INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 881627 G/A 1 36 46 82 16.9718386269481 24.3137617544552 -7.34192312750706 A:G G A 10 0.52856003814033 0.121161575027592 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 1139565 G/A 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000186891:ENST00000379268:exon_1139414_1139616:TNFRSF18;ENSG00000186891:ENST00000486728:exon_1139414_1139616:TNFRSF18;ENSG00000186891:ENST00000379265:exon_1139435_1139616:TNFRSF18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 1147422 C/T 1 6 10 16 2.82863977115802 5.2856003814033 -2.45696061024528 T:C C T 10 0.52856003814033 0.316716189138101 ENSG00000186827:ENST00000379236:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000497869:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000379234:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000453580:exon_1147399_1147518:TNFRSF4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 1390875 C/T 0 13 0 13 6.12871950417571 0 6.12871950417571 C C 10 0.52856003814033 0.000308145002435499 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000475091:exon_1390840_1390899:ATAD3C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 12 6 18 5.65727954231604 3.17136022884198 2.48591931347406 A:C C A 10 0.52856003814033 0.345436270087802 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 24 19 43 11.3145590846321 10.0426407246663 1.27191835996581 T:C T C 10 0.52856003814033 0.76110615007255 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 1455586 C/T 1 5 8 13 2.35719980929835 4.22848030512264 -1.87128049582429 T:C C T 10 0.52856003814033 0.406604439196984 ENSG00000197785:ENST00000378756:exon_1455521_1455686:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000378759:exon_1455521_1455686:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000378755:exon_1455521_1455686:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000339113:exon_1455521_1455686:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000429957:exon_1455521_1455686:ATAD3A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 80 68 148 37.7151969487736 35.9420825935424 1.77311435523115 A:T:G A G 10 0.52856003814033 0.805175175454713 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 56 30 86 26.4006378641415 15.8568011442099 10.5438367199316 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0233703832345653 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 36 20 56 16.9718386269481 10.5712007628066 6.40063786414152 T:C C T 10 0.52856003814033 0.107528635410247 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 2441358 T/C 1 10 8 18 4.7143996185967 4.22848030512264 0.485919313474059 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2441232_2441369:PANK4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 16 29 45 7.54303938975472 15.3282411060696 -7.78520171631485 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0243623251603122 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 3701663 T/C 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3701651_3701767:LRRC47 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 3713027 G/A 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 A:G G A 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3712426_3713068:LRRC47 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 3761479 C/T 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494951:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378223:exon_3761471_3761547:KIAA0562 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 20 15 35 9.4287992371934 7.92840057210495 1.50039866508845 A:G A G 10 0.52856003814033 0.735465815093857 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 7909737 C/T 0 0 56 56 0 29.5993621358585 -29.5993621358585 T C T 10 0.52856003814033 5.15083935551402e-19 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000400910:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000361696:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7909700_7909743:UTS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 7913430 G/A 0 39 0 39 18.3861585125271 0 18.3861585125271 G G 10 0.52856003814033 2.40806790576631e-11 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7913367_7913572:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7913367_7913491:UTS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 11731448 G/A 1 8 6 14 3.77151969487736 3.17136022884198 0.60015946603538 A:G G A 10 0.52856003814033 0.795264899593225 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11731323_11731449:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11731323_11731449:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11731323_11731449:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11731323_11731449:FBXO6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 17 19 36 8.01447935161439 10.0426407246663 -2.02816137305188 A:G A G 10 0.52856003814033 0.509527565956857 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 12252955 T/G 1 4 8 12 1.88575984743868 4.22848030512264 -2.34272045768396 T:G T G 10 0.52856003814033 0.248143449837288 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 42 41 83 19.8004783981061 21.6709615637535 -1.87048316564739 A:G G A 10 0.52856003814033 0.741813380252724 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 26 22 48 12.2574390083514 11.6283208390873 0.629118169264158 A:G A G 10 0.52856003814033 0.885992388491449 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 14143003 A/G 1 3 10 13 1.41431988557901 5.2856003814033 -3.87128049582429 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0481210508977837 ENSG00000116731:ENST00000376048:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000503842:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000505823:exon_14142922_14143065:PRDM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 15755248 C/T 1 111 67 178 52.3298357664234 35.4135225554021 16.9163132110213 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0130105648321827 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 15905501 G/A 1 9 1 10 4.24295965673703 0.52856003814033 3.7143996185967 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0235047864407302 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15905354_15905549:AGMAT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 15909744 C/T 1 1 9 10 0.47143996185967 4.75704034326297 -4.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00832466243874547 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 15909850 C/G 1 9 11 20 4.24295965673703 5.81416041954363 -1.5712007628066 C:G C G 10 0.52856003814033 0.509501749881068 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 16056364 G/A 1 8 8 16 3.77151969487736 4.22848030512264 -0.456960610245281 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 16255644 C/T 1 12 7 19 5.65727954231604 3.69992026698231 1.95735927533373 T:C C T 10 0.52856003814033 0.491911774893767 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN;ENSG00000065526:ENST00000375753:exon_16254586_16255713:SPEN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 16262404 C/T 1 3 6 9 1.41431988557901 3.17136022884198 -1.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.322282730829835 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 16271260 G/A 1 13 16 29 6.12871950417571 8.45696061024528 -2.32824110606957 A:G G A 10 0.52856003814033 0.458172935319808 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16271192_16271334:ZBTB17 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 16577794 C/T 1 38 37 75 17.9147185506675 19.5567214111922 -1.64200286052475 T:C C T 10 0.52856003814033 0.729618709629515 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 16577908 G/C 1 29 30 59 13.6717588939304 15.8568011442099 -2.18504225027947 C:G G C 10 0.52856003814033 0.603341311792607 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 16641899 C/T 1 8 3 11 3.77151969487736 1.58568011442099 2.18583958045637 T:C C T 10 0.52856003814033 0.234946711874713 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16641664_16641930:FBXO42 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 17313656 C/T 1 14 14 28 6.60015946603538 7.39984053396462 -0.799681067929241 T:C C T 10 0.52856003814033 0.850610910526834 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313541_17313764:ATP13A2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 21268390 G/A 1 15 13 28 7.07159942789505 6.87128049582429 0.200318932070759 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000356916:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374927:exon_21267984_21268823:EIF4G3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 23419855 T/C 1 12 13 25 5.65727954231604 6.87128049582429 -1.21400095350825 T:C T C 10 0.52856003814033 0.691078714041608 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 35 21 56 16.5003986650884 11.0997608009469 5.40063786414152 T:C C T 10 0.52856003814033 0.180413979099018 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 35 6 41 16.5003986650884 3.17136022884198 13.3290384362465 T:C T C 10 0.52856003814033 2.44324216090228e-05 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 36 5 41 16.9718386269481 2.64280019070165 14.3290384362465 T:C C T 10 0.52856003814033 2.62240592909887e-06 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 24201094 G/C 1 20 12 32 9.4287992371934 6.34272045768396 3.08607877950944 C:G G C 10 0.52856003814033 0.293533111544821 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 24201109 C/T 1 21 8 29 9.90023919905307 4.22848030512264 5.67175889393043 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0402872063734771 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 19 10 29 8.95735927533373 5.2856003814033 3.67175889393043 A:G A G 10 0.52856003814033 0.195643304784761 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 7 7 14 3.30007973301769 3.69992026698231 -0.39984053396462 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 5 11 16 2.35719980929835 5.81416041954363 -3.45696061024528 T:C C T 10 0.52856003814033 0.130508776647043 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 11 15 26 5.18583958045637 7.92840057210495 -2.74256099164858 A:G G A 10 0.52856003814033 0.328203988236900 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 24201919 T/C 1 7 9 16 3.30007973301769 4.75704034326297 -1.45696061024528 T:C T C 10 0.52856003814033 0.618027034384742 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 24201920 T/C 1 7 10 17 3.30007973301769 5.2856003814033 -1.98552064838561 T:C T C 10 0.52856003814033 0.345083621048323 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 26608782 C/T 0 21 0 21 9.90023919905307 0 9.90023919905307 C C 10 0.52856003814033 1.66968084850035e-06 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26607819_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26608772_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26608773_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26608773_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26608775_26608846:UBXN11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 14 10 24 6.60015946603538 5.2856003814033 1.31455908463208 T:C C T 10 0.52856003814033 0.684625035844179 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 26610891 A/C 1 17 9 26 8.01447935161439 4.75704034326297 3.25743900835142 A:C A C 10 0.52856003814033 0.240423666471852 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26610853_26612032:UBXN11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 27676925 G/A 1 12 13 25 5.65727954231604 6.87128049582429 -1.21400095350825 A:C:G G A 10 0.52856003814033 0.691078714041608 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27676463_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27676463_27676976:SYTL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 27679797 A/G 1 20 22 42 9.4287992371934 11.6283208390873 -2.19952160189386 A:T:G A G 10 0.52856003814033 0.53839837659526 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 27679954 G/A 1 36 29 65 16.9718386269481 15.3282411060696 1.64359752087855 A:G G A 10 0.52856003814033 0.710918152525052 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 31 19 50 14.6146388176498 10.0426407246663 4.5719980929835 A:G A G 10 0.52856003814033 0.205415656212564 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 28209509 G/A 1 29 17 46 13.6717588939304 8.98552064838561 4.68623824554482 A:G G A 10 0.52856003814033 0.185226780899501 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 123 103 226 57.9871153087394 54.441683928454 3.54543138028541 T:G T G 10 0.52856003814033 0.641712000185697 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 29529699 T/C 1 12 7 19 5.65727954231604 3.69992026698231 1.95735927533373 T:C T C 10 0.52856003814033 0.491911774893767 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475773:exon_29529643_29529713:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463412:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000453185:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29529654_29529745:MECR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 10 8 18 4.7143996185967 4.22848030512264 0.485919313474059 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 79 116 195 37.2437569869139 61.3129644242783 -24.0692074373644 A:G A G 10 0.52856003814033 0.00070776996653505 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 36556867 C/T 1 14 4 18 6.60015946603538 2.11424015256132 4.48591931347406 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0357240121562821 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36556845_36556941:ADPRHL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 36557619 G/A 1 30 26 56 14.1431988557901 13.7425609916486 0.400637864141517 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36557511_36557695:ADPRHL2;ENSG00000116863:ENST00000468594:exon_36557511_36557695:ADPRHL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 36602943 C/T 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000054116:ENST00000462715:exon_36602182_36603579:TRAPPC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 36643685 C/A 1 62 51 113 29.2292776352995 26.9565619451568 2.27271569014271 A:C C A 10 0.52856003814033 0.706742759859965 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373148:exon_36643474_36643802:MAP7D1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 36643783 C/T 1 77 80 157 36.3008770631946 42.2848030512264 -5.98392598803181 T:C C T 10 0.52856003814033 0.338957751794032 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373148:exon_36643474_36643802:MAP7D1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 36752433 C/T 1 33 38 71 15.5575187413691 20.0852814493325 -4.52776270796343 T:C C T 10 0.52856003814033 0.287406631726009 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 36755040 C/G 1 56 67 123 26.4006378641415 35.4135225554021 -9.01288469126059 A:C:G C G 10 0.52856003814033 0.104956597852040 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36754661_36755365:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36754661_36755365:THRAP3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 36921371 G/T 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:G G T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000116898:ENST00000373116:exon_36921319_36921526:MRPS15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 28 27 55 13.2003189320708 14.2711210297889 -1.07080209771815 T:G G T 10 0.52856003814033 0.788563799907285 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 38338795 A/G 1 21 6 27 9.90023919905307 3.17136022884198 6.72887897021109 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0111195289261493 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 7 23 30 3.30007973301769 12.1568808772276 -8.8568011442099 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00145752405822285 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 40315888 A/T 1 3 6 9 1.41431988557901 3.17136022884198 -1.75704034326297 A:T A T 10 0.52856003814033 0.322282730829835 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000469476:exon_40315795_40315933:TRIT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 40349131 G/A 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40348990_40349145:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40348990_40349176:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40348990_40349183:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000491865:exon_40348990_40349152:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40348990_40349153:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40348990_40349147:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40348990_40349168:TRIT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 40768344 C/T 1 15 13 28 7.07159942789505 6.87128049582429 0.200318932070759 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000466267:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000427563:exon_40768293_40768481:COL9A2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 41493811 C/T 1 13 11 24 6.12871950417571 5.81416041954363 0.314559084632079 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000010803:ENST00000372597:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372596:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000337495:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372595:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000326197:exon_41492874_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361191:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361705:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397174:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397171:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000456518:exon_41492877_41493991:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000402904:exon_41492877_41493991:SCMH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 44137257 C/A 1 7 5 12 3.30007973301769 2.64280019070165 0.65727954231604 A:C C A 10 0.52856003814033 0.778794317245757 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44137176_44137546:KDM4A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 45218895 A/T 1 13 6 19 6.12871950417571 3.17136022884198 2.95735927533373 A:T A T 10 0.52856003814033 0.25018193083756 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 45224998 A/C 1 38 31 69 17.9147185506675 16.3853611823502 1.52935736831723 A:C:G A C 10 0.52856003814033 0.71975182441768 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45224878_45225020:KIF2C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 45226084 G/A 1 31 28 59 14.6146388176498 14.7996810679292 -0.185042250279471 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45225952_45226156:KIF2C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 45270024 G/C 1 4 8 12 1.88575984743868 4.22848030512264 -2.34272045768396 C:G G C 10 0.52856003814033 0.248143449837288 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45270011_45270451:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461769:exon_45270011_45270173:PLK3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 45340342 A/C 1 7 14 21 3.30007973301769 7.39984053396462 -4.09976080094693 A:C A C 10 0.52856003814033 0.0825740304514078 ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45340199_45340498:EIF2B3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 45444038 G/A 1 11 8 19 5.18583958045637 4.22848030512264 0.957359275333729 A:G G A 10 0.52856003814033 0.819137161107216 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000480675:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000477953:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372182:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000487532:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000497010:exon_45443987_45444132:EIF2B3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 45797505 C/G 1 17 22 39 8.01447935161439 11.6283208390873 -3.61384148747287 C:G C G 10 0.52856003814033 0.264633756928444 ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45797333_45797544:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45797333_45797755:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45797406_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45797419_45797758:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000466231:exon_45797442_45797521:MUTYH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 45973928 G/A 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 A:G G A 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000132763:ENST00000401061:exon_45973884_45974036:MMACHC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 3 11 14 1.41431988557901 5.81416041954363 -4.39984053396462 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0286627679013754 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 94 73 167 44.315356414809 38.5848827842441 5.73047363056488 A:G A G 10 0.52856003814033 0.394426552346355 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 101 81 182 47.6154361478267 42.8133630893667 4.80207305845993 T:C C T 10 0.52856003814033 0.504334821541162 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 62 100 162 29.2292776352995 52.856003814033 -23.6267261787335 A:C:G A G 10 0.52856003814033 0.000204879886021728 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 68 83 151 32.0579174064576 43.8704831656474 -11.8125657591898 T:C T C 10 0.52856003814033 0.060588803328617 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 6 7 13 2.82863977115802 3.69992026698231 -0.87128049582429 A:G A G 10 0.52856003814033 0.782861958075039 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 12 13 25 5.65727954231604 6.87128049582429 -1.21400095350825 A:G A G 10 0.52856003814033 0.691078714041608 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 78 76 154 36.7723170250543 40.1705628986651 -3.39824587361083 C:G G C 10 0.52856003814033 0.628350880987142 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 309 245 554 145.674948214638 129.497209344381 16.1777388702572 A:C:G C G 10 0.52856003814033 0.173386145850249 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 117 92 209 55.1584755375814 48.6275235089104 6.53095202867102 A:G G A 10 0.52856003814033 0.368884379518612 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 55188382 C/T 1 3 7 10 1.41431988557901 3.69992026698231 -2.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.206826979960111 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55188348_55188472:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55188348_55188472:TTC4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 62579907 C/T 0 0 9 9 0 4.75704034326297 -4.75704034326297 T C T 10 0.52856003814033 0.00115036997128126 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 65311262 G/A 1 8 1 9 3.77151969487736 0.52856003814033 3.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0418258618356361 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 17 15 32 8.01447935161439 7.92840057210495 0.086078779509438 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 75190452 C/T 1 24 9 33 11.3145590846321 4.75704034326297 6.55751874136911 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0234434275347925 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75190395_75190518:CRYZ HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 22 16 38 10.3716791609127 8.45696061024528 1.91471855066746 A:G A G 10 0.52856003814033 0.626753997525001 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 76227022 A/G 1 63 100 163 29.7007175971592 52.856003814033 -23.1552862168738 A:G A G 10 0.52856003814033 0.000291365107707733 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76226807_76227300:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76226807_76227055:ACADM HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 78178976 T/A 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 A:T T A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000077254:ENST00000477949:exon_78178885_78179193:USP33 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 2 8 10 0.94287992371934 4.22848030512264 -3.2856003814033 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0541817455657943 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 78408536 C/G 1 17 4 21 8.01447935161439 2.11424015256132 5.90023919905307 C:G C G 10 0.52856003814033 0.0141397657673816 ENSG00000162614:ENST00000330010:exon_78408146_78409576:NEXN;ENSG00000162614:ENST00000294624:exon_78408146_78409576:NEXN;ENSG00000162614:ENST00000334785:exon_78408146_78408909:NEXN;ENSG00000162614:ENST00000480732:exon_78408146_78408884:NEXN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 85724283 C/T 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 85742012 G/C 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 C:G G C 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000142867:ENST00000394761:exon_85741979_85742480:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000370580:exon_85741979_85742773:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000271015:exon_85741979_85742479:BCL10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 48 54 102 22.6291181692642 28.5422420595778 -5.91312389031366 A:G A G 10 0.52856003814033 0.275267165941375 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 94342564 C/A 1 125 119 244 58.9299952324587 62.8986445386993 -3.96864930624053 A:C C A 10 0.52856003814033 0.653618798756376 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 94343023 A/G 1 73 79 152 34.4151172157559 41.7562430130861 -7.34112579733016 A:T:G A G 10 0.52856003814033 0.255416837994532 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 94344716 C/T 1 9 8 17 4.24295965673703 4.22848030512264 0.0144793516143897 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 10 5 15 4.7143996185967 2.64280019070165 2.07159942789505 C:G G C 10 0.52856003814033 0.313640302764783 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 109479978 G/T 1 9 10 19 4.24295965673703 5.2856003814033 -1.04264072466627 T:G G T 10 0.52856003814033 0.653229248249193 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369969:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369968:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000348264:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000302500:exon_109479699_109480040:CLCC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 790 751 1541 372.437569869139 396.948588643388 -24.5110187742486 T:C C T 10 0.52856003814033 0.211320306602139 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 111957311 G/C 1 9 1 10 4.24295965673703 0.52856003814033 3.7143996185967 C:G G C 10 0.52856003814033 0.0235047864407302 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 113236681 C/T 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 T:C C T 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113236527_113236794:MOV10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 113239382 G/A 1 26 23 49 12.2574390083514 12.1568808772276 0.100558131123828 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113239361_113239468:MOV10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 24 35 59 11.3145590846321 18.4996013349116 -7.18504225027947 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0679407136347101 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 98 88 186 46.2011162622477 46.513283356349 -0.312167094101383 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 114372630 G/C 1 15 17 32 7.07159942789505 8.98552064838561 -1.91392122049056 C:G G C 10 0.52856003814033 0.596081373087417 ENSG00000134242:ENST00000359785:exon_114372571_114372651:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000528414:exon_114372571_114372651:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000532224:exon_114372571_114372651:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000420377:exon_114372571_114372651:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000525799:exon_114372571_114372651:PTPN22 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 114948281 A/G 1 23 20 43 10.8431191227724 10.5712007628066 0.271918359965808 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000476908:exon_114946948_114948381:TRIM33 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 117617705 A/G 1 5 14 19 2.35719980929835 7.39984053396462 -5.04264072466627 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0222839607838942 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 117618067 C/T 1 9 17 26 4.24295965673703 8.98552064838561 -4.74256099164858 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0765655389670701 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 144917546 A/G 0 8 0 8 3.77151969487736 0 3.77151969487736 A A 10 0.52856003814033 0.00853204551585355 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144917499_144917636:PDE4DIP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 144921924 G/A 0 10 0 10 4.7143996185967 0 4.7143996185967 G G 10 0.52856003814033 0.00224426647978634 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144921835_144922065:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000532801:exon_144921835_144922020:PDE4DIP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 144930940 T/C 0 9 0 9 4.24295965673703 0 4.24295965673703 T T 10 0.52856003814033 0.00437031847588073 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 144931087 T/C 0 14 0 14 6.60015946603538 0 6.60015946603538 T T 10 0.52856003814033 0.000159627258521305 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 1 10 17 27 4.7143996185967 8.98552064838561 -4.27112102978891 A:G G A 10 0.52856003814033 0.122832916601449 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 31 31 0 16.3853611823502 -16.3853611823502 C T C 10 0.52856003814033 7.52000590313430e-11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 18 18 0 9.51408068652594 -9.51408068652594 T G T 10 0.52856003814033 1.32335107082565e-06 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 12 12 0 6.34272045768396 -6.34272045768396 A C A 10 0.52856003814033 0.000120535983391860 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 35 0 35 16.5003986650884 0 16.5003986650884 G G 10 0.52856003814033 3.52858658631606e-10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 20 20 0 10.5712007628066 -10.5712007628066 C T C 10 0.52856003814033 2.94122236065611e-07 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 81 81 0 42.8133630893667 -42.8133630893667 T C T 10 0.52856003814033 3.5280751648418e-27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 99 0 99 46.6725562241073 0 46.6725562241073 C C 10 0.52856003814033 4.1477105406279e-28 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 38 40 78 17.9147185506675 21.1424015256132 -3.22768297494574 T:G G T 10 0.52856003814033 0.497128223205985 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 150445819 A/G 1 24 18 42 11.3145590846321 9.51408068652594 1.80047839810614 A:G A G 10 0.52856003814033 0.644219020860247 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 151260852 C/T 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000426871:exon_151259960_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000459919:exon_151260667_151260882:ZNF687 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 151372138 G/A 1 100 76 176 47.143996185967 40.1705628986651 6.97343328730192 A:G G A 10 0.52856003814033 0.326357468878889 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 151374025 T/C 1 309 265 574 145.674948214638 140.068410107187 5.60653810745058 T:C T C 10 0.52856003814033 0.645841523839515 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151374018_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151374018_151374410:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151373715_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000466425:exon_151374018_151374106:PSMB4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 151377693 T/C 1 27 14 41 12.7288789702111 7.39984053396462 5.32903843624647 T:C T C 10 0.52856003814033 0.117222018727854 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 151867560 G/A 1 7 5 12 3.30007973301769 2.64280019070165 0.65727954231604 A:G G A 10 0.52856003814033 0.778794317245757 ENSG00000159445:ENST00000368814:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000471464:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000344296:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000489410:exon_151867306_151867670:THEM4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 92 73 165 43.3724764910896 38.5848827842441 4.78759370684554 A:G A G 10 0.52856003814033 0.483214702460981 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 T:C T C 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 153941514 C/T 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000143578:ENST00000449724:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368607:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000271889:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000461688:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368601:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368603:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368600:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000479010:exon_153941406_153941787:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000492729:exon_153941406_153941931:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000473340:exon_153940998_153941830:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000431292:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000405694:exon_153941406_153941652:CREB3L4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 9 11 20 4.24295965673703 5.81416041954363 -1.5712007628066 C:G C G 10 0.52856003814033 0.509501749881068 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 154744852 A/G 1 9 10 19 4.24295965673703 5.2856003814033 -1.04264072466627 A:G A G 10 0.52856003814033 0.653229248249193 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 154918524 T/C 1 45 36 81 21.2147982836851 19.0281613730519 2.18663691063327 T:C T C 10 0.52856003814033 0.657377017239878 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368458:exon_154918510_154918548:PBXIP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 69 74 143 32.5293573683172 39.1134428223844 -6.58408545406719 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.27721621944025 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 155289545 T/G 1 2 13 15 0.94287992371934 6.87128049582429 -5.92840057210495 T:G T G 10 0.52856003814033 0.00290156009961604 ENSG00000160752:ENST00000492887:exon_155289402_155289676:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489324:exon_155289446_155289719:FDPS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 156697056 T/C 1 48 55 103 22.6291181692642 29.0708020977182 -6.44168392845399 T:C T C 10 0.52856003814033 0.236144884070772 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156696698_156698227:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156696698_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000496538:exon_156696698_156697178:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000470713:exon_156697003_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000469074:exon_156697034_156697600:ISG20L2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/C,G 0 0 10 10 0 5.2856003814033 -5.2856003814033 C:G A G 10 0.52856003814033 0.000542330375385347 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 199 181 380 93.8165524100743 95.6693669033997 -1.85281449332541 C:G G C 10 0.52856003814033 0.877527515242019 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 145 121 266 68.3587944696521 63.9557646149799 4.40302985467221 A:G A G 10 0.52856003814033 0.62332609009661 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 91 104 195 42.90103652923 54.9702439665943 -12.0692074373644 A:C C A 10 0.52856003814033 0.0854941066964467 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 80 94 174 37.7151969487736 49.684643585191 -11.9694466364174 A:T T A 10 0.52856003814033 0.0804302976738563 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 159024668 A/T 1 297 293 590 140.017668672322 154.868091175117 -14.8504225027947 A:T A T 10 0.52856003814033 0.231749254850417 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159024611_159024945:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159024611_159024918:IFI16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 160183288 G/A 1 31 23 54 14.6146388176498 12.1568808772276 2.45775794042218 A:G G A 10 0.52856003814033 0.586080176720939 ENSG00000162734:ENST00000360472:exon_160183212_160185166:PEA15;ENSG00000162734:ENST00000368077:exon_160183212_160183825:PEA15;ENSG00000162734:ENST00000368076:exon_160183212_160185166:PEA15;ENSG00000162734:ENST00000368075:exon_160183212_160184402:PEA15;ENSG00000162734:ENST00000488858:exon_160183212_160183507:PEA15;ENSG00000162734:ENST00000432157:exon_160183212_160184402:PEA15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 160461060 C/T 1 7 5 12 3.30007973301769 2.64280019070165 0.65727954231604 T:C C T 10 0.52856003814033 0.778794317245757 ENSG00000162739:ENST00000368059:exon_160460915_160461178:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368057:exon_160460915_160461178:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368055:exon_160460915_160461178:SLAMF6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 117 250 367 55.1584755375814 132.140009535082 -76.9815339975011 A:G G A 10 0.52856003814033 7.21969052388526e-16 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 161721707 C/T 1 2 7 9 0.94287992371934 3.69992026698231 -2.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.093882474099143 ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 43 34 77 20.2719183599658 17.9710412967712 2.30087706319459 A:G A G 10 0.52856003814033 0.648683367973408 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 163313539 C/T 1 7 8 15 3.30007973301769 4.22848030512264 -0.92840057210495 T:C C T 10 0.52856003814033 0.79709726410062 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163313523_163313613:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000531529:exon_163313523_163313605:NUF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 169762807 T/G 1 14 20 34 6.60015946603538 10.5712007628066 -3.97104129677122 T:G T G 10 0.52856003814033 0.2287009467528 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000454472:exon_169762283_169763038:C1orf156 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 169821135 C/T 1 1 7 8 0.47143996185967 3.69992026698231 -3.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0304181799638115 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 179051300 T/C 1 39 15 54 18.3861585125271 7.92840057210495 10.4577579404222 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0041148359878758 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179050512_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000367625:exon_179051205_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179051213_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179051221_179051522:TOR3A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 179319541 C/G 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179319431_179319566:SOAT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 179320578 A/G 1 14 17 31 6.60015946603538 8.98552064838561 -2.38536118235023 A:G A G 10 0.52856003814033 0.472618372786915 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179320452_179320597:SOAT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 180165699 A/C 1 28 30 58 13.2003189320708 15.8568011442099 -2.65648221213914 A:C A C 10 0.52856003814033 0.512614391541586 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180165397_180165734:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180165397_180173165:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180165397_180165734:QSOX1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 181058891 C/T 1 45 41 86 21.2147982836851 21.6709615637535 -0.456163280068385 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000162783:ENST00000367577:exon_181057638_181059977:IER5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 12 15 27 5.65727954231604 7.92840057210495 -2.27112102978891 A:G A G 10 0.52856003814033 0.442707659990859 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 184020945 G/A 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184020811_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184020813_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184020860_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184020867_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184020880_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184020894_184021024:TSEN15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 184023529 A/C 1 12 16 28 5.65727954231604 8.45696061024528 -2.79968106792924 A:C A C 10 0.52856003814033 0.345219155939412 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000457455:exon_184023495_184023569:TSEN15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 184765072 A/G 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 A:G A G 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 186316488 C/T 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186316424_186316590:TPR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 200635550 T/C 1 9 2 11 4.24295965673703 1.05712007628066 3.18583958045637 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0701714577429645 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 200635560 T/C 1 9 3 12 4.24295965673703 1.58568011442099 2.65727954231604 T:C T C 10 0.52856003814033 0.153869078916603 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 201844057 T/C 1 18 20 38 8.48591931347406 10.5712007628066 -2.08528144933254 T:C T C 10 0.52856003814033 0.519594239599048 ENSG00000198700:ENST00000361565:exon_201843960_201844064:IPO9;ENSG00000198700:ENST00000456707:exon_201843960_201844064:IPO9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 201934578 G/A 1 58 41 99 27.3435177878609 21.6709615637535 5.67255622410732 A:G G A 10 0.52856003814033 0.269199935786567 ENSG00000134375:ENST00000367287:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000478378:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000482943:exon_201934561_201934671:TIMM17A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 21 27 48 9.90023919905307 14.2711210297889 -4.37088183073584 A:G G A 10 0.52856003814033 0.24742095911044 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 47 41 88 22.1576782074045 21.6709615637535 0.486716643650954 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 8 4 12 3.77151969487736 2.11424015256132 1.65727954231604 A:G G A 10 0.52856003814033 0.397101977790935 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 207646322 G/A 1 26 45 71 12.2574390083514 23.7852017163149 -11.5277627079634 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00844298466025515 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 207646462 G/A 1 37 38 75 17.4432785888078 20.0852814493325 -2.64200286052475 A:G G A 10 0.52856003814033 0.564500714806482 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 207646898 T/C 1 7 4 11 3.30007973301769 2.11424015256132 1.18583958045637 T:C T C 10 0.52856003814033 0.556140452563778 ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646890_207647066:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646890_207647066:CR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 207646923 G/A 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 A:G G A 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646890_207647066:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646890_207647066:CR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 209933528 G/A 1 25 20 45 11.7859990464917 10.5712007628066 1.21479828368515 A:G G A 10 0.52856003814033 0.766594405818084 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 209952707 T/C 1 97 94 191 45.729676300388 49.684643585191 -3.95496728480304 T:C T C 10 0.52856003814033 0.612038631215858 ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209952660_209952719:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209952660_209952719:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209952660_209953000:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209952660_209952719:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209952660_209952719:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209952660_209952719:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209952660_209953001:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209952660_209952998:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209952660_209952709:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000471368:exon_209952660_209952719:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000460314:exon_209951712_209953951:TRAF3IP3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 212276276 A/G 1 22 40 62 10.3716791609127 21.1424015256132 -10.7707223647005 A:G A G 10 0.52856003814033 0.00719222247273929 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212276184_212278348:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212276184_212278186:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212276184_212277936:DTL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 117 106 223 55.1584755375814 56.027364042875 -0.868888505293597 T:C T C 10 0.52856003814033 0.94654718561793 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 212788567 C/T 1 7 3 10 3.30007973301769 1.58568011442099 1.7143996185967 T:C C T 10 0.52856003814033 0.351744435761646 ENSG00000162772:ENST00000366981:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366987:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000426071:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000391902:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000341491:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000465155:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366985:exon_212788494_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000464547:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366983:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000336937:exon_212788490_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366984:exon_212788490_212788603:ATF3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 23 23 46 10.8431191227724 12.1568808772276 -1.31376175445518 T:C T C 10 0.52856003814033 0.768336814301971 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 9 2 11 4.24295965673703 1.05712007628066 3.18583958045637 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0701714577429645 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 9 10 19 4.24295965673703 5.2856003814033 -1.04264072466627 T:C T C 10 0.52856003814033 0.653229248249193 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 11 7 18 5.18583958045637 3.69992026698231 1.48591931347406 T:C T C 10 0.52856003814033 0.638181278212874 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 223980207 G/C 1 11 5 16 5.18583958045637 2.64280019070165 2.54303938975472 C:G G C 10 0.52856003814033 0.222015324368485 ENSG00000143514:ENST00000391879:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000447749:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000391878:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000343537:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000360391:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000483398:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000498843:exon_223980091_223980224:TP53BP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 226033030 G/C 1 3 11 14 1.41431988557901 5.81416041954363 -4.39984053396462 C:G G C 10 0.52856003814033 0.0286627679013754 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226032847_226033260:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226032847_226033260:EPHX1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 226046974 T/C 1 2 10 12 0.94287992371934 5.2856003814033 -4.34272045768396 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0173067676742740 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226046896_226047049:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000487971:exon_226046896_226047241:TMEM63A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 226550829 T/C 1 58 103 161 27.3435177878609 54.441683928454 -27.0981661405931 T:C T C 10 0.52856003814033 2.43159395302620e-05 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226550800_226550861:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226550800_226550861:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000463968:exon_226550800_226550861:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000468608:exon_226550800_226550861:PARP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 226555302 A/G 1 47 67 114 22.1576782074045 35.4135225554021 -13.2558443479976 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0144901345981308 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226555181_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226555181_226555309:PARP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 226564836 G/A 1 104 83 187 49.0297560334057 43.8704831656474 5.15927286775828 A:G G A 10 0.52856003814033 0.464608337261054 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226564809_226565004:PARP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 226570840 T/C 1 76 87 163 35.8294371013349 45.9847233182087 -10.1552862168738 T:C T C 10 0.52856003814033 0.116871881110335 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 52 46 98 24.5148780167028 24.3137617544552 0.201116262247655 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 226595647 C/G 1 20 20 40 9.4287992371934 10.5712007628066 -1.1424015256132 C:G C G 10 0.52856003814033 0.753183226177787 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 14 11 25 6.60015946603538 5.81416041954363 0.785999046491749 A:G G A 10 0.52856003814033 0.842467073650159 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 226923938 A/C 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 A:C A C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 228335125 C/T 1 267 282 549 125.874469816532 149.053930755573 -23.1794609390412 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0492376485942016 ENSG00000143774:ENST00000366730:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000462807:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485838:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000312726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000492871:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366728:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366727:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000453943:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366723:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366729:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000391865:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366722:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498092:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000435153:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366721:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000460224:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000472939:exon_228335107_228335146:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000412265:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366719:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366720:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366718:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366715:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470040:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366716:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485168:exon_228335107_228335188:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000478725:exon_228335107_228335260:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000420445:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000495999:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000486668:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000464858:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470155:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000481341:exon_228335111_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498115:exon_228335107_228335400:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470740:exon_228335107_228335239:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000465025:exon_228335125_228335245:GUK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 229738170 T/G 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 T:G T G 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 229772693 T/G 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 T:G T G 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 229790048 A/G 1 5 9 14 2.35719980929835 4.75704034326297 -2.39984053396462 A:G A G 10 0.52856003814033 0.284510641180970 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229789996_229790135:URB2;ENSG00000135763:ENST00000434387:exon_229789996_229790135:URB2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 20 22 42 9.4287992371934 11.6283208390873 -2.19952160189386 A:G A G 10 0.52856003814033 0.53839837659526 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 10 8 18 4.7143996185967 4.22848030512264 0.485919313474059 A:T T A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 234509972 A/G 1 9 15 24 4.24295965673703 7.92840057210495 -3.68544091536792 A:C:G A G 10 0.52856003814033 0.154100749403488 ENSG00000168275:ENST00000366612:exon_234509447_234510135:C1orf31 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 234529519 C/T 1 18 1 19 8.48591931347406 0.52856003814033 7.95735927533373 T:C C T 10 0.52856003814033 0.000112264479951219 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 234529540 G/A 0 17 0 17 8.01447935161439 0 8.01447935161439 G G 10 0.52856003814033 2.24227277053202e-05 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 234541801 A/G 1 7 9 16 3.30007973301769 4.75704034326297 -1.45696061024528 A:G A G 10 0.52856003814033 0.618027034384742 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234541649_234541845:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234541649_234543701:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234541649_234542126:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000481183:exon_234541649_234541845:TARBP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 235324298 T/C 1 29 23 52 13.6717588939304 12.1568808772276 1.51487801670284 T:C T C 10 0.52856003814033 0.78148485958361 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000447801:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000468751:exon_235324208_235324486:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000485019:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324208_235324382:ARID4B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 235324545 T/A 1 17 22 39 8.01447935161439 11.6283208390873 -3.61384148747287 A:T T A 10 0.52856003814033 0.264633756928444 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324489_235324772:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324489_235324571:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324489_235324561:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324489_235324561:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324489_235324549:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324489_235324547:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324489_235324573:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324489_235324598:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324489_235324772:ARID4B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 236389999 C/T 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236389947_236390039:ERO1LB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 10 4 14 4.7143996185967 2.11424015256132 2.60015946603538 A:T T A 10 0.52856003814033 0.189499784192365 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 10 2 12 4.7143996185967 1.05712007628066 3.65727954231604 T:C T C 10 0.52856003814033 0.042272250685085 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 0 10 0 10 4.7143996185967 0 4.7143996185967 C C 10 0.52856003814033 0.00224426647978634 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 17 13 30 8.01447935161439 6.87128049582429 1.1431988557901 T:C T C 10 0.52856003814033 0.717865637118853 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 16 18 34 7.54303938975472 9.51408068652594 -1.97104129677122 T:C C T 10 0.52856003814033 0.606991695211752 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 38 28 66 17.9147185506675 14.7996810679292 3.11503748273822 T:C T C 10 0.52856003814033 0.461967988489447 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 47 37 84 22.1576782074045 19.5567214111922 2.60095679621228 T:C T C 10 0.52856003814033 0.586634232908091 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 27 34 61 12.7288789702111 17.9710412967712 -5.24216232656013 A:G A G 10 0.52856003814033 0.200169472205218 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 236723074 G/C 1 13 7 20 6.12871950417571 3.69992026698231 2.4287992371934 C:G G C 10 0.52856003814033 0.371226288997467 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 236737983 A/G 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236737961_236738203:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000490339:exon_236737961_236738075:HEATR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 236746511 G/A 1 1 12 13 0.47143996185967 6.34272045768396 -5.87128049582429 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00113638155416099 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 241755348 C/T 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 T:C C T 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241755255_241755590:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366555:exon_241755255_241755451:KMO;ENSG00000054277:ENST00000462265:exon_241755312_241755422:OPN3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 4 15 19 1.88575984743868 7.92840057210495 -6.04264072466627 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0094326877631885 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 247006051 G/C 1 47 5 52 22.1576782074045 2.64280019070165 19.5148780167028 C:G G C 10 0.52856003814033 1.01841200544405e-08 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 247322967 G/C 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 C:G G C 10 0.52856003814033 0.730113654655552 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 1 249141782 A/T 1 13 21 34 6.12871950417571 11.0997608009469 -4.97104129677122 A:T A T 10 0.52856003814033 0.12082825647777 ENSG00000171161:ENST00000306562:exon_249141251_249143716:ZNF672;ENSG00000171161:ENST00000306576:exon_249141474_249141854:ZNF672;ENSG00000171161:ENST00000394454:exon_249141474_249142832:ZNF672 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 27 24 51 12.7288789702111 12.6854409153679 0.0434380548431683 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 3150898 C/T 1 16 17 33 7.54303938975472 8.98552064838561 -1.44248125863089 T:C C T 10 0.52856003814033 0.727910534501847 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 17 21 38 8.01447935161439 11.0997608009469 -3.08528144933254 T:C C T 10 0.52856003814033 0.333620849695116 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 3155353 C/T 1 39 43 82 18.3861585125271 22.7280816400342 -4.34192312750706 T:C C T 10 0.52856003814033 0.376536091229566 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155311_3155380:PFKP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 19 23 42 8.95735927533373 12.1568808772276 -3.19952160189386 A:G A G 10 0.52856003814033 0.355689308661571 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 3155698 C/T 1 46 54 100 21.6862382455448 28.5422420595778 -6.85600381403301 T:C C T 10 0.52856003814033 0.192766602709032 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 116 110 226 54.6870355757217 58.1416041954363 -3.45456861971459 T:C T C 10 0.52856003814033 0.689419664425505 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 77 65 142 36.3008770631946 34.3564024791214 1.94447458407314 T:C C T 10 0.52856003814033 0.801038584051155 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 77 56 133 36.3008770631946 29.5993621358585 6.70151492733611 T:C T C 10 0.52856003814033 0.259489876121301 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 12 16 28 5.65727954231604 8.45696061024528 -2.79968106792924 T:C C T 10 0.52856003814033 0.345219155939412 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 A:G G A 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 6 13 19 2.82863977115802 6.87128049582429 -4.04264072466627 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0693466793754615 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 3206027 A/G 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 5790616 A/G 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 5920121 T/C 1 12 7 19 5.65727954231604 3.69992026698231 1.95735927533373 T:C T C 10 0.52856003814033 0.491911774893767 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5920060_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5920025_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5920050_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5920053_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5920085_5920250:ANKRD16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 5925971 C/A 1 5 9 14 2.35719980929835 4.75704034326297 -2.39984053396462 A:C C A 10 0.52856003814033 0.284510641180970 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000492368:exon_5925932_5926040:ANKRD16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 5926034 T/C 1 10 9 19 4.7143996185967 4.75704034326297 -0.0426407246662706 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000492368:exon_5925932_5926040:ANKRD16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 5929962 G/C 1 10 11 21 4.7143996185967 5.81416041954363 -1.09976080094693 C:G G C 10 0.52856003814033 0.667148390379936 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5929884_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5929810_5930030:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5929810_5930030:ANKRD16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 5979117 T/C 1 78 76 154 36.7723170250543 40.1705628986651 -3.39824587361083 T:C T C 10 0.52856003814033 0.628350880987142 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5979073_5979556:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5979073_5979555:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5979073_5979556:FBXO18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 5995052 C/T 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 T:C C T 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_5994756_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_5994784_5995289:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_5994861_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_5995008_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_5995014_5995169:IL15RA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 21 9 30 9.90023919905307 4.75704034326297 5.1431988557901 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0679525940161119 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 11504752 T/C 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 T:C T C 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 57 77 134 26.8720778260012 40.6991229368054 -13.8270451108042 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0192071431583214 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 65 83 148 30.6435975208785 43.8704831656474 -13.2268856447688 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0321426715240233 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 13152394 G/A 1 14 15 29 6.60015946603538 7.92840057210495 -1.32824110606957 A:G G A 10 0.52856003814033 0.7109964573597 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13152180_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13152274_13152476:OPTN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 13178697 C/A 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:C C A 10 0.52856003814033 0.488044846697727 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 13364914 C/G 1 30 35 65 14.1431988557901 18.4996013349116 -4.35640247912145 C:G C G 10 0.52856003814033 0.320511449000958 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13364835_13365047:SEPHS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 13629102 T/G 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:G T G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13628927_13629152:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13628939_13629152:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000320054:exon_13628968_13629152:PRPF18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 5 15 20 2.35719980929835 7.92840057210495 -5.5712007628066 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0137149004795043 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 16794623 C/T 1 10 21 31 4.7143996185967 11.0997608009469 -6.38536118235023 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0293562060321658 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16794533_16794652:RSU1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 16 21 37 7.54303938975472 11.0997608009469 -3.55672141119221 A:C C A 10 0.52856003814033 0.253370797269923 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 17279256 G/A 1 382 232 614 180.090065430394 122.625928848557 57.4641365818374 A:G G A 10 0.52856003814033 3.16432714955279e-06 ENSG00000026025:ENST00000224237:exon_17279229_17279592:VIM;ENSG00000026025:ENST00000487938:exon_17279229_17279592:VIM;ENSG00000026025:ENST00000469543:exon_17279229_17279592:VIM HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 27037496 A/G 1 89 81 170 41.9581566055106 42.8133630893667 -0.855206483856108 A:G A G 10 0.52856003814033 0.938804543205104 ENSG00000136754:ENST00000376138:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376170:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376166:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376160:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376142:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000359188:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376139:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000346832:exon_27035525_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376134:exon_27035525_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000355394:exon_27035525_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376137:exon_27035525_27037674:ABI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 27322303 C/G 1 15 7 22 7.07159942789505 3.69992026698231 3.37167916091274 C:G C G 10 0.52856003814033 0.199871210957820 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27322154_27322306:ANKRD26 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 27437964 T/C 1 21 19 40 9.90023919905307 10.0426407246663 -0.142401525613201 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27437835_27437969:YME1L1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 27459746 C/G 1 14 14 28 6.60015946603538 7.39984053396462 -0.799681067929241 C:G C G 10 0.52856003814033 0.850610910526834 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 35302705 C/T 1 23 20 43 10.8431191227724 10.5712007628066 0.271918359965808 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35302627_35302728:CUL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 43089156 C/T 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 T:C C T 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 43289407 G/A 1 24 8 32 11.3145590846321 4.22848030512264 7.08607877950944 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0127648856127502 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43289300_43289439:BMS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 43315693 G/A 1 30 31 61 14.1431988557901 16.3853611823502 -2.24216232656013 A:G G A 10 0.52856003814033 0.608954083707478 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43315684_43315872:BMS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 45920526 G/A 1 11 2 13 5.18583958045637 1.05712007628066 4.12871950417571 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0252169663553230 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45920408_45920580:ALOX5;ENSG00000012779:ENST00000483623:exon_45920408_45920580:ALOX5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 50943248 G/A 1 8 11 19 3.77151969487736 5.81416041954363 -2.04264072466627 A:G G A 10 0.52856003814033 0.367905468198703 ENSG00000197444:ENST00000374103:exon_50942689_50943397:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000419399:exon_50942690_50943397:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000432695:exon_50942690_50943397:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000490844:exon_50942692_50943397:OGDHL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 51827763 A/G 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000099290:ENST00000434114:exon_51827684_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000282633:exon_51827721_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000351071:exon_51827721_51827768:FAM21A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 52026532 G/A 0 49 0 49 23.1005581311238 0 23.1005581311238 G G 10 0.52856003814033 3.25826742151838e-14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 2 10 12 0.94287992371934 5.2856003814033 -4.34272045768396 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0173067676742740 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 62553763 A/G 1 11 7 18 5.18583958045637 3.69992026698231 1.48591931347406 A:G A G 10 0.52856003814033 0.638181278212874 ENSG00000170312:ENST00000395284:exon_62553635_62554610:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000316629:exon_62553635_62554601:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000448257:exon_62553635_62554586:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000373809:exon_62553635_62554610:CDK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 70748666 A/G 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 A:G A G 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 126 149 275 59.4014351943184 78.7554456829092 -19.3540104885908 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0215752613188641 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 71142420 G/A 1 22 19 41 10.3716791609127 10.0426407246663 0.329038436246469 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 73972957 C/T 1 2 8 10 0.94287992371934 4.22848030512264 -3.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0541817455657943 ENSG00000138303:ENST00000394919:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000342444:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000317168:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000373101:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000317126:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000394915:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000531048:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000530461:exon_73972945_73973035:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000527593:exon_73972945_73973109:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000524829:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000532011:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000526751:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000492502:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000533958:exon_73972945_73973089:ASCC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 75884157 G/T 1 18 5 23 8.48591931347406 2.64280019070165 5.84311912277241 T:G G T 10 0.52856003814033 0.0196891304810898 ENSG00000185009:ENST00000425908:exon_75884138_75884282:AP3M1;ENSG00000185009:ENST00000355264:exon_75884138_75884282:AP3M1;ENSG00000185009:ENST00000372745:exon_75884138_75884282:AP3M1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 53 26 79 24.9863179785625 13.7425609916486 11.2437569869139 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0127805678266273 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 81926718 A/G 1 31 55 86 14.6146388176498 29.0708020977182 -14.4561632800684 A:G A G 10 0.52856003814033 0.00230083767489762 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 95259979 C/G 1 19 14 33 8.95735927533373 7.39984053396462 1.55751874136911 C:G C G 10 0.52856003814033 0.606360395334725 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95259797_95259991:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95259797_95259991:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95259797_95259991:CEP55 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 18 25 43 8.48591931347406 13.2140009535083 -4.72808164003419 A:T A T 10 0.52856003814033 0.169838533883129 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 95459817 C/T 1 31 18 49 14.6146388176498 9.51408068652594 5.10055813112383 T:C C T 10 0.52856003814033 0.154540895986168 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95459787_95459863:FRA10AC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 97023630 T/C 1 309 314 623 145.674948214638 165.967851976064 -20.2929037614256 T:C T C 10 0.52856003814033 0.108424230064602 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_97023621_97023820:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_97023621_97023820:PDLIM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 97447373 A/T 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 A:T A T 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371209:exon_97447349_97447476:TCTN3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 22 35 57 10.3716791609127 18.4996013349116 -8.12792217399881 A:T:G A G 10 0.52856003814033 0.0337944077267874 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 99129230 T/C 1 8 11 19 3.77151969487736 5.81416041954363 -2.04264072466627 T:C T C 10 0.52856003814033 0.367905468198703 ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99129182_99129339:RRP12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 99139140 G/A 1 13 13 26 6.12871950417571 6.87128049582429 -0.742560991648581 A:G G A 10 0.52856003814033 0.845363867960316 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000490815:exon_99139050_99139171:RRP12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 99196219 C/T 1 83 66 149 39.1295168343526 34.8849625172618 4.24455431709082 T:C C T 10 0.52856003814033 0.512107572465802 ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99195655_99196308:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99195899_99196308:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000477692:exon_99195998_99196307:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99196001_99196308:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370885:exon_99196005_99196308:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000461413:exon_99196186_99196308:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99196201_99196308:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000485122:exon_99196201_99196308:EXOSC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 99205731 A/G 1 14 7 21 6.60015946603538 3.69992026698231 2.90023919905307 A:G A G 10 0.52856003814033 0.274795735904410 ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99205712_99205751:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99205712_99205743:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370885:exon_99205712_99205750:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000485122:exon_99205712_99205742:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000476234:exon_99205712_99205763:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000489158:exon_99205712_99205763:EXOSC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 19 20 39 8.95735927533373 10.5712007628066 -1.61384148747287 A:G G A 10 0.52856003814033 0.633205267079494 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 8 7 15 3.77151969487736 3.69992026698231 0.0715994278950496 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 99969475 A/C 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 A:C A C 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 99969568 A/G 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 A:G A G 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 100190920 G/A 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 A:G G A 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100190888_100191039:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000414009:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100190888_100191048:HPS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 101502968 A/G 1 13 10 23 6.12871950417571 5.2856003814033 0.843119122772409 A:G A G 10 0.52856003814033 0.83562946433756 ENSG00000119929:ENST00000493385:exon_101502910_101503080:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370476:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000471520:exon_101502910_101503119:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000370472:exon_101502910_101503119:CUTC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 101639616 C/T 1 10 13 23 4.7143996185967 6.87128049582429 -2.15688087722759 T:C C T 10 0.52856003814033 0.408211246480868 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 101639796 G/A 1 10 10 20 4.7143996185967 5.2856003814033 -0.571200762806601 A:G G A 10 0.52856003814033 0.826187510866658 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 101639877 A/C 1 7 9 16 3.30007973301769 4.75704034326297 -1.45696061024528 A:C A C 10 0.52856003814033 0.618027034384742 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 101645498 T/C 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101645444_101645623:DNMBP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 102116311 A/C 1 8 10 18 3.77151969487736 5.2856003814033 -1.51408068652594 A:C A C 10 0.52856003814033 0.490005542254718 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102116289_102116367:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102116289_102116521:SCD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 102762256 C/T 1 1 7 8 0.47143996185967 3.69992026698231 -3.