376 T:C C T 10 0.529510832924535 5.7891955884801e-14 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 32 14 46 15.0556533464149 7.41315166094349 7.64250168547139 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0263943509902493 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 50967605 G/A 1 4 8 12 1.88195666830186 4.23608666339628 -2.35412999509442 A:G G A 10 0.529510832924535 0.247834349729258 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50967603_50967789:MYBPC2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 81 98 179 38.1096225331127 51.8920616266044 -13.7824390934918 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0430365749882084 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 51323440 A/C 1 87 53 140 40.9325575355655 28.0640741450004 12.8684833905651 A:C A C 10 0.529510832924535 0.0339542467942033 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 52519608 C/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 52658510 T/C 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 T:C T C 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000196267:ENST00000322146:exon_52658125_52660793:ZNF836;ENSG00000196267:ENST00000457013:exon_52658125_52660793:ZNF836 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 0 0 9 9 0 4.76559749632082 -4.76559749632082 C T C 10 0.529510832924535 0.00112965714869375 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 53117531 C/T 1 16 10 26 7.52782667320744 5.29510832924535 2.23271834396209 T:C C T 10 0.529510832924535 0.435554956053702 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 53117809 C/A 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 A:C C A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 53453777 C/T 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 T:C C T 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 53453873 T/C 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 53454543 G/A 1 4 8 12 1.88195666830186 4.23608666339628 -2.35412999509442 A:G G A 10 0.529510832924535 0.247834349729258 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 53571306 T/C 1 5 11 16 2.35244583537732 5.82461916216989 -3.47217332679256 T:C T C 10 0.529510832924535 0.130420532691613 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 1 2 7 9 0.94097833415093 3.70657583047175 -2.76559749632082 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0935246236081911 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 54656709 A/T 1 44 39 83 20.7015233513205 20.6509224840569 0.05060086726359 A:T A T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000088038:ENST00000221232:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000358389:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000411507:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000445408:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000482247:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000406403:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000447684:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000457463:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000496327:exon_54656604_54656736:CNOT3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 54697079 C/T 1 32 29 61 15.0556533464149 15.3558141548115 -0.300160808396639 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54697030_54697173:TSEN34 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 94 165 259 44.2259817050937 87.3692874325483 -43.1433057274546 T:G T G 10 0.529510832924535 9.38031338349767e-08 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 54962467 G/A 1 15 13 28 7.05733750613197 6.88364082801896 0.173696678113019 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376514:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000443957:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54962467_54962559:LENG8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 54965860 G/A 1 27 11 38 12.7032075110376 5.82461916216989 6.87858834886767 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0333377020384577 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54965609_54965861:LENG8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 54966579 C/G 1 32 24 56 15.0556533464149 12.7082599901888 2.34739335622604 C:G C G 10 0.529510832924535 0.593157498100976 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 54973198 G/A 1 55 31 86 25.8769041891506 16.4148358206606 9.46206836848999 A:T:G G A 10 0.529510832924535 0.0512138668661397 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54971946_54973217:LENG8;ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 54973280 C/G 1 24 17 41 11.2917400098112 9.0016841597171 2.29005585009406 C:G C G 10 0.529510832924535 0.533085115396517 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 55174498 T/C 1 12 10 22 5.64587000490558 5.29510832924535 0.350761675660229 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 55493651 C/T 1 18 8 26 8.46880500735837 4.23608666339628 4.23271834396209 T:C C T 10 0.529510832924535 0.116418578208414 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 55493728 C/T 1 11 17 28 5.17538083783011 9.0016841597171 -3.82630332188698 T:C C T 10 0.529510832924535 0.184953401348688 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 55493847 C/T 1 9 15 24 4.23440250367918 7.94266249386803 -3.70825999018884 T:C C T 10 0.529510832924535 0.153584329941182 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 55494632 A/G 1 24 14 38 11.2917400098112 7.41315166094349 3.87858834886767 A:G A G 10 0.529510832924535 0.255505476181789 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 55494740 T/C 1 21 10 31 9.88027250858476 5.29510832924535 4.58516417933941 T:C T C 10 0.529510832924535 0.107859965484981 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 55756980 A/G 1 13 13 26 6.11635917198104 6.88364082801896 -0.767281656037911 A:G A G 10 0.529510832924535 0.845219179890685 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 55964720 G/A 1 161 137 298 75.7487558991499 72.5429841106613 3.20577178848855 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.727953135421183 ENSG00000063241:ENST00000438389:exon_55964345_55964755:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000085068:exon_55964345_55964755:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000425675:exon_55964345_55964755:ISOC2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 56090076 G/T 1 16 13 29 7.52782667320744 6.88364082801896 0.644185845188484 T:G G T 10 0.529510832924535 0.854303742578924 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 44 39 83 20.7015233513205 20.6509224840569 0.05060086726359 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 56156447 A/G 1 66 47 113 31.0522850269807 24.8870091474531 6.16527587952754 A:G A G 10 0.529510832924535 0.259069270113091 ENSG00000171425:ENST00000270451:exon_56155919_56156988:ZNF581 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 57839567 T/A 1 3 7 10 1.41146750122639 3.70657583047175 -2.29510832924535 A:T T A 10 0.529510832924535 0.206417065723492 ENSG00000178229:ENST00000321545:exon_57839072_57842144:ZNF543 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58004346 G/C 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 C:G G C 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000105136:ENST00000524372:exon_58004224_58004367:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000427558:exon_58004224_58005153:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000354197:exon_58004224_58005151:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000424930:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000426954:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000284020:exon_58004278_58004600:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000442920:exon_58004224_58005588:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000523439:exon_58004224_58005621:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000517598:exon_58004224_58005255:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000347466:exon_58004224_58006032:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000415379:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000521754:exon_58004224_58004423:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000221735:exon_58004224_58006048:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000521137:exon_58004224_58004544:ZNF419;ENSG00000105136:ENST00000522346:exon_58004224_58006033:ZNF419 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58018618 A/G 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000152439:ENST00000282292:exon_58017726_58019508:ZNF773;ENSG00000152439:ENST00000430084:exon_58017726_58019508:ZNF773 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58132106 A/C 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:C A C 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000213762:ENST00000396161:exon_58131528_58134372:ZNF134 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58152795 C/T 1 7 10 17 3.29342416952825 5.29510832924535 -2.0016841597171 T:C C T 10 0.529510832924535 0.344125043526582 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58152817 G/C 1 6 8 14 2.82293500245279 4.23608666339628 -1.41315166094349 C:G G C 10 0.529510832924535 0.594278475296019 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58153000 T/C 1 4 9 13 1.88195666830186 4.76559749632082 -2.88364082801896 T:C T C 10 0.529510832924535 0.163083153099282 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58153009 C/T 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 T:C C T 10 0.529510832924535 0.129310521443327 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58153577 T/C 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C T C 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 14 11 25 6.58684833905651 5.82461916216989 0.762229176886623 A:G A G 10 0.529510832924535 0.842602807462717 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58233008 G/A 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 A:G G A 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231855_58233065:ZNF671 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 18 20 38 8.46880500735837 10.5902166584907 -2.12141165113233 A:G A G 10 0.529510832924535 0.518950365306029 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 8 4 12 3.76391333660372 2.11804333169814 1.64587000490558 A:G G A 10 0.529510832924535 0.397734651849528 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 10 6 16 4.70489167075465 3.17706499754721 1.52782667320744 A:G G A 10 0.529510832924535 0.46714284442011 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58929200 A/C 0 8 0 8 3.76391333660372 0 3.76391333660372 A A 10 0.529510832924535 0.00858117377180446 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 58989495 A/C 1 5 9 14 2.35244583537732 4.76559749632082 -2.41315166094349 A:C A C 10 0.529510832924535 0.28431222286612 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58989454_58989548:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58989454_58989548:ZNF446 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 59028585 G/A 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:G G A 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000119574:ENST00000354590:exon_59027762_59029040:ZBTB45 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 59058682 C/G 1 13 14 27 6.11635917198104 7.41315166094349 -1.29679248896245 C:G C G 10 0.529510832924535 0.701228237889621 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 59058693 G/A 1 14 13 27 6.58684833905651 6.88364082801896 -0.296792488962446 A:G G A 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 19 59074653 T/C 1 5 10 15 2.35244583537732 5.29510832924535 -2.94266249386803 T:C T C 10 0.529510832924535 0.194474740642524 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 22 15 37 10.3507616756602 7.94266249386803 2.4080991817922 T:C C T 10 0.529510832924535 0.510936519453645 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 146 136 282 68.6914183930179 72.0134732777368 -3.32205488471888 A:G A G 10 0.529510832924535 0.720514981037076 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 3261173 A/G 1 12 12 24 5.64587000490558 6.35412999509442 -0.708259990188841 A:G A G 10 0.529510832924535 0.839421058538893 ENSG00000032389:ENST00000382125:exon_3261070_3261226:TSSC1;ENSG00000032389:ENST00000478754:exon_3261070_3261226:TSSC1;ENSG00000032389:ENST00000398659:exon_3261070_3261226:TSSC1;ENSG00000032389:ENST00000482570:exon_3261070_3261330:TSSC1;ENSG00000032389:ENST00000443925:exon_3261070_3261226:TSSC1;ENSG00000032389:ENST00000406835:exon_3261070_3261226:TSSC1;ENSG00000032389:ENST00000462515:exon_3261070_3261226:TSSC1;ENSG00000032389:ENST00000444776:exon_3261122_3261226:TSSC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 16 7 23 7.52782667320744 3.70657583047175 3.82125084273569 T:C T C 10 0.529510832924535 0.143299201177607 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 3392295 A/G 1 13 12 25 6.11635917198104 6.35412999509442 -0.237770823113376 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 3425729 C/T 1 13 17 30 6.11635917198104 9.0016841597171 -2.88532498773605 T:C C T 10 0.529510832924535 0.361005199197405 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3425652_3425741:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000457845:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000441983:exon_3425652_3425765:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3425654_3425765:TTC15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 42 46 88 19.7605450171695 24.3574983145286 -4.59695329735909 C:G G C 10 0.529510832924535 0.338153077105492 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 74 83 157 34.8161983635844 43.9493991327364 -9.133200769152 T:C C T 10 0.529510832924535 0.150564168390191 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 10262920 T/G 1 88 117 205 41.4030467026409 61.9527674521706 -20.5497207495297 T:G T G 10 0.529510832924535 0.00500803652109245 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10262839_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10262866_10263184:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10262879_10263024:RRM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 15372562 C/T 1 10 11 21 4.70489167075465 5.82461916216989 -1.11972749141524 T:C C T 10 0.529510832924535 0.66667332357797 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15372546_15372635:NBAS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 15378808 C/G 1 12 17 29 5.64587000490558 9.0016841597171 -3.35581415481152 C:G C G 10 0.529510832924535 0.264593278715465 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15378592_15378810:NBAS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 20240668 C/A 1 23 16 39 10.8212508427357 8.47217332679256 2.34907751594313 A:C C A 10 0.529510832924535 0.522318756140582 ENSG00000068697:ENST00000175091:exon_20240652_20240772:LAPTM4A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 25046090 T/C 1 33 33 66 15.5261425134903 17.4738574865097 -1.94771497301931 T:C T C 10 0.529510832924535 0.711750392860016 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 25047408 A/G 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 A:G A G 10 0.529510832924535 0.352283066981699 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 16 18 34 7.52782667320744 9.53119499264163 -2.00336831943419 T:C T C 10 0.529510832924535 0.498122028363949 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 25384169 G/A 1 22 26 48 10.3507616756602 13.7672816560379 -3.41651998037768 A:G G A 10 0.529510832924535 0.385936040307634 ENSG00000115138:ENST00000380794:exon_25383722_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000405623:exon_25383784_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000264708:exon_25383854_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000395826:exon_25383922_25384621:POMC;ENSG00000115138:ENST00000449220:exon_25384015_25384621:POMC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 26502875 T/C 1 57 48 105 26.8178825233015 25.4165199803777 1.40136254292382 T:C:G T C 10 0.529510832924535 0.845149543141107 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502862_26502983:HADHB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 27260469 G/A 1 31 23 54 14.5851641793394 12.1787491572643 2.40641502207511 A:G G A 10 0.529510832924535 0.586174047289812 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000475258:exon_27260429_27260532:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460904:exon_27260429_27260683:TMEM214 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 27293150 G/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:G G T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000084693:ENST00000487078:exon_27292960_27293490:AGBL5;ENSG00000084693:ENST00000360131:exon_27292960_27293488:AGBL5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 27355991 G/T 1 49 39 88 23.0539691866978 20.6509224840569 2.40304670264091 T:G G T 10 0.529510832924535 0.669624301629397 ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 11 7 18 5.17538083783011 3.70657583047175 1.46880500735837 A:G G A 10 0.529510832924535 0.638208767464486 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 27435374 G/A 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 A:G G A 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000138074:ENST00000428518:exon_27435331_27435390:SLC5A6;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27435238_27435475:C2orf28 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 27438615 G/C 1 80 98 178 37.6391333660372 51.8920616266044 -14.2529282605672 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0353663228107491 ENSG00000138085:ENST00000380171:exon_27438500_27438621:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27438500_27438621:C2orf28 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 11 10 21 5.17538083783011 5.29510832924535 -0.119727491415236 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 16 16 32 7.52782667320744 8.47217332679256 -0.944346653585121 T:C C T 10 0.529510832924535 0.859808885917593 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 27464814 C/T 1 43 28 71 20.231034184245 14.826303321887 5.40473086235801 T:C C T 10 0.529510832924535 0.234432154466878 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27464779_27464991:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27464779_27464991:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27464779_27464819:CAD;ENSG00000084774:ENST00000428460:exon_27464789_27464991:CAD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 17 26 43 7.9983158402829 13.7672816560379 -5.76896581575501 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0925121460462383 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 27589810 T/C 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 T:C T C 10 0.529510832924535 0.556631979728114 ENSG00000115211:ENST00000475582:exon_27588425_27591600:EIF2B4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 27667297 A/G 1 4 9 13 1.88195666830186 4.76559749632082 -2.88364082801896 A:G A G 10 0.529510832924535 0.163083153099282 ENSG00000138002:ENST00000260570:exon_27667238_27667388:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000509128:exon_27667244_27667388:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000507184:exon_27667265_27667388:IFT172 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 27851918 G/A 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000198522:ENST00000264718:exon_27851863_27852036:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000452876:exon_27851863_27852036:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000449402:exon_27851863_27852036:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000458167:exon_27851863_27852036:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000436280:exon_27851891_27852036:GPN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 27887034 C/A 1 13 8 21 6.11635917198104 4.23608666339628 1.88027250858476 A:C C A 10 0.529510832924535 0.513839468737654 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 29001691 A/G 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 A:G A G 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000213639:ENST00000455580:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000420282:exon_29001675_29001865:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000441461:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000427786:exon_29001675_29001797:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000358506:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395367:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000296122:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395366:exon_29001675_29001905:PPP1CB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 29092679 T/C 1 12 11 23 5.64587000490558 5.82461916216989 -0.178749157264306 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 29092850 G/T 1 8 8 16 3.76391333660372 4.23608666339628 -0.472173326792561 T:G G T 10 0.529510832924535 0.80894998850296 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 29152456 A/G 1 42 38 80 19.7605450171695 20.1214116511323 -0.360866633962804 A:T:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 29356567 G/C 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 C:G G C 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000115295:ENST00000426642:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401605:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401617:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000415891:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000404424:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000402240:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000456385:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000320081:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000530644:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000379543:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000450018:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000449202:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000438819:exon_29356521_29356682:CLIP4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 29404570 G/A 1 10 12 22 4.70489167075465 6.35412999509442 -1.64923832433977 A:G G A 10 0.529510832924535 0.526608667804835 ENSG00000115295:ENST00000404424:exon_29404438_29404789:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000402240:exon_29404438_29404789:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000320081:exon_29404438_29406679:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000530644:exon_29404438_29406679:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000379543:exon_29404438_29406678:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000481628:exon_29404438_29404624:CLIP4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 34 23 57 15.9966316805658 12.1787491572643 3.8178825233015 T:C T C 10 0.529510832924535 0.35379793299752 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 32702561 G/A 1 6 8 14 2.82293500245279 4.23608666339628 -1.41315166094349 A:G G A 10 0.529510832924535 0.594278475296019 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32702436_32702651:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32702436_32702651:BIRC6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 32774505 C/T 1 10 12 22 4.70489167075465 6.35412999509442 -1.64923832433977 T:C C T 10 0.529510832924535 0.526608667804835 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32774380_32774548:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32774380_32774548:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32774380_32774548:BIRC6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 32819010 G/A 1 8 11 19 3.76391333660372 5.82461916216989 -2.06070582556617 A:G G A 10 0.529510832924535 0.367060340223589 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32818982_32819127:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32818982_32819127:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32818982_32819127:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000470250:exon_32818982_32819377:BIRC6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 32822957 G/A 1 9 5 14 4.23440250367918 2.64755416462268 1.58684833905651 A:G G A 10 0.529510832924535 0.435350095576674 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 12 10 22 5.64587000490558 5.29510832924535 0.350761675660229 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 33774761 T/C 1 30 22 52 14.1146750122639 11.6492383243398 2.46543668792418 T:C T C 10 0.529510832924535 0.578921120912241 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33774671_33774818:RASGRP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 37230728 T/C 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 T:C T C 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37230685_37230829:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37230685_37230829:HEATR5B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 37458668 G/A 1 47 36 83 22.1129908525469 19.0623899852833 3.05060086726359 A:G G A 10 0.529510832924535 0.511954409560771 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 37471114 C/A 1 16 5 21 7.52782667320744 2.64755416462268 4.88027250858476 A:C C A 10 0.529510832924535 0.0467329952614361 ENSG00000003509:ENST00000455230:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37471054_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000431821:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000483999:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000439218:exon_37471006_37471116:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474257:exon_37471006_37471116:C2orf56 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 44123759 G/A 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000138095:ENST00000472420:exon_44123376_44123847:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000483489:exon_44123583_44123847:LRPPRC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 44201376 T/C 1 16 15 31 7.52782667320744 7.94266249386803 -0.414835820660587 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44201289_44201434:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44201289_44201434:LRPPRC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 45640334 T/C 1 13 15 28 6.11635917198104 7.94266249386803 -1.82630332188698 T:C T C 10 0.529510832924535 0.571481182501315 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 45640374 C/A 1 10 13 23 4.70489167075465 6.88364082801896 -2.17874915726431 A:C C A 10 0.529510832924535 0.407596227656326 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 45645512 C/T 1 7 15 22 3.29342416952825 7.94266249386803 -4.64923832433977 T:C C T 10 0.529510832924535 0.05493206250743 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45645504_45645680:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45645504_45645680:SRBD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 47301029 A/G 1 27 31 58 12.7032075110376 16.4148358206606 -3.71162830962303 A:G A G 10 0.529510832924535 0.358470176602005 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47300841_47301062:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 60689441 T/C 1 10 4 14 4.70489167075465 2.11804333169814 2.58684833905651 T:C T C 10 0.529510832924535 0.19016988576375 ENSG00000119866:ENST00000356842:exon_60687817_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000359629:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000378117:exon_60688487_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000489516:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000492272:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000335712:exon_60684333_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000477659:exon_60686955_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000358510:exon_60687409_60689559:BCL11A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 62 68 130 29.1703283586788 36.0067366388684 -6.83640828018956 A:T:G A G 10 0.529510832924535 0.253447382758616 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 61450454 A/G 1 9 1 10 4.23440250367918 0.529510832924535 3.70489167075465 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0236424935815757 ENSG00000115464:ENST00000487547:exon_61450383_61450796:USP34 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 61647901 A/G 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000453133:exon_61647881_61647968:USP34 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 16 13 29 7.52782667320744 6.88364082801896 0.644185845188484 A:G G A 10 0.529510832924535 0.854303742578924 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 65217089 G/C 1 9 3 12 4.23440250367918 1.58853249877361 2.64587000490558 C:G G C 10 0.529510832924535 0.154401063622286 ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65216535_65217304:SLC1A4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 17 17 34 7.9983158402829 9.0016841597171 -1.00336831943419 A:G G A 10 0.529510832924535 0.734980712954295 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 67630980 G/A 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 67631831 G/A 1 16 6 22 7.52782667320744 3.17706499754721 4.35076167566023 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0858428353801745 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 67632125 C/T 1 13 7 20 6.11635917198104 3.70657583047175 2.4097833415093 T:C C T 10 0.529510832924535 0.371363290052013 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 68364478 T/C 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 T:C T C 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 68385097 A/G 1 27 36 63 12.7032075110376 19.0623899852833 -6.35918247424571 A:G A G 10 0.529510832924535 0.129454342561977 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68384928_68385254:PPP3R1;ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68384976_68385273:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68385049_68385273:PNO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 70037739 C/G 1 20 24 44 9.4097833415093 12.7082599901888 -3.29847664867954 C:G C G 10 0.529510832924535 0.365753629684787 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70035038_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000409920:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70037726_70037752:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000487351:exon_70037726_70037857:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000468815:exon_70037726_70038034:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000472124:exon_70037726_70037805:ANXA4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 71417134 C/T 1 2 7 9 0.94097833415093 3.70657583047175 -2.76559749632082 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0935246236081911 ENSG00000124374:ENST00000244221:exon_71416975_71417151:PAIP2B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 73478536 C/T 1 587 595 1182 276.177141073298 315.058945590098 -38.8818045168004 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0248233487600500 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 73989785 G/C 1 35 34 69 16.4671208476413 18.0033683194342 -1.53624747179292 C:G G C 10 0.529510832924535 0.719268555349385 ENSG00000144048:ENST00000272444:exon_73989311_73989986:DUSP11;ENSG00000144048:ENST00000432812:exon_73989325_73989986:DUSP11;ENSG00000144048:ENST00000480948:exon_73989721_73989986:DUSP11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 74761539 T/A 1 11 10 21 5.17538083783011 5.29510832924535 -0.119727491415236 A:T T A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74761443_74761558:LOXL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 74763258 C/G 1 11 7 18 5.17538083783011 3.70657583047175 1.46880500735837 C:G C G 10 0.529510832924535 0.638208767464486 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000481835:exon_74763123_74763277:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000420535:exon_74763123_74763277:LOXL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 87000551 T/G 1 11 13 24 5.17538083783011 6.88364082801896 -1.70825999018884 T:G T G 10 0.529510832924535 0.542854194228007 ENSG00000153561:ENST00000283632:exon_87000471_87005164:RMND5A;ENSG00000153561:ENST00000471113:exon_87000471_87000720:RMND5A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 88874891 C/A 1 12 12 24 5.64587000490558 6.35412999509442 -0.708259990188841 A:C:G C A 10 0.529510832924535 0.839421058538893 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000470706:exon_88874879_88874926:EIF2AK3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 89161073 A/G 1 13 5 18 6.11635917198104 2.64755416462268 3.46880500735837 A:G A G 10 0.529510832924535 0.154754113990996 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 89185474 G/A 0 622 1 623 292.644261920939 0.529510832924535 292.114751088015 C:G G C 10 0.529510832924535 5.7750728622825e-170 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 89185519 G/C 1 174 230 404 81.8651150711309 121.787491572643 -39.9223765015122 A:C:G G C 10 0.529510832924535 7.86644289687625e-05 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 89185589 A/T 0 272 0 272 127.973053444526 0 127.973053444526 A A 10 0.529510832924535 1.18958042625499e-75 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 96789787 T/C 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 T:C T C 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000188886:ENST00000342380:exon_96789589_96790010:ASTL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 96944553 G/A 1 63 76 139 29.6408175257543 40.2428233022647 -10.6020057765104 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0746607075367174 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 98274527 G/C 1 19 26 45 8.93929417443383 13.7672816560379 -4.82798748160408 C:G G C 10 0.529510832924535 0.178800632037820 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98274406_98274580:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274441_98274580:ACTR1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 11 6 17 5.17538083783011 3.17706499754721 1.9983158402829 A:G A G 10 0.529510832924535 0.467294043415163 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 101010082 G/C 1 1 9 10 0.470489167075465 4.76559749632082 -4.29510832924535 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0082459486500564 ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 103334969 G/A 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 A:G G A 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000135953:ENST00000258436:exon_103332299_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000438943:exon_103333497_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000437075:exon_103334030_103335666:MFSD9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 105959592 G/A 1 21 15 36 9.88027250858476 7.94266249386803 1.93761001471674 A:G G A 10 0.529510832924535 0.617249536501202 ENSG00000135974:ENST00000258457:exon_105959305_105959680:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000437250:exon_105959558_105959680:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000410049:exon_105959558_105959680:C2orf49 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 109098854 A/G 1 20 8 28 9.4097833415093 4.23608666339628 5.17369667811302 A:G A G 10 0.529510832924535 0.058248794119806 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109098743_109098907:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109098743_109098907:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109098743_109098907:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109098743_109098907:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000447558:exon_109098743_109098907:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109098743_109098907:GCC2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 109106381 A/G 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109106294_109106591:GCC2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 113404708 G/A 1 2 7 9 0.94097833415093 3.70657583047175 -2.76559749632082 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0935246236081911 ENSG00000144136:ENST00000272542:exon_113404140_113404739:SLC20A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 113498566 A/G 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 A:G A G 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113498395_113498584:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113498395_113498584:CKAP2L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 20 12 32 9.4097833415093 6.35412999509442 3.05565334641488 T:C T C 10 0.529510832924535 0.294309831651362 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 13 11 24 6.11635917198104 5.82461916216989 0.291740009811159 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 11 13 24 5.17538083783011 6.88364082801896 -1.70825999018884 A:G A G 10 0.529510832924535 0.542854194228007 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 114220055 T/C 1 10 15 25 4.70489167075465 7.94266249386803 -3.23777082311338 T:C T C 10 0.529510832924535 0.230939624838663 ENSG00000136682:ENST00000259199:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000448780:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000426479:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000358604:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000456188:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000492566:exon_114219985_114220411:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000472995:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000486174:exon_114219985_114220071:CBWD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 118583940 C/T 1 49 32 81 23.0539691866978 16.9443466535851 6.10962253311266 T:C C T 10 0.529510832924535 0.18305974071151 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 41 30 71 19.2900558500941 15.8853249877361 3.40473086235801 T:C T C 10 0.529510832924535 0.476088300613972 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 40 25 65 18.8195666830186 13.2377708231134 5.58179585990522 T:C T C 10 0.529510832924535 0.173665151366269 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 127821207 G/A 1 47 49 96 22.1129908525469 25.9460308133022 -3.83303996075536 A:G G A 10 0.529510832924535 0.474561001137241 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127821147_127821222:BIN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 50 60 110 23.5244583537732 31.7706499754721 -8.24619162169886 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.126496982168213 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 128464116 G/A 1 63 68 131 29.6408175257543 36.0067366388684 -6.36591911311409 A:G G A 10 0.529510832924535 0.293655684646109 ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128458596_128464126:WDR33 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 15 9 24 7.05733750613197 4.76559749632082 2.29174000981116 T:C C T 10 0.529510832924535 0.4160778721084 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 128939799 C/T 1 13 5 18 6.11635917198104 2.64755416462268 3.46880500735837 T:C C T 10 0.529510832924535 0.154754113990996 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 143798189 A/G 1 101 142 243 47.519405874622 75.190538275284 -27.671132400662 A:G A G 10 0.529510832924535 0.000395127127079221 ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143797997_143798227:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143797997_143798227:KYNU HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 152132130 A/G 1 125 92 217 58.8111458844331 48.7149966290572 10.0961492553759 A:G A G 10 0.529510832924535 0.174354920633903 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152131998_152132184:NMI HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 152139416 G/A 1 140 147 287 65.8684833905651 77.8380924399066 -11.9696090493416 A:G G A 10 0.529510832924535 0.173717153906225 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000414946:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000477072:exon_152139285_152139468:NMI HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 152314385 G/A 1 4 9 13 1.88195666830186 4.76559749632082 -2.88364082801896 A:G G A 10 0.529510832924535 0.163083153099282 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152314275_152314477:RIF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 160105007 A/G 1 14 14 28 6.58684833905651 7.41315166094349 -0.826303321886982 A:G A G 10 0.529510832924535 0.850504264084444 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160104883_160105023:WDSUB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 160114315 G/A 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 A:G G A 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160114269_160114375:WDSUB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 160132089 T/G 1 3 7 10 1.41146750122639 3.70657583047175 -2.29510832924535 T:G T G 10 0.529510832924535 0.206417065723492 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160132057_160132149:WDSUB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 160206483 T/C 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:C T C 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000123636:ENST00000392783:exon_160206219_160206868:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000392782:exon_160206219_160206868:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000343439:exon_160206219_160206868:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000355831:exon_160206219_160206868:BAZ2B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 57 80 137 26.8178825233015 42.3608666339628 -15.5429841106613 A:T:C T C 10 0.529510832924535 0.00796945263991482 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 163137871 C/G 1 45 22 67 21.1720125183959 11.6492383243398 9.52277419405615 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0201356681634491 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 163137983 T/C 1 13 8 21 6.11635917198104 4.23608666339628 1.88027250858476 T:C T C 10 0.529510832924535 0.513839468737654 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 170417031 T/C 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 T:C T C 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170416897_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000487293:exon_170416781_170417295:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000483355:exon_170416902_170417295:FASTKD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 394 327 721 185.372731827733 173.150042366323 12.2226894614102 A:T:C:G T A 10 0.529510832924535 0.370719798447544 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 170493253 A/G 1 249 215 464 117.151802601791 113.844829078775 3.30697352301574 A:G A G 10 0.529510832924535 0.780302768489483 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 173356225 A/T 1 7 9 16 3.29342416952825 4.76559749632082 -1.47217332679256 A:T A T 10 0.529510832924535 0.617975933604282 ENSG00000091409:ENST00000409532:exon_173356153_173356251:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000264107:exon_173356153_173356251:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000264106:exon_173356153_173356251:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000343713:exon_173356153_173356251:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000375221:exon_173356153_173356251:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000409080:exon_173356153_173356251:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000442250:exon_173356153_173356251:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000458358:exon_173356153_173356251:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000416789:exon_173356153_173356251:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000475302:exon_173356153_173356251:ITGA6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 183584755 G/A 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000469118:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183584734_183584896:DNAJC10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 183593697 C/T 1 6 11 17 2.82293500245279 5.82461916216989 -3.0016841597171 T:C C T 10 0.529510832924535 0.154173856512779 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000494462:exon_183593303_183593834:DNAJC10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 183622547 T/G 1 27 28 55 12.7032075110376 14.826303321887 -2.12309581084943 T:G T G 10 0.529510832924535 0.591040046308657 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183622419_183622552:DNAJC10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 35 47 82 16.4671208476413 24.8870091474531 -8.41988829981187 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0761284423920551 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 185801917 A/G 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 A:G A G 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 190323530 A/G 1 8 16 24 3.76391333660372 8.47217332679256 -4.70825999018884 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0654353604302778 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190323479_190323598:WDR75 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 T:G G T 10 0.529510832924535 0.779088238758133 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 92 86 178 43.2850033709428 45.53793163151 -2.25292826056724 T:C T C 10 0.529510832924535 0.764140230119577 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 46 73 119 21.6425016854714 38.6542908034911 -17.0117891180197 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00230221952153051 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 14 17 31 6.58684833905651 9.0016841597171 -2.41483582066059 T:C T C 10 0.529510832924535 0.472439231356365 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 315 259 574 148.204087628771 137.143305727455 11.0607819013169 T:C T C 10 0.529510832924535 0.358008772059884 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 67 117 184 31.5227741940562 61.9527674521706 -30.4299932581144 A:G A G 10 0.529510832924535 7.92801415956013e-06 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 200820505 T/G 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 T:G T G 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000178074:ENST00000491721:exon_200820091_200820658:C2orf69;ENSG00000162972:ENST00000295079:exon_200820220_200820971:C2orf47;ENSG00000162972:ENST00000392290:exon_200820326_200820971:C2orf47 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 201253956 A/G 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000196141:ENST00000439084:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000439395:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000444012:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000451764:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000423749:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000471601:exon_201253946_201255577:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000457757:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000428692:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000453663:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000459656:exon_201253946_201255591:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409397:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000421573:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000449647:exon_201253946_201254006:SPATS2L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 201342616 C/T 1 34 21 55 15.9966316805658 11.1197274914152 4.87690418915057 T:C C T 10 0.529510832924535 0.224096604984688 ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201342359_201343252:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409385:exon_201342359_201343252:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201342359_201342825:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201342359_201342932:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000460095:exon_201342359_201342869:SPATS2L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 10 6 16 4.70489167075465 3.17706499754721 1.52782667320744 C:G C G 10 0.529510832924535 0.46714284442011 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 201355106 G/A 1 7 7 14 3.29342416952825 3.70657583047175 -0.413151660943491 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 202149696 G/A 1 11 15 26 5.17538083783011 7.94266249386803 -2.76728165603791 A:G G A 10 0.529510832924535 0.327727272541139 ENSG00000064012:ENST00000392263:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392264:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000303385:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392266:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000264274:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392259:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000432109:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000264275:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000358485:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000339403:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000323492:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000444430:exon_202149539_202150040:CASP8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 204154552 C/T 1 4 8 12 1.88195666830186 4.23608666339628 -2.35412999509442 T:C C T 10 0.529510832924535 0.247834349729258 ENSG00000119004:ENST00000356079:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000449301:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000429815:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000461371:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000421618:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431118:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000302927:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431075:exon_204154488_204154599:CYP20A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 216190020 C/G 1 76 86 162 35.7571766977353 45.53793163151 -9.78075493377467 C:G C G 10 0.529510832924535 0.134778571321812 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216189903_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000427397:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000413174:exon_216189964_216190052:ATIC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 216209531 C/T 1 226 152 378 106.330551759055 80.4856466045293 25.8449051545258 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00851322187770733 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216209502_216209594:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216209502_216209594:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216209502_216209594:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000446622:exon_216209502_216209594:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000426233:exon_216209502_216209594:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000479093:exon_216209502_216209594:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000467388:exon_216209502_216209594:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000459796:exon_216209502_216210310:ATIC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 217288388 G/C 1 2 11 13 0.94097833415093 5.82461916216989 -4.88364082801896 C:G G C 10 0.529510832924535 0.00956286367176584 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000412913:exon_217288356_217288406:SMARCAL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 217363597 C/T 1 3857 2748 6605 1814.67671741007 1455.09576887662 359.580948533446 A:T:C:G C T 10 0.529510832924535 6.48528074021521e-19 ENSG00000197756:ENST00000491306:exon_217362912_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000490649:exon_217363548_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000487233:exon_217363567_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000446558:exon_217363578_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000420712:exon_217363585_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 217363638 G/A 1 7 9 16 3.29342416952825 4.76559749632082 -1.47217332679256 A:G G A 10 0.529510832924535 0.617975933604282 ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 219266423 C/A 1 27 19 46 12.7032075110376 10.0607058255662 2.64250168547139 A:C C A 10 0.529510832924535 0.463418293565778 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000494067:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000496785:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000431127:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219265890_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219266287_219266435:CTDSP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 219267781 C/T 1 29 29 58 13.6441858451885 15.3558141548115 -1.71162830962303 T:C C T 10 0.529510832924535 