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0304181799638115 ENSG00000107816:ENST00000426584:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000489526:exon_102762254_102762934:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000429732:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000481129:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102759233_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000454422:exon_102762254_102762703:LZTS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 103826887 C/T 1 43 51 94 20.2719183599658 26.9565619451568 -6.68464358519102 T:C C T 10 0.52856003814033 0.179803418488949 ENSG00000166189:ENST00000299238:exon_103825147_103827790:HPS6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 104161967 T/C 1 6 7 13 2.82863977115802 3.69992026698231 -0.87128049582429 A:T:C T C 10 0.52856003814033 0.782861958075039 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 18 25 43 8.48591931347406 13.2140009535083 -4.72808164003419 C:G C G 10 0.52856003814033 0.169838533883129 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 104436641 C/T 1 16 40 56 7.54303938975472 21.1424015256132 -13.5993621358585 T:C C T 10 0.52856003814033 0.000395761043283830 ENSG00000138175:ENST00000260746:exon_104436315_104436698:ARL3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 17 25 42 8.01447935161439 13.2140009535083 -5.19952160189386 A:G G A 10 0.52856003814033 0.122729910240029 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 105344756 T/C 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 T:C T C 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000107954:ENST00000369780:exon_105344293_105344982:NEURL;ENSG00000107954:ENST00000369777:exon_105344293_105344982:NEURL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 12 4 16 5.65727954231604 2.11424015256132 3.54303938975472 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0844359796960055 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 121196335 G/A 1 8 8 16 3.77151969487736 4.22848030512264 -0.456960610245281 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000369108:exon_121196163_121196353:GRK5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 121436068 T/G 1 10 5 15 4.7143996185967 2.64280019070165 2.07159942789505 T:G T G 10 0.52856003814033 0.313640302764783 ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121435976_121437331:BAG3;ENSG00000151929:ENST00000450186:exon_121435979_121436219:BAG3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 121436286 C/T 1 10 2 12 4.7143996185967 1.05712007628066 3.65727954231604 T:C C T 10 0.52856003814033 0.042272250685085 ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121435976_121437331:BAG3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 121436362 A/G 1 5 12 17 2.35719980929835 6.34272045768396 -3.98552064838561 A:G A G 10 0.52856003814033 0.086003743852648 ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121435976_121437331:BAG3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 121551581 A/C 1 5 10 15 2.35719980929835 5.2856003814033 -2.92840057210495 A:C A C 10 0.52856003814033 0.194617397098600 ENSG00000198825:ENST00000453198:exon_121551381_121551596:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369081:exon_121551381_121551717:INPP5F HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 121586882 A/G 1 8 7 15 3.77151969487736 3.69992026698231 0.0715994278950496 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000198825:ENST00000361976:exon_121586143_121588652:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369080:exon_121586143_121587837:INPP5F HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 122663585 G/A 1 11 7 18 5.18583958045637 3.69992026698231 1.48591931347406 A:G G A 10 0.52856003814033 0.638181278212874 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122663559_122663654:WDR11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 122665459 C/G 1 8 7 15 3.77151969487736 3.69992026698231 0.0715994278950496 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122665388_122666367:WDR11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 1 82 66 148 38.6580768724929 34.8849625172618 3.77311435523115 C:G G C 10 0.52856003814033 0.564867799715891 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 133786586 T/C 1 11 41 52 5.18583958045637 21.6709615637535 -16.4851219832972 T:C T C 10 0.52856003814033 4.35398918459319e-06 ENSG00000176171:ENST00000368636:exon_133786538_133786622:BNIP3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 134017295 A/G 1 8 1 9 3.77151969487736 0.52856003814033 3.24295965673703 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0418258618356361 ENSG00000151640:ENST00000338492:exon_134017266_134017431:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368629:exon_134017266_134017431:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368627:exon_134017266_134017431:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000471544:exon_134017057_134017431:DPYSL4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 134021576 C/T 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134020994_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368622:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000298630:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000462160:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368625:exon_134020996_134021655:STK32C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 1 22 2 24 10.3716791609127 1.05712007628066 9.31455908463208 A:G A G 10 0.52856003814033 0.000101594951642942 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 22 2 24 10.3716791609127 1.05712007628066 9.31455908463208 C:G C G 10 0.52856003814033 0.000101594951642942 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 0 15 0 15 7.07159942789505 0 7.07159942789505 T T 10 0.52856003814033 8.28423543272065e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 31 13 44 14.6146388176498 6.87128049582429 7.74335832182548 T:G G T 10 0.52856003814033 0.0227537955930176 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 134145336 G/T 1 8 5 13 3.77151969487736 2.64280019070165 1.12871950417571 T:G G T 10 0.52856003814033 0.589189446313547 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 134161633 A/G 1 8 7 15 3.77151969487736 3.69992026698231 0.0715994278950496 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000148814:ENST00000368615:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000392638:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000432555:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000344079:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368614:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000462656:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368613:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000356571:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368612:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000450442:exon_134161488_134161853:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368610:exon_134161488_134161860:LRRC27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 10 135197680 G/A 1 15 8 23 7.07159942789505 4.22848030512264 2.84311912277241 A:G G A 10 0.52856003814033 0.297564808088866 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135197628_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135197649_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135197464_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135197464_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135197464_135197716:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135197464_135197716:PAOX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 212479 C/T 1 32 46 78 15.0860787795094 24.3137617544552 -9.22768297494574 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0409336640216800 ENSG00000177963:ENST00000526104:exon_212416_212511:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000325207:exon_212416_212511:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527696:exon_212416_212511:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527728:exon_212416_212511:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527039:exon_212416_212591:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000530149:exon_210364_213780:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000532241:exon_212468_212511:RIC8A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 237087 A/G 1 15 13 28 7.07159942789505 6.87128049582429 0.200318932070759 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000185627:ENST00000532097:exon_236546_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000529372:exon_236966_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000534590:exon_236977_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000431206:exon_236977_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000528906:exon_236981_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000525665:exon_237000_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000527047:exon_237004_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000352303:exon_237026_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000382671:exon_237038_237144:PSMD13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 244197 T/C 1 40 12 52 18.8575984743868 6.34272045768396 12.5148780167028 T:C T C 10 0.52856003814033 0.000436149828212772 ENSG00000185627:ENST00000532097:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000529372:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000534590:exon_244041_244469:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000431206:exon_244041_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000528906:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000525665:exon_244041_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000527047:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000352303:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000382671:exon_244161_244216:PSMD13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 562219 C/G 1 11 4 15 5.18583958045637 2.11424015256132 3.07159942789505 C:G C G 10 0.52856003814033 0.127429524906155 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 614864 C/T 1 95 96 191 44.7867963766686 50.7417636614717 -5.95496728480303 T:C C T 10 0.52856003814033 0.425389955597721 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614797_614984:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614797_614952:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532788:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614797_614887:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 654043 G/A 1 34 23 57 16.0289587032288 12.1568808772276 3.87207782600119 A:G G A 10 0.52856003814033 0.353526142266623 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_653941_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_653962_654051:DEAF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 8 6 14 3.77151969487736 3.17136022884198 0.60015946603538 A:G A G 10 0.52856003814033 0.795264899593225 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 811853 C/T 1 7 14 21 3.30007973301769 7.39984053396462 -4.09976080094693 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0825740304514078 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 840363 C/T 1 152 149 301 71.6588742026698 78.7554456829092 -7.09657148023933 T:C C T 10 0.52856003814033 0.41943027674428 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 870446 G/A 1 21 33 54 9.90023919905307 17.4424812586309 -7.54224205957782 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0415561985856468 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 985547 C/T 1 5 7 12 2.35719980929835 3.69992026698231 -1.34272045768396 T:C C T 10 0.52856003814033 0.566216755054812 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_985435_985586:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_985435_985597:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_983146_987654:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527917:exon_985384_985582:AP2A2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 1011490 G/A 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_1010967_1011602:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_1010548_1012239:AP2A2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 1974029 G/A 1 176 237 413 82.9734332873019 125.268729039258 -42.2952957519563 A:G G A 10 0.52856003814033 3.30331665746926e-05 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1974012_1974552:MRPL23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 357 317 674 168.304066383902 167.553532090485 0.750534293417559 A:G G A 10 0.52856003814033 0.969234836942432 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 2356823 C/T 1 178 1 179 83.9163132110212 0.52856003814033 83.3877531728809 T:C C T 10 0.52856003814033 7.36791706671819e-48 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 20 8 28 9.4287992371934 4.22848030512264 5.20031893207076 C:G G C 10 0.52856003814033 0.0579776465631215 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 5664684 T/G 1 18 25 43 8.48591931347406 13.2140009535083 -4.72808164003419 T:G T G 10 0.52856003814033 0.169838533883129 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 37 42 79 17.4432785888078 22.1995216018939 -4.75624301308607 A:C C A 10 0.52856003814033 0.311075775591747 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 5701074 C/A 1 14 10 24 6.60015946603538 5.2856003814033 1.31455908463208 A:C C A 10 0.52856003814033 0.684625035844179 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700991_5701087:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700991_5701161:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 5701409 G/C 1 11 10 21 5.18583958045637 5.2856003814033 -0.0997608009469308 C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 78 66 144 36.7723170250543 34.8849625172618 1.88735450779247 C:G G C 10 0.52856003814033 0.80242903771815 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 6415463 G/A 1 17 26 43 8.01447935161439 13.7425609916486 -5.72808164003419 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0928642148229359 ENSG00000166311:ENST00000299397:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000356761:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000342245:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000534405:exon_6415428_6416221:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000527275:exon_6415428_6416008:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000533123:exon_6415428_6416228:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000531303:exon_6415408_6416008:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000526280:exon_6415428_6416228:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000531336:exon_6415126_6415603:SMPD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 52 32 84 24.5148780167028 16.9139212204906 7.60095679621228 T:C C T 10 0.52856003814033 0.101895275463567 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 85 91 176 40.0723967580719 48.09896347077 -8.02656671269808 A:G G A 10 0.52856003814033 0.228051132035084 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 6632857 A/T 1 9 5 14 4.24295965673703 2.64280019070165 1.60015946603538 A:T A T 10 0.52856003814033 0.43463285635379 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632619_6633179:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000532344:exon_6632632_6633049:TAF10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 6636106 T/A 1 20 19 39 9.4287992371934 10.0426407246663 -0.613841487472872 A:T T A 10 0.52856003814033 0.873655585838834 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000429085:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000524611:exon_6636097_6636222:TPP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 7662732 C/T 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534409:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530081:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532172:exon_7662710_7663387:PPFIBP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 7673015 G/A 1 16 9 25 7.54303938975472 4.75704034326297 2.78599904649175 A:G G A 10 0.52856003814033 0.318679892721310 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 7686596 G/A 1 13 16 29 6.12871950417571 8.45696061024528 -2.32824110606957 A:G G A 10 0.52856003814033 0.458172935319808 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 7686674 T/C 1 24 22 46 11.3145590846321 11.6283208390873 -0.313761754455181 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 7687715 T/C 1 21 12 33 9.90023919905307 6.34272045768396 3.55751874136911 T:C T C 10 0.52856003814033 0.227579142767160 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7687682_7687915:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7687682_7687781:CYB5R2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 8707083 G/A 1 17 9 26 8.01447935161439 4.75704034326297 3.25743900835142 A:G G A 10 0.52856003814033 0.240423666471852 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 8707233 C/T 1 2519 1523 4042 1187.55726392451 804.996938087723 382.560325836786 A:T:C C T 10 0.52856003814033 8.21958158732137e-34 ENSG00000166441:ENST00000314138:exon_8707225_8711419:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000524496:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000534599:exon_8707225_8707392:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000532359:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530022:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000526562:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000525981:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530913:exon_8707225_8707395:RPL27A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 9537904 G/C 1 7 4 11 3.30007973301769 2.11424015256132 1.18583958045637 C:G G C 10 0.52856003814033 0.556140452563778 ENSG00000166478:ENST00000396604:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396602:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000530463:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396597:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000299606:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000447186:exon_9537748_9537909:ZNF143 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 9754221 C/T 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9754076_9754257:SWAP70 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 9769483 C/T 1 6 18 24 2.82863977115802 9.51408068652594 -6.68544091536792 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0071685453272939 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 9769562 C/G 1 18 12 30 8.48591931347406 6.34272045768396 2.1431988557901 C:G C G 10 0.52856003814033 0.469352400778903 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 5 26 31 2.35719980929835 13.7425609916486 -11.3853611823502 T:C C T 10 0.52856003814033 3.62461458254469e-05 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 18505552 G/A 1 29 18 47 13.6717588939304 9.51408068652594 4.15767820740449 A:G G A 10 0.52856003814033 0.244750359183006 ENSG00000074319:ENST00000357193:exon_18505417_18505619:TSG101;ENSG00000074319:ENST00000251968:exon_18505417_18505619:TSG101 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 28057957 T/C 1 7 18 25 3.30007973301769 9.51408068652594 -6.21400095350825 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0153145633362947 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 7 24 31 3.30007973301769 12.6854409153679 -9.38536118235023 T:C T C 10 0.52856003814033 0.000888358316241547 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 32874926 G/A 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 A:G G A 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 15 21 36 7.07159942789505 11.0997608009469 -4.02816137305188 T:G T G 10 0.52856003814033 0.186077966715380 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 8 13 21 3.77151969487736 6.87128049582429 -3.09976080094693 T:C C T 10 0.52856003814033 0.194847234835071 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 12 5 17 5.65727954231604 2.64280019070165 3.01447935161439 A:G G A 10 0.52856003814033 0.154523241687106 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 34991727 T/C 1 12 2 14 5.65727954231604 1.05712007628066 4.60015946603538 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0149199851373939 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34991686_34991833:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34991686_34991833:PDHX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 43702530 A/G 1 5 7 12 2.35719980929835 3.69992026698231 -1.34272045768396 A:G A G 10 0.52856003814033 0.566216755054812 ENSG00000149084:ENST00000531185:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000395700:exon_43702331_43702537:HSD17B12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 76 53 129 35.8294371013349 28.0136820214375 7.81575507989742 T:G G T 10 0.52856003814033 0.185937598274211 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 44101118 C/T 1 5 10 15 2.35719980929835 5.2856003814033 -2.92840057210495 T:C C T 10 0.52856003814033 0.194617397098600 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44101081_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44101081_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44101081_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000531940:exon_44101081_44101157:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44098873_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000532122:exon_44100888_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000531190:exon_44100888_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527557:exon_44101079_44101170:ACCS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 11 25 36 5.18583958045637 13.2140009535083 -8.02816137305188 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0111877492638567 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 44636833 G/A 1 81 79 160 38.1866369106333 41.7562430130861 -3.5696061024528 A:G G A 10 0.52856003814033 0.580282558925297 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 42 34 76 19.8004783981061 17.9710412967712 1.82943710133492 A:G A G 10 0.52856003814033 0.730848565120222 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 45975130 C/T 1 8 10 18 3.77151969487736 5.2856003814033 -1.51408068652594 T:C C T 10 0.52856003814033 0.490005542254718 ENSG00000135365:ENST00000257821:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527401:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000323180:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000418153:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527753:exon_45975078_45975176:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000534766:exon_45975078_45975166:PHF21A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 47640429 G/C 1 54 62 116 25.4577579404222 32.7707223647005 -7.31296442427828 A:C:G G C 10 0.52856003814033 0.192927953045795 ENSG00000109919:ENST00000302503:exon_47638868_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000534074:exon_47640256_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000531669:exon_47640262_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000525649:exon_47640391_47640471:MTCH2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 47772545 T/C 1 24 22 46 11.3145590846321 11.6283208390873 -0.313761754455181 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000109920:ENST00000263773:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000526109:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000532646:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000534003:exon_47772468_47772588:FNBP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 3 10 13 1.41431988557901 5.2856003814033 -3.87128049582429 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0481210508977837 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 57509690 G/A 1 292 325 617 137.660468863024 171.782012395607 -34.1215435325836 A:T:G G A 10 0.52856003814033 0.00608996490746929 ENSG00000211450:ENST00000534355:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000533321:exon_57509281_57510529:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000388857:exon_57509589_57510129:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000528798:exon_57509589_57509699:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000534386:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000254732:ENST00000531074:exon_57509635_57509719:RP11-691N7.6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 58892558 C/T 1 19 20 39 8.95735927533373 10.5712007628066 -1.61384148747287 T:C C T 10 0.52856003814033 0.633205267079494 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 58920905 A/G 1 27 29 56 12.7288789702111 15.3282411060696 -2.59936213585848 A:G A G 10 0.52856003814033 0.505837160846055 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 59405867 C/T 1 49 44 93 23.1005581311238 23.2566416781745 -0.156083547050692 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000166889:ENST00000300146:exon_59404189_59405884:PATL1;ENSG00000166889:ENST00000428532:exon_59404194_59405884:PATL1;ENSG00000166889:ENST00000435054:exon_59404550_59405884:PATL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 60161296 C/T 1 11 3 14 5.18583958045637 1.58568011442099 3.60015946603538 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0629725641543962 ENSG00000166927:ENST00000300184:exon_60161260_60162284:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000358246:exon_60161260_60163424:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000435979:exon_60161260_60163424:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000534016:exon_60161260_60161995:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000528587:exon_60161260_60161450:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000533849:exon_60161260_60161450:MS4A7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 62334908 G/C 1 1029 472 1501 485.1117207536 249.480338002236 235.631382751365 A:T:C:G G C 10 0.52856003814033 4.46474322584243e-35 ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000524420:exon_62334871_62335000:EEF1G HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 62370155 G/A 0 11 1 12 5.18583958045637 0.52856003814033 4.65727954231604 C:G G C 10 0.52856003814033 0.00730684791126346 ENSG00000149499:ENST00000439994:exon_62369690_62370251:EML3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 62378660 G/A 1 9 11 20 4.24295965673703 5.81416041954363 -1.5712007628066 A:G G A 10 0.52856003814033 0.509501749881068 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 62378801 T/C 1 10 8 18 4.7143996185967 4.22848030512264 0.485919313474059 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 62430659 T/A 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 A:T T A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000162194:ENST00000525675:exon_62430587_62430805:C11orf48 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 62439569 G/A 1 112 144 256 52.801275728283 76.1126454922075 -23.3113697639245 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00390999495001282 ENSG00000204922:ENST00000531323:exon_62439425_62441049:C11orf83;ENSG00000204922:ENST00000377953:exon_62439425_62439848:C11orf83 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 63988102 C/T 1 259 243 502 122.102950121655 128.4400892681 -6.33713914644568 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.591710170467718 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 63991801 T/C 1 86 90 176 40.5438367199316 47.5704034326297 -7.02656671269808 T:C T C 10 0.52856003814033 0.291614892003100 ENSG00000149743:ENST00000394547:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63991757_63991813:TRPT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 64034866 G/A 1 7 13 20 3.30007973301769 6.87128049582429 -3.5712007628066 A:G G A 10 0.52856003814033 0.121360991375261 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64034825_64035394:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64034825_64035394:PLCB3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 64039175 G/A 1 16 16 32 7.54303938975472 8.45696061024528 -0.913921220490561 A:G G A 10 0.52856003814033 0.859846792144475 ENSG00000002330:ENST00000394532:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000309032:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000394531:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000493798:exon_64039085_64039340:BAD;ENSG00000002330:ENST00000492141:exon_64039085_64039275:BAD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 64081445 G/A 1 8 4 12 3.77151969487736 2.11424015256132 1.65727954231604 A:G G A 10 0.52856003814033 0.397101977790935 ENSG00000173153:ENST00000406310:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000000442:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000405666:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000467987:exon_64081243_64081539:ESRRA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:G T G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 64111076 C/G 1 3 6 9 1.41431988557901 3.17136022884198 -1.75704034326297 C:G C G 10 0.52856003814033 0.322282730829835 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111011_64111087:CCDC88B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 16 25 41 7.54303938975472 13.2140009535083 -5.67096156375353 T:C T C 10 0.52856003814033 0.085704351783196 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 64124515 T/C 1 164 156 320 77.3161537449859 82.4553659498915 -5.13921220490562 T:C T C 10 0.52856003814033 0.575862229007108 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64124511_64125006:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64124511_64124958:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64124511_64124997:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64124511_64125002:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64122666_64125000:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64124511_64124842:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000472524:exon_64124511_64125003:CCDC88B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 21 18 39 9.90023919905307 9.51408068652594 0.38615851252713 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 64138905 T/G 1 12 3 15 5.65727954231604 1.58568011442099 4.07159942789505 T:G T G 10 0.52856003814033 0.0395336693355746 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 157 145 302 74.0160740119682 76.6412055303479 -2.62513151837967 T:C T C 10 0.52856003814033 0.773434038729515 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 65101378 T/C 1 2 7 9 0.94287992371934 3.69992026698231 -2.75704034326297 T:C T C 10 0.52856003814033 0.093882474099143 ENSG00000133884:ENST00000528416:exon_65101225_65101389:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000444314:exon_65101323_65101389:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000415073:exon_65101326_65101389:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000530993:exon_65101333_65101389:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000252268:exon_65101338_65101389:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000524666:exon_65101344_65101389:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000532264:exon_65101346_65101389:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000532102:exon_65101348_65101389:DPF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 65168281 C/T 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65168195_65168338:FRMD8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 65172429 C/T 1 7 2 9 3.30007973301769 1.05712007628066 2.24295965673703 T:C C T 10 0.52856003814033 0.186100445119176 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65172335_65172539:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65172335_65172539:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65172335_65172539:FRMD8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 65266541 G/T 1 3296 2148 5444 1553.86611428947 1135.34696192543 418.519152364043 A:T:C:G G T 10 0.52856003814033 3.63858640980513e-30 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 65408937 C/T 1 20 14 34 9.4287992371934 7.39984053396462 2.02895870322878 T:C C T 10 0.52856003814033 0.498751575151667 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65408300_65409071:SIPA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 65546857 A/C 1 7 5 12 3.30007973301769 2.64280019070165 0.65727954231604 A:C A C 10 0.52856003814033 0.778794317245757 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 65623739 A/G 1 2 13 15 0.94287992371934 6.87128049582429 -5.92840057210495 A:G A G 10 0.52856003814033 0.00290156009961604 ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172803:ENST00000530101:exon_65623600_65624367:SNX32 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 66204664 C/T 1 78 86 164 36.7723170250543 45.4561632800684 -8.68384625501412 T:C C T 10 0.52856003814033 0.183957558536945 ENSG00000174547:ENST00000310999:exon_66204575_66204734:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000430466:exon_66204575_66204734:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000524576:exon_66204575_66204734:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000528272:exon_66204575_66204693:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000534488:exon_66204575_66204734:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000329819:exon_66204575_66204734:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000394025:exon_66204575_66204734:MRPL11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 66610645 G/C 1 18 21 39 8.48591931347406 11.0997608009469 -2.61384148747287 C:G G C 10 0.52856003814033 0.426070117386460 ENSG00000173715:ENST00000360962:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000346672:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000527634:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000528340:exon_66610640_66610793:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532565:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000525449:exon_66610640_66610795:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532727:exon_66610640_66610763:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000531415:exon_66610640_66610744:C11orf80;ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66610306_66611332:RCE1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 66626234 T/C 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000173621:ENST00000393952:exon_66625206_66626347:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000309602:exon_66624973_66626564:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000525479:exon_66624996_66626528:LRFN4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 67412529 T/G 1 21 20 41 9.90023919905307 10.5712007628066 -0.670961563753531 T:G T G 10 0.52856003814033 0.876477995604021 ENSG00000132744:ENST00000255082:exon_67412516_67412623:ACY3;ENSG00000132744:ENST00000529256:exon_67412516_67412623:ACY3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 68216478 C/T 1 21 21 42 9.90023919905307 11.0997608009469 -1.19952160189386 T:C C T 10 0.52856003814033 0.758487243409083 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68216277_68216743:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68216277_68216740:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529702:exon_68216277_68216606:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529481:exon_68216277_68216650:LRP5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 70049523 A/G 1 19 27 46 8.95735927533373 14.2711210297889 -5.31376175445518 A:G A G 10 0.52856003814033 0.139418239172262 ENSG00000168040:ENST00000301838:exon_70049269_70049851:FADD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 71155129 G/A 1 7 10 17 3.30007973301769 5.2856003814033 -1.98552064838561 A:G G A 10 0.52856003814033 0.345083621048323 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155039_71155165:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 71191817 C/T 1 16 9 25 7.54303938975472 4.75704034326297 2.78599904649175 T:C C T 10 0.52856003814033 0.318679892721310 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527852:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71191801_71191925:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527227:exon_71191801_71192476:NADSYN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 71192439 C/A 1 12 14 26 5.65727954231604 7.39984053396462 -1.74256099164858 A:C C A 10 0.52856003814033 0.558131650023887 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527852:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71192402_71192450:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527227:exon_71191801_71192476:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71191857_71193071:NADSYN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 71726212 C/T 1 9 14 23 4.24295965673703 7.39984053396462 -3.15688087722759 T:C C T 10 0.52856003814033 0.213560740713796 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71723941_71727306:NUMA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 71945332 A/G 1 11 17 28 5.18583958045637 8.98552064838561 -3.79968106792924 A:G A G 10 0.52856003814033 0.185302150967130 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71945325_71945438:INPPL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 71948536 C/G 1 47 37 84 22.1576782074045 19.5567214111922 2.60095679621228 C:G C G 10 0.52856003814033 0.586634232908091 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71948168_71948840:INPPL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 72408657 C/T 1 24 19 43 11.3145590846321 10.0426407246663 1.27191835996581 T:C C T 10 0.52856003814033 0.76110615007255 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408643_72408694:ARAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 72470319 G/A 1 5 25 30 2.35719980929835 13.2140009535083 -10.8568011442099 A:G G A 10 0.52856003814033 6.42258525363869e-05 ENSG00000214530:ENST00000334805:exon_72470279_72470426:STARD10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 87 105 192 41.0152766817913 55.4988040047347 -14.4835273229434 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0426857463697409 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 7 8 15 3.30007973301769 4.22848030512264 -0.92840057210495 T:C T C 10 0.52856003814033 0.79709726410062 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 17 9 26 8.01447935161439 4.75704034326297 3.25743900835142 C:G C G 10 0.52856003814033 0.240423666471852 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 75277992 C/T 1 21 16 37 9.90023919905307 8.45696061024528 1.44327858880779 T:C C T 10 0.52856003814033 0.74251134411024 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277764_75278016:SERPINH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 17 7 24 8.01447935161439 3.69992026698231 4.31455908463208 T:C C T 10 0.52856003814033 0.100928155525354 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 31 16 47 14.6146388176498 8.45696061024528 6.15767820740449 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0799531717943647 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 18 20 38 8.48591931347406 10.5712007628066 -2.08528144933254 T:C T C 10 0.52856003814033 0.519594239599048 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 77790653 T/C 1 186 191 377 87.6878329058986 100.954967284803 -13.2671343789044 T:C:G T C 10 0.52856003814033 0.179871981609823 ENSG00000151366:ENST00000528251:exon_77790625_77790890:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000530054:exon_77790625_77790911:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000281031:exon_77790625_77791265:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000527806:exon_77790625_77790887:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000534029:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000525085:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000528164:exon_77790625_77790907:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000324742:exon_77790625_77790931:NDUFC2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 9 10 19 4.24295965673703 5.2856003814033 -1.04264072466627 A:G G A 10 0.52856003814033 0.653229248249193 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 61 26 87 28.7578376734399 13.7425609916486 15.0152766817913 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00120066458788031 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 12 11 23 5.65727954231604 5.81416041954363 -0.15688087722759 A:C A C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 85374993 C/T 1 10 2 12 4.7143996185967 1.05712007628066 3.65727954231604 T:C C T 10 0.52856003814033 0.042272250685085 ENSG00000137504:ENST00000490820:exon_85374568_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000528561:exon_85374568_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000260058:exon_85374859_85375697:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527529:exon_85374859_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000525639:exon_85374859_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000398294:exon_85374859_85375269:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527447:exon_85372110_85376146:CREBZF HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 96116444 T/C 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 T:C T C 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96113701_96116637:CCDC82 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 102196019 A/G 1 29 25 54 13.6717588939304 13.2140009535083 0.457757940422178 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102195187_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102192568_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102195192_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102195186_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102195694_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527309:exon_102195952_102196093:BIRC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 102248797 T/C 1 32 15 47 15.0860787795094 7.92840057210495 7.15767820740449 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0406038557582679 ENSG00000110330:ENST00000530675:exon_102248721_102248967:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000227758:exon_102248721_102249401:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000532672:exon_102248721_102249400:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000531259:exon_102248721_102248871:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000527910:exon_102248721_102249401:BIRC2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 18 14 32 8.48591931347406 7.39984053396462 1.08607877950944 C:G G C 10 0.52856003814033 0.727026616884364 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 107299623 A/C 1 19 18 37 8.95735927533373 9.51408068652594 -0.556721411192211 A:C A C 10 0.52856003814033 0.870676060986228 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 111746056 T/C 1 13 12 25 6.12871950417571 6.34272045768396 -0.214000953508251 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111744780_111746828:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111745483_111746828:AP001781.3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 113669979 T/C 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 T:C T C 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000048028:ENST00000260188:exon_113668598_113670137:USP28;ENSG00000048028:ENST00000003302:exon_113668598_113670137:USP28 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 12 14 26 5.65727954231604 7.39984053396462 -1.74256099164858 A:G A G 10 0.52856003814033 0.558131650023887 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 117096652 G/A 1 6 11 17 2.82863977115802 5.81416041954363 -2.98552064838561 A:G G A 10 0.52856003814033 0.223521253075844 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117096647_117096737:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117095417_117097592:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117096647_117096737:PCSK7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 117869591 C/T 1 9 2 11 4.24295965673703 1.05712007628066 3.18583958045637 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0701714577429645 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117869430_117872194:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117869430_117870513:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117869430_117870592:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117869430_117870503:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117869430_117870613:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117869430_117872196:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117869430_117869660:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000525467:exon_117869430_117870174:IL10RA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 118471423 T/C 1 7 17 24 3.30007973301769 8.98552064838561 -5.68544091536792 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0237903315662806 ENSG00000095139:ENST00000392859:exon_118471340_118471708:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000359415:exon_118471340_118473643:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000264028:exon_118471340_118473643:ARCN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 2754 2931 5685 1298.34565496153 1549.20947178931 -250.863816827776 A:T:C:G A G 10 0.52856003814033 3.00232807585692e-11 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 124502114 C/T 1 5 14 19 2.35719980929835 7.39984053396462 -5.04264072466627 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0222839607838942 ENSG00000154144:ENST00000473629:exon_124501989_124502330:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000530731:exon_124501989_124502348:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000284290:exon_124501989_124505287:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000441174:exon_124501989_124504698:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000375005:exon_124501989_124502331:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000529543:exon_124501989_124503320:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000438907:exon_124501989_124502134:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000491010:exon_124500284_124502339:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000531033:exon_124501989_124502301:TBRG1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 44 67 111 20.7433583218255 35.4135225554021 -14.6701642335766 T:C T C 10 0.52856003814033 0.00571056834862793 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 36 26 62 16.9718386269481 13.7425609916486 3.22927763529954 A:G A G 10 0.52856003814033 0.446840850057335 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 128355988 G/A 1 30 20 50 14.1431988557901 10.5712007628066 3.5719980929835 A:G G A 10 0.52856003814033 0.325295794058059 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128355964_128356041:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128355964_128356041:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000531611:exon_128355964_128356041:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128355964_128356041:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128355964_128356041:ETS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 129739724 C/T 1 9 6 15 4.24295965673703 3.17136022884198 1.07159942789505 T:C C T 10 0.52856003814033 0.616121686737298 ENSG00000170322:ENST00000304521:exon_129739389_129740156:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000446488:exon_129739389_129740156:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524794:exon_129739389_129740156:NFRKB;ENSG00000170322:ENST00000524746:exon_129739389_129740156:NFRKB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 11 134047243 T/C 1 9 5 14 4.24295965673703 2.64280019070165 1.60015946603538 T:C T C 10 0.52856003814033 0.43463285635379 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 863517 G/A 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 A:G G A 10 0.52856003814033 0.531695721084805 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 939302 A/G 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_939169_939326:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_939169_939326:WNK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 993930 C/T 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 1702219 T/C 1 6 13 19 2.82863977115802 6.87128049582429 -4.04264072466627 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0693466793754615 ENSG00000171823:ENST00000339235:exon_1702039_1703331:FBXL14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 3789452 C/T 1 8 3 11 3.77151969487736 1.58568011442099 2.18583958045637 T:C C T 10 0.52856003814033 0.234946711874713 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3789404_3789515:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3789404_3789515:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3789404_3789515:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3789404_3789515:EFCAB4B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 4388084 C/G 1 19 20 39 8.95735927533373 10.5712007628066 -1.61384148747287 C:G C G 10 0.52856003814033 0.633205267079494 ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4387926_4388085:CCND2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 4461485 G/A 1 13 12 25 6.12871950417571 6.34272045768396 -0.214000953508251 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4461426_4469188:C12orf5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 4791379 G/A 1 46 41 87 21.6862382455448 21.6709615637535 0.0152766817912848 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000139180:ENST00000266544:exon_4791371_4791466:NDUFA9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 6500105 T/G 1 3 6 9 1.41431988557901 3.17136022884198 -1.75704034326297 T:G T G 10 0.52856003814033 0.322282730829835 ENSG00000111321:ENST00000228918:exon_6499826_6500733:LTBR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 120 206 326 56.5727954231604 108.883367856908 -52.3105724337476 T:G G T 10 0.52856003814033 6.23573607990229e-09 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 6649710 G/A 1 9 5 14 4.24295965673703 2.64280019070165 1.60015946603538 A:G G A 10 0.52856003814033 0.43463285635379 ENSG00000010295:ENST00000472558:exon_6648127_6649754:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000471408:exon_6648127_6649754:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000465801:exon_6648127_6649754:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000416019:exon_6648694_6649754:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000336604:exon_6648694_6649754:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000494107:exon_6648694_6649754:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000487279:exon_6648694_6649754:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000396840:exon_6648694_6649754:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000356896:exon_6648694_6649754:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000423501:exon_6648694_6649754:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000436152:exon_6648706_6649754:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000396830:exon_6648706_6649754:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000488007:exon_6648743_6649754:IFFO1;ENSG00000010295:ENST00000358846:exon_6649709_6649754:IFFO1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 6675767 A/G 1 22 17 39 10.3716791609127 8.98552064838561 1.38615851252713 A:G A G 10 0.52856003814033 0.749102696220119 ENSG00000111641:ENST00000322166:exon_6675695_6675783:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000382421:exon_6675695_6675783:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000399466:exon_6675695_6675783:NOP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 2 9 11 0.94287992371934 4.75704034326297 -3.81416041954363 A:T T A 10 0.52856003814033 0.0308106138001003 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 A:G A G 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 7047044 C/T 1 8 6 14 3.77151969487736 3.17136022884198 0.60015946603538 T:C C T 10 0.52856003814033 0.795264899593225 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7047008_7047230:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7047008_7047230:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000229279:exon_7047008_7047230:ATN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 7249598 T/C 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000139178:ENST00000266542:exon_7247153_7249759:C1RL;ENSG00000139178:ENST00000396661:exon_7249181_7249759:C1RL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 7592035 G/T 0 51 0 51 24.0434380548432 0 24.0434380548432 G G 10 0.52856003814033 8.83443784970426e-15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 12814822 C/T 0 8 0 8 3.77151969487736 0 3.77151969487736 C C 10 0.52856003814033 0.00853204551585355 ENSG00000183150:ENST00000332427:exon_12813995_12815404:GPR19 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 14976021 A/G 1 7 4 11 3.30007973301769 2.11424015256132 1.18583958045637 A:G A G 10 0.52856003814033 0.556140452563778 ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 16516994 G/A 1 17 16 33 8.01447935161439 8.45696061024528 -0.442481258630892 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000008394:ENST00000010404:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396210:exon_16516729_16517342:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396209:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396207:exon_16516729_16517343:MGST1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 32 25 57 15.0860787795094 13.2140009535083 1.87207782600119 T:C C T 10 0.52856003814033 0.691235498925627 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 22602796 A/G 1 14 19 33 6.60015946603538 10.0426407246663 -3.44248125863089 A:G A G 10 0.52856003814033 0.295437717187171 ENSG00000111731:ENST00000333957:exon_22601541_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000446597:exon_22602479_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000396028:exon_22602479_22602825:KIAA0528 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 25243072 C/T 1 44 39 83 20.7433583218255 20.6138414874729 0.129516834352607 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 32481093 G/C 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000151746:ENST00000457150:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000281474:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000395758:exon_32480395_32481489:BICD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 39695445 G/A 1 3 6 9 1.41431988557901 3.17136022884198 -1.75704034326297 A:G G A 10 0.52856003814033 0.322282730829835 ENSG00000139116:ENST00000341813:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000395670:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361418:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361961:exon_39695282_39695481:KIF21A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 42554505 A/G 1 31 35 66 14.6146388176498 18.4996013349116 -3.88496251726178 A:G A G 10 0.52856003814033 0.388391974622503 ENSG00000015153:ENST00000327791:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000380790:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000442791:exon_42552837_42554628:YAF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 46321547 A/G 1 21 18 39 9.90023919905307 9.51408068652594 0.38615851252713 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 46322449 C/T 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 50529736 G/A 1 11 3 14 5.18583958045637 1.58568011442099 3.60015946603538 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0629725641543962 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50529724_50529852:LASS5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 51203371 C/T 1 6 12 18 2.82863977115802 6.34272045768396 -3.51408068652594 T:C C T 10 0.52856003814033 0.104602675868325 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 52639302 G/C 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000135480:ENST00000331817:exon_52639196_52639416:KRT7;ENSG00000135480:ENST00000422319:exon_52639196_52639416:KRT7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 52642518 G/A 1 7 15 22 3.30007973301769 7.92840057210495 -4.62832083908726 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0553058909861206 ENSG00000135480:ENST00000331817:exon_52642375_52642709:KRT7;ENSG00000135480:ENST00000422319:exon_52642375_52642709:KRT7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 31 30 61 14.6146388176498 15.8568011442099 -1.24216232656013 T:C T C 10 0.52856003814033 0.798165280893737 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 53682986 C/T 1 11 12 23 5.18583958045637 6.34272045768396 -1.15688087722759 T:C C T 10 0.52856003814033 0.67969531497135 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682874_53683087:ESPL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 56142749 G/A 1 11 6 17 5.18583958045637 3.17136022884198 2.01447935161439 A:G G A 10 0.52856003814033 0.467313177256825 ENSG00000135414:ENST00000257868:exon_56142370_56142767:GDF11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 56360876 G/A 1 24 15 39 11.3145590846321 7.92840057210495 3.38615851252713 A:G G A 10 0.52856003814033 0.336419713709802 ENSG00000123374:ENST00000266970:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000440311:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000354056:exon_56360556_56360908:CDK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 56536140 G/C 1 19 33 52 8.95735927533373 17.4424812586309 -8.48512198329716 C:G G C 10 0.52856003814033 0.0252936406304811 ENSG00000139641:ENST00000394048:exon_56536069_56536209:ESYT1;ENSG00000139641:ENST00000267113:exon_56536069_56536209:ESYT1;ENSG00000139641:ENST00000402331:exon_56536069_56536209:ESYT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 14 10 24 6.60015946603538 5.2856003814033 1.31455908463208 T:C C T 10 0.52856003814033 0.684625035844179 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 57627074 G/T 1 199 218 417 93.8165524100743 115.226088314592 -21.4095359045176 T:G G T 10 0.52856003814033 0.0392689974422636 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57626963_57627128:SHMT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 57869582 T/C 0 12 0 12 5.65727954231604 0 5.65727954231604 T T 10 0.52856003814033 0.000596015597603251 ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57869559_57869714:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57869559_57869714:ARHGAP9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 42 39 81 19.8004783981061 20.6138414874729 -0.813363089366732 A:C A C 10 0.52856003814033 0.911528271184507 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 26 38 64 12.2574390083514 20.0852814493325 -7.82784244098112 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0597680526769599 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 58176614 T/C 1 23 14 37 10.8431191227724 7.39984053396462 3.44327858880779 T:C T C 10 0.52856003814033 0.323350657732138 ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 62785663 T/C 1 18 19 37 8.48591931347406 10.0426407246663 -1.55672141119221 T:C T C 10 0.52856003814033 0.625136106908905 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62785596_62785666:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62785596_62785666:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62785596_62785666:USP15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 A:T T A 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 66725202 C/T 1 1 7 8 0.47143996185967 3.69992026698231 -3.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0304181799638115 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 72164395 C/T 1 5 13 18 2.35719980929835 6.87128049582429 -4.51408068652594 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0558100460820762 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 98921623 C/G 1 2 8 10 0.94287992371934 4.22848030512264 -3.2856003814033 C:G C G 10 0.52856003814033 0.0541817455657943 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 104341398 T/A 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 A:T T A 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 105380152 A/C 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 A:C A C 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 108954862 G/C 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 C:G G C 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 108956433 C/T 1 8 4 12 3.77151969487736 2.11424015256132 1.65727954231604 T:C C T 10 0.52856003814033 0.397101977790935 ENSG00000136003:ENST00000311893:exon_108956294_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000392807:exon_108956294_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000431221:exon_108956382_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000338291:exon_108956382_108956512:ISCU HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 10 9 19 4.7143996185967 4.75704034326297 -0.0426407246662706 T:G G T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 10 9 19 4.7143996185967 4.75704034326297 -0.0426407246662706 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 110019338 C/T 1 8 3 11 3.77151969487736 1.58568011442099 2.18583958045637 T:C C T 10 0.52856003814033 0.234946711874713 ENSG00000110921:ENST00000392727:exon_110019200_110019355:MVK;ENSG00000110921:ENST00000447878:exon_110019200_110019355:MVK;ENSG00000110921:ENST00000228510:exon_110019200_110019355:MVK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 112580071 C/T 1 3 7 10 1.41431988557901 3.69992026698231 -2.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.206826979960111 ENSG00000135148:ENST00000257604:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000412615:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000432758:exon_112579893_112580099:TRAFD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 83 70 153 39.1295168343526 36.9992026698231 2.1303141645295 A:G G A 10 0.52856003814033 0.746630464305743 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 113424893 C/G 1 14 15 29 6.60015946603538 7.92840057210495 -1.32824110606957 C:G C G 10 0.52856003814033 0.7109964573597 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 8 9 17 3.77151969487736 4.75704034326297 -0.98552064838561 T:C C T 10 0.52856003814033 0.637676890163413 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 114374887 T/C 1 19 6 25 8.95735927533373 3.17136022884198 5.78599904649175 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0259699471165643 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114374812_114374941:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114374812_114374941:RBM19 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 114377835 A/G 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 A:G A G 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 120636549 C/A 1 27 7 34 12.7288789702111 3.69992026698231 9.02895870322878 A:C C A 10 0.52856003814033 0.00174080376276524 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 120966921 A/G 1 9 5 14 4.24295965673703 2.64280019070165 1.60015946603538 A:G A G 10 0.52856003814033 0.43463285635379 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120966743_120966964:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120966743_120966953:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120966743_120966953:COQ5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 121174938 C/T 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 22 14 36 10.3716791609127 7.39984053396462 2.97183862694812 A:G G A 10 0.52856003814033 0.404312724237877 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 41 27 68 19.3290384362465 14.2711210297889 5.05791740645756 C:G G C 10 0.52856003814033 0.227076596153325 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 22 23 45 10.3716791609127 12.1568808772276 -1.78520171631485 T:C C T 10 0.52856003814033 0.655183539080577 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 12 18 30 5.65727954231604 9.51408068652594 -3.8568011442099 A:G G A 10 0.52856003814033 0.200232689278046 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 7 7 14 3.30007973301769 3.69992026698231 -0.39984053396462 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 122079295 A/G 1 70 43 113 33.0007973301769 22.7280816400342 10.2727156901427 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0592336588809277 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 122079348 T/C 1 88 41 129 41.486716643651 21.6709615637535 19.8157550798974 T:C T C 10 0.52856003814033 0.000532558423868462 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 122079429 T/C 1 96 53 149 45.2582363385283 28.0136820214375 17.2445543170908 T:C T C 10 0.52856003814033 0.00512465447630148 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 122079599 T/A 1 99 55 154 46.6725562241073 29.0708020977182 17.6017541263892 A:T T A 10 0.52856003814033 0.0046358848752674 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 122326812 T/C 1 15 11 26 7.07159942789505 5.81416041954363 1.25743900835142 T:C T C 10 0.52856003814033 0.696829234380297 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122326646_122326900:PSMD9;ENSG00000110801:ENST00000340175:exon_122326646_122326900:PSMD9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 67 44 111 31.5864774445979 23.2566416781745 8.32983576642336 A:G A G 10 0.52856003814033 0.128060869029072 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 123097751 C/T 1 6 9 15 2.82863977115802 4.75704034326297 -1.92840057210495 T:C C T 10 0.52856003814033 0.439187658248891 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123097659_123097777:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123097659_123097777:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000436959:exon_123097659_123097777:KNTC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 8 2 10 3.77151969487736 1.05712007628066 2.7143996185967 T:C C T 10 0.52856003814033 0.115110163415260 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 123738494 C/T 1 62 67 129 29.2292776352995 35.4135225554021 -6.18424492010257 T:C C T 10 0.52856003814033 0.290557769476652 ENSG00000130921:ENST00000253233:exon_123738194_123738503:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000425637:exon_123738194_123739580:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000366329:exon_123738194_123738503:C12orf65 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 123794104 G/T 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 T:G G T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123794036_123794130:SBNO1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 123799938 C/T 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 T:C C T 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 14 9 23 6.60015946603538 4.75704034326297 1.84311912277241 A:G G A 10 0.52856003814033 0.533087865539123 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 124815439 T/C 1 32 23 55 15.0860787795094 12.1568808772276 2.92919790228185 T:C T C 10 0.52856003814033 0.499986516422951 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124815391_124815444:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124815391_124815444:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124815391_124815444:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124815391_124815444:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124815391_124815444:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124815391_124815444:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124815391_124815444:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124815391_124815444:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124815391_124815444:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000418829:exon_124815391_124815444:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440337:exon_124815391_124815444:NCOR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 124817789 A/G 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440337:exon_124817676_124817802:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000461081:exon_124817676_124817825:NCOR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 125263061 C/T 1 47 56 103 22.1576782074045 29.5993621358585 -7.44168392845399 T:C C T 10 0.52856003814033 0.166761533731231 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125262186_125263132:SCARB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 125284748 A/G 1 13 13 26 6.12871950417571 6.87128049582429 -0.742560991648581 A:G A G 10 0.52856003814033 0.845363867960316 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125284670_125284788:SCARB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 125298877 G/A 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125298748_125298951:SCARB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 125626685 C/T 1 31 35 66 14.6146388176498 18.4996013349116 -3.88496251726178 T:C C T 10 0.52856003814033 0.388391974622503 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125626638_125627871:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125626638_125627861:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125626638_125627861:AACS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 132241120 C/T 1 17 7 24 8.01447935161439 3.69992026698231 4.31455908463208 T:C C T 10 0.52856003814033 0.100928155525354 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132241018_132241189:SFSWAP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 132624675 G/A 1 17 31 48 8.01447935161439 16.3853611823502 -8.37088183073584 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0198552449201022 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132624643_132624744:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132624643_132624744:DDX51 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 12 133683020 C/T 1 11 19 30 5.18583958045637 10.0426407246663 -4.8568011442099 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.0986109440450021 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140;ENSG00000196387:ENST00000433577:exon_133682901_133683171:ZNF140 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 21742311 C/T 0 48 0 48 22.6291181692642 0 22.6291181692642 C C 10 0.52856003814033 6.26835863018136e-14 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21742127_21742538:SKA3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 97 102 199 45.729676300388 53.9131238903137 -8.18344758992568 T:C:G C G 10 0.52856003814033 0.256301369004362 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 25009297 G/T 1 57 58 115 26.8720778260012 30.6564822121391 -3.78440438613795 T:G G T 10 0.52856003814033 0.513668426559468 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 25009441 C/G 1 35 35 70 16.5003986650884 18.4996013349116 -1.99920266982311 C:G C G 10 0.52856003814033 0.634515468733035 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 25009485 C/G 1 22 14 36 10.3716791609127 7.39984053396462 2.97183862694812 C:G C G 10 0.52856003814033 0.404312724237877 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 25479541 A/C 1 19 21 40 8.95735927533373 11.0997608009469 -2.1424015256132 A:C A C 10 0.52856003814033 0.529207851346488 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 25480145 G/A 1 8 9 17 3.77151969487736 4.75704034326297 -0.98552064838561 A:G G A 10 0.52856003814033 0.637676890163413 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 224 118 342 105.602551456566 62.3700845005589 43.2324669560071 T:C C T 10 0.52856003814033 2.84281151712220e-06 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 28239940 G/C 1 122 131 253 57.5156753468797 69.2413649963832 -11.7256896495035 C:G G C 10 0.52856003814033 0.147594071278103 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 157 182 339 74.0160740119682 96.1979269415401 -22.1818529295719 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0166301132210770 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 41 37 78 19.3290384362465 19.5567214111922 -0.227682974945743 C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 39587166 A/G 1 59 50 109 27.8149577497205 26.4280019070165 1.38695584270403 A:G A G 10 0.52856003814033 0.848002996833298 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 24 21 45 11.3145590846321 11.0997608009469 0.21479828368515 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 39587865 A/C 1 30 32 62 14.1431988557901 16.9139212204906 -2.77072236470046 A:C A C 10 0.52856003814033 0.525643147716016 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 39587889 T/C 1 34 35 69 16.0289587032288 18.4996013349116 -2.47064263168278 T:C T C 10 0.52856003814033 0.629891642415304 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 41635763 G/A 1 17 6 23 8.01447935161439 3.17136022884198 4.84311912277241 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0582528254395026 ENSG00000120688:ENST00000379487:exon_41635410_41635811:WBP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 41834744 C/T 1 7 4 11 3.30007973301769 2.11424015256132 1.18583958045637 T:C C T 10 0.52856003814033 0.556140452563778 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 26 21 47 12.2574390083514 11.0997608009469 1.15767820740449 A:C A C 10 0.52856003814033 0.771782849129508 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 38 0 38 17.9147185506675 0 17.9147185506675 G G 10 0.52856003814033 4.70039039947931e-11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 48528283 C/T 1 20 13 33 9.4287992371934 6.87128049582429 2.55751874136911 T:C C T 10 0.52856003814033 0.389780865478144 ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48528275_48528417:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000467222:exon_48528275_48528689:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48528278_48528417:SUCLA2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 19 9 28 8.95735927533373 4.75704034326297 4.20031893207076 T:C T C 10 0.52856003814033 0.131076740791388 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 52602919 A/C 1 7 7 14 3.30007973301769 3.69992026698231 -0.39984053396462 A:C A C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 73319171 T/C 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73319119_73319345:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000377814:exon_73319119_73319317:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000471712:exon_73319119_73319183:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73319119_73319345:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000464754:exon_73319119_73319274:C13orf34 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 33 25 58 15.5575187413691 13.2140009535083 2.34351778786086 A:G G A 10 0.52856003814033 0.599633128408749 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 73343039 C/T 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73342923_73343050:DIS3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 12 11 23 5.65727954231604 5.81416041954363 -0.15688087722759 C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 76423248 T/C 1 11 7 18 5.18583958045637 3.69992026698231 1.48591931347406 T:C T C 10 0.52856003814033 0.638181278212874 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76423112_76423428:LMO7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 77574983 A/G 1 10 19 29 4.7143996185967 10.0426407246663 -5.32824110606957 A:G A G 10 0.52856003814033 0.061555168760767 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 103328660 A/G 1 65 75 140 30.6435975208785 39.6420028605248 -8.99840533964621 A:G A G 10 0.52856003814033 0.128604002488726 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103328646_103328765:TPP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 103418728 A/G 1 21 16 37 9.90023919905307 8.45696061024528 1.44327858880779 A:G A G 10 0.52856003814033 0.74251134411024 ENSG00000151287:ENST00000376027:exon_103418340_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376019:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376022:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376021:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376032:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376029:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376031:exon_103418467_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000455589:exon_103418467_103418930:C13orf27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 T:C T C 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 162 138 300 76.3732738212665 72.9412852633655 3.43198855790099 C:G G C 10 0.52856003814033 0.728687788286959 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 111176519 G/T 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 T:G G T 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 111279844 G/A 1 1 8 9 0.47143996185967 4.22848030512264 -3.75704034326297 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0159780666639568 ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111279786_111279899:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000424185:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000397191:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000439607:exon_111279786_111279894:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111279786_111279894:CARKD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 17 9 26 8.01447935161439 4.75704034326297 3.25743900835142 A:G G A 10 0.52856003814033 0.240423666471852 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 12 4 16 5.65727954231604 2.11424015256132 3.54303938975472 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0844359796960055 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 115002305 G/A 1 8 6 14 3.77151969487736 3.17136022884198 0.60015946603538 A:G G A 10 0.52856003814033 0.795264899593225 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115002277_115002371:CDC16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 115004914 C/T 1 9 8 17 4.24295965673703 4.22848030512264 0.0144793516143897 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 115004935 T/C 1 11 14 25 5.18583958045637 7.39984053396462 -2.21400095350825 A:T:C T C 10 0.52856003814033 0.426100767961122 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 115030714 T/C 1 122 142 264 57.5156753468797 75.0555254159269 -17.5398500690471 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0310513678282523 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 13 115047305 G/A 1 8 6 14 3.77151969487736 3.17136022884198 0.60015946603538 A:G G A 10 0.52856003814033 0.795264899593225 ENSG00000169062:ENST00000375299:exon_115047059_115047321:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000492270:exon_115047078_115047321:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000351487:exon_115047103_115047321:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000484246:exon_115047120_115047321:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000480362:exon_115047195_115047321:UPF3A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 20784431 G/A 1 148 128 276 69.7731143552312 67.6556848819622 2.11742947326891 A:G G A 10 0.52856003814033 0.809707975515757 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20784386_20784731:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 24 34 58 11.3145590846321 17.9710412967712 -6.65648221213914 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0877156711283654 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 12 18 30 5.65727954231604 9.51408068652594 -3.8568011442099 C:G G C 10 0.52856003814033 0.200232689278046 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 20928359 C/A 1 6 9 15 2.82863977115802 4.75704034326297 -1.92840057210495 A:C C A 10 0.52856003814033 0.439187658248891 ENSG00000165782:ENST00000250489:exon_20928351_20928457:TMEM55B;ENSG00000165782:ENST00000398020:exon_20928351_20928457:TMEM55B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 20940606 G/A 1 30 25 55 14.1431988557901 13.2140009535083 0.929197902281848 A:G G A 10 0.52856003814033 0.892763036059116 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 20940626 C/T 1 34 34 68 16.0289587032288 17.9710412967712 -1.94208259354244 T:C C T 10 0.52856003814033 0.71585968091083 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 21250124 G/A 1 133 61 194 62.7015149273361 32.2421623265601 30.459352600776 A:G G A 10 0.52856003814033 1.00741551632303e-05 ENSG00000169413:ENST00000304677:exon_21249854_21250626:RNASE6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 21967438 G/A 1 43 44 87 20.2719183599658 23.2566416781745 -2.98472331820871 A:G G A 10 0.52856003814033 0.521903048642948 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 21968619 A/G 1 13 1 14 6.12871950417571 0.52856003814033 5.60015946603538 A:G A G 10 0.52856003814033 0.00223887567332002 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 23282449 C/T 0 0 8 8 0 4.22848030512264 -4.22848030512264 T C T 10 0.52856003814033 0.00244011976995637 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000488800:exon_23282184_23282649:SLC7A7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 65 32 97 30.6435975208785 16.9139212204906 13.729676300388 T:G G T 10 0.52856003814033 0.00580059352071089 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 23346025 G/A 1 47 38 85 22.1576782074045 20.0852814493325 2.07239675807195 A:G G A 10 0.52856003814033 0.665650059876123 ENSG00000197324:ENST00000359591:exon_23345898_23346027:LRP10;ENSG00000197324:ENST00000470660:exon_23345926_23346027:LRP10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 35 23 58 16.5003986650884 12.1568808772276 4.34351778786086 C:G G C 10 0.52856003814033 0.293161086700613 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 23374435 G/A 1 14 18 32 6.60015946603538 9.51408068652594 -2.91392122049056 A:G G A 10 0.52856003814033 0.376407054068302 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374303_23374455:RBM23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 23374862 C/T 1 9 9 18 4.24295965673703 4.75704034326297 -0.51408068652594 T:C C T 10 0.52856003814033 0.818276179396142 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374815_23374868:RBM23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 24 24 48 11.3145590846321 12.6854409153679 -1.37088183073584 A:G A G 10 0.52856003814033 0.772920077769575 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 38 19 57 17.9147185506675 10.0426407246663 7.87207782600119 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0457291851516755 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 23945598 G/A 1 70 75 145 33.0007973301769 39.6420028605248 -6.64120553034786 A:G G A 10 0.52856003814033 0.280263616465060 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23945448_23945616:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23945448_23945616:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23945448_23945616:NGDN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 24029436 C/A 1 7 3 10 3.30007973301769 1.58568011442099 1.7143996185967 A:C C A 10 0.52856003814033 0.351744435761646 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 8 9 17 3.77151969487736 4.75704034326297 -0.98552064838561 A:G A G 10 0.52856003814033 0.637676890163413 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 24 17 41 11.3145590846321 8.98552064838561 2.32903843624647 A:T A T 10 0.52856003814033 0.532790301318707 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 24568323 C/T 1 14 14 28 6.60015946603538 7.39984053396462 -0.799681067929241 T:C C T 10 0.52856003814033 0.850610910526834 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24568258_24568445:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24568258_24568445:PCK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 24572812 G/A 1 74 87 161 34.8865571776156 45.9847233182087 -11.0981661405931 A:T:G G A 10 0.52856003814033 0.0827395731675623 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24572719_24573339:PCK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 T:C C T 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 24761805 A/C 1 2 9 11 0.94287992371934 4.75704034326297 -3.81416041954363 A:C A C 10 0.52856003814033 0.0308106138001003 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 24768192 G/A 1 11 5 16 5.18583958045637 2.64280019070165 2.54303938975472 A:G G A 10 0.52856003814033 0.222015324368485 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24768163_24768336:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24768163_24768336:DHRS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 24785092 G/T 1 9 4 13 4.24295965673703 2.11424015256132 2.12871950417571 T:G G T 10 0.52856003814033 0.277047309964302 ENSG00000213903:ENST00000345363:exon_24784843_24786152:LTB4R;ENSG00000213903:ENST00000396789:exon_24784843_24787061:LTB4R;ENSG00000213903:ENST00000396782:exon_24784843_24787242:LTB4R HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 5 7 12 2.35719980929835 3.69992026698231 -1.34272045768396 C:G C G 10 0.52856003814033 0.566216755054812 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 44 44 88 20.7433583218255 23.2566416781745 -2.51328335634904 A:G G A 10 0.52856003814033 0.595452710144786 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 35871960 G/A 1 14 9 23 6.60015946603538 4.75704034326297 1.84311912277241 A:G G A 10 0.52856003814033 0.533087865539123 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 39644498 G/A 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39644425_39644596:PNN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 39650824 C/T 1 321 342 663 151.332227756954 180.767533043993 -29.4353052870388 A:T:C:G C T 10 0.52856003814033 0.0239869784832804 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 39650924 A/G 1 229 205 434 107.959751265864 108.354807818768 -0.395056552903227 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 39871017 T/C 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 T:C T C 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000165355:ENST00000298097:exon_39870380_39871065:FBXO33 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 45696037 T/G 1 13 5 18 6.12871950417571 2.64280019070165 3.48591931347406 T:G T G 10 0.52856003814033 0.154748832098885 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45695946_45696039:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45696029_45696039:C14orf106 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 45711594 T/C 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 T:C T C 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45711237_45711683:C14orf106 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 51196407 G/T 1 20 16 36 9.4287992371934 8.45696061024528 0.971838626948118 T:G G T 10 0.52856003814033 0.867744765296129 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51196241_51196441:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51196241_51196441:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51196241_51196441:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51196241_51196441:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51196241_51196441:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51196241_51196441:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51196241_51196441:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51196241_51196441:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51196241_51196441:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51196241_51196441:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51196241_51196441:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51196241_51196441:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51196241_51196441:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51196241_51196441:NIN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 51219349 G/A 1 14 19 33 6.60015946603538 10.0426407246663 -3.44248125863089 A:G G A 10 0.52856003814033 0.295437717187171 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51219236_51219451:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51219236_51219451:NIN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 53325090 C/T 1 9 6 15 4.24295965673703 3.17136022884198 1.07159942789505 T:C C T 10 0.52856003814033 0.616121686737298 ENSG00000073712:ENST00000341590:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000395631:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000343279:exon_53323993_53325268:FERMT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 55604935 C/A 1 10 4 14 4.7143996185967 2.11424015256132 2.60015946603538 A:C C A 10 0.52856003814033 0.189499784192365 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 18 17 35 8.48591931347406 8.98552064838561 -0.499601334911551 A:C A C 10 0.52856003814033 0.867525314175691 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 55619311 A/G 1 51 50 101 24.0434380548432 26.4280019070165 -2.38456385217333 A:G A G 10 0.52856003814033 0.690388728097337 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 55818517 T/A 1 15 10 25 7.07159942789505 5.2856003814033 1.78599904649175 A:T T A 10 0.52856003814033 0.550569951685472 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 55818706 T/C 1 12 10 22 5.65727954231604 5.2856003814033 0.371679160912739 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 59939727 T/C 1 10 10 20 4.7143996185967 5.2856003814033 -0.571200762806601 T:C T C 10 0.52856003814033 0.826187510866658 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 67805403 C/T 1 24 16 40 11.3145590846321 8.45696061024528 2.8575984743868 T:C C T 10 0.52856003814033 0.429448649690425 ENSG00000100554:ENST00000216442:exon_67804806_67805479:ATP6V1D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 70235586 G/A 1 157 163 320 74.0160740119682 86.1552862168738 -12.1392122049056 A:G G A 10 0.52856003814033 0.179241706131025 ENSG00000100650:ENST00000394366:exon_70235515_70235613:SRSF5;ENSG00000100650:ENST00000451983:exon_70235515_70235613:SRSF5;ENSG00000100650:ENST00000344070:exon_70235515_70235613:SRSF5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 28 24 52 13.2003189320708 12.6854409153679 0.51487801670284 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 74388908 T/C 1 12 23 35 5.65727954231604 12.1568808772276 -6.49960133491155 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0406134531752317 ENSG00000119725:ENST00000334521:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000458102:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000442160:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000398139:exon_74388769_74388909:ZNF410 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 74428000 A/T 1 10 5 15 4.7143996185967 2.64280019070165 2.07159942789505 A:T A T 10 0.52856003814033 0.313640302764783 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74427876_74428078:COQ6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 31 35 66 14.6146388176498 18.4996013349116 -3.88496251726178 A:G G A 10 0.52856003814033 0.388391974622503 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 12 8 20 5.65727954231604 4.22848030512264 1.4287992371934 T:C T C 10 0.52856003814033 0.655655571127766 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 78174473 A/C 1 81 72 153 38.1866369106333 38.0563227461038 0.130314164529509 A:C A C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 78184566 C/A 1 99 99 198 46.6725562241073 52.3274437758927 -5.65488755178535 A:C C A 10 0.52856003814033 0.434175082728003 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78183946_78184629:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78183946_78184629:SNW1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 31 22 53 14.6146388176498 11.6283208390873 2.98631797856251 T:C C T 10 0.52856003814033 0.491891055510259 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 90744672 G/A 1 3 14 17 1.41431988557901 7.39984053396462 -5.98552064838561 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00566557927197770 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90744398_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90744402_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90744402_90744805:C14orf102 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 90745422 T/C 1 11 10 21 5.18583958045637 5.2856003814033 -0.0997608009469308 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90745406_90745477:C14orf102 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 91636395 C/T 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000133943:ENST00000521334:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518871:exon_91636347_91636416:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522170:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000519950:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517518:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523894:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521064:exon_91636347_91636466:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91636385_91636545:C14orf159 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 91739081 A/G 1 16 18 34 7.54303938975472 9.51408068652594 -1.97104129677122 A:G A G 10 0.52856003814033 0.606991695211752 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000427583:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000334448:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000331194:exon_91738969_91739562:CCDC88C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 8 4 12 3.77151969487736 2.11424015256132 1.65727954231604 T:C C T 10 0.52856003814033 0.397101977790935 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 92470291 T/A 1 20 11 31 9.4287992371934 5.81416041954363 3.61463881764977 A:T T A 10 0.52856003814033 0.211922767246012 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92469763_92472792:TRIP11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 267 214 481 125.874469816532 113.111848162031 12.7626216545013 T:G T G 10 0.52856003814033 0.253652510127335 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 12 8 20 5.65727954231604 4.22848030512264 1.4287992371934 T:C C T 10 0.52856003814033 0.655655571127766 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 93119407 C/T 1 20 13 33 9.4287992371934 6.87128049582429 2.55751874136911 T:C C T 10 0.52856003814033 0.389780865478144 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 85 100 185 40.0723967580719 52.856003814033 -12.7836070559611 T:C C T 10 0.52856003814033 0.065463908221941 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 93180727 A/G 1 16 10 26 7.54303938975472 5.2856003814033 2.25743900835142 A:G A G 10 0.52856003814033 0.435111822543937 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93180721_93180796:LGMN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 15 11 26 7.07159942789505 5.81416041954363 1.25743900835142 C:G C G 10 0.52856003814033 0.696829234380297 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 7 10 17 3.30007973301769 5.2856003814033 -1.98552064838561 A:G A G 10 0.52856003814033 0.345083621048323 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 94405871 G/C 1 9 16 25 4.24295965673703 8.45696061024528 -4.21400095350825 C:G G C 10 0.52856003814033 0.109429702594063 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94405454_94406018:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94405454_94406018:ASB2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 94417421 G/A 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 94417541 A/G 1 7 8 15 3.30007973301769 4.22848030512264 -0.92840057210495 A:G A G 10 0.52856003814033 0.79709726410062 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 94417586 G/A 1 9 12 21 4.24295965673703 6.34272045768396 -2.09976080094693 A:G G A 10 0.52856003814033 0.388875747413323 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 135 122 257 63.6443948510554 64.4843246531203 -0.839929802064823 A:T:C T C 10 0.52856003814033 0.950202996076832 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 95910933 T/C 1 13 4 17 6.12871950417571 2.11424015256132 4.01447935161439 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0552329538663803 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95910822_95910965:C14orf49 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 97299853 A/G 1 15 8 23 7.07159942789505 4.22848030512264 2.84311912277241 A:G A G 10 0.52856003814033 0.297564808088866 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97299804_97299968:VRK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 97321689 C/T 1 49 46 95 23.1005581311238 24.3137617544552 -1.21320362333135 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.83751694198631 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97321561_97321693:VRK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 99876505 A/G 1 9 5 14 4.24295965673703 2.64280019070165 1.60015946603538 A:G A G 10 0.52856003814033 0.43463285635379 ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99876141_99876552:SETD3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 66 44 110 31.1150374827382 23.2566416781745 7.8583958045637 A:G G A 10 0.52856003814033 0.151831052501066 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 100996312 T/C 1 11 7 18 5.18583958045637 3.69992026698231 1.48591931347406 T:C T C 10 0.52856003814033 0.638181278212874 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100996157_100996625:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100996157_100996640:WDR25 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 102391577 G/C 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 C:G G C 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000078304:ENST00000328724:exon_102391478_102394022:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334743:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000350249:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334756:exon_102391478_102394075:PPP2R5C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 102551674 C/T 1 946 845 1791 445.982203919248 446.633232228579 -0.651028309331082 T:C C T 10 0.52856003814033 0.981120455981526 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102551635_102551768:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102551635_102551768:HSP90AA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 102808330 C/T 1 16 15 31 7.54303938975472 7.92840057210495 -0.385361182350231 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 102814945 G/A 1 139 87 226 65.5301546984941 45.9847233182087 19.5454313802854 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00932247522864802 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 103342049 T/C 1 20 22 42 9.4287992371934 11.6283208390873 -2.19952160189386 T:C T C 10 0.52856003814033 0.53839837659526 ENSG00000131323:ENST00000392745:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000347662:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000351691:exon_103341961_103342065:TRAF3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 105179194 T/C 1 3 8 11 1.41431988557901 4.22848030512264 -2.81416041954363 T:C T C 10 0.52856003814033 0.129625044921933 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000480763:exon_105179170_105179270:INF2;ENSG00000203485:ENST00000477497:exon_105179050_105179329:INF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 105180652 C/T 1 11 12 23 5.18583958045637 6.34272045768396 -1.15688087722759 T:C C T 10 0.52856003814033 0.67969531497135 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/C 1 9 9 18 4.24295965673703 4.75704034326297 -0.51408068652594 A:C A C 10 0.52856003814033 0.818276179396142 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 42 29 71 19.8004783981061 15.3282411060696 4.47223729203657 T:C C T 10 0.52856003814033 0.341703327367925 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 105239894 C/T 1 14 17 31 6.60015946603538 8.98552064838561 -2.38536118235023 T:C C T 10 0.52856003814033 0.472618372786915 ENSG00000142208:ENST00000349310:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000407796:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000402615:exon_105239792_105239917:AKT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 28 33 61 13.2003189320708 17.4424812586309 -4.24216232656013 A:G G A 10 0.52856003814033 0.305780515326655 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 106110966 C/T 1 14 7 21 6.60015946603538 3.69992026698231 2.90023919905307 T:C C T 10 0.52856003814033 0.274795735904410 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 106174261 C/G 1 23 199 222 10.8431191227724 105.183447589926 -94.3403284671533 C:G C G 10 0.52856003814033 9.28943409413224e-41 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 106236141 G/A 1 1082 106 1188 510.098038732163 56.027364042875 454.070674689288 A:G G A 10 0.52856003814033 4.97089094837382e-181 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 14 106307418 G/A 1 91 1127 1218 42.90103652923 595.687162984152 -552.786126454922 A:T:G G A 10 0.52856003814033 1.32607849070139e-254 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 34159986 T/C 1 17 7 24 8.01447935161439 3.69992026698231 4.31455908463208 T:C T C 10 0.52856003814033 0.100928155525354 ENSG00000169857:ENST00000306730:exon_34159696_34160056:AVEN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 34634124 C/G 1 487 7 494 229.591261425659 3.69992026698231 225.891341158677 C:G C G 10 0.52856003814033 1.62200564730008e-122 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 34634138 G/A 1 520 27 547 245.148780167028 14.2711210297889 230.877659137239 A:G G A 10 0.52856003814033 7.98608658517932e-108 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 34634139 T/C 1 505 34 539 238.077180739133 17.9710412967712 220.106139442362 T:C T C 10 0.52856003814033 1.53059075644308e-97 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 40313141 C/T 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40313100_40313228:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40313100_40313228:EIF2AK4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 40327290 A/G 1 59 53 112 27.8149577497205 28.0136820214375 -0.198724271716966 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 71 65 136 33.4722372920366 34.3564024791214 -0.884165187084882 A:G G A 10 0.52856003814033 0.931603279286704 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 40328665 G/A 1 978 932 1910 461.068282698757 492.617955546788 -31.5496728480304 A:T:G G A 10 0.52856003814033 0.148834176985525 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40327891_40328701:SRP14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 40849408 C/T 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.743227953420132 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 41819696 T/C 1 1 7 8 0.47143996185967 3.69992026698231 -3.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0304181799638115 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41819621_41819803:RPAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 45059390 C/T 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 T:C C T 10 0.52856003814033 0.594416539080471 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 49620200 C/T 1 10 29 39 4.7143996185967 15.3282411060696 -10.6138414874729 T:C C T 10 0.52856003814033 0.000652627540862189 ENSG00000156958:ENST00000327171:exon_49620149_49622002:GALK2;ENSG00000156958:ENST00000396509:exon_49620149_49622002:GALK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 56739063 C/T 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 T:C C T 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000138587:ENST00000260453:exon_56739039_56739141:MNS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 63433785 G/A 1 114 100 214 53.7441556520024 52.856003814033 0.888151837969374 A:G G A 10 0.52856003814033 0.945442229017638 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 63597857 T/G 1 5 10 15 2.35719980929835 5.2856003814033 -2.92840057210495 T:G T G 10 0.52856003814033 0.194617397098600 ENSG00000138613:ENST00000380343:exon_63597813_63601324:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000261879:exon_63597813_63601325:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000380340:exon_63597813_63598754:APH1B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 8 11 19 3.77151969487736 5.81416041954363 -2.04264072466627 A:G G A 10 0.52856003814033 0.367905468198703 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 64710827 T/C 1 8 10 18 3.77151969487736 5.2856003814033 -1.51408068652594 T:C T C 10 0.52856003814033 0.490005542254718 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64710740_64710927:TRIP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 64966526 C/T 1 16 6 22 7.54303938975472 3.17136022884198 4.37167916091274 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0857064844778537 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64966115_64968455:ZNF609 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 66618342 A/G 1 26 13 39 12.2574390083514 6.87128049582429 5.38615851252713 A:G A G 10 0.52856003814033 0.107789259833537 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 70350607 C/T 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70350498_70350630:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70350489_70350630:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70350498_70350630:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70350489_70350630:TLE3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 89008835 A/G 1 34 47 81 16.0289587032288 24.8423217925955 -8.81336308936674 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0580472879776735 ENSG00000173867:ENST00000312475:exon_89008818_89009004:MRPL46;ENSG00000173867:ENST00000445432:exon_89008818_89009004:MRPL46 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 283 269 552 133.417509206287 142.182650259749 -8.76514105346217 A:T:G A G 10 0.52856003814033 0.468707774485233 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 89860786 A/C 1 7 4 11 3.30007973301769 2.11424015256132 1.18583958045637 A:C A C 10 0.52856003814033 0.556140452563778 ENSG00000140521:ENST00000526671:exon_89860607_89861059:POLG HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 90771704 G/A 1 9 10 19 4.24295965673703 5.2856003814033 -1.04264072466627 A:G G A 10 0.52856003814033 0.653229248249193 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 91485698 G/C 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91485667_91485978:UNC45A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 91543010 T/C 1 10 9 19 4.7143996185967 4.75704034326297 -0.0426407246662706 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91542907_91543023:VPS33B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 100269680 G/C 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 160602 T/G 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 T:G T G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000103148:ENST00000405960:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000445810:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000428323:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399957:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399953:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000262313:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399951:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000473674:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000483663:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000457916:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000468260:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000456528:exon_160523_160604:NPRL3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 347064 G/A 1 18 18 36 8.48591931347406 9.51408068652594 -1.02816137305188 A:G G A 10 0.52856003814033 0.741707280310665 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347056_347226:AXIN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 134 93 227 63.1729548891958 49.1560835470507 14.0168713421451 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0629719567882784 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 28 9 37 13.2003189320708 4.75704034326297 8.44327858880779 T:C T C 10 0.52856003814033 0.00752653182588069 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 427784 G/A 1 10 1 11 4.7143996185967 0.52856003814033 4.18583958045637 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0131344150402337 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427671_427805:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427671_427807:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 449345 G/C 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 C:G G C 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449295_449480:NME4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 151 139 290 71.1874342408102 73.4698453015059 -2.28241106069571 A:C:G G A 10 0.52856003814033 0.814091844184786 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 450165 T/C 1 7 1 8 3.30007973301769 0.52856003814033 2.77151969487736 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0738868803430894 ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_450109_450190:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 460358 G/T 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:G G T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_460243_460367:NME4;ENSG00000242612:ENST00000219481:exon_460243_460367:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000382934:exon_460243_460367:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000424398:exon_460243_460367:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000439661:exon_460209_460367:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000437024:exon_460243_460367:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000445291:exon_460243_460367:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000461947:exon_460243_460404:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000429116:exon_460243_460404:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000461749:exon_459599_460367:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000469922:exon_460112_460367:DECR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 16 22 38 7.54303938975472 11.6283208390873 -4.08528144933254 A:G A G 10 0.52856003814033 0.196772928599343 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 705110 G/A 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_705029_705147:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000429287:exon_705029_705147:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000420061:exon_705029_705147:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000389495:exon_705029_705147:WDR90 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 837116 C/G 1 15 17 32 7.07159942789505 8.98552064838561 -1.91392122049056 C:G C G 10 0.52856003814033 0.596081373087417 ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_837077_837179:RPUSD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 904551 G/C 1 9 13 22 4.24295965673703 6.87128049582429 -2.62832083908726 C:G G C 10 0.52856003814033 0.290886693884256 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_903638_904706:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_903638_904706:LMF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 1818503 G/C 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 C:G G C 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 101 90 191 47.6154361478267 47.5704034326297 0.0450327151969603 A:T:G T A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 1827836 T/C 1 37 28 65 17.4432785888078 14.7996810679292 2.64359752087855 T:C T C 10 0.52856003814033 0.53662084761443 ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000162032:ENST00000301717:exon_1827748_1827873:SPSB3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 1838640 T/C 1 122 93 215 57.5156753468797 49.1560835470507 8.35959179982905 A:T:C T C 10 0.52856003814033 0.274477821664019 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 1877494 T/C 1 18 21 39 8.48591931347406 11.0997608009469 -2.61384148747287 T:C T C 10 0.52856003814033 0.426070117386460 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 1877550 A/G 1 29 24 53 13.6717588939304 12.6854409153679 0.986317978562509 A:G A G 10 0.52856003814033 0.890745662385714 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 1877558 G/A 1 33 35 68 15.5575187413691 18.4996013349116 -2.94208259354244 A:G G A 10 0.52856003814033 0.543959547581953 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2009697 C/T 1 62 64 126 29.2292776352995 33.8278424409811 -4.59856480568158 T:C C T 10 0.52856003814033 0.423085021597362 ENSG00000140990:ENST00000268668:exon_2009519_2009755:NDUFB10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2014424 C/G 1 1 9 10 0.47143996185967 4.75704034326297 -4.2856003814033 C:G C G 10 0.52856003814033 0.00832466243874547 ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 68 54 122 32.0579174064576 28.5422420595778 3.51567534687973 A:C A C 10 0.52856003814033 0.586550961080432 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2035868 C/T 1 57 68 125 26.8720778260012 35.9420825935424 -9.07000476754126 T:C C T 10 0.52856003814033 0.107477219837846 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2048826 C/G 1 25 13 38 11.7859990464917 6.87128049582429 4.91471855066746 C:G C G 10 0.52856003814033 0.142818868576511 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2049003 A/T 1 7 3 10 3.30007973301769 1.58568011442099 1.7143996185967 A:T A T 10 0.52856003814033 0.351744435761646 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048966_2049122:ZNF598 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 35 33 68 16.5003986650884 17.4424812586309 -0.942082593542445 A:G A G 10 0.52856003814033 0.903441327104524 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2203041 G/T 1 3 7 10 1.41431988557901 3.69992026698231 -2.2856003814033 T:G G T 10 0.52856003814033 0.206826979960111 ENSG00000167964:ENST00000210187:exon_2202990_2203046:RAB26 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2220647 C/T 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000131653:ENST00000326181:exon_2220615_2220731:TRAF7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2285357 C/T 1 48 46 94 22.6291181692642 24.3137617544552 -1.68464358519102 T:C C T 10 0.52856003814033 0.757214266425784 ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2293184 G/A 1 45 41 86 21.2147982836851 21.6709615637535 -0.456163280068385 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000167969:ENST00000301729:exon_2293047_2293225:DCI HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2326753 G/A 1 11 6 17 5.18583958045637 3.17136022884198 2.01447935161439 A:G G A 10 0.52856003814033 0.467313177256825 ENSG00000167972:ENST00000301732:exon_2325877_2326806:ABCA3;ENSG00000167972:ENST00000382381:exon_2325879_2326806:ABCA3;ENSG00000167972:ENST00000436770:exon_2326177_2326806:ABCA3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2512523 G/A 1 1 11 12 0.47143996185967 5.81416041954363 -5.34272045768396 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00221769833474503 ENSG00000162062:ENST00000361837:exon_2512416_2512527:C16orf59;ENSG00000162062:ENST00000483320:exon_2512416_2512527:C16orf59 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2812647 C/T 1 10 12 22 4.7143996185967 6.34272045768396 -1.62832083908726 T:C C T 10 0.52856003814033 0.527192616710381 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 17 14 31 8.01447935161439 7.39984053396462 0.614638817649769 A:G A G 10 0.52856003814033 0.859133520696697 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2814162 G/A 1 21 21 42 9.90023919905307 11.0997608009469 -1.19952160189386 A:G G A 10 0.52856003814033 0.758487243409083 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2820882 G/T 1 503 486 989 237.134300815414 256.8801785362 -19.7458777207864 T:C:G G T 10 0.52856003814033 0.214211140491314 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382300:exon_2820859_2821411:SRRM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2880286 T/C 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2880170_2880329:ZG16B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 2983483 C/G 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 C:G C G 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 3170188 C/T 1 12 14 26 5.65727954231604 7.39984053396462 -1.74256099164858 T:C C T 10 0.52856003814033 0.558131650023887 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 19 15 34 8.95735927533373 7.92840057210495 1.02895870322878 C:G C G 10 0.52856003814033 0.735448892895924 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 3534892 G/A 1 20 10 30 9.4287992371934 5.2856003814033 4.1431988557901 A:G G A 10 0.52856003814033 0.145808863789451 ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3534699_3535061:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3534699_3535083:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000421765:exon_3534691_3534926:NAT15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 3708820 C/G 1 156 15 171 73.5446340501085 7.92840057210495 65.6162334780036 C:G C G 10 0.52856003814033 1.7301226879147e-27 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3708794_3708866:TRAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 3721773 G/C 1 129 5 134 60.8157550798974 2.64280019070165 58.1729548891958 C:G G C 10 0.52856003814033 1.69581309654916e-29 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3721723_3721792:TRAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 4 65 69 1.88575984743868 34.3564024791214 -32.4706426316828 C:G G C 10 0.52856003814033 4.71255862401737e-17 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 4415038 G/A 0 64 0 64 30.1721575590189 0 30.1721575590189 G G 10 0.52856003814033 1.98830912097664e-18 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4415004_4415061:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4415004_4415061:CORO7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 9 4 13 4.24295965673703 2.11424015256132 2.12871950417571 T:C T C 10 0.52856003814033 0.277047309964302 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 8 5 13 3.77151969487736 2.64280019070165 1.12871950417571 A:T A T 10 0.52856003814033 0.589189446313547 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 A:T T A 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 8 6 14 3.77151969487736 3.17136022884198 0.60015946603538 T:C C T 10 0.52856003814033 0.795264899593225 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 4910861 C/G 1 10 17 27 4.7143996185967 8.98552064838561 -4.27112102978891 C:G C G 10 0.52856003814033 0.122832916601449 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4910665_4911103:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4910665_4911103:UBN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 5128001 C/T 1 7 8 15 3.30007973301769 4.22848030512264 -0.92840057210495 T:C C T 10 0.52856003814033 0.79709726410062 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5127908_5128018:ALG1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 5139186 G/C 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 C:G G C 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 5139217 C/G 1 7 7 14 3.30007973301769 3.69992026698231 -0.39984053396462 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 5140541 G/C 1 8 8 16 3.77151969487736 4.22848030512264 -0.456960610245281 C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5140433_5140566:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5140433_5140566:FAM86A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 72 81 153 33.9436772538962 42.8133630893667 -8.86968583547049 A:G A G 10 0.52856003814033 0.168500444056587 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 11000848 G/C 1 12 6 18 5.65727954231604 3.17136022884198 2.48591931347406 C:G G C 10 0.52856003814033 0.345436270087802 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 11001421 C/A 1 17 11 28 8.01447935161439 5.81416041954363 2.20031893207076 A:C C A 10 0.52856003814033 0.452917850447464 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 11001770 G/T 1 14 16 30 6.60015946603538 8.45696061024528 -1.8568011442099 T:G G T 10 0.52856003814033 0.584372825849598 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 11002904 G/A 1 9 10 19 4.24295965673703 5.2856003814033 -1.04264072466627 A:G G A 10 0.52856003814033 0.653229248249193 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 11769948 C/T 1 13 6 19 6.12871950417571 3.17136022884198 2.95735927533373 T:C C T 10 0.52856003814033 0.25018193083756 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 13 8 21 6.12871950417571 4.22848030512264 1.90023919905307 T:C C T 10 0.52856003814033 0.51366593633507 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 89 68 157 41.9581566055106 35.9420825935424 6.01607401196818 C:G C G 10 0.52856003814033 0.379277751410548 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 11852354 A/C 1 5 13 18 2.35719980929835 6.87128049582429 -4.51408068652594 A:C A C 10 0.52856003814033 0.0558100460820762 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 14742400 T/G 1 36 24 60 16.9718386269481 12.6854409153679 4.2863977115802 T:G T G 10 0.52856003814033 0.301736293777521 ENSG00000103429:ENST00000261658:exon_14742245_14742449:BFAR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 15129970 A/G 1 6 12 18 2.82863977115802 6.34272045768396 -3.51408068652594 A:G A G 10 0.52856003814033 0.104602675868325 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 15131962 A/G 1 68 44 112 32.0579174064576 23.2566416781745 8.80127572828303 A:G A G 10 0.52856003814033 0.107460557845972 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 15131974 G/T 1 65 33 98 30.6435975208785 17.4424812586309 13.2011162622477 T:G G T 10 0.52856003814033 0.00827695116420696 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 15133889 T/G 1 15 19 34 7.07159942789505 10.0426407246663 -2.97104129677122 T:G T G 10 0.52856003814033 0.39073568744534 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 15793639 C/T 1 45 37 82 21.2147982836851 19.5567214111922 1.65807687249294 T:C C T 10 0.52856003814033 0.741069988675306 ENSG00000072864:ENST00000396353:exon_15793586_15793679:NDE1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 15818141 A/C 1 15 17 32 7.07159942789505 8.98552064838561 -1.91392122049056 A:C A C 10 0.52856003814033 0.596081373087417 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 20 41 61 9.4287992371934 21.6709615637535 -12.2421623265601 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00190566845519629 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 15818653 G/A 1 54 28 82 25.4577579404222 14.7996810679292 10.6580768724929 A:G G A 10 0.52856003814033 0.01993310026166 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818504_15818656:MYH11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 15961351 T/C 1 17 5 22 8.01447935161439 2.64280019070165 5.37167916091274 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0304806990395939 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 15961356 C/T 1 17 4 21 8.01447935161439 2.11424015256132 5.90023919905307 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0141397657673816 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 15961369 G/A 0 19 0 19 8.95735927533373 0 8.95735927533373 G G 10 0.52856003814033 6.10402719264681e-06 ENSG00000133393:ENST00000255759:exon_15959576_15961373:C16orf63;ENSG00000133393:ENST00000413903:exon_15959576_15961373:C16orf63 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 16228242 G/A 1 3 8 11 1.41431988557901 4.22848030512264 -2.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.129625044921933 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16228207_16228365:ABCC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 8 5 13 3.77151969487736 2.64280019070165 1.12871950417571 T:C C T 10 0.52856003814033 0.589189446313547 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 20748331 C/A 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 A:C C A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000066654:ENST00000381337:exon_20748182_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000396083:exon_20744991_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000431224:exon_20746723_20748608:THUMPD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 23403744 A/G 1 13 19 32 6.12871950417571 10.0426407246663 -3.91392122049056 A:G A G 10 0.52856003814033 0.214699143984084 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23403701_23403844:COG7;ENSG00000168434:ENST00000429391:exon_23403701_23403844:COG7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 23409440 G/A 1 14 7 21 6.60015946603538 3.69992026698231 2.90023919905307 A:G G A 10 0.52856003814033 0.274795735904410 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23409367_23409450:COG7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 23535680 A/C 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:C A C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23533335_23535775:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23534832_23535775:EARS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 23672560 A/T 1 9 7 16 4.24295965673703 3.69992026698231 0.54303938975472 A:T A T 10 0.52856003814033 0.808687083852748 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23672491_23672602:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23672491_23672563:DCTN5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 23677006 A/G 1 15 30 45 7.07159942789505 15.8568011442099 -8.78520171631485 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0105290973635757 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23676947_23677049:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23676996_23677049:DCTN5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 23701458 G/A 1 138 112 250 65.0587147366345 59.198724271717 5.85999046491749 A:G G A 10 0.52856003814033 0.486071262135404 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 23701538 A/G 1 272 286 558 128.23166962583 151.168170908134 -22.9365012823042 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0562822457744822 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 24202458 C/T 1 31 16 47 14.6146388176498 8.45696061024528 6.15767820740449 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0799531717943647 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000466124:exon_24202411_24202909:PRKCB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 24582299 C/G 1 97 74 171 45.729676300388 39.1134428223844 6.61623347800356 C:G C G 10 0.52856003814033 0.320287370513776 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 174 173 347 82.0305533635826 91.4408865982771 -9.41033323469452 A:G A G 10 0.52856003814033 0.333128575976127 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 24788645 T/A 1 6 13 19 2.82863977115802 6.87128049582429 -4.04264072466627 A:T T A 10 0.52856003814033 0.0693466793754615 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24788254_24788679:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24788569_24788679:TNRC6A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 33 38 71 15.5575187413691 20.0852814493325 -4.52776270796343 T:C T C 10 0.52856003814033 0.287406631726009 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 29675928 C/T 1 108 126 234 50.9155158808444 66.5985648056816 -15.6830489248372 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.042330909198681 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 30536672 A/G 1 27 39 66 12.7288789702111 20.6138414874729 -7.88496251726178 A:G A G 10 0.52856003814033 0.063688761822807 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 31193942 C/A 1 169 127 296 79.6733535542842 67.1271248438219 12.5462287104623 A:C C A 10 0.52856003814033 0.145993683605925 ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 46723598 T/C 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000091651:ENST00000219097:exon_46723558_46723682:ORC6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 50711334 G/A 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 A:G G A 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50711308_50711446:SNX20 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 50745583 T/G 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 T:G T G 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000167207:ENST00000526417:exon_50744469_50746284:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000300589:exon_50744469_50746284:NOD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 53514580 A/G 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53514479_53514681:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53514479_53514681:RBL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 56396486 C/T 1 71 61 132 33.4722372920366 32.2421623265601 1.23007496547643 T:C C T 10 0.52856003814033 0.861848605754768 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 56873495 C/T 1 29 34 63 13.6717588939304 17.9710412967712 -4.29928240284079 T:C C T 10 0.52856003814033 0.313206881228702 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56873433_56873516:NUP93 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 57080528 C/A 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:C C A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57080464_57080553:NLRC5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 57108465 G/C 0 8 0 8 3.77151969487736 0 3.77151969487736 G G 10 0.52856003814033 0.00853204551585355 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 57392733 A/C 1 46 91 137 21.6862382455448 48.09896347077 -26.4127252252252 A:C A C 10 0.52856003814033 6.81722796136123e-06 ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57392684_57392801:CCL22 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 57499902 T/C 1 16 5 21 7.54303938975472 2.64280019070165 4.90023919905307 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0466706947021433 ENSG00000102978:ENST00000219252:exon_57499865_57499933:POLR2C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 57787027 C/T 1 9 6 15 4.24295965673703 3.17136022884198 1.07159942789505 T:C C T 10 0.52856003814033 0.616121686737298 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786989_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786989_57787179:KATNB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 58550484 G/A 1 8 5 13 3.77151969487736 2.64280019070165 1.12871950417571 A:G G A 10 0.52856003814033 0.589189446313547 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000418480:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000467320:exon_58550036_58550576:SETD6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 58575489 G/A 1 14 11 25 6.60015946603538 5.81416041954363 0.785999046491749 A:G G A 10 0.52856003814033 0.842467073650159 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58575405_58575524:CNOT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 58579274 C/T 1 21 20 41 9.90023919905307 10.5712007628066 -0.670961563753531 T:C C T 10 0.52856003814033 0.876477995604021 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58579265_58579395:CNOT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 58743454 A/C 1 47 29 76 22.1576782074045 15.3282411060696 6.82943710133492 A:C A C 10 0.52856003814033 0.135064663462446 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000494627:exon_58742953_58743471:GOT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 58750604 G/A 1 34 17 51 16.0289587032288 8.98552064838561 7.04343805484317 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0503197455784474 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58750567_58750717:GOT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 58757668 A/C 1 13 13 26 6.12871950417571 6.87128049582429 -0.742560991648581 A:C A C 10 0.52856003814033 0.845363867960316 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 58757683 A/G 1 12 15 27 5.65727954231604 7.92840057210495 -2.27112102978891 A:G A G 10 0.52856003814033 0.442707659990859 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 66919604 C/T 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000172840:ENST00000311765:exon_66918134_66921855:PDP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 67265360 C/A 1 24 41 65 11.3145590846321 21.6709615637535 -10.3564024791215 A:C C A 10 0.52856003814033 0.0124391546609452 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265333_67265452:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265333_67265452:FHOD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 67268008 G/A 1 6 10 16 2.82863977115802 5.2856003814033 -2.45696061024528 A:G G A 10 0.52856003814033 0.316716189138101 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67267560_67268170:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67267560_67268170:FHOD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 67682157 C/T 1 9 14 23 4.24295965673703 7.39984053396462 -3.15688087722759 T:C C T 10 0.52856003814033 0.213560740713796 ENSG00000159753:ENST00000334583:exon_67681955_67682217:RLTPR;ENSG00000159753:ENST00000398282:exon_67681955_67682217:RLTPR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 67911517 T/C 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 67964203 T/C 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964088_67964221:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67963848_67964221:CTRL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 313 307 620 147.560708062077 162.267931709081 -14.7072236470046 A:G A G 10 0.52856003814033 0.243476373101605 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 68055495 G/C 1 63 73 136 29.7007175971592 38.5848827842441 -8.88416518708489 T:C:G G C 10 0.52856003814033 0.144043153362202 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 68344363 A/C 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 A:C A C 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344238_68344516:SLC7A6OS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 68387457 C/T 1 19 35 54 8.95735927533373 18.4996013349116 -9.54224205957782 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00961332356436408 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68387395_68387469:PRMT7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 41 20 61 19.3290384362465 10.5712007628066 8.75783767343987 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0286717339270826 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 69391437 T/C 1 16 16 32 7.54303938975472 8.45696061024528 -0.913921220490561 T:C T C 10 0.52856003814033 0.859846792144475 ENSG00000132604:ENST00000254942:exon_69391421_69391464:TERF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 46 40 86 21.6862382455448 21.1424015256132 0.543836719931615 A:G G A 10 0.52856003814033 0.914535195124557 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 82 121 203 38.6580768724929 63.9557646149799 -25.297687742487 T:C C T 10 0.52856003814033 0.000417449747166197 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 72042682 A/C 1 17 6 23 8.01447935161439 3.17136022884198 4.84311912277241 A:C A C 10 0.52856003814033 0.0582528254395026 ENSG00000102967:ENST00000219240:exon_72042643_72042684:DHODH;ENSG00000102967:ENST00000378782:exon_72042643_72042684:DHODH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 72137681 C/T 1 13 9 22 6.12871950417571 4.75704034326297 1.37167916091274 T:C C T 10 0.52856003814033 0.671001928035497 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 51 0 51 24.0434380548432 0 24.0434380548432 C C 10 0.52856003814033 8.83443784970426e-15 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 74708886 A/G 1 12 9 21 5.65727954231604 4.75704034326297 0.90023919905307 A:G A G 10 0.52856003814033 0.82792147817971 ENSG00000168404:ENST00000306247:exon_74708858_74708998:MLKL;ENSG00000168404:ENST00000308807:exon_74708858_74708998:MLKL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 74949759 A/T 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 A:T A T 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 132 142 274 62.2300749654764 75.0555254159269 -12.8254504504504 T:C C T 10 0.52856003814033 0.130263424938307 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 81061827 G/A 1 9 2 11 4.24295965673703 1.05712007628066 3.18583958045637 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0701714577429645 ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000393335:exon_81061776_81061902:CENPN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 81819768 T/C 1 15 17 32 7.07159942789505 8.98552064838561 -1.91392122049056 T:C T C 10 0.52856003814033 0.596081373087417 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81819548_81819787:PLCG2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 81929488 C/T 1 24 24 48 11.3145590846321 12.6854409153679 -1.37088183073584 T:C C T 10 0.52856003814033 0.772920077769575 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 81957137 C/T 1 28 22 50 13.2003189320708 11.6283208390873 1.5719980929835 T:C C T 10 0.52856003814033 0.673830950568398 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81957090_81957199:PLCG2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 82203758 C/T 0 7 1 8 3.30007973301769 0.52856003814033 2.77151969487736 A:C C A 10 0.52856003814033 0.0738868803430894 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 83933193 C/T 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83932730_83933277:MLYCD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 84522897 G/C 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 C:G G C 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84522884_84523028:KIAA1609 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 1 37 38 0.47143996185967 19.5567214111922 -19.0852814493325 A:G A G 10 0.52856003814033 1.69718970806809e-11 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 84778690 C/T 0 31 0 31 14.6146388176498 0 14.6146388176498 C C 10 0.52856003814033 2.68089805701573e-09 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 84778697 G/C 1 34 1 35 16.0289587032288 0.52856003814033 15.5003986650884 C:G G C 10 0.52856003814033 9.48008624545194e-09 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 85711860 C/T 1 149 113 262 70.2445543170908 59.7272843098573 10.5172700072335 T:C C T 10 0.52856003814033 0.194508161371759 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 88779032 G/C 1 29 25 54 13.6717588939304 13.2140009535083 0.457757940422178 C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 88781125 T/C 1 38 55 93 17.9147185506675 29.0708020977182 -11.1560835470507 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0221854485913298 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 89180883 G/A 1 5 7 12 2.35719980929835 3.69992026698231 -1.34272045768396 A:G G A 10 0.52856003814033 0.566216755054812 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 89348018 C/T 1 15 21 36 7.07159942789505 11.0997608009469 -4.02816137305188 T:C C T 10 0.52856003814033 0.186077966715380 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 89349128 G/A 1 63 65 128 29.7007175971592 34.3564024791214 -4.65568488196224 A:G G A 10 0.52856003814033 0.426426621232389 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 89349377 G/C 1 58 61 119 27.3435177878609 32.2421623265601 -4.89864453869928 C:G G C 10 0.52856003814033 0.40874231988496 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 89350038 G/A 1 63 48 111 29.7007175971592 25.3708818307358 4.32983576642337 A:C:G G A 10 0.52856003814033 0.447364467022221 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 89614457 G/A 1 8 1 9 3.77151969487736 0.52856003814033 3.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0418258618356361 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89614411_89614521:SPG7;ENSG00000197912:ENST00000312613:exon_89614435_89614521:SPG7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 89661807 C/T 1 12 4 16 5.65727954231604 2.11424015256132 3.54303938975472 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0844359796960055 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000529800:exon_89661775_89661831:CPNE7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 89663025 C/T 1 10 19 29 4.7143996185967 10.0426407246663 -5.32824110606957 T:C C T 10 0.52856003814033 0.061555168760767 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 36 23 59 16.9718386269481 12.1568808772276 4.81495774972053 A:G G A 10 0.52856003814033 0.240944382701691 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 89712374 A/C 1 19 10 29 8.95735927533373 5.2856003814033 3.67175889393043 A:C A C 10 0.52856003814033 0.195643304784761 ENSG00000131165:ENST00000253475:exon_89710846_89712495:CHMP1A;ENSG00000131165:ENST00000397901:exon_89710846_89712495:CHMP1A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 89712380 G/A 1 19 10 29 8.95735927533373 5.2856003814033 3.67175889393043 A:G G A 10 0.52856003814033 0.195643304784761 ENSG00000131165:ENST00000253475:exon_89710846_89712495:CHMP1A;ENSG00000131165:ENST00000397901:exon_89710846_89712495:CHMP1A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 16 90075226 C/T 1 11 6 17 5.18583958045637 3.17136022884198 2.01447935161439 T:C C T 10 0.52856003814033 0.467313177256825 ENSG00000003249:ENST00000304733:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000002501:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000392973:exon_90075192_90075332:DBNDD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 7 9 16 3.30007973301769 4.75704034326297 -1.45696061024528 A:G G A 10 0.52856003814033 0.618027034384742 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 648157 G/A 1 101 104 205 47.6154361478267 54.9702439665943 -7.35480781876766 A:G G A 10 0.52856003814033 0.327462652575891 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 106 101 207 49.972635957125 53.3845638521733 -3.41192789504832 A:G G A 10 0.52856003814033 0.676270296131942 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 649505 T/A 1 48 36 84 22.6291181692642 19.0281613730519 3.60095679621228 A:T T A 10 0.52856003814033 0.446380914540553 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 31 31 62 14.6146388176498 16.3853611823502 -1.77072236470046 C:G G C 10 0.52856003814033 0.703438622310035 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 0 28 0 28 13.2003189320708 0 13.2003189320708 G G 10 0.52856003814033 1.83634833786758e-08 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 685752 G/A 1 10 6 16 4.7143996185967 3.17136022884198 1.54303938975472 A:G G A 10 0.52856003814033 0.466348600091948 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685696_685794:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 1373612 C/T 1 20 30 50 9.4287992371934 15.8568011442099 -6.4280019070165 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0882049444903573 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 1637074 A/G 1 5 10 15 2.35719980929835 5.2856003814033 -2.92840057210495 A:G A G 10 0.52856003814033 0.194617397098600 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 1640793 C/T 1 9 9 18 4.24295965673703 4.75704034326297 -0.51408068652594 T:C C T 10 0.52856003814033 0.818276179396142 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 1795180 T/C 1 13 37 50 6.12871950417571 19.5567214111922 -13.4280019070165 T:C T C 10 0.52856003814033 0.000167548919643116 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 1940232 A/G 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1940129_1940250:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1940129_1940250:DPH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 2236404 T/C 1 20 23 43 9.4287992371934 12.1568808772276 -2.72808164003419 T:C T C 10 0.52856003814033 0.446704988132492 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2236255_2236418:TSR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 2585113 C/T 1 36 34 70 16.9718386269481 17.9710412967712 -0.999202669823102 T:C C T 10 0.52856003814033 0.812149936455992 ENSG00000007168:ENST00000397195:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000451360:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000006951:exon_2585023_2585201:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000397193:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 3631241 A/G 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000083457:ENST00000263087:exon_3631213_3631320:ITGAE;ENSG00000083457:ENST00000397107:exon_3631213_3631320:ITGAE HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 3631473 C/G 1 3 7 10 1.41431988557901 3.69992026698231 -2.2856003814033 C:G C G 10 0.52856003814033 0.206826979960111 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 31 27 58 14.6146388176498 14.2711210297889 0.343517787860858 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 3839685 G/A 1 4 15 19 1.88575984743868 7.92840057210495 -6.04264072466627 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0094326877631885 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3839561_3839763:ATP2A3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 3840928 A/G 1 15 9 24 7.07159942789505 4.75704034326297 2.31455908463208 A:G A G 10 0.52856003814033 0.415732751316567 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3840710_3840930:ATP2A3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 3845927 A/G 1 7 2 9 3.30007973301769 1.05712007628066 2.24295965673703 A:G A G 10 0.52856003814033 0.186100445119176 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3845900_3846025:ATP2A3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 4391132 C/T 1 11 8 19 5.18583958045637 4.22848030512264 0.957359275333729 T:C C T 10 0.52856003814033 0.819137161107216 ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4391101_4391498:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4391101_4391498:SPNS3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 4391153 A/G 1 13 9 22 6.12871950417571 4.75704034326297 1.37167916091274 A:G A G 10 0.52856003814033 0.671001928035497 ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4391101_4391498:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4391101_4391498:SPNS3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 4391201 A/G 1 9 14 23 4.24295965673703 7.39984053396462 -3.15688087722759 A:G A G 10 0.52856003814033 0.213560740713796 ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4391101_4391498:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4391101_4391498:SPNS3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 4446457 G/A 1 38 31 69 17.9147185506675 16.3853611823502 1.52935736831723 A:G G A 10 0.52856003814033 0.71975182441768 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 4449228 C/T 1 27 47 74 12.7288789702111 24.8423217925955 -12.1134428223844 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00507726270769252 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4449141_4449237:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4449141_4449237:MYBBP1A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 4451453 C/T 1 16 14 30 7.54303938975472 7.39984053396462 0.143198855790099 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4451438_4451605:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4451438_4451605:MYBBP1A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 4700993 C/G 1 137 153 290 64.5872747747748 80.8696858354705 -16.2824110606957 C:G C G 10 0.52856003814033 0.0597112535857382 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 131 138 269 61.7586350036168 72.9412852633655 -11.1826502597488 T:C C T 10 0.52856003814033 0.17928485052227 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 4701402 C/T 1 351 331 682 165.475426612744 174.953372624449 -9.47794601170509 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.466512916744229 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4701304_4701448:PSMB6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 4926882 A/G 1 32 24 56 15.0860787795094 12.6854409153679 2.40063786414152 A:G A G 10 0.52856003814033 0.592982297680519 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 5009583 C/T 1 9 16 25 4.24295965673703 8.45696061024528 -4.21400095350825 T:C C T 10 0.52856003814033 0.109429702594063 ENSG00000167840:ENST00000250076:exon_5008930_5009828:ZNF232;ENSG00000167840:ENST00000381274:exon_5009033_5009828:ZNF232;ENSG00000167840:ENST00000416429:exon_5009119_5009801:ZNF232 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 41 44 85 19.3290384362465 23.2566416781745 -3.92760324192805 A:G A G 10 0.52856003814033 0.447171607130469 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 13 15 28 6.12871950417571 7.92840057210495 -1.79968106792924 T:C T C 10 0.52856003814033 0.571763425359152 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 85 90 175 40.0723967580719 47.5704034326297 -7.49800667455776 T:C C T 10 0.52856003814033 0.257278794740419 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 89 89 178 41.9581566055106 47.0418433944894 -5.08368678897875 C:G C G 10 0.52856003814033 0.453674243415281 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 5392161 C/T 1 3 10 13 1.41431988557901 5.2856003814033 -3.87128049582429 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0481210508977837 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 5392173 A/C 1 10 6 16 4.7143996185967 3.17136022884198 1.54303938975472 A:C A C 10 0.52856003814033 0.466348600091948 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 9 9 18 4.24295965673703 4.75704034326297 -0.51408068652594 T:C T C 10 0.52856003814033 0.818276179396142 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 6483046 T/C 1 12 3 15 5.65727954231604 1.58568011442099 4.07159942789505 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0395336693355746 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6481646_6483184:KIAA0753 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 6531648 A/G 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:G A G 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6531437_6532061:KIAA0753 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 6942108 C/T 0 13 0 13 6.12871950417571 0 6.12871950417571 C C 10 0.52856003814033 0.000308145002435499 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 6942111 G/T 0 0 13 13 0 6.87128049582429 -6.87128049582429 T G T 10 0.52856003814033 5.68254794129763e-05 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 6943266 G/A 1 11 12 23 5.18583958045637 6.34272045768396 -1.15688087722759 A:G G A 10 0.52856003814033 0.67969531497135 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6943082_6943438:SLC16A13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 103 69 172 48.558316071546 36.4706426316828 12.0876734398632 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0670246502390273 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7246851 C/T 1 61 65 126 28.7578376734399 34.3564024791214 -5.59856480568158 T:C C T 10 0.52856003814033 0.327447739473882 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7246698_7246881:ACAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7251605 G/C 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 C:G G C 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7297121 G/A 1 7 7 14 3.30007973301769 3.69992026698231 -0.39984053396462 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7296920_7297155:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7296920_7297155:PLSCR3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7297452 A/G 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 A:G A G 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7297423_7297590:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7297423_7297590:PLSCR3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7414575 G/A 1 20 26 46 9.4287992371934 13.7425609916486 -4.31376175445518 A:G G A 10 0.52856003814033 0.237683215480364 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7414534_7414638:POLR2A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7460517 G/C 1 17 23 40 8.01447935161439 12.1568808772276 -4.1424015256132 C:G G C 10 0.52856003814033 0.207287567185845 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7460416_7460549:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7460685 G/A 1 13 24 37 6.12871950417571 12.6854409153679 -6.55672141119221 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0328744017348971 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7479892 C/T 1 277 213 490 130.588869435129 112.58328812389 18.0055813112383 T:C C T 10 0.52856003814033 0.103570620240694 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7479842_7480010:EIF4A1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7530147 G/C 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 C:G G C 10 0.52856003814033 0.531695721084805 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7530271 C/T 1 41 29 70 19.3290384362465 15.3282411060696 4.0007973301769 T:C C T 10 0.52856003814033 0.402190953580802 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7530261_7530362:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7530261_7530362:SAT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 209 177 386 98.530952028671 93.5551267508384 4.97582527783261 A:G G A 10 0.52856003814033 0.646411048584568 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7843053 C/T 1 12 6 18 5.65727954231604 3.17136022884198 2.48591931347406 T:C C T 10 0.52856003814033 0.345436270087802 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000419170:exon_7842831_7843067:CNTROB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7847955 C/A 1 26 16 42 12.2574390083514 8.45696061024528 3.80047839810614 A:C C A 10 0.52856003814033 0.280234246515657 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7847794_7847956:CNTROB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 7849087 C/G 1 16 10 26 7.54303938975472 5.2856003814033 2.25743900835142 C:G C G 10 0.52856003814033 0.435111822543937 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 14 8 22 6.60015946603538 4.22848030512264 2.37167916091274 A:G G A 10 0.52856003814033 0.39453671919514 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 8092694 T/G 1 15 10 25 7.07159942789505 5.2856003814033 1.78599904649175 T:G T G 10 0.52856003814033 0.550569951685472 ENSG00000196544:ENST00000389017:exon_8091652_8093564:C17orf59;ENSG00000196544:ENST00000357939:exon_8092385_8093056:C17orf59 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 T:C T C 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 8192277 C/T 1 26 34 60 12.2574390083514 17.9710412967712 -5.7136022884198 T:C C T 10 0.52856003814033 0.15537562684273 ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000108961:ENST00000226105:exon_8192274_8192390:RANGRF;ENSG00000108961:ENST00000407006:exon_8192274_8192390:RANGRF;ENSG00000108961:ENST00000439238:exon_8192274_8192390:RANGRF;ENSG00000108961:ENST00000314193:exon_8192274_8192376:RANGRF HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 8192922 C/T 1 31 42 73 14.6146388176498 22.1995216018939 -7.58488278424409 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0793713899209038 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8192892_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8192892_8192961:SLC25A35 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 8193298 C/T 1 71 55 126 33.4722372920366 29.0708020977182 4.40143519431842 T:C C T 10 0.52856003814033 0.47555984728482 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8193172_8193302:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8193172_8193302:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8193172_8193302:SLC25A35;ENSG00000108961:ENST00000226105:exon_8193131_8193403:RANGRF HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 8416901 C/T 1 1 8 9 0.47143996185967 4.22848030512264 -3.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0159780666639568 ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8416856_8416987:MYH10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 8701423 A/G 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000185156:ENST00000329805:exon_8700481_8702586:MFSD6L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 8736394 T/C 1 7 2 9 3.30007973301769 1.05712007628066 2.24295965673703 T:C T C 10 0.52856003814033 0.186100445119176 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 68 55 123 32.0579174064576 29.0708020977182 2.9871153087394 A:G A G 10 0.52856003814033 0.651760726314647 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 7 5 12 3.30007973301769 2.64280019070165 0.65727954231604 A:G G A 10 0.52856003814033 0.778794317245757 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 16842991 G/A 1 145 163 308 68.3587944696521 86.1552862168738 -17.7964917472217 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0456502912640028 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16842970_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 17062241 C/G 1 3 8 11 1.41431988557901 4.22848030512264 -2.81416041954363 C:G C G 10 0.52856003814033 0.129625044921933 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000423885:exon_17061811_17062316:MPRIP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 17250159 C/T 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000205309:ENST00000446264:exon_17250127_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000478373:exon_17250119_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000379552:exon_17250119_17250975:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000389022:exon_17250119_17250975:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000470418:exon_17250119_17250172:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000483704:exon_17250119_17250977:NT5M;ENSG00000205309:ENST00000480529:exon_17250119_17250466:NT5M HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 17394611 G/A 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000141026:ENST00000268711:exon_17394593_17396535:MED9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 17409560 C/T 1 17 8 25 8.01447935161439 4.22848030512264 3.78599904649175 T:C C T 10 0.52856003814033 0.161198885597744 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000490392:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000484838:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000477595:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000482906:exon_17409541_17409615:PEMT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 17425631 C/T 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000421096:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000461404:exon_17425594_17425709:PEMT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 17707105 T/C 1 3 12 15 1.41431988557901 6.34272045768396 -4.92840057210495 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0168651853154702 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17707070_17707163:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17707070_17707355:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17707070_17707433:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17707070_17707355:RAI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 17750907 G/A 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17750663_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000486413:exon_17750866_17751097:TOM1L2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 17942199 C/T 1 20 7 27 9.4287992371934 3.69992026698231 5.72887897021109 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0328709256168387 ENSG00000171953:ENST00000462733:exon_17942195_17942389:ATPAF2;ENSG00000171953:ENST00000302530:exon_17942195_17942459:ATPAF2;ENSG00000171953:ENST00000474627:exon_17942195_17942480:ATPAF2;ENSG00000171953:ENST00000444058:exon_17942195_17942364:ATPAF2;ENSG00000171953:ENST00000497871:exon_17942195_17942515:ATPAF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 17997146 C/G 1 14 4 18 6.60015946603538 2.11424015256132 4.48591931347406 C:G C G 10 0.52856003814033 0.0357240121562821 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 18151906 G/A 1 39 28 67 18.3861585125271 14.7996810679292 3.58647744459789 A:G G A 10 0.52856003814033 0.394504864066644 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18151864_18152035:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18151864_18152035:FLII HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 T:C C T 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 10 0 10 4.7143996185967 0 4.7143996185967 T T 10 0.52856003814033 0.00224426647978634 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 8 0 8 3.77151969487736 0 3.77151969487736 T T 10 0.52856003814033 0.00853204551585355 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 12 0 12 5.65727954231604 0 5.65727954231604 G G 10 0.52856003814033 0.000596015597603251 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 11 0 11 5.18583958045637 0 5.18583958045637 G G 10 0.52856003814033 0.00115525162374160 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 14 0 14 6.60015946603538 0 6.60015946603538 C C 10 0.52856003814033 0.000159627258521305 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 21203964 C/G 0 10 0 10 4.7143996185967 0 4.7143996185967 C C 10 0.52856003814033 0.00224426647978634 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 15 1 16 7.07159942789505 0.52856003814033 6.54303938975472 A:C C A 10 0.52856003814033 0.000679491512456453 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 26 0 26 12.2574390083514 0 12.2574390083514 C C 10 0.52856003814033 6.6390637762783e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 25 0 25 11.7859990464917 0 11.7859990464917 C C 10 0.52856003814033 1.26346824893297e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 28 0 28 13.2003189320708 0 13.2003189320708 C C 10 0.52856003814033 1.83634833786758e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 29 0 29 13.6717588939304 0 13.6717588939304 C C 10 0.52856003814033 9.6652087685267e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 32 0 32 15.0860787795094 0 15.0860787795094 G G 10 0.52856003814033 2.68464802039077e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 48 0 48 22.6291181692642 0 22.6291181692642 G G 10 0.52856003814033 6.26835863018136e-14 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 25974258 T/C 0 0 8 8 0 4.22848030512264 -4.22848030512264 C T C 10 0.52856003814033 0.00244011976995637 ENSG00000168961:ENST00000486774:exon_25974056_25974458:LGALS9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 26676135 C/T 1 105 94 199 49.5011959952653 49.684643585191 -0.183447589925677 T:C C T 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 26684849 A/G 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26684646_26684904:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000509083:exon_26684670_26684904:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000457710:exon_26684694_26684904:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000483505:exon_26684731_26684904:TMEM199 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 26686416 G/A 1 11 13 24 5.18583958045637 6.87128049582429 -1.68544091536792 A:G G A 10 0.52856003814033 0.543332647381807 ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000509083:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000457710:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000483505:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000395404:exon_26686338_26686427:TMEM199 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 26955330 A/C 1 12 7 19 5.65727954231604 3.69992026698231 1.95735927533373 A:C A C 10 0.52856003814033 0.491911774893767 ENSG00000007202:ENST00000389003:exon_26955283_26955577:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000005905:exon_26955283_26955577:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000528896:exon_26955283_26955577:KIAA0100 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 27014396 C/T 1 9 14 23 4.24295965673703 7.39984053396462 -3.15688087722759 T:C C T 10 0.52856003814033 0.213560740713796 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 27014483 C/A 1 9 20 29 4.24295965673703 10.5712007628066 -6.32824110606957 A:C C A 10 0.52856003814033 0.0242523026502797 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 27052358 C/T 1 6 9 15 2.82863977115802 4.75704034326297 -1.92840057210495 T:C C T 10 0.52856003814033 0.439187658248891 ENSG00000160606:ENST00000292090:exon_27052322_27052404:TLCD1;ENSG00000160606:ENST00000394933:exon_27052322_27052404:TLCD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 27225586 A/T 1 5 8 13 2.35719980929835 4.22848030512264 -1.87128049582429 A:T A T 10 0.52856003814033 0.406604439196984 ENSG00000167536:ENST00000378895:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000394901:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000426464:exon_27224801_27225910:DHRS13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 12 7 19 5.65727954231604 3.69992026698231 1.95735927533373 T:C C T 10 0.52856003814033 0.491911774893767 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 27613677 G/A 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000108256:ENST00000225388:exon_27613010_27614734:NUFIP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 29326140 G/T 1 37 20 57 17.4432785888078 10.5712007628066 6.87207782600119 T:G G T 10 0.52856003814033 0.0838505306060417 ENSG00000181481:ENST00000328381:exon_29325680_29326929:RNF135;ENSG00000181481:ENST00000324689:exon_29325680_29326927:RNF135 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 30932133 C/T 1 18 23 41 8.48591931347406 12.1568808772276 -3.67096156375353 T:C C T 10 0.52856003814033 0.275603803927315 ENSG00000176658:ENST00000318217:exon_30932105_30932259:MYO1D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 33749546 A/G 1 3 9 12 1.41431988557901 4.75704034326297 -3.34272045768396 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0796439798478496 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 33768199 G/A 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 A:G G A 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 33768383 T/A 1 4 8 12 1.88575984743868 4.22848030512264 -2.34272045768396 A:T T A 10 0.52856003814033 0.248143449837288 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 34252537 A/C 1 2 7 9 0.94287992371934 3.69992026698231 -2.75704034326297 A:C A C 10 0.52856003814033 0.093882474099143 ENSG00000187456:ENST00000293273:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000419453:exon_34252519_34252554:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394529:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000431884:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000436836:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000430160:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000425909:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394528:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394527:exon_34252519_34252641:RDM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 34416537 G/A 1 267 170 437 125.874469816532 89.8552064838561 36.0192633326758 A:T:G G A 10 0.52856003814033 0.000551059353025652 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 34432663 A/G 1 91 58 149 42.90103652923 30.6564822121391 12.2445543170908 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0487288804142767 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 34432664 T/A 1 91 58 149 42.90103652923 30.6564822121391 12.2445543170908 A:T T A 10 0.52856003814033 0.0487288804142767 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 5 8 13 2.35719980929835 4.22848030512264 -1.87128049582429 A:G G A 10 0.52856003814033 0.406604439196984 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 46 45 91 21.6862382455448 23.7852017163149 -2.09896347077003 A:G G A 10 0.52856003814033 0.67565616246734 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 12 23 35 5.65727954231604 12.1568808772276 -6.49960133491155 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0406134531752317 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 36926731 T/G 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 T:G T G 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 37034365 C/T 1 8 5 13 3.77151969487736 2.64280019070165 1.12871950417571 T:C C T 10 0.52856003814033 0.589189446313547 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37034339_37034433:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37034339_37034433:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37034339_37034433:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000443937:exon_37034339_37034433:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37034339_37034433:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37034339_37034433:LASP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 37071335 A/G 1 15 8 23 7.07159942789505 4.22848030512264 2.84311912277241 A:G A G 10 0.52856003814033 0.297564808088866 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37071296_37071399:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37071296_37071399:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37071296_37071388:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37071296_37071399:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37071296_37071394:LASP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 37074932 C/T 1 10 14 24 4.7143996185967 7.39984053396462 -2.68544091536792 T:C C T 10 0.52856003814033 0.31012508646494 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37074858_37075031:LASP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 37334243 G/A 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000067191:ENST00000394303:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000344140:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000394310:exon_37334237_37334332:CACNB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 38137364 G/A 1 66 72 138 31.1150374827382 38.0563227461038 -6.94128526336554 A:G G A 10 0.52856003814033 0.267614381415263 ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38137050_38137443:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38137312_38137443:PSMD3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 12 16 28 5.65727954231604 8.45696061024528 -2.79968106792924 A:G A G 10 0.52856003814033 0.345219155939412 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 40120250 C/T 1 12 18 30 5.65727954231604 9.51408068652594 -3.8568011442099 T:C C T 10 0.52856003814033 0.200232689278046 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40120086_40120758:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40120086_40120758:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40120091_40120758:CNP;ENSG00000173786:ENST00000441615:exon_40120086_40120312:CNP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 40125864 G/A 1 33 31 64 15.5575187413691 16.3853611823502 -0.827842440981122 A:G G A 10 0.52856003814033 0.900553143046234 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 40459737 C/T 1 40 30 70 18.8575984743868 15.8568011442099 3.0007973301769 T:C C T 10 0.52856003814033 0.549760557737538 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40459611_40459741:STAT5A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 12 16 28 5.65727954231604 8.45696061024528 -2.79968106792924 A:C C A 10 0.52856003814033 0.345219155939412 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 35 23 58 16.5003986650884 12.1568808772276 4.34351778786086 A:G A G 10 0.52856003814033 0.293161086700613 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 40722029 A/G 1 17 19 36 8.01447935161439 10.0426407246663 -2.02816137305188 A:G A G 10 0.52856003814033 0.509527565956857 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 40724977 G/A 1 31 29 60 14.6146388176498 15.3282411060696 -0.713602288419802 A:G G A 10 0.52856003814033 0.897477382149947 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40723565_40725220:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40723565_40725220:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40723565_40725220:MLX;ENSG00000131470:ENST00000253789:exon_40724329_40725042:PSMC3IP;ENSG00000131470:ENST00000393795:exon_40724329_40725042:PSMC3IP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 22 8 30 10.3716791609127 4.22848030512264 6.1431988557901 A:G G A 10 0.52856003814033 0.027714428285441 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 16 6 22 7.54303938975472 3.17136022884198 4.37167916091274 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0857064844778537 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 40822678 C/T 1 13 12 25 6.12871950417571 6.34272045768396 -0.214000953508251 A:T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000412503:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000445882:exon_40822591_40822723:PLEKHH3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 40849573 G/A 1 3 9 12 1.41431988557901 4.75704034326297 -3.34272045768396 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0796439798478496 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40849572_40849817:CNTNAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 40931054 T/C 1 95 99 194 44.7867963766686 52.3274437758927 -7.54064739922403 T:C T C 10 0.52856003814033 0.281656440700134 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40930975_40931616:VPS25 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 3 8 11 1.41431988557901 4.22848030512264 -2.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.129625044921933 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 19 2 21 8.95735927533373 1.05712007628066 7.90023919905307 C:G C G 10 0.52856003814033 0.000325992284598732 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 41352643 C/T 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.488044846697727 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 42239292 A/G 1 10 4 14 4.7143996185967 2.11424015256132 2.60015946603538 A:G A G 10 0.52856003814033 0.189499784192365 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42239239_42239844:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42239239_42239844:C17orf53 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 42268255 G/C 1 22 25 47 10.3716791609127 13.2140009535083 -2.84232179259551 T:C:G G C 10 0.52856003814033 0.465794066556751 ENSG00000168591:ENST00000357984:exon_42267869_42269098:TMUB2;ENSG00000168591:ENST00000319511:exon_42267869_42269098:TMUB2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 42286789 C/T 1 54 49 103 25.4577579404222 25.8994418688762 -0.441683928453994 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42286720_42286909:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42286720_42286909:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42286720_42286909:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42286720_42286909:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42286720_42286909:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42286720_42286909:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42286720_42286909:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42286720_42286909:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529947:exon_42286720_42286790:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000531368:exon_42286587_42286909:UBTF HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 60 63 123 28.2863977115802 33.2992824028408 -5.0128846912606 T:C C T 10 0.52856003814033 0.3682014449621 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 4 9 13 1.88575984743868 4.75704034326297 -2.87128049582429 C:G G C 10 0.52856003814033 0.163321106873792 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 43013460 C/G 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 C:G C G 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43013400_43013728:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43013400_43013726:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000376982:exon_43013400_43013728:KIF18B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 43111688 G/A 1 10 6 16 4.7143996185967 3.17136022884198 1.54303938975472 A:G G A 10 0.52856003814033 0.466348600091948 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 52 47 99 24.5148780167028 24.8423217925955 -0.327443775892675 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 43176804 C/T 1 58 60 118 27.3435177878609 31.7136022884198 -4.37008450055895 T:C C T 10 0.52856003814033 0.460948296161663 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43176773_43176881:NMT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 43226887 A/G 1 56 33 89 26.4006378641415 17.4424812586309 8.95815660551063 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0704881381757449 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 43227214 T/C 1 49 39 88 23.1005581311238 20.6138414874729 2.48671664365096 T:C T C 10 0.52856003814033 0.669560623635626 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 14 16 30 6.60015946603538 8.45696061024528 -1.8568011442099 T:C C T 10 0.52856003814033 0.584372825849598 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 47783602 G/A 1 27 18 45 12.7288789702111 9.51408068652594 3.21479828368515 A:G G A 10 0.52856003814033 0.372490330730488 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47782486_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47783228_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000503334:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508520:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000435059:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000514907:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000515850:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000511763:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508926:exon_47783566_47783717:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000511657:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000509781:exon_47783230_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508607:exon_47783438_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000505765:exon_47783564_47783671:SLC35B1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 48226811 C/T 1 18 25 43 8.48591931347406 13.2140009535083 -4.72808164003419 T:C C T 10 0.52856003814033 0.169838533883129 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 48433958 T/C 1 3 11 14 1.41431988557901 5.81416041954363 -4.39984053396462 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0286627679013754 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48433872_48434134:XYLT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 48455985 A/T 1 11 8 19 5.18583958045637 4.22848030512264 0.957359275333729 A:T A T 10 0.52856003814033 0.819137161107216 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48455956_48456042:EME1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 48456193 T/C 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 48549791 C/G 1 12 15 27 5.65727954231604 7.92840057210495 -2.27112102978891 C:G C G 10 0.52856003814033 0.442707659990859 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000508245:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000510262:exon_48549789_48549807:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512119:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512537:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000503295:exon_48549492_48549940:ACSF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 48562185 G/A 1 7 7 14 3.30007973301769 3.69992026698231 -0.39984053396462 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48562105_48563336:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000451010:exon_48562105_48563335:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000506211:exon_48562105_48562359:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000513650:exon_48562105_48562224:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000511005:exon_48562105_48562258:RSAD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 48629370 G/A 1 16 1 17 7.54303938975472 0.52856003814033 7.01447935161439 A:G G A 10 0.52856003814033 0.000373354001064243 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48629146_48629541:SPATA20 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 48940422 T/C 1 24 15 39 11.3145590846321 7.92840057210495 3.38615851252713 T:C T C 10 0.52856003814033 0.336419713709802 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1;ENSG00000141232:ENST00000268957:exon_48940341_48941524:TOB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 55027850 T/C 1 19 13 32 8.95735927533373 6.87128049582429 2.08607877950944 T:C T C 10 0.52856003814033 0.484583347213854 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 55058558 C/A 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 A:C C A 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000121064:ENST00000262288:exon_55058443_55058591:SCPEP1;ENSG00000121064:ENST00000393142:exon_55058443_55058591:SCPEP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 55079471 T/C 1 33 39 72 15.5575187413691 20.6138414874729 -5.05632274610376 T:C T C 10 0.52856003814033 0.240005689271352 ENSG00000121064:ENST00000262288:exon_55079379_55079542:SCPEP1;ENSG00000121064:ENST00000393142:exon_55079379_55079542:SCPEP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 55926732 C/A 1 50 43 93 23.5719980929835 22.7280816400342 0.843916452949308 A:C C A 10 0.52856003814033 0.917410095406072 ENSG00000181610:ENST00000313608:exon_55926601_55926771:MRPS23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 56769979 C/T 1 9 3 12 4.24295965673703 1.58568011442099 2.65727954231604 T:C C T 10 0.52856003814033 0.153869078916603 ENSG00000108384:ENST00000461271:exon_56769934_56770046:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000337432:exon_56769934_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487921:exon_56769937_56769993:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000476741:exon_56769963_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000475762:exon_56769963_56771011:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000486827:exon_56769967_56771172:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487525:exon_56769967_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000482007:exon_56769976_56770149:RAD51C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 37 38 75 17.4432785888078 20.0852814493325 -2.64200286052475 A:T T A 10 0.52856003814033 0.564500714806482 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 61903445 G/C 1 16 19 35 7.54303938975472 10.0426407246663 -2.49960133491155 C:G G C 10 0.52856003814033 0.403702484367607 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903416_61903495:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903416_61903495:FTSJ3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 242 270 512 114.08847077004 142.711210297889 -28.622739527849 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0116111213231337 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 392 457 849 184.804465048991 241.551937430131 -56.7474723811402 T:C C T 10 0.52856003814033 0.000100798184522371 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 99 105 204 46.6725562241073 55.4988040047347 -8.82624778062733 A:G A G 10 0.52856003814033 0.233222033409111 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 65362552 T/A 1 12 17 29 5.65727954231604 8.98552064838561 -3.32824110606957 A:T T A 10 0.52856003814033 0.264908318222203 ENSG00000197170:ENST00000356126:exon_65362528_65362743:PSMD12;ENSG00000197170:ENST00000357146:exon_65362528_65362721:PSMD12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 65717525 T/C 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65717494_65717642:NOL11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 66 76 142 31.1150374827382 40.1705628986651 -9.05552541592687 A:G A G 10 0.52856003814033 0.131028083763694 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 65988049 T/C 1 2 12 14 0.94287992371934 6.34272045768396 -5.39984053396462 T:C T C 10 0.52856003814033 0.00530328487690469 ENSG00000186665:ENST00000449250:exon_65987218_65988219:C17orf58;ENSG00000186665:ENST00000334461:exon_65987218_65988219:C17orf58 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 128 130 258 60.3443151180378 68.7128049582429 -8.36848984020514 A:G A G 10 0.52856003814033 0.318449370020898 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 27 30 57 12.7288789702111 15.8568011442099 -3.12792217399881 A:G A G 10 0.52856003814033 0.428246560688776 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 71 59 130 33.4722372920366 31.1850422502795 2.28719504175709 A:T T A 10 0.52856003814033 0.725671992518821 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 66449122 G/A 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000070540:ENST00000262139:exon_66449051_66449133:WIPI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 70120551 A/C 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:C A C 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000125398:ENST00000245479:exon_70119684_70122561:SOX9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 71204440 C/T 1 53 59 112 24.9863179785625 31.1850422502795 -6.19872427171697 T:C C T 10 0.52856003814033 0.256648154113679 ENSG00000133193:ENST00000405159:exon_71203492_71205907:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000403627:exon_71203492_71205907:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000255557:exon_71203493_71205907:FAM104A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 72473553 T/C 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 0.488044846697727 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 72771766 C/G 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72771761_72771846:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72771761_72771846:NAT9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 72859291 C/T 1 27 35 62 12.7288789702111 18.4996013349116 -5.77072236470046 T:C C T 10 0.52856003814033 0.161836615922102 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72859198_72859368:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72859198_72859368:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72859198_72859368:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72859198_72859368:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72859198_72859368:FDXR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 72860653 G/A 1 23 24 47 10.8431191227724 12.6854409153679 -1.84232179259551 A:G G A 10 0.52856003814033 0.661854091973607 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860602_72860686:FDXR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 62 75 137 29.2292776352995 39.6420028605248 -10.4127252252252 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0866468770090521 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 5 7 12 2.35719980929835 3.69992026698231 -1.34272045768396 C:G G C 10 0.52856003814033 0.566216755054812 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 73491068 C/A 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 A:C C A 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73490977_73491115:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73490977_73491115:KIAA0195 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 73518203 G/C 1 18 32 50 8.48591931347406 16.9139212204906 -8.4280019070165 C:G G C 10 0.52856003814033 0.0224961246931247 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 73518284 G/C 1 20 27 47 9.4287992371934 14.2711210297889 -4.84232179259551 C:G G C 10 0.52856003814033 0.188360863252860 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 20 19 39 9.4287992371934 10.0426407246663 -0.613841487472872 T:C C T 10 0.52856003814033 0.873655585838834 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 73625430 G/A 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 73627539 T/C 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73627530_73627748:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73627530_73627748:RECQL5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 73824121 T/C 1 52 62 114 24.5148780167028 32.7707223647005 -8.25584434799762 T:C T C 10 0.52856003814033 0.133383275323169 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73823310_73824167:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73824079_73824167:UNC13D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 73827205 T/C 1 27 37 64 12.7288789702111 19.5567214111922 -6.82784244098112 T:C T C 10 0.52856003814033 0.103156209258592 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73827203_73827250:UNC13D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 73831016 G/A 1 25 20 45 11.7859990464917 10.5712007628066 1.21479828368515 A:G G A 10 0.52856003814033 0.766594405818084 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73831001_73831144:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73831001_73831144:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73831001_73831144:UNC13D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 73836162 C/G 1 8 7 15 3.77151969487736 3.69992026698231 0.0715994278950496 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73836099_73836191:UNC13D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 73900688 T/C 1 33 25 58 15.5575187413691 13.2140009535083 2.34351778786086 T:C T C 10 0.52856003814033 0.599633128408749 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493383:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000461602:exon_73900307_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000464758:exon_73900303_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000410030:exon_73900621_73900800:MRPL38 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 20 20 40 9.4287992371934 10.5712007628066 -1.1424015256132 T:C C T 10 0.52856003814033 0.753183226177787 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 106 95 201 49.972635957125 50.2132036233314 -0.240567666206339 C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 74077797 C/T 1 48 40 88 22.6291181692642 21.1424015256132 1.48671664365096 T:C C T 10 0.52856003814033 0.831056029217182 ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000421794:exon_74077681_74077836:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 75085363 G/A 1 6 3 9 2.82863977115802 1.58568011442099 1.