0.694164040435948 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219267734_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219267758_219267850:CTDSP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 219503113 C/T 1 25 26 51 11.7622291768866 13.7672816560379 -2.00505247915129 T:C C T 10 0.529510832924535 0.578425451644159 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219502644_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219502868_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219502868_219503531:ZNF142 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 219527712 C/T 1 34 24 58 15.9966316805658 12.7082599901888 3.28837169037697 T:C C T 10 0.529510832924535 0.431120453803839 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000436603:exon_219527606_219527723:BCS1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 219527866 T/C 1 31 27 58 14.5851641793394 14.2967924889624 0.288371690376968 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527857_219528127:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527857_219528136:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527857_219528137:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527857_219528164:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527857_219528165:BCS1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 219528995 T/C 1 82 66 148 38.5801117001881 34.9477149730193 3.63239672716881 T:C T C 10 0.529510832924535 0.565305402934491 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 219529247 A/C 1 93 96 189 43.7554925380182 50.8330399607554 -7.07754742273713 A:C A C 10 0.529510832924535 0.308490280810073 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 219529881 G/A 1 20 13 33 9.4097833415093 6.88364082801896 2.52614251349034 A:G G A 10 0.529510832924535 0.390602689905416 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219529877_219529970:RNF25 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 219533378 T/C 1 11 10 21 5.17538083783011 5.29510832924535 -0.119727491415236 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219532802_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219533328_219533402:RNF25 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 19 10 29 8.93929417443383 5.29510832924535 3.64418584518848 A:G G A 10 0.529510832924535 0.196206016705251 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 220037444 G/A 1 43 42 85 20.231034184245 22.2394549828305 -2.00842079858548 A:G G A 10 0.529510832924535 0.665677919873629 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 220045454 G/A 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 A:G G A 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443757:exon_220045392_220045473:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452293:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430747:exon_220045392_220045472:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045390_220045476:FAM134A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 220046840 G/A 1 19 15 34 8.93929417443383 7.94266249386803 0.996631680565809 A:G G A 10 0.529510832924535 0.863935342116717 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220046735_220046842:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 220075045 T/C 1 4 9 13 1.88195666830186 4.76559749632082 -2.88364082801896 T:C T C 10 0.529510832924535 0.163083153099282 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 220085845 A/G 1 9 6 15 4.23440250367918 3.17706499754721 1.05733750613197 A:G A G 10 0.529510832924535 0.61671670096814 ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000475339:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220085802_220086024:ATG9A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 220097257 G/C 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220097212_220097415:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000453432:exon_220097212_220097388:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000475202:exon_220097212_220097692:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000474225:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000467884:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000461731:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000496346:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000435521:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000486203:exon_220097212_220097756:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000447157:exon_220097212_220097269:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000491181:exon_220097212_220097503:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000465550:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000489580:exon_220097212_220097481:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000493563:exon_220097212_220097601:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000490526:exon_220097212_220097405:ANKZF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 220250800 C/T 1 51 65 116 23.9949475208487 34.4182041400948 -10.4232566192461 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0624167998385697 ENSG00000123992:ENST00000273075:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373972:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000523282:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373963:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373966:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000337010:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000457935:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000429013:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000521459:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000460963:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000322176:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000434339:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000430206:exon_220250704_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000520694:exon_220250760_220250820:DNPEP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 28 15 43 13.173696678113 7.94266249386803 5.23103418424499 T:C C T 10 0.529510832924535 0.126966685410306 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 20 8 28 9.4097833415093 4.23608666339628 5.17369667811302 A:G G A 10 0.529510832924535 0.058248794119806 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 9 12 21 4.23440250367918 6.35412999509442 -2.11972749141524 A:G G A 10 0.529510832924535 0.388145875482006 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 220405321 T/C 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 10 14 24 4.70489167075465 7.41315166094349 -2.70825999018884 T:C T C 10 0.529510832924535 0.309537938097369 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 228221725 A/G 1 118 135 253 55.5177217149049 71.4839624448122 -15.9662407299074 A:T:G A G 10 0.529510832924535 0.0506822916167266 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228221702_228222550:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228221702_228221970:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228221702_228221931:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228221702_228222515:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228221702_228221867:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228221702_228221847:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228221702_228222528:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228221702_228222543:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228221702_228222524:MFF;ENSG00000168958:ENST00000456345:exon_228221702_228222097:MFF;ENSG00000168958:ENST00000490857:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476262:exon_228221702_228222547:MFF;ENSG00000168958:ENST00000477362:exon_228221702_228221897:MFF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 230632268 G/A 1 183 172 355 86.0995175748101 91.07586326302 -4.97634568820993 A:G G A 10 0.529510832924535 0.595527411861268 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230631930_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230632157_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230632157_230632466:TRIP12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 231077112 G/A 1 82 95 177 38.5801117001881 50.3035291278308 -11.7234174276427 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0832826206397288 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 231118041 A/C 1 18 19 37 8.46880500735837 10.0607058255662 -1.5919008182078 A:C A C 10 0.529510832924535 0.624566114977031 ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231118031_231118132:SP140 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 231149097 T/C 1 42 32 74 19.7605450171695 16.9443466535851 2.81619836358441 T:C T C 10 0.529510832924535 0.561156696051681 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000476126:exon_231149061_231149126:SP140 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 231222655 G/T 1 19 12 31 8.93929417443383 6.35412999509442 2.58516417933941 T:G G T 10 0.529510832924535 0.374459447746206 ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 231222675 T/C 1 22 11 33 10.3507616756602 5.82461916216989 4.52614251349034 T:C T C 10 0.529510832924535 0.120347961470773 ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 231248261 C/T 1 17 21 38 7.9983158402829 11.1197274914152 -3.12141165113233 T:C C T 10 0.529510832924535 0.332866583821859 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231248225_231248290:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231248225_231248290:SP140L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 8 12 20 3.76391333660372 6.35412999509442 -2.5902166584907 T:C T C 10 0.529510832924535 0.269589908278233 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 24 17 41 11.2917400098112 9.0016841597171 2.29005585009406 T:C C T 10 0.529510832924535 0.533085115396517 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 231775144 G/A 1 7 1 8 3.29342416952825 0.529510832924535 2.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0741292491828888 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000438398:exon_231774952_231775811:GPR55 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 232035429 G/A 1 251 219 470 118.092780935942 115.962872410473 2.12990852546852 A:G G A 10 0.529510832924535 0.853486651142971 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000373635:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000491229:exon_232035116_232035435:PSMD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 232196564 C/T 1 14 8 22 6.58684833905651 4.23608666339628 2.35076167566023 T:C C T 10 0.529510832924535 0.394779767186122 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 232196597 G/A 1 16 7 23 7.52782667320744 3.70657583047175 3.82125084273569 A:G G A 10 0.529510832924535 0.143299201177607 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 232952286 A/G 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 A:G A G 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000144535:ENST00000273009:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000360410:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409401:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000445090:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000464554:exon_232952197_232952554:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000470087:exon_232952197_232952431:DIS3L2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 233201328 A/G 1 6 8 14 2.82293500245279 4.23608666339628 -1.41315166094349 A:G A G 10 0.529510832924535 0.594278475296019 ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_233201179_233201907:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_233201179_233201908:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_233200924_233201687:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_233201179_233201340:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000429283:exon_233199079_233201686:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000418143:exon_233201020_233201684:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000417808:exon_233200851_233201683:DIS3L2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 233925166 G/A 1 7 15 22 3.29342416952825 7.94266249386803 -4.64923832433977 A:G G A 10 0.529510832924535 0.05493206250743 ENSG00000168918:ENST00000422935:exon_233924677_233925322:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000451407:exon_233925062_233925322:INPP5D HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 234368821 T/C 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 T:C T C 10 0.529510832924535 0.514634999402426 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 234386134 A/G 1 13 3 16 6.11635917198104 1.58853249877361 4.52782667320744 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0247917218023686 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234384166_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234384172_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234384172_234386149:USP40 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 234394487 G/A 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 A:G G A 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 234394569 A/G 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 234432017 A/G 1 9 4 13 4.23440250367918 2.11804333169814 2.11635917198104 A:G A G 10 0.529510832924535 0.277734246411223 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234431816_234432135:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234431816_234432135:USP40;ENSG00000085982:ENST00000427112:exon_234431816_234432135:USP40 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 238903399 G/A 1 8 16 24 3.76391333660372 8.47217332679256 -4.70825999018884 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0654353604302778 ENSG00000184182:ENST00000440223:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000441728:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000512459:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000518380:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434002:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000272930:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433568:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000448502:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409633:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000470484:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000455999:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000417231:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434137:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000445676:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439338:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439780:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000454786:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449191:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433241:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409953:exon_238903386_238903451:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434655:exon_238903386_238903451:UBE2F HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 242063448 G/A 1 6 8 14 2.82293500245279 4.23608666339628 -1.41315166094349 A:G G A 10 0.529510832924535 0.594278475296019 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242063364_242063548:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242063364_242063548:PASK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 242573211 T/C 1 31 41 72 14.5851641793394 21.7099441499059 -7.12477997056652 T:C T C 10 0.529510832924535 0.09899694730944 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 43 26 69 20.231034184245 13.7672816560379 6.46375252820708 T:C T C 10 0.529510832924535 0.147336831754138 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 242610773 T/A 1 42 28 70 19.7605450171695 14.826303321887 4.93424169528254 A:T:C T A 10 0.529510832924535 0.281224942706256 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 242617851 A/G 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 A:G A G 10 0.529510832924535 0.589735300550817 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 242690675 G/A 1 12 15 27 5.64587000490558 7.94266249386803 -2.29679248896245 A:G G A 10 0.529510832924535 0.442316378908255 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 242690745 C/T 1 15 8 23 7.05733750613197 4.23608666339628 2.82125084273569 T:C C T 10 0.529510832924535 0.297861335201159 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 2 242690770 T/C 1 11 16 27 5.17538083783011 8.47217332679256 -3.29679248896245 T:C T C 10 0.529510832924535 0.248146889531717 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 259818 G/A 1 7 12 19 3.29342416952825 6.35412999509442 -3.06070582556617 A:G G A 10 0.529510832924535 0.174545004364366 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 278806 C/T 1 10 14 24 4.70489167075465 7.41315166094349 -2.70825999018884 T:C C T 10 0.529510832924535 0.309537938097369 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 50 32 82 23.5244583537732 16.9443466535851 6.58011170018813 T:C C T 10 0.529510832924535 0.151797552866951 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 391025 T/C 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 T:C T C 10 0.529510832924535 0.321803815351283 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 130 135 265 61.1635917198104 71.4839624448122 -10.3203707250018 T:C C T 10 0.529510832924535 0.218440069155096 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 60 73 133 28.2293500245279 38.6542908034911 -10.4249407789632 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0819770247735741 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 48 56 104 22.5834800196223 29.652606643774 -7.06912662415165 T:C C T 10 0.529510832924535 0.170209259301797 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 3090848 T/G 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 T:G T G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000185019:ENST00000217173:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000348031:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000440298:exon_3088219_3090960:UBOX5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 3171337 C/T 1 79 75 154 37.1686441989617 39.7133124693401 -2.5446682703784 T:C C T 10 0.529510832924535 0.687332196021198 ENSG00000198171:ENST00000354488:exon_3170996_3171465:DDRGK1;ENSG00000198171:ENST00000496781:exon_3170996_3171465:DDRGK1;ENSG00000198171:ENST00000470203:exon_3171166_3171465:DDRGK1;ENSG00000198171:ENST00000449522:exon_3171167_3171465:DDRGK1;ENSG00000198171:ENST00000380213:exon_3171299_3171346:DDRGK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 3838441 C/G 1 8 6 14 3.76391333660372 3.17706499754721 0.586848339056509 C:G C G 10 0.529510832924535 0.795582240516341 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3838282_3838456:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000441852:exon_3838282_3838581:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3838282_3838456:MAVS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 3846397 C/T 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3846330_3849280:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000416600:exon_3846330_3848972:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3846330_3847950:MAVS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 5169799 C/T 1 11 5 16 5.17538083783011 2.64755416462268 2.52782667320744 T:C C T 10 0.529510832924535 0.222816733853050 ENSG00000101290:ENST00000460006:exon_5169713_5169832:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000379062:exon_5169713_5169832:CDS2;ENSG00000101290:ENST00000379070:exon_5169713_5169832:CDS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 5556512 G/A 1 12 23 35 5.64587000490558 12.1787491572643 -6.53287915235873 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0283986377988601 ENSG00000125772:ENST00000378992:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000379019:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000481038:exon_5556462_5556624:GPCPD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 37 32 69 17.4080991817922 16.9443466535851 0.463752528207081 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 37 31 68 17.4080991817922 16.4148358206606 0.993263361131618 T:C T C 10 0.529510832924535 0.903431897728429 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 27 27 54 12.7032075110376 14.2967924889624 -1.59358497792489 T:C C T 10 0.529510832924535 0.684532874281158 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 7980390 C/T 1 10 5 15 4.70489167075465 2.64755416462268 2.05733750613197 T:C C T 10 0.529510832924535 0.314439025315697 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7980379_7980469:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7980379_7980507:TMX4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 13695680 C/T 1 86 96 182 40.46206836849 50.8330399607554 -10.3709715922654 T:C C T 10 0.529510832924535 0.137364133925165 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 22 41 63 10.3507616756602 21.7099441499059 -11.3591824742457 A:C C A 10 0.529510832924535 0.00512413994294427 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 55 73 128 25.8769041891506 38.6542908034911 -12.7773866143405 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.0266066545932233 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 17932210 C/T 1 98 104 202 46.1079383733956 55.0691266241516 -8.96118825075608 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.230753698231255 ENSG00000089006:ENST00000377768:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000490175:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377759:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000483485:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377739:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000476648:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000431277:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000419004:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000494401:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000474883:exon_17932170_17932239:SNX5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 17943492 A/T 1 34 9 43 15.9966316805658 4.76559749632082 11.231034184245 A:T A T 10 0.529510832924535 0.000604432427791094 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 17 12 29 7.9983158402829 6.35412999509442 1.64418584518848 T:C T C 10 0.529510832924535 0.581370651083963 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 20006368 T/C 1 30 22 52 14.1146750122639 11.6492383243398 2.46543668792418 T:C T C 10 0.529510832924535 0.578921120912241 ENSG00000173418:ENST00000334982:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000484480:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000310450:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000463154:exon_20006313_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000480550:exon_20006313_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000398602:exon_20006321_20006411:NAA20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 30915461 T/C 1 9 2 11 4.23440250367918 1.05902166584907 3.17538083783011 T:C T C 10 0.529510832924535 0.070493162541885 ENSG00000101350:ENST00000375712:exon_30915359_30915464:KIF3B;ENSG00000101350:ENST00000418717:exon_30915359_30915464:KIF3B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 31022469 G/A 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 31024274 T/C 1 29 29 58 13.6441858451885 15.3558141548115 -1.71162830962303 T:C T C 10 0.529510832924535 0.694164040435948 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 31025163 A/G 1 11 11 22 5.17538083783011 5.82461916216989 -0.649238324339771 A:G A G 10 0.529510832924535 0.833021301127803 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 8 6 14 3.76391333660372 3.17706499754721 0.586848339056509 T:C T C 10 0.529510832924535 0.795582240516341 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 32248163 C/T 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000125967:ENST00000375238:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000246190:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000488489:exon_32247691_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000483813:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000485399:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000485976:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000478237:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000494174:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000463246:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000480994:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000439478:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000498353:exon_32248065_32248201:NECAB3;ENSG00000125967:ENST00000493590:exon_32248065_32248201:NECAB3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 33591006 G/A 1 53 36 89 24.9359258549996 19.0623899852833 5.87353586971638 A:G G A 10 0.529510832924535 0.242846751218552 ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33590207_33591086:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33590215_33591086:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33590215_33591086:TRPC4AP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 240 272 512 112.917400098112 144.026946555474 -31.1095464573619 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00603774803931977 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 34218673 G/C 1 86 21 107 40.46206836849 11.1197274914152 29.3423408770748 C:G G C 10 0.529510832924535 4.65265576683866e-09 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34218361_34218956:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34218663_34218717:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34218663_34218717:CPNE1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 122 29 151 57.3996783832067 15.3558141548115 42.0438642283952 T:C T C 10 0.529510832924535 1.15251743680727e-12 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 34243017 C/T 1 18 20 38 8.46880500735837 10.5902166584907 -2.12141165113233 T:C C T 10 0.529510832924535 0.518950365306029 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000431148:exon_34242815_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000435161:exon_34242843_34243266:RBM12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 34502107 G/A 1 11 16 27 5.17538083783011 8.47217332679256 -3.29679248896245 A:G G A 10 0.529510832924535 0.248146889531717 ENSG00000025293:ENST00000374012:exon_34501955_34502119:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000439301:exon_34501955_34502119:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000373994:exon_34501955_34502119:PHF20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 34528935 G/A 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 A:G G A 10 0.529510832924535 0.129310521443327 ENSG00000025293:ENST00000374012:exon_34528786_34528969:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000439301:exon_34528786_34528969:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000373994:exon_34528786_34528969:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000413965:exon_34528786_34528969:PHF20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 37570725 C/T 1 1 7 8 0.470489167075465 3.70657583047175 -3.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0301990106165060 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37570602_37570769:FAM83D HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 42225114 G/A 1 14 10 24 6.58684833905651 5.29510832924535 1.29174000981116 A:G G A 10 0.529510832924535 0.684850962838789 ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000486243:exon_42225075_42225162:IFT52 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 42302371 C/T 1 9 5 14 4.23440250367918 2.64755416462268 1.58684833905651 T:C C T 10 0.529510832924535 0.435350095576674 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 42328639 T/C 1 68 32 100 31.9932633611316 16.9443466535851 15.0489167075465 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0025563184494525 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42328397_42328684:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42328397_42328684:MYBL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 43566787 A/G 1 15 19 34 7.05733750613197 10.0607058255662 -3.00336831943419 A:G A G 10 0.529510832924535 0.309030590911357 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43566743_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000482486:exon_43566484_43566832:PABPC1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 11 17 28 5.17538083783011 9.0016841597171 -3.82630332188698 A:G G A 10 0.529510832924535 0.184953401348688 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 24 17 41 11.2917400098112 9.0016841597171 2.29005585009406 T:C T C 10 0.529510832924535 0.533085115396517 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 44420637 G/A 1 14 6 20 6.58684833905651 3.17706499754721 3.4097833415093 A:G G A 10 0.529510832924535 0.177997080950173 ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 44507307 T/C 1 2 8 10 0.94097833415093 4.23608666339628 -3.29510832924535 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0539366762210793 ENSG00000132801:ENST00000255152:exon_44505353_44507761:ZSWIM3;ENSG00000132801:ENST00000454862:exon_44505353_44507767:ZSWIM3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 44520579 C/G 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000064601:ENST00000372471:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000372484:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000354880:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000191018:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000419493:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000372459:exon_44520555_44520666:CTSA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 46264888 G/C 1 12 5 17 5.64587000490558 2.64755416462268 2.9983158402829 C:G G C 10 0.529510832924535 0.223483974880525 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46264635_46265506:NCOA3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 47712930 G/T 1 208 210 418 97.8617467516967 111.197274914152 -13.3355281624556 T:G G T 10 0.529510832924535 0.202682806902017 ENSG00000124207:ENST00000449004:exon_47712886_47713484:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000417408:exon_47712886_47713484:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000262982:exon_47712886_47713489:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000476393:exon_47712345_47713069:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000469700:exon_47712713_47713489:CSE1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 45 34 79 21.1720125183959 18.0033683194342 3.16864419896173 T:C C T 10 0.529510832924535 0.500517619477387 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 47865011 C/T 1 13 9 22 6.11635917198104 4.76559749632082 1.35076167566023 T:C C T 10 0.529510832924535 0.671166937576677 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 47865372 G/A 1 17 10 27 7.9983158402829 5.29510832924535 2.70320751103755 A:G G A 10 0.529510832924535 0.338828655163755 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 14 11 25 6.58684833905651 5.82461916216989 0.762229176886623 A:G G A 10 0.529510832924535 0.842602807462717 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 47872327 A/G 1 3 9 12 1.41146750122639 4.76559749632082 -3.35412999509442 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0794211024472422 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 8 16 24 3.76391333660372 8.47217332679256 -4.70825999018884 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0654353604302778 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 47886684 G/A 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 A:G G A 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47886479_47888287:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47886479_47887760:ZNFX1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 49576348 A/G 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 A:G A G 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000124217:ENST00000244051:exon_49575363_49577820:MOCS3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 50769183 G/A 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 50769379 C/T 1 4 9 13 1.88195666830186 4.76559749632082 -2.88364082801896 T:C C T 10 0.529510832924535 0.163083153099282 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 50769549 A/G 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 52645166 A/G 1 2 7 9 0.94097833415093 3.70657583047175 -2.76559749632082 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0935246236081911 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52644931_52645239:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52645080_52645289:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000411563:exon_52644411_52645511:BCAS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 54961463 T/C 1 34 27 61 15.9966316805658 14.2967924889624 1.69983919160336 T:C T C 10 0.529510832924535 0.70173451030812 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 54961541 A/T 1 21 22 43 9.88027250858476 11.6492383243398 -1.76896581575501 A:T A T 10 0.529510832924535 0.647881754255173 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 55093178 C/T 1 60 78 138 28.2293500245279 41.3018449681137 -13.0724949435858 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0266926653417323 ENSG00000022277:ENST00000023939:exon_55093143_55093943:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000395881:exon_55093143_55093943:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000357348:exon_55093143_55093938:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000435342:exon_55093143_55093938:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000477485:exon_55093143_55093301:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000477573:exon_55093143_55093943:C20orf43;ENSG00000124103:ENST00000481560:exon_55093143_55093353:C20orf106 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 56064105 G/A 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:G G A 10 0.529510832924535 0.742993974261161 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 56179808 T/C 1 21 8 29 9.88027250858476 4.23608666339628 5.64418584518848 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0405206067598885 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56178906_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56179111_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56179803_56179825:ZBP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 56185303 G/A 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000453793:exon_56185205_56185321:ZBP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 56190634 C/T 1 11 14 25 5.17538083783011 7.41315166094349 -2.23777082311338 T:C C T 10 0.529510832924535 0.42559887349422 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56190568_56193137:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56190568_56191524:ZBP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 396 324 720 186.313710161884 171.561509867549 14.7522002943348 T:C C T 10 0.529510832924535 0.279046463707613 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 57572614 T/C 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:C T C 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000101160:ENST00000488395:exon_57572447_57572808:CTSZ HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 60575191 A/T 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 A:T A T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60575180_60575310:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60575180_60575310:TAF4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 60768497 C/T 1 50 28 78 23.5244583537732 14.826303321887 8.69815503188627 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0536593659253785 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 60884880 C/G 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 C:G C G 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000130702:ENST00000370691:exon_60884772_60884891:LAMA5;ENSG00000130702:ENST00000252999:exon_60884772_60884891:LAMA5;ENSG00000130702:ENST00000495695:exon_60884772_60884891:LAMA5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 61299501 C/T 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000101187:ENST00000370512:exon_61299490_61299536:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000217159:exon_61299364_61299536:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000497209:exon_61299097_61299893:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000370507:exon_61299364_61299536:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000342674:exon_61299364_61299536:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000470412:exon_61299364_61299536:SLCO4A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 62191558 G/A 1 14 17 31 6.58684833905651 9.0016841597171 -2.41483582066059 A:G G A 10 0.529510832924535 0.472439231356365 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191524_62191680:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191524_62191680:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191524_62191680:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191524_62191680:RP4-697K14.7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 62324280 C/T 1 11 11 22 5.17538083783011 5.82461916216989 -0.649238324339771 T:C C T 10 0.529510832924535 0.833021301127803 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 20 62521252 C/T 1 18 26 44 8.46880500735837 13.7672816560379 -5.29847664867954 T:C C T 10 0.529510832924535 0.130717901317923 ENSG00000101150:ENST00000369927:exon_62521203_62522888:TPD52L2;ENSG00000101150:ENST00000346249:exon_62521203_62522898:TPD52L2;ENSG00000101150:ENST00000348257:exon_62521203_62522898:TPD52L2;ENSG00000101150:ENST00000352482:exon_62521203_62522898:TPD52L2;ENSG00000101150:ENST00000351424:exon_62521203_62522898:TPD52L2;ENSG00000101150:ENST00000217121:exon_62521203_62522898:TPD52L2;ENSG00000101150:ENST00000358548:exon_62521203_62522898:TPD52L2;ENSG00000101150:ENST00000474176:exon_62521203_62522898:TPD52L2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 15399864 T/C 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 0.487573754416657 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 30380901 C/T 1 20 5 25 9.4097833415093 2.64755416462268 6.76222917688662 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0080221326518716 ENSG00000156253:ENST00000493196:exon_30380716_30380942:RWDD2B;ENSG00000156253:ENST00000286777:exon_30380716_30380942:RWDD2B;ENSG00000156253:ENST00000472184:exon_30380561_30380942:RWDD2B;ENSG00000156253:ENST00000486719:exon_30380716_30380942:RWDD2B;ENSG00000156253:ENST00000466746:exon_30380197_30380942:RWDD2B;ENSG00000156253:ENST00000481411:exon_30380221_30380942:RWDD2B;ENSG00000156253:ENST00000471269:exon_30380716_30380942:RWDD2B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 33068962 T/C 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 T:C T C 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000156304:ENST00000435228:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000419806:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000434667:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000286835:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000399804:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000467731:exon_33068882_33069049:SFRS15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 33074633 A/G 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 A:G A G 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000156304:ENST00000435228:exon_33074557_33074692:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000419806:exon_33074557_33074692:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000434667:exon_33074557_33074692:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000286835:exon_33074557_33074692:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000399804:exon_33074557_33074692:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000485790:exon_33074557_33074692:SFRS15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 34614250 T/C 1 16 12 28 7.52782667320744 6.35412999509442 1.17369667811302 T:C T C 10 0.529510832924535 0.708183978146927 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 34640788 A/G 1 9 10 19 4.23440250367918 5.29510832924535 -1.06070582556617 A:G A G 10 0.529510832924535 0.65266342372252 ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34640699_34640822:AP000295.9;ENSG00000243646:ENST00000290200:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000422891:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000493295:exon_34640233_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000498371:exon_34640587_34640822:IL10RB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 34878407 C/T 1 39 15 54 18.3490775159431 7.94266249386803 10.4064150220751 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0058734467270904 ENSG00000159131:ENST00000414353:exon_34878281_34878411:GART;ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34878281_34878411:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34878281_34878411:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34878281_34878411:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34878281_34878411:GART;ENSG00000159131:ENST00000482663:exon_34878347_34878411:GART HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 34922643 C/T 1 43 41 84 20.231034184245 21.7099441499059 -1.47890996566094 T:C C T 10 0.529510832924535 0.744630037149507 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34921782_34923769:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34921782_34923595:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 37507501 G/A 1 2 9 11 0.94097833415093 4.76559749632082 -3.82461916216989 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0306516707381973 ENSG00000159231:ENST00000290354:exon_37507210_37507779:CBR3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 40720494 C/T 1 55 86 141 25.8769041891506 45.53793163151 -19.6610274423594 T:C C T 10 0.529510832924535 0.000961879466327858 ENSG00000205581:ENST00000380749:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000431390:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000492280:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000288344:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000486741:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000436324:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000380748:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000419378:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000489072:exon_40720471_40720788:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000482192:exon_40720471_40720549:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000380747:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000485550:exon_40720471_40720523:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000443046:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000464078:exon_40720348_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000491183:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000479586:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000471260:exon_40720471_40720546:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000482733:exon_40719921_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000463631:exon_40720348_40720503:HMGN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 42771176 T/C 1 17 28 45 7.9983158402829 14.826303321887 -6.82798748160408 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0513314921611261 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000482953:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000496774:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000493753:exon_42771123_42771693:MX2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 43792869 C/T 1 6 8 14 2.82293500245279 4.23608666339628 -1.41315166094349 T:C C T 10 0.529510832924535 0.594278475296019 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43792000_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43792000_43792888:TMPRSS3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 18 6 24 8.46880500735837 3.17706499754721 5.29174000981116 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0392319148383750 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 44323461 G/A 1 32 29 61 15.0556533464149 15.3558141548115 -0.300160808396639 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 57 51 108 26.8178825233015 27.0050524791513 -0.187169955849786 T:G T G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 53 36 89 24.9359258549996 19.0623899852833 5.87353586971638 A:G G A 10 0.529510832924535 0.242846751218552 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 44485527 G/A 1 16 11 27 7.52782667320744 5.82461916216989 1.70320751103755 A:G G A 10 0.529510832924535 0.566839782462308 ENSG00000160200:ENST00000352178:exon_44485497_44485631:CBS;ENSG00000160200:ENST00000359624:exon_44485497_44485631:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398165:exon_44485497_44485631:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398158:exon_44485497_44485631:CBS;ENSG00000160200:ENST00000461686:exon_44485497_44485631:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398168:exon_44485497_44485631:CBS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 45096206 G/A 1 24 10 34 11.2917400098112 5.29510832924535 5.99663168056581 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0404959420579129 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45096153_45096217:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45096153_45096217:RRP1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 45107518 A/G 1 12 13 25 5.64587000490558 6.88364082801896 -1.23777082311338 A:G A G 10 0.529510832924535 0.690766577028411 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45107397_45108121:RRP1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 45107562 T/C 1 10 19 29 4.70489167075465 10.0607058255662 -5.35581415481152 T:C T C 10 0.529510832924535 0.061359401612007 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45107397_45108121:RRP1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 45168884 G/A 1 61 52 113 28.6998391916034 27.5345633120758 1.16527587952754 A:G G A 10 0.529510832924535 0.850956067064281 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398085:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45168876_45168961:PDXK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 11 9 20 5.17538083783011 4.76559749632082 0.409783341509299 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 45523416 C/T 1 10 13 23 4.70489167075465 6.88364082801896 -2.17874915726431 T:C C T 10 0.529510832924535 0.407596227656326 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45523174_45524614:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000459741:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000468864:exon_45523174_45524932:TRAPPC10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 24 16 40 11.2917400098112 8.47217332679256 2.8195666830186 T:C T C 10 0.529510832924535 0.429725367700234 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 22 18 40 10.3507616756602 9.53119499264163 0.819566683018598 A:T:G A G 10 0.529510832924535 0.874679732608783 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 45547913 C/A 1 19 29 48 8.93929417443383 15.3558141548115 -6.41651998037768 A:C C A 10 0.529510832924535 0.0817269866340977 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 48 38 86 22.5834800196223 20.1214116511323 2.46206836848999 T:C:G T C 10 0.529510832924535 0.665959924374318 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 45564766 C/G 1 107 95 202 50.3423408770747 50.3035291278308 0.0388117492439193 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45564702_45564894:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45564702_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000419699:exon_45564703_45564798:C21orf33 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 45648880 C/T 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45642874_45648927:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400377:exon_45646717_45648927:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45646717_45649972:ICOSLG HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 11 10 21 5.17538083783011 5.29510832924535 -0.119727491415236 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 26 19 45 12.2327183439621 10.0607058255662 2.17201251839592 T:C C T 10 0.529510832924535 0.552979271011725 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 46951556 A/G 1 7 8 15 3.29342416952825 4.23608666339628 -0.942662493868026 A:G A G 10 0.529510832924535 0.797047341083576 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 21 46957794 T/C 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000427839:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000443742:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000486303:exon_46957685_46957847:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000528477:exon_46957692_46957922:SLC19A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 17662793 A/G 1 7 8 15 3.29342416952825 4.23608666339628 -0.942662493868026 A:G A G 10 0.529510832924535 0.797047341083576 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17662710_17662912:CECR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 17669306 T/C 1 11 15 26 5.17538083783011 7.94266249386803 -2.76728165603791 T:C T C 10 0.529510832924535 0.327727272541139 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000469063:exon_17669229_17669617:CECR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 17688123 T/C 1 7 1 8 3.29342416952825 0.529510832924535 2.76391333660372 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0741292491828888 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17687961_17688180:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17687961_17688180:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17687961_17688180:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17688096_17688180:CECR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 17690430 C/G 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17690246_17690575:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17690246_17690779:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17690246_17690614:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17690246_17690613:CECR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 18609642 C/T 1 34 31 65 15.9966316805658 16.4148358206606 -0.418204140094776 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000215193:ENST00000474897:exon_18609121_18609801:PEX26;ENSG00000183785:ENST00000316027:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000330423:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000416740:exon_18609121_18609801:TUBA8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 19365538 C/T 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:C C T 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000100084:ENST00000340170:exon_19365392_19365589:HIRA;ENSG00000100084:ENST00000263208:exon_19365392_19365589:HIRA;ENSG00000242259:ENST00000509549:exon_19365392_19365589:C22orf39 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 0 106 0 106 49.8718517099993 0 49.8718517099993 C C 10 0.529510832924535 1.08848138868028e-29 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 46 40 86 21.6425016854714 21.1804333169814 0.462068368489987 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 20307256 G/A 1 32 22 54 15.0556533464149 11.6492383243398 3.40641502207511 A:G G A 10 0.529510832924535 0.413883598039945 ENSG00000128185:ENST00000248879:exon_20307162_20307322:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000405465:exon_20307162_20307309:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000443409:exon_20307162_20307322:DGCR6L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 20800835 A/G 1 13 10 23 6.11635917198104 5.29510832924535 0.821250842735695 A:G A G 10 0.529510832924535 0.835734692191848 ENSG00000099910:ENST00000429594:exon_20800730_20800907:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000328879:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000399308:exon_20800766_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000451094:exon_20800772_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000440659:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000417168:exon_20800771_20800963:KLHL22 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 21084208 G/A 1 10 7 17 4.70489167075465 3.70657583047175 0.998315840282904 A:G G A 10 0.529510832924535 0.808990208344625 ENSG00000241973:ENST00000255882:exon_21084180_21084299:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000477245:exon_21084180_21084299:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000414196:exon_21084180_21084299:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000437178:exon_21084180_21084299:PI4KA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 22048862 C/T 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 T:C C T 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 12 12 24 5.64587000490558 6.35412999509442 -0.708259990188841 T:C C T 10 0.529510832924535 0.839421058538893 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 22318538 C/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 22318671 G/A 1 7 10 17 3.29342416952825 5.29510832924535 -2.0016841597171 A:G G A 10 0.529510832924535 0.344125043526582 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 22550510 T/G 1 11 1 12 5.17538083783011 0.529510832924535 4.64587000490558 T:G T G 10 0.529510832924535 0.00737270813879148 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 23055533 G/A 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 A:G G A 10 0.529510832924535 0.186533779694549 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 23055539 G/T 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 T:G G T 10 0.529510832924535 0.186533779694549 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 24086107 A/G 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 A:G A G 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000187792:ENST00000341976:exon_24083769_24087406:ZNF70 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 24180581 G/C 1 15 19 34 7.05733750613197 10.0607058255662 -3.00336831943419 C:G G C 10 0.529510832924535 0.309030590911357 ENSG00000099958:ENST00000406855:exon_24180539_24180632:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000404056:exon_24180539_24180632:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000290730:exon_24180325_24180632:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24180539_24180632:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24180539_24180632:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000430614:exon_24180539_24180632:DERL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 24564477 C/T 1 3 9 12 1.41146750122639 4.76559749632082 -3.35412999509442 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0794211024472422 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000403176:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000337989:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000485008:exon_24564415_24564489:CABIN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 24939868 C/T 1 8 15 23 3.76391333660372 7.94266249386803 -4.17874915726431 T:C C T 10 0.529510832924535 0.095514454463493 ENSG00000138867:ENST00000407471:exon_24939810_24940051:C22orf13;ENSG00000138867:ENST00000435822:exon_24939810_24940051:C22orf13;ENSG00000138867:ENST00000398245:exon_24939810_24940051:C22orf13;ENSG00000138867:ENST00000404664:exon_24939810_24940051:C22orf13;ENSG00000138867:ENST00000266155:exon_24939810_24940051:C22orf13;ENSG00000138867:ENST00000493099:exon_24939810_24940051:C22orf13;ENSG00000138867:ENST00000478017:exon_24939830_24939928:C22orf13 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 25747749 G/A 1 16 12 28 7.52782667320744 6.35412999509442 1.17369667811302 A:G G A 10 0.529510832924535 0.708183978146927 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25747385_25747869:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25747388_25747869:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25747424_25747781:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25747579_25747869:LRP5L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 26853905 C/A 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 A:C C A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26853825_26853933:HPS4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 26859942 C/T 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26859883_26859981:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26859883_26860158:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 29630337 G/A 1 1 12 13 0.470489167075465 6.35412999509442 -5.88364082801896 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00112248104368015 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000433143:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000487477:exon_29630294_29630338:EMID1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 29683098 A/G 1 211 231 442 99.2732142529231 122.317002405568 -23.0437881526445 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0284399095633468 ENSG00000182944:ENST00000397938:exon_29682912_29683123:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000332050:exon_29682912_29683123:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000406548:exon_29682912_29683123:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000437155:exon_29682911_29683123:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000331029:exon_29682912_29683123:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000483415:exon_29682912_29683123:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000405024:exon_29682912_29683123:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000414183:exon_29682912_29683123:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000451900:exon_29682912_29683123:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000333395:exon_29682912_29683123:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000332035:exon_29682912_29683123:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000455726:exon_29682912_29683123:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000354516:exon_29682912_29683123:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000479135:exon_29682912_29683123:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000460063:exon_29682974_29683123:EWSR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 30823196 T/C 1 37 41 78 17.4080991817922 21.7099441499059 -4.30184496811373 T:C T C 10 0.529510832924535 0.364667935070518 ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 30975861 C/T 1 146 137 283 68.6914183930179 72.5429841106613 -3.85156571764342 T:C C T 10 0.529510832924535 0.676904934347502 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30975738_30975910:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30974824_30976061:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30975738_30975922:PES1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 30987861 G/C 1 13 12 25 6.11635917198104 6.35412999509442 -0.237770823113376 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 30987864 C/T 1 12 13 25 5.64587000490558 6.88364082801896 -1.23777082311338 T:C C T 10 0.529510832924535 0.690766577028411 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 31006860 A/G 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G A G 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000423350:exon_31006858_31007101:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31006858_31007050:TCN2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 17 11 28 7.9983158402829 5.82461916216989 2.17369667811302 T:C T C 10 0.529510832924535 0.453454999245345 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 31673111 A/G 1 12 5 17 5.64587000490558 2.64755416462268 2.9983158402829 A:G A G 10 0.529510832924535 0.223483974880525 ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31672775_31673126:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31672775_31673624:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31672775_31673624:LIMK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 31673116 A/G 1 12 5 17 5.64587000490558 2.64755416462268 2.9983158402829 A:G A G 10 0.529510832924535 0.223483974880525 ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31672775_31673126:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31672775_31673624:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31672775_31673624:LIMK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 31722886 T/G 1 13 8 21 6.11635917198104 4.23608666339628 1.88027250858476 T:G T G 10 0.529510832924535 0.513839468737654 ENSG00000100105:ENST00000266269:exon_31721790_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000405309:exon_31721795_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000351933:exon_31721795_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000440325:exon_31721795_31723295:PATZ1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 31859859 A/G 1 11 12 23 5.17538083783011 6.35412999509442 -1.17874915726431 A:G A G 10 0.529510832924535 0.679304562332551 ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000423097:exon_31859686_31859953:EIF4ENIF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 31998612 G/A 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_31998593_31998771:SFI1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 32000930 C/T 1 6 10 16 2.82293500245279 5.29510832924535 -2.47217332679256 T:C C T 10 0.529510832924535 0.316631120754283 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32000855_32000931:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32000855_32000931:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32000855_32000931:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32000855_32000931:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32000855_32000931:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32000855_32000931:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32000855_32002416:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_32000855_32000931:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_32000855_32000931:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000488883:exon_32000855_32000931:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000466991:exon_32000855_32000931:SFI1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 23 19 42 10.8212508427357 10.0607058255662 0.760545017169528 T:C T C 10 0.529510832924535 0.877812645675207 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 60 50 110 28.2293500245279 26.4755416462268 1.75380837830114 T:C C T 10 0.529510832924535 0.774919048995477 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 32871383 T/G 1 15 6 21 7.05733750613197 3.17706499754721 3.88027250858476 T:G T G 10 0.529510832924535 0.124532991157165 ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32871244_32871385:FBXO7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 22 26 48 10.3507616756602 13.7672816560379 -3.41651998037768 T:G T G 10 0.529510832924535 0.385936040307634 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 31 31 62 14.5851641793394 16.4148358206606 -1.82967164132117 C:G G C 10 0.529510832924535 0.70322057448046 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 37271882 T/C 1 5 22 27 2.35244583537732 11.6492383243398 -9.29679248896245 T:C T C 10 0.529510832924535 0.000339917337546769 ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 37602560 C/T 1 3 13 16 1.41146750122639 6.88364082801896 -5.47217332679256 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0097876216175532 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 37603021 G/A 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 102 120 222 47.9898950416974 63.5412999509442 -15.5514049092468 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0372665643312388 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 9 10 19 4.23440250367918 5.29510832924535 -1.06070582556617 T:C C T 10 0.529510832924535 0.65266342372252 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 38470938 C/T 1 14 21 35 6.58684833905651 11.1197274914152 -4.53287915235873 T:C C T 10 0.529510832924535 0.130972362234130 ENSG00000100151:ENST00000404072:exon_38470871_38471708:PICK1;ENSG00000100151:ENST00000484021:exon_38470871_38471700:PICK1;ENSG00000100151:ENST00000414087:exon_38470871_38471707:PICK1;ENSG00000100151:ENST00000356976:exon_38470871_38471708:PICK1;ENSG00000100151:ENST00000426823:exon_38470871_38471139:PICK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 24 13 37 11.2917400098112 6.88364082801896 4.4080991817922 T:C T C 10 0.529510832924535 0.187211545095096 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 39134207 C/T 1 34 32 66 15.9966316805658 16.9443466535851 -0.947714973019313 T:C C T 10 0.529510832924535 0.901988286305542 ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39133956_39134304:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000489527:exon_39133956_39134300:GTPBP1;ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39133765_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134040_39134270:SUN2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 39134715 T/C 1 28 33 61 13.173696678113 17.4738574865097 -4.30016080839664 T:C:G T C 10 0.529510832924535 0.305336386505354 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 39137478 G/A 1 12 15 27 5.64587000490558 7.94266249386803 -2.29679248896245 A:G G A 10 0.529510832924535 0.442316378908255 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 39148483 G/A 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 A:G G A 10 0.529510832924535 0.779088238758133 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 39477123 T/C 1 76 56 132 35.7571766977353 29.652606643774 6.10457005396137 A:T:C T C 10 0.529510832924535 0.296654359616247 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000486357:exon_39476938_39477199:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39475667_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39476640_39477232:APOBEC3G HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 47 21 68 22.1129908525469 11.1197274914152 10.9932633611316 C:G G C 10 0.529510832924535 0.00745281125562416 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 17 7 24 7.9983158402829 3.70657583047175 4.29174000981116 C:G G C 10 0.529510832924535 0.101156594830765 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 39497452 A/G 1 15 1 16 7.05733750613197 0.529510832924535 6.52782667320744 A:G A G 10 0.529510832924535 0.000690759813742041 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 39497454 G/C 1 14 1 15 6.58684833905651 0.529510832924535 6.05733750613197 C:G G C 10 0.529510832924535 0.00125260279741628 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 37 25 62 17.4080991817922 13.2377708231134 4.17032835867883 C:G G C 10 0.529510832924535 0.310667883309929 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 39811120 C/T 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000100324:ENST00000216160:exon_39811011_39811147:TAB1;ENSG00000100324:ENST00000473613:exon_39810885_39811147:TAB1;ENSG00000100324:ENST00000331454:exon_39811011_39811147:TAB1;ENSG00000100324:ENST00000461775:exon_39810735_39811147:TAB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 41610024 G/A 1 10 7 17 4.70489167075465 3.70657583047175 0.998315840282904 A:G G A 10 0.529510832924535 0.808990208344625 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41609855_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000489136:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41609897_41610030:L3MBTL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 35 23 58 16.4671208476413 12.1787491572643 4.28837169037697 C:G C G 10 0.529510832924535 0.293483183637355 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 41911525 C/T 1 38 43 81 17.8785883488677 22.768965815755 -4.89037746688734 T:C C T 10 0.529510832924535 0.316560614657807 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000478010:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000481310:exon_41911517_41911539:ACO2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 42059768 G/T 1 575 545 1120 270.531271068392 288.583403943872 -18.0521328754792 A:T:G G T 10 0.529510832924535 0.281372185975861 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 28 38 66 13.173696678113 20.1214116511323 -6.94771497301931 C:G G C 10 0.529510832924535 0.108252129476276 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 42293140 G/C 1 22 29 51 10.3507616756602 15.3558141548115 -5.00505247915129 C:G G C 10 0.529510832924535 0.163908244249899 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000463741:exon_42293072_42293165:SREBF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 42300948 C/A 1 64 90 154 30.1113066928298 47.6559749632082 -17.5446682703784 A:C C A 10 0.529510832924535 0.00587812945449081 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000435061:exon_42300867_42300977:SREBF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 42335147 G/A 1 115 114 229 54.1062542136785 60.364234953397 -6.25798073971853 A:G G A 10 0.529510832924535 0.42723559460187 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42334725_42335200:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000472374:exon_42334741_42335200:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42334741_42335200:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42334741_42335200:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42334753_42335200:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42334760_42335200:CENPM HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 42341308 A/G 1 94 59 153 44.2259817050937 31.2411391425476 12.9848425625461 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0425469765886165 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42340925_42341308:CENPM HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 42341934 A/G 1 99 63 162 46.578427540471 33.3591824742457 13.2192450662253 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0405722305705046 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42341917_42342009:CENPM HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 42343091 G/A 1 57 32 89 26.8178825233015 16.9443466535851 9.87353586971638 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0430922766904085 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42343024_42343168:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42343024_42343140:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42343024_42343148:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42343024_42343155:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000460824:exon_42343024_42343137:CENPM HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 14 12 26 6.58684833905651 6.35412999509442 0.232718343962088 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 42999059 G/A 1 13 23 36 6.11635917198104 12.1787491572643 -6.06238998528326 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0460299489676512 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000451060:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000339677:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000452567:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000414913:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000454057:exon_42998776_42999166:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000463133:exon_42998774_42999166:POLDIP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 25 11 36 11.7622291768866 5.82461916216989 5.93761001471674 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0648080166938698 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 43206950 A/C 1 6 13 19 2.82293500245279 6.88364082801896 -4.06070582556617 A:C A C 10 0.529510832924535 0.0688369807190561 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43206819_43206950:ARFGAP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 43525321 G/A 1 14 2 16 6.58684833905651 1.05902166584907 5.52782667320744 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00518550368313598 ENSG00000100290:ENST00000216115:exon_43525219_43525718:BIK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 43 25 68 20.231034184245 13.2377708231134 6.99326336113162 C:G G C 10 0.529510832924535 0.113612022228960 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 45577231 T/C 1 5 13 18 2.35244583537732 6.88364082801896 -4.53119499264163 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0353717025263609 ENSG00000093000:ENST00000347635:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000432759:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000425733:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000355253:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000407019:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000493456:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000396096:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000440908:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000422489:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000469163:exon_45577167_45577248:NUP50 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 47083010 T/C 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:C T C 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 47083012 T/A 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 A:T T A 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 47085924 G/A 1 5 8 13 2.35244583537732 4.23608666339628 -1.88364082801896 A:G G A 10 0.529510832924535 0.406366482999609 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47085889_47086097:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47085889_47086097:CERK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 47569310 C/T 1 80 42 122 37.6391333660372 22.2394549828305 15.3996783832067 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0062781351296155 ENSG00000054611:ENST00000337137:exon_47569141_47571336:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000407381:exon_47569141_47569726:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000355704:exon_47569141_47569729:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000394449:exon_47569141_47569730:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000441162:exon_47569141_47569735:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000406733:exon_47569141_47569735:TBC1D22A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50688348 A/G 1 36 42 78 16.9376100147167 22.2394549828305 -5.30184496811373 A:G A G 10 0.529510832924535 0.256941973507603 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496909:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000488270:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000489424:exon_50688288_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470965:exon_50688297_50688393:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50688289_50688393:MAPK12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50694297 A/G 1 31 13 44 14.5851641793394 6.88364082801896 7.70152335132046 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0228736774942239 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000496942:exon_50694044_50694628:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000497738:exon_50694239_50694582:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50694239_50694310:MAPK12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50696678 G/A 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 A:G G A 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000492218:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50696672_50696730:MAPK12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50719058 G/A 1 15 13 28 7.05733750613197 6.88364082801896 0.173696678113019 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50718918_50719099:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50718918_50719099:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50718918_50719099:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50718918_50719099:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50718918_50719099:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50718918_50719099:PLXNB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50720622 C/T 1 10 5 15 4.70489167075465 2.64755416462268 2.05733750613197 T:C C T 10 0.529510832924535 0.314439025315697 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720613_50720991:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720613_50720742:PLXNB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50722408 T/C 1 8 4 12 3.76391333660372 2.11804333169814 1.64587000490558 T:C T C 10 0.529510832924535 0.397734651849528 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722262_50722419:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722262_50722419:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722262_50722419:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722262_50722419:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722262_50722419:PLXNB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50751529 G/C 1 53 43 96 24.9359258549996 22.768965815755 2.16696003924464 T:C:G G C 10 0.529510832924535 0.683596797736268 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50751428_50751537:FAM116B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 59 37 96 27.7588608574524 19.5919008182078 8.16696003924464 T:C C T 10 0.529510832924535 0.102180802255825 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50878196 G/A 1 13 26 39 6.11635917198104 13.7672816560379 -7.65092248405687 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0157952639843798 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50878182_50878478:PPP6R2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 75 67 142 35.2866875306599 35.4772258059438 -0.190538275283977 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 13 18 31 6.11635917198104 9.53119499264163 -3.41483582066059 A:G G A 10 0.529510832924535 0.280312149032782 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 167 146 313 78.5716909016027 77.3085816069821 1.26310929462053 T:G T G 10 0.529510832924535 0.909901130358324 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 80 66 146 37.6391333660372 34.9477149730193 2.69141839301788 C:G C G 10 0.529510832924535 0.679102016745184 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50964236 G/A 1 170 99 269 79.983158402829 52.421572459529 27.5615859433001 A:G G A 10 0.529510832924535 0.000760066573885933 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50988062 G/T 1 3 7 10 1.41146750122639 3.70657583047175 -2.29510832924535 T:G G T 10 0.529510832924535 0.206417065723492 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 50988193 A/G 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 A:G A G 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 22 51064039 G/C 1 31 29 60 14.5851641793394 15.3558141548115 -0.770649975472104 C:G G C 10 0.529510832924535 0.89737644457207 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 8579032 G/A 1 9 4 13 4.23440250367918 2.11804333169814 2.11635917198104 A:G G A 10 0.529510832924535 0.277734246411223 ENSG00000071282:ENST00000157600:exon_8578871_8579126:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000415597:exon_8578871_8579126:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000470776:exon_8578871_8579204:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000454244:exon_8578871_8579126:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000426878:exon_8578869_8579126:LMCD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 9867625 C/T 1 9 13 22 4.23440250367918 6.88364082801896 -2.64923832433977 T:C C T 10 0.529510832924535 0.290191579780574 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9867484_9867632:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000482269:exon_9867090_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000492440:exon_9867250_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9867545_9867632:TTLL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 9870857 G/A 1 20 20 40 9.4097833415093 10.5902166584907 -1.1804333169814 A:G G A 10 0.529510832924535 0.752871272158077 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 9871030 T/G 1 19 17 36 8.93929417443383 9.0016841597171 -0.0623899852832608 T:G T G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 11 10 21 5.17538083783011 5.29510832924535 -0.119727491415236 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 11 10 21 5.17538083783011 5.29510832924535 -0.119727491415236 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 13 3 16 6.11635917198104 1.58853249877361 4.52782667320744 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0247917218023686 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 10067794 A/G 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 A:G A G 10 0.529510832924535 0.129310521443327 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 10067797 T/C 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 T:C T C 10 0.529510832924535 0.129310521443327 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 20 15 35 9.4097833415093 7.94266249386803 1.46712084764127 T:G T G 10 0.529510832924535 0.735480935698242 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 11831953 C/T 1 7 8 15 3.29342416952825 4.23608666339628 -0.942662493868026 T:C C T 10 0.529510832924535 0.797047341083576 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11831916_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11831916_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000498127:exon_11831916_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11831920_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000486090:exon_11831922_11832055:C3orf31 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 33155782 G/A 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33155471_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33155531_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33155546_33156040:CRTAP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 37 37 74 17.4080991817922 19.5919008182078 -2.18380163641559 T:C C T 10 0.529510832924535 0.642399030403088 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 56 56 112 26.347393356226 29.652606643774 -3.30521328754793 A:G A G 10 0.529510832924535 0.570466519665654 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 37367628 A/G 1 23 25 48 10.8212508427357 13.2377708231134 -2.41651998037768 A:G A G 10 0.529510832924535 0.563536071188031 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 38047680 G/A 1 7 8 15 3.29342416952825 4.23608666339628 -0.942662493868026 A:G G A 10 0.529510832924535 0.797047341083576 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000488209:exon_38047672_38047695:VILL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 14 10 24 6.58684833905651 5.29510832924535 1.29174000981116 C:G G C 10 0.529510832924535 0.684850962838789 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 39139776 G/A 1 10 6 16 4.70489167075465 3.17706499754721 1.52782667320744 A:G G A 10 0.529510832924535 0.46714284442011 ENSG00000114745:ENST00000441302:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000319283:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000453680:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000452389:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000422110:exon_39138159_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000431601:exon_39138950_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000479927:exon_39139519_39139980:GORASP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 39180099 T/C 1 18 8 26 8.46880500735837 4.23608666339628 4.23271834396209 T:C T C 10 0.529510832924535 0.116418578208414 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 39180219 C/T 1 16 4 20 7.52782667320744 2.11804333169814 5.4097833415093 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0226128813501457 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180202_39180394:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180202_39180391:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180202_39180350:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180202_39180370:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180202_39180390:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180202_39180393:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 39180263 G/A 1 13 5 18 6.11635917198104 2.64755416462268 3.46880500735837 A:G G A 10 0.529510832924535 0.154754113990996 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180202_39180394:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180202_39180391:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180202_39180350:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180202_39180370:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180202_39180390:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180202_39180393:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 T:C C T 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 39185248 A/G 1 7 8 15 3.29342416952825 4.23608666339628 -0.942662493868026 A:G A G 10 0.529510832924535 0.797047341083576 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 39431081 G/A 1 3 10 13 1.41146750122639 5.29510832924535 -3.88364082801896 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0479728035133114 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39430986_39431107:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39430986_39431107:SLC25A38 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 161 53 214 75.7487558991499 28.0640741450004 47.6846817541495 T:C T C 10 0.529510832924535 2.38245237677552e-11 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 40498845 C/T 1 22 16 38 10.3507616756602 8.47217332679256 1.87858834886767 T:C C T 10 0.529510832924535 0.626888529069802 ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 40558150 G/C 1 7 10 17 3.29342416952825 5.29510832924535 -2.0016841597171 C:G G C 10 0.529510832924535 0.344125043526582 ENSG00000177842:ENST00000314529:exon_40557351_40560227:ZNF620;ENSG00000177842:ENST00000418905:exon_40557351_40559200:ZNF620 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 42251263 C/T 1 7 10 17 3.29342416952825 5.29510832924535 -2.0016841597171 T:C C T 10 0.529510832924535 0.344125043526582 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 42251329 C/T 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 45588857 T/C 1 9 9 18 4.23440250367918 4.76559749632082 -0.53119499264163 T:C T C 10 0.529510832924535 0.817944843022877 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45588843_45590329:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45588843_45590913:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45588843_45589101:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000485461:exon_45588843_45588896:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000474585:exon_45588843_45589046:LARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 45869972 C/T 1 9 1 10 4.23440250367918 0.529510832924535 3.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0236424935815757 ENSG00000163818:ENST00000296135:exon_45869931_45870107:LZTFL1;ENSG00000163818:ENST00000418700:exon_45869931_45870107:LZTFL1;ENSG00000163818:ENST00000448111:exon_45869931_45870107:LZTFL1;ENSG00000163818:ENST00000411866:exon_45869931_45870107:LZTFL1;ENSG00000163818:ENST00000469874:exon_45869931_45870107:LZTFL1;ENSG00000163818:ENST00000440576:exon_45869931_45870107:LZTFL1;ENSG00000163818:ENST00000478551:exon_45869931_45870065:LZTFL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 47045846 C/T 1 17 14 31 7.9983158402829 7.41315166094349 0.585164179339413 T:C C T 10 0.529510832924535 0.85934843118329 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 47452118 G/A 1 9 6 15 4.23440250367918 3.17706499754721 1.05733750613197 A:G G A 10 0.529510832924535 0.61671670096814 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 14 12 26 6.58684833905651 6.35412999509442 0.232718343962088 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 47454399 G/A,C 0 0 44 44 0 23.2984766486795 -23.2984766486795 A:C G A 10 0.529510832924535 3.9100620238889e-15 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47454196_47454925:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47454196_47454931:PTPN23 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 47459679 C/T 1 13 11 24 6.11635917198104 5.82461916216989 0.291740009811159 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47459624_47459739:SCAP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 18 14 32 8.46880500735837 7.41315166094349 1.05565334641488 T:C T C 10 0.529510832924535 0.72745880699673 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 32 25 57 15.0556533464149 13.2377708231134 1.8178825233015 T:C C T 10 0.529510832924535 0.691408244633164 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 33 17 50 15.5261425134903 9.0016841597171 6.52445835377325 T:G G T 10 0.529510832924535 0.066864742380755 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 22 24 46 10.3507616756602 12.7082599901888 -2.35749831452861 A:G A G 10 0.529510832924535 0.555364792856892 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 48507934 G/T 1 11 4 15 5.17538083783011 2.11804333169814 3.05733750613197 T:G G T 10 0.529510832924535 0.128035315987776 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 117 108 225 55.0472325478294 57.1871699558498 -2.13993740802038 T:C C T 10 0.529510832924535 0.789637903475341 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 49027798 G/C 1 1 7 8 0.470489167075465 3.70657583047175 -3.23608666339628 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0301990106165060 ENSG00000178467:ENST00000383729:exon_49027319_49028043:P4HTM;ENSG00000178467:ENST00000343546:exon_49027322_49028043:P4HTM;ENSG00000178467:ENST00000472301:exon_49027341_49028043:P4HTM;ENSG00000178467:ENST00000484115:exon_49027371_49028347:P4HTM;ENSG00000178467:ENST00000416619:exon_49027685_49028043:P4HTM;ENSG00000178467:ENST00000475629:exon_49027771_49028043:P4HTM HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 49114343 A/G 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 A:G A G 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000198218:ENST00000395443:exon_49114142_49114471:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000357496:exon_49114142_49114471:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000424300:exon_49114142_49114471:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000437939:exon_49114140_49114471:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000450685:exon_49114140_49114471:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000411682:exon_49114140_49114471:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000430979:exon_49114306_49114471:QRICH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 49141859 G/A 1 36 29 65 16.9376100147167 15.3558141548115 1.58179585990522 A:G G A 10 0.529510832924535 0.711326717983689 ENSG00000172053:ENST00000306125:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000430182:exon_49141806_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000445471:exon_49141764_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000414533:exon_49141790_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000420147:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000464962:exon_49141757_49141944:QARS;ENSG00000172053:ENST00000452739:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000482261:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000470619:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000479495:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000418549:exon_49141806_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000417025:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000482438:exon_49141448_49141904:QARS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 49751585 C/T 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000469978:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000444689:exon_49751523_49751607:RNF123 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 46 46 92 21.6425016854714 24.3574983145286 -2.71499662905723 A:G A G 10 0.529510832924535 0.6022977362287 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 49847623 A/G 1 2 9 11 0.94097833415093 4.76559749632082 -3.82461916216989 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0306516707381973 ENSG00000182179:ENST00000473992:exon_49847411_49847783:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000489826:exon_49847412_49847861:UBA7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 49949071 A/G 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 A:G A G 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000164077:ENST00000296473:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000419032:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000417270:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000484985:exon_49948965_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000483022:exon_49949054_49949444:MON1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 116 63 179 54.5767433807539 33.3591824742457 21.2175609065082 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00159733909881776 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 65 69 134 30.5817958599052 36.5362474717929 -5.9544516118877 T:C T C 10 0.529510832924535 0.34117102736511 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 50369546 C/A 1 36 22 58 16.9376100147167 11.6492383243398 5.28837169037697 A:C C A 10 0.529510832924535 0.188695526511035 ENSG00000068028:ENST00000362008:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000327761:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395126:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000357043:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395117:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000359365:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395129:exon_50369481_50369597:RASSF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 6 12 18 2.82293500245279 6.35412999509442 -3.53119499264163 T:G T G 10 0.529510832924535 0.103938094519762 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 51978529 C/T 1 15 7 22 7.05733750613197 3.70657583047175 3.35076167566023 T:C C T 10 0.529510832924535 0.200087997681823 ENSG00000041880:ENST00000417220:exon_51978406_51978594:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000408970:exon_51978406_51978594:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000431474:exon_51978406_51978594:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000447362:exon_51978406_51978594:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000398755:exon_51978406_51978594:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000471971:exon_51978406_51978594:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000470601:exon_51978406_51978916:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000470749:exon_51978406_51978733:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000498510:exon_51978406_51978594:PARP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 51979083 C/T 1 14 9 23 6.58684833905651 4.76559749632082 1.82125084273569 T:C C T 10 0.529510832924535 0.533349006667712 ENSG00000041880:ENST00000417220:exon_51979014_51979240:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000408970:exon_51979014_51979240:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000431474:exon_51979014_51979240:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000447362:exon_51979014_51979240:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000398755:exon_51979014_51979240:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000471971:exon_51979014_51979240:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000498510:exon_51979014_51979240:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000475782:exon_51978803_51979240:PARP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 51979531 G/A 1 14 13 27 6.58684833905651 6.88364082801896 -0.296792488962446 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000041880:ENST00000417220:exon_51979511_51979660:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000408970:exon_51979511_51979660:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000431474:exon_51979511_51979660:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000447362:exon_51979511_51979660:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000398755:exon_51979511_51979660:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000471971:exon_51979511_51979660:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000498510:exon_51979511_51979644:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000475782:exon_51979511_51979660:PARP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 52029048 G/A 1 27 8 35 12.7032075110376 4.23608666339628 8.46712084764127 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00382193912852598 ENSG00000162244:ENST00000481629:exon_52028313_52029122:RPL29;ENSG00000162244:ENST00000486565:exon_52028951_52029485:RPL29 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 52720080 A/C 1 36 22 58 16.9376100147167 11.6492383243398 5.28837169037697 A:C A C 10 0.529510832924535 0.188695526511035 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 52734488 G/A 1 14 16 30 6.58684833905651 8.47217332679256 -1.88532498773605 A:G G A 10 0.529510832924535 0.58418180440881 ENSG00000016864:ENST00000478968:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000394783:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000266014:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000407584:exon_52734461_52734513:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000491606:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000394786:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000484163:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000344383:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000485899:exon_52734461_52734513:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000479553:exon_52734461_52734673:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000489119:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000497436:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000497953:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000487642:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000464705:exon_52734461_52734512:GLT8D1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 5 9 14 2.35244583537732 4.76559749632082 -2.41315166094349 T:C C T 10 0.529510832924535 0.28431222286612 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 54 55 109 25.4064150220751 29.1230958108494 -3.71668078877432 T:C C T 10 0.529510832924535 0.502507920649274 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 44 32 76 20.7015233513205 16.9443466535851 3.75717669773534 A:C A C 10 0.529510832924535 0.422236626424087 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 53321655 T/C 1 45 32 77 21.1720125183959 16.9443466535851 4.2276658648108 T:C T C 10 0.529510832924535 0.362260880760842 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 53914093 G/A 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53913966_53914099:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000498740:exon_53913966_53914136:ACTR8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 56597954 C/T 1 3 9 12 1.41146750122639 4.76559749632082 -3.35412999509442 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0794211024472422 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000439445:exon_56597934_56598167:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000460838:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000459746:exon_56597680_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000472582:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000434467:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422788:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000442522:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000469966:exon_56597712_56598184:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000473322:exon_56597544_56598153:CCDC66 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 56653424 A/T 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 A:T A T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000480884:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000476142:exon_56651129_56653555:CCDC66 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 56653427 T/C 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000480884:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000476142:exon_56651129_56653555:CCDC66 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 57882601 C/T 1 11 10 21 5.17538083783011 5.29510832924535 -0.119727491415236 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000163681:ENST00000295951:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000295952:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416870:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000383718:exon_57882600_57887872:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000428312:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000449503:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416658:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000442599:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000459654:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000472546:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000417128:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000438794:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000495364:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000494088:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000461354:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000466255:exon_57882600_57882659:SLMAP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 58191266 C/T 1 2 7 9 0.94097833415093 3.70657583047175 -2.76559749632082 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0935246236081911 ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58191217_58191287:DNASE1L3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 58196639 C/T 1 9 2 11 4.23440250367918 1.05902166584907 3.