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 0.514204578379993 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 76115353 T/C 1 13 6 19 6.12871950417571 3.17136022884198 2.95735927533373 T:C T C 10 0.52856003814033 0.25018193083756 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 76121031 C/T 1 7 19 26 3.30007973301769 10.0426407246663 -6.74256099164858 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00974967398915626 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 76121318 G/A 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76121239_76121344:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76121239_76121344:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76121239_76121344:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76121239_76121344:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76121239_76121344:TMC6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 9 11 20 4.24295965673703 5.81416041954363 -1.5712007628066 T:C C T 10 0.52856003814033 0.509501749881068 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 76449505 G/C 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000187775:ENST00000442057:exon_76449425_76449547:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76449425_76449547:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76449425_76449547:DNAH17 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 76455218 G/A 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 A:G G A 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000187775:ENST00000442057:exon_76455083_76455290:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76455083_76455290:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76455083_76455290:DNAH17 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 76968109 C/G 1 22 7 29 10.3716791609127 3.69992026698231 6.67175889393043 C:G C G 10 0.52856003814033 0.0147675074962854 ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76967337_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000418895:exon_76967338_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000431152:exon_76967658_76968641:LGALS3BP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 78091405 G/A 1 7 5 12 3.30007973301769 2.64280019070165 0.65727954231604 A:G G A 10 0.52856003814033 0.778794317245757 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 78091513 G/A 1 8 3 11 3.77151969487736 1.58568011442099 2.18583958045637 A:G G A 10 0.52856003814033 0.234946711874713 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 78093133 G/A 1 17 12 29 8.01447935161439 6.34272045768396 1.67175889393043 A:G G A 10 0.52856003814033 0.580875484028571 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78093071_78093678:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78093071_78093678:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78093071_78093678:GAA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 78363847 G/A 1 23 23 46 10.8431191227724 12.1568808772276 -1.31376175445518 A:G G A 10 0.52856003814033 0.768336814301971 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78363812_78363996:RNF213 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79163758 G/A 1 30 26 56 14.1431988557901 13.7425609916486 0.400637864141517 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79163715_79163775:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79163715_79163775:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79163715_79163775:AZI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79164707 C/T 1 32 21 53 15.0860787795094 11.0997608009469 3.98631797856251 T:C C T 10 0.52856003814033 0.335582812909746 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79164707_79164884:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79164707_79164884:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79164707_79164884:AZI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79166384 C/T 1 12 6 18 5.65727954231604 3.17136022884198 2.48591931347406 T:C C T 10 0.52856003814033 0.345436270087802 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79166276_79166393:AZI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79169641 G/A 1 3 7 10 1.41431988557901 3.69992026698231 -2.2856003814033 A:G G A 10 0.52856003814033 0.206826979960111 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79169635_79169751:AZI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79170578 C/T 1 9 7 16 4.24295965673703 3.69992026698231 0.54303938975472 T:C C T 10 0.52856003814033 0.808687083852748 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170501_79170626:AZI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79173224 T/C 1 3 6 9 1.41431988557901 3.17136022884198 -1.75704034326297 T:C T C 10 0.52856003814033 0.322282730829835 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79173181_79173349:AZI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79220016 T/C 1 63 36 99 29.7007175971592 19.0281613730519 10.6725562241073 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0343396513629129 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79226362 G/A 1 24 12 36 11.3145590846321 6.34272045768396 4.97183862694812 A:G G A 10 0.52856003814033 0.131870294845431 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79801977 C/T 1 7 1 8 3.30007973301769 0.52856003814033 2.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0738868803430894 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 292 344 636 137.660468863024 181.824653120274 -44.1641842572499 A:G A G 10 0.52856003814033 0.000468186842852123 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79873533 C/T 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000187531:ENST00000328666:exon_79873487_79873557:SIRT7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79954544 T/A 1 20 14 34 9.4287992371934 7.39984053396462 2.02895870322878 A:T T A 10 0.52856003814033 0.498751575151667 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79954296_79954722:ASPSCR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 22 19 41 10.3716791609127 10.0426407246663 0.329038436246469 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79991603 C/T 1 9 9 18 4.24295965673703 4.75704034326297 -0.51408068652594 T:C C T 10 0.52856003814033 0.818276179396142 ENSG00000169750:ENST00000306897:exon_79991575_79992077:RAC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 79993919 C/T 1 112 89 201 52.801275728283 47.0418433944894 5.75943233379366 T:C C T 10 0.52856003814033 0.437461771434847 ENSG00000169738:ENST00000306869:exon_79993757_79993939:DCXR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 80012449 G/A 1 28 28 56 13.2003189320708 14.7996810679292 -1.59936213585848 A:G G A 10 0.52856003814033 0.689847368438491 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80012374_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000320548:exon_80012408_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 80017902 C/T 1 39 32 71 18.3861585125271 16.9139212204906 1.47223729203657 T:C C T 10 0.52856003814033 0.812301217940036 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80017824_80017969:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80017824_80017969:DUS1L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 80019207 G/C 1 23 13 36 10.8431191227724 6.87128049582429 3.97183862694812 C:G G C 10 0.52856003814033 0.242243901432471 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 80020812 C/T 1 18 17 35 8.48591931347406 8.98552064838561 -0.499601334911551 T:C C T 10 0.52856003814033 0.867525314175691 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80020737_80020849:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80020737_80020820:DUS1L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 80045086 G/C 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 C:G G C 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044926_80045129:FASN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 80377690 T/G 1 2 8 10 0.94287992371934 4.22848030512264 -3.2856003814033 T:G T G 10 0.52856003814033 0.0541817455657943 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80377625_80377759:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80377665_80377759:HEXDC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 80401946 A/G 1 23 12 35 10.8431191227724 6.34272045768396 4.50039866508845 A:G A G 10 0.52856003814033 0.174738967883526 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 80863857 T/C 1 6 3 9 2.82863977115802 1.58568011442099 1.24295965673703 T:C T C 10 0.52856003814033 0.514204578379993 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80863812_80863929:TBCD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 47 57 104 22.1576782074045 30.1279221739988 -7.97024396659432 T:C T C 10 0.52856003814033 0.140303115496148 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 691266 A/G 1 7 9 16 3.30007973301769 4.75704034326297 -1.45696061024528 A:G A G 10 0.52856003814033 0.618027034384742 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_691204_691276:ENOSF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 2595443 G/T 1 29 32 61 13.6717588939304 16.9139212204906 -3.24216232656013 T:G G T 10 0.52856003814033 0.442690998725159 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2595415_2595620:NDC80 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 9221883 C/G 1 12 13 25 5.65727954231604 6.87128049582429 -1.21400095350825 C:G C G 10 0.52856003814033 0.691078714041608 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9221850_9221997:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9221850_9221997:ANKRD12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 9254785 C/T 1 121 98 219 57.0442353850201 51.7988837377523 5.24535164726773 T:C C T 10 0.52856003814033 0.49889869082798 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000359158:exon_9254209_9255428:ANKRD12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 9255784 C/A 1 249 198 447 117.388550503058 104.654887551785 12.7336629512725 A:C C A 10 0.52856003814033 0.236387856560265 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255630_9255795:ANKRD12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 222 205 427 104.659671532847 108.354807818768 -3.69513628592092 A:G A G 10 0.52856003814033 0.734513798068029 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 9258531 C/T 1 20 20 40 9.4287992371934 10.5712007628066 -1.1424015256132 T:C C T 10 0.52856003814033 0.753183226177787 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 9258537 T/C 1 19 21 40 8.95735927533373 11.0997608009469 -2.1424015256132 T:C T C 10 0.52856003814033 0.529207851346488 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 9562042 C/T 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9561978_9562073:PPP4R1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 12308273 G/T 1 10 22 32 4.7143996185967 11.6283208390873 -6.91392122049056 T:G G T 10 0.52856003814033 0.0199422669004956 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12308070_12308348:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12308257_12308348:TUBB6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 12308793 G/C 1 20 56 76 9.4287992371934 29.5993621358585 -20.1705628986651 A:C:G G C 10 0.52856003814033 4.53074268812792e-06 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12308686_12308794:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12308686_12308794:TUBB6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 199 198 397 93.8165524100743 104.654887551785 -10.838335141711 C:G C G 10 0.52856003814033 0.29115035685423 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 34 23 57 16.0289587032288 12.1568808772276 3.87207782600119 T:C T C 10 0.52856003814033 0.353526142266623 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 33 31 64 15.5575187413691 16.3853611823502 -0.827842440981122 T:C C T 10 0.52856003814033 0.900553143046234 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 43678225 T/C 1 39 38 77 18.3861585125271 20.0852814493325 -1.69912293680541 A:T:C T C 10 0.52856003814033 0.732763252674303 ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43678138_43678245:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43678138_43678319:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43678138_43678261:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000484856:exon_43678138_43678245:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000475026:exon_43678138_43678239:ATP5A1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 47318626 T/C 1 26 41 67 12.2574390083514 21.6709615637535 -9.41352255540211 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0269133630333044 ENSG00000167315:ENST00000285093:exon_47318522_47318697:ACAA2;ENSG00000167315:ENST00000398549:exon_47318522_47318697:ACAA2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 47803354 C/T 1 10 8 18 4.7143996185967 4.22848030512264 0.485919313474059 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803202_47803368:MBD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 47809843 G/C 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 C:G G C 10 0.52856003814033 0.295468489539448 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 47813990 C/A 1 28 22 50 13.2003189320708 11.6283208390873 1.5719980929835 A:C C A 10 0.52856003814033 0.673830950568398 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47813957_47814674:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47813957_47814692:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000445672:exon_47813957_47814692:CXXC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 47911631 A/G 1 8 1 9 3.77151969487736 0.52856003814033 3.24295965673703 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0418258618356361 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47911586_47911723:SKA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 47918536 C/T 1 9 9 18 4.24295965673703 4.75704034326297 -0.51408068652594 T:C C T 10 0.52856003814033 0.818276179396142 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000488454:exon_47918469_47918621:SKA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 13 17 30 6.12871950417571 8.98552064838561 -2.8568011442099 A:C A C 10 0.52856003814033 0.361259627736537 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 48458717 T/A 1 12 2 14 5.65727954231604 1.05712007628066 4.60015946603538 A:T T A 10 0.52856003814033 0.0149199851373939 ENSG00000082212:ENST00000321341:exon_48458628_48458730:ME2;ENSG00000082212:ENST00000382927:exon_48458628_48458730:ME2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 51820268 T/A 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:T T A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 56149048 A/G 1 13 7 20 6.12871950417571 3.69992026698231 2.4287992371934 A:G A G 10 0.52856003814033 0.371226288997467 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56148479_56149271:ALPK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 56196451 C/T 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 T:C C T 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56196323_56196470:ALPK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 11 16 27 5.18583958045637 8.45696061024528 -3.27112102978891 A:C C A 10 0.52856003814033 0.248567283323368 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 56203074 G/A 1 6 7 13 2.82863977115802 3.69992026698231 -0.87128049582429 A:G G A 10 0.52856003814033 0.782861958075039 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 56203120 C/T 1 9 3 12 4.24295965673703 1.58568011442099 2.65727954231604 T:C C T 10 0.52856003814033 0.153869078916603 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 56204644 T/G 1 12 8 20 5.65727954231604 4.22848030512264 1.4287992371934 T:G T G 10 0.52856003814033 0.655655571127766 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 56204671 A/T 1 12 12 24 5.65727954231604 6.34272045768396 -0.68544091536792 A:T A T 10 0.52856003814033 0.839606713971287 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 1 13 3 16 6.12871950417571 1.58568011442099 4.54303938975472 T:G T G 10 0.52856003814033 0.0245662325487644 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 1 14 3 17 6.60015946603538 1.58568011442099 5.01447935161439 C:G C G 10 0.52856003814033 0.0151303182971902 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 56204977 C/T 1 12 3 15 5.65727954231604 1.58568011442099 4.07159942789505 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0395336693355746 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 56204991 C/T 1 10 3 13 4.7143996185967 1.58568011442099 3.12871950417571 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0991231984509586 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 56205262 A/C 1 11 16 27 5.18583958045637 8.45696061024528 -3.27112102978891 A:C A C 10 0.52856003814033 0.248567283323368 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 56205481 G/A 1 13 17 30 6.12871950417571 8.98552064838561 -2.8568011442099 A:G G A 10 0.52856003814033 0.361259627736537 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 57000469 T/A 1 20 12 32 9.4287992371934 6.34272045768396 3.08607877950944 A:T T A 10 0.52856003814033 0.293533111544821 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57000323_57000476:LMAN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 60242740 T/C 1 1 8 9 0.47143996185967 4.22848030512264 -3.75704034326297 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0159780666639568 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 61654297 A/G 1 29 15 44 13.6717588939304 7.92840057210495 5.74335832182548 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0966134057156657 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 18 17 35 8.48591931347406 8.98552064838561 -0.499601334911551 A:G A G 10 0.52856003814033 0.867525314175691 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 67687860 T/C 1 7 13 20 3.30007973301769 6.87128049582429 -3.5712007628066 T:C T C 10 0.52856003814033 0.121360991375261 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67687851_67688053:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67687851_67688053:RTTN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 71816278 G/A 1 46 25 71 21.6862382455448 13.2140009535083 8.47223729203657 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0564043061201333 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 71920855 G/A 1 71 73 144 33.4722372920366 38.5848827842441 -5.11264549220753 A:G G A 10 0.52856003814033 0.404841573582806 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71920531_71920900:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71920628_71920900:CYB5A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 21 19 40 9.90023919905307 10.0426407246663 -0.142401525613201 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 48 25 73 22.6291181692642 13.2140009535083 9.41511721575591 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0341395403296171 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 21 14 35 9.90023919905307 7.39984053396462 2.50039866508845 T:C T C 10 0.52856003814033 0.49885728724397 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 77171061 T/G 1 4 8 12 1.88575984743868 4.22848030512264 -2.34272045768396 T:G T G 10 0.52856003814033 0.248143449837288 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 77894844 G/A 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 18 77896242 C/T 1 4 8 12 1.88575984743868 4.22848030512264 -2.34272045768396 T:C C T 10 0.52856003814033 0.248143449837288 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 532066 C/T 1 31 47 78 14.6146388176498 24.8423217925955 -10.2276829749457 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0229992326785598 ENSG00000099804:ENST00000215574:exon_531733_532108:CDC34 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 15 8 23 7.07159942789505 4.22848030512264 2.84311912277241 C:G G C 10 0.52856003814033 0.297564808088866 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 622336 T/G 1 10 7 17 4.7143996185967 3.69992026698231 1.01447935161439 T:G T G 10 0.52856003814033 0.808994871295111 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622149_622373:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622149_622373:POLRMT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 868115 C/T 1 51 62 113 24.0434380548432 32.7707223647005 -8.72728430985729 T:C C T 10 0.52856003814033 0.109231677975956 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_867964_868251:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_867964_868499:MED16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 871135 A/G 1 11 22 33 5.18583958045637 11.6283208390873 -6.44248125863089 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0348244583163876 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_871037_871253:MED16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 871987 G/A 1 27 43 70 12.7288789702111 22.7280816400342 -9.9992026698231 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0222386410027424 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 875389 G/A 1 22 25 47 10.3716791609127 13.2140009535083 -2.84232179259551 A:G G A 10 0.52856003814033 0.465794066556751 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_875244_875454:MED16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 880066 G/A 1 4 9 13 1.88575984743868 4.75704034326297 -2.87128049582429 A:G G A 10 0.52856003814033 0.163321106873792 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 899444 C/T 1 59 65 124 27.8149577497205 34.3564024791214 -6.54144472940092 T:C C T 10 0.52856003814033 0.243640040137177 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_899440_899495:C19orf22 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 17 16 33 8.01447935161439 8.45696061024528 -0.442481258630892 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 990281 G/A 1 39 26 65 18.3861585125271 13.7425609916486 4.64359752087855 A:G G A 10 0.52856003814033 0.265406445010675 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_990223_990364:WDR18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 991968 T/C 1 110 103 213 51.8583958045637 54.441683928454 -2.58328812389029 T:C T C 10 0.52856003814033 0.731937552026846 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991955_992121:WDR18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 16 20 36 7.54303938975472 10.5712007628066 -3.02816137305188 A:G A G 10 0.52856003814033 0.322011772212768 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1036039 G/A 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1037941 G/T 1 145 84 229 68.3587944696521 44.3990432037877 23.9597512658644 T:G G T 10 0.52856003814033 0.00146492139071151 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1037624_1039060:CNN2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1065018 G/T 1 8 4 12 3.77151969487736 2.11424015256132 1.65727954231604 T:G G T 10 0.52856003814033 0.397101977790935 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000524383:exon_1064930_1065170:ABCA7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 15 7 22 7.07159942789505 3.69992026698231 3.37167916091274 T:C T C 10 0.52856003814033 0.199871210957820 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 15 7 22 7.07159942789505 3.69992026698231 3.37167916091274 A:G G A 10 0.52856003814033 0.199871210957820 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1074000 A/T 1 10 21 31 4.7143996185967 11.0997608009469 -6.38536118235023 A:T A T 10 0.52856003814033 0.0293562060321658 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1073947_1074013:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1073947_1074013:HMHA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1080311 G/C 1 32 42 74 15.0860787795094 22.1995216018939 -7.11344282238442 C:G G C 10 0.52856003814033 0.103801772522415 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080254_1080378:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080254_1080378:HMHA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1081617 A/G 1 29 33 62 13.6717588939304 17.4424812586309 -3.77072236470046 A:G A G 10 0.52856003814033 0.374025302491909 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1081549_1081737:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1081549_1081737:HMHA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1223125 C/G 1 44 40 84 20.7433583218255 21.1424015256132 -0.399043203787723 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000118046:ENST00000326873:exon_1222984_1223171:STK11;ENSG00000118046:ENST00000405031:exon_1222984_1223171:STK11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 9 26 35 4.24295965673703 13.7425609916486 -9.49960133491155 T:C:G C T 10 0.52856003814033 0.00184793634175111 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 45 40 85 21.2147982836851 21.1424015256132 0.072396758071946 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1619333 G/A 1 39 14 53 18.3861585125271 7.39984053396462 10.9863179785625 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00233851644027681 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1827321 C/T 1 2 8 10 0.94287992371934 4.22848030512264 -3.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0541817455657943 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1854557 A/G 1 14 8 22 6.60015946603538 4.22848030512264 2.37167916091274 A:G A G 10 0.52856003814033 0.39453671919514 ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 14 8 22 6.60015946603538 4.22848030512264 2.37167916091274 T:C T C 10 0.52856003814033 0.39453671919514 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1912986 C/T 1 20 16 36 9.4287992371934 8.45696061024528 0.971838626948118 T:C C T 10 0.52856003814033 0.867744765296129 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1979386 C/T 1 23 23 46 10.8431191227724 12.1568808772276 -1.31376175445518 T:C C T 10 0.52856003814033 0.768336814301971 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1979318_1979402:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1979318_1979402:CSNK1G2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 64 70 134 30.1721575590189 36.9992026698231 -6.82704511080423 A:G A G 10 0.52856003814033 0.260739541556806 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 7 12 19 3.30007973301769 6.34272045768396 -3.04264072466627 A:G A G 10 0.52856003814033 0.175319074565204 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 2037842 A/C 1 528 992 1520 248.920299861906 524.331557835207 -275.411257973302 A:C A C 10 0.52856003814033 1.11922594141998e-45 ENSG00000099875:ENST00000250896:exon_2037481_2039855:MKNK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 35 26 61 16.5003986650884 13.7425609916486 2.75783767343987 A:G G A 10 0.52856003814033 0.522681902898178 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 19 9 28 8.95735927533373 4.75704034326297 4.20031893207076 A:G A G 10 0.52856003814033 0.131076740791388 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 26 29 55 12.2574390083514 15.3282411060696 -3.07080209771815 A:C C A 10 0.52856003814033 0.420765578853564 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 2732741 G/A 1 93 121 214 43.8439164529493 63.9557646149799 -20.1118481620306 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00612465588988185 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 17 12 29 8.01447935161439 6.34272045768396 1.67175889393043 A:C A C 10 0.52856003814033 0.580875484028571 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 12 11 23 5.65727954231604 5.81416041954363 -0.15688087722759 T:G G T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 2933480 C/T 1 5 9 14 2.35719980929835 4.75704034326297 -2.39984053396462 T:C C T 10 0.52856003814033 0.284510641180970 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 2934282 T/C 1 14 2 16 6.60015946603538 1.05712007628066 5.54303938975472 T:C T C 10 0.52856003814033 0.00512048675071429 ENSG00000175691:ENST00000444249:exon_2933536_2934388:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000341064:exon_2933536_2934393:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 2994903 T/C 1 7 4 11 3.30007973301769 2.11424015256132 1.18583958045637 T:C T C 10 0.52856003814033 0.556140452563778 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 13 9 22 6.12871950417571 4.75704034326297 1.37167916091274 A:G G A 10 0.52856003814033 0.671001928035497 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 29 20 49 13.6717588939304 10.5712007628066 3.10055813112383 T:C:G T C 10 0.52856003814033 0.394228477428164 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 55 38 93 25.9291979022818 20.0852814493325 5.84391645294931 A:G A G 10 0.52856003814033 0.253413995103196 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 3752515 G/A 1 51 37 88 24.0434380548432 19.5567214111922 4.48671664365096 A:G G A 10 0.52856003814033 0.393130594155047 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752506_3752718:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752506_3752718:APBA3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 3752874 A/G 1 11 9 20 5.18583958045637 4.75704034326297 0.4287992371934 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752818_3753060:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752818_3752988:APBA3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 3762698 C/T 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3762665_3762816:MRPL54 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 3767265 C/T 1 101 108 209 47.6154361478267 57.0844841191556 -9.46904797132898 T:C C T 10 0.52856003814033 0.212250558470263 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3767259_3767562:MRPL54 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 4180836 C/T 1 5 10 15 2.35719980929835 5.2856003814033 -2.92840057210495 T:C C T 10 0.52856003814033 0.194617397098600 ENSG00000077463:ENST00000337491:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000305232:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000269860:exon_4180779_4180906:SIRT6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 4352959 A/G 1 7 11 18 3.30007973301769 5.81416041954363 -2.51408068652594 A:G A G 10 0.52856003814033 0.24852778175064 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 4670236 C/G 1 33 35 68 15.5575187413691 18.4996013349116 -2.94208259354244 A:C:G C G 10 0.52856003814033 0.543959547581953 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4670173_4670415:C19orf10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 4670313 C/G 1 43 38 81 20.2719183599658 20.0852814493325 0.186636910633268 A:C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4670173_4670415:C19orf10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 11 22 33 5.18583958045637 11.6283208390873 -6.44248125863089 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0348244583163876 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 26 28 54 12.2574390083514 14.7996810679292 -2.54224205957782 T:C:G T C 10 0.52856003814033 0.498876872398649 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 33 46 79 15.5575187413691 24.3137617544552 -8.75624301308607 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0550866059861531 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 26 8 34 12.2574390083514 4.22848030512264 8.02895870322878 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00569588448901684 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 5789565 T/C 1 16 3 19 7.54303938975472 1.58568011442099 5.95735927533373 T:C T C 10 0.52856003814033 0.00561186437792331 ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5789218_5789730:DUS3L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 15 5 20 7.07159942789505 2.64280019070165 4.4287992371934 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0705898240950017 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 806 765 1571 379.980609258894 404.348429177353 -24.3678199184585 A:T:C:G G A 10 0.52856003814033 0.225123909008657 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 6731057 T/C 1 30 48 78 14.1431988557901 25.3708818307358 -11.2276829749457 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0123017443067324 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 9 4 13 4.24295965673703 2.11424015256132 2.12871950417571 T:C T C 10 0.52856003814033 0.277047309964302 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 7622226 G/A 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 7992052 A/C 1 81 86 167 38.1866369106333 45.4561632800684 -7.26952636943511 A:C A C 10 0.52856003814033 0.278083873895584 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7991604_7992191:TIMM44 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 7992126 G/A 1 54 65 119 25.4577579404222 34.3564024791214 -8.89864453869927 A:G G A 10 0.52856003814033 0.118220999118781 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7991604_7992191:TIMM44 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 8000001 C/T 1 30 32 62 14.1431988557901 16.9139212204906 -2.77072236470046 T:C C T 10 0.52856003814033 0.525643147716016 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7999950_8000030:TIMM44 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 8028544 A/G 1 123 120 243 57.9871153087394 63.4272045768396 -5.4400892681002 A:G A G 10 0.52856003814033 0.520603634168138 ENSG00000066044:ENST00000351593:exon_8023458_8028691:ELAVL1;ENSG00000066044:ENST00000407627:exon_8023458_8028691:ELAVL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 8326866 C/T 1 59 29 88 27.8149577497205 15.3282411060696 12.486716643651 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00755365640630955 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 8326944 G/A 1 76 41 117 35.8294371013349 21.6709615637535 14.1584755375814 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00933810775541384 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 8326999 C/T 1 31 19 50 14.6146388176498 10.0426407246663 4.5719980929835 T:C C T 10 0.52856003814033 0.205415656212564 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 8376431 G/A 1 82 89 171 38.6580768724929 47.0418433944894 -8.38376652199644 A:T:G G A 10 0.52856003814033 0.220308420388197 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8376234_8376479:NDUFA7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 8381493 G/C 1 78 64 142 36.7723170250543 33.8278424409811 2.94447458407313 C:G G C 10 0.52856003814033 0.674460399581274 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8381380_8381529:NDUFA7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 9453655 C/T 1 13 2 15 6.12871950417571 1.05712007628066 5.07159942789505 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00876656408784868 ENSG00000188321:ENST00000317221:exon_9452371_9453744:ZNF559;ENSG00000188321:ENST00000393883:exon_9452371_9454519:ZNF559 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 36 37 73 16.9718386269481 19.5567214111922 -2.58488278424409 A:G A G 10 0.52856003814033 0.559692590423513 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10260252 G/A 1 15 5 20 7.07159942789505 2.64280019070165 4.4287992371934 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0705898240950017 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10260129_10260333:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10260129_10260333:DNMT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10265725 G/A 1 10 4 14 4.7143996185967 2.11424015256132 2.60015946603538 A:G G A 10 0.52856003814033 0.189499784192365 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10265581_10265732:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10265581_10265732:DNMT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10369086 C/T 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.743227953420132 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10369434 C/T 1 26 29 55 12.2574390083514 15.3282411060696 -3.07080209771815 T:C C T 10 0.52856003814033 0.420765578853564 ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10370369 G/A 1 323 259 582 152.275107680673 136.897049878345 15.3780578023279 A:G G A 10 0.52856003814033 0.212912943328286 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10385540 A/T 1 9 6 15 4.24295965673703 3.17136022884198 1.07159942789505 A:T A T 10 0.52856003814033 0.616121686737298 ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10385441_10385704:ICAM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10385743 C/G 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 C:G C G 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10395248 C/T 1 30 30 60 14.1431988557901 15.8568011442099 -1.7136022884198 T:C C T 10 0.52856003814033 0.699045924649385 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395079_10395333:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395079_10395333:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395079_10395333:ICAM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10426422 A/C 1 13 2 15 6.12871950417571 1.05712007628066 5.07159942789505 A:C A C 10 0.52856003814033 0.00876656408784868 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10426597 T/C 1 12 6 18 5.65727954231604 3.17136022884198 2.48591931347406 T:C T C 10 0.52856003814033 0.345436270087802 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 11 5 16 5.18583958045637 2.64280019070165 2.54303938975472 T:C T C 10 0.52856003814033 0.222015324368485 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10439501 C/T 1 9 11 20 4.24295965673703 5.81416041954363 -1.5712007628066 T:C C T 10 0.52856003814033 0.509501749881068 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10439318_10439787:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10439318_10439787:RAVER1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10439540 A/G 1 9 8 17 4.24295965673703 4.22848030512264 0.0144793516143897 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10439318_10439787:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10439318_10439787:RAVER1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10439711 A/G 1 9 8 17 4.24295965673703 4.22848030512264 0.0144793516143897 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10439318_10439787:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10439318_10439787:RAVER1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10445806 C/T 1 131 118 249 61.7586350036168 62.3700845005589 -0.611449496942178 T:C C T 10 0.52856003814033 0.949456738274775 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10445742_10446029:ICAM3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10449514 T/C 1 46 52 98 21.6862382455448 27.4851219832972 -5.79888373775234 T:C T C 10 0.52856003814033 0.265947959849399 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10463235 G/A 1 8 9 17 3.77151969487736 4.75704034326297 -0.98552064838561 A:G G A 10 0.52856003814033 0.637676890163413 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 11 9 20 5.18583958045637 4.75704034326297 0.4287992371934 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10477206 G/A 1 7 2 9 3.30007973301769 1.05712007628066 2.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 0.186100445119176 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10477093_10477256:TYK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 3 14 17 1.41431988557901 7.39984053396462 -5.98552064838561 C:G G C 10 0.52856003814033 0.00566557927197770 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10668673 A/G 1 22 37 59 10.3716791609127 19.5567214111922 -9.18504225027947 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0186105606093018 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668648_10668736:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668648_10668736:KRI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 27 18 45 12.7288789702111 9.51408068652594 3.21479828368515 T:C T C 10 0.52856003814033 0.372490330730488 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 11034846 C/T 1 23 6 29 10.8431191227724 3.17136022884198 7.67175889393043 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00460453166692203 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 19 24 43 8.95735927533373 12.6854409153679 -3.72808164003419 T:C T C 10 0.52856003814033 0.286285121242471 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 11172517 C/T 1 134 140 274 63.1729548891958 73.9984053396462 -10.8254504504504 T:C C T 10 0.52856003814033 0.203824125845804 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11172460_11172958:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11172460_11172958:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11172460_11172958:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11172460_11172958:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11172460_11172958:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11172460_11172958:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11172460_11172958:SMARCA4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 11230881 T/C 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 T:C T C 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11230768_11230909:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11230768_11230909:LDLR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 11624790 G/A 1 21 15 36 9.90023919905307 7.92840057210495 1.97183862694812 A:G G A 10 0.52856003814033 0.617191029889971 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11624619_11625036:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000252440:exon_11624619_11625036:ECSIT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 11664542 G/A 1 64 62 126 30.1721575590189 32.7707223647005 -2.59856480568158 A:T:G G A 10 0.52856003814033 0.656365262518573 ENSG00000130165:ENST00000252445:exon_11663858_11664625:ELOF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 12256358 T/G 1 3 8 11 1.41431988557901 4.22848030512264 -2.81416041954363 T:G T G 10 0.52856003814033 0.129625044921933 ENSG00000213297:ENST00000434822:exon_12256073_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000455799:exon_12255705_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000355738:exon_12255711_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000439556:exon_12256080_12257039:ZNF625 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 12383540 G/C 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000197857:ENST00000397742:exon_12383302_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000356109:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000457673:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000355684:exon_12383144_12384878:ZNF44 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 12501810 T/C 1 6 10 16 2.82863977115802 5.2856003814033 -2.45696061024528 T:C T C 10 0.52856003814033 0.316716189138101 ENSG00000196466:ENST00000460935:exon_12500830_12503020:ZNF799;ENSG00000196466:ENST00000419318:exon_12500830_12503020:ZNF799;ENSG00000196466:ENST00000430385:exon_12501280_12503020:ZNF799;ENSG00000196466:ENST00000357979:exon_12501280_12503020:ZNF799 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 12739705 G/A 1 11 9 20 5.18583958045637 4.75704034326297 0.4287992371934 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000173875:ENST00000446165:exon_12738535_12740461:ZNF791;ENSG00000173875:ENST00000343325:exon_12738535_12742735:ZNF791;ENSG00000173875:ENST00000393303:exon_12739673_12739912:ZNF791 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 13008607 G/T 1 20 17 37 9.4287992371934 8.98552064838561 0.443278588807788 T:G G T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 13010520 A/G 1 46 64 110 21.6862382455448 33.8278424409811 -12.1416041954363 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0218211719138983 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13010514_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13010282_13010782:GCDH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 13035006 G/A 1 146 130 276 68.8302344315118 68.7128049582429 0.117429473268913 A:T:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13034965_13035079:FARSA;ENSG00000179115:ENST00000423140:exon_13034965_13035079:FARSA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 649 697 1346 305.964535246926 368.40634658381 -62.4418113368842 A:T:C:G G T 10 0.52856003814033 0.0007053266356927 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 13221085 G/A 1 30 22 52 14.1431988557901 11.6283208390873 2.51487801670284 A:G G A 10 0.52856003814033 0.578910849280539 ENSG00000104907:ENST00000221504:exon_13220972_13221120:TRMT1;ENSG00000104907:ENST00000437766:exon_13220972_13221120:TRMT1;ENSG00000104907:ENST00000357720:exon_13220972_13221120:TRMT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 13249244 A/G 1 24 20 44 11.3145590846321 10.5712007628066 0.743358321825479 A:G A G 10 0.52856003814033 0.880632874011172 ENSG00000160877:ENST00000292431:exon_13248961_13251955:NACC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 7 7 14 3.30007973301769 3.69992026698231 -0.39984053396462 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 14153293 T/C 1 7 7 14 3.30007973301769 3.69992026698231 -0.39984053396462 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000104998:ENST00000263379:exon_14153265_14153424:IL27RA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 14574959 G/A 1 131 105 236 61.7586350036168 55.4988040047347 6.25983099888212 A:G G A 10 0.52856003814033 0.434304529917857 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14574872_14574965:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14574872_14574965:PKN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 14580328 A/G 1 145 167 312 68.3587944696521 88.2695263694351 -19.910731899783 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0268487338163675 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 14589378 C/T 1 10 7 17 4.7143996185967 3.69992026698231 1.01447935161439 T:C C T 10 0.52856003814033 0.808994871295111 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14588574_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14588574_14589379:GIPC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 16 17 33 7.54303938975472 8.98552064838561 -1.44248125863089 A:G G A 10 0.52856003814033 0.727910534501847 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 14629171 C/T 1 16 16 32 7.54303938975472 8.45696061024528 -0.913921220490561 T:C C T 10 0.52856003814033 0.859846792144475 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 28 21 49 13.2003189320708 11.0997608009469 2.10055813112383 A:G G A 10 0.52856003814033 0.570358815143703 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 24 10 34 11.3145590846321 5.2856003814033 6.02895870322878 A:G G A 10 0.52856003814033 0.040157857460212 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 13 18 31 6.12871950417571 9.51408068652594 -3.38536118235023 A:G A G 10 0.52856003814033 0.280519231673384 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 16197377 C/T 1 9 4 13 4.24295965673703 2.11424015256132 2.12871950417571 T:C C T 10 0.52856003814033 0.277047309964302 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 18 11 29 8.48591931347406 5.81416041954363 2.67175889393043 T:C T C 10 0.52856003814033 0.356621182457111 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 23 27 50 10.8431191227724 14.2711210297889 -3.4280019070165 T:C T C 10 0.52856003814033 0.395648327443981 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 18 15 33 8.48591931347406 7.92840057210495 0.557518741369109 T:C C T 10 0.52856003814033 0.86372274013279 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 17 31 48 8.01447935161439 16.3853611823502 -8.37088183073584 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0198552449201022 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 16 8 24 7.54303938975472 4.22848030512264 3.31455908463208 A:G A G 10 0.52856003814033 0.220702538987053 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 17622614 C/T 1 56 16 72 26.4006378641415 8.45696061024528 17.9436772538962 A:T:C C T 10 0.52856003814033 1.55347751197829e-05 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17622432_17622769:PGLS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 17837689 C/T 1 55 57 112 25.9291979022818 30.1279221739988 -4.19872427171696 T:C C T 10 0.52856003814033 0.44971993065992 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 18123738 T/C 1 7 4 11 3.30007973301769 2.11424015256132 1.18583958045637 T:C T C 10 0.52856003814033 0.556140452563778 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18123722_18124903:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18123722_18124903:ARRDC2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 18170384 G/A 1 17 8 25 8.01447935161439 4.22848030512264 3.78599904649175 A:G G A 10 0.52856003814033 0.161198885597744 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 18538742 A/C 1 9 4 13 4.24295965673703 2.11424015256132 2.12871950417571 A:C A C 10 0.52856003814033 0.277047309964302 ENSG00000130511:ENST00000348495:exon_18538708_18538792:SSBP4;ENSG00000130511:ENST00000270061:exon_18538708_18538792:SSBP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 18545786 G/T 1 48 58 106 22.6291181692642 30.6564822121391 -8.02736404287498 T:G G T 10 0.52856003814033 0.12067834910271 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18545625_18545927:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18545625_18545927:ISYNA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 18546678 T/C 1 47 47 94 22.1576782074045 24.8423217925955 -2.68464358519103 T:C T C 10 0.52856003814033 0.6063418421923 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18546567_18546731:ISYNA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 66 65 131 31.1150374827382 34.3564024791214 -3.24136499638323 T:C T C 10 0.52856003814033 0.599996320061153 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 19243175 C/T 1 7 12 19 3.30007973301769 6.34272045768396 -3.04264072466627 T:C C T 10 0.52856003814033 0.175319074565204 ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19243161_19243317:TMEM161A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 19312496 C/G 1 101 94 195 47.6154361478267 49.684643585191 -2.06920743736436 C:G C G 10 0.52856003814033 0.774628931185323 ENSG00000064490:ENST00000353145:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000303088:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000456252:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000407360:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000392324:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000184162:ENST00000331552:exon_19312226_19312850:NR2C2AP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 19609438 C/G 1 6 12 18 2.82863977115802 6.34272045768396 -3.51408068652594 C:G C G 10 0.52856003814033 0.104602675868325 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19609252_19609531:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19609252_19609531:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19609252_19609531:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19609252_19609531:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19609252_19609531:GATAD2A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 19613284 G/A 1 22 23 45 10.3716791609127 12.1568808772276 -1.78520171631485 A:G G A 10 0.52856003814033 0.655183539080577 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19613140_19613335:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19613140_19613335:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19613140_19613335:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19613140_19613335:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19613140_19613335:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000418032:exon_19613140_19613335:GATAD2A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 19737686 C/T 1 4 9 13 1.88575984743868 4.75704034326297 -2.87128049582429 T:C C T 10 0.52856003814033 0.163321106873792 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19737352_19738093:LPAR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 19747587 G/A 1 9 6 15 4.24295965673703 3.17136022884198 1.07159942789505 A:G G A 10 0.52856003814033 0.616121686737298 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19747516_19747605:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19747516_19747596:GMIP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 19749013 C/T 1 12 19 31 5.65727954231604 10.0426407246663 -4.38536118235023 T:C C T 10 0.52856003814033 0.149215444517873 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19748968_19749138:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19748968_19749138:GMIP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 19767680 C/T 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000105726:ENST00000291503:exon_19767656_19767725:ATP13A1;ENSG00000105726:ENST00000357324:exon_19767656_19767725:ATP13A1;ENSG00000105726:ENST00000474955:exon_19767469_19767725:ATP13A1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 20003109 A/G 1 3 9 12 1.41431988557901 4.75704034326297 -3.34272045768396 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0796439798478496 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000355095:exon_20003002_20003556:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000427401:exon_20003035_20003166:ZNF90 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 20003576 C/G 1 10 6 16 4.7143996185967 3.17136022884198 1.54303938975472 C:G C G 10 0.52856003814033 0.466348600091948 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 21719401 T/C 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 T:C T C 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 23543095 T/C 1 10 5 15 4.7143996185967 2.64280019070165 2.07159942789505 T:C T C 10 0.52856003814033 0.313640302764783 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 33098632 G/C 1 8 4 12 3.77151969487736 2.11424015256132 1.65727954231604 C:G G C 10 0.52856003814033 0.397101977790935 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33098541_33098738:ANKRD27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 33183277 C/G 1 8 12 20 3.77151969487736 6.34272045768396 -2.5712007628066 C:G C G 10 0.52856003814033 0.270388168695337 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 33183352 G/C 1 10 13 23 4.7143996185967 6.87128049582429 -2.15688087722759 C:G G C 10 0.52856003814033 0.408211246480868 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 33370070 A/G 1 8 3 11 3.77151969487736 1.58568011442099 2.18583958045637 A:G A G 10 0.52856003814033 0.234946711874713 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 33370084 T/A 1 11 3 14 5.18583958045637 1.58568011442099 3.60015946603538 A:T T A 10 0.52856003814033 0.0629725641543962 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 33370161 A/C 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:C A C 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 13 13 26 6.12871950417571 6.87128049582429 -0.742560991648581 A:G G A 10 0.52856003814033 0.845363867960316 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 33605300 A/G 1 10 6 16 4.7143996185967 3.17136022884198 1.54303938975472 A:G A G 10 0.52856003814033 0.466348600091948 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 33605312 T/C 1 12 8 20 5.65727954231604 4.22848030512264 1.4287992371934 T:C T C 10 0.52856003814033 0.655655571127766 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 33878197 G/A 1 39 31 70 18.3861585125271 16.3853611823502 2.0007973301769 A:G G A 10 0.52856003814033 0.719765599139526 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33877865_33878387:PEPD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 35175775 C/T 1 18 19 37 8.48591931347406 10.0426407246663 -1.55672141119221 T:C C T 10 0.52856003814033 0.625136106908905 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 35506795 C/T 1 13 20 33 6.12871950417571 10.5712007628066 -4.44248125863089 T:C C T 10 0.52856003814033 0.162100095066129 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 71 67 138 33.4722372920366 35.4135225554021 -1.94128526336554 T:G T G 10 0.52856003814033 0.798223278855415 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 35660450 T/C 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 35660546 T/C 1 306 244 550 144.260628329059 128.968649306241 15.2919790228185 A:T:C T C 10 0.52856003814033 0.20012502195416 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 35741456 T/C 1 2 10 12 0.94287992371934 5.2856003814033 -4.34272045768396 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0173067676742740 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 35770056 G/A 1 19 9 28 8.95735927533373 4.75704034326297 4.20031893207076 A:G G A 10 0.52856003814033 0.131076740791388 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 38 88 126 17.9147185506675 46.513283356349 -28.5985648056816 A:G A G 10 0.52856003814033 3.74487253783382e-07 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 254 265 519 119.745750312356 140.068410107187 -20.3226597948313 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0785677469951065 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 36205867 A/T 1 67 59 126 31.5864774445979 31.1850422502795 0.401435194318413 A:T A T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36205529_36206409:ZBTB32 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 36207077 G/A 1 90 108 198 42.4295965673703 57.0844841191556 -14.6548875517854 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0389706581546087 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36207035_36207199:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36207035_36207199:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36207035_36207199:ZBTB32 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 10 9 19 4.7143996185967 4.75704034326297 -0.0426407246662706 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 36594369 C/T 1 4 9 13 1.88575984743868 4.75704034326297 -2.87128049582429 T:C C T 10 0.52856003814033 0.163321106873792 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 11 7 18 5.18583958045637 3.69992026698231 1.48591931347406 A:C A C 10 0.52856003814033 0.638181278212874 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 37005998 A/G 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 A:G A G 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 37038092 T/C 1 8 5 13 3.77151969487736 2.64280019070165 1.12871950417571 T:C T C 10 0.52856003814033 0.589189446313547 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 37129806 G/A 1 2 9 11 0.94287992371934 4.75704034326297 -3.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0308106138001003 ENSG00000197808:ENST00000360357:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396893:exon_37128283_37130945:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396896:exon_37129686_37130439:ZNF461;ENSG00000197808:ENST00000396892:exon_37129591_37129890:ZNF461 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 38631856 C/T 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38631824_38632075:SIPA1L3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 9 12 21 4.24295965673703 6.34272045768396 -2.09976080094693 T:C C T 10 0.52856003814033 0.388875747413323 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 39955515 C/T 1 21 16 37 9.90023919905307 8.45696061024528 1.44327858880779 T:C C T 10 0.52856003814033 0.74251134411024 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39955438_39955689:SUPT5H HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 40030704 C/T 1 7 9 16 3.30007973301769 4.75704034326297 -1.45696061024528 T:C C T 10 0.52856003814033 0.618027034384742 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 40197924 T/C 1 54 5 59 25.4577579404222 2.64280019070165 22.8149577497205 T:C T C 10 0.52856003814033 1.90661230455586e-10 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40197818_40198028:LGALS14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 40199914 C/G 1 134 14 148 63.1729548891958 7.39984053396462 55.7731143552312 C:G C G 10 0.52856003814033 4.93963749017357e-23 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40199837_40200087:LGALS14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 40928944 A/G 1 11 28 39 5.18583958045637 14.7996810679292 -9.61384148747287 A:G A G 10 0.52856003814033 0.00212590308619791 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 12 15 27 5.65727954231604 7.92840057210495 -2.27112102978891 T:C T C 10 0.52856003814033 0.442707659990859 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 41129842 C/T 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41129841_41129987:LTBP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 11 5 16 5.18583958045637 2.64280019070165 2.54303938975472 T:C T C 10 0.52856003814033 0.222015324368485 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 41889748 T/C 1 9 10 19 4.24295965673703 5.2856003814033 -1.04264072466627 T:C T C 10 0.52856003814033 0.653229248249193 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41889620_41889985:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41889466_41889985:TMEM91 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 16 25 41 7.54303938975472 13.2140009535083 -5.67096156375353 A:G G A 10 0.52856003814033 0.085704351783196 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 31 29 60 14.6146388176498 15.3282411060696 -0.713602288419802 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.897477382149947 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 97 54 151 45.729676300388 28.5422420595778 17.1874342408102 A:G A G 10 0.52856003814033 0.00544987724575541 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 10 16 26 4.7143996185967 8.45696061024528 -3.74256099164858 C:G C G 10 0.52856003814033 0.169917266118540 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 12 6 18 5.65727954231604 3.17136022884198 2.48591931347406 T:C T C 10 0.52856003814033 0.345436270087802 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 43979589 G/T 1 7 9 16 3.30007973301769 4.75704034326297 -1.45696061024528 T:G G T 10 0.52856003814033 0.618027034384742 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 44001345 C/T 1 1 7 8 0.47143996185967 3.69992026698231 -3.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0304181799638115 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_44001270_44001431:PHLDB3;ENSG00000176531:ENST00000314735:exon_44000186_44001431:PHLDB3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 9 12 21 4.24295965673703 6.34272045768396 -2.09976080094693 T:C T C 10 0.52856003814033 0.388875747413323 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 44153003 C/T 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44152732_44153295:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44152732_44153295:PLAUR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 44610665 A/G 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:G A G 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 44610798 A/T 1 9 2 11 4.24295965673703 1.05712007628066 3.18583958045637 A:T A T 10 0.52856003814033 0.0701714577429645 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 44611162 G/T 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 T:G G T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 3 6 9 1.41431988557901 3.17136022884198 -1.75704034326297 T:C T C 10 0.52856003814033 0.322282730829835 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 44680489 G/A 1 11 5 16 5.18583958045637 2.64280019070165 2.54303938975472 A:G G A 10 0.52856003814033 0.222015324368485 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 44732658 C/G 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 T:C:G C G 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44732599_44732725:ZNF227 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 44739303 T/C 1 4 9 13 1.88575984743868 4.75704034326297 -2.87128049582429 T:C T C 10 0.52856003814033 0.163321106873792 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 44740602 G/A 1 14 12 26 6.60015946603538 6.34272045768396 0.25743900835142 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 45476422 T/C 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 T:C T C 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45476344_45476467:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45476344_45476467:CLPTM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 23 34 57 10.8431191227724 17.9710412967712 -7.12792217399881 A:C A C 10 0.52856003814033 0.063624996787406 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 56 34 90 26.4006378641415 17.9710412967712 8.4295965673703 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0906355981746326 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 40 24 64 18.8575984743868 12.6854409153679 6.17215755901888 A:G G A 10 0.52856003814033 0.133710527334883 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 26 18 44 12.2574390083514 9.51408068652594 2.74335832182548 A:C C A 10 0.52856003814033 0.45223191266939 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 46024584 T/G 1 103 87 190 48.558316071546 45.9847233182087 2.57359275333729 A:T:G T G 10 0.52856003814033 0.717047500966483 ENSG00000125753:ENST00000245932:exon_46024580_46024664:VASP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 46124517 C/T 1 14 26 40 6.60015946603538 13.7425609916486 -7.1424015256132 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0264332795194359 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46124465_46124590:EML2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 46129999 C/A 1 16 10 26 7.54303938975472 5.2856003814033 2.25743900835142 A:C C A 10 0.52856003814033 0.435111822543937 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46129963_46130097:EML2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 46319415 G/C 1 109 106 215 51.386955842704 56.027364042875 -4.64040820017096 T:C:G G C 10 0.52856003814033 0.539207439367235 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46319109_46319441:SYMPK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 46341824 C/T 1 21 16 37 9.90023919905307 8.45696061024528 1.44327858880779 T:C C T 10 0.52856003814033 0.74251134411024 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46341719_46341873:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46341719_46341873:SYMPK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 46352122 A/G 1 3 7 10 1.41431988557901 3.69992026698231 -2.2856003814033 A:G A G 10 0.52856003814033 0.206826979960111 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46352008_46352134:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46352008_46352134:SYMPK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 46387792 G/C 1 25 18 43 11.7859990464917 9.51408068652594 2.27191835996581 C:G G C 10 0.52856003814033 0.542908997814718 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 13 16 29 6.12871950417571 8.45696061024528 -2.32824110606957 C:G C G 10 0.52856003814033 0.458172935319808 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 46857015 C/T 1 17 20 37 8.01447935161439 10.5712007628066 -2.55672141119221 T:C C T 10 0.52856003814033 0.415115247521212 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46857005_46857164:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46857005_46857246:PPP5C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 47124714 T/G 1 2 9 11 0.94287992371934 4.75704034326297 -3.81416041954363 T:G T G 10 0.52856003814033 0.0308106138001003 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 47226434 C/T 1 11 11 22 5.18583958045637 5.81416041954363 -0.628320839087261 T:C C T 10 0.52856003814033 0.83325131156315 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47226371_47226541:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47226371_47226541:STRN4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 47226450 A/G 1 9 12 21 4.24295965673703 6.34272045768396 -2.09976080094693 A:G A G 10 0.52856003814033 0.388875747413323 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47226371_47226541:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47226371_47226541:STRN4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 47770032 C/T 1 23 12 35 10.8431191227724 6.34272045768396 4.50039866508845 T:C C T 10 0.52856003814033 0.174738967883526 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 47865947 G/A 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 A:G G A 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 47978739 C/T 1 20 29 49 9.4287992371934 15.3282411060696 -5.89944186887617 T:C C T 10 0.52856003814033 0.114698886774939 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 10 2 12 4.7143996185967 1.05712007628066 3.65727954231604 T:C T C 10 0.52856003814033 0.042272250685085 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 7 7 14 3.30007973301769 3.69992026698231 -0.39984053396462 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 48836673 G/T 1 8 8 16 3.77151969487736 4.22848030512264 -0.456960610245281 T:G G T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000161558:ENST00000435956:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000377431:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48835613_48836690:TMEM143 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 48949286 G/T 1 6 3 9 2.82863977115802 1.58568011442099 1.24295965673703 T:G G T 10 0.52856003814033 0.514204578379993 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48949062_48949449:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48949251_48949449:GRWD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 48954421 G/A 1 9 6 15 4.24295965673703 3.17136022884198 1.07159942789505 A:G G A 10 0.52856003814033 0.616121686737298 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48954291_48954488:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48954291_48954488:GRWD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 49129393 C/T 1 17 10 27 8.01447935161439 5.2856003814033 2.72887897021109 T:C C T 10 0.52856003814033 0.338314026995623 ENSG00000063176:ENST00000245222:exon_49129148_49129619:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000340932:exon_49129148_49129619:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000443164:exon_49128218_49129619:SPHK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 49513273 C/T 1 124 107 231 58.4585552705991 56.5559240810153 1.90263118958377 T:C C T 10 0.52856003814033 0.843347673214333 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 50183788 G/A 1 247 193 440 116.445670579338 102.012087361084 14.4335832182548 A:C:G G A 10 0.52856003814033 0.181158399178466 ENSG00000126457:ENST00000529284:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000532489:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000527382:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000528623:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000534465:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000391851:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000534280:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000351853:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000419451:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000449059:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000534676:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000454376:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000525616:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000524771:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000408976:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000529836:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000526224:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000527412:exon_50183744_50183845:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000391849:exon_50183744_50183845:PRMT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 50188046 G/A 1 342 340 682 161.232466956007 179.710412967712 -18.4779460117051 A:T:G G A 10 0.52856003814033 0.167303323166040 ENSG00000126457:ENST00000529284:exon_50188011_50188073:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000532489:exon_50188011_50188098:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000527382:exon_50188011_50188098:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000534465:exon_50188011_50188098:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000391851:exon_50188011_50188098:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000351853:exon_50188011_50188098:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000419451:exon_50188011_50188098:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000449059:exon_50188011_50188098:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000534676:exon_50188011_50188098:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000454376:exon_50188011_50188098:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000525616:exon_50188011_50188285:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000524771:exon_50188011_50188098:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000408976:exon_50188011_50188098:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000526224:exon_50188011_50188075:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000391849:exon_50188011_50188098:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000529650:exon_50188011_50188054:PRMT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 43 24 67 20.2719183599658 12.6854409153679 7.58647744459789 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0669935639010101 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 106 84 190 49.972635957125 44.3990432037877 5.57359275333729 A:G G A 10 0.52856003814033 0.425155394362349 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 53453260 C/G 1 11 8 19 5.18583958045637 4.22848030512264 0.957359275333729 C:G C G 10 0.52856003814033 0.819137161107216 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 53453777 C/T 1 9 10 19 4.24295965673703 5.2856003814033 -1.04264072466627 T:C C T 10 0.52856003814033 0.653229248249193 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 53571306 T/C 1 7 10 17 3.30007973301769 5.2856003814033 -1.98552064838561 T:C T C 10 0.52856003814033 0.345083621048323 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 A:G A G 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 55485899 G/A 1 2 11 13 0.94287992371934 5.81416041954363 -4.87128049582429 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0096219812206849 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55485868_55485912:NLRP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 55494881 C/G 1 57 1 58 26.8720778260012 0.52856003814033 26.3435177878609 C:G C G 10 0.52856003814033 4.83260976201999e-15 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 55512137 C/A 1 1 208 209 0.47143996185967 109.940487933189 -109.469047971329 A:C C A 10 0.52856003814033 1.31153476096446e-66 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 55559715 G/A 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 A:G G A 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55559697_55559909:RDH13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 55624113 G/A 1 2 8 10 0.94287992371934 4.22848030512264 -3.2856003814033 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0541817455657943 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55624033_55624163:PPP1R12C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 55738746 G/A 1 1 10 11 0.47143996185967 5.2856003814033 -4.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00430844742662333 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55738116_55738931:TMEM86B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 55739605 C/T 1 5 7 12 2.35719980929835 3.69992026698231 -1.34272045768396 T:C C T 10 0.52856003814033 0.566216755054812 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55739559_55739805:TMEM86B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 55751001 G/C 1 28 35 63 13.2003189320708 18.4996013349116 -5.29928240284079 C:G G C 10 0.52856003814033 0.207119204770716 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55750962_55751051:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55750962_55751051:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55750962_55751051:PPP6R1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 55756980 A/G 1 18 12 30 8.48591931347406 6.34272045768396 2.1431988557901 A:G A G 10 0.52856003814033 0.469352400778903 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 56104136 T/C 1 11 7 18 5.18583958045637 3.69992026698231 1.48591931347406 T:C T C 10 0.52856003814033 0.638181278212874 ENSG00000179943:ENST00000221665:exon_56102738_56105012:FIZ1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 46 40 86 21.6862382455448 21.1424015256132 0.543836719931615 A:G G A 10 0.52856003814033 0.914535195124557 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 29 30 59 13.6717588939304 15.8568011442099 -2.18504225027947 T:C C T 10 0.52856003814033 0.603341311792607 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 56180968 C/T 1 139 102 241 65.5301546984941 53.9131238903137 11.6170308081805 T:C C T 10 0.52856003814033 0.138148247061221 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 8 11 19 3.77151969487736 5.81416041954363 -2.04264072466627 A:G A G 10 0.52856003814033 0.367905468198703 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 58596449 C/T 1 13 8 21 6.12871950417571 4.22848030512264 1.90023919905307 T:C C T 10 0.52856003814033 0.51366593633507 ENSG00000176293:ENST00000515535:exon_58595587_58597677:ZNF135;ENSG00000121413:ENST00000240727:exon_58595210_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000433686:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000402070:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000421612:exon_58595212_58596743:ZSCAN18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 41 43 84 19.3290384362465 22.7280816400342 -3.39904320378772 A:G A G 10 0.52856003814033 0.512299913576274 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 58806083 T/C 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 T:C T C 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 58904396 G/A 1 1666 1472 3138 785.41897645821 778.040376142566 7.37860031564435 A:G G A 10 0.52856003814033 0.802340424336868 ENSG00000083845:ENST00000196551:exon_58904343_58904552:RPS5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 58928302 T/C 1 2 11 13 0.94287992371934 5.81416041954363 -4.87128049582429 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0096219812206849 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 58928786 A/G 1 7 13 20 3.30007973301769 6.87128049582429 -3.5712007628066 A:G A G 10 0.52856003814033 0.121360991375261 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 9 18 27 4.24295965673703 9.51408068652594 -5.27112102978891 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0528420601478719 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 9 14 23 4.24295965673703 7.39984053396462 -3.15688087722759 A:G G A 10 0.52856003814033 0.213560740713796 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 58929194 A/G 1 12 15 27 5.65727954231604 7.92840057210495 -2.27112102978891 A:G A G 10 0.52856003814033 0.442707659990859 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 58982447 A/G 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 A:G A G 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000083812:ENST00000196482:exon_58982098_58984765:ZNF324 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 58989495 A/C 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 A:C A C 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58989454_58989548:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58989454_58989548:ZNF446 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 58991900 G/A 1 15 8 23 7.07159942789505 4.22848030512264 2.84311912277241 A:G G A 10 0.52856003814033 0.297564808088866 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 19 59067425 T/C 1 200 179 379 94.287992371934 94.6122468271191 -0.324254455185084 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000130725:ENST00000253023:exon_59067080_59067596:UBE2M HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 7 8 15 3.30007973301769 4.22848030512264 -0.92840057210495 T:C C T 10 0.52856003814033 0.79709726410062 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 101 163 264 47.6154361478267 86.1552862168738 -38.5398500690471 A:T:G A G 10 0.52856003814033 2.40059398962398e-06 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 3391539 G/A 1 24 27 51 11.3145590846321 14.2711210297889 -2.95656194515683 A:G G A 10 0.52856003814033 0.483505186903121 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 37 34 71 17.4432785888078 17.9710412967712 -0.527762707963433 T:C T C 10 0.52856003814033 0.906003312230435 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 8871342 C/A 1 7 8 15 3.30007973301769 4.22848030512264 -0.92840057210495 A:C C A 10 0.52856003814033 0.79709726410062 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 455 404 859 214.50518264615 213.538255408693 0.966927237456503 A:G G A 10 0.52856003814033 0.972740169281877 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 10930903 T/C 1 74 72 146 34.8865571776156 38.0563227461038 -3.16976556848818 T:C T C 10 0.52856003814033 0.619517241478684 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10930845_10930959:PDIA6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 17962450 A/G 1 8 3 11 3.77151969487736 1.58568011442099 2.18583958045637 A:G A G 10 0.52856003814033 0.234946711874713 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 17963098 T/G 1 14 16 30 6.60015946603538 8.45696061024528 -1.8568011442099 T:G T G 10 0.52856003814033 0.584372825849598 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 20824498 C/T 1 8 6 14 3.77151969487736 3.17136022884198 0.60015946603538 T:C C T 10 0.52856003814033 0.795264899593225 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000415264:exon_20824492_20824533:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 20824559 C/T 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 24426534 A/G 1 10 17 27 4.7143996185967 8.98552064838561 -4.27112102978891 A:C:G A G 10 0.52856003814033 0.122832916601449 ENSG00000198399:ENST00000478720:exon_24425733_24427287:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24425733_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24425733_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24425735_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24425735_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24425735_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24425735_24426652:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000427234:exon_24426151_24426652:ITSN2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 25061344 T/G 1 5 8 13 2.35719980929835 4.22848030512264 -1.87128049582429 T:G T G 10 0.52856003814033 0.406604439196984 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25061314_25061491:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25061314_25061491:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25061314_25061491:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25061314_25061491:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000454027:exon_25061314_25061491:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25061314_25061491:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25061314_25061491:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25061314_25061491:ADCY3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 27260469 G/A 1 7 18 25 3.30007973301769 9.51408068652594 -6.21400095350825 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0153145633362947 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000475258:exon_27260429_27260532:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460904:exon_27260429_27260683:TMEM214 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 27293150 G/T 1 8 9 17 3.77151969487736 4.75704034326297 -0.98552064838561 T:G G T 10 0.52856003814033 0.637676890163413 ENSG00000084693:ENST00000487078:exon_27292960_27293490:AGBL5;ENSG00000084693:ENST00000360131:exon_27292960_27293488:AGBL5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 12 13 25 5.65727954231604 6.87128049582429 -1.21400095350825 A:G G A 10 0.52856003814033 0.691078714041608 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 13 11 24 6.12871950417571 5.81416041954363 0.314559084632079 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 14 26 40 6.60015946603538 13.7425609916486 -7.1424015256132 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0264332795194359 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 27466368 C/T 1 116 105 221 54.6870355757217 55.4988040047347 -0.811768429012936 T:C C T 10 0.52856003814033 0.946313718125 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27466284_27466660:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27466284_27466653:CAD;ENSG00000084774:ENST00000428460:exon_27466284_27466458:CAD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 32822957 G/A 1 5 8 13 2.35719980929835 4.22848030512264 -1.87128049582429 A:G G A 10 0.52856003814033 0.406604439196984 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 32983480 G/A 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 11 7 18 5.18583958045637 3.69992026698231 1.48591931347406 T:C C T 10 0.52856003814033 0.638181278212874 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 78 59 137 36.7723170250543 31.1850422502795 5.58727477477478 A:G G A 10 0.52856003814033 0.347888155398445 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 37458668 G/A 1 9 6 15 4.24295965673703 3.17136022884198 1.07159942789505 A:G G A 10 0.52856003814033 0.616121686737298 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 39008949 G/A 1 74 67 141 34.8865571776156 35.4135225554021 -0.526965377786532 A:G G A 10 0.52856003814033 0.933002359525622 ENSG00000152147:ENST00000409011:exon_39008659_39009107:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000281950:exon_39008659_39009598:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000409566:exon_39008659_39009089:GEMIN6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 42578481 C/T 1 261 317 578 123.045830045374 167.553532090485 -44.5077020451108 T:C C T 10 0.52856003814033 0.000239861585198109 ENSG00000115944:ENST00000378669:exon_42576478_42578499:COX7A2L;ENSG00000115944:ENST00000482463:exon_42577647_42578499:COX7A2L;ENSG00000115944:ENST00000234301:exon_42577647_42578499:COX7A2L;ENSG00000115944:ENST00000464443:exon_42577992_42578499:COX7A2L;ENSG00000115944:ENST00000397185:exon_42578427_42578499:COX7A2L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 5 7 12 2.35719980929835 3.69992026698231 -1.34272045768396 A:C C A 10 0.52856003814033 0.566216755054812 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 9 2 11 4.24295965673703 1.05712007628066 3.18583958045637 C:G G C 10 0.52856003814033 0.0701714577429645 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 42990522 C/T 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 43452183 A/G 1 9 5 14 4.24295965673703 2.64280019070165 1.60015946603538 A:G A G 10 0.52856003814033 0.43463285635379 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 46739157 A/G 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000250565:ENST00000306448:exon_46738986_46739951:ATP6V1E2;ENSG00000250565:ENST00000522587:exon_46739006_46739951:ATP6V1E2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 48030838 A/T 1 3 7 10 1.41431988557901 3.69992026698231 -2.2856003814033 A:T A T 10 0.52856003814033 0.206826979960111 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 53955850 C/T 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 T:C C T 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 54035447 A/G 1 21 11 32 9.90023919905307 5.81416041954363 4.08607877950944 A:G A G 10 0.52856003814033 0.160233266807919 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 54035508 G/C 1 9 18 27 4.24295965673703 9.51408068652594 -5.27112102978891 C:G G C 10 0.52856003814033 0.0528420601478719 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 9 7 16 4.24295965673703 3.69992026698231 0.54303938975472 A:G A G 10 0.52856003814033 0.808687083852748 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 1 7 8 0.47143996185967 3.69992026698231 -3.22848030512264 A:T A T 10 0.52856003814033 0.0304181799638115 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 54858511 C/T 1 18 19 37 8.48591931347406 10.0426407246663 -1.55672141119221 T:C C T 10 0.52856003814033 0.625136106908905 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 35 18 53 16.5003986650884 9.51408068652594 6.98631797856251 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0726662222266552 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 19 16 35 8.95735927533373 8.45696061024528 0.500398665088449 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 7 5 12 3.30007973301769 2.64280019070165 0.65727954231604 T:G G T 10 0.52856003814033 0.778794317245757 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 4 14 18 1.88575984743868 7.39984053396462 -5.51408068652594 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0156447592335215 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 46 36 82 21.6862382455448 19.0281613730519 2.65807687249294 A:G A G 10 0.52856003814033 0.581733661828649 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 64124722 C/A 1 7 1 8 3.30007973301769 0.52856003814033 2.77151969487736 A:C C A 10 0.52856003814033 0.0738868803430894 ENSG00000143952:ENST00000354504:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000272322:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000409558:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000416400:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000394400:exon_64124630_64124724:VPS54 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 26 33 59 12.2574390083514 17.4424812586309 -5.18504225027947 A:G G A 10 0.52856003814033 0.193169815178455 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 65217089 G/C 1 13 8 21 6.12871950417571 4.22848030512264 1.90023919905307 C:G G C 10 0.52856003814033 0.51366593633507 ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65216535_65217304:SLC1A4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 65296657 A/G 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 A:G A G 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65296533_65296935:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65296533_65296935:CEP68 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 65298839 A/G 1 11 9 20 5.18583958045637 4.75704034326297 0.4287992371934 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 65299766 T/C 1 4 11 15 1.88575984743868 5.81416041954363 -3.92840057210495 T:C T C 10 0.52856003814033 0.066773241017641 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 65315711 G/A 1 117 109 226 55.1584755375814 57.613044157296 -2.45456861971459 A:T:G G A 10 0.52856003814033 0.78991589241997 ENSG00000138069:ENST00000409784:exon_65313989_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000409892:exon_65313989_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000409751:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000398529:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000356214:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000260638:exon_65315014_65315824:RAB1A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 65495887 G/A 1 85 59 144 40.0723967580719 31.1850422502795 8.88735450779247 A:G G A 10 0.52856003814033 0.155744034873266 ENSG00000138071:ENST00000260641:exon_65495698_65498387:ACTR2;ENSG00000138071:ENST00000377982:exon_65495698_65497280:ACTR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 67630980 G/A 0 9 0 9 4.24295965673703 0 4.24295965673703 G G 10 0.52856003814033 0.00437031847588073 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 67631831 G/A 1 21 8 29 9.90023919905307 4.22848030512264 5.67175889393043 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0402872063734771 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 67632125 C/T 1 12 17 29 5.65727954231604 8.98552064838561 -3.32824110606957 T:C C T 10 0.52856003814033 0.264908318222203 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 4 10 14 1.88575984743868 5.2856003814033 -3.39984053396462 A:T A T 10 0.52856003814033 0.105344207452060 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 70033584 C/T 1 9 5 14 4.24295965673703 2.64280019070165 1.60015946603538 T:C C T 10 0.52856003814033 0.43463285635379 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460439:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70033517_70033630:ANXA4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 69 54 123 32.5293573683172 28.5422420595778 3.9871153087394 A:G G A 10 0.52856003814033 0.527432619350964 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 85570388 G/T 1 15 1 16 7.07159942789505 0.52856003814033 6.54303938975472 T:G G T 10 0.52856003814033 0.000679491512456453 ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85569079_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85569079_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85569211_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85569211_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85569805_85570504:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85570114_85570504:RETSAT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 85571433 G/A 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000475624:exon_85571362_85571444:RETSAT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 85625222 T/G 1 5 16 21 2.35719980929835 8.45696061024528 -6.09976080094693 T:G T G 10 0.52856003814033 0.00834049676909856 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85625143_85625254:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85625143_85625475:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85625143_85625275:CAPG HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 85769975 A/G 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 A:G A G 10 0.52856003814033 0.757894792307515 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 85786074 G/A 1 13 14 27 6.12871950417571 7.39984053396462 -1.27112102978891 A:G G A 10 0.52856003814033 0.701466812491088 ENSG00000115486:ENST00000233838:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000430215:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000423570:exon_85786069_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000428479:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000421496:exon_85786069_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000481541:exon_85785707_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000496962:exon_85785848_85786198:GGCX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 85806266 C/T 1 400 366 766 188.575984743868 193.452973959361 -4.87698921549281 T:C C T 10 0.52856003814033 0.744669524432896 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 85824251 T/C 1 344 325 669 162.175346879726 171.782012395607 -9.60666551588079 A:T:C T C 10 0.52856003814033 0.46207087668495 ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85824227_85824704:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85824076_85824301:RNF181 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 85852667 G/A 1 8 5 13 3.77151969487736 2.64280019070165 1.12871950417571 A:G G A 10 0.52856003814033 0.589189446313547 ENSG00000168883:ENST00000459775:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000448971:exon_85852662_85852712:USP39;ENSG00000168883:ENST00000442708:exon_85852662_85852740:USP39;ENSG00000168883:ENST00000450066:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85852662_85852719:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000487400:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85852662_85852813:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000493829:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000467885:exon_85852662_85852814:USP39 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 89160076 T/G 1 3 11 14 1.41431988557901 5.81416041954363 -4.39984053396462 T:G T G 10 0.52856003814033 0.0286627679013754 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 89160457 T/C 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 T:C T C 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 89161086 C/T 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C C T 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 89265856 A/G 1 18 20 38 8.48591931347406 10.5712007628066 -2.08528144933254 A:G A G 10 0.52856003814033 0.519594239599048 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 89265922 G/A 1 17 20 37 8.01447935161439 10.5712007628066 -2.55672141119221 A:G G A 10 0.52856003814033 0.415115247521212 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 89265930 G/C 1 13 22 35 6.12871950417571 11.6283208390873 -5.49960133491155 T:C:G G C 10 0.52856003814033 0.0889850858550857 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 89266024 A/G 0 63 0 63 29.7007175971592 0 29.7007175971592 A A 10 0.52856003814033 3.77971912127768e-18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 89266046 G/A 1 16 23 39 7.54303938975472 12.1568808772276 -4.61384148747287 A:G G A 10 0.52856003814033 0.150920038093284 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 96944553 G/A 1 56 66 122 26.4006378641415 34.8849625172618 -8.48432465312026 A:G G A 10 0.52856003814033 0.146487697916055 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 98354511 G/A 1 9 4 13 4.24295965673703 2.11424015256132 2.12871950417571 A:G G A 10 0.52856003814033 0.277047309964302 ENSG00000115085:ENST00000264972:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000389518:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000463643:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000442208:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000487283:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000451498:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000489250:exon_98354458_98355040:ZAP70 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 98355990 G/A 1 16 6 22 7.54303938975472 3.17136022884198 4.37167916091274 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0857064844778537 ENSG00000115085:ENST00000264972:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000389518:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000463643:exon_98355838_98356325:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000442208:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000487283:exon_98355838_98356322:ZAP70 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 98409046 G/A 1 9 7 16 4.24295965673703 3.69992026698231 0.54303938975472 A:G G A 10 0.52856003814033 0.808687083852748 ENSG00000075568:ENST00000186436:exon_98408849_98409447:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000425805:exon_98408849_98409447:TMEM131 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 21 15 36 9.90023919905307 7.92840057210495 1.97183862694812 A:T:C T C 10 0.52856003814033 0.617191029889971 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 25 39 64 11.7859990464917 20.6138414874729 -8.82784244098112 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0326676607784738 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 18 17 35 8.48591931347406 8.98552064838561 -0.499601334911551 A:G G A 10 0.52856003814033 0.867525314175691 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 99995517 C/T 1 210 211 421 99.0023919905307 111.52616804761 -12.5237760570789 T:C C T 10 0.52856003814033 0.222730328067584 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995482_99995589:EIF5B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 67 63 130 31.5864774445979 33.2992824028408 -1.71280495824291 T:C T C 10 0.52856003814033 0.792458661111418 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 8 18 26 3.77151969487736 9.51408068652594 -5.74256099164858 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0296659676359784 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 100020945 C/T 1 15 20 35 7.07159942789505 10.5712007628066 -3.49960133491155 T:C C T 10 0.52856003814033 0.241812496821128 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100020907_100021140:REV1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 2 15 17 0.94287992371934 7.92840057210495 -6.98552064838561 T:C T C 10 0.52856003814033 0.00085322383853076 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 105665808 C/T 1 23 18 41 10.8431191227724 9.51408068652594 1.32903843624647 T:C C T 10 0.52856003814033 0.755287354384206 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105665629_105665808:MRPS9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 105705507 C/T 1 11 6 17 5.18583958045637 3.17136022884198 2.01447935161439 T:C C T 10 0.52856003814033 0.467313177256825 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105705442_105705527:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105705476_105705527:MRPS9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 105713697 A/G 1 43 53 96 20.2719183599658 28.0136820214375 -7.74176366147168 A:G A G 10 0.52856003814033 0.125223059988954 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105713613_105713782:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105713613_105713746:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000472220:exon_105713613_105713782:MRPS9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 111850515 C/T 1 7 2 9 3.30007973301769 1.05712007628066 2.24295965673703 T:C C T 10 0.52856003814033 0.186100445119176 ENSG00000153093:ENST00000389811:exon_111850442_111850543:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000439055:exon_111850442_111850543:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000283065:exon_111850442_111850543:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000422487:exon_111850442_111850543:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000417074:exon_111850442_111850543:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000443586:exon_111850442_111850543:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000441974:exon_111850442_111850543:ACOXL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 13 8 21 6.12871950417571 4.22848030512264 1.90023919905307 T:C T C 10 0.52856003814033 0.51366593633507 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 11 5 16 5.18583958045637 2.64280019070165 2.54303938975472 C:G G C 10 0.52856003814033 0.222015324368485 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 16 10 26 7.54303938975472 5.2856003814033 2.25743900835142 A:G A G 10 0.52856003814033 0.435111822543937 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 113956371 G/C 1 23 38 61 10.8431191227724 20.0852814493325 -9.24216232656013 C:G G C 10 0.52856003814033 0.0205369441840848 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113956317_113956407:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000464559:exon_113956135_113956803:PSD4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 114220055 T/C 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 T:C T C 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000136682:ENST00000259199:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000448780:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000426479:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000358604:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000456188:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000492566:exon_114219985_114220411:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000472995:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000486174:exon_114219985_114220071:CBWD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 53 61 114 24.9863179785625 32.2421623265601 -7.25584434799763 C:G C G 10 0.52856003814033 0.189241626532040 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 118583940 C/T 1 10 19 29 4.7143996185967 10.0426407246663 -5.32824110606957 T:C C T 10 0.52856003814033 0.061555168760767 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 6 15 21 2.82863977115802 7.92840057210495 -5.09976080094693 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0290839994216129 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 10 14 24 4.7143996185967 7.39984053396462 -2.68544091536792 T:C T C 10 0.52856003814033 0.31012508646494 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 254 255 509 119.745750312356 134.782809725784 -15.037059413428 A:T:C A C 10 0.52856003814033 0.183187489817316 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 127816695 C/T 1 9 25 34 4.24295965673703 13.2140009535083 -8.97104129677122 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00289762070992268 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127816587_127816731:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127816587_127816731:BIN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 127821207 G/A 1 3 23 26 1.41431988557901 12.1568808772276 -10.7425609916486 A:G G A 10 0.52856003814033 1.47765773848118e-05 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127821147_127821222:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127821147_127821222:BIN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 4 19 23 1.88575984743868 10.0426407246663 -8.15688087722759 A:G A G 10 0.52856003814033 0.000614025926068198 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 132277686 C/T 1 9 5 14 4.24295965673703 2.64280019070165 1.60015946603538 T:C C T 10 0.52856003814033 0.43463285635379 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 135893372 A/G 1 11 11 22 5.18583958045637 5.81416041954363 -0.628320839087261 A:G A G 10 0.52856003814033 0.83325131156315 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 143798189 A/G 1 43 40 83 20.2719183599658 21.1424015256132 -0.870483165647393 A:G A G 10 0.52856003814033 0.912562064848861 ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143797997_143798227:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143797997_143798227:KYNU HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 16 10 26 7.54303938975472 5.2856003814033 2.25743900835142 A:G G A 10 0.52856003814033 0.435111822543937 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 152321090 C/G 1 8 11 19 3.77151969487736 5.81416041954363 -2.04264072466627 C:G C G 10 0.52856003814033 0.367905468198703 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 152321272 C/T 1 17 13 30 8.01447935161439 6.87128049582429 1.1431988557901 T:C C T 10 0.52856003814033 0.717865637118853 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 21 13 34 9.90023919905307 6.87128049582429 3.02895870322878 A:T:C A T 10 0.52856003814033 0.309436404562537 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 152331418 C/G 1 17 9 26 8.01447935161439 4.75704034326297 3.25743900835142 C:G C G 10 0.52856003814033 0.240423666471852 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152331371_152332136:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152331371_152332419:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152331371_152333863:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152331371_152331733:RIF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 143 149 292 67.4159145459328 78.7554456829092 -11.3395311369764 T:C C T 10 0.52856003814033 0.197184783802922 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 30 36 66 14.1431988557901 19.0281613730519 -4.88496251726178 T:C T C 10 0.52856003814033 0.267157152938021 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 360 317 677 169.718386269481 167.553532090485 2.16485417899656 A:T:G T A 10 0.52856003814033 0.87768434772059 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 170938389 C/T 1 9 11 20 4.24295965673703 5.81416041954363 -1.5712007628066 T:C C T 10 0.52856003814033 0.509501749881068 ENSG00000144357:ENST00000272793:exon_170938236_170940641:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000442603:exon_170938236_170940637:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000418381:exon_170938236_170940637:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000421104:exon_170938236_170940637:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000430321:exon_170938236_170940641:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392632:exon_170938236_170940630:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392631:exon_170938236_170940637:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000439681:exon_170938236_170938769:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000444475:exon_170938236_170940641:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000474426:exon_170938236_170940641:UBR3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 71 57 128 33.4722372920366 30.1279221739988 3.34431511803776 A:G G A 10 0.52856003814033 0.595643112792986 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 182374534 A/G 1 8 8 16 3.77151969487736 4.22848030512264 -0.456960610245281 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000115232:ENST00000425522:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000490435:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000476824:exon_182374385_182374534:ITGA4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 182399097 T/C 1 13 5 18 6.12871950417571 2.64280019070165 3.48591931347406 T:C T C 10 0.52856003814033 0.154748832098885 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 190531615 T/C 1 31 32 63 14.6146388176498 16.9139212204906 -2.29928240284079 T:C T C 10 0.52856003814033 0.614409376486878 ENSG00000138381:ENST00000260952:exon_190530767_190532322:ASNSD1;ENSG00000138381:ENST00000420250:exon_190530767_190532322:ASNSD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 190611084 T/C 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 190788123 G/T 0 671 0 671 316.336214407839 0 316.336214407839 G G 10 0.52856003814033 1.88910887674996e-186 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 191064753 C/T 1 3 7 10 1.41431988557901 3.69992026698231 -2.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.206826979960111 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 191235901 A/C 1 33 14 47 15.5575187413691 7.39984053396462 8.15767820740449 A:C A C 10 0.52856003814033 0.0189528176168836 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191235570_191236390:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191235570_191236391:INPP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 191874667 A/G 1 22 22 44 10.3716791609127 11.6283208390873 -1.25664167817452 A:G A G 10 0.52856003814033 0.763531841963704 ENSG00000115415:ENST00000361099:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000409465:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392322:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000452281:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392323:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000424722:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000454414:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000432058:exon_191874602_191874730:STAT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 81 102 183 38.1866369106333 53.9131238903137 -15.7264869796804 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0215819464652331 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 35 26 61 16.5003986650884 13.7425609916486 2.75783767343987 A:G A G 10 0.52856003814033 0.522681902898178 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 8 9 17 3.77151969487736 4.75704034326297 -0.98552064838561 T:C T C 10 0.52856003814033 0.637676890163413 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 185 167 352 87.2163929440389 88.2695263694351 -1.05313342539617 T:C T C 10 0.52856003814033 0.915071677984941 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 14 18 32 6.60015946603538 9.51408068652594 -2.91392122049056 T:C T C 10 0.52856003814033 0.376407054068302 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 203155155 A/G 1 77 48 125 36.3008770631946 25.3708818307358 10.9299952324588 A:T:G A G 10 0.52856003814033 0.059500761385278 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203155046_203155180:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492688:exon_203155046_203155180:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203155046_203155180:NOP58 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 219267781 C/T 1 31 32 63 14.6146388176498 16.9139212204906 -2.29928240284079 T:C C T 10 0.52856003814033 0.614409376486878 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219267734_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219267758_219267850:CTDSP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 219498300 A/G 1 4 11 15 1.88575984743868 5.81416041954363 -3.92840057210495 A:G A G 10 0.52856003814033 0.066773241017641 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 219503113 C/T 1 29 30 59 13.6717588939304 15.8568011442099 -2.18504225027947 T:C C T 10 0.52856003814033 0.603341311792607 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219502644_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219502868_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219502868_219503531:ZNF142 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 219507302 C/T 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 219527712 C/T 1 35 32 67 16.5003986650884 16.9139212204906 -0.413522555402114 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527606_219527723:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000436603:exon_219527606_219527723:BCS1L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 219527866 T/C 1 33 31 64 15.5575187413691 16.3853611823502 -0.827842440981122 T:C T C 10 0.52856003814033 0.900553143046234 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527857_219528127:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527857_219528136:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527857_219528137:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527857_219528164:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527857_219528165:BCS1L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 219528995 T/C 1 62 55 117 29.2292776352995 29.0708020977182 0.158475537581388 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 219529247 A/C 1 79 64 143 37.2437569869139 33.8278424409811 3.41591454593281 A:T:C A C 10 0.52856003814033 0.615483032810456 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 219529881 G/A 1 20 7 27 9.4287992371934 3.69992026698231 5.72887897021109 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0328709256168387 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219529878_219529970:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219529877_219529970:RNF25 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 219533378 T/C 1 14 8 22 6.60015946603538 4.22848030512264 2.37167916091274 T:C T C 10 0.52856003814033 0.39453671919514 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219532802_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219533328_219533402:RNF25 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 220037608 A/C 1 70 72 142 33.0007973301769 38.0563227461038 -5.05552541592687 A:T:C A C 10 0.52856003814033 0.401862380839005 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 220045902 C/T 1 5 9 14 2.35719980929835 4.75704034326297 -2.39984053396462 T:C C T 10 0.52856003814033 0.284510641180970 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045784_220046185:FAM134A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 220085845 A/G 1 14 4 18 6.60015946603538 2.11424015256132 4.48591931347406 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0357240121562821 ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000475339:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220085802_220086024:ATG9A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 220097257 G/C 1 13 5 18 6.12871950417571 2.64280019070165 3.48591931347406 C:G G C 10 0.52856003814033 0.154748832098885 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220097212_220097415:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000453432:exon_220097212_220097388:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000475202:exon_220097212_220097692:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000474225:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000467884:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000461731:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000496346:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000435521:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000486203:exon_220097212_220097756:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000447157:exon_220097212_220097269:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000491181:exon_220097212_220097503:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000465550:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000489580:exon_220097212_220097481:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000493563:exon_220097212_220097601:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000490526:exon_220097212_220097405:ANKZF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 27 13 40 12.7288789702111 6.87128049582429 5.8575984743868 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0804897175861642 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 14 15 29 6.60015946603538 7.92840057210495 -1.32824110606957 A:G G A 10 0.52856003814033 0.7109964573597 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 7 7 14 3.30007973301769 3.69992026698231 -0.39984053396462 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 230723777 G/C 1 3 7 10 1.41431988557901 3.69992026698231 -2.2856003814033 C:G G C 10 0.52856003814033 0.206826979960111 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000479037:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000409677:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000453485:exon_230723635_230723998:TRIP12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 84 90 174 39.6009567962123 47.5704034326297 -7.96944663641742 A:G A G 10 0.52856003814033 0.254631668956777 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 231072709 C/T 1 44 50 94 20.7433583218255 26.4280019070165 -5.68464358519102 T:C C T 10 0.52856003814033 0.25656269449273 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231072706_231072774:SP110 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 9 14 23 4.24295965673703 7.39984053396462 -3.15688087722759 T:C C T 10 0.52856003814033 0.213560740713796 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 232196564 C/T 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 232196597 G/A 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 233201328 A/G 1 13 6 19 6.12871950417571 3.17136022884198 2.95735927533373 A:G A G 10 0.52856003814033 0.25018193083756 ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_233201179_233201907:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_233201179_233201908:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_233200924_233201687:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_233201179_233201340:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000429283:exon_233199079_233201686:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000418143:exon_233201020_233201684:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000417808:exon_233200851_233201683:DIS3L2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 234113057 G/A 1 53 36 89 24.9863179785625 19.0281613730519 5.95815660551063 A:G G A 10 0.52856003814033 0.242718300025238 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 234113301 C/T 1 49 26 75 23.1005581311238 13.7425609916486 9.35799713947525 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.0367246585465359 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000491070:exon_234113288_234113760:INPP5D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 234749258 T/C 1 90 68 158 42.4295965673703 35.9420825935424 6.48751397382785 T:C T C 10 0.52856003814033 0.338982654081185 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 234749269 G/A 1 80 72 152 37.7151969487736 38.0563227461038 -0.341125797330164 A:T:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 234749354 G/A 1 91 73 164 42.90103652923 38.5848827842441 4.31615374498588 A:G G A 10 0.52856003814033 0.531844920279148 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 234749780 G/C 1 68 82 150 32.0579174064576 43.3419231275071 -11.2840057210495 C:G G C 10 0.52856003814033 0.0718064110984134 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 24 23 47 11.3145590846321 12.1568808772276 -0.842321792595511 C:G G C 10 0.52856003814033 0.884123851177806 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 234761225 C/T 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234761211_234761266:HJURP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 40 45 85 18.8575984743868 23.7852017163149 -4.92760324192805 A:G A G 10 0.52856003814033 0.328234115584296 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 74 81 155 34.8865571776156 42.8133630893667 -7.92680591175115 A:G A G 10 0.52856003814033 0.227413466582025 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 238671609 A/G 1 115 134 249 54.215595613862 70.8270451108042 -16.6114494969422 A:C:G A G 10 0.52856003814033 0.0362265185814893 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 238671889 G/A 1 204 202 406 96.1737522193727 106.769127704347 -10.595375484974 A:G G A 10 0.52856003814033 0.296869940095189 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 238671940 C/T 1 241 246 487 113.61703080818 130.025769382521 -16.4087385743407 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.146315745474459 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 120 104 224 56.5727954231604 54.9702439665943 1.60255145656607 C:G C G 10 0.52856003814033 0.841184975904078 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 238672795 C/T 1 90 86 176 42.4295965673703 45.4561632800684 -3.02656671269808 T:C C T 10 0.52856003814033 0.651404797061878 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 238990388 G/A 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238990350_238990477:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000413463:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000443532:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000482031:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000431487:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238987206_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238990376_238990477:SCLY HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 9 9 18 4.24295965673703 4.75704034326297 -0.51408068652594 T:C T C 10 0.52856003814033 0.818276179396142 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 239006879 C/T 0 9 0 9 4.24295965673703 0 4.24295965673703 C C 10 0.52856003814033 0.00437031847588073 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 239079542 A/G 1 10 6 16 4.7143996185967 3.17136022884198 1.54303938975472 A:G A G 10 0.52856003814033 0.466348600091948 ENSG00000132323:ENST00000450411:exon_239079049_239079665:ILKAP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 239344412 C/T 1 10 7 17 4.7143996185967 3.69992026698231 1.01447935161439 T:C C T 10 0.52856003814033 0.808994871295111 ENSG00000065802:ENST00000463352:exon_239344352_239344654:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000264607:exon_239344352_239344654:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000469885:exon_239344352_239344522:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000438264:exon_239344352_239344654:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000491653:exon_239344352_239344654:ASB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 241570127 C/T 1 8 2 10 3.77151969487736 1.05712007628066 2.7143996185967 T:C C T 10 0.52856003814033 0.115110163415260 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 242036797 A/G 1 16 22 38 7.54303938975472 11.6283208390873 -4.08528144933254 A:G A G 10 0.52856003814033 0.196772928599343 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000455202:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000493169:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000414146:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000406593:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000439144:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000460915:exon_242036341_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242036602_242036842:MTERFD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 242046785 A/C 1 125 87 212 58.9299952324587 45.9847233182087 12.94527191425 A:C A C 10 0.52856003814033 0.0852317145813833 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242046768_242046914:PASK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 242051777 G/A 1 34 13 47 16.0289587032288 6.87128049582429 9.15767820740449 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00809482477502164 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000489256:exon_242051655_242052201:PASK;ENSG00000115687:ENST00000475666:exon_242051655_242051840:PASK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 242062162 C/T 1 12 10 22 5.65727954231604 5.2856003814033 0.371679160912739 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242062147_242062314:PASK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 17 15 32 8.01447935161439 7.92840057210495 0.086078779509438 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 242439595 G/A 1 33 33 66 15.5575187413691 17.4424812586309 -1.88496251726178 A:G G A 10 0.52856003814033 0.711840007776228 ENSG00000115694:ENST00000316586:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000403346:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000401869:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405883:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405585:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000423004:exon_242439588_242439659:STK25;ENSG00000115694:ENST00000461760:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000450497:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000442307:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000424537:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000413760:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000429279:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000436402:exon_242439588_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000492127:exon_242438822_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000479442:exon_242439318_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000496159:exon_242439462_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000440109:exon_242439558_242439696:STK25;ENSG00000115694:ENST00000435225:exon_242439587_242439696:STK25 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 242572846 A/G 1 82 82 164 38.6580768724929 43.3419231275071 -4.68384625501413 A:G A G 10 0.52856003814033 0.482043361819715 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 40 33 73 18.8575984743868 17.4424812586309 1.41511721575591 T:C T C 10 0.52856003814033 0.814885062064113 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 256763 G/C 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 C:G G C 10 0.52856003814033 0.159769451784926 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 278806 C/T 1 25 18 43 11.7859990464917 9.51408068652594 2.27191835996581 T:C C T 10 0.52856003814033 0.542908997814718 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 371972 T/C 1 24 17 41 11.3145590846321 8.98552064838561 2.32903843624647 T:C T C 10 0.52856003814033 0.532790301318707 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 42 44 86 19.8004783981061 23.2566416781745 -3.45616328006838 T:G T G 10 0.52856003814033 0.517189920632339 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 1108122 C/T 1 53 73 126 24.9863179785625 38.5848827842441 -13.5985648056816 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0159541521444384 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1108069_1108151:PSMF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 40 35 75 18.8575984743868 18.4996013349116 0.357997139475245 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 36 40 76 16.9718386269481 21.1424015256132 -4.17056289866508 T:C C T 10 0.52856003814033 0.359297624085539 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 2840773 C/T 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2840700_2840797:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2840700_2840797:VPS16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 2840929 G/A 1 8 6 14 3.77151969487736 3.17136022884198 0.60015946603538 A:G G A 10 0.52856003814033 0.795264899593225 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2840885_2841013:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2840885_2841013:VPS16 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 2844911 C/T 1 21 35 56 9.90023919905307 18.4996013349116 -8.59936213585848 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0228933891564744 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000458279:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380443:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000487461:exon_2844595_2844933:VPS16;ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2844830_2844933:PTPRA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 3008448 C/T 1 31 20 51 14.6146388176498 10.5712007628066 4.04343805484317 T:C C T 10 0.52856003814033 0.265835285538383 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_3008353_3008487:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_3008353_3008487:PTPRA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 3018782 G/A 1 52 77 129 24.5148780167028 40.6991229368054 -16.1842449201026 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00466739325959383 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_3018705_3019320:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_3018705_3019320:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_3018705_3019314:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_3018705_3019314:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_3018705_3019314:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_3018705_3019320:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_3018705_3019314:PTPRA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 3090848 T/G 1 15 9 24 7.07159942789505 4.75704034326297 2.31455908463208 T:G T G 10 0.52856003814033 0.415732751316567 ENSG00000185019:ENST00000217173:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000348031:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000440298:exon_3088219_3090960:UBOX5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 22 25 47 10.3716791609127 13.2140009535083 -2.84232179259551 A:G A G 10 0.52856003814033 0.465794066556751 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 8 11 19 3.77151969487736 5.81416041954363 -2.04264072466627 T:C C T 10 0.52856003814033 0.367905468198703 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 13763601 A/G 1 98 95 193 46.2011162622477 50.2132036233314 -4.01208736108369 A:G A G 10 0.52856003814033 0.565052828481058 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13763150_13763829:ESF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 13779113 T/C 1 5 15 20 2.35719980929835 7.92840057210495 -5.5712007628066 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0137149004795043 ENSG00000101247:ENST00000378106:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000378081:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000463598:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000485738:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000477732:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000475968:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000481249:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000476536:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000464269:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000479716:exon_13779107_13779146:C20orf7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 21 23 44 9.90023919905307 12.1568808772276 -2.25664167817452 A:C C A 10 0.52856003814033 0.547193698457945 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 17597482 G/A 1 28 30 58 13.2003189320708 15.8568011442099 -2.65648221213914 A:G G A 10 0.52856003814033 0.512614391541586 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17597377_17597484:RRBP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 17608233 C/T 1 20 12 32 9.4287992371934 6.34272045768396 3.08607877950944 T:C C T 10 0.52856003814033 0.293533111544821 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000495501:exon_17608149_17608327:RRBP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 17932210 C/T 1 99 118 217 46.6725562241073 62.3700845005589 -15.6975282764516 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0349688328030124 ENSG00000089006:ENST00000377768:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000490175:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377759:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000483485:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377739:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000476648:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000431277:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000419004:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000494401:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000474883:exon_17932170_17932239:SNX5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 17943492 A/T 1 8 3 11 3.77151969487736 1.58568011442099 2.18583958045637 A:T A T 10 0.52856003814033 0.234946711874713 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 17950588 C/G 1 12 10 22 5.65727954231604 5.2856003814033 0.371679160912739 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17950444_17951013:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17950444_17950773:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377704:exon_17950444_17951013:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17950503_17950773:C20orf72 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 8 6 14 3.77151969487736 3.17136022884198 0.60015946603538 T:C T C 10 0.52856003814033 0.795264899593225 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 18143355 C/T 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18143021_18143589:CSRP2BP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 18462421 A/G 1 11 7 18 5.18583958045637 3.69992026698231 1.48591931347406 A:G A G 10 0.52856003814033 0.638181278212874 ENSG00000132664:ENST00000377603:exon_18462263_18462454:POLR3F;ENSG00000132664:ENST00000462997:exon_18462263_18462454:POLR3F HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 18523002 C/G 1 29 22 51 13.6717588939304 11.6283208390873 2.04343805484317 C:G C G 10 0.52856003814033 0.578665466607559 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18522940_18523046:SEC23B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 30381789 C/A 1 51 48 99 24.0434380548432 25.3708818307358 -1.32744377589267 A:C C A 10 0.52856003814033 0.840628794730434 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30381651_30381827:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30381651_30381827:TPX2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 31022469 G/A 1 6 3 9 2.82863977115802 1.58568011442099 1.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 0.514204578379993 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 31291161 C/T 1 60 53 113 28.2863977115802 28.0136820214375 0.272715690142704 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31290493_31291260:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31290494_31291260:COMMD7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 34090519 G/A 1 4 11 15 1.88575984743868 5.81416041954363 -3.92840057210495 A:G G A 10 0.52856003814033 0.066773241017641 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425525:exon_34090218_34090632:CEP250 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 34241559 C/T 1 51 43 94 24.0434380548432 22.7280816400342 1.31535641480898 T:C C T 10 0.52856003814033 0.836597643678203 ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34241450_34241599:CPNE1;ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 37396120 A/G 1 13 5 18 6.12871950417571 2.64280019070165 3.48591931347406 A:G A G 10 0.52856003814033 0.154748832098885 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37396107_37396239:ACTR5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 43251240 A/G 1 50 62 112 23.5719980929835 32.7707223647005 -9.19872427171696 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0885119724482378 ENSG00000196839:ENST00000372874:exon_43251229_43251293:ADA;ENSG00000196839:ENST00000464097:exon_43251229_43251293:ADA;ENSG00000196839:ENST00000492931:exon_43251229_43251293:ADA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 43252915 T/C 1 19 22 41 8.95735927533373 11.6283208390873 -2.67096156375353 T:C T C 10 0.52856003814033 0.436592039919530 ENSG00000196839:ENST00000372874:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000464097:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000492931:exon_43252843_43252970:ADA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 44511257 G/A 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 44512082 G/A 1 9 13 22 4.24295965673703 6.87128049582429 -2.62832083908726 A:G G A 10 0.52856003814033 0.290886693884256 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 46264888 G/C 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 C:G G C 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46264635_46265506:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46264635_46265506:NCOA3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 47249077 C/T 1 25 11 36 11.7859990464917 5.81416041954363 5.97183862694812 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0647953453898416 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47248815_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47249034_47249177:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47248815_47249177:PREX1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 47258763 C/T 1 6 9 15 2.82863977115802 4.75704034326297 -1.92840057210495 T:C C T 10 0.52856003814033 0.439187658248891 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000496915:exon_47258651_47258796:PREX1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 47261017 T/C 1 11 10 21 5.18583958045637 5.2856003814033 -0.0997608009469308 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 47841660 G/T 1 8 13 21 3.77151969487736 6.87128049582429 -3.09976080094693 T:G G T 10 0.52856003814033 0.194847234835071 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000462328:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000493252:exon_47841650_47841736:DDX27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 47855496 C/T 1 107 105 212 50.4440759189847 55.4988040047347 -5.05472808574996 T:C C T 10 0.52856003814033 0.49231307237953 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47855486_47855592:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47855486_47855592:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000471144:exon_47855486_47855592:DDX27;ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47854483_47855837:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000469991:exon_47855480_47855837:ZNFX1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 47864833 G/A 1 8 10 18 3.77151969487736 5.2856003814033 -1.51408068652594 A:G G A 10 0.52856003814033 0.490005542254718 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 47865784 C/T 1 5 8 13 2.35719980929835 4.22848030512264 -1.87128049582429 T:C C T 10 0.52856003814033 0.406604439196984 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 9 9 18 4.24295965673703 4.75704034326297 -0.51408068652594 C:G C G 10 0.52856003814033 0.818276179396142 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 47874005 A/G 1 13 18 31 6.12871950417571 9.51408068652594 -3.38536118235023 A:G A G 10 0.52856003814033 0.280519231673384 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47873954_47874201:ZNFX1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 21 13 34 9.90023919905307 6.87128049582429 3.02895870322878 A:G G A 10 0.52856003814033 0.309436404562537 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 48522392 G/A 1 14 16 30 6.60015946603538 8.45696061024528 -1.8568011442099 A:G G A 10 0.52856003814033 0.584372825849598 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 49493167 G/A 1 102 99 201 48.0868761096863 52.3274437758927 -4.24056766620634 A:G G A 10 0.52856003814033 0.572254830105707 ENSG00000124243:ENST00000358791:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000262591:exon_49493023_49493713:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000371608:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000463943:exon_49493023_49493714:BCAS4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 50769183 G/A 1 7 10 17 3.30007973301769 5.2856003814033 -1.98552064838561 A:G G A 10 0.52856003814033 0.345083621048323 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 50769379 C/T 1 9 2 11 4.24295965673703 1.05712007628066 3.18583958045637 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0701714577429645 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 50769549 A/G 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 A:G A G 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 54961541 A/T 1 18 16 34 8.48591931347406 8.45696061024528 0.0289587032287795 A:T A T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 124 121 245 58.4585552705991 63.9557646149799 -5.49720934438086 A:G A G 10 0.52856003814033 0.482381952172184 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 57610059 C/A 1 63 70 133 29.7007175971592 36.9992026698231 -7.2984850726639 A:C C A 10 0.52856003814033 0.224110816487629 ENSG00000101166:ENST00000355937:exon_57608200_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000371033:exon_57609689_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000463057:exon_57609964_57610181:SLMO2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 60711819 T/G 1 204 219 423 96.1737522193727 115.754648352732 -19.5808961333596 T:G T G 10 0.52856003814033 0.0576036231795589 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60711791_60712005:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60711791_60712005:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60711791_60712005:PSMA7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 60966318 G/T 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:G G T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60966305_60966509:CABLES2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 61588159 A/G 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000411611:exon_61588117_61588314:SLC17A9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 62126185 A/G 0 0 8 8 0 4.22848030512264 -4.22848030512264 G A G 10 0.52856003814033 0.00244011976995637 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62126158_62126454:EEF1A2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 62152819 G/A 1 5 12 17 2.35719980929835 6.34272045768396 -3.98552064838561 A:G G A 10 0.52856003814033 0.086003743852648 ENSG00000125534:ENST00000464438:exon_62152637_62152879:PPDPF HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 62191919 G/A 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 A:G G A 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 62193445 G/A 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 62324289 C/T 1 7 1 8 3.30007973301769 0.52856003814033 2.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0738868803430894 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 62331989 T/G 1 29 27 56 13.6717588939304 14.2711210297889 -0.599362135858483 T:G T G 10 0.52856003814033 0.894195142332126 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62331954_62332129:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62331954_62332054:ARFRP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 62366478 A/G 0 0 8 8 0 4.22848030512264 -4.22848030512264 G A G 10 0.52856003814033 0.00244011976995637 ENSG00000197114:ENST00000478385:exon_62366057_62366537:ZGPAT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 39 30 69 18.3861585125271 15.8568011442099 2.52935736831723 T:G G T 10 0.52856003814033 0.549716350225512 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00959_parsed_pileup.txt . 20 62492922 T/A 1 5 9 14 2.35719980929835 4.75704034326297 -2.39984053396462 A:T:G T A 10 0.52856003814033 0.284510641180970 ENSG00000183260:ENST00000369916:exon_62492851_62494341:C20orf135 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 21 22 43 9.90023919905307 11.6283208390873 -1.72808164003419 C:G G C 10 0.52856003814033 0.648201546844192 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 27056250 A/G 1 10 2 12 4.7143996185967 1.05712007628066 3.65727954231604 A:G A G 10 0.52856003814033 0.042272250685085 ENSG00000154721:ENST00000480456:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000400533:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000400532:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000400537:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000400535:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000425221:exon_27056195_27056260:JAM2;ENSG00000154721:ENST00000312957:exon_27056195_27056260:JAM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 16 22 38 7.54303938975472 11.6283208390873 -4.08528144933254 T:G T G 10 0.52856003814033 0.196772928599343 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 233 235 468 109.845511113303 124.211608962978 -14.3660978496745 A:G A G 10 0.52856003814033 0.194804697290446 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 38437951 T/G 1 25 22 47 11.7859990464917 11.6283208390873 0.157678207404489 T:G T G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38435146_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38436448_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38437674_38438012:PIGP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 5 12 17 2.35719980929835 6.34272045768396 -3.98552064838561 A:G G A 10 0.52856003814033 0.086003743852648 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 40191431 T/G 1 8 2 10 3.77151969487736 1.05712007628066 2.7143996185967 T:G T G 10 0.52856003814033 0.115110163415260 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 27 25 52 12.7288789702111 13.2140009535083 -0.485121983297162 A:T:G A G 10 0.52856003814033 0.89068583683676 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 42771176 T/C 1 16 18 34 7.54303938975472 9.51408068652594 -1.97104129677122 T:C T C 10 0.52856003814033 0.606991695211752 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000482953:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000496774:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000493753:exon_42771123_42771693:MX2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 43792869 C/T 1 4 23 27 1.88575984743868 12.1568808772276 -10.2711210297889 T:C C T 10 0.52856003814033 5.9368720620958e-05 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43791999_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43792000_43792888:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43792000_43792888:TMPRSS3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 43803167 T/C 1 22 18 40 10.3716791609127 9.51408068652594 0.857598474386799 T:C T C 10 0.52856003814033 0.87460251411932 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43802174_43803860:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43803142_43803307:TMPRSS3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 43805637 C/T 1 3 8 11 1.41431988557901 4.22848030512264 -2.81416041954363 T:C C T 10 0.52856003814033 0.129625044921933 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43805518_43805643:TMPRSS3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 45732116 C/T 1 27 29 56 12.7288789702111 15.3282411060696 -2.59936213585848 T:C C T 10 0.52856003814033 0.505837160846055 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000491298:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45731988_45732177:PFKL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 18 11 29 8.48591931347406 5.81416041954363 2.67175889393043 T:C C T 10 0.52856003814033 0.356621182457111 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 46271460 T/C 1 19 10 29 8.95735927533373 5.2856003814033 3.67175889393043 T:C T C 10 0.52856003814033 0.195643304784761 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 46387078 G/T 1 16 4 20 7.54303938975472 2.11424015256132 5.4287992371934 T:G G T 10 0.52856003814033 0.022596855211574 ENSG00000160256:ENST00000291634:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000397826:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000458015:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000479127:exon_46386949_46387096:C21orf70 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 47821588 A/G 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 A:G A G 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47821465_47821635:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47821465_47821635:PCNT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 15 6 21 7.07159942789505 3.17136022884198 3.90023919905307 A:G A G 10 0.52856003814033 0.124403758285604 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 47851796 G/A 1 19 4 23 8.95735927533373 2.11424015256132 6.84311912277241 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00538567502225073 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 47855876 A/G 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 A:G A G 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47855817_47856061:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47855817_47856061:PCNT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 21 47858248 A/G 1 8 6 14 3.77151969487736 3.17136022884198 0.60015946603538 A:G A G 10 0.52856003814033 0.795264899593225 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47858077_47858250:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47858077_47858250:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000418394:exon_47858077_47858250:PCNT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 17590269 C/T 1 4 10 14 1.88575984743868 5.2856003814033 -3.39984053396462 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.105344207452060 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 19121721 C/T 1 30 38 68 14.1431988557901 20.0852814493325 -5.94208259354244 T:C C T 10 0.52856003814033 0.181111716278116 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19117792_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19121450_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19121481_19121988:DGCR14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 19124866 G/A 1 13 8 21 6.12871950417571 4.22848030512264 1.90023919905307 A:G G A 10 0.52856003814033 0.51366593633507 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19124836_19124945:DGCR14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 19132061 C/T 1 8 8 16 3.77151969487736 4.22848030512264 -0.456960610245281 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19132019_19132197:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19132019_19132197:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19131570_19132146:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000469466:exon_19131637_19132172:DGCR14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 19776303 C/T 1 24 29 53 11.3145590846321 15.3282411060696 -4.01368202143749 T:C C T 10 0.52856003814033 0.274855892242147 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19770747_19776483:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19775938_19776483:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19775987_19776483:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19776227_19776483:GNB1L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 19789541 A/C 1 34 20 54 16.0289587032288 10.5712007628066 5.45775794042218 A:C A C 10 0.52856003814033 0.172339894503222 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000481086:exon_19789522_19789739:GNB1L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 19907099 C/A 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 A:C C A 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 19907118 G/A 1 6 7 13 2.82863977115802 3.69992026698231 -0.87128049582429 A:G G A 10 0.52856003814033 0.782861958075039 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 37 36 73 17.4432785888078 19.0281613730519 -1.58488278424409 C:G C G 10 0.52856003814033 0.726407742162452 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 21213380 C/T 1 22 18 40 10.3716791609127 9.51408068652594 0.857598474386799 T:C C T 10 0.52856003814033 0.87460251411932 ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 21213416 A/G 1 30 19 49 14.1431988557901 10.0426407246663 4.10055813112383 A:G A G 10 0.52856003814033 0.255429487943355 ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 22550450 C/G 1 11 1 12 5.18583958045637 0.52856003814033 4.65727954231604 C:G C G 10 0.52856003814033 0.00730684791126346 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 22550510 T/G 0 13 0 13 6.12871950417571 0 6.12871950417571 T T 10 0.52856003814033 0.000308145002435499 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 23055533 G/A 0 20 0 20 9.4287992371934 0 9.4287992371934 G G 10 0.52856003814033 3.19070873952924e-06 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 23055539 G/T 0 21 0 21 9.90023919905307 0 9.90023919905307 G G 10 0.52856003814033 1.66968084850035e-06 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 24095127 C/G 1 227 119 346 107.016871342145 62.8986445386993 44.1182268034458 C:G C G 10 0.52856003814033 1.90980929235383e-06 ENSG00000128218:ENST00000398466:exon_24095082_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000248948:exon_24094930_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000398465:exon_24094930_24095337:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000405618:exon_24094937_24095385:VPREB3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 318 255 573 149.917907871375 134.782809725784 15.1350981455909 A:G G A 10 0.52856003814033 0.209552909039698 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 24964128 T/C 1 384 379 763 181.032945354113 200.324254455185 -19.2913091010718 A:T:C T C 10 0.52856003814033 0.168222595465574 ENSG00000100028:ENST00000215829:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000457691:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000402849:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000404603:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000458544:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000448916:exon_24963952_24964144:SNRPD3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 25747749 G/A 1 11 16 27 5.18583958045637 8.45696061024528 -3.27112102978891 A:G G A 10 0.52856003814033 0.248567283323368 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25747385_25747869:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25747388_25747869:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25747424_25747781:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25747579_25747869:LRP5L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 26853905 C/A 1 4 9 13 1.88575984743868 4.75704034326297 -2.87128049582429 A:C C A 10 0.52856003814033 0.163321106873792 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26853825_26853933:HPS4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 26854441 G/A 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26854411_26854543:HPS4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 26859942 C/T 1 13 8 21 6.12871950417571 4.22848030512264 1.90023919905307 T:C C T 10 0.52856003814033 0.51366593633507 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26859883_26859981:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26859883_26860158:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 26884039 G/A 1 13 16 29 6.12871950417571 8.45696061024528 -2.32824110606957 A:G G A 10 0.52856003814033 0.458172935319808 ENSG00000100104:ENST00000215917:exon_26883995_26884254:SRRD;ENSG00000100104:ENST00000477945:exon_26883948_26884254:SRRD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 26895337 G/A 1 17 29 46 8.01447935161439 15.3282411060696 -7.31376175445518 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0378403496692615 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26895070_26895348:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26895070_26895357:TFIP11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 26936766 G/A 1 20 19 39 9.4287992371934 10.0426407246663 -0.613841487472872 A:G G A 10 0.52856003814033 0.873655585838834 ENSG00000128294:ENST00000338754:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000528868:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000403880:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000398110:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000422943:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000455980:exon_26936755_26937601:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000446035:exon_26936755_26937600:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000445720:exon_26936755_26936837:TPST2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 29925221 C/T 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29924926_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000484924:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000443089:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000492707:exon_29925151_29925228:THOC5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 30221201 G/A 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000431535:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000495967:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000412689:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000465667:exon_30221075_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000463203:exon_30221076_30221347:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000495681:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000462454:exon_30221092_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000453160:exon_30221097_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000460313:exon_30221150_30221246:ASCC2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 30689998 G/A 1 8 15 23 3.77151969487736 7.92840057210495 -4.15688087722759 A:G G A 10 0.52856003814033 0.095977438095532 ENSG00000248751:ENST00000330168:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434987:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434291:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000418047:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000447976:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30689974_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30689640_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000466666:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000437122:exon_30689910_30690099:TBC1D10A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 30823196 T/C 1 27 26 53 12.7288789702111 13.7425609916486 -1.01368202143749 T:C T C 10 0.52856003814033 0.785149379375557 ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 9 2 11 4.24295965673703 1.05712007628066 3.18583958045637 C:G G C 10 0.52856003814033 0.0701714577429645 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 31491332 C/T 1 8 1 9 3.77151969487736 0.52856003814033 3.24295965673703 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0418258618356361 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 31741067 G/A 1 9 9 18 4.24295965673703 4.75704034326297 -0.51408068652594 A:G G A 10 0.52856003814033 0.818276179396142 ENSG00000100105:ENST00000266269:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000405309:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000351933:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000440325:exon_31740318_31742218:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000215919:exon_31740318_31741762:PATZ1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 36537500 A/T 1 40 42 82 18.8575984743868 22.1995216018939 -3.34192312750706 A:T A T 10 0.52856003814033 0.507327165562849 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 36537893 A/G 1 30 31 61 14.1431988557901 16.3853611823502 -2.24216232656013 A:G A G 10 0.52856003814033 0.608954083707478 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 36661330 G/A 1 11 9 20 5.18583958045637 4.75704034326297 0.4287992371934 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36661197_36661361:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 36661536 C/A 1 24 17 41 11.3145590846321 8.98552064838561 2.32903843624647 A:C C A 10 0.52856003814033 0.532790301318707 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 36661566 G/A 1 23 11 34 10.8431191227724 5.81416041954363 5.02895870322878 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0884896832654 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 36661646 G/A 1 20 16 36 9.4287992371934 8.45696061024528 0.971838626948118 A:G G A 10 0.52856003814033 0.867744765296129 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 36661842 G/A 1 10 20 30 4.7143996185967 10.5712007628066 -5.8568011442099 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0427542793504863 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 36700175 A/G 1 13 16 29 6.12871950417571 8.45696061024528 -2.32824110606957 A:G A G 10 0.52856003814033 0.458172935319808 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36700041_36700201:MYH9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 123 117 240 57.9871153087394 61.8415244624186 -3.85440915367921 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.650973753740895 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 34 28 62 16.0289587032288 14.7996810679292 1.22927763529954 A:G A G 10 0.52856003814033 0.799985226923095 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 797 822 1619 375.737649602157 434.476351351351 -58.7387017491943 A:T:C T C 10 0.52856003814033 0.00357614629663887 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 38323507 G/T 1 10 11 21 4.7143996185967 5.81416041954363 -1.09976080094693 T:G G T 10 0.52856003814033 0.667148390379936 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 38710112 G/A 1 7 8 15 3.30007973301769 4.22848030512264 -0.92840057210495 A:G G A 10 0.52856003814033 0.79709726410062 ENSG00000213923:ENST00000359867:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000396832:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000402865:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000400206:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000403904:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000438038:exon_38710087_38710173:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000413574:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000405675:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000398519:exon_38710087_38710174:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000430335:exon_38710087_38710174:CSNK1E HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 38882037 G/A 1 94 106 200 44.315356414809 56.027364042875 -11.712007628066 A:G G A 10 0.52856003814033 0.10335234161895 ENSG00000100201:ENST00000396821:exon_38879445_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000532271:exon_38879445_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000381633:exon_38879469_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000415456:exon_38879469_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000415748:exon_38879469_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000444597:exon_38879469_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000216019:exon_38881686_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000403230:exon_38881883_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000404499:exon_38881883_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000431312:exon_38881940_38882445:DDX17 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 23 15 38 10.8431191227724 7.92840057210495 2.91471855066746 T:C T C 10 0.52856003814033 0.41719881665482 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 39134207 C/T 1 31 27 58 14.6146388176498 14.2711210297889 0.343517787860858 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39133956_39134304:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000489527:exon_39133956_39134300:GTPBP1;ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39133765_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134040_39134270:SUN2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 39134715 T/C 1 22 14 36 10.3716791609127 7.39984053396462 2.97183862694812 T:C T C 10 0.52856003814033 0.404312724237877 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 39137478 G/A 1 3 8 11 1.41431988557901 4.22848030512264 -2.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.129625044921933 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 7 8 15 3.30007973301769 4.22848030512264 -0.92840057210495 T:C C T 10 0.52856003814033 0.79709726410062 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 8 5 13 3.77151969487736 2.64280019070165 1.12871950417571 A:G G A 10 0.52856003814033 0.589189446313547 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 15 11 26 7.07159942789505 5.81416041954363 1.25743900835142 A:C C A 10 0.52856003814033 0.696829234380297 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 15 13 28 7.07159942789505 6.87128049582429 0.200318932070759 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 41833116 C/T 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000183864:ENST00000327492:exon_41829496_41833411:TOB2;ENSG00000183864:ENST00000434408:exon_41833046_41833411:TOB2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 41903813 A/C 1 8 8 16 3.77151969487736 4.22848030512264 -0.456960610245281 A:C A C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000471094:exon_41903795_41904053:ACO2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 41911525 C/T 1 31 14 45 14.6146388176498 7.39984053396462 7.21479828368515 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0360109677689949 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000478010:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000481310:exon_41911517_41911539:ACO2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 42073134 C/T 1 6 128 134 2.82863977115802 67.6556848819622 -64.8270451108042 T:C C T 10 0.52856003814033 2.67330654627839e-34 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 42293140 G/C 1 9 10 19 4.24295965673703 5.2856003814033 -1.04264072466627 C:G G C 10 0.52856003814033 0.653229248249193 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42293056_42293165:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000463741:exon_42293072_42293165:SREBF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 42300948 C/A 1 88 86 174 41.486716643651 45.4561632800684 -3.96944663641742 A:C C A 10 0.52856003814033 0.595172776417814 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42300867_42300978:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000435061:exon_42300867_42300977:SREBF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 42341934 A/G 1 39 42 81 18.3861585125271 22.1995216018939 -3.81336308936673 A:G A G 10 0.52856003814033 0.436440430191941 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341917_42342009:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42341917_42342009:CENPM HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 4 13 17 1.88575984743868 6.87128049582429 -4.98552064838561 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0256862693068555 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 160 98 258 75.4303938975472 51.7988837377523 23.6315101597948 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00332593812883669 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 19 12 31 8.95735927533373 6.34272045768396 2.61463881764977 T:C C T 10 0.52856003814033 0.373737080489224 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 42912097 C/T 1 65 22 87 30.6435975208785 11.6283208390873 19.0152766817913 T:C C T 10 0.52856003814033 3.56010662323822e-05 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 42912106 C/T 1 27 64 91 12.7288789702111 33.8278424409811 -21.09896347077 T:C C T 10 0.52856003814033 1.18843782160496e-05 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 T:C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 43435812 C/T 1 3 7 10 1.41431988557901 3.69992026698231 -2.