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.070493162541885 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58196493_58196696:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58196493_58196950:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000463694:exon_58196493_58196647:DNASE1L3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 58414382 C/T 1 8 10 18 3.76391333660372 5.29510832924535 -1.53119499264163 T:C C T 10 0.529510832924535 0.489195304177666 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 59908126 A/G 1 8 6 14 3.76391333660372 3.17706499754721 0.586848339056509 A:G A G 10 0.529510832924535 0.795582240516341 ENSG00000189283:ENST00000492590:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000476844:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000466788:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000468189:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000341848:exon_59908072_59908140:FHIT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 66433676 A/G 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 A:G A G 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66433406_66433825:LRIG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 69096614 G/A 1 8 3 11 3.76391333660372 1.58853249877361 2.17538083783011 A:G G A 10 0.529510832924535 0.235512259698034 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 15 14 29 7.05733750613197 7.41315166094349 -0.355814154811517 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 87276699 C/T 1 21 21 42 9.88027250858476 11.1197274914152 -1.23945498283047 T:C C T 10 0.529510832924535 0.758233996771047 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87276421_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87276435_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87276452_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87276459_87276706:CHMP2B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 87299075 A/C 1 9 17 26 4.23440250367918 9.0016841597171 -4.76728165603791 A:T:C A C 10 0.529510832924535 0.0762485810939982 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87299025_87299127:CHMP2B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 88199179 T/C 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 T:C T C 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 88199298 T/C 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 T:C T C 10 0.529510832924535 0.779088238758133 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 97664725 C/T 1 9 18 27 4.23440250367918 9.53119499264163 -5.29679248896245 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0526074098364202 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97664182_97664731:MINA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 98250862 C/A 1 74 49 123 34.8161983635844 25.9460308133022 8.87016755028219 A:C C A 10 0.529510832924535 0.124420459686637 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 99886662 G/A 1 32 36 68 15.0556533464149 19.0623899852833 -4.00673663886838 A:G G A 10 0.529510832924535 0.334340481018695 ENSG00000184220:ENST00000421999:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000491299:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000489081:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000478909:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000497345:exon_99886582_99886684:C3orf26;ENSG00000184220:ENST00000479555:exon_99886582_99886684:C3orf26 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 56 41 97 26.347393356226 21.7099441499059 4.6374492063201 T:C T C 10 0.529510832924535 0.361504229128509 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 101405535 G/A 1 14 13 27 6.58684833905651 6.88364082801896 -0.296792488962446 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000114391:ENST00000464595:exon_101405326_101405556:RPL24;ENSG00000114391:ENST00000394077:exon_101405516_101405626:RPL24;ENSG00000114391:ENST00000495401:exon_101405516_101405549:RPL24;ENSG00000114391:ENST00000469605:exon_101405516_101405539:RPL24;ENSG00000114391:ENST00000470961:exon_101405516_101405558:RPL24 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 119150836 C/T 1 68 56 124 31.9932633611316 29.652606643774 2.34065671735765 T:C C T 10 0.529510832924535 0.719277975939703 ENSG00000176142:ENST00000438581:exon_119148347_119151061:TMEM39A;ENSG00000176142:ENST00000319172:exon_119148347_119151061:TMEM39A;ENSG00000176142:ENST00000473684:exon_119148347_119151061:TMEM39A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 119222456 G/C 1 25 29 54 11.7622291768866 15.3558141548115 -3.59358497792489 C:G G C 10 0.529510832924535 0.342685779223781 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000492164:exon_119222379_119222467:C3orf1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 119263680 C/T 1 56 25 81 26.347393356226 13.2377708231134 13.1096225331127 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00363302212973246 ENSG00000121594:ENST00000264246:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383669:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383668:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000478182:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000463729:exon_119263190_119263714:CD80 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 232 183 415 109.153486761508 96.9004824251899 12.253004336318 T:C T C 10 0.529510832924535 0.238050587714595 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 121354583 G/A 1 229 191 420 107.742019260281 101.136569088586 6.60545017169528 A:G G A 10 0.529510832924535 0.525536643082066 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121354582_121354651:HCLS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 121383297 G/A 1 152 154 306 71.5143533954707 81.5446682703784 -10.0303148749077 A:G G A 10 0.529510832924535 0.252672505946484 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 121414061 C/T 1 22 18 40 10.3507616756602 9.53119499264163 0.819566683018598 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.874679732608783 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 121415720 T/C 1 30 15 45 14.1146750122639 7.94266249386803 6.17201251839592 T:C:G T C 10 0.529510832924535 0.0733172826280897 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 44 56 100 20.7015233513205 29.652606643774 -8.95108329245351 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0880771290052769 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 121526204 G/A 1 8 21 29 3.76391333660372 11.1197274914152 -7.35581415481152 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00817215169393851 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000460108:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000498104:exon_121526191_121526290:IQCB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 121563355 T/C 1 54 45 99 25.4064150220751 23.8279874816041 1.57842754047103 T:C T C 10 0.529510832924535 0.76373746843365 ENSG00000145088:ENST00000490434:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000273668:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000451944:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000490477:exon_121563300_121563394:EAF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 121838319 G/A 1 30 60 90 14.1146750122639 31.7706499754721 -17.6559749632082 A:G G A 10 0.529510832924535 0.000196219001660614 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121838285_121838921:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121838285_121839175:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121838285_121839982:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121838285_121838667:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121838285_121838440:CD86 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 23 23 46 10.8212508427357 12.1787491572643 -1.35749831452861 C:G G C 10 0.529510832924535 0.76819401671838 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 122277160 G/T 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 T:G G T 10 0.529510832924535 0.295900852930508 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 122277172 G/A 1 8 2 10 3.76391333660372 1.05902166584907 2.70489167075465 A:G G A 10 0.529510832924535 0.115498370857198 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 122345870 C/T 1 13 2 15 6.11635917198104 1.05902166584907 5.05733750613197 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0088616695804921 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000473627:exon_122345674_122345880:PARP15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 88 92 180 41.4030467026409 48.7149966290572 -7.31194992641631 A:G A G 10 0.529510832924535 0.296005915849736 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 122354716 C/T 1 92 101 193 43.2850033709428 53.480594125378 -10.1955907544353 T:C C T 10 0.529510832924535 0.149438023489560 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 124458938 T/A 1 15 29 44 7.05733750613197 15.3558141548115 -8.29847664867954 A:T T A 10 0.529510832924535 0.014956638853404 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000487622:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124458871_124459046:UMPS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 124462824 A/G 1 102 106 208 47.9898950416974 56.1281482900007 -8.13825324830329 A:G A G 10 0.529510832924535 0.266922404091740 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 124462959 A/G 1 93 88 181 43.7554925380182 46.5969532973591 -2.84146075934085 A:G A G 10 0.529510832924535 0.709833500024957 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 124732618 A/G 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 A:G A G 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124732316_124732834:HEG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 124746049 A/G 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:G A G 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 124802677 A/G 1 86 44 130 40.46206836849 23.2984766486795 17.1635917198104 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00270707984305171 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 56 21 77 26.347393356226 11.1197274914152 15.2276658648108 A:G A G 10 0.529510832924535 0.000532463551403981 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 55 24 79 25.8769041891506 12.7082599901888 13.1686441989617 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00318853626730886 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 13 7 20 6.11635917198104 3.70657583047175 2.4097833415093 T:C C T 10 0.529510832924535 0.371363290052013 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 127292333 G/A 1 61 41 102 28.6998391916034 21.7099441499059 6.98989504169743 A:G G A 10 0.529510832924535 0.197004087243000 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 127323592 G/A 1 21 17 38 9.88027250858476 9.0016841597171 0.878588348867668 A:G G A 10 0.529510832924535 0.87133953035346 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000480910:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323451_127323626:MCM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 26 27 53 12.2327183439621 14.2967924889624 -2.06407414500036 T:C C T 10 0.529510832924535 0.584825526424954 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 128344786 G/A 1 124 115 239 58.3406567173577 60.8937457863215 -2.55308906896388 A:G G A 10 0.529510832924535 0.74638229491564 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344717_128344855:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344717_128344855:RPN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 128614185 A/C 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 A:C A C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 25 18 43 11.7622291768866 9.53119499264163 2.23103418424499 T:C C T 10 0.529510832924535 0.543289426315433 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 129034578 G/A 1 51 64 115 23.9949475208487 33.8886933071702 -9.89374578632153 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0755189535513747 ENSG00000184897:ENST00000333762:exon_129033615_129035117:H1FX HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 131220550 G/A 1 90 86 176 42.3440250367918 45.53793163151 -3.19390659471816 A:G G A 10 0.529510832924535 0.650917049478343 ENSG00000114686:ENST00000264995:exon_131220375_131220559:MRPL3;ENSG00000114686:ENST00000511168:exon_131220375_131220559:MRPL3;ENSG00000114686:ENST00000425847:exon_131220375_131220559:MRPL3;ENSG00000114686:ENST00000507669:exon_131220375_131220559:MRPL3;ENSG00000114686:ENST00000512877:exon_131220375_131220559:MRPL3;ENSG00000114686:ENST00000510923:exon_131220375_131220559:MRPL3;ENSG00000114686:ENST00000510154:exon_131220375_131220559:MRPL3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 133342218 C/T 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133342155_133342301:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133342155_133342301:TOPBP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 133524717 G/C 1 32 22 54 15.0556533464149 11.6492383243398 3.40641502207511 C:G G C 10 0.529510832924535 0.413883598039945 ENSG00000144867:ENST00000466490:exon_133524520_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000484684:exon_133524459_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000273406:exon_133524665_133524846:SRPRB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 7 8 15 3.29342416952825 4.23608666339628 -0.942662493868026 A:G G A 10 0.529510832924535 0.797047341083576 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 137881265 T/A 1 7 13 20 3.29342416952825 6.88364082801896 -3.5902166584907 A:T T A 10 0.529510832924535 0.120726784497272 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 138218994 T/C 1 3 7 10 1.41146750122639 3.70657583047175 -2.29510832924535 T:C T C 10 0.529510832924535 0.206417065723492 ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000489254:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000459695:exon_138218952_138219022:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138218726_138219066:CEP70 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 138289163 T/C 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 T:C T C 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000468900:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000462419:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000478673:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000464035:exon_138289160_138289340:CEP70 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 142168331 C/T 1 46 54 100 21.6425016854714 28.5935849779249 -6.9510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 0.192573874330687 ENSG00000175054:ENST00000504521:exon_142168077_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515810:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142168080_142172075:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142168080_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515107:exon_142168160_142168444:ATR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 145788467 T/C 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000152952:ENST00000282903:exon_145787227_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000461497:exon_145787227_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000360060:exon_145787231_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000494950:exon_145787968_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000495700:exon_145788028_145788659:PLOD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 13 16 29 6.11635917198104 8.47217332679256 -2.35581415481152 T:G T G 10 0.529510832924535 0.457889314355892 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 7 16 23 3.29342416952825 8.47217332679256 -5.17874915726431 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0362407048294852 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 24 25 49 11.2917400098112 13.2377708231134 -1.94603081330222 C:G C G 10 0.529510832924535 0.668140459023759 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 34 25 59 15.9966316805658 13.2377708231134 2.75886085745243 C:G G C 10 0.529510832924535 0.515705086410572 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 156395945 T/C 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 T:C T C 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000163659:ENST00000486483:exon_156395446_156396403:TIPARP;ENSG00000163659:ENST00000295924:exon_156395446_156396403:TIPARP;ENSG00000163659:ENST00000461166:exon_156395446_156396403:TIPARP;ENSG00000163659:ENST00000473702:exon_156395446_156396403:TIPARP;ENSG00000163659:ENST00000481853:exon_156395446_156396403:TIPARP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 158320703 C/A 1 12 5 17 5.64587000490558 2.64755416462268 2.9983158402829 A:C C A 10 0.529510832924535 0.223483974880525 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 56 71 127 26.347393356226 37.595269137642 -11.2478757814159 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0503282395341236 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 160143943 A/G 1 42 46 88 19.7605450171695 24.3574983145286 -4.59695329735909 A:G A G 10 0.529510832924535 0.338153077105492 ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160143862_160143988:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160143862_160143988:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469762:exon_160143862_160143988:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160143862_160143988:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160143862_160143988:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462668:exon_160143862_160143988:SMC4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 160942832 G/A 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 A:G G A 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000169251:ENST00000468606:exon_160942718_160942852:NMD3;ENSG00000169251:ENST00000460503:exon_160942718_160942852:NMD3;ENSG00000169251:ENST00000493066:exon_160942718_160942852:NMD3;ENSG00000169251:ENST00000473909:exon_160942718_160942852:NMD3;ENSG00000169251:ENST00000351193:exon_160942718_160942852:NMD3;ENSG00000169251:ENST00000472947:exon_160942718_160942852:NMD3;ENSG00000169251:ENST00000463518:exon_160942718_160942852:NMD3;ENSG00000169251:ENST00000476237:exon_160942718_160942852:NMD3;ENSG00000169251:ENST00000460469:exon_160942718_160942852:NMD3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 169846728 A/G 1 12 8 20 5.64587000490558 4.23608666339628 1.4097833415093 A:G A G 10 0.529510832924535 0.655754725288894 ENSG00000173889:ENST00000494943:exon_169846472_169847340:PHC3;ENSG00000173889:ENST00000495893:exon_169846472_169847340:PHC3;ENSG00000173889:ENST00000413540:exon_169846472_169847340:PHC3;ENSG00000173889:ENST00000467570:exon_169846472_169847340:PHC3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 170825920 G/A 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 A:G G A 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170825854_170825951:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170825854_170825951:TNIK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 20 11 31 9.4097833415093 5.82461916216989 3.58516417933941 A:G G A 10 0.529510832924535 0.212599970713911 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 174951756 T/C 1 10 15 25 4.70489167075465 7.94266249386803 -3.23777082311338 T:C T C 10 0.529510832924535 0.230939624838663 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 178976777 C/T 1 9 3 12 4.23440250367918 1.58853249877361 2.64587000490558 T:C C T 10 0.529510832924535 0.154401063622286 ENSG00000171121:ENST00000392686:exon_178976736_178977679:KCNMB3;ENSG00000171121:ENST00000485523:exon_178976736_178976996:KCNMB3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 178978078 T/G 1 1 7 8 0.470489167075465 3.70657583047175 -3.23608666339628 T:G T G 10 0.529510832924535 0.0301990106165060 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 179306648 A/G 1 79 81 160 37.1686441989617 42.8903774668873 -5.72173326792561 A:G A G 10 0.529510832924535 0.384123406916846 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 179306775 C/T 1 167 183 350 78.5716909016027 96.9004824251899 -18.3287915235873 T:C:G C T 10 0.529510832924535 0.0537868435652529 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 179322385 A/C 1 58 78 136 27.288371690377 41.3018449681137 -14.0134732777368 A:C A C 10 0.529510832924535 0.0200391312911697 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179322315_179322442:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179322315_179322428:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179322315_179322434:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179322315_179322437:MRPL47 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 182755209 T/G 1 27 17 44 12.7032075110376 9.0016841597171 3.70152335132046 T:G T G 10 0.529510832924535 0.292562722533181 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755202_182755222:MCCC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 15 7 22 7.05733750613197 3.70657583047175 3.35076167566023 T:C T C 10 0.529510832924535 0.200087997681823 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 9 11 20 4.23440250367918 5.82461916216989 -1.5902166584907 A:C C A 10 0.529510832924535 0.508807175217642 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 185135338 T/A 0 2619 0 2619 1232.21112857064 0 1232.21112857064 T T 10 0.529510832924535 0 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 0 1769 10 1779 832.295336556498 5.29510832924535 827.000228227252 T:C:G G T 10 0.529510832924535 4.94065645841247e-324 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 9 12 21 4.23440250367918 6.35412999509442 -2.11972749141524 A:C C A 10 0.529510832924535 0.388145875482006 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 185823424 G/A 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000244405:ENST00000306376:exon_185823414_185823501:ETV5;ENSG00000244405:ENST00000434744:exon_185823414_185823501:ETV5;ENSG00000244405:ENST00000440773:exon_185823414_185823501:ETV5;ENSG00000244405:ENST00000421809:exon_185823414_185823501:ETV5;ENSG00000244405:ENST00000413301:exon_185823414_185823501:ETV5;ENSG00000244405:ENST00000422039:exon_185823414_185823501:ETV5;ENSG00000244405:ENST00000476890:exon_185823414_185823501:ETV5;ENSG00000244405:ENST00000495808:exon_185823414_185823513:ETV5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 187088812 C/T 1 18 5 23 8.46880500735837 2.64755416462268 5.82125084273569 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0197453258478573 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 187088903 C/A 1 15 13 28 7.05733750613197 6.88364082801896 0.173696678113019 A:C C A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 187089031 C/A 1 20 21 41 9.4097833415093 11.1197274914152 -1.70994414990594 A:C C A 10 0.529510832924535 0.640483953032678 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 193385059 G/A 1 30 21 51 14.1146750122639 11.1197274914152 2.99494752084871 A:G G A 10 0.529510832924535 0.483465186906548 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000445863:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000429164:exon_193384965_193385069:OPA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 194369352 T/G 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 T:G T G 10 0.529510832924535 0.742993974261161 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 194369579 C/A 1 1 9 10 0.470489167075465 4.76559749632082 -4.29510832924535 A:C C A 10 0.529510832924535 0.0082459486500564 ENSG00000041802:ENST00000460584:exon_194369410_194369748:LSG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 194369580 C/A 1 1 9 10 0.470489167075465 4.76559749632082 -4.29510832924535 A:C C A 10 0.529510832924535 0.0082459486500564 ENSG00000041802:ENST00000460584:exon_194369410_194369748:LSG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 194373832 T/C 1 5 10 15 2.35244583537732 5.29510832924535 -2.94266249386803 T:C T C 10 0.529510832924535 0.194474740642524 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 194373833 G/A 1 5 10 15 2.35244583537732 5.29510832924535 -2.94266249386803 A:G G A 10 0.529510832924535 0.194474740642524 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 195022657 C/T 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 0.487573754416657 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 195027339 G/A 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000114331:ENST00000326793:exon_195027240_195027345:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000484296:exon_195027240_195027594:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000439758:exon_195027240_195027345:ACAP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 195594494 C/T 1 22 30 52 10.3507616756602 15.8853249877361 -5.53456331207582 T:C C T 10 0.529510832924535 0.128765908367593 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 195599257 G/A 1 6 13 19 2.82293500245279 6.88364082801896 -4.06070582556617 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0688369807190561 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000481865:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000424563:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000478623:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000411741:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000489628:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000478715:exon_195599147_195599274:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000468680:exon_195599147_195599677:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000316664:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000486523:exon_195599151_195599341:TNK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 15 11 26 7.05733750613197 5.82461916216989 1.23271834396209 T:C C T 10 0.529510832924535 0.697111831856919 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 195800925 T/C 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 T:C T C 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 10 16 26 4.70489167075465 8.47217332679256 -3.76728165603791 T:G G T 10 0.529510832924535 0.169480008002253 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 196210590 A/G 1 10 3 13 4.70489167075465 1.58853249877361 3.11635917198104 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0995863157160923 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 196743130 T/C 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 T:C T C 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196743060_196743240:MFI2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 197566254 T/C 1 12 6 18 5.64587000490558 3.17706499754721 2.46880500735837 T:C T C 10 0.529510832924535 0.345463610504387 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000494069:exon_197566192_197566268:LRCH3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 3 197579466 C/T 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 T:C C T 10 0.529510832924535 0.186533779694549 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000481048:exon_197579199_197579491:LRCH3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 87113 T/C 1 2 12 14 0.94097833415093 6.35412999509442 -5.41315166094349 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0052689787515052 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 843720 T/C 1 89 85 174 41.8735358697164 45.0084207985855 -3.1348849288691 T:C T C 10 0.529510832924535 0.649191737048438 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843680_844197:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843680_843856:GAK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 882643 G/A 1 14 12 26 6.58684833905651 6.35412999509442 0.232718343962088 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504435:exon_879571_882758:GAK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 946226 T/C 1 8 9 17 3.76391333660372 4.76559749632082 -1.0016841597171 T:C T C 10 0.529510832924535 0.637013022123958 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515492:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504180:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000506669:exon_946199_946238:TMEM175 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 951947 T/C 1 11 10 21 5.17538083783011 5.29510832924535 -0.119727491415236 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_951612_952363:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_951612_952297:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_951612_952427:TMEM175 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 1330759 T/C 1 6 20 26 2.82293500245279 10.5902166584907 -7.76728165603791 T:C T C 10 0.529510832924535 0.00263964876400273 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 105 87 192 49.4013625429238 46.0674424644345 3.33392007848927 A:G G A 10 0.529510832924535 0.664689651314748 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 1729953 G/A 1 58 62 120 27.288371690377 32.8296716413212 -5.5412999509442 A:G G A 10 0.529510832924535 0.316008248282961 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1729435_1729959:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 1729988 G/A 1 56 71 127 26.347393356226 37.595269137642 -11.2478757814159 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0503282395341236 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 110 102 212 51.7538083783011 54.0101049583026 -2.25629658000143 A:G A G 10 0.529510832924535 0.78333017748145 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 1732978 G/A 1 52 45 97 24.4654366879242 23.8279874816041 0.637449206320102 A:G G A 10 0.529510832924535 0.919308484885601 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1732899_1733028:TACC3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 52 45 97 24.4654366879242 23.8279874816041 0.637449206320102 T:C C T 10 0.529510832924535 0.919308484885601 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 1746229 G/T 1 8 17 25 3.76391333660372 9.0016841597171 -5.23777082311338 T:G G T 10 0.529510832924535 0.044204604125891 ENSG00000013810:ENST00000484264:exon_1746166_1746351:TACC3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 2233852 T/C 1 30 23 53 14.1146750122639 12.1787491572643 1.93592585499964 T:C T C 10 0.529510832924535 0.680249323670917 ENSG00000130997:ENST00000506518:exon_2233672_2233870:POLN;ENSG00000214367:ENST00000243706:exon_2230076_2233887:HAUS3;ENSG00000214367:ENST00000443786:exon_2233568_2233887:HAUS3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 2 7 9 0.94097833415093 3.70657583047175 -2.76559749632082 T:G G T 10 0.529510832924535 0.0935246236081911 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 2826400 T/C 1 11 5 16 5.17538083783011 2.64755416462268 2.52782667320744 T:C T C 10 0.529510832924535 0.222816733853050 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2826340_2826644:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2826340_2826641:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2826340_2826429:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2826340_2826828:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826392_2826486:SH3BP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 23 11 34 10.8212508427357 5.82461916216989 4.99663168056581 T:G T G 10 0.529510832924535 0.120775978879887 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 15 13 28 7.05733750613197 6.88364082801896 0.173696678113019 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 3227419 A/G 1 10 13 23 4.70489167075465 6.88364082801896 -2.17874915726431 A:G A G 10 0.529510832924535 0.407596227656326 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 12 19 31 5.64587000490558 10.0607058255662 -4.41483582066059 A:G G A 10 0.529510832924535 0.149025268406671 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 3234980 G/A 1 18 14 32 8.46880500735837 7.41315166094349 1.05565334641488 A:G G A 10 0.529510832924535 0.72745880699673 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3234890_3235080:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3234890_3235080:HTT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 4304605 G/A 1 1 8 9 0.470489167075465 4.23608666339628 -3.76559749632082 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0158444396711090 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4304038_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000504302:exon_4304354_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000511458:exon_4304459_4304818:ZBTB49 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 4322570 G/A 1 2 11 13 0.94097833415093 5.82461916216989 -4.88364082801896 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00956286367176584 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 4322770 T/C 1 3 13 16 1.41146750122639 6.88364082801896 -5.47217332679256 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0097876216175532 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 6303680 A/G 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G A G 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 2 7 9 0.94097833415093 3.70657583047175 -2.76559749632082 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0935246236081911 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 8229774 C/T 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 6 10 16 2.82293500245279 5.29510832924535 -2.47217332679256 T:C T C 10 0.529510832924535 0.316631120754283 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 8 10 18 3.76391333660372 5.29510832924535 -1.53119499264163 T:C T C 10 0.529510832924535 0.489195304177666 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 10669522 A/C 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 A:C A C 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000109684:ENST00000226951:exon_10669483_10669535:CLNK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 13601337 G/A 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 17506042 G/A 1 31 19 50 14.5851641793394 10.0607058255662 4.52445835377325 A:G G A 10 0.529510832924535 0.206172792253662 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17506002_17506098:QDPR HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 17818885 T/C 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000509719:exon_17818855_17819076:NCAPG HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 7 10 17 3.29342416952825 5.29510832924535 -2.0016841597171 T:C C T 10 0.529510832924535 0.344125043526582 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 32 39 71 15.0556533464149 20.6509224840569 -5.59526913764199 T:C T C 10 0.529510832924535 0.192515750956143 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 37903756 T/C 1 10 4 14 4.70489167075465 2.11804333169814 2.58684833905651 T:C T C 10 0.529510832924535 0.19016988576375 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 38972691 T/C 1 14 32 46 6.58684833905651 16.9443466535851 -10.3574983145286 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0027642142426138 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_38972652_38972757:TMEM156 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 23 22 45 10.8212508427357 11.6492383243398 -0.827987481604078 T:C T C 10 0.529510832924535 0.881613859608674 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 21 14 35 9.88027250858476 7.41315166094349 2.46712084764127 T:C T C 10 0.529510832924535 0.498877287546952 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 39303925 A/G 1 19 13 32 8.93929417443383 6.88364082801896 2.05565334641488 A:G A G 10 0.529510832924535 0.485297135983152 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39303898_39303996:RFC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 86 10 96 40.46206836849 5.29510832924535 35.1669600392446 A:G A G 10 0.529510832924535 1.76993165087100e-14 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 40428010 T/C 1 10 1 11 4.70489167075465 0.529510832924535 4.17538083783012 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0132312338126181 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40425272_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40425698_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40426355_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40427429_40428160:RBM47 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 40438576 A/G 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.159283336846293 ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40438458_40438664:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40438458_40438902:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40438458_40438664:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40438458_40438664:RBM47 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 48165757 G/A 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 A:G G A 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48165719_48165784:TEC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 48172266 G/A 1 5 9 14 2.35244583537732 4.76559749632082 -2.41315166094349 A:G G A 10 0.529510832924535 0.28431222286612 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48172265_48172393:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48172262_48172395:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48172265_48172393:TEC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 53751932 C/T 1 24 22 46 11.2917400098112 11.6492383243398 -0.357498314528613 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_53751914_53752033:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_53751914_53752033:SCFD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 54232110 G/A 1 12 9 21 5.64587000490558 4.76559749632082 0.880272508584764 A:G G A 10 0.529510832924535 0.827993527930512 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54231271_54232242:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54231271_54232228:SCFD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 54327584 A/G 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 A:G A G 10 0.529510832924535 0.159283336846293 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 57361553 A/G 1 73 64 137 34.3457091965089 33.8886933071702 0.457015889338699 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57361523_57361560:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57361523_57361560:SRP72 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 57797414 C/T 1 7 10 17 3.29342416952825 5.29510832924535 -2.0016841597171 T:C C T 10 0.529510832924535 0.344125043526582 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 57797580 G/A 1 12 6 18 5.64587000490558 3.17706499754721 2.46880500735837 A:G G A 10 0.529510832924535 0.345463610504387 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 57798189 G/A 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 A:T:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 69203080 T/C 1 36 29 65 16.9376100147167 15.3558141548115 1.58179585990522 T:C T C 10 0.529510832924535 0.711326717983689 ENSG00000083896:ENST00000344157:exon_69202745_69203168:YTHDC1;ENSG00000083896:ENST00000355665:exon_69202745_69203168:YTHDC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 73942678 C/T 1 41 35 76 19.2900558500941 18.5328791523587 0.757176697735336 T:C C T 10 0.529510832924535 0.908793519268485 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 76836137 A/G 1 7 1 8 3.29342416952825 0.529510832924535 2.76391333660372 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0741292491828888 ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76836021_76836138:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000513045:exon_76836021_76836138:NAAA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 76857309 C/T 0 8 0 8 3.76391333660372 0 3.76391333660372 C C 10 0.529510832924535 0.00858117377180446 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 76857388 C/T 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:C C T 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507940:exon_76857317_76857388:NAAA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 49 53 102 23.0539691866978 28.0640741450004 -5.01010495830258 A:G G A 10 0.529510832924535 0.323358399507422 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 76878727 G/C 1 64 61 125 30.1113066928298 32.3001608083966 -2.18885411556688 C:G G C 10 0.529510832924535 0.720544801944244 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 89421086 A/G 1 26 11 37 12.2327183439621 5.82461916216989 6.4080991817922 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0467123127319429 ENSG00000138646:ENST00000264350:exon_89421077_89421143:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000508159:exon_89421077_89421143:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000510223:exon_89421077_89421143:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000502913:exon_89421077_89421143:HERC5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 95202640 A/G 1 4 11 15 1.88195666830186 5.82461916216989 -3.94266249386803 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0666655440918002 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95202623_95202741:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95202623_95202741:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95202623_95202741:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95202623_95202741:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95202623_95202741:SMARCAD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 100784980 C/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000070190:ENST00000296414:exon_100784927_100785012:DAPP1;ENSG00000070190:ENST00000512369:exon_100784927_100785012:DAPP1;ENSG00000070190:ENST00000507994:exon_100784927_100785443:DAPP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 742 612 1354 349.102961969995 324.060629749815 25.0423322201796 A:T A T 10 0.529510832924535 0.173571125280773 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 123280860 T/C 1 20 17 37 9.4097833415093 9.0016841597171 0.408099181792204 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123280712_123280877:KIAA1109 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 128814492 G/A 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814355_128814573:PLK4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 128842761 G/A 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 A:G G A 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000164073:ENST00000296468:exon_128842679_128842926:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000515130:exon_128842679_128842926:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000513559:exon_128842679_128842926:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000504126:exon_128842512_128842926:MFSD8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 128949799 C/T 1 13 6 19 6.11635917198104 3.17706499754721 2.93929417443383 T:C C T 10 0.529510832924535 0.25025489550222 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 128949850 A/G 1 22 8 30 10.3507616756602 4.23608666339628 6.11467501226395 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0279094848478697 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 128949929 C/A 1 11 8 19 5.17538083783011 4.23608666339628 0.939294174433834 A:C C A 10 0.529510832924535 0.81917282175653 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 129012638 A/G 1 15 32 47 7.05733750613197 16.9443466535851 -9.88700914745315 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00498245170393841 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000394288:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000432347:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129012502_129012667:LARP1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 129043204 C/G 1 11 10 21 5.17538083783011 5.29510832924535 -0.119727491415236 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 129043286 C/T 1 14 8 22 6.58684833905651 4.23608666339628 2.35076167566023 T:C C T 10 0.529510832924535 0.394779767186122 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507259:exon_129043272_129043343:LARP1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 129913345 G/A 1 3 7 10 1.41146750122639 3.70657583047175 -2.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 0.206417065723492 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129913322_129913392:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000434680:exon_129913322_129913392:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000503215:exon_129913322_129913392:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129913322_129913392:SCLT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 130023884 G/T 1 10 5 15 4.70489167075465 2.64755416462268 2.05733750613197 T:G G T 10 0.529510832924535 0.314439025315697 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 130030644 C/T 1 18 5 23 8.46880500735837 2.64755416462268 5.82125084273569 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0197453258478573 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 11 9 20 5.17538083783011 4.76559749632082 0.409783341509299 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 16 14 30 7.52782667320744 7.41315166094349 0.114675012263948 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 151199080 G/A 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151199005_151199156:LRBA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 151207127 C/T 1 6 8 14 2.82293500245279 4.23608666339628 -1.41315166094349 T:C C T 10 0.529510832924535 0.594278475296019 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000508606:exon_151207085_151207186:LRBA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 152609826 A/C 1 19 12 31 8.93929417443383 6.35412999509442 2.58516417933941 A:C:G A C 10 0.529510832924535 0.374459447746206 ENSG00000059691:ENST00000263985:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515812:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515564:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000503160:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000510720:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000513504:exon_152609782_152609915:PET112L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 156273768 T/C 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000503466:exon_156273748_156273838:MAP9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 156276289 C/T 1 10 9 19 4.70489167075465 4.76559749632082 -0.0607058255661652 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156276223_156276312:MAP9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 156289900 C/T 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156289738_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393836:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000379248:exon_156289318_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393834:exon_156289654_156289961:MAP9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 156289917 G/A 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 A:G G A 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156289738_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393836:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000379248:exon_156289318_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393834:exon_156289654_156289961:MAP9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 65 66 131 30.5817958599052 34.9477149730193 -4.3659191131141 A:T:C:G A C 10 0.529510832924535 0.484032807640145 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 90 84 174 42.3440250367918 44.4789099656609 -2.1348849288691 T:C T C 10 0.529510832924535 0.761704780965485 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 166021811 G/C 1 5 8 13 2.35244583537732 4.23608666339628 -1.88364082801896 C:G G C 10 0.529510832924535 0.406366482999609 ENSG00000170088:ENST00000306480:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000506087:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000505095:exon_166021780_166022044:TMEM192 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 169931274 G/A 1 13 6 19 6.11635917198104 3.17706499754721 2.93929417443383 A:G G A 10 0.529510832924535 0.25025489550222 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 170429402 T/C 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 T:C T C 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000137601:ENST00000439128:exon_170429399_170429482:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000379072:exon_170429399_170429482:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000511633:exon_170429399_170429482:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000510533:exon_170429399_170429482:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000507142:exon_170429399_170429482:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000512193:exon_170429399_170429482:NEK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 170634408 A/G 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G A G 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 170678993 T/C 1 34 25 59 15.9966316805658 13.2377708231134 2.75886085745243 T:C T C 10 0.529510832924535 0.515705086410572 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170678981_170679104:C4orf27;ENSG00000056050:ENST00000506125:exon_170678981_170679055:C4orf27 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 5 15 20 2.35244583537732 7.94266249386803 -5.5902166584907 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0135453328641453 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 186097045 C/T 1 9 9 18 4.23440250367918 4.76559749632082 -0.53119499264163 T:C C T 10 0.529510832924535 0.817944843022877 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 33 22 55 15.5261425134903 11.6492383243398 3.87690418915057 T:C T C 10 0.529510832924535 0.344837496040275 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 9 6 15 4.23440250367918 3.17706499754721 1.05733750613197 A:G G A 10 0.529510832924535 0.61671670096814 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 186379899 G/C 1 11 5 16 5.17538083783011 2.64755416462268 2.52782667320744 C:G G C 10 0.529510832924535 0.222816733853050 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 4 186380243 A/C 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:C A C 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 205565 G/A 1 23 16 39 10.8212508427357 8.47217332679256 2.34907751594313 A:G G A 10 0.529510832924535 0.522318756140582 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 226160 A/C 1 80 70 150 37.6391333660372 37.0657583047175 0.573375061319744 A:C A C 10 0.529510832924535 0.935027584644552 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_225748_226162:SDHA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 228362 T/C 1 55 55 110 25.8769041891506 29.1230958108494 -3.24619162169886 T:C T C 10 0.529510832924535 0.56715383082209 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_227724_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_228300_228448:SDHA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 233734 C/G 1 91 113 204 42.8145142038673 59.8347241204725 -17.0202099166051 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0204125377360707 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_233718_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_233592_233744:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_233592_234253:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_233592_234253:SDHA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 256472 G/A 1 283 162 445 133.148434282357 85.7807549337747 47.3676793485819 A:T:G G A 10 0.529510832924535 6.07970669648257e-06 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 256509 G/A 1 254 166 420 119.504248437168 87.8987982654728 31.6054501716953 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00204870353163747 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 151 119 270 71.0438642283952 63.0117891180197 8.03207511037554 T:C T C 10 0.529510832924535 0.330208358156462 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 442571 A/C 1 12 9 21 5.64587000490558 4.76559749632082 0.880272508584764 A:C A C 10 0.529510832924535 0.827993527930512 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 18 31 49 8.46880500735837 16.4148358206606 -7.94603081330222 A:G G A 10 0.529510832924535 0.030787209809938 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 476353 C/T 1 2 8 10 0.94097833415093 4.23608666339628 -3.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0539366762210793 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_476317_476493:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_476317_476493:SLC9A3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 21 24 45 9.88027250858476 12.7082599901888 -2.82798748160408 A:G G A 10 0.529510832924535 0.456087423267675 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 5489383 G/A 1 29 28 57 13.6441858451885 14.826303321887 -1.1821174766985 A:G G A 10 0.529510832924535 0.791598199203232 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5489262_5490347:KIAA0947 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 10239261 G/A 1 8 2 10 3.76391333660372 1.05902166584907 2.70489167075465 A:G G A 10 0.529510832924535 0.115498370857198 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 10239278 C/T 1 8 2 10 3.76391333660372 1.05902166584907 2.