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.206826979960111 ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43435645_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43435675_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43435773_43435911:TTLL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 25 35 60 11.7859990464917 18.4996013349116 -6.7136022884198 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0928069975882929 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 44386281 C/T 1 92 102 194 43.3724764910896 53.9131238903137 -10.540647399224 T:C C T 10 0.52856003814033 0.131600140340084 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000494795:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000465768:exon_44386208_44386286:SAMM50 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 168 174 342 79.2019135924246 91.9694466364174 -12.7675330439929 A:C A C 10 0.52856003814033 0.175753419155307 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 45577231 T/C 1 1 8 9 0.47143996185967 4.22848030512264 -3.75704034326297 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0159780666639568 ENSG00000093000:ENST00000347635:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000432759:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000425733:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000355253:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000407019:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000493456:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000396096:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000440908:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000422489:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000469163:exon_45577167_45577248:NUP50 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 8 6 14 3.77151969487736 3.17136022884198 0.60015946603538 A:G G A 10 0.52856003814033 0.795264899593225 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 47085924 G/A 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47085889_47086097:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47085889_47086097:CERK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 47290714 C/T 1 17 14 31 8.01447935161439 7.39984053396462 0.614638817649769 T:C C T 10 0.52856003814033 0.859133520696697 ENSG00000054611:ENST00000337137:exon_47290680_47290742:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000380995:exon_47290680_47290742:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000407381:exon_47290680_47290742:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000355704:exon_47290680_47290742:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000394449:exon_47290680_47290742:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000441162:exon_47290680_47290742:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000406733:exon_47290680_47290742:TBC1D22A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 22 50684296 T/C 1 15 14 29 7.07159942789505 7.39984053396462 -0.328241106069571 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 9515062 A/G 1 10 10 20 4.7143996185967 5.2856003814033 -0.571200762806601 A:G A G 10 0.52856003814033 0.826187510866658 ENSG00000168137:ENST00000402198:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000402466:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000406341:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000407969:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000302463:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000493918:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000399686:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000413704:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000466242:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000486465:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000492939:exon_9514920_9515221:SETD5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 8 4 12 3.77151969487736 2.11424015256132 1.65727954231604 C:G C G 10 0.52856003814033 0.397101977790935 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 9885615 G/C 1 8 6 14 3.77151969487736 3.17136022884198 0.60015946603538 C:G G C 10 0.52856003814033 0.795264899593225 ENSG00000156990:ENST00000433535:exon_9885574_9885698:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000383820:exon_9885574_9885700:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000287624:exon_9885574_9885678:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000424438:exon_9885409_9885626:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000427174:exon_9885574_9885670:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000484134:exon_9885574_9885700:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000418713:exon_9885574_9885686:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000472381:exon_9885149_9885702:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433972:exon_9885574_9885743:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433555:exon_9885574_9885660:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000451405:exon_9885409_9885679:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000460909:exon_9885574_9885700:RPUSD3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 54 70 124 25.4577579404222 36.9992026698231 -11.5414447294009 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0388279733139539 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 14 7 21 6.60015946603538 3.69992026698231 2.90023919905307 C:G G C 10 0.52856003814033 0.274795735904410 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 9 7 16 4.24295965673703 3.69992026698231 0.54303938975472 C:G C G 10 0.52856003814033 0.808687083852748 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 10136893 C/A 1 6 12 18 2.82863977115802 6.34272045768396 -3.51408068652594 A:C C A 10 0.52856003814033 0.104602675868325 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10136884_10136958:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10136884_10136958:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10136884_10136958:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10136884_10136958:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10136884_10136958:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10136884_10136958:FANCD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 10142949 C/T 1 44 43 87 20.7433583218255 22.7280816400342 -1.98472331820871 T:C C T 10 0.52856003814033 0.669472933986822 ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10142872_10143610:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10142872_10142966:FANCD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 10302045 C/T 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 10302056 A/G 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 10311939 C/T 1 2 7 9 0.94287992371934 3.69992026698231 -2.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.093882474099143 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 10312507 A/G 1 20 8 28 9.4287992371934 4.22848030512264 5.20031893207076 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0579776465631215 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 11887991 C/G 1 10 9 19 4.7143996185967 4.75704034326297 -0.0426407246662706 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11887976_11888393:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11887976_11888246:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11887976_11888355:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11887976_11888253:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11887976_11888366:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11887976_11888359:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000494388:exon_11887976_11888338:C3orf31 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 36 34 70 16.9718386269481 17.9710412967712 -0.999202669823102 T:C C T 10 0.52856003814033 0.812149936455992 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 6 10 16 2.82863977115802 5.2856003814033 -2.45696061024528 T:G G T 10 0.52856003814033 0.316716189138101 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 11 14 25 5.18583958045637 7.39984053396462 -2.21400095350825 T:C C T 10 0.52856003814033 0.426100767961122 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 10 10 20 4.7143996185967 5.2856003814033 -0.571200762806601 A:G G A 10 0.52856003814033 0.826187510866658 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 13383540 A/G 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13383496_13383623:NUP210 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 43 37 80 20.2719183599658 19.5567214111922 0.715196948773599 T:G G T 10 0.52856003814033 0.91114259510225 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 14220023 G/C 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 C:G G C 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14219966_14220283:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14219966_14220172:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14219966_14220101:XPC;ENSG00000154767:ENST00000511155:exon_14219984_14220121:XPC;ENSG00000170860:ENST00000306024:exon_14219858_14220381:LSM3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 35 28 63 16.5003986650884 14.7996810679292 1.70071759715921 A:G G A 10 0.52856003814033 0.706264595116755 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 16364954 C/T 1 83 78 161 39.1295168343526 41.2276829749457 -2.09816614059314 T:C C T 10 0.52856003814033 0.752712089817832 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 17051328 T/C 1 3 6 9 1.41431988557901 3.17136022884198 -1.75704034326297 T:C T C 10 0.52856003814033 0.322282730829835 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 17053499 A/G 1 13 9 22 6.12871950417571 4.75704034326297 1.37167916091274 A:G A G 10 0.52856003814033 0.671001928035497 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 20216519 T/A 1 20 18 38 9.4287992371934 9.51408068652594 -0.0852814493325411 A:T T A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000383774:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000443724:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000456624:exon_20216214_20216547:SGOL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 23930669 T/C 1 36 33 69 16.9718386269481 17.4424812586309 -0.470642631682772 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000170142:ENST00000306627:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000346855:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000442670:exon_23930603_23930707:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000424381:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000467766:exon_23930603_23930917:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000475680:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000452012:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000493707:exon_23930603_23930750:UBE2E1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 23932105 T/A 1 27 38 65 12.7288789702111 20.0852814493325 -7.35640247912145 A:T T A 10 0.52856003814033 0.0813683622753713 ENSG00000170142:ENST00000306627:exon_23932000_23932807:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000346855:exon_23932000_23932807:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000424381:exon_23932000_23932805:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000475680:exon_23932000_23932580:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000452012:exon_23932000_23932807:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000493707:exon_23932000_23932363:UBE2E1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 33038747 C/G 1 14 12 26 6.60015946603538 6.34272045768396 0.25743900835142 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000170266:ENST00000399402:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33038221_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33038226_33038836:GLB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 33434831 G/A 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 A:G G A 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000492136:exon_33429830_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000466441:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000486388:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000464787:exon_33434804_33434946:UBP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 33879770 G/A 1 1 9 10 0.47143996185967 4.75704034326297 -4.2856003814033 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00832466243874547 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33879696_33879819:PDCD6IP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 20 10 30 9.4287992371934 5.2856003814033 4.1431988557901 T:C C T 10 0.52856003814033 0.145808863789451 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 66 65 131 31.1150374827382 34.3564024791214 -3.24136499638323 A:G A G 10 0.52856003814033 0.599996320061153 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 39180099 T/C 1 5 10 15 2.35719980929835 5.2856003814033 -2.92840057210495 T:C T C 10 0.52856003814033 0.194617397098600 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 39180263 G/A 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180202_39180394:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180202_39180391:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180202_39180350:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180202_39180370:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180202_39180390:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180202_39180393:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 7 8 15 3.30007973301769 4.22848030512264 -0.92840057210495 T:C C T 10 0.52856003814033 0.79709726410062 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 12 12 24 5.65727954231604 6.34272045768396 -0.68544091536792 A:G G A 10 0.52856003814033 0.839606713971287 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 39433037 A/G 1 11 16 27 5.18583958045637 8.45696061024528 -3.27112102978891 A:G A G 10 0.52856003814033 0.248567283323368 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39432932_39433111:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39432932_39433111:SLC25A38 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 53 27 80 24.9863179785625 14.2711210297889 10.7151969487736 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0183229546851464 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 39450065 C/T 1 8 7 15 3.77151969487736 3.69992026698231 0.0715994278950496 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000168028:ENST00000490490:exon_39449695_39450215:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39450028_39450215:RPSA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 39453160 G/A 1 280 273 553 132.003189320708 144.29689041231 -12.2937010916025 A:G G A 10 0.52856003814033 0.306718804786973 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 40498845 C/T 1 18 21 39 8.48591931347406 11.0997608009469 -2.61384148747287 T:C C T 10 0.52856003814033 0.426070117386460 ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 42265166 T/C 1 7 1 8 3.30007973301769 0.52856003814033 2.77151969487736 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0738868803430894 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42264434_42267381:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42264434_42267260:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42264434_42267381:TRAK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 39 12 51 18.3861585125271 6.34272045768396 12.0434380548432 C:G C G 10 0.52856003814033 0.000654286540999056 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 23 14 37 10.8431191227724 7.39984053396462 3.44327858880779 A:G G A 10 0.52856003814033 0.323350657732138 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 47162661 A/G 1 4 13 17 1.88575984743868 6.87128049582429 -4.98552064838561 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0256862693068555 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 47450504 C/T 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000076201:ENST00000456408:exon_47450266_47450577:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47450266_47450577:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47450266_47450577:PTPN23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 47451778 G/T 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 T:G G T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 12 14 26 5.65727954231604 7.39984053396462 -1.74256099164858 A:G G A 10 0.52856003814033 0.558131650023887 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 47459679 C/T 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 T:C C T 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47459624_47459739:SCAP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 38 42 80 17.9147185506675 22.1995216018939 -4.2848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.370861415685643 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 35 33 68 16.5003986650884 17.4424812586309 -0.942082593542445 T:G G T 10 0.52856003814033 0.903441327104524 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 22 32 54 10.3716791609127 16.9139212204906 -6.54224205957782 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0777368954945965 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 168 151 319 79.2019135924246 79.8125657591898 -0.610652166765277 T:C C T 10 0.52856003814033 0.955325438064375 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 48636585 G/A 1 58 60 118 27.3435177878609 31.7136022884198 -4.37008450055895 A:G G A 10 0.52856003814033 0.460948296161663 ENSG00000010256:ENST00000471189:exon_48636435_48636625:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000203407:exon_48636436_48636625:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000480561:exon_48636467_48637143:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000415995:exon_48636487_48636625:UQCRC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 48718771 C/T 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000213672:ENST00000341520:exon_48718720_48719213:NCKIPSD;ENSG00000213672:ENST00000416649:exon_48718720_48719213:NCKIPSD;ENSG00000213672:ENST00000294129:exon_48718720_48719213:NCKIPSD;ENSG00000213672:ENST00000415281:exon_48718720_48719017:NCKIPSD;ENSG00000213672:ENST00000439518:exon_48718626_48719213:NCKIPSD HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 49051931 C/T 1 121 67 188 57.0442353850201 35.4135225554021 21.630712829618 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.00162874070494341 ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49051816_49051932:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000420783:exon_49051816_49051932:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49051816_49051932:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000415265:exon_49051816_49051932:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000452875:exon_49051816_49051932:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000471162:exon_49051816_49051932:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000448293:exon_49051816_49051932:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000498023:exon_49051816_49051932:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000492780:exon_49051672_49051932:WDR6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 49336052 G/A 1 15 19 34 7.07159942789505 10.0426407246663 -2.97104129677122 A:G G A 10 0.52856003814033 0.39073568744534 ENSG00000114316:ENST00000351842:exon_49335985_49336068:USP4;ENSG00000114316:ENST00000265560:exon_49335985_49336068:USP4;ENSG00000114316:ENST00000485450:exon_49335985_49336068:USP4;ENSG00000114316:ENST00000431357:exon_49335985_49336068:USP4;ENSG00000114316:ENST00000486549:exon_49335985_49336068:USP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 50326020 G/A 1 75 67 142 35.3579971394752 35.4135225554021 -0.0555254159268657 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000426499:exon_50326014_50326070:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000486322:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000492387:exon_50325943_50326142:IFRD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 50327429 A/G 1 16 23 39 7.54303938975472 12.1568808772276 -4.61384148747287 A:G A G 10 0.52856003814033 0.150920038093284 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50327360_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000483071:exon_50327143_50327501:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000489569:exon_50327360_50327517:IFRD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 50334231 T/A 1 28 20 48 13.2003189320708 10.5712007628066 2.62911816926416 A:T T A 10 0.52856003814033 0.473002037760409 ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 50336661 T/C 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000186792:ENST00000336307:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000415204:exon_50336644_50336832:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000513170:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000450982:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000066014:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50336644_50336847:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50336644_50336852:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50336644_50336831:NAT6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 50355730 T/G 1 5 13 18 2.35719980929835 6.87128049582429 -4.51408068652594 T:G T G 10 0.52856003814033 0.0558100460820762 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50355221_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50355227_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50355240_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50355243_50355970:HYAL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 64 44 108 30.1721575590189 23.2566416781745 6.91551588084436 T:C C T 10 0.52856003814033 0.210094707164349 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 52255284 G/T 1 34 39 73 16.0289587032288 20.6138414874729 -4.58488278424409 T:G G T 10 0.52856003814033 0.293404544152547 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 15 18 33 7.07159942789505 9.51408068652594 -2.44248125863089 T:C C T 10 0.52856003814033 0.486149344764456 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 52521897 G/A 1 13 13 26 6.12871950417571 6.87128049582429 -0.742560991648581 A:G G A 10 0.52856003814033 0.845363867960316 ENSG00000010322:ENST00000479054:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000345716:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000414197:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000489895:exon_52521212_52522621:NISCH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 53259850 C/T 1 280 296 576 132.003189320708 156.453771289538 -24.4505819688301 T:C:G C T 10 0.52856003814033 0.0450563887833249 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53258723_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53259767_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53259655_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53259675_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53259718_53259947:TKT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 53264485 A/G 1 258 191 449 121.631510159795 100.954967284803 20.6765428749918 A:T:G A G 10 0.52856003814033 0.0525980001083341 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53264473_53264637:TKT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 53269046 T/C 1 111 95 206 52.3298357664234 50.2132036233314 2.11663214309201 T:C:G T C 10 0.52856003814033 0.780561293251453 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53268999_53269080:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53268999_53269132:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 53269163 G/A 1 52 41 93 24.5148780167028 21.6709615637535 2.8439164529493 A:C:G G A 10 0.52856003814033 0.604030514462990 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 40 19 59 18.8575984743868 10.0426407246663 8.81495774972053 A:C A C 10 0.52856003814033 0.0259246182947112 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 56658871 T/C 1 8 6 14 3.77151969487736 3.17136022884198 0.60015946603538 T:C T C 10 0.52856003814033 0.795264899593225 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 56667480 C/T 1 8 9 17 3.77151969487736 4.75704034326297 -0.98552064838561 T:C C T 10 0.52856003814033 0.637676890163413 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56667072_56668000:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56667072_56667871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56667072_56667994:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56667072_56667871:C3orf63 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 58186775 G/A 1 24 1 25 11.3145590846321 0.52856003814033 10.7859990464917 A:G G A 10 0.52856003814033 5.56587648506125e-06 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58186724_58186836:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58186724_58186836:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58186724_58186836:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000450710:exon_58186724_58186861:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58186724_58186836:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000477209:exon_58186724_58186836:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58186750_58186836:DNASE1L3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 58414382 C/T 1 18 14 32 8.48591931347406 7.39984053396462 1.08607877950944 T:C C T 10 0.52856003814033 0.727026616884364 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 63981635 C/T 1 8 5 13 3.77151969487736 2.64280019070165 1.12871950417571 T:C C T 10 0.52856003814033 0.589189446313547 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 66419942 A/G 1 7 11 18 3.30007973301769 5.81416041954363 -2.51408068652594 A:G A G 10 0.52856003814033 0.24852778175064 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 66430811 T/G 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 T:G T G 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 66430819 C/T 1 3 8 11 1.41431988557901 4.22848030512264 -2.81416041954363 T:C C T 10 0.52856003814033 0.129625044921933 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 11 8 19 5.18583958045637 4.22848030512264 0.957359275333729 T:C T C 10 0.52856003814033 0.819137161107216 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 81627175 T/C 1 6 10 16 2.82863977115802 5.2856003814033 -2.45696061024528 T:C T C 10 0.52856003814033 0.316716189138101 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81627076_81627247:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81627076_81627247:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81627076_81627247:GBE1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 81698130 T/C 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 81720076 G/A 1 6 12 18 2.82863977115802 6.34272045768396 -3.51408068652594 A:G G A 10 0.52856003814033 0.104602675868325 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000477426:exon_81719989_81720133:GBE1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 87276699 C/T 1 8 7 15 3.77151969487736 3.69992026698231 0.0715994278950496 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87276421_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87276435_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87276452_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87276459_87276706:CHMP2B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 87299075 A/C 1 8 9 17 3.77151969487736 4.75704034326297 -0.98552064838561 A:C A C 10 0.52856003814033 0.637676890163413 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87299025_87299127:CHMP2B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 97664725 C/T 1 18 9 27 8.48591931347406 4.75704034326297 3.72887897021109 T:C C T 10 0.52856003814033 0.178733215091274 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97664182_97664731:MINA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 26 24 50 12.2574390083514 12.6854409153679 -0.428001907016501 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 14 17 31 6.60015946603538 8.98552064838561 -2.38536118235023 T:C C T 10 0.52856003814033 0.472618372786915 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 105438957 T/G 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 T:G T G 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 105439026 G/A 1 9 5 14 4.24295965673703 2.64280019070165 1.60015946603538 A:G G A 10 0.52856003814033 0.43463285635379 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 107769319 A/C 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 A:C A C 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 111842431 T/C 1 92 91 183 43.3724764910896 48.09896347077 -4.72648697968039 T:C T C 10 0.52856003814033 0.505559158921393 ENSG00000174500:ENST00000308910:exon_111839688_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000438451:exon_111839692_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000484193:exon_111841943_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000470085:exon_111842072_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000495418:exon_111842152_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000460387:exon_111842302_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000383684:exon_111842302_111842622:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000488580:exon_111842408_111842619:GCET2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 111842471 C/T 1 98 93 191 46.2011162622477 49.1560835470507 -2.95496728480303 T:C C T 10 0.52856003814033 0.717171688211154 ENSG00000174500:ENST00000308910:exon_111839688_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000438451:exon_111839692_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000484193:exon_111841943_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000470085:exon_111842072_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000495418:exon_111842152_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000460387:exon_111842302_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000383684:exon_111842302_111842622:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000488580:exon_111842408_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000487901:exon_111842454_111842619:GCET2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 112063850 C/A 1 11 8 19 5.18583958045637 4.22848030512264 0.957359275333729 A:C C A 10 0.52856003814033 0.819137161107216 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112063809_112064135:CD200 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 112724661 T/C 1 37 38 75 17.4432785888078 20.0852814493325 -2.64200286052475 T:C T C 10 0.52856003814033 0.564500714806482 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112721287_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112723801_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112723811_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112724023_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112724169_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112724328_112724851:C3orf17 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 9 6 15 4.24295965673703 3.17136022884198 1.07159942789505 A:T A T 10 0.52856003814033 0.616121686737298 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 112727199 G/A 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 118948716 G/A 1 15 15 30 7.07159942789505 7.92840057210495 -0.856801144209902 A:G G A 10 0.52856003814033 0.85541913037237 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 119133554 G/A 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 119222456 G/C 1 6 11 17 2.82863977115802 5.81416041954363 -2.98552064838561 C:G G C 10 0.52856003814033 0.223521253075844 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000492164:exon_119222379_119222467:C3orf1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 119305169 G/A 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119305132_119305210:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 121351338 C/T 1 152 148 300 71.6588742026698 78.2268856447688 -6.56801144209901 T:C C T 10 0.52856003814033 0.452739540162046 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121351253_121351410:HCLS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 121361787 G/A 1 132 108 240 62.2300749654764 57.0844841191556 5.14559084632079 A:G G A 10 0.52856003814033 0.51850637346355 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121361774_121363030:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121361774_121361828:HCLS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 121412892 A/G 1 19 24 43 8.95735927533373 12.6854409153679 -3.72808164003419 A:G A G 10 0.52856003814033 0.286285121242471 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 121414217 C/A 1 22 21 43 10.3716791609127 11.0997608009469 -0.728081640034191 A:C C A 10 0.52856003814033 0.879156036024893 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 121415610 G/A 1 27 24 51 12.7288789702111 12.6854409153679 0.0434380548431683 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 121838319 G/A 1 18 27 45 8.48591931347406 14.2711210297889 -5.78520171631485 A:G G A 10 0.52856003814033 0.100095395612752 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121838285_121838921:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121838285_121839175:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121838285_121839982:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121838285_121838667:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121838285_121838440:CD86 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 27 28 55 12.7288789702111 14.7996810679292 -2.07080209771815 T:C T C 10 0.52856003814033 0.591617612011239 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 13 13 26 6.12871950417571 6.87128049582429 -0.742560991648581 C:G G C 10 0.52856003814033 0.845363867960316 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 127292333 G/A 1 71 50 121 33.4722372920366 26.4280019070165 7.04423538502007 A:G G A 10 0.52856003814033 0.203826243326641 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 13 20 33 6.12871950417571 10.5712007628066 -4.44248125863089 T:C C T 10 0.52856003814033 0.162100095066129 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 127327718 A/G 1 14 19 33 6.60015946603538 10.0426407246663 -3.44248125863089 A:G A G 10 0.52856003814033 0.295437717187171 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127327675_127327866:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127327675_127327866:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127327675_127327866:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127327675_127327866:MCM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 128618283 T/C 1 3 9 12 1.41431988557901 4.75704034326297 -3.34272045768396 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0796439798478496 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128618208_128618304:ACAD9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 10 3 13 4.7143996185967 1.58568011442099 3.12871950417571 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0991231984509586 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 128890350 G/A 1 155 112 267 73.0731940882488 59.198724271717 13.8744698165319 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0977662976068436 ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 31 21 52 14.6146388176498 11.0997608009469 3.51487801670284 T:C T C 10 0.52856003814033 0.404853617648628 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 128984583 C/T 1 35 29 64 16.5003986650884 15.3282411060696 1.17215755901888 T:C C T 10 0.52856003814033 0.803269381917134 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513410:exon_128984392_128984635:COPG HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 129023630 G/A 1 39 33 72 18.3861585125271 17.4424812586309 0.943677253896237 A:G G A 10 0.52856003814033 0.906159022571018 ENSG00000183624:ENST00000383463:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000417226:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000502878:exon_129023432_129024146:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000389735:exon_129023432_129024105:C3orf37 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 129155451 C/T 1 77 79 156 36.3008770631946 41.7562430130861 -5.45536594989148 T:C C T 10 0.52856003814033 0.422671848342301 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 130718472 G/A 1 30 16 46 14.1431988557901 8.45696061024528 5.68623824554482 A:G G A 10 0.52856003814033 0.104760752256588 ENSG00000017260:ENST00000504381:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000505330:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507488:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000510168:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000508532:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000513801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504948:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000328560:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000533801:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000428331:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000393221:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000422190:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000359644:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000347421:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504612:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000514654:exon_130718362_130718503:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507194:exon_130718362_130718503:ATP2C1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 132257069 G/A 1 22 34 56 10.3716791609127 17.9710412967712 -7.59936213585848 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0449937838442378 ENSG00000138246:ENST00000260818:exon_132257020_132257876:DNAJC13;ENSG00000138246:ENST00000509279:exon_132257020_132257352:DNAJC13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 133341988 T/C 1 3 7 10 1.41431988557901 3.69992026698231 -2.2856003814033 T:C T C 10 0.52856003814033 0.206826979960111 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133341935_133342037:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133341935_133342037:TOPBP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 19 15 34 8.95735927533373 7.92840057210495 1.02895870322878 A:G G A 10 0.52856003814033 0.735448892895924 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 137881265 T/A 1 7 3 10 3.30007973301769 1.58568011442099 1.7143996185967 A:T T A 10 0.52856003814033 0.351744435761646 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 139069875 T/G 1 34 42 76 16.0289587032288 22.1995216018939 -6.17056289866508 T:G T G 10 0.52856003814033 0.168692432487437 ENSG00000175110:ENST00000495075:exon_139069819_139069902:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000310776:exon_139069819_139069902:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000498505:exon_139069819_139069902:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000480938:exon_139069021_139069902:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000465056:exon_139069819_139069902:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000466690:exon_139069819_139069904:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000478464:exon_139069819_139069902:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000483545:exon_139069819_139069998:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000445257:exon_139069819_139069902:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000480644:exon_139069873_139069902:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000492644:exon_139069712_139071634:MRPS22 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 141464146 G/A 1 222 197 419 104.659671532847 104.126327513645 0.533344019201706 A:G G A 10 0.52856003814033 0.96102597112713 ENSG00000114125:ENST00000273480:exon_141464001_141466402:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000480908:exon_141464001_141464542:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000393000:exon_141464001_141464544:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000477012:exon_141464001_141464511:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000477393:exon_141464001_141464359:RNF7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 149459341 A/G 1 33 33 66 15.5575187413691 17.4424812586309 -1.88496251726178 A:G A G 10 0.52856003814033 0.711840007776228 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 9 5 14 4.24295965673703 2.64280019070165 1.60015946603538 T:C C T 10 0.52856003814033 0.43463285635379 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 1 105 2 107 49.5011959952653 1.05712007628066 48.4440759189847 T:C T C 10 0.52856003814033 1.30710242880407e-26 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 C:G G C 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 4 11 15 1.88575984743868 5.81416041954363 -3.92840057210495 T:C T C 10 0.52856003814033 0.066773241017641 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 167728054 C/T 1 17 15 32 8.01447935161439 7.92840057210495 0.086078779509438 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000173905:ENST00000470487:exon_167726465_167728206:GOLIM4;ENSG00000173905:ENST00000309027:exon_167728023_167728206:GOLIM4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 170584249 C/A 1 1244 1122 2366 586.471312553429 593.04436279345 -6.57305024002085 A:T:C:G C A 10 0.52856003814033 0.788966020281384 ENSG00000163584:ENST00000295830:exon_170582664_170584313:RPL22L1;ENSG00000163584:ENST00000509554:exon_170582664_170584313:RPL22L1;ENSG00000163584:ENST00000523196:exon_170582664_170584313:RPL22L1;ENSG00000163584:ENST00000530415:exon_170582664_170584313:RPL22L1;ENSG00000163584:ENST00000478578:exon_170583583_170584313:RPL22L1;ENSG00000163584:ENST00000475836:exon_170584052_170584313:RPL22L1;ENSG00000163584:ENST00000466674:exon_170584053_170584313:RPL22L1;ENSG00000163584:ENST00000469760:exon_170584053_170584313:RPL22L1;ENSG00000163584:ENST00000477326:exon_170584053_170584313:RPL22L1;ENSG00000163584:ENST00000531436:exon_170584053_170584313:RPL22L1;ENSG00000163584:ENST00000494771:exon_170584056_170584313:RPL22L1;ENSG00000163584:ENST00000463836:exon_170584057_170584313:RPL22L1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 179051472 A/G 1 47 34 81 22.1576782074045 17.9710412967712 4.18663691063326 A:G A G 10 0.52856003814033 0.374704693682804 ENSG00000121864:ENST00000496856:exon_179051057_179052402:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000326361:exon_179051057_179053323:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466264:exon_179051057_179051617:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000484866:exon_179051057_179052400:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466663:exon_179051057_179051518:ZNF639 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 10 20 30 4.7143996185967 10.5712007628066 -5.8568011442099 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0427542793504863 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 77 61 138 36.3008770631946 32.2421623265601 4.05871473663446 C:G C G 10 0.52856003814033 0.496654783377978 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 24 15 39 11.3145590846321 7.92840057210495 3.38615851252713 A:G A G 10 0.52856003814033 0.336419713709802 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 183861243 A/G 1 28 50 78 13.2003189320708 26.4280019070165 -13.2276829749457 A:G A G 10 0.52856003814033 0.00302170415726468 ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 15 17 32 7.07159942789505 8.98552064838561 -1.91392122049056 A:C C A 10 0.52856003814033 0.596081373087417 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 185252919 G/A 1 7 1 8 3.30007973301769 0.52856003814033 2.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0738868803430894 ENSG00000163898:ENST00000296252:exon_185252553_185252920:LIPH;ENSG00000163898:ENST00000424591:exon_185252553_185252920:LIPH;ENSG00000163898:ENST00000429510:exon_185252553_185252920:LIPH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 4 10 14 1.88575984743868 5.2856003814033 -3.39984053396462 A:C C A 10 0.52856003814033 0.105344207452060 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 187088926 G/A 1 32 22 54 15.0860787795094 11.6283208390873 3.45775794042218 A:G G A 10 0.52856003814033 0.413772939849159 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 11 8 19 5.18583958045637 4.22848030512264 0.957359275333729 T:C T C 10 0.52856003814033 0.819137161107216 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 193385059 G/A 1 21 37 58 9.90023919905307 19.5567214111922 -9.65648221213914 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0122138418615324 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000445863:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000429164:exon_193384965_193385069:OPA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 194373592 G/A 1 13 4 17 6.12871950417571 2.11424015256132 4.01447935161439 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0552329538663803 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000437613:exon_194373458_194373831:LSG1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 194790434 C/G 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 C:G C G 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000173950:ENST00000310380:exon_194789008_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000437101:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000355729:exon_194789330_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000458652:exon_194790020_194790677:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000460582:exon_194790322_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000473200:exon_194790360_194790840:C3orf21;ENSG00000173950:ENST00000429994:exon_194790406_194790840:C3orf21 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 36 20 56 16.9718386269481 10.5712007628066 6.40063786414152 T:G G T 10 0.52856003814033 0.107528635410247 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 196210590 A/G 1 7 10 17 3.30007973301769 5.2856003814033 -1.98552064838561 A:G A G 10 0.52856003814033 0.345083621048323 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 196210808 T/C 1 7 7 14 3.30007973301769 3.69992026698231 -0.39984053396462 T:C T C 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 18 36 54 8.48591931347406 19.0281613730519 -10.5422420595778 T:C T C 10 0.52856003814033 0.00587474352407543 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 196454939 C/T 1 18 8 26 8.48591931347406 4.22848030512264 4.25743900835142 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.116090047573509 ENSG00000163964:ENST00000426755:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000421265:exon_196454794_196455222:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196454794_196455007:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000451319:exon_196454794_196454981:PIGX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 196746629 T/C 1 16 11 27 7.54303938975472 5.81416041954363 1.72887897021109 T:C T C 10 0.52856003814033 0.566418285796463 ENSG00000163975:ENST00000296351:exon_196745824_196746672:MFI2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 3 197616531 T/C 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 T:C T C 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000114473:ENST00000265239:exon_197615946_197616585:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000455191:exon_197615948_197616585:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000490748:exon_197615949_197616585:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000478903:exon_197615949_197616585:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000485787:exon_197616284_197616585:IQCG HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 337709 T/C 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 A:T:C T C 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 25 37 62 11.7859990464917 19.5567214111922 -7.77072236470046 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0559323844746105 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 0 0 27 27 0 14.2711210297889 -14.2711210297889 T:G A G 10 0.52856003814033 1.52234333334072e-09 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 55 44 99 25.9291979022818 23.2566416781745 2.67255622410733 A:G G A 10 0.52856003814033 0.615838559613208 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 1729953 G/A 1 109 101 210 51.386955842704 53.3845638521733 -1.99760800946931 A:G G A 10 0.52856003814033 0.782713319306743 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1729435_1729959:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 1729988 G/A 1 93 97 190 43.8439164529493 51.270323699612 -7.42640724666271 A:G G A 10 0.52856003814033 0.309003630865969 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 96 76 172 45.2582363385283 40.1705628986651 5.08767343986324 A:T:G A G 10 0.52856003814033 0.446116604993323 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 1732978 G/A 1 17 30 47 8.01447935161439 15.8568011442099 -7.84232179259551 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0275297952307624 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1732899_1733028:TACC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 22 21 43 10.3716791609127 11.0997608009469 -0.728081640034191 T:C C T 10 0.52856003814033 0.879156036024893 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 1746229 G/T 1 5 8 13 2.35719980929835 4.22848030512264 -1.87128049582429 T:G G T 10 0.52856003814033 0.406604439196984 ENSG00000013810:ENST00000484264:exon_1746166_1746351:TACC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 1746455 G/A 1 248 201 449 116.917110541198 106.240567666206 10.6765428749918 A:C:G G A 10 0.52856003814033 0.321123835125645 ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1746439_1746559:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1746439_1746559:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484264:exon_1746439_1746803:TACC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 2252237 C/T 0 131 0 131 61.7586350036168 0 61.7586350036168 C C 10 0.52856003814033 6.18527764474955e-37 ENSG00000123933:ENST00000337190:exon_2249159_2252428:MXD4;ENSG00000123933:ENST00000513372:exon_2251191_2252428:MXD4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 70 50 120 33.0007973301769 26.4280019070165 6.57279542316039 A:G G A 10 0.52856003814033 0.235962625244667 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 2933271 G/A 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000109736:ENST00000508276:exon_2933102_2933663:MFSD10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 11 10 21 5.18583958045637 5.2856003814033 -0.0997608009469308 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 3227419 A/G 1 13 6 19 6.12871950417571 3.17136022884198 2.95735927533373 A:G A G 10 0.52856003814033 0.25018193083756 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 3234980 G/A 1 20 2 22 9.4287992371934 1.05712007628066 8.37167916091274 A:G G A 10 0.52856003814033 0.000327936224795798 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3234890_3235080:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3234890_3235080:HTT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 4276475 C/A 1 169 156 325 79.6733535542842 82.4553659498915 -2.78201239560727 A:C C A 10 0.52856003814033 0.78126053970164 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 6303354 G/A 1 7 1 8 3.30007973301769 0.52856003814033 2.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0738868803430894 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 6303680 A/G 1 8 13 21 3.77151969487736 6.87128049582429 -3.09976080094693 A:G A G 10 0.52856003814033 0.194847234835071 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:G A G 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 7 8 15 3.30007973301769 4.22848030512264 -0.92840057210495 T:C T C 10 0.52856003814033 0.79709726410062 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 8375342 G/A 1 2 10 12 0.94287992371934 5.2856003814033 -4.34272045768396 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0173067676742740 ENSG00000087008:ENST00000512411:exon_8375288_8375542:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000515797:exon_8375288_8375355:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8375288_8375355:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8375288_8375355:ACOX3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 13601337 G/A 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 13606576 A/T 1 55 63 118 25.9291979022818 33.2992824028408 -7.37008450055895 A:T A T 10 0.52856003814033 0.196624874794998 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 17829990 G/C 1 14 8 22 6.60015946603538 4.22848030512264 2.37167916091274 C:G G C 10 0.52856003814033 0.39453671919514 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000510063:exon_17829901_17830011:NCAPG HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 8 4 12 3.77151969487736 2.11424015256132 1.65727954231604 T:C C T 10 0.52856003814033 0.397101977790935 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 12 25 37 5.65727954231604 13.2140009535083 -7.55672141119221 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0135597072837182 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 3 10 13 1.41431988557901 5.2856003814033 -3.87128049582429 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0481210508977837 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 37851856 A/C 1 14 11 25 6.60015946603538 5.81416041954363 0.785999046491749 A:C A C 10 0.52856003814033 0.842467073650159 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37851805_37851994:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37851805_37851994:PGM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 37903756 T/C 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 37904082 T/C 1 5 12 17 2.35719980929835 6.34272045768396 -3.98552064838561 T:C T C 10 0.52856003814033 0.086003743852648 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 236 225 461 111.259830998882 118.926008581574 -7.66617758269214 A:G A G 10 0.52856003814033 0.484297797392873 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 38774889 T/C 1 174 165 339 82.0305533635826 87.2124062931545 -5.18185292957189 T:C T C 10 0.52856003814033 0.586685039015409 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 102 133 235 48.0868761096863 70.2984850726639 -22.2116089629776 A:G A G 10 0.52856003814033 0.00398169351536801 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 35 27 62 16.5003986650884 14.2711210297889 2.22927763529954 T:G T G 10 0.52856003814033 0.612238567952009 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 20 18 38 9.4287992371934 9.51408068652594 -0.0852814493325411 A:C C A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 49 128 177 23.1005581311238 67.6556848819622 -44.5551267508384 T:G T G 10 0.52856003814033 1.36150655844518e-11 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 98 7 105 46.2011162622477 3.69992026698231 42.5011959952653 A:G A G 10 0.52856003814033 1.43328678666444e-19 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 40138676 A/G 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 A:G A G 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000078177:ENST00000261435:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000381804:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000511480:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000513269:exon_40138564_40138702:N4BP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 54011526 A/G 1 16 25 41 7.54303938975472 13.2140009535083 -5.67096156375353 A:G A G 10 0.52856003814033 0.085704351783196 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 57219592 G/A 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57219570_57219762:AASDH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 57250285 T/C 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 T:C T C 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000510012:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514796:exon_57250236_57250465:AASDH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 57356588 A/G 1 19 31 50 8.95735927533373 16.3853611823502 -7.4280019070165 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0463069209635721 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57356499_57356602:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57356499_57356602:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000505314:exon_57356499_57356602:SRP72 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 57361553 A/G 1 65 51 116 30.6435975208785 26.9565619451568 3.68703557572172 A:G A G 10 0.52856003814033 0.516046774262902 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57361523_57361560:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57361523_57361560:SRP72 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 57796900 G/A 1 45 45 90 21.2147982836851 23.7852017163149 -2.5704034326297 A:G G A 10 0.52856003814033 0.599128338657452 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 57797414 C/T 1 16 9 25 7.54303938975472 4.75704034326297 2.78599904649175 T:C C T 10 0.52856003814033 0.318679892721310 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 57798174 C/G 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 57798189 G/A 1 3 6 9 1.41431988557901 3.17136022884198 -1.75704034326297 A:G G A 10 0.52856003814033 0.322282730829835 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 57830663 T/C 1 20 26 46 9.4287992371934 13.7425609916486 -4.31376175445518 T:C T C 10 0.52856003814033 0.237683215480364 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57830572_57830692:C4orf14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 57843295 C/A 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 A:C C A 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57842608_57844989:C4orf14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 53 45 98 24.9863179785625 23.7852017163149 1.20111626224766 T:C C T 10 0.52856003814033 0.840107649155966 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 68374597 C/T 1 5 11 16 2.35719980929835 5.81416041954363 -3.45696061024528 T:C C T 10 0.52856003814033 0.130508776647043 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 68380215 G/A 1 12 10 22 5.65727954231604 5.2856003814033 0.371679160912739 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68379792_68380405:CENPC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 68384008 C/T 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68383874_68384086:CENPC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 68442968 A/G 1 33 36 69 15.5575187413691 19.0281613730519 -3.47064263168277 A:G A G 10 0.52856003814033 0.469634829280423 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 75937971 C/T 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 75938179 G/A 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 76878727 G/C 1 43 54 97 20.2719183599658 28.5422420595778 -8.27032369961201 C:G G C 10 0.52856003814033 0.103564436187207 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 83765581 C/T 1 35 35 70 16.5003986650884 18.4996013349116 -1.99920266982311 T:C C T 10 0.52856003814033 0.634515468733035 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503937:exon_83765539_83765613:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000264405:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000511338:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83764838_83765662:SEC31A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 102839287 G/A 1 7 3 10 3.30007973301769 1.58568011442099 1.7143996185967 A:G G A 10 0.52856003814033 0.351744435761646 ENSG00000153064:ENST00000504592:exon_102839150_102839346:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000322953:exon_102839150_102839346:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000428908:exon_102839150_102839346:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000508653:exon_102839150_102839346:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000444316:exon_102839150_102839346:BANK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 103225513 T/C 1 11 3 14 5.18583958045637 1.58568011442099 3.60015946603538 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0629725641543962 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512337:exon_103225474_103225645:SLC39A8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 103228734 C/T 1 9 2 11 4.24295965673703 1.05712007628066 3.18583958045637 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0701714577429645 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000510255:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512657:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000502903:exon_103228714_103228762:SLC39A8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 103527699 A/C 1 5 22 27 2.35719980929835 11.6283208390873 -9.27112102978891 A:C A C 10 0.52856003814033 0.000346372882164483 ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103527653_103527854:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103527653_103527854:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103527653_103527854:NFKB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 20 21 41 9.4287992371934 11.0997608009469 -1.67096156375353 A:G A G 10 0.52856003814033 0.640884192554672 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 103557077 G/A 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000508141:exon_103557063_103557164:MANBA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 123280860 T/C 1 8 12 20 3.77151969487736 6.34272045768396 -2.5712007628066 T:C T C 10 0.52856003814033 0.270388168695337 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123280712_123280877:KIAA1109 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 128949799 C/T 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 T:C C T 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 128949850 A/G 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 128949929 C/A 1 8 7 15 3.77151969487736 3.69992026698231 0.0715994278950496 A:C C A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 129012638 A/G 1 5 11 16 2.35719980929835 5.81416041954363 -3.45696061024528 A:G A G 10 0.52856003814033 0.130508776647043 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000394288:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000432347:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129012502_129012667:LARP1B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 129043204 C/G 1 11 7 18 5.18583958045637 3.69992026698231 1.48591931347406 C:G C G 10 0.52856003814033 0.638181278212874 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 129043286 C/T 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507259:exon_129043272_129043343:LARP1B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 129867280 T/A 1 4 9 13 1.88575984743868 4.75704034326297 -2.87128049582429 A:T T A 10 0.52856003814033 0.163321106873792 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129867162_129867307:SCLT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 130023759 A/T 1 8 3 11 3.77151969487736 1.58568011442099 2.18583958045637 A:T A T 10 0.52856003814033 0.234946711874713 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 130030652 A/G 1 6 3 9 2.82863977115802 1.58568011442099 1.24295965673703 A:G A G 10 0.52856003814033 0.514204578379993 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 12 6 18 5.65727954231604 3.17136022884198 2.48591931347406 A:G G A 10 0.52856003814033 0.345436270087802 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 152609784 C/T 1 7 9 16 3.30007973301769 4.75704034326297 -1.45696061024528 T:C C T 10 0.52856003814033 0.618027034384742 ENSG00000059691:ENST00000263985:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515812:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515564:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000503160:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000510720:exon_152609782_152609915:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000513504:exon_152609782_152609915:PET112L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 154513627 A/G 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 154523845 G/A 1 9 11 20 4.24295965673703 5.81416041954363 -1.5712007628066 A:G G A 10 0.52856003814033 0.509501749881068 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154523694_154523879:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154523694_154523879:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154523694_154523879:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154523694_154523879:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154523694_154523879:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154523694_154523879:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000497247:exon_154523694_154523879:KIAA0922 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 155459194 A/T 1 37 26 63 17.4432785888078 13.7425609916486 3.70071759715921 A:T A T 10 0.52856003814033 0.378739461815152 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155459121_155459234:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000503251:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155459121_155459260:PLRG1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 155461113 T/C 1 35 22 57 16.5003986650884 11.6283208390873 4.87207782600119 T:C T C 10 0.52856003814033 0.232515070736707 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000507125:exon_155461103_155461424:PLRG1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 156273768 T/C 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000503466:exon_156273748_156273838:MAP9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 156274377 T/C 1 3 7 10 1.41431988557901 3.69992026698231 -2.2856003814033 T:C T C 10 0.52856003814033 0.206826979960111 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156274331_156274492:MAP9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 164085425 T/C 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 T:C T C 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000145414:ENST00000422287:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000274054:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000509232:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000502973:exon_164085369_164085543:NAF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 28 27 55 13.2003189320708 14.2711210297889 -1.07080209771815 A:C:G A C 10 0.52856003814033 0.788563799907285 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 55 36 91 25.9291979022818 19.0281613730519 6.90103652922997 T:C T C 10 0.52856003814033 0.172025064793521 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 3 12 15 1.41431988557901 6.34272045768396 -4.92840057210495 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0168651853154702 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 184426387 C/T 1 8 2 10 3.77151969487736 1.05712007628066 2.7143996185967 T:C C T 10 0.52856003814033 0.115110163415260 ENSG00000168556:ENST00000302327:exon_184426147_184426520:ING2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 186379899 G/C 1 7 2 9 3.30007973301769 1.05712007628066 2.24295965673703 C:G G C 10 0.52856003814033 0.186100445119176 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 4 186380243 A/C 1 2 7 9 0.94287992371934 3.69992026698231 -2.75704034326297 A:C A C 10 0.52856003814033 0.093882474099143 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 231111 T/C 1 34 31 65 16.0289587032288 16.3853611823502 -0.356402479121453 A:T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_231058_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_231058_231115:SDHA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 94 102 196 44.315356414809 53.9131238903137 -9.59776747550469 T:C T C 10 0.52856003814033 0.174549050607223 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 434981 G/C 1 3 11 14 1.41431988557901 5.81416041954363 -4.39984053396462 C:G G C 10 0.52856003814033 0.0286627679013754 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 22 26 48 10.3716791609127 13.7425609916486 -3.37088183073584 A:G G A 10 0.52856003814033 0.386143540404065 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 8 19 27 3.77151969487736 10.0426407246663 -6.27112102978891 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0195572218037124 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 5489383 G/A 1 24 18 42 11.3145590846321 9.51408068652594 1.80047839810614 A:G G A 10 0.52856003814033 0.644219020860247 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5489262_5490347:KIAA0947 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 6600203 C/T 1 106 118 224 49.972635957125 62.3700845005589 -12.3974485434339 T:C C T 10 0.52856003814033 0.108053044237070 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6600143_6600345:NSUN2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 10250430 G/A 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 10250443 T/C 1 6 7 13 2.82863977115802 3.69992026698231 -0.87128049582429 T:C T C 10 0.52856003814033 0.782861958075039 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000423695:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000510326:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000512975:exon_10250431_10250557:CCT5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 10254817 A/G 1 53 59 112 24.9863179785625 31.1850422502795 -6.19872427171697 A:C:G A G 10 0.52856003814033 0.256648154113679 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10254786_10254835:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10254786_10255142:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10254786_10254950:CCT5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 10256161 T/C 1 43 65 108 20.2719183599658 34.3564024791214 -14.0844841191556 T:C T C 10 0.52856003814033 0.00690327791308957 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503454:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000506600:exon_10256067_10256265:CCT5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 10262740 C/A 1 10 6 16 4.7143996185967 3.17136022884198 1.54303938975472 A:C C A 10 0.52856003814033 0.466348600091948 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 14741984 T/C 1 3 6 9 1.41431988557901 3.17136022884198 -1.75704034326297 T:C T C 10 0.52856003814033 0.322282730829835 ENSG00000154122:ENST00000284268:exon_14741936_14742031:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000503939:exon_14741936_14742031:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000515517:exon_14741566_14742031:ANKH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 33461355 G/A 1 123 113 236 57.9871153087394 59.7272843098573 -1.74016900111789 A:G G A 10 0.52856003814033 0.845042316647442 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33461263_33461400:TARS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 33989518 C/T 1 10 5 15 4.7143996185967 2.64280019070165 2.07159942789505 T:C C T 10 0.52856003814033 0.313640302764783 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 34008100 C/T 1 1 8 9 0.47143996185967 4.22848030512264 -3.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0159780666639568 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_34007878_34008213:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_34007878_34008136:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_34007878_34008133:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_34007878_34008209:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_34007878_34008189:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_34007878_34008133:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_34007878_34008133:AMACR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 36985303 A/G 1 16 8 24 7.54303938975472 4.22848030512264 3.31455908463208 A:G A G 10 0.52856003814033 0.220702538987053 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 42800808 C/T 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 43297144 A/G 1 16 15 31 7.54303938975472 7.92840057210495 -0.385361182350231 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43297104_43297268:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43297104_43297268:HMGCS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 52942197 A/G 1 36 29 65 16.9718386269481 15.3282411060696 1.64359752087855 A:G A G 10 0.52856003814033 0.710918152525052 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506765:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000509443:exon_52942025_52942235:NDUFS4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 54674296 A/G 1 6 5 11 2.82863977115802 2.64280019070165 0.18583958045637 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54674142_54674314:SKIV2L2;ENSG00000039123:ENST00000506750:exon_54674142_54674314:SKIV2L2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 55246001 A/G 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 A:G A G 10 0.52856003814033 0.295468489539448 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 25 7 32 11.7859990464917 3.69992026698231 8.08607877950944 T:C T C 10 0.52856003814033 0.00417894855055111 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 66478729 A/G 1 8 11 19 3.77151969487736 5.81416041954363 -2.04264072466627 A:G A G 10 0.52856003814033 0.367905468198703 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 11 12 23 5.18583958045637 6.34272045768396 -1.15688087722759 A:T A T 10 0.52856003814033 0.67969531497135 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 68524133 A/G 1 20 24 44 9.4287992371934 12.6854409153679 -3.25664167817452 A:G A G 10 0.52856003814033 0.366178751854652 ENSG00000134056:ENST00000256441:exon_68524027_68524214:MRPS36;ENSG00000134056:ENST00000507022:exon_68524027_68524214:MRPS36;ENSG00000134056:ENST00000512880:exon_68524027_68524214:MRPS36 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 68695940 T/G 1 17 19 36 8.01447935161439 10.0426407246663 -2.02816137305188 T:G T G 10 0.52856003814033 0.509527565956857 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000513214:exon_68695876_68695996:RAD17 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 70785301 G/A 1 10 12 22 4.7143996185967 6.34272045768396 -1.62832083908726 A:G G A 10 0.52856003814033 0.527192616710381 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70785231_70785509:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70785231_70785509:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70785231_70785509:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70785231_70785509:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70785231_70785509:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70785231_70785509:BDP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 20 15 35 9.4287992371934 7.92840057210495 1.50039866508845 A:G G A 10 0.52856003814033 0.735465815093857 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 15 14 29 7.07159942789505 7.39984053396462 -0.328241106069571 A:T T A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 70806711 C/G 1 16 20 36 7.54303938975472 10.5712007628066 -3.02816137305188 C:G C G 10 0.52856003814033 0.322011772212768 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 70806958 G/A 1 8 10 18 3.77151969487736 5.2856003814033 -1.51408068652594 A:G G A 10 0.52856003814033 0.490005542254718 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 70809169 A/G 1 7 4 11 3.30007973301769 2.11424015256132 1.18583958045637 A:G A G 10 0.52856003814033 0.556140452563778 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70809012_70809234:BDP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 70945075 A/G 1 10 18 28 4.7143996185967 9.51408068652594 -4.79968106792924 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0875342887255213 ENSG00000131844:ENST00000512218:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000323375:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000340941:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000509539:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000505435:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000508703:exon_70944924_70945080:MCCC2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 72182857 A/G 1 1 9 10 0.47143996185967 4.75704034326297 -4.2856003814033 A:G A G 10 0.52856003814033 0.00832466243874547 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 72184098 C/T 1 7 1 8 3.30007973301769 0.52856003814033 2.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0738868803430894 ENSG00000083312:ENST00000337273:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000454282:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000415341:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000523768:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000396346:exon_72183954_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000447967:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000506351:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000519220:exon_72184065_72184130:TNPO1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 72798845 A/G 1 456 464 920 214.97662260801 245.251857697113 -30.2752350891036 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0475161999651644 ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 74970236 G/A 1 5 8 13 2.35719980929835 4.22848030512264 -1.87128049582429 A:G G A 10 0.52856003814033 0.406604439196984 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_74969949_74970403:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_74970015_74970403:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_74970033_74970403:POC5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 75003678 T/C 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000507421:exon_75003309_75003700:POC5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 15 17 32 7.07159942789505 8.98552064838561 -1.91392122049056 A:C C A 10 0.52856003814033 0.596081373087417 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 13 11 24 6.12871950417571 5.81416041954363 0.314559084632079 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 82500734 G/T 1 14 12 26 6.60015946603538 6.34272045768396 0.25743900835142 T:G G T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000514538:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000509268:exon_82500634_82500740:XRCC4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 138 98 236 65.0587147366345 51.7988837377523 13.2598309988821 A:G A G 10 0.52856003814033 0.089977500724869 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 95234350 A/G 1 14 5 19 6.60015946603538 2.64280019070165 3.95735927533373 A:G A G 10 0.52856003814033 0.105318095857354 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 95234377 C/T 1 14 8 22 6.60015946603538 4.22848030512264 2.37167916091274 T:C C T 10 0.52856003814033 0.39453671919514 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 95234392 A/C 1 16 4 20 7.54303938975472 2.11424015256132 5.4287992371934 A:C A C 10 0.52856003814033 0.022596855211574 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 95236415 G/A 1 6 7 13 2.82863977115802 3.69992026698231 -0.87128049582429 A:G G A 10 0.52856003814033 0.782861958075039 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 96076487 G/A 1 24 1 25 11.3145590846321 0.52856003814033 10.7859990464917 A:G G A 10 0.52856003814033 5.56587648506125e-06 ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000421689:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512620:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96076449_96076487:CAST HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 96112083 T/G 1 14 14 28 6.60015946603538 7.39984053396462 -0.799681067929241 A:T:G T G 10 0.52856003814033 0.850610910526834 ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96110188_96112255:ERAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 7 2 9 3.30007973301769 1.05712007628066 2.24295965673703 T:G G T 10 0.52856003814033 0.186100445119176 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 15 1 16 7.07159942789505 0.52856003814033 6.54303938975472 T:C C T 10 0.52856003814033 0.000679491512456453 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 40 5 45 18.8575984743868 2.64280019070165 16.2147982836851 T:C C T 10 0.52856003814033 5.16175189399874e-07 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 45 2 47 21.2147982836851 1.05712007628066 20.1576782074045 T:C C T 10 0.52856003814033 9.81766385633276e-11 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 25 9 34 11.7859990464917 4.75704034326297 7.02895870322878 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0161485997173199 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 37 41 78 17.4432785888078 21.6709615637535 -4.22768297494574 T:C C T 10 0.52856003814033 0.365115165028132 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 115428381 T/G 1 8 4 12 3.77151969487736 2.11424015256132 1.65727954231604 T:G T G 10 0.52856003814033 0.397101977790935 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 122682348 A/G 1 6 7 13 2.82863977115802 3.69992026698231 -0.87128049582429 A:G A G 10 0.52856003814033 0.782861958075039 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 125939409 C/T 1 41 23 64 19.3290384362465 12.1568808772276 7.17215755901888 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0798205243994705 ENSG00000164902:ENST00000297540:exon_125939262_125939875:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000514725:exon_125939266_125939756:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000456348:exon_125939262_125939534:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000505674:exon_125939253_125939875:PHAX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 7 16 23 3.30007973301769 8.45696061024528 -5.15688087722759 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0365130375762073 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 132094205 G/A 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132091697_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132092025_132094699:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132093835_132094516:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378701:exon_132093836_132094248:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000458488:exon_132093892_132094248:SEPT8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 132334252 A/G 1 12 18 30 5.65727954231604 9.51408068652594 -3.8568011442099 A:G A G 10 0.52856003814033 0.200232689278046 ENSG00000155329:ENST00000324170:exon_132332677_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000355372:exon_132332688_132334524:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509437:exon_132333792_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513848:exon_132333904_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513541:exon_132334100_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000508080:exon_132334105_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509008:exon_132334220_132334542:ZCCHC10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 134076812 G/A 1 30 27 57 14.1431988557901 14.2711210297889 -0.127922173998813 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000164615:ENST00000297156:exon_134076753_134077213:CAMLG HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 134223593 A/G 1 16 16 32 7.54303938975472 8.45696061024528 -0.913921220490561 A:G A G 10 0.52856003814033 0.859846792144475 ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134223465_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506916:exon_134223391_134223752:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508810:exon_134223385_134223870:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134223385_134223872:TXNDC15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 134364518 C/G 1 7 1 8 3.30007973301769 0.52856003814033 2.77151969487736 T:C:G C T 10 0.52856003814033 0.0738868803430894 ENSG00000069011:ENST00000265340:exon_134363424_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000506438:exon_134364243_134365011:PITX1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 11 10 21 5.18583958045637 5.2856003814033 -0.0997608009469308 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 138856982 C/T 1 13 2 15 6.12871950417571 1.05712007628066 5.07159942789505 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00876656408784868 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138856953_138857100:TMEM173 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 138857925 C/G 1 8 6 14 3.77151969487736 3.17136022884198 0.60015946603538 C:G C G 10 0.52856003814033 0.795264899593225 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 139938337 G/A 1 10 24 34 4.7143996185967 12.6854409153679 -7.97104129677122 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0089383292284221 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139937853_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000358580:exon_139937854_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139937857_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139937979_139938406:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139938170_139938406:APBB3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 140021482 C/T 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000113119:ENST00000394671:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000513002:exon_140021455_140021650:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000511410:exon_140021250_140021970:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000514449:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000505086:exon_140021455_140021922:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000252100:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000510336:exon_140021455_140021638:TMCO6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 140023238 C/G 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 C:G C G 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000113119:ENST00000394671:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000252100:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000510336:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000509605:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000515265:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000509269:exon_140022948_140023260:TMCO6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 140057535 G/A 1 41 38 79 19.3290384362465 20.0852814493325 -0.756243013086074 A:G G A 10 0.52856003814033 0.910471596086302 ENSG00000170445:ENST00000504156:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000457527:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000431330:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000504366:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000307633:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000448240:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000438307:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000415192:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512655:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000506579:exon_140057240_140058712:HARS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 141014494 T/C 1 14 23 37 6.60015946603538 12.1568808772276 -5.55672141119221 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0716828267972412 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141014378_141014731:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141014378_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141014460_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141014378_141014520:HDAC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 141309824 G/A 1 19 14 33 8.95735927533373 7.39984053396462 1.55751874136911 A:G G A 10 0.52856003814033 0.606360395334725 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000502729:exon_141309812_141309839:KIAA0141 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 145499996 C/T 1 81 94 175 38.1866369106333 49.684643585191 -11.4980066745578 T:C:G C T 10 0.52856003814033 0.0954767106843589 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145499934_145500066:LARS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 145508340 A/G 1 20 16 36 9.4287992371934 8.45696061024528 0.971838626948118 A:G A G 10 0.52856003814033 0.867744765296129 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145508235_145508345:LARS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 145519821 G/A 1 26 19 45 12.2574390083514 10.0426407246663 2.21479828368515 A:G G A 10 0.52856003814033 0.552516028611383 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000512412:exon_145519767_145519824:LARS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 145523105 G/A 1 28 20 48 13.2003189320708 10.5712007628066 2.62911816926416 A:G G A 10 0.52856003814033 0.473002037760409 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000514104:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000504323:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508667:exon_145522807_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000507095:exon_145523050_145523113:LARS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 145539996 T/G 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 T:G T G 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145539937_145540049:LARS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 149776232 C/T 1 79 83 162 37.2437569869139 43.8704831656474 -6.62672617873346 T:C:G C T 10 0.52856003814033 0.307024387102731 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149775845_149776405:TCOF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 149792113 G/A 1 8 7 15 3.77151969487736 3.69992026698231 0.0715994278950496 A:G G A 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 149792135 G/A 1 7 4 11 3.30007973301769 2.11424015256132 1.18583958045637 A:G G A 10 0.52856003814033 0.556140452563778 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 149792337 C/T 1 15 21 36 7.07159942789505 11.0997608009469 -4.02816137305188 T:C C T 10 0.52856003814033 0.186077966715380 ENSG00000019582:ENST00000353334:exon_149792188_149792492:CD74;ENSG00000019582:ENST00000517791:exon_149792188_149792475:CD74 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 149826526 C/T 1 3826 3689 7515 1803.7292940751 1949.85798069968 -146.12868662458 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.00074064457885154 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 149827098 G/A 1 7 7 14 3.30007973301769 3.69992026698231 -0.39984053396462 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 150415196 G/A 1 52 51 103 24.5148780167028 26.9565619451568 -2.44168392845399 A:G G A 10 0.52856003814033 0.693212635738647 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000517504:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522574:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000517329:exon_150415143_150415215:TNIP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 150429444 G/A 1 40 44 84 18.8575984743868 23.2566416781745 -4.39904320378772 A:T:G G A 10 0.52856003814033 0.382139101687346 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521423:exon_150429385_150429464:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150429385_150429508:TNIP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 150429452 G/A 1 40 45 85 18.8575984743868 23.7852017163149 -4.92760324192805 A:G G A 10 0.52856003814033 0.328234115584296 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150429385_150429508:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521423:exon_150429385_150429464:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150429385_150429508:TNIP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 150578574 A/G 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 151043103 G/C 1 18 38 56 8.48591931347406 20.0852814493325 -11.5993621358585 C:G G C 10 0.52856003814033 0.00196986522488314 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151040657_151043160:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000520687:exon_151042049_151043160:SPARC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 153372525 G/A 1 14 15 29 6.60015946603538 7.92840057210495 -1.32824110606957 A:G G A 10 0.52856003814033 0.7109964573597 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153369688_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153371263_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153372059_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153372066_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518914:exon_153372248_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518946:exon_153372274_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153372515_153372670:FAM114A2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 154275786 G/A 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154275652_154275903:GEMIN5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 154346259 A/G 1 100 97 197 47.143996185967 51.270323699612 -4.12632751364502 A:G A G 10 0.52856003814033 0.568647159305288 ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154346246_154346526:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154346246_154346528:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154346246_154346453:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000520040:exon_154346246_154346505:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000518364:exon_154346246_154346531:MRPL22 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 15 10 25 7.07159942789505 5.2856003814033 1.78599904649175 A:G A G 10 0.52856003814033 0.550569951685472 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 162896650 C/T 1 20 8 28 9.4287992371934 4.22848030512264 5.20031893207076 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.0579776465631215 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000520345:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000522094:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162896647_162896712:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000517936:exon_162896647_162896916:HMMR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 162909716 C/T 1 37 21 58 17.4432785888078 11.0997608009469 6.34351778786086 T:C C T 10 0.52856003814033 0.114050777973072 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162909648_162909794:HMMR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 162940999 A/G 1 20 17 37 9.4287992371934 8.98552064838561 0.443278588807788 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000038274:ENST00000280969:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000415433:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000321757:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000421814:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000518095:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000523606:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000520449:exon_162940848_162941000:MAT2B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 167937607 G/A 1 37 41 78 17.4432785888078 21.6709615637535 -4.22768297494574 A:G G A 10 0.52856003814033 0.365115165028132 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167937586_167937691:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167937586_167937691:RARS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 167943827 G/A 1 59 53 112 27.8149577497205 28.0136820214375 -0.198724271716966 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167943783_167943955:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167943783_167943955:RARS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 171523436 G/A 1 28 28 56 13.2003189320708 14.7996810679292 -1.59936213585848 A:G G A 10 0.52856003814033 0.689847368438491 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171523430_171523564:STK10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 T:G G T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 12 10 22 5.65727954231604 5.2856003814033 0.371679160912739 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 176491539 T/G 1 8 5 13 3.77151969487736 2.64280019070165 1.12871950417571 T:G T G 10 0.52856003814033 0.589189446313547 ENSG00000113761:ENST00000358149:exon_176491513_176492986:ZNF346;ENSG00000113761:ENST00000506693:exon_176491513_176492242:ZNF346;ENSG00000113761:ENST00000512315:exon_176491513_176491602:ZNF346;ENSG00000113761:ENST00000503425:exon_176491513_176491967:ZNF346;ENSG00000113761:ENST00000508155:exon_176491513_176492459:ZNF346;ENSG00000113761:ENST00000261948:exon_176491513_176492975:ZNF346;ENSG00000113761:ENST00000511834:exon_176491513_176492966:ZNF346;ENSG00000113761:ENST00000513587:exon_176491513_176492019:ZNF346;ENSG00000113761:ENST00000503039:exon_176491513_176491602:ZNF346 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 176721198 T/C 1 13 10 23 6.12871950417571 5.2856003814033 0.843119122772409 T:C T C 10 0.52856003814033 0.83562946433756 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 176733116 A/G 1 243 243 486 114.5599107319 128.4400892681 -13.8801785362004 A:G A G 10 0.52856003814033 0.219897559833803 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000511309:exon_176732872_176733148:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510797:exon_176733099_176733154:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503853:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510701:exon_176733099_176733164:PRELID1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 176733616 T/C 1 383 317 700 180.561505392254 167.553532090485 13.007973301769 A:T:C T C 10 0.52856003814033 0.343921261122105 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733423_176733960:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733423_176733670:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733456_176733950:PRELID1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 176734855 G/C 1 28 33 61 13.2003189320708 17.4424812586309 -4.24216232656013 C:G G C 10 0.52856003814033 0.305780515326655 ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000509339:exon_176734782_176735063:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513169:exon_176734814_176734965:MXD3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 176737720 A/G 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 A:G A G 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176737427_176738485:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176737427_176738485:MXD3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 176915143 C/T 1 10 20 30 4.7143996185967 10.5712007628066 -5.8568011442099 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0427542793504863 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176914898_176915249:PDLIM7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 176931706 G/C 1 3 6 9 1.41431988557901 3.17136022884198 -1.75704034326297 C:G G C 10 0.52856003814033 0.322282730829835 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 1 4128 5 4133 1946.10416255672 2.64280019070165 1943.46136236602 A:T:C T C 10 0.52856003814033 4.94065645841247e-324 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 177483184 A/G 1 15 3 18 7.07159942789505 1.58568011442099 5.48591931347406 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0092464057660211 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 177652392 T/C 1 5 11 16 2.35719980929835 5.81416041954363 -3.45696061024528 T:C T C 10 0.52856003814033 0.130508776647043 ENSG00000175309:ENST00000308158:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000481436:exon_177652356_177653080:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000489262:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000493197:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000494126:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000510913:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000514424:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000323594:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000506001:exon_177652356_177652430:AGXT2L2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 178140090 C/T 1 3 9 12 1.41431988557901 4.75704034326297 -3.34272045768396 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0796439798478496 ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 46 45 91 21.6862382455448 23.7852017163149 -2.09896347077003 A:G G A 10 0.52856003814033 0.67565616246734 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 179036457 G/C 1 50 49 99 23.5719980929835 25.8994418688762 -2.32744377589267 C:G G C 10 0.52856003814033 0.68752440738687 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 44 39 83 20.7433583218255 20.6138414874729 0.129516834352607 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 180219984 C/T 1 5 7 12 2.35719980929835 3.69992026698231 -1.34272045768396 T:C C T 10 0.52856003814033 0.566216755054812 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000504671:exon_180219373_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000506889:exon_180219511_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000514283:exon_180219590_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000512695:exon_180219625_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000506269:exon_180219638_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000514438:exon_180219658_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000502678:exon_180219662_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000513431:exon_180219686_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000507384:exon_180219870_180220097:MGAT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 5 180665065 G/C 1 16 10 26 7.54303938975472 5.2856003814033 2.25743900835142 C:G G C 10 0.52856003814033 0.435111822543937 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 348181 C/A 1 18 10 28 8.48591931347406 5.2856003814033 3.20031893207076 A:C C A 10 0.52856003814033 0.259092327813496 ENSG00000112679:ENST00000457386:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000419235:exon_348103_348274:DUSP22 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 16 253 269 7.54303938975472 133.725689649503 -126.182650259749 A:G G A 10 0.52856003814033 2.21787690259404e-62 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 564145 A/G 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_564033_564154:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_564033_564154:EXOC2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 14 23 37 6.60015946603538 12.1568808772276 -5.55672141119221 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0716828267972412 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 4032373 G/A 1 64 83 147 30.1721575590189 43.8704831656474 -13.6983256066285 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0255812636349119 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 5431340 A/G 1 9 3 12 4.24295965673703 1.58568011442099 2.65727954231604 A:G A G 10 0.52856003814033 0.153869078916603 ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000445533:exon_5431274_5431405:FARS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 7310259 A/G 1 11 11 22 5.18583958045637 5.81416041954363 -0.628320839087261 A:G A G 10 0.52856003814033 0.83325131156315 ENSG00000124783:ENST00000474597:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000244763:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000397511:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000489567:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000479365:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000462112:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000488834:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000483409:exon_7310150_7310262:SSR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 10702799 G/A 1 17 13 30 8.01447935161439 6.87128049582429 1.1431988557901 A:G G A 10 0.52856003814033 0.717865637118853 ENSG00000111845:ENST00000379568:exon_10702798_10702872:PAK1IP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 13470412 C/T 1 13 6 19 6.12871950417571 3.17136022884198 2.95735927533373 T:C C T 10 0.52856003814033 0.25018193083756 ENSG00000187461:ENST00000379278:exon_13469507_13470862:C6orf114 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 13599303 C/T 1 1 8 9 0.47143996185967 4.22848030512264 -3.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0159780666639568 ENSG00000124523:ENST00000379262:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000397350:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13599264_13599387:SIRT5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 13794147 C/T 1 29 25 54 13.6717588939304 13.2140009535083 0.457757940422178 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13794126_13794179:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13794126_13794179:CCDC90A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 16306866 G/A 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 17629616 G/A 1 18 10 28 8.48591931347406 5.2856003814033 3.20031893207076 A:G G A 10 0.52856003814033 0.259092327813496 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17628886_17629770:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17628886_17629770:NUP153 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 24403455 C/T 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24403420_24403464:MRS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 24418786 T/C 1 10 12 22 4.7143996185967 6.34272045768396 -1.62832083908726 T:C T C 10 0.52856003814033 0.527192616710381 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418689_24419469:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418689_24418791:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418689_24418789:MRS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 10 8 18 4.7143996185967 4.22848030512264 0.485919313474059 C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 27775674 A/G 1 9 7 16 4.24295965673703 3.69992026698231 0.54303938975472 A:G A G 10 0.52856003814033 0.808687083852748 ENSG00000185130:ENST00000377401:exon_27775257_27775709:HIST1H2BL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 27839746 T/C 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 T:C T C 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000182572:ENST00000328488:exon_27839683_27840093:HIST1H3I HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 28097193 G/A 1 6 9 15 2.82863977115802 4.75704034326297 -1.92840057210495 A:G G A 10 0.52856003814033 0.439187658248891 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 28200409 A/G 1 8 8 16 3.77151969487736 4.22848030512264 -0.456960610245281 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000137185:ENST00000425468:exon_28200340_28201244:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000252207:exon_28200340_28201244:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000531979:exon_28200340_28201260:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000527844:exon_28200340_28200793:ZNF193 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 28269663 A/G 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 A:G A G 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 29910402 G/A 1 137 19 156 64.5872747747748 10.0426407246663 54.5446340501085 A:G G A 10 0.52856003814033 1.81553134321092e-20 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910331_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910331_29910403:HLA-A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 29911360 A/G 1 2 8 10 0.94287992371934 4.22848030512264 -3.2856003814033 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0541817455657943 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 29912297 A/G 1 7 119 126 3.30007973301769 62.8986445386993 -59.5985648056816 A:G A G 10 0.52856003814033 1.49116530791931e-30 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 0 306 0 306 144.260628329059 0 144.260628329059 A A 10 0.52856003814033 1.97252684006354e-85 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 29912386 G/C 1 1 229 230 0.47143996185967 121.040248734136 -120.568808772276 C:G G C 10 0.52856003814033 2.00053922040521e-73 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 45 86 131 21.2147982836851 45.4561632800684 -24.2413649963832 A:G A G 10 0.52856003814033 2.27056225362294e-05 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 21 30 51 9.90023919905307 15.8568011442099 -5.95656194515683 A:C C A 10 0.52856003814033 0.122039342634904 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 30313268 G/A 0 0 50 50 0 26.4280019070165 -26.4280019070165 A G A 10 0.52856003814033 4.69158563209546e-17 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 30460232 C/T 1 11 5 16 5.18583958045637 2.64280019070165 2.54303938975472 T:C C T 10 0.52856003814033 0.222015324368485 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 16 21 37 7.54303938975472 11.0997608009469 -3.55672141119221 A:G G A 10 0.52856003814033 0.253370797269923 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 30530245 T/C 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 T:C T C 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 30680916 C/T 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30680733_30681131:MDC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 11 5 16 5.18583958045637 2.64280019070165 2.54303938975472 T:C C T 10 0.52856003814033 0.222015324368485 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 7 11 18 3.30007973301769 5.81416041954363 -2.51408068652594 A:C A C 10 0.52856003814033 0.24852778175064 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 30888161 T/C 1 3 7 10 1.41431988557901 3.69992026698231 -2.2856003814033 T:C T C 10 0.52856003814033 0.206826979960111 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 7 9 16 3.30007973301769 4.75704034326297 -1.45696061024528 T:C T C 10 0.52856003814033 0.618027034384742 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 15 11 26 7.07159942789505 5.81416041954363 1.25743900835142 A:G G A 10 0.52856003814033 0.696829234380297 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 30893728 C/T 1 33 37 70 15.5575187413691 19.5567214111922 -3.9992026698231 T:C C T 10 0.52856003814033 0.341423642864554 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893657_30893785:VARS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31110786 T/A 1 36 42 78 16.9718386269481 22.1995216018939 -5.22768297494574 A:T T A 10 0.52856003814033 0.257394176145260 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110740_31110911:CCHCR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31116220 G/A 1 11 9 20 5.18583958045637 4.75704034326297 0.4287992371934 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 A:G G A 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31118511 T/G 1 10 6 16 4.7143996185967 3.17136022884198 1.54303938975472 T:G T G 10 0.52856003814033 0.466348600091948 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 6 7 13 2.82863977115802 3.69992026698231 -0.87128049582429 C:G G C 10 0.52856003814033 0.782861958075039 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31122330 G/A 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 A:G G A 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31238068 C/T 1 39 4 43 18.3861585125271 2.11424015256132 16.2719183599658 T:C C T 10 0.52856003814033 1.25949416797410e-07 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237987_31238199:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31237987_31238262:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31237991_31238108:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31237998_31238262:HLA-C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31322367 T/G 1 28 11 39 13.2003189320708 5.81416041954363 7.38615851252713 T:G T G 10 0.52856003814033 0.0235276717445309 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 28 7 35 13.2003189320708 3.69992026698231 9.50039866508845 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00111378477211156 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 32 2 34 15.0860787795094 1.05712007628066 14.0289587032288 T:C T C 10 0.52856003814033 2.56092894951878e-07 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31322855 C/T 1 39 18 57 18.3861585125271 9.51408068652594 8.87207782600119 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0233051861564432 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 1732 980 2712 816.534013940948 517.988837377523 298.545176563425 A:T:C:G C T 10 0.52856003814033 5.96756746106829e-31 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31540556 T/C 1 43 35 78 20.2719183599658 18.4996013349116 1.77231702505426 T:C T C 10 0.52856003814033 0.734346044018412 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 80 85 165 37.7151969487736 44.9276032419281 -7.21240629315446 A:C C A 10 0.52856003814033 0.275350924100397 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31550213 A/G 1 5 13 18 2.35719980929835 6.87128049582429 -4.51408068652594 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0558100460820762 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 62 63 125 29.2292776352995 33.2992824028408 -4.07000476754126 A:G G A 10 0.52856003814033 0.474860767041552 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 117 107 224 55.1584755375814 56.5559240810153 -1.39744854343392 A:C:G C G 10 0.52856003814033 0.893565449401892 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 29 18 47 13.6717588939304 9.51408068652594 4.15767820740449 C:G G C 10 0.52856003814033 0.244750359183006 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 30 34 64 14.1431988557901 17.9710412967712 -3.82784244098112 A:G A G 10 0.52856003814033 0.381281089357753 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31626928 T/C 1 18 12 30 8.48591931347406 6.34272045768396 2.1431988557901 T:C T C 10 0.52856003814033 0.469352400778903 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31627449 C/G 1 18 22 40 8.48591931347406 11.6283208390873 -3.1424015256132 C:G C G 10 0.52856003814033 0.344841727872767 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 29 39 68 13.6717588939304 20.6138414874729 -6.94208259354244 T:C C T 10 0.52856003814033 0.113681442495344 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 106 142 248 49.972635957125 75.0555254159269 -25.0828894588019 T:C T C 10 0.52856003814033 0.00145270206723307 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31639655 T/C 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 T:C T C 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31639657 C/T 1 8 4 12 3.77151969487736 2.11424015256132 1.65727954231604 T:C C T 10 0.52856003814033 0.397101977790935 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 22 15 37 10.3716791609127 7.92840057210495 2.44327858880779 A:G A G 10 0.52856003814033 0.510821809807751 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31731881 C/T 1 18 24 42 8.48591931347406 12.6854409153679 -4.19952160189386 T:C C T 10 0.52856003814033 0.217614063074012 ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000228727:ENST00000433778:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000415669:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000425424:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000494299:exon_31731397_31731936:C6orf26 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 59 51 110 27.8149577497205 26.9565619451568 0.858395804563695 A:G G A 10 0.52856003814033 0.924012709884023 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31807489 C/T 1 23 30 53 10.8431191227724 15.8568011442099 -5.01368202143749 T:C C T 10 0.52856003814033 0.171920691879876 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 31936552 T/C 1 53 45 98 24.9863179785625 23.7852017163149 1.20111626224766 T:C T C 10 0.52856003814033 0.840107649155966 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936400_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936463_31936573:SKIV2L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32088854 G/C 1 21 26 47 9.90023919905307 13.7425609916486 -3.84232179259551 C:G G C 10 0.52856003814033 0.306804627180626 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32088766_32088901:ATF6B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 74 88 162 34.8865571776156 46.513283356349 -11.6267261787335 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0704552528777919 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32410941 T/C 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 1468 1501 2969 692.073864009996 793.368617248635 -101.29475323864 A:C:G A C 10 0.52856003814033 0.00020371406281905 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 13 4 17 6.12871950417571 2.11424015256132 4.01447935161439 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0552329538663803 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 4497 3426 7923 2120.06550848294 1810.84669066877 309.218817814165 A:T:C:G T G 10 0.52856003814033 3.19575109188272e-12 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32411726 G/A 1 10 1 11 4.7143996185967 0.52856003814033 4.18583958045637 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0131344150402337 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32605288 T/C 0 24 0 24 11.3145590846321 0 11.3145590846321 T T 10 0.52856003814033 2.40609786822856e-07 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32605295 C/T 0 24 0 24 11.3145590846321 0 11.3145590846321 C C 10 0.52856003814033 2.40609786822856e-07 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32632832 A/T 1 1 13 14 0.47143996185967 6.87128049582429 -6.39984053396462 A:T A T 10 0.52856003814033 0.000580126744443419 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000529407:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 17 31 48 8.01447935161439 16.3853611823502 -8.37088183073584 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0198552449201022 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 21 27 48 9.90023919905307 14.2711210297889 -4.37088183073584 A:C C A 10 0.52856003814033 0.24742095911044 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32811645 A/G 1 102 119 221 48.0868761096863 62.8986445386993 -14.8117684290129 A:T:G A G 10 0.52856003814033 0.0505409208810493 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 167 126 293 78.7304736305649 66.5985648056816 12.1319088248833 T:C T C 10 0.52856003814033 0.160495064406751 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 53 47 100 24.9863179785625 24.8423217925955 0.143996185966994 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32826233 A/G 1 296 274 570 139.546228710462 144.82545045045 -5.27922173998812 A:T:G A G 10 0.52856003814033 0.674899291407272 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32826141_32826677:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000395333:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32826141_32826499:PSMB9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 32974551 G/T 1 39 38 77 18.3861585125271 20.0852814493325 -1.69912293680541 T:G G T 10 0.52856003814033 0.732763252674303 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32971955_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32971959_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32973372_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974384_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974523_32974618:HLA-DOA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 1 962 392 1354 453.525243309003 207.195534951009 246.329708357993 A:G A G 10 0.52856003814033 1.83401441731031e-42 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 33052981 C/A 1 853 889 1742 402.138287466298 469.889873906753 -67.7515864404549 A:C:G C A 10 0.52856003814033 0.00119150396317205 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 33179689 C/T 1 22 15 37 10.3716791609127 7.92840057210495 2.44327858880779 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.510821809807751 ENSG00000204227:ENST00000374656:exon_33179506_33179779:RING1;ENSG00000204227:ENST00000478431:exon_33179506_33179779:RING1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 41162518 T/C 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000112195:ENST00000373108:exon_41162163_41162571:TREML2;ENSG00000112195:ENST00000483722:exon_41162163_41162571:TREML2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 141 141 282 66.4730346222135 74.5269653777865 -8.05393075557308 T:C C T 10 0.52856003814033 0.34054384557152 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 118 108 226 55.6299154994411 57.0844841191556 -1.45456861971459 T:C T C 10 0.52856003814033 0.894029424913755 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 43013395 C/T 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43013325_43013420:CUL7;ENSG00000044090:ENST00000478630:exon_43013325_43013420:CUL7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 43492578 G/A 1 50 30 80 23.5719980929835 15.8568011442099 7.7151969487736 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0930465338664083 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 43968814 A/G 1 7 7 14 3.30007973301769 3.69992026698231 -0.39984053396462 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43968317_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43968754_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43968711_43968880:C6orf223 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 250 208 458 117.859990464917 109.940487933189 7.91950253172884 A:G G A 10 0.52856003814033 0.482708271200718 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 51 53 104 24.0434380548432 28.0136820214375 -3.97024396659432 T:G G T 10 0.52856003814033 0.491932672433726 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 44371714 C/T 1 24 18 42 11.3145590846321 9.51408068652594 1.80047839810614 T:C C T 10 0.52856003814033 0.644219020860247 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 52268890 G/A 1 5 8 13 2.35719980929835 4.22848030512264 -1.87128049582429 A:G G A 10 0.52856003814033 0.406604439196984 ENSG00000170915:ENST00000442253:exon_52267960_52272575:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000361841:exon_52267960_52272574:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000360726:exon_52267960_52272489:PAQR8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 56484758 C/T 1 9 3 12 4.24295965673703 1.58568011442099 2.65727954231604 T:C C T 10 0.52856003814033 0.153869078916603 ENSG00000151914:ENST00000370765:exon_56482784_56485513:DST;ENSG00000151914:ENST00000281662:exon_56482784_56485513:DST HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 10 0 10 4.7143996185967 0 4.7143996185967 G G 10 0.52856003814033 0.00224426647978634 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 8 8 0 4.22848030512264 -4.22848030512264 G A G 10 0.52856003814033 0.00244011976995637 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 1 1 13 14 0.47143996185967 6.87128049582429 -6.39984053396462 A:G G A 10 0.52856003814033 0.000580126744443419 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 9 0 9 4.24295965673703 0 4.24295965673703 C C 10 0.52856003814033 0.00437031847588073 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 57512678 G/A 0 0 15 15 0 7.92840057210495 -7.92840057210495 A G A 10 0.52856003814033 1.26297831610302e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 T:C C T 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 74125875 A/G 0 0 8 8 0 4.22848030512264 -4.22848030512264 G A G 10 0.52856003814033 0.00244011976995637 ENSG00000080007:ENST00000370336:exon_74125836_74125974:DDX43 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 74125888 A/G 0 0 10 10 0 5.2856003814033 -5.2856003814033 G A G 10 0.52856003814033 0.000542330375385347 ENSG00000080007:ENST00000370336:exon_74125836_74125974:DDX43 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 22 8 30 10.3716791609127 4.22848030512264 6.1431988557901 T:C C T 10 0.52856003814033 0.027714428285441 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 10 5 15 4.7143996185967 2.64280019070165 2.07159942789505 A:T A T 10 0.52856003814033 0.313640302764783 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 12 6 18 5.65727954231604 3.17136022884198 2.48591931347406 A:G G A 10 0.52856003814033 0.345436270087802 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 79675701 A/G 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79675662_79675773:PHIP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 79692751 G/A 1 33 27 60 15.5575187413691 14.2711210297889 1.2863977115802 A:G G A 10 0.52856003814033 0.796574461921546 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79692603_79692834:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79692603_79692834:PHIP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 83075914 G/A 1 2 12 14 0.94287992371934 6.34272045768396 -5.39984053396462 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00530328487690469 ENSG00000146242:ENST00000369750:exon_83074340_83080545:TPBG HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 15 16 31 7.07159942789505 8.45696061024528 -1.38536118235023 T:C C T 10 0.52856003814033 0.719780004878637 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 83881740 T/C 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83881639_83881778:PGM3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 84650310 A/G 1 12 14 26 5.65727954231604 7.39984053396462 -1.74256099164858 A:G A G 10 0.52856003814033 0.558131650023887 ENSG00000065615:ENST00000369681:exon_84650234_84650320:CYB5R4;ENSG00000065615:ENST00000479164:exon_84650234_84650320:CYB5R4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 87969480 G/A 1 26 32 58 12.2574390083514 16.9139212204906 -4.65648221213914 A:G G A 10 0.52856003814033 0.238010145520756 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 88224164 T/C 1 17 9 26 8.01447935161439 4.75704034326297 3.25743900835142 T:C T C 10 0.52856003814033 0.240423666471852 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88224098_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000493269:exon_88224125_88224217:RARS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 90039670 G/C 1 126 108 234 59.4014351943184 57.0844841191556 2.31695107516277 C:G G C 10 0.52856003814033 0.793529694120688 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90039279_90039676:UBE2J1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 90340734 G/A 1 7 3 10 3.30007973301769 1.58568011442099 1.7143996185967 A:G G A 10 0.52856003814033 0.351744435761646 ENSG00000135299:ENST00000369408:exon_90340152_90343553:ANKRD6;ENSG00000135299:ENST00000339746:exon_90340152_90341302:ANKRD6;ENSG00000135299:ENST00000447838:exon_90340152_90341216:ANKRD6;ENSG00000135299:ENST00000522441:exon_90340152_90341055:ANKRD6;ENSG00000135299:ENST00000520793:exon_90340152_90341219:ANKRD6;ENSG00000135299:ENST00000518253:exon_90340152_90341196:ANKRD6;ENSG00000135299:ENST00000415924:exon_90340152_90343373:ANKRD6;ENSG00000135299:ENST00000479572:exon_90340152_90341217:ANKRD6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 90348407 G/T 1 10 18 28 4.7143996185967 9.51408068652594 -4.79968106792924 T:G G T 10 0.52856003814033 0.0875342887255213 ENSG00000083099:ENST00000412237:exon_90348391_90348453:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520441:exon_90348391_90348453:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523377:exon_90348391_90348472:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520318:exon_90348391_90348468:LYRM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 49 53 102 23.1005581311238 28.0136820214375 -4.91312389031366 A:G A G 10 0.52856003814033 0.372196164634706 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 9 9 18 4.24295965673703 4.75704034326297 -0.51408068652594 T:C T C 10 0.52856003814033 0.818276179396142 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 107076696 G/A 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 107076783 A/T 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 A:T A T 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 111346806 C/T 1 12 4 16 5.65727954231604 2.11424015256132 3.54303938975472 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0844359796960055 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 111346808 G/A 1 12 7 19 5.65727954231604 3.69992026698231 1.95735927533373 A:G G A 10 0.52856003814033 0.491911774893767 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 111695887 G/A 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 111696852 T/C 1 9 2 11 4.24295965673703 1.05712007628066 3.18583958045637 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0701714577429645 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 116599665 T/C 1 25 21 46 11.7859990464917 11.0997608009469 0.686238245544819 T:C T C 10 0.52856003814033 0.88338836664541 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 116784850 C/G 1 23 30 53 10.8431191227724 15.8568011442099 -5.01368202143749 C:G C G 10 0.52856003814033 0.171920691879876 ENSG00000188820:ENST00000368606:exon_116784446_116784931:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000532607:exon_116784446_116784931:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000368605:exon_116784446_116784934:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000368604:exon_116784446_116784931:FAM26F HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 116973182 T/C 1 13 6 19 6.12871950417571 3.17136022884198 2.95735927533373 T:C T C 10 0.52856003814033 0.25018193083756 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 118886961 G/T 1 1 7 8 0.47143996185967 3.69992026698231 -3.22848030512264 T:G G T 10 0.52856003814033 0.0304181799638115 ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000434604:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392500:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000360290:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000419517:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392498:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000483035:exon_118886198_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000472713:exon_118886722_118887479:C6orf204 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 127611296 C/T 1 86 77 163 40.5438367199316 40.6991229368054 -0.15528621687379 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000093144:ENST00000454859:exon_127609855_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000531967:exon_127609857_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000309620:exon_127609861_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368293:exon_127609861_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368290:exon_127609861_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000474289:exon_127609865_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368295:exon_127609907_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000528402:exon_127610412_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000454591:exon_127610412_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000479525:exon_127610777_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368291:exon_127610779_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000475319:exon_127610925_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000430841:exon_127611014_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368289:exon_127611022_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000417628:exon_127611074_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368292:exon_127611133_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000488087:exon_127611191_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000436638:exon_127611195_127611422:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000460558:exon_127611255_127611422:ECHDC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 1306 673 1979 615.700590188729 355.720905668442 259.979684520287 A:G A G 10 0.52856003814033 2.98676986566345e-32 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 13 15 28 6.12871950417571 7.92840057210495 -1.79968106792924 T:C T C 10 0.52856003814033 0.571763425359152 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 134305751 G/C 1 23 23 46 10.8431191227724 12.1568808772276 -1.31376175445518 C:G G C 10 0.52856003814033 0.768336814301971 ENSG00000028839:ENST00000367871:exon_134305715_134305861:TBPL1;ENSG00000028839:ENST00000237264:exon_134305715_134305809:TBPL1;ENSG00000028839:ENST00000481694:exon_134305715_134305809:TBPL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 135287533 A/G 1 34 28 62 16.0289587032288 14.7996810679292 1.22927763529954 A:G A G 10 0.52856003814033 0.799985226923095 ENSG00000112339:ENST00000367837:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000445176:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367824:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527005:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527578:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000415177:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367826:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000533274:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000526100:exon_135287467_135287611:HBS1L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 121 0 121 57.0442353850201 0 57.0442353850201 T T 10 0.52856003814033 4.38881068592024e-34 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 144 0 144 67.8873545077925 0 67.8873545077925 A A 10 0.52856003814033 1.40114592324281e-40 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 145 0 145 68.3587944696521 0 68.3587944696521 A A 10 0.52856003814033 7.37480819105884e-41 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 58 0 58 27.3435177878609 0 27.3435177878609 G G 10 0.52856003814033 9.45491350669432e-17 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 65 0 65 30.6435975208785 0 30.6435975208785 T T 10 0.52856003814033 1.04638187526546e-18 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 137519588 A/C 1 138 191 329 65.0587147366345 100.954967284803 -35.8962525481686 A:C A C 10 0.52856003814033 8.35066566708112e-05 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 137519780 T/C 1 8 4 12 3.77151969487736 2.11424015256132 1.65727954231604 T:C T C 10 0.52856003814033 0.397101977790935 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 143825104 G/T 1 37 25 62 17.4432785888078 13.2140009535083 4.22927763529954 T:G G T 10 0.52856003814033 0.310128626924125 ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143825050_143825389:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143825050_143825389:FUCA2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 143828543 T/C 1 14 9 23 6.60015946603538 4.75704034326297 1.84311912277241 T:C T C 10 0.52856003814033 0.533087865539123 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143828374_143828561:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143828374_143828561:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143828374_143828561:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000367585:exon_143828374_143828561:FUCA2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 18 8 26 8.48591931347406 4.22848030512264 4.25743900835142 A:G G A 10 0.52856003814033 0.116090047573509 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 10 5 15 4.7143996185967 2.64280019070165 2.07159942789505 A:G G A 10 0.52856003814033 0.313640302764783 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 149953981 C/T 1 11 10 21 5.18583958045637 5.2856003814033 -0.0997608009469308 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 150004779 A/G 1 3 13 16 1.41431988557901 6.87128049582429 -5.45696061024528 A:G A G 10 0.52856003814033 0.00981958051399525 ENSG00000131023:ENST00000253339:exon_150004215_150005728:LATS1;ENSG00000131023:ENST00000441107:exon_150004215_150005728:LATS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 150114745 G/A 1 8 18 26 3.77151969487736 9.51408068652594 -5.74256099164858 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0296659676359784 ENSG00000120265:ENST00000367384:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000484601:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367378:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000464889:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367380:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000486585:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000495487:exon_150114685_150114768:PCMT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 25 26 51 11.7859990464917 13.7425609916486 -1.95656194515683 T:C C T 10 0.52856003814033 0.674346242436282 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 151766822 C/A 1 7 7 14 3.30007973301769 3.69992026698231 -0.39984053396462 A:C C A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 151789868 G/A 1 22 17 39 10.3716791609127 8.98552064838561 1.38615851252713 A:G G A 10 0.52856003814033 0.749102696220119 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 152469188 C/G 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 C:G C G 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 155635585 A/C 1 1 9 10 0.47143996185967 4.75704034326297 -4.2856003814033 A:C A C 10 0.52856003814033 0.00832466243874547 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000470239:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000475849:exon_155635430_155635627:TFB1M HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 159058767 C/A 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:C C A 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000146425:ENST00000367088:exon_159057506_159058926:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159058252_159058926:DYNLT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 A:G A G 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 16 18 34 7.54303938975472 9.51408068652594 -1.97104129677122 A:T T A 10 0.52856003814033 0.606991695211752 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 84 104 188 39.6009567962123 54.9702439665943 -15.369287170382 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0281791848837249 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 51 49 100 24.0434380548432 25.8994418688762 -1.856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.764038481661347 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 64 77 141 30.1721575590189 40.6991229368054 -10.5269653777865 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0770617103698109 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 166721224 C/G 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000176381:ENST00000322583:exon_166719168_166721871:PRR18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 199 148 347 93.8165524100743 78.2268856447688 15.5896667653055 T:C C T 10 0.52856003814033 0.095719920389597 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 166739646 T/C 1 36 35 71 16.9718386269481 18.4996013349116 -1.52776270796343 T:C T C 10 0.52856003814033 0.723128949373063 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000494682:exon_166739361_166739655:SFT2D1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 167343199 C/T 1 145 163 308 68.3587944696521 86.1552862168738 -17.7964917472217 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0456502912640028 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167343004_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167343006_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167343013_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167343028_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167343033_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167343086_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167343121_167343279:RNASET2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 170058374 C/T 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 T:C C T 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000184465:ENST00000423258:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000443144:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000420344:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000441385:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000467418:exon_170058372_170058454:WDR27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 170176146 G/A 1 12 14 26 5.65727954231604 7.39984053396462 -1.74256099164858 A:G G A 10 0.52856003814033 0.558131650023887 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000492738:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170175974_170176161:C6orf70 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 170176647 C/T 1 8 3 11 3.77151969487736 1.58568011442099 2.18583958045637 T:C C T 10 0.52856003814033 0.234946711874713 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 170176648 A/G 1 8 3 11 3.77151969487736 1.58568011442099 2.18583958045637 A:G A G 10 0.52856003814033 0.234946711874713 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 75 76 151 35.3579971394752 40.1705628986651 -4.81256575918984 C:G G C 10 0.52856003814033 0.463460046018066 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 T:C T C 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 810219 T/C 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 T:C T C 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 930689 C/T 1 45 58 103 21.2147982836851 30.6564822121391 -9.44168392845399 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0751551958924236 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 1008966 C/T 1 17 12 29 8.01447935161439 6.34272045768396 1.67175889393043 T:C C T 10 0.52856003814033 0.580875484028571 ENSG00000240230:ENST00000344111:exon_1005711_1009092:COX19 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 1131356 T/C 1 8 1 9 3.77151969487736 0.52856003814033 3.24295965673703 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0418258618356361 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 13 10 23 6.12871950417571 5.2856003814033 0.843119122772409 A:G G A 10 0.52856003814033 0.83562946433756 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 75 98 173 35.3579971394752 51.7988837377523 -16.4408865982771 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0145830770504283 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 2578181 C/T 1 36 31 67 16.9718386269481 16.3853611823502 0.58647744459789 T:C C T 10 0.52856003814033 0.903285731560204 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 30 36 66 14.1431988557901 19.0281613730519 -4.88496251726178 T:C T C 10 0.52856003814033 0.267157152938021 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 2578371 G/A 1 32 27 59 15.0860787795094 14.2711210297889 0.814957749720527 A:T:G G A 10 0.52856003814033 0.89655152570291 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 2582907 C/T 1 11 6 17 5.18583958045637 3.17136022884198 2.01447935161439 T:C C T 10 0.52856003814033 0.467313177256825 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2582838_2582957:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2582838_2582957:C7orf27 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 2946461 T/C 1 57 49 106 26.8720778260012 25.8994418688762 0.972635957125018 T:C T C 10 0.52856003814033 0.92256288342416 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 5399044 C/G 1 15 7 22 7.07159942789505 3.69992026698231 3.37167916091274 C:G C G 10 0.52856003814033 0.199871210957820 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5399029_5399200:TNRC18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 4 9 13 1.88575984743868 4.75704034326297 -2.87128049582429 C:G G C 10 0.52856003814033 0.163321106873792 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 6026864 G/A 1 10 16 26 4.7143996185967 8.45696061024528 -3.74256099164858 A:G G A 10 0.52856003814033 0.169917266118540 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 10 9 19 4.7143996185967 4.75704034326297 -0.0426407246662706 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 182 132 314 85.8020730584599 69.7699250345236 16.0321480239364 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0706977202527536 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 6194274 T/C 1 10 11 21 4.7143996185967 5.81416041954363 -1.09976080094693 T:C T C 10 0.52856003814033 0.667148390379936 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 6441688 T/C 1 8 5 13 3.77151969487736 2.64280019070165 1.12871950417571 T:C T C 10 0.52856003814033 0.589189446313547 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 6442008 C/T 1 277 428 705 130.588869435129 226.223696324061 -95.6348268889327 T:C C T 10 0.52856003814033 5.63249098851929e-13 ENSG00000136238:ENST00000348035:exon_6441947_6443608:RAC1;ENSG00000136238:ENST00000356142:exon_6441947_6442151:RAC1;ENSG00000136238:ENST00000415346:exon_6441947_6443595:RAC1;ENSG00000136238:ENST00000488373:exon_6441947_6442112:RAC1;ENSG00000136238:ENST00000497741:exon_6441947_6442133:RAC1;ENSG00000136238:ENST00000495499:exon_6441947_6442151:RAC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 6449496 T/C 1 20 17 37 9.4287992371934 8.98552064838561 0.443278588807788 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6448757_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6448760_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6448761_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6449148_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6449231_6449666:DAGLB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 6505901 T/C 1 67 50 117 31.5864774445979 26.4280019070165 5.15847553758138 T:C T C 10 0.52856003814033 0.355566218853335 ENSG00000136240:ENST00000258739:exon_6505702_6505954:KDELR2;ENSG00000136240:ENST00000454368:exon_6505702_6505954:KDELR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 19744417 T/C 1 15 21 36 7.07159942789505 11.0997608009469 -4.02816137305188 T:C T C 10 0.52856003814033 0.186077966715380 ENSG00000105849:ENST00000222567:exon_19744402_19744543:TWISTNB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 21956405 G/A 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000373934:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000405437:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000465490:exon_21956372_21956515:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000396561:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000447180:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000435031:exon_21956372_21956512:CDCA7L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 23164701 C/T 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000122550:ENST00000521082:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322231:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000339077:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322275:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000459661:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000491352:exon_23164667_23164821:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000409689:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000410047:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000479700:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000477076:exon_23164599_23164791:KLHL7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 23221870 T/C 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 T:C T C 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23221460_23222108:NUPL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 18 19 37 8.48591931347406 10.0426407246663 -1.55672141119221 C:G G C 10 0.52856003814033 0.625136106908905 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 32598630 T/A 1 7 2 9 3.30007973301769 1.05712007628066 2.24295965673703 A:T T A 10 0.52856003814033 0.186100445119176 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 32598656 C/T 1 6 2 8 2.82863977115802 1.05712007628066 1.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.295468489539448 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 32613020 A/G 1 18 17 35 8.48591931347406 8.98552064838561 -0.499601334911551 A:G A G 10 0.52856003814033 0.867525314175691 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 32623477 C/G 1 22 19 41 10.3716791609127 10.0426407246663 0.329038436246469 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32623404_32628333:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32623404_32625778:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32623404_32623519:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32623404_32628323:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000470500:exon_32623404_32623779:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000467779:exon_32623404_32623818:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000497020:exon_32623404_32623714:AVL9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 32909182 G/A 1 13 14 27 6.12871950417571 7.39984053396462 -1.27112102978891 A:G G A 10 0.52856003814033 0.701466812491088 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 36492212 C/T 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36492086_36493400:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36492086_36493400:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000491782:exon_36492086_36493264:ANLN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 37936530 T/C 1 17 14 31 8.01447935161439 7.39984053396462 0.614638817649769 T:C T C 10 0.52856003814033 0.859133520696697 ENSG00000086288:ENST00000199447:exon_37936472_37936709:TXNDC3;ENSG00000086288:ENST00000440017:exon_37936472_37936694:TXNDC3;ENSG00000086288:ENST00000476435:exon_37936419_37936709:TXNDC3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 39991447 C/T 1 1 8 9 0.47143996185967 4.22848030512264 -3.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0159780666639568 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_39989636_39991451:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000326351:exon_39989959_39991451:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_39990109_39991451:CDK13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 40027484 A/G 1 10 3 13 4.7143996185967 1.58568011442099 3.12871950417571 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0991231984509586 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000326351:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000484589:exon_40027435_40027857:CDK13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 40127767 G/A 1 9 5 14 4.24295965673703 2.64280019070165 1.60015946603538 A:G G A 10 0.52856003814033 0.43463285635379 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000478563:exon_40127725_40127930:CDK13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 264 235 499 124.460149930953 124.211608962978 0.248540967975302 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 44096439 T/G 1 21 26 47 9.90023919905307 13.7425609916486 -3.84232179259551 T:G T G 10 0.52856003814033 0.306804627180626 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44096339_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000458579:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000464762:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000439815:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000485932:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000441904:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000423561:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44096356_44096502:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44096392_44096502:DBNL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 98 107 205 46.2011162622477 56.5559240810153 -10.3548078187677 T:C T C 10 0.52856003814033 0.161678868753537 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 44104788 A/C 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:C A C 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44100376_44109055:DBNL;ENSG00000164708:ENST00000297283:exon_44104715_44105186:PGAM2;ENSG00000164708:ENST00000425387:exon_44104715_44104789:PGAM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 44112873 G/T 1 19 7 26 8.95735927533373 3.69992026698231 5.25743900835142 T:G G T 10 0.52856003814033 0.0483242128927259 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 44153614 C/G 1 2 11 13 0.94287992371934 5.81416041954363 -4.87128049582429 C:G C G 10 0.52856003814033 0.0096219812206849 ENSG00000106624:ENST00000223357:exon_44153193_44154159:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000450684:exon_44153193_44154161:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000413907:exon_44153193_44154158:AEBP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 44153780 A/G 1 4 11 15 1.88575984743868 5.81416041954363 -3.92840057210495 A:G A G 10 0.52856003814033 0.066773241017641 ENSG00000106624:ENST00000223357:exon_44153193_44154159:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000450684:exon_44153193_44154161:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000413907:exon_44153193_44154158:AEBP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 44606098 C/T 1 78 87 165 36.7723170250543 45.9847233182087 -9.21240629315446 T:C C T 10 0.52856003814033 0.160625891379883 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000479602:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000448192:exon_44605737_44606123:DDX56 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 44620836 C/A 1 7 11 18 3.30007973301769 5.81416041954363 -2.51408068652594 A:C C A 10 0.52856003814033 0.24852778175064 ENSG00000158604:ENST00000457408:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000419520:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000481238:exon_44619496_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000477639:exon_44619503_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000444131:exon_44620692_44620838:TMED4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 44747514 C/T 1 44 28 72 20.7433583218255 14.7996810679292 5.94367725389624 T:C C T 10 0.52856003814033 0.193824281060163 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 44747578 G/A 1 48 34 82 22.6291181692642 17.9710412967712 4.65807687249294 A:G G A 10 0.52856003814033 0.321034118026073 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 44747589 C/T 1 45 39 84 21.2147982836851 20.6138414874729 0.600956796212277 T:C C T 10 0.52856003814033 0.913434352693245 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 44800176 G/T 1 11 16 27 5.18583958045637 8.45696061024528 -3.27112102978891 T:G G T 10 0.52856003814033 0.248567283323368 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 15 19 34 7.07159942789505 10.0426407246663 -2.97104129677122 A:G G A 10 0.52856003814033 0.39073568744534 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 45148667 G/A 1 64 77 141 30.1721575590189 40.6991229368054 -10.5269653777865 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0770617103698109 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148426_45148682:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 45148773 C/A 1 25 29 54 11.7859990464917 15.3282411060696 -3.54224205957782 A:C C A 10 0.52856003814033 0.343501519539024 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 10 5 15 4.7143996185967 2.64280019070165 2.07159942789505 A:G A G 10 0.52856003814033 0.313640302764783 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 55840888 A/C 0 0 21 21 0 11.0997608009469 -11.0997608009469 C A C 10 0.52856003814033 1.38660975752853e-07 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 130 132 262 61.2871950417571 69.7699250345236 -8.48272999276647 A:T:C T C 10 0.52856003814033 0.293710353156967 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 56128090 C/T 1 128 124 252 60.3443151180378 65.5414447294009 -5.19712961136317 T:C C T 10 0.52856003814033 0.528393887957946 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56127962_56128109:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56127962_56128109:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000492618:exon_56127962_56128109:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000466572:exon_56127558_56128109:CCT6A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 63981563 A/G 1 6 7 13 2.82863977115802 3.69992026698231 -0.87128049582429 A:G A G 10 0.52856003814033 0.782861958075039 ENSG00000173041:ENST00000309683:exon_63980262_63982878:ZNF680 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 64291830 T/C 1 23 4 27 10.8431191227724 2.11424015256132 8.72887897021109 T:C T C 10 0.52856003814033 0.000717183508114863 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 64291987 G/A 1 8 12 20 3.77151969487736 6.34272045768396 -2.5712007628066 A:G G A 10 0.52856003814033 0.270388168695337 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 64389089 A/C 1 11 6 17 5.18583958045637 3.17136022884198 2.01447935161439 A:C A C 10 0.52856003814033 0.467313177256825 ENSG00000198039:ENST00000527278:exon_64388032_64389502:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000476120:exon_64388032_64389635:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000319636:exon_64388032_64389416:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000395375:exon_64388032_64391344:ZNF273 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 64451558 G/A 0 0 8 8 0 4.22848030512264 -4.22848030512264 A G A 10 0.52856003814033 0.00244011976995637 ENSG00000213462:ENST00000394323:exon_64451187_64453792:ERV3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 11 14 25 5.18583958045637 7.39984053396462 -2.21400095350825 A:G G A 10 0.52856003814033 0.426100767961122 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 10 18 28 4.7143996185967 9.51408068652594 -4.79968106792924 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0875342887255213 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 72718278 G/A 1 31 26 57 14.6146388176498 13.7425609916486 0.872077826001188 A:G G A 10 0.52856003814033 0.894696430754812 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72718227_72718401:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72718227_72718700:NSUN5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 51 51 102 24.0434380548432 26.9565619451568 -2.91312389031366 T:C C T 10 0.52856003814033 0.620217489647732 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 72984918 G/A 1 35 47 82 16.5003986650884 24.8423217925955 -8.34192312750707 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0762977690805188 ENSG00000106638:ENST00000459913:exon_72983990_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000424598:exon_72983990_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000450285:exon_72983990_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000305632:exon_72983993_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000417008:exon_72984338_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000432538:exon_72984525_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000433464:exon_72984741_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000488915:exon_72984801_72985302:TBL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 44 35 79 20.7433583218255 18.4996013349116 2.24375698691393 T:C C T 10 0.52856003814033 0.653084863970538 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 73097948 G/C 1 28 16 44 13.2003189320708 8.45696061024528 4.74335832182548 C:G G C 10 0.52856003814033 0.174864661954873 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 73151644 A/G 1 10 10 20 4.7143996185967 5.2856003814033 -0.571200762806601 A:G A G 10 0.52856003814033 0.826187510866658 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 73753250 T/C 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 T:C T C 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 73814702 C/A 1 5 7 12 2.35719980929835 3.69992026698231 -1.34272045768396 A:C C A 10 0.52856003814033 0.566216755054812 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73814700_73814885:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73814700_73814885:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73814700_73814885:CLIP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 75609677 A/G 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 A:G A G 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75609657_75609711:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75609657_75610056:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75609657_75609729:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75609657_75609789:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75609657_75610040:POR;ENSG00000127948:ENST00000426184:exon_75609657_75609757:POR;ENSG00000127948:ENST00000475509:exon_75609657_75609678:POR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 23 17 40 10.8431191227724 8.98552064838561 1.8575984743868 T:C T C 10 0.52856003814033 0.63574480711507 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 10 16 26 4.7143996185967 8.45696061024528 -3.74256099164858 T:C T C 10 0.52856003814033 0.169917266118540 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 76111835 G/A 1 19 26 45 8.95735927533373 13.7425609916486 -4.78520171631485 A:G G A 10 0.52856003814033 0.179154628324009 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 87537177 A/G 1 77 82 159 36.3008770631946 43.3419231275071 -7.04104606431248 A:G A G 10 0.52856003814033 0.267216720843129 ENSG00000006634:ENST00000413643:exon_87536503_87537691:DBF4;ENSG00000006634:ENST00000265728:exon_87536503_87538856:DBF4;ENSG00000006634:ENST00000431138:exon_87536503_87537688:DBF4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 29 12 41 13.6717588939304 6.34272045768396 7.32903843624647 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0274525324863212 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 19 22 41 8.95735927533373 11.6283208390873 -2.67096156375353 T:C C T 10 0.52856003814033 0.436592039919530 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 77 85 162 36.3008770631946 44.9276032419281 -8.62672617873346 T:G G T 10 0.52856003814033 0.18147888726502 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 12 12 24 5.65727954231604 6.34272045768396 -0.68544091536792 A:G A G 10 0.52856003814033 0.839606713971287 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 2 10 12 0.94287992371934 5.2856003814033 -4.34272045768396 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0173067676742740 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 9 11 20 4.24295965673703 5.81416041954363 -1.5712007628066 A:C A C 10 0.52856003814033 0.509501749881068 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 27 34 61 12.7288789702111 17.9710412967712 -5.24216232656013 A:G A G 10 0.52856003814033 0.200169472205218 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 92027906 C/A 1 8 13 21 3.77151969487736 6.87128049582429 -3.09976080094693 A:C C A 10 0.52856003814033 0.194847234835071 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 14 7 21 6.60015946603538 3.69992026698231 2.90023919905307 A:C C A 10 0.52856003814033 0.274795735904410 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 92760738 T/G 1 81 67 148 38.1866369106333 35.4135225554021 2.77311435523116 T:G T G 10 0.52856003814033 0.680984742360357 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92760530_92761298:SAMD9L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 92762681 A/G 1 8 12 20 3.77151969487736 6.34272045768396 -2.5712007628066 A:G A G 10 0.52856003814033 0.270388168695337 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 97599548 G/T 1 14 4 18 6.60015946603538 2.11424015256132 4.48591931347406 T:G G T 10 0.52856003814033 0.0357240121562821 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99047978 T/C 1 6 14 20 2.82863977115802 7.39984053396462 -4.5712007628066 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0452390864048274 ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99081730 A/G 1 1 8 9 0.47143996185967 4.22848030512264 -3.75704034326297 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0159780666639568 ENSG00000198556:ENST00000331410:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481472:exon_99081653_99081769:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000448667:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000447047:exon_99081653_99081787:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481108:exon_99081278_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000494186:exon_99081653_99081766:ZNF789 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99490002 C/A 1 10 9 19 4.7143996185967 4.75704034326297 -0.0426407246662706 A:C C A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99488036_99490369:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99488036_99490369:TRIM4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99654600 A/G 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99654689 G/A 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99654630_99654872:ZSCAN21 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99662201 A/G 1 20 20 40 9.4287992371934 10.5712007628066 -1.1424015256132 A:G A G 10 0.52856003814033 0.753183226177787 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99661411_99662659:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99661706_99662661:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99661411_99662659:ZSCAN21;ENSG00000166526:ENST00000413658:exon_99661656_99662535:ZNF3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 303 266 569 142.84630844348 140.596970145328 2.24933829815222 A:G G A 10 0.52856003814033 0.866667240408468 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 47 38 85 22.1576782074045 20.0852814493325 2.07239675807195 A:T:G A T 10 0.52856003814033 0.665650059876123 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 60 43 103 28.2863977115802 22.7280816400342 5.55831607154601 A:G A G 10 0.52856003814033 0.279539446146588 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99711757 T/A 1 10 5 15 4.7143996185967 2.64280019070165 2.07159942789505 A:T T A 10 0.52856003814033 0.313640302764783 ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99711677_99711891:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99711677_99711891:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99711677_99712181:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99711677_99711891:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99711677_99711891:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99711677_99711891:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99711707_99711832:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99711707_99711891:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99711677_99711891:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000487288:exon_99711677_99711891:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000493322:exon_99711677_99711854:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000440225:exon_99711677_99711891:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452438:exon_99711677_99711891:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000523306:exon_99711707_99711891:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000449571:exon_99711677_99711891:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000520135:exon_99711707_99711891:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000451699:exon_99711677_99711891:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417349:exon_99711677_99711891:TAF6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 137 100 237 64.5872747747748 52.856003814033 11.7312709607418 A:G G A 10 0.52856003814033 0.134615036111993 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 4 8 12 1.88575984743868 4.22848030512264 -2.34272045768396 A:G A G 10 0.52856003814033 0.248143449837288 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99752586 G/C 1 18 34 52 8.48591931347406 17.9710412967712 -9.48512198329716 C:G G C 10 0.52856003814033 0.0116665253157703 ENSG00000146826:ENST00000394035:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000457641:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419037:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000316937:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000448720:exon_99752047_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000456769:exon_99752047_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000470260:exon_99752098_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419841:exon_99752447_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000275726:exon_99752489_99752758:C7orf43 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99817859 A/G 1 33 38 71 15.5575187413691 20.0852814493325 -4.52776270796343 A:G A G 10 0.52856003814033 0.287406631726009 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99817737_99818296:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99817737_99818087:PVRIG HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 99821685 C/T 1 20 5 25 9.4287992371934 2.64280019070165 6.78599904649175 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00798278255395752 ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000435519:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000328453:exon_99821505_99821698:GATS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 100172813 A/G 1 6 7 13 2.82863977115802 3.69992026698231 -0.87128049582429 A:G A G 10 0.52856003814033 0.782861958075039 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100170920_100173405:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100172283_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100172283_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100172283_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100172283_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000476881:exon_100172332_100172927:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100172686_100172927:LRCH4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 100458795 T/C 1 10 7 17 4.7143996185967 3.69992026698231 1.01447935161439 T:C T C 10 0.52856003814033 0.808994871295111 ENSG00000146828:ENST00000448342:exon_100458634_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000418037:exon_100458760_100458802:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000416675:exon_100458760_100458852:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100457772_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100456358_100459206:SLC12A9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 100460331 G/A 1 5 8 13 2.35719980929835 4.22848030512264 -1.87128049582429 A:G G A 10 0.52856003814033 0.406604439196984 ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100460303_100460449:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000482184:exon_100460303_100460449:SLC12A9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 100463822 G/A 1 14 22 36 6.60015946603538 11.6283208390873 -5.02816137305188 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0977609770306986 ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100463341_100464630:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100463341_100464631:SLC12A9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 65 24 89 30.6435975208785 12.6854409153679 17.9581566055106 A:G A G 10 0.52856003814033 0.000114565957672777 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 100482026 T/C 1 52 56 108 24.5148780167028 29.5993621358585 -5.08448411915564 T:C T C 10 0.52856003814033 0.336561069406512 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 100486035 C/A 1 21 16 37 9.90023919905307 8.45696061024528 1.44327858880779 A:C C A 10 0.52856003814033 0.74251134411024 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 100486088 C/T 1 23 11 34 10.8431191227724 5.81416041954363 5.02895870322878 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0884896832654 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 100486656 T/G 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 T:G T G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000176125:ENST00000388761:exon_100486346_100487339:UFSP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 100488658 G/C 0 0 10 10 0 5.2856003814033 -5.2856003814033 C G C 10 0.52856003814033 0.000542330375385347 ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100487616_100488709:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100488337_100488709:ACHE HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 100731505 C/G 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 100731829 T/C 1 7 4 11 3.30007973301769 2.11424015256132 1.18583958045637 T:C T C 10 0.52856003814033 0.556140452563778 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 100861452 T/C 1 11 5 16 5.18583958045637 2.64280019070165 2.54303938975472 T:C T C 10 0.52856003814033 0.222015324368485 ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100860949_100861498:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000461205:exon_100861447_100861498:ZNHIT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 100875772 T/G 1 10 10 20 4.7143996185967 5.2856003814033 -0.571200762806601 T:G T G 10 0.52856003814033 0.826187510866658 ENSG00000106404:ENST00000308344:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000401528:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000305064:exon_100875374_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000433833:exon_100875686_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000414035:exon_100875769_100875796:CLDN15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 102107848 C/T 1 11 4 15 5.18583958045637 2.11424015256132 3.07159942789505 T:C C T 10 0.52856003814033 0.127429524906155 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102107786_102107926:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102107786_102107926:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102107786_102107926:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102107786_102107926:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485417:exon_102107789_102107926:LRWD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 104717517 C/T 1 24 22 46 11.3145590846321 11.6283208390873 -0.313761754455181 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000478990:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000476671:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000482560:exon_104717410_104717640:MLL5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 107217020 G/A 1 17 19 36 8.01447935161439 10.0426407246663 -2.02816137305188 A:G G A 10 0.52856003814033 0.509527565956857 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107216854_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000471763:exon_107216811_107217636:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107216811_107217037:DUS4L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 111981007 G/A 1 31 17 48 14.6146388176498 8.98552064838561 5.62911816926416 A:G G A 10 0.52856003814033 0.112932785819684 ENSG00000198839:ENST00000361822:exon_111980927_111981101:ZNF277;ENSG00000198839:ENST00000361946:exon_111980927_111981101:ZNF277 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 112102355 T/G 1 8 9 17 3.77151969487736 4.75704034326297 -0.98552064838561 T:G T G 10 0.52856003814033 0.637676890163413 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102325_112102433:IFRD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 18 11 29 8.48591931347406 5.81416041954363 2.67175889393043 A:G G A 10 0.52856003814033 0.356621182457111 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 115890510 C/T 1 32 48 80 15.0860787795094 25.3708818307358 -10.2848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0246928523231789 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115890215_115890550:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115890215_115890550:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115890215_115890550:TES;ENSG00000135269:ENST00000393484:exon_115890489_115890550:TES;ENSG00000135269:ENST00000494384:exon_115890503_115890550:TES HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 8 7 15 3.77151969487736 3.69992026698231 0.0715994278950496 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 127222521 G/A 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 A:G G A 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 127224286 A/G 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 A:G A G 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127224205_127225661:GCC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 127721507 T/C 1 68 68 136 32.0579174064576 35.9420825935424 -3.88416518708489 T:C T C 10 0.52856003814033 0.547893208598275 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000470463:exon_127721412_127721553:SND1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 128140982 T/C 1 13 11 24 6.12871950417571 5.81416041954363 0.314559084632079 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000165055:ENST00000262432:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000482555:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000480046:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000481392:exon_128140957_128141022:METTL2B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 130144943 G/C 0 0 10 10 0 5.2856003814033 -5.2856003814033 C G C 10 0.52856003814033 0.000542330375385347 ENSG00000106484:ENST00000341441:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000416162:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000378576:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000393187:exon_130144780_130146127:MEST;ENSG00000106484:ENST00000223215:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000437945:exon_130144780_130145194:MEST;ENSG00000106484:ENST00000463263:exon_130144780_130145139:MEST HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 133749164 G/A 1 17 29 46 8.01447935161439 15.3282411060696 -7.31376175445518 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0378403496692615 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 23 28 51 10.8431191227724 14.7996810679292 -3.95656194515683 T:C T C 10 0.52856003814033 0.326246599055015 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 A:G G A 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 7 2 9 3.30007973301769 1.05712007628066 2.