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.115498370857198 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 14508347 A/T 1 12 12 24 5.64587000490558 6.35412999509442 -0.708259990188841 A:T A T 10 0.529510832924535 0.839421058538893 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14507989_14510313:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14507989_14508785:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000344135:exon_14507989_14510312:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000508717:exon_14507989_14508442:TRIO HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 14741984 T/C 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:C T C 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000154122:ENST00000284268:exon_14741936_14742031:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000503939:exon_14741936_14742031:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000515517:exon_14741566_14742031:ANKH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 33989518 C/T 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 T:C C T 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 36171780 A/G 1 17 9 26 7.9983158402829 4.76559749632082 3.23271834396209 A:G A G 10 0.529510832924535 0.24086494409280 ENSG00000145604:ENST00000274254:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000274255:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000308927:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000509692:exon_36171705_36171835:SKP2;ENSG00000145604:ENST00000513151:exon_36171705_36171835:SKP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 36985303 A/G 1 11 9 20 5.17538083783011 4.76559749632082 0.409783341509299 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 42800808 C/T 1 2 7 9 0.94097833415093 3.70657583047175 -2.76559749632082 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0935246236081911 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 43297144 A/G 1 20 26 46 9.4097833415093 13.7672816560379 -4.35749831452861 A:G A G 10 0.529510832924535 0.237361346053958 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43297104_43297268:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43297104_43297268:HMGCS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 21 24 45 9.88027250858476 12.7082599901888 -2.82798748160408 C:G G C 10 0.529510832924535 0.456087423267675 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 52096889 C/A 1 24 25 49 11.2917400098112 13.2377708231134 -1.94603081330222 A:C C A 10 0.529510832924535 0.668140459023759 ENSG00000152684:ENST00000274311:exon_52095719_52096954:PELO;ENSG00000152684:ENST00000381463:exon_52095956_52096954:PELO HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 23 17 40 10.8212508427357 9.0016841597171 1.8195666830186 C:G G C 10 0.529510832924535 0.635952191783907 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 52942083 A/C 1 160 129 289 75.2782667320744 68.306897447265 6.97136928480938 A:C A C 10 0.529510832924535 0.443713352766529 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506765:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000509443:exon_52942025_52942235:NDUFS4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 52942197 A/G 1 129 64 193 60.693102552735 33.8886933071702 26.8044092455647 A:G A G 10 0.529510832924535 0.000120748500533837 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506765:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000509443:exon_52942025_52942235:NDUFS4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 54603822 T/C 1 13 7 20 6.11635917198104 3.70657583047175 2.4097833415093 T:C T C 10 0.529510832924535 0.371363290052013 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 55246001 A/G 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 A:G A G 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 12 13 25 5.64587000490558 6.88364082801896 -1.23777082311338 A:G G A 10 0.529510832924535 0.690766577028411 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 64883155 G/T 1 106 95 201 49.8718517099993 50.3035291278308 -0.431677417831544 T:G G T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64883080_64883376:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64883080_64883249:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64883080_64883354:PPWD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 26 28 54 12.2327183439621 14.826303321887 -2.59358497792489 T:G G T 10 0.529510832924535 0.4981576455005 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 68524133 A/G 1 68 71 139 31.9932633611316 37.595269137642 -5.60200577651037 A:G A G 10 0.529510832924535 0.35099619164489 ENSG00000134056:ENST00000256441:exon_68524027_68524214:MRPS36;ENSG00000134056:ENST00000507022:exon_68524027_68524214:MRPS36;ENSG00000134056:ENST00000512880:exon_68524027_68524214:MRPS36 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 72184098 C/T 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000083312:ENST00000337273:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000454282:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000415341:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000523768:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000396346:exon_72183954_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000447967:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000506351:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000519220:exon_72184065_72184130:TNPO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 73985215 A/G 1 4 9 13 1.88195666830186 4.76559749632082 -2.88364082801896 A:G A G 10 0.529510832924535 0.163083153099282 ENSG00000049860:ENST00000511181:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000515528:exon_73985153_73985674:HEXB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 73992881 A/G 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 A:G A G 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000049860:ENST00000511181:exon_73992821_73992931:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73992821_73992931:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73992821_73992931:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000510820:exon_73992821_73992931:HEXB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 T:C T C 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 77425028 A/T 1 11 8 19 5.17538083783011 4.23608666339628 0.939294174433834 A:T A T 10 0.529510832924535 0.81917282175653 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77424945_77425131:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77424945_77425131:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517561:exon_77424945_77425131:AP3B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 80736444 A/G 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 A:G A G 10 0.529510832924535 0.129310521443327 ENSG00000145687:ENST00000320672:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000509053:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000514493:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504985:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000512923:exon_80736357_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000510060:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000505980:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000515395:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000380182:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504136:exon_80736377_80736455:SSBP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 82648977 T/G 1 15 19 34 7.05733750613197 10.0607058255662 -3.00336831943419 T:G T G 10 0.529510832924535 0.309030590911357 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82648950_82649577:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82648944_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82648950_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82648944_82649606:XRCC4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 86695274 A/G 1 73 80 153 34.3457091965089 42.3608666339628 -8.01515743745386 A:G A G 10 0.529510832924535 0.196186118533211 ENSG00000134480:ENST00000505587:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000510921:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000508855:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000256897:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504878:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000511207:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504115:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000448765:exon_86695211_86695322:CCNH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 94050447 C/T 1 10 3 13 4.70489167075465 1.58853249877361 3.11635917198104 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0995863157160923 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 94050487 T/A 1 13 7 20 6.11635917198104 3.70657583047175 2.4097833415093 A:T T A 10 0.529510832924535 0.371363290052013 ENSG00000175471:ENST00000514040:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94050482_94050591:MCTP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 122 148 270 57.3996783832067 78.3676032728312 -20.9679248896245 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0122949650547155 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 96121524 C/T 1 30 11 41 14.1146750122639 5.82461916216989 8.29005585009406 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0114877253148227 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96121343_96121675:ERAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 96124330 T/C 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 T:C T C 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96124234_96124388:ERAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 96129512 A/G 1 7 7 14 3.29342416952825 3.70657583047175 -0.413151660943491 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 96130836 T/C 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 T:C T C 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96130745_96130865:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96130745_96130865:ERAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 96248496 T/C 1 49 62 111 23.0539691866978 32.8296716413212 -9.77570245462339 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0706106394569682 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96248341_96248502:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96248341_96248502:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96248341_96248502:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96248341_96248502:ERAP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 96512865 T/A 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 A:T T A 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 96512871 T/A 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 A:T:C T A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 98199204 C/T 1 12 8 20 5.64587000490558 4.23608666339628 1.4097833415093 T:C C T 10 0.529510832924535 0.655754725288894 ENSG00000153922:ENST00000514344:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000284049:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000505657:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000511067:exon_98199112_98199290:CHD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 110096939 G/A 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 A:G G A 10 0.529510832924535 0.129310521443327 ENSG00000164209:ENST00000513807:exon_110096904_110097967:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000355943:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000514046:exon_110096904_110098787:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509442:exon_110096904_110097147:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000504098:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000502462:exon_110096904_110097355:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000513706:exon_110096904_110100857:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509432:exon_110096904_110097913:SLC25A46 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 112312580 T/C 1 5 20 25 2.35244583537732 10.5902166584907 -8.23777082311338 T:C T C 10 0.529510832924535 0.00101510349541854 ENSG00000172795:ENST00000515408:exon_112312399_112312683:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000513585:exon_112312407_112312683:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000389063:exon_112312433_112312683:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000510046:exon_112312491_112312683:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000504961:exon_112312510_112312683:DCP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 27 28 55 12.7032075110376 14.826303321887 -2.12309581084943 A:T T A 10 0.529510832924535 0.591040046308657 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 114573602 T/C 0 0 8 8 0 4.23608666339628 -4.23608666339628 C T C 10 0.529510832924535 0.00240102690507337 ENSG00000164219:ENST00000419445:exon_114573555_114573706:PGGT1B;ENSG00000164219:ENST00000379615:exon_114573555_114573706:PGGT1B;ENSG00000164219:ENST00000296642:exon_114573555_114573706:PGGT1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 114860161 G/A 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000145780:ENST00000274457:exon_114856608_114861314:FEM1C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 114860397 G/A 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000145780:ENST00000274457:exon_114856608_114861314:FEM1C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 115428381 T/G 1 15 7 22 7.05733750613197 3.70657583047175 3.35076167566023 T:G T G 10 0.529510832924535 0.200087997681823 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 122682348 A/G 1 6 15 21 2.82293500245279 7.94266249386803 -5.11972749141524 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0288150252561382 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 122685727 C/G 1 10 9 19 4.70489167075465 4.76559749632082 -0.0607058255661652 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122685638_122685783:CEP120 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 18 13 31 8.46880500735837 6.88364082801896 1.58516417933941 A:G G A 10 0.529510832924535 0.594701624173538 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 132437531 C/T 1 156 165 321 73.3963100637725 87.3692874325483 -13.9729773687757 T:C C T 10 0.529510832924535 0.131010321209741 ENSG00000170606:ENST00000304858:exon_132437451_132437570:HSPA4;ENSG00000170606:ENST00000514825:exon_132437288_132437570:HSPA4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 134364518 C/G 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000069011:ENST00000265340:exon_134363424_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000506438:exon_134364243_134365011:PITX1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 A:G G A 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 137717213 G/A 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 A:G G A 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000512928:exon_137717205_137717437:KDM3B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 137892170 G/A 1 595 564 1159 279.941054409902 298.644109769438 -18.7030553595361 A:G G A 10 0.529510832924535 0.276333464986245 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000524109:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000512328:exon_137892141_137892262:HSPA9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 138266546 G/A 1 54 27 81 25.4064150220751 14.2967924889624 11.1096225331127 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0141432872703247 ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 138456815 T/C 1 31 40 71 14.5851641793394 21.1804333169814 -6.59526913764199 T:C T C 10 0.529510832924535 0.123290861309432 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138456724_138456859:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138456724_138456862:SIL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 11 11 22 5.17538083783011 5.82461916216989 -0.649238324339771 A:G A G 10 0.529510832924535 0.833021301127803 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 138856982 C/T 1 12 9 21 5.64587000490558 4.76559749632082 0.880272508584764 T:C C T 10 0.529510832924535 0.827993527930512 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138856953_138857100:TMEM173 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 138857925 C/G 1 11 9 20 5.17538083783011 4.76559749632082 0.409783341509299 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 138861146 C/G 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 C:G C G 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 139940302 G/A 1 7 9 16 3.29342416952825 4.76559749632082 -1.47217332679256 A:G G A 10 0.529510832924535 0.617975933604282 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139940284_139940339:APBB3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 140041960 T/G 1 181 166 347 85.1585392406592 87.8987982654728 -2.74025902481367 T:G T G 10 0.529510832924535 0.788129135908074 ENSG00000113141:ENST00000417647:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000261812:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000515592:exon_140041764_140042064:IK;ENSG00000113141:ENST00000518969:exon_140041887_140042012:IK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 12 11 23 5.64587000490558 5.82461916216989 -0.178749157264306 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 140062751 G/A 1 27 15 42 12.7032075110376 7.94266249386803 4.76054501716953 A:T:G G A 10 0.529510832924535 0.164661806282727 ENSG00000170445:ENST00000504156:exon_140062685_140062804:HARS;ENSG00000170445:ENST00000457527:exon_140062685_140062804:HARS;ENSG00000170445:ENST00000504366:exon_140062685_140062804:HARS;ENSG00000170445:ENST00000448240:exon_140062685_140062804:HARS;ENSG00000170445:ENST00000415192:exon_140062685_140062804:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512655:exon_140062685_140062804:HARS;ENSG00000170445:ENST00000507746:exon_140062685_140062804:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512396:exon_140062685_140062804:HARS;ENSG00000170445:ENST00000518126:exon_140062685_140062804:HARS;ENSG00000170445:ENST00000502888:exon_140062346_140062804:HARS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 23 19 42 10.8212508427357 10.0607058255662 0.760545017169528 A:C:G C A 10 0.529510832924535 0.877812645675207 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 141307833 T/C 1 25 23 48 11.7622291768866 12.1787491572643 -0.416519980377682 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141307716_141307863:KIAA0141 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 141309265 C/T 1 12 10 22 5.64587000490558 5.29510832924535 0.350761675660229 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309147_141309305:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309147_141309305:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309147_141309305:KIAA0141 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 141391532 G/A 1 4 8 12 1.88195666830186 4.23608666339628 -2.35412999509442 A:G G A 10 0.529510832924535 0.247834349729258 ENSG00000113552:ENST00000513454:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000311337:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000500692:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000458112:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000508177:exon_141391477_141392359:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503794:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504139:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000505689:exon_141391414_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000510194:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503229:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000507107:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504424:exon_141391514_141391606:GNPDA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 143200053 C/T 1 13 8 21 6.11635917198104 4.23608666339628 1.88027250858476 T:C C T 10 0.529510832924535 0.513839468737654 ENSG00000158497:ENST00000289448:exon_143200045_143200284:HMHB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 150425467 G/A 1 106 78 184 49.8718517099993 41.3018449681137 8.57000674188555 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.210175604421136 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521782:exon_150425422_150425922:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150425427_150425511:TNIP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 510 524 1034 239.949475208487 277.463676452456 -37.5142012439692 A:T:G A G 10 0.529510832924535 0.0211041014929527 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 154 92 246 72.4553317296216 48.7149966290572 23.7403351005644 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00261989551027972 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 19 14 33 8.93929417443383 7.41315166094349 1.52614251349034 T:C C T 10 0.529510832924535 0.727867490735252 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 150584981 C/G 1 16 6 22 7.52782667320744 3.17706499754721 4.35076167566023 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0858428353801745 ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150584961_150585038:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000421260:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150584961_150585036:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522179:exon_150584961_150585036:CCDC69 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 151043103 G/C 1 19 13 32 8.93929417443383 6.88364082801896 2.05565334641488 C:G G C 10 0.529510832924535 0.485297135983152 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151040657_151043160:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000520687:exon_151042049_151043160:SPARC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 153372525 G/A 1 18 25 43 8.46880500735837 13.2377708231134 -4.76896581575501 A:G G A 10 0.529510832924535 0.169394237056324 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153369688_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153371263_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153372059_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153372066_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518914:exon_153372248_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518946:exon_153372274_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153372515_153372670:FAM114A2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 153413390 C/T 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 T:C C T 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153413351_153413426:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153413351_153413437:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522395:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518900:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000523705:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000519808:exon_153413377_153413443:FAM114A2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 157158553 C/T 1 23 33 56 10.8212508427357 17.4738574865097 -6.65260664377396 T:C C T 10 0.529510832924535 0.082215355453126 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157158205_157158639:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157158428_157158639:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157158428_157158639:THG1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 43 28 71 20.231034184245 14.826303321887 5.40473086235801 T:C T C 10 0.529510832924535 0.234432154466878 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 25 27 52 11.7622291768866 14.2967924889624 -2.53456331207582 A:G A G 10 0.529510832924535 0.490905646795924 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 159912418 C/G 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 C:G C G 10 0.529510832924535 0.765231830293731 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 167937607 G/A 1 52 75 127 24.4654366879242 39.7133124693401 -15.247875781416 A:T:G G A 10 0.529510832924535 0.00749585891360037 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167937586_167937691:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167937586_167937691:RARS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 169127097 C/A 1 8 17 25 3.76391333660372 9.0016841597171 -5.23777082311338 A:C C A 10 0.529510832924535 0.044204604125891 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169127018_169127143:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169127018_169127143:DOCK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 169129422 A/G 1 19 5 24 8.93929417443383 2.64755416462268 6.29174000981116 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0126410983712017 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 169267784 G/A 1 22 24 46 10.3507616756602 12.7082599901888 -2.35749831452861 A:G G A 10 0.529510832924535 0.555364792856892 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520836:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520181:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519628:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169267761_169267856:DOCK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 169435713 A/C 1 19 18 37 8.93929417443383 9.53119499264163 -0.591900818207796 A:T:C A C 10 0.529510832924535 0.870465810362237 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169435692_169435750:DOCK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 27 41 68 12.7032075110376 21.7099441499059 -9.00673663886838 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0381133608288082 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 57 62 119 26.8178825233015 32.8296716413212 -6.01178911801967 T:C C T 10 0.529510832924535 0.272190895616532 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 40 41 81 18.8195666830186 21.7099441499059 -2.89037746688734 A:G A G 10 0.529510832924535 0.578187299800291 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 171533629 A/G 1 21 16 37 9.88027250858476 8.47217332679256 1.4080991817922 A:G A G 10 0.529510832924535 0.742581671935698 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 171533656 C/T 1 18 15 33 8.46880500735837 7.94266249386803 0.526142513490344 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 171533782 T/C 1 11 14 25 5.17538083783011 7.41315166094349 -2.23777082311338 T:C T C 10 0.529510832924535 0.42559887349422 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 175772208 C/T 1 8 10 18 3.76391333660372 5.29510832924535 -1.53119499264163 T:C C T 10 0.529510832924535 0.489195304177666 ENSG00000170085:ENST00000345702:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000430704:exon_175772186_175772569:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000443967:exon_175772186_175772994:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000341199:exon_175772186_175772992:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000420396:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000332772:exon_175772186_175772992:C5orf25 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 T:G G T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 32 28 60 15.0556533464149 14.826303321887 0.229350024527896 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 176721198 T/C 1 13 7 20 6.11635917198104 3.70657583047175 2.4097833415093 T:C T C 10 0.529510832924535 0.371363290052013 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 176733116 A/G 1 265 207 472 124.679629274998 109.608742415379 15.0708868596194 A:G A G 10 0.529510832924535 0.166860282475079 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000511309:exon_176732872_176733148:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510797:exon_176733099_176733154:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503853:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510701:exon_176733099_176733164:PRELID1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 176733616 T/C 1 413 432 845 194.312026002167 228.748679823399 -34.4366538212321 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0190597877766887 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733423_176733960:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733423_176733670:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733456_176733950:PRELID1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 176737720 A/G 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176737427_176738485:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176737427_176738485:MXD3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 176761336 T/C 1 138 153 291 64.9275050564142 81.0151574374539 -16.0876523810397 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0603453110723215 ENSG00000169223:ENST00000303127:exon_176761285_176761404:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000504071:exon_176761285_176761553:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000515209:exon_176761285_176761404:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000514458:exon_176761285_176761337:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000502560:exon_176761310_176761404:LMAN2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 176795906 G/C 1 13 21 34 6.11635917198104 11.1197274914152 -5.00336831943419 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0888839677216021 ENSG00000169220:ENST00000408923:exon_176795718_176795921:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000398128:exon_176795718_176795921:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000336477:exon_176795718_176795921:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000514713:exon_176795718_176796076:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000511890:exon_176795718_176795921:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000425155:exon_176795718_176795921:RGS14 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 176931706 G/C 1 7 15 22 3.29342416952825 7.94266249386803 -4.64923832433977 C:G G C 10 0.529510832924535 0.05493206250743 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 69 51 120 32.4637525282071 27.0050524791513 5.45870004905579 A:G G A 10 0.529510832924535 0.360557197271043 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 177031348 T/C 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 T:C T C 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000502420:exon_177031280_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000510761:exon_177031180_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505468:exon_177031067_177031542:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000507061:exon_177031313_177031542:B4GALT7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 23 17 40 10.8212508427357 9.0016841597171 1.8195666830186 T:C:G T C 10 0.529510832924535 0.635952191783907 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 178310446 C/T 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 T:C C T 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178309710_178312029:ZNF354B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 18 20 38 8.46880500735837 10.5902166584907 -2.12141165113233 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.518950365306029 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 179045142 G/A 1 7 5 12 3.29342416952825 2.64755416462268 0.645870004905579 A:G G A 10 0.529510832924535 0.779088238758133 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 24 19 43 11.2917400098112 10.0607058255662 1.23103418424499 T:G T G 10 0.529510832924535 0.761326844638213 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 43 38 81 20.231034184245 20.1214116511323 0.109622533112663 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 180219984 C/T 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 T:C C T 10 0.529510832924535 0.186533779694549 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000504671:exon_180219373_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000506889:exon_180219511_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000514283:exon_180219590_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000512695:exon_180219625_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000506269:exon_180219638_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000514438:exon_180219658_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000502678:exon_180219662_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000513431:exon_180219686_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000507384:exon_180219870_180220097:MGAT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 180651231 G/A 1 10 17 27 4.70489167075465 9.0016841597171 -4.29679248896245 A:G G A 10 0.529510832924535 0.122483857632165 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 180665065 G/C 1 23 13 36 10.8212508427357 6.88364082801896 3.93761001471674 C:G G C 10 0.529510832924535 0.242302687177711 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 5 180669370 A/G 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 A:G A G 10 0.529510832924535 0.129310521443327 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 164 95 259 77.1602234003763 50.3035291278308 26.8566942725454 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.000934304284857476 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 24 11 35 11.2917400098112 5.82461916216989 5.46712084764127 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0889703137000197 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 6174866 G/A 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000124491:ENST00000264870:exon_6174813_6175100:F13A1;ENSG00000124491:ENST00000441301:exon_6174813_6175100:F13A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 13 8 21 6.11635917198104 4.23608666339628 1.88027250858476 A:G G A 10 0.529510832924535 0.513839468737654 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 13470412 C/T 1 7 10 17 3.29342416952825 5.29510832924535 -2.0016841597171 T:C C T 10 0.529510832924535 0.344125043526582 ENSG00000187461:ENST00000379278:exon_13469507_13470862:C6orf114 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 12 10 22 5.64587000490558 5.29510832924535 0.350761675660229 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 24403455 C/T 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 T:C C T 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24403420_24403464:MRS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 24412530 G/T 1 3 9 12 1.41146750122639 4.76559749632082 -3.35412999509442 T:G G T 10 0.529510832924535 0.0794211024472422 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24412514_24412623:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24412450_24412623:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24412450_24412623:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24412450_24412623:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24412450_24412623:MRS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 24418786 T/C 1 21 14 35 9.88027250858476 7.41315166094349 2.46712084764127 T:C T C 10 0.529510832924535 0.498877287546952 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418689_24419469:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418689_24418791:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418689_24418789:MRS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 24503597 C/T 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000112294:ENST00000357578:exon_24503491_24503661:ALDH5A1;ENSG00000112294:ENST00000491546:exon_24503491_24503661:ALDH5A1;ENSG00000112294:ENST00000348925:exon_24503491_24503661:ALDH5A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 24653215 C/T 1 37 27 64 17.4080991817922 14.2967924889624 3.11130669282976 T:C C T 10 0.529510832924535 0.455123470619328 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26045929 T/C 1 2 8 10 0.94097833415093 4.23608666339628 -3.29510832924535 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0539366762210793 ENSG00000196532:ENST00000360577:exon_26045612_26047022:HIST1H3C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26056312 T/G 1 254 191 445 119.504248437168 101.136569088586 18.3676793485819 T:G T G 10 0.529510832924535 0.0872603444526222 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26056549 A/G 1 70 94 164 32.9342416952825 49.7740182949063 -16.8397765996237 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0096620017293632 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26056604 G/A 1 209 249 458 98.3322359187722 131.848197398209 -33.5159614794371 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.00197351036844668 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26104448 A/G 1 336 152 488 158.084360137356 80.4856466045293 77.5987135328269 A:G A G 10 0.529510832924535 1.0012407164243e-12 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26184102 G/A 1 13 20 33 6.11635917198104 10.5902166584907 -4.47385748650966 A:G G A 10 0.529510832924535 0.162000968884620 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26285560 A/G 1 13 11 24 6.11635917198104 5.82461916216989 0.291740009811159 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26285683 T/C 1 20 16 36 9.4097833415093 8.47217332679256 0.937610014716739 T:C T C 10 0.529510832924535 0.867767613934243 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 19 20 39 8.93929417443383 10.5902166584907 -1.65092248405687 T:C T C 10 0.529510832924535 0.632721672477926 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26370660 G/A 1 26 17 43 12.2327183439621 9.0016841597171 3.23103418424499 A:G G A 10 0.529510832924535 0.361402517437889 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26393021 G/A 1 17 20 37 7.9983158402829 10.5902166584907 -2.5919008182078 A:G G A 10 0.529510832924535 0.414339932154864 ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26468276 C/T 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 T:C C T 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000265424:exon_26468176_26468635:BTN2A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 111 107 218 52.2242975453766 56.6576591229253 -4.43336157754865 A:G G A 10 0.529510832924535 0.587390137830261 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 33 39 72 15.5261425134903 20.6509224840569 -5.12477997056652 A:G A G 10 0.529510832924535 0.239244624605261 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 40 49 89 18.8195666830186 25.9460308133022 -7.12646413028362 A:G A G 10 0.529510832924535 0.137860479114949 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 26598798 G/A 1 49 39 88 23.0539691866978 20.6509224840569 2.40304670264091 A:G G A 10 0.529510832924535 0.669624301629397 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598493_26600278:ABT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 27833315 C/G 1 10 5 15 4.70489167075465 2.64755416462268 2.05733750613197 C:G C G 10 0.529510832924535 0.314439025315697 ENSG00000198374:ENST00000357320:exon_27833034_27833606:HIST1H2AL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 27834677 C/T 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 T:C C T 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000184357:ENST00000331442:exon_27834570_27835359:HIST1H1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 28891423 G/A 1 8 13 21 3.76391333660372 6.88364082801896 -3.11972749141524 A:G G A 10 0.529510832924535 0.194145459913548 ENSG00000204713:ENST00000377199:exon_28890990_28891766:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000377194:exon_28890990_28891765:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000481474:exon_28890990_28891690:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000444898:exon_28890990_28891768:TRIM27 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 29910402 G/A 1 133 41 174 62.5750592210368 21.7099441499059 40.8651150711309 A:G G A 10 0.529510832924535 2.22237413672719e-10 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910331_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910331_29910403:HLA-A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 0 369 0 369 173.610502650847 0 173.610502650847 C C 10 0.529510832924535 1.42677924490125e-102 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 29910839 C/T 1 8 1 9 3.76391333660372 0.529510832924535 3.23440250367918 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0420136690367002 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 29911003 G/A 1 7 1 8 3.29342416952825 0.529510832924535 2.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0741292491828888 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 29911360 A/G 1 4 16 20 1.88195666830186 8.47217332679256 -6.5902166584907 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00323622178701136 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 29912297 A/G 1 45 81 126 21.1720125183959 42.8903774668873 -21.7183649484914 A:G A G 10 0.529510832924535 0.000111710996589431 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 0 189 0 189 88.9224525772629 0 88.9224525772629 A A 10 0.529510832924535 1.10516185607946e-52 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 29912386 G/C 1 1 146 147 0.470489167075465 77.3085816069821 -76.8380924399066 C:G G C 10 0.529510832924535 1.21914424766116e-46 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 123 157 280 57.8701675502822 83.133200769152 -25.2630332188698 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00271235212088058 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 13 26 39 6.11635917198104 13.7672816560379 -7.65092248405687 A:C C A 10 0.529510832924535 0.0157952639843798 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 404 383 787 190.077623498488 202.802649010097 -12.7250255116091 A:G G A 10 0.529510832924535 0.372100251183830 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 46 35 81 21.6425016854714 18.5328791523587 3.10962253311266 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.50629746437549 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30552117 G/A 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30569951 G/A 1 28 30 58 13.173696678113 15.8853249877361 -2.71162830962303 A:G G A 10 0.529510832924535 0.512096268418236 ENSG00000204569:ENST00000376511:exon_30569713_30570468:PPP1R10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30570224 G/T 1 25 21 46 11.7622291768866 11.1197274914152 0.642501685471387 T:G G T 10 0.529510832924535 0.883537625320194 ENSG00000204569:ENST00000376511:exon_30569713_30570468:PPP1R10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 9 13 22 4.23440250367918 6.88364082801896 -2.64923832433977 A:C A C 10 0.529510832924535 0.290191579780574 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30882781 G/T 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 T:G G T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30887988 C/T 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 T:C C T 10 0.529510832924535 0.186533779694549 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30888169 G/A 1 11 7 18 5.17538083783011 3.70657583047175 1.46880500735837 A:G G A 10 0.529510832924535 0.638208767464486 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30890483 G/T 1 38 19 57 17.8785883488677 10.0607058255662 7.8178825233015 T:G G T 10 0.529510832924535 0.0458268458875326 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30890360_30890551:VARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30892322 C/T 1 20 16 36 9.4097833415093 8.47217332679256 0.937610014716739 T:C C T 10 0.529510832924535 0.867767613934243 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30892131_30892341:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 22 15 37 10.3507616756602 7.94266249386803 2.4080991817922 A:G G A 10 0.529510832924535 0.510936519453645 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 30893428 G/A 1 29 24 53 13.6441858451885 12.7082599901888 0.935925854999642 A:G G A 10 0.529510832924535 0.890761870617593 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30893321_30893451:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893321_30893496:VARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31110786 T/A 1 52 54 106 24.4654366879242 28.5935849779249 -4.12814829000071 A:T T A 10 0.529510832924535 0.437531168035934 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110740_31110911:CCHCR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 40 39 79 18.8195666830186 20.6509224840569 -1.83135580103827 T:C T C 10 0.529510832924535 0.735640855434065 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 24 20 44 11.2917400098112 10.5902166584907 0.701523351320459 A:G G A 10 0.529510832924535 0.880759238622842 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31116220 G/A 1 14 18 32 6.58684833905651 9.53119499264163 -2.94434665358512 A:G G A 10 0.529510832924535 0.3762625903731 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 20 18 38 9.4097833415093 9.53119499264163 -0.12141165113233 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31122330 G/A 1 25 21 46 11.7622291768866 11.1197274914152 0.642501685471387 A:G G A 10 0.529510832924535 0.883537625320194 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31122502 C/T 1 14 16 30 6.58684833905651 8.47217332679256 -1.88532498773605 T:C C T 10 0.529510832924535 0.58418180440881 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 12 16 28 5.64587000490558 8.47217332679256 -2.82630332188698 A:G A G 10 0.529510832924535 0.344853719729691 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C,G 0 0 19 19 0 10.0607058255662 -10.0607058255662 C:G A C 10 0.529510832924535 6.00403117057612e-07 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 23 27 50 10.8212508427357 14.2967924889624 -3.47554164622675 T:C T C 10 0.529510832924535 0.395548169653231 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31170528 A/G 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 A:G A G 10 0.529510832924535 0.487573754416657 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31170608 C/T 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.352283066981699 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31239335 G/A 0 0 12 12 0 6.35412999509442 -6.35412999509442 A G A 10 0.529510832924535 0.000117650977528432 ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 216 13 229 101.6256600883 6.88364082801896 94.7420192602815 T:C C T 10 0.529510832924535 1.12667835509412e-43 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31239518 C/T 1 87 27 114 40.9325575355655 14.2967924889624 26.635765046603 T:C C T 10 0.529510832924535 4.08540677333985e-07 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 0 24 0 24 11.2917400098112 0 11.2917400098112 G G 10 0.529510832924535 2.49887612492125e-07 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31322367 T/G 1 81 22 103 38.1096225331127 11.6492383243398 26.4603842087729 T:G T G 10 0.529510832924535 8.96273265445163e-08 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 77 10 87 36.2276658648108 5.29510832924535 30.9325575355655 T:C C T 10 0.529510832924535 2.45778639847089e-12 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 110 10 120 51.7538083783011 5.29510832924535 46.4587000490558 T:C T C 10 0.529510832924535 4.51529207442973e-20 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31322855 C/T 1 105 82 187 49.4013625429238 43.4198882998119 5.98147424311195 T:C C T 10 0.529510832924535 0.420435305846543 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 2167 822 2989 1019.55002505253 435.257904663968 584.292120388565 T:C:G C T 10 0.529510832924535 4.1316600498824e-106 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31379752 C/T 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:C C T 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000204520:ENST00000376222:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000484008:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000364810:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000399172:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000376218:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000458313:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000420260:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000449934:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000451012:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000376219:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000421350:exon_31379724_31380002:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000468458:exon_31379724_31380002:AL645933.1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31431757 A/G 1 19 22 41 8.93929417443383 11.6492383243398 -2.70994414990594 A:G A G 10 0.529510832924535 0.436035278715442 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31473561 A/G 1 5 12 17 2.35244583537732 6.35412999509442 -4.0016841597171 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0859595749856374 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31473957 C/G 1 5 16 21 2.35244583537732 8.47217332679256 -6.11972749141524 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0082282689911091 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31474000 G/A 1 5 8 13 2.35244583537732 4.23608666339628 -1.88364082801896 A:G G A 10 0.529510832924535 0.406366482999609 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31583312 G/A 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 A:G G A 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000204472:ENST00000376059:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000497362:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000337917:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000376063:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000466820:exon_31583298_31583359:AIF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31590898 C/T 1 9 6 15 4.23440250367918 3.17706499754721 1.05733750613197 T:C C T 10 0.529510832924535 0.61671670096814 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31595795 C/T 1 27 24 51 12.7032075110376 12.7082599901888 -0.0050524791512867 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000204469:ENST00000414096:exon_31595542_31595821:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31595542_31596016:BAT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31600304 G/C 1 46 39 85 21.6425016854714 20.6509224840569 0.99157920141452 C:G G C 10 0.529510832924535 0.913563070944455 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31599982_31600769:BAT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 65 63 128 30.5817958599052 33.3591824742457 -2.77738661434049 A:G G A 10 0.529510832924535 0.658329715446358 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31605167 G/A 1 35 34 69 16.4671208476413 18.0033683194342 -1.53624747179292 A:G G A 10 0.529510832924535 0.719268555349385 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 34 34 68 15.9966316805658 18.0033683194342 -2.00673663886838 C:G G C 10 0.529510832924535 0.629531868012701 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 28 12 40 13.173696678113 6.35412999509442 6.8195666830186 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0384066645536252 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 71 76 147 33.404730862358 40.2428233022647 -6.83809243990665 T:C C T 10 0.529510832924535 0.282871597052945 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 208 155 363 97.8617467516967 82.0741791033029 15.7875676483938 T:C T C 10 0.529510832924535 0.103074697984905 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31639757 G/A 1 31 20 51 14.5851641793394 10.5902166584907 3.99494752084871 A:G G A 10 0.529510832924535 0.326193705233109 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31731881 C/T 1 54 53 107 25.4064150220751 28.0640741450004 -2.65765912292525 T:C C T 10 0.529510832924535 0.629075111662935 ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000228727:ENST00000433778:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000415669:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000425424:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000494299:exon_31731397_31731936:C6orf26 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31732207 C/T 1 33 20 53 15.5261425134903 10.5902166584907 4.93592585499964 T:C C T 10 0.529510832924535 0.215289972115285 ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31732043_31732628:MSH5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31747041 C/T 1 39 56 95 18.3490775159431 29.652606643774 -11.3035291278308 T:C C T 10 0.529510832924535 0.023381777259167 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000463184:exon_31747007_31747069:VARS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 50 45 95 23.5244583537732 23.8279874816041 -0.303529127830828 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31860337 T/C 1 5 9 14 2.35244583537732 4.76559749632082 -2.41315166094349 T:C T C 10 0.529510832924535 0.28431222286612 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000463484:exon_31860195_31860339:EHMT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31868938 C/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000204366:ENST00000375527:exon_31867384_31869102:ZBTB12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31931747 G/A 1 17 13 30 7.9983158402829 6.88364082801896 1.11467501226395 A:G G A 10 0.529510832924535 0.718250953485475 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31931690_31931902:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31931690_31931902:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31931690_31931902:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31931690_31931902:SKIV2L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31936679 C/T 1 43 45 88 20.231034184245 23.8279874816041 -3.59695329735908 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.456414997873604 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000471818:exon_31936678_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 15 7 22 7.05733750613197 3.70657583047175 3.35076167566023 A:G A G 10 0.529510832924535 0.200087997681823 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32097475 T/C 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000204315:ENST00000375156:exon_32096484_32097631:FKBPL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32150296 C/A 1 1 7 8 0.470489167075465 3.70657583047175 -3.23608666339628 A:C C A 10 0.529510832924535 0.0301990106165060 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32154998 C/T 1 11 9 20 5.17538083783011 4.76559749632082 0.409783341509299 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000204304:ENST00000478678:exon_32154750_32155172:PBX2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 769 890 1659 361.806169481033 471.264641302836 -109.458471821804 A:C:G C A 10 0.529510832924535 7.93821597307482e-08 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32410941 T/C 1 12 6 18 5.64587000490558 3.17706499754721 2.46880500735837 T:C T C 10 0.529510832924535 0.345463610504387 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 2466 2610 5076 1160.2262860081 1382.02327393304 -221.79698792494 A:T:C:G A C 10 0.529510832924535 5.0180501552009e-10 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 26 13 39 12.2327183439621 6.88364082801896 5.34907751594313 T:C T C 10 0.529510832924535 0.107936197728808 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 4709 3257 7966 2215.53348775836 1724.61678283521 490.916704923154 A:T:C:G T G 10 0.529510832924535 2.01004739660456e-28 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32411712 G/A 1 5 9 14 2.35244583537732 4.76559749632082 -2.41315166094349 A:G G A 10 0.529510832924535 0.28431222286612 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32605295 C/T 1 1604 1 1605 754.664623989046 0.529510832924535 754.135113156121 T:C C T 10 0.529510832924535 0 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32605336 G/A 0 17 0 17 7.9983158402829 0 7.9983158402829 G G 10 0.529510832924535 2.2936587960941e-05 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32781554 G/A 1 52 50 102 24.4654366879242 26.4755416462268 -2.01010495830257 A:G G A 10 0.529510832924535 0.692970414778958 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32781500_32781610:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32781500_32781610:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32781500_32782378:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32781544_32781610:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32781544_32781610:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32783086 A/G 1 49 39 88 23.0539691866978 20.6509224840569 2.40304670264091 A:G A G 10 0.529510832924535 0.669624301629397 ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32782821_32783090:HLA-DOB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 51 39 90 23.9949475208487 20.6509224840569 3.34402503679184 A:C C A 10 0.529510832924535 0.526900686453463 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 32811629 G/T 1 230 227 457 108.212508427357 120.198959073869 -11.9864506465125 T:G G T 10 0.529510832924535 0.261236033639381 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 670 308 978 315.227741940562 163.089336540757 152.138405399805 T:C T C 10 0.529510832924535 5.04576734447986e-23 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 785 418 1203 369.33399615424 221.335528162456 147.998467991784 T:C C T 10 0.529510832924535 6.64624609173315e-18 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 695 369 1064 326.989971117448 195.389497349153 131.600473768295 T:C T C 10 0.529510832924535 3.68258796507007e-16 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 33053026 C/G 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 C:G C G 10 0.529510832924535 0.295900852930508 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 33095762 G/A 0 34 0 34 15.9966316805658 0 15.9966316805658 G G 10 0.529510832924535 6.97885584361006e-10 ENSG00000224557:ENST00000470997:exon_33095595_33095875:HLA-DPB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 33173842 G/A 1 10 12 22 4.70489167075465 6.35412999509442 -1.64923832433977 A:G G A 10 0.529510832924535 0.526608667804835 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 33179689 C/T 1 39 37 76 18.3490775159431 19.5919008182078 -1.24282330226466 T:C C T 10 0.529510832924535 0.818663479293465 ENSG00000204227:ENST00000374656:exon_33179506_33179779:RING1;ENSG00000204227:ENST00000478431:exon_33179506_33179779:RING1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 33239905 A/G 1 9 13 22 4.23440250367918 6.88364082801896 -2.64923832433977 A:G A G 10 0.529510832924535 0.290191579780574 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 33240506 A/G 1 12 11 23 5.64587000490558 5.82461916216989 -0.178749157264306 A:T:G A T 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 33254665 A/G 1 52 53 105 24.4654366879242 28.0640741450004 -3.59863745707618 A:G A G 10 0.529510832924535 0.495116043306035 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33254572_33254671:WDR46 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 33256397 G/A 1 43 45 88 20.231034184245 23.8279874816041 -3.59695329735908 A:G G A 10 0.529510832924535 0.456414997873604 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256341_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256391_33256471:WDR46 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 33359716 G/C 1 13 20 33 6.11635917198104 10.5902166584907 -4.47385748650966 C:G G C 10 0.529510832924535 0.162000968884620 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000450504:exon_33359638_33359774:KIFC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 33659472 C/G 1 12 8 20 5.64587000490558 4.23608666339628 1.4097833415093 C:G C G 10 0.529510832924535 0.655754725288894 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 34214348 C/T 1 69 64 133 32.4637525282071 33.8886933071702 -1.42494077896316 T:C C T 10 0.529510832924535 0.862168678033315 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 34741175 G/A 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 A:G G A 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 89 76 165 41.8735358697164 40.2428233022647 1.63071256745172 A:C C A 10 0.529510832924535 0.815452884969726 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 48 54 102 22.5834800196223 28.5935849779249 -6.01010495830257 T:C C T 10 0.529510832924535 0.235852304672287 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 36713263 A/G 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000124772:ENST00000459703:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000244751:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000493411:exon_36713164_36713292:CPNE5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 36824399 C/T 1 15 11 26 7.05733750613197 5.82461916216989 1.23271834396209 T:C C T 10 0.529510832924535 0.697111831856919 ENSG00000137168:ENST00000373699:exon_36824362_36824430:PPIL1;ENSG00000137168:ENST00000483552:exon_36824362_36824430:PPIL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 8 8 16 3.76391333660372 4.23608666339628 -0.472173326792561 A:G A G 10 0.529510832924535 0.80894998850296 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 36938432 G/A 1 28 23 51 13.173696678113 12.1787491572643 0.994947520848712 A:G G A 10 0.529510832924535 0.888629901558796 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000490662:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36938423_36938692:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000460219:exon_36938423_36938470:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000492754:exon_36938182_36938470:MTCH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 37348920 C/T 1 8 3 11 3.76391333660372 1.58853249877361 2.