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 0.186100445119176 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 139415775 G/C 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 C:G G C 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 17 19 36 8.01447935161439 10.0426407246663 -2.02816137305188 A:G G A 10 0.52856003814033 0.509527565956857 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 14 4 18 6.60015946603538 2.11424015256132 4.48591931347406 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0357240121562821 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 7 2 9 3.30007973301769 1.05712007628066 2.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 0.186100445119176 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 140159721 T/C 1 23 14 37 10.8431191227724 7.39984053396462 3.44327858880779 T:C T C 10 0.52856003814033 0.323350657732138 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000494939:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000498535:exon_140159572_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000473444:exon_140159598_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475180:exon_140159641_140159736:MKRN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 0 0 405 405 0 214.066815446834 -214.066815446834 A G A 10 0.52856003814033 5.46624565975102e-133 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 293 268 561 138.131908824883 141.654090221608 -3.52218139672513 A:T:C T C 10 0.52856003814033 0.76740591080002 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 143884103 G/A 1 11 6 17 5.18583958045637 3.17136022884198 2.01447935161439 A:G G A 10 0.52856003814033 0.467313177256825 ENSG00000213214:ENST00000378115:exon_143883176_143885488:ARHGEF35 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 148506396 A/C 1 7 11 18 3.30007973301769 5.81416041954363 -2.51408068652594 A:C A C 10 0.52856003814033 0.24852778175064 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150028098 A/G 1 7 9 16 3.30007973301769 4.75704034326297 -1.45696061024528 A:G A G 10 0.52856003814033 0.618027034384742 ENSG00000188707:ENST00000343855:exon_150027401_150029808:C7orf29 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 16 6 22 7.54303938975472 3.17136022884198 4.37167916091274 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0857064844778537 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 31 12 43 14.6146388176498 6.34272045768396 8.27191835996581 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0137379928460812 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 29 9 38 13.6717588939304 4.75704034326297 8.91471855066746 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0050232634905303 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 24 17 41 11.3145590846321 8.98552064838561 2.32903843624647 T:C T C 10 0.52856003814033 0.532790301318707 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150094851 A/G 1 26 17 43 12.2574390083514 8.98552064838561 3.27191835996581 A:G A G 10 0.52856003814033 0.360957547502182 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150094853 G/A 1 17 26 43 8.01447935161439 13.7425609916486 -5.72808164003419 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0928642148229359 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150163837 A/G 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 A:G A G 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150163759_150164422:GIMAP8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150171710 T/C 1 6 9 15 2.82863977115802 4.75704034326297 -1.92840057210495 T:C T C 10 0.52856003814033 0.439187658248891 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150171100_150171726:GIMAP8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 110 96 206 51.8583958045637 50.7417636614717 1.11663214309202 A:T:C C T 10 0.52856003814033 0.889221044162532 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 184 174 358 86.7449529821793 91.9694466364174 -5.22449365423816 T:C C T 10 0.52856003814033 0.596730001161494 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150773807 A/T 1 105 110 215 49.5011959952653 58.1416041954363 -8.64040820017095 A:T A T 10 0.52856003814033 0.245980242232378 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150773679_150773888:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150773711_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000465272:exon_150773713_150774114:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150773716_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150773725_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150773733_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150773742_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150773803_150773919:FASTK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150779447 C/T 1 142 156 298 66.9444745840731 82.4553659498915 -15.5108913658184 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0723469620795469 ENSG00000164897:ENST00000297533:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000392818:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000462940:exon_150779262_150779995:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000482202:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000476627:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000488752:exon_150779262_150779680:TMUB1;ENSG00000164897:ENST00000492838:exon_150779262_150779680:TMUB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 29 21 50 13.6717588939304 11.0997608009469 2.5719980929835 A:G G A 10 0.52856003814033 0.482720989378696 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 14 14 28 6.60015946603538 7.39984053396462 -0.799681067929241 C:G C G 10 0.52856003814033 0.850610910526834 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 71 56 127 33.4722372920366 29.5993621358585 3.87287515617809 C:G C G 10 0.52856003814033 0.534146029696411 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 151064064 C/T 1 6 9 15 2.82863977115802 4.75704034326297 -1.92840057210495 T:C C T 10 0.52856003814033 0.439187658248891 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000480907:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000497987:exon_151064025_151064211:NUB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 36 23 59 16.9718386269481 12.1568808772276 4.81495774972053 A:G A G 10 0.52856003814033 0.240944382701691 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 12 13 25 5.65727954231604 6.87128049582429 -1.21400095350825 C:G G C 10 0.52856003814033 0.691078714041608 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 14 13 27 6.60015946603538 6.87128049582429 -0.271121029788911 A:T:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 9 4 13 4.24295965673703 2.11424015256132 2.12871950417571 A:G A G 10 0.52856003814033 0.277047309964302 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 623593 G/A 1 74 90 164 34.8865571776156 47.5704034326297 -12.6838462550141 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0505027708300134 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_623289_623657:ERICH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 6302971 C/T 1 22 15 37 10.3716791609127 7.92840057210495 2.44327858880779 T:C C T 10 0.52856003814033 0.510821809807751 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 6478986 C/T 1 4 5 9 1.88575984743868 2.64280019070165 -0.75704034326297 T:C C T 10 0.52856003814033 0.743227953420132 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 6479042 C/T 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 5 13 18 2.35719980929835 6.87128049582429 -4.51408068652594 A:C C A 10 0.52856003814033 0.0558100460820762 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 8176554 C/T 1 39 40 79 18.3861585125271 21.1424015256132 -2.75624301308607 T:C C T 10 0.52856003814033 0.573856662145259 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 8176614 G/C 1 25 28 53 11.7859990464917 14.7996810679292 -3.01368202143749 C:G G C 10 0.52856003814033 0.413106584226241 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 8234077 G/C 1 10 2 12 4.7143996185967 1.05712007628066 3.65727954231604 C:G G C 10 0.52856003814033 0.042272250685085 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 8234113 G/A 1 3 8 11 1.41431988557901 4.22848030512264 -2.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.129625044921933 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 8234192 G/C 1 11 1 12 5.18583958045637 0.52856003814033 4.65727954231604 C:G G C 10 0.52856003814033 0.00730684791126346 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 8234218 C/T 0 12 0 12 5.65727954231604 0 5.65727954231604 C C 10 0.52856003814033 0.000596015597603251 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 8234219 G/A 0 12 0 12 5.65727954231604 0 5.65727954231604 G G 10 0.52856003814033 0.000596015597603251 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 8234714 C/T 1 8 3 11 3.77151969487736 1.58568011442099 2.18583958045637 T:C C T 10 0.52856003814033 0.234946711874713 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 10623138 T/A 1 58 69 127 27.3435177878609 36.4706426316828 -9.12712484382191 A:T T A 10 0.52856003814033 0.110027535633728 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 18 12 30 8.48591931347406 6.34272045768396 2.1431988557901 T:C T C 10 0.52856003814033 0.469352400778903 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 11637276 G/A 1 6 4 10 2.82863977115802 2.11424015256132 0.7143996185967 A:G G A 10 0.52856003814033 0.757894792307515 ENSG00000154328:ENST00000530433:exon_11637107_11637461:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11637254_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11637107_11637459:NEIL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 11643553 G/T 1 21 17 38 9.90023919905307 8.98552064838561 0.914718550667459 T:G G T 10 0.52856003814033 0.871288779483588 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528113:exon_11643472_11643606:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 11643803 C/T 1 30 34 64 14.1431988557901 17.9710412967712 -3.82784244098112 T:C C T 10 0.52856003814033 0.381281089357753 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 11689119 G/C 1 368 419 787 173.489905964359 221.466655980798 -47.9767500164398 A:C:G G C 10 0.52856003814033 0.000684698985950408 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11689027_11689176:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529521:exon_11689027_11689303:FDFT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 7 3 10 3.30007973301769 1.58568011442099 1.7143996185967 T:C C T 10 0.52856003814033 0.351744435761646 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 17794792 G/A 1 5 13 18 2.35719980929835 6.87128049582429 -4.51408068652594 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0558100460820762 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518936:exon_17794643_17794830:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17794685_17794888:PCM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 17814915 A/G 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:G A G 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17814773_17814930:PCM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 17817553 G/T 1 11 8 19 5.18583958045637 4.22848030512264 0.957359275333729 T:G G T 10 0.52856003814033 0.819137161107216 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17817523_17817612:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17817523_17817674:PCM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 17820714 A/T 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:T A T 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524356:exon_17820462_17820800:PCM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 28 50 78 13.2003189320708 26.4280019070165 -13.2276829749457 T:C T C 10 0.52856003814033 0.00302170415726468 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 13 24 37 6.12871950417571 12.6854409153679 -6.55672141119221 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0328744017348971 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 21766900 G/A 1 26 32 58 12.2574390083514 16.9139212204906 -4.65648221213914 A:G G A 10 0.52856003814033 0.238010145520756 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 21767275 C/G 1 8 20 28 3.77151969487736 10.5712007628066 -6.79968106792924 C:G C G 10 0.52856003814033 0.0127516972694462 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000524001:exon_21766975_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000517422:exon_21767126_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000518197:exon_21767146_21767442:DOK2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 17 15 32 8.01447935161439 7.92840057210495 0.086078779509438 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 21964944 C/T 1 40 47 87 18.8575984743868 24.8423217925955 -5.98472331820872 T:C C T 10 0.52856003814033 0.237323073243365 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 22107986 A/G 1 36 31 67 16.9718386269481 16.3853611823502 0.58647744459789 A:G A G 10 0.52856003814033 0.903285731560204 ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22107909_22108680:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22107909_22109485:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000518039:exon_22107909_22108409:POLR3D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 23104195 G/T 1 1 9 10 0.47143996185967 4.75704034326297 -4.2856003814033 T:G G T 10 0.52856003814033 0.00832466243874547 ENSG00000147457:ENST00000397677:exon_23103769_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000313219:exon_23103604_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519414:exon_23104150_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000517325:exon_23104155_23104337:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000442460:exon_23104157_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519984:exon_23104172_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519529:exon_23104172_23104507:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519503:exon_23104179_23104507:CHMP7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 25364834 A/T 1 45 66 111 21.2147982836851 34.8849625172618 -13.6701642335766 A:T A T 10 0.52856003814033 0.0101210241386821 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 25364960 A/G 1 68 112 180 32.0579174064576 59.198724271717 -27.1408068652594 A:G A G 10 0.52856003814033 5.12278288754676e-05 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 60 32 92 28.2863977115802 16.9139212204906 11.3724764910896 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0211126303804524 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 27145133 G/A 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000104228:ENST00000305364:exon_27142404_27145644:TRIM35;ENSG00000104228:ENST00000380544:exon_27143269_27145644:TRIM35 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 53 52 105 24.9863179785625 27.4851219832972 -2.49880400473466 C:G C G 10 0.52856003814033 0.626708695929164 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 5 7 12 2.35719980929835 3.69992026698231 -1.34272045768396 A:C A C 10 0.52856003814033 0.566216755054812 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 29961951 C/T 1 20 37 57 9.4287992371934 19.5567214111922 -10.1279221739988 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0077800648559116 ENSG00000104660:ENST00000321250:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000397339:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000518001:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000520682:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000442880:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000523116:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000532394:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000520739:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000518192:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000519466:exon_29961816_29962002:LEPROTL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 30567332 G/A 1 8 3 11 3.77151969487736 1.58568011442099 2.18583958045637 A:G G A 10 0.52856003814033 0.234946711874713 ENSG00000104687:ENST00000221130:exon_30567331_30567419:GSR;ENSG00000104687:ENST00000414019:exon_30567331_30567419:GSR;ENSG00000104687:ENST00000523295:exon_30567331_30567419:GSR;ENSG00000104687:ENST00000520888:exon_30567331_30567419:GSR;ENSG00000104687:ENST00000521479:exon_30567331_30567419:GSR HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 30999280 G/T 1 9 2 11 4.24295965673703 1.05712007628066 3.18583958045637 T:G G T 10 0.52856003814033 0.0701714577429645 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 31024638 C/T 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 T:C:G C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 37623868 T/G 1 16 10 26 7.54303938975472 5.2856003814033 2.25743900835142 T:G T G 10 0.52856003814033 0.435111822543937 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37623798_37623873:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000520073:exon_37623798_37624259:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000523358:exon_37623798_37623873:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000523187:exon_37623798_37623873:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000518036:exon_37623798_37623873:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000523994:exon_37623798_37623873:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37623798_37623873:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37623798_37623873:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000523521:exon_37623798_37623873:PROSC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 37702472 G/A 1 12 7 19 5.65727954231604 3.69992026698231 1.95735927533373 A:G G A 10 0.52856003814033 0.491911774893767 ENSG00000104221:ENST00000220659:exon_37700786_37702731:BRF2;ENSG00000104221:ENST00000520601:exon_37702220_37702731:BRF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 37963239 C/T 1 11 6 17 5.18583958045637 3.17136022884198 2.01447935161439 T:C C T 10 0.52856003814033 0.467313177256825 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37962760_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37963011_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517719:exon_37963018_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37963068_37963256:ASH2L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 37985897 A/G 1 11 10 21 5.18583958045637 5.2856003814033 -0.0997608009469308 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000428278:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000521652:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000524247:exon_37985858_37985976:ASH2L HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 38095662 C/T 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000085788:ENST00000397166:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000519857:exon_38095607_38096576:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000526237:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000532222:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000520272:exon_38095607_38095727:DDHD2;ENSG00000085788:ENST00000319246:exon_38095607_38095727:DDHD2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 38458696 T/C 0 44 0 44 20.7433583218255 0 20.7433583218255 T T 10 0.52856003814033 8.69941538446179e-13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 48710955 A/G 1 19 20 39 8.95735927533373 10.5712007628066 -1.61384148747287 A:G A G 10 0.52856003814033 0.633205267079494 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48710798_48710958:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48710798_48710958:AC103686.1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 54684673 T/C 1 20 19 39 9.4287992371934 10.0426407246663 -0.613841487472872 T:C T C 10 0.52856003814033 0.873655585838834 ENSG00000047249:ENST00000355221:exon_54684549_54684727:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000520188:exon_54684549_54684727:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000359530:exon_54684549_54684727:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000440871:exon_54684549_54684727:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000396774:exon_54684549_54684727:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000524164:exon_54684549_54684727:ATP6V1H HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 56866452 G/A 1 10 10 20 4.7143996185967 5.2856003814033 -0.571200762806601 A:G G A 10 0.52856003814033 0.826187510866658 ENSG00000254087:ENST00000519728:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000520220:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000502902:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000507431:exon_56866391_56866543:LYN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 56986883 G/C 1 14 35 49 6.60015946603538 18.4996013349116 -11.8994418688762 C:G G C 10 0.52856003814033 0.000818911499160203 ENSG00000008988:ENST00000524349:exon_56986619_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521262:exon_56986813_56987069:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000523936:exon_56986813_56986915:RPS20 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 56986948 T/C 1 1451 1467 2918 684.059384658381 775.397575951864 -91.3381912934831 T:C T C 10 0.52856003814033 0.000736561432884924 ENSG00000008988:ENST00000519807:exon_56986940_56987068:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000427539:exon_56986940_56987069:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000009589:exon_56986940_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000524349:exon_56986619_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520490:exon_56986940_56987031:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521262:exon_56986813_56987069:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520627:exon_56986940_56987069:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519606:exon_56986940_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521289:exon_56986940_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000518875:exon_56986940_56987057:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519369:exon_56986940_56987065:RPS20 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 67341743 A/G 1 41 41 82 19.3290384362465 21.6709615637535 -2.34192312750707 A:G A G 10 0.52856003814033 0.658561424427263 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 67592152 T/C 1 13 12 25 6.12871950417571 6.34272045768396 -0.214000953508251 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000104205:ENST00000520044:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000104205:ENST00000519289:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000213865:ENST00000521113:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000519561:exon_67591956_67593393:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000390159:exon_67591956_67593235:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000396609:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000518860:exon_67591774_67592259:C8orf44 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 12 11 23 5.65727954231604 5.81416041954363 -0.15688087722759 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 9 6 15 4.24295965673703 3.17136022884198 1.07159942789505 A:C A C 10 0.52856003814033 0.616121686737298 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 8 11 19 3.77151969487736 5.81416041954363 -2.04264072466627 T:C T C 10 0.52856003814033 0.367905468198703 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 21 15 36 9.90023919905307 7.92840057210495 1.97183862694812 A:G A G 10 0.52856003814033 0.617191029889971 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 8 8 16 3.77151969487736 4.22848030512264 -0.456960610245281 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 94746049 T/G 1 4 8 12 1.88575984743868 4.22848030512264 -2.34272045768396 T:G T G 10 0.52856003814033 0.248143449837288 ENSG00000183808:ENST00000399300:exon_94741584_94748666:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000517700:exon_94742492_94746416:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000329529:exon_94745633_94746416:RBM12B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 95523434 T/A 1 32 46 78 15.0860787795094 24.3137617544552 -9.22768297494574 A:T T A 10 0.52856003814033 0.0409336640216800 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95523413_95523957:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95523413_95523957:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95523413_95523957:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000521080:exon_95523413_95523957:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95523413_95523957:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000523405:exon_95523413_95523790:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95522961_95523957:KIAA1429 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 99057150 C/A 1 17 8 25 8.01447935161439 4.22848030512264 3.78599904649175 A:C C A 10 0.52856003814033 0.161198885597744 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 99057526 G/A 1 9 10 19 4.24295965673703 5.2856003814033 -1.04264072466627 A:G G A 10 0.52856003814033 0.653229248249193 ENSG00000156482:ENST00000517489:exon_99057171_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 11 15 26 5.18583958045637 7.92840057210495 -2.74256099164858 T:C T C 10 0.52856003814033 0.328203988236900 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 22 21 43 10.3716791609127 11.0997608009469 -0.728081640034191 A:G G A 10 0.52856003814033 0.879156036024893 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 16 11 27 7.54303938975472 5.81416041954363 1.72887897021109 A:G A G 10 0.52856003814033 0.566418285796463 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 104439375 A/G 1 10 14 24 4.7143996185967 7.39984053396462 -2.68544091536792 A:G A G 10 0.52856003814033 0.31012508646494 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104439325_104439480:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104439325_104440945:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521999:exon_104439325_104439480:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104439325_104439658:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104439325_104442917:DCAF13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 110539186 G/A 1 1 9 10 0.47143996185967 4.75704034326297 -4.2856003814033 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00832466243874547 ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000534623:exon_110539013_110539256:PKHD1L1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 121528385 T/C 1 9 3 12 4.24295965673703 1.58568011442099 2.65727954231604 T:C T C 10 0.52856003814033 0.153869078916603 ENSG00000172167:ENST00000305949:exon_121528165_121528431:MTBP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 125463435 C/G 1 10 11 21 4.7143996185967 5.81416041954363 -1.09976080094693 C:G C G 10 0.52856003814033 0.667148390379936 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 125463544 T/C 1 8 13 21 3.77151969487736 6.87128049582429 -3.09976080094693 T:C T C 10 0.52856003814033 0.194847234835071 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 125499363 G/A 1 30 35 65 14.1431988557901 18.4996013349116 -4.35640247912145 A:G G A 10 0.52856003814033 0.320511449000958 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 125528135 G/A 1 14 8 22 6.60015946603538 4.22848030512264 2.37167916091274 A:G G A 10 0.52856003814033 0.39453671919514 ENSG00000147687:ENST00000276692:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523214:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519548:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522810:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000517678:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519776:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521546:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521973:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520321:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522310:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519232:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520938:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523888:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523152:exon_125528128_125528271:TATDN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 128098838 G/A 0 13 0 13 6.12871950417571 0 6.12871950417571 G G 10 0.52856003814033 0.000308145002435499 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 135524797 G/T 1 36 25 61 16.9718386269481 13.2140009535083 3.75783767343987 T:G G T 10 0.52856003814033 0.370551333830041 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135524718_135524844:ZFAT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 141461062 G/A 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 142161032 A/C 1 7 3 10 3.30007973301769 1.58568011442099 1.7143996185967 A:C A C 10 0.52856003814033 0.351744435761646 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142160933_142161052:DENND3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 142170884 C/T 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521477:exon_142170731_142170886:DENND3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 23 28 51 10.8431191227724 14.7996810679292 -3.95656194515683 A:G G A 10 0.52856003814033 0.326246599055015 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 44 38 82 20.7433583218255 20.0852814493325 0.658076872492938 C:G C G 10 0.52856003814033 0.91230392580534 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 17 37 54 8.01447935161439 19.5567214111922 -11.5422420595778 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00237980231290066 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 18 18 36 8.48591931347406 9.51408068652594 -1.02816137305188 A:G G A 10 0.52856003814033 0.741707280310665 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 20 17 37 9.4287992371934 8.98552064838561 0.443278588807788 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144663466 G/A 1 510 520 1030 240.434380548432 274.851219832972 -34.4168392845399 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0337677925260207 ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144663224_144666421:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144663456_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144663456_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144663456_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534377:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526786:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533204:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530191:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531218:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530848:exon_144663224_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533494:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530445:exon_144663399_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529516:exon_144663456_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534232:exon_144663456_144663876:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533749:exon_144663399_144663498:EEF1D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144671244 C/G 1 3 9 12 1.41431988557901 4.75704034326297 -3.34272045768396 C:G C G 10 0.52856003814033 0.0796439798478496 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144671956 G/A 1 8 7 15 3.77151969487736 3.69992026698231 0.0715994278950496 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144681714 G/A 1 15 14 29 7.07159942789505 7.39984053396462 -0.328241106069571 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144689146 C/T 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144874078 C/T 1 64 74 138 30.1721575590189 39.1134428223844 -8.94128526336554 T:C C T 10 0.52856003814033 0.146939506201060 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144874046_144874083:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144874046_144874083:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144874046_144874083:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144874046_144874083:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144874046_144874083:SCRIB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144885580 A/G 1 18 12 30 8.48591931347406 6.34272045768396 2.1431988557901 A:G A G 10 0.52856003814033 0.469352400778903 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144885553_144885741:SCRIB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144889172 A/G 1 2 6 8 0.94287992371934 3.17136022884198 -2.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 0.159769451784926 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000531942:exon_144889094_144889183:SCRIB HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144992862 A/G 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:G A G 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 T:C C T 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144993377 A/G 1 5 3 8 2.35719980929835 1.58568011442099 0.77151969487736 A:G A G 10 0.52856003814033 0.730113654655552 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144996029 A/G 1 3 6 9 1.41431988557901 3.17136022884198 -1.75704034326297 A:G A G 10 0.52856003814033 0.322282730829835 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 9 8 17 4.24295965673703 4.22848030512264 0.0144793516143897 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144998169 C/T 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144998190 A/G 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144999417 C/T 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 144999684 A/G 1 5 5 10 2.35719980929835 2.64280019070165 -0.285600381403301 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 145057868 A/G 1 18 26 44 8.48591931347406 13.7425609916486 -5.25664167817452 A:G A G 10 0.52856003814033 0.131081983917344 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 22 9 31 10.3716791609127 4.75704034326297 5.61463881764977 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0481236372586562 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 12 7 19 5.65727954231604 3.69992026698231 1.95735927533373 A:G G A 10 0.52856003814033 0.491911774893767 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 145154709 C/T 1 32 41 73 15.0860787795094 21.6709615637535 -6.58488278424409 T:C C T 10 0.52856003814033 0.128674599353455 ENSG00000179526:ENST00000398712:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000359551:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000530216:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000534242:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000525275:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000533948:exon_145154606_145154747:SHARPIN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 145583707 C/T 1 29 20 49 13.6717588939304 10.5712007628066 3.10055813112383 T:C C T 10 0.52856003814033 0.394228477428164 ENSG00000185803:ENST00000530047:exon_145583283_145584153:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000527078:exon_145583283_145584153:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000402965:exon_145583283_145584153:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000532887:exon_145583283_145584153:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000329994:exon_145583283_145584153:GPR172A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 19 20 39 8.95735927533373 10.5712007628066 -1.61384148747287 T:C C T 10 0.52856003814033 0.633205267079494 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 7 8 15 3.30007973301769 4.22848030512264 -0.92840057210495 T:C:G C G 10 0.52856003814033 0.79709726410062 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 5 9 14 2.35719980929835 4.75704034326297 -2.39984053396462 A:G G A 10 0.52856003814033 0.284510641180970 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 146067054 G/A 1 5 6 11 2.35719980929835 3.17136022884198 -0.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.76539358067816 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146066740_146067121:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 146068322 C/T 1 54 40 94 25.4577579404222 21.1424015256132 4.31535641480897 T:C C T 10 0.52856003814033 0.409086732366675 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 146076708 C/T 1 22 30 52 10.3716791609127 15.8568011442099 -5.48512198329716 T:C C T 10 0.52856003814033 0.164194789181547 ENSG00000170619:ENST00000402718:exon_146075559_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000450361:exon_146075573_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000305103:exon_146075604_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000529143:exon_146076210_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000533270:exon_146076211_146076780:COMMD5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 8 146277957 C/T 1 12 5 17 5.65727954231604 2.64280019070165 3.01447935161439 T:C C T 10 0.52856003814033 0.154523241687106 ENSG00000182307:ENST00000524395:exon_146277851_146278322:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000534350:exon_146277853_146278283:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000530455:exon_146277853_146278283:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000529593:exon_146277854_146277971:C8orf33 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 2073292 A/G 1 16 14 30 7.54303938975472 7.39984053396462 0.143198855790099 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2073212_2073342:SMARCA2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 5774225 T/G 1 17 8 25 8.01447935161439 4.22848030512264 3.78599904649175 T:G T G 10 0.52856003814033 0.161198885597744 ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 10 7 17 4.7143996185967 3.69992026698231 1.01447935161439 A:G A G 10 0.52856003814033 0.808994871295111 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 6012734 A/C 1 15 8 23 7.07159942789505 4.22848030512264 2.84311912277241 A:C A C 10 0.52856003814033 0.297564808088866 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 77 78 155 36.3008770631946 41.2276829749457 -4.92680591175115 A:C C A 10 0.52856003814033 0.469143465125243 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 113 116 229 53.2727156901427 61.3129644242783 -8.04024873413558 T:G G T 10 0.52856003814033 0.290382971117419 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 33466219 A/C 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:C A C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33466069_33466223:NOL6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 35105257 G/A 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 A:G G A 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000005238:ENST00000378566:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35104118_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35104120_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35104139_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000479357:exon_35104827_35105371:KIAA1539 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 12 7 19 5.65727954231604 3.69992026698231 1.95735927533373 T:C T C 10 0.52856003814033 0.491911774893767 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 35704150 C/T 1 132 129 261 62.2300749654764 68.1842449201026 -5.95416995462614 T:C:G C T 10 0.52856003814033 0.495315258192629 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35703988_35704171:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000464379:exon_35703988_35704171:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000466916:exon_35703988_35704190:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000465002:exon_35703988_35704412:TLN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 35752124 G/A 1 1 7 8 0.47143996185967 3.69992026698231 -3.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0304181799638115 ENSG00000107185:ENST00000456972:exon_35751953_35752142:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000378078:exon_35751953_35752142:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000496906:exon_35751953_35752142:RGP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 1 10 6 16 4.7143996185967 3.17136022884198 1.54303938975472 A:G G A 10 0.52856003814033 0.466348600091948 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 4 8 12 1.88575984743868 4.22848030512264 -2.34272045768396 T:C C T 10 0.52856003814033 0.248143449837288 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 38396065 G/T 1 14 19 33 6.60015946603538 10.0426407246663 -3.44248125863089 T:G G T 10 0.52856003814033 0.295437717187171 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 71606148 A/G 1 8 8 16 3.77151969487736 4.22848030512264 -0.456960610245281 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000107242:ENST00000377290:exon_71606056_71606173:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000265382:exon_71606056_71606173:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000478500:exon_71606056_71606173:PIP5K1B HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 7 15 22 3.30007973301769 7.92840057210495 -4.62832083908726 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0553058909861206 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 5 11 16 2.35719980929835 5.81416041954363 -3.45696061024528 A:G G A 10 0.52856003814033 0.130508776647043 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 77752510 C/T 1 8 8 16 3.77151969487736 4.22848030512264 -0.456960610245281 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77752454_77752532:OSTF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 82006446 G/A 0 16 0 16 7.54303938975472 0 7.54303938975472 G G 10 0.52856003814033 4.30657437852568e-05 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 90322023 G/A 1 20 22 42 9.4287992371934 11.6283208390873 -2.19952160189386 A:G G A 10 0.52856003814033 0.53839837659526 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 106888978 C/T 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 T:C C T 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106888922_106889065:SMC2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 106901506 A/G 1 27 38 65 12.7288789702111 20.0852814493325 -7.35640247912145 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0813683622753713 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106901420_106903690:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106901420_106903698:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106901420_106901932:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000493955:exon_106901420_106901933:SMC2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 5 10 15 2.35719980929835 5.2856003814033 -2.92840057210495 A:G G A 10 0.52856003814033 0.194617397098600 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 111641806 G/A 1 8 3 11 3.77151969487736 1.58568011442099 2.18583958045637 A:G G A 10 0.52856003814033 0.234946711874713 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 111727670 C/G 1 36 19 55 16.9718386269481 10.0426407246663 6.92919790228185 C:G C G 10 0.52856003814033 0.078217718675655 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 114411945 G/T 1 4 10 14 1.88575984743868 5.2856003814033 -3.39984053396462 T:G G T 10 0.52856003814033 0.105344207452060 ENSG00000059769:ENST00000313525:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000463589:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000447096:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000436202:exon_114411733_114412203:DNAJC25 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 56 45 101 26.4006378641415 23.7852017163149 2.61543614782667 T:C T C 10 0.52856003814033 0.619637279355937 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 73 63 136 34.4151172157559 33.2992824028408 1.11583481291511 T:C C T 10 0.52856003814033 0.86402821188761 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 25 18 43 11.7859990464917 9.51408068652594 2.27191835996581 A:G G A 10 0.52856003814033 0.542908997814718 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 116044998 A/G 1 6 8 14 2.82863977115802 4.22848030512264 -1.39984053396462 A:G A G 10 0.52856003814033 0.594416539080471 ENSG00000136875:ENST00000374199:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000374198:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000488937:exon_116044926_116045456:PRPF4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 116132334 C/T 1 6 9 15 2.82863977115802 4.75704034326297 -1.92840057210495 T:C C T 10 0.52856003814033 0.439187658248891 ENSG00000119411:ENST00000374183:exon_116131896_116133513:BSPRY;ENSG00000119411:ENST00000462085:exon_116131896_116133513:BSPRY HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 21 43 64 9.90023919905307 22.7280816400342 -12.8278424409811 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0015660813497303 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 119187839 C/T 1 7 4 11 3.30007973301769 2.11424015256132 1.18583958045637 T:C C T 10 0.52856003814033 0.556140452563778 ENSG00000148219:ENST00000288520:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000341734:exon_119187507_119187905:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373986:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000361209:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000313400:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373996:exon_119187507_119188367:ASTN2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 119461275 G/A 1 4 4 8 1.88575984743868 2.11424015256132 -0.22848030512264 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000119401:ENST00000394497:exon_119459944_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000450136:exon_119459941_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000373983:exon_119459935_119463579:TRIM32 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 123163053 G/A 1 14 13 27 6.60015946603538 6.87128049582429 -0.271121029788911 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000474262:exon_123163020_123163297:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000484546:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480467:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000433194:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 123170733 C/G 1 13 7 20 6.12871950417571 3.69992026698231 2.4287992371934 C:G C G 10 0.52856003814033 0.371226288997467 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 123182202 C/T 1 7 10 17 3.30007973301769 5.2856003814033 -1.98552064838561 T:C C T 10 0.52856003814033 0.345083621048323 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 123205912 C/G 1 13 11 24 6.12871950417571 5.81416041954363 0.314559084632079 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000479584:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 123205981 C/T 1 11 3 14 5.18583958045637 1.58568011442099 3.60015946603538 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0629725641543962 ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000479584:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 123291036 C/G 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 C:G C G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000482047:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123291022_123291051:CDK5RAP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 123301346 T/G 1 5 4 9 2.35719980929835 2.11424015256132 0.24295965673703 T:G T G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123301315_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123301319_123301398:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 123671520 G/A 1 140 148 288 66.0015946603538 78.2268856447688 -12.2252909844151 A:T:G G A 10 0.52856003814033 0.156702119567549 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 123875967 C/T 1 21 9 30 9.90023919905307 4.75704034326297 5.1431988557901 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0679525940161119 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123875780_123875980:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123875780_123876002:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123875780_123876002:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123875780_123875983:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123875780_123876002:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123875780_123876002:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123875780_123876002:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123875780_123876002:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000468952:exon_123875780_123875969:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373851:exon_123875780_123876002:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123875955_123876002:CEP110 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 123929770 C/T 1 21 32 53 9.90023919905307 16.9139212204906 -7.01368202143749 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0552751224727099 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123929767_123929955:CEP110 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 124094800 T/C 1 12 6 18 5.65727954231604 3.17136022884198 2.48591931347406 T:C T C 10 0.52856003814033 0.345436270087802 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124094712_124095121:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373806:exon_124094712_124094940:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373805:exon_124094712_124095016:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477553:exon_124094712_124094867:GSN HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 29 33 62 13.6717588939304 17.4424812586309 -3.77072236470046 T:C C T 10 0.52856003814033 0.374025302491909 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 125009839 C/T 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 T:C C T 10 0.52856003814033 1 ENSG00000119446:ENST00000417201:exon_125009797_125009883:RBM18;ENSG00000119446:ENST00000483428:exon_125009797_125009883:RBM18 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 125652757 G/A 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 A:G G A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 127996046 A/G 1 50 56 106 23.5719980929835 29.5993621358585 -6.02736404287498 A:G A G 10 0.52856003814033 0.244752454168197 ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127995967_127996334:RABEPK HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 128246786 G/A 1 9 17 26 4.24295965673703 8.98552064838561 -4.74256099164858 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0765655389670701 ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128246722_128246862:MAPKAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 130206669 C/T 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 130242166 A/G 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 A:G A G 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130242118_130242257:LRSAM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 130263351 G/A 1 18 10 28 8.48591931347406 5.2856003814033 3.20031893207076 A:G G A 10 0.52856003814033 0.259092327813496 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000472592:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000479957:exon_130263289_130263371:LRSAM1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 27 30 57 12.7288789702111 15.8568011442099 -3.12792217399881 A:G G A 10 0.52856003814033 0.428246560688776 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 130511552 G/A 1 16 13 29 7.54303938975472 6.87128049582429 0.671758893930429 A:G G A 10 0.52856003814033 0.854113456238506 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130511490_130511944:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130511490_130511944:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130511490_130511944:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130511490_130511944:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130511490_130511944:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130511490_130511944:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130511490_130511944:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130511490_130511944:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130511490_130511944:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130511490_130511944:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000414380:exon_130511491_130511944:SH2D3C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 130513469 A/G 1 9 10 19 4.24295965673703 5.2856003814033 -1.04264072466627 A:G A G 10 0.52856003814033 0.653229248249193 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000471939:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000414380:exon_130513451_130513579:SH2D3C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 130523904 T/C 1 7 10 17 3.30007973301769 5.2856003814033 -1.98552064838561 T:C T C 10 0.52856003814033 0.345083621048323 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130523890_130523931:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130523890_130523929:SH2D3C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 130677112 G/A 1 11 11 22 5.18583958045637 5.81416041954363 -0.628320839087261 A:G G A 10 0.52856003814033 0.83325131156315 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000361444:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000483438:exon_130676935_130677145:ST6GALNAC4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 103 91 194 48.558316071546 48.09896347077 0.459352600775979 C:G G C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 130698845 C/T 1 71 76 147 33.4722372920366 40.1705628986651 -6.69832560662852 T:C C T 10 0.52856003814033 0.283319175964221 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130698832_130698934:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130698832_130699802:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130698832_130698934:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000373110:exon_130698313_130698934:DPM2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 131088076 G/A 1 4 7 11 1.88575984743868 3.69992026698231 -1.81416041954363 A:G G A 10 0.52856003814033 0.368260783015119 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131088058_131088160:COQ4;ENSG00000167113:ENST00000372875:exon_131088058_131088679:COQ4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 131285955 A/G 1 1 8 9 0.47143996185967 4.22848030512264 -3.75704034326297 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0159780666639568 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131285927_131286125:GLE1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 2 8 10 0.94287992371934 4.22848030512264 -3.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0541817455657943 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 23 27 50 10.8431191227724 14.2711210297889 -3.4280019070165 T:C C T 10 0.52856003814033 0.395648327443981 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 29 19 48 13.6717588939304 10.0426407246663 3.62911816926416 A:G G A 10 0.52856003814033 0.314581199474046 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 8 10 18 3.77151969487736 5.2856003814033 -1.51408068652594 T:C C T 10 0.52856003814033 0.490005542254718 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 131403096 A/G 1 10 8 18 4.7143996185967 4.22848030512264 0.485919313474059 A:G A G 10 0.52856003814033 1 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 16 21 37 7.54303938975472 11.0997608009469 -3.55672141119221 A:G G A 10 0.52856003814033 0.253370797269923 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 132638424 C/T 1 3 7 10 1.41431988557901 3.69992026698231 -2.2856003814033 T:C C T 10 0.52856003814033 0.206826979960111 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000496927:exon_132638409_132638517:USP20 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 133576256 T/C 1 7 5 12 3.30007973301769 2.64280019070165 0.65727954231604 T:C T C 10 0.52856003814033 0.778794317245757 ENSG00000130713:ENST00000372358:exon_133576254_133576322:EXOSC2;ENSG00000130713:ENST00000430138:exon_133576254_133576322:EXOSC2;ENSG00000130713:ENST00000372352:exon_133576254_133576322:EXOSC2;ENSG00000130713:ENST00000372351:exon_133576254_133576322:EXOSC2;ENSG00000130713:ENST00000372350:exon_133576254_133576322:EXOSC2;ENSG00000130713:ENST00000467138:exon_133576229_133577697:EXOSC2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 133761001 A/G 1 8 11 19 3.77151969487736 5.81416041954363 -2.04264072466627 A:G A G 10 0.52856003814033 0.367905468198703 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 135139826 T/C 1 47 39 86 22.1576782074045 20.6138414874729 1.54383671993162 T:C T C 10 0.52856003814033 0.747456826341887 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 135147182 C/T 1 8 23 31 3.77151969487736 12.1568808772276 -8.38536118235023 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00333536608734657 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135147097_135147195:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135147097_135147195:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135147097_135147195:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135147097_135147195:SETX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 135173685 T/C 1 6 6 12 2.82863977115802 3.17136022884198 -0.34272045768396 T:C T C 10 0.52856003814033 1 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135173467_135173699:SETX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 135202829 T/C 1 5 9 14 2.35719980929835 4.75704034326297 -2.39984053396462 T:C T C 10 0.52856003814033 0.284510641180970 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 135203231 C/T 1 11 5 16 5.18583958045637 2.64280019070165 2.54303938975472 T:C C T 10 0.52856003814033 0.222015324368485 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 135203409 A/C 1 3 6 9 1.41431988557901 3.17136022884198 -1.75704034326297 A:C A C 10 0.52856003814033 0.322282730829835 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 135203530 A/C 1 3 5 8 1.41431988557901 2.64280019070165 -1.22848030512264 A:C A C 10 0.52856003814033 0.488044846697727 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 135277130 C/A 1 58 45 103 27.3435177878609 23.7852017163149 3.55831607154601 A:C C A 10 0.52856003814033 0.491662452150745 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 135537994 T/C 1 2 8 10 0.94287992371934 4.22848030512264 -3.2856003814033 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0541817455657943 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135537826_135538082:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135537826_135538082:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135537826_135538082:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135537826_135538082:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000310532:exon_135537826_135538082:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000480876:exon_135537826_135538082:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000482620:exon_135537826_135538082:DDX31 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 135554566 G/A 1 6 16 22 2.82863977115802 8.45696061024528 -5.62832083908726 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0184510675559899 ENSG00000125484:ENST00000372146:exon_135553364_135555190:GTF3C4;ENSG00000125484:ENST00000483873:exon_135554265_135554697:GTF3C4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 135974079 G/C 1 21 28 49 9.90023919905307 14.7996810679292 -4.89944186887617 C:G G C 10 0.52856003814033 0.197449063236790 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 29 38 67 13.6717588939304 20.0852814493325 -6.41352255540211 A:G G A 10 0.52856003814033 0.141481327052033 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 136221724 G/A 1 11 20 31 5.18583958045637 10.5712007628066 -5.38536118235023 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0705266728795218 ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136221679_136221812:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000437995:exon_136221679_136221812:SURF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 33 51 84 15.5575187413691 26.9565619451568 -11.3990432037877 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0157313336437224 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 136324239 C/A 1 7 6 13 3.30007973301769 3.17136022884198 0.12871950417571 A:C C A 10 0.52856003814033 1 ENSG00000160323:ENST00000485925:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371929:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371916:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000338351:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000355699:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000356589:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371910:exon_136324096_136324508:ADAMTS13 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 136340200 T/G 1 11 6 17 5.18583958045637 3.17136022884198 2.01447935161439 T:G T G 10 0.52856003814033 0.467313177256825 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136340083_136340235:SLC2A6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 139100805 T/C 1 7 2 9 3.30007973301769 1.05712007628066 2.24295965673703 T:C T C 10 0.52856003814033 0.186100445119176 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139098179_139101121:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139098185_139101121:QSOX2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 41 33 74 19.3290384362465 17.4424812586309 1.88655717761558 A:G A G 10 0.52856003814033 0.727255502087836 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 15 28 43 7.07159942789505 14.7996810679292 -7.72808164003419 T:C T C 10 0.52856003814033 0.0213738908228714 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 139273402 C/T 1 22 16 38 10.3716791609127 8.45696061024528 1.91471855066746 T:C C T 10 0.52856003814033 0.626753997525001 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 139275204 A/C 1 5 10 15 2.35719980929835 5.2856003814033 -2.92840057210495 A:C A C 10 0.52856003814033 0.194617397098600 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 139275294 G/C 1 4 6 10 1.88575984743868 3.17136022884198 -1.2856003814033 C:G G C 10 0.52856003814033 0.531695721084805 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 139298580 C/T 1 25 18 43 11.7859990464917 9.51408068652594 2.27191835996581 T:C C T 10 0.52856003814033 0.542908997814718 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 13 10 23 6.12871950417571 5.2856003814033 0.843119122772409 A:G A G 10 0.52856003814033 0.83562946433756 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 139299637 C/T 1 21 22 43 9.90023919905307 11.6283208390873 -1.72808164003419 T:C C T 10 0.52856003814033 0.648201546844192 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139299543_139299800:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139299570_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139299543_139299654:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139299570_139299654:SDCCAG3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 139306467 C/T 1 49 33 82 23.1005581311238 17.4424812586309 5.65807687249294 T:C C T 10 0.52856003814033 0.224918559486261 ENSG00000165688:ENST00000371720:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000446975:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139306449_139306651:PMPCA HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 139621168 G/A 1 5 7 12 2.35719980929835 3.69992026698231 -1.34272045768396 A:G G A 10 0.52856003814033 0.566216755054812 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 20 20 40 9.4287992371934 10.5712007628066 -1.1424015256132 A:G A G 10 0.52856003814033 0.753183226177787 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 140135784 C/A 1 45 33 78 21.2147982836851 17.4424812586309 3.77231702505426 A:C C A 10 0.52856003814033 0.42818601659807 ENSG00000188229:ENST00000340384:exon_140135665_140135869:TUBB2C HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 42 41 83 19.8004783981061 21.6709615637535 -1.87048316564739 A:T:G G A 10 0.52856003814033 0.741813380252724 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 140446707 G/A 1 337 235 572 158.875267146709 124.211608962978 34.6636581837312 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00382740378070491 ENSG00000182154:ENST00000371443:exon_140446526_140447007:MRPL41 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 140611436 T/C 1 9 16 25 4.24295965673703 8.45696061024528 -4.21400095350825 T:C T C 10 0.52856003814033 0.109429702594063 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 140638416 G/A 1 7 4 11 3.30007973301769 2.11424015256132 1.18583958045637 A:G G A 10 0.52856003814033 0.556140452563778 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 11 4 15 5.18583958045637 2.11424015256132 3.07159942789505 T:C T C 10 0.52856003814033 0.127429524906155 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 229493 G/A 1 8 16 24 3.77151969487736 8.45696061024528 -4.68544091536792 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0657887106301226 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 7 14 21 3.30007973301769 7.39984053396462 -4.09976080094693 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0825740304514078 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 295097 C/T 1 21 2 23 9.90023919905307 1.05712007628066 8.84311912277241 T:C C T 10 0.52856003814033 0.000182837264560554 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 295135 G/A 0 21 0 21 9.90023919905307 0 9.90023919905307 G G 10 0.52856003814033 1.66968084850035e-06 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 299360 G/A 1 27 5 32 12.7288789702111 2.64280019070165 10.0860787795094 A:G G A 10 0.52856003814033 0.000272078606192419 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 117 122 239 55.1584755375814 64.4843246531203 -9.32584911553888 T:C C T 10 0.52856003814033 0.243560852863649 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 1537002 C/G 1 43 47 90 20.2719183599658 24.8423217925955 -4.5704034326297 C:G C G 10 0.52856003814033 0.343833833557434 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 10 15 25 4.7143996185967 7.92840057210495 -3.21400095350825 T:C C T 10 0.52856003814033 0.231461156218361 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 17 14 31 8.01447935161439 7.39984053396462 0.614638817649769 C:G C G 10 0.52856003814033 0.859133520696697 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 6995417 C/T 1 7 12 19 3.30007973301769 6.34272045768396 -3.04264072466627 T:C C T 10 0.52856003814033 0.175319074565204 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000412827:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_6995261_6995490:HDHD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 6995438 C/T 1 8 13 21 3.77151969487736 6.87128049582429 -3.09976080094693 T:C C T 10 0.52856003814033 0.194847234835071 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000412827:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_6995261_6995490:HDHD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 7023678 G/A 1 10 14 24 4.7143996185967 7.39984053396462 -2.68544091536792 A:G G A 10 0.52856003814033 0.31012508646494 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000498474:exon_7023661_7023879:HDHD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 15838366 C/T 1 3 14 17 1.41431988557901 7.39984053396462 -5.98552064838561 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00566557927197770 ENSG00000169249:ENST00000307771:exon_15838330_15838439:ZRSR2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 23858452 G/A 1 12 27 39 5.65727954231604 14.2711210297889 -8.61384148747287 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00615849916281771 ENSG00000184831:ENST00000379226:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000476598:exon_23858430_23858522:APOO;ENSG00000184831:ENST00000439528:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000379220:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000490078:exon_23858430_23858494:APOO HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 46332301 A/C 1 6 16 22 2.82863977115802 8.45696061024528 -5.62832083908726 A:C A C 10 0.52856003814033 0.0184510675559899 ENSG00000147121:ENST00000344302:exon_46332185_46334074:ZNF673;ENSG00000147121:ENST00000298190:exon_46332185_46333104:ZNF673;ENSG00000147121:ENST00000487081:exon_46332188_46333029:ZNF673;ENSG00000147121:ENST00000397212:exon_46332185_46334073:ZNF673 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 47062534 G/A 1 37 77 114 17.4432785888078 40.6991229368054 -23.2558443479976 A:C:G G A 10 0.52856003814033 1.29106455577507e-05 ENSG00000130985:ENST00000377351:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000335972:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000424033:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377271:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000490869:exon_47062533_47062613:UBA1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 47444985 T/C 1 40 101 141 18.8575984743868 53.3845638521733 -34.5269653777865 T:C T C 10 0.52856003814033 4.98477687889396e-09 ENSG00000102265:ENST00000218388:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377018:exon_47444335_47445482:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000456754:exon_47444604_47445422:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377017:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377013:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000445623:exon_47444741_47445066:TIMP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 47500700 C/T 1 1 7 8 0.47143996185967 3.69992026698231 -3.22848030512264 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0304181799638115 ENSG00000126767:ENST00000247161:exon_47500631_47500874:ELK1;ENSG00000126767:ENST00000376983:exon_47500631_47500874:ELK1;ENSG00000126767:ENST00000480157:exon_47500631_47500874:ELK1;ENSG00000126767:ENST00000343894:exon_47500631_47500874:ELK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 47662972 T/G 0 0 8 8 0 4.22848030512264 -4.22848030512264 G T G 10 0.52856003814033 0.00244011976995637 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 48382174 G/T 1 41 190 231 19.3290384362465 100.426407246663 -81.0973688104162 T:G G T 10 0.52856003814033 4.49740974830398e-28 ENSG00000147155:ENST00000495186:exon_48382087_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000498425:exon_48382142_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000446158:exon_48382087_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000414061:exon_48382087_48382460:EBP HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 48418126 A/G 1 5 17 22 2.35719980929835 8.98552064838561 -6.62832083908726 A:G A G 10 0.52856003814033 0.00501733661668241 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000481090:exon_48418002_48418274:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 48418659 G/A 1 9 43 52 4.24295965673703 22.7280816400342 -18.4851219832972 A:G G A 10 0.52856003814033 1.78046836839230e-07 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 48751471 A/G 1 22 140 162 10.3716791609127 73.9984053396462 -63.6267261787335 A:G A G 10 0.52856003814033 1.62477869351164e-25 ENSG00000126768:ENST00000376582:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000466995:exon_48751183_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000396779:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000495490:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000472645:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000465150:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000490755:exon_48751380_48751508:TIMM17B HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 48847497 T/C 1 28 6 34 13.2003189320708 3.17136022884198 10.0289587032288 T:C T C 10 0.52856003814033 0.000454069735810798 ENSG00000068400:ENST00000376425:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376444:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376441:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000473581:exon_48847338_48847798:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376423:exon_48847338_48847514:GRIPAP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 48888074 T/C 1 8 3 11 3.77151969487736 1.58568011442099 2.18583958045637 T:C T C 10 0.52856003814033 0.234946711874713 ENSG00000068323:ENST00000315869:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000493583:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000478476:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000336239:exon_48887729_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000495940:exon_48888024_48888110:TFE3 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 54836361 A/G 1 54 17 71 25.4577579404222 8.98552064838561 16.4722372920366 A:G A G 10 0.52856003814033 7.02911907191512e-05 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 54836505 A/G 1 35 9 44 16.5003986650884 4.75704034326297 11.7433583218255 A:G A G 10 0.52856003814033 0.000385799475293585 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54836305_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54836155_54836633:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54836314_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54836356_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000485483:exon_54836155_54836565:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54836155_54836646:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54836314_54836646:MAGED2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 54837340 C/T 1 45 11 56 21.2147982836851 5.81416041954363 15.4006378641415 T:C C T 10 0.52856003814033 2.35490710099922e-05 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54837254_54837563:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54837254_54837562:MAGED2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 54838077 C/T 1 27 7 34 12.7288789702111 3.69992026698231 9.02895870322878 T:C C T 10 0.52856003814033 0.00174080376276524 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375062:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000441374:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000454156:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54838007_54838077:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375060:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54838007_54838086:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000487482:exon_54837965_54838086:MAGED2 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 64744122 C/T 1 8 53 61 3.77151969487736 28.0136820214375 -24.2421623265601 T:C C T 10 0.52856003814033 1.49030608098278e-10 ENSG00000001497:ENST00000374807:exon_64743936_64744142:LAS1L;ENSG00000001497:ENST00000374811:exon_64743936_64744142:LAS1L;ENSG00000001497:ENST00000374804:exon_64743936_64744142:LAS1L;ENSG00000001497:ENST00000484069:exon_64743936_64744142:LAS1L;ENSG00000001497:ENST00000312391:exon_64743936_64744142:LAS1L HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 76937963 G/C 1 42 175 217 19.8004783981061 92.4980066745578 -72.6975282764516 C:G G C 10 0.52856003814033 3.88809006014041e-24 ENSG00000085224:ENST00000373344:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000395603:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000480283:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000395605:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000343347:exon_76937012_76940085:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000400862:exon_76937807_76938943:ATRX;ENSG00000085224:ENST00000400861:exon_76937807_76938943:ATRX HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 77528317 G/A 1 18 4 22 8.48591931347406 2.11424015256132 6.37167916091274 A:G G A 10 0.52856003814033 0.0087637677580273 ENSG00000173198:ENST00000373304:exon_77526961_77529270:CYSLTR1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 78216024 A/C 1 20 27 47 9.4287992371934 14.2711210297889 -4.84232179259551 A:C A C 10 0.52856003814033 0.188360863252860 ENSG00000078589:ENST00000171757:exon_78216005_78217451:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000475374:exon_78216005_78216577:P2RY10;ENSG00000078589:ENST00000461541:exon_78216005_78216368:P2RY10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 101858470 A/G 1 9 41 50 4.24295965673703 21.6709615637535 -17.4280019070165 A:G A G 10 0.52856003814033 5.37629931464148e-07 ENSG00000125962:ENST00000246174:exon_101856808_101859087:ARMCX5;ENSG00000125962:ENST00000372742:exon_101856808_101859081:ARMCX5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 117819773 A/C 1 68 8 76 32.0579174064576 4.22848030512264 27.8294371013349 A:C A C 10 0.52856003814033 1.13818290543027e-11 ENSG00000147251:ENST00000276204:exon_117819651_117820126:DOCK11;ENSG00000147251:ENST00000276202:exon_117819651_117820110:DOCK11 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 118587003 C/T 1 5 22 27 2.35719980929835 11.6283208390873 -9.27112102978891 T:C C T 10 0.52856003814033 0.000346372882164483 ENSG00000077713:ENST00000217909:exon_118586828_118588441:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000488158:exon_118586918_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000326714:exon_118586828_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000336249:exon_118586828_118588435:SLC25A43;ENSG00000077713:ENST00000493093:exon_118586828_118587145:SLC25A43 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 118604436 T/C 1 235 1133 1368 110.788391037022 598.858523212994 -488.070132175971 A:T:C T C 10 0.52856003814033 1.81414757121327e-164 ENSG00000005022:ENST00000317881:exon_118604336_118604476:SLC25A5;ENSG00000005022:ENST00000460013:exon_118604336_118604476:SLC25A5;ENSG00000005022:ENST00000463551:exon_118604225_118604476:SLC25A5 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 129058882 T/C 1 40 6 46 18.8575984743868 3.17136022884198 15.6862382455448 T:C T C 10 0.52856003814033 1.77756632929572e-06 ENSG00000156697:ENST00000425117:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000371051:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000394422:exon_129058771_129059171:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000427972:exon_129058771_129058886:UTP14A;ENSG00000156697:ENST00000371042:exon_129058771_129059171:UTP14A HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 135593629 C/T 1 195 52 247 91.9307925626356 27.4851219832972 64.4456705793385 T:C C T 10 0.52856003814033 2.13625236437902e-17 ENSG00000102241:ENST00000218364:exon_135592967_135594505:HTATSF1;ENSG00000102241:ENST00000415377:exon_135592967_135593831:HTATSF1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153009197 G/C 0 10 0 10 4.7143996185967 0 4.7143996185967 G G 10 0.52856003814033 0.00224426647978634 ENSG00000101986:ENST00000218104:exon_153008943_153010216:ABCD1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153176254 A/G 1 77 18 95 36.3008770631946 9.51408068652594 26.7867963766687 A:G A G 10 0.52856003814033 1.26362743199832e-08 ENSG00000089820:ENST00000393721:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000370028:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000420383:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000350060:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000494397:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000370016:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000470209:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000494302:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000404127:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000454164:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000467421:exon_153176154_153176325:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000442172:exon_153176154_153176288:ARHGAP4 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153195393 G/A 1 203 56 259 95.702312257513 29.5993621358585 66.1029501216545 A:T:G G A 10 0.52856003814033 2.36322899367854e-17 ENSG00000102030:ENST00000464845:exon_153194695_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000482485:exon_153195280_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370015:exon_153195367_153195760:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000393712:exon_153195374_153195756:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370009:exon_153195377_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000466877:exon_153195379_153195676:NAA10 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153220360 A/G 1 8 1 9 3.77151969487736 0.52856003814033 3.24295965673703 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0418258618356361 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153219517_153220993:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153219517_153220993:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153219517_153220993:HCFC1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153247722 C/T 1 8 1 9 3.77151969487736 0.52856003814033 3.24295965673703 T:C:G C T 10 0.52856003814033 0.0418258618356361 ENSG00000177854:ENST00000369982:exon_153247301_153248646:TMEM187 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153247954 C/T 1 13 4 17 6.12871950417571 2.11424015256132 4.01447935161439 T:C C T 10 0.52856003814033 0.0552329538663803 ENSG00000177854:ENST00000369982:exon_153247301_153248646:TMEM187 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153248248 G/A 1 32 10 42 15.0860787795094 5.2856003814033 9.80047839810614 A:G G A 10 0.52856003814033 0.00286729840702373 ENSG00000177854:ENST00000369982:exon_153247301_153248646:TMEM187 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153278829 G/A 1 6 29 35 2.82863977115802 15.3282411060696 -12.4996013349116 A:G G A 10 0.52856003814033 2.22431078209471e-05 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000444254:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000443220:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000467236:exon_153278787_153278884:IRAK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153284483 G/A 1 4 8 12 1.88575984743868 4.22848030512264 -2.34272045768396 A:G G A 10 0.52856003814033 0.248143449837288 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393682:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000444230:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393687:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000429936:exon_153284426_153284529:IRAK1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153579448 A/G 1 1 7 8 0.47143996185967 3.69992026698231 -3.22848030512264 A:G A G 10 0.52856003814033 0.0304181799638115 ENSG00000196924:ENST00000490936:exon_153578399_153580064:FLNA HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153581932 A/G 1 22 136 158 10.3716791609127 71.8841651870849 -61.5124860261721 A:G A G 10 0.52856003814033 2.96493534132406e-24 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369852:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000428077:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000490936:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000415241:exon_153581922_153581966:FLNA HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153609504 G/T 1 224 62 286 105.602551456566 32.7707223647005 72.8318290918656 T:G G T 10 0.52856003814033 5.30496659694931e-19 ENSG00000102119:ENST00000369842:exon_153609242_153609883:EMD;ENSG00000102119:ENST00000369835:exon_153609242_153609651:EMD;ENSG00000102119:ENST00000486738:exon_153609113_153609639:EMD;ENSG00000102119:ENST00000428228:exon_153609242_153609643:EMD;ENSG00000102119:ENST00000492448:exon_153609242_153609641:EMD;ENSG00000102119:ENST00000471965:exon_153609242_153609803:EMD HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153664066 C/T 1 30 130 160 14.1431988557901 68.7128049582429 -54.5696061024528 T:C C T 10 0.52856003814033 8.90694722066561e-19 ENSG00000071553:ENST00000369762:exon_153664028_153664862:ATP6AP1;ENSG00000071553:ENST00000445849:exon_153664028_153664862:ATP6AP1;ENSG00000071553:ENST00000455205:exon_153664028_153664861:ATP6AP1;ENSG00000071553:ENST00000491569:exon_153664028_153664861:ATP6AP1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153667176 T/C 1 6 29 35 2.82863977115802 15.3282411060696 -12.4996013349116 T:C T C 10 0.52856003814033 2.22431078209471e-05 ENSG00000203879:ENST00000447750:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000445564:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000475976:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000369741:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000434049:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000415109:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000481304:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000485143:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000491154:exon_153667111_153667210:GDI1 HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 153760654 G/A 1 9 50 59 4.24295965673703 26.4280019070165 -22.1850422502795 A:G G A 10 0.52856003814033 3.43079626312795e-09 ENSG00000160211:ENST00000393562:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000291567:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000442162:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000434882:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000393564:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000369620:exon_153760601_153760677:G6PD;ENSG00000160211:ENST00000490651:exon_153760601_153760677:G6PD HGDP00959_parsed_pileup.txt . X 154507173 T/G 1 5 12 17 2.35719980929835 6.34272045768396 -3.98552064838561 T:G T G 10 0.52856003814033 0.086003743852648 ENSG00000155962:ENST00000369449:exon_154505500_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000422096:exon_154505526_154507353:CLIC2;ENSG00000155962:ENST00000360485:exon_154505526_154507353:CLIC2