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.235512259698034 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 37349033 G/A 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 A:G G A 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 15 10 25 7.05733750613197 5.29510832924535 1.76222917688662 A:G G A 10 0.529510832924535 0.550913585527032 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 98 102 200 46.1079383733956 54.0101049583026 -7.90216658490701 T:C:G C T 10 0.529510832924535 0.288005537958076 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 115 114 229 54.1062542136785 60.364234953397 -6.25798073971853 T:C T C 10 0.529510832924535 0.42723559460187 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 41895150 G/A 1 30 27 57 14.1146750122639 14.2967924889624 -0.182117476698497 A:C:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000494032:exon_41895112_41895382:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000489290:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000475702:exon_41895112_41895274:BYSL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 41900232 C/T 1 54 47 101 25.4064150220751 24.8870091474531 0.519405874621963 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41900099_41900784:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000489290:exon_41900099_41900393:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000372996:exon_41900099_41900734:BYSL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 41900406 C/T 1 73 72 145 34.3457091965089 38.1247799705665 -3.77907077405758 T:C C T 10 0.529510832924535 0.560694754755178 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41900099_41900784:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000372996:exon_41900099_41900734:BYSL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 43184132 A/C 1 4 9 13 1.88195666830186 4.76559749632082 -2.88364082801896 A:C:G A C 10 0.529510832924535 0.163083153099282 ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43183896_43184241:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000508656:exon_43183896_43184241:CUL9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 43273604 A/G 1 16 11 27 7.52782667320744 5.82461916216989 1.70320751103755 A:G A G 10 0.529510832924535 0.566839782462308 ENSG00000146215:ENST00000372569:exon_43273210_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000451294:exon_43273251_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000477866:exon_43273455_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000274990:exon_43273563_43273862:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000449267:exon_43273563_43273862:CRIP3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 43307861 G/A 1 18 12 30 8.46880500735837 6.35412999509442 2.11467501226395 A:G G A 10 0.529510832924535 0.469979708299931 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 43488144 A/G 1 49 53 102 23.0539691866978 28.0640741450004 -5.01010495830258 A:G A G 10 0.529510832924535 0.323358399507422 ENSG00000171453:ENST00000372389:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000372373:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000436688:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000481352:exon_43487444_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000372344:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000304004:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000488601:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000455605:exon_43487444_43488786:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000495762:exon_43488054_43488165:POLR1C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 43492578 G/A 1 81 73 154 38.1096225331127 38.6542908034911 -0.544668270378395 A:G G A 10 0.529510832924535 0.935847361787073 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 43581755 A/G 1 18 17 35 8.46880500735837 9.0016841597171 -0.532879152358726 A:G A G 10 0.529510832924535 0.867280533607478 ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43581397_43583397:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43581468_43583397:POLH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 43968814 A/G 1 23 28 51 10.8212508427357 14.826303321887 -4.00505247915129 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.265852835777356 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43968317_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43968754_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43968711_43968880:C6orf223 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 44115169 G/A 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000534326:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000456124:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000497371:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000525873:exon_44115114_44115237:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44115114_44115237:TMEM63B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 22 18 40 10.3507616756602 9.53119499264163 0.819566683018598 T:G G T 10 0.529510832924535 0.874679732608783 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 44269193 C/T 1 14 8 22 6.58684833905651 4.23608666339628 2.35076167566023 T:C C T 10 0.529510832924535 0.394779767186122 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 44371714 C/T 1 34 36 70 15.9966316805658 19.0623899852833 -3.06575830471745 T:C C T 10 0.529510832924535 0.474887788767278 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 44413463 T/A 1 61 37 98 28.6998391916034 19.5919008182078 9.10793837339557 A:T T A 10 0.529510832924535 0.0688481266442554 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44413392_44413604:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44413392_44413604:CDC5L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 47577064 G/A 1 11 1 12 5.17538083783011 0.529510832924535 4.64587000490558 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00737270813879148 ENSG00000198087:ENST00000486693:exon_47576859_47577249:CD2AP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 49403282 T/C 1 13 10 23 6.11635917198104 5.29510832924535 0.821250842735695 T:C T C 10 0.529510832924535 0.835734692191848 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 49415448 C/T 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 T:C C T 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49415383_49415498:MUT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 49459978 A/G 0 0 8 8 0 4.23608666339628 -4.23608666339628 G A G 10 0.529510832924535 0.00240102690507337 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49459857_49460820:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49459857_49460820:CENPQ HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 56327849 C/T 1 19 10 29 8.93929417443383 5.29510832924535 3.64418584518848 T:C C T 10 0.529510832924535 0.196206016705251 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 56463410 T/C 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 T:C T C 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56463274_56463507:DST HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 56484758 C/T 1 28 18 46 13.173696678113 9.53119499264163 3.64250168547139 T:C C T 10 0.529510832924535 0.304115292478031 ENSG00000151914:ENST00000370765:exon_56482784_56485513:DST;ENSG00000151914:ENST00000281662:exon_56482784_56485513:DST HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 14 0 14 6.58684833905651 0 6.58684833905651 G G 10 0.529510832924535 0.000162265427935967 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 57246884 A/G 0 9 0 9 4.23440250367918 0 4.23440250367918 A A 10 0.529510832924535 0.00440211186369249 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 23 23 0 12.1787491572643 -12.1787491572643 A G A 10 0.529510832924535 2.94199175709725e-08 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 17 17 0 9.0016841597171 -9.0016841597171 G T G 10 0.529510832924535 2.71233720752216e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 14 0 14 6.58684833905651 0 6.58684833905651 C C 10 0.529510832924535 0.000162265427935967 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 13 13 0 6.88364082801896 -6.88364082801896 C T C 10 0.529510832924535 5.53535104229664e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 29 26 55 13.6441858451885 13.7672816560379 -0.123095810849428 A:T A T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 71289188 C/T 1 35 24 59 16.4671208476413 12.7082599901888 3.75886085745243 T:C C T 10 0.529510832924535 0.362527968621373 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 16 10 26 7.52782667320744 5.29510832924535 2.23271834396209 T:C C T 10 0.529510832924535 0.435554956053702 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 27 24 51 12.7032075110376 12.7082599901888 -0.0050524791512867 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 74155346 G/T 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 T:G G T 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000459924:exon_74155251_74155408:C6orf150 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 74229792 A/G 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000156508:ENST00000316292:exon_74229606_74230741:EEF1A1;ENSG00000156508:ENST00000456206:exon_74229606_74230741:EEF1A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 79657391 G/A 1 12 6 18 5.64587000490558 3.17706499754721 2.46880500735837 A:G G A 10 0.529510832924535 0.345463610504387 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79657340_79657492:PHIP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 15 12 27 7.05733750613197 6.35412999509442 0.703207511037554 A:G A G 10 0.529510832924535 0.848752855647907 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 79692751 G/A 1 95 86 181 44.6964708721692 45.53793163151 -0.841460759340841 A:G G A 10 0.529510832924535 0.940682831684668 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79692603_79692834:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79692603_79692834:PHIP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 87969480 G/A 1 48 100 148 22.5834800196223 52.9510832924535 -30.3676032728312 A:G G A 10 0.529510832924535 5.70041227675277e-07 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 88224150 G/A 1 11 5 16 5.17538083783011 2.64755416462268 2.52782667320744 A:G G A 10 0.529510832924535 0.222816733853050 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88224098_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000493269:exon_88224125_88224217:RARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 88224164 T/C 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 T:C T C 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88224098_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000493269:exon_88224125_88224217:RARS2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 73 60 133 34.3457091965089 31.7706499754721 2.57505922103684 C:G G C 10 0.529510832924535 0.665190640726577 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 90039670 G/C 1 209 210 419 98.3322359187722 111.197274914152 -12.8650389953802 C:G G C 10 0.529510832924535 0.221139853032807 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90039279_90039676:UBE2J1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 99374400 G/A 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000112234:ENST00000369244:exon_99374353_99374936:FBXL4;ENSG00000112234:ENST00000229971:exon_99374353_99374936:FBXL4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 14 11 25 6.58684833905651 5.82461916216989 0.762229176886623 T:C T C 10 0.529510832924535 0.842602807462717 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 100964147 G/C 1 11 9 20 5.17538083783011 4.76559749632082 0.409783341509299 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100964056_100964203:ASCC3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 101296389 G/A 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000522650:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000468245:exon_101295880_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324723:exon_101296296_101296583:ASCC3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 57 61 118 26.8178825233015 32.3001608083966 -5.48227828509514 T:C C T 10 0.529510832924535 0.312416903655163 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 106999822 G/A 1 12 18 30 5.64587000490558 9.53119499264163 -3.88532498773605 A:G G A 10 0.529510832924535 0.199979463359089 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106999727_107000189:AIM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 107076783 A/T 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 A:T A T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 107100396 A/G 1 17 16 33 7.9983158402829 8.47217332679256 -0.473857486509656 A:G A G 10 0.529510832924535 0.863906691758278 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107100342_107100457:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107100342_107101698:QRSL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 109762332 C/T 1 11 12 23 5.17538083783011 6.35412999509442 -1.17874915726431 T:C C T 10 0.529510832924535 0.679304562332551 ENSG00000185250:ENST00000440797:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000521072:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000368958:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109761966_109762374:SMPD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 111283628 A/C 1 114 137 251 53.635765046603 72.5429841106613 -18.9072190640583 A:C A C 10 0.529510832924535 0.0191417555781819 ENSG00000155115:ENST00000329970:exon_111283595_111283708:GTF3C6;ENSG00000155115:ENST00000480191:exon_111283595_111283708:GTF3C6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 116599665 T/C 1 14 9 23 6.58684833905651 4.76559749632082 1.82125084273569 T:C T C 10 0.529510832924535 0.533349006667712 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 119510941 C/A 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:C C A 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119510829_119511048:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119510829_119511048:MAN1A1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 129899632 T/C 1 4 13 17 1.88195666830186 6.88364082801896 -5.0016841597171 A:T:C T C 10 0.529510832924535 0.0256522869308762 ENSG00000146376:ENST00000368149:exon_129897277_129899749:ARHGAP18;ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_129898241_129899749:ARHGAP18;ENSG00000146376:ENST00000483367:exon_129899564_129899749:ARHGAP18;ENSG00000146376:ENST00000463225:exon_129899564_129899749:ARHGAP18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 131190838 G/A 1 28 22 50 13.173696678113 11.6492383243398 1.52445835377325 A:G G A 10 0.529510832924535 0.777257189211731 ENSG00000079819:ENST00000337057:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000257986:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368128:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527411:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000524581:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529208:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527423:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000456097:exon_131190799_131191266:EPB41L2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 135287533 A/G 1 53 42 95 24.9359258549996 22.2394549828305 2.69647087216917 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.608388408177302 ENSG00000112339:ENST00000367837:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000445176:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367824:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527005:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527578:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000415177:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367826:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000533274:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000526100:exon_135287467_135287611:HBS1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 241 2 243 113.387889265187 1.05902166584907 112.328867599338 A:T T A 10 0.529510832924535 2.4329695177702e-63 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 276 0 276 129.855010112828 0 129.855010112828 A A 10 0.529510832924535 8.36467945605275e-77 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 271 0 271 127.502564277451 0 127.502564277451 A A 10 0.529510832924535 2.32065970038235e-75 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 44 0 44 20.7015233513205 0 20.7015233513205 G G 10 0.529510832924535 9.06285611275464e-13 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 40 1 41 18.8195666830186 0.529510832924535 18.2900558500941 A:T T A 10 0.529510832924535 2.19449055882991e-10 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 137519780 T/C 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C T C 10 0.529510832924535 0.758162898033516 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 139097232 C/T 1 21 20 41 9.88027250858476 10.5902166584907 -0.709944149905937 T:C C T 10 0.529510832924535 0.876331999731154 ENSG00000024862:ENST00000026464:exon_139097216_139097415:CCDC28A;ENSG00000024862:ENST00000332797:exon_139097216_139097415:CCDC28A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 143816859 C/T 1 59 64 123 27.7588608574524 33.8886933071702 -6.12983244971781 T:C C T 10 0.529510832924535 0.279323826108181 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143815949_143816984:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143816614_143816984:FUCA2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 143823112 G/A 1 16 28 44 7.52782667320744 14.826303321887 -7.29847664867954 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0336687637370098 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000451668:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000367585:exon_143823082_143823259:FUCA2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 143823157 T/C 1 13 24 37 6.11635917198104 12.7082599901888 -6.5919008182078 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0325623880992635 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000451668:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000367585:exon_143823082_143823259:FUCA2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 144181619 A/G 1 37 24 61 17.4080991817922 12.7082599901888 4.69983919160336 A:G A G 10 0.529510832924535 0.24970604888409 ENSG00000135521:ENST00000367576:exon_144181563_144181690:LTV1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 13 7 20 6.11635917198104 3.70657583047175 2.4097833415093 A:G G A 10 0.529510832924535 0.371363290052013 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 150052898 T/C 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 0.487573754416657 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 53 42 95 24.9359258549996 22.2394549828305 2.69647087216917 C:G G C 10 0.529510832924535 0.608388408177302 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 151766552 G/A 1 9 5 14 4.23440250367918 2.64755416462268 1.58684833905651 A:G G A 10 0.529510832924535 0.435350095576674 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 151789912 C/T 1 13 16 29 6.11635917198104 8.47217332679256 -2.35581415481152 T:C C T 10 0.529510832924535 0.457889314355892 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 152443756 C/T 1 14 9 23 6.58684833905651 4.76559749632082 1.82125084273569 T:C C T 10 0.529510832924535 0.533349006667712 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000460912:exon_152443195_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152443528_152443811:SYNE1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 152469188 C/G 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 C:G C G 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 24 13 37 11.2917400098112 6.88364082801896 4.4080991817922 C:G G C 10 0.529510832924535 0.187211545095096 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 153323594 C/T 1 14 5 19 6.58684833905651 2.64755416462268 3.93929417443383 T:C C T 10 0.529510832924535 0.105354482370937 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000482526:exon_153323562_153323671:MTRF1L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 155152175 G/A 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155152056_155152274:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155152056_155152274:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155152056_155152274:RBM16 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 155577671 G/A 1 4 10 14 1.88195666830186 5.29510832924535 -3.41315166094349 A:G G A 10 0.529510832924535 0.105177291482310 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155577618_155578854:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155577618_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155577618_155579221:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155577594_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155577618_155578334:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155577618_155578354:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155577618_155579216:TIAM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 93 80 173 43.7554925380182 42.3608666339628 1.39462590405544 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.879013796229344 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 160199687 T/C 1 61 62 123 28.6998391916034 32.8296716413212 -4.12983244971781 T:C T C 10 0.529510832924535 0.470933269611389 ENSG00000120438:ENST00000321394:exon_160199530_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000392168:exon_160199531_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000420894:exon_160199531_160200293:TCP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 219 141 360 103.037127589527 74.6610274423594 28.3761001471674 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00305740172074226 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 166739646 T/C 1 27 42 69 12.7032075110376 22.2394549828305 -9.53624747179292 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0221713969896852 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000494682:exon_166739361_166739655:SFT2D1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 170627437 G/A 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 170627586 G/T 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 T:G G T 10 0.529510832924535 0.129310521443327 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 122 115 237 57.3996783832067 60.8937457863215 -3.4940674031148 C:G G C 10 0.529510832924535 0.649477779897701 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 10 7 17 4.70489167075465 3.70657583047175 0.998315840282904 T:C T C 10 0.529510832924535 0.808990208344625 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 T:C T C 10 0.529510832924535 0.556631979728114 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 590199 A/G 1 6 15 21 2.82293500245279 7.94266249386803 -5.11972749141524 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0288150252561382 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 618938 A/G 1 14 9 23 6.58684833905651 4.76559749632082 1.82125084273569 A:G A G 10 0.529510832924535 0.533349006667712 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 810219 T/C 1 9 6 15 4.23440250367918 3.17706499754721 1.05733750613197 T:C T C 10 0.529510832924535 0.61671670096814 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 814788 G/A 1 9 14 23 4.23440250367918 7.41315166094349 -3.17874915726431 A:G G A 10 0.529510832924535 0.212944448586151 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 925717 G/A 1 44 44 88 20.7015233513205 23.2984766486795 -2.59695329735909 A:G G A 10 0.529510832924535 0.594821742045818 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_925693_925771:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_925693_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_925693_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_923180_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000441491:exon_925693_925771:GET4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 930608 G/A 1 22 25 47 10.3507616756602 13.2377708231134 -2.88700914745315 A:G G A 10 0.529510832924535 0.465553137512157 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 1131394 G/A 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 A:G G A 10 0.529510832924535 0.186533779694549 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 1131411 C/T 1 1 8 9 0.470489167075465 4.23608666339628 -3.76559749632082 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0158444396711090 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 1132505 G/A 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 1510282 G/A 1 89 64 153 41.8735358697164 33.8886933071702 7.98484256254613 A:G G A 10 0.529510832924535 0.224326696737195 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1509913_1510328:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1509913_1510328:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000493446:exon_1510114_1510347:INTS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 1976457 C/T 1 36 32 68 16.9376100147167 16.9443466535851 -0.00673663886838227 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 4823070 A/G 1 9 14 23 4.23440250367918 7.41315166094349 -3.17874915726431 A:G A G 10 0.529510832924535 0.212944448586151 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000491375:exon_4822954_4823429:KIAA0415 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 4823971 C/T 1 10 9 19 4.70489167075465 4.76559749632082 -0.0607058255661652 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000491375:exon_4823834_4824002:KIAA0415 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 5347749 G/A 1 9 12 21 4.23440250367918 6.35412999509442 -2.11972749141524 A:G G A 10 0.529510832924535 0.388145875482006 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 5347914 G/A 1 9 12 21 4.23440250367918 6.35412999509442 -2.11972749141524 A:G G A 10 0.529510832924535 0.388145875482006 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 5399044 C/G 1 41 28 69 19.2900558500941 14.826303321887 4.46375252820708 C:G C G 10 0.529510832924535 0.334748372856387 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5399029_5399200:TNRC18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 11 7 18 5.17538083783011 3.70657583047175 1.46880500735837 C:G G C 10 0.529510832924535 0.638208767464486 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 T:C T C 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 6441688 T/C 1 5 10 15 2.35244583537732 5.29510832924535 -2.94266249386803 T:C T C 10 0.529510832924535 0.194474740642524 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 8008970 C/G 1 8 6 14 3.76391333660372 3.17706499754721 0.586848339056509 C:G C G 10 0.529510832924535 0.795582240516341 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8008423_8009438:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8008425_8009438:GLCCI1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 25163461 G/C 1 374 476 850 175.962948486224 252.047156472079 -76.0842079858548 T:C:G G C 10 0.529510832924535 1.97807112569244e-07 ENSG00000172115:ENST00000305786:exon_25159710_25163468:CYCS;ENSG00000172115:ENST00000409409:exon_25162926_25163468:CYCS;ENSG00000172115:ENST00000409764:exon_25163063_25163468:CYCS;ENSG00000172115:ENST00000413447:exon_25163335_25163468:CYCS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 27570892 A/G 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 A:G A G 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000106049:ENST00000265395:exon_27570811_27570967:HIBADH;ENSG00000106049:ENST00000428288:exon_27570811_27570967:HIBADH;ENSG00000106049:ENST00000425715:exon_27570873_27570967:HIBADH HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 29980471 C/T 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000136193:ENST00000242059:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000416113:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000426154:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000425819:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000409497:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000434476:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000421434:exon_29980300_29980492:SCRN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 49 66 115 23.0539691866978 34.9477149730193 -11.8937457863215 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0312655620120358 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 32598630 T/A 1 10 2 12 4.70489167075465 1.05902166584907 3.64587000490558 A:T T A 10 0.529510832924535 0.0425238621817513 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 32598656 C/T 1 12 2 14 5.64587000490558 1.05902166584907 4.58684833905651 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0150557366008361 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 32613020 A/G 1 15 34 49 7.05733750613197 18.0033683194342 -10.9460308133022 A:G A G 10 0.529510832924535 0.00230678507829297 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 32623477 C/G 1 32 22 54 15.0556533464149 11.6492383243398 3.40641502207511 C:G C G 10 0.529510832924535 0.413883598039945 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32623404_32628333:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32623404_32625778:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32623404_32623519:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32623404_32628323:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000470500:exon_32623404_32623779:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000467779:exon_32623404_32623818:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000497020:exon_32623404_32623714:AVL9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 33060946 A/G 1 4 12 16 1.88195666830186 6.35412999509442 -4.47217332679256 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0416249079443736 ENSG00000122643:ENST00000456458:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000381626:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000396152:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000242210:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000405342:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409467:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409787:exon_33060884_33060969:NT5C3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 36895216 G/A 1 31 23 54 14.5851641793394 12.1787491572643 2.40641502207511 A:G G A 10 0.529510832924535 0.586174047289812 ENSG00000155849:ENST00000341056:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396042:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_36893966_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396045:exon_36893966_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396040:exon_36894067_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_36894600_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_36894896_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000497024:exon_36894972_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000487843:exon_36895103_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_36895128_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_36895156_36895356:ELMO1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 38796570 G/A 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 A:G G A 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38796438_38796582:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38796438_38796582:VPS41 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 295 240 535 138.794304287262 127.082599901888 11.7117043853737 A:T:G G A 10 0.529510832924535 0.319366904947501 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 48 37 85 22.5834800196223 19.5919008182078 2.99157920141452 T:C T C 10 0.529510832924535 0.587212025441456 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 43664280 A/G 1 103 117 220 48.4603842087729 61.9527674521706 -13.4923832433977 A:G A G 10 0.529510832924535 0.078852452874241 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43664117_43666385:STK17A;ENSG00000164543:ENST00000474211:exon_43664117_43664783:STK17A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 43810764 G/A 1 34 58 92 15.9966316805658 30.711628309623 -14.7149966290572 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00233625072883491 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43810737_43810769:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43810737_43810769:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43810737_43810769:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43810734_43810769:BLVRA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 44153780 A/G 1 1 15 16 0.470489167075465 7.94266249386803 -7.47217332679256 A:G A G 10 0.529510832924535 0.000147769161280482 ENSG00000106624:ENST00000223357:exon_44153193_44154159:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000450684:exon_44153193_44154161:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000413907:exon_44153193_44154158:AEBP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 44800176 G/T 1 23 37 60 10.8212508427357 19.5919008182078 -8.7706499754721 T:G G T 10 0.529510832924535 0.0273867196263682 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 44800182 A/G 1 37 22 59 17.4080991817922 11.6492383243398 5.75886085745243 A:G A G 10 0.529510832924535 0.151667948675452 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 24 31 55 11.2917400098112 16.4148358206606 -5.12309581084943 A:G A G 10 0.529510832924535 0.178339422682211 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 41 17 58 19.2900558500941 9.0016841597171 10.288371690377 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00801689691383391 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 45008963 C/T 1 6 9 15 2.82293500245279 4.76559749632082 -1.94266249386803 T:C C T 10 0.529510832924535 0.439062493647043 ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45008519_45009082:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45008122_45009082:MYO1G HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 118 50 168 55.5177217149049 26.4755416462268 29.0421800686781 A:G G A 10 0.529510832924535 6.10879364967353e-06 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 45067267 G/C 1 5 10 15 2.35244583537732 5.29510832924535 -2.94266249386803 C:G G C 10 0.529510832924535 0.194474740642524 ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45066625_45067396:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45066985_45067396:CCM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 45113170 G/A 1 81 62 143 38.1096225331127 32.8296716413212 5.27995089179149 A:G G A 10 0.529510832924535 0.402666449353243 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 45148667 G/A 1 58 58 116 27.288371690377 30.711628309623 -3.42325661924607 A:G G A 10 0.529510832924535 0.577008612953101 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148426_45148682:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 45148773 C/A 1 25 32 57 11.7622291768866 16.9443466535851 -5.1821174766985 A:C C A 10 0.529510832924535 0.185513411645612 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 55433880 G/C 1 13 4 17 6.11635917198104 2.11804333169814 3.9983158402829 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0556541699752264 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55433141_55433922:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55433815_55433922:LANCL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 55433884 A/C 1 12 3 15 5.64587000490558 1.58853249877361 4.05733750613197 A:C A C 10 0.529510832924535 0.0398320046822122 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55433141_55433922:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55433815_55433922:LANCL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 9 13 22 4.23440250367918 6.88364082801896 -2.64923832433977 A:G A G 10 0.529510832924535 0.290191579780574 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 9 11 20 4.23440250367918 5.82461916216989 -1.5902166584907 A:G G A 10 0.529510832924535 0.508807175217642 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 56122076 A/T 1 119 97 216 55.9882108819803 51.3625507936799 4.62566008830043 A:T:C:G A T 10 0.529510832924535 0.54028224579307 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56122062_56122196:CCT6A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 64389089 A/C 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:C A C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000198039:ENST00000527278:exon_64388032_64389502:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000476120:exon_64388032_64389635:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000319636:exon_64388032_64389416:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000395375:exon_64388032_64391344:ZNF273 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 64439701 C/T 1 8 2 10 3.76391333660372 1.05902166584907 2.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.115498370857198 ENSG00000152926:ENST00000398695:exon_64439109_64439914:ZNF117;ENSG00000152926:ENST00000282869:exon_64438360_64439914:ZNF117 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 65429359 G/A 1 87 68 155 40.9325575355655 36.0067366388684 4.92582089669707 A:G G A 10 0.529510832924535 0.469135775678941 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000461622:exon_65429133_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000462371:exon_65429317_65429445:GUSB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 65617284 G/A 1 20 17 37 9.4097833415093 9.0016841597171 0.408099181792204 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000241258:ENST00000422170:exon_65617195_65617884:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000360415:exon_65617195_65619555:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000395326:exon_65617195_65619548:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000431089:exon_65617195_65617857:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000398684:exon_65617195_65617498:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000338592:exon_65617195_65618276:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000415001:exon_65617195_65617884:CRCP;ENSG00000241258:ENST00000492264:exon_65617195_65617639:CRCP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 66774604 G/C 1 10 9 19 4.70489167075465 4.76559749632082 -0.0607058255661652 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 72300332 G/A 1 1 9 10 0.470489167075465 4.76559749632082 -4.29510832924535 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0082459486500564 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 48 41 89 22.5834800196223 21.7099441499059 0.873535869716381 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.915559687797445 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 73097238 G/A 1 28 19 47 13.173696678113 10.0607058255662 3.11299085254685 A:G G A 10 0.529510832924535 0.384224653602232 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 22 13 35 10.3507616756602 6.88364082801896 3.46712084764127 T:C C T 10 0.529510832924535 0.309714315957545 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 73097971 C/T 1 87 63 150 40.9325575355655 33.3591824742457 7.57337506131974 T:C C T 10 0.529510832924535 0.220936357727876 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000430270:exon_73097956_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423497:exon_73097956_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000487006:exon_73097961_73098003:WBSCR22 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 73108310 T/C 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 0.487573754416657 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 73151644 A/G 1 7 17 24 3.29342416952825 9.0016841597171 -5.70825999018884 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0235976590078984 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 73249165 T/A 1 9 2 11 4.23440250367918 1.05902166584907 3.17538083783011 A:T T A 10 0.529510832924535 0.070493162541885 ENSG00000165171:ENST00000297873:exon_73248920_73249332:WBSCR27;ENSG00000165171:ENST00000434654:exon_73248926_73249332:WBSCR27 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 73638035 A/G 1 16 27 43 7.52782667320744 14.2967924889624 -6.76896581575501 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0463563120916201 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 73731906 C/T 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73731810_73731997:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73731810_73731997:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73731877_73731997:CLIP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 75616577 G/A 1 263 224 487 123.738650940847 118.610426575096 5.12822436575142 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.650133988528674 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 75623893 G/A 1 27 38 65 12.7032075110376 20.1214116511323 -7.41820414009478 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0812011997592962 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 75633160 C/T 1 34 32 66 15.9966316805658 16.9443466535851 -0.947714973019313 T:C C T 10 0.529510832924535 0.901988286305542 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000430497:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000454618:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000492053:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75633076_75633173:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75633057_75633173:STYXL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 75689765 C/T 1 197 219 416 92.6863659138666 115.962872410473 -23.2765064966066 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0237903951548832 ENSG00000146701:ENST00000315758:exon_75689691_75689816:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000443006:exon_75689691_75689816:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000424167:exon_75689686_75689816:MDH2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 75931974 C/T 1 28 37 65 13.173696678113 19.5919008182078 -6.41820414009478 T:C C T 10 0.529510832924535 0.135402576288870 ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75931861_75932393:HSPB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 77256407 A/G 1 8 11 19 3.76391333660372 5.82461916216989 -2.06070582556617 A:G A G 10 0.529510832924535 0.367060340223589 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 20 37 57 9.4097833415093 19.5919008182078 -10.1821174766985 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00768302801826233 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 89983808 T/G 1 4 8 12 1.88195666830186 4.23608666339628 -2.35412999509442 T:G T G 10 0.529510832924535 0.247834349729258 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89983772_89983863:GTPBP10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 60 30 90 28.2293500245279 15.8853249877361 12.3440250367918 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0108811586373607 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 91504058 T/C 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 T:C T C 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000456229:exon_91503629_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000442961:exon_91503632_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000425936:exon_91503968_91504078:MTERF HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 60 59 119 28.2293500245279 31.2411391425476 -3.01178911801967 T:G G T 10 0.529510832924535 0.583179898310044 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 91641928 A/G 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 A:G A G 10 0.529510832924535 0.186533779694549 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91641743_91641956:AKAP9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 12 8 20 5.64587000490558 4.23608666339628 1.4097833415093 T:C C T 10 0.529510832924535 0.655754725288894 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 91700295 G/A 1 20 21 41 9.4097833415093 11.1197274914152 -1.70994414990594 A:G G A 10 0.529510832924535 0.640483953032678 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91700219_91700323:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91700219_91700323:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91700219_91700323:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91700219_91700323:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91700219_91700323:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91700219_91700323:AKAP9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 26 28 54 12.2327183439621 14.826303321887 -2.59358497792489 A:G A G 10 0.529510832924535 0.4981576455005 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 91715662 C/T 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91715542_91715730:AKAP9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 5 13 18 2.35244583537732 6.88364082801896 -4.53119499264163 A:C A C 10 0.529510832924535 0.0353717025263609 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 33 35 68 15.5261425134903 18.5328791523587 -3.00673663886838 A:G A G 10 0.529510832924535 0.469202339815713 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 15 11 26 7.05733750613197 5.82461916216989 1.23271834396209 T:C T C 10 0.529510832924535 0.697111831856919 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 92027537 C/G 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 C:G C G 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 92734451 A/G 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 A:G A G 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 119 116 235 55.9882108819803 61.4232566192461 -5.43504573726574 A:G G A 10 0.529510832924535 0.513544974272064 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 92762681 A/G 1 13 12 25 6.11635917198104 6.35412999509442 -0.237770823113376 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 21 25 46 9.88027250858476 13.2377708231134 -3.35749831452861 T:C C T 10 0.529510832924535 0.376009292894768 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 92970847 C/T 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92970739_92970887:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92970739_92970887:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92970739_92970887:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000480943:exon_92970739_92970887:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92970739_92970887:CCDC132 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 92985252 T/C 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 T:C T C 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92985203_92985390:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000443443:exon_92985203_92985498:CCDC132 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 93551428 C/T 1 8 3 11 3.76391333660372 1.58853249877361 2.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.235512259698034 ENSG00000127920:ENST00000248564:exon_93551011_93551545:GNG11 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 97488569 A/T 1 59 55 114 27.7588608574524 29.1230958108494 -1.36423495339699 A:T A T 10 0.529510832924535 0.85128824985622 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97488554_97488710:ASNS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:C C T 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 99017737 G/A 1 12 19 31 5.64587000490558 10.0607058255662 -4.41483582066059 A:G G A 10 0.529510832924535 0.149025268406671 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99014362_99017772:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99016757_99017772:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99016757_99017772:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99017372_99017772:RP5-900K19.1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 99654600 A/G 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 A:G A G 10 0.529510832924535 0.186533779694549 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 196 188 384 92.2158767467911 99.5480365898126 -7.33215984302146 A:G G A 10 0.529510832924535 0.474280726895827 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 288 254 542 135.500880117734 134.495751562832 1.005128554902 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.965683943539647 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 11 10 21 5.17538083783011 5.29510832924535 -0.119727491415236 A:G A G 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 99754723 T/C 1 12 8 20 5.64587000490558 4.23608666339628 1.4097833415093 T:C T C 10 0.529510832924535 0.655754725288894 ENSG00000146826:ENST00000457641:exon_99754717_99754837:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419037:exon_99754717_99754837:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000316937:exon_99754717_99754837:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000448720:exon_99754717_99754762:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000456769:exon_99754717_99754837:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419841:exon_99754717_99754837:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000498638:exon_99754717_99754822:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000472061:exon_99754562_99754837:C7orf43 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100173282 G/A 1 6 10 16 2.82293500245279 5.29510832924535 -2.47217332679256 A:G G A 10 0.529510832924535 0.316631120754283 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100170920_100173405:LRCH4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100276038 C/T 1 264 238 502 124.209140107923 126.023578236039 -1.81443812811659 T:C C T 10 0.529510832924535 0.89332689760905 ENSG00000172354:ENST00000303210:exon_100276021_100276237:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000451587:exon_100276021_100276075:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000436220:exon_100276021_100276237:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000424361:exon_100276021_100276237:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000419828:exon_100276021_100276237:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000427895:exon_100276021_100276237:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000393926:exon_100276021_100276237:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000393924:exon_100276021_100276237:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000469287:exon_100276021_100276237:GNB2;ENSG00000172354:ENST00000470354:exon_100276021_100276237:GNB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100285476 C/T 1 11 10 21 5.17538083783011 5.29510832924535 -0.119727491415236 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100285411_100285506:GIGYF1;ENSG00000146830:ENST00000471340:exon_100285411_100285506:GIGYF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100285888 C/T 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:C C T 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100285827_100287071:GIGYF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100463822 G/A 1 23 32 55 10.8212508427357 16.9443466535851 -6.12309581084943 A:G G A 10 0.529510832924535 0.105946769304173 ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100463341_100464630:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100463341_100464631:SLC12A9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100731112 C/T 1 9 7 16 4.23440250367918 3.70657583047175 0.527826673207439 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56;ENSG00000169871:ENST00000412507:exon_100730593_100731409:TRIM56 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100731829 T/C 1 18 17 35 8.46880500735837 9.0016841597171 -0.532879152358726 T:C T C 10 0.529510832924535 0.867280533607478 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100731925 C/T 1 22 13 35 10.3507616756602 6.88364082801896 3.46712084764127 T:C C T 10 0.529510832924535 0.309714315957545 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100799970 C/T 1 46 41 87 21.6425016854714 21.7099441499059 -0.0674424644345493 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000106367:ENST00000337619:exon_100799875_100800053:AP1S1;ENSG00000106367:ENST00000443943:exon_100799875_100800053:AP1S1;ENSG00000106367:ENST00000429457:exon_100799875_100800053:AP1S1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100850908 G/A 1 12 15 27 5.64587000490558 7.94266249386803 -2.29679248896245 A:G G A 10 0.529510832924535 0.442316378908255 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100850859_100851005:PLOD3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100850982 G/A 1 15 13 28 7.05733750613197 6.88364082801896 0.173696678113019 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100850859_100851005:PLOD3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100853714 G/A 1 16 11 27 7.52782667320744 5.82461916216989 1.70320751103755 A:G G A 10 0.529510832924535 0.566839782462308 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000487563:exon_100853374_100853720:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000460132:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000440925:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000466881:exon_100853637_100853725:PLOD3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100855823 G/A 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 A:G G A 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100855811_100855936:PLOD3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100855877 G/A 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478264:exon_100855825_100855936:PLOD3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 100865847 T/C 1 7 2 9 3.29342416952825 1.05902166584907 2.23440250367918 T:C T C 10 0.529510832924535 0.186533779694549 ENSG00000106400:ENST00000485387:exon_100863662_100866055:ZNHIT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 102098010 G/A 1 13 12 25 6.11635917198104 6.35412999509442 -0.237770823113376 A:C:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000160993:ENST00000292566:exon_102096685_102098428:ALKBH4;ENSG00000160993:ENST00000490528:exon_102097281_102098428:ALKBH4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 102108532 G/A 1 11 19 30 5.17538083783011 10.0607058255662 -4.88532498773605 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0984062165532483 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102108166_102109509:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485417:exon_102108509_102108634:LRWD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 37 23 60 17.4080991817922 12.1787491572643 5.2293500245279 A:G G A 10 0.529510832924535 0.196713462560973 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 104717517 C/T 1 64 64 128 30.1113066928298 33.8886933071702 -3.77738661434049 A:T:C C T 10 0.529510832924535 0.535799518523554 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000478990:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000476671:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000482560:exon_104717410_104717640:MLL5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 105206088 T/C 1 36 24 60 16.9376100147167 12.7082599901888 4.2293500245279 T:C T C 10 0.529510832924535 0.302167129492345 ENSG00000135249:ENST00000257700:exon_105205977_105206095:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000497979:exon_105205977_105206095:RINT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 105752691 G/A 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 A:G G A 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000008282:ENST00000455385:exon_105752586_105752777:SYPL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 23 15 38 10.8212508427357 7.94266249386803 2.87858834886767 A:G G A 10 0.529510832924535 0.417373527175481 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 112102355 T/G 1 13 18 31 6.11635917198104 9.53119499264163 -3.41483582066059 T:G T G 10 0.529510832924535 0.280312149032782 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102325_112102433:IFRD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 26 35 61 12.2327183439621 18.5328791523587 -6.30016080839664 A:G G A 10 0.529510832924535 0.123527320564354 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 117825681 A/G 1 14 12 26 6.58684833905651 6.35412999509442 0.232718343962088 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 10 6 16 4.70489167075465 3.17706499754721 1.52782667320744 A:G G A 10 0.529510832924535 0.46714284442011 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 127721507 T/C 1 115 116 231 54.1062542136785 61.4232566192461 -7.3170024055676 T:C T C 10 0.529510832924535 0.356275476418469 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000470463:exon_127721412_127721553:SND1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 128038555 C/G 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000497868:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000468842:exon_128038544_128038667:IMPDH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 128388648 G/A 1 8 6 14 3.76391333660372 3.17706499754721 0.586848339056509 A:G G A 10 0.529510832924535 0.795582240516341 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128388627_128388858:CALU HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 48 43 91 22.5834800196223 22.768965815755 -0.185485796132689 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 128641226 G/C 1 1 9 10 0.470489167075465 4.76559749632082 -4.29510832924535 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0082459486500564 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128641113_128641288:TNPO3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 6 9 15 2.82293500245279 4.76559749632082 -1.94266249386803 A:C:G G A 10 0.529510832924535 0.439062493647043 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 138761034 G/C 1 13 19 32 6.11635917198104 10.0607058255662 -3.94434665358512 C:G G C 10 0.529510832924535 0.214546608356418 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000460845:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 138764233 C/T 1 7 13 20 3.29342416952825 6.88364082801896 -3.5902166584907 T:C C T 10 0.529510832924535 0.120726784497272 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 139026152 T/G 1 38 29 67 17.8785883488677 15.3558141548115 2.52277419405615 T:G T G 10 0.529510832924535 0.624796778363521 ENSG00000164898:ENST00000297534:exon_139025878_139026268:C7orf55 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 139102490 A/G 1 16 12 28 7.52782667320744 6.35412999509442 1.17369667811302 A:G A G 10 0.529510832924535 0.708183978146927 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 139661778 G/A 1 15 16 31 7.05733750613197 8.47217332679256 -1.41483582066059 A:G G A 10 0.529510832924535 0.719675534707041 ENSG00000059377:ENST00000425687:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000263552:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000336425:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000448866:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000436047:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000416849:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000414508:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000422328:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000458722:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000411653:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000462275:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000469630:exon_139661718_139662850:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000494876:exon_139661718_139662035:TBXAS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 32 30 62 15.0556533464149 15.8853249877361 -0.829671641321173 A:G G A 10 0.529510832924535 0.898962842083434 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 14 19 33 6.58684833905651 10.0607058255662 -3.47385748650966 T:C C T 10 0.529510832924535 0.295339984350597 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 18 11 29 8.46880500735837 5.82461916216989 2.64418584518848 A:G G A 10 0.529510832924535 0.357241115671972 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 142494606 C/G 1 9 3 12 4.23440250367918 1.58853249877361 2.64587000490558 C:G C G 10 0.529510832924535 0.154401063622286 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 142495126 G/A 1 6 10 16 2.82293500245279 5.29510832924535 -2.47217332679256 A:G G A 10 0.529510832924535 0.316631120754283 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 142495127 G/T 1 6 10 16 2.82293500245279 5.29510832924535 -2.47217332679256 T:G G T 10 0.529510832924535 0.316631120754283 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 224 0 224 105.389573424904 0 105.389573424904 T T 10 0.529510832924535 1.44301541764395e-62 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 148506396 A/C 1 7 18 25 3.29342416952825 9.53119499264163 -6.23777082311338 A:C A C 10 0.529510832924535 0.0151817758296095 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 148978710 G/A 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 A:G G A 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000204946:ENST00000434415:exon_148978596_148982082:ZNF783 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 149129829 C/T 1 11 19 30 5.17538083783011 10.0607058255662 -4.88532498773605 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0984062165532483 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149128454_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149129360_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149128867_149130026:ZNF777 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 149152673 G/A 1 10 11 21 4.70489167075465 5.82461916216989 -1.11972749141524 A:G G A 10 0.529510832924535 0.66667332357797 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 150028098 A/G 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G A G 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000188707:ENST00000343855:exon_150027401_150029808:C7orf29 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 T:C T C 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 11 17 28 5.17538083783011 9.0016841597171 -3.82630332188698 A:G A G 10 0.529510832924535 0.184953401348688 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 17 13 30 7.9983158402829 6.88364082801896 1.11467501226395 A:G G A 10 0.529510832924535 0.718250953485475 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 14 12 26 6.58684833905651 6.35412999509442 0.232718343962088 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 150217089 G/A 1 4 10 14 1.88195666830186 5.29510832924535 -3.41315166094349 A:G G A 10 0.529510832924535 0.105177291482310 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 150217302 A/T 1 8 4 12 3.76391333660372 2.11804333169814 1.64587000490558 A:T A T 10 0.529510832924535 0.397734651849528 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 150217309 C/T 1 10 4 14 4.70489167075465 2.11804333169814 2.58684833905651 T:C C T 10 0.529510832924535 0.19016988576375 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 150324825 C/T 1 8 11 19 3.76391333660372 5.82461916216989 -2.06070582556617 T:C C T 10 0.529510832924535 0.367060340223589 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 150325175 C/T 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 28 34 62 13.173696678113 18.0033683194342 -4.82967164132117 C:G G C 10 0.529510832924535 0.252373869275184 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 24 31 55 11.2917400098112 16.4148358206606 -5.12309581084943 T:C C T 10 0.529510832924535 0.178339422682211 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 59 35 94 27.7588608574524 18.5328791523587 9.22598170509371 T:C C T 10 0.529510832924535 0.062742636209193 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 151064064 C/T 1 21 14 35 9.88027250858476 7.41315166094349 2.46712084764127 T:C C T 10 0.529510832924535 0.498877287546952 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000480907:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000497987:exon_151064025_151064211:NUB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 34 43 77 15.9966316805658 22.768965815755 -6.7723341351892 A:G A G 10 0.529510832924535 0.137767336559088 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 154738409 T/C 1 38 29 67 17.8785883488677 15.3558141548115 2.52277419405615 T:C T C 10 0.529510832924535 0.624796778363521 ENSG00000214106:ENST00000411526:exon_154738350_154738546:AC093726.6;ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154738303_154738501:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154738389_154738523:PAXIP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 10 15 25 4.70489167075465 7.94266249386803 -3.23777082311338 A:G G A 10 0.529510832924535 0.230939624838663 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 19 33 52 8.93929417443383 17.4738574865097 -8.53456331207582 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0184199078761078 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 25 39 64 11.7622291768866 20.6509224840569 -8.88869330717024 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0325422603035318 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 158528233 A/G 1 5 25 30 2.35244583537732 13.2377708231134 -10.8853249877361 A:G A G 10 0.529510832924535 6.29390544175182e-05 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 158534372 G/A 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 A:G G A 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 C:G G C 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 8 4 12 3.76391333660372 2.11804333169814 1.64587000490558 T:C T C 10 0.529510832924535 0.397734651849528 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 158536334 G/A 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 A:G G A 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G A G 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 7 158540945 C/T 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 T:C C T 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158540885_158540971:ESYT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 623593 G/A 1 66 60 126 31.0522850269807 31.7706499754721 -0.718364948491416 A:G G A 10 0.529510832924535 0.92900679239047 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_623289_623657:ERICH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 1514009 C/A 1 12 2 14 5.64587000490558 1.05902166584907 4.58684833905651 A:C C A 10 0.529510832924535 0.0150557366008361 ENSG00000198010:ENST00000421627:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000356067:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000357934:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000520901:exon_1513849_1514060:DLGAP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 6303025 G/A 1 27 19 46 12.7032075110376 10.0607058255662 2.64250168547139 A:G G A 10 0.529510832924535 0.463418293565778 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 6357435 C/G 1 9 2 11 4.23440250367918 1.05902166584907 3.17538083783011 C:G C G 10 0.529510832924535 0.070493162541885 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6357373_6357450:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6357373_6357450:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6357373_6357450:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6357373_6357450:MCPH1;ENSG00000091879:ENST00000325203:exon_6357172_6360782:ANGPT2;ENSG00000091879:ENST00000415216:exon_6357195_6360782:ANGPT2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 5 9 14 2.35244583537732 4.76559749632082 -2.41315166094349 A:C C A 10 0.529510832924535 0.28431222286612 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 9 19 28 4.23440250367918 10.0607058255662 -5.82630332188698 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0358414853668081 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 8234192 G/C 1 7 1 8 3.29342416952825 0.529510832924535 2.76391333660372 C:G G C 10 0.529510832924535 0.0741292491828888 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 9627791 A/G 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 A:G A G 10 0.529510832924535 0.782760397275129 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 10623138 T/A 1 96 64 160 45.1669600392446 33.8886933071702 11.2782667320744 A:T T A 10 0.529510832924535 0.081318645340824 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 10697276 C/G 1 22 21 43 10.3507616756602 11.1197274914152 -0.768965815755008 C:G C G 10 0.529510832924535 0.879040013315706 ENSG00000254093:ENST00000354846:exon_10697248_10697357:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10697248_10697386:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10697248_10697386:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000524114:exon_10697218_10697281:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000523559:exon_10697248_10697386:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000520018:exon_10697248_10697350:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000524026:exon_10697248_10697394:PINX1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 34 40 74 15.9966316805658 21.1804333169814 -5.18380163641559 T:C T C 10 0.529510832924535 0.245177152207174 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 11418773 C/T 1 21 31 52 9.88027250858476 16.4148358206606 -6.53456331207582 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0722982141266019 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 11689119 G/C 1 428 347 775 201.369363508299 183.740259024814 17.6291044834853 C:G G C 10 0.529510832924535 0.208018999328971 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11689027_11689176:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529521:exon_11689027_11689303:FDFT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 11706581 T/G 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 T:G T G 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 T:C C T 10 0.529510832924535 0.129310521443327 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 17794792 G/A 1 18 24 42 8.46880500735837 12.7082599901888 -4.23945498283047 A:G G A 10 0.529510832924535 0.217090603619072 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518936:exon_17794643_17794830:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17794685_17794888:PCM1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 20 29 49 9.4097833415093 15.3558141548115 -5.94603081330222 T:C T C 10 0.529510832924535 0.114556502401989 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 14 23 37 6.58684833905651 12.1787491572643 -5.5919008182078 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0711873542441478 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 21766900 G/A 1 13 15 28 6.11635917198104 7.94266249386803 -1.82630332188698 A:G G A 10 0.529510832924535 0.571481182501315 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 21767275 C/G 1 19 8 27 8.93929417443383 4.23608666339628 4.70320751103755 C:G C G 10 0.529510832924535 0.0828338368378422 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000524001:exon_21766975_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000517422:exon_21767126_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000518197:exon_21767146_21767442:DOK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 27 23 50 12.7032075110376 12.1787491572643 0.524458353773248 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 22864986 C/T 1 17 12 29 7.9983158402829 6.35412999509442 1.64418584518848 T:C C T 10 0.529510832924535 0.581370651083963 ENSG00000008853:ENST00000519685:exon_22864241_22865259:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000522948:exon_22864241_22865259:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000251822:exon_22864241_22865259:RHOBTB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 22900701 G/A 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519910:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22900417_22900756:TNFRSF10B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 23294761 T/C 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000520936:exon_23294547_23294771:ENTPD4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 23423669 A/G 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 A:G A G 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 23423758 G/A 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 A:G G A 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 23429329 T/C 1 19 18 37 8.93929417443383 9.53119499264163 -0.591900818207796 T:C T C 10 0.529510832924535 0.870465810362237 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 9 9 18 4.23440250367918 4.76559749632082 -0.53119499264163 A:G G A 10 0.529510832924535 0.817944843022877 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 119 93 212 55.9882108819803 49.2445074619818 6.74370341999857 A:C A C 10 0.529510832924535 0.371491771868886 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 27311703 T/C 1 83 85 168 39.0506008672636 45.0084207985855 -5.95781993132189 T:C T C 10 0.529510832924535 0.39530689098972 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 175 115 290 82.3356042382064 60.8937457863215 21.4418584518848 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0133501658404304 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 186 129 315 87.5109850760365 68.306897447265 19.2040876287715 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0318901592015109 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 A:C A C 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 27880826 C/T 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000189233:ENST00000413272:exon_27879481_27880979:C8orf80 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 13 14 27 6.11635917198104 7.41315166094349 -1.29679248896245 C:G G C 10 0.529510832924535 0.701228237889621 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 29197672 A/G 1 38 32 70 17.8785883488677 16.9443466535851 0.934241695282548 A:G A G 10 0.529510832924535 0.904832285095606 ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000462477:exon_29197615_29197760:DUSP4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 30999280 G/T 1 9 5 14 4.23440250367918 2.64755416462268 1.58684833905651 T:G G T 10 0.529510832924535 0.435350095576674 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 31024654 T/C 1 14 11 25 6.58684833905651 5.82461916216989 0.762229176886623 T:C T C 10 0.529510832924535 0.842602807462717 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 33246538 A/G 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 33246591 G/C 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 33246685 G/A 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 A:G G A 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 13 13 26 6.11635917198104 6.88364082801896 -0.767281656037911 A:G A G 10 0.529510832924535 0.845219179890685 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 37732217 C/T 1 7 10 17 3.29342416952825 5.29510832924535 -2.0016841597171 T:C C T 10 0.529510832924535 0.344125043526582 ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37732033_37732840:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37732033_37732840:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37732033_37732840:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37732033_37732840:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37732033_37732840:RAB11FIP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 37963239 C/T 1 14 12 26 6.58684833905651 6.35412999509442 0.232718343962088 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37962760_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37963011_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517719:exon_37963018_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37963068_37963256:ASH2L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 37985897 A/G 1 13 25 38 6.11635917198104 13.2377708231134 -7.12141165113233 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0227926480248785 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000428278:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000521652:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000524247:exon_37985858_37985976:ASH2L HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 38095662 C/T 1 5 12 17 2.35244583537732 6.35412999509442 -4.0016841597171 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0859595749856374 ENSG00000085788:ENST00000397166:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000519857:exon_38095607_38096576:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000526237:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000532222:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000520272:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000319246:exon_38095607_38095727:DDHD2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 38458696 T/C 0 19 0 19 8.93929417443383 0 8.93929417443383 T T 10 0.529510832924535 6.27091337319104e-06 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 48649894 G/A 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 A:G G A 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000221869:ENST00000408965:exon_48649471_48650770:CEBPD HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 52746153 C/T 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000168300:ENST00000360540:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519559:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000522514:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519554:exon_52746078_52746249:PCMTD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 53537316 A/G 1 12 9 21 5.64587000490558 4.76559749632082 0.880272508584764 A:G A G 10 0.529510832924535 0.827993527930512 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 19 15 34 8.93929417443383 7.94266249386803 0.996631680565809 A:G A G 10 0.529510832924535 0.863935342116717 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 56866452 G/A 1 14 33 47 6.58684833905651 17.4738574865097 -10.8870091474531 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00184923552128368 ENSG00000254087:ENST00000519728:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000520220:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000502902:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000507431:exon_56866391_56866543:LYN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 56986883 G/C 1 31 63 94 14.5851641793394 33.3591824742457 -18.7740182949063 C:G G C 10 0.529510832924535 0.000112658787368168 ENSG00000008988:ENST00000524349:exon_56986619_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521262:exon_56986813_56987069:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000523936:exon_56986813_56986915:RPS20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 56986948 T/C 1 2192 2023 4215 1031.31225422942 1071.20041500633 -39.8881607769154 T:C:G T C 10 0.529510832924535 0.222860452168205 ENSG00000008988:ENST00000519807:exon_56986940_56987068:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000427539:exon_56986940_56987069:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000009589:exon_56986940_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000524349:exon_56986619_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520490:exon_56986940_56987031:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521262:exon_56986813_56987069:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520627:exon_56986940_56987069:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519606:exon_56986940_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521289:exon_56986940_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000518875:exon_56986940_56987057:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519369:exon_56986940_56987065:RPS20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 61654081 G/A 1 10 2 12 4.70489167075465 1.05902166584907 3.64587000490558 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0425238621817513 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000526846:exon_61653818_61654089:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000524602:exon_61653924_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61653992_61655656:CHD7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 64099240 G/A 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 0.159283336846293 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 67341938 G/T 1 32 30 62 15.0556533464149 15.8853249877361 -0.829671641321173 T:G G T 10 0.529510832924535 0.898962842083434 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 72965973 G/A 1 11 4 15 5.17538083783011 2.11804333169814 3.05733750613197 A:G G A 10 0.529510832924535 0.128035315987776 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 72966002 G/A 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 A:G G A 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000523582:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000262209:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 81897200 C/T 0 0 12 12 0 6.35412999509442 -6.35412999509442 T C T 10 0.529510832924535 0.000117650977528432 ENSG00000076641:ENST00000220597:exon_81897011_81897612:PAG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 82592967 G/A 1 5 10 15 2.35244583537732 5.29510832924535 -2.94266249386803 A:G G A 10 0.529510832924535 0.194474740642524 ENSG00000133731:ENST00000256108:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000311489:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000449740:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000523942:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000518188:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000523710:exon_82592885_82593014:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000519964:exon_82592885_82593014:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000521360:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000521979:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000522997:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000518202:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000519816:exon_82592885_82593018:IMPA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 26 22 48 12.2327183439621 11.6492383243398 0.583480019622318 A:C A C 10 0.529510832924535 0.886163543227794 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 20 21 41 9.4097833415093 11.1197274914152 -1.70994414990594 A:G A G 10 0.529510832924535 0.640483953032678 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 95523385 T/C 1 14 13 27 6.58684833905651 6.88364082801896 -0.296792488962446 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95522961_95523957:KIAA1429 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 95541302 A/G 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 A:G A G 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95541298_95541570:KIAA1429 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 99057126 C/T 1 21 17 38 9.88027250858476 9.0016841597171 0.878588348867668 T:C C T 10 0.529510832924535 0.87133953035346 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 100899793 G/A 1 1218 1180 2398 573.055805497916 624.822782850951 -51.766977353035 A:T:G G A 10 0.529510832924535 0.0351024645140138 ENSG00000164919:ENST00000522934:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520517:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520468:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000297564:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520271:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000517682:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000524245:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000522940:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000518171:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000523016:exon_100899289_100899846:COX6C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 9 11 20 4.23440250367918 5.82461916216989 -1.5902166584907 T:C T C 10 0.529510832924535 0.508807175217642 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 16 10 26 7.52782667320744 5.29510832924535 2.23271834396209 A:G G A 10 0.529510832924535 0.435554956053702 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 103663912 T/G 1 9 8 17 4.23440250367918 4.23608666339628 -0.00168415971709557 T:G T G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000155090:ENST00000285407:exon_103663377_103664289:KLF10;ENSG00000155090:ENST00000395884:exon_103663377_103664289:KLF10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 104419956 T/C 1 4 7 11 1.88195666830186 3.70657583047175 -1.82461916216989 T:C T C 10 0.529510832924535 0.367903952777456 ENSG00000164933:ENST00000297578:exon_104419862_104420012:SLC25A32;ENSG00000164933:ENST00000521645:exon_104419862_104420012:SLC25A32;ENSG00000164933:ENST00000523256:exon_104419862_104420012:SLC25A32;ENSG00000164933:ENST00000523866:exon_104419862_104420012:SLC25A32 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 50 52 102 23.5244583537732 27.5345633120758 -4.01010495830257 A:G A G 10 0.529510832924535 0.429592919157056 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 110301998 T/C 1 15 9 24 7.05733750613197 4.76559749632082 2.29174000981116 T:C T C 10 0.529510832924535 0.4160778721084 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 110302047 T/G 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 T:G T G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 117783774 A/T 1 34 43 77 15.9966316805658 22.768965815755 -6.7723341351892 A:T A T 10 0.529510832924535 0.137767336559088 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 41 48 89 19.2900558500941 25.4165199803777 -6.12646413028362 A:T:C:G A G 10 0.529510832924535 0.203637593553877 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 125463250 T/C 1 4 8 12 1.88195666830186 4.23608666339628 -2.35412999509442 T:C T C 10 0.529510832924535 0.247834349729258 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 125463435 C/G 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 C:G C G 10 0.529510832924535 0.159283336846293 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 125498547 C/T 1 4 8 12 1.88195666830186 4.23608666339628 -2.35412999509442 T:C C T 10 0.529510832924535 0.247834349729258 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 125499363 G/A 1 17 7 24 7.9983158402829 3.70657583047175 4.29174000981116 A:G G A 10 0.529510832924535 0.101156594830765 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 125528135 G/A 1 15 20 35 7.05733750613197 10.5902166584907 -3.53287915235873 A:G G A 10 0.529510832924535 0.240916033451795 ENSG00000147687:ENST00000276692:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523214:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519548:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522810:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000517678:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519776:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521546:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521973:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520321:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522310:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519232:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520938:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523888:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523152:exon_125528128_125528271:TATDN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 126033079 G/A 1 44 39 83 20.7015233513205 20.6509224840569 0.05060086726359 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033026_126033113:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033026_126033113:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000518931:exon_126033026_126033179:SQLE HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 132982824 A/G 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 A:G A G 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000132294:ENST00000254624:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000407309:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000377917:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000334503:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000519656:exon_132982723_132982890:EFR3A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 133844508 C/T 1 15 9 24 7.05733750613197 4.76559749632082 2.29174000981116 T:C C T 10 0.529510832924535 0.4160778721084 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 133844598 C/T 1 7 18 25 3.29342416952825 9.53119499264163 -6.23777082311338 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0151817758296095 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 135524797 G/T 1 53 61 114 24.9359258549996 32.3001608083966 -7.364234953397 T:G G T 10 0.529510832924535 0.188891178289830 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135524718_135524844:ZFAT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 135602581 A/G 1 13 6 19 6.11635917198104 3.17706499754721 2.93929417443383 A:G A G 10 0.529510832924535 0.25025489550222 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 15 8 23 7.05733750613197 4.23608666339628 2.82125084273569 A:G A G 10 0.529510832924535 0.297861335201159 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 141566311 C/T 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000521325:exon_141566266_141566337:EIF2C2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 141568622 G/A 1 8 8 16 3.76391333660372 4.23608666339628 -0.472173326792561 A:G G A 10 0.529510832924535 0.80894998850296 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141568584_141568671:EIF2C2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 26 26 52 12.2327183439621 13.7672816560379 -1.53456331207582 A:G G A 10 0.529510832924535 0.679486098664135 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 75 67 142 35.2866875306599 35.4772258059438 -0.190538275283977 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 144403408 C/T 0 34 0 34 15.9966316805658 0 15.9966316805658 C C 10 0.529510832924535 6.97885584361006e-10 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 144413416 G/A 1 9 5 14 4.23440250367918 2.64755416462268 1.58684833905651 A:G G A 10 0.529510832924535 0.435350095576674 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523417:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518007:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518760:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000520950:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522043:exon_144413394_144413509:TOP1MT HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 144660046 G/A 0 0 8 8 0 4.23608666339628 -4.23608666339628 A G A 10 0.529510832924535 0.00240102690507337 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144659827_144660085:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144660031_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000491904:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000462059:exon_144659986_144660491:NAPRT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 144671244 C/A 1 6 9 15 2.82293500245279 4.76559749632082 -1.94266249386803 A:C C A 10 0.529510832924535 0.439062493647043 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 144671922 G/A 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 A:G G A 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 144689146 C/T 1 8 2 10 3.76391333660372 1.05902166584907 2.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.115498370857198 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 144775871 C/A 1 10 9 19 4.70489167075465 4.76559749632082 -0.0607058255661652 A:C C A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000181135:ENST00000525185:exon_144775841_144776000:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000534303:exon_144775841_144776009:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000528456:exon_144775841_144775942:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530574:exon_144775841_144775997:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531985:exon_144775841_144775893:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527293:exon_144775841_144775926:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531811:exon_144775841_144775918:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000525862:exon_144775841_144775873:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000526315:exon_144775841_144776129:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530341:exon_144775841_144775881:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531254:exon_144775841_144776199:ZNF707 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 23 10 33 10.8212508427357 5.29510832924535 5.52614251349034 A:C A C 10 0.529510832924535 0.0566936216503037 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 144874957 G/A 1 64 55 119 30.1113066928298 29.1230958108494 0.988210881980329 A:G G A 10 0.529510832924535 0.926885814896354 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144874655_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000525051:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144874655_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144874878_144875037:SCRIB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 144886809 C/T 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144886738_144886995:SCRIB HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 144994566 G/A 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 A:G G A 10 0.529510832924535 0.352283066981699 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 145008605 C/T 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145008486_145008613:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145008486_145008613:PLEC HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 145619317 G/A 1 14 11 25 6.58684833905651 5.82461916216989 0.762229176886623 A:G G A 10 0.529510832924535 0.842602807462717 ENSG00000071894:ENST00000531480:exon_145619098_145619375:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000532725:exon_145618882_145619452:CPSF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 145662149 G/A 1 5 9 14 2.35244583537732 4.76559749632082 -2.41315166094349 A:G G A 10 0.529510832924535 0.28431222286612 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145662140_145662303:NFKBIL2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 145738039 C/T 1 25 35 60 11.7622291768866 18.5328791523587 -6.7706499754721 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0924484520931941 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145738025_145738154:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145738025_145738154:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145738025_145738154:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145738025_145738154:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145738025_145738155:RECQL4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 146067054 G/A 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 A:G G A 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146066740_146067121:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 146068322 C/T 1 69 43 112 32.4637525282071 22.768965815755 9.69478671245207 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0720940535617084 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 146076708 C/T 1 29 31 60 13.6441858451885 16.4148358206606 -2.7706499754721 T:C C T 10 0.529510832924535 0.518794375481265 ENSG00000170619:ENST00000402718:exon_146075559_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000450361:exon_146075573_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000305103:exon_146075604_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000529143:exon_146076210_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000533270:exon_146076211_146076780:COMMD5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 8 146156247 C/A 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 A:C C A 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 143 106 249 67.2799508917915 56.1281482900007 11.1518026017908 A:G G A 10 0.529510832924535 0.162825333565994 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 64 61 125 30.1113066928298 32.3001608083966 -2.18885411556688 C:G C G 10 0.529510832924535 0.720544801944244 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 73 71 144 34.3457091965089 37.595269137642 -3.24955994113304 A:G A G 10 0.529510832924535 0.616856170629415 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 5089776 C/G 1 4 5 9 1.88195666830186 2.64755416462268 -0.765597496320815 C:G C G 10 0.529510832924535 0.742993974261161 ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5089674_5089863:JAK2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 5774225 T/G 1 10 13 23 4.70489167075465 6.88364082801896 -2.17874915726431 T:G T G 10 0.529510832924535 0.407596227656326 ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 5968416 A/G 1 48 49 97 22.5834800196223 25.9460308133022 -3.3625507936799 A:G A G 10 0.529510832924535 0.542003168577016 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 18 21 39 8.46880500735837 11.1197274914152 -2.65092248405687 A:G A G 10 0.529510832924535 0.425404727751142 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 121 87 208 56.9291892161313 46.0674424644345 10.8617467516967 A:C C A 10 0.529510832924535 0.144566296770867 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 122 86 208 57.3996783832067 45.53793163151 11.8617467516967 T:G G T 10 0.529510832924535 0.109989501708963 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 15591372 T/A 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 A:T T A 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000164989:ENST00000297641:exon_15591364_15591554:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380689:exon_15591364_15591554:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380701:exon_15591364_15591554:C9orf93 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 20953049 A/G 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 A:G A G 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20952984_20953064:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20952984_20953064:KIAA1797 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 21816758 G/A 1 10 7 17 4.70489167075465 3.70657583047175 0.998315840282904 A:G G A 10 0.529510832924535 0.808990208344625 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 26892654 G/A 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26892411_26892802:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26892411_26892801:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26892257_26892785:C9orf82 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 32542204 A/G 1 30 35 65 14.1146750122639 18.5328791523587 -4.41820414009478 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.32028420500174 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 33318937 C/T 1 10 9 19 4.70489167075465 4.76559749632082 -0.0607058255661652 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000086102:ENST00000379540:exon_33318908_33319125:NFX1;ENSG00000086102:ENST00000379521:exon_33318908_33319125:NFX1;ENSG00000086102:ENST00000263220:exon_33318908_33319125:NFX1;ENSG00000086102:ENST00000318524:exon_33318908_33319125:NFX1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 33466219 A/C 1 16 14 30 7.52782667320744 7.41315166094349 0.114675012263948 A:C A C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33466069_33466223:NOL6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 33817964 C/T 1 7 8 15 3.29342416952825 4.23608666339628 -0.942662493868026 T:C C T 10 0.529510832924535 0.797047341083576 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 33941759 T/C 1 3 6 9 1.41146750122639 3.17706499754721 -1.76559749632082 T:C T C 10 0.529510832924535 0.321803815351283 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379225:exon_33941647_33941860:UBAP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 19 11 30 8.93929417443383 5.82461916216989 3.11467501226395 A:G A G 10 0.529510832924535 0.277439515962505 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 34017106 C/T 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000351580:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000412543:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000480885:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000459988:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000418786:exon_34017048_34017146:UBAP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 35077441 T/C 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C T C 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 35089403 G/A 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000165282:ENST00000298004:exon_35089377_35089447:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000474436:exon_35088687_35093577:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000378617:exon_35089377_35089447:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000465745:exon_35088690_35090281:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000341666:exon_35089377_35089447:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000361778:exon_35089377_35089447:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000491687:exon_35089377_35089447:PIGO HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 35105257 G/A 1 8 3 11 3.76391333660372 1.58853249877361 2.17538083783011 A:G G A 10 0.529510832924535 0.235512259698034 ENSG00000005238:ENST00000378566:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35104118_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35104120_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35104139_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000479357:exon_35104827_35105371:KIAA1539 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 35606884 G/A 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 A:G G A 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35606834_35606980:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35606834_35606980:TESK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 35650458 G/A 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 A:G G A 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650354_35650467:SIT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 13 10 23 6.11635917198104 5.29510832924535 0.821250842735695 T:C T C 10 0.529510832924535 0.835734692191848 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 35704150 C/T 1 127 117 244 59.7521242185841 61.9527674521706 -2.20064323358655 T:C C T 10 0.529510832924535 0.797729988301494 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35703988_35704171:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000464379:exon_35703988_35704171:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000466916:exon_35703988_35704190:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000465002:exon_35703988_35704412:TLN1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 35752124 G/A 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 A:G G A 10 0.529510832924535 0.556631979728114 ENSG00000107185:ENST00000456972:exon_35751953_35752142:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000378078:exon_35751953_35752142:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000496906:exon_35751953_35752142:RGP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 38395928 C/T 1 12 9 21 5.64587000490558 4.76559749632082 0.880272508584764 T:C C T 10 0.529510832924535 0.827993527930512 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 38396002 C/T 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 19 4 23 8.93929417443383 2.11804333169814 6.82125084273569 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00540275458652324 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 16 3 19 7.52782667320744 1.58853249877361 5.93929417443383 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00942790030879335 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 72897440 T/C 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 90265015 C/T 1 11 3 14 5.17538083783011 1.58853249877361 3.58684833905651 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0633528876970293 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469067:exon_90264836_90265426:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000475804:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000495281:exon_90264836_90265394:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000494010:exon_90264905_90265033:DAPK1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 93637015 C/T 1 27 12 39 12.7032075110376 6.35412999509442 6.34907751594313 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0530788807168481 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93636954_93637131:SYK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 93639973 G/C 1 32 20 52 15.0556533464149 10.5902166584907 4.46543668792418 C:G G C 10 0.529510832924535 0.266297797726572 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 93640009 G/A 1 43 17 60 20.231034184245 9.0016841597171 11.2293500245279 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00410594343239937 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 93641175 C/T 1 31 18 49 14.5851641793394 9.53119499264163 5.05396918669778 T:C C T 10 0.529510832924535 0.155177980603943 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 93641199 T/C 1 30 18 48 14.1146750122639 9.53119499264163 4.58348001962232 T:C T C 10 0.529510832924535 0.19605971311455 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 8 8 16 3.76391333660372 4.23608666339628 -0.472173326792561 A:C C A 10 0.529510832924535 0.80894998850296 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 95872854 G/A 1 25 19 44 11.7622291768866 10.0607058255662 1.70152335132046 A:G G A 10 0.529510832924535 0.652569387870209 ENSG00000165233:ENST00000375464:exon_95872850_95873003:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466409:exon_95872850_95874571:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000495641:exon_95872850_95873496:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466929:exon_95872850_95873003:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000468781:exon_95872850_95873003:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000490488:exon_95872850_95873003:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000498243:exon_95872850_95873469:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000475574:exon_95872850_95873003:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000488630:exon_95872174_95874571:C9orf89 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 100459578 T/C 1 16 29 45 7.52782667320744 15.3558141548115 -7.82798748160408 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0242277677132764 ENSG00000136936:ENST00000375128:exon_100459403_100459639:XPA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 101981009 C/T 1 23 25 48 10.8212508427357 13.2377708231134 -2.41651998037768 T:C C T 10 0.529510832924535 0.563536071188031 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101978708_101981118:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000319033:exon_101978708_101981118:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101979649_101981118:ALG2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 101984093 G/C 1 10 8 18 4.70489167075465 4.23608666339628 0.46880500735837 C:G G C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101983829_101984224:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101983829_101984238:ALG2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 106901546 G/A 1 30 29 59 14.1146750122639 15.3558141548115 -1.24113914254757 A:G G A 10 0.529510832924535 0.794845824631893 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106901420_106903690:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106901420_106903698:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106901420_106901932:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000493955:exon_106901420_106901933:SMC2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 16 22 38 7.52782667320744 11.6492383243398 -4.12141165113233 A:G G A 10 0.529510832924535 0.196062898787779 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 111641825 G/A 1 17 16 33 7.9983158402829 8.47217332679256 -0.473857486509656 A:G G A 10 0.529510832924535 0.863906691758278 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 111651620 A/T 1 9 13 22 4.23440250367918 6.88364082801896 -2.64923832433977 A:T A T 10 0.529510832924535 0.290191579780574 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111651612_111651673:IKBKAP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 111653574 C/G 1 6 6 12 2.82293500245279 3.17706499754721 -0.354129995094421 C:G C G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111653483_111653684:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111653483_111653684:IKBKAP HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 111727670 C/G 1 37 28 65 17.4080991817922 14.826303321887 2.58179585990522 C:G C G 10 0.529510832924535 0.537219938620727 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 111755008 C/T 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 T:C C T 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374593:exon_111754912_111755099:CTNNAL1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 113013734 A/C 1 975 865 1840 458.726937898578 458.026870479723 0.700067418855554 A:C A C 10 0.529510832924535 0.981371466834207 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113013638_113013742:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113013638_113013742:TXN HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 114125854 T/A 1 7 3 10 3.29342416952825 1.58853249877361 1.70489167075465 A:T T A 10 0.529510832924535 0.352283066981699 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 10 10 20 4.70489167075465 5.29510832924535 -0.5902166584907 T:C T C 10 0.529510832924535 0.82590918224165 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 114359624 C/A 0 8 0 8 3.76391333660372 0 3.76391333660372 C C 10 0.529510832924535 0.00858117377180446 ENSG00000106853:ENST00000309195:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374324:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000407693:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000333580:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000238248:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000422125:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374313:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374308:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000485319:exon_114359597_114359693:PTGR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 114411945 G/T 1 9 6 15 4.23440250367918 3.17706499754721 1.05733750613197 T:G G T 10 0.529510832924535 0.61671670096814 ENSG00000059769:ENST00000313525:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000463589:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000447096:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000436202:exon_114411733_114412203:DNAJC25 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 114694486 A/G 1 8 4 12 3.76391333660372 2.11804333169814 1.64587000490558 A:G A G 10 0.529510832924535 0.397734651849528 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114694450_114694639:UGCG HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 18 36 54 8.46880500735837 19.0623899852833 -10.5935849779249 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00406794923850984 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 115950156 G/A 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950073_115950179:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950073_115950179:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950073_115950179:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115948716_115950179:FKBP15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 115950706 A/C 1 3 5 8 1.41146750122639 2.64755416462268 -1.23608666339628 A:C A C 10 0.529510832924535 0.487573754416657 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950669_115950841:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115950669_115950771:FKBP15 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 39 30 69 18.3490775159431 15.8853249877361 2.46375252820708 A:G A G 10 0.529510832924535 0.62989339404706 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 117110046 C/T 1 19 22 41 8.93929417443383 11.6492383243398 -2.70994414990594 T:C C T 10 0.529510832924535 0.436035278715442 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117110004_117110180:AKNA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 16 15 31 7.52782667320744 7.94266249386803 -0.414835820660587 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 A:G G A 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 125 108 233 58.8111458844331 57.1871699558498 1.62397592858333 A:G A G 10 0.529510832924535 0.844191254605389 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 123850770 G/A 1 6 3 9 2.82293500245279 1.58853249877361 1.23440250367918 A:G G A 10 0.529510832924535 0.514634999402426 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123850574_123850821:CEP110 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 123860689 C/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123860664_123860850:CEP110 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 123886324 C/T 1 6 8 14 2.82293500245279 4.23608666339628 -1.41315166094349 T:C C T 10 0.529510832924535 0.594278475296019 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373851:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123886209_123886362:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123886209_123886362:CEP110 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 123917020 T/A 1 2 12 14 0.94097833415093 6.35412999509442 -5.41315166094349 A:T T A 10 0.529510832924535 0.0052689787515052 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 123935818 C/T 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 T:C C T 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 28 21 49 13.173696678113 11.1197274914152 2.05396918669778 A:G G A 10 0.529510832924535 0.570979763485987 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 130566960 C/T 1 45 40 85 21.1720125183959 21.1804333169814 -0.00842079858547606 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000136877:ENST00000479147:exon_130566915_130566979:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000479375:exon_130566915_130566979:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373247:exon_130566915_130566979:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373245:exon_130566915_130566979:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000393706:exon_130566915_130566979:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373244:exon_130566915_130566979:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000488307:exon_130566915_130566979:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373228:exon_130566915_130566979:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000460181:exon_130566915_130566979:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000475765:exon_130566915_130566979:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000496586:exon_130566915_130566979:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373225:exon_130566915_130566979:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000431857:exon_130566915_130566979:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000423577:exon_130566915_130566979:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000469310:exon_130566915_130567136:FPGS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 79 57 136 37.1686441989617 30.1821174766985 6.98652672226323 C:G G C 10 0.529510832924535 0.264059938633785 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 82 56 138 38.5801117001881 29.652606643774 8.92750505641416 A:G A G 10 0.529510832924535 0.146918646476264 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 130707081 A/G 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 A:G A G 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130707056_130707177:FAM102A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 131020066 C/G 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 C:G C G 10 0.529510832924535 0.159283336846293 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 9 18 27 4.23440250367918 9.53119499264163 -5.29679248896245 A:C:G A G 10 0.529510832924535 0.0526074098364202 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 131285955 A/G 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 A:G A G 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131285927_131286125:GLE1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 131396527 A/T 1 74 109 183 34.8161983635844 57.7166807887743 -22.9004824251899 A:T A T 10 0.529510832924535 0.000817458188138098 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131396505_131396662:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131396505_131396662:WDR34 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 131483741 G/A 1 38 22 60 17.8785883488677 11.6492383243398 6.2293500245279 A:G G A 10 0.529510832924535 0.120907730941482 ENSG00000160446:ENST00000372663:exon_131483148_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372672:exon_131483699_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372667:exon_131483149_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000467312:exon_131483159_131483759:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372664:exon_131483700_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000452105:exon_131483676_131483809:ZDHHC12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 131515547 G/T 1 5 3 8 2.35244583537732 1.58853249877361 0.76391333660372 T:G G T 10 0.529510832924535 0.730352777445792 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131515443_131515879:ZER1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 131772127 G/A 1 28 20 48 13.173696678113 10.5902166584907 2.58348001962232 A:G G A 10 0.529510832924535 0.47366272178497 ENSG00000148341:ENST00000372564:exon_131772050_131772150:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000479237:exon_131772050_131772150:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372559:exon_131772050_131772150:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372554:exon_131772050_131772150:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000461811:exon_131772050_131772150:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000417224:exon_131772050_131772150:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000416629:exon_131772050_131772150:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000455407:exon_131772050_131772150:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000483980:exon_131772015_131772150:SH3GLB2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 131849036 C/T 1 8 3 11 3.76391333660372 1.58853249877361 2.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.235512259698034 ENSG00000167130:ENST00000372546:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000406974:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000327812:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000412363:exon_131848988_131849077:DOLPP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 131909736 C/T 1 53 42 95 24.9359258549996 22.2394549828305 2.69647087216917 T:C C T 10 0.529510832924535 0.608388408177302 ENSG00000119383:ENST00000358994:exon_131909666_131911223:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000393370:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000524946:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000337738:exon_131909666_131911223:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000348141:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000405725:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000347048:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000357197:exon_131909666_131911224:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000355007:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000423100:exon_131909666_131910277:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000414510:exon_131909666_131910566:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000419582:exon_131909666_131910236:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000432651:exon_131909666_131910285:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000435132:exon_131909666_131910051:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000434095:exon_131909666_131910274:PPP2R4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 12 14 26 5.64587000490558 7.41315166094349 -1.76728165603791 A:G G A 10 0.529510832924535 0.557753688524909 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 132401752 C/T 1 5 4 9 2.35244583537732 2.11804333169814 0.234402503679185 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132401681_132401787:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132401681_132401787:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132401681_132401787:ASB6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 132594180 T/C 1 118 131 249 55.5177217149049 69.3659191131141 -13.8481973982092 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0863722299555574 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461539:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000492991:exon_132594175_132594252:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000495934:exon_132594174_132594251:C9orf78 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 132638424 C/T 1 6 11 17 2.82293500245279 5.82461916216989 -3.0016841597171 T:C C T 10 0.529510832924535 0.154173856512779 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000496927:exon_132638409_132638517:USP20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 132638496 C/T 1 6 7 13 2.82293500245279 3.70657583047175 -0.883640828018956 T:C C T 10 0.529510832924535 0.782760397275129 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000496927:exon_132638409_132638517:USP20 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 134053722 C/T 1 6 2 8 2.82293500245279 1.05902166584907 1.76391333660372 T:C C T 10 0.529510832924535 0.295900852930508 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134053698_134053797:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134053698_134053797:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134053698_134053797:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134053698_134053797:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000526346:exon_134053698_134053797:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000531929:exon_134053698_134053797:NUP214 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 135139901 T/C 1 44 48 92 20.7015233513205 25.4165199803777 -4.71499662905723 T:C T C 10 0.529510832924535 0.348022466264761 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 135150616 T/C 1 7 6 13 3.29342416952825 3.17706499754721 0.116359171981044 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000107290:ENST00000464133:exon_135150310_135150807:SETX HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 135172412 A/G 1 3 7 10 1.41146750122639 3.70657583047175 -2.29510832924535 A:G A G 10 0.529510832924535 0.206417065723492 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135172274_135172441:SETX HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 135173685 T/C 1 8 9 17 3.76391333660372 4.76559749632082 -1.0016841597171 T:C T C 10 0.529510832924535 0.637013022123958 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135173467_135173699:SETX HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 135202829 T/C 1 3 8 11 1.41146750122639 4.23608666339628 -2.82461916216989 T:C T C 10 0.529510832924535 0.129310521443327 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 135203409 A/C 1 7 7 14 3.29342416952825 3.70657583047175 -0.413151660943491 A:C A C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 135203838 G/A 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 135254512 C/T 1 9 11 20 4.23440250367918 5.82461916216989 -1.5902166584907 T:C C T 10 0.529510832924535 0.508807175217642 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135254446_135254531:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000461970:exon_135254446_135254592:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135254446_135254531:TTF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 135273607 C/G 1 12 21 33 5.64587000490558 11.1197274914152 -5.47385748650966 C:G C G 10 0.529510832924535 0.079604682567306 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135273528_135273713:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135273528_135273713:TTF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 135277341 C/A 1 53 58 111 24.9359258549996 30.711628309623 -5.77570245462339 A:C C A 10 0.529510832924535 0.29594039523583 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 135470414 T/C 1 13 17 30 6.11635917198104 9.0016841597171 -2.88532498773605 T:C T C 10 0.529510832924535 0.361005199197405 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 47 28 75 22.1129908525469 14.826303321887 7.28668753065987 A:G G A 10 0.529510832924535 0.105166125245011 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 136217376 T/A 1 63 48 111 29.6408175257543 25.4165199803777 4.22429754537661 A:T:C T A 10 0.529510832924535 0.447742585189330 ENSG00000148303:ENST00000463740:exon_136217095_136217582:RPL7A HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 136219594 G/A 1 58 58 116 27.288371690377 30.711628309623 -3.42325661924607 A:T:G G A 10 0.529510832924535 0.577008612953101 ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136219549_136219621:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000495952:exon_136219549_136219621:SURF1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 12 11 23 5.64587000490558 5.82461916216989 -0.178749157264306 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139100805 T/C 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C T C 10 0.529510832924535 1 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139098179_139101121:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139098185_139101121:QSOX2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139100882 G/T 1 12 3 15 5.64587000490558 1.58853249877361 4.05733750613197 T:G G T 10 0.529510832924535 0.0398320046822122 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139098179_139101121:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139098185_139101121:QSOX2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139270975 C/T 1 14 5 19 6.58684833905651 2.64755416462268 3.93929417443383 T:C C T 10 0.529510832924535 0.105354482370937 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 50 45 95 23.5244583537732 23.8279874816041 -0.303529127830828 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 13 16 29 6.11635917198104 8.47217332679256 -2.35581415481152 T:C C T 10 0.529510832924535 0.457889314355892 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139275204 A/C 1 8 9 17 3.76391333660372 4.76559749632082 -1.0016841597171 A:C A C 10 0.529510832924535 0.637013022123958 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139275294 G/C 1 5 6 11 2.35244583537732 3.17706499754721 -0.824619162169885 C:G G C 10 0.529510832924535 0.765231830293731 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139279173 G/A 1 8 7 15 3.76391333660372 3.70657583047175 0.0573375061319741 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139279172_139279266:SNAPC4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139289825 A/G 1 7 9 16 3.29342416952825 4.76559749632082 -1.47217332679256 A:G A G 10 0.529510832924535 0.617975933604282 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139289750_139289875:SNAPC4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139298580 C/T 1 29 23 52 13.6441858451885 12.1787491572643 1.46543668792418 T:C C T 10 0.529510832924535 0.781492453927733 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 22 19 41 10.3507616756602 10.0607058255662 0.290055850094063 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139299637 C/T 1 19 25 44 8.93929417443383 13.2377708231134 -4.29847664867954 T:C C T 10 0.529510832924535 0.227322916822683 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139299543_139299800:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139299570_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139299570_139299654:SDCCAG3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139301583 T/C 1 6 8 14 2.82293500245279 4.23608666339628 -1.41315166094349 T:C T C 10 0.529510832924535 0.594278475296019 ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139301398_139301660:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139621326 G/A 1 16 3 19 7.52782667320744 1.58853249877361 5.93929417443383 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00942790030879335 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 39 34 73 18.3490775159431 18.0033683194342 0.345709196508942 A:G A G 10 0.529510832924535 1 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139732331 G/C 1 42 46 88 19.7605450171695 24.3574983145286 -4.59695329735909 C:G G C 10 0.529510832924535 0.338153077105492 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139732314_139732432:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139732314_139732467:C9orf86 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139744453 C/T 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000054148:ENST00000463215:exon_139744231_139744589:PHPT1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139820421 G/A 1 33 35 68 15.5261425134903 18.5328791523587 -3.00673663886838 A:G G A 10 0.529510832924535 0.469202339815713 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139835652 C/T 1 5 5 10 2.35244583537732 2.64755416462268 -0.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139983339 A/G 1 2 6 8 0.94097833415093 3.17706499754721 -2.23608666339628 A:G A G 10 0.529510832924535 0.159283336846293 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_139983321_139983457:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000371587:exon_139983321_139983457:MAN1B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139994161 T/C 1 4 10 14 1.88195666830186 5.29510832924535 -3.41315166094349 T:C T C 10 0.529510832924535 0.105177291482310 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_139994148_139994333:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000371587:exon_139994148_139994333:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_139994148_139994333:MAN1B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 139994278 C/T 1 11 7 18 5.17538083783011 3.70657583047175 1.46880500735837 T:C C T 10 0.529510832924535 0.638208767464486 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_139994148_139994333:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000371587:exon_139994148_139994333:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_139994148_139994333:MAN1B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 140001180 A/G 1 12 20 32 5.64587000490558 10.5902166584907 -4.94434665358512 A:G A G 10 0.529510832924535 0.109594536031492 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140001141_140001261:MAN1B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 140001194 G/A 1 13 15 28 6.11635917198104 7.94266249386803 -1.82630332188698 A:G G A 10 0.529510832924535 0.571481182501315 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140001141_140001261:MAN1B1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 360 391 751 169.376100147167 207.038735673493 -37.6626355263258 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00609744468362349 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 140007492 G/A 1 86 82 168 40.46206836849 43.4198882998119 -2.95781993132189 A:G G A 10 0.529510832924535 0.699297337075304 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140007405_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140007405_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140007405_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140007405_140007564:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140007405_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140007405_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140007405_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000460830:exon_140007405_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000482088:exon_140007269_140007571:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140007415_140007571:DPP7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 140007716 T/C 1 48 62 110 22.5834800196223 32.8296716413212 -10.2461916216989 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0559055907283101 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140007658_140007739:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140007658_140007739:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140007658_140007739:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140007658_140007739:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000482088:exon_140007658_140007739:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140007658_140007739:DPP7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 140007915 C/T 1 37 24 61 17.4080991817922 12.7082599901888 4.69983919160336 T:C C T 10 0.529510832924535 0.24970604888409 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140007813_140007948:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140007809_140007948:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140007813_140007948:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140007827_140008167:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140007886_140007948:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140007886_140007948:DPP7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 140100224 A/G 1 8 13 21 3.76391333660372 6.88364082801896 -3.11972749141524 A:G A G 10 0.529510832924535 0.194145459913548 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 140135784 C/A 1 40 27 67 18.8195666830186 14.2967924889624 4.52277419405615 A:C C A 10 0.529510832924535 0.274083100899564 ENSG00000188229:ENST00000340384:exon_140135665_140135869:TUBB2C HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 34 55 89 15.9966316805658 29.1230958108494 -13.1264641302836 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00565353679144288 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 140262426 C/T 1 14 15 29 6.58684833905651 7.94266249386803 -1.35581415481152 T:C C T 10 0.529510832924535 0.71082694647542 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140262017_140262441:EXD3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 140267490 G/A 1 7 9 16 3.29342416952825 4.76559749632082 -1.47217332679256 A:G G A 10 0.529510832924535 0.617975933604282 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140267357_140267524:EXD3 HGDP00955_parsed_pileup.txt . 9 140477032 T/C 1 75 80 155 35.2866875306599 42.3608666339628 -7.07417910330293 T:C T C 10 0.529510832924535 0.260924609994018 ENSG00000165724:ENST00000298585:exon_140476531_140477138:ZMYND19 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 229493 G/A 1 20 24 44 9.4097833415093 12.7082599901888 -3.29847664867954 A:G G A 10 0.529510832924535 0.365753629684787 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 295069 A/G 1 48 11 59 22.5834800196223 5.82461916216989 16.7588608574524 A:G A G 10 0.529510832924535 9.67569308635092e-06 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 295097 C/T 1 53 12 65 24.9359258549996 6.35412999509442 18.5817958599052 T:C C T 10 0.529510832924535 2.30143217031293e-06 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 44 5 49 20.7015233513205 2.64755416462268 18.0539691866978 T:C T C 10 0.529510832924535 5.60785384117787e-08 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 299360 G/A 1 46 6 52 21.6425016854714 3.17706499754721 18.4654366879242 A:G G A 10 0.529510832924535 7.24928765331167e-08 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 322257 G/A 1 4 4 8 1.88195666830186 2.11804333169814 -0.23608666339628 A:G G A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 1471138 G/T 1 13 13 26 6.11635917198104 6.88364082801896 -0.767281656037911 T:G G T 10 0.529510832924535 0.845219179890685 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 1497644 G/C 1 69 55 124 32.4637525282071 29.1230958108494 3.34065671735765 C:G G C 10 0.529510832924535 0.58974911036751 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1497552_1497657:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1497552_1497657:IL3RA HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 78 114 192 36.6981550318863 60.364234953397 -23.6660799215107 T:C C T 10 0.529510832924535 0.000655796226218376 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 2139200 T/C 1 8 5 13 3.76391333660372 2.64755416462268 1.11635917198104 T:C T C 10 0.529510832924535 0.589735300550817 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 128 77 205 60.2226133856595 40.7723341351892 19.4502792504703 T:C C T 10 0.529510832924535 0.00769105631403235 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 2644302 C/T 1 61 52 113 28.6998391916034 27.5345633120758 1.16527587952754 T:C C T 10 0.529510832924535 0.850956067064281 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 2644323 C/T 1 55 72 127 25.8769041891506 38.1247799705665 -12.2478757814159 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0326800012580801 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 15838366 C/T 1 3 7 10 1.41146750122639 3.70657583047175 -2.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 0.206417065723492 ENSG00000169249:ENST00000307771:exon_15838330_15838439:ZRSR2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 38147170 C/T 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000156313:ENST00000309513:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000339363:exon_38146347_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000338898:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000482855:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000318842:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000342811:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000378505:exon_38147114_38147294:RPGR HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 40460040 T/C 1 34 17 51 15.9966316805658 9.0016841597171 6.99494752084871 T:C T C 10 0.529510832924535 0.0507087417282161 ENSG00000182220:ENST00000378438:exon_40460014_40460133:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000486558:exon_40460014_40460133:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000447485:exon_40460014_40460128:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000423649:exon_40460014_40460133:ATP6AP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 46472826 G/A 1 7 11 18 3.29342416952825 5.82461916216989 -2.53119499264163 A:G G A 10 0.529510832924535 0.247634630922160 ENSG00000065923:ENST00000328306:exon_46472724_46472829:SLC9A7;ENSG00000065923:ENST00000464933:exon_46472724_46472829:SLC9A7;ENSG00000065923:ENST00000491894:exon_46472724_46472829:SLC9A7 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 47065473 C/G 1 446 201 647 209.838168515657 106.431677417832 103.406491097826 C:G C G 10 0.529510832924535 1.46857506173231e-16 ENSG00000130985:ENST00000377351:exon_47065347_47065512:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000335972:exon_47065347_47065512:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000431324:exon_47065347_47065512:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000424033:exon_47065347_47065512:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377271:exon_47065347_47065512:UBA1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 47662972 T/G 0 0 13 13 0 6.88364082801896 -6.88364082801896 G T G 10 0.529510832924535 5.53535104229664e-05 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 47663200 G/A 0 0 8 8 0 4.23608666339628 -4.23608666339628 A G A 10 0.529510832924535 0.00240102690507337 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 48317386 A/G 1 200 81 281 94.097833415093 42.8903774668873 51.2074559482057 A:G A G 10 0.529510832924535 5.05575061730882e-10 ENSG00000017483:ENST00000376876:exon_48316920_48317420:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000376875:exon_48316922_48317420:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000317669:exon_48316928_48317420:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000462359:exon_48317076_48317420:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000453124:exon_48317346_48317420:SLC38A5 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 48382174 G/T 1 44 108 152 20.7015233513205 57.1871699558498 -36.4856466045293 T:G G T 10 0.529510832924535 2.57373610682016e-09 ENSG00000147155:ENST00000495186:exon_48382087_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000498425:exon_48382142_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000446158:exon_48382087_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000414061:exon_48382087_48382460:EBP HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 48418126 A/G 1 4 8 12 1.88195666830186 4.23608666339628 -2.35412999509442 A:G A G 10 0.529510832924535 0.247834349729258 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000481090:exon_48418002_48418274:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 48418659 G/A 1 5 11 16 2.35244583537732 5.82461916216989 -3.47217332679256 A:G G A 10 0.529510832924535 0.130420532691613 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 48932930 C/T 1 25 9 34 11.7622291768866 4.76559749632082 6.99663168056581 T:C C T 10 0.529510832924535 0.0163222039550056 ENSG00000196998:ENST00000465806:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000376372:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000470270:exon_48932814_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000486337:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000322995:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000356463:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000485908:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000367375:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000433252:exon_48932345_48933124:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000376368:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000396681:exon_48932795_48932940:WDR45;ENSG00000196998:ENST00000474217:exon_48932795_48933033:WDR45 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 51645065 G/C 1 5 8 13 2.35244583537732 4.23608666339628 -1.88364082801896 C:G G C 10 0.529510832924535 0.406366482999609 ENSG00000179222:ENST00000494718:exon_51644649_51645450:MAGED1;ENSG00000179222:ENST00000473931:exon_51644649_51645450:MAGED1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 53430830 A/G 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 A:G A G 10 0.529510832924535 0.565981457468987 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 54471028 A/G 1 68 21 89 31.9932633611316 11.1197274914152 20.8735358697164 A:G A G 10 0.529510832924535 6.07630137227634e-06 ENSG00000158526:ENST00000375151:exon_54470849_54471920:TSR2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 55479299 G/A 1 54 16 70 25.4064150220751 8.47217332679256 16.9342416952825 A:G G A 10 0.529510832924535 3.61578196457167e-05 ENSG00000187601:ENST00000342972:exon_55478538_55479998:MAGEH1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 57475132 T/C 1 5 7 12 2.35244583537732 3.70657583047175 -1.35412999509442 T:C T C 10 0.529510832924535 0.565981457468987 ENSG00000165591:ENST00000374900:exon_57474957_57475151:FAAH2;ENSG00000165591:ENST00000491179:exon_57475115_57475151:FAAH2;ENSG00000165591:ENST00000465623:exon_57474957_57475151:FAAH2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 69550080 A/G 1 7 1 8 3.29342416952825 0.529510832924535 2.76391333660372 A:G A G 10 0.529510832924535 0.0741292491828888 ENSG00000090889:ENST00000374388:exon_69550007_69550182:KIF4A;ENSG00000090889:ENST00000374403:exon_69550007_69550182:KIF4A HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 69572490 C/T 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 T:C C T 10 0.529510832924535 1 ENSG00000090889:ENST00000374388:exon_69572450_69572506:KIF4A;ENSG00000090889:ENST00000374403:exon_69572450_69572506:KIF4A HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 70352767 C/T 1 6 4 10 2.82293500245279 2.11804333169814 0.70489167075465 T:C C T 10 0.529510832924535 0.758162898033516 ENSG00000184634:ENST00000333646:exon_70352695_70352806:MED12;ENSG00000184634:ENST00000374102:exon_70352695_70352806:MED12;ENSG00000184634:ENST00000374080:exon_70352695_70352806:MED12;ENSG00000184634:ENST00000430072:exon_70352695_70352806:MED12;ENSG00000184634:ENST00000439750:exon_70352695_70352806:MED12 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 71416721 C/T 1 111 47 158 52.2242975453766 24.8870091474531 27.3372883979235 T:C C T 10 0.529510832924535 1.01968209877978e-05 ENSG00000102309:ENST00000373662:exon_71416635_71416951:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000218432:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000423432:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000373669:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000475071:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000439980:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000496835:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000446576:exon_71416635_71417204:PIN4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 71549512 G/C 1 59 13 72 27.7588608574524 6.88364082801896 20.8752200294335 C:G G C 10 0.529510832924535 3.58624350231114e-07 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71549366_71549559:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71549367_71549926:HDAC8 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 73047284 T/C 1 20 40 60 9.4097833415093 21.1804333169814 -11.7706499754721 T:C T C 10 0.529510832924535 0.00270014882518626 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 76937963 G/C 1 112 38 150 52.6947867124521 20.1214116511323 32.5733750613197 C:G G C 10 0.529510832924535 6.6171016039096e-08 ENSG00000085224:ENST00000373344:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000395603:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000480283:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000395605:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000343347:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000400862:exon_76937807_76938943:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000400861:exon_76937807_76938943:ATRX HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 77528317 G/A 1 2 7 9 0.94097833415093 3.70657583047175 -2.76559749632082 A:G G A 10 0.529510832924535 0.0935246236081911 ENSG00000173198:ENST00000373304:exon_77526961_77529270:CYSLTR1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 78216024 A/C 1 41 32 73 19.2900558500941 16.9443466535851 2.34570919650894 A:C A C 10 0.529510832924535 0.639685318646434 ENSG00000078589:ENST00000171757:exon_78216005_78217451:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000475374:exon_78216005_78216577:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000461541:exon_78216005_78216368:P2RY10 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 100265552 T/A 1 17 9 26 7.9983158402829 4.76559749632082 3.23271834396209 A:T T A 10 0.529510832924535 0.24086494409280 ENSG00000188917:ENST00000490509:exon_100265374_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000372939:exon_100264339_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000372935:exon_100264531_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000372936:exon_100264531_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000338687:exon_100264548_100265696:TRMT2B HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 119590533 T/A 0 10 0 10 4.70489167075465 0 4.70489167075465 T T 10 0.529510832924535 0.00226429167281657 ENSG00000005893:ENST00000434600:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000200639:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371335:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371345:exon_119590506_119590624:LAMP2 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 129201179 C/T 1 7 4 11 3.29342416952825 2.11804333169814 1.17538083783011 T:C C T 10 0.529510832924535 0.556631979728114 ENSG00000102034:ENST00000335997:exon_129198849_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000455513:exon_129198849_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000308167:exon_129198903_129201500:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000527455:exon_129198903_129201500:ELF4 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 134421168 C/T 1 4 6 10 1.88195666830186 3.17706499754721 -1.29510832924535 T:C C T 10 0.529510832924535 0.531350440107521 ENSG00000186376:ENST00000370766:exon_134419720_134421778:ZNF75D;ENSG00000186376:ENST00000439821:exon_134419720_134421778:ZNF75D;ENSG00000186376:ENST00000370764:exon_134419724_134421778:ZNF75D;ENSG00000186376:ENST00000469456:exon_134420812_134421778:ZNF75D HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 153215839 G/A 1 11 25 36 5.17538083783011 13.2377708231134 -8.06238998528326 A:G G A 10 0.529510832924535 0.00745490378660646 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000444191:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153215694_153215994:HCFC1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 153577719 G/A 1 8 14 22 3.76391333660372 7.41315166094349 -3.64923832433977 A:G G A 10 0.529510832924535 0.137310126362436 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 153631033 G/T 1 21 15 36 9.88027250858476 7.94266249386803 1.93761001471674 T:G G T 10 0.529510832924535 0.617249536501202 ENSG00000013563:ENST00000393638:exon_153629579_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369809:exon_153629579_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000014935:exon_153630099_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369808:exon_153630099_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369807:exon_153630099_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000309585:exon_153630102_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000497242:exon_153630828_153631531:DNASE1L1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 154020114 C/A 1 6 5 11 2.82293500245279 2.64755416462268 0.175380837830115 A:C C A 10 0.529510832924535 1 ENSG00000130830:ENST00000369534:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000413259:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000439370:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000393531:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000393529:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000417435:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000488694:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000369531:exon_154020044_154020122:MPP1;ENSG00000130830:ENST00000471821:exon_154019906_154020122:MPP1 HGDP00955_parsed_pileup.txt . X 154507173 T/G 1 4 24 28 1.88195666830186 12.7082599901888 -10.826303321887 T:G T G 10 0.529510832924535 3.18122148580669e-05 ENSG00000155962:ENST00000369449:exon_154505500_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000422096:exon_154505526_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000360485:exon_154505526_154